cometadata/datacite-titles-descriptions-related-identifiers huggingface dataset:
DOI: 10.5281/zenodo.15824560
title: data for "Feeding-Induced Olfactory Cortex Suppression Reduces Satiation", Lo et al., Neuron, 2025

description: Data repository for Lo et al., Neuron, 2025 (Binge feeding aPC)

For Ca2+ traces and neuromodulator traces from the miniscope recording, all traces can be found in the “miniscope_data” folder. Inside the folder, additional subfolders separate the recording data into different recording regions and cell types. The raw Ca2+ movies are excluded due to the large data size. Please contact the lead contact author of the paper if you want to access the raw, unprocessed data.

The behavioral data (lick events, pump events, etc), accompanying the miniscope recording can be found in the “behavior_data” folder. Note the behavioral data is formatted with the separator “;” instead of “,”. The “,” was used for the decimal point (commonly used with “.”). This is due to the common computer formats in Germany.

Optogenetics manipulation data can be found in the “aPC_optogenetics” folder, including eOPN3 and ChR2 data.

Measurement of OT VGAT neuron projection intensity by brain regions is located in the “OT_axonal_projection_measures” folder. Since the raw whole-brain image files are too large, we excluded them here.

3-photon microscopy data on OB mitral cells are located in the “3PM_data” folder.

In vitro patch-clamp recording data on aPC neurons can be found in the “aPC_slicework” folder.

Source data for plotting figure panels in the paper can be found in the “source_data_fig” folder. Note that the annotation is based on the original submission of the manuscript (Lo et al., bioRxiv, 2023), so it is not aligned with the publication version of the manuscript.

An overview file of the mice we used for the miniscope recording can be found in the “mouse_overview_sheet” folder. We documented which protocol, condition, food flavors, body weights, and other information.

 

If you have any questions regarding the dataset, please contact:

Friedrich Johenning (friedrich.johenning@charite.de) (lead contact)

or

Hung Lo (hung.lo@einsteinmed.edu)
DOI: 10.15468/dl.2z5928
title: Occurrence Download

description: A dataset listing the 8997 species recorded in GBIF matching the query:
{
 "and" : [
 "Geometry POLYGON((10.41984 -2.43178,3.28536 -3.68898,3.28536 -9.93648,5.4362 -12.86731,13.20019 -9.4711,13.72479 -8.84962,13.61987 -7.91545,12.83298 -5.98881,12.36084 -4.63075,10.41984 -2.43178))",
 "HasGeospatialIssue is false",
 "OccurrenceStatus is Present"
 ]
}

 The dataset's 8997 records were derived from 371 constituent datasets; see https://api.gbif.org/v1/occurrence/download/0055933-250827131500795/datasets/export for details.
 
Data from some individual datasets included in this download may be licensed under less restrictive terms.
DOI: 10.17026/dans-xtd-7zx5
title: Plangebied Zandlaan/Het Nieuwe Zwembad te Ede, gemeente Ede; archeologische opgraving - variant begeleiding RAAP-RAPPORT 6459, Plangebied Zandlaan ? Het Nieuwe Zwembad te Ede

