cometadata/datacite-titles-descriptions-related-identifiers huggingface dataset:
DOI: 10.5281/zenodo.17104948
title: Replication package for 'Go with the Flow: Using Data-Flow Spectra in Ensemble-Based Fault Localization'

description: Replication package for the paper titled Go with the Flow: Using Data-Flow Spectra in Ensemble-Based Fault Localization, to be submitted to FSE 2026.

This package contains the results of baseline FL (in baseline/), reduced instrumentation DUA coverage collection (in reduced_instr/), and ensemble-based FL (in ensemble/). The scripts to replicate these results are stored in scripts/ and their usage explained in README.md. The output generation and statistical testing are performed in statistical.ipynb and the output saved to figures/.
DOI: 10.5281/zenodo.17104947
title: Replication package for 'Go with the Flow: Using Data-Flow Spectra in Ensemble-Based Fault Localization'

description: Replication package for the paper titled Go with the Flow: Using Data-Flow Spectra in Ensemble-Based Fault Localization, to be submitted to FSE 2026.

This package contains the results of baseline FL (in baseline/), reduced instrumentation DUA coverage collection (in reduced_instr/), and ensemble-based FL (in ensemble/). The scripts to replicate these results are stored in scripts/ and their usage explained in README.md. The output generation and statistical testing are performed in statistical.ipynb and the output saved to figures/.
DOI: 10.15468/dl.y8f9c9
title: Occurrence Download

description: A dataset listing the 85 species recorded in GBIF matching the query:
{
 "TaxonKey" : [
 "is Phylloxeridae"
 ]
}

 The dataset's 85 records were derived from 72 constituent datasets; see https://api.gbif.org/v1/occurrence/download/0055692-250827131500795/datasets/export for details.
 
Data from some individual datasets included in this download may be licensed under less restrictive terms.
DOI: 10.17026/dans-xbu-6q8b
title: Ede Smachtenburg (fase 3) Archeologisch onderzoek naar de middeleeuwse hoeve Heijenerf

description: &lt;p&gt;Bij het onderzoek van Fase 3 zijn de resten van een omgreppeld erf uit de late middeleeuwen en vroege Nieuwe tijd aangetroffen. Het erf ligt op enkele tientallen meters ten noordwesten van het erf uit fase 1 en kan als directe opvolger daarvan worden beschouwd. De bewoning op het nieuwe erf start rond 1200 en loopt vervolgens onafgebroken door tot ca. 1600. Op basis van de archeologische gegevens kunnen op het nieuwe erf minimaal drie bouwfasen onderscheiden worden. Het erf bestond in de verschillende fasen uit een hoofdgebouw met verschillende bijgebouwen en waterputten. Van de hoofdgebouwen uit de 15e en 16e eeuw zijn geen sporen teruggevonden, vermoedelijk omdat in deze periode gebouwd werd op stiepen die geen duidelijke sporen achtergelaten hebben.&lt;/p&gt;
DOI: 10.34810/data1355
title: Replication Data for: How the heterogeneity of the severely injured brain affects hybrid diffuse optical signals: case examples and guidelines

description: Wide-spread adoption of diffuse optics in clinical settings for head injury assessment has been hindered by several factors. First, results from commercially available near-infrared spectroscopy (NIRS) devices often lack reproducibility and may produce physiologically implausible values. 
Second, significant variability exists between different systems. These limitations can be partially attributed to the physics of continuous-wave light sources, but a major culprit is the inherent heterogeneity of the head, including morphological and functional abnormalities within the tissue being probed. Our study aimed to investigate the impact of atypical tissue in injured brains on DO signals and to develop recommendations for 
avoiding data misinterpretation. Diffuse optical measurements and computed tomography (CT) scans were obtained from patients with brain injuries and stroke. The relationship between the diffuse optical signals and the underlying tissue types was analyzed on an individual patient basis.
description: RadiAnt DICOM Viewer, 2021.1, Medixant, Poland
description: Matlab, Release 2018b
DOI: 10.5281/zenodo.15693040
title: OnDemand Loop - Test
DOI: 10.5281/zenodo.15693948
title: OnDemand Loop - Test
DOI: 10.34810/data1354
title: Replication Data for “Ionic control of magnetism in all-solid-state CoOx/yttria-stabilized zirconia heterostructures”

