cometadata/datacite-titles-descriptions-related-identifiers huggingface dataset:
DOI: 10.22002/r560d-sqh62
title: Hpylori_dFliF_FISE

description: These are H_pylori cells that are lacking FliP protein. In these cells, FliF protein was knocked out  .  to examine its relation to the hat-like complex.
description: <strong>Tilt Series Date:</strong> 2020-10-08</p>
<strong>Data Taken By:</strong> Mohammed Kaplan</p>
<strong>Species / Specimen:</strong> Helicobacter pylori</p>
<strong>Strain:</strong> 26695</p>
<strong>Tilt Series Settings:</strong>  Single Axis, tilt range: (-60.0°, 60.0°), step: 3°, constant angular increment, dosage: 120.0 eV/Å²,  defocus: -8.0 μm,  magnification: 19500x. </p>
<strong>Microscope:</strong> Caltech Titan Krios</p>
<strong>Acquisition Software:</strong> Serial EM</p>
<strong>Upload Method:</strong> pipeline</p>
<strong>Processing Software Used:</strong> Raptor</p>
<strong>Collaborators and Roles:</strong> The cells were prepared and sent by Carrie Schaffer from the university of Kentucky. The cells were grown at 37C with 5% CO2 on sheep blood agar plates for 2 days from a -80C. No growth was seen . on the plates after 24 hr therefore the plates were kept in the . incubator for another 24Hr.</p>
<strong>Purification / Growth Conditions / Treatment:</strong> The samples were prepared with Vitrobot IV. Blotting conditions were either: blot force 6, blot . time 3, drain time 1 OR blot force -3, blot time 4, drain time 1, 100%  humidity. Cu grids. 10 nm . gold</p>
description: Files available via S3 at https://sdsc.osn.xsede.org/ini210004tommorrell/tomography_archive/mka2020-10-08-455/rawdata/</p>Hpylori_DFliF_FISE_461.mrc,  Tilt Series (Pixel Size 0.452 nm), 1.9 GB  
        
<a role="button" class="ui compact mini button" href="https://sdsc.osn.xsede.org/ini210004tommorrell/tomography_archive/mka2020-10-08-455/rawdata/Hpylori_DFliF_FISE_461.mrc"
        > <i class="download icon"></i> Download </a></p>

        Hpylori_DFliF_FISE_461_full.rec,  Reconstruction (Pixel Size 1.808 nm), 737.3 MB  
        
<a role="button" class="ui compact mini button" href="https://sdsc.osn.xsede.org/ini210004tommorrell/tomography_archive/mka2020-10-08-455/3dimage_114346/Hpylori_DFliF_FISE_461_full.rec"
        > <i class="download icon"></i> Download </a></p>
DOI: 10.22002/zj703-qkv23
title: JV9082_Janelia42k

description: DotF-sfGFP fusion
description: <strong>Tilt Series Date:</strong> 2018-08-29</p>
<strong>Data Taken By:</strong> Debnath Ghosal</p>
<strong>Species / Specimen:</strong> Legionella pneumophila</p>
<strong>Strain:</strong> Philadelphia-1_Lp02</p>
<strong>Tilt Series Settings:</strong>  Single Axis, tilt range: (-54.0°, 54.0°), step: 3.0°, constant angular increment, dosage: 100.0 eV/Å²,  defocus: -7.0 μm,  magnification: 42000x. </p>
<strong>Microscope:</strong> Janelia Titan</p>
<strong>Acquisition Software:</strong> UCSFTomo</p>
<strong>Upload Method:</strong> pipeline</p>
<strong>Processing Software Used:</strong> Raptor</p>
<strong>Collaborators and Roles:</strong> Strain sent to us by Joseph P. Vogel, Washington University School of Medicine. Data collected and processed by Debnath Ghosal. Janelia Krios.</p>
<strong>Purification / Growth Conditions / Treatment:</strong> Cells were grown in AYE liquid culture with following supplements: ferric nitrate, cysteine hydrochloride and thymidine.</p>
<strong>Sample Preparation:</strong> 6 grids were frozen for the JV9082 strain (2x concentrated culture); Vitrobot (MK iv) settings: 100% humidity, 4µl sample, Blot force 6, blot time 4.5 sec. Wait time 0 sec. Drain time 1 sec. Ethane/propane mix. Grid: Quantifoil Cu 2/2 200.</p>
description: Files available via S3 at https://sdsc.osn.xsede.org/ini210004tommorrell/tomography_archive/dga2018-08-29-356/rawdata/</p>JV9082_20180901a0130.mrc,  Tilt Series (Pixel Size 0.26 nm), 1.1 GB  
        
