cometadata/datacite-titles-descriptions-related-identifiers huggingface dataset:
DOI: 10.6073/pasta/9b1ff3dd2d358f125ed23a9a3a3236e3
title: Jornada Basin LTER: Wireless meteorological station at NPP C-SAND site: 1-second summary precipitation data: 2013 - ongoing

description: 1-second summary precipitation data at NPP C-SAND met station. Total precipitation per second is recorded only if there is measurable precipitation. This is recorded at an automated meteorological station installed at Jornada LTER NPP C-SAND site.. This climate station is operated by the Jornada LTER Program. This is an ONGOING dataset. IMPORTANT: Rainfall is only recorded when a bucket tip occurs on the tipping bucket rain gauge. If there is missing data due to equipment or other problems, there will be no indication of this within this dataset. The user needs to review precipitation values in the 30 minute or hourly summary datasets to determine if there are missing data in this 1 second detailed precipitation dataset. Reference the package i.d.'s knb-lter-jrn.210437018, knb-lter-jrn.210437033, and knb-lter-jrn.210437048 for the NPP C-SAND met station 30 minute, hourly, and daily summary datasets, respectively.
DOI: 10.6073/pasta/edf5a17ecabd18588ff5a3a00df05cf7
title: Jornada Basin LTER: Wireless meteorological station at NPP C-SAND site: 30-minute summary data: 2013 - ongoing

description: 30-minute summary data at NPP C-SAND met station. Average air temperature, relative humidity, wind speed, wind direction, and solar radiation are measured and calculated based on 1-second scan rate of all sensors located at an automated meteorological station installed at Jornada LTER NPP C-SAND site. Wind speed is measured at 75 cm, 150 cm, and 300 cm, wind direction at approximately 3m, and air temperature and relative humidity at approximate 2.5m. Solar radiation is measured at 3m. This climate station is operated by the Jornada LTER Program. This is an ONGOING dataset.
DOI: 10.6073/pasta/3ee5f331fa75c342ed8a4544ce784dd7
title: Jornada Basin LTER: Wireless meteorological station at NPP C-SAND site: Daily average soil volumetric water content data: 2013 - ongoing

description: Daily average of 30-minute Volumetric Water Content at NPP C-SAND met station. Collection of soil volumetric water content data at Jornada LTER NPP sites, New Mexico, supports the environmental monitoring objectives of the Jornada LTER monitoring program that look at plant-soil water dynamics. Volumetric water content, bulk electrical conductivity, soil temperature, and bulk dielectric permittivity are measured and calculated at an automated meteorological station installed at Jornada LTER NPP C-SAND site. The daily average at 3 soil depths is calculated from measurements made every 30 minutes at 10 cm, 20 cm, and 30 cm. This is an ONGOING dataset.
DOI: 10.6073/pasta/91050fdb26eea00515e0f4f828e27152
title: Jornada Basin LTER: Wireless meteorological station at NPP C-SAND site: 30-minute soil volumetric water content data: 2013 - ongoing

description: 30-minute Soil Moisture data at NPP C-SAND met station. Collection of soil volumetric water content data at Jornada LTER NPP sites, New Mexico, supports the environmental monitoring objectives of the Jornada LTER monitoring program that look at plant-soil water dynamics. Volumetric water content, bulk electrical conductivity, soil temperature, and bulk dielectric permittivity are measured every 30 minutes at an automated meteorological station installed at Jornada LTER NPP C-SAND site. Measurements are made every 30 minutes at 10 cm, 20 cm, and 30 cm soil depths. This is an ONGOING dataset.
DOI: 10.6073/pasta/a5cd1d1f3b633a8ad14ec0223fee1bb1
title: Jornada Basin LTER: Wireless meteorological station at NPP C-SAND site: 5-minute summary wind and air temperature data: 2013 - ongoing

description: 5-minute summary data at NPP C-SAND met station. Average air temperature, wind speed and wind direction are measured and calculated based on 1-second scan rate of all sensors located at an automated meteorological station installed at Jornada LTER NPP C-SAND site. Wind speed is measured at 75 cm, 150 cm, and 300 cm, wind direction at approximately 3m, and air temperature at approximate 2.5m. This climate station is operated by the Jornada LTER Program. This is an ONGOING dataset.
DOI: 10.6073/pasta/3396926b3ae08cb4d01c2616289ad762
title: Jornada Basin LTER: Wireless meteorological station at NPP G-BASN site: Daily summary data: 2013 - ongoing

