cometadata/datacite-titles-descriptions-related-identifiers huggingface dataset:
DOI: 10.5281/zenodo.5829773
title: A ten-year (2010-2019) global terrestrial NEE inferred from the GOSAT v9 XCO2 retrievals (GCAS2021)

description: Top-down atmospheric inversion is one of the major methods to estimate the global NEE. Here, by assimilating the GOSAT ACOS v9 XCO<sub>2</sub> product, we generate a ten-year (2010–2019) global monthly terrestrial NEE dataset using the Global Carbon Assimilation System, version 2 (GCASv2), which is named as GCAS2021. It includes(1) monthly and annual prior and posterior NEE and OCN fluxes, and prescribed FIRE and FFC emissions in a global spatial resolution of 1°×1°; (2) globally, latitudinally, and regionally aggregated monthly and annual posterior NEE and NBE, and their uncertainties; and (3) weekly gridded ensemble members of posterior NEE and OCN fluxes. The regional fluxes are aggregated both in the TRANSCOM and RECCAP2 regions. The latitudinal fluxes are aggregated in northern mid-high latitudes (&gt; 30° N, NL), low latitudes (30° S ~ 30° N, TL), and southern middle latitudes (&lt;30° N, SL). The weekly grided ensemble members could be used for calculating the posterior uncertainties of the user's area and time scale. Combining the OCN flux, and FIRE and FFC emissions, the net biosphere flux (NBE) and atmospheric growth rate (AGR) as well as their inter-annual variabilities (IAVs) agree well with the estimates of Global Carbon Budget 2020. Regionally, GCAS2021 shows that eastern North America, Amazon, Congo Basin, Europe, boreal forests, southern China and Southeast Asia are carbon sinks, while western US, African grasslands, Brazilian plateaus and parts of South Asia are carbon sources. In the TRANSCOM land regions, the NBEs of temperate N. America, northern Africa and boreal Asia are between the estimates of CMS-Flux NBE 2020 and CT2019B, and those in temperate Asia, Europe, and Southeast Asia are consistent with CMS-Flux NBE 2020 but significantly different from CT2019B. In the RECCAP2 regions, except for Africa and South Asia, the NBEs are comparable with the latest bottom-up estimate of Ciais et al. (2021). Compared with previous studies, the IAVs and seasonal cycles of NEE of this dateset could clearly reflect the impacts of extreme climates and large-scale climate anomalies on the carbon flux. The evaluations also show that the posterior CO<sub>2</sub> concentrations at remote sites and in regional scale, as well as on vertical CO<sub>2</sub> profiles in the Asia-Pacific region and the Amazon basin, are all consistent with independent CO<sub>2</sub> measurements from surface flask and aircraft CO<sub>2</sub> observations, indicating that this dataset captures surface carbon fluxes well. We believe that this data set will contribute to regional or national-scale carbon cycle and carbon neutrality assessment, and carbon dynamics research.
DOI: 10.34740/kaggle/dsv/3018183
title: Cryptocurrency extra data - Ethereum
DOI: 10.14457/cu.the.1979.13
title: ความคิดเห็นของครูและผู้ปกครองต่อการให้การบ้านนักเรียน ในระดับชั้นประถมศึกษาปีที่ 3 และ ขั้นประถมศึกษาปีที่ 4

