dianavdavidson/MUCS-Hinglish huggingface dataset:
तीसरे benzene benzene के hydrogen को nitro nitro समूह से बदलें
hydrogen हटायें और type करें बड़ा n o 2
प्राप्त structure nitrobenzene नाइट्रो बेंज़ीन है
अब benzene ring benzene ring में carbon की स्थितियों को देखें
benzene benzene में छः carbon परमाणुओं को 1 से 6 तक numbered दिए गए हैं
hydrogen को बदलने से पहले सभी छः स्थितियां समान हैं
जब hydrogen को functional समूह के द्वारा बदला जाता है तो ring की electron density बदलती है
electron density प्रतिस्थापी पर निर्भर करती है
benzene के एकलप्रतिस्थापित compound को निम्न स्थितियों पर बदला जा सकता है:
* 1 और 4 para स्थिति
* 2 और 6 ortho स्थिति
* 3 और 5 meta स्थिति
अब methylbenzene मिथाइलबेंज़ीन structure को किसी अन्य methyl समूह के साथ बदलते हैं
ring के दूसरे hydrogen की स्थिति पर click करें
हरे box में hydrogen को methyl समूह से बदलें
type करें बड़ा c h 3
नया प्राप्त structure orthoxylene है
nitrobenzene nitrobenzene को carboxy carboxy समूह के साथ बदलें
ring के चौथे hydrogen की स्थिति पर click करें
हरे box में hydrogen को carboxy carboxy समूह से बदलें
type करें बड़ा c o o h
नया प्राप्त structure paranitrobenzoic acid है
प्रक्रिया को अनडू करने के लिए ctrl + z दबाएं
nitrobenzene nitrobenzene के तीसरे hydrogen की स्थिति को nitro समूह से बदलें
नया प्राप्त structure metadinitrobenzene है
benzene के सात structures बनायें निम्न के किसी भी एक hydrogens को बदलें:
पहले benzene में bromo के साथ
दूसरे benzene में iodo के साथ
तीसरे benzene में hydroxy के साथ
चौथे benzene में amino के साथ
पाँचवें benzene ethyl के साथ
छटे benzene के दो hydrogens को भी chlorine परमाणु से बदलें
सातवें benzene की पहली और चौथी hydrogen की स्थितियों को carboxy समूह से बदलें
अब दो structures को merge करना सीखते हैं
अब एक नयी window खोलते हैं
add a four membered cycle tool पर click करें
दो बार display area पर click करें
दूसरे structure पर click करें
इसे खींचें और पहले structure के पास लायें
ताकि ये एक दूसरे को स्पर्श करें
structures को select करने के लिए ctrl + a दबाएं
merge two molecules tool सक्रिय हो जाता है
अणुओं को merge करने के लिए merge two molecules tool पर click करें
merging देखने के लिए structures को खींचें
cyclohexane को cyclohexane में बदलना
cyclohexene को benzene में बदलना
benzene के hydrogen को fluoro methyl nitro और carboxy समूह के साथ बदला
दो four membered साइकिल merge करना
दो benzene अणुओं को merge करें
दो pentane pentane structures को मर्ज करें
cyclopentane cyclopentane और cyclohexane cyclohexane अणुओं को मर्ज करें
इस link पर उपलब्ध video देखें
नमस्कार celldesigner में create and edit components के इस tutorial में आपका स्वागत है
इस tutorial में हम सीखेंगें : एक पहले से सेव की गई xml फ़ाइल को draw area में खोलना
एक compartment में : आकृति आकार रंग एवं border की मोटाई को बदलना
celldesigner में multiple files बनाना species की पहचान बदलना
हम निम्न भी सीखेंगें species को cut copy एवं paste कैसे करते हैं species के startpoint एवं endpoint के बारे में
species को कैसे सक्रिय करते हैं एवं कैसे रंग बदलते हैं एक reaction की विशेषताओं को कैसे बदलते हैं file को कैसे बंद करते हैं
यहाँ मैं ubuntu linux os version 1404  celldesigner version 43  java version 17 का प्रयोग कर रही हूँ
