ጎንደር ዩኒቨርሲቲን የሚወክል ቢጫና ሰማያዊ ቀለም ያለው ክብ አርማ ነው። አርማው የፋሲል ግንብ፣ ጥቅልል ብራናና ማርሽ ምስል ይዟል። ታሪካዊውን ግንብ ማካተቱ ፍቅርን እና መደነቅን የሚገልፅ፤ የታሪክና የትምህርት ውህደትንም ፍንትው አድርጎ ያሳያል።