DOCUMENT DE TRAVAIL
ORDONNANCE DU TRIBUNAL (cinquième chambre)
13 septembre 2017 (*)
« Recours en annulation – FEDER – Réduction d’un concours financier – Non-respect du délai d’adoption d’une décision – Violation des formes substantielles – Recours manifestement fondé »
Dans l’affaire T‑97/09,
République fédérale d’Allemagne, représentée initialement par MM. M. Lumma, C. Blaschke et T. Henze, puis par MM. Henze et J. Möller, en qualité d’agents, assistés de Me C. von Donat, avocat,
partie requérante,
soutenue par
Royaume d’Espagne, représenté initialement par Me J.  Rodríguez Cárcamo, avocat, puis par M. A. Rubio González, abogado del estado, et enfin par Mme V. Ester Casas, en qualité d’agent,
et par
Royaume des Pays-Bas, représenté représenté initialement par Mme C. Wissels et M. Y. de Vries, puis par M. J. Langer et Mme B. Koopman, en qualité d’agents,
parties intervenantes,
contre
Commission européenne, représentée par Mmes B. Conte, A. Steiblytė et M. B.-R. Killmann, en qualité d’agents,
partie défenderesse,
ayant pour objet une demande fondée sur l’article 263 TFUE et tendant à l’annulation de la décision C(2008) 8465 final de la Commission, du 19 décembre 2008, relative à la réduction du concours communautaire du Fonds européen de développement régional (FEDER) à un programme opérationnel dans la région concernée par l’objectif n° 1 du Land de Saxe en République fédérale d’Allemagne (1994-1999), accordé par les décisions C(94) 1939/4 de la Commission, du 5 août 1994, C(94) 2273/4 de la Commission, du 22 août 1994, et C(94) 1425 de la Commission, du 6 septembre 1994,
LE TRIBUNAL (cinquième chambre),
composé de M. D. Gratsias, président, Mme I. Labucka (rapporteur) et M. I. Ulloa Rubio, juges,
greffier : M. E. Coulon,
rend la présente
Ordonnance
Cadre juridique
1        Pour les périodes de programmation 1989-1993 et 1994-1999, les règles en matière de fonds structurels (notamment concernant les objectifs, la programmation, les paiements, la gestion, le contrôle et les corrections financières) ont été énoncées, notamment, dans le règlement (CEE) n° 2052/88 du Conseil, du 24 juin 1988, concernant les missions des Fonds à finalité structurelle, leur efficacité ainsi que la coordination de leurs interventions entre elles et celles de la Banque européenne d’investissement et des autres instruments financiers existants (JO 1988, L 185, p. 9), lequel a été modifié notamment par le règlement (CEE) n° 2081/93 du Conseil, du 20 juillet 1993 (JO 1993, L 193, p. 5), et dans le règlement (CEE) n° 4253/88 du Conseil, du 19 décembre 1988, portant dispositions d’application du règlement n° 2052/88 en ce qui concerne la coordination entre les interventions des différents Fonds structurels, d’une part, et entre celles-ci et celles de la Banque européenne d’investissement et des autres instruments financiers existants, d’autre part (JO 1988, L 374, p. 1), lequel a été modifié par le règlement (CEE) n° 2082/93 du Conseil, du 20 juillet 1993 (JO 1993, L 193, p. 20).
2        L’article 24 du règlement n° 4253/88 dispose :
« 1. Si la réalisation d’une action ou d’une mesure semble ne justifier ni une partie ni la totalité du concours financier qui lui a été alloué, la Commission procède à un examen approprié du cas dans le cadre du partenariat, en demandant notamment à l’État membre ou aux autres autorités désignées par celui-ci pour la mise en œuvre de l’action de présenter leurs observations dans un délai déterminé.
2. Suite à cet examen, la Commission peut réduire ou suspendre le concours pour l’action ou la mesure concernée si l’examen confirme l’existence d’une irrégularité ou d’une modification importante qui affecte la nature ou les conditions de mise en œuvre de l’action ou de la mesure et pour laquelle l’approbation de la Commission n’a pas été demandée.
[...] »
3        Les règlements nos 2052/88 et 4253/88 ont été remplacés, avec effet au 1er janvier 2000, par le règlement (CE) n° 1260/1999 du Conseil, du 21 juin 1999, portant dispositions générales sur les Fonds structurels (JO 1999, L 161, p. 1).
4        L’article 39 du règlement n° 1260/1999, intitulé « Corrections financières », énonce, en ses paragraphes 2 et 3, ce qui suit :
« […]
2. Si, après avoir procédé aux vérifications nécessaires, la Commission conclut :
a) qu’un État membre ne s’est pas conformé aux obligations qui lui incombent en vertu du paragraphe 1 ou
b) qu’une partie ou la totalité d’une intervention ne justifie ni une partie ni la totalité de la participation des Fonds ou
c) qu’il existe des insuffisances graves dans les systèmes de gestion ou de contrôle qui pourraient conduire à des irrégularités de caractère systémique,
la Commission suspend les paiements intermédiaires concernés et demande, en indiquant ses motifs, à l’État membre de présenter ses observations et, le cas échéant, d’effectuer les corrections éventuelles dans un délai déterminé.
Si l’État membre conteste les observations de la Commission, celle-ci l’invite à une audience au cours de laquelle les deux parties s’efforcent, dans un esprit de coopération fondée sur le partenariat, de parvenir à un accord sur les observations et les conclusions à en tirer.
