dataesr/scientific-paragraphs-categorization huggingface dataset:
Partant de plusieurs sources statistiques construites en Nouvelle-Zélande (DairyNZ Economic Survey), aux États-Unis (Dairy farm management business pour l'État de New York ; Dairy marketing cost of production pour la Californie) et dans l'UE (RICA), une analyse des caractéristiques des exploitations laitières spécialisées et de leurs coûts de production est proposée pour l'année 2012 (Tableaux 2 et 3). Les informations ne sont pas statistiquement représentatives en Californie et dans l'État de New York puisque les producteurs adhèrent à ces bases de données uniquement de manière volontaire ; elles offrent cependant une image assez fidèle des grands troupeaux hors-sol de l'Ouest des États-Unis et des systèmes de production plus traditionnels du Nord du pays. En Nouvelle-Zélande, une répartition géographique et structurelle permet une plus grande généralisation.
Pour l'UE, les zones sélectionnées dans la base de données individuelles du RICA correspondent aux bassins les plus exportateurs et les plus spécialisés en zone de plaine pour faciliter la comparaison. La Figure 3 présente l'évolution entre 2004 et 2014 d'un indicateur proche du prix de revient du lait, intitulé « le point mort ». Cet indicateur comptabilise le coût de production du lait, hors rémunération du travail familial non salarié et du capital familial, après déduction des produits joints et des aides (Perrot et al, 2011). Cet indicateur peut s'interpréter comme le prix du lait à partir duquel l'exploitation commence à rémunérer la main-d'oeuvre non salariée (celle des chefs d'exploitation notamment). Cet indicateur n'est calculable que pour les exploitations spécialisées. Pour une exploitation laitière totalement spécialisée, il se confond avec le prix de revient hors charges supplétives (Institut de l'Élevage, 2012b).
entre 2000 et 2015, soit une progression moyenne de près de 2 millions de Teql par an, notamment sous l'impulsion de l'Asie destinataire de 58% des échanges mondiaux d'après la FAO. D'après la base de données d'échanges des Nations Unies, Comtrade, les principaux pays importateurs sont, en valeur et par ordre décroissant en 2015, la Chine, la Russie, les États-Unis, l'Arabie Saoudite, l'Algérie, le Japon et le Mexique. La Nouvelle-Zélande, qui occupe le premier rang des exportateurs (27% du total mondial.
entre 2000 et 2015, soit une progression moyenne de près de 2 millions de Teql par an, notamment sous l'impulsion de l'Asie destinataire de 58% des échanges mondiaux d'après la FAO. D'après la base de données d'échanges des Nations Unies, Comtrade, les principaux pays importateurs sont, en valeur et par ordre décroissant en 2015, la Chine, la Russie, les États-Unis, l'Arabie Saoudite, l'Algérie, le Japon et le Mexique. La Nouvelle-Zélande, qui occupe le premier rang des exportateurs (27% du total mondial en Teql en 2015), bénéficie d'atouts indéniables pour produire du lait à bas coût (valorisation de l'herbe) et pour exporter (forte concentration des acteurs industriels, proximité géographique des bassins importateurs, etc. ). Ainsi, entre 2000 et 2015, ses exportations sont passées de 7 à 21 millions de Teql en raison notamment d'un fort développement de ses ventes de poudre de lait entier à destination des pays asiatiques.
D'après cette approche, le montant s'élève, en 2015, à 643 euros par tonne d'équivalent lait. En raison des types de biens échangés, ce montant diffère d'un pays à l'autre. Il est, par exemple, nettement plus faible lorsque les exportations comprennent une proportion significative de lait vrac (vers l'Italie avec 363 euros/Teql, ou l'Allemagne avec 621 euros/Teql) que lorsque celles-ci concernent des poudres de lait, notamment infantiles, vers l'Algérie (812 euros/Teql), et surtout la Chine (940 euros/Teql), ou des fromages mondiale et 16. 9% de la collecte européenne. Elle occupe ainsi le deuxième rang européen derrière l'Allemagne (20. 9%), mais devant le Royaume-Uni (9. 9%), les Pays-Bas (8. 7%), la Pologne (7. 1%) et l'Italie (7%). Partant de la base de données d'Eurostat, Comext, pour la période 2000 à 2015 et de la méthodologie développée par le Centre Interprofessionnel de l'Economie Laitière (CNIEL) pour estimer les flux en équivalent lait (CNIEL, 2016), une analyse de l'évolution de la dépendance de la production laitière française aux marchés extérieurs est proposée ci-après.
