dataesr/scientific-paragraphs-categorization huggingface dataset:
Parmi ces connaissances, nous pouvons citer les connaissances qui permettront de mettre en place des contre-mesures médicales (vaccination…) en cas de crises sanitaires. On peut également citer les connaissances qui permettront de réagir face à une incertitude liée à l' émergence d'un évènement épidémique. Comme dernier exemple, on peut citer les connaissances permettant d'anticiper ou prévenir des évènements à risque pour la population militaire et pouvant constituer une menace pour la mission. La connaissance épidémique est donc, dans ce contexte, de premier plan. Elle est principalement collectée par le mécanisme de la veille. Cette connaissance est tacite et facilement formalisable dans des bases de données. Elle peut, par exemple, être collectée à partir des bases de données d' experts en médecine tropicale et maladies infectieuses.
This latest work by Ghemawat and his co-authors seems to reprise Ghemawat's research on distance from the last 30 years and to combine it with other relevant literature and research to show what globalization is and indeed is not. As a result, the book is full of hard data and statistical information on this issue, especially based on an economic model known as the gravity model; it also includes results from  Ghemawat's homepage (www. ghemawat. com). Here, he and his team have completed a massive tool, the DHL Global Connectedness Index (GCI), which is based on interactions among 140 countries and contains data on the flow of trade, capital, information, and people. The book can be read as a summary of the current state of distance research, as it treats past research, paints a picture of today's world (and research), and indicates where we are heading.
Les échanges commerciaux ont ainsi cru deux fois plus vite que le PIB mondial au cours des années 1990-2007. Si ce commerce a ralenti depuis, la coopération a sans doute été moins touchée : l'usine numérique d'apparition récente permet à des producteurs chinois de bénéficier des services 27/12/2016 rendus par les réseaux multinationaux des groupes leaders en termes d'innovations, tout en adaptant les produits aux goûts des clientèles locales. Le modèle de relation au marché proposé par les plateformes numériques est inédit. À de nombreux égards. Elles jouent les intermédiaires entre deux foules d'offreurs et de demandeurs potentiels pour un bien ou un service déterminé. Ces messagères d'un nouveau type occupent les deux côtés du marché ; elles génèrent une forme de marché "biface" présentant trois atouts distinctifs : elles maîtrisent les volumes d'informations considérables provenant des bases de données collectées en amont et en aval.
Modes spatio-temporels et analyses météorologiques synoptiques Pour faciliter la lecture et l'analyse des différentes distributions de température à l'échelle du site d'étude, celles-ci ont été regroupées par classe via la méthode des 'Self-Organize Maps' (SOM). Il s'agit d'une méthode de classification non supervisée, basée sur les réseaux de neurones, détectant les relations topologiques entre différentes variables  (Kohonen, 1988 (Kohonen, , 2012) )  qui sont regroupées en un nombre de clusters définis par l'utilisateur. En météorologie et climatologie, la méthode SOM est utilisée pour identifier les principaux patterns spatiaux de température, précipitation ou de circulation atmosphérique  (Alexander et al. , 2010 ; Nigro et al. , 2011 ; Katurji et al. , 2015). L'algorithme SOM, employé dans cette étude, provient du package R Kohonnen  (Wehrens et Buydens, 2007).
À la différence d'autres pays européens, la situation française est encore relativement neuve sur la question. Il n'existe aucune politique nationale ou institutionnelle d'incitation à publier dans des revues en accès ouvert et, à notre connaissance, une seule institution a mis en place un fonds centralisé destiné au paiement d'APC (Inria). Les biais méthodologiques rencontrés seront principalement ceux des outils utilisés et seront détaillés au fil de l'étude, qui se veut surtout être un constat de l'existant. Dans le fil de l'article les expressions françaises "accès ouvert" et anglaises "open access" seront utilisées de manière indifférente. Après une courte présentation des établissements universitaires analysés, et d'un état des lieux européen, la partie principale de l'étude s'attache à décrire les potentialités et les limites de trois méthodes d'identification des coûts d'APC qui présentent chacune des avantages et des inconvénients : la base de données bibliographiques Web of Science (WoS), les éditeurs, le logiciel comptable Sifac.
