উদ্ভিদবিজ্ঞানের ইতিহাস

উদ্ভিদবিদ্যার ইতিহাস উদ্ভিদবিজ্ঞানের ঐতিহাসিক বিকাশের সন্ধান করে পৃথিবীতে জীবনকে বোঝার জন্য মানুষের প্রচেষ্টাকে অধ্যয়ন করে।
প্রাথমিক উদ্ভিদবিজ্ঞান শুরু হয়েছিল প্রয়োগভিত্তিক উদ্ভিদ সম্পর্কিত জ্ঞান দিয়ে, যা প্রজন্মের পর প্রজন্মে মৌখিকভাবে পুরা প্রস্তর যুগের শিকারি-সংগ্রাহকদের মধ্যে প্রচারিত হতো। প্রথম লেখালিখি, যা মূলত উদ্ভিদ সম্পর্কে মানুষের কৌতূহল প্রকাশ করে, প্রাচীন গ্রীস এবং প্রাচীন ভারতে পাওয়া যায়।
প্রাচীন গ্রীসে, ৩৫০ খ্রিস্টপূর্বাব্দে অ্যারিস্টটলের ছাত্র থিওফ্রাস্টাসের শিক্ষাপ্রদানকে পশ্চিমা উদ্ভিদবিদ্যার সূচনা বিন্দু বলে মনে করা হয়। প্রাচীন ভারতে, পরাশরের নামে পরিচিত বৃক্ষায়ুর্বেদ উদ্ভিদবিজ্ঞানের বিভিন্ন শাখা বর্ণনা করা প্রাচীন গ্রন্থ হিসাবে বিবেচিত হয়।
ইউরোপে, উদ্ভিদবিজ্ঞান মধ্যযুগীয় সময়ে উদ্ভিদের ঔষধি গুণাবলীর প্রতি মনোযোগের দ্বারা ছায়াচ্ছন্ন হয়ে পড়ে, যা এক হাজার বছরেরও বেশি সময় ধরে স্থায়ী ছিল। এই সময়ে, শাস্ত্রীয় প্রাচীন যুগের ঔষধি কাজগুলি পাণ্ডুলিপি এবং হারবালস নামে পরিচিত বইয়ে পুনরুত্পাদিত হয়েছিল। চীন এবং আরব বিশ্বে, গ্রীক-রোমান ঔষধি উদ্ভিদ সম্পর্কিত কাজগুলি সংরক্ষণ করা হয়েছিল এবং আরও প্রসারিত হয়েছিল।
ইউরোপে ১৪ থেকে ১৭ শতকের পুনর্জাগরণ যুগে একটি বৈজ্ঞানিক পুনরুজ্জীবনের সূচনা হয়, যার মাধ্যমে উদ্ভিদবিদ্যা ধীরে ধীরে প্রাকৃতিক ইতিহাস থেকে পৃথক হয়ে স্বতন্ত্র বিজ্ঞান হিসেবে আত্মপ্রকাশ করে, যা চিকিৎসা ও কৃষি থেকে স্বতন্ত্র। হারবালস-এর পরিবর্তে ফ্লোরাস নামে বই প্রকাশিত হয়, যা স্থানীয় অঞ্চলের দেশীয় উদ্ভিদসমূহের বিবরণ দেয়। অণুবীক্ষণ যন্ত্রের আবিষ্কার উদ্ভিদ অঙ্গসংস্থানবিদ্যার অধ্যয়নকে উৎসাহিত করে এবং উদ্ভিদ শারীরবিদ্যার প্রথম সযত্নে পরিকল্পিত পরীক্ষা-নিরীক্ষা করা হয়। ইউরোপের বাইরে বাণিজ্য ও অভিযানের প্রসারের সাথে সাথে, নতুন আবিষ্কৃত উদ্ভিদের নামকরণ, বিবরণ ও শ্রেণীবিভাগের ক্রমবর্ধমান প্রক্রিয়া শুরু হয়।
ক্রমবর্ধমান উন্নত বৈজ্ঞানিক প্রযুক্তি উদ্ভিদবিজ্ঞানের একাধিক আধুনিক শাখার বিকাশে সহায়ক হয়েছে, যা উদ্ভিদ বিজ্ঞানের বিভিন্ন প্রয়োগক্ষেত্রকে অন্তর্ভুক্ত করে, যেমন অর্থনৈতিক উদ্ভিদবিদ্যা (বিশেষ করে কৃষি, উদ্যানবিদ্যা এবং বনবিদ্যা) থেকে শুরু করে উদ্ভিদের গঠন, কার্যকারিতা এবং পরিবেশের সঙ্গে তাদের আন্তঃক্রিয়ার বিস্তৃত বিশ্লেষণ। এই বিশ্লেষণ উদ্ভিদ ও উদ্ভিদ সম্প্রদায়ের বৈশ্বিক গুরুত্ব (জীবভূগোল এবং পরিবেশবিদ্যা) থেকে শুরু করে কোষতত্ত্ব, আণবিক জীববিদ্যা এবং উদ্ভিদ জীবরসায়নের মতো তুলনামূলক ক্ষুদ্র পরিসরের বিষয়গুলোর দিকেও বিস্তৃত।
যাযাবর মানুষ তাদের উদ্ভিদ সম্পর্কিত জ্ঞান (তাদের প্রায়োগিক পর্যবেক্ষণ) মৌখিক ঐতিহ্যের মাধ্যমে প্রজন্ম থেকে প্রজন্মে দিয়ে করত। তারা যেসব উদ্ভিদ খাবার, আশ্রয়, বিষ, ওষুধ আচার-অনুষ্ঠানের জন্য ব্যবহার করত, সেইসব উদ্ভিদের ব্যবহার তাদের দ্বারা প্রতিষ্ঠিত স্থানীয় শ্রেণীবিভাগে (ফোক-ট্যাক্সোনমি) প্রতিফলিত হত। এইরকম সমাজে উদ্ভিদগুলোর ব্যবহার তাদের দৈনন্দিন কথোপকথনে তাদের শ্রেণীবিন্যাস এবং নামকরণের উপায়কে প্রভাবিত করত। প্রায় ১০,০০০ থেকে ২,৫০০ বছর আগে পর্যন্ত বিস্তৃত নিওলিথিক বিপ্লবের সময়ে, যখন পৃথিবীর প্রায় ১২টি অঞ্চলে স্থায়ী সমাজ গড়ে উঠল, তখন যাযাবর জীবনযাত্রায় ব্যাপক পরিবর্তন ঘটে। এই সমাজগুলির বিকাশের সাথে উদ্ভিদ ও প্রাণীকে গৃহপালিত করার জন্য প্রয়োজনীয় প্রযুক্তি এবং দক্ষতা বিকশিত হয়। সেই সাথে লিখিত ভাষার উদ্ভব ঘটে, যা পরবর্তী প্রজন্মের কাছে নিয়মতান্ত্রিক জ্ঞান ও সংস্কৃতি হস্তান্তরের মাধ্যম হিসাবে কাজ করে।
নিওলিথিক বিপ্লবের সময় উদ্ভিদ সম্পর্কিত জ্ঞান বিশেষ করে খাদ্য ও ঔষধ হিসেবে উদ্ভিদ ব্যবহারের মাধ্যমে ব্যাপকভাবে বৃদ্ধি পায়। আধুনিক সময়ের সকল মৌলিক খাদ্য প্রাগৈতিহাসিক কালে ধীরে ধীরে উচ্চ ফলনশীল জাতের নির্বাচন প্রক্রিয়ার মাধ্যমে গৃহপালিত হয়েছে, যা সম্ভবত অজানা অবস্থায় শতাব্দী থেকে সহস্রাব্দের মধ্যে ঘটেছে। সমস্ত মহাদেশে মটরশুটি চাষ করা হলেও, প্রধান খাদ্যের মধ্যে শস্যগুলি ছিল প্রধান: পূর্ব এশিয়ায় চাল, মধ্যপ্রাচ্যে গম ও বার্লি, এবং কেন্দ্রীয় ও দক্ষিণ আমেরিকায় মাক্স। গ্রীক-রোমান সময়ে, বর্তমানের জনপ্রিয় খাদ্য উদ্ভিদ, যেমন আঙ্গুর, আপেল, রুই, এবং জলপাই, প্রাচীন পাণ্ডুলিপিতে নামকৃত জাত হিসেবে তালিকাবদ্ধ হয়েছিল। বিশেষজ্ঞ উইলিয়াম স্টিয়ার্ন পর্যবেক্ষণ করেছেন যে "গৃহপালিত উদ্ভিদ মানবজাতির সবচেয়ে মূল্যবান এবং অমূল্য ঐতিহ্য, যা প্রাচীনকাল থেকে এসেছে"।
নিওলিথিক যুগ, আনুমানিক ৩০০০ খ্রিস্টপূর্বাব্দ, থেকে আমরা প্রথম পরিচিত উদ্ভিদের চিত্র দেখতে পাই। তবে প্রোটোবটানি, অর্থাৎ উদ্ভিদের প্রথম প্রাক-বৈজ্ঞানিক লিখিত রেকর্ড, খাদ্য থেকে শুরু হয়নি; ঔষধি সাহিত্য থেকে শুরু হয়। অ্যালান মোর্টন উল্লেখ করেছেন যে কৃষি ছিল দরিদ্র ও অশিক্ষিত মানুষের পেশা, যেখানে চিকিৎসা ছিল সামাজিকভাবে প্রভাবশালী শামান, পুরোহিত, ঔষধি বিশেষজ্ঞ, যাদুকর এবং চিকিৎসকদের দায়িত্ব, যারা তাদের জ্ঞান ভবিষ্যতের জন্য সংরক্ষণ করতে অধিক আগ্রহী ছিলেন।
প্রাচীন ভারতীয় গ্রন্থ যেমন বেদে বিভিন্ন গুণাবলীসম্পন্ন উদ্ভিদের উল্লেখ রয়েছে। সুশ্রুত সংহিতা গ্রন্থে ৭০০টিরও বেশি ঔষধি উদ্ভিদের তালিকা রয়েছে। এটি প্রাচীন মিশরের মতোই উন্নত চিকিৎসা জ্ঞানকে প্রতিফলিত করে। এখানে খাদ্য উদ্ভিদকে তাদের ব্যবহৃত অংশ, স্বাদ এবং খাদ্যগত প্রভাবের ভিত্তিতে শ্রেণীবদ্ধ করা হয়েছে। চরক সংহিতা হলো আরেকটি প্রাথমিক আয়ুর্বেদিক গ্রন্থ, যা ভারতে উদ্ভিদের প্রথম পরিচিত শ্রেণীবিন্যাস পদ্ধতি উপস্থাপন করে। এই গ্রন্থে উদ্ভিদকে আবাসস্থল, ফুল বা ফলের উপস্থিতি এবং প্রজনন পদ্ধতির উপর ভিত্তি করে শ্রেণীবদ্ধ করা হয়েছে।