<a role="button" class="ui compact mini button" href="https://sdsc.osn.xsede.org/ini210004tommorrell/tomography_archive/dga2018-08-29-356/rawdata/JV9082_20180901a0130.mrc"
        > <i class="download icon"></i> Download </a></p>

        JV9082_20180901a0130_full.rec,  Reconstruction (Pixel Size 1.04 nm), 445.4 MB  
        
<a role="button" class="ui compact mini button" href="https://sdsc.osn.xsede.org/ini210004tommorrell/tomography_archive/dga2018-08-29-356/3dimage_97063/JV9082_20180901a0130_full.rec"
        > <i class="download icon"></i> Download </a></p>
DOI: 10.22002/vrzqa-qj358
title: Lp02-fixed

description: WT Lp02 cells were fixed with GA and re-suspended in  PBS.
description: <strong>Tilt Series Date:</strong> 2017-11-20</p>
<strong>Data Taken By:</strong> Debnath Ghosal</p>
<strong>Species / Specimen:</strong> Legionella pneumophila</p>
<strong>Strain:</strong> Philadelphia-1_Lp02</p>
<strong>Tilt Series Settings:</strong>  Single Axis, tilt range: (-60.0°, 60.0°), step: 1.5°, constant angular increment, dosage: 100.0 eV/Å²,  defocus: -7.0 μm,  magnification: 27500x. </p>
<strong>Microscope:</strong> Caltech Polara</p>
<strong>Acquisition Software:</strong> UCSFTomo</p>
<strong>Upload Method:</strong> pipeline</p>
<strong>Processing Software Used:</strong> Raptor</p>
<strong>Collaborators and Roles:</strong> Joelle Gabay and Howard Shuman prepared samples, Debnath Ghosal collected data.</p>
<strong>Purification / Growth Conditions / Treatment:</strong> Shuman Lab</p>
<strong>Sample Preparation:</strong> 6 grids were frozen, cell density was increased to 2x by centrifugation. Vitrobot (MK iv) settings: 100% humidity, 4µl sample, Blot force 6, blot time 4.5 sec. Wait time 0 sec. Drain time 1 sec. Ethane/propane mix. Grid: Quantifoil Cu 2/2 200. Add gold to cells prior to freezing: 1ul of gold to 4 ul of cells, freeze.</p>
description: Files available via S3 at https://sdsc.osn.xsede.org/ini210004tommorrell/tomography_archive/dga2017-11-20-25/rawdata/</p>Legionella_fixed_201711200031.mrc,  Tilt Series (Pixel Size 0.39 nm), 2.3 GB  
        
<a role="button" class="ui compact mini button" href="https://sdsc.osn.xsede.org/ini210004tommorrell/tomography_archive/dga2017-11-20-25/rawdata/Legionella_fixed_201711200031.mrc"
        > <i class="download icon"></i> Download </a></p>

        Legionella_fixed_201711200031_full.rec,  Reconstruction (Pixel Size 1.56 nm), 445.4 MB  
        
