dataesr/scientific-paragraphs-categorization huggingface dataset:
Remerciements EV et KR tiennent à remercier  Gérard de Bélair (Univ. Annaba), El Hamlaoui Ouzzani (Sidi-Aïch ), ainsi que Nacereddine et  Youcef Rebbas  ( M'Sila ) pour leur disponibilité lors des excursions sur le terrain. EV remercie également  Sami Youssef  (univ. Duhok/AMAP) pour l'aide bibliographique concernant la flore adventice des cultures. Les auteurs remercient enfin  Reinhard Fritsch  et un relecteur anonyme pour leurs remarques ayant permis l'amélioration du manuscrit. Le  MNHN donne accès aux collections dans le cadre de l'Infrastructure de Recherche nationale RECOLNAT.
Remerciements. Nous remercions toutes les personnes qui pratiquent des activités d'intermédiation pour accompagner la réduction des pesticides, pour le temps qu'elles nous ont accordé à travers leur participation aux séminaires DYCOT. Nous remercions également Lorène Prost et Marianne Le Bail qui ont contribué à la conception et l'organisation des séminaires DYCOT. La recherche qui a donné lieu à cette publication a bénéficié du soutien financier du métaprogramme SMACH INRA et de l'ONEMA dans le cadre de l'APR « Pour et sur le plan Écophyto (PSPE) ».
Pour rendre compte des nombreux processus contrôlant l'évolution des stocks de C du sol sous l'effet des pratiques, en interaction avec la variabilité du pédoclimat, l'approche choisie pour la quantification du potentiel de stockage additionnel de carbone a été celle d'une modélisation spatialement explicite à une résolution spatiale la plus fine possible pour une analyse à l'échelle nationale (de l'ordre du km 2 ). L'intérêt est de tenir compte de l'extrême variabilité des contextes pédoclimatiques et agronomiques français, bien renseignée par les bases de données disponibles sur les sols, les climats, les systèmes de culture et d'élevage, tout en couvrant une large gamme de modes d'occupation du sol et de types d'agriculture représentatifs d'Europe de l'Ouest, donnant ainsi une certaine généricité aux résultats.
Les simulations ont été faites en utilisant les modèles Stics en grandes cultures et PaSim en prairie permanente, intégrant une représentation explicite du cycle du carbone dans le système sol-plante et pouvant rendre compte de l'effet des multiples facteurs pédoclimatiques et des pratiques sur l'évolution des stocks de carbone et d'autres variables d'intérêt (rendement, lixiviation d'azote, émissions de N 2 O…). Ces modèles, ou leur module carbone, ont été évalués dans les conditions françaises ou européennes sur leur capacité à prévoir l'évolution des stocks de carbone du sol  (Clivot et al. , 2019)  ou des variables associées aux cycles C-N (production de biomasse, flux de carbone et d'azote)  (Constantin et al. , 2012 ; Coucheney et al. , 2015 ; Ma et al. , 2015). Plusieurs bases de données nationales sur les sols, les climats, les pratiques agricoles ont été mobilisées pour renseigner les variables d'entrée des modèles.
Le coût calculé est le coût technique pour l'agriculteur ; il peut représenter une perte (coût positif ) ou un gain (coût négatif ). Dans quelques cas, ce coût pour l'agriculteur a été complété par des indications relatives au coût pour la collectivité quand celui-ci était non négligeable. Les calculs ont été effectués à l'échelle des anciennes régions administratives en utilisant les données technico-économiques (d'assolement, de prix des produits et des intrants…) disponibles dans des bases de données existantes (Statistique agricole annuelle, Réseau d'information comptable agricole…), moyennées sur la période 2009-2013 afin de lisser les variations interannuelles. La ligne de base des scénarios sur 30 ans est une référence « statique ». Le choix d'une référence « dynamique », avec évolution tendancielle des assolements, du cheptel, des prix des facteurs de production et des produits, aurait nécessité de disposer de projections cohérentes et complètes sur 30 années en termes de prix, de quantités et de ressources disponibles.
Elle permet de prendre en compte les interactions complexes dont dépendent les entrées et le devenir du carbone dans les sols. Elle valorise à la fois les progrès des connaissances capitalisés dans le cadre des modèles de fonctionnement des écosystèmes et les bases de données constituées pour renseigner les variables d'entrées. La méthode mise en oeuvre est originale et reproductible, elle pourrait être utilisée dans d'autres contextes à l'international. A contrario, les résultats sont très dépendants de la qualité des modèles et de leur paramétrage. Des progrès sont nécessaires pour mieux simuler l'évolution du stock de carbone dans les horizons profonds et prendre en compte de nouveaux mécanismes (le priming effect par exemple). Un travail de simulation équivalent à ce qui a été fait en grandes cultures et prairies permanentes est nécessaire dans le cas des forêts.