description: Daily summary data at NPP G-BASN met station. Average/maximum/minimum air temperature; average/maximum relative humidity and wind speed and average wind direction. These are measured and calculated based on 1-second scan rate of all sensors located at an automated meteorological station installed at Jornada LTER NPP G-BASN site. Wind speed is measured at 75 cm, 150 cm, and 300 cm, wind direction at approximately 3m, and air temperature and relative humidity at approximate 2.5m. This climate station is operated by the Jornada LTER Program. This is an ONGOING dataset.
DOI: 10.6073/pasta/45f2b43123f0a47b45ff061f22646427
title: Jornada Basin LTER: Wireless meteorological station at NPP G-BASN site: 1-hour summary data: 2013 - ongoing

description: Hourly summary data at NPP G-BASN met station. Average/maximum/minimum air temperature; average relative humidity and wind direction; average/maximum wind speed. These are measured and calculated based on 1-second scan rate of all sensors located at an automated meteorological station installed at Jornada LTER NPP G-BASN site. Wind speed is measured at 75 cm, 150 cm, and 300 cm, wind direction at approximately 3m, and air temperature and relative humidity at approximate 2.5m. This climate station is operated by the Jornada LTER Program. This is an ONGOING dataset.
DOI: 10.6073/pasta/5ad15ed4c3dff22e857d8ebcc4b93631
title: Jornada Basin LTER: Wireless meteorological station at NPP G-BASN site: 30-minute summary data: 2013 - ongoing

description: 30-minute summary data at NPP G-BASN met station. Average air temperature, relative humidity, wind speed and wind direction are measured and calculated based on 1-second scan rate of all sensors located at an automated meteorological station installed at Jornada LTER NPP G-BASN site. Wind speed is measured at 75 cm, 150 cm, and 300 cm, wind direction at approximately 3m, and air temperature and relative humidity at approximate 2.5m. This climate station is operated by the Jornada LTER Program. This is an ONGOING dataset.
DOI: 10.6073/pasta/e153bd744d09e160a92c98feb16cf945
title: Jornada Basin LTER: Wireless meteorological station at NPP G-BASN site: 1-second summary precipitation data: 2013 - ongoing

description: 1-second summary precipitation data at NPP G-BASN met station. Total precipitation per second is recorded only if there is measurable precipitation. This is recorded at an automated meteorological station installed at Jornada LTER NPP G-BASN site.. This climate station is operated by the Jornada LTER Program. IMPORTANT: Rainfall is only recorded when a bucket tip occurs on the tipping bucket rain gauge. If there is missing data due to equipment or other problems, there will be no indication of this within this dataset. The user needs to review precipitation values in the 30 minute or hourly summary datasets to determine if there are missing data in this 1 second detailed precipitation dataset. Reference the package i.d.'s knb-lter-jrn.210437019, knb-lter-jrn.210437034, and knb-lter-jrn.210437049 for the NPP G-BASN met station 30 minute, hourly, and daily summary datasets, respectively. This is an ONGOING dataset.
DOI: 10.6073/pasta/4166561d804fb8ff74b0137e6ac03849
title: Jornada Basin LTER: Wireless meteorological station at NPP G-BASN site: 5-minute summary wind and air temperature data: 2013 - ongoing

description: 5-minute summary data at NPP G-BASN met station. Average air temperature, wind speed and wind direction are measured and calculated based on 1-second scan rate of all sensors located at an automated meteorological station installed at Jornada LTER NPP G-BASN site. Wind speed is measured at 75 cm, 150 cm, and 300 cm, wind direction at approximately 3m, and air temperature at approximate 2.5m. This climate station is operated by the Jornada LTER Program. This is an ONGOING dataset.
DOI: 10.6073/pasta/8049bb7f727cab84b4d1b4464a0227d4
title: Jornada Basin LTER: Wireless meteorological station at NPP G-IBPE site: 15-minute summary data: 2016 - ongoing

description: 15-minute summary data at NPP G-IBPE met station. Average/maximum/minimum air temperature; average relative humidity and wind direction; average/maximum wind speed; atmospheric pressure; PAR; solar radiation. These are measured and calculated based on 1-second scan rate of all sensors located at an automated meteorological station installed at Jornada LTER NPP G-IBPE site. Wind speed is measured at 75 cm, 150 cm, and 300 cm, wind direction at approximately 3m, and air temperature and relative humidity at approximate 2.5m. This climate station is operated by the Jornada LTER Program. This is an ONGOING dataset.
DOI: 10.6073/pasta/c67c4ae6670f7502c4b489955bf2926d
title: Jornada Basin LTER: Wireless meteorological station at NPP G-BASN site: 30-minute soil volumetric water content data: 2013 - ongoing

