Colonization with and possible spread of multi resistant Escherichia coli bacteria during hospital stay in Tanzania Kolonisering med och möjlig spridning av multiresistenta Escherichia coli bakterier under sjukhusvistelse i Tanzania Bakterier som är resistenta mot antibiotika ökar i hela världen, vilket leder till svårigheter att behandla vanliga infektioner såsom urinvägsinfektioner, sårinfektioner och blodförgiftning. Resistenta bakterier kan spridas mellan individer i samhället, men risken för spridning är mycket större på sjukhus, särskilt vid brister i basala hygienrutiner. I låginkomstländer saknas ofta medel och kompetens för övervakning av resistenta bakterier på sjukhuset och ute i samhället. Escherichia coli (E. coli ) är en vanlig tarmbakterie, som kan producera olika enzymer såsom Extended Spektrum Beta-Laktamaser (ESBL) eller karbapenemaser. Dessa enzymer bryter ner vanliga antibiotika som ofta används på sjukhus, inklusive penicilliner och cefalosporiner, respektive karbapenemer. I många fall är dessa bakterier multiresistenta, vilket innebär att få eller inga behandlingsalternativ återstår. Frekvensen av både ESBL-bärande och karbapenemresistenta E. coli har ökat över hela världen och utgör idag ett av de främsta hoten mot människans hälsa. I detta projekt kommer vi att undersöka förekomsten av kolonisering av ESBL- och karbapenemas-producerande E. coli hos kvinnor och barn i feces vid inskrivning på gynekologiska respektive pediatriska avdelningar på ett sjukhus i Moshi i Tanzania. Ett andra prov kommer att tas efter cirka en vecka efter inskrivningen för att undersöka förändringar i kolonisering av resistenta bakterier i tarmen, ställt i relation till antibiotikabehandling. Risken att patienter förvärvar ESBL-bärande bakterier under sjukhusvistelse har studerats i andra länder, men inte i Tanzania. Huruvida karbapenemresistenta E. coli finns i Tanzania är i nuläget okänt. För undersökning av förekomsten av resistenta tarmbakterier i samhället kommer fecesprover att samlas från kvinnor och barn som besöker öppenvård i Moshi-området. Patienter kommer att tillfrågas om de nyligen behandlats med antibiotika, vilket relateras till förekomsten av ESBL- och karbapenemas-producerande E. coli i tarmen. Förutom screeningprover kommer prover att tas från miljön på sjukhuset för att undersöka om resistenta tarmbakterier även finns i sjukhusmiljön och i sådana fall kan utgöra en tänkbar smittkälla. De resistenta bakterierna kommer att undersökas med molekylärbiologiska tekniker för att utreda förekomsten av särskilt spridningsbenägna bakterier, exempelvis E. coli tillhörande O25b-ST131-klonen, i Tanzania. Resultaten kommer att användas för att öka den lokala kunskapen om basala hygienrutiner i den dagliga sjukhusrutinen med syfte att minska spridningen av multiresistenta bakterier mellan patienter. Nya analyser för detektion av ESBL- och karbapenemas-producerande E. coli, som inte användes förut i Moshi, kommer att utföras vid det Kliniska Mikrobiologiska Laboratoriet, och en lokal biomedicinsk analytiker kommer att bjudas in till Klinisk Mikrobiologi vid Sahlgrenska Universitetssjukhuset och lära sig att utföra de molekylärbiologiska analyser som används i Sverige. Det möjliggör ett inflöde av kompetens för påvisning av resistenta bakterier i Moshi-området. Multiresistant bacteria are a fastly growing world-wide threat to human health. These resistant bacteria may easily spread between patients in the hospital setting in the absence of proper hygiene. Escherichia coli, present in the normal human gut, may produce enzymes called Extended Spectrum â-Lactamases (ESBL) or carbapenemases, which degrade penicillins, cephalosporins and carbapenems, respectively. There is no study in Africa, including Tanzania, investigating the risk to acquire ESBL- or carbapenemas-producing E. coli during hospital stay. We will investigate this risk for patients in the pediatric and gynecological units at a hospital in the Moshi area, Tanzania. The prevalence of colonization in faeces will be related to antibiotic use and possible contamination of the hospital environment with these bacteria. For comparison colonization of patients in the outpatient setting will be investigated as well. The prevalence of the globally present O25b-ST131 clone said to be largely responsible for the spread of ESBL will be determined as will the genotypes of ESBL- and carbapenemas-producing strains to elucidate possible transmission routes. The results will be used to increase the local knowledge of basic hygiene routines and their implementation in daily hospital care in order to decrease the spread of multiresistant bacteria between patients. The study will also increase the competence at the local microbiological laboratory in diagnosing resistant bacteria.