dataesr/scientific-paragraphs-categorization huggingface dataset:
For distribution, consider multiple options-a Docker or Singularity containers  [42, 43] , or the Conda  [44] /Bioconda  [45]  environment management systems can make complex setups much easier to install, and providing users with the details to install with dependencies on other systems is also valuable. Web applications (e. g. , those built with JavaScript) are great for avoiding multiple setup issues as they can work with any web browser. When time and resources allow, making a popular tool available on several platforms and programming languages is a good option for sustainability. JBrowse is a good illustration since it is available in both web and desktop versions  [5] , can be embedded in large genome portals as a Drupal module  [46] , has an R markdown and R Shiny compliant version (JBrowseR  [47] ), and exists as a Jupyter package  [48].
Plus, you can centralize answers to frequent questions and, if you have an active user base, GitHub Discussions now supports polls, making it a convenient way to get input on new ideas. Furthermore, as reproducible research and FAIR-sharing principles are applicable to software products  [52, 53] , it may encourage users to cite a released version of your tool by using tools like Zenodo to issue persistent Digital Object Identifiers (DOI) against your releases. When presenting at a conference, try to end with 1 to 2 questions about new feature requests or biggest issues, along with contact details. You could create dedicated groups on online platforms like meet-up or organize training sessions towards federating a user community. Also consider setting up a google search notifications around the name of your tool-you might find mentions on Biostars, publications, and other sites you were not expecting.
Conclusions Our 10 simple rules for developing genomic visualization tools will not replace the experience gained by trial-and-error but will hopefully make the development process less painful for future bio-datavis practitioners and other datavis enthusiasts. Moreover, these rules merely cover the tip of the iceberg, and we strongly encourage our readers to take a look at the references included in this paper to further improve their understanding. Other interesting matters that did not make it through the introductory cut include visual design validation  [55, 56] , inclusion and accessibility matters  [57, 58] , and visual representation of uncertainty  [59, 60] , which are subfields on their own. Most of the elements presented here would also be applicable to non-genomic datavis tools; what may be more specific to genomics here is that the datasets are increasing at fast pace  [15] , with a target audience of scientists that have specialized questions covering a wide range of data types and scales.
Aujourd'hui, nous aurions tout intérêt à faire dialoguer ce qui est traditionnellement séparé : la didactique du FLM, la didactique du FLS et du FLE, et ainsi à bénéficier des apports de chacune dans une perspective transversale en vue de faciliter l'accès au sens. Pour autant, la grande diversité des publics n'induit-elle pas une certaine spécificité des pratiques langagières au regard de la multiplicité des répertoires linguistiques et culturels des apprenants ? La question reste entière. 13. Le projet ALECTOR (ANR-16-CE28-0005) a été financé par l'Agence Nationale pour la Recherche (ANR), https://alectorsite. wordpress. com/ 14. https://journals. openedition. org/tipa/pdf/5763 15. http://corpusalector. huma-num. fr 16. https://lpc. univ-amu. fr/fr/hibou-livre-interactif 17. Le projet XENIOS ZEUS ( eXpanding Educational Training actIvities fOr refugeeS in Zones of apprEndship Utilising educational Structures) a été financé par le programme Erasmus+ de septembre 2016 à septembre 2018.
We examined studies for detailed and reoccurring themes regarding the stroke treatment, outcomes, and decisionmaking for patients with and without pre-existing impairments. Treatment is understood to consist of the evaluation of the patient, the immediate treatment, and post-stroke care. Authors C. C. and N. M. M. searched four databases: PUBMED, Web of Science Core Collection, Ovid Healthstar, Ovid Medliner, and EBSCO. Within EBSCO we used Academic Search Complete, CINAHL Plus with Full Text, Health Source: Nursing/Academic Edition, and Family and Society Studies Worldwide to search the literature. Our search terms were "stroke" or "cerebrovascular accident" or "cerebral vascular event" or "transient ischemic attack" AND "disability evaluation" or "dementia" or "cognitive disorders" or "cognitive dysfunction" or "intellectual disability" or "cognitive impairment" or "intellectual impairment" or "cognitive disability" or "major neurocognitive disorder" or "minor neurocognitive disorder" AND "pre-existing.
" We also ran a search in each of the databases using the above terms in addition to the terms "qualitative" or "action research" or "case study" or "content analysis" or "discourse analysis" or "ethnographic" or "focus group" or "grounded theory" or "interview" or "narrative" or "observational" or "phenomenological. " Our inclusion criteria were that articles needed to contribute to (a) an understanding of the decision process of professionals to intervene when people with disabilities have a stroke, and/or (b) how interventions provided to patients with disabilities differed from interventions offered to patients without disabilities. We assessed the difference in interventions that used a propensity score-matched analysis to share findings of the effectiveness and use of interventions for people with and without disabilities, as well as studies that solely focused on people with disabilities.
