dataesr/scientific-paragraphs-categorization huggingface dataset:
a décrit près de 60 taxons dans le genre Primula L. , dont 16 ont fait l'objet de discussions dans une première publication. Notre présent article poursuit les recherches consacrées à la typification des noms de Primula, sur la base de l'étude experte des spécimens dans les herbiers BM, E, G, K, LE, MHA, MW, NS, NSK, P, W, WU, Z et dans les bases de données en ligne. En 1886, A. R. Franchet publia un article : « Observations sur deux Primula monocarpiques de la Chine et descriptions d'espèces nouvelles de la Chine et du Thibet oriental » et y décrivit 11 nouvelles espèces. Pour P. davidii et P. heucherifolia, nous avons trouvé seulement une part d'herbier, ce sont donc des holotypes. Pour huit espèces :.
In many cases, the original descriptions of Primula taxa were based on one or a few different gatherings, comprising several specimens which were sent to different herbaria. Consequently, a high number of isotypes and syntypes can be found for some names. The modern revision of various Primula taxa during the inspection of material in some important herbaria (BM, E, G, K, LE, MHA, MW, NS, NSK, P, W, WU, Z) and using Databases of herbarium collections through internet, have revealed the need to restrict the typifications of several names. In our first publication  (Kovtonyuk 2017) , devoted to Franchet's paper "Les Primula du Yun-nan" Franchet (1885), 16 taxa were discussed and 11 of them were lectotypified. In 1886, in "Observations sur deux Primula monocarpiques de la Chine et descriptions d'espèces nouvelles de la Chine et du Thibet oriental", Franchet described again 11 new species of Primula.
Comments The herbarium sheet of P. davidii P00649651, marked as "type" in P Herbarium database, has not handwritten label and date "avril 1869", so it cannot be type specimen. The third herbarium sheet P04571715 without date and place is not type too. Herbarium specimen from the Royal Botanical Gardens Kew: "Herb. Mus. Paris, Chine (Tibet Oriental), Prov. de Moupin, Hautes prairies fraiches, mars 1869, M l'Abbé David", K000750146! was collected in March 1869, so it cannot be type, as its photocopy in Royal Botanical Gardens Edinburgh E00024321! Fletcher (1944: 309)  wrote: "[…] the paucity of material of P. davidii in any herbarium is unfortunate […] Franchet has given two descriptions and a figure: it is founding in moist shady alpine woods; it is 'planta speciosisima', it is one of the most ornamental species in the genus by reason of its large violet-purple flowers; its leaves recall those of P.
RemaRks We found 54 herbarium sheets with P. forbesii in P herbarium database. Part of them with full handwritten text and no. 858, but date 1885 (P04567391, P04567401), some with no. 311 and short text according protologue, but date "mars 1884" (P04567379), or "janvier 1883" (P04567409, P05250285, P01029601 and P01029602), or just the no. 311, without locality and date (P04567380 and P04567403). Some others with n° 858 and date "avril 1884" but with text "in rizière prope Tapin-tze" (P01029599). There are also specimens which have no number but the locality, date and collector's name correspond to the protologue exactly (P04567405, P04567410). All of them are syntypes. According to Art. 9. 6 and Rec. 9A of the  ICN (Turland et al. 2018)  among syntypes one of the herbarium specimens may be chosen as lectotype.
Acknowledgements We would like to thank curators of herbarium collections BM, E, G, K, LE,  MHA ,  MW, NSK, NS  ( UNU_440537 ), P, SVER,  VLA , VBGI, W, WU, Z for the possibility to work with specimens and specially  Dr Irina Sokolova  (LE) and  Dr Irina Belyaeva  (K) for the consultations. We are especially grateful to  Dr Porter Pete Lowry  for his advice and his help on collection of  Herbarium Drake del Castillo  and the nomenclature, but also for valuable suggestions that helped to improve the manuscript. We also thankful  Thierry Deroin  and a anonymous reviewer for their useful comments on the article. The study was supported by the  Russian Foundation for Basic Research  (grant no. 15-29-02429 ) in working trip to  LE Herbarium (Sankt-Petersburg, Russia)  and the base project  VI. 52.
