마크로젠 분기보고서 (2025.09)
3. 연결재무제표 주석

제 30(당) 기 분기 2025년 1월 1일 부터 2025년 9월 30일 까지
제 29(전) 기 전기 2024년 1월 1일 부터 2024년 9월 30일 까지
주식회사 마크로젠과 그 종속회사

1. 일반 사항

주식회사 마크로젠(이하 '지배회사')은 1997년 설립되어 2000년 2월에 한국거래소가개설한 코스닥 시장에 상장한 이후 현재까지 유전체 분석, 올리고 합성, Microarray 분석, 유전자 편집 마우스 생산, 임상진단, 개인유전체 및 바이옴/마이크로바이옴 분석 업무를 주요 사업 부문으로 하여 수익을 창출하고 있습니다. 지배회사는 그 동안 수차례의 증자 등을 실시하여 당분기말 현재의 자본금은 보통주 5,421백만원이며, 당분기말 현재 주요 주주현황은 다음과 같습니다.

주주명	소유주식수(주)	지분율(%)

서정선 및 특수관계인	2,182,822	20.13

기타	8,658,578	79.87

계	10,841,400	100.00

1.1 종속기업 현황

연결대상 종속기업에 대한 현황은 아래와 같습니다.

직접지분소유기업	종속기업	소유지분율(%)(*1)	소재지	주요영업	결산월

당분기말	전기말

(주)마크로젠	Macrogen Japan Corp.	65.2	65.2	일본	유전체분석서비스	12월

(주)마크로젠	Macrogen Asia Pacific Pte. Ltd	100.0	100.0	싱가포르	유전체분석서비스	12월

(주)마크로젠	Macrogen Europe B.V.	100.0	100.0	네덜란드	유전체분석서비스	12월

(주)마크로젠	Psomagen, Inc.	54.8	54.8	미국	유전체분석서비스	12월

Psomagen, Inc.	Macrogen Japan Corp.	34.8	34.8	일본	유전체분석서비스	12월

Psomagen, Inc.	KEAN Health Corp(*2)	59.8	59.8	일본	유전체분석서비스	12월

Macrogen Japan Corp.	KEAN Health Corp(*2)	19.9	19.9	일본	유전체분석서비스	12월

Macrogen Europe B.V.	Macrogen Europe GmbH	100.0	100.0	스위스	유전체분석서비스	12월

(*1) 지배회사 또는 중간지배회사가 직접 보유하고 있는 지분율입니다.(*2) 지배회사의 종속기업인 Macrogen Japan Corp.과 Psomagen, Inc.의 합산지분율을 통해 지배력을 보유하고 있어 종속기업으로 분류하였습니다.

2. 중요한 회계정책

다음은 연결재무제표 작성에 적용된 중요한 회계정책입니다. 이러한 정책은 별도의 언급이 없다면, 표시된 회계기간에 계속적으로 적용됩니다.

2.1 연결재무제표 작성 기준

연결회사의 2025년 9월 30일로 종료하는 9개월 보고기간에 대한 분기연결재무제표는 기업회계기준서 제1034호 '중간재무보고'에 따라 작성되었습니다. 이 분기연결재무제표는 보고기간말인 2025년 9월 30일 현재 유효하거나 조기 도입한 한국채택국제회계기준에 따라 작성되었습니다.

가. 연결회사가 채택한 제ㆍ개정 기준서연결회사는 2025년 1월 1일로 개시하는 회계기간부터 다음의 주요 제ㆍ개정 기준서를 신규로 적용하였습니다.

- 기업회계기준서 제1021호 '환율변동효과' 개정

외환시장이 정상적으로 작동하지 않을 때 기능통화에 의한 외화거래 보고를 명확히 하기 위해 두 통화간 교환가능성을 평가하는 규정을 추가합니다. 또한, 두 통화간 교환이 가능한지를 평가하여 교환가능성이 결여되었다고 판단한 경우, 적용할 현물환율을 추정하는 규정을 추가하였습니다. 동 개정사항은 2025년 1월 1일 이후 시작하는 회계연도부터 적용되며, 해당 기준서의 개정이 연결재무제표에 미치는 영향은 없습니다.

나. 회사가 적용하지 않은 제ㆍ개정 기준서제정ㆍ공표되었으나 2025년 1월 1일 이후 시작하는 회계연도에 시행일이 도래하지아니한 주요 제ㆍ개정 기준서 및 해석서는 다음과 같습니다. 연결회사는 재무제표 작성시 다음의 제ㆍ개정 기준서 및 해석서를 조기적용하지 아니하였습니다. 연결회사에 중요한 영향을 미치지 않을 것으로 판단됩니다.

