cometadata/datacite-titles-descriptions-related-identifiers huggingface dataset:
DOI: 10.15472/cwwbex
title: Caracterización de especies bentónicas y bentopelágicas asociadas al Bajo Navegador, Dorsal Yuruparí, Colombia

description: Las dorsales oceánicas de Malpelo y Yuruparí juegan un papel muy importante en la conectividad ecológica del Corredor Marino del Pacífico Oriental Tropical. En particular, el Bajo Navegador, localizado sobre la dorsal de Yuruparí a unos 520 kilómetros de la costa pacífica colombiana, es uno de los montes submarinos más remotos del territorio colombiano. El bajo se ubica dentro del Distrito de Manejo integrado de Yuruparí de Colombia y colinda al oriente con el Santuario de Fauna y Flora Malpelo (Colombia) y al norte con el Área de Recursos Manejados Cordillera de Coiba (Panamá). Aunque estudios preliminares consideran que el Bajo Navegador es una pieza clave en la conectividad de megafauna pelágica (Ladino et. al., 2023), poco se conoce sobre su estructura bentónica.
description: Con el fin de complementar la línea base sobre biodiversidad en la región y proporcionar información científica sólida como insumo a tomadores de decisiones, entre marzo y abril del 2022 se llevó a cabo la expedición National Geographic Pristine Seas-Colombia, en donde se exploró el Bajo Navegador como parte de la primera fase. A bordo de la embarcación Argo y del sumergible tripulado DeepSee, se realizaron 5 inmersiones en donde se registró la fauna bentónica y bentopelágica entre profundidades de 150 y 268 m. De estas inmersiones se obtuvo un total de 68 registros.
DOI: 10.25607/dyraip
title: Cheloniidae Instituto Tartabinhas Brazil

description: Instituto Tartabinhas is a non-profit organization dedicated to nature conservation, which aims to: (1) increase knowledge about sea turtles found on the coast of the peninsula through scientific research; (2) expand knowledge to the entire population and visitors through environmental education; and (3) protect sea turtles and all the flora and fauna of the seas that surround the city of Bombinhas, Brazil. Partners: The Mariscal Neighborhood Sport, Environment and Mobility Association – AEMARISCAL, HyBrazil Diving School, O Alquimista Burguer, Marina Blue Marine, Sacolão Bombinhas, Zimbros Ecotur, Ohana Dive, Pet Farma, Hermoso Burguer, Real Estate Cássia Lippmann, Bombinhas Department of Tourism, Sicredi, Pino bank, and The Mafia do Mergulho. Supporters: City of Bombinhas, Bombinhas Environmental Support Foundation FAMAB, Federal University of Rio Grande do Sul UFRGS, Pró TAMAR Foundation, and ICMBio.
DOI: 10.25607/fkn6ys
title: Previous Fisheries REVIZEE Program

description: Fisheries data from the REVIZEE Program, Brazil
DOI: 10.25607/eaddvw
title: Application of non-destructive methods for assessing rock pool fish assemblages on Lord Howe Island, Australia: Fishes Checklist

description: Examination of mini-BRUVs? data, for 30 min samples, identified that the vast majority of fish species were detected within 15 min and indicated that a shorter 15 min sampling period would generally be suitable for collecting fish data from rock pools. The baseline data collected on fishes in LHI rock pools demonstrated the uniqueness of LHI assemblages, which were significantly different from those on the NSW coast. This study demonstrates that non-destructive sampling methods can be used in rock pool environments, making these methods suitable for sampling in inter-tidal habitats, especially within marine protected areas.
DOI: 10.25607/iekols
title: Controlling Parameters of Benthic Deep-Sea Foraminiferal Biogeography at the Brazilian Continental Margin (11-22°S)

