cometadata/datacite-titles-descriptions-related-identifiers huggingface dataset:
DOI: 10.6084/m9.figshare.24150621
title: Patchy emergence of pathogens associated with an invasive plant and their potential for inducing bioresistance

description: Datasets associated with a manuscript exploring the potential use of soil microbial communities that have adapted to an invasive plant to induce biological resistance to the plant in other locations.<b>Chronosequence_data.xlsx</b> - Experimental results identifying locations with soil microbial communities that suppress the invasive plant <i>Verbena brasiliensis</i>.<b>Spatial_variance_data.xlsx</b> - Experimental results comparing the effects of the soil microbial communities at two sites about 30km apart.<b>Biological_resistance_data.xlsx</b> - Experimental results showing how three soil microbial communities shown previously to suppress <i>V. brasiliensis</i> affect the growth of the invasive plant and a co-occurring native species when introduced into a group of different live background soils.<br><br>
DOI: 10.5281/zenodo.8339363
title: JUMP synonyms table

description: Public table to be queried for translation between InChI key, Entrez, JUMP ID or Broad sample.
DOI: 10.5281/zenodo.8339362
title: JUMP synonyms table

description: Public table to be queried for translation between InChI key, Entrez, JUMP ID or Broad sample.
DOI: 10.5281/zenodo.8350225
title: JUMP synonyms table

description: Public table to be queried for translation between InChI key, Entrez, JUMP ID or Broad sample.
DOI: 10.5281/zenodo.8350361
title: JUMP synonyms table

description: Public table to be queried for translation between InChI key, Entrez, JUMP ID or Broad sample.
DOI: 10.5281/zenodo.8303011
title: PBF-LB/M Ti6Al4V micrographs and labeled manufacturing defects

description: <strong>Desciption:</strong> This dataset contains 775 micrographs of laser additive manufactured Ti6Al4V. Further the dataset contains 1200 labeled binary images of defects classified in lack of fusion (400), keyhole (400) and process pores (400). Additional local extracted features are added as csv File. To all of the 757 micrographs are the process parameter combinations included, also for those which couldn´t be built. The process parameters were created randomly and equally distributed in between limits. The layer thicknesses included are 25 µm, 50 µm, 75 µm and 100 µm. Further the laser power, the hatch distance and the scan speed were changed. The build platform temperature was set to 200 °C. All specimens were printed an a SLM 125 HL by SLM Solutions with CL 41 Ti ELI powder by Concept Laser. <strong>Author Contributions: </strong>Conceptualisation S.M., M.L.A., L.M., A.T.; methodology for (randomised) test series: M.L.A., L.M., S.M.; data creation, printing and imaging: L.M., S.M., T.B.; defect data labeling: M.L.A., T.B.; defect feature extraction: M.L.A.; supervision: A.T.; funding acqusition : A.T. <strong>Funding: </strong>This work is funded by the University of Bremen Research Alliance (UBRA) AI Center for Healthcare within the project ENABLE.
DOI: 10.5281/zenodo.8303010
title: PBF-LB/M Ti6Al4V micrographs and labeled manufacturing defects

description: <strong>Desciption:</strong> This dataset contains 775 micrographs of laser additive manufactured Ti6Al4V. Further the dataset contains 1200 labeled binary images of defects classified in lack of fusion (400), keyhole (400) and process pores (400). Additional local extracted features are added as csv File. To all of the 757 micrographs are the process parameter combinations included, also for those which couldn´t be built. The process parameters were created randomly and equally distributed in between limits. The layer thicknesses included are 25 µm, 50 µm, 75 µm and 100 µm. Further the laser power, the hatch distance and the scan speed were changed. The build platform temperature was set to 200 °C. All specimens were printed an a SLM 125 HL by SLM Solutions with CL 41 Ti ELI powder by Concept Laser. <strong>Author Contributions: </strong>Conceptualisation S.M., M.L.A., L.M., A.T.; methodology for (randomised) test series: M.L.A., L.M., S.M.; data creation, printing and imaging: L.M., S.M., T.B.; defect data labeling: M.L.A., T.B.; defect feature extraction: M.L.A.; supervision: A.T.; funding acqusition : A.T. <strong>Funding: </strong>This work is funded by the University of Bremen Research Alliance (UBRA) AI Center for Healthcare within the project ENABLE.
DOI: 10.5281/zenodo.8350201
title: 230915_Legacy_2021_2022

