dataesr/scientific-paragraphs-categorization huggingface dataset:
(C) Distributions of the distance separating the double bands observed in cells of type a and c in (A) and (B) (R800, n(a) = 194 and n(c) = 72 cells; D39 Dcps , n(a) = 125 and n(c) = 56 cells). (D) Distributions of the longitudinal width of the double bands observed in cells of type a, b2, and c in (A) and (B) (R800, n(a) = 194, n(b2) = 101, and n(c) = 72 cells; D39 Dcps , n(a) = 125, n(b2) = 26, and n(c) = 56 cells). (C and D) Data are represented with boxplots showing the interquartile range (10 th and 90 th percentile), the median value, and whiskers for minimum and maximum values. p values from the U test of Mann-Whitney between different datasets are indicated with triple or quadruple asterisks when the observed differences are statistically significant with p < 0. 001 or p < 0. 0001, respectively.
Turbidimetric titration using Light Scattering (LS) and ζ-potential To avoid sedimentation, we have repeated the turbidimetric titration experiment on selected samples using the automatic titration unit MPT-2 of a Malvern Zetasizer Nano ZS90 employed using an energy of E= 12 keV and a fixed sample-to-detector (Eiger X 4M) distance of 1. 995 m. For all experiments: the q-range is calibrated to be contained between ~5. 10 -3 < q/Å -1 < ~4. 5. 10 -1 ; raw data collected on the 2D detector are integrated azimuthally using the inhouse software provided at the beamline and so to obtain the typical scattered intensity I(q) profile, with q being the wavevector (𝑞 = 4𝜋 sin 𝜃 𝜆 ⁄ , where 2θ is the scattering angle and λ is the wavelength). Defective pixels and beam stop shadow are systematically masked before azimuthal integration.
Absolute intensity units are determined by measuring the scattering signal of water (Iq=0= 0. 0163 cm -1 ). SAXS profiles are treated with SasView software, version 3. 1. 2, available at the developer's website (sasview. org). The same sample experimental setup is employed on both beamlines: the sample solution (V= 1 mL) with the lipid and PEC at their final concentration and pH ~11 is contained in an external beaker under stirring at room temperature (T= 23 ± 2°C). The solution is continuously flushed through a 1 mm glass capillary using an external peristaltic pump. The pH of the solution in the beaker is changed using an interfaced push syringe, injecting microliter amounts of a 0. 5 M HCl solution. pH is measured using a micro electrode (Mettler-Toledo) and the value of pH is monitored live and manually recorded from the control room via a network camera pointing at the pH-meter located next to the beaker in the experimental hutch.
Cryogenic transmission electron microscopy (cryo-TEM) Cryo-TEM experiments are carried out on an FEI Tecnai 120 twin microscope operated at 120 kV and equipped with a Gatan Orius CCD numeric camera. The sample holder is a Gatan Cryoholder (Gatan 626DH, Gatan). Digital Micrograph software is used for image acquisition. Cryofixation is done using a homemade cryofixation device. The solutions are deposited on a glow-discharged holet carbon coated TEM copper grid (Quantifoil R2/2, Germany). Excess solution is removed and the grid is immediately plunged into liquid ethane at -180°C before transferring them into liquid nitrogen. All grids are kept at liquid nitrogen temperature throughout all experimentation. Cryo-TEM images have been treated and analyzed using Fiji software, available free of charge at the developer's website.
Isothermal Titration Calorimetry (ITC) ITC experiments were performed using a TAM III isothermal calorimeter from TA The data was fitted with a multi site model using NanoAnalyse data analysis software (TA Instruments) in order to determine the thermodynamic as well as the reaction parameters of the interaction between PLL and G-C18:1. From the enthalpy (∆𝐻) and the binding constant (𝐾 𝑎 ) of the reaction, the entropy (∆𝑆) and the Gibbs free energy (∆𝐺) of reaction were calculated using the following equation: ∆𝐺 = ∆𝐻 -𝑇∆𝑆 = -𝑅𝑇𝑙𝑛(𝐾 𝑎 ).