description: &lt;p&gt;&lt;p&gt;In opdracht van de gemeente Ede heeft RAAP op 4 april 2023 een archeologisch proefsleuvenonder-zoek uitgevoerd in het kader van het project Zandlaan - Het Nieuwe Zwembad in de gemeente Ede.&lt;br&gt;&lt;p&gt;Het doel van het proefsleuvenonderzoek was het vaststellen van de archeologische waarde van het terrein. Hiertoe was het noodzakelijk inzicht te krijgen in de precieze aard en omvang van de vindplaats. In het verlengde daarvan is in kaart gebracht wat de consequenties zijn van de onderzoeksresultaten voor de verdere planvorming in het plangebied. Is de archeologische vindplaats behoudenswaardig, en, zo ja, kan deze behouden blijven of dient deze te worden opgegraven?&lt;br&gt;&lt;p&gt;Tijdens het onderzoek is centraal in het plangebied één proefsleuf aangelegd met een oppervlak van 28 m2. Dit komt neer op een dekkingsgraad van 5% van het totale plangebied.&lt;br&gt;&lt;p&gt;Verspreid over de proefsleuven zijn verschillende archeologische resten aangetroffen. Het gaat om vijf paalsporen die mogelijk tot een bijgebouw behoren. Daarnaast is in de akkerlaag direct boven het sporenniveau aardewerk uit de periode van de ijzertijd tot en met de vroeg-Romeinse tijd gevonden. Vermoedelijk dateren de sporen uit dezelfde periode.&lt;br&gt;&lt;p&gt;Aard van de vindplaats : nederzetting &lt;p&gt;Diepteligging : 150 cm ? mv &lt;p&gt;Datering : ijzertijd tot en met vroeg-Romeinse tijd &lt;p&gt;Op basis van de waardering van de aangetroffen resten, waarbij is gekeken naar zowel de fysieke als de inhoudelijke kwaliteit van de vindplaats, wordt geconcludeerd dat het gaat om een behoudenswaardige vindplaats.&lt;br&gt;&lt;p&gt;Het selectieadvies luidt: behoud van de archeologische resten. Indien duurzaam behoud van de resten niet mogelijk is tijdens de voorgenomen werkzaamheden dienen de resten veilig te worden gesteld door middel van een opgraving.&lt;/p&gt;
DOI: 10.60952/p3f5-rx16
title: Zmiany w miąższu płuc myszy zarażonych 200 i 400 larwami Trichinella spiralis (2)

description: Materiał zdjęciowy uzyskany w ramach badań, których celem było: zbadanie ultrastruktury transformującej komórki mięśniowej na skutek oddziaływania larw Trichinella spiralis na przestrzeni prawie całego okresu życia żywiciela (myszy szczepu BALB/c); opis relacji morfologicznej między komórką pielęgniarką a larwą włośnia krętego w różnym czasie od zarażenia organizmu żywicielskiego; przedstawienie zmian na poziomie rozdzielczości mikroskopu elektronowego, jakie zachodzą w narządach miąższowych, przez które migrują larwy Trichinella spiralis. Do badań użyto 90 immunokompetentnych myszy płci męskiej szczepu BALB/c w wieku 6 - 8 tygodni. Myszy zarażano doustnie różnymi ilościami larw włośnia krętego, a następnie w różnych okresach życia żywiciela pobierano wycinki tkankowe z wątroby, płuc, serca, przepony i mięśnia czterogłowego uda. Materiał tkankowy utrwalono w
roztworze będącym mieszaniną 2 % paraformaldehydu i 2,5% glutaraldehydu w 0,1 M buforze kakodylowym o pH 7,4. Zatopiony materiał biologiczny w żywicach cięto na skrawki
o grubości 5 μm i 50 nm, oglądano w mikroskopie świetlnym i mikroskopie elektronowym JEM 1200 EX, a następnie wykonano mikrografie elektronowe na płytkach TM – 6. Materiał zdjęciowy dotyczy analizy zmiany w miąższu płuc myszy zarażonych 200 i 400 larwami Trichinella spiralis. Na zdjęciu naczynie kapilarne miąższu płucnego wypełnione płytkami krwi (PK). Niektóre z tych płytek są ściśle zespolone z powierzchnią komórek śródbłonkowych (Ś). Powiększenie 12 000 x.
DOI: 10.17026/dans-xte-k9h4
title: Pletsmolen RAAPrap_5808_MEEPL2_20220519_inclusief-bijlagen

description: &lt;p&gt;&lt;p&gt; Tijdens het archeologisch onderzoek zijn in alle werkputten resten van de historische molenvijver aangetroffen die onderdeel uitmaakte van de Pletsmolen of Watervaldermolen. Deze molen was een bovenslagwatermolen dat rond 1748 werd gebouwd. Het molenrad werd in beweging gezet door water uit de Watervalderbeek die werd opgeslagen in de molenvijver. Uit het onderzoek is niet duidelijk geworden wat de exacte omvang is geweest van de vijver aangezien de oevers van de vijver niet zijn aangetroffen. Wel is duidelijk geworden dat de vijver minimaal een lengte gehad heeft van 98 meter en een breedte van 11 meter. De vijver had een vlakke bodem en was vermoedelijk circa 90 tot 120 cm diep (tot circa 150 tot 190 cm ?mv).&lt;br&gt;&lt;p&gt; De molen is in onbruik geraakt rond 1953 toen de laatste molenaar de molen verliet en de gemeente de molen opkocht. Vermoedelijk is toen ook de vijver gedempt.&lt;br&gt;&lt;p&gt; Tijdens het archeologisch onderzoek zijn geen vondsrijke lagen aangetroffen in de vijver. Wel zijn in het zuiden van de vijver verstoringen waargenomen die zeer waarschijnlijk zijn ontstaan rond 1966 toen het terrein ten zuiden van de vijver (waar de molen en huizen stonden) deels werd uitgebreid. Deze verstoringen hebben ervoor gezorgd dat de zuidelijke oevers van de vijver zijn verstoord.&lt;/p&gt;
DOI: 10.15468/dl.3x2vej
title: Occurrence Download

