আগ্রা ছিল সম্রাট আকবরের রাজধানী। সিকান্দ্রা শহরের বাইরে তাঁর সমাধিসৌধ ছিল আগ্রার দুর্গের অবস্থান। ফতেহপুর সিক্রির কয়েক মাইল পশ্চিমে তিনি এক পুত্রের জন্মোৎসব পালনের জন্য নির্মিত বিস্ময়কর নির্জন শহর ফতেহপুর সিক্রিতে অবস্থিত ছিলেন। তিনি উত্তর-পশ্চিম সীমান্তে যুদ্ধ করার জন্য পরিত্যাগ করেন।
মহান আকবরের মৃত্যুর পর আগ্রা প্রতিষ্ঠিত হয়।