Kesultanan Cirebon

Kesultanan Cirebonadalah sebuahkesultanandidaratan utara pulau Jawa bagian baratpada abad ke-15 dan 16, dan merupakan pangkalan penting dalam jalur perdagangan dan pelayaran antar pulau. Lokasinya di pantai utarapulau Jawa
Kesultanan Cirebon didirikan diDalem Agung Pakungwatisebagai pusat pemerintahan negara islam kesultanan Cirebon, letak dalem agung pakungwati sekarang menjadiKeraton Kasepuhan.
Kesultanan Cirebon erat kaitannya dengan sosokSunan Gunung Jatiyang dikenal sebagai salah satu dari sembilan wali yang menyebarkan agamaIslamdi Lampungdan Jawa bagian barat.
Kesultanan Cirebon mampu bertahan selama 3 abad, sejak diakuinya Walangsungsang sebagaiSri Mangana(Penguasa) Cirebon pada 1430 hingga terjadinya kisruh kekuasaan akibat kosongnya posisi Sultan Cirebon sepeninggal Sultan Abdul Karim  pada 1677. Tipu dayaMatarammasa Amangkurat I serta dekatnya sebagian keluarga kesultanan Cirebon dengan Belanda menyebabkan perlahan kekuasaan Cirebon akhirnya runtuh, terlebih perkarapribawa(derajat paling tinggi) diantara keluarga besar kesultanan Cirebon semakin mempercepat keruntuhan kesultanan Cirebon pada akhir abad ke 17.
MenurutSulendraningratyang mendasarkan pada naskahBabad Tanah SundadanAtjapada naskahCarita Purwaka Caruban Nagari,Cirebonpada awalnya adalah sebuah dukuh kecil yang dibangun oleh Ki Gedeng Tapa, yang lama-kelamaan berkembang menjadi sebuah desa yang ramai dan diberi namaCaruban(Bahasa Jawa: campuran), karena di sana bercampur para pendatang dari berbagai macam suku bangsa, agama, bahasa, adat istiadat, dan mata pencaharian yang berbeda-beda dan datang untuk bertempat tinggal atau berdagang.
Di abad ke-14, seorang pangeranGaluhbernamaBratalegawamemelukIslamdan memutuskan pindah ke Caruban Girang serta bermukim disana dengan tujuan untuk menyebarkanIslamkepada penduduk sekitar, menjadikan Cirebon sebagai cikal bakal pusat penyebaran agama Islam di Jawa Barat.
Mengingat pada awalnya sebagian besar mata pencaharian masyarakat adalah sebagai nelayan, maka berkembanglah pekerjaan menangkap ikan dan rebon (udang kecil) di sepanjang pantai serta pembuatan terasi, petis, dan garam. Dari istilah air bekas pembuatan terasi (belendrang) dari udang rebon inilah berkembanglah sebutancai-rebon(Bahasa Sunda: air rebon) yang kemudian menjadiCirebon.
Dengan dukungan pelabuhan yang ramai dan sumber daya alam dari pedalaman, Cirebon kemudian menjadi sebuah kota besar dan menjadi salah satu pelabuhan penting di pesisir utara Jawa baik dalam kegiatan pelayaran dan perdagangan di kepulauanNusantaramaupun dengan bagian dunia lainnya.
Ki Gedeng Tapa (Ki Gedeng Jumajan Jati) adalah seorang Mangkubumi dari Kerajaan Sing Apura.Kerajaan ini bertugas mengatur pelabuhan Muarajati, Cirebon setelah tidak adanya penerus takhta di kerajaan tetangganya yaitu Surantaka setelah anak perempuan penguasanya yaituNyiAmbet Kasih menikah dengan Jayadewata (prabu Silih Wangi).
Bratalegawa (Haji Purwa) adalah seorang pangeran dari Kerajaan Galuh anak dari prabuBunisora.Ia sebelumnya telah memeluk Islam diIndiadan memutuskan untuk pindah ke Cirebon serta menyebarkan Islam disana, dikarenakan pengaruh Hindu diKawali, ibukota Galuh saat itu masih sangat kuat. Sebagai seorang saudagar, Bratalegawa juga berperan dalam memajukan perekonomian Cirebon, dimana Cirebon menjadi pintu utama ekspor dari barang-barang yang dihasilkan oleh Kerajaan Galuh.
Masduqi dalam artikelnya yang berjudul Mengembalikan Perdagangan Islam yang Berkeadilan dalam acara konferensi Islam Internasional AICIS ke 12 di Surabaya menjelaskan bahwa patut diduga penggunaanDinar(uang meas)Dirham(uang perak) danFulus(uang tembaga) telah terjadi pada masa Ki Gedeng Tapa, hal tersebut dikarenakan pada masa itu pelabuhan Muara Jati telah banyak dikunjungi kapal-kapal asing
Cheng Hodalam misi diplomatiknya sempat berlabuh di pelabuhan Muara Jati, Cirebon pada tahun 1415, kedatangan Cheng Ho disambut olehKi Gedeng Tapa, Cheng Ho kemudian memberikan cenderamata berupa piring yang bertuliskan ayat kursi (piring ini sekarang tersimpan dikeraton Kasepuhan,kesultanan KasepuhanCirebon).Cheng Ho dan anak buahnya kemudian berbaur dengan warga sekitar dan berbagi ilmu pembuatan keramik, penangkapan ikan dan manajemen pelabuhan. Kung Wu Ping (Panglima angkatan bersenjata pada armada Cheng Ho)kemudian menginisiasi pendirian sebuah mercusuar (bahasa Cirebon:Prasada Tunggang Prawata) untuk pelabuhan Muara Jatipembangunannya kemudian mengambil tempat di bukit Amparan Jati.
Pada masa persinggahan laksamana Cheng Ho tersebut sangat dimungkinkan uang emas dan uang perak dijadikan sebagai alat tukarnya karena uang emas dan uang perak telah menjadi standar internasional pada masa tersebut terutama di pelabuhan-pelabuhan internasional.
Pemukiman warga muslimTionghoapun kemudian dibangun di sekitarprasada tunggang prawata(bahasa Indonesia : mercusuar) bukit Amparan Jati, yaitu di wilayah Sembung, Sarindil dan Talang lengkap dengan masjidnya, pemukiman di Sarindil ditugaskan untuk menyediakan kayu jati guna perbaikan kapal-kapal, pemukiman di Talang ditugaskan untuk memelihara dan merawat pelabuhan, pemukiman di Sembung ditugaskan memeliharamercusuar, ketiga pemukiman Tionghoa tersebut secara bersama-sama ditugaskan pula memasok bahan-bahan makanan untuk kapal-kapal,masjid di wilayah Talang sekarang telah berubah fungsinya menjadi sebuah klenteng.
Pada masa kedatangan pangeran Walangsungsang dannyimasRara Santang ke Cirebon untuk memperdalam agamaIslam, pangeran Walangsungsang kemudian membangun sebuah tempat tinggal yang disebutGedong Witanapada tahun 1428 Masehi.yang sekarang menjadi bagian dari komplekskeraton Kanoman,kesultanan Kanoman, setelah mendapatkan pengajaran agama yang cukup, pangeran Walangsungsang dannyimasRara Santang kemudian menunaikan ibadahhajikeMekah, di sananyimasRara Santang menemukan jodohnya yaitu seorang pembesar Arab dan menikah sehingganyimastidak ikut kembali keCirebon. Sepulangnya dari melaksanakanhajipangeran Walangsungsang diminta oleh gurunya untuk membuka lahan guna membuat perkampungan baru sebagai cikal-bakal negeri yang ia cita-citakan, setelah memilih dari beberapa tempat akhirnya diputuskan perkampungan baru tersebut akan dibangun di wilayah Kebon Pesisir.
Menurut sejarah lisan dan sebagian babad mengenai masalah ini, dikatakan bahwa Pengeran Walangsungsang diperintahkan oleh gurunya Syekh Datuk Kahfi (Nur Jati) untuk membuka lahan di wilayah Kebon Pesisir, tetapi dikatakan bahwa di Kebon Pesisir tidak sepenuhnya kosong karena sudah ada sepasang suami istri yaitu Ki Danusela dan istrinya yang tinggal di sana, akhirnya sebagai bentuk penghormatan makaKuwu(Kepala Desa) Caruban yang pertama yang diangkat oleh masyarakat baru itu adalah Ki Danusela dengan gelar Ki Gedeng Alang-alang, sebagai Pangraksabumi atau wakilnya, diangkatlah Raden Walangsungsang, yaitu putra Prabu Siliwangi dan Nyi Mas Subanglarang atau Subangkranjang, yang tak lain adalah putri dari Ki Gedeng Tapa. Setelah Ki Gedeng Alang-alang wafat, Walangsungsang yang juga bergelar Ki Cakrabumi diangkat menjadi penggantinya sebagai kuwu yang kedua, dengan gelar Pangeran Cakrabuana.
Pada masa pemerintahankiDanusela sebagaikuwuKebon Pesisir, dibangun jugatajug(bahasa Indonesia: Mushola) pertama di wilayah tersebut atas prakarsa dari menantunya yaitu pangeran Walangsungsang,tajugtersebut bernamatajugJalagrahan.
Pangeran Cakrabuana adalah keturunan Pajajaran. Putra pertama Sri Baduga Maharaja Prabu Siliwangi dari istrinya yang pertama bernama Subanglarang (putri Ki Gedeng Tapa). Raden Walangsungsang, ia mempunyai dua orang saudara seibu, yaitu Nyai Rara Santang dan Raden Kian Santang.
Sebagai anak sulung dan laki-laki ia tidak mendapatkan haknya sebagai putra mahkota Pakuan Pajajaran. Hal ini disebabkan oleh karena ia memeluk agama Islam (diturunkan oleh Subanglarang - ibunya), sementara saat itu (abad 15) ajaran agama mayoritas di Pajajaran adalah Sunda Wiwitan (agama leluhur orang Sunda) Hindu dan Budha. Posisinya digantikan oleh adiknya, Prabu Surawisesa,anak laki-laki Prabu Siliwangi dari istrinya yang kedua Nyai Cantring Manikmayang.
Pangeran Cakrabuana, yang usai menunaikan ibadah haji kemudian disebut Haji Abdullah Iman,menurut Pangeran Sulaeman Sulendraningrat dalam naskah Sejarah Babad Tanah Sunda, Pangeran Cakrabuana sepulang dari Mesir ia dibekali oleh saudara iparnya (suami Nyimas Rara Santang) yaitu Sultan Hud atau Mahmud Asyar al-Qibthi atau dikenal juga dengan nama Syarief Abdullah denganDirham(uang perak) sebanyak seribu keping.
Pangeran Walangsungsang lalu membuat sebuah pedukuhan di Kebon Pesisir, membangunKuta Kosod (susunan tembok bata merah tanpa spasi)mendirikanDalem Agung Pakungwatiserta dan membentuk pemerintahan di Cirebon pada tahun 1430 M.Dengan demikian, yang dianggap sebagai pendiri pertama Kesultanan Cirebon adalah Walangsungsang atau Pangeran Cakrabuana. Pangeran Cakrabuana, tampil sebagai "raja" Cirebon pertama yang memerintah dari keraton Pakungwati dan aktif menyebarkan agama Islam kepada penduduk Cirebon.
Pendirian kesultanan ini sangat berkaitan erat dengan keberadaanKesultanan Demak.
Pangeran Walangsungsang wafat pada tahun 1529 Mdan dimakamkan di gunung Sembung,Cirebon.
Pada tahun 1478 diadakan sebuah musyawarah para wali diTuban,Jawa Timuruntuk mencari penggantiSunan Ampelsebagai pimpinan para wali, akhirnya terpilihlah Syarif Hidayatullah (Sunan Gunung Jati), sejak saat itu, pusat kegiatan para wali dipindahkan ke gunung Sembung,kecamatan Gunung Jati,kabupaten Cirebon,propinsi Jawa Barat. Pusat kegiatan keagamaan ini kemudian disebut sebagaiPuser Bumi(bahasa Indonesia: pusatnya dunia).
Pada tahun 1479 M, kedudukan pangeran Walangsungsang sebagai penguasaCirebonkemudian digantikan putra adiknya yakni Syarif Hidayatullah (anak dari pernikahanNyaiRarasantang dengan Syarif Abdullah dariMesir) yang sebelumnya menikahiNyimasPakungwati (putri dari Pangeran Walangsungsang danNyaiIndang Geulis) yang setelah wafat dikenal dengan sebutanSunan Gunung Jatidengan gelar Syarif Hidayatullah bin Maulana Sultan Muhammad Syarif Abdullah dan bergelar pula sebagaiIngkang Sinuhun Kangjeng Susuhunan Jati Purba Panetep Panatagama Awlya Allah Kutubid Jaman Khalifatur Rasulullah.
Syarif Hidayatullah melalui lembagaWali Sangaselalu mendekati kakeknya yakni Jaya Dewata (prabuSilih Wangi) agar berkenan memeluk agama Islam seperti halnya neneknyaNyaiSubang Larang yang memang sudah lama menjadi seorangmuslimjauh sebelum menikah dengan prabuSilih Wangi, tetapi hal tersebut tidak membuahkan hasil, pada tahun 1482 (pada saat kekuasaan kerajaan Galuh dan Sunda sudah menjadi satu kembali di tangan prabuSilih Wangi), seperti yang tertuang dalam naskahPurwaka Caruban Nagarikarya Pangeran Arya Carbon.
Pada tanggal 12 Shafar 887 Hijriah atau tepatnya pada tanggal 2 April 1482 Masehi, akhirnya Syarif Hidayatullah membuat maklumat yang ditujukan kepada prabuSilih Wangiselaku Raja Pakuan Pajajaran bahwa mulai saat itu Cirebon tidak akan lagi mengirimkan upeti.Maklumat tersebut kemudian diikuti oleh para pembesar di wilayah Cirebon (bahasa Cirebon:gegeden).
Untuk memperkuat hubungan dengankesultanan Demakdilakukan dengan pernikahan putra putri kedua kesultanan.
Pertumbuhan dan perkembangan yang pesat pada kesultanan Cirebon dimulailah oleh Syarif Hidayatullah atauSunan Gunung Jati. Sunan Gunung Jati kemudian diyakini sebagai leluhur dari dinasti raja-raja kesultanan Cirebon dankesultanan Bantenserta penyebar agama Islam di Jawa Barat sepertiMajalengka,Kuningan,Kawali(Galuh),Sunda Kelapa, danBanten.
Pada abad ke 15 atau sekitar tahun 1400an, kesultanan Cirebon telah memberlakukanDinardanDirhamsebagai uang kartal  kesultanannya.
Pada masa awal perkembangan kesultanan Cirebon, wilayah Cirebon terkenal sebagai jalur perdagangan, pada masa itu di Cirebon diberlakukanPicis(uang logam) yang terbuat dari timah sebagai mata uangnya.
Syiar Islam ke wilayah Kuningan telah dilakukan dengan cara yang persuasif, di wilayahLuragungIslam sudah terbangun dengan baik pada tahun 1481 M, dengan penguasanyaKigede Luragung, pada 1 September 1488,Sunan Gunung Jatimenjadikan putraKigede Luragung (anak angkatSunan Gunung Jati) yang bernama Pangeran Kuningan atau yang oleh masyarakat Kuningan dikenal dengan namaSangkukudiangkat sebagaiDepati Kuningan(bahasa Indonesia: gubernur kesultanan Cirebon untuk wilayahKuningan).
Pada tahun 1518,Syekh Syarif Hidayatullahmengutus Janapura yang merupakan muridnya yang berasal dariKudusuntuk membuat sebuah pedukuhan di dekat laut di wilayah ujung Karawang yang sekarang berada di sekitar Pisangan - Sedari,Karawang, pedukuhan yang dibangun oleh Janapura kemudian menjadi pos kesultanan Cirebon di wilayah pesisir utara bagian barat
Pedukuhan yang pertama dibuat oleh Janapura adalah pedukuhan Pisangan, setelah 10 tahun menetap di Pisangan, kedua puteri dari Janapura yaitu Dewi Sondari dan Andidari datang berkunjung. Pada tahun 1528 Janapura yang kemudian dikenal sebagai Syekh Janapura mendapatkan misi untuk mengislamkan daerah Tanjung Suwung yang sekarang dikenal dengan nama Sedari. Wilayah Tanjung Suwung pada masa itu banyak dihuni oleh masyarakat pelarian dari kerajaan Telaga, Syekh Janapura kemudian berhasil mengislamkan masyarakat di Tanjung Suwung dan selanjutnya mengembangkan pedukuhan di sana,menurut Zakaria Husein (sejarahwan Karawang) berita keberhasilan Syekh Janapura mengislamkan Tanjung Suwung kemudian tersebar hingga keKudus, tidak lama kemudian Raden Imanillah (keluarga Sunan Kudus) meminang Dewi Sondari dan membawanya kembali keKudus, untuk memperingati pernikahan puterinya yaitu Dewi Sondari dengan Raden Imanillah, Syekh Janapura kemudian memberikan nama pada pedukuhan di Tanjung Suwung tersebut dengan nama pedukuhan Sondari yang kemudian dikenal oleh masyarakat sekarang dengan nama Sedari.