description: Remote sensed products for Legacy 1 2021 UAV capture - ortho and digital elevation models were processed in Agisoft and the REM was created in ArcMap using CWCB's REMMaker tool. Also included are the ortho and DEM for Legacy 1 2022.
DOI: 10.5281/zenodo.8350200
title: 230915_Legacy_2021_2022

description: Remote sensed products for Legacy 1 2021 UAV capture - ortho and digital elevation models were processed in Agisoft and the REM was created in ArcMap using CWCB's REMMaker tool. Also included are the ortho and DEM for Legacy 1 2022.
DOI: 10.13026/a1j7-ky04
title: MIMIC-IV-ECG - Diagnostic Electrocardiogram Matched Subset

description: The MIMIC-IV-ECG module contains approximately 800,000 diagnostic
electrocardiograms across nearly 160,000 unique patients. These diagnostic
ECGs use 12 leads and are 10 seconds in length. They are sampled at 500 Hz.
This subset contains all of the ECGs for patients who appear in the MIMIC-IV
Clinical Database. When a cardiologist report is available for a given ECG, it
is also provided. The patients in MIMIC-IV-ECG have been matched against the
MIMIC-IV Clinical Database, making it possible to link to information across
the MIMIC-IV modules.
DOI: 10.13026/dp3j-2c96
title: MIMIC-IV-ECG - Diagnostic Electrocardiogram Matched Subset

description: The MIMIC-IV-ECG module contains approximately 800,000 diagnostic
electrocardiograms across nearly 160,000 unique patients. These diagnostic
ECGs use 12 leads and are 10 seconds in length. They are sampled at 500 Hz.
This subset contains all of the ECGs for patients who appear in the MIMIC-IV
Clinical Database. When a cardiologist report is available for a given ECG, it
is also provided. The patients in MIMIC-IV-ECG have been matched against the
MIMIC-IV Clinical Database, making it possible to link to information across
the MIMIC-IV modules.
DOI: 10.6073/pasta/f737d411765fc6ed607ec9dbe18362ee
title: MCR LTER: Coral Reef: Material legacy disturbance type model; data for Kopecky et al., 2023 Ecology

description: This data package contains the code necessary to create a mathematical model of coral reef recovery dynamics following different types and intensities of disturbances that either remove dead coral skeletons (e.g., tropical storms) or leave standing dead skeletons (e.g., coral bleaching) and run associated analyses. We explored the sensitivity of the model to variation in key parameters, such as the strength of herbivory, and the degree to which dead skeletons protect algae from herbivory. Further, we assessed disturbance intensities and values of these parameters that lead to shifts between coral and macroalgae-dominated reefs. This code was published in Ecology and were a part of the thesis of K. Kopecky (2023). Analyses and full methods descriptions of this model can be found in the manuscript “Material legacies can degrade resilience: Structure-retaining disturbances promote regime shifts on coral reefs” (DOI: https://doi.org/10.1002/ecy.4006). No novel data were used or generated in this study. This manuscript uses data collected by the U.S. National Science Foundation's (NSF) Moorea Coral Reef Long Term Ecological Research (MCR LTER) site under Grant No. OCE 2224354 (and earlier awards). Additional financial support to the MCR LTER site was provided through a generous gift from the Gordon and Betty Moore Foundation. Research was completed under permits issued by the French Polynesian Government (Délégation à la Recherche) and the Haut-commissariat de la République en Polynésie Francaise (DTRT) (Protocole d'Accueil 2005-2023).
DOI: 10.22003/xfel.eu-data-004256-00
title: Transient modification of oxygen hybridization in a cuprate superconductor
DOI: 10.22003/xfel.eu-data-005917-00
title: Asymmetric Channelcut polarizer test
DOI: 10.22003/xfel.eu-data-004446-00
title: Exploring low-z Hydrogen jet targets for time-resolved x-ray probing of relativistic laser plasmas at high-repetition rate
DOI: 10.22003/xfel.eu-data-005417-00
title: LTP - Dynamics of nanoscale phenomena in solids and liquids studied with X-ray Transient Gratings at European XFEL (joint FXE/MID) (derived from 3323)
DOI: 10.6084/m9.figshare.24126756
title: <b>Selection of natural compounds as target inhibitors of BACE1 (data set)</b>

