cometadata/datacite-titles-descriptions-related-identifiers huggingface dataset:
DOI: 10.15468/dztsm3
title: Disentangling the Anacondas: Revealing a New Green Species and Rethinking Yellows

description: This dataset contains the digitized treatments in Plazi based on the original journal article Rivas, Jesús A., Quintana, Paola De La, Mancuso, Marco, Pacheco, Luis F., Rivas, Gilson A., Mariotto, Sandra, Salazar-Valenzuela, David, Baihua, Marcelo Tepeña, Baihua, Penti, Burghardt, Gordon M., Vonk, Freek J., Hernandez, Emil, García-Pérez, Juán Elías, Fry, Bryan G., Corey-Rivas, Sarah (2024): Disentangling the Anacondas: Revealing a New Green Species and Rethinking Yellows. Diversity 16 (127): 1-28, DOI: 10.3390/d16020127Abstract: Anacondas, genus Eunectes, are a group of aquatic snakes with a wide distribution in South America. The taxonomic status of several species has been uncertain and/or controversial. Using genetic data from four recognized anaconda species across nine countries, this study investigates the phylogenetic relationships within the genus Eunectes. Akey finding was the identification of two distinct clades within Eunectes murinus, revealing two species as cryptic yet genetically deeply divergent. This has led to the recognition of the Northern Green Anaconda as a separate species (Eunectes akayima sp. nov), distinct from its southern counterpart (E. murinus), the Southern Green Anaconda. Additionally, our data challenge the current understanding of Yellow Anaconda species by proposing the unification of Eunectes deschauenseei and Eunectes beniensis into a single species with Eunectes notaeus. This reclassification is based on comprehensive genetic and phylogeographic analyses, suggesting closer relationships than previously recognized and the realization that our understanding of their geographic ranges is insufficient to justify its use as a separation criterion. We also present a phylogeographic hypothesis that traces the Miocene diversification of anacondas in western South America. Beyond its academic significance, this study has vital implications for the conservation of these iconic reptile species, highlighting our lack of knowledge about the diversity of the South American fauna and the need for revised strategies to conserve the newly identified and reclassified species.
DOI: 10.5281/zenodo.18042762
title: R project with data and code to reproduce the analysis on

description: This R project contains everything to reproduce the results found in the paper titled "Tackling spatial sampling bias in biodiversity records “blindly”: A simple solution to improve species distribution models and conservation decisions".

Data contained is publicly available from diverse sources, all of which are detailed both in the main text of the manuscript and within the code documentation.The paper's abstract is reproduced below:

Abstract

AimSpatial sampling bias (SSB) arises when spatial variation in reporting rate—the probability that a species present at a site is observed and reported—is not accounted for in species distribution models (SDMs). Existing bias-correction methods implicitly assume a homogeneous observation process across presence-only records, an assumption often violated when opportunistic observations are pooled with systematically collected survey data in biodiversity aggregator databases. We aim to demonstrate how this mixing weakens the detectable SSB signal. We propose a simple metadata solution that would improve SDM predictions and conservation decisions.

LocationAustralia.

MethodsUsing > 2.3 million georeferenced marsupial records from the Atlas of Living Australia, we applied extensive metadata filtering to discriminate records likely derived from systematic surveys from opportunistic observations. We compared spatial patterns of record density before and after filtering, and quantified the strength of associations between record density and known drivers of SSB (human population density and accessibility) using generalized linear models.

ResultsApproximately 75% of records were classified as likely systematic, although this required labour-intensive and subjective filtering due to inconsistent metadata. Filtering out systematic records strengthened the association between presence-only records and known drivers of sampling bias, improving the accountability of the reporting-rate signal.

Main conclusionsPooling records with fundamentally different observation processes undermines attempts to diagnose and correct SSB when using presence-only data. We propose adding a simple, standardised “incidental observation” metadata flag at data intake AND retrospectively to allow bias-correction methods to be applied where most appropriate and therefore strengthen SDMs used for conservation planning. If made available across presence-only biodiversity aggregator databases, this information would unlock substantial gains from existing and emerging analytical tools.

