cometadata/datacite-titles-descriptions-related-identifiers huggingface dataset:
DOI: 10.15468/xcfy7s
title: Fish larvae from May to June '95 of the "Capricórnio" campaign in the Republic of Guinea Bissau

description: This report presents the results of the fifth research cruise in the waters off Guiné-Bissau coast from 7 May to 5 July 1995, on board of the Portuguese RV “Capricórnio”. 33 plankton surveys using a FAO net were carried on.
DOI: 10.15472/vip9ch
title: Registros de peces y cetaceos en el marco del proyecto Ocurrencia, distribución, estado genético y de contaminantes de los cetáceos de La Guajira

description: La Guajira es una región de Colombia que contiene una alta diversidad de especies asociadas a ecosistemas marino-costeros, debido a la surgencia periódica que ocurre en sus aguas, lo que implica una gran variedad de oferta alimenticia para diversos predadores, incluyendo al hombre. A pesar de ésto, la investigación científica con predadores tope como los cetáceos se ha centrado en áreas del Pacífico como bahía Málaga y la Isla Gorgona. En consecuencia, existe un gran vacío de información acerca de la biología, estado de conservación, ecología, historias de vida y patrones poblacionales de los mamíferos marinos en el Caribe, particularmente en La Guajira.
description: La extracción de carbón es una de las principales actividades económicas de la región, la cual ha resultado en graves problemas ambientales. En La Guajira existen varios puertos para transportar carbón y hay planes de construir uno adicional, lo cual ha generado diversos impactos en la biodiversidad local, sin que se conozca cuantitativamente la magnitud de este impacto. Estudiar a los mamíferos marinos de la región, puede proveer información relevante sobre el estado de salud de los ecosistemas, ya que los cetáceos son predadores tope de la red trófica. Por esta razón, datos sobre la ecología, distribución, estado genético y de contaminantes de los cetáceos en La Guajira, pueden constituir la información de línea base clave para el establecimiento de planes de manejo que permitan la conservación de los cetáceos y de los ecosistemas marinos asociados a su distribución.
description: Con el fin de adelantar un diagnóstico preliminar sobre la ocurrencia, distribución, estructura genética y estado de contaminantes de los cetáceos de la Guajira, se realizarán recorridos en bote cubriendo los hábitats costeros y oceánicos durante la temporada seca (mayo y octubre). Información acerca del comportamiento, rumbo, coordenadas geográficas, contexto social y condiciones oceanográficas será registrada en cada viaje. Se tomarán biopsias de piel usando el sistema PAXARMS, así como fotografías de aletas dorsales para adelantar un proceso de foto-identificación. Este estudio proporcionará datos importantes para determinar no sólo la estructura poblacional de los delfínidos a nivel local en La Guajira, sino para establecer una línea base que permita definir unidades de manejo adecuadas en el Caribe colombiano, así como conocer los niveles de contaminación y diversidad genética de los cetáceos en La Guajira y conocer la conectividad con otras poblaciones del Caribe.
description: Este recurso contiene la información de 98 registros de peces (79) y mamíferos marinos (19) pertenecientes a 7 familias, con un 71% clasificado a nivel de especie, 18 a género y 10% a familia. Los datos fueron tomados en 4 municipios del departamento de La Guajira en los años 2016 y 2018.
DOI: 10.6092/001y-7x62
title: Mesozooplankton in the South Adriatic Sea (MEDGES Experiment) in March 2013

description: Mesozooplankton collected in the South Adriatic Sea during a cruise in March 2013, as part of MEDGES experiment in the framework of the Italian project "RITMARE - La Ricerca ITaliana per il MARE".
description: Vertical net (WP2). Samples were fixed with Ca(HCO3)2-buffered formaldehyde (2-4% final concentration) for determination of species abundance and composition. Individuals were sorted and counted under binocular microscope. One cruise in the South Adriatic during March 2013, described at http://seadata.bsh.de/cgi-csr/XML/xmlDownload_V2.pl?edmo=120&identifier=IO48201313017
description: One ZIP file which contians the dataset in two formats: DwC-A file and a XLSX file which unites all Darwin-Core data files.
DOI: 10.15472/c3ggag
title: Zooplancton del estrecho de Bransfield y alrededores de Isla Elefante, verano austral 2019-2020, durante la VI Expedición Científica de Colombia en la Antártica