Menurut data yang dihimpun oleh Zakaria Husein, Syekh Janapura tinggal di Tanjung Suwung hingga akhir hayatnya yakni pada tahun 1567, ia kemudian dimakamkan di dekat pantai.
Pangeran Sulaeman Sulendraningrat dalam bukunya Sejarah Cirebon menjelaskan bahwa setelah wafatnya Pangeran Sebrang Lor (Sultan Demak kedua) pada tahun 1521 pada penyerangan keMelakayang dikuasi Portugis,Ratu Ayu, putri Sunan Jati (Sultan Cirebon kedua) dan istri dari Pangeran Sebrang Lor (Sultan Demak kedua) kemudian membawa gamelan dakwah yang disebut "Sukahati" (bahasa Indonesia: kebahagian karena ikhlas) ke wilayahCirebondariDemaksebagai benda untuk mengenang mendiang suaminya. Budayawan Cirebon meyakini bahwaGong Sukahati(bahasa Indonesia: gong Sekati) adalah alat musik gamelan dakwah pertama yang dibawa masuk ke Cirebon dari Demak.Sementara Cirebon sudah memiliki gamelan dakwahnya sendiri disaat yang sama, dalambahasa Cirebonorang-orang yang sedang terlibat dalam pagelaran gongSuka HatidisebutSukatenatauSekatendari tata bahasa CirebonSuka hati+ akhiran -an (yang berarti orang yang melaksanakan kata benda) sehinggaSuka(h)at(ia)nmenjadiSukaten(huruf "h" tidak dibaca dan "i" bertemu "a" menjadi "e") atau sering masyarakat luar Cirebon mengatakanSekaten, hingga sekarang kesenianGong Sekati Cirebonmasih sering diperdengarkan di keraton-keraton Cirebon.
Pada masa awal kedatangannya ke Cirebon, Syekh Syarif Hidayatullah (Sunan Gunung Jati) bersama dengan Pangeran Walangsungsang sempat melakukan syiar Islam di wilayah Banten yang pada masa itu disebut sebagaiWahanten, Syarif Hidayatullah dalam syiarnya menjelaskan bahwa artijihad(perang) tidak hanya dimaksudkan perang melawan musuh-musuh saja namun juga perang melawan hawa nafsu, penjelasan inilah yang kemudian menarik hati masyarakatWahantendanpucuk umum(penguasa)Wahanten Pasisir. Pada masa itu di wilayahWahantenterdapat dua penguasa yaitu Sang Surosowan (anak dari prabu Jaya Dewata atau Silih Wangi) yang menjadipucuk umum(penguasa) untuk wilayahWahanten Pasisirdan Arya Suranggana yang menjadipucuk umumuntuk wilayahWahanten Girang.
Di wilayahWahanten PasisirSyarif Hidayatullah bertemu dengan Nyai Kawung anten (putri dari Sang Surosowan), keduanya kemudian menikah dan dikaruniai dua orang anak yaitu Ratu Winaon (lahir pada 1477 M) dan PangeranMaulana Hasanuddin(Pangeran Sabakingkin: nama pemberian dari kakeknya Sang Surosowan) yang lahir pada 1478 M.Sang Surosowan walaupun tidak memeluk agama Islam namun sangat toleran kepada para pemeluk Islam yang datang ke wilayahnya.
Syarif Hidayatullah kemudian kembali ke kesultanan Cirebon untuk menerima tanggung jawab sebagai penguasa kesultanan Cirebon pada 1479 setelah sebelumnya menghadiri rapat para wali di Tuban yang menghasilkan keputusan menjadikanSunan Gunung Jatisebagai pemimpin dari para wali.
Perkawinan Pangeran Sabrang Lor (Yunus Abdul Kadir) dengan Ratu Ayu (putriSunan Gunung Jati) terjadi 1511. Sebagai Senapati Sarjawala, panglima angkatan laut, Kerajaan Demak, Sabrang Lor untuk sementara berada di Cirebon, kelak Yunus Abdul Kadir akan menjadi Sultan Demak pada 1518.
Persekutuan kesultanan Cirebon dankesultanan Demakini sangat mencemaskan Jaya dewata (Siliwangi) di Pakuan. Tahun 1512, ia mengutus putra mahkota Surawisesa menghubungi Panglima Portugis Afonso de Albuquerque di Malaka yang ketika itu baru saja gagal merebut Pelabuhan Pasai milik Kesultanan Samudera Pasai.
Pada tahun 1513 M,Tome Pirespelaut Portugis menyatakan dalam catatannya bahwa sudah banyak dijumpai orang Islam di pelabuhanBanten.
Syarif Hidayatullah mengajak putranyaMaulana Hasanuddinuntuk berangkat keMekah,sekembalinya dariMekahSyarif Hidayatullah dan putranya yaitu Maulana Hasanuddin kemudian melakukan dakwah Islam dengan sopan, ramah serta suka membantu masyarakat sehingga secara sukarela sebagian dari mereka memeluk dan taat menjalankan agama Islam, dari aktivitas dakwah ini di wilayah Banten, Syarif Hidayatullah dikenal dengan namaSyekh Nurullah(Syekh yang membawa cahaya Allah swt),aktivitas dakwah kemudian dilanjutkan oleh Maulana Hasanuddin hingga ke pedalamanWahantenseperti gunung Pulosari dikabupaten Pandeglangdi mana ia pernah tinggal selama sekitar 10 tahun untuk berdakwah kepada paraajar(pendeta), gunung Karang, gunung Lor, hingga ke Ujung Kulon dan pulau Panaitandengan pola syiar yang kurang lebih sama seperti yang dilakukan ayahnya.
Pada tahun 1521, Jaya dewata (prabuSiliwangi) mulai
membatasi pedagang muslim yang akan singgah di pelabuhan-pelabuhankerajaan Sundahal ini bertujuan untuk mengurangi pengaruh Islam yang akan diterima oleh para pedagang pribumi ketika melakukan kontak perdagangan dengan para pedagang muslim, tetapi upaya tersebut kurang mendatangkan hasil yang memuaskan karena pada kenyataannya pengaruh Islam jauh lebih kuat dibandingkan upaya pembatasan yang dilakukan tersebut, bahkan pengaruh Islam mulai memasuki daerah pedalaman kerajaan Sunda. Pada tahun itu juga kerajaan Sunda berusaha mencari mitra koalisi dengan negara yang dipandang memiliki kepentingan yang sama dengan kerajaan Sunda, Jaya dewata (Siliwangi) memutuskan untuk menjalin persahabatan dengan Portugis dengan tujuan dapat mengimbangi kekuatan pasukankesultanan Demakdan kesultanan Cirebon.
Pada tahun 1521 untuk merealisasikan persahabatan tersebut Jaya dewata (Siliwangi) mengirim beberapa utusan ke Malaka di bawah pimpinan RatuSamiam(Surawisesa), mereka berusaha meyakinkan bangsa Portugis bagi suatu persahabatan yang saling menguntungkan antarakerajaan SundadanPortugis. Surawisesa memberikan penawaran kepada Portugis untuk melakukan perdagangan secara bebas terutama lada di pelabuhan-pelabuhan milik kerajaan Sunda sebagai imbalannya, Surawisesa mengharapkan bantuan militer dari Portugis apabila kerajaan Sunda diserang olehkesultanan Demakdan kesultanan Cirebon dengan memberi hak kepada Portugis untuk membangun benteng.
Pada tahun 1522 GubernurAlfonso d'Albuquerqueyang berkedudukan di Malaka mengutus Henrique Leme untuk menghadiri undangan raja Sunda Surawisesa (dalam naskah Portugis disebut sebagai Raja Samiam)untuk membangun benteng keamanan di Sunda Kalapa guna melawan orang-orang Cirebon yang menurutnya bersifat ekspansif.
Pada tanggal21 Agustus1522dibuatlah suatu perjanjian yang menyebutkan bahwa orang Portugis akan membuat loji (perkantoran dan perumahan yang dilengkapi benteng) di Sunda Kelapadan Banten, sedangkan Sunda Kelapa akan menerima barang-barang yang diperlukan. Raja Sunda Surawisesa akan memberikan kepada orang-orang Portugis 1.000 keranjang lada sebagai tanda persahabatan, sebuah batu peringatan ataupadraõ(dibaca: Padraun) dibuat untuk memperingati peristiwa itu.Padrão dimaksuddisebut dalam cerita masyarakatSundasebagai Layang Salaka Domas dalam cerita rakyatMundinglaya Dikusumah, dari pihakkerajaan Sundaperjanjian ditandatangani olehPadam Tumungo(yang terhormat Tumenggung),Samgydepaty(Sang Depati),e outre Benegar(dan bendahara)e easy o xabandar(dan Syahbandar)Syahbandar Sunda Kelapa yang menandatangani bernama Wak Item dari kalangan muslim Betawi, dia menandatangani dengan membubuhkan huruf Wau dengan Khot.
Pada tahun 1522,Maulana Hasanuddinmembangun kompleks istana yang diberi nama keraton Surosowan, pada masa tersebut dia juga membangun alun-alun, pasar, masjid agung serta masjid di kawasan Pacitan.Sementara yang menjadipucuk umum(penguasa) diWahanten Pasisiradalah Arya Surajaya (putra dari Sang Surosowan dan paman dari Maulana Hasanuddin) setelah meninggalnya Sang Surosowan pada 1519 M. Arya Surajaya diperkirakan masih memegang pemerintahanWahanten Pasisirhingga tahun 1526 M.
Pada tahun 1524 M,Sunan Gunung Jatibersama pasukan gabungan dari kesultanan Cirebon dankesultanan Demakmendarat di pelabuhanBanten.Pada masa ini tidak ada pernyataan yang menyatakan bahwaWahanten Pasisirmenghalangi kedatangan pasukan gabungan Sunan Gunung Jati sehingga pasukan difokuskan untuk merebutWahanten Girang.
Dalam Carita Sajarah Banten dikatakan ketika pasukan gabungan kesultanan Cirebon dan kesultanan Demak mencapaiWahanten Girang,KiJongjo (seorang kepala prajurit penting) dengan sukarela memihak kepada Maulana Hasanuddin.
Dalam sumber-sumber lisan dan tradisional diceritakan bahwapucuk umum(penguasa) Banten Girang yang terusik dengan banyaknya aktivitas dakwahMaulana Hasanuddinyang berhasil menarik simpati masyarakat termasuk masyarakat pedalamanWahantenyang merupakan wilayah kekuasaanWahanten Girang, sehinggapucuk umumArya Suranggana meminta Maulana Hasanuddin untuk menghentikan aktivitas dakwahnya dan menantangnyasabung ayam(adu ayam) dengan syarat jikasabung ayamdimenangkan Arya Suranggana maka Maulana Hasanuddin harus menghentikan aktivitas dakwahnya.Sabung Ayampun dimenangkan oleh Maulana Hasanuddin dan dia berhak melanjutkan aktivitas dakwahnya.Arya Suranggana dan masyarakat yang menolak untuk masuk Islam kemudian memilih masuk hutan di wilayah Selatan.
Sepeninggal Arya Suranggana, kompleks Banten Girang digunakan sebagai pesanggrahan bagi para penguasa Islam, paling tidak sampai di penghujung abad ke-17.
Atas petunjuk ayahnya yaituSunan Gunung Jati,Maulana Hasanuddinkemudian memindahkan pusat pemerintahanWahanten Girangke pesisir di kompleks Surosowan sekaligus membangun kota pesisir.
Kompleks istana Surosowan tersebut akhirnya selesai pada tahun 1526.Pada tahun yang sama juga Arya Surajayapucuk umum(penguasa)Wahanten Pasisirdengan sukarela menyerahkan kekuasannya atas wilayahWahanten Pasisirkepada Sunan Gunung Jati, akhirnya kedua wilayahWahanten GirangdanWahanten Pasisirdisatukan menjadiWahantenyang kemudian disebut sebagaiBantendengan status sebagaikadipaten(setingkat dengan provinsi) dari kesultanan Cirebon pada tanggal 1 Muharram 933 Hijriah (sekitar tanggal 8 Oktober 1526 M),kemudian Sunan Gunung Jati kembali ke kesultanan Cirebon dan pengurusan wilayah Banten diserahkan kepada Maulana Hasanuddin, dari kejadian tersebut sebagian ahli berpendapat bahwa Sunan Gunung Jati adalah Sultan pertama di Banten,meskipun demikian Sunan Gunung Jati tidak menahbiskan dirinya menjadi penguasa (sultan) di Banten.Alasan-alasan demikianlah yang membuat pakar sejarah seperti Hoesein Djajadiningrat berpendapat bahwaSunan Gunung Jatilahyang menjadi pendiriBantendan bukannyaMaulana Hasanuddin.
Menurut catatan dari Joao de Barros, semenjakBantendan Sunda Kelapa dikuasai oleh kesultanan Islam,Bantenlah yang lebih ramai dikunjungi oleh kapal dari berbagai negara.
Pada tahun 1530, Cirebon berhasil menguasai Lampung dan menempatkannya dibawah kendaliDepatiBanten
Pada tahun 1552, Maulana Hasanuddin diangkat menjadi sultan di wilayah Banten oleh ayahnya Syarif Hidayatullah (Sunan Gunung Jati).
Laporan Portugis menjelaskan bahwa Sunda Kelapa terbujur sepanjang satu atau dua kilometer di atas potongan-potongan tanah sempit yang dibersihkan di kedua tepi sungai Ciliwung. Tempat ini ada di dekat muaranya yang terletak di teluk yang terlindung oleh beberapa buah pulau. Sungainya memungkinkan untuk dimasuki 10 kapal dagang yang masing-masing memiliki kapasitas sekitar 100 ton. Kapal-kapal tersebut umumnya dimiliki oleh orang-orangMelayu, Jepang dan Tionghoa. Di samping itu ada pula kapal-kapal dari daerah yang sekarang disebut Indonesia Timur. Sementara itu kapal-kapal Portugis dari tipe kecil yang memiliki kapasitas muat antara 500 - 1.000 ton harus berlabuh di depan pantai. Tome Pires juga menyatakan bahwa barang-barang komoditas dagang Sunda diangkut denganlancaran, yaitu semacam kapal yang muatannya sampai kurang lebih 150 ton.
Lalu pada tahun 1522 GubernurAlfonso d'Albuquerqueyang berkedudukan di Malaka mengutus Henrique Leme untuk menghadiri undangan raja Sunda Surawisesa (dalam naskah Portugis disebut sebagai Raja Samiam)untuk membangun benteng keamanan di Sunda Kalapa guna melawan orang-orang Cirebon yang menurutnya bersifat ekspansif.
Pada masa ini nama Fatahilah (Fadilah Khan) yang dipercaya sebagian masyarakat Cirebon berasal dari Pasai sudah dikenal dibeberapa kalangan masyarakat Demak dan Cirebon setelah sebelumnya hidupnya berpindah pindah dari Pasai ke Melaka sebelum datang ke Cirebon akibat kedua tempat tersebut dikuasai oleh Portugis, Fatahilah dikenal dikarenakan dia turut membantu dalam hal syiar Islam, di Cirebon setelah meninggalnya Sultan Demak Pangeran Sebrang Lor ia kemudian menikahi mantan Istri pangeran Sebrang Lor yaitu Ratu Ayu yang merupakan anak dari Sunan Gunung Jati dan setelah Pangeran Jayakelana dari Cirebon meninggal, ia pun kemudian menikahi mantan istrinya yang berasal darikesultanan Demakyaitu Ratu Ayu Pembayun,hal ini membuat Fatahilah menjadi menantu Sunan Gunung Jati dan kesultanan Demak.
Pada tanggal21 Agustus1522dibuatlah suatu perjanjian yang menyebutkan bahwa orang Portugis akan membuatloji(perkantoran dan perumahan yang dilengkapi benteng) di Sunda Kelapadan Banten, sedangkan Sunda Kelapa akan menerima barang-barang yang diperlukan. Raja Sunda Surawisesa akan memberikan kepada orang-orang Portugis 1.000 keranjang lada sebagai tanda persahabatan, sebuah batu peringatan ataupadraõ(dibaca: Padraun) dibuat untuk memperingati peristiwa itu.Padrão dimaksuddisebut dalam cerita masyarakatSundasebagai Layang Salaka Domas dalam cerita rakyatMundinglaya Dikusumah, dari pihakkerajaan Sundaperjanjian ditandatangani oleh Syahbandar Sunda Kelapa yang bernama Wak Item dari kalangan muslim Betawi dengan membubuhkan huruf Wau dengan Khot.