description: This repository consists of the following files:(.xlsx file) List of 400 compounds screened (including ID and affinity).(.zip file) Raw data (PDBQT files).
DOI: 10.58020/9ry7-0982
title: Losartan for the Treatment of Pediatric Nonalcoholic Fatty Liver Disease

description: The STOP-NAFLD (Losartan for the Treatment of Pediatric NAFLD) trial was a multicenter, double-masked, placebo-controlled, randomized phase 2 trial designed by the NASH Clinical Research Network to determine whether treatment with losartan improves measures of NAFLD in children. Children between the ages of 8 and 17 years with biopsy-proven NAFLD were eligible for the STOP-NAFLD study. Participants were enrolled and randomized to treatment with either 100 mg of losartan or matching placebo orally once daily for 24 weeks. Improvement in NAFLD at 24 weeks, defined as a decrease in serum alanine aminotransferase (ALT), was assessed as the primary outcome measure. Secondary outcome measures, also assessed at 24 weeks, included relative change in ALT; changes in serum aspartate aminotransferase (AST) and gamma-glutamyl transpeptidase (GGT); change in Homeostatic Model Assessment of Insulin Resistance (HOMA-IR); changes in anthropometric measurements, BMI z-score, and serum lipid profiles; and self-reported quality of life.
DOI: 10.25345/c51v5bq59
title: MassIVE MSV000092870 - French et al, P. biseptata, 2023
title: MS/MS peaklist of P. biseptata supernatant sample after incubation with DFOB and protochelin
DOI: 10.6084/m9.figshare.24150747
title: bifiEBBbenchmarks data folder

description: Populated data folder of the repository bifiEBBbenchmarks. This folder contains the following subfolders:availableFunctions: Gives the names of the implemented bifidelity benchmarksclusterResults: Is empty and is used by the code in the repository to store results when running experimentsfeatures: Contains the feature values for a variety of benchmarks, using both a large and small sample, as well both before and after processingmisc: A folder containing miscellaneous files, mainly related to the SOLAR simulatorsamplePlans: Contains already optimised LHS sample plans and chosen subsets for a variety of sample sizes, seeds and dimensions.This zipped folder should be downloaded and used to replace the empty data folder provided in the repository. For more information, please refer to the readme given in github.
DOI: 10.6084/m9.figshare.24150747.v1
title: bifiEBBbenchmarks data folder

description: Populated data folder of the repository bifiEBBbenchmarks. This folder contains the following subfolders:availableFunctions: Gives the names of the implemented bifidelity benchmarksclusterResults: Is empty and is used by the code in the repository to store results when running experimentsfeatures: Contains the feature values for a variety of benchmarks, using both a large and small sample, as well both before and after processingmisc: A folder containing miscellaneous files, mainly related to the SOLAR simulatorsamplePlans: Contains already optimised LHS sample plans and chosen subsets for a variety of sample sizes, seeds and dimensions.This zipped folder should be downloaded and used to replace the empty data folder provided in the repository. For more information, please refer to the readme given in github.
DOI: 10.26093/cds/vizier.36420086
title: Circumstellar disks in Lupus complex

