cometadata/datacite-titles-descriptions-related-identifiers huggingface dataset:
DOI: 10.3535/b2k-mq3-wax
title: Lepidoptera Linnaeus, 1758

description: Digital Specimen for the physical specimen hosted at Naturalis Biodiversity Center.
DOI: 10.3535/kvf-0dz-79e
title: Animalia

description: Digital Specimen for the physical specimen hosted at Naturalis Biodiversity Center.
DOI: 10.17026/dans-xkr-znqf
title: PAN-00011120 - copper alloy bead barrel shaped

description: &lt;p&gt;This find is registered at Portable Antiquities of the Netherlands with number PAN-00011120&lt;/p&gt;
description: Modified: 2021-01-18T11:08:02+01:00
DOI: 10.3535/rar-3c5-1gz
title: Lepidoptera Linnaeus, 1758

description: Digital Specimen for the physical specimen hosted at Naturalis Biodiversity Center.
DOI: 10.3535/qw5-h93-bsl
title: Animalia

description: Digital Specimen for the physical specimen hosted at Naturalis Biodiversity Center.
DOI: 10.3535/vs5-hpv-k7e
title: Lepidoptera Linnaeus, 1758

description: Digital Specimen for the physical specimen hosted at Naturalis Biodiversity Center.
DOI: 10.17026/dans-xkr-zqgc
title: Plangebied XL Businesspark Twente te Almelo. Onderzoeksterrein Erve Drijerink, deelgebied 9. Inventariserend Veldonderzoek dmv Proefsleuven
title: Almelo fase 3 dlgebied 9

description: &lt;p&gt;In opdracht van het Openbaar Lichaam Regionaal Bedrijventerrein&lt;br&gt;Twente heeft BAAC bv op 6 maart 2015 een (eerste fase van een)&lt;br&gt;inventariserend veldonderzoek d.m.v. proefsleuven (IVO-P) uitgevoerd&lt;br&gt;nabij Erve Drijerink aan de Wolbes Landen 11 te Almelo. Tijdens deze fase&lt;br&gt;van het IVO-P is alleen het zuidwestelijke deel van het onderzoeksterrein&lt;br&gt;door middel van drie proefsleuven onderzocht omdat voor de rest van&lt;br&gt;het terrein de betredingstoestemming ontbrak. De aanleiding voor het&lt;br&gt;archeologisch onderzoek was de ontwikkeling van het XL Businesspark&lt;br&gt;Twente ten zuiden van Almelo.&lt;br&gt;Op basis van archeologisch vooronderzoek werden binnen het&lt;br&gt;onderzoeksterrein archeologische resten uit de volle en late&lt;br&gt;middeleeuwen verwacht, meer specifiek resten die samenhangen met het&lt;br&gt;nabijgelegen historische Erve Drijerink. De verwachting bestond dat zich&lt;br&gt;binnen het onderzoeksterrein een voorganger van dit erf heeft&lt;br&gt;bevonden. Het doel van het IVO-P is de kartering van het&lt;br&gt;onderzoeksterrein en het waarderen van de (eventueel) aangetroffen&lt;br&gt;vindplaats(en).&lt;br&gt;Sporen van een voorganger van Erve Drijerink zijn op de flank van een&lt;br&gt;dekzandkop, in het zuidwestelijke deel van het onderzoeksgebied, niet&lt;br&gt;aangetroffen. Wel bevonden zich hier grondverbeteringskuilen. Deze&lt;br&gt;zogenaamde off-site sporen stammen uit de periode vóór het ontstaan&lt;br&gt;van het esdek en hebben vermoedelijk een datering in de middeleeuwen&lt;br&gt;en/of het begin van de nieuwe tijd. De kuilen zijn waarschijnlijk gegraven&lt;br&gt;bij de ontginning van het gebied en bevinden zich mogelijk in de&lt;br&gt;periferie van een (gelijktijdig) erf. Indien inderdaad een (gelijktijdig) erf&lt;br&gt;in de nabijheid aanwezig is, zou deze zich hoger in het landschap, op de&lt;br&gt;dekzandkop kunnen bevinden. Dit deel van het onderzoeksgebied moet&lt;br&gt;nog onderzocht worden.&lt;br&gt;Voor het zuidwestelijke deel van het onderzoeksgebied geldt dat geen&lt;br&gt;vindplaats is aangetroffen. Voor dit deel wordt dan ook geen&lt;br&gt;vervolgonderzoek geadviseerd. In de rest van het onderzoeksgebied&lt;br&gt;dient nog een proefsleuvenonderzoek uitgevoerd te worden.&lt;/p&gt;
description: Date: 06/03/2015 (veldwerk)
DOI: 10.3535/hzz-20p-xxx
title: Delias oraia Doherty, 1891

