cometadata/datacite-titles-descriptions-related-identifiers huggingface dataset:
DOI: 10.14473/csda/2kccbf
title: Život během pandemie 12. vlna

description: Cílem projektu Život během pandemie bylo shromažďovat data o vývoji epidemiologicky významného chování českých dospělých během pandemie nemoci covid-19 (zejména počty kontaktů, styk s nakaženým, testování, dodržování preventivních opatření, sociální aktivity, docházka na pracoviště, symptomy onemocnění). Sledovány byly také změny v pracovní aktivitě dotazovaných, ekonomická situace domácností a míry duševního zdraví s cílem vyhodnocovat dopady epidemie na uvedené oblasti života. Dále byly zjišťovány postoje veřejnosti k vládním opatřením, testování a očkování. K základní sadě sociodemografických proměnných dotázaných v první vlně šetření byly v jednotlivých vlnách postupně doplňovány socioekonomické charakteristiky respondentů a domácností, včetně retrospektivního zjišťování stavu před začátkem epidemie. Součástí šetření byly také ad hoc moduly týkající se distanční výuky nebo práce z domova. Veřejně přístupný datový soubor zahrnuje především kontinuální epidemiologický a ekonomický modul.
DOI: 10.14473/csda/vgdqbc
title: Život během pandemie 14. vlna

description: Cílem projektu Život během pandemie bylo shromažďovat data o vývoji epidemiologicky významného chování českých dospělých během pandemie nemoci covid-19 (zejména počty kontaktů, styk s nakaženým, testování, dodržování preventivních opatření, sociální aktivity, docházka na pracoviště, symptomy onemocnění). Sledovány byly také změny v pracovní aktivitě dotazovaných, ekonomická situace domácností a míry duševního zdraví s cílem vyhodnocovat dopady epidemie na uvedené oblasti života. Dále byly zjišťovány postoje veřejnosti k vládním opatřením, testování a očkování. K základní sadě sociodemografických proměnných dotázaných v první vlně šetření byly v jednotlivých vlnách postupně doplňovány socioekonomické charakteristiky respondentů a domácností, včetně retrospektivního zjišťování stavu před začátkem epidemie. Součástí šetření byly také ad hoc moduly týkající se distanční výuky nebo práce z domova. Veřejně přístupný datový soubor zahrnuje především kontinuální epidemiologický a ekonomický modul.
DOI: 10.14473/csda/ntzgti
title: Život během pandemie 15. vlna

description: Cílem projektu Život během pandemie bylo shromažďovat data o vývoji epidemiologicky významného chování českých dospělých během pandemie nemoci covid-19 (zejména počty kontaktů, styk s nakaženým, testování, dodržování preventivních opatření, sociální aktivity, docházka na pracoviště, symptomy onemocnění). Sledovány byly také změny v pracovní aktivitě dotazovaných, ekonomická situace domácností a míry duševního zdraví s cílem vyhodnocovat dopady epidemie na uvedené oblasti života. Dále byly zjišťovány postoje veřejnosti k vládním opatřením, testování a očkování. K základní sadě sociodemografických proměnných dotázaných v první vlně šetření byly v jednotlivých vlnách postupně doplňovány socioekonomické charakteristiky respondentů a domácností, včetně retrospektivního zjišťování stavu před začátkem epidemie. Součástí šetření byly také ad hoc moduly týkající se distanční výuky nebo práce z domova. Veřejně přístupný datový soubor zahrnuje především kontinuální epidemiologický a ekonomický modul.
DOI: 10.14473/csda/ar7ep8
title: Život během pandemie 16. vlna

description: Cílem projektu Život během pandemie bylo shromažďovat data o vývoji epidemiologicky významného chování českých dospělých během pandemie nemoci covid-19 (zejména počty kontaktů, styk s nakaženým, testování, dodržování preventivních opatření, sociální aktivity, docházka na pracoviště, symptomy onemocnění). Sledovány byly také změny v pracovní aktivitě dotazovaných, ekonomická situace domácností a míry duševního zdraví s cílem vyhodnocovat dopady epidemie na uvedené oblasti života. Dále byly zjišťovány postoje veřejnosti k vládním opatřením, testování a očkování. K základní sadě sociodemografických proměnných dotázaných v první vlně šetření byly v jednotlivých vlnách postupně doplňovány socioekonomické charakteristiky respondentů a domácností, včetně retrospektivního zjišťování stavu před začátkem epidemie. Součástí šetření byly také ad hoc moduly týkající se distanční výuky nebo práce z domova. Veřejně přístupný datový soubor zahrnuje především kontinuální epidemiologický a ekonomický modul.
DOI: 10.34681/n51b-p562
title: Florida Study of Professionals for Safe Families (FSPSF): Waves 1-4

