cometadata/datacite-titles-descriptions-related-identifiers huggingface dataset:
DOI: 10.25607/ys9koa
title: ReefSYN | Standardized datasets of Brazilian reef diversity in space and time - Dataset VI: Santa Catarina reef fish monitoring

description: The data was collected yearly by the LBMM team (https://lbmm.ufsc.br/), from 2007 to 2022. Dataset includes fish species, size and abundance recorded at 40 m² (20 × 2 m) belt transects at nine locations along the Santa Catarina state coastal area. Transects were laid at different depths at approximately 5 m intervals according to local maximum depths, which ranged from 1 to 25 m. This dataset, named TimeFISH, was recently published by Quimbayo et al. (2023).
DOI: 10.4225/15/56369d520a118
title: Toxicity of copper, cadmium and zinc to Macquarie Island marine invertebrates
DOI: 10.15468/mpqvtt
title: National Taiwan Museum

description: This dataset from National Taiwan Museum includes 1,470 digitized specimens from the Museum’s collection of Taiwanese fish species, mainly freshwater fishes. Specimens were collected from 1984 to 2007. The largest group is Perciformes. There are also Scorpaeniformes, Cypriniformes, Anguilliformes, Pleuronectiformes, etc. The digitization work is funded by Taiwan e-Learning and Digital Archives Program (TELDAP).
DOI: 10.15472/wpiljn
title: Estructura trófica del Santuario de Fauna y Flora Malpelo a partir del análisis de isótopos estables de carbono y nitrógeno

description: Las redes tróficas representan las interacciones entre especies en los ecosistemas, permitiendo identificar aquellas especies y procesos claves del ecosistema. Este estudio analiza estructuralmente las redes tróficas terrestre (RT) y marina (RM) de la Isla Malpelo, Colombia, a partir de análisis isotópicos (d13C, d 15N) y topológicos. De las muestras analizadas isotópicamente, 67 terrestres y 140 marinas, las RT y RM reflejaron valores entre –30.3‰ y –14.8‰ para d13C y desde 3.7‰ a 19.4‰ para d15N, indicando 3 y 5 niveles tróficos para las RT y RM, respectivamente.
description: Usando modelos de mezcla, se evidenció una alta conectividad entre los ecosistemas terrestre y marino debido a la mayor contribución de nutrientes marinos al ambiente terrestre aportados por el ave marina piquero de Nazca Sula granti y al bajo aporte de plantas (musgos). Topológicamente, los modelos de redes fueron construidas con 170 nodos, 27 para la RT y 140 para la RM. Los patrones de conectividad sugieren la existencia de 3 y 4 subredes tróficas terrestres y marinas, respectivamente.
description: Adicionalmente, existe una alta recurrencia de procesos de competencia y cadena tróficas de tres pasos de longitud. Se identificaron ocho trofogrupos (RT: detrito, cangrejos, lagartos y lagartijas; RM: zooplancton, cangrejos, Carangidae y Scombridae) como nodos que centralizan los flujos tróficos. La RT presentó cadenas tróficas más cortas en contraste con la RM, caracterizada por cadenas largas. Ambas redes estuvieron conformadas por grupos de organismos con alta interacción trófica y diferentes patrones de conectividad constituidos por pocos trofogrupos claves. Lo anterior indica que las características estructurales y dinámica ecológica de estos ecosistemas, pueden verse modificadas si sus componentes principales son perturbados. Asimismo, se confirma el rol de S. granti como especie clave funcionando como puente entre ambos ecosistemas.
description: El presente recurso contiene la información asociada a tres eventos de muestreo y 51 registros biológicos.
DOI: 10.15472/xc3lqs
title: Macroalgas del atolón Albuquerque durante la Expedición Seaflower 2018 - Proyecto Colombia BIO