description: This dataset contains the information on our recent body of work on the study of magneto-ionic properties in all-solid-state CoOx/yttria-stabilized zirconia heterostructures and all the relevant data files. Magneto-ionics, an emerging approach to manipulate magnetism that relies on voltage-driven ion motion, holds the promise to boost energy efficiency in information technologies such as spintronic devices or future non-von Neumann computing architectures. Most previous studies in all-solid-state magneto-ionic systems have focused on the control of interfacial magnetism of ultrathin (i.e., 1 – 3 nm) magnetic films, taking advantage of an adjacent ionic conducting oxide, usually GdOx or HfOx, that transports functional ionic species (e.g., H+ or O2?). Here, we report on room-temperature OFF-ON ferromagnetism by solid-state magneto-ionics in relatively thick (25 nm) patterned CoOx films grown on an yttria-stabilized zirconia (YSZ) layer, which acts as a dielectric to hold electric field and as an O2? ions reservoir. Upon negatively biasing, O2? ions from the CoOx tend to migrate toward the YSZ gate electrode, leading to the gradual generation of magnetization (i.e., OFF-to-ON switching of a ferromagnetic state). X-ray absorption and magnetic circular dichroism studies reveal subtle changes in the electronic/chemical characteristics, responsible for the induced magnetoelectric effects in such all-oxide heterostructures. Recovery of the initial (virtually non-magnetic) state is achieved by application of positive voltage. The study may guide future development of all-solid-state low-power CMOS-compatible magneto-ionic devices.
description: METHODOLOGICAL INFORMATION

1. Description of methods used for collection-generation of data: 
Various experimental tools were employed in this line of work, such as pulsed laser deposition and magnetron sputter for the materials growth, MOKE magnetometry for magnetic property study, X-ray absorption and magnetic circular dichroism studies reveal subtle changes in the electronic/chemical characteristics. 

2. Methods for processing the data: 
The data files can be processed using Origin software.

3. Instrument- or software- specific information needed to interpret the data:
For the magnetometry data, linear background signals were subtracted using the Durham Magneto Optics NanoMOKE3 software. 

4. Instruments, calibration and standards information:
For the XAS spectra, reference spectra from Co, Co2+ and Co3+ are collected from standard samples (i.e., Co, CoO and LaCoO3, respectively).

5. Environmental or experimental conditions:
The measurements were conducted in ambient conditions. 

6. Quality-assurance procedures performed on the data:
The results were carefully analyzed and interpreted. Peer review process of the corresponding scientific article by experts in this field has been done.
description: MS Excel, null
DOI: 10.5281/zenodo.17106392
title: Artifacts of the paper under review
DOI: 10.5281/zenodo.17106391
title: Artifacts of the paper under review
DOI: 10.15468/dl.nra6vw
title: Occurrence Download

description: A dataset containing 38 species occurrences available in GBIF matching the query:
{
 "and" : [
 "HasCoordinate is true",
 "HasGeospatialIssue is false",
 "TaxonKey is Picumnus pygmaeus",
 "BasisOfRecord is Specimen"
 ]
}

 The dataset includes 38 records from 13 constituent datasets; see https://api.gbif.org/v1/occurrence/download/0055729-250827131500795/datasets/export for details.
 
Data from some individual datasets included in this download may be licensed under less restrictive terms.
DOI: 10.6084/m9.figshare.30112405.v1
title: Supplementary Material for: Jean-Martin Charcot and the Clinical Foundations of Amyotrophic Lateral Sclerosis: A Historical Case Revisited

description: We revisit a landmark clinical case recorded by Jean-Martin Charcot in 1877–78, describing a patient with bulbar-onset amyotrophic lateral sclerosis (ALS). This case offers a rich window into Charcot’s observational method, clinical reasoning, and early neuropathological insights. We discuss the methodological rigor of Charcot’s case analysis and place it in dialogue with modern understandings of ALS pathophysiology, diagnosis, and care. This historical reflection highlights how 19th-century neurology laid the foundation for current multidisciplinary approaches to managing neurodegenerative diseases.
DOI: 10.6084/m9.figshare.30112408
title: Supplementary Material for: Risk factor analysis and prediction of acute postoperative lung injury after type A aortic dissection

