cometadata/datacite-titles-descriptions-related-identifiers huggingface dataset:
DOI: 10.15468/dl.59xjfq
title: Occurrence Download

description: A dataset containing 232476 species occurrences available in GBIF matching the query:
{
 "and" : [
 "Continent is Asia",
 "Country is India",
 "Geometry POLYGON((32 -43,127 -43,127 28,32 28,32 -43))",
 "MediaType is Image",
 "TaxonKey is Plantae"
 ]
}

 The dataset includes 232476 records from 104 constituent datasets; see https://api.gbif.org/v1/occurrence/download/0031340-250827131500795/datasets/export for details.
 
Data from some individual datasets included in this download may be licensed under less restrictive terms.
DOI: 10.5281/zenodo.15716763
title: Supplementary material: video stimuli used in main study of van Veen et al. (2025).

description: Supplementary material with van Veen, S., Willemse, C. Garcia Goo, H., and Truong, K.P. (2025). The role of voice and appearance in gender perception of speaking robots. In Proceedings of IEEE RO-MAN, to appear.

These are the video stimuli containing the combined robot appearance and voice, used in the main study.
DOI: 10.5281/zenodo.15716764
title: Supplementary material: video stimuli used in main study of van Veen et al. (2025).

description: Supplementary material with van Veen, S., Willemse, C. Garcia Goo, H., and Truong, K.P. (2025). The role of voice and appearance in gender perception of speaking robots. In Proceedings of IEEE RO-MAN, to appear.

These are the video stimuli containing the combined robot appearance and voice, used in the main study. This version 1 (outdated), please see version 2 for an updated version.
DOI: 10.34740/kaggle/dsv/9842325
title: Super Resolution Benchmark: RACD
DOI: 10.15468/dl.ajjhv3
title: Occurrence Download

description: A dataset containing 0 species occurrences available in GBIF matching the query:
{
 "and" : [
 "TaxonKey is one of (Carcharhinus leucas, Fontitrygon garouaensis, Fontitrygon ukpam, Pristis clavata, Pristis pristis, Acipenser sturio, Anguilla anguilla, Anguilla bengalensis, Anguilla bicolor, Anguilla marmorata, Anguilla mossambica, Congresox talabonoides, Strophidon sathete, Uropterygius concolor, Dalophis boulengeri, Dalophis cephalopeltis, Pisodonophis boro, Pisodonophis cancrivorus, Yirrkala tenuis, Atherina boyeri, Atherina caspia, Atherinomorus duodecimalis, Teramulus kieneri, Teramulus waterloti, Bedotia albomarginata, Bedotia alveyi, Bedotia geayi, Bedotia leucopteron, Bedotia longianalis, Bedotia madagascariensis, Bedotia marojejy, Bedotia masoala, Bedotia tricolor, Rheocles alaotrensis, Rheocles derhami, Rheocles lateralis, Rheocles pellegrini, Rheocles sikorae, Rheocles vatosoa, Rheocles wrightae, Allenbatrachus meridionalis, Thalassophryne maculosa, Thalassophryne uranoscopus, Zenarchopterus dispar, Zenarchopterus gilli, Brycinus abeli, Brycinus affinis, Alestes ansorgii, Alestes baremoze, Brachyalestes bimaculatus, Brycinus bimaculatus, Brachyalestes carolinae, Brycinus carolinae, Brachyalestes comptus, Brycinus comptus, Alestes dentex, Brycinus ferox, Brachyalestes fwaensis, Brycinus fwaensis, Brycinus humilis, Brachyalestes jacksonii, Brycinus jacksonii, Brachyalestes kingsleyae, Brycinus kingsleyae, Alestes liebrechtsii, Alestes macrophthalmus, Brycinus minutus, Brycinus nigricauda, Brycinus opisthotaenia, Brycinus peringueyi, Brycinus sadleri, Alestes stuhlmannii, Brycinus taeniurus, Alestopetersius bifasciatus, Alestopetersius brichardi, Alestopetersius caudalis, Alestopetersius compressus, Alestopetersius hilgendorfi, Alestopetersius leopoldianus, Alestopetersius nigropterus, Alestopetersius smykalai, Alestopetersius tumbensis, Arnoldichthys spilopterus, Bathyaethiops breuseghemi, Bathyaethiops caudomaculatus, Bathyaethiops greeni, Brachypetersius altus, Phenacogrammus altus, Brachypetersius cadwaladeri)",
 "HasCoordinate is true",
 "HasGeospatialIssue is false",
 "BasisOfRecord is one of (Specimen, Observation, Human Observation, Machine Observation, Material sample, Literature Occurrence, Material citation, Occurrence evidence)",
 "Geometry POLYGON ((28.1382 29.0599,19.1382 29.0599,19.1382 20.0599,28.1382 20.0599,28.1382 29.0599))"
 ]
}