description: Digital Specimen for the physical specimen hosted at Naturalis Biodiversity Center.
DOI: 10.3535/s8g-l5q-dvy
title: Lepidoptera Linnaeus, 1758

description: Digital Specimen for the physical specimen hosted at Naturalis Biodiversity Center.
DOI: 10.3535/gkn-lxw-0r7
title: Animalia

description: Digital Specimen for the physical specimen hosted at Naturalis Biodiversity Center.
DOI: 10.17026/dans-xkr-zybg
title: Inventariserend veldonderzoek Brede School Rijswijk
title: Antea Group Archeologie 2017/89

description: &lt;p&gt;In het voor het gebied opgestelde bureauonderzoek is geconcludeerd dat het plangebied in een zone ligt waar mogelijke bewoningssporen uit de prehistorie, de Romeinse tijd en vanaf de late middeleeuwen te verwachten zijn. Het advies uit het bureauonderzoek was dat de locatie door middel van verkennende boringen op de aanwezigheid van archeologische waarden onderzocht moest worden.&lt;br&gt;Het veldonderzoek is op 24 mei 2017 door AnteaGroup uitgevoerd.&lt;br&gt;Het uitgevoerde onderzoek betreft een inventariserend veldonderzoek door middel van boringen, verkennende fase. Een verkennend onderzoek met als doel het in kaart brengen van de bodemopbouw, de verstoringen en de intactheid van de archeologische lagen (top van het kleipakket) en het voorkomen van een duin in de ondergrond.&lt;br&gt;In het plangebied konden in totaal 14 boringen doorgezet worden tot een diepte van 4 meter – mv. Uit dit onderzoek is vastgesteld dat er geen duin in het plangebied aanwezig is en dat het gebied kan worden vrijgegeven van verder onderzoek naar archeologische vindplaatsen vanaf het neolithicum. &lt;br&gt;In het noordelijke en zuidelijke deel van het plangebied is ten aanzien van de archeologische verwachting voor de Romeinse tijd enkel een verwachting op diep ingegraven sporen in de top van het kleipakket. In dit deel van het plangebied is in de top van het kleipakket geen intacte oude bouwvoor meer aangetroffen.&lt;br&gt;In het middendeel van het plangebied worden geen sporen uit de romeinse tijd verwacht vanwege de diepe verstoring van de bouw en de sloop van het in 2015 afgebrande schoolgebouw. &lt;/p&gt;&lt;p&gt;Op basis van de resultaten uit het verkennende booronderzoek wordt aanbevolen om in het noordelijk en het zuidelijke deel van het plangebied graafwerkzaamheden die dieper gaan dan 1,50 meter –mv. archeologisch te laten begeleiden en de rest van het plangebied vrij te geven van verder archeologisch onderzoek.&lt;/p&gt;
description: &lt;p&gt;Antea Group Archeologie 2017/89&lt;/p&gt;
DOI: 10.3535/hc2-sfp-6hz
title: Lepidoptera Linnaeus, 1758

description: Digital Specimen for the physical specimen hosted at Naturalis Biodiversity Center.
DOI: 10.3535/m6l-t70-rtz
title: Animalia

description: Digital Specimen for the physical specimen hosted at Naturalis Biodiversity Center.
DOI: 10.3535/s82-p0q-k56
title: Animalia