description: The Florida Study of Professionals for Safe Families (FSPSF) is a longitudinal study of Florida’s child welfare workforce. The primary focus of the study examines turnover and retention decisions among frontline workers. FSPSF project staff recruited all Child Protective Investigators and Dependency Case Managers in pre-service training between Sept. 1, 2015 and December 31, 2016 and 84% of eligible participants provided consent and baseline information (N = 1,500). Participants were followed even if they left their child welfare positions during the study timeframe. Workers were surveyed every six months for approximately 3.5 years focusing on individual, occupational, and organizational influences on child welfare employee retention. 
This statewide study examined worker personal characteristics (e.g., educational background, family history, self-esteem, etc.) worker experiences and responses (e.g., stress and burnout, work/family balance, social support, and coping, etc.), and organizational influences (e.g., organizational climate, supervisory practices, and caseload responsibilities etc.). Respondents were surveyed every 6-7 months with a core instrument and three in-depth substantive modules that were rotated during the data collection period. Modules included a focus on 
(1) supervision and organizational functioning (assessed at waves 2, 5, and 8); 
(2) work/family life balance (assessed at waves 3, 6 and 8); and 
(3) mental health (assessed at waves 4 and 7). 
Overall, 100% of child welfare administrative units across the state of Florida agreed to be part of the study. Individual response rates for each wave were also very high. Across all waves of data collection, response rates averaged 81% and ranged from 77% to 87%, and 62% (n = 929) of participants responded at every wave of data collection.
DOI: 10.14473/csda/hflztd
title: Život během pandemie 19.vlna

description: Cílem projektu Život během pandemie bylo shromažďovat data o vývoji epidemiologicky významného chování českých dospělých během pandemie nemoci covid-19 (zejména počty kontaktů, styk s nakaženým, testování, dodržování preventivních opatření, sociální aktivity, docházka na pracoviště, symptomy onemocnění). Sledovány byly také změny v pracovní aktivitě dotazovaných, ekonomická situace domácností a míry duševního zdraví s cílem vyhodnocovat dopady epidemie na uvedené oblasti života. Dále byly zjišťovány postoje veřejnosti k vládním opatřením, testování a očkování. K základní sadě sociodemografických proměnných dotázaných v první vlně šetření byly v jednotlivých vlnách postupně doplňovány socioekonomické charakteristiky respondentů a domácností, včetně retrospektivního zjišťování stavu před začátkem epidemie. Součástí šetření byly také ad hoc moduly týkající se distanční výuky nebo práce z domova. Veřejně přístupný datový soubor zahrnuje především kontinuální epidemiologický a ekonomický modul.
DOI: 10.34681/wjmw-7n19
title: Florida Study of Professionals for Safe Families (FSPSF): Waves 1-6

description: The Florida Study of Professionals for Safe Families (FSPSF) is a longitudinal study of Florida’s child welfare workforce. The primary focus of the study examines turnover and retention decisions among frontline workers. FSPSF project staff recruited all Child Protective Investigators and Dependency Case Managers in pre-service training between Sept. 1, 2015 and December 31, 2016 and 84% of eligible participants provided consent and baseline information (N = 1,500). Participants were followed even if they left their child welfare positions during the study timeframe. Workers were surveyed every six months for approximately 3.5 years focusing on individual, occupational, and organizational influences on child welfare employee retention. 
This statewide study examined worker personal characteristics (e.g., educational background, family history, self-esteem, etc.) worker experiences and responses (e.g., stress and burnout, work/family balance, social support, and coping, etc.), and organizational influences (e.g., organizational climate, supervisory practices, and caseload responsibilities etc.). Respondents were surveyed every 6-7 months with a core instrument and three in-depth substantive modules that were rotated during the data collection period. Modules included a focus on 
(1) supervision and organizational functioning (assessed at waves 2, 5, and 8); 
(2) work/family life balance (assessed at waves 3, 6 and 8); and 
(3) mental health (assessed at waves 4 and 7). 
Overall, 100% of child welfare administrative units across the state of Florida agreed to be part of the study. Individual response rates for each wave were also very high. Across all waves of data collection, response rates averaged 81% and ranged from 77% to 87%, and 62% (n = 929) of participants responded at every wave of data collection.
DOI: 10.5517/ccdc.csd.cc2dqrjf
title: CCDC 2226405: Experimental Crystal Structure Determination