<a role="button" class="ui compact mini button" href="https://sdsc.osn.xsede.org/ini210004tommorrell/tomography_archive/dga2017-11-20-25/3dimage_90348/Legionella_fixed_201711200031_full.rec"
        > <i class="download icon"></i> Download </a></p>
DOI: 10.22002/qhxk7-ba619
title: V. cholerae JAS286 delta-tcpD

description: Classical strain with ctxA deletionStrain name JAS286 (tcpD gene knonkout)Cell harbors pMT5 plasmid (inducible toxT)
description: <strong>Tilt Series Date:</strong> 2016-08-05</p>
<strong>Data Taken By:</strong> Yi-Wei Chang</p>
<strong>Species / Specimen:</strong> Vibrio cholerae</p>
<strong>Strain:</strong> O395-N1</p>
<strong>Tilt Series Settings:</strong>  Single Axis, tilt range: (-60.0°, 60.0°), step: 1.0°, constant angular increment, dosage: 160.0 eV/Å²,  defocus: -6.0 μm,  magnification: 27500x. </p>
<strong>Microscope:</strong> Caltech Polara</p>
<strong>Acquisition Software:</strong> UCSFTomo</p>
<strong>Upload Method:</strong> pipeline</p>
<strong>Processing Software Used:</strong> Raptor</p>
<strong>Collaborators and Roles:</strong> Strain from Gabriela Kovacikova</p>
<strong>Purification / Growth Conditions / Treatment:</strong> O/N cultures of Vibrio cholerae O395 N1 pMT5 grown in LB, 1 mM IPTG and 100 ug/mL ampicillin.</p>
<strong>Sample Preparation:</strong> Vitrobot (MK iv) settings: 100% humidity, 3.5µl sample, 10 mg/ml BSA treated gold. Blot force 6, blot time 3 sec. Wait time 0 sec. Drain time 1 sec. Ethane/propane mix. Grid: Quantifoil Cu 2/2 200.</p>
description: Files available via S3 at https://sdsc.osn.xsede.org/ini210004tommorrell/tomography_archive/ycw2016-08-05-21/rawdata/</p>20160805_YWC215_10021.mrc,  Tilt Series (Pixel Size 0.39 nm), 3.4 GB  
        
<a role="button" class="ui compact mini button" href="https://sdsc.osn.xsede.org/ini210004tommorrell/tomography_archive/ycw2016-08-05-21/rawdata/20160805_YWC215_10021.mrc"
        > <i class="download icon"></i> Download </a></p>

        20160805_YWC215_10021_full.rec,  Reconstruction (Pixel Size 1.56 nm), 534.5 MB  
        
<a role="button" class="ui compact mini button" href="https://sdsc.osn.xsede.org/ini210004tommorrell/tomography_archive/ycw2016-08-05-21/3dimage_76338/20160805_YWC215_10021_full.rec"
        > <i class="download icon"></i> Download </a></p>
DOI: 10.22002/2ce0r-grh65
title: Lp02 ΔlspDE

description: Raw data files of Lp02 ΔlspDE
description: <strong>Tilt Series Date:</strong> 2017-03-02</p>
<strong>Data Taken By:</strong> Debnath Ghosal</p>
<strong>Species / Specimen:</strong> Legionella pneumophila</p>
<strong>Strain:</strong> Philadelphia-1_Lp02</p>
<strong>Tilt Series Settings:</strong>  Single Axis, tilt range: (-60.0°, 60.0°), step: 1.5°, constant angular increment, dosage: 100.0 eV/Å²,  defocus: -8.0 μm,  magnification: 27500x. </p>
<strong>Microscope:</strong> Caltech Polara</p>
<strong>Acquisition Software:</strong> UCSFTomo</p>
<strong>Upload Method:</strong> pipeline</p>
<strong>Processing Software Used:</strong> Raptor</p>
<strong>Collaborators and Roles:</strong> Strain sent to us by Nicholas Cianciotto at Northwestern University Medical School Data collected and processed by Debnath Ghosal</p>
<strong>Sample Preparation:</strong> 4 grids were frozen for this strain at OD= 3 Vitrobot (MK iv) settings: 100% humidity, 4µl sample, Blot force 6, blot time 3 sec. Wait time 0 sec. Drain time 1 sec. Ethane/propane mix. Grid: Quantifoil Cu 2/2 200. Add gold to cells prior to freezing: 1ul of gold to 4 ul of cells, freeze.</p>
description: Files available via S3 at https://sdsc.osn.xsede.org/ini210004tommorrell/tomography_archive/dga2017-03-02-45/rawdata/</p>Lg_DeltaDE_201703020006.mrc,  Tilt Series (Pixel Size 0.39 nm), 2.3 GB  
        
