dataesr/scientific-paragraphs-categorization huggingface dataset:
de source d'information et la qualité de cette information réside certes dans le bon fonctionnement du piégeage et l'obtention de (bonnes) photographies (emplacement, environnement, exposition, paramétrage …), mais tout autant en amont dans la préparation matérielle et logicielle ainsi qu'en aval dans la récupération, le stockage et la gestion des données (avant exploitation). Ces phases ne sont pas à négliger: une bonne préparation et un minimum de rigueur dans la méthode permettent d'alléger et sécuriser le travail quotidien et d'éviter les problèmes. Les photos obtenues doivent être triées juste après la réalisation de chaque bloc d'échantillonnage (élimination des photos «vides» d'animaux) puis insérées dans la base de données sous CameraBase®. Les données issues du camera trapping peuvent être traitées à l'aide du logiciel Présence® (dans le cas où l'on souhaite obtenir des estimations de patrons d'occurrence) ou bien utilisées pour réaliser des cartes Gorille de plaine, Gabon (©CIFOR-CIRAD/Rémy Fagot) François (stagiaire de CIFOR-CIRAD) en train de déposer une caméra piège en forêt (©CIFOR-CIRAD/Idriss Ayaya) Difficultés potentielles et astuces pour la mise en oeuvre du diagnostic de l'.
Depuis 1989 avec le programme STOC (Suivi temporel des oiseaux communs), mais surtout depuis 2006 et les débuts de Vigie-Nature, un laboratoire du Muséum national d'histoire naturelle contribue avec un ensemble de partenaires à mettre en place un vaste programme de science participative dont l'objectif est d'alimenter des bases de données d'observations standardisées afin de suivre l'état de santé de la biodiversité métropolitaine. Il s'agit ici d'un témoignage de cette aventure par l'un de ses principaux protagonistes, ainsi que d'une modeste tentative de mise en perspective, historique, d'une part, autoréflexive et prospective, d'autre part. Si le succès d'estime est bien là, il reste modéré et fragile par bien des aspects, notamment si l'on mesure le taux de participation et la place des participants dans ces démarches de recherche.
On retrouve là plusieurs caractéristiques des sciences participatives : le volontariat, le projet collectif autour d'une base de données commune en vue d'améliorer la connaissance. Cela dit, le lien avec la recherche académique n'est pas systématique et se fait éventuellement dans un second temps si ces bases de données sont déposées dans des banques de données publiques et/ou réanalysées par des chercheurs. Cette perspective est bien présente dans l'imaginaire des naturalistes, même s'il faut constater que la plupart du considérable effort d'observation de leur part ne suit pas cette voie et reste dans les carnets de terrains. Cette activité a pris de l'ampleur tout au long du XX e siècle. Cet essor semble s'être accompagné d'une distension avec la recherche académique qui s'est elle-même considérablement développée et semble avoir voulu se distinguer de la pratique de l'amateur.
Science participative et biodiversité : où en est-on ? Ce premier panorama montre que dans le domaine de la biodiversité, le partenariat entre la recherche académique et des amateurs volontaires n'est pas nouveau et qu'il prend des formes variées. Quoi de neuf alors ? L'émergence de la thématique des changements globaux conduit à une forte augmentation de la demande de connaissance sur la biodiversité, à commencer par le besoin en données qui permettent de comparer l'état de la biodiversité dans le temps et dans l'espace. Par ailleurs, l'arrivée des outils numériques a changé la manière de faire de l'histoire naturelle en démocratisant la pratique : les bases de données collaboratives en ligne remplacent les carnets de terrain ; la photo numérique permet à tout le monde de produire de l'information de qualité sur les insectes pollinisateurs en suivant un protocole (voir plus loin) ; les possibilités d'échanges entre les parties prenantes, chercheurs et amateurs, sont fluidifiées par les réseaux sociaux, etc.
