TRIF

TRIF, také známý jako TICAM-1, je adaptorový protein Toll-like receptoru (TLR), hraje klíčovou roli při iniciaci downstream signálních drah v reakci na aktivaci TLR,,,, zejména TLR3 a TLR4, což vede k produkci interferonů a dalších zánětlivých mediátorů. Tato reakce pomáhá bojovat proti virovým infekcím a dalším hrozbám pro imunitní systém těla,.
TRIF, esenciální pro přenos signálů uvnitř buněk, je komplexní protein s několika klíčovými doménami, které ovlivňují jeho funkci. Patří sem N-terminální doména (NTD) podílející se na autoregulaci, konsensus TRAF6-vazebný motiv, Toll/interleukin-1 receptorová (TIR) doména a RIP homotypický interakční motiv (RHIM) na C-konci. U lidí se TRIF skládá ze 712 aminokyselin, u myší obsahuje 732 aminokyselin,,,. NTD TRIF hraje důležitou úlohu ve své funkci interakcí s TBK1 a IKKi/IKKɛ, členy kinázové rodiny IKK, což usnadňuje následnou fosforylaci a aktivaci interferonového regulačního faktoru 3 (IRF3),,,). TIR doména TRIF interaguje s TIR doménou TRAM nebo TIR doménou TLR3 během náboru do endozomálního TLR4 a TLR3, na druhé straně se C-terminální oblast TRIF podílí na aktivaci NF-kB, iniciaci apoptózy,nebo, pokud je kaspáza-8 inhibována, indukci nekroptózy. Doména TIR a C-terminální oblast TRIF, jsou zodpovědné za samovolnou asociaci, což je velmi důležitá událost v signalizaci proteiny obsahujícími doménu TIR. NTD, když je izolovaná, je monomerní se šroubovicovou strukturou. Tato doména působí jako negativní regulátor aktivace promotoru IFN-β a aktivity reportérového genu závislého na NF-kBzprostředkované TRIF interakcí přímo s doménou TIR, aby se inhibovala samovolná asociace molekul TRIF. TRIF je zodpovědný za zprostředkování TLR4-dependentní aktivace produkce NF-κB a IFN-β,,. Stejně jako za TLR3-dependentní produkci IFN-β,. TIR doména je nezbytná k umožnění interakce domény TIR:TIR, dále také usnadňuje sestavení signálního komplexu obsahujícího TLR a cytosolické TRAM a TRIF, naopak N-terminální oblast dává vzniknout downstream signalizacím zprostředkovaným interakcemi TRAF6 s dalšími signálními molekulami,,. Signalizace prostřednictvím TRIF dokáže aktivovat několik transkripčních faktorů, včetně NF-κB, IRF3 a AP-1, což dále vede k produkci interferonů typu I a ke zrání myeloidních dendritických buněk,,,. Nicméně biologické odpovědi, které pocházejí ze signalizace závislé na TRIF se formují v závislosti na tom, o jaký buněčný typ se jedná, tak i na specifikaci aktivovaného TLR. TRIF je široce exprimován  klidovými buňkami, v jejichž cytoplazmách je lokalizován,. K aktivaci TLR3 pomocí dvouvláknové RNA se TRIF přechodně kolokalizuje s receptorem předtím, než se znovu rozdělí a organizuje do struktur podobných skvrnám, které s největší pravděpodobností slouží jako centra pro následné signalizační reakce,, naproti tomu se v průběhu signalizace TLR4 TRIF spojuje s internalizovaným TLR4, a to prostřednictvím endozomální TRAM. Důsledky signalizace TLR závisí na různých fyziologických a patologických podnětech, přičemž dráhu TRIF řídí množství pozitivních a negativních regulátorů. Tyto regulátory hrají zásadní roli v TLR3- a TLR4-zprostředkovaných signalizačních reakcích a mohou být potenciálně využity pro selektivní manipulaci s různými TLR signalizačními rameny.
Pomocné faktory na buněčném povrchu mohou zlepšit signalizaci TRIF. Například CD16 byl identifikován jako pozitivní regulátor TRIF-dependentních TLR4 odpovědí na LPS v lidských monocytárních buňkách. Modulací exprese IRAK-M a antagonisty IL-1R, CD16 zvyšuje TRIF-dependentní signalizaci, ale snižuje MyD88-dependentní signalizaci. Podobně CD14, známý pro svou roli při senzibilizaci signalizace TLR4 závislého na LPS, se podílí na podpoře signalizace TLR3, pravděpodobně prostřednictvím zvýšení příjmu ligandu a dodání do lysozomálního kompartmentu obsahujícího TLR3. To podtrhuje promiskuitní roli CD14 v signalizaci TLR, přesahující odpovědi TLR4,. Kromě toho bylo identifikováno několik molekul, které zesilují TLR reakce regulací endozomální translokace a signalizace - například TRIL, původně identifikovaný jako protein vázající LPS, zesiluje signalizaci TLR4i TLR3 lokalizací do endozomálního kompartmentu. Podobně UNC93B působí jako molekula chaperonu usnadňující translokaci TLR citlivých na nukleovou kyselinu do endolysozomů, což je klíčové pro jejich signalizační funkci,,,. Přesahující modulaci buněčného povrchu působí různé pozitivní regulátory signalizace TRIF na úrovni adaptorových a downstream signálních molekul. Členové rodiny TRIM E3 ubikvitin ligáz, jako je TRIM56a TRIM62, podporují signalizaci TLR závislou na TRIF zvýšením aktivace NF-kB a AP-1,. Tyto ligázy interagují přímo s TRIF, čímž modulují downstream signalizační události. Kromě toho byl nukleární BS69, původně charakterizovaný jako transkripční korepresor, identifikován jako pozitivní regulátor signalizace TLR3 zprostředkované TRIF. Rozpoznáním methylovaného histonu H3.3k36 BS69 zvyšuje aktivaci NF-kB závislou na TRIF a produkci IFN typu I,,,,. Dále se imunoproteazomové podjednotky jako LMP7, LMP2 a LMP10 podílejí na pozitivní regulaci signalizace TLR4 zprostředkované TRIF/TRAM, zejména v kontextu produkce NO,,
Dráha TRIF, která je silným zánětlivým signalizačním modulem, podléhá přísné regulaci mnoha hostitelskými faktory, naopak několik patogenů vyvinulo strategie pro zacílení na TRIF-dependentní signalizaci jako prostředek úniku hostitele. Značné množství faktorů odvozených od hostitele a patogenu má inhibiční účinky na dráhu TRIF, které působí na různých úrovních včetně receptoru, adaptéru a downstream signalizačních složek. To podtrhuje kritický význam signální dráhy TRIF pro hostitele.