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On prend ainsi au sérieux la métaphore « chasseurs de virus » souvent reprise par les virologues  (Perrey, 2012)  pour interroger en retour le rapport compliqué des observateurs d'oiseaux aux chasseurs  (Barrows, 1998 ; Moss, 2004 ; Della Bernardina, 2012). Peut-on qualifier l'usage des bases de données par les virologues et les observateurs d'oiseaux de « pouvoir cynégétique »  (Chamayou, 2010)  ? En quoi cette qualification permet-elle d'éclairer autrement la mobilisation contre la grippe aviaire qu'à travers les images d'abattage spectaculaire qui manifestent un pouvoir souverain  (Braun, 2007)  ? Comment, en retour, peut-on décrire la passion des naturalistes et des virologues pour le recensement des oiseaux 2 En ce sens, la notion de sentinelle se distingue de celle de lanceur d'alerte  (Chateauraynaud & Torny 1999)  : elle vise moins la construction d'une affaire ou d'une cause dans une sphère publique par la montée en généralité d'arguments, que la mise en visibilité de signaux à différentes échelles ontologiques.
Sa capacité à varier d'une échelle ontologique à une autre lui évite de se développer dans une sphère publique centralisée. et de leurs pathogènes autrement qu'à travers un « biopouvoir » assurant le contrôle de l'humanité sur la nature  (Youatt, 2008)  ? Qu'y a-t-il dans l'usage des données sur les oiseaux et leurs virus qui relève de la chasse ? Comment se pose dans ce cadre le problème de la saisie et de l'accumulation des données ? De telles questions visent à compléter l'anthropologie de la biopolitique par une anthropologie de la nature, c'est-à-dire à mesurer l'effet de l'entrée des naturalistes dans le jeu complexe d'alliances établi au niveau global autour de la grippe aviaire 3. On peut la formuler de façon plus simple : si la bio-informatique est orientée par des préoccupations de biosécurité, en quoi est-elle infléchie par la question de la biodiversité  (Hinchliffe & Lavau, 2013)  ? Comment la bio-informatique s'organise-t-elle entre les intérêts apparemment conflictuels de la biosécurité et de la biodiversité ? Si les bases de données sur la diversité des formes du vivant se sont multipliées au cours des vingt dernières années  (Bowker, 2000) , cette diversité apparaît dangereuse dans une perspective de biosécurité, car elle élargit le réservoir pour les mutations des pathogènes.
Le travail virtuel sur la base de données n'a de sens que s'il s'enracine dans une pratique du matériel vivant. Ce point, qui a déjà été observé pour d'autres bases de données dans les sciences de la vie  (Hine, 2006) , est confirmé par l'entretien avec un virologue de Hong Kong d'origine indienne, appelé du diminutif de « Vijay ». « En général, je ne fais pas le travail de laboratoire, tout ce qui salit les mains. Je travaille surtout sur l'ordinateur. Mais si je n'avais pas le personnel pour faire le séquençage, je pourrais le faire parce que c'est ce que j'ai fait pendant des années. » (Dhanasekaran  Vijaykrishna, 23 juillet 2009). La bio-informatique donne ainsi accès à un monde virtuel situé aux marges du monde réel, dont elle explique les soudaines cassures épidémiques par de simples changements de séquence.
Ces laboratoires sont organisés selon des niveaux de sécurité allant de 1 à 4 selon la dangerosité des virus qu'ils manipulent. Un laboratoire ne peut contenir à lui seul toutes les souches de virus : il doit demander à d'autres laboratoires de lui envoyer ces souches dans des conditions très contrôlées 4. Comme l'explique Carlo Caduff, la préoccupation pour la biosécurité vient d'abord de la nécessité de protéger le matériel biologique qui circule entre les laboratoires, car on a là des bases de données potentiellement contagieuses. Les « données » sont le plus souvent « échangées », et donc soumises aux mêmes procédures de contrôle de la circulation que celles qui s'imposent aux virus à l'extérieur des laboratoires -alors même les bases de données virales ont aussi pour finalité de faire de la recherche en dehors des périodes d'épidémies.
