cometadata/datacite-titles-descriptions-related-identifiers huggingface dataset:
DOI: 10.5066/p9jy7gp2
title: Groundwater flux estimates from Quashnet River, MA using vertical temperature profilers and seepage meters (2022-2023)

description: This data release contains groundwater flux estimates from twelve locations in wetlands surrounding the Quashnet River in Cape Cod, located near Mashpee and Falmouth, Massachusetts. A VTP (i.e., rod with vertical temperature sensors with known spacings and depths) was also installed at a key groundwater discharge location to estimate 1D groundwater flux through time (Sohn et al., 2024). Vertical discharge flux patterns were estimated over time using the extended Kalman Filter (EKF) recursive estimation approach of McAliley et al. (2022). The EKF method was used to recursively estimate specific discharge in discrete time when temperature measurements were acquired (i.e., hourly) at each discharge location. The methodology used here has been previously tested on both synthetic and field data in McAliley et al. (2022) where EKF methods were shown to converge to step changes in synthetic discharge data on sub-daily timescales, and residuals between observed (i.e., field observations) and estimated (i.e., EKF predictions) temperatures were generally within 0.1°C, consistent with expected measurement precision. Further information on the numerical implementation, comparisons to synthetic and field observations, as well as links to open-source code can be found in McAliley et al. (2022). To complement these estimates, discrete measurements of groundwater discharge were taken using seepage meters directly coupled to the streambed interface. Vertical head gradients were also measured in some seeps and mean hydraulic conductivity values obtained from seepage meter measurements were used to produce estimates of 1D groundwater flux (m/d) from measured head differentials. This release covers data associated with the estimation of groundwater flux from these identified discharge zones using the methods above described above.
DOI: 10.6084/m9.figshare.30048379
title: Data and code used in the study: "Ecological niche structure and the interactive role of leaf-nosed bats (Phyllostomidae) within frugivory networks: Another dimension of the niche centroid hypothesis"

description: Data and code used in the study: "Ecological niche structure and the interactive role of leaf-nosed bats (Phyllostomidae) within frugivory networks: Another dimension of the niche centroid hypothesis"
DOI: 10.6084/m9.figshare.30048379.v1
title: Data and code used in the study: "Ecological niche structure and the interactive role of leaf-nosed bats (Phyllostomidae) within frugivory networks: Another dimension of the niche centroid hypothesis"

description: Data and code used in the study: "Ecological niche structure and the interactive role of leaf-nosed bats (Phyllostomidae) within frugivory networks: Another dimension of the niche centroid hypothesis"
DOI: 10.15468/dl.rr7hu2
title: Occurrence Download

description: A dataset containing 35 species occurrences available in GBIF matching the query:
{
 "and" : [
 "Country is Argentina",
 "OccurrenceStatus is Present",
 "TaxonKey is Boisea trivittata"
 ]
}

 The dataset includes 35 records from 1 constituent datasets; see https://api.gbif.org/v1/occurrence/download/0032264-250827131500795/datasets/export for details.
 
Data from some individual datasets included in this download may be licensed under less restrictive terms.
DOI: 10.5281/zenodo.17047058
title: Data & Code for Elastic-plastic flexure on icy moons

description: This archive contains a python code to solve the elastic-plastic flexural equation as discussed in Broquet (2025), Elastic-plastic flexure on icy moons. 

Requirements: numpy, scipy, and matplotlib.

Archive content:

Calc_Elastic_Plastic.py: Python script to solve the elastic-plastic flexural problem

utils.py: Utility function to build the moment-curvature relationship. This function is from Adrien Broquet. AB-Ares/Te_HF_Conversion: 0.2.3 (Version 0.2.3). Zenodo. http://doi.org/10.5281/zenodo.4973893.