description: Database from the study: Saupe A, Schmidt J, Petersen J, Bahr A, Dias BB, Albuquerque ALS, Díaz Ramos RA and Grunert P (2022) Controlling Parameters of Benthic Deep-Sea Foraminiferal Biogeography at the Brazilian Continental Margin (11-22°S). Front. Mar. Sci. 9:901224. Abstract This study presents new quantitative data on benthic foraminifera from three bathymetric transects of the Brazil (11-14°S, 420-1900 m) and Campos (22°S, 430-2000 m) basins. The quantity and quality of organic matter flux as well as substrate properties and hydrodynamic conditions at the sediment-water interface are identified as key parameters controlling assemblage distribution. Based on the total (stained and unstained) fauna, a distinct biogeographic divide between a Globocassidulina subglobosa/crassa assemblage in the Campos Basin and a rosalinid/bolivinid assemblage in the Brazil Basin occurs across the bifurcation of the South Atlantic Central Water into its southward subtropical and northward tropical branches. In the Campos Basin, coarser sediments, increased bottom current activity, and variable nutrient supply favor an assemblage of Globocassidulina subglobosa/crassa, Nuttalides umbonifer and Alabaminella weddellensis. Occurrences of cold-water coral mounds in 870 m provide an ecological niche favoring species such as Alabaminella weddellensis which benefit from trapped nutrients. The Brazil Basin is characterized by increased abundances of Rosalina and Bolivina, while Globocassidulina subglobosa/crassa is comparatively less frequent. Assemblages with G. subglobosa/ crassa, Rosalina spp., Bolivina variabilis and Bolivina subreticulata are favored by a relatively high nutrient input at 14°S. Further north, assemblages with Bolivina subreticulata, Bolivina variabilis, Epistominella exigua, G. subglobosa/crassa are located beneath the velocity core of the North Brazil Undercurrent (NBUC), coinciding with more clayey sediments rich in TOC. Occurrences of delicate branching forms such as Saccorhiza ramosa indicate a more stable setting, distal to the main current. Rose Bengal stained (living) specimens are scarce in all three regions, as is typical for deep-sea foraminiferal faunas. Their patterns of species distribution largely reflect those observed for the total fauna.
DOI: 10.25607/vo4qfn
title: PELD HCES | In Vitro and In Silico Evaluation of Laurencia obtusa Anticancer Activity

description: Occurrence record of macroalga Laurencia obtusa sampled for laboratory analyses.
DOI: 10.17031/65966f3fe0bcc
title: 1967 - 1992 P.E. Gibbs Plymouth Sound and South Coast Devon and Cornwall Polychaete Records
title: P.E. Gibbs Polychaetes in the Plymouth Sound records from 1967 - mid 1970s

description: Polychaete records for the Plymouth Sound area collected by P.E. Gibbs from 1967 onwards. The majority of the sightings are within the late 1960's and 1970's but records continue until the early 1990's. The data has been transcribed from record cards into a spreadsheet format. Information includes detailed observations, dates and location names.
DOI: 10.25607/c2c37e
title: ReefSYN | Standardized datasets of Brazilian reef diversity in space and time - Dataset XVI: Benthic communities from Rio Grande do Norte

description: This dataset was collected by Guilherme Longo and Natália Roos, and includes the relative benthic cover of reef formations in northeast coast of Brazil (Rio Grande do Norte state) sampled with photoquadrats along transects at different depths.
DOI: 10.25607/l2cbpk
title: South BR Mangrove

description: Western South Atlantic mangrove ecosystems of Brazil, roughly 85% of 7,367 km coastline covering 16 States, on her South area. Original data obtained from http://splink.cria.org.br/brobis/DiGIR.php and registered into iOBIS on 2010-12-07. This dataset on OBIS-SEAMAP is a <b>subset</b> of marine mammal, seabird and/or sea turtle records from the dataset on iOBIS (Total number of records: 2127) harvested into OBIS-SEAMAP on 2011-10-11. Dataset credit = Tropical and Subtropical Western South Atlantic OBIS
DOI: 10.25607/zevqp7
title: Checklist and analysis of completeness of the reef fish fauna of the Revillagigedo Archipelago, Mexico: Fishes Checklist