description: วัตถุประสงค์ของการวิจัย การวิจัยครั้งนี้มีวัตถุประสงค์เพื่อสำรวจ และเปรียบเทียบความคิดเห็นของครูและผู้ปกครอง ต่อการให้การบ้านนักเรียนในระดับชั้นประถมศึกษาปีที่ 3 และชั้นประถมศึกษาปีที่ 4 ของโรงเรียนต่างสังกัด ในกรุงเทพมหานคร วิธีดำเนินการวิจัย ศึกษาและรวบรวมข้อมูลเกี่ยวกับการให้การบ้านนักเรียน และนำมาปรับปรุงเป็นแบบสอบถาม โดยมีลักษณะเป็นแบบมาตราส่วนประเมินค่าคำถามปลายปิด และคำถามปลายเปิด นำไปใช้กับโรงเรียนที่เป็นกลุ่มตัวอย่างประชากร 34 โรง ประกอบด้วยครู 204 คน และผู้ปกครอง 204 คน และนำข้อมูลที่ได้มาวิเคราะห์โดยหาค่าร้อยละ ค่าเฉลี่ย ส่วนเบี่ยงเบนมาตรฐาน การทดสอบค่าที และการวิเคราะห์ความแปรปรวนแบบทางเดียว ผลของการวิจัย ครูและผู้ปกครองส่วนมากมีความคิดเห็นตรงกันว่า การบ้านเป็นสิ่งจำเป็นที่ครูควรให้อย่างสม่ำเสมอขึ้นอยู่กับบทเรียน เพราะการบ้านเป็นการฝึกฝนทบทวนบทเรียน และฝึกความรับผิดชอบของนักเรียน นอกจากนั้นทำให้ผู้ปกครองมีโอกาสใกล้ชิด และทราบพัฒนาการทางการเรียนของนักเรียน ครูและผู้ปกครองสามารถร่วมมือกันแก้ไขข้อบกพร่องของนักเรียนได้ สำหรับการให้การบ้านนั้น ครูควรคำนึงถึงเวลา สภาพแวดล้อมและความสามารถของนักเรียนด้วย
DOI: 10.14457/cu.the.2008.2137
title: การศึกษาความเข้าใจและการปฏิบัติของครูในโรงเรียนแกนนำตามหลักเศรษฐกิจพอเพียง

