cometadata/datacite-titles-descriptions-related-identifiers huggingface dataset:
DOI: 10.5878/x5wv-0133
title: Comparative Life-Cycle Assessment for Renovation Methods of Waste-Water Sewerage Systems in Apartment Buildings – Comprehensive Data used in SimaPro for Model and Analyse LCA
title: Comparative Life-Cycle Assessment for Renovation Methods of Waste-Water Sewerage Systems in Apartment Buildings – Comprehensive Data used in SimaPro for Model and Analyse LCA

description: Appendix on how life-cycle assessment was modeled in the LCA toolset SimaPro for the article: Comparative life-cycle assessment for renovation methods of waste water sewerag.

The dataset was originally published in DiVA and moved to SND in 2024.
description: Bilaga om hur livscykelanalys modellerades i LCA-verktygsuppsättningen SimaPro för artikeln: Comparative life-cycle assessment for renovation methods of waste water sewerag.

Datasetet har ursprungligen publicerats i DiVA och flyttades över till SND 2024.
DOI: 10.5878/62ed-8017
title: Dataset of confocal microscopy from plant samples - High-throughput characterization of cortical microtubule arrays response to anisotropic tensile stress
title: Datauppsättning från konfokalmikroskopi av växtprover – ”High throughput”-karakterisering av kortikala mikrotubuli-nätverks svar på mekanisk stress. - Dataset of confocal microscopy from plant samples - High-throughput characterization of cortical microtubule arrays response to anisotropic tensile stress

description: The data set contains Tiff Z-stacks from light-grown hypocotyls and cotyledons of cortical microtubule (CMT) reporter lines either with few or no ablated cells from a time series experiment. This data set was analyzed with a new semi-automated image analysis workflow we have developed to quantify CMTs reorganization in individual cells following an ablation (https://github.com/VergerLab/MT_Angle2Ablation_Workflow).

The dataset in the zip file was analyzed using the scripts on GitHub (https://github.com/VergerLab/MT_Angle2Ablation_Workflow). A step by step describes and explains all the scripts of the image analysis procedure. The intermediate data generated by the analysis method can be found on zenodo (https://zenodo.org/record/7436075#.Y5rmd-zMJF8). 

The documentation file Example_2D_Image.tif gives a visual representation from a typical z-stack.
description: Datamängden innehåller Tiff Z-stackar från transgena ljusodlade hypokotyler och hjärtblad från Arabidopsis thaliana uttryckande kortikala mikrotubuli (CMT)-reporterlinjer antingen med få eller inga dödade celler från ett tidsserieexperiment. Denna datauppsättning analyserades med ett nytt halvautomatiserat arbetsflöde för bildanalys som vi har utvecklat för att kvantifiera CMT-omorganisation i enskilda celler efter en ablation. (https://github.com/VergerLab/MT_Angle2Ablation_Workflow).

Datamängden i zip-filen analyserades med hjälp av skripten på GitHub (https://github.com/VergerLab/MT_Angle2Ablation_Workflow). Ett steg för steg beskriver och förklarar alla skript för bildanalysproceduren. De mellanliggande data som genereras av analysmetoden kan hittas på zenodo (https://zenodo.org/record/7436075#.Y5rmd-zMJF8).

Dokumentationsfilen Example_2D_Image.tif ger en visuell representation från en typisk z-stack.
DOI: 10.5878/001048
title: SIFO 1989: The natural step
title: SIFO 1989: Det naturliga steget

