cometadata/datacite-titles-descriptions-related-identifiers huggingface dataset:
DOI: 10.5281/zenodo.10636797
title: A Decade of Progress: Insights of Open Data Practices in Biosciences at the University of Edinburgh

description: Abstract:   
  The evolution of scientific research now emphasizes Open Data's role in fostering transparency and collaboration.   This study evaluates the University of Edinburgh's progress in adopting open data practices,   particularly since its 2021 open research policy. Our analysis analyses biosciences research data sharing from 2014 to 2022,   reviewing 193 papers for their adherence to Openness and FAIRness criteria:   Completeness, Reusability, Accessibility, and Licensing.   Findings reveal an uptick in data completeness and reusability,   with genome data being shared more frequently than image data.   Data availability statements (DAS) and preprint sharing show a strong correlation with higher Openness and FAIRness scores.   Furthermore, the FAIR principal implementation in 2016 had a positive impact on data reusability and a notable increase in DAS.   On the other hand, the COVID-19 pandemic shows a substantial increase in preprint sharing and a continued trend towards open data sharing,   while also resulting in significant improvements in 'Complete,' 'Reuse,' and 'Access' scores.   This paper spotlights The University of Edinburgh's journey towards open data, addressing the changes and advocating for best practices to nurture this progression.      
Data Reuse:  
  This dataset is provided to facilitate further research and analysis in the field of Open Data in biosciences.  Researchers are encouraged to use this data to replicate study findings, conduct meta-analyses, or extend the research into new areas.  Before reusing the data, please review the accompanying variable descriptions and usage guidelines to ensure accurate interpretation.  Users are expected to reference this dataset according to the citation guidelines provided and adhere to the licensing terms outlined.   For any modifications, enhancements, or distributions,   we urge users to maintain the integrity of the original data and provide transparent documentation of any data processing steps.    
Dataset details are included in the README file within the deposit. We recommend accessing the datasets content via the linked GitHub repository.
description: Funding This project was funded by MRC grant MR/X009726/1
DOI: 10.5281/zenodo.10636796
title: A Decade of Progress: Insights of Open Data Practices in Biosciences at the University of Edinburgh

description: Abstract:   
  The evolution of scientific research now emphasizes Open Data's role in fostering transparency and collaboration.   This study evaluates the University of Edinburgh's progress in adopting open data practices,   particularly since its 2021 open research policy. Our analysis analyses biosciences research data sharing from 2014 to 2022,   reviewing 193 papers for their adherence to Openness and FAIRness criteria:   Completeness, Reusability, Accessibility, and Licensing.   Findings reveal an uptick in data completeness and reusability,   with genome data being shared more frequently than image data.   Data availability statements (DAS) and preprint sharing show a strong correlation with higher Openness and FAIRness scores.   Furthermore, the FAIR principal implementation in 2016 had a positive impact on data reusability and a notable increase in DAS.   On the other hand, the COVID-19 pandemic shows a substantial increase in preprint sharing and a continued trend towards open data sharing,   while also resulting in significant improvements in 'Complete,' 'Reuse,' and 'Access' scores.   This paper spotlights The University of Edinburgh's journey towards open data, addressing the changes and advocating for best practices to nurture this progression.      
Data Reuse:  
  This dataset is provided to facilitate further research and analysis in the field of Open Data in biosciences.  Researchers are encouraged to use this data to replicate study findings, conduct meta-analyses, or extend the research into new areas.  Before reusing the data, please review the accompanying variable descriptions and usage guidelines to ensure accurate interpretation.  Users are expected to reference this dataset according to the citation guidelines provided and adhere to the licensing terms outlined.   For any modifications, enhancements, or distributions,   we urge users to maintain the integrity of the original data and provide transparent documentation of any data processing steps.    
Dataset details are included in the README file within the deposit. We recommend accessing the datasets content via the linked GitHub repository.
description: Funding This project was funded by MRC grant MR/X009726/1
DOI: 10.6084/m9.figshare.14252010
title: Additional file 1 of Genome-wide identification of CLE gene family and their potential roles in bolting and fruit bearing in cucumber (Cucumis sativus L.)