description: Objective To investigate the risk factors of acute lung injury (ALI) after type A aortic dissection and establish a predictive model to evaluate the risk of ALI. Methods The clinical data of patients who underwent type A aortic dissection in the First Affiliated Hospital of Nanchang University from January 2022 to June 2024 were retrospectively analyzed. According to whether acute lung injury occurred after surgery, ALI group and non-ALI group were divided into two groups. Univariate and multivariate analysis were performed on the factors that may cause acute lung injury, and multivariate Logistic regression prediction model was constructed. Results A total of 187 patients were included in the study, including 94 patients in the non-ALI group and 93 patients in the ALI group. The incidence of ALI after type A aortic dissection was 49.7%. Multivariate analysis showed that BMI, smoking history, D-dimer, interleukin-6, and cardiopulmonary bypass time were independent risk factors for ALI after type A aortic dissection. The prediction model based on these risk factors has good prediction efficiency. Conclusion BMI, smoking history, D-dimer, interleukin-6 and cardiopulmonary bypass time are independent risk factors for ALI after type A aortic dissection. The predictive model established based on these risk factors has good predictive efficacy, which helps to identify high-risk patients early, take appropriate preventive measures, improve surgical safety and improve patient prognosis.
DOI: 10.6084/m9.figshare.30112408.v1
title: Supplementary Material for: Risk factor analysis and prediction of acute postoperative lung injury after type A aortic dissection

description: Objective To investigate the risk factors of acute lung injury (ALI) after type A aortic dissection and establish a predictive model to evaluate the risk of ALI. Methods The clinical data of patients who underwent type A aortic dissection in the First Affiliated Hospital of Nanchang University from January 2022 to June 2024 were retrospectively analyzed. According to whether acute lung injury occurred after surgery, ALI group and non-ALI group were divided into two groups. Univariate and multivariate analysis were performed on the factors that may cause acute lung injury, and multivariate Logistic regression prediction model was constructed. Results A total of 187 patients were included in the study, including 94 patients in the non-ALI group and 93 patients in the ALI group. The incidence of ALI after type A aortic dissection was 49.7%. Multivariate analysis showed that BMI, smoking history, D-dimer, interleukin-6, and cardiopulmonary bypass time were independent risk factors for ALI after type A aortic dissection. The prediction model based on these risk factors has good prediction efficiency. Conclusion BMI, smoking history, D-dimer, interleukin-6 and cardiopulmonary bypass time are independent risk factors for ALI after type A aortic dissection. The predictive model established based on these risk factors has good predictive efficacy, which helps to identify high-risk patients early, take appropriate preventive measures, improve surgical safety and improve patient prognosis.
DOI: 10.6084/m9.figshare.30112405
title: Supplementary Material for: Jean-Martin Charcot and the Clinical Foundations of Amyotrophic Lateral Sclerosis: A Historical Case Revisited

description: We revisit a landmark clinical case recorded by Jean-Martin Charcot in 1877–78, describing a patient with bulbar-onset amyotrophic lateral sclerosis (ALS). This case offers a rich window into Charcot’s observational method, clinical reasoning, and early neuropathological insights. We discuss the methodological rigor of Charcot’s case analysis and place it in dialogue with modern understandings of ALS pathophysiology, diagnosis, and care. This historical reflection highlights how 19th-century neurology laid the foundation for current multidisciplinary approaches to managing neurodegenerative diseases.
DOI: 10.34810/data1389
title: Replication data for: Effect of biphasic in vitro maturation (CAPA-IVM) on EGF receptor and embryo development of prepubertal goat oocytes according to follicle size

description: Raw data of research article "Effect of biphasic in vitro maturation (CAPA-IVM) on EGF receptor and embryo development of prepubertal goat oocytes according to follicle size"
The objective of this study was to assess the effect of CAPA-IVM on oocyte competence of prepubertal goat oocytes derived from small (&lt; 3 mm) and large (&gt; 3 mm) follicles. 
In experiment 1, oocytes were cultured for 6 h in pre-IVM medium with the meiotic inhibitors CNP and estradiol (CNP group) or without them (control group), and GV rate and chromatin configuration were assessed. 
In experiment 2, oocytes were cultured in conventional IVM (c-IVM) or CAPA-IVM (pre-IVM followed by c-IVM) and blastocyst development, epidermal growth factor receptor (EGFR) protein expression in oocytes and cumulus cells (CCs), and intra-oocyte ROS and glutathione (GSH) level were assessed.

