In welchem Fall braucht man das Elektronenvolt?
in der Atomphysik, der Kernphysik und der Elementarteilchenphysik zur Angabe von Teilchenenergien und Energieniveaus
Energie
Energie

== Einheiten ==
Neben der abgeleiteten SI-Einheit Joule sind je nach Anwendungsgebiet noch andere Energieeinheiten in Gebrauch. Wattsekunde (Ws) und Newtonmeter (Nm) sind mit dem Joule identisch.
Das Elektronenvolt (eV) wird in der Atomphysik, der Kernphysik und der Elementarteilchenphysik zur Angabe von Teilchenenergien und Energieniveaus verwendet. Seltener kommt in der Atomphysik das Rydberg vor. Die cgs-Einheit erg wird häufig in der theoretischen Physik benutzt.
Die Kalorie war in der Kalorimetrie üblich und wird heute noch umgangssprachlich und im Warenverkehr zusätzlich zur gesetzlichen Einheit Joule bei der Angabe des physiologischen Brennwerts von Lebensmitteln verwendet. In Kilowattstunden (kWh) messen Energieversorger die Menge der an die Kunden gelieferten Energie. Die Steinkohleeinheit und die Öleinheit dienen zur Angabe des Energieinhaltes von Primärenergieträgern. Mit dem TNT-Äquivalent misst man die Sprengkraft von Sprengstoffen.
Elektronenvolt Elektronenvolt Smith-Waterman-Algorithmus
Elektronenvolt

=== Als Einheit für die Energie ===
Das Elektronenvolt wird als „handliche“ Einheit der Energie in der Atomphysik und verwandten Fachgebieten wie der experimentellen Kern- und Elementarteilchenphysik verwendet. Beispielsweise wird die kinetische Energie, auf die ein Teilchen in einem Teilchenbeschleuniger gebracht wird, stets in Elektronenvolt angegeben. Handlich ist das deshalb, weil sich die Änderung der kinetischen Energie  jedes im elektrischen Feld beschleunigten Teilchens aus seiner Ladung  und der durchlaufenen Spannung  als  berechnen lässt und unabhängig von anderen Einflüssen ist: Die Masse des Teilchens, die Länge des Weges oder der genaue räumliche Verlauf der Feldstärke spielen keine Rolle.
Der Betrag der Ladung eines freien, beobachtbaren Teilchens ist immer die Elementarladung  oder ein ganzzahliges Vielfaches davon. Anstatt die Elementarladung einzusetzen und die Energie in Joule anzugeben, kann man daher die aus einer elektrischen Beschleunigung resultierende Änderung der kinetischen Energie direkt in der Einheit eV angeben. Dabei gilt für einfach geladene Teilchen – wie Elektronen, Protonen und einfach geladene Ionen – die Formel ; bei -fach geladenen Teilchen gilt entsprechend . So ändert sich beispielsweise die kinetische Energie eines Protons beim Durchfliegen einer Potentialdifferenz von 100 V um 100 eV, die Energie eines zweifach geladenen Heliumkerns ändert sich um 200 eV.
Die kinetische Energie eines positiv geladenen Teilchens nimmt um den genannten Betrag ''zu'', wenn die durchlaufene Spannung so gepolt ist, dass das elektrische Potential auf dem Weg des Teilchens ''ab''nimmt (umgangssprachlich: „wenn sich das Teilchen von Plus nach Minus bewegt“); im umgekehrten Fall nimmt sie ab. Für negativ geladene Teilchen gilt dasselbe mit umgekehrten Vorzeichen (siehe z. B. Gegenfeldmethode beim Photoeffekt).
Die Verwendung der Einheit Elektronenvolt ist nicht auf Beschleunigungsarbeit an geladenen Teilchen im elektrischen Feld beschränkt. Da sie eine für die Atom- und Kernphysik günstige Größenordnung hat, wird sie häufig für ganz andere Energien im mikroskopischen Maßstab verwendet, etwa für Bindungsenergien in der Atomhülle oder im Atomkern oder für die Energie von einzelnen Photonen. Elektronenvolt

=== Als Einheit für die Masse in der Teilchenphysik ===
Das Elektronenvolt kann auch als Einheit der Masse von Teilchen verwendet werden. Die Umrechnung von Masse in Energie geschieht gemäß der Äquivalenz von Masse und Energie. Diese Energie wird Ruheenergie genannt.
*  für die Lichtgeschwindigkeit steht.
Die entsprechende Masseneinheit ist also . Die Umrechnung in Kilogramm lautet:
Beispielsweise beträgt die Masse eines Elektrons 9,11 · 10−31 kg = 511 keV/c².
In der Teilchenphysik wird oft ein System „natürlicher“ Einheiten verwendet. Dabei wird  gesetzt. Damit hat die Masse eines Teilchens die gleiche Einheit wie seine kinetische Energie. Beide werden dann üblicherweise in Elektronenvolt angegeben. Smith-Waterman-Algorithmus

== Effizienz ==
Die Laufzeitkomplexität des Smith-Waterman-Algorithmus ist in  und der Speicherbedarf in . Dies kann man einfach aus den Matrix-Rekurrenzen ableiten.
Weil man die Score-Matrix zeilen- bzw. spaltenweise berechnen kann, braucht man jeweils nur die aktuelle und die letzte Zeile bzw. Spalte zu speichern, wenn man nur den Score und nicht das Alignment berechnen möchte. In  dem Fall liegt der Speicherbedarf in  bzw. .
In linearem Speicherbedarf kann man auch das lokale Alignment mit Hilfe der Programmiermethode Divide-and-Conquer berechnen. Siehe Hirschberg-Algorithmus.