 The dataset includes 0 records from 0 constituent datasets; see https://api.gbif.org/v1/occurrence/download/0031437-250827131500795/datasets/export for details.
DOI: 10.15468/dl.rpa2an
title: Occurrence Download

description: A dataset containing 968 species occurrences available in GBIF matching the query:
{
 "and" : [
 "TaxonKey is Mya arenaria",
 "Country is Norway",
 "HasCoordinate is true"
 ]
}

 The dataset includes 968 records from 20 constituent datasets; see https://api.gbif.org/v1/occurrence/download/0031438-250827131500795/datasets/export for details.
 
Data from some individual datasets included in this download may be licensed under less restrictive terms.
DOI: 10.34810/data735
title: Biological effects of cytotoxic inflammatory proteins formulated as self-assembling, protein-only nanoparticles

description: Data describing the biological effects of cytotoxic inflammatory proteins formulated as self-assembling, protein-only nanoparticles
description: METHODOLOGICAL INFORMATION

1. Description of methods used for collection-generation of data: 
Methods are standard and generically described in 
Elisa Rioja-Blanco, Irene Arroyo-Solera, Patricia Álamo, Isolda Casanova, Alberto Gallardo, Ugutz Unzueta, Naroa Serna, Laura Sánchez-García, Miquel Quer, Antonio Villaverde, Esther Vázquez, Ramon Mangues, Lorena Alba-Castellón, Xavier León,
Self-assembling protein nanocarrier for selective delivery of cytotoxic polypeptides to CXCR4+ head and neck squamous cell carcinoma tumors,
Acta Pharmaceutica Sinica B,
Volume 12, Issue 5,
2022,
Pages 2578-2591,
ISSN 2211-3835,
https://doi.org/10.1016/j.apsb.2021.09.030.
(https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S2211383521003919)

2. Methods for processing the data: 
Standard statistical methods.

3. Instrument- or software- specific information needed to interpret the data:
Microsoft excel
description: Microsoft Excel, null
DOI: 10.15468/dl.jc7kmw
title: Occurrence Download

description: A dataset containing 1 species occurrences available in GBIF matching the query:
{
 "and" : [
 "TaxonKey is Desmodium incanum",
 "Country is Kiribati",
 "HasCoordinate is true"
 ]
}

 The dataset includes 1 records from 1 constituent datasets; see https://api.gbif.org/v1/occurrence/download/0031439-250827131500795/datasets/export for details.
 
Data from some individual datasets included in this download may be licensed under less restrictive terms.
DOI: 10.15468/dl.a964ug
title: Occurrence Download

description: A dataset containing 1 species occurrences available in GBIF matching the query:
{
 "and" : [
 "TaxonKey is Desmodium incanum",
 "Country is Liberia",
 "HasCoordinate is true"
 ]
}

 The dataset includes 1 records from 1 constituent datasets; see https://api.gbif.org/v1/occurrence/download/0031441-250827131500795/datasets/export for details.
 
Data from some individual datasets included in this download may be licensed under less restrictive terms.
DOI: 10.15468/dl.yhvb8g
title: Occurrence Download

description: A dataset containing 2184 species occurrences available in GBIF matching the query:
{
 "and" : [
 "TaxonKey is Mya arenaria",
 "Country is Sweden",
 "HasCoordinate is true"
 ]
}

 The dataset includes 2184 records from 19 constituent datasets; see https://api.gbif.org/v1/occurrence/download/0031440-250827131500795/datasets/export for details.
 
