Pirimidina

Pirimidina(bahasa Inggris:Pyrimidine) adalah suatusenyawa organikheterosiklikaromatikyang mirip denganpiridina.Satu dari tigadiazina(senyawa heterosiklik enamkarbondengan duanitrogenpada cincin), mempunyainitrogenpada posisi 1 dan 3 dalam cincin.Kedua diazina lain adalahpirazina(nitrogen pada posisi 1 dan 4) danpiridazina( pada posisi 1 dan 2). Dalamasam nukleat, ketiga tipebasa nukleotidamerupakan derivatpirimidinyaitu:sitosina (= cytosine)(C),timina(T), danurasil(U).
Sistem cincin pirimidina banyak dijumpai dalam alamsebagai senyawa berfusi substitusi dan cincin serta derivatifnya, termasuknukleotida,tiamina(vitamin B1) danalloxan. Juga didapati dalam banyak senyawa sintetik sepertibarbituratdan obatHIV,zidovudine. Meskipun derivatif pirimidina sepertiasam uratdan alloxan telah dikenal sejak awal abad ke-19, sintesis pirimidina dalam laboratorium baru dilakukan pada tahun 1879,ketika Grimaux melaporkan pembuatanasam barbituratdariureaIvy danasam malonatdengan katalisfosfor oxiklorida.Studi sistematik pirimidina dimulaipada tahun 1884 olehPinner,yang melakukan sintesis derivatif melalui kondensasietil asetoasetatdenganamidina. Pinner pertama kali mengusulkan nama “pyrimidin” pada tahun 1885.Senyawa induk pertama kali dibuat olehGabriel& Colman pada tahun 1900,melalui konversiasam barbituratmenjadi 2,4,6-trikloropirimidina diikuti oleh reduksi menggunakan debusengdalam air panas.
Nomenklatur pirimidina tergolong sederhana. Namun, sebagaimana heterosiklik lainnya, gugus hidroksil tautomerik menghasilkan komplikasi karena mereka adanya terutama dalam bentuk amida siklik. Misalnya, 2-hidroksipirimidina lebih tepat dinamai [struktur] 2-pirimidon. Tersedia daftar sebagian nama-nama trivial dari berbagai pirimidina.
Sifat-sifat fisika dapat dilihat pada kotak info. Diskusi lebih mendalam, termasuk spektrum, dapat dilihat dalam Brownet al.
Menurut klasifikasi Albertheterosiklik enam karbon dapat dikatakan "π-deficient" ("kekurangan π"). Substitusi oleh guguselektronegatifatau atom nitrogen tambahan dalam cincin secara signifikan meningkatkan "kekurangan π" itu. Efek ini juga menurunkan kadar basa.
Sebagaimana piridina, dalam pirimidina densitas elektron π menurun sampai taraf lebih besar. Karenanya,substitusi aromatik elektrofiliklebih sulit sementarasubstitusi aromatik nukleofilikterbantu. Contoh jenis reaksi terakhir adalah penghilangan gugusaminodalam 2-aminopirimidina olehklor.dan reaksi sebaliknya.
Ketersediaan pasangan elektron tunggal (kadar basa) menurun dibandingkanpiridina. Dibandingkan piridina,N-alkilasidanN-oksidasilebih sulita. NilaipKauntuk pirimidina terprotonasi adalah 1,23 dibandingkan 5,30 untuk piridina. Protonasi dan tambahan elektrofilik lain akan terjadi pada hanya satunitrogenkarena deaktivasi lebih lanjut oleh nitrogen kedua.Posisi 2-, 4-, dan 6- pada cincin pirimidina merupakan analog kekurangan elektron dari senyawa pyridina dan nitro- serta dinitrobenzena. Posisi 5 lebih rendah tingkat kekurangan elektronnya dan substituen di sana sangat stabil.  Namun, substitusi eletrofilik relatif lancar pada posisi 5, termasuknitrasidan halogenasi.
Reduksi dalamstabilisasi resonansipirimidina dapat lebih menghasilkanreaksi adisidan pemutusan cincin daripada substitusi. Salah satu manifestasinya dapat diamati pada "Dimroth rearrangement".
Pirimidina juga ditemukan padameteorit, tetapi para ilmuwan masih tidak tahu asal usulnya. Pirimidina juga secara fotolitik mengalami dekomposisi menjadiurasildi bawah cahayaUV.
Sebagaimana sering kali dijumpai pada sistem heterosiklik induk, sintesis pirimidina tidak begitu lazim dan biasanya dilakukan dengan menghilangangugus fungsidari derivatif. Sintesis primer dalam jumlah besar melibatkanformamidatelah dilaporkan.
Sebagai suatu kelas, pirimidina biasanya disintesis melalui “Principal Synthesis” melibatkan siklisasi senyawa beta-dikarbonil dengan senyawa N-C-N. Reaksi sebelumnya dengan amidina menghasilkan substitusi pirimidina pada posisi 2, biasanya dengan urea menghasilkan 2-pirimidion, dan dengan guanidina menghasilkan 2-aminopirimidina.
Karena menurunnya kadar basa dibandingkan piridina, substitusi elektrofilik pirimidina kurang lancar.Protonasiataualkilasibiasanya berlangsung pada hanya satu atom nitrogen dalam cincin.Oksidasi-Nmono terjadi melalui reaksi dengan perasida.
Tiganucleobaseyang ditemukan dalamasam nukleat, yaitusitosina/cytosine(C),timina(T), danurasil(U), merupakan derivatif pirimidina:
DalamDNAdanRNA, basa-basa ini membentukikatan hidrogendenganpurinakomplementer. Jadi, dalam DNA, senyawapurinaadenina(A) danguanina(G) masing-masing berpasangan dengan senyawa pirimidina timina (T) dan sitosina (C), membentuk pasangan-pasangan A:T dan G:C.
DalamRNA, komplemenadenina(A) adalahurasil(U) bukannyatimina(T), sehingga pasangan yang dibentuk adalahadenina:urasil(A:U) danguanina:sitosina(G:C).