cometadata/datacite-titles-descriptions-related-identifiers huggingface dataset:
DOI: 10.5281/zenodo.14424730
title: Geisweid Hütten Apotheke

description: Historical questionnaire/s 1924/1948 and index cards, partly selected enclosures regarding the history of a German pharmacy, catalogued via Kalliope portal (Historischer Fragebogen 1924/1948 und Karteikarten, ggf. gemeinfreie Anlagen zur Apothekengeschichte; als Katalog dient das Nachlassportal Kalliope):

https://kalliope-verbund.info/ead?ead.id=DE-611-BF-70963

Please note: The Kalliope catalogue entry might indicate related material in the archival folder which cannot be published due to copyright or other legal restrictions (NB: Das Katalogisat bei Kalliope kann auch auf Materialien - teils erheblichen Umfangs - verweisen, die aus archiv- oder urheberrechtlichen Gründen nicht veröffentlicht werden dürfen).
DOI: 10.5281/zenodo.10987735
title: Deidesheim Apotheke

description: Historical questionnaire/s 1924/1948 and index cards, partly selected enclosures regarding the history of a German pharmacy, catalogued via Kalliope portal (Historischer Fragebogen 1924/1948 und Karteikarten, ggf. gemeinfreie Anlagen zur Apothekengeschichte; als Katalog dient das Nachlassportal Kalliope): https://kalliope-verbund.info/DE-611-BF-70963[Funktion: Im Findbuch anzeigen]Please note: The Kalliope catalogue entry might indicate related material in the archival folder which cannot be published due to copyright or other legal restrictions (NB: Das Katalogisat bei Kalliope kann auch auf Materialien - teils erheblichen Umfangs - verweisen, die aus archiv- oder urheberrechtlichen Gründen nicht veröffentlicht werden dürfen).
DOI: 10.5281/zenodo.10991274
title: Dietmannsrieg Apotheke

description: Historical questionnaire/s 1924/1948 and index cards, partly selected enclosures regarding the history of a German pharmacy, catalogued via Kalliope portal (Historischer Fragebogen 1924/1948 und Karteikarten, ggf. gemeinfreie Anlagen zur Apothekengeschichte; als Katalog dient das Nachlassportal Kalliope): https://kalliope-verbund.info/DE-611-BF-70963[Funktion: Im Findbuch anzeigen]Please note: The Kalliope catalogue entry might indicate related material in the archival folder which cannot be published due to copyright or other legal restrictions (NB: Das Katalogisat bei Kalliope kann auch auf Materialien - teils erheblichen Umfangs - verweisen, die aus archiv- oder urheberrechtlichen Gründen nicht veröffentlicht werden dürfen).
DOI: 10.5281/zenodo.10990474
title: Demnitz-Thumitz Apotheke

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DOI: 10.5281/zenodo.10996210
title: Dortmund Berg- u. Hütten Apotheke

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DOI: 10.5281/zenodo.10987766
title: Delbrück Löwen Apotheke

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DOI: 10.5281/zenodo.10996046
title: Dornstetten Stadt Apotheke

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DOI: 10.5281/zenodo.10987288
title: Dassel Apotheke

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DOI: 10.5281/zenodo.10995916
title: Döbeln An der Oberbrücke Apotheke

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DOI: 10.5281/zenodo.10995720
title: Dinkelscherben Apotheke

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DOI: 10.5281/zenodo.10996511
title: Dortmund-Husen Bienen Apotheke

