DOI: 10.25666/dataubfc-2024-07-19
title: Raman spectra of extracellular vesicles derived from HMEC-1 cells exposed or not to B[a]P (2024)
title: Spectres Raman de vésicules extracellulaires dérivées des cellules HMEC-1 exposées ou non au B[a]P (2024)

description: Raman spectra (693) of extracellular vesicles derived from HMEC-1 cells exposed or not to Benzo[a]pyrene (B[a]P). Data were collected with a Raman microscope on 2 samples exposed to B[a]P and 3 samples control, and preprocessed (baseline correction, normalization). Further details can be found in a publication currently being submitted (link to be added later).
description: Spectres Raman (693) de vésicules extracellulaires dérivées de cellules HMEC-1 exposées ou non au Benzo[a]pyrène (B[a]P). Les données ont été collectées avec un microscope Raman sur 2 échantillons exposés au B[a]P et 3 échantillons de contrôle, et ont été prétraitées (correction de la ligne de base, normalisation). De plus amples détails peuvent être trouvés dans une publication en cours de soumission (lien à ajouter ultérieurement).
description: Audience: Research
description: UpdatePeriodicity: no update
description: Project: IdEx Université Paris Cité, ANR-18-IDEX-0001 (French National Agency for Research)
description: Project: SESAME 2019 – IVETh (EX047011), SESAME 2019 – IVETh (EX047011) (Another region)
description: Project: France 2030 “Integrateur biotherapie-bioproduction”, ANR-22-AIBB-0002 (French National Agency for Research)
description: Project: ENDOMITOPAH, ANR R23137NN (French National Agency for Research)
description: Project: Ingénierie et Innovation par les sciences physiques, les savoir-faire technologiques et l'interdisciplinarité, PIA, Equipements structurants pour la recherche - ANR-17-EURE-0002 (French National Agency for Research)
description: Experimental data: This dataset comprises 693 Raman spectra, themselves comprising 1531 decimal numbers (arbitrary units). Two vectors are added: one of 1531 decimal numbers (from 449.6 to 3400.1 cm-1) for the Raman shift and one of 693 character strings for the labels. 
Raman spectra were measured on extracellular vesicles (EVs) from HMEC-1 cells, adsorbed onto a gold chip. Some cells were exposed to a poly-aromatic hydrocarbon: benzo[a]pyrene (B[a]P). Data were taken at several ROIs (3 um steps) on the different biochips, 3 biochips with EVs from exposed cells (“BaP” label) and 2 biochips with EVs from unexposed cells (“control” label). A 532 nm laser was used, with a power of 10 mW and an exposure time of 200 ms, with 50 accumulations.
Spectra were pre-processed, removing the baseline by arPLS, and normalizing to have a mean intensity of zero between 1900 and 2500 cm-1, and a mean intensity equal to 1 between 2835 and 2970 cm-1. 
Further details can be found in a publication currently being submitted (link to be added later).
description: Données expérimentales: Ce jeu de données comprend 693 spectres Raman, eux-mêmes composés de 1531 nombres décimaux (unités arbitraires). Deux vecteurs sont ajoutés : un de 1531 nombres décimaux (de 449,6 à 3400,1 cm-1) pour le décalage Raman et un de 693 chaînes de caractères pour les étiquettes. 
Les spectres Raman ont été mesurés sur des vésicules extracellulaires (EVs) de cellules HMEC-1, adsorbées sur une puce en or. Certaines cellules ont été exposées à un hydrocarbure poly-aromatique : le benzo[a]pyrène (B[a]P). Les données ont été prises à plusieurs ROIs (pas de 3 um) sur différentes biopuces, 3 biopuces avec des EVs de cellules exposées (étiquette « BaP ») et 2 biopuces avec des EVs de cellules non exposées (étiquette « contrôle »). Un laser 532 nm a été utilisé, avec une puissance de 10 mW et un temps d'exposition de 200 ms, avec 50 accumulations.
Les spectres ont été prétraités, en supprimant la ligne de base par arPLS, et en normalisant pour avoir une intensité moyenne de zéro entre 1900 et 2500 cm-1, et une intensité moyenne égale à 1 entre 2835 et 2970 cm-1. 
De plus amples détails peuvent être trouvés dans une publication en cours de soumission (lien à ajouter ultérieurement).