cometadata/datacite-titles-descriptions-related-identifiers huggingface dataset:
DOI: 10.15472/sxnwhh
title: Entomofauna de la Ecoreserva Predio Isla IV (Cantagallo, Bolívar) - Proyecto FIBRAS

description: I2D-BIO_2022_051. Bajo el convenio de cooperación No. 19-155 entre ECOPETROL y el Instituto de Investigación de Recursos Biológicos Alexander von Humboldt, se llevó a cabo el levantamiento de la Línea Base de Biodiversidad y Servicios Ecosistémicos para seis predios piloto de Ecoreservas en predios de ECOPETROL, ubicados en cuatro regiones del país. Este levantamiento incluyó el desarrollo de muestreos rápidos de biodiversidad para siete grupos biológicos y la recolección de sonidos en predios ubicados en los departamentos del Huila, Casanare, Meta y la región del Magdalena Medio. El presente conjunto de datos contiene 685 registros de tres órdenes de insectos (Coleoptera:Scarabaeinae, Lepidoptera: Papilionoidea y Hymenoptera: Formicidae).
DOI: 10.6084/m9.figshare.12511124
title: Additional file 6 of Upregulation of RIN3 induces endosomal dysfunction in Alzheimer’s disease

description: Additional file 6: Table 1. Identify RIN3 interacting protein via Mass Spectrum. Recombinant flag tagged RIN3 protein were purified from HEK293T cells. RIN3-interactomes were identified by Mass Spectrometry. Two replicates were performed. PSM representing abundancy of each protein were used to sort the proteins. BIN1 and CD2AP were highlighted with light yellow in tables.
DOI: 10.6084/m9.figshare.12511124.v1
title: Additional file 6 of Upregulation of RIN3 induces endosomal dysfunction in Alzheimer’s disease

description: Additional file 6: Table 1. Identify RIN3 interacting protein via Mass Spectrum. Recombinant flag tagged RIN3 protein were purified from HEK293T cells. RIN3-interactomes were identified by Mass Spectrometry. Two replicates were performed. PSM representing abundancy of each protein were used to sort the proteins. BIN1 and CD2AP were highlighted with light yellow in tables.
DOI: 10.15472/9zydch
title: Hongos filamentosos potencialmente tolerantes al cadmio aislados de suelos cultivados con Theobroma cacao

description: Los suelos son los principales sumideros de contaminantes y metales pesados liberados al medio ambiente por diversas actividades antropogénicas. A diferencia de los contaminantes orgánicos que son oxidados por acción microbiana, los metales pesados no sufren oxidación, acumulándose en suelos y persistiendo por muchos años, razón por la cual, la contaminación metálica representa una amenaza medioambiental importante para los seres vivos, ya que diversos metales que son micronutrientes esenciales, como el cobre y el zinc, resultan tóxicos en concentraciones elevadas, mientras que otros como cadmio, plomo mercurio y arsénico, son tóxicos a dosis mínimas.
description: Actualmente la presencia de cadmio en suelos dedicados al cultivo de cacao en Santander, constituye un serio problema, niveles más altos que los permitido (0.5 ppm), pueden llegar a afectar el cultivo por la acumulación de Cd en el fruto a niveles no permisibles, limitando la comercialización y exportación de este producto agrícola, afectando considerablemente la cadena productiva. Diversas estrategias de biorremediación se han planteado para mitigar la translocación de Cd a los diversos tejidos vegetales y en especial al fruto de cacao, en tales estrategias, los microorganismos del suelo juegan un papel importante, pues se ha reportado que ciertas especies fúngicas, presentan adaptaciones para sobrevivir en zonas contaminadas con metales pesados.
description: El uso de su biomasa viva y/o muerta, ha venido utilizándose para biorremediar diferentes áreas contaminadas. Las biomasas fúngicas utilizan mecanismos tales como bioacumulación o biosorción de metales pesados en sus tejidos sin afectar su metabolismo, y se ha reportado que diferentes especies fúngicas poseen la capacidad de sobrevivir adaptándose o mutando a altas concentraciones de metales pesados, de ahí que el objetivo de este trabajo está dirigido al aislamiento de hongos filamentosos de suelos contaminados por cadmio de la región cacaotera del municipio de San Vicente de Chucuri (Santander), con el propósito de evaluar el nivel de tolerancia por especies fúngicas nativas a diferentes concentraciones del metal pesado, ensayos que se evaluarán a través del crecimiento y desarrollo en medios micológicos modificados con cadmio (100, 200, 300 ppm respectivamente) posteriormente se identificarán molecularmente las especies más tolerantes. Los resultados obtenidos permitirán ampliar el conocimiento sobre las especies fúngicas nativas útiles en los procesos de biorremediación.
description: Se presentan 5 registros de hongos filamentosos tolerantes al cadmio, aislados de cultivos de cacao en febrero del 2019 en un suelo agrícola del municipio San Vicente de Chucurí, Santander. Los hongos identificados corresponden a las especies: Aspergillus niger, Fusarium solani, Trichoderma hamatum, Trichoderma virens y Talaromyces santanderensis.
DOI: 10.15472/wgnk91
title: Evaluación de la calidad del Agua Potable en el acueducto ASUALDEA de la comunidad Altos de la Aldea en Girón, Santander

