cometadata/datacite-titles-descriptions-related-identifiers huggingface dataset:
DOI: 10.25934/pr00000270.0
title: Available IPD datapackage for study 'A Multi-Center, Randomized, Phase 3 Study of Rituximab Versus Iodine I 131 Tositumomab Therapeutic Regimen For Patients With Relapsed Follicular Non-Hodgkins Lymphoma'

description: Comparison of rituximab versus Iodine I 131 Tositumomab Therapeutic Regimen (Tositumomab and Iodine I 131 Tositumomab or the Bexxar Therapeutic Regimen, formerly called Iodine-131 Anti-B1 Antibody) in subjects with follicular non Hodgkins B cell lymphoma. 506 subjects will be enrolled at 30 to 40 sites in the US, Canada, and Europe. Subjects will be randomly assigned to one of two treatment arms. In Arm A, subjects will receive 375 milligrams/meter2 (mg/m2 )of rituximab, given as an intravenous (IV) infusion once weekly for 4 weeks. In Arm B, subjects will undergo a two-phase treatment. In the first phase, termed the "dosimetric dose," subjects will receive an infusion of unlabeled Tositumomab (450 mg) immediately followed by an infusion of 5 millicuries (mCi) (0.18 gigabecquerel [GBq]) of Iodine 131 Tositumomab (35 mg). Whole body gamma camera scans will be obtained three times (Day 0; Day 2, 3, or 4; and Day 6 or 7) following the dosimetric dose. The information derived from the scans will enable a patient specific dose to be calculated to deliver the desired total body dose of radiation (65 or 75 centigray [cGy]). In the second phase, termed the "therapeutic dose," subjects in Arm B will receive an infusion of unlabeled Tositumomab (450 mg) immediately followed by an infusion of the subject specific activity of Iodine 131-conjugated Tositumomab (35 mg). Thyroid blockade will be implemented 24 hours prior to the dosimetric dose and continued for 14 days following the therapeutic dose. Subjects on study will be followed for response and safety at Week 7, Week 13, and every three months for the first and second year, every six months for the third year, and then annually for the forth and fifth years; and then for vital status, additional therapy, and long term safety events through year ten. Follow Up after subsequent NHL therapy will be carried out to assess tolerance of next anti-lymphoma therapy, development of myelodysplasia (MDS)/acute myelogenous leukemia (AML), HAMA or hypothyroidism, unexpected safety issues, and death.
DOI: 10.5281/zenodo.6342769
title: Data & R Scripts - Jönander et al. (2022) Single substance and mixture toxicity of dibutyl-phthalate and sodium dodecyl sulphate to marine zooplankton. Ecotoxicol. Environ. Saf.

description: Data and R scripts associated with: Jönander, C., Backhaus, T., Dahllöf, I. (2022) Single substance and mixture toxicity of dibutyl-phthalate and sodium dodecyl sulphate to marine zooplankton. Ecotoxicol. Environ. Saf.
DOI: 10.5281/zenodo.6342768
title: Data & R Scripts - Jönander et al. (2022) Single substance and mixture toxicity of dibutyl-phthalate and sodium dodecyl sulphate to marine zooplankton. Ecotoxicol. Environ. Saf.

description: Data and R scripts associated with: Jönander, C., Backhaus, T., Dahllöf, I. (2022) Single substance and mixture toxicity of dibutyl-phthalate and sodium dodecyl sulphate to marine zooplankton. Ecotoxicol. Environ. Saf.
DOI: 10.48370/ofd/qxktlp/wunluq
title: 3125_1.S3Dm

description: :unav
DOI: 10.48370/ofd/qxktlp/wozwp0
title: 3125_2.S3Dm

description: :unav
DOI: 10.48370/ofd/qxktlp
title: Peniophora cinerea (Pers.) Cooke, 3125

description: Fungarium Makromycetes
DOI: 10.17632/jyg9fywx3w.1
title: Standard mechanical testing is inadequate for the mechanical characterisation of shape memory alloys: source of errors and a new corrective approach