3. À l’expiration du délai fixé par la Commission, en l’absence d’accord et si l’État membre n’a pas effectué les corrections et compte tenu des observations éventuelles de l’État membre, la Commission peut décider, dans un délai de trois mois :
a) de réduire l’acompte visé à l’article 32, paragraphe 2 ou
b) de procéder aux corrections financières requises en supprimant tout ou partie de la participation des Fonds à l’intervention concernée ».
5        L’article 5, paragraphe 3, du règlement (CE) n° 448/2001 de la Commission, du 2 mars 2001, fixant les modalités d’application du règlement n° 1260/1999 en ce qui concerne la procédure de mise en œuvre des corrections financières applicables au concours octroyé au titre des Fonds structurels (JO 2001, L 64, p. 13) dispose que :
« […]
3. Chaque fois que l’État membre conteste les observations de la Commission et qu’une audience a lieu en application de l’article 39, paragraphe 2, deuxième alinéa, du règlement (CE) n° 1260/1999, le délai de trois mois au cours duquel la Commission peut prendre une décision au titre de l’article 39, paragraphe 3, dudit règlement commence à courir à partir de la date de l’audience ».
6        Aux termes de l’article 52, paragraphe 1, du règlement n° 1260/1999, ce règlement n’affecte pas la poursuite ni la modification, y compris la suppression totale ou partielle, d’une intervention approuvée par le Conseil de l’Union européenne ou par la Commission des Communautés européennes sur la base des règlements nos 2052/88 et 4253/88 et de toute autre législation applicable à cette intervention le 31 décembre 1999.
7        Le règlement n° 1260/1999 a été abrogé par le règlement (CE) n° 1083/2006 du Conseil, du 11 juillet 2006, portant dispositions générales sur le Fonds européen de développement régional, le Fonds social européen et le Fonds de cohésion (JO 2006, L 210, p. 25).
8        L’article 100 du règlement n° 1083/2006, intitulé « Procédure », dispose :
« 1. Avant de statuer sur une correction financière, la Commission ouvre la procédure en informant l’État membre de ses conclusions provisoires et en l’invitant à faire part de ses observations dans un délai de deux mois.
Lorsque la Commission propose une correction financière sur la base d’une extrapolation ou à un taux forfaitaire, l’État membre a la possibilité de démontrer, par un examen des documents concernés, que l’étendue réelle de l’irrégularité est inférieure à l’évaluation faite par la Commission. En accord avec celle-ci, l’État membre peut limiter la portée de cet examen à une partie ou un échantillon approprié des documents concernés. Sauf dans les cas dûment justifiés, le délai imparti pour cet examen ne dépasse pas deux mois après la période de deux mois visée au premier alinéa.
2. La Commission tient compte de tout élément fourni par l’État membre dans les délais visés au paragraphe 1.
3. Si l’État membre n’accepte pas les conclusions provisoires de la Commission, celle-ci l’invite à une audition au cours de laquelle les deux parties s’efforcent, dans un esprit de coopération fondée sur le partenariat, de parvenir à un accord sur les observations et les conclusions à en tirer.
4. En cas d’accord, l’État membre peut réutiliser les fonds communautaires concernés conformément à l’article 98, paragraphe 2, deuxième alinéa.
5. En l’absence d’accord, la Commission statue sur la correction financière dans les six mois suivant la date de l’audition en tenant compte de toutes les informations et observations présentées au cours de la procédure. S’il n’y a pas d’audition, la période de six mois débute deux mois après la date de l’envoi de la lettre d’invitation par la Commission. »
9        L’article 105 du règlement n° 1083/2006, intitulé « Dispositions transitoires », énonce, en son paragraphe 1, ce qui suit :
« Le présent règlement n’affecte pas la poursuite ni la modification, y compris la suppression totale ou partielle, d’une intervention cofinancée par les Fonds structurels ou d’un projet cofinancé par le Fonds de cohésion, approuvé par la Commission sur la base des règlements (CEE) n° 2052/88 [...], (CEE) n° 4253/88 [...], (CE) n° 1164/94 [...] et (CE) n° 1260/1999, ou de toute autre législation applicable à cette intervention au 31 décembre 2006, qui s’applique dès lors, à partir de cette date, à cette intervention ou à ce projet jusqu’à sa clôture. »
10      L’article 108 du règlement n° 1083/2006, intitulé « Entrée en vigueur », prévoit ce qui suit :
« Le présent règlement entre en vigueur le jour suivant celui de sa publication au Journal officiel de l’Union européenne.
Les dispositions des articles 1er à 16, 25 à 28, 32 à 40, 47 à 49, 52 à 54, 56, 58 à 62, 69 à 74, 103 à 105 et 108 sont applicables à compter de la date d’entrée en vigueur du présent règlement, uniquement pour les programmes de la période 2007-2013. Les autres dispositions sont applicables à partir du 1er janvier 2007. »
11      Le règlement n° 1083/2006 a été abrogé par le règlement (UE) n° 1303/2013 du Parlement européen et du Conseil, du 17 décembre 2013, portant dispositions communes relatives au Fonds européen de développement régional, au Fonds social européen, au Fonds de cohésion, au Fonds européen agricole pour le développement rural et au Fonds européen pour les affaires maritimes et la pêche, portant dispositions générales applicables au Fonds européen de développement régional, au Fonds social européen, au Fonds de cohésion et au Fonds européen pour les affaires maritimes et la pêche (JO 2013, L 347, p. 320, et rectificatif, JO L 200 du 26.7.2016, p. 140).