Le suivi de l'évolution des coûts engendrés par l'open access gold aussi bien que par l'open access hybride suscite un intérêt depuis la fin des années 2000. Il devient crucial dans certains pays (Royaume-Uni) à compter de 2012 et est désormais un enjeu reconnu à l'échelon européen. Après avoir présenté l'état de la réflexion européenne dans le domaine du suivi des dépenses d'APC, l'étude s'attache à présenter trois méthodes de suivi qui peuvent être mises en place au sein d'établissements d'enseignement supérieur et de recherche : utilisation d'une base de données bibliographique ; sollicitation des éditeurs et recours au logiciel comptable. Ces méthodes ont été appliquées à deux universités (Aix-Marseille Université et l'Université de Lorraine) sur des données allant de deux à trois années (2013-2015).
The monitoring of APC costs has started to gain interest at the end of the 2000's and became an important data in some countries (United Kingdom) after 2012. APC expenditures are now considered as an important stake at the european level. After a presentation of the current situation in Europe regarding APC monitoring, the study focuses on three different methods that can be used in HER institutions in order to get a better knowledge of this source of expenditure: large bibliographic database, publishers requests and accounting system. These methods have been applied to two HER institutions (Aix-Marseille Université and Université de Lorraine) on a 2 to 3 years timespan(2013-2015). The article presents some first results that help to identify and discuss the strenghts and weaknesses of each of the three methodologies.
Corpus d'APM 7 La mise en oeuvre d'une méthode probabiliste nécessite l'exploitation du plus grand nombre possible de cas d'accidents. Les cas analysés ont été extraits de la base de données EPICEA qui rassemble environ 23 000 accidents du travail survenus depuis les années 1980 dans les entreprises françaises qui dépendent du régime général de sécurité sociale  (EPICEA, 2011). Cette base de données contient les analyses d'accidents du travail mortels, et des analyses d'accidents non mortels lorsqu'ils sont jugés pertinents pour la prévention des risques professionnels, c'est-à-dire lorsque leur analyse enrichit la connaissance des risques et améliore la pertinence des mesures de prévention. Chaque accident est décrit à travers 80 variables en majorité codées (valeur correspondant à un code prédéfini dans une liste de modalités, par exemple la liste des professions ou du type d'accident).
Identification des facteurs singuliers d'accident 9 Dans chacun des récits, trois experts en accidentologie ont relevé les éléments ayant contribué à la survenue de la lésion (les facteurs singuliers). Chaque élément n'était considéré comme facteur singulier que si les trois experts s'accordaient sur son rôle possible dans la survenue de la lésion. Les échanges avec la victime ou l'enquêteur, destinés à éclairer les questions émergeant à la lecture des récits, n'étaient pas possibles puisque ces récits étaient extraits d'une base de données anonyme. L'« activité réalisée par la victime au moment de la perturbation du mouvement » et le « fait blessant » sont deux éléments qui ont été systématiquement repérés pour chaque accident.
On constate tout d'abord un faible pourcentage d'APM répertoriés dans la base de données EPICEA, au regard des données statistiques présentées en introduction. Ceci peut s'expliquer par le fait que les accidents mortels y sont répertoriés de façon systématique. Les autres accidents ne sont répertoriés dans la base que s'ils ont donné lieu à enquête et qu'ils sont considérés significatifs pour la prévention. On peut supposer que la nature des APM et le regard porté sur ces accidents sont autant d'obstacles à leur analyse approfondie et à leur recensement systématique, expliquant le faible pourcentage d'APM dans EPICEA.
On constate tout d'abord un faible pourcentage d'APM répertoriés dans la base de données EPICEA, au regard des données statistiques présentées en introduction. Ceci peut s'expliquer par le fait que les accidents mortels y sont répertoriés de façon systématique. Les autres accidents ne sont répertoriés dans la base que s'ils ont donné lieu à enquête et qu'ils sont considérés significatifs pour la prévention. On peut supposer que la nature des APM et le regard porté sur ces accidents sont autant d'obstacles à leur analyse approfondie et à leur recensement systématique, expliquant le faible pourcentage d'APM dans EPICEA. 4. Discussion 4. 1 Corpus d'APM.
Dans ce contexte incertain, l'outil en ligne resourcetrade. earth d'interrogation d'une base de données sur le commerce des ressources naturelles est une véritable mine d'information. Proposé par le Royal Institute of International Affairs (Chatham House), cet outil s'appuie sur le contenu de la base de données de l'ONU Comtrade 1 qui retrace les échanges internationaux à partir des déclarations d'imports et exports recueillies en douane.
