cometadata/datacite-titles-descriptions-related-identifiers huggingface dataset:
DOI: 10.48723/qz6r-qk57
title: Integrated genomic and transcriptomic analysis improves disease classification and risk stratification of MDS with ring sideroblasts
title: Integrated genomic and transcriptomic analysis improves disease classification and risk stratification of MDS with ring sideroblasts

description: Full transcriptome (RNA-sequencing) from bulk CD34+ bone marrow mononuclear cells from MDS patients with ring sideroblasts. CD34+ cells were isolated from the MNC using AUTO-MACS with double-separation option (Miltenyi Biotec, Germany) and submitted for RNA extraction. RNA was extracted with RNeasy Microkit (Qiagen, Hilden, Germany) and treated with DNase, according to manufacturer instruction. RNA integrity number was estimated using Agilent RNA 6000 Pico (Agilent Technologies, Palo Alto, CA) and was greater than 6.5 for all the samples (median 8.2). The RNA-sequencing (RNA-seq) libraries were prepared from total RNA using SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v2 Pico Input Mammalian with enzymatic ribosomal depletion (Takara Bio, Japan). Libraries were sequenced using the Novaseq 6000 with paired-end 150bp configuration. The molecular data were integrated with clinical information aiming to improve prognosis prediction in this hematologic malignancy.

The dataset consists of 2 files:
- FASTQ_RS.tar.gz: compressed folder that includes 258 fastq files
- metadata_RS.xlsx

The total size of the dataset is approximately 1 TB.
description: Heltranskriptom-sekvensering (RNA-seq) från CD34-uttryckande mononukleära benmärgsceller från patienter med myelodysplastisk syndrom med ringsideroblaster (MDS-RS). CD34-uttryckande celler isolerades från mononukleära benmärgsceller via instrumentet AUTO-MACS med dubbelseparation (Miltenyi Biotec, Germany). RNA extraherades från CD34-uttryckande celler via RNeasy Microkit (Qiagen, Hilden, Germany) och behandlades därefter med DNase i enlighet med tillverkarens instruktion. RNA integritetsnumret uppskattades sedan via Agilent RNA 6000 Pico (Agilent Technologies, Palo Alto, CA) och var högre än 6.5 i alla prover (median 8.2). RNA sekvenseringsbiblioteken sattes upp från allt RNA via SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v2 Pico Input Mammalian med enzymatisk degradering av ribosomalt RNA (Takara Bio, Japan). RNA-biblioteken sekvenserades sedan på Novaseq 6000 med ”paired-end 150bp” inställning. Slutligen kombinerade vi molekylära och kliniska data i syfte att hitta nya prognostiska markörer och förbättra karaktärisering av sjukdomen hos patienter med MDS.

Datasetet består av två filer:
- FASTQ_RS.tar.gz: komprimerad mapp innehållande 258 fastq-filer
- metadata_RS.xlsx 

Datasetets totala storlek är ca 1 TB.
DOI: 10.5281/zenodo.15261992
title: Summary statistics for dementia WGS
DOI: 10.5281/zenodo.17174325
title: Summary statistics for dementia WGS
DOI: 10.5878/1277-nk52
title: Environmental DNA metabarcoding of fish and amphibian occurrence in created biodiversity wetlands in Uppland, Sweden
title: Miljö-DNA metastreckkodning av förekomst av fisk och amfibier i skapade biologiska mångfaldsmarker i Uppland, Sverige

description: The conducted study was done to determine the fish and amphibian occurrence patterns in created wetlands for biodiversity. The geographical study units were individual wetlands in Uppland, Sweden. For each wetland, the data contains all environmental variables considered and estimated within the study: Landscape forest within 1 km buffer, Size, Water vegetation, Flooded area, Year of creation, Connectivity to other wetlands. The data of amphibians and fish were obtained using environmental DNA metabarcoding, where a number of sequences were obtained. We report only whether the species eDNA was detected in a wetland or not (1/0).

Data: data contains fish and amphibian occurrence data in created wetlands in Uppland, Sweden.

