마크로젠 분기보고서 (2026.03)
3. 연결재무제표 주석

## 1. 일반 사항 (연결)

주식회사 마크로젠(이하 '지배회사')은 1997년 설립되어 2000년 2월에 한국거래소가개설한 코스닥 시장에 상장한 이후 현재까지 현재까지 유전체 분석, 올리고 합성, Microarray 분석, 유전자 편집 마우스 생산, 임상진단서비스, 개인유전체/바이옴 분석 서비스, 마이크로바이옴 서비스를 주요 사업 부문으로 하여 수익을 창출하고 있습니다. 지배회사는 그 동안 수차례의 증자 등을 실시하여 당분기말 현재의 자본금은 보통주 5,421백만원이며, 당분기말 현재 주요 주주현황은 다음과 같습니다.
1.1 종속기업 현황
연결대상 종속기업에 대한 현황은 아래와 같습니다.
(*1) 지배회사 또는 중간지배회사가 직접 보유하고 있는 지분율입니다.

## 2. 중요한 회계정책 (연결)

다음은 연결재무제표 작성에 적용된 중요한 회계정책입니다. 이러한 정책은 별도의 언급이 없다면, 표시된 회계기간에 계속적으로 적용됩니다. 이 분기연결재무제표는 보고기간말인 2026년 3월 31일 현재 유효하거나 조기 도입한 한국채택국제회계기준에 따라 작성되었습니다.
2.1 연결재무제표 작성 기준
연결회사의 2026년 3월 31일로 종료하는 3개월 보고기간에 대한 요약분기연결재무제표는 기업회계기준서 제1034호 '중간재무보고'에 따라 작성되었습니다.
2.2.1 연결회사가 채택한 제ㆍ개정 기준서 및 해석서
연결회사는 2026년 1월 1일로 개시하는 회계기간부터 다음의 제ㆍ개정 기준서 및 해석서를 신규로 적용하였습니다.
2.2.2 회사가 적용하지 않은 제ㆍ개정 기준서 및 해석서
제정ㆍ공표되었으나 2026년 1월 1일 이후 시작하는 회계연도에 시행일이 도래하지 아니한 주요 제ㆍ개정 기준서 및 해석서는 다음과 같습니다. 연결회사는 재무제표 작성시다음의 제ㆍ개정 기준서 및 해석서를 조기적용하지 아니하였습니다.
2.3 회계정책
중간재무제표를 작성하기 위하여 채택한 중요한 회계정책은 위에 적용되는 기준서를제외하고는 2025년 12월 31일로 종료되는 회계기간에 대한 연차재무제표 작성 시 채택한 회계정책과 동일합니다.

## 3. 중요한 회계추정 및 가정 (연결)

분기연결재무제표 작성시 회사의 경영진은 회계정책의 적용과 보고되는 자산ㆍ부채의 장부금액 및 이익ㆍ비용에 영향을 미치는 판단, 추정 및 가정을 하고 있습니다. 추정 및가정은 지속적으로 평가되며, 과거 경험과 현재의 상황에서 합리적으로 예측가능한 미래의 사건과 같은 다른 요소들을 고려하여 이루어집니다. 이러한 회계추정은 실제 결과와 다를 수도 있습니다.분기연결재무제표 작성시 사용된 중요한 회계추정 및 가정은 법인세비용을 결정하는데 사용된 추정의 방법을 제외하고는 2025년 12월 31일로 종료하는 회계연도에 대한 연차재무제표 작성시 적용된 회계추정 및 가정과 동일합니다.