YSE_DombMcKinnon.txt: Yield strength envelope based on data from Dombard & McKinnon (2006) https://doi.org/10.1016/j.jsg.2005.12.003.
DOI: 10.17026/dans-za4-tv3w
title: Campus Wildbaan

description: &lt;p&gt;Bureau voor Archeologie heeft een inventariserend veldonderzoek in de vorm van boringen uitgevoerd voor bouwwerkzaamheden aan de Haarloseweg 7 te Borculo. De vraagstelling van het onderzoek luidt: hoe kan rekening gehouden worden met eventuele archeologische resten bij de voorgenomen ontwikkeling? Het onderzoek is uitgevoerd in overeenstemming met de richtlijnen van de KNA, protocol 4003.In april 2021 zijn een bureauonderzoek en verkennend booronderzoek uitgevoerd voor de bouw van een school en een gymzaal. Tijdens het verkennend booronderzoek was in één van de zeventien boringen een verstoring met houtresten in de bodem aangetroffen waarvan niet vastgesteld kon worden of het archeologisch spoor is en wat daarvan de omvang is. Daarom is besloten een aanvullend karterend booronderzoek uit te voeren om te bepalen wat de aard en omvang van de verstoring is.Wegens de brede verwachting voor de aanwezigheid van archeologische resten is de kartering gebaseerd op methode E1 uit de Leidraad IVO Karterend Booronderzoek. In het onderzoeksgebied zijn zeven boringen gezet met een 15 cm Edelmanboor. De opgeboorde grond is gezeefd over een zeef met een maaswijdte van 4 mm.De einddieptes van de boringen ligt tussen 150 en 250 cm -mv. Uit het booronderzoek blijkt dat de bodemopbouw ter hoogte van vijf omliggende boorpunten vergelijkbaar is met die van de eerder genoemde verstoring. Hieruit blijkt dat het sterk humeuze pakket, waaruit het spoor bestaat, waarschijnlijk natuurlijk is gevormd in een nat beekdal of depressie. Het gebied met dit pakket ligt langs de noordzijde van het plangebied en loopt door in noordelijke en oostelijk richting. Aan de hand van een roodbakkend, aan twee zijden geglazuurd, aardewerkfragment wordt het pakket gedateerd in de 16e eeuw of later. De beekdalbodem is echter ongunstig voor bewoning en de kans op het verstoren van archeologische resten tijdens graafwerkzaamheden wordt dan ook klein geschat. Bureau voor Archeologie adviseert het plangebied vrij te geven voor de voorgenomen ontwikkeling. Dit onderzoek is met grote zorgvuldigheid uitgevoerd. Het is echter nooit uit te sluiten dat bij de graafwerkzaamheden toch archeologische resten worden aangetroffen op plaatsen en dieptes waar die niet worden verwacht. Eventuele archeologische resten is men verplicht te melden bij de Minister van OCW in overeenstemming met de Erfgoedwet uit 2015. In dit geval wordt aangeraden om contact op te nemen met de gemeente Berkelland.&lt;/p&gt;
DOI: 10.15468/dl.5skaxx
title: Occurrence Download

description: A dataset containing 12256 species occurrences available in GBIF matching the query:
{
 "and" : [
 "TaxonKey is one of (Epidendrum angustisegmentum, Epidendrum rigidum, Epidendrum octomerioides, Epidendrum summerhayesii, Epidendrum ciliare, Epidendrum lacustre, Epidendrum repens, Epidendrum ramosum, Epidendrum oxyglossum, Epidendrum anoglossum, Epidendrum bicuniculatum, Epidendrum talamancanum, Epidendrum rousseauae, Epidendrum igneum, Epidendrum nocturnum, Epidendrum rivulare, Epidendrum anisatum, Epidendrum juergensenii, Epidendrum cusii, Epidendrum matudae, Epidendrum gasteriferum, Epidendrum conopseum, Epidendrum propinquum, Epidendrum lacertinum, Epidendrum parkinsonianum, Epidendrum longicaule, Epidendrum mathewsii, Epidendrum succulentum, Epidendrum trialatum, Epidendrum barbeyanum, Epidendrum difforme, Epidendrum nora-mesae, Epidendrum phyllocharis, Epidendrum sophronitoides)",
 "HasCoordinate is true",
 "HasGeospatialIssue is false",
 "OccurrenceStatus is Present"
 ]
}

 The dataset includes 12256 records from 283 constituent datasets; see https://api.gbif.org/v1/occurrence/download/0032263-250827131500795/datasets/export for details.
 
Data from some individual datasets included in this download may be licensed under less restrictive terms.
DOI: 10.5281/zenodo.16944361
title: Comparative Analysis of Classical Machine Learning and Deep Learning Models for Robust Brain Tumor Detection: A Benchmarking Study

description: Paper:

Comparative Analysis of Classical Machine Learning and Deep Learning Models for Robust Brain Tumor Detection: A Benchmarking Study.