<a role="button" class="ui compact mini button" href="https://sdsc.osn.xsede.org/ini210004tommorrell/tomography_archive/dga2017-03-02-45/rawdata/Lg_DeltaDE_201703020006.mrc"
        > <i class="download icon"></i> Download </a></p>

        Lg_DeltaDE_201703020006_full.rec,  Reconstruction (Pixel Size 1.56 nm), 445.4 MB  
        
<a role="button" class="ui compact mini button" href="https://sdsc.osn.xsede.org/ini210004tommorrell/tomography_archive/dga2017-03-02-45/3dimage_82811/Lg_DeltaDE_201703020006_full.rec"
        > <i class="download icon"></i> Download </a></p>
DOI: 10.5281/zenodo.16964548
title: test_pressure_field

description: test
DOI: 10.5281/zenodo.16964549
title: test_pressure_field

description: test
DOI: 10.14457/stou.the.2009.336
title: สภาพการใช้งานระบบเทคโนโลยีสารสนเทศส่วนสนับสนุนของข้าราชการกรมสรรพสามิต กรุงเทพมหานคร

description: การศึกษาครั้งนี้มีวัตถุประสงค์เพื่อ (1) ศึกษาสภาพการใช้ระบบเทคโนโลยีสารสนเทศส่วนสนับสนุนของข้าราชการกรมสรรพสามิต (2) เปรียบเทียบสภาพการใช้ระบบเทคโนโลยีสารสนเทศส่วนสนับสนุนแต่ละระบบ จำแนกตามข้อมูลส่วนบุคคล (3) ศึกษาประโยชน์ปัญหา และอุปสรรคในการใช้ระบบเทคโนโลยีสารสนเทศส่วนสนับสนุนของกรมสรรพสามิตประชากรที่ใช้ในการศึกษา เป็นข้าราชการกรมสรรพสามิตที่ปฏิบัติงานในกรุงเทพมหานคร จำนวน 13 หน่วยงาน จำนวน 550 คน ทำการสุ่มตัวอย่างแบบแบ่งชั้นภูมิ จำนวน 226 คน เก็บรวบรวมข้อมูลโดยใช้แบบสอบถาม สถิติที่ใช้ในการวิเคราะห์ข้อมูล ได้แก่ ความถี่ ร้อยละ ค่าเฉลี่ย ส่วนเบี่ยงเบนมาตรฐาน ทคสอบค่าสถิติที และค่าสถิติเอฟ ผลการศึกษาพบว่า (1) ข้าราชการกรมสรรพสามิตส่วนใหญ่ใช้เครื่องคอมพิวเตอร์ ในการปฏิบัติงาน ร้อยละ 98.67 โคยมีการใช้ระบบเทคโนโลยีสารสนเทศส่วนสนับสนุนเรียงลำดับจากมากไปน้อย ได้แก่ ระบบ e-Mail ระบบ e-Office ระบบ Intranet และระบบe-Law (2) ข้าราชการกรมสรรพสามิตที่มีเพศ ระดับการศึกษา และตำแหน่งงานต่างกัน มีสภาพการใช้ระบบ e-Mail แตกต่างอย่างมีนัยสำคัญทางสถิติที่ 0.05 อายุงานที่ต่างกันมีสภาพการใช้ระบบ Intranet แตกต่างอย่างมีนัยสำคัญทางสถิติที่ 0.05 และตำแหน่งานที่ต่างกันมีสภาพการใช้ระบบ e-Law แตกต่างอย่างมีนัยสำคัญทางสถิติที่ 0.05 ในขณะที่ไม่พบความแตกต่างของสภาพการใช้งานในระบบ e-Office (3) ประโยชน์จากการใช้ระบบงานเทคโนโลยีสารสนเทศส่วนสนับสนุน ในด้านประหยัดสถานที่จัดเก็บเอกสาร ลดเวลาในการติดต่อสื่อสารภายในองค์กร และสามารถติดต่อประสานงานนอกเวลาทำงาน ส่วนปัญหาและอุปสรรคที่พบมากที่สุด ได้แก่ ระบบล่มและขัดข้องบ่อย การเก็บรวบรวมข้อมูลและสารสนเทศไม่เป็นระบบและไม่ทันต่อเหตุการณ์ โดยมีข้อเสนอแนะว่าควรเพิ่มจำนวนเครื่องคอมพิวเตอร์และอุปกรณ์ที่ทันสมัยและมีประสิทธิภาพรองรับกับระบบงานใหม่ๆ ของกรมสรรพสามิตและควรมีการพัฒนาระบบงานอย่างต่อเนื่อง
DOI: 10.14457/stou.the.2010.142
title: ปัจจัยในการตัดสินใจเลือกซื้อบ้านจัดสรรในระดับราคา 3 ถึง 5 ล้านบาทของบริษัท มั่นคงเคหะการ จำกัด (มหาชน)

