cometadata/datacite-titles-descriptions-related-identifiers huggingface dataset:
DOI: 10.15472/70gq9k
title: Inventario arbóreo del Jardín Botánico Universitario del campus Meléndez de la Universidad del Valle, Santiago de Cali.

description: El campus Meléndez de la Universidad del Valle (Santiago de Cali, Valle del Cauca) posee una gran diversidad de especies de plantas y fue declarado Jardín Botánico Universitario (JBU) en el año 2010 (Acuerdo 004 de 2010). Este estudio muestra que gran parte de la vegetación del campus es representativa del ecosistema de bosque seco tropical. Se registraron 5011 individuos con un DAP ≥ 10 cm correspondientes a 184 especies, 144 géneros y 50 familias. Las especies con mayor número de individuos fueron Mangifera indica y Pithecellobium dulce con 696 y 546 individuos respectivamente.
DOI: 10.15472/aukumf
title: Ictiofauna Asociada a los Cativales del Municipio de Riosucio, como Aspecto Relevante dentro de la Estructura Ecológica Principal del Chocó Biogeográfico

description: El Chocó Biogeográfico en especial el Bajo Atrato, cuenta con una inusual riqueza de flora, fauna y cultural, que les brinda a sus comunidades recursos naturales de gran valor, entre los que sobresalen las especies de alto valor maderable comercial, sin embargo, enfrenta una problemática ambiental, social y económica en las distintas áreas de los bosques naturales que se traduce en su deterioro progresivo y en la pérdida significativa de la Biodiversidad. La destrucción y devastación de los bosques tropicales, puede entenderse desde varias perspectivas ambientales. Para comenzar es preciso mencionar que resulta ser una zona de gran relevancia ecológica que incluye además a los Cativales de la zona baja del Atrato. La población del Priora copaifera, se desarrolló de manera importante la cual, llega a sobrepasar lo 20m de altura. Además se derrollan otras especies arbóreas de gran interés como dormilón (Pentaclethra macroloba); el bambudo (Pterocarpus officinalis); el mangle duro (Cynometra martiniana), el Cativo (Prioria copaifera); el salero (Pachira aquatica); el Güino (Carapa guianensis) y el roble (Tabebuia rosea), Cecropia sp (Yarumo), Aserrin (Parkia pendula), Lirio (Crouma macrocarpa), Hobo (Spondias mombim) entre otras. Por otra parte, los ecosistemas de esta área resultan de gran importancia para el descanso y alimentación de varias especies de aves migratorias, aunque también alberga hábitats críticos para la fauna silvestre regional residente. Con el ánimo de contribuir de forma directa a la real problemática ambiental, social y económica en las distintas áreas de influencia bosque de la zona baja del Atrato en el entorno potencial forestal, lo cual se traduce en su deterioro progresivo y en la pérdida significativa de biodiversidad, costumbres y equilibrio ecológico, en función a lo mencionado, se estructuraron los bosques de Cativo (Prioria copaifera), metodologías y resultados de los muestreos de campo resaltando los estados de desarrollo empleados en el desarrollo del proyecto, en él se expresa la forma de escogencia de los sitios de muestreo, el trabajo en campo y la forma como se llevó a cabo el procesamiento de la información obtenida , así como un panorama en función de las especies asociadas a sus poblaciones a fin de entender su dinámica y determinar sus densidades poblacionales, que a su vez a su vez serán incluidas en el documento de Estructura ecológica Principal del departamento del Chocó.
DOI: 10.15472/fijwbi
title: Flora de las sabanas inundables de las cuencas de los ríos Bita, Manacacías y Cravo Sur - SULU II

description: Se reconocieron seis tipos de sabana para la ventana Bita (Sabana Alta de Arena, de Banco y de Ripia, Médano, Sabana Baja Inundable y Saladillal); Tres para Manacacías (Sabana Alta no inundable, Sabana Baja no inundable y Sabana Inundable) y tres para Palmarito (Sabana Inundable de Banco, Sabana Inundable de Bajo y Estero). Se realizaron transectos de 100 metros al azar, en los diferentes tipos de ecosistemas, en dónde cada 10 metros se hacía una parcela de 1x1mts en dónde se contaban todos los individuos presentes y se colectaban las muestras para realizar una posterior identificación u homologación de especies presentes en cada parcela.
DOI: 10.15472/ofhhcm
title: Aves de la cuenca media del río Chambery, Caldas

