cometadata/datacite-titles-descriptions-related-identifiers huggingface dataset:
DOI: 10.17025/1764155
title: Photoelectrochemically Self Improving Si/GaN Photocathode: Figure 2d Raw Data

description: After 10 hrs of chronoamperometry (CA) photoconductive atomic force microscopy (PC-AFM) measurements were conducted on Si/GaN samples using a commercial AFM system (Bruker Dimension Icon). PeakForce TUNA mode was used to acquire the morphology and current simultaneously. A PtIr conductive probe with spring constant of 2.8 Nm-1 was used for the scanning. A white light source was used to illuminate the surface during the acquisition. Line scan extracting the topography and photocurrent from this 10 hour CA tested Si/GaN sample. The topography mapping is 2 × 2 µm2. No sample bias was applied and this photoconductive AFM measurement was performed under white light front illumination with an angle.
DOI: 10.17025/1764156
title: Photoelectrochemically Self Improving Si/GaN Photocathode: Figure 3c Raw Data

description: XPS after 0hr of chronoampometry. Surface chemical composition and valence band structure of GaN were obtained by X-ray photoemission spectroscopy (XPS) on a Kratos Axis Ultra DLD system at a takeoff angle of 0° relative to the surface normal. An Al Kα source (hν = 1486.6 eV) was used to excite the core level electrons. Pass energy of 20 eV was used for the narrow scan of core levels and valence band spectra, and step size of 0.05 eV and 0.025 eV, respectively. The Spectral fitting was conducted using CasaXPS analysis software. The binding energy scales of all core levels were corrected to the N 1s of Ga – N bond at 397.8 eV. XPS O1s core level spectra from as-received Si/GaN sample, and deconvolution shows O - Ga bond and OH - H2O bond.
DOI: 10.17025/1764157
title: Photoelectrochemically Self Improving Si/GaN Photocathode: Figure 3d Raw Data

description: XPS of Si/GaN photocathode after 1 hour chronoamperometry (CA) testing. Surface chemical composition and valence band structure of GaN were obtained by X-ray photoemission spectroscopy (XPS) on a Kratos Axis Ultra DLD system at a takeoff angle of 0° relative to the surface normal. An Al Kα source (hν = 1486.6 eV) was used to excite the core level electrons. Pass energy of 20 eV was used for the narrow scan of core levels and valence band spectra, and step size of 0.05 eV and 0.025 eV, respectively. The Spectral fitting was conducted using CasaXPS analysis software. The binding energy scales of all core levels were corrected to the N 1s of Ga – N bond at 397.8 eV. X-ray photoemission spectroscopy (XPS) O1s core level spectra from 1 hour chronoamperometry (CA) tested Si/GaN sample, and deconvolution shows O - Ga bond, O - N - Ga bond, and OH - H2O bond.
DOI: 10.17025/1764159
title: Photoelectrochemically Self Improving Si/GaN Photocathode: Figure 3f Raw Data

description: XPS of Si/GaN photocathode after 10 hour chronoamperometry (CA) testing. Surface chemical composition and valence band structure of GaN were obtained by X-ray photoemission spectroscopy (XPS) on a Kratos Axis Ultra DLD system at a takeoff angle of 0° relative to the surface normal. An Al Kα source (hν = 1486.6 eV) was used to excite the core level electrons. Pass energy of 20 eV was used for the narrow scan of core levels and valence band spectra, and step size of 0.05 eV and 0.025 eV, respectively. The Spectral fitting was conducted using CasaXPS analysis software. The binding energy scales of all core levels were corrected to the N 1s of Ga – N bond at 397.8 eV. XPS O1s core level spectra from 10 hours CA tested Si/GaN sample, and deconvolution shows O - Ga bond, O - N - Ga bond and OH - H2O bond.
DOI: 10.17025/1764161
title: Photoelectrochemically Self Improving Si/GaN Photocathode: Figure 3e Raw Data