Ont aussi été utilisés, plus ponctuellement : les barèmes CUMA pour prestation par des tiers pour les coûts des opérations culturales 8 (labour, épandage d'engrais…), ou la base de données Eurostat pour le prix des engrais azotés. P ur compléter les bilans de GES (émissions non simulées par les modèles utilisés et émissions induites par les pratiques en amont/aval de l'exploitation), ce sont les équations et facteurs d'émission de l'inventaire Citepa et la Base Carbone qui ont été utilisés.
Pour la pratique mobilisant de nouvelles ressources organiques épandues sur les parcelles, le stockage additionnel calculé par simulation a été corrigé pour tenir compte du stockage intervenant dans la ligne de base en dehors des parcelles agricoles simulées (cas des déchets verts mobilisés pour la fabrication de composts épandus sur parcelles agricoles dans la pratique stockante « Mobilisation de nouvelles ressources organiques » retournant déjà en grande partie au sol, mais hors parcelle agricole, dans la ligne de base). Les calculs de bilans de GES ont utilisé à la fois des sorties des modèles (émissions de N 2 O, lixiviation de nitrate, volatilisation ammoniacale…) et des ordres de grandeur issus de bases de données.
Ainsi, 23 149 UPC comportant au moins 100 ha de surface déclarée dans le RPG ont été considérées dans l'étude (figure 3-2). Les paramètres d'entrées des modèles ont été définis pour ces  UPC  à l'aide de différentes bases de données : • le climat a été caractérisé grâce à la base de données  Safran de Météo-France , qui rapporte les données météorologiques quotidiennes sur 1979-2013 ; • les caractéristiques et propriétés des sols ont été fournies par l' Unité de service Inra Infosol pour chaque UCS. Au sein d'une UCS , on trouve généralement plusieurs types de sol (ou UTS). Une à 3 UTS ont été sélectionnées par UCS afin de représenter au moins 70 % de sa surface pour les simulations ; • les teneurs initiales en carbone et azote organique ont été recalculées à partir des données de stocks de carbone sur 0-30 cm (pour  Stics) et sur l'ensemble du profil de sol (pour PaSim) de la carte nationale des stocks de carbone des sols produite par le GIS Sol  (Mulder et al.
Ont aussi été utilisés, plus ponctuellement : les barèmes CUMA pour prestation par des tiers pour les coûts des opérations culturales 8 (labour, épandage d'engrais…), ou la base de données Eurostat pour le prix des engrais azotés. P ur compléter les bilans de GES (émissions non simulées par les modèles utilisés et émissions induites par les pratiques en amont/aval de l'exploitation), ce sont les équations et facteurs d'émission de l'inventaire Citepa et la Base Carbone qui ont été utilisés. les principales cultures ; • les enquêtes « Pratiques culturales », réalisées tous les 5 ans environ, qui enregistrent l'itinéraire technique détaillé mis en oeuvre sur les parcelles pour les 8 cultures principales. La dernière enquête disponible date de 2011 ; les résultats de celle de 2017 n'étaient pas accessibles au début de l'étude ; • le Réseau d'information comptable agricole (RICA), qui enregistre, sur un échantillon représentatif des grandes et moyennes exploitations agricoles (couvrant 93 % de la SAU et 97 % du potentiel productif ), de nombreuses informations économiques, par exemple Les pratiques actuelles ont été renseignées en mobilisant toutes les références et bases de données statistiques disponibles (enquêtes « Pratiques culturales », Statistique agricole annuelle…).
L'utilisation couplée de ces modèles avec une représentation spatialement explicite du climat, du type de sol, des modes d'occupation du sol et des pratiques à une résolution spatiale fine (de l'ordre du km 2 ), pour rendre compte de la très grande diversité des contextes agropédoclimatiques français, permet en partie de rendre compte des nombreux processus dont dépend l'évolution des stocks de carbone du sol et de leurs interactions. Les simulations ont été réalisées à la résolution de mailles homogènes en matière de type de sol et de climat. Ces unités pédoclimatiques (UPC) correspondent à l'intersection spatiale entre les unités cartographiques de sol (UCS) de la carte des sols au 1/1 000 000 (Base de données géographique des sols de France -BDGSF ; 318 UCS réparties sur 3 489 polygones) et les mailles Safran de 8 km × 8 km de description du climat (Météo- France ; 8 987 mailles).