## 4. 금융상품 공정가치 (연결)

4.1 금융상품 종류별 공정가치
금융상품의 종류별 장부금액 및 공정가치는 다음과 같습니다.
(*) 기타금융부채는 리스부채(당분기말: 11,490백만원, 전기말: 11,621백만원)가 제외되었으며, 금융상품에 해당하지 않는 종업원급여 관련 부채도 제외하였습니다.상각후원가로 인식된 금융자산과 부채의 공정가치는 미래의 현금흐름을 보고기간 말현재의 시장이자율로 할인한 현재의 가치로 평가하며, 동 공정가치는 주석공시목적으로 산정합니다. 한편, 상각후원가로 인식된 금융자산과 부채는 공정가치가 장부금액과 근사하여 공정가치 평가를 수행하지 않았습니다.
4.2 금융상품 공정가치 서열 체계
공정가치로 측정되거나 공정가치가 공시되는 항목은 공정가치 서열체계에 따라 구분하며, 정의된 수준들은 다음과 같습니다.
공정가치로 측정되거나 공정가치가 공시되는 금융상품의 공정가치 서열체계 구분은 다음과 같습니다.
- 당분기말
- 전기말
4.3 반복적인 공정가치 측정치의 서열체계 수준 간 이동반복적인 측정치의 수준 3의 변동내역은 다음과 같습니다.
4.4 가치평가기법 및 투입 변수연결회사는 공정가치 서열체계에서 수준 3으로 분류되는 반복적인 공정가치 측정치,비반복적인 공정가치측정치에 대해 다음의 가치평가기법과 투입변수를 사용하고 있습니다.
(*) 당분기 중 공정가치 측정을 위한 충분한 정보를 얻을 수 없고 전기 또는 당분기에가치변동에 대한 명확한 증거가 없기에 "비상장주식에 대한 공정가치 평가 관련 가이드라인"에 따라 취득원가를 공정가치로 측정하였습니다.
4.5 수준 3으로 분류된 공정가치 측정치의 가치평가과정회사는 수준 3으로 분류된 금융상품에 대해서 독립적인 외부평가기관의 전문가적인 판단에 근거한 합리적인 평가모형과 적절한 추정치를 사용하여 산정한 금액을 공정가치로 보아 평가하고 있습니다.

## 5. 범주별 금융상품 (연결)

5.1 금융상품 범주별 장부금액
- 당분기말
(*) 기타금융부채는 범주별 금융부채의 적용을 받지 않는 리스부채(11,490백만원)가제외된 금액이며, 기업회계기준서 제1019호를 적용하는 종업원급여제도에 따른 사용자의 권리와 의무에 대한 부채도 제외하였습니다.
- 전기말
(*) 기타금융부채는 범주별 금융부채의 적용을 받지 않는 리스부채(11,621백만원)가 제외되었으며, 금융상품에 해당하지 않는 종업원급여 관련 부채도 제외하였습니다.

## 6. 관계기업투자 (연결)

(1) 당분기말과 전기말 현재 관계기업의 현황은 다음과 같습니다.
(*1) 연결회사가 보유한 (주)헬스브리즈의 보통주와 보통주로 전환 가능한 잠재적 의결권을 고려하여 관계기업으로 분류하였습니다.(*2) 전기 중 신규로 취득하였습니다. 연결회사의 의결권이 20% 미만이나 의사결정기구에 대한 참여 등을 통해 유의적인 영향력을 행사할 수 있으므로, 관계기업으로 분류하였습니다.
(2) 당분기와 전분기의 관계기업투자에 대한 지분법 평가 내역은 다음과 같습니다.- 당분기
- 전분기
(3) 주요 관계기업의 요약 재무정보는 아래와 같습니다.
- 당분기말 및 당분기
- 전기말 및 전분기
(*1) 전기 4분기 중 종속기업으로 편입되었으므로, 전분기의 요약재무정보는 기재하지 않았습니다.

## 7. 유형자산 (연결)

(1) 유형자산의 변동내역
- 당분기
(*) 건설중인자산 취득에는 차입원가 자본화로 인한 취득 32백만원을 포함하고 있습니다.- 전분기
(*) 건설중인자산 취득에는 차입원가 자본화로 인한 취득 185백만원을 포함하고 있습니다.(2) 담보제공 내역당분기말 현재 유형자산과 투자부동산이 타인에게 담보로 제공되어 있습니다(주석17참조).

## 8. 리스 (연결)

8.1. 리스이용자(1) 연결재무상태표에 인식된 금액
리스와 관련해 연결재무상태표에 인식된 금액은 다음과 같습니다.
(*) 연결재무상태표의 '유형자산'항목에 포함되었습니다.당분기 중 증가된 사용권자산은 153백만원(전분기: 452백만원)입니다.
(*) 연결재무상태표의 '기타금융부채'항목에 포함되었습니다.
(2) 연결손익계산서에 인식된 금액
리스와 관련해서 연결손익계산서에 인식된 금액은 다음과 같습니다.
당분기 중 리스의 총 현금유출은 1,117백만원(전분기: 729백만원)입니다.
8.2. 리스제공자
(1) 금융리스계약회사는 기계장치를 특수관계자에게 금융리스로 제공하고 있습니다.
(2) 금융리스채권의 내역
(3) 금융리스채권의 유동성분류 내역
(4) 리스순투자의 금융수익

## 9. 무형자산 (연결)

(1) 무형자산의 변동내역- 당분기
- 전분기
(*) 유형자산에서 무형자산으로의 대체가 포함되어 있습니다.당분기 연결회사가 비용으로 인식한 경상적인 연구 및 개발 지출의 총액은 892백만원(전분기: 1,220백만원) 입니다.

