Verktyg för att studera effekterna av rotavirusvaccination i Burkina Faso Tools to study the effects of rotavirus vaccination in Burkina Faso Vilka faktorer påverkar skyddet av rotavirusvaccination av barn i Burkina Faso? Akuta diarrésjukdomar är fortfarande ett av de främsta globala hälsoproblemen och orsakar nästan en femtedel av alla dödsfall bland yngre barn i utvecklingsländer. Rotavirus är den vanligaste orsaken till akut och allvarlig diarré hos barn och orsakar ca en halv miljon dödsfall per år. Eftersom förbättrad sanitet och hygien har begränsad effekt på sjukdomsspridning anses rotavirusvaccination vara det viktigaste sättet att minska dödligheten i hårt drabbade länder. Vaccinen rekommenderas av WHO och andra hälsoorganisationer men flera studier har visat på att vaccinen inte är lika effektiva i utvecklingsländer, framförallt i Afrika. Skälen till den låga effektiviteten är ännu inte fastställda men några anledningar kan vara undernäring, förekomst av andra sjukdomar, samt cirkulation av ovanliga rotavirusstammar mot vilka vaccinen inte skyddar. Burkina Faso, ett land i Västafrika med mycket hög barnadödlighet, planerar nu att införa rotavirusvaccination under senare delen av 2014. I detta projekt vill vi i nära samarbete Dr. Isidore Bonkoudougou vid nationella folkhälsoinstitutet i Ouagadougou, Burkina Faso på nära håll följa effekterna av vaccinationen. Genom dessa studier har vi en unik möjlighet att undersöka vilka faktorer som påverkar hur bra vaccinen fungerar. Vi kommer att i första skedet (projekt 1) etablera tekniker och metoder för att undersöka rotavirusförekomst och vilka stammar som cirkulerar i Burkina Faso innan vaccination börjar. Under och efter vaccinationen (projekt 2) kommer vi sedan undersöka effektiviten av vaccinet och om vaccinet skyddar mot de rotavirusstammar som finns i Burkina Faso. Vi kommer även med molekylärbiologiska tekniker övervaka om nya muterade rotavirus uppkommer mot vilket vaccinet inte skyddar. Slutligen har vi genom tidigare studier i Burkina Faso utvecklat en hypotes om att det finns genetiska faktorer hos en tredjedel av populationen som gör dem mindre mottagliga för vaccinet. Vi kommer således (projekt 3) undersöka om de barn som inte blir skyddade av vaccinen har denna genetiska faktor. Detta projekt är vetenskapligt helt nytt och kan leda till att nya och bättre vaccin utvecklas bättre anpassade för utsatta populationer. Genom att anordna workshops, seminarier samt föreläsningar ska metoder, teknik och kunskap överföras till samarbetspartners i Burkina Faso. Detta är speciellt viktigt i detta skede så att de nödvändiga vetenskapliga redskapen finns på plats innan vaccineringen börjar. Vårt övergripande mål är att genom kontinuerligt samarbete med forskare i Burkina Faso stärka kunskapsbasen inom virologi och vaccination med huvudfokus på rotavirus och andra diarrésjukdomar. Diarrhea is a major global health issue in children, and heavily affects sub-Saharan Africa. Rotavirus is the major cause for severe childhood diarrhea, thus rotavirus vaccines are an important preventive measure of diarrhea. Vaccine trials have, however, showed a reduced vaccine efficacy in many African countries. Burkina Faso is now about to implement vaccination nationwide and our research proposal is centered on this. By closely monitoring rotavirus before; during and after national immunization, we can investigate factors important for vaccine efficacy. A first objective is to establish RV surveillance logistics and techniques before vaccination. We have performed preliminary studies and found many unusual strains which could influence vaccine efficacy. The major objective is to determine the vaccine efficacy and relate this to evolving escape mutants and specific strains present in Burkina Faso. Our third scientific approach is most novel and based on preliminary data from Burkina Faso observing that children with the Lewis-negative phenotype, common in Burkina Faso, where not infected with vaccine-like strains, providing an explanation for reduced vaccine efficacy in Africa. The overall objective of this collaboration is increased knowledge and better techniques to study RV and factors important for successful vaccination; which will be done through regular workshops, lectures and scientific visits by researchers from Sweden and Burkina Faso.