description: การวิจัยครั้งนี้มีวัตถุประสงค์เพื่อศึกษา (1) ปัจจัยส่วนบุคคลของผู้ตัดสินใจซื้อบ้านจัดสรรในระดับราคา 3 ถึง5 ล้านบาท(2) ระดับความคิดเห็นต่อปัจจัยเลือกซื้อบ้านจัดสรร (3) เปรียบเทียบปัจจัยในการตัดสินใจซื้อบ้านจัดสรรในระดับราคา 3 ถึง 5 ล้านบาท โดยจำแนกตามลักษณะส่วนบุคคล การวิจัยครั้งนี้เป็นการวิจัยเชิงสำรวจ ประชากรคือลูกค้าที่ซื้อบ้านในโครงการบ้านจัดสรรของบริษัท มั่นคงเคหะการ จำกัด(มหาชน)ในระดับราคาตั้งแต่ 3 ถึง 5 ล้านบาท จำนวน 400 คน กรอบของการสุ่ม คือ โครงการชวนชื่นปิ่นเกล้า-วงแหวน และชวนชื่นโมดัสจรัญ-ปิ่นเกล้า ของบริษัท มั่นคงเคหะการ จำกัด (มหาชน) จำนวน 200 รายโดยการใช้วิธีการสุ่มตัวอย่างแบบชั้น ภูมิ โดยใช้เครื่องมือแบบสอบถาม สถิติที่ใช้คือ ค่าร้อยละ ค่าเฉลี่ย การทดสอบค่าที การทดสอบ ค่าเอฟ การวิจัยครั้งนี้พบว่า (1) ลักษณะส่วนบุคคสของกลุ่มตัวอย่างส่วนใหญ่เป็นเพศหญิง มีอายูระหว่าง 31-40ปี สถานภาพสมรส ประกอบอาชีพพนักงานบริษัทเอกชน ระดับการศึกษาปริญญาตรีหรือเทียบเทา มีรายได้ต่อเดือนของครอบครัว ระหว่าง 30,001-50,000 จำนวนผู้อยู่อาศัย 4 คนขึ้นไป (2)ระดับความคิดเห็นต่อปัจจัยการเลือกซื้อบ้านจัดสรรราคา 3-5 ล้าน บาท ในภาพรวมทุกด้านอยู่ในระดับมาก โดยเรียงลำดับจากมากไปน้อยคือ ด้านทำเลที่ตั้งโครงการคือ ใกล้รถไฟฟ้า ด้านองค์ประกอบของบ้านคือ สามารถต่อเดิมได้ง่าย ด้านราคาบ้านคือ ราคาถูกกว่า แต่คุณภาพดีกว่า การส่งเสริมการขายคือการแถมเฟอร์นิเจอร์ การเลือกทำเลที่ตั้งบ้านจัดสรรคือ ใกล้ญาติ ปัญหาที่พบในโครงการอื่นๆคือความปลอดภัย แสงสว่าง สิ่งอำนวยความสะดวกใน โครงการคือ สปอร์คลับ และการรับข้อมูลข่าวสารคือป้ายโฆษณา(3)เปรียบเทียบปัจจัยต่อการ ตัดสินใจซื้อบ้านจัดสรรในระดับราคา 3 ถึง 5 ล้านบาท ของบริษัท มั่นคงเคหะการ จำกัด(มหาชน) โดยจำแนกตามลักษณะส่วนบุคคลพบว่าเมื่อเปรียบเทียบโดยรวมและรายด้านแล้วไม่พบความแตกต่าง
DOI: 10.14457/stou.the.2009.337
title: พฤติกรรมผู้บริโภคในการซื้อรถจักรยานยนต์ในอำเภอศรีราชาจังหวัดชลบุรี