description: Additional file 1: S1 Table. Location and sequences of cucumber CLE genes. S2 Table. Location and sequences of Arabidopsis CLE genes. S3 Table. Location and sequences of melon CLE genes. S4 Table. Ka, Ks, and divergence time of the homologous pair CsCLE24-CsCLE25. S5 Table. RPKM of cucumber CLE genes during different developmental stages. S6 Table. Expression of cucumber CLE genes during different tissue in Chinese long ‘9930’. S7 Table. Expression of heterologous overexpression of CsCLV3 gene in Arabidopsis.
DOI: 10.6084/m9.figshare.14252100
title: Additional file 1 of Diffusion tensor imaging revealed different pathological processes of white matter hyperintensities

description: Additional file 1.
DOI: 10.6084/m9.figshare.21067843.v1
title: Additional file 10 of Identification and characterization of miRNAs and PHAS loci related to the early development of the embryo and endosperm in Fragaria × ananassa

description: Additional file 10: Table S5. The primers for qRT-PCR.
DOI: 10.6084/m9.figshare.21067867
title: Additional file 8 of Identification and characterization of miRNAs and PHAS loci related to the early development of the embryo and endosperm in Fragaria × ananassa

description: Additional file 8: Table S3. Prediction and analysis miRNA target genes.
DOI: 10.6084/m9.figshare.21067870.v1
title: Additional file 9 of Identification and characterization of miRNAs and PHAS loci related to the early development of the embryo and endosperm in Fragaria × ananassa

description: Additional file 9: Table S4. The basic information and annotation of the predicted PHAS loci in the strawberry.
DOI: 10.6084/m9.figshare.14252100.v1
title: Additional file 1 of Diffusion tensor imaging revealed different pathological processes of white matter hyperintensities

description: Additional file 1.
DOI: 10.6084/m9.figshare.14252010.v1
title: Additional file 1 of Genome-wide identification of CLE gene family and their potential roles in bolting and fruit bearing in cucumber (Cucumis sativus L.)

description: Additional file 1: S1 Table. Location and sequences of cucumber CLE genes. S2 Table. Location and sequences of Arabidopsis CLE genes. S3 Table. Location and sequences of melon CLE genes. S4 Table. Ka, Ks, and divergence time of the homologous pair CsCLE24-CsCLE25. S5 Table. RPKM of cucumber CLE genes during different developmental stages. S6 Table. Expression of cucumber CLE genes during different tissue in Chinese long ‘9930’. S7 Table. Expression of heterologous overexpression of CsCLV3 gene in Arabidopsis.
DOI: 10.6084/m9.figshare.21067843
title: Additional file 10 of Identification and characterization of miRNAs and PHAS loci related to the early development of the embryo and endosperm in Fragaria × ananassa

description: Additional file 10: Table S5. The primers for qRT-PCR.
DOI: 10.6084/m9.figshare.21067861
title: Additional file 6 of Identification and characterization of miRNAs and PHAS loci related to the early development of the embryo and endosperm in Fragaria × ananassa

description: Additional file 6: Table S1. Distribution of the sRNA sequencing in the 12 libraries.
DOI: 10.25592/dgs.corpus-1.0-type-55582
title: BRAUN8^ (MEINE DGS – annotiert. Öffentliches Korpus der Deutschen Gebärdensprache, 1. Release)
title: BROWN8^ (MY DGS – annotated. Public Corpus of German Sign Language, 1st release)

