dataesr/scientific-paragraphs-categorization huggingface dataset:
PARAFAC modeling was performed using the DOMFLuor toolbox within MATLAB  (Stedmon and Bro 2008)  in order to decompose EEMs into independent fluorescent components. Excitation wavelengths below 260 nm and emission wavelengths below 312. 95 were removed from matrices in order to avoid deteriorating signal-to-noise ratios  (Stedmon et al. 2003). Prior to modelling, regions of the spectra influenced by 1 st and 2 nd order scatter peaks and with no fluorescence (i. e. emission << excitation) were cut and replaced by missing values. A five-component model was generated incorporating a total of 199 samples from the four streams and from a few ponds and subsurface seepage sites within the catchments. Samples from the ponds and seepage sites were included in order to compare the character of DOM from these different hydrological settings, with the DOM in runoff.
Model parameters were constrained to be non-negative. The model, which identified components with unimodal emission maxima, was validated using residual analysis characterized by instrument noise and a lack of systematic pattern, split-half analysis and random initialization  (Murphy et al. 2013; Stedmon and Bro 2008). It explained 99. 9 % of the fluorescence signature. Identified component emission and excitation loadings were compared with the open fluorescence database (openfluor. org, 53 PARAFAC models) and with previous studies using PARAFAC analysis that are not included in the database. All components have been previously reported by both 20 independent studies from openfluor database in various environments (Tucker Congruence Coefficient, TCC > 0. 95) and in many studies in arctic ecosystems.
Statistical Analyses All statistical analysis were carried out using the R free software version 3. 2. 1 (R Core Team between hydrologic phases and degrees of permafrost disturbance among catchments. A Principle Component Analysis (PCA) was performed to explore relationships between PARAFAC components, optical properties, discharge, SSC and biogeochemical composition and better understand stream water composition across the hydrologic season and depending on ALD impact. Before performing the PCA autoscaling was conducted on all variables with FactoMineR package in order to decrease the leverage of high values.
The component C4 exhibited a wide excitation maximum at 312 nm and an emission peak at 522 nm (Figure  4 ). C4, which has not been previously reported in the openfluor database, displayed an emission spectra at longer wavelengths indicating that this component likely contains highly aromatic molecules with very high molecular weight compounds  (Cory and McKnight 2005; Laurion and Mladenov 2013). In  Cory and McKnight (2005) , this component corresponds to semiquinones (SQ1). The component 5 (C5) exhibited an excitation peak at 282 nm and an emission maximum at lower wavelength (332 nm) corresponding to tryptophan-like fluorescence (Table  2 ). This fluorescent group represents amino acids, soluble bound microbial DOM and more aromatic protein than tyrosinelike component  (Fellman et al. 2010; Murphy et al.
relationships between optical DOM properties, DOC, DON, DIN, TDS, discharge and suspended sediment concentration were explored using principle component analysis (PCA) (Figure 8). The three first principle components explained 70 % of the total variance of the dataset. The first principal component corresponds to the shift in molecular weight, freshness and terrestrial inputs from HMW humic-like PARAFAC components to LMW humic-like PARAFAC component (C3) associated with inorganic ions concentrations. The second principal component is related to the contribution of the protein-like PARAFAC component (C5) and the decrease in humification. Noteworthy is the positive correlation between.
Acknowledgements This research was funded by the  ArcticNet Network of Centres of Excellence of Canada , the  Natural Sciences and Engineering Research Council (NSERC) Discovery Frontiers ADAPT  and individual Discovery grants. Logistics support was provided by the  Polar Continental Shelf Programme. We also gratefully acknowledge the 2007 and 2012 CBAWO field research teams. We also thank the two anonymous reviewers for their great comments leading to improvements of the paper.
com, Justeacote. com, Qype. fr) qui informent sur les horaires des transports en commun, permettent de donner un avis sur un produit, un lieu, un professionnel, et des conseils en tout genre. Le Web 2. 0 est un modèle de participation collective qui place l'usager au centre de ses processus. A l'origine de la transformation du Web en Web 2. 0, on retrouve bon nombre de plateformes collaboratives où l'utilisateur agrémente lui-même la base de données. L'avènement de l'Internet mobile, des systèmes GPS embarqués (Global Positionning System) et de la géolocalisation des smartphones ouvre une nouvelle porte vers un monde où l'information géographique se partage en temps réel, mais surtout, se spatialise d'elle-même. Plus besoin d'être spécialiste ou expert en géomatique pour alimenter une base de données cartographique.