description: A dataset containing 30724 species occurrences available in GBIF matching the query:
{
 "and" : [
 "TaxonKey is Procyon lotor",
 "HasCoordinate is true",
 "HasGeospatialIssue is false",
 "Geometry POLYGON ((40.81373 29.26705, 40.81373 50.94, -6.6 50.94, -6.6 29.26705, 40.81373 29.26705))",
 "BasisOfRecord is one of (Human Observation, Machine Observation, Observation, Material sample)"
 ]
}

 The dataset includes 30724 records from 168 constituent datasets; see https://api.gbif.org/v1/occurrence/download/0055970-250827131500795/datasets/export for details.
 
Data from some individual datasets included in this download may be licensed under less restrictive terms.
DOI: 10.17026/dans-xtf-taqt
title: Capaciteitsvergroting N279 NO6166_DEN32_binder_eindversie

description: &lt;p&gt;In opdracht van Combinatie de Vaart heeft RAAP, in het kader van de capaciteitsvergroting van de N279 ter plaatse van plangebied Sint-Michielsgestel 2, een archeologische onderzoek uitgevoerd. Concreet werd de aanleg van een sloot en de graafwerkzaamheden van drie poelen archeologisch begeleid.&lt;br&gt;Tijdens het onderzoek zijn archeologische resten uit de (Late) Middeleeuwen tot de Vroege Nieuwe tijd aangetroffen. Deze zijn vermoedelijk onderdeel van de nederzetting Middelrode-het Gewad. De resten bestaan voornamelijk uit (paal)kuilen en greppels.&lt;/p&gt;
DOI: 10.17026/dans-xq4-nnq8
title: Bataafs platteland
title: Het Romeinse nederzettingslandschap in het Nederlandse Kromme-Rijngebied

description: &lt;p&gt;In de Romeinse tijd woonde in het Nederlandse rivierengebied een bevolkingsgroep die we kennen onder de naam Bataven. De afgelopen jaren is uitvoerig onderzoek gedaan naar hun bewoning op het platteland van het Kromme-Rijngebied. De vraag daarbij was of uit ruimtelijke ontwikkelingen van het platteland kon worden afgelezen of en zo ja hoe boerengemeenschappen integreerden in het Romeinse rijk.&lt;br&gt;Opgravingen en veldkarteringen in het studiegebied toonden ruim honderd Romeinse nederzettingen aan op het platteland van het Kromme-Rijngebied. Dat kenmerkte zich door grootschalige verkavelingen van landbouwgronden rondom kleine dorpen en gehuchten, waardoor een geordend cultuurlandschap ontstond. Die ruimtelijke indeling heeft te maken met de intensivering van de landbouw, waarbij men zich toelegde op het produceren van overschotten (runderen, paarden, veevoer) ten behoeve van een markt. Die bestond uit het Romeinse leger dat in de eerste eeuw na Christus ons land veroverde.&lt;br&gt;Verder is aannemelijk dat Bataafse boerderijen sterk zijn beïnvloed door de architectuur uit de legerkampen. Bataafse veteranen, die na 25 jaar krijgsdienst terugkeerden naar hun geboortegrond, hebben deze invloeden meegenomen. Die militaire architectuur is tot uitdrukking gebracht in het uiterlijk van huistypen met lage dakhellingshoeken, die lijken op soldatenbarakken en als&lt;br&gt;'veteranenboerderijen' kunnen worden betiteld. Dergelijke gebouwen benadrukken, samen met de grootschalige verkavelingen, de ruimtelijke plattelandsontwikkelingen in het Kromme-Rijngebied en weerspiegelen de integratie van Bataafse boerengemeenschappen in het Romeinse rijk.&lt;/p&gt;
description: &lt;p&gt;Het Romeinse nederzettingslandschap in het Nederlandse Kromme-Rijngebied&lt;/p&gt;
description: Date Submitted: 2009-06-23
DOI: 10.15468/dl.ye2n9e
title: Occurrence Download

