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Ils ont mis au point le TrialsTracker 8 , qui identifie toutes les études devant publier leurs résultats sur ClinicalTrials. gov et dans le Registre des essais cliniques de l9UE, et vérifie si elles respectent effectivement la loi. Le nombre d9essais en retard, c9est-à-dire qui auraient dû publier leurs résultats mais des données à sa disposition, que les essais aient été publiés ou non. Le fait de cantonner la méta-analyse aux données publiées a fait augmenter de 32 % l9importance de l9effet constaté, entre 11 % et 69 % selon le médicament évalué individuellement. Transparence des recherches en santé Que faire ? Les méta-chercheurs essaient toujours d9inventer des solutions faciles et peu coûteuses pour améliorer la recherche. En l9occurrence, nous avons proposé Isabelle Boutron Cochrane/Inserm/Université de Paris d9envoyer un courriel rappelant aux participants aux essais cliniques l9obligation légale d9en publier les résultats sur ClinicalTrials.
Nous avons des exigences similaires en Europe avec la nécessité de publier les résultats sommaires des essais cliniques dans le Registre des essais cliniques de l9Union Européenne 4. Néanmoins, avons-nous bien accès aux informations relatives aux essais cliniques ? Une étude a été réalisée pour évaluer la disponibilité publique des résultats des essais évaluant les médicaments anticancéreux aux États-Unis 5. Tous les essais sélectionnés étaient régis par le FDA Amendments Act et étaient censés publier leurs résultats. Cependant, trois ans après la fin de l9étude, 69 % des essais n9avaient pas de résultats affichés sur le registre ClinicalTrials. gov et la moitié d9entre eux n9avaient pas de résultats accessibles au public, c9est-à-dire aucun résultat affiché ou publié. ne l9ont pas fait, augmente avec le temps.
Dans ce modèle, les chercheurs sont explicitement encouragés à soumettre des travaux courts. Ceux-ci sont examinés par des pairs et publiés de manière assez standard. Il n9est pas nécessaire de réunir ses nombreuses découvertes au sein d9une théorie globale, et ces résultats sont indexés dans des bases de données comme PubMed et Europe PMC. Une deuxième innovation est le pré-enregistrement et les rapports enregistrés. Le pré-enregistrement consiste à publier dans un registre en libre accès la conception d9une future étude, en en partageant à l9avance protocoles et méthodes. Les rapports enregistrés 4   vont un peu plus loin : dans ce cas de figure, les revues (plus de 300) acceptent d9évaluer et de publier des articles en se basant uniquement sur la conception de l9étude et sa méthodologie, et non sur ses futurs résultats.
On peut citer par exemple une coopération lancée entre le Mexique et l9Angola autour du LA Diamant, qui oblige à se demander comment un État aux ressources limitées peut investir au mieux dans ses universités pour créer des mécanismes appropriés de communication scientifique et encourager la création de plateformes et d9entrepôts nationaux, ainsi que, surtout, comment soutenir à long terme et renforcer un travail collectif autour de cet écosystème de l9accès ouvert non commercial. L9édition scientifique et l9Amérique latine Arianna Becerril-García Universidad Autónoma del Estado de México/Redalyc Pour aller plus loin Ce genre de liens réciproques gagnerait énormément à être généralisé à toutes les bases de données bibliographiques. » Il est important d9utiliser une terminologie précise et de comprendre la différence entre ces différents modèles, car ils mettent en Suvre énormément d9innovations « Les micropublications sont surtout utiles aux communautés scientifiques dans les- et d9expérimentations.
Et c9est autour de cette communauté que nous avons lancé un projet de recherche qui a été financé par la Sloan Foundation et le Publishing Research Consortium sur une longue période, entre Il y a une véritable culture du facteur d9impact dans la manière dont on forme les jeunes chercheurs, et cette culture se négocie parfois entre jeunes chercheurs et seniors : est-ce que je vais soumettre cet article dans cette revue qui a un facteur d9impact élevé, ou avoir une stratégie plus safe et soumettre dans une revue avec un moindre facteur d9impact, ou le contraire ? Ces stratégies, qui se retrouvent d9un jeune chercheur à l9autre, d9un pays à l9autre, sont véritablement structurées autour du facteur d9impact et les bases de données internationales, je pense au Web of Science, à Scopus, qui sont là pour enraciner et justifier cette stratégie.
