Interpretacja indywidualna
Sygnatura: 0114-KDIP4-2.4012.726.2025.2.MŻA
Organ: Dyrektor Krajowej Informacji Skarbowej
Data wydania: 2025-11-27
Teza: Prawo do częściowego odliczenia podatku VAT od
wydatków związanych z realizacją Projektu.
Słowa kluczowe: instytut
odliczenia-odliczenie częściowe
proporcja
Zagadnienia: Ustawa o podatku od towarów i usług-Dział IX. Odliczenie
i zwrot podatku. Odliczenie częściowe-Rozdział 1.
Odliczenie i zwrot podatku-Odliczenie podatku
naliczonego-Odliczenie podatku naliczonego z tytułu
nabycia towarów i usług wykorzystywanych zarówno do
celów działalności gospodarczej jak i do celów innych niż
działalność gospodarcza (prewspółczynnik)
Przepisy: [VAT][WIS] Ustawa o podatku od towarów i usług-Dział IX-
Rozdział 1-art. 86-ust. 2h

## Interpretacja indywidualna – stanowisko prawidłowe

Szanowni Państwo,
    stwierdzam, że Państwa stanowisko w sprawie oceny skutków podatkowych opisanego
    stanu faktycznego i zdarzenia przyszłego w podatku od towarów i usług jest prawidłowe.

## Zakres wniosku o wydanie interpretacji indywidualnej

24 września 2025 r. wpłynął Państwa wniosek z 24 września 2025 r. o wydanie
    interpretacji indywidualnej, który dotyczy prawa do częściowego odliczenia podatku VAT

    od wydatków związanych z realizacją Projektu. Uzupełnili Państwo wniosek – w
    odpowiedzi na wezwanie, pismem z 23 października 2025 r. Treść wniosku jest
    następująca:
    Opis stanu faktycznego i zdarzenia przyszłego
    Wnioskodawca jest państwowym instytutem badawczym prowadzącym działalność na
    podstawie przepisów ustawy z 30 kwietnia 2010 r. o instytutach badawczych oraz Statutu
    uchwalonego przez Radą Naukową i zatwierdzonego przez organ sprawujący nadzór
    Ministerstwo Rolnictwa i Rozwoju Wsi w dniu (...) r. Przedmiotem działalności
    Wnioskodawcy jest prowadzenie badań naukowych oraz prac rozwojowych w określonych
    dziedzinach nauki i technologii związanych m.in. z bioinżynierią, biopreparatami, analizą
    fizykochemiczną i mikrobiologiczną produktów żywnościowych, opracowywania i rozwoju
    technologii w dziedzinie produkcji spożywczej, przemysłu fermentacyjnego,
    browarniczego, piekarskiego itp. Ponadto Wnioskodawca w ramach działalności
    statutowej zajmuje się wdrażaniem i upowszechnianiem wyników badań naukowych w
    praktyce rolniczej i przemyśle rolno-spożywczym.
    Ponadto w oparciu o posiadane przez Wnioskodawcę zasoby i wyposażenie naukowo-
    badawcze, a także wysoko wykwalifikowaną kadrę naukową, Wnioskodawca prowadzi
    działalność komercyjną na rzecz przedsiębiorców i innych podmiotów z sektora rolno-
    spożywczego, w szczególności polegającą na:
        dostarczaniu szczepów mikroorganizmów, o wysokiej wartości użytkowej, dla
        przemysłów: gorzelniczego, piwowarskiego i winiarskiego i podobnych;
        świadczeniu usług analitycznych w szerokim zakresie badań związanych z oceną
        jakości i właściwości produktów przemysłu rolno-spożywczego, jako akredytowane
        laboratorium badawcze.
    Wnioskodawca świadczy także usługi wynajmu i dzierżawy nieruchomości oraz innych
    składników majątku związanych z nieruchomościami, w obiektach stanowiących własność
    Wnioskodawcy, które nie są aktualnie wykorzystywane do prowadzenia własnej
    działalności Wnioskodawcy.
    Wnioskodawca finansuje swoją działalność pozyskując środki pieniężne z trzech głównych
    źródeł:
        subwencji ze środków na finansowanie nauki, zgodnie z przepisami ustawy z dnia
        20 lipca 2018 r. Prawo o szkolnictwie wyższym i nauce (tzw. „Ustawa 2.0);
        dotacji (grantów) przyznanych przez instytucje publiczne zarządzające środkami
        przeznaczonymi na finansowanie badań naukowych i prac rozwojowych, np.
        Narodowym Centrum Badań, Narodowym Centrum Badań i Rozwoju Nauki,
        Agencją Restrukturyzacji i Modernizacji Rolnictwa, w związku z realizacją
        określonych projektów badawczych i badawczo-rozwojowych, na podstawie umów
        zawartych z tymi instytucjami;
        dotacji celowych z części budżetowej przeznaczonej na rolnictwo przeznaczonej na
        realizację zadań szczególnie ważnych dla bezpieczeństwa Państwa;
        prowadzenia odpłatnej działalności produkcyjnej i usługowej, w szczególności w
        zakresie dostarczania mikroorganizmów oraz świadczenia specjalistycznych usług

