cometadata/datacite-titles-descriptions-related-identifiers huggingface dataset:
DOI: 10.5281/zenodo.5602156
title: MetaFunc Databases: nr-go database

description: MetaFunc is a computational pipeline that can take input reads and pass it through a pipeline that will then analyse host genes from the reads on one side, and microbiome taxonomies and gene ontology annotations on the other, and finally allowing for microbe-host gene correlations. This dataset contains databases used for analysing the microbiome component of the pipeline. Full description of the pipeline can be found at https://metafunc.readthedocs.io/en/latest/#.
description: Funding: Maurice and Phyllis Paykel Trust Gut Cancer Foundation (NZ), with support from the Hugh Green Foundation Colorectal Surgical Society of Australia and New Zealand (CSSANZ) The Health Research Council of New Zealand
description: {"references": ["Menzel, P., Ng, K.L., Krogh, A., 2016. Fast and sensitive taxonomic classification for metagenomics with Kaiju. Nature Communications 7, 11257. https://doi.org/10.1038/ncomms11257", "Shen, W., Ren, H., TaxonKit: a practical and efficient NCBI Taxonomy toolkit, Journal of Genetics and Genomics, https://doi.org/10.1016/j.jgg.2021.03.006", "https://dx.doi.org/10.5281/zenodo.2529950; release date: 2020-01-01", "Ashburner, M., Ball, C. A., Blake, J. A., Botstein, D., Butler, H., Cherry, J. M., Davis, A. P., Dolinski, K., Dwight, S. S., Eppig, J. T., Harris, M. A., Hill, D. P., Issel-Tarver, L., Kasarskis, A., Lewis, S., Matese, J. C., Richardson, J. E., Ringwald, M., Rubin, G. M., & Sherlock, G. (2000). Gene Ontology: Tool for the unification of biology. Nature Genetics, 25(1), 25\u201329. https://doi.org/10.1038/75556", "Huang, H., McGarvey, P.B., Suzek, B.E., Mazumder, R., Zhang, J., Chen, Y., Wu, C.H., 2011. A comprehensive protein-centric ID mapping service for molecular data integration. Bioinformatics 27, 1190\u20131191. https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btr101", "The UniProt Consortium, 2017. UniProt: the universal protein knowledgebase. Nucleic Acids Research 45, D158\u2013D169. https://doi.org/10.1093/nar/gkw1099", "Camon, E., Magrane, M., Barrell, D., Lee, V., Dimmer, E., Maslen, J., Binns, D., Harte, N., Lopez, R., Apweiler, R., 2004. The Gene Ontology Annotation (GOA) Database: sharing knowledge in Uniprot with Gene Ontology. Nucleic Acids Res 32, D262\u2013D266. https://doi.org/10.1093/nar/gkh021"]}
DOI: 10.5281/zenodo.5602177
title: MetaFunc Databases: Kaiju database

description: MetaFunc is a computational pipeline that can take input reads and pass it through a pipeline that will then analyse host genes from the reads on one side, and microbiome taxonomies and gene ontology annotations on the other, and finally allowing for microbe-host gene correlations. This dataset contains databases used for analysing the microbiome component of the pipeline. Full description of the pipeline can be found at https://metafunc.readthedocs.io/en/latest/#.
description: Funding: Maurice and Phyllis Paykel Trust Gut Cancer Foundation (NZ), with support from the Hugh Green Foundation Colorectal Surgical Society of Australia and New Zealand (CSSANZ) The Health Research Council of New Zealand
description: {"references": ["Menzel, P., Ng, K.L., Krogh, A., 2016. Fast and sensitive taxonomic classification for metagenomics with Kaiju. Nature Communications 7, 11257. https://doi.org/10.1038/ncomms11257"]}
DOI: 10.6084/m9.figshare.14585976.v4
title: De novo Production of glycyrrhetic acid 3-O-mono-β-D-glucuronide in Saccharomyces cerevisiae

description: Supplementary Material <br>
DOI: 10.5281/zenodo.5641430
title: Oligonucleotide primers used for RT-PCR

description: Oligonucleotide primers used for RT-PCR
DOI: 10.34740/kaggle/dsv/2771506
title: BART Ridership
DOI: 10.6084/m9.figshare.16921120
title: The effectiveness of controlling COVID-19 epidemic by implementing soft lockdown policy and extensive community screening in Taiwan

