신테카바이오 분기보고서 (2025.03)
6. 주요계약 및 연구개발활동

가. 주요계약 (1) 당사가 체결한 주요 유효 계약내역은 다음과 같습니다.① 공동연구개발 계약

품 목	계약상대방	계약의 개요	계약체결일	계약종료일	선급금	계약금액	진행경과 등비고

DeepMatcher®플랫폼	한미사이언스	- DeepMatcher® 적용 공동연구
-계약금 10억원
-연구결과물 시판 시 마일스톤최대 15억원	2021.1.14	2023.1.13	1,000백만원	2,500백만원	진행중

(주1) 당초 계약에 따라 계약 목적 달성 시까지 또는 해지 전까지 계약기간이 연장되었습니다.[계약 1]

①계약 상대방	한미사이언스

②계약 내용	DeepMatcher® 플랫폼 공동연구 계약

③대상 지역	연구결과물의 판권 및 지적재산권의 귀속에 관한 협의는 전세계를 대상으로 진행

④총 계약금액	2,500백만원

⑤수취 금액	1,000백만원

⑥계약 조건	계약 내용
- DeepMatcher®를 이용하여 한미사인언스가 제시한 의약품별 약물재창출 및 신규 적응증에 대한 개발 타당성을 예측함
- 연구 결과물을 기반으로 하는 의약품의 후속 개발을 도모함
- 연구결과 및 지식재산을 공유하고 권리의 지분은 추후 협의함
계약 금액: 25억원
- 선급금 10억원
- 마일스톤 최대 15억원
지식재산권:
- 연구 결과 및 지적재산을 공유하고, 협의된 지분의 비율로 지식재산권을 확보하기 위한 출원 기타 신청을 함

⑦회계처리 방법	반환 조건 및 반환의무 있음. 선급금은 기간에 걸쳐 수행의무를 이행하고 산출법을 적용한 진행률로 수익인식함

⑧대상 기술	DeepMatcher® 약물재창출

⑨개발 진행경과	진행중

⑩기타 사항	비공개

② 라이센스인(License-In) 계약

품 목	계약상대방	계약의 개요	계약체결일	계약종료일	계약금액	진행경과 등비고

항암제	HK 이노엔(구, CJ헬스케어)	- CJ헬스케어로부터 IDOㆍTDO 이중저해제 물질 및 연구자료 독점적 이전
- 해당 물질은 2017년 DeepMatcher®용역을 통해 당사가 발굴한 물질
- 상업적 수익 발생 시 수익의 5%를CJ헬스케어에 지급	2019.03.11	수익 발생의종료시점까지	비공개	자체 연구개발 중

[계약 1]

①계약 상대방	HK 이노엔(구, CJ헬스케어)

②계약 내용	STB-C017 물질 이전 계약

③대상 지역	제한 없음

④총 계약금액	비공개

⑤지급 금액	비공개

⑥계약 조건	계약 내용
- CJ헬스케어로부터 IDOㆍTDO 이중저해제 물질 및 연구자료 독점적 이전
- 해당 물질은 2017년 DeepMatcher® 용역을 통해 당사가 발굴한 물질임
계약 금액: 비공개
지식재산권: 당사 독점적 보유

⑦회계처리 방법	계약금액 지급 시 일시에 비용 인식함

⑧대상 기술	DeepMatcher® 약물재창출

⑨개발 진행경과	선도물질 최적화 진행중

⑩기타 사항	비공개

나. 연구개발활동(1) 연구개발활동의 개요당사는 플랫폼 기술인 AI 신약 플랫폼 서비스와 Genome Platform Services(유전체 빅데이터 플랫폼)의 고도화 및 새로운 서비스를 위한 연구개발과 상기 두 플랫폼을 기반으로 자체적으로 합성신약 후보 물질 및 약물재창출 후보물질(Drug Repositioning Candidates) 발굴과 항암백신 및 세포치료제 타겟을 발굴하는 연구개발을 진행하고 있습니다. 연구개발활동 중에서도 당사의 주요 파이프라인 개발 현황은 아래 [4) 연구개발현황]에서 자세히 기술하였습니다.(2) 연구개발 담당조직당사는 포스트오믹스연구소, 인실리코 임상연구소라는 2개의 기업부설연구소를 설치하여 연구개발을 진행하고 있습니다.① 연구개발 조직구성

