cometadata/datacite-titles-descriptions-related-identifiers huggingface dataset:
DOI: 10.13127/sd/mrc5s6rtzq
title: Seismic Data acquired by INGV Emergency Group - FERMO MACERATA-Italy - 2010 - T04
title: Dati sismici acquisiti dal Gruppo di emergenza INGV - Fermo Macerata - Italia 2010 - T04
title: SDE-2010-T04
title: Seismic data from temporary network 3H

description: From 10 to 12 January 2010, the Istituto Nazionale di Geofisica e Vulcanologia (INGV) recorded 3 earthquakes with magnitude ML>4.0 in an area between the provinces of Macerata and Fermo, in Central Italy. The area in question has a particular seismicity, confined in a fragile seismogenic layer at a depth between 15 and 25 km, worthy of detailed analysis. In order to improve the studies of the seismicity of the area, 2 seismic stations were installed to integrate the permanent seismic network of the INGV (FDSV code= IV, doi: https://doi.org/10.13127/SD/X0FXNH7QFY). The stations were connected in real time with the data acquisition center.
description: Dal 10 al 12 gennaio 2010, l'Istituto Nazionale di Geofisica e Vulcanologia (INGV) ha registrato 3 terremoti di magnitudo ML>4.0 in un'area compresa tra le province di Macerata e Fermo, nell'Italia centrale. L'area in questione presenta una sismicità particolare, confinata in uno strato sismogenetico fragile ad una profondità compresa tra 15 e 25 km, meritevole di un'analisi dettagliata. Al fine di migliorare gli studi sulla sismicità dell'area, si decise di installare 2 stazioni sismiche temporanee ad integrazione della rete sismica permanente dell'INGV (codice FDSV= IV, doi: https://doi.org/10.13127/SD/X0FXNH7QFY). Le stazioni erano collegate in tempo reale con il centro di acquisizione dati INGV di Roma contribuendo al servizio di sorveglianza sismica.
L'acquisizione è durata circa 2 mesi.
DOI: 10.5281/zenodo.10083864
title: Nonperturbative phase diagram of two-dimensional N=(2,2) super-Yang--Mills theory --- data release

description: This HDF5 file collects data and analysis results for non-perturbative lattice field theory calculations investigating two-dimensional supersymmetric SU(N) Yang--Mills theory with four supercharges.  See the README for further information.
DOI: 10.5281/zenodo.10083865
title: Nonperturbative phase diagram of two-dimensional N=(2,2) super-Yang--Mills theory --- data release

description: This HDF5 file collects data and analysis results for non-perturbative lattice field theory calculations investigating two-dimensional supersymmetric SU(N) Yang--Mills theory with four supercharges.  See the README for further information.
DOI: 10.5281/zenodo.14393064
title: Приложения к отчёту по гранту РНФ № 22-14-00330

description: Приложения к отчёту по гранту РНФ № 22-14-00330


Таблица 1 содержит описание криптических кассетных экзонов, найденных в данных RNA-Seq GTEx. Для каждого кассетного экзона сообщаются координаты, степень покрытия и поддержка ЭЭС в данных GTEx, уровень консервативности в выравнивании 100 позвоночных (столбцы SR_support, Coverage, phastCons_score соответственно). Cреди КЭ выделены ядовитые экзоны (столбец transcript_biotype) и указано изменение включения КЭ в экспериментах по подавлению NMD в клеточной линии A549 (столбец CHX_dPSI).


Таблица 2 содержит описание криптических альтернативных сайтов сплайсинга, найденных в данных RNA-Seq GTEx. Для каждого альтернативного сайта сообщаются координаты, степень покрытия и поддержка ЭЭС в данных GTEx, уровень консервативности в выравнивании 100 позвоночных (столбцы SR_support, Coverage, phastCons_score соответственно).


Таблица 3 содержит информацию о регионах, содержащих событие НС и обогащенных мутациями в опухолях - гене и координатах ядовитого или необходимого экзона и фланкирующих его интронов, средней консервативности региона по phastCons (столбец mean_conservation_score), плотности мутаций в регионе (столбцы mutation_density_tcga, mutation_density_icgc), а также о статьях, в которых описан возможный механизм вовлечения гена в патогенез онкологических заболеваний.


