cometadata/datacite-titles-descriptions-related-identifiers huggingface dataset:
DOI: 10.15472/0skaoj
title: Interacciones coral-césped, estructura de tallas de corales masivos y diversidad funcional de herbívoros como indicadores de estado de los arrecifes del complejo Islas Cayos de Bolívar, Reserva de Biosfera Seaflower

description: Se evaluó el estado del complejo arrecifal de Islas Cayos de Bolívar, Reserva de la Biosfera Seaflower. Para esto, se tomaron fotografías del sustrato, se seleccionaron entre 1 y 2 colonias de corales masivos morfológicamente contrastantes según su tipo de organización colonial (meandroide, plocoide y cerioide), que tuvieran bordes de interacción activa con céspedes algales y sobre estas interacciones, se estimó la diversidad y la redundancia funcional de herbívoros y macroalgas, se realizaron censos visuales de peces y macroinvertebrados en 3 puntos del arrecife utilizando el método de tipo estacionario y se realizaron anotaciones sobre la riqueza de especies/géneros, abundancia, tamaño y estadio de vida de los peces herbívoros pertenecientes a las familias Acanthuridae, Labridae-Scarinae, Ephippidae y Kyphosidae. Para el caso de los macroinvertebrados móviles, se buscaron ejemplares de Echinoideos y del crustáceo Maguimithrax sp.
description: Se identificó la presencia de 39 especies de corales pétreos y 4 especies de hidrocorales. Las especies que se encontraron en más del 50 % de las estaciones fueron: Agaricia agaricites, Favia fragum, Madracis decactis, Montastraea cavernosa, Orbicella annularis, Orbicella faveolata, Porites astraeoides, Porites porites, Pseudodiploria strigosa, Siderastrea siderea y Millepora alcicornis. Se encontraron 100 colonias afectadas por 9 signos asociados con enfermedades coralinas. Estos signos afectaron a 11 especies de corales pétreos y una especie de coral blando. Las especies que registraron mayor número de casos fueron O. annularis (31 %), S. siderea (21 %) y P. strigosa (19 %). Los herbívoros estuvieron representados por 16 especies de peces, pertenecientes a 3 familias (Acanthuridae = 3; Labridae = 9 y Kyphosidae = 4); 4 especies de erizos (Diadema antillarum, Echinometra lucunter, Echinometra viridis, Eucidaris tribuloides y Tripneustes ventricosus) y 2 especies de crustáceos (Percnon gibbesi y Maguimithrax spinosissimus).
DOI: 10.15472/awgfxy
title: Fauna críptica del Bajo de las Ánimas, Caribe colombiano

description: Al adelantar la valoración de la biodiversidad de grupos importantes como peces, algas, esponjas entre otros, se evidenció la necesidad de implementar alguna metodología que permita conocer la fauna críptica, sumado a que la zona por la poca visibilidad entre diciembre y abril durante la época de vientos fuertes es de difícil acceso para un monitoreo continuo. Por lo tanto, conociendo sobre los alcances de los ARMS, se realizó el montaje de cuatro estructuras que fueron retiradas a los 8, 10, 12 y 18 meses.
description: En dichas estructuras se encontró una gran riqueza de organismos y un potencial enorme de información que fue cuantificada y analizada. Por lo anterior, se identificó y evaluó el material biológico que fue colectado en esas estructuras, para dar un aporte de información muy importante que promueve la investigación de especies clave dentro de la fauna críptica de la zona arrecifal de áreas de difícil acceso como es el Banco de las Ánimas, que permitan establecer planes de monitoreo. Estos resultados pueden ser considerados como datos preliminares de los modelos a escala regional de la diversidad de la fauna críptica y mostrar el potencial del método para entender la biodiversidad de los organismos, además puede proveer una indicación cuantitativa de la importancia relativa de las principales taxa de la criptofauna del Banco de las Ánimas y su potencial implicación para la trofodinámica de los sistemas arrecifales.
DOI: 10.15472/fqcpai
title: Sistema de Monitoreo de Arrecifes Coralinos - SIMAC: Abundancia de Gorgonáceos

