cometadata/datacite-titles-descriptions-related-identifiers huggingface dataset:
DOI: 10.15468/dl.km3cnj
title: Occurrence Download

description: A dataset containing 2283 species occurrences available in GBIF matching the query:
{
 "and" : [
 "TaxonKey is Willisornis vidua",
 "DecimalLongitude is not null",
 "DecimalLatitude is not null"
 ]
}

 The dataset includes 2283 records from 9 constituent datasets; see https://api.gbif.org/v1/occurrence/download/0063485-251120083545085/datasets/export for details.
 
Data from some individual datasets included in this download may be licensed under less restrictive terms.
DOI: 10.60502/soildata/kbpvxc
title: Levantamento de reconhecimento dos solos da Região Sul-Sudeste do Estado do Amazonas

description: Conjunto de dados públicos do solo originalmente obtidos do Sistema de Informação de Solos Brasileiros (SISB), construído e mantido pela Embrapa Solos (Rio de Janeiro) e Embrapa Informática Agropecuária (Campinas), referente ao Levantamento de reconhecimento dos solos da região sul-sudeste do Estado do Amazonas-IPAAM. Dados de localização espacial de observações do solo sem coordenadas espaciais foram completados usando dados produzidos por Cooper et al. (2005) e publicados no artigo 'A national soil profile database for Brazil available to international scientists' do Soil Science Society of America Journal, ou então usando os dados de localização descritiva para inferir sobre as coordenadas espaciais mais prováveis usando serviços de mapas online como o Google Maps e o Google Earth. Erros e inconsistências nos dados das coordenadas espaciais das observações foram corrigidos manualmente visualizando as respectivas observações no Google Maps. Nos casos em que dados sobre o sistema de coordenadas de referência não estava disponível, adotou-se o WGS 84 como datum padrão. Também foram corrigidos erros e inconsistências, e realizadas atualizações no nome do município e código da unidade federativa onde as observações foram realizadas. Dados do conteúdo de ferro apresentando valores discrepantes foram corrigidos depois de consultar o relatório do levantamento do solo onde originalmente foram publicados. A fim de preservar a conexão dos dados com o SISB, usa-se o mesmo código de identificação daquele sistema para o conjunto de dados, assim como o código de identificação de cada observação corresponde ao código do perfil do solo no SISB e o código das amostras corresponde ao código dos horizontes. Todas os demais dados são mantidos como dados adicionais para facilitar o reuso do conjunto de dados como um todo. Nenhum item técnico-científico do SISB e seu respectivo banco de dados que seja fruto da atividade intelectual, criativa, inovadora e inédita dos projetos conduzidos pela Embrapa foi ou é usado para organizar estruturalmente a presente versão do conjunto de dados. O emprego deste conjunto de dados para finalidades profissionais e/ou comerciais deve ser precedido pelo contato com a Embrapa.
DOI: 10.60502/soildata/w9mvis
title: Conjunto de dados do 'Caracterização de ambientes na Chapada dos Veadeiros / Vale do Rio Paranã: Contribuição para a classificação brasileira de solos'

description: Conjunto de dados públicos do solo originalmente obtidos do Sistema de Informação de Solos Brasileiros (SISB), construído e mantido pela Embrapa Solos (Rio de Janeiro) e Embrapa Informática Agropecuária (Campinas), referente ao 'Caracterização de Ambientes na Chapada dos Veadeiros / Vale do Rio Paranã: Contribuição para a Classificação Brasileira de Solos'. Dados de localização espacial de observações do solo sem coordenadas espaciais foram completados usando dados produzidos por Cooper et al. (2005) e publicados no artigo 'A national soil profile database for Brazil available to international scientists' do Soil Science Society of America Journal, ou então usando os dados de localização descritiva para inferir sobre as coordenadas espaciais mais prováveis usando serviços de mapas online como o Google Maps e o Google Earth. Erros e inconsistências nos dados das coordenadas espaciais das observações foram corrigidos manualmente visualizando as respectivas observações no Google Maps. Nos casos em que dados sobre o sistema de coordenadas de referência não estava disponível, adotou-se o WGS 84 como datum padrão. Também foram corrigidos erros e inconsistências, e realizadas atualizações no nome do município e código da unidade federativa onde as observações foram realizadas. Dados do conteúdo de ferro apresentando valores discrepantes foram corrigidos depois de consultar o relatório do levantamento do solo onde originalmente foram publicados. A fim de preservar a conexão dos dados com o SISB, usa-se o mesmo código de identificação daquele sistema para o conjunto de dados, assim como o código de identificação de cada observação corresponde ao código do perfil do solo no SISB e o código das amostras corresponde ao código dos horizontes. Todas os demais dados são mantidos como dados adicionais para facilitar o reuso do conjunto de dados como um todo. Nenhum item técnico-científico do SISB e seu respectivo banco de dados que seja fruto da atividade intelectual, criativa, inovadora e inédita dos projetos conduzidos pela Embrapa foi ou é usado para organizar estruturalmente a presente versão do conjunto de dados. O emprego deste conjunto de dados para finalidades profissionais e/ou comerciais deve ser precedido pelo contato com a Embrapa.
DOI: 10.60502/soildata/eykwyv
title: Mapeamento digital de solos por regressão logística múltipla em ambiente de mar de Morros em Pinheiral, RJ

