DOI: 10.21966/jxrd-8g95
title: Carbon and nitrogen stable isotope ratios and elemental composition of specimens from the pelagic food web collected during the 2019 International Year of the Salmon expedition to the Gulf of Alaska

description: All samples were collected on board of the chartered R/V Professor Kaganovsky between February and March 2019 during the winter expedition of the International Year of the Salmon project to the Gulf of Alaska, North Pacific Ocean. Samples of Particulate Organic Matter (POM) were obtained by filtering approximately 2 L of water onto pre-combusted 25 mm GF/F filters with a vacuum pump.  Water samples were collected at every station from 5m depth using Niskin bottles. Two replicates were filtered per station, one subsample was acidified by immersion in 1M HCl for 30 seconds. After acidification, the sample was rinsed with 0.7 μm filtered seawater and dried by applying vacuum pressure to the filter. Each filter was transferred to its own aluminum foil envelope and stored at -20oC. Zooplankton samples were collected with a Bongo net (50 cm mouth diameter and 236 µm mesh) hauled vertically from 250 m depth. The zooplankton sample collected at each station was size fractionated using a sieve stack with 4 mm, 2 mm, 1 mm, 0.5 mm and 0.25 mm mesh sizes, and then frozen at -40°C. Samples of salmon, squids, jellyfish, myctophids and other fishes were obtained using a surface trawl (~120 m2, 30m deep x 40m wide) deployed at each station and towed at 4-5 knots for one hour.  All organisms caught in the trawl were identified to the lowest practical taxon (species except for some invertebrates), enumerated, and measured (length [total, fork, mantle, or bell diameter as appropriate] to the nearest 1 mm, weight to the nearest 1 g). For salmonids, a 2x2 cm piece of muscle tissue was collected from above the lateral line and in front of the dorsal fin and stored at -40°C. For large non-salmonid fish, a muscle sample was collected in the same way as for salmonids samples. A 2x2 cm piece of muscle from the anterior dorsal margin of the mantle was collected from squids, and jellyfish were collected either whole or a piece in the case of large specimens. For micronekton species, either a piece of muscle was sampled (e.g., myctophids posterior region; squids’ mantle) or the specimen was analysed whole (e.g., krill, small jellyfish). All samples were stored frozen at -20○C. Samples were then processed in the laboratory at the University of British Columbia. POM Filters were oven dried at 50°C and later encapsulated for isotopic analysis. POM ẟ13C values are reported from the set of acidified samples, while ẟ15N are reported from non-acidified samples. Animal samples were either oven dried at 50°C (zooplankton, squids, myctophids and non-salmonid fishes) or freeze-dried (salmon and jellyfish), and then homogenized to a fine powder using mortar and pestle. Approximately 1 mg of each sample was encapsulated in tin caps and sent for carbon and nitrogen analysis at the UC Davis stable isotope facility (Davis, CA, USA). Tissue samples were analysed using an elemental analyser (PDZ Europa ANCA-GSL) interfaced to an isotope ratio mass spectrometer (PDZ Europa 20-20, Sercon Ltd., Cheshire, UK). Details on analytical procedure are provided in the supplementary materials 1. The data reported includes each sample ẟ13C (raw and lipid corrected, see supplementary material 1 and 2), total C content (mg), ẟ15N, total N content (mg), CN ratios, calculated trophic positions (see supplementary material 3), and salmon condition factor (supplementary material 4), in addition to the metadata associated with each sample (e.g., coordinates of oceanographic station and bottom depth where specimens were collected, etc.).