description: Bajo el marco del proyecto conservación y uso sostenible de la biodiversidad de los Andes colombianos, se estudió la composición y estructura de la avifauna asociada a trece elementos del paisaje en la cuenca media del río Chambery, en los municipios de Aranzazu y Salamina, departamento de Caldas entre marzo y octubre de 2006. Se obtuvieron 4251 registros pertenecientes a 134 especies, entre las que se destacan dos especies amenazadas en Colombia, el atlapetes de anteojos (Atlapetes flaviceps) y el tapaculo de Stiles (Scytalopus stilesi).
DOI: 10.1594/pangaea.251312
title: Nannofossil abundance of Hole 66-489

description: Relative abundance: D = dominant, A = abundant, C = common, F = few, R = rare, T = trace, P = present (numerical values are abundance in percent)
DOI: 10.1594/pangaea.51927
title: Planktic foraminifera counts in surface sediment samples
DOI: 10.1594/pangaea.687745
title: Microplankton abundance at Station MARCH-1997-GN36199704601MSB07 in the euphotic zone of the Aegean Sea in spring 1997. Part 2 - dinoflagellates

description: Microplankton species composition analysis was performed according to the inverted microscope method of Utermoehl. Samples for identification and enumeration of larger phytoplankton cells (&gt;5µm) were preserved in alkaline Lugol solution. Utermoehl, H., 1958. Zur Vervollkommung der quantitativen Phytoplankton-Methodik. Mitt. Int. Ver. Theor. Angew. Limnol., 9:1-38.
DOI: 10.15468/bamgbn
title: arim

description: Collection Arim : Arthropodes d'interet medical ( Arthropods of medical interest)

Ird montpellier.
DOI: 10.15468/htcyxb
title: SILENE-FAUNE-PACA - DREAL_PACA_-_N2000_-_Parc_Naturel_Régional_de_Camargue_2017_12_18

description: DREAL PACA - N2000 - Parc Naturel Régional de Camargue
DOI: 10.15468/jhlacu
title: Paleobotany Specimens

description: As the state’s natural history museum, we maintain exceptionally large holdings of specimens from Oklahoma. For example, one collection extensively documents the palynology of 11 of the 17 major coal seams in Oklahoma, many of which are no longer available due to abandonment, flooding and reclamation. Nevertheless, we also have specimens from all 50 states and more than 50 countries. Overall, the collections contain more than 250 type and figured specimens.
DOI: 10.15468/na7jbv
title: Species plots from the Norwegian Vegetation Mapping Programme

description: As an integrated part of an on-going survey programme for vegetation mapping, plant species have been recorded. This dataset contains 18 521 registrations of plants from 1190 different circular plots throughout Norway. All species localities are georeferenced, the spatial uncertainty is provided, and additional ecological information is reported.
DOI: 10.15468/owocvj
title: Mollusca collection, Museum of Natural and Environmental History, Shizuoka

description: Mollusca specimens deposited in Museum of Natural and Environmental History, Shizuoka
DOI: 10.15468/xczem3
title: CNIN/Mantodea
DOI: 10.15468/zmnk0m
title: FBIP:IZIKO-UCT:Historical Survey (1930-1980)

description: Around the 1930’s Stevenson and Day along with the University of Cape Town (UCT) started up the UCT ecological survey project which aimed to create a reference collection of the biodiversity along the southern African coastline and various other localities around the world (e.g. Beaufort shelf transect Alaska, Madagascar, etc.) (Griffiths et al. 2010). Initially the survey/project was conducted along the shoreline of southern Africa (estimated collection areas: 36). The survey/project was later expanded to surveying the estuaries of southern Africa (estimated collection areas: 17). The survey/project was completed by conducting deeper water trawls and dredges of the west, south and east coast of southern Africa. It is important to note that each collection area contains various collection sites, for example False Bay (collection area) contains an estimated 856 collection sites. The reference collection and registers were donated to the IZIKO South African museum in the 1960’s by UCT. Numerous amounts of literature have been published by using the data in the registers (Barnard 1951, Stock & Day 1959, Stock & Day 1962, Griffiths 1974, Blaber 1974 and Griffiths et al. 2010). Currently there are a number of taxanomic projects underway, that rely on the data contained within the registers. By making the data available in a sensible electronic format will greatly improve the time taken to complete current and future projects that rely on the registers for data. Along with the reference specimen collection it also contains a vast number of observational records, which could potentially provide a massive historical database of species occurrences dating back to more than forty years ago. Datasets such as these could potentially give us greater insights into the effects of global change on biodiversity (Chapman 2005, Chapman 2010).
DOI: 10.15472/2kwarh
title: Anillamiento de Aves Sierra Nevada de Santa Marta - Proyecto Cruzando el Caribe

