에이프로젠 — 주식등의대량보유상황보고서(일반) (20260529)
제출인: 지베이스

주식등의 대량보유상황보고서(일반)
6.0
(주)에이프로젠

0010
0001
20260508

주식등의 대량보유상황보고서

(일반서식 : 자본시장과 금융투자업에 관한 법률 제147조에 의한 보고 중 '경영권에 영향을 주기 위한 목적'의 경우)

금융위원회 귀중
보고의무발생일　 :
2026년 05월 29일

한국거래소 귀중
보고서작성기준일 :
2026년 05월 29일

보고자 :
(주)지베이스

요약정보

발행회사명
(주)에이프로젠
발행회사와의 관계
최대주주

보고구분
변동ㆍ변경

보유주식등의 수 및 보유비율

보유주식등의 수
보유비율

직전 보고서
38,925,738
71.98

이번 보고서
43,413,268
74.13

주요계약체결 주식등의 수 및 비율

주식등의 수
비율

직전 보고서
17,976,117
33.24

이번 보고서
17,976,117
30.70

의결권의 수 및 보유비율

의결권의 수
보유비율

직전 보고서
-
-

이번 보고서
-
-

주요계약체결 의결권의 수 및비율

의결권의 수
비율

직전 보고서
-
-

이번 보고서
-
-

보고사유
특별관계자 추가에 따른 변동특별관계자의 전환사채 취득에 따른 변동 및 비율 변경

※ 보고자 본인은 보고서작성기준일 현재 본인과 특별관계자의 주식등의 보유상황을 관련 법규 및 기재상의 주의에 따라 정확하게 작성하였고, 중요한 사항의 허위기재 또는 기재누락이 없음을 확인합니다.

제1부 보고의 개요

1. 발행회사에 관한 사항

회사명
(주)에이프로젠
회사코드
007460

법인구분
유가증권상장법인
의결권있는 발행주식 총수(주)
23,594,933

2. 대량보유자에 관한 사항

가. 보고자

(1) 보고자 개요

보고구분
변동ㆍ변경
연명

보고자 구분
국내법인
국 적
대한민국

보고자 구분 기재 근거(법령상 조합 또는 기타단체로 기재한 경우만 기재)
-

성명(명칭)
한글
(주)지베이스
한자(영문)
G-BAISE Inc.

주소(본점소재지)[읍ㆍ면ㆍ동까지만 기재]
경기도 성남시 중원구 둔촌대로 545
생년월일 또는사업자등록번호 등
129-86-85599

직업(사업내용)
바이오의약품 연구, 개발 및 관련 컨설팅
발행회사와의 관계
최대주주

업무상 연락처및 담당자
소속회사
(주)지베이스
부서
경영관리팀

직위
과장
전화번호
031-80*******

성명
김동규
팩스번호
02-561*****

이메일 주소
******aprogen.com

(2) 보고자에 대한 구체적인 사항(법인, 기타단체, 법령상조합, 민법상 조합의 경우 기재) (단위: 백만원)

법적성격
주식회사

자산총액(또는 운용자산총액)
77,426
부채총액
123,439

자본총액
-46,013
자본금
1,000

대표자(대표조합원 또는업무집행조합원)
강선주

의사결정기구(의사결정권자)
이사회

최대주주(최다출자자)
(주)넥스코닉스
최대주주 지분율(%)(최다출자자 출자비율)
95.24

【보고자의 최대주주가 법인, 기타단체, 법령상조합, 민법상 조합의 경우】

법적성격
주식회사

자산총액(또는 운용자산총액)
21,370
부채총액
3,921

자본총액
17,449
자본금
350

대표자(대표조합원 또는업무집행조합원)
유원형

의사결정기구(의사결정권자)
이사회

최대주주(최다출자자)
(주)케이포르투나인베스트먼트
최대주주 지분율(%)(최다출자자 출자비율)
100.00

* 상기 자산총액, 부채총액, 자본총액 및 자본금, 최대주주 지분율은 2025년도말 기준(단위:백만원)입니다.