Таблица 4 содержит информацию о доменах РСБ, обогащенных мутациями в опухолях, и плотности соматических опухолевых мутаций в них (столбец mutation_density).


Таблица 5 содержит список регуляторных событий непродуктивного сплайсинга и описание их реакции на пертурбацию экспрессии РСБ. Для пар (событие; эксперимент по пертурбации) сообщается изменение уровня включения в эксперименте по пертурбации с и без подавления системы NMD (столбцы dpsi+CHX, dpsi-CHX), изменение экспрессии в эксперименте по пертурбации (столбец log2FoldChange), изменение включения при подавлении системы NMD (столбец dpsi_chx). Кроме того, в таблице собрана информация об ассоциации генов и событий с развитием опухоли из баз данных Cancer Gene Census (CGC), OnkoKB, ASCancer Atlas (столбец tumor_associated) и предложены типы опухолей, в которых изменение экспрессии РСБ, изменение включения события и изменение экспрессии целевого гена направлены согласованно (столбец tcga_eff).

 

Таблица 6 содержит список последовательностей праймеров и миРНК для нокдауна регуляторов.
DOI: 10.5281/zenodo.14185976
title: Приложения к отчёту по гранту РНФ № 22-14-00330

description: Приложения к отчёту по гранту РНФ № 22-14-00330


Таблица 1 содержит описание криптических кассетных экзонов, найденных в данных RNA-Seq GTEx. Для каждого кассетного экзона сообщаются координаты, степень покрытия и поддержка ЭЭС в данных GTEx, уровень консервативности в выравнивании 100 позвоночных (столбцы SR_support, Coverage, phastCons_score соответственно). Cреди КЭ выделены ядовитые экзоны (столбец transcript_biotype) и указано изменение включения КЭ в экспериментах по подавлению NMD в клеточной линии A549 (столбец CHX_dPSI).


Таблица 2 содержит описание криптических альтернативных сайтов сплайсинга, найденных в данных RNA-Seq GTEx. Для каждого альтернативного сайта сообщаются координаты, степень покрытия и поддержка ЭЭС в данных GTEx, уровень консервативности в выравнивании 100 позвоночных (столбцы SR_support, Coverage, phastCons_score соответственно).


Таблица 3 содержит информацию о регионах, содержащих событие НС и обогащенных мутациями в опухолях - гене и координатах ядовитого или необходимого экзона и фланкирующих его интронов, средней консервативности региона по phastCons (столбец mean_conservation_score), плотности мутаций в регионе (столбцы mutation_density_tcga, mutation_density_icgc), а также о статьях, в которых описан возможный механизм вовлечения гена в патогенез онкологических заболеваний.


Таблица 4 содержит информацию о доменах РСБ, обогащенных мутациями в опухолях, и плотности соматических опухолевых мутаций в них (столбец mutation_density).


Таблица 5 содержит список регуляторных событий непродуктивного сплайсинга и описание их реакции на пертурбацию экспрессии РСБ. Для пар (событие; эксперимент по пертурбации) сообщается изменение уровня включения в эксперименте по пертурбации с и без подавления системы NMD (столбцы dpsi+CHX, dpsi-CHX), изменение экспрессии в эксперименте по пертурбации (столбец log2FoldChange), изменение включения при подавлении системы NMD (столбец dpsi_chx). Кроме того, в таблице собрана информация об ассоциации генов и событий с развитием опухоли из баз данных Cancer Gene Census (CGC), OnkoKB, ASCancer Atlas (столбец tumor_associated) и предложены типы опухолей, в которых изменение экспрессии РСБ, изменение включения события и изменение экспрессии целевого гена направлены согласованно (столбец tcga_eff).

 

Таблица 6 содержит список последовательностей праймеров и миРНК для нокдауна регуляторов.
DOI: 10.5281/zenodo.14185977
title: NExon - CE catalog

description: Catalog of cryptic cassette exons detected with NExon pipeline in GTEx data
DOI: 10.5281/zenodo.14264696
title: NExon - AS events catalog

description: Catalog of alternative splicing events detected with NExon pipeline in GTEx data.

Contents:



ST1 : cassette exons with additional annotation

ST2: alternative 5'- and 3'-splice sites
DOI: 10.5281/zenodo.14264814
title: NExon - AS events catalog

description: Catalog of alternative splicing events detected with NExon pipeline in GTEx data.

