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씨젠 분기보고서 (2025.09)
분 기 보 고 서

(제 26 기)

사업연도 2025년 01월 01일 부터
2025년 09월 30일 까지

금융위원회
한국거래소 귀중 2025 년 11 월 14 일

제출대상법인 유형 : 주권상장법인
면제사유발생 : 해당사항 없음

회 사 명 : 주식회사 씨젠
대 표 이 사 : 천종윤, 이대훈
본 점 소 재 지 : 서울특별시 송파구 오금로 91 (방이동, 태원빌딩)
(전 화) 02-2240-4000
(홈페이지) https://www.seegene.co.kr
작 성 책 임 자 : (직 책) 이사 (성 명) 권영재
(전 화) 02-2240-4000
1. 회사의 개요

회사의 개요는 기업공시서식 작성기준에 따라 분기보고서에 기재하지 않습니다.(반기/사업보고서에 기재 예정)
2. 회사의 연혁

회사의 연혁은 기업공시서식 작성기준에 따라 분기보고서에 기재하지 않습니다.(반기/사업보고서에 기재 예정)
3. 자본금 변동사항

자본금 변동사항은 기업공시서식 작성기준에 따라 분기보고서에 기재하지 않습니다.(반기/사업보고서에 기재 예정)
4. 주식의 총수 등

주식의 총수 등은 기업공시서식 작성기준에 따라 분기보고서에 기재하지 않습니다.(반기/사업보고서에 기재 예정)
5. 정관에 관한 사항

정관에 관한 사항은 기업공시서식 작성기준에 따라 분기보고서에 기재하지 않습니다.(반기/사업보고서에 기재 예정)
1. 사업의 개요

당사는 2000년 9월 설립 후 인체 및 동식물에서 채취한 검체로부터 유전자 정보가 들어있는 DNA 및 RNA 분석을 통해 질환의 원인을 검출하는 분자진단 사업에 주력하고 있습니다.당사 매출은 진단 시약을 제조/판매하는 제품 매출, 진단장비를 외부에서 도입 후 당사 제품에 맞게 재가공하여 판매하는 상품 매출, 용역 제공 등의 기타 매출로 구성됩니다.당사의 기본적인 영업 경로는 국내외 협력 대리점 및 해외 법인으로, 이탈리아, UAE, 미국, 캐나다, 독일, 브라질, 멕시코, 콜롬비아, 남아공에 현지 법인과 지점을 보유하고 있으며, 100여개 국가 및 지역에서 대리점 운영을 통해 글로벌 판매망을 꾸준히 확대해 나가고 있습니다. 2025년 3분기 기준 총 매출액 중 수출 비중은 93%를 차지하고 있습니다.당사의 핵심 경쟁력은 독자적인 기술력에 있습니다. 당사는 유사한 증상을 유발할 수 있는 다양한 병원체(pathogen)를 하나의 튜브로 동시 진단할 수 있는 하이 멀티플렉스(High Multiplex) 기술인 신드로믹 정량 PCR(Syndromic qPCR) 기술을 보유하고 있습니다. 당사의 신드로믹 정량 PCR 기술은 코로나19 바이러스와 같은 감염질환 병원체 검사, 단일 염기 변이 검사, 약제 내성 검사, 돌연변이 검사 등 모든 유전자 관련 질병 검사에 적용 가능한 동시 다중 분자진단을 위한 최적의 솔루션이라고 할 수 있습니다.관련하여 당사는 하이 멀티플렉스 진단시약에 대한 원천 기술(DPO™, TOCE™, MuDT™ 등)을 보유하고 있으며, 19개 특허기술을 통합해 한 번의 검사로 15개 타깃을 동시 검사하고 정량값(Ct Value)을 제공할 수 있는 3Ct 기술을 완성했습니다. 이러한 기술을 적용하여 당사는 총 117개 제품에 대하여 전 세계 각국에서 인허가를 획득하여 판매하고 있으며, 37가지 핵심 기술 관련 특허를 보유하고 있습니다.당사는 진단시약 개발에만 머물지 않고 시약 원재료, 장비 등에 이르기까지 자체 기술을 개발하고 있으며, 독보적인 시약 개발 자동화 시스템인 SGDDS(Seegene Digitalized Development System) 구축을 통한 SG OneSystem™ 실현을 위해 세계 최고 수준의 독자적인 신드로믹 정량 PCR 기술을 전세계에 공유하는 기술공유사업을 추진하고 있습니다.당사의 기술공유사업은 질병 없는 세상을 구현하기 위해 추진하는 글로벌 전략으로, 씨젠의 SG OneSystem™을 각국 대표 기업들에 공유하고 전세계 과학자들이 참여해 다양한 분야의 현지 맞춤형 진단제품을 직접 개발하는 것입니다. 당사는 2025년 4월 이스라엘 Hylabs, 2025년 5월 스페인 Werfen과 현지 법인을 설립하고 새로운 진단 시약 개발 기회를 확대하고 있습니다. 또한 기술공유사업의 일환으로, 2024년 1월 Microsoft와 전략적 협업 관계를 맺고 인공지능(AI) 기술을 활용해 기존의 시약 개발 자동화의 고도화를 꾀하고 있으며, 세계 과학자 및 전문가들과 네트워크를 구축하고 있는 Springer Nature와 공동으로 글로벌 진단시약 공모 프로젝트인 Open Innovation Program(OIP)을 진행하고 있습니다. 이와 관련하여 2024년 10월에는 영국 런던에서 Microsoft, Springer Nature와 기술공유사업 파트너 라운드 테이블(Technology-Sharing Initiative Partner Round Table)을 개최하였습니다.
3. 원재료 및 생산설비