description: Base de datos con registros de capturas y recapturas de aves anilladas en la Sierra Nevada de Santa Marta, Magdalena, Colombia. La base de datos contiene nombre científico y nombre común de las especies, nombre de la localidad con coordenadas geográficas y altura, fecha de captura, nombre del anillador, número de anillo, código del esquema del anillo (0 = ninguno, 1 = SELVA, 2 = ProAves, 3 = USGS, 4 = otro), url para reporte de recapturas y recuperaciones del anillo, codigo de captura (1 = nueva, 2 = recaptura, 3 = no anillado), edad (0 = desconocido, 1 = volanton, 2 = juvenil, 3 = inmaduro, 4 = adulto), sexo (0 = desconocido, 1 = macho, 2 = hembra), cantidad de grasa subcutánea (códigos de 0 a 8 (Kaiser 1993)), músculo pectoral (Códigos de 0 a 3 (Redfen & Clark 2001)), cuerda alar (mm) y peso (g). La precisión de la información es del 100%, tomada en campo por anilladores certificados. Los datos corresponden a jornadas de anillamiento de esfuerzo constante en estaciones fijas de 10 a 15 redes de niebla de 12 o 18 m, abiertas desde el amanecer por un promedio de 5 horas. NOTA - Los Colibríes no fueron anillados, el código que aparece en anillo de colibríes es un registro numérico de la base de datos, por lo tanto no son individuos diferentes necesariamente. Para la identificación se utilizaron las siguientes guías de campo: Hilty & Brown 1986, Pyle 1997, Sibley 2001, Restall 2006.
DOI: 10.15472/5e9jiq
title: Segunda caracterización biológica de aves del proyecto "Incorporación de la Biodiversidad en el sector cafetero en Colombia"

description: Segunda caracterización biológica del proyecto “Incorporación de la biodiversidad en el sector cafetero en Colombia”, utilizada para identificar las especies existentes en los paisajes cafeteros y evaluar la estrategia de restauración implementada anteriormente a través de herramientas de manejo del paisaje. Caracterización biológica de aves con 8007 registros, encontradas en 18 agroforestales, 5 sitios de árboles dispersos, 16 bosques, 13 cafetales, 8 cercas vivas y 15 minicorredores de los departamentos de Quindío, Valle y Nariño. Las caracterizaciones se realizaron durante el segundo semestre del año 2012. La metodología utilizada fue una adaptación de la metodología desarrolla por el Instituto Humboldt para la Caracterizaciones biológicas en paisajes rurales. Se registraron las aves observadas sobre tres puntos de conteo en transectos de 150m para cada elemento del paisaje caracterizado. La base de datos contiene información sobre familia, especies, número de individuos, amenaza, endemismo, migración y coordenadas del sitio de colección. Se encontraron alrededor de 244 especies de aves de 46 familias.
DOI: 10.15472/5ttqll
title: Caracterización de flora, edafofauna epígea, anfibios y aves del Complejo de Páramos Pisba, Boyacá

description: Este conjunto de datos contiene 3018 registros biológicos de Plantas, Aves, Anfibios y Artrópodos obtenidos para la realización del Estudio Biótico para la delimitación del complejo de páramos de Pisba – Boyacá, utilizando tres transectos ubicados en las regiones de páramo en los municipios de Socotá, Socha y Tasco, dentro de los cuales se analizó la variación en aspectos ecológicos de las especies presentes a lo largo de un gradiente altitudinal desde los 2800 a los 3200 m.
DOI: 10.15472/ahcjrq
title: Herbario virtual bosques secos de Colombia - Sección herbario ICESI

description: Este conjunto de datos contiene los registros biológicos y medidas de rasgos funcionales asociados a las imágenes digitales de alta resolución de los ejemplares del herbario virtual bosques secos de Colombia. Este ecosistema se caracteriza por presentar una fuerte estacionalidad de lluvias y un período de tres a ocho meses de sequía. Se encuentra en las zonas bajas de la costa Caribe, los valles interandinos de los ríos Cauca y Magdalena, la región del Chicamocha en Santander y Norte de Santander, el cañón del río Patía en los departamentos de Cauca y Nariño, y los Llanos. Se presentan 2000 registros de bosque seco del herbario ICESI, los cuales fueron seleccionados con base al sitio de colecta; sólo los registros que provenían de localidades donde hay bosque seco fueron incluidos. Éstos fueron ubicados en la colección, codificados, sistematizados y digitalizados con el fin de publicar las imágenes en el recurso virtual "Herbario virtual Bosques Secos de Colombia" en Flickr. Cada registro tiene una dirección electrónica que permite acceder a la imagen del ejemplar en alta resolución.
DOI: 10.15472/bwmmwe
title: Flora del Bosque de los Guayupes Acacias, Meta, Colombia

