cometadata/datacite-titles-descriptions-related-identifiers huggingface dataset:
DOI: 10.15472/km5xtt
title: Avifauna asociada al complejo cenagoso La Larga, Tagachí, Chocó 2012

description: A nivel faunístico las ciénagas son consideradas ecosistemas altamente productivos, que permiten el flujo de la energía a través de niveles tróficos complejos, que van desde macroinvertebrados acuáticos hasta aves carroñeras eliminadoras de la materia orgánica, que terminan devolviéndola al ecosistema como parte de una dinámica ecológica que incluye dos ambientes totalmente diferentes, los cuales responden a los requerimientos de los organismos existentes. La fauna presente en estos ecosistemas hace parte esencial en la funcionalidad del mismo y en la composición del paisaje, recreándolo y ayudando a su mantenimiento en el tiempo y el espacio. La fauna silvestre de los humedales es, quizá, una de las más ricas y variadas de los ecosistemas del planeta. Los innumerables microhábitats, la enorme productividad primaria, los nutrientes que por él circulan, ayudan a explicar esta inestimable diversidad. Los animales que habitan los humedales tienen diversos mecanismos para adaptarse a ellos. Patas palmeadas con membradas interdigitales para nadar, picos aguzados como las garzas para proveerse el alimento, plumas y pelos muy bien lubricados para protegerse del frío y muchas aves de picos aplanados para filtrar alimento. Las anteriores razones crean la necesidad de conocer el potencial faunístico de las ciénagas y el papel que las especies desempeñan en la funcionalidad y mantenimiento de dicho ecosistema. Por lo tanto esta investigación tiene como objetivo analizar el estado de conservación del complejo cenagoso La Larga, a partir del conocimiento de la composición de vertebrados silvestres presentes en los diferentes estratos del ecosistema y su contribución con el funcionamiento del mismo. Este apartado contiene una metodología estandarizada para los diferentes grupos faunísticos y modificada para facilitar el trabajo de campo en el área objeto de estudio. También se presentan los resultados obtenidos que incluyen la composición faunística del complejo, destacando la presencia de especies con gran importancia ecológica y de interés especial para la conservación y con ello las consideraciones a las que finalmente nos lleva dicho estudio.
DOI: 10.15472/uimues
title: Avifauna asociada a la cuenca del río Quito - Chocó, 2014

description: Las cuencas hidrográficas son sistemas que proveen importantes bienes y servicios, que sustentan gran partes de las necesidades básicas de las comunidades humanas ubicadas en las inmediaciones de sus riberas. Además de esto, se constituyen como el eje central e integrador de muchos grupos faunísticos que interactúan en función de los mismos, utilizándolos como la base de toda su dinámica, la cual mantiene en gran medida la producción de ambientes, que son utilizados como sitios de alimentación, reproducción, refugio y lugares de paso para numerosos organismos. Así pues, cualquier disturbio en el sistema repercutirá en la fauna asociada a estos ambientes; afectando su estructura, funcionalidad y ciclo de vida. A pesar de esto, con el transcurrir del tiempo aumentan las amenazas sobre dichos ecosistemas, debido a diferentes actividades antrópicas; Como por ejemplo la minera de oro y platino, que en el ejercicio de sus actividades termina modificando gran parte de la estructura del sistemas hídricos y con ello la disponibilidad de diferentes ambientes que modelan la diversidad de la fauna dependientes de estos cauces. En consecuencia con todo lo anterior y preocupado por el aumento del ejercicio de la actividad minera, en las riberas de la cuenca del Río Quito, el Instituto de Investigaciones Ambientales del Pacifico; tuvo como finalidad realizar la caracterización ecológica de la fauna de vertebrados asociada (Aves, anfibios, reptiles y aves,), a la cuenca del Río Quito. Como un aporte al conocimiento del estado de las fuentes hídricas del mismo, ya que el bienestar de las comunidades asentadas en el territorio, la vida silvestre y los ecosistemas dependen de los suministros adecuados de agua limpia. A continuación se presenta el análisis de la composición de los diferentes grupos faunístico, asociadas a la cuenca del Río Quito. Esperamos que esta información sirva de base a las autoridades ambientales y a los diferentes entes territoriales, para la toma de decisiones en caminadas a la recuperación de este ambiente.
DOI: 10.15472/ybuokw
title: Registro de la anfibiofauna presente en el páramo del Duende - 2017

