cometadata/datacite-titles-descriptions-related-identifiers huggingface dataset:
DOI: 10.6084/m9.figshare.5131840.v2
title: Source data of Green's function and figure files.

description: In the article of "The role of electron-electron interactions in two dimensional Dirac fermions", we present the analysis of the unequal time Green's function to find the Fermi velocity according to the first excitation energy. This link provide both the source data of Green's function datGF.mat and the .fig files in the article. <br><br>This matlab data file includes the source data of unequal time Green's function for every parameters we simulated in projective quantum Monte Carlo. We study the fermionic model with the on-site Hubbard U and the long range Coulomb interaction \alpha on honeycomb lattice. \gamma is the ratio between on-site interaction and long-range Coulomb interaction. <br><br>The file contain a list of three levels. In the first level of the list, we classify the data according to the parameter \gamma, U and lattice size L. In second level, we list out all the Green's function (G_k(tau)=) of momentum k=(kx,ky) for both conduction band (c.b.) and valence band (v.b.). In our simulation, we find G(tau=0 to 10) in the imaginary time interval of 0.1. The Green function format is that the first column is tau label, the second column is the Green's function, and the third column is the error estimation of the Green's function. <br>For example, if we search the unequal time Green's function of valence band at the Dirac point (4.18,0) for \gamma=1.227, U=6.5 and lattice size L=15. We can access by datGF{437,6}{226,4}, which gives the Green's function and associated error in term of imaginary time. The Green's function here are calculated by averaging the data bins in converged Monte Carlo process.<br>Note:Typo corrected - Fig1_update.fig (originally Fig1.fig)
DOI: 10.6084/m9.figshare.5131771
title: Structural and functional MRI brain scans of a single subject

description: T1 and several functional brain scans of a single subject obtained on a 3T scanner. The subject (also the author of this dataset) is was a 28 years old healthy male. Brain Imaging Data Structure (BIDS) was used.
DOI: 10.6084/m9.figshare.5131801.v1
title: Lactate.sav

description: Data on lactate values obtained during the first 24 postoperative hours following major digestive surgery were collected. Patient demographic and clinical data, as well the data regarding their clinical outcomes are contained in the database.<br>
DOI: 10.6084/m9.figshare.5131771.v1
title: Structural and functional MRI brain scans of a single subject

description: T1 and several functional brain scans of a single subject obtained on a 3T scanner. The subject (also the author of this dataset) is was a 28 years old healthy male. Brain Imaging Data Structure (BIDS) was used.
DOI: 10.6084/m9.figshare.5131693
title: Chilean citizens opinion about two contentious management practices of beef cattle production systems

description: A survey regarding opinion of Chilean citizens towards two contentious management practices<br>
DOI: 10.6084/m9.figshare.5131693.v1
title: Chilean citizens opinion about two contentious management practices of beef cattle production systems

description: A survey regarding opinion of Chilean citizens towards two contentious management practices<br>
DOI: 10.6084/m9.figshare.5131723
title: DFT study of the reaction between tetrachloro-phthalimido-N-oxyl (Cl4PINO) radical and various alcohols

description: Data to support article: Electrochemically Driven C-H Hydrogen Abstraction Processes with the Tetrachloro-Phthalimido-N-Oxyl (Cl<sub>4</sub>PINO) Catalyst<br> DOI: 10.6084/m9.figshare.5131723 Journal: Electroanalysis<br> Authors: Mark A. Buckingham <sup>1</sup>, William Cunningham <sup>1</sup>, Steven D. Bull <sup>1</sup>, Antoine Buchard <sup>1</sup>, Andrea Folli <sup>2</sup>, Damien Murphy <sup>2</sup>, Frank Marken <sup>1* </sup> <i><br><br>1 Department of Chemistry, University of Bath, Claverton Down, Bath BA2 7AY, UK 2 School of Chemistry, Cardiff University, Cardiff CF10 3AT, UK</i>DFT study: - The DFT optimised geometries and computed free enthalpies of various alcohols and alcohol radicals were used to calculate the thermodynamics of the hydrogen abstraction reaction of various primary alcohols in presence of tetrachloro-phthalimido-N-oxyl (Cl4PINO) radical catalyst. - A transition state for the hydrogen abstraction was also calculated and used to calculate the related activation barrier for each alcohol Protocol: rB3LYP/6-311+G(d,p)/cpcm=acetonitrile/T=298.15K Content: - Gaussian09 rev D.01 output files<br>- Computational_full_details_and_results.pdf<br>
DOI: 10.6084/m9.figshare.5131750
title: Antibiotic MICs

