An epidemiological tool for surveillance of virulence and resistance in environmental indicator bacteria. Ett epidemiologiskt verktyg för övervakning av virulens och resistens hos indikatorbakterier i miljön. Ytvatten kan innehålla bakterier som härrör från tarmfloran hos människor och djur. Dessa bakterier kan nå ytvattnet via avloppsvatten från sjukhus och kommuner eller via naturgödsel och eftersom framför allt avloppsvatten utgör en viktig reservoar för sjukdomsframkallande och/eller antibiotikaresistenta bakterier är det mycket allvarligt om en vidare spridning till dricksvatten sker. Målsättningen med projektet är att utvärdera en kombination av nya, förenklade metoder för att med begränsade laboratorieresurser studera spridning av sjukdomsframkallande och/eller resistenta bakterier från avloppsvatten eller naturgödsel till ytvatten och vidare till livsmedelskedjan i ett samhälle (León) i Nicaragua. Vi kommer att ta prover från avlopp, gödsel, ytvatten och dricksvatten i León, Nicaragua. Proverna skall analyseras med molekylärbiologiska metoder (PCR, qPCR) för förekomst av diarréframkallande kolibakterier (E.coli), och screenas för förekomst av antibiotikaresistenta indikatorbakterier (Enterokocker och kolibakterier) och diversiteten hos dessa bestäms med hjälp av på KI utvecklade förenklade mikroplattbaserade screeningmetoder (AREB och PhP). Resultat av projektet blir en enkel standardiserad metod för provtagning och analys av spridning av kliniskt relevanta bakterier i miljön. Vi kommer också att få information om huruvida antibiotikaresistenta bakterier i avlopp/gödsel speglar resistensläget hos bakterier hos människa och djur, samt om avloppsvatten innehåller en pool av resistenta bakteriestammar som kan spridas i samhället. Våra data kan också få stor betydelse för framtida åtgärder då det gäller säker hantering av avloppsvatten och andra avfallsprodukter som innehåller stora mängder bakterier i denna typ av samhällen. Våra erfarenheter skall bl.a. presenteras vid två kurser som vi ämnar hålla i Nicaragua i slutet av projektet. Kurserna kommer att vara öppna för deltagare från de latinamerikanska länderna. Kurserna kommer att bilda ett embryo till en framtida harmonisering av de viktiga ansträngningarna att minska (diarré)sjukdomar hos fr. a. barn och att minska spridningen av antibiotikaresistens i u-land. Public health protection requires safe drinking water, which must be free of pathogenic bacteria. Bacterial contamination of drinking water may be due to fecal contamination either from human and/or warm-blooded animals, or to bacteria from the soil. Indicator bacteria (e.g. E. coli or Enterococcus spp.) have been used for many years to monitor and to determine the quality and safety of water for consumption. In this collaborative study, we propose to evaluate new simplified methods for and to determine the extent of risk factors due to contamination of water used for consumption, and to investigate sewage from the community and from the hospital as potential vehicles of spread of pathogenic bacteria and antibiotic resistance in bacteria in a Nicaraguan community. By analyzing indicator bacteria, particularly E. coli and Enterococci, with the aid of biochemical fingerprinting (PhenePlate system), screening for antibiotic resistance (AREB system) and molecular (PCR or qPCR) analysis we will be able to monitor the presence of antibiotic resistant or pathogenic strains, and to follow the spread of bacteria from animals/humans to surface and well water. Our results and experiences will be presented in two courses in Leon, Nicaragua, open to Latin-American countries. This spread knowledge will form an embryo to increased measures against infant (diarrheal) diseases due to poor hygienic conditions as well as to the global galloping spread of antibiotic resistance.