Contents:



ST1 : cassette exons with additional annotation

ST2: alternative 5'- and 3'-splice sites
DOI: 10.5281/zenodo.14352964
title: Приложения к отчёту по гранту РНФ № 22-14-00330

description: Приложения к отчёту по гранту РНФ № 22-14-00330


Таблица 1 содержит описание криптических кассетных экзонов, найденных в данных RNA-Seq GTEx. Для каждого кассетного экзона сообщаются координаты, степень покрытия и поддержка ЭЭС в данных GTEx, уровень консервативности в выравнивании 100 позвоночных (столбцы SR_support, Coverage, phastCons_score соответственно). Cреди КЭ выделены ядовитые экзоны (столбец transcript_biotype) и указано изменение включения КЭ в экспериментах по подавлению NMD в клеточной линии A549 (столбец CHX_dPSI).


Таблица 2 содержит описание криптических альтернативных сайтов сплайсинга, найденных в данных RNA-Seq GTEx. Для каждого альтернативного сайта сообщаются координаты, степень покрытия и поддержка ЭЭС в данных GTEx, уровень консервативности в выравнивании 100 позвоночных (столбцы SR_support, Coverage, phastCons_score соответственно).


Таблица 3 содержит информацию о регионах, содержащих событие НС и обогащенных мутациями в опухолях - гене и координатах ядовитого или необходимого экзона и фланкирующих его интронов, средней консервативности региона по phastCons (столбец mean_conservation_score), плотности мутаций в регионе (столбцы mutation_density_tcga, mutation_density_icgc), а также о статьях, в которых описан возможный механизм вовлечения гена в патогенез онкологических заболеваний.


Таблица 4 содержит информацию о доменах РСБ, обогащенных мутациями в опухолях, и плотности соматических опухолевых мутаций в них (столбец mutation_density).


Таблица 5 содержит список регуляторных событий непродуктивного сплайсинга и описание их реакции на пертурбацию экспрессии РСБ. Для пар (событие; эксперимент по пертурбации) сообщается изменение уровня включения в эксперименте по пертурбации с и без подавления системы NMD (столбцы dpsi+CHX, dpsi-CHX), изменение экспрессии в эксперименте по пертурбации (столбец log2FoldChange), изменение включения при подавлении системы NMD (столбец dpsi_chx). Кроме того, в таблице собрана информация об ассоциации генов и событий с развитием опухоли из баз данных Cancer Gene Census (CGC), OnkoKB, ASCancer Atlas (столбец tumor_associated) и предложены типы опухолей, в которых изменение экспрессии РСБ, изменение включения события и изменение экспрессии целевого гена направлены согласованно (столбец tcga_eff).
DOI: 10.13127/sd/-kalgllhua
title: Seismic Data acquired by the INGV Emergency Group - Parma-Italy 2008 - RE
title: Dati sismici acquisiti dal Gruppo di emergenza INGV - Parma 2008 - RE0
title: SDE-2008-RE
title: Seismic data from temporary network 2D_2008

description: On 23 December 2008 a magnitude (ML) 5.2 earthquake affected the Apennine area between the provinces of Reggio Emilia and Parma (Northern Italy). The seismic event, felt by a large part of the population of Italy central-northern, was located by the Istituto Nazionale di Geofisica e Vulcanologia (INGV) at a hypocentral depth of approximately 23 km between the municipalities of Vetto, Canossa and
Neviano degli Arduini (Lat. 44.544N and Lon. 10.345E).
A few hours after the mainshock, the INGV installed some temporary seismic stations to integrate the INGV National Seismic Network (RSN) already present in the area with the aim of acquiring higher quality data and detail in such a way as to be able to study the seismic sources, the space-time evolution of the sequence and characterize through micro seismicity, the activated fault structures.
description: Il 23 dicembre 2008, un terremoto di magnitudo 5,2 (ML) ha colpito la zona appenninica tra le province di Reggio Emilia e Parma (Italia settentrionale). L'evento sismico, avvertito da una vasta parte della popolazione del centro-nord Italia, è stato localizzato dall'Istituto Nazionale di Geofisica e Vulcanologia (INGV) a una profondità ipocentrale di circa 23 km tra i comuni di Vetto, Canossa e Neviano degli Arduini (Lat. 44.544N e Lon. 10.345E).
Poche ore dopo il terremoto principale, l'INGV ha installato alcune stazioni sismiche temporanee per integrare la Rete Sismica Nazionale (RSN) già presente nella zona, con l'obiettivo di acquisire dati di maggiore qualità e dettaglio, al fine di studiare le fonti sismiche, l'evoluzione spazio-temporale della sequenza e caratterizzare, attraverso la microsismicità, le strutture di faglia attivate.
DOI: 10.5281/zenodo.14393105
title: O'QUVCHILARGA TRIGONOMETRIK TENGLAMALARNI YECHISHNING NOSTANDART USULLARINI O'RGATISH
DOI: 10.5281/zenodo.14393106
title: O'QUVCHILARGA TRIGONOMETRIK TENGLAMALARNI YECHISHNING NOSTANDART USULLARINI O'RGATISH
DOI: 10.13127/sd/fqwsu1k6ib
title: Seismic Data acquired by the INGV Emergency Group - Emilia-Italy 2012 - T08
title: SDE-2012-T08