Padraõ itu ditemukan kembali pada tahun 1918 di sudut Prinsenstraat (Jalan Cengkih) dan Groenestraat (Jalan Nelayan Timur) di Jakarta.
Fatahilah kemudian mengungkapkan rencananya untuk menyerang Portugis di Sunda Kelapa, rencana Fatahilah mendapatkan dukungan dari kesultanan Demak, Sultan Trenggana yang melihat kedekatan kerajaan Sunda denganPortugissebagai ancaman kemudian juga turut merencanakan serangan ke Sunda Kelapa.
Penyerangan ke Sunda Kelapa kemudian dilakukan dengan gabungan prajurit kesultanan Cirebon,kesultanan Demakdankesultanan Banten(pada saat ituBantenmasih menjadikadipatendi bawah kesultanan Cirebon) yang baru saja berdiri pada tahun 1526 hasil penyerangan prajurit Cirebon dan Demak di bawah pimpinanMaulana HasanuddinputraSunan Gunung Jatiatas wilayah Banten Girang, setelah sebelumnya Fatahilah meminta saudara iparnya yaitu Sultan Banten pertama Maulana Hasanuddin agar tidak menyerang Sunda Kelapa sendirian.
Pada saat menyerang Sunda Kelapa pada tahun 1527, menurut sejarawan dan budayawanBetawiRidwan Saidi, pasukan Fatahilah hanya menghadapi Syahbandar Sunda Kelapa yaitu Wak Item dan dua puluh anggotanya, Wak Item tewas dan tubuhnya ditenggelamkan di laut, kemudian Fatahilah membumihanguskan perkampungan yang ada di sana termasuk perkampungan yang didiami tiga ribu orang muslim Betawi,yang pemukimannya berada di wilayah Mandi Racan, sekarang masuk wilayah Pasar Ikan,Jakarta. Fatahilah kemudian membangun istana dengan tembok tinggi di sisi barat Kali Besar (terusan sungai di sebelah barat Ciliwung), masyarakat muslim Betawi yang rumahnya berada di dekat istananya diusir dan rumahnya dibumihanguskan,Sunda Kelapa akhirnya dapat dikuasai sepenuhnya pada 22 Juni 1527.
Pada pertempuran antarakerajaan Sundadengan gabungan prajurit Banten, Cirebon dan Demak di Sunda Kelapa yang berakhir dengan tewasnya Wak Item (Syahbandar Sunda Kelapa) bersama dua puluh anggotanya serta sebagian penduduk Sunda Kelapa salah satunya disebabkan karena keterlambatan bantuan dari Portugis, Francisco de Xa yang ditugasi membangun benteng diangkat menjadi GubernurGoasebuah koloni Portugis diIndia.Keberangkatan kekerajaan Sundadipersiapkan dari Goa dengan 6 buah kapal.Galiun(kapal perang) yang dinaiki Francisco De Xa dan berisi peralatan untuk membangun benteng terpaksa ditinggalkan karena armada ini diterpa badai dan karam diTeluk Benggala,tepatnya diCeylon(Srilanka). Francisco De Xa tiba diMelakatahun 1527.
Ekspedisi ke Sunda bertolak dari Malaka. Mula-mula menuju Banten, akan tetapi karena Banten sudah dikuasai olehMaulana Hasanuddin, perjalanan dilanjutkan ke Pelabuhan Kalapa. DiMuara Cisadane, Francisco De Xa memancangkan Padrão pada tanggal 30 Juni 1527 dan memberikan nama kepada Cisadane "Rio de São Jorge" (dibaca: Rio de Saun Horhe) yang berarti sungai Santo Jorge.Kemudian galiun Francisco De Xa memisahkan diri, hanya kapalbrigantinyang dipimpin oleh Duarte Coelho yang langsung berangkat ke Pelabuhan Sunda Kelapa. Duarte Coelho terlambat mengetahui perubahan situasi, kapalnya menepi terlalu dekat ke pantai dan menjadi mangsa sergapan pasukan Fatahilah, dengan kerusakan yang berat dan korban yang banyak, kapal Portugis ini berhasil meloloskan diri ke Pasai.
Tahun 1529 Portugis menyiapkan 8 buah kapal untuk melakukan serangan balasan, akan tetapi karena peristiwa 1527 yang menimpa pasukan Duarte Coelho demikian menakutkan, maka tujuan armada lalu diubah menujuPedudi wilayahPantai Emas Portugalyang merupakan koloni Portugis diAfrikayang sekarang menjadi bagian dari negaraGhana.
Perseteruan antara kesultanan Cirebon dengan kerajaan Rajagaluh bermula dari permintaan kerajaan Rajagaluh yang mengharuskan kesultanan Cirebon mengakui kerajaan Rajagaluh sebagai pusatnya yang secara langsung menjadikan kesultanan Cirebon sebagai negara bagian dari kerajaan Rajagaluh.
Duta pertama yang tercatat dikirimkan oleh prabu Cakraningrat (raja Rajagaluh) adalahdepati(bahasa Indonesia: gubernur) Kiban atau pada masyaraakat Cirebon dikenal dengan nama Arya Kiban (depatipalimanan), rombongan pimpinandepatiKiban berulang kali berusaha memasuki wilayah kota Cirebon namun selalu ditolak dan hanya beberapa yang diizinkan untuk memasuki kota Cirebon, mereka yang memasuki kota Cirebon kemudian memeluk agama Islam.
Pada masa awal perseteruan antara kesultanan Cirebon dengan kerajaan Rajagaluh, wilayah Palimanan (sekarang terdiri dariCiwaringin,Gempol,Palimananserta sebagian dariDukupuntangyang dahulu disebut sebagai kedondong), merupakan wilayah kerajaan Rajagaluh yang wilayahnya paling dekat dengan pantai.
Duta kedua yang dikirim prabu Cakraningrat adalahdemangDipasara yang membawa pesan agar kesultanan Cirebon mengakui kerajaan Rajagaluh sebagai pusatnya,demangDipasara tidak berhasil memasuki kota Cirebon dikarenakan rombongannya bertemu dengan pangerandepatiKuningan (putraKigede Luragung yang diangkat anak olehSunan Gunung Jati)dan pasukannya yang memintanya kembali ke Rajagaluh dengan membawa pesan agar Rajagaluh tunduk kepada kesultanan Cirebon.
Pangeran Depati Kuningan kemudian memberitahu peristiwa pertemuannya denganDemangDipasara kepada Sunan Gunung Jati sekaligus memohon izin untuk menyerang kerajaan Rajagaluh, sebelum menyerang, Pangeran Depati Kuningan membuat pertahanan diPleredsekaligus mengirimkan duta yaituKi DemangSingagati dengan membawa pesan kepada prabu Cakraningrat agar prabu dan rakyatnya memeluk Islam dan menggabungkan diri dengan kesultanan Cirebon namun pesan tersebut ditolak prabu Cakraningrat.
Perang Palimanan terjadi tidak lama setelah kepulanganKi DemangSingagati yang membawa pesan penolakan dari prabu Cakraningrat. Prajurit kesultanan Cirebon pada mulanya dipimpin langsung oleh PangeranDepatiKuningan sementara kerajaan Rajagaluh berada dibawahDepatiKiban (penguasa Palimanan).
Prajurit dari kedua kerajaan kemudian mendapatkan bantuan kekuatan, prajuritDepatiKiban mendapat bantuan dari pasukan induk kerajaan Rajagaluh dibawah pimpinan Sanghyang Gempol sementara prajurit PangeranDepatiKuningan mendapat bantuan dari pasukan induk kesultanan Cirebon ditambah 700 orang pasukankesultanan Demakyang pada saat itu sedang berada di kesultanan Cirebon untuk keperluan pengawalan Sultan Demak yang pada saat itu sedang berada di Cirebon.
Pada perang Palimanan,DepatiKiban dan Sanghyang Gempol dapat dikalahkan, pasukan kesultanan Cirebon kemudian bergerak menuju ibu kota Rajagaluh dan mengepung istana kerajaan Rajagaluh.
Perang akhirnya dapat dimenangkan oleh kesultanan Cirebon dan kerajaan Rajagaluh digabungkan wilayahnya dengan kesultanan Cirebon, sementara para pemimpin kerajaan Rajagaluh dibiarkan lari.
Pada tahun 1528 Kawali (ibukota Galuh) berhasil dikuasai oleh Cirebon.Kesultanan Cirebon kemudian menugaskan Pangeran Dungkut untuk menjadi penguasa di Galuh.Pangeran Dungkut dipercaya sebagai putra dari Prabu Langlangbuana dari Kuningan.
Pada tahun 1528 mSyarief Hidayatullahmenyerahkan (mewakilkan) kekuasaan kesultanan Cirebon kepada putranya yaitu Pangeran Mohammad Arifin (Pangeran Pasarean) yang merupakandepati Cirebon(gubernur kesultanan Cirebon untuk wilayah Cirebon) sementara ia mengkhususkan diri kepada dakwahIslam.
Proses bergabungnya Talaga masuk menjadi bagian dari wilayah kesultanan Cirebon pada awalnya dikarenakan ada kesalahpahaman antara pasukan Cirebon yang sedang mengarak pangeran-pangeran Cirebon denganDemangdari kerajaan Talaga.
Pada awalnya pasukankesultanan Demakdan kesultanan Cirebon sedang mengarak para pangeran Cirebon yaitu pangeran Bratakelana dan pangeran Jayakelana yang dikawal dari depan (oleh pasukan dari Jawa (pasukankesultanan Demakdan juga dari belakang oleh pasukan Cirebon danSunan Jati, secara tidak sengaja arak-arakan telah memasuki wilayah kerajaan Talaga dan membuat kehebohan di Talaga, masyarakat kemudian melaporkan ke Istana Kerajaan,Pucuk Umum(bahasa Indonesia: penguasa) Talaga memerintah Demang kerajaan memimpin sejumlah prajurit kerajaan untuk menyelidiki hal tersebut.
Pasukan dari kerajaan Talaga dipimpin oleh Demang kerajaan lantas menemui iring-iringan tersebut menanyakan kepada arak-arakan prajurit paling depan tentang asal usul dan keperluan mereka masuk ke wilayah Talaga, dikarenakan para prajurit Talaga bertanya dengan menggunakanbahasa Sundamaka para prajurit yang mengawal di depan yang kebetulansuku Jawadarikerajaan Demaktidak memahami arti pertanyaannya dan hanya diam saja. Sikap diam yang ditunjukkan para barisan prajuritsuku Jawatersebut dianggap sebagai penghinaan kepada rombongan pasukan kerajaan Talaga, Demang kerajaan Talaga marah dan mengamuk namun dapat segera diatasi oleh barisan prajurit di depan (barisan prajuritkesultanan Demak) tersebut, Demang kerajaan Talaga lantas melaporkan masalah kepada Pangeran Aria Salingsingan (Putra Mahkota Talaga), ketika Pangeran Aria datang ke iring-iringan tersebut untuk membalas perlakuan mereka kepada rombongan prajurit kerajaan Talaga dan Demang kerajaan, terjadi keributan kembali (tanpa Pangeran Aria sempat mencari tahu apa maksud kedatangan para rombongan prajurit tersebut) beberapa prajurit barisan depan tadi kemudian ada yang meninggal, dikatakan setelah melihat sosokSunan Gunung Jatiyang maju kedepan untuk melihat ada keributan apa sehingga iring-iringan tertahan, Pangeran Aria Salingsingan kemudian menghentikan serangannya kepada para prajurit, diyakini kemudianSunan Gunung Jatimenjelaskan tujuan iring-iringan prajurit tersebut yang tidak sengaja memasuki wilayah Talaga, dikarenakan telah membunuh beberapa prajurit barisan depan (prajurit kesultanan Demak) maka Pangeran Aria Salingsingan meminta maaf. Sunan Gunung Jati kemudian memintanya agar masuk Islam dengan membaca dua kalimat syahadat dan Pangeran Aria Salingsingan dengan sukarela mengikutinya (masuk Islam).
Rombongan iring-iringan para pangeran Cirebon kemudian menuju ke kraton Talaga untuk menemuipucuk umum(penguasa) Talaga (kabar bahwa Pangeran Aria Salingsingan masuk Islam dan menghentikan serangan kemudian sampai ke keraton Talaga) namun ketika mereka sampai raja sudah tidak ada di keraton, begitu pula dengan saudari Pangeran Arya Salingsingan yang bernama Ratu Mas Tanduran Gagang yang juga keluar Istana dan dikabarkan pergi bertapa,dikarenakan tidak adanya raja pada saat itu maka Pangeran Aria Salingsingan menjadi penguasa Talaga dan kemudian menggabungkan wilayahnya dengan kesultanan Cirebon pada tahun 1529 dan masyakarat Talaga mulai mengenal ajaran Islam.
Latar belakang bergabungnyakerajaan Sumedang Larangmenjadi bagian dari kesultanan Cirebon adalah dengan pendekatan dakwah Islam, pada awal 1500an Maulana Muhammad (putra dari Maulana Abdurahman (PangeranPanjunan) keturunan dari Syekh Datuk Kahfi (Syekh Nur Jati) melakukan dakwah Islam di wilayah kerajaan Sumedang Larang disekitar wilayah Sindang Kasih (sebelah timur Cilutung / sungai Lutung), di wilayah Sindang Kasih Maulana Muhammad menikah dengan Nyai Armillah(diyakini sebagai kerabat pembesar Sindang Kasih) dan memiliki putra yang diberi nama Soleh (masyarakat lebih mengenalnya dengan nama pangeran Santri karena dia berasal dari pesantren).
Pangeran Soleh ini kemudian menikah dengan Ratu Setyasih (putri Raja Tirtakusuma (Patuakan))yang sedang memerintah di kerajaan Sumedang Larang. Pada 21 Okober 1530 (13 bagian gelap bulan Asuji tahun 1452 Saka) Pangeran Soleh diserahi kekuasaan atas kerajaan Sumedang Larang dari istrinya dan kemudian dia dinobatkan menjadi penguasa Sumedang Larang dengan gelarKusumahdinata.Tiga bulan setelahnya (12 bagian terang bulan Margasira tahun 1452 Saka) diadakan syukuran di kesultanan Cirebon tepatnya diDalem Agung Pakungwatiatas diangkatnya Pangeran Soleh sebagai penguasakerajaan Sumedang Larangjuga keberhasilan Cirebon menguasai wilayahkerajaan Pajajaransebelah timur (Galuh).
Pasca pertempuran diKalapa(kini:Jakarta) pada tahun 1527 M, para prajurit dari kesultanan Cirebon dankerajaan Pajajaranmasih terlibat pertempuran di pedalaman hingga beberapa tahun, akhirnya ditandatanganilah perjanjian perdamaian di antara keduanya pada tanggal 14 paro terang bulan Asada tahun 1453 sakaatau bertepatan pada 12 Juni 1531 M.Pada masa itu yang menjadi raja di kerajaan Pajajaran adalah Prabu Surawisesa (saudara Pangeran Walangsungsang penguasa pertama kesultanan Cirebon) sementara kesultanan Cirebon dipimpin olehSyarief Hidayatullahyang diwalikan urusan pemerintahannya kepada anaknya yaitu Pangeran Mohammad Arifin (Pangeran Pasarean).
Isi surat perjanjian damai tersebut di antaranya adalah,
Pada tahun 1543,Sultan TrengganamengundangSunan Kalijagauntuk datang kekerajaan Demakguna menjadi penasihatSultan Trenggana
Pada tahun 1546 Msultan Trengganatidak sengaja terbunuh dalam usaha penyerangan kePanarukan, pada saat ituPanarukansudah dikepung selama tiga bulan oleh gabungan prajuritkesultanan Demakdan kesultanan Cirebon, kesultanan Cirebon mengirimkan sekitar 7.000 prajuritnya yang didatangkan dari wilayahBantendanJayakartasertaCirebon, di antara prajurit yang dikirim dari kesultanan Cirebon ada Fernão Medes Pinto (dibaca: Fernaun Mendes Pinto, penjelajah Portugis yang mencatat ekspedisi penyerangan kePanarukandalam catatannyaPeregrinação(dibaca: Peregrinasaun (perjalanan)) bersama empat puluh orang temannya yang ikut serta. Fernão Mendes Pinto sebelumnya tiba diBantenpada tanggal 1 Oktober 1545 untuk membeli lada dalam pelayarannya dariGoamenujuTiongkok, ia terpaksa menunggu berbulan-bulan karena pada saat itu persediaan lada di pelabuhanBantenbelum mencukupi.Usai pengepungan selama tiga bulanSultan Trengganakemudian mengadakan sebuah rapat bersama para adipati untuk merencanakan penyerangan lanjutan kePanarukan, pada saat itu putra adipati Surabayayang berumur sepuluh tahun menjadi pelayannya membawakan tempat sirih, karena tertarik dengan jalannya rapat tersebut putra adipati Surabaya tidak mendengarkan perintahsultan Trengganasehingga sultan memarahinya dan memukulnya, putra adipati Surabaya itu merasa sangat tersinggung dan tiba-tiba menusukkan pisau kecil yang terselip di ikat pinggangnya ke arah jantung Sultan. Sultan pun tewas seketika dan dibawa pulang keDemakdariPanarukan.