description: El presente proyecto de valoración de servicios ecosistémicos se desarrolló con el objetivo de aportar conocimiento integral acerca de los servicios ecosistémicos aportados por arrecifes de coral de Isla Cayos de Albuquerque, generando conocimiento integral acerca de la biodiversidad y de los servicios ecosistémicos que aportan los arrecifes de coral, se enfatizaron en el trabajo de campo el servicio de provisión de hábitat y refugio de biodiversidad (macroalgas y peces arrecifales) con mediciones de atributos del arrecife como la complejidad topográfica submarina, porcentajes de cobertura del bentos, composición, abundancia y biomasa de peces arrecifales, de macroalgas e interacciones coral-céspedes algales), con un enfoque a la conectividad ecosistémica y el servicio de protección costera para evaluar de manera cuantitativa y con datos de campo la capacidad de atenuación de la energía del oleaje en distintas áreas de la barrera arrecifal ubicada al Este de la Isla Cayos de Albuquerque. Se logró cumplir con los objetivos y metas planteadas, como la toma de muestras e identificación de amplia biodiversidad de macroalgas, el levantamiento de complejidad topográfica submarina en más de 15 estaciones y su relación con el servicio ecosistémico de hábitat para peces arrecifales con el registro de las especies de peces presentes con datos cuantitativos de abundancia y rangos de tallas, con lo que se puede realizar análisis ecológicos y poder comparar también con otras islas como Serranilla con los datos tomados durante la expedición 2017.
description: Durante la expedición llevada a cabo en el segundo semestre del 2018 se caracterizó un total de 95 registros.
DOI: 10.48518/00001
title: JAMSTEC Marine Biological Samples Database
DOI: 10.15472/m9t84v
title: Macroinvetebrados del Distrito Nacional de Manejo Integrado Cabo Manglares Bajo Mira y Frontera, Pacífico colombiano - Proyecto Colombia BIO

description: Este conjunto de datos corresponde a inventario de especies de macroinvertebrados intermareales asociados a bosques de manglar y litorales arenosos en el área comprendida entre la Bahía de Tumaco y Candelilla de la Mar en la Costa Pacífica del Departamento de Nariño – Colombia.
description: La propuesta de este proyecto surgió a lo largo del desarrollo de la Expedición Pacífico 2018, cuando se apreció la gran diversidad y abundancia de especies de invertebrados entre las raíces de manglar y en los playones formados durante la marea baja. En vista de lo anterior, se inició una recopilación de conchas y registros fotográficos para identificar las especies, así como reuniones con pobladores de cada localidad visitada y con representantes del Consejo Comunitario Bajo Mira y Frontera, para compilar información tradicional sobre las especies en la zona. Finalmente, surgió la idea de generar un catálogo de las especies encontradas, pero con un diseño vistoso, mucho material gráfico y lenguaje sencillo, para poder socializarlo y distribuirlo entre la población local.
description: En total se registraron 50 registros durante la expedición.
DOI: 10.25607/yppfqu
title: Fish communities of subtropical seagrass meadows and associated habitats in Shark Bay, Western Australia: Fishes Checklist

description: Seagrass habitats support some of the most productive marine communities and provide critical habitat for many fish species. Previous studies have shown that fish communities of seagrass meadows are usually more diverse than those of adjacent habitats. However, most studies have been conducted in very shallow waters and generally have used seining methods to collect fish, which tend to select for slower species as well as small species and size classes. Antillean?Z style fish traps were used to study the fish communities of seagrass and associated habitats in both deep and shallow waters of Shark Bay, Western Australia. While more individuals were caught per trap in vegetated than in unvegetated habitats, the number of species and biomass was influenced by an interaction of depth and seagrass cover. The structure of fish communities was influenced by an interaction among season, seagrass cover, and depth. Unlike previous studies, a small number of species dominated fish trap catches, most notably, striped trumpeters, Pelates sexlineatus Quoy and Gaimard, 1925 and western butterfish, Pentapodus vitta Quoy and Gaimard, 1824. The factors that influenced the abundance of common species, including season, depth, and seagrass cover, often interacted and varied among species. This study suggests that future research on fish communities of seagrass ecosystems would benefit from using several sampling techniques and considering multiple environmental factors simultaneously.
DOI: 10.26179/5b62a18cb394e
title: The Ecology and Biogeography of Heard Island Marine Benthos
DOI: 10.15472/2poedl
title: Monitoreo de las condiciones ambientales y los cambios estructurales y funcionales de las comunidades vegetales y de los recursos pesqueros durante la rehabilitación de la Ciénaga Grande de Santa Marta