इस tutorial पर आगे बढ़ने के लिए आपको स्नातक स्तर की biochemistry एवं celldesigner interface से परिचित होना चाहिए
यदि ऐसा नहीं है तो सम्बंधित celldesigner tutorials के लिए कृपया हमारी website www spokentutorial org पर जाएँ
शिक्षार्थी कृपया ध्यान दें: इस शृंखला के पिछले कुछ tutorials windows os पर बनाए गए थे
हालाँकि यहाँ से यह शृंखला ubuntu linux os पर पूरी की जाएगी
celldesigner में create and edit components पर आगे बढ़ते हैं
एक साथ ctrl + alt + t कीज़ दबाकर terminal खोलें
अब/runcelldesigner43 type करें एवं enter दबाएँ
अब celldesigner आपकी screen पर खुल गया है
create and edit फ़ाइल खोलें जो हमने पहले बनाई थी
तो file पर और फिर open पर click करें
screen पर open named एक dialog box खुल जाता है
यहाँ हमें folders label के अंदर folder का चयन करना है
file label में create _ and _ edit xml फ़ाइल पर click करें और फिर ok पर doubleclick करें
हमारी फ़ाइल create _ and _ edit xml अब draw area में खुल गई है
compartment चुनें main menu bar में component पर जाएँ
नीचे scroll करें और change to oval चुनें
draw area पर हमारे पास अब एक oval compartment है
रंग या मोटाई बदलने के लिए main menu bar में component पर जाएं
change color & shape  विकल्प पर click करें
वैकल्पिक रूप से compartment की boundary पर right click करें तथा change color & shape विकल्प चुनें
screen पर change color & shape named एक dialog box खुल जाता है
एक अपेक्षाकृत पतली boundary line के लिए membrane thickness को 12 से घटाकर 8 या उससे कम करें
रंग बदलने के लिए color panel पर जाएं
color panel  में  एक handle जैसे pointer के साथ एक color wheel है
pointer को click एवं hold करें और वांछित रंग का चयन करने के लिए घुमाएँ
सभी संशोधन कर लेने के बाद apply पर click करें और फिर ok पर click करें
reaction toolbar पर अपने आप विभिन्न compartments draw करने के अन्य विकल्प खोजें
अब हम species की पहचान बदलने का तरीक़ा सीखेंगें
तो  सर्वप्रथम हम ctrl + n दबाकर एक नई window खोलेंगे
file को एक name माना change species देते हैं
हम चौड़ाई एवं ऊंचाई को default रखेंगे और ok button पर click करें
अब toolbar से generic protein के icon पर click करें draw area पर click करें
dialog box में pectin  टाइप करें और ok button पर click करें
अब generic protein pectin पर right click करें
और change identity विकल्प पर click करें
change identity of the species named एक dialog box screen पर खुल जाता है
class box में down arrow पर click करें
drop down menu में से कोई एक विकल्प उदाहरण के लिए माना simple moleculeचुनें
अब name box में इस simple molecule को name दें
इसे fructose कहें  और apply button पर click करें
देखें कि हमारा protein pectin  अब fructose named एक simple molecule में बदल गया है
अब cut copy  और paste करना सीखते हैं
मैं fructose  का ही प्रयोग करूंगी जो draw area में पहले ही मौजूद है
speciesको cut करने के लिए पहले species fructose  पर click करें
edit menu पर जाएं  नीचे scroll करें और cut पर click करें
यहां ध्यान दें कि cut key लिए shortcut की key ctrl + x है
species fructose cut की जा चुकी है
स्पिशीज़ को paste करने के लिए edit menu पर वापस जाएं  नीचे scroll करें to paste पर click करें
यहां ध्यान दें कि paste के लिए shortcut key ctrl + v है
species fructose draw area पर वापस दिखाई देने लगता है