Selanjutnya terjadi huru-hara perebutan kekuasaan dikesultanan Demak, masa itu Pangeran Mohammad Arifin (Pangeran Pasarean) yang menjabat sebagaiDepati Cirebon(gubernur kesultanan Cirebon untuk wilayah Cirebon) sekaligus putra mahkota kesultanan Cirebon yang sedang berada di Demak mewakili sultan Cirebon (oleh Fernão Mendes Pinto disebut sebagaiQuiay Ansedaa Pate de Cherbom(Kyai Sang Depati Cirebon)) meninggal dalam peristiwa tersebut.Istrinya Ratu Nyawa yang turut mendampinginya berhasil selamat. Satu tahun setelah peristiwa huru-hara diDemakyang menyebabkan meninggalnyaDepati CirebonPangeran Muhammad Arifin, Ratu Wanawati (puteri Fadillah Khan dengan Ratu Ayu (janda Yunus Abdul Kadir al-Idrus), istri Pangeran Sawarga melahirkan Pangeran Mas Zainul Arifinpada tahun 1547 M.Pada peristiwa huru-hara dikesultanan Demakjuga terbunuh Pangeran Hadiri(suami dari Ratu Kalinyamat (Ratna Kencana), putri pertama Sultan Trenggana sekaligus Adipati Jepara.
Kesultanan Cirebon menggelar musyawarah dalam menyikapi peristiwa meninggalnya Pangeran Mohammad Arifin diDemak,Syarief Hidayatullahselaku penguasa kesultanan Cirebon pada saat itu tengah menetap diBanten,hasil dari musyawarah tersebut pada tahun 1552 m menyatakan bahwa putra pertamaSyarief Hidayatullahyaitu Pangeran Maulana Hasanuddin yang menjabat sebagaidepati Banten(gubernur kesultanan Cirebon untuk wilayahBanten) dinaikkan statusnya daridepati(gubernur) menjadisultanatas wilayahBantenyang kemudian mengembangkankesultanan Bantensementara untuk mengisi kekosongan posisi sebagaiwakil sultan Cirebonyang mengurusi kesultanan Cirebon saat Syarief Hidayatullah tidak berada di tempat diputuskan untuk diisi oleh Fadillah Khan (Fatahilah).
Pada tahun 1552, setelah Maulana Hasanuddin resmi menjadi penguasakesultanan Banten,Syarief Hidayatullahkembali keCirebon
Pasca perjanjian damai Cirebon dengankerajaan Pajajaranpada tahun 1530 dan setelahkesultanan Bantenberdiri pada tahun 1552, maka wilayah antara sungai Angke dan sungai Cipunegara dibagi dua. MenurutCarita Sajarah Banten,Sunan Gunung Jatipada abad ke 15membagi wilayah antara sungai Angke dan sungai Cipunegara menjadi dua bagian dengan sungai Citarum sebagai pembatasnya, sebelah timur sungai Citarum hingga sungai Cipunegara masuk wilayah Kesultanan Cirebon yang sekarang menjadi Kabupaten Karawang,Kabupaten PurwakartadanKabupaten Subangdan sebelah barat sungai Citarum hingga sungai Angke menjadi wilayah bawahanKesultanan Bantendengan namaJayakarta.
Pada tahun 1568,Maulana Hasanuddin sebagai penguasa Banten yang juga membawahi wilayah Jayakarta mengangkat menantunya yaitu Kawis Adimarta (Tubagus Angke) suami dari Ratu Ayu Fatimah (anak ke enam dari Maulana Hasanuddin)sebagai penguasa Jayakarta, sebelumnya, sejak peristiwa penaklukanKelapapada tahun 1527 hingga diangkatnya Kawis Adimarta pada tahun 1568, wilayah ini berada dibawah kekuasaan Fadillah Khan
Pada tahun 1568 MSyarief Hidayatullahmeninggal dunia maka kekosongan pemegang kekuasaan itu kemudian diisi dengan mengukuhkan pejabat keraton yang selama Syarief Hidayatullah melaksanakan tugas dakwah dijadikan wakilnya sebagai pengurus kesultanan Cirebon, Fadillah Khan (Fatahillah) kemudian naik takhta (sebagaiwali kesultanan)dan memerintah Cirebon secara resmi sejak tahun 1568. Fadillah Khan (Fatahillah) mengurusi kesultanan Cirebon hanya berlangsung dua tahun karena ia meninggal dunia pada tahun 1570, dua tahun setelah Sunan Gunung Jati wafat dan dimakamkan berdampingan dengan makam Sunan Gunung Jati di Gedung Jinem Astana Gunung Sembung.
Sepeninggal Fadillah Khan (Fatahillah), oleh karena tidak ada calon lain yang layak menjadi raja, takhta kerajaan jatuh kepada cicitSyarief Hidayatullahyaitu Pangeran Mas Zainul Arifin atau dikenal juga dengan namaPanembahan Ratu I, putra dari Pangeran Sawargaatau cicit Sunan Gunung Jati yang sudah berusia 21 tahun. Pangeran Mas kemudian bergelar Panembahan Ratu I dan memerintah Cirebon selama kurang lebih 81 tahun.
Pada masa pemerintahan Pangeran Mas Zainul Arifin atauPanembahan Ratu Iini dikatakan bahwa keraton Mataram (pada masa ini Mataram menjadi bawahan kerajaan Pajang) mulai dibangun di sekitar kali Opak dan kali Progo pada tahun 1578 oleh Ki Ageng Pamanahan, tetapi beberapa tahun kemudian dia wafat, tepatnya pada tahun 1584 sehingga kepemimpinan di keratonnya dilanjutkan oleh putranya yang bernamaDanang Sutawijaya, beberapa tahun setelah meninggalnya Ki Ageng Pamanahan, Sultan Hadiwijaya dari kerajaanPajang(sekarang wilayahnya diperkirakan meliputi wilayah kekuasaanKasunanan SurakartadanMangkunegara) pun meninggal, tepatnya pada tahun 1587, pada saat meninggalnya SultanPajang, Danang Sutawijaya yang selama ini tidak suka menghadap Sultan Pajang akhirnya datang juga untuk menghadiri upacara pemakaman Sultan.Pada masa pemerintahannya, Danang Sutawijaya melakukan perluasan wilayahnya;
Pada masa pemerintahan Pangeran Mas Zainul Arifin, kesultanan Cirebon berhasil mempertahankan hubungan baik antarakesultanan Bantendengankesultanan Mataram, hal itu disebabkan adanya hubungan keluarga antarakesultanan Bantendengan kesultanan Cirebon yang masih sama-sama keturunansunan Gunung Jatisementara dengan kesultanan Mataram hubungan persahabatan yang erat telah dijalin antara Pangeran Mas Zainul Arifin denganDanang Sutawijayapenguasa Mataram pertama.
Pada masa perluasan dan penaklukan wilayah yang dilakukan kerajaanMataramolehDanang Sutawijaya, Mataram juga menjalin kedekatan dengan kesultanan Cirebon, tetapi hubungan yang dimaksud bukan dihasilkan dari sebuah penaklukan melainkan dari persahabatan.Benteng Kuta Raja Cirebon yang dalam Naskah Kacirebonan disebut sebagai Benteng Seroja diyakini pembangunannya mendapatkan bantuan dariDanang SutawijayaRajaMataram.
Benteng Kuta Raja Cirebon diperkirakan telah dibangun sebelum tahun 1596, dikarenakan benteng tersebut diceritakan pada pelayaran pertama bangsa Belanda pada tahun 1596dan tiga tahun setelah ditandatanganinya perjanjian persahabatan yang sebenarnya adalah perjanjian monopoli dagang Belanda terhadap Cirebon pada tahun 1681 benteng tersebut masih dapat dikenali.
Sultan Agung Hanyaraka Kusumadari Mataram sangat menghormati Pangeran Mas sebagai gurunya (Sultan Agung Hanyaraka Kusumadikatakan sebagai salah satu murid kesayangan Pangeran Mas), hal tersebut tidak lain adalah pesan dariDanang SutawijayaSultan Mataram pertama yang berpesan kepada keturunannya agar selalu menjaga hubungan baik denganCirebon.
Pada tahun 1614 ketikaGubernur Jendral Pieter Bothberkuasa di Hindia Belanda, Belanda mengirimkan utusan ke Mataram, rombongan dipimpin oleh Jan Piterszoon Coen (yang kelak menjadi Gubernur Jendral Hindia Belanda pada tahun 1619). Mataram pada masa itu diperintah oleh Sultan Agung (1613-1645), kepada utusan Belanda ini Sultan Agung menyampaikan klaim sepihak bahwa seluruh wilayah pulau Jawa bagian barat adalah wilayah Mataram kecuali wilayahkesultanan Bantendan kesultanan Cirebon.
Rijckloff Volckertsz van GoensGubernur Jendral Hindia Belanda periode 1678 - 1681 menyatakan bahwa utusanVereenigde Oostindische Compagnie(VOC) telah lima kali ditugaskan ke Mataram pada periode sekitar tahun 1648 - 1654. Sejak zamanDanang Sutawijaya(teman Pangeran Mas Zainul Arifin), sudah dipelihara hubungan yang erat dalam suasana perdamaian (groote correspon-dentie on foede vreede), sebelumDanang Sutawijayawafat ia telah berpesan pula kepada putranya agar tetap memelihara hubungan baik denganCirebon,Rijckloff Volckertsz van Goensberpendapat bahwa hal tersebut dimungkinkan karenaCirebondianggap suci” (guansuis, omdat den Cheribonder voor hem’t geloof hadde aengenoomen ende een heilige man was).
Perdagangan di Cirebon yang semakin ramai membuat Sultan Zainul Airifin memutuskan untuk membuat uangKepeng(uang logam pecahan lebih kecil) yang terbuat dari besi, tembaga dan perunggu.
Konflik antara kesultanan Cirebon dengankerajaan Sumedang Larangterjadi dikarenakan adanya peristiwa Harisbaya pada tahun 1585(namun sejarahwan Uka Candrasasmita memperkirakan bahwa peristiwa Harisbaya terjadi pada 1588). Pada masa ituPrabu Geusan Ulundari kerajaan Sumedang Larang diyakini melarikan Harisbaya, istri Sultan Cirebon Zainul Arifin ke Sumedang, menurutBabad Sumedang,Suriadiwangsaadalah anak Harisbaya dari pernikahannya dengan Sultan Cirebon Zainul Arifin,kelak Suriadiwangsa menjadi penguasa Sumedang yang bersekutu dengan Mataram dalam penyerangan keBatavia.
Pada tanggal 7 - 12 Mei 1632 kapal-kapal Melayu datang dari Cirebon ke Batavia membawa gula, minyak dan keperluan lainnya.
Pada tanggal 8 Oktober 1632, telah datang di Batavia 20 kapaljungdari Cirebon yang dikomandoi oleh Simkeij dengan membawa minyak kelapa, gula hitam, beras dan buncis putih.
Pada tanggal 28 Maret 1633 telah datang 2 perahu dari Cirebon di wilayah Tiku (Sumatera barat) yang akan membawa sekitar 1.000 hingga 5.000 pikul lada.
Pada tanggal 16 April  1633, dua buah kapaljungmilik Sultan Zainul Arifin yang berlayar dari kerajaan Selebar (Bengkulu) rusak karena menabrak karang.
Pada tanggal 19 Desember 1633, kapal-kapal dari Cirebon berlayar menuju Batavia dengan membawa gula, asam dan beras.
Pada tanggal 9 Oktober 1634, ada kapal dari Cirebon berlayar menuju Batavia membawa gula dan beras.
Pada tanggal 26 Oktober 1634, ada kapal-kapal dari Cirebon berlayar menuju Batavia membawa gula dan beras serta daging kijang, mangga, pisang serta barang-barang lainnya.
Pada tanggal 30 Oktober 1634, ada kapal-kapal dari Cirebon berlayar menuju Batavia membawa daging kijang, mangga, pisang serta barang-barang lainnya
Pada tahun 1567 kaisar Cina menghapus larangan perdagangan Cina ke wilayah selatan termasuk asia tenggara, akibatnya terjadi arus masuk secara besar-besaran mata uang tembaga Cina. Pada tahun 1596, kelompok Belanda yang pertama datang ke Jawa menyatakan bahwa mata uang ini banyak sekali beredar di wilayah kepulauan-kepulauan sekitar Jawa. Arus keluar mata uang tembaga Cina yang sedemikian besar membuat khawatir para pejabat Cina, hal tersebut dikarenakan kegiatan perdagangan dengan membawa mata uang tembaga tersebut akan semakin menguras sumber bahan baku pembuatnya yakni tembaga yang semakin langka.
Pada tahun 1590 di Guangdong dan Fujian akhirnya dibuat mata uang baru (PicisCina) yang terbuat dari campurang timah yang murah untuk diedarkan khususnya di kepulauan asia tenggara. Mata uang baru yang terbuat dari timah murah ini membuat khawatir kalangan eropa dikarenakan mata uang tersebut akan rusak sendiri dalam waktu tiga hingga empat tahun.
Pada tahun 1596,Picisyang bermutu rendah akibat logam dasarnya yang buruk ini beredar hingga ke pedalaman pulau Jawa, pedagang Cina membawanya untuk membeli lada di pedalaman Banten dengan nilaiPicisyang dihargai seperempat dari uang biasanya (uang Tembaga) yang beredar di pasar Banten.
Pada periode antara tahun 1613 hingga 1618 pernah terjadi kelangkaanPicisdi wiayah Banten yang membuat nilaiPicismeningkat terhadap perak, akhirnya masuklah perak secara besar-besaran sebagai akat tukar termasuk dalam pembayaran pembelian lada.
Mata uangPicisCina tersebut memiliki beberapa kekurangan, selain dari bahannya yang mudah rusak karena terbuat dari bahan yang buruk, hal lainnya adalahPicisCina mudah ditiru, namun kekurangan pasokan timah adalah hambatan untuk membuatPicisCina secara lokal (dalam artian dibuat sendiri tidak mengimpornya dari Guangdong atau Fujian) sampai orang Inggris dan Belanda menemukan pasokan timah tersebut. Orang Inggris di Banten memesan timah dari 20 ton pada tahun 1608 hingga menjadi 50 - 60 ton pada tahun 1615 dan kemudian meningkat sampai kira-kira 150 ton pada tahun 1636. Orang Inggris menggunakan sebagian dari pesanan timah mereka untuk membuat peluru.Timah yang dicetak menjadi mata uang kemudian dikirim untuk memasok wilayah Banjarmasin, Palembang dan juga Banten. Belanda lebih berhati-hati dalam menjual timah-timah mereka, dikarenakan takut timah-timah tersebut dijadikan pasokan keperluan militer oleh musuhnya.
Pada tahun 1633, Belanda mulai mengetahui bahwa timah dapat diperoleh dari orang-orang Cina yang ada di Batavia, dari situ Belanda mengetahui bahwa sudah ada industri pembuatanPicisCina di pulau Jawa, khususnya di Banten, Cirebon dan Jepara.Belanda berusaha mengambil keuntungan dari industri pembuatanPicisCina tersebut dengan memonopoli dan memberikan timah kepada para orang Cina terkemuka yang berada di wilayah kekuasaan Belanda di nusantara.
Kereta Singa Barong dibuat atas perintah Pangeran Mas Zainul Arifin pada tahun 1649 M berdasarkanCandrasangkalayang berbunyiiku pandita buta rupananeyang berarti 1751 atau 1571 saka jawa (tahun Jawa),menurut H.B Vos, kereta Singa Barong bukanlah kereta yang didesain untuk ditarik dengan kuda akan tetapi ia didesain untuk ditarik dengan sapi.
Kereta Singa Barong didesain oleh Pangeran Angkawijaya (Pangeran Losari) yang teknis pengerjaannya dipimpin oleh Dalem Gebang Sepuh dan pemahatnya ialahKiNataguna daridesa Kaliwulu.
Perang Pacirebonanatau yang oleh masyarakat Cirebon dikenal dengan namaperang Pagarageadalah sebuah peristiwa pengiriman pasukan kesultanan Cirebon ke wilayahkesultanan Banten.