나. 특별관계자

(1) 특별관계자 개요

연번
성 명(명칭)
구분
보고자와의구체적 관계
생년월일또는사업자등록번호 등
국적
주 소(소재지)
직 업(사업내용)
발행회사와의 관계

1
(주)앱토크롬
국내법인
계열회사
114-81-82858
대한민국
경기도 성남시중원구 둔촌대로
무선원격제어기 및 의약품유통 등
계열회사등

2
(주)에이프로젠바이오로직스
국내법인
계열회사
218-81-00518
대한민국
서울특별시 송파구 백제고분로
의약품 제조 등
계열회사등

3
(주)넥스코닉스
국내법인
계열회사
107-88-32631
대한민국
경기도 성남시중원구 둔촌대로
소프트웨어 개발 및 공급업
계열회사등

4
김재섭
개인(국내)
최대주주
630131
대한민국
경기도 성남시 분당구
경영자
임원(등기)

5
김정출
개인(국내)
계열회사 임원
560511
대한민국
경기도 성남시 분당구
경영자
계열회사등 임원

6
박미령
개인(국내)
기타
650531
대한민국
경기도 성남시 분당구
-
주주

7
강선주
개인(국내)
대표이사
730625
대한민국
경기도 의왕시 왕곡로
회사원
임원(등기)

8
제이드신기술조합제79호
법령상 조합
기타
144-80-07926
대한민국
경기도 성남시 분당구 성남대로 331
-
기타

9
(주)엔투텍
국내법인
계열회사
759-88-00172
대한민국
경기도 안성시 원곡면원당로 157
반도체 장비 부품 등
계열회사등

* 주소는 읍ㆍ면ㆍ동까지만 기재

(2) 특별관계자에 대한 구체적인 사항(법인, 기타단체, 법령상조합, 민법상 조합의 경우 기재)
- (주)에이프로젠바이오로직스 (단위 : 백만원,%)

법적성격
주식회사

자산총액(또는 운용자산총액)
586,993
부채총액
309,426

자본총액
277,567
자본금
99,204

대표자
김재섭, 김정출

의사결정기구(의사결정권자)
이사회

최대주주(최다출자자)
(주)에이프로젠
최대주주 지분율
58.72

* 상기 자산총액, 부채총액, 자본총액 및 자본금은 2025년도말 연결기준금액입니다.* 상기 최대주주 지분율은 본 보고서 제출일 현재 기준 입니다.

- (주)앱토크롬 (
변경전:(주) 에이피헬스케어
) (단위 : 백만원,%)

법적성격
주식회사

자산총액(또는 운용자산총액)
320,455
부채총액
13,886

자본총액
306,569
자본금
110,395

대표자(대표조합원 또는업무집행조합원)
김정출

의사결정기구(의사결정권자)
이사회

최대주주(최다출자자)
(주)에이프로젠
최대주주 지분율(%)(최다출자자 출자비율)
52.28

* 상기 자산총액, 부채총액, 자본총액 및 자본금은 2025년도말 연결기준금액입니다.* 상기 최대주주 지분율은 본 보고서 제출일 현재 기준 입니다.
- (주)넥스코닉스 (단위 : 백만원,%)

법적성격
주식회사

자산총액(또는 운용자산총액)
21,370
부채총액
3,921

자본총액
17,449
자본금
350

대표자
유원형

의사결정기구(의사결정권자)
이사회

최대주주(최다출자자)
(주)케이포르투나인베스트먼트
최대주주 지분율
100.00

* 상기 자산총액, 부채총액, 자본총액 및 자본금, 최대주주 지분율은 2025년도말 기준입니다.

- 제이드신기술조합 제79호

(단위 : 백만원,%)

법적성격
법령상조합

자산총액(또는 운용자산총액)
67,599
부채총액
1,500

자본총액
66,099
자본금
-

대표자(대표조합원 또는업무집행조합원)
(주)이스트게이트인베스트먼트

의사결정기구(의사결정권자)
조합원총회

최대주주(최다출자자)
(주)엔투텍
최대주주 지분율(%)(최다출자자 출자비율)
95.57

* 상기 자산총액, 부채총액, 자본총액 및 자본금, 최대주주 지분율은 2025년도말 기준입니다.- (주)엔투텍 (단위 : 백만원,%)

법적성격
주식회사

자산총액(또는 운용자산총액)
149,005
부채총액
21,295

자본총액
127,710
자본금
17,254

대표자(대표조합원 또는업무집행조합원)
김재섭, 이욱재

의사결정기구(의사결정권자)
이사회

최대주주(최다출자자)
몬타나 신기술조합제72호
최대주주 지분율(%)(최다출자자 출자비율)
45.77

* 상기 자산총액, 부채총액, 자본총액 및 자본금은 2025년도말 연결기준금액입니다.* 상기 최대주주 지분율은 본 보고서 제출일 현재 기준 입니다.

