cometadata/datacite-titles-descriptions-related-identifiers huggingface dataset:
DOI: 10.6084/m9.figshare.14252227
title: Additional file 1 of Differential microRNAs expression profiles in liver from three different lifestyle modification mice models

description: Additional file 1.
DOI: 10.6084/m9.figshare.14252295.v1
title: Additional file 2 of Genome-wide association study reveals the genetic basis of yield- and quality-related traits in wheat

description: Additional file 2: Table S1 Categories and descriptive statistics for the 25 yield- and quality-related traits evaluated in six different environments. Table S2 Correlations among 25 yield- and quality-related traits. Table S3 Basic details regarding the SNP markers used for a genome-wide association study of 543 wheat genotypes. Table S4 Information regarding the candidate genes identified based on BLUP data.
DOI: 10.5281/zenodo.10528562
title: 120-years of ecological monitoring data shows that the risk of overhunting is increased by environmental degradation for an isolated marine mammal population: the Baltic grey seal.

description: Code for the manuscript "120 years of ecological monitoring data indicates that current Baltic grey seal hunting quotas are unsustainable. " .zip file containes code and data compiled to assess the impact of hunting on the Baltic grey seal.

Scripts:

Basic_model.R Age structured single sex popualiotn model

Generation_time_calculator.R Function to calcualte generation time Parameters.R Parameters for the blatic grey seal population model

1_Ordered_scripts.R Grey seal PVA script 1, load packages and base scripts for core parameters and functions

2_Historical_data.R Grey seal PVA script 2, plot hitstorical populaiton estimates alongside current aerial survey data 3_Explicit_populaiton_modelling.R Grey seal PVA script 3, estimate intrinsic growth rate givne moult survey data 4_Fertility_survival_estimation.R Grey seal PVA script 4, estimate fertility based on data and parameterise a leslie matrix through modification of first year survival

5_Undisturbed_population_modelling.R Grey seal PVA script 5, estimate vital rates fro an undistturbed popualiton by adding hunted animals back into the popualiton

6_Scenarios.R Grey seal PVA script 6, Running simulations with a range of scenarios outlined in Table 1

7_Risk_averages.R Grey seal PVA script 7, Estimating the risk of i) stabilising below the precautionary RL, stabilising below the critical RL, 10% decline in three gneerations, 50% decline in 3 gneerations, 70% decline in 3 generations

*scripts should be run in order

Data:

Areial_Counts.csv moult survey counts for the whole baltic

Historical.csv estimates of historical popualoitn size for the whole baltic from hunting records

Ice.csv record of maximum extend of baltic sea ice

age_structures.csv age, source country, and manner of death for seals

bycatch_structure.csv age structure of bycaught animals

grey_seal_hunting.csv summary of hunting in Sweden and Finland

hunt_structure.csv age structure of hunted animals 

population_counts.csv moult survey counts for the whole baltic

reproduction.csv summary of reporductive rates accross age classes

Compiled risks.csv outputs of risk modelling from popualiotn simulations
DOI: 10.5281/zenodo.10528563
title: 120-years of ecological monitoring data shows that the risk of overhunting is increased by environmental degradation for an isolated marine mammal population: the Baltic grey seal.

description: Code for the manuscript "120 years of ecological monitoring data indicates that current Baltic grey seal hunting quotas are unsustainable. " .zip file containes code and data compiled to assess the impact of hunting on the Baltic grey seal.