description: The datasets we used in the paper.
DOI: 10.6084/m9.figshare.16854057
title: SanchezAmaro_studydataset_ESM from Chimpanzees and bonobos use social leverage in an ultimatum game

description: Complete study dataset
DOI: 10.6084/m9.figshare.16854057.v2
title: SanchezAmaro_studydataset_ESM from Chimpanzees and bonobos use social leverage in an ultimatum game

description: Complete study dataset
DOI: 10.6084/m9.figshare.16854057.v1
title: SanchezAmaro_studydataset_ESM from Chimpanzees and bonobos use social leverage in an Ultimatum Game

description: Complete study dataset
DOI: 10.6084/m9.figshare.16863167
title: Supplementary Material Summary from Phase transformation-driven artificial muscle mimics the multifunctionality of avian wing muscle

description: Contains in-depth details and other features of the bipedal model as well as titles and captions of other supplementary files
DOI: 10.6084/m9.figshare.16863167.v2
title: Supplementary Material Summary from Phase transformation-driven artificial muscle mimics the multifunctionality of avian wing muscle

description: Contains in-depth details and other features of the bipedal model as well as titles and captions of other supplementary files
DOI: 10.6084/m9.figshare.16863167.v1
title: Supplementary Material Summary from Phase transformation-driven artificial muscle mimics the multi-functionality of avian wing muscle

description: Contains in-depth details and other features of the bipedal model as well as titles and captions of other supplementary files
DOI: 10.5281/zenodo.5641555
title: Base de datos

description: Link de acceso a base de datos mapeo sistematico: Conductas agresivas e inteligencia emocional en adolescentes de 13 a 17 años
DOI: 10.5281/zenodo.5641554
title: Base de datos

description: Link de acceso a base de datos mapeo sistematico: Conductas agresivas e inteligencia emocional en adolescentes de 13 a 17 años
DOI: 10.6084/m9.figshare.14253692
title: Additional file 3 of RNA-seq analysis and gene expression dynamics in the salivary glands of the argasid tick Ornithodoros erraticus along the trophogonic cycle

description: Additional file 3: Table S3. Pfam domain occurrences in the O. erraticus predicted proteins. A total of 9828 Pfam domains were observed in the O. erraticus proteins, of which 2458 were unique. Up to 6619 of the proteins contained at least one Pfam domain. The top 30 Pfam domain ocurrences are highlighted.
DOI: 10.6084/m9.figshare.14253686
title: Additional file 1 of RNA-seq analysis and gene expression dynamics in the salivary glands of the argasid tick Ornithodoros erraticus along the trophogonic cycle

description: Additional file 1: Table S1. Metrics for de novo assembled transcriptomes of each salivary gland sample, for consensus transcriptomes at 0, 7 and 14 days after feeding and for the merged transcriptome.
DOI: 10.6084/m9.figshare.14253698
title: Additional file 5 of RNA-seq analysis and gene expression dynamics in the salivary glands of the argasid tick Ornithodoros erraticus along the trophogonic cycle

description: Additional file 5: Table S5. Differentially expressed genes (DEG) in the salivary glands of O. erraticus females between three physiological states: 7-day fed vs unfed (7 vs 0), 14-day fed vs 7-day fed (14 vs 7) and 14-day fed vs unfed (14 vs 0).
DOI: 10.6084/m9.figshare.14253689.v1
title: Additional file 2 of RNA-seq analysis and gene expression dynamics in the salivary glands of the argasid tick Ornithodoros erraticus along the trophogonic cycle

description: Additional file 2: Table S2. Annotated sialotranscriptome of O. erraticus.
DOI: 10.6084/m9.figshare.14253695
title: Additional file 4 of RNA-seq analysis and gene expression dynamics in the salivary glands of the argasid tick Ornithodoros erraticus along the trophogonic cycle

description: Additional file 4: Table S4. Biological pathways represented in the transcriptome of O. erraticus salivary glands, enzymes and transcript sequences involved in each pathway. The analysis of the salivary annotated genes was done in the KEGG pathway database.
DOI: 10.6084/m9.figshare.14253686.v1
title: Additional file 1 of RNA-seq analysis and gene expression dynamics in the salivary glands of the argasid tick Ornithodoros erraticus along the trophogonic cycle

description: Additional file 1: Table S1. Metrics for de novo assembled transcriptomes of each salivary gland sample, for consensus transcriptomes at 0, 7 and 14 days after feeding and for the merged transcriptome.
DOI: 10.6084/m9.figshare.14253689
title: Additional file 2 of RNA-seq analysis and gene expression dynamics in the salivary glands of the argasid tick Ornithodoros erraticus along the trophogonic cycle