description: VizieR online Data Catalogue associated with article published in journal Astronomy & Astrophysics with title 'A wide survey for circumstellar disks in the Lupus complex.' (bibcode: 2020A&A...642A..86T)
DOI: 10.5519/qd.9vl27pr5
title: Query on the Natural History Museum Data Portal (data.nhm.ac.uk) (83 records)
DOI: 10.6084/m9.figshare.3761562.v2709
title: Online Labour Index: Measuring the Online Gig Economy for Policy and Research

description: Data repository for the data underlying the Online Labour Index. See http://ilabour.oii.ox.ac.uk online-labour-index/ for details.
DOI: 10.25345/c5x34n30n
title: MassIVE MSV000092871 - Investigating the relationship between islet function and protein abundance
title: We obtained 140 human cadaveric donor islets the Alberta Diabetes Institute IsletCore. We correlated whole islet protein abundances to insulin secretion in response to different macronutrients.
DOI: 10.5066/p9vgxmgn
title: Molecular and distributional data used to investigate misidentifications, population genetic diversity, and spatiotemporal trends in distribution for Pleurobema riddellii to help guide ESA listing decisions

description: We provide genetic and distribution data for the Louisiana Pigtoe, Pleorubema riddellii, to guide decisions related to federal protection for the species under the U.S. Endangered Species Act. Our final dataset includes 125 COI sequences generated as part of our study representing P. riddellii from eight North American river basins. This includes the COI sequence we generated from a museum specimen collected from the Trinity River in the late 1900s, which is the first genetic confirmation of P. riddellii in the Trinity River basin. Also included are sequences from specimens initially identified as Fusconaia cerina (n=3) Fusconaia flava (n=1), Fusconaia sp. (n=5), Pleurobema sintoxia (n=10), and Pustulosa pustulosa (n=1) that were genetically confirmed to be P. riddellii. Additionally, we provide distribution data from freshwater mussel surveys, museum records, and field notes representing 467 records of P. riddellii collected from pre-1900 - 2022. The occurrence data includes records from 9 river basins (Amite, Calcasieu, Neches, Ouachita, Pearl, Red, Sabine, San Jacinto, Trinity), 54 HUC-10 watersheds, and 5 states (Arkansas, Louisiana, Mississippi, Oklahoma, Texas).
DOI: 10.25345/c5sb3x86w
title: MassIVE MSV000092872 - Temporal dynamics of single cell protein covariation during TGFB induced epithelial to mesenchymal transition
title: Single cell proteomic dataset (~420 cells passing filter, 1827 proteins at 1% FDR and 4096 proteins post update via DART-ID) characterizing the Epithelial to Mesenchymal transition induced by TGF-B in MCF10A cells. Cells were sampled from day 0 (epithelial), day 3 (intermediate) and day 9 (sustained) treatment. The single cell samples were prepped using nPoP and prepared in the SCoPE2 format. Dataset also includes two bulk biological replicates (samples from day 0, 3 and 9 respectively) that were analyzed via label free DIA.
DOI: 10.14457/tu.the.2022.551
title: การวิเคราะห์ความคิดเห็นของผู้ใช้งานเพื่อช่วยในการวางแผนการบำรุงรักษาโมบายแอปพลิเคชัน