প্রাচীন চীনে, বিভিন্ন উদ্ভিদ ও ঔষধি মিশ্রণের তালিকা ওষধি উদ্দেশ্যে কমপক্ষে ৪৮১ খ্রিস্টপূর্ব থেকে পাওয়া যায়। শতাব্দীর পর শতাব্দী ধরে অনেক চীনা লেখক ঔষধি সংক্রান্ত জ্ঞান লিখিত আকারে অবদান রেখেছেন। চীনা অভিধান-এনসাইক্লোপিডিয়া এর ইয়্যা সম্ভবত ৩০০ খ্রিস্টপূর্বাব্দে রচিত এবং এতে প্রায় ৩৩৪টি উদ্ভিদের বর্ণনা রয়েছে, যা গাছ বা গুল্ম হিসেবে শ্রেণীবদ্ধ, প্রতিটির সাধারণ নাম ও চিত্রসহ। হান রাজবংশের সময়কালে (২০২ খ্রিস্টপূর্ব - ২২০ খ্রিস্টাব্দ) উল্লেখযোগ্য হলো হুয়াংদি নেজিং এবং বিখ্যাত ফার্মাকোলজিস্ট ঝাং ঝংজিং এর কাজ।
এম্পেদোক্লেস (৪৯০–৪৩০ খ্রিস্টপূর্বাব্দ) প্রজাতির পরিবর্তনশীলতা এবং প্রাকৃতিক নির্বাচনের একটি প্রাথমিক ধারণা দিয়ে বিবর্তন তত্ত্বের পূর্বাভাস দিয়েছিলেন। চিকিৎসক হিপোক্রেটিস (৪৬০–৩৭০ খ্রিস্টপূর্বাব্দ) তখনকার প্রচলিত কুসংস্কার এড়িয়ে ঘনিষ্ঠ পর্যবেক্ষণ এবং অভিজ্ঞতার পরীক্ষার মাধ্যমে রোগ নিরাময়ের পথে এগিয়েছিলেন। এই সময়কালে উদ্ভিদ নিয়ে লেখা প্রধান গ্রন্থগুলো তাদের ঔষধি ব্যবহার বর্ণনার বাইরে গিয়ে উদ্ভিদ ভূগোল, আকৃতি, শারীরতত্ত্ব, পুষ্টি, বৃদ্ধি এবং প্রজনন বিষয়গুলো নিয়েও আলোচনা শুরু করে।
উদ্ভিদবিদ্যা নিয়ে গবেষণা করা পণ্ডিতদের মধ্যে সবচেয়ে গুরুত্বপূর্ণ ছিলেন থিওফ্রাস্টাস (গ্রিক: Θεόφραστος; আনুমানিক ৩৭১–২৮৭ খ্রিস্টপূর্বাব্দ), যাকে "উদ্ভিদবিদ্যার জনক" বলা হয়। তিনি অ্যারিস্টটলের (৩৮৪–৩২২ খ্রিস্টপূর্বাব্দ) ছাত্র ও ঘনিষ্ঠ বন্ধু ছিলেন এবং অ্যারিস্টটলের মৃত্যুর পর এথেন্সের লাইসিয়াম (একটি আধুনিক বিশ্ববিদ্যালয়ের মতো শিক্ষা প্রতিষ্ঠান) এর প্রধান হিসেবে তার স্থলাভিষিক্ত হন,। অ্যারিস্টটলের উদ্ভিদ বিষয়ক বিশেষ গ্রন্থ থিওরিয়া পেরি ফুটন হারিয়ে গেছে, যদিও তার অন্যান্য লেখায় অনেক উদ্ভিদ সংক্রান্ত পর্যবেক্ষণ ছড়িয়ে-ছিটিয়ে রয়েছে (যা ক্রিশ্চিয়ান উইমার ১৮৩৬ সালে Phytologiae Aristotelicae Fragmenta-তে সংকলিত করেছেন), কিন্তু সেগুলো তার উদ্ভিদবিজ্ঞানী চিন্তার উপর খুব বেশি অন্তর্দৃষ্টি দেয় না। লাইসিয়াম কারণমূলক সংযোগের পদ্ধতিগত পর্যবেক্ষণ, সমালোচনামূলক পরীক্ষা ও যৌক্তিক তত্ত্বায়নের ঐতিহ্যের জন্য উল্ল্যেখযোগ্য ছিল। থিওফ্রাস্টাস তার সমসাময়িক চিকিৎসক, যাদের রাইজোটমি বলা হতো, তাদের কুসংস্কারপূর্ণ চিকিৎসা পদ্ধতিকে চ্যালেঞ্জ করেছিলেন এবং পুরোহিতের কর্তৃত্ব ও ঐতিহ্যের মাধ্যমে চিকিৎসা নিয়ন্ত্রণের বিরোধিতা করেছিলেন। লাইসিয়ামের বাগানে সম্ভবত সংগ্রহ করা উদ্ভিদ নমুনা এবং দূরবর্তী অঞ্চলে অন্যান্য অনুসন্ধান থেকে সংগৃহীত উদ্ভিদ রাখা হতো। এই বাগানে থেকেই তিনি উদ্ভিদ সম্পর্কে তার অধিকাংশ জ্ঞান অর্জন করেছিলেন। থিওফ্রাস্টাসের উল্ল্যেখযোগ্য দুটি বই হলো Causae Plantarum এবং Historia Plantarum ।
প্রাচীন গ্রিক ঔষধি বিজ্ঞানের একটি পূর্ণাঙ্গ সংকলন De Materia Medica প্রায় ৬০ খ্রিস্টাব্দে পেডানিয়াস ডায়োসকোরিডিস (প্রায় ৪০–৯০ খ্রিস্টাব্দ) দ্বারা সংকলিত হয়েছিল। এই গ্রন্থটি প্রায় পনেরোশো বছর ধরে, ইউরোপীয় রেনেসাঁর সূচনা পর্যন্ত, ওরিয়েন্টাল এবং অক্সিডেন্টাল উভয় ঔষধি উদ্ভিদের ওপর নির্ভরযোগ্য গ্রন্থ হিসেবে বিবেচিত হতো এবং এই এটি অনেকবার অনুলিপি করা হয়েছিল। যদিও এতে প্রায় ৬০০ ঔষধি উদ্ভিদের বর্ণনা সহ সমৃদ্ধ ঔষধি তথ্য ছিল, এর উদ্ভিদবিজ্ঞান বিষয়ক বিষয়বস্তু ছিল অত্যন্ত সীমিত।
রোমানরা কৃষি হিসেবে প্রয়োগকৃত উদ্ভিদবিজ্ঞানের জ্ঞান বৃদ্ধিতে গুরুত্বপূর্ণ অবদান রেখেছে। De Re Rustica শিরোনামে রচিত কিছু গ্রন্থে চারজন রোমান লেখক Scriptores Rei Rusticae নামে একটি সংকলনে অবদান রেখেছিলেন, যা রেনেসাঁ যুগ থেকে প্রকাশিত হয়েছিল এবং এতে কৃষির নীতি ও চর্চার বিবরণ রয়েছে। এই লেখকরা হলেন ক্যাটো (২৩৪–১৪৯ খ্রিস্টপূর্ব), ভ্যারো (১১৬–২৭ খ্রিস্টপূর্ব), কলুমেলা (৪–৭০ খ্রিস্টাব্দ) এবং পাল্লাদিয়াস (৪র্থ শতাব্দী খ্রিস্টাব্দ)। রোমান বিশ্বকোষ রচয়িতা প্লিনি দ্য এল্ডার (২৩–৭৯ খ্রিস্টাব্দ) তার ৩৭ খণ্ডের Naturalis Historiaর ১২ থেকে ২৬ নম্বর বইয়ে উদ্ভিদ বিষয়ে আলোচনা করেছেন। ধারণা করা হয়, রোমান সাম্রাজ্যের সময় প্রায় ১৩০০ থেকে ১৪০০ উদ্ভিদ নথিভুক্ত করা হয়েছিল।
১০০ থেকে ১৭০০ খ্রিস্টাব্দের মধ্যে, চীনে ঔষধি উদ্ভিদবিজ্ঞানের ওপর অনেক নতুন কাজ রচিত হয়েছিল। ১১ শতাব্দীর বিজ্ঞানী ও রাষ্ট্রবিজ্ঞানী সু সঙ এবং শেন কুও প্রাকৃতিক ইতিহাসের উপর শিক্ষিত treatises রচনা করেন, যা ঔষধি চিকিৎসার ওপর গুরুত্ব দেয়। ঔষধি উদ্ভিদবিজ্ঞানের কাজগুলির মধ্যে আদালতের জন্য সংকলিত বিশ্বকোষীয় প্রতিবেদন এবং treatises অন্তর্ভুক্ত ছিল। এইগুলি কুসংস্কার ও মিথ থেকে মুক্ত ছিল এবং সযত্নে গবেষণা করা বর্ণনা ও নামকরণ ছিল; এতে চাষের তথ্য এবং অর্থনৈতিক ও ঔষধি ব্যবহারের তথ্য অন্তর্ভুক্ত ছিল — এমনকি অলঙ্কারিক উদ্ভিদ নিয়ে বিস্তারিত মোনোগ্রাফও ছিল। তবে এখানে কোন পরীক্ষামূলক পদ্ধতি ছিল না এবং উদ্ভিদের প্রজনন, পুষ্টি, বা অ্যানাটমির কোনো বিশ্লেষণ ছিল না।
ভারতে পরাশর (আনুমানিক ৪০০ – ৫০০ খ্রিস্টাব্দ) বৃক্ষায়ুর্বেদ (গাছের জীবন বিজ্ঞান) রচনা করেন। তিনি কোষ ও পাতা সম্পর্কে নিবিড় পর্যবেক্ষণ করেছেন এবং উদ্ভিদকে দ্বিমাত্রকা (ডাইকোটাইলেডন) এবং একামাত্রকা (মনোকোটাইলেডন) এ বিভক্ত করেছেন। তিনি ফুলের বৈশিষ্ট্য এবং তাদের সাদৃশ্য ও পার্থক্যের মতো রূপগত বিবেচনার উপর ভিত্তি করে একটি আরও জটিল শ্রেণীবিভাগ তৈরি করেছেন, যা আধুনিক ফুলের পরিবারের মতো গণে বিভক্ত: সামিগণিয়া (ফ্যাবেসি), পুপলিকাগলনিয়া (রুটেসি), স্বস্তিকগণিয়া (ক্রুসিফেরা), ত্রিপুষ্পগণিয়া (কিউকাররবিটেসি), মল্লিকাগণিয়া (অপোসিনাসি), এবং কুরচাপুষ্পগণিয়া (অ্যাস্টেরেসি)। মধ্যযুগীয় ভারতীয় উদ্ভিদ শারীরবিজ্ঞান সম্পর্কিত গুরুত্বপূর্ণ কাজগুলির মধ্যে উদয়নার প্র্থ্বীনিরাপর্যাম, ধর্মোত্তরের ন্যায়াবিন্দুতিকা, গুণরত্নের saddarsana-samuccaya, এবং শঙ্করমিশ্রের উপস্কার অন্তর্ভুক্ত।