description: XPS of Si/GaN photocathode after 4 hour chronoamperometry (CA) testing. Surface chemical composition and valence band structure of GaN were obtained by X-ray photoemission spectroscopy (XPS) on a Kratos Axis Ultra DLD system at a takeoff angle of 0° relative to the surface normal. An Al Kα source (hν = 1486.6 eV) was used to excite the core level electrons. Pass energy of 20 eV was used for the narrow scan of core levels and valence band spectra, and step size of 0.05 eV and 0.025 eV, respectively. The Spectral fitting was conducted using CasaXPS analysis software. The binding energy scales of all core levels were corrected to the N 1s of Ga – N bond at 397.8 eV. XPS O1s core level spectra from 4 hour CA tested Si/GaN sample, and deconvolution shows O - Ga bond, O - N - Ga bond and OH - H2O bond.
DOI: 10.15468/kad3yx
title: A new species of Princaxelia from Shinkai Seep Field, Mariana Trench (Crustacea, Amphipoda, Pardaliscidae)

description: This dataset contains the digitized treatments in Plazi based on the original journal article Tomikawa, Ko, Watanabe, Hiromi Kayama, Tanaka, Katsuhiko, Ohara, Yasuhiko (2021): A new species of Princaxelia from Shinkai Seep Field, Mariana Trench (Crustacea, Amphipoda, Pardaliscidae). ZooKeys 1015: 115-127, DOI: http://dx.doi.org/10.3897/zookeys.1015.59683, URL: http://dx.doi.org/10.3897/zookeys.1015.59683
DOI: 10.15468/pr7bt6
title: Description of Hemienchytraeus wuhanensis sp. nov. (Annelida, Clitellata, Enchytraeidae) from central China, with comments on species records of Hemienchytraeus from China

description: This dataset contains the digitized treatments in Plazi based on the original journal article Chen, Juanjuan, Schmelz, Ruediger M., Xie, Zhicai (2021): Description of Hemienchytraeus wuhanensis sp. nov. (Annelida, Clitellata, Enchytraeidae) from central China, with comments on species records of Hemienchytraeus from China. ZooKeys 1015: 87-97, DOI: http://dx.doi.org/10.3897/zookeys.1015.59019, URL: http://dx.doi.org/10.3897/zookeys.1015.59019
DOI: 10.15468/7ttfrd
title: Molecular identification and larval morphology of spionid polychaetes (Annelida, Spionidae) from northeastern Japan

description: This dataset contains the digitized treatments in Plazi based on the original journal article Abe, Hirokazu, Sato-Okoshi, Waka (2021): Molecular identification and larval morphology of spionid polychaetes (Annelida, Spionidae) from northeastern Japan. ZooKeys 1015: 1-86, DOI: http://dx.doi.org/10.3897/zookeys.1015.54387, URL: http://dx.doi.org/10.3897/zookeys.1015.54387
DOI: 10.15468/kjd39p
title: A new species of the genus Opisa Boeck, 1876 (Crustacea, Amphipoda, Opisidae) and a new record for Opisa takafuminakanoi from the East Sea, South Korea

description: This dataset contains the digitized treatments in Plazi based on the original journal article Heo, Jun-Haeng, Kim, Young-Hyo (2021): A new species of the genus Opisa Boeck, 1876 (Crustacea, Amphipoda, Opisidae) and a new record for Opisa takafuminakanoi from the East Sea, South Korea. ZooKeys 1015: 99-113, DOI: http://dx.doi.org/10.3897/zookeys.1015.60095, URL: http://dx.doi.org/10.3897/zookeys.1015.60095
DOI: 10.14457/cu.the.2016.704
title: Geology and mineralization characteristics of Khamkeut Saen Oudom gold deposit, Bolikhamxai, Lao PDR