- 금융상품 분류와 측정 요구사항 (기업회계기준서 제1107호 '금융상품: 공시', 기업회계기준서 제1109호 '금융상품')- 연차개선 (기업회계기준서 제1007호 '현금흐름표', 기업회계기준서 제1101호 '한국채택국제회계기준의 최초채택', 기업회계기준서 제1107호 '금융상품: 공시', 기업회계기준서 제1109호 '금융상품', 기업회계기준서 제1110호 '연결재무제표')

2.2 회계정책

분기연결재무제표를 작성하기 위하여 채택한 중요한 회계정책은 아래에 적용되는 기준서를 제외하고는 2024년 12월 31일로 종료되는 회계기간에 대한 연차재무제표 작성시 채택한 회계정책과 동일합니다.

한편, 공표되었으나 아직 시행되지 않은 제ㆍ개정된 기준서 및 해석서 중 연결회사가조기 적용한 기준서 또는 해석서는 없습니다.

3. 중요한 회계추정 및 가정

분기연결재무제표 작성 시 사용된 중요한 회계추정 및 가정은 법인세비용을 결정하는데 사용된 추정의 방법을 제외하고는 2024년 12월 31일로 종료하는 회계연도에 대한 연차재무제표 작성 시 적용된 회계추정 및 가정과 동일합니다.

4. 금융상품 공정가치 4.1 금융상품 종류별 공정가치

금융상품의 종류별 장부금액 및 공정가치는 다음과 같습니다.

(단위: 천원)

구분	당분기말	전기말

장부금액	공정가치	장부금액	공정가치

금융자산

현금및현금성자산	22,418,681	22,418,681	33,045,322	33,045,322

단기금융상품	4,969,674	4,969,674	9,575,259	9,575,259

매출채권	41,074,018	41,074,018	39,611,371	39,611,371

기타금융자산(유동)	4,179,117	4,179,117	2,843,146	2,843,146

금융리스채권(유동)	580,372	580,372	677,325	677,325

기타포괄손익-공정가치 측정 금융자산	4,495,643	4,495,643	6,501,316	6,501,316

당기손익-공정가치 측정 금융자산(유동)	3,019,829	3,019,829	-	-

당기손익-공정가치 측정 금융자산(비유동)	11,534,712	11,534,712	9,045,166	9,045,166

금융리스채권(비유동)	-	-	401,400	401,400

기타금융자산(비유동)	2,564,533	2,564,533	2,849,684	2,849,684

금융부채

매입채무	10,314,180	10,314,180	8,389,508	8,389,508

단기차입금	52,777,492	52,777,492	33,874,592	33,874,592

유동성장기차입금	938,250	938,250	21,165,720	21,165,720

기타금융부채(유동) (*)	14,059,953	14,059,953	15,297,215	15,297,215

장기차입금	32,146,352	32,146,352	13,349,014	13,349,014

기타금융부채(비유동) (*)	1,523,522	1,523,522	2,081,194	2,081,194

(*) 기타금융부채는 범주별 금융부채의 적용을 받지 않는 리스부채(당분기말: 10,833백만원, 전기말: 12,402백만원)가 제외된 금액이며, 기업회계기준서 제1019호를 적용하는 종업원급여제도에 따른 사용자의 권리와 의무에 대한 부채가 포함되어 있습니다.상각후원가로 인식된 금융자산과 부채는 공정가치가 장부금액과 근사하여 공정가치 평가를 수행하지 않았습니다.

4.2 금융상품 공정가치 서열 체계

공정가치로 측정되거나 공정가치가 공시되는 항목은 공정가치 서열체계에 따라 구분하며, 정의된 수준들은 다음과 같습니다.

구분	투입변수의 유의성

수준 1	측정일에 동일한 자산이나 부채에 대한 접근 가능한 활성시장의 (조정되지 않은) 공시가격

수준 2	수준 1의 공시가격 이외에 자산이나 부채에 대해 직접적으로 또는 간접적으로 관측가능한 투입변수

수준 3	자산이나 부채에 대한 관측가능하지 않은 투입변수

공정가치로 측정되거나 공정가치가 공시되는 금융상품의 공정가치 서열체계 구분은 다음과 같습니다.

- 당분기말(단위: 천원)

구분	수준 1	수준 2	수준 3	합계

반복적인 공정가치 측정치

당기손익-공정가치 측정 금융자산	6,158,500	3,021,284	5,374,756	14,554,540

기타포괄손익-공정가치 측정 금융자산	4,495,643	-	-	4,495,643

- 전기말(단위 : 천원)

구분	수준 1	수준 2	수준 3	합계

반복적인 공정가치 측정치

당기손익-공정가치 측정 금융자산	4,390,000	2,997,891	4,655,166	12,043,057

기타포괄손익-공정가치 측정 금융자산	6,501,316	-	-	6,501,316

4.3 반복적인 공정가치 측정치의 수준 3의 변동내역

(단위 : 천원)

구분	당기손익-공정가치 측정 금융자산	기타포괄손익-공정가치 측정 금융자산

당분기	전분기	당분기	전분기

기초	4,655,166	12,470,130	-	702,634

취득	759,590	-	-	-

처분	(40,000)	-	-	-

대체(*)	-	-	-	26,305

기말	5,374,756	12,470,130	-	728,939

(*) 전분기 중 소유지분율이 20% 미만으로 하락하여 유의적인 영향력을 행사할 수 없음에 따라 관계기업투자에서 기타포괄손익-공정가치 측정 지분증권으로 재분류하였습니다.4.4 수준 3으로 분류된 공정가치 측정치의 가치평가과정연결회사는 수준 3으로 분류된 금융상품에 대해서 매 사업연도말 독립적인 외부평가기관의 전문가적인 판단에 근거한 합리적인 평가모형과 적절한 추정치를 사용하여 산정한 금액을 공정가치로 보아 평가하고 있습니다.