다. 집합투자업자

(보고자 또는 특별관계자가 규정 제3-10조 제2항에 따른 "집합투자기구"인 경우에 한함)

(1) 집합투자업자 개요

연번
명칭
사업자등록번호 등
대상 집합투자기구
국적
주 소(소재지)
비고

-
-
-
-
-
-
-

3. 보유주식등의 수 및 보유비율

보고서작성기준일
보고자
주식등
주권
의결권 있는 발행주식총수(주)

본인 성명
특별관계자수
주식등의 수(주)
비율(%)
주식수(주)
비율(%)

직전보고서
2026.05.22
(주)지베이스
9
38,925,738
71.98
8,445,081
35.79
23,594,933

이번보고서
2026.05.29
(주)지베이스
10
43,413,268
74.13
8,445,081
35.79
23,594,933

증 감
4,487,530
2.15
0
0
0

4. 보유목적

경영권 영향

- 회사의 업무집행과 관련한 사항이 발생할 경우에는 관계법령 등에서 허용하는 범위 및 방법에 따라 회사의 경영목적에 부합하도록 주주로서 권리를 행사할 예정입니다.- 자본시장과 금융투자업에 관한 법률 시행령 제 154조 제1항 각 호 (아래1~10호)1. 임원의 선임ㆍ해임 또는 직무의 정지2. 이사회 등 회사의 기관과 관련된 정관의 변경3. 회사의 자본금의 변경4.<삭제>5. 회사의 합병, 분할과 분할합병6. 주식의 포괄적 교환과 이전7. 영업전부의 양수ㆍ도 또는 금융위원회가 정하여 고시하는 중요한 일부의 양수ㆍ도8. 자산 전부의 처분 또는 금융위원회가 정하여 고시하는 중요한 일부의 처분9. 영업전부의 임대 또는 경영위임, 타인과 영업의 손익 전부를 같이하는 계약, 그밖에 이에 준하는 계약의체결, 변경 또는 해약10. 회사의 해산

5. 변동[변경]사유

변동방법
특별관계자 추가 및 특별관계자의 전환사채 취득에 따른 변동

변동사유
특별관계자 추가 및 특별관계자의 전환사채 취득에 따른 변동

변경사유
특별관계자의 전환사채 취득에 따른 비율 변경

제2부 대량보유내역

1. 보고자 및 특별관계자별 보유내역

가. 주식등의 종류별 보유내역

관 계
성 명(명칭)
생년월일또는사업자등록번호 등
보유주식등의 내역

주 권
신주인수권이표시된것
전환사채권
신주인수권부사채권
교환사채권
증권예탁증권
기타
합 계

의결권있는주식
의결권있는 주식으로상환될주식
의결권있는 주식으로전환될 주식
주수(주)
비율(%)

보고자
(주)지베이스
129-86-85599
5,254,476
-
-
-
-
-
-
-
-
5,254,476
8.97

특별관계자
(주)앱토크롬
114-81-82858
-
-
-
-
27,706,298
-
-
-
-
27,706,298
47.31

(주)에이프로젠바이오로직스
218-81-00518
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-

(주)넥스코닉스
107-88-32631
1,764,694
-
-
-
-
-
-
-
-
1,764,694
3.01

김재섭
630131
888,533
-
-
-
-
-
-
-
-
888,533
1.52

김정출
560511
74,895
-
-
-
-
-
-
-
-
74,895
0.13

박미령
650531
449,271
-
-
-
-
-
-
-
-
449,271
0.77

강선주
730625
13,212
-
-
-
-
-
-
-
-
13,212
0.02

제이드신기술조합제79호
144-80-07926
-
-
-
-
5,392,731
-
-
-
-
5,392,731
9.21

(주)엔투텍
759-88-00172
-
-
-
-
1,869,158
-
-
-
-
1,869,158
3.19

A
a1
a2
B
C
D
E
F
G

H

의결권있는발행주식 총수(I)
보유잠재주식의 수(a1+a2+B+C+D+E+F+G=H)
보유비율(%)

