Förbättrad identifiering av lungtuberkulos genom sputumfri diagnostik, transkriptomik och bakteriell metagenomik i ett högendemiskt område - Optimizing tuberculosis case finding by a step wise approach using host transcriptomics, bacterial metagenomics and sputum free sampling adopted Årligen insjuknar omkring 10 miljoner och nära 1.4 miljoner dör i tuberkulos (tbc) vilket är en sjukdomsom oftast drabbar lungorna. WHO uppskattar att åtminstone 3 miljoner människor med tbc förblir odiagnostiserade vilket är en reservoar för fortsatt smittspridning. Vi har utvecklat en snabb och tillförlitlig klinisk graderings-skala – TBscore – som är utvecklad förhögendemiska länder och i en klinisk studie i Etiopien nyligen visat att man genom användning av TBscore fyrfalt kan öka andelen smittsamma fall som diagnosticeras. I denna studie identifierades dock att en viktig faktor för att öka andelen fall vore att förbättra befintliga diagnostiska metoder. Vårt övergripande syfte är därför att bygga vidare på tidigare samarbeten och utföra en klinisk studie i två högendemiska länder för tbc där vi vetenskapligt utvärderar förbättrade strategier för tidig identifiering och förbättrad diagnosik av tbc.Vi föreslår nu en klinisk studie vid vårdcentraler i Etiopien och Guinea Bissau under 2023-25 där vijämför standardiserad diagnostik med lungröntgen och mikroskopi med en optimerad diagnostiskstrategi. Denna strategi innebär förbättrad sputumprovtagning och analys, sputum-fri analys med hjälp av en mask samt nya molekylärbiologiska tekniker som anpassas efter områden med begränsade resurser. Som utvärdering mäts i första hand skillnad i antal tbc-patienter somdiagnosticeras och behandlas före och efter införandet av den optimerade strategin. En central del av projektet som alla ingående samarbetsländer  kommer att ha stor nytta av är uppbyggnaden och bibehållandet av kapacitet för attdriva större kliniska interventionsprojekt vilket kommer befolkningen i låginkomstländer till del då diagnostiken är anpassad för dessa områden. Nya diagnostiska strategier för optimera tidig upptäckt av smittsam tbc i högendemiska områden är avstor vikt för att nå WHOs millenium-mål att reducera aktiv tbc i världen. In 2020, WHO estimated that among 10 million new tuberculosis (TB) cases, 3 million are undiagnosed and only 57% bacteriologically confirmed. In a cluster-randomised trial in Ethiopia and Guinea Bissau implementing a clinical scoring tool (TBscore), we recently showed a 4-fold increasein case detection rate in Ethiopia. Buidling on our network and clinical trial experience, we now plan to conduct a randomised trial in 2023-24 at health care facilities in Ethiopia and Guinea Bissau to evaluate an optimized diagnostic procedure (ODP) compared with standard care in an effort to enhance early case finding and treatment aiming for sustainable development in low resource settings by limiting TB associated mortality. The ODP consists of a step wise approach by analysing (i) smear microscopy and PCR in pooled sputum and a recently developed sputum free technique using face mask sampling, (ii) a clinical follow up where computer assisted chest X-ray evaluation will be followed by (iii) a benchtop sequencing technology adopted for field use (Oxford nanopore) combining mycobacterial metagenomics and a validated host transcriptomic signature (RISK6). The main outcomes are the the rate of patients diagnosed and treated for TB within one week compared to standard of care and the difference in diagnostic yield between face mask sampling and conventional sputum. Optimizing early diagnosis in treatment using nove strategies are essential to reach the goal of reducing TB world-wide.