Citrus

Citrusest ungenredeplantesangiospermesde lafamilledesRutaceae,sous-familledesAurantioideae(en),tribudesCitreae(en),sous-tribudesCitrinae. Ce genre contient les arbres donnant les fruits communément appelés«agrumes»: orange, citron, pamplemousse, mandarine, etc.
De nombreuses plantes de ce genre résultent d'unedomestication, processus ancien se poursuivant activement, qui a conduit lesCitrusà faire partie des fruits les plus consommés dans le monde. Par leurs caractéristiques propres les citrus se prêtent à la diversité variétale, présentent des avantages nutritionnels ; leurs fruits se transportent et se conservent bien grâce à leur peau épaisse, et offrent une diversité de goûts, parfums et textures. Leurs centres de domestication, Asie subtropicale et tempérée et climat méditerranéen chaud, sont aussi des régions d'expertise agronomique ancienne et performante.
Citrus, -ien latin classique qui désigne soit un bois soit un fruit odorant (le cèdre et le cédrat), à ne pas confondre aveccitriumqui désigne une courge (famille desCucurbitaceae, du genreLagenaria) et donne le françaiscitrouille.
Linnéretientcitruscomme nom de genre. Le mot est ensuite utilisé dans la plupart des langues pour désigner fruits et plantes apparentés aux oranges et aux citrons connus en occident à l'époque, jusqu'auXVIIsiècle on parlait d'orangers en français. À partir de la seconde moitié duXXsiècle,agrumese substitue àcitrusdans la plupart des usages.
Le genreCitrusprésente des singularités économiques, botaniques, génétiques et  morphologiques qui en font un candidat idéal pour une domestication de plus en plus mondialisée.
Spontanément les agrumes tendent vers la diversité. La reproduction par graine, encore largement pratiquée notamment pour lesporte-greffes, permet un assainissement continu de la plupart desvirusetbactéries. Lapolyembryoniedes graines de nombreuses espèces permet unclonagenaturel qui maintient lescultivarsà l'identique, tout en offrant desmutations spontanéesduméristèmedes bourgeons qui sont autant d'occasion de rencontrer des nouveaux cultivars. Untriploïdecomme lecitron vert(Citrus latifoliaTanaka) est un exemple de fruit naturellement sans graines. Enfin, la large compatibilité sexuelle interspécifique engendre une création continue de nouveauxcultivars, de même que les progrès de la connaissance de leur génome.
Sur la base des statistiques 2014, la production mondiale (121 millions de tonnes dont 57 % d'orange, en croissance de 30 % sur les 20 dernières années) en faitles premiers fruits consommés, d'où des moyens en conséquence pour son amélioration. Leur production provient pour 57 % de la zone de primo domestication (Asie du sud-est et pays méditerranéens) et pour 10 % des États-Unis, foyer actif de domestication moderne. Plus des 2/3 des agrumes sont donc produits dans des pays à forte tradition de sélection et qui possèdent  laboratoires et compétences pour faire progresser la qualité de l'offre.
L'origine géographique, l'époque et les voies de dispersion des agrumes primitifs à travers l'Asie du Sud-Estsont encore mal connus. Le genreCitruset les genres apparentés (Fortunella,Poncirus,EremocitrusetMicrocitrus) est largement distribuée dans l'Asie desmoussons(ouest duPakistan,Chine, Indes orientales,Nouvelle-GuinéeetArchipel Bismarck, nord-est de l'Australie,Nouvelle-Calédonie,MélanésieetPolynésieoccidentale). La particularité de nombreux agrumes est de se propager largement  clonage apomictique par l'embryon nucellaire, autrement dit de jeunes plantes naissent directement  du tissu nucellaire maternel non fécondé. La domestication de génotypes fixes par semis, y compris des hybrides interspécifiques comme les oranges, les citrons verts, les citrons, les pamplemousses etc. facilite la domestication. Seconde particularité les agrumes se transportent bien.