Mappemonde, 121 | 2017 La page « Data » permet d'accéder à l'interface d'interrogation de la base de données que nous venons d'explorer à travers l'exemple de l'amidon de blé. La page « Stories » comprend pour l'instant trois analyses écrites par des experts de la question du commerce des ressources naturelles. Ces analyses sont ponctuées de visualisations dont certaines interactives (des diagrammes en chords). Le contenu de ces analyses enrichit le site en démontrant tout l'intérêt, pour la compréhension du contexte mondial et contemporain, de ces données rendues accessibles aux journalistes, décideurs et scientifiques. Enfin la page « About », donne de très nombreux renseignements sur la méthodologie suivie par les experts de Chatham House pour traiter les données. Des liens sont fournis pour aller vers d'autres sources et vers les références utilisées, notamment pour les regroupements de pays puisqu'il est possible de consulter les données par grands groupes de pays.
Une alternative pourrait être l'homogénéisation du lait maternel pasteurisé afin d'augmenter sa digestibilité lipidique(Thomaz, Goncalves, &  Martinez, 1999). L'homogénéisation, qui fragmente les globules gras en gouttelettes, conduit à l'augmentation de la surface disponible pour les lipases(Bourlieu et al. , 2015). L'objectif était d'évaluer l'impact de l'homogénéisation de lait pasteurisé sur ses cinétiques d'hydrolyse gastrique et sa déconstruction en phase gastrique chez le prématuré. Matériel et méthodes : 8 enfants prématurés hospitalisés nourris par sonde gastrique ont participé à cette étude randomisée (NCT02112331). Sur 6 jours consécutifs, chaque enfant recevait chaque jour du lait maternel pasteurisé (LMP) et pasteurisé homogénéisé (LMP+H). Les effluents gastriques étaient collectés à jeun puis à 35, 60 ou 90 min, chaque temps étant collecté en double.
Un pool de lait maternel cru ou pasteurisé (62,5 • C, 30 min) issu de mères d'enfants prématurés (n = 5) a été digéré in vitro. Les digestas gastriques étaient prélevés à intervalle régulier. En parallèle, la digestion de lait maternel cru ou pasteurisé a été suivie chez des nouveaunés prématurés au centre hospitalier universitaire de Rennes (NCT02112331, n = 12). Des prélèvements postprandiaux étaient réalisés à 35, 60 ou 90 minutes après le début du repas par la sonde d'alimentation de ces enfants. La structure des digestas (in vitro et in vivo) a été analysée par granulométrie laser et microscopie confocale, la protéolyse par électrophorèse (SDS-PAGE) et la lipolyse par chromatographies en couche mince et gazeuse. Le pH et les volumes des digestas étaient également suivis. Résultats et analyse statistique Au cours des digestions in vitro et in vivo, une hydrolyse rapide des caséines et une résistance de l'alpha-lactalbumine ont été observées.
Instrumentation and Chromatographic Conditions The chromatographic analysis was performed on a liquid chromatographic system equiped with a Waters Alliance 2695 HPLC module (Milford, MA, USA) connected to a Waters 996 photodiode array (PDA) detector and column oven with a variable UV-vis detector. A quaternary pump, Waters 600 E, was used for high-pressure gradient elution. Data were collected, stored and analyzed using the EMPOWER software version 5. 0 from Waters (Milford, MA, USA). Injections were made with an automatic injector Waters W717. The column used was a C18 Macherey-Nagel (250 mm x 4. 6 mm -5 μm Nucleodur -100A °). 20 μL of sample are injected and the elution is carried out at a constant flow rate (0. 8 ml / min) with a mobile binary phase consisted of A (95/5, H 2 O/MeOH + 0.
Validation of the Method The validation of this analytical method was performed according to the ICH guidelines Detection limits, quantification limits and linearity were evaluated using standard samples. The linearity of the assay was performed with an eight point calibration curve from 0. 66 to 50 µg. mL -  , and each point was run at least three times. These solutions were prepared by diluting stock analytes solution in water/ethanol mixture at room temperature. The limit of detection (LOD) and the limit of quantification (LOQ) based on the standard deviation of the response and the slopes were determined. Specificity, accuracy and repeatability were evaluated with crude cola extract solution. To demonstrate specificity, we performed peak purity test using photo-diode-array analysis and confirmed that each chromatographic peak of the five compounds was attributable to a single component (data not shown).
Furthermore, the limit of detection (LOD) were 0. 13, 0. 26, 0. 47, 0. 13 and 0. 098 µg/mL for caffeine, catechin, epicatechin, chlorogenic and caffeic acid. These values of LOQ were sufficiently sensitive to evaluate the studied analytes in the Cola nitida samples. The recovery rates of all compounds were in the range of 97 to 104% with relative low standard deviation (RSD < 2. 19%, n=5). The data is listed in Table  3. These results (RSD < 2. 1% for all cases) confirm that good precision can be obtained with this operation condition. After the standard solution was kept for two months, no significance decrease of each compound was observed.