description: Digital Specimen for the physical specimen hosted at Naturalis Biodiversity Center.
DOI: 10.3535/sgq-pnf-bqg
title: Lepidoptera Linnaeus, 1758

description: Digital Specimen for the physical specimen hosted at Naturalis Biodiversity Center.
DOI: 10.3535/44q-grm-963
title: Parnassius

description: Digital Specimen for the physical specimen hosted at Naturalis Biodiversity Center.
DOI: 10.3535/9af-zlt-5c4
title: Animalia

description: Digital Specimen for the physical specimen hosted at Naturalis Biodiversity Center.
DOI: 10.3535/dn0-dhn-zpx
title: Lepidoptera Linnaeus, 1758

description: Digital Specimen for the physical specimen hosted at Naturalis Biodiversity Center.
DOI: 10.3535/s6w-cwt-0xp
title: Colias erate (Esper, [1805] )

description: Digital Specimen for the physical specimen hosted at Naturalis Biodiversity Center.
DOI: 10.3535/9l9-d9y-zk0
title: Animalia

description: Digital Specimen for the physical specimen hosted at Naturalis Biodiversity Center.
DOI: 10.17026/dans-xks-46w5
title: PAN-00072807 - copper wire shaped eye

description: &lt;p&gt;This find is registered at Portable Antiquities of the Netherlands with number PAN-00072807&lt;/p&gt;
description: Modified: 2020-06-18T11:38:59+02:00
DOI: 10.3535/vjq-3zw-red
title: Choaspes benjaminii japonica (Murray, 1875)

description: Digital Specimen for the physical specimen hosted at Naturalis Biodiversity Center.
DOI: 10.3535/whz-lz2-3gb
title: Animalia

description: Digital Specimen for the physical specimen hosted at Naturalis Biodiversity Center.
DOI: 10.3535/kkw-bnh-3z9
title: Animalia

description: Digital Specimen for the physical specimen hosted at Naturalis Biodiversity Center.
DOI: 10.17026/dans-xks-4mtn
title: Archeologisch vooronderzoek ten behoeve van een gestuurde boring bij de Pol 52 te Spaarndam, gemeente Haarlem. Ruimtelijk advies op basis van bureauonderzoek

description: &lt;p&gt;In opdracht van Visser & Smit Hanab Distributie bv heeft Vestigia Archeologie & Cultuurhistorie een archeologisch en cultuurhistorisch bureauonderzoek verricht voor een plangebied in de gemeente Haarlem (afbeelding 1, kaart 1). Het onderzoek is uitgevoerd in het kader van de voorgenomen uitvoering van een gestuurde boring ter hoogte van Pol 52 te Spaarndam, in opdracht van Liander. De gestuurde boring heeft een lengte van ca. 196,9 meter. Het betreft twee buizen met een diameter van elk 16 centimeter, met een ruimgat met een diameter van in totaal 39 centimeter. Aan weerszijden van de boring zal bij de in- en uittredepunten een ontgraving plaatsvinden van ca. 2,5 x 2,5 meter, met een diepte van een meter. Voorafgaand aan de ontwikkelingen dient in kaart gebracht te worden of zich binnen het onderzoeksgebied behoudenswaardige archeologische of cultuurhistorische waarden (zouden kunnen) bevinden, die tegen de achtergrond van de bodemingrepen gevaar lopen. De leiding zal worden aangelegd binnen een UNESCO erfgoed (tevens een provinciaal monument), namelijk de Stelling van Amsterdam bij Fort bezuiden Spaarndam. Het in- en het uittredepunt zijn gesitueerd in de berm van de Spaarndamseweg (afbeelding 2) respectievelijk de Pol (afbeelding 3). Advies archeologie Het plangebied ligt volgens de gemeentelijke archeologische beleidskaart in een zone met een middellage archeologische verwachting. De ingrepen in de vorm van open ontgravingen zijn zeer beperkt (ca. 2,5 x 2,5 m), met een diepte van ca. 1 m –mv. De ingrepen zijn waarschijnlijk gesitueerd in reeds verstoord gebied. De gestuurde boring gaat vervolgens over een lengte van ca. 200 m tot maximaal 8 m –mv. Gezien de diameter van ca. 39 centimeter is er niet of nauwelijks sprake van dreiging voor eventuele archeologische waarden en blijft de ingreep in ieder geval onder de vrijstellingsgrens van ingrepen groter dan 2.500 m2 en dieper dan 30 cm –mv. Op basis van de resultaten van onderhavig onderzoek adviseert Vestigia Archeologie & Cultuurhistorie dan ook geen vervolgstappen in het kader van de Archeologische Monumentenzorg (AMZ). Aangezien het nooit volledig is uit te sluiten dat tijdens eventueel grondverzet een archeologische ‘toevalsvondst’ wordt gedaan, is het wenselijk de uitvoerder van dit grondwerk te wijzen op de plicht om hiervan zo spoedig mogelijk melding te doen bij het bevoegd gezag, de gemeente Haarlem en de Rijksdienst voor het Cultureel Erfgoed.&lt;/p&gt;
description: Issued: 2017-04-12
DOI: 10.3535/ph0-kz1-5yn
title: Lepidoptera Linnaeus, 1758

