eddmpython/dartlab-data huggingface dataset:
툴젠 분기보고서 (2025.03)
분 기 보 고 서

(제 27 기)

사업연도 2025년 01월 01일 부터
2025년 03월 31일 까지

금융위원회
한국거래소 귀중 2025 년 5 월 15 일

제출대상법인 유형 : 주권상장법인
면제사유발생 : 해당사항 없음

회 사 명 : 주식회사 툴젠
대 표 이 사 : 유종상
본 점 소 재 지 : 서울특별시 강서구 마곡중앙로 172, 바이오이노베이션파크 8층
(전 화) 0 2-3660-1300
(홈페이지) http://www.toolgen.com
작 성 책 임 자 : (직 책) 상무이사 (성 명) 하장협
(전 화) 02-3660-1335
1. 회사의 개요

1. 연결대상 종속회사 개황 (1) 연결대상 종속회사 현황(요약)

(단위 : 사)

구분	연결대상회사수	주요종속회사수

기초	증가	감소	기말

상장	-	-	-	-	-

비상장	1	-	-	1	-

합계	1	-	-	1	-

※상세 현황은 '상세표-1. 연결대상 종속회사 현황(상세)' 참조

(2) 연결대상회사의 변동내용

구 분	자회사	사 유

신규연결	-	-

-	-

연결제외	-	-

-	-

나. 회사의 법적, 상업적 명칭 - 국문명칭: 주식회사 툴젠- 영문명칭: ToolGen Incorporated- 법인등록번호 : 110111-1785827- 사업자등록번호 : 108-81-18555- 종목코드 : 199800 다. 설립일자 및 존속기간 당사는 유전자교정 플랫폼 관련 사업을 영위하기 위해 1999년 10월 08일 설립되었습니다. 2014년 06월 25일 코넥스시장에서 매매가 개시된 이후 2021년 12월 10일 코스닥 시장으로 이전상장하여 매매가 개시되었습니다.

라. 본사의 주소, 전화번호, 홈페이지 주소

구 분	내 용

주소	서울특별시 강서구 마곡중앙로 172, 바이오이노베이션 파크 8층

전화번호	02-3660-1300

홈페이지	www.toolgen.com

마. 중소기업 등 해당 여부

중소기업 해당 여부	해당

벤처기업 해당 여부	해당

중견기업 해당 여부	미해당

바. 주요 사업의 내용 당사는 1999년 10월 08일 설립 이후 유전자교정 제품 및 서비스를 주된 사업으로 영위하며, 지속적인 연구개발을 통해 ZFN 유전자가위, TALEN 유전자가위 개발에 이어 2012년 CRISPR/Cas9 유전자가위 개발에 성공하면서 현재의 사업기반을 마련하였습니다.당사는 유전자교정 플랫폼 기술의 원천특허를 기반으로 특허수익화 사업 및 유전자교정 기술을 적용한 치료 제 및 종자 관련 제품에 대한 연구개발을 진행하고 있습니다. 현재 특허수익화 사업의 수익이 당사의 전체 매 출액의 90% 이상을 차 지하고 있으며 주요 사업과 관련한 자세한 사항은『Ⅱ. 사업의 내용』부분을 참고해주시기 바랍니다.

사. 신용평가에 관한 사항 당사는 보고서 제출 기준일 현재 해당사항이 없습니다.

아. 회사의 주권상장(또는 등록ㆍ지정) 및 특례상장에 관한 사항

주권상장(또는 등록ㆍ지정)현황	주권상장(또는 등록ㆍ지정)일자	특례상장 유형

코스닥시장 상장	2021년 12월 10일	기술성장기업의 코스닥시장 상장

(주) 당사는 기술성장기업의 코스닥시장 상장 및 코넥스기업의 코스닥시장 신속이전상장에 해당합니다.
3. 자본금 변동사항

가. 자본금 변동추이(단위 : 원, 주)

종류	구분	당분기말(2025년 3월말)	26기(2024년말)	25기(2023년말)	24기(2022년말)	23기(2021년말)