description: Ein Type aus der Annotation von MEINEDGS mit allen seinen Tokens aus MEINEDGS: The Public DGS Corpus consists of more than 50 hours of video data from the DGS-Korpus project made available together with annotations for research purposes. In this project, data were collected all across Germany in the timeframe 2010-2012. The public corpus shows 330 informants in 4 different age groups (from 18 years on) from 13 different regions. All parts are conversations between two informants in German Sign Language (DGS). The majority of transcripts included cover discussions and reports on Deaf life and personal experiences, although there are examples of other tasks such as story retellings as well.<br>Transcripts are made available in iLex and ELAN format as well as in SRT subtitles format that can be imported in MaxQDA and other analysis tools, together with the mp4 video files in 360p50. Diese DOI identifiziert die Version 1.0 des Datensatzes.
description: A type from the annotation of MYDGS including all its tokens in MYDGS: Das Öffentliche DGS-Korpus besteht aus mehr als 50 Stunden Video aus dem Projekt DGS-Korpus, die zusammen mit Annotationen für Forschungszwecke zur Verfügung gestellt werden. Die Datenerhebung im Projekt fand im Zeitraum 2010-2012 in ganz Deutschland statt. Das öffentliche Korpus besteht aus Gesprächen jeweils zweier Informantinnen oder Informanten in Deutscher Gebärdensprache. Das Korpus umfasst 330 Informantinnen und Informanten in vier verschiedenen Altersgruppen (ab 18 Jahren) aus 13 verschiedenen Regionen. Der Schwerpunkt der Sammlung liegt auf Transkripten von Diskussionen und Berichten über das Leben Gehörloser sowie persönliche Erfahrungen, sie enthält aber auch Beispiele anderer Erhebungsformate wie Nacherzählungen.<br>Transkripte werden im iLex- und ELAN-Format sowie als SRT-Untertiteldateien (zum Import etwa in MaxQDA) zur Verfügung gestellt. Die zugehörigen MP4-Videodaten sind durchgängig im Format 360p50. This DOI identifies the version 1.0 of the dataset.
DOI: 10.25592/dgs.corpus-1.0-type-55632
title: ROSA4^ (MEINE DGS – annotiert. Öffentliches Korpus der Deutschen Gebärdensprache, 1. Release)
title: PINK4^ (MY DGS – annotated. Public Corpus of German Sign Language, 1st release)

description: Ein Type aus der Annotation von MEINEDGS mit allen seinen Tokens aus MEINEDGS: The Public DGS Corpus consists of more than 50 hours of video data from the DGS-Korpus project made available together with annotations for research purposes. In this project, data were collected all across Germany in the timeframe 2010-2012. The public corpus shows 330 informants in 4 different age groups (from 18 years on) from 13 different regions. All parts are conversations between two informants in German Sign Language (DGS). The majority of transcripts included cover discussions and reports on Deaf life and personal experiences, although there are examples of other tasks such as story retellings as well.<br>Transcripts are made available in iLex and ELAN format as well as in SRT subtitles format that can be imported in MaxQDA and other analysis tools, together with the mp4 video files in 360p50. Diese DOI identifiziert die Version 1.0 des Datensatzes.
description: A type from the annotation of MYDGS including all its tokens in MYDGS: Das Öffentliche DGS-Korpus besteht aus mehr als 50 Stunden Video aus dem Projekt DGS-Korpus, die zusammen mit Annotationen für Forschungszwecke zur Verfügung gestellt werden. Die Datenerhebung im Projekt fand im Zeitraum 2010-2012 in ganz Deutschland statt. Das öffentliche Korpus besteht aus Gesprächen jeweils zweier Informantinnen oder Informanten in Deutscher Gebärdensprache. Das Korpus umfasst 330 Informantinnen und Informanten in vier verschiedenen Altersgruppen (ab 18 Jahren) aus 13 verschiedenen Regionen. Der Schwerpunkt der Sammlung liegt auf Transkripten von Diskussionen und Berichten über das Leben Gehörloser sowie persönliche Erfahrungen, sie enthält aber auch Beispiele anderer Erhebungsformate wie Nacherzählungen.<br>Transkripte werden im iLex- und ELAN-Format sowie als SRT-Untertiteldateien (zum Import etwa in MaxQDA) zur Verfügung gestellt. Die zugehörigen MP4-Videodaten sind durchgängig im Format 360p50. This DOI identifies the version 1.0 of the dataset.
DOI: 10.25592/dgs.corpus-1.0-type-55643
title: ROSTOCK1^ (MEINE DGS – annotiert. Öffentliches Korpus der Deutschen Gebärdensprache, 1. Release)
title: ROSTOCK1^ (MY DGS – annotated. Public Corpus of German Sign Language, 1st release)