description: 30-minute Soil Moisture data at NPP G-BASN met station. Collection of soil volumetric water content data at Jornada LTER NPP sites, New Mexico, supports the environmental monitoring objectives of the Jornada LTER monitoring program that look at plant-soil water dynamics. Volumetric water content, bulk electrical conductivity, soil temperature, and bulk dielectric permittivity are measured every 30 minutes at an automated meteorological station installed at Jornada LTER NPP G-BASN site. Measurements are made every 30 minutes at 10 cm, 20 cm, and 30 cm soil depths. This is an ONGOING dataset.
DOI: 10.6073/pasta/db41b12ec61c008abb0791e5f58a0f0b
title: Jornada Basin LTER: Wireless meteorological station at NPP G-BASN site: Daily average soil volumetric water content data: 2013 - ongoing

description: Daily average of 30-minute Volumetric Water Content at NPP G-BASN met station. Collection of soil volumetric water content data at Jornada LTER NPP sites, New Mexico, supports the environmental monitoring objectives of the Jornada LTER monitoring program that look at plant-soil water dynamics. Volumetric water content, bulk electrical conductivity, soil temperature, and bulk dielectric permittivity are measured and calculated at an automated meteorological station installed at Jornada LTER NPP G-BASN site. The daily average at 3 soil depths is calculated from measurements made every 30 minutes at 10 cm, 20 cm, and 30 cm. This is an ONGOING dataset.
DOI: 10.14457/tu.the.2017.1744
title: ความชุกของภาวะแทรกซ้อนที่ตับประเมินด้วยวิธีแบบไม่รุกรานในผู้ติดเชื้อร่วมไวรัสตับอักเสบซีและเอชไอวีในสถาบันบำราศนราดูร

description: การติดเชื้อไวรัสตับอักเสบซีจัดเป็นปัญหาสุขภาพสำคัญทั่วโลก โดยเฉพาะในกลุ่มผู้ติดเชื้อเอชไอวี โดยเป็นปัจจัยเสี่ยงสำคัญของการเกิดโรคตับเรื้อรัง จึงควรมีการติดตามภาวะแทรกซ้อนที่ตับในผู้ป่วยกลุ่มนี้ อย่างไรก็ตาม ข้อมูลความชุกของโรคตับเรื้อรังและปัจจัยทางคลินิกที่มีความเกี่ยวข้อง โดยเฉพาะในกลุ่มผู้ป่วยชาวไทยข้อมูลยังคงมีน้อย ผู้วิจัยจึงศึกษาความชุกและปัจจัยเสี่ยงต่อการเกิดภาวะแทรกซ้อนที่ตับ ในผู้ป่วยเอชไอวีที่ติดเชื้อร่วมกับไวรัสตับอักเสบซี ที่เข้ารักษาในสถาบันบำราศนราดูร โดยประเมินความผิดปกติที่ตับด้วยวิธีแบบไม่รุกรานโดยใช้ตัวบ่งชี้คือ ภาวะค่าเอนไซม์ตับสูง และภาวะพังผืดที่ตับอย่างมีนัยสำคัญ ที่ประเมินจากค่า Fibrosis-4 score (FIB-4) และค่า aspartate aminotransferase to platelet ratio index (APRI) การศึกษาครั้งนี้เป็นการศึกษาแบบภาคตัดขวางในกลุ่มผู้ป่วยจำนวน 105 ราย ที่เก็บข้อมูลตั้งแต่เดือนพฤศจิกายน 2559 ถึงเดือนธันวาคม 2560 เป็นเพศชายถึงร้อยละ 90.5 มีค่ามัธยฐานอายุเท่ากับ 46 (27-67) ปี ส่วนใหญ่เป็นผู้ที่ได้รับยาต้านไวรัสเอชไอวีถึงร้อยละ 99 มีค่าเฉลี่ยของระดับเม็ดเลือดขาวลิมโฟไซต์ชนิดซีดีสี่ เท่ากับ 566 (±2.66) cells/ul ในการติดเชื้อไวรัสตับอักเสบซี พบสายพันธุ์ 1, 3 และ 6 คิดเป็นร้อย-ละ 38.1, 25.7 และ 5.7 ตามลำดับ โดยพบผู้ได้รับการรักษาด้วยยาต้านไวรัสตับอักเสบซีแล้วร้อยละ 43 ผู้ป่วยกลุ่มนี้มีอัตราการเกิดภาวะค่าเอนไซม์ตับสูงถึงร้อยละ 71.4 และพบภาวะพังผืดอย่างมีนัยสำคัญเมื่อประเมินโดยค่า FIB-4 ≥ 1.45 และค่า APRI ≥ 0.5 ถึงร้อยละ 53 และร้อยละ 64 ตามลำดับ ในการวิเคราะห์ความสัมพันธ์กับปัจจัยทางคลินิกโดยสถิติไคสแควร์ และสถิติถดถอยลอ- จิสติก พบว่าการไม่รักษาไวรัสตับอักเสบซี เป็นปัจจัยเสี่ยงสำคัญของการมีค่า APRI ≥ 0.5 (OR 5.4, 95% CI 1.7-16.3, p = 0.003) นอกจากนี้ ยังพบว่าช่วงอายุที่มากกว่า 50 ปี การมีระดับเม็ดเลือดขาวลิมโฟไซต์ชนิดซีดีสี่ &lt; 350 cells/ul และค่าไขมันในเลือด ชนิด Low-density lipoprotein ≤ 130 mg/dl ก็เป็นปัจจัยเสี่ยงของภาวะแทรกซ้อนที่ตับในผู้ป่วยกลุ่มนี้เช่นกัน ผลการศึกษาในครั้งนี้ จะเป็นข้อมูลพื้นฐานที่มีประโยชน์ต่อการดูแลรักษาผู้ป่วยกลุ่มนี้ต่อไป
DOI: 10.14457/tu.the.2017.1745
title: การเปรียบเทียบตัวชี้วัดทางชีวภาพของไตในกลุ่มคนอ้วนที่มีความผิดปกติของโรคไตระยะแรก

