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지노믹트리 분기보고서 (2025.09)
분 기 보 고 서

(제 26 기)

사업연도 2025년 01월 01일 부터
2025년 09월 30일 까지

금융위원회
한국거래소 귀중 2025년 11월 14일

제출대상법인 유형 : 주권상장법인
면제사유발생 : 해당사항 없음

회 사 명 : (주)지노믹트리
대 표 이 사 : 안성환
본 점 소 재 지 : 대전광역시 유성구 테크노10로 44-6(탑립동)
(전 화) 042-861-4551
(홈페이지) http://genomictree.com
작 성 책 임 자 : (직 책) 경영지원본부장 (성 명) 이홍선
(전 화) 042-861-4551
1. 회사의 개요

기업공시서식 작성기준에 따라 분기보고서에는 본 항목을 기재하지 않습니다.(반기/사업보고서에 기재 예정)
2. 회사의 연혁

기업공시서식 작성기준에 따라 분기보고서에는 본 항목을 기재하지 않습니다.(반기/사업보고서에 기재 예정)
3. 자본금 변동사항

기업공시서식 작성기준에 따라 분기보고서에는 본 항목을 기재하지 않습니다.(반기/사업보고서에 기재 예정)
4. 주식의 총수 등

기업공시서식 작성기준에 따라 분기보고서에는 본 항목을 기재하지 않습니다.(반기/사업보고서에 기재 예정)
5. 정관에 관한 사항

기업공시서식 작성기준에 따라 분기보고서에는 본 항목을 기재하지 않습니다.(반기/사업보고서에 기재 예정)
1. 사업의 개요

당사가 속한 암 보조진단 체외진단 산업은 바이오마커 기반 분자진단 기술로 암을 조기에 발견하는 분야입니다. 이 산업은 전통적인 증상 후 진단이 아닌 무증상 일반인 대상 선별검사를 다루며, 고령화로 암 발병이 늘어나는 추세 속에 새롭게 확장되는 시장입니다. 조기 발견을 통해 암 치료 성공률을 높이고 치료 비용을 절감할 수 있기 때문에 국민보건 및 경제 측면에서 중요성이 부각되고 있습니다. 예를 들어 대장암의 경우 1기 조기 발견 시 5년 생존율이 90%에 달해 예후가 훨씬 좋으나, 기존의 내시경 검사는 침습성과 준비 불편, 높은 비용 등의 한계가 있었습니다. 이러한 미충족 수요(Unmet Needs)를 배경으로 체액(분변, 소변, 혈액 등)을 이용한 비침습 암 진단기술이 개발되어 건강한 삶의 질 향상과 의료비 절감에 기여하는 것을 목표로 성장하고 있습니다.

당사는 2000년 창립된 국내 암 보조진단 전문기업으로, 바이오마커 기반 체외 분자진단 기술을 개발하여 암을 조기에 발견하는 제품을 상용화하고 있습니다. 당사의 핵심 기술은 DNA 메틸화 바이오마커 발굴 및 초민감 검출로, 이를 활용한 대표 제품이'얼리텍(EarlyTect) 대장암 검사(얼리텍-C)'입니다. 얼리텍-C는 환자의 분변(대변) 일부를 사용해 대장암 여부를 판별하는 키트로, 2018년 국내 식약처 허가를 받고 2019년부터 국내 시장에 출시되었습니다. 이 제품은 대장내시경 검사의 대안으로, 조직 침습 없이 간편하게 암을 찾아낼 수 있는 것이 강점입니다. 특히 당사가 자체 발견한 SDC2 유전자 메틸화 마커는 암 발생 초기부터 안정적으로 나타나는 특징이 있어 민감도가 높고, 검사 과정이 단순해 8시간 내 결과 도출이 가능합니다. 이는 경쟁 키트인 미국 콜로가드의 검사시간(약 26시간) 대비 월등히 빠른 것으로, 기술력 우위를 보여준다고 볼 수 있습니다.

