Alessandro Valignano

Alessandro Valignano, oValignani(Chieti,15 febbraio1539–Macao,20 gennaio1606), è stato ungesuita,scrittoreemissionarioitaliano,padre provincialeinIndiaed aMacao. Il suo nome cinese fuFan Li'An(范禮安,范礼安, Fàn Lǐ’ān).
Evangelizzatore delGiappone, in qualità di visitatore plenipotenziario vicario delPreposito generale della Compagnia di Gesùper l'Asiasotto ilpatronato regiodel Portogallo coordinò e sovrintese tutte le missioni gesuite in Oriente e ne istituì di nuove tra gli ultimi decenni del XVI secolo e l'inizio del XVII. Affidò la missione in Cina al suo ex allievoMatteo Ricci. Promosse il metodo catechistico dell'inculturazionenel continente asiatico.
Figlio di Giambattista Valignano membro di una delle più illustri famiglieteatine, quella deiValignani, e di Isabellade' Sangro (o di Sangro), nobildonna napoletana. Venne inviato presso l'università di Padovaa studiarediritto. La sua impronta aristotelica Valignano la formò «nell'ambiente filosofico dell'immanentismomaterialisticopatavino di cui era stato antesignano il filosofoPietro Pomponazzie che al suo tempo era stato illustrato da esponenti di notevole rilievo come loZabarellae ilCardano.»
Laureatosi, nel1557ottenne ilbeneficio dell'abbaziadi Santo Stefano del Casale e nel1559, grazie a papaPaolo IV, giàvescovo di Chietie amico di famiglia, ricevette uncanonicatodelcapitolocattedralediChieti; nel1561ebbe anche il beneficio dell'abbazia di Sant'Antonio.
Fallì il tentativo di impiegarsi presso lacuria romanaa causa della morte di papa Paolo IV. Tornò quindi aPadova.
Nel1562venne accusato (probabilmente ingiustamente) di aver pugnalato una donna, Franceschina Trona, e venne rinchiuso in un carcere aVeneziadal novembre 1562 al marzo 1564: venne liberato dallaQuarantia al Criminaldella Repubblica solo grazie all'intercessione dell'arcivescovo di Milano,Carlo Borromeoe delnunzio apostolicodi Venezia,Ippolito Capilupi, e comunque solo dopo essere stato condannato al risarcimento della presunta vittima con 200ducatied essere stato bandito per quattro anni dallaRepubblica di Venezia.
Nel1565si trasferì aRomae divenne "uditore" del Cardinale austriacoMark Sittich von Hohenems, cugino dell'arcivescovo Carlo Borromeo. Lì ebbe modo di conoscere da vicino laCompagnia di Gesùe rimase fortemente colpito dai racconti sullemissioni: l'anno seguente entrò nelnoviziatodiSant'Andrea al Quirinalee iniziò a studiarefilosofia,metafisicaoltre afisicaematematicaconCristoforo ClavioalCollegio Romano(oraPontificia Università Gregoriana). Lì scoprirà gliAnnales EcclesiasticidiCesare Baroniosull'interpretazione dei quali poggiò gran parte dei suoi futuri metodi missionari.
Nominato amministratore della casa di noviziato, continuò comunque gli studi e frequentò il corso diteologia(1569-1571), al termine del quale venneordinatosacerdoteinLaterano.
In seguito, ebbe diversi incarichi nellaCompagnia, visitòLoretoe l'Abruzzo, ove caldeggiò l'edificazione di uncollegiogesuita aChieti, governata dalla sua famiglia, che però fu istituito nel luglio1628, ventidue anni dopo la sua morte, grazie ai buoni uffici di Giovanni Andrea ed Ascanio, fratelli di padre Alessandro. Poi fu maestro dei novizi erettoredel Collegio dei Gesuiti diMacerata, dando altresì la sua disponibilità a partire missionario per le Indie. Nell'estate del1572, dopo che Valignano ebbe compiuta la professione del"quarto voto", ilPreposito generale della Compagnia di GesùEverardo Mercurianolo ritenne profilo idoneo al delicato e difficile incarico divisitatoregenerale delle missioni delleIndie Orientalicon facoltà di mandato in tutto l'ambito di competenza coloniale del Portogallo (patronato regio), cioè tutte le terre ad est diCapo di Buona Speranzafino all'arcipelago filippino, escluso perché di competenza spagnola. Il ruolo del Visitatore implicava poteri vastissimi di ispezione, organizzazione e gestione di tutte le missioni inAsiadei Gesuiti, con responsabilità divicariodel Preposito generale medesimo.