보통주	발행주식총수	8,556,355	8,549,116	7,919,274	7,885,094	7,852,427

액면금액	500	500	500	500	500

자본금	4,278,177,500	4,274,558,000	3,959,637,000	3,942,547,000	3,926,213,500

우선주	발행주식총수	-	-	-	-	-

액면금액	-	-	-	-	-

자본금	-	-	-	-	-

기타	발행주식총수	-	-	-	-	-

액면금액	-	-	-	-	-

자본금	-	-	-	-	-

합계	자본금	4,278,177,500	4,274,558,000	3,959,637,000	3,942,547,000	3,926,213,500
4. 주식의 총수 등

가. 주식의 총수 현황

(기준일 : 2025년 03월 31일 ) (단위 : 주, %)

구 분	주식의 종류	비고

보통주	종류주	합계

Ⅰ. 발행할 주식의 총수	100,000,000	-	100,000,000	-

Ⅱ. 현재까지 발행한 주식의 총수	8,556,355	-	8,556,355	-

Ⅲ. 현재까지 감소한 주식의 총수	-	-	-	-

1. 감자	-	-	-	-

2. 이익소각	-	-	-	-

3. 상환주식의 상환	-	-	-	-

4. 기타	-	-	-	-

Ⅳ. 발행주식의 총수 (Ⅱ-Ⅲ)	8,556,355	-	8,556,355	-

Ⅴ. 자기주식수	2,500	-	2,500	-

Ⅵ. 유통주식수 (Ⅳ-Ⅴ)	8,553,855	-	8,553,855	-

Ⅶ. 자기주식 보유비율	0.03	-	0.03	-

나. 자기주식 취득 및 처분 현황

(기준일 : 2025년 03월 31일 ) (단위 : 주)

취득방법	주식의 종류	기초수량	변동 수량	기말수량	비고

취득(+)	처분(-)	소각(-)

배당가능이익범위이내취득	직접취득	장내 직접 취득	-	-	-	-	-	-	-

-	-	-	-	-	-	-

장외직접 취득	-	-	-	-	-	-	-

-	-	-	-	-	-	-

공개매수	-	-	-	-	-	-	-

-	-	-	-	-	-	-

소계(a)	-	-	-	-	-	-	-

-	-	-	-	-	-	-

신탁계약에 의한취득	수탁자 보유물량	-	-	-	-	-	-	-

-	-	-	-	-	-	-

현물보유물량	-	-	-	-	-	-	-

-	-	-	-	-	-	-

소계(b)	-	-	-	-	-	-	-

-	-	-	-	-	-	-

기타 취득(c)	보통주	2,500	-	-	-	2,500	(주)

-	-	-	-	-	-	-

총 계(a+b+c)	보통주	2,500	-	-	-	2,500	(주)

-	-	-	-	-	-	-

(주) 당사 자기주식은 2005년 7월 최대주주로부터 무상증여 받았습니다.

다. 종류주식 발행현황 본 보고서 작성 기준일 현재 해당사항 없습니다.
1. 사업의 개요

보고서 제출 기준일 현재 당사는 유전자교정 연구개발 및 유전자교정 플랫폼 기술 기반 특허수익화 사업 및 치료제/ 종자 개발 등과 관련된 사업부문을 영위하고 있으며, 유전자교정(유전자가위)기술을 이용하여 인류에게 질병 없는 건강한 삶, 종자 의 육종을 통한 풍족한 삶을 만들어가는 목표를 가지고 있습니다.