현재 당사의 주력 사업부문은 암 분자진단 사업이며, 부수적으로 유전체 분석 용역 사업도 병행하고 있습니다. 국내 영업은 주로 병의원, 건강검진센터 등 B2B 채널을 중심으로 이뤄지고 있습니다. 얼리텍-C는 현재 비급여 검사로서 일부 1차 의료기관과 종합검진센터에 도입되어 있는데, 환자들은 선택적으로 해당 검사를 추가해 검진을 받을 수 있습니다. 아직 국민건강보험 급여화가 되지 않아 보편화 단계는 아니지만, 대장내시경 검진 등을 적극 받아온 한국인의 검진 문화 덕분에 조기 시장반응은 긍정적인 편으로 판단됩니다. 영업 환경 측면에서는, 동일한 국산 경쟁제품이 없고 초기 선점 효과가 있어 국내에서는 우월적 지위를 가지고 영업을 전개하고 있습니다. 다만 대장암 국가검진에 아직 포함되지 못해 검진센터 중심의 제한적 판매에 머물러 있고, 향후 보험등재 여부가 시장 확대의 핵심 변수라고 할 수 있습니다.

당사는 해외시장 개척에도 주력하고 있습니다. 미국은 2019년 자회사 Promis Diagnostics를 설립하여 현지 임상과 인허가 준비를 진행 중입니다. 중국은 2020년 오리온홀딩스와 중국 국영제약사가 합작 설립한 법인인 산둥루캉하오리요우에 기술이전을 완료하며 진출 기반을 마련했으며, 현재 중국 현지 임상을 마치고 품목 허가 신청을 진행하여 당사는 마일스톤을 수령하였습니다. 이처럼 국내 시장을 바탕으로 글로벌 시장에 도전장을 내밀고 있으며, "세계적인 암 보조진단 기업"을 지향한 사업을 영위하고 있습니다.

2025년 3분기 당사의 연결매출액은 29.3억원으로 전년 대비 90.8% 증가하였습니다. 2025년 당사의 주요 매출처로는 산둥루캉하오리요우(오리온 합작회사), (재)한국의학연구소(강남분사무소, 광화문센터, 수원센터, 여의도분사무소)(가나다순)가 있습니다. 당사의 주요 5대 매출처에 대한 매출 비중은 전체 매출액 대비 약 58.2% 수준입니다.당사는 대부분의 원부자재를 국내 제품을 사용하고 있으며, 해외 제품의 경우 국내 대리점을 통해 매입을 하고 일부 원부자재는 중국에서 직매입을 진행하고 있습니다.
5. 위험관리 및 파생거래

