পেপটাইড

পেপটাইডহলোঅ্যামিনো এসিডেরছোট শিকল যাপেপটাইড বন্ধনদ্বারা পরস্পরের সাথে যুক্ত থাকে।একটি পলিপেপটাইড হলো একটি লম্বা, অবিচ্ছিন্ন, অশাখা পেপটাইড শিকল।যে পলিপেপটাইডগুলোরআণবিক ভর১০,০০০ডাল্টনবা তার বেশি হয় সেগুলোকেপ্রোটিনবলা হয়।বিশটির কম অ্যামিনো এসিডের শিকলগুলোকেঅলিগোপেপটাইডবলা হয়। এগুলোর মধ্যে রয়েছেডাইপেপটাইড,ট্রাইপেপটাইডএবংটেট্রাপেপটাইড।
পেপটাইডগুলোজৈব পলিমারএবংঅলিগোমারেরবিস্তৃত রাসায়নিক শ্রেণীর অন্তর্ভুক্ত। এর পাশাপাশিনিউক্লিক এসিড,অলিগোস্যাকারাইড,পলিস্যাকারাইডইত্যাদিও এই শ্রেণীতে পড়ে।
প্রোটিন জৈবিক ও কার্যকরীভাবে সাজানো এক বা একাধিক পলিপেপটাইড দ্বারা গঠিত হয়, যা প্রায়শইকোএনজাইমএবংকোফ্যাক্টরেরমতোলিগ্যান্ড, অন্যান্য প্রোটিন,ডিএনএবাআরএনএরমতো অন্যান্যবৃহদাণুঅথবা জটিলম্যাক্রোমলিকিউলার সমাহারেরসাথে আবদ্ধ থাকে।
পেপটাইড গঠনের সময় অ্যামিনো এসিডগুলোকেঅবশিষ্টাংশ(residues) বলা হয়। পেপটাইড বাঅ্যামাইডবন্ধন গঠনের সময় অ্যামিনো এসিডগুলো পরস্পরের সাথে যুক্ত হয় এবং সেই যুক্ত হওয়ার সময় একটি ছোট্ট পানির অণু বেরিয়ে যায়।এই যুক্তকরণ দুই প্রান্তে দুটি বিশেষ গ্রুপ তৈরি করে, যাN-টার্মিনালএবংC-টার্মিনালনামে পরিচিত।সাইক্লিক পেপটাইডছাড়া সকল পেপটাইডের শেষে একটি N-টার্মিনাল (অ্যামিন গ্রুপ) এবং একটি C-টার্মিনাল (কার্বক্সিল গ্রুপ) অবশিষ্টা থাকে (ছবির টেট্রাপেপটাইডে দেখানো হয়েছে)।
বহু ধরনের পেপটাইড রয়েছে, যাদের উৎস এবং কাজের উপর ভিত্তি করে শ্রেণীবদ্ধ করা হয়েছে।Handbook of Biologically Active Peptidesবইটি অনুযায়ী, পেপটাইডের উৎস এবং কাজের উপর ভিত্তি করে বিভিন্ন ধরনের পেপটাইড রয়েছে। এগুলোর মধ্যে কিছু উল্লেখযোগ্য গ্রুপ হলো:
কিছু রাইবোজোমাল পেপটাইডপ্রোটিওলাইসিসনামক প্রক্রিয়ার মাধ্যমে ভেঙে যায়। সাধারণত উচ্চতর জীবদেহে, এই পেপটাইডগুলোহরমোনএবং সংকেত অণু হিসাবে কাজ করে। কিছু সূক্ষ্মজীবঅ্যান্টিবায়োটিকহিসাবে পেপটাইড উৎপাদন করে, যেমনমাইক্রোসিনএবংব্যাকটেরিওসিন।
পেপটাইডগুলো প্রায়শই "পরিবর্তন-পরবর্তী পরিবর্ধন" এর মধ্য দিয়ে যায়, যেমন -ফসফোরাইলেশন,হাইড্রোক্সিলেশন,সালফোনেশন,পামিটয়েলেশন,গ্লাইকোসিলেশনএবংডাইসালফাইডগঠন। সাধারণত পেপটাইডগুলো সরল, রৈখিক শৃঙ্খল আকারে থাকে, তবেল্যারিয়েটগঠনও দেখা যায়।এছাড়াও কিছু অস্বাভাবিক পরিবর্তনও ঘটে থাকে, যেমনপ্ল্যাটিপাসের বিষেL-অ্যামিনো অ্যাসিডগুলো D-অ্যামিনো অ্যাসিডে রেসিমিজেশন।
নন-রাইবোজোমাল পেপটাইডসাধারণ রাইবোজোমের মাধ্যমে নয়, বিশেষএনজাইমেরমাধ্যমে তৈরি হয়। এই ধরনের পেপটাইডের একটি সাধারণ উদাহরণ হলোগ্লুটাথায়োন, যা অধিকাংশ এ্যারোবিক জীবেরজারণরোধকপ্রতিরক্ষা ব্যবস্থার একটি গুরুত্বপূর্ণ উপাদান।অন্যান্য নন-রাইবোজোমাল পেপটাইডগুলো সাধারণতএককোষী জীব,উদ্ভিদএবংছত্রাক-এ পাওয়া যায় এবংমডুলারএনজাইম কমপ্লেক্স নামক এনজাইমের জটিল গঠনের মাধ্যমে সংশ্লেষিত হয়। এই এনজাইম কমপ্লেক্সকেনন-রাইবোজোমাল পেপটাইড সিন্থেটেসবলা হয়।