Pour la pratique mobilisant de nouvelles ressources organiques épandues sur les parcelles, le stockage additionnel calculé par simulation a été corrigé pour tenir compte du stockage intervenant dans la ligne de base en dehors des parcelles agricoles simulées (cas des déchets verts mobilisés pour la fabrication de composts épandus sur parcelles agricoles dans la pratique stockante « Mobilisation de nouvelles ressources organiques » retournant déjà en grande partie au sol, mais hors parcelle agricole, dans la ligne de base). Les calculs de bilans de GES ont utilisé à la fois des sorties des modèles (émissions de N 2 O, lixiviation de nitrate, volatilisation ammoniacale…) et des ordres de grandeur issus de bases de données. Pratiques stockantes À partir de ces « systèmes actuels », six scénarios de changements de pratiques ont été construits pour estimer le potentiel de stockage additionnel de carbone permis par des pratiques identifiées comme potentiellement stockantes.
Il travaille sur les cycles carbone et éléments nutritifs dans les agroécosystèmes et leur modélisation. Laure Bamière, chercheur INRAE à l'UMR Économie publique (centre de Versailles-Grignon) est l'une des deux pilotes scientifiques de l'étude. Économiste de l'environnement, elle étudie et modélise les liens entre les activités agricoles et l'atténuation du changement climatique. IsabelleSavini est chargée d'études à la Direction de l'expertise scientifique collective, de la prospective et des études d'INRAE à Paris. Olivier Réchauchère, agronome et coordinateur du projet, était chargé d'études à la Direction de l'expertise scientifique collective, de la prospective et des études d'INRAE à Paris. Il est désormais chercheur à l'UMR Agronomie (centre de Versailles-Grignon). Ademe Agence de l'environnement et de la ODR Observatoire des programmes com- DEPE Délégation à l'expertise scientifique SSP Service de la statistique et de la pros- maîtrise de l'énergie munautaires de développement rural collective, à la prospective et aux études pective du ministère chargé de l'Agriculture AE Assiette effective (d'une pratique P Phosphore de l'Inra STEP Station d'épuration (production de stockante) RICA Réseau d'information comptable GES Gaz à effet de serre boues épandables) AMG Modèle AMG (du nom de ses auteurs : agricole GIEC Groupe d'experts intergouverne-tC Tonne de carbone Andriulo, Mary, Guérif ) RMQS Réseau de mesure de la qualité des mental sur l'évolution du climat (IPCC en TMR Temps moyen de résidence (du car- AMT Assiette maximale technique (d'une sols anglais) bone dans le sol) pratique stockante) RPG Registre parcellaire graphique GIS Groupement d'intérêt scientifique uN Unités d'azote (apportées par la AT Assiette théorique (d'une pratique S Soufre Gt Gigatonne (10 9 t) fertilisation) stockante) SAA Statistique agricole annuelle IPCC Intergovernmental Panel on Climate BCAE Bonnes conditions agricoles et terres BDAT Base de données d'analyses des environnementales SNBC Stratégie nationale bas carbone prairies ISOP Information et suivi objectif des Change BDGSF Base de données géographique des K Potassium sols de France MACC Marginal abatement cost curve C Carbone Sylvain (courbe de coût d'abattement marginal) CaCO 3 Carbonate de calcium MB Matière brute CEC Capacité d'échange cationique M€ Million d'euros CH 4 Méthane Mha Million d'hectares Citepa Centre interprofessionnel technique MO Matière(s) organique(s) d'études de la pollution atmosphérique MOD Matière(s) organique(s) dissoute(s) CO 2 Gaz carbonique MOP Matière(s) organique(s) particulaire(s) CO 2 e Gaz carbonique équivalent MOS Matière(s) organique(s) du sol COD Carbone organique dissous MS Matière sèche COP 21 21 e Conférence des Parties de la MtC Million de tonnes (10 6 t) de carbone Convention-Cadre des Nations unies sur les changements climatiques (CCNUCC) ; tenue à Paris en 2015 N Azote N 2 O Protoxyde d'azote COS Carbone organique des sols NH 3 Ammoniac CUE Carbon use efficency NO 3 -Nitrate CUMA Coopérative d'utilisation de maté- NRO Nouvelles ressources organiques riel agricole O 2 Oxygène.