description: The Khamkeut Saen Oudom (KSO) gold deposit is located at Bolikhamxai district, central Lao PDR. It lies within the Truong Son Fold Belt where there are several significant mineral deposits particularly gold and copper. At KSO deposit, the mineralization occurs as quartz-carbonate-sulfides veins, minor stockworks and breccias. Major veins are trending almost E-W where it forms as single ore zone in the west and splays to three narrow veins at the eastern part of area. Several ore lenses are present along this E-W structure (e.g. Houay Keh, Nam Pan-east, Nam Pan-west). The gold mineralized veins are mainly hosted by meta-sedimentary rocks (e.g. meta-sandstone, meta-siltstone and slate). At least three stages of mineralization have been identified namely; Stage 1, microcrystalline quartz - arsenopyrite - pyrite; Stage 2, quartz ± calcite - sulfides (arsenopyrite - pyrite - sphalerite - chalcopyrite - galena-pyrrhotite) - gold and Stage 3, quartz - chlorite - calcite. Gold is closely associated with sulfide minerals (e.g., pyrite, arsenopyrite, chalcopyrite, sphalerite and galena), quartz and calcite. Alteration associated with gold mineralization is less pervasive and extensive and mainly characterized by 1) quartz - calcite - sericite - chlorite and 2) chlorite - sericite - calcite assemblages. EPMA analyzes of gold reveals that at Nam Pan ore lens it occurs as electrum with gold fineness range from 637 to 715 whereas, at Houay Keh ore lens it occurs native gold with gold fineness ranges from 827 to 866. EPMA analyzes of light-color sphalerite from Nam Pan has FeS content of 5.00 to 8.05 mole %. In contrast, dark-color sphalerite from Houay Keh ore lens has values of 8.49 to 16.08 mole %. Using FeS content of sphalerite, T and P of gold mineralization at KSO were calculated to be 320 to 450°C and 7.17 to 15.08 kbar respectively. Based on the above evidences (e.g., metamorphic host rocks, weak alteration, mineral assemblages, gold fineness and FeS content of sphalerite), the KSO gold deposit is likely to be orogenic deposit.
DOI: 10.14457/cu.the.2014.1508
title: รูปแบบการให้แสงสว่างประดับตกแต่งสำหรับมัสยิดเขตธนบุรีในกรุงเทพมหานคร