description: El agua es el recurso más importante para mantener la vida en el planeta, tener agua de buena calidad es indispensable si se quiere gozar de buena salud. Solo una de cada tres personas tiene acceso al agua potable a nivel mundial (Secretaría del Convenio sobre la Diversidad Biológica 2010). La comunidad Alto de la altea está ubicada en el municipio de Girón – Santander y está conformada por aproximadamente 100 familias aquejadas con diversas problemáticas de accesibilidad, en especial con los recursos públicos vitales. Esta población construyó su propio acueducto veredal llamado ASUALDEA, por lo que es indispensable conocer la calidad del agua almacenada y distribuida desde su acueducto a todos los usuarios de dicha comunidad.
description: Desde el laboratorio de biotecnología de la Universidad de Santander, se analizó la calidad del agua potable suministrada a la comunidad, únicamente como presencia o ausencia de microorganismos y siguiendo lo establecido en la resolución 2115 del 2007 del MINISTERIO DE LA PROTECCIÓN SOCIAL, MINISTERIO DE AMBIENTE, VIVIENDA Y DESARROLLO TERRITORIAL. Se realizaron 2 muestreos en una línea de tiempo de 2 meses y en diferentes puntos seleccionados a lo largo de dicho acueducto los cuales fueron: aljibe, tanque de captación y tanque de distribución y finalmente a 3 casas (elegidas al azar) inscritas a este servicio.
description: El presente conjunto de datos cuenta con 8 registros biológicos que fueron identificados como resultado del análisis de calidad de agua realizado en la comunidad Altos de la Aldea en Girón-Santander, correspondientes a los órdenes de Enterobacterales y Pseudomonadales. Se identificaron casi en su totalidad a nivel de especie (7) y uno a nivel de género (1).
DOI: 10.15472/flfqwt
title: Arácnidos de la cuenca media del río Putumayo, el Encanto, Amazonas - Expedición Binacional

description: La Expedición Binacional a la Biodiversidad de la Cuenca del río Putumayo entre Perú y Colombia es una oportunidad valiosa para documentar la diversidad biológica de la cuenca media del río Putumayo y su potencial de uso sostenible, que presenta un estado de conservación ideal con muy poca transformación de coberturas naturales, características que han motivado la creación áreas protegidas en la región. Es por lo tanto un área representativa de los ecosistemas de la cuenca amazónica influenciados por ríos de aguas negras; en consecuencia, es un área representativa de la flora y fauna de esta importante región del territorio nacional fronteriza. El objetivo principal del proyecto se enfoca en caracterizar la diversidad biológica de la cuenca media del río Putumayo en la frontera Perú-Colombia.
description: El presente recurso cuenta con información de 193 registros biológicos de la clase Arachnida, recolectados durante el mes de abril 2022 en el área no municipalizada de El Encanto y San Rafael, Amazonas.
DOI: 10.15472/ufe4ar
title: Coleoptera de la Colección entomológica de la Universidad del Atlántico UARC