৯ম থেকে ১৩শ শতাব্দীর (খ্রিস্টাব্দ) ৪০০ বছরের সময়কাল ছিল ইসলামী রেনেসাঁ, এই সমযয়ে ইসলামী সংস্কৃতি ও বিজ্ঞান বিকশিত হয়েছিল। গ্রিক-রোমান গ্রন্থগুলি সংরক্ষণ, অনুলিপি এবং সম্প্রসারণ করা হয়েছিল, নতুন গ্রন্থগুলিতে সর্বদা উদ্ভিদগুলির ঔষধি দিকগুলোকে বিশেষভাবে গুরুত্ব দেওয়া হয়েছে। কুর্দি জীববিজ্ঞানী আবু হানিফাহ আহমদ ইবন দাউদ দিনাওয়ারী (৮২৮–৮৯৬ খ্রিস্টাব্দ) আরবি উদ্ভিদবিজ্ঞানের প্রতিষ্ঠাতা হিসেবে পরিচিত; তার Kitâb al-nabât ('উদ্ভিদের বই') ৬৩৭ প্রজাতি বর্ণনা করেছে, যা অঙ্কুরোদগম থেকে বার্ধক্য পর্যন্ত উদ্ভিদের বিকাশ নিয়ে আলোচনা করে এবং ফুল ও ফলের বিশদ বিবরণ অন্তর্ভুক্ত করে। মুতাজিলাইট দার্শনিক ও চিকিৎসক ইবন সিনা (আভিসেনা) (প্রায় ৯৮০–১০৩৭ খ্রিস্টাব্দ) আরেকজন উল্ল্যেখযোগ্য ব্যাক্তি ছিলেন, তার The Canon of Medicine চিকিৎসা ইতিহাসে গুরুত্বপুর্ন।
কনস্টান্টিনোপল পতনের (১৪৫৩) পর, নতুন অটোমান সাম্রাজ্য এর রাজধানীতে ইউরোপীয় দূতাবাসগুলিকে স্বাগত জানায়, যা সেই অঞ্চলের উদ্ভিদগুলির উৎস হয়ে ওঠে যা সাম্রাজ্যের সাথে বাণিজ্য করত। এই নতুন জ্ঞান থেকে ইতালি উপকৃত হয়, বিশেষ করে ভেনিস, যা পূর্বের সাথে ব্যাপকভাবে বাণিজ্য করত। সেখান থেকে, এই নতুন উদ্ভিদগুলি দ্রুত পশ্চিম ইউরোপের বাকি অংশে ছড়িয়ে পড়ে। ষোড়শ শতকের মাঝের দিকে, তুরস্ক থেকে ইউরোপে বিভিন্ন উদ্ভিদের সমৃদ্ধ রপ্তানি বাণিজ্য শুরু হয়ে গিয়েছিল। ১৫শ এবং ১৬শ শতাব্দীর ইউরোপীয় মধ্যযুগে, ইউরোপীয় নাগরিকদের জীবন কৃষির চারপাশে আবর্তিত হত। কিন্তু যখন মুদ্রণ প্রযুক্তি, মুভেবল টাইপ এবং কাঠের খোদাই করা চিত্রাবলী আবির্ভূত হয়, তখন কৃষি বিষয়ক treatises নয়, বরং ঔষধি উদ্ভিদের তালিকা, তাদের বৈশিষ্ট্য বা "গুণাবলী" সহ বর্ণনা প্রকাশিত হতে শুরু করে। এই বইগুলো, যাদের হার্বাল বলা হয়, দেখায় যে উদ্ভিদবিদ্যা তখনও চিকিৎসাবিজ্ঞানের একটি অংশমাত্র ছিল, প্রাচীন যুগের মতোই। হার্বাল লেখকরা অনেকেই বিশ্ববিদ্যালয় বাগানের কিউরেটর ছিলেন।
তবে, সঠিক এবং বিস্তারিত উদ্ভিদ বর্ণনার প্রয়োজনীয়তার কারণে কিছু হার্বালের উদ্ভিদবিজ্ঞানগত গুণ বেশি ছিল।
জার্মান অটো ব্রুনফেলস (১৪৬৪–১৫৩৪) এর Herbarum Vivae Icones (১৫৩০) প্রায় ৪৭টি নতুন উদ্ভিদের প্রজাতির বর্ণনা এবং সঠিক চিত্র অন্তর্ভুক্ত করেছিল। তাঁর সহকর্মী হায়েরোনিমাস বক (১৪৯৮–১৫৫৪) এর Kreutterbuch (১৫৩৯) তার কাছাকাছি বনে এবং মাঠে পাওয়া উদ্ভিদগুলোর বর্ণনা দিয়েছিলেন, এবং এগুলো ১৫৪৬ সালের সংস্করণে চিত্রিত করা হয়েছিল। ভ্যালেরিয়াস করডাস (১৫১৫–১৫৪৪) ছিলেন উদ্ভিদের আনুষ্ঠানিক বর্ণনার অগ্রদূত, তার নেতৃত্বে ফুল এবং ফলের বিশদ বিবরণ, ডিম্বাশয়ের প্রকৃতি এবং ওভিউলের স্থানের ধরন সহ কিছু শারীরবৃত্তীয় বিশ্লেষণ করা হয়েছিল। তিনি পরাগ এবং বিভিন্ন ফুলের গুচ্ছ সম্পর্কে পর্যবেক্ষণও করেছিলেন। তার পাঁচ খণ্ডের Historia Plantarum ১৫৬১-১৫৬৩ সালে প্রকাশিত হয়েছিল। ইংল্যান্ডে, উইলিয়াম টার্নার (১৫১৫–১৫৬৮) তার Libellus De Re Herbaria Novus (১৫৩৮) গ্রন্থে অনেক স্থানীয় ব্রিটিশ উদ্ভিদের নাম, বর্ণনা এবং স্থান উল্লেখ করেছিলেন। নেদারল্যান্ডসে, রেমবার্ট ডোডোয়েন্স (১৫১৭–১৫৮৫) তার Stirpium Historiae (১৫৮৩) গ্রন্থে অনেক নতুন প্রজাতির বর্ণনা বৈজ্ঞানিকভাবে সাজিয়ে অন্তর্ভুক্ত করেছিলেন।
হার্বাল উদ্ভিদবিদ্যায় অবদান রেখেছিল উদ্ভিদের বর্ণনা, শ্রেণীবিভাগ এবং উদ্ভিদ চিত্রণ বিজ্ঞানের সূচনা করে। ১৭শ শতাব্দী পর্যন্ত উদ্ভিদবিদ্যা এবং চিকিৎসাশাস্ত্রে বিশেষ পার্থক্য ছিল না, তবে যেসব বইয়ে ঔষধি দিকগুলোর ওপর গুরুত্ব দেওয়া হয়েছিল, সেগুলো ধীরে ধীরে উদ্ভিদ বিজ্ঞান বাদ দিয়ে আধুনিক ফার্মাকোপিয়া বা ঔষধবিজ্ঞানে রূপান্তরিত হয়েছিল। আর যেসব বইয়ে চিকিৎসাবিদ্যাকে বাদ দেওয়া হয়েছিল, সেগুলো আরও বেশি করে উদ্ভিদবিষয়ক হয়ে উঠেছিল এবং উদ্ভিদের বর্ণনা সংকলনের আধুনিক রূপ ফ্লোরায় পরিণত হয়েছিল। হার্বাল থেকে ফ্লোরায় রূপান্তর উদ্ভিদবিজ্ঞানের চিকিৎসাশাস্ত্র থেকে স্বতন্ত্র হওয়াকে নির্দেশ করে।
ইউরোপীয় রেনেসাঁর সময়ে শিক্ষার পুনর্জাগরণ উদ্ভিদ বিষয়ে নতুন আগ্রহ সৃষ্টি করে। গির্জা, সামন্তপ্রথার অভিজাত সমাজ এবং ক্রমবর্ধমান প্রভাবশালী বণিক শ্রেণী, যারা বিজ্ঞান ও শিল্পকে সমর্থন করত, বর্ধিত বাণিজ্যের জগতে প্রতিযোগিতা শুরু করে। সমুদ্র অভিযানের মাধ্যমে নতুন পাওয়া উদ্ভিদ-সম্পদ বড় বড় উদ্ভিদ উদ্যানগুলোতে আনা হয়। উদ্যমী জনগণ এশিয়া এবং আমেরিকা মহাদেশ থেকে আসা নতুন শস্য, ঔষধ এবং মসলার সাথে পরিচিত হয়। বিজ্ঞান বিষয়ক প্রকাশনার সংখ্যা বৃদ্ধি পায়।
উদাহরণস্বরূপ, ইংল্যান্ডে বৈজ্ঞানিক যোগাযোগ এবং কার্যক্রমকে সহজতর করেছিল রয়্যাল সোসাইটি, লিনিয়ান সোসাইটি এর মতো সংগঠন গুলো। পাশাপাশি উদ্ভিদ সংক্রান্ত প্রতিষ্ঠানগুলোর সহায়তা এবং কর্মকাণ্ড যেমন প্যারিসের জার্ডিন দু রোয়া, চেলসি ফিজিক গার্ডেন, রয়্যাল বোটানিক গার্ডেনস কিউ, এবং অক্সফোর্ড ও কেমব্রিজ বিশ্ববিদ্যালয়ের উদ্ভিদ উদ্যানগুলোও প্রভাব বিস্তার করেছিল। এছাড়া বিখ্যাত ব্যক্তিগত উদ্যান এবং ধনী উদ্যোক্তা নার্সারি মালিকদেরও প্রভাব ছিল। ১৭শ শতাব্দীর প্রথম দিকে ইউরোপে বৈজ্ঞানিক প্রক্রিয়ায় বর্ণিত উদ্ভিদের সংখ্যা প্রায় ৬০০০-এ পৌঁছে যায়। ১৮শ শতাব্দীর এনলাইটেনমেন্ট বা আলোকপ্রাপ্তির যুগে যুক্তি এবং বিজ্ঞানের মূল্যবোধের সাথে দূরবর্তী স্থানে নতুন অভিযানের মাধ্যমে উদ্ভিদের নতুনভাবে পরিচয়, নামকরণ, বর্ণনা এবং চিত্রায়নের একটি নতুন পর্যায় শুরু হয়, যা ইতিহাসে "পুষ্প চিত্রাঙ্কন" এর সেরা সময় হিসেবে বিবেচিত হয়। দূরদূরান্তর থেকে আনা উদ্ভিদগুলি ইউরোপের ক্ষমতাশালী এবং ধনীদের বাগান সজ্জিত করত। এই সময়কালে প্রাকৃতিক ইতিহাস, বিশেষ করে উদ্ভিদবিদ্যার প্রতি মানবসমাজে এক অসাধারণ আগ্রহ ছিল (একে "বোটানোফিলিয়া"ও বলা হয়)।
১৮শ শতাব্দীতে ইউরোপে উদ্ভিদবিদ্যা সুশীল শিক্ষিত নারীদের জন্য উপযুক্ত বলে বিবেচিত হতো। প্রায় ১৭৬০ সালের দিকে, লিনিয়ান সিস্টেমের জনপ্রিয়তার সঙ্গে, উদ্ভিদবিদ্যা শিক্ষিত নারীদের মধ্যে আরও ব্যাপক হয়ে ওঠে। তারা উদ্ভিদের চিত্রাঙ্কন করতেন, উদ্ভিদ শ্রেণিবিন্যাসের ক্লাসে যোগ দিতেন এবং হারবেরিয়াম নমুনা সংগ্রহ করতেন। এই সময়কালে উদ্ভিদের ঔষধি গুণাবলী নিয়ে বেশি জোর দেওয়া হতো, প্রজনন নিয়ে নয়, কারণ প্রজনন বিষয়টি যৌনতার সাথে সম্পৃক্ত ছিল। নারীরা উদ্ভিদবিদ্যা বিষয়ে প্রকাশনা শুরু করেন এবং শিশুদের জন্য উদ্ভিদবিদ্যা বিষয়ক বই প্রকাশ করেন। এদের মধ্যে উল্ল্যেখযোগ্য শার্লট টার্নার স্মিথ। সাংস্কৃতিক কর্তৃপক্ষ যুক্তি দিতেন যে উদ্ভিদবিদ্যার মাধ্যমে শিক্ষা মানুষকে সাংস্কৃতিক ও বৈজ্ঞানিকভাবে সচেতন নাগরিক হিসেবে গড়ে তুলবে, যা এনলাইটেনমেন্ট বা আলোকপ্রাপ্তির যুগের "উন্নতি" প্রচেষ্টার অংশ ছিল। তবে ১৯শ শতাব্দীর গোড়ার দিকে উদ্ভিদবিদ্যাকে একটি আনুষ্ঠানিক বিজ্ঞান হিসেবে স্বীকৃতি দেওয়া হলে, নারীরা পুনরায় এই শাস্ত্র থেকে বাদ পড়েন। তবে অন্যান্য বিজ্ঞানের তুলনায় উদ্ভিদবিদ্যায় নারী গবেষক, সংগ্রাহক বা চিত্রকরদের সংখ্যা সবসময়ই উল্লেখযোগ্যভাবে বেশি ছিল।