description: Los páramos son ecosistemas de alta montaña surge en medio de imponentes paisajes; tienen un ambiente en el que, a pesar de su extrema fragilidad, la plenitud de la vida triunfa en medio de desiertos helados, extensos arenales y áreas pantanosas, también son un lugar lleno de sorpresas y de gran importancia, que garantiza diferentes procesos vitales que se desarrollan en un mismo ambiente, son considerados corredores biológicos que albergan una fauna y flora singular, convirtiéndose de esta manera en refugio de especies endémicas o con algún grado de amenaza. Desde el punto de vista científico, los ecosistemas paramunos constituyen un interesante laboratorio del conocimiento, pues albergan una variedad de especies biológicas adaptadas a diversas condiciones ambientales (topografía y clima). Desde su ecología, este medio suministra una inmensa variedad de bienes y servicios, esenciales para grupos faunísticos permitiéndole realizar funciones como indicadoras de calidad de la misma, así como el reciclaje de nutrientes, el control de insectos, la polinización y dispersión de semillas, de esta manera se constituye un recurso muy importante para el desarrollo de la diversidad biológica, los cuales interactúan entre sí para mantener el equilibrio el entorno. Hablar de paramos en el Chocó Biogeográfico es casi extraño, aunque éste estratégicamente geo posicionado y considerado uno de los lugares más biodiversos en ecosistemas, las características tropicales y paisajísticas de la región, razón por la cual el IIAP ha venido desarrollando múltiples caracterizaciones en ecosistemas de media y alta montaña. Bajo esa perspectiva, en esta oportunidad se inició una caracterización del Páramo del Duende, con el fin de documentar la dinámica del componente faunístico que coexiste en la localidad. En ese contexto, en el presente capitulo se muestran los resultados obtenidos sobre la avifauna que habita dicho paramo a lo largo del gradiente altitudinal.
DOI: 10.6084/m9.figshare.8841158.v1
title: Additional file 7: of Microarray analysis of infectious bronchitis virus infection of chicken primary dendritic cells

description: GO and KEEG analysis of differentially expressed lncRNAs target in IBV-stimulated avian BMDCs. (XLS 458 kb)
DOI: 10.15472/2hv0a2
title: Registro de una poblacion de Abejorros en los departamentos de Boyacá y Cundinamarca

description: Los abejorros, o abejas del género Bombus Latreille, 1802 (Thorp & Shepherd, 2005), son un grupo importante de insectos sociales reconocidos en latitudes altas y regiones templadas como polinizadores de plantas silvestres y agrícolas (Abrahamovich, et.al, 2001). Sin embargo, en Colombia se pueden encontrar en altitudes desde los 0 hasta los 3600 metros (Abrahamovich, et. al, 2001). Estas abejas robustas y peludas tienen adaptaciones termo-regulatorias, incluida la endotérmia facultativa, lo cual les permite vivir en grandes elevaciones como en ecosistemas alpinos (Heinrich, 1979) y en el caso de Colombia en páramos. El conocimiento y conservación de estos organismos, es de vital importancia debido a su relación y coevolución con plantas silvestres y de producción agrícola, en especial en regiones alto-andinas donde se concentra diversos cultivos de alta importancia (Klein et. al, 2007). Este estudio pretende evaluar las poblaciones de abejorros presentes en un gradiente altitudinal en la cordillera oriental colombiana, utilizando técnicas biogeográficas y de filogenia molecular, para esclarecer los patrones de divergencia y distribución de este género. Esto, con el fin de aportar al bajo conocimiento de estos organismos en Colombia (Liévano et. al, 1994); y ayudar al reciente proceso sobre el conocimiento de la desaparición de poblaciones de estos organismos debido a la perdida de hábitat, el uso de pesticidas y el calentamiento global (Goulson et. al, 2008). Comprende 113 registros de abejorros pertenecientes a 4 especies del género Bombus.
DOI: 10.15472/1w0xo6
title: Macroinvertebrados acuáticos de la Reserva Forestal Protectora Regional Alto de San Miguel, Antioquia