description: This study was carried out by the Swedish Institute of Public Opinion Research (SIFO) at the request of an environmental campaign called ´Det naturliga steget´. The first interview took place before the campaign. Respondents were asked about their interest in environmental issues and how they get information about such issues; events the respondents felt anxious about during the last year, and to what extent they felt anxious about environmental pollution; opinion on the environmental situation now compared with 10 years ago, and if the pollution of the environment threatens the survival of mankind; the five most important causes of environmental pollution; concern about 20 different environmental problems and confidence in the way different groups handles the environmental issue; own activities during the last year to improve environment and changes one is prepared to do for improving the environment. Furthermore the respondents were asked if they agreed or disagreed with eight different statements concerning the environment. The knowledge of environmental issues was also tested by a battery of questions. The second interview was carried through after the accomplishment of the campaign. Many of the questions asked in the pre-campaign interview was also asked this time. New questions dealt with knowledge of the campaign. One part of the campaign consisted of a pamphlet and a tape sent to all households in Sweden. The respondents were asked about their usage of and attitude toward this information material. Background variables include information on age, housing, size of household, age of members of household, adult children moved out, car ownership, amount of money needed in household, personal income and household income, marital status, education, occupation, employed or self-employed, public or private sector, trade union membership, size of place of work, gender, Swedish citizenship and party preference.
description: Undersökningen genomfördes vid två tillfällen, en gång innan kampanjen "Det naturliga steget" genomfördes och en gång efter. Frågorna gällde bland annat oro under det senaste året, intresse för och kunskaper om miljöfrågor, orsaker till miljöproblem och hur orolig man är för olika miljöproblem. Andra frågor gällde förtroendet för olika grupper i samhället då det gäller miljöproblem och egna aktiviteter för att förbättra miljön. Den del av undersökningen som genomfördes efter kampanjen innehöll även frågor om hur man tagit del av programmet och hur man uppfattat det.
DOI: 10.57804/3gj5-xt38
title: Reflection seismic study of the Siljan Ring impact structure: Orsa - Raw data
title: Reflection seismic study of the Siljan Ring impact structure: Orsa - Raw data

description: Two new reflection seismic profiles over the Paleozoic successions of the western part of the Siljan Ring impact structure were acquired during 2011, the Mora and the Orsa profile. This data set concerns the Orsa profile. The profile has length of c. 12 km and the processed data image the geological section to about 3 km depth (Silurian siliciclastic and Ordovician carbonate rocks to serveral hundred metres depth, below disturbed Paleoproterozoic crystalline basement). During the survey, 542 source points (VIBSIST 3000) were recorded by 320 receiver channels for 30 seconds. From this recording, the following data sets were generated and published: 1) decoded and quality controlled raw data; 2) pre-processed (shot geometry applied) data; 3) stacked data; 4) migrated data; 5) depth converted data and velocity field.

This dataset contains the raw data of the Orsa profile after decoding the sweep signal the VIBSIST 3000 source.
Processing steps for this data set:
1: Read decoded VIBSIST data

Key acquisition parameters are:
Number of channels: 320 (160–160)
Near offset: 0m
Geophone spacing: 10 m
Geophone type: 28 Hz single
Source spacing: 20 m
Source type: VIBSIST 3000
Hit interval between hammer blows: 100–200 ms
Sweeps per source point: 3–4
Nominal fold: 80
Recording instrument: SERCEL 428UL
Sample rate: 1 ms
Field low cut: Out
Field high cut: 400 Hz
Record length: 30 s
Profile length: 12 km
Source points: 542
Dates acquired: 10/6–15/6: 2011

File format: SEGD rev 2; Field acquisition notes scanned to PDF

Digital shot records, one file per shot, according to SEG technical standard SEG-D revision 2.1 (SEG-D_r2.1, 2006); https://seg.org/Publications/SEG-Technical-Standards

Data is available on request due to file size.
description: År 2011 gjordes två nya reflexionsseismiska undersökningar över västra delen av Siljansringen, Mora och Orsa profilerna. Siljansringen är en struktur som uppkom för ca 377 miljoner sedan genom ett meteoritnedslag. Orsa profilen (detta dataset) är ca 12 km lång och visar de geologiska strukturerna till ca 3 km djup. Geologin består av flera hundra meter med siluriska klastiska sedimentära bergarter och ordoviciska karbonatbergarter som vilar på paleoproterozoiskt kristallint urberg. 