description: Composición taxonómica y abundancia del meso y macro zooplancton recolectado en el Estrecho de Bransfield y alrededores de isla Elefante durante el verano austral 2019-2020. Las muestras de meso zooplancton se obtuvieron a partir de dos tipos de arrastres recolectados desde alrededor de los 300 m de profundidad hasta la superficie; el primero realizando arrastres oblicuos utilizando una red bongo con mallas de 300 μm y 500 μm, y el segundo a partir de arrastres verticales utilizando una red estándar de 200 µm. Las muestras de macrozooplancton se obtuvieron mediante arrastres oblicuos desde los 170 m de profundidad hasta la superficie, utilizando una red IKMT con malla de 500 µm. El volumen de agua filtrada en las tres redes utilizadas para la recolecta de las muestras biológicas se determinó mediante flujómetros Hydrobios®; con este valor se calculó la abundancia de las morfoespecies encontradas, estandarizadas en función del volumen de agua filtrada en cada estación a individuos por 1000 m3.
DOI: 10.15472/ywuiiq
title: Condrictios del atolón Albuquerque durante la Expedición Seaflower 2018 - Proyecto Colombia BIO

description: Conduct Baited Remote Underwater Video (BRUV) surveys, eDNA surveys, and catch-and-release surveys of reef elasmobranch to assess diversity and relative abundance in the Colombian Caribbean at Isla Cayos de Albuquerque (San Andrés Archipelago). These key baseline data will support future studies on elasmobranchs in other areas of the Seaflower Biosphere Reserve and fill in gaps on the status of elasmobranch populations in the region. This will be combined with large existing BRUV and eDNA datasets collected in other key locations around the world for a global analysis.
DOI: 10.14284/477
title: Plankton community in Régent (680µm) net, Point B, Villefranche-sur-Mer, France

description: This series is part of the long term planktonic monitoring of Villefranche-sur-mer, which is one of the oldest and richest in the world. It aims at describing the dynamics of the mesozooplankton community. The data collection and processing has been funded by several projects over its lifetime. It is currently supported directly by the Institut de la Mer de Villefranche (IMEV), as part of its long term monitoring effort. This dataset contains the planktonic organisms collected by a Régent net (680μm mesh) and therefore cover organisms from ~700µm to ~5cm.
description: "Régent net (680μm mesh) hauled vertically from the bottom (~80m) to the surface, in the morning. Sample preserved in 4% buffered formalin and stored over the long term at the Centre de Collections Planctoniques de Villefranche (CCPv). Sample scanned on a ZooScan, images processed with ZooProcess and sorted taxonomically on EcoTaxa, within the Plateforme d'Imagerie Quantitative de Villefranche (PIQv). The PIQv and CCPv platforms are part of EMBRC-France, a national Research Infrastructure supported by ANR, under the reference ANR-10-INSB-02.
DOI: 10.14284/620
title: ARMS-MBON data on long-term monitoring of hard-bottom communities: COI results from 2018-2020

description: ARMS-MBON is a network of more than 25 partners who deploy Autonomous Reef Monitoring Structures (ARMS) settlement units in the vicinity of marine stations and Long-term Ecological Research sites in European coastal waters and Ant/arctica. After a few months the units are brought up, and visual, photographic, and genetic assessments are made of the lifeforms that settled on them. The collected data are published (see the related datasets and GitHub links listed in this record) and the omics data analysed. In this record we include the outputs of our analysis of the COI data from 2018-2020. The analysis used the PEMA bioinformatics software, and the resulting taxonomics inventory has been submitted as DwCA to (Eur)OBIS. In addition, all the PEMA inputs and outputs can be found on the ARMS-MBON GitHub site (see links in this record), and the subset of the sampling data to which these COI results are linked can also be found on the ARMS-MBON GitHub site.
DOI: 10.15472/wlcrcf
title: Registros de una Tortuga carey (Eretmochelys imbricata) incautada y rehabilitada en el municipio de Riohacha