CSRT Program and Database The home-based rehabilitation took place under the guidance of the CSRT. The CSRT includes a part-time rehabilitation medicine doctor, neuropsychologist, occupational therapist, and physical activity teacher, as well as a full-time nurse coordinator. A first interview with the coordinating nurse and/or doctor allowed defining the home-based rehabilitation objectives and the implementation of the program. Several home visits were organized according to identified needs, as well as a weekly multidisciplinary meeting. The home visits were based on an individualized task-specific approach. Patients specified concrete tasks that they wished to carry out with the professional, and the personal or physical barriers that hampered their actions. Home-based rehabilitation provides services to help these individuals achieve social participation in their current living environment.
Acknowledgments. The authors thank the HRA, the departmental council ( département de la Haute-Vienne ), and IPSEN for their support for this project. We also thank the members of the  CSRT HEMIPASS of the CHU de Limoges  for their work with patients. Funding. The CSRT was financed by the  Health Regional Agency (HRA) , supplemented in part by the  departmental council (département de la Haute Vienne). The IPSEN company participated in financing the database. They funded the project, but subsequently were not involved in the various tasks of the project. There was no conflict of interest with the funder, who is totally independent. The funder did not take part in the study design, data collection, analysis, and interpretation of data and in writing the manuscript.
Remerciements Je remercie  Jean-Pierre Chrétien ,  Shane Doyle ,  Yvan Droz ,  Marie-Aude Fouéré ,  Valérie Golaz ,  Holly Hanson ,  Robinson Kisaka ,  Phillipa Luck ,  Claire Médard ,  Bastien Miraucourt  et  David Schoenbrun  pour leur aide, leurs relectures et leur patience. Ce travail a bénéficié de l'aide de l'ANR franco-suisse  SALMEA (Self-Accomplishment and Local Moralities in East Africa), de l'Institut des mondes africains (IMAF) et de l'Institut français de recherche en Afrique de Nairobi (IFRA-Nairobi ).
The form which the respective practices take incorporates and expresses ethnographic research not as a chronological, linear, and divided process between fieldwork, analysis and representation, but weaves together different dimensions in a constant movement. The ethnographic experience happens in and through creative forms, initially, and not only in writing. To conclude, while creating spaces for publications in multiple forms is a slow but positive development to be encouraged, the examples in this article also bear evidence to the heuristic value of creative forms of expressions, as they play an important part in the very production of academic knowledge, one that acknowledges the senses, subjectivity, and the body in the research process. These very practices of bringing different dimensions together have brought to the fore a key aspect of ethnographic practice: the weaving together of different elements (datasets, moments, encounters, sources) and dimensions (temporal, spatial, material, sensorial), but also the constant circular movement between research, thinking through, and representation.
Depuis 2016, la loi pour une République numérique prévoit que les bases de données et les données qui présentent un intérêt économique, social, sanitaire ou environnemental doivent être diffusées en ligne, mises à jour et « dans un standard ouvert, aisément réutilisable et exploitable par un système de traitement automatisé. » Cette exigence de lisibilité des données par les machines a été essentielle pour de nombreux acteurs qui ne souhaitaient pas seulement accéder aux chiffres. Obtenir des données exploitables par les machines avec un fort niveau de détail a permis de refaire certains calculs, de proposer de nouvelles analyses, de nouvelles formes de visualisations, de renforcer ou de contester une décision. Cet article est ainsi centré sur l'ouverture des données liées à la pandémie de Covid-19 en France et vise à documenter ce moment charnière pour le mouvement récent de l'open data.
Une pandémie instantanément mise en données Il n'est pas excessif d'afÏrmer que la pandémie a débuté par une ouverture de données. Alors que le 31 décembre 2019 les autorités de la ville de Wuhan en Chine annonçaient publiquement les signes d'une épidémie de pneumonie, le département des zoonoses du Centre chinois de contrôle et de prévention des maladies soumettait le 5 janvier 2020 le génome du virus identifié dans le marché de fruits de mer de Wuhan  4. Le 11 janvier, ces données étaient publiées sur Genbank  5  , une des plus anciennes et plus grandes bases de données en génétique au monde (Strasser, 2011). La publication du génome a donné le départ de la course internationale aux vaccins, plusieurs équipes déjà préparées à l'éventualité de l'émergence d'un nouveau virus se constituant dès le 11 janvier.