Datasetet innehåller rådata för Orsa-profilen, efter avkodning.

En mer detaljerad beskrivning av datasetet som inkluderar alla viktiga parametrar är tillgängligt på den engelska katalogsidan.

Data är tillgängliga efter förfrågan med anledning av filstorlek.
DOI: 10.5878/ef3e-ch95
title: Dynamic Mechanical Thermal Analysis Data of Sheets Made from Wood-Based Cellulose Fibers Partially Converted to Dialcohol Cellulose
title: Dynamic Mechanical Thermal Analysis Data of Sheets Made from Wood-Based Cellulose Fibers Partially Converted to Dialcohol Cellulose

description: This data article contains the dynamic mechanical thermal analysis (DMTA) results for sheets made from cellulose fibers partially converted to dialcohol cellulose. 

The DMTA tests were conducted at four different relative humidity levels: 0, 50, 60, and 70 % RH, and the temperature was swept between 10 and 113 °C. The DMTA results enable the understanding of the elastic, viscoelastic, and viscoplastic mechanical properties of this material at a wide range of temperature and relative humidity combinations.

A description of the collected variables and the initial specimen geometry can be found on the sheet "Readme". A graphical summary of the DMA results is provided on the following sheet named "SummaryGraphs". The raw data for the four runs can be found on the four final sheets. 

The dataset was originally published in DiVA and moved to SND in 2024.
description: En beskrivning av de insamlade variablerna och den initiala provets geometri finns på bladet "Readme". En grafisk sammanfattning av DMA-resultaten finns på följande ark med namnet "SummaryGraphs". Rådata för de fyra körningarna finns på de fyra sista arken.

Se engelsk beskrivning för mer information.

Datasetet har ursprungligen publicerats i DiVA och flyttades över till SND 2024.
DOI: 10.5878/9vfz-ca92
title: Data for: Early season mass-flowering crop cover dilutes wild bee abundance and species richness in temperate regions: a quantitative synthesis
title: Data för: Tidig säsongs massblommande grödtäckning späder ut vilda bins abundans och artrikedom i tempererade områden: en kvantitativ syntes

description: The dataset combines 22 datasets from 13 publications conducted in 9 temperate countries (20 European and 2 North American). The data was used to investigate if mass-flowering crop flowering time (early or late season), bloom state (during or after crop flowering) and extent of non-crop habitat cover in the landscape moderated the effect of mass-flowering crop cover on wild pollinator abundance and species richness in mass-flowering crop and non-crop habitats. 
The dataset include the following files: SNHds_final (16 variables, 583 Rows) which included the data for non-crop habitat analyses and, MFCds_final (15 variables, 348 Rows) which includes the data for mass-flowering crop habitat analyses.
description: Datauppsättningen kombinerar 22 dataset från 13 publikationer utförda i 9 tempererade länder (20 europeiska och 2 nordamerikanska). Data användes för att undersöka om massblommande grödas blomningstid (tidig eller sen säsong), blomningstillstånd (under eller efter grödans blomning) och omfattningen av icke-gröda habitattäckning i landskapet modererade effekten av massblommande grödtäckning på vilda pollinerare överflöd och artrikedom i massblommande grödor och icke-grödor livsmiljöer. 
Datauppsättningen innehåller följande filer: SNHds_final (16 variabler, 583 rader) som inkluderade data för habitatanalyser för icke-grödor och MFCds_final (15 variabler, 348 rader) som inkluderar data för massblommande växtmiljöanalyser.
DOI: 10.15468/dl.npp3x7
title: Occurrence Download

description: A dataset listing the 4469 species recorded in GBIF matching the query:
{
 "DatasetKey" : [
 "is Plants of Ghana"
 ]
}

 The dataset's 4469 records were derived from 1 constituent datasets; see https://api.gbif.org/v1/occurrence/download/0005003-250920141307145/datasets/export for details.
 