description: ภาวะอ้วน (Obesity) เป็นปัญหาสุขภาพที่มีอัตราเพิ่มขึ้นทุก ๆ ปี ในประชากรทั่วโลก จากการศึกษาที่ผ่านมาพบว่าภาวะอ้วนเป็นปัจจัยเสี่ยงที่สำคัญของการเกิดโรคไตเรื้อรัง ดังนั้นการตรวจคัดกรองและวินิจฉัยโรคไตตั้งแต่ระยะเริ่มแรก (Early Renal Dysfunction; ERD) เพื่อนำไปใช้ในการควบคุมปัจจัยเสี่ยง และดำเนินการดูแลรักษาตั้งแต่ระยะแรกจึงมีความสำคัญอย่างยิ่ง ในปัจจุบันมีการพัฒนาและทดสอบหาตัวชี้วัดทางชีวภาพ (Biomarkers) ต่างๆเพื่อประเมินความผิดปกติของไตในระยะเริ่มต้น เช่น Cystatin C, Kidney injury molecule-1 (KIM-1) และ Neutrophil gelatinase-associated lipocalin (NGAL) เป็นต้น แต่อย่างไรก็ตามการศึกษาตัวชี้วัดทางชีวภาพดังกล่าวส่วนใหญ่ทำการศึกษาในกลุ่มผู้ป่วยเบาหวานที่มีภาวะแทรกซ้อนที่ไต แต่ยังขาดข้อมูลในกลุ่มของผู้ป่วยที่มีภาวะอ้วน ซึ่งอาจมีปัญหาในเรื่องการทำงานของไตเช่นกัน การศึกษาครั้งนี้จึงมีวัตถุประสงค์เพื่อเปรียบเทียบระดับ Cystatin C, NGAL และ KIM-1 ในกลุ่มผู้ที่มีภาวะอ้วนที่มีความผิดปกติของโรคไตระยะแรก (ERD) กับผู้ที่มีการทำงานไตปกติ (Normal Kidney Function; NKF) และวิเคราะห์ความสัมพันธ์ระหว่าง parameter of obesity (Body Mass Index; BMI, Waist Circumference; WC และ Waist to hip ratio; WHR) กับ renal biomarkers (serum creatinine, cystatin C, eGFR (สูตร CKD-EPI), Urine Albumin/creatinine ratio (UACR), NGAL และ KIM-1) ในการบ่งชี้ความผิดปกติของไตระยะแรกในผู้ที่มีภาวะอ้วน โดยทำการศึกษาในอาสาสมัครเพศหญิงและเพศชายที่มีอายุระหว่าง 35-60 ปี จำนวน 180 ราย อาสาสมัครจะถูกแบ่งกลุ่มออกเป็น 6 กลุ่มย่อย ตามระดับ BMI (Normal weight; 18-22.9 kg/m2, Overweight; 23.0-24.9 kg/m2, Obesity; ≥ 25 kg/m2) และค่าประเมินการทำงานของไต (NKF; eGFR &gt; 90 หรือ UACR &lt; 30 mg/g, ERD; eGFR 30 – 89 หรือ UACR 30-300 mg/g) กลุ่มละ 30 ราย กลุ่ม NKF มีค่า eGFR เท่ากับ 105.02±8.34 และกลุ่ม ERD มีค่า eGFR เท่ากับ 79.90±10.76 เมื่อเปรียบเทียบประชากรตามกลุ่ม BMI ระหว่างกลุ่ม NKF กับกลุ่ม ERD พบว่าระดับ Creatinine และ Cystatin C ในกลุ่ม ERD มีระดับเพิ่มขึ้น และค่า eGFR ลดลงอย่างมีนัยสำคัญทางสถิติทั้ง 3 กลุ่มน้ำหนัก (p = &lt;0.001) ในขณะที่ระดับ KIM-1 ในปัสสาวะจะมีระดับลดลงอย่างมีนัยสำคัญทางสถิติเฉพาะในกลุ่ม Obesity Group เท่านั้น และไม่พบความแตกต่างอย่างมีนัยสำคัญของระดับ NGAL ในปัสสาวะของทุกกลุ่ม ผลจากการศึกษาพบว่าระดับ Cystatin C มีความสัมพันธ์เชิงบวกกับทั้ง BMI (r=0.211), WC (r=0.317) และ WHR (r=0.223) นอกจากนี้ยังพบว่า Cystatin C มีความสัมพันธ์ค่อนข้างสูงกับค่า eGFR (r=-0.612) ดังนั้นในผู้ที่มีภาวะอ้วนจะมีระดับการทำงานของไตที่ลดลง โดยระดับ Cystatin C ในเลือดมีประโยชน์และมีความไวในการเป็นตัวบ่งชี้โรคไตในระยะเริ่มแรก สามารถใช้ในการติดตามการทำงานของไตโดยเฉพาะในคนอ้วน เพื่อที่จะทำให้สามารถคัดกรองผู้ป่วยโรคไต นำไปใช้ในการควบคุมปัจจัยเสี่ยง และเริ่มต้นการดูแลรักษาฟื้นฟูการทำงานของไตได้ตั้งแต่ในระยะแรก
DOI: 10.14457/tu.the.2018.1649
title: ความสัมพันธ์ระหว่างค่าน้ำตาลในพลาสมาหลังงดอาหาร ค่าน้ำตาลสะสมในเลือดและค่าประมาณการน้ำตาลในเลือดในผู้ป่วยเบาหวานที่มีฮีโมโกลบินผิดปกติของโรงพยาบาลสิรินธร

