dataesr/scientific-paragraphs-categorization huggingface dataset:
In order to include the full spatial component in statistical analyses (i. e. not only the height on tree trunk which was only used as a proxy of the spatial component in illustrations), we used a principal coordinates of neighbour matrices (PCNM) approach. PCNM allows the reduction of a complex system of spatial coordinates into a limited number of vectors called eigenvectors. PCNM eigenvectors were computed using the pcnm function of the vegan package. Eigenvectors (i. e. PCNM axes) associated with positive eigenvalues were submitted to a forward selection  (Blanchet et al. , 2008)  using the code provided in  (Bauman et al. , 2018). Variance partitioning was then performed using the varpart function in the vegan r-package, using the orchid species identity as first explanatory variable and the sets of selected PCNM vectors as second explanatory variable.
| Data quality and fungal community description A total of 25,806,753 and 24,989,711 raw sequencing reads were obtained with primer pairs ITS86-F/ITS4 and 5. 8S-OF/ITS4-Tul respectively. The remaining 32,593,936 reads obtained after the selective bioinformatics process clustered into 4564 OTUs in total. The expected fungal species were all identified in the 36 mock community positive controls. After filtering OTUs' occurrences representing <0. 5% of reads from each sample, the remaining reads in positive controls all belonged to fungal species of the mock community. Applying this stringent curation of the data led to 794 OTUs (i. e. 27,595,918 reads). The 5. 8S-OF/ITS4-Tul primer pair detected 57 OTUs of Tulasnellaceae (Figure  1 ), among which only one OTU was amplified with the more universal pair ITS86-F/ITS4.
| Diversity of OMF in bark-dwelling communities After filtering low-count OTU's occurrences (i. e. <0. 5% of reads in each sample), we retrieved 794 fungal OTUs in the whole dataset, 91 (11. 46%) of which were considered as OMF. Perhaps because of the use of an additional specific primer pair, Tulasnellaceae were the most abundant OMF in nearly all orchid species. However, the need to use specific primers to amplify this family is largely acknowledged and has been recently demonstrated by  Rammitsu et al. (2021). Tulasnellaceae and Serendipitaceae were both represented by numerous OTUs whereas only three OTUs of Ceratobasidiaceae were detected, only one being frequent, suggesting that Ceratobasidiaceae might be rarer in these epiphytic rainforest habitats  (Martos et al. , 2012).
Overview of fungal community composition in the epiphytic environment colonized by orchid species identified with the primers (a) ITS86-F/ITS4 or (b) 5. 8S-OF/ITS4-Tul across the whole dataset. (i) Ranked relative abundances of the first 30 OTUs. OTUs are coloured according to their taxonomy and main OMF OTUs are named. (ii) Relative abundance of the main identified fungal clades. (c) Main fungal clades occurring in epiphytic orchid roots and in the surrounding bark with the two set of primers using presence/absence data. LabCal, Labourdonnaisia calophylloides; NuxVer, Nuxia verticillata. The number of samples considered is given in brackets.
F Overview of fungal community composition in the epiphytic environment colonized by orchid species identified with the primers (a) ITS86-F/ITS4 or (b) 5. 8S-OF/ITS4-Tul across the whole dataset. (i) Ranked relative abundances of the first 30 OTUs. OTUs are coloured according to their taxonomy and main OMF OTUs are named. (ii) Relative abundance of the main identified fungal clades. (c) Main fungal clades occurring in epiphytic orchid roots and in the surrounding bark with the two set of primers using presence/absence data. LabCal, Labourdonnaisia calophylloides; NuxVer, Nuxia verticillata. The number of samples considered is given in brackets.
Neanmoins, certaines femmes restent reticentes al'idee d'une surveillance, meme rapprochee, en raison de l'incertitude qui persiste quant au risque que leur lesion evolue vers un cancer. Recemment, l'etude multicentrique NOMAT (NOMOgram for ATypia, clinicaltrials. gov NCT02523612), qui a inclus et suivi de maniere prospective 300 femmes porteuses de lesions atypiques, a permis de proposer un modele predictif du risque de developper un cancer du sein en presence d'une LF, dans augmentation de la detection de lesions « frontieres » (LF). Recemment, l'etude multicentrique NOMAT a proposeun modele predictif du risque de developper un cancer apres detection d'une LF afin d'eviter l'exerese chirurgicale de lesions a« bas risque ». Elle avait egalement pour objectif de renseigner le vecu psychologique, notamment l'anxiete, afin d'orienter le processus de decision medicale partagee.