가. 주요 원재료 매입 현황(단위: 백만원)

매입유형	구 분	제26기 3분기	제25기	제24기

원재료	국 내	21,228	27,270	30,617

수 입	17,777	34,310	22,060

소 계	39,005	61,580	52,677

상품	국 내	4,589	22,897	30,283

수 입	19,066	31,014	13,383

소 계	23,655	53,911	43,666

합계	국 내	25,818	50,167	60,899

수 입	36,843	65,324	35,444

합 계	62,660	115,491	96,343

나. 주요 원재료 구매금액 변동 추이(단위: 백만원)

품목	제26기 3분기	제25기	제24기

Oligonucleotide (Probe 외)	9,389	22,831	16,428

Oligonucleotide (Primer)	3,057	5,890	4,542

PCR Enzyme Master Mixture A	1,585	1,657	2,101

PCR Enzyme Master Mixture B	2,420	3,028	6,093

다. 주요 원재료 매입처 당사 제품의 주요 원재료는 Oligonucleotide 및 효소이며 국내 및 해외 업체들로부터 매입하고 있습니다. 당사는 원재료 매입처를 분산하고 재고를 충분히 마련하는 등 원재료 공급의 안정성을 확보하고 있습니다.

라. 생산 능력 및 생산 실적 당사의 제품 생산 능력을 결정할 때 생산 인력 등이 주요 변수가 됩니다. 제품 생산 인력은 제품 생산 이외에도 진단제품의 인허가와 관련된 각종 실험 지원 및 서류 작성 등의 작업을 함께 수행하고 있습니다.당사의 2025년 3분기 말 현재 생산 능력은 완제품 기준 월 약 100,000 Kit(약 1,000만 테스트)이며, 생산 실적은 영업 정보 보호를 위하여 공개하지 않습니다.

마. 생산 설비(연구 설비)에 관한 사항(요약)

용도	시설명	수량

제품 생산 등	분주기 외	1,695

제품 검사 등	7500 Real time PCR system 외	1,778

※상세 현황은 '상세표-4. 생산설비(연구설비)에 관한 사항' 참조
4. 매출 및 수주상황

가. 매출 실적(단위: 천원)

구분	내역	제26기 3분기	제25기	제24기

제품(분자진단 시약)	국내 매출	161,040,255	190,800,704	165,856,065

해외 매출	110,548,275	145,444,143	122,172,924

소계	271,588,529	336,244,847	288,028,989

상품(분자진단 장비 등)	국내 매출	22,373,704	25,828,128	32,312,908

해외 매출	32,364,347	32,426,295	33,410,414

소계	54,738,051	58,254,423	65,723,322

기타	국내 매출	6,467,892	3,842,687	407,375

해외 매출	10,805,900	15,909,777	13,215,363

소계	17,273,792	19,752,464	13,622,738

합 계	국내 매출	189,881,851	220,471,519	198,576,348

해외 매출	153,718,521	193,780,215	168,798,701

소계	343,600,372	414,251,733	367,375,049

* 상기 내용은 결산조정이 포함되어 있으며, 국내 매출과 해외 매출의 구분은 한국채택국제회계기준에 따라 분류하였습니다.