description: Antibiotic MICs for a systematic review
DOI: 10.6084/m9.figshare.5131723.v1
title: DFT study of the reaction between tetrachloro-phthalimido-N-oxyl (Cl4PINO) radical and various alcohols

description: Data to support article: Electrochemically Driven C-H Hydrogen Abstraction Processes with the Tetrachloro-Phthalimido-N-Oxyl (Cl<sub>4</sub>PINO) Catalyst<br> DOI: 10.6084/m9.figshare.5131723 Journal: Electroanalysis<br> Authors: Mark A. Buckingham <sup>1</sup>, William Cunningham <sup>1</sup>, Steven D. Bull <sup>1</sup>, Antoine Buchard <sup>1</sup>, Andrea Folli <sup>2</sup>, Damien Murphy <sup>2</sup>, Frank Marken <sup>1* </sup> <i><br><br>1 Department of Chemistry, University of Bath, Claverton Down, Bath BA2 7AY, UK 2 School of Chemistry, Cardiff University, Cardiff CF10 3AT, UK</i>DFT study: - The DFT optimised geometries and computed free enthalpies of various alcohols and alcohol radicals were used to calculate the thermodynamics of the hydrogen abstraction reaction of various primary alcohols in presence of tetrachloro-phthalimido-N-oxyl (Cl4PINO) radical catalyst. - A transition state for the hydrogen abstraction was also calculated and used to calculate the related activation barrier for each alcohol Protocol: rB3LYP/6-311+G(d,p)/cpcm=acetonitrile/T=298.15K Content: - Gaussian09 rev D.01 output files<br>- Computational_full_details_and_results.pdf<br>
DOI: 10.6084/m9.figshare.5131750.v1
title: Antibiotic MICs

description: Antibiotic MICs for a systematic review
DOI: 10.6084/m9.figshare.5131519
title: 1-D Nanoslit and 2-D Squarehole periodic array optical properties - Coupled Mode Theory - Matab GUI

description: Matlab User Interface for the Coupled Mode Theory for Transmission and Reflection spectra of Nanohole arrays for any dimension of the structure and refractive index and metal. Also included is the field distribution around the structure.
DOI: 10.6084/m9.figshare.5130508
title: The tracks of giant theropods (<i>Jurabrontes curtedulensis</i> ichnogen. & ichnosp. nov.) from the Late Jurassic of NW Switzerland: palaeoecological & palaeogeographical implications

description: <i>Jurabrontes curtedulensis</i>, a new ichnogenus and species of Late Jurassic giant theropod dinosaur track is described based on very well-preserved and morphologically-distinct tracks, all carefully excavated along federal highway A16 (Canton Jura, NW Switzerland). All trackways were systematically documented including parameter measurements, descriptions, outline drawings, orthophotos and laserscans. <i>Jurabrontes</i> is characterised by sub-equal track length and width, a small anterior triangle, weak mesaxony, three blunt digits (dII-III-IV) with pronounced (sub)triangular claw marks, a rounded heel, and clear phalangeal pad impressions. The combination of features of <i>Jurabrontes</i> is typical for a theropod (and not ornithopod) trackmaker. <i>Jurabrontes</i> is compared to other similar ichnotaxa and unnamed tracks of large theropods from the Early Jurassic to Late Cretaceous, from which it is clearly different. The sheer size of the largest tracks, that are amongst the largest worldwide and of similar size to <i>Tyrannosauripus</i> from the Late Cretaceous, suggests a ‘megalosaurid’ or large allosaurid theropod as a trackmaker. The presence of such large theropod tracks in tidal-flat deposits of the Jura carbonate platform and associated with small to large sauropod tracks has important palaeoecological implications for the dinosaur community and for palaeoenvironmental and palaeogeographical reconstructions. <i>Jurabrontes</i> - urn:lsid:zoobank.org:act:B482D2AF-637A-4B2D-8B0B-FEAD54CA2A26 <i>J. curtedulensis</i>- urn:lsid:zoobank.org:act:30D45944-5A2B-45E1-89B9-20298E475D51
DOI: 10.6084/m9.figshare.5129980
title: Data and code to reproduce analyses from "Trait-based prediction of host species roles in parasite sharing networks"