Les criteres de non-inclusion etaient : la presence d'un nodule a l'echographie, la presence de carcinome canalaire in situ ou de signe d'invasion, un antecedent personnel de cancer du sein, un antecedent de radiotherapie mammaire ou une predisposition a ùne mutation germinale connue. Les femmes enceintes, en cours d'allaitement, sous tutelle/curatelle ou dans l'impossibilitede suivre les procedures de suivi pour des raisons geographiques, sociales ou psychologiques ne pouvaient egalement pas etre incluses. L'accord du comitede protection des personnes I ˆle-de-France a eteobtenu le 11 mars 2015 (2015-A00045-44). L'essai clinique a eteinscrit sur clinicaltrials. gov sous le numero NCT02523612.
Conclusion. -La chirurgie des LF ne semble s'associer que dans tres peu de cas aune augmentation de l'anxieteet ne fait evoluer qu'ala marge la perception du risque de developper un cancer. La prise en compte de la dimension psychologique reste dans tous les cas essentielle dans la decision medicale partagee. Clinical Trial Registration Number. -NCT02523612 Les femmes devaient etre agees de plus de 18 ans et presenter une LF pouvant correspondre aune hyperplasie canalaire atypique, une metaplasie cylindrique avec atypie ou une neoplasie lobulaire (hyperplasie lobulaire atypique ou carcinome lobulaire in situ). Les femmes avec des lesions multifocales ont eteincluses, la lesion presentant le plus haut risque d'evolution ou d'association aun cancer du sein etait alors consideree comme la lesion principale.
, F. tularensis, and F. tularensis subsp. holarctica, were all negative for DNA extracted from this strain (2,3). Species identification could not be obtained by using MALDI-TOF mass spectrometry, either with the routine database (MBT IVD Library DB-7171), the Biotox database (MBT SR Library; both from Bruker, https://www. bruker. com), or the French National Reference Centre for Francisella database containing F. tularensis, F. novicida, and F. philomiragia  (4). Therefore, we performed whole-genome sequencing by using second and third next-generation sequencing platforms MiSeq (Illumina, https://www. illumina. com) and MinION (Oxford Nanopore Technologies, https:// nanoporetech. com). Hybrid assembly of the sequencing data using Unicycler software on the Galaxy web platform (https://usegalaxy.
org) enabled circularization of a 1,940,863 bp bacterial chromosome (Genbank accession no. CP076680). Whole-genome-based identification of the strain was assessed by using the Type Strain Genome Server (https://tygs. dsmz. de) (  5 ). The CHUGA-F75 strain clustered in the same branch as the F. salimarina SYSU SYW-1, the F. marina E95-16, and the F. salina TX07-7308 strains (Appendix Figure, https:// wwwnc. cdc. gov/EID/article/28/2/21-1380-App1. pdf), probably representing the same species because of high genetic homology, although different species names have been published  (6) (7) (8). Digital DNA-DNA hybridization >70%, average nucleotide identity >95%, and difference in percent guanine-cytosine content <1 percent between the CHUGA-F75 strain and the 3 F. salimarina, F. marina, and F. salina strains confirmed the CHUGA-F75 isolate belonged to the same species.
clinicaltrials. gov as NCT01936532. Induction therapy comprised three 28-day cycles of oral ixazomib (4 mg on days 1,8,15), oral lenalidomide (25 mg on days 1-21) and oral dexamethasone (40 mg on days 1,8,15,22). Stem cell harvest was planned for all patients after high-dose cyclophosphamide (3g/m 2 ) plus granulocytecolony stimulating factor (G-CSF). Patients proceeded to transplant using melphalan 200 mg/m 2 as the conditioning regimen. Non-progressive patients then proceeded to early consolidation therapy with two 28-day IRD cycles, followed by late consolidation (six 28-day cycles of ixazomib (4 mg on days 1,8,15) and lenalidomide (25 mg on days 1-21) without dexamethasone. Patients subsequently received maintenance therapy with ixazomib (4 mg/day on days 1,8,15) for one year. The primary endpoint was stringent complete response (sCR) rate at the completion of extended consolidation.