সর্বজনীন এবং ব্যক্তিগত উদ্যান সর্বদাই উদ্ভিদবিজ্ঞানের ইতিহাসের বিকাশের সাথে ঘনিষ্ঠভাবে সম্পর্কিত ছিল। প্রাচীন উদ্ভিদ উদ্যানগুলো সাধারণত ছিল ওষধি উদ্যান, যেখানে হারবালের বর্ণিত ঔষধি গাছপালাগুলির সংগ্রহ রাখা হতো। যেহেতু এগুলি সাধারণত বিশ্ববিদ্যালয় বা অন্যান্য শিক্ষাপ্রতিষ্ঠানের সাথে যুক্ত ছিল, তাই এই উদ্ভিদগুলো অধ্যয়নের জন্যও ব্যবহৃত হতো। এই উদ্যানগুলির পরিচালকরা সাধারণত বিখ্যাত চিকিৎসক হতেন এবং তাদের ভূমিকা ছিল "বৈজ্ঞানিক উদ্যানপালক" হিসেবে, এবং এই প্রতিষ্ঠানগুলির কর্মীরাই বেশিরভাগ প্রকাশিত হার্বালের প্রণেতা ছিলেন।
আধুনিক উদ্ভিদ উদ্যানগুলির প্রতিষ্ঠা হয়েছিল উত্তর ইতালিতে, যার প্রথমটি পিসা শহরে লুকা গিনি কর্তৃক প্রতিষ্ঠিত হয়। যদিও এটি চিকিৎসা বিভাগের অংশ ছিল, উদ্ভিদবিদ্যার প্রথম অধ্যাপনা প্রতিষ্ঠিত হয়েছিল পাডুয়ায় ১৫৩৩ সালে। তারপর ১৫৩৪ সালে, গিনি বোলোনিয়া বিশ্ববিদ্যালয়ে মেটেরিয়া মেডিকার পাঠক হন, যেখানে উলিসে আলদ্রোভান্ডি ১৫৬৮ সালে একটি একই ধরনের উদ্যান প্রতিষ্ঠা করেন। শুকনো উদ্ভিদের সংগ্রহকে বলা হতো হোরতুস সিক্কুস (শুকনো উদ্যান) এবং এইভাবে উদ্ভিদ সংগ্রহের প্রথম প্রবর্তন (যার মধ্যে উদ্ভিদ প্রেস ব্যবহার অন্তর্ভুক্ত) গিনির কৃতিত্ব বলে মনে করা হয়। হেরবারিয়া নামক ভবনগুলোতে এসব নমুনা সংরক্ষিত থাকতো কার্ডের উপর লাগানো এবং বর্ণনামূলক লেবেলসহ। সেগুলো আলমারিতে সংরক্ষণ করা হতো এবং স্থায়ীভাবে রাখা বা অন্যান্য প্রতিষ্ঠানের সাথে বিনিময় করা যেত। এই পদ্ধতি আজও ব্যবহৃত হয়।
১৮শ শতাব্দীর মধ্যে ওষধি উদ্যানগুলো রূপান্তরিত হয়েছিল "অর্ডার বেড" হিসেবে, যা তৎকালীন উদ্ভিদবিদদের দ্বারা উদ্ভাবিত শ্রেণীবিন্যাস পদ্ধতি প্রদর্শন করত। তবে এই উদ্যানগুলোতে নতুন, চমকপ্রদ এবং সুন্দর উদ্ভিদগুলির একটি বিশাল প্রবাহকে স্থান দিতে হয়েছিল, যা ইউরোপীয় ঔপনিবেশিক সম্প্রসারণের সাথে যুক্ত অন্বেষণ অভিযানের মাধ্যমে এসেছিল।
১৭শ এবং ১৮শ শতাব্দীর উদ্ভিদ শ্রেণীবিন্যাস পদ্ধতি উদ্ভিদকে মানুষের সাথে সম্পর্কিত না করে অন্য উদ্ভিদের সাথে সম্পর্কিত করে, যা ১৫০০ বছর আগে থিওফ্রাস্টাস দ্বারা প্রচারিত অ-মনুষ্যকেন্দ্রিক উদ্ভিদবিজ্ঞানের পুনরুত্থানকে চিহ্নিত করে। ইংল্যান্ডে, লাতিন বা ইংরেজিতে বিভিন্ন হার্বাল ছিল মূলত মহাদেশীয় ইউরোপীয় কাজের সংকলন এবং অনুবাদ, যা ব্রিটিশ দ্বীপপুঞ্জের জন্য খুব বেশি প্রাসঙ্গিক ছিল না। এর মধ্যে ছিল জন জেরার্ডের কিছুটা কাজ। ব্রিটিশ উদ্ভিদ সম্পর্কে তথ্য সংগ্রহের প্রথম পদ্ধতিগত প্রচেষ্টা করেন থমাস জনসন (১৬২৯)। তিনি পরে জেরার্ডের কাজের (১৬৩৩–১৬৩৬) নিজস্ব সংশোধনী প্রকাশ করেছিলেন।
তবে, জনসন তার স্থানীয় ফ্লোরাকে সুসংগঠিত করা প্রথম ওষুধ ব্যবসায়ী বা চিকিৎসক ছিলেন না। ইতালিতে, উলিসে আলদ্রোভান্ডি (১৫২২-১৬০৫) ১৫৫৭ সালে উম্বরিয়ার সিবিলাইন পর্বতসমূহে একটি অভিযানের আয়োজন করেন এবং স্থানীয় উদ্ভিদের তালিকা তৈরি করেন। এরপর তিনি তার অনুসন্ধানগুলি ইউরোপের অন্যান্য পণ্ডিতদের মধ্যে ছড়িয়ে দিতে শুরু করেন এবং জ্ঞান বিনিময়ের একটি প্রাথমিক নেটওয়ার্ক গড়ে তোলেন, যেটিকে তিনি "molti amici in molti luoghi" (অনেক স্থানে অনেক বন্ধু) বলতেন। এই নেটওয়ার্কের মধ্যে ছিলেন মঁপেলিয়েরের চার্লস ডি লিক্লুস (ক্লুসিয়াস) (১৫২৬–১৬০৯) এবং মালাইনের জাঁ দে ব্রঁসিওঁ। তারা একসঙ্গে সাধারণ নামের পাশাপাশি উদ্ভিদের লাতিন নাম দিতে শুরু করেন। পণ্ডিতদের মধ্যে তথ্য ও নমুনা বিনিময় প্রায়শই উদ্ভিদ উদ্যানগুলির প্রতিষ্ঠার সাথে সম্পর্কিত ছিল এবং এ উদ্দেশ্যে আলদ্রোভান্ডি ১৫৬৮ সালে বোলোনিয়ায় তার বিশ্ববিদ্যালয়ে অরটো বোটানিকো ডি বোলোনিয়া নামক একটি উদ্ভিদ উদ্যান প্রতিষ্ঠা করেন।
ফ্রান্সে, ক্লুসিয়াস পশ্চিম ইউরোপের বেশিরভাগ অংশে ভ্রমণ করেন এবং এই সময়ে উদ্ভিদ বিষয়ে বিভিন্ন আবিষ্কার করেন। তিনি ১৫৭৬ সালে স্পেনের এবং ১৫৮৩ সালে অস্ট্রিয়া ও হাঙ্গেরির ফ্লোরার তালিকা তৈরি করেন। তিনিই প্রথম উদ্ভিদকে বিভিন্ন শ্রেণিতে ভাগ করার প্রস্তাব দেন। একই সময়ে, সুইজারল্যান্ডে, ১৫৫৪ সাল থেকে, কনরাড গেসনার (১৫১৬–১৫৬৫) তার নিজ শহর জুরিখ থেকে নিয়মিতভাবে সুইস আল্পস পরিদর্শন করেন এবং অনেক নতুন উদ্ভিদ আবিষ্কার করেন। তিনি প্রস্তাব করেন যে উদ্ভিদের বিভিন্ন গণ বা "জেনাস" রয়েছে। তিনি বলেন, প্রতিটি জেনাস অনেক প্রজাতির সমন্বয়ে গঠিত এবং এগুলি একই ধরনের ফুল ও ফল দ্বারা সংজ্ঞায়িত হয়। এই সংগঠনের নীতিটি ভবিষ্যতের উদ্ভিদবিদদের জন্য ভিত্তি স্থাপন করে। তিনি তার গুরুত্বপূর্ণ গ্রন্থ "হিস্টোরিয়া প্লান্টারাম" মৃত্যুর ঠিক আগে রচনা করেন। ফ্ল্যান্ডার্সের মালাইনে, তিনি ১৫৬৮ থেকে ১৫৭৩ পর্যন্ত জাঁ দে ব্রঁসিওঁ-এর উদ্ভিদ উদ্যানগুলির পরিচালনা ও রক্ষণাবেক্ষণ করেন।
এই পদ্ধতি এবং নতুন দ্বিপদ নামকরণের ব্যবস্থার সঙ্গে মিলিয়ে ঔষধি তথ্যবিহীন উদ্ভিদ বিশ্বকোষ, যেগুলিকে "ফ্লোরা" বলা হয়, তৈরি হতে থাকে যা নির্দিষ্ট অঞ্চলে জন্মানো উদ্ভিদ সুক্ষ্মভাবে বর্ণনা এবং চিত্রিত করত। ১৭শ শতাব্দী উদ্ভিদ বিজ্ঞানের পরীক্ষামূলক গবেষণার সূচনাও চিহ্নিত করে এবং কঠোর বৈজ্ঞানিক পদ্ধতির প্রয়োগ শুরু হয়, যেখানে অণুবীক্ষণ যন্ত্রের উন্নতির ফলে উদ্ভিদ শারীরতত্ত্বের নতুন শাখা গড়ে ওঠে। নেহেমিয়া গ্রিউ এবং মার্সেলো মালপিজির যত্নসহকারে পর্যবেক্ষণের ভিত্তিতে উদ্ভিদ অ্যানাটমির এই ভিত্তি স্থাপন করা হয়, যা পরবর্তী ১৫০ বছর ধরে স্থায়ী থাকবে।
