যে পাহাড়ের উপর এটি অবস্থিত এবং যা মধ্যযুগে একটি ম্যালেরিয়ার জলাভূমি দ্বারা বেষ্টিত ছিল, তার নামানুসারে নামকরণ করা হয়েছে, ভ্যাটিকান ৬০০ বছরেরও বেশি সময় ধরে পোপের বাসভবন ছিল, কিন্তু ১৯২৯ সালে মুসোলিনি স্বাক্ষরিত ল্যাটেরান চুক্তির পর ইতালি থেকে স্বাধীন একটি সার্বভৌম রাষ্ট্র।
ভ্যাটিকান ছয় শতাব্দীরও বেশি সময় ধরে পোপের গৃহ হিসেবে সেবা করে আসছে।