Philippe Lemoine sur Twitter, 2020. Adresse : https://twitter. com/phl43/status/1239590836947517442 21. Perez L. (2020), « Amis data scientists, avez-vous quelques minutes pour m'aider à monter un projet open data ? », LinkedIn. Adresse : https://www. linkedin. com/posts/liorperez_opendata-covid19-dataset-activity-6642013973241704448-55L2/ Statistique et Société, vol. 10, n° 2 | www. statistique-et-societe. fr © Société Française de Statistique (SFdS), Octobre/October 2022 22. Perez L. (2020), « Update README. md • lperez31/coronavirus-france-dataset@5e87cb8 », GitHub. Adresse : https://github. com/lperez31/ coronavirus-france-dataset/commit/5e87cb88abc46458639bd218254d3136e0ecc97d?short_path=b335630#diff-b335630551682c19a781afebcf 4d07bf978fb1f8ac04c6bf87428ed5106870f5 23. « Ces citoyens luttent contre le coronavirus grâce à une arme : la data », Les Echos Start.
Adresse : https://start. lesechos. fr/societe/engagementsocietal/ces-citoyens-luttent-contre-le-coronavirus-grace-a-une-arme-la-data-1191396 24. « Data Against COVID-19 / FR ». Adresse : https://opencovid19-fr. github. io/ 25. GitHub -opencovid19-fr/data : Consolidation des données de sources ofÏcielles concernant l'épidémie de COVID19. Adresse : https://github. com/ opencovid19-fr/data QUESTIONS DE SOCIÉTÉ.
Adresse : https://www. liberation. fr/checknews/sur-quoi-se-base-olivier-veran-pour-afÏrmer-que-93-des-patientscovid-admis-dans-30-grands-hopitaux-de-france-ne-sont-pas-vaccineshttps://drees-site-v2. cegedim. cloud/sources-outils-et-enquetes/les-appariements-si-vic-si-dep-et-vac-si 65. « Covid-19 : résultats par âge issus des appariements entre SI-VIC, SI-DEP et VAC-SI », 2021, DATA. DREES. Adresse : https://data. drees. solidaritessante. gouv. fr/explore/dataset/covid-19-resultats-par-age-issus-des-appariements-entre-si-vic-si-dep-et-vac-si/information/ Adresse : https://www. francetvinfo. fr/sante/maladie/coronavirus/urgence-cafouillages-mille-feuille-d-indicateurs-dans-les-coulisses-desdonnees-tres-strategiques-sur-le-covid-19_4099757. html répété à.
Méthodes et données pour l'étude de la prosodie Les premiers travaux sur la prosodie menés au LPL, comme ceux de Georges Faure dans les années 60, reposaient essentiellement sur des analyses perceptuo-auditives, le plus souvent impressionnistes. Mais très rapidement, les études menées au sein de ce laboratoire l'ont été dans un cadre expérimental et ont pris pour objet la perception de la parole et le rôle qu'y jouait la prosodie (voir partie 1 du présent article). Le développement des outils informatiques pour l'analyse du signal (années 39 L'utilisation de ces nouvelles bases de données conversationnelles a permis de développer des travaux sur de nouveaux objets d'étude spécifiques aux conversations tels que les disfluences  (Pallaud et al. , 2004 (Pallaud et al. , , 2019)) , les rires  (Bigi et al.
Cependant les mécanismes sous-jacents à l'adaptation respiratoire lors de la production de la parole, et en particulier de la prosodie, sont encore mal compris. Récemment, on observe un regain d'intérêt à l'égard d'hypothèses relativement anciennes concernant le rôle linguistique et communicatif de la respiration. En particulier, dans le passé, certains chercheurs ont supposé que les manoeuvres respiratoires pouvaient jouer un rôle majeur dans les variations prosodiques dans des fenêtres temporelles larges (ex. déclinaison de la fréquence fondamentale), ainsi que dans des fenêtres temporelles plus courtes (ex. proéminence). Cependant, un soutien empirique solide a souvent fait défaut à ces hypothèses. Les travaux de C. Petrone ont testé certaines de ces hypothèses au moyen de techniques non-invasives, qui permettent de collecter des bases de données considérables.