description: El presente set de datos hace referencia a 500 individuos de Coleptera depositadas en la Colección entomológica de la Universidad del Atlántico - UARC, los cuales se encuentran repartidos en 13 familias del orden, de las cuales Scarabaeidae tiene mayor representación, seguida de Carabidae. La mayoría de los Scarabaeidae corresponden a las subfamilias Dynastinae, Rutelinae y Melolonthinae que están identificados en su mayoría, hasta especie. Estos especímenes se encuentran montados y en seco y provienen de localidades dentro de los departamentos de Atlántico, Bolívar, Cesar, Guajira, Magdalena y Sucre.
DOI: 10.15472/44jhn9
title: Hemiptera de la Colección entomológica de la Universidad del Atlántico UARC

description: El presente set de datos hace referencia a 150 individuos de Hemiptera repartidos en ocho familias del orden, los cuales se encuentran depositados en la Colección entomológica de la Universidad del Atlántico -UARC. Sólo 20 se encuentran a nivel de orden, sin etiqueta de identificación. Estos corresponden a especímenes montados y en seco, provenientes de localidades de los departamentos Atlántico, Bolívar, Cesar y Magdalena.
DOI: 10.15472/dqlygf
title: Peces de la cuenca media del río Putumayo, el Encanto, Amazonas - Expedición Binacional

description: La Expedición Binacional a la Biodiversidad de la Cuenca del río Putumayo entre Perú y Colombia es una oportunidad valiosa para documentar la diversidad biológica de la cuenca media del río Putumayo y su potencial de uso sostenible, que presenta un estado de conservación ideal con muy poca transformación de coberturas naturales, características que han motivado la creación áreas protegidas en la región. Es por lo tanto un área representativa de los ecosistemas de la cuenca amazónica influenciados por ríos de aguas negras; en consecuencia, es un área representativa de la flora y fauna de esta importante región del territorio nacional fronteriza. El objetivo principal del proyecto se enfoca en caracterizar la diversidad biológica de la cuenca media del río Putumayo en la frontera Perú-Colombia.
description: El presente recurso cuenta con información de 491 registros biológicos de las clases Actinopterygii y Chondrichthyes, recolectados durante el mes de abril 2022 en el área no municipalizada de El Encanto y San Rafael, Amazonas.
DOI: 10.15472/ppdwto
title: Lepidoptera de la Colección entomológica de la Universidad del Atlántico UARC

description: El presente set de datos hace referencia a 200 individuos de Lepidoptera repartidos en seis familias del orden, los cuales se encuentran depositados en la Colección entomológica de la Universidad del Atlántico -UARC, identificados en su totalidad hasta especie. Estos corresponden a especímenes montados y en seco, provenientes de localidades de los departamentos Atlántico, Bolívar, Guajira y Magdalena.
DOI: 10.15472/ouydbp
title: Colección de Microorganismos del Grupo de Investigación de Ecología Microbiana y Bioprospección

description: Esta colección se comenzó en el año 2015 con el aislamiento, identificación y registro de diferentes aislados microbianos (hongos filamentosos, levaduras y bacterias) provenientes de diferentes microhábitats incluyendo microorganismos relacionados al cultivo de cacao y proceso de beneficio para estudios ecológicos.
DOI: 10.15472/fmgzpl
title: Macroinvertebrados acuáticos asociados a la ciénaga La Larga, Tagachí, municipio de Quibdó, Chocó. 2022