description: Related Article: Abraham Mensah, Wei-Min Chen, Ennin Vendish Kweku, Peng-Lai Liu, Juan-Juan Shao, Fang-Ming Wang, Li-Zhuang Chen|2023|CrystEngComm|25|5722|doi:10.1039/D3CE00815K
description: An entry from the Cambridge Structural Database, the world’s repository for small molecule crystal structures. The entry contains experimental data from a crystal diffraction study. The deposited dataset for this entry is freely available from the CCDC and typically includes 3D coordinates, cell parameters, space group, experimental conditions and quality measures.
DOI: 10.14473/csda/d8lpmk
title: Život během pandemie 21.vlna

description: Cílem projektu Život během pandemie bylo shromažďovat data o vývoji epidemiologicky významného chování českých dospělých během pandemie nemoci covid-19 (zejména počty kontaktů, styk s nakaženým, testování, dodržování preventivních opatření, sociální aktivity, docházka na pracoviště, symptomy onemocnění). Sledovány byly také změny v pracovní aktivitě dotazovaných, ekonomická situace domácností a míry duševního zdraví s cílem vyhodnocovat dopady epidemie na uvedené oblasti života. Dále byly zjišťovány postoje veřejnosti k vládním opatřením, testování a očkování. K základní sadě sociodemografických proměnných dotázaných v první vlně šetření byly v jednotlivých vlnách postupně doplňovány socioekonomické charakteristiky respondentů a domácností, včetně retrospektivního zjišťování stavu před začátkem epidemie. Součástí šetření byly také ad hoc moduly týkající se distanční výuky nebo práce z domova. Veřejně přístupný datový soubor zahrnuje především kontinuální epidemiologický a ekonomický modul.
DOI: 10.14473/csda/fbffzh
title: Život během pandemie 22. vlna

description: Cílem projektu Život během pandemie bylo shromažďovat data o vývoji epidemiologicky významného chování českých dospělých během pandemie nemoci covid-19 (zejména počty kontaktů, styk s nakaženým, testování, dodržování preventivních opatření, sociální aktivity, docházka na pracoviště, symptomy onemocnění). Sledovány byly také změny v pracovní aktivitě dotazovaných, ekonomická situace domácností a míry duševního zdraví s cílem vyhodnocovat dopady epidemie na uvedené oblasti života. Dále byly zjišťovány postoje veřejnosti k vládním opatřením, testování a očkování. K základní sadě sociodemografických proměnných dotázaných v první vlně šetření byly v jednotlivých vlnách postupně doplňovány socioekonomické charakteristiky respondentů a domácností, včetně retrospektivního zjišťování stavu před začátkem epidemie. Součástí šetření byly také ad hoc moduly týkající se distanční výuky nebo práce z domova. Veřejně přístupný datový soubor zahrnuje především kontinuální epidemiologický a ekonomický modul.
DOI: 10.14473/csda/wkqoyq
title: Život během pandemie 23. vlna

description: Cílem projektu Život během pandemie bylo shromažďovat data o vývoji epidemiologicky významného chování českých dospělých během pandemie nemoci covid-19 (zejména počty kontaktů, styk s nakaženým, testování, dodržování preventivních opatření, sociální aktivity, docházka na pracoviště, symptomy onemocnění). Sledovány byly také změny v pracovní aktivitě dotazovaných, ekonomická situace domácností a míry duševního zdraví s cílem vyhodnocovat dopady epidemie na uvedené oblasti života. Dále byly zjišťovány postoje veřejnosti k vládním opatřením, testování a očkování. K základní sadě sociodemografických proměnných dotázaných v první vlně šetření byly v jednotlivých vlnách postupně doplňovány socioekonomické charakteristiky respondentů a domácností, včetně retrospektivního zjišťování stavu před začátkem epidemie. Součástí šetření byly také ad hoc moduly týkající se distanční výuky nebo práce z domova. Veřejně přístupný datový soubor zahrnuje především kontinuální epidemiologický a ekonomický modul.
DOI: 10.14473/csda/ycpny3
title: Život během pandemie 17.vlna

description: Cílem projektu Život během pandemie bylo shromažďovat data o vývoji epidemiologicky významného chování českých dospělých během pandemie nemoci covid-19 (zejména počty kontaktů, styk s nakaženým, testování, dodržování preventivních opatření, sociální aktivity, docházka na pracoviště, symptomy onemocnění). Sledovány byly také změny v pracovní aktivitě dotazovaných, ekonomická situace domácností a míry duševního zdraví s cílem vyhodnocovat dopady epidemie na uvedené oblasti života. Dále byly zjišťovány postoje veřejnosti k vládním opatřením, testování a očkování. K základní sadě sociodemografických proměnných dotázaných v první vlně šetření byly v jednotlivých vlnách postupně doplňovány socioekonomické charakteristiky respondentů a domácností, včetně retrospektivního zjišťování stavu před začátkem epidemie. Součástí šetření byly také ad hoc moduly týkající se distanční výuky nebo práce z domova. Veřejně přístupný datový soubor zahrnuje především kontinuální epidemiologický a ekonomický modul.
DOI: 10.14473/csda/wpndwg
title: Život během pandemie 18.vlna