12      En ce qui concerne les corrections financières, l’article 145 du règlement n° 1303/2013 dispose :
« 1. Avant de statuer sur une correction financière, la Commission ouvre la procédure en informant l’État membre des conclusions provisoires de son examen et en l’invitant à faire part de ses observations dans un délai de deux mois.
2. Lorsque la Commission propose une correction financière sur la base d’une extrapolation ou à un taux forfaitaire, l’État membre se voit offrir la possibilité de démontrer, par un examen des documents concernés, que l’étendue réelle de l’irrégularité est inférieure à l’évaluation faite par la Commission. En accord avec celle-ci, l’État membre peut limiter la portée de cet examen à une partie ou un échantillon approprié des documents concernés. Sauf dans les cas dûment justifiés, le délai imparti pour cet examen ne dépasse pas deux mois après la période de deux mois visée au paragraphe 1.
3. La Commission tient compte de tout élément fourni par l’État membre dans les délais visés aux paragraphes 1 et 2.
4. Si l’État membre n’accepte pas les conclusions provisoires de la Commission, celle-ci l’invite à une audition afin de s’assurer de la disponibilité de toutes les informations et observations pertinentes devant former la base des conclusions de la Commission sur la demande de correction financière.
5. En cas d’accord et sans préjudice des dispositions du paragraphe 7 du présent article, l’État membre peut réutiliser les Fonds concernés ou le [Fonds européen pour les affaires maritimes et la pêche (FEAMP)] conformément à l’article 143, paragraphe 3.
6. Pour appliquer des corrections financières, la Commission statue, par voie d’actes d’exécution, dans les six mois suivant la date de l’audition ou la date de réception des informations complémentaires lorsque l’État membre accepte d’en fournir à la suite de l’audition. La Commission tient compte de toutes les informations et observations présentées au cours de la procédure. En l’absence d’audition, la période de six mois débute deux mois après la date de l’envoi de la lettre d’invitation à l’audition par la Commission.
7. Lorsque la Commission, dans l’exercice des responsabilités qui lui incombent en vertu de l’article 75, ou la Cour des comptes européenne décèle des irrégularités traduisant une insuffisance grave dans le bon fonctionnement des systèmes de gestion et de contrôle, la correction financière qui en résulte réduit le soutien accordé par les Fonds ou le FEAMP au programme opérationnel.
Le premier alinéa ne s’applique pas dans le cas d’une insuffisance grave dans le bon fonctionnement du système de gestion et de contrôle qui, avant la date où elle a été décelée par la Commission ou par la Cour des comptes européenne :
a) a été répertoriée dans la déclaration de gestion, dans le rapport de contrôle annuel ou dans l’avis d’audit communiqués à la Commission conformément à l’article 59, paragraphe 5, du règlement financier, ou dans d’autres rapports d’audit présentés à la Commission par l’autorité d’audit, et a fait l’objet de mesures appropriées ; ou
b) a fait l’objet de mesures correctives appropriées adoptées par l’État membre.
L’évaluation des insuffisances graves dans le bon fonctionnement des systèmes de gestion et de contrôle est fondée sur le droit applicable lorsque les déclarations de gestion, les rapports de contrôle annuels et les avis d’audit concernés ont été communiqués.
Lorsqu’elle statue sur une correction financière, la Commission :
a) respecte le principe de proportionnalité en tenant compte de la nature et de la gravité de l’insuffisance dans le bon fonctionnement du système de gestion et de contrôle et de ses incidences financières sur le budget de l’Union ;
b) aux fins de l’application d’une correction forfaitaire ou extrapolée, exclut les dépenses irrégulières précédemment décelées par l’État membre qui ont fait l’objet d’un ajustement dans les comptes conformément à l’article 139, paragraphe 10, et les dépenses dont la légalité et la régularité font l’objet d’une évaluation en vertu de l’article 137, paragraphe 2 ;
c) tient compte des corrections forfaitaires ou extrapolées appliquées aux dépenses par l’État membre pour d’autres insuffisances graves qu’il a décelées lors de l’évaluation du risque résiduel pour le budget de l’Union.
8. Les règles spécifiques des Fonds applicables au FEAMP peuvent établir des règles complémentaires relatives aux corrections financières visées à l’article 144, paragraphe 7. »
13      Aux termes de l’article 152 du règlement n° 1303/2013 :
« 1. Le présent règlement n’affecte ni la poursuite ni la modification, y compris la suppression totale ou partielle, d’une intervention approuvée par la Commission sur la base du règlement (CE) n° 1083/2006 ou de tout autre instrument législatif applicable à cette intervention au 31 décembre 2013. Ledit règlement ou une autre législation applicable doit continuer à s’appliquer après le 31 décembre 2013 à ladite intervention ou aux opérations concernées jusqu’à leur achèvement. Aux fins du présent paragraphe, l’assistance couvre les programmes opérationnels et les grands projets.
2. Les demandes d’assistance qui sont présentées ou approuvées dans le cadre du règlement (CE) n° 1083/2006 du Conseil restent valables.
3. Lorsqu’un État membre a recours à la possibilité visée à l’article 123, paragraphe 3, il peut soumettre une demande à la Commission afin que, par dérogation à l’article 59, paragraphe 1, [sous] b), du règlement (CE) n° 1083/2006, l’autorité de gestion exécute les tâches de l’autorité de certification dans le cadre des programmes opérationnels correspondants mis en œuvre sur la base du règlement (CE) n° 1083/2006. La demande est assortie d’une évaluation réalisée par l’autorité d’audit. Si, sur la base des informations qui lui sont communiquées par l’autorité d’audit et de celles obtenues dans le cadre de ses propres audits, la Commission a pu s’assurer du bon fonctionnement des systèmes de gestion et de contrôle de ces programmes opérationnels et si elle estime que l’exercice des fonctions de l’autorité de certification par l’autorité de gestion ne portera pas atteinte à ce fonctionnement, elle notifie son accord aux États membres dans un délai de deux mois à compter de la date de réception de la demande. »
14      L’article 153 du règlement n° 1303/2013 énonce ce qui suit :
« 1. Sans préjudice des dispositions prévues à l’article 152, le règlement (CE) n° 1083/2006 est abrogé avec effet au 1er janvier 2014.
