Screening antibiotic resistance genes in wastewater: resistance mechanisms and AMR control approach in the West Bank Dépistage des gènes de résistance aux antibiotiques dans les eaux usées : mécanismes de résistance de la RAM en Cisjordanie Antimicrobial resistance (AMR) poses a significant threat to public health globally, exacerbated by zoonotic epidemic risk (diseases which originate in animals and are passed to humans), climate change and the release of antibiotic-resistant bacteria and genes into the environment. This project aims to establish an effective AMR surveillance system in the West Bank by adopting a One Health (combining animal, human and ecological health) approach and leveraging advanced techniques. 

The study aims to assess the frequency, distribution and hotspots of AMR, investigating the impact of urbanization and food production on AMR, identifying pathways of AMR transmission, and developing interventions to disrupt its spread. The methodology involves wastewater-based surveillance as a cost-effective method for monitoring AMR at the population level. Culture-based screening will be performed to confirm and characterize the identified resistance mechanisms in sewage samples. Additionally, a survey targeting human and veterinary laboratories will be conducted to determine the prevalence of resistant pathogens. 

The project will assess the impact of urbanization and intensive food production on AMR, particularly in slaughterhouse wastewater and animal manure used as fertilizer. Informed by surveillance data, future water and sanitation interventions can be crucial in preventing the transmission of antibiotic-resistance genes, antibiotic-resistant bacteria and the spread of antibiotic residues across humans, animals, the environment and the food supply chain.

Through collaboration with local partners and in-house training on research, this project will implement water and sanitation interventions as part of the comprehensive approach to tackle AMR. Additionally, the project will utilize advanced technology to gather and analyze genetic data, which will be shared through a public dashboard, promoting collaboration between the academic sector, government agencies and NGOs. Project results will inform evidence-based interventions and policy recommendations to mitigate the spread of AMR, ultimately contributing to improved public health outcomes. La résistance aux antimicrobiens (RAM) constitue une menace importante pour la santé publique à l’échelle mondiale, exacerbée par le risque d’épidémies zoonotiques (maladies d’origine animale transmises aux humains), les changements climatiques et la dissémination dans l’environnement de bactéries et de gènes résistants aux antibiotiques. Ce projet vise à mettre en place un système efficace de surveillance de la résistance aux antimicrobiens en Cisjordanie en adoptant une approche « One Health » (Une seule santé), combinant la santé animale, humaine et écologique, et en tirant parti de techniques de pointe. 

L’étude vise à évaluer la fréquence, la distribution et les points névralgiques de la RAM, à étudier les répercussions de l’urbanisation et de la production alimentaire sur la RAM, à déterminer les voies de transmission de la RAM et à mettre au point des interventions visant à enrayer sa propagation. La méthodologie implique une surveillance basée sur les eaux usées comme méthode rentable de contrôle de la RAM à l’échelle de la population. Un dépistage basé sur la culture sera effectué afin de confirmer et caractériser les mécanismes de résistance déterminés dans les échantillons d’eaux usées. 

Le projet évaluera les répercussions de l’urbanisation et de la production alimentaire intensive sur la RAM, en particulier dans les eaux usées des abattoirs et le fumier animal utilisé comme engrais. Sur la base des données de surveillance, les futures interventions dans le domaine de l’eau et de l’assainissement peuvent jouer un rôle crucial dans le cadre de la prévention de la transmission des gènes de résistance aux antibiotiques, des bactéries résistantes aux antibiotiques et de la propagation des résidus d’antibiotiques chez les humains, les animaux, dans l’environnement et dans la chaîne d’approvisionnement alimentaire.

Ce projet mettra en œuvre des interventions dans le domaine de l’eau et de l’assainissement dans le cadre d’une approche globale de la lutte contre la RAM. En outre, le projet utilisera des technologies de pointe pour collecter et analyser les données génétiques, qui seront mutualisées au moyen d’un tableau de bord public, favorisant ainsi la collaboration entre le secteur universitaire, les agences gouvernementales et les organisations non gouvernementales. Les résultats du projet serviront de base à des interventions fondées sur des données probantes et à des recommandations politiques visant à limiter la propagation de la résistance aux antimicrobiens.