Scripts:

Basic_model.R Age structured single sex popualiotn model

Generation_time_calculator.R Function to calcualte generation time Parameters.R Parameters for the blatic grey seal population model

1_Ordered_scripts.R Grey seal PVA script 1, load packages and base scripts for core parameters and functions

2_Historical_data.R Grey seal PVA script 2, plot hitstorical populaiton estimates alongside current aerial survey data 3_Explicit_populaiton_modelling.R Grey seal PVA script 3, estimate intrinsic growth rate givne moult survey data 4_Fertility_survival_estimation.R Grey seal PVA script 4, estimate fertility based on data and parameterise a leslie matrix through modification of first year survival

5_Undisturbed_population_modelling.R Grey seal PVA script 5, estimate vital rates fro an undistturbed popualiton by adding hunted animals back into the popualiton

6_Scenarios.R Grey seal PVA script 6, Running simulations with a range of scenarios outlined in Table 1

7_Risk_averages.R Grey seal PVA script 7, Estimating the risk of i) stabilising below the precautionary RL, stabilising below the critical RL, 10% decline in three gneerations, 50% decline in 3 gneerations, 70% decline in 3 generations

*scripts should be run in order

Data:

Areial_Counts.csv moult survey counts for the whole baltic

Historical.csv estimates of historical popualoitn size for the whole baltic from hunting records

Ice.csv record of maximum extend of baltic sea ice

age_structures.csv age, source country, and manner of death for seals

bycatch_structure.csv age structure of bycaught animals

grey_seal_hunting.csv summary of hunting in Sweden and Finland

hunt_structure.csv age structure of hunted animals 

population_counts.csv moult survey counts for the whole baltic

reproduction.csv summary of reporductive rates accross age classes

Compiled risks.csv outputs of risk modelling from popualiotn simulations
DOI: 10.6084/m9.figshare.13203415
title: Additional file 2 of High-quality bacterial genomes of a partial-nitritation/anammox system by an iterative hybrid assembly method

description: Additional file 2: File S1. Genome information of 49 MAGs reconstructed by using IHA workflow (See Additional file 2: File S1). File S2. Comparison of 26 MAG pairs reconstructed using hybrid and short reads only assembly approaches. (See Additional file 2: File S2). File S3. Nitrogen related marker genes in the PNA system. (See Additional file 2: File S3).
DOI: 10.6084/m9.figshare.14252295
title: Additional file 2 of Genome-wide association study reveals the genetic basis of yield- and quality-related traits in wheat

description: Additional file 2: Table S1 Categories and descriptive statistics for the 25 yield- and quality-related traits evaluated in six different environments. Table S2 Correlations among 25 yield- and quality-related traits. Table S3 Basic details regarding the SNP markers used for a genome-wide association study of 543 wheat genotypes. Table S4 Information regarding the candidate genes identified based on BLUP data.
DOI: 10.6084/m9.figshare.22641063.v1
title: Additional file 2 of RPL21 interacts with LAMP3 to promote colorectal cancer invasion and metastasis by regulating focal adhesion formation

description: Additional file 2: Table S2. The list of primer sequences used in the study.
DOI: 10.6084/m9.figshare.22641066.v1
title: Additional file 3 of RPL21 interacts with LAMP3 to promote colorectal cancer invasion and metastasis by regulating focal adhesion formation

description: Additional file 3: Table S3. The list of RNA interference oligo sequences used in the study.
DOI: 10.6084/m9.figshare.21592513
title: Additional file 2 of PTEN overexpression and nuclear β-catenin stabilization promote morular differentiation through induction of epithelial–mesenchymal transition and cancer stem cell-like properties in endometrial carcinoma

description: Additional file 1: Table S1. Primer sequences used in this study
DOI: 10.6084/m9.figshare.22641060.v1
title: Additional file 1 of RPL21 interacts with LAMP3 to promote colorectal cancer invasion and metastasis by regulating focal adhesion formation

description: Additional file 1: Table S1. The list of primary antibodies used in the study.
DOI: 10.6084/m9.figshare.22641066
title: Additional file 3 of RPL21 interacts with LAMP3 to promote colorectal cancer invasion and metastasis by regulating focal adhesion formation

description: Additional file 3: Table S3. The list of RNA interference oligo sequences used in the study.
DOI: 10.6084/m9.figshare.22641090
title: Additional file 1 of BSA modification of bacterial surface: a promising anti-cancer therapeutic strategy

