Molecular Epidemiology of Campylobacter spp. in Broiler Meat and Quantitative Modeling of the Risk of Human Campylobacteriosis in the Egyptian Se Molekylär karaktärisering av Campylobacter spp. i kyckling och kvantitativ modellering av risk för human campylobacterios i Egypten Campylobacterios orsakas av bakterien Campylobacter. Detta är en zoonotisk bakterie, det vill säga den kan spridas mellan djur och människa. Sjukdomen är troligtvis den vanligaste bakterieorsakade diarrésjukdomen globalt sett och orsakas vanligtvis av livsmedel som förorenats med bakterien. Patienter som insjuknar i campylobacterios kan även drabbas av den allvarliga komplikationen Guillain-Barré. Detta syndrom kännetecknas av förlamning i armar och ben som tilltar under loppet av några dagar och orsakas av akut inflammation i perifera nerver och nervrötter. Det livsmedel som vanligen associeras med campylobacterios är kyckling. I en slaktkycklingbesättning kan majoriteten av slaktkycklingarna vara infekterade med Campylobacter utan att visa några som helst symptom. Detta gör det omöjligt att avgöra vilka djur i flocken som kan utgöra smittrisker för människa utan bakteriell provtagning av varje individ. Detta är dock både en praktisk och ekonomisk omöjlig strategi, både för hög- och låginkomstländer. Resultat från tidigare studier utförda i Egypten visar att incidenstalet, det vill säga antalet nya insjuknanden som uppträder per enhet persontid, är 0,6 episoder av diarré per personår. Detta är det högsta incidenstalet som har rapporterats från ett låginkomstland och tyder på, trots att rapporteringen brister i flera låginkomstländer, att sjukdomen har stor påverkan på folkhälsan i Egypten. Ytterligare studier från Egypten visar att de personer som drabbades av komplikationen Guillain-Barré framförallt var unga personer och att de allra flesta av dem var infekterade med olika undertyper av Campylobacter-bakterier. I ett land såsom Egypten, där i jämfört med andra länder en stor andel av befolkningen drabbas av sjukdomen, är de socio-ekonomiska konsekvenserna av campylobacterios stor. Ett exempel på detta kan vara nedsatt inkomst hos den fattiga delen av befolkningen på grund av oförmåga att arbeta under sjukdomsperioden, samt kostnader orsakade av långvarig sjukhusvistelse vid fall av Guillain-Barré. Syftet med projektet är att få ökade kunskaper om själva bakterien och dess spridning i livsmedelskedjan i Egypten för att kunna föreslå lämpliga åtgärder för att på sikt minska sjukdomens betydelse i landet. I projektet kommer en kombination av mikrobiell övervakning, avancerad sekvensbaserad karaktärisering av bakterien och mikrobiell riskvärderingsverktyg att användas. På så sätt kommer vi att kunna få ökade kunskaper om den molekylära epidemiologin kring Campylobacter hos slaktkyckling och dess kött. Vi kommer även att kunna kvantifiera folkhälsorisker vid konsumtion av kyckling i Egypten. Konsumtion av kyckling är den vanligaste smittvägen även i Egypten. Resultat som erhålls inom projektet kommer att kunna användas generellt, det vill säga kommer att kunna appliceras även i andra låginkomstländer med liknande förutsättningar. Det gäller både specifikt för Campylobacter likväl som för andra zoonotiska bakterier som sprids i livsmedelskedjan. Finansieringen för projektet kommer att användas för att stärka forskningskapaciteten och internationellt samarbete mellan forskare inom livsmedelssäkerhet, primärt för forskare från Alexandria universitetet i Egypten och Sveriges lantbruksuniversitet i Sverige. I projektet kommer forskningsutbyte, teoretiska kurser, praktisk träning, utförande av konkreta projekt och publicering av forskningsresultat att ingå. Projektets relevans är mycket stor med tanke på den stora påverkan livsmedelsburna sjukdomar har, inte bara i form av personligt lidande orsakat av sjukdomen utan även ur ett ekonomiskt perspektiv. Sjukdomen har stor ekonomisk påverkan i fattiga hushåll, men även i ett större samhällsperspektiv, till exempel i form av arbetsförlust och ökade kostnader för hälsovård. Campylobacter is one of the most common bacterial zoonotic pathogens worldwide. In Egypt, previous research reported an incidence of Campylobacter diarrhea of 0.6 episodes per person-year, which was concluded as the highest incidence rate ever reported from a developing country. One complication associated with Campylobacter diarrhea is Guillain-Barre´ Syndrome (GBS), an acute, symmetric, ascending paralysis. Recent Egyptian data suggested that GBS cases were primarily in the young aged and cases and many controls had a history of infection to a variety of Campylobacter serotypes. In hyperendemic settings such as in Egypt, the socio-economic burden of illnesses associated with Campylobacter is substantial. In this project we aim to integrate microbiological surveillance data, sequence-based subtyping, and probabilistic risk assessment modeling tools together to investigate the molecular epidemiology of Campylobacter in the broiler meat, the most important source of human campylobacteriosis, and to quantitatively assess the public health burden of human campylobacteriosis arising from consumption of broiler meat in Egypt. The research approach of this project could be adopted as a model for investigating other zoonotic pathogens in developing countries. The project fund will be directed toward enhancing personnel capacities and institutional collaboration between food safety researchers from Alexandria University in Egypt and the Swedish Agricultural University in Sweden.