2. Les références faites au règlement abrogé s’entendent comme faites au présent règlement et sont à lire selon le tableau de correspondance figurant à l’annexe XIV. »
15      L’article 154 du règlement n° 1303/2013 dispose :
« Le présent règlement entre en vigueur le jour suivant celui de sa publication au Journal officiel de l’Union européenne.
Les articles 20 à 24, l’article 29, paragraphe 3, l’article 38, paragraphe 1, [sous] a), les articles 58, 60, 76 à 92, 118, 120, 121 et 129 à 147 du présent règlement sont applicables avec effet au 1er janvier 2014.
L’article 39, paragraphe 2, septième alinéa, deuxième phrase, et l’article 76, paragraphe 5, sont applicables à compter de la date à laquelle la modification du règlement financier sur les dégagements des crédits est entrée en vigueur. »
Antécédents du litige
16      Par décisions des 5 août, 22 août et 6 septembre 1994, la Commission a approuvé différents programmes d’interventions des Fonds européen de développement régional (FEDER), Fonds social européen (FSE) et Fonds européen d’orientation et de garantie agricole (FEOGA), au titre de l’objectif n° 1 pour le Land de Saxe en République fédérale d’Allemagne (ci-après les « interventions »).
17      Le 5 août 1994, la Commission a adopté la décision C(94) 1939/4, approuvant le programme opérationnel à dominante FEDER pour la région du Land de Saxe relevant de l’objectif n° 1.
18      Cette décision prévoyait une contribution des fonds structurels de 2 081 244 000 euros, dont 1 583 521 000 euros en provenance du FEDER. La décision C(94) 1939/4 a été modifiée, notamment, par la décision C(1999) 4923, du 29 décembre 1999, qui a augmenté la contribution au titre des fonds structurels à 2 169 919 000 euros, dont 1 662 875 000 euros au titre du FEDER.
19      Le 22 août 1994, la Commission a adopté la décision C (94) 2273/4 approuvant le programme opérationnel à dominante FEOGA pour la région du Land de Saxe relevant de l’objectif n° 1.
20      Cette décision prévoyait une contribution des fonds structurels de 621 481 000 euros, dont 100 701 000 euros au titre du FEDER. La décision C(94) 2273/4 a été modifiée, notamment, par la décision C(1999) 4200, du 7 décembre 1999, qui a augmenté la contribution des fonds structurels à 644 738 390 euros, dont à nouveau 100 701 000 euros au titre du FEDER.
21      Le 6 septembre 1994, la Commission a adopté la décision C(94) 1425, approuvant le programme opérationnel à dominante FSE pour la région du Land de Saxe relevant de l’objectif n° 1.
22      Cette décision prévoyait une contribution des fonds structurels de 659 812 000 euros, dont 325 805 000 euros au titre du FEDER. La décision C(94) 1425 a été modifiée, notamment, par la décision C(1999) 4285, du 23 décembre 1999, qui a ramené la contribution au titre des fonds structurels à 657 716 000 euros, dont 296 405 000 euros au titre du FEDER.
23      Par lettres du 22 octobre, du 12 novembre et du 20 décembre 2002, les autorités allemandes ont fait parvenir leur demande de versement du paiement final, accompagnée du certificat final des dépenses.
24      Par lettre du 27 novembre 2002, les autorités allemandes ont également transmis la déclaration prévue à l’article 8 du règlement (CE) n° 2064/97 de la Commission, du 15 octobre 1997, arrêtant les modalités détaillées d’application du règlement nº 4253/88 en ce qui concerne le contrôle financier effectué par les États membres sur les opérations cofinancées par les Fonds structurels (JO 1997, L 290, p. 1) pour les interventions.
25      Entre mai et novembre 2003, la Commission a, dans le cadre de son audit de clôture des programmes cofinancés par le FEDER, au cours de la période de programmation 1994‑1999, effectué plusieurs visites de contrôle.
26      Par lettre du 2 décembre 2004, la Commission a communiqué son rapport d’audit, qui a révélé plusieurs irrégularités.
27      Par lettre du 17 février 2005, les autorités allemandes ont présenté leurs observations sur ledit rapport d’audit et ont communiqué de nouveaux éléments.
28      Par lettre du 26 octobre 2005, la Commission a communiqué ses conclusions concernant l’audit et a annoncé l’ouverture de la procédure prévue à l’article 24 du règlement n° 4253/88.
29      Par lettre du 13 janvier 2006, les autorités allemandes se sont opposées une nouvelle fois à l’application de corrections financières forfaitaires et extrapolées et ont soumis de nouveaux éléments attestant la légalité des dépenses ayant bénéficié d’un soutien financier.
30      Par lettres du 13 et du 26 octobre 2006, la Commission a communiqué ses conclusions à la suite de l’examen réalisé conformément à l’article 24 du règlement n° 4253/88.
31      À la suite d’une réunion bilatérale qui s’est tenue le 10 novembre 2006, les autorités allemandes ont, par lettre du 13 décembre 2006 et par courrier électronique du 31 août 2007, communiqué de nouvelles observations et des éléments de preuve supplémentaires.