L'histoire de la domestication montre une sélection des traits d'intérêt, acidité, métabolisme, résistance aux maladie, floraison précoce (2020). Les agrumes offrent des réponses adaptées à des besoins sanitaires importants. Par exemple, lecitrondevient acide avec les premières longues navigations (IXsiècle), son acidité favorise sa conservation, savitamine Cest unantiscorbutique. Lejus d'orangeentre dans le petit déjeuner des enfants américains, puis des adultes, à la suite des travaux d' Albert H. Byfield dans les années 1920sur la prévention des troubles de la croissance chez l'enfant et à unecommunicationgénéralisée auprès desmères de familles.
Le genreCitruset les genres apparentés commeFortunella,Poncirus,EremocitrusetMicrocitrussont largement répandus, avant leur acclimatation enOccident, dans toute la zone soumise auxmoussons, de l'ouest duPakistanjusqu'au centre de laChineet au sud enInsulinde, enNouvelle-Guinée, dans l'archipel Bismarck, au nord-est de l'Australie, enNouvelle-Calédonie, enMélanésieet enPolynésieoccidentale.
Le genreCitruss'est développé à partir d'une zone incluant leYunnan, laBirmanieet le nord-est de l'Inde. Un fossile trouvé au Yunnan et datant duMiocènesupérieur présente des traits caractéristiques des principaux groupes actuels deCitrus, ce qui établit la présence d'un ancêtre commun au Yunnan il y a environ 8Ma. Le genre s'est ensuite répandu et diversifié en Asie assez rapidement (en 2Maenviron), peut-être à la faveur d'un affaiblissement des moussons et d'un assèchement net du climat régional.
Le genreCitrusa été répandu par la culture dans toutes les régions tropicales et subtropicales du globe. Il semble que seul lecédratierfût véritablement connu dans le monde méditerranéen dans l'Antiquité, à partir desVetIVsiècles av. J.-C. (la légende veut qu'il ait été rapporté lors de la conquête de la vallée de l’Indus (-326 / -325) parAlexandre le Grand).
Il reste encore beaucoup à découvrir dans le monde descitrus. Lepamplemousse(Citrus maxima(Burm.)Merr.) est quasi inconnu hors de sa vaste zone de domestication où il est un des fruits les plus consommés : la Chine produit autant de pamplemousses que d'oranges (7 millions de t.). Certains cultivars sont délicieux. Lekumquatn'est connu en Occident que depuis une centaine d'années, ladomesticationdesmicro citrusaustraliens a commencé débutXXIsiècle.
LeJaponcultiverait environ 800 espèces et cultivars decitrusnommés, offrant un vaste potentiel de gouts et d'applications.
L'histoire de la domestication descitrusest une réponse à des besoins de circonstance, pour des raisons de conservation et de climat ce sont uniquement ceux qui fructifient pendant lesjours courtsqui sont produits et consommés par les Occidentaux et les Méditerranéens. Or il existe en Asie descitrusde jours longs: tardifs de printemps et des acides précoces d'été.
Les espèces du genreCitrussont des arbres ou des arbustes de moins de 4 m à 12 m de haut. Les feuilles sont généralement simples et persistantes, sauf chez les hybrides dePoncirus. Beaucoup d'espèces portent des épines axillaires. Le pétiole est souvent ailé. Les jeunes pousses sont pubescentes chez lespamplemoussierset nettement anthocyanées chez lescitronniers.
Les inflorescences sont des cymes feuillées présentant tous les intermédiaires entre la fleur isolée et la pousse où chaque feuille a une fleur. La fleur a généralement 5 sépales et 5 pétales généralement blancs (teintés de pourpre chez les citronniers). L'androcéepolyadelphepolystémoneest composé de 20 à 40 étamines souvent soudées à la base en faisceaux par leurs filets. Au milieu des étamines, le réceptacle est élargi latéralement et forme un disque nectarifère intrastaminal. L'ovairepluricarpellé, supère et  pluriloculaire comprend des rangées d'ovules anatropes bitégumentés en placentation axile.
