Guerra civile in Somalia

Laguerra civile somalaè un conflitto scoppiato nel1986inSomalia, e tuttora in corso, che abbraccia nel suo complesso quattro fasi distinte:
Nel1992, la grave crisi umanitaria che stava sconvolgendo la Somalia indusse le Nazioni Unite ad un intervento armato nella regione, concretizzatosi con le missioniUNOSOM I(1992),UNITAF(1992-1993)  eUNOSOM II(1993-1995); icaschi blu, tuttavia, non raggiunsero l'obiettivo di riappacificare il paese, di fatto divenuto unoStato fallito.
Altri motivi di conflitto riguardano poi le contese territoriali fra entità statali non riconosciute; prima fra tutti ladisputa Somaliland-Puntland.
Nel2006l'Unione Africana, al fine di favorire la riconciliazione tra le varie fazioni in lotta, ha istituito la missioneAMISOM. Successivamente, nel2011, è stata avviata l'operazione Linda Nchi, condotta dalle forze somale in collaborazione con forze multinazionali, mentre, nell'agosto2014, il governo ha dato il via all'operazione Oceano Indianocon lo scopo di riconquistare gli ultimi territori controllati dai ribelli.
Secondo le stime, dal 1991 sono morte a causa del conflitto circa 500.000 persone. Armed Conflict Location e Event Dataset stima che circa 3.300 persone furono uccise nel 2012, mentre nel 2013 le perdite furono 3150.
Il presidente somaloSiad Barre, aveva preso il potere da capo dell'esercito, con un colpo di Stato nell'ottobre1969, dopo che era stato assassinato il presidente eletto, e instaurato un regime autoritario marxista-leninista filosovietico.
Nel luglio1977, Barre volendo unificare le terre abitate dasomalinella"Grande Somalia", ruppe la storica alleanza con l'URSS, invadendo laregione etiope dell'Ogaden, abitata da somali. L'Etiopia comunista del Derg, tuttavia, respinse l'esercito somalo nel marzo 1978. A seguito della sconfitta, nel1978, diversi ufficiali dell'esercito somalo ed esponenti del Governo ordirono un tentativo di golpe contro Barre, represso con uccisioni sommarie. Diversi ufficiali ribelli riuscirono tuttavia a fuggire all'estero, fondando ilFronte Democratico di Salvezza Somalo(FDSS), primo di una serie di gruppi ribelli che intendevano rimuovere Barre con la forza.
Il 23 maggio1986, a seguito di un tamponamento con un autobus, il presidente Barre rimase gravemente ferito,e fu costretto a restare per diversi mesi in cura in un ospedale saudita. Durante la degenza il vicepresidente, gen.Muhammad Ali Samatar, governòad interimin sua vece. Tali circostanze riuscirono comunque a mettere in dubbio la candidatura unica di Barre alleelezioni presidenziali previste per il 23 dicembre: le speculazioni indicarono come possibili contendenti alla successione lo stesso vicepresidenteSamatare il Ministro dell'Interno (nonché genero di Barre), gen. Ahmed Suleiman Abdile.
Per mantenere il suo potere, dunque, Barre divenne ancor più autoritario ed arbitrario, fatto che determinò un incremento dei disordini da parte dei ribelli. Accanto alFronte Democratico di Salvezza Somalo, operante nelPuntland, un altro gruppo di ribelli fondò nel 1987 ilCongresso della Somalia Unita, mentre gli indipendentisti delSomalilandfondarono ilMovimento Nazionale Somalo. Altri gruppi ribelli sorsero per iniziativa del governo comunista delDergdell'Etiopia. Falliti gli appelli al nazionalismo, Barre si affidò sempre più alla sua cerchia, autorizzando a partire dal1988interventi delleforze armatenon soltanto contro i gruppi ribelli, ma contro le stesse comunità locali che si riteneva li supportassero, soprattutto nelle regioni del nord, sfruttando le storiche rivalità tra i clan. La repressione si avvalse anche di bombardamenti, come quello del 1988 suHargeisa, roccaforte delMovimento Nazionale Somalo.
Nel maggio1990, oltre 100 esponenti politici somali, capeggiati daAden Abdulla Osman, primo Presidente della Somalia indipendente, firmarono un manifesto chiedendo la cessazione delle ostilità e il ritiro di Barre dal potere. Molti dei firmatari furono successivamente arrestati. L'inasprirsi della repressione ebbe il solo effetto di riunire il fronte eterogeneo dei ribelli nell'obiettivo comune della caduta del regime.
Anche nella capitaleMogadisciovi furono scontri tra i clan sostenitori di Barre e quelli a lui contrari, riunitisi in comitati di difesa. Nel luglio del 1990, in occasione di una partita di calcio allo stadio della Capitale, Barre fece aprire il fuoco sugli spettatori perché questi avevano manifestato rumorosamente il lorodissensoverso il dittatore.