description: A dataset containing 0 species occurrences available in GBIF matching the query:
{
 "and" : [
 "HasGeospatialIssue is false",
 "HasCoordinate is true",
 "OccurrenceStatus is Present",
 "BasisOfRecord is one of (Human Observation, Machine Observation, Occurrence evidence, Observation)",
 "TaxonKey is one of (Didelphis virginiana)",
 "Country is one of (Algeria, Angola, Benin, Botswana, British Indian Ocean Territory, Burkina Faso, Burundi, Cabo Verde, Cameroon, Central African Republic, Chad, Comoros, Congo, Congo, Democratic Republic of the, Côte d’Ivoire, Djibouti, Egypt, Equatorial Guinea, Eritrea, Eswatini, Ethiopia, French Southern Territories, Gabon, Gambia, Ghana, Guinea, Guinea-Bissau, Kenya, Lesotho, Liberia, Libya, Madagascar, Malawi, Mali, Mauritania, Mauritius, Mayotte, Morocco, Mozambique, Namibia, Niger, Nigeria, Réunion, Rwanda, Saint Helena, Ascension and Tristan da Cunha, Sao Tome and Principe, Senegal, Seychelles, Sierra Leone, Somalia, South Africa, South Sudan, Sudan, Tanzania, United Republic of, Togo, Tunisia, Uganda, Western Sahara, Zambia, Zimbabwe)"
 ]
}

 The dataset includes 0 records from 0 constituent datasets; see https://api.gbif.org/v1/occurrence/download/0055971-250827131500795/datasets/export for details.
DOI: 10.15468/dl.7zpqz4
title: Occurrence Download

description: A dataset containing 0 species occurrences available in GBIF matching the query:
{
 "and" : [
 "HasGeospatialIssue is false",
 "HasCoordinate is true",
 "OccurrenceStatus is Present",
 "BasisOfRecord is one of (Human Observation, Machine Observation, Occurrence evidence, Observation)",
 "TaxonKey is one of (Didelphis virginiana)",
 "Country is one of (Åland Islands, Albania, Andorra, Austria, Belarus, Belgium, Bosnia and Herzegovina, Bulgaria, Croatia, Czechia, Denmark, Estonia, Faroe Islands, Finland, France, Germany, Gibraltar, Greece, Guernsey, Holy See, Hungary, Iceland, Ireland, Isle of Man, Italy, Jersey, Latvia, Liechtenstein, Lithuania, Luxembourg, Malta, Moldova, Republic of, Monaco, Montenegro, Netherlands, North Macedonia, Norway, Poland, Portugal, Romania, Russian Federation, San Marino, Serbia, Slovakia, Slovenia, Spain, Svalbard and Jan Mayen, Sweden, Switzerland, Ukraine, United Kingdom of Great Britain and Northern Ireland)"
 ]
}

 The dataset includes 0 records from 0 constituent datasets; see https://api.gbif.org/v1/occurrence/download/0055973-250827131500795/datasets/export for details.
DOI: 10.15468/dl.55gnc3
title: Occurrence Download

description: A dataset containing 2814 species occurrences available in GBIF matching the query:
{
 "TaxonKey" : [
 "is Philadelphus tenuifolius"
 ]
}

 The dataset includes 2814 records from 91 constituent datasets; see https://api.gbif.org/v1/occurrence/download/0055972-250827131500795/datasets/export for details.
 
Data from some individual datasets included in this download may be licensed under less restrictive terms.
DOI: 10.15468/dl.4r9wqp
title: Occurrence Download

description: A dataset listing the 582 species recorded in GBIF matching the query:
{
 "and" : [
 "OccurrenceStatus is Present",
 "StateProvince is Île-de-France",
 "TaxonKey is Hymenoptera"
 ]
}

 The dataset's 582 records were derived from 13 constituent datasets; see https://api.gbif.org/v1/occurrence/download/0055945-250827131500795/datasets/export for details.
 
