যদিও জেন দ্বাদশ শতাব্দী থেকে জাপানে উপস্থিত ছিলেন, তার প্রতিপত্তি কামাকুরা শাসনের অধীনে শুরু হয়েছিল, যা রহস্যময় চীনা দর্শনকে জাপানী সংবেদনশীলতা, ইমপ্রেশনিজম এবং ফর্ম এবং আচারের প্রেমের সাথে প্রশংসনীয়ভাবে মানানসই বলে মনে করেছিল।
যদিও জেন জাপানে উপস্থিত ছিলেন, এটি কামাকুরা শাসনের আগ পর্যন্ত দেশের প্রধান ধর্ম হয়ে ওঠে নি।