የባሕር ዳር ዩኒቨርሲቲ ዋና ሕንጻ በቅርብ ተቀርጾ ይታያል። ፈዛዛ ቀይ ቀለም ያለው ባለ ብዙ ፎቅ ሕንጻ በሁለት ክፍሎች የተከፈለ ሲሆን፣ በመካከላቸው የነጻነት ችቦ የያዘ ሐውልት ቆሟል። ከሕንፃው ላይ የዩኒቨርሲቲው ስም በአማርኛና በእንግሊዝኛ ተጽፏል።