En somme, « on peut dire sans forcer le trait qu'il n'existe aucune publication de recherche récente sur [ce] thème d'étude »  (Roche, 2016 : 20). Le dispositif narratif de l'ouvrage peut surprendre. Il se structure autour de deux grandes parties inégales dans leur longueur. Une première section se compose de multiples portraits subdivisés en quatre catégories de bénéficiaires de l'aide sociale. Le matériel ici présenté est imposant : il s'agit au total de 96 récits (regroupant souvent plusieurs acteurs), et on imagine des centaines d'heures d'entretiens retranscrits. À cet égard, on peut d'ailleurs envisager que ces 96 portraits puissent constituer une base de données qualitative dans laquelle pourront puiser de futures recherches. Au cours de ces 193 pages -quasiment les deux tiers du livre -, on découvre les histoires de jeunes, de retraités, de travailleurs pauvres et de paysans.
Remerciements Cet article s'appuie sur des travaux de recherche conduits dans le projet de recherche Rédopic financé par le métaprogramme INRA SMACH. Nous remercions l'ensemble des personnes ayant accepté d'être enquêtées et impliquées dans ce projet et qui ont permis l'élaboration de l'analyse présentée ici. Nous remercions également les relecteurs de cet article pour la qualité de leur évaluation riche et constructive.
TIRF and FRAP experiments in TIRF mode. Total Internal Reflection Fluorescence (TIRF) Microscopy was done using the inverted Zeiss microscope previously described (AxioObserver Z1) equipped with azimuthal-TIRF iLas2 system (Roper Scientific) and a 100x Plan-Apochromat objective (numerical aperture 1. 46, oil immersion). Pixel size was 0. 13µm. The azimuth calibration was performed using the manufacturer recommendation and the iLas2 module in Metamorph software. The optimum critical angle was determined as giving the best signal-to-noise ratio. Images were acquired with 200ms exposure time, and 300ms between frames in time-lapse experiments. The photobleaching of ROP6 microdomains was achieved on circular ROIs (15µm diameter) by two successive scans at full laser power (150 W) using the iLas2 FRAP module.
RNA was reverse transcribed using the SuperScript VILO cDNA Synthesis Kit (Invitrogen) according to the manufacturer's protocol. PCR reactions were performed in an optical 396-well plate in theQuantStudio 6 Flex Real-Time PCR System (Applied Biosystems), using FastStart Universal SYBR Green Master (Rox) (Roche), in a final volume of 10 µl, according to the manufacturer's instructions. The following standard thermal profile was used for all PCR reactions: 95 °C for 10 min, 40 cycles of 95 °C for 10 s, and 60 °C for 30 s. Data were analyzed using the QuantStudio 6 Flex Real-Time PCR System Software (Applied Biosystems; www. thermofisher. com). Two set of primers were used to amplify PSS1 cDNA, the first set of primers (black dots on Fig. S1D ) ggcttacaagcctcgcactatc/tcaagagctccactagcccaaatg was located at the 5' end of PSS1 cDNA.
The second set of primers (grey dots on Fig. S1D ) gcattctgttggctgtcactgg/ttctgttgggtacaatccacttcc was located at the 3' end of the PSS1 cDNA. As a reference, the primers gactacagtccactcaatcactgc/aagagctggaagcacctttccg were used to amplify the GAPC1 (At3g04120) cDNA. PCR efficiency (E) was estimated from the data obtained from standard curve amplification using the equation E=10 -1/slope. Expression levels are presented as E -CtPSS1 / E -CtGAPC1.
IMAGE QUANTIFICATION Gravitropic response and gravitropic defects. 7-8 days old seedlings were subjected to 135° angle for 12 hours. For each genotype analyzed at least 30 roots in three independent experiments were used for quantification. Every 4 hours, plates were scanned with EPSON scanner perfection V300 PHOTO at 800 dpi. Each plate at the different time points were cropped and aligned using "Template Matching and Slice Alignment" plugin on FIJI to obtain a timelapse for 12h. To allow high throughput data analyses, the process has been automatized on a macro. To quantify the average root angle of curvature RootTrace software was used  (51). In Fig. 2A , 2B and 6A, statistical analyses were performed on the root bending at 8 hours after reorientation. The horizontal and vertical growth index were calculated on 10 days old seedlings of WT, pss1-3, pss1-4 and pss1-5 mutant plants using the "segment line" tool on FIJI.