나. 판매 경로

당사는 기본적으로 국내외 대리점과 해외 법인을 통해 영업을 하고 있습니다. 국내외 대리점에 판매를 하고 대리점이 마진을 추가하여 고객에게 판매를 하는 방식입니다. 다만, 당사 해외 법인을 통한 거래의 경우 직접 판매를 통하여 매출이 발생합니다. 매출 규모는 영업 기밀에 해당하여 별도 기재를 생략합니다.

다. 판매 조직 및 활동(1) 국내 영업 조직

당사의 한국 영업 부서는 진단검사의학과, 병리과, 검진센터 등을 담당하는 전문 대리점과 협력하여 상급 병원과 검사 수탁 기관 등을 대상으로 영업 활동을 전개하고 있습니다. 전국을 권역별로 세분화하여 각 지역별 대리점과 연계하여 관리하고 있으며, 대리점과 정기적인 영업미팅, 시연, 세미나, 교육 등을 통해 각 대리점이 당사의 제품을 독자적으로 소개하고 판매할 수 있도록 지원하고 있습니다.당사의 영업 사원들은 고객 확보와 제품 홍보 및 사후 관리를 위해 담당 지역 내 병원과 검진센터를 정기적으로 방문하고 있으며, 특히 포괄적인 마케팅 활동을 기반으로 장비에 대한 User Service는 물론, 제품의 우수성 및 임상적 유용성을 입증할 수 있는 대규모 임상 실시, 당사 주력 제품인 호흡기 바이러스 검출 시약의 국내 최초 정도 관리 서비스 등 차별화된 서비스를 제공함으로써 고객들의 높은 신뢰를 확보하고 있습니다. 특히 당사는 분자진단의 어려움인 Human Error 및 검사 중 오염 등을 최소화함과 동시에 좋은 검사 결과를 보증할 수 있는 자동화 시스템을 통해 국내 시장 점유율을 확대하고 있습니다.

(2) 해외 영업 조직

당사는 이탈리아, 중동, 미국, 캐나다, 독일, 브라질, 멕시코, 콜롬비아에 현지 법인을 설립하여 지역적 접근성 향상 및 직접 관리를 강화하면서 글로벌 판매망을 확대해 가고 있습니다. 지역별로 세분화된 100여개 대리점 및 해외 법인을 통한 글로벌 영업 네트워크 확장에 박차를 가하고 있으며, 해당 국가 병원과 진단센터 등에 견고한 영업망을 구축해 분야별 권위자들과 긴밀하게 협력하며 시장 확대를 위해 노력하고 있습니다.이를 지원하기 위해 당사의 해외 영업 사원들은 수시 및 정기 출장을 통해 담당 해외 대리점과의 미팅, 제품 교육, 시연, 학회, 전시회 참석 및 고객 동행 방문 등을 실시하고 있으며 분자진단 검사의 저변 확대를 위한 제품 홍보와 고객 확보에 총력을 기울이고 있습니다. 연구소, 마케팅 인력과 동도출장을 통한 주요 고객 대상 영업 활동 및 대리점 지원을 강화하고 있습니다.

라. 수주 현황

당사는 보고서 작성기준일 현재 거래가 종료되지 않은 중요한 수주 현황 등은 없습니다.
5. 위험관리 및 파생거래

가. 시장 위험과 위험 관리

당사는 여러 활동으로 인하여 시장 위험(외환 위험, 현금흐름 및 공정가치 이자율 위험), 신용 위험 및 유동성 위험과 같은 다양한 금융 위험에 노출되어 있습니다. 당사의 전반적인 위험 관리는 당사의 재무성과에 잠재적으로 불리할 수 있는 영향을 최소화하는 데 중점을 두고 있습니다.위험 관리는 이사회에서 승인한 정책에 따라 재무관리실에 의해 이루어지고 있습니다. 당사 재무관리실은 영업 부서들과 긴밀히 협력하여 금융위험을 식별, 평가 및 회피하고 있습니다.

