dataesr/scientific-paragraphs-categorization huggingface dataset:
de correspondre avec les auteurs. moins un produit chimique cancérogène (17). issues des Centres de Pathologies Professionnelles français, 27 585 cas de cancer ont été recensés. La 2,3% des nouveaux cas de cancers (3,9% chez les hommes) pourraient être attribués à des expositions majorité sont broncho-pulmonaire (64,1%) et urinaires (7%) (22). professionnelles passées (18). Seulement 0,5% des cancers seraient reconnus et indemnisés en tant Plusieurs agents classés cancérogène certain par le CIRC pour ces deux localisations de cancer sont que cancers « professionnels » (19). dans la liste d'agent permettant l'ouverture de droit au SPP (amiante, arsenic, amines aromatiques, silice cristalline notamment). Méthodologie Perspectives et développement futurs Pour une meilleure information auprès des médecins généralistes, une communication via le Conseil de l'ordre des médecins, des articles dans des revues scientifiques et des présentations en congrès sont Construction de la base de données Le développement du site pourra inclure également l'accès à des ordonnances types pour les demandes prévues.
Dans un degré encore plus fin de subsidiarité, les priorisations données à des projets ou des programmes particuliers forment des sous-thématiques précisément circonscrites et dessinent les contours d'une urgence cette fois à impulser un thème à une place de premier rang par rapport aux autres. C'est « l'urgence » signalée par l'ensemble des « tournants » (turn) auxquels invitent les plus convaincus de leurs défenseurs : on ne compte plus les tournants littéraires, spatiaux, cognitifs, de genre… comme autant d'invites à sauter en urgence dans le train des révolutions paradigmatiques qui se veulent coperniciennes. En outre, des inflexions sont introduites dans la réflexion en fonction de la nature de l'urgence, ou de ce que le terme qualifie dans un domaine donné. Le cas de l'urgence climatique, qui est à la fois une thèse attestée ou contestée sur la base de données scientifiques, est à ce titre particulièrement significatif de la double rapidité du phénomène et de la recherche qui lui est consacrée.
Dans certaines situations, pour lesquelles les données étaient insuffisantes, les résultats d'études de cohorte de plus de 300 sujets ont été inclus dans cette analyse de la littérature. La recherche bibliographique a porté sur les articles de la base de données Pubmed publiés entre août 2010 (date postérieure à la requête de l'ACS) et février 2019 (pour les métaanalyses, analyses poolées et essais), et novembre 2018 pour les études de cohorte. Au total, 8605 références ont été examinées, à partir desquelles 826 résumés ont été sélectionnés, puis 243 articles pertinents ont été retenus (63 méta-analyses, 22 analyses poolées, 65 essais d'intervention et 93 études de cohorte). Les conclusions de cette expertise reposent sur la qualité des études présentant des associations dont le niveau de preuve a été établi sur des critères précis (figure  1 ).
Alcazer, S. Depil tome 108 > n810S > October 2021 S76 Synthèse classe I. Pour ce faire, la délétion de la bêta 2-microglobuline permet d'éliminer efficacement l'expression des complexes de classe I en surface [29]. Ceci s'accompagne, cependant, d'un risque accru de reconnaissance par les cellules NK (« missing self »). Il est alors possible de prévenir la lyse par les cellules NK en faisant exprimer par les cellules CAR-T des ligands des récepteurs inhibiteurs des NK tel HLA-E [30]. À noter, toutefois, que le risque de lyse NK pourrait dépendre de la pathologie et du contexte clinique. Il a ainsi été montré que les cellules NK avaient des fonctions cytotoxiques réduites dans certaines pathologies malignes [31]. Un premier essai, évaluant des cellules CAR-T anti-CD19 avec élimination du TCR endogène (par intégration du CAR dans le locus TRAC) et de la bêta 2microglobuline par CRIPSR, est en cours (NCT04035434).