Le fruit, très caractéristique, est unebaieparticulière, enveloppée d'une écorce parfois très épaisse, le zeste, et formée par la réunion de 10 à 15 carpelles, formant autant de « tranches » dont la pulpe est formée de poils devenant juteux à maturité souvent plus ou moins acide et sucrée ou amère.
Les graines sont souvent polyembryonnées dont les embryons surnuméraires sont formées sans fécondations d'autres ont des embryons zygotiques ne reproduisant pas toujours le type.
Les feuilles et les fleurs portent des glandes produisant unehuile essentielleà odeur suave caractéristique.
Ils ont une croissance rythmique chaque phase de croissance suivie d'un arrêt marquée même en conditions climatiques favorable. Les citrus remontants, citronniers et assimilés, fleurissent à chaque reprise de croissance.
Chez lesCitruset les genres apparentés le caryotype diploïde présente 18 chromosomes (2n=18).
Deux grandes classifications existent pour le genre Citrus. Celle dujaponaisTyozaburo Tanaka(1961) comprend 156 espèces tandis que Walter T. Swingle et Reece (1967) n'en distinguent que 16. Cette contradiction s'explique par les larges possibilités d'hybridationsinterspécifiques ainsi que par lapolyembryoniequi fixe ces structures hybrides :  Tanaka élève ainsi au rang d'espèce de nombreux hybrides intra ou interspécifiques.
La phylogénie est discutée, les cinq espèces sauvages dont dériveraient les espèces et variétés cultivées actuelles sont chez Wu et al. (2018)
Le genre comprend plusieurs sous-genres variables selon les auteurs. La classification de Swingle propose 2 sous-genres :
Dans le groupe desEucitrus, 3 espèces (C. maxima,medicaetreticulata) sont considérées comme étant à la base de pratiquement toutes les variétés et hybrides existant de nos jours. Bien queC. aurantiifoliaait longtemps été considérée comme une espèce primitive, de récentes analyses chromosomiques auraient montré qu'elle a des héritages deC. medica,C. ×limonetC. micrantha.
L'Australieest un autre centre de diversification avec plusieurs espèces (classées en deux sous-genresEremocitrusetMicrocitrus) dont les hybridations sont très prometteuses pour des agrumes résistant à la sécheresse, au froid, et/ou à certaines maladies.
En 1930Tanakadonne 2 sous genres et
En 1962, Zeng Mian, classe le genreCitrusen sous-genresPapeda, Cédrat, Cephalocitrus, AurantiumetSinocitrus.En 2013 Cuihua Liuet al. donnent 3 sous-groupes deCitrusque la base de leur chimiotaxonomie:Citrophorum, CephalocitrusetSinocitrus.
La comparaison des génomes chloroplastiques complets de 16 espèces d'agrumes et de leurs caractères uniques amène Wenbo Shiet al. (2023) à distinguer  7 sous-genres d'agrumes:Poncirus, Fortunella, Papeda, C. medica, Cephalocitrus, Aurantiumet Sinocitrus.Cephalocitrusest un sous-genre non reconnu mais usuellement utilisé par les auteurs asiatiques (21 espèces chez Tanaka)parmi lesquellesKotokan(C. kotokanHayata), TenguC. tenguHort. ex Tanaka.
Le genreCitrophyllumqui été créé par Berry (1909) pour regrouper des feuilles fossiles ailées comme on en rencontre chez lesCitrusvivants n'est plus rattaché auxRutaceaemais auxSapindales. Il n'y a pas de fossile de Rutaceae auCrétacé.
SelonITIS(28 janv. 2012):
SelonBioLib(31 décembre 2017):
SelonCatalogue of Life(31 décembre 2017):