description: Cílem projektu Život během pandemie bylo shromažďovat data o vývoji epidemiologicky významného chování českých dospělých během pandemie nemoci covid-19 (zejména počty kontaktů, styk s nakaženým, testování, dodržování preventivních opatření, sociální aktivity, docházka na pracoviště, symptomy onemocnění). Sledovány byly také změny v pracovní aktivitě dotazovaných, ekonomická situace domácností a míry duševního zdraví s cílem vyhodnocovat dopady epidemie na uvedené oblasti života. Dále byly zjišťovány postoje veřejnosti k vládním opatřením, testování a očkování. K základní sadě sociodemografických proměnných dotázaných v první vlně šetření byly v jednotlivých vlnách postupně doplňovány socioekonomické charakteristiky respondentů a domácností, včetně retrospektivního zjišťování stavu před začátkem epidemie. Součástí šetření byly také ad hoc moduly týkající se distanční výuky nebo práce z domova. Veřejně přístupný datový soubor zahrnuje především kontinuální epidemiologický a ekonomický modul.
DOI: 10.14473/csda/gz0teg
title: Život během pandemie 20. vlna

description: Cílem projektu Život během pandemie bylo shromažďovat data o vývoji epidemiologicky významného chování českých dospělých během pandemie nemoci covid-19 (zejména počty kontaktů, styk s nakaženým, testování, dodržování preventivních opatření, sociální aktivity, docházka na pracoviště, symptomy onemocnění). Sledovány byly také změny v pracovní aktivitě dotazovaných, ekonomická situace domácností a míry duševního zdraví s cílem vyhodnocovat dopady epidemie na uvedené oblasti života. Dále byly zjišťovány postoje veřejnosti k vládním opatřením, testování a očkování. K základní sadě sociodemografických proměnných dotázaných v první vlně šetření byly v jednotlivých vlnách postupně doplňovány socioekonomické charakteristiky respondentů a domácností, včetně retrospektivního zjišťování stavu před začátkem epidemie. Součástí šetření byly také ad hoc moduly týkající se distanční výuky nebo práce z domova. Veřejně přístupný datový soubor zahrnuje především kontinuální epidemiologický a ekonomický modul.
DOI: 10.5281/zenodo.1003104
title: Input and output datasets for the testing of joint inversion code(s) and sensitivity analysis.

description: Dataset associated to the paper: "Sensitivity of constrained joint inversions to geological and petrophysical input data uncertainties with posterior geological analysis" by Giraud J., Ogarko V., Pakyuz-Charrier E., Jessell M., Lindsay M., and Martin R. This paper is under review for publication in Geophysical Journal International. The complete reference will be updated upon publication.
This dataset comprises:- petrophysical model (x3)- reference models for density contrast and magnetic susceptibility - density contrast and magnetic susceptibility starting models (x3)- inverted density contrast and magnetic susceptibility models (x3)- three probabilistic geological models (x3)
description: Content made available to ensure reproducibility of work presented in the associated paper and in anticipation of the release of the inversion platform's source code.
DOI: 10.5281/zenodo.1003105
title: Input and output datasets for the testing of joint inversion code(s) and sensitivity analysis.

description: Dataset associated to the paper: "Sensitivity of constrained joint inversions to geological and petrophysical input data uncertainties with posterior geological analysis" by Giraud J., Ogarko V., Pakyuz-Charrier E., Jessell M., Lindsay M., and Martin R. This paper is under review for publication in Geophysical Journal International. The complete reference will be updated upon publication.
This dataset comprises:- petrophysical model (x3)- reference models for density contrast and magnetic susceptibility - density contrast and magnetic susceptibility starting models (x3)- inverted density contrast and magnetic susceptibility models (x3)- three probabilistic geological models (x3)
description: Content made available to ensure reproducibility of work presented in the associated paper and in anticipation of the release of the inversion platform's source code.
DOI: 10.5281/zenodo.10044741
title: TCGA breast cancer (BRCA) mRNA-Seq data from GDC

description: TCGA BRCA mRNA-seq data used in https://ocbe-uio.github.io/survomics/survomics.html
DOI: 10.5281/zenodo.10044740
title: TCGA breast cancer (BRCA) mRNA-Seq data from GDC

description: TCGA BRCA mRNA-seq data used in https://ocbe-uio.github.io/survomics/survomics.html
DOI: 10.5281/zenodo.7551431
title: Digitized geological and geophysical data from the Po Plain and the northern Adriatic Sea (north Italy) collected from public sources.