V. Alcazer, S. Depil tome 108 > n810S > October 2021 S76 Synthèse classe I. Pour ce faire, la délétion de la bêta 2-microglobuline permet d'éliminer efficacement l'expression des complexes de classe I en surface [29]. Ceci s'accompagne, cependant, d'un risque accru de reconnaissance par les cellules NK (« missing self »). Il est alors possible de prévenir la lyse par les cellules NK en faisant exprimer par les cellules CAR-T des ligands des récepteurs inhibiteurs des NK tel HLA-E [30]. À noter, toutefois, que le risque de lyse NK pourrait dépendre de la pathologie et du contexte clinique. Il a ainsi été montré que les cellules NK avaient des fonctions cytotoxiques réduites dans certaines pathologies malignes [31]. Un premier essai, évaluant des cellules CAR-T anti-CD19 avec élimination du TCR endogène (par intégration du CAR dans le locus TRAC) et de la bêta 2microglobuline par CRIPSR, est en cours (NCT04035434).
La disponibilité de CAR-T allogéniques offrirait la possibilité de traiter rapidement des pathologies en rechute ou réfractaires, sans la mise en place d'un processus complexe et le risque d'évolution avant la disponibilité d'un produiT-cellulaire. Des essais sont en cours dans la LAL B, les lymphomes de phénotype B et le myélome. Les cibles sont les mêmes que pour les CAR-T autologues, CD19 et CD22 dans la LAL et les lymphomes de phénotype B, BCMA et SLAMF7/CS1 dans le myélome, CD123 dans la leucémie aiguë myéloblastique (LAM) par exemple (tableau II). Compte tenu de la persistance limitée des premières versions de CAR-T allogéniques, il est envisageable d'utiliser ce type de thérapeutiques comme « bridge » vers la greffe. Les nouvelles générations de CAR-T allogéniques Développement des CAR-T allogéniques TABLEAU II Principaux essais cliniques en cours évaluant des CAR-T allogéniques Promoteur Cible Pathologie Méthode Stade Essai clinique Servier/Allogene Therapeutics CD19 LAL B pédiatrique Édition génique TCR et CD52 Phase 1 NCT02808442 (PALL) Servier/Allogene Therapeutics CD19 LAL B adulte Édition génique TCR et CD52 Phase 1 NCT02746952 (CALM) Précision biosciences CD19 LAL B et lymphomes B Édition génique TCR Phase 1/2 NCT03666000 Allogene Therapeutics CD19 Lymphomes B Édition génique TCR et CD52 Phase 1/2 NCT03939026 (ALPHA) CRISPR therapeutics CD19 Lymphomes B Édition génique TCR et Phase 1 NCT04035434 beta2-microglobuline Cellectis CD22 LAL B Édition génique TCR Phase 1 NCT04150497 (BALLI-01) Cellectis CD123 LAM Édition génique TCR Phase 1 NCT03190278 (AMELI-01) Allogene Therapeutics BCMA Myélome Édition génique TCR et CD52 Phase 1 NCT04093596 (UNIVERSAL) Poseida BCMA Myélome Édition génique TCR Phase 1 NCT03288493 CRISPR therapeutics BCMA Myélome Édition génique TCR et Phase 1 NCT04244656 beta2-microglobuline Cellectis CS1 Myélome Édition génique TCR et CS1 Phase 1 NCT04142619 (MELANI-01) Celyad Ligands NKG2D Cancer colorectal Inhibition du TCR par un Phase 1 NCT03692429 (alloSHRINK) peptide (fragment CD3z) tome 108 > n810S > October 2021 S77Synthèse(partiellement HLA matchés ou rendus invisibles au système immunitaire) pourraient cependant persister plus longtemps ou être administrées plusieurs fois après un conditionnement modéré, de manière à maintenir un nombre suffisant de ces cellules dans le temps et permettre ainsi une approche curative.
Remerciements Aux patients ayant accepté de participer. À tous les intervenants médicaux de notre équipe ayant participé à la délivrance et au recueil des questionnaires aux patients :  Dr Chaleat ,  Dr Barboni ,  Dr Garcia ,  Dr Baciuchka ,  Dr Jeanson. À Mme Ghaleb , étudiante en pharmacie, pour son aide à l'inclusion des patients, supervisée par le  Dr Ausias. Au  Dr Resseguier  pour son aide précieuse pour la méthodologie de cette étude.