description: Ein Type aus der Annotation von MEINEDGS mit allen seinen Tokens aus MEINEDGS: The Public DGS Corpus consists of more than 50 hours of video data from the DGS-Korpus project made available together with annotations for research purposes. In this project, data were collected all across Germany in the timeframe 2010-2012. The public corpus shows 330 informants in 4 different age groups (from 18 years on) from 13 different regions. All parts are conversations between two informants in German Sign Language (DGS). The majority of transcripts included cover discussions and reports on Deaf life and personal experiences, although there are examples of other tasks such as story retellings as well.<br>Transcripts are made available in iLex and ELAN format as well as in SRT subtitles format that can be imported in MaxQDA and other analysis tools, together with the mp4 video files in 360p50. Diese DOI identifiziert die Version 1.0 des Datensatzes.
description: A type from the annotation of MYDGS including all its tokens in MYDGS: Das Öffentliche DGS-Korpus besteht aus mehr als 50 Stunden Video aus dem Projekt DGS-Korpus, die zusammen mit Annotationen für Forschungszwecke zur Verfügung gestellt werden. Die Datenerhebung im Projekt fand im Zeitraum 2010-2012 in ganz Deutschland statt. Das öffentliche Korpus besteht aus Gesprächen jeweils zweier Informantinnen oder Informanten in Deutscher Gebärdensprache. Das Korpus umfasst 330 Informantinnen und Informanten in vier verschiedenen Altersgruppen (ab 18 Jahren) aus 13 verschiedenen Regionen. Der Schwerpunkt der Sammlung liegt auf Transkripten von Diskussionen und Berichten über das Leben Gehörloser sowie persönliche Erfahrungen, sie enthält aber auch Beispiele anderer Erhebungsformate wie Nacherzählungen.<br>Transkripte werden im iLex- und ELAN-Format sowie als SRT-Untertiteldateien (zum Import etwa in MaxQDA) zur Verfügung gestellt. Die zugehörigen MP4-Videodaten sind durchgängig im Format 360p50. This DOI identifies the version 1.0 of the dataset.
DOI: 10.25592/dgs.corpus-1.0-type-55654
title: FARBEN2B^ (MEINE DGS – annotiert. Öffentliches Korpus der Deutschen Gebärdensprache, 1. Release)
title: COLOURS2B^ (MY DGS – annotated. Public Corpus of German Sign Language, 1st release)

description: Ein Type aus der Annotation von MEINEDGS mit allen seinen Tokens aus MEINEDGS: The Public DGS Corpus consists of more than 50 hours of video data from the DGS-Korpus project made available together with annotations for research purposes. In this project, data were collected all across Germany in the timeframe 2010-2012. The public corpus shows 330 informants in 4 different age groups (from 18 years on) from 13 different regions. All parts are conversations between two informants in German Sign Language (DGS). The majority of transcripts included cover discussions and reports on Deaf life and personal experiences, although there are examples of other tasks such as story retellings as well.<br>Transcripts are made available in iLex and ELAN format as well as in SRT subtitles format that can be imported in MaxQDA and other analysis tools, together with the mp4 video files in 360p50. Diese DOI identifiziert die Version 1.0 des Datensatzes.
description: A type from the annotation of MYDGS including all its tokens in MYDGS: Das Öffentliche DGS-Korpus besteht aus mehr als 50 Stunden Video aus dem Projekt DGS-Korpus, die zusammen mit Annotationen für Forschungszwecke zur Verfügung gestellt werden. Die Datenerhebung im Projekt fand im Zeitraum 2010-2012 in ganz Deutschland statt. Das öffentliche Korpus besteht aus Gesprächen jeweils zweier Informantinnen oder Informanten in Deutscher Gebärdensprache. Das Korpus umfasst 330 Informantinnen und Informanten in vier verschiedenen Altersgruppen (ab 18 Jahren) aus 13 verschiedenen Regionen. Der Schwerpunkt der Sammlung liegt auf Transkripten von Diskussionen und Berichten über das Leben Gehörloser sowie persönliche Erfahrungen, sie enthält aber auch Beispiele anderer Erhebungsformate wie Nacherzählungen.<br>Transkripte werden im iLex- und ELAN-Format sowie als SRT-Untertiteldateien (zum Import etwa in MaxQDA) zur Verfügung gestellt. Die zugehörigen MP4-Videodaten sind durchgängig im Format 360p50. This DOI identifies the version 1.0 of the dataset.
DOI: 10.25592/dgs.corpus-1.0-type-55673
title: AUGEN-ÜBERMÜDET1^ (MEINE DGS – annotiert. Öffentliches Korpus der Deutschen Gebärdensprache, 1. Release)
title: EYES-OVERTIRED1^ (MY DGS – annotated. Public Corpus of German Sign Language, 1st release)