description: Additional file 1.
DOI: 10.6084/m9.figshare.22641060
title: Additional file 1 of RPL21 interacts with LAMP3 to promote colorectal cancer invasion and metastasis by regulating focal adhesion formation

description: Additional file 1: Table S1. The list of primary antibodies used in the study.
DOI: 10.6084/m9.figshare.14776528
title: Additional file 2 of Positive natural selection of N6-methyladenosine on the RNAs of processed pseudogenes

description: Additional file 2: Table S1. The list of pseudogenes and their cognate protein-coding genes. Table S2. The m6A levels of pseudogenes and their cognate protein-coding genes in GM12878 cell line. Table S3. The m6A levels of pseudogenes and their cognate protein-coding genes in H1 cell line. Table S4. The primers of processed pseudogenes (DSTNP2; NAP1L4P1) and their cognate protein-coding genes (DSTN; NAP1L4). Table S5. The list of collected GEO datasets. Table S6. The list of collected EBI datasets.
DOI: 10.6084/m9.figshare.22641090.v1
title: Additional file 1 of BSA modification of bacterial surface: a promising anti-cancer therapeutic strategy

description: Additional file 1.
DOI: 10.25592/dgs.corpus-1.0-type-62616
title: HONIG2^ (MEINE DGS – annotiert. Öffentliches Korpus der Deutschen Gebärdensprache, 1. Release)
title: HONEY2^ (MY DGS – annotated. Public Corpus of German Sign Language, 1st release)

description: Ein Type aus der Annotation von MEINEDGS mit allen seinen Tokens aus MEINEDGS: The Public DGS Corpus consists of more than 50 hours of video data from the DGS-Korpus project made available together with annotations for research purposes. In this project, data were collected all across Germany in the timeframe 2010-2012. The public corpus shows 330 informants in 4 different age groups (from 18 years on) from 13 different regions. All parts are conversations between two informants in German Sign Language (DGS). The majority of transcripts included cover discussions and reports on Deaf life and personal experiences, although there are examples of other tasks such as story retellings as well.<br>Transcripts are made available in iLex and ELAN format as well as in SRT subtitles format that can be imported in MaxQDA and other analysis tools, together with the mp4 video files in 360p50. Diese DOI identifiziert die Version 1.0 des Datensatzes.
description: A type from the annotation of MYDGS including all its tokens in MYDGS: Das Öffentliche DGS-Korpus besteht aus mehr als 50 Stunden Video aus dem Projekt DGS-Korpus, die zusammen mit Annotationen für Forschungszwecke zur Verfügung gestellt werden. Die Datenerhebung im Projekt fand im Zeitraum 2010-2012 in ganz Deutschland statt. Das öffentliche Korpus besteht aus Gesprächen jeweils zweier Informantinnen oder Informanten in Deutscher Gebärdensprache. Das Korpus umfasst 330 Informantinnen und Informanten in vier verschiedenen Altersgruppen (ab 18 Jahren) aus 13 verschiedenen Regionen. Der Schwerpunkt der Sammlung liegt auf Transkripten von Diskussionen und Berichten über das Leben Gehörloser sowie persönliche Erfahrungen, sie enthält aber auch Beispiele anderer Erhebungsformate wie Nacherzählungen.<br>Transkripte werden im iLex- und ELAN-Format sowie als SRT-Untertiteldateien (zum Import etwa in MaxQDA) zur Verfügung gestellt. Die zugehörigen MP4-Videodaten sind durchgängig im Format 360p50. This DOI identifies the version 1.0 of the dataset.
DOI: 10.25592/dgs.corpus-1.0-type-62627
title: FORMEN4^ (MEINE DGS – annotiert. Öffentliches Korpus der Deutschen Gebärdensprache, 1. Release)
title: TO-FORM4^ (MY DGS – annotated. Public Corpus of German Sign Language, 1st release)