Pada tahun 1588 ketikakesultanan Matarammuncul setelah meninggalnya Sultan Hadiwijaya darikerajaan Pajang, Danang Sutawijaya kemudian mengadakan ekspansi wilayah dan diplomasi guna mendapatkan pengakuan atas eksistensinya, wilayah-wilayah di sebelah timur Mataram satu demi satu jatuh dan mengakui eksistensinya sementara kesultanan Cirebon pada masa itu diperintah oleh Sultan Mas Zainul Arifin yang merupakan sahabat dari Danang Sutawijaya telah mengakui Mataram yang sebelumnya adalah sebuahKadipatendarikerajaan Pajangkini menjadi kesultanan yang mandiri, namun demikian,kesultanan Bantenpada masa itu belum mengakui eksistensikesultanan Mataram, Sultan Maulana Muhammad, sultan Banten yang bertakhta saat itu baru berumur sekitar 12 tahun (ia naik takhta pada 1585pada usia 9 tahun).
Kesultanan Bantenpada masa awal pemerintahan Sultan Maulana Muhammad disibukkan dengan klaim takhta oleh Arya Jepara (saudara Maulana Yusuf, ayah dari Sultan Maulana Muhammad yang dibesarkan oleh Ratu Kalinyamat (putri Sultan Trenggana dari Demak sekaligus istri dari pangeran Hadiri seorang Adipati Jepara)). Pangeran Arya Jepara mengajukan usul kepadakesultanan Bantenagar dirinya dijadikan penguasakesultanan Bantensampai pangeran Maulana Muhammad cukup umur untuk memegang pemerintahan, tetapi usul tersebut ditolak oleh para pejabatkesultanan Bantenyang menganggap bahwa pangeran Arya Jepara adalah orang luar Banten, para pejabat dengan dukunganQadikesultanan Bantenpada masa itu mengangkat Maulana Muhammad sebagai Sultan Banten, sementara menunggu usia Sultan Banten cukup untuk memegang pemerintahan, makaQadidibantu dengan empat pejabat lainnya menjadi wakil Sultan Banten dalam memerintahkesultanan Banten,mereka adalahPatih(bahasa Indonesia: Perdana Menteri) Jayanegara,Senapati(bahasa Indonesia: Panglima) Pontang,KiWaduaji danKiWijamanggala.
PenolakanQadidan para pejabatkesultanan Bantenmembuat Pangeran Arya Jepara memutuskan untuk menyerangkesultanan Banten. Pangeran Arya Jepara bersama para pasukan danDemang Laksamana(bahasa Indonesia: Laksamana) Jepara pergi menujukesultanan Bantenmelalui jalur laut, dalam peperangan tersebutDemang LaksamanaJepara tewas dan membuat Pangeran Arya Jepara memutuskan untuk kembali ke Jepara.
Pada masa ketika Danang Sutawijaya melakukan penaklukan wilayah timur pulau Jawa untuk memperkuat eksistensinya dan membantu Sultan Mas Zainul Arifin membangun benteng Kuta Raja di Cirebon, Husein Djajadiningrat dalam penelitiannya berkaitan denganBantenmenemukan bahwa pada tahun yang sama yakni 1596, Mataram pernah mengirimkan 15.000 pasukannya untuk menyerangkesultanan Bantendari laut namun gagal.Sultan Maulana Muhammad pada masa itu disibukkan dengan kegiatan dakwah Islam dan baru pada tahun 1596 (tahun yang sama dengan penyeranganMataramkekesultanan Banten) atas masukan dari Pangeran Mas (putra Arya Penggiri, cucu Sunan Prawoto darikesultanan Demak) yang berambisi menjadi penguasaPalembangmaka Sultan Maulana Muhammad memutuskan untuk melakukan penyerangan ke wilayah Palembang, dalam penyerangan tersebut Sultan Maulana Muhammad yang baru berusia 19 tahun wafat dan meninggalkan putra mahkotakesultanan Bantenyang baru berusia 5 bulanyang kemudian dikenal dengan nama Abdul Mufakhir Mahmud Abdul Kadir.
Sepeninggal Sultan Maulana Muhammad, putra mahkota yang masih bayi tersebut lantas dinobatkan menjadi Sultan Banten dan perwalian segera dibentuk, untuk masalah pemerintahanPatihJayanegara ditunjuk menjadi walinya.PatihJayanegara dikenal sebagai pejabatkesultanan Bantenyang handal dan sangat setia sehingga dalam dua kali masa jabatannya sebagai walikesultanan Banten, kesultanan berada dalam kondisi yang tenteram.
Pada tanggal 28 November 1598, dua tahun setelah meninggalnya Sultan Maulana Muhammad, datanglah rombongan pedagang Belanda yang dipimpin olehJacob Corneliszoon van Neckditemani olehlaksamana madyaWybrand van Warwijckdan seorang penjelajah kutub yang ternama pada masa itu sekaligus seorang laksamana yaituJacob van Heemskerck, van Heemskerck pernah berlayar ke kutub mengikuti rencana yang disusun pemerintah Belanda karena ketika terjadiPerang Delapan Puluh Tahunantara Belanda dengan Spanyol. Belanda yang selama ini mengambil rempah dariLisbon(Portugal) dan menjualnya kembali ke Jerman dan sekitarnya mengalami kesulitan saat Spanyol menguasai Portugal dan melarang kapal-kapal dagang Belanda berlabuh di wilayah yang dikuasainya, akibatnya pemerintah Belanda berusaha mencari jalan untuk berhubungan langsung dengan pedagang rempah di Asia, tetapi usaha itu kurang membuahkan hasil karena kapal dagang mereka selalu menjadi incaran Spanyol dan Portugal (Portugal juga menyisir kapal-kapal Belanda karena statusnya pada masa itu berada di bawah Kerajaan Spanyol) juga orang-orang Inggris, ketikaItinerariosebuah buku yang berisi informasi tentang Asia dan Hindia karyaHuygen van Linschotenterbit pada tahun 1593, Belanda berusaha mencari jalan alternatif ke Asia guna menghindari patroli kerajaan Spanyol, munculah ide untuk melewati kutub utara dengan kapal yang didesain khusus oleh pemerintah Belanda, tiga kali usaha dilakukan untuk melewati kutub utara, tiga kali pula usaha tersebut gagal, Jacob van Heemskerck yang ikut dalam misi melintasi kutub utara menemukan kapalnya terjepit es dan separuh anak buahnya meninggal karena kedinginan, dia dan yang lainnya kemudian kembali ke Belanda untuk melaporkan kegagalan tersebut. Dari laporan Jacob van Heemskerck, Belanda kemudian menyiapkan misi menuju Asia melewatiTanjung Harapan,Afrika Selatan, misi itu dipimpin olehCornelis de Houtman, tetapi Jacob van Heemskerk tidak ikut dalam misi ini, baru ketika Jacob van Neck akan menjalankan misi ke Asia mencari rempah-rempah ia ikut serta ke dalamnya, mereka kemudian berlayar dengan mengikuti arahan dari seorangastronomdan kartografer (pembuat peta) kelahiranFlandria(sekarang bagian dariBelgia) yang bernamaPetrus Plancius.Jacob van Necksebenarnya bukanlah orang yang ahli di bidang navigasi pelayaran, latar belakang keahliannya adalah bidang perdagangan, oleh karenanya dia memutuskan untuk mengambil kelas di bidang navigasi guna mendalaminya.Kedatangan para pedagang Belanda kali ini disambut baik olehkesultanan Banten, tidak seperti pendahulunya yakni Cornelis de Houtman yang tercatat sempat berbuat tidak baik di Banten dengan menggerebek kapal-kapal pembawa rempah dari Sumatra dan Kalimantan yang datang ke Banten,walaupun sebenarnya sikap Cornelis de Houtman dilatarbelakangi kejadian buruk yang menimpanya ketika dia mencapai Banten pada tahun 1596, ketika dia berusaha membeli rempah, pihak Portugis membujuk orang Banten agar memberikan harga yang sangat tinggi hingga tidak masuk diakal kepada rombongan Cornelis de Houtman bahkan rombongan inipun tidak diberi akses untuk memenuhi kebutuhan air bersih, akhirnya rombongan Cornelis de Houtman pergi ke Sumatra untuk mendapatkan logistik dan lebih banyak rempah namun ia dan rombongannya ditangkap dan kemudian dibebaskan setelah tebusan dibayar,kejadian itu membuat Cornelis de Houtman kesal hingga melakukan penggerebekan kepada kapal-kapal pembawa rempah yang menuju Banten.
Pembawaan Jacob Corneliszoon van Neck dan rekan-rekannya dikatakan berbeda oleh masyarakat Banten, sikapnya yang mudah membawa diri membuatnya diizinkan untuk bertemu dengan Sultan Abdul Mufakhir yang ketika itu masih berumur sekitar 2 tahun, Jacob Corneliszoon van Neck kemudian memberi sebuah piala berkaki emas sebagai hadiah untuk Sultan dan tanda persahabatan.
Pada tahun 1602,PatihJayanegara meninggal dunia, posisi ini kemudian digantikan oleh adiknya, tetapi dia dipecat pada 17 November 1602 dengan alasan berkelakuan tidak baik, ibunda sultan yaitu Nyi Gede Wanogiri kemudian menikah dengan seorang bangsawan keraton yang bernama Pangeran Camara, dia mendesak agar suami barunya itu diperkenankan menjadi wali bagi Sultan Abdul Mufakhir,setelah suami barunya ini menjadi wali Sultan, dia membuat berbagai perjanjian dagang dengan para pedagang asing, wali Sultan yang baru ini juga dituduh menerima suap sehingga perjanjian dagang yang dibuatnya cenderung menguntungkan beberapa pihak saja ketimbang kesultanan pada umumnya, banyak rakyat Banten dan para pejabat tidak puas dengan keadaan ini ditambah banyak keributan di wilayahkesultanan Bantenyang diprakarsai oleh para pedagang asing yang berpihak pada para pedagang Belanda atau Portugis.
KeberadaanPatihsudah tidak dihiraukan oleh pejabat wilayahkesultanan Bantensehingga dikatakan bahwa kekuasaanPatihyang sekaligus adalah suami dari Nyi Gede Wanogiri hanya terbatas pada keraton dan wilayah sekitarnya saja. Pada tahun 1604 terdapat insiden ditahannya sebuahkapal JungdariJohoroleh Pangeran Mandalika (anak dari Pangeran Maulana Yusuf), seruanPatihuntuk melepaskanJungtersebut tidak dihiraukan, bahkan Pangeran Mandalika bersekutu dengan para pangeran lain dan orang-orang yang menentang kekuasaanPatih, mereka kemudian membuat benteng pertahanan di luar kota, masalah ini kemudian dapat diselesaikan dengan penyerangan ke benteng pertahanan Pangeran Mandalika oleh Pangeran Jayakarta yang dibantu oleh Inggris pada tahun 1605, ketika Pangeran Jayakarta datang ke Banten bersama pasukannya untuk menghadiri acarakhitananSultan Abdul Mufakir Abdul Kadir pada saat ituPatihmeminta bantuannya, akhirnya perjanjian damai dilakukan antara kesultanan Banten dengan kubu Pangeran Mandalika, dikatakan bahwa mereka diharuskan meninggalkan wilayah kesultanan Banten selambatnya 6 hari dan hanya boleh diikuti oleh 30 orang anggota keluarga.
Setelah peristiwa Pangeran Mandalika, pada tahun 1608 terjadi lagi peristiwa yang dikenal dengan namaPailir(bahasa Indonesia: bertempat di hilir), peristiwa peperangan antara para pangeran dari keraton di bawah perintah Pangeran Ranamanggala dengan kubu Pangeran Kulon dan paraponggawa (pejabat), sebenarnya peristiwaPailirdisebabkan oleh peristiwa yang terjadi setelahPangeran Ranamanggaladan rekan-rekannya bersekutu untuk membunuhPatihyang juga merupakan suami dari Nyi Gede Wanogiri. Keadaankesultanan Bantensetelah peristiwa Pangeran Mandalika tidak bisa dikatakan membaik, di daerah, para penguasa sibuk mempersenjatai diri untuk memperkuat kedudukannya masing-masing, tidak jarang untuk memenuhi hal tersebut mereka lakukan dengan jalan merampok kapal-kapal dagang sehingga membuat pedagang beranggapan bahwakesultanan Bantentidak aman untuk berdagang, hal ini kemudian yang menyebabkan kondisi perdagangan dikesultanan Bantenterhenti sebagaimana pernyataan pedagang Belanda Jacques l'Hermitre yang menyatakan bahwa perdagangan di kota Banten terhenti pada bulan Juli 1608.Kacaunya kondisikesultanan Bantenkemudian oleh Pangeran Ranamanggala, Pangeran Mandura, Pangeran Kulon, Pangeran Singaraja, Tubagus Kulon, Depati Yudanegara dan lainnya yang mengadakan pertemuan guna membahas kondisi Banten disimpulkan bahwa semuanya terjadi akibat kesalahanPatihdari mulai membuat kebijakan yang tidak memihak kesultanan Banten hingga lainnya di mana figurnya tidak dapat dijadikan panutan. Pada pertemuan tersebut kemudian disepakati untuk membunuhPatihsebagai penyebab masalah yang terjadi. Upaya untuk membunuhPatihdiserahkan kepadaDepatiYudanegara dengan jaminan keselamatan dari Pangeran Ranamanggala, Pangeran Mandura dan juga Qadikesultanan Banten.
Pada tanggal 23 Oktober 1608,DepatiYudanegara membakar bagian dalam keraton sehinggaPatihkeluar tanpa membawa Sultan Abdul Mufakir, dikatakan bahwa, walaupunPatihyang sekaligus suami Nyi Gede Wanogiri ini adalah orang yang membuat kebijakan kurang berpihak kepada kesultanan Banten dan tidak mampu menjadi figur yang baik namun ia sebagai ayah sambung dari Sultan Abdul Mufakir menjalankan tugasnya dengan sangat baik, ia mendidik Sultan Abdul Mufakir dengan penuh tanggung jawab, mendampingi Sultan dalam setiap pertemuan dengan para pejabat dan lain sebagainya sehingga Sultan Abdul Mufakir yang masih remaja pada masa itu sangat dekat dan menyukainya. SetelahPatihdan juru tulisnya keluar dari keraton,DepatiYudanegara kemudian membunuhya.
Kebakaran yang terjadi di keraton dan ditujukan untuk membunuh Pangeran Camara (Patih) sebenarnya sudah terjadi beberapa kali setelah peristiwa Pangeran Mandalika, peristiwa pembakaran yang pertama terjadi pada tanggal 4 Desember 1605 yang dapat diatasi, kemudian peristiwa kebakaran selanjutnya terjadi pada tanggal 16 Juli 1607 di mana kebakaran berhasil menghanguskan kediamanPatihnamun pada peristiwa iniPatihberhasil selamat.
Pasca terbunuhnya Pangeran CamaraPatihkesultanan Banten, keadaan Sultan Abdul Mufakir menjadi rentan, ia yang masih muda diliputi rasa kehilangan yang mendalam karena ditinggal ayah sambungnya, dilatarbelakangi hal tersebut Pangeran Ranamanggala membuat sebuah pertemuan yang membahas kematian Pangeran Camara selakuPatihkesultanan Banten, tetapi Pangeran Kulon, Pangeran Singaraja, Tubagus Kidul yang sebelumnya mengikuti pertemuan untuk membunuh Pangeran Camara tidak bersedia hadir, temasuk Pangeran Prabangsa pun menolak hadir, sehingga yang hadir pada saat itu hanyalah Pangeran Ranamanggala, Pangera Upapatih serta pejabat lainnya, peristiwa pembahasan kematian Pangeran Camara selakuPatihkesultanan Banten inilah yang kemudian membuatDepatiYudanegara selaku orang yang ditugasi membunuh Pangeran Camara khawatir dirinya akan dijadikan penjahat dan dihukum mati, rasa khawatir ini membuatDepatiYudanegara menemui Pangeran Kulon dan menyatakan bahwa dia dan rekan-rekannya akan mendukung Pangeran Kulon yang merupakan cucu dari Sultan Maulana Yusuf dari anak sulung perempuannya yakni Ratu Winaon yang menikahi Pangeran Gebang dari Cirebon untuk menjadi Sultan Banten, inilah awal dari terjadinya peristiwa Pailir.
Peristiwa Pailir berlangsung selama kurang lebih empat bulan, para pejabat kerajaan yang memihak Pangeran Kulon, Syahbandar dan seorang Andamohi Keling (orang Keling) membuat benteng pertahanan di hilir di sekitar pelabuhan, untuk mengamankan usaha mereka, kelompok Pangeran Kulon tidak segan membunuh orang dan keluarganya yang dianggap berkhianat atau tidak mau ikut serta dalam peperangan, hal ini terjadi kepadaKiWijaya Manggala dan keluarganya yang berusaha pergi dari wilayah pelabuhan dengan menggunakan perahu karena tidak mau ikut serta dalam perang saudara tersebut.