description: การวิจัยครั้งนี้มีวัตถุประสงค์เพื่อศึกษาความเข้าใจของครูเกี่ยวกับหลักปรัชญาของเศรษฐกิจพอเพียงในด้าน 1) ความหมายของหลักปรัชญาของเศรษฐกิจพอเพียง 2) การประยุกต์ใช้หลักปรัชญาของเศรษฐกิจพอเพียง และเพื่อศึกษาการปฏิบัติของครูเกี่ยวกับหลักปรัชญาของเศรษฐกิจพอเพียงในด้าน 1) การได้รับความรู้เกี่ยวกับหลักเศรษฐกิจพอเพียง 2) การนำความรู้หลักปรัชญาของเศรษฐกิจพอเพียงไปประยุกต์ใช้ 3) การขยายผลเพื่อเผยแพร่หลักปรัชญาของเศรษฐกิจพอเพียง การเก็บรวบรวมข้อมูลแบ่งเป็น 2 ขั้นตอน ขั้นตอนแรกคือ การพัฒนาเครื่องมือ โดยเก็บข้อมูลเชิงคุณภาพแบบพหุกรณีศึกษา คือ โรงเรียนแกนนำการบูรณาการเศรษฐกิจพอเพียงในจังหวัดกรุงเทพมหานครและส่วนภูมิภาคอย่างละ 1 โรงเรียนด้วยการเลือกแบบเจาะจง เครื่องมือที่ใช้ในการวิจัยคือ แบบสังเกต แบบสัมภาษณ์ แบบวิเคราะห์เอกสาร วิเคราะห์ข้อมูลด้วยสถิติบรรยาย ขั้นตอนที่สองคือ การสำรวจ โดยเก็บข้อมูลเชิงปริมาณ กลุ่มตัวอย่างคือ ครูในโรงเรียน แกนนำการบูรณาการเศรษฐกิจพอเพียง จำนวน 192 คน ใช้การสุ่มแบบแบ่งชั้น เครื่องมือที่ใช้ในการวิจัยคือ แบบวัด วิเคราะห์ข้อมูลด้วยโปรแกรม SPSS for Windows ผลการวิจัยพบว่า 1.ด้านความเข้าใจ 1.1 ครูมีความเข้าใจด้านความหมายหลักปรัชญาของเศรษฐกิจพอเพียงในภาพรวมในระดับปานกลาง โดยด้านการมีภูมิคุ้มกันในตัวที่ดีและเงื่อนไขความรู้มีความเข้าใจในระดับสูง 1.2 ครูมีความเข้าใจด้านการประยุกต์ใช้หลักปรัชญาของเศรษฐกิจพอเพียงในภาพรวมในระดับสูง 2.ด้านการปฏิบัติ 2.1 ครูมีการปฏิบัติด้านการได้รับความรู้ โดยการสร้างความตระหนักและเข้าใจหลักปรัชญาเศรษฐกิจพอเพียงอยู่ในระดับดี 2.2 ครูมีการปฏิบัติด้านการนำความรู้ไปประยุกต์ใช้ ได้แก่ การจัดการเรียนการสอน การจัดกิจกรรมพัฒนาผู้เรียน และการดำเนินชีวิต อยู่ในระดับพอใช้ 2.3 ครูมีการปฏิบัติด้านการขยายผลเพื่อเผยแพร่อยู่ในระดับพอใช้ มีเพียงด้านความสัมพันธ์กับผู้เรียนที่มีการปฏิบัติอยู่ในระดับดี
DOI: 10.14457/cu.the.1984.38
title: ความคิดเห็นของผู้บริหารการศึกษาและข้าราชการ ที่รับผิดชอบการจัดการศึกษา เกี่ยวกับโครงสร้างการบริหารการศึกษาระดับจังหวัด ในภาคเหนือ
DOI: 10.14457/cu.the.1978.12
title: ความคิดเห็นของครูประถมศึกษาในกรุงเทพมหานคร ที่มีต่อการใช้บทเพลงประกอบการสอน
DOI: 10.14457/cu.the.1977.10
title: ความสัมพันธ์ระหว่างตัวประกอบกับลักษณะการสำเร็จการศึกษา ของนักศึกษามหาวิทยาลัยภูมิภาค : การเปรียบเทียบระหว่างมหาวิทยาลัยขอนแก่น และมหาวิทยาลัยเชียงใหม่
DOI: 10.14457/cu.the.1979.14
title: ความสัมพันธ์ระหว่างผลสัมฤทธิ์ทางการเรียนกับความสนใจ ในกิจกรรมเสริมหลักสูตรวิชาวิทยาศาสตร์
DOI: 10.14457/cu.the.1977.11
title: การเปรียบเทียบผลการสอนวิทยาศาสตร์ แบบศูนย์การเรียนกับแบบบรรยายประกอบการสาธิต ในชั้นมัธยมศึกษาปีที่สอง
DOI: 10.14457/cu.the.1985.48
title: การสำรวจแนวบทบาทนักศึกษาตามการรับรู้ ของนักศึกษาวิทยาลัยครู
DOI: 10.14457/cu.the.1981.12
title: การสร้างคู่มือเรียนทางวิทยุและไปรษณีย์ สำหรับวิชาสร้างเสริมประสบการณ์ชีวิต หลักสูตรการศึกษาผู้ใหญ่แบบเบ็ดเสร็จระดับที่ 3 ของศูนย์การศึกษานอกโรงเรียนประจำภาคเหนือ
DOI: 10.14457/cu.the.1978.13
title: การสร้างชุดการสอนตามเอกัตภาพวิชาคณิตศาสตร์ เรื่อง "ตรรกศาสตร์สัญญลักขณ์" สำหรับระดับประกาศนียบัตรวิชาการศึกษาชั้นสูง