description: การวิจัยครั้งนี้มีวัตถุประสงค์เพื่อศึกษา (1) ปัจจัยส่วนบุคคลของผู้บริโภคที่ซื้อรถจักรยานยนต์ในอำเภอศรีราชา จังหวัดชลบุรี (2) ปัจจัยส่วนประสมทางการตลาดที่มีผลต่อการซื้อรถจักรยานยนต์ของผู้บริโภคในอำเภอศรีราชา จังหวัดชลบุรี (3) พฤติกรรมการซื้อรถจักรยานยนต์ ของผู้บริโภคในอำเภอศรีราชา จังหวัดชลบุรี (4) ความสัมพันธ์ระหว่างปัจจัยส่วนบุคคล ปัจจัยส่วนประสมการตลาดกับพฤติกรรมการซื้อรถจักรยานยนต์ของผู้บริโภคในอำเภอศรีราชา จังหวัดชลบุรี การวิจัยเป็นการวิจัยเชิงสำรวจกลุ่มตัวอย่างที่ใช้ในการสำรวจคือผู้ซื้อรถจักรยานยนต์ ในเขตอำเภอศรีราชา จังหวัดชลบุรี โดยใช้สูตรของยามาเน่ในการหาจำนวนกลุ่มตัวอย่างได้จำนวน 400 คนเครื่องมือที่ใช้ในเก็บข้อมูลคือแบบสอบถามสถิติที่ใช้ในการวิเคราะห์ข้อมูลคือ ค่าร้อยละ ค่าเฉลี่ย ค่าส่วนเบี่ยงเบนมาตรฐาน การทดสอบที การวิเคราะห์ความแปรปรวน และ ค่าสถิติ ไค-สแควร์ ผลการวิจัยพบว่า (1) กลุ่มตัวอย่างส่วนใหญ่เป็นเพศชายมีอายุระหว่าง 31-35 ปี มีสถานภาพสมรส มีการศึกษาในระดับอนุปริญญา / ปวช. / ปวส. มีสมาชิกอยู่ในครอบครัว 2-3 คน มีอาชีพเป็นพนักงานบริษัทเอกชนและค้าขาย/ธุรกิจส่วนตัว และมีรายได้โดยรวมมากกว่า 25,001 บาท (2) ผู้บริโภคส่วนใหญ่ให้ความสำคัญต่อปัจจัยส่วนประสมการตลาดอยู่ในระดับมาก เมื่อพิจารณาเป็นรายด้านผู้บริโภคให้ความสำคัญด้านส่งเสริมการขายมากเป็นลำดับแรก ด้านการจัดจำหน่าย ด้านราคา และด้านผลิตภัณฑ์ เรียงตามลำดับ (3) ผู้บริโภคส่วนใหญ่จะเลือกซื้อ รถจักรยานยนต์ประเภทครอบครัวกึ่งสปอร์ต โดยเลือกซื้อยี่ห้อฮอนด้า เป็นเครื่องยนต์ 4 จังหวะที่มีราคาอยู่ในช่วง 45,001 - 50,000 บาท และซื้อด้วยเงินของตนเอง (4) ปัจจัยส่วนบุคคลมีความสัมพันธ์กับพฤติกรรมการซื้อรถจักรยานยนต์ ในด้านเพศ อายุ ระดับการศึกษา อาชีพ และรายได้ส่วนปัจจัยส่วนประสมการตลาดมีความสัมพันธ์กับพฤติกรรมการซื้อรถจักรยานยนต์ของผู้บริโภคในด้านราคา
DOI: 10.22002/j05nd-cas07
title: P_aeruginosa_PA14_DfliF_Krios

