cometadata/datacite-titles-descriptions-related-identifiers huggingface dataset:
DOI: 10.5878/8r0v-jk54
title: Study of the yeast cytosolic Hsp70-system in protein homeostasis and life span regulation - The misfolding protein marker guk1-7-GFP before, during and after in recovery from heat shock stress in Hsp70-mutant yeast strains
title: Studier av det cytosoliska Hsp70-systemet från jäst och dess roll i proteinhomeostas och reglering av livslängd - Det felveckande markörproteinet guk1-7-GFP avbildat före, under och i återhämtning från värmestress i Hsp70-mutanta jäststammar

description: Our study aims to answer the question "Which functions of the Hsp70 class of molecular chaperones are essential for yeast to maintain a standard replicative life span?". To answer this question, we utilised the disparate functions of the Hsp70's Ssa1 and 2 and their paralog Ssa4 in a yeast strain that lacks Ssa1/2 but has an ectopically increased production of Ssa4. We have gathered data on the behaviour of several different markers for protein aggregation under different circumstances, as well as data on proteins from other classes of molecular chaperones. The bulk of the data is in the form of multichannel microscopy images from widefield microscopy, with a few sets of western blots of protein extracts.

Fluorescence microscopy of live yeast cells at mid-exponential growth before stress, directly after 30 minutes of heat shock, and 20, 40 and 60 minutes after heat shock. The yeast is grown in complete synthetic medium with 2 % glucose as carbon source. All strains produce the aggregate marker protein guk1-7-GFP.
The dataset was collected through fluorescence microscopy.
The image files are provided in Carl Zeiss Image format (.czi).
description: Vi har systematiskt studerat vilka funktioner hos de cytosoliska molekylära chaperonerna av klassen Hsp70 hos jäst som krävs för att upprätthålla en normal livslängd.

Fluorescensmikroskopibilder av levande jästceller i mitten av den exponentiella tillväxtfasen före stress, direkt efter 30 minuters värmestress samt 20, 40 och 60 minuter efter värmestress. Jästen är odlad i komplett syntetiskt medium med 2 % glukos som kolkälla. Alla stammar producerar det felveckade markörproteinet guk1-7-GFP. 
Datasetet har samlats in genom fluorescensmikroskopi.
Bildfilerna är i Carl Zeiss Image-format (.czi).
DOI: 10.5878/gv2g-xc30
title: Study of the yeast cytosolic Hsp70-system in protein homeostasis and life span regulation - The molecular chaperone GFP-Hsp104 before and after heat stress in Hsp70-mutant yeast strains
title: Studier av det cytosoliska Hsp70-systemet från jäst och dess roll i proteinhomeostas och reglering av livslängd - Det molekylära chaperonet GFP-Hsp104 före och efter värmestress i Hsp70-mutanta jäststammar

description: Our study aims to answer the question "Which functions of the Hsp70 class of molecular chaperones are essential for yeast to maintain a standard replicative life span?". To answer this question, we utilised the disparate functions of the Hsp70's Ssa1 and 2 and their paralog Ssa4 in a yeast strain that lacks Ssa1/2 but has an ectopically increased production of Ssa4. We have gathered data on the behaviour of several different markers for protein aggregation under different circumstances, as well as data on proteins from other classes of molecular chaperones. The bulk of the data is in the form of multichannel microscopy images from widefield microscopy, with a few sets of western blots of protein extracts.

Fluorescence microscopy of live yeast cells at mid-exponential growth and after 30 minutes of heat shock. The cells were grown in complete synthetic media lacking histidine (CSM-HIS) with 2 % galactose as carbon source. All strains carry a plasmid expressing GFP-HSP104 under the control of the GAL-promoter.

The dataset was collected through fluorescence microscopy.
The image files are provided in Carl Zeiss Image format (.czi).
description: Vi har systematiskt studerat vilka funktioner hos de cytosoliska molekylära chaperonerna av klassen Hsp70 hos jäst som krävs för att upprätthålla en normal livslängd.