Keywords Citizen science, data integration, observation process, observers bias, sampling bias, sampling effort, species distribution models, reporting rate.
DOI: 10.5281/zenodo.17032276
title: R project with data and code to reproduce the analysis on

description: This R project contains everything to reproduce the results found in the paper titled "Tackling spatial sampling bias in biodiversity records “blindly”: A simple solution to improve species distribution models and conservation decisions".

Data contained is publicly available from diverse sources, all of which are detailed both in the main text of the manuscript and within the code documentation.The paper's abstract is reproduced below:

Abstract

AimSpatial sampling bias (SSB) arises when spatial variation in reporting rate—the probability that a species present at a site is observed and reported—is not accounted for in species distribution models (SDMs). Existing bias-correction methods implicitly assume a homogeneous observation process across presence-only records, an assumption often violated when opportunistic observations are pooled with systematically collected survey data in biodiversity aggregator databases. We aim to demonstrate how this mixing weakens the detectable SSB signal. We propose a simple metadata solution that would improve SDM predictions and conservation decisions.

LocationAustralia.

MethodsUsing > 2.3 million georeferenced marsupial records from the Atlas of Living Australia, we applied extensive metadata filtering to discriminate records likely derived from systematic surveys from opportunistic observations. We compared spatial patterns of record density before and after filtering, and quantified the strength of associations between record density and known drivers of SSB (human population density and accessibility) using generalized linear models.

ResultsApproximately 75% of records were classified as likely systematic, although this required labour-intensive and subjective filtering due to inconsistent metadata. Filtering out systematic records strengthened the association between presence-only records and known drivers of sampling bias, improving the accountability of the reporting-rate signal.

Main conclusionsPooling records with fundamentally different observation processes undermines attempts to diagnose and correct SSB when using presence-only data. We propose adding a simple, standardised “incidental observation” metadata flag at data intake AND retrospectively to allow bias-correction methods to be applied where most appropriate and therefore strengthen SDMs used for conservation planning. If made available across presence-only biodiversity aggregator databases, this information would unlock substantial gains from existing and emerging analytical tools.

Keywords Citizen science, data integration, observation process, observers bias, sampling bias, sampling effort, species distribution models, reporting rate.
DOI: 10.15468/e7hyxc
title: A new giant dung midge from Miocene Ethiopian amber (Diptera: Scatopsidae)

description: This dataset contains the digitized treatments in Plazi based on the original journal article Szadziewski, Ryszard, Bojarski, Błażej, Sontag, Elżbieta, Szwedo, Jacek (2022): A new giant dung midge from Miocene Ethiopian amber (Diptera: Scatopsidae). Zootaxa 5099 (5): 549-562, DOI: 10.11646/zootaxa.5099.5.3AbstractFossil new genus and species Afroscatopse haennii gen. et sp. nov. from Miocene Ethiopian amber are described and illustrated and placed in the tribe Colobostematini. The gigantic adults of this scavenger fly, largest within the family, with dull body, long antennae and broad wings evidently were adapted to live on bark of trees. It is suggested that it was a myrmecophilous species with larvae living in the nests of tree ants.
DOI: 10.25345/c56t0h76w
title: MassIVE MSV000096324 - Enhancing the bothropic antivenom through a reverse antivenomics approach
title: Antivenoms are the only effective treatment for snakebite envenomation and have saved countless lives over more than a century. Despite its value, antivenoms often present risks of adverse reactions. Current formulations contain a substantial fraction of non-specific antibodies and serum proteins that do not neutralize venom toxins. While new alternatives are being researched and promising candidates emerge as the next generation of antivenoms, it remains clear that animal-derived antivenoms will still play a critical role for years to come. And current antivenom formulations could still be optimized for safety and efficacy. In this study, we used a reverse antivenomics approach to improve the bothropic antivenom (BAv), capturing toxin-specific antibodies through affinity chromatography using Bothrops jararaca venom toxins immobilized on CNBr-activated resin. This process produced an improved antivenom formulation (iBAv) enriched in neutralizing antibodies and depleted of serum protein contaminants. Proteomic analysis showed that iBAv was 87% depleted in albumin and 37-83% lower in other serum proteins compared to the original BAv. Functional assessments demonstrated that iBAv had a 2.9-fold higher affinity for B. jararaca venom toxins via surface plasmon resonance and a 2.8-fold lower ED50 in vivo in a mice model, indicating enhanced potency and efficacy. Our findings suggest that enriching specific neutralizing antibodies while depleting serum proteins may reduce the overall protein dose required and potentially decrease the risk of adverse reactions. Although technical and economic considerations remain for large-scale implementation, this affinity-enriched antivenom formulation represents a significant advancement in enhancing antivenom efficacy against Bothrops jararaca envenomations.
DOI: 10.6084/m9.figshare.27628080
title: Raw Data from: The role of rolling corals and free-living calcifying coralline algae in the management of greenhouse gas CO2 in the Co-lombian Caribbean