Acknowledgements Diamond synchrotron radiation facility (U. K. ) is acknowledged for accessing to the B21 beamline and financial support (proposal N° 23247). Ghazi Ben Messaoud  ( DWI-Leibniz Institute for Interactive Materials, Aachen, Germany ) is kindly acknowledged for helpful discussions. We thank  Dr. S. Roelants ,  Prof. W. Soetaert  and  Prof. C. V. Stevens  at  Gent University  for providing us the glycolipids. We thank  P. Dhasaiyan  ( Institute for Basic Science Center for Self Assembly and Complexity, Gyeongsangbuk- do,  South Korea ) for helpful suggestions. This work benefited from the use of the SasView application, originally developed under  NSF  award  DMR-0520547. SasView containscode developedwith funding from the  European Union 's  Horizon 2020 research and innovation program  under the  SINE2020project , grant agreement No.
Remerciements Les résultats regroupés dans cet article sont issus des projets  ACI Masse de données MEGATOR  ( 2004MEGATOR ( -2007 ) ) http ://www. megator. fr, ANR Masse de données et connaissances EFIDIR  ( 2008-2012 ) http ://www. efidir. fret  CNES-TOSCA CESTENG  ( 2013-2015 ). Les auteurs souhaitent remercier  Philippe Bolon ,  Flavien Vernier  et  Blaise Girard  (LISTIC),  Laurent Ott  (GIPSA-lab),  Laurent Ferro-Famil (IETR) , ainsi qu' Andréa Walpersdorf  et  Jean-Louis Mugnier  (ISTerre),  Luc Moreau  (EDYTEM),  Etienne Berthier  (LEGOS) et  Noel Gourmelen  ( School of Geosciences, Edinburgh ) pour leur collaboration et leur analyse de ces résultats. Ils remercient également l'agence spatiale européenne (ESA) pour les images ERS (projet Cat. 1 3525) et l'agence spatiale allemande (DLR) pour les données TerraSAR-X et TanDEM-X (projets MTH0232 et  GLAC0874 ).
Fonctions 2 (développement des connaissances) et 3 (échange de connaissances). Ces deux fonctions sont également essentielles. Elles sont spécifiquement ciblées par plusieurs mesures du deuxième pilier et le PEI-AGRI. Le succès de ce dernier est inégal selon les pays (régions). Le développement et l'échange de connaissances sont réels à l'intérieur des groupes opérationnels du PEI-AGRI, mais diffusent trop peu au-delà. Une cartographie exhaustive des thématiques expérimentées dans le cadre des groupes opérationnels et des réseaux thématiques serait utile. Cela permettrait de s'assurer que les thèmes couvrent bien les différents domaines d'innovation prioritaires, plus spécifiquement ceux qui ciblent des biens publics. Par ailleurs, il serait utile de développer une base de données et un cadre d'analyse et de modélisation.
8. Les autres sources citées sont le cadastre (au « faible degré de fiabilité »), l'Inventaire forestier national et les données d'Agreste issues de son enquête Teruti-Lucas. 9. Paul Arnould et al. (1988) avaient retenu le cadastre comme « source principale de données » mais en reconnaissant « l'imprécision des chiffres ». 10. Base de données inventoriant les formations végétales. 11. https://www. natura2000. fr/natura-2000/modalites-gestion. 12. Dans le camp des opposants aussi, le « rejet [est] beaucoup plus "viscérale" […] [qu']objectif ».
8. Les autres sources citées sont le cadastre (au « faible degré de fiabilité »), l'Inventaire forestier national et les données d'Agreste issues de son enquête Teruti-Lucas. 9. Paul Arnould et al. (1988) avaient retenu le cadastre comme « source principale de données » mais en reconnaissant « l'imprécision des chiffres ». 10. Base de données inventoriant les formations végétales. 11. https://www. natura2000. fr/natura-2000/modalites-gestion. 12. Dans le camp des opposants aussi, le « rejet [est] beaucoup plus "viscérale" […] [qu']objectif » Le peuplier, un arbre qui cache la forêt ? Le peuplier, un arbre qui cache la forêt ? Conclusion 26 Projets de paysage, 22 | 2020 Projets de paysage, 22 | 2020.