description: Contiene 59 individuos los cuales hacen parte de la evaluación ecológica rápida del Bosque de los Guayupes, Acacías, Meta, Colombia.
DOI: 10.15472/fr2gym
title: Caracterización Ecológica de la Mastofauna del Alto Galápagos

description: El área de influencia del alto Galápagos en jurisdicción de San José del Palmar posee unas condiciones naturales que se traducen en una diversidad de hábitats que hacen posible la existencia de una variedad de vida en la región, convirtiéndose esté en un lugar atractivo para el estudio de poblaciones y comunidades faunísticas, estos hábitat se constituyen en uno de los más importantes atributos que convierten a la zonas de alta montaña en regiones prioritarias para consolidar estrategias de conservación de la biodiversidad tropical. Sin embargo, para ello es necesario avanzar en el conocimiento de la estructura, dinámica y función de la fauna en estos ecosistemas estratégicos.

La enorme riqueza faunística que presentan esta región tropical, el gran número de especies que pueden estar sin describir y la gran amenaza de desaparición de muchas de estas por la destrucción de sus hábitats debido a actividades humanas (cultivos, corte de madera, ganadería etc.), hacen que estas caracterizaciones tengan una enorme importancia tanto científica como biológica; por lo anterior se hace necesario establecer criterios para definir prioridades de investigación, como los inventarios bióticos y proporcionar información ecológica que permita generar estrategia para el conocimiento y la conservación de las mismas.

El presente documento presenta los resultados de la caracterización de vertebrados terrestres (Anfibios, Reptiles, Aves y Mamíferos), siguiendo métodos estandarizados y modificados según las condiciones topográficas del Cerro Galápagos y genera información necesaria para el manejo (conocimiento, valoración y conservación) de poblaciones y comunidades de los diferentes grupos faunísticos
DOI: 10.15472/oyj27o
title: Herbario Pontificia Universidad Javeriana

description: Plantas, hongos y líquenes depositadas en la colección del Herbario Pontificia Universidad Javeriana. Las colecciones provienen principalmente de la región altoandina de la Cordillera Oriental, cubre 33 departamentos del territorio nacional colombiano e incluye algunos ejemplares de Estados Unidos, Bolivia, Brasil, Costa Rica, Cuba, Ecuador, España, Francia, Guayana Francesa, Guayana Británica, Italia, México, Panamá, Perú, Puerto Rico, República Dominicana, Surinam y Venezuela. Ejemplares representados en 7 filos distribuidos en 24 clases, 132 órdenes y 438 familias. Actualmente cuenta con 13.131 registros identificados hasta especie. La colección de orquídeas se considera como la más representativa e incluye más de 3.912 especímenes, incluyendo colecciones Tipo La colecta de ejemplares proviene de diferentes actividades como proyectos de investigación y salidas de campo programadas en las cátedras de la universidad. La publicación de los datos se enmarca bajo un convenio de cooperación acordado entre el Instituto de Investigación de Recursos Biológicos Alexander von Humboldt y la Pontificia Universidad Javeriana.
DOI: 10.15472/rmn2cj
title: Ictiofauna de las sabanas inundables de las cuencas de los ríos Bita, Manacacías y Cravo Sur - SULU II

description: Desde el 2 al 20 julio del 2018 se realizaron las expediciones a las sabanas inundables del río Bita, serranía del río Manacacías y reserva Palmarito-Casamba, cuenca del río Cravo Sur. Durante esta fecha se evaluaron las tres ventanas de trabajo, y se establecieron un total de 38 estaciones de muestreo en diferentes tipos de hábitats entre los que se encuentran lagunas, caños, morichales, esteros, madreviejas, cañadas y jagüeyes. A nivel general, se registró un total de 5834 individuos, distribuidos en 151 especies, 103 géneros, 35 familias y ocho órdenes. Los Characiformes, Cichliformes y Siluriformes fueron los más diversos y abundantes. Los caños y lagunas fueron los hábitats con un mayor número de especies, las variables que influyeron sobre los ensamblajes ícticos fueron el pH, ancho del cauce, flujo del agua y el porcentaje de hojarasca. En las tres ventanas evaluadas, no se registraron especies bajo categorías de amenaza; se registraron cinco especies comerciales, cuatro de consumo y ocho migratorias, la gran mayoría fueron de uso ornamental.
DOI: 10.15472/suxc4t
title: Caracterización morfométrica del bagre rayado para la cuenca del Magdalena