description: Los ambientes naturales como los humedales representan un potencial importante en la conservación de especies endémicas, además de participar en los mecanismos de regulación ecológica y recarga hídrica, generalmente estos albergan una enorme variedad de especies de flora y fauna y es una importante área de endemismos; por ello, constituyen una reserva genética de importancia mundial y no menos significativa es la función que cumplen sus bosques alrededores, que actúan como parte importante resguardo especies y ayudan en los procesos y roles tróficos de los mismos. A pesar de los múltiples beneficios que aportan, presentan una preocupante reducción de sus hábitats producto del avance de la urbanización, actividades agrícolas, pastoreo, drenaje y presencia de plantas invasoras que desplazan a las especies nativas, lo que genera su paulatino y constante deterioro, debido en mayor parte, a las alteraciones por contaminación y saneamiento básico, provocado cambios en la estructura y composición de las comunidades biológicas presentes y procesos de eutrofización. El fitoplancton es un conjunto de microorganismos acuáticos, fotosintetizadores con ciclos de vida corta, que viven suspendidos en la columna del agua, la presencia y abundancia de esta comunidad puede ser utilizada para evaluar el estado ecológico del medio en el que se encuentran los humedales, permitiendo inferir sobre los problemas que estén sucediendo, estas microalgas presentan, una alta heterogeneidad tanto espacial como temporal dependiendo de la variabilidad en los factores ambientales, e hidrología, que determinan su comportamiento y distribución. El uso de los macroinvertebrados acuáticos (y muy especialmente los insectos) también son indicadores ideales de la calidad de las aguas de los ecosistemas (ríos, lagos o humedales) está generalizándose en todo el mundo. Los beneficios del uso de herramientas integradoras y no solo las características fisicoquímicas del agua para la medida de su calidad han sido explicitadas también para medir el “Estado Ecológico”, de los mismos. En muchos estudios de macroinvertebrados acuáticos en ambientes lénticos, se ha manifestado que la hidrología, la vegetación acuática, las perturbaciones antropogénicas y la depredación son los factores que controlan la dinámica de los invertebrados en estos ambientes, con base en lo expuesto, el Instituto de Investigaciones Ambientales del Pacifico (IIAP), en su marco de generar conocimiento, presenta el informe técnico relacionado con el estado ecológico utilizando la comunidad de algas planctónicas y macroinvertebrados en la ciénaga la Larga de Tagachí, del municipio de Quibdó, en el Chocó Biogeográfico.
DOI: 10.15472/gyakqs
title: Hormigas del Bosque Seco Tropical de los Montes de María y serranía de Piojó, Colombia

description: Los diferentes registros biológicos provistos aquí, corresponden a hormigas que habitan en la hojarasca del bosque seco tropical de los Montes de María y la serranía del Piojó. Estos registros son parte del proyecto de investigación "Diversidad taxonómica y funcional de hormigas (Hymenoptera: Formicidae) asociadas a la hojarasca en ecosistemas amenazados de bosques seco tropical en los Montes de María y serranía de Piojo, Caribe colombiano" dentro del programa de investigación "Diversidad genética, taxonómica y funcional y algunos aspectos poblacionales de grupos taxonómicos con importancia para la conservación del bosque seco tropical en los Montes de María y la serranía de Piojo en el Caribe colombiano" financiado por MinCiencias.
description: Este recurso consta de 2.029 registros biológicos de hormigas pertenecientes a la familia Formicidae, que fueron tomados mediante el establecimiento de dos transectos de 100 m y el uso de sacos MiniWinkler, durante el último trimestre del año 2022, en los departamentos de Atlántico, Bolívar y Sucre. El total de registros fue identificado a nivel de género.
DOI: 10.15472/ey5axj
title: Anidación de tortugas de río en el Parque Cahuinarí, temporada 2014 a 2020