description: Raw data files of P_aeruginosa_PA14_DfliF_Krios
description: <strong>Tilt Series Date:</strong> 2018-09-29</p>
<strong>Data Taken By:</strong> Mohammed Kaplan</p>
<strong>Species / Specimen:</strong> Pseudomonas aeruginosa</p>
<strong>Strain:</strong> </p>
<strong>Tilt Series Settings:</strong>  Single Axis, tilt range: (50.0°, -50.0°), step: 2°, constant angular increment, dosage: 160.0 eV/Å²,  defocus: -9.0 μm,  magnification: 26000x. </p>
<strong>Microscope:</strong> Caltech Titan Krios</p>
<strong>Acquisition Software:</strong> Serial EM</p>
<strong>Upload Method:</strong> pipeline</p>
<strong>Processing Software Used:</strong> RAPTOR</p>
<strong>Collaborators and Roles:</strong> I (mohammed) obtained the cells from Shannon Park (Dianne Newman lab). The cells are available in their library of Pseudomonas aeruginosa PA14.</p>
<strong>Purification / Growth Conditions / Treatment:</strong> I inoculated one colony from an LB agar plate and grew the cells overnight in LB with 100 ug/ml of Gentamycin. Then I concentrated the cells three times and mixed them with gold nanoparticles and added 3 ul on to thick carbon R2 grids and blotted them and plunge froze them (force either 6 or 3, time either 3 or 2 seconds respectively, drain time 1 second).</p>
description: Files available via S3 at https://sdsc.osn.xsede.org/ini210004tommorrell/tomography_archive/mka2018-09-29-58/rawdata/</p>Pseudomonas_DfliF55.mrc,  Tilt Series (Pixel Size 0.53 nm), 1.5 GB  
        
<a role="button" class="ui compact mini button" href="https://sdsc.osn.xsede.org/ini210004tommorrell/tomography_archive/mka2018-09-29-58/rawdata/Pseudomonas_DfliF55.mrc"
        > <i class="download icon"></i> Download </a></p>

        Pseudomonas_DfliF55_full.rec,  Reconstruction (Pixel Size 2.12 nm), 445.4 MB  
        
<a role="button" class="ui compact mini button" href="https://sdsc.osn.xsede.org/ini210004tommorrell/tomography_archive/mka2018-09-29-58/3dimage_97250/Pseudomonas_DfliF55_full.rec"
        > <i class="download icon"></i> Download </a></p>
DOI: 10.22002/tzxx6-ayx66
title: JV9082_Janelia42k

description: DotF-sfGFP fusion
description: <strong>Tilt Series Date:</strong> 2018-08-29</p>
<strong>Data Taken By:</strong> Debnath Ghosal</p>
<strong>Species / Specimen:</strong> Legionella pneumophila</p>
<strong>Strain:</strong> Philadelphia-1_Lp02</p>
<strong>Tilt Series Settings:</strong>  Single Axis, tilt range: (-54.0°, 54.0°), step: 3.0°, constant angular increment, dosage: 100.0 eV/Å²,  defocus: -7.0 μm,  magnification: 42000x. </p>
<strong>Microscope:</strong> Janelia Titan</p>
<strong>Acquisition Software:</strong> UCSFTomo</p>
<strong>Upload Method:</strong> pipeline</p>
<strong>Processing Software Used:</strong> Raptor</p>
<strong>Collaborators and Roles:</strong> Strain sent to us by Joseph P. Vogel, Washington University School of Medicine. Data collected and processed by Debnath Ghosal. Janelia Krios.</p>
<strong>Purification / Growth Conditions / Treatment:</strong> Cells were grown in AYE liquid culture with following supplements: ferric nitrate, cysteine hydrochloride and thymidine.</p>
<strong>Sample Preparation:</strong> 6 grids were frozen for the JV9082 strain (2x concentrated culture); Vitrobot (MK iv) settings: 100% humidity, 4µl sample, Blot force 6, blot time 4.5 sec. Wait time 0 sec. Drain time 1 sec. Ethane/propane mix. Grid: Quantifoil Cu 2/2 200.</p>
description: Files available via S3 at https://sdsc.osn.xsede.org/ini210004tommorrell/tomography_archive/dga2018-08-29-214/rawdata/</p>JV9082_201808290214.mrc,  Tilt Series (Pixel Size 0.26 nm), 1.1 GB  
        