Data from some individual datasets included in this download may be licensed under less restrictive terms.
DOI: 10.5878/7e4t-sn25
title: Stig Sjödin's poetry in Swedish journals: A bibliography
title: Stig Sjödins lyrik i svenska tidskrifter: En bibliografi

description: Bibliography of Stig Sjödin's poetry in Swedish journals. The compilation is based on Professor Lars Furuland's bibliography in Svenskt bibliografiskt lexikon and on his own searches. 

The dataset was originally published in DiVA and moved to SND in 2024.
description: Bibliografi över Stig Sjödins lyrik i svenska tidskrifter. Sammanställningen bygger på professor Lars Furulands bibliografi i Svenskt bibliografiskt lexikon samt på egna sökningar.

Datasetet har ursprungligen publicerats i DiVA och flyttades över till SND 2024.
DOI: 10.5878/5wea-fk76
title: Starting structures and NMR and simulation relaxation data for the structural ensembles of Dengue protease NS2B/NS3pro
title: Startstrukturer och NMR- och simuleringsrelaxationsdata för de strukturella ensemblerna av Dengue-proteas NS2B/NS3pro

description: The dengue protease NS2B/NS3pro has been reported to adopt either an ‘open’ or a ‘closed’ conformation. We have developed a conformational filter that combines nuclear magnetic resonance (NMR) with molecular dynamics (MD) simulations to identify conformational ensembles that dominate in solution. Experimental values derived from relaxation parameters for the backbone and methyl side chains were compared with the corresponding back-calculated relaxation parameters of different conformational ensembles obtained from free MD simulations. Our results demonstrate a high prevalence for the ‘closed’ conformational ensemble while the ‘open’ conformation is absent, indicating that the latter conformation is most probably due to crystal contacts. Conversely, conformational ensembles in which the positioning of the co-factor NS2B results in a ‘partially’ open conformation, previously described in both MD simulations and X-ray studies, were identified by our conformational filter. Altogether, we believe that our approach allows for unambiguous identification of true conformational ensembles, an essential step for reliable drug discovery.
description: Dengueproteaset NS2B/NS3pro har rapporterats anta antingen en "öppen" eller en "stängd" konformation. Vi har utvecklat ett konformationsfilter som kombinerar kärnmagnetisk resonans (NMR) med molekylär dynamiska (MD)-simuleringar för att identifiera konformationella ensembler som dominerar i lösning. Experimentella värden härledda från relaxationsparametrar för ryggraden och metylsidokedjorna jämfördes med motsvarande beräknade relaxationsparametrar för olika konformationella ensembler erhållna från fria MD-simuleringar. Våra resultat visar en hög prevalens för den "slutna" konformationsensemblen medan den "öppna" konformationen är frånvarande, vilket indikerar att den senare konformationen troligen beror på kristallkontakter. Omvänt identifierades konformationella ensembler där positioneringen av kofaktorn NS2B resulterar i en "delvis" öppen konformation, som tidigare beskrivits i både MD-simuleringar och röntgenstudier, av vårt konformationsfilter. Sammantaget tror vi att vårt tillvägagångssätt möjliggör entydig identifiering av verkliga konformationella ensembler, ett viktigt steg för tillförlitlig läkemedelsupptäckt.
DOI: 10.5878/j8br-vd54
title: Vegetation cover estimates and sediment records for Gåsfjärden and Lake Storsjön, Sweden
title: Vegetationstäckning och sedimentdata för Gåsfjärden och Storsjön, Sverige

description: Datasets of vegetation cover estimates in percentage from Gåsfjärden and Lake Storsjön based on the Landscape Reconstruction Algorithm and the lignin phenols records of the sediment cores from Lake Storsjön and Gåsfjärden. For a more detailed description of the methodology, see 
Yang, B., Ljung, K., Ning, W., Filipsson H.L., Nielsen, A.B. Relationships between land use and terrestrial organic matter transfer to the Baltic Sea over the last 500 years. JGR Biogeosciences, Submitted.
description: Vegetationstäckning och sedimentdata från Gåsfjärden, Östersjön och Storsjön, Småland, Sverige.