유전자교정 기술은 CRISPR/Cas9의 개발로 인해 유전질환 및 암 등 치료제 개발, 유전자원 한계를 극복한 고부가가치 종자 품종개량 등의 개발에 혁신을 일으킬 것으로 기대됩니다. 또한 2020년 노벨 화학상을 수상하 면서 유전자교정 기술에 대한 산업의 관심이 높아졌고 다양한 산업에 적용하기 위한 연구개발이 전세계에서 활발하게 일어나고 있습니다. 향후 유전자교정 기술이 발달함에 따라 건강, 웰니스/웰빙, 디지털 유전체, 기술 간의 연결 및 융합, 미래인프라 개발, 사회적 영향 등에 직접적인 영향을 줄 것이라고 예상되고 있습니다. 당사는 유전자교정 기술 개발에 있어 세계적 선도기업이며, 다양한 생명과학 관련 산업 분야에서 유전자교정 기술을 사업화하고 있습니다. 당사의 핵심기술인 유전자교정 플랫폼 기술은 세포 내에서 정확하고 효율적인 유전정보 변화를 유도할 수 있습니다. 당사는 유전자교정을 가능하게 하는 핵심적 도구인 유전자가위의 발명과 세계적 수준의 기술 발전을 지속적으로 선도하여 왔습니다. 특히 당사는 ZFN(Zinc Finger Nuclease), TALEN(TAL Effector Nuclease), CRISPR(Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats)/Cas9과 같은 3종의 유전자가위를 모두 개발한 세계 유일의 회사로, 이 중 최근 학계와 생명과학 산업계의 큰 주목을 받고 있는 CRISPR 유전자가위를 진핵세포에서 작동하는 것을 증명한 특허를 전 세계에서 가장 빠르게 출원하였으며, 세계 최초로 사업화하였습니다. 사업화와 관련한 보다 자세한 사항은(II. 사업의 내용 - 7. 기타 참고사항), 주요제품, 서비스 관련 사항은(II. 사업의 내용 - 2. 주요 제품 및 서비스), 매출과 관련 된 사항은(II. 사업의 내용 - 4. 매출 및 수주상황)을 참조해 주 시기 바랍니다.참고로, 당사는 CRISPR 유전자가위 원천특허를 보유하고 있는 아시아 유일 기업으로, 보고서 제출 기준일 현재 당사의 산업재산권 (특허 및 상표)은 총 397건으로, 등록 193건 (특허 등록 145건 및 상표 등록 48건) 출원 204건 (특허 196건 및 상표 출원 8건)입니다.
3. 원재료 및 생산설비

가. 원재료에 관한 사항 (1) 주요 원재료 매입 현황당사의 주요 제품인 특허수익화 사업, GE 플랫폼 적용 제품( 치료제, 종자)의 경우 , 유전자교정 도구인 CRISPR 유전자가위 원천기술 및 활용기술(치료제 연구개발 기술 포함)에 대한 기술 권리 사용료 등이 매출로 이어지는 사업구조로 해당 제품에 대해 매입에 관한 사항은 없습니다.따라서 보고서 제출 기준일 현재 당사의 제품 중 유전자가위 관련 제품, 세포주 및 동물에 한해 매입에 관한 사항을 기재하였습니다.

(단위: 천원)

매입유형	구 분	2025년 1분기말	2024년	2023년

(제27기)	(제26기)	(제25기)

시약재료비	Oligo	260	1,561	3,738

Enzyme	-	325	7,803

기 타	57,935	55,241	81,932

소 계	58,195	57,127	93,473

상품	-	-	-

외주용역비	-	-	-

합 계	58,195	57,127	93,473

(주1) 상기 금액은 발생 비용에서 차감하여 회계처리하는 정부보조금 금액을 차감하기 전 금액입니다.
(주2) 시약재료비는 바이오의약품 연구개발 과정에서 필요한 시약 및 실험소모품 등을 의미하며, 외주용역비는 연구개발 과정에서 외부 전문기관에 위탁하여 수행하여야하는 실험 및 결과물 의뢰, 전임상 또는 임상 시료를 외부에 위탁하여 수행하는 경우 소요되는 비용입니다.