description: งานวิจัยนี้นำเสนอแนวคิดในการวิเคราะห์ความคิดเห็นของผู้ใช้งานโมบายแอปพลิเคชันแบบอัตโนมัติ โดยวิธีการที่นำเสนอ คือ การสร้างรูปแบบข้อความเพื่อวิเคราะห์ความคิดเห็นของผู้ใช้งาน ซึ่งการวิเคราะห์ความคิดเห็นของผู้ใช้งานแบ่งออกเป็น 2 มุมมอง มุมมองแรกคือมุมมองทางด้านคุณภาพของซอฟต์แวร์ และมุมมองที่สองเป็นมุมมองด้านฟังก์ชันการให้บริการของระบบตามขอบเขต ผลการวิเคราะห์ความคิดเห็นสามารถช่วยในการวางแผนและจัดลำดับความสำคัญของการปรับปรุงและพัฒนาระบบได้อย่างต่อเนื่องและรวดเร็ว เพื่อให้ตอบสนองต่อการใช้งานและตรงตามความต้องการของผู้ใช้งานสำหรับงานวิจัยนี้ได้นำความคิดเห็นของผู้ใช้งานโมบายแอปพลิเคชันของธนาคารเป็นกรณีทดสอบ โดยนำความคิดเห็นของผู้ใช้งานมาสร้างรูปแบบข้อความและจะใช้ชุดข้อมูลมาทดสอบความถูกต้องของการจำแนกหมวดหมู่ การทดสอบแบ่งออกเป็น 4 รูปแบบ ได้แก่ การจำแนกหมวดหมู่ถูกต้องครบถ้วนอยู่ที่ 72% การจำแนกหมวดหมู่ถูกต้องบางส่วน โดยไม่มีการจำแนกผิดอยู่ที่ 13% การจำแนกหมวดหมู่ถูกต้องบางส่วนและผิดบางส่วนอยู่ที่ 9% และการจำแนกหมวดหมู่ไม่ถูกต้องอยู่ที่ 6% จากผลการทดสอบสามารถจัดประเภทของปัญหาได้ 4 ประเภท คือ ปัญหาที่ต้องได้รับการแก้ไขอย่างเร่งด่วน ปัญหาการใช้งานทั่วไป คำร้องหรือคำแนะนำของผู้ใช้งาน และการสอบถามรายละเอียดเพิ่มเติม
DOI: 10.14457/tu.the.2022.552
title: Predicting gamefi’s daily market direction

description: This study presents predicting the direction of the GameFi market on a daily basis. GameFi is a Blockchain product that is a combination of gaming and trading. The customer can make profits from playing, buying, and selling items in-game. Although GameFi is easy to make money, the GameFi market has a high price deviation. As we know, machine learning can predict the future by using historical data or attribute data such as open, high, low, close, volume, and market cap, so many researchers try to create machine learning models to predict the market value of stock, gold, gas, and recently cryptocurrency. The main purpose of this paper is to predict the price direction of GameFi on a daily basis by comparing the performance of SVM and Random Forest on selected features. The experimental result shows that SVM prediction performance result is best at 64.1% with all original features, while the Random Forest performance is best at 85% with some selected features. This study concludes that a suitable model for predicting the direction of the GameFi market on a daily basis is Random Forest.
DOI: 10.14457/tu.the.2022.553
title: การจำแนกอารมณ์และระดับอารมณ์ของมนุษย์จากการแสดงออกทางสีหน้าและภาษากาย