Un autre format remarquable issu de l'OGC est le langage WMS (Web Map Service) qui permet de produire des cartes à partir de différents serveurs de données. Ce format est très pratique, car en plus d'une excellente intégration avec les suites SIG, il permet également d'éditer et de consulter des cartes sur le web, directement à partir d'un navigateur via la barre d'adresse URL. En pratique, une requête WMS permet de renvoyer à l'utilisateur une image visualisable sur un écran d'ordinateur après connexion à un serveur qui produit une image aux formats JPEG (Joint Photographic Experts Group) ou SVG (Scalable Vector Graphics). Pour illustrer les possibilités de l'open source en vue d'un projet d'aménagement, une boite à outils peut-être utile à tous. Les exemples suivants donne un aperçu des possibilités de l'open source : de la constitution, gestion de la base de données, des SIG à la modélisation 3D, jusqu'à la publication de cartes sur des plateformes en ligne.
Base de données : PostgreSQL et son extension géographique PostGIS PostgreSQL 32 est un Système de Gestion de Base de Données relationnelles (SGBD) open source fonctionnant avec un langage SQL (Structured Query Language, soit Langage de requêtes structurée). Les avantages sont nombreux quant à l'utilisation de PostgreSQL dans la constitution d'une base de données géomatiques. Il agit comme un serveur pouvant avoir des relations avec des usagers informatiques, les clients. Cela s'avère pratique lors d'une utilisation entre plusieurs partenaires (en interne ou en externe) souhaitant collaborer et travailler sur une même base de données. PostgreSQL fonctionne sur les principaux systèmes d'exploitation et traite tous types de données (entiers, caractères, fonctions…). L'extension PostGIS 33 permet de joindre des informations géographiques et géométriques aux données contenues dans la base (forme, projection, emprise, couleur, taille…).
En effet, la première étape du géomaticien dans la mise en place du SIG est la constitution de la base de données. Certaines suites propriétaires de SIG comme « ArcGis » possèdent leur propre système de gestion de base de données (comme ArcCatalog). A première vue cela peut sembler plus simple et plus efficace de gérer et de traiter les données avec le même logiciel. Cependant, il existe de nombreux avantages à utiliser PostgreSQL et ce en toute intégration avec les outils de traitement SIG, ce qui constitue tout l'intérêt de l'open source. L'intégration de PostgreSQL aux SIG libres permet de consulter la base directement sous l'interface SIG et d'exporter les données issues de ce SIG directement dans PostgreSQL : les informations utiles sont donc adressées à PostGIS. Cela permet également à chaque partenaire de travailler sur des données mises à jour en temps réel.
Par exemple, si le fichier client d'une entreprise est réalisé sous PostgreSQL, le géomaticien transformera la base de données en SIG et ainsi spatialisera toutes les informations qu'elle contient. On peut alors repérer sur une carte tous les acteurs, sélectionnés via une requête SQL, et prévoir le meilleur itinéraire pour les rencontrer. Cela permet également à chaque partenaire de travailler sur des données mises à jour en temps réel, même si ceux-ci sont à des centaines de kilomètres. Cette manipulation peut sembler à première vue complexe, mais elle s'avère très utile, par exemple lorsque le fichier client d'une entreprise est fait avec PostgreSQL : il devient alors plus simple de transformer la base de données en SIG, ainsi de spatialiser toutes les informations qu'elle contient, ce qui permet de repérer sur une carte tous les clients, de sélectionner via une requête SQL ceux qu'il faut rencontrer dans la journée et ainsi prévoir le meilleur itinéraire pour relier tous les clients.
Cartographie et SIG : le binôme Grass GIS et QuantumGIS Grass GIS  34     La prise en main de Grass repose en partie sur la capacité de l'utilisateur à maitriser les lignes de commandes. Pour pallier cette difficulté, il est possible de l'intégrer à un autre logiciel libre : QuantumGIS, dont l'interface est plus ergonomique. Le logiciel de SIG, libre, QuantumGIS (QGis) est moins performant que Grass, mais présente une interface graphique, sans lignes de commandes, pour l'utilisateur. Il permet de gérer l'extension spatiale de Postgre, PostGIS, d'intégrer la lecture et l'écriture de données GPS. Il possède également un module de géoréférencement et intègre les fichiers Shapes (. shp)  36. Qgis fournit une interface graphique conviviale à l'utilisateur en lui permettant d'avoir accès à toutes les puissantes fonctionnalités de Grass.