연구소	팀명	주요 업무

포스트오믹스연구소	ADD팀	대규모 바이오데이터 인덱싱 및 검색, 초고속 오믹스 데이터 분석 시스템, 단백질 엔지니어링, 전문 생물 정보 소프트웨어개발, 바이오시스템 통합 등

인실리코임상연구소	ADSP팀	약물재창출(Drug repositioning)을 위한 게놈 단위의 연구, 약물 패스웨이 유전자발현 바이오마커 연구, 약물의 Pk/Pd 및 표적결합(Kd) 위한 분자동역학 연구 등

② 연구개발 인력 현황보고서 작성기준일 현재 당사는 다음과 같은 연구개발 인력을 보유하고 있습니다.

연구소	팀명	인원

박사	석사	기타	합계

포스트오믹스연구소	ADD팀	1명	6명	3명	10명

인실리코임상연구소	ADSP팀	1명	0명	1명	2명

③ 핵심 연구인력당사의 대표이사를 포함한 주요 연구진은 국내에서 한국질병관리본부, 한국과학기술연구원 등에서 오랜 경험을 가진 핵심요원들입니다. 창업 이후 국내외 연구인력을 지속적으로 채용하였습니다. 2025년 3월 말 현재 전체 인원 57명 중, 경영관리 7명을 제외한 50명의 연구진을 확보하고 있습니다. 전공별로는 Biology 등 전공자 26명, IT 전공자 22명, 기타 2명으로 구성되어 있습니다.

구분	성명	직급	담당업무	최종학위	주요 학력 및 경력	주요연구실적

1	정종선	대표이사	연구개발총괄	박사	- American Univ. 생화학/생물정보 박사(1999년)- NIH(미국국립보건성) 박사후 연구원(1999년~2001년)- KIST 박사후 연구원(2001년~2003년)- 한국질병관리본부 책임연구원 (전)(2004년~2008년)- (주)디엔에이링크 BI본부장 (전)(2008년~2009년)현, 신테카바이오 대표이사(2009년~)	(주1)

2	홍종희	이사	DB시스템총괄,포스트오믹스연구소장	박사수료	-서울대학교 제약학과 박사수료(2002년)-한국과학기술연구원 연구원 (전)(2000년~2010년)현, (주)신테카바이오 포스트오믹스 연구소장(2010년~)	(주2)

(주1) 연구인력(정종선 대표이사)의 주요 연구실적은 다음과 같습니다.

2013년 : 2020 미래 100대 기술과 주역 수상

2009년~ : 단백체/유전체/화합물 BI연구 및 회사운영

SCI 논문 28편특허 출원 27건, 특허 등록 29건

(주2) 당 연구인력(홍종희 포스트오믹스 연구소장)의 주요 연구실적은 다음과 같습니다.2009년~2011년 : 바이오공용빅데이터 DB생성 (BIORI)

2011년~2013년 : 단백체빅데이터 DB생성(BMAP)

2013년~2017년 : 유전체 빅데이터 DB생성(PMAP)

2017년~현재 : AI신약 알고리듬 개발 (Neoscan)

SCI 논문 4편특허 출원 19건, 특허 등록 13건

(3) 연구개발비 집행현황(별도재무제표 기준)

(단위 : 천원)

구분	제17기 1분기	제16기	제15기

시약재료비	77,124	546,738	483,950

인건비	274,657	1,249,212	1,422,600

감가상각비	63,536	291,776	253,442

기술개발비	240,161	782,781	955,274

기타	14,144	66,891	109,572

연구개발비용 계	669,622	2,937,398	3,224,838

정부보조금	-	-	-

회계처리	매출원가	-	-	-

영업비용	669,622	2,937,398	3,224,838

연구개발비 / 매출액 비율 [연구개발비용계÷당기매출액×100]	77.07%	2,429.87%	2,613.20%

(주1) 연구개발비용은 정부보조금을 차감하기 전의 지출총액 기준으로 산정하였습니다.

(주2) 연결재무제표 기준 연구개발비 집행현황도 상기와 동일하여 별도로 작성하지 않았습니다.

(4) 연구개발현황당사는 AI 신약 플랫폼 서비스를 이용하여 자체적으로 합성신약 후보 물질 및 약물재창출 후보물질(Drug Repositioning Candidates) 발굴과 항암백신 및 세포치료제 타겟을 발굴하는 연구개발을 진행하고 있습니다.