description: Los datos se derivan de la línea de investigación del SIMAC: Sistema de monitoreo para los ambientes arrecifales en Colombia y evaluación de agentes de mortalidad coralina; dentro del programa de Biodiversidad y Ecosistemas Marinos. El proyecto busca generar información sobre la salud y la dinámica de los arrecifes coralinos en Colombia, mediante la evaluación de su estado, para contribuir a su entendimiento y a su conservación, así como al uso sostenible de sus recursos. En este conjunto de datos se reporta la abundancia de gorgonáceos erectos documentados en estaciones de monitoreo del SIMAC, ubicadas en el Mar Caribe colombiano, que corresponden a un total de 3.291 registros biológicos obtenidos entre 1994 y 2018. Los datos colectados de 1994 a 1998 se tomaron en el marco del programa internacional CARICOMP, en donde se realizó monitoreo de corales, únicamente en las estaciones de Bahía de Chengue en Santa Marta. Posteriormente, estos monitoreos se unieron a los datos obtenidos por el SIMAC a partir de 1998.
DOI: 10.25607/tzzetb
title: Coastal fish diversity of the Socotra Archipelago, Yemen: Fishes Checklist

description: The Socotra Archipelago, located in the eastern Gulf of Aden, has a unique marine environment which combines tropical and ?pseudo-temperate? elements. Studies on the fish biogeography of the archipelago, partially framed in regional studies, have substantially outpaced critical elementary research on the archipelago?s fish diversity. The present study seeks to close this gap and identifies the Socotra Archipelago as a major hotspot of coastal fish diversity in the Indian Ocean. The archipelago supports unique coastal fish assemblages which are predominantly composed of coral-associated (?reef?) species, in spite of the limited biogenic reef frameworks. A Preliminary Checklist comprises 682 species with confirmed records and a ?Working List? includes an additional 51 records, totalling 733 faunal records in 108 families.
DOI: 10.25607/veprj7
title: BIOGEOMAR | Marine Invertebrates | Bryozoa

description: BIOGEOMAR | Dataset | Mollusca | Aplacophora The BioGeoMar Program was created in 2019 with the support of the Boticário Group Foundation for Nature Protection in order to analyze the state of knowledge of marine biodiversity in Brazil, describe how biodiversity is distributed along the coast, and point out priority areas for conservation and carry out future studies. The program gathered 18 researchers, 9 postgrads, and 6 research assistants, from different expertise representing 12 public universities in Brazil, working in a collaborative network. Global platforms are being used that obtain information on the geographic distribution of the species and unprecedented data for science from the zoological and botanical collections of the researchers' laboratories are being accessed. All the data will be publicly available in national and international digital repositories. BioGeoMar is also promoting continuous training and contributing to the UN Ocean Decade. University Consortium: Universidade Federal do Rio de Janeiro, Universidade Federal de Minas Gerais, Universidade Federal do Paraná, Museu Nacional/UFRJ, Universidade Estadual de Londrina, Universidade Federal de Alagoas, Universidade Federal Fluminense, Universidade Estadual Paulista, Universidade Federal do Estado do Rio de Janeiro, Universidade Federal de Santa Catarina, Universidade de São Paulo. Coordinator: Dr. Fernanda Correia Azevedo
DOI: 10.26071/ogsl-f10f496a-acf4
title: Baie de Mille-Vaches marsh - Characterization of important coastal habitats on the north shore of the St.Lawrence maritime Estuary
title: Le marais de la baie de Mille-Vaches - Caractérisation des habitats littoraux d’importance de la rive nord de l’estuaire maritime du Saint-Laurent