Nel dicembre1990, gli scontri si ampliarono con la partecipazione dei ribelli delCongresso della Somalia Unita(USC) a sostegno dei comitati popolari di difesa, e dell'unità d'élite della Guardia Presidenziale deiBerretti Rossia fianco dei clan sostenitori di Barre. Dopo un mese di scontri, la sera del 27 gennaio1991i ribelli dell'USC asserragliarono Barre pressoVilla Somaliae lo costrinsero alla fugaalla volta diChisimaio, e quindi all'isola keniota diLamu.
Il 29 gennaio, IlCongresso della Somalia Unita, che aveva destituito Barre, nominò comePresidente della Repubblicail proprio leaderAli Mahdi Mohamed.
Siad Barre venne destituito e riparò nel sud ovest del paese, in una regione controllata da suo genero Mohamed Said Hersi. Da lì tentò due volte di riprendere il potere su Mogadiscio, ma ilgenerale Aididne decretò l'esilio nel maggio del1992.
Nonostante la fuga di Barre, gli scontri tra i ribelli e i contro-rivoluzionari, che cercavano di ristabilire nuovamente Barre al potere, proseguirono, portando a una situazione sempre più violenta e caotica prossima a uno stato di anarchia, specialmente al sud, per sfuggire alla quale la regione nord-occidentale del Paese, ilSomaliland, si dichiarò indipendente, ma la sua sovranità non fu internazionalmente riconosciuta.
L'Italia,durante i governi di Bettino Craxinegli anni 1980, aveva rinsaldato i rapporti con il regime di Barre, con affari non sempre trasparenti, come finanziamenti occultie tangenti fatte passare per aiuti umanitari, come i 400 miliardi di lire per lacooperazione allo sviluppoversati al governo somalo nel1986dal sottosegretario agli EsteriFrancesco Fortein qualità di commissario delFondo Aiuti Italiani.
Fu a suo tempo evidenziato come la Somalia fosse divenuta "una riserva di caccia per politici e faccendieri". Ad esempio, giunse alle cronache la vicenda di sei pescherecci italiani donati come aiuti allo sviluppo ad una società di diritto pubblico somala, la Shifco, ma entrati in possesso di un imprenditore italo-somalo, Omar Said Mugne. Almeno uno di questi pescherecci, il21 Ottobre, sarebbe stato al centro di un traffico internazionale di armi e di rifiuti tossici, cui secondo alcuni sarebbe collegato anche ungrave incidente navaleavvenuto nelporto di Livornonel 1991, e l'uccisione, durante un'imboscata aBalad, del sottoufficiale delSISMIVincenzo Li Causi, che avrebbe dovuto fare ritorno in Italia il giorno seguente per rendere dichiarazioni davanti all'autorità giudiziaria riguardo alla questione dei traffici illeciti di armi. Sulla vicenda avrebbero cercato di far luce anche la giornalistaIlaria Alpie l'operatoreMiran Hrovatin, uccisi il 20 marzo 1994 nei pressi dell'ambasciata italiana aMogadiscio, dove erano giunti dopo aver intervistato sui traffici di armi e di rifiuti tossici tra Italia e Somalia il signore della guerra diBosaso, Abdullahi Mussa Bogor.
A seguito della caduta di Barre, il Governo diGiulio Andreottiricevette l'invito ufficiale di Ali Mahdi per avviare una nuova fase della cooperazione bilaterale, ed inviò il sottosegretario agli EsteriAndrea Borrusoper verificarne le condizioni. Tuttavia il generale somalo Aidid impedì l'atterraggio del diplomatico italiano all'aeroporto di Mogadiscio,costringendolo ad atterrare aNairobi. La figlia del generale, Faduma Aidid, dichiarò in un'intervista che la diffidenza verso l'Italia fosse dovuta al sostegno al regime di Barre, sostenendo che Craxi avesse ordito un complotto contro il padre al fine di riportare Barre al potere. Un altro possibile motivo di contrasto avrebbe riguardato una causa per insolvenza intentata dallo stesso Aidid al tribunale civile di Milano controPaolo Pillitteri, Presidente della Camera di commercio italo-somala, e lo stesso Craxi, per il mancato pagamento della quota pattuita alla Camera di commercio di Mogadiscio, presieduta da Ali Hashi Dorre, genero di Aidid; il tribunale avrebbe rigettato la richiesta somala e trasmesso gli atti alla procura per accertarne eventuali elementi di rilevanza penale. Accanto all'azione diplomatica del sottosegretario Borruso, dellaDC, si affiancò comunque un'azione diplomatica parallela delPSIattraverso il deputatoMario Raffaelli.