description: Supporting Material for: Standard mechanical testing is inadequate for the mechanical characterisation of shape memory alloys: source of errors and a new corrective approach
DOI: 10.25345/c55717r51
title: MassIVE MSV000089030 - Vascular proteome responses precede organ dysfunction in a murine model of Staphylococcus aureus bacteremia
title: Vascular dysfunction and organ failure are two distinct, albeit highly interconnected clinical outcomes linked to morbidity and mortality in human sepsis. The mechanisms driving vascular and parenchymal damage are dynamic and display significant molecular crosstalk between organs and tissues. Therefore, assessing their individual contribution to disease progression is technically challenging. Here, we hypothesize that dysregulated vascular responses predispose the organism to organ failure. To address this hypothesis, we have evaluated four major organs in a murine model of S. aureus sepsis by combining in vivo labeling of the endothelial proteome, data-independent acquisition (DIA) mass spectrometry, and an integrative computational pipeline. The data reveal, with unprecedented depth and throughput, that a septic insult evokes organ-specific proteome responses that are highly compartmentalized, synchronously coordinated, and significantly correlated with the progression of the disease. This includes abundant vascular shedding, dysregulation of the intrinsic pathway of coagulation, compartmentalization of the acute phase-response, and abundant upregulation of glycocalyx components. Vascular proteome changes were also found to precede bacterial invasion and leukocyte infiltration into the organs, as well as to precede changes in various well-established cellular and biochemical correlates of systemic coagulopathy and tissue dysfunction. Importantly, our data suggests a potential role for the vascular proteome as a determinant of the susceptibility of the organs to undergo failure during sepsis.
DOI: 10.34740/kaggle/dsv/3278527
title: Polish-Ukrainian translations from Tatoeba
DOI: 10.5281/zenodo.5957598
title: Piante di fase della villa di Sirmione, Grotte di Catullo

description: Piante di fase della villa romana di Sirmione (BS), Grotte di Catullo. In dettaglio il dataset è composto da: due tavole relative a strutture esistenti e ipotesi ricostruttive del Livello Superiore della villa, una tavola dello stato di fatto del Livello Intermedio, una tavola dello stato di fatto del Livello Inferiore e infine due tavole relative una alle fasi tardo antiche e l'altra alle frequentazione alto medievali. Le piante di fase sono state ottenute mediante rielaborazione dei rilievi CAD eseguiti dalla ditta Tracciatori s.a.s. e digitalizzazione dell'ortofoto fornita dal Polo Museale della Lombardia. È stata utilizzata per l'elaborazione e gestione dei dati una piattaforma GIS open Source. Il prodotto finale è stato la generazione di tavole in formato pdf. Il gruppo di lavoro è composto da: dott.ssa Elisa Lerco e dott. Nicola Mancassola.
DOI: 10.5281/zenodo.5957597
title: Piante di fase della villa di Sirmione, Grotte di Catullo

description: Piante di fase della villa romana di Sirmione (BS), Grotte di Catullo. In dettaglio il dataset è composto da: due tavole relative a strutture esistenti e ipotesi ricostruttive del Livello Superiore della villa, una tavola dello stato di fatto del Livello Intermedio, una tavola dello stato di fatto del Livello Inferiore e infine due tavole relative una alle fasi tardo antiche e l'altra alle frequentazione alto medievali. Le piante di fase sono state ottenute mediante rielaborazione dei rilievi CAD eseguiti dalla ditta Tracciatori s.a.s. e digitalizzazione dell'ortofoto fornita dal Polo Museale della Lombardia. È stata utilizzata per l'elaborazione e gestione dei dati una piattaforma GIS open Source. Il prodotto finale è stato la generazione di tavole in formato pdf. Il gruppo di lavoro è composto da: dott.ssa Elisa Lerco e dott. Nicola Mancassola.
DOI: 10.5281/zenodo.5985051
title: Sirmione (BS), Grotte di Catullo, ipotesi ricostruttiva: piante, sezioni, prospetti ed Extended Matrix

description: Nell'ambito del progetto e-Archeo, coordinato dalla società ALES e avente come obiettivo la valorizzazione di diversi siti archeologici italiani, l'Università di Verona si è occupata dello studio della Villa Romana di Desenzano e del sito "grotte di Catullo" di Sirmione, con la guida della prof.ssa Patrizia Basso. Sono qui presentati i risultati dei lavori volti a fornire un'ipotesi ricostruttiva del sito "grotte di Catullo". Si è proceduto con lo studio stilistico e comparato di edifici e contesti simili a quelli oggetto di studio che unito all’analisi delle fonti antiche ha permesso di dedurre le norme di proporzionamento dei diversi elementi architettonici e strutturali nonché di formulare delle ipotesi interpretative di come doveva apparire l’edificio all’epoca della sua costruzione. Ciò ha permesso di elaborare dei disegni ricostruttivi 2D propedeutici alla realizzazione dei modelli 3D della villa romana (Soriano). Contestualmente si è proceduto con la realizzazione dei contenuti scientifici, quali fonti (storiche, iconografiche e di confronto) e processi interpretativi, fondamentali per poter effettuare la mappatura dei livelli di affidabilità sulle ricostruzioni virtuali. La mappatura dei livelli di affidabilità è stata effettuata utilizzando il linguaggio Extended Matrix (sviluppato da E. Demetrescu, CNR) che permette di implementare in un modello tridimensionale per volumi semplificati le fonti ed i processi interpretativi che hanno condotto all’ipotesi ricostruttiva (Delbarba). A tutto ciò si è affiancato un lavoro di studio e confronto dei frammenti pittorici per permettere di proporre un'ipotesi della decorazione parietale originaria di due ambienti oggetto di ricostruzione (Bianchi).
DOI: 10.5281/zenodo.5957596
title: Piante di fase della Villa di Desenzano (BS), loc. Borgo Regio

