A smart surveillance strategy for carbapenem-resistant Pseudomonas aeruginosa Une stratégie de surveillance intelligente pour le bacille pyocyanique résistant aux carbapénèmes Pseudomonas aeruginosa is a bacteria that causes severe infections in hospitalized patients. The worldwide emergence of carbapenem-resistant P. aeruginosa (CR-PA) makes infections by these pathogens almost untreatable. The World Health Organization now ranks CR-PA highest in the list of urgent threats. Information for action to prevent further emergence has to come from insight into sources and transmission routes through smart surveillance. 

The aim of this project is to develop a globally applicable smart surveillance strategy to guide action against the spread of CR-PA. Since P. aeruginosa prefers moist niches, the focus will be on the human-water interface. First, highly sensitive methods to detect CR-PA in specific environmental and human niches will be developed. Subsequently, CR-PA will be collected in three study sites with increasing prevalence of CR-PA, increasingly warmer climates, and different water situations (Rotterdam in The Netherlands; Rome, Italy; and Jakarta, Indonesia). The study will search for CR-PA in a variety of niches outside and inside the hospital and in healthy humans and hospitalized patients. Whole genome sequencing will compare the CR-PA from different sources and identify transmission routes. The project will provide insight into how the different potential reservoirs of CR-PA contribute to its spread in different settings. This knowledge will be used to develop a globally-applicable surveillance strategy for CR-PA to guide preventive actions.

This is one of five IDRC-funded projects developed through the Joint Programming Initiative on Antimicrobial Resistance (JPIAMR), an international platform that coordinates global funding to support collaborative research and action on antimicrobial resistance. Through the JPIAMR, IDRC has partnered with 18 other donor agencies to fund innovative research on diagnostics and surveillance strategies, tools, and technologies that can be used to detect and monitor antimicrobial resistance in human, animal, and environmental settings, particularly in low and middle-income countries. Le bacille pyocyanique est une bactérie qui provoque des infections graves chez les patients hospitalisés. L’émergence mondiale du bacille pyocyanique résistant aux carbapénèmes rend les infections par ces agents pathogènes presque impossibles à traiter. L’Organisation mondiale de la santé classe maintenant le bacille pyocyanique résistant aux carbapénèmes en tête de la liste des menaces urgentes. Par ailleurs, les renseignements concernant les mesures à prendre pour prévenir la propagation de la bactérie doivent provenir d’une meilleure connaissance des sources et des voies de transmission grâce à une surveillance intelligente. 

L’objectif de ce projet est d’élaborer une stratégie de surveillance intelligente applicable à l’échelle mondiale pour orienter les mesures à prendre contre la propagation du bacille pyocyanique résistant aux carbapénèmes. Comme cette dernière préfère les niches humides, l’accent sera mis sur le rapport homme-eau. Tout d’abord, on élaborera des méthodes très sensibles pour détecter le bacille pyocyanique résistant aux carbapénèmes dans des niches environnementales et humaines précises. Par la suite, le bacille pyocyanique résistant aux carbapénèmes sera recueilli dans trois sites  où la prévalence de cette bactérie est en augmentation, où le climat est de plus en plus chaud, et où l’on retrouve différentes situations hydriques (Rotterdam, Rome, et Jakarta). L’étude recherchera le bacille pyocyanique résistant aux carbapénèmes dans diverses niches à l’intérieur et à l’extérieur de l’hôpital, et chez les humains en bonne santé et les patients hospitalisés. Par ailleurs, le séquençage du génome entier permettra de comparer le bacille pyocyanique résistant aux carbapénèmes qui provient de différentes sources, et de déterminer les voies de transmission. Enfin, le projet permettra de comprendre la façon dont les différents réservoirs potentiels contribuent à sa propagation dans différents milieux. 

Il s’agit de l’un des cinq projets financés par le CRDI qui ont été élaborés dans le cadre de Joint Programming Initiative on Antimicrobial Resistance (JPIAMR), une plateforme internationale qui coordonne le financement mondial pour appuyer la recherche et l’action concertées sur la résistance aux antimicrobiens. Par l’intermédiaire du JPIAMR, le CRDI s’est associé à 18 autres organismes donateurs pour financer des recherches novatrices sur les stratégies, les outils et les technologies de diagnostic et de surveillance pouvant servir à la détection et au suivi de la résistance aux antimicrobiens chez les humains, les animaux et dans l’environnement, en particulier dans les pays à revenu faible et à revenu intermédiaire.