পশ্চিমা বাণিজ্যের কেন্দ্র হওয়ার পাশাপাশি নাগাসাকি ক্যাথলিক চার্চের জন্য জাপানে একটি দৃঢ় অবস্থান প্রদান করেছিল, যা আজ টোকুগাওয়া শোগানদের অধীনে ২৫০ বছর ধরে নিষ্ঠুর দমনের পরে পুনরুজ্জীবিত হয়েছে।
নাগাসাকি বিদেশী বিদ্বেষের কেন্দ্র হয়ে ওঠে যেখানে পশ্চিমা বাণিজ্য নিষিদ্ধ ছিল।