32      En adoptant, le 19 décembre 2008, la décision C(2008) 8465 final, relative à la réduction du concours communautaire du FEDER à un programme opérationnel dans la région concernée par l’objectif n° 1 du Land de Saxe en République fédérale d’Allemagne (1994-1999), accordé par les décisions C(94) 1939/4 de la Commission, du 5 août 1994, C(94) 2273/4 de la Commission, du 22 août 1994, et C(94) 1425 de la Commission, du 6 septembre 1994, la Commission a réduit le concours financier du FEDER pour les interventions de 127 957 617,62 euros, de 22 290 833,65 euros et de 7 835 083,30 euros (ci-après la « décision attaquée »).
Procédure et conclusions des parties
33      Par requête déposée au greffe du Tribunal le 4 mars 2009, la République fédérale d’Allemagne a formé le présent recours.
34      Le 11 mai 2010, la Commission a demandé au Tribunal de joindre la présente affaire aux affaires T‑265/08, T‑270/08, T‑21/10, T‑104/10, T‑114/10 et T‑116/10, Allemagne/Commission et, à défaut, de la suspendre, dans la mesure où toutes ces affaires portent sur une décision par laquelle elle a procédé à des corrections financières dans le cadre de la clôture des derniers programmes des fonds structurels pour la période de programmation 1994‑1999 qui étaient encore ouverts.
35      Le 18 mai 2010, la République fédérale d’Allemagne a introduit une demande de traitement confidentiel, à l’égard du Royaume d’Espagne, de certains éléments contenus dans le dossier.
36      Par actes déposés au greffe du Tribunal respectivement le 23 avril 2010 et le 9 juillet 2010, le Royaume d’Espagne et le Royaume des Pays-Bas ont demandé à intervenir dans la présente procédure au soutien des conclusions de la République fédérale d’Allemagne. Par décision du 9 juillet 2010, le président de la quatrième chambre du Tribunal a, d’une part, autorisé le Royaume d’Espagne à intervenir au soutien des conclusions de la République fédérale d’Allemagne, conformément à l’article 116, paragraphe 6, du règlement de procédure du Tribunal du 2 mai 1991, et, d’autre part, réservé sa décision quant à la demande de traitement confidentiel à la communication ultérieure du rapport d’audience.
37      Le 29 juillet 2010, la République fédérale d’Allemagne a introduit une demande de traitement confidentiel, à l’égard du Royaume des Pays-Bas, de certains éléments contenus dans le dossier.
38      Par décision du 31 août 2010, le président de la quatrième chambre du Tribunal a, d’une part, autorisé le Royaume des Pays-Bas à intervenir au soutien des conclusions de la République fédérale d’Allemagne conformément à l’article 116, paragraphe 6, du règlement de procédure du 2 mai 1991, et, d’autre part, réservé sa décision quant à la demande de traitement confidentiel à la communication ultérieure du rapport d’audience.
39      Par ordonnance du 9 septembre 2010, le président de la quatrième chambre du Tribunal a décidé de suspendre la procédure dans la présente affaire, soit jusqu’à l’expiration des délais de pourvoi contre les décisions du Tribunal mettant fin à l’instance dans les affaires T‑265/08, Allemagne/Commission et T‑270/08, Allemagne/Commission, soit jusqu’au prononcé des décisions de la Cour statuant sur les pourvois formés contre les décisions du Tribunal dans lesdites affaires.
40      Le 24 juin 2015, la Cour a prononcé l’arrêt Allemagne/Commission (C‑549/12 P et C‑54/13 P, ci-après l’« arrêt sur pourvoi », EU:C:2015:412), par lequel cette dernière a annulé les décisions de correction financière en cause dans ces affaires, relatives à des programmes de financement antérieurs à l’année 2000, en soulevant d’office la violation par la Commission du délai de six mois prévu par l’article 100, paragraphe 5, du règlement n° 1083/2006.
41      Par l’arrêt sur pourvoi, les arrêts du 19 septembre 2012, Allemagne/Commission (T‑265/08, EU:T:2012:434), et du 21 novembre 2012, Allemagne/Commission (T‑270/08, non publié, EU:T:2012:612), ont également été annulés, dans la mesure où le Tribunal avait rejeté les recours formés par la République fédérale d’Allemagne.
42      Le 2 juillet 2015, le Tribunal a invité les parties à soumettre leurs observations sur l’incidence, dans la présente affaire, de l’arrêt sur pourvoi.
43      Les 14 et 16 juillet 2015, la Commission et la République fédérale d’Allemagne ont, respectivement, présenté leurs observations.
44      Dans ses observations, la Commission a attiré l’attention du Tribunal sur les pourvois formés contre les arrêts du 20 janvier 2015, Espagne/Commission (T‑111/12, non publié, EU:T:2015:28), du 20 janvier 2015, Espagne/Commission (T‑109/12, non publié, EU:T:2015:29), et du 15 juillet 2015, Portugal/Commission (T‑314/13, non publié, EU:T:2015:493), par lesquels le Tribunal avait annulé les décisions de corrections financières en cause, relatives à des programmes de financements antérieurs à l’année 2000, pour violation par la Commission du délai de six mois prévu par l’article 100, paragraphe 5, du règlement n° 1083/2006.