Aligner des séquences génétiques La bio-informatique est issue de la grande quantité d'information génétique produite par les techniques de séquençage et de cartographie du génome  (Rabinow, 1996). En ramenant la vie à ses conditions moléculaires  (Rose, 2006 ; Braun, 2007) , c'est-à-dire à une séquence d'acides aminés de type ACTG, elle constitue un code permettant de comparer les formes les plus diverses. Le site GenBank, entretenu depuis 1989 par le NCBI américain (Centre national pour l'information biotechnologique), contient ainsi toutes les séquences génétiques des organismes vivants étudiées et publiées dans des revues scientifiques, du virus à la baleine en passant par le maïs. Cette banque de données contient plus de cent millions de séquences, et double tous les dix mois. Face à une telle quantité d'information, le raisonnement biologique permet d'organiser les données.
De même qu'un linguiste comparatiste n'étudie pas une langue pour la parler, mais pour la comparer à d'autres langues, de même le bioinformaticien ne cherche pas comment la séquence génétique code pour des protéines dans un processus physiologique, mais en quoi elle ressemble ou diffère d'autres séquences, ce qui permet de faire des hypothèses sur leurs rapports d'évolution. « Lire la séquence elle-même est finalement beaucoup moins important que lire la séquence à côté d'autres séquences. »  (MacKenzie, 2003, p. 321)  Un terme technique désigne ce geste de comparaison des séquences : l'alignement. De puissants logiciels, comme BLAST (Basic Local Alignment Search Tool) ou MSA (Multiple Sequence Analysis), permettent de télécharger un grand nombre de séquences et de proposer des corrélations.
« Imagine que j'aie séquencé un virus, je veux connaître son évolution, savoir d'où il vient. Je télécharge toutes les séquences sur Genbank, puis je fais les alignements pour savoir quels nucléotides sont importants. Mais s'il y a quelque chose d'obscur dans la séquence, je vérifie la référence et je demande à ceux qui l'ont fournie quand ils ont fait l'analyse. Pour la grippe, il n'y a pas de problème, car ce sont seulement les gros laboratoires qui peuvent le faire. » (Dhanasekaran  Vijaykrishna, 23 juillet 2009)  Ce propos de « Vijay » révèle une tension entre des valeurs affichées de gratuité et de partage des données (« Open Access »), sur le mode des communautés de biohackers, et des valeurs de compétitivité dans le maniement des codes, établissant une hiérarchie entre les laboratoires à partir de la quantité de matériel accumulé.
« Un ensemble de décisions théoriques doivent être prises sur le chemin bio-informatique vers un arbre, et ces choix prennent une vie qui leur est propre lorsqu'ils sont insérés dans des procédures de programmes. […] Les similitudes génétiques que l'on peut découvrir dans une base de données ne recoupent pas nécessairement des similitudes dans le monde organique, encore moins des récits sur la façon dont ces similitudes sont venues à l'existence. »  (Helmreich, 2009, p. 81-82)  La notion de similitude proposée par Helmreich est ici féconde en ce qu'elle se distingue de celle, strictement biologique, de corrélation, et celle, strictement sociale, de parenté. Il s'agit pour les biologistes de s'orienter dans un espace de similitudes à partir d'une hypothèse sur ce qui s'est passé. Un tel espace peut être décrit comme feuilleté, puisque les similitudes entre les données virtuelles se rajoutent aux similitudes entre les virus réels au lieu de simplement les recouper, et les récits historiques que l'on fait à leur sujet rajoutent encore une troisième couche de signification.