description: ค่าน้ำตาลในพลาสมาหลังงดอาหาร (FPG) ค่าน้ำตาลสะสมในเลือด (HbA1c) เป็นการทดสอบเพื่อการวินิจฉัยและติดตามผลการควบคุมน้ำตาลในเลือดของผู้ป่วยเบาหวาน ค่า HbA1c สามารถนำมาคำนวณหาค่าประมาณการน้ำตาลในเลือด (eAG) เพื่อประเมินผลการควบคุมระดับน้ำตาลในเลือดในช่วง 2-3 เดือนก่อนหน้านี้ของผู้ป่วย อย่างไรก็ตามการวิเคราะห์ HbA1c ยังมีความคลาดเคลื่อนจากผลกระทบจากฮีโมโกลบินผิดปกติและธาลัสซีเมียได้ งานวิจัยครั้งนี้มีวัตถุประสงค์เพื่อศึกษาความสัมพันธ์ระหว่างค่า FPG, HbA1c และ eAG ในเลือด และศึกษาผลกระทบของฮีโมโกลบินผิดปกติต่อการตรวจวัดค่า HbA1c จากหลักการ Ion Exchange HPLC และTurbidimetric Inhibition Immunoassay (Immunoassay) โดยตัวอย่างทั้งหมด จำนวน 453 คน แบ่งออกเป็น 4 กลุ่ม ได้แก่ ผู้ป่วยเบาหวานที่มีฮีโมโกลบินผิดปกติ จำนวน 117 คน ผู้ป่วยเบาหวานที่มีฮีโมโกลบินปกติจำนวน 96 คน ผู้ที่ไม่ได้เป็นเบาหวานที่มีฮีโมโกลบินผิดปกติจำนวน 120 คน และผู้ที่ไม่ได้เป็นเบาหวานที่มีฮีโมโกลบินปกติจำนวน 120 คน ผลการศึกษาพบว่า FPG และ HbA1c รวมทั้ง eAG มีความสัมพันธ์กันในระดับสูงในกลุ่มผู้ป่วยเบาหวานที่มีฮีโมโกลบินผิดปกติ ทั้งหลักการ Ion Exchange HPLC และ Immunoassay (r=0.627, r=0.653)อย่างมีนัยสำคัญ(p&lt;0.001) ส่วนในกลุ่มผู้ป่วยเบาหวานที่มีฮีโมโกลบินปกติพบว่ามีความสัมพันธ์ระดับสูงกับหลักการ Ion Exchang HPLC (r=0.520, p&lt;0.001) และระดับปานกลางกับหลักการ Immunoassay (0.477, p&lt;0.001) อย่างมีนัยสำคัญ กลุ่มผู้ที่ไม่ได้เป็นเบาหวานที่มีฮีโมโกลบินผิดปกติพบความสัมพันธ์อยู่ในระดับต่ำ (r=0.260, r=0.132, p=0.004, 0.151) และกลุ่มผู้ที่ไม่ได้เป็นเบาหวานที่มีฮีโมโกลบินปกติพบความสัมพันธ์อยู่ในระดับต่ำเช่นเดียวกัน (r=0.231, r=0.169, p=0.017, 0.065) การพบความสัมพันธ์กันในระดับสูงในกลุ่มผู้ป่วยเบาหวานแสดงว่าสามารถนำผล FPG และ HbA1c มาใช้ประกอบกันในการวินิจฉัยและติดตามผลการรักษาในผู้ป่วยเบาหวานได้ ส่วนค่า eAG ที่คำนวณจาก HbA1c พบว่ามีค่าเฉลี่ยสูงกว่า FPG อย่างมีนัยสำคัญทุกกลุ่มตัวอย่าง (p&lt;0.05) แสดงถึงการชี้แนะผู้ป่วยเบาหวานในการควบคุมเบาหวานยังไม่ดีเท่าที่ควร นอกจากนี้ยังพบว่า HbE มีผลกระทบต่อการตรวจ HbA1c โดยหลักการ Ion Exchange HPLC ทำให้ผลตรวจยังมีข้อจำกัดที่จะนำมาใช้ในกรณีผู้ป่วยเบาหวานที่มีฮีโมโกลบินผิดปกติโดยเฉพาะ HbE
DOI: 10.14457/tu.the.2018.1650
title: การพัฒนาวิธี Real-time PCR ในการตรวจหาจีโนไทป์ และการกลายพันธุ์ตำแหน่ง A1762T/G1764A ของเชื้อไวรัสตับอักเสบบี