L'utilisation de ces deux outils permet de disposer d'une suite de logiciels libres pour la mise en place, gratuitement, de tout SIG. De plus, avec Qgis l'intégration des données traitées dans PostgreSQL, via PostGIS, permet de relier la base de données principale au SIG et de la mettre à jour à chaque fin de session de travail. Ainsi, après avoir présenté l'utilisation de logiciels open source et leur contribution au traitement et au partage de données, la partie diffusion et mise en réseau de ces données est abordée.
Modélisation 3D : Blender et Google Sketchup Blender et Google Sketchup constituent deux logiciels utiles à la modélisation en trois dimensions. En effet, la modélisation 3D détaillée est un formidable outil d'aide à la décision et de communication en matière d'aménagement du territoire. Si Grass permet de générer les MNT qui servent de supports à la modélisation, les deux logiciels suivants permettent de créer des formes et des objets qui viennent s'implanter sur le MNT. La stabilité et les performances du logiciel Blender 39 sont équivalentes à celles de logiciels propriétaires de Conception Assistée par Ordinateur (CAO) 40 et de Dessin Assisté par Ordinateur (DAO)  41. Ses applications vont de la conception d'objets 3D, de films d'animation, et de jeux vidéo (modélisation, rendu en 3D, animation).
Blender permet, à partir d'un environnement virtuel, de générer un programme exécutable (format «. exe ») où l'utilisateur évolue à l'aide des touches directionnelles du clavier, et interagir avec les éléments du projet d'aménagement. 39 Lien de téléchargement du logiciel libre « Blender », [URL : http://www. blender. org/download/getblender], consulté le 26 juin 2013. 40 La CAO comprend l'ensemble des logiciels et des techniques de modélisation géométrique permettant de concevoir, de tester virtuellement -à l'aide d'un ordinateur et des techniques de simulation numériqueet de réaliser des produits manufacturés et les outils pour les fabriquer. Elle n'a pas pour fonction première l'édition du dessin. Elle désigne principalement du dessin en 2D et 3D : calcul de résistance, optimisation de l'utilisation des matériaux, pilotage de machines-outils et robots, calcul de coûts de fabrication, etc.
2. 0 regorgent de capteurs qui collectent une masse d'informations : météo, qualité de l'air, trafic autoroutier, vidéosurveillance… Ces informations, massives et brutes, sont autant de données à traiter qui n'apparaissent cohérentes qu'une fois analysées et spatialisées. Ces données brutes manquent souvent de structure et de lisibilité, c'est donc en s'attachant à développer des outils qui permettent de les mettre en relation et d'effectuer les traitements spatiaux et analytiques adéquats, qu'il est possible de les rendre intelligibles. Ainsi, l'utilisation du SIG prend tout son sens. Les SIG offrent toutes les possibilités de traitements relatifs aux systèmes de bases de données et permettent une visualisation cartographique. Parce qu'ils permettent l'analyse d'informations relatives aux enjeux majeurs de notre société (environnement, démographie, santé, aménagement du territoire), les SIG sont un outil incontournable dans la planification et la gestion des territoires.
BACKGROUND: The effect of photodamage on facial stratum corneum (SC) is still poorly understood. OBJECTIVE: To describe the SC proteome from tape strippings of Caucasian SC from photoexposed cheek and photoprotected postauricular (PA) site, a global analysis of photodamage on the skin will be developed leading to a better understanding of keratinocyte signalling pathways and identification of new molecular targets for the treatment of photoaged skin. METHODS: Female Caucasian subjects had nine consecutive tape strippings taken from their cheeks and PA site. Proteins were extracted and the trypsin-digested peptides were analysed by nanochromatography coupled to a high-resolution mass spectrometer. Data-dependent acquisition allowed protein identification that was processed by Paragon algorithm of Protein Pilot software.
