Geotrichum candidum

Geotrichum candidummerupakan organisme yang dapat ditemukan padamikrobioma manusia, terutama pada kulit, dahak, dan feses yang ditemukan pada 25-30% spesimen.Organisme tersebut termasuk kedalam kelompok fungi yang umumnya dapat ditemukan di tanah dan dapat diisolasi di seluruh dunia.
G. candidumadalah agen yang dapat menyebabkan penyakit pada manusia berupageotrichosis, kemudian penyakitbusuk asamyang dapat menginfeksi buah-buahan sepertijeruk,tomat,wortel, dan sayuran.Organisme tersebut dapat mempengaruhi hasil panen buah durian, yaitu padaDurio graveolens.
G. candidumbiasa digunakan secara luas dalam produksi produk susu termasuk keju sepertiCamembert,Saint-Nectaire,Reblochondan lain-lain. Selain itu, jamur tersebut juga dapat ditemukan dalamyogurtNordikyang dikenal sebagaiviili, berperan dalam menentukan tekstur dari suatu produk.
Sebuah studi pada tahun 2001 menunjukkan bahwaG. candidummengonsumsipolikarbonat.Namun, efek dari hal tersebut belum diketahui.
Pada tahun 1809, genusGeotrichumdideskripsikan olehJohann Heinrich Friedrich Linkuntuk mengakomodasi spesiesG. candidumyang ditemukan pada daun yang membusuk. Sejak saat itu, lebih dari 130 taksa berhasil dideskripsikan dan diidentifikasi ke dalam genus tersebut serta diperoleh ratusan sinonim.Misalnya,G. candidumsalah diklasifikasikan sebagaiOidium lactisberdasarkan banyak literatur awal.SpesiesGeotrichummemiliki kemiripan denganTrichosporondanProtendomycopsis.Namun,Geotrichummerupakan afiliasi dariascomycetoussedangkan yang terakhir adalah anggota kelompokBasidiomycota. SpesiesGeotrichumjuga terkadang salah diklasifikasikan sebagai anggota genusDipodaskusyang tumbuh dengan cepat, memiliki hifa yang bercabang tidak teratur, lebar 10-14 μm dan memproduksiaskusspora tunggal. Berbeda denganGeotrichum, anggota genusDipodascustidak mempunyai percabangan yang dikotomis dari hifa perifer serta memiliki tingkat pertumbuhan yang umumnya kurang dari 3 mm per hari.
Galactomyces candidus, sebelumnya dianggap kedalam kelompok takson yang berbeda, kemudian ditemukan tahap seksual dariG. candidummenggunakan metode berbasis urutan gen.Geotrichum candidumsecara luas terdiri dari 3klade, yaitu spesiesG. candidum,G. clavatumdanG. fici, di mana ketiganya memiliki potensi sebagai patogen.SpesiesGeotrichumdapat dibedakan dengan menggunakan analisis sekuens18S rRNAatau dengan menggunakan daerahpengatur jarak yang ditranskripsi internaldari gen RNA ribosom inti.
Dalam keadaan anamorf,G. candidummemiliki koloni yang tipis, menyebar, lembut, berwarna krem dan putih.G. candidummemiliki hifa yang tampak merayap,berseptadan sebagian besar terendam.Hifa memiliki warna yang tampakhialinatau berpigmen ringan.Ketika hifa yang terbentuk berupa hifa aerial atau mengudara, ia berubah bentuk dariarthroconidiamenjadi silinder atau berbentuk ellipsoidal.Klamidosporabersifat soliter, subglobose, dan terlahir dari hifa yang tidak terdiferensiasi.Blastoconidiaterkadang berkembang pada hifa secara lateral.Konidiadapat tampak bersifatarthrosporous, terminal atau interkalar/kabisat, dan juga pada permukaan agar-agar tampak aerial. Konidia memiliki ukuran berkisar antara 4,8-12,5 μm x 2,4–2,5 μm.
G. candidumdianggaphomotaliktetapi sebagian besar merupakan isolat steril.Reproduksi seksual pertama kali diamati pada strain yang diisolasi dari tanah diPuerto Rico.Jamur dapat menghasilkan askus berbentuk bulat yang mengandungaskosporatunggal, berdinding tebal, tidakberinti, berbentuk bulat hingga oval dengan ukuran 6-7 μm kali 7–10 μm.Askospora memiliki dinding bagian dalam yang halus, sedangkan dinding luarnya berkerut.Septa dilubangi olehmikrospora, dan disusun dalam struktur cincin. Pada tahap seksual, koloni dapat tumbuh lebih cepat dibandingkan dengan pada tahap aseksual. Koloni dapat tumbuh dengan kecepatan 5–7 mm setiap hari pada suhu 24 °C (75 °F) .
