Was ist ein Genom?
die Gesamtheit der materiellen Träger der vererbbaren Informationen einer Zelle oder eines Viruspartikels: Chromosomen, Desoxyribonukleinsäure (DNS = DNA) oder Ribonukleinsäure (RNS = RNA) bei RNA-Viren, bei denen RNA anstelle von DNA als Informationsträger dient
Genom
Das Genom, auch Erbgut eines Lebewesens oder eines Virus, ist die Gesamtheit der materiellen Träger der vererbbaren Informationen einer Zelle oder eines Viruspartikels: Chromosomen, Desoxyribonukleinsäure (DNS = DNA) oder Ribonukleinsäure (RNS = RNA) bei RNA-Viren, bei denen RNA anstelle von DNA als Informationsträger dient. Im abstrakten Sinn versteht man darunter auch die Gesamtheit der vererbbaren Informationen (Gene) eines Individuums.
Die Bezeichnung ''Genom'' wurde, nach der durch Thomas Hunt Morgan gelungenen Verknüpfung der Chromosomentheorie der Vererbung mit der durch Wilhelm Johannsen aufgestellten Hypothese von Genen als Erbeinheiten, 1920 von Hans Winkler geprägt. Das Teilgebiet der Genetik, das sich mit der Erforschung des Aufbaus von Genomen und der Wechselwirkungen zwischen Genen befasst, wird als ''Genomik'' () bezeichnet.
Genom
Das Genom, auch Erbgut eines Lebewesens oder eines Virus, ist die Gesamtheit der materiellen Träger der vererbbaren Informationen einer Zelle oder eines Viruspartikels: Chromosomen, Desoxyribonukleinsäure (DNS = DNA) oder Ribonukleinsäure (RNS = RNA) bei RNA-Viren, bei denen RNA anstelle von DNA als Informationsträger dient. Im abstrakten Sinn versteht man darunter auch die Gesamtheit der vererbbaren Informationen (Gene) eines Individuums.
Die Bezeichnung ''Genom'' wurde, nach der durch Thomas Hunt Morgan gelungenen Verknüpfung der Chromosomentheorie der Vererbung mit der durch Wilhelm Johannsen aufgestellten Hypothese von Genen als Erbeinheiten, 1920 von Hans Winkler geprägt. Das Teilgebiet der Genetik, das sich mit der Erforschung des Aufbaus von Genomen und der Wechselwirkungen zwischen Genen befasst, wird als ''Genomik'' () bezeichnet.
Anelloviridae
Die ''Anelloviridae'' sind eine Familie von DNA-Viren. Ihr Genom besteht aus einer ringförmigen (zirkulären) Einzelstrang-DNA negativer Polarität.
Sie haben ein nicht umhülltes Kapsid von abgerundet ikosaedrischer Geometrie mit .
Ihre Wirte sind Wirbeltiere. Es sind etwa 200 verschiedene Arten bekannt.
Die Typusart ist das 1997 entdeckte ''Torque-Teno-Virus 1'' (TTV-1) aus der Gattung ''Alphatorquevirus''.
Die Namensbezeichnung ist abgeleitet von , was sich auf das zirkuläre Genom der ''Anelloviridae'' bezieht. Vibrio_cholerae Spiraviridae
Anelloviridae
Die ''Anelloviridae'' sind eine Familie von DNA-Viren. Ihr Genom besteht aus einer ringförmigen (zirkulären) Einzelstrang-DNA negativer Polarität.
Sie haben ein nicht umhülltes Kapsid von abgerundet ikosaedrischer Geometrie mit .
Ihre Wirte sind Wirbeltiere. Es sind etwa 200 verschiedene Arten bekannt.
Die Typusart ist das 1997 entdeckte ''Torque-Teno-Virus 1'' (TTV-1) aus der Gattung ''Alphatorquevirus''.
Die Namensbezeichnung ist abgeleitet von , was sich auf das zirkuläre Genom der ''Anelloviridae'' bezieht. Vibrio_cholerae

=== Genetik ===
Das Genom des Stammes ''Vibrio cholerae'' O1 N16961 (auch als Biovar El Tor bezeichnet) wurde im Jahr 2000 vollständig sequenziert. Der für die Untersuchung verwendete Bakterienstamm wurde aus einer Stuhlprobe eines Patienten einer Choleraepidemie in Bangladesch 1971 isoliert. Das Genom weist eine Größe von 4033 Kilobasenpaaren (kb) auf, was in etwa mit der Genomgröße von ''Escherichia coli'' vergleichbar ist. Es sind 3887 Proteine annotiert. Die Ergebnisse der Sequenzierungen des El-Tor-Stammes und weiterer Stämme der Art zeigen einen GC-Gehalt (den Anteil der Nukleinbasen Guanin und Cytosin) in der Bakterien-DNA von 47–48 Mol-Prozent. Dies ist vergleichbar mit dem GC-Gehalt in der DNA von ''E. coli'' und anderer Enterobacteriaceae, die wie ''Vibrio'' zur Klasse der Gammaproteobacteria gehören.
Das Genom von ''V. cholerae'' verteilt sich auf zwei zirkuläre Chromosomen, was für Bakterien ungewöhnlich ist, da die meisten Bakterien nur ein einziges kovalent geschlossenes, ringförmiges Bakterienchromosom besitzen. Chromosom 1 von ''V. cholerae'' umfasst 2961 kb, während Chromosom 2 mit 1072 kb kleiner ausfällt. Die meisten Gene für wichtige Zellfunktionen, wie Replikation, Transkription, Translation der DNA sowie Synthese der Bakterienzellwand, aber auch die Virulenzfaktoren befinden sich auf dem großen Chromosom. Das kleinere Chromosom umfasst Gene, die nicht typisch für das Genom der Gammaproteobacteria sind. Vielmehr handelt es sich um Gene, die typischerweise auf einem Plasmid lokalisiert sind. So findet sich hier beispielsweise ein Integron (als ''Integron Island'' bezeichnet). Dieser Genabschnitt dient dazu, Gene aus einem Chromosom oder einem Plasmid einzufangen, was für die Pathogenität von Bedeutung ist. Da derartige Integrons sonst nur auf einem Plasmid enthalten sind, führte ihre Entdeckung auf dem Bakterienchromosom 2 zu der Annahme, dass sein Ursprung ein „Megaplasmid“ ist, das von der Urform einer ''Vibrio''-Art aufgenommen wurde. Spiraviridae

=== Genom ===
Das Genom von ACV besteht aus einem einzigen Segment (monopartit) einer zirkulär geschlossenen Einzelstrang-DNA positiver Polarität ((+)ssDNA) mit einer Länge von 24.893&nt (Nukleotiden).
Der GC-Gehalt des Genoms beträgt 46,7 %.
Nach den Analysen sollte das Genom 57 offene Leserahmen (, ORFs) haben, die größer als 40 Codons (Basentripletts) sind; diese machen  93,5 % des Genoms aus. D. h., es sollte für ca. 57 Proteine kodieren.
Alle bis auf einen ORF haben die gleiche Richtung (Direktionalität, ) wie der DNA-Strang, was darauf hindeutet, dass das Genom positive Polarität hat.
Die Anzahl der vorhergesagten Gene ist damit viel größer als bei anderen bekannten ssDNA-Viren.
Diese Gene kodieren unter anderem für eine mutmaßliche Trypsin-ähnliche Serin-Protease, eine Tyrosin-Rekombinase, zwei Thioredoxin-ähnliche Proteine, sowie für Proteine, die am Kohlenhydratstoffwechsel beteiligt sind und für DNA-bindende Proteine.