On voit ici formulée la position de sentinelle de la grippe dans le vocabulaire spécifique de la bio-informatique. Si la sentinelle est située sur la première ligne de front où elle lance l'alerte, il est possible d'être en alerte depuis un laboratoire équipé d'ordinateurs, car ceux-ci reproduisent dans leurs bases de données les frontières politiques. Le gouvernement chinois a plusieurs fois interdit aux chercheurs de Hong Kong de venir sur son territoire pour prélever des échantillons sur les volailles, en particulier à Shantou, zone économique spéciale où les chercheurs de Hong Kong possèdent un laboratoire financé par l'homme d'affaires hong-kongais Li Ka-Shing. Mais ceux-ci peuvent continuer leur activité de veille depuis leur ordinateur à partir des données qu'ils ont séquencées dans le passé.
Les bases de données font ainsi dire aux virus ce que le gouvernement chinois veut cacher : il y a bien émergence de nouveaux virus dans le sud de la Chine du fait de la densité de la population animale et humaine. Les chercheurs de l'Université de Hong Kong ont ainsi publié une série d'articles qui leur ont attiré les critiques de la Chine. Ils ont montré que le virus du SRAS provenait du réservoir animal des chauves-souris, d'où il s'est transmis aux humains par les civettes consommées dans la médecine chinoise traditionnelle  (Vijaykrishna, Smith et al. , 2007)  ; que la souche de H5N1 qui s'est répandue en Asie et en Europe en 2005 avait été avantagée par la vaccination obligatoire des volailles en Chine  (Smith et al. , 2006). Mais ils ont aussi publié des articles critiques envers le gouvernement américain, en montrant que le virus H1N1 à l'origine de la pandémie d'origine mexicaine en 2009 avait un « jumeau » sur des porcs à Hong Kong en 2004  (Smith, Bahl, Vijaykrishna et al.
, 2009a) , et que la souche à l'origine de la grippe espagnole en 1918 circulait déjà chez les porcs depuis 1911  (Smith, Bahl, Vijaykrishna et al. , 2009a). Chacun de ces articles demande aux gouvernements de renforcer la surveillance, et plaide pour la production d'un plus grand nombre de données afin d'anticiper les prochaines pandémies. La bio-informatique pousse sur le principe de préparation à ses ultimes conséquences : la simulation d'une pandémie à venir doit s'étendre à tout le vivant, dans le spectre d'espèces et dans le temps historique. Les gouvernements se sont plaints d'être ainsi mis en cause, ce qui a donné lieu à des controverses intéressantes sur les noms donnés aux virus. GenBank fournit pour chaque virus le nom de l'espèce animale et du pays ou de la province où il a été détecté pour la première fois : par exemple : A/ Goose/Guangdong/1/96 H5N1 (ou Gs/Gd).
Par contraste, les virus conservés dans le wetlab portent des noms de province (Anhui, Cambodge), voire de personnes : le virus du SRAS utilisé dans la plupart des laboratoires porte le nom du médecin italien, Carlo Urbani, qui fut le premier à signaler à l'OMS la dangerosité de ce virus et qui en décéda lui-même au terme d'un voyage en avion de Hanoï à Bangkok. Ces controverses sur les noms des virus éclairent le statut ambivalent des bases de données des virologues. Si les données du wetlab indiquent directement la dangerosité des virus manipulés, en faisant même parfois référence à des chercheurs tués par ces virus, celles du drylab n'y renvoient qu'indirectement. Il faut alors l'interprétation bio-informatique pour rapporter les noms codés des souches à des bifurcations significatives.
L'image de l'arbre phylogénétique réintroduit dans les données produites par le séquençage cette signification vitale, en faisant voir les franchissements de barrières d'espèces et les lieux où ils se produisent, même si ces événements biologiques ne correspondent pas nécessairement à des épidémies déclarées. L'arbre phylogénétique décale la signification biologique en la déplaçant dans un espace virtuel, où elle ne devient lisible que pour des initiés. Un tel espace est régi par des règles apparemment contradictoires : il faut qu'il soit ouvert à tous dans l'accès aux données, selon les normes de transparence gouvernant la santé globale, mais il faut aussi qu'il s'adosse à des bases de données virales réelles, selon des règles de biosécurité et de confidentialité. D'où la tension entre compétition et collaboration qui caractérise le monde des virologues : si faire sentinelle, c'est dédoubler les virus réels par des virus virtuels aux bonnes bifurcations, il y a concurrence entre les sentinelles pour tracer ces bifurcations passées et anticiper les épidémies.