description: Following the significant seismic sequence that affected the Po Valley starting from the night of May 20, 2012, the Seismic Emergency Response of the Istituto Nazionale di Geofisica e Vulcanologia (INGV) was activated.
The main event occurred at 02:03 UTC on May 20, with the epicenter approximately 30 km west of Ferrara and a local magnitude ML 5.9 (Mw 5.8). In the minutes and the hour following the main shock, a total of 11 events with a magnitude greater than 4.0 were recorded. Throughout the day, a total of 16 earthquakes ranging from magnitude 4.0 to 5.0 were registered, with epicenters located between the municipalities of Mirandola, San Felice sul Panaro, and Finale Emilia.
Less than ten days later, on May 29 at 07:00 UTC, a second event occurred with a local magnitude ML of 5.8 (Mw 5.6) and an epicenter approximately 20 km west of the initial main shock, still within the Modena region between the municipalities of Medolla and Cavezzo.
The seismic sequence exhibited various phases of activity. The initial phase featured a high number of earthquakes per day (with peak values of over 300 events on May 20 and 29), concluding by the end of June 2012. A second phase with reduced activity occurred from July to October 2012, followed by a third phase of gradually decreasing activity with only a few events per month. Consequently, the geometry of the temporary network was progressively adjusted.
description: A seguito dell'importante sequenza sismica che a partire dalla notte del 20 maggio 2012 ha interessato la Pianura Padana, è stato attivato il Pronto Intervento Sismico dell’Istituto Nazionale di Geofisica e Vulcanologia (INGV). 
L’evento principale si è verificato alle 02:03 UTC del 20 maggio, con epicentro circa 30 km a ovest di Ferrara e magnitudo locale ML 5.9 (Mw 5.8). Nei minuti e nell’ora successiva alla scossa principale sono stati registrati ben 11 eventi di magnitudo superiore a 4.0 e nel corso della giornata un totale di 16 terremoti di magnitudo compresa tra 4.0 e 5.0, con epicentri tra i comuni di Mirandola, San Felice sul Panaro e Finale Emilia. 
A meno di dieci giorni, il 29 maggio alle ore 07:00 UTC, si è verificato un secondo evento con una magnitudo locale ML 5.8 (Mw 5.6) ed epicentro posto circa 20 km a ovest della prima scossa principale, sempre nel modenese tra i comuni di Medolla e Cavezzo. 
La sequenza ha avuto diverse fasi di attività. Una prima fase con un elevato numero di terremoti al giorno (con picchi principali di oltre 300 eventi il 20 e il 29 maggio), che si è conclusa già alla fine di giugno 2012. Una seconda fase con un’attività ridotta da luglio a ottobre 2012, e poi una terza fase di attività via via minore con pochi eventi al mese. Di conseguenza,  la geometria della rete temporanea è stata via via rimodulata.
DOI: 10.15468/m32g2q
title: Coleção de Mastofauna do Museu de Ciências Univates

description: Coleção zoológica de Mastozoologia do Museu de Ciências Univates
DOI: 10.48579/pro/wkemqa
title: data physico-chimie sources du Puy de Dôme Gossaume et al. 2024 Hydrobiologia