description: Raw data from incubation experiments and parameters. Values of seawater chemistry variables of total alkalinity (∆TA), dissolved inorganic carbon (∆DIC), bicarbonate (∆HCO<sub>3</sub>), D) carbon dioxide (∆CO<sub>2</sub>), carbonate (∆CO<sub>3</sub>), dissolved oxygen (∆DO) obtained during incubations at different times of the day (morning, afternoon, and night) and physicochemical parameters of seawater chemistry indicate the difference between the measurements taken at the end of the incubation period and the initial values (final – initial = ∆) of total alkalinity ∆T<sub>A</sub>, dissolved inorganic carbon ∆DIC, bicarbonate ∆HCO<sub>3</sub>, carbon dioxide ∆CO<sub>2</sub>, carbonate ∆CO<sub>3</sub> and dissolved oxygen ∆DO for free-living CCA and corals at different times of day, morning, afternoon and night. See manuscript in the journal for details.
DOI: 10.6084/m9.figshare.27628080.v1
title: Raw Data from: The role of rolling corals and free-living calcifying coralline algae in the management of greenhouse gas CO2 in the Co-lombian Caribbean

description: Raw data from incubation experiments and parameters. Values of seawater chemistry variables of total alkalinity (∆TA), dissolved inorganic carbon (∆DIC), bicarbonate (∆HCO<sub>3</sub>), D) carbon dioxide (∆CO<sub>2</sub>), carbonate (∆CO<sub>3</sub>), dissolved oxygen (∆DO) obtained during incubations at different times of the day (morning, afternoon, and night) and physicochemical parameters of seawater chemistry indicate the difference between the measurements taken at the end of the incubation period and the initial values (final – initial = ∆) of total alkalinity ∆T<sub>A</sub>, dissolved inorganic carbon ∆DIC, bicarbonate ∆HCO<sub>3</sub>, carbon dioxide ∆CO<sub>2</sub>, carbonate ∆CO<sub>3</sub> and dissolved oxygen ∆DO for free-living CCA and corals at different times of day, morning, afternoon and night. See manuscript in the journal for details.
DOI: 10.15468/dl.gjzdq9
title: Occurrence Download

description: A dataset containing 8 species occurrences available in GBIF matching the query:
{
 "and" : [
 "DatasetKey is MBM herbarium - Museu Botânico Municipal \\ Curitiba - Herbário Virtual REFLORA",
 "Country is Croatia"
 ]
}

 The dataset includes 8 records from 1 constituent datasets; see https://api.gbif.org/v1/occurrence/download/0002472-241106120511685/datasets/export for details.
 
Data from some individual datasets included in this download may be licensed under less restrictive terms.
DOI: 10.6084/m9.figshare.26431303
title: Differential flight responses of sympatric raptor species to weather conditions and extreme temperature events- Data and code

description: File 1. R code for analysis. File 2. Phyton functions and codes for the initial data processing, where data obtained directly from the GPS repository are modified, in-flight/post data are corrected, meteorological data are added, and other variables of interest for the article are calculated. File 3. Raw data
DOI: 10.15468/dl.2mqcfz
title: Occurrence Download

description: A dataset containing 8 species occurrences available in GBIF matching the query:
{
 "and" : [
 "DatasetKey is Global compendium of Aedes albopictus occurrence",
 "Country is Croatia"
 ]
}

 The dataset includes 8 records from 1 constituent datasets; see https://api.gbif.org/v1/occurrence/download/0002470-241106120511685/datasets/export for details.
 