description: Additional file 2: Table S2. Annotated sialotranscriptome of O. erraticus.
DOI: 10.6084/m9.figshare.14253698.v1
title: Additional file 5 of RNA-seq analysis and gene expression dynamics in the salivary glands of the argasid tick Ornithodoros erraticus along the trophogonic cycle

description: Additional file 5: Table S5. Differentially expressed genes (DEG) in the salivary glands of O. erraticus females between three physiological states: 7-day fed vs unfed (7 vs 0), 14-day fed vs 7-day fed (14 vs 7) and 14-day fed vs unfed (14 vs 0).
DOI: 10.6084/m9.figshare.14253692.v1
title: Additional file 3 of RNA-seq analysis and gene expression dynamics in the salivary glands of the argasid tick Ornithodoros erraticus along the trophogonic cycle

description: Additional file 3: Table S3. Pfam domain occurrences in the O. erraticus predicted proteins. A total of 9828 Pfam domains were observed in the O. erraticus proteins, of which 2458 were unique. Up to 6619 of the proteins contained at least one Pfam domain. The top 30 Pfam domain ocurrences are highlighted.
DOI: 10.6084/m9.figshare.14253695.v1
title: Additional file 4 of RNA-seq analysis and gene expression dynamics in the salivary glands of the argasid tick Ornithodoros erraticus along the trophogonic cycle

description: Additional file 4: Table S4. Biological pathways represented in the transcriptome of O. erraticus salivary glands, enzymes and transcript sequences involved in each pathway. The analysis of the salivary annotated genes was done in the KEGG pathway database.
DOI: 10.6084/m9.figshare.14253701
title: Additional file 6 of RNA-seq analysis and gene expression dynamics in the salivary glands of the argasid tick Ornithodoros erraticus along the trophogonic cycle

description: Additional file 6: Table S6. Significantly enriched GO terms assigned to the differentially expressed transcripts in the three comparisons: 7-day fed vs unfed (7 vs 0), 14-day fed vs 7-day fed (14 vs 0) and 14-day fed vs unfed (14 vs 0). NumInCat, total number of sequences in the category. NumDEInCat, number of enriched sequences in each category.
DOI: 10.6084/m9.figshare.14253701.v1
title: Additional file 6 of RNA-seq analysis and gene expression dynamics in the salivary glands of the argasid tick Ornithodoros erraticus along the trophogonic cycle

description: Additional file 6: Table S6. Significantly enriched GO terms assigned to the differentially expressed transcripts in the three comparisons: 7-day fed vs unfed (7 vs 0), 14-day fed vs 7-day fed (14 vs 0) and 14-day fed vs unfed (14 vs 0). NumInCat, total number of sequences in the category. NumDEInCat, number of enriched sequences in each category.
DOI: 10.6084/m9.figshare.14253704
title: Additional file 7 of RNA-seq analysis and gene expression dynamics in the salivary glands of the argasid tick Ornithodoros erraticus along the trophogonic cycle

description: Additional file 7: Table S7. Significantly enriched pathways in the three comparisons: 7-day fed vs unfed (7 vs 0), 14-day fed vs 7-day fed (14 vs 0) and 14-day fed vs unfed (14 vs 0). NumInCat, total number of sequences in the category. NumDEInCat, number of enriched sequences in each category.
DOI: 10.6084/m9.figshare.14253707.v1
title: Additional file 8 of RNA-seq analysis and gene expression dynamics in the salivary glands of the argasid tick Ornithodoros erraticus along the trophogonic cycle

description: Additional file 8: Table S8. Differentially downregulated genes in the salivary glands of O. erraticus between unfed and 7-day fed females (7 vs 0). The top 100 transcripts most highly expressed at day 0 (in average RPKM) are highlighted in green. Average RPKM 0 and average RPKM 7, average expression level in RPKM of the two biological replicas of unfed and 7-day fed females, respectively.
DOI: 10.6084/m9.figshare.14253704.v1
title: Additional file 7 of RNA-seq analysis and gene expression dynamics in the salivary glands of the argasid tick Ornithodoros erraticus along the trophogonic cycle