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DOI: 10.5281/zenodo.10995970
title: Donaustauf Thurn-u. Taxis Apotheke

description: Historical questionnaire/s 1924/1948 and index cards, partly selected enclosures regarding the history of a German pharmacy, catalogued via Kalliope portal (Historischer Fragebogen 1924/1948 und Karteikarten, ggf. gemeinfreie Anlagen zur Apothekengeschichte; als Katalog dient das Nachlassportal Kalliope): https://kalliope-verbund.info/DE-611-BF-70963[Funktion: Im Findbuch anzeigen]Please note: The Kalliope catalogue entry might indicate related material in the archival folder which cannot be published due to copyright or other legal restrictions (NB: Das Katalogisat bei Kalliope kann auch auf Materialien - teils erheblichen Umfangs - verweisen, die aus archiv- oder urheberrechtlichen Gründen nicht veröffentlicht werden dürfen).
DOI: 10.5281/zenodo.13904523
title: Field measurement data of hydrodynamic and morphological processes in the mangrove forest of Lac Bay, Bonaire, Caribbean Netherlands

description: 31-10-2024, Rik Gijsman

_________________________________________________________Dataset of field measurement of hydrodynamic and morphological processes in the mangrove forest of Lac Bay, Bonaire, Caribbean Netherlands.

_________________________________________________________For more information please see scientific publication:

Gijsman, R., Engel, S., van der Wal, D., van Zee, R., Johnson, J., van der Geest, M., Wijnberg, K.M. and Horstman, E.M. (2024). The Importance of Tidal Creeks for Mangrove Survival on Small Oceanic Islands. Unpublished Manuscript.

_________________________________________________________

Dataset contains: 



Timeseries data from field instruments: 



Atmospheric pressure

Water depth

Water level

Flow velocity

Waves

Turbidity

Rainfall

Temperature

Wind

Tidal creek flows

Tidal creek transport

Lagoon suspension



Mapped data of field surveys:



Bathymetry and creek profiles

Sediment characteristics



Python script for importing and plotting data

Overview map with shapefiles of instrument location coordinates


________________________________________Additional notes for your information:



Timeseries data stored in .txt files

Visualization of data in .txt files provided with accompanying .png files

Timeseries data of Hobo sensors, Rain gauge and KNMI station interpolated between 19-01-2022 00:00:00 and 18-05-2022 23:55:00 (120 days) on 5 minute intervals 

Timeseries data of other sensors interpolated between 19-01-2022 00:00:00 and 08-03-2022 23:55:00 (49 days) on 5 minute intervals

Column headers show instrument station abbreviation

Datetime in local timezone of Bonaire (GMT-4)

When a property (e.g., water depth) was measured by different instruments, the instrument used is mentioned in the file name, e.g. "water_depth_hobo.txt"

Measurements from KNMI (The Royal Netherlands Meteorological Institute) station 990 were included in the dataset and indicated with '_knmi' in the file name. Data obtained from 'https://www.knmi.nl/nederland-nu/klimatologie/uurgegevens_Caribisch_gebied'
DOI: 10.5281/zenodo.14513337
title: Grossenwiehe Apotheke

description: Historical questionnaire/s 1924/1948 and index cards, partly selected enclosures regarding the history of a German pharmacy, catalogued via Kalliope portal (Historischer Fragebogen 1924/1948 und Karteikarten, ggf. gemeinfreie Anlagen zur Apothekengeschichte; als Katalog dient das Nachlassportal Kalliope):

https://kalliope-verbund.info/ead?ead.id=DE-611-BF-70963

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DOI: 10.5281/zenodo.11236200
title: Duisburg Adler Apotheke

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DOI: 10.5281/zenodo.14427255
title: Goslar Einhorn Apotheke

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https://kalliope-verbund.info/ead?ead.id=DE-611-BF-70963

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DOI: 10.5281/zenodo.11236796
title: Duisburg-Hamborn Glückauf Apotheke

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DOI: 10.5281/zenodo.14513445
title: Grosshartmannsdorf Apotheke

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https://kalliope-verbund.info/ead?ead.id=DE-611-BF-70963