senegalensis), jusqu'à l'African Plant Database  (CJBG et SANBI, 2012)  qui en retient aujourd'hui cinq : K. anthotheca, K. grandifoliola, K. ivorensis K. madagascariensis et K. senegalensis. Nous ne traiterons ici que des quatre espèces de l'Afrique continentale, hormis donc K. madagascariensis. Malgré leur importance économique et deux siècles environ d'exploitation industrielle  (CTFT, 1979) , il existe encore de nombreuses controverses sur le nombre d'espèces constituant le genre Khaya  (Bouka et al. , 2017)   (Chevalier, 1937 ; Aubréville, 1959). Actuellement, quatre espèces sont acceptées en Afrique continentale dans l'African Plant Database  (tableau I ; CJBG et SANBI, 2012). Il s'agit de K. anthotheca, K. grandifoliola, K. ivorensis et K. senegalensis. Du fait d'une importante variabilité phénotypique au sein de chaque espèce, générant une proximité morphologique entre elles, plusieurs taxons furent décrits et publiés, puis mis ultérieurement en synonymie de ces quatre espèces (tableaux I et II ;  Aubréville, 1959 ; Voorhoeve, 1965 ; Styles et White, 1991 ; Bouka et al.
DOI: 10. 20870/IVES-TR. 2019. 2586 The set-up and launch of IVES Technical Reviews are supported by the LabEx COTE via its Transfer and valorization call for projects. ‚ The retained stage corresponds to the date at which 50 % budburst has been reached in relation to the number of productive buds left at the pruning. ‚ It is necessary to undertake the observations on at least five vine-plants per homogenous zone. ‚ Passage frequency: From the moment when a minimum of 5 % of buds have burst, do at least one additional passage with a maximum of one-week interval, in a manner to have one observation after 50 % of the buds have burst. ‚ The date of «50 % budburst» is obtained by interpolation between the observed values before and after 50 %. The flowering marks the beginning of the reproductive stage: the fall of the cap corresponds to the moment where the pollen will come into contact with the stigmas.
In this paper, we are taking our previous work on Siwa date palms  (Battesti et al. , 2018)  to the next level, using a joint ethnographic study and genetic analysis. First, we greatly expanded the number of named types sampled in Siwa to further test whether named types are true-to-type cultivars or ethnovarieties or local categories. Secondly, we also increased our sampling of uncultivated individuals from the abandoned oases in the desert nearby Siwa (also known as "feral" in  Battesti et al. , 2018). This enabled a full assessment of local biodiversity and potential connections between the currently cultivated pool of the oasis and the uncultivated abandoned date palms. Lastly, we used genotyping data from more than 200 cultivated date palms sampled across the entire historical range of the species in order to locate Siwa diversity located within a wider germplasm diversity.
, 2013; Gros-Balthazard et al. , 2017; Pintaud et al. , 2010; Zehdi-Azouzi et al. , 2015). In addition to this newly generated genotyping dataset, we utilized P. dactylifera genotyping data from previous studies  (Moussouni, Pintaud, Vigouroux, & Bouguedoura, 2017; Zango et al. , 2017; Zehdi-Azouzi et al. , 2015)  (Table  S1 ). Both these data and our new data relied on the same set of microsatellite markers and were generated by the same company (ADNid, Montpellier, France) with the same protocol, enabling a meta-analysis. These additional accessions are a good representation of the cultivated germplasm as their origin spans the historic date palm distribution, stretching from North Africa to the Middle East and Pakistan  (Barrow, 1998).
| Genotyping data analysis Statistical analysis was conducted with the R Statistical Programming Language  (R Core Team, 2015) , unless otherwise stated. To identify duplicated genotypes among the whole dataset, we performed an identity analysis using Cervus v3. 0. 7  (Kalinowski, Taper, & Marshall, 2007). For each pair of accessions, Cervus calculates the number of matching genotypes across the 17 nuclear loci. We used the same software for calculation of the polymorphic information content (PIC) for each locus. We estimated null allele frequencies using null. all function in the R package PopGenReport  (Adamack & Gruber, 2014; Gruber & Adamack, 2015). For each locus, the number of alleles N A , and the observed (H O ) and expected heterozygosity (H S ) were estimated using the R package pegas  (Paradis, 2010).
