cometadata/datacite-titles-descriptions-related-identifiers huggingface dataset:
DOI: 10.5281/zenodo.51713
title: Testing Sky Brightness Models Against Radial Dependency: A Dense Two Dimensional Survey Around The City Of Madrid, Spain: Sqm Data

description: We present a study of the night sky brightness around the extended<br>
metropolitan area of Madrid using Sky Quality Meter (SQM) photometers. The map is the first to cover the spatial distribution of the sky brightness in the<br>
center of the Iberian peninsula. These surveys are neccessary to test the light<br>
pollution models that predict night sky brightness as a function of the<br>
location and brightness of the sources of light pollution and the scattering of<br>
light in the atmosphere. We describe the data-retrieval methodology, which<br>
includes an automated procedure to measure from a moving vehicle in order to<br>
speed up the data collection, providing a denser and wider survey than previous<br>
works with similar time frames. We compare the night sky brightness map to the<br>
nocturnal radiance measured from space by the DMSP satellite. We find that i) a<br>
single source model is not enough to explain the radial evolution of the night<br>
sky brightness, despite the predominance of Madrid in size and population, and<br>
ii) that the orography of the region should be taken into account when deriving<br>
geo-specific models from general first-principles models. We show the tight<br>
relationship between these two luminance measures. This finding sets up an<br>
alternative roadmap to extended studies over the globe that will not require<br>
the local deployment of photometers or trained personnel.
description: This data is the source of Zamorano, J., de Miguel, A. S., Ocaña, F., Pila-Diez, B., Castaño, J. G., Pascual, S., ... & Nievas, M. (2015). Testing sky brightness models against radial dependency: a dense two dimensional survey around the city of Madrid, Spain. JQSRT. doi:10.1016/j.jqsrt.2016.02.029
DOI: 10.5281/zenodo.51715
title: Quasar Spectra And Absorption Profile Fits Of He 0515-4414 For Limiting Fine-Structure Constant Variability

description: This is the first public pre-release upon submission to MNRAS and to obtain a DOI.
DOI: 10.14469/hpc/526
title: Desilylation using sodium acetate,to 5-coord intermediate TS1 freq

description: Gaussian Calculation
DOI: 10.14469/hpc/527
title: Desilylation using sodium acetate,to 5-coord intermediate TS1 IRC

description: Gaussian Calculation
DOI: 10.6092/unibo/amsacta/5157
title: Zeri Photo Archive RDF Dataset

description: The Zeri Photo Archive RDF dataset represents a considerable subset of data already available at Zeri Catalog web site and discoverable through the Europeana Portal, mostly regarding works of Modern Art (15th-16th centuries): about 19.000 works of art and more than 30.000 photographs depicting such works are accurately described by means of like 10 million of RDF triples.
DOI: 10.15472/7pwqdq
title: Plantas priorizadas para la conservación en la Región del Eje Cafetero

description: Este listado contiene 40 especies de plantas, priorizadas a través de un ejercicio de calificación para el Eje Cafetero, utilizando la matriz de Prioridad de conservación y Capacidad de Gestión como lo sugiere la estrategia nacional de conservación de plantas amenazadas. El taller se realizó en la cuidad de Manizales en el mes de mayo del 2011 y fue coordinado por el Jardín Botánico de la Universidad de Caldas y el Instituto Alexander Von Humboldt. A el asistieron 29 personas, representando 17 instituciones (CAR’s, Jardines Botánicos, ONG’s y Herbarios) de los departamentos de Caldas, Tolima, Risaralda y Valle del Cauca. Con la ayuda de bibliografía especializada y la colaboración de algunos expertos botánicos de la región, fueron calificadas 123 especies, seleccionando las de mayor ponderación (40 especies) y convirtiendo esta lista en un instrumento para la planificación de las decisiones frente a la conservación de plantas en la región.
DOI: 10.15472/yotbyy
title: Plantas priorizadas para la conservación en la Región Orinoquia

description: Se implementó la Agenda de investigación y monitoreo mediante su “Metodología para la priorización de especies en Colombia como un requerimiento para programas de conservación”,  empleando criterios de conservación y de gestión para priorizar las especies en el taller de priorización de especies de plantas para la región de la Orinoquia, que se llevó a cabo en la ciudad de Villavicencio (Meta) en la Universidad de los Llanos, los días 29 y 30 de noviembre de 2012, contó con 22 asistentes representando a 14 instituciones, consolidando un listado de especies (73 especies) priorizadas.