L'OAB répond ainsi à un double objectif : (i) l'amélioration des connaissances scientifiques sur la biodiversité en lien avec les pratiques agricoles, par l'alimentation d'une base de données, et à terme par l'élaboration d'indicateurs ; (ii) l'acquisition de connaissances et de compétences par les participants, en leur permettant, grâce à des observations effectuées sur leurs parcelles, de qualifier la biodiversité, de la relier à leurs pratiques, et de s'en approprier les enjeux. -Vigie-Nature École (VNE) concerne l'enseignement, à la fois au collège et en primaire (150 instituteurs et professeurs, 400 classes participantes en 2015 dans une phase pré-opérationnelle). VNE est animé au Muséum par un enseignant détaché, et relayé par des correspondants académiques formés au dispositif. Il propose à ce jour sept protocoles de Vigie-Nature qui servent de supports aux cours, et qui sont mis en oeuvre sur le temps scolaire, lors de plusieurs séances dans et hors de l'établissement.
Pour l'EU, les USA, et la Chine, les standards publics apparaissent daans la liste des standards privés ; dans ce tableau nous ne les comptons pas comme privés. Une autre limite de cette base de données est qu'elle ne retient que les standards pour l'exportation ; par conséquent les standards privés utilisés uniquement sur les marchés domestiques n'y figurent pas. ** Ces données sont de 2000 ou celles de la première année enregistrée (Pays-Bas (1999), Suisse (1999), Espagne (1999), Suède (1999). Willer and Yussefi (2001).
Lancé au départ comme petit certificateur militant et n'intervenant que dans la certification biologique, Ecocert est devenu vingt ans plus tard une firme multinationale de la certification. Avec 24 bureaux et filiales, il intervient et propose ses services dans plus de 120 pays 20. La tendance est générale ; l'Institute for Marketecology (IMO) par exemple, certificateur suisse issu du mouvement biologique, a suivi un chemin similaire avant d'être racheté par Ecocert en 2013 21. Au total, l'International Trade Center compte à ce jour 391 certificateurs pour l'agriculture biologique dans sa base de données, parmi lesquels 147 sont Européens, 75 Japonais, 28 Chinois et 44 Nord-Américains 22. les549certificateursbiologiquesdénombrésen201223,121 déclaraient proposer leur propre standard bio(UNCTAD et al.
REMERCIEMENTS L'un des auteurs (E. V. ) a bénéficié d'une bourse de mobilité académique Averroes-3 (Erasmus-Mundus) à destination de l'université Abderrahmane Mira de Bejaïa et a été accueilli au laboratoire d'écologie et environnement sous la direction du Pr. A. Moali. Nous tenons à remercier M. Rebbas, enseignant à l'université de M'Sila (Algérie), pour son aide dans la détermination des espèces ainsi que les trois relecteurs anonymes qui ont commenté une première mouture de ce texte. RÉFÉRENCES  ANDERSON, S. (2002). -Identifying important plant area: a site selection manual for Europe and a basis for developing guide lines for other regions of the world. London: Plantlife international. BARBERO, M. , LOISEL, R. ,  MÉDAIL, F. & QUÉZEL, P. (2001). -Signification biogéographique et biodiversité des forêts du bassin méditerranéen.
La significativité de l'évolution de S s dans chaque site et de S v dans chaque village entre 2007 et 2012 a été déterminée par des tests de randomisation implémentés dans le package R rich  (Rossi, 2011). L'indice composite de diversité de Shannon, tenant compte à la fois de la richesse et de la distribution de fréquence des différentes variétés, a été calculé pour chaque site (H s ) et chaque village (H v ) dans chacun des sites suivant la formule : H ¼ À X s i¼1 p i logp i : ð1Þ Avec p i la proportion de la variété i dans l'unité d'étude considérée (village ou site). Les valeurs de H s dans chaque site et H v dans chaque village ont été comparées entre les deux années en construisant un intervalle de confiance à 95 % par bootstrapping (2000 permutations) avec le package R simboot  (Scherer et Pallmann, 2014).