description: วัตถุประสงค์ของการวิจัย เพื่อสร้างชุดการสอนตามเอกัตภาพวิชาคณิตศาสตร์เรื่อง “ตรรกศาสตร์สัญลักขณ์” สำหรับระดับประกาศนียบัตรวิชาการศึกษาชั้นสูง และหาประสิทธิภาพของชุดการสอนตามเกณฑ์มาตรฐาน 90/90 ผู้วิจัยได้สร้างชุดการสอนจำนวน 6 หน่วย และแบบสอบ 30 ข้อ ซึ่งมีค่าความเชื่อมั่น 0.79 โดยให้นักศึกษาชั้นปีที่ 2 ระดับประกาศนียบัตรวิชาการศึกษาชั้นสูง วิทยาลัยครูบุรีรัมย์ จำนวน 20 คน เป็นตัวอย่างประชากร ทำแบบสอบก่อนและหลังการใช้ชุดการสอน แล้วนำข้อมูลทั้งหมดมาวิเคราะห์ เพื่อหาประสิทธิภาพของชุดการสอนตามมาตรฐาน 90/90 ผลการวิจัยปรากฏว่า ชุดการสอนตามเอกัตภาพที่สร้างขึ้น มีประสิทธิภาพ 94.06/91.66 ซึ่งแสดงว่า นักศึกษาทำแบบฝึกหัดในชุดการสอนได้ถูกต้องสูงกว่ามาตรฐาน 90 ตัวแรก และทำแบบสอบหลังเรียนจากชุดการสอนได้ถูกต้อง สูงกว่ามาตรฐาน 90 ตัวหลัง การทดสอบความแตกต่างระหว่างคะแนนเฉลี่ยนของการสอบก่อนและหลังเรียนจากชุดการสอนปรากฏว่า มีความแตกต่างกันอย่างมีนัยสำคัญทางสถิติที่ระดับ .01 แสดงว่าชุดการสอนตามเอกัตภาพที่สร้างขึ้นครั้งนี้ มีประสิทธิภาพสูง ทำให้ผู้เรียนมีความรู้เรื่องตรรกศาสตร์สัญญลักขณ์เพิ่มขึ้นอย่างแท้จริง
DOI: 10.5281/zenodo.3876639
title: Gassert: Evolutionary Improvement of Assertion Oracles - experimental data

description: This dataset contains the data of our experiments that we conducted in our paper "Evolutionary Improvement of Assertion Oracles" published at ESEC/FSE 2020. <br>
DOI: 10.5281/zenodo.3876638
title: Gassert: Evolutionary Improvement of Assertion Oracles - experimental data

description: This dataset contains the data of our experiments that we conducted in our paper "Evolutionary Improvement of Assertion Oracles" published at ESEC/FSE 2020. <br>
DOI: 10.5281/zenodo.5830027
title: How does moving Public Engagement with Research Online Change Audience Diversity? Comparing Inclusion Indicators for 2019 & 2020 European Researchers' Night events

description: Taking place annually in more than 400 cities, European Researchers’ Night is a pan- European synchronized event that aims to bring researchers closer to the public. In this paper audience profiles are compared from events in 2019 and 2020. In 2019, face-to-face events reached an estimated 1.6 million attendees, while in 2020, events shifted online due to the COVID-19 pandemic and reached an estimated 2.3 million attendees. Focusing on social inclusion metrics, survey data is analyzed across two national contexts (Ireland and Malta) in 2019 (n=656) and 2020 (n=506). The results from this exploratory, descriptive study shed light on how moving public engagement with research online shifted audience profiles. Based on prior research about the digital divide in access and use of online media, hypotheses were proposed that online European Researchers’ Night events would attract audiences with higher educational attainment levels and greater self-reported, subjective economic well-being. While changes were observed from 2019 to 2020, results for each hypothesis show a mixed picture. The first hypothesis was upheld for the highest education levels but failed for the lowest levels suggesting that the pivot to online events simultaneously attracted participants with no formal education and those with postgraduate qualifications, while attracting less of those with undergraduate or lower levels of education. The second hypothesis was not upheld, with online European Researchers’ Night events attracting audiences with slightly higher levels of economic well-being compared to face-to-face events. The findings of this study indicate that European Researchers’ Night events present a clear opportunity to measure the effects of the digital divide in relation to public engagement with research across Europe.
description: Article linked to this dataset published in PLOS ONE.
DOI: 10.5281/zenodo.5830026
title: How does moving Public Engagement with Research Online Change Audience Diversity? Comparing Inclusion Indicators for 2019 & 2020 European Researchers' Night events