Innehåller procentuell vegetationstäckning uppskattad med den pollenbaserade algoritmen Landscape Reconstruction Algorithm (LRA), samt mätningar av organiskt material i sedimentkärnor som gjorts med hjälp av ligninfenoler.

Se readme och den tillhörande artikeln för vidare metodbeskrivning:
Yang, B., Ljung, K., Ning, W., Filipsson H.L., Nielsen, A.B. Relationships between land use and terrestrial organic matter transfer to the Baltic Sea over the last 500 years. JGR Biogeosciences, Submitted.
DOI: 10.57804/ryn2-9s58
title: Type 2 diabetes and Change in Total Hip Bone Area and Bone Mineral Density in Elderly Swedish Men and Women: Supplementary material
title: Type 2 diabetes and Change in Total Hip Bone Area and Bone Mineral Density in Elderly Swedish Men and Women: Supplementary material

description: Supporting data to the manuscript "Type 2 diabetes and Change in Total Hip Bone Area and Bone Mineral Density in Elderly Swedish Men and Women"

In SMCC, Fasting plasma glucose concentrations were analysed using three different methods depending on date of collection; glucose dehydrogenase reagent (Bergman & Beving, instrument Advia 1650, Stockholm, Sweden), glucose oxidase method (Bayer, instrument Advia 1650, Leverkusen, Germany), and hexokinase method (Abbott, Abbott Architect, Illinois, USA).

In PIVUS, fasting plasma glucose concentrations were analysed using the standard method at Uppsala University Hospital.

In ULSAM, fasting plasma glucose concentrations (mmol/l) were measured by the glucose dehydrogenase method (Gluc-DH, Merck, Darmstadt, Germany).

The dataset was originally published in DiVA and moved to SND in 2024.
description: Supporting data to the manuscript "Type 2 diabetes and Change in Total Hip Bone Area and Bone Mineral Density in Elderly Swedish Men and Women"

Se engelsk beskrivning för mer information.

Datasetet har ursprungligen publicerats i DiVA och flyttades över till SND 2024.
DOI: 10.58141/4av5-kt46
title: Åloppe Human Remains
title: Åloppe mänskliga kvarlevor

description: Osteoarchaeological analysis of human remains from the Neolithic site Åloppe, Norrskog. The material has been analyzed during two occasions, partly in connection with the faunal analysis (see Gummesson 2008) and partly separately where also material that did not have context information was included. The material has been analyzed at the osteoarchaeological research laboratory at Stockholm University and its reference collections have been used. The database is in Swedish and Latin.
description: Osteoarkeologisk analys av mänskliga lämningar från den neolitiska lokalen Åloppe, Norrskog. Materialet har analyserats i två omgångar, dels i samband med att fauna materialet analyserades (se Gummesson 2008) och dels separat där även material som inte haft kontextinformation ingått. Materialet har analyserats vid osteoarkeologiska forskningslaboratoriet vid Stockholms universitet och dess referenssamlingar har använts. Databasen är utformad på svenska och latin.
DOI: 10.5878/h2hc-h513
title: Unique brood ester profile in a Varroa destructor resistant population of European honey bee (Apis mellifera)
title: Unik kullesterprofil i en Varroa destructor resistent population av europeiskt honungsbi (Apis mellifera)

description: Data of chemical compounds extracted from honey bee (Apis mellifera) brood in a varroa resistant and varroa susceptible population. Samples were taken 0, 6, 12, 18, 24, and 36 hours after brood capping by immersing pupae in pentane for 10 minutes. 6 hives from each population were used, and 3 replicates were taken per hive per time point. The FAME column was calculated by adding Methyl Palmitate, Linoloate, and Stearate together, while the FAEE columb was calculateed by adding Ethyl Palmitate, Linoloate, and Stearate together. Samples were analyzed using gas chromatography. 

