지씨지놈 분기보고서 (2025.09)
6. 주요계약 및 연구개발활동

가. 경영상의 주요계약(단위: 천원)

계약 상대방	계약기간	계약의 목적 및 주요내용	계약금액	대금수금기준

녹십자의료재단	2019.01.01 ~	검사실운영에 관한 용역계약	단가 계약	90일이내 현금

삼성서울병원	2019.06.25 ~	Guardant360 임상검사위탁서비스계약	단가 계약	30일이내 현금

Genece Health	2023.04.11	Exclusive License Agreement	$10.3 M	Upfront, Milestone

MP Group	2023.09.22 ~ 2033.09.21	Exclusive License Agreement	$0.15 M	Upfront, Milestone

일루미나코리아	2022.01.20	물품공급계약NGS(NovaSeq 6000)	1,202,440	30일이내 현금

(주)비엠에스	2019.12.20	물품공급계약DNBSEQ-G400Dx	575,000	30일이내 현금

(주)파워랩	2021.06.03	물품공급계약Echo Liquid Handler	574,000	30일이내 현금

(1) 라이센스아웃(License-out) 계약 공시서류 작성기준일 현재 당사가 체결 중인 라이센스 아웃(License-out) 계약의 현황은 다음과 같습니다.

라이센스아웃 계약 총괄표
(단위: 백만원)

품 목	계약상대방	대상지역	계약체결일	계약종료일	총계약금액	수취금액	진행단계

아이캔서치	Genece Health	미국 / 북미	2023.04.11	모든 로열티 지급 종료 후	주2)	670	제품 개발

지놈헬스	MP Group	태국	2023.09.22	2033.09.21	214	149	기술이전

주1) 수취금액은 실제 금액 수령일 환율을 적용하였습니다.
주2) 총 계약금액의 경우 영업기밀에 해당되므로 기재하지 않았습니다.

나. 연구개발활동(1) 연구개발활동의 개요 당사는 임상유전체 분석 전문 기업으로서 질병 진단 및 치료 현장에서 수집된 개인 유전체 빅데이터 분석 정보를 질병의 조기 선별과 예측, 더 나아가 맞춤형 치료에 활용하는 것을 목표로 개인 맞춤형 정밀의료 기술을 지속적이고 활발하게 연구 개발하고 있습니다.당사가 보유 중인 생애전주기 맞춤 유전체 분석기술을 바탕으로 적용 분야 확장, 기술고도화, 포트폴리오 다각화 등을 통해 국내 및 해외시장을 선도하는 글로벌 임상유전체 분석기업으로 성장해 가고자 합니다. (2) 연구개발 담당조직 (가) 연구개발 조직 개요 당사의 연구개발 조직은 연구소 산하의 연구기획팀, 연구개발팀, 제품개발팀, AI-C팀, 의학본부 산하의 Medical Office, AI-G팀, 분석본부 산하의 검사개발팀으로 구성되어 있으며, 그 현황은 다음과 같습니다.연구기획팀은 기업부설연구소의 연구개발 프로젝트를 계획하고 지원하며, 프로젝트가 원활하게 진행되도록 관리하고 있습니다. 연구개발팀은 NGS 기반 액체생검 관련 다양한 검사법을 개발하고 표준화하며, 연구개발 성과를 통해 제품화를 하고 있습니다. 설계, 개발 및 제조, 출시에 이르는 전과정에 참여하고 있습니다. 제품개발팀은 액체생검 관련 단일암 검사 제품의 설계, 개발 및 제조를 전담하고 있습니다. AI-C( Artificial Intelligence-Cancer )팀은 당사의 핵심 기술 혁신을 주도하는 핵심적인 부서 중 하나로, 주로 Bioinformatics 및 딥러닝 기술을 활용하여 액체생검 기반의 암 검사 서비스와 제품에 대한 분석 부분을 개발하고 있습니다.Medical Office Unit은 진단검사의학과 전문의가 직접 검사결과를 판독하며 수많은 판독 경험을 바탕으로 유전성 질환 분야와 관련된 다양한 연구를 진행합니다. 개발 부서의 검사서비스 개발 과정에서도 기술적 조언 및 방향을 제시하고 있으며, 지속적으로 연구과제, 특허 및 논문에 참여하여 성과를 내고 있습니다.AI-G( Artificial Intelligence-Genome )팀은 NGS 서비스의 검사 데이터를 분석하고 Bioinformatics를 고도화하여 더욱 정확한 판독을 지원하고 있습니다. 검사개발팀은 분석본부에서 운영하는 검사 서비스의 성능 개선 작업 및 신규 검사 항목을 설계, 개발하고 있습니다.이와 같이, 각 팀은 전문성을 극대화하고 체계적인 업무 분장을 통해 혁신 기술을 활용한 암 진단 검사 서비스의 연구개발을 중점적으로 수행하고 있습니다.