description: Se cuenta con 2013 registros morfométricos de del bagre rayado Pseudoplatystoma magdaleniatum tomados a lo largo del río Magdalena (cuenca lata, media y baja), del río Cauca (cuenca baja) y del río San Jorge (cuenca baja) a nivel de longitud estándar, peso total, peso evicerado, peso gónada, peso hígado y peso grasa
DOI: 10.15472/wpykyq
title: Insectos recolectados en trampas Malaise en el departamento de Santander - Proyecto Colombia Bio

description: Se procesaron los ordenes de insectos, Psocoptera, Hemiptera, Hymenoptera, Coleoptera y Diptera recolectados en trampas Malaise durante la Expedición de El Peñón -Santander, obteniendo un total de 855 individuos seleccionados, los cuales se determinaron al menos a nivel de familia, se invididualizaron y asignó un código de la colección entomológica del Instituto Humboldt, se les extrajo una muestra de tejido con el objetivo de ser enviadas a posterior análisis genético. Además se toma registro fotográfico a cada voucher para ser incorporada junto con toda la información asociada a la base de datos BOLD Systems.
DOI: 10.1594/pangaea.240039
title: Benthic foraminifera abundance of Hole 76-533

description: Relative abundance: D = dominant, A = abundant, C = common, F = few, R = rare, T = trace, P = present (numerical values are abundance in percent)
DOI: 10.1594/pangaea.605401
title: Numbers and weights of nematodes from surface sediments of the Iberian deep sea basin (Table 7)

description: Counts per core, core surface 25 cm**2
DOI: 10.1594/pangaea.684666
title: Benthic foraminifera accumulation rate and benthic foraminiferal productivity proxies at ODP Site 165-999 in the Caribbean (Appendix A)

description: This study tests the hypothesis that the late Miocene to early Pliocene constriction and closure of the Central American Seaway (CAS), connecting the tropical Atlantic and East quatorial Pacific (EEP), caused a decrease in productivity in the Caribbean, due to decreased coastal upwelling and an end to the connection with high-productivity tropical Pacific waters. The present study compared paleoceanographic proxies for the interval between 8.3 and 2.5 Ma in 47 samples from south Caribbean ODP Site 999 with published data on EEP DSDP Site 503. Proxies for Site 999 include the relative abundance of benthic foraminiferal species representing bottom current velocity and the flux of organic matter to the sea floor, the ratio of infaunal/epifaunal benthic foraminiferal species and benthic foraminifer accumulation rates (BFARs). In addition, we calculated % resistant planktic foraminifers species and used the previously published % sand fraction and benthic carbon isotope values from Site 999. During early shoaling of the Isthmus (8.3-7.9 Ma) the Caribbean was under mesotrophic conditions, with little ventilation of bottom waters and low current velocity. The pre-closure interval (7.6-4.2 Ma) saw enhanced seasonal input of phytodetritus with even more reduced ventilation, and enhanced dissolution between 6.8 and 4.8 Ma. During the post-closure interval (4.2-2.5 Ma) in the Caribbean, paleoproductivity decreased, current velocity was reduced, and ventilation improved, while the seasonality of phytodetrital input was reduced dramatically, coinciding with the establishment of the Atlantic-Pacific salinity contrast at 4.2 Ma. Our data support the hypothesis that late Miocene constriction of the CAS at 7.9 Ma and its closure at 4.2 Ma caused a gradual decrease in paleoproductivity in the Caribbean, consistent with decreased current velocity and seasonality of the phytodetrital input.
description: Age model of Kameo and Bralower (2000). Depth is composite depth (mcd)
description: Supplement to: Jain, Sreepat; Collins, Laurel S (2007): Trends in Caribbean Paleoproductivity related to the Neogene closure of the Central American Seaway. Marine Micropaleontology, 63(1-2), 57-74
DOI: 10.1594/pangaea.727353
title: Planktic foraminifera counts of sediment core V19-19