        analitycznych i laboratoryjnych dla przedsiębiorstw sektora rolno-spożywczego,
        produktów spożywczych, a ponadto świadczenie usług wynajmu i dzierżawy
        posiadanych składników majątku, ze szczególnym uwzględnieniem nieruchomości.
    Instytut (...) podpisał umowę o realizacji projektu partnerskiego „(...)” w ramach Programu
    Fundusze Europejskie dla (...) współfinansowanego z Europejskiego Funduszu Rozwoju
    Regionalnego ze Spółką (...) Spółka z ograniczoną odpowiedzialnością Spółka
    komandytowa reprezentowaną przez:
    AA – Prokurent Komplementariusza
    BB – Prokurent Komplementariusza
    Umowa Partnerstwa określa zasady funkcjonowania partnerstwa, zasady współpracy
    Partnera wiodącego i Partnera. Podmiotem aplikującym o dofinansowanie w ramach
    Programu Fundusze Europejskie dla (...) była spółka (...) Spółka z ograniczoną
    odpowiedzialnością Spółka komandytowa jako Partner wiodący, a realizatorem projektu
    oraz Partnerem w projekcie jest Wnioskodawca.
    Założeniem projektu jest przeprowadzenie prac badawczo-rozwojowych mających na celu
    redukcję strat surowca – (...) w procesie ich przechowywania w cyklu produkcyjnym.
    Będzie to możliwe do osiągnięcia dzięki opracowaniu kontrolowanych warunków
    przechowywania przy zastosowaniu technologii opartej na regulowanym przechowywaniu
    przy użyciu aparatury chłodniczej. Zastosowanie ujednoliconych i kontrolowanych
    warunków pozwoli na dostosowanie temperatury przechowywania by zredukować
    zachodzące procesy schnięcia, pleśnienia i gnicia oraz osiągnąć surowiec jakości
    porównywalnej do surowca świeżego.
    Wnioskodawca jest podatnikiem podatku od towarów i usług zarejestrowanym jako
    czynny podatnik VAT.
    Powstałe w ramach projektu prawa majątkowe do wyników prac B+R, w tym wyników
    badań będących rezultatem Projektu przysługują Partnerowi wiodącemu i Wnioskodawcy
    w proporcji odpowiadającej faktycznemu ich udziałowi w całkowitej kwocie kosztów
    kwalifikowalnych prac B+R określonej w Umowie o dofinansowanie Projektu (Paragraf 6
    ust. 1 i 6 Umowy Partnerstwa). Komercjalizacja wyników badań jest kluczowym
    elementem Projektu a przeniesienie autorskich praw majątkowych następuje za
    wynagrodzeniem odpowiadającym wartości rynkowej tych praw.
    Niezależnie od powyższego, Wnioskodawca planuje wykorzystać wyniki badań na
    potrzeby publikacji naukowych, ale także na potrzeby innych opracowań nie służących
    działalności gospodarczej.
    W konsekwencji dysponowanie autorskimi prawami majątkowymi podlegać będzie także
    sprzedaży opodatkowanej podatkiem VAT.
    Wnioskodawca w związku z realizacją Projektu będzie dokonywał zakupów towarów i
    usług od podmiotów zewnętrznych, udokumentowanych fakturami zawierającymi
    podatek VAT. Jak wskazano powyżej, zakupy towarów i usług opodatkowane podatkiem
    VAT będą stanowiły część kosztów ponoszonych przez Wnioskodawcę w związku z
    Projektem i będą służyć zarówno wykonywanej działalności gospodarczej, opodatkowanej
    podatkiem od towarów i usług, jak i działalności niepodlegającej opodatkowaniu oraz
    zwolnionej z opodatkowania podatkiem od towarów i usług.
    Uzupełnienie i doprecyzowanie opisu stanu faktycznego i zdarzenia przyszłego
    Na pytanie: Na kogo będą wystawione faktury dokumentujące nabycie towarów i usług
    związanych z realizacją Projektu, odpowiedzieli Państwo: Wnioskodawca oświadcza, że
    faktury wystawiane będą bezpośrednio na (...) w części związanej z wykonywaniem przez
    niego zadań określonych w umowie o realizację projektu partnerskiego (załącznik do
    wniosku o wydanie interpretacji indywidualnej).

    Na pytanie: Czy mają Państwo możliwość jednoznacznego i bezpośredniego
    przyporządkowania wydatków ponoszonych w ramach realizacji Projektu w całości do
    celów działalności gospodarczej, odpowiedzieli Państwo: Nie jest to możliwe na etapie
    realizacji Projektu.
    Na pytanie: Czy mają Państwo obiektywną możliwość odrębnego przyporządkowania
    całości lub części kwot podatku naliczonego od wydatków ponoszonych w ramach
    realizacji Projektu do czynności opodatkowanych oraz czynności zwolnionych od podatku,
    odpowiedzieli Państwo: Nie jest to możliwe na obecnym etapie.