description: ​This repository contains code and data to reproduce the analyses and create figures from:<br><br>&gt; Dallas, T, BA Han, CL Nunn, AW Park, PR Stepehns, and JM Drake. 2017. "Trait-based prediction of host species roles in parasite sharing networks" <br><br><br>The RData file (`dataForGBM.RData`) contains files also generated in the data processing script (`DataProcessing.Rmd`), which reads in the associated csv files in this repository. <br>`Dallas2017.Rmd` runs the analyses and produces the plots from the manuscript. Generated plots may differ slightly, as data subsetting and model training have elements of randomness.<br><br>For more details on the analyses presented here, please see the original publication.
DOI: 10.6084/m9.figshare.5129965
title: Supplementary Material for: Auswirkungen von automatischen Gedanken und psychologischer Flexibilität auf die depressive Symptomatik und Rückfallwahrscheinlichkeit remittiert Depressiver

description: <b><i>Hintergrund:</i></b> Obwohl positive und negative automatische Gedanken (PAG, NAG) sowie die psychologische Flexibilität (PF) einen engen Zusammenhang mit der depressiven Symptomatik aufweisen, wurde die Rolle dieser Variablen bei einem depressiven Rückfall bisher nicht erforscht. <b><i>Fragestellung:</i></b> In dieser Studie wird untersucht, wie sich eine stationäre Intervention auf klinische Variablen (PAG, NAG und PF) auswirkt. Zudem wird der Verlauf von PAG, NAG und PF von Frührückfälligen in der Katamnesephase erforscht. Dabei geht es darum, inwiefern PAG, NAG und PF einen Rückfall vorhersagen. <b><i>Methode:</i></b> Bei 39 remittierten Depressiven sowie 45 gesunden Kontrollpersonen wurden die oben genannten Variablen erhoben. In der experimentellen Phase wurde bei den Probanden beider Gruppen eine traurige Stimmung induziert. Die remittiert depressiven Probanden wurden über eine 16-monatige Katamnesephase nachuntersucht. <b><i>Ergebnisse:</i></b> Nach der negativen Stimmungsinduktion riefen remittiert Depressive im Vergleich zu Gesunden weniger PAG ab. Zudem zeigten Frührückfällige während der Katamnesephase einen eingeschränkten Zugang zu PAG und eine niedrige PF. Weder PAG, NAG noch PF erwiesen sich als bedeutsame Prädiktoren eines depressiven Rückfalls. <b><i>Schlussfolgerung:</i></b> Remittiert Depressive und Frührückfällige zeigen einen eingeschränkten Zugang zu PAG. Die schwache Produktion von PAG stellt einen Risikofaktor für einen depressiven Rückfall dar.
DOI: 10.6084/m9.figshare.5129962
title: Supplementary Material for: Rivaroxaban in Chronic Hemodialysis Patients: Clarification of an Editorial Error

description: Medicine
DOI: 10.6084/m9.figshare.5129965.v1
title: Supplementary Material for: Auswirkungen von automatischen Gedanken und psychologischer Flexibilität auf die depressive Symptomatik und Rückfallwahrscheinlichkeit remittiert Depressiver