Data from some individual datasets included in this download may be licensed under less restrictive terms.
DOI: 10.15468/dl.89a47a
title: Occurrence Download

description: A dataset containing 592130 species occurrences available in GBIF matching the query:
{
 "TaxonKey" : [
 "is Impatiens glandulifera"
 ]
}

 The dataset includes 592130 records from 1150 constituent datasets; see https://api.gbif.org/v1/occurrence/download/0055893-250827131500795/datasets/export for details.
 
Data from some individual datasets included in this download may be licensed under less restrictive terms.
DOI: 10.15468/dl.fupy4m
title: Occurrence Download

description: A dataset containing 39069 species occurrences available in GBIF matching the query:
{
 "and" : [
 "Geometry POLYGON((4.57387 45.16827,4.80681 45.16827,4.80681 45.32599,4.57387 45.32599,4.57387 45.16827))",
 "HasGeospatialIssue is false",
 "Year 2014-2024"
 ]
}

 The dataset includes 39069 records from 95 constituent datasets; see https://api.gbif.org/v1/occurrence/download/0026574-240626123714530/datasets/export for details.
 
Data from some individual datasets included in this download may be licensed under less restrictive terms.
DOI: 10.34740/kaggle/dsv/8967789
title: World Stock Prices ( Daily Updating )
DOI: 10.15468/dl.aasgxy
title: Occurrence Download

description: A dataset containing 12 species occurrences available in GBIF matching the query:
{
 "TaxonKey" : [
 "is Myrcia sessilissima M.F.Santos"
 ]
}

 The dataset includes 12 records from 9 constituent datasets; see https://api.gbif.org/v1/occurrence/download/0026575-240626123714530/datasets/export for details.
 
Data from some individual datasets included in this download may be licensed under less restrictive terms.
DOI: 10.18150/eeclp4
title: In the circle of power: friends of King Vladislav IV Vasa

description: Any early modern ruler had to have devoted supporters. Most of them gathered around the king in order to obtain specific official and financial benefits, and sometimes they had similar political views to the monarch. However, this issue looked a bit different in relation to Vladislav IV Vasa, king of Poland and grand duke of Lithuania, who was considered by the nobility as a sympathetic and easy-going ruler (as opposed to his more secretive father, Sigismund III). Vladislav was a king who made friendships easily, and people close to him were very clearly at the centre of influence and thus political power. One of the main objectives is to indicate when and how the magnates established private contacts with Vladislav as prince and how they developed once he became king. A separate issue discussed centres on categories related to the understanding of friendship as an element of privacy in the early modern period. Through an in-depth analysis of the letters and memoirs left by the elite of the Polish-Lithuanian state, case studies of private friendships emerge, including the King’s close relationships with Adam Kazanowski, Jan Stanislaw Sapieha, Gerard Denhoff, Aleksander Ludwik Radziwiłł, Krzysztof Radziwiłł and several others. The repository contains data on articles, old prints and manuscripts that were used to write this article also this accessible in Open Access.
DOI: 10.5281/zenodo.12546535
title: When to Sweat the Small Stuff

description: This data release contains samples of detected compact binary coalescences in networks of advanced detectors and with cosmic explorer. Each sample set contains associated draw probabilities so that the events can be reweighed to mimic other injection distributions.See, e.g.,



  https://arxiv.org/abs/2307.02765

  https://arxiv.org/abs/2204.00461


for more discussion.
DOI: 10.5281/zenodo.12546536
title: When to Sweat the Small Stuff

description: This data release contains samples of detected compact binary coalescences in networks of advanced detectors and with cosmic explorer. Each sample set contains associated draw probabilities so that the events can be reweighed to mimic other injection distributions.See, e.g.,



  https://arxiv.org/abs/2307.02765

  https://arxiv.org/abs/2204.00461


for more discussion.
DOI: 10.15468/dl.n6g7yv
title: Occurrence Download

description: A dataset containing 974647 species occurrences available in GBIF matching the query:
{
 "and" : [
 "DatasetKey is EOD – eBird Observation Dataset",
 "GadmGid is one of (USA.5.17_1, USA.5.28_1)"
 ]
}

 The dataset includes 974647 records from 1 constituent datasets; see https://api.gbif.org/v1/occurrence/download/0026571-240626123714530/datasets/export for details.
 