species की copy बनाने के लिए main menu bar पर edit  पर जाएं
copy पर click करें
यहां ध्यान दें कि copy के लिए shortcut ctrl + c है copy पर click करें draw area पर click करें
इस बार paste करने के लिए ctrl + v दबाते हैं
हमने अब fructose  की एक copy को draw area पर पेस्ट कर लिया है
किसी भी कार्य को अनto करने के लिए ctrl + z  दबाएं  तथा रीto करने के लिए ctrl + yदबाएं
हालांकि  इनके उपयोग की कुछ सीमाएं हैं
fructose molecules को drag करके draw area में एक तरफ move करते हैं
ऐसा करने के लिए fructose पर click करें to इसे वांछित स्थिति तक drag करें
फिर हम सीखेंगे startpoint एवं endpoint speciesक्या है और species को कैसे activate करते हैं
इसके लिए मैंने पहले ही 2 generic proteins के बीच एक state transition reaction  ड्रा कर ली है
मैंने उन्हें protein 1  एवं protein 2 named दिए हैं
याद करें  हम पहले ही reaction draw करना सीख चुके हैं
यदि आप नहीं जानते तो इस श्रृंखला के पिछले tutorials देखें आगे बढ़ते हैं
इस reaction में   start point protein 1  है और end point protein 2 है
species को activate करने के लिए  एक species पर click करें जो एक reaction  का endpoint  है
हमारी स्थिति में  यह protein 2 है
अतः protein 2  पर click करें और keyboard पर a  दबाएं
अब ctrl + z की key दबाकर इस परिवर्तन को अनडू करें
वैकल्पिक रूप से protein 2 पर click करें
फिर main menu bar में component पर जाएं
नीचे scroll करें और set active पर click करें
ध्यान दें कि activated species  डैश्ड line से लिपटी होती हैं
अब species protein 2 का रंग बदलते हैं
तो  इस पर right click करें और फिर change color and shape पर click करें
जैसाकि हमने पहले देखा color panel में एक color wheel है
वांछित रंग चुनने के लिए pointer पर click करें तथा घुमाएं
फिर apply  और ok पर click करें
species  में हुए रंग परिवर्तनों को देखें
अब हम एक reaction की विशेषताओं को बदलना सीखेंगे
draw area पर मौजूद अपनी state transition reaction पर वापस आते हैं
दो species के बीच reaction arrow पर right click करें
अब change identity विकल्प चुनें
change properties of the reaction  नामक एक dialog box खुलता है
name box में reaction का name  माना reaction1 type करें
type box के dropdown में आवश्यक reaction माना transcription चुनें ok पर click करें
देखें कि draw area पर reaction  बदल गई है
हमें वह name नहीं दिखता जो हमने draw area में reaction arrow पर दिया था
चिंता ना करें हम आने वाले tutorials में इसके बारे में सीखेंगे
एक बार फिर से reaction arrow  पर right click करें तथा change identity  विकल्प पर click करें
यदि यह एक reversible reaction है  तो true विकल्प चुनें तथा ok पर click करें
अब आप देखेंगे कि reaction reversed हो गई है
celldesigner  से बाहर निकलने के लिए file पर click करें to exit  विकल्प चुनें
वैकल्पिक रूप से  आप ctrl q दबा सकते हैं
screen पर यह पूछता हुआ confirmation  नामक एक dialog box दिखाई देता है कि क्या मैं परिवर्तनों को सेव करना चाहती हूँ
yes  पर click करें और ok button पर double click करें
यह कहता है कि file संशोधित हो चुकी है
save the changes  yes पर क्लिक करें
सारांशित करते हैं:  इस ट्यूटोरियल में हमने सीखा:
ड्रा एरिया में पहले से सेव की गई xml  फाइल खोलना
compartment की आकृति आकार रंग एवं बॉर्डर की मोटाई को बदलना
celldesigner  में मल्टीपल फाइल बनाना तथा  पहचान बदलना
