এজেন্সিগুলির মিশনের পার্থক্য এবং ঝুঁকির মাত্রাগুলি গুণগত ও পরিমাণগতভাবে নির্ধারণ করার অসুবিধার কারণে সংস্থা দ্বারা ব্যবহৃত নির্দিষ্ট ঝুঁকির বিশ্লেষণ পদ্ধতিগুলি পরিবর্তিত হতে পারে।
প্রতিটি সংস্থার জন্য যে ঝুঁকি বিশ্লেষণ পদ্ধতি ব্যবহার করা হয় তা একই।