description: การติดเชื้อไวรัสตับอักเสบบีแบบเรื้อรังเป็นปัญหาทางสาธารณสุขที่สำคัญของโลกรวมถึงประเทศไทย ผู้ป่วยที่พบการติดเชื้อแบบเรื้อรังอาจมีการดำเนินโรคที่รุนแรงสามารถพัฒนาไปเป็นมะเร็งตับและทำให้ผู้ป่วยเสียชีวิตได้ จีโนไทป์และการกลายพันธุ์ของตัวเชื้อไวรัสโดยเฉพาะบริเวณยีนส์ Basal core promoter (BCP) มีความสัมพันธ์กับการดำเนินโรคของผู้ป่วยที่ติดเชื้อแบบเรื้อรัง การตรวจวินิจฉัยจีโนไทป์และการกลายพันธุ์ของเชื้อจึงเป็นสิ่งสำคัญ ซึ่งแต่ละเทคนิคทางอณูชีววิทยาที่ใช้ตรวจพบว่ามีความไวและความจำเพาะแตกต่างกันไป โดยชุดตรวจสำเร็จรูปที่มีใช้ในประเทศไทยปัจจุบันนั้นมีราคาสูง ทำให้ผู้ป่วยในประเทศไทยขาดโอกาสเข้ารับการตรวจประเมินจีโนไทป์และการกลายพันธุ์ การศึกษานี้จึงมีวัตถุประสงค์เพื่อพัฒนาวิธีการตรวจวินิจฉัยจีโนไทป์ B และ C และตรวจวินิจฉัยการกลายพันธุ์บริเวณ BCP ตำแหน่ง A1762T/G1764A ของไวรัสตับอักเสบบีด้วยเทคนิค real-time PCR ร่วมกับ melting curve analysis โดยใช้สาร SYBR green I เป็นตัวติดตาม และเปรียบเทียบประสิทธิภาพการตรวจวินิจฉัยจีโนไทป์ กับวิธี multiplex PCR และตรวจวินิจฉัยการกลายพันธุ์ชนิด A1762T/G1764A กับวิธี PCR ร่วมกับ restriction analysis ซึ่งทั้งสองวิธีเป็นเทคนิคดั้งเดิม โดยใช้ DNA จากพลาสมาของผู้ป่วยที่ติดเชื้อไวรัสตับอักเสบบีแบบเรื้อรังจำนวน 30 ตัวอย่าง จากการศึกษาการตรวจวินิจฉัยจีโนไทป์ของตัวเชื้อไวรัสด้วยเทคนิค real-time PCR ร่วมกับ melting curve analysis พบค่า Tm เฉลี่ย ± ความแปรปรวน ของจีโนไทป์ B และ C เท่ากับ 78.38 ± 0.21 °C และ 77.37 ± 0.49 °C ตามลำดับ ส่วนการตรวจวินิจฉัยการกลายพันธุ์พบ ค่า Tm เฉลี่ย ± ความแปรปรวน ของการกลายพันธุ์ A1762T/G1764A และ wild type เท่ากับ 77.19 ± 0.32 °C และ 80.70 ± 0.37 °C ตามลำดับ โดยการตรวจจีโนไทป์มีค่าความถูกต้องเท่ากับ 96.67% และ การตรวจการกลายพันธุ์มีค่าความถูกต้องเท่ากับ 86.67% จากการวิเคราะห์ทางสถิติพบว่าเทคนิค real-time PCR ในการตรวจจีโนไทป์และการกลายพันธุ์ ให้ผลการทดสอบไม่แตกต่างกับวิธีดั้งเดิม (p &gt; 0.05) ที่ความเชื่อมั่น 95% ผลการวิจัยสรุปได้ว่า เทคนิค real-time PCR ร่วมกับ melting curve analysis เป็นเทคนิคที่มีความไวและความความถูกต้องสูงในการตรวจหาจีโนไทป์และการกลายพันธุ์ A1762T/G1764A อีกทั้งต้นทุนในการตรวจวิเคราะห์ที่ราคาถูก มีความเหมาะสมที่จะนำมาตรวจไวรัสตับอักเสบบีในประเทศไทย อย่างไรก็ตามก่อนนำมาตรวจทางคลินิกควรเพิ่มตัวอย่างเพื่อตรวจสอบกับตัวอย่างที่หลากหลายให้มากขึ้น
DOI: 10.14457/tu.the.2018.1651
title: การวิเคราะห์รูปแบบเปปไทด์ของเชื้อ Escherichia coli ในการตอบสนองต่อโลหะหนัก โดยใช้เทคนิค matrix-assisted laser desorption ionization–time of flight (MALDI-TOF) mass spectrometry