« La publication scientifique ne doit pas se limiter aux revues et aux articles. Il s9agit de savoir comment valoriser d9autres ensembles de compétences et d9autres domaines d9expertise qui ne débouchent pas nécessairement sur la publication d9un article. » « Dans le changement de paradigme vers une évaluation de la recherche davantage basée sur la qualité, on permet aux chercheurs de participer activement à cette évaluation. On leur demande quels domaines de recherche et quelles activités de recherche ils considèrent comme les plus importants sur une période donnée. On obtient ainsi des indicateurs basés sur les opinions des chercheurs plutôt que ceux fournis par des bases de données très coûteuses appartenant à des acteurs commerciaux hégémoniques. Science ouverte et évaluation académique dans un monde pluriel Fernanda Beigel CONICET National University of Cuyo-Mendoza, Argentine Évaluation de la recherche 3 Deuxième session » Références 1.
L9un des points clés à cet égard est le multilinguisme. Le caractère hypercentral de l9anglais ne fait désormais absolument aucun doute dans le monde de la recherche. Cependant, bien que l9anglais soit une réalité dominante, il n9est pas l9unique réalité, et en Amérique du Sud, nous disposons d9un certain nombre de voies de circulation des connaissances qui passent outre l9usage de l9anglais. En interrogeant par exemple Scopus ou le Web of Science, les articles en espagnol ou en portugais représentent une part marginale. Par contraste, la base de données OLIVA7  , qui réunit les entrées de SciELO et de Redalyc, compte 345 391 entrées en espagnol, soit plus que le Web of Science (270 632 entrées) et quasiment autant que Scopus (373 419 entrées). On peut faire le même constat dans BIBLAT 8 et dans LA Referencia 9, cette dernière base comportant énormément plus de références en portugais que Scopus et le Web of Science.
Des données provenant de huit pays européens 2 montrent que la base de données du Web of Science ne couvre qu9une petite partie de toutes les publications évaluées par les pairs en sciences humaines. La publication de monographies est un moyen important de communiquer la recherche, mais celles-ci sont invisibles dans le Web of Science ou dans Scopus. Par exemple, seuls 15 % de toutes les publications des chercheurs polonais en SHS sont indexées dans le Web of Science et seulement un peu plus de 50 % de celles des chercheurs danois. Heureusement, depuis plus d9une décennie, divers pays européens utilisent actuellement des systèmes nationaux d9information de recherche, grâce auxquels nous pouvons obtenir une bonne image de l9ensemble du paysage de la publication dans le monde académique. Une étude a été réalisée sur le pourcentage de publications de SHS évaluées par les pairs publiées en anglais, dans les langues nationales et dans d9autres langues dans huit pays européens.
Dans cette étude, nous avons pris en compte tous les types de publications et les résultats ne se limitent pas aux publications indexées dans les plus grandes bases de données de citations. Dans les pays nordiques, la plupart des publications sont en anglais, mais dans les pays d9Europe centrale et orientale, la Science ouverte, évaluation de la recherche et SHS (sciences humaines et sociales) Emanuel Kulczycki Université Adam Mickiewicz de PoznaE Pour aller plus loin Nous devons travailler ensemble, aussi est-il nécessaire de prêter attention à toutes les initiatives internationales (et il y en a beaucoup ces jours-ci 3 je suis d9accord pour dire que nous gagnons du terrain) et de partager nos propres expériences lors de conférences comme celle-ci. Nous partageons tous une même vision et nous nous efforçons d9établir un changement de culture, mais nous avons besoin de diversité dans les approches, nous avons besoin de communication et nous avons besoin de partager nos bonnes pratiques pour rendre ce changement possible.
Nous avons besoin d9accéder au code source qui le sous-tend, afin de le promouvoir. Il ne s9agit pas forcément de publications de recherche, les logiciels ne rentrent pas dans le cadre des styles de citation habituels, et les éditeurs ne savent pas comment les étiqueter ou comment les traiter. C9est un problème sur lequel je me suis penchée. De plus, comme dit, les logiciels ne sont pas statiques, ils ne se comportent donc pas comme une publication de recherche pour laquelle vous obtenez votre DOI, vous le publiez et c9est fini. Ce n9est pas non plus la même chose que des données. Toutes ces questions sont problématiques pour nous, éditeurs, qui essayons de gérer la citation du code. Une solution très populaire dans le monde de l9édition a été de faire des liens entre GitHub et Zenodo. Les auteurs de code peuvent très facilement archiver leur code sur Zenodo et obtenir un DOI.