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DOI: 10.5281/zenodo.11236395
title: Duisburg Kaiserberg Apotheke

description: Historical questionnaire/s 1924/1948 and index cards, partly selected enclosures regarding the history of a German pharmacy, catalogued via Kalliope portal (Historischer Fragebogen 1924/1948 und Karteikarten, ggf. gemeinfreie Anlagen zur Apothekengeschichte; als Katalog dient das Nachlassportal Kalliope): https://kalliope-verbund.info/DE-611-BF-70963[Funktion: Im Findbuch anzeigen]Please note: The Kalliope catalogue entry might indicate related material in the archival folder which cannot be published due to copyright or other legal restrictions (NB: Das Katalogisat bei Kalliope kann auch auf Materialien - teils erheblichen Umfangs - verweisen, die aus archiv- oder urheberrechtlichen Gründen nicht veröffentlicht werden dürfen).
DOI: 10.5281/zenodo.11236442
title: Duisburg Löwen Apotheke

description: Historical questionnaire/s 1924/1948 and index cards, partly selected enclosures regarding the history of a German pharmacy, catalogued via Kalliope portal (Historischer Fragebogen 1924/1948 und Karteikarten, ggf. gemeinfreie Anlagen zur Apothekengeschichte; als Katalog dient das Nachlassportal Kalliope): https://kalliope-verbund.info/DE-611-BF-70963[Funktion: Im Findbuch anzeigen]Please note: The Kalliope catalogue entry might indicate related material in the archival folder which cannot be published due to copyright or other legal restrictions (NB: Das Katalogisat bei Kalliope kann auch auf Materialien - teils erheblichen Umfangs - verweisen, die aus archiv- oder urheberrechtlichen Gründen nicht veröffentlicht werden dürfen).
DOI: 10.5281/zenodo.14547064
title: Grünheim Apotheke

description: Historical questionnaire/s 1924/1948 and index cards, partly selected enclosures regarding the history of a German pharmacy, catalogued via Kalliope portal (Historischer Fragebogen 1924/1948 und Karteikarten, ggf. gemeinfreie Anlagen zur Apothekengeschichte; als Katalog dient das Nachlassportal Kalliope):

https://kalliope-verbund.info/ead?ead.id=DE-611-BF-70963

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DOI: 10.5281/zenodo.13898433
title: DNA hypomethylation-related expression of hsa-miR-184 contribute to invasive growth of gonadotroph neuroendocrine pituitary tumors

description: Gonadotroph neuroendocrine pituitary tumors are among the most common intracranial neoplasms. A notable proportion of these tumors is characterized by invasive growth which hamper the treatment results and worsen prognosis for patients. Increased hsa-miR-184 expression was observed in invasive gonadotroph tumor. This study was aimed to determine the role hsa-miR-184 expression in invasive growth of gonadotroph tumors.

QRT-PCR and bisulfite pyrosequencing were used for evaluating hsa-miR-184 expression and MIR184 DNA methylation levels in tumor and normal pituitary samples. LβT2 and αT3-1 gonadotroph cells were used to test the effect of miR-184 on cell viability (MTT test), proliferation (BrDU incorporation) and migration (scratch assay). RNA sequencing was used for transcriptome analysis in mir-184 treated and untreated LβT2 cells. Differential expression analysis combined with target prediction were used to identify miR-184 target followed by its validation with Luciferase reporter assay.

Analysis of tissue samples showed that hsa-miR-184 is downregulated in gonadotroph tumors and its expression is lower in invasive that noninvasive ones. Promoter of MIR184 is demethylated in tumors and the methylation level is negatively correlated with hsa-miR-184 expression. Transfecting LβT2 and αT3-1 with miR-184 mimic resulted in increasing cellular proliferation and viability. Differentially expressed genes were identified when comparing miR-184 treated and untreated cells including only Nus1 as predicted miR-184 target. The interaction between miR-184 and 3’UTR of Nus1 was confirmed in both LβT2 and αT3-1. Overexpression of Nus1 resulted in lowering cell viability in both cells and proliferation in LβT2. The expression level of NUS1 was found lowered in invasive than noninvasive tumors.