description: Taking place annually in more than 400 cities, European Researchers’ Night is a pan- European synchronized event that aims to bring researchers closer to the public. In this paper audience profiles are compared from events in 2019 and 2020. In 2019, face-to-face events reached an estimated 1.6 million attendees, while in 2020, events shifted online due to the COVID-19 pandemic and reached an estimated 2.3 million attendees. Focusing on social inclusion metrics, survey data is analyzed across two national contexts (Ireland and Malta) in 2019 (n=656) and 2020 (n=506). The results from this exploratory, descriptive study shed light on how moving public engagement with research online shifted audience profiles. Based on prior research about the digital divide in access and use of online media, hypotheses were proposed that online European Researchers’ Night events would attract audiences with higher educational attainment levels and greater self-reported, subjective economic well-being. While changes were observed from 2019 to 2020, results for each hypothesis show a mixed picture. The first hypothesis was upheld for the highest education levels but failed for the lowest levels suggesting that the pivot to online events simultaneously attracted participants with no formal education and those with postgraduate qualifications, while attracting less of those with undergraduate or lower levels of education. The second hypothesis was not upheld, with online European Researchers’ Night events attracting audiences with slightly higher levels of economic well-being compared to face-to-face events. The findings of this study indicate that European Researchers’ Night events present a clear opportunity to measure the effects of the digital divide in relation to public engagement with research across Europe.
description: Article linked to this dataset published in PLOS ONE.
DOI: 10.5281/zenodo.5830109
title: Collection of primary literature pdfs from the Goldberg reviews

description: These are the archive copies of all currently crawled pdf files from the Goldberg reviews.
DOI: 10.5281/zenodo.5829744
title: Dataset for the refractory aerosol thermal desorption mass spectrometer (rTDMS)

description: A particle mass spectrometer to quantify non-refractory and refractory aerosols (referred to as refractory aerosol thermal desorption mass spectrometer: rTDMS) has been developed. The combination of a graphite particle collector and a carbon dioxide laser enables high desorption temperature. Ion signals originating from evolved gas molecules are detected by a quadrupole mass spectrometer.
description: {"references": ["Kobayashi, Y., Ide, Y., and Takegawa, N.: Development of a novel particle mass spectrometer for online measurements of refractory sulfate aerosols, Aerosol Sci. Technol., 55, 371-386, https://doi.org/10.1080/02786826.2020.1852168, 2021.", "Kobayashi, Y. and Takegawa, N.: A new method to quantify particulate sodium and potassium salts (nitrate, chloride, and sulfate) by thermal desorption aerosol mass spectrometry, Atmos. Meas. Tech. Discuss., https://doi.org/10.5194/amt-2021-228, 2021."]}
DOI: 10.5281/zenodo.5829743
title: Dataset for the refractory aerosol thermal desorption mass spectrometer (rTDMS)

description: A particle mass spectrometer to quantify non-refractory and refractory aerosols (referred to as refractory aerosol thermal desorption mass spectrometer: rTDMS) has been developed. The combination of a graphite particle collector and a carbon dioxide laser enables high desorption temperature. Ion signals originating from evolved gas molecules are detected by a quadrupole mass spectrometer.
description: {"references": ["Kobayashi, Y., Ide, Y., and Takegawa, N.: Development of a novel particle mass spectrometer for online measurements of refractory sulfate aerosols, Aerosol Sci. Technol., 55, 371-386, https://doi.org/10.1080/02786826.2020.1852168, 2021.", "Kobayashi, Y. and Takegawa, N.: A new method to quantify particulate sodium and potassium salts (nitrate, chloride, and sulfate) by thermal desorption aerosol mass spectrometry, Atmos. Meas. Tech. Discuss., https://doi.org/10.5194/amt-2021-228, 2021."]}
DOI: 10.5517/ccdc.csd.cc25ft8q
title: CCDC 2009273: Experimental Crystal Structure Determination