description: Digital Specimen for the physical specimen hosted at Naturalis Biodiversity Center.
DOI: 10.3535/xnb-tp1-el6
title: Animalia

description: Digital Specimen for the physical specimen hosted at Naturalis Biodiversity Center.
DOI: 10.3535/7g3-rxx-yl8
title: Animalia

description: Digital Specimen for the physical specimen hosted at Naturalis Biodiversity Center.
DOI: 10.3535/vts-rtf-55h
title: Lepidoptera Linnaeus, 1758

description: Digital Specimen for the physical specimen hosted at Naturalis Biodiversity Center.
DOI: 10.3535/y49-hbm-gw8
title: Lepidoptera Linnaeus, 1758

description: Digital Specimen for the physical specimen hosted at Naturalis Biodiversity Center.
DOI: 10.17026/dans-xks-4r8b
title: PAN-00019506 - lobed belt mount

description: &lt;p&gt;This find is registered at Portable Antiquities of the Netherlands with number PAN-00019506&lt;/p&gt;
description: Modified: 2020-06-09T09:07:57+02:00
DOI: 10.3535/28p-e6v-7dz
title: Lepidoptera Linnaeus, 1758

description: Digital Specimen for the physical specimen hosted at Naturalis Biodiversity Center.
DOI: 10.3535/bad-nwz-r9x
title: Lepidoptera Linnaeus, 1758

description: Digital Specimen for the physical specimen hosted at Naturalis Biodiversity Center.
DOI: 10.15468/dl.ea2sbr
title: Occurrence Download

description: A dataset containing 9471664 species occurrences available in GBIF matching the query:
{
 "and" : [
 "Country is China",
 "HasCoordinate is true",
 "HasGeospatialIssue is false",
 "OccurrenceStatus is Present"
 ]
}

 The dataset includes 9471664 records from 2981 constituent datasets; see https://api.gbif.org/v1/occurrence/download/0089611-250525065834625/datasets/export for details.
 
Data from some individual datasets included in this download may be licensed under less restrictive terms.
DOI: 10.18738/t8/qtpcng/ql64ec
title: 260.tar.gz

description: Sphere ice far-infrared single-scattering properties computed with the new ice refractive index compilation at the temperature of 260 K.
DOI: 10.15468/dl.e97nta
title: Occurrence Download

description: A dataset containing 5327 species occurrences available in GBIF matching the query:
{
 "and" : [
 "TaxonKey is one of (Arthropoda, Nematoda, Tardigrada, Rotifera, Annelida, Mollusca, Platyhelminthes)",
 "Geometry POLYGON ((-81.589673 28.25987, -81.588193 27.989071, -81.283113 27.990037, -81.283825 28.260848, -81.589673 28.25987))",
 "HasGeospatialIssue is false",
 "HasCoordinate is true",
 "OccurrenceStatus is Present",
 {
 "not" : {
 "BasisOfRecord" : [
 "is one of (Fossil, Living Specimen)"
 ]
 }
 },
 "Year is greater than or equal to 1900",
 {
 "not" : {
 "CoordinateUncertaintyInMeters" : [
 "is one of (301, 3036, 999, 9999)"
 ]
 }
 },
 {
 "or" : [
 "CoordinateUncertaintyInMeters is less than 10000",
 "CoordinateUncertaintyInMeters is null"
 ]
 }
 ]
}

 The dataset includes 5327 records from 37 constituent datasets; see https://api.gbif.org/v1/occurrence/download/0242340-230224095556074/datasets/export for details.
 