## Pytanie

Czy w związku z nabywaniem towarów i usług związanych z prowadzeniem badań
    naukowych w ramach realizacji programu (...) Wnioskodawcy przysługuje prawo do
    odliczenia podatku naliczonego związanego z nabyciem takich towarów i usług?
    Państwa stanowisko w sprawie
    W ocenie Wnioskodawcy, z uwagi na fakt, że poniesione w ramach Projektu wydatki będą
    służyć Instytutowi do wykonywania zarówno czynności opodatkowanych,
    niepodlegających opodatkowaniu, jak i zwolnionych z opodatkowania podatkiem od
    towarów i usług, to Wnioskodawca będzie mógł odliczyć tylko taką część podatku
    naliczonego na nabyciu tych towarów i usług, jaka pozostanie do odliczenia po
    zastosowaniu proporcji określonych w art. 86 ust. 2a i art. 90 ust. 2 ustawy VAT.
    Uzasadnienie stanowiska Wnioskodawcy.
    Jak wskazano w stanie faktycznym, Wnioskodawca jest zarejestrowanym czynnym
    podatnikiem podatku od towarów i usług, który posiada status państwowego instytutu
    badawczego i prowadzi badania oraz prace badawczo-rozwojowe w zakresie
    biotechnologii i technologii rolno-spożywczej. W prowadzonej ewidencji księgowej Instytut
    wyodrębnia co do zasady następujące grupy działalności: opodatkowaną, zwolnioną oraz
    niepodlegającą opodatkowaniu, natomiast mając na uwadze treść zawartych przez
    Wnioskodawcę umów, jak również cel Projektu, Wnioskodawca będzie dokonywał nabycia
    towarów i usług które będzie wykorzystywał zarówno do celów wykonywanej działalności
    gospodarczej, jak i do celów innych niż działalność gospodarcza. Jednocześnie przypisanie
    tych towarów i usług w całości do działalności gospodarczej Wnioskodawcy nie jest
    możliwe.
    W konsekwencji kwotę podatku naliczonego, oblicza się na podstawie art. 86 ust 2a
    zgodnie ze sposobem określenia zakresu wykorzystywania nabywanych towarów i usług
    do celów działalności gospodarczej (sposobem określenia proporcji). Sposób określenia
    proporcji powinien najbardziej odpowiadać specyfice wykonywanej przez podatnika
    działalności i dokonywanych przez niego nabyć.
    W tym miejscu Wnioskodawca wskazuje także, że nie jest możliwe wyodrębnienie całości
    lub części kwot, podatku naliczonego związanego z czynnościami, w stosunku do których
    przysługiwać będzie Wnioskodawcy prawo do obniżenia kwoty podatku należnego,
    dlatego też w ocenie Wnioskodawcy dopuszczalne będzie pomniejszenie podatku
    należnego o taką część kwoty podatku naliczonego, którą można proporcjonalnie
    przypisać czynnościom, w stosunku do których podatnikowi przysługuje prawo do
    obniżenia kwoty podatku należnego, tj. zastosowania w tym zakresie art. 90 ust. 2 ustawy
    o VAT.

## Ocena stanowiska

Stanowisko, które przedstawili Państwo we wniosku jest prawidłowe.

## Uzasadnienie interpretacji indywidualnej

Zgodnie z art. 86 ust. 1 ustawy z dnia 11 marca 2004 r. o podatku od towarów i usług (t. j.
    Dz. U. z 2025 r. poz. 775 ze zm.), zwanej dalej „ustawą”:

      w zakresie, w jakim towary i usługi są wykorzystywane do wykonywania czynności
      opodatkowanych, podatnikowi, o którym mowa w art. 15, przysługuje prawo do
      obniżenia kwoty podatku należnego o kwotę podatku naliczonego, z zastrzeżeniem
      art. 114, art. 119 ust. 4, art. 120 ust. 17 i 19 oraz art. 124
    Zgodnie z art. 86 ust. 2 pkt 1 ustawy:
      kwotę podatku naliczonego stanowi suma kwot podatku wynikających z faktur
      otrzymanych przez podatnika z tytułu:
      a) nabycia towarów i usług,
      b) dokonania całości lub części zapłaty przed nabyciem towaru lub wykonaniem
      usługi.
    Prawo do obniżenia kwoty podatku należnego o kwotę podatku naliczonego przysługuje
    gdy:
        odliczenia dokonuje zarejestrowany czynny podatnik podatku od towarów i usług,
        towary i usługi, z których nabyciem podatek został naliczony, są wykorzystywane do
        wykonywania czynności opodatkowanych.
    Aby skorzystać z prawa do odliczenia podatku naliczonego od towarów i usług
    zakupionych na potrzeby wykonania określonej czynności, podmiot musi wykonywać tę
    czynność jako podatnik podatku od towarów i usług, który działa w ramach prowadzonej
    działalności gospodarczej.
    W świetle art. 15 ust. 1 ustawy:
      podatnikami są osoby prawne, jednostki organizacyjne niemające osobowości
      prawnej oraz osoby fizyczne, wykonujące samodzielnie działalność gospodarczą, o
      której mowa w ust. 2, bez względu na cel lub rezultat takiej działalności.
    Zgodnie z art. 15 ust. 2 ustawy:
      działalność gospodarcza obejmuje wszelką działalność producentów, handlowców
      lub usługodawców, w tym podmiotów pozyskujących zasoby naturalne oraz
      rolników, a także działalność osób wykonujących wolne zawody. Działalność
      gospodarcza obejmuje w szczególności czynności polegające na wykorzystywaniu
      towarów lub wartości niematerialnych i prawnych w sposób ciągły dla celów
      zarobkowych.
    Zasada wyrażona w art. 86 ust. 1 ustawy wyklucza możliwość odliczenia podatku
    naliczonego związanego z towarami i usługami, które nie są wykorzystywane do
    wykonywania czynności opodatkowanych, czyli w przypadku ich wykorzystania do
    czynności zwolnionych od podatku VAT oraz niepodlegających opodatkowaniu.
    W każdym przypadku należy dokonać oceny, czy intencją podatnika wykonującego
    określone czynności, z którymi łączą się skutki podatkowoprawne, było wykonywanie
    czynności opodatkowanych. Podatnik ma obowiązek dokonania tzw. alokacji podatku,
    czyli określenia, z jakim rodzajem działalności będzie związany podatek wynikający z
    otrzymanych faktur zakupu. Obowiązkiem podatnika jest przypisanie konkretnych
    wydatków do określonego rodzaju sprzedaży, z którymi wydatki te są związane.
    Prawo do odliczenia podatku naliczonego przysługuje pod warunkiem, że:
        spełnione zostały przesłanki pozytywne, wynikające z art. 86 ust. 1 ustawy oraz
        nie zaistniały przesłanki negatywne, określone w art. 88 ustawy – pozbawiają one
        podatnika prawa do obniżenia kwoty podatku należnego o kwotę podatku
        naliczonego.