description: Tous les échantillons ont été prélevés à bord du sous-marin affrété Professor Kaganovsky entre février et mars 2019 lors de l'expédition hivernale du projet de l'Année internationale du saumon dans le golfe d'Alaska, dans l'océan Pacifique Nord. Des échantillons de matière organique particulaire (POM) ont été obtenus en filtrant environ 2 L d'eau sur des filtres GF/F de 25 mm prébrûlés à l'aide d'une pompe à vide. Des échantillons d'eau ont été prélevés à chaque station à 5 m de profondeur à l'aide de bouteilles Niskin. Deux répétitions ont été filtrées par station, un sous-échantillon a été acidifié par immersion dans du HCl 1M pendant 30 secondes. Après acidification, l'échantillon a été rincé avec de l'eau de mer filtrée à 0,7 µm et séché en appliquant une pression de vide sur le filtre. Chaque filtre a été transféré dans sa propre enveloppe en aluminium et stocké à -20 oC. Des échantillons de zooplancton ont été prélevés à l'aide d'un filet Bongo (diamètre de bouche de 50 cm et maille de 236 µm) tiré verticalement à 250 m de profondeur. L'échantillon de zooplancton prélevé à chaque station a été fractionné à l'aide d'un tamis à mailles de 4 mm, 2 mm, 1 mm, 0,5 mm et 0,25 mm, puis congelé à -40 °C. Des échantillons de saumon, de calmars, de méduses, de myctophides et d'autres poissons ont été prélevés à l'aide d'un chalut de surface (~120 m2, 30 m de profondeur x 40 m de large) déployé à chaque station et remorqué à 4-5 nœuds pendant une heure. Tous les organismes capturés au chalut ont été identifiés selon le taxon le plus bas possible (espèces à l'exception de certains invertébrés), dénombrés et mesurés (longueur [total, diamètre de la fourche, du manteau ou de la cloche, selon le cas] à 1 mm près, poids à 1 g près). Pour les salmonidés, un morceau de tissu musculaire de 2 x 2 cm a été prélevé au-dessus de la ligne latérale et devant la nageoire dorsale et conservé à -40 °C. Pour les gros poissons autres que les salmonidés, un échantillon musculaire a été prélevé de la même manière que pour les échantillons de salmonidés. Un morceau de muscle de 2 x 2 cm provenant de la marge dorsale antérieure du manteau a été prélevé sur des calmars, et des méduses ont été prélevées entières ou en morceaux dans le cas de grands spécimens. Pour les espèces de micronekton, soit un morceau de muscle a été prélevé (par exemple, région postérieure des myctophidés ; manteau des calmars), soit le spécimen a été analysé entier (par exemple, krill, petite méduse). Tous les échantillons ont été conservés congelés à -20 °C. Les échantillons ont ensuite été traités dans le laboratoire de l'Université de la Colombie-Britannique. Les filtres POM ont été séchés au four à 50 °C puis encapsulés pour une analyse isotopique. Les valeurs POM 13C sont rapportées à partir de l'ensemble d'échantillons acidifiés, tandis que 15n sont rapportées à partir d'échantillons non acidifiés. Les échantillons d'animaux ont été soit séchés au four à 50 °C (zooplancton, calmars, myctophides et poissons non salmonidés) soit lyophilisés (saumon et méduses), puis homogénéisés en une poudre fine à l'aide d'un mortier et d'un pilon. Environ 1 mg de chaque échantillon a été encapsulé dans des capsules en étain et envoyé pour analyse du carbone et de l'azote à l'installation d'isotopes stables UC Davis (Davis, Californie, États-Unis). Les échantillons de tissus ont été analysés à l'aide d'un analyseur élémentaire (PDZ Europa ANCA-GSL) interfacé à un spectromètre de masse à rapport isotopique (PDZ Europa 20-20, Serçon Ltd., Cheshire, Royaume-Uni). Les détails de la procédure analytique sont fournis dans les documents supplémentaires 1. Les données déclarées incluent chaque échantillon 13C (brut et corrigé des lipides, voir matériel supplémentaire 1 et 2), teneur en C total (mg), 15N, teneur en N total (mg), ratios CN, positions trophiques calculées (voir matériel supplémentaire 3) et facteur d'état du saumon (matériel supplémentaire 4), en plus des métadonnées associées à chaque échantillon (par exemple, coordonnées de la station océanographique et profondeur du fond où les spécimens ont été collectés, etc.).