(가) Oligo수 개에서 수십 개의 뉴클레오티드(당, 인산의 세 가지 요소로 구성된 화학적 단량체로서, DNA 사슬의 기본 구성 단위)가 인산디에스테르결합으로 중합한 상태를 지칭하며, 당사는 고객이 원하는 DNA를 잘라낼 수 있도록 DNA를 설계하여 해당 설계대로 제작된 Oligo를 매입하고 있습니다.(나) Enzyme당사 제품의 공정 중 Cloning 및 QC 등의 공정에 사용되는 주요 효소들로 Cloning시에 잘라진 벡터와 PCR에서 증폭한 Oligo를 붙여주거나, DNA에서 타겟 유전체를 잘라 줄 때 들어가는 효소 등 생산 공정에 필요한 효소류를 통칭합니다.(2) 원재료의 가격변동 추이당사의 주요 원재료는 비교적 범용으로 쓰이는 경우가 많으며, 매입처도 다양하여 안정적인 가격을 유지하고 있습니다. 주요 원재료는 고객 변화, 발주수량에 따른 매입가격 변화에 따라 가격이 변화는 특징이 있습니다. 당사는 원재료를 모두 국내에서 조달하고 있기때문에 환율 변동에 따른 가격 변동이 없습니다.또한, 당사의 주요 매입처는 (주)코스모진텍 등이며 당사와 특수관계는 없습니다. 바이오의약품 연구개발의 특성상 매입품목은 다양한 종류의 시약 및 실험소모품 등이며, 공급의 독과점이나 안전성에는 문제가 없습니다. 한편, 공시대상기간 중 수익성에 중요한 영향을 미치는 원재료의 가격변동은 있지 않습니다.주요 원재료에 대한 가격변동 추이는 아래와 같습니다.

(단위: 원)

구분	2025년 1분기말(제27기)	2024년(제26기)	2023년(제25기)

Oligo	Oligo	230 /mer	230 /mer	230 /mer

Enzyme	Phusion DNA Polymerase	702,000 /500 unit	702,000 /500 unit	702,000 /500 unit

나. 생산 및 생산설비에 관한 사항

당사는 연구개발 중심 기업의 특성상 생산능력(당사의 경우는 프로젝트 수행능력)은 연구원의 기본자질과 풍부한 경험의 정도에 의해서 좌우되므로 생산능력이 실험기계나 연구실의 단순한 인프라의 규모로 산정되지는 않으며, 연구의 단계별로 일정한 부분에 대해서는 언제든지 연구 네트워킹을 통한 외부의 전문 연구기관과의 협력을 통해 협업이 가능하므로 생산능력이 물적 조건에 의해 제약되기보다는 회사의 연구전략에 의해서 정해지는 특성이 있습니다.

특히 당사의 주력 제품인 특허수익화 사업, GE 플랫폼 적용 제품(치료제, 종자 )의 연구개발 전략 및 능력이 중요하며, 생산 및 설비에 대해서는 큰 영향을 받지 않습니다. 따라서 보고서 제출 기준일 현재 당사는 유전자가위 관련 제품, 세포주(Cell Line), 동물(마우스, 랫 등) 제품을 중심으로 생산 및 생산설비에 관한 사항을 기재하였습니다.(1) 생산능력 및 생산실적

(단위: 시간)

제 품	구 분	2025년 1분기말(제27기)	2024년(제26기)	2023년
(제25기)

유전자가위
관련 제품	생산능력	1,044	4,392	4,464

생산실적	986	4,148	4,216

가 동 율	94.44%	94.44%	94.44%

당사 제품은 대부분 주문 생산 방식으로 생산되고 있으며, 생산에 있어서 연구개발 장비의 투입보다는 당사 제품을 생산할 수 있는 당사 제품에 대한 이해도가 높은 생산 인력의 투입이 더 중요한 요소입니다. 따라서 당사의 생산능력 및 생산실적은 매 사업연도마다 당사가 보유 중인 연구인력을 기준으로 아래와 같은 산출 방식을 이용하여 산출하였습니다.

※ 산출 근거

- 연간가동가능시간 = 근무일 X 1일 근무시간 (9시간) X 인원수

근무일은 연간일수에서 휴일을 제외한 일수를 적용하였으며 1일 근무시간은 9시간으로 가정하였습니다. 인원은 연간으로 환산한 인원수를 적용하였습니다.

- 연간실제가동시간

연간실제가동시간은 인원별 실제로 근무한 시간을 합산하여 계산하였습니다.