Data from some individual datasets included in this download may be licensed under less restrictive terms.
DOI: 10.15468/dl.gswa5r
title: Occurrence Download

description: A dataset containing 4720 species occurrences available in GBIF matching the query:
{
 "TaxonKey" : [
 "is Ulva flexuosa Wulfen"
 ]
}

 The dataset includes 4720 records from 179 constituent datasets; see https://api.gbif.org/v1/occurrence/download/0010910-230828120925497/datasets/export for details.
 
Data from some individual datasets included in this download may be licensed under less restrictive terms.
DOI: 10.18738/t8/qtpcng/nmh0kq
title: 230.tar.gz

description: Sphere ice far-infrared single-scattering properties computed with the new ice refractive index compilation at the temperature of 230 K.
DOI: 10.18738/t8/qtpcng/uxr2fz
title: 220.tar.gz

description: Sphere ice far-infrared single-scattering properties computed with the new ice refractive index compilation at the temperature of 220 K.
DOI: 10.18738/t8/qtpcng/49v69b
title: 210.tar.gz

description: Sphere ice far-infrared single-scattering properties computed with the new ice refractive index compilation at the temperature of 210 K.
DOI: 10.15468/dl.bmfqb3
title: Occurrence Download

description: A dataset containing 394587 species occurrences available in GBIF matching the query:
{
 "and" : [
 "Continent is Europe",
 "OccurrenceStatus is Present",
 "TaxonKey is Coenagrion puella (Linnaeus, 1758)",
 "Year 2000-2023"
 ]
}

 The dataset includes 394587 records from 1640 constituent datasets; see https://api.gbif.org/v1/occurrence/download/0003451-230918134249559/datasets/export for details.
 
Data from some individual datasets included in this download may be licensed under less restrictive terms.
DOI: 10.26138/sxs:bbh:3279v3.0
title: Binary black-hole simulation SXS:BBH:3279
DOI: 10.26138/sxs:bbh:3398v3.0
title: Binary black-hole simulation SXS:BBH:3398
DOI: 10.15468/dl.ma9vex
title: Occurrence Download

description: A dataset containing 159599691 species occurrences available in GBIF matching the query:
{
 "and" : [
 "Country is Canada",
 "DatasetKey is one of (EOD – eBird Observation Dataset, International Barcode of Life project (iBOL), DFO Pacific: Herring Biosample Database, iNaturalist Research-grade Observations, Pacific Multispecies Small Mesh Bottom Trawl Survey, Maritimes Summer Research Vessel Surveys, Centre for Biodiversity Genomics - Canadian Specimens, INSDC Sequences, Metabarcoding of Benthic Marine Communities in Nova Scotia and New Brunswick, DFO Pacific Groundfish - Hecate Strait Multispecies Assemblage Bottom Trawl Survey)",
 "HasCoordinate is true",
 "HasGeospatialIssue is false",
 "License is one of (CC0 1.0, CC-BY 4.0)"
 ]
}

 The dataset includes 159599691 records from 10 constituent datasets; see https://api.gbif.org/v1/occurrence/download/0017060-250310093411724/datasets/export for details.
 