One way of improving IRD efficacy in the context of transplantation could be the addition of anti-CD38 antibody. The convenience and efficacy profile of IRD in TE NDMM patients led to the design of the IFM phase 2 study 2018-01 (NCT03669445) to evaluate the efficacy and safety of IRD in combination with daratumumab in TE NDMM. Based on their efficacy/safety profile, bortezomib or carfilzomib-based induction regimen with anti-CD38 should be considered as a standard of care in TE NDMM patients.
These models are developed based on the behaviour of real ACS modules and the energy models are obtained using reference measures of real ACS. After simulating the real scenario, we validate the ACS model of the system by comparing results to those obtained on a real ACS. This paper is organized as follows. In Section 2, we give a brief description of the ACS that is developed in OMNeT++. Section 3 presents the developed ACS with its internal architecture including the modeling of energy consumption. Simulations are listed and discussed in Section 4. Finally, conclusions and perspectives are given in Section 5.
The controller MCU receives and then processes the data packets sent by the reader. The described states' transition are related to the controller MCU, where this sequence is periodically performed. The following sequence refers to the operating states   4 , as well as the corresponding states' transition. The B2F circuit is responsible for transmitting and receiving data accordingly. All these states are implemented according to the application requirements. Based on these states, the energy consumption has been evaluated. Note that the B2F circuit is made by off-the-shelf electronic components (e. g. resistances, transistors). This circuit has been developed to perform communication through two wires, where power and data are coupled on the same wire. This circuit has some limitation and drawback, where the maximum bitrate is 38400 bps and the power consumption during the idle state is higher than the transmitting state.
Energy Modeling After modeling the nodes on OMMeT++, we take advantage of the INET framework to integrate the power consumption for each element embedded in the nodes. In this framework, several existing features were commonly used to model the energy of the ACS. The energy model computes the energy consumption of the modules based on the power that is specified during operating states. Since most implemented layers are modeled as FSM, in which each operating state of a module is described, we are able to assign a power consumption value to each of these states. Each module has its own energy model, where the energy models of the MCUs are implemented in the MCU's application layer, and the energy models of the B2F circuits is modeled in the B2F circuit's PHY layer. Typically, using simulators, the energy consumption is modeled by rather simple state-based approaches, where the time T i of the module, i.
CONCLUSION AND FUTURE WORK In this paper, we presented the access control system used to limit the physical access to any secured and restricted area. The architecture and the internal modules of the ACS are presented in details. This work focuses on the energy consumption of the communication and the computation of hardware devices used in the studied systems. A simulation environment for ACS based on OMNeT++ and the INET framework is described as well. The purpose of this paper is to compare the energy consumption of the studied system and its simulated model with the same working scenario. After the implementation and the calibration phases, both energies were calculated to evaluate the system's performance, where we have validated the modeled system. For future works, we will study and simulate several configurations in order to achieve better energy efficiency.
Dans [80] (Mihalcea et col. 2010), les auteurs testent si une chute terminant un contexte est ou non comique (compris au sens d'incongru), en se basant sur des représentations vectorielles de textes et des mesures appropriées aux blagues (polysémie, allitération, similarité avec les blagues du dataset). Récemment [46] (Hasan et col. 2021) se sont attaqués (par des techniques d'apprentissage avancé basées sur des architectures de type « Transformer ») à la détection multimodale de l'humour dans des vidéos, ce qui requiert la prise en compte des composantes verbales et non verbales ainsi que l'intégration de connaissances externes.
Désobéir au capitalisme de plateforme Docteur en physique théorique, converti à l'art dans le courant des années 2000, l'artiste français Christophe Bruno a pensé son oeuvre comme un véritable cheval de Troie contre l'hégémonie de Google. Il s'est engagé en 2001 dans une entreprise systématique de détournement critique et prospectif, souvent cocasse, des fonctionnalités et des usages du désormais célèbre et « incontournable » moteur de recherche. À l'heure du Web 2. 0, il incarne le renouveau de la figure de l'« artiste hacker » qui révèle et questionne les organes et les rituels du Web, conscient qu'Internet est devenu un outil de surveillance et de contrôle inégalé, dont la dynamique économique repose sur l'analyse et la prédiction des comportements à l'aide de logiciels de traçage de la vie privée, des goûts et des identités sur la Toile  8.