Dades brutes de l'article de recerca "Effect of biphasic in vitro maturation (CAPA-IVM) on EGF receptor and embryo development of prepubertal goat oocytes according to follicle size"
L'objectiu d'aquest estudi va ser avaluar l'efecte de CAPA-IVM sobre la competència ovocitària dels oòcits de cabra prepuberals derivats de fol·licles petits (&lt; 3 mm) i grans (&gt; 3 mm). 
En l'experiment 1, es van cultivar oòcits durant 6 h en medi pre-IVM amb els inhibidors meiòtics CNP i estradiol (grup CNP) o sense ells (grup control), i es va avaluar la taxa de GV i la configuració de la cromatina. 
En l'experiment 2, es van cultivar oòcits en IVM convencional (c-IVM) o CAPA-IVM (pre-IVM seguida de c-IVM) i desenvolupament de blastocist, expressió de proteïnes receptores del factor de creixement epidèrmic (EGFR) en oòcits i cèl·lules cúmuls (CC), i es va avaluar el nivell intraoòcit de ROS i glutatió (GSH).
description: Microsoft Excel, null
DOI: 10.17026/dans-xbw-kd95
title: Veere Serooskerke Poortstraat Op zoek naar een ijzertijdnederzetting

description: &lt;p&gt;In opdracht van de gemeente Veere heeft ADC ArcheoProjecten een Inventariserend Veldonderzoek in de vorm van proefsleuven (IVO-P) en vervolgens een Opgraving uitgevoerd voor het Plangebied Serooskerke Oost Poortstraat – Kadetweg. In het plangebied zal een nieuwe woonwijk worden gerealiseerd. De exacte bouwplannen zijn nog niet bekend, maar deze zullen de archeologische resten vernietigen of ernstig beschadigen.&lt;br&gt;Tijdens de archeologische onderzoeken in het Plangebied Serooskerke Oost zijn resten aangetroffen uit de Nieuwe tijd en de IJzertijd. De resten uit de Nieuwe tijd werden net onder de bouwvoor aangetroffen en bestaan uit verschillende bakstenen gootjes en een ovale vijver die bij de tuinen van Buitenplaats Noordhout hoorden. De gootjes zijn waarschijnlijk afwateringsgootjes die ondergronds liepen en afwaterden in een sloot of de vijver.. In de vijver is een fraai fragment van een ornamentele tuinvaas aangetroffen uit de 17e of de 18e eeuw.&lt;br&gt;In enkele werkputten aan de zuidkant van het plangebied is de ondergrond vanaf de bouwvoor vergraven voor veenwinning om zout uit te winnen, het zogenaamde moernering of darinkdelven.&lt;br&gt;Voor de middeleeuwse zoutproductie werd veen gewonnen en verbrand. Of dit hier al in de Late Middeleeuwen plaatsvond of pas een aanvang nam in de Nieuwe tijd is niet bekend. Het winnen van het met zout verzadigde veen heeft eventuele oudere sporen in de top van het veen vernietigd.&lt;br&gt;In de werkputten aan de noordkant van het plangebied werd op het veen een laag aangetroffen die uit grijs zand en schelpen bestaat en op het vlak grillige vormen heeft. De laag is als overstromingslaag geïnterpreteerd. Vooral in de schelpenlagen werd op verschillende plekken veel aardewerk uit de Late IJzertijd aangetroffen, maar ook klein botmateriaal en een fragment van een La Tène armband van blauw glas uit de Late IJzertijd. Het aardewerk is hier waarschijnlijk terecht gekomen met de overstromingen die vanaf de Romeinse tijd veelvuldig voorkomen.&lt;br&gt;Omdat het aardewerk niet veel afgesleten is of afgerond, suggereert dat het slechts over een korte afstand verspoeld is en dat er zich in de directe omgeving, maar buiten het huidige plangebied een huisplaats of nederzetting moet hebben bevonden. De locatie hiervan is helaas tot nu toe niet aangetroffen&lt;/p&gt;
DOI: 10.17026/dans-xbx-t6kh
title: Geldrop-Mierlo Hekelstraat Sporen van ontginning aen die Hekelstrate