description: Piante di fase della villa romana di Desenzano (BS), loc. Borgo Regio. Nel complesso il dataset comprende il rilievo generale dell'area archeologica, una tavola del settore A ascrivibile alla metà del IV secolo e una tavola del settore B anch'esso databile alla metà del IV secolo. Le piante di fase sono state ottenute mediante rialaborazioni di rilievi CAD eseguiti da E. Laidelli 2006, proprietà del Polo Museale della Lombardia e digitalizzazione delle ortofoto eseguite nel 2020 dal gruppo di ricerca dell'Università di Verona (dott.ssa Fiammetta Soriano). Per l'elaborazione e gestione dei dati è stata utilizzata una piattaforma GIS open souce, QGIS. Il prodotto finale è stato la generazione di tavole in formato pdf. Gruppo di lavoro: dott. Nicola Mancassola, dott.ssa Elisa Lerco.
DOI: 10.5281/zenodo.5985050
title: Sirmione (BS), Grotte di Catullo, ipotesi ricostruttiva: piante, sezioni, prospetti ed Extended Matrix

description: Nell'ambito del progetto e-Archeo, coordinato dalla società ALES e avente come obiettivo la valorizzazione di diversi siti archeologici italiani, l'Università di Verona si è occupata dello studio della Villa Romana di Desenzano e del sito "grotte di Catullo" di Sirmione, con la guida della prof.ssa Patrizia Basso. Sono qui presentati i risultati dei lavori volti a fornire un'ipotesi ricostruttiva del sito "grotte di Catullo". Si è proceduto con lo studio stilistico e comparato di edifici e contesti simili a quelli oggetto di studio che unito all’analisi delle fonti antiche ha permesso di dedurre le norme di proporzionamento dei diversi elementi architettonici e strutturali nonché di formulare delle ipotesi interpretative di come doveva apparire l’edificio all’epoca della sua costruzione. Ciò ha permesso di elaborare dei disegni ricostruttivi 2D propedeutici alla realizzazione dei modelli 3D della villa romana (Soriano). Contestualmente si è proceduto con la realizzazione dei contenuti scientifici, quali fonti (storiche, iconografiche e di confronto) e processi interpretativi, fondamentali per poter effettuare la mappatura dei livelli di affidabilità sulle ricostruzioni virtuali. La mappatura dei livelli di affidabilità è stata effettuata utilizzando il linguaggio Extended Matrix (sviluppato da E. Demetrescu, CNR) che permette di implementare in un modello tridimensionale per volumi semplificati le fonti ed i processi interpretativi che hanno condotto all’ipotesi ricostruttiva (Delbarba). A tutto ciò si è affiancato un lavoro di studio e confronto dei frammenti pittorici per permettere di proporre un'ipotesi della decorazione parietale originaria di due ambienti oggetto di ricostruzione (Bianchi).
DOI: 10.5281/zenodo.5957595
title: Piante di fase della Villa di Desenzano (BS), loc. Borgo Regio

description: Piante di fase della villa romana di Desenzano (BS), loc. Borgo Regio. Nel complesso il dataset comprende il rilievo generale dell'area archeologica, una tavola del settore A ascrivibile alla metà del IV secolo e una tavola del settore B anch'esso databile alla metà del IV secolo. Le piante di fase sono state ottenute mediante rialaborazioni di rilievi CAD eseguiti da E. Laidelli 2006, proprietà del Polo Museale della Lombardia e digitalizzazione delle ortofoto eseguite nel 2020 dal gruppo di ricerca dell'Università di Verona (dott.ssa Fiammetta Soriano). Per l'elaborazione e gestione dei dati è stata utilizzata una piattaforma GIS open souce, QGIS. Il prodotto finale è stato la generazione di tavole in formato pdf. Gruppo di lavoro: dott. Nicola Mancassola, dott.ssa Elisa Lerco.
DOI: 10.5281/zenodo.4727613
title: Repeating earthquakes from Pernicana fault system (Mt. Etna, Italy)