description: มัสยิดเปรียบเสมือนบ้านของพระเจ้า นับเป็นสถาปัตยกรรมที่มีเอกลักษณ์เฉพาะตัวและแสดงออกถึงวัฒนธรรมของชนชาติมุสลิมมาตั้งแต่อดีต ซึ่งพบว่าในหลายประเทศมีการประดับตกแต่งแสงไฟในเวลากลางคืน บางแห่งถือว่าเป็นจุดหมายตา แต่ในประเทศไทยยังไม่พบเห็นการส่องสว่างมากนักและยังไม่มีรูปแบบการส่องสว่างที่ชัดเจน งานวิจัยนี้มีจุดประสงค์เพื่อศึกษาองค์ประกอบทางสถาปัตยกรรมของอาคารมัสยิด เพื่อนำไปสู่การเสนอแนะรูปแบบการให้ส่องสว่างประดับตกแต่งแก่มัสยิดในเขตธนบุรี ซึ่งหลายแห่งมีความสำคัญทางประวัติศาสตร์ มีคุณค่าทางสถาปัตยกรรมและเป็นจุดหมายตาของชุมชน ผู้วิจัยจึงได้เลือกมัสยิดกรณีศึกษาซึ่งมีองค์ประกอบที่แสดงออกถึงความเป็นสถาปัตยกรรมอิสลามจำนวน 24 แห่ง จากการศึกษาประวัติศาสตร์ รูปแบบและองค์ประกอบทางสถาปัตยกรรม ทำการแจกแจงข้อมูลและจัดกลุ่ม จากนั้นจึงเลือกตัวแทนแต่ละกลุ่มมา 5 แห่ง เพื่อทำการศึกษาต่อ การศึกษาใช้วิธีวิเคราะห์องค์ประกอบหลักของมัสยิดที่ควรให้แสงสว่าง คือ โดม ซุ้มโค้ง (ซุ้มทางเข้าและซุ้มโค้งเรียง) และหออะซาน โดยพิจารณาองค์ประกอบเหล่านั้นตามหลักการออกแบบสถาปัตยกรรมเบื้องต้น คำนึงถึงสภาพพื้นที่โดยรอบและมุมมอง จากนั้นจึงเสนอรูปแบบทางเลือกของการให้แสงประดับตกแต่งองค์ประกอบเหล่านั้น โดยนำมาจำลองการส่องสว่างผ่านโปรแกรมจำลองสภาพแสงสว่าง เพื่อทำแบบสอบถามความรู้สึกกับทั้งชาวพุทธและมุสลิม คำที่นำมาสอบถาม ได้แก่ สว่าง สวย สบายตา และส่งเสริมความเป็นมัสยิด แล้วจึงนำไปประเมินผลทางสถิติ เพื่อหารูปแบบการส่องสว่างประดับตกแต่งที่เหมาะสมต่อไป ผลการศึกษา ผู้วิจัยได้เสนอแนะรูปแบบการให้แสงสว่างประดับตกแต่งแต่ละกรณีศึกษา โดยพิจารณาจากสภาพพื้นที่ตั้งและมุมมอง เน้นองค์ประกอบหลักของมัสยิด ด้วยวิธีการต่างๆ เช่น การให้แสงแบบสาด การให้แสงแบบเงาดำ การให้แสงส่องเน้น เป็นต้น สำหรับองค์ประกอบย่อยอาจมีการส่องเน้นเพื่อเสริมรายละเอียดทางสถาปัตยกรรม ผลจากการศึกษานี้สามารถนำไปใช้ในการออกแบบส่องสว่างเพื่อประดับตกแต่งมัสยิดอื่นหรือสถาปัตยกรรมที่มีลักษณะใกล้เคียงกันได้
DOI: 10.14457/cu.the.2014.1509
title: การเคลื่อนไหวทางสังคมเพื่อเปลี่ยนแปลงระบอบการปกครองในโลกอาหรับ: ศึกษากรณีอียิปต์

description: วิทยานิพนธ์ฉบับนี้มีวัตถุประสงค์เพื่อศึกษาการดำเนินนโยบายทางการเมืองและเศรษฐกิจของระบอบการปกครองในอียิปต์นับตั้งแต่การปฏิวัติในปี 1952 และเพื่อวิเคราะห์ปัจจัยที่นำไปสู่การเคลื่อนไหวทางสังคมรูปแบบใหม่ อันนำไปสู่การเปลี่ยนแปลงที่เกิดขึ้นในอียิปต์ กรอบแนวคิดทฤษฎีที่ใช้ในการศึกษานี้ประกอบไปด้วยแนวคิดการเคลื่อนไหวทางสังคมรูปแบบใหม่ และทฤษฎีระดมทรัพยากร จากการศึกษาพบว่าการเคลื่อนไหวทางสังคมในรูปแบบใหม่ภายใต้ขบวนการคีฟายาและขบวนการเยาวชน 6 เมษายนนั้น มีการเคลื่อนไหวที่มีการยกระดับจิตสำนึกเพื่อก่อให้เกิดการเปลี่ยนแปลงทางสังคม โดยที่การเคลื่อนไหวทางสังคมรูปแบบใหม่ผ่านขบวนการเหล่านี้มีอุดมการณ์ที่ต้องการเสรีภาพ ความเท่าเทียม ความยุติธรรม การปกครองภายใต้ระบอบประชาธิปไตย และสภาพความเป็นอยู่ของชีวิตที่ดีขึ้น การเคลื่อนไหวทางสังคมรูปแบบใหม่ที่เกิดขึ้นในอียิปต์มีการกระทำแบบรวมหมู่ กล่าวคือมีการเคลื่อนไหวที่มีลักษณะเป็นเครือข่ายองค์กร มีเป้าหมายในการเคลื่อนไหวที่ชัดเจน มีความต้องการที่จะแก้ปัญหาในสังคม อีกทั้งยังต้องการให้เกิดความเปลี่ยนแปลงทางสังคมโดยใช้การเคลื่อนไหวดังกล่าวเป็นกลไกสำคัญในการต่อรอง นอกจากนี้ขบวนการเคลื่อนไหวในอียิปต์ยังมี ลักษณะการระดมทรัพยากรที่ต้องอาศัยคน เวลา เงิน รวมทั้งนวัตกรรมในการสื่อสารแบบใหม่ เช่น Facebook, Twitter, YouTube และ Weblogs เป็นต้น การเคลื่อนไหวดังกล่าวเป็นไปอย่างมีเหตุมีผล มีการรวมตัวเป็นกลุ่มก้อนชัดเจน ก่อให้เกิดศักยภาพในการเคลื่อนไหวที่สัมฤทธิ์ผลได้
DOI: 10.14457/cu.the.2016.705
title: Population dynamics and emergence of black-bearded tomb bat Taphozous melanopogon Temminck, 1841 at Samaesan Islands, Chonburi Province