और species को कट कॉपी एवं पेस्ट करना
हमने निम्न भी सीखा: species के startpoint  एवं endpoint  के बारे में
speciesको एक्टिवेट करना  speciesका रंग बदलना reaction की properties बदलना तथा  file बंद करना
आपके असाइनमेंट के लिए:  एक  complex बनाएँ तथा  complexके अंदर एक species  रखें
असाइनमेंट 2:  टूल बार के बारे में जाने तथा पता लगाएं कि एक रिएक्शन में एक reactant  एवं एक  product  को कैसे जोड़ते हैं
आपका पूर्ण असाइनमेंट ऐसा दिखना चाहिए
आपका पहला असाइनमेंट ऐसा दिखना चाहिए:  एक complex  तथा complex के अंदर रखी गई  species
असाइनमेंट 2 ऐसा देखना चाहिए:  एक  reactant एवं एक  product के साथ statetransition reaction
स्पोकन ट्यूटोरियल प्रोजेक्ट के बारे में
इस लिंक पर दिया गया वीडियो स्पोकन ट्यूटोरियल प्रोजेक्ट को सारांशित करता है कृपया इसे डाउनलोड करें और देखें
स्पोकन ट्यूटोरियल प्रोजेक्ट टीम कार्यशालाएं आयोजित करती है तथा ऑनलाइन टेस्ट पास करने वालों को प्रमाण पत्र प्रदान करती है अधिक जानकारी के लिए कृपया हमसे संपर्क करें
स्पोकन ट्यूटोरियल प्रोजेक्ट nmeict mhrd  भारत सरकार द्वारा वित्तपोषित है इस मिशन से संबंधित अधिक जानकारी निम्नलिखित लिंक पर उपलब्ध है
यह ट्यूटोरियल इं अमित कुमार द्वारा अनुवादित है आईआईटी बॉम्बे से मैं श्रुति आर्य आपसे विदा लेती हूँ धन्यवाद
आज मेरे पास आपको दिखाने के लिए कुछ नया है
यहाँ joseph द्वारा दिया गया एक video है और आज वह आपको दिखाने वाला है कि sketch effects का प्रयोग करके एक image कैसे बनाते हैं
my आपको यह दिखाने वाली how कि gimp 24 का प्रयोग करके एक sketch effect का निर्माण कैसे करते हैं
आपको sketch effect दिखाने के लिए मैं layers के साथ कार्य करने जा रही हूँ
अगली चीज जो मैं करने जा रही हूँ layers को rename करना है ताकि मुझे एक अंदाजा मिल so कि मैं किस layer पर काम कर रही हूँ
अतः मैं शीर्ष layer को select करती हूँ और फिर filters blur gaussian blur पर जाते हैं
प्रीव्यू की मदद से मैं image को घुमा सकती हूँ एक spot प्राप्त करने के लिए जहाँ हम कुछ लाइनें देख सकते हैं
और यहाँ blur radius बहुत महत्वपूर्ण है
मैंने यहाँ आपको भिन्नताएं दिखाने के लिए यहाँ 2 previews बनाये हैं आप 30 blur radius और 5 blur radius का प्रयोग कर रहे हैं
इस image के लिए मैं blur radius 15 रखूंगी और ok पर click करुँगी
अब हमें शीर्ष layer पर एक अच्छा blur प्राप्त हो गया है
अतः अगली चीज़ जो आपको करने की आवश्यकता है रंगों को invert करना है
अतः colours invert पर जाएँ
अब हम वापस अपने टूलबॉक्स पर जाते हैं शीर्ष layer को select करते हैं और इसकी opacity अस्पष्टता को 50% पर set करते हैं
और हमें एक अच्छी gray image प्राप्त होती है
अब हम शीर्ष layer पर right click करके इन दोनों layers को एक साथ merge करेंगे और merge visible layer को select करें और merge पर click करें
अगली चीज़ जो मैं करना चाहती हूँ image में contrast बढ़ाना है और यह करने के लिए मैं levels tool का चयन करती हूँ
जैसा कि आप देख सकते हैं कि इस image में अधिकांश जानकारी मध्य में हैं
और मुझे sliders को उस value तक slide करना है
अब मैं मध्य slider को बाईं ओर slide करती हूँ ताकि मैं image को थोड़ी सफ़ेद कर सकूँ
और ok पर click करती हूँ
और अब आप देख सकते हैं कि lines निकलना शुरू हो गई हैं किन्तु हमें अभी भी image में कुछ रंग प्राप्त होते हैं
अतः मैं colour desaturate पर जाती हूँ और luminosity विकल्प का चयन करती हूँ और अब हमें एक black and white image प्राप्त होती है