description: <b><i>Hintergrund:</i></b> Obwohl positive und negative automatische Gedanken (PAG, NAG) sowie die psychologische Flexibilität (PF) einen engen Zusammenhang mit der depressiven Symptomatik aufweisen, wurde die Rolle dieser Variablen bei einem depressiven Rückfall bisher nicht erforscht. <b><i>Fragestellung:</i></b> In dieser Studie wird untersucht, wie sich eine stationäre Intervention auf klinische Variablen (PAG, NAG und PF) auswirkt. Zudem wird der Verlauf von PAG, NAG und PF von Frührückfälligen in der Katamnesephase erforscht. Dabei geht es darum, inwiefern PAG, NAG und PF einen Rückfall vorhersagen. <b><i>Methode:</i></b> Bei 39 remittierten Depressiven sowie 45 gesunden Kontrollpersonen wurden die oben genannten Variablen erhoben. In der experimentellen Phase wurde bei den Probanden beider Gruppen eine traurige Stimmung induziert. Die remittiert depressiven Probanden wurden über eine 16-monatige Katamnesephase nachuntersucht. <b><i>Ergebnisse:</i></b> Nach der negativen Stimmungsinduktion riefen remittiert Depressive im Vergleich zu Gesunden weniger PAG ab. Zudem zeigten Frührückfällige während der Katamnesephase einen eingeschränkten Zugang zu PAG und eine niedrige PF. Weder PAG, NAG noch PF erwiesen sich als bedeutsame Prädiktoren eines depressiven Rückfalls. <b><i>Schlussfolgerung:</i></b> Remittiert Depressive und Frührückfällige zeigen einen eingeschränkten Zugang zu PAG. Die schwache Produktion von PAG stellt einen Risikofaktor für einen depressiven Rückfall dar.
DOI: 10.6084/m9.figshare.5129956
title: Supplementary Material for: Arbeitsplatzbezogene kognitive Verhaltenstherapie mit Fokus auf die Rückkehr an den Arbeitsplatz: Zwei Fallbeschreibungen

description: <b>Hintergrund:</b> Psychische Störungen bei Erwerbstätigen führen zu hohen Fehlzeiten und verursachen damit entsprechende Kosten für die Betriebe und das Gesundheitssystem. Das Arbeitsleben ist eine wichtige Quelle der Lebenszufriedenheit. Daher scheint es wichtig, die Wiedereingliederung an den Arbeitsplatz im Rahmen einer kognitiven Verhaltenstherapie als Therapieziel aufzunehmen und den Wiedereinstieg therapeutisch zu begleiten. <b>Falldarstellungen:</b> Anhand von 2 Kasuistiken wird die Vorgehensweise der arbeitsplatzbezogenen kognitiven Verhaltenstherapie nach Lagerveld et al. [2012] beschrieben. <b>Schlussfolgerung:</b> Voraussetzungen und Grenzen des Ansatzes werden diskutiert.
DOI: 10.6084/m9.figshare.5129959
title: Supplementary Material for: Die Cognitive Processing Therapy - Cognitive Therapy Only zur Behandlung der komplexen Posttraumatischen Belastungsstörung

description: <b><i>Hintergrund:</i></b> Das Störungsbild der komplexen Posttraumatischen Belastungsstörung (PTBS) tritt häufig nach wiederholten Gewalterfahrungen in der Kindheit und Jugend auf und zeichnet sich neben den Kernsymptomen der PTBS durch Störungen der Emotionsregulation, instabile Beziehungen sowie hohe Komorbiditäten aus. Viele Behandler haben Bedenken, bei dieser Patientengruppe expositionsbasierte Methoden anzuwenden. Die Cognitive Prozessing Therapy (CPT; [Resick et al., 2007]) stellt in ihrer rein kognitiven Variante (CPT-C) eine wirksame alternative Methode dar, die ohne formale Expositionselemente auskommt. Neben der Vorstellung dieser Behandlung wird ein Überblick über Evaluationsstudien gegeben sowie die Anwendung anhand eines Fallbeispiels beschrieben. <b><i>Fallbericht:</i></b> Die Patientin kam nach sexueller Gewalt im Kindesalter in die Behandlung. Neben einer PTBS wurde eine emotional instabile Persönlichkeitsstörung (Borderline-Typus) diagnostiziert. Die durchgeführten CPT-C-Interventionen, der Therapieverlauf sowie das Behandlungsergebnis werden beschrieben und Besonderheiten bei der Behandlung der komplexen PTBS aufgezeigt. <b><i>Schlussfolgerungen:</i></b> Die kognitive Variante der CPT, die CPT-C, ermöglicht es, auf eine formale Exposition zu verzichten, und zeigt dennoch eine genauso gute Wirksamkeit wie expositionsbasierte Methoden. Sie sollte deshalb in der Versorgung traumatisierter Patientinnen und Patienten und besonders auch zur Behandlung der komplexen PTBS eine größere Beachtung und Verbreitung finden.
DOI: 10.6084/m9.figshare.5129962.v1
title: Supplementary Material for: Rivaroxaban in Chronic Hemodialysis Patients: Clarification of an Editorial Error