À partir d'un mot-clé saisi par un internaute dans la barre de recherche du moteur, son générateur d'Épiphanies parasite l'algorithme de Google afin de collecter sur Internet des bribes de phrases, réagencées comme des petits poèmes aléatoires. L'algorithme développé par l'artiste glane en effet, au hasard de la navigation, parmi tous les textes archiveś sur le Web, des fragments de phrases en relation avec les motsclés saisis par les internautes  10. L'état d'esprit [de cette pièce] n'est pas de faire un générateur de texte […] mais c'est vraiment l'attitude de se positionner comme un parasite d'une structure globale qui est en train d'émerger -Google -et qui contient dans sa base de données l'ensemble de toutes les paroles de l'humanité. La question de la globalisation du langage est très importante.
Que nous dit ce projet de Google ? Google est un champion de la démocratie culturelle, mais sans culture et sans démocratie. Car il n'est un maître ni en culture (l'information n'est pas la paideia) ni en politique (la démocratie des clics n'est pas une démocratie 24 ). Organiser et faire le bien ! Ces deux missions que s'est donné Google adoptent comme mode opérationnel de mettre de l'ordre dans le chaos. Mais de ce point de vue, la multinationale semble davantage symboliser et prolonger à sa manière le vecteur de l'impérialisme américain : le bien contre le mal. L'espoir ou la croyance démocratique trouve alors définitivement ses limites. In the age of GAFA and platform capitalism, some artists are doing digital disobedience. In the wake of tactical media, with Michel de Certeau as a tutelary figure, they target proprietary software environments, their algorithms and incarnations in tangible objects: bots, connected objects, robots, androids, etc.
Like Christophe Bruno, who diverts the Google application from its utilitarian functions to better reveal its constraining and hidden dimensions. His Google hacks question and divert the tool of surveillance and control that Google has become, whose economic dynamics are based on the analysis and prediction of language, with the help of software for tracking private life that cause formatting tastes and identities on the Web. The digital disobedience, considered here under a double speculative and experimental angle, shakes and renews the conditions of investigation and action on our technical environments.
Certaines institutions ou infrastructures de recherche proposent d'ouvrir des comptes sur leur serveur eScriptorium, mais il est difficile de les recenser toutes. Heureusement, il est aisé de déplacer ses données d'une instance à une autre puisque tout peut être téléchargé. À l'heure actuelle, eScriptorium propose un modèle de segmentation par défaut efficace mais n'en propose pas pour la transcription : il faut en créer un soi-même ou trouver sur Internet ceux que d'autres utilisateurs de Kraken/eScriptorium ont créés. Certains sont déposés sur Zenodo 3 et des initiatives comme HTR-United 4 permettent de trouver des données à partir desquelles générer ces modèles. La production de modèles, qu'ils soient spécialistes d'une écriture, d'un type de document ou bien généralistes, est l'un des principaux défis à relever pour faire progresser l'implémentation de l'HTR dans les institutions patrimoniales.
L'avantage de l'écosystème ouvert de Kraken/eScriptorium réside justement dans le fait qu'il permet aux utilisateurs de créer en autonomie et en toute transparence ces données et ces modèles. Alix Chagué Doctorante en humanités numériques au sein de l'équipe ALMnaCH (Inria -Paris) et du GREN (Université de Montréal) alix. chague@inria. fr [1] SCRIPTA PSL : https://scripta. psl. eu [2] Kraken : https://kraken. re [3] Zenodo : https://zenodo. org/communities/ ocr_models [4] HTR-United : https://htr-united. github. io Développée en 2019, l'application eScriptorium dote le logiciel Kraken d'une interface graphique et facilite la conduite de campagnes de transcription automatique. eScriptorium : une application libre pour la transcription automatique des manuscrits Vue du tableau de bord d'eScriptorium permettant de gérer la segmentation et la transcription d'un document manuscrit.