 

Code details: 

Please see the GitHub repository for code and usage instructions: 

https://github.com/yangzi334/BrainTumorClassification

 

Uploaded Contents in Zenodo:

- Primary



The primary raw dataset (Brain tumor data.rar)

Cleaned primary raw dataset (brain tumor binary data.zip)

After splitting 'cleaned primary raw dataset' with ratio 0.7, 0.15, 0.15,  'train.zip', 'validataion.zip', 'test.zip' were generated.


- Cross-Dataset



Cross-domain raw data (brain tumor cross-domain data.zip)

Cleaned Cross-domain  (brain tumor cross-domain binary data.zip)


Note: In the data preprocessing step, before we generated 'brain tumor external data.zip' , we first used phash alogrithm to compare total images from cross-domain source data (brain tumor external raw.zip) against training images from the primary data (train_folder.zip), any visually identical or nearly identical images will be removed from the cross-dataset. The details can be found in the 'check image leakage.ipynb' in the GitHub. 

 

Training models:

SVN_HOG_new.zip



best_svm_hog_model.pkl — Final support vector machine (SVM) model trained with HOG features. 


 

ResNet18.zip



best_resnet18_overall.pth — Final fine-tuned resnet18 model weights with best overall validation performance.

best_resnet18_run1.pth — Best checkpoint for resnet18 from run 1.

best_resnet18_run2.pth — Best checkpoint for resnet18 from run 2.

best_resnet18_run3.pth — Best checkpoint for resnet18 from run 3.


 

Vit_B_16_new.zip





best_vit_overall.pth — Final fine-tuned ViT-B/16 model weights with best overall validation performance.




best_vit_run1.pth — Best checkpoint for ViT-B/16 from run 1.




best_vit_run2.pth — Best checkpoint for ViT-B/16 from run 2.




best_vit_run3.pth — Best checkpoint for ViT-B/16 from run 3.



 

SimCLR.zip



best_simclr_overall.pth — Final fine-tuned simclr model weights with best overall validation performance.

best_simclr_run1.pth — Best checkpoint for simclr from run 1.

best_simclr_run2.pth — Best checkpoint for simclr from run 2.

best_simclr_run3.pth — Best checkpoint for simclr from run 3.

best_simclr_encoder_only.pth — SimCLR encoder weights only (trained with contrastive learning, no classifier head). Can be used for downstream tasks
DOI: 10.15468/dl.jdht73
title: Occurrence Download