description: données physico-chimique de 54 sources minérales: ions majeurs (mg/l), conductivité, carbonates (mg/l), pH, oxygène dissous dans l'eau, température de l'eau. De décembre 2014 à avril 2022.
DOI: 10.13127/sd/f705_maix3
title: Seismic data acquired during the Val d'Agri temporary survey

description: The Val d’Agri temporary seismic network is installed in the Southern Apennines seismic belt (Italy), which is one of regions in Italy with the highest seismogenic potential, as evidenced by the large 1857 M7 historical earthquakes. Also, the area hosts one of  the most important on-shore European oil field. The survey area is about 1600 km2 covering the Val d’Agri basin, the Monti della Maddalena ridge, the southern sector of the Vallo di Diano basin and the Monte Alpi massif. The network operated in continuous-mode for 13 months between
May 2005 and June 2006, and it is composed of 22 continuously recording seismic stations equipped with different digital acquisition systems (Reftek130 and Marslite88) and three-component short period sensors (LE-3D/1S e LE-3D/5S).
DOI: 10.13127/sd/ei9hlsxpdc
title: Seismic Data acquired by the INGV Emergency Group - Montefeltro - Italy 2011
title: Dati sismici acquisiti dal Gruppo di emergenza INGV - Montefeltro-Italia 2011 - T02
title: SDE-2011-T05
title: Seismic data from temporary network 2J

description: On May 24, 2011, at 12.40 UTC, the Istituto Nazionale di Geofisica e Vulcanologia (INGV) recorded the beginning of a seismic sequence in the Montefeltro area (Province of Forlì-Cesena, Italy) of modest magnitude. In the following two weeks, over 600 events were localized by the INGV Seismic Surveillance Room, of which 13 of ML ≥ 3.0. Eight of these more energetic events occurred within the first 16 hours of the first shock. The highest energy event occurred on the night between 24 and 25 May (2011-05-04 22:03:51 utc) with a magnitude of ML 3.9.
Considering the peculiar evolution of the sequence in the first 24 hours from the first event, the proximity of the epicentral area to the Alta Val Tiberina (Central Italy), it was deemed appropriate to activate response procedures to a seismic emergency and prepare an intervention aimed at improving the instrumental coverage of the area.
On May 25, a temporary seismic network was installed to integrate the permanent stations already present in the area (FDSN code= IV, doi: https://doi.org/10.13127/SD/X0FXNH7QFY) with local data acquisition.
description: Il 24 maggio 2011, alle ore 12.40 UTC, l'Istituto Nazionale di Geofisica e Vulcanologia (INGV) ha registrato l'inizio di una sequenza sismica nell'area del Montefeltro (Provincia di Forlì-Cesena, Italia) di modesta magnitudo. Nelle due settimane successive sono stati localizzati dalla Sala di Sorveglianza Sismica dell'INGV oltre 600 eventi, di cui 13 di ML ≥ 3,0. Otto di questi eventi più energici si sono verificati entro le prime 16 ore dalla prima scossa. L'evento di massima energia si è verificato nella notte tra il 24 e il 25 maggio (2011-05-04 22:03:51 utc) con una magnitudo pari a ML 3.9.
Considerando la peculiare evoluzione della sequenza nelle prime 24 ore dal primo evento, la vicinanza dell'area epicentrale all'Alta Val Tiberina (Italia Centrale), si è ritenuto opportuno attivare procedure di risposta all'emergenza sismica e predisporre un intervento mirato al miglioramento della copertura strumentale del territorio.
Il 25 maggio è stata installata una rete sismica temporanea per integrare le stazioni permanenti già presenti nell'area (codice FDSN= IV, doi: https://doi.org/10.13127/SD/X0FXNH7QFY) con l'acquisizione dati locale.
DOI: 10.13127/sd/b3m2aw6cwl
title: INGV temporary seismic network of Osservatorio Vesuviano
title: TESNET-OV

description: The Mobile Seismic Network of Osservatorio Vesuviano has been engaged in active and passive seismic studies both on volcanic and tectonic areas.Particularly, the contribution of the Mobile Seismic Network for the monitoring of Neapolitan active volcanoes has been very important to improve the Permanent Network. During seismic crises high quality data have been gathered allowing detailed analyses of the seismic activity.
DOI: 10.15472/m1nhyl
title: Registros de flora provenientes de la caracterización paisajística de la Reserva Forestal El Malmo