주식등의 보유비율[A+H / I+H-(E+F+G)※] × 100
주권의 보유비율(A / I) × 100

23,594,933
34,968,187
74.13
35.79

※ 교환대상이 주식인 교환사채권, 기초자산이 주식인 증권예탁증권ㆍ파생결합증권 및 자기주식을 교부하는 주식매수선택권 등에 한하여 분모에서 제외하고 보유비율을 산정

나. 보유형태별 보유내역

관계
성명(명칭)
생년월일또는사업자등록번호 등
소유에 준하는 보유(자본시장과 금융투자업에 관한 법률 시행령 제142조) 형태
합계

제1호
제2호
제3호
제4호
제5호
제6호
제7호
주수
비율

보고자
(주)지베이스
129-86-85599
5,254,476
-
-
-
-
-
-
5,254,476
8.97

특별관계자
(주)앱토크롬
114-81-82858
27,706,298
-
-
-
-
-
-
27,706,298
47.31

(주)에이프로젠바이오로직스
218-81-00518
-
-
-
-
-
-
-
-
-

(주)넥스코닉스
107-88-32631
1,764,694
-
-
-
-
-
-
1,764,694
3.01

김재섭
630131
888,533
-
-
-
-
-
-
888,533
1.52

김정출
560511
74,895
-
-
-
-
-
-
74,895
0.13

박미령
650531
449,271
-
-
-
-
-
-
449,271
0.77

강선주
730625
13,212
-
-
-
-
-
-
13,212
0.02

제이드신기술조합제79호
144-80-07926
5,392,731
-
-
-
-
-
-
5,392,731
9.21

(주)엔투텍
759-88-00172
1,869,158
-
-
-
-
-
-
1,869,158
3.19

※ 소유에 준하는 보유(자본시장과 금융투자업에 관한 법률 시행령 제142조) - 제1호 누구의 명의로든지 자기의 계산으로 주식등을 소유하는 경우 - 제2호 법률의 규정이나 매매, 그 밖의 계약에 따라 주식등의 인도청구권을 가지는경우 - 제3호 법률의 규정이나 금전의 신탁계약ㆍ담보계약, 그 밖의 계약에 따라 해당 주식등 의 의결권(의결권의 행사를 지시할 수 있는 권한을 포함한다)을 가지는 경우 - 제4호 법률의 규정이나 금전의 신탁계약ㆍ담보계약ㆍ투자일임계약, 그 밖의 계약에 따라 해당 주식등의 취득이나 처분의 권한을 가지는 경우 - 제5호 주식등의 매매의 일방예약을 하고 해당 매매를 완결할 권리를 취득하는 경우로 서 그 권리행사에 의하여 매수인으로서의 지위를 가지는 경우 - 제6호 주식등을 기초자산으로 하는 법 제5조제1항제2호에 따른 계약상의 권리를 가지 는 경우로서 그 권리의 행사에 의하여 매수인으로서의 지위를 가지는 경우 - 제7호 주식매수선택권을 부여받은 경우로서 그 권리의 행사에 의하여 매수인으로서의 지위를 가지는 경우

2. 보유주식등에 관한 계약

가. 계약 여부

신탁ㆍ담보ㆍ대차ㆍ일임ㆍ장외매매ㆍ공동보유 등 주요계약 체결, 변경 여부

없음

*주요계약 체결ㆍ변경사실 미보고시 해당 미보고분에 대해 의결권이 제한될 수 있음

나. 계약 내용

연번
성명(명칭)
보고자와의관계
생년월일 또는사업자등록번호 등
주식등의종류
주식등의수
계약 상대방
계약의종류
계약체결(변경)일
계약기간
비율
비고

1
(주)지베이스
본인
129-86-85599
의결권있는 주식
666,666
(주)투파스
담보계약
2026.04.30
2026.10.31
1.14
주식담보

2
(주)지베이스
본인
129-86-85599
의결권있는 주식
155,440
에이프로젠아이앤씨(주)
담보계약
2025.07.22
상환시
0.27
주식담보