description: Ein Type aus der Annotation von MEINEDGS mit allen seinen Tokens aus MEINEDGS: The Public DGS Corpus consists of more than 50 hours of video data from the DGS-Korpus project made available together with annotations for research purposes. In this project, data were collected all across Germany in the timeframe 2010-2012. The public corpus shows 330 informants in 4 different age groups (from 18 years on) from 13 different regions. All parts are conversations between two informants in German Sign Language (DGS). The majority of transcripts included cover discussions and reports on Deaf life and personal experiences, although there are examples of other tasks such as story retellings as well.<br>Transcripts are made available in iLex and ELAN format as well as in SRT subtitles format that can be imported in MaxQDA and other analysis tools, together with the mp4 video files in 360p50. Diese DOI identifiziert die Version 1.0 des Datensatzes.
description: A type from the annotation of MYDGS including all its tokens in MYDGS: Das Öffentliche DGS-Korpus besteht aus mehr als 50 Stunden Video aus dem Projekt DGS-Korpus, die zusammen mit Annotationen für Forschungszwecke zur Verfügung gestellt werden. Die Datenerhebung im Projekt fand im Zeitraum 2010-2012 in ganz Deutschland statt. Das öffentliche Korpus besteht aus Gesprächen jeweils zweier Informantinnen oder Informanten in Deutscher Gebärdensprache. Das Korpus umfasst 330 Informantinnen und Informanten in vier verschiedenen Altersgruppen (ab 18 Jahren) aus 13 verschiedenen Regionen. Der Schwerpunkt der Sammlung liegt auf Transkripten von Diskussionen und Berichten über das Leben Gehörloser sowie persönliche Erfahrungen, sie enthält aber auch Beispiele anderer Erhebungsformate wie Nacherzählungen.<br>Transkripte werden im iLex- und ELAN-Format sowie als SRT-Untertiteldateien (zum Import etwa in MaxQDA) zur Verfügung gestellt. Die zugehörigen MP4-Videodaten sind durchgängig im Format 360p50. This DOI identifies the version 1.0 of the dataset.
DOI: 10.25592/dgs.corpus-1.0-type-55690
title: GRÜN19^ (MEINE DGS – annotiert. Öffentliches Korpus der Deutschen Gebärdensprache, 1. Release)
title: GREEN19^ (MY DGS – annotated. Public Corpus of German Sign Language, 1st release)