    Jedno z takich ograniczeń zostało wskazane w art. 88 ust. 3a pkt 2 ustawy, zgodnie z
    którym:
      nie stanowią podstawy do obniżenia podatku należnego oraz zwrotu różnicy
      podatku lub zwrotu podatku naliczonego faktury i dokumenty celne w przypadku
      gdy transakcja udokumentowana fakturą nie podlega opodatkowaniu albo jest
      zwolniona od podatku.
    Oznacza to, że podatnik nie może skorzystać z prawa do odliczenia w odniesieniu do
    podatku, który jest należny wyłącznie z tego względu, że został wykazany na fakturze w
    sytuacji, gdy transakcja nie podlega opodatkowaniu albo jest zwolniona od podatku.
    Na podstawie art. 88 ust. 4 ustawy:
      obniżenia kwoty lub zwrotu różnicy podatku należnego nie stosuje się również do
      podatników, którzy nie są zarejestrowani jako podatnicy VAT czynni, zgodnie z art.
      96, z wyłączeniem przypadków, o których mowa w art. 86 ust. 2 pkt 7.
    Z art. 86 ust. 1 ustawy wynika, że odliczenie podatku naliczonego może być częściowe, tzn.
    w tej części, w jakiej dane towary lub usługi, z którymi związany jest podatek naliczony, są
    wykorzystywane do realizacji czynności opodatkowanych. Przy odliczeniu częściowym
    pomija się tę część podatku, w jakiej zakupione towary i usługi są wykorzystywane do
    wykonywania czynności nieopodatkowanych podatkiem VAT i zwolnionych z podatku.
    Generalną zasadę uprawniającą do odliczenia podatku naliczonego uzupełniają regulacje
    zawarte w art. 86 ust. 2a i następne oraz art. 90 ustawy.
    W świetle art. 86 ust. 2a ustawy:
      w przypadku nabycia towarów i usług wykorzystywanych zarówno do celów
      wykonywanej przez podatnika działalności gospodarczej, jak i do celów innych niż
      działalność gospodarcza, z wyjątkiem celów osobistych, do których ma zastosowanie
      art. 7 ust. 2 i art. 8 ust. 2, oraz celów, o których mowa w art. 8 ust. 5 - w przypadku, o
      którym mowa w tym przepisie, gdy przypisanie tych towarów i usług w całości do
      działalności gospodarczej podatnika nie jest możliwe, kwotę podatku naliczonego, o
      której mowa w ust. 2, oblicza się zgodnie ze sposobem określenia zakresu
      wykorzystywania nabywanych towarów i usług do celów działalności gospodarczej,
      zwanym dalej „sposobem określenia proporcji”. Sposób określenia proporcji
      powinien najbardziej odpowiadać specyfice wykonywanej przez podatnika
      działalności i dokonywanych przez niego nabyć.
    W myśl art. 86 ust. 2b ustawy:
      Sposób określenia proporcji najbardziej odpowiada specyfice wykonywanej przez
      podatnika działalności i dokonywanych przez niego nabyć, jeżeli:
      1) zapewnia dokonanie obniżenia kwoty podatku należnego o kwotę podatku
      naliczonego wyłącznie w odniesieniu do części kwoty podatku naliczonego
      proporcjonalnie przypadającej na wykonywane w ramach działalności gospodarczej
      czynności opodatkowane oraz
      2) obiektywnie odzwierciedla część wydatków przypadającą odpowiednio na
      działalność gospodarczą oraz na cele inne niż działalność gospodarcza, z wyjątkiem
      celów osobistych, do których ma zastosowanie art. 7 ust. 2 i art. 8 ust. 2, oraz celów,
      o których mowa w art. 8 ust. 5 - w przypadku, o którym mowa w tym przepisie, gdy
      przypisanie tych wydatków w całości do działalności gospodarczej nie jest możliwe.
    Na podstawie art. 86 ust. 2g ustawy:
      proporcję określa się procentowo w stosunku rocznym. Proporcję tę zaokrągla się w
      górę do najbliższej liczby całkowitej. Przepisy art. 90 ust. 5, 6, 9a, 10 i 10c-10g stosuje
      się odpowiednio.