Valignano partì da Roma nel1573per ilPortogallo, da dove salpò a bordo di naveCostantina, nel marzo1574, sotto l'egida del regno lusitano e con al seguito 41 gesuiti, per la sede della, al tempo, unicaarcidiocesi metropolitanadell'Asia, lacoloniaportoghese diGoa, inIndia, ove giunse, dopo una infruttuosa breve sosta inMozambico, nell'agosto1574ed ove, nominato responsabileprovinciale, restò quattro anni. Creò una scuola diTamil, fondò una tipografia ove stampò laDottrina Cristianain Tamil, riorganizzò modernamente le missioni indiane creando seminari, parrocchie e confraternite ed edificò nuove residenze gesuite; pur essendo figlio del suo tempo, (seppur in modo lieve, Valignano non era esente, come all'epoca tutti in occidente ed in oriente, di stimare i popoli in base alle "razze") adottò una strategia fondamentale per ilproselitismocattolico, l'adattamento, facendo un compromesso con le usanze locali, e ciò pur non reputando gliindianiuna popolazione idonea ad esercitare il cattolicesimo e ancor meno iministericattolici; fu la prima sua applicazione di unametodologiache evolse nel futuro. LasciataGoa, visitò le missioni dei gesuiti in India,Malaysia,MoluccheeMacao, piccola colonia portoghese in terra cinese, dove giunse nel1578e dove successivamente fondò, nel1594, ilCollegio dei gesuiti di San Paolo, primauniversitànell'estremo oriente e punto di riferimento per la Compagnia di Gesù in Asia.
Stabilitosi aMacao, Valignano subito notò che nessunmissionarioera riuscito ad insediarsi nell'impero cinese. Al fine di intraprendere unamissione in Cina, dopo aver dovuto rinunciare a padre Bernardino de Ferraris, già impegnato come rettore aCochin, in India, convocò per quello scopo uno studioso gesuita, ilsinologoMichele Ruggierie, su richiesta di questi, vista l'immane impresa, convocò ancheMatteo Ricci, matematico, anch'egli sinologo e suo ex allievo in Italia, che si unì a Ruggieri nel 1582.
Valignano supervisionò sempre la missione inCinané fece mai mancare il suo sostegno: subito, nel1582, dovette opporsi, con successo, al gesuita Alonso Sanchez che sosteneva gli spagnoli e li invitava ad invadere militarmente la Cina partendo dalleFilippine, nonostante laCinafosse zona d'influenza portoghese, approfittando dellatemporanea unificazione delle corone di Spagna e Portogallo; nel1588, scontento dell'impostazione di Ruggieri, lo allontanò lasciando la missione all'operato di Ricci; nel1592convocò Ricci aMacao, discusse per due mesi con lui sull'"adattamento"da applicare in Cina e gli consegnò la direttiva missionaria; nel1593approvò lemetodologiecatechistichedi Ricci spronandolo a recarsi aPechino; nel1597nominò Ricci Superiore della missione e, dopo che riuscì a presentarsi acortenel1601, nel1604lo nominòSuperiore provincialedella nuovaProvinciadi Cina, che aveva appena scorporato dalla Provincia di Macao.