All'interno del Congresso della Somalia Unita, la leadership diAli Mahdi Mohamede il controllo della capitale Mogadiscio fu contesa dalla fazione rivale guidata dal gen.Mohammed Farah Aidid, aprendo una nuova fase di scontri interni al fronte dei ribelli. Peraltro l'effettivo controllo del Congresso era limitato alla capitaleMogadiscioed alla circostante regione delBenadir, mentre il resto della Somalia era controllato da diversi gruppi armati, risultanti dalla disgregazione dell'esercito somaloin diverse forze irregolari che si unirono con le milizie locali dei clan.
I principali gruppi armati che si spartirono la Somalia all'indomani della caduta del regime furono i seguenti:
Nella regione settentrionale delPuntlandvi erano poi:
Nell regione nord-occidentale delSomalilandvi erano infine:
Per risolvere gli scontri a Mogadiscio tra le due fazioni rivali interne alCongresso della Somalia Unita, furono convocate aGibutiuna prima conferenza di pace nel giugno 1991 e una seconda conferenza dal 15 al 21 luglio.
Le conferenze confermarono la Presidenza diAli Mahdi Mohamed, e venne raggiunta un'intesa per il coinvolgimento di tutti i clan del Paese nella formazione di un Governo transitorio. Per scongiurare il boicottaggio della conferenza da parte del generale Aidid, uno dei maggiori contendenti, i delegati del clanhauiafurono scelti dal sottoclan degliHabr Ghedir, cui apparteneva Aidid, piuttosto che da quello degliAbgal, cui apparteneva Ali Mahdi. Ciò non servì tuttavia ad evitare che Aidid disertasse la conferenza e non ne riconoscesse le conclusioni. In seguito, tuttavia, fu raggiunto un accordo separato con Aidid, che acconsentì a riconoscere la Presidenza ad Ali Mahdi, ottenendo in cambio la nomina a Segretario del Congresso e la Presidenza del Parlamento.
Per tenere conto di tutti i clan presenti in Somalia, alla fine il Governo provvisorio risultò composto da circa ottanta Ministri.
A novembre, tuttavia, l'ala politica delCongresso della Somalia Unitaconvocò l'assemblea per destituire Aidid da Segretario, pur non riuscendo a raggiungere il numero di firme necessario. Il 17 novembre, inoltre, a seguito del tentativo del Presidente Ali Mahdi di liberare l'aeroporto di Mogadiscio dalle forze del gen. Aidid, questi scatenò un'efficace controffensiva, occupandoRadio Mogadiscioe dando inizio alla guerra civile. Il giorno seguente buona parte di Mogadiscio era sotto il controllo delle forze del generale Aidid. Anche l'ambasciata italiana in Via Alto Giuba fu catturata ed il personale fu sequestrato, ma non l'ambasciatoreMario Sica, che si trovava già a Nairobi.
Il 3 gennaio 1992, l'inviato speciale dell'ONU, James Jonah, giunse a Bali Dogle, cittadina a 140 km a nord-ovest diMogadiscio, per ricercare una mediazione al conflitto..
Il 23 gennaio, ilConsiglio di sicurezza delle Nazioni Unite, con la risoluzione733stabilì unembargosu tutte le spedizioni di armi per la Somalia ed autorizzò ilSegretario generaleBoutros-Ghalia prendere contatto con tutte le parti coinvolte nel conflitto per ottenere la cessazione delle ostilità e consentire la distribuzione degli aiuti umanitari.
Il 14 febbraio Ali Mahdi e Aidid firmarono un impegno per la cessazione delle ostilità, formalizzato il 3 marzo in una vera e propria tregua, che consentì la distribuzione di aiuti umanitari alla popolazione, minacciata dalla carestia. Dallo scoppio nel novembre 1991, il conflitto aveva infatti provocato la morte di 40'000 persone.
Le successive risoluzioni746, del 17 marzo 1992, e751, del 27 aprile 1992, autorizzarono l'invio di un'équipe tecnica e di cinquanta osservatori dell'ONU per sovrintendere il rispetto dell'accordo, con la missioneUNOSOM I. Nel giugno 1992 intanto il generale Aidid si separò definitivamente dal CSU, riunendo nell'Alleanza Nazionale Somalatutte le fazioni armate a lui fedeli.
A luglio, gli inviati arrivarono in Somalia, aMogadiscioe aBerbera, mentre la risoluzione767, del 27 luglio, definì la ripartizione delle zone d'intervento.
Ad agosto iniziò un ponte aereo per la consegna di aiuti umanitari alla popolazione da parte di truppe di Italia, Francia e Stati Uniti; a settembre cominciarono ad arrivare anche gli aiuti dell'ONU. Il Presidente Ali Mahdi e il Ministro degli Esteri Haji Mohamed Hashi Haile invitarono ufficialmente l'Italia a svolgere un ruolo di mediazione.
