cometadata/datacite-titles-descriptions-related-identifiers huggingface dataset:
DOI: 10.35097/dubqhzscilsbdxib
title: High-Throughput Miniaturized Synthesis of PROTAC-Like Molecules

description: The development of miniaturized high-throughput in situ screening platforms capable of handling the entire process of drug synthesis to final screening is essential for advancing drug discovery in the future. In this study, an approach based on combinatorial solid-phase synthesis, enabling the efficient synthesis of libraries of proteolysis targeting chimeras (PROTACs) in an array format is presented. This on-chip platform allows direct biological screening without the need for transfer steps. UV-induced release of target molecules into individual droplets facilitates further on-chip experimentation. Utilizing a mitogen-activated protein kinase kinases (MEK1/2) degrader as a template, a series of 132 novel PROTAC-like molecules is synthesized using solid-phase Ugi reaction. These compounds are further characterized using various methods, including matrix-assisted laser desorption ionization mass spectrometry (MALDI-MS) imaging, while consuming only a few milligrams of starting materials in total. Furthermore, the feasibility of culturing cancer cells on the modified spots and quantifying the effect of MEK suppression is demonstrated. The miniaturized synthesis platform lays a foundation for high-throughput in situ biological screening of potent PROTACs for potential anticancer activity and offers the potential for accelerating the drug discovery process by integrating miniaturized synthesis and biological steps on the same array.
description: Dataset: High-Throughput Miniaturized Synthesis of PROTAC-Like Molecules
DOI: 10.15468/dl.v583qp
title: Occurrence Download

description: A dataset containing 155 species occurrences available in GBIF matching the query:
{
 "and" : [
 "Country is Colombia",
 "Geometry POLYGON((-71.54278 12.13537,-72.70451 12.70264,-75.12476 11.47203,-77.25459 9.28196,-78.99718 7.65418,-77.83545 6.40514,-77.83545 4.38123,-79.48123 2.44855,-79.28761 0.9003,-75.4152 -0.55181,-73.47899 -2.48724,-70.57468 -2.48724,-71.6396 -4.03365,-70.47787 -4.80583,-68.92891 -1.90681,-69.8002 0.99709,-66.9927 1.67458,-67.76718 6.30892,-69.60658 6.69367,-71.93003 7.17418,-73.28537 9.47299,-71.93003 10.90221,-71.54278 12.13537))",
 "HasCoordinate is true",
 "HasGeospatialIssue is false",
 "TaxonKey is Hermetia illucens (Linnaeus, 1758)"
 ]
}

 The dataset includes 155 records from 4 constituent datasets; see https://api.gbif.org/v1/occurrence/download/0044521-241126133413365/datasets/export for details.
 
Data from some individual datasets included in this download may be licensed under less restrictive terms.
DOI: 10.21227/wb0q-6b98
title: AMP Test Data

description: Audio-Motion Processor Data Set to support the submission for publishing in a IEEE Journal.This dataset supports the investigation of a novel wearable audio-motion processor (AMP) system designed for combined cochlear-vestibular implants (CVI). It includes test bench measurements of motion-modulated vestibular stimulation and simultaneous audio stimulation for cochlear electrodes. The dataset contains parameters for pulse amplitude modulation (PAM), pulse rate modulation (PRM), and hybrid pulse rate amplitude modulation (PRAM), along with transfer function characteristics and latency data. Data were collected during controlled rotational motion experiments using a rotary platform and validated for consistency across various electrode configurations. This dataset enables further research into CVI systems, modulation techniques, and their impact on neurostimulation outcomes.
DOI: 10.15468/dl.zbc7yn
title: Occurrence Download

description: A dataset containing 102081 species occurrences available in GBIF matching the query:
{
 "DatasetKey" : [
 "is India Biodiversity Portal publication grade dataset"
 ]
}

 The dataset includes 102081 records from 1 constituent datasets; see https://api.gbif.org/v1/occurrence/download/0044502-241126133413365/datasets/export for details.
 