এই সময়কালে নতুন নতুন দেশ ইউরোপীয় ঔপনিবেশিক শক্তির জন্য উন্মুক্ত হচ্ছিল, আর সেখান থেকে উদ্ভিদসম্ভার ইউরোপীয় উদ্ভিদবিদদের কাছে বর্ণনার জন্য পাঠানো হচ্ছিল। এটি ছিল উদ্ভিদবিজ্ঞান অনুসন্ধানকারীদের, নির্ভীক উদ্ভিদ সন্ধানীদের এবং উদ্যানবিদ-উদ্ভিদবিদদের এক স্বর্ণযুগ। উল্লেখযোগ্য উদ্ভিদ সংগ্রহগুলি এসেছিল বিভিন্ন স্থান থেকে: ওয়েস্ট ইন্ডিজ (হ্যান্স স্লোন (১৬৬০–১৭৫৩)); চীন (জেমস কানিংহাম); পূর্ব ইন্ডিজের মসলা দ্বীপপুঞ্জ (মোলুক্কাস, জর্জ রাম্পফিয়াস (১৬২৭–১৭০২)); চীন ও মোজাম্বিক (জোয়াও ডি লরেইরো (১৭১৭–১৭৯১)); পশ্চিম আফ্রিকা (মিশেল আদানসন (১৭২৭–১৮০৬)), যিনি তার নিজস্ব শ্রেণীবিন্যাস পদ্ধতি তৈরি করেন এবং প্রজাতির পরিবর্তনশীলতার একটি সাধারণ তত্ত্ব উপস্থাপন করেন; কানাডা, হেব্রিডিস, আইসল্যান্ড, নিউজিল্যান্ড থেকে ক্যাপ্টেন জেমস কুকের প্রধান উদ্ভিদবিদ জোসেফ ব্যাংকস (১৭৪৩–১৮২০)।
১৮শ শতাব্দীর মাঝামাঝি সময়ে, বিভিন্ন উপনিবেশ থেকে সংগৃহীত উদ্ভিদসম্ভার বাগান এবং হার্বারিয়ায় জমা হচ্ছিল এবং এগুলিকে পদ্ধতিগতভাবে শ্রেণীবদ্ধ করা প্রয়োজন ছিল। এই কাজটি ছিল উদ্ভিদ শ্রেণীবিদ বা প্ল্যান্ট ট্যাক্সনমিস্টদের, যারা উদ্ভিদগুলিকে শ্রেণীবদ্ধ করতেন।
উদ্ভিদ শ্রেণীবিন্যাস সময়ের সাথে পরিবর্তিত হয়েছে। প্রথমে উদ্ভিদগুলিকে "কৃত্রিম" পদ্ধতিতে শ্রেণীবদ্ধ করা হত যা সাধারণ আকার ও প্রকৃতির উপর ভিত্তি করে ছিল। এরপর, প্রাক-বিবর্তনীয় "প্রাকৃতিক" পদ্ধতি উদ্ভিদের মধ্যে সাদৃশ্য প্রকাশের জন্য অনেক চরিত্র ব্যবহার করত। অবশেষে, উত্তর-বিবর্তনীয় "প্রাকৃতিক" পদ্ধতি বিভিন্ন চরিত্রের মাধ্যমে উদ্ভিদের বিবর্তনীয় সম্পর্ক নির্ধারণের চেষ্টা করে।
ইতালির চিকিৎসক আন্দ্রেয়া কায়সালপিনো (১৫১৯–১৬০৩) ৪০ বছরের বেশি সময় ধরে পিসা বিশ্ববিদ্যালয়ে চিকিৎসাবিজ্ঞান অধ্যয়ন করেন এবং উদ্ভিদবিদ্যা পড়ান। তিনি ১৫৫৪ থেকে ১৫৫৮ সালের মধ্যে পিসার উদ্ভিদ উদ্যানের পরিচালকও ছিলেন। তার ষোল খণ্ডের "ডে প্লানটিস" (১৫৮৩) ১৫০০টি উদ্ভিদের বর্ণনা করেছে এবং তার ২৬০ পৃষ্ঠার হার্বারিতে ৭৬৮টি মাউন্ট করা নমুনা এখনও অবশিষ্ট আছে। কায়সালপিন ফুল এবং ফলের বিস্তারিত গঠন অনুযায়ী শ্রেণী প্রস্তাব করেছিলেন; তিনি প্রজাতির ধারণাও প্রয়োগ করেছিলেন। তিনি উদ্ভিদগুলির মধ্যে সামগ্রিক সাদৃশ্য প্রতিফলিত করে প্রাকৃতিক শ্রেণীবিন্যাসের মূলনীতি নির্ধারণের প্রথম চেষ্টা করেন এবং একটি শ্রেণীবিন্যাস স্কিম তৈরি করেন যা তার সময়ের তুলনায় অনেক এগিয়ে ছিল। গ্যাসপার্ড বাউহিন (১৫৬০–১৬২৪) দুটি প্রভাবশালী প্রকাশনা তৈরি করেন: "প্রোড্রোমাস থিয়েট্রিস বোটানিস" (১৬২০) এবং "পিনাক্স" (১৬২৩)। এইগুলো ৬০০০ প্রজাতির বর্ণনায় ব্যবস্থা আনে এবং পরে তিনি দ্বিপদী ও সমার্থক শব্দ ব্যবহার করেন যা সম্ভবত লিনিয়াসের চিন্তাভাবনায় প্রভাব ফেলেছিল। তিনি মনে করতেন যে শ্রেণীবিন্যাস প্রাকৃতিক সাদৃশ্যের উপর ভিত্তি করে হওয়া উচিত।
বর্ণনা এবং শ্রেণীবিন্যাসের যথার্থতা বাড়ানোর জন্য, জোয়াকিম জাং (১৫৮৭–১৬৫৭) একটি প্রয়োজনীয় উদ্ভিদবিদ্যা শব্দকোষ সংকলন করেছিলেন। ইংরেজ উদ্ভিদবিদ জন রে (১৬২৩–১৭০৫) জাংয়ের কাজের ভিত্তিতে সেই সময়ের সবচেয়ে জটিল এবং গভীর শ্রেণীবিন্যাস ব্যবস্থা প্রতিষ্ঠা করেন। তার পর্যবেক্ষণগুলি ক্যামব্রিজের স্থানীয় উদ্ভিদগুলি দিয়ে শুরু হয় যেখানে তিনি বাস করতেন, "ক্যাটালোগাস স্টির্পিয়াম সারকা ক্যান্টাব্রিগিয়াম নাসেন্টিয়াম" (১৮৬০) দিয়ে যা পরে তার "সিনপসিস মেথডিকা স্টির্পিয়াম ব্রিটানিকারুম"-এ প্রসারিত হয়, যা মূলত প্রথম ব্রিটিশ ফ্লোরা। তিনি কায়সালপিনোর প্রাকৃতিক ব্যবস্থাকে উচ্চ শ্রেণীবিন্যাস স্তরের আরও সঠিক সংজ্ঞার মাধ্যমে প্রসারিত করেন, যার ফলে অনেক আধুনিক পরিবার তৈরি হয়, এবং দাবী করেন যে উদ্ভিদের সকল অংশ শ্রেণীবিন্যাসে গুরুত্বপূর্ণ। তিনি স্বীকৃতি দেন যে পরিবর্তনগুলি উভয় অভ্যন্তরীণ (জেনোটিপিক) এবং বাইরের পরিবেশগত (ফেনোটিপিক) কারণ থেকে উদ্ভূত হয় এবং শুধুমাত্র প্রথমটি শ্রেণীবিন্যাসের গুরুত্ব বহন করে। তিনি প্রথম পরীক্ষামূলক শারীরবৃত্তবিদদের মধ্যে একজন ছিলেন। "হিস্টোরিয়া প্লানটাম" আধুনিক উদ্ভিদবিদ্যার জন্য প্রথম উদ্ভিদগত সংশ্লেষণ এবং পাঠ্যপুস্তক হিসাবে বিবেচিত হয়। রের ব্যবস্থা পরে পিয়েরে ম্যাগনোল (১৬৩৮–১৭১৫) দ্বারা প্রসারিত হয় এবং ম্যাগনোলের ছাত্র জোসেফ দে টুর্নেফোর্ট (১৬৫৬–১৭০৮) তার উদ্ভিদ অভিযান, শ্রেণীবিন্যাসে ফুলের চরিত্রের উপর জোর দেওয়া এবং শ্রেণীবিন্যাসের মৌলিক ইউনিট হিসাবে জেনাসের ধারণাটি পুনরুজ্জীবিত করার জন্য খ্যাতি অর্জন করেন।
সর্বোপরি, সুইডিশ বিজ্ঞানী কার্ল লিনিয়াস (১৭০৭–১৭৭৮) উদ্ভিদ তালিকাভুক্তকরণের ক্ষেত্রে উল্লেখযোগ্য কাজ করেছিলেন। তিনি ফুলের স্টেমেন এবং পিস্টিল ব্যবহার করে শ্রেণীবিন্যাসের একটি নতুন ব্যবস্থা গ্রহণ করেন। তাঁর সবচেয়ে গুরুত্বপূর্ণ প্রকাশনাগুলির মধ্যে রয়েছে "সিস্টেমা নাতুরায়" (১৭৩৫), "জেনেরা প্লান্টারুম" (১৭৩৭), এবং "ফিলোসোফিয়া বোটানিকা" (১৭৫১) কিন্তু তাঁর "স্পিসিস প্ল্যান্টারুম" (১৭৫৩) -তে তিনি প্রতিটি প্রজাতিকে একটি দ্বিপদী নাম দিয়েছিলেন, যা সব জীবের নামকরণের ভবিষ্যৎ গৃহীত পদ্ধতির পথ তৈরি করে। লিনিয়াসের চিন্তাভাবনা প্রায় এক শতাব্দী ধরে শ্রেণীবিন্যাসের জগতকে প্রভাবিত করেছে। তার যৌন ব্যবস্থা পরে বের্নার্ড দে জুসিউ (১৬৯৯–১৭৭৭) আরও বিস্তার করেন,অ্যান্টোইন লরেন্ট ডি জুসিউ (১৭৪৮–১৮৩৬) এটিকে আবারও বাড়িয়ে প্রায় ১০০টি শ্রেণী (বর্তমানের পরিবার) অন্তর্ভুক্ত করেন। ফরাসি বিজ্ঞানী মিশেল আদানসন (১৭২৭–১৮০৬) তাঁর "ফামিলেস দে প্লান্টস"-এ, বর্তমান পারিবারিক নামগুলির ব্যবস্থা সম্প্রসারণ করার পাশাপাশি, জোর দিয়ে বলেন যে একটি প্রাকৃতিক শ্রেণীবিন্যাস অবশ্যই সমস্ত বৈশিষ্ট্যের উপর ভিত্তি করে হতে হবে, যদিও পরবর্তীকালে বিশেষ উদ্ভিদ গোষ্ঠীর জন্য তাদের পরিচয়মূলক মূল্য অনুযায়ী ভিন্নভাবে হতে পারে। আদানসনের পদ্ধতি আজও কিছুটা অনুসরণ করা হয়।