Les DOI sont au cSur de l9activité des éditeurs, qui comprennent de quoi il s9agit. Nous utilisons les DOI via Crossref pour les articles de journaux depuis très, très longtemps, ce sont des éléments faciles à reconnaître pour les éditeurs et dont le code est archivé quelque part, donc tout le monde est gagnant dans cette situation. Zenodo peut également renvoyer vers le site GitHub, de sorte que si des modifications sont apportées, il est possible d9aller voir ce qui s9y trouve. Grâce au travail d9un spécialiste des données d9Europe PMC, nous avons sélectionné 7 000 documents XML aléatoires, et y avons trouvé 300 000 citations. Sur ce grand nombre, seules 10 renvoyaient vers Zenodo, que nous avons identifiées en utilisant le système DOI de Zenodo. Comme Roberto l9a dit plus tôt, il existe des archives dédiées aux logiciels, ce que n9est pas Zenodo.
Sur ces 10 citations, trois renvoyaient à des jeux de données, une à un article de journal et les autres à des logiciels. Cependant, en regardant comment les éditeurs ont intitulé ces contenus lorsqu9ils ont structuré leurs citations au format XML, nous avons constaté qu9il n9y en avait qu9une seule qui était bien identifiée comme un logiciel, toutes les autres étaient un méli-mélo de choses différentes, ce qui est problématique si nous cherchons comment citer, attribuer et réutiliser des logiciels de façon convenable. L9un des problèmes auxquels j9ai souvent réfléchi est que Zenodo n9est pas synonyme de dépôt de code, et qu9il n9est donc pas possible pour les éditeurs de dire : « Bon, d9accord, il y a un DOI Zenodo, identifiez-le comme du code », car ce n9est pas si simple. Zenodo contient beaucoup de choses différentes.
Les éditeurs connaissent parfaitement Crossref, qui est maintenu par des éditeurs. Ils obtiennent des DOI et utilisent les outils de Crossref pour valider des références, les vérifier et récupérer d9éventuelles métadonnées manquantes ou ajouter des DOI à leurs publications si les auteurs ne les ont pas fournies. Mais c9est DataCite qui fournit des DOI à Zenodo, et beaucoup d9éditeurs n9utilisent pas les outils de DataCite pour vérifier leurs références. Par conséquent, si des DOI sont générés pour Zenodo, ils ne bénéficient souvent pas des étapes de validation supplémentaires qui permettent à l9éditeur de préciser s9il s9agit d9un code, de données ou autre. Une solution autre que Zenodo est la solution Software Heritage, dont a parlé Roberto. C9est la voie qu9a empruntée eLife. L9équipe avait le pressentiment que les DOI n9étaient finalement que des constructions d9éditeurs, et donc pas nécessairement la meilleure voie à suivre pour référencer toutes les différentes variétés de logiciels.
Software Heritage archive des contenus provenant d9un grand nombre de sources différentes. Il renvoie à des éléments spécifiques de code, il interroge et génère des mises à jour et indexe davantage de sources, mais un autre élément décisif pour eLife était qu9il n9est pas nécessaire de demander aux auteurs d9indexer, de créer le lien Zenodo et d9archiver leur code eux-mêmes. Nous pouvions le faire pour eux, ce qui a été fondamental pour nous car, comme vous le savez, ma première remarque a été : « Oh non, encore une autre chose qu9ils me demandent de faire. » Nous avons estimé que nous ne voulions pas insister pour qu9ils fassent le travail supplémentaire. Nous allions le faire pour eux. Melissa Harrison EMBL-EBI.
Nous voulions également des identifiants pérennes, largement connus et attribuables à tout matériau correctement archivé. Malheureusement, GitHub ne produit pas d9éléments de ce genre, mais Zenodo et Software Heritage le font. Dans le sous-ensemble d9articles d9eLife et de PeerJ que nous avons examinés, nous avons constaté que 202 d9entre eux avaient un identifiant pérenne, tous des DOI. À défaut, la meilleure solution consiste à intégrer dans la référence un lien externe, même si nous en connaissons tous les limites. Il est bien mieux d9intégrer des identifiants-systèmes dans les références, mais à défaut, des liens externes fonctionnent, et nous avons identifié dans notre sous-ensemble 2 524 entrées avec des liens externes. Cela signifie malheureusement que 3 834 autres ne contenaient ni identifiant pérenne ni lien externe, ce qui les rend beaucoup plus difficiles à identifier, interroger et réutiliser du point de vue de leurs références.