BIRDWATCHERS ENROLÉS DANS LA SURVEILLANCE DES OISEAUX Peut-on alors comparer cet usage des bases de données par les virologues dans la mobilisation contre la grippe aviaire à celle des observateurs d'oiseaux ? La comparaison se justifie à deux niveaux : l'un, ethnographique, vient de la rencontre à Hong Kong entre ces deux groupes apparemment hétérogènes dans l'évaluation du risque de contagion par les oiseaux sauvages ; l'autre, théorique, vient de la possibilité de décrire ces deux groupes métaphoriquement comme des « chasseurs ». Notre hypothèse est la suivante : de même que la bionformatique dédouble virtuellement les données des « chasseurs de virus » par des données génétiques (ou le wetlab en drylab), de même la biodiversité dédouble les pratiques des « chasseurs d'oiseaux » par des données numériques.
En s'éloignant historiquement des pratiques des chasseurs tout en en gardant la trace, les birdwatchers ont inventé de nouveaux modes de saisie des mouvements des oiseaux. En refusant le geste de mise à mort qui reste central chez le chasseur, ils déplacent la menace de mort sur l'espèce plutôt que sur l'individu. Les bases de données constituent un espace codé où les birdwatchers peuvent « jouer » avec les données, c'est-à-dire essayer des mouvements possibles afin de deviner l'avenir  (Hamayon, 2012). De même que le chasseur amazonien perçoit sa proie alternativement comme un ami ou un ennemi, en fonction des dispositions de l'esprit animal avec lequel il communique  (Descola, 2005) , de même le birdwatcher asiatique peut voir derrière l'oiseau qu'il protège des forces invisibles (virus pandémique, réchauffement climatique, radiations nucléaires…) qui menacent les humains.
Un rapport précise ainsi les modalités par lesquelles le gouvernement centralise les données produites sur le terrain par les observateurs d'oiseaux. « Toutes les données de la HKBWS sont actuellement enregistrées sur le terrain par des feuilles de papier et ensuite tapées sur un tableau Microsoft Excel -une feuille par aire de comptage. Les données historiques existent sur Excel et seront appropriées dans la base de données lorsque celle-ci sera établie. Avec l'augmentation proposée dans l'éventail et la zone de surveillance, il faut déterminer qui sera responsable de l'entrée des données dans le futur. Si les données continuent d'être enregistrées directement sur des feuilles de papier et requièrent ultimement une incorporation dans la base de données, une première recommandation est que le personnel du département de l'Agriculture s'en occupe, et qu'ensuite les fichiers de données soient exportés à la HKBWS pour leur propre usage.
De façon alternative, en raison de leur familiarité avec le mode de présentation des données, les membres de la HKBWS peuvent entrer les données brutes directement dans la base de données. » (AFCD (Agriculture Fisheries and Conservation Department of Hong Kong SAR, Development of an Ecological Monitoring Programme for the Mai Po and Inner Deep Bay Ramsar Site, 2000, section 8, p. 4) Ce rapport souligne le caractère rudimentaire des données produites par les birdwatchers. Il s'agit essentiellement de listes d'espèces d'oiseaux rédigées sur le terrain. L'identification et le comptage des espèces sont des compétences transmises sur plusieurs générations par un apprentissage mutuel. Lorsqu'une espèce rare ou nouvelle est observée, une confirmation est demandée à un observateur plus « qualifié » (skilled), ce qui implique une hiérarchie basée sur la connaissance mutuelle et non sur l'attribution de diplômes.