১৮শ শতকের প্রথমার্ধে উদ্ভিদবিদ্যা বর্ণনামূলক বিজ্ঞান থেকে পরীক্ষামূলক বিজ্ঞানের দিকে অগ্রসর হতে শুরু করেছিল। ১৫৯০ সালে অণুবীক্ষণ যন্ত্র আবিষ্কৃত হয়েছিল। ১৭শ শতকের শেষের দিকে বড় আবিষ্কার করার মতো রেজোলিউশন পাওয়া সম্ভব হয়। অ্যান্থনি ভন লিউয়েনহুক প্রাথমিক লেন্স গ্রাইন্ডারদের একজন উল্লেখযোগ্য উদাহরণ, যিনি তার একক লেন্সের অণুবীক্ষণ যন্ত্রগুলির মাধ্যমে অসাধারণ রেজোলিউশন অর্জন করেছিলেন। রবার্ট হুক (১৬৩৫–১৭০৩) একাধিক গুরুত্বপূর্ণ সাধারণ জীববৈজ্ঞানিক পর্যবেক্ষণ করেছিলেন। উদ্ভিদের শারীরতত্ত্বের ভিত্তি স্থাপন করেছিলেন ইতালির মার্সেলো মালপিজি (১৬২৮–১৬৯৪) বোলোনিয়া বিশ্ববিদ্যালয়ে তার Anatome Plantarum (১৬৭৫) এবং রয়্যাল সোসাইটির ইংরেজ নেহেমিয়াহ গ্রিউ (১৬২৮–১৭১১) তার The Anatomy of Plants Begun (১৬৭১) এবং Anatomy of Plants (১৬৮২) গ্রন্থে। এই উদ্ভিদবিদরা বীজ থেকে পূর্ণাঙ্গ উদ্ভিদে বিকাশের রূপান্তর পর্যবেক্ষণ, বর্ণনা এবং আঁকার মাধ্যমে যা এখন উন্নয়নমূলক শারীরতত্ত্ব এবং আকারবিদ্যা হিসেবে পরিচিত, তা অন্বেষণ করেছিলেন, এবং কান্ড ও কাঠের গঠন লিপিবদ্ধ করেছিলেন। এই কাজে প্যারেনকাইমা এবং স্টোমাটা আবিষ্কার ও নামকরণও অন্তর্ভুক্ত ছিল।
উদ্ভিদ শারীরতত্ত্বে গবেষণা মূলত রসের প্রবাহ এবং শিকড়ের মাধ্যমে পদার্থ শোষণের উপর কেন্দ্রীভূত ছিল। ইয়ান হেলমন্ট (১৫৭৭–১৬৪৪) পরীক্ষামূলক পর্যবেক্ষণ এবং হিসাবের মাধ্যমে লক্ষ্য করেছিলেন যে কোনো উদ্ভিদের ওজন বৃদ্ধি শুধুমাত্র মাটি থেকে হতে পারে না এবং তিনি সিদ্ধান্তে পৌঁছেছিলেন যে এর সঙ্গে অবশ্যই জলের শোষণের সম্পর্ক আছে। স্টিফেন হেলস (১৬৭৭–১৭৬১) পরিমাণগত পরীক্ষার মাধ্যমে প্রমাণ করেছিলেন যে উদ্ভিদে জল শোষিত হয় এবং পরিবেশগত অবস্থার প্রভাবে তা উদ্ভিদে বাষ্পীভূত হয়: তিনি "শিকড়ের চাপ", "পাতার শোষণ" এবং "জল শোষণ" সম্পর্কে আলাদা আলাদা ধারণা দেন এবং লক্ষ্য করেন যে কাষ্ঠল টিস্যুতে রসের প্রধান প্রবাহের দিকটি ঊর্ধ্বমুখী। তার ফলাফল ভেজিটেবল স্ট্যাটিক্স (১৭২৭) গ্রন্থে প্রকাশিত হয়। তিনি আরও উল্লেখ করেছিলেন যে "বায়ু উদ্ভিদের একটি উল্লেখযোগ্য অংশ গঠন করে"। ইংরেজ রসায়নবিদ জোসেফ প্রিস্টলি (১৭৩৩–১৮০৪) অক্সিজেনের আবিষ্কারের জন্য খ্যাতি অর্জন করেন এবং উদ্ভিদ দ্বারা এর উৎপাদন সম্পর্কেও তিনি গবেষণা করেন। পরবর্তীকালে, ইয়ান ইনজেনহাউস (১৭৩০–১৭৯৯) পর্যবেক্ষণ করেন যে শুধুমাত্র সূর্যালোকে উদ্ভিদের সবুজ অংশ বাতাস শোষণ করে এবং অক্সিজেন নির্গত করে, যা উজ্জ্বল সূর্যালোকে আরও দ্রুত হয়, আর রাতে সব অংশ থেকে বায়ু (CO2) নির্গত হয়। তার ফলাফল এক্সপেরিমেন্টস আপন ভেজিটেবলস (১৭৭৯) গ্রন্থে প্রকাশিত হয় এবং এর মাধ্যমে ২০শ শতকের কার্বন সংশ্লেষণ গবেষণার ভিত্তি স্থাপিত হয়। তার পর্যবেক্ষণ থেকে, তিনি প্রকৃতিতে কার্বনের চক্রের একটি রূপরেখা তৈরি করেছিলেন, যদিও তখনও কার্বন ডাইঅক্সাইডের গঠন সম্পর্কে সঠিক ধারণা তৈরি হয়নি। উদ্ভিদ পুষ্টি সম্পর্কিত গবেষণাও অগ্রসর হয়েছিল। ১৮০৪ সালে, নিকোলাস-থিওডোর দে সসুর (১৭৬৭–১৮৪৫) এর Recherches Chimiques sur la Végétation দেখিয়েছিল যে উদ্ভিদ এবং প্রাণীর শ্বাস-প্রশ্বাসে মিল রয়েছে, কার্বন ডাইঅক্সাইড সংশ্লেষণে জল অন্তর্ভুক্ত রয়েছে, এবং যে সামান্য পরিমাণ লবণ এবং পুষ্টি (যা তিনি উদ্ভিদ ছাই থেকে রাসায়নিকভাবে বিশ্লেষণ করেছিলেন) উদ্ভিদের বৃদ্ধিতে শক্তিশালী প্রভাব ফেলে।
রুডলফ ক্যামেরারিয়াস (১৬৬৫–১৭২১) প্রথম পরীক্ষার মাধ্যমে উদ্ভিদের যৌনতা প্রমাণ করেন। ১৬৯৪ সালে তিনি তার এক সহকর্মীকে লেখা "ডে সেক্সু প্লান্টারাম এপিস্টোলা" শিরোনামের একটি চিঠিতে ঘোষণা করেছিলেন যে "পুরুষ যৌন অঙ্গ, অর্থাৎ পুংকেশরচক্র থেকে পরাগ না আসা পর্যন্ত উদ্ভিদের গর্ভকেশরচক্র এবং ডিম্বাশয় থেকে কোনো বীজাণু কখনো বীজে পরিণত হতে পারে না"।
পরে জার্মান পণ্ডিত এবং প্রাকৃতিক ইতিহাসবিদ জোসেফ কোলরয়টার (১৭৩৩–১৮০৬) এই কাজটি আরও সম্প্রসারিত করেন। তিনি পরাগমিলনে মকরন্দের ভূমিকা এবং বায়ু ও পোকামাকড়ের মাধ্যমে পরাগায়ণের ভূমিকা লক্ষ্য করেন। তিনি সংকর উদ্ভিদও তৈরি করেন, পরাগকণার ক্ষুদ্রাতিক্ষুদ্র গঠন পর্যবেক্ষণ করা এবং কীভাবে পরাগ থেকে ডিম্বাশয়ে পদার্থ স্থানান্তরিত হয়, যা ভ্রূণের গঠনের সূচনা করে, তা বিশ্লেষণ করার জন্য।
ক্যামেরারিয়াসের ১০০ বছর পর, ১৭৯৩ সালে, ক্রিশ্চিয়ান স্প্রেঙ্গেল (১৭৫০–১৮১৬) ফুলের পরাগায়ণে মধু নির্দেশকের ভূমিকা, পরাগমিলনের জন্য ফুলের অভিযোজনমূলক প্রক্রিয়া এবং পরাগমিলনের ব্যাপকতা বর্ণনা করে বিষয়টি আরও বিস্তৃত করেন।
মস, লিভারওয়ার্ট এবং শৈবালের প্রজনন প্রক্রিয়া উন্মোচনের মাধ্যমে উদ্ভিদের যৌনতার বিষয়ে অনেক কিছু শেখা যায়। ১৮৫১ সালে Vergleichende Untersuchungen গ্রন্থে, উইলহেল্ম হফমেইস্টার (১৮২৪–১৮৭৭)দেখান যে ফার্ন এবং ব্রায়োফাইট থেকে শুরু করে উদ্ভিদের যৌন প্রজনন প্রক্রিয়াটি স্পোরোফাইট এবং গ্যামেটোফাইট প্রজন্মের মধ্যে একটি "প্রজন্মের বিকল্পক্রম" অন্তর্ভুক্ত করে। এটি তুলনামূলক আকারবিদ্যা মরফোলজির একটি নতুন ক্ষেত্রের সূচনা করে। উইলিয়াম ফারলো (১৮৪৪–১৯১৯), নাথানায়েল প্রিংসহাইম (১৮২৩–১৮৯৪), ফ্রেডেরিক বোয়ার, এডুয়ার্ড স্ট্রাসবার্গার এবং অন্যান্যদের সম্মিলিত কাজের মাধ্যমে প্রতিষ্ঠিত হয় যে উদ্ভিদ জগতে "প্রজন্মের বিকল্পক্রম" ঘটে।
ঊনবিংশ শতাব্দীর মাঝামাঝি সময়ে, বিজ্ঞানীরা যে পদ্ধতিতে ধারণা আদান-প্রদান করতেন, তা পরিবর্তিত হয়। এর আগে, মানুষ প্রধানত ক্ষমতাশালী এবং সম্মানিত বিজ্ঞানীদের লেখা থেকে শিখত। কিন্তু এই সময়, বিশ্ববিদ্যালয় বা গবেষণা গোষ্ঠীগুলির মাধ্যমে প্রকাশিত পত্রিকাগুলিতে গবেষণা প্রকাশ হতে থাকে, যা পুরনো ধারণাকে চ্যালেঞ্জ করার উৎসাহ দেয়। এই পরিবর্তন শুরু হয়েছিল অষ্টাদশ শতাব্দীর শেষ দিকে, যখন নির্দিষ্ট ক্ষেত্রের বিজ্ঞান জার্নাল প্রকাশিত হতে শুরু করে। প্রথম "আধুনিক" পাঠ্যবই, ম্যাথিয়াস জ্যাকব শ্লেইডেনের(১৮০৪–১৮৮১) Grundzüge der Wissenschaftlichen Botanik, যা ১৮৪৯ সালে ইংরেজিতে Principles of Scientific Botany নামে প্রকাশিত হয়, উদ্ভিদবিদ্যাকে ব্যাপকভাবে উদ্দীপিত করে। ১৮৫০ সালের মধ্যে উদ্দীপিত জৈব রসায়ন অনেক উদ্ভিদ উপাদানের গঠন উদ্ঘাটন করেছিল। যদিও উদ্ভিদ শ্রেণীবিন্যাসের স্বর্ণযুগ তখন শেষ হয়ে গিয়েছিল, তবুও বর্ণনামূলক কাজ অব্যাহত ছিল। অগাস্টিন ডি ক্যান্ডল (১৭৭৮–১৮৪১) অঁতোয়ান-লরেন্ট ডি জুসিউয়ের পরে Prodromus Systematis Naturalis Regni Vegetabilis (১৮২৪–১৮৪১) নামক উদ্ভিদ প্রকল্প পরিচালনা করেন, যা ৩৫ জন সম্পাদনা করেছিলেন। এতে সেই সময়ে পরিচিত সমস্ত দ্বিবীজপত্রী উদ্ভিদ অন্তর্ভুক্ত ছিল, প্রায় ৫৮০০০ প্রজাতি এবং ১৬১টি পরিবারে বিভক্ত হয়ে। এই কাজটি তার পুত্র আলফঁস (১৮০৬–১৮৯৩) ১৮৪১ থেকে ১৮৭৩ সালের মধ্যে সম্পন্ন করেন।