Data from some individual datasets included in this download may be licensed under less restrictive terms.
DOI: 10.15468/dl.ep2efh
title: Occurrence Download

description: A dataset containing 8 species occurrences available in GBIF matching the query:
{
 "and" : [
 "DatasetKey is Grethe Hasle Diatom Collection",
 "Country is Croatia"
 ]
}

 The dataset includes 8 records from 1 constituent datasets; see https://api.gbif.org/v1/occurrence/download/0002471-241106120511685/datasets/export for details.
 
Data from some individual datasets included in this download may be licensed under less restrictive terms.
DOI: 10.15468/dl.y4xj83
title: Occurrence Download

description: A dataset containing 36865 species occurrences available in GBIF matching the query:
{
 "and" : [
 "Country is Spain",
 "TaxonKey is Otis tarda Linnaeus, 1758"
 ]
}

 The dataset includes 36865 records from 45 constituent datasets; see https://api.gbif.org/v1/occurrence/download/0002473-241106120511685/datasets/export for details.
 
Data from some individual datasets included in this download may be licensed under less restrictive terms.
DOI: 10.21242/31111.2022.00.00.3.1.0
title: Statistik der Baugenehmigungen 2022, SUF, Version 0

description: Die Baugenehmigungsstatistik ist eine monatlich durchgeführte Erhebung, in der alle genehmigungspflichtigen und ihnen gleichgestellten Baumaßnahmen im Hochbau, bei denen Wohn- oder Nutzraum geschaffen oder verändert wird, erfasst werden.
Diese Statistik charakterisiert im Wesentlichen die Zugänge zur Bausubstanz anhand solcher Indikatoren wie z.B. Anzahl der Gebäude, Wohnungen, Wohnfläche, Nutzfläche und umbauter Raum. Bei der Errichtung neuer Gebäude werden darüber hinaus weitere Informationen, beispielsweise über die verwendeten Baustoffe, die Beheizung und die Heizenergie, geliefert.
Die Statistik der Baugenehmigungen dient der kurzfristigen Beurteilung der konjunkturellen Lage des Baumarktes. Die Erhebung stellt damit unverzichtbare Unterlagen für die Arbeit der gesetzgebenden Körperschaften, der Bundes- und Landesregierung, der Bau- und Handwerksverbände sowie der Kammern zur Verfügung und ist somit eine unentbehrliche Grundlage für zahlreiche Entscheidungen auf dem Gebiet der gesamten Wirtschaftspolitik, insbesondere der Baupolitik.
Hauptnutzerinnen und -nutzer der Statistik der Baugenehmigungen sind Ministerien, Wirtschaftsverbände, Bundesbank, OECD, EUROSTAT, UN, Unternehmen, Forschungsinstitute, Handelskammern sowie Universitäten / Studentinnen und Studenten.
Die Baugenehmigungsstatistik ist eng an die Baufertigstellungsstatistik gekoppelt.
DOI: 10.21242/31111.2023.00.00.1.1.0
title: Statistik der Baugenehmigungen 2023, On-Site, Version 0