Data collection description:
Fish and amphibian occurrence in 52 created biodiversity wetlands in Sweden determined by using environmental DNA metabarcoding from water samples. This took place during June and July year 2018. 

The variables are described in detail in the documentation file.

A file with geographical coordinates for the wetlands can be found in the linked data repository, where Site_ID could be used as a common identifier.

A raw data file including the number of DNA reads can be provided upon request.
description: Studien utfördes för att undersöka förekomstmönster av fisk och groddjur i våtmarker anlagda för biologisk mångfald. Undersökningsområdet omfattade anlagda våtmarker i Uppland, Sverige. Data innehåller beskrivande miljövariabler: andel skog inom 1 km radie, våtmarkens storlek, andel vattenvegetation (t.ex. vass, kaveldun), area omgivande mark som översvämmas, anläggningsår, anslutning till andra vatten via vattendrag. Förekomstdata på fisk- och groddjursarter erhölls via vattenprov och eDNA analys. Här anges bara förekomst/icke förekomst av respektive art.

Data: Datat innehåller förekomstdata av fiskar och groddjur i anlagda våtmarker i Uppland.

Beskrivning av datainsamling:
Förekomst av olika arter fisk och groddjur i 52 anlagda våtmarker för biologisk mångfald i Sverige bestämdes genom att via vattenprover analysera rester av DNA i vattnet (sk. eDNA) för identifiering av arter. Det utfördes i juni och juli 2018.

Variablerna finns beskrivna i detalj i dokumentationsfilen

Ytterligare en datafil med geografiska koordinater för varje våtmark kan hittas i länkad dataförvaring, där ”Site ID” kan användas som en allmän markör för respektive våtmark.

En rådatafil, inkluderande antal läsningar DNA, kan fås vid förfrågan.
DOI: 10.57804/z3vq-r993
title: GIS-material for the archaeological project: Settlement remains in Motala and Fågelsta_2
title: GIS-material för arkeologiskt projekt: Boplatslämningar i Motala och Fågelst_2

description: GIS-material for the archaeological project: Settlement remains in Motala and Fågelsta

The ZIP file consist of GIS files and an Access database with information about the excavations, findings and other metadata about the archaeological survey.
description: Informationen i sammanfattning är hämtad ur rapporten för undersökningen:
Riksantikvarieämbetet UV Öst utförde sommaren 2006, med anledning av att Motala kommun skulle lägga om VA-ledning, arkeologisk utredning etapp 2 och arkeologisk förundersökning i Motala stad och i Fågelsta samhälle. Utredningsområdet i Motala var beläget alldeles norr om Göta kanal medan förundersökningsområdet låg söder om Motala ström. I samband med utredningen påträffades en tidigare ej känd stenålderslokal, RAÄ 187. Vid förundersökningen påträffades ett eftermedeltida odlingslager. Utredningsområdet i Fågelsta låg väster om samhället, nordväst om den medeltida byn Sund. Förundersökningsområdet var beläget i södra delarna av Fågelsta, väster om Sund och i direkt anslutning till en tidigare undersökt boplats. Förundersökningen resulterade i ytterligare anläggningar som troligen kan knytas till den kända boplatsen. Dessa undersöktes och togs bort i samband med förundersökningen. I utredningsområdet påträffades däremot inga fornlämningar.

Syfte:

Informationen i syfte är hämtad ur rapporten för undersökningen:
Syftet med den arkeologiska utredningen har varit att fastställa om lagskyddad fornlämning eller andra kulturlämningar berörs av arbetsföretaget. Syftet med den arkeologiska förundersökningen har varit att fastställa fornlämningens art/karaktär, ålder och utbredning.