구분	부서명	주요업무

연구소	연구기획팀	연구 기획 및 관리

연구개발팀	액체생검 기반 NGS 검사 제품 개발

AI-C팀	Bioinformatic, AI 개발

제품개발팀	액체생검 기반 단일암 조기선별 제품 개발

의학본부	Medical Office	유전체 검사 판독, 검사법 개발

AI-G팀	유전체 정보 분석, Bioinformatic 파이프라인 운용

분석본부	검사개발팀	GCLP, 검사 서비스 개발

연구개발 조직도

(나) 연구개발 인력 현황 보고서 제출일 현재 당사는 석박사급 32명을 포함한 총 35명의 연구개발 관련 인력을 보유하고 있습니다.

구분	인원

박사	석사	학사	합계

연구소	연구소장	1	-	-	1

연구개발팀	-	4	2	6

연구기획팀	-	2	-	2

제품개발팀	1	2	-	3

AI-C팀	2	6	-	8

의학본부	Medical Office	3	-	-	3

AI-G팀	2	5	1	8

분석본부	검사개발팀	-	4	-	4

계	9	23	3	35

(다) 핵심 연구인력 당사의 핵심 연구인력은 다음과 같습니다.

직 위	성 명	담당업무	주요 경력

연구소장	조은해	연구개발총괄	- 성균관대 의학 박사 -現. 지씨지놈 연구소장 -前. 의료법인 녹십자의료재단 이사 -前. 삼성서울병원 전임의 -前. 삼성서울병원 전공의

팀장	김00	액체생검 기반 NGS 검사 제품 개발	- 을지대 임상병리학 학사 -現. 지씨지놈 연구소 연구개발팀 팀장 -前. 의료법인 녹십자의료재단

팀장	이00	Bioinformatic, AI 개발	- 숭실대 생명정보학 박사 -現. 지씨지놈 연구소 AI-C팀 팀장

팀장	이00	유전체 정보 분석	- 서울대 농생명공학 박사 -現. 지씨지놈 AI-G팀 팀장 -前. 서울대학교 농업생명과학연구원

팀장	정00	액체생검 기반 암검사 제품 설계 및 제조	- 명지대 환경생명화학 박사 -現. 지씨지놈 제품개발팀 팀장 -前. 진스랩 R 다중진단팀 팀장 -前. 비엠에스 기술영업팀 -前. 싱가포르국립대 합성생물학연구실

(3) 연구개발비용(단위: 천원)

과 목	제13기 (2025년)3분기	제12기 (2024년)	제11기 (2023년)	제10기 (2022년)	비고

연구개발비용 계	4,823,083	6,052,989	7,355,432	8,121,031	-

매출액	23,456,123	25,887,799	27,292,052	24,113,610	-

연구개발비 / 매출액 비율
[연구개발비용계÷당기매출액×100]	20.6%	23.4％	27.0％	33.7％	-

(4) 연구개발실적

(가) 자체 연구개발 실적 당사는 12건의 연구개발을 통해 58개의 제품을 출시하였으나, 핵심기술 제품과 매출실적이 높은 연구개발 실적에 대하여 아래 기재하였습니다. 1) 산과

구분	내용

연구과제	ㆍAI 기반 비침습적 산전 선별 기술 개발

연구결과 및 기대효과	ㆍ산모의 혈액 내 태아의 세포유리 DNA를 분석하여 태아의 염색체 이상을 검출하는 AI기반 산전태아 염색체 이상 검출 기술 개발 완료
ㆍ기존 산전 태아 염색체 이상 기술 대비 민감도와 특이도를 개선 하였으며 양성예측도를 기존기술보다 2배 이상 높은 성능 확보
ㆍ[특허] 핵산 단편간 거리 정보를 이용한 염색체 이상 검출 방법 (특허등록 제10-2452413호)
ㆍ[특허] 인공지능 기반 염색체 이상 검출 방법(특허등록 제10-2586651호)
ㆍ[논문] Front Genet 2022년 게재

관련제품	ㆍG-NIPT

2) 암

구분	내용

연구과제	ㆍNGS 기반 림프종 유전자 패널 검사법 및 분석법 개발

연구결과 및 기대효과	ㆍ림프종(Lymphoma) 환자의 골수 및 혈액에서 DNA를 추출하여 질병과 관련된 유전자의 돌연변이 정보를 분석 검사법 개발 완료
ㆍ혈액암 진단과 예후 평가 및 치료방침 결정

