ফুঞ্চালের গভীর প্রাকৃতিক পোতাশ্রয় ১৫শ এবং ১৬শ শতাব্দীতে শহরটির উন্নয়ন ত্বরান্বিত করেছিল, যখন মা?­দেই?­রা দূরপ্রাচ্য এবং আমেরিকা যাওয়ার পথে অভিযান চালানোর জন্য পরিচিত হয়ে উঠেছিল।
ফুঞ্চাল হল মনুষ্যসৃষ্ট একটি বন্দর যা ১৩শ শতাব্দীতে ব্যবহৃত হত।