Data from some individual datasets included in this download may be licensed under less restrictive terms.
DOI: 10.57745/kosfxa
title: 4-month-old-Behavior_Data.csv

description: :unav
DOI: 10.57745/mqnsgg
title: Behavior_Metadata_lamb.txt

description: :unav
DOI: 10.57745/ef4mk2
title: 3-month-old-Behavior_Data.csv

description: :unav
DOI: 10.15468/dl.setcc7
title: Occurrence Download

description: A dataset containing 2541 species occurrences available in GBIF matching the query:
{
 "and" : [
 "TaxonKey is Mya arenaria",
 "Country is Germany",
 "HasCoordinate is true"
 ]
}

 The dataset includes 2541 records from 44 constituent datasets; see https://api.gbif.org/v1/occurrence/download/0031442-250827131500795/datasets/export for details.
 
Data from some individual datasets included in this download may be licensed under less restrictive terms.
DOI: 10.57745/w81fbd
title: Animal_Metadata_lamb.txt

description: :unav
DOI: 10.57745/dfdgt8
title: Animal_Data_lamb2.tab

description: :unav
DOI: 10.57745/aiyzuv
title: Behavioral Measures on lambs Exposed to Olfactory Stimuli in a Positive Context

description: The dataset presented comes from an experimental study on the behavioral responses of lambs exposed to olfactory stimuli in a positive context. The study involved 30 lambs aged 3 months and 30 lambs aged 4 months, Ile-de-France. The animals were categorized based on age and sex (see the Animal_Data_lamb file). They were born at the UEPAO (Unité Expérimentale de Physiologie Animale de l'Orfrasière, INRAE, Nouzilly; doi:10.15454/1.5573896321728955E12). This individual behavioral test was conducted over a 5-minute period, during which each lamb was placed in an experimental setup containing a social resource (three companions) and a food resource, aiming to create a positive context. The lambs were exposed to various olfactory stimuli to study their behavioral responses, including water (control condition), wolf feces (repulsive), orange essential oil (attractive), and cadaverine (repulsive). The dataset includes detailed behavioral measurements, such as the total time spent in the food zone (Food_Zone_TS), the number of eating occurrences (Eat_Total_Occ), the time spent in the social zone (Social_Zone_TS), and vocalizations (Voc_Occ), recorded during exposure to the different olfactory stimuli. Additional variables, such as food intake, were also measured to assess the behavioral responses of the ewes (see the Behavioral_Data files). The behaviors were analyzed using video recordings processed with BORIS software.
DOI: 10.17026/dans-x7v-d4xd
title: Absdale Tolweg 109 Absdale Tolweg 109, gemeente Hulst. Archeologisch Bureauonderzoek en Inventariserend Veldonderzoek door middel van verkennende boringen