ZIP-filen innehåller GIS-filer samt en Access datafil vilka innehåller information om schakt, fyndföremål, lämningstyper samt annan metadata om den arkeologiska undersökningen.
DOI: 10.5878/a5fr-1p29
title: Institutional networks and self-organized adaptation: Tracing the democratic architectures of climate response
title: Institutionella nätverk och självorganiserande anpassning: Att spåra den demokratiska arkitekturen för klimatrespons

description: This project, “Institutional Networks and Self-organized Adaptation”, examines the role of rural institutions and public support systems in shaping responses to shocks and stressors in rural India & Nepal during 2020-21. We include stressors related to COVID-19, climate, health, and other challenges identified by rural households. 

The data includes:

- Village information on demographics, infrastructure, and natural resources
- Village level institutions involved in livelihood support and adaptive responses
- Networks of interaction between these institutions
- Household information on demographics, livelihoods, interaction with institutions, shocks & stressors, and responses to these stressors

Household level data includes high-frequency repeat visits (approximately monthly) to gather detailed information about stressors and responses over the calendar year. 

This dataset contains 480 households nested within 16 local governmental units in the Himalayan region. This includes 8 villages in the Kangra District of India’s northern state of Himachal Pradesh and the Dhulikhel and Ramechhap Districts of east central Nepal. 

Through repeated visits during the calendar year, we have captured 8694 self-observed shocks and stressors, i.e. "threats" (3550 in India & 5144 in Nepal), and 5859 responses to cope or adapt to these threats (2553 in India, 3306 in Nepal).
DOI: 10.57804/yxre-xq05
title: GIS-material for the archaeological project: Preliminary investigations at the bypass - National road 50, bypass Vadstena_4
title: GIS-material för arkeologiskt projekt: Förundersökningar i förbifarten - RV 50 förbifart Vadstena_4

description: GIS-material for the archaeological project: Preliminary investigations at the bypass

The ZIP file consist of GIS files and an Access database with information about the excavations, findings and other metadata about the archaeological survey.
description: Informationen i sammanfattning är hämtad ur rapporten för undersökningen:
Inför planerad ombyggnation av riksväg 50 vid Vadstena har Östergötlands länsmuseum genomfört fyra arkeologiska förundersökningar. Förundersökningarna omfattade RAÄ 58 och 44 (Vadstena stad), RAÄ 11 och 12 (Vadstena stad), RAÄ 36 (S:t Pers socken) samt RAÄ 29 och 35 (S:t Pers socken). De undersökta fornlämningarna har främst daterats till äldre järnålder. Majoriteten av dem klassas av Fornminnesregistret som boplatser men några konkreta spår efter byggnader framkom inte vid förundersökningarna. Istället var härdar och andra eld- och värmerelaterade anläggningar dominerande. Dessutom påträffades flera stenansamlingar med oklara funktioner. I några fall tyder omständigheterna på att det rör sig om sönderplöjda gravar. Ett flertal stenansamlingar, som vid utredningen tolkats som gravar, visade sig vara stora stenfyllda gropar. Groparnas tillkomst och funktion kvarstår att fastställa. Förutom boplatslämningar undersöktes ett gravfält från äldre järnålder. Gravarna, som låg i åkermark, framkom direkt under matjordslagret och var skadade av plöjning. Vid en lokal framkom medeltida lämningar i form av kulturlager, gropar, stenansamlingar och stolphål. Möjligen är lämningarna spår efter en mindre bebyggelseenhet.

Syfte:

Informationen i syfte är hämtad ur rapporten för undersökningen:
Syftet med den arkeologiska förundersökningen var att fastställa och beskriva lämningarnas utbredning, karaktär, datering, omfattning, sammansättning och komplexitet. En övergripande målsättning var att utforska relationen mellan fornlämningarna och landskapets utveckling över tid.