description: Matrix-assisted laser desorption/ionization time-of-flight mass-spectrometry (MALDI-TOF/MS) based biotyping เป็นเทคโนโลยีแบบ High throughput technology สำหรับใช้ในการวิเคราะห์เชื้อแบคทีเรีย ได้เริ่มมีการนำเทคนิคนี้มาแทนเทคนิคเดิมที่ใช้ในการวินิจฉัยทางคลินิก ในหลายๆโรงพยาบาลในประเทศไทย การปนเปื้อนของอาหารโดยโลหะหนักหลายชนิดเป็นสถานการณ์ที่หลีกเลี่ยงไม่ได้ในประเทศไทย อย่างไรก็ตามยังไม่มีการรายงานผลกระทบของโลหะหนักต่อการแสดงออกของรูปแบบเปปไทด์โดยการใช้เทคนิค MALDI-TOF/MS (Bruker MALDI Biotyper) ดังนั้นเราจึงศึกษารูปแบบของเปปไทด์ของเชื้อ Escherichia coli ATCC 25922 กับเชื้อสายพันธุ์ก่อโรค เลี้ยงภายใต้โลหะแคดเมียม ตะกั่ว และสังกะสี โดยใช้เทคนิค MALDI-TOF/MS เชื้อ E. coli สัมผัสกับโลหะ แคดเมียม ตะกั่ว และสังกะสี ในปริมาณสารที่ปลอดภัยตามคำแนะนำของ WHO และภายใต้ความสามารถในการทนต่อโลหะหนัก จากการเปรียบเทียบวิธีสกัดโปรตีนที่ใช้ในการทดลอง พบว่าวิธีการสกัดโปรตีนที่เหมาะสมในการทดลองนี้คือ Extraction (Ext) Procedure เนื่องจากให้ spectra peak ที่มากที่สุด และมี peak ที่จำเพาะกับวิธีนี้โดยไม่พบในการสกัดโปรตีนด้วยวิธีอื่นมากที่สุด และวิธีนี้ยังสามารถระบุชนิดของเชื้อเป็น E. coli ATCC 25922 โดยยังให้ค่า score ที่น่าเชื่อถือ ผลการทดลองแสดงให้เห็นผลกระทบของโลหะหนักต่อรูปแบบเปปไทด์ ของการวิเคราะห์เชื้อแบคทีเรียโดยเทคนิค MALDI-TOF MS แต่ไม่ส่งผลต่อการระบุ genus species strain ของเชื้อ จากการวิเคราะห์ด้วย PCA และ cluster analysis จะพบว่าสามารถแยกเชื้อที่ได้รับผลของโลหะกับตัวควบคุมออกจากกันได้ และยังพบว่า รูปแบบการแสดงออกของ spectra peaks ขึ้นอยู่กับ strain ของเชื้อ ความเข้มข้นของโลหะ และ ชนิดของโลหะ นอกจากนี้จากผลการทดลองยังพบ spectra peaks ที่ 3673 และ 7872 (m/z) ที่พบเฉพาะในเชื้อที่ได้รับตะกั่วและแคดเมียมที่ความเข้มข้น heavy metals tolerance value/2 ของเชื้อ E. coli ATCC 25922 strain ตามลำดับ ในขณะที่ spectra peaks ที่ 4867 และ 15833 (m/z) ที่พบในเชื้อ E. coli o157:H7 ที่ได้รับสังกะสีที่ความเข้มข้น safety dose และ heavy metals tolerance value/2 ตามลำดับ ในที่นี้ข้อมูลแสดงให้เห็นถึงผลกระทบของโลหะหนักต่อรูปแบบ spectra peaks ของแบคทีเรียที่ของการวิเคราะห์ด้วยเทคนิค MALDI-TOF/MS ความรู้จากการศึกษาครั้งนี้สามารถบรรจุในฐานข้อมูลภายในองค์กรซึ่งจะช่วยให้ผู้ที่ใช้เครื่อง MALDI-TOF/MS ได้ค่า score value ที่ดีกว่าในการวิเคราะห์เชื้อ โดยเฉพาะอย่างยิ่งในการวิเคราะห์ตัวอย่างที่ได้มาจากพื้นที่ที่คาดว่ามีการปนเปื้อนโลหะหนัก
DOI: 10.14457/tu.the.2018.1652
title: การพัฒนาชุดน้ำยาตรวจจีโนไทป์ของหมู่เลือดระบบ Diego ด้วยวิธีพีซีอาร์