description: Medicine
DOI: 10.6084/m9.figshare.5129950
title: Supplementary Material for: AGO Recommendations for the Diagnosis and Treatment of Patients with Advanced and Metastatic Breast Cancer: Update 2016

description: Medicine
DOI: 10.6084/m9.figshare.5129950.v1
title: Supplementary Material for: AGO Recommendations for the Diagnosis and Treatment of Patients with Advanced and Metastatic Breast Cancer: Update 2016

description: Medicine
DOI: 10.6084/m9.figshare.5129953
title: Supplementary Material for: Die KINDEX-App - ein Instrument zur Erfassung und unmittelbaren Auswertung von psychosozialen Belastungen bei Schwangeren in der täglichen Praxis bei Gynäkologinnen, Hebammen und in Frauenkliniken

description: <b><i>Hintergrund:</i></b> Der Konstanzer Index (KINDEX) ist ein strukturiertes Interview, das entwickelt wurde, um bereits pränatal zuverlässig und umfassend Risiken für eine beeinträchtigte psychische Entwicklung des Kindes und der Mutter zu erfassen. Um eine unmittelbare automatisierte Auswertung zu ermöglichen, haben wir das Instrument in Form einer Tablet-gestützten Anwendung (KINDEX-App) weiterentwickelt, die die schwangere Frau eigenständig bedienen kann. <b><i>Methoden:</i></b> In dieser Studie kam die KINDEX-App in gynäkologischen Praxen und in Frauenkliniken bei insgesamt N = 956 schwangeren Frauen als Selbstbeurteilungsinstrument zum Einsatz. Zur Bestimmung der Validität des Instruments wurden Vergleiche der Prävalenzen der erhobenen psychosozialen Belastungen mit repräsentativen Studien vorgenommen und Cronbachs alpha wurde berechnet. Des Weiteren wurde die Akzeptanz des Instrumentes sowohl bei den schwangeren Frauen als auch bei Gynäkologinnen und Hebammen erhoben. <b><i>Ergebnisse:</i></b> Die Prävalenzzahlen aus unserer Erhebung entsprechen weitgehend anderen Befunden, die in vergleichbaren Kollektiven erhoben wurden, wodurch die externe Validität der App angenommen werden kann. Die Anzahl fehlender Werte war äußerst gering (&lt; 6%) und lässt den Schluss auf eine gute Akzeptanz zu. Die interne Konsistenz der App lag im akzeptablen Bereich (α = 0,68). <b><i>Schlussfolgerungen:</i></b> Die KINDEX-App ist ein praktikables und valides Screening-Instrument zur Erfassung psychosozialer Belastungsfaktoren bereits während der Schwangerschaft und bildet damit eine gute Basis für die Prävention und frühe Intervention, sodass eine gelingende Mutter-Kind-Bindung und eine gesunde kindliche Entwicklung gefördert werden können.
DOI: 10.6084/m9.figshare.5129980.v1
title: Data and code to reproduce analyses from "Trait-based prediction of host species roles in parasite sharing networks"

description: ​This repository contains code and data to reproduce the analyses and create figures from:<br><br>&gt; Dallas, T, BA Han, CL Nunn, AW Park, PR Stepehns, and JM Drake. 2017. "Trait-based prediction of host species roles in parasite sharing networks" <br><br><br>The RData file (`dataForGBM.RData`) contains files also generated in the data processing script (`DataProcessing.Rmd`), which reads in the associated csv files in this repository. <br>`Dallas2017.Rmd` runs the analyses and produces the plots from the manuscript. Generated plots may differ slightly, as data subsetting and model training have elements of randomness.<br><br>For more details on the analyses presented here, please see the original publication.
DOI: 10.6084/m9.figshare.5129944
title: Supplementary Material for: Serum Bicarbonate and Structural and Functional Cardiac Abnormalities in Chronic Kidney Disease - A Report from the Chronic Renal Insufficiency Cohort Study