description: &lt;p&gt;Artefact! Advies en Onderzoek in Erfgoed heeft in juni 2016 een Archeologisch Bureauonderzoek en een Inventariserend Veldonderzoek uitgevoerd binnen een plangebied aan de Tolweg 109 te Absdale, gemeente Hulst. De initiatiefnemer heeft het voornemen om aan de Tolweg 109 te Absdale een nieuw bowlingcentrum te realiseren. De geplande uitbreiding heeft een oppervlakte van 800 vierkante meter. Ten behoeve van de geplande uitbreiding is een bestemmingsplanwijziging noodzakelijk. Gelijk oplopend met de bestemmingsplanprocedure zal een omgevingsvergunning worden aangevraagd. De oppervlakte van het gehele plangebied bedraagt 12.000 vierkante meter.&lt;/p&gt;&lt;p&gt;Op basis van de beschikbare aardwetenschappelijke, archeologische en historische gegevens werd in het Archeologisch Bureauonderzoek een gespecificeerd archeologisch verwachtingsmodel opgesteld. Tijdens het Inventariserend Veldonderzoek door middel van verkennende boringen werd het opgestelde verwachtingsmodel middels 9 boringen (tot maximaal 1,9 meter beneden maaiveld) getoetst. Tijdens het booronderzoek werd vastgesteld dat de oorspronkelijke dekzandtop van het Laagpakket van Wierden niet meer intact aanwezig is. Onder een (recent) ophoogpakket en de geploegde a-horizont werd in alle boringen de C-horizont waargenomen. In twee boringen werd nog een restant van een BC-horizont waargenomen. Paleosols werden tot een diepte van 1,9 meter beneden maaiveld niet vastgesteld.&lt;/p&gt;&lt;p&gt;Naar aanleiding van de resultaten van het booronderzoek kon het opgestelde verwachtingsmodel worden verfijnd en bijgesteld. Samengevat kan gesteld worden dat: - de verwachting op het aantreffen van vindplaatsen uit het Finaal Paleolithicum middelhoog geacht wordt. Paleosols werden niet vastgesteld binnen de boordiepte. Indien aanwezig dan bevinden deze zich in ieder geval dieper dan 1,90 meter beneden maaiveld; - de verwachting op het aantreffen van (god bewaarde) vindplaatsen uit het Mesolithicum laag wordt geacht; - de verwachting op het aantreffen van vindplaatsen uit het Neolithicum hoog wordt geacht; - vindplaatsen die gekenmerkt worden door (dieper) ingegraven sporen echter wel nog aanwezig kunnen zijn. De verwachting op vindplaatsen uit de Bronstijd, IJzertijd, Romeinse Tijd en Vroege Middeleeuwen wordt middelhoog geacht; - de verwachting op het aantreffen van vindplaatsen uit de Late Middeleeuwen hoog wordt geacht; - de verwachting op het aantreffen van vindplaatsen uit de Nieuwe Tijd laag wordt laag geacht;&lt;/p&gt;
DOI: 10.17026/dans-2z5-uxbf
title: Kapelle Bruëlisstraat 107 Kapelle Bruëlisstraat 107. Gemeente Kapelle. Archeologisch Bureauonderzoek en Inventariserend Veldonderzoek door middel van verkennende boringen

description: &lt;p&gt;Het voornemen ia om het bestaande woonzorgcomplex aan de Bruëlisstraat uit te breiden. Uit een studie blijkt dat voorgenomen uitbreiding niet past binnen het vigerende bestemmingsplan. In het kader van de hiertoe benodigde bestemmingsplanwijziging heeft Artefact! Advies en Onderzoek in Erfgoed een Archeologisch Bureauonderzoek en een Inventariserend Veldonderzoek door middel van verkennende boringen uitgevoerd.&lt;/p&gt;&lt;p&gt;In het kader van het bureauonderzoek werd een groot aantal bronnen bestudeerd die geleid hebben tot een gespecificeerd verwachtingsmodel voor het plangebied. Dit model werd vervolgens getoetst door het uitvoeren van een verkennend booronderzoek. Op basis van de resultaten van dit onderzoek kan gesteld worden dat: - Het plangebied gesitueerd is aan de rand van een brede getij-inversierug, waar ook oudere niveaus zoals het Hollandveen en fluviatiele afzettingen van de Oosterschelde onder de jongste getijdenafzettingen zijn waargenomen; - Binnen het gehele plangebied een middelhoge verwachting geldt op het voorkomen van vindplaatsen uit de Middeleeuwen en deze verwachting is te situeren in de top van het Laagpakket van Walcheren;  Binnen het gehele plangebied een lage verwachting geldt op het voorkomen van vindplaatsen uit jongere of oudere periodes dan de Middeleeuwen; - Binnen het plangebied de toplaag van de bodem enigszins verstoord is door grondgebruik en de latere inrichting van het plangebied als woonzone, maar dat de verstoring (behoudens ter plaatse van de bestaande bebouwing) als lokaal en beperkt moet worden beschouwd.&lt;/p&gt;
DOI: 10.15468/dl.q5s5xu
title: Occurrence Download

description: A dataset containing 173 species occurrences available in GBIF matching the query:
{
 "DatasetKey" : [
 "is Killer whales of the Caribbean Sea 1866-2012"
 ]
}

 The dataset includes 173 records from 1 constituent datasets; see https://api.gbif.org/v1/occurrence/download/0031443-250827131500795/datasets/export for details.
 
