Anthracnose resistance genes in the climate resilient crop sorghum, Sorghum bicolor Resistensgener för att motverka antraknos i den torktåliga grödan durra (Sorghum bicolor) Durra är en av de viktigaste matgrödorna i många utvecklingsländer, särskilt i sub-Sahariska Afrika. I Etiopien, ett låg-inkomstland med problem med matförsörjningen, intar durra en särskilt viktig roll i livsmedelsförsörjningen tack vare dess förmåga att växa i halvtorrt jordar. Den är viktig för inkomsten för miljontals småbrukare. Durrans tolerans mot torka gör att den är väl rustad för framtida klimatförändringar och kommer kunna fortsätta spela en avgörande roll i livsmedelssäkerheten. Trots dess betydande roll för livsmedelssäkerhet, hindrar tyvärr växtskadegörare durraproduktionen. Antraknos, som orsakats av en vanligt förekommande och aggressiva svamppatogenen Colletotrichum sublineolum, har utpekats som en av de viktigaste sjukdomarna som påverkar durraproduktionen i Etiopien. Upp till 67 % avkastningsförlust på grund av antraknos har rapporterats. Förbättrad värdresistans mot antraknos hos durra-sorter och en bättre förståelse av resistansmekanismerna är nu i fokus hos forskarna för att upprätthålla en hållbar durraproduktion. Att identifiera durragenotyper med resistens är ett avgörande steg mot att förbättra värdmotståndet i grödan. Identifierandet av resistans (R-) gener i arvsmassan och införlivande av denna resistens i utvalda sorter anses vara det mest lovande sättet att förbättra värdmotståndet i grödor. I Etiopien, är den naturliga genetiska mångfalden hos durra är lyckligtvis hög, och naturlig variation är den rikaste källan till sjukdomsresistens. I detta projekt, som är ett samarbete mellan Sveriges Lantbruksuniversitet, Addis Ababa University och Mekelle Uiversity (Ethiopia), och University of Copenhagen (Denmark) för att identifiera R-generna kommer vi att använda en avancerad sekvenseringteknik för resistensgensberiknings kallad RenSeq. Parallellt vill vi dessutom testa och utveckla molekylärbiologi och metabolitanalys för att förstå resistensmekanismerna i durra. Dessutom vill vi utföra en funktionell analys av identifierade R-gener. Resultaten kommer att underlätta screening av befintliga durrasorter i Etiopienför resistens mot antraknos och ytterligare införlivande av nya R-gener i förädlingsprogram för durraresistens. Detta projekt fördjupar kunskapen om viktiga resistensmekanismer och faktorer för framtida produktion av durra. Resultaten kommer att bidra till att förbättra vår förståelse av molekylära mekanismer för resistens mot antraknos i durra och att utveckla genomiska verktyg för markördriven förädling samt, allra viktigast, stärka livsmedelsförsörjningen i Etiopien. Sorghum, Sorghum bicolor, is one of the most important crops in many developing countries. It plays a crucial role for food security in Ethiopia. In Ethiopia, sorghum production is adversely affected by the widely distributed anthracnose disease caused by the fungal pathogen Colletotrichum sublineolum. Reducing the effects of this pathogen will improve livelihood of smallholder famers and strengthen food security in the country. Plant host resistance is an effective and sustainable method to protect sorghum from anthracnose. However, the breeding efforts to develop sorghum cultivars resistant to anthracnose is hampered by the poor understanding of the sorghum-anthracnose interactions, and lack of known major resistance (R-) genes. Here, we propose to apply the state-of-the-art resistance gene sequence capture method (RenSeq) coupled with single-molecule real-time (SMRT) sequencing, emerging molecular biology, metabolomics and biotechnology techniques for improving sorghum resistance. We will screen sorghum genotypes for resistance to anthracnose and understand the molecular basis of resistance against this disease, as well as identify and perform functional analysis of novel R-genes. Apart from an improved understanding about resistance mechanisms against anthracnose in sorghum, it will help develop genomic tools for marker assisted breeding; thus, advancing the knowledge and increasing sorghum production in Ethiopia, and other sub-Saharan countries.