Le site Internet de la HKBWS est également une source majeure de coordination de l'information et des données. Les birdwatchers y notent les espèces observées, et si une espèce est rare, d'autres observateurs peuvent se rendre sur place pour confirmer l'observation : il arrive ainsi qu'un oiseau remarqué le matin dans un Ce qui fait la valeur du travail de cet observateur aux yeux de ses collègues, c'est qu'il va toujours au même endroit et peut « aligner » ses observations -pour reprendre le vocabulaire des virologues -dans le cadre d'un tableau, alors que la plupart des birdwatchers ne peuvent entrer que des données ponctuelles dans la base de données. Il est remarquable cependant que Geoff Welsh ne parle pas de bases de données (data bank), comme celles qui sont constituées par Birdlife International sur les spatules à face noire, ni de surveillance(monitoring) dans le cadre d'un programme de conservation de la biodiversité, mais d'enregistrements (records).
Un mystérieux « expert », Éric B. , travaillerait ainsi pour le site Hong Kong Wildlife en identifiant les oiseaux rares sur les photographies, dont les photographes ignorent eux-mêmes la rareté. Une photographie peut être assez précise pour donner le numéro de bague d'un oiseau migrateur et permettre de l'enregistrer dans la base de données. La controverse porte sur le bon moment en vue de la publication de la photographie : faut-il l'afficher immédiatement pour permettre sa confirmation par un « expert », ou plus tard pour éviter la dégradation du site par des photographes peu respectueux ? La photographie comme donnée immédiate interroge sur le caractère médiatisé des données numériques produites par les birdwatchers : il y a une valeur produite dans le décalage entre l'observation et son enregistrement, car c'est dans ce décalage que s'opère l'identification par contrôle mutuel.
CONCLUSION La comparaison entre virologues et birdwatchers a permis d'opposer des données « réelles » (celle du wetlab ou du marché aux oiseaux) à des données « virtuelles » (celle du drylab ou de la base de données sur Internet). Les premières concentrent le matériel vivant dans des conditions de biosécurité, puisqu'il présente un fort risque de transmission ; les secondes ouvrent à un raisonnement en termes de biodiversité, puisqu'il saisit les mutations des virus comme révélateurs de changement dans les écosystèmes. La constitution de ces bases de données permet ainsi d'atténuer le caractère catastrophique de l'annonce d'une pandémie de grippe aviaire, pour l'inscrire dans les changements des relations entre les humains et leur environnement. La métaphore de la chasse, prise au sérieux et systématisée, nous a permis de saisir le décalage entre les données virtuelles et les données réelles.
Il s'agit de déterminer à chaque fois le moment opportun où l'information peut être rassemblée dans une image. La base de données se présente ainsi comme un opérateur d'ajustement de l'action, soit par anticipation soit par retardement. Les gouvernements peuvent trop tarder à déclarer des cas de grippe aviaire ou au contraire agir trop vite en fermant une réserve d'oiseaux ; les observateurs peuvent publier une photographie trop tard pour identifier une espèce ou au contraire trop tôt pour la protéger ; les arbres phylogénétiques et les cartes d'identification retracent alors les informations manquantes. Lorsque les relations entre humains et oiseaux se présentent comme une consommation catastrophique, la base de données instaure un espace virtuel où ces relations sont suspendues et réfléchies.
Si la grippe aviaire opère une coupure dans les relations entre humains et oiseaux, la base de données reconstitue le franchissement biologique de la barrière d'espèces à un autre niveau. On a ainsi décrit ces deux groupes comme des « sentinelles » au sens où elles redoublent la frontière ontologique entre humains et animaux par des frontières symboliques, qui passent entre amateur et professionnel, entre terrain et laboratoire, ou entre des régimes politiques différents. La sentinelle se définit par sa capacité à équiper une frontière pour lui faire produire des signaux signifiants à des niveaux de communication différents, du plus réel au plus virtuel. Il faudrait alors interroger d'autres techniques d'anticipation des pathogènes franchissant la barrière des espèces, comme les simulations d' épidémies ou les stockages de vaccins et d'antiviraux, pour voir comment les bases de données biologiques instaurent d'autres espaces virtuels dans une visée de santé publique.