Nel1580, giunto inGiappone, Valignano riuscì a farsi assegnare, daldaimyōconvertitoŌmura "Bartolomeo" Sumitada, lagestionedel porto diNagasaki(già utilizzato da anni dai portoghesi). Sumitada, isolato dai suoi stessi parenti, era pressato dai clanMatsuuraeArimae, militarmente, dalla crescente potenza diRyūzōji Takanobu, daimyō diHizen. Pur cosciente che avrebbe comunque perso poteri e privilegi feudali, cedendo ufficialmente sia l'abitato che la gestione del porto ai gesuiti si assicurò la protezione dell'impero portoghesee sottrasse la struttura a Takanobu, consapevole che questi, non conoscendo la potenza effettiva degli europei, non avrebbe osato attaccarli. Valignano trasformò il porto di pescatori in porto commerciale, sviluppando enormemente il traffico merci con Macao, anch'essa gestita dai gesuiti perconcessioneportoghese, e con i cui proventi finanziò le missioni in Asia. Rapidamente Valignano riuscì ad imbastire linee navali di interscambio di merci tra Cina e Giappone, soprattutto per l'interscambio tra lasetacinese e l'argento giapponese, con unprofitto, per i commercianti, del 70% del valore, il 5% del quale veniva riconosciuto ai gesuiti, che ottennero anche la salvaguardia del risarcimento delle loro quota in caso di merci perdute. Il tutto oltre, ovviamente, ai diritti portuali ed aidazidiimportazioneche Valignano incrementò notevolmente. Malgrado reiterati divieti formali delle autorità giapponesi, si incrementò anche latratta degli schiavi, tollerata dai Gesuiti (Bolledei papiNiccolò V,Callisto IIIeSisto IV), e pratica all'epoca normale per i portoghesi e per i giapponesi.Nonostante il riconoscimento dell'importo dei dazi a Sumitada, fino alla fine del '500 la missione in Giappone fu considerata, economicamente, la più importante in assoluto per la Compagnia di Gesù (L'attività mercantile portuale, così sfacciatamente gestita in modo diretto dai gesuiti, non fu gradita dalla Santa Sede, fomentata dalle altre congregazioni e dai commercianti esclusi dall'affare; tuttavia i proventi di tale attività, e nonostante i fondi garantiti comunque dal patronato regio portoghese, mantenevano di fatto l'intero impianto missionario in Giappone, in forte sviluppo, ed aiutavano nel resto dell'Asia, per cui Valignano, con molto tatto, ignorò le raccomandazioni e gli ordini da Roma rassicurando sull'assoluta transitorietà e necessità contingente dell'impresa).
Sempre nel1580, grazie agli ottimi rapporti con il potentissimo daimyо̄Oda Nobunaga, Valignano si fece donare un terreno per la fondazione di unseminarioadAzuchipresso illago Biwa, poi affidato al confratelloOrgantino Gnecchi Soldo(Nobunaga chiese a Valignano di cedergli il suo cameriere-guardia del corpo africanoYasukein qualità dibushi, cioè guardia personale, e che poi, tramite il daimyō, fu forse promossohatamotonell'accezione ante seicentesca, cioè servitore degno di impugnare due spade). Per emulazione altri signori convertiti, con altre loro donazioni, permisero la creazione di un seminario ad Arima (zonaShimabara, un exmonasterobuddistache Valignano lasciò inalterato anche negli arredi per integrare meglio i seminaristi), un noviziato aUsukie un collegio intitolato a San Paolo a Funay (entrambi nei pressi dell'attualeŌita). I seminari furono attentamente progettati in adattamento culturale per fondere la sensibilità giapponese con l'impianto ideologico e filosofico europeo cercando di replicare l'istituzione giapponese del"dojuku", il noviziato monastico buddista.
A fine1581padre Valignano poté già creare la vice Provincia gesuita del Giappone.
Valignano, che organizzò personalmente la missione inGiappone, vi si recò in tre occasioni, nel1579fino al1583, nel1590fino al1592e nel1598fino a tutto il1603; il ruolo di Visitatore, infatti, lo costringeva a viaggi per ispezioni e gestione dei problemi nelle varie missioni gesuitiche in tutta l'Asia.
Valignano aveva intuito l'importanza di mantenere saldo il rispetto della cultura locale, verso la quale nutriva un'altissima considerazione, e raccomandò con insistenza i propri confratelli ad apprendere usi e costumi dei paesi che li ospitavano.