description: La ecorregión de la Ciénaga Grande de Santa Marta - CGSM es el complejo lagunar estuarino más extenso de Colombia del que hacen parte 14 municipios. Por sus características hidrológicas, ecológicas y geomorfológicas, sus ecosistemas estuarinos son considerados de los más productivos de la zona tropical, hecho que le ha permitido estar designada con cinco figuras de protección. A pesar de su gran importancia, la CGSM mostró un grave deterioro ambiental en la década de los 90 como producto del desequilibrio hídrico originado por la construcción de la carretera Ciénaga-Barranquilla en los 50s, que condujo progresivamente a la hipersalinización del sistema. Con el objeto de promover su rehabilitación, se realizó la reapertura de cinco canales naturales preexistentes con conexión al río Magdalena. Desde la apertura de los canales y para evaluar los cambios ambientales, estructurales y funcionales de las comunidades vegetales (manglar), de la calidad del agua y los recursos pesqueros, el Instituto de Investigaciones Marinas y Costeras – INVEMAR, con el apoyo de la Corporación Autónoma Regional del Magdalena – CORPAMAG y el Ministerio de Ambiente y Desarrollo Sostenible - MinAmbiente, ha venido realizando el presente monitoreo ambiental en la CGSM, en el marco del convenio de cooperación No. 16 del 27 de diciembre del 2006, estos esfuerzos fueron reforzados en el 2014 con la suscripción del convenio de asociación No 40.
description: En este conjunto de datos se reportan manglares, documentados en seis estaciones de monitoreo en la región del Caribe continental colombiano, que corresponden a 29.650 registros biológicos obtenidos entre los años 1995 y 2021.
DOI: 10.15472/dt2wzf
title: Poliquetos de la Colección de Referencia de Biología Marina de la Universidad del Valle (CRBMUV) - Tesis de Grado (John Alexander Salazar Hernandez)

description: Este subconjunto de datos hace parte de la Colección de Referencia de Biología Marina de la Universidad del Valle y provienen del trabajo de grado "Taxocenosis de poliquetos asociados al arrecife coralino La Azufrada, PNN Gorgona, Colombia" del estudiante John Alexander Salazar Hernández, con la dirección del profesor Edgardo Londoño-Cruz y la codirección de la doctora Bellineth Valencia. Este conjunto posee 88 registros de poliquetos correspondientes a 53 morfoespecies (43 identificadas hasta especie, 7 hasta género, 1 hasta familia, 1 hasta orden y 1 hasta clase), las cuales se encuentran repartidas en 5 órdenes (Amphinomida, Eunicida, Phyllodocida, Sabellida y Terebellida). Los registros provienen en su totalidad de la región del Pacífico colombiano; datan de 2019-08 a 2019-09 y son nuevos para la Colección de Referencia de Biología Marina de la Universidad del Valle (CRBMUV). De las 53 morfoespecies incluidas en este reporte, se estima que 37 son nuevos registros para el Pacífico colombiano y de estas, 7 son nuevos registros para el Pacífico Oriental Tropical (POT): Dentatisyllis mangalis, Harmothoe crucis, Leodice calcaricola, Lysidice cf. notata, Platynereis mucronata, Pterocirrus foliosus y Sphaerosyllis cf. aciculata. Esto representa una contribución importante para llenar el vacío de información referente a las especies de poliquetos presentes en el Pacífico colombiano y el POT. El presente trabajo aporta un 31% de nuevos lotes/registros biológicos para la Colección de Referencia de Biología Marina de la Universidad del Valle (CRBMUV), la cual es una de las más importantes en la región Pacífica colombiana. Estos nuevos registros fueron documentados y digitalizados en el marco del proyecto BID-CA2020-055-NAC.
DOI: 10.26179/5cd12873643f1
title: Quantitative radiolarian data collected from the 2017 RV Investigator voyage, IN2017_V01
DOI: 10.14284/432
title: 2014_DEMER - Acoustic telemetry data for four fish species in the Demer river (Belgium)