(2) 생산설비에 관한 사항(단위: 천원)

자산별	기초가액	당기증감	당기상각	환율적용차이	기말가액	비 고

(25.01.01)	증가	감소	25.03.31

토지	3,214,872	-	-	-	-	3,214,872	-

건물	10,372,323	-	-	67,353	-	10,304,970	-

기계장치	1,152,269	35,901	1	146,188	410	1,042,391	-

비 품	415,467	15,359	2,299	36,926	-	391,601	-

시설장치	926,409	-	-	87,547	18	838,880	-

차량운반구	76,774	-	-	7,867	208	69,115	-
4. 매출 및 수주상황

가. 매출실적(단위: 천원)

구분	매출 유형	2025년 1분기말	2024년	2023년

(제27기)	(제26기)	(제25기)

전사	라이센스 수익	수출	88,263	738,902	916,493

내수	21,250	60,000	89,837

소계	109,513	798,902	1,006,330

유전자가위관련 제품	수출	-	-	-

내수	256	27,478	43,483

소계	256	27,478	43,483

세포주 및 동물	수출	-	-	-

내수	-	-	-

소계	-	-	-

NGS	수출	-	-	-

내수	19,365	23,525	42,372

소계	19,365	23,525	42,372

기타(상품, 연구용역 등)	수출	-	41,056	11,224

내수	-	-	-

소계	-	41,056	11,224

합 계	수출	88,263	779,958	927,717

내수	40,871	111,003	175,692

합계	129,134	890,961	1,103,409

나. 판매경로 및 전략 (1) 판매조직

[ 주요 판매(사업개발) 조직 ]

구 분	사업개발
(판매조직)인원	업 무 내 용

종자사업실	4명	- 유전자교정 종자개발
- 개발 완료 종자에 대한 기술사업화(라이센싱) 추진 및 재배/마케팅/ 판매 등
- 유전자분석(NGS) 서비스 등

사업개발실	2명	- 유전자교정 플랫폼 특허 관련 특허수익화 사업개발
- 유전자교정 응용 특허(치료제/종자) 관련 사업개발 총괄

합 계	6명	-

(주) 상기 인원은 각 사업본부에서 판매(라이센싱) 관련 업무를 진행하는 인원만 기재하였습니다.

(2) 판매경로

당사는 유전자교정(GE) 플랫폼에 관련한 원천/응용 특허를 기반으로 한 특허수익화 사업(사용료 수입 등)을 주요 사업모델로 사업을 영위하고 있습니다. 특허수익화 사업 관련 수입 등은 유전자교정 도구인 CRISPR 유전자가위 원천/응용기술에 대한 권리 사용료 등이 매출로 이어지는 사업구조로 유전자교정 기술 시장의 확대와 함께 당사가 확보한 지식재산권의 범위, 특허 관할국 확대, 특허 등록 승인여부 등에 따라 매출이 변동될 수 있습니다.

또한 유전자교정 플랫폼 기술을 1) 치료제, 2) 종자, 3) 동물, 4) 화학제품 등의 다양한 사업분야에 적용하는 연구개발을 진행하고 있습니다. 해당 사업모델은 유전자교정 플랫폼의 특허권과 당사가 직접 개발한 파이프라인을 함께 기술이전하는 구조입니다. 특허수익화 사업이 특허권에 대한 실시권에 대한 기술료만 수령한다면, 해당 사업모델은 당사가 직접 개발한 파이프라인의 기술에 대한 기술료를 수령하기 때문에 더 높은 가치의 기술이전을 기대하고 있습니다.