Data from some individual datasets included in this download may be licensed under less restrictive terms.
DOI: 10.15468/dl.nbrbrv
title: Occurrence Download

description: A dataset containing 627 species occurrences available in GBIF matching the query:
{
 "and" : [
 "BasisOfRecord is one of (Specimen, Material citation, Human Observation)",
 "HasCoordinate is true",
 "HasGeospatialIssue is false",
 "TaxonKey is Lasiurus xanthinus (Thomas, 1897)"
 ]
}

 The dataset includes 627 records from 28 constituent datasets; see https://api.gbif.org/v1/occurrence/download/0044524-241126133413365/datasets/export for details.
 
Data from some individual datasets included in this download may be licensed under less restrictive terms.
DOI: 10.15468/dl.3phtm4
title: Occurrence Download

description: A dataset containing 4587 species occurrences available in GBIF matching the query:
{
 "and" : [
 "Geometry POLYGON((-92.00848 -40.43487,-22.61487 -40.43487,-22.61487 17.99385,-92.00848 17.99385,-92.00848 -40.43487))",
 "HasCoordinate is true",
 "HasGeospatialIssue is false",
 "OccurrenceStatus is Present",
 "TaxonKey is Momordica charantia L."
 ]
}

 The dataset includes 4587 records from 263 constituent datasets; see https://api.gbif.org/v1/occurrence/download/0044523-241126133413365/datasets/export for details.
 
Data from some individual datasets included in this download may be licensed under less restrictive terms.
DOI: 10.5281/zenodo.11394920
title: GeoMorphoGuard
title: Servizio open data di monitoraggio e protezione delle aree a rischio idro-geomorfologico

description: Dall'esigenza di fornire dati sempre più aggiornati sui rischi naturali e antropici causati dalla crisi climatica, nasce GeoMorphoGuard, il servizio open data di monitoraggio e protezione delle aree a rischio idrogeologico attraverso l'utilizzo di prodotti LiDAR (DTM e DSM con risoluzione a 5 m) messi a disposizione dal Geoportale RSDI della Regione Basilicata, dati del PAI (Piano Assetto Idrogeologico) dell'Autorità di Bacino Distrettuale dell'Appennino Meridionale e di prodotti interferometrici elaborati da immagini satellitari Sentinel-1 e ottici di Sentinel-2 del programma Copernicus dell'Unione Europea. Area di interesse: Vulture Alto-Bradano (Basilicata - Italia).
DOI: 10.5281/zenodo.12571906
title: GeoMorphoGuard
title: Servizio open data di monitoraggio e protezione delle aree a rischio idro-geomorfologic

description: Dall'esigenza di fornire dati sempre più aggiornati sui rischi naturali e antropici causati dalla crisi climatica, nasce GeoMorphoGuard, il servizio open data di monitoraggio e protezione delle aree a rischio idrogeologico attraverso l'utilizzo di prodotti LiDAR (DTM e DSM con risoluzione a 5 m) messi a disposizione dal Geoportale RSDI della Regione Basilicata, dati del PAI (Piano Assetto Idrogeologico) dell'Autorità di Bacino Distrettuale dell'Appennino Meridionale e di prodotti interferometrici elaborati da immagini satellitari Sentinel-1 e ottici di Sentinel-2 del programma Copernicus dell'Unione Europea. Area di interesse: Vulture Alto-Bradano (Basilicata - Italia).
DOI: 10.5281/zenodo.13822663
title: GeoMorphoGuard
title: Servizio open data di monitoraggio e protezione delle aree a rischio idro-geomorfologico