SptPALM data quantifications and representations. For each movie corresponding to one condition/genotype, the natural logarithm of apparent diffusion coefficient (log(D)) per molecule was extracted from MTT data (42) by CBS sptPALM analyser (Martinière et al. , unpublished). For sptPALM analyses, only tracks with at least five successive points were selected and the rest of the molecules were discarded from the analysis. We pooled values from each condition in order to get the log(D) distribution using R software (as histogram shown on left panel of Fig. S5 , number of bins set to 80). A first partition P was done; the set of molecules which present a log(D) value below -1. 75 refers to the immobile group, whereas values above this threshold denote the mobile group. To obtain the percentage of molecules in the immobile group, we divided the number of tracks below -1.
75 by the total track number multiplied by one hundred. Then, each condition was analyzed using an R script to automatize the analysis. To statistically test the existence of these two behaviors (mobile and immobile), we analyzed the log(D) distribution per condition using the mclust R package. For each condition, the percentages of data in each of the 2 groups defined by the partition P with the absolute log(D) value (-1. 75) are first reported. We then fitted two distinct two-component Gaussian mixture models, M0 and M1, using the mclust::Mclust R function. M0 is a model where σ 1 ≠ σ 2 and M1 is a model where σ 1 = σ 2. For each model, every molecule is assigned to one of the 2 Gaussian components G i (i Î  [1, 2] ) according to a MAP (Maximum A Posteriori)-based classification. M1 model was used since it provided more representative results despite of a lower Bayesian information criterion values.
Note that one acquisition may represent more than 1 cell but that different acquisitions are always from different cells. LivePALM, Voronoi tessellation analyses and representation. For each movie corresponding to one condition/genotype, the object localization was extracted from MTT data (42) by CBS sptPALM analyser  (Martiniere et al. , unpublished). SR-tesseler software was used to reconstruct live PALM images and determine protein local density  (37). Multiple detections of single object were corrected as previously described by Levet et al. (37). Local density was extracted from Voronoï segmentation of the image as shown in Fig. 3F , 5A and Fig. S6. We pooled values from each condition in order to get the log(local density) distribution using R software (as histogram in Fig. S6 , left panel, number of bins set to 80).
A first partition P was done; the set of molecules which present a log(local density) value below 3. 5 refers to the immobile group, whereas values above this threshold denote the mobile group. To obtain the percentage of molecules in the immobile group, we divided the number of molecules below 3. 5 by the total molecules number multiplied by one hundred. Then, each condition was analyzed using an R script to automatize the analysis. To statistically test the existence of these two behaviors (mobile and immobile), we analyzed the local density distribution per condition using the mclust R package. For each condition, the percentages of data in each of the 2 groups defined by the partition P with the absolute log(local density) value (3. 5) are first reported. We then fitted two distinct two-component Gaussian mixture models, M0 and M1, using the mclust::Mclust R function.
Ratio PM/cytosol quantification. To determine the localization in the basal meristem (BM) and in the elongation zone (EZ) but also the effects of NAA on PS biosensors mCITRINE-C2 LACT and mCITRINE-2xPH EVCT2 we calculated and analyzed the "Ratio PM/cytosol fluorescence intensity". This correspond to the ratio between the fluorescence intensity (Mean Grey Value function of Fiji software) measured in two elliptical region of interest (ROIs) from the plasma membrane region (one at the apical/basal PM region and one in the lateral PM region) and two elliptical ROIs in the cytosol. We quantified in 150 cells over three independent replicates (50 cells per replicate) for mock and NAA and two replicated for BM and EZ. This ratio reveals the degree of localization of the fluorescent reporters from the plasma membrane to the cytosol/endosomes, between the mock and perturbed conditions or BM and EZ.
In each graph relative to the ratio PM/cyto fluorescence intensity, "n" represents the number of cells used for quantification at least 17 roots were used. Ratiometric FRET measurement. Interaction between ROP6 and PAK-CRIB domains within the raichu sensors was evaluated by FRET calculation from the CFP to YFP. In each field of view, two pictures were recorded. The first corresponds to the CFP channel and give the donor fluorescent (Ex458, Em467-493). Whereas the second one is the FRET channel called YFP FRET (Ex458, Em 538-573). The ratio image, YFP FRET /CFP, was calculated with Fiji software. Mean Grey value of each cells present in the field of view was measured independently by drawing specific ROI. At least 10 fields of view out of two independent transformation assays were analyzed.
STATISTICAL ANALYSES Each sample were subjected to four different normality tests (Jarque-Bera, Lilliefors, Anderson-Darling and Shapiro-Wilk), sample were considered as a Gaussian distribution when at least one test was significant (p=0. 05). Consequently, parametric or non-parametric test were performed. For parametric test, an ANOVA was performed coupled to a Fisher test in order to proceed to pairwise comparison between samples (confidence index, 95%). Statistical analyses between two samples were performed using the Student t-test (p-value=0. 05 or 0. 10 in the case of gravitropism experiment). For non-parametric test, results were statistically compared using the Kruskal-Wallis bilateral test (p-value=0. 05) using XLstat software (http://www. xlstat. com/). Pairwise comparisons between groups were performed according to Steel-Dwass-Critchlow-Fligner procedure (different letters indicate statistical difference between samples) (Hollander and Wolfe, 1999).