Data from some individual datasets included in this download may be licensed under less restrictive terms.
DOI: 10.17026/dans-z3n-ds9a
title: Wolphaartsdijk Veerweg 30 Wolphaartsdijk Veerweg 30. Gemeente Goes. Inventariserend Veldonderzoek door middel van verkennende boringen

description: &lt;p&gt;Artefact! Advies en Onderzoek in Erfgoed heeft een Inventariserend Veldonderzoek door middel van verkennende boringen uitgevoerd binnen een plangebied aan de Veerweg 30 te Wolphaartsdijk. De aanleiding tot het onderzoek wordt gevormd door het voornemen van de eigenaar om binnen het plangebied de bestaande bebouwing te verbouwen en uit te breiden. Mogelijk wordt ook de bestaande vijver uitgebreid. Het plangebied omvat (een deel van) het perceel dat kadastraal bekend staat onder Gemeente Goes, Sectie AE, Perceel 914, de nieuwbouw beslaat een oppervlakte van circa 300 vierkante meter, de vijveruitbreiding 95 m2.. Omdat de vigerende vrijstellingsgrenzen worden overschreden werd in het kader van de noodzakelijke omgevingsvergunning voorliggend archeologisch onderzoek uitgevoerd.&lt;/p&gt;&lt;p&gt;Artefact heeft in 2017, in opdracht van de Gemeente Goes, een uitgebreid Archeologisch Bureauonderzoek opgesteld waarin de bebouwde kom van Wolphaartsdijk is opgenomen. Ook het huidige plangebied maakt deel uit van dit gebied. In het voorliggende rapport werd op basis van dit bureauonderzoek, aangevuld met gebiedseigen informatie, een gespecificeerd verwachtingsmodel voor het plangebied opgenomen. Dit model werd vervolgens getoetst door het uitvoeren van een Inventariserend Veldonderzoek door middel van verkennende boringen. Op basis van de resultaten dit onderzoek kan gesteld worden dat: - Binnen het gehele plangebied een lage verwachting geldt op het voorkomen van vindplaatsen vanaf het neolithicum tot en met de midden ijzertijd, de vroege en late middeleeuwen en de nieuwe tijd.&lt;br&gt;- Er geen verwachting geldt voor resten uit de late ijzertijd en Romeinse tijd.&lt;/p&gt;
DOI: 10.5281/zenodo.16927653
title: Cylindrically Converging Shocks Interacting with a Cylindrical Bubble: High-Speed Image and Electrical Data

description: These data were acquired during experiments at ID19 of the European Synchrotron Radiation Facility (ESRF), in which a high-voltage, high-current pulsed power driver was used to generate microsecond explosions of thin copper wire arrays immersed in a water-gelatine solution. These explosions create cylindrically converging shock waves (SWs), which interact with cylindrical air bubbles. Two different experiments are included: (1) a purely azimuthally symmetric, cylindrically converging SW impinging on a coaxial cylindrical bubble; and (2) a semicylindrical converging SW, corresponding to half of the cylindrical front, interacting with the same target. In the cylindrical configuration, the array contained 32 copper wires, each with a length of 40 mm and a diameter of 50 μm. The semicylindrical configuration employed 17 copper wires, each 40 mm long and 100 μm in diameter. The bubble is 3 mm in diameter and the wire arrays are 16 mm in diameter. For each experiment, the data consist of measurements from various diagnostics of quantities related to the electrical discharge across the exploding wire arrays (captured with a Lecroy WaveRunner 8404M digital oscilloscope), as well as subsequent high-speed shadowgraph camera images (recorded with two synchronized Shimadzu HPV-X2). The current was measured using a Rogowski coil, and the voltage was measured with a P6015A Tektronix high-voltage probe. Time is in seconds, resistive voltage in volts, current in amperes, power in watts, and energy in joules. Time synchronization: Oscilloscope and image data are aligned to a common zero-time reference.Spatial scaling: Shadowgraph images have a resolution of 32 μm/pixel.
DOI: 10.6084/m9.figshare.29877361
title: Mutation-specific structural changes in BRAF: understanding dimerization and drug binding for targeted therapy