description: งานวิจัยนี้ได้เสนอขั้นตอนการรู้จำอารมณ์ของมนุษย์ จากการแสดงออกทางสีหน้าและภาษากายด้วยการวิเคราะห์ภาพ เพื่อทำให้คอมพิวเตอร์สามารถประมวลผลอารมณ์และระดับอารมณ์ได้หลากหลายมากยิ่งขึ้น โดยแบ่งการทำงานของระบบออกเป็น 4 ขั้นตอน คือ ขั้นตอนการเตรียมภาพ ขั้นตอนการแบ่งส่วนของภาพ ขั้นตอนการหาคุณลักษณะ และขั้นตอนการจำแนก ในขั้นตอนการเตรียมภาพจะปรับปรุงคุณภาพของภาพนำเข้าให้ดีขึ้นก่อนการประมวลผลจริง ในขั้นตอนการแบ่งส่วนของภาพจะแบ่งส่วนของภาพออกเป็น 2 ส่วน คือ ส่วนของใบหน้า และส่วนของร่างกาย ในขั้นตอนการหาคุณลักษณะจะทำการหาคุณลักษณะของวัตถุต่าง ๆ ในภาพ โดยใช้วิธี HOG, Star Skeletonization และ Shoulder Slope และในขั้นตอนการจำแนกจะนำข้อมูลคุณลักษณะของวัตถุไปวิเคราะห์ว่าเป็นการแสดงออกทางอารมณ์ใด และมีระดับอารมณ์เท่าใด ชุดข้อมูลที่ใช้ในการทดลองประกอบด้วยภาพการแสดงอารมณ์และระดับอารมณ์ของมนุษย์ที่มีการแสดงอารมณ์ความสุขปกติ ความสุขมาก โกรธปกติ โกรธมาก ประหลาดใจปกติ และประหลาดใจมาก รวม 600 ภาพ โดยผลการทดลองพบว่าการนำภาษากายมาวิเคราะห์อารมณ์และระดับอารมณ์ร่วมกับการแสดงออกทางสีหน้า ให้ค่าความถูกต้องร้อยละ 80.56 และ 83.89 จากตัวจำแนก k-NN และ SVM ตามลำดับ ซึ่งมีผลความถูกต้องมากกว่าการวิเคราะห์จากการใช้การแสดงออกทางสีหน้าเพียงอย่างเดียว
DOI: 10.14457/tu.the.2022.554
title: การเร่งสมรรถนะงานประมวลภาษาธรรมชาติบนขอบเครือข่ายเพื่อการสื่อสารด้วยคำพูดหลายภาษาระหว่างเผชิญเหตุภัยพิบัติ

description: ในปัจจุบันที่โลกมีประชากรอยู่ทุกหนแห่ง มนุษย์เราแม้จะต่างชนชาติ ต่างภาษา ต่างพื้นที่ ก็ต่างเชื่อมต่อกันด้วยเทคโนโลยี ทั้งนี้มีเหตุการณ์ที่สามารถเกิดขึ้นได้ทุกหนแห่งบนโลก นั่นคือภัยพิบัติ ไม่ว่าจะเป็นภัยพิบัติที่เกิดจากธรรมชาติหรือภัยพิบัติที่เกิดจากมนุษย์ ดังนั้นการช่วยเหลือทางมนุษยธรรมเป็นสิ่งที่จำเป็น และเร่งด่วน ในงานวิจัยนี้ ผู้วิจัยได้ทำระบบการเตือนภัยพิบัติบนขอบเครือข่าย โดยได้ทำการฝึกฝนโมเดลการเรียนรู้ภาษาธรรมชาติให้มีความรู้เฉพาะในด้านภัยพิบัติ และเร่งสมรรถนะการทำงานของโมเดลด้วยการลดขนาดของโมเดลการเรียนรู้ภาษาธรรมชาติ ให้มีขนาดที่เล็กและใช้ทรัพยากรน้อย สำหรับใช้บนอุปกรณ์บนขอบเครือข่ายที่มีทรัพยากรการประมวลผลอันจำกัด เพื่อความยืดหยุ่นของระบบเครือข่าย จากการวิจัยพบว่า การใช้โทรศัพท์มือถือระบบปฏิบัติการแอนดรอยด์ประกอบกับโมเดลการเรียนรู้ภาษาธรรมชาติ สามารถรู้จำ และทำความเข้าใจข้อความช่วยเหลือของผู้ประสบภัยได้ในหลายภาษา ระบบมีความเร็วในการประมวลผลภาษาธรรมชาติในระดับที่ยอมรับได้ ใช้ทรัพยากรในการประมวลผลน้อย และในการวิจัยในครั้งนี้ทำให้ได้ทราบว่า การเร่งการประมวลผลภาษาธรรมชาติโดยใช้โมเดลการประมวลผลภาษาธรรมชาติร่วมกับการแปลภาษา สามารถนำไปใช้บนอุปกรณ์บนขอบเครือข่าย มีการตอบสนองที่ฉับไวสำหรับสถาณการณ์ภัยพิบัติต่างๆ และนอกจากนี้ยังสามารถปรับใช้วิธีการฝึกฝนโมเดลการเรียนรู้ภาษาธรรมชาตินี้กับชุดข้อมูลอื่น เพื่อให้โมเดลการประมวลผลภาษาธรรมชาติมีความรู้ความเข้าใจเฉพาะด้าน สำหรับเหตุการณ์อื่นนอกเหนือจากเหตุการณ์ภัยพิบัติ
DOI: 10.14457/tu.the.2022.555
title: Efficient estimation strategies for a partially linear model