এই জটিল এনজাইম গঠনগুলো প্রায়শই একই রকমভাবে সাজানো থাকে এবং বিভিন্ন ধরনের মডিউল থাকতে পারে, যা তৈরি হওয়া পেপটাইডের উপর বিভিন্ন ধরনের রাসায়নিক পরিবর্তন সাধন করে।এই পেপটাইডগুলো প্রায়শই চক্রাকার হয় এবং খুব জটিলচক্রাকারগঠন থাকতে পারে, তবে সরল, রৈখিক নন-রাইবোজোমাল পেপটাইডও সাধারণ। যেহেতু এই ব্যবস্থাটিফ্যাটি অ্যাসিডএবংপলিশেটিডগঠনের প্রক্রিয়ার সাথে ঘনিষ্ঠভাবে সম্পর্কযুক্ত, তাই এই পদ্ধতিতে তৈরি হওয়া যৌগগুলো প্রায়শই মিশ্র প্রকৃতির হয়। যদি কোনো যৌগেঅক্সাজোলবাথিয়াজোলপাওয়া যায়, তাহলে সাধারণত ধরে নেওয়া হয় সেটি এই পদ্ধতিতে তৈরি হয়েছে।
পেপটোনহলো প্রাণিজ দুধ বা মাংসকেপ্রোটিওলাইসিসনামক প্রক্রিয়ার মাধ্যমে ভেঙে তৈরি করা হয় এমন একধরনের জৈবিক পদার্থ।ছোট পেপটাইড থাকার পাশাপাশি, এতে চর্বি, ধাতু, লবণ, ভিটামিন এবং অন্যান্য অনেক জৈবিক যৌগও থাকে।
পেপটাইড ফ্রাগমেন্টহলো প্রোটিনের ছোট টুকরা যা একটি নির্দিষ্ট প্রোটিনের উৎস নির্ধারণ বা তার পরিমাণ পরিমাপ করতে ব্যবহৃত হয়।সাধারণত এগুলো গবেষণারে নিয়ন্ত্রিত পরিবেশে এনজাইমের মাধ্যমে প্রোটিন ভেঙে পাওয়া যায়। তবে প্রাকৃতিকভাবে ক্ষতিগ্রস্ত ফরেনসিক বা প্রত্নতাত্ত্বিক নমুনা থেকেও পাওয়া যেতে পারে।
পেপটাইড প্রোটিন এবং অন্যান্য ম্যাক্রোমলিকিউলের সাথে মিথস্ক্রিয়া করতে পারে। এগুলো মানব কোষে বিভিন্ন গুরুত্বপূর্ণ কাজের জন্য দায়ী, যেমন কোষ সংকেত, এবং রোগ প্রতিরোধ ব্যবস্থাকে নিয়ন্ত্রণ করে।গবেষণায় দেখা গেছে, মানব কোষে প্রোটিন-প্রোটিন মিথস্ক্রিয়ার ১৫-৪০% পেপ্টাইডের মাধ্যমে পরিচালিত হয়।এছাড়াও, অনুমান করা হয় যে ঔষধ বাজারের কমপক্ষে ১০% পেপ্টাইড পণ্যের উপর ভিত্তি করে তৈরি।
এই অংশে উল্লিখিত পেপটাইড গোত্রগুলো প্রধানত হরমোনের কার্যকলাপ সম্পন্ন করা রাইবোজোমাল পেপটাইড। এই সব পেপটাইডগুলো কোষে দীর্ঘ "প্রোপেপটাইড" বা "প্রোপ্রোটিন" হিসাবে সংশ্লেষিত হয় এবং কোষ থেকে বের হওয়ার আগে কাটা হয়। এরপর সেগুলো রক্তপ্রবাহে মুক্তি পায় এবং সেখানে সংকেত বহনের কাজ করে।
পলিপেপটাইড,প্রোটিনএবংঅলিগোপেপটাইড- এই তিনটি শব্দই অ্যামিনো অ্যাসিড দ্বারা গঠিত, তবে তাদের মধ্যে দৈর্ঘ্যের ভিন্নতা রয়েছে।
পেপটাইড এবং প্রোটিন সাধারণত তাদের শৃঙ্খলে থাকা অ্যামিনো অ্যাসিডের সংখ্যা দ্বারা বর্ণনা করা হয়। উদাহরণস্বরূপ, ১৫৮টি অ্যামিনো অ্যাসিড দীর্ঘ একটি প্রোটিনকে "১৫৮ অ্যামিনো অ্যাসিড দীর্ঘ প্রোটিন" হিসাবে বর্ণনা করা যেতে পারে। নির্দিষ্ট সংখ্যক অ্যামিনো অ্যাসিডযুক্ত পেপটাইডগুলোকেআইইউপিএসি সংখ্যাসূচক গুণকউপসর্গ ব্যবহার করে নামকরণ করা হয়:
একই শব্দগুলো বৃহত্তর পলিপেপটাইডের (যেমন,আরজিডি মোটিফ) অবশিষ্টাংশ গ্রুপকে বর্ণনা করতেও ব্যবহৃত হয়।