Les participants ont été recrutés au sein de structures à vocation sociale ou médico-sociale (neuf centres sociaux et deux centres médico-sociaux) dans des quartiers défavorisés de Marseille par des professionnels intéressés par la démarche Opticourses. Les critères d'inclusion retenus pour participer à l'étude étaient : o être volontaire pour participer à cinq ateliers de deux heures sur alimentation et budget ; o résider dans le 13 e , 14 e ou 15 e arrondissement de Marseille ; o être impliqué dans les achats alimentaires de son foyer ; o appartenir à un foyer présentant des difficultés financières (identifiées par les travailleurs sociaux). Tous les participants ont consenti par écrit à participer à l'étude. L'étude est enregistrée sur clinicaltrials. gov (numéro NCT02383875). La Figure 1 présente le déroulement de l'étude, avec une phase de co-construction, suivie d'une phase d'intervention et d'évaluation.
Remerciements Les auteurs remercient  Rozenn Gazan  ( MS Nutrition ) pour l'analyse des données ;  Bernard Ruffieux  et  Laurent Muller  ( Laboratoire d'Economie Appliquée de Grenoble ) pour l'aide à la mise en place de l'évaluation quantitative par économie expérimentale et  Clélia Bianchi  ( UMR Nutrition Obésité et Risque Thrombotique (NORT) pour la traduction de l'article initial. Les auteurs remercient  Célia Chischportich  (experte en évaluation qualitative, Regards.
; l'analyse du processus de mise à l'agenda politique (ou de non mise à l'agenda) du problème auquel la recherche peut apporter une solution ; l'identification d'effets sur les AP : place du problème traité par les chercheurs dans le débat public, situations d'apprentissage par la recherche pour les AP (entendues comme les conditions et les circonstances qui amènent des individus ou des collectifs d'individus à construire et à appliquer des connaissances), changement dans les pratiques des AP. Deux outils issus de la méthode ImpresS ont plus particulièrement fourni les matériaux qualitatifs et quantitatifs qui ont permis l'analyse des cas à l'aide de cette grille : les récits d'innovation recueillis auprès des parties prenantes, qui décrivent les différentes étapes du chemin d'impact, les évènements principaux influençant l'innovation, les actions affectant l'innovation ; la base de données des cas qui structure l'information sur les AP : leurs types (quatre types/trois échelles géographiques), leurs rôles (majeurs, influents, impactés), la phase de l'innovation dans laquelle ils interviennent (entre deux et cinq phases selon les cas).
Remerciements Nous remercions Gilles Renand et  Jean-Luc Brunet  pour l'aide fournie lors de la rédaction de cet article. Nous remercions également l'ensemble des collègues ayant par le passé contribué à la mise en place du dispositif français d'amélioration génétique des bovins allaitants, notamment pour les plus récents,  Florence Phocas ,  Marie-Noëlle Fouilloux ,  Denis Laloë  et  Gilles Renand. Enfin , nous remercions Normabev pour la fourniture annuelle des données nécessaires aux évaluations sur les aptitudes bouchères.
Cette étude repose sur le traitement de l'enregistrement vidéo des sept journées techniques du réseau Pâtur'Ajuste (de novembre 2013 à novembre 2016, voir figure  2 ), ainsi que sur celui de l'enregistrement audio de nos réunions de travail avec Scopela (une dizaine de réunions). Tous ces enregistrements ont été retranscrits. Nous avons également recueilli et analysé les divers documents produits par le réseau, comme les fiches techniques et la Charte du réseau. L'ensemble du corpus (entretiens retranscrits, documents techniques et articles scientifiques) a été structuré dans une base de données à l'aide du Computer-Aided Qualitative Data Analysis Software NVivo. Ce corpus a ensuite été codé et analysé de manière inductive, avec une stratégie proche de la « grounded theory » consistant à comparer de manière systématique des unités de données et à construire graduellement un système de catégories  (Langley, 1999).
Cet article a bénéficié du soutien des projets financés par l'ANR, TATA-BOX (ANR-13-AGRO-0006) et IDAE (ANR-15-CE21-0006), ainsi que du projet financé dans le cadre du programme « Pour et Sur le Développement Régional » (PSDR) ATA-RI (Accompagnement des Transformations Agro-écologiques -Recherche Ingénierique).