description: This paper presents an updated checklist of cartilaginous and bony fishes from the Revillagigedo Archipelago reefs and nearby areas (Tropical Eastern Pacific). To compile this list, we gathered data from field surveys between 1994 and 2015, from an exhaustive literature review, and by consulting museum collections and databases. With these records we estimated the completeness of the local fish inventory using four non-parametric rarefaction methods. We report a total of 389 species in 102 families; 235 of these are reef fish that occur in the Eastern but also in the Central Pacific, and 13 species were identified as endemic to the archipelago. A non-parametric statistical model predicts that the expected number of reef fish present at Revillagigedo should be 244.3 ? 3.2 species, which is 9 species more than the observed richness, and this difference was statistically significant (p = 0.02). That predictive model estimates that about 96% of the total richness of reef fish from the archipelago is known. Comparisons of the completeness of the inventory at Revillagigedo to that reported for the fish fauna of the Eastern Pacific and worldwide, showed that the quality of the sampling effort is remarkably high, in spite of the geographic isolation of the archipelago.
DOI: 10.14284/157
title: Mangrove crabs and their relationship with the environment in mangrove forests of Dabaso and Gazi (Kenya) sampled in 1998 and 1999
DOI: 10.14284/211
title: POPA- Fisheries Observer Program of the Azores: Accessory species caught in the Azores tuna fishery between 2000 and 2013
DOI: 10.14284/278
title: Periphytal turbellarians in the Bay of Calvi (Corsica) sampled in 1982 and 1983
DOI: 10.15468/ibm5hb
title: Joint Nature Conservation Committee - Seabird 2000

description: NBN Gateway Dataset GA000089
DOI: 10.48518/00010
title: Regionally Integrated Marine Database (RINKAI), managed by JAMBIO, an association of Japanese university-based marine stations
DOI: 10.14284/257
title: Asteroidea distribution data from: Deep-sea fauna of European seas - an annotated species check-list of benthic invertebrates living deeper than 2000 m in the seas bordering Europe
DOI: 10.15472/gdddsu
title: Caracterización de organismos asociados a microplásticos en las playas de Santa Marta

description: En las últimas décadas se ha registrado el aumento del microplástico en ambientes marinos y costeros, convirtiéndose en una creciente preocupación por los posibles efectos sobre los ecosistemas, problema que se ha atribuido al desmedido consumo de plástico por parte de la población. A pesar de que las grandes industrias de plástico están alejadas de los países sudamericanos, la contaminación por microfragmentos plásticos en estos países se ha hecho evidente e inclusive se han registrado su ingesta por parte de organismos planctónicos y bentónicos. El microplástico perjudica directamente al medio ambiente al reducir la eficiencia de los procesos fisiológicos de los organismos, en muchos casos conllevándolos a la muerte, lo que afecta el funcionamiento natural de los ecosistemas marinos. Asimismo, los microplásticos puede liberar sustancias tóxicas que pueden ser transferidas entre los niveles de las redes tróficas afectando la totalidad de los ecosistemas. En Colombia, son escasos los estudios realizados en esta temática; especialmente en la región Caribe no se ha estimado la composición de microplásticos en los ecosistemas costeros y mucho menos su influencia sobre las comunidades meiofaunales.
description: Este recurso contiene la información de 222 registros biológicos que representan 40.119 observaciones de organismos meiobentónicos, agrupados en 12 filos diferentes. Fueron recolectados en tres playas, La Bahía de Santa Marta, Taganga y Rodadero, todos en la ciudad de Santa Marta en el año 2019.
DOI: 10.17882/93375
title: Abundance data of planktonic cnidarians collected during the Camadas Finas III survey performed along the North Brazilian continental shelf and open ocean

description: Abundance data (individuals.100 m-3) of planktonic cnidarians collected during the Camadas Finas III oceanographic cruise along the North Brazilian continental shelf between the Amazon and Oyapok river mouths and equatorial Atlantic oceanic waters between 8°N, 51°W and 3.5°S, 37°W. Data was obtained during the oceanographic cruise Camadas Finas III, aboard the research vessel NHo. Cruzeiro do Sul - H38 (DHN/Brazilian Navy), performed in 9-31 October 2012. Planktonic cnidarians were sorted from zooplankton samples collected at at 44 stations in oblique hauls, using Bongo nets with 120 and 300 µm mesh and 0.3 and 0.6 m mouth diameter, respectively. The water column was sampled from near the bottom to the surface over the continental shelf and from 200 m to the surface in the offshore. The net was towed at approximately 2 knots, at various times of day and night.
DOI: 10.15472/d7bhjp
title: Zooplancton presente en el área marina protegida de los Archipielagos del Rosario y San Bernardo, Caribe Colombiano