description: Conjunto de dados produzido como parte da Dissetação submetida como requisito parcial para obtenção do grau de Mestre no Curso de Pós-Graduação em Agronomia da Universidade Federal Rural do Rio de Janeiro. Inclui dados do conteúdo de ferro total determinado via extração com solução de ácido sulfúrico para 20 perfis do solo observados no município de Pinheiral (RJ). Com base no conhecimento da área de estudo, a partir de informações prévias sobre o meio físico e solo, foram selecionados pontos representativos que contemplassem a variação dos fatores de formação do solo. Foram abertas tricheiras para descrição dos perfis e coleta de amostras dos horizontes para caracterização do solo segundo procedimentos descritos no Manual de Descrição e Coleta de Solo no Campo (Santos et al., 2013). Devido à existência de limitações orçamentárias, apenas amostras de horizontes selecionados foram submetidos à determinação do conteúdo de ferro total. Em alguns casos apenas os horizontes B diagnósticos foram analisados, em outros o primeiro horizonte A e um ou mais horizontes subsuperficiais.
DOI: 10.60502/soildata/ydqsgs
title: Conjunto de dados do levantamento de reconhecimento 'Projeto de irrigação e drenagem da cana-de-açúcar na Região Norte-fluminense'

description: Conjunto de dados públicos do solo originalmente obtidos do Sistema de Informação de Solos Brasileiros (SISB), construído e mantido pela Embrapa Solos (Rio de Janeiro) e Embrapa Informática Agropecuária (Campinas), referente ao levantamento de reconhecimento 'Projeto de Irrigação e Drenagem da Cana-de-açúcar na Região Norte-fluminense.'. Dados de localização espacial de observações do solo sem coordenadas espaciais foram completados usando dados produzidos por Cooper et al. (2005) e publicados no artigo 'A national soil profile database for Brazil available to international scientists' do Soil Science Society of America Journal, ou então usando os dados de localização descritiva para inferir sobre as coordenadas espaciais mais prováveis usando serviços de mapas online como o Google Maps e o Google Earth. Erros e inconsistências nos dados das coordenadas espaciais das observações foram corrigidos manualmente visualizando as respectivas observações no Google Maps. Nos casos em que dados sobre o sistema de coordenadas de referência não estava disponível, adotou-se o WGS 84 como datum padrão. Também foram corrigidos erros e inconsistências, e realizadas atualizações no nome do município e código da unidade federativa onde as observações foram realizadas. Dados do conteúdo de ferro apresentando valores discrepantes foram corrigidos depois de consultar o relatório do levantamento do solo onde originalmente foram publicados. A fim de preservar a conexão dos dados com o SISB, usa-se o mesmo código de identificação daquele sistema para o conjunto de dados, assim como o código de identificação de cada observação corresponde ao código do perfil do solo no SISB e o código das amostras corresponde ao código dos horizontes. Todas os demais dados são mantidos como dados adicionais para facilitar o reuso do conjunto de dados como um todo. Nenhum item técnico-científico do SISB e seu respectivo banco de dados que seja fruto da atividade intelectual, criativa, inovadora e inédita dos projetos conduzidos pela Embrapa foi ou é usado para organizar estruturalmente a presente versão do conjunto de dados. O emprego deste conjunto de dados para finalidades profissionais e/ou comerciais deve ser precedido pelo contato com a Embrapa.
DOI: 10.60502/soildata/ytnvdw
title: Levantamento de reconhecimento dos solos do Oeste do Estado do Paraná (informe preliminar)