description: En el marco del Convenio No. ORC 011 de 2014 celebrado entre Petrobras, la Universidad Jorge Tadeo Lozano y la Corporación Autónoma de La Guajira, y con el objeto de dar continuidad en la estabilización y estimación de la situación actual de las poblaciones de tortugas marinas que transitan la región de La Guajira, se realizó la rehabilitación y reintroducción de un ejemplar de tortuga carey. El ejemplar fue incautado por la Policía en el Municipio de Uribia, La Guajira y rehabilitado durante 12 semanas en las instalaciones del Acuario Mundo Marino. Una vez se estabilizó su condición de salud, fue reintroducido al mar portando un trasmisor satelital.
DOI: 10.14284/83
title: Counts of isopods sampled at Gazi Bay (Kenya) between 18 and 25 October 1994
DOI: 10.15472/geltab
title: Sistema de Monitoreo de Arrecifes Coralinos - SIMAC: Abundancia de peces arrecifales

description: Los datos se derivan de la línea de investigación del SIMAC: Sistema de monitoreo para los ambientes arrecifales en Colombia y evaluación de agentes de mortalidad coralina; dentro del programa de Biodiversidad y Ecosistemas Marinos. El proyecto busca generar información sobre la salud y la dinámica de los arrecifes coralinos en Colombia, mediante la evaluación de su estado, para contribuir a su entendimiento y a su conservación, así como al uso sostenible de sus recursos. En este conjunto de datos se reportan los peces arrecifales de importancia comercial y/o ecológica, documentados en estaciones de monitoreo del Mar Caribe y Océano Pacífico colombiano, que corresponden a 42.927 registros biológicos obtenidos entre el año 1998 y 2019.
DOI: 10.25607/xm2wak
title: BIOGEOMAR | Marine Invertebrates | Mollusca | Polyplacophora

description: BIOGEOMAR | Dataset | Mollusca | Polyplacophora | The BioGeoMar Program was created in 2019 with the support of the Boticário Group Foundation for Nature Protection in order to analyze the state of knowledge of marine biodiversity in Brazil, describe how biodiversity is distributed along the coast, and point out priority areas for conservation and carry out future studies. The program gathered 18 researchers, 9 postgrads, and 6 research assistants, from different expertise representing 12 public universities in Brazil, working in a collaborative network. Global platforms are being used that obtain information on the geographic distribution of the species and unprecedented data for science from the zoological and botanical collections of the researchers' laboratories are being accessed. All the data will be publicly available in national and international digital repositories. BioGeoMar is also promoting continuous training and contributing to the UN Ocean Decade. University Consortium: Universidade Federal do Rio de Janeiro, Universidade Federal de Minas Gerais, Universidade Federal do Paraná, Museu Nacional/UFRJ, Universidade Estadual de Londrina, Universidade Federal de Alagoas, Universidade Federal Fluminense, Universidade Estadual Paulista, Universidade Federal do Estado do Rio de Janeiro, Universidade Federal de Santa Catarina, Universidade de São Paulo. | Coordinator: Dr. Fernanda Correia Azevedo | Dataset organizer: Dr. Rafael da Rocha Fortes
DOI: 10.4225/15/58af8adceae21
title: Gross body measurements of Laternula elliptica collected from sites adjacent to Casey Station
DOI: 10.14284/12
title: POPA- Fisheries Observer Program of the Azores: Seabird sightings in the Azores tuna fishery from 1998 to 2013: while fishing
DOI: 10.17031/mehqrq
title: Marine Recorder Snapshot extract of surveys entered by JNCC

description: The UK Marine Recorder public snapshot is an aggregated UK-wide marine dataset, published on a 6monthly basis. Data are collated by JNCC from publicly accessible data provided to JNCC by UK governmental and non-governmental conservation bodies from data holdings within each organisation’s internal “Marine Recorder” marine data management database application. Marine Recorder is a benthic survey data management system used widely within the UK’s statutory nature conservation bodies to store and query benthic sample data across the UK’s offshore and inshore waters. The system is able to store species occurrence data (with associated measurements), biotope information in the Marine Habitat Classification for Britain & Ireland and physical attribute data. The system maintains consistency and relationships between sample information, measurements and surveys allowing for accessible querying of the database. Contributors to the snapshot are: Centre for Environmental Data and Recording (CEDaR, Northern Ireland); Data Archive for Seabed Species and Habitats (DASSH); Joint Nature Conservation Committee; Natural England; Natural Resources Wales; Porcupine Marine Natural History Society; Scottish Natural Heritage; Seasearch (Marine Conservation Society); Shoresearch Kent Wildlife Trust and The Wildlife Trusts. This dataset consists of surveys entered by JNCC.
DOI: 10.25959/70zv-vs11
title: New Zealand sea lion movement and dive data - Campbell Island/Motu Ihupuku
DOI: 10.15468/dl.pe832c
title: Occurrence Download

description: A dataset containing 32358 species occurrences available in GBIF matching the query:
{
 "and" : [
 "BasisOfRecord is Human Observation",
 "TaxonKey is Anthribidae"
 ]
}

 The dataset includes 32358 records from 553 constituent datasets; see https://api.gbif.org/v1/occurrence/download/0000747-250325103851331/datasets/export for details.
 
