cometadata/datacite-titles-descriptions-related-identifiers huggingface dataset:
DOI: 10.15468/2nmqyj
title: LIGNE NOUVELLE MONTPELLIER PERPIGNAN DUP PHASE 1 - Autres invertébrés aquatiques - Inventaire non protocolé

description: Liste des autres groupes d'invvertébrés aquatiques (Hors insectes, crustacés, et mollusques) observés dans le cadre des prospections de terrain réalisées au niveau de l'aire d'étude du projet SNCF de la Ligne Nouvelle Montpellier Perpignan. Inventaire à vue et capture avec relâché immédiat sur place pour les espèces à détermination complexe. Expertises ciblées sur plusieurs groupes d'invertébrés aquatiques.
DOI: 10.15468/rervbm
title: CardObs : Observations naturalistes issues de l'outil CardObs-Données naturalistes de LE RALLIC-MAHO Oona

description: Les données issues de l'outil de gestion CardObs et de son application mobile Carnat (hors programme relavant d'un cadre d'acquisition spécifique) regroupent les observations de naturalistes expérimentés. Ces observations concernent la faune, la flore et la fonge tant continentales que marines. L’emprise géographique des saisies couvre la France métropolitaine et l’Outre-mer. Les données peuvent être opportunistes aussi bien que protocolées en fonction des utilisateurs, et peuvent disposer de champs complémentaires propres à chaque jeu de données. L'outil CardObs a été mis en place en 2007 par le Service du Patrimoine Naturel du MNHN. Il est actuellement géré par PatriNat (OFB, MNHN, CNRS, IRD).
DOI: 10.15468/ucaddg
title: Ferme éolienne du Germancé - Donnees_Flore_Ciral

description: Liste des espèces de plantes contactées au cours de l'étude d'impact du projet éolien de la société Ferme éolienne du Germancé
DOI: 10.15468/urf4gw
title: Projet d'une zone d'aménagement économique à Malamani (Chirongui) EPFAM - FLORE_OPPORT

description: Le jeu de données regroupe les données d'observation sur la flore
DOI: 10.15468/phmdhq
title: Projet de construction d'une centrale solaire photovoltaïque au sol - reconversion d'un site d'extraction de calcaire à ciel ouvert - Données Faune

description: Données faune / Construction d'une centrale solaire photovoltaïque au sol (et ses bâtiments annexes: 2 postes de transformation, 1 poste de livraison, 1 local de maintenance)
DOI: 10.15468/symdqa
title: ACQUISITION_CBNMC - 2019_04_TOURETTE

description: 2019_04_TOURETTE / Les données ont été acquises par le Conservatoire botanique national du Massif-Central.
DOI: 10.15468/jeu6cu
title: Parc éolien des Landes de Lauviais

description: Le projet de parc éolien Landes de Lauviais se localise dans la région Bretagne, à l’est du département de l’Ille-et-Vilaine (35). Il se situe à mi-chemin entre Rennes et Saint-Malo. Le site d’étude s’inscrit sur les communes de Pleugueneuc et de Meillac qui appartiennent à la Communauté de communes Bretagne romantique. Le projet prévoit l'implantation de 4 éoliennes.
DOI: 10.15468/ppx3tj
title: Projet de parc photovoltaïque au sol à Vallon-en-Sully (03) au lieu-dit "Les Graves" - 2018 Inventaire faune-flore à Vallon-en-Sully (03)

description: Diagnostic écologique initial
DOI: 10.15468/x56hze
title: ACQUISITION_CBNMC - 2019_12_13_CENRhAl_wolff

description: 2019_12_13_CENRhAl_wolff / Les données ont été acquises par le Conservatoire botanique national du Massif-Central.
DOI: 10.15468/gbx48b
title: Plan d'actions du Canal des Deux mers en Midi Pyrénées-Inventaires de la flore le long du canal du Midi et du canal des 2 mers

description: Inventaires de la flore le long du canal du Midi et du canal des 2 mers
DOI: 10.15468/hf5gbz
title: ACQUISITION_CBNMC - DAUGE_Iris

description: DAUGE_Iris / Les données ont été acquises par le Conservatoire botanique national du Massif-Central.
DOI: 10.15468/qqvxsp
title: ACQUISITION_CBNMC - NICOLAS_Sylvain_juin2013