description: Se presentan 46 registros de macroinvertebrados acuáticos asociados a 232 individuos colectados en la Reserva Forestal Protectora Regional Alto de San Miguel ubicada en el municipio de Caldas, Antioquia el 18 de febrero de 2018 en el marco del Curso de Bioestadística III de la Universidad.
description: Se realizaron análisis de riqueza mediante curvas de rarefacción para los sitios de puente y potrero, por tipo de sustrato, raíz y roca, con ayuda del software Past versión 3.20. Se realizaron boxplots tanto para la riqueza como para la abundancia obtenida en ambos sitios por sustrato, como una primera aproximación a evaluar el comportamiento de los datos, en el software Rstudio versión 1.1.442.
description: Los individuos colectados se identificaron hasta orden y se depositaron en la Colección Biológica de la Universidad CES (CBUCES).
DOI: 10.15472/pj4hlg
title: Invertebrados marinos asociados a ecosistemas de manglar en Buenaventura, Valle del Cauca. EPA-IIAP 2019

description: En el marco del proceso de Ejecución del proyecto de Conservación, Protección, Restauración y Aprovechamiento sostenible de Ecosistemas Forestales del Distrito de Buenaventura para el establecimiento Público Ambiental -EPA, se establecen como objetivos de específicos, la caracterización de la biota marina presente en los ecosistemas estratégicos en la jurisdicción del EPA, como aporte a la elaboración del diagnóstico para la identificación, actualización y caracterización de dichos ecosistemas, así como en la generación del registro único de ecosistemas y áreas ambientales. En dicho proceso se contó con el apoyo del equipo técnico del IIAP y de miembros de las comunidades aledañas a las zonas de monitoreo, los cuales participaron de manera muy activa y comprometida con el proceso de caracterización que el Establecimiento Publico Ambiental del Distrito de Buenaventura, ha iniciado para propender por el mejoramientos del ambiente en su territorio, a través de identificar con que cuenta cada uno de dichos ecosistemas, en materia de fauna marina, lo que se traducirá en acciones pertinentes que aporten a la solución de los problemas que se puedan identificar a nivel ambiental.
DOI: 10.15472/vc4dh8
title: Ictioplancton de Siluriformes migratorios en el brazo Bayonero, río Arauca

description: Este proyecto tiene como objetivo estudiar el ictioplancton de Siluriformes migratorios en el río Arauca, en la Orinoquía colombiana. Aunque se han registrado cerca de 15 especies de bagres migratorios en la zona, actualmente no se conocen las condiciones ambientales de los embriones o larvas de estas especies. Por lo tanto, el proyecto busca responder preguntas sobre las condiciones de desarrollo inicial de los bagres migratorios in situ, así como los periodos de desove, las condiciones ambientales que favorecen el desove y el mantenimiento de embriones y larvas, y las características morfológicas y morfométricas del desarrollo inicial de Siluriformes en el río Arauca. Además, se espera que la investigación contribuya a la mejora de los procesos de larvicultura y la conservación de las especies pesqueras en la región.
description: El presente conjunto de datos cuenta con 737 registros biológicos de ictioplancton identificado a nivel de clase y orden. Los datos fueron tomados entre el segundo semestre del año 2022 y enero del 2023, en el departamento de Arauca, municipios de Arauquita (brazo Bayonero del río Arauca, vereda Nueva Jerusalén) y Arauca (vereda Clarinetero), utilizando como protocolo de muestreo una red de ictioplancton.
DOI: 10.15472/jzidbk
title: Anfibios del cerro Tapartó, Santa Cecilia - Risaralda. 2020