Data from some individual datasets included in this download may be licensed under less restrictive terms.
DOI: 10.17031/66a3c4f841842
title: 2015 Marine Biological Association of the United Kingdom (MBA) Whitsand bay Sandy Shore Box Cores

description: At Whitsand Bay work experience students took box cores and recorded the abundance of species found using SACFOR. Data were recorded for upper, middle and lower shore on 21/03/15
DOI: 10.25607/iyek7l
title: Molluscs from two rocky shores (infralittoral zone) of the North coast of Crete, collected for the NaGISA project 2007-2008

description: This dataset contains occurrence records of infralittoral molluscs from two infralittoral rocky shore sampling sites in northern Crete (Greece). Samples were collected for a monitoring project of infralittoral rocky shores in Crete, in the framework of the NaGISA project (Natural Geography in Shore Areas, http://www.coml.org/projects/natural-geography-shore-areas-nagisa). The two sampling sites are characterised by a continuous hard bottom habitat with dense algal coverage and a moderate wave exposure and are not impacted by detectable anthropogenic activity. At each site, five random replicate units were collected from each depth of 1m, 5m, 10m, 15m and 20m by placing a plexiglas frame (25x25 cm) on the substrate and scraping the framed area completely. The samples were then collected with an underwater suction device working with pressure from a diving bottle. Samples were washed through a 0.5 mm mesh sieve and fixed in 99% ethanol. In the laboratory, all samples were identified to the most precise taxonomic level possible, using the most recent literature for the phylum. The pollychaetes records are available as a separate dataset in the dataset "Polychaetes from two subtidal rocky shores of the North coast of Crete, collected for the NaGISA project 2007-2008" available at http://ipt.medobis.eu/resource?r=nagisa_species_2007_2008.
DOI: 10.25607/vvjwcv
title: ReefSYN | Standardized datasets of Brazilian reef diversity in space and time - Dataset V: Fish assemblages from Trindade and Martin Vaz

description: This dataset is part of a broader compilation named 'Standardized datasets of Brazilian reef diversity in space and time' created from a research network of reef scientists within several projects and collaborations and finally gathered and published by the ReefSYN group.
The data were collected by Hudson T. Pinheiro during two expeditions to Trindade Island, organized by the TAMAR-ICMBio Project and the Brazilian Navy.
DOI: 10.14284/82
title: Caulerpales (Chlorophyta) of the Kenyan coast (July 1985 - September 1989)
DOI: 10.15472/5ebq5x
title: Fauna íctica pelágica y demersal del Caribe norte colombiano asociada al proyecto de Ecología Trófica

description: La información recopilada en este recurso tenía el objetivo describir los patrones alimentarios de los peces pelágicos y demersales del Caribe norte de Colombia, a partir del análisis de contenido estomacal y análisis isotópico (δ15N y δ13C) y así Identificar las variaciones en los patrones alimentarios y las relaciones tróficas de los peces pelágicos y demersales, asociadas a las épocas climáticas y relacionarlas con las condiciones ambientales de la zona.
DOI: 10.15472/ohqepf
title: Elasmobranquios de la Isla Cayo Serranilla durante la Expedición Seaflower 2017 - Proyecto Colombia BIO