Fluorescensmikroskopi av levande jäst i mitten av den exponentiella tillväxtfasen före och efter 30 minuter värmestress. Jästen är odlad i syntetiskt medium utan histidin med 2 % galaktos som kolkälla. Alla avbildade stammar bär på en plasmid som uttrycker GFP-HSP104 under kontroll av en GAL-promotor.
Datasetet har samlats in genom fluorescensmikroskopi.
Bildfilerna är i Carl Zeiss Image-format (.czi).
DOI: 10.5878/0d00-3p92
title: Sweden now 1978 - Skåne survey
title: ORVESTO 1978 - Skåneundersökningen
title: Sverige nu 1978 - Skåneundersökningen

description: ORVESTO is a TNS Sifo survey series that measures the reach of certain media elements by asking informants about their media habits.
This particular survey focused on Scania in the year 1978.
description: ORVESTO-rapporterna (Räckviddsrapporterna) är TNS Sifos stora postala medie- och målgruppsundersökning. Här mäts räckvidderna för ett stort antal medier, tidningar såväl som etermedier, bio, utomhusreklam etc.
Denna undersökning fokuserar på skånska hushåll år 1978.
DOI: 10.5878/mez1-3z30
title: Study of the yeast cytosolic Hsp70-system in protein homeostasis and life span regulation - The molecular chaperone GFP-Hsp104 before and after heat stress in a Hsp70-mutant yeast strain with exogenous complementation of wildtype and chimaeric mutant alleles of yeast Hsp70-alleles
title: Studier av det cytosoliska Hsp70-systemet från jäst och dess roll i proteinhomeostas och reglering av livslängd - Det molekylära chaperonet GFP-Hsp104 avbildat före och efter värmestress i Hsp70-mutanta jäststammar som komplementerats med exogena vildtyp- och chimärmutanta Hsp70-alleler

description: Our study aims to answer the question "Which functions of the Hsp70 class of molecular chaperones are essential for yeast to maintain a standard replicative life span?". To answer this question, we utilised the disparate functions of the Hsp70's Ssa1 and 2 and their paralog Ssa4 in a yeast strain that lacks Ssa1/2 but has an ectopically increased production of Ssa4. We have gathered data on the behaviour of several different markers for protein aggregation under different circumstances, as well as data on proteins from other classes of molecular chaperones. The bulk of the data is in the form of multichannel microscopy images from widefield microscopy, with a few sets of western blots of protein extracts.

Fluorescence microscopy of live yeast cells at mid-exponential growth and after 30 minutes of heat shock. The cells were grown in complete synthetic media lacking histidine and leucine with 2 % galactose as carbon source. All strains carry two plasmids; one expressing GFP-HSP104 under the control of the GAL-promoter and one expressing SSA1, SSA4 or SSA1/SSA4 chimaeras (alternatively an empty plasmid) under the control of the GPD-promoter.
The dataset was collected through fluorescence microscopy.
The image files are provided in Carl Zeiss Image format (.czi).
description: Vi har systematiskt studerat vilka funktioner hos de cytosoliska molekylära chaperonerna av klassen Hsp70 hos jäst som krävs för att upprätthålla en normal livslängd.

Fluorescensmikroskopi av levande jäst i mitten av den exponentiella tillväxtfasen före och efter 30 minuter värmestress. Jästen är odlad i syntetiskt medium utan histidin och leucin med 2 % galaktos som kolkälla. Alla avbildade stammar bär på två plasmider; en som uttrycker GFP-HSP104 under kontroll av en GAL-promotor samt en som uttrycker SSA1, SSA4 eller SSA1/SSA4 chimärer (alternativt en tom plasmid) under kontroll av en GPD-promotor.
Datasetet har samlats in genom fluorescensmikroskopi.
Bildfilerna är i Carl Zeiss Image-format (.czi).
DOI: 10.5878/6jnb-7042
title: HCV forest areas in Norrbotten County (Sweden) based on density analysis of HCV forests
title: Värdetrakter för boreal skog i Norrbottens län baserat på täthetsanalys av skogliga värdekärnor

description: This dataset shows areas in Norrbotten County (Sweden) that consist of at least 20% HCV forests within a radius of 250 meters. 

The dataset consists of a Geopackage with two vector layers (polygons), incl. and excl. continuity forest, respectively.

For more information, see the documentation.
description: Detta dataset visar områden i Norrbottens län som utgörs av minst 20% skogliga värdekärnor inom en radie 250 m. 

Datasetet utgörs av ett Geopackage med två vektorlager (polygon), inklusive resp. exklusive kontinuitetsskog.

För mer information, se dokumentationen.
DOI: 10.5878/6j4g-y180
title: Parameterised finite element model for S&C Benchmark in Matlab and Abaqus format
title: Parameteriserad finita element-modell för S&C Benchmark i Matlab och Abaqus-format

description: A finite element model of a 60E1-R760-1:15 turnout with parameterised rail pad and ballast properties for simulation Benchmark purposes.

The matlab script WriteAbaqus_210927 generates a turnout FE model in Abaqus format with the track stiffness properties (ballast and pad) and nodal constraints defined at the top of the file.