5. 범주별 금융상품5.1 금융상품 범주별 장부금액

- 당분기말(단위 : 천원)

재무상태표 상 자산	상각후원가측정 금융자산	당기손익-공정가치 측정 금융자산	기타포괄손익-공정가치측정 금융자산	합계

현금및현금성자산	22,418,681	-	-	22,418,681

단기금융상품	4,969,674	-	-	4,969,674

매출채권	41,074,018	-	-	41,074,018

기타금융자산(유동)	4,179,117	-	-	4,179,117

금융리스채권(유동)	580,372	-	-	580,372

기타포괄손익-공정가치 측정 금융자산	-	-	4,495,643	4,495,643

당기손익-공정가치 측정 금융자산	-	14,554,540	-	14,554,540

기타금융자산(비유동)	2,564,533	-	-	2,564,533

합계	75,786,395	14,554,540	4,495,643	94,836,578

(단위 : 천원)

재무상태표 상 부채	상각후원가 측정 금융부채

매입채무	10,314,180

단기차입금	52,777,492

유동성장기차입금	938,250

장기차입금	32,146,352

기타금융부채(유동)(*)	14,059,953

기타금융부채(비유동)(*)	1,523,522

합계	111,759,749

(*) 기타금융부채는 범주별 금융부채의 적용을 받지 않는 리스부채(10,833백만원)가제외된 금액이며, 기업회계기준서 제 1019호를 적용하는 종업원급여제도에 따른 사용자의 권리와 의무에 대한 부채가 포함되어 있습니다.

- 전기말(단위 : 천원)

재무상태표 상 자산	상각후원가측정 금융자산	당기손익-공정가치측정 금융자산	기타포괄손익-공정가치측정 금융자산	합계

현금및현금성자산	33,045,322	-	-	33,045,322

단기금융상품	6,577,368	2,997,891	-	9,575,259

매출채권	39,611,371	-	-	39,611,371

기타금융자산(유동)	2,843,146	-	-	2,843,146

금융리스채권(유동)	677,325	-	-	677,325

기타포괄손익-공정가치 측정 금융자산	-	-	6,501,316	6,501,316

당기손익-공정가치 측정 금융자산	-	9,045,166	-	9,045,166

기타금융자산(비유동)	2,849,684	-	-	2,849,684

금융리스채권(비유동)	401,400	-	-	401,400

합계	86,005,616	12,043,057	6,501,316	104,549,989

(단위 : 천원)

재무상태표 상 부채	상각후원가 측정 금융부채

매입채무	8,389,508

단기차입금	33,874,592

유동성장기차입금	21,165,720

기타금융부채(유동)(*)	15,297,215

장기차입금	13,349,014

기타금융부채(비유동)(*)	2,081,194

합계	94,157,243

(*) 기타금융부채는 범주별 금융부채의 적용을 받지 않는 리스부채(12,402백만원)가제외된 금액이며, 기업회계기준서 제1019호를 적용하는 종업원급여제도에 따른 사용자의 권리와 의무에 대한 부채가 포함되어 있습니다.

6. 관계기업투자6.1 관계기업투자 현황

(단위: 천원)

기업명	소유지분율(%)	장부금액	주된
사업장	주요영업

당분기말	전기말	당분기말	전기말

관계기업:

(주)헬스브리즈(*1)	18.1	18.1	205,034	256,248	한국	의료용 애니메이션 설명처방서비스

Sotirion Biosciences(*2)	33.4	35.1	483,695	684,137	미국	미세잔존 유전체분석

합계	688,729	940,385

(*1) 연결회사가 보유한 (주)헬스브리즈의 보통주와 보통주로 전환 가능한 잠재적 의결권을 고려하여 관계기업으로 분류하였습니다.(*2) 전기 중 신규로 취득하였습니다.