In Giappone la predicazione delcattolicesimodiede ottimi frutti e produsse una significativa comunità cristiana, radicata nella fede e nella cultura locale: Valignano apprese lalingua giapponeseed obbligò tutti i confratelli europei a seguirne un corso biennale, curò personalmente la diffusione dellastampadelle belle arti occidentali; introdusse lastampa a caratteri mobiliin Oriente, anche in caratteri giapponesi, con la tipografia da lui fondata a Kazusa (provincia diHizen) ed affidata al confratello Giovanni Battista Pesce, riuscendo ad avere ladispensa pontificiadalla necessità dell'ImprimaturdellaSanta Inquisizionedi Goa per tutte le proprie stampe. Redasse la prima grammatica e il primo vocabolario di conversione linguistica con il giapponese, con ben 32.798 voci, con la collaborazione di padre Antonio Prenestino, e commissionò allo storico missionarioLuis Froisla scrittura della storia della missione in Giappone.
Fondò chiese, collegi (quattro seminari e scuola di belle arti occidentali come musica e pittura, quest'ultima affidata a padre Giovanni Cola, pittore) e ospedali; tramite il vescovo coadiutore Luis Cerqueira, succeduto in Funay dal 1598 al titolare Martins, deceduto, (Macao era diocesidal 1576, eFunayfu scorporata da essa nel 1588),permise l'ordinazione presbiteriale, assoluta novità, di sacerdoti indigeni: Valignano stimava molto il popolo giapponese e riteneva indispensabile la creazione di unclerolocale per radicare il cristianesimo. Nei collegi, seminari e noviziati si seguiva lo stesso programma di studi adottato aRoma, aParigio aCoimbracon la sola sostituzione dellatino(comunque studiato ai fini sacramentali) colgiapponese, in più Valignano fu il primo che adottòstudicomparatiin Giappone combinando gli studi deiclassici giapponesiecinesicon gli studiumanisticieuropei.
Dopo il suo"Catechismus Iaponensis"del1580redasse nel1581il"Cerimoniale per i missionari in Giappone", vero e proprio manuale dei concetti di"inculturazione"e di"adattamento", di sua ideazione, affinché i propri confratelli missionari in Asia potessero giovarsene, al fine di proseguire nell'evangelizzazione senza intaccare o offendere i principi millenari dellatradizioneeculturalocali, rendendo nel contempo comprensibile ilCristianesimosenza falsarne ladottrina.
Il testo prodotto era connesso ad un aspetto della cultura italiana delRinascimentocostituito dall'elaborazione dicodici di comportamentovalidi entro determinati contesti, individuando con essi una nuova personalità che favorisse la capacità di adattamento flessibile agli altri. In tal modo Valignano, culturalmente debitore dellatradizionediBaldassarre CastiglioneeGiovanni Della Casa, sperava di ottenere un equilibrio fra due culture diversissime, la cultura occidentale e quella nipponica. Valignano poneva l'accento sull'importanza di approfondire la conoscenza di aspetti religiosi ma anche artistici, linguistici e letterari delle diverse culture, nonché degli usi e dei costumi, tenendo ben fermi quattro cardini di comportamento: autorità, rispetto, amore e confidenza. Di conseguenza, abbandonando l'approccioeurocentrico, prevedeva di conformarsi al luogo, alle persone, al tempo e alle circostanze con le quali si aveva a che fare, compresi, in primis, la lingua, da imparare, e quindi le regole di etichetta da osservare, la cura del proprio corpo e della propria immagine, fino a corrispondere con gli ospiti locali le espressioni, le gestualità e gli stati d'animo. L'ignoranza delle diversità avrebbe senza meno condotto ad equivoci tra persone di diversa provenienza e cultura. Valignano ebbe a scrivere nel 1580:"[...] Pertanto né in India né in Europa le condizioni giapponesi possono essere ben giudicate o definite, e nemmeno comprese o immaginate così come stanno accadendo. Perché qui c'è un modo molto diverso di andare avanti e usanze e leggi diverse. Molte cose che in Europa