description: Additional file 7: Table S7. Significantly enriched pathways in the three comparisons: 7-day fed vs unfed (7 vs 0), 14-day fed vs 7-day fed (14 vs 0) and 14-day fed vs unfed (14 vs 0). NumInCat, total number of sequences in the category. NumDEInCat, number of enriched sequences in each category.
DOI: 10.6084/m9.figshare.14253707
title: Additional file 8 of RNA-seq analysis and gene expression dynamics in the salivary glands of the argasid tick Ornithodoros erraticus along the trophogonic cycle

description: Additional file 8: Table S8. Differentially downregulated genes in the salivary glands of O. erraticus between unfed and 7-day fed females (7 vs 0). The top 100 transcripts most highly expressed at day 0 (in average RPKM) are highlighted in green. Average RPKM 0 and average RPKM 7, average expression level in RPKM of the two biological replicas of unfed and 7-day fed females, respectively.
DOI: 10.21258/1255577
title: Inventario forestale nazionale svizzero - Tabella n. 195191
DOI: 10.21258/1255578
title: Inventario forestale nazionale svizzero - Tabella n. 195190
DOI: 10.21258/1255570
title: Inventario forestale nazionale svizzero - Tabella n. 195200
DOI: 10.21258/1255571
title: Inventario forestale nazionale svizzero - Tabella n. 195193
DOI: 10.21258/1255572
title: Inventario forestale nazionale svizzero - Tabella n. 195195
DOI: 10.21258/1255573
title: Inventario forestale nazionale svizzero - Tabella n. 195194
DOI: 10.21258/1255574
title: Inventario forestale nazionale svizzero - Tabella n. 195202
DOI: 10.21258/1255564
title: Inventario forestale nazionale svizzero - Tabella n. 195223
DOI: 10.21258/1255565
title: Inventario forestale nazionale svizzero - Tabella n. 195236
DOI: 10.21258/1255566
title: Inventario forestale nazionale svizzero - Tabella n. 195222
DOI: 10.21258/1255567
title: Inventario forestale nazionale svizzero - Tabella n. 195224
DOI: 10.21258/1255568
title: Inventario forestale nazionale svizzero - Tabella n. 195221
DOI: 10.21258/1255569
title: Inventario forestale nazionale svizzero - Tabella n. 195201
DOI: 10.21258/1255558
title: Inventario forestale nazionale svizzero - Tabella n. 195237
DOI: 10.21258/1255559
title: Inventario forestale nazionale svizzero - Tabella n. 195235
DOI: 10.21258/1255560
title: Inventario forestale nazionale svizzero - Tabella n. 195245
DOI: 10.21258/1255561
title: Inventario forestale nazionale svizzero - Tabella n. 195226
DOI: 10.21258/1255562
title: Inventario forestale nazionale svizzero - Tabella n. 195244
DOI: 10.21258/1255563
title: Inventario forestale nazionale svizzero - Tabella n. 195225
DOI: 10.21258/1255555
title: Inventario forestale nazionale svizzero - Tabella n. 195248
DOI: 10.21258/1255556
title: Inventario forestale nazionale svizzero - Tabella n. 195246
DOI: 10.21258/1255557
title: Inventario forestale nazionale svizzero - Tabella n. 195243
DOI: 10.21258/1255549
title: Inventario forestale nazionale svizzero - Tabella n. 195268
DOI: 10.21258/1255550
title: Inventario forestale nazionale svizzero - Tabella n. 195254
DOI: 10.21258/1255551
title: Inventario forestale nazionale svizzero - Tabella n. 195253
DOI: 10.21258/1255552
title: Inventario forestale nazionale svizzero - Tabella n. 195252
DOI: 10.21258/1255553
title: Inventario forestale nazionale svizzero - Tabella n. 195271
DOI: 10.21258/1255554
title: Inventario forestale nazionale svizzero - Tabella n. 195247
DOI: 10.21258/1255542
title: Inventario forestale nazionale svizzero - Tabella n. 195285
DOI: 10.21258/1255543
title: Inventario forestale nazionale svizzero - Tabella n. 195278
DOI: 10.21258/1255544
title: Inventario forestale nazionale svizzero - Tabella n. 195269
DOI: 10.21258/1255545
title: Inventario forestale nazionale svizzero - Tabella n. 195284
DOI: 10.21258/1255546
title: Inventario forestale nazionale svizzero - Tabella n. 195272
DOI: 10.21258/1255547
title: Inventario forestale nazionale svizzero - Tabella n. 195270
DOI: 10.21258/1255548
title: Inventario forestale nazionale svizzero - Tabella n. 195273
DOI: 10.21258/1255537
title: Inventario forestale nazionale svizzero - Tabella n. 195286
DOI: 10.21258/1255538
title: Inventario forestale nazionale svizzero - Tabella n. 195291
DOI: 10.21258/1255539