6.2 관계기업투자에 대한 지분법 평가 내역- 당분기

(단위: 천원)

기업명	당기초	지분법평가손익	지분법자본변동	관계기업투자처분손익	당분기말

관계기업:

(주)헬스브리즈	256,248	(51,214)	-	-	205,034

Sotirion Biosciences	684,137	(207,882)	(11,519)	18,959	483,695

합계	940,385	(259,096)	(11,519)	18,959	688,729

- 전분기(단위: 천원)

기업명	전기초	대체	지분법평가손익	지분법자본변동	관계기업투자처분손익	전분기말

관계기업:

Psomagen, Inc.	41,573,443	-	(1,879,181)	48,042	4,841	39,747,145

Microba Life Sciences Ltd.	2,607,888	(2,607,888)	-	-	-	-

㈜헬스브리즈	190,603	-	51,429	-	-	242,032

KEAN Health Corp.	17,640	(26,305)	8,665	-	-	-

합계	44,389,574	(2,634,193)	(1,819,087)	48,042	4,841	39,989,177

6.3 주요 관계기업의 요약 재무정보- 당분기말 및 당분기

(단위: 천원)

기업명	당분기말	당분기

자산	부채	매출액	분기순손실

관계기업:

(주)헬스브리즈	3,487,996	1,329,797	640,758	(239,609)

Sotirion Biosciences	352,008	23,519	-	(502,967)

- 전기말 및 전분기(단위: 천원)

기업명	전기말	전분기

자산	부채	매출액	분기순손실

관계기업:

Psomagen, Inc	52,446,028	21,536,407	29,765,241	(4,788,768)

(주)헬스브리즈	3,633,442	1,235,634	768,598	(123,097)

Sotirion Biosciences(*)	779,486	27,321

(*) 연결회사는 Sotirion Biosciences를 전분기말 이후 취득하였으므로 전분기의 요약재무정보를 포함하지 아니하였습니다.

7. 유형자산7.1 유형자산 변동내역(단위 : 천원)

구분	당분기	전분기

기초	106,158,538	77,787,596

취득	31,493,970	26,440,584

처분	(362,927)	(1,081,197)

감가상각	(10,609,631)	(6,543,010)

손상차손환입	(684,136)	(1,162,215)

대체(*)	(6,065,074)	(2,102,562)

환율효과	(516,193)	235,338

분기말	119,414,547	93,574,534

(*) 토지 및 건물 1,043 백만원이 투자부동산으로 대체되었으며, 기계장치 1,130백만원이 매각예정자산으로 대체 되었습니다. 또한 건설중인자산 561백만원이 무형자산으로 대체 되었습니다.당분기 중 자본화된 차입원가는 753백만원(전분기: 567백만원)이며, 자본화가능차입원가를 산정하기 위해 사용된 자본화차입이자율은 3.78%(전분기: 4.01%)입니다.

7.2 타인 담보제공 내역 당분기말 현재 차입금과 관련하여, 유형자산과 투자부동산이 타인에게 담보로 제공되어 있습니다(주석 16 참조).

7.3 매각예정자산의 내역(단위 : 천원)

계정명	당분기말	전기말

기계장치	1,198,435	-

8. 리스 연결회사가 리스이용자인 경우의 리스에 대한 정보는 다음과 같습니다. 8.1 연결재무상태표에 인식된 금액

리스와 관련해 연결재무상태표에 인식된 금액은 다음과 같습니다.

(단위: 천원)

구분	당분기말	전기말

사용권자산(*)

부동산	8,464,475	10,170,277

차량운반구	479,863	436,914

기계장치	675,616	696,320

합계	9,619,954	11,303,511

(*) 연결재무상태표의 '유형자산'항목에 포함되었습니다.

(단위: 천원)

구분	당분기말	전기말

리스부채(*)

유동	2,886,103	3,232,835

비유동	7,946,563	9,169,568

합계	10,832,666	12,402,403

복구충당부채

유동	180,351	149,171

비유동	44,806	102,552

합계	225,157	251,723

(*) 연결재무상태표의 '기타금융부채'항목에 포함되었습니다. 당분기 중 증가된 사용권자산은 1,288백만원(전분기: 688백만원)입니다.

8.2 연결손익계산서에 인식된 금액

리스와 관련해서 연결손익계산서에 인식된 금액은 다음과 같습니다.

(단위: 천원)

구분	당분기	전분기

사용권자산의 감가상각비

부동산	2,186,418	890,280

차량운반구	197,276	162,646

기계장치	236,713	192,421

합계	2,620,407	1,245,347

리스부채에 대한 이자비용(금융비용에 포함)	158,809	84,310

단기리스료(매출원가 및 관리비에 포함)	5,074	4,739

단기리스가 아닌 소액자산 리스료(매출원가 및 관리비에 포함)	81,252	61,502

리스부채 측정치에 포함되지 않은 변동리스료에 관련되는 비용	-	7,771

합계	245,135	158,322

당분기 중 리스의 총 현금유출은 2,788백만원(전분기: 1,550백만원)입니다.

9. 무형자산9.1 무형자산의 변동내역

(단위 : 천원)

구분	당분기	전분기

기초	40,276,461	2,625,960

취득	566,309	1,031,688

상각	(2,025,275)	(859,493)

손상	(48,576)	(1,329,666)

대체(*)	146,509	803,200

환율효과	(288,183)	4,568

분기말	38,627,245	2,276,257

(*) 유형자산에서 대체되었습니다.당분기 상각비 2,025백만원(전분기: 859백만원)은 포괄손익계산서상 판매비와관리비및 매출원가에 포함되어 있습니다.당분기 연결회사가 비용으로 인식한 경상적인 연구 및 개발 지출의 총액은 3,197백만원(전분기: 2,828백만원) 입니다.