M ETHODES: 9 pr el evements cons ecutifs par bandes adh esives ont et e r ealis es sur des femmes caucasiennes au niveau de la joue et de la zone post-auriculaire. Les prot eines ont et e extraites des echantillons et les peptides issus de leur digestion trypsique analys es par nano-chromatographie coupl ee a un spectrom etre de masse haute r esolution. L'acquisition d ependante des donn ees a permis l'identification des prot eines par l'algorithme Paragon du logiciel Protein Pilot. R ESULTATS: Des changements notables des taux de prot eines impliqu ees dans la diff erentiation epidermique et la maturation du SC (k eratines, prot eines de l'enveloppe corn ee (EC)) indiquent que celles-ci sont amoindries au niveau des joues photo-expos ees. Des diff erences de l' equilibre prot eases-antiprot eases ont et e observ ees pour la corn eodesmolyse (favorisant la desquamation) et la filaggrinolyse (favorisant la r eduction du traitement de la filaggrine).
Data analysis and peptide annotation DDA spectra processing and database searching were performed with ProteinPilot (v4. 5 beta, ABSciex, Framingham, US) using the Paragon algorithm. The search parameters were as follows: sample type: identification; cys alkylation: iodoacetamide; digestion: trypsin; instrument: TripleTOF 5600; special factors: urea denaturation. ID focus: biological modifications. The database was downloaded from Uniprot (June 2014), filtering for reviewed human proteins only  (20 194 entries). The resulting. group file was loaded into Peakview â (v2. 0, AB Sciex, Framingham, USA), and peaks from SWATH runs were extracted with a peptide confidence threshold of 99% and a false discovery rate <1%. Label-free quantification was performed using Marker View (v1. 2. 1, AB Sciex, Framingham, USA).
Acknowledgements This study was financially supported by  DSM Nutritional Products Ltd. , Basel, Switzerland. We would like to thank  Isabelle Metton  and  Gilbert Skorski  of  Phylogene, Bernis, France , and  Angelika Friedel  and  Igor Bendik  of  DSM Nutritional Products Ltd. , Basel, Switzerland , for their consulting and support in proteomics but also  Lebogang Kgatuke ,  Marlize Lategan ,  Caroline Moeletsi  and  Lee-Ann Raaff  of the  Photobiology Laboratory, Medunsa Campus, Sefako Makgatho University, Pretoria, South Africa , for their enthusiasm in conducting the clinical aspect of the study. Most importantly, we would like to thank the volunteers for their willing and valuable participation in this study.
Across large distances and swaths of time, capturing micro-level data to establish both site-specific and systemwide change is difficult. Their solution is to merge the framework of ecosystems services with open data and citizen science as a new method for capturing information. In chapter 3, Marx turns to issues of scale and power. In her words, humankind is "not a single global agent. " Both the causes and the consequences of environmental change are experienced unevenly. Looking at the Koga water projects in Ethiopia, she shows that even narratives about how to respond to environmental change operate differently at different scales. Drummond continues the theme of narrative by focusing on the story of the Anthropocene itself. She argues that all narratives-especially historical ones-embed ethical constructions.
Assessing Ecosystem Service Provision Using Virtual Globe Technologies For a range of earth systems including freshwaters,  Brown et al. (2016)  conclude that we need to improve our criteria for diagnosing human impacts on the connectivity, integrity, and resilience of critical zone processes. Panoptic mapping tools including Google Earth and other virtual globes (e. g. , Microsoft's Virtual Earth, NASA's World Wind) offer much potential for such assessments of rivers of the Anthropocene. A key advantage is that these mapping tools are free and easily accessible and offer global coverage of both heavily modified and less disturbed catchments. Potential users of these tools simply need the skill sets to identify relevant riverscape-scale features and the ability to extract riverscape features/attributes from remotely sensed data at appropriate scales.
ACKNOWLED GMENT S This work has been generated by the Piren-Seine program, initiated in 1989 by Ghislain de Marsily, then directed by Gilles Billen and Jean Marie Mouchel, and now by Nicolas Flipo. We have used the work of dozens of our colleagues and benefited from our annual meeting discussions. The position of river basins within the Anthropocene started to be analyzed in the IGBP with colleagues in the BAHC, LOICZ, and IGBP-Water group, particularly Charles Vörösmarty. The water quality issues are addressed in the French ANR Makara program (ANR-12-SENV-009). Aurélien Baro assisted us in preparing the illustrations, and Jason M. Kelly provided editorial advice, although we might have added other editorial flaws. To all we express our warm thanks.