[ 판매 경로 및 매출 비중 ]

(단위: 천원)

매출유형	품 목	구분	판매경로	판매경로별
매출액 및 비중
(2025년 1분기말)	판매경로별
매출액 및 비중
(2024년)

라이선스 수익	특허수익화 사업
(라이센싱, 사용료 수입)	수출	당사→ (Agent→ ) 고객사	88,263	68.3%	738,902	82.9%

국내	당사→ 고객사	21,250	16.5%	60,000	6.7%

GE 플랫폼
적용 제품의 기술사업화
(라이센싱)	수출	당사→ (Agent→) 고객사	-	-	-	-

국내	당사→ 고객사	-	-	-	-

제품	유전자가위 관련 제품	수출	당사→ (Agent→) 고객사	-	-	-	-

국내	당사→ 고객사	256	0.2%	27,478	3.1%

세포주 및 동물	수출	당사→ (Agent→) 고객사	-	-	-	-

국내	당사→ 고객사	-	-	-	-

서비스	NGS	수출	당사→ 고객사	-	-	-	-

국내	당사→ 고객사	19,365	15.0%	23,525	2.7%

연구용역
등	기타
(상품, 연구용역 등)	수출	당사→ 고객사	-	-	-	-

국내	당사→ 고객사	-	-	41,056	4.6%

합 계	129,134	100.0%	890,961	100.0%

(3) 판매전략

유전자교정 사업관련 판매조직은 당사의 각 분야별 사업본부의 전문인력이 담당하고 있습니다.

또한 사업개발 및 연구개발 관련 전문 컨설턴트와의 협력을 통해 제품 개발 및 Deal making의 역량을 확대하고 있습니다. 전문 컨설턴트와 함께 미국 내 사업개발 관련 기업과의 네트워킹을 지속적으로 확장하고 Buyer의 니즈를 파악하여 Licensing Deal의 가능성을 지속적으로 높여가고 있습니다.

당사는 기존 사업개발 채널을 활용하고 1) 주요 기술에 대한 특허 등록 및 출원, 2) 주요 논문 게재 및 학회 참여, 3) 글로벌 사업개발 미팅 참여 등 적극적인 방식을 통하여 사업개발 기회를 늘려 나가고 있습니다.

최근 유전자치료 및 세포치료 개발 트렌드는 유전자교정 기술을 접목하고 있습니다. 기존 치료제 개발 기술과의 유전자교정 기술의 접목은 유전자교정 기술의 연구개발 노하우 및 임상 경험이 주요한 부분을 차지하기 때문에 당사는 잠재적으로 여러 기업들과 사업제휴가 다양하다는 장점을 갖습니다.

다. 수주현황

당사의 주요 제품인 특허수익화 사업, GE 플랫폼 적용 제품(치료제, 종자 )의 경우 기술 이전(License-out 등) 계약에 의해 제품매출이 발생하므로 수주현황의 경우 해당사항 없습니다. 유전자가위 제품/서비스 및 세포주 등의 경우 대부분 생산기간이 2~4주로 생산주기가 상대적으로 짧으며, 대부분의 매출처에서 필요한 시기마다 주문을 하여 생산하는 주문생산 방식으로 생산됩니다.
5. 위험관리 및 파생거래

당사를 포함한 연결회사는 여러 활동으로 인하여 시장위험(통화위험, 공정가치이자율위험 및 가격위험 포함), 신용위험 및 유동성 위험과 같은 다양한 금융위험에 노출되어 있습니다. 당사는 금융위험 요인에서 발생할 수 있는 위험을 최소화하는 데 중점을 두고 있습니다. 위험관리는 이사회에서 승인한 정책에 따라 이루어지고 있으며, 이사회는 전반적인 위험관리에 대한 문서화된 정책, 외환위험, 이자율위험, 신용위험, 파생금융상품과 비파생금융상품의 이용 및 유동성을 초과하는 투자와 같은 특정 분야에 관한 문서화된 정책을 검토하고 승인합니다. 시장위험과 위험관리와 관련한 자세한 사항은 "III. 재무에 관한 사항 - 3. 연결재무제표 주석 - 30. 위험관리" 및 "III. 재무에 관한 사항 - 5. 재무제표 주석 - 31. 위험관리" 내용을 참고하시기 바라며, 파생거래 관련사항은 "III. 재무에 관한 사항 - 3. 연결재무제표 주석 - 17. 내재파생상품부채" 및 "III. 재무에 관한 사항 - 5. 재무제표 주석 - 17. 내재파생상품부채" 내용을 참고하여 주시기 바랍니다.