description: This is an acoustic telemetry dataset published by the Research Institute for Nature and Forest (INBO). It contains animal (fish) tracking data collected by the Permanent Belgian Acoustic Receiver Network (https://lifewatch.be/en/fish-acoustic-receiver-network) for the project/study 2014_demer, using VEMCO tags (V7, V13) and receivers (VR2W). In total 16 adult individuals of four local wild fish species (Petromyzon marinus, Rutilus rutilus, Silurus glanis, Squalius cephalus) were captured, tagged and released in 2014, to study the effect of a specific barrier on their upstream/downstream migration in the Demer basin.
description: Longitudinal and lateral connectivity of rivers is necessary for fish to successfully fulfill their life cycle. In Flanders, fish are obstructed in their essential free migrations by weirs, sluices, mills, and pumping stations, which are needed to control the water level. The Demer river drains the eastern part of the Scheldt basin. Fish migrating from the sea to the Demer river are obstructed by three hydraulic constructions. In this study we aimed to evaluate the possibilities for fish migration around the most upstream of these three constructions, the Grote Steunbeer in the city of Diest. Therefore, behaviour of two sea lamprey (Petromyzon marinus), two roach (Rutilus rutilus), nine Wels catfish (Silurus glanis) and three chub (Squalius cephalus) was investigated by acoustic telemetry in the areas up-, downstream and around the fish migration barrier. The results indicated that free upstream fish migration in the Demer river is obstructed by the Grote Steunbeer barrier in its current state, and that adaptations to this barrier should get priority as the tributary of the Zwarte beek only partly offers an alternative route for fish to qualitative spawning habitats upstream. This dataset was collected using infrastructure provided by VLIZ and INBO funded by the Research Foundation - Flanders (FWO) as part of the Belgian contribution to LifeWatch. The study was commissioned by the Flemish Environment Agency (VMM). Data were exported from the European Tracking Network data portal (http://www.lifewatch.be/etn) developed by VLIZ using the ETN R package (https://inbo.github.io/etn/) developed by INBO. Field definitions can be found at https://inbo.github.io/etn/articles/etn_fields.html.
DOI: 10.15472/satm8b
title: Colección de Hongos del Museo de Historia Natural Marina de Colombia – Makuriwa (Invemar)

description: El Museo de Historia Natural Marina de Colombia que hace parte del INVEMAR, cuenta entre sus colecciones vivas con la colección de Hongos creada en el año 2018, la cual se estableció con 84 lotes de cultivos obtenidos por el Programa Valoración y Aprovechamiento de Recursos del instituto a partir de los proyectos de investigación DC – Hongos marinos y ANH COL 3, llevados a cabo en áreas costeras estuarinas y zonas oceánicas del Caribe colombiano respectivamente. Actualmente los lotes se mantienen en condiciones de criopreservación a -80°C con glicerol como agente crioprotectante. El presente conjunto de datos incluye 84 registros biológicos de especímenes catalogados, de los cuales el 12% se encuentra identificados a género y el resto representan aislados identificados hasta la categoría de reino Fungi. Del total de registros documentados, el 84% fueron obtenidos de muestras colectadas en zonas estuarinas y el 16% corresponden a áreas profundas del talud continental.
DOI: 10.25607/smz2be
title: BR Offshore Islands