description: Dall'esigenza di fornire dati sempre più aggiornati sui rischi naturali e antropici causati dalla crisi climatica, nasce GeoMorphoGuard, il servizio open data di monitoraggio e protezione delle aree a rischio idrogeologico attraverso l'utilizzo di prodotti LiDAR (DTM e DSM con risoluzione a 5 m) messi a disposizione dal Geoportale RSDI della Regione Basilicata, dati del PAI (Piano Assetto Idrogeologico) dell'Autorità di Bacino Distrettuale dell'Appennino Meridionale e di prodotti interferometrici elaborati da immagini satellitari Sentinel-1 e ottici di Sentinel-2 del programma Copernicus dell'Unione Europea. Area di interesse: Vulture Alto-Bradano (Basilicata - Italia).
DOI: 10.5281/zenodo.13866592
title: GeoMorphoGuard
title: Servizio open data di monitoraggio e protezione delle aree a rischio idro-geomorfologico

description: Dall'esigenza di fornire dati sempre più aggiornati sui rischi naturali e antropici causati dalla crisi climatica, nasce GeoMorphoGuard, il servizio open data di monitoraggio e protezione delle aree a rischio idrogeologico attraverso l'utilizzo di prodotti LiDAR (DTM e DSM con risoluzione a 5 m) messi a disposizione dal Geoportale RSDI della Regione Basilicata, dati del PAI (Piano Assetto Idrogeologico) dell'Autorità di Bacino Distrettuale dell'Appennino Meridionale e di prodotti interferometrici elaborati da immagini satellitari Sentinel-1 e ottici di Sentinel-2 del programma Copernicus dell'Unione Europea. Area di interesse: Vulture Alto-Bradano (Basilicata - Italia).
DOI: 10.5281/zenodo.13954734
title: GeoMorphoGuard
title: Servizio open data di monitoraggio e protezione delle aree a rischio idro-geomorfologico

description: Dall'esigenza di fornire dati sempre più aggiornati sui rischi naturali e antropici causati dalla crisi climatica, nasce GeoMorphoGuard, il servizio open data di monitoraggio e protezione delle aree a rischio idrogeologico attraverso l'utilizzo di prodotti LiDAR (DTM e DSM con risoluzione a 5 m) messi a disposizione dal Geoportale RSDI della Regione Basilicata, dati del PAI (Piano Assetto Idrogeologico) dell'Autorità di Bacino Distrettuale dell'Appennino Meridionale e di prodotti interferometrici elaborati da immagini satellitari Sentinel-1 e ottici di Sentinel-2 del programma Copernicus dell'Unione Europea. Area di interesse: Vulture Alto-Bradano (Basilicata - Italia).
DOI: 10.5281/zenodo.14244293
title: GeoMorphoGuard
title: Servizio open data di monitoraggio e protezione delle aree a rischio idro-geomorfologico

description: Dall'esigenza di fornire dati sempre più aggiornati sui rischi naturali e antropici causati dalla crisi climatica, nasce GeoMorphoGuard, il servizio open data di monitoraggio e protezione delle aree a rischio idrogeologico attraverso l'utilizzo di prodotti LiDAR (DTM e DSM con risoluzione a 5 m) messi a disposizione dal Geoportale RSDI della Regione Basilicata, dati del PAI (Piano Assetto Idrogeologico) dell'Autorità di Bacino Distrettuale dell'Appennino Meridionale e di prodotti interferometrici elaborati da immagini satellitari Sentinel-1 e ottici di Sentinel-2 del programma Copernicus dell'Unione Europea. Area di interesse: Vulture Alto-Bradano (Basilicata - Italia).
DOI: 10.5281/zenodo.14360415
title: GeoMorphoGuard
title: Servizio open data di monitoraggio e protezione delle aree a rischio idro-geomorfologico