    Zgodnie z art. 86 ust. 2h ustawy:
      w przypadku gdy podatnik, dla którego sposób określenia proporcji wskazują
      przepisy wydane na podstawie ust. 22, uzna, że wskazany zgodnie z przepisami
      wydanymi na podstawie ust. 22 sposób określenia proporcji nie będzie najbardziej
      odpowiadać specyfice wykonywanej przez niego działalności i dokonywanych przez
      niego nabyć, może zastosować inny bardziej reprezentatywny sposób określenia
      proporcji.
    Jak stanowi art. 86 ust. 22 ustawy:
      Minister właściwy do spraw finansów publicznych może, w drodze rozporządzenia,
      określić w przypadku niektórych podatników sposób określenia proporcji uznany za
      najbardziej odpowiadający specyfice wykonywanej przez tych podatników
      działalności i dokonywanych przez nich nabyć oraz wskazać dane, na podstawie
      których jest obliczana kwota podatku naliczonego z wykorzystaniem tego sposobu
      określenia proporcji, uwzględniając specyfikę prowadzenia działalności przez
      niektórych podatników i uwarunkowania obrotu gospodarczego.
    Na podstawie delegacji ustawowej określonej ww. przepisem wydane zostało
    rozporządzenie Ministra Finansów z 17 grudnia 2015 r. w sprawie sposobu określania
    zakresu wykorzystywania nabywanych towarów i usług do celów działalności gospodarczej
    w przypadku niektórych podatników (t. j. Dz. U. z 2021 r. poz. 999), zwane dalej
    rozporządzeniem.
    Na mocy § 1 rozporządzenia:
      rozporządzenie:
      1) określa w przypadku niektórych podatników sposób określania zakresu
      wykorzystywania nabywanych towarów i usług do celów działalności gospodarczej
      uznany za najbardziej odpowiadający specyfice wykonywanej przez tych podatników
      działalności i dokonywanych przez nich nabyć, zwany dalej ,,sposobem określenia
      proporcji”;
      2) wskazuje dane, na podstawie których jest obliczana kwota podatku naliczonego z
      wykorzystaniem sposobu określenia proporcji.
    W rozporządzeniu tym zostali wskazani podatnicy, do których przepisy w nim zawarte się
    odnoszą. Są to: jednostki samorządu terytorialnego, samorządowe instytucje kultury,
    państwowe instytucje kultury, uczelnie publiczne, instytuty badawcze.
    W świetle § 7 rozporządzenia:
      w przypadku instytutu badawczego, jako sposób określenia proporcji uznaje się
      sposób ustalony według wzoru:
      X = A x 100/A + B
      gdzie poszczególne symbole oznaczają:
      X - proporcję określoną procentowo, zaokrągloną w górę do najbliższej liczby
      całkowitej,
      A - roczny obrót z działalności gospodarczej instytutu badawczego,
      B - sumę wykorzystanych przez instytut badawczy środków obejmującą:
      1) subwencje, dotacje i inne środki o podobnym charakterze przeznaczone w danym
      roku przez ten instytut na zadania związane z działalnością naukową lub
      kształceniem w szkole doktorskiej, w rozumieniu przepisów ustawy z dnia 20 lipca
      2018 r. - Prawo o szkolnictwie wyższym i nauce, których realizacja nie mieści się w
      działalności gospodarczej,