An overview of the model is provided in the article

Björn A. Pålsson, Ramakrishnan Ambur, Michel Sebès, Ping Wang, Jou-Yi Shih,
Demeng Fan, Jingmang Xu, and Jiayin Chen, A comparison of track model formulations for simulation of dynamic
vehicle–track interaction in switches and crossings, Vehicle System Dynamics, https://doi.org/10.1080/00423114.2021.1983183

The main file for the FE model is called TurnoutMaster.inp An optional tangent track extension section of 25.2 metres can be written if trackExtensionFlag=1. The main file is called TrackExtensionMaster.inp

The rail and sleeper body files are provided "as is" while the bushing properties and nodal constraint files are updated each time the script is run. 

The rail and sleeper bodies are available in the zip folder RailAndSleeperBodies.zip

Example models for the calulation of track receptance are included in the folders Turnout_1 and TrackExtension_1. 

The Turnout_1 model also includes a file called RUNNING_SURFACE_NODES.inp with sets of nodes for the different rails required for some software implementations (e.g. Simpack linear flextrack) and for simulations of traffic in the through and diverging routes. 

If the track extension is used, additional node sets would have to be created for those rails as well, but it's straightforward to use the nodes of the straight rail bodies for this purpose.
description: En finita element-modell av en 60E1-R760-1:15 spårväxel med parameteriserade egenskaper för rälbefästningar och ballastegenskaper.

En beskrivning av innehållet i datasetet finns på den engelska katalogsidan.
DOI: 10.5878/d0ya-5n21
title: Study of the yeast cytosolic Hsp70-system in protein homeostasis and life span regulation - Hsp70-mutant yeast strains with the misfolding marker protein guk1-7-GFP and with or without an intact HSP104-allele, imaged during mid-exponential growth
title: Studier av det cytosoliska Hsp70-systemet från jäst och dess roll i proteinhomeostas och reglering av livslängd - Hsp70-mutanta jäststammar med det felveckande markörproteinet guk1-7-GFP samt med eller utan intakt HSP104-allel, avbildade under mitten av den exponentiella tillväxtfasen

description: Our study aims to answer the question "Which functions of the Hsp70 class of molecular chaperones are essential for yeast to maintain a standard replicative life span?". To answer this question, we utilised the disparate functions of the Hsp70's Ssa1 and 2 and their paralog Ssa4 in a yeast strain that lacks Ssa1/2 but has an ectopically increased production of Ssa4. We have gathered data on the behaviour of several different markers for protein aggregation under different circumstances, as well as data on proteins from other classes of molecular chaperones. The bulk of the data is in the form of multichannel microscopy images from widefield microscopy, with a few sets of western blots of protein extracts.

Fluorescence microscopy of live yeast cells at mid-exponential growth. The yeast is grown in complete synthetic medium with 2 % glucose as carbon source. All strains produce the aggregate marker protein guk1-7-GFP.
The dataset was collected through fluorescence microscopy.
The image files are provided in Carl Zeiss Image format (.czi).
description: Vi har systematiskt studerat vilka funktioner hos de cytosoliska molekylära chaperonerna av klassen Hsp70 hos jäst som krävs för att upprätthålla en normal livslängd.

Fluorescensmikroskopibilder av levande jästceller i mitten av den exponentiella tillväxtfasen. Jästen är odlad i komplett syntetiskt medium med 2 % glukos som kolkälla. Alla stammar producerar det felveckade markörproteinet guk1-7-GFP. 
Datasetet har samlats in genom fluorescensmikroskopi.
Bildfilerna är i Carl Zeiss Image-format (.czi).
DOI: 10.5878/9hks-7g79
title: Journalists' questions during the Public Health Agency of Sweden's press conferences during the corona pandemic 2020
title: Journalisternas frågor under Folkhälsomyndighetens presskonferenser under coronapandemin 2020

description: This dataset contains questions/turn-takings asked by journalists during the Public Health Agency of Sweden's press conferences during the corona pandemic throughout 2020, as well as during personal interviews with government representatives (mainly the Public Health Agency) on Aftonbladet's web TV and on Sveriges Television's live TV broadcasts. The purpose was to investigate the proportion of journalists' questions that were critical. The data is collected through a quantitative content analysis coded by hand by an individual coder. A total of 1,215 questions / turn-takings (with 26 variables) were asked by journalists, collected during the period 2020-03-06 to 2020-12-29.