Peristiwa Pailir berakhir dengan perundingan yang dimediasi oleh Pangeran Jayakarta atas permohonan pihak Pangeran Kulon yang pada saat itu telah terdesak, pihak Pangeran Kulon dalam perang sebenarnya berhasil merebut meriam Banten yang bernamaKiJajaka Tua namun hal tersebut tidak begitu mengubah keadaan. Perang yang oleh Sultan Abdul Mufakir (masa itu Sultan berusia 13 tahun) sempat disaksikan dari atas benteng berakhir dengan perjanjian bahwa pihak Pangeran Kulon harus mengasingkan diri dari wilayah inti Kesultanan Banten, pada bulan Februari 1609 berangkatlah Tumenggung Anggabaya, Syahbandar dan pihak lainnya yang memihak Pangeran Kulon menuju Jayakarta jumlahnya kira-kira delapan ribu orang, baru pada tahun 1617,para Pangeran, Tumenggung dan Syahbandar diizinkan kembali ke Banten namun mereka tidak diberikan peranan politik apapun, setelah peristiwa Pailir, Pangeran Ranamanggala naik menjadi wali Sultan bagi Sultan Abdul Mufakir yang masa itu berusia 13 tahun, waktu kejadian peristiwa Pailir diabadikan dalam sengkalaTanpa Guna Tataning Prang(1530 saka / 1608 M) jika dihitung dari penyebab atau latar belakang munculnya peristiwa Pailir hingga tuntasnya perpindahan delapan ribu orang pengikut Pangeran Kulon maka secara keseluruhan peristiwa ini berlangsung pada tanggal 8 Maret 1608 hingga 26 Maret 1609sementara inti peperangan dalam peristiwaPailirberlangsung dari sekitar akhir Oktober atau awal November 1608 hingga perundingan damai yang menghasilkan keputusan pengasingan kepada pihak Pangeran Kulon pada bulan Februari 1609.
Selepas peristiwaPailirPangeran Ranamanggala menjabat sebagai wali sultan Banten menggantikan Pangeran Camara ayah sambung sultan yang terbunuh, segera Pangeran Ranamanggala melakukan penertiban dan peninjauan ulang terhadap peraturan yang dibuat oleh wali sultan sebelumnya berkenaan dengan para pedagang Eropa. Pajak kemudian ditingkatkan, terutama yang berasal dari wilayah Banten, Pangeran Ranamanggala melakukan hal tersebut dikarenakan berpendapat bahwa para pedagang Eropa di wilayah kesultanan Banten tidak hanya berniat berdagang saja namun juga berniat mencampuri urusan internal kesultanan Banten.
Setelah peristiwaPailiryang menyebabkan migrasi besar-besaran para pendukung Pangeran Kulon ke wilayah Jayakarta pada tahun 1609, setahun kemudian pada tahun 1610, untuk pertama kalinyaVereenigde Oostindische Compagniemengangkat Gubernur Jenderal untuk pulau Jawa yaituPieter Both,Gubernur Jenderal Pieter Bothbertugas untuk mencari sebuah tempat guna mendirikan kantor dagang Vereenigde Oostindische Compagnie sekaligus dapat dijadikan sebagai pusat pelayaran seluruh Hindia.Gubernur Jenderal Pieter Both kemudian memilih wilayahkesultanan Bantensebagai calon tempat pendirian kantor dagangnya dikarenakan selama ini (sejak misi dagangJacob Corneliszoon van Neck) Belanda sering membeli dan menumpuk barang dagangannya diBanten, tetapi karena khawatir bahwa suatu saat akan ada gangguan dari penguasa setempat dan juga dikarenakan aturan-aturan baru yang diberlakukan oleh wali sultan yang baru yaitu Pangeran Ranamanggala maka Gubernur Jenderal Pieter Both pada tahun yang sama memalingkan orientasinya dari wilayah inti kesultanan Banten ke wilayahJayakarta.Gubernur Jenderal Pieter Both melakukan perundingan dengan Pangeran Wijayakrama (penguasa wilayah otonom Jayakarta atau biasa dikenal dengan nama Pangeran Jayakarta) untuk membahas seputar perumusan naskah perjanjian pembayaran bea, proses-proses hukum serta pembelian sebidang tanah di sisi timur sungai Ciliwung guna mendirikan rumah dari batu dan kayu yang berfungsi sebagai tempat tinggal, kantor dan gudang, perjanjian yang dibagi menjadi dua bagian tersebut (satu bagian berkenaan dengan bea dan masalah hukum, satu lagi berkenaan dengan penjualan tanah) kemudian ditandatangani pada tahun 1611, uang sebesar 1200 real kemudian diberikan kepada Pangeran Jayakarta sebagai pembayaran atas pembelian tanah di sisi timur sungai Ciliwung seluas 50x50vadem(depa),akan tetapi rumusan kedua naskah awal surat perjanjian tersebut sengaja dibuat berbeda oleh Vereenigde Oostindische Compagnie di bawah Gubernur Jenderal Pieter Both, hal tersebut dilakukan sebagai alasan menyerang pihak kesultanan Banten karena tidak menepati perjanjian di kemudian hari. Adanya perbedaan antara rumusan naskah awal dengan surat perjanjian tersebut menimbulkan pengertian yang berbeda antara Pangeran Jayakarta dengan Gubernur Jenderal Pieter Both, dalam ketentuan perihal penjualan tanah misalnya, dalam ketentuan hukum kesultanan Banten tentang pertanahan (yang juga berlaku di wilayah Jayakarta) dinyatakan bahwa tanah adalah milik sultan Banten yang hanya boleh dipergunakan untuk waktu tertentu dengan syarat-syarat yang bisa berubah sewaktu-waktu, tetapi dengan perbedaan yang dibuat oleh Vereenigde Oostindische Compagnie maka pembelian tanah tersebut diartikan sebagai perpindahan kepemilikan dari sultan Banten kepada Vereenigde Oostindische Compagnie,walaupun terjadi ketegangan akibat rumusan naskah yang berbeda dengan naskah pada perundingan awal, tetapi tanah untuk Vereenigde Oostindische Compagnie akhirnya ditentukan.
Tanah untukVereenigde Oostindische Compagniedisetujui berada di sisi timur sungai Ciliwung, berdampingan denganPecinan(kampung Tiognhoa) yang dikepalai oleh Wat Ting (seorang Nakhoda) di sekitar terusan kali Besar dan kampung pribumi di sebelah timurnya yang dikepalai oleh Kyai Aria yang juga merupakanPatihPangeran Wijayakrama atau Pangeran Jayakarta (penguasa Jayakarta), pada tahun yang sama (1611),Gubernur Jenderal Pieter Bothsegera menunjuk Abraham Theunemans untuk mendirikan gudang yang tidak permanen berukuran 31,5 x 11,4 m terbuat darigedek(tembok kayu) dan batu. Gudang tersebut kemudian dapat diselesaikan pembangunannya oleh Abraham Theuneumans pada 1613, gudang yang didirikan di sebelah timur terusan kali Besar (bagian dari aliran sungai Ciliwung yang berada di sebelah timur istana Pangeran Jayakarta, di seberang terusan kali Besar terdapat perkampungan yang dipimpin olehKiAria, patih Pangeran Jayakarta) tersebut kemudian diberi namaNassau. Pada 7 November 1614Gerard Reijnstseorang pedagang dan salah satu pemilik dariNieuwe Compagnie(Brabantsche) serta anak dari Pieter Reijnst (pembuat sabun) diangkat menjadi Gubernur Jenderal Hindia Belanda selanjutnya menggantikanPieter Bothyang habis masa jabatannya pada 6 November 1614. Pada tahun 1615 terdapat kabar bahwa gubernur jenderal sebelumnya yaitu Pieter Both yang tengah kembali ke Belanda bersama empat kapalnya setelah menyelesaikan jabatannya mendapatkan kecelakaan di laut sekitarMauritiustepatnya di sekitarFlic-en-Flac, dua dari empat kapal dalam rombongan Pieter Both tenggelam dan Pieter Both berada di dalamnya. Berkenaan dengan kepemimpinan Gerard Reynst dikatakan bahwa Gubernur Jenderal Gerard Reijnst bersikap tidak lebih baik dari pendahulunya, keadaan malah cenderung lebih buruk.Gubernur Jenderal Gerard Reijnst tidak bisa berbuat banyak pada masa jabatannya karena dia terserang disentri dan akhirnya meninggal 7 Desember 1615, setelah meninggalnya Gerard Reynst, Belanda menunjukLaurens Reaelsebagai penggantinya, dia menjabat sebagai gubernur jenderal Hindia Belanda pada 16 Juni 1616, pada masaGubernur Jenderal Laurens Reaeltepatnya pada tahun 1617 dibangunlahMauritiussebuah rumah yang berada di sisi kali Ciliwung.Gubernur Jenderal Laurens Reael sebenarnya adalah orang yang adil, dia menentang cara yang diambil oleh para petinggi Vereenigde Oostindische Compagnie dalam memperlakukan orang-orang pribumi dan para pesaing dagangnya (dalam kasus kehadiran para pedagang Inggris di Maluku), bagi Gubernur Jenderal Laurens Reael dan jugaLaksamana Laut Steven van der Hagentujuan dan kesuksesan dari Vereenigde Oostindische Compagnie hanya bisa dicapai melalui jalur perdagangan dan diplomatik saja, tanpa melakukan serbuan dan penaklukan kepada pribumi, baginya penyerangan-penyerangan kepada negara lain hanya bisa dilakukan sesuai dengan hukum internasional yang berlaku, dikarenakan perbedaan prinsip ini Gubernur Jenderal Laurens Reael memutuskan mengundurkan diri pada 31 Oktober 1617, tetapi dia baru bisa meninggalkan posisinya setelah kedatanganJan Pieterszoon Coen. Laurens Reael kemudian mengulangi kembali pemikirannya melalui laporan yang ia tulis untuk Dewan Perwakilan Rakyat Belanda dan para pemimpin Vereenigde Oostindische Compagnie agar dapat diterima dengan jelas pesan dan posisinya.
Pada tahun 1618,Jan Pieterszoon Coendiangkat menjadi Gubernur Jenderal, dia dipilih menjadi Gubernur Jenderal selanjutnya karena dianggap lebih keras sikapnya dibandingkan pandahulunya Laurens Reael, bangunan tidak permanen yang terbuat dari gedek dan batu tersebut kemudian diperkuat dan dilengkapi dengan pagar tembok dari tanah, di setiap sudutnya lantas diperkuat dengan pembangunancatteyang berfungsi sebagai tempat meriam yang pada masa itu posisinya sengaja diarahkan ke wilayah Pangeran Jayakarta, selain memperkuat bangunan sebelumnyaGubernur Jenderal Jan Pieterszoon Coenjuga membangun sebuah pangkalan laut yang kecil dengan fasilitas pergudangan dan perbaikan, gereja dan rumah sakit di pulau sekitar Jayakarta.
Peningkatan struktur bangunan dari yang sebelumnya merupakan bangunan tidak permanen menjadi bangunan permanen oleh Gubernur Jenderal Jan Pieterszoon Coen pada rumahMauritiussebenarnya sudah menyalahi kesepakatan awal antaraPieter BothdanPangeran Wijayakrama(Pangeran Jayakarta), dikarenakan walaupun Belanda mengubah isi perjanjian jual beli tanahnya namun kesepakatan terhadap bangunannya yang harus tidak permanen tidak mengalami perubahan, khawatir bahwa permasalahan diJayakartaini terdengar hingga keBantenmaka Pangeran Wijayakrama selaku penguasa Jayakarta berusaha menanggulangi masalahnya, salah satunya dengan bekerja sama dengan Inggris yang kantor dagangnya berada tepat di seberang bangunan Belanda, mendengar adanya persekutuan antara pihak Inggris dengan Pangeran Jayakarta maka Belanda segera menyerang markas Inggris yang berada di seberangnya yang langsung di serang balik oleh Inggris, hasilnya Belanda menderita kekalahan dengan korban tewas berjumlah 15 orang dan korban luka-luka sebanyak 10 orang, melihat kondisi tersebut Gubernur Jenderal Jan Pieterszoon Coen segera melarikan diri keMalukusementara kekuasaan terhadap aset Belanda di Jayakarta diserahkan kepadaPieter van den Broecke. Pangeran Jayakarta kemudian berhasil menahan Pieter van den Broecke, ketika berita penahanan Pieter van den Broecke sampai keBanten, wali sultan pada masa itu Pangeran Ranamanggala tidak menyetujui tindakan yang diambil oleh Pangeran Wijayakrama selaku penguasa Jayakarta.Pangeran Ranamanggala selaku wali Sultan Banten segera menarik Pangeran Wijayakrama kembali keBantendan kekuasaan terhadap wilayah Kepangeranan Jayakarta diambil alih olehnya sementara waktu.
Pangeran Wijayakrama yang ditarik keBantenoleh wali Sultan Banten kemudian ditempatkan di pesisir utara Banten tepatnya dikampung Tanara, keputusan Pangeran Ranamanggala sebagai wali sultan Banten pada masa itu dianggap bias, di satu sisi setelah peristiwaPailiria menerapkan peraturan ketat dan menaikkan pajak terhadap para pedagang Eropa, tetapi di sisi lain tindakan penegakan hukum yang dilakukanPangeran Wijayakramaselaku penguasaJayakartadalam kasus rumahMauritiusdianggap salah oleh Pangeran Ranamanggala bahkan berimbas pada penarikannya ke Banten, kuat dugaan bahwa Pangeran Ranamanggala dan beberapa pihak dikesultanan Bantentidak begitu menyukai Pangeran Wijayakrama sejak ia menjadi mediator konflik-konflik di Banten, sebagian pihak kesultanan Banten berpendapat bahwa Pangeran Wijayakrama terlalu berpihak kepada para golongan yang menyusahkan Banten, sebut saja dalam kasus terbunuhnya Sultan Maulana Muhammad diPalembang, tindakan Pangeran Mas yang dianggap membuat Sultan Maulana Muhammad terbunuh dalam penyerangan ke Palembang membuat banyak orang di Banten tidak menyukainya, ia lantas pergi ke Jayakarta untuk meminta bantuan agar diperbolehkan menetap di sana, walau kemudian dia dibunuh oleh anaknya sendiri,serta kasus-kasus lainnya di mana kehadiran Pangeran Wijayakrama sebagai mediator dianggap oleh sebagian pihak di kesultanan Banten tidak memihak kepada kesultanan sehingga menyebabkan perang dingin di antara Pangeran Wijayakrama dengan sebagian pihak kesultanan Banten berlangsung cukup lama.Rentetan kejadian inilah yang oleh sebagian peneliti Banten dianggap sebagai hal yang melatarbelakangi alasan ditariknya Pangeran Wijayakrama ke Banten secara komplek ketimbang hanya berpikir bahwa Pangeran Wijayakrama ditarik karena kasus rumahMauritius.
Menurut Profesor Hembing Wijayakusuma dalam tulisannya tentang pembantaian masal 1740, ia menjelaskan bahwa sebelum jatuhnya kekuasaanPangeran Wijayakramaselaku penguasaJayakartayang ditandai dengan penarikan dirinya keBanten, pihakVereenigde Oostindische Compagnietelah sekali lagi mengubah isi perjanjian yang disepakati antara Pangeran Wijayakrama denganPieter Both, perubahan dalam rumusan perjanjian oleh Vereenigde Oostindische Compagnie adalah bahwa pihak Vereenigde Oostindische Compagnie diberikan izin untuk membongkar rumah-rumah orang Tionghoa diPecinanyang dianggap terlalu dekat dengan gudang Vereenigde Oostindische Compagnie, alasan penambahan klausul tersebut dikarenakan menurut Vereenigde Oostindische Compagnie tidak adanya kepastian mengenai bea cukai, menurut pihak Vereenigde Oostindische Compagnie, Wat Ting yang merupakan pemimpinPecinanpada masa itu bertugas sebagai saksi sekaligus penerjemah antara pihak Vereenigde Oostindische Compagnie dan Pangeran Wijayakrama. Pada saatPangeran Wijayakramaditarik ke Banten dan kekuasaan kepangeranan Jayakarta dikendalikan langsung dari Banten, Pangeran Ranamanggala pada saat itu membunuh Wat Ting.