sono apprezzate come segno di cortesia e onore sono grandi e gravi insulti e molte altre cose che sono così comuni qui che non si può vivere e negoziare con i giapponesi senza, che si applichino in Europa come indelicate e non adatte." "Sono tanto padroni delle loro passioni che, sebbene le sentano nell'interno (honne), non le danno a vedere al di fuori (tatemae) [...]" "Non raccontano i loro guai come sogliono fare i nostri europei, merceghé tengono per principio che, visitando alcuno, non gli se deve dire cosa che possa affliggerlo [...] colla professione che fanno di sapere soffrire ogni molestia e di ostentare coraggio nell'avversità [...] incontrandosi con altri danno sempre a vedere animo grande e viso allegro." "[...] pur covando nel cuore crudelissima nimicizia, ostentano scambievolmente allegro sembiante [...]". Alla luce di ciò, soprattutto i concetti di "esame di coscienza" e di "confessione" si dimostravano particolarmente estranei alla cultura giapponese, tendente alla soppressione e occultamento delle emozioni, così come, d'altro canto, ilculto degli antenatie l'importanza data ai beni materiali nelle culture orientali mal si confacevano con la dottrina cristiana. Persino il concetto di vita religiosa in Giappone non era considerato completamente separato dalla vita secolare ma poteva esserne una tappa, cosa normale nel buddismo, quindi nella cultura preesistente, ma era del tutto avulso dall'enfasi cattolica sul sacerdozio eterno. Chiaro quindi che Valignano ritenesse indispensabile, per l'evangelizzazione dei popoli orientali, seguire le orme diPaolo di Tarso, che al suo tempo dovette affrontare un mondopaganoepoliteista, e come esso seguire il sottilissimo crinale tra l'inculturazione e ilrelativismoculturale, con il costante rischio che questo avrebbe potuto sovrapporsi alladottrina, soffocandola.
Valignano diffuse la suametodologianel1586scrivendo il"Catechismus Christianae fidei", libro di testo per gli studenti giapponesi ai seminari. Nel1592sostituì il"Cerimoniale"con il più aggiornato e sintetico"Libro delle Regole".
Questi aspetti delcatechismodi Valignano lo posero in rotta di collisione con iFrancescanied iDomenicani, che predicavano la supremazia dellaculturaoccidentalee la necessità che tutti dovessero piegarsi alla più rigorosaortodossiareligiosa e agli usi e costumi nonché alle regole civili vigenti in Europa. 
Se a ciò si aggiunge che, all'epoca, l'appartenenza politica dei gesuiti era per le colonizzazioniportoghesimentre francescani e domenicani parteggiavano per la rivaleSpagna, si capisce come il confronto dottrinale e il tentativo di ostacolarsi a vicenda anche a livello di missioni fosse anche strumentale e violento nonché particolarmente delicato anche per ilpapato.
Saranno queste le cause del vero e proprio conflitto dottrinale, laControversia dei riti cinesiche, con altri motivigeopolitici, provocò quegli insuccessi missionari in Asia che andavano profilandosi.
Fu proprio per eliminare l'eccessiva personalizzazione dellecongregazionisulle missioni, con tutto quel che ne conseguiva, che dopo pochi anni,papa Gregorio XVdecise di creare, con laBolla"Inscrutabili divinae"del 22 giugno1622, un appositoentesotto il suo stretto controllo che si occupasse diprepararee quindi coordinare e gestire le missioni nel mondo, laSacra congregazione"de Propaganda Fide"(o più semplicemente"Propaganda Fide"), attualeDicastero per l'evangelizzazione.
Valignano ebbe netti contrasti anche con il gesuitaFrancisco Cabral, Superiore della vice Provincia del Giappone, che consideravaortodossie adeguati i metodi di evangelizzazione, sprezzanti per i locali, dell'impostazione domenicana, e li applicava. In breve, nel1580, su richiesta dello stesso Cabral, Valignano lo sollevò dall'incarico sostituendolo con padre Gaspar Coelho cui attribuì dignità di Superiore della missione in Giappone e vice-Provinciale.