The dataset contains raw data, R scripts with comments and plotted graphs. Refer to the documentation file README.pdf (Swedish) for descriptions of individual files.
description: Detta dataset innehåller frågor/turordningar som ställdes av journalister under Folkhälsomyndighetens presskonferenser under coronapandemin under hela 2020, samt under personliga intervjuer med myndighetsföreträdare (främst Folkhälsomyndigheten) i Aftonbladets webb-tv och i Sveriges Televisions direktsända tv-sändningar. Syftet var att undersöka hur stor andel av journalisternas frågor som var kritiska. Datan är insamlad genom en kvantitativ innehållsanalys som kodats för hand av en enskild kodare. Totalt ingår 1 215 frågor/turordningar (med 26 variabler) som ställdes av journalister, insamlade under perioden 2020-03-06 till 2020-12-29.

Datasetet innehåller rådata, kommenterade R-skript och plottade figurer. Se dokumentationsfilen README.pdf för beskrivning av individuella filer.
DOI: 10.5878/jbab-cy46
title: Swedish Forest Phenology dataset
title: Svensk skogsfenologi - Svenskt skogsfenologidataset

description: As part of the SLU environmental monitoring and assessment program, the Experimental Forests of the university collect detailed phenological measurements and observations on the tree species downy birch (betula pubescens), silver birch (betula pendula), Norway spruce (picea abies) and Scots pine (pinus sylvestris), and on two berry shrubs common in the Swedish forest, bilberry (vaccinium myrtillus) and lingonberry (vaccinium vitis-idaea). The dataset includes detailed data on leaf and shoot development on the tree species, and on flowering, emergence of unripe and ripe berries on the berry species during the years 2006-2020. The dataset shows the averaged values of measurements and observations performed on several individuals during the same assessment day.

The dataset includes temperature sums, calculated from climate monitoring data performed at each observation site.

The dataset also includes R-scripts that read and handle the observation data tables by interpolation between assessment days and between temperature sum levels at assessments, to get estimated daily values and values for even steps of temperature sums, respectively. By this, daily averages and SE and temperature sum step averages and SE for all years can be calculated and plotted by the scripts.

Also, standard phenological phase shifts are observed on the birches (from bud burst to shedding of leaves), and on spruce and pine (only bud burst and shoot elongation).
description: Som en del av SLU:s fortlöpande miljöanalys, samlar universitetets skogliga försöksparker in detaljerade fenologiska mätningar och observationer på björk, gran, tall, blåbär och lingon, sedan 2006. Detta dataset innehåller data om löv- och skottutveckling hos träden, samt blomning, kartbildning och bärmognad hos bären för åren 2006-2020. I data redovisas medeltalet av ett flertal individer (se instruktion) som mätts eller observerats vid varje tillfälle.

Här tillhandahålls också temperatursummor, beräknade utifrån respektive observationsplats klimatstations dygnsmedeltemperaturer under samma tidsperiod.

Förutom mätvärden och observationer, tillhandahålls också R-script för att interpolera dagliga värden mellan observationstillfällena och för beräkningar av mellanårsmedelvärden och medföljande medelfel för varje observationsplats och art. R-scripten interpolerar även värden fördelade på uppnådd temperatursumma vid varje tillfälle, samt mellanårsmedelvärden och medelfel för temperatursummans utveckling över säsongen.

Även observationer av fenologiska fasförändringar görs på björk (från skottskjutning till lövfällning), samt tall och gran (endast skottskjutning) och finns i en separat tabell.
DOI: 10.5878/a3kq-6708
title: Study of the yeast cytosolic Hsp70-system in protein homeostasis and life span regulation - Immunocytofluoroscense of Hsp70-mutant yeast strains with primary antibodies against Hsp42p
title: Studier av det cytosoliska Hsp70-systemet från jäst och dess roll i proteinhomeostas och reglering av livslängd - Immunocytofluorescens av Hsp70-mutanta jäststammar med primära antikroppar mot Hsp42p

description: Our study aims to answer the question "Which functions of the Hsp70 class of molecular chaperones are essential for yeast to maintain a standard replicative life span?". To answer this question, we utilised the disparate functions of the Hsp70's Ssa1 and 2 and their paralog Ssa4 in a yeast strain that lacks Ssa1/2 but has an ectopically increased production of Ssa4. We have gathered data on the behaviour of several different markers for protein aggregation under different circumstances, as well as data on proteins from other classes of molecular chaperones. The bulk of the data is in the form of multichannel microscopy images from widefield microscopy, with a few sets of western blots of protein extracts.