45      Le 16 décembre 2015, le Tribunal a invité les parties à soumettre leurs observations sur l’incidence, dans la présente affaire, dans la perspective d’une éventuelle suspension, des pourvois formés par la Commission contre les arrêts du 20 janvier 2015, Espagne/Commission (T‑111/12, non publié, EU:T:2015:28), du 20 janvier 2015, Espagne/Commission (T‑109/12, non publié, EU:T:2015:29), et du 15 juillet 2015, Portugal/Commission (T‑314/13, non publié, EU:T:2015:493).
46      Par courrier du 5 janvier 2016, la Commission a indiqué ne soulever aucune objection à la suspension de la présente affaire, dans l’attente du prononcé par la Cour des décisions dans les affaires C‑139/15 P et C‑140/15 P, Commission/Espagne et C‑495/15 P, Commission/Portugal.
47      Par courrier du 6 janvier 2016, la République fédérale d’Allemagne a informé le Tribunal qu’elle s’opposait à la suspension de la présente affaire afin de ne pas retarder davantage son traitement.
48      Par décision du 12 janvier 2016, le président de la quatrième chambre du Tribunal a décidé de suspendre la procédure dans la présente affaire jusqu’au prononcé par la Cour des décisions dans les affaires C‑139/15 P et C‑140/15 P, Commission/Espagne et C‑495/15 P, Commission/Portugal.
49      Par arrêts du 21 septembre 2016, Commission/Espagne (C‑139/15 P, EU:C:2016:707), et du 21 septembre 2016, Commission/Espagne (C‑140/15 P, EU:C:2016:708), la Cour a rejeté les pourvois formés contre les arrêts du 20 janvier 2015, Espagne/Commission (T‑111/12, non publié, EU:T:2015:28), et du 20 janvier 2015, Espagne/Commission (T‑109/12, non publié, EU:T:2015:29).
50      La composition des chambres du Tribunal ayant été modifiée, le juge rapporteur a été affecté à la cinquième chambre, à laquelle la présente affaire a, par conséquent, été attribuée.
51      Par courrier du 7 octobre 2016, la République fédérale d’Allemagne a demandé au Tribunal la reprise de la procédure dans la présente affaire.
52      Par courrier du 21 octobre 2016, la Commission a informé le Tribunal qu’elle ne s’opposait pas à la reprise de la procédure dans la présente affaire.
53      Par ordonnance du 10 novembre 2016, Commission/Portugal (C‑495/15 P, non publiée, EU:C:2016:907), l’affaire C‑495/15 P a été radiée du registre de la Cour à la suite du désistement de la Commission.
54      Le 20 décembre 2016, le Tribunal a invité les parties à soumettre leurs observations sur l’incidence dans la présente affaire des arrêts du 21 septembre 2016, Commission/Espagne (C‑139/15 P, EU:C:2016:707), et du 21 septembre 2016, Commission/Espagne (C‑140/15 P, EU:C:2016:708).
55      Le 9 janvier 2017, la République fédérale d’Allemagne et la Commission ont présenté leurs observations.
56      La Commission a fait valoir que le Tribunal disposait de tous les éléments nécessaires pour rendre son jugement dans la présente affaire tandis que la République fédérale d’Allemagne a soutenu que la décision attaquée encourait l’annulation pour violation par la Commission du délai de six mois, prévu par l’article 100, paragraphe 5, du règlement n° 1083/2006.
57      Le 10 mars 2017, le Tribunal a invité les parties à soumettre leurs observations sur le relevé d’office par le Tribunal, dans le cadre de l’article 132 de son règlement de procédure, du moyen tiré d’une violation par la Commission des formes substantielles.
58      Le 14 mars 2017, la Commission a présenté ses observations et a fait valoir que le Tribunal pouvait, par voie d’ordonnance, déclarer le recours manifestement fondé, en vertu de l’article 132 du règlement de procédure.
59      Le 23 mars 2017, la République fédérale d’Allemagne a présenté ses observations et soutenu, à nouveau, que la décision attaquée encourait l’annulation en raison d’une violation par la Commission des formes substantielles.
60      La République fédérale d’Allemagne, soutenue par le Royaume d’Espagne et le Royaume des Pays-Bas, conclut à ce qu’il plaise au Tribunal :
–        annuler la décision attaquée ;
–        condamner la Commission aux dépens.
61      La Commission conclut à ce qu’il plaise au Tribunal :
–        rejeter le recours ;
–        condamner la République fédérale d’Allemagne aux dépens.
En droit
62      Aux termes de l’article 132 du règlement de procédure du Tribunal, lorsque la Cour ou le Tribunal a déjà statué sur une ou plusieurs questions de droit identiques à celles soulevées par les moyens du recours et que le Tribunal constate que les faits sont établis, il peut, après la clôture de la phase écrite de la procédure, les parties entendues, décider de déclarer le recours manifestement fondé, par voie d’ordonnance motivée comportant référence à la jurisprudence pertinente.
63      En l’espèce, le Tribunal estime que les conditions d’application de l’article 132 du règlement de procédure sont réunies et décide de statuer sans poursuivre la procédure.
64      En premier lieu, au soutien de son recours, la République fédérale d’Allemagne fait valoir que la décision attaquée encourt l’annulation dans la mesure où elle a été adoptée postérieurement à l’expiration du délai légal de six mois, fixé par l’article 100, paragraphe 5, du règlement n° 1083/2006.
65      Pour sa part, tout d’abord, la Commission considère que le règlement n° 1083/2006 ne constitue pas le cadre juridique pertinent pour apprécier les règles de procédure applicables aux décisions de correction financière pour les programmes antérieurs à la période 2007‑2013.