description: The objective of this dissertation was to address the problem of estimating regression coefficients for both univariate and multivariate partially linear models in the presence of uncertain prior information. We improved estimation strategies using linear shrinkage, pretest, shrinkage pretest, shrinkage, and positive-part shrinkage methods, which efficiently combine the full model and submodel estimators optimally. The asymptotic properties of the proposed estimators were examined. We conducted Monte Carlo simulation studies to assess the performance of proposed estimators, and compared with those of penalty estimators including LASSO and aLASSO. The proposed estimation strategies were applied to real datasets to investigate their usefulness.A univariate partially linear model was studied in Chapter 3. In this model, the nonparametric component was estimated using smoothing splines method. The asymptotic distributional bias and risk of the proposed estimators were investigated. The asymptotic results show the superiority of proposed estimation strategies. Monte Carlo simulations were conducted for comparing the estimators in context of both low-dimensional and high-dimensional data. Two data examples were also presented. The numerical results supported those from the theoretical results.In Chapter 4, efficient estimation strategies in a multivariate partially linear model have been discussed. In this model, the nonparametric component was estimated using kernel smoothing method. The asymptotic properties of the proposed estimators were examined. We numerically compared their performance to those of penalty estimators using simulation studies and real-world data examples. Regardless of the accuracy of the information, the proposed estimators were found to be more efficient than the full model estimator.
DOI: 10.5519/qd.y7gvmfs3
title: Query on the Natural History Museum Data Portal (data.nhm.ac.uk) (30 records)
DOI: 10.6084/m9.figshare.14195380
title: Oxidative stress in early metabolic syndrome impairs cardiac RyR2 and SERCA2a activity and modifies the interplay of these proteins during Ca<sup>2+</sup> waves

description: We investigated how oxidative stress (OS) alters Ca<sup>2+</sup> handling in ventricular myocytes in early metabolic syndrome (MetS) in sucrose-fed rats. The effects of <i>N</i>-acetyl cysteine (NAC) or dl-Dithiothreitol (DTT) on systolic Ca<sup>2+</sup> transients (SCaTs), diastolic Ca<sup>2+</sup> sparks (CaS) and Ca<sup>2+</sup> waves (CaW), recorded by confocal techniques, and L-type Ca<sup>2+</sup> current (I<sub>Ca</sub>), assessed by whole-cell patch clamp, were evaluated in MetS and Control cells. MetS myocytes exhibited decreased SCaTs and CaS frequency but unaffected CaW propagation. In Control cells, NAC/DTT reduced RyR2/SERCA2a activity blunting SCaTs, CaS frequency and CaW propagation, suggesting that basal ROS optimised Ca<sup>2+</sup> signalling by maintaining RyR2/SERCA2a function and that these proteins facilitate CaW propagation. Conversely, NAC/DTT in MetS recovered RyR2/SERCA2a function, improving SCaTs and CaS frequency, but unexpectedly decreasing CaW propagation. We hypothesised that OS decreases RyR2/SERCA2a activity at early MetS, and while decreased SERCA2a favours CaW propagation, diminished RyR2 restrains it.