Para consolidar los registros biológicos para la Orinoquia, se consultaron los herbarios virtuales como el Herbario Nacional Colombiano (sede Bogotá), Herbario Universidad Distrital (UDBC), Sistema de Información sobre Biodiversidad para Colombia (SIB- Colombia) y de la Universidad de los Llanos como herbario regional; dicha información se consignó en la plantilla para la documentación de registros biológicos de especies basada en el estándar Darwin Core (versión 2011-10-26).
DOI: 10.15472/rj6pz5
title: Plantas priorizadas para la conservación en la Región Caribe

description: En el “Taller regional para la priorización de especies vegetales de interés para la conservación en el Caribe”, que se llevó a cabo en el Jardín Botánico Quinta de San Pedro Alejandrino entre el 1-2 de agosto en la ciudad de Santa Marta, donde participaron 21 entidades, representadas por 26 personas, se consolido un listado de 111 especies de plantas prioritarias para la conservación y con estas especies se construyeron las matrices de Ponderación de la prioridad de conservación para especies y Criterios para ponderar la capacidad de gestión de los programas de conservación de especies prioritarias para la conservación, basándose en la Estrategia Nacional para la Conservación de Plantas.

Luego se incorporó el formtato DwC para la estandarización de datos.
DOI: 10.15128/1n79h428d
title: Excitation of knotted vortex lines in matter waves: Supporting data

description: Supporting data for the publication http://arxiv.org/abs/1512.01012, "Excitation of knotted vortex lines in matter waves".  Authors: Fabian Maucher, Simon A. Gardiner, Ifan G. Hughes.
description: Abstract from paper: Abstract. We study the creation of knotted ultracold matter waves in Bose-Einstein
condensates via coherent two-photon Raman transitions with a Λ level configuration. The Raman transition allows an indirect transfer of atoms from the internal state |a&gt; to the target state |b&gt; via an excited state |e&gt;, that would be otherwise dipole-forbidden.
This setup enables us to imprint three-dimensional knotted vortex lines embedded in the the probe field to the density in the target state. We elaborate on experimental feasibility as well as on subsequent dynamics of the matter wave.
DOI: 10.14469/hpc/533
title: PentaSi_1 (pentavalent Si) (opt freq)

description: Gaussian Calculation
DOI: 10.14469/hpc/534
title: A_Product_1 (opt freq)

description: Gaussian Calculation
DOI: 10.14469/hpc/535
title: A_Reactant_1 (opt freq)

description: Gaussian Calculation
DOI: 10.14469/hpc/536
title: isoB_Reactant_1

description: Gaussian Calculation
DOI: 10.14469/hpc/537
title: isoB_Product_1

description: Gaussian Calculation
DOI: 10.5281/zenodo.51745
title: Action Potential Dependent Sipscs From Juvenile (P21-30) C57Bl/6J Male Mice

description: species : Mus musculus

sex : male

strain : C57BL/6J

age : post-natal day 21-30

Voltage-clamp recordings of GABAA spontaneous inhibitory post-synaptic currents (sIPSCs) were obtained from juvenile (P21-30) C57BL/6J male mice. The dataset contains 267 individual events recorded from 3 different neurons (expA1-A3).
DOI: 10.15129/ac8aeef2-8109-4c20-bb0d-d8d808e3ceda
title: The IPaul NHC Ligand and Complexes Thereof

