DOI: 10.5878/qpef-2205
title: Subcellular Thiol Functional Group Distribution in Geobacter sulfurreducens Determined by Hg LIII-Edge EXAFS: Research Data
title: Subcellular Thiol Functional Group Distribution in Geobacter sulfurreducens Determined by Hg LIII-Edge EXAFS: Research Data

description: This dataset is linked to a manuscript that is currently under submission: “Subcellular Thiol Functional Group Distribution in Geobacter sulfurreducens Determined by Hg LIII-Edge EXAFS.” The dataset includes diverse measurements and spectroscopic data used to investigate subcellular thiol concentrations in Geobacter sulfurreducens PCA (G. sulfurreducens).

The dataset comprises measurements of subcellular biomass, total organic carbon (TOC), total sulfur (TS), thiol groups (RSH), and spectroscopic data (EXAFS and XANES) collected to characterize subcellular compartments of G. sulfurreducens PCA (Caccavo et al., 1994), including extracellular, periplasmic, cytoplasmic, and membrane fractions.

TOC and TS were quantified using an elemental analyzer (Vario MACRO cube) with a relative standard deviation (RSD) of 0.5%. Total mercury concentrations were determined by combustion atomic absorption spectrometry with a direct mercury analyzer (DMA-80, Milestone; detection limit = 0.01 ng; RSD = 6%).

Sulfur K-edge XANES spectra were collected at the 4B7A Medium Energy X-ray Beamline of the Beijing Synchrotron Radiation Facility. Data processing, including normalization and linear combination fitting (LCF), was performed using the Larch software package.

Hg LIII-edge EXAFS spectra were acquired at Diamond Light Source (Beamline I20-scanning). Data analysis and fitting were carried out using WinXAS in combination with FEFF-7.

Further details are provided in the accompanying README.txt file. Full publication details, including the journal name, will be added once the manuscript has been accepted and published.
description: Detta dataset är kopplat till ett manuskript som för närvarande är under granskning: “Subcellular Thiol Functional Group Distribution in Geobacter sulfurreducens Determined by Hg LIII-Edge EXAFS.” Datasetet innehåller olika mätningar och spektroskopiska data som används för att undersöka subcellulära tiolkoncentrationer i Geobacter sulfurreducens PCA (G. sulfurreducens).

Datasetet omfattar mätningar av subcellulär biomassa, totalt organiskt kol (TOC), totalt svavel (TS), tiolgrupper (RSH) samt spektroskopiska data (EXAFS och XANES) insamlade för att karakterisera subcellulära fraktioner av G. sulfurreducens PCA (Caccavo et al., 1994), inklusive extracellulära, periplasmiska, cytoplasmatiska och membranfraktioner.

TOC och TS kvantifierades med en elementaranalysator (Vario MACRO cube) med en relativ standardavvikelse (RSD) på 0,5 %. Totala kvicksilverkoncentrationer bestämdes med förbränningsatomabsorptionsspektrometri med en direktkvicksilveranalysator (DMA-80, Milestone; detektionsgräns = 0,01 ng; RSD = 6 %).

Svavel K-kant XANES-spektra samlades in vid 4B7A Medium Energy X-ray Beamline vid Beijing Synchrotron Radiation Facility. Databearbetning, inklusive normalisering och linjärkombinationsanpassning (LCF), utfördes med Larch-programvaran.

Hg LIII-kant EXAFS-spektra erhölls vid Diamond Light Source (Beamline I20-scanning). Dataanalys och anpassning utfördes med WinXAS i kombination med FEFF-7.

Ytterligare detaljer finns i den medföljande filen README.txt. Fullständiga publiceringsuppgifter, inklusive tidskriftsnamn, kommer att tillhandahållas när manuskriptet har accepterats och publicerats.