10. 투자부동산10.1 투자부동산의 변동내역

(단위 : 천원)

구분	당분기	전분기

기초	46,537,475	32,621,807

취득	32,000	30,400

상각	(490,401)	(179,356)

대체(*)	1,042,855	-

분기말	47,121,929	32,472,851

(*) 회사 자체 사용으로 인한 유형자산 대체가 포함되어 있습니다.10.3 당분기 중 투자부동산에서 발생한 운용리스로부터의 임대수익은 975백만원(전분기 : 1,047백만원), 운영비용 490백만원(전분기 : 179백만원)입니다(주석15참조).10.2 타인 담보제공 내역당분기말 현재 차입금과 관련하여, 유형자산과 투자부동산이 타인에게 담보로 제공되어 있습니다(주석 16 참조).

11. 차입금11.1 차입금 장부금액의 내역

(단위: 천원)

구분	내용	차입처	만기일	금리	연이자율(%)	당분기말	전기말

유동성장기차입금(*)	시설자금대출	KDB산업은행	2025.06.28	-	-	-	21,000,000

시설자금대출	2032.10.26	변동	4.25	662,250	165,720

시설자금대출	2032.10.26	변동	3.88	276,000	-

소계	938,250	21,165,720

장기차입금(*)	시설자금대출	KDB산업은행	2032.10.26	변동	4.25	4,137,750	4,634,280

시설자금대출	2032.10.26	변동	3.88	1,724,000	-

시설자금대출	신한은행	2026.10.25	고정	3.79	15,435,245	100,000

시설자금대출	2027.10.25	고정	2.79	10,000,000	7,490,958

소계	31,296,995	12,225,238

유동성사채	무담보사모사채(1회)	Mizuho Bank	2025.12.31	변동	0.65(3개월 TIBOR)	377,492	374,592

장기사채	2028.10.31	변동	849,357	1,123,776

단기차입금(*)	운영자금대출	KEB하나은행	2026.06.28	변동	3.68	9,000,000	9,000,000

운영자금대출	2026.04.29	변동	3.84	5,000,000	5,000,000

운영자금대출	2026.09.11	고정	3.89	5,000,000

운영자금대출	신한은행	2026.06.15	변동	3.32	3,800,000	6,500,000

운영자금대출	3.32	900,000	-

운영자금대출	3.75	2,800,000	1,000,000

운영자금대출	농협은행	2025.09.11	변동	3.57	-	5,000,000

운영자금대출	우리은행	2025.09.15	고정	3.79	7,000,000	7,000,000

시설자금대출	KDB산업은행	2026.06.28	변동	4.04	18,900,000	-

소계	52,400,000	33,500,000

합계	85,862,094	68,389,326

(*) 장단기차입금에 대해 유형자산과 투자부동산이 담보로 제공되어 있습니다(주석 16 참조).

12. 퇴직급여 12.1 확정기여형 퇴직급여제도당분기 중 확정기여제도와 관련해 비용으로 인식한 금액은 2,010백만원(전분기: 1,908백만원)입니다.

12.2 확정급여제도

(1) 분기연결포괄손익계산서에 반영된 금액

(단위 : 천원)

구분	당분기	전분기

당기근무원가	81,112	67,726

순이자원가	16,118	10,534

종업원 급여에 포함된 비용	97,230	78,260

(2) 분기연결포괄손익계산서에 인식한 확정급여제도 관련 비용

(단위 : 천원)

구분	당분기	전분기

매출원가	39,663	9,869

판매비와관리비	57,566	68,391

합계	97,229	78,260

(3) 순확정급여부채 산정내역(단위 : 천원)

구분	당분기말	전기말

기금이 적립된 확정급여채무의 현재가치	314,713	290,228

기금이 적립되지 않은 확정급여채무의 현재가치	729,814	639,007

소계	1,044,527	929,235

사외적립자산의 공정가치	(238,669)	(232,811)

재무상태표상 순확정급여부채	805,858	696,424

13. 법인세비용 중간기간의 법인세비용은 전체 회계연도에 대해서 예상되는 최선의 가중평균연간법인세율, 즉 추정평균연간유효법인세율을 중간기간의 세전손익에 적용하여 계산합니다.

14. 자본금과 주식발행초과금

회사가 발행할 주식의 총수는 100,000,000주이고, 당분기말 현재 발행한 주식수는 보통주식 10,841,400주(전기: 10,841,400주)이며 1주당 액면금액은 500원입니다.

(단위: 천원)

구분	주식수	자본금	주식발행초과금	합계

전기말	10,841,400주	5,420,700	94,179,142	99,599,842

당분기말	10,841,400주	5,420,700	94,179,142	99,599,842

2024년 12월 31일로 종료하는 회계기간에 대한 보통주 배당금 3,252백만원은 2025년 4월에 지급되었습니다.

15. 고객과의 계약에서 생기는 수익 및 관련 계약부채

15.1 고객과의 계약에서 생기는 수익(1) 연결회사는 수익과 관련해 포괄손익계산서에 다음 금액을 인식하였습니다.