description: This database comprises subsurface geological and geophysical data from the Po Plain and the northern Adriatic Sea (north Italy). We realized the database by collecting, revising, and digitizing data, originally in raster format, from public sources. The data have a common geographical system: WGS 84/UTM zone 32N; EPSG: 32632. We organized the database into two groups: “primitive data” and “derived data”. Primitive data are the result of the digitization of public data. We collected and digitized data from 160 deep wells, 52 geological cross-sections, and 8 geological maps. The database of the primitive data is formed by the main horizons reported in the geological cross-sections, the isobaths of the main geological surfaces represented in the geological maps, the well locations, comprised of their trajectory along depth, lithological and stratigraphical information, and geophysical logs from composite well logs. Well data include specific sets of well logs aimed at geological/mechanical characterization of the geological units (e.g., Spontaneous Potential log, Resistivity log, Gamma Ray log, and Sonic log). Derived data consist of two datasets: i) the primitive isobaths maps and geological cross-sections data that have been filtered and verified after a data accuracy analysis performed to unravel discrepancies in the interpretation of the subsurface geological horizons; ii) a set of regional surfaces of the main geological units of the Po Plain subsurface. These surfaces were generated by interpolating the filtered primitive data according to the lithostratigraphic architecture of the area and without considering the fault occurrence/displacements. Primitive and derived data are provided in delimited text file format organized according to the data type (i.e., well, geological cross-section, map, and gridded surface). The format and the organization of data are explained in the related “readme” file. Our database represents a collection of the main published works regarding the Po Plain. Detailed studies related to specific sectors of the Po Plain might not be present in our database. Furthermore, during the processing and revision of the collected data, some published subsurface data reconstruction might have not been included in the database. Further details about the data processing and organization are given in the related manuscript.
DOI: 10.5281/zenodo.10032209
title: zol: prepTG Databases for Other Bacterial Taxa

description: Each of the tar.gz compressed directories corresponds to prepTG databases (for the zol suite) featuring distinct, representative genomes for some well studied taxa/genera. Representative genomes for each genus/taxon were selected using skDER v1.0.7 in greedy mode with 99% ANI and 90% AF cutoffs.
The compressed folders also contain an extra file, corresponding to a species tree of the representative genomes constructed using GToTree with Universal markers (ribosomal proteins) from Hug et al. 2016 and in best-hits mode. Note, GToTree was modified to always use -super5 mode for SCG alignments for computational efficiency. Also, note, because genomes can be dropped by GToTree prior to phylogeny inference (e.g. if they lack enough SCGs), not all genomes in the database might be represented in the phylogenies.
DOI: 10.5281/zenodo.10042148
title: zol: prepTG Databases for ESKAPE Pathogens

description: Each of the tar.gz compressed directories corresponds to prepTG databases (for the zol suite) featuring distinct, representative genomes for one of the six genera containing ESKAPE pathogens. Representative genomes for each genus/taxon were selected using skDER v1.0.7 in greedy mode with 99% ANI and 90% AF cutoffs.
The compressed folders also contain an extra file, corresponding to a species tree of the representative genomes constructed using GToTree with Universal markers (ribosomal proteins) from Hug et al. 2016 and in best-hits mode. Note, GToTree was modified to always use -super5 mode for SCG alignments for computational efficiency. Also, note, because genomes can be dropped by GToTree prior to phylogeny inference (e.g. if they lack enough SCGs), not all genomes in the database might be represented in the phylogenies.
DOI: 10.5281/zenodo.8270366
title: zol: prepTG Databases for ESKAPE Pathogens

description: Each of the tar.gz compressed directories corresponds to prepTG databases (for the zol suite) featuring distinct, representative genomes for one of the six genera containing ESKAPE pathogens. Representative genomes for each genus/taxon were selected using skDER v1.0.7 in greedy mode with 99% ANI and 90% AF cutoffs.
The compressed folders also contain an extra file, corresponding to a species tree of the representative genomes constructed using GToTree with Universal markers (ribosomal proteins) from Hug et al. 2016 and in best-hits mode. Note, GToTree was modified to always use -super5 mode for SCG alignments for computational efficiency. Also, note, because genomes can be dropped by GToTree prior to phylogeny inference (e.g. if they lack enough SCGs), not all genomes in the database might be represented in the phylogenies.