, 2020). AixOx est le plus grand sous-corpus d'une base de données plus large, OMPRODAT  (Hirst et al. , 2013) , où l'on trouve des productions d'apprenants de quatre langues différentes (anglais, français, coréen et chinois). Les corpus d'apprenants ont pris un essor considérable dans la recherche sur l'acquisition d'une L2. Des recherches futures envisagent la création d'un nouveau corpus d'apprenants francophones de l'anglais intégrant une multimodalité de l'expression de l'apprenant ainsi qu'une tâche d'échanges avec un natif. Ces corpus constituent une ressource précieuse pour l'analyse phonétique de l'interlangue  (Selinker 1972 ) et pour le développement de modèles d'acquisition d'une L2, comme le PAM-L2  (Best & Tyler, 2007)  et le  SLM-r (Flege & Bohn, 2020 ). Et ceci s'applique tout aussi bien pour le niveau segmental.
Les contributions des prosodistes du LPL à ces questions sont présentées dans cette deuxième partie. La troisième partie aborde les méthodes et les données dont les chercheurs doivent se doter pour mener à bien l'étude scientifique de la prosodie. Elle aborde la question des avancées technologiques (notamment en termes de détection automatique de f0, avancées auxquelles le laboratoire a notablement contribué) qui permettent la production de nouvelles données et de nouvelles observations, en particulier sur des corpus conversationnels auparavant plus difficiles d'accès. La complémentarité très contemporaine des pratiques autrefois dissociées de l'expérimentation et de l'analyse de corpus tient une place importante dans la contribution du LPL, notamment par la production de bases de données conversationnelles comme le CID, mais aussi par la constitution de nouveaux types de données prosodiques, comme celles qui accompagnent les fragments et les feedbacks, ou qui informent les phénomènes de disfluence.
(Swerts & Hirschberg, 1998)Parole et Langage : histoire, recherches actuelles. large des différents styles de parole, et plus particulièrement de la parole conversationnelle. 4. 1. Base de données conversationnelles36 Les bases de données conversationnelles désormais disponibles permettent de systématiser et de quantifier les phénomènes analysés. De nouveaux centres d'intérêt et de nouvelles pratiques ont émergé depuis deux décennies environ autour de l'étude prosodique de la parole spontanée en interaction(Swerts & Hirschberg, 1998). Il faut souligner que peu d'études ont été menées sur la prosodie de l'interaction jusqu'à cette période faute de données disponibles et exploitables. En effet, l'étude de la prosodie requiert une qualité audio optimale. À ce jour encore, seul un enregistrement de chaque locuteur sur piste séparée permet de traiter exhaustivement sa parole (les logiciels existants ne permettant pas de démêler les voix durant les chevauchements de parole) ou encore de ne pas passer à côté de phénomènes produits à une intensité très faible comme certains feedbacks.
2. Nouvelles méthodes et nouveaux objets d'étude : développement et systématisation 38 Soulignons que les diverses étapes de pré-traitement des données ont été testées et validées et sont désormais systématiquement effectuées pour tout nouveau corpus. Différents outils, créés ou améliorés (au niveau morphosyntaxique comme Marsatag 8 (voir fiche technique) par exemple, au niveau mimo-gestuel (HMAD 9 , voir fiche technique) ou encore en prosodie (MOMEL 10 , INTSINT 11 , voir fiches techniques 80-90) et respectives) permettent une exploitation beaucoup plus rapide et systématique d'un celui des bases de données importantes et mutualisées (années 2000 et suivantes) ont nombre de données de plus en plus conséquent. permis de modifier les pratiques de recherches en donnant un nouveau souffle à l'expérimentation tant en production (analyse acoustique) qu'en perception (basée sur (Bertrand et al.
, 2008 ;Blache et al. , 2017) ;PallPrévot et al. 2021)) de participants et à une quantité plus grande de données. Ce changement d'échelle a TIPA. Travaux interdisciplinaires sur la parole et le langage, 38 | 2022 favorisé une exploration L'émergence de bases de données conversationnelles est le reflet d'un changement non seulement dans les intérêts de recherche des uns et des autres mais également l'occasion d'un changement de pratiques radical. Enfin, l'engouement depuis les années 2000 pour le dialogue ou la conversation a consacré aussi l'étude des liens entre les différents niveaux linguistiques (dépassant celui de la syntaxe et de la prosodie), tout en favorisant une analyse très minutieuse au sein de chaque niveau, ce qui semble un point très important à souligner. A titre d'exemple, les disfluences, phénomènes propres à la parole spontanée(Pallaud et al.