description: Related Article: Amira Abdelmadjid Madi, Djahida Haffar, Fatiha Benghanem|2020|CSD Communication|||
description: Related Article: Amira Abdelmadjid Madi, Djahida Haffar, Fatiha Benghanem, Samira Ghedjati, Linda Toukal, Vincent Dorcet, Riadh Bourzami|2020|J.Mol.Struct.|1227|129368|doi:10.1016/j.molstruc.2020.129368
DOI: 10.5517/ccdc.csd.cc28l9mt
title: CCDC 2102966: Experimental Crystal Structure Determination

description: Related Article: Bo-Kai Su, Yi-Hung Liu, Shie-Ming Peng, Shiuh-Tzung Liu|2021|Organometallics|40|4110|doi:10.1021/acs.organomet.1c00569
DOI: 10.34740/kaggle/dsv/3018367
title: Cryptocurrency extra data - Litecoin
DOI: 10.6084/m9.figshare.18074270.v1
title: 201186-2.xlsx

description: Microarray analysis of normalized mRNA expression of genes in H3122 cells treated with DMSO or YHO-1701 (3 µM) for 24 h.
DOI: 10.6084/m9.figshare.18074270
title: 201186-2.xlsx

description: Microarray analysis of normalized mRNA expression of genes in H3122 cells treated with DMSO or YHO-1701 (3 µM) for 24 h.
DOI: 10.6084/m9.figshare.18079136
title: Master Data.xlsx

description: Underlying data for a submission to F1000Research entitled: <b>Correlation between serum methotrexate-polyglutamate 3 (MTX-PG3) level and disease activity in rheumatoid arthritis patients: A prospective cohort study by Eva Musdalita et al</b><b></b>
DOI: 10.34740/kaggle/dsv/3018472
title: AutoXGB
DOI: 10.6084/m9.figshare.17040803
title: Supplementary material.docx

description: This research investigated the response of soil macroinvertebrates to paddy rice farming pathways. It was approved by University of Nairobi, School of Biological Studies and Makerere University. Soil samples for macroinvertebrate analysis were collected by digging monoliths measuring 25cmx25cmx15cm. Richness was obtained and evenness and diversity calculated using diversity indices. Rank-abundance curves were also generated and correlations made with environmental variables. Ordination, permanova, SIMPER, envfit and correlation analyses were all performed in R 4.0.4
DOI: 10.6084/m9.figshare.17040803.v2
title: Supplementary material.docx

description: This research investigated the response of soil macroinvertebrates to paddy rice farming pathways. It was approved by University of Nairobi, School of Biological Studies and Makerere University. Soil samples for macroinvertebrate analysis were collected by digging monoliths measuring 25cmx25cmx15cm. Richness was obtained and evenness and diversity calculated using diversity indices. Rank-abundance curves were also generated and correlations made with environmental variables. Ordination, permanova, SIMPER, envfit and correlation analyses were all performed in R 4.0.4
DOI: 10.6084/m9.figshare.17040803.v1
title: Supplementary material.docx

description: This research investigated the response of soil macroinvertebrates to paddy rice farming pathways. The research was approved by University of Nairobi, School of Biological Studies and Makerere University. Soil samples for macroinvertebrates were collected by digging monoliths measuring 25cmx25cmx10cm deep. Richness, evenness, and diversity were calculated. Rank-abundance curves generated. Ordination, permanova, SIMPER, envfit and correlation analyses were all performed in R 4.0.4
DOI: 10.6084/m9.figshare.17099957
title: RNA sequencing P. euphratica salt uptake extrusion experiment

description: RNA-seq procedure: Raw sequence data have been deposited in the ArrayExpress database at EMBL-EBI (accession number E-MTAB-8988). Processing of raw sequence data was performed with fastp (Chen et al. 2018) using default parameters. The processed sequences were mapped against the transcriptome of Populus euphratica (GCF_000495115.1_PopEup_1.0_rna.fna.gz, https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/13265) using Bowtie 2 (Langmead and Salzberg, 2012). Depending on the sample, 88.4 to 92.1 % of all filtered reads could be mapped to a gene model. Bowtie mapping files were summarized to count tables of the gene models in R (R Core Team 2018) (Supplemental Table S1). Identification of differentially expressed transcripts was conducted using the DESeq2 package (Love et al., 2014), using a generalized linear model with Benjamini and Hochberg correction to adjust p-values.
DOI: 10.6084/m9.figshare.17099957.v2
title: RNA sequencing P. euphratica salt uptake extrusion experiment