description: Die Baugenehmigungsstatistik ist eine monatlich durchgeführte Erhebung, in der alle genehmigungspflichtigen und ihnen gleichgestellten Baumaßnahmen im Hochbau, bei denen Wohn- oder Nutzraum geschaffen oder verändert wird, erfasst werden.
Diese Statistik charakterisiert im Wesentlichen die Zugänge zur Bausubstanz anhand solcher Indikatoren wie z.B. Anzahl der Gebäude, Wohnungen, Wohnfläche, Nutzfläche und umbauter Raum. Bei der Errichtung neuer Gebäude werden darüber hinaus weitere Informationen, beispielsweise über die verwendeten Baustoffe, die Beheizung und die Heizenergie, geliefert.
Die Statistik der Baugenehmigungen dient der kurzfristigen Beurteilung der konjunkturellen Lage des Baumarktes. Die Erhebung stellt damit unverzichtbare Unterlagen für die Arbeit der gesetzgebenden Körperschaften, der Bundes- und Landesregierung, der Bau- und Handwerksverbände sowie der Kammern zur Verfügung und ist somit eine unentbehrliche Grundlage für zahlreiche Entscheidungen auf dem Gebiet der gesamten Wirtschaftspolitik, insbesondere der Baupolitik.
Hauptnutzerinnen und -nutzer der Statistik der Baugenehmigungen sind Ministerien, Wirtschaftsverbände, Bundesbank, OECD, EUROSTAT, UN, Unternehmen, Forschungsinstitute, Handelskammern sowie Universitäten / Studentinnen und Studenten.
Die Baugenehmigungsstatistik ist eng an die Baufertigstellungsstatistik gekoppelt.
DOI: 10.21242/31111.2023.00.00.3.1.0
title: Statistik der Baugenehmigungen 2023, SUF, Version 0

description: Die Baugenehmigungsstatistik ist eine monatlich durchgeführte Erhebung, in der alle genehmigungspflichtigen und ihnen gleichgestellten Baumaßnahmen im Hochbau, bei denen Wohn- oder Nutzraum geschaffen oder verändert wird, erfasst werden.
Diese Statistik charakterisiert im Wesentlichen die Zugänge zur Bausubstanz anhand solcher Indikatoren wie z.B. Anzahl der Gebäude, Wohnungen, Wohnfläche, Nutzfläche und umbauter Raum. Bei der Errichtung neuer Gebäude werden darüber hinaus weitere Informationen, beispielsweise über die verwendeten Baustoffe, die Beheizung und die Heizenergie, geliefert.
Die Statistik der Baugenehmigungen dient der kurzfristigen Beurteilung der konjunkturellen Lage des Baumarktes. Die Erhebung stellt damit unverzichtbare Unterlagen für die Arbeit der gesetzgebenden Körperschaften, der Bundes- und Landesregierung, der Bau- und Handwerksverbände sowie der Kammern zur Verfügung und ist somit eine unentbehrliche Grundlage für zahlreiche Entscheidungen auf dem Gebiet der gesamten Wirtschaftspolitik, insbesondere der Baupolitik.
Hauptnutzerinnen und -nutzer der Statistik der Baugenehmigungen sind Ministerien, Wirtschaftsverbände, Bundesbank, OECD, EUROSTAT, UN, Unternehmen, Forschungsinstitute, Handelskammern sowie Universitäten / Studentinnen und Studenten.
Die Baugenehmigungsstatistik ist eng an die Baufertigstellungsstatistik gekoppelt.
DOI: 10.21242/31121.2021.00.00.1.1.0
title: Statistik der Baufertigstellungen 2021, On-Site, Version 0

description: Die Baufertigstellungsstatistik ist eine monatlich durchgeführte Erhebung, in der alle genehmigungspflichtigen und ihnen gleichgestellten Baumaßnahmen im Hochbau, bei denen Wohn- oder Nutzraum geschaffen oder verändert wird, erfasst werden.
Diese Statistik charakterisiert im Wesentlichen die Zugänge zur Bausubstanz anhand solcher Indikatoren wie z. B. Anzahl der Gebäude, Wohnungen, Wohnfläche, Nutzfläche und umbauter Raum. Bei der Errichtung neuer Gebäude werden darüber hinaus weitere Informationen, beispielsweise über die verwendeten Baustoffe, die Beheizung und die Heizenergie, geliefert.
Die Statistik der Baufertigstellungen dient der Beurteilung der Lage des Baumarktes. Die Erhebung stellt damit unverzichtbare Unterlagen für die Arbeit der gesetzgebenden Körperschaften, der Bundes- und Landesregierung, der Bau und Handwerksverbände sowie der Kammern zur Verfügung und ist somit eine unentbehrliche Grundlage für zahlreiche Entscheidungen auf dem Gebiet der gesamten Wirtschaftspolitik, insbesondere der Baupolitik.
Hauptnutzerinnen und -nutzer der Statistik der Baufertigstellungen sind Ministerien, Wirtschaftsverbände, Bundesbank, OECD, EUROSTAT, UN, Unternehmen, Forschungsinstitute, Handelskammern sowie Universitäten / Studentinnen und Studenten.
Die Baufertigstellungsstatistik ist eng an die Baugenehmigungsstatistik gekoppelt.
DOI: 10.21242/31121.2021.00.00.3.1.0
title: Statistik der Baufertigstellungen 2021, SUF, Version 0