description: El cerro Taparto se constituye en uno de los ecosistemas de media montaña del Chocó Biogeográfico priorizados para realizar prospecciones biologicas, razón por la cual el Instituto de Investigaciones del Pacifico IIAP, incluye dentro de las actividades del Plan Operativo Anual 2020, caracterizar ecologica y ambientalmente este ecosistema. El Cerro se encuentra ubicado hacia al nordeste del corregimiento de Santa Cecilia y esta ubicado a una altura de 1.235 msnm corresponde a un bosque primario, con algunas intervenciones antropicas notables en la parte baja, potreros para la cria y producción de ganado y algunos cultivos de pancoger como el, platano, guadua, piña, yuca, etc. Realmente hasta la fecha es poco lo que se conoce de este desconocido Cerro del Chocó Biogeográfico, razon por la cual se considera sumamente importante la información colectada durante la caracterización bioecologica del ecosistema en Por lo anterior el presente documento incluye información especifica relacionada con la anfibiofauna que habita el Cerro Tapartó, especies abundantes, amenazadas, ademas de convertirse en una herramienta clave que permite mostrar al mundo información desconocida de estos ecosistemas estrategicos locales que día a día a traves de un enorme esfuerzo institucional van revelando detalles de los misterios y las invaluables joyas biologicas que allí se encuentran.
DOI: 10.15472/a1tln7
title: Flebótomos colectados en un área endémica de leishmaniasis cutánea en Norte de Santander, Colombia

description: Se realizo un muestreo de flebótomos mediante trampas de luz CDC y Shannon en dos localidades del municipio de Arboledas del departamento de Norte de Santander entre junio y septiembre del 2018, con el objetivo de Identificar en un área endémica de intensa transmisión de leishmaniasis cutánea, los hospedadores vertebrados que circulan e interactúan con los vectores, la infección natural, y la genotipificación de las especies de leishmania a partir de flebótomos colectados.
description: Como resultado del muestreo realizado, el presente recurso contiene la información asociada a 546 registros biológicos de insectos dípteros de la subfamilia Phlebotominae.
DOI: 10.15472/kbnkvn
title: Registros de ectoparásitos para la detección de patógenos emergentes (SARS-CoV-2) y re-emergentes (Rickettsias) en caninos procedentes del departamento de Santander

description: Las pulgas y garrapatas son ectoparásitos comunes de mamíferos domésticos como el perro (Canis lupus familiaris). En Colombia se conoce que estos mamíferos pueden ser reservorios de bacterias del género Rickettsia, agentes etiológicos de fiebres hemorrágicas que pueden desencadenar en casos fatales cuando no son detectadas a tiempo. Por otra parte, en la actual pandemia de Covid-19, no existen estudios encaminados a la detección de SARS-CoV-2 en mascotas en el país, aun cuando existe evidencia de infección por el virus en otros países. Durante el desarrollo del proyecto se pretende detectar SARS-CoV-2 en caninos e identificar Rickettsia spp. asociadas a ectoparásitos (pulgas y garrapatas) de caninos procedentes del área metropolitana de la ciudad de Bucaramanga y otras ciudades del departamento de Santander.
description: Pulgas y garrapatas fueron colectadas manualmente en perros infestados, además de muestras respiratorias e intestinales. La identificación de los ectoparásitos se realizó utilizando caracteres morfológicos (claves dicotómicas) y moleculares (COI y COII). La detección de Rickettsia se realizó usando pooles de pulgas y garrapatas, que serán organizados por especie, y se usará para la identificación de las bacterias, un fragmento del gen de la enzima citrato sintasa (gltA) y una proteína de membrana (ompB); para SARS-CoV-2 en caninos se amplificará los genes E y Rd/Rp.
description: El presente conjunto de datos cuenta con 151 registros entre los cuales se tienen 76 registros biológicos de la especie Ctenocephalides felis y 70 registros biológicos de Rhipicephalus sanguineus.
DOI: 10.15472/zewatf
title: Muestra de Cladosporium tenuissimum asociado a la roña en gulupa, en el departamento de Tolima