Rôle fondamental des espaces latents Un des points forts du DL est sa capacité à adresser un ensemble Z de variables de contrôle et de manipulation au sein d'un réseau multicouche (fig. 1 ), appelé espace latent, dans lequel se trouve une forme de représentation comprimée des données. C'est aussi un continuum dont la dimension paramétrique peut être assez élevée (512 paramètres pour StyleGAN2). On peut alors considérer une image générée comme un moment figé de cet espace fluide. Par exemple, StyleGAN2 offre la possibilité d'opérer une translation entre deux points de cet espace (deep-morphing) ou un mélange de styles entre deux images apprises (fig. 2 ). Toutefois, une condition nécessaire est de disposer d'un remplissage suffisant de cet espace, ce qui nécessite au minimum d'avoir entraîné le GAN sur un dataset de taille suffisante (4000 échantillons pour StyleGAN2-ada).
Désormais, avec des datasets de plusieurs dizaines de milliers d'images représentant des projets d'architecture, cette éponge à complexité nourrit la sérendipité, comme jamais auparavant avec des systèmes génératifs non supervisés. Les images produites sont souvent source d'inspiration, à condition de ne pas oublier que le processus apprend à partir de ce qu'on lui donne, donc fournit en somme une synthèse des intentions implicites de l'auteur du dataset. Le premier dataset (1650 images) est destiné à l'apprentissage et à la création de coupes longitudinales (fig. 4 ), et le second (1700 images) à la génération de perspectives architecturales et urbaines originales et plausibles, dans leur environnement bâti et paysager (fig. 5 ). De toute évidence, StyleGAN2 comprend implicitement la notion de perspective et de profondeur de scène, comme cela a été remarqué dans  [24].
[4] , Bachl et al. ont cherché à générer des images de façades contenant les caractéristiques stylistiques de certaines villesen tirant parti des avantages des cGANs pour générer des façades urbaines pour des villes connues avec de plus grands datasets, ce qui permet d'accéder à un espace latent assez continu et réaliser des morphing inter-villes avec peu d'artefacts. De notre côté, nous avons utilisé StyleGAN2 sur le dataset de la Rue Monge à Paris, pour mettre en évidence la capacité de ce GAN à traiter des images issues de collections très hétérogènes. Puis nous avons généré des résultats avec la fonctionnalité de style-mixing (fig. 2), en jouant sur le nombre de couches conservées, pour moduler des détails géométriques et texturaux.
On peut vraisemblablement lui donner deux significations différentes (qui se cumulent) : 1. Les éditeurs d'écrits scientifiques ne peuvent valablement obtenir de cessions exclusives de droits sur des données de recherche liées à la publication, qu'elles soient déposées sur un entrepôt de données ou qu'elles figurent comme supplementary materials de l'article. 2. Lorsque des éditeurs rassemblent des données de recherche liés à des publications dans des entrepôts, ils ne peuvent faire jouer leur droit de producteur de bases de données pour limiter la réutilisation. Ce passage de l'article 533-4-III du code de la recherche constitue une forte protection des données de recherche. Il garantit que les éditeurs ne peuvent exiger d'exclusivité et donc empêcher que les données leur ayant été fournies soient diffusées par ailleurs par les chercheurs.
Researchers' social networks seem to influence the practices and uses related to Open Science in France. By distinguishing uses and practices according to two approaches, one where Open Science is associated with a human dimension, including opening up research results to the wider range and the other where the technical dimension, including the use of a free digital environment, is what prevails, the results lead to disciplinary distinctions, but also to distinctions in terms of status, generation and work context. The outcomes are equivalent regarding the arrival of new software and programming languages, as we have been able to see with to R, Excel and Python. Acculturation to the challenges of Open Science is achieved through collectives, which are more accessible in research environments than in the research-teaching pair.
sanitaire et cette demande en cours de Terre Environnement de Lorraine) -CNRS. pas laissé la possibilité d'enregistrer les passation obligeant également à revoir Suite à ce premier échange, il a été convenu réponses. Ce choix peut entraîner une notre demande de consentement en de diffuser ce questionnaire auprès des perte de réponses étant donné la durée début de questionnaire, nous n'avons 14 membres du collège Données de la d'engagement demandée aux répondants. pas pu répondre favorablement. Afin de recherche du Comité pour la Science faire valider la passation dans des éta- Ouverte, ( chercheurs et professionnels de blissements et obtenir l'appui de leur l'information) durant deux semaines au mois institution pour la passation auprès de de mai 2020. Nous souhaitons les remercier leurs chercheurs, nous avons mis à dis- ici pour leurs nombreux retours, leur éclai- position le questionnaire sur ZENODO.