description: In response to population declines noted for many sharks and other elasmobranch species around the world, protecting them from overexploitation has become a global priority. However, the necessary data to assess the diversity and abundance of elasmobranchs has often hindered efforts to effectively restore and protect such species. Many reef surveys around the world have been conducted by scuba divers, although many studies have exposed the flaws and biases of this type of surveys for species such as elasmobranchs. Sampling of these species has traditionally been resource and time intensive due to the need to capture sharks or rays on lines. Recently, advances in video technology have allowed the deployment BRUVs. This technique involves positioning a bait source in front of an underwater video camera and quantifying the fish that are observed in the field of view over a standard sampling period and are an ideal way to quickly, and inexpensively, sample populations of relatively low-density predators like sharks and rays. Due to the remote location of Isla Cayo Serranilla, in the northernmost region of the Seaflower Biosphere Reserve, there is a lack of knowledge of elasmobranch species and their abundance in the area. In order to estimate reef elasmobranch diversity and relative abundance in the Colombian Caribbean at Isla Cayo Serranilla and detect possible bright spots in the region, 52 BRUVs were deployed on the fore-reef and the inner lagoon. Depth was standardized between 8 and 30 m and deployments were performed using standardized pre-weighted bait. Videos will be watched, and species and the maximum number of reef species observed in a single frame (Nmax) will be recorded. This estimate (Nmax) is similar to the Catch per Unit of Effort (CPUE) and will be used to assess the relative abundance of reef shark at Isla Cayo Serranilla.
description: Conduct a 2-week Baited Remote Underwater Video Survey (BRUV) of reef elasmobranch diversity and relative abundance in the Colombian Caribbean at Isla Cayo Serranilla (San Andrés Archipelago) and detect possible bright spots in the region. These key baseline data will support future studies on elasmobranchs in other areas of the Seaflower Biosphere Reserve and fill in gaps on the status of elasmobranch populations in the region. This will be combined with large existing BRUV datasets collected in other key locations around the world for a global analysis through the Global FinPrint project (www.globalfinprint.org).
DOI: 10.15468/0fscv9
title: Naturalis National Natural History Museum (NL) – Invertebrate specimens from marine expeditions

description: RMNH_INVERTEBRATE_MARINE_EXPEDITIONS_SPECIMENS is an extract of several databases which were the result of  NWO Groot "Building de database of Life" in 2005 and 2006 in which the handwritten registers were digitised
DOI: 10.15472/icspfx
title: Familia Udoteaceae (Chlorophyta) de la colección ficológica "Germán Bula Meyer", de la Universidad del Magdalena

description: La familia Udoteaceae (Bryopsidales, Chlorophyta) es muy diversa. Ejemplo de ella se puede apreciar en la colección de referencia “German Antonio Bula Meyer”, la cual cuenta con especies de las Bahamas, Estados Unidos y Colombia. Estos especímenes fueron recolectados manualmente a profundidades entre 0,5 y 40 m, entre los años 1972 hasta 2017, en su mayoría asociadas al fondo arenoso. La colección cuenta con 611 especies del Phyllun Chlorophyta de las cuales 105 pertenecen a la Familia Udoteaceae.
description: Este conjunto de datos comprende 105 registros biológicos de la familia Udoteaceae dispuestos en la colección ficológica German Bula Meyer. Representado en 3 géneros y 11 especies. Un 78.09% está determinado a nivel de especies y un 21.9% a nivel de género.
description: En este conjunto de datos podemos encontrar de 1 a 3 códigos de colector en la misma celda; esto ase referencia a que es la misma especie o Género y que se encuentran en los tres tipos de preparaciones, pero en colecciones diferentes.
DOI: 10.15472/jd4g0x
title: Invertebrados Bentónicos de la II y III Expedición Colombia a la Antártica (CCO)

description: Con el objetivo de contribuir al conocimiento de las comunidades de invertebrados bentónicos de la península Antártica se recolectaron especímenes durante la II y III Expedición Científica de Colombia a la Antártica, todo el trabajo se realizo con el apoyo logístico del Instituto Antártico Chileno, INACH, desde la Base Profesor Julio Escudero ubicada en la Bahía Fildes, Isla del Rey Jorge, Islas Shetland del Sur, se obtuvieron muestras tanto del intermareal como del submareal en diferentes bahías.
description: De estás muestras se separaron organismos de los Phyla: Chlorophyta, Rhodophyta, Ochrophyta, Cnidaria, Platyhelminthes, Annelida (Polychaeta), Mollusca (Gasteropoda, Bivalvia, Polyplacophora), Crustacea (Taniadacea, Cumacea, Decapoda, Isopoda) Echinodermata, Bryozoa, Sipuncula y Nemertea. Particularmente, los organismos del phylum Annelida, clase Polychaeta, se separaron organismos de al menos 13 familias. Adicionalmente, por su tamaño y representatividad de la zona, se pudieron identificar hasta especie el isópodo Glyptonotus antarticus, la estrella Odontaster validus, y los moluscos bivalvos, Laternulla elliptica y Nacella conccina.