description: Ein Type aus der Annotation von MEINEDGS mit allen seinen Tokens aus MEINEDGS: The Public DGS Corpus consists of more than 50 hours of video data from the DGS-Korpus project made available together with annotations for research purposes. In this project, data were collected all across Germany in the timeframe 2010-2012. The public corpus shows 330 informants in 4 different age groups (from 18 years on) from 13 different regions. All parts are conversations between two informants in German Sign Language (DGS). The majority of transcripts included cover discussions and reports on Deaf life and personal experiences, although there are examples of other tasks such as story retellings as well.<br>Transcripts are made available in iLex and ELAN format as well as in SRT subtitles format that can be imported in MaxQDA and other analysis tools, together with the mp4 video files in 360p50. Diese DOI identifiziert die Version 1.0 des Datensatzes.
description: A type from the annotation of MYDGS including all its tokens in MYDGS: Das Öffentliche DGS-Korpus besteht aus mehr als 50 Stunden Video aus dem Projekt DGS-Korpus, die zusammen mit Annotationen für Forschungszwecke zur Verfügung gestellt werden. Die Datenerhebung im Projekt fand im Zeitraum 2010-2012 in ganz Deutschland statt. Das öffentliche Korpus besteht aus Gesprächen jeweils zweier Informantinnen oder Informanten in Deutscher Gebärdensprache. Das Korpus umfasst 330 Informantinnen und Informanten in vier verschiedenen Altersgruppen (ab 18 Jahren) aus 13 verschiedenen Regionen. Der Schwerpunkt der Sammlung liegt auf Transkripten von Diskussionen und Berichten über das Leben Gehörloser sowie persönliche Erfahrungen, sie enthält aber auch Beispiele anderer Erhebungsformate wie Nacherzählungen.<br>Transkripte werden im iLex- und ELAN-Format sowie als SRT-Untertiteldateien (zum Import etwa in MaxQDA) zur Verfügung gestellt. Die zugehörigen MP4-Videodaten sind durchgängig im Format 360p50. This DOI identifies the version 1.0 of the dataset.
DOI: 10.25592/dgs.corpus-1.0-type-55729
title: BLAU13^ (MEINE DGS – annotiert. Öffentliches Korpus der Deutschen Gebärdensprache, 1. Release)
title: BLUE13^ (MY DGS – annotated. Public Corpus of German Sign Language, 1st release)

description: Ein Type aus der Annotation von MEINEDGS mit allen seinen Tokens aus MEINEDGS: The Public DGS Corpus consists of more than 50 hours of video data from the DGS-Korpus project made available together with annotations for research purposes. In this project, data were collected all across Germany in the timeframe 2010-2012. The public corpus shows 330 informants in 4 different age groups (from 18 years on) from 13 different regions. All parts are conversations between two informants in German Sign Language (DGS). The majority of transcripts included cover discussions and reports on Deaf life and personal experiences, although there are examples of other tasks such as story retellings as well.<br>Transcripts are made available in iLex and ELAN format as well as in SRT subtitles format that can be imported in MaxQDA and other analysis tools, together with the mp4 video files in 360p50. Diese DOI identifiziert die Version 1.0 des Datensatzes.
description: A type from the annotation of MYDGS including all its tokens in MYDGS: Das Öffentliche DGS-Korpus besteht aus mehr als 50 Stunden Video aus dem Projekt DGS-Korpus, die zusammen mit Annotationen für Forschungszwecke zur Verfügung gestellt werden. Die Datenerhebung im Projekt fand im Zeitraum 2010-2012 in ganz Deutschland statt. Das öffentliche Korpus besteht aus Gesprächen jeweils zweier Informantinnen oder Informanten in Deutscher Gebärdensprache. Das Korpus umfasst 330 Informantinnen und Informanten in vier verschiedenen Altersgruppen (ab 18 Jahren) aus 13 verschiedenen Regionen. Der Schwerpunkt der Sammlung liegt auf Transkripten von Diskussionen und Berichten über das Leben Gehörloser sowie persönliche Erfahrungen, sie enthält aber auch Beispiele anderer Erhebungsformate wie Nacherzählungen.<br>Transkripte werden im iLex- und ELAN-Format sowie als SRT-Untertiteldateien (zum Import etwa in MaxQDA) zur Verfügung gestellt. Die zugehörigen MP4-Videodaten sind durchgängig im Format 360p50. This DOI identifies the version 1.0 of the dataset.