description: This dataset is associated with a project to prepare and characterise a new NHC ligand, which can affect the properties of metal compounds that can be used as catalysts. Characterisation data for the 'IPaul' N-heterocyclic carbine ligand, and silver, copper, iridium, and nickel complexes thereof is included. This includes NMR spectroscopy data and mass spectroscopy data that indicate the identity of the new chemical compounds that were prepared as part of the study.
DOI: 10.15472/1jkyqv
title: Flora del piedemonte araucano, municipio de Tame, Arauca

description: Bajo el marco del proyecto "Planeación ambiental para la conservación de la biodiversidad en las áreas operativas de Ecopetrol", adelantado por el Instituto Humboldt y Ecopetrol, se realizó el inventario de las plantas vasculares para la zona del Oso ubicada en el municipio de Tame, departamento de Arauca, región de la Orinoquia. Para la realización del inventario, se llevó a cabo una salida de campo que fue realizada con la Fundación Yoluka, ONG que ha adelantado varios trabajos de investigación en las sabanas del Casanare y en otras regiones del país. Durante 10 días el equipo de investigadores de la Fundación y del Instituto Humboldt realizó los muestreos para plantas. Finalmente, se registraron 268 especies de plantas vasculares, agrupadas en 90 familias. Entre estas especies se encuentra una con categoría nacional de amenaza Vulnerable (VU), según los criterios de la UICN: el cedro amargo (Cedrela odorata). Además, se definieron 8 especies de plantas como Objeto de Conservación (OdC): Aniba panurensis, Calathea sp. nov, Cedrela odorata, Cyathea andina, Encyclia profusa, Eschweilera caudiculata, Mabea macrocalix y Pachira quinata.

En total se registraron 281 especies derivadas de 576 registros biológicos. La base de datos de registros fue incorporada dentro de la Infraestructura Institucional de Datos del Instituto Humboldt.
DOI: 10.14469/hpc/528
title: Desilylation using sodium acetate,to 5-coord product

description: Gaussian Calculation
DOI: 10.15129/26e38705-5d3d-47c2-9b15-b2aef53641a2
title: PVDF crystal structures

description: Input files for Quantum ESPRESSO for alpha, delta and beta phases. Ultrasoft pseudopotentials used were downloaded from the QE website. The exchange and correlation potentials in the input files are LDA, PBE, vdW-DF, vdW-DF2 and DFT-D.
DOI: 10.5281/zenodo.51842
title: Parallel Reverse Genetic Screening In Mutant Human Cells Using Transcriptomics - Data And Analyses

description: This dataset contains data files and analysis code associated with manuscript entitled "Parallel reverse genetic screening in mutant human cells using transcriptomics".

Data files include expression profiles for over 1800 RNA-seq samples and annotations.

Analysis files include R scripts to generate summary figures.
DOI: 10.14469/hpc/529
title: Desilylation using sodium acetate,to 5-coord reactant

description: Gaussian Calculation
DOI: 10.14469/hpc/530
title: IRC_A_isoTS_1 (Esilylenol ether) (IRC)

description: Gaussian Calculation
DOI: 10.14469/hpc/531
title: IRC_C_isoTS_1 (Esilylenol ether) (IRC)

description: Gaussian Calculation
DOI: 10.14469/hpc/532
title: IRC_C_TS_1 (Zsilylenol ether) (IRC)

description: Gaussian Calculation
DOI: 10.14469/hpc/541
title: Da_isoTS_1 (E silylenol ether) (ts)

description: Gaussian Calculation
DOI: 10.14469/hpc/538
title: 12...HOMe X-ray conformation methanol TS Def2-TZVPPD + MeOH solvent

description: Gaussian Calculation
DOI: 10.14469/hpc/542
title: isoC_Reactant_1 (opt freq)

description: Gaussian Calculation
DOI: 10.14469/hpc/543
title: C_Product_1 (opt freq)

description: Gaussian Calculation
DOI: 10.14469/hpc/544
title: isoC_Product_1 (opt freq)

description: Gaussian Calculation
DOI: 10.18434/t4x59v
title: NIST Mated Fingerprint Card Pairs 2 (MFCP2), NIST Special Database 14
DOI: 10.14469/hpc/545
title: C_Reactant_1 (opt freq)