시장 위험 및 위험 관리에 대한 자세한 내용은 'III. 연결재무제표' 주석 사항 중 '3. 금융위험관리'의 내용을 참고해 주시기 바랍니다.

나. 파생상품 및 풋백옵션 등 거래 현황

당사는 파생상품의 계약에 따라 발생된 권리와 의무를 공정가액으로 평가하여 자산과 부채로 계상하고, 동 계약으로부터 발생한 손익은 발생 시점에 당기 손익으로 인식하고 있습니다. 다만, 요건을 충족한 현금흐름 위험회피와 해외사업장에 대한 순투자에 대한 위험회피금액은 자본 항목으로 이연하고 있습니다.

파생상품에 대한 자세한 내용은 'III. 연결재무제표' 주석 사항 중 '3. 금융위험관리'의 내용을 참고해 주시기 바랍니다.
1. 요약재무정보

가. 요약연결재무정보(단위: 백만원)

과 목	제26기 3분기	제25기	제24기

재무상태표	(2025년 9월말)	(2024년 12월말)	(2023년 12월말)

[유동자산]	771,267	746,257	783,486

당좌자산	683,385	636,887	645,850

재고자산	87,881	109,370	137,637

[비유동자산]	446,594	459,022	467,966

투자자산	11,236	6,273	6,310

유형자산	223,362	226,669	242,262

무형자산	35,151	33,003	27,366

기타비유동자산	176,845	193,077	192,028

자산총계	1,217,861	1,205,279	1,251,452

[유동부채]	159,620	161,440	162,153

[비유동부채]	54,840	62,362	58,900

부채총계	214,460	223,802	221,053

[자본금]	26,113	26,113	26,113

[자본잉여금]	62,717	62,717	62,717

[자본조정]	(188,114)	(188,221)	(192,795)

[기타포괄손익누계액]	20,689	13,092	7,740

[이익잉여금]	1,079,033	1,064,924	1,123,926

[비지배지분]	2,963	2,850	2,698

자본총계	1,003,401	981,477	1,030,399

종속관계공동기업 투자주식 평가방법	원가법	원가법	원가법

손익계산서	(2025.01.01~2025.09.30)	(2024.01.01~2024.12.31)	(2023.01.01~2023.12.31)

매출액	343,600	414,252	367,375

영업이익(영업손실)	27,601	(16,479)	(30,053)

법인세차감전순이익	41,240	(9,426)	(1,413)

당기순이익(당기순손실)	43,460	(20,270)	733

1. 지배기업 소유주지분	43,337	(20,337)	669

2. 비지배지분	123	67	64

기본주당순이익(주당순손실)(원)	940	(441)	14

희석주당순이익(주당순손실)(원)	940	(441)	14

연결에 포함된 회사 수	13	12	10

나. 요약재무정보(단위: 백만원)

과 목	제26기 3분기	제25기	제24기

재무상태표	(2025년 9월말)	(2024년 12월말)	(2023년 12월말)

[유동자산]	661,527	639,624	713,381

당좌자산	585,799	538,202	584,637

재고자산	75,728	101,422	128,743

[비유동자산]	359,382	373,683	400,823

투자자산	6,245	6,273	6,310

유형자산	176,670	178,155	183,175

무형자산	20,585	22,997	26,084

기타비유동자산	155,882	166,258	185,254

자산총계	1,020,910	1,013,307	1,114,204

[유동부채]	118,637	119,468	132,828

[비유동부채]	37,681	44,014	51,322

부채총계	156,319	163,482	184,150

[자본금]	26,113	26,113	26,113

[자본잉여금]	66,614	66,614	66,614

[기타자본항목]	(188,114)	(188,221)	(192,795)

[이익잉여금]	959,978	945,319	1,030,122

자본총계	864,591	849,825	930,054

종속관계공동기업 투자주식 평가방법	원가법	원가법	원가법

손익계산서	(2025.01.01~2025.09.30)	(2024.01.01~2024.12.31)	(2023.01.01~2023.12.31)

매출액	255,478	299,122	272,463

영업이익(영업손실)	26,483	(17,823)	(31,509)

법인세차감전순이익	38,848	(43,193)	(5,223)

당기순이익(당기순손실)	44,056	(46,172)	(1,712)

기본주당순이익(주당순손실)(원)	955	(1,000)	(36)

희석주당순이익(주당순손실)(원)	955	(1,000)	(36)