description: Die Baufertigstellungsstatistik ist eine monatlich durchgeführte Erhebung, in der alle genehmigungspflichtigen und ihnen gleichgestellten Baumaßnahmen im Hochbau, bei denen Wohn- oder Nutzraum geschaffen oder verändert wird, erfasst werden.
Diese Statistik charakterisiert im Wesentlichen die Zugänge zur Bausubstanz anhand solcher Indikatoren wie z. B. Anzahl der Gebäude, Wohnungen, Wohnfläche, Nutzfläche und umbauter Raum. Bei der Errichtung neuer Gebäude werden darüber hinaus weitere Informationen, beispielsweise über die verwendeten Baustoffe, die Beheizung und die Heizenergie, geliefert.
Die Statistik der Baufertigstellungen dient der Beurteilung der Lage des Baumarktes. Die Erhebung stellt damit unverzichtbare Unterlagen für die Arbeit der gesetzgebenden Körperschaften, der Bundes- und Landesregierung, der Bau und Handwerksverbände sowie der Kammern zur Verfügung und ist somit eine unentbehrliche Grundlage für zahlreiche Entscheidungen auf dem Gebiet der gesamten Wirtschaftspolitik, insbesondere der Baupolitik.
Hauptnutzerinnen und -nutzer der Statistik der Baufertigstellungen sind Ministerien, Wirtschaftsverbände, Bundesbank, OECD, EUROSTAT, UN, Unternehmen, Forschungsinstitute, Handelskammern sowie Universitäten / Studentinnen und Studenten.
Die Baufertigstellungsstatistik ist eng an die Baugenehmigungsstatistik gekoppelt.
DOI: 10.21242/31121.2022.00.00.1.1.0
title: Statistik der Baufertigstellungen 2022, On-Site, Version 0

description: Die Baufertigstellungsstatistik ist eine monatlich durchgeführte Erhebung, in der alle genehmigungspflichtigen und ihnen gleichgestellten Baumaßnahmen im Hochbau, bei denen Wohn- oder Nutzraum geschaffen oder verändert wird, erfasst werden.
Diese Statistik charakterisiert im Wesentlichen die Zugänge zur Bausubstanz anhand solcher Indikatoren wie z. B. Anzahl der Gebäude, Wohnungen, Wohnfläche, Nutzfläche und umbauter Raum. Bei der Errichtung neuer Gebäude werden darüber hinaus weitere Informationen, beispielsweise über die verwendeten Baustoffe, die Beheizung und die Heizenergie, geliefert.
Die Statistik der Baufertigstellungen dient der Beurteilung der Lage des Baumarktes. Die Erhebung stellt damit unverzichtbare Unterlagen für die Arbeit der gesetzgebenden Körperschaften, der Bundes- und Landesregierung, der Bau und Handwerksverbände sowie der Kammern zur Verfügung und ist somit eine unentbehrliche Grundlage für zahlreiche Entscheidungen auf dem Gebiet der gesamten Wirtschaftspolitik, insbesondere der Baupolitik.
Hauptnutzerinnen und -nutzer der Statistik der Baufertigstellungen sind Ministerien, Wirtschaftsverbände, Bundesbank, OECD, EUROSTAT, UN, Unternehmen, Forschungsinstitute, Handelskammern sowie Universitäten / Studentinnen und Studenten.
Die Baufertigstellungsstatistik ist eng an die Baugenehmigungsstatistik gekoppelt.