La relation dose-réponse Il est nécessaire de rappeler ici les résultats de l'étude classique sur l'effet-dose en psychothérapie mise en évidence par la Méga-analyse  de Howard et al. , (1986) , à partir d'un pool de 15 bases de données de recherches couvrant une population de plus de 2400 patients suivis en psychothérapie ; et pour lesquels il s'agissait de modéliser statistiquement la réponse au traitement en fonction du nombre de séances attendues. A la 8ème séance, quasiment 50% des patients étaient améliorés de manière quantifiable et approximativement 75% à la 26ème séance (6 mois de traitement). Il existerait une diminution des gains tirés de la thérapie au cours du temps, telle que sur les premières séances, si nous matérialisons les gains par un graphique d'évolution symptomatique (par exemple en mesurant un niveau de détresse psychologique), nous pourrions constater la présence d'une forte pente descendante, indiquant un haut niveau de diminution de la symptomatologie, et tel que cette « accélération du changement » aurait tendance à diminuer au fil de séances.
2001 ; Whipple et al. 2003). Ainsi, en utilisant d'importantes bases de données normatives,  Brown et Lambert (1998)   L'utilisation du feedback des patients en thérapie pour informer le praticien (parfois le patient également) et guider le processus thérapeutique est un exemple direct de ces recherches (que nous pouvons regrouper sous l'appellation Traitement Orienté par le Feedback ou TOF ; pour une revue voir  Cazauvieilh, 2013 Cazauvieilh, , 2014 Cazauvieilh, , 2015)). Ce Suivi Continu des Résultats (ROM) est un développement prometteur des recherches centrées sur le patient  (Lambert et al. , 2001). Une recension récente de la littérature  de Schuckard et al. (2016)  documente que la pratique ROM peut amener dans certaines études à une diminution des taux d'abandon (jusqu'à 50%), réduire les taux de détérioration pendant les soins (jusqu'à 33%), et peut être efficiente en maximisant le changement cliniquement significatif (jusqu'à le multiplier par deux) ; avec des économies de santé dans les ressources allouées aux soins.
ACKNOWLEDGMENTS This work was financially supported by the  French Archaeological Mission at Khirokitia  ( French Ministry for Foreign Affairs ) and by the  Archéorient laboratory. The first author wishes to express her gratitude to  A. Le Brun  who have entrusted to her the study of the burials and skeletal remains from Khirokitia. Thanks are also given to  O. Le Brun ,  C. Baron  and  A. Fontaine  for their help on the field and during the cleaning and reconstruction of the skeleton. Technical assistance in the illustration of this paper was provided by  B. Chamel  and  F. Notter-Truxa. The authors are also grateful to the anonymous reviewers for their constructive comments.
Méthodes. -Dans cette revue narrative, la base de données Medline a été interrogée pour identifier toutes les publications rapportant une utilisation de l'impression 3D en médecine et plus spécifiquement en urologie. Les différents apports de l'impression 3D ont été catégorisés afin d'être recherchés dans Medline avec plus de précision. Résultats. -L'impression 3D peut donc aider pour l'information préopératoire délivrée au patient, pour le chirurgien et sa planification opératoire, pour l'enseignement aux étudiants en médecine et aux jeunes médecins, ou pour des outils de simulation chirurgicale. En urologie, c'est en chirurgie rénale oncologique que la littérature est la plus abondante, pour la planification opératoire, mais également pour la simulation opératoire et l'enseignement de la technique chirurgicale.