Le terme de friche est donc défini en creux, comme l'absence d'une autre forme d'usage du sol et est, de ce fait, absent des bases de données d'occupation du sol et des statistiques agricoles. Ce manque peut être expliqué par les caractéristiques intrinsèques des friches. Elles couvrent généralement des parcelles de petites superficies, sont morcelées dans le paysage et présentent divers faciès. Elles sont ainsi difficiles à référencer et catégoriser  (Arlaud, 1994). Les friches jouent cependant un rôle majeur pour le territoire et son devenir, dans la mesure où elles peuvent laisser place à toute nouvelle forme d'utilisation du sol. Vient donc s'ajouter la difficulté à prévoir leur état futur  (Houzard, 1994) , la parcelle en friche peut poursuivre sa dynamique de boisement spontané selon l'auto-organisation des dynamiques végétales, être l'objet de formes de remobilisations ou encore d'une rétention foncière.
La cartographie des modes d'occupation du sol a été réalisée au 1 : 5000 afin de pouvoir identifier avec certitude les parcelles en friche qui sont de faible superficie et peuvent présenter différentes formes. Pour diminuer le biais induit par l'observateur dans la quantification des friches, l'étude des images satellites du passé est venue appuyer ce (Le Guen, 2019 ;Pic, 2019)arcelle, le couplage des photographies aériennes (Orthophotographies haute résolution) de 2017 et du parcellaire cadastral de l'Institut national de l'information géographique et forestière (IGN) -défini comme maille de référence -a été privilégié. Un mode d'occupation du sol a été attribué à chaque parcelle sous SIG(Le Guen, 2019 ;Pic, 2019). Puis l'ensemble des parcelles correspondant au mode d'occupation du sol « friche » ont été extraites, de façon à construire une base de données aussi complète que possible des friches.
travail. Les photographies aériennes ont été confrontées aux images d'archive Google Earth disponibles depuis 2007, permettant d'identifier la vocation viticole initiale de la La dynamique d'enfrichement, ses expressions paysagères et ses significations. VertigO -la revue électronique en sciences de l'environnement, Volume 20 numéro 2 | octobre 2020 parcelle en fricheCaractériser la diversité des friches par observation paysagèreEntre avril et mai 2019, des observations de terrain ont permis de caractériser les friches dans l'optique de la construction d'une typologie à l'échelle de la parcelle. Toutes les friches recensées ne pouvant être caractérisées, un échantillonnage aléatoire a été privilégié, en veillant à regrouper un maximum de formes et de contextes d'enfrichement différents. Une douzaine de friches a été sélectionnée pour chaque bassin versant à partir de la base de données d'occupation du sol (2017) issue du travail de photo-interprétation.
Le dossier rejoint la pile des « à traiter » qu'Étienne saisira ensuite dans une base de données qu'il a lui-même configurée et qui regroupe tous les points de chaque visite. Ces données informent le reste de la régie de l'état des ouvrages et permettent de prioriser les interventions tout au long de l'année. Au-delà de leurs spécificités, ces deux scènes partagent plusieurs traits importants. Elles donnent à voir des séquences d'inspection, communes à la plupart des activités de maintenance, qui consistent pour les agents à s'assurer que « tout va bien » et dans le cas contraire, à recenser ce qui est appelé dans le vocabulaire de la maintenance professionnelle les « désordres ». Ces séquences sont rattachées à des documents variés (lois, normes, contrats, guides…) qui en définissent certains aspects.