description: Ein Type aus der Annotation von MEINEDGS mit allen seinen Tokens aus MEINEDGS: The Public DGS Corpus consists of more than 50 hours of video data from the DGS-Korpus project made available together with annotations for research purposes. In this project, data were collected all across Germany in the timeframe 2010-2012. The public corpus shows 330 informants in 4 different age groups (from 18 years on) from 13 different regions. All parts are conversations between two informants in German Sign Language (DGS). The majority of transcripts included cover discussions and reports on Deaf life and personal experiences, although there are examples of other tasks such as story retellings as well.<br>Transcripts are made available in iLex and ELAN format as well as in SRT subtitles format that can be imported in MaxQDA and other analysis tools, together with the mp4 video files in 360p50. Diese DOI identifiziert die Version 1.0 des Datensatzes.
description: A type from the annotation of MYDGS including all its tokens in MYDGS: Das Öffentliche DGS-Korpus besteht aus mehr als 50 Stunden Video aus dem Projekt DGS-Korpus, die zusammen mit Annotationen für Forschungszwecke zur Verfügung gestellt werden. Die Datenerhebung im Projekt fand im Zeitraum 2010-2012 in ganz Deutschland statt. Das öffentliche Korpus besteht aus Gesprächen jeweils zweier Informantinnen oder Informanten in Deutscher Gebärdensprache. Das Korpus umfasst 330 Informantinnen und Informanten in vier verschiedenen Altersgruppen (ab 18 Jahren) aus 13 verschiedenen Regionen. Der Schwerpunkt der Sammlung liegt auf Transkripten von Diskussionen und Berichten über das Leben Gehörloser sowie persönliche Erfahrungen, sie enthält aber auch Beispiele anderer Erhebungsformate wie Nacherzählungen.<br>Transkripte werden im iLex- und ELAN-Format sowie als SRT-Untertiteldateien (zum Import etwa in MaxQDA) zur Verfügung gestellt. Die zugehörigen MP4-Videodaten sind durchgängig im Format 360p50. This DOI identifies the version 1.0 of the dataset.
DOI: 10.25592/dgs.corpus-1.0-type-62678
title: SCHEISSE-VERDAMMT1^ (MEINE DGS – annotiert. Öffentliches Korpus der Deutschen Gebärdensprache, 1. Release)
title: FUCKING-HELL1^ (MY DGS – annotated. Public Corpus of German Sign Language, 1st release)

description: Ein Type aus der Annotation von MEINEDGS mit allen seinen Tokens aus MEINEDGS: The Public DGS Corpus consists of more than 50 hours of video data from the DGS-Korpus project made available together with annotations for research purposes. In this project, data were collected all across Germany in the timeframe 2010-2012. The public corpus shows 330 informants in 4 different age groups (from 18 years on) from 13 different regions. All parts are conversations between two informants in German Sign Language (DGS). The majority of transcripts included cover discussions and reports on Deaf life and personal experiences, although there are examples of other tasks such as story retellings as well.<br>Transcripts are made available in iLex and ELAN format as well as in SRT subtitles format that can be imported in MaxQDA and other analysis tools, together with the mp4 video files in 360p50. Diese DOI identifiziert die Version 1.0 des Datensatzes.
description: A type from the annotation of MYDGS including all its tokens in MYDGS: Das Öffentliche DGS-Korpus besteht aus mehr als 50 Stunden Video aus dem Projekt DGS-Korpus, die zusammen mit Annotationen für Forschungszwecke zur Verfügung gestellt werden. Die Datenerhebung im Projekt fand im Zeitraum 2010-2012 in ganz Deutschland statt. Das öffentliche Korpus besteht aus Gesprächen jeweils zweier Informantinnen oder Informanten in Deutscher Gebärdensprache. Das Korpus umfasst 330 Informantinnen und Informanten in vier verschiedenen Altersgruppen (ab 18 Jahren) aus 13 verschiedenen Regionen. Der Schwerpunkt der Sammlung liegt auf Transkripten von Diskussionen und Berichten über das Leben Gehörloser sowie persönliche Erfahrungen, sie enthält aber auch Beispiele anderer Erhebungsformate wie Nacherzählungen.<br>Transkripte werden im iLex- und ELAN-Format sowie als SRT-Untertiteldateien (zum Import etwa in MaxQDA) zur Verfügung gestellt. Die zugehörigen MP4-Videodaten sind durchgängig im Format 360p50. This DOI identifies the version 1.0 of the dataset.
DOI: 10.25592/dgs.corpus-1.0-type-62701
title: SOFORT2A^ (MEINE DGS – annotiert. Öffentliches Korpus der Deutschen Gebärdensprache, 1. Release)
title: IMMEDIATELY2A^ (MY DGS – annotated. Public Corpus of German Sign Language, 1st release)