description: &lt;p&gt;Op 13 en 14 januari 2014 is door een team van Archol BV een inventariserend veldonderzoek uitgevoerd in plangebied Hekelstraat te Geldrop-Mierlo. Ondanks de relatief goede conservering en landschappelijk ligging zijn de archeologische resten beperkt van aard. Op een prehistorisch paalspoor na zijn alle sporen en vondsten te relateren aan het gebruik van het terrein ten behoeve van landbouw, mogelijk voor vlasteelt. Hoewel de fysieke kwaliteit van de resten middelhoog scoort is de inhoudelijke kwaliteit laag. Er zijn geen behoudenswaardige vindplaatsen aan te wijzen en plangebied Hekelstraat kan dan ook worden vrijgegeven.&lt;/p&gt;
DOI: 10.3886/e237861
title: Cross-sectional data of IVF Neuropsychology

description: Data were retrieved as a cohort baseline.
DOI: 10.3886/e237861v1
title: Cross-sectional data of IVF Neuropsychology

description: Data were retrieved as a cohort baseline.
DOI: 10.17026/dans-xc9-nhmg
title: Plangebied Molenbeek te Roosendaal, gemeente Roosendaal NO3565_ROOMO2

description: &lt;p&gt;In opdracht van Adviesbureau De Meent B.V. heeft RAAP Archeologisch Adviesbureau in mei 2010 een archeologische begeleiding uitgevoerd ten behoeve van natuurherstel met diverse inrichtingsmaatregelen aan de Molenbeek te Roosendaal (provincie Noord-Brabant). Er werden ecologische verbindingszones langs de Molenbeek (deelgebied 1 en 2) aangelegd, waarbij in beide deelgebieden poelen gegraven werden en in deelgebied 2 tevens nog maaiveldverlaging zou plaatsvinden.&lt;/p&gt;&lt;p&gt;De bodem in de deelgebieden blijkt verstoord te zijn. Naast verdwenen historisch-geografische elementen, zoals perceelsgreppels en de oude Molenbeekloop, zijn 3 vindplaatsen (ARCHISvondstmeldingsnummer 414448) in deelgebied 1 aangetroffen, specifiek in de oude historische beekloop. Het betreft (1) de vondst van een loden musketkogel uit de Nieuwe tijd, (2) een loden maar afgesleten netverzwaarder/netzinker te dateren vanaf de Romeinse tijd en (3) een fragment van een ovoide kleipijp te dateren vanaf de Nieuwe tijd B. De aangetroffen vondsten staan in verband met de economische exploitatie van het beekdal, zoals vissen en jagen. Landschappelijk kunnen ze betrekking hebben op het kasteelterrein Moerendaal (ARCHIS-monumentnummer 2392), gelegen aan de overkant van de Molenbeek en/of de verdwenen watermolen, die mogelijk behoorde tot het kasteeldomein, verder stroomopwaarts. De kans is zeer gering dat de 3 archeologica zich in situ bevinden; hoogstwaarschijnlijk zijn deze verspoeld. In deelgebied 2 zijn geen archeologische vindplaatsen aangetroffen. Net zoals in deelgebied 1 is een deel van de historische loop van de Molenbeek aangetroffen.&lt;/p&gt;
DOI: 10.17026/dans-xca-jz4y
title: Nisse Drieweg Nisse Drieweg, Gemeente Borsele. Archeologisch Bureauonderzoek en Inventariserend Veldonderzoek door middel van verkennende boringen