For this purpose, we calculated a measure of identity by averaging over each named type the proportion of matching genotypes across the 18 chloroplastic and nuclear loci. For true-to-type cultivars, this number is expected to be 100%, except in case of somatic mutations or genotyping error. Second, we calculated the Euclidean distance between each of the Siwa samples (function dist, R package stats) and built a heatmap of those distances using heatmap function (R package stats). To investigate the extent of the diversity in the whole region, and not only in the oasis, we included uncultivated date palms from the abandoned oases in the following analyses. We generated a neighbor-joining tree based on Nei's genetic distance  (Nei, 1972)  using aboot function in poppr package  (Kamvar, Tabima, & Grünwald, 2014)  with 100 bootstrap replicates.
| Extent and partitioning of worldwide date palm diversity To draw up a picture of the overall Phoenix population structure, we applied two different approaches to our dataset comprising 128 unique genotypes from Siwa, 219 date palms originating from all over its historical distribution area, and nine wild Phoenix theophrasti. First, we performed a principal component analysis, as described above for Siwa accessions only. We further used the Bayesian clustering method based on a Markov chain Monte Carlo (MCMC) algorithm implemented in Structure v2. 3. 3  (Pritchard, Stephens, & Donnelly, 2000). Individuals are partitioned into a predefined number of clusters (K) so as to minimize linkage disequilibrium and deviation from Hardy-Weinberg within cluster. Allelic frequencies at each locus are calculated at the same time for each cluster.
4. 7  (Rousset, 2008). The proportion of shared alleles between populations and subpopulations was calculated with the pairwise. propShared function of the R package PopGenReport  (Adamack & Gruber, 2014; Gruber & Adamack, 2015). Further, we calculated various diversity estimates for each population. The allelic richness and private allelic richness were calculated with a custom R script. Because the numbers of distinct alleles and private alleles depend heavily on sample size in each population, we used the rarefaction method  (Petit, El Mousadik, & Pons, 1998) , allowing a direct comparison among populations of different sample size. For each set of comparison, we thus used the smallest haploid sample size (n = 18 in Phoenix theophrasti) as the number of alleles to sample, and ran 1,000 replicates of allelic and private allelic richness calculation.
To test for significant differences among populations, these diversity estimates were assigned to Tukey groups (function HSD. test, Agricolae package,  de Mendiburu, 2015)  at a significant threshold of 0. 05. Expected and observed heterozygosity (H S and H O ) were calculated using the basic. stats function of the R package hierfstat. The inbreeding coefficient F IS was calculated with the same package, and confidence intervals were estimated by performing 1,000 bootstrap replicates over loci with the function boot. ppfis.
| RE SULTS A total of 406 Phoenix spp. samples (Table  1 ; Table  S1 ) genotyped across 17 nuclear microsatellites and one chloroplastic minisatellite (Table  2 ) were analyzed in the present study. We report new genotyping data for 176 cultivated and uncultivated date palms from the Egyptian oasis of Siwa and the surrounding abandoned oases (Figure  1 ; Figure  S1C ), nine Phoenix theophrasti, and two Phoenix reclinata (Table  S2 ). Additional genotyping data for 98 Middle Eastern/ Asian and 121 North African date palms were retrieved from previous studies  (Moussouni et al. , 2017; Zango et al. , 2017; Zehdi-Azouzi et al. , 2015). Missing data across the full dataset were very limited with an average of 1. 1%, and the mean null allele frequency was 6. 8%, on average, across all 18 chloroplastic and nuclear loci (Table  2 ).