description: The dimerization of BRAF with CRAF is a critical regulatory mechanism within the MAPK/ERK signaling cascade, and its disruption by mutations in the BRAF kinase domain contributes to tumorigenesis across various cancers. While wild-type BRAF depends on RAS-mediated dimerization for activation, oncogenic mutations alter this dependency, impacting structural conformation, ATP/drug binding, and downstream signaling. Despite extensive functional data, the structural and biophysical consequences of these mutations remain poorly defined. Here, we examine five BRAF mutations oncogenic (V600E, G469E, D594G) and benign (N581S, E586K) through molecular dynamics simulations, ATP-binding assessments, and drug interaction analyses involving Sorafenib and U0126. Our results suggest that V600E stabilizes the activation loop in an active, monomeric form, bypassing dimerization and conferring resistance to Sorafenib. G469E retains dimerization dependence, shows intermediate activity, and exhibits moderate drug responsiveness. D594G, a kinase-inactive mutant, functions as a scaffold for CRAF activation, with transient ATP-induced stabilization but minimal Sorafenib sensitivity. Benign variants maintain wild-type-like structural integrity, dimer stability, and inhibitor response. Simulations highlight mutation-specific effects on key regions, including the P-loop, DFG motif, and catalytic loop, and reveal distinct conformational landscapes through free energy and compactness analyses. Our findings provide a mechanistic framework linking structure to function in BRAF mutants, supporting mutation-guided therapeutic strategies in precision oncology.
DOI: 10.6084/m9.figshare.29877361.v1
title: Mutation-specific structural changes in BRAF: understanding dimerization and drug binding for targeted therapy

description: The dimerization of BRAF with CRAF is a critical regulatory mechanism within the MAPK/ERK signaling cascade, and its disruption by mutations in the BRAF kinase domain contributes to tumorigenesis across various cancers. While wild-type BRAF depends on RAS-mediated dimerization for activation, oncogenic mutations alter this dependency, impacting structural conformation, ATP/drug binding, and downstream signaling. Despite extensive functional data, the structural and biophysical consequences of these mutations remain poorly defined. Here, we examine five BRAF mutations oncogenic (V600E, G469E, D594G) and benign (N581S, E586K) through molecular dynamics simulations, ATP-binding assessments, and drug interaction analyses involving Sorafenib and U0126. Our results suggest that V600E stabilizes the activation loop in an active, monomeric form, bypassing dimerization and conferring resistance to Sorafenib. G469E retains dimerization dependence, shows intermediate activity, and exhibits moderate drug responsiveness. D594G, a kinase-inactive mutant, functions as a scaffold for CRAF activation, with transient ATP-induced stabilization but minimal Sorafenib sensitivity. Benign variants maintain wild-type-like structural integrity, dimer stability, and inhibitor response. Simulations highlight mutation-specific effects on key regions, including the P-loop, DFG motif, and catalytic loop, and reveal distinct conformational landscapes through free energy and compactness analyses. Our findings provide a mechanistic framework linking structure to function in BRAF mutants, supporting mutation-guided therapeutic strategies in precision oncology.
DOI: 10.15468/dl.ta95ns
title: Occurrence Download

description: A dataset containing 0 species occurrences available in GBIF matching the query:
{
 "and" : [
 "TaxonKey is one of (Tropodiaptomus stuhlmanni, Typhlocaris lethaea, Typhlopatsa pauliani)",
 "HasCoordinate is true",
 "HasGeospatialIssue is false",
 "BasisOfRecord is one of (Specimen, Observation, Human Observation, Machine Observation, Material sample, Literature Occurrence, Material citation, Occurrence evidence)",
 "Geometry POLYGON ((44.5146 10.8961,44.3186 11.0599,37.1382 11.0599,37.1382 2.0599,46.1382 2.0599,46.1382 11.0599,45.0861 11.0599,44.7982 10.9157,44.5146 10.8961))"
 ]
}

 The dataset includes 0 records from 0 constituent datasets; see https://api.gbif.org/v1/occurrence/download/0031445-250827131500795/datasets/export for details.
DOI: 10.15468/dl.dr77qy
title: Occurrence Download

description: A dataset containing 14292 species occurrences available in GBIF matching the query:
{
 "and" : [
 "TaxonKey is Mikania micrantha",
 "HasCoordinate is true",
 "HasGeospatialIssue is false",
 "Geometry POLYGON((-180 -90, 180 -90, 180 90, -180 90, -180 -90))"
 ]
}

 The dataset includes 14292 records from 308 constituent datasets; see https://api.gbif.org/v1/occurrence/download/0031444-250827131500795/datasets/export for details.
 
Data from some individual datasets included in this download may be licensed under less restrictive terms.