description: Gaussian Calculation
DOI: 10.14469/hpc/546
title: isoA_Reactant_1 (opt freq)

description: Gaussian Calculation
DOI: 10.14469/hpc/547
title: Db_isoTS_1 (Esilylenol ether) (ts)

description: Gaussian Calculation
DOI: 10.14469/hpc/548
title: Db_TS_1 (Z silylenol ether) (ts)

description: Gaussian Calculation
DOI: 10.18434/t4sg6k
title: NIST Plain and Rolled Images from Paired Fingerprint Cards, NIST Special Database 29
DOI: 10.15472/vgvll2
title: Arañas de Colombia (Arachnida: Araneae)

description: Este listado contiene 914 especies de arañas citadas en localidades colombianas. Información recogida y compilada de 273 documentos científicos, que aportan el nombre válido de la especie, su distribución en América y en Colombia, así como el rango altitudinal en el cual han sido colectados, el museo en el que se encuentran depositados. Este listado pretende ser una herramienta de consulta rápida y eficaz para aquellos interesados en la aracnofauna existente en Colombia.

Abstract:

The present list reviews 914 species of spiders with occurrence in Colombia. The source information was obtained and compiled from two hundred seventy-three scientific documents which provided the valid name of the species, distribution in the Americas and Colombia, elevation range of specimens, and the collections where specimens were deposited. The aim of this list is to be a quick reference tool for those interested in the existing arachnofauna of Colombia.
DOI: 10.15472/dwbd29
title: Servicios ecosistémicos de especies de fauna y flora presentes en la Orinoquía colombiana

description: Base de datos creada a partir de recopilación de información primaria y secundaria. Contiene 128 especies de fauna y flora presentes en la Orinoquía colombiana y los servicios ecosistemicos que prestan. Contiene nombres científicos, comunes en español y sikuani y el tipo de cobertura en el que se encuentra.
DOI: 10.15472/yzo28f
title: Vertebrados terrestres endémicos y amenazados de Colombia

description: La información de las especies del país en muchos casos se encuentra en fuentes diversas y no existe un consolidado de esta. Por tal razón se plantea la necesidad de acudir a las fuentes de información publicadas y copiarla de manera organizada en bases de datos para su uso por parte de los investigadores.

En este caso se hizo una revisión de fuentes potenciales de información de listados de especies, taxonomía, distribución, rasgos de historia de vida y ecología de las especies amenazadas y endémicas de vertebrados terrestres. La búsqueda de fuentes bibliográficas se hizo a través de buscadores con las siguientes palabras clave: Threatened, UICN, CITES, Endémico, Endemic, Vulnerable, Near threatened, Casi amenazado, Endangered, En peligro, Critically endangered, Aves, Bird, Mamíferos, Mammal, Mammalia, Reptiles, Reptile, Reptilia, Anfibios, Amphibia y Amphibian. Adicionalmente se utilizó la resolución 383 del 23 de febrero de 2010 del entonces Ministerio de Ambiente, Vivienda y Desarrollo Territorial

Una vez tenidas las referencias de las fuentes se procedió a la extracción de la información y la organización de ésta en unas planillas entregadas por el CAS. Las plantillas fueron revisadas y supervisadas por Iván González del CAS con ayuda y apoyo de Johanna Velásquez de la Infraestructura Institucional de Datos (I2D), quien posteriormente haría la curaduría de la información para publicarla en el IPT del IAvH.