A causa della persistenza di condizioni di insicurezza nello svolgimento della missione umanitaria, il 3 dicembre 1992, con la risoluzione794, ilConsiglio di sicurezza delle Nazioni Uniteapprovò all'unanimità l'invio di una coalizione di forze dimantenimento della pacea guida statunitense, con il compito di garantire le condizioni per la consegna degli aiuti umanitari, autorizzando per la prima volta nella storia dell'ONU l'utilizzo di ogni mezzo necessario allo scopo, compreso il ricorso all'uso della forza (missioneUNITAF). In ottemperanza ad essa, l'8 dicembre sbarcarono a Mogadiscio i primi marines americani della missioneRestore Hope, e nei giorni seguenti giunsero anche i militari italiani al comando del generale Giampiero Rossi.
Nel frattempo i due capi fazione a Mogadiscio, Aidid e Ali Madhi, si accordarono, alla presenza dell'ambasciatore somalo negli Stati Uniti, Abdulkadir Yahya Ali, su una divisione della capitale in due aree di influenza, che rimase però inattuato per il proseguire dei combattimenti fino ad un secondo accordo il 26 dicembre.
L'8 gennaio1993, a seguito di una nuova tregua, le Nazioni Unite promossero l'avvio di una conferenza di pace, che si svolse tra il 15 e il 27 marzo adAddis Abeba, presieduta dalla portavoce dell'ONULansana Kouyatée con la mediazione delPresidente etiopeMeles Zenawi, e si concluse con la firma di un accordo tra 15 capi fazione, tra cui Aidid e il rappresentante di Ali Mahdi, Mohamed Afrah Qanyare. Gli accordi prevedevano la creazione di unConsiglio nazionale di transizioneformato da tre rappresentanti per ciascuna delle18 regioni della Somalia, cinque seggi in rappresentanza di Mogadiscio e un membro per ogni fazione presente alla conferenza, oltre a Dipartimenti amministrativi centrali, Consigli regionali e consigli distrettuali.
L'accordo, tuttavia, si rivelò di difficile implementazione e nei mesi seguenti proseguirono gli scontri, mentre l'ONU riorganizzò le regole di ingaggio della missione UNITAF, che divenne nel marzo1993UNOSOM II.
Il 4 giugno 1993 si raggiunse un accordo per la regione delMudughcon le forze del generaleAidide ilFronte Democratico di Salvezza Somalo, che ritirarono le loro milizie dalla città diGallacaio.
AMogadiscioperò proseguivano gli attacchi delle milizie del generale Aidid alle forze ONU, durante i quali il 5 giugno furono uccisi 23 Caschi blupakistani.
Il 2 luglio, a seguito di un rastrellamento nel quartiere Haliwa di Mogadiscio, ebbe luogo la cosiddettabattaglia del pastificioin cui militari italiani furono assaliti da miliziani di Aidid, durante la quale 3 italiani furono uccisi e altri 20 feriti.
Il 12 luglio, le forze statunitensi bombardarono l'abitazione del miliziano Abdi Hassan Keybdid a Mogadiscio Sud, mentre vi si svolgeva una riunione dell'Alleanza Nazionale Somala, uccidendo anche 50 civili somali e causando la reazione della folla che linciò 4 giornalisti stranieri.
In settembre altri due parà italiani caduti, nel corso dell'agguato al porto nuovo di Mogadiscio, da parte di cecchini somali.
Il 3 ottobre, nel corso di un'operazione statunitense denominataGothic Serpentebbe luogo la cosiddettabattaglia di Mogadiscio, che causò numerose perdite tra i civili, di centinaia di miliziani e la morte di 19 militari statunitensi con l'abbattimento di due elicotteriBlack Hawkamericani (episodio cui è ispirato il libroBlack Hawk Downe l'omonimofilm).
Nel gennaio1994si raggiunse un accordo tra i due sottoclan rivaliAbgaleHabr GhedirdiMogadiscio, che consentì la rimozione dei blocchi stradali lungo la "linea verde" che divideva la città. In marzo le truppe Usa, italiane, belghe e francesi si ritirarono dalla missione.
In seguito, con l'iniziativa diChisimaio, si ottenne un accordo tra ciò che restava delleforze armate somale,Movimento Patriottico Somalo,Fronte Democratico di Salvezza Somaloe 99 clan delle regioni meridionali delBassoeMedio Giuba; infine, con la conferenza diBardera, si risolse il conflitto per le risorse locali tra i clan Marehan e Rahanweyn, e tra i clan Digil e Mirifle nelle regioni meridionali diBaieBakool.
Il 3 marzo1995gli ultimi 8.000Caschi blu, con l'Operazione United Shieldfurono evacuati dalla Somalia. In tre anni avevano subito molte perdite, senza essere riusciti a ristabilire l'ordine.