description: The dataset is associated with the paper: <strong>Repeating earthquakes and ground deformation reveal the structure and triggering mechanisms of the Pernicana fault, Mt. Etna</strong> <em>Andrea Cannata<sup>1,2</sup>*, Adriana Iozzia<sup>1*</sup>, Salvatore Alparone<sup>2</sup>, Alessandro Bonforte<sup>2</sup>, Flavio Cannavò<sup>2</sup>, Simone Cesca<sup>3</sup>, Stefano Gresta<sup>1</sup>, Eleonora Rivalta<sup>3,4</sup>, Andrea Ursino<sup>2</sup></em> 1 Università degli Studi di Catania, Dipartimento di Scienze Biologiche, Geologiche e Ambientali - Sezione di Scienze della Terra, Corso Italia 57, I-95129, Catania, Italy. 2 Istituto Nazionale di Geofisica e Vulcanologia, Osservatorio Etneo – Sezione di Catania, Piazza Roma 2, 95125 Catania, Italy. 3 GFZ German Research Centre for Geosciences Potsdam, Potsdam, Germany 4 Università di Bologna, Dipartimento di Fisica e Astronomia, Via Zamboni, 33 - 40126 Bologna, Italy * Corresponding Authors: andrea.cannata@unict.it adriana.iozzia@phd.unict.it <strong>Journal</strong>: Communications Earth & Environment <strong>Abstract: </strong>Structure and dynamics of fault systems can be investigated using repeating earthquakes as repeatable seismic sources, alongside ground deformation measurements. Here we utilise a dataset of repeating earthquakes which occurred between 2000 and 2019 along the transtensive Pernicana fault system on the northeast flank of Mount Etna, Italy, to investigate the fault structure, as well as the triggering mechanisms of the seismicity. By grouping the repeating earthquakes into families and integrating the seismic data with GPS measurements of ground deformation, we identify four distinct portions of the fault. Each portion shows a different behaviour in terms of seismicity, repeating earthquakes and ground deformation, which we attribute to structural differences including a segmentation of the fault plane at depth. The recurrence intervals of repeating earthquake families display a low degree of regularity which suggests an episodic triggering mechanism, such as magma intrusion, rather than displacement under a constant stress. <strong>Dataset description</strong>: The dataset consists of a xls file with the main features of all the detected repeating earthquake families, which occurred during 2000 - 2019 along the Pernicana fault system on the northeast flank of Mount Etna (Italy). In particular, this file contains: a first sheet with the main features of all the families; a sheet per each family with information about all the earthquakes composing the family, as well as figures with waveforms and cross correlation matrices. The analysed earthquakes belong to the INGV Osservatorio Etneo earthquakes database (https://www.ct.ingv.it/).
DOI: 10.5281/zenodo.4727612
title: Repeating earthquakes from Pernicana fault system (Mt. Etna, Italy)

description: The dataset is associated with the paper: <strong>Repeating earthquakes and ground deformation reveal the structure and triggering mechanisms of the Pernicana fault, Mt. Etna</strong> <em>Andrea Cannata<sup>1,2</sup>*, Adriana Iozzia<sup>1*</sup>, Salvatore Alparone<sup>2</sup>, Alessandro Bonforte<sup>2</sup>, Flavio Cannavò<sup>2</sup>, Simone Cesca<sup>3</sup>, Stefano Gresta<sup>1</sup>, Eleonora Rivalta<sup>3,4</sup>, Andrea Ursino<sup>2</sup></em> 1 Università degli Studi di Catania, Dipartimento di Scienze Biologiche, Geologiche e Ambientali - Sezione di Scienze della Terra, Corso Italia 57, I-95129, Catania, Italy. 2 Istituto Nazionale di Geofisica e Vulcanologia, Osservatorio Etneo – Sezione di Catania, Piazza Roma 2, 95125 Catania, Italy. 3 GFZ German Research Centre for Geosciences Potsdam, Potsdam, Germany 4 Università di Bologna, Dipartimento di Fisica e Astronomia, Via Zamboni, 33 - 40126 Bologna, Italy * Corresponding Authors: andrea.cannata@unict.it adriana.iozzia@phd.unict.it <strong>Journal</strong>: Communications Earth & Environment <strong>Abstract: </strong>Structure and dynamics of fault systems can be investigated using repeating earthquakes as repeatable seismic sources, alongside ground deformation measurements. Here we utilise a dataset of repeating earthquakes which occurred between 2000 and 2019 along the transtensive Pernicana fault system on the northeast flank of Mount Etna, Italy, to investigate the fault structure, as well as the triggering mechanisms of the seismicity. By grouping the repeating earthquakes into families and integrating the seismic data with GPS measurements of ground deformation, we identify four distinct portions of the fault. Each portion shows a different behaviour in terms of seismicity, repeating earthquakes and ground deformation, which we attribute to structural differences including a segmentation of the fault plane at depth. The recurrence intervals of repeating earthquake families display a low degree of regularity which suggests an episodic triggering mechanism, such as magma intrusion, rather than displacement under a constant stress. <strong>Dataset description</strong>: The dataset consists of a xls file with the main features of all the detected repeating earthquake families, which occurred during 2000 - 2019 along the Pernicana fault system on the northeast flank of Mount Etna (Italy). In particular, this file contains: a first sheet with the main features of all the families; a sheet per each family with information about all the earthquakes composing the family, as well as figures with waveforms and cross correlation matrices. The analysed earthquakes belong to the INGV Osservatorio Etneo earthquakes database (https://www.ct.ingv.it/).
DOI: 10.5281/zenodo.6343887
title: Vegetation changes over the last centuries in the Lower Lake Constance region reconstructed from sediment-core environmental DNA

