የቦይና ውሃ ማከፋፈያ መስኖ በዋነኛነት በትላልቅ ፕሮጀክቶች ውሃን ከዋናው ምንጭ ወደ መሰራጫ መስኖዎች የሚያደርስ የቦይና የፍሰት መቆጣጠሪያ መረቦች ቦይ ነው። የዉሃ ክፍፍል ስርአትን በመጠቀም በተጠቃሚዎች ዘንድ ውሃ በፍታዊነት እንዲደረስ ያደርጋል።