|-
|Azocina
|
|Otonecina
|-
|Azacicloalcanos
|
|Motuporaminas, macrociclolactamas, Keramafidina C
|-
|7-azabiciclo[2.2.1]heptano
|
|Epibatidina
|-
|Tropano
|
| Atropina, escopolamina, hiosciamina, cocaína, ecgonina, calisteginas
|-
|9-Azabiciclo[3.3.1]nonano
|
|Pseudopeletierina, eufococcinina
|-
|Pirrolizidina
|
|Necinas: Retronecina, heliotridina, laburnina, indicina, lindelofina, sarracina, platifilina, tricodesmina, falenopsina, licopsamina, creatonotinas, calimorfina, supidina, rosmarinecina, danaiona, traquelantamidina, hastanecina, crotanecina, platinecina, turneforcidina, ipangulinas, minalobinas, pirrolamas,
|-
|Indolizidina
|
| Swainsonina, castanospermina, pumiliotoxinas, la lentiginosina, las poligonatinas, monomorina, eslaframina, serratinina.
|-
|Indol
|
|Ciclo-DOPA, oleraceínas, auxinas, glucobrassinina, escatol, triptamina, serotonina, aeruginascina, indol, indoxilo, isatina, camalexina, 5-(3’-metilbuten-2’-il)isatina, ascorbígenos, melosatinas, hipaforina, bufotenina, beocistina, plakohipaforinas, bromoindoles, indolmicina, Sinalexina, Convolutindol A, Petromindol, Brasilidinas, Dilemaonas, 5-MeO-DMT, 5,6-hidroxiindol, mesembrina, ésteres del triptofol, 1-(2-metilbut-3-en-2-il)-1H-indol-3-carboxilato de metilo, 1-(3,4-dihidroxi-2-metilbutan-2-il)-1H-indol-3-carboxilato de metilo, homolicorina, birnbauminas, cinereapirroles, fragilamida, martensinas, urdamicina D, violaceína, Convolutindol A.
|-
|Isoindol
|
|Citocalasinas, quetoglobosinas, cespitulactamas, hericerina, estereninas, clitocibinas.
|-
|Benzotiazol
|
|Luciferina
|-
|Benzoxazol
|
|Nakijinol, pseudopteroxazoles
|-
|Indazol
|
|Nigelidina, nigelicina, nigeglanina
|-
|Pirrolo[3,2-b]piridina
|
|Laccarina, agrocibenina, cortamidinas
|-
|Pirrolo[1,2-a]pirazina
|
|Vercapamida A
|-
|Imidazo[1,2-a]pirazina
|
|Coelenteracina, vargulina
|-
|Quinolina
|
|'Hidroquinolinas: Mirionina, tortuosamina
'Quinolinas: Ácido xanturénico, ácido quinurénico, 2-quinolinamina, quinolina, ácido quináldico, ácido cinconínico, lepidina, 4,8-Quinolinodiol, 2-quinolinametanotiol, 2-quinolinametanol, 4-quinolinametanol, 2,3,4,7,8-quinolinapentol, 2,3,4,7-quinolinatetrol, 2,3,4,8-quinolinatetrol, 2,4,6,8-quinolinatetrol, 2,4,7,8-quinolinatetrol, 3,4,5,8-quinolinatetrol, 2,3,4-quinolinatriol, 2,4,6-quinolinatriol, 2,4,8-quinolinatriol, 4,7,8-quinolinotriol, 2-quinolinol, 3-quinolinol, 4-quinolinol, 2(1H)-quinolinona, 4(1H)-quinolinona, viridicatina, cusparina, evocarpina, equinopsina, crispina E, dictamnina, fagarina, esterculinina.
|-
|Isoquinolina
|
|Tetrahidroisoquinolinas: canadalina, filocriptina, filocriptonina, velucriptina, ceratonicina, Policarpina (Isoquinolina), anocherinas, macrostomina, arenina, compostelina, sarcocapninas, la gouregina, aristoyagonina, aristocularinas, cularina, secocularinas, noyaína, quetaminas, hidrastina, autumnalina, pisopowetina, pisopowiaridina, dauricina, vanuatina, malekulatina, ambrinina, neferina, rodiasina, tiliacorina, berbamina, oxiacantina, talicberanos, talidasanos, talmanos, tubocuraranos trilobina, repandulina, auroramina, pennsylpavina, baluchistanamina, epiberbivaldina, cancentrina, punjabina, gilgitina, talcamina, jhelumina, chenabina, karakoramina, ipecósido, korupensaminas, michelamina, habropetalinas, dioncofilina, liensinina, bicuculinina, talifarapina, pakistanamina.