Il grande progetto di evangelizzazione necessitava di nuove sovvenzioni per la costruzione di chiese ed infrastrutture. A tal fine Valignano pensò di rendere omaggio alponteficeinviando una ambasceria giapponese inEuropa(poi nota comeambasciata Tenshō) che dimostrasse sia la raffinatezza dei modi e costumi nipponici, sfatando radicati stereotipi, sia il valido percorso intrapreso dalla missione. Contestualmente, al ritorno degli ambasciatori, i loro resoconti avrebbero contribuito ad attenuare il sempre presente senso di superiorità nipponico. In accordo con i"daimyō"cristianiŌtomo Sōrin,Ōmura SumitadaeArima Harunobu, Valignano scelse quattro giovani seminaristi giapponesi di nobile stirpe:Itō Mancio, Michele Chijiwa,Giuliano Nakaurae Martino Hara. Partirono nel1582con un piccolo gruppo di accompagnatori e con l'interprete gesuita Diogo de Mesquita, fecero tappa a Macao,Cochine Goa approdando aLisbonanel1584. Valignano, avuto l'ulteriore incarico di superiore Provinciale delle Indie (che lascerà nel1587), non poté accompagnarli. Visitarono ilPortogalloe laSpagnaove furono ricevuti dal reFilippo II, sovrano di entrambe le corone.
Successivamente raggiunsero L'Italia sbarcando aLivornonel1585ove, accompagnati dal granducaFrancesco I de' Medici, visitaronoFirenze,PisaeSiena. Chiamati dal pontefice incontraronoPapa Gregorio XIIIe, alla morte di questi, anchePapa Sisto Vche li onorò della cittadinanza romana e donò loro lachiesa di Santa Maria dell'Orto, tuttora la chiesa di riferimento per la comunità giapponese in Italia. Successivamente gli ambasciatori fecero tappa aNapoli,Ferrara(accolti dal ducaAlfonso II d'Este),Venezia,Mantova,MilanoeGenova, da dove si imbarcarono per il viaggio di ritorno. La loro presenza in Europa fu un vero e proprio evento ed ebbe grande notorietà. Gli ambasciatori giunsero in Giappone nel1590dopo quattro anni di viaggio, in totale la visita in Europa durò oltre otto anni. Furono accolti da eroi, ma ormai il clima politico in Giappone, per i cattolici, era cambiato.
Rispetto alla Cina, ove Matteo Ricci operava su una base statuale solida e tranquilla, la situazione politica in Giappone era molto instabile. L'istituzione imperiale, all'epoca, esisteva sulla carta, il vero potere era detenuto daifeudatari in continuo scontroper il predominio. I giapponesi erano consci delle loro dimensioni territoriali, del loro livellodemograficoe della debolezza militare, soprattutto nella marina da guerra, costituita perlopiù da fortezze galleggianti ben armate e corazzate ma pesantissime, lente ed adatte alla sola difesa costiera e per il resto da naviglio leggero, veloce ma inadeguato al combattimento (solo nel 1604 lo "shōgun" Tokugawa cominciò a porvi rimedio commissionando navi di tipo occidentale al navigatore britannicoWilliam Adamsdivenuto suo consigliere). Il timore di invasione, prima religiosa ed a seguire commerciale ed infine militare da parte delle potenze europee, terrorizzava i signori locali, e cominciavano ad avvertirsene i prodromi. Peraltro molti potenti daimyо̄ erano convertiti, spesso solo perché li faceva preferire nei rapporti economici con gli europei, e ciò li rendeva sospetti di possibili tradimenti in eventuali collusioni politiche e militari con gli stranieri.