66      Elle soutient que le règlement pertinent pour apprécier le respect ou non des formes substantielles en l’espèce est le règlement n° 4253/88, dont l’article 24 ne fixe aucun délai pour l’adoption d’une décision de correction financière.
67      Ensuite, dans l’hypothèse de l’applicabilité en l’espèce du règlement n° 1083/2006, la Commission précise que les délais fixés par l’article 100, paragraphe 5, dudit règlement ne concernent que les programmes mis en place après le 1er janvier 2007 et ne sauraient s’appliquer aux programmes antérieurs à cette date.
68      Elle ajoute qu’il ressort de l’article 105 du règlement n° 1083/2006 que les projets cofinancés approuvés dans le cadre d’un régime antérieur continuent de relever de ce régime jusqu’à leur clôture.
69      De même, selon la Commission, les règles de procédure constituent un tout indissociable avec les règles de fond et il ne saurait y avoir application rétroactive des délais fixés par l’article 100, paragraphe 5, du règlement n° 1083/2006.
70      À cet égard, il convient de relever que la République fédérale d’Allemagne a fait état du moyen tiré d’une violation de l’article 100, paragraphe 5, du règlement n° 1083/2006 non dans la requête, mais dans le cadre de ses observations sur l’incidence dans la présente affaire de l’arrêt sur pourvoi, de sorte que ce moyen doit être considéré comme un moyen nouveau.
71      Toutefois, indépendamment de la question de la recevabilité d’un tel moyen nouveau, il y a lieu de relever que, selon la jurisprudence, le non-respect des règles de procédure relatives à l’adoption d’un acte faisant grief constitue une violation des formes substantielles, qu’il appartient au juge de l’Union européenne de soulever même d’office (voir arrêts du 4 septembre 2014, Espagne/Commission, C‑192/13 P, EU:C:2014:2156, point 103 et jurisprudence citée, et du 4 septembre 2014, Espagne/Commission, C‑197/13 P, EU:C:2014:2157, point 103 et jurisprudence citée).
72      À cet égard, il convient de rappeler qu’il est de jurisprudence constante que, hors les cas particuliers tels que, notamment, ceux prévus par les règlements de procédure des juridictions de l’Union, le juge de l’Union ne peut fonder sa décision sur un moyen de droit relevé d’office, fût‑il d’ordre public, sans avoir invité au préalable les parties à présenter leurs observations sur ledit moyen (voir arrêt sur pourvoi, point 93 et jurisprudence citée).
73      Or, dans la présente affaire, premièrement, en ce qui concerne la question du délai dans lequel une décision de correction financière doit être adoptée, le Tribunal a interrogé les parties dans le cadre d’une mesure d’organisation de la procédure adoptée à la suite du prononcé de l’arrêt sur pourvoi, par lequel la Cour a annulé les décisions de correction financière en cause, relatives à des programmes de financement antérieurs à l’année 2000, en soulevant d’office la violation par la Commission du délai de six mois prévu par l’article 100, paragraphe 5, du règlement n° 1083/2006.
74      Deuxièmement, le Tribunal a adopté une seconde mesure d’organisation de la procédure, à la suite des arrêts du 21 septembre 2016, Commission/Espagne (C‑139/15 P, EU:C:2016:707), et du 21 septembre 2016, Commission/Espagne (C‑140/15 P, EU:C:2016:708).
75      Partant, force est de constater que les parties ont été en mesure de présenter leurs observations, relativement à l’application du délai prévu à l’article 100, paragraphe 5, du règlement n° 1083/2006.
76      En second lieu, s’agissant de la réglementation applicable dans la présente affaire, il importe de rappeler que le règlement n° 4253/88 a été abrogé, avec effet au 1er janvier 2000, par le règlement n° 1260/1999. Ce dernier règlement a été abrogé, avec effet au 1er janvier 2007, par le règlement n° 1083/2006, lequel a été abrogé par le règlement n° 1303/2013, avec effet au 1er janvier 2014.
77      Ainsi, il y a lieu, tout d’abord, de relever que le règlement n° 1303/2013 ne saurait s’appliquer dans la présente affaire, dans la mesure où la décision attaquée a été adoptée en 2008.
78      Ensuite, s’agissant du règlement n° 1083/2006, s’il ressort, certes, de l’article 108, second alinéa, dudit règlement que certaines de ses dispositions s’appliquent pour les programmes de financement de la période 2007-2013, il n’en demeure pas moins que ce dernier dispose également que l’article 100 dudit règlement fixant les délais de procédure est applicable à partir du 1er janvier 2007, sans aucune précision quant à la période de financement couverte.
79      Il convient d’ajouter que l’article 100 dudit règlement s’applique également aux programmes antérieurs à la période 2007-2013, et ce conformément au principe selon lequel les règles de procédure trouvent à s’appliquer immédiatement après leur entrée en vigueur (arrêts du 4 septembre 2014, Espagne/Commission, C‑192/13 P, EU:C:2014:2156, point 98 ; du 4 septembre 2014, Espagne/Commission, C‑197/13 P, EU:C:2014:2157, point 98 ; du 22 octobre 2014, Espagne/Commission, C-429/13 P, EU:C:2014:2310, point 31 ; du 4 décembre 2014, Espagne/Commission, C‑513/13 P, non publié, EU:C:2014:2412, point 48, et du 24 juin 2015, Espagne/Commission, C‑263/13 P, EU:C:2015:415, point 53 ; voir également, en ce sens, arrêt sur pourvoi, point 84).