description: Absalao, R.S.; Pimenta, A.D.; Gomes, R.S. e Cecchetti, F. 1999 Associcao malacologica dos substratos inconsolidados na area de protecao ambiental do Arquipelago de Santana, Macae, Rio de Janeiro. Oecol. Bras., 7: 273-289. ISSN 1980-6442. Absalao, R.S. e Pimenta, A.D. 2005. Moluscos marinhos da APA do Arquipelago de Santana, Macae, RJ. 84p. ISBN 85-7393-408-5.
DOI: 10.15472/vl4qz2
title: Caracterización de la fauna epibentónica y demersal de la Reserva Natural Cordillera Beata

description: Este recurso es producto de la caracterización de la megafauna bentónica y demersal de la Cresta Beata realizada entre 2021 y 2022 por el Invemar, en acuerdo con el Ministerio de Ambiente y Desarrollo Sostenible de Colombia como insumo para la declaratoria del área como Reserva Natural (Categoria I de la UICN). El conjunto de datos incluye 432 registros de especies de fauna profunda, obtenidas a partir de las imágenes capturadas en video y fotografía por un vehículo de operación remota (R.O.V), mediante transectos realizados a través de la Cresta Beata entre los 1641 y 3000 m de profundidad. La identificación del material visual, fue llevada a cabo por especialistas nacionales reconocidos para los diferentes grupos y corroborada por expertos internacionales. Del total de especies reportadas el 42% corresponden a Equinodermos, 20% a cnidarios, 18% a esponjas, 11% a crustáceos, 6% a peces, 2% a moluscos, 1% son anélidos y 0.2% ctenóforos. Asociado al conjunto de datos también se incluye la información multimedia de 119 fotografías aportadas como evidencia de las ocurrencias, la cual se detalla en la extensión SimpleMultimedia. Las imágenes forman parte de la Colección Digital Catálogo de Fauna de Profundidad (CFP) del Museo de Historia Natural Marina de Colombia Makuriwa (MHNMC).
DOI: 10.15472/xhfmaj
title: Diversidad, abundancia y distribución del ictioplancton y su relación con las condiciones oceanográficas y los períodos mareales en la subregión Sanquianga-Gorgona, frente al delta del río Patía

description: Este estudio investigó las condiciones oceanográficas de la subregión Sanquianga-Gorgona durante los períodos de pleamar y bajamar cerca del delta del río Sanquianga, y su relación con la diversidad y abundancia del plancton, particularmente el ictioplancton. La Expedición Científica Pacífico 2021-I Bocas de Sanquianga se llevó a cabo del 28 de abril al 19 de mayo de 2021 en la subregión Gorgona-Sanquianga, departamentos de Nariño y Cauca, a bordo del Buque Oceanográfico ‘ARC Providencia’ de la Dirección General Marítima.
DOI: 10.25607/rklus6
title: Development of biodiversity and habitat monitoring systems for key trawl fisheries in Western Australia: Fishes Checklist

description: The need for this project was identified through the ESD Risk Assessment workshops held for the Shark Bay and Exmouth Gulf trawl fisheries in May and October 2001. Bycatch issues in the Shark Bay and Exmouth fisheries were identified as a moderate risk through an Ecological Risk Assessment workshop. A better understanding of the faunal composition and habitat preferences of bycatch species in both trawled and untrawled areas has assisted in determining the level of risk to bycatch species. The project provided baseline data on biodiversity and variability of trawl bycatch on and off the trawl grounds in Shark Bay and Exmouth Gulf in order to set up potential reference sites for long-term monitoring.
DOI: 10.25607/wtx3w5
title: Checklist of the coastal fishes of Lord Howe, Norfolk and Kermadec Islands, southwest Pacific Ocean: Fishes Checklist