description: &lt;p&gt;De initiatiefnemer heeft het voornemen om binnen een plangebied aan de Drieweg te Nisse (gemeente Borsele) een nieuw agrarisch bouwvlak te realiseren. Het plangebied omvat een deel van het kadastrale percelen Borsele, Sectie W, nr. 157. De oppervlakte van het voorzien bouwvlak bedraagt circa 2,9 ha. In het kader van het hiertoe benodigde delegatieplan heeft Artefact! Advies en Onderzoek in Erfgoed in opdracht van de RHO Adviseurs een archeologisch vooronderzoek uitgevoerd.&lt;br&gt;Dit onderzoek bestond in eerste instantie uit een bureauonderzoek waarbij een gespecificeerd verwachtingsmodel werd opgesteld voor het plangebied. Dit model is vervolgens getoetst door het uitvoeren van een inventariserend veldonderzoek door middel van boringen (verkennende fase). Tijdens deze verkennende fase werden de landschappelijke vormeenheden bepaald met als doel kansarme zones uit te sluiten en kansrijke zones aan te duiden voor eventuele volgende vormen van onderzoek. Op basis van de resultaten van dit onderzoek kan gesteld worden dat:  In, en op, de afzettingen van het Laagpakket van Walcheren (die dagzomend voorkomen) een lage verwachting geldt op het voorkomen van vindplaatsen uit de middeleeuwen tot en met de nieuwe tijd.&lt;br&gt; Er in een deel van het plangebied (bruine zone op figuur 23) een middelhoge verwachting geldt voor resten uit de late ijzertijd en Romeinse tijd op het niveau van het Hollandveen. Dit vanaf een diepte van 1,49 m -NAP/ 1,35 m -mv.&lt;br&gt; Er voor het plangebied deels een lage en deels geen verwachting geldt voor resten uit de bronstijd tot midden ijzertijd op het niveau van het Hollandveen.&lt;br&gt; Er deels een lage en deels geen verwachting geldt voor resten uit het neolithicum op het niveau van het Laagpakket van Wormer.&lt;br&gt; De verwachting voor het Laagpakket van Wierden en eventueel hierop gelegen Basisveen door de grote diepteligging van de betreffende pakketten niet getoetst kon worden. Er geldt dan ook nog steeds een gematigde verwachting voor het laat-paleolithicum tot mesolithicum op het niveau van het Laagpakket van Wierden en de lage verwachting voor het laat-mesolithicum tot midden-neolithicum op het niveau van het Basisveen (waar aanwezig.). Dit vanaf een diepte van circa 6,6 m -NAP (circa 7,1 m – mv).&lt;br&gt;Op basis van de resultaten van het onderzoek wordt geadviseerd om in de gebieden met een middelhoge verwachting voor de late ijzertijd en Romeinse tijd geen bodemverstoringen uit te voeren die dieper reiken dan 1,3 m-mv (oranje op figuur 24). Indien dergelijke verstoringen wel noodzakelijk zijn bij de geplande ontwikkeling en planaanpassing niet mogelijk is wordt vervolgonderzoek aanbevolen voor deze zones.&lt;br&gt;Voor de overige delen van het plangebied (groen op figuur 24) wordt geen vervolgonderzoek noodzakelijk geacht. Voor de argumentatie met betrekking tot dit advies wordt verwezen naar hoofdstuk 4.2.&lt;/p&gt;
DOI: 10.17026/dans-xcc-4h5z
title: Plangebied Leechein 21 te Akkrum RAAPrap_6481_HELEE_20230522

description: &lt;p&gt;Op basis van de resultaten van het bronnenonderzoek kunnen we zeggen dat voor het plangebied, gezien de ligging binnen een AMK-terrein (monumentnummer 8070; een terp vanaf de vroege middeleeuwen) een hoge archeologische verwachting geldt. De archeologische laag kan direct onder de bouwvoor/verstoorde laag aanwezig zijn, hierbij moet rekening gehouden worden met bijvoorbeeld ophogingspakketten, grondsporen, funderingsresten, aardewerk, houtskool en/of botresten.&lt;br&gt;Uit de resultaten van het booronderzoek is gebleken dat de bodemopbouw binnen het plangebied bestaat uit een bouwvoor/verstoorde laag op een laat middeleeuwse ? nieuwe tijdse ophogingslaag, soms op veen, op klei (geulafzettingen) op veen. In een boring is een fragment roodbakkend geglazuurd aardewerk uit de 14e tot 17e eeuw aangetroffen.&lt;/p&gt;