১৯শ শতাব্দীর শুরুতে জলবায়ু এবং উদ্ভিদ বিতরণের মধ্যে সম্পর্কের প্রতি আগ্রহ বৃদ্ধি পায়। কার্ল উইলডেনাও বীজ ছড়ানো এবং উদ্ভিদ বিতরণের সম্পর্ক, উদ্ভিদ প্রকৃতি এবং ভূতাত্ত্বিক ইতিহাসের প্রভাব পরীক্ষা করেন। তিনি উত্তর আমেরিকা ও উত্তর এশিয়া, কেপ কলোনি এবং অস্ট্রেলিয়ার উদ্ভিদজগতের সাদৃশ্য লক্ষ্য করেন এবং "বৈচিত্র্যের কেন্দ্র" এবং "উৎপত্তির কেন্দ্র" ইত্যাদি ধারণা অন্বেষণ করেন। আলেকজান্ডার ফন হুমবোল্‌ড্‌ট্ ও বোনপ্ল্যান্ড তাদের ভ্রমণ নিয়ে একটি উল্লেখযোগ্য কাজ প্রকাশ করেন। রবার্ট ব্রাউন দক্ষিণ আফ্রিকা, অস্ট্রেলিয়া এবং ভারতের উদ্ভিদজগতের সাদৃশ্য পর্যবেক্ষণ করেন। জোয়াকিম শাউ উদ্ভিদ বন্টনে তাপমাত্রা, মাটির উপাদান এবং আলোর প্রভাবকে গভীরভাবে বিশ্লেষণ করেন, যা পরে আলফঁস ডি ক্যান্ডল আরও বিস্তৃত করেন। জোসেফ হুকার অ্যান্টার্কটিকা, ভারত এবং মধ্যপ্রাচ্যের উদ্ভিদ অধ্যয়নে এন্ডেমিজমের উপর উল্ল্যেখযোগ্য কাজ করেন। অগাস্ট গ্রিসেবাখ তার Die Vegetation der Erde তে জলবায়ুর সাথে উদ্ভিদের বাহ্যিক বৈশিষ্ট্যের সম্পর্ক পরীক্ষা করেন ।
শারীরবৃত্তীয় উদ্ভিদ ভূগোল, বা পরিবেশবিজ্ঞান, ১৯শ শতকের শেষদিকে উদ্ভিদজগতের ভৌগোলিক তথ্য থেকে উদ্ভূত হয়, যখন উদ্ভিদের উপর পরিবেশগত প্রভাবের প্রতি বেশি মনোযোগ দেওয়া হতে থাকে। এই ক্ষেত্রে প্রথম কাজটি হলো ডেনমার্কের অধ্যাপক ইউজেনিয়াস ওয়ার্মিং এর বই Plantesamfund । এই বইয়ে উদ্ভিদ, অভিযোজন এবং পরিবেশগত প্রভাবের নতুন ধারণা অন্তর্ভুক্ত ছিল। এর পরে ১৮৯৮ সালে অ্যান্ড্রিয়াস শিম্পার কর্তৃক আরেকটি উল্ল্যেখযোগ্য কাজ প্রকাশিত হয়, যার নাম Pflanzengeographie auf Physiologischer Grundlage ( এটি ১৯০৩ সালে ইংরেজিতে Plant-geography upon a physiological basis নামে অনুবাদ করা হয়)।
১৯শ শতকে, জার্মান বিজ্ঞানীরা উদ্ভিদের গঠন ও জীবনচক্রের একক তত্ত্বের দিকে অগ্রসর হন। ১৮ শতকের শেষে অণুবীক্ষণ যন্ত্রের উন্নতির পরে, চার্লস মিরবেল ১৮০২ সালে তার Traité d'Anatomie et de Physiologie Végétale প্রকাশ করেন। জোহান মোল্ডেনহাওয়ার ১৮১২ সালে Beyträge zur Anatomie der Pflanzen প্রকাশ করেন, যেখানে তিনি কোষ বিভাজনের কৌশল বর্ণনা করেন। তিনি ধমনী এবং প্যারেনকাইমা টিস্যু শনাক্ত করেন, ধমনীর গোছা বর্ণনা করেন, ক্যাম্বিয়ামের কোষ পর্যবেক্ষণ করেন এবং গাছের বৃত্ত ব্যাখ্যা করেন। তিনি দেখতে পান যে স্টোমাটা একক কোষ নয়, একজোড়া কোষ নিয়ে গঠিত।
কার্ল সানিও সেকেন্ডারি টিস্যু এবং ক্যাম্বিয়ামের কাজের বর্ণনা দেন। হুগো ভন মোল ১৮৫১ সালে তার Die Vegetabilische Zelle এ উদ্ভিদ কোষবিদ্যার সংক্ষিপ্তসার লেখেন। পরবর্তীতে হেইনরিখ অ্যান্টন ডে বারির ১৮৭৭ সালের ব্যাপক তুলনামূলক কোষবিদ্যা এ কাজের স্থান নেয়। ভ্যান টিগহেম শিকড় ও কাণ্ডের স্টিল সম্পর্কে জ্ঞান সম্পূর্ণ করেন। কার্ল নাগেলি মেরিস্টেম সম্পর্কে উল্লেখযোগ্য কাজ করেন। ফুলের উৎপত্তি নিয়ে গবেষণা এই সময়কালেই শুরু হয়েছিল।
উদ্ভিদের মধ্যে জল এবং পুষ্টি পরিবহন কীভাবে ঘটে তা বিজ্ঞানীদের মধ্যে অমীমাংসিত ছিল। জীবতত্ত্ববিদ ফন মল দ্রবণের পরিবহন এবং শিকড় দ্বারা জলগ্রহণ তত্ত্ব নিয়ে কাজ করেন। তিনি সংহতি, বাষ্পীভবনীয় টান, সূক্ষ্ম নালীকরণ এবং শিকড়ের চাপের ধারণা ব্যবহার করেন। পরীক্ষামূলক শারীরবিদ্যার ক্ষেত্রে জার্মান বিজ্ঞানীদের প্রাধান্য দেখা যায়। ভিলহেম নপ এবং জুলিয়াস ভন স্যাক্স ১৮৮২ সালে প্রকাশিত স্যাক্সের "Vorlesungen über Pflanzenphysiologie" নামক উদ্ভিদের শারীরবিদ্যা বিষয়ক পাঠ্যপুস্তকের মাধ্যমে প্রতিষ্ঠিত করেন, যা এই সময়ের কাজগুলোর সংশ্লেষণ করে। তবে, অন্য দেশেও কিছু অগ্রগতি হয়েছিল, যেমন ইংরেজ থমাস নাইটের দ্বারা জিওট্রপিজম (মাধ্যাকর্ষণ দ্বারা বৃদ্ধি নিয়ন্ত্রণ) বিষয়ে প্রাথমিক অনুসন্ধান এবং ফরাসি বিজ্ঞানী হেনরি ডুট্রোশেট (১৭৭৬–১৮৪৭) দ্বারা অভিস্রবণ সংক্রান্ত গবেষণা। আমেরিকান বিজ্ঞানী ডেনিস রবার্ট হোগল্যান্ড (১৮৮৪–১৯৪৯) উদ্ভিদের পুষ্টি শোষণ এবং স্থানান্তর প্রক্রিয়া যে বিপাকীয় শক্তির উপর নির্ভর করে তা আবিষ্কার করেন।
রবার্ট ব্রাউন ১৮৩১ সালে প্রথম কোষের নিউক্লিয়াস আবিষ্কার করেন। জীবের সমস্ত কোষ যে কোষীয় গঠনের অধিকারী এবং প্রতিটি কোষ জীবনের সমস্ত বৈশিষ্ট্য ধারণ করে, এই ধারণাটি উদ্ভিদবিজ্ঞানী ম্যাথিয়াস শ্লেইডেন এবং প্রাণিবিজ্ঞানী থিওডর শোয়ান (১৮১০–১৮৮২) এর যৌথ প্রচেষ্টার মাধ্যমে ১৯ শতকের গোড়ার দিকে প্রতিষ্ঠিত হয়। এর আগেই মোল্ডেনহাওয়ার দেখিয়েছিলেন যে উদ্ভিদ সম্পূর্ণরূপে কোষীয় এবং প্রতিটি কোষের নিজস্ব কোষপ্রাচীর আছে। জুলিয়াস ফন স্যাচস প্রমাণ করেছিলেন যে কোষপ্রাচীরের মধ্যে প্রোটোপ্লাজমের অবিচ্ছিন্নতা রয়েছে।
১৮৭০ থেকে ১৮৮০ সালের মধ্যে স্পষ্ট হয়েছিল যে নিউক্লিয়াস কখনো নতুনভাবে গঠিত হয় না, বরং অন্য কোষ কেন্দ্র থেকে বিভাজিত হয়। ১৮৮২ সালে ফ্লেমিং কোষ বিভাজনের সময় ক্রোমোজোমের অনুদৈর্ঘ্য বিভাজন পর্যবেক্ষণ করেন এবং সিদ্ধান্তে পৌঁছান যে প্রতিটি কন্যা নিউক্লিয়াস মাতা কোষ নিউক্লিয়াসের প্রতিটি ক্রোমোজোমের অর্ধেক পায়। এরপর ২০ শতকের গোড়ার দিকে জানা যায় যে একটি নির্দিষ্ট প্রজাতির ক্রোমোজোমের সংখ্যা নির্দিষ্ট থাকে। জিনগত ধারাবাহিকতা নিশ্চিত হওয়ার পরে এবং এডুয়ার্ড স্ট্রাসবার্গার দেখিয়েছিলেন যে প্রজনন কোষগুলির (পরাগ এবং ভ্রূণ) কোষ নিউক্লিয়াসে একটি হ্রাস বিভাজন ঘটে (যা এখন মিয়োসিস নামে পরিচিত), বংশগতির ক্ষেত্রটি উন্মোচিত হয়। ১৯২৬ সালের মধ্যে, থমাস মর্গান জিনের গঠন ও কার্যক্রম সম্পর্কে একটি তত্ত্ব তৈরি করতে সক্ষম হন। প্লাস্টিডের গঠন ও কার্যকারিতাও একইভাবে গবেষণার বিষয়বস্তু ছিল, এবং তাদের সঙ্গে শর্করার সম্পর্ক আগেই উল্লেখ করা হয়েছিল। সকল জীবের কোষীয় গঠন, কোষ বিভাজন এবং জিনগত উপাদানের ধারাবাহিকতা পর্যবেক্ষণ করে প্রোটোপ্লাজম ও কোষপ্রাচীরের পাশাপাশি প্লাস্টিড ও ভ্যাকুয়োলের গঠন বিশ্লেষণ করা হয় – যা আজকে সাইটোলোজি বা কোষ তত্ত্ব নামে সুপ্রতিষ্ঠিত।