(단위 : 천원)

구분	당분기	전분기

고객과의 계약에서 생기는 수익	138,034,456	93,759,108

기타 원천으로부터의 수익: 임대수익 등	975,091	1,047,043

총 수익	139,009,547	94,806,151

(2) 고객과의 계약에서 생기는 수익의 구분연결회사는 다음의 주요 제품라인과 지역에서 재화나 용역을 한 시점에 이전함으로써 수익을 창출합니다.

- 당분기(단위: 천원)

당분기	NGS부문	CES부문	게놈응용부문	임상진단부문	기타부문	합계

국내	해외	국내	해외	국내	해외	국내	해외	국내	해외

외부고객으로부터 수익	24,783,975	61,903,721	13,625,505	15,813,934	4,288,566	2,338,993	1,015,635	1,307,734	6,248,136	6,708,256	138,034,455

- 전분기(단위: 천원)

전분기	NGS부문	CES부문	게놈응용부문	임상진단부문	기타부문	합계

국내	해외	국내	해외	국내	해외	국내	해외	국내	해외

외부고객으로부터 수익	19,065,613	31,999,049	13,424,327	10,851,109	3,800,815	3,340,951	1,572,364	815,573	8,278,411	610,896	93,759,108

외부고객으로부터의 수익은 유전자 및 유전체 분석, Microarray 분석 그리고 유전자조작 마우스 생산 등을 토대로 수익을 창출하고 있습니다.

15.2 고객과의 계약과 관련된 부채 (1) 연결회사가 인식하고 있는 계약부채는 아래와 같습니다.

(단위: 천원)

구분	당분기말	전기말

계약부채 - 선수금	47,863,248	43,545,068

(2) 계약부채와 관련하여 인식한 수익

전기에서 이월된 계약부채와 관련하여 당분기 및 전분기에 수익으로 인식한 금액은 다음과 같습니다.

(단위 : 천원)

구분	당분기	전분기

기초의 계약부채 잔액 중 당기에 인식한 수익

NGS사업부문 등	17,446,076	10,671,324

16. 우발상황과 약정사항 16.1 수기 특약 및 전자상거래 특약연결회사는 당분기말 현재 현대카드, 비씨카드 및 신한카드와 수기 특약 및 전자상거래 특약을 체결하고 있습니다. 연결회사는 이 약정과 관련하여 보증금 75백만원을 제공하고 있습니다.

16.2 차입 약정(단위: 천원)

구분	금융기관	한도액	실행액	기간

산업시설자금대출(*)	KDB산업은행	18,900,000	18,900,000	2025.06.28~2026.06.28

산업시설자금대출(*)	6,800,000	4,800,000	2022.10.26~2032.10.26

산업시설자금대출(*)	2,000,000	2025.03.05~2032.10.26

운전일반자금대출(*)	KEB하나은행	9,000,000	9,000,000	2025.06.28~2026.06.28

운전일반자금대출	5,000,000	5,000,000	2025.04.29~2026.04.29

운전일반자금대출	5,000,000	5,000,000	2025.09.11~2026.09.11

운전일반자금대출	신한은행	3,800,000	3,800,000	2025.06.16~2026.06.15

운전일반자금대출	900,000	900,000	2025.06.16~2026.06.15

운전일반자금대출	2,800,000	2,800,000	2025.06.16~2026.06.15

운전일반자금대출	우리은행	7,000,000	7,000,000	2024.09.13~2025.09.15

시설자금대출(*)	신한은행	22,300,000	15,435,245	2024.10.25~2026.10.25

시설자금대출(*)	10,000,000	10,000,000	2024.10.25~2027.10.25

운전자금대출	Mizuho Bank	JPY 40,000,000	JPY 40,000,000	2023.10.31~2025.12.31

운전자금대출	JPY 90,000,000	JPY 90,000,000	2023.10.31~2028.10.31

(*) 차입금에 대하여 유형자산과 투자부동산 836억원이 담보로 설정되어 있습니다.

(단위: 천원)

구분	금융기관	한도액	실행액	기간

산업시설자금대출(*)	KDB산업은행	12,000,000	4,800,000	2022.10.26~2032.10.26

산업시설자금대출(*)	21,000,000	21,000,000	2022.06.28~2025.06.28

산업운영자금대출(*)	KEB하나은행	9,000,000	9,000,000	2024.06.28~2025.06.28

운전일반자금대출	5,000,000	5,000,000	2024.04.29~2025.04.29

운전일반자금대출	신한은행	6,500,000	6,500,000	2024.06.18~2025.06.15

운전일반자금대출	1,000,000	1,000,000	2024.06.18~2025.06.15

운전일반자금대출(*)	농협은행	5,000,000	5,000,000	2024.09.11~2025.09.11

운전일반자금대출	우리은행	7,000,000	7,000,000	2024.09.13~2025.09.15

시설자금대출(*)	신한은행	22,300,000	100,000	2024.10.25~2026.10.25

시설자금대출(*)	10,000,000	7,490,958	2024.10.25~2027.10.25

운전자금대출	Mizuho Bank	JPY 40,000,000	JPY 40,000,000	2023.10.31~2025.12.31

운전자금대출	JPY 120,000,000	JPY 120,000,000	2023.10.31~2028.10.31

(*) 차입금에 대하여 유형자산과 투자부동산 902억원이 담보로 설정되어 있습니다.