title: Inventario forestale nazionale svizzero - Tabella n. 195290
DOI: 10.21258/1255540
title: Inventario forestale nazionale svizzero - Tabella n. 195279
DOI: 10.21258/1255541
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DOI: 10.21258/1255532
title: Inventario forestale nazionale svizzero - Tabella n. 195297
DOI: 10.21258/1255533
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DOI: 10.21258/1255534
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DOI: 10.21258/1255535
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DOI: 10.21258/1255536
title: Inventario forestale nazionale svizzero - Tabella n. 195307
DOI: 10.21258/1255528
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DOI: 10.21258/1255529
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DOI: 10.21258/1255530
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DOI: 10.21258/1255531
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DOI: 10.21258/1255523
title: Inventario forestale nazionale svizzero - Tabella n. 195330
DOI: 10.21258/1255524
title: Inventario forestale nazionale svizzero - Tabella n. 195329
DOI: 10.21258/1255525
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DOI: 10.21258/1255526
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DOI: 10.21258/1255527
title: Inventario forestale nazionale svizzero - Tabella n. 195321
DOI: 10.21258/1255518
title: Inventario forestale nazionale svizzero - Tabella n. 195350
DOI: 10.21258/1255519
title: Inventario forestale nazionale svizzero - Tabella n. 195349
DOI: 10.21258/1255520
title: Inventario forestale nazionale svizzero - Tabella n. 195351
DOI: 10.21258/1255521
title: Inventario forestale nazionale svizzero - Tabella n. 195334
DOI: 10.21258/1255522
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DOI: 10.21258/1255515
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DOI: 10.21258/1255516
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DOI: 10.21258/1255517
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DOI: 10.21258/1255513
title: Inventario forestale nazionale svizzero - Tabella n. 195356
DOI: 10.21258/1255514
title: Inventario forestale nazionale svizzero - Tabella n. 195357
DOI: 10.21258/1255506
title: Inventario forestale nazionale svizzero - Tabella n. 195695
DOI: 10.21258/1255507
title: Inventario forestale nazionale svizzero - Tabella n. 195694
DOI: 10.21258/1255508
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DOI: 10.21258/1255509
title: Inventario forestale nazionale svizzero - Tabella n. 195698
DOI: 10.21258/1255510
title: Inventario forestale nazionale svizzero - Tabella n. 195692
DOI: 10.21258/1255511
title: Inventario forestale nazionale svizzero - Tabella n. 195696
DOI: 10.21258/1255499
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DOI: 10.21258/1255500
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DOI: 10.21258/1255501
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DOI: 10.21258/1255502
title: Inventario forestale nazionale svizzero - Tabella n. 195703
DOI: 10.21258/1255503
title: Inventario forestale nazionale svizzero - Tabella n. 195701
DOI: 10.21258/1255504
title: Inventario forestale nazionale svizzero - Tabella n. 195700
DOI: 10.21258/1255505
title: Inventario forestale nazionale svizzero - Tabella n. 195697
DOI: 10.21258/1255494
title: Inventario forestale nazionale svizzero - Tabella n. 195730
DOI: 10.21258/1255495
title: Inventario forestale nazionale svizzero - Tabella n. 195709
DOI: 10.21258/1255496
title: Inventario forestale nazionale svizzero - Tabella n. 195707
DOI: 10.21258/1255497
title: Inventario forestale nazionale svizzero - Tabella n. 195706
DOI: 10.21258/1255498
title: Inventario forestale nazionale svizzero - Tabella n. 195705
DOI: 10.21258/1255488
title: Inventario forestale nazionale svizzero - Tabella n. 195735
DOI: 10.21258/1255489
title: Inventario forestale nazionale svizzero - Tabella n. 195732
DOI: 10.21258/1255490
title: Inventario forestale nazionale svizzero - Tabella n. 195711
DOI: 10.21258/1255491
title: Inventario forestale nazionale svizzero - Tabella n. 195731
DOI: 10.21258/1255492
title: Inventario forestale nazionale svizzero - Tabella n. 195710
DOI: 10.21258/1255493
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