description: A project to characterize important coastal habitats on the north shore of the St. Lawrence Estuary was funded for a period of 4 years (2018-2022). The purpose of this project is to generate reference ecological data to draw a global portrait of the state of coastal marshes in the upper north shore sector of Quebec. This dataset covers the area of the Baie de Mille-Vaches marsh, also known as Pointe à Boisvert (Municipality of Longue-Rive). In order to improve knowledge of this ecosystem, flora and fauna (ichthyological and benthic) inventories have been carried out and the various abiotic factors characterized. Geomorphological data was also collected, but is not included in this dataset. However, they remain available, contact the ZIP Committee of the North Shore of the Estuary (RNE) directly to access them. The ZIP RNE Committee also holds orthomosaics of the marsh. It is possible to consult the five other marsh datasets that were characterized as part of the project to characterize important coastlines: The Pointe-aux-Outardes Marsh, Portneuf-sur-Mer Marsh, Pointe des Fortin Marsh, Bays des Grandes and Petites Bergeronnes, Hickey Marsh. This project is part of the Coastal Environmental Baseline Program Initiative under the Oceans Protection Plan of Fisheries and Oceans Canada.
description: Un projet de caractérisation des habitats littoraux d’importance de la rive nord de l’estuaire maritime du Saint-Laurent a été subventionné pour une période de 4 ans (2018-2022). Ce projet a pour but de générer des données écologiques de référence pour tracer un portrait global de l’état des marais littoraux dans le secteur de la haute côte-nord du Québec. Ce jeu de données couvre le secteur du marais de la baie de Mille-Vaches, également connu sous le nom de la pointe à Boisvert (Municipalité Longue-Rive). Afin d’améliorer les connaissances de cet écosystème, des inventaires floristiques et fauniques (ichtyologiques et benthiques) ont été réalisés et les différents facteurs abiotiques caractérisés. Des données géomorphologiques ont aussi été collectés, mais elles ne sont pas incluses dans ce jeu de données. Elles restent toutefois disponibles, contactez directement le Comité ZIP de la Rive Nord de l’Estuaire (RNE) pour y avoir accès. Le Comité ZIP RNE détient aussi des orthomosaïques du marais. Il est possible de consulter les cinq autres jeux de données de marais qui ont été caractérisés dans le cadre du projet de caractérisation des littoraux d'importance : Le marais de la Pointe-aux-Outardes, le marais de Portneuf-sur-Mer, le marais de la pointe des Fortin, le marais des baies des Grandes et des Petites Bergeronnes, le marais à Hickey. Ce projet fait partie du Programme sur les données environnementales côtières de référence de Pêches et Océan Canada.
DOI: 10.14284/154
title: Study of epifauna and meiobenthos using field exclusion experiments in a Ceriops tagal and Avicennia marina mangrove at Gazi Bay (Kenya) in August and September 1992
DOI: 10.14284/434
title: 2015_PHD_VERHELST_EEL - Acoustic telemetry data for European eel (Anguilla anguilla) in the Scheldt estuary and southern North Sea (Belgium)

description: This is an acoustic telemetry dataset published by Ghent University. It contains animal (fish) tracking data collected by the Permanent Belgian Acoustic Receiver Network (https://lifewatch.be/en/fish-acoustic-receiver-network) for the project/study 2015_phd_verhelst_eel, using VEMCO tags (V13) and receivers (VR2AR, VR2Tx, VR2W). In total 136 female individuals of European eel (Anguilla anguilla) were captured, tagged and released between 2015 and 2018 in the Scheldt estuary, to study their migration behaviour - especially their use of selective tidal stream transport - in a tidal system without migration barriers.
description: Large estuaries with a complete salinity gradient from a tidal freshwater zone to marine have become rare due to water regulating constructions such as sluices, shipping locks, water pumping stations and dams. However, the Scheldt estuary in Belgium still has an extensive estuary of ca 160 km. Diadromous fish have to overcome substantial distances which come with a high energetic cost. Due to the high energetic cost of migration and the low adult survival, some of these species have developed semelparity. Consequently, a bioenergetic trade-off between migration and reproduction may exist for semelparous fish species, especially since many will stop feeding during migration: the smaller the energy expenditure during migration, the larger the amount of energy that may remain available for gonad maturation. An example where migration can have important bioenergetic repercussions is migration through strong tidal systems. To reduce energy loss in such systems, fish may perform selective tidal stream transport (STST): an animal ascends into the water column with the appropriate tide and rests on or in the bottom during the opposite tide. However, the use of STST by silver European eels is still controversial. In this study, we found strong evidence that silver European eels apply STST. The results illustrate that eels can distinguish between ebb and flood and suggest that tides play a role in orientation, either directly or indirectly. The general migration speed was higher in the downstream part of the estuary compared to the upstream part, while tidal migration speed was equal in both parts, indicating that eels migrated more consistently in the downstream part. The results of this study give insight in how a diadromous species migrates through an estuary and underline the importance of the tides. This dataset was collected using infrastructure provided by VLIZ and INBO funded by the Research Foundation - Flanders (FWO) as part of the Belgian contribution to LifeWatch. Data were exported from the European Tracking Network data portal (http://www.lifewatch.be/etn) developed by VLIZ using the ETN R package (https://inbo.github.io/etn/) developed by INBO. Field definitions can be found at https://inbo.github.io/etn/articles/etn_fields.html.
DOI: 10.15472/jlg8ij
title: Composición de pesca de prospección para grandes pelágicos del Caribe colombiano, recolectados en el marco del Programa de Investigación Pesquera en Aguas Marinas Jurisdiccionales de Colombia INVEMAR – AUNAP (2013-2018)