abstract: couting viruses, observing birDs : Data banks for avian fLu This article compares the uses of data banks by virologists and birdwatchers during the mobilization around Avian Flu in Hong Kong. Criticizing governments who do too little or too much, these groups use data banks to understand the conditions in which viruses mutate from their animal reservoir. By constituting an environmental sentinel, these two groups link biosecurity to biodiversity, introducing techniques of « hunting » in the biopolitical world. Keywords: avian flu, sentinel, biosecurity, bioinformatics, biodiversity, zoonoses resumen: contar viruses, observar aves : bancos De Datos Per La griPe aviaria Este articulo compara el use dos bancos de datos por virologos y observadores de aves durante la mobilisation contra la gripe aviaria in Hong Kong.
C'est ainsi que les tables SU-VI-MAX (SU-VI-MAX 2006) vont fournir les compositions en protéines de 17 différents morceaux de viande bovine, données à partir desquelles il est presque impossible de reconstituer, par exemple, la composition moyenne en protéines de la carcasse. La base de données de l'USDA (USDA, 2011) et les bilans alimentaires de la FAO (FAO, 2010) sont des tables qui permettent d'obte- nir des données de composition sur des produits agricoles. C'est finalement celle de la FAO que nous avons utilisée dans la mesure où elle propose une déclinaison par pays qui tient mieux compte des pratiques de valorisation des produits agricoles qui y sont appliquées. Quand les don- nées de la FAO ne fournissaient pas de renseignements sur certains produits c'est sur la base des compositions pu- bliées par Darmon (Darmon et Darmon 2008) que nous avons complété notre référentiel nutritionnel.
Remerciements La fondation Agropolis, la  Commission europeenne et l'Agence nationale de la recherche (ANR) sont vivement remerciees pour leur soutien aux activites de l 'equipe. Les auteurs remercient  Martine Bes, Nadege Lanau ,  Florence Artus ,  Aurore Vernet ,  Murielle Portefaix ,  Christian Chaine ,  Remy Michel et Eve Lorenzini pour leur participation aux projets de recherche de l'equipe. Ils remercient Nourollah Ahmadi et Brigitte Courtois pour leur relecture du manuscrit.
triquement 6 en tenant compte de la situation géographique (Dakar et autres villes). Les unités artisanales Deux produits laitiers sont particuliè- Il s'agit d'activités individuelles de produc- rement consommés par les Sénégalais à tion de lait caillé à partir du lait en poudre acheté auprès des grossistes ou des impor- 4. Voir par exemple Sadoulet et De Janvry (1995). 5. La fonction d'utilité du type Stone-Geary s'écrit : U q c i i n i b i = ∏ -= ( ) 1 6. Les données utilisées sont issues de la base de données de la Direction statistique du Sénégal (DPS). tateurs. La transformation se fait sur le lieu de vente. Les transformateurs utilisent de grandes bassines en plastique et des petits batteurs artisanaux en bois pour battre et Elles concernent les dépenses de consommation des différents produits laitiers à Dakar et dans les autres villes du Sénégal, leurs prix d'achat, les dépenses 7.
Certaines variables telles que les superficies équipées pour l'irrigation, le mode d'accès à l'eau et le type de ressources en eau mobilisées sont moins dépendantes des conditions économiques ou climatiques annuelles. Il n'existe malheureusement pas de base de données permettant une analyse de la variabilité interannuelle des superficies irriguées sur l'ensemble du territoire national à une échelle fine. Les enquêtes sur les structures des exploitations agricoles sont réalisées à intervalles plus réduits  (2005, 2007)  mais comme elles sont basées sur des échantillons, la L 1. Les irrigations de printemps ne sont pas systématiques ; elles sont très dépendantes des conditions météorologiques alors que les irrigations d'été sont toujours nécessaires sur certaines cultures quelles que soient les conditions météorologiques.