출처: 식품의약품안전처 의약품통합정보시스템 당사는 AI 신약 플랫폼 서비스인 DeepMatcher®유효물질 스크리닝 서비스, DeepMatcher®선도물질 최적화 서비스와 NEO-ARS®개인 맞춤 신생항원 발굴 서비스를 이용하여 상기 그림 01. 일반적인 신약개발 R 과정 중 주로 기초/탐색연구 단계에 해당하는 연구를 진행하고 있습니다. 이 단계에서는 약물의 특징(약효, 체내 노출도, 대사정도, 독성, 물성 등)을 약효평가, ADME 평가와 독성평가를 통해 파악하면서 타겟에 대해 가장 효과가 뛰어나고 안전하며 안정성이 뛰어난 물질을 찾는 연구가 수행됩니다. 그 결과 유효물질(Hit)을 발굴하여 최적화 과정을 통하여 선도물질(Lead)과 후보물질을 확보하게 됩니다. 상기 그림과 같이 평균 10,000개의 화합물 중 후보물질 최적화 단계로 50개의 화합물만 진입하는 것에서 알 수 있듯이 성공확률이 아주 낮은 R 단계입니다. 이 같은 특성으로 인해 당사의 연구개발도 프로젝트별로 탐색 물질의 수가 매우 많은 특성이 있습니다. 다만, 당사의 AI 신약 플랫폼 서비스를 이용하므로 평균적으로 5년이 걸리는 일반적인 신약개발 R 과정과 비교했을 때 대폭 단축된 기간만 소요됩니다.① 당사가 AI 신약 발굴 플랫폼 기술인 DeepMatcher® 및 NEO-ARS®를 이용하여 수행하고 있는 주요 후보물질 발굴 연구개발 프로젝트는 다음과 같습니다.

프로젝트명	프로젝트 내용

신약 파이프라인 프로젝트	당사는 DeepMatcher®를 이용하여 미충족 의료수요(Unmet Medical Needs)가 높은 혈액암, 고형암, 급성골수성백혈병 등의 질환에 적용할 수 있는 유효물질을 발굴하여 연구개발을 진행하고 있습니다.
보고서 작성기준일 현재 당사는 기존 혈액암 치료제들에 대해 약제 내성을 유발하는 이중변이를 타겟할 수 있을 것으로 기대되는 다수의 차세대 혈액암 치료 유효물질을 발굴하여 최적화를 진행하고 있습니다. 또한 난치성 고형암(폐암, 삼중음성 유방암(TNBC) 등)과 급성골수성백혈병(AML) 치료제로 개발할 수 있는 유효물질로써, 특정 표적에 대한 우수한 활성과 선택성 및 BBB 투과성을 지니고 있는 것으로 기대되는 유효물질도 발굴하여 약물 최적화를 진행하고 있습니다.
향후 이들 약물에 대한 약물성과 활성 개선 등 최적화가 완료되면 본격적으로 비임상 연구를 진행할 예정입니다.

DeepMatcher® 기반 약물재창출 후보 발굴 프로젝트 등	당사는 DeepMatcher®를 기반으로 약물재창출 후보 발굴 프로젝트 또한 진행하고 있습니다.
2021년 3분기에 DeepMatcher®를 통한 다수의 유효물질을 예측 완료하였고, 4분기부터 해당 물질을 구매하여 글로벌 CRO 4곳에서 in vitro 효능시험을 진행하였습니다. 그 결과 1차 스크리닝에서 초기 효능이 확인된 유효물질 수십 종을 발굴하였습니다. biochemical assay 시험에서 확인된 DeepMatcher®의 유효물질 발굴 적중률은 0%~60%의 범위에서 타깃별로 차이를 보입니다. 이는 타깃 단백질과 리간드의 결합 정보에 따른 차이로 판단됩니다.또한 보고서 작성기준일 현재 발굴된 약물에 대해 추가 스크리닝 및 적응증 검토가 진행되고 있으며, 일부 유효물질에 대해서는 적응증별로 동물효능실험을 진행하여 효능을 확인하였습니다.
유효물질이 발굴된 타깃 단백질은 모두 질환과 높은 연관성이 보고된 바 있으며, 일례로 한 타깃의 경우 세포 내 주요 신호전달물질의 양을 조절하여 다양한 염증 질환을 유도하는 것으로 알려져 있습니다. 해당 타깃의 관련 질환은 중추신경계(CNS) 질환인 정신분열증(schizophrenia), 헌팅턴병(huntington's disease)과 염증 질환인 천식(asthma), 아토피(atopic dermatitis) 등이 있고, 최근에는 항암제로의 개발 가능성을 시사하는 연구가 보고되기도 하였습니다. 다른 타깃들에 대한 유효물질도 항암제 등 다양한 질환에 적용할 수 있을 것으로 기대하고 있습니다.상기 약물재창출 후보 발굴 프로젝트 외에도 신규 타깃을 발굴하여 유효물질을 발굴하는 다수의 내부 프로젝트를 기획하여 진행하고 있습니다.