Matériel et méthodes Le groupe de travail était composé de 4 membres (2 urologues, 1 radiologue et 1 ingénieur spécialisé en impression 3D), réunis autour d'un projet propre d'impression 3D de reins tumoraux avant néphrectomie partielle (Projet Rein-3D-print, UroCCR n • 39). Ce groupe a réalisé une revue de la littérature dans la base de données Pubmed/Medline (http://www. ncbi. nlm. nih. gov/pubmed/) de 2000 à 2020 en utilisant les mots clés suivants : « 3D printed » ; « rapid prototyping » ; « 3D printing ». Seules les publications en anglais ont été retenues. Les études concernant des disciplines paramédicales, pharmacologiques ou dentaires ont été exclues. Une attention particulière a été portée sur les essais cliniques. Pour être plus restrictif et permettre des recherches plus affinées, on a ensuite ajouté les mots clés correspondant aux différentes catégories d'apport de l'impression 3D retrouvées dans la litérature, à savoir : • L'information au patient (« patient information ») ; • L'enseignement (« education ») ; • La planification chirurgicale ou préopératoire (« preoperative planning ») ; • La simulation chirurgicale (« surgical simulation ») ; • L'impression de matériel implantable ou d'instruments de chirurgie (« prosthetics ») ; • L'impression de tissus biologiques (« bioprinting).
Les résultats péri-opératoires des 7 patients en question ont été comparés favorablement à leur base de données, mais sans significativité et sans pertinence clinique directe du fait du faible effectif et de l'absence d'évaluation comparative directe. Dans cette étude, la simulation était réalisée par le chirurgien luimême, sur le modèle patient-spécifique, en préopératoire. Il ne s'agissait donc pas d'enseignement chirurgical mais réellement d'une simulation préopératoire devant bénéficier directement au patient à traiter. L'analyse du service médical rendu de cette simulation serait difficile à évaluer quantitativement mais des résultats sur des effectifs plus importants seraient intéressants. Les auteurs concluaient effectivement sur le besoin d'une étude cas-témoins afin de mieux en évaluer le bénéfice (Figs.
Remerciements : La SFGM-TC remercie les partenaires industriels pour leurs soutiens financiers qui ont permis la réussite de cette onzième édition des ateliers d'harmonisation des pratiques : ACCORD, AMGEN, ASTELLAS, BIOTEST, BLUEBIRDBIO, INCYTE, JAZZ PHARMACEUTICALS, MACOPHARMA, MALLINCKRODT THERAKOS, MSD  FRANCE, SANOFI GENZYME. Déclaration de liens d'intérêts : Les auteurs déclarent ne pas avoir de liens d' intérêts. Matériel complémentaire Le matériel complémentaire accompagnant la version en ligne de cet article est disponible sur http://www. sciencedirect. comet https://doi. org/10. 1016/j. bulcan. 2021. 02. 012.
ECG analysis Two physicians blinded to the clinical and genetic status reviewed all baseline ECGs. P wave, PQ interval, QRS, QT peak, QTend, QTc duration (corrected by Bazett formula), and Tpeak-Tend interval (TPE, time interval between the peak and the end of the T wave) were measured in D2, V1, V2 and V3. S-wave duration and amplitude were additionally measured in D1. All measurements were performed using Image J software as previously described. 2, 3 TPE in precordial lead, fragmented QRS, earlyrepolarization pattern and prominent R wave in lead aVR were determined as previously described. 4, 5.
Transcript expression analysis Quantitative RT-PCR: Total RNA samples were isolated using the NucleoSpin RNA kit (MACHEREY-NAGEL). One μg of tRNA was reverse transcribed using High-Capacity cDNA Reverse Transcription Kit (Applied Biosystems) following the manufacturer's instructions. PCR amplification was performed using FAM labeled-TaqMan probes (Applied Biosystems) to verify the pluripotency of derived hiPSCs as compared to parental fibroblasts (OCT3/4 and NANOG). According to the ΔΔCt method, all data were normalized to ACTB and represented relative to controls. TaqMan Low Density array (TLDA): TLDA studies were conducted using beating clusters of hiPSC-CMs obtained from 12 samples of Ctrl, 4 samples of Non-BrS and 14 samples of BrS hiPSC-CMs. One μg of RNA was reverse transcribed into cDNA using SuperScript IV Vilo Master Mix (Thermo Fisher Scientific).