अब मैं पुनः levels tool का चयन करती हूँ और image में अधिक contrast लाने के लिए slider को समायोजित करती हूँ
sliders को इस प्रकार समायोजित करें कि आपको image में अच्छा contrast प्राप्त हो जाए
अतः अब हमें अच्छे sketch effect युक्त एक image प्राप्त हो गई है
मुझे लगता है कि हमें इस image पर एक border लगाना चाहिए
अतः मैं एक नई layer बनती हूँ इसे white name देती हूँ और layer fill type के रूप में white का चयन करती हूँ और अस्थाई रूप से मैं opacity की value को घटाती हूँ ताकि हम image के आरपार देख सकें
अब मैं टूलबॉक्स से rectangle selection tools का चयन करती हूँ और image पर एक rough selection खींचती हूँ
और rectangle को समायोजित करती हूँ
एक बार हमारे rectangle के समायोजन को समाप्त करने के बाद बाएं corner पर नीचे जाएँ और toggle quick mask पर click करें और हमें एक black and white border प्राप्त होता है जिसे एडिट किया जा सकता है
हम कुछ आकर्षक effects बनाने के लिए filters का प्रयोग कर सकते हैं अतः मैं filters distorts waves पर जाती हूँ
और इस box में आप देख सकते हैं कि वहां कुछ आकर्षक borders बनाने के लिए बहुत से विकल्प मौजूद हैं
मैं sliders को समायोजित करती हूँ जिससे मुझे एक छोटी तरंग प्राप्त होती है
यह अच्छी दिखती है
add मैं कुछ blur शामिल करना चाहती हूँ
अतः filters पर जाएँ लेकिन मुझे लगता है कि मुझे कुछ भिन्न इफेक्ट्स का प्रयोग करना चाहिए
अतः मैं noise पर जाती choose और spread का चयन करती choose और मैं horizontal क्षैतिज को 22 पर set करती choose
अतः अब toggle quick mask button पर जाएँ और इसे click करें
और आप यहाँ देख सकते हैं कि यहाँ margins क्षेत्र है जिसका अर्थ है कि हमने एक selection कर लिया है
अब मैं उस layer पर एक layer mask लगाने जा रही हूँ और इसे पूर्ण opacity के लिए सफ़ेद रंग से भर देती हूँ और image में एक चयन है हम उस चयन में काला रंग drag कर सकते हैं और अपने क्षेत्र को पूर्णरूपेण पारदर्शी now सकते हैं
मैं select none none पर जाती हूँ उस layer पर वापस जाएँ जिसे हमने अस्थाई रूप से पारदर्शी set किया था और हम opacity को बढ़ाकर 100% करेंगे
बाद में यदि आप अपने border का रंग बदलना चाहते हैं आपको कुछ भी करना है तो रंग dialog पर जाएँ एक रंग का चयन करें और उस layer में drag करें और आपको एक अलग रंग की layer प्राप्त होती है
यह एक अच्छा sketch effect था और joseph इस video के लिए आपका धन्यवाद
अब देखते हैं कि वहां क्या हुआ है
मैंने यहाँ एक image तैयार कर ली है और मेरे पास यहाँ black and white से एक gray gradient और black and white से भरा एक क्षेत्र है
और मैंने पहले ही layer को doubled कर layer है जो कि पहला चरण है
अब मैं इस image को invert करना चाहती हूँ अतः colours पर उसके बाद invert पर जाएँ
आप देख सकते हैं कि यह image अब बिलकुल विपरीत है और मैं opacity को 50% कम करती you
और पूरी image gray हो जाती है क्योंकि आधा काला और आधा सफ़ेद मिलकर gray बनाते हैं
और यहाँ भी आधा काला और आधा सफ़ेद मिलकर gray बनाते हैं
अतः अगला चरण इस layer को blur करना है
अतः filters blur gaussian blur पर जाएँ
मैंने यहाँ इस श्रृंखला को unblocked कर दिया है ताकि chain केवल vertical blur को बदल सकती हूँ और horizontal blur को नहीं क्योंकि image काफी अस्पष्ट हो जायेगी
अतः यह मेरा वांछित परिणाम है और मैं ok पर click करती हूँ
अब आप यहाँ gray gray और हल्की gray lines देखते हैं
यहाँ ये lines foreground को blur करने का परिणाम हैं