পরবর্তীতে, ১৯০০–১৯৪৪ সালের মধ্যে জিন-ক্রোমোজোম বংশগতির তত্ত্বের সাইটোলোজিকাল ভিত্তি প্রসারিত হয় । গ্রেগর মেন্ডেলের (১৮২২–১৮৮৪) উদ্ভিদের বংশগতির নীতি পুনরাবিষ্কারের মাধ্যমে শুরু হয়, যা প্রথম ১৮৬৬ সালে এক্সপেরিমেন্টস অন প্ল্যান্ট হাইব্রিডাইজেশন এ প্রকাশিত হয় এবং চাষ করা পিসাম স্যাটিভাম এর উপর ভিত্তি করে ছিল। এটি উদ্ভিদ জিনতত্ত্বের একটি নতুন অধ্যায় উন্মোচন করে। জিন-ক্রোমোজোম তত্ত্বের সাইটোলোজিকাল ভিত্তি পলিপ্লয়েডি এবং প্রজাতির উদ্ভবের ক্ষেত্রে সংকরায়ণের ভূমিকা দ্বারা অন্বেষণ করা হয়, এবং ক্রমবর্ধমানভাবে বোঝা যাচ্ছিল যে আন্তঃপ্রজনন জনসংখ্যা জীববিজ্ঞানের অভিযোজন পরিবর্তনের একক।
১৮৬০ এর দশক পর্যন্ত মনে করা হতো যে প্রজাতি সময়ের সঙ্গে অপরিবর্তিত থাকে: প্রতিটি জীববৈজ্ঞানিক রূপ একটি স্বতন্ত্র সৃষ্টিকর্মের ফল এবং সম্পূর্ণ ভিন্ন এবং অপরিবর্তনীয়। কিন্তু এই ধারনায় ভূতাত্ত্বিক গঠন এবং অজানা জীবাশ্মর বৈজ্ঞানিক ব্যাখ্যা করা যেত না । চার্লস ডারউইনের অরিজিন অফ স্পিসিস (১৮৫৯) প্রজাতির ধ্রুবতার ধারণাকে প্রতিস্থাপন করে বংশগতির সাথে পরিবর্তনের তত্ত্ব প্রতিষ্ঠা করে। ফাইলোজেনি একটি নতুন নীতি হয়ে ওঠে কারণ "প্রাকৃতিক" শ্রেণীবিভাগগুলি কেবলমাত্র সাদৃশ্য নয়, বিবর্তনীয় সম্পর্ককে প্রতিফলিত করতে শুরু করে। উইলহেম হফমিস্টার দেখান যে সমস্ত উদ্ভিদে প্রজন্মের পরিবর্তন এবং কাঠামোর বিস্তৃত সাদৃশ্যের মাধ্যমে সংগঠনের একটি অনুরূপ প্যাটার্ন রয়েছে।
জার্মান লেখক ইয়োহান উলফগ্যাং ভন গ্যেটে (১৭৪৯–১৮৩২) ডাই মেটামরফোসে ডার প্লান্টসেন (১৭৯০) গ্রন্থে উদ্ভিদের রূপবিজ্ঞান সম্পর্কে একটি তত্ত্ব দেন (তিনিই "মরফোলজি" শব্দটি প্রবর্তন করেন) এবং তিনি তাঁর "মেটামরফোসিস" ধারণার মধ্যে বিবর্তনের সময় পরিবর্তন অন্তর্ভুক্ত করেছিলেন, যা তুলনামূলক রূপবিজ্ঞানকে ফাইলোজেনির সাথে সংযুক্ত করে। যদিও তাঁর কাজের উদ্ভিদবিদ্যাগত ভিত্তি নিয়ে বিতর্ক রয়েছে, তবুও এতে সন্দেহ নেই যে তিনি ফুলের অংশগুলির উত্স এবং কার্যকারিতা সম্পর্কে আলোচনা ও গবেষণা উত্সাহিত করেছিলেন। তাঁর তত্ত্ব সম্ভবত জার্মান উদ্ভিদবিদ আলেকজান্ডার ব্রাউন (১৮০৫–১৮৭৭) এবং ম্যাথিয়াস শ্লেইডেনের বিরোধী মতামতগুলোকে উদ্দীপিত করেছিল, যারা পরীক্ষামূলক পদ্ধতিটি বৃদ্ধির নীতি এবং রূপের ক্ষেত্রে প্রয়োগ করেছিলেন, যা পরে অগাস্টিন ডে ক্যান্ডোল (১৭৭৮–১৮৪১) দ্বারা সম্প্রসারিত হয়।
২০শ শতকের বিজ্ঞান ১৯শ শতকে গড়ে ওঠা বিস্তৃত দৃষ্টিভঙ্গি এবং বিস্তারিত পরীক্ষামূলক পর্যবেক্ষণের মজবুত ভিত্তির উপর দাঁড়িয়েছিল। গবেষণার একটি বিশাল শক্তি উদ্ভিদ সংক্রান্ত জ্ঞানের দিগন্তকে সমস্ত স্তরে, অণু থেকে শুরু করে বৈশ্বিক উদ্ভিদ প্রতিবেশব্যবস্থা পর্যন্ত, দ্রুত সম্প্রসারিত করছিল। এই সময় জীববিজ্ঞানের গঠন ও কার্যকারিতার ঐক্যের প্রতি সেলুলার এবং জৈবরাসায়নিক স্তরে সচেতনতা তৈরি হয়েছিল। উদ্ভিদবিজ্ঞানের অগ্রগতি ছিল পদার্থবিদ্যা ও রসায়নের অগ্রগতির সাথে ঘনিষ্ঠভাবে সম্পর্কিত, যেখানে ২০শ শতকে প্রধান অগ্রগতিগুলি মূলত অণুর সংগঠনে প্রবেশের সাথে সম্পর্কিত। তবে উদ্ভিদ সম্প্রদায়ের স্তরে পরিবেশবিদ্যা এবং জনসংখ্যা জেনেটিক্সের উপর কাজকে একত্রিত করতে এই শতকের মধ্যভাগ পর্যন্ত সময় লেগেছিল। ১৯১০ সালের মধ্যে, লেবেলযুক্ত আইসোটোপ ব্যবহার করে উদ্ভিদের জৈবরাসায়নিক পথগুলো উদ্ঘাটনের জন্য পরীক্ষা-নিরীক্ষা শুরু হয়, যা জিন প্রযুক্তির গবেষণার পথ খুলে দেয়।
১৯০৩ সালে প্রথম ক্লোরোফিল a এবং b পাতলা স্তরীয় ক্রোম্যাটোগ্রাফি দ্বারা পৃথক করা সম্ভব হয়। এরপর, ১৯২০ এবং ১৯৩০-এর দশকে, জৈব রসায়নবিদরা, বিশেষত হান্স ক্রেবস (১৯০০–১৯৮১),কার্ল কোরি (১৮৯৬–১৯৮৪) ও গার্টি কোরি (১৮৯৬–১৯৫৭), জীবনের মূল বিপাকীয় পথগুলো চিহ্নিত করতে শুরু করেন। ১৯৩০ থেকে ১৯৫০-এর দশকের মধ্যে, এটিপি (ATP) মাইটোকন্ড্রিয়াতে অবস্থিত এবং এটি কোষের রাসায়নিক শক্তির উৎস হিসেবে নির্ধারিত হয়েছিল, এবং ফটোসিন্থেসিসের (ছত্রাকসংশ্লেষণের) বিভিন্ন প্রতিক্রিয়া ক্রমশ উদ্ঘাটিত হতে থাকে। ১৯৪৪ সালে প্রথমবারের মতো ডিএনএ (DNA) নিষ্কাশিত হয়। এই আবিষ্কারগুলোর পাশাপাশি উদ্ভিদ হরমোন বা "বৃদ্ধি পদার্থ", বিশেষ করে অক্সিন (১৯৩৪), জিব্বেরেলিন(১৯৩৪) এবং সাইটোকাইনিন (১৯৬৪) এবং ফটোপিরিয়ডিজমের প্রভাব, যা দিনের এবং রাতের আপেক্ষিক দৈর্ঘ্যের দ্বারা উদ্ভিদ প্রক্রিয়া, বিশেষত ফুল ফোটানো নিয়ন্ত্রণ করে, আবিষ্কৃত হয়।
মেন্ডেলের নীতি প্রতিষ্ঠার পর, অগাস্ট ওয়েইসম্যানের কাজের মাধ্যমে জিন-ক্রোমোজোম তত্ত্বটি নিশ্চিত করা হয়, যিনি ক্রোমোজোমকে বংশগত উপাদান হিসেবে চিহ্নিত করেন। তিনি জীবকোষে ক্রোমোজোম সংখ্যার অর্ধেক হয়ে যাওয়ার বিষয়টি পর্যবেক্ষণ করে মেইয়োসিস প্রক্রিয়ার সূক্ষ্ম বিবরণ নিয়ে আগাম ধারণা দিয়েছিলেন, যা জীবকোষে বংশগত উপাদানের পুনর্বন্টনের জটিল প্রক্রিয়া। ১৯২০ এবং ১৯৩০-এর দশকে, জনসংখ্যা জেনেটিক্স মেন্ডেলীয় জেনেটিক্সের সঙ্গে বিবর্তন তত্ত্বকে একত্রিত করে আধুনিক সংশ্লেষণ তৈরি করে। ১৯৬০-এর দশকের মাঝামাঝি সময়ে, বিপাক এবং প্রজননের জৈবিক ভিত্তি আণবিক জীববিজ্ঞানের নতুন শাখার মাধ্যমে দৃঢ়ভাবে প্রতিষ্ঠিত হয়। ১৯৭০-এর দশকে, জেনেটিক ইঞ্জিনিয়ারিং, ক্লোনিংয়ের জন্য কোনো হোস্ট কোষে জিন প্রবেশ করানো, পুনঃসংযোজিত ডিএনএ প্রযুক্তি আবিষ্কারের মাধ্যমে শুরু হয় এবং এর বাণিজ্যিক প্রয়োগ ১৯৯০-এর দশকে কৃষিক্ষেত্রে ব্যবহার করা হয়। তখন মলিকুলার "ফিঙ্গারপ্রিন্টিং"-এর মাধ্যমে জীবদের শনাক্তকরণ এবং মলিকুলার "ঘড়ি" ব্যবহার করে অতীতে গুরুত্বপূর্ণ বিবর্তনীয় পরিবর্তনগুলোর সময় নির্ধারণের সম্ভাবনা তৈরি হয়।