R package DESeq2 (Bioconductor) was used to normalize gene expression, and detect differentially expressed genes. Sample correlation matrix was performed using R package ComplexHeatmap (Bioconductor). Cluster 3. 0 software was used to perform the differentially expressed gene heatmap. Gene Set Enrichment Analysis (GSEA) was performed using GeneTrail2. Statistically significant categories within the GO Molecular Process were identified using Kolomogorov-Smirnov test and p values were adjusted using the Benjamini and Hochberg method.
p. N1722D Na v 1. 5 study in COS-7 cells The point mutation p. N1722D (c. 1859G>A) in SCN5A was introduced using mutated oligonucleotide extension (QuikChange II XL Site-Directed Mutagenesis Kit) in SCN5A isoform 2 cDNA (GenBank Acc. Nb. NM_000335). The resulting plasmid was verified by complete sequencing of the cDNA insert. African green monkey kidney-derived cells COS-7, were transiently transfected with 0. Borosilicate glass pipettes (2-3 MΩ of tip resistance) were filled with a solution containing (in mM): 125 K-Gluconate, 20 KCl, 5 NaCl, 5 HEPES; pH 7. 2 (KOH) and 0. 22 amphotericin-B. We first recorded spontaneous APs in order to determine, for each individual included in the study, the proportion of nodal-like, atrial-like and ventricular-like, as previously described. 11 Then to overcome limited I K1 contribution during hiPSC-CM AP, artificial I K1 was injected using dynamic patch-clamp.
16 Both cell stimulation and I K1 injection were realized using a custom-made software running on RT-Linux and an F o r R e v i e w O n l y A/D converter (National Instrument PCI-6221) connected to the current command of the amplifier. The AP parameters measured were the maximum diastolic potential (MDP), the maximum upstroke velocity of phase 0 depolarization (dV/dt max ), the AP amplitude and the AP duration at different levels of full repolarization, from 30% (APD30) to 90% (APD90), as previously described. 11 Following I K1 injection, at a peak outward density that sets the membrane potential between -80 to -85mV for all.
All genomic positions were based on Human Genome Build 37 (hg19). Analysis was performed with GenomeStudio software. Chromosome abnormalities were determined by visual inspection of logR ratios and B-allele frequencies (BAF) values and F o r R e v i e w O n l y comparing parental cells with hiPSC-derived samples. LogR ratio, the ratio between observed and expected probe intensity, is informative of copy number variation (CNV, i. e. deletions/duplications), whereas BAF is informative of heterozygosity. SNP data were used to compute CNV. In particular, this type of chips allows detecting loss of heterozygosity (LOH), an important concern for hiPSCs, which is not detectable with classical CGH arrays.
16 Both cell stimulation and I K1 injection were realized using a custom-made software running on RT-Linux and an The AP parameters measured were the maximum diastolic potential (MDP), the maximum upstroke velocity of phase 0 depolarization (dV/dt max ), the AP amplitude and the AP duration at different levels of full repolarization, from 30% (APD30) to 90% (APD90), as previously described. 11   subepicardial human ventricular cells. 18, 19 In the original model used by Gima and Rudy, a slow inactivation gate (j) of the Na+ channel was added to include the property of slow recovery,  20  without modifying fast inactivation (realized with h gate). A few modifications were operated. Since this 'j' inactivation was originally as fast as 'h' inactivation, it prevents the appearance of a persistent current when altering the 'h' gate.
Digital gene expression profiles were generated by counting the number of UMIs associated with each RefSeq genes, for each sample. R package DESeq2 (Bioconductor) was used to normalize gene expression, and detect differentially expressed genes. Sample correlation matrix was performed using R package ComplexHeatmap (Bioconductor). Cluster 3. 0 software was used to perform the differentially expressed gene heatmap. Gene Set Enrichment Analysis (GSEA) was performed using GeneTrail2. Statistically significant categories within the GO Molecular Process were identified using Kolomogorov-Smirnov test and p values were adjusted using the Benjamini and.