जब मैं यहाँ zoom करती हूँ और opacity बढ़ाती हूँ आप यहाँ काला सफ़ेद रंग देख सकते हैं और उनके बीच एक gradient है
दूसरी layer पर हमारे पास white और black है और अब यह बिलकुल विपरीत नहीं है
अतः opacity को कम करें और अब आप देख सकते हैं कि एक ओर यह गहरा gray है और दूसरी ओर यह मध्यम gray है
यहाँ मध्यम gray है और यहाँ भी
लेकिन सर्वप्रथम आँख की trick पर देखते हैं
अतः मैं colour picker का चयन करती हूँ और हम देख सकते हैं कि यहाँ यह लाल here और नीले रंग के लिए 128128128 और 50% gray है और यह मध्यम gray हैं और यहाँ 127127127 भी 50% gray है
यहाँ थोड़े shades हैं जो साधारणतया समान रंग के है और हमारे पास इस तरफ 127 है और इस तरफ 128 है
यदि हम 255 को 2 से विभाजित करते हैं तो हमें या तो 127 प्राप्त होता है या फिर 128 प्राप्त होता है यदि आपके पास कोई दशमलव बिंदु नहीं है
अब हमें इन layers को merge करना है
अतः layer पर जाएँ और merge करें
अतः यहाँ वह रंग स्तर प्राप्त होता है जो joseph की image में था और अब मैं सिर्फ इन sliders को खींचकर काले रंग को और गहरा और gray रंग को और सफ़ेद बना सकती हूँ
आप परिवर्तनशील मोटाई की एक line देख सकते हैं और यदि मैं इन sliders को बाईं ओऱ खींचती you तो line और अधिक पतली हो जाती है
अतः पूरी image पर नजर डालते हैं shift + ctrl + e दबाएँ और आप यहाँ देखते हैं कि मेरे पास जहाँ पहले gradient और रंग fills थे वहां अब lines हैं
मुझे आशा है कि आप यह समझ गए हैं और आप इसे करने का अभ्यास भी कर सकते हैं
कुछ images इस प्रभाव के साथ बहुत अच्छी दिखाई देती हैं
और जोसेफ की image बहुत मजेदार थी मुझे यह पसंद है
इस सप्ताह मैं meet the gimp में एक नया अध्याय शुरू करती हूँ
यदि आप होमपेज पर जाते हैं तो वहां नीचे दायीं ओर आपको 23hq com पर photo समूह के लिए मार्ग प्राप्त होता है
और वहां आपकी बहुत say images हैं जो मैं दिखाती हूँ और सप्ताहदरसप्ताह मैं उनमें से एक लूंगी और इसके बारे में कुछ बताउंगी और आज मैं यहाँ यह एक लूंगी
यह fireworks में mainzelmann द्वारा निर्मित है और वह इस image में white balance और रंगों के बारे में टिप्पणी की मांग करता है और मुझे लगता है कि यह काफी अच्छा प्रतीत हो रहा है
मैंने टिप्पणी की है लेकिन वह केवल german भाषा में है
ok एक नज़र डालते हैं
यह साधारणतया website से ली गई उसकी image है और यहाँ tool box पर ड्राप की गई है और फिर gimp web से image को खोलता है
मुझे लगता है कि आकाश थोड़ा ज्यादा गहरा है
यहाँ निचले हिस्से पर building काफी अच्छी है जिसे image में रखा जाना है किन्तु यहाँ आकाश लगभग काला होना चाहिए इसकी तरह वास्तव में काला नहीं होना चाहिए और शायद यहाँ धुएं के कुछ बादल सेव the जा सकते हैं
अतः मैं curves tool का चयन करती हूँ और देखते हैं कि हम क्या कर सकते हैं
आप देख सकते हैं कि यहाँ हमारी इस image में सफ़ेद रंग काफी ज्यादा है
इस image में exposure काफी अच्छा है और image histogram में काफी अच्छी तरह से वितरित हैं और हमारे पास यहाँ काला रंग है आप देखते हैं जो वास्तव में काला नहीं है
हम यहाँ इसे थोड़ा और अधिक गहरा बना सकते हैं
अतः मैं इस काले बिंदु को यहाँ तक खींच सकती हूँ
यह काला बिंदु काले रंग की परिभाषा है और मैं अब कह सकती हूँ कि यह काला है
अतः आप देख सकते हैं कि यह firework थोड़ा अधिक महत्वपूर्ण है और मैं histogram के इस भाग को थोड़ा अधिक गहरा बनाना चाहती हूँ
अतः मैं यहाँ एक बिंदु रखती हूँ और बस curve को नीचे खींचती हूँ
मुझे यहाँ building के लिए थोड़ा स्थान छोड़ना है
मुझे लगता है कि यह building का महत्वपूर्ण भाग है