description: El conjunto de datos recopila información pesquera de ocho proyectos realizados en el Caribe Colombiano, en el Archipiélago de San Andrés, Providencia y Santa Catalina, tanto en ambientes someros como en profundos, que aporte a la gestión integrada de la región y a la planificación de sistemas naturales marino-costeros de gran valor en biodiversidad, en diferentes épocas (seca y lluvia) y de transición sobre el Mar Caribe, con el fin de crear una base ambiental preliminar del conocimiento físico, biológico y de recursos pesqueros de los sistemas marinos presentes en el bloque con miras a su conservación y manejo frente al sector de hidrocarburos del país. Los proyectos fueron liderados por el INVEMAR con apoyo de la Autoridad Nacional de Acuicultura y Pesca (AUNAP), la Agencia Nacional de Hidrocarburos (ANH) y la Corporación para el Desarrollo Sostenible del Archipiélago de San Andrés, Providencia y Santa Catalina (Coralina).
description: El conjunto de datos se compone de 1.374 registros biológicos, representado en 1 filos, 2 clase, 7 órdenes, 12 familias, 19 géneros y 22 especies.
DOI: 10.15472/na9fdj
title: Sistema de Monitoreo de Arrecifes Coralinos - SIMAC: Estructura Coralina

description: Los datos se derivan de la línea de investigación del SIMAC: Sistema de monitoreo para los ambientes arrecifales en Colombia y evaluación de agentes de mortalidad coralina; dentro del programa de Biodiversidad y Ecosistemas Marinos. El proyecto busca generar información sobre la salud y la dinámica de los arrecifes coralinos en Colombia, mediante la evaluación de su estado, para contribuir a su entendimiento y a su conservación, así como al uso sostenible de sus recursos.
En este conjunto de datos se reporta la información sobre la estructura coralina en estaciones de monitoreo del SIMAC, ubicadas en el Mar Caribe y Océano Pacífico colombiano, que corresponden a un total de 113.004 registros biológicos obtenidos entre 1994 y 2018.
Los datos colectados de 1994 a 1998 se tomaron en el marco del programa internacional
CARICOMP, en donde se realizó monitoreo de corales, únicamente en las estaciones de Bahía de Chengue en Santa Marta. Posteriormente, estos monitoreos se unieron a los datos obtenidos por el SIMAC a partir de 1998.
DOI: 10.17031/1837
title: 2017 Eastern Inshore Fisheries and Conservation Authority (EIFCA) The Wash (Box A and G) Ground Truthing Survey
DOI: 10.25607/0nciew
title: UNESCO eDNA expedition in Shark Bay, Western Australia (Australia): October 2022

description: This dataset contains the eDNA data collected as a part of the UNESCO eDNA expeditions in Marine World Heritage Sites project in 2022-2024. The project was coordinated in collaboration with the Ocean Biodiversity Information System (OBIS) of IOC-UNESCO and the marine programme of the UNESCO World Heritage Center, and funded by the government of Flanders (Kingdom of Belgium). The samples were collected with citizen science eDNA sampling kits, containing a syringe and a filter, and preserved with Longmire's buffer, before sequencing at a central laboratory. Five different biomarkers were analysed, including 12SMifish, Mimammal, Teleo, 16S-Vert and COI markers. The sequences were analysed with the PacMAN pipeline and quality controlled including a validation check by local scientists and site managers as well as compared to existing knowledge on species distributions in OBIS and GBIF. The full sampling protocols and materials are available on the project website (https://www.unesco.org/en/edna-training-materials?hub=66910), and the bioinformatics pipeline is on github (https://github.com/iobis/PacMAN-pipeline). The data can also be explored on the eDNA expeditions dashboard (https://dashboard.ednaexpeditions.org/).
DOI: 10.15472/gqcscx
title: Anélidos de las Colecciones Biológicas de la Universidad del Magdalena