<a role="button" class="ui compact mini button" href="https://sdsc.osn.xsede.org/ini210004tommorrell/tomography_archive/dga2018-08-29-214/rawdata/JV9082_201808290214.mrc"
        > <i class="download icon"></i> Download </a></p>

        JV9082_201808290214_part37_16.rec,  Reconstruction (Pixel Size 1.04 nm), 445.4 MB  
        
<a role="button" class="ui compact mini button" href="https://sdsc.osn.xsede.org/ini210004tommorrell/tomography_archive/dga2018-08-29-214/3dimage_96824/JV9082_201808290214_part37_16.rec"
        > <i class="download icon"></i> Download </a></p>
DOI: 10.22002/5902z-34k83
title: JV9082_K3_janelia

description: JV9082:DotF-sfGFP fusion
description: <strong>Tilt Series Date:</strong> 2019-12-04</p>
<strong>Data Taken By:</strong> Debnath Ghosal</p>
<strong>Species / Specimen:</strong> Legionella pneumophila</p>
<strong>Strain:</strong> Philadelphia-1_Lp02</p>
<strong>Tilt Series Settings:</strong>  Single Axis, tilt range: (-54.0°, 54.0°), step: 3.0°, constant angular increment, dosage: 90.0 eV/Å²,  defocus: -3.0 μm,  magnification: 26000x. </p>
<strong>Microscope:</strong> Janelia Titan</p>
<strong>Acquisition Software:</strong> SerialEM</p>
<strong>Upload Method:</strong> pipeline</p>
<strong>Processing Software Used:</strong> Raptor</p>
<strong>Collaborators and Roles:</strong> Strain sent to us by Joseph P. Vogel, Washington University School of Medicine. Data collected and processed by Debnath Ghosal.</p>
<strong>Purification / Growth Conditions / Treatment:</strong> Cells were grown in AYE liquid culture with following supplements: ferric nitrate, cysteine hydrochloride and thymidine.</p>
<strong>Sample Preparation:</strong> Vitrobot (MK iv) settings: 100% humidity, 4µl sample, Blot force 6, blot time 4.5 sec. Wait time 0 sec. Drain time 1 sec. Ethane/propane mix. Grid: Quantifoil Cu 2/2 200. Data collected at Janelia Krios (K3 camera). Mag: 26000, pixel size: 2.61A. Defocus range -2 to -4 um.</p>
description: Files available via S3 at https://sdsc.osn.xsede.org/ini210004tommorrell/tomography_archive/dga2019-12-04-29/rawdata/</p>9082_Box1_No4_S61.mrc,  Tilt Series (Pixel Size 0.261 nm), 1.7 GB  
        
<a role="button" class="ui compact mini button" href="https://sdsc.osn.xsede.org/ini210004tommorrell/tomography_archive/dga2019-12-04-29/rawdata/9082_Box1_No4_S61.mrc"
        > <i class="download icon"></i> Download </a></p>

        9082_Box1_No4_S61_full.rec,  Reconstruction (Pixel Size 1.044 nm), 737.3 MB  
        
<a role="button" class="ui compact mini button" href="https://sdsc.osn.xsede.org/ini210004tommorrell/tomography_archive/dga2019-12-04-29/3dimage_113001/9082_Box1_No4_S61_full.rec"
        > <i class="download icon"></i> Download </a></p>