description: This study aimed to investigate population dynamics and emergence activity of Taphozous melanopogon in 2 maternity colonies (the Kham and Changkleua colonies) at Samaesan Islands, Chonburi Province. From January 2015 to April 2016 using emergence counts from infrared video camera and mark and recapture method were conducted at cave entrance, the results showed that T. melanopogon resided in studied caves throughout the year and exhibited variation on colony size, composition and movement. Increasing of colony size and proportion of male bats into colonies during November 2015–February 2016 probably indicated mating season. From March to October 2015, colony size and proportion of male bats declined concordant with observing pregnant females during April–June 2015 and lactating female during June–August 2015. Fledgling juveniles were captured from June to August 2015 and late juveniles were captured from August to December 2015. Results from mark and recapture method revealed that only 26 individuals were recaptured from a total of 581 banded adult bats. Colony size fluctuation and low fidelity on roosts suggested the complexity of movement pattern and roost network in this species. Observation on emergence activities indicated that sunset time had greatly impact on bat emergence. In addition, weather conditions, which were wind speed and cloud cover, influenced on bat emergence as well. Late emergence times were observed in windy evening due to unsuitable condition for flight. Late emergence were also observed in cloudy nights, but reason for this was unclear. Change in colony composition also affected to bat emergence. The Results revealed that emergence duration tended to longer during April–July 2015. The reason was that pregnant and lactating females tended to emerge later than other individuals due to less flight maneuverability, which increased predation risks. Early emergence during August–December 2015 were observed because juveniles tended to emerge early to find food which is important for their growth and development compared to adults bats.
DOI: 10.5281/zenodo.4432110
title: Data for Wang and Kent, GRL, 2021, "RESET: A method to monitor thermoremanent alteration in Thellier-series paleointensity experiments"

description: This zip file contains data presented in the GRL paper “RESET: A method to monitor thermoremanent alteration in Thellier-series paleointensity experiments” by Wang and Kent, 2021. Folder “Figure2e” contains a subfolder that contains all the raw hysteresis measurements (with heated temperatures in degree Celsius in file names) and an Excel spreadsheet that summarizes the hysteresis parameters, which are used in plotting the Day diagram as shown in Figure 2e. Folder “Figure2f-s” contains raw FORC data of specimens GA79.5y and GA84.6y measured after each heating treatment (with heated temperatures in degree Celsius in file names) that are used in plotting the FORC diagrams as shown in Figure 2f to 2s.
DOI: 10.5281/zenodo.4432109
title: Data for Wang and Kent, GRL, 2021, "RESET: A method to monitor thermoremanent alteration in Thellier-series paleointensity experiments"