      2) dotacje i inne środki o podobnym charakterze przeznaczone na realizację przez
      ten instytut w danym roku badań naukowych, prac rozwojowych lub innych
      zleconych zadań, których realizacja nie mieści się w działalności gospodarczej
      - z wyłączeniem środków finansowych przeznaczonych na stypendia dla doktorantów.
    Według § 2 pkt 4 rozporządzenia:
      ilekroć w rozporządzeniu jest mowa o obrocie – rozumie się przez to podstawę
      opodatkowania, o której mowa w art. 29a, art. 32, art. 119 oraz art. 120 ust. 4 i 5
      ustawy, w zakresie:
      a) dokonywanych przez podatników:
      - odpłatnych dostaw towarów na terytorium kraju,
      - odpłatnego świadczenia usług na terytorium kraju,
      - eksportu towarów,
      - wewnątrzwspólnotowej dostawy towarów,
      b) odpłatnych dostaw towarów lub świadczenia usług poza terytorium kraju, które
      podlegałyby opodatkowaniu podatkiem gdyby były wykonywane na terytorium kraju.
    Stosownie do § 8 rozporządzenia:
      w celu obliczenia kwoty podatku naliczonego w przypadkach, o których mowa w § 3-
      7, mogą być przyjęte dane za rok podatkowy poprzedzający poprzedni rok
      podatkowy.
    Przepis art. 86 ust. 2a ustawy ma zatem zastosowanie wyłącznie do sytuacji, w której
    nabywane towary i usługi, wykorzystywane są zarówno do celów wykonywanej przez
    podatnika działalności gospodarczej, jak i do celów innych niż działalność gospodarcza, w
    sytuacji gdy przypisanie tych wydatków w całości do działalności gospodarczej nie jest
    możliwe. Ww. przepis wprost określa, co stanowi kwotę podatku naliczonego w przypadku
    nabycia towarów i usług, wykorzystywanych zarówno do celów wykonywanej przez
    podatnika działalności gospodarczej, jak i do celów innych.
    W przypadku wykonywania w ramach działalności gospodarczej czynności
    opodatkowanych podatkiem od towarów i usług oraz zwolnionych od podatku, należy
    mieć na uwadze uregulowania zawarte w art. 90 ustawy o VAT. Powyższe przepisy
    stanowią uzupełnienie regulacji art. 86 ustawy o VAT.
    Zgodnie z art. 90 ust. 1 ustawy:
      w stosunku do towarów i usług, które są wykorzystywane przez podatnika do
      wykonywania czynności, w związku z którymi przysługuje prawo do obniżenia kwoty
      podatku należnego, jak i czynności, w związku z którymi takie prawo nie przysługuje,
      podatnik jest obowiązany do odrębnego określenia kwot podatku naliczonego
      związanych z czynnościami, w stosunku do których podatnikowi przysługuje prawo
      do obniżenia kwoty podatku należnego.
    W myśl art. 90 ust. 2 ustawy:
      jeżeli nie jest możliwe wyodrębnienie całości lub części kwot, o których mowa w ust.
      1, podatnik może pomniejszyć kwotę podatku należnego o taką część kwoty podatku
      naliczonego, którą można proporcjonalnie przypisać czynnościom, w stosunku do
      których podatnikowi przysługuje prawo do obniżenia kwoty podatku należnego, z
      zastrzeżeniem ust. 10.
    Na podstawie art. 90 ust. 3 ustawy:
      proporcję, o której mowa w ust. 2, ustala się jako udział rocznego obrotu z tytułu
      czynności, w związku z którymi przysługuje prawo do obniżenia kwoty podatku
      należnego, w całkowitym obrocie uzyskanym z tytułu czynności, w związku z którymi

      podatnikowi przysługuje prawo do obniżenia kwoty podatku należnego, oraz
      czynności, w związku z którymi podatnikowi nie przysługuje takie prawo.
    Przepis art. 90 ust. 4 ustawy stanowi, że:
      proporcję, o której mowa w ust. 3, określa się procentowo w stosunku rocznym na
      podstawie obrotu osiągniętego w roku poprzedzającym rok podatkowy, w
      odniesieniu do którego jest ustalana proporcja. Proporcję tę zaokrągla się w górę do
      najbliższej liczby całkowitej.
    Przepisy dotyczące zasad odliczania częściowego, zawarte w art. 90 ustawy, znajdują
    zastosowanie wyłącznie w odniesieniu do czynności wykonywanych w ramach działalności
    gospodarczej w rozumieniu ustawy. Zatem dotyczą czynności podlegających
    opodatkowaniu (opodatkowanych i zwolnionych).
    Aby odliczyć podatek naliczony podatnik powinien w pierwszej kolejności
    przyporządkować ponoszone wydatki do poszczególnych rodzajów działalności:
        opodatkowanej podatkiem VAT,
        zwolnionej od podatku,
        niepodlegającej opodatkowaniu.
    W przypadku zakupów bezpośrednio związanych z działalnością opodatkowaną, podatnik,
    na podstawie art. 86 ust. 1 ustawy, odlicza podatek naliczony w całości. Natomiast w
    sytuacji, gdy takie przyporządkowanie nie jest możliwe, a wydatki służą zarówno do celów
    wykonywanej przez podatnika działalności gospodarczej, jak i do celów innych niż
    działalność gospodarcza, podatnik winien ustalić proporcję, o której mowa w art. 86 ust.
    2a ustawy (tzw. prewspółczynnik), a następnie – w przypadku wystąpienia także czynności
    zwolnionych od podatku – w art. 90 ust. 2 i 3 ustawy (tzw. współczynnik sprzedaży).
    Wskazali Państwo, że są państwowym instytutem badawczym oraz podatnikiem podatku
    od towarów i usług zarejestrowanym jako czynny podatnik VAT. Przedmiotem Państwa
    działalności jest prowadzenie badań naukowych oraz prac rozwojowych w określonych
    dziedzinach nauki i technologii związanych m.in. z bioinżynierią, biopreparatami, analizą
    fizykochemiczną i mikrobiologiczną produktów żywnościowych, opracowywania i rozwoju
    technologii w dziedzinie produkcji spożywczej, przemysłu fermentacyjnego,
    browarniczego, piekarskiego itp. Ponadto w ramach działalności statutowej zajmują się
    Państwo wdrażaniem i upowszechnianiem wyników badań naukowych w praktyce
    rolniczej i przemyśle rolno-spożywczym.
    Podpisali Państwo umowę o realizacji projektu partnerskiego „(...)”.
    Założeniem projektu jest przeprowadzenie prac badawczo-rozwojowych mających na celu
    redukcję (...) w w procesie ich przechowywania w cyklu produkcyjnym.
    Powstałe w ramach projektu prawa majątkowe do wyników prac B+R, w tym wyników
    badań będących rezultatem Projektu przysługują Partnerowi wiodącemu i Państwu w
    proporcji odpowiadającej faktycznemu ich udziałowi w całkowitej kwocie kosztów
    kwalifikowalnych prac B+R określonej w Umowie o dofinansowanie Projektu.
    Komercjalizacja wyników badań jest kluczowym elementem Projektu a przeniesienie
    autorskich praw majątkowych następuje za wynagrodzeniem odpowiadającym wartości
    rynkowej tych praw. Niezależnie od powyższego, planują Państwo wykorzystać wyniki
    badań na potrzeby publikacji naukowych, ale także na potrzeby innych opracowań nie
    służących działalności gospodarczej. W konsekwencji dysponowanie autorskimi prawami
    majątkowymi podlegać będzie także sprzedaży opodatkowanej podatkiem VAT.
    W związku z realizacją Projektu będą Państwo dokonywać zakupów towarów i usług od
    podmiotów zewnętrznych, udokumentowanych fakturami zawierającymi podatek VAT.
    Zakupy towarów i usług opodatkowane podatkiem VAT będą stanowiły część kosztów