Jonathan Lenglet et Sylvain Caurla Les auteurs remercient les deux relecteurs anonymes pour leurs suggestions avisées et leur contribution à l'amélioration de cet article. Ce travail a reçu le soutien financier du Labex Arbre (Advanced Research on the Biology of Tree and Forest EcosystemsANR-11-LABX-0002-01) à travers le projet SATIsFor (Characterize and support sustainable adaptations in territorial forestry systems). 1 La forêt et le bois sont au centre d'une actualité politique et sociale qui ravive les intérêts et les enjeux portés par un secteur où les injonctions de durabilité sont souvent voisines des notions prônées d'écologie et de développement territorial. Le programme national de la forêt et du bois (PNFB) lancé par le ministère de l'Agriculture en 2016 affirme par exemple que la politique forestière se doit de laisser « d'importantes marges de manoeuvre aux territoires » tout en soulignant l'articulation nécessaire avec les enjeux nationaux et les engagements de la France sur le plan environnemental.
2. Une nouvelle génération de CFT tournée vers un développement local et durable ? Le cas du pays d'Épinal (Vosges) permettant de valoriser la ressource locale sans toutefois contrevenir à la réglementation encadrant 24 Face à ce constat et dotées de nouveaux outils, certaines collectivités choisissent les appels d'offres dans le cadre des marchés publics. L'enjeu pour les collectivités est d'intégrer la filière forêt-bois comme véritable outil de développement du territoire. ainsi de territorialiser l'usage du produit (y compris sa transformation), seul paramètre C'est notamment le cas du Pays d'Épinal Coeur des Vosges, situé en région Grand-Est, sur lequel elles ont la main grâce notamment à la commande publique. Dans les faits, que nous présentons ici. Les exemples s'appuient sur les données collectées et les les conséquences sont doubles et permettent d'une part de contrarier les flux entretiens réalisés dans le cadre du projet SATiSFor (Programme Investissement nationalisants en redonnant de la capacité d'action et du sens à l'échelle locale d'avenir de l'ANR (n° ANR-11-LABX-0002-01), Laboratoire d'excellence ARBRE) de 2017 (notamment pour permettre ou favoriser l'ancrage des activités), d'autre part d'afficher une ambition écologique par l'utilisation de matériaux renouvelables à 2019 auprès de 44 acteurs de la filière forêt-bois du nord-est de la France.
Subject area Biology More specific subject area Transcriptomic data Type of data Drought stress is an important issue related to crop adaptation to climate change and sunflower is particularly impacted as it is grown mainly in marginal lands  (Debaeke et al. , 2017). In this experiment, plants were subjected during the vegetative stage to two treatments (Well-Watered or Water-Deficit) managed on the outdoor high-throughput phenotyping platform Heliaphen. Heterosis is the most outstanding phenomenon used by natural selection and mankind to adapt plants to environmental constraints. Twenty-four genotypes of cultivated sunflower comprising four maintainer lines, four restorer lines and their 16 corresponding hybrids are included in this experiment and allow the study of heterosis. This dataset provides transcriptomic data of sunflower leaves under water deficit.
(2019). Soil water evaporation was estimated according to  Marchand et al. (2013). Both WW and WD plants were weighed three or four times per day by the Heliaphen robot to estimate transpiration  (Gosseau et al. , 2019). WW plants were re-watered at each weighing by the robot to reach soil water full retention capacity. Pairs of WD and WW plants were harvested when the Fraction of Transpirable Soil Water (FTSW) of the stressed plant reached 0. 1 (occurring between the 42 and the 47 DAG). Two out of three SF342 plants died under control condition. Plant samples could not be harvested and data could not be obtained. At harvest, leaves for molecular analysis were cut without their petiole and immediately frozen in liquid nitrogen from 11 a. m. to 1 p. m. On sunflower, the mature leaf developmental stage corresponds to a dark green leaf, assumed to be experiencing its highest photosynthetic rate and having recently reached its maximum size  (Andrianasolo et al.