16.3 담보제공자산-당분기말(단위: 천원)

담보제공자산	장부금액	담보설정금액	관련 차입액	담보권자

유형자산 및 투자부동산(토지, 건물)	57,679,698	34,000,000	25,700,000	KDB 산업은행

10,800,000	9,000,000	KEB하나은행

38,760,000	17,420,103	신한은행

합계	83,560,000	52,120,103

-전기말(단위: 천원)

담보제공자산	장부금액	담보설정금액	관련 차입액	담보권자

유형자산 및 투자부동산(토지, 건물)	50,187,222	39,600,000	25,800,000	KDB산업은행

10,800,000	9,000,000	KEB하나은행

6,000,000	5,000,000	농협은행

38,760,000	7,590,958	신한은행

합계	95,160,000	47,390,958

16.4 서울보증보험연결회사는 당분기말 현재 서울보증보험으로부터 계약이행등과 관련하여 11,370백만원 (전기말 5,719백만원)의 지급보증을 제공 받고 있습니다.16.5 연구용역계약연결회사는 연구용역계약 및 기술실시 계약을 체결하고 아래 기관으로부터 국고보조금을수령하였습니다. 동 계약에 따르면, 회사는 동 연구개발을 완료한 후에 기술사용을 위하여 기술료를 지급하여야 합니다.

전문기관	과제명

한국산업기술진흥원	WC300프로젝트 기술개발지원사업

한국산업기술평가관리원	소재부품기술개발 산업기술혁신사업

한국산업기술기획평가원	바이오산업기술개발(R)

16.6 소송사건연결회사가 당분기말 현재 원고로 계류 중인 소송사건은 2건입니다. 당분기말 현재 소송사건의 최종 결과를 합리적으로 예측할 수 없다고 판단하여 관련 자산을 인식하지 않았습니다.

(단위 : 천원)

소송내용	소송액	원고	피고	계류법원

사건>

물품대금 외	75,600	주식회사 마크로젠	주식회사 플랜젠	서울남부지방법원

물품대금 외	164,911	주식회사 마크로젠	조철호	서울북부지방법원

연결회사는 건설공제조합과의 분쟁에 따라 소송을 제기하였으며, 2025년 09월 26일대법원에서 최종 승소 판결이 확정되었습니다.이에 따라 연결회사는 수령한 원금 1,726,252천원과 지연손해금 234,959천원을 영업외수익으로 인식하였으며, 해당 소송과 관련된 추가적인 우발채무는 존재하지 않습니다.

16.7 연결회사는 2022년 3월 (주)랩지노믹스와 사업시너지 및 우호관계를 목적으로 각사가보유중인 자기주식을 상호 양수도교환 하였습니다. 양사는 동 거래 이후 상대방의 주식을 추가적으로 취득할 수 없습니다. 당분기 말 현재 연결회사는 랩지노믹스의 총 발행주식 74,239,990주 중 1,335,288주(지분율 약 1.80%), 랩지노믹스는 연결회사의 총 발행주식 10,841,400주 중 200,883주(지분율약 1.85%)를 각각 소유하고 있습니다.16.8 연결회사는 2022년 3월 송도국제도시 인천테크노파크 확대조성단지 첨단산업클러스터(B) 내 연구소 유치를 목적으로 하는 인천광역시 경제자유구역청으로부터 송도 소재 토지를 취득하였습니다. 해당 토지 취득과 관련하여 개발 완공 기한 준수, 담보 제공 및 매각 제한의 약정 사항이 존재합니다.

17. 특수관계자 거래17.1 특수관계자 현황

구분	당분기말	전기말

관계기업	(주)헬스브리즈	(주)헬스브리즈

Sotirion Biosciences	Sotirion Biosciences

기타	의료법인 마크로젠의료재단 진헬스의원	의료법인 마크로젠의료재단 진헬스의원

공우생명정보재단	공우생명정보재단

17.2 주요 거래내역(단위: 천원)

구분	회사명	당분기

매출 등	매입 등

관계기업	㈜헬스브리즈	3,570	540

기타	의료법인 마크로젠의료재단진헬스의원	404,660	23,600

공우생명정보재단	15,660	-

합계	423,890	24,140

(단위: 천원)

구분	회사명	전분기

매출 등	매입 등

관계기업	Psomagen, Inc.	182,494	1,356,725

㈜헬스브리즈	1,795	812

기타	의료법인 마크로젠의료재단 진헬스의원	418,352	216,084

공우생명정보재단	15,930	-

합계	618,571	1,573,621

17.3 주요 채권 및 채무 내역- 당분기말

(단위: 천원)