Indeed, the field survey showed they refer to individuals sharing fruit characteristics and/or originate from seedlings, and the genetic analysis confirmed that samples are unrelated (Figures  2  and 3 ; Table  3 ). Four úšik nevertheless present the same microsatellite profiles as the Siwa widespread cultivar ṣaɛidi (Figure  3 ) meaning that these were actually ṣaɛidi but thought wrongly, by the sampler, to be accidental seedlings (because they were found in abandoned areas of the palm grove). Following this identity analysis, we removed 58 genotypes from the initial Siwa dataset in order to only keep 128 unique genotypes in downstream analyses.
771 0. 71 0. 79 0. 00 mPdCIR025 Billotte et al. (2004) 0. 00 0. 025 18 0. 791 0. 77 0. 81 0. 00 mPdCIR063 Billotte et al. (2004) 2. 21 0. 087 14 0. 681 0. 61 0. 72 0. 00 mPdCIR078 Billotte et al. (2004) 0. 00 0. 057 27 0. 886 0. 79 0. 88 0. 00 PdCUC3-ssr1 Accession number: HM622273 0. 25 0. 000 5 0. 017 0. 02 0. 02 1. 00 PdCUC3-ssr2 Accession number: HM622273 0. 00 0. 119 9 0. 885 0. 77 0. 86 0. 00 mPdIRD013 Aberlenc-Bertossi et al. (2014) 0. 00 0. 072 31 0. 159 0. 7 0. 88 0. 00 mPdIRD031 Aberlenc-Bertossi et al. (2014) 0. 49 0. 036 4 0. 356 0. 13 0. 16 0. 00 mPdIRD033 Aberlenc-Bertossi et al. (2014) 0. 00 0. 110 4 0. 479 0. 33 0. 35 0. 00 mPdIRD040 Aberlenc-Bertossi et al. (2014) 0. 00 0. 040 5 0. 593 0. 39 0. 48 0. 00 Abbreviations: % MD, Proportion of missing data; N 0 , null allele frequency; # All), number of alleles; PIC, polymorphic information content; Ho and He, observed and expected heterozygosity; HWD, deviation from Hardy-Weinberg p-value.
Introduction et énoncé des résultats Répondant à une question de Steinhaus, Cassels  [4]  a construit en 1959 un ensemble de mesure de Hausdorff positive dont les éléments sont normaux en toute base qui n'est pas une puissance de 3. Dans le même esprit, alors qu'il est généralement conjecturé que les développements des entiers dans des bases multiplicativement indépendantes sur Z sont statistiquement indépendants, il est naturel d'attendre un phénomène de dépendance pour une infinité d'entiers exceptionnels. Deshouillers et al. [7]  ont ainsi Mots-clés : somme des chiffres, indépendence multiplicative, exposant d'irrationalité, recentrage binomial. Classification Mathématique (2010) : 11A63, 11K16, 11K60, 11J82. (*) Ce travail a bénéficié d'un soutien financier de l'Agence Nationale de la Recherche (ANR) et du Fonds zur Förderung der wissenschaftlichen Forschung (FWF) dans le cadre du projet bilatéral MuDeRa (France-Autriche), ANR-14-CE34-0009.
Measurements, by use of scales and a humidity meter, were taken at each kiln to determine mass (PH) and humidity (H%) of wood input and mass of charcoal output (PC) and mass of unburnt wood (I). The charcoal yield efficiency, by mass on dry basis (PO = PH*[1-H%/100]) was calculated by the formula: R = ((PC/ (PO-I))*100  (Girard, 1992). Descriptive statistics presented mean values and standard deviations of kiln data for the two areas. Comparative analysis of statistical differences was conducted by applying the non-parametric Mann-Whitney U test using STATA software. Data on the production process was collected using a structured protocol for noting down information on duration, number of persons involved and specific observations per step of the process.