NEO-ARS®공통 신생항원(항암백신/세포치료제의 타겟에 해당) 발굴 프로젝트	NEO-ARS®을 이용한 치료용 항암백신 또는 면역세포치료제 타겟 발굴 프로젝트를 진행하고 있습니다. 대체로 신생항원은 환자 개인별로 매우 다르게 발현되나 공통 신생항원의 경우 특정 또는 여러 암종에서 공통으로 발견되기 때문에 항암면역치료제 개발에 있어 매력적인 표적입니다. 그런데도 이미 알려진 극소수의 공통 신생항원 외에는 체계적인 공통 신생항원 발굴연구는 전무한 실정입니다.
이에 당사는 회사의 자체 라이브러리를 구축하기 위해 NEO-ARS®를 이용한 공통 신생항원 예측 작업을 장기적으로 추진하고 있습니다.
현재 신장암, 방광암, 폐암, 혈액암을 시작으로, TCGA, ICGC, COSMIC 등의 공개된 인간 암유전체 정보로부터 빈번하게 발생하는 암변이를 추출하고, 높은 빈도의 HLA 형질에 대한 공통 신생항원 후보군 선정을 진행하고 있습니다. 1차 스크리닝을 통해 HLA에 안정적으로 결합하는 공통 신생항원 후보를 수 종 도출하였습니다.보고서 작성 기준일 현재, 면역항암 치료제 개발사들의 니즈를 지속적으로 모니터링하면서 미충족 의료 수요가 높은 암종을 대상으로 공통 신생항원 라이브러리를 확장하기 위해 공공 데이터베이스에 등재된 암환자의 유전체 시퀀싱 원시데이터를 이용한 NEO-ARS® 후속 예측 작업을 준비하고 있습니다.당사는 많은 환자들의 치료에 공통적으로 이용할 수 있는 최적의 타겟 항원 조합을 찾아내는 기능을 추가해 기성품(off-the-shelf) 암백신 개발사들과도 협력 범위를 확대해 나갈 예정입니다.선별된 유력 후보에 대해서는 향후에 면역원성검증을 실시하고 항암면역표적으로서의 기본조건 충족여부를 확인한 후 면역치료제 전달 시스템 기술 보유 회사와의 공동개발을 모색하거나 서비스를 제공할 계획입니다.

AB-ARS ™항체 신약 발굴 및 최적화 플랫폼 개발 프로젝트	항체신약 플랫폼은 항원의 epitope를 기반으로 하여 항원과 binding 하는 새로운 항체 후보를 생성해내고, 생성한 후보들에서 optimization까지 진행할 수 있는 플랫폼입니다.
linear하게 이어진 epitope 서열만 타겟 하는 소프트웨어들은 있지만 대부분의 epitope는 conformational 하기 때문에 3D 구조 기반의 접근이 중요합니다. Epitope와 binding 할 수 있는 항체후보 서열들에 대해 대규모 연산을 통해 3D 구조화가 가능하고 구조 측면에서 항체의 특성을 분석하는 항체개발가능성, 항원-항체 binding 예측을 통해 항체 후보를 제공할 수 있는 서비스입니다.
현재, AB-ARS ™ 은 항체의 유효성을 검증하는 국가기관 및 CRO와 공동 플랫폼으로 개발을 개발하여 서비스를 제공할 계획입니다.