description: La Reserva Forestal Protectora Nacional El Malmo se encuentra ubicada en Tunja, Boyacá, Colombia, y está destinada para conservación de fauna y flora autóctona de zonas altoandinas (bosque y subpáramo) por su característica de espacio ecológico (Castaño-Villa, 2005). Sin embargo, solo 51 ha se encuentran bajo la protección de un ente gubernamental (Parques Nacionales Naturales de Colombia, n.d.), lo cual genera preocupación frente a las afectaciones que se puedan generar en la zona restante por actividades antrópicas como la agricultura y ganadería, fuente económica de los campesinos de la región (Ramos Franco et al., 2021). Además, no se evidencia información actualizada sobre la riqueza biodiversa de la misma. Por lo tanto, este trabajó busca aportar a este vacío de conocimiento al generar un inventario forestal de la zona, mediante el levantamiento de datos por transectos vegetales utilizando el método Gentry, teniendo en cuenta bejucos, árboles y arbustos.
description: El presente recurso contiene la información asociada a 18 registros biológicos de plantas vasculares.
DOI: 10.13127/sd/9gq-9e14z9
title: Seismic Data acquired by Monte Cotugno Reservoir Seismic Experiment

description: The network is composed of 6 temporary seismic stations around the artificial reservoir of Monte Cotugno (Basilicata, Italy) that integrate the regional permanent network of the area. The main goal of the experiment is to record and study micro-seismicity, for the identification of possible reservoir-induced effects. The instruments used for the experiment are (a) Nanometrics Trillium Compact 120s broadband sensor connected to Reftek C130 datalogger, and (b) SARA SS10 sensor connected to Reftek 72A datalogger. All the instruments have acquired data in continuous mode at a sampling rate of 100 Hz.
DOI: 10.13127/sd/2pnsq5uatq
title: Seismic Data acquired by the SISMIKO Emergency Group - Central Italy 2016 - T12
title: Dati sismici acquisiti dal Gruppo di emergenza SISMIKO - Centro Italia 2016 - T12
title: SDE-2016-T12
title: Seismic data from temporary network <net code>

description: At 01:36 UTC (03:36 local time) on August 24th 2016, an earthquake Mw 6.0 struck an extensive sector of the central Apennines (coordinates: latitude 42.70° N, longitude 13.23° E, 8.0 km depth). The earthquake caused about 300 casualties and severe damage to the historical buildings and economic activity in an area located near the borders of the Umbria, Lazio, Abruzzo and Marche regions.
Just after the mainshock, SISMIKO, the coordinating body of the emergency seismic network at Istituto Nazionale di Geofisica e Vulcanologia (INGV) , was activated in order to install a temporary seismic network integrated with the existing permanent network in the epicentral area.
All data acquired from SISMIKO stations, are available at the European Integrated Data Archive (EIDA).
description: Alle 01:36 UTC (03:36 ora locale) del 24 agosto 2016, un terremoto di magnitudo 6.0 ha colpito un ampio settore degli Appennini centrali causando  circa 300 vittime e gravi danni a edifici storici e attività economiche in un'area situata vicino ai confini delle regioni dell'Umbria, Lazio, Abruzzo e Marche.
Subito dopo il terremoto principale, il Gruppo operativo SISMIKO, il coordinamento della rete sismica mobile di emergenza dell'Istituto Nazionale di Geofisica e Vulcanologia (INGV), è stato attivato al fine di installare una rete sismica temporanea integrata con la rete permanente esistente nell'area epicentrale. Dal 24 al 30 agosto, SISMIKO ha dispiegato diciotto stazioni sismiche, la maggiorparte dotate sia di velocimetro che di accelerometro, con tredici stazioni sismiche che trasmettevano in tempo reale alla sala di monitoraggio sismico dell'INGV a Roma.
Tutti i dati acquisiti dalle stazioni SISMIKO sono disponibili presso l'Archivio Integrato Europeo dei Dati (EIDA).
DOI: 10.5281/zenodo.14392491
title: Code for the study of origin and de novo domestication of sweet orange

description: Code used for the study of “Origin and de novo domestication of sweet orange”