ZIP-filen innehåller GIS-filer samt en Access datafil vilka innehåller information om schakt, fyndföremål, lämningstyper samt annan metadata om den arkeologiska undersökningen.
DOI: 10.5878/gsjj-jk89
title: Harvests in Sweden before the agrarian revolution: Halland
title: Skördar i Sverige före agrarrevolutionen: Halland

description: Grain tithe (Swe: Spannmålstiondet) has often been used as an indicator of crop development. It was a tax based in the principle of one-tenth of the harvest. This database is based on the accounts of the Crown's share of the tithe for Sweden in present-day borders excluding Scania. The databases relate to the period from and including 1665, when the volume measures were uniform in the country, until the tithe was a fixed tax without further linked to harvests. The transition to the tenth occurred successively in different provinces and was essentially completed by the mid-1700s.
description: Spannmålstiondet har ofta använts som indikator på skördeutvecklingen, det utgick ju i princip med en tiondel av skörden. Föreliggande databaser bygger på räkenskaper över kronans andel av tiondet för Sverige inom nutida gränser exklusive Skåne. Databaserna avser tiden fr o m 1665, då volymmåtten blev enhetliga i landet, tills tiondet blev en fast skatt utan vidare anknytning till skördarna. Övergången till fast tionde skedde successivt i olika landskap och var i huvudsak avslutad vid 1700-talets mitt.
DOI: 10.57804/zngm-7447
title: Swedish electorate 1887-1968_4
title: Svenska väljarkåren 1887-1968_4

description: The study concerns the parliamentary elections (for the second chamber) from 1887, the first election of modern type in Sweden´s history with clearly demarcated political groupings within the electorate, to 1968, the last election under the bicameral parliamentary system.
The aim is to study the mobilization of the Swedish electorate during the period and how social structure influences political behaviour. The data are of two types: political data and social data.

Purpose:

Study the mobilization of the Swedish electorate during 1887 to 1968.
description: Studien omfattar riksdagsval (till den andra kammaren) från 1887, det första valet av modern typ i Sveriges historia med klart avgränsade politiska grupperingar inom väljarkåren, till 1968, det sista valet med tvåkammarsystem. 
Syftet är att studera förändringen av det svenska valdeltagande under den här tidsperioden, samt att se hur sociala strukturer påverkar det politiska beteendet. Datamaterialet består av två olika typer, politiska data och sociala data.

Syfte:

Studera mobiliseringen av den svenska väljarkåren under åren 1887 till 1968.
DOI: 10.5878/1rdy-qq27
title: Census of the population 1940 - Occupation_2
title: Folkräkningen 1940 - Yrkesgrupper_2

description: This data collection is divided into two subset. For each municipality and town there is information about total population within the principal occupational groups agriculture and subsidiary industry, industry and craft, transport, storage, communication and commerce, public service and independent professions, domestic work, and unspecified occupation and also about total number of professionally employed. For towns with more than 10 000 inhabitants there is a subset including information about total population and number of professionally employed within the principal occupational groups and also within subgroups of these principal groups.
description: För samtliga kommuner och städer finns uppgifter om totala folkmängden inom huvudgrupperna jordbruk med binäringar, industri och hantverk, samfärdsel och handel, allmän förvaltningstjänst och fria yrken, husligt arbete och ospecificerad verksamhet samt uppgift om antal yrkesverksam befolkning. För städer med mer än 10 000 invånare finns dessutom ett dataset med uppgifter om hela folkmängden och antalet yrkesutövare inom huvudgrupperna samt uppgifter om hela folkmängden och antalet yrkesutövare inom undergrupper till ovannämnda huvudgrupper.
DOI: 10.15468/dl.mk3dar
title: Occurrence Download

description: A dataset containing 4025 species occurrences available in GBIF matching the query:
{
 "and" : [
 "GadmGid is USA.33.32_1",
 "OccurrenceStatus is Present",
 "Year 1950-1975"
 ]
}

 The dataset includes 4025 records from 45 constituent datasets; see https://api.gbif.org/v1/occurrence/download/0063903-251120083545085/datasets/export for details.
 
Data from some individual datasets included in this download may be licensed under less restrictive terms.
DOI: 10.15468/dl.dqbbun
title: Occurrence Download

description: A dataset containing 55563 species occurrences available in GBIF matching the query:
{
 "and" : [
 "Continent is Europe",
 "OccurrenceStatus is Present",
 "TaxonKey is Pelophylax perezi (López-Seoane, 1885)"
 ]
}

 The dataset includes 55563 records from 176 constituent datasets; see https://api.gbif.org/v1/occurrence/download/0003790-250127130748423/datasets/export for details.
 