description: Ein Type aus der Annotation von MEINEDGS mit allen seinen Tokens aus MEINEDGS: The Public DGS Corpus consists of more than 50 hours of video data from the DGS-Korpus project made available together with annotations for research purposes. In this project, data were collected all across Germany in the timeframe 2010-2012. The public corpus shows 330 informants in 4 different age groups (from 18 years on) from 13 different regions. All parts are conversations between two informants in German Sign Language (DGS). The majority of transcripts included cover discussions and reports on Deaf life and personal experiences, although there are examples of other tasks such as story retellings as well.<br>Transcripts are made available in iLex and ELAN format as well as in SRT subtitles format that can be imported in MaxQDA and other analysis tools, together with the mp4 video files in 360p50. Diese DOI identifiziert die Version 1.0 des Datensatzes.
description: A type from the annotation of MYDGS including all its tokens in MYDGS: Das Öffentliche DGS-Korpus besteht aus mehr als 50 Stunden Video aus dem Projekt DGS-Korpus, die zusammen mit Annotationen für Forschungszwecke zur Verfügung gestellt werden. Die Datenerhebung im Projekt fand im Zeitraum 2010-2012 in ganz Deutschland statt. Das öffentliche Korpus besteht aus Gesprächen jeweils zweier Informantinnen oder Informanten in Deutscher Gebärdensprache. Das Korpus umfasst 330 Informantinnen und Informanten in vier verschiedenen Altersgruppen (ab 18 Jahren) aus 13 verschiedenen Regionen. Der Schwerpunkt der Sammlung liegt auf Transkripten von Diskussionen und Berichten über das Leben Gehörloser sowie persönliche Erfahrungen, sie enthält aber auch Beispiele anderer Erhebungsformate wie Nacherzählungen.<br>Transkripte werden im iLex- und ELAN-Format sowie als SRT-Untertiteldateien (zum Import etwa in MaxQDA) zur Verfügung gestellt. Die zugehörigen MP4-Videodaten sind durchgängig im Format 360p50. This DOI identifies the version 1.0 of the dataset.
DOI: 10.25592/dgs.corpus-1.0-type-62703
title: SCHLIMM2^ (MEINE DGS – annotiert. Öffentliches Korpus der Deutschen Gebärdensprache, 1. Release)
title: BAD2^ (MY DGS – annotated. Public Corpus of German Sign Language, 1st release)