Data from some individual datasets included in this download may be licensed under less restrictive terms.
DOI: 10.26138/sxs:bbh:2743v3.0
title: Binary black-hole simulation SXS:BBH:2743
DOI: 10.5281/zenodo.15047820
title: EPA CAMPD (Clean Air Markets Program Data) emission data: Hourly emissions for 2002 by quarter

description: This dataset contains EPA CAMPD (Clean Air Markets Program Data) hourly emissions data for 2002 by quarter. It includes detailed information on emissions for the specified period. The data was collected from the EPA CAMPD system and is intended for use in environmental analysis and reporting in February 2025.
DOI: 10.5281/zenodo.15047821
title: EPA CAMPD (Clean Air Markets Program Data) emission data: Hourly emissions for 2002 by quarter

description: This dataset contains EPA CAMPD (Clean Air Markets Program Data) hourly emissions data for 2002 by quarter. It includes detailed information on emissions for the specified period. The data was collected from the EPA CAMPD system and is intended for use in environmental analysis and reporting in February 2025.
DOI: 10.26138/sxs:bbh:3232v3.0
title: Binary black-hole simulation SXS:BBH:3232
DOI: 10.26138/sxs:bbh:4033v3.0
title: Binary black-hole simulation SXS:BBH:4033
DOI: 10.26138/sxs:bbh:4199v3.0
title: Binary black-hole simulation SXS:BBH:4199
DOI: 10.26138/sxs:bbh:4176v3.0
title: Binary black-hole simulation SXS:BBH:4176
DOI: 10.26138/sxs:bbh:4249v3.0
title: Binary black-hole simulation SXS:BBH:4249
DOI: 10.26138/sxs:bbh:4265v3.0
title: Binary black-hole simulation SXS:BBH:4265
DOI: 10.26138/sxs:bbh:4036v3.0
title: Binary black-hole simulation SXS:BBH:4036
DOI: 10.26138/sxs:bbh:4139v3.0
title: Binary black-hole simulation SXS:BBH:4139
DOI: 10.26138/sxs:bbh:4205v3.0
title: Binary black-hole simulation SXS:BBH:4205
DOI: 10.26138/sxs:bbh:4080v3.0
title: Binary black-hole simulation SXS:BBH:4080
DOI: 10.26138/sxs:bbh:4086v3.0
title: Binary black-hole simulation SXS:BBH:4086
DOI: 10.26138/sxs:bbh:4184v3.0
title: Binary black-hole simulation SXS:BBH:4184
DOI: 10.26138/sxs:bbh:4227v3.0
title: Binary black-hole simulation SXS:BBH:4227
DOI: 10.26138/sxs:bbh:4132v3.0
title: Binary black-hole simulation SXS:BBH:4132
DOI: 10.26138/sxs:bbh:4100v3.0
title: Binary black-hole simulation SXS:BBH:4100
DOI: 10.26138/sxs:bbh:4218v3.0
title: Binary black-hole simulation SXS:BBH:4218
DOI: 10.26138/sxs:bbh:4233v3.0
title: Binary black-hole simulation SXS:BBH:4233
DOI: 10.26138/sxs:bbh:4071v3.0
title: Binary black-hole simulation SXS:BBH:4071
DOI: 10.26138/sxs:bbh:4167v3.0
title: Binary black-hole simulation SXS:BBH:4167
DOI: 10.26138/sxs:bbh:4149v3.0
title: Binary black-hole simulation SXS:BBH:4149
DOI: 10.26138/sxs:bbh:4046v3.0
title: Binary black-hole simulation SXS:BBH:4046
DOI: 10.26138/sxs:bbh:4115v3.0
title: Binary black-hole simulation SXS:BBH:4115
DOI: 10.26138/sxs:bbh:4107v3.0
title: Binary black-hole simulation SXS:BBH:4107
DOI: 10.26138/sxs:bbh:4238v3.0
title: Binary black-hole simulation SXS:BBH:4238
DOI: 10.15468/dl.whfdb5
title: Occurrence Download

description: A dataset containing 37 species occurrences available in GBIF matching the query:
{
 "and" : [
 "Geometry POLYGON((-1.49938 43.46384,-1.4395 43.46384,-1.4395 43.50842,-1.49938 43.50842,-1.49938 43.46384))",
 "HasGeospatialIssue is false",
 "OccurrenceStatus is Present",
 "TaxonKey is Lonicera japonica Thunb."
 ]
}

 The dataset includes 37 records from 10 constituent datasets; see https://api.gbif.org/v1/occurrence/download/0017084-250310093411724/datasets/export for details.
 