Geotrichum candidummembentuk koloni yang memiliki kemampuan tumbuh cepat. Koloni dapat tumbuh hingga memiliki diameter dengan ukuran 5–6 cm setelah 5 hari pada media berupaagar Sabouraud-glukosa, agar wort dan media sintetis. Secara mikroskopis, pertumbuhan ditandai dengan tumbuhnya hifa bercabangdikotomisyang menyerupaigarpudi sepanjang tepi koloni. Rantai kondial berubah menjadi aerial, tegak dan memiliki ukuran 6–12 (−20) x 3–6 (−9) μm. Jamur dapat tumbuh pada berbagai buah seperti jeruk dan menyebabkan penyakit asam membusuk. Hal tersebut cenderung terjadi pada buah-buahan yang disimpan pada suhu 0–5 °C (32–41 °F) sehingga menyebabkan pembusukan. Konidia tidak berwarna dan memiliki lapisan berlendir.G. candidumterkadang dapat ditemukan pada usus manusia,feses,dahakdan pada kulit. Jamur tersebut dapat tumbuh di tanah, air, kotoran, berbagai substrat tanaman, adonan roti, sekam fermentasi, roti, susu dan produk susu.Pertumbuhan optimal dapat terjadi pada suhu 25 °C (77 °F) dengan kisaran pH 5,0–5,5.Rentang suhu dapat berubah tergantung pada permukaan tempat jamur tersebut tumbuh. Contohnya pada tumbuhan, suhu optimal berkisar antar 25–27 °C (77–81 °F). Sedangkan pada hewan, suhu optimal berkisar antara 30–31 °C (86–88 °F).Suhu maksimum untuk pertumbuhan berkisar antara 35–38 °C (95–100 °F).Jamur memerlukan nutrisi berupa sumber karbon untuk pertumbuhannya. Pertumbuhan dapat didukung olehD-glukosa,D-manosa,D-xilosa,L-sorbosa,D-fruktosa,D-galaktosa,sukrosa,D-manitol,SorbitolD-sorbital,etanoldangliserol. Keseimbangan nutrisi berupa karbon dan nitrogen memiliki peranan penting dalam tahap sporulasi.
G. candidumsangat umum ditemukan di tanah dan telah diisolasi dari substrat diKanada,Amerika Serikat,Inggris,Jerman,Austria,India,Afrika Selatan,Jepang,Brasil, danPeru.Ia dapat berperan sebagai agen penyebab penyakit asam membusuk pada buah jeruk serta busuk dengan tekstur lunak dapat memiliki keterkaitan dengan bau buah yang di emisi kan.Jamur tersebut juga merupakan agen pembusukan pada produk pasca panen seperti melon, labu, dan mentimun. Jamur dapat berperan dalam pembusukan buah tomat saat disimpan pada rentang suhu 0–5 °C (32–41 °F).
Ini merupakan koloni alami yang dapat diperoleh dari produk susu tertentu terutama keju dan terkadang digunakan dan diinokulasi pada kulit di permukaan keju.
G. candidumdapat digunakan secara komersial dan diinokulasi dalam proses pembuatan keju.Kultur dapat dicampur dengan susu, air garam, atau disemprotkan pada permukaan keju. pH optimal untuk pembuatan keju berkisar antara 4,4 hingga 6,7. Pada tahap awal pematangan, jamur tumbuh hampir di seluruh permukaan keju. Jamur tersebut dapat ditemukan pada keju lunak seperti Camembert dan keju semi-keras seperti Saint-Nectaire dan Reblochon.Pada keju Camembert, jamur tumbuh pada bagian luar keju membentuk lapisan kulit yang tipis.Pada kejuSaint-Marcellin, jamur bertanggung jawab dalam menentukan keseragaman, warna putih, dan lapisan beludru pada keju.Enzim lipase dan protease yang dihasilkan olehG. candidumdapat melepaskan asam lemak dan peptida yang memberikan rasa yang khas pada keju.G. candidumdapat mengurangi rasa pahit pada keju melalui aktivitasaminopeptidaseyang berperan dalam hidrolisis peptida hidrofobik dengan berat molekul yang rendah. Aminopeptidase dapat memberikan pengaruh terhadap aroma yang dihasilkan pada Norman Camembert tradisional. Jamur juga dapat menetralkan pH dadih dengan mengkatabolismeasam laktatyang dihasilkan oleh bakteri.G. candidummempersiapkan keju untuk kolonisasi bakteri yang sensitif terhadap asam, sepertiBrevibacterium.Jamur dapat menghambat pertumbuhan mikroba patogen, sepertiListeria monocytogenes.StrainG. candidumyang bersifat komersial tersedia untuk pematangan keju.