description: This zip file contains data presented in the GRL paper “RESET: A method to monitor thermoremanent alteration in Thellier-series paleointensity experiments” by Wang and Kent, 2021. Folder “Figure2e” contains a subfolder that contains all the raw hysteresis measurements (with heated temperatures in degree Celsius in file names) and an Excel spreadsheet that summarizes the hysteresis parameters, which are used in plotting the Day diagram as shown in Figure 2e. Folder “Figure2f-s” contains raw FORC data of specimens GA79.5y and GA84.6y measured after each heating treatment (with heated temperatures in degree Celsius in file names) that are used in plotting the FORC diagrams as shown in Figure 2f to 2s.
DOI: 10.5281/zenodo.4505730
title: Forager mobility, lithic discard probability, and the patterning of raw material transport distances in the archaeological record - Supplemental Materials

description: The data, R code and Netlogo model used in "Forager mobility, lithic discard probability, and the patterning of raw material transport distances in the archaeological record".
DOI: 10.6084/m9.figshare.13718950
title: Additional file 1 of Psychometric properties of a condition-specific PROM for the psychosocial consequences of Labelling hypertension by using Rasch analysis

description: Additional file 1. Plots: observed mean score in each class interval (line) and the 95% confidence region of the model expectations (shaded area).
DOI: 10.6084/m9.figshare.13718950.v1
title: Additional file 1 of Psychometric properties of a condition-specific PROM for the psychosocial consequences of Labelling hypertension by using Rasch analysis

description: Additional file 1. Plots: observed mean score in each class interval (line) and the 95% confidence region of the model expectations (shaded area).
DOI: 10.6084/m9.figshare.13718991
title: Additional file 1 of Quality and readability of web-based Arabic health information on periodontal disease

description: Additional file 1: Websites included in the analysis.
DOI: 10.6084/m9.figshare.13718991.v1
title: Additional file 1 of Quality and readability of web-based Arabic health information on periodontal disease

description: Additional file 1: Websites included in the analysis.
DOI: 10.6084/m9.figshare.13719016.v1
title: Additional file 2 of Protein disulfide isomerase ERp57 protects early muscle denervation in experimental ALS

description: Additional file 2: Proteomics Dataset.
DOI: 10.6084/m9.figshare.13719016
title: Additional file 2 of Protein disulfide isomerase ERp57 protects early muscle denervation in experimental ALS

description: Additional file 2: Proteomics Dataset.
DOI: 10.6084/m9.figshare.13719091.v1
title: Additional file 14 of Phenotype and multi-omics comparison of Staphylococcus and Streptococcus uncovers pathogenic traits and predicts zoonotic potential

description: Additional file 14. Optimal hyper parameters
DOI: 10.6084/m9.figshare.13719094
title: Additional file 1 of Phenotype and multi-omics comparison of Staphylococcus and Streptococcus uncovers pathogenic traits and predicts zoonotic potential

description: Additional file 1. List of Staphylococcus genomes
DOI: 10.6084/m9.figshare.13719091
title: Additional file 14 of Phenotype and multi-omics comparison of Staphylococcus and Streptococcus uncovers pathogenic traits and predicts zoonotic potential

description: Additional file 14. Optimal hyper parameters
DOI: 10.6084/m9.figshare.13719097
title: Additional file 2 of Phenotype and multi-omics comparison of Staphylococcus and Streptococcus uncovers pathogenic traits and predicts zoonotic potential

description: Additional file 2. List of Streptococcus genomes
DOI: 10.6084/m9.figshare.13719094.v1
title: Additional file 1 of Phenotype and multi-omics comparison of Staphylococcus and Streptococcus uncovers pathogenic traits and predicts zoonotic potential

description: Additional file 1. List of Staphylococcus genomes
DOI: 10.6084/m9.figshare.13719100
title: Additional file 3 of Phenotype and multi-omics comparison of Staphylococcus and Streptococcus uncovers pathogenic traits and predicts zoonotic potential

description: Additional file 3. Staphylococcus All proteins
DOI: 10.6084/m9.figshare.13719100.v1
title: Additional file 3 of Phenotype and multi-omics comparison of Staphylococcus and Streptococcus uncovers pathogenic traits and predicts zoonotic potential

description: Additional file 3. Staphylococcus All proteins
DOI: 10.6084/m9.figshare.13719103
title: Additional file 4 of Phenotype and multi-omics comparison of Staphylococcus and Streptococcus uncovers pathogenic traits and predicts zoonotic potential