description: Se presentan los datos biológicos de las colectas de zooplancton realizadas en el marco del proyecto titulado "EVALUACIÓN DE LA CONTAMINACIÓN POR MICROPLÁSTICOS SOBRE LA COMUNIDAD DE ZOOPLANCTON EN EL PARQUE NACIONAL NATURAL CORALES DE PROFUNDIDAD Y EN EL PARQUE NACIONAL NATURAL LOS CORALES DEL ROSARIO Y DE SAN BERNARDO". Se recolectaron un total 24 muestras en la columna de agua, 12 muestras tomadas en el Parque Nacional Natural Corales del Rosario y San Bernardo que corresponden a seis estaciones costeras y 12 muestras tomadas en el Parque Nacional Natural Corales de Profundidad que corresponden a seis estaciones oceánicas y dos épocas de año correspondiente a la temporada seca en marzo 2022 y temporada de lluvias en octubre del 2022. En cada estación, se registró la profundidad con un profundímetro portátil. Las muestras de zooplancton se recolectaron mediante arrastres oblicuos (Smith & Richardson, 1979) desde la superficie hasta una profundidad de 80 m, y en las estaciones someras hasta el fondo con un margen de seguridad de 5 m, utilizando una red tipo Mini-Bongo de 30 cm de diámetro y 2.1 m de largo, provista con mallas de 200 μm y 500 μm de apertura del poro de malla, equipada con un flujómetro digital Hydrobios run stop (Modelo No. 438115) para establecer el volumen de agua filtrado. La duración del arrastre de zooplancton fue de 5 minutos a una velocidad promedio de 3.5 km/h durante las horas diurnas entre las 7:00 y 16:00 horas. Todas las muestras recolectadas fueron preservadas en una solución de formalina neutralizada al 4 % y frascos de vidrio
description: En este recurso se presentan 1.198 registros de especímenes colectados en 6 estaciones del Parque Nacional Natural Corales del Rosario y San Bernardo y 6 estaciones en el Parque Nacional Natural Corales de Profundidad, en dos épocas de muestreo lluvias y sequia durante el año 2022.
DOI: 10.15472/dlayg6
title: Datos de monitoreo de las praderas de pastos marinos del Caribe colombiano - Estructura

description: En el contexto de los proyectos "Diseño e implementación del subsistema de áreas marinas protegidas en Colombia" y "Protección de la biodiversidad en el Caribe suroccidental", financiados conjuntamente por el GEF y llevados a cabo por Invemar y Coralina, se han unido esfuerzos para desarrollar y establecer protocolos de monitoreo para los elementos de conservación más importantes en las diversas Áreas Marinas Protegidas (AMP) del país. Estos protocolos se basan en la experiencia adquirida en los últimos 15 años en Colombia, a través de iniciativas como el Sistema de Monitoreo de Arrecifes Coralinos (Simac), la Red de Monitoreo de la Calidad de Aguas Marinas y Costeras (Redcam) y el Sistema de Información Pesquera (Sipein). Estas iniciativas han demostrado su fortaleza al trabajar en conjunto con el Sistema Nacional Ambiental (SINA), en particular con las Corporaciones Autónomas Regionales costeras, el Sistema de Parques Nacionales Naturales y las instituciones académicas. El objetivo de estos protocolos de monitoreo para las AMP no solo consiste en obtener información científicamente sólida mediante la selección de variables mínimas, sino también en considerar la capacidad operativa y de mantenimiento a largo plazo de cada una de las instituciones responsables de estas actividades. La experiencia ha demostrado que resulta cada vez más difícil y costoso mantener sistemas de monitoreo que aborden los desafíos locales y proporcionen respuestas relevantes para evaluar la efectividad de la gestión de las áreas con menor incertidumbre.
description: Este trabajo fue realizado entre 2012 y 2014, aplicando la metodología Seagrass Net, adoptada por el INVEMAR desde 2015, y descrita en el documento de Protocolo Indicador Condición Tendencia Praderas de Pastos Marinos (ICTpm), logrando concertar que variables mínimas eran necesarias tomarlas en campo para responder a preguntas de manejo y gestión y de esta forma poder diseñar la red de estaciones específica en cada una de las áreas, partiendo de criterios como la zonificación del manejo y los usos permitidos o no que se desarrollan al interior del AMP.
description: El conjunto de datos se compone de 1759 registros biológicos de grandes pelágicos, representado en 1 filos, 1 clase, 1 órdenes, 2 familias, 4 géneros y 4 especies.
DOI: 10.15472/pqjrec
title: Caracterización del caracol pala Lobatus gigas de la Isla Cayo Serranilla durante la Expedición Seaflower 2017 - Proyecto Colombia BIO