Cette valeur n'intègre pas les résultats de compilations : intégrant des études fondées sur de la modélisation, des échantillons trop limités, enregistrant des stockages trop variables ou mesurés sur des prairies récentes installées après une grande culture, auquel cas les valeurs mesurées peuvent être beaucoup plus élevées. Quant aux mesures obtenues par les méthodes micro-météorologiques (dites « tours à flux ») utilisées pour établir le bilan C des prairies, elles apparaissent très variables (de -350 à plus de + 1 000 kgC/ha/an) et non comparables aux données issues des inventaires de sol, car elles prennent en compte l'intégralité de l'écosystème. Évolution tendancielle des stocks de carbone organique du sol en sols cultivés L'analyse de l'évolution des stocks de C organique des sols cultivés métropolitains s'appuie sur quatre sources : quelques études régionales, les données de la BDAT (Base de données d'analyses des terres), l'analyse de l'évolution des stocks de C dans des essais de longue durée français, et la littérature internationale dans des conditions pédoclimatiques équivalentes.
L'analyse des données de la BDAT (figure 2. 12) montre des évolutions contrastées : des tendances à la baisse depuis plusieurs décennies dans certaines régions (Bretagne) et des inversions de tendances (baisses des teneurs puis augmentation ou inversement). Ces évolutions sont expliquées principalement par des changements d'occupation des sols et par des systèmes de culture caractérisés par de faibles restitutions. Certains biais inhérents à la BDAT pourraient aussi expliquer ces résultats : présence de parcelles en prairie dans la base de données, choix des parcelles analysées par les exploitants agricoles biaisant l'analyse, tendance à la diminution de la profondeur de travail du sol. L'analyse des données issues de 60 traitements dans 20 essais agronomiques de longue durée entre 1970 et 2015, correspondant à des contextes pédoclimatiques diversifiés et représentatifs des rotations et des pratiques agricoles françaises, montre un déstockage de -200 kgC/ha/an, pouvant s'expliquer à la fois par les systèmes de culture mis en place et par un historique de retournement de prairies.
rotations de grandes cultures/prairies temporaires et 2 types de prairies permanentes ont été sélectionnés par UPC, correspondant aux systèmes couvrant la plus grande surface de l'UPC (systèmes « dominants ») ; UCS : unités cartographiques de sol ; BDGSF : Base de données géographique des sols de France ; UPC : unités pédoclimatiques ; RPG : Registre parcellaire graphique ; UTS : unités typologiques de sols.
La géographie du terrorisme : un chantier prometteur Même si la recherche géographique est encore assez marginale au sein du champ des études sur le terrorisme, plus connues sous leur désignation anglaise de terrorism studies  4  , on dispose déjà d'un nombre non négligeable de travaux qui s'attachent à étudier la distribution spatiale des actes terroristes, la territorialité des acteurs qui recourent à cette forme de violence (principalement) politique, ainsi que celle de plusieurs autres composantes du complexe terroriste  5. De même, plusieurs publications incluent des représentations cartographiques de la dynamique territoriale du djihadisme en Afrique de l'Ouest, permettant de visualiser sa progression vers le sud  6. Ce que nos cartes confirment à partir de données concernant la localisation des actes terroristes répertoriés dans la Global Terrorism Database (GTD).
Une carte exploitant la GTD par le calcul des barycentres La GTD répertorie les évènements considérés comme relevant du terrorisme dans le monde depuis 1970. Elle est basée à l'Université du Maryland, et elle est régulièrement alimentée par le consortium START qui bénéficie d'un soutien direct du gouvernement des États-Unis. Ses données, issues principalement d'informations de presse sur les incidents, ont été synthétisées depuis 2012 dans le Global Terrorism Index, rapport élaboré en collaboration avec l'Institute for Economics and Peace (Sidney). Actuellement, il s'agit de la meilleure base de données disponible, incluant tant les incidents domestiques que ceux qui relèvent du terrorisme international  7. Cependant, tout comme les autres sources similaires, sa fiabilité dépend de la valeur de ses définitions, des procès de codification, des lacunes dans le recueil ou la disponibilité des informations, etc.
Remerciements Les auteurs adressent leurs remerciements aux responsables de l'IRED, parmi lesquels son directeur général, le  Dr Adoum Goudja , qui a contribué à orienter ces recherches. Les auteurs remercient aussi le  Prof. Youssouf Mopate Logtene , directeur adjoint de l'IRED, pour sa lecture attentive du manuscrit et ses compléments précieux. Enfin, les auteurs tiennent à remercier le comité éditorial de la revue ainsi que les évaluateurs du manuscrit pour leurs remarques constructives et rigoureuses.