Je conclurai en reconnaissant que la route est encore longue, nous le savons, mais de nombreux progrès ont déjà été réalisés. Les logiciels gagnent du terrain. Le fait qu9il s9agisse de l9un des piliers de la conférence d9aujourd9hui montre à quel point ils sont importants et à quel point les gens pensent qu9ils devraient l9être. Dans le monde de l9édition, le fait qu9autant de personnes aient contribué au sein du groupe de travail JATS4R à la rédaction de notre recommandation et à sa mise en Suvre est remarquable. L9un des enjeux qui persiste est la difficulté à choisir quelle voie prendre. Par exemple, chez eLife, nous avons choisi la voie du patrimoine logiciel. Il y a aussi Zenodo. Je suis sûre qu9il y en aura d9autres et qu9il y aura différentes manières de travailler. Cette diversité peut poser problème en attendant d9atteindre ce point de basculement où tout le monde se retrouvera sur la même voie, mais pour l9instant l9avenir est incertain.
Remerciements Je remercie tout particulièrement  Jenny Boucard  pour ses retours approfondis dans l'écriture de cette introduction. Je remercie également François Jarrige et  Jean-Baptiste Bahers  pour leurs précieux conseils, ainsi que les membres du Comité de rédaction des  Cahiers F. Viète ,  Josep Simon  et  Alexis Vrignon , qui ont beaucoup apporté au numéro par leur suivi scientifique.
Methods of literature research and aim of the review Our literature search was performed using PubMed 3 and Google Scholar 4 using the keywords "dog" OR "canine" AND "digestion", "pH", "enzyme", "digestive secretions", "absorption", "microbiota", "bile acids", "transit time", "short chain fatty acids", "fermentation", "gas", "mucus", "in vitro", "model" in all available years. The online database search was last performed in August 2021 on titles, abstracts, and key words including original articles, reviews, theses, and books. Relevant studies were identified after consultation of the main text, figures and supplementary materials, and information regarding involved dogs (i. e. , number of dogs, age, weight, breed, sex, reproduction state, living environment), alimentation (i. e. , type of food, feeding frequency, principal components of food), health (i.
Baseline data by study site Table  2  shows the characteristics of patients at baseline and D28 in the five study sites. Some data are not shown as some variables were "not measured" (nm) according to authors. Age was not measured in Kamundala in the A. afra group but was measured in the A. annua and ASAQ groups. How can some core baseline variables be collected in some randomization arms but not in others in a double blind randomized controlled trial? Age must be collected before randomization. The same problem applies to parasitemia (trophozoites/µl) at D0 and D28. The handling of these missing data on a major outcome is never described: were these patients excluded for parasitemia analyses)?.
, 1973)  : 1 thorax + 1 abdomen. À partir du signal obtenu, nous mesurons l'amplitude des gestes inspiratoires, définie comme étant la différence entre la valeur minimum et la valeur maximum du mouvement respiratoire (Rochet-Capellan & Fuchs, 2013), en fonction de la capacité vitale de chaque individu. La calibration a été réalisée pour chaque locuteur au début de la passation. Cinq cycles respiratoires complets ont été enregistrés. La manoeuvre a ensuite été répétée en respiration forcée. Les locuteurs avaient pour consigne de respirer aussi fort que possible. Cinq cycles respiratoires ont été enregistrés. Grâce à ces manoeuvres, nous pouvons estimer le déplacement maximal thoraco-abdominal  (Rochet-Capellan & Fuchs, 2013). Les signaux respiratoires et acoustiques synchronisés ont été traités à l'aide du logiciel MatLab (The Matworks, version R2021b).
Résultats Nous avons procédé aux analyses statistiques à l'aide du logiciel RStudio  (version 3. 5. 1, 2018). Le seuil de significativité est : p < 0,05. L'indice de significativité des durées a été calculé à l'aide du U-test de Wilcoxon, ces variables ne suivant pas une loi normale. Afin d'étudier la variabilité des mouvements inspiratoires, nous avons mené une analyse de variance multiple (anova) selon les facteurs suivants : la localisation syntaxique et l'âge des locuteurs.
Variations saisonnières des péritonites entériques en Belgique et France: données du RDPLF (Seasonal variations of enteric peritonitis in Belgium and France: from RDPLF data) Résumé Peu d'informations sont disponibles sur l'écologie saisonnière des germes responsables des péritonites en dialyse péritonéale. Nous avons réalisé une étude rétrospective à partir de la base de données du RDPLF portant sur les 20 dernières années et 20411 épisodes de péritonites. Nous montrons une proportion de péritonites à germes entériques plus élevée en été, la plus faible en hiver et identique au printemps et en automne. Cette proportion de germes d'origine entérique plus élevée en été a elle même tendance à augmenter ces dernières années. Nous postulons qu'une contamination alimentaire par des germes entériques associée à une translocation bactérienne accrue au niveau du tube digestif, elle-même favorisée par la constipation et des changements saisonniers d'alimentation pourrait être responsable de ce phénomène.