    ponoszonych przez Państwa w związku z Projektem i będą służyć zarówno wykonywanej
    działalności gospodarczej, opodatkowanej podatkiem od towarów i usług, jak i działalności
    niepodlegającej opodatkowaniu oraz zwolnionej z opodatkowania podatkiem od towarów
    i usług.
    Faktury wystawiane będą bezpośrednio na Państwa w części związanej z wykonywaniem
    przez Państwa zadań określonych w umowie o realizację projektu partnerskiego.
    Nie mają Państwo możliwość jednoznacznego i bezpośredniego przyporządkowania
    wydatków ponoszonych w ramach realizacji Projektu w całości do celów działalności
    gospodarczej. Nie mają Państwo obiektywną możliwość odrębnego przyporządkowania
    całości lub części kwot podatku naliczonego od wydatków ponoszonych w ramach
    realizacji Projektu do czynności opodatkowanych oraz czynności zwolnionych od podatku,
    odpowiedzieli Państwo: Nie jest to możliwe na obecnym etapie.
    Państwa wątpliwości dotyczą prawa do odliczenia podatku naliczonego z tytułu
    nabywanych towarów i usług związanych z prowadzeniem badań naukowych w ramach
    realizacji Programu.
    Jak wynika z powołanych powyżej przepisów prawa, rozliczenie podatku naliczonego na
    zasadach określonych w art. 86 ust. 1 ustawy uwarunkowane jest tym, aby nabywane
    towary i usługi były wykorzystywane przez zarejestrowanego, czynnego podatnika
    podatku VAT w ramach działalności gospodarczej do wykonywania czynności
    opodatkowanych podatkiem od towarów i usług.
    Odliczyć można w całości podatek naliczony, który jest związany z czynnościami
    opodatkowanymi podatnika. Wskazana zasada wyłącza tym samym możliwość
    dokonywania odliczeń podatku naliczonego związanego z towarami i usługami, które nie
    są w ogóle wykorzystywane do czynności opodatkowanych, czyli w przypadku ich
    wykorzystywania do czynności zwolnionych od podatku lub niepodlegających
    opodatkowaniu podatkiem VAT.
    Jednocześnie z zasady tej wynika, że odliczenie podatku naliczonego może być częściowe,
    tzn. w tej części, w jakiej dane towary lub usługi, z którymi związany jest podatek naliczony
    są wykorzystywane do realizacji czynności opodatkowanych, z pominięciem tej części
    podatku od tych towarów i usług, w jakiej towary i usługi są wykorzystywane do
    wykonywania czynności zwolnionych lub niepodlegających opodatkowaniu podatkiem VAT.
    Z okoliczności sprawy wynika, że zakupy towarów i usług opodatkowane podatkiem VAT
    będą stanowiły część kosztów ponoszonych przez Państwa w związku z Projektem i będą
    służyć zarówno wykonywanej działalności gospodarczej, opodatkowanej podatkiem od
    towarów i usług, jak i działalności niepodlegającej opodatkowaniu oraz zwolnionej z
    opodatkowania podatkiem od towarów i usług.
    Zatem w zakresie wydatków dotyczycących realizacji Projektu przysługuje Państwu prawo
    do pełnego odliczenia podatku naliczonego od nabyć towarów i usług, które będą
    Państwo wykorzystywać w całości do czynności opodatkowanych. Od zakupionych
    towarów i usług które będą wykorzystywane wyłączenia do czynności niepodlegających
    opodatkowaniu i zwolnionych nie przysługuje Państwu prawo do odliczenia podatku.
    Odnośnie nabywanych w ramach realizacji Projektu towarów i usług, dla których nie są
    Państwo w stanie wyodrębnić kwot podatku naliczonego w zakresie w jakim służą one do
    wykonywania czynności podlegających opodatkowaniu i niepodlegających
    opodatkowaniu, przysługuje Państwu prawo do odliczenia podatku naliczonego zgodnie
    ze sposobem określenia zakresu wykorzystywania nabywanych towarów i usług do celów
    działalności gospodarczej, o którym mowa w art. 86 ust. 2a i nast. ustawy z
    uwzględnieniem § 7 rozporządzenia Ministra Finansów z dnia 17 grudnia 2015 r.
    Następnie biorąc pod uwagę, że nabywane towary i usługi wykorzystywane będą zarówno
    do czynności opodatkowanych, jak i do czynności zwolnionych od podatku, w zakresie w
    jakim nie będą Państwo w stanie dokonać bezpośredniej alokacji podatku do czynności