La recopilación de la información se resume en 46 fuentes bibliográficas y 1333 especies. Taxonómicamente la información recopilada abarca 4 clases,  34 órdenes,  126 familias y 462 géneros.
DOI: 10.14469/hpc/549
title: isoA_Product_1 (opt freq)

description: Gaussian Calculation
DOI: 10.15472/3alff8
title: Flora y fauna del municipio de Paipa, Boyacá

description: La región de Paipa hace parte del cinturón de páramos de la Cordillera Oriental, donde se encuentran los de mayor extensión y número de especies respecto a los páramos de las otras cordilleras.  Se caracteriza por presentar dos ecosistemas muy importantes para el aprovisionamiento de agua y claramente diferenciados entre sí: los páramos y los bosques altoandinos. Los páramos se destacan por su gran diversidad de frailejones y por su alto nivel de endemismo de especies, es decir, que las especies que se encuentran allí no se encuentran en ningún otro lugar del mundo. Los bosques altoandinos son en su mayoría secundarios, alcanzan en los sitios de mejor desarrollo 15 m de altura, presentan abundantes epífitas sobre troncos y ramas, y en algunos casos pueden estar dominados por encenillos (Weinmannia tomentosa), susques (Ocotea calophylla) o robles (Quercus humboldtii, Vulnerable) (Cárdenas y Salinas 2007).

El área de estudio cuenta con áreas emblemáticas como El Parque Natural Municipal Ranchería, que abarca áreas de páramo y de bosque altoandino, y la Laguna El Palmar, que se caracteriza por no drenar a través de una quebrada sino por un desagüe subterráneo.  En esta zona existe una alta presión por la expansión de los sistemas agropecuarios, lo que se evidencia en franjas estrechas de bosque en la rivera de las quebradas, en la fragmentación de las coberturas naturales y en la reforestación con especies introducidas. 

Con el fin de conocer más detalladamente esta región, en abril de 2013 un grupo de trabajo conformado por los investi¬gadores del Instituto de Investigación en Recursos Biológicos Alexander von Hum¬boldt (IAvH), el grupo de investigación LimnoBasE-BiotaMAR de la Universidad de Antioquia, la Fundación Natura y la comunidad local, llevaron a cabo una investigación de campo para identificar las especies de animales y plan¬tas que habitan los páramos y los bosques altoandinos de Paipa. 

Esta investigación se desarrolla en el mar¬co del proyecto “Planeación Ambiental para la Conservación de la Biodiversidad en las Áreas Operativas de Ecopetrol” (convenio Ecopetrol - IAvH). En total se registraron 289 especies de fauna y flora. De estas, 179 son plantas, 4 peces, 3 anfibios, 5 reptiles, 84 aves y 14 mamíferos. Es de resaltar el registro de cuatro especies: una planta, el frailejón de Paipa (Espeletia paipana, En Peligro Crítico) (Calderón et al. 2005), una especie microendémica (que solamente se encuentra en una localidad del municipio de Paipa) y de la que al parecer solo quedan 38 individuos; una lagartija restringida a la alta montaña (Anolis heterodermus); una marmosa (Micoureus sp.) nuevo registro para el área de estudio y  la presencia del roedor Thomasomys niveipes que, aunque es abundante en la zona, tiene una distribución restringida a un área de aproximadamente 12.000 km2, en elevaciones superiores a 2.600 m en los departamentos de Cundinamarca y Boyacá (Gómez-Laverde et al. 1997).
DOI: 10.15472/wpgart
title: Magnoliopsidas terrestres endémicas y amenazadas de Colombia

description: La información de las especies del país en muchos casos se encuentra en fuentes diversas y no existe un consolidado de esta. Por tal razón se plantea la necesidad de acudir a las fuentes de información publicadas y copiarla de manera organizada en bases de datos para su uso por parte de los investigadores.

En este caso se hizo una revisión de fuentes potenciales de información de listados de especies, taxonomía, distribución, rasgos de historia de vida y ecología de las especies amenazadas y endémicas de plantas vasculares (Magnoliophyta) terrestres. La búsqueda de fuentes bibliográficas se hizo a través de buscadores con las siguientes palabras clave: Magnoliopsida, Colombia, Plants, Plantas, Threatened, UICN, CITES, Endémico, Endemic, Vulnerable, Near threatened, Casi amenazado, Endangered, En peligro, Critically endangered. Adicionalmente se utilizó la resolución 383 del 23 de febrero de 2010 del entonces Ministerio de Ambiente, Vivienda y Desarrollo Territorial

Una vez tenidas las referencias de las fuentes se procedió a la extracción de la información y la organización de ésta en unas planillas entregadas por el CAS. Las plantillas fueron revisadas y supervisadas por Iván González del CAS con ayuda y apoyo de Johanna Velásquez de la Infraestructura Institucional de Datos (I2D), quien posteriormente haría la curaduría de la información para publicarla en el IPT del IAvH.