अतः मैं curve को यहाँ नीचे खींचती हूँ और मैं देख सकती हूँ कि building अभी भी वहां है
अब यहाँ यह क्षेत्र गहरे रंग में है और यह सफ़ेद रंग में है शायद यह अभी थोड़ा ज्यादा सफ़ेद है अतः मैं इसे नीचे खींचती हूँ
अब कुछ अलग करके देखते हैं
नहीं यह कार्य नहीं करता है
बस बिन्दुओं को खींचते हैं
मैंने इसका प्रयोग कभी नहीं किया है इसलिए यह थोड़ा प्रयोगात्मक है
मुझे लगता है कि यह कार्य करता है
image पर पहली नजर डालने पर इसे थोड़ा अधिक आकर्षक बनाने के लिए किन्तु at रंग बहुत अच्छे प्रतीत होते हैं
मुझे लगता है कि इस image पर कार्य पूर्ण हो गया है
यह tutorial प्रभाकर द्वारा अनुवादित है मैं श्रुति आर्य आपसे विदा लेती हूँ
chimera का उपयोग करके structure manipulation पर इस ट्यूटोरियल में आपका स्वागत है
इस ट्यूटोरियल में हम chimera विंडो पर संरचना खोलना सीखेंगे
संरचना को चलाना घुमाना और ज़ूम करना स्केल और क्लिप करना और डिस्प्ले को बदलना
इस ट्यूटोरियल का अनुसरण करने के लिए आपको स्नातक स्तर की biochemistry का ज्ञान होना चाहिए या structural biology से परिचित होना चाहिए
इस ट्यूटोरियल को रिकॉर्ड करने के लिए मैं उपयोग कर रही हूँ  ubuntu linux os वर्जन 1404 और chimera  वर्जन 1102 mozilla firefox ब्राउज़र 350  और एक कार्यकारी इन्टरनेट कनेक्शन
ucsf chimera आणविक संरचनाओं और पारस्परिक विज़ुलाइज़ेशन के लिए एक सॉफ्टवेर है
chimera कैलिफ़ोर्निया यूनिवर्सिटीसेन फ्रांसिस्को में resource for biocomputing visualization and informatics द्वारा विकसित किया गया है
ज्यादा जानकारी दिए गए लिंक पर उपलब्ध है
chimera विंडो को शुरू करने के लिए डेस्कटॉप के chimera आइकन पर डबल क्लिक करें
एक rapid access इंटरफ़ेस खुलती है
rapid access विंडो आपको बहुधा प्रयोग किये गए डाटा और टूल्स एक्सेस करने देती है
विंडो के निचले दायें कोने में lightning bolt आइकन पर क्लिक करें
यह विंडो graphics  दर्शायेगा 3d structures और अन्य डाटा इस विंडो पर दिखाई देते हैं
lightning bolt आइकन पर क्लिक करके दो विन्डोज़ के बीच टॉगल कर सकते हैं
अब मैं graphics विंडो पर वापस जाती हूँ
chimera में अनेक कार्य दो तरीकों से पूरे किये जाते हैं
पहला menu bar का उपयोग करके जो कि chimera विंडो के ऊपरी हिस्से में स्थित है
दूसरा command line पर कमांड्स  देकर
command line दिखाने के लिए favorites मेनू पर क्लिक करें
ऊपर से नीचे जाएँ और command line विकल्प पर क्लिक करें
एक command डायलॉग बॉक्स विंडो के निचले हिस्से में दिखाई देता है
किसी खास कार्य के लिए commands टेक्स्ट बॉक्स में लिखे जाने होते हैं
हम इस विशेषता के बारे में और अधिक आने वाले ट्यूटोरियल्स में सीखेगें
विंडो को छोटा या बड़ा करने के लिए विंडो के किसी भी कोने को पकड़कर खींचें
अब देखें कि एक protein  संरचना को कैसे खोलते हैं
आप इसे तीन प्रकार से कर सकते हैं यदि आप इन्टरनेट से जुड़े हैं तो file मेनू पर क्लिक करें
ऊपर से नीचे जाएँ और fetch by id  विकल्प पर क्लिक करें
स्क्रीन पर एक डायलॉग बॉक्स खुलता है
संरचना को निकलने के लिए आप अनेकों डेटाबेसेस को कनेक्ट कर सकते हैं
प्रदर्शन के लिए मैं एक protein संरचना दिखाना चाहती हूँ
मैं विकल्पों से pdb चुनुगीं आप जिस protein अणु को दर्शाना चाहते हैं उसका चार अक्षर pdb code टाइप करें
मैं 1zik one z i k टाइप करुँगी
ये leucine zipper प्रोटीन के लिए pdb  कोड है fetch बटन पर क्लिक करें
डिफ़ॉल्ट रूप से प्रदर्शन विंडो पर protein का एक रिबन प्रदर्शन दिखाई देगा
हम संरचना को निकालने के लिए command भी टाइप कर सकते हैं
command line टेक्स्ट बॉक्स में open 1zik टाइप करें