Già all'alba dell'ultimo decennio del Cinquecento l'ostilità delle istituzioni verso gli stranieri cominciò a manifestarsi con le prime persecuzioni contro i cristiani, sospettati di essereteste di ponteper la conquista europea del Giappone. Ed i sospetti delle istituzioni nipponiche erano fomentati e alimentati dagli stessi occidentali (portoghesi, spagnoli, inglesi e, soprattutto, olandesi) che reciprocamente si denigravano e calunniavano, cercando di mettersi l'un l'altro in cattiva luce, agli occhi dei nativi, per motivi di interessi commerciali o religiosi (l'unificazione dei regno portoghese sotto l'egida del regno spagnolo portò ad un rapido cambio di alleanze politiche e commerciali, per cui gliinglesie gliolandesi, alleati dei portoghesi quand'erano indipendenti, divennero di colpo loro nemici e concorrenti commerciali colregno iberico unificato).
Lareazione dei giapponesimontò rapidamente, per paura. Ne avevano ben donde del diffidare degli occidentali, considerato, per esempio, quel che successe all'India pochissimi anni dopo, con laCompagnia inglese delle Indie Orientaliprima e con ilRajdopo. L'obbiettivo diventò eliminare tutto ciò che non fosse giapponese ed isolare quasi del tutto l'Impero al fine di proteggerlo, impresa che, in pochi decenni, riuscì, (Sakoku1641) nonostante i tentativi di rivolte, soffocati nel sangue (Rivolta di Shimabara1637).
La persecuzione contro i cristiani, avviata nel1587daToyotomi Hideyoshi, e nei decenni seguenti facilitata, su specifico ordine, dalle delazioni deimonaci buddisti, distrusse quasi completamente la fiorente cristianità giapponese: il numero deimartiri, nelle sole esecuzioni, toccò il numero di 1 200 (ma altre fonti parlano di 1 600). Dopo il doloroso episodio dimostrativo deiventisei martiri, nel1597, Valignano dovette accorrere in Giappone, in incognito, nell'agosto del1598, dopo essere mancato oltre cinque anni durante i quali svolse il compito di Visitatore in altre missioni (dal marzo1595all'aprile1597, visitò l'India, e, in un nuovo aperto contrasto coll'ivi padre provinciale Francisco Cabral, rimise l'incarico di Visitatore per le Indie, mantenne l'incarico per il solo estremo oriente e tornò a Macao).
Approfittando della morte di Hideyoshi nel1598e con l'importante aiuto del vescovo gesuita Luis Cerqueira, riuscì in parte a riparare gli enormi danni derivanti dalla predicazione catechistica dei francescani, arrivati dalle Filippine in sua assenza, che propugnava un sistema di vita e di comportamento, nonché di animo penitente e povertà materiale del tutto avulso se non opposto alla millenaria realtà culturale nipponica, orgogliosa, tesa a reprimere i sentimenti ed a ostentare, come ovunque in Oriente, bellezza e ricchezza personale. A ciò si aggiunga che tale predicazione, rivolta direttamente al popolo scavalcando il controllo della nobiltà, in una società giapponese ancora rigidamente feudale e sempre più bloccata in caste sociali, era una cosa inaccettabile per la perdita di prestigio del signore e il rischio di possibili rivolte che poteva provocare (con il regno iberico unificato il Papa non ebbe alcuna remora derivante dalla politica internazionale all'accontentare le congregazioni che insistevano per recarsi in Giappone). Valignano riaprì collegi e seminari chiusi da Hideyoshi, trasferendoli prudenzialmente con l'aiuto di daimyо̄ ben disposti, ne fondò altri, battezzò moltissimi nuovi convertiti e iniziò la scrittura dell'opera"Principio e progresso de la religion christiana en Jappon"per sostituire l'analoga opera del suo segretario Froìs che non lo soddisfaceva. Scrisse solo il primo dei cinque libri previsti: alla salita al potere diIeyasu Tokugawacon la carica di"shōgun"(inizialmente benevolo verso i cattolici ma poi fomentato negativamente dai protestanti olandesi e daWilliam Adamsavventuriero britannico al soldo degli olandesi, nemico di lunga data dei cattolici, che lo avrebbero voluto messo a morte come traditore ed eretico, degli spagnoli e dei portoghesi, che lo bandivano come un corsaro avverso, naturalizzato giapponese e divenuto consigliere di Ieyasu Tokugawa) Valignano dovette, nel1604, tornare definitivamente a Macao.