description: <b><i>Background:</i></b> Heart failure (HF) is a frequent occurrence in chronic kidney disease (CKD) patients and predicts poor survival. Serum bicarbonate is associated with increased rates of HF in CKD; however, the mechanisms leading to this association are incompletely understood. This study aims to assess whether serum bicarbonate is independently associated with structural and functional cardiac abnormalities in CKD. <b><i>Methods:</i></b> The association between serum bicarbonate and left ventricular (LV) hypertrophy (LVH), LV mass indexed to height<sup>2.7</sup>, LV geometry, ejection fraction (EF) and diastolic dysfunction was assessed in 3,483 participants without NYHA class III/IV HF, enrolled in the Chronic Renal Insufficiency Cohort study. <b><i>Results:</i></b> The mean estimated glomerular filtration rate was 42.5 ± 17 ml/min/1.73 m<sup>2</sup>. The overall prevalence of LVH was 51.2%, with 57.8, 50.9 and 47.7% for bicarbonate categories &lt;22, 22-26 and &gt;26 mmol/l, respectively. Participants with low bicarbonate were more likely to have LVH and abnormal LV geometry (OR 1.32; 95% CI 1.07-1.64, and OR 1.57; 95% CI 1.14-2.16, respectively). However, the association was not statistically significant after adjustment for demographics, traditional cardiovascular risk factors, medications and kidney function (OR 1.07; 95% CI 0.66-1.72, and OR 1.27; 95% CI 0.64-2.51, respectively). No association was found between bicarbonate and systolic or diastolic dysfunction. During follow-up, no significant changes in LV mass or EF were observed in any bicarbonate strata. <b><i>Conclusions:</i></b> In a large CKD study, serum bicarbonate was associated with LV mass and concentric LVH; however, this association was attenuated after adjustment for clinical factors suggesting that the observed cardiac effects are mediated through yet unknown mechanisms.
DOI: 10.6084/m9.figshare.5129947
title: Supplementary Material for: Obesity, Renin-Angiotensin System Blockade and Risk of Adverse Renal Outcomes: A Population-Based Cohort Study

description: <b><i>Background:</i></b> Obesity substantially increases the risk of the development of chronic kidney disease. Adipose tissue expresses all of the components of the renin-angiotensin system (RAS), contributing to the high prevalence of hypertension in obese patients and driving renal hyperfiltration and subsequent glomerular injury. <b><i>Methods:</i></b> We performed a retrospective cohort study using a United Kingdom primary care database, evaluating the effect of time-updated exposure to RAS blockade versus all other antihypertensive medications in obese, hypertensive, non-diabetic patients. We used Cox proportional hazards modeling with and without marginal structural modeling to assess the hazards of developing a primary outcome of 50% reduction in estimated glomerular filtration rate (eGFR) (across 2 consecutive values), end stage renal disease or death. <b><i>Results:</i></b> A total of 219,701 patients met inclusion criteria, with a median 7.2 years of follow-up. Median baseline eGFR was 72.6 ml/min/1.73 m<sup>2</sup>. Compared to other antihypertensive medications, patients treated with RAS blockade had a modestly elevated hazard of adverse renal outcomes using traditional Cox regression (hazard ratio (HR) 1.04, 95% CI 1.01-1.07) and no significantly increased hazard by marginal structural modeling (HR 1.02, 95% CI 0.97-1.08). Patients treated with RAS blockade had a significantly reduced hazard of incident diabetes, but no significant difference in mortality. <b><i>Conclusion:</i></b> This study, conducted in a large real-world cohort, provides evidence that RAS blockade may not provide benefit with regard to longitudinal renal outcomes in obese, hypertensive patients. Further research is needed to elucidate the hemodynamic and renoprotective role of antihypertensive medications in obese patients.