Given the high amount of samples (140) and the high amount of lowly expressed genes, normality could not be achieved. The set of parameters that were deemed to have the best balance between normality was where genes were considered expressed if there were at least three libraries with at least three CPM. Thirty thousand eight hundred and thirty-one genes were found with at least three CPM in three libraries. Normalization by the method of trimmed mean of M-values (TMM) was performed using the calcNormFactors function of edgeR package as in the user guide. Table  1  describes the library sizes and number of genes studied before and after filtering. 5 Data records.
DISPOSITIF GLOBAL DE PRÉVENTION L' ensemble de ces observations programmées positives et négatives est compilé dans une base de données permettant de les tracer et de les présenter sous forme spatiale ou temporelle. Ces données permettent également d'établir des modèles de dispersion du risque qui sont très utiles pour anticiper la progression probable de ces organismes et pour orienter les choix d'essences en région dans le cadred uc hangement climatique tout en tenant compte du risque biotique (exemple du pathosystème Pinl aricio/maladie des bandes rouges, figure3 ,p. 127).
Par exemple, si la surveillance en forêt est bien organisée avec des bases de données produites accessibles, il n'en est pas encored emême en milieu urbain ou périurbain. Desa ctions innovantes visant àu ne détection précoce de ces éventuelles introductions sont mises en oeuvrep ar les organismes de recherche. Un récent projet associant acteurs de la recherche (INRAE, ANSES) et de la surveillance (DSF) am ontré qu'il est possible de détecter des agents pathogènes àd issémination aérienne via le réseau de capteurs volumétriques de type HIRST du RNSA, le Réseau national de surveillance aérobiologique  (Aguayo et al. , 2020)  les BioaGresseurs inVasiFs Dans les ForÊts FranÇaises :P assÉ, PrÉsenteta Venir (résumé) Les bioagresseurs invasifs affectent lourdement les forêts françaises depuis la fin du XIX e siècle et le phénomène s'accélèrec es dernières années.
Acknowledgments The illustrations come from field work in Mali and Niger funded by  ILRI  ( International Livestock Research Institute, Nairobi, Kenya). More recent data collection was funded by  AMMA-CATCH Observatory  (www. amma-catch. org). The results on the carbon balance of pastoral livestock in Senegal were obtained by  SELMET (Tropical and Mediterranean Animal Production Systems) research unit of CIRAD (French Agricultural Research Centre for International Development)  and  PPZS (Project Pastoralism in Arid Lands, Dakar, Senegal ).
Encadré 5. Prévoir d'alimenter des bases de données robustes dans le temps. Comme pour beaucoup de cultures pérennes, les données acquises dans les plantations de palmier à huile sont examinées en regroupant plusieurs années de mesure, jusqu'à une décennie et en combinant plusieurs variables disponibles à des échelles différentes (exemple : rendements à la parcelle, analyses foliaires par unité de fertilisation et analyses chimiques par unités de sol). Sur des pas de temps longs, la structure de la plantation subira des changements en particulier lors des replantations. L'organisation des données doit permettre de pouvoir les analyser rapidement sans risques, ce qui signifie que chaque objet permettant l'acquisition d'une valeur à un moment donné doit être identifié de façon unique et ses propriétés doivent être décrites (métadonnées).
C'est le cas des unités de fertilisation, immatriculées par un numéro unique et décrite par la liste des palmiers des parcelles qui servent à prélever l'échantillon de l'unité de fertilisation. Avec cette information, on pourra examiner les relations entre les teneurs foliaires et d'autres variables collectées à l'échelle de la parcelle comme le rendement, le matériel végétal etc. Ces informations doivent être centralisées dans une base de données et partagées pour pouvoir résister au renouvellement du personnel qui collecte et analyse les données.