description: NICOLAS_Sylvain_juin2013 / Les données ont été acquises par le Conservatoire botanique national du Massif-Central.
DOI: 10.15468/b4sem9
title: ACQUISITION_CBNMC - 2020_06_corbel_pnrlf

description: 2020_06_corbel_pnrlf / Les données ont été acquises par le Conservatoire botanique national du Massif-Central.
DOI: 10.15468/dl.m7j2dn
title: Occurrence Download

description: A dataset containing 197 species occurrences available in GBIF matching the query:
{
 "and" : [
 "TaxonKey is one of (Haptoncus luteolus (Erichson, 1843))",
 "HasCoordinate is true"
 ]
}

 The dataset includes 197 records from 36 constituent datasets; see https://api.gbif.org/v1/occurrence/download/0026115-240506114902167/datasets/export for details.
 
Data from some individual datasets included in this download may be licensed under less restrictive terms.
DOI: 10.15468/2k6res
title: Extension Carrière de la Jaunaie - Données biologiques Carrière La Jaunais

description: Données biologiques résultant des inventaires de 2016 du CPIE du Cotentin
DOI: 10.15470/sqvd69
title: A biodiversity inventory of the 16th century based on a land and socio-economic survey in Spain

description: We mined the information of an exhaustive standardized historical survey developed in 628 localities across Spain between 1574 and 1582 (Relaciones Topogr?ficas de Felipe II) with the goal of producing a rigorous national inventory of the socio-economic status and natural resources of Spanish settlements. The survey includes records of plant and animal species, both wild and domestic. We were able to collate 7,309 records for 75 wild plant taxa, 89 wild animal taxa, and 60 crop and domestic animal taxa. These data can be used to reconstruct historical land use and habitat cover, and model historical distributions of many species, including emblematic ones such as wolf and bear, which can establish reference distributions to assess range and niche expansion, contraction and shifts.
DOI: 10.15468/79bysa
title: ACQUISITION_CBNMC - NICOLAS_juil2013

description: NICOLAS_juil2013 / Les données ont été acquises par le Conservatoire botanique national du Massif-Central.
DOI: 10.15468/a89s5t
title: Données espèces - expertise IPE - Azalys - 2017

description: L’Indice de Potentialité Ecologique (IPE) repose sur les mêmes critères d’évaluation que l’IQE, mais sur un seul jour d’inventaire. Il brosse à grands traits un portrait succinct du site et de ses potentialités. Il est assimilable à un pré-diagnostic. Ces données espèces sont issues des Expertises IPE en lien avec la convention SUEZ. iqe-patrinat.mnhn.fr
DOI: 10.15468/v5qf5y
title: Projet de parc photovoltaïque au sol à Vitry-en-Charollais (71) au lieu-dit "Colaillot" - inventaire faune-flore

description: Réalisation d'une centrale photovoltaïque au sol d'une puissance de 7 MWc environ sur une surface clôturée de 8,7 hectares. Le terrain correspond à une friche industrielle ayant accueilli une usine de fabrication de produits en amiante-ciment puis une installation de traitement de terres polluées. La surface au sol couverte par les panneaux est d'environ 3,1 hectares (soit 36 % de l'emprise clôturée). Les panneaux seront posés sur des structures fixes de moins de 3,5 m de haut. Le parc sera équipé de 6 postes de transformation et 1 poste de livraison.
DOI: 10.15468/ucuxqe
title: ACQUISITION_CBNMC - 2019_06_17_PERRET

description: 2019_06_17_PERRET / Les données ont été acquises par le Conservatoire botanique national du Massif-Central.
DOI: 10.15468/kxdex7
title: ACQUISITION_CBNMC - DAUGE_janv2013

description: DAUGE_janv2013 / Les données ont été acquises par le Conservatoire botanique national du Massif-Central.
DOI: 10.15468/xgwfzr
title: ACQUISITION_CBNMC - CG 07

description: Données communiquées par le conseil général de l'Ardèche
DOI: 10.15468/8m2qhz
title: Projet éolien de Largeasse - teletransmission_NEOEN_Largeasse