관련제품	ㆍ악성림프종 유전자 패널검사

구분	내용

연구과제	ㆍNGS 기반 난소암 표적항암제 동반진단 기술

연구결과 및 기대효과	ㆍ난소암의 표적 치료제 대상을 선별하기 위한 위한 동반진단 기술 개발 완료ㆍ국내 최초 신의료기술 승인(보건복지부고시 제2022-63호)
ㆍ해외 검사 국내 내수화를 통한 유전자데이터 보안 강화 및 검사비용 절감

관련제품	ㆍ2021년 난소암 상동 재조합 결핍 검사(그린플랜 HRD)

3) 유전희귀

구분	내용

연구과제	ㆍNGS 기반 희귀질환 유전자 패널 검사법 및 분석법 개발

연구결과 및 기대효과	ㆍ질환 관련 변이 필터링 및 우선순위 결정을 위한 자체 알고리즘 개발 완료ㆍ희귀질환의 유전성 진단 및 확진
ㆍ환자의 경과에 대한 예측 및 삶의 질 향상

관련제품	ㆍ빈혈 유전자 패널검사, 근위축성 측삭경화증 유전자 패널검사, 골수부전증후군 유전자 패널검사 외 20종

4) 검진

구분	내용

연구과제	ㆍAI 기반 비침습적 조기암 선별 기술 개발

연구결과 및 기대효과	ㆍ혈액 속 떠다니는 순환 종양 DNA 정보를 딥러닝 알고리즘으로 분석하여 6종 암 (대장암, 폐암, 식도암, 간암, 췌장담도암, 난소암)을 조기선별 하는 기술 개발ㆍ국내 최다 임상검체로 검증하였으며, 기존 암 표지자 검사보다 민감도,특이도 높음
ㆍ해당 기술제품은 기존 검사성능이 낮은 국가암검진 선별검사를 보완ㆍ국가암검진 미포함 암종에 대한 (췌장암, 난소암, 식도암) 미충족 수요 해결ㆍ조기암 검출률 상승
ㆍ[특허] 세포유리 핵산단편 말단 서열 모티프 빈도 및 크기를 이용한 암 진단 및 암 종 예측방법(특허출원 제10-2021-0068891호)
ㆍ[특허] 무세포 핵산의 단일염기변이를 이용한 암 진단 및 암 종 예측방법 (특허출원 제10-2022-0072680호)
ㆍ[논문] Nat Communications 2023년 게재

관련제품	ㆍ아이캔서치

구분	내용

연구과제	ㆍ실험 배치 효과 보정 기술 개발

연구결과 및 기대효과	ㆍ세포유리 핵산 단편 전장 유전체 시퀀싱 데이터에서 실험배치 효과를 보정하는 기술 개발ㆍ암 환자의 검출 정확도 향상
ㆍ[특허] 세포유리 핵산 단편 전장 유전체 시퀀싱 데이터에서 실험 배치 효과를 보정하여 암환자의 검출 정확도를 향상시키는 방법(특허출원 제10-2024-0022357호)

관련제품	ㆍ아이캔서치

구분	내용

연구과제	ㆍNGS 기반 지놈헬스 검사법 개발

연구결과 및 기대효과	ㆍ질환 발병 위험도를 높일 수 있는 질환 취약 유전인자 확인 검사 개발 완료ㆍ주요 암과 일반질환 45종과 연관성이 있는 SNP 검사를 통해 유전적 위험도를 예측하고 질환의 효율적인 예방, 관리 방법을 제공

관련제품	ㆍ지놈헬스 프리미엄 외 17종

구분	내용

연구과제	ㆍ마이크로바이옴 검사법 개발

연구결과 및 기대효과	ㆍ미생물 관련 최신 논문을 바탕으로 임상적 가치가 높은 균종을 선정하여 개발 완료
ㆍ장내 세균, 구강 세균, 질내 세균 유전체를 실시간 중합효소연쇄반응법(Real-time polymerase chain reaction, real-time PCR)을 이용하여 정량값 및 밸런스 결과 보고
ㆍ[논문]Frontiers in Microbiomes 게재

관련제품	ㆍ그린바이옴 Gut 외 5종

(나) 정부과제 수행 실적

당사는 2021년부터 2024년까지 총 9건의 국책과제를 수행하였습니다. 그 중 주요제품과 관련된 국책과제는 아래와 같습니다.