Isoquinolinas: Isoquinolina, salsolina, lofocerina, coridaldina, oxihidrastinina, ancistrocladinas, papaverina, laudanosina, sendaverina, papaveraldina, carcrisina B, fusarimida, cassiarinas, monascorubramina, fredericamicinas A y B, lagunamicina.
|-
|Quinolizidina
|
|Lupinina, nufaridina, nufarolutina, nufacristina, nufarpumilaminas.
|-
|quinazolina
|
|Febrifuguina, glicorina, arborina, glicosminina, glicoscimina, glicofimolina, glomerina, homoglomerina, equinozolinona, tetrodotoxina, 2-acetilquinazolin-4(3H)-ona, 7-bromoquinazolino-2,4-diona, 7-hidroxiequinozolinona, dictioquinazoles.
|-
|Quinoxalina
|
| Baimantuoluoamida B
|-
|3H-Pirrolo[1,2-a]azepina
|
|Estemoadina
|-
|3H-3-benzazepina
|
|Roeadina, papaverrubinas
|-
|2,7-Naftiridina
|
|Lofocladinas
|-
|Purina
|
|Xantosina, adenina, guanina, cordicepina, eritadeninas, nebularina, citoquininas, cafeína, teofilina, teobromina.
|-
|Pteridina
|
|Biopterinas, leucopterina, xantopterina
|-
|Pirimido[5,4-e][1,2,4]triazina
|
|Reumitsina, toxoflavina.
|-
|Pirazolo[4,3-e][1,2,4]triazina
|
|Fluvioles
|-
|Carbazol
|
|3-Metilcarbazol, 3-Formilcarbazol, Ácido 3-carbazolcarboxílico, 1-Hidroxi-3-metilcarbazol, clausinas, murrayafolinas, koenolina, murrayanina, ácido mukoénico, mukonina, 2-hidroxi-3-metilcarbazol, mukonal, mukonidina, 2-metoxi-3-metilcarbazol, glicosinina, heptafilina., currayanina, exozolina, carquinostatinas
|-
|Acridina
|
|Rutacridona, melicopidina, Xantevodina, eskimianina.
|-
|Fenazina
|
|Piocianina, aeruginosinas.
|-
|Fenoxazina
|
| Cinabarina, ácido cinabarínico, tramesanguina, polistictina, fenoxazona, α-aminofenoxazona, orceínas, picnoporina.
|-
|Benzo[g]isoquinolina
|
|Tolipocladina
|-
|Benzo[g]quinolina
|
|Cleistofolina
|-
|4H-1,4-benzoxazina
|
|DIMBOA
|-
|Quinuclidina
| 
| Quinina quinidina cinconina, cinchonidina.
|-
|1,2-Dihidroespiro[indol-3,3'-pirrolidina]
|
|Coerulescina, Horsfilina
|-
|β-Carbolina
|
|Harmano, harmina, harmalina, eleagnina, cecilina, tripargimina, bruneínas, flazina, flazinamida.
|-
|Benzo[g]pteridina
|
|Lumazina, Limicromo, isoaloxazinas, roseoflavina
|-
|7H-dibenzo[d,f]azonina
|
|Protostefanina
|-
|Benzo[h]isoquinolina
|
|Chiloenina, santiagonamina
|-
|Fenantridina
|
|Crinina
|-
|Benzo[c]cinolina
|
|Necatorina
|-
|Pirido[1,2-a]indol
|
|Gliotoxina, dioxopirazinoindoles
|-
|Pirido[2,1,6-de]quinolizina
|
|Coccinelina, mirrina, precoccinelina, hipodamina, convergina, poranterina, porantelidina, porantericina, propileína
|-
|11bH-pirido[2,1-a]isoquinolina
|
|Emetina
|-
|Pirrolo [2,1-a]isoquinolina
|
|Lamelarinas
|-
|Pirrolo[4,3,2-de]quinolina
|
|Micearubinas, makaluvaminas, damirona C, hematopodinas.
|-
|2H-1,8,8b-Triazaacenaftileno
|
|Cilindrospermopsina y sus derivados.
|-
|5H-5,6,8b-Triazaacenaftileno
|
|Ptilomicalinas, batzeladinas, cambrescidinas.
|-
|9aH-5,8-diazabenzo[cd]azuleno
|
|Aaptosamina
|-
|4H-benzo[de][1,6]-naftiridina
|
|Aaptaminas, isoaaptaminas
|-
|Pirido[2,1-j]quinolina
|
|Cilindricina B, fasicularina, policitorol A
|-
|1H-pirrolo[2,1-j]quinolina
|
|Cilindricinas A, K, D, E, J, I; Lepadiforminas A y B.