PATIENTS ET MÉTHODES Nous avons réalisé une étude observationnelle de cohorte pour mesurer les variations de l'écologie bactérienne des péritonites en dialyse péritonéale en France métropolitaine et Belgique dans le Registre de Dialyse Péritonéale de Langue Française (RDPLF]. La base de données du RDPLF est déclarée à la Commission Nationale de L'Information et des libertés sous le numéro : 11950164795. Les données ont été exportées dans un fichier indépendant après anonymisation totale et irréversible. S'agissant de données rétrospectives à partir d'un registre le consentement écrit des patients n'était pas nécessaire pour l'étude. La conception et le fonctionnement du RDPLF ont été décrit par ailleurs  [1]  La variable d'intérêt dans cette étude est le germe responsable de péritonites en dialyse péritonéale, tel qu'enregistré par les infirmières et médecins des centres participants, sur la base des résultats de leur laboratoire de bactériologie respectif.
Nous avons sélectionné dans la base de données du RDPLF les centres de Belgique et France, dont les conditions climatiques sont voisines ; les régions francophones du sud ont été exclues du fait de conditions climatiques très différentes. Nous avons étudié l'ensemble des péritonites déclarées de 2000 à 2019. La description du traitement n'est pas disponible dans la base de données, mais nous avons postulé que la durée moyenne de traitement est de 2 semaines. Comme la définition de récidive de l'ISPD [3 ] est la survenue d'une péritonite dans les 4 semaines qui suivent l'arrêt du traitement nous avons définis comme récidive toute péritonite au même germe survenant dans les 6 semaines de la date de l'épisode précédent. Afin de ne conserver que les germes clairement identifiés selon leurs fréquences saisonnière, nous avons supprimé les épisodes de liquide trouble en rapport avec un hémo péritoine, une ré-action à éosinophiles, les péritonites chyleuse aseptique, les péritonites sans germe identifié, les récidives.
Statistiques : Les résultats sont présentés en pourcentages de péritonites selon les saisons. Le test du chi2 a été appliqué sur les nombres de péritonites observées. Un p<. 05 a été considéré comme statistiquement significatif. Tests effectués sur le logiciel Medcalc Statistical Software. Des résultats similaires étant observés sur la période des 20 dernières années et des 10 dernières années nous avons limité l'étude en groupes de patients à cette seconde période qui est celle pour laquelle nous disposons du score de Charlson des patients.
2) Le LFO est utilisé non seulement pour produire des modulations sonores, mais aussi pour « moduler » les effets sonores eux-mêmes, à travers l'approche d'« interpolation numérique » (voir figure  13 ). 3). Notre outil Data Stream Control permet de mesurer la fréquence d'oscillation moyenne de balancement du corps. (19)  On peut transformer cette donnée obtenue en différents paramètres musicaux. Afin de cultiver cette écoute des sensations trans-modales (auditive, visuelle, tactile, kinesthésique) provenant de tout corps, nous proposons plusieurs exercices kinesthésiques liés à l'expérience musicale : le déphasage, les illusions ambiguës entre le son pulsé et le son continu, les battements binauraux.
Background: Although age-standardized stroke occurrence has been decreasing, the absolute number of stroke events globally, and in Canada, is increasing. Stroke surveillance is necessary for health services planning, informing research design, and public health messaging. We used administrative data to estimate the number of stroke events resulting in hospital or emergency department presentation across Canada in the 2017-18 fiscal year. Methods: Hospitalization data were obtained from the Canadian Institute for Health Information (CIHI) Discharge Abstract Database and the Ministry of Health and Social Services in Quebec. Emergency department data were obtained from the CIHI National Ambulatory Care Reporting System (Alberta and Ontario). Stroke events were identified using ICD-10 coding. Data were linked into episodes of care to account for readmissions and interfacility transfers.
Contexte : Bien que la fréquence, normalisée selon l'âge, des AVC ait diminué, le nombre absolu d'AVC augmente néanmoins dans le monde ainsi qu'au Canada. Leur surveillance est ainsi nécessaire pour planifier les services de santé, pour favoriser une conception éclairée de la recherche et pour diffuser des messages de santé publique. Nous avons donc utilisé des données administratives pour estimer le nombre d'événements caractérisés comme AVC qui ont entraîné une présentation à l'hôpital ou aux urgences partout au Canada, et ce, au cours de l'année 2017-2018. Méthodes : Ces données sur les hospitalisations ont été obtenues auprès de la Base de données sur les congés des patients (BDCP) de l'Institut canadien d'information sur la santé (ICIS) et du ministère de la Santé et des Services sociaux du Québec (MSSSQ).