description: Dall'esigenza di fornire dati sempre più aggiornati sui rischi naturali e antropici causati dalla crisi climatica, nasce GeoMorphoGuard, il servizio open data di monitoraggio e protezione delle aree a rischio idrogeologico attraverso l'utilizzo di prodotti LiDAR (DTM e DSM con risoluzione a 5 m) messi a disposizione dal Geoportale RSDI della Regione Basilicata, dati del PAI (Piano Assetto Idrogeologico) dell'Autorità di Bacino Distrettuale dell'Appennino Meridionale e di prodotti interferometrici elaborati da immagini satellitari Sentinel-1 e ottici di Sentinel-2 del programma Copernicus dell'Unione Europea. Area di interesse: Vulture Alto-Bradano (Basilicata - Italia).
DOI: 10.5281/zenodo.11002748
title: GeoMorphoGuard
title: Servizio open data di monitoraggio e protezione delle aree a rischio idro-geomorfologico

description: Dall'esigenza di fornire dati sempre più aggiornati sui rischi naturali e antropici causati dalla crisi climatica, nasce GeoMorphoGuard, il servizio open data di monitoraggio e protezione delle aree a rischio idrogeologico attraverso l'utilizzo di prodotti LiDAR (DTM e DSM con risoluzione a 5 m) messi a disposizione dal Geoportale RSDI della Regione Basilicata, dati del PAI (Piano Assetto Idrogeologico) dell'Autorità di Bacino Distrettuale dell'Appennino Meridionale e di prodotti interferometrici elaborati da immagini satellitari Sentinel-1 e ottici di Sentinel-2 del programma Copernicus dell'Unione Europea. Area di interesse: Vulture Alto-Bradano (Basilicata - Italia).
DOI: 10.5281/zenodo.13810799
title: GeoMorphoGuard
title: Servizio open data di monitoraggio e protezione delle aree a rischio idro-geomorfologico

description: Dall'esigenza di fornire dati sempre più aggiornati sui rischi naturali e antropici causati dalla crisi climatica, nasce GeoMorphoGuard, il servizio open data di monitoraggio e protezione delle aree a rischio idrogeologico attraverso l'utilizzo di prodotti LiDAR (DTM e DSM con risoluzione a 5 m) messi a disposizione dal Geoportale RSDI della Regione Basilicata, dati del PAI (Piano Assetto Idrogeologico) dell'Autorità di Bacino Distrettuale dell'Appennino Meridionale e di prodotti interferometrici elaborati da immagini satellitari Sentinel-1 e ottici di Sentinel-2 del programma Copernicus dell'Unione Europea. Area di interesse: Vulture Alto-Bradano (Basilicata - Italia).
DOI: 10.5281/zenodo.13987010
title: GeoMorphoGuard
title: Servizio open data di monitoraggio e protezione delle aree a rischio idro-geomorfologico

description: Dall'esigenza di fornire dati sempre più aggiornati sui rischi naturali e antropici causati dalla crisi climatica, nasce GeoMorphoGuard, il servizio open data di monitoraggio e protezione delle aree a rischio idrogeologico attraverso l'utilizzo di prodotti LiDAR (DTM e DSM con risoluzione a 5 m) messi a disposizione dal Geoportale RSDI della Regione Basilicata, dati del PAI (Piano Assetto Idrogeologico) dell'Autorità di Bacino Distrettuale dell'Appennino Meridionale e di prodotti interferometrici elaborati da immagini satellitari Sentinel-1 e ottici di Sentinel-2 del programma Copernicus dell'Unione Europea. Area di interesse: Vulture Alto-Bradano (Basilicata - Italia).
DOI: 10.5281/zenodo.14394219
title: GeoMorphoGuard
title: Servizio open data di monitoraggio e protezione delle aree a rischio idro-geomorfologico