description: Se realizo un muestreo para colecta de material vegetal en cultivos comerciales de gulupa en los municipios de Casabianca, Santa Isabel y Rovira (departamento de Tolima). Las muestras vegetales colectadas fueron georreferenciadas, empacadas y rotuladas para su posterior procesamiento e identificación de patógenos en el C.I Nataima. La caracterización macroscópica de Cladosporium sp fue realizada por: medición del crecimiento de la colonia a partir del día 8 y hasta el día 13 después de la siembra en PDA; Adicionalmente, se determinó el color, aspecto y textura de cada aislamiento. La caracterización microscópica de Cladosporium se realizó por mediciones micrométricas asociados a órganos reproductivos asexuales. Inicialmente cada aislamiento del hongo fue llevado a microcultivo, para luego ser observado en microscopio de luz (Zeizz), en el cual fueron medidas el ancho y largo de conidias terminales (AT y LT), intercalares (AI y LI) y ramoconidias (AR y LR). Las mediciones fueron realizadas en 20 estructuras por cada tipo de conidia por aislamiento. La caracterización molecular de los aislamientos de Cladosporium se realizó a partir de la extracción de AND de cultivo puro monospórico de 15 dias para la obtención de biomasa del hongo empleando la metodología de Moslem y colaboradores de 2010, el DNA extraído fue cuantificado con ayuda de un nanodrop one (Thermo Scientific). El ADN extraído de los aislamientos se empleó un fragmento de la región ITS con los siguientes primers ITS1 5’- TCCGTAGGTGAACCTGCGG-3’ ITS2 5’- GCTGCGTTCTTCATCGATGC-3'. Posteriormente, se visualizaron los productos de PCR mediante corrido electroforético en gel de agarosa al 1.5%. Los productos de PCR fueron enviados al Instituto de Genética de la Universidad Nacional de Colombia para el Servicio de Secuenciación y Análisis Molecular – SsiGMoL. Posteriormente, las secuencias se editaron mediante leer con programas como BioEdit Sequence Alignment Editor y la identificación determinando su porcentaje de identidad nucleotídica usando algoritmo heurístico de Blast, teniendo como base de comparación el NCBI (National Center for Biotechnology Information). Este recurso contiene 1 registro de Cladosporium tenuissimum, tomado en mayo de 2023.
DOI: 10.15472/ogi9nb
title: Murciélagos de la isla de Providencia. Expedición Seaflower 2019 proyecto Colombia BIO

description: Se presentan los especímenes recolectados de las especies de murciélagos registradas mediante la captura con redes de niebla en la Isla de Providencia durante la Expedición Seaflower 2019. Contiene la información de 21 murciélagos pertenecientes a los géneros Artibeus (16), Micronycteris (3) y Rhogeessa (2), colectados en 4 localidades de Providencia.
DOI: 10.15472/whlx64
title: Larvas de Chironomidae (Insecta: Diptera) en un gradiente altitudinal de un río de la Sierra Nevada de Santa Marta - Colombia

description: Los insectos acuáticos son uno de los grupos biológicos más abundantes e importantes en el funcionamiento de los ecosistemas acuáticos. En los diferentes grupos de insectos se encuentra el orden Diptera al que pertenece, a su vez, la familia Chironomidae; este grupo se caracteriza por su alta diversidad y abundancia en los ecosistemas tropicales de agua dulce, sin embargo, existe poca información sobre su distribución y relación con variables ambientales. El objetivo de esta investigación fue estimar la diversidad de géneros de la familia Chironomidae en la cuenca del río Gaira (Sierra Nevada de Santa Marta) para lo cual se realizaron ocho muestreos en total en tres sitios a lo largo de un gradiente altitudinal (60, 900 y 1700 msnm) entre el 2018 y 2019 cubriendo los períodos secos y lluviosos.
description: Las muestras de bentos se recolectaron usando una red Surber en los sustratos grava y sedimento y mediante colecta manual en los sustratos hojarasca y piedra. Los resultados de esta investigación contribuyen con el reconocimiento de la diversidad de quironómidos en el departamento del Magdalena y proporciona evidencia adicional para sugerir que la Sierra Nevada de Santa Marta es un importante reservorio de biodiversidad aún inexplorado. Contiene 81 registros de dipteros de la familia Chironomidae, todos clasificados a nivel de género.
DOI: 10.6084/m9.figshare.14608333.v1
title: Additional file 2 of ddRAD sequencing: an emerging technology added to the biosecurity toolbox for tracing the origin of brown marmorated stink bug, Halyomorpha halys (Hemiptera: Pentatomidae)