description: A dataset containing 0 species occurrences available in GBIF matching the query:
{
 "and" : [
 "TaxonKey is one of (Distichodus microps, Distichodus mossambicus, Distichodus nefasch, Distichodus noboli, Distichodus notospilus, Distichodus petersii, Distichodus rostratus, Distichodus rufigiensis, Distichodus schenga, Distichodus sexfasciatus, Dundocharax bidentatus, Eugnathichthys eetveldii, Eugnathichthys macroterolepis, Ichthyborus besse, Ichthyborus monodi, Ichthyborus ornatus, Ichthyborus quadrilineatus, Mesoborus crocodilus, Microstomatichthyoborus bashforddeani, Microstomatichthyoborus katangae, Monostichodus elongatus, Hemistichodus lootensi, Monostichodus lootensi, Hemistichodus mesmaekersi, Monostichodus mesmaekersi, Hemistichodus vaillanti, Nannaethiops unitaeniatus, Nannocharax altus, Hemigrammocharax angolensis, Nannocharax angolensis, Nannocharax ansorgii, Nannocharax brevis, Nannocharax elongatus, Nannocharax fasciatus, Nannocharax fasciolaris, Nannocharax gracilis, Nannocharax hollyi, Nannocharax intermedius, Nannocharax latifasciatus, Nannocharax lineomaculatus, Hemigrammocharax lineostriatus, Nannocharax lineostriatus, Nannocharax luapulae, Hemigrammocharax machadoi, Nannocharax machadoi, Nannocharax macropterus, Nannocharax maculicauda, Nannocharax micros, Hemigrammocharax minutus, Nannocharax minutus, Hemigrammocharax monardi, Nannocharax monardi, Hemigrammocharax multifasciatus, Nannocharax multifasciatus, Nannocharax niloticus, Nannocharax occidentalis, Hemigrammocharax ocellicauda, Nannocharax ocellicauda, Nannocharax ogoensis, Nannocharax parvus, Nannocharax procatopus, Nannocharax pteron, Nannocharax reidi, Nannocharax rubrolabiatus, Nannocharax schoutedeni, Nannocharax seyboldi, Nannocharax taenia, Hemigrammocharax uniocellatus, Nannocharax uniocellatus, Hemigrammocharax wittei, Nannocharax wittei, Neolebias ansorgii, Neolebias axelrodi, Neolebias gossei, Neolebias gracilis, Neolebias kerguennae, Neolebias lozii, Neolebias philippei, Neolebias powelli, Neolebias spilotaenia, Neolebias trewavasae, Neolebias trilineatus, Neolebias unifasciatus, Paradistichodus dimidiatus, Paraphago rostratus, Phago boulengeri, Phago intermedius, Phago loricatus, Xenocharax crassus, Hepsetus cuvieri, Hepsetus kingsleyae, Hepsetus lineatus, Hepsetus occidentalis, Hepsetus odoe, Alosa agone, Alosa algeriensis, Alosa alosa, Alosa fallax, Congothrissa gossei, Ethmalosa fimbriata)",
 "HasCoordinate is true",
 "HasGeospatialIssue is false",
 "BasisOfRecord is one of (Specimen, Observation, Human Observation, Machine Observation, Material sample, Literature Occurrence, Material citation, Occurrence evidence)",
 "Geometry POLYGON ((46.8392 -11.8033,47.0739 -12.037,47.4888 -12.0535,47.8142 -11.7664,47.8606 -11.3694,47.5422 -11.0403,47.0944 -11.1109,46.8389 -11.3512,46.8392 -11.8033))"
 ]
}

 The dataset includes 0 records from 0 constituent datasets; see https://api.gbif.org/v1/occurrence/download/0032265-250827131500795/datasets/export for details.
DOI: 10.17026/dans-xgn-5zq2
title: Aanpassen Waterhuishouding Waalwijk Aanpassen Waterhuishouding Waalwijk (BO)

description: &lt;p&gt;Uit het verkennend booronderzoek is gebleken dat in het plangebied de top van het dekzand nauwelijks intact en op wisselende dieptes aanwezig is, er geen veraarde niveaus in het (geërodeerde) veenpakket aanwezig zijn en dat het milieu van de mariene afzettingen onder onbewoonbare omstandigheden is gevormd. Er kan derhalve worden gesteld dat de kans op het aantreffen van archeologische resten in het plangebied zeer klein is.&lt;/p&gt;
DOI: 10.15468/dl.8qs27k
title: Occurrence Download

description: A dataset containing 1779 species occurrences available in GBIF matching the query:
{
 "and" : [
 "Geometry POLYGON((-184.74621 22.81423,-36.25379 22.81423,-36.25379 82.18577,-184.74621 82.18577,-184.74621 22.81423))",
 "HasCoordinate is true",
 "HasGeospatialIssue is false",
 "OccurrenceStatus is Present",
 "TaxonKey is Lasioglossum inconditum"
 ]
}

 The dataset includes 1779 records from 30 constituent datasets; see https://api.gbif.org/v1/occurrence/download/0032266-250827131500795/datasets/export for details.
 
Data from some individual datasets included in this download may be licensed under less restrictive terms.
DOI: 10.17026/dans-247-fxfk
title: Kesteren Casterhoven Kesteren Casterhoven, archeologisch onderzoek door middel van proefsleuven (IVO-P)

description: &lt;p&gt;In opdracht van Kesteren Zuid C.V. heeft EARTH Integrated Archaeology in juli 2019 archeologisch onderzoek uitgevoerd. Op de locatie ten westen van de hoofdstraat en ten oosten van de Cuneraweg (N233) zijn negen proefsleuven onderzocht onder SIKB BRL4000 protocol 4003 IVO-P. De aanleiding voor dit onderzoek is de geplande nieuwbouw voor dit terrein.&lt;br&gt;Het doel van het inventariserend onderzoek d.m.v. proefsleuven, is om het terrein systematisch te onderzoeken op de aanwezigheid van vondsten, sporen en archeologische vindplaatsen, en - in het geval vindplaatsen worden aangetroffen - deze te documenteren en de aangetroffen materialen veilig te stellen. Daarnaast is het van belang om de aard, omvang, datering, gaafheid, conservering en inhoudelijke kwaliteit van de eventuele archeologische resten vast te stellen (waardering).&lt;/p&gt;
DOI: 10.15468/dl.pj5f9y
title: Occurrence Download

description: A dataset containing 74 species occurrences available in GBIF matching the query:
{
 "and" : [
 "TaxonKey is Lotus creticus",
 "Country is Australia",
 "HasCoordinate is true"
 ]
}