description: Dall'esigenza di fornire dati sempre più aggiornati sui rischi naturali e antropici causati dalla crisi climatica, nasce GeoMorphoGuard, il servizio open data di monitoraggio e protezione delle aree a rischio idro-geomorfologico attraverso l'utilizzo di prodotti LiDAR (DTM e DSM con risoluzione a 5 m) messi a disposizione dal Geoportale RSDI della Regione Basilicata, dati del PAI (Piano Assetto Idrogeologico) dell'Autorità di Bacino Distrettuale dell'Appennino Meridionale e di prodotti interferometrici elaborati da immagini satellitari Sentinel-1 e ottici di Sentinel-2 del programma Copernicus dell'Unione Europea. Area di interesse: Vulture Alto-Bradano (Basilicata - Italia).
DOI: 10.5281/zenodo.14537432
title: GeoMorphoGuard
title: Servizio open data di monitoraggio e protezione delle aree a rischio idro-geomorfologico

description: Dall'esigenza di fornire dati sempre più aggiornati sui rischi naturali e antropici causati dalla crisi climatica, nasce GeoMorphoGuard, il servizio open data di monitoraggio e protezione delle aree a rischio idro-geomorfologico attraverso l'utilizzo di prodotti LiDAR (DTM e DSM con risoluzione a 5 m) messi a disposizione dal Geoportale RSDI della Regione Basilicata, dati del PAI (Piano Assetto Idrogeologico) dell'Autorità di Bacino Distrettuale dell'Appennino Meridionale e di prodotti interferometrici elaborati da immagini satellitari Sentinel-1 e ottici di Sentinel-2 del programma Copernicus dell'Unione Europea. Area di interesse: Vulture Alto-Bradano (Basilicata - Italia).
DOI: 10.15468/dl.arwpvj
title: Occurrence Download

description: A dataset containing 296 species occurrences available in GBIF matching the query:
{
 "and" : [
 "Geometry POLYGON((-88.29096 -40.43487,-25.7128 -40.43487,-25.7128 15.62157,-88.29096 15.62157,-88.29096 -40.43487))",
 "HasCoordinate is true",
 "HasGeospatialIssue is false",
 "OccurrenceStatus is Present",
 "TaxonKey is Morus alba L."
 ]
}

 The dataset includes 296 records from 60 constituent datasets; see https://api.gbif.org/v1/occurrence/download/0044525-241126133413365/datasets/export for details.
 
Data from some individual datasets included in this download may be licensed under less restrictive terms.
DOI: 10.15468/dl.323sr9
title: Occurrence Download

description: A dataset containing 4 species occurrences available in GBIF matching the query:
{
 "and" : [
 "TaxonKey is Hypothenemus hampei (Ferrari, 1867)",
 "Country is India",
 "Year is greater than or equal to 1500"
 ]
}

 The dataset includes 4 records from 2 constituent datasets; see https://api.gbif.org/v1/occurrence/download/0044527-241126133413365/datasets/export for details.
 
Data from some individual datasets included in this download may be licensed under less restrictive terms.
DOI: 10.15468/dl.py28rh
title: Occurrence Download

description: A dataset listing the 65 species recorded in GBIF matching the query:
{
 "and" : [
 {
 "or" : [
 "PublishingCountry is Colombia",
 {
 "and" : [
 "Country is Colombia",
 {
 "not" : {
 "Issue" : [
 "is Country coordinate mismatch"
 ]
 }
 }
 ]
 }
 ]
 },
 {
 "and" : [
 {
 "or" : [
 "StateProvince is valle del cauca",
 "StateProvince ~valle del cauca",
 "StateProvince is valle del cauca department",
 "StateProvince is valle del cauca dept.",
 "StateProvince is valle del cauca departamento",
 "StateProvince is valle del cauca département"
 ]
 },
 "GadmGid is one of (COL.31.12_2)",
 "Elevation is 1700m"
 ]
 }
 ]
}

 The dataset's 65 records were derived from 12 constituent datasets; see https://api.gbif.org/v1/occurrence/download/0044522-241126133413365/datasets/export for details.
 