Gubernur Jenderal Jan Pieterszoon Coenkembali dariMalukukeJayakartapada tanggal 30 Mei 1619 dengan membawa bantuan armada dari markasVereenigde Oostindische CompagniediMaluku, longgarnya pemerintahan di Jayakarta dengan ditariknyaPangeran WijayakramakeBantensegera dimanfaatkan oleh Gubernur Jenderal Jan Pieterszoon Coen yang juga bertekad untuk merebut Jayakarta dari tangan Pangeran Ranamanggala. Penyerbuan yang dilakukan oleh Gubernur Jenderal Jan Pieterszoon Coen akhirnya berhasil. Pangeran Wijayakrama yang kemudian dapat kembali ke Jayakarta menemukan bahwa kondisi Jayakarta sudah berubah, ia lantas berjuang untuk mendapatkan kembali Jayakarta hingga akhirnya meninggal di wilayah yang sekarang disebutJatinegara.
Gubernur Jenderal Jan Pieterszoon Coensegera membangun tembok benteng kota yang disebutnya sebagaiNiuew Hoorn(sebagai pengganti namaJayakarta) setelah kemenangannya terhadap kubuPangeran Wijayakrama, namaNiuew Hoorndipilih karena Gubernur Jenderal Jan Pieterszoon Coen berasal dari daerahHoorn, tetapi dikemudian hari para petinggiVereenigde Oostindische Compagnielebih memilih namaBataviayang berarti tanahnya orang-orangBatav(mengacu pada zaman Romawi), profesor Hembing Wijayakusuma berpendapat bahwa namaBataviaberarti tempat tinggal Bata / Bato (pahlawan Suku). Pemilihan namaBataviasebagai nama sebuah wilayah tidak hanya disematkan kepada Jayakarta saja, tetapi juga disematkan kepada wilayah wilayah yang di bangun Belanda diAmerikadanSuriname.
Pasca menguasaiJayakarta, Belanda melaluiVereenigde Oostindische Compagnieberusaha menguasai perdagangan diBantenterutama komoditas lada. Penghadangan terhadap kapal kapal dagang yang hendak berlabuh di Banten pun dilakukan yang menyebabkan harga lada di Banten turun.
Setelah Sultan Zainul Arifin meninggal dunia pada tahun 1649, pemerintahan Kesultanan Cirebon dilanjutkan oleh cucunya yang bernama Pangeran Rasmi atau Pangeran Abdul Karim, karena ayah Pangeran Rasmi yaitu Pangeran Seda ing Gayam atau Panembahan Adiningkusumah meninggal lebih dahulu. Pangeran Rasmi kemudian menggunakan nama gelar ayahnya almarhum yakni Panembahan Adiningkusuma yang kemudian dikenal pula dengan sebutan Panembahan Girilaya atauPanembahan Ratu II.
Panembahan Girilaya pada masa pemerintahannya terjepit di antara dua kekuatan kekuasaan, yaitu Kesultanan Banten dan Kesultanan Mataram. Banten merasa curiga sebab Cirebon dianggap lebih mendekat ke Mataram (Amangkurat I adalah mertua Panembahan Girilaya). Mataram di lain pihak merasa curiga bahwa Cirebon tidak sungguh-sungguh mendekatkan diri, karena Panembahan Girilaya dan Sultan Ageng Tirtayasa dari Banten adalah sama-sama keturunan sunan Gunung Jati.
Pada surat perwakilan Belanda di Cirebon 1 Oktober 1684 (tiga tahun setelah ditandatanganinya perjanjian persahabatan Cirebon dengan Belanda tahun 1681) diceritakan tentangPeristiwa Girilaya. Pada tahun 1649 pangeran Girilaya naik takhta menjadi penguasa Cirebon, tidak lama setelah penobatannya, sekitar tahun 1650-anAmangkurat Idari Mataram mengundangnya beserta kedua putra tertuanya yaitu Martawijaya dan Kartawijaya untuk berkunjung ke keraton Mataram dikota Gedesekaligus menghormati naiknya Girilaya sebagai penguasa baru kesultanan Cirebon. Selepas acara penghormatan selesai, ia bersama kedua putranya dilarang kembali ke Cirebon dan tinggal di lingkungan Mataram hingga kematiannya.Sultan Abdul Karim (Pangeran Girilaya) atau yang dikenal dengan nama Panembahan Ratu Pakungwati II menurut Mason Hoadley meninggal pada tahun 1666,tetapi menurut naskah Mertasinga, Sultan Abdul Karim telah meninggal di Mataram pada tahun 1585 saka jawa atau sekitar tahun 1662 M,12 tahun setelah kepergiannya ke Mataram. Kebijakan menawan tersebut merupakan kebijakan politikAmangkurat Iterhadap para penguasa pesisir, hal yang sama juga dialami oleh pangeran Prasena, anak dari pangeran Tengah penguasa kerajaan Arosbaya (Bangkalan) di Madura, pada tahun 1624, empat tahun setelah pangeran Tengah meninggal dunia pada 1620, Mataram menyerang kerajaan Arosbaya, wali raja pada saat itu pangeran Mas dari Arosbaya (adik dari pangeran Tengah sekaligus paman bagi pangeran Prasena yang pada saat itu masih kecil) berhasil melarikan diri ke Demak sementara pangeran Prasena berhasil dibawa ke Mataram dan diangkat menjadi adipati Cakraningrat penguasa Madura bagian barat,tetapi selama menjadi adipati, pangeran Prasena menghabiskan waktunya di Mataram mirip seperti kejadian yang menimpa pangeran Abdul Karim atau dikenal dengan nama pangeran Girilaya.
Makamnya di Jogjakarta, di bukit Girilaya, dekat dengan makam raja raja Mataram di Imogiri, Kabupaten Bantul. Menurut beberapa sumber di Imogiri maupun Girilaya, tinggi makam Panembahan Girilaya adalah sejajar dengan makam Sultan Agung di Imogiri.
Pada saat Pangeran Girilaya dan kedua anak tertuanya yaitu Martawijaya dan Kartawijaya diundang ke Mataram untuk menerima upacara penghormatan atas naiknya Pangeran Girilaya menjadi penguasa Cirebon namun ternyata tidak kunjung kembali, kesultanan Cirebon mengalami perguncangan karena tidak adanya pemimpin di kesultanan Cirebon. Pada masa tersebut untuk menghindari kesultanan Cirebon dari kekacauan dikarenakan di keraton Cirebon Pangeran Girilaya masih memiliki keturunan dari istri-istrinya yang lain seperti Pangeran Ketimang dan Pangeran Giyanti (anak Pangeran Girilaya dari istrinya yang merupakan keturunan bangsawan Cirebon) dan Bagus Jaka (anak Pangeran Girilaya dengan istrinya yang merupakan rakyat biasa), makaSultan Ageng Tirtayasadari kesultanan Banten menunjuk pangeran Wangsakerta (adik pangeran Martawijaya dan Kartawijaya) untuk menjadi wali sultan sampai ayahnya kembali.Keluarga akhirnya menyetujui pangeran Wangsakerta menjadiWalisampai kembalinya ayahnya pangeran Girilaya dari Mataram.
Sepeninggalsultan Agung Hanyaraka Kusumadari Mataram, penerusnya yaitu Amangkurat I bersikap lebih lunak kepada Belanda, perjanjian antara keduanya untuk saling membantu pun dilakukan, pada masa pemberontakan Trunojoyo, Mataram meminta bantuan Belanda untuk memadamkannya, Belanda yang diwakili Admiral Speelman (yang dikemudian hari menjadiGubernur Jendral Cornelis Speelman) melalui Syahbandar Jepara yaitu Wangsadipa mengajukan syarat yaitu perluasan wilayah kekuasaan Belanda hingga sungai Cipunegara (di bagian utara) terus menyusuri ke selatan hingga bertemu laut. Syarat tersebut dibawa oleh residen James Cooper(menurut sejarahwan Sartono Kartodiharjo nama residen tersebut ialah Jacob Couper) pada tanggal 4 Maret 1677 dan diterima oleh sultan Mataram,Amangkurat Idan putranya (beberapa bulan sebelum Trunojoyo merebut ibu kota Mataram tanggal 28 Juni 1677 dan membebaskan putra-putra pangeran Girilaya yang ditahan oleh Mataram yaitu Martawijaya dan Kartawijaya).
Syarat tersebut kemudian disetujui oleh Amangkurat I walau wilayah yang diminta sebagiannya adalah milik kesultanan Cirebon yaitu wilayah Karawang atau sebagian masyarakat mengenalnya dengan Rangkas Sumedang (wilayah antara sungai Citarum dan Cibeet hingga sungai Cipunegara yang sekarang menjadikabupaten Karawang,kabupaten Purwakartadankabupaten Subang), para pangeran Cirebon ditahan sebagai garansi Cirebon mau melepaskan wilayah pesisir bagian baratnya untuk Belanda.
Pangeran Wangsakerta yang berada di Cirebon dan menjadi wali setelah ayahnya (pangeran Girilaya) tidak kunjung kembali dari Mataram akibat ditahan olehAmangkurat Ikemudian meminta bantuankesultanan Banten,sultan Ageng Tirtayasakemudian mengirimkan bantuan persenjataan kepada Trunojoyo dengan memintanya untuk membebaskan para pangeran Cirebon yang ditahan oleh Mataram, ketika Trunojoyo berhasil merebut keraton Mataram, orang-orang yang ada di dalamnya kemudian ditawan dan dibawa ke Kediri,awalnya Tronojoyo tidak mengetahui bahwa para pangeran Cirebon ada di antara para tahanan yang dibawa ke Kediri, setelah memeriksa para tahanan yang berasal dari Mataram dan menemukan para pangeran Cirebon, Trunojoyo kemudian membebaskan mereka dengan hormat dan mengirimnya kekesultanan Banten.
Posisi Cirebon yang sedang lemah pada saat itu ditambah dengan kosongnya kursi sultan dan hanya diisi oleh seorang wali sultan saja membuat kesultanan Cirebon belum bisa merebut kembali wilayah Karawang yang direbut Belanda secara ilegal dan paksa dengan bantuanAmangkurat Idari Mataram, sehingga ketika kedua pangeran Cirebon kembali dari Banten dan mewarisi kesultanan Cirebon dengan namaKasepuhandanKanomanmereka mewarisi wilayahnya yang telah dikurangi wilayah Karawang yang diambil paksa tersebut, sehingga wilayah kekuasaan kesultanan Cirebon paling barat ialah wilayahKandang Haurdan sekitarnya hingga batas sungai Cipunegara.
Pangeran Kusumadinata IV bupati Sumedang atauRangga Gempol IIIbercita-cita untuk menguasai kembali wilayah kerajaan Sumedang Larang seperti klaim yang pernah dilakukan oleh leluhurnya yakni Pangeran Angkawijaya bin Raden Sholeh (Kusumadinata IIatau Prabu Geusan Ulun).Pangeran Kusumahdinata IV beranggapan bahwa perjanjian antara Amangkurat I danVereenigde Oostindische Compagniedengan perantara James Cooper(menurut sejarahwan Sartono Kartodiharjo nama residen tersebut ialah Jacob Couper) pada Maret 1677 menandakan bahwa Mataram sudah mulai menurun kekuatannya., untuk mewujudkan cita-citanya, Pangeran Kusumahdinata IV memulai serangannya ke wilayah Karawang, wilayah pertama yang diserang adalah wilayahPamanukankemudian Pangeran Kusumahdinata IV menyerangCiasemlalu keCiparage.
Pada wilayahCiparagePangeran Kusumahdinata IV menempatkan pasukannya guna persiapan menyerangKarawang.
Sebenarnya sebelum melakukan penyerangan ke wilayah Karawang, Pangeran Kusumahdinata IV pernah mendekati Banten untuk meminta bantuan agar membantu Sumedang mendapatkan wilayah Karawang.Kesultanan Bantenyang sebelumnya pernah membantu Pangeran Suriadiwangsa II bin Raja Sumedang Suriadiwangsa I menyerang Sumedang dalam rangka klaim tahta oleh Pangeran Suriadiwangsa II menerima dengan baik permintaan Pangeran Kusumahdinata IV namun dengan syarat bahwa Pangeran Kusumahdinata IV harus membantuKesultanan Bantendalam memerangiVereenigde Oostindische Compagniedan Mataram, namun syarat tersebut ditolak oleh Pangeran Kusumahdinata IV mengingat keadaan pada masa itu tidak memungkinkan bagi kekuatannya untuk menyerangVereenigde Oostindische Compagniedan Mataram. Penolakan tersebut membuat Pangeran Kusumahdinata IV terpaksa bersiap menerima seranganKesultanan Bantensewaktu-waktu.
Pangeran Kusumahdinata IV merupakan keturunan dari Pangeran Angkawijaya (Prabu Geusan Ulun) dari istrinya yang bernama Nyai Cukang Gede sementara Pangeran Suriadiwangsa II merupakan anak dari Suriadiwangsa I bin Sultan Cirebon Zainul Arifin dari istrinya yang bernama Ratu Harisbaya (sebelum Ratu Harisbaya menikah dengan Pangeran Angkawijaya dia sedang mengandung dua bulan dengan Sultan Cirebon Zainul Arifin (suami pertamanya)) Suriadiwangsa I kemudian dianggap anak sendiri oleh Pangeran Angkawijaya (Prabu Geusan Ulun) suami keduanya.
Pangeran Kusumahdinata IV setelah memperhitungkan situasi, memanfaatkan keadaan dari ketidaktahuanVereenigde Oostindische Compagnietentang kewilayahan dengan mengirimkan surat pada tanggal 25 Oktober 1677 kepadaVereenigde Oostindische Compagnieyang isinya memohon kepadaVereenigde Oostindische Compagnieuntuk menutup (menjaga) muara Cipamanukan dengan imbalan akan diberikan tanah diantara Batavia hingga IndramayuMuara Cipamanukan yang dimaksud sebenarnya adalah muara dari sungai Cipunegara yang memang telah menjadi milikVereenigde Oostindische Compagnie, sehingga dalam hal ini Pangeran Kusumahdinata IV sebenarnya tidak menyerahkan wilayah manapun dalam kepemilikaannya kepadaVereenigde Oostindische Compagnie.
Setelah menguasai Karawang,Vereenigde Oostindische Compagniemengirimkan ekspedisi pada bulan November hingga Desember 1677 untuk mempertahankan wilayah Karawang dari ancaman Banten, Makassar, Cirebon dan Sumedang.
Pada bulan Januari hingga Maret 1678Vereenigde Oostindische Compagniemengirimkan  Evert Jansz sebagai utusan ke Sumedang.Pada tanggal 10 Maret 1678 bergerak pasukan  Banten bergerak menuju Sumedang melaluiMuaraberes(sekitar 10 km ke utara Bogor) danTangerang.
Pada bulan Mei 1678Vereenigde Oostindische Compagniemengirimkan utusannya ke Karawang yaitu Willem Hartsinck dan juga mengirimkan Muller sebagai utusanVereenigde Oostindische Compagnieke Sumedang.Pasukan Banten telah sampai di Sumedang sejak awal Mei 1678 dan mengepung kota Sumedang selama satu bulan lamanya, pasukanKesultanan Bantendalam peristiwa ini dibantu oleh pasukan dari bupati Bandung yaitu Wira Angun-angun dan juga pasukan dari Sukapura dan Parakan Muncang.
Pada bulan Juni 1678 Pasukan Banten yang sedang mengepung kota Sumedang dipanggil pulang olehSultan Ageng Tirtayasa dari kesultanan Banten, alasannya ialah guna menghadapi kemungkinan perlawanan terhadap Pangeran Haji.Pasukankesultanan Bantenyang sedang pulang tersebut kemudian dikejar oleh pasukan Sumedang dan terjadilah peristiwa perang Tegal luar di mana pimpinan pasukan kesultanan Banten tewas
Pada bulan Juli hingga September 1678Vereenigde Oostindische Compagniemengirimkan Jochem Michielsz (atau Joachim Michiefs) ke Sumedang.Semua utusan yang dikirimkan tersebut adalah dalam upaya membendung pengaruhkesultanan Bantendan Kesultanan Cirebon pada wilayah Karawang yang baru saja dikuasai olehVereenigde Oostindische Compagnie
Pasukan Trunajaya berhasil menyelamatkan para Pangeran Cirebon dan kemudian mengantarkannya keBanten.