80      Cette jurisprudence a, par ailleurs, été confirmée par les arrêts du 21 septembre 2016, Commission/Espagne (C‑139/15 P, EU:C:2016:707, point 89), et du 21 septembre 2016, Commission/Espagne (C‑140/15 P, EU:C:2016:708, point 89), ce que la Commission ne conteste pas.
81      En l’espèce, la procédure administrative ayant conduit à l’adoption de la décision attaquée, modifiant le concours financier accordé à la République fédérale d’Allemagne pour la période 1994-1999, s’est déroulée de 2003 à 2008, période durant laquelle, le 1er janvier 2007, l’article 100 du règlement n° 1083/2006 est devenu applicable.
82      Toutefois, il ressort également du dossier de la présente affaire qu’une audition s’est tenue à Bruxelles (Belgique) le 10 novembre 2006 entre la Commission et les représentants de la République fédérale d’Allemagne.
83      Aussi, au jour de l’audition, la procédure administrative était soumise aux dispositions du règlement n° 1260/1999 (voir, par analogie, arrêts du 4 septembre 2014, Espagne/Commission, C‑192/13 P, EU:C:2014:2156, point 98 ; du 4 septembre 2014, Espagne/Commission, C‑197/13 P, EU:C:2014:2157, point 98, et du 22 octobre 2014, Espagne/Commission, C‑429/13 P, EU:C:2014:2310, point 31).
84      En effet, il importe de préciser qu’il résulte de l’article 56 du règlement n° 1260/1999 que l’article 39, paragraphe 3, dudit règlement est applicable dès l’entrée en vigueur du règlement, à savoir le troisième jour suivant celui de sa publication au Journal officiel des Communautés européennes, le 26 juin 1999, sans aucune précision quant à la période de financement couverte.
85      À cet égard, il ressort d’une lecture combinée de l’article 39, paragraphe 3, du règlement n° 1260/1999 et de l’article 5, paragraphe 3, du règlement n° 448/2001 que la Commission se devait d’adopter une décision de correction financière dans un délai de trois mois à compter de l’audition des représentants de la République fédérale d’Allemagne, de sorte que ce délai expirait, en l’espèce, le 10 février 2007.
86      Or, ledit délai n’ayant pas expiré au jour de l’entrée en vigueur de l’article 100 du règlement n° 1083/2006, le respect par la Commission des formes substantielles dans le cadre de l’adoption de la décision attaquée se doit d’être apprécié relativement au délai de six mois prévu par ledit article et non relativement au délai de trois mois prévu par l’article 39, paragraphe 3, du règlement n° 1260/1999.
87      Ainsi, à partir du 1er janvier 2007 et conformément au principe selon lequel les règles de procédure trouvent à s’appliquer immédiatement après leur entrée en vigueur, la Commission se devait de respecter, aux fins de l’adoption de la décision attaquée, le délai de six mois prévu par l’article 100, paragraphe 5, du règlement n° 1083/2006.
88      À cet égard, il y a lieu de préciser que, en application de cette disposition, la Commission se doit de statuer sur la correction financière dans les six mois suivant la date de l’audition des représentants de l’État membre concerné, dans l’hypothèse où ce dernier n’accepterait pas ses conclusions provisoires. En l’absence d’audition, la période de six mois débute deux mois après la date de l’envoi de la lettre d’invitation par la Commission.
89      Ainsi, lorsque l’État membre n’accepte pas les conclusions provisoires de la Commission, l’envoi, par cette dernière, d’une lettre d’invitation à une audition ou la tenue d’une audition constitue, selon le cas, le point de départ de la computation du délai.
90      Or, d’une part, il ressort du dossier de la présente affaire que l’audition des représentants de la République fédérale d’Allemagne s’est tenue le 10 novembre 2006.
91      D’autre part, force est de constater que la décision attaquée a été adoptée le 19 décembre 2008, soit près de deux ans après l’audition du 10 novembre 2006, ce que la Commission ne conteste pas.
92      Partant, la Commission n’a pas respecté le délai de six mois fixé à l’article 100, paragraphe 5, du règlement n °1083/2006.
93      Par conséquent, il y a lieu de déclarer le recours manifestement fondé et d’annuler la décision attaquée.
Sur les dépens
94      Aux termes de l’article 134, paragraphe 1, du règlement de procédure, toute partie qui succombe est condamnée aux dépens, s’il est conclu en ce sens. La Commission ayant succombé, il y a lieu de la condamner aux dépens, conformément aux conclusions de la République fédérale d’Allemagne.
95      Le Royaume d’Espagne et le Royaume des Pays-Bas supporteront leurs propres dépens, conformément aux dispositions de l’article 138, paragraphes 1, du règlement de procédure.
Par ces motifs,
LE TRIBUNAL (cinquième chambre)
ordonne :
1)      La décision C(2008) 8465 final de la Commission, du 19 décembre 2008, relative à la réduction du concours communautaire du Fonds européen de développement régional à un programme opérationnel dans la région concernée par l’objectif n° 1 du Land de Saxe en République fédérale d’Allemagne (1994-1999), accordé par les décisions C(94) 1939/4 de la Commission, du 5 août 1994, C(94) 2273/4 de la Commission, du 22 août 1994, et C(94) 1425 de la Commission, du 6 septembre 1994, est annulée.
2)      La Commission européenne supportera, outre ses propres dépens, ceux exposés par la République fédérale d’Allemagne.
3)      Le Royaume d’Espagne et le Royaume des Pays-Bas supporteront leurs propres dépens.
Fait à Luxembourg, le 13 septembre 2017.
Le greffier
Le président
E. Coulon
D. Gratsias
*      Langue de procédure : l’allemand.