description: El presente conjunto de datos contiene la colección de anélidos del Centro de Colecciones Biológicas - CBUMAG, adscrito al Centro de Colecciones Científicas de la Universidad del Magdalena (CCC). El recurso cuenta actualmente con 1110 registros biológicos de especímenes que fueron recolectados en distintos puntos del Caribe colombiano tanto en áreas costeras como profundas. El 59% de estos corresponden a lotes depositados por entidades externas en el CBUMAG y el restante 41% fueron obtenidos mediante diferentes proyectos producto de las actividades académicas desarrolladas por la Universidad.
description: La colección fue documentada, digitalizada y publicada por primera vez durante la ejecución del proyecto BID-CA2020-055-NAC "Incremento de la accesibilidad de información marina de las Colecciones de Historia Natural de Colombia, mediante la movilización de datos, el fortalecimiento de la infraestructura y el entrenamiento". El presente conjunto de datos es el producto de dicho proceso realizado entre 2021-07-01 y 2023-06-30, como parte del entregable “Colección de biología marina del Centro de Colecciones Biológicas de la Universidad del Magdalena – CBUMAG” aportado por la UniMagdalena al proyecto.
description: This dataset contains the annelid collection of the Biological Collections Center - CBUMAG, which is part of the Scientific Collections Center of the University of Magdalena (CCC). The resource currently has 1110 biological records of specimens that were collected in different parts of the Colombian Caribbean in both coastal and deep sea areas. Fifty-nine percent of these correspond to lots deposited by external entities in the CBUMAG and the remaining 41% were obtained through different projects as a result of academic activities developed by the University.
description: The collection was documented, digitized and published for the first time during the execution of the BID-CA2020-055-NAC project "Increasing the accessibility of marine information of the Natural History Collections of Colombia, through data mobilization, infrastructure strengthening and training". The present dataset is the product of that process carried out between 2021-07-01 and 2023-06-30, as part of the deliverable "Marine Biology Collection of the Biological Collections Center of the University of Magdalena - CBUMAG" contributed by UniMagdalena to the project.
DOI: 10.17031/ghed-7t19
title: 2013 University of Plymouth Thanet Coast (UK) Special Area of Conservation (SAC) towed underwater video condition assessment of epibenthic communities and biotopes

description: This data set comprises of marine epibenthos (approx. 57  identified taxa derived of Algae, Annelida, Arthropoda, Bryozoa, Chordata, Cnidaria, Echinodermata, Mollusca, Porifera) collected in July 2013 from Thanet Coast  (UK) Special Area of Conservation (SAC) using a high definition towed underwater video system. Three replicate 200 m x 0.5 m transects were recorded in each area 12 areas. The extent and condition of biotopes was also identified and mapped.
DOI: 10.25607/cvamrq
title: NEODAAS- NERC Earth Observation Data Acquisition and Analysis Service

description: NEODAAS automatically receives, archives, processes and maps global data from multiple polar-orbiting sensors (MERIS, MODIS, SeaWiFS and AVHRR) and offers data from multiple geostationary satellites (SEVIRI, VISSR, GOES and MTSAT).
DOI: 10.14284/273
title: A summary of benthic studies in the sluice dock of Ostend during 1976-1981
DOI: 10.13120/rf7p-7w07
title: Phytoplankton time-series in the North Adriatic, C1-LTER time-series 2010-2020

description: Time series of phytoplankton abundance collected with a monthly frequency at 0.5, 5, 10 and 15 meters in the Gulf of Trieste. The time series station C1, located in the Gulf of Trieste in the northernmost part of the Adriatic Sea, is part of the Adriatic Long Term Ecological Research (LTER) site. It is a shallow coastal station (17 m depth) located at 0.2 Km from the coast, at the outer border of the Natural Marine Reserve of Miramare, Trieste. More information about activities carried out and about datasets from other periods can be found at: http://nettuno.ogs.trieste.it/ilter/GoTTs/en_index.html. Samples were fixed with Ca(HCO3)2-buffered formaldehyde (0.8% final concentration) and cell abundance was estimated according to Utermöhl's method (1958), using an inverted microscope equipped with phase contrast, at 200-320-400x final magnifications. Abundant cells were counted in defined random fields, rarer species were counted on the whole chamber (Fonda Umani et al., 2007).
DOI: 10.14284/172
title: Zooplankton respiration data from Fort Jesus and measurements of dry weight and length of copepods collected at Tudor Creek between August 1985 and June 1986
DOI: 10.14284/194
title: Ecological study of the plankton in the port of Ostend in 1965
DOI: 10.15468/gk9xqd
title: SEAPOP NINA

description: Observations of seabirds from localities all over the country. Latest observation per locality. Data from all seasons.
DOI: 10.14284/13
title: POPA- Fisheries Observer Program of the Azores: Turtle sightings in the Azores tuna fishery from 2000 on: during navigation or search mode
DOI: 10.17031/645e29fe023d5
title: 2022 SafetyNet Technologies Irish Sea Golden Ray Nephrops light trial
title: 2022 SafetyNet Technologies Golden Ray Nephrops light trial

description: Experimental deployment of LED lights on trawl headline to examine finfish bycatch rates in twin-rig Nephrops fishery.