description: Additional file 4. Streptococcus All proteins
DOI: 10.6084/m9.figshare.13719103.v1
title: Additional file 4 of Phenotype and multi-omics comparison of Staphylococcus and Streptococcus uncovers pathogenic traits and predicts zoonotic potential

description: Additional file 4. Streptococcus All proteins
DOI: 10.6084/m9.figshare.13719097.v1
title: Additional file 2 of Phenotype and multi-omics comparison of Staphylococcus and Streptococcus uncovers pathogenic traits and predicts zoonotic potential

description: Additional file 2. List of Streptococcus genomes
DOI: 10.6084/m9.figshare.13719202.v1
title: Additional file 3 of Multi-trait association studies discover pleiotropic loci between Alzheimer’s disease and cardiometabolic traits

description: Additional file 3:. Supplemental Table 12. Locus discovery analysis single-tissue-eQTL results.
DOI: 10.6084/m9.figshare.13719199.v1
title: Additional file 2 of Multi-trait association studies discover pleiotropic loci between Alzheimer’s disease and cardiometabolic traits

description: Additional file 2:. Supplemental Table 8. Single-tissue eQTLs for rs11642612 downloaded from GTExPortal.
DOI: 10.6084/m9.figshare.13719202
title: Additional file 3 of Multi-trait association studies discover pleiotropic loci between Alzheimer’s disease and cardiometabolic traits

description: Additional file 3:. Supplemental Table 12. Locus discovery analysis single-tissue-eQTL results.
DOI: 10.6084/m9.figshare.13719199
title: Additional file 2 of Multi-trait association studies discover pleiotropic loci between Alzheimer’s disease and cardiometabolic traits

description: Additional file 2:. Supplemental Table 8. Single-tissue eQTLs for rs11642612 downloaded from GTExPortal.
DOI: 10.6084/m9.figshare.13719207
title: Additional file 5 of Targeted RNAseq assay incorporating unique molecular identifiers for improved quantification of gene expression signatures and transcribed mutation fraction in fixed tumor samples

description: Additional File 5: Table S1. List of genes included in SET4 assay. Table S2. Pairwise comparison of reproducibility (difference between replicates) between protocols. Table S3. Wilcoxon paired test and Levene’s test for concordance measures from comparison between FF and FFPE of individual gene measurements. Table S4. Concordance analysis of two BC signatures, and all the transcripts, between wtRNAseq and targeted RNAseq. Table S5. Wilcoxon paired test and Levene’s test for concordance measures from comparison between wtRNAseq and targeted RNAseq of individual gene measurements. Table S6. Summary statistics for allele fraction (AF). Table S7. Wilcoxon test for allele fraction (AF) comparison between FF and FFPE.
DOI: 10.6084/m9.figshare.13719207.v1
title: Additional file 5 of Targeted RNAseq assay incorporating unique molecular identifiers for improved quantification of gene expression signatures and transcribed mutation fraction in fixed tumor samples

description: Additional File 5: Table S1. List of genes included in SET4 assay. Table S2. Pairwise comparison of reproducibility (difference between replicates) between protocols. Table S3. Wilcoxon paired test and Levene’s test for concordance measures from comparison between FF and FFPE of individual gene measurements. Table S4. Concordance analysis of two BC signatures, and all the transcripts, between wtRNAseq and targeted RNAseq. Table S5. Wilcoxon paired test and Levene’s test for concordance measures from comparison between wtRNAseq and targeted RNAseq of individual gene measurements. Table S6. Summary statistics for allele fraction (AF). Table S7. Wilcoxon test for allele fraction (AF) comparison between FF and FFPE.
DOI: 10.6084/m9.figshare.13467341
title: Additional file 3 of Improving CLIP-seq data analysis by incorporating transcript information

description: Additional file 3 Table S5: Motif search results for 9 RBPs and 28 binding motifs collected from various sources (.xlsx)