3-1
(주)지베이스
본인
129-86-85599
의결권있는 주식
693,284
(주)에이프로젠바이오로직스
담보계약
2025.07.23
상환시
1.18
주식담보

3-2
김재섭
특수관계인
630131
의결권있는 주식
888,533
(주)에이프로젠바이오로직스
담보제공계약
2023.02.17
상환시
1.52
주식담보

3-3
(주)지베이스
본인
129-86-85599
의결권있는 주식
449,271
(주)에이프로젠바이오로직스
담보계약
2025.07.22
상환시
0.77
주식담보

3-4
(주)지베이스
본인
129-86-85599
의결권있는 주식
333,333
(주)에이프로젠바이오로직스
담보계약
2024.11.19
상환시
0.57
주식담보

4
(주)앱토크롬
특수관계인
114-81-82858
전환사채권
1,172,332
임정연
전환사채양수도계약
2026.03.31
2026.06.30
2.00
29CB 일부

5
(주)앱토크롬
특수관계인
114-81-82858
전환사채권
2,344,665
(주)투파스
전환사채양수도계약
2026.03.31
2026.06.30
4.00
29CB 일부

6
(주)지베이스
본인
129-86-85599
의결권있는 주식
866,666
블루케이대부
담보계약
2026.05.13
2026.09.27
1.48
주식담보

7
(주)앱토크롬
특수관계인
114-81-82858
전환사채권
3,282,533
(주)하베스트로즈
전환사채양수도계약
2026.05.13
2026.06.30
5.61
27CB

8
(주)지베이스
본인
129-86-85599
의결권있는 주식
466,667
블루케이대부
담보계약
2026.05.08
2026.08.23
0.80
주식담보

9
(주)넥스코닉스
특수관계인
107-88-32631
의결권있는 주식
140,000
수원지방법원성남지원
공탁
2024.11.15
공탁해지시
0.24
납세담보

10
(주)넥스코닉스
특수관계인
107-88-32631
의결권있는 주식
24,000
수원지방법원성남지원
공탁
2025.05.08
공탁해지시
0.04
납세담보

11
제이드신기술조합제79호
특수관계인
144-80-07926
전환사채권
586,166
주식회사 올케이
전환사채 매매 계약
2026.03.23
2026.06.30
1.00
25CB 일부

12
제이드신기술조합제79호
특수관계인
144-80-07926
전환사채권
468,933
주식회사 씨제이컨설팅
전환사채 매매 계약
2026.03.23
2026.06.30
0.80
25CB 일부

13
제이드신기술조합제79호
특수관계인
144-80-07926
전환사채권
304,806
이영수
전환사채 매매 계약
2026.04.30
2026.06.30
0.52
25CB 일부

14
제이드신기술조합제79호
특수관계인
144-80-07926
전환사채권
633,059
이영철
전환사채 매매 계약
2026.05.04
2026.06.30
1.08
25CB 일부

15
제이드신기술조합제79호
특수관계인
144-80-07926
전환사채권
445,486
(주)씨엔컨설팅
전환사채 매매 계약
2026.04.30
2026.06.30
0.76
25CB 일부

16
제이드신기술조합제79호
특수관계인
144-80-07926
전환사채권
984,759
(주)에프앤에프
전환사채 매매 계약
2026.05.07
2026.12.31
1.68
25CB 일부

17
(주)지베이스
본인
129-86-85599
의결권있는 주식
800,000
(주)온리홀딩스대부
담보계약
2026.05.08
2026.11.08
1.37
주식담보

18
(주)지베이스
본인
129-86-85599
의결권있는 주식
300,000
(주)온리홀딩스대부
담보계약
2026.05.14
2026.11.14
0.51
주식담보

19
제이드신기술조합제79호
특수관계인
144-80-07926
전환사채권
797,186
오대희
전환사채 매매 계약
2026.05.18
2026.12.31
1.36
25CB 일부

20
제이드신기술조합제79호
특수관계인
144-80-07926
전환사채권
468,933
변창규
전환사채 매매 계약
2026.05.18
2026.12.31
0.80
25CB 일부