## 10. 투자부동산 (연결)

(1) 투자부동산의 변동내역- 당분기
- 전분기
(2) 당분기 중 투자부동산에서 발생한 운용리스로부터의 임대수익은 361백만원(전분기: 329백만원), 운영 비용 154백만원(전분기: 179백만원) 입니다.(3) 담보제공 내역보고기간말 현재 일부 유형자산과 투자부동산이 담보로 제공되어 있습니다(주석 19 참조).

## 11. 차입원가 (연결)

당분기와 전기 중 연결회사가 유형자산으로 자본화한 차입원가 내역은 다음과 같습니다.

## 12. 매각예정비유동자산 (연결)

(단위 : 원) 구분 당분기 전분기 기초 43,047,000 - 증가 1,769,053,621 40,115,858 환율변동 2,355,000 - 기말 1,814,455,621 40,115,858

## 13. 차입금 및 사채 (연결)

(1) 단기차입금 및 사채
(*) 유형자산과 투자부동산이 담보로 제공되어 있습니다(주석 19 참조)
(2) 장기차입금 및 사채
(*) 유형자산과 투자부동산이 담보로 제공되어 있습니다(주석 19 참조).

## 14. 충당부채 (연결)

연결회사는 임차 중인 사무실과 관련하여, 복구충당부채를 계상하고 있으며, 당분기 중 변동내역은 다음과 같습니다.

## 15. 퇴직급여 (연결)

15.1 확정기여제도당분기 중 확정기여제도와 관련해 비용으로 인식한 금액은 590백만원(전분기: 667백만원)입니다.
15.2 확정급여제도
(1) 분기연결포괄손익계산서에 반영된 금액
(2) 연결포괄손익계산서에 인식한 확정급여제도 관련비용
(3) 순확정급여부채 산정내역

## 16. 법인세비용 (연결)

법인세비용은 전체 회계연도에 대해서 예상되는 최선의 가중평균 연간법인세율의 추정에 기초하여 인식하고 있습니다.

## 17. 자본금과 주식발행초과금 (연결)

지배회사가 발행할 주식의 총수는 100,000,000주이고, 발행한 주식수는 보통주식 10,841,400주(전기: 10,841,400주)이며 1주당 액면금액은 500원입니다.
2025년 12월 31일로 종료하는 회계기간에 대한 보통주 배당금 5,420백만원은 2026년 4월에 지급되었습니다.

## 18. 고객과의 계약에서 생기는 수익 및 관련 계약부채 (연결)

18.1 고객과의 계약에서 생기는 수익
(1) 연결회사는 수익과 관련해 포괄손익계산서에 다음 금액을 인식하였습니다.
(2) 고객과의 계약에서 생기는 수익의 구분연결회사는 다음의 주요 제품라인과 지역에서 재화나 용역을 한 시점에 이전함으로써 수익을 창출합니다.
(*) 일부 사업부문의 분류 변경이 반영된 금액입니다.외부고객으로부터의 수익은 유전자 및 유전체 분석, Microarray 분석 그리고 유전자조작 마우스 생산 등을 토대로 수익을 창출하고 있습니다.
18.2 고객과의 계약과 관련된 부채
(1) 연결회사가 인식하고 있는 계약부채는 아래와 같습니다.
(2) 계약부채와 관련하여 인식한 수익
전기에서 이월된 계약부채와 관련하여 당기에 수익으로 인식한 금액은 다음과 같습니다.