description: Le projet retenu est est composé de 6 éoliennes de 117 mètres de diamètre de rotor pour une hauteur totale en bout de pale de 150 mètres. Le type d’éolienne retenu pourra être la Nordex N117 à 2.4 MW, la puissance installée sera donc de 14.4MW. Il est également équipé d'un poste de livraison et du raccordement entre ces différentes installations
DOI: 10.15468/a8abjf
title: CardObs : Observations naturalistes issues de l'outil CardObs-Données naturalistes de ULMER André

description: Les données issues de l'outil de gestion CardObs et de son application mobile Carnat (hors programme relavant d'un cadre d'acquisition spécifique) regroupent les observations de naturalistes expérimentés. Ces observations concernent la faune, la flore et la fonge tant continentales que marines. L’emprise géographique des saisies couvre la France métropolitaine et l’Outre-mer. Les données peuvent être opportunistes aussi bien que protocolées en fonction des utilisateurs, et peuvent disposer de champs complémentaires propres à chaque jeu de données. L'outil CardObs a été mis en place en 2007 par le Service du Patrimoine Naturel du MNHN. Il est actuellement géré par PatriNat (OFB, MNHN, CNRS, IRD).
DOI: 10.15468/2vgc5v
title: Suivis ornithologiques Domaine départemental de Lindre-Suivis ornithologiques du Domaine de départemental de Lindre

description: Depuis 1993, toutes les espèces d'oiseaux présentes sur les étangs du Domaine départemental de Lindre, classé Natura 2000 et RAMSAR sont inventoriées et dénombrées 2 à 4 fois par mois. Ce suivi, réalisé selon un protocole basé sur des IPA permet de suivre l'évolution de la fréquentation du site par les 240 espèces migratrices et sédentaires qui y ont déjà été observées.
Ce comptage est réalisé sur l'étang de Lindre et ses étangs satellites. Afin de balayer l'ensemble de la surface de l'étang de Lindre, vu la superficie, il a été nécessaire d'établir 9 points de comptage sur le site. Sur les étangs satellites, un seul point de comptage est effectué, généralement depuis la digue de l'étang, sauf sur l'étang Zommange où un deuxième point d'observation est réalisé afin d'avoir une vue sur la cornée qui est invisible de la digue.
DOI: 10.15468/x8rd8z
title: Observations aléatoires des espaces protégés de la LPO France et de l'OFB - Observations aléatoires | RNN Saint-Denis-du-Payré

description: Observations aléatoires de la Réserve Naturelle nationale de Saint-Denis-du-Payré et espaces naturels alentours.
DOI: 10.15468/cjtdkh
title: Appui technique et scientifique à la mise en œuvre de la MAET Herb07 zones humides-Inventaires du CBNPMP dans le cadre du Concours Prairies fleuries en Midi-Pyrénées

description: Inventaires du CBNPMP dans le cadre du Concours Prairies fleuries en Midi-Pyrénées
DOI: 10.15468/95m4z2
title: Suivi environnemental du parc éolien de l'Oasis (2018) - Suivi post-implantation du parc éolien des Hardanges en 2018

description: Suivis mares, amphibiens, avifaune et suivi de la mortalité
DOI: 10.15468/mdt579
title: Centrale solaire des Nénuphars - Données flore

description: Les informations de ce jeu de données ont été acquises dans le cadre de l’étude écologique de la centrale solaire des Nénuphars
DOI: 10.15468/mqegqj
title: ACQUISITION_CBNMC - ECO-MED_avril2012

description: Données flore sous format MapInfo
DOI: 10.15468/ghg3vh
title: Centrale photovoltaïque de Roézé-sur-Sarthe - Inventaire faune flore de l'etude d'impact

description: Inventaire de la Flore, des Insectes, des Amphibiens, des Reptiles et les Oiseaux, des Mammifères dont les Chiroptères.
DOI: 10.15468/htspq6
title: Amélioration de la connaissance de la flore, la fonge et les habitats naturels sur le territoire de la « plaine » de Midi-Pyrénées-Inventaire des végétations et habitats péri-aquatiques dans le secteur de plaine de Midi-Pyrénées par le CBNPMP