가. 시장위험과 위험관리 (1) 자본위험관리회사의 자본관리 목적은 지속 가능한 경영활동을 통해 주주 및 이해관계자들에게 꾸준히 이익을 제공할 수 있는 역량을 확보하는 것입니다. 이를 위해 자본비용을 최소화할 수 있는 최적의 자본구조를 유지하고 관리함으로써 장기적으로 안정적인 기업 가치를 창출하고자 합니다.(2) 재무위험관리회사는 회사의 운영과 관련한 여러 활동으로 인하여 시장위험(외환 위험, 이자율 변동 위험, 가격위험), 신용위험, 유동성 위험과 같은 다양한 재무위험에 노출되어 있습니다. 당사의 전반적인 위험관리 정책은 금융시장의 예측 불가능성에 초점을 맞추고 있으며 재무성과에 잠재적으로 불리할 수 있는 효과를 최소화하는데 중점을 두고 있습니다.(가) 시장위험1) 외환 위험회사는 국제적으로 영업활동을 영위하고 있어 외환 위험, 특히 주로 달러화와 관련된 환율변동 위험에 노출되어 있습니다. 회사의 경영진은 외환 위험을 관리하도록 하고 있으며 환율변동에 대한 환위험을 정기적으로 측정하고 있습니다.2) 이자율 변동 위험이자율위험은 미래의 시장이자율 변동에 따라 예금 또는 차입금 등에서 발생하는 이자수익 및 이자비용이 변동될 위험으로서 이는 주로 변동금리부 조건의 예금과 차입금에서 발생하고 있습니다. 당사의 이자율 위험관리의 목표는 이자율변동으로 인한 불확실성과 순이자비용의 최소화를 추구함으로써 기업의 가치를 극대화하는 데 있습니다.3) 가격위험회사는 유동성관리 및 영업상의 필요 등으로 지분증권 및 채무증권에 투자하고 있습니다. 당기 말 현재 해당 지분증권 및 채무증권은 가격위험에 노출되어 있습니다.회사의 지분투자는 비상장 투자지분이고 동 투자가 당기손익 및 기타포괄손익에 미치는 영향은 주석에서 설명하고 있습니다.(나) 신용위험신용위험은 회사의 통상적인 거래 및 투자활동에서 발생하며 고객 또는 거래상대방이 계약 조건상 의무 사항을 지키지 못하였을 때 발생합니다. 이러한 신용위험을 관리하기 위하여 당사는 주기적으로 고객과 거래상대방의 재무상태와 과거 경험 및 기타 요소들을 고려하여 재무신용도를 평가하고 있으며 고객과 거래상대방 각각에 대한 신용한도를 설정하고 있습니다. 신용위험은 현금및현금성자산, 각종 예금 그리고 파생금융상품 등과 같은 금융기관과의 거래에서도 발생할 수 있습니다. 이러한 위험을 줄이기 위해, 당사는 신용도가 높은 금융기관들에 대해서만 거래를 하고 있습니다.(다) 유동성 위험회사는 유동성위험을 관리하기 위하여 단기 및 중장기 자금관리계획을 수립하고 현금유출예산과 실제현금유출액을 지속적으로 분석 및 검토하여 금융부채와 금융자산의 만기구조를 대응시키고 있습니다. 회사의 경영진은 영업활동 현금흐름과 금융자산의 현금유입으로 금융부채를 상환가능하다고 판단하고 있습니다. 나. 파생상품 및 풋백옵션 등 거래 현황 Ⅲ. 재무에 관한 사항 - 3. 연결재무제표 주석 - 파생상품 항목을 참고하시기 바랍니다.
3. 연결재무제표 주석

1. 일반사항

(1) 지배기업의 개요주식회사 지노믹트리와 그 종속기업(이하 "연결실체")의 지배기업인 주식회사 지노믹트리(이하 "지배기업")는 분자진단 기술개발 및 제조, 분자진단 서비스, DNA칩 제조 등을 목적으로 2000년 10월 6일에 설립되었으며, 대전시 유성구에 본점을 두고 있습니다. 지배기업의 수권주식수는 50,000,000주이며, 1주당 액면가액은 500원이며, 수차례의 유상증자 및 무상증자를 통해 현재 발행주식수는 보통주 24,376,642주, 보통주자본금은 12,188백만원입니다. 지배기업은 2016년 7월 코넥스시장에 주식을 상장하였으며, 2019년 3월 코스닥시장으로 이전상장 하였으며 주요 주주현황은 다음과 같습니다.

구 분	보통주식수(주)	지분율(%)	비고

안성환	3,249,103	13.3	대표이사

(주)오리온홀딩스	341,297	1.4	-

자기주식	359,699	1.5	-

기타(소액주주)	20,426,543	83.8	-

합 계	24,376,642	100.0	-

(2) 종속기업의 개요1) 현황

기업명	소재국가	지분율	연차 결산월

당분기말	전기말

Promis Diagnostics, Inc. (주1)	미국	94.80%	94.80%	12월

(주1) 2020년 1월 9일 전환우선주 1,337,792주 추가 출자로 인하여 지분율이 90.57%에서 94.80%로 변동하였습니다. 해당 전환우선주는 우선주 1주당 보통주 1주로 전환이 가능하며, 청산시에는 우선주 취득원가와 청산직전에 보통주 전환을 가정하여 배분 받을 수 있는 금액 중 큰 금액으로 보통주에 우선하여 배분 받을 수 있습니다. 다만, 청산시점 잔여재산이 우선주 취득원가에 미달하는 경우에는 청산시점 잔여재산을 한도로 하여, 모든 잔여재산은 우선주주에게 귀속됩니다. 지배기업은 동 전환우선주를 통하여 Promis Diagnostics, Inc.에 대한 힘을 보유하고 있으며, 변동이익에 노출됨에 따라 지배력을 보유하고 있다고 판단하여 연결대상에 포함하였습니다.2) 요약재무정보

(단위 : 천원)