Methods: Male Sprague Dawley rats (n=10-12 per group) were fed one of four reconstituted skim dairy drinks (3% protein; sheep and cow milk, pre-and post-fermentation) for 2 weeks. Transit of metallic beads was assessed by X-ray, and bead location was rated in vivo. This was used to compare stomach emptying (4 hours), and transit through the small (9 hours) and large intestine (12 hours). Peptides in the drinks were analysed and sequenced by LC-MS/MS followed by searching of cow and sheep protein databases. Bioactive sequences were then identified by matching against a database of known bioactive peptides. Results: Stomach emptying in animals treated with sheep yogurt was 2. 7-fold greater than that for cow yogurt. Transit to the large intestine was 18% faster for sheep milk-treated animals than for cow milk (P<.
DNA was extracted from biopsy specimens of the colon during routine colonoscopy. The mitochondrial D-loop were sequenced and variants were identified in comparison with the reference sequence from Genbank (NC-012920). We searched on Genbank and MitoMap (www. mitomap. org) to determine if a variant can be considered as an SNP. Results: No significant differences were found regarding sex, age and BMI between IBS and controls. The average number of SNPs is 12. 2±2. 7, 9. 8±1. 8 and 9. 9±2. 1 in IBS-D group, IBS-C group and controls, respectively. The frequency of SNPs in IBS-D group is significantly higher than both IBS-C group and the control group (Kruskal-Wallis test, P=. 01). However, no significant difference was found between the latter two groups. Each SNP was compared among three groups and the frequency of 199C was found significantly higher in the control group compared with IBS-D group (chi-square test, P=.
045) and from baseline to after placebo for the Methods: This study is connected to the REFIT study, where the treatment of IBS with FMT is investigated in a double blind randomized controlled trial (ClinicalTrials. gov Identifier NCT02154867). Eightythree subjects were allocated to receive donor FMT or placebo FMT (own feces) by colonoscope to cecum. We obtained biopsies from sigmoideum as part of the FMT procedure. Ten amongst our best responders, defined by improvement in IBS-symptom severity score (IBS-SSS), and ten non-responders without any changes in IBS-SSS, consented to a new biopsy one-year post FMT. Out of these participants (n=20), 16 received donor FMT and 4 received placebo FMT. Biopsies were immunostained by Avidin biotin complex method for chromogranin A, serotonin, somatostatin, peptide YY, enteroglucagon and pancreatic polypeptide, and quantified using computerized image analysis.
F I G U R E 1 Methods: During presentation of food and non-food images (images from international affective picture system and food image database) we measured activity of the autonomic nervous system using skin conductance response (SCR), heart rate variability (HRV), emotional response using facial electromyography, and visual attention using eye-tracking. The study was performed in 15 FD patients and 17 ageand BMI-matched healthy controls (12 females in each group) after a standard breakfast (402. 09 kcal, fat 14. 52 g, carbohydrate 53. 61 g, protein 12. 98 g). Results: Compared to healthy controls, FD patients showed increased food craving, decreased food intake (P<. 05), food-induced aggravation of FD symptoms, increased sympathetic activation (low frequency/ high frequency ratio of HRV, P<.
After recovery, biphasic stimulation was performed for seven days with 100 µA and 130 Hz. Body weight and food intake were measured every day. Behavior was monitored manually during the pre-dark phase activity period on days two and three. Correct operation of the stimulator was assessed on day eight by measurement of current flow in vivo and ex vivo, correct placement of the electrode was assessed immunohistochemically. Data were assessed by two-way ANOVA or t-tests. DBS (n=6) increased body weight gain (expressed as %, 13. 1±2. 1) compared to sham-stimulated controls (n=6, 9. 0±1. 8, F(1,95)=12. 0, P<. 001) without affecting daily food intake (DBS: 16. 7±0. 3 vs sham: 16. 9±0. 4 g/200 g body weight, F(1,95)=3. 0, P>. 05). Behavior including eating, drinking, grooming and locomotion did not differ compared to controls (P>.