description: Many European lake ecosystems, including their respective catchment areas, underwent anthropogenic environmental changes over the last centuries. This has resulted in changes in the aquatic and terrestrial vegetation, but historical records on the composition of the past vegetation on centennial scale are scarce. In this study, we examined changes in the terrestrial and aquatic plant communities in and around Lower Lake Constance using metabarcoding of sedimentary DNA (sedDNA) of three cores from different sub- basins covering the past, up to 300 years. We successfully identified an average of c. 3000 sequence variants (molecular operational taxonomic units - MOTUs) and obtained a taxonomically annotated dataset of 127 species, 104 genera and 72 families. We could detect major changes in the terrestrial and aquatic vegetation of the Lower Lake Constance region by examining the cores. For example, alpha diversity decreased in the last c. 100 years, and this decrease was more pronounced in the terrestrial than in the aquatic plant community. Unlike the terrestrial plant-community, the current aquatic plant- community composition partially resembles the community from before the 20th-century eutrophication phase of the lake. In addition to changes that can be attributed to anthropogenic impacts, we also captured the effect of DNA sedimentation on the terrestrial DNA diversity representation in sediments during periods of extensive flooding and potentially as a consequence of extremely cold winters. With 1sedDNA from Lower Lake Constance, we provide a new local dataset to investigate and extend the historical changes of different shoreline habitats and to identify characteristic and invasive plant species. Such highly-resolved datasets spanning the past centuries can provide detailed information on human environmental history in densely populated regions that have undergone severe changes in the recent past.
DOI: 10.5281/zenodo.6343886
title: Vegetation changes over the last centuries in the Lower Lake Constance region reconstructed from sediment-core environmental DNA

description: Many European lake ecosystems, including their respective catchment areas, underwent anthropogenic environmental changes over the last centuries. This has resulted in changes in the aquatic and terrestrial vegetation, but historical records on the composition of the past vegetation on centennial scale are scarce. In this study, we examined changes in the terrestrial and aquatic plant communities in and around Lower Lake Constance using metabarcoding of sedimentary DNA (sedDNA) of three cores from different sub- basins covering the past, up to 300 years. We successfully identified an average of c. 3000 sequence variants (molecular operational taxonomic units - MOTUs) and obtained a taxonomically annotated dataset of 127 species, 104 genera and 72 families. We could detect major changes in the terrestrial and aquatic vegetation of the Lower Lake Constance region by examining the cores. For example, alpha diversity decreased in the last c. 100 years, and this decrease was more pronounced in the terrestrial than in the aquatic plant community. Unlike the terrestrial plant-community, the current aquatic plant- community composition partially resembles the community from before the 20th-century eutrophication phase of the lake. In addition to changes that can be attributed to anthropogenic impacts, we also captured the effect of DNA sedimentation on the terrestrial DNA diversity representation in sediments during periods of extensive flooding and potentially as a consequence of extremely cold winters. With 1sedDNA from Lower Lake Constance, we provide a new local dataset to investigate and extend the historical changes of different shoreline habitats and to identify characteristic and invasive plant species. Such highly-resolved datasets spanning the past centuries can provide detailed information on human environmental history in densely populated regions that have undergone severe changes in the recent past.