Dopo il ritiro della missione ONU, la guerra proseguì a minore intensità e a livello locale, mentre le fazioni principali si dedicarono a consolidare i risultati ottenuti, anche grazie alle iniziative locali riconciliazione nel centro e nel sud del Paese.
Il 15 giugno 1995, il generale Aidid si autoproclamò Presidente della Somalia, contestando il ruolo di Presidentead interimdiAli Mahdi Muhammad, confermato alla conferenza diGibutie riconosciuto dalla comunità internazionale, e portò avanti la lotta per la sua egemonia nel sud, occupando in settembre la città diBaidoae mantenendone il controllo fino al gennaio1996, mentre la milizia localeEsercito di Resistenza Rahanweyncontrollava la periferia della città.
I combattimenti proseguirono nel sud anche aChisimaioe nella valle delGiuba, come anche nel sudovest e nel centro, mentre le regioni meridionali diGhedoe del medioUebi Scebeli, e quelle settentrionali delPuntlande delSomaliland, si mantennero relativamente in pace e le amministrazioni distrettuali istituite negli anni precedenti continuarono ad operare.
Un terzo potente signore della guerra, insediato nella zona della città diMerca, fuOsman Ali Atto, già alleato del generale Aidid, a cui contese il controllo dello strategico porto nel sud della città; gli scontri proseguirono anche aMogadiscio.
Nell'agosto1996, il generale Aidid morì in seguito alle conseguenze del ferimento in scontri armati nel distretto di Wadajir contro miliziani di Ali Mahdi e di Atto.
A seguito di ciò, il processo di pace sembrò avviarsi a prendere forma con gli accordi diNairobi, in ottobre, tra il presidente Ali Mahdi, il figlio del defunto generale Aidid,Hussein Farrah Aidid, e Ali Atto.
A novembre fu poi convocata una conferenza di pace aSodere, inEtiopia, che proseguì fino al 3 gennaio1997, nonostante il 13 dicembre precedenteHussein Aididavesse ripreso le ostilità contro Ali Ato e Muse Sudi Yalahow, alleato di Ali Mahdi, per il controllo della zona diMogadisciosud, con scontri che causarono la morte di oltre cento persone, tra civili e miliziani.
La conferenza di Sodere terminò con una solenne dichiarazione al popolo somalo e alla comunità internazionale, e condusse alla formazione di un Consiglio di salvezza nazionale, rappresentativo delle varie cabile presenti nel Paese, costituito da 41 esponenti scelti proporzionalmente tra tutti i clan: 9 seggi a ciascuno dei quattro clan maggiori (Darod,Hauia, Issaq e Reewin), i restanti 5 agli altri gruppi. Altri 6 seggi furono in seguito assegnati alMovimento Nazionale Somalo, formato dai clan Issaq e Dir delPuntland, che non avevano preso parte ai lavori. Fu poi istituita una Commissione esecutiva nazionale formata da 11 membri, e presieduta da cinque: il Presidente uscenteAli Mahdi Muhammad, Osman Ali Ato,Aden Abdullahi Nur Gabyow,Abdullahi Yusuf Ahmed, Abdulkadir Muhammad Aden.
La costituzione di un governo nazionale provvisorio fu rinviata a una seconda conferenza, da tenersi aBosaso, che non fu più convocata.
Hussein Aididaccusò l'Etiopiadi interferire nelle questioni somale; ilprimo ministro etiope,Meles Zenawi, ribadì che la mediazione da lui offerta aSodererispondeva alle richieste prospettate dalle diverse fazioni in lotta.
Il 20 gennaio1997l'ambasciatore italiano in Somalia, Giuseppe Cassini, incontrò Ali Mahdi e Hussein Aidid al Ramadan Hotel a Mogadiscio, per smantellare la linea verde della città e cessare le ostilità per la grave emergenza umanitaria.
Il 18 maggio si tenne una nuova conferenza aSana'a, inYemen, tra Ali Mahdi, Hussein Aidid e Ali Ato.Il 29 luglio il sottosegretario agli EsteriRino Serrigiunse a Mogadiscio per incontrare separatamente i tre capi somali.
Dal 12 novembre al 22 dicembre 1997 si svolse una nuova conferenza di pace aIl Cairo, che condusse a un accordo di massima, sottoscritto da Ali Mahdi, Hussein Aidid e altri 26 capi fazione, per la costituzione di una Conferenza di riconciliazione nazionale di 464 delegati. A gennaio1998, Ali Mahdi, Hussein Aidid e Ali Ato strinsero un accordo riguardante l'amministrazione della città di Mogadiscio, confermato a marzo.
La Conferenza di riconciliazione si sarebbe dovuta tenere aBaidoail 15 febbraio 1998, ma fu rinviata al 15 maggio e di nuovo procrastinata, finché in giugno Ali Ato dichiarò il fallimento del processo di pace del Cairo, cui seguì un periodo di decentralizzazione del potere, caratterizzato da un ritorno ai costumi e alle leggi religiose e dall'insediamento di governi locali nelle regioni periferiche della Somalia.