 The dataset includes 74 records from 10 constituent datasets; see https://api.gbif.org/v1/occurrence/download/0032267-250827131500795/datasets/export for details.
 
Data from some individual datasets included in this download may be licensed under less restrictive terms.
DOI: 10.17026/dans-zwb-55k8
title: Archeologisch onderzoek aan de Driebergsestraatweg 63 te Doorn door middel van een archeologische begeleiding

description: &lt;p&gt;Binnen het plangebied zijn geen archeologische sporen en/of vondsten aangetroffen. Tijdens de sloop van de fundering van de school in het centrale deel van het plangebied is meer informatie gekregen op de bouw hiervan. Bij de bouw van de school is ten behoeve van de fundering een bouwkuip over de gehele oppervlakte gegraven die tot ca. 1,40m – maaiveld reikt. Hierbij is de top van de C-horizont vergraven. In het onderzoek van BAAC is aangegeven dat archeologische resten aanwezig zouden kunnen zijn indien men niet dieper had ontgraven dan tot 3,80 m – NAP. De verstoring reikt net iets dieper en laat tegelijk zien dat het toenmalige bouwzand erosief op de onthoofde C-horizont terecht is gekomen. &lt;br&gt;Concluderend kan worden gesteld dat de kans dat er onder de overige funderingsresten nog sporen van archeologische bewoning aanwezig zijn zeer laag is. Derhalve wordt geadviseerd om ook de overige sloopwerkzaamheden en de aanleg van de bouwweg vrij te stellen van verder archeologisch onderzoek.&lt;/p&gt;
DOI: 10.17026/dans-25h-6nrh
title: Bureauonderzoek Vijverlaan 48 Groenekan Eindrapportage OM 4044032100

description: &lt;p&gt;Het plangebied ligt volgens de gemeentelijke archeologische beleidskaart in een gebied met archeologische waarde AW1. Deze waarde betreft gebieden waar of archeologische monumenten en/of archeologische vindplaatsen en/of historische kernen/landgoederen aanwezig zijn. 9 Eventuele archeologische resten zijn te verwachten op of net onder maaiveld, in de bovenkant van het dekzand.&lt;br&gt;Op basis van uitgevoerd bureauonderzoek geldt voor het plangebied een lage archeologische verwachting voor de perioden Paleolithicum/Mesolithicum. Voor de periode Neolithicum tot en met Vroege Middeleeuwen is de archeologische verwachting nihil. Voor de perioden Late Middeleeuwen en Nieuwe Tijd geldt een lage tot middelhoge tot hoge verwachting voor het aantreffen van archeologische resten gerelateerd aan de ontginning van het veen en de aanwezigheid van landgoed Voordaan.&lt;br&gt;Gezien de beperkte bodemverstoring die gepaard zal gaan met de bouw van de schuur (fundering op staal en er vindt geen uitgraving van een bouwkuip plaats) en het feit dat de schuur gebouwd gaat worden op dezelfde locaties als waar de huidige schuur staat, adviseert EARTH Integrated Archaeology om geen nader archeologisch onderzoek in het plangebied uit te voeren.&lt;/p&gt;
DOI: 10.17026/dans-xwf-ryxz
title: Inventariserend Veldonderzoek Westbroekse Binnenweg Eindrapportage OM 4545059100