구분	회사명	매출채권	기타채권(*)	기타채무

관계기업	(주)헬스브리즈	-	-	66

기타	의료법인 마크로젠의료재단 진헬스의원	956,255	2,488,210	661,305

공우생명정보재단	1,573	-	20,000

합계	957,828	2,488,210	681,371

(*) 연결회사는 관계기업 등에 기계장치 등 금융리스계약을 체결하였습니다. 당분기말 현재 금융리스 채권 잔액은 580백만원입니다.- 전기말

(단위: 천원)

구분	회사명	매출채권	기타채권(*)	기타채무

관계기업	(주)헬스브리즈	-	-	33

기타	의료법인 마크로젠의료재단 진헬스의원	711,129	2,444,630	789,479

공우생명정보재단	1,320	-	20,000

합계	712,449	2,444,630	809,512

(*) 연결회사는 관계기업 등에 기계장치 등 금융리스계약을 체결하였습니다. 전기말 현재 금융리스 채권 잔액은 1,079백만원입니다

17.4 당분기 및 전분기 중 특수관계자와의 자금 거래내역은 없습니다.

17.5 주요 경영진에 대한 보상주요 경영진에는 연결회사의 활동의 계획, 운영 및 통제에 대한 중요한 권한과 책임을 가진 이사(비상임 포함) 및 감사가 포함되어 있습니다. 종업원 용역의 대가로서 주요 경영진에게 지급됐거나 지급될 보상금액은 다음과 같습니다.

(단위 : 천원)

구분	당분기	전분기

급여	4,084,475	2,815,993

퇴직급여	219,085	100,500

주식보상비용	475,157	156,951

합계	4,778,717	3,073,444

18. 영업부문 정보

18.1 연결회사의 보고부문 구분에 대한 주요 내용은 다음과 같습니다.

연결회사 경영진은 자원배분과 성과평가를 수행하는 부문에서 검토 및 보고한 정보에 기초하여 사업부문을 결정하고 있습니다.

사업부문은 NGS부문, CES부문, 게놈응용부문, 임상진단부문 및 기타부문으로 구분하고 있으며 영업손익에 근거하여 성과를 검토하고 있습니다. 연결회사는 사업부문의 성과를 영업손익에 근거해서 평가하고 있으며, 이는 당분기 연결포괄손익계산서에 보고된 내용과 차이가 없습니다.

(1) 수익 및 부문별 영업손익(단위: 천원)

구분	당분기

NGS부문	CES부문	게놈응용부문	임상진단부문	기타부문	계

분석매출	제품매출	분석매출	제품매출	분석매출	제품매출	분석매출	상품매출	분석매출	상품매출	임대매출	분석매출	제상품매출	임대매출

보고부문수익	86,681,111	6,585	21,457,493	7,981,946	5,074,003	1,553,556	1,357,228	966,141	9,695,058	3,261,334	975,091	124,264,893	13,769,562	975,091

보고부문영업이익	3,293,474	10	712,609	914,048	382,198	(332,402)	(1,331,530)	(86,722)	(3,298,435)	(4,001,421)	287,935	(241,684)	(3,506,487)	287,935

(단위: 천원)

구분	전분기

NGS부문	CES부문	게놈응용부문	임상진단부문	기타부문	계

분석매출	제품매출	분석매출	제품매출	분석매출	제품매출	분석매출	상품매출	분석매출	상품매출	임대매출	분석매출	제상품매출	임대매출

보고부문수익	50,335,175	-	17,335,061	7,101,843	5,814,946	1,564,043	2,143,158	575,575	8,437,762	451,545	1,047,043	84,066,102	9,693,006	1,047,043

보고부문영업이익	996,317	-	441,610	582,268	184,348	(205,962)	(680,132)	(17,645)	(3,764,208)	(1,424,618)	479,474	(2,822,065)	(1,065,957)	479,474

(2) 고객의 지역별 위치에 따른 매출

(단위: 천원)

해당 국가	당분기	전분기

한국	50,936,909	47,202,873

유럽	15,907,457	16,785,945

미국	38,472,718	126,552

호주	898,897	831,241

일본	15,836,430	14,752,604

기타국가	16,957,134	15,106,934

합계	139,009,545	94,806,149

19. 재무위험관리

19.1 재무위험관리요소연결회사는 여러 활동으로 인하여 신용위험, 유동성 위험과 시장위험(환율변동위험, 가격변동위험 및 이자율변동위험)에 노출되어 있습니다. 연결회사는 이러한 위험요소들을 관리하기 위하여 각각의 위험요인에 대해 면밀하게 모니터링하고 대응하는 위험관리 정책 및 프로그램을 운용하고 있습니다.분기연결재무제표는 연차연결재무제표에서 요구되는 모든 재무위험관리와 공시사항을 포함하지 않으므로 2024년 12월 31일의 연차연결재무제표를 참고하시기 바랍니다. 연결회사의 위험관리부서 및 기타 위험관리정책에는 전기말 이후 중요한 변동사항이 없습니다.