Acknowledgements The authors thank  Dr. Connie Bezzina  and  Dr. Isabella Mengarelli  for the gift of hiPSCs from BrS6patient,  Dr. Pierre Lindenbaum  and  Dr. Stephanie Bonnaud  for the Haloplex targeted capture and NGS experiments, and  Adeline Goudal  for her support in the variant annotation. Genomic and bioinformatics analysis, flow cytometry and iPSCs derivation were performed with the support of  GenoBiRD (Biogenouest) ,  CytoCell  and iPS core facility of Nantes university, respectively. Finally, the authors are grateful to the patients and families who agreed to participate in our research.
Source of funding This work was supported by grants from the  Fondation pour la Recherche Médicale  ( DEQ20140329545 ), The  National Research Agency   ANR-14-CE10-0001-01  and  HEART  iPS  ANR-15-CE14-0019-01 , and  La Fédération Française de Cardiologie. Dr. Nathalie Gaborit  was laureate of fellowships from  Fondation Lefoulon-Delalande  and  Marie Curie Actions ,  International Incoming Fellowship   FP7-PEOPLE-2012-IIF [PIIF-GA-2012-331436 ]. Dr. Zeina R. Al-Sayed  was supported by scholarships from the  Lebanese University, Eiffel program of Excellence (Campus France) , and  The Fondation Genavie. Dr. Mariam Jouni  was funded by a scholarship from the  Association of Scientific Orientation and Specialization (ASOS)  and by a grant from the  Lebanese University  to  Dr. Kazem Zibara. Eric Charpentier  was supported by  Data-Santé  ( Région Pays de la Loire ).
Dr. Barc  was supported by the  H2020-MSCA-IF-2014. Acknowledgements The authors thank  Dr. Connie Bezzina  and  Dr. Isabella Mengarelli  for the gift of hiPSCs from BrS6patient,  Dr. Pierre Lindenbaum  and  Dr. Stephanie Bonnaud  for the Haloplex targeted capture and NGS experiments, and  Adeline Goudal  for her support in the variant annotation. Genomic and bioinformatics analysis, flow cytometry and iPSCs derivation were performed with the support of  GenoBiRD (Biogenouest) ,  CytoCell  and iPS core facility of Nantes university, respectively. Finally, the authors are grateful to the patients and families who agreed to participate in our research.
Digital gene expression profiles were generated by counting the number of UMIs associated with each RefSeq genes, for each sample. R package DESeq2 (Bioconductor) was used to normalize gene expression, and detect differentially expressed genes. Sample correlation matrix was performed using R package ComplexHeatmap (Bioconductor). Cluster 3. 0 software was used to perform the differentially expressed gene heatmap. Gene Set Enrichment Analysis (GSEA) was performed using GeneTrail2. Statistically significant categories within the GO Molecular Process were identified using Kolomogorov-Smirnov test and p values were adjusted using the Benjamini and F o r R Hochberg method. w e i v e O n l y 12-14 3' Sequencing RNA Profiling (3'SRP): 3'SRP protocol was performed according to Kilens et al. 15 Briefly, the libraries were prepared from 10 ng of total RNA.
32 BA oil immersion lens. Numbers of IBA1-, GFAP-, GR-, and BrdU-ir cells were counted using an integrated microscopic counting chamber that delineated the region of interest by a square of 425. 10 mm 2. The average cell counts from 10 ± 2 sections were used for statistical analysis. For GR quantification, we calculated the percentage of GR/ DAPI ir-cells among GR-ir cells to assess for GR nuclear localization. For BrdU quantification, we calculated the percentage of BrdU ir-cells persisting at d30 to assess the survival of the proliferative cells observed at d3. The quantification of the KCC2 immunolabeling was performed according to a previously published protocol  [103]  using a custom program written in MATLAB ® (The Mathworks, Inc. ). Briefly, the program allows analysis of the fluorescence at the plasma membrane of neurons.