Nel maggio 1998 si tenne la conferenza diGaroe, cui partecipò l'élite politica, economica, intellettuale e gli anziani (Issims) della regione nord-orientale delPuntland; la conferenza durò tre mesi, al termine della quale il Puntland si costituì come regione autonoma, per fornire alla popolazione sicurezza, servizi, facilitazioni nel commercio e nel dialogo con le controparti nazionali ed internazionali.
Il 3 settembre 1998 anche la regione sud-occidentale dell'Oltregiubaproclamò la propria indipendenza, con presidente Mohammed Said Hersi Morgan, cognato di Barre ed ex Ministro della Difesa durante il regime.
Anche le milizie dell'Esercito di Resistenza Rahanweyn, spalleggiate dalle truppe etiopi, proclamarono l'autonomia dellaSomalia sud-occidentale, con presidente il leader del gruppo,Hasan Muhammad Nur Shatigadud, mentre il portavoce del gruppo, Mohamed Ali Aden Qalinleh, si proclamò governatore della regione diBai.
La costituzione di regioni autonome portò a un periodo di relativa calma negli anni 1997 e 1998, nei quali la Somalia fu rimossa dalla lista dei maggiori conflitti in corso delSIPRI, ma nel 1999 si verificò un nuovo intensificarsi delle ostilità, con centinaia di morti tra civili e miliziani; la crisi fu acuita da un'epidemia dicoleranella regione diBardera, con centinaia di vittime; in primavera Ali Mahdi si trasferì inEgitto.
In dicembre si giunse a un nuovo accordo per l'amministrazione della città diMogadiscio, tra Hussein Aidid, Ali Ato, Mohamed Qanyare Afrah, Hussein Haji Bod e un rappresentante di Ali Mahdi, che fece ritorno in Somalia nel febbraio 2000; il porto e l'aeroporto di Mogadiscio furono riaperti, anche se la zona portuale fu in seguito occupata da alcune milizie del generale Aidid, comandate da Jama Mohamed Furuh.
Nell'agosto2000si tenne una nuova conferenza di pace aGibutitra più di 2000 capiclan somali, al termine della quale, il 13 agosto, venne istituito un Parlamento di 225 deputati e unGoverno nazionale di transizione. Fu eletto presidenteAbdiqasim Salad Hassan, già Ministro dell'Interno durante il regime di Barre, mentrePrimo ministrosarebbe divenutoAli Khalif Galaid. Alla conferenza prese parte anche Ali Madhi, che comunque aveva perso ogni effettiva influenza nel Paese. Le violenze tra clan e tra signori della guerra continuarono per tutto il periodo, e i cosiddetti "Movimenti di governo nazionale" mantennero un limitato controllo del Paese.
Nel2004i politici somali istituirono, a Nairobi, ilGoverno federale di transizione(GFT), sotto gli auspici dell'Autorità Intergovernativa per lo Sviluppo(IGAD); la situazione era ancora troppo instabile in Somalia perché la Convenzione potesse tenersi a Mogadiscio. Il processo portò anche alla creazione delle Istituzioni Federali Transitorie e si concluse nell'ottobre 2004 con l'elezione diAbdullahi Yusuf Ahmedcome presidente. Il GFT divenne il governo somalo riconosciuto a livello internazionale.
Nella prima metà del2005, emersero delle divergenze tra il primo ministroAli Mohammed Ghedied il presidente del ParlamentoSharif Hassan Sheikh Adansu dove insediare il GFT. Ghedi preferivaGioharmentre Adan era favorevole aBaidoa. In un tentativo di convincere il presidente Yusuf Ahmed, Adan insieme ad un gruppo di parlamentari e ministri visitaronoMogadiscio, per mobilitare il supporto da parte della comunità economica locale. I due leader, il presidente Yusuf Ahmed e membri del Parlamento, inoltre, si incontrarono inKenyaper trovare un compromesso. Allo stesso tempo, il GFT inviava delle delegazioni ufficiali nelle città diGiohareBaidoaper verificare se fossero in grado di ospitare, temporaneamente, il quartier generale del GFT, prima di un'eventuale ricollocazione degli uffici governativi aMogadiscio. Nel giugno-luglio 2005, il GFT istituiva una sede temporanea aGiohar, a causa della persistente insicurezza della capitale. Successivamente, all'inizio del 2006, il GFT spostava la sua sede temporanea aBaidoa.
Mentre ilGoverno federale di transizione, guidato dal presidenteYusuf Ahmed, tentava di insediarsi in Somalia con l'appoggio dell'Etiopiae degliStati Uniti, i giudici delle corti islamiche locali si unirono nell'Unione delle corti islamiche(UCI), con l'obiettivo di conquistare il governo del Paese e di imporvi laShari'a, aiutati dall'Eritreae dalla rete internazionale delfondamentalismo islamico.