description: Conjunto de dados públicos do solo originalmente obtidos do Sistema de Informação de Solos Brasileiros (SISB), construído e mantido pela Embrapa Solos (Rio de Janeiro) e Embrapa Informática Agropecuária (Campinas), referente ao 'Levantamento de Reconhecimento dos Solos do Oeste do Estado do Paraná (Informe Preliminar)'. Dados de localização espacial de observações do solo sem coordenadas espaciais foram completados usando dados produzidos por Cooper et al. (2005) e publicados no artigo 'A national soil profile database for Brazil available to international scientists' do Soil Science Society of America Journal, ou então usando os dados de localização descritiva para inferir sobre as coordenadas espaciais mais prováveis usando serviços de mapas online como o Google Maps e o Google Earth. Erros e inconsistências nos dados das coordenadas espaciais das observações foram corrigidos manualmente visualizando as respectivas observações no Google Maps. Nos casos em que dados sobre o sistema de coordenadas de referência não estava disponível, adotou-se o WGS 84 como datum padrão. Também foram corrigidos erros e inconsistências, e realizadas atualizações no nome do município e código da unidade federativa onde as observações foram realizadas. Dados do conteúdo de ferro apresentando valores discrepantes foram corrigidos depois de consultar o relatório do levantamento do solo onde originalmente foram publicados. A fim de preservar a conexão dos dados com o SISB, usa-se o mesmo código de identificação daquele sistema para o conjunto de dados, assim como o código de identificação de cada observação corresponde ao código do perfil do solo no SISB e o código das amostras corresponde ao código dos horizontes. Todas os demais dados são mantidos como dados adicionais para facilitar o reuso do conjunto de dados como um todo. Nenhum item técnico-científico do SISB e seu respectivo banco de dados que seja fruto da atividade intelectual, criativa, inovadora e inédita dos projetos conduzidos pela Embrapa foi ou é usado para organizar estruturalmente a presente versão do conjunto de dados. O emprego deste conjunto de dados para finalidades profissionais e/ou comerciais deve ser precedido pelo contato com a Embrapa.
DOI: 10.15468/dl.36br89
title: Occurrence Download

description: A dataset listing the 1116000 species recorded in GBIF matching the query:
{
 "TaxonKey" : [
 "is Plantae"
 ]
}

 The dataset's 1116000 records were derived from 19365 constituent datasets; see https://api.gbif.org/v1/occurrence/download/0063481-251120083545085/datasets/export for details.
 
Data from some individual datasets included in this download may be licensed under less restrictive terms.
DOI: 10.6084/m9.figshare.29281931
title: The final scores and analysis

description: To evaluate changes in drawing quality, an analytical rubric was developed with criteria targeting specific aspects of line and volumetric representation. Drawings were categorized into performance bands (low, mid, high) to support subgroup comparisons. Paired data structure enabled analysis of within-subject improvements and clearer mapping of individual development trajectories.
DOI: 10.6084/m9.figshare.29281931.v2
title: The final scores and analysis

description: To evaluate changes in drawing quality, an analytical rubric was developed with criteria targeting specific aspects of line and volumetric representation. Drawings were categorized into performance bands (low, mid, high) to support subgroup comparisons. Paired data structure enabled analysis of within-subject improvements and clearer mapping of individual development trajectories.
DOI: 10.6084/m9.figshare.29281931.v1
title: The final scores and analysis

description: To evaluate changes in drawing quality, an analytical rubric was developed with criteria targeting specific aspects of line and volumetric representation. Drawings were categorized into performance bands (low, mid, high) to support subgroup comparisons. Paired data structure enabled analysis of within-subject improvements and clearer mapping of individual development trajectories.
DOI: 10.15468/dl.g7xp34
title: Occurrence Download

description: A dataset containing 0 species occurrences available in GBIF matching the query:
{
 "and" : [
 "TaxonKey is Atherina boyeri Risso, 1810",
 "HasCoordinate is true",
 "HasGeospatialIssue is false",
 "BasisOfRecord is one of (Specimen, Living Specimen, Observation, Human Observation, Machine Observation, Material sample, Literature Occurrence, Material citation, Occurrence evidence)",
 "Geometry POLYGON ((44.5146 10.8961,44.3186 11.0599,37.1382 11.0599,37.1382 2.0599,46.1382 2.0599,46.1382 11.0599,45.0861 11.0599,44.7982 10.9157,44.5146 10.8961))"
 ]
}

 The dataset includes 0 records from 0 constituent datasets; see https://api.gbif.org/v1/occurrence/download/0056703-250525065834625/datasets/export for details.
DOI: 10.15468/dl.stx8p6
title: Occurrence Download

description: A dataset containing 0 species occurrences available in GBIF matching the query:
{
 "and" : [
 "TaxonKey is Characiopsis A.Borzì, 1895",
 "HasCoordinate is true",
 "HasGeospatialIssue is false",
 "BasisOfRecord is one of (Specimen, Living Specimen, Observation, Human Observation, Machine Observation, Material sample, Literature Occurrence, Material citation, Occurrence evidence)",
 "Geometry POLYGON ((32.064 -28.9416,32.4847 -28.5786,30.5701 -28.5786,30.5701 -30.7329,30.6252 -30.6659,31.4179 -29.4257,31.8178 -29.0299,32.064 -28.9416))"
 ]
}