Il n'en demeure pas moins que cette méthode a été la règle pendant plus de 50 ans pour les bovins laitiers. Pour mettre en place ce dispositif, l'État a promulgué la Loi sur l'Élevage en décembre 1966. Si cette loi ne concerne pas que les bovins, ils y occupent cependant une place centrale. Cette loi a organisé la sélection, mais aussi sa co-gestion et son financement par l'État et les professionnels. Elle a organisé l'activité par métiers (identification, certification de parenté, contrôle de performances, insémination, évaluation génétique…) et par monopoles géographiques (établissements de l'élevage, contrôle de performances, centres d'insémination) ou fonctionnels (calcul des index, diffusion des index, orientation raciale). Elle a conçu un système centralisé avec une base de données nationale et une évaluation génétique par l'INRA.
C'est cet aléa de méiose qui explique la différence entre frères ou soeurs. L'évaluation génétique analyse des données provenant de nombreux élevages. Elle repose donc sur une base de données, gérée en France par le Centre de Traitement de l'Information Génétique (CTIG, Jouy-en-Josas) de l'INRA et alimentée par des centaines d'organismes différents (Établissements de l'Élevage (EDE), contrôle de performances, centres d'insémination, organismes de sélection, laboratoires, etc). Cette base s'est beaucoup enrichie au cours du temps. D'abord limitée à la production et à la croissance ainsi qu'aux pedigrees, elle s'est diversifiée avec la composition du lait, la morphologie, la reproduction, les conditions de naissance, les mortalités, la longévité, la résistance aux mammites, le comportement, les qualités de carcasses en abattoir, etc.
Cette possibilité est d'autant plus pertinente que la sélection génomique bovine induit deux fois plus de progrès génétique potentiel et laisse donc de la place à de nouveaux caractères. On voit ainsi se développer de nombreuses initiatives pour créer ces populations, au minimum de quelques milliers à quelques dizaines de milliers d'animaux  (Boichard & Brochard, 2012). Citons quelques exemples. On peut valoriser des données existantes mais précédemment inutilisées pour la sélection : c'est le cas des données d'abattage pour les qualités bouchères, ou le carnet sanitaire pour les caractères de santé ; on peut également tirer plus d'information des données existantes, comme la persistance laitière mesurable à partir des contrôles mensuels successifs ou la mortalité chez le jeune, disponibles dans les bases de données mais naguère ignorées.
On peut aussi organiser et normaliser l'enregistrement de certaines activités de conduite du troupeau pour créer de nouveaux phénotypes. C'est le cas de l'activité de parage qui permet de constituer une base de données de pathologies des pattes. L'utilisation de données haut débit : c'est le cas des spectres moyen infra rouge du lait qui permettent de prédire des caractères aussi variés que la composition en acides gras, protéines, minéraux du lait, l'aptitude fromagère, l'acétonémie, voire la production de méthane entérique. À l'avenir, on utilisera sans doute les mesures issues de capteurs ou de systèmes d'imagerie, par exemple pour la détection des oestrus, la mesure de la mobilisation corporelle ou la détection des boiteries. Enfin, même si c'est un choix coûteux, on peut organiser un protocole de mesure et d'enregistrement spécifique, par exemple pour la mesure de l'ingestion alimentaire ou le statut pour la paratuberculose.
Conséquences organisationnelles La sélection génomique a entraîné de grands changements organisationnels. Alors que l'activité était organisée au niveau national, en particulier avec une base de données mutualisée et une évaluation génétique, on observe aujourd'hui le développement d'initiatives plus globales et d'autres plus locales. En France, le changement réglementaire de 2006 et la sélection génomique ont provoqué une grande réorganisation. Le contexte plus concurrentiel a favorisé la concentration des acteurs (généralement par fusion). Ces nouvelles entreprises ont fait évoluer leurs activités et ont souvent développé leur propre Recherche & Développement, historiquement plutôt réduite. La façon la plus efficace et économe d'agrandir sa population de référence est de la partager avec des alliés.