Data from some individual datasets included in this download may be licensed under less restrictive terms.
DOI: 10.15468/dl.gnk6cd
title: Occurrence Download

description: A dataset containing 564 species occurrences available in GBIF matching the query:
{
 "and" : [
 "Geometry POLYGON((-87.05179 -41.37143,-30.66949 -41.37143,-30.66949 17.99387,-87.05179 17.99387,-87.05179 -41.37143))",
 "HasCoordinate is true",
 "HasGeospatialIssue is false",
 "OccurrenceStatus is Present",
 "TaxonKey is Murraya paniculata (L.) Jacq."
 ]
}

 The dataset includes 564 records from 104 constituent datasets; see https://api.gbif.org/v1/occurrence/download/0044528-241126133413365/datasets/export for details.
 
Data from some individual datasets included in this download may be licensed under less restrictive terms.
DOI: 10.15468/dl.9vrgzh
title: Occurrence Download

description: A dataset containing 488 species occurrences available in GBIF matching the query:
{
 "and" : [
 "Geometry POLYGON((-86.4322 -38.03578,-25.7128 -38.03578,-25.7128 17.99382,-86.4322 17.99382,-86.4322 -38.03578))",
 "HasCoordinate is true",
 "HasGeospatialIssue is false",
 "OccurrenceStatus is Present",
 "TaxonKey is Neustanthus phaseoloides (Roxb.) Benth."
 ]
}

 The dataset includes 488 records from 76 constituent datasets; see https://api.gbif.org/v1/occurrence/download/0044529-241126133413365/datasets/export for details.
 
Data from some individual datasets included in this download may be licensed under less restrictive terms.
DOI: 10.15468/dl.yfmutt
title: Occurrence Download

description: A dataset containing 1101 species occurrences available in GBIF matching the query:
{
 "and" : [
 "Geometry POLYGON((-90.14972 -40.43489,-26.33239 -40.43489,-26.33239 19.1684,-90.14972 19.1684,-90.14972 -40.43489))",
 "HasCoordinate is true",
 "HasGeospatialIssue is false",
 "OccurrenceStatus is Present",
 "TaxonKey is Nymphoides indica (L.) Kuntze"
 ]
}

 The dataset includes 1101 records from 134 constituent datasets; see https://api.gbif.org/v1/occurrence/download/0044530-241126133413365/datasets/export for details.
 
Data from some individual datasets included in this download may be licensed under less restrictive terms.
DOI: 10.25378/janelia.26513077
title: Manual nuclei segmentations in near-isotropic, reconstructed volume electron microscopy (FIB-SEM) of BFA-treated HeLa cell (jrc_hela-bfa)

description: <b>Annotation description</b>: Dense segmentations of nuclei in jrc_hela-bfa using Amira-Avizo (Thermo Fisher Scientific) and "Using Amira to manually segment organelles in vEM for machine learning V.3" protocol.<b>Annotation protocol</b>: Using Amira to manually segment organelles in vEM for machine learning V.3 (http://dx.doi.org/10.17504/protocols.io.bp2l61rb5vqe/v3)<b>Software</b>: Amira 3D 2021.1, Classic Segmentation Workroom<b>Classes annotated</b>: Nuclei<b>Source (EM) dataset ID</b>: jrc_hela-bfa<b>Source (EM) voxel size (nm)</b>: 8 x 8 x 8 (X, Y, Z)<b>Source (EM) data dimensions (µm)</b>: 65 x 4.8 x 51.6 (X, Y, Z)<b>Source (EM) DOI</b>: https://doi.org/10.25378/janelia.13469814<b>Dataset URL</b>: s3://janelia-cosem-datasets/jrc_hela-bfa/jrc_hela-bfa.zarr/recon-1/labels/inference/segmentations/nuc/<b>Visualization website</b>: https://openorganelle.janelia.org/datasets/jrc_hela-bfa
DOI: 10.25378/janelia.26513077.v1
title: Manual nuclei segmentations in near-isotropic, reconstructed volume electron microscopy (FIB-SEM) of BFA-treated HeLa cell (jrc_hela-bfa)