 The dataset includes 0 records from 0 constituent datasets; see https://api.gbif.org/v1/occurrence/download/0056704-250525065834625/datasets/export for details.
DOI: 10.5281/zenodo.15148999
title: Optimized Geometries for Enabling Next Generation Enzyme Mimics Through Local Electric Field Control in Organic Cage Catalysts

description: This dataset contains geometry files (.xyz) used to investigate the effects of external and local electric fields on molecular cages and their reactivity. It includes optimized structures of 14 distinct cage molecules, as well as geometries of cage 1 under a range of electric field strengths and directions. All files are in standard .xyz format and the data are structured as follows:

1. 1ac1_1/ — Substituted Cages (No Field)

This folder contains .xyz files labeled 1.xyz through 14.xyz, each representing a different substituted molecular cage with an anhydride moiety inside the cage. All structures are optimized in the absence of external electric fields.

2. explicit_field/ — Cage 1 Under Uniform Electric Fields

This folder contains geometries of cage 1 optimized under externally applied uniform electric fields of varying strengths and directions (measured in volts per ångström, V/Å). It includes two subdirectories:





opt-TS/: Optimized transition state (TS) geometries of cage 1 under electric fields ranging from –0.25 V/Å to +0.35 V/Å.




six_in_1ac1_1/: Optimized reactant complex geometries of cage 1 under the same range of electric fields. 



 

3. local_field/ — Cages 1–14 Under Local Electric Fields

This folder includes optimized geometries of all 14 substituted cages under local (non-uniform) electric field conditions. It contains two subdirectories:





opt-TS/: Optimized transition state geometries for cages 1–14 (1.xyz to 14.xyz) under local fields.




six_in_1ac1_1/: Corresponding reactant complex geometries under local field conditions, also for cages 1–14.
DOI: 10.6084/m9.figshare.29269475
title: <i>S. venezuelae</i> plate growth assay 2025

description: To investigate the phenotypic characteristics, the growth rate and the timing of sporulation onset in the <i>S. venezuelae</i> <i>hupS</i>ΔCTD::<i>apra</i> mutants, a plate growth assay was performed. Spore samples of the four mutants FH04, FH08, FH10 and FH11 as well as the <i>S. venezuelae</i> WT and ∆<i>hupS</i> were diluted to the same initial OD of 0,05-0,06 and inoculated onto separate sectors of a MYM agar plate without antibiotics. The plate was incubated at 30°C for 52,5 hours in a sealed growth chamber. To monitor bacterial growth, the plate was automatically imaged every 30 minutes. The images starting from 19,5 hours up to 52,5 hours were compiled to generate this time-lapse video.
DOI: 10.6084/m9.figshare.29269475.v1
title: <i>S. venezuelae</i> plate growth assay 2025

description: To investigate the phenotypic characteristics, the growth rate and the timing of sporulation onset in the <i>S. venezuelae</i> <i>hupS</i>ΔCTD::<i>apra</i> mutants, a plate growth assay was performed. Spore samples of the four mutants FH04, FH08, FH10 and FH11 as well as the <i>S. venezuelae</i> WT and ∆<i>hupS</i> were diluted to the same initial OD of 0,05-0,06 and inoculated onto separate sectors of a MYM agar plate without antibiotics. The plate was incubated at 30°C for 52,5 hours in a sealed growth chamber. To monitor bacterial growth, the plate was automatically imaged every 30 minutes. The images starting from 19,5 hours up to 52,5 hours were compiled to generate this time-lapse video.
DOI: 10.5281/zenodo.15697367
title: Datasets of the scientific paper "Natural variation of response to glyphosate in Sinapis alba (Brassicaceae): physiological effects, shikimate accumulation and genetic mechanisms"

description: Description of the data and file structure

This study has been made with a total of XX individuals belonging to 25 different populations from the south of the iberian peninsula.

In the datasets, you can find the data we have worked with, including physiological parameters (photosynthetic rate, chlorophyll content, SLA, and shikimate accumulation) as well as genetic data (EPSPS gene copy number and expression levels of the EPSPS and ABCC8 genes).

Files and variables

File: exposed_parameters.xlsx

Description: dataset including the results of all variables in glyphosate exposed plants.