Data from some individual datasets included in this download may be licensed under less restrictive terms.
DOI: 10.15468/dl.eku3s6
title: Occurrence Download

description: A dataset containing 15200 species occurrences available in GBIF matching the query:
{
 "and" : [
 "Country is Sweden",
 "DatasetKey is Artportalen",
 "TaxonKey is Alces alces (Linnaeus, 1758)",
 "Year 2015-2025"
 ]
}

 The dataset includes 15200 records from 1 constituent datasets; see https://api.gbif.org/v1/occurrence/download/0003791-250127130748423/datasets/export for details.
 
Data from some individual datasets included in this download may be licensed under less restrictive terms.
DOI: 10.15468/dl.7z3hvz
title: Occurrence Download

description: A dataset containing 3403551 species occurrences available in GBIF matching the query:
{
 "and" : [
 "Geometry POLYGON ((148.5 -57,147.5 -35,124.8 -26,117.1 -27,130.6 -17,130.6 -17,144.5 -22,146 -7,100.5 27,80 20.5,59.1 33.2,38.5 33.5,26.4 28.8,44.3 6,34.7 0,28.5 -23,15.2 -32,15 -58,148.5 -57))",
 "Depth is greater than or equal to 0m",
 "HasGeospatialIssue is false",
 "HasCoordinate is true",
 "OccurrenceStatus is Present",
 {
 "not" : {
 "BasisOfRecord" : [
 "is one of (Fossil)"
 ]
 }
 },
 "TaxonKey is Animalia",
 "CoordinateUncertaintyInMeters is less than 1e+05"
 ]
}

 The dataset includes 3403551 records from 304 constituent datasets; see https://api.gbif.org/v1/occurrence/download/0003768-250127130748423/datasets/export for details.
 
Data from some individual datasets included in this download may be licensed under less restrictive terms.
DOI: 10.25418/crick.27952842
title: Raw numerical data and qPCR amplification curves for Mears et al PLoS Biol "Emergence of SARS-CoV-2 subgenomic mRNAs that that enhance viral fitness and immune evasion"

description: 241126_PLoS-TRS_rawdata: Numerical data used to create figures for Mears et al Plos Biol "Emergence of SARS-CoV-2 subgenomic mRNAs that that enhance viral fitness and immune evasion".2021-05-06_N-ORF9b_ampcurves: qPCR amplification curves for ORF9b, underlying data for Fig S7.
DOI: 10.25418/crick.27952842.v1
title: Raw numerical data and qPCR amplification curves for Mears et al PLoS Biol "Emergence of SARS-CoV-2 subgenomic mRNAs that that enhance viral fitness and immune evasion"

description: 241126_PLoS-TRS_rawdata: Numerical data used to create figures for Mears et al Plos Biol "Emergence of SARS-CoV-2 subgenomic mRNAs that that enhance viral fitness and immune evasion".2021-05-06_N-ORF9b_ampcurves: qPCR amplification curves for ORF9b, underlying data for Fig S7.
DOI: 10.15468/dl.9r9msy
title: Occurrence Download

description: A dataset containing 27172 species occurrences available in GBIF matching the query:
{
 "TaxonKey" : [
 "is Picea glauca (Moench) Voss"
 ]
}

 The dataset includes 27172 records from 346 constituent datasets; see https://api.gbif.org/v1/occurrence/download/0003794-250127130748423/datasets/export for details.
 