description: En el marco de la expedición científica en la Reserva de Biosfera Seaflower 2017, se llevó a cabo el monitoreo de la distribución y abundancia del caracol pala en la plataforma arrecifal de las islas Cayo Serranilla. En total se observaron 145 registros de la especie Lobatus gigas distribuidos en 54 estaciones de muestreo.
description: Para la expedición del año 2019, se llevó a cabo el monitoreo en la Reserva de Biosfera Seaflower y se observaron un 222 regristros distribuidos en 11 puntos de muestreo.
DOI: 10.15472/rbhmg8
title: Aves y mamíferos terrestres de la Bahía Tukakas, Alta Guajira. Proyecto Colombia BIO: Expedición Colombia BIO Lamuuna Neimalu’u.

description: Con el propósito de generar conocimiento sobre la biodiversidad marina y costera de la Bahía Tukakas, el Instituto de Investigaciones Marinas y Costeras - INVEMAR en asocio con la Corporación Autónoma Regional de La Guajira - CORPOGUAJIRA, diseñaron y ejecutaron la expedición científica Lamuuna Neimaluú, llevada a cabo entre el 19 y 28 de abril del 2023, en el marco de la estrategia Colombia BIO del Ministerio de Ciencia, Tecnología e Innovación. Este recurso presenta 112 registros biológicos de observaciones de avifauna y mastofauna, que fueron obtenidos durante la expedición en los ambientes costeros de la bahía, principalmente en las áreas de manglar, litoral rocoso, y playas. El 96% de los registros corresponden a aves y 4% a mamíferos terrestres, y en suma taxonómicamente representan un total de 46 especies. 

Este conjunto de datos complementa al recurso titulado "Biodiversidad marina de la Bahía Tukakas, Alta Guajira colombiana. Proyecto Colombia BIO: Expedición Lamuuna Neimalu’u", los cuales en suma presentan el inventario general de registros de biota generado por la expedición.
DOI: 10.25607/bce6up
title: DNA barcoding as a tool to explore elasmobranch diversity in environmental DNA off the Banc d?Arguin (Mauritania)

description: Metabarcoding was used to explore species diversity in eDNA samples from the PNBA. Results confirmed the presence of 29 different species, 12 sharks and 17 rays of which 14 species had previously never been reported from the PNBA in the literature.
DOI: 10.14284/304
title: ImagDOP Benthic Video Annotations in Condor seamount in 2010
DOI: 10.14286/sxm1h2
title: DFO: Porbeagle and Blue Sharks

description: This is the OBIS extraction of the Ocean Tracking Network and Department of Fisheries and Oceans Canada (DFO) DFO: Porbeagle and Blue Sharks, consisting of the release tagging metadata, i.e. the location and date when the tagged animal was released, and summarized detection events of tagged individuals. If readers are interested in the source dataset they may also inquire with the project PIs as listed here or on the OTN web site (https://members.oceantrack.org/project?ccode=JPBS).
description: Abstract:To determine movements of porbeagle and blue sharks in Canadian waters and to see if they cross over the US/Canadian border to American waters. The data would help with future management of both species.
DOI: 10.25494/p66w3j
title: Bull Kelp Forest Ecosystem Monitoring Database, Northern California, 1971-2023 (ongoing)

description: Kelps are critical habitat structuring organisms forming dense underwater forests in nearshore rocky reefs of northern California. Kelp forests support a range of species such as red abalone and red sea urchins which form the basis for important invertebrate fisheries in the region. Along with fisheries, kelp forests provide a suite of other ecosystem services including supporting biodiversity and carbon sequestration, making them critical habitats to monitor. Monitoring of kelps and kelp obligate species is now more important than ever with the intensification of ocean changes such as marine heatwaves, low oxygen events and ocean acidification. Changes in kelp forest ecosystems associated with fishing can be observed inside fished sites whereas changes in protected sites suggests region wide stressors. In this long-term, bull kelp forest monitoring program, divers quantify key marine invertebrates, algal cover and substrate types along transects inside and outside fished sites centered in Sonoma and Mendocino Counties, in northern California. As nearshore kelp forest ecosystems face increasing stressors, long term monitoring programs will be critical for informing fishery management, restoration strategies and marine spatial planning.