Pada akhir tahun 1676, sebuah kapal dari Cirebon yang berlabuh diBantenmemberitahu bahwa Pekalongan sudah berhasil dikuasai pasukanTrunajayapada sekitar 25 Desember 1676, penguasa daerah pesisir pada masa itu Singawangsa diberitakan ikut dengan para pasukanTrunajaya
Pada tanggal 2 Januari 1677, Tegal berhasil dikuasai pasukanTrunajayatanpa kekerasan
Pada tanggal 5 Januari 1677, pasukanTrunajayayang dipimpin olehNgabehiSindukarti (paman Trunajaya) danNgabehiLanglang Pasir sampai di pelabuhan Cirebon dengan 12 kapal berisi 150 pasukan, mereka menuntut agar wakil Mataram yang ditempatkan di Cirebon sebagai Syahbandar yaitu Martadipa menyerah dan menyetujui syarat-syaratnya, yaitu
1. Cirebon tidak lagi membayar pajak kepada Mataram,2. Tentara Madura harus melindungi anak-anak dan wanita,3. Sandera Cirebon tidak ada lagi yang dikirim ke Mataram,4. Selanjutnya Cirebon berada di bawah pemerintahan rajanya sendiri,5. Cirebon berada di bawah pertanggungan hak-hak Sultan Banten,6. Orang Cirebon menyokong Banten dengan senjata serta mengakui Sultan Banten sebagai pelindung
Syarat-syarat tersebut disertai peringatan dengan ancaman seandainya tidak diterima.Martadipa yang pada saat itu telah berusia lanjut akhirnya menerima syarat yang disodorkan kepadanya atas nama Raden Trunajayadan bersedia menyerahkan kekuasaannya kepada keturunan atau kerabat dekat Sultan Abdul Karim (Sultan Cirebon yang ditawan Mataram)
Pembagian terhadap kesultanan Cirebon secara resmi terjadi pada tahun 1679 saat Pangeran Martawijaya dan Kartawijaya dinobatkan menjadi sultan di keraton Pakungwati, kesultanan Cirebon, sebelum kedua pangeran kembali ke Cirebon setelah diselamatkan oleh Tronojoyo dari Mataram dengan bantuan persenjataan dari kesultanan Banten pada tahun 1677,Sultan Ageng Tirtayasadari Banten terpaksa membagi kesultanan Cirebon menjadi dua kesultanan dan satu peguron dikarenakan untuk menghindari perpecahan keluarga kesultanan Cirebon karena adanya perbedaan pendapat di kalangan keluarga besar mengenai penerus kesultanan Cirebon, pendapat keluarga besar terbelah dan mendukung ketiganya (Martawijaya, Kartawijaya dan Wangsakerta) untuk menjadi penguasa, makaSultan Ageng Tirtayasamenobatkan ketiganya menjadi penguasa Cirebon di Banten pada tahun yang sama setelah mereka tiba dikesultanan Bantendari Mataram yaitu pada tahun 1677, dua orang menjadi sultan dan memiliki wilayahnya masing-masing (walaupun belum bersifat mengikat atau tetap) yaitu Pangeran Martawijaya dan Kartawijaya sementara satu orang yaitu Pangeran Wangsakerta menjadi Panembahan tanpa wilayah kekuasaan namun memegang kekuasaan atas kepustakaan keraton.
Hal tersebut merupakan babak baru bagi kesultanan Cirebon, di mana kesultanan terpecah menjadi tiga dan masing-masing berkuasa dan menurunkan para penguasa berikutnya, berikut gelar ketiganya setelah resmi dinobatkan:
Perubahan gelar dari Panembahan menjadi Sultan bagi dua putra tertua Pangeran Girilaya ini dilakukan oleh Sultan Ageng Tirtayasa, karena keduanya dilantik menjadiSultanCirebon diBanten. Sebagai sultan, mereka mempunyai wilayah kekuasaan penuh, rakyat, dan keraton masing-masing. Pangeran Wangsakerta tidak diangkat menjadi sultan melainkan hanya Panembahan. Ia tidak memiliki wilayah kekuasaan atau keraton sendiri, akan tetapi berdiri sebagai Kaprabon (Paguron) yaitu tempat belajar para intelektual keraton.
Pada 4 Januari 1678,Rijckloff van Goensditunjuk sebagai pengganti Gubernur JenderalJoan Maetsuyckerkemudian pada 31 Januari 1679Rijckloff van Goensmenulis surat kepada pemerintah Belanda, dia menuliskan bahwa
Penobatan ketiga putra Sultan Cirebon Abdul Karim sebagai penguasa wilayah dan penguasapeguronpada tahun 1677 diBantenolehSultan Abdul Fatahdan dilanjutkan dengan deklarasi ketiganya dikeraton Pakungwatipada 1679 ternyata masih menyisakan ketidakpuasan, Pangeran Martawijaya yang sudah dinobatkan menjadi Sultan Sepuh Syamsuddin dan berkuasa dikesultanan Kasepuhanmasih beranggapan bahwa dia adalah pewaris tahta yang sah karena dia adalah putera tertua dari Sultan Cirebon Abdul Karim yang meninggal ketika dalam penawanan Mataram, konflik internal keturunan Sultan Abdul Karim diperkirakan bermula ketikaSultan Abdul FatahdariBantenhanya memediasi ketiganya dengan cara menobatkan mereka bertiga sebagai penguasa wilayah dan penguasapeguronnamun tidak membagi wilayah kekuasaan kepada masing-masingnya secara tetap dan mengikat
Pangeran Martawijaya yang telah dinobatkan menjadi Sultan Sepuh Syamsuddin kemudian menyampaikan keinginannya kepada utusanVereenigde Oostindische Compagnieyang bernama Jacob van Dyck agarVereenigde Oostindische CompagnieBelanda mau membantunya mendapatkan tahta kesultanan Cirebon, hal ini kemudian mendapatkan penentangan oleh Pangeran Kartawijaya yang telah dinobatkan menjadi Sultan Anom Badriddin dan Pangeran Wangsakerta yang telah dinobatkan menjadi Panembahan Nasiruddin. Pangeran Kartawijaya (Sultan Anom Badruddin) berpendapat bahwa mereka telah sama-sama dinobatkan sebagai penguasa wilayah di Cirebon, menyikapi hal ini kemudian Pangeran Kartawijaya meminta perlindungan kepadakesultanan Banten, sementara Pangeran Wangsakerta (Panembahan Nasiruddin) menuntut agar dirinya juga dapat berkuasa di Cirebon karena selama terjadi kekosongan akibat ayah dan saudaranya ditawan oleh Mataram dialah yang menjadi Wali dan menjalankan pemerintahan kesultanan Cirebon
Pada bulan April tahun 1679kesultanan BantenmenyerangLoji(bahasa Indonesia : gudang)Vereenigde Oostindische Compagniedi Indramayu dibawah pimpinan Arya Surya dan Ratu Bagus Abdul Qadir,penyerangankesultanan Bantenini adalah bagian dari perang gerilya kesultanan Banten terhadapVereenigde Oostindische Compagniedan sekutunya di pulau Jawa.
Pada masa perang antarakesultanan BantendenganVereenigde Oostindische Compagnie, pihakVereenigde Oostindische Compagniemengirim pasukan dari Batavia untuk menyerang wilayah kesultanan Cirebon.Pada bulan September 1680, ketika pasukan gerilyakesultanan Bantendi Cirebon diambang kehancuran olehVereenigde Oostindische Compagnie, Jacob van Dyck yang sebelumnya adalah utusanVereenigde Oostindische Compagnieyang diminta bantuan oleh Pangeran Martawijaya (Sultan Sepuh Syamsuddin) agar menyampaikan keinginannya supayaVereenigde Oostindische Compagniemau membantunya dalam mendapatkan tahta kesultanan Cirebon telah diutus ke Cirebon sebagai seorangCommissaris(bahasa Indonesia : mediator atau penengah perjanjian) untuk menyerahkan surat keputusan pemerintahan tertinggi Belanda yang menyatakan bahwa pemerintahan tertinggi Belanda sudah menganggap para penguasa Cirebon sebagai raja-raja yang bebas tidak terikat oleh pihak manapun dan pemerintahan tertinggi Belanda berjanji akan melindungi para penguasa Cirebon dengan cara menempatkannya sebagai protektorat (wilayah dalam perlindungan Belanda)
Pada saat yang sama Gubernur JenderalRijckloff van Goensdan para penasehatnya yang diketuai olehCornelis Janzoon Speelman(menjabat sejak 18 Januari 1678) sudah menyusun teks perjanjian yang akan diserahkan kepada tiga penguasa Cirebon, teks perjanjian tersebut disusun sendiri olehCornelis Janzoon Speelmanyang kemudian pada tanggal 29 Oktober 1680 ditunjuk sebagai Gubernur Jenderal Hindia Belanda.PenunjukanCornelis Janzoon Speelmansebagai Gubernur Jenderal dikarenakan Gubernur JenderalRijckloff van Goensmenyatakan keinginannya untuk mengundurkan diri, keinginan Gubernur JenderalRijckloff van Goensuntuk mengundurkan diri dikarenakan merasa tidak mampu lagi menghadapi penentangan demi penentangan yang dilakukan olehCornelis Janzoon Speelmandan rekan-rekannya di pemerintahan tinggi
Pengajuan pengunduran diri yang dilakukan oleh Gubernur JenderalRijcklof van Goenssebenarnya telah dilakukan sejak 1679 namun baru mendapatkan respon dariHeeren XVII(tujuh belas orang pemimpin tinggiVereenigde Oostindische Compagnie) melalui surat tertanggal 29 Oktober 1680, didalam surat tersebutHeeren XVIImenerima pengunduran dirinya dengan hormat dan sebagai penghargaan atas jasa-jasanya selama ini kepadaVereenigde Oostindische Compagnie,Heeren XVIImenawarkan kepada anaknya yang bernamaRijcklof van Goens Jryang pada masa itu menjabat sebagai Gubernur wilayah jajahan Belanda di Srilanka sebuah posisi di pemerintahan tinggi
Pada masa gerilya iniSultan Abdul Fatahdarikesultanan Bantenmenghadapi konflik internal yang dipicu oleh kekhawatiran Pangeran Haji akan tahtakesultanan Bantenyang mungkin tidak akan jatuh kepadanya, konflik internal ini memulai puncaknya ketikaCornelis Janzoon Speelmanditunjuk sebagai Gubernur Jenderal Hindia Belanda untuk menggantikanRijckloff van Goenspada 29 Oktober 1680.
Pangeran Haji kemudian pada tanggal 25 November 1680 mengirimkan surat ucapan selamat kepadaCornelis Janzoon Speelmanatas penunjukan dirinya sebagai Gubernur Jenderal Hindia Belanda. Pengiriman surat ucapan selamat oleh Pangeran Haji kepadaCornelis Janzoon Speelmanmemicu kekecewaanSultan Abdul Fatahdikarenakan pada masa ituVereenigde Oostindische Compagniebaru saja menghancurkan pasukan gerilyakesultanan Bantendi Cirebonyang berimbas pada berhasil dikuasai sepenuhnya wilayah kesultanan Cirebon olehVereenigde Oostindische CompagnieBelanda.
Pada akhir tahun 1680 pemerintahan tertinggi Belanda menyetujui isi teks perjanjian yang ditujukan kepada para penguasa Cirebon, kemudian pada saat tahun baru 1681 tujuh orang utusan dari tiga penguasa Cirebon yang tinggal di Batavia menghadiri upacara kenegaraan di rumahRijckloff van Goens(Gubernur Jenderal Hindia Belanda yang baru saja mengundurkan diri pada 29 Oktober 1680) yang dipimpin oleh Jacob van Dyck, setelah bersulang untuk keselamatan Raja Belanda dengan anggur spanyol maka diserahkan surat keputusan pemerintah tertinggi Belanda untuk ketiga penguasa Cirebon disertai dengan hadiah-hadiah kepada mereka dan atasan mereka (para penguasa Cirebon), menjelang malam harinya Jacob van Dyck berlayar dengan dua buah kapal diikuti oleh perahu-perahu yang membawa para utusan Cirebon menuju keCirebon, iringan Jacob van Dyck sampai di pelabuhan Cirebon empat hari kemudian (tanggal 5 Januari 1681), iring-iringan Jacob van Dyck disambut oleh tembakan meriam dan kapten Joachim Michiefs yang telah terlebih dahulu ada di Cirebon.
Pada tanggal 4 Januari 1681, para penguasa Cirebon yakni Sultan Sepuh dan Sultan Anom dipaksa untuk membuat perjanjian bahwaCirebonmenjadi sekutu setia dariVereenigde Oostindische Compagnie.
Pada keesokan harinya tanggal 6 Januari 1681, diadakanlah upacara yang dihadiri oleh para penguasa Cirebon di alun-alun yang disertai tembakan meriam sebagai bentuk penghormatan, kemudian surat keputusan pemerintahan tertinggi Belanda yang dibawa dari Batavia pada tanggal 1 Januari 1681 tersebut dibacakan.
Pada tanggal 7 Januari 1681 dimulailah perundingan diantara para penguasa Cirebon dan pada malam harinya dicapailah kesepakatan untuk memberlakukan perjanjian antara Belanda dan Cirebon, Perjanjian tersebut kemudian ditandatangani oleh ketiga penguasa Cirebon.Pada perjanjian tersebut Belanda diwakili oleh komisioner Jacob van Dijk dan kapten Joachim Michiefs,perjanjian persahabatan yang dimaksud adalah untuk memonopoli perdagangan di wilayah Cirebon diantaranya perdagangan komoditas kayu, beras, gula,lada serta Jati sekaligus menjadikan kesultanan-kesultanan di Cirebon protektorat Belanda (wilayah dibawah naungan Belanda).
Perjanjian Belanda - Cirebon 1681 tersebut juga membatasi perdagangan, membatasi pelayaran penduduk dan memastikanVereenigde Oostindische Compagniememperoleh hak di sana
Sesudah kejadian tersebut, pemerintah Kolonial Belanda pun semakin dalam ikut campur dalam mengatur Cirebon, sehingga semakin surutlah peranan dari keraton-keraton Kesultanan Cirebon di wilayah-wilayah kekuasaannya. Puncaknya terjadi pada tahun-tahun 1906 dan 1926, di mana kekuasaan pemerintahan Kesultanan Cirebon secara resmi dihapuskan dengan disahkannya Gemeente Cheirebon (Kota Cirebon), yang mencakup luas 1.100 Hektare, dengan penduduk sekitar 20.000 jiwa (Stlb. 1906 No. 122 dan Stlb. 1926 No. 370). Tahun 1942, Kota Cirebon kembali diperluas menjadi 2.450 hektare.
Pada masa kemerdekaan, wilayah Kesultanan Cirebon menjadi bagian yang tidak terpisahkan dari Negara KesatuanRepublik Indonesia. Secara umum, wilayah Kesultanan Cirebon tercakup dalam Kota Cirebon dan Kabupaten Cirebon, yang secara administratif masing-masing dipimpin oleh pejabat pemerintah Indonesia yaitu wali kota dan bupati.
Kesultanan Cirebon sebagai pusat keagamaan Islam tercermin dari banyaknya karya seni dan sastra yang bernuansa Islami yang tumbuh seiring dengan perkembangan kesultanan Cirebon, naskah-naskah kuno Cirebon yang memuat tentang sastra biasanya ditulis dengan menggunakan aksara Pegon ataupunJawi. Berdasarkan isinya, naskah Cirebon bisa dikategorikan ke dalam tiga belas kategori yaitu, sejarah, silsilah, wayang sastra, ajaran agama, doa-doa, cerita islam, primbon, pengobatan, mantra, hukum, dongeng, legenda dan lainnya termasuk jimat, adat istiadat dan pelajaran asmara. Naskah kuno di Cirebon juga ada yang memuat tentangtasawufyang ditulis oleh ahli agama dari kalangan keraton yaitu pangeran Muhammad Nasiruddin (wangsakerta) dan pangeran Kaharuddin (arya Cirebon), selain di keraton, naskah kuno, mushaf al Qur'an dan kitab-kitab fiqih juga dapat ditemukan di pesantren-pesantren yang ada di wilayah kesultanan Cirebon, seperti di pesantren Buntet yang didirikan olehKiMuqoyyim yang merupakan seorangQadidarikesultanan Kanoman, oleh karena banyaknya naskah-naskah yang memuat tentang segala hal yang berkenaan dengan sendi kehidupan manusia dari mulai pelajaran agama, hukum hingga masalah asmara maka wilayah kesultanan Cirebon disebut sebagai pusatnya kebudayaan.
Panembahan Ratu II wafat pada 1677, terjadilah kekosongan kekuasaan selama 16 tahun. Pada masa ini Cirebon dalam pengaruh Mataram dan Banten. Pada 1678 Kesultanan Cirebon terpecah menjadi dua kerajaan yaitu Kasepuhan dan Kanoman. Karena terjadi perebutan kekuasaan atara kakak beradik, sebab itulah kerajaan baru tersebut disebut Kasepuhan (sepuh/tua) dan Kanoman (anom/muda).
Setelah pembagian Kesultanan Cirebon,Kasepuhandipimpin oleh anak pertama Panembahan Ratu II yang bernamaPangeran Syamsudin Martawijayayang kemudian dinobatkan sebagaiSultan Sepuh IsedangkanKanomandipimpin adiknya yang bernamaPangeran Muhammad Badrudin Kartawijayakemudian dinobatkan sebagaiSultan Anom I.