Ce travail a été réalisé dans le cadre du laboratoire d'excellence LabexMed (Les sciences humaines et sociales au coeur de l'interdisciplinarité pour la Méditerranée) portant la référence 10-LABX-0090. Ce travail a bénéficié d'une aide de l'État gérée par l'Agence nationale de la recherche au titre du projet Investissements d'Avenir A*MIDEX portant la référence n°ANR-11-IDEX-0001-02. R. & YOUNG R. 2013. Essential oil safety: a guide for health care professionals. Edinburgh (Écosse, Royaume-Uni) / New York (États-Unis), Churchill Livingstone Elsevier, (2 nd ed. ).
Ce travail a été réalisé dans le cadre du laboratoire d'excellence LabexMed (Les sciences humaines et sociales au coeur de l'interdisciplinarité pour la Méditerranée) portant la référence 10-LABX-0090. Ce travail a bénéficié d'une aide de l'État gérée par l'Agence nationale de la recherche au titre du projet Investissements d'Avenir A*MIDEX portant la référence n°ANR-11-IDEX-0001-02. R. & YOUNG R. 2013. Essential oil safety: a guide for health care professionals. Edinburgh (Écosse, Royaume-Uni) / New York (États-Unis), Churchill Livingstone Elsevier, (2 nd ed. ). Financement typhimurium TA98 et TA 100, avec ou sans ajout de S9 mix. L'effet antimutagène des goudrons a été évalué à partir du nombre moyen de révertants/ plaque, de l'écart-type (SD) et du pourcentage d'inhibition (% I) de l'activité mutagène de NPD, 2AF, 2AA et SA sur les cinq concentrations de goudrons.
To complement these analyses and the very valuable coverage of the NASPG at low resolution by Argo floats, we construct monthly time series of temperature (T ), salinity (S), and density along tracks in the interior of the gyre, and over the nearby shelves. The expectation is that data coverage and accuracy are good enough to resolve interannual variability at seasonal timescale since the early or mid 1990s at the ocean surface, and thus provide valuable information for studies on the interannual to decadal variability of the NASPG. This extends earlier work on data presented in  Reverdin et al. (2002). The data and methods used are first described in Sect. 2, and then the time series are presented in Sect. 3. Some statistical properties are described to illustrate the potential of the binned data to characterize interannual variability: the pattern of standard deviations, and empirical orthogonal function (EOF) analysis.
Data A large part of the data presented here are from SBE21 and SBE45 thermosalinographs (TSGs) installed on cargo ships running along the AX01 transect between Denmark and western Greenland and along the AX02 transect between Iceland, Newfoundland, and the northeastern USA (Fig. 1 ). Along AX01, TSG data were collected on M/V Nuka Arctica between July 1997 and December 2017 (with intake temperature in  [2005] [2006] [2007] [2008] [2009] [2010] [2011] [2012] [2013] [2014] [2015] [2016] [2017]. Along AX02, TSG data are available between April 1994 and December 2007 (with intake temperature during  April 1994 April -1996) )  and between March 2011 and March 2016. Along AX02, TSG data collected in February 2003 to December 2004 were not included, as they were judged to be of irregular quality, and could not be fully validated.
Along AX02, a succession of ships has been used, with different installations usually in the engine room at mid-ship, between 4 and 7 m below the water line. The route taken by these vessels is often roughly straight between southeastern Newfoundland and the western tip of the Reykjanes Peninsula (Fig. 1 , which we will refer to as the standard route B-AX02), but with some deviations depending on sea ice or weather conditions. Due to seasonal sea ice, in particular, there were no standard TSG data on the route northeast of Newfoundland on shelf and slope in  February-April 1994 -1995 and 2014 -2016. The validation and correction of the TSG salinity data are mostly based on comparison with water samples collected from a water intake at the TSG (AX01 and AX02) and using nearby upper-level Argo float data (primarily for AX02)  (Alory et al.
, 2015). On AX02, adjusting T from the TSG to near-surface ocean temperature was done when no intake measurements were available, largely based on comparison with T from expandable bathythermograph (XBT) observations at 5-7 m. XBT observations along these two transects were started in 2000 (AX01) and 1993 (AX02) and have produced approximately 4000 temperature profiles available for these comparisons. In addition, T measurements from the TSG on Nuka Arctica (AX01) were also used to adjust T along AX02 where there were crossovers of the AX01 and AX02 ship route. Validation of T and S data from the thermosalinographs is discussed further in Appendix A. For AX02, additional T and S data originate from seasonal surface sampling, in particular in  July 1993 , January and April 1994 , in 1995 , in 2003 -2004 , and in 2007 -2017.