description: RNA-seq procedure: Raw sequence data have been deposited in the ArrayExpress database at EMBL-EBI (accession number E-MTAB-8988). Processing of raw sequence data was performed with fastp (Chen et al. 2018) using default parameters. The processed sequences were mapped against the transcriptome of Populus euphratica (GCF_000495115.1_PopEup_1.0_rna.fna.gz, https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/13265) using Bowtie 2 (Langmead and Salzberg, 2012). Depending on the sample, 88.4 to 92.1 % of all filtered reads could be mapped to a gene model. Bowtie mapping files were summarized to count tables of the gene models in R (R Core Team 2018) (Supplemental Table S1). Identification of differentially expressed transcripts was conducted using the DESeq2 package (Love et al., 2014), using a generalized linear model with Benjamini and Hochberg correction to adjust p-values.
DOI: 10.6084/m9.figshare.17099957.v1
title: Untitled Item

description: RNA-seq procedure: Raw sequence data have been deposited in the ArrayExpress database at EMBL-EBI (accession number E-MTAB-8988). Processing of raw sequence data was performed with fastp (Chen et al. 2018) using default parameters. The processed sequences were mapped against the transcriptome of Populus euphratica (GCF_000495115.1_PopEup_1.0_rna.fna.gz, https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/13265) using Bowtie 2 (Langmead and Salzberg, 2012). Depending on the sample, 88.4 to 92.1 % of all filtered reads could be mapped to a gene model. Bowtie mapping files were summarized to count tables of the gene models in R (R Core Team 2018) (Supplemental Table S1). Identification of differentially expressed transcripts was conducted using the DESeq2 package (Love et al., 2014), using a generalized linear model with Benjamini and Hochberg correction to adjust p-values.
DOI: 10.34740/kaggle/dsv/3018527
title: Cryptocurrency extra data - Monero
DOI: 10.34740/kaggle/dsv/3018589
title: Omicron daily cases by country (COVID-19 variant)
DOI: 10.6084/m9.figshare.18086747
title: Crude oil price.xlsx

description: Crude oil price
DOI: 10.6084/m9.figshare.18086636
title: Therapeutical interference with the epigenetic landscape of germ cell tumors: a comparative drug study and new mechanistical insights

description: Background: Type II germ cell tumors (GCT) are the most common solid cancers in males of age 15 to 35 years. Treatment of these tumors includes cisplatin-based therapy achieving high cure rates, but also leading to late toxicities. As mainly young men are suffering from GCTs, late toxicities play a major role regarding life expectancy, and the development of therapy resistance emphasizes the need for alternative therapeutic options. GCTs are highly susceptible to interference with the epigenetic landscape; therefore, this study focuses on screening of drugs against epigenetic factors as a treatment option for GCTs.<br> Results:We present seven different epigenetic inhibitors efficiently decreasing cell viability in GCT cell lines including cisplatin-resistant subclones at low concentrations by targeting epigenetic modifiers and interactors, like histone deacetylases (Quisinostat), histone demethylases (JIB-04), histone methyltransferases (Chaetocin), epigenetic readers (MZ-1, LP99) and polycomb-repressive complexes (PRT4165, GSK343). Mass spectrometry-based analyses of the histone modification landscape revealed effects beyond the expected mode-of-action of each drug, suggesting a wider spectrum of activity than initially assumed. Moreover, we characterized the effects of each drug on the transcriptome of GCT cells by RNA sequencing and found common deregulations in gene expression of ion transporters and DNA binding factors. A kinase array revealed deregulations of signaling pathways, like cAMP, JAK-STAT and WNT.<br> Conclusion:Our study identified seven drugs against epigenetic modifiers to treat cisplatin-resistant GCTs. Further, we extensively analyzed off-target effects and modes-of-action, which are important for risk assessment of the individual drugs.