Remerciements Nos remercions  Leslie Couëdelo ,  Benjamin Buaud ,  Maria Urdaci ,  Justine Vande Weghe  et  Didier Majou , en tant que collaborateurs de l' UMT BALI (Unité Mixte Technologique, Biodisponibilité intestinale des lipides)  et du projet de thèse LECIMETA. Nous remercions également  Dominique Rainteau ,  Lydie Humbert ,  Carole Knibbe ,  Fabienne Laugerette ,  Charline Buisson ,  Emmanuelle Meugnier ,  Emmanuelle Loizon ,  Francois Caillet ,  Benjamin Van Dorsselaer ,  Hélène Abrous ,  Ikram Chamekh ,  Laurence Fonseca  et  Elisabeth Errazuriz-Cerda  pour leur contribution au projet LECIMETA. Enfin, nous remercions l'ANRT pour leur contribution à ce projet de thèse  CIFRE, et l'ACTIA pour leur soutien à l'UMT BALI.
Scientific and naturalist communities support and promote increasing data-sharing habits, and some data are publicly available through dedicated platforms. However, many local data remain inaccessible and/ or non-digitalized. Gathering them requires identifying local datasets and/or contacting local flora specialists. Remaining regional or national gaps can be filled only by collecting data in the field or through expert knowledge; (4) Reliability: the reliability of the different sources is highly variable, especially information from biodiversity data portals  4. For conservation and biogeographical purposes, it is crucial to detect and discard doubtful occurrences. The introduced or native status of a species is very informative but not always explicitly indicated. Functional and genetic diversities are recognized as important components of biodiversity, implying that an effective conservation strategy should rely on the evolutionary processes in habitats, especially in the face of global change  [5] [6] [7] [8].
Functional traits are important proxies to understand the relationships between biodiversity, ecosystem functioning, and environmental constraints. Over the last two decades, important efforts have been devoted to the centralization of plant traits in curated databases through international networks of plant scientists (e. g. TRY database  9  ). However, these databases on functional traits are often biased toward guilds or species of specific interest (in trees, for instance, on economically important forestry species). Challenges 1, 3, and 4 identified above therefore also apply to tree functional trait data. Measuring phylogenetic diversity is a potentially powerful way to explain the role of abiotic and biotic factors on community species and biogeographic histories in communities  10, 11.
Many economically or ecologically important tree species of the Mediterranean Basin have undergone molecular genetic analyses and several sequences are often available for them  12. For other species, sequence data are missing or sparse, requiring new field or herbarium sampling, DNA extraction and sequencing. The WOODIV project funded by the FRB-CESAB and the LabEx OT-Med aimed to collate, homogenize, and verify datasets on tree species, their functional traits, and phylogeny, from existing but sparse datasets and complete them where possible (new data collected) for the Euro-Mediterranean area. The WOODIV database provides reliable occurrences, functional traits, and sequences for three DNA regions, together with the modelled occurrences and a phylogeny for the 210 Euro-Mediterranean tree species identified by Médail et al.
1  , including the 44 cryptic tree species which are often neglected in existing forest databases. The native or introduced status of a species in each location is also provided. This information combined with the number of considered taxa and sources of data, the inclusion of Mediterranean islands, and its resolution (10 × 10 km reference grid), result in a database of high significance and interest for macroecological studies in the Euro-Mediterranean area in the fields of conservation, biogeography, and community ecology.
Methods The geographic area covered by the WOODIV database is the Euro-Mediterranean region, as defined by Médail et al. 1. The northern Mediterranean region was selected following the definition of terrestrial ecoregions of the world by Olson et al. 13. The study area covers all or part of the following countries and islands: Albania, Croatia, Cyprus, France, Greece, Italy, Malta, Montenegro, Portugal, Slovenia, Southern Macedonia, and Spain, including the Balearic archipelago, Corsica, Sardinia, Sicily, and Crete. We focused on the 245 tree taxa (210 species and 35 subspecies) identified in the Euro-Mediterranean checklist from Médail et al. 1. These taxa belong to 33 families and 64 genera and include 46 endemics (as defined by Médail et al. 1  , i. e. range-restricted taxa in and outside of the study area).
Observed occurrence data. We collected tree occurrence data (at the species or subspecies level) from 23 sources: national databases and floras, regional databases, and publications (Table  1 ). Some records still unpublished were specifically provided at the grid level for this project by experts for southern Macedonia, Malta, Montenegro, and Sicily (four sources, Table  1 ). When considering the subspecies level, the WOODIV database lacks the occurrences of 11 sub-species among the 35 listed by Médail et al. 1. When aggregated at the species level (to match the taxonomic resolution of the functional and phylogenetic data which are available at the species level only), the WOODIV database lacks only the occurrences of 3 of the 210 species from the Médail et al. The raw dataset obtained from gathering occurrences from all sources included a total of 1,248,701 occurrence records distributed across the participating countries.