description: <b>Annotation description</b>: Dense segmentations of nuclei in jrc_hela-bfa using Amira-Avizo (Thermo Fisher Scientific) and "Using Amira to manually segment organelles in vEM for machine learning V.3" protocol.<b>Annotation protocol</b>: Using Amira to manually segment organelles in vEM for machine learning V.3 (http://dx.doi.org/10.17504/protocols.io.bp2l61rb5vqe/v3)<b>Software</b>: Amira 3D 2021.1, Classic Segmentation Workroom<b>Classes annotated</b>: Nuclei<b>Source (EM) dataset ID</b>: jrc_hela-bfa<b>Source (EM) voxel size (nm)</b>: 8 x 8 x 8 (X, Y, Z)<b>Source (EM) data dimensions (µm)</b>: 65 x 4.8 x 51.6 (X, Y, Z)<b>Source (EM) DOI</b>: https://doi.org/10.25378/janelia.13469814<b>Dataset URL</b>: s3://janelia-cosem-datasets/jrc_hela-bfa/jrc_hela-bfa.zarr/recon-1/labels/inference/segmentations/nuc/<b>Visualization website</b>: https://openorganelle.janelia.org/datasets/jrc_hela-bfa
DOI: 10.15468/dl.fpxuga
title: Occurrence Download

description: A dataset containing 291690 species occurrences available in GBIF matching the query:
{
 "and" : [
 "Continent is South America",
 "Country is Brazil",
 "DatasetKey is one of (Observation.org, Nature data from around the World, Royal Botanic Gardens, Kew - Herbarium Specimens)"
 ]
}

 The dataset includes 291690 records from 2 constituent datasets; see https://api.gbif.org/v1/occurrence/download/0044520-241126133413365/datasets/export for details.
 
Data from some individual datasets included in this download may be licensed under less restrictive terms.
DOI: 10.15468/dl.txhrpp
title: Occurrence Download

description: A dataset containing 1 species occurrences available in GBIF matching the query:
{
 "and" : [
 "TaxonKey is Leptinotarsa decemlineata (Say, 1824)",
 "Country is China",
 "Year is greater than or equal to 1500"
 ]
}

 The dataset includes 1 records from 1 constituent datasets; see https://api.gbif.org/v1/occurrence/download/0044532-241126133413365/datasets/export for details.
 
Data from some individual datasets included in this download may be licensed under less restrictive terms.
DOI: 10.25378/janelia.26513224
title: Manual nuclei segmentations in near-isotropic, reconstructed volume electron microscopy (FIB-SEM) of mouse Spinal Cord (jrc_mus-sc-zp104a)

description: <b>Annotation description</b>: Dense segmentations of nuclei in jrc_mus-sc-zp104a using Amira-Avizo (Thermo Fisher Scientific) and "Using Amira to manually segment organelles in vEM for machine learning V.3" protocol.<b>Annotation protocol</b>: Using Amira to manually segment organelles in vEM for machine learning V.3 (http://dx.doi.org/10.17504/protocols.io.bp2l61rb5vqe/v3)<b>Software</b>: Amira 3D 2021.1, Classic Segmentation Workroom<b>Classes annotated</b>: Nuclei<b>Source (EM) dataset ID</b>: jrc_mus-sc-zp104a<b>Source (EM) voxel size (nm)</b>: 6.0 x 6.0 x 6.0 (X, Y, Z)<b>Source (EM) data dimensions (µm)</b>: 40 x 30 x 75 (X, Y, Z)<b>Source (EM) DOI</b>: https://doi.org/10.25378/janelia.20134574<b>Dataset URL</b>: s3://janelia-cosem-datasets/jrc_mus-sc-zp104a/jrc_mus-sc-zp104a.zarr/recon-1/labels/inference/segmentations/nuc/<b>Visualization website</b>: https://openorganelle.janelia.org/datasets/jrc_mus-sc-zp104a