DOI: 10.26036/cnphis0000126
title: Denovo sequencing of 118 Yersinia pestis strains

description: This is a population analysis project of Yersinia pestis. A total of 118 strains were sequenced.The strains were provided by the Qinghai Institute for Endemic Diseases Prevention and Control, Xinjiang Center for Disease Control and Prevention, Yunnan Institute for Epidemic Diseases Control and Research, Chinese Academy of Inspection and Quarantine, and Max von Pettenkofer Institute Germany. tax_id Organism name 665028 Yersinia pestis EV76 755858 Yersinia pestis 112001 755859 Yersinia pestis 12 755860 Yersinia pestis 142 755861 Yersinia pestis 164 755862 Yersinia pestis 2330 755863 Yersinia pestis 2504 755864 Yersinia pestis 2506 755865 Yersinia pestis 2654 755866 Yersinia pestis 2 755867 Yersinia pestis 30017 755868 Yersinia pestis 320 755869 Yersinia pestis 34008 755870 Yersinia pestis 34202 755871 Yersinia pestis 351001 755872 Yersinia pestis 372007 755873 Yersinia pestis 375002 755874 Yersinia pestis 41025 755875 Yersinia pestis 42013 755876 Yersinia pestis 42082 755877 Yersinia pestis 42091 755878 Yersinia pestis 42095 755879 Yersinia pestis 52008 755880 Yersinia pestis 5 755881 Yersinia pestis 620024 755882 Yersinia pestis 640038 755883 Yersinia pestis 71011 755884 Yersinia pestis 71021 755885 Yersinia pestis 710317 755886 Yersinia pestis 7338 755887 Yersinia pestis 77011 755888 Yersinia pestis 780441 755889 Yersinia pestis 7 755890 Yersinia pestis 80075 755891 Yersinia pestis 890658 755892 Yersinia pestis 910706 755893 Yersinia pestis 91 755894 Yersinia pestis 945 755895 Yersinia pestis 970754 755896 Yersinia pestis 9 755897 Yersinia pestis CMCC010807 755898 Yersinia pestis CMCC02041 755899 Yersinia pestis CMCC03001 755900 Yersinia pestis CMCC05009 755901 Yersinia pestis CMCC05013 755902 Yersinia pestis CMCC10012 755903 Yersinia pestis CMCC104003 755904 Yersinia pestis CMCC106002 755905 Yersinia pestis CMCC107004 755906 Yersinia pestis CMCC11001 755907 Yersinia pestis CMCC113001 755908 Yersinia pestis CMCC114001 755909 Yersinia pestis CMCC12003 755910 Yersinia pestis CMCC120058 755911 Yersinia pestis CMCC12009 755912 Yersinia pestis CMCC124026 755913 Yersinia pestis CMCC125002 755914 Yersinia pestis CMCC128001 755915 Yersinia pestis CMCC15017 755916 Yersinia pestis CMCC160032 755917 Yersinia pestis CMCC18019 755918 Yersinia pestis CMCC21106 755919 Yersinia pestis CMCC27002 755920 Yersinia pestis CMCC31004 755921 Yersinia pestis CMCC347001 755922 Yersinia pestis CMCC348002 755923 Yersinia pestis CMCC38001 755924 Yersinia pestis CMCC41001 755925 Yersinia pestis CMCC42007 755926 Yersinia pestis CMCC43032 755927 Yersinia pestis CMCC46501 755928 Yersinia pestis CMCC47004 755929 Yersinia pestis CMCC49003 755930 Yersinia pestis CMCC51020 755931 Yersinia pestis CMCC58010 755932 Yersinia pestis CMCC64001 755933 Yersinia pestis CMCC640047 755934 Yersinia pestis CMCC67001 755935 Yersinia pestis CMCC71001 755936 Yersinia pestis CMCC74008 755937 Yersinia pestis CMCC82010 755938 Yersinia pestis CMCC8211 755939 Yersinia pestis CMCC84018 755940 Yersinia pestis CMCC84033 755941 Yersinia pestis CMCC84038 755942 Yersinia pestis CMCC84046 755943 Yersinia pestis CMCC87001 755944 Yersinia pestis CMCC90027 755945 Yersinia pestis CMCC91090 755946 Yersinia pestis CMCC92004 755947 Yersinia pestis CMCC92010 755948 Yersinia pestis CMCC93014 755949 Yersinia pestis CMCC95001 755950 Yersinia pestis CMCC96001 755951 Yersinia pestis CMCC96007 755952 Yersinia pestis CMCC99082 755953 Yersinia pestis CMCC99103 755954 Yersinia pestis CMCCK100001 755955 Yersinia pestis CMCCK110001 755956 Yersinia pestis CMCCN010025 755957 Yersinia pestis G8786 755958 Yersinia pestis I160001 755959 Yersinia pestis MGJZ11 755960 Yersinia pestis MGJZ12 755961 Yersinia pestis MGJZ3 755962 Yersinia pestis MGJZ6 755963 Yersinia pestis MGJZ7 755964 Yersinia pestis MGJZ9 755965 Yersinia pestis SHAN11 755966 Yersinia pestis SHAN12 755967 Yersinia pestis YN1065 755968 Yersinia pestis YN1683 755969 Yersinia pestis YN2179 755970 Yersinia pestis YN2551 755971 Yersinia pestis YN2588 755972 Yersinia pestis YN472 755973 Yersinia pestis YN663 755974 Yersinia pestis YN802