Our results indicate that DNA hypomethylation-related increase of hsa-mir-184 expression contribute to invasive growth of gonadotroph pituitary tumors through targeting NUS1- being one the various molecular mechanisms involved acquiring the aggressive growth potential..fastq.gz files are raw sequences, which were aligned to GRCm39 genome by STAR aligner, subsequently differentiall expression with DESeq2 was performed (DEGs_mir184.csv) and gene set expression analysis was accomplished with fgsea against a range of gene sets (Reactome, Gene Ontology, KEGG, etc.); these results are stored in gsea.zip.
DOI: 10.5281/zenodo.10029396
title: Berlin Apotheke am Olivaer Platz

description: Historical questionnaire/s 1924/1948 and index cards, partly selected enclosures regarding the history of a
German pharmacy, catalogued via Kalliope portal (Historischer Fragebogen 1924/1948 und Karteikarten, ggf.
gemeinfreie Anlagen zur Apothekengeschichte; als Katalog dient das Nachlassportal Kalliope):
https://kalliope-verbund.info/DE-611-BF-70963
[Funktion: Im Findbuch anzeigen]
 
Please note: The Kalliope catalogue entry might indicate related material in the archival folder which cannot
be published due to copyright or other legal restrictions (NB: Das Katalogisat bei Kalliope kann auch auf
Materialien - teils erheblichen Umfangs - verweisen, die aus archiv- oder urheberrechtlichen Gründen nicht
veröffentlicht werden dürfen).
DOI: 10.5281/zenodo.10029397
title: Berlin Apotheke am Olivaer Platz

description: Historical questionnaire/s 1924/1948 and index cards, partly selected enclosures regarding the history of a
German pharmacy, catalogued via Kalliope portal (Historischer Fragebogen 1924/1948 und Karteikarten, ggf.
gemeinfreie Anlagen zur Apothekengeschichte; als Katalog dient das Nachlassportal Kalliope):
https://kalliope-verbund.info/DE-611-BF-70963
[Funktion: Im Findbuch anzeigen]
 
Please note: The Kalliope catalogue entry might indicate related material in the archival folder which cannot
be published due to copyright or other legal restrictions (NB: Das Katalogisat bei Kalliope kann auch auf
Materialien - teils erheblichen Umfangs - verweisen, die aus archiv- oder urheberrechtlichen Gründen nicht
veröffentlicht werden dürfen).
DOI: 10.15468/dl.9769fh
title: Occurrence Download

description: A dataset containing 12303 species occurrences available in GBIF matching the query:
{
 "and" : [
 "TaxonKey is Mullus surmuletus Linnaeus, 1758",
 "HasGeospatialIssue is false",
 "HasCoordinate is true",
 "OccurrenceStatus is Present",
 "Year is greater than or equal to 1900"
 ]
}

 The dataset includes 12303 records from 133 constituent datasets; see https://api.gbif.org/v1/occurrence/download/0053623-241126133413365/datasets/export for details.
 
Data from some individual datasets included in this download may be licensed under less restrictive terms.
DOI: 10.15468/dl.yvhx8j
title: Occurrence Download

description: A dataset containing 20 species occurrences available in GBIF matching the query:
{
 "and" : [
 "TaxonKey is one of (Latania verschaffeltii)",
 "HasCoordinate is true",
 "HasGeospatialIssue is false"
 ]
}

 The dataset includes 20 records from 10 constituent datasets; see https://api.gbif.org/v1/occurrence/download/0006671-251009101135966/datasets/export for details.
 
Data from some individual datasets included in this download may be licensed under less restrictive terms.
DOI: 10.15468/dl.npuu5p
title: Occurrence Download

description: A dataset containing 329917 species occurrences available in GBIF matching the query:
{
 "DatasetKey" : [
 "is Insect Species Occurrence Data from Multiple Projects Worldwide with Focus on Bees and Wasps in North America"
 ]
}

 The dataset includes 329917 records from 1 constituent datasets; see https://api.gbif.org/v1/occurrence/download/0013347-190320150433242/datasets/export for details.
 
Data from some individual datasets included in this download may be licensed under less restrictive terms.