የጎንደር ዩኒቨርሲቲ ከሰማያዊ ሞላላ ቅርጽ ያለው አርማ፣ “ጎንደር ዩኒቨርሲቲ” የሚለው ጽሑፍ በአማርኛና በእንግሊዝኛ በቢጫ ቀለም ተቀርጿል። መሃል ላይ ቢጫ የፋሲል ግንብ ተስሏል። ይህ አርማ የአንድነትና የመደነቅ ስሜት ይገልጻል።