Fluorescence microscopy of fixated yeast cells at mid-exponential growth. The samples have been stained with antibodies against Hsp42 (primary antibody: rabbit anti Hsp42, secondary antibody: goat anti rabbit Alexa Flour488) and counterstained with DAPI (datasets from 170505 and 170608) and antibodies against Actin (primary antibody: mouse anti- Act1, secondary antibody: goat anti mouse Alexa Flour 568) (dataset from 170518) or nucleoporin complexes (dataset from 170608) (primary antibody: mouse anti- Nsp1, secondary antibody: goat anti mouse Alexa Flour 568).
The dataset was collected through fluorescence microscopy.
The image files are provided in Carl Zeiss Image format (.czi).
description: Vi har systematiskt studerat vilka funktioner hos de cytosoliska molekylära chaperonerna av klassen Hsp70 hos jäst som krävs för att upprätthålla en normal livslängd.

Immunocytofluorescensbilder av jästceller som fixerats i mitten av den exponentiella tillväxtfasen. Cellerna har färgats med antikroppar mot Hsp42 (primär antikropp: kanin anti-Hsp42, sekundär antikropp: get anti-kanin AlexaFlour488) och kontrastfärgats med DAPI (dataset från 170505 och 170608), antikroppar mot aktin (dataset från 170518) (primär antikropp: mus anti-Act1, sekundär antikropp: get anti-mus Alexa Flour568) eller nukleoporinkomplexet (dataset från 170608) (primär antikropp: mus anti-Nsp1, sekundär antikropp: get anti-mus Alexa Flour568).
Datasetet har hämtats in med fluorescensmikroskopi.
Bildfilerna är i Carl Zeiss Image-format (.czi).
DOI: 10.5878/yz9j-q902
title: Environmental benefits and biomass production from riparian buffers and windbreaks in Europe
title: Environmental benefits and biomass production from riparian buffers and windbreaks in Europe
title: Strategic deployment of riparian buffers and windbreaks in Europe can co-deliver biomass and multiple environmental benefits

description: Three scenarios of large-scale deployment for riparian buffers and windbreaks, across over 81,000 landscapes in Europe, with quantified corresponding areas, biomass output, and environmental benefits.

Abstract:

Within the scope of the new Common Agricultural Policy of the European Union, in coherence with other EU policies, new incentives are developed for farmers to deploy practices that are beneficial for climate, water, soil, air, and biodiversity. Such practices include establishment of multifunctional biomass production systems, designed to reduce environmental impacts while providing biomass for food, feed, bioenergy, and other biobased products. Here, we model three scenarios of large-scale deployment for two such systems, riparian buffers and windbreaks, across over 81,000 landscapes in Europe, and quantify the corresponding areas, biomass output, and environmental benefits. The results show that these systems can effectively reduce nitrogen emissions to water and soil loss by wind erosion, while simultaneously providing substantial environmental co-benefits, having limited negative effects on current agricultural production. This kind of beneficial land-use change using strategic perennialization is important for meeting environmental objectives while advancing towards a sustainable bioeconomy.
description: Tre scenarier för storskalig etablering av buffertzoner och lähägn, över fler än 81,000 landskap i Europa, med kvantifierad areal, biomassaproduktion, och miljönytta. 

Se engelsk beskrivning för information om studien.
DOI: 10.5878/h758-5n57
title: Data for: Road verges are corridors and roads barriers for the movements of flower-visiting insects
title: Data till: Vägrenar fungerar som korridorer och vägar som barriärer för rörelser av blombesökande insekter

description: This publication makes part of the research project GINFRA – green rights-of-way infrastructure for biodiversity and ecosystem services. The aim of the project is to quantify whether linear infrastructure habitats (road verges, power line corridors, etc) support biodiversity by assessing the influence of the amount of this habitats in the landscape and their contribution to landscape connectivity. 

The linked data was collected by experimentally tracking the movements of flower-visiting insects using fluorescent dye placed along the road verges and adjacent habitat of 20 sites that varied in the number of vehicles per day and on the habitat quality of the road verges. The data set consists of 240 observations. The first 120 observations correspond to the colour blue and the last 120 to the colour red.
description: Denna publikation är en del av projektet GINFRA – green rights-of-way infrastructure for biodiversity and ecosystem services. Projektets huvudsyfte var att kvantifiera om linjära infrastrukturmiljöer (såsom vägkanter och kraftledningsgator) bidrar till mångfalden av växter och insekter i olika rumsliga skalor. Detta gjordes genom att uppskatta hur linjära infrastrukturmiljöers mängd i landskapet bridrar till mångfalden samt hur mycket de bidrar till landskapets konnektivitet.

Datan samlades genom ett försök som syftade på att spåra blombesökande insekters rörelser med fluorescerande puder. Blommor markerade med pudret placerades i 20 lokaler som varierade i trafikintensitet och vägrenenskvalité. Datasetet utgör 240 observationer. De första 120 observationer tillhör den blåa färgen och de sista 120 observationer tillhör den röda färgen.