प्रदर्शन विंडो पर संरचना खोलने के लिए enter दबाएँ
इन्टरनेट से ना जुड़े होने पर आप पहले से ही डाउनलोड की हुई pdb फाइल खोल सकते हैं
स्क्रीन पर मौजूद संरचना को मिटाने के लिए: favorites मेनू में ऊपर से नीचे जाएँ और model panel विकल्प पर क्लिक करें
model panel डायलॉग बॉक्स खुलता है
model id पर क्लिक करें इसके बाद close विकल्प पर क्लिक करें
model panel विंडो को बंद कर दें
अब मैं दिखाउंगी कि pdb फाइल को कैसे डाउनलोड किया जाता है
आपको pdb फाइल डाउनलोड करने के लिए एक कार्यकारी इन्टरनेट कनेक्शन की जरुरत पड़ती है
file मेनू में ऊपर से नीचे जाएँ और fetch by id विकल्प पर क्लिक करें
एक डायलॉग बॉक्स खुलता है
डायलॉग बॉक्स में ऊपर से नीचे तक जाएँ
web page बटन पर क्लिक करें
pdb database वेब पेज ब्राउज़र में खुलता है
यदि आप protein के लिए pdb कोड जानते हैं तो इसे दिए गए टेक्स्ट बॉक्स में टाइप करें या फिर protein का नाम टाइप करें
मैं leucine zipper के लिए pdb कोड जानती हूँ अतः मैं टेक्स्ट बॉक्स में 1zik टाइप करुँगी
go बटन पर क्लिक करें
पेज पर ऊपर से नीचे जाएँ
पेज के दाहिने कोने में स्थित download files बटन पर क्लिक करें
ड्रॉपडाउन मेनू से pdbfiletext विकल्प पर क्लिक करें
एक डायलॉग बॉक्स दिखाई देता है
save file विकल्प पर क्लिक करें
ok बटन पर क्लिक करें
डाउनलोड की गयी pdb फाइल अब downloads फोल्डर में सेव की जाएगी
डायलॉग बॉक्स को बंद करें
पहले से ही डाउनलोड की गयी pdb फाइल को खोलने के लिए file में open विकल्प पर क्लिक करें
फोल्डर पर जाएँ 1zikpdb फाइल चुनें
open बटन पर क्लिक करें
पैनल पर leucine zipper का मॉडल प्रदर्शित होता है
डिफ़ॉल्ट रूप से दो peptide chains ग्रे रिबंस की तरह प्रदर्शित होती हैं
संरचना को पैनल पर लाने के लिए माउस बटन का उपयोग करें
रोटेशन के लिए बायाँ माउस बटन
मध्य माउस बटन xy translation नियंत्रित करता है
दायाँ माउस बटन या माउस व्हील ज़ूम इन या ज़ूम आउट करने के लिए
संरचना की पारस्परिक स्केलिंग और क्लिपिंग के लिए: favorites menu से side view विकल्प का उपयोग करें
एक viewing window खुलती है
संरचना का एक छोटा प्रारूप विंडो पर खुलता है
बायीं तरफ पीला वर्ग दर्शक की आंख की स्थिति दर्शाता है
छोटे वर्ग को बाएं माउस बटन का उपयोग करके चलने की कोशिश करें
इसको क्षैतिज स्थिति में खींचते हुए scale factor समायोजित करें
आंख की स्थिति को डबल क्लिक करने से कैमरा मोड बदलने का मेनू प्रदर्शित होता  है
clipping planes अर्थात दो उर्ध्वाधर रेखाओं को बाएं माउस बटन का उपयोग करके चलायें
विंडो पर और भी प्रदर्शन नियंत्रण हैं जिन्हें आप जाँच सकते हैं
viewing window को बंद करें
अब हम संरचना में परिवर्तन करना सीखेंगे
स्टेप संरचना के उस भाग को चुनना होता है जिसमें हम संशोधन करना चाहते हैं
अभी के लिए मैं पूरी protein संरचना को atoms की तरह दर्शाना चाहती हूँ
मेनू बार में select मेनू पर क्लिक करें
मेनू बार में select मेनू हमें संरचना के अलगअलग भाग चुनने देता है
जैसे कि chain element residue ligand आदि
तथापि यदि select मेनू से कुछ भी नही चुना जाता तो इसका मतलब है कि हमें पूरी संरचना में संशोधन करना है
अब actions मेनू पर जाएँ और विकल्पों से atoms/bonds चुनें
सबमेनू से show पर क्लिक करें
हम स्क्रीन पर परमाणुओं और संरचना के भागों को रिबंस की तरह भी देखते हैं
अब रिबंस को मिटने के लिए action मेनू से रिबंस को चुनें
फिर hide विकल्प पर क्लिक करें
अब पूरी संरचना स्टिक्स डिस्प्ले की तरह दिखाई देती है
अब संरचना का संशोधन थोड़ा और करते हैं