কিছু কিছু ওষুধ, যেমন টেস্টোস্টেরন রিপ্লেসমেন্ট থেরাপি, দীর্ঘকাল ধরে এ্যানাবোলিক স্টেরয়েড ব্যবহার, কেমোথেরাপির মত ক্যান্সারের ওষুধ, কিছু কিছু এ্যান্টিবায়োটিক বা বিষণ্ণতা কাটানোর ওষুধও শুক্রাণুর মান ও সংখ্যা কমিয়ে দিতে পারে।
কিছু ওষুধ, যেমন টেস্টোস্টেরন প্রতিস্থাপন থেরাপি, অ্যানাবলিক স্টেরয়েডের দীর্ঘমেয়াদী ব্যবহার, কেমোথেরাপি, কিছু অ্যান্টিবায়োটিক, বা এন্টিডিপ্রেসেন্টের মতো ক্যান্সার ঔষধও শুক্রাণুর মান এবং সংখ্যা কমাতে পারে।