Acknowledgements The authors are grateful for contributions and revisions of the case studies by  Christian Burren ,  Richard Knodt ,  Didier Hubert ,  Sabin Murererehe  and  Mary Njenga. The authors thank the anonymous reviewers for their detailed comments on earlier drafts of the paper. The data and lessons presented on charcoal efficiency of kilns in the Democratic Republic of Congo was collected in the context of two different projects, both funded by the  European Union : the  Makala project on 'Sustainable Management of Woodfuel in the Democratic Republic of Congo  (2009Congo ( -2013)), coordinated by the  French Agricultural Research Centre for International Development (CIRAD)  and the  Forest project "Formation, Recherche, Environnement dans la Tshopo " (Training, research and environment in the Tshopo Province), implemented by CIFOR and partners.
> les produits globaux de variables biophysiques de surface (surface foliaire, humidité du sol, température de surface, indices spectraux de végétation, etc. ) et d'occupation des sols. Ils sont obtenus en routine sur l'ensemble du globe avec une résolution spatiale basse, de 250 mètres à plusieurs kilomètres. Un des exemples les plus connus est le produit annuel Land Cover de la Climate Change Initiative de l'Agence spatiale européenne (ESA), à 300 mètres de résolution spatiale, disponible depuis 1992 ; > les cartes d'occupation des sols à plus fine résolution spatiale, produites à la demande sur de grandes étendues, souvent dans le cadre de projets. La Base de données d'occupation des terres (BDOT) du Burkina Faso au 1/100 000 e est ainsi réalisée par l'Institut géographique burkinabé (IGB) avec l'assistance technique d'IGN FI, l'opérateur technique de l'Institut national de l'information géographique et forestière (IGN, France) pour ses projets à l'international ; > les spatiocartes, qui sont des images satellitaires en couleurs naturelles, géo-référencées, avec une surcouche incluant des éléments de paysage tels que routes, villes, cours d'eau, etc.
plus opérationnels à grande échelle (1/5 000 e à 1/50 000 e ), comme les plans d'affectation des sols, les statistiques agricoles ou l'agriculture de précision. Pour développer ces applications, il faut disposer de cartes d'occupation des sols à haute résolution spatiale fréquemment mises à jour. L'utilisation conjointe des données des satellites d'observation de la Terre Sentinel-2 de l'ESA et du satellite Landsat-8 de la NASA devrait permettre d'élaborer une base de données d'occupation des sols équivalente à la base de données européenne CORINE Land Cover (CLC), produite dans le cadre du programme Copernicus, qui couvre 39 États (Europe élargie). La production de ces bases de données répond à des besoins prioritaires pour la majorité des pays africains. d'appui au secteur agricole et à certains producteurs agricoles.
La recherche ouvre alors d'autres voies d'exploitation des images satellitaires pour documenter et expliciter les processus de transformation de l'agriculture. Enfin, des réseaux de compétences interdisciplinaires structurés sur le temps long sont nécessaires pour favoriser les échanges méthodologiques et thématiques. plus opérationnels à grande échelle (1/5 000 e à 1/50 000 e ), comme les plans d'affectation des sols, les statistiques agricoles ou l'agriculture de précision. Pour développer ces applications, il faut disposer de cartes d'occupation des sols à haute résolution spatiale fréquemment mises à jour. L'utilisation conjointe des données des satellites d'observation de la Terre Sentinel-2 de l'ESA et du satellite Landsat-8 de la NASA devrait permettre d'élaborer une base de données d'occupation des sols équivalente à la base de données européenne CORINE Land Cover (CLC), produite dans le cadre du programme Copernicus, qui couvre 39 États (Europe élargie).