L'UCI entrò in possesso della capitaleMogadiscionel giugno 2006 e di diversi territori meridionali dalloGiubalandalle frontiere delPuntland, in stato di guerra con il GFT, alleato dei governi autonomi diPuntlandeGalmudug, l'ultimo dei quali nato precipuamente come argine politico al fondamentalismo islamico.
Nel dicembre 2006 l'Etiopiaentrò militarmente nelle regioni somale diGhedoe diBai, per sostenere ilGFTnella lotta contro l'ICU, che in risposta proclamò ilJihādcontro l'Etiopia. Le forze etiopi occuparono in breve tempoGiohar,Mogadiscio,Gelib,ChisimaioeRas Chiambone, portando alla dissoluzione dell'UCI e consentendo al GFT di insediarsi aMogadiscionel gennaio2007.
Nel febbraio2007, l'ONU decise di sospendere l'embargo sulle armi alla Somalia per permettere alGFTdi ricostituire il proprioesercito nazionale, ed in marzo anche l'Unione africanainviò proprie truppe, iniziando lamissione dell'Unione africana in Somalia(AMISOM).
Tuttavia, anche se il GFT aveva ripreso possesso diMogadiscioe della maggior parte del Sud del Paese, il fronte islamista proseguiva gli atti diguerrigliacontro il governo e le forze etiopi, e le sue frange più radicali si riunirono in nuovi gruppi comeAl-Shabaab. A marzo 2007 una coalizione di ribelli locali guidati da Al-Shabaab attaccò Mogadiscio, causando una violenta battaglia contro le truppe etiopi.
Nel corso del 2008, gliAl-Shabaabottennero diverse vittorie militari ed il controllo di città-chiave nel centro-sud della Somalia, comeDinsoreChisimaio, causando frustrazione tra i leader etiopi per la persistenza della ribellione e per i cronici problemi interni del GFT. Tra il 31 maggio ed il 9 giugno2008, durante colloqui di pace aGibuti, una parte del GFT, l'opposizione al presidenteYusuf Ahmed, si fuse con l'ala moderata dell'UCI nella coalizione dell'Alleanza per la Riliberazione della Somalia(ARS) in seguito a un accordo che prevedeva il ritiro delle truppe etiopi in cambio della fine delle ostilità. Dopo che i membri islamisti dell'ARS entrarono a far parte del Parlamento diBaidoa, il Presidente Yusuf, rimasto politicamente isolato, cercò di arginare l'avanzata islamista versoMogadisciocol supporto del governo regionale autonomo delPuntland, ma infine il 29 dicembre2008annunciò al Parlamento diBaidoale proprie dimissioni, lasciando la Presidenza del GFT ad interim al Presidente del Parlamento.
Nel gennaio 2009 gli islamisti ottennero il completo ritiro delle truppe etiopi,e l'elezione dell'ex-leader delle UCI,Sharif Sheikh Ahmed, come nuovo presidente del GFT. Nel febbraio2009la nuova coalizione si insediò al governo aMogadiscio, dando il via ad un'operazione congiunta contro i gruppi radicali diAl-Shabaabe Hizbul Islam da parte delle forze somale, di quelle dell'AMISOM, di quelle della parte moderata dell'ICUconfluita nell'ARS, e della milizia sufi Ahlu Sunna Waljama'a. Gli estremisti islamici risposero con attentati terroristici kamikaze contro il governo, per costringerlo ad adottare laShari'a, avanzando militarmente versoMogadiscio, che fu raggiunta il 25 maggio; il 6 giugno il fronte si estese a Wabho, mentre si contavano ormai centinaia di vittime. Il 22 giugno, il presidenteSharif Sheikh Ahmed, assediato a Mogadiscio, dichiarò lostato di emergenzae lanciò un appello internazionale. Le forze etiopi si mantennero operative, mentre si verificarono anche scontri interni traAl-Shabaabe Hizbul Islam. Il governo risiedeva in una piccola parte di Mogadiscio, controllata dalle forze dell'Unione africana; in giugno un attentato terroristico uccise il Ministro della Sicurezza Homar Hashi Aden, mentre il 3 dicembre2009un altro attentato terroristico uccise 5 Ministri del governo ed altre 19 persone, prevalentemente studenti, ad opera di un kamikaze che si fece esplodere durante una festa di laurea all'Università di Mogadiscio. Il governo accusò dell'attentato l'organizzazioneAl-Shabaab, che tuttavia negò la propria responsabilità. Il governo rimase accerchiato aMogadiscioanche nei mesi seguenti. Il 23 agosto2010milizie diAl-Shabaabirruppero nell'hotel frequentato dai deputati e fucilarono 4 parlamentari ed altre 29 persone; nei giorni seguenti, i miliziani raggiunsero il palazzo presidenziale, costringendo il PresidenteSharif Ahmedad abbandonare la capitale, mentre molti deputati e ministri si erano già da tempo stabiliti aNairobi. In tale occasione il parlamentare di maggioranza Sharif Said annunciò come imminente la fine del GFT. A novembre venne comunque insediato un governo tecnico, che portò avanti diverse riforme, come il pagamento dei soldati e l'esecuzione di un registro biometrico delle forze di sicurezza. Nell'estate2011, a causa di una carestia che interessò tutta la Somalia, gliAl-Shabaabsi ritirarono da Mogadiscio, consentendo la controffensiva del GFT nell'ottobre 2011, con un'operazione coordinata tra Forze armate somale e keniote contro gliAl-Shabaab, guidata ufficialmente dall'esercito somalo.