description: Additional file 2. SNP distribution in Scaffold.
DOI: 10.6084/m9.figshare.14608333
title: Additional file 2 of ddRAD sequencing: an emerging technology added to the biosecurity toolbox for tracing the origin of brown marmorated stink bug, Halyomorpha halys (Hemiptera: Pentatomidae)

description: Additional file 2. SNP distribution in Scaffold.
DOI: 10.15472/ui7a6g
title: Colección de Líquenes del Centro de Colecciones Biológicas de la Universidad del Magdalena

description: Este conjunto de datos sobre biodiversidad se registra la colección de líquenes del Centro de Colecciones Científicas - sección colecciones biológicas de la Universidad del Magdalena (CBUMAG), que consta de 80 líquenes hasta la fecha, de los cuales 40 son de la división Ascomycota y uno (1) a Basidiomycota. El 50% de los registros están identificados hasta el nivel de género, y el restante 50% a nivel de división. La información de este recurso proviene de las salidas de campo realizadas entre 2011 y 2015 en el marco de distintos proyectos que buscaban determinar la diversidad de invertebrados anhidrobióticos que viven asociados a líquenes.
DOI: 10.15472/mfxxir
title: Diversidad de macroinvertebrados acuáticos de morichal en dos periodos hidrológicos, finca Manacacías – Meta, Colombia

description: La fauna de macroinvertebrados acuáticos en morichales de la Orinoquia colombiana aún es un desafío en términos del conocimiento de su composición y estructura taxonómica. Esta investigación tuvo como objetivo describir la diversidad de macroinvertebrados acuáticos en morichales de la Finca Manacacías de la Universidad de los Llanos en dos periodos hidrológicos. El material biológico se recolectó con la Red D y capturas manuales en tres tramos a lo largo del caño Cacuare en el periodo seco (marzo) y lluvias (junio) de 2021. La diversidad se analizó a partir de la abundancia, composición y estructura de los macroinvertebrados acuáticos, y se aplicaron los índices de diversidad alfa (paquete iNext) y beta (paquete betapart) en RStudio. Se registró una alta riqueza y abundancia de macroinvertebrados acuáticos en el periodo de aguas altas en contraste con el periodo de aguas bajas, y a nivel espacial no se registraron diferencias en la composición taxonómica
description: El presente conjunto de datos consta de 111 registros biológicos que se distribuyen en 8 órdenes, 30 familias y 37 géneros, los registros fueron identificados como mínimo a nivel de familia. La toma de datos se realizó en Puerto Gaitán, Meta dentro de la finca Manacacías de la Universidad de los Llanos. Los especímenes registrados se ingresaron al Museo de Historia Natural Unillanos (MHNU).
DOI: 10.15472/6iinap
title: Bioprospección de bacterias halófilas aisladas de las salinas de Manaure, La Guajira-Colombia, como fuentes de compuestos que puedan ser usados como antibióticos

description: En este recurso se presentan 23 registros biológicos de Bacterias, identificadas mediante el aislamiento de una muestra de sedimentos salobres obtenidos de Salinas ubicadas en el municipio de Manaure en La Guajira, entre el 18 y 20 de junio del 2015. Las Bacterias aisladas fueron identificadas mediante secuenciación del gen 16S y se estableció que la distribución taxonómica consta de 3 órdenes, 3 familias, 3 géneros y 5 especies. Estos especímenes fueron utilizados como fuente de estudio para la exploración de los potenciales bioprospectivos de las bacterias aisladas de dichos sedimentos.