La production de ces bases de données répond à des besoins prioritaires pour la majorité des pays africains. d'appui au secteur agricole et à certains producteurs agricoles. Ces utilisateurs finaux sont demandeurs d'informations récurrentes telles que les superficies emblavées, le suivi de la campagne agricole et les prévisions de rendements. Les services informationnels produisent de façon régulière et normalisée des informations facilement accessibles et utilisables. En conséquence, ces services obéissent à un cahier des charges précis, en fonction des besoins des utilisateurs finaux. Les produits thématiques d'aide à la décision sont plus complexes à concevoir que les produits génériques parce qu'ils intègrent des données complémentaires et nécessitent d'adapter les méthodes aux conditions locales.
Remerciements Ce travail a été réalisé avec le soutien du projet AWA ( Ecosystem Approach  to  Management of Fisheries and Marine Environment in West African Waters ) financé par l' IRD-France et le ministère de la recherche allemand BMBF  (grant  01DG12073E ), ainsi que du projet  PREFACE (Enhancing Prediction of Tropical Atlantic Climate and its Impacts) financé par European Commission 's  Seventh Framework Programme  under Grant Agreement (number  603521 ). Nous remercions pour ses critiques constructives  Juliette Desfrançois.
MATÉRIEL ET MÉTHODES Le travail présenté ici a été réalisé dans le cadre du projet en cours d'une nouvelle flore des ptéridophytes de Madagascar. Cette étude s'appuie sur l'examen des spécimens d'herbier des collections de Paris (P), de Kew (K) et du Missouri Botanical Garden (MO). Les photos des spécimens types déposés dans les différents instituts internationaux ont été consultées sur le site JSTOR Plant Science (https://plants. jstor. org). Les photos de spécimens types déposés à Berlin (B) ont été consultées sur le site http://www. bgbm. org/en/herbarium. Une version numérique de tous les spécimens de Paris est consultable sur la base de données Sonnerat (http://www. mnhn. fr/base/ sonnerat. html). Les spécimens cultivés n'ont pas été pris en compte dans cette révision, des croisements interspécifiques pouvant être fréquents dans des milieux confinés tels que ceux des serres et des jardins horticoles.
Remerciements Nous tenons à remercier toutes les personnes qui ont contribué à la rédaction de cet article : Jacques Florence pour la rédaction des diagnoses latines ;  Simon Verlynde  pour ses conseils ; les conservateurs des herbiers de K et de MO pour le prêt de spécimens ;  M. Boudrie  et  T. Deroin  pour leurs remarques et suggestions qui ont été prises en compte dans la version finale du texte.
Acknowledgements The in situ hybridization was conducted by  Marco Massironi ,  Cutec Srl ,  Padova, Italy , and immunohistochemical staining was performed by  Victoria Newton  at the  Centre for Dermatology Research & The Dermatology Centre ,  Salford Royal NHS Foundation Trust , Manchester  Academic Health Science Centre, University of Manchester, UK. The immunogold labelling was observed using facilities of the  University of Lyon: Centre Technologique des Microstructures (CTµ)  and  Centre d'Imagerie Quantitative Lyon-Est (CIQLE) ,  France. Special thanks are due to Na€ ıma  El Kholti  from  PrImaTiss platform, LBTI , for her expert technical assistance.
À l'échelle internationale, la revue DD&T est récemment entrée dans des bases de référencement comme le Emerging sources La course aux étoiles des revues académiques : une quête de visibilité et de. Développement durable et territoires, Vol. 10, n°1 | Avril 2019 citation index de Clarivate Analytics (ex Thomson-Reuters), ou encore à l'échelle européenne, dans la base de référencement ERIH-PLUS (European Reference Index for the Humanities and Social Sciences). En outre, elle fait l'objet d'un dépouillement de ses titres, résumés et auteurs dans des bases de données bibliographiques comme CAB International et Proquest. En parallèle, Google Scholar Metrics, qui publie depuis quelques années un classement par langues des 100 revues les plus importantes au regard de son indicateur h5 1 , a vu l'entrée, puis la progression de la revue DD&T dans le classement des revues francophones.