First, we know about these episodes of mass extinction by studying fossil evidence originally deposited in layers of sedimentary rock. The fossil record in effect serves as the "database" or the "archive" that documents the evolution of life on earth. Second, mass extinctions one through five took place in the complete absence of human agency. Within the past few decades, scientists have begun arguing that earth may be entering a sixth period of mass extinction-driven directly by the actions of people. 4 Some of the new information, and especially that aimed at public audiences, declares that this sixth mass extinction is already under way. In the fall of 2014, National Public Television in the United States broadcast a documentary film titled From Billions to None: The Passenger Pigeons' Flight to Extinction  (Mrazek 2014) , which follows the naturalist Joel Greenberg, author of A Feathered River Across the Sky: The Passenger Pigeon's Flight to  Extinction (2014).
F. MIMO Channel Capacity Using the feeding levels from Fig. 6  together with the ETSI STF 410 measurement data  [14] , allows to predict MIMO PLC channel capacity as summarized in Table  III. For better comparison among individual feeding PSDs, country or region specific notches are not applied. The noise is recorded with an average detector using a resolution bandwidth of 9 kHz. The capacity results in Table III take into account noise correlation by calculating an equivalent channel matrix with the help of a noise whitening filter  [84] ,  [94]. "Capacity" refers to the ideal maximum Shannon capacity making full use of the equivalent channel eigenmodes  [95]. The channel matrix may be decomposed by means of a singular value decomposition (SVD) into parallel and independent channels (see also Section IV) where the MIMO capacity is the sum of the capacity of the individual channels.
A. ITU-T G. hn The ITU-T G. hn standards belong to the "G" family specifying "Transmission systems and media, digital systems and networks. " The acronym "hn" stands for home networking and was an intermediate name used in the early stages of standard development. Based on this legacy, the term G. hn is still commonly used to refer to the family of standards G. 9960 to G. 9964. ITU-T G. hn is not only applicable to power lines but also to phone lines and coaxial cables, therewith for the first time defining a single standard for all major wireline communications media. In 2009, the PHY layer and the overall architecture were approved as ITU-T Recommendation G. 9960  [16]. The Data Link Layer (DLL) Recommendation G. 9961  [17]  was approved in June 2010. Finally, a MIMO transceiver extension G.
Even if many features appear to be individually developed by ITU-T and IEEE/HomePlug, several are actually identical. The fact that ITU-T G. hn and HomePlug AV2 largely agree on channel coherence time, coherence bandwidth, guard interval, roll-off window timings, etc. shows that the BB-PLC channel is analyzed similarly and that channel difference for comparable topologies are not very different around the globe. Similarities continue with PHY-frame header settings making use of QPSK, FEC coderate 1/2, and repetition codes. The segmentation process of embedding the application data into PLC convenient packets is similar and data is in both cases encrypted using AES-128  [141]. The MAC cycle or Beacon period is selected to be 2 AC line cycles. The bit-loading of carriers can be line cycle dependent, and immediate, as well as delayed acknowledgments are possible.
Besides, while the normalization factor 1/ √ 2 is explicitly included in  (11) , this factor is included via the power allocation and not via the unitary precoding definition of  (10)  for HomePlug AV2. The carriers' precoding information may be grouped in ITU-T G. hn while HomePlug AV2 may interpolate the precoding matrix based on pilot carriers. The group size and pilot spacing are variable in order to balance performance and memory requirements. With all these communalities, differences are that ITU-T G. hn supports multicast transmissions, i. e. , transmitting to multiple nodes using a common bit allocation table (BAT), while HomePlug AV2 does not. Nevertheless, HomePlug AV2 implements the option of a short delimiter, i. e. , data and pilot carriers in preamble and frame control, an option not implemented by ITU-T G.
hn. Modulation and FEC coding of both MIMO PLC standards is kept identical to their SISO predecessors in order to maintain backward compatibility. In the case of eigenbeamforming the payload bits are independently quadrature amplitude modulated on both steams in an adaptive manner, where the available SINR per stream and carrier defines the amount of payload for each carrier. The allowed constellations vary from 1 bit per OFDM carrier up to 12 bits. However, two very different FECs, i. e. , low-density parity-check code (LDPC) in ITU-T G. hn and Turbo Code in HomePlug AV2, are chosen-see  [143]  for a comparative analysis. This makes it more difficult (or costly) to implement both standards in a single chip, as the FEC part is up to the present day a non-negligible space factor when manufacturing wafers.