description: Ein Type aus der Annotation von MEINEDGS mit allen seinen Tokens aus MEINEDGS: The Public DGS Corpus consists of more than 50 hours of video data from the DGS-Korpus project made available together with annotations for research purposes. In this project, data were collected all across Germany in the timeframe 2010-2012. The public corpus shows 330 informants in 4 different age groups (from 18 years on) from 13 different regions. All parts are conversations between two informants in German Sign Language (DGS). The majority of transcripts included cover discussions and reports on Deaf life and personal experiences, although there are examples of other tasks such as story retellings as well.<br>Transcripts are made available in iLex and ELAN format as well as in SRT subtitles format that can be imported in MaxQDA and other analysis tools, together with the mp4 video files in 360p50. Diese DOI identifiziert die Version 1.0 des Datensatzes.
description: A type from the annotation of MYDGS including all its tokens in MYDGS: Das Öffentliche DGS-Korpus besteht aus mehr als 50 Stunden Video aus dem Projekt DGS-Korpus, die zusammen mit Annotationen für Forschungszwecke zur Verfügung gestellt werden. Die Datenerhebung im Projekt fand im Zeitraum 2010-2012 in ganz Deutschland statt. Das öffentliche Korpus besteht aus Gesprächen jeweils zweier Informantinnen oder Informanten in Deutscher Gebärdensprache. Das Korpus umfasst 330 Informantinnen und Informanten in vier verschiedenen Altersgruppen (ab 18 Jahren) aus 13 verschiedenen Regionen. Der Schwerpunkt der Sammlung liegt auf Transkripten von Diskussionen und Berichten über das Leben Gehörloser sowie persönliche Erfahrungen, sie enthält aber auch Beispiele anderer Erhebungsformate wie Nacherzählungen.<br>Transkripte werden im iLex- und ELAN-Format sowie als SRT-Untertiteldateien (zum Import etwa in MaxQDA) zur Verfügung gestellt. Die zugehörigen MP4-Videodaten sind durchgängig im Format 360p50. This DOI identifies the version 1.0 of the dataset.
DOI: 10.25592/dgs.corpus-1.0-type-62707
title: SPAREN1^ (MEINE DGS – annotiert. Öffentliches Korpus der Deutschen Gebärdensprache, 1. Release)
title: TO-SAVE1^ (MY DGS – annotated. Public Corpus of German Sign Language, 1st release)

description: Ein Type aus der Annotation von MEINEDGS mit allen seinen Tokens aus MEINEDGS: The Public DGS Corpus consists of more than 50 hours of video data from the DGS-Korpus project made available together with annotations for research purposes. In this project, data were collected all across Germany in the timeframe 2010-2012. The public corpus shows 330 informants in 4 different age groups (from 18 years on) from 13 different regions. All parts are conversations between two informants in German Sign Language (DGS). The majority of transcripts included cover discussions and reports on Deaf life and personal experiences, although there are examples of other tasks such as story retellings as well.<br>Transcripts are made available in iLex and ELAN format as well as in SRT subtitles format that can be imported in MaxQDA and other analysis tools, together with the mp4 video files in 360p50. Diese DOI identifiziert die Version 1.0 des Datensatzes.
description: A type from the annotation of MYDGS including all its tokens in MYDGS: Das Öffentliche DGS-Korpus besteht aus mehr als 50 Stunden Video aus dem Projekt DGS-Korpus, die zusammen mit Annotationen für Forschungszwecke zur Verfügung gestellt werden. Die Datenerhebung im Projekt fand im Zeitraum 2010-2012 in ganz Deutschland statt. Das öffentliche Korpus besteht aus Gesprächen jeweils zweier Informantinnen oder Informanten in Deutscher Gebärdensprache. Das Korpus umfasst 330 Informantinnen und Informanten in vier verschiedenen Altersgruppen (ab 18 Jahren) aus 13 verschiedenen Regionen. Der Schwerpunkt der Sammlung liegt auf Transkripten von Diskussionen und Berichten über das Leben Gehörloser sowie persönliche Erfahrungen, sie enthält aber auch Beispiele anderer Erhebungsformate wie Nacherzählungen.<br>Transkripte werden im iLex- und ELAN-Format sowie als SRT-Untertiteldateien (zum Import etwa in MaxQDA) zur Verfügung gestellt. Die zugehörigen MP4-Videodaten sind durchgängig im Format 360p50. This DOI identifies the version 1.0 of the dataset.