Les variations interannuelles de rendements sont connues et elles induisent probablement des flux d'éléments qui se répercutent sur les teneurs foliaires. Il faut donc interpréter les brusques variations que l'on observe certaines années avec beaucoup de prudence. À l'avenir, le diagnostic foliaire devra évoluer vers un outil qui tienne compte de ces variations interannuelles. Il devra intégrer les variables que l'on utilise pour les modèles de prédiction de rendement et l'absorption des éléments. Ce sont principalement les variables qui agissent sur l'activité photosynthétique (données climatiques et réserves en eau des sols). L'évolution vers un outil générique à plusieurs variables devra s'appuyer sur des bases de données robustes (données météorologiques, productivité mensuelle par unité de fertilisation, rapports d'épandage d'engrais, propriétés des sols des unités de fertilisation) pour tester des hypothèses qui permettent d'accéder à la compréhension de la nutrition minérale en tant que facteur de rendement.
Remerciements Nous voulons remercier ici  Cécile Fovet-Rabot sans qui ce livre n'aurait pas existé, sa lecture critique des premières versions et les suggestions ont permis d'améliorer l'agencement de cet ouvrage et sa lisibilité. Un grand merci aussi à Bruno Rapidel et Alain Rival pour leur soutien sans réserve et le temps qu 'ils ont consacré à la relecture attentive du manuscrit. Nous remercions également l' UPR systèmes de pérennes et la délégation à l'information scientifique et technique du Cirad pour leur soutien financier à la réalisation de cet ouvrage. Lors  de la mise en place d'un essai, il ne faudra pas négliger l'étiquetage des arbres et l'identification des traitements à appliquer sur chaque parcelle expérimentale. Il conviendra d'organiser précisément la collecte et l'enregistrement des données pour assurer leur conservation sur toutes les années où durera l'essai.
Remerciements Noust enons àr emercier lesé tudiants ayant participé àc etteé tude :M ohamedA loui,  Tojo Ravoajanahary  et  Caroline Jaozandry , étudiantee té tudiants de la spécialité«BoisF orêt Développement durable»(BFD)d um aster«Agrosciences,e nvironnement, territoires,p aysage, forêt»(AETPF ;U niversitéd eL orraine et AgroParisTech, Nancy), ainsiq ue lese nseignants ayant contribuéàl 'encadrement et au déroulé dec et ravail collectif :P hilippe  Durand et Yves Ehrhart (AgroParisTech) ,  Tim Burzlaff  ( Albert-Ludwigs-Universität Freiburg,C hair of Forest Entomologya nd Forest Protection ) et  Thomas Fillbrandt (Albert-Ludwigs-Universität Freiburg ,C hair of Forest Operations). N ousa dressons égalementn os remerciements aux acteurs de la filièref orêt-boisp ourl eurp articipation aux entretiens et leura ccueil surs ite; aux gestionnaires du centre AgroParisTechd eN ancy pour l'aide dans l'organisation de la phased et errain et de la restitution orale desr ésultats de notre étudef in janvier 2020 ;àl ' INRAE  et àl 'équiped up rojetE xtraFor_Est pourn ousa voir associé àl eurc olloque pouru ne restitution de nosr ésultats ;e tàl'ONF pourl es outienf inancier accordét ousl es ans àl 'unitéd 'enseignement «Projetd ef ilièref orêt-bois».
dans le cadre du service d'observation «OI 2 » (Observatoire InSAR de l'Océan Indien) de l'Observatoire de Physique du Globe de Clermont-Ferrand. En exploitant les données SAR acquises en bande C par les satellites canadiens RADARSAT-1 et RADARSAT-2, les satellites européens ENVISAT et Sentinel-1, en bande X par les satellites allemands TerraSAR-X et Tandem-X et les satellites italiens de la constellation Cosmo-Skymed et en bande L par les satellites japonais ALOS et ALOS-2, OI 2 a pu imager les déplacements du sol produits par plus de 40 éruptions. Ce service d'observation a été labellisé en 2010 comme composante du Service National des Observations en Volcanologie de l'INSU. Les données et les interférogrammes produits dans son cadre sont intégrés dans une base de données dédiée accessible via un DATA HUB (https://wwwobs.