연구과제명	연구기간	관련제품	비고

유방암의 선별항암치료를 위한 차세대염기서열분석법 기반 액체생검기술의 상용화	2019.05 ~ 2021.12	아이캔서치	완료

간세포암 치료반응 예측을 위한 AI기술 유전체분석데이터 융합형 진단보조기기개발	2019.06 ~ 2024.06	아이캔서치	완료

액체생검 유전체 데이터의 인공지능 학습을 통한 방사선 치료효과 모니터링 및 치료반응의 예측검사 개발	2020.07 ~ 2023.12	아이캔서치	완료

난소암 항암치료제 선별을 위한 인공지능 융합 RNA 패턴 기반 HRD 검사 실증	2020.09 ~ 2022.03	tHRD 개발 중	완료

폐암 조기진단용 액체생검 바이오마커 기반 검사의 상용화	2022.04 ~ 2023.12	아이캔서치	완료

(5) 연구개발 계획 당사는 다음과 같은 연구 개발 계획을 진행할 예정입니다.

(가) 산과

구분	내용

기술명	G-PrEMIA

연구과제	AI 기반 산전 태아 유전질환 검출 확대

연구기관	㈜지씨지놈

기대효과	ㆍG-NIPT 검사의 적용 범위 확대
ㆍ태아의 미세결실/중복 증후군 유전질환 검출 확대 (140종 이상)
ㆍ국내 최다 유전질환 검사 개발을 통해 G-NIPT 검사의 국내외 경쟁력 확보

(나) 암/유전희귀

구분	내용

기술명	G-Predict

연구과제	AI 기반 유방암 치료예후예측 기술 개발

연구기관	㈜지씨지놈

기대효과	ㆍ유방암 치료 후 무질병 생존에 대한 예후예측ㆍ수술 전 항암치료 대상자를 대상으로 치료 효과 모니터링 및 맞춤치료제 선별 활용

구분	내용

기술명	G-MRD

연구과제	AI 기반 비침습적 액체생검 기술을 이용한 미세잔존암 검출 기술 개발

연구기관	㈜지씨지놈

기대효과	ㆍ치료 예후예측을 통해 치료 효과 모니터링 및 맞춤치료제 선별 활용
ㆍ기존 영상 검사로 발견하기 어려운 미세잔존암을 조기에 감지하여 재발 가능성을 보다 정확하게 예측하여 환자의 치료과정의 편의성과 지속적인 모니터링 가능ㆍ유방암, 대장암 대상 미세잔존암 검출 기술 개발

구분	내용

기술명	G-HRD

연구과제	AI기반 난소암 표적항암제 동반진단 기술 개발

연구기관	㈜지씨지놈

기대효과	ㆍ난소암의 표적 치료제 대상을 선별하기 위한 AI를 접목한 동반진단 기술 개발
ㆍRNA를 이용하여 당사에서 출시된 상동재조합결핍 검사의 성능 향상

구분	내용

기술명	G-PancrOMx

연구과제	AI 기반 멀티오믹스 융합 분석을 통한 췌장암 조기 선별 기술 개발

연구기관	㈜지씨지놈

기대효과	ㆍ다중 오믹스 개발을 통한 췌장암 정밀 스크리닝 ㆍ췌장암 조기 발견을 통한 생존율 향상

(다) 검진

구분	내용

기술명	G-SeNTInEL

연구과제	AI 기반 비침습적 조기암 선별 기술 암종 확대 및 기술 고도화

연구기관	㈜지씨지놈

기대효과	ㆍ동일비용으로 기존 대비 20종의 암 선별 검사 제공 가능ㆍ차세대 NGS 플랫폼 통합 연구를 통한 고효율 데이터생산
ㆍAI 기반 비침습적 액체생검 기술을 이용한 조기암 선별 기술 성능 향상
ㆍ국가암검진 미포함 암종에 대한 선별검사 확장
ㆍ알고리즘 고도화에 따른 조기암 검출 성능 향상

구분	내용

기술명	EMFLiMax

연구과제	메틸화 마커 검출 플랫폼 기반 단일암 조기선별 검사 개발

연구기관	㈜지씨지놈

기대효과	ㆍ비침습적 혈액기반 암관련 DNA 메틸화검출 플랫폼으로 수검자의 순응도 증대ㆍ원천특허기반 메틸화 마커선발 및 검출 플랫폼화로 타 암종으로의 유연한 확장성ㆍReal-time PCR 기반 플랫폼으로 높은 접근성 및 가격경쟁력