description: การศึกษานี้มีวัตถุประสงค์ในการพัฒนาชุดน้ำยาตรวจหาจีโนไทป์ของ DI*A และ DI*B อัลลีล ในผู้บริจาคเลือดคนไทย ด้วยวีธี polymerase chain reaction with sequence specific primer (PCR-SSP) และรายงานความถี่ของ DI*A และ DI*B อัลลีล โดยทำการวิจัยในตัวอย่างเลือดของผู้บริจาคเลือดคนไทย จากศูนย์บริการโลหิตแห่งชาติ สภากาชาดไทย รวมตัวอย่างทั้งหมดจำนวน 1,011 ราย มีเพียง 391 ตัวอย่างเท่านั้น ที่ถูกทดสอบด้วย anti-Dia ด้วยวิธี indirect antiglobulin test (IAT) ตัวอย่างทั้งหมดจะนำมาทดสอบด้วยวิธีพีซีอาร์ เอสเอสพี ที่พัฒนาขื้น เพื่อจีโนไทป์หา DI*A และ DI*B อัลลีล ผลการศึกษาพบว่าผลการตรวจ DI ฟีโนไทป์และจีโนไทป์ ให้ผลสอดคล้องกันทุกราย จากผลการศึกษาเพื่อตรวจหาอัลลีล DI*A และ DI*B ด้วยวิธีพีซีอาร์ เอสเอสพี พบ homozygous DI*B/DI*B มากที่สุด 974 ราย (96.34%) และ heterozygous DI*A/DI*B พบรองลงมาจำนวน 37 ราย (3.66%) สำหรับ DI*A/DI*A ไม่พบในการศึกษาครั้งนี้ แล้วจึงนำมาคำนวณหาความถี่ของอัลลีล DI*A และ DI*B ในผู้บริจาคเลือดคนไทย คือ 0.018 (37/2,022) และ 0.982 (1,985/2,022) ตามลำดับ จากผลการตรวจด้วยวิธีพีซีอาร์ เอสเอสพี ทำนายได้เป็นฟีโนไทป์ Di(a+) เท่ากับ 3.66% ซึ่งให้ความชุกสูงกว่าเมื่อนำมาเปรียบเทียบกับงานวิจัยก่อนหน้านี้ในผู้บริจาคเลือดคนไทย การศึกษาครั้งนี้ยืนยันความชุกของอัลลีล DI*A และ DI*B ในประชากรภาคกลางของไทย ว่ามีความคล้ายคลึงกับประชากรใน Southeast Asia แต่มีความแตกต่างจากประชากรอื่นๆของโลก และวิธีพีซีอาร์ เอสเอสพี ที่ผู้วิจัยพัฒนาขึ้นเพื่อตรวจหา DI จีโนไทป์ให้ผลที่ถูกต้องและมี ประสิทธิภาพมากกว่าเมื่อเปรียบเทียบกับวิธีทางซีโรโลยีที่ยังมีข้อจำกัดหลายด้าน และสามารถนำมาใช้เป็นเครื่องมือในการศึกษาพันธุศาสตร์ในประชากรได้