La recopilación de la información se resume en 19 fuentes bibliográficas y 95 especies. Taxonómicamente la información recopilada abarca 2 clases, 3 órdenes, 3 familias y 10 géneros.
DOI: 10.15472/p7ynyf
title: Flora y fauna del municipio de Rionegro, Santander

description: Bajo el marco del proyecto "Planeación ambiental para la conservación de la biodiversidad en las áreas operativas de Ecopetrol" (convenio Ecopetrol - IAvH), adelantado por el Instituto Humboldt y Ecopetrol, se realizó el inventarios de la flora y fauna de la zona de Rionegro (Santander). El área de estudio presenta una cobertura boscosa de parches relativamente grandes sobre una topografía muy escarpada y abrupta de difícil acceso (por lo cual los hábitats naturales se han preservado relativamente intactos a lo largo del tiempo), que incluye a la subcuenca superior del río Lebrija, la cual abarca a la subcuenca del alto río Lebrija y a la subcuenca del río Negro; esta área en particular para la región carecía de inventarios específicos conocidos. La gran mayoría de los cuerpos de agua identificados corresponden a quebradas que recorren topografías escarpadas, con presencia de fracturas y cascadas, sustratos rocosos y pobres en nutrientes por un lado, y ríos de lecho amplio con sustrato de arena y roca, con conductividades intermedias por el otro. Se diferenciaron de manera general dos grandes unidades de muestreo: 1) la cobertura boscosa presente en el cañón del río Lebrija y el cañón de la quebrada La Honda, y 2) los bosques secundarios de la cuenca del río Negro. En general la zona presenta dos grandes amenazas: deforestación para el establecimiento de sistemas agropecuarios y contaminación de los cuerpos de agua.

Para la realización del inventario, se llevó a cabo una salida de campo que fue realizada con BIOTICA Consultores LTDA, organización que ha adelantado varios trabajos de investigación en la región, y el instituto Humboldt. Durante 10 días se llevó a cabo la investigación de campo en la cual se realizaron los muestreos para flora y fauna. 
Con esta investigación en total se registraron 484 especies, las cuales corresponden a 279 especies de plantas, 30 especies de peces, 12 de anfibios, 12 de reptiles, 111 especies de aves y 40 de mamíferos. 

Es de resaltar el hallazgo de una probable nueva especie de un pez diminuto del género Characidium, en una pequeña quebrada que drena directamente al río Lebrija;  el primer registro para el país de la bromelia Pitcairnia tuberculata; y la ampliación del rango de distribución altitudinal (en más de 500 m) de la rana Allobates niputidia. Así mismo, se  registró una especie de anfibio que solo se encuentra en las zonas altas de la cordillera Oriental (endémico de Boyacá y Santander) (Pristimantis miyatai), dos aves migratorias boreales (que viajan desde Canadá y norte de Estados Unidos hasta nuestro país): el vireo ojirrojo (Vireo olivaceus) y el zorzal carigrís (Catharus minimus); y un reptil, la culebra de la hojarasca (Coniophanes fissidens) con sólo dos registros continentales en el país.
DOI: 10.15472/wossny
title: Polinizadores en Territorio Colombiano

description: La lista de 65 polinizadores enunciada en este recurso se origina a partir de datos reportados en publicaciones científicas, especialmente revistas y journals indexados. La revisión de esas publicaciones es parte del trabajo desarrollado para la elaboración de un documento que contenga la propuesta de la Iniciativa Colombiana de Polinizadores como insumo de política para la gestión sostenible de un servicio ecosistémico estratégico para la productividad nacional.