A seguito della repressione ormai decisa da Ieyasu Tokugawa, inasprita dai discendenti e che durò decenni, i pochi cristiani rimasti furono costretti alla clandestinità (kakure kirishitan).
Il metodo di Valignano, avversato da altri missionari (soprattutto francescani e domenicani), che consideravanoidolatricheesincretistichele pratiche tradizionali delle popolazioni orientali, venne definitivamente abbandonato nel1742, quando, con le bolle "Ex quo singulari" e, due anni dopo, "Omnium solicitudinum",papa Benedetto XIV(particolarmente vicino alle tesi dello storico e presbiteroLudovico Antonio Muratoriesplicitate nelle opere "De Superstitione Vitanda" ed altre, tra cui la successiva "De regolata devotione de' cristiani") proibì ai neoconvertiti la pratica dei cosiddettiRiti Cinesi. Già però la"Propaganda Fide", dalla sua fondazione nel 1622, anche aggirando le stringenti norme delpatronato regioper mezzo dell'invio divicari apostolici, aveva adottato un criterio di evangelizzazione più rigido ed eurocentrico, isolando sempre più la Compagnia di Gesù.
Si dovette aspettare il secolo XXe il decretoAd Gentesdel1965a conclusione delConcilio Ecumenico Vaticano IIperché tutta la Chiesa si rendesse conto, anche se, ovviamente, con un'analisi più evoluta e moderna, dell'importanza dell'inculturazione, a suo tempo intuita ed applicata dal Valignano, come necessità assoluta per l'incontro fra i popoli e il Vangelo e, ancora più recentemente, come metodoantropologico(a cui fondere in questo contesto anche il concetto diacculturazione) efficace per rapportarsi con altre culture in ogni campo delle relazioni umane.
I metodi di Valignano, poi adottati, tra gli altri, anche da Matteo Ricci eRoberto de Nobili, dovettero essere abbandonati, sostituiti da rigide regole diconversione religiosache non diedero molti frutti nell'evangelizzazione dell'Asia.
Alessandro Valignano morì il 20 gennaio1606aMacao, all'età di sessantasei anni, per un letale aggravamento dellagottadi cui soffriva, giusto prima di poter partire per la Cina, ove l'allievo Matteo Ricci l'attendeva per mostrargli i progressi conseguiti.
Oltre l'università a Macao e le tipografie, la sua eredità missionaria in Giappone prima della repressione fu di 150000 convertiti, 200 chiese edificate, 600 trapresbiterieaccolitilocali, scuole, ospedali, quattroseminaried il porto commerciale di Nagasaki che sopravvisse e fu utilizzato dagli unici europei ammessi in Giappone dopo ilsakoku, gliolandesi(che stavano soppiantando i portoghesi nei commerci e nelle colonie asiatiche e,calvinisti, non presentavano mire religiose recepite come pericolose dai potentati locali).Del Valignano Matteo Ricci ebbe a scrivere al Preposito generaleClaudio Acquaviva:"Quest'anno, oltre agli altri travagli che mai ce ne mancano, avessimo questo molto grande della morte del padre Valignano, padre di questa missione, con la perdita del quale restassimo come orfani, e non so con cheVostra Paternitàce la possa ristorare [...] fu notato da tutti aver Iddio permesso che questo regno non potesse godere dell'aiuto di due grandi servi di Iddio, ilBeatopadreFrancesco Saverioet il padre Alessandro Valignano, che desiderarono tanto entrare in questo regno per il bene di tante anime, et ambedue morirono alla porta di esso senza potere porre in opera il loro desiderio".
Padre Alessandro Valignano venne sepolto a Macao, nellachiesa della Mater Dei, adiacente al collegio da lui fondato.
Lo storico gesuita statunitense Thomas J. Campbell, già docente e presidente del St. John's College (oraFordham University, NYC), nel suo trattato"I gesuiti 1534-1921"lo definì"il più grande uomo delle missioni in Oriente dopo Francesco Saverio".