description: &lt;p&gt;In het plangebied zijn tijdens het karterend booronderzoek geen primaire archeologische indicatoren aangetroffen en daarmee dus geen aanwijzingen voor de aanwezigheid van een archeologische vindplaats.&lt;br&gt;Evenals bij het grotere onderzoek dat in de Oostelijke Vechtplassen is uitgevoerd, komen in de top van het dekzand in het plangebied variabele hoeveelheden houtskool voor. Meestal gaat het hierbij om enkele stukjes (1-5 stukjes), in twee boringen gaat het om meerdere stukjes (5-15 stukjes). Van het houtskool is echter niet met zekerheid te zeggen of het gerelateerd is aan menselijke activiteiten. Houtskool wordt dan ook als een secundaire indicator beschouwd en de aanwezigheid van alleen houtskool in de monsters is dan ook geen aanleiding om vervolgonderzoek uit te voeren.&lt;/p&gt;
DOI: 10.15468/dl.4z43ez
title: Occurrence Download

description: A dataset containing 25832 species occurrences available in GBIF matching the query:
{
 "and" : [
 "Country is Mexico",
 "DatasetKey is one of (Aves y mamíferos del Parque Nacional Sierra de Órganos, Zacatecas, Distribución histórica, prospección actual y áreas potenciales para reintroducir lobo mexicano (Canis lupus baileyi) en Durango, sur de la Sierra Madre Occidental, México, Restauración y conservación de Isla Guadalupe)",
 "HasCoordinate is true",
 "HasGeospatialIssue is false"
 ]
}

 The dataset includes 25832 records from 3 constituent datasets; see https://api.gbif.org/v1/occurrence/download/0032268-250827131500795/datasets/export for details.
 
Data from some individual datasets included in this download may be licensed under less restrictive terms.
DOI: 10.17026/dans-xxm-t8pk
title: Koenestraat Amerongen Koenestraat te Amerongen. Archeologisch onderzoek dmv archeologische begeleiding en toezicht

description: &lt;p&gt;Binnen het plangebied zijn in de periode april tot september geen sporen en geen vondsten aangetroffen. De bodem was grotendeels verstoord tot voorbij de top van natuurlijke bodem. Conform PvE (en de aanvullingen hierop) zijn alle kruispunten geïnspecteerd op archeologie. Enige tijd was sprake van onduidelijk of het archeologische toezicht ook gold voor de nabijgelegen straten, waar vanwege een uitbreiding van het project ook gegraven is i.v.m. rioleringswerkzaamheden. In overleg met het Bevoegd Gezag (telefonische mededeling d.d. 03-09-2019, de gemeente Utrechtse Heuvelrug) is besloten om het toezicht op de te ontgraven delen verder te staken. Hoogstwaarschijnlijk is het plangebied, tegen de verwachting in, in het verleden al verstoord geraakt als gevolg van de aanleg van de weg en nabijgelegen wijk. Geadviseerd wordt om dit plangebied vrij te geven voor verdere ontwikkelingen.&lt;/p&gt;
DOI: 10.11587/zqbnnl/oiajy2
title: 20323_ta_de_v1_0.pdf

description: GfK-323: Tabulation report
DOI: 10.17026/dans-2c8-jtcr
title: Natuurontwikkeling Oostelijke Vechtplassen Eindrapportage OM 4577079100

description: &lt;p&gt;Voor de drie plangebieden geldt meer specifiek dat alleen plangebied Van der Tol zich in een gebied bevindt met een hoge archeologische verwachting voor het aantreffen van resten van jagers-verzamelaars uit de periode Paleo-Mesolithicum (zie Afb. 9). Hier bevindt de top van het dekzand zich vermoedelijk binnen 1 meter onder maaiveld. Voor de plangebieden Van Vliet en Van Heerdt geldt dat deze in een zone liggen waarvoor geen hoge archeologische verwachting op het aantreffen van resten van jagers-verzamelaars geldt. Hier ligt de top van het dekzand vermoedelijk dieper dan 1 meter onder maaiveld.&lt;br&gt;De plangebieden Van Heerdt en Van Vliet bevinden zich dus niet in een zone met een hoge archeologische verwachting. Conform het Afwegingskader archeologie Oostelijke Vechtplassen (zie paragraaf 4.3) is vervolgonderzoek hier niet meer noodzakelijk. EARTH Integrated Archaeology adviseert dan ook om hier geen vervolgonderzoek meer uit te voeren. Indien tijdens de uitvoering van het grondwerk archeologische (toevals)vondsten worden gedaan, geldt nog steeds de wettelijke plicht om deze te melden bij de bevoegde overheid, zoals staat aangegeven in de Monumentenwet/Erfgoedwet.&lt;/p&gt;