Data from some individual datasets included in this download may be licensed under less restrictive terms.
DOI: 10.15151/esrf-dc-1823716253
title: Structure of Proline-rich binding domain bound to proline-rich peptides

description: Diffraction datasets of crystals of complexes of the Creator-1 proline-rich binding domain complex with proline-rich peptides from dZfc3h1 and Pih1D1.
DOI: 10.5281/zenodo.12750596
title: Reaction between serpentinite-equilibrated fluid and sulfide-bearing metagabbo at high P-T conditions

description: This repository contains the output files of the reaction-path models that simulate the reaction between fluid that is previously in equilibrium with serpentinite and a sulfide-bearing metagabbro over a range of oxygen fugacity. This repository contains supplementary information in support of the manuscript entitled "Mobilization of isotopically heavy sulfur during serpentinite subduction" by Schwarzenbach and coworkers in Science Advances.
DOI: 10.5281/zenodo.12750597
title: Reaction between serpentinite-equilibrated fluid and sulfide-bearing metagabbo at high P-T conditions

description: This repository contains the output files of the reaction-path models that simulate the reaction between fluid that is previously in equilibrium with serpentinite and a sulfide-bearing metagabbro over a range of oxygen fugacity. This repository contains supplementary information in support of the manuscript entitled "Mobilization of isotopically heavy sulfur during serpentinite subduction" by Schwarzenbach and coworkers in Science Advances.
DOI: 10.5281/zenodo.12744388
title: The extrAIM dataset: A merged satellite-based daily precipitation dataset for the Mediterranean region (including an ensemble of 20 synthetic realisations)

description: extrAIM dataset is a new merged daily precipitation product (extraim_merged_data.nc) for the Mediterranean region with the following characteristics:



Dataset format: NetCDF

Spatial resolution: 25 x 25 km

Temporal resolution: 1 day

Spatial coverage: Longitude: from -6.25 to 38.25, Latitude: 27.75 to 49

Temporal coverage: 01-01-2007 to 30-09-2021

Merging approach: Two-step merging (classification and regression)



Algorithm: Random Forest for both classification and regression

Training strategy: Full training strategy



Merged precipitation products: SM2Rain-ASCAT and GPM Late Run

Reference precipitation product: EMO5

Static covariates: Longitude, Latitude and Elevation, in both classification and regression step



Classification step: probability dry and probability dry of the 5 neighboring points around the target locations

Regression step: mean, standard deviation and skewness of daily precipitation, of the entire series and non-zero amounts, as well as mean precipitation of the 5 neighboring points around the target locations




In addition, an ensemble of 20 synthetic realizations (equiprobable and bias-adjusted) of the merged dataset is provided (files named: “extraim_realisation_XX.nc”). The synthetic realisations were produced using the extrAIM’s uncertainty-quantification approach and the associated conditional sampling method.
DOI: 10.5281/zenodo.12744389
title: The extrAIM dataset: A merged satellite-based daily precipitation dataset for the Mediterranean region (including an ensemble of 20 synthetic realisations)

description: extrAIM dataset is a new merged daily precipitation product (extraim_merged_data.nc) for the Mediterranean region with the following characteristics:



Dataset format: NetCDF

Spatial resolution: 25 x 25 km

Temporal resolution: 1 day

Spatial coverage: Longitude: from -6.25 to 38.25, Latitude: 27.75 to 49

Temporal coverage: 01-01-2007 to 30-09-2021

Merging approach: Two-step merging (classification and regression)



Algorithm: Random Forest for both classification and regression

Training strategy: Full training strategy



Merged precipitation products: SM2Rain-ASCAT and GPM Late Run

Reference precipitation product: EMO5

Static covariates: Longitude, Latitude and Elevation, in both classification and regression step



Classification step: probability dry and probability dry of the 5 neighboring points around the target locations

Regression step: mean, standard deviation and skewness of daily precipitation, of the entire series and non-zero amounts, as well as mean precipitation of the 5 neighboring points around the target locations




In addition, an ensemble of 20 synthetic realizations (equiprobable and bias-adjusted) of the merged dataset is provided (files named: “extraim_realisation_XX.nc”). The synthetic realisations were produced using the extrAIM’s uncertainty-quantification approach and the associated conditional sampling method.