Factors determining susceptibility of peste des petits ruminants virus infections in domestic and wild small ruminants Faktorer som påverkar mottaglighet för peste des petits ruminants virusinfektion hos domesticerade och vilda små idisslare Peste des petits ruminants hos får, getter och vilda idisslare - ökad förståelse av utbredning och sjukdomsmekanismer kan leda till bättre levnadsvillkor för småbrukare i Tanzania och Pakistan Peste des petits ruminants (PPR) är en smittsam virussjukdom hos får, getter och andra små idisslare som främst drabbar de fattigaste människorna i de fattigaste länderna i världen. Får och getter är nämligen vanliga husdjur i små lantbruk och för eget husbehov i Afrika, Mellanöstern och Asien, områden där PPR är vanligt förekommande och därmed drabbar extra hårt. Djuren sköts ofta av kvinnor och småbruket utgör en stor extrainkomst för dem och deras familjer, avgörande för deras dagliga överlevnad och ett viktigt led i demokrati- och jämlikhetsutvecklingen då kvinnor får en egen inkomst. Smittsamma sjukdomar såsom PPR utgör emellertid allvarliga hinder för vidareutveckling av småbruken och har beskrivits som en viktig faktor som kan leda till kronisk fattigdom bland småbrukare. PPR orsakas av PPR virus (PPRV), som är ett morbillivirus likt mässlingsvirus och framför allt boskapspestvirus (Rinderpestvirus, RPV). RPV orsakade liknande symtom som PPRV (feber, ödem, blåsor och skador i slemhinnor, diarré, minskad mjölkproduktion, akut död och hög dödlighet) fast hos nötboskap. Nyligen förklarades RPV utrotat, vilket betyder att det är den andra allvarliga virussjukdomen som utrotats efter smittkoppor hos människa. Viktiga anledningar till att RPV lyckosamt utrotades var tillgången till enkla och effektiva vacciner, att det endast var en kort tid då infekterade djur spred smitta och då enbart genom nära kontakt, samt ekonomiska incitament för att fullfölja ett utrotningsprogram på lokal och nationell nivå. PPR fortsätter dock att sprida sig snabbt trots tillgång till vaccin och bra diagnostik. Sjukdomen har spridit sig till Nordafrika och Turkiet, nära EU:s gränser, och hotar även att sprida sig allt längre söderut i Afrika. Vilda idisslares roll för smittspridning är ännu oklar, men PPRV har nyligen påvisats i bl a vilda getter i Tibet, Pakistan och Kurdistan, samt i antiloper i Tanzania. En viktig fråga att besvara är därför om vilda idisslare kan bli sjuka och/eller sprida virus till tamboskap. Forskningsprojektets övergripande mål är därför att klargöra den nuvarande situationen för PPRV hos både tama och vilda små idisslare i Tanzania och Pakistan genom att föra samman ett tvärvetenskapligt och multinationellt team med forskare inom virologi, epidemiologi, immunogenetik och evolutionsbiologi. Specifika mål för projektet är att: i) identifiera särskilt intressanta och viktiga områden där vilda och tama idisslare interagerar med varandra och utvärdera betydelsen av detta för smittspridning; ii) förstå och övervaka hur PPRV utvecklas genetiskt baserat på sekvensering av hela arvsmassan; iii) förstå varför vilda och tama idisslare har olika sjukdomsmottaglighet; iv) bestämma genuttrycket hos infekterade djur för att förstå skillnader i immunsvar och sjukdomsutveckling mellan olika djurarter, samt att v) förklara vilka funktioner vissa PPRV-proteiner har och deras roll för sjukdomsutveckling. Sådan kunskap som projektet ämnar leda till är viktiga och fundamentala för att kunna utveckla bättre vacciner och bättre kontrollstrategier för att bekämpa PPRV. Förhoppningsvis kan denna förödande sjukdom som drabbar de fattigaste så hårt så småningom utrotas. Peste des petits ruminants (PPR) is an economically important disease, especially affecting the household economy of the poorest people, since the main hosts are domestic sheep and goats in Africa, the Middle East and Asia, species important for the daily survival. Smallholders keeping small ruminants, mostly women, are one key driver in poverty alleviation in many regions of the world, but infectious diseases, such as PPR, represent serious threats to further development of the smallholder production. PPR is spreading rapidly despite availability of vaccines and diagnostic tests. The role of wildlife in PPR epidemiology is still uncertain. The overall purpose of the proposed project is to ascertain the current situation of PPR virus (PPRV) in both domestic and wild small ruminants in Tanzania and Pakistan by bringing a multidisciplinary and multinational team of scientists together. Through this project, data will be collected on the epidemiology and risk factors related to PPRV infected livestock and wildlife from study locations and experimental infections. Genetic factors of PPRV and its hosts associated with disease susceptibility will be monitored by molecular epidemiology based on full genome sequencing, transcriptomic analysis of global host response, and functional studies to understand molecular mechanisms of pathogenesis in a host and species dependent manner. Such knowledge is fundamental to devise better vaccines and to facilitate control strategies against PPRV.