description: Amélioration de la connaissance des végétations et habitats péri-aquatique dans le secteur de plaine de Midi-Pyrénées par le CBNPMP
DOI: 10.15468/nxeu2c
title: ACQUISITION_CBNMC - LPOAuv_ambroisie

description: LPOAuv_ambroisie / Les données ont été acquises par le Conservatoire botanique national du Massif-Central.
DOI: 10.15468/55p3qx
title: Unité de fabrication de batteries électriques - Flore - Inventaire

description: Liste des espèces végétales observés dans le cadre des prospections de terrain réalisées au niveau de l'aire d'étude du projet à Douai (59).
DOI: 10.15468/scj7un
title: ACQUISITION_CBNMC - PRADINASR_bryo

description: PRADINASR_bryo / Les données ont été acquises par le Conservatoire botanique national du Massif-Central.
DOI: 10.15468/dmsbzp
title: ACQUISITION_CBNMC - 2020_8_guillerme_CBNMC

description: 2020_8_guillerme_CBNMC / Les données ont été acquises par le Conservatoire botanique national du Massif-Central.
DOI: 10.15468/df7jqy
title: Projet de rénovation urbaine Créteil, haut Mont-Mesly - Données Faune-Flore-Habitats

description: Données Faune-Flore-Habitats
DOI: 10.15468/s3gtu5
title: 2018 Etude d'impact concernant la centrale photovoltaïque flottante du Vallon Dol - Taxons floristiques réserve du Vallon Dol

description: Observations de taxons floristiques. La zone d'étude concernée est le pourtour de la réserve du Vallon Dol pour le projet photovoltaïque flottant sur le plan d'eau de la réserve.
DOI: 10.15468/93z858
title: Projet de centrale photovoltaïque au sol de Pouy Nègue

description: La centrale solaire photovoltaïque sera implantée sur la commune de Cère, qui comptait 403 habitants en 2014. Cère fait partie de la Communauté de Commune Coeur Haute Lande qui regroupe 26 communes et comptait 15 765 habitants en 2014. Le secteur tertiaire est fortement représenté. Le projet s’inscrit dans un contexte majoritairement forestier. A une échelle plus fine, le site d’implantation prévu pour la centrale photovoltaïque est localisé sur des parcelles autrefois exploitées mais qui depuis la tempête Klaus de 2009, sont restées en friche. Certains secteurs ont été replantés avec de jeunes pins. La surface totale du site est de 121 ha.Le projet se situe dans un domaine sédimentaire et concerne l’entité hydrogéologique du des sables et graviers d’Arengosse. Des mesures devront être prises en compte en phase travaux afin d’éviter tout rejet de polluant dans les sols et les milieux aquatiques.
DOI: 10.15468/3p6xsf
title: Projet de parc éolien de la Côte du Moulin à Vésigneul (51) - Faune / Flore

description: Dans ce contexte, la mission d’Ecosphère consiste : • À acquérir une bonne compréhension du fonctionnement des écosystèmes présents et une fine connaissance des enjeux de l’aire d’étude ; • À inventorier la faune et la flore, notamment les espèces susceptibles d’être directement ou indirectement concernées par le projet ; • Evaluer l’ensemble des impacts sur la biodiversité ; • Proposer des mesures d’évitement, de réduction, voire de compensation des impacts écologiques ; • Evaluer les éventuelles incidences du projet sur les sites Natura 2000.
DOI: 10.15468/jd7hwv
title: ACQUISITION_CBNMC - WEISS_juin2012

description: WEISS_juin2012 / Les données ont été acquises par le Conservatoire botanique national du Massif-Central.
DOI: 10.15468/d69srz
title: ACQUISITION_CBNMC - BOUDRIE

description: Données communiquées par M. BOUDRIE
DOI: 10.15468/avwujy
title: Données d’observations floristiques agrégées au sein de Mascarine (CBN-CPIE Mascarin) - Données CBN-CPIE Mascarin mixte (CBNM, 2011-2018)

description: Données CBN-CPIE Mascarin mixte (Life+ COREXERUN, Plan national de lutte Herbe de la Pampa...)
DOI: 10.15468/5sfuxt
title: ACQUISITION_CBNMC - ROUX_Florediverse