Il 1º agosto2012fu approvata la Costituzione della Repubblica Federale di Somalia, che subentrò al GFT. Le elezioni presidenziali portarono alla vittoria diHassan Sheikh Mohamud. La guerra agliAl-Shabaabè proseguita anche sotto la sua presidenza. Tra la fine di settembre e l'inizio di ottobre2012, le truppe somale e quelle dipeacekeepingdell'AMISOMriconquistarono agliAl-Shabaabla città strategica diChisimaio, loro ultima roccaforte, il cui centro abitato rappresentava una delle maggiori fonti di reddito per l'organizzazione.
Nel novembre 2012, secondo quanto dichiarato dall'Inviata speciale ONU per la Somalia Augustine Mahiga, circa l'85% dei territori contesi era ormai sotto il controllo del governo somalo, tuttavia il ritiro delle truppeAMISOMsarebbe avvenuto soltanto una volta che le forze di sicurezza e di polizia somale avessero raggiunto un adeguato livello di preparazione.
Nel dicembre 2013, intanto, il premier Shirdon fu sfiduciato dal Parlamento somalo, e al suo posto fu elettoAbdiweli Sheikh Ahmed.
Nel2014con una risoluzione ONU si autorizzò l'ampliamento dell'organico dell'AMISOMcon altre 4.000 unità, consentendo, accanto ai contingenti già in essere di Gibuti, Burundi, Sierra Leone, Kenya e Uganda, la formazione di un sesto contingente dell'Etiopia, che ebbe la responsabilità delle operazioni nelle regioni meridionali.
In marzo le forze di sicurezza somale e quelle dell'AMISOM lanciarono un'intensa operazione militare contro gliAl-Shabaabnella Somalia meridionale, conquistando dieci città tra cui Rab Dhure, Hudur, Wajid, Burdhbo, Coriolei ed El Bur e attuando nei territori liberati interventi di supporto all'amministrazione locale e alla sicurezza, dislocando in ciascuna città un vice ministro e dei religiosi per coordinare e supervisionare le iniziative del governo. A fine agosto, dopo una seconda operazione militare la grande maggioranza delle città somale erano ormai sotto controllo dell'esercito somalo e delle forze alleate.
Il 1º settembre 2014 un drone statunitense uccise Moktar Ali Zubeyr, leader dell'organizzazione Al-Shabaab.
Dal giugno 2015 ripresero gli attacchi degli islamisti contro basi militari somale e della coalizione africana, proseguiti nel 2016 con raid mirati e attentati.
L'8 febbraio2017fu eletto presidente della RepubblicaMohamed Abdullahi Mohamed, il quale nominò il 1º marzo Hassan Ali Khayrecome Primo Ministro. Il 30 marzo 2017, il presidente statunitenseDonald Trumpfirmò un decreto per dichiarare la Somalia "area di ostilità attive", autorizzando così il Comando militare degli Stati Uniti in Africa (AFRICOM) ad eseguire operazioni di antiterrorismo con minore tutela verso i civili.
I raid aerei statunitensi contribuirono a ridurre la capacità di Al-Shabaab di condurre nuovi attacchi, anche se un attentato il 17 ottobre a Mogadiscio, provocò oltre 300 vittime civili.
Quando il mandato del presidente Mohamed Abdullahi Mohamed è scaduto nel febbraio 2021, non erano state fissate le date per l'elezione di un successore e successivamente sono scoppiati i combattimenti a Mogadiscio. Questi combattimenti sono continuati fino a maggio 2021, quando il governo e l'opposizione hanno deciso di tenere le elezioni entro 60 giorni, poi effettivamente svolte il 15 maggio 2022, conHassan Sheikh Mohamuddichiarato nuovo presidente in una pacifica transizione di potere.
L'AMISOM è stato sostituito il 1º aprile 2022 dalla Missione di transizione dell'Unione Africanain Somalia (African Union Transition Mission in Somalia), in acronimo ATMIS.