|-
|1,8-dihidropirrolo[2,3-b]indol
|
|Fisostigmina (eserina), eteramina, fisovenina, eptastigmina, flustraminas.
|-
|5H,10H-Dipirrolo[1,2-a:1',2'-d]pirazina
|
|Vercapamida C, pirocol, aranotina.
|-
|2-oxa-6-azatriciclo[4.2.1.03,7]nonano.
|
|Lolinas, temulina
|-
|Dibenzo[c,g]azecina
|
|Protopina, coricavamina, coricavidina.
|-
|Dibenzo[b,i]quinolizina
|
|Cohirsina, shaheenina, cohirsinina, cohirsitinina.
|-
|Pirrolo 2,1,5-cdindolizina
|
|Mirmicarinas
|-
|1H,10H-pirrolo[1,2-c]purina
|
|Saxitoxinas
|-
|Indolo[2,1-a]isoquinolina
|
|Criptowolidina, criptowolinol, criptowolina.
|-
|9H-Indeno[2,1-b]piridina
|
| Haouamina
|-
|Azepino[3,2,1-hi]indol
|
|Estenina, tuberostemonina, estemoamida, estemonina, neostemonina, croomina, estemonidina.
|-
|6,10-Metano-4,6-dihidropirido[1,2-a]azepina
|
|Securiniaminas, sufruticodina, securinoles, filocrisina
|-
|2,5-Metano-9H-pirido[1,2-b][1,2]oxazepina
|
|Filantidina, secuamamida D
|-
|4H-dibenzo[de,g]quinolina
|
|Alcaloides aporfinoides: Glaucina, boldina, bulbocapnina, nanteína, hernandialina, nuciferina, liriodenina, pukateína, laurotetamina, lauroscolzina, escolina, magnoflorina, duguenaína y pancoridina, talifaberina, urabaína, dehatrifina
|-
|7H-dibenzo[de,h]quinolina
|
|Menisporfina
|-
|Indeno[1,2,3-ij]isoquinolina
|
|Rufescina, imeluteína
|-
|1,2-Epimino-3H-pirrolo[1,2-a]indol
|
|Mitomicinas
|-
|Eupolauridina
|
|Eupolauridina y sus derivados
|-
|Pirrolo[3,2,1-de]fenantridina
|
|Licorina
|-
|7H-Nafto[1,2,3-ij][2,7]naftiridina
|
|Sampangina, eupomatidinas
|-
|Espiro[2,5-ciclohexadieno-1,7'(1H)-ciclopenta[ij]isoquinolina]
|
|Orientalinona, glaziovina, estefarina, mecambrina, pronuciferina.
Dímero: Roehibridina
|-
|1,2-dihidrospiro[2-H-indeno-2,1'-isoquinolina]
|
|Lahorina
|-
|Benzo[d]-[4,5-g]pirido[4,3,2-jk][2]benzazepina
|
|Dragabina
|-
|Esparteína
|
|Esparteína
|-
|1H,4H,9H-Dipirido[2,1-b:3',2',1'-ij]quinazolina
|
|Sibiridina, schoberina
|-
|Morfinano
|
|Codeína, tebaína, salutarina, morfina, oripavina
|-
|Hasubanano
|
|Hasubanonina, cefaramina, cefasamina
|-
|(1S,9R)-7,11-diazatriciclo[7.3.1.02,7]tridecano
|
|Citisina, angustifolina
|-
|Dibenzo[f,h]pirrolo[1,2-b]isoquinolina
|
|Ficuseptinas, la criptopleurina y la tiloforina.
|-
|(6S,11bS)-6,11b-Metano-3a,6,11a,11b-tetrahidrofuro[2,3-c]pirido[1,2-a]azepina
|
| Securiniaminas, sufruticodina y los securinoles A-D
|-
|Dibenzo[a,g]-9aH-quinolizina
|
|Protoberberina, anisociclina, palmatina, coripalmina, discretamina, berlambina, lambertina, coreximina, talifaurina, coptisina, escoulerina, estilopina.
|-
|6,15-epimino-4H-isoquino[3,2-b][3]benzazocina.