Il est égale- mais réalisant une formation spécialisée transversale en onco- Oui ment important de mentionner que pour les 531 étudiants 33 57 % 25 43 % Délais entre ECN et thèse Médiane [Min-Max] affectés à l'oncologie médicale entre 2010 et 2015, seulement 5,9 [3,9-7,9] 4,9 [2,9-6,9] 0,002 185 travaux de thèse ont été identifiés par le croisement des données CGN avec la base de données SUDOC soulignant qu'il y a [14]e)[14]. Le souhait d'exercice futur le plus exprimé par les internes était en centre de lutte contre le cancer (CLCC) (60,5 %), suivi par les établissements privés (50,8 %), par les Centres encore niveau d'IF où 71 % des projets publiés dans des journaux à fort impact étaient prospectifs. D'après le sondage GERCOR-AERIO, seulement 17,8 % des internes considéraient comme inutile la valorisation de leur travail de thèse par une publication, soit un potentiel de 82,2 % des étudiants intéressés par la publication de leurs travaux.
Ainsi, la transition qui va de la fin de 8, 839 à 841 comporte de nombreuses marques de la première personne : ego signorum duodecim nomina Guelf. 132 Gud. lat. , qui ne transmet que des extraits des livres II et VIII : ces deux manuscrits se rattachent en effet également à cet état ancien du texte. 64. Préaux, 1966, p. 142-144 ; voir aussi Préaux, 1978, p. 110-113. 65. D'après nos estimations (obtenues grâce à une base de données en cours d'élaboration qui intègre les manuscrits de C. Leonardi et les rares qui ont été découverts depuis), 106 manuscrits conservés transmettent ces deux paragraphes. Notre étude est donc loin d'être exhaustive, mais elle intègre l'essentiel des manuscrits du IX e au XI e siècle. Par cette étude, nous espérions établir des rapprochements textuels plus nets, ce qui n'a malheureusement pas été possible de manière déterminante.
Ré-usages politiques : la tentation du risque L'usage à des fins politiques des données collectées lors d'une démarche de consultation ou pour la réalisation d'un service public constitue le premier risque de détournement des données personnelles. Il est tentant pour des candidats ou des personnalités politiques en quête de notoriété de réutiliser des bases de données qualifiées de personnes dont on sait qu'elles sont engagées dans la vie citoyenne, qui vont aller voter et qui encourageront probablement leurs proches à se rendre aux urnes. La réutilisation à des fins électorales par des acteurs politiques est l'un des écueils pour ces technologies, dès lors qu'elles sont portées et/ou commanditées par ces mêmes acteurs politiques. L'actualité fournit de nombreuses illustrations de tels détournements à des fins politiques.
À la rentrée 2018, un président de Région utilise une base de données de lycéens pour leur souhaiter par SMS une « excellente rentrée », ce qui a déclenché des plaintes à la CNIL donnant notamment lieu à un rappel des règles à respecter. En septembre 2019, l'autorité de protection des données britannique, la ICO (Information Commissioners's Office), s'inquiète de la possible utilisation par le Premier Ministre Boris Johnson des données collectées par les sites en. gov. uk 36. Plus tôt, il aurait demandé au Conseil des ministres de centraliser les données d'utilisation du site pour envoyer de l'information ciblée à ses utilisateurs en vue du Brexit. Au Venezuela en 2004, le gouvernement publie la liste de signataires de la pétition en faveur de l'organisation d'un référendum révocatoire d'Hugo Chavez, la liste Tascón, du nom du député chaviste qui l'a faite circuler.
De l'analyse automatisée à la délégation des choix politiques ? Des outils d'analyse sémantique, éventuellement associés à des systèmes de machine learning, peuvent être utilisés pour faire émerger et hiérarchiser les demandes citoyennes dans de larges bases de données. Ce fut le cas pour le Grand Débat et les 569 020 propositions ouvertes qui ont été postées sur la plateforme. Un tel type de traitement automatisé, sans relecture « humaine » des contenus, doit cependant tenir compte d'un certain nombre de risques. En effet, l'intégration en amont d'une liste de mots-clés risque selon Clément Mabi de concentrer l'étude sur des points précis et de « rendre secondaire l'analyse du message de la contribution par rapport à ces objectifs sémantiques » 56. Cela conduit à isoler les thématiques de l'argumentation mobilisée dans la contribution.
59 https://github. com/fm89/granddebat 60 Le guide CNIL à destination des collectivités « Concilier ouverture des données et protection des données personnelles » présente les principales règles de publication ouverte des données. https://www. cnil. fr/fr/les-collectivites-territoriales-et-lopen-data-concilier-ouverture-des-donnees-et-protection-des 61 https://giletsjaunes.