description: ROUX_Florediverse / Les données ont été acquises par le Conservatoire botanique national du Massif-Central.
DOI: 10.15468/9x86xn
title: ACQUISITION_CBNMC - VCLF

description: Données communiquées par le service Environnement de la Ville de Clermont-Ferrand
DOI: 10.15468/5a52e9
title: ACQUISITION_CBNMC - 2020_04_GARDARIN

description: 2020_04_GARDARIN / Les données ont été acquises par le Conservatoire botanique national du Massif-Central.
DOI: 10.15468/644rp6
title: 16 - Inventaire général de la flore et de la fonge - Groupe Mycologique et Botanique du Val de Saône - inventaire général de la flore et de la fonge réalisé sur le terrain

description: Groupe Mycologique et Botanique du Val de Saône - inventaire général de la flore et de la fonge réalisé sur le terrain
DOI: 10.15468/9322cg
title: Ferme éolienne de Pouligny Saint Pierre - Données Faune/Flore Pouligny

description: Relevés avifaunistiques-chiroptère/mammalogique-herpétofaune étude naturaliste, relevés floristique/habitats
DOI: 10.5281/zenodo.7687882
title: A public manifold left/right ventricular database

description: A public manifold left/right ventricular database

This database contains the 44 postprocessed meshes based on the public databases 10.5281/zenodo.4590294 and 10.5281/zenodo.3890034. This database was used to train the DeepSDF of our work Shape of my heart: Cardiac models through learned implicitly defined functions 10.48550/arXiv.2308.16568. Further information on the postprocessing can be found in this article.

Structure

The database is split into the closed surfaces for each chamber between endo- and epicardium.



lv



endo

epi



rv



endo

epi




The metadata files metadata.pkl.gz and metadata.csv contain a path to all meshes and their respective sources. Here's an example how the files can be read:

import pandas as pd
metadata = pd.read_pickle("metadata.pkl.gz")
#or
metadata = pd.read_csv("metadata.csv", sep=";")

The file point_clouds.pkl.gz contains a DataFrame of the point cloud data that was used for generated for all 44 meshes and used in the validation and training. The data can be read similar to the metadata:

import pandas as pd
point_clouds = pd.read_pickle("metadata.pkl.gz")

The data contains the following fields (SDF = signed distance function, LV = left ventricular, RV = right ventricular)




mesh_id
xyz
sdf_lv_endo
sdf_lv_epi
sdf_rv_endo
sdf_rv_epi


ID of the mesh from which the point cloud was generated
Spatial coordinate
SDF to the LV endocardium
SDF to the LV epicardium
SDF to the RV endocardium
SDF to the RV epicardium




All provided meshes contain the following fields:

The fiber and sheet orientation of the original meshes, computed using a rule-based approach.



fiber

sheet


A true/false, (0/1) mask marking the valves of the meshes.



valve


The universal ventricular coordinates from the original meshes to provide orientation inside the ventricles. See 10.1016/j.media.2018.01.005 for more details.



uvc_intraventricular

uvc_longitudinal

uvc_rotational

uvc_transmural


Acknowledgements

This work was supported by the Swiss National Science Fund [Cardiotwin, Weave/Lead Agency, Project number 214817], by the Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG, German Research Foundation) [EXC-2047/1-390685813, and EXC2151-390873048], PRIN-PNRR [project no. P2022N5ZNP], and CSCS [production grant no. s1074].
DOI: 10.15468/3wx5v7
title: Projet d'aménagement d'un entrepôt logistique sur le Parc d'activité de DOUZIES - inventaire faune flore SIG MAUBEUGE

description: INVENAIRE DES ESPECES FAUNE FLORE SUR LE PARC ACTIVITE DOUZIES MAUBEUGE
DOI: 10.15472/u01phh
title: Biological characterization of natural areas La Cumbre Nucleus, Valle del Cauca, Colombia