description: El evento de muestreo fue realizado en el Parque Nacional Natural Cahuinarí para el reporte de anidación de las tortugas Charapa (Podocnemis expansa) y Taricaya (Podocnemis unifilis), comprendidos entre los años 2014 a 2020. El lote cuenta con un total de 5.861 registros para la anidación de las tortugas en el Parque. La metodología empleada fue aplicada para el monitoreo y seguimiento de las zonas de desove, alimentación y resguardo, y recorridos de vigilancia. Esta consistió en realizar turnos de control y monitoreo por tres semanas, intentando cubrir las dos épocas hidroclimáticas de la región (aguas bajas y aguas altas). Adicionalmente hay información acerca de la eclosión y supervivencia de los huevos en los nidos.
DOI: 10.15472/qgrczj
title: Entomofauna asociada a Duranta erecta y Lantana camara en un vivero ornamental de Santa Marta, Colombia.

description: Los datos provienen de una investigación que buscó identificar la entomofauna asociada a dos especies de plantas (Durante erecta y Lantana camara) tratadas con un fertilizante mineral, en un vivero ornamental ubicado en el casco urbano de la ciudad de Santa Marta. Se presentan un total de 282 registros pertenecientes al subfilo Hexapoda.
DOI: 10.15472/qcnlfh
title: Línea base general de insectos (Collembola) para el valle medio del Magdalena - VMM

description: Bajo los Convenios No. 21-095 y 21-450 suscritos con la Agencia Nacional de Hidrocarburos - ANH, se llevó a cabo el levantamiento de la línea base general de la biodiversidad y ecosistemas para el área de interés del Valle Medio del Magdalena. Se realizaron muestreos de biodiversidad de diferentes grupos biológicos, en este recurso se presentan los resultados del grupo taxonómico Collembola. Durante la temporada de aguas altas se obtuvo un total de 2693 registros de colémbolos distribuidos en 4 órdenes, 14 familias, 49 géneros, 14 especies y 158 morfoespecies definidas; durante la temporada de aguas bajas se obtuvo un total de 3255 registros, distribuidos en 4 órdenes, 15 familias, 52 géneros, 1 especie y 264 morfoespecies. En general se obtuvo un total de 5948 registros para las dos temporadas evaluadas con 17 familias, 70 géneros, 15 especies y 379 morfoespecies. La colecta de colémbolos se llevó a cabo mediante dos técnicas de muestreo: trampas de caída y embudos de Berlese-Tullgren. Se analizaron 40 unidades muestrales en cada temporada, clasificadas en 8 tipos de coberturas: bosques abiertos, bosques densos, bosques riparios, cultivos de palma, herbazales, pastos arbolados, pastos enmalezados y pastos limpios. En cada unidad muestral, se trazó un transecto lineal de 60 metros en donde se ubicaron seis puntos de recolección de suelo para los embudos y se instalaron seis trampas de caída. Se tomaron 354 cm3 de suelo y en el mismo sitio se instalaron las trampas de caída las cuales se distanciaron a 10 metros entre sí. Las trampas de caída se dejaron por un periodo de tiempo de 48 horas y los embudos de Berlese-Tullgren por 7 días. Se establecieron un total de 120 trampas de caída y 120 muestras de suelo en embudos de Berlese-Tullgren durante las dos temporadas de muestreo. Todo el material colectado se procesó en el laboratorio de Villa de Leyva empleando estereoscopios, microscopios y claves taxonómicas especializadas para la determinación de los ejemplares. Se generó una colección de referencia con un total de 818 placas, y material de 25 morfoespecies se envió a la colección de tejidos para la extracción de su ADN. El material restante se encuentra almacenado en viales de 2 ml con tapa hermética y alcohol al 96% clasificados por género y temporada evaluada en frascos de vidrio depositados en la colección de invertebrados del Instituto Alexander von Humboldt, sede Villa de Leyva.
DOI: 10.15472/sdcj6o
title: Babilla del Apaporis (Caiman crocodilus apaporiensis) en la cuenca media del río Apaporis, municipio de Pacoa