description: A checklist ofcoastal fishes includes 433 species from Lord Howe Island, 254 from Norfolk Island, and 145 from the Kermadec Islands. Tropical and subtropical species dominate all three faunas, but the proportion of tropical species decreases, and the proportion of subtropical species increases, from west to east. Subtropical species are the most abundant individual fishes at all three islands. Only 4.6% of the combined fauna is endemic, with individual island endemism even lower (1.2-2.1 %). The fish faunas of the three islands appear to have originated mainly by larval dispersal from Australia and the Coral Sea. Evidence for present-day dispersal is discussed. Faunal relationships among the subtropical islands of the western, central, and eastern South Pacific are examined. In the South Pacific as a whole, there is a high positive correlation between coastal fish diversity and hermatypic coral diversity..
DOI: 10.15468/dl.cbscer
title: Occurrence Download

description: A dataset containing 876994 species occurrences available in GBIF matching the query:
{
 "DatasetKey" : [
 "is Swiss National Fungi Databank"
 ]
}

 The dataset includes 876994 records from 1 constituent datasets; see https://api.gbif.org/v1/occurrence/download/0000743-250325103851331/datasets/export for details.
 
Data from some individual datasets included in this download may be licensed under less restrictive terms.
DOI: 10.15472/kaggz5
title: Peces del Distrito Nacional de Manejo Integrado Cabo Manglares Bajo Mira y Frontera, Pacífico colombiano - Proyecto Colombia BIO

description: Durante el 2018 se realizó una expedición al Distrito Nacional de Manejo Integrado Cabo Manglares Bajo Mira y Frontera, Pacífico colombiano con el objetivo de proporcionar información biológica que sirva de soporte para las acciones de protección de la biodiversidad y el manejo de los recursos pesqueros del área marino-costera protegida del DNMI Cabo Manglares Bajo Mira y Frontera en el departamento de Nariño, Pacífico colombiano.
description: En total se reportan 98 registros biológicos para este recurso.
DOI: 10.17031/1759
title: 2014 Scottish Environment Protection Agency (SEPA) Fifth of Forth and Forth Estuary Intertidal Seagrass Survey
DOI: 10.17031/65d8c350b17d0
title: 2022-2023 mNCEAP Environment Agency (EA) and DEFRA UK Zooplankton vertical net survey

description: A survey of zooplankton samples for the CPR Survey using 200um (100um dropped after trial) vertical plankton nets across 12  coastal sites around England on a monthly basis. This forms part of the NC34 Pelagic Monitoring Programme and is for 1 year in the first instance, out of a three year project.
DOI: 10.14284/466
title: Mesopelagic Crustaceans of the North Western Portuguese Coast between 1998 and 2000

description: The objective of this data collection was to study the structure of the mesopelagic ecosistem off the Northwestern Portuguese coast which is composed by planktonic and nectonics organisms. Mesopelagic organisms live during the day concentrating in big numbers in deeper depths while during the night migrates towards the upper layers. The data was collected aiming to study the composition and the Dynamics of the mesopelagic community and their trophic relations with the fish in the area. Data was collected with an Isaac-Kidd midwater trawl in May 1998 and 2000 and February 1999, together with environmental parameters as temperature, salinity, etc.
description: The results showed a strong temporal variability of the abundance of the diferent taxonomic groups in study. The analysis of the results lead to the conclusion that, being the sampling locations and methods used were similar for the studied period, the big variability in the abundances and taxa have been found must be related mainly to the season of the year in which the sampling was performed (winter season for 1999 and late spring for 1998 and 2000).
DOI: 10.15472/eclf87
title: Esponjas observadas en la Expedición Seaflower Isla Cayo Bolivar 2022 - Proyecto Colombia BIO

description: Este proyecto tiene como objetivo la caracterización de la biodiversidad de poríferos asociados a ambientes fóticos en cayo Bolívar, además de la utilización de códigos de barras de ADN y la identificación de moléculas con potencial biotecnológico producidas en sus tejidos mediante el uso de herramientas meta-transcriptómicas, enfocado sobre biomoléculas que puedan ser utilizadas para desarrollar biopesticidas orgánicos. Esto, con el fin de generar un catálogo de la diversidad de esponjas presentes en cayo Bolívar, y sentar bases para el desarrollo de una bioeconomía fundamentada en el potencial biotecnológico de nuestros arrecifes de coral.