Remerciements -Cette  étude n'aurait pu être réalisée sans l'autorisation, accordée par le ministère de la Culture du Pérou, de sortie du territoire des échantillons pour les analyses au laboratoire IRAMAT-CRP2A de Bordeaux ; qu'il en soit remercié. Les institutions françaises, l'université  Bordeaux Montaigne  et le CNRS sont à remercier également pour l'aide qui a été apportée par les personnels techniciens et ingénieurs notamment dans la préparation des échantillons avant analyse. Nous tenons à remercier également le programme  IdEx de Bordeaux (Initiative d'excellence de l'université de Bordeaux)  qui a soutenu le travail par un contrat doctoral international. Cette recherche a bénéficié d'une aide de l' État gérée par l'Agence nationale de la recherche au titre du Programme investissements d'avenir portant la référence ANR-10-LABX-52/Laboratoire des sciences archéologiques de Bordeaux.
Remerciements Nous tenons à remercier les personnes et les institutions qui ont permis la réalisation de la fouille de ce site et la datation de ses vestiges osseux. La fouille de 2007 a été rendue possible grâce à l' autorisation et au soutien du SRA Rhône-Alpes, aux facilités accordées par la Cité de la préhistoire d'Orgnac Grand Site pour l'hébergement des fouilleurs et à l'aide financière du ministère de la Culture et du département de l'Ardèche. Les datations ont été financées par le ministère de la Culture et par le laboratoire de physiogénomique du CEA de Saclay. Les auteurs souhaitent également remercier les professeurs Michel Panuel et Kathia Chaumoître (APHM, service de radiologie et imagerie médicale, UMR 7268 ADES), qui nous ont donné accès à la base de données du  CHU , hôpital nord de  Marseille.
Cette étude a non seulement permis de clarifier l'attribution des différents calcanéus présents à Regourdou et d'attester de la présence de deux individus sur le site mais également d'apporter de nouvelles informations quant à son histoire et sa découverte grâce à l'étude taphonomique. De plus, notre étude permet d'alimenter la base de données des calcanéus néandertaliens et démontre que la variabilité morphologique connue jusqu'alors pour cet os et ce groupe est plus large qu'on ne le pensait. asymmetry and handedness, Bulletins et Mémoires de la Société d'anthropologie de Paris, t. 17, p. 288-289. VOLPATO V. , COUTURE C. , VANDERMEERSCH B. , MACCHIARELLI R. 2006 -High-resolution endostructural characterisation of the Regourdou 1 Neandertal proximal arm: bilateral asymmetry and handedness.
Remerciements Nos remerciements s'adressent à  Bernard Vandermeersch  qui nous a confié l'étude de ce calcanéus inédit. Nous tenons à remercier  Véronique Merlin-Anglade ,  Conservatrice au Musée d'Art et d'Archéologie du Périgord, et Jean-Jacques Cleyet-Merle ,  Conservateur au Musée National de Préhistoire des Eyzies-de-Tayac , pour leurs autorisations d'étude du matériel fossile de Regourdou. Nous remercions également  David Cochard et Catherine Ferrier  (Pacea) pour leurs conseils et orientations sur les atteintes taphonomiques et les concrétions ;  Erik Trinkaus  ( Washington University ) pour nous avoir transmis des données métriques inédites et  Bruno Maureille  (Pacea) pour les discussions que nous avons pu avoir sur le site de Regourdou. Enfin, nous sommes reconnaissants envers  Gauthier Devilder  (Pacea) pour la conception des planches photographiques.