| Alterations of gut microbiota composition in patients with chronic alcohol overconsumption H. Aanes 1 ; V. Skar 2 ; A. W. Medhus 1 ; J. G. Bramness 3 ; J. Valeur 2 ; S. T. Bjørkhaug 2 Sequences with ≥97% similarity were assigned to the same OTU and annotated using the GreenGene Database (version 2. 2. 25).
| Neurotransmission in Quantitative magnetic resonance spectroscopy (qMRS) was performed in a 3 T MRI scanner. A water-suppressed MEGA-PRESS sequence (kindly provided by R. Edden, Johns Hopkins University) was used with a voxel (4. 5×2. 0×3. 0 cm 3 ) placed in bilateral AIns. Mean hours of abdominal pain per day (pain duration) were extracted from diary data and correlated with levels of AIns GABA+ and Glx. Results: Pain duration was inversely associated with Glx concentrations in the right AIns (r=-. 51; P=. 005; Figure  1A ), whereas no correlation was observed for the left AIns. There was no significant correlation between GABA+ levels in AIns and pain duration (Figure  1B ). Main Results: We found RAIR in 49% (n=23) of CARM patients. Of the patients born without fistula 29% had RAIR, of patients with a rectoperineal fistula 75%, of patients who had either urethral-, bulbar-, vestibular, or prostatic fistula 43%, of patients who had a bladderneck fistula none had RAIR, and of patients with a cloaca 67% had RAIR.
| Enhanced organization of bilateral anterior limb of internal capsule in Irritable Bowel Syndrome (IBS) relates to gastrointestinal specific anxiety S. Witt 1 ; A. Icenhour 2 ; O. Bednarska 2 ; M. Engström 2 ; S. Walter  Methods: Diffusion weighted images were acquired for 71 women diagnosed with IBS and 38 healthy women (HCs). The images were acquired using a 64-direction sequence on a 3T MRI scanner. Prior to calculating that tensor in FSL, data for each participant were individually eddy corrected. Group-level maps of fractional anisotropy (FA) and radial diffusivity (RD) were estimated using tract based spatial statistics. Average FA and RD values for the left and right ALICs were extracted for each subject using the JHU-ICBM-labels parcellations. The Visceral Sensitivity Index (VSI) was used to measure the level of GIspecific anxiety in all participants (IBS: 44.
Methods: We searched major electronic databases (MEDLINE, EMBASE, Scopus, and Cochrane library) to find comparative studies on IBS patients and healthy controls. The primary outcome was a standardized mean difference (SMD) of anxiety and depression levels; sub-group analyses were conducted according to IBS-subtypes. Results: In total, 2293 IBS patients and 4951 healthy controls from 27 studies were included. In random effect analysis, depression and anxiety levels were significantly higher in IBS patients (pooled SMD=0. 76, 95% CI 0. 62-0. 90; P<. 001; I2=77. 2% and pooled SMD=0. 84, 95% CI 0. 67-1. 01; P<. 001; I2=85. 6%, respectively). Both analyses' funnel plots showed symmetry. In meta-regression analysis, heterogeneity was due to the studied region and questionnaire type for both depression and anxiety.
Furthermore, while STW5 tended to increase colonic transit as compared to control in basal condition it the increase in colonic transit induced by WAS. Finally, STW5 did not modify the changes in corticosterone induced by WAS. Conclusion: Our study suggests that SWT5 can prevent WAS induced changes in paracellular and transcellular permeability in specific regions of the gastrointestinal tract. Such effects could contribute to STW5 therapeutical effects in irritable bowel syndrome and support F I G U R E 1 Population aggregate of within-person correlations (r) between several IBS features novel therapeutical indications for pathologies in which intestinal barrier functions are altered. Policy of full disclosure: This work was funded by a research grant from Bayer Consumer Health, Steigerwald Arzneimittelwerk GmbH.
ence questionnaire DIFF score (how much they suppress high fat food consumption, r=-. 93), energy intake and fat preference questionnaire DIFF score (r=-. 95), and STAI_state (anxiety) and FCQ_state score (food craving, r=-. 91) (all P<. 05) in FD patients. Conclusion: The results suggest that high level cognitive functions rather than autonomic and emotional mechanisms are more likely to operate differently in FD patients. Additional to the somatic symptoms from gastrointestinal tract, abnormal dietary behavior, reduced subjective rating of pleasantness and visual attention to food should be considered as important pathophysiological characteristics in FD patients. Supported by the People Programme of the European Union's Seventh Framework Programme under REA grant agreement no. 607652 (NeuroGUT), the European Union Seventh Framework Programme (FP7/2007-2013) under Grant Agreement 607310 (Nudge-it).