description: As part of the landscape, flora is a component of biodiversity that requires special and spatial attention and management. A rapid flora inventory was carried out in the La Cumbre nucleus using rapid assessment plots RAP (Gentry 1982), within properties managed by Smurfit Kappa, in order to generate a biological characterization of the area, determining the species of the biodiversity present in the area, pointing out those that, due to their threat status, endemism or special importance, require greater attention, emphasizing the flora component.
description: Twenty-nine species were recorded, including Otoba lehmannii (Myristicaceae) categorized as vulnerable (VU). It can be characterized as abundant in the natural forest fragments of the core and is represented both in mature individuals, of great phenotypic vigor and large size, which were in full fruiting, as well as in intermediate and smaller sizes, and in natural regeneration. This species is scarce in other parts of the country and the presence of the populations in the Nucleus La Cumbre can be catalogued preliminarily as an important genetic reservoir for the species.
description: This dataset contains 276 biological records from the Plantae kingdom. They are distributed in 1 phylo, 3 classes, 16 orders, 28 families, 37 genus and 29 species. 43% is classified at the species level and 30% at the genus level.
DOI: 10.15468/86kpg5
title: Parc Eolien de Saint-Sulpice-les-Feuilles - Volet milieu naturel de l'étude d'impact du Parc éolien de Saint-Sulpice

description: Inventaire de l'avifaune, des chiroptères, de la faune terrestre, de la flore (ou Inventaires faune, flore)
DOI: 10.15468/smmhk4
title: ACQUISITION_CBNMC - Tisserand_gagee_janv2016

description: Tisserand_gagee_janv2016 / Les données ont été acquises par le Conservatoire botanique national du Massif-Central.
DOI: 10.15468/9qascs
title: Centrale Photovoltaïque du CET de Dijon - Données brutes biodiversité

description: Le projet est localisé au nord de la commune de Dijon, au lieu-dit « Aux charmes d’Asnières nord ». Le terrain concerné par le projet de parc photovoltaïque est actuellement occupé par un centre d’enfouissement technique (CET) dont la gestion est assurée par Dijon Métropole. Ce CET est aujourd’hui exploité dans sa partie est en tant que dépôt de déchets inertes. Cette activité doit se terminer à la fin de l’année 2018 et le projet de centrale photovoltaïque fait partie intégrante du projet de remise en état du site. Le terrain d’implantation est composé de 38 parcelles d’une superficie totale d’environ 28,85 hectares. L’emprise de l’installation photovoltaïque (surface clôturée) sera d’environ 15,6 hectares. Au regard de la nature du projet et des sensibilités potentielles du territoire, les principaux enjeux environnementaux sont les suivants : • production d'énergie renouvelable : la mise en place d’un parc photovoltaïque concourt aux objectifs de la transition énergétique et notamment de réduction des émissions de gaz à effets de serre (GES) ; • biodiversité : le projet ne se situe pas au sein d’une zone de protection réglementaire ou d’inventaire ; la zone est aujourd’hui fortement anthropisée. Toutefois, le secteur est susceptible d’accueillir des espèces d’intérêt patrimonial inféodées aux milieux pionniers ou des espèces exotiques envahissantes (EEE), à cause du sol régulièrement perturbé par l’activité humaine. Il est attendu que le projet intègre dans sa conception la prise en compte des espèces et habitats présents et qu’il démontre plus particulièrement la prise en compte des EEE ; • paysage : le site du projet est inclus dans un espace fortement anthropisé (deux routes à fort trafic, zone d’activités de Valmy, usine de traitement des déchets) représentant une sensibilité paysagère faible. Cependant, le projet est soumis à plusieurs co-visibilités avec divers sites patrimoniaux à proximité, étant donné la topographie particulière au droit du projet (surplomb par rapport à la plaine). Il est donc attendu que le projet démontre la prise en compte des enjeux paysagers et que des mesures soient prises pour l’intégrer dans son environnement immédiat. • risques naturels : le projet est concerné par plusieurs risques et aléas naturels, à savoir les risques mouvement de terrain et ruissellement en lien avec le CET (sol meuble, topographie du site) et l’aléa retrait et gonflement des argiles. Il est donc attendu que le projet démontre la prise en compte de ces risques et les intègre dans la réflexion du projet.
DOI: 10.15468/wqew8k
title: ACQUISITION_CBNMC - CERANGE_Obs_Loire

description: CERANGE_Obs_Loire / Les données ont été acquises par le Conservatoire botanique national du Massif-Central.