Data from some individual datasets included in this download may be licensed under less restrictive terms.
DOI: 10.26138/sxs:bbh:4272v3.0
title: Binary black-hole simulation SXS:BBH:4272
DOI: 10.26138/sxs:bbh:4266v3.0
title: Binary black-hole simulation SXS:BBH:4266
DOI: 10.26138/sxs:bbh:4250v3.0
title: Binary black-hole simulation SXS:BBH:4250
DOI: 10.26138/sxs:bbh:4198v3.0
title: Binary black-hole simulation SXS:BBH:4198
DOI: 10.26138/sxs:bbh:4081v3.0
title: Binary black-hole simulation SXS:BBH:4081
DOI: 10.26138/sxs:bbh:4030v3.0
title: Binary black-hole simulation SXS:BBH:4030
DOI: 10.26138/sxs:bbh:4058v3.0
title: Binary black-hole simulation SXS:BBH:4058
DOI: 10.26138/sxs:bbh:4156v3.0
title: Binary black-hole simulation SXS:BBH:4156
DOI: 10.26138/sxs:bbh:4064v3.0
title: Binary black-hole simulation SXS:BBH:4064
DOI: 10.26138/sxs:bbh:4113v3.0
title: Binary black-hole simulation SXS:BBH:4113
DOI: 10.26138/sxs:bbh:4170v3.0
title: Binary black-hole simulation SXS:BBH:4170
DOI: 10.26138/sxs:bbh:4231v3.0
title: Binary black-hole simulation SXS:BBH:4231
DOI: 10.26138/sxs:bbh:4214v3.0
title: Binary black-hole simulation SXS:BBH:4214
DOI: 10.26138/sxs:bbh:4039v3.0
title: Binary black-hole simulation SXS:BBH:4039
DOI: 10.26138/sxs:bbh:4125v3.0
title: Binary black-hole simulation SXS:BBH:4125
DOI: 10.26138/sxs:bbh:4131v3.0
title: Binary black-hole simulation SXS:BBH:4131
DOI: 10.26138/sxs:bbh:4287v3.0
title: Binary black-hole simulation SXS:BBH:4287
DOI: 10.26138/sxs:bbh:4136v3.0
title: Binary black-hole simulation SXS:BBH:4136
DOI: 10.26138/sxs:bbh:4259v3.0
title: Binary black-hole simulation SXS:BBH:4259
DOI: 10.26138/sxs:bbh:4045v3.0
title: Binary black-hole simulation SXS:BBH:4045
DOI: 10.26138/sxs:bbh:4275v3.0
title: Binary black-hole simulation SXS:BBH:4275
DOI: 10.26138/sxs:bbh:4195v3.0
title: Binary black-hole simulation SXS:BBH:4195
DOI: 10.5281/zenodo.12801380
title: SciGeneX : docker image

description: Dataset from article: SciGeneX: Enhancing transcriptional analysis through gene module detection in single-cell and spatial transcriptomics data.

Summary: The standard pipeline to analyze scRNA-seq or spatial transcriptomics data focuses on a gene-centric approach that overlooks the collective behavior of genes. However, understanding cell populations necessitates recognizing intricate combinations of activated and repressed pathways. Therefore, a broader view of gene behavior offers more accurate insights into cellular heterogeneity in single-cell or spatial transcriptomics data. Here, we describe SciGeneX, a R package implementing a neighborhood analysis and a graph partitioning method to generate co-expression gene modules. These modules, whether shared or restricted to cell populations, collectively reflect cellular heterogeneity. Their combinations are able to highlight specific cell populations, even rare ones. SciGeneX uncovers rare and novel cell populations which were not observed before in human thymus spatial transcriptomics data. We show that SciGeneX outperforms existing methods on both artificial and experimental datasets. Overall, SciGeneX will aid in unravelling cellular and molecular diversity in single-cell and spatial transcriptomics studies.

Data: Docker image to reproduce analysis performed in the article.