② 후보물질 등 연구 현황

구분	품목	적응증	연구시작일	현재 진행 단계	비고

단계(국가)	승인일

화학
합성	신약	STB-C017(IDOㆍTDO 이중 억제제)	신장암, 간암, 폐암 등	2017. 3분기	선도물질 최적화	n/a	-

개량신약	STB-R040(3CL protease저해제)	Covid-19 치료제	2020. 1분기	신약후보물질	n/a	-

- 면역항암제 (IDOㆍTDO 이중 억제제, 개발번호 : STB-C017)

①구분	화학 합성 저분자 신약

②적응증	다양한 난치성 고형암 (위암, 대장암, 폐암, 유방암, 뇌교종암 포함)

③작용기전	종양 내 면역억제 물질인 키뉴레닌 (Kynurenine) 생성 효소 억제를 통해 면역세포 (T-cell) 활성화를 통한 항암 작용 수행

④제품의 특성	First-in-Class IDO/TDO-dual 저해제

⑤진행경과	- IDO/TDO-dual 저해제를 발굴하여 대장암 동물모델에서 효능을 확인함
- C-017 물질 특허를 확보하였고, PD-1/CTLA 계열의 면역함암제와의 병 용 항암 효능 우수성 확인 후 특허 출원 완료함
- C-017의 화학적 안정성을 증진시킨 신규 유도체를 발굴하여 신규 출원 을 완료하였고, 현재 비임상 진입을 위한 선도물질 최적화를 진행 중임

⑥향후계획	- 최적화 성공 시 비임상 개시 및 기술이전 추진

⑦경쟁제품	- IDO1 저해제인 Epacadostat (Incyte사) 약물의 다른 면역억제제와의 병 용임상이 진행하였으나, 효능 부족으로 실패함. (2018년 AACR 발표)
- IDO/TDO dual 저해제는 Emcure사에서 임상 1상 진행 중이며, 그 외 몇 개 회사에서 비임상 진행 중

⑧관련 논문등	STB C-017 삼중병용 논문발표:
Deep learning model enables the discovery of a novel immunotherapeutic agent regulating the kynurenine pathway, Oncoimmunology 10 (1):e2005280, 2021.

⑨시장규모	- 면역억제제 시장규모는 2018년 142억 달러이고, 연평균 약 17%로 성장 하여, 2024년에는 361억 달러에 이를 것으로 전망됨(출처: EvaluatePharma)
- 따라서, IDO/TDO 저해제도 개발 성공 시 큰 시장을 형성하리라 전망됨

⑩기타 사항	PD-1/PD-L1/CTLA-1 면역 억제제와의 병용 항암 효능 결과를 살펴 볼 때, 향 후 타 글로벌 제약사와의 공동임상개발도 가능할 것으로 기대됨

- 3CL protease저해제 (STB-R040)

①구분	화학 합성 개량신약

②적응증	COVID-19

③작용기전	COVID-19 증식 기전 중 main protease(3CL protease) 및 PL protease의 활성을 억제하여 세포 내 바이러스의 증식을 억제

④제품의 특성	기존 천식 치료에 사용되는 류코그리엔 수용체 길항제의 개량신약

⑤진행경과	- 당초 약물재창출을 통해 경구용 약물 코로나 치료제로 용도변경을 진행 하였으나, Covid-19의 엔데믹화 등 시장환경의 변화를 고려하여 개발 전략을 수정함- DeepMatcher® 선도물질 최적화 서비스(Auto Lead Opt)를 적용하여 효능 개선 및 제형변경 등을 통해 보다 경쟁력 있는 약물을 개발하기로 함- 상기 플랫폼의 고도화와 병행하여 효능 개선 및 독성 예측을 진행할 예정임

⑥향후계획	신규 유도체 발굴 등 최적화 성공 시 기술이전 추진

⑦경쟁제품	화이자의 경구용 치료제 팍스로비드(nirmatrelvir, ritonavir) 등

⑧관련논문등	특허등록: 제2형 중증급성호흡기증후군 코로나바이러스 감염 질환의 예방 또는 치료용 조성물 (한국: 10-2169476, US: 11,213,511, JP: 7104449)

⑨시장규모	코로나19 경구용 항바이러스제 시장규모는 60억 달러로 예상됨
(출처: 로니갈(Ronny Gal) 샌포드 번스타인 애널리스트 제공)

⑩기타 사항	-