    opodatkowanych i zwolnionych od podatku, powinni Państwo dokonać odliczenia podatku
    naliczonego w oparciu o zasady wskazane w art. 90 ust. 2, ust. 3 i następne ustawy.
    Zaznaczyć jednocześnie należy, że prawo do odliczenia podatku naliczonego przysługuje,
    pod warunkiem niezaistnienia przesłanek negatywnych, określonych w art. 88 ustawy.
    Państwa stanowisko jest prawidłowe.

## Dodatkowe informacje

Informacja o zakresie rozstrzygnięcia
    Interpretacja dotyczy zaistniałego stanu faktycznego, który Państwo przedstawili i stanu
    prawnego, który obowiązywał w dacie zaistnienia zdarzenia oraz zdarzenia przyszłego,
    które Państwo przedstawili i stanu prawnego, który obowiązuje w dniu wydania
    interpretacji.
    Pouczenie o funkcji ochronnej interpretacji
        Funkcję ochronną interpretacji indywidualnych określają przepisy art. 14k-14nb
        ustawy z dnia 29 sierpnia 1997 r. – Ordynacja podatkowa (t. j. Dz. U. z 2025 r. poz.
        111 ze zm.). Interpretacja będzie mogła pełnić funkcję ochronną, jeśli Państwa
        sytuacja będzie zgodna (tożsama) z opisem stanu faktycznego i zdarzenia
        przyszłego i zastosują się Państwo do interpretacji.
        Zgodnie z art. 14na § 1 Ordynacji podatkowej:
      Przepisów art. 14k-14n Ordynacji podatkowej nie stosuje się, jeśli stan faktyczny lub
      zdarzenie przyszłe będące przedmiotem interpretacji indywidualnej jest elementem
      czynności, które są przedmiotem decyzji wydanej:
      1) z zastosowaniem art. 119a;
      2) w związku z wystąpieniem nadużycia prawa, o którym mowa w art. 5 ust. 5 ustawy
      z dnia 11 marca 2004 r. o podatku od towarów i usług;
      3) z zastosowaniem środków ograniczających umowne korzyści.
        Zgodnie z art. 14na § 2 Ordynacji podatkowej:
      Przepisów art. 14k-14n nie stosuje się, jeżeli korzyść podatkowa, stwierdzona w
      decyzjach wymienionych w § 1, jest skutkiem zastosowania się do utrwalonej
      praktyki interpretacyjnej, interpretacji ogólnej lub objaśnień podatkowych.

## Pouczenie o prawie do wniesienia skargi na interpretację

Mają Państwo prawo do zaskarżenia tej interpretacji indywidualnej do Wojewódzkiego
    Sądu Administracyjnego (...). Zasady zaskarżania interpretacji indywidualnych reguluje
    ustawa z dnia 30 sierpnia 2002 r. Prawo o postępowaniu przed sądami administracyjnymi
    (t. j. Dz. U. z 2024 r. poz. 935 ze zm.; dalej jako „PPSA”).
    Skargę do Sądu wnosi się za pośrednictwem Dyrektora KIS (art. 54 § 1 PPSA). Skargę
    należy wnieść w terminie trzydziestu dni od dnia doręczenia interpretacji indywidualnej
    (art. 53 § 1 PPSA):
        w formie papierowej, w dwóch egzemplarzach (oryginał i odpis) na adres: Krajowa
        Informacja Skarbowa, ul. Warszawska 5, 43-300 Bielsko-Biała (art. 47 § 1 PPSA), albo

        w formie dokumentu elektronicznego, w jednym egzemplarzu (bez odpisu), na
        adres Krajowej Informacji Skarbowej na platformie ePUAP: /KIS/wnioski albo /KIS
        /SkrytkaESP (art. 47 § 3 i art. 54 § 1a PPSA).
    Skarga na interpretację indywidualną może opierać się wyłącznie na zarzucie naruszenia
    przepisów postępowania, dopuszczeniu się błędu wykładni lub niewłaściwej oceny co do
    zastosowania przepisu prawa materialnego. Sąd jest związany zarzutami skargi oraz
    powołaną podstawą prawną (art. 57a PPSA).

## Podstawa prawna dla wydania interpretacji

Podstawą prawną dla wydania tej interpretacji jest art. 13 § 2a oraz art. 14b § 1 Ordynacji
    podatkowej.