## 19. 우발상황과 약정사항 (연결)

(1) 차입 약정
(*) 차입금에 대하여 유형자산과 투자부동산 836억원이 담보로 설정되어 있습니다.
(*) 차입금에 대하여 유형자산과 투자부동산 836억원이 담보로 설정되어 있습니다.
(2) 담보제공자산-당분기말
-전기말
(3) 서울보증보험연결회사는 당분기말 현재 서울보증보험으로부터 계약이행등과 관련하여 11,260백만원(전기말: 11,175백만원)의 지급보증을 제공 받고 있습니다.
(4) 소송사건
연결회사가 당분기말 현재 원고로 계류 중인 소송사건은 2건입니다. 당분기말 현재 소송사건의 최종 결과를 합리적으로 예측할 수 없다고 판단하여 관련 자산을 인식하지 않았습니다.
(5) 연결회사는 2022년 3월 (주)랩지노믹스와 사업시너지 및 우호관계를 목적으로 각사가보유중인 자기주식을 상호 양수도교환 하였습니다. 양사는 동 거래 이후 상대방의 주식을 추가적으로 취득할 수 없습니다. 당분기 말 현재 연결회사는 랩지노믹스의총 발행주식 74,239,990주 중 1,335,288주(지분율 약 1.80%), 랩지노믹스는 회사의 총 발행주식 10,841,400주 중 200,883주(지분율약 1.85%)를 각각 소유하고 있습니다. 연결회사는 2026년 04월 중 보유하고 있던 (주)랩지노믹스 주식 1,335,288주를 전량매각하였습니다. 해당 거래로 인한 재무적 영향은 현재 산정 중이며, 차기 재무제표에 반영될 예정입니다. (6) 연결회사는 2022년 3월 송도국제도시 인천테크노파크 확대조성단지 첨단산업클러스터(B) 내 연구소 유치를 목적으로 하는 인천광역시 경제자유구역청으로부터 송도 소재 토지를 취득하였습니다. 해당 토지 취득과 관련하여 개발 완공 기한 준수, 담보 제공 및 매각 제한의 약정 사항이 존재합니다.(7) 연결회사는 한국산업기술진흥원과 WC300프로젝트 기술개발지원사업과제와 관련된 연구용역계약 및 기술실시 계약을 체결하고 동 기관으로부터 국고보조금을 수령하였습니다. 동 계약에 따르면, 연결회사는 동 연구개발을 완료한 후에 기술사용을위하여 기술료를 지급하여야 합니다.
(8) 연결회사는 당분기말과 전기말 현재 (주)현대카드, (주)비씨카드와 수기특약 및 전자상거래 특약을 체결하고 있습니다. 회사는 이 약정과 관련하여 보증금 75백만원을 제공하고 있습니다.

## 20. 특수관계자거래 (연결)

(1) 특수관계자 현황
(*) 전기 중 신규출자하여 관계기업에 포함되었습니다.
(2) 주요 거래내역- 당분기
- 전분기
(3) 주요 채권 및 채무 내역
(*) 연결회사는 관계기업 등에 기계장치 등 금융리스계약을 체결하였습니다. 당분기말 현재 금융리스 채권 잔액은 226백만원입니다.
(*) 연결회사는 관계기업 등에 기계장치 등 금융리스계약을 체결하였습니다. 전기말 현재 금융리스 채권 잔액은 393백만원입니다.
(4) 당분기 및 전분기 중 특수관계자와의 자금 거래내역은 없습니다.
(5) 주요 경영진에 대한 보상주요 경영진에는 연결회사의 활동의 계획, 운영 및 통제에 대한 중요한 권한과 책임을 가진 이사(비상임 포함) 및 감사가 포함되어 있습니다. 종업원 용역의 대가로서 주요 경영진에게 지급됐거나 지급될 보상금액은 다음과 같습니다.
(7) 특수관계자에 대해 당기에 지급한 배당금은 1,091백만원(전기: 655만원)입니다.

## 21. 영업부문 정보 (연결)

(1) 연결회사의 보고부문 구분에 대한 주요 내용은 다음과 같습니다.
연결회사 경영진은 자원배분과 성과평가를 수행하는 부문에서 검토 및 보고한 정보에 기초하여 사업부문을 결정하고 있습니다.
사업부문은 NGS부문, CES부문, 게놈응용부문, 임상진단부문, 기타부문으로 구분하고 있으며 영업손익에 근거하여 성과를 검토하고 있습니다. 연결회사는 사업부문의 성과를 영업손익에 근거해서 평가하고 있으며, 이는 당기 연결포괄손익계산서에 보고된 내용과 차이가 없습니다.
1) 수익 및 부문별 영업손익
2) 당분기 및 전분기 중 고객의 지역별 위치에 따른 매출은 다음과 같습니다.

## 22. 재무위험관리 (연결)

(1) 재무위험관리요소연결회사는 여러 활동으로 인하여 신용위험, 유동성 위험과 시장위험(환율변동위험, 가격변동위험 및 이자율변동위험)에 노출되어 있습니다. 연결회사는 이러한 위험요소들을 관리하기 위하여 각각의 위험요인에 대해 면밀하게 모니터링하고 대응하는 위험관리 정책 및 프로그램을 운용하고 있습니다.중간연결재무제표는 연차연결재무제표에서 요구되는 모든 재무위험관리와 공시사항을 포함하지 않으므로 2025년 12월 31일의 연차연결재무제표를 참고하시기 바랍니다. 연결회사의 위험관리부서 및 기타 위험관리정책에는 전기말 이후 중요한 변동사항이 없습니다.