) pour fédérer la communauté. Les données collectées sont ré-utilisables sous licence libre, la licence ODbL 8 , qui permet à chacun d'exploiter publiquement, commercialement ou non, des bases de données à condition de maintenir la licence sur la base de données, éventuellement sur les modifications qui y sont apportées et de mentionner expressément l'usage s'il génère des créations à partir de celles-ci. Les « communs » constituent ainsi dans OSM non seulement un ensemble de valeurs partagées quant aux formes d'engagement (fabrique en commun d'une « carte du monde ») mais imprègnent aussi les règles quant à la diffusion et la circulation des données à l'image des droits d'auteurs et des licences qui y sont associées 9. 1. 1. 2. Des « amateurs » qui prennent de plus en plus de place De multiples expressions sont apparues récemment pour « capter » et qualifier les recompositions techniques, organisationnelles et juridiques qui bousculent depuis une dizaine d'années le monde de l'information géographique.
Différentes communautés de la recherche ou du marketing, de la géographie ou de l'informatique, de la cartographie ou de la géomatique parlent, en fonction des ruptures sur lesquelles elles souhaitent mettre l'emphase, de contenus cartographiques générés par les utilisateurs  (Purves et al. , 2011) , de crowdsourcing géographique  (Sui et al. , 2013) , de néogéographie  (Turner, 2006)  ou encore de géoweb  (Leszczynski et Wilson, 2013). M. Goodchild (2007)  propose d'utiliser la notion de Volunteered Geographic Information (VGI) comme un cadre fédérateur (ou une méta-catégorie) permettant de réunir sous un même 7 http://wiki. openstreetmap. org/wiki/FR:%C3%89l%C3%A9ments_cartographiques. 8 Open Database License (ODbL), https://fr. wikipedia. org/wiki/Open_Database_License. 9 « OpenStreetMap est un ensemble de données ouvertes, disponibles sous licence libre Open Data Commons Open Database License (ODbL).
Les deux premiers articles scientifiques à évoquer le projet dans des revues à comité de lecture semblent être le panorama de la cartographie numérique dressé en 2006 par Taylor et Caquard et l'analyse sur la qualité des bases de données routières proposées par Nelson, Sherbinin et Pozzi. Depuis, de multiples articles ont été publiés : Google Scholar indique plus de 16500 références 14  et une page du wiki d'OSM tente un récapitulatif des projets de recherche par pays  15. Parmi cette myriade de contributions, plusieurs chercheurs en informatique ou dans le domaine de la visualisation de données ont profité de la masse de données mises à disposition pour engager différentes expérimentations  16. L'ouvrage OpenStreetMap in GIScience : Experiences, Research and Applications, sorti en 2015 offre un intéressant tour d'horizon des centres d'intérêts des chercheurs en géographie et géomatique qui travaillent sur cet objet.
Si ces premières analyses fournissent des éléments intéressants pour caractériser OSM par rapport à d'autres projets de géographie contributive, elles ne permettent cependant pas d'avoir une idée précise de la communauté étudiée. Côté « base de données », Pascal Neis propose quant à lui de distinguer les contributeurs en fonction de leur niveau d'implication : cela se traduit dans ses travaux par le volume de données intégrées, ajoutées ou mises à jour  (Neis et Zipf, 2012). Il propose ainsi de multiples tableaux de bord visant, par des analyses uniquement quantitatives de la base de données, à stimuler les contributeurs dans une logique de « coopétition »  (Nalebuff et Brandenburger, 1996)  pour les inciter à passer du statut de « non recurring mappers » à celui de « junior mappers » voire de « seniors mappers ».
Entre miroir du quotidien et démarche militante Le périmètre de prédilection d'arpentage des contributeurs est avant tout celui délimité au lieu de vie (personnel ou familial) et/ou celui de la pratique de loisirs : c'est celui du quotidien ou celui du terrain de jeu. Ici deux motifs ont été évoqués pour mettre en mots cette bascule entre utilisateur et citoyen-capteur : une volonté de mise en visibilité de lieux qui font sens (lieux de vie) ou le souhait d'apporter des corrections à des données erronées en arguant une forme de connaissance territoriale fine, à jour, constituée. « La carte de ma commune était blanche donc j'ai voulu remédier à ce problème », « J'ai mappé autour de chez moi pour corriger des erreurs et ajouter des détails », « Quand je me suis rendu compte que toutes les bases de données des GPS contenaient la même erreur (concernant un point proche de chez moi), ce qui rendait erronées leurs indications de trajet.
