বেশ কিছু অমূল্য ফ্রেসকো মারাত্মকভাবে ক্ষতিগ্রস্ত বা ধ্বংস করা হয়েছে, বিশেষ করে অমূল্য শিল্পকর্ম সিমাবু (১২২৬ ১৩৩৭) দ্বারা যা আপার চার্চের ভল্টেড ছাদের একটি অংশে ছিল, যা ভূমিকম্পের সময় মেঝেতে পড়ে ছিল।
দা ভিঞ্চির কাজগুলো হয় খুব খারাপভাবে ক্ষতিগ্রস্ত অথবা ধ্বংস হয়ে গেছে, এমনকি ম্যাডোনা অব দ্য রকসও, যা আপার চার্চের ভল্টেড ছাদের একটা অংশে দেখানো হয়েছে।