Variables





accessions




chlorophyll content




photosynthetic rate




sla




shikimate accumulation




EPSPS expression level




ABCC8 expression leve




EPSPS copy number




survival




seed production



File: physiological_parameters.xlsx

Description: dataset including the physiological variables studied in both glyphosate-exposed and control plants.

Variables





Population




Accession




Replica




Treatment




Photosynthetic rate




Chlorophyll content




SLA



File: shikimate_quantification.xlsx

Description: dataset including measurements of shikimate quantification in plants exposed and not exposed to glyphosate

Variables





Population




Accession




Replica




Treatment




Shikimate quantification
DOI: 10.15468/dl.qkstgb
title: Occurrence Download

description: A dataset containing 747 species occurrences available in GBIF matching the query:
{
 "and" : [
 "Country is Spain",
 "TaxonKey is Zapornia parva (Scopoli, 1769)",
 "Year 2019-2024"
 ]
}

 The dataset includes 747 records from 5 constituent datasets; see https://api.gbif.org/v1/occurrence/download/0056705-250525065834625/datasets/export for details.
 
Data from some individual datasets included in this download may be licensed under less restrictive terms.
DOI: 10.15468/dl.8kpbtk
title: Occurrence Download

description: A dataset containing 747 species occurrences available in GBIF matching the query:
{
 "and" : [
 "Country is Spain",
 "TaxonKey is Zapornia parva (Scopoli, 1769)",
 "Year 2019-2024"
 ]
}

 The dataset includes 747 records from 5 constituent datasets; see https://api.gbif.org/v1/occurrence/download/0056706-250525065834625/datasets/export for details.
 
Data from some individual datasets included in this download may be licensed under less restrictive terms.
DOI: 10.15468/dl.6vbws9
title: Occurrence Download

description: A dataset containing 0 species occurrences available in GBIF matching the query:
{
 "and" : [
 "TaxonKey is Atherina boyeri Risso, 1810",
 "HasCoordinate is true",
 "HasGeospatialIssue is false",
 "BasisOfRecord is one of (Specimen, Living Specimen, Observation, Human Observation, Machine Observation, Material sample, Literature Occurrence, Material citation, Occurrence evidence)",
 "Geometry POLYGON ((40.3629 -22.8988,40.7455 -22.7347,40.8996 -22.3696,40.751 -22.0066,40.3849 -21.8351,39.9523 -22.0203,39.831 -22.3517,39.978 -22.7301,40.3629 -22.8988))"
 ]
}

 The dataset includes 0 records from 0 constituent datasets; see https://api.gbif.org/v1/occurrence/download/0056708-250525065834625/datasets/export for details.
DOI: 10.6084/m9.figshare.28887965
title: The genome annotation files of <i>Cheilinus undulatus</i>

description: This genome annotation mainly includes three aspects: gene structure prediction, functional annotation, and prediction of non-coding RNA.
DOI: 10.6084/m9.figshare.28887965.v1
title: The genome annotation files of <i>Acanthopagrus latus</i>

description: This genome annotation mainly includes three aspects: gene structure prediction, functional annotation, and prediction of non-coding RNA.
DOI: 10.6084/m9.figshare.28887965.v2
title: The genome annotation files of <i>Cheilinus undulatus</i>

description: This genome annotation mainly includes three aspects: gene structure prediction, functional annotation, and prediction of non-coding RNA.
DOI: 10.15468/dl.je2wek
title: Occurrence Download

description: A dataset containing 2321 species occurrences available in GBIF matching the query:
{
 "TaxonKey" : [
 "is Lepus saxatilis F.Cuvier, 1823"
 ]
}

 The dataset includes 2321 records from 52 constituent datasets; see https://api.gbif.org/v1/occurrence/download/0056707-250525065834625/datasets/export for details.
 
Data from some individual datasets included in this download may be licensed under less restrictive terms.
DOI: 10.5281/zenodo.15697477
title: Dataset on Caravanserais and Qanat Networks in Khorasan, Iran

description: This dataset comprises 280 caravanserais and over 750 associated qanat irrigation systems in Iran's Khorasan region. Caravanserais were roadside structures that provided shelter and services to travellers, while qanats are subterranean channels designed to transport water from underground aquifers across long distances. Together, these infrastructural systems played a critical role in shaping trade, agriculture, and settlement patterns across the Iranian Plateau since ancient times.
Compiled by the EAMENA project at the University of Oxford, the dataset enables analysis of the spatial relationship between caravan routes and qanat networks, as well as the preservation status of these sites and the threats they face. It covers sites across the three Khorasan provinces and Semnan, which, although now administratively separate, historically formed part of key caravan corridors.
description: EAMENA data entry methodology