কিছু দূষণকারী পদার্থের জন্য প্রাসঙ্গিক জটিল বায়ুমন্ডলীয় রসায়ন শনাক্ত করা ছাড়াও, বায়ু মানের মডেলারদের অবশ্যই পরিবর্তনশীল আবহবিদ্যা এবং নির্গমনের স্থানিক ও কালগত বণ্টনের সাথে সম্পর্কিত অনিশ্চয়তার সাথে মোকাবিলা করতে হবে।
এটা গুরুত্বপূর্ণ যে এয়ার কোয়ালিটি মডেলাররা বিভিন্ন ধরনের ভেরিয়েবল অ্যাক্সেস করতে সক্ষম।