Je me suis rappelé alors d'OSM, dans lequel j'ai pu corriger cette erreur, et du coup compléter la base de données près de chez moi » « Des lieux où je faisais souvent du sport et qui étaient mal décrits sur la plupart des sites : petits sentiers pour courir, sources et cavités paumées où je pratique la spéléo et la plongée souterraine » « L'absence de certains chemins de randonnée dans la base de données, et de circuits de vélotourisme » Ce basculement vers la contribution a aussi été décrit comme une réaction face au constat du manque d'ouverture des données. « J'ai reçu en cadeau un GPS de rando (je suis un cycliste passionné) et quelle ne fut pas ma surprise en découvrant le prix abusif des cartes à installer (d'ailleurs peu souvent à jour, j'ai pu le vérifier de nombreuses fois). Une recherche sur internet.
Enfin, une « course à l'actualisation » est perceptible à travers la myriade d'outils de monitoring qui permettent de contrôler, valider, corriger les mises à jour de la base de données. Le site http://live. openstreetmap. fr/ constitue un bon exemple de ce type de tableau de bord visant à suivre « en direct » l'activité du projet. Exhaustivité, actualisation et précision sont trois enjeux forts pour les contributeurs d'OSM, considérant qu'ils sont les piliers de la plus-value de cette base de données collaborative face aux bases institutionnelles. Si le périmètre de la base de données peut sembler clair puisqu'il s'agit, selon le slogan du site de « cartographier le monde, rue après rue », les questions posées lors des focus group sur ce qui a vocation à être « sur la carte » révèle un discours positiviste intéressant à analyser.
De la « carte amateur » au « référentiel institutionnel » Souvent présenté comme le « Wikipédia de la cartographie », OSM constitue un projet collectif dont les multiples environnements collaboratifs visent à alimenter une base de données cartographique mondiale librement éditable et partagée. Steve Coast, alors étudiant en physique à University College London (UCL), intègre comme premières empreintes cartographiques les pistes cyclables à Londres : la figure 1 est une copie d'écran de la « carte » OpenStreetMap du Département de Physique où il a étudié. Ici, la partie gauche renvoie à la description d'un parking à vélo (ensemble de tags), à droite les contributions (points, lignes, surface) visibles en octobre 2017 sur ce secteur (sources : « © les contributeurs d'OpenStreetMap »).
i g u re 1 : Le Département de Physique -University College London, vu depuis OpenStreetMap (octobre 2017). 1. 1. 1. Plus qu'une carte, une base de données collaborative Tout objet géolocalisé sur OSM possède deux facettes : l'une géométrique (noeud, ligne, relation), l'autre attributaire (balise). Un noeud (node) est un point ayant une latitude et une longitude. Une ligne (way) est constituée d'un ensemble de points reliés les uns aux autres. Elle forme une surface (area) lorsque les points de départ et d'arrivée se rejoignent. Les relations sont utilisées pour regrouper des objets liés géographiquement. Enfin, un attribut (tag) est une paire clé/valeur utilisée pour décrire un objet, la nomenclature étant régulièrement discutée 7.
1. 1. 1 De la « carte amateur » au « référentiel institutionnel » Souvent présenté comme le « Wikipédia de la cartographie », OSM constitue un projet collectif dont les multiples environnements collaboratifs visent à alimenter une base de données cartographique mondiale librement éditable et partagée. Steve Coast, alors étudiant en physique à University College London (UCL), intègre comme premières empreintes cartographiques les pistes cyclables à Londres : la figure 1 est une copie d'écran de la « carte » OpenStreetMap du Département de Physique où il a étudié. Ici, la partie gauche renvoie à la description d'un parking à vélo (ensemble de tags), à droite les contributions (points, lignes, surface) visibles en octobre 2017 sur ce secteur (sources : « © les contributeurs d'OpenStreetMap »).