|
|Saframicina, renieramicina, jorunamicinas
|-
|(1R,2R,7S,12R,13S,15S)-14-Oxa-6,8-diazapentaciclo[10.6.0.02,7.02,15.08,13]octadecano
(Nitraramida)
|
|Nitraramida, nitrabirina
|-
|3,5-o-fenilen-2,3,4,5-tetrahidro-1H-2-benzazepina
|
|Amurensina
|-
|3,6-Dihidropirrolo[3,2-e]indol
|
|Duocarmicinas, yatakemicina.
|-
|5,11-Epiminodibenzo[a,e][8]anuleno
|
|Pavinas, isopavinas
|-
|10H-azuleno[1,2,3-ij]isoquinolina
|
|Imerubrina
|-
|5H-Indeno[1,2-b]piridina
|
|Oniquina
|-
|Dibenzo[6,5,4-cd:f]indol
|
|Cefaronas
|-
|5H-Isoindolo[1,2-b][3]benzazepina
|
|Lennoxamina
|-
|Benzo[6,7]ciclohept[1,2,3-ij]isoquinolina
|
|Kreysigina,
|-
|9H-azuleno[1,2,3-ij]isoquinolina
|
|Grandirubrina
|-
|Homoeritrinano ([4,5-h]indolo[7a,1-a][2]benzazepina)
|
|Schelhameridina, erimelantina, erisopinoforina.
|-
|Eritrinano
|
|β-Erytroidina, Erisotramidina.
|-
|3H-ciclopenta[b]pirrolo[1,2-a][3]benzazepina
|
|Cefalotaxina, harringtonina, isoharringtonina, cefalezominas
|-
|Dibenzo[5,6-a:4',5'-g]-4H-quinolizina
|
|Cavidina, Talictrifolina, apocavidina, isoapocavidina.
|-
|Quinolino[2',3':3,4]pirrolo[2,1-b]quinazolina
|
|Luotoninas
|-
|Benzo[c]fenantridina
|
|Quelidonina, sanguinarina, palmatina, queleritrina
|-
|Benzo[j,k]acridina
|
|Necatarona
|-
|Indolo[3,2-c]quinolina
|
|Isocriptolepina
|-
|Quindolidina
|
|Quindolidina, Criptolepina
|-
|Quinindolina
|
|Neocriptolepina
|-
|7H-Indolo[2',3':3,4]pirido[2,1-b]quinazolina
|
|Evodiamina
|-
|5H-indolo[2,3-a]pirrolo[3,4-c]carbazol
|
|Arciriaflavinas, estaurosporina
|-
|9H-Quino[4,3,2-de][1,10]fenantrolina
|
|Ascididemina
|-
|11,22-Diazatetraciclo[11.11.2.12,22.02,12]heptacosane
|
|Ircinales
|-
|}
  Alcaloides de núcleo pirídico: a este grupo pertenecen la nicotina, la pilocarpina y la esparteína. La nicotina se encuentra en el jugo del tabaco acompañada de otros alcaloides. Es un líquido incoloro, de olor semejante al tabaco y sabor ardiente y picante. Es muy tóxica en dosis altas.
 Alcaloides de núcleo isoquinoleico: se encuentran en las plantas papaveráceas y ranunculáceas. El más importante es la papaverina, que tiene propiedades hipnóticas (aunque no tan acentuadas como las de la morfina).
 Alcaloides de núcleo fenantrénico: el más importante es la morfina. Se encuentra en el opio en forma de sal. Se emplea en medicina en forma de clorhidrato y sulfato, como sedantes, analgésicos, anestésicos y calmantes.
 Alcaloides de núcleo tropánico: pertenecen a este grupo la atropina y la cocaína. La atropina se encuentra en el jugo de varias plantas como la belladona, la brugmansia, el floripondio, el toloache y el estramonio. La cocaína se extrae de las hojas de coca o Erytroxylium Coca, es de sabor amargo, insensibiliza la lengua, y se usa en medicina en forma de clorhidrato como anestésico local para curar el dolor y la epistaxis severa.
 Alcaloides de núcleo indólico: los más importantes son la estricnina y la brucina. La estricnina es uno de los alcaloides más enérgicos y tóxicos, se extrae de diversas plantas del género Strychnos, entre ellas el haba de San Ignacio y de la nuez vómica o Nux Vomica. Es de sabor amargo muy intenso y es una sustancia extremadamente tóxica. su ingestión produce convulsiones tetánicas.
 Alcaloides de núcleo no definido: son todos aquellos alcaloides cuya constitución aún no se ha establecido con claridad. Entre ellos se encuentra la aconitina (veneno muy violento, utilizado en terapéutica para combatir ciertas dolencias) y la ergotinina (uno de los principios activos del cornezuelo de centeno, que ejerce una acción específica sobre el útero).