Data from some individual datasets included in this download may be licensed under less restrictive terms.
DOI: 10.5517/ccdc.csd.cc2ltdhb
title: CCDC 2407692: Experimental Crystal Structure Determination

description: Related Article: M. Chodkiewicz, K. Woźniak|2025|IUCrJ|12|74|doi:10.1107/S2052252524011242
description: An entry from the Cambridge Structural Database, the world’s repository for small molecule crystal structures. The entry contains experimental data from a crystal diffraction study. The deposited dataset for this entry is freely available from the CCDC and typically includes 3D coordinates, cell parameters, space group, experimental conditions and quality measures.
DOI: 10.5517/ccdc.csd.cc2ltdjc
title: CCDC 2407693: Experimental Crystal Structure Determination

description: Related Article: M. Chodkiewicz, K. Woźniak|2025|IUCrJ|12|74|doi:10.1107/S2052252524011242
description: An entry from the Cambridge Structural Database, the world’s repository for small molecule crystal structures. The entry contains experimental data from a crystal diffraction study. The deposited dataset for this entry is freely available from the CCDC and typically includes 3D coordinates, cell parameters, space group, experimental conditions and quality measures.
DOI: 10.5517/ccdc.csd.cc2ltdkd
title: CCDC 2407694: Experimental Crystal Structure Determination

description: Related Article: M. Chodkiewicz, K. Woźniak|2025|IUCrJ|12|74|doi:10.1107/S2052252524011242
description: An entry from the Cambridge Structural Database, the world’s repository for small molecule crystal structures. The entry contains experimental data from a crystal diffraction study. The deposited dataset for this entry is freely available from the CCDC and typically includes 3D coordinates, cell parameters, space group, experimental conditions and quality measures.
DOI: 10.5517/ccdc.csd.cc2ltdlf
title: CCDC 2407695: Experimental Crystal Structure Determination

description: Related Article: M. Chodkiewicz, K. Woźniak|2025|IUCrJ|12|74|doi:10.1107/S2052252524011242
description: An entry from the Cambridge Structural Database, the world’s repository for small molecule crystal structures. The entry contains experimental data from a crystal diffraction study. The deposited dataset for this entry is freely available from the CCDC and typically includes 3D coordinates, cell parameters, space group, experimental conditions and quality measures.
DOI: 10.5517/ccdc.csd.cc2ltdmg
title: CCDC 2407696: Experimental Crystal Structure Determination

description: Related Article: M. Chodkiewicz, K. Woźniak|2025|IUCrJ|12|74|doi:10.1107/S2052252524011242
description: An entry from the Cambridge Structural Database, the world’s repository for small molecule crystal structures. The entry contains experimental data from a crystal diffraction study. The deposited dataset for this entry is freely available from the CCDC and typically includes 3D coordinates, cell parameters, space group, experimental conditions and quality measures.
DOI: 10.5517/ccdc.csd.cc2ltdnh
title: CCDC 2407697: Experimental Crystal Structure Determination

description: Related Article: M. Chodkiewicz, K. Woźniak|2025|IUCrJ|12|74|doi:10.1107/S2052252524011242
description: An entry from the Cambridge Structural Database, the world’s repository for small molecule crystal structures. The entry contains experimental data from a crystal diffraction study. The deposited dataset for this entry is freely available from the CCDC and typically includes 3D coordinates, cell parameters, space group, experimental conditions and quality measures.
DOI: 10.5517/ccdc.csd.cc2ltdpj
title: CCDC 2407698: Experimental Crystal Structure Determination

description: Related Article: M. Chodkiewicz, K. Woźniak|2025|IUCrJ|12|74|doi:10.1107/S2052252524011242
description: An entry from the Cambridge Structural Database, the world’s repository for small molecule crystal structures. The entry contains experimental data from a crystal diffraction study. The deposited dataset for this entry is freely available from the CCDC and typically includes 3D coordinates, cell parameters, space group, experimental conditions and quality measures.
DOI: 10.5517/ccdc.csd.cc2ltdqk
title: CCDC 2407699: Experimental Crystal Structure Determination

description: Related Article: M. Chodkiewicz, K. Woźniak|2025|IUCrJ|12|74|doi:10.1107/S2052252524011242
description: An entry from the Cambridge Structural Database, the world’s repository for small molecule crystal structures. The entry contains experimental data from a crystal diffraction study. The deposited dataset for this entry is freely available from the CCDC and typically includes 3D coordinates, cell parameters, space group, experimental conditions and quality measures.