description: La babilla del Apaporis (Caiman crocodilus apaporiensis) ha sido de particular interés desde su descripción debido principalmente a su claro y diferenciado morfotipo (hocico aguzado) dentro del morfo-espacio Caiman. Sin embargo, la falta de muestras derivadas de especímenes vivos o tejidos y el reducido tamaño muestreal con que se cuenta (holotipos y paratipos), ha limitado el alcance de los estudios hechos a la fecha sobre esta especie. Sumado a esto, la falta de estudios ecológicos y poblacionales han impedido definir el estado de conservación de esta subespecie endémica para Colombia desde su descripción en 1955, mostrando la inherente necesidad de reactivar cuento antes la investigación sobre esta subespecie. Es así como el presente estudio pretende evaluar las relaciones filogenéticas de la subespecie C. c. apaporiensis así como evaluar y describir aspectos ecológicos y poblacionales de la misma en la cuenca media del río Apaporis.
description: Este recurso contiene 42 registros de la babilla, tomados en los municipios de Pacoa en Amazonas y Vaupés en los años 2019 y 2021.
DOI: 10.15472/voyd04
title: Línea base general de microorganismos para el valle medio del Magdalena - VMM

description: Bajo los Convenios No. 21-095 y 21-450 suscritos con la Agencia Nacional de Hidrocarburos - ANH, se llevó a cabo el levantamiento de la línea base general de la biodiversidad y ecosistemas para el área de interés del Valle Medio del Magdalena. En el área de interés del Valle Medio del Magdalena se realizaron muestreos de biodiversidad de diferentes grupos biológicos y en este recurso se presentan los resultados para microorganismos en dos temporadas climáticas presentes en aguas subterráneas, aguas superficiales, sedimentos, y suelos. Para caracterizar la diversidad se utilizando metabarcoding a partir de regiones del ADN ribosomal que permitieron la identificación de cuatro grupos biológicos: bacterias, arqueas, hongos, y micro eucariotas.
description: En ambas temporadas se analizaron un total de 125 unidades de muestreo en temporada de aguas altas y 126 unidades de muestreo en temporada de aguas bajas. En aguas subterráneas se analizaron 9 unidades de muestreo en aguas altas y 10 unidades de muestreo en aguas bajas; en aguas superficiales y sedimentos 40 unidades de muestreo en cada temporada, y en suelos 36 unidades de muestreo en cada temporada. Para todas las muestras se realizaron extracciones de ADN, amplificaciones y secuenciación de alto rendimientos bajo la plataforma NovaSeq PE250, Illumina. Para cada muestra, incluyendo los controles positivos, de filtración, de extracción y blancos de PCR se realizaron tres réplicas de PCR con una cobertura de 100.000 lecturas aproximadamente por replica. En bacterias y arqueas se amplificaron la región 16S, en hongos la región ITS y en eucariotas 18S. Para bacterias se obtuvieron un total de 13.729.09 de lecturas para ambas temporadas, que fueron agrupadas en 72.962 ASV. Para arqueas se alcanzaron 38.544.193 lecturas en ambas temporadas, las cuales fueron asignadas en 125.994 ASV. En hongos se consiguieron 68.015.668 lecturas para ambas temporadas, que fueron agrupadas en 174.294 ASV. En eucariotas se obtuvieron 75.309.811 lecturas para ambas temporadas, asignadas a 157.978 ASV. En aguas subterráneas se reportaron para ambas temporadas 221 familias de bacterias, 31 familias de arqueas, 167 familias de hongos y 69 órdenes de eucariotas. En aguas superficiales se registraron 318 familias de bacterias, 38 familias de arqueas, 514 familias de hongos y 172 órdenes de eucariotas. En sedimentos, se registraron 281 familias de bacterias, 35 familias de arqueas, 444 familias de hongos y para eucariotas 170 órdenes. En suelos se registraron 182 familias de bacterias, 24 familias de arqueas, 442 familias de hongos, y 118 órdenes de eucariotas. Adicionalmente, en el presente conjunto de datos se incluyen los datos fisicoquímicos tomados in situ.