R version 4.4.0 and RStudio version 1.4.1.748 were used to analyze the data. All packages and their version is listed in the attached R script. 

Data files included:
Scaramella_et_al_2024_Contrast.tsv: 16 rows × 12 columns
Scaramella_et_al_2024_Data.tsv: 210 rows × 14 columns
description: Data om kemiska föreningar utvunna från honungsbiyngel (Apis mellifera) i en varroaresistent och varroamottaglig population. Prover togs 0, 6, 12, 18, 24 och 36 timmar efter avtäckning av yngel genom nedsänkning av puppor i pentan under 10 minuter. 6 bikupor från varje population användes och 3 replikat togs per bikupa per tidpunkt. FAME-kolonnen beräknades genom att tillsätta metylpalmitat, linoloat och stearat tillsammans, medan FAEE-kolumnen beräknades genom att tillsätta etylpalmitat, linoloat och stearat tillsammans. Prover analyserades med användning av gaskromatografi.

R version 4.4.0 och RStudio version 1.4.1.748 användes för att analysera data. Alla paket och deras version listas i det bifogade R-skriptet.

Inkluderade datafiler:
Scaramella_et_al_2024_Contrast.tsv: 16 rader × 12 kolumner
Scaramella_et_al_2024_Data.tsv: 210 rader × 14 kolumner
DOI: 10.5878/17te-jg54
title: Dataset of confocal microscopy from plant samples - High-throughput characterization of cortical microtubule arrays response to anisotropic tensile stress
title: Datauppsättning från konfokalmikroskopi av växtprover – ”High throughput”-karakterisering av kortikala mikrotubuli-nätverks svar på mekanisk stress.

description: The data set contains Tiff Z-stacks from light-grown hypocotyls and cotyledons of cortical microtubule (CMT) reporter lines either with few or no ablated cells from a time series experiment. This data set was analyzed with a new semi-automated image analysis workflow we have developed to quantify CMTs reorganization in individual cells following an ablation (https://github.com/VergerLab/MT_Angle2Ablation_Workflow).

The dataset in the zip file was analyzed using the scripts on GitHub (https://github.com/VergerLab/MT_Angle2Ablation_Workflow). A step by step describes and explains all the scripts of the image analysis procedure. The intermediate data generated by the analysis method can be found on zenodo (https://doi.org/10.5281/zenodo.7436075). 

The documentation file Example_2D_Image.tif gives a visual representation from a typical z-stack.
description: Datamängden innehåller Tiff Z-stackar från transgena ljusodlade hypokotyler och hjärtblad från Arabidopsis thaliana uttryckande kortikala mikrotubuli (CMT)-reporterlinjer antingen med få eller inga dödade celler från ett tidsserieexperiment. Denna datauppsättning analyserades med ett nytt halvautomatiserat arbetsflöde för bildanalys som vi har utvecklat för att kvantifiera CMT-omorganisation i enskilda celler efter en ablation. (https://github.com/VergerLab/MT_Angle2Ablation_Workflow).

Datamängden i zip-filen analyserades med hjälp av skripten på GitHub (https://github.com/VergerLab/MT_Angle2Ablation_Workflow). Ett steg för steg beskriver och förklarar alla skript för bildanalysproceduren. De mellanliggande data som genereras av analysmetoden kan hittas på zenodo (https://doi.org/10.5281/zenodo.7436075).

Dokumentationsfilen Example_2D_Image.tif ger en visuell representation från en typisk z-stack.
DOI: 10.57804/3xew-2472
title: Confirming existing parameterizations for methane gas transfer velocity in lakes based on direct and high-frequent methods
title: Confirming existing parameterizations for methane gas transfer velocity in lakes based on direct and high-frequent methods

description: Data set for publication 'Gas transfer velocity determination for methane in a temperate lake using direct and high-frequency methods'.

The dataset was originally published in DiVA and moved to SND in 2024.
description: Se engelsk beskrivning.

Datasetet har ursprungligen publicerats i DiVA och flyttades över till SND 2024.