21
제이드신기술조합제79호
특수관계인
144-80-07926
전환사채권
468,933
김병수
전환사채 매매 계약
2026.05.18
2026.12.31
0.80
25CB 일부

22
제이드신기술조합제79호
특수관계인
144-80-07926
전환사채권
234,466
권은자
전환사채 매매 계약
2026.05.18
2026.12.31
0.40
25CB 일부

합계(주식등의 수)
17,976,117
합계(비율)
30.70
-

다. 주요계약이 담보계약인 경우 추가 기재사항

연번
주식등의 수
대출금액
채무자
이자율
담보유지비율
기타

1
666,666
1,700,000,000
(주)지베이스
4.6
140
-

2
155,440
3,000,000,000
(주)지베이스
4.0
150
-

3
2,364,421
37,200,000,000
(주)지베이스
4.0
150
-

6
866,666
4,000,000,000
(주)지베이스
6.0
150
-

8
466,667
400,000,000
(주)지베이스
6.5
150
-

17
800,000
2,000,000,000
(주)지베이스
6.5
-
-

18
300,000
1,000,000,000
(주)지베이스
6.5
-
-

3. 자기계정 및 고객계정별 보유내역(금융기관에 한함)

명칭
보고자와의관계
계정별 내역
합 계

자기계정(주)
비율(%)
고객계정(주)
비율(%)
계(주)
비율(%)

-
-
-
-
-
-
-
-

합 계
-
-
-
-
-
-

제3부 직전보고일 이후 대량변동 내역

1. 변동내역 총괄표

가. 주식등의 변동내역

관 계
성 명(명칭)
생년월일또는사업자등록번호 등
증감주식등의 내역

주 권
신주인수권이표시된것
전환사채권
신주인수권부사채권
교환사채권
증권예탁증권
기타
합 계

의결권있는주식
의결권있는 주식으로상환될주식
의결권있는 주식으로전환될 주식
주수(주)
비율(%)

보고자
(주)지베이스
129-86-85599
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-0.75

특별관계자
(주)앱토크롬
114-81-82858
-
-
-
-
2,618,372
-
-
-
-
2,618,372
0.92

(주)에이프로젠바이오로직스
218-81-00518
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-

(주)넥스코닉스
107-88-32631
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-0.26

김재섭
630131
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-0.12

김정출
560511
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-0.01

박미령
650531
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-0.06

강선주
730625
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-

제이드신기술조합제79호
144-80-07926
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-0.76

(주)엔투텍
759-88-00172
-
-
-
-
1,869,158
-
-
-
-
1,869,158
3.19

2. 세부변동내역

가. 주식등의 세부변동내역

(단위 : 주, 원)

성명(명칭)
생년월일 또는사업자등록번호 등
변동일*
취득/처분방법
주식등의종류
변동 내역
취득/처분단가**
비 고

변동전
증감
변동후

(주)앱토크롬
114-81-82858
2026.05.08
CB인수(+)
전환사채권
25,087,926
2,618,372
27,706,298
4,583
()
30CB 인수(전환가 : 4,583원)

(주)엔투텍
759-88-00172
2026.05.29
CB인수(+)
전환사채권
-
1,869,158
1,869,158
5,350
()
31CB 인수(전환가 : 5,350원)

* 증권시장에서 주식등을 매매한 경우에는 그 계약체결일

** 주식 외의 증권의 경우 해당 증권의 행사(전환ㆍ교환)가액 또는 해당 증권의 권리행사로 취득ㆍ처분하는 주식의 매매단가를 의미하며, ( )의 금액은 해당 증권의 매매단가를 의미

3. 취득에 필요한 자금등의 조성내역

(1) 취득자금등의 개요

(단위 : 원)

성명
생년월일 또는사업자등록번호등
자기자금(H)
차입금(I)
기타(J)
계(H+I+J)

(주)앱토크롬
114-81-82858
12,000,000,000
-
-
12,000,000,000

(주)엔투텍
759-88-00172
10,000,000,000
-
-
10,000,000,000

(2) 취득자금등의 조성경위 및 원천

ㅇ 자기자금의 경우

성명
생년월일 또는사업자등록번호등
취득자금등의 조성경위 및 원천

(주)앱토크롬
114-81-82858
3자배정 유상증자

(주)엔투텍
759-88-00172
보유자금