DOI: 10.21966/q1m4-pz94
title: iTrack Oysters September 2023 Experiment - Environmental and Oyster Health Data
title: Expérience iTrack Oysters de septembre 2023 - Données relatives à l'environnement et à la santé des huîtres

description: This data package is a component of the Hakai Institute’s Marna Wet Lab and Caren Helbing (University of Victoria, UVic) collaborative iTrack project investigating environmental effects on eDNA and eRNA. Hakai Institute's Marna Wet Lab experimental research program uses laboratory experiments to evaluate marine organisms' responses to simulated current and future ocean environmental conditions. The overarching objective of Hakai Wet Lab experimental research is to investigate the mechanisms of vulnerability and resilience of a variety of marine species and communities under static or dynamic future environmental conditions, and understand how organisms are responding phenotypically, physiologically and/or genomically to thermal and acidification stress.

This experiment was part two of a series of mesocosm experiments and took place at the Marna Wet Lab at Hakai’s Quadra Island Ecological Observatory September 19-28, 2023. The purpose of this experiment was to investigate eDNA and eRNA production and degradation of adult Pacific oysters (Crassostrea gigas) under different pCO2 and temperature conditions. Oysters were exposed to various temperatures (10oC and 20oC) and pCO2 concentrations (avg. 735 µatm and 1540 µatm), resulting in four distinct temperature/pCO2 treatments. One tank per temperature/pCO2 treatment combination contained no oysters to serve as a control. The oysters were destructively sampled for weight, size, ability to close valves, tissue condition, mantle recession, conchiolin deposits, lesions, digestive gland colouration, and gill and gonad DNA.

This data package contains the mesocosm temperature and carbonate chemistry data and oyster health data only and will be available upon request until the manuscript has been accepted at which time the data will be made publicly available. 

In light of the effort required to obtain these data and create data packages, we request all data users that, in addition to following the CC-BY license terms, they give attribution to the data providers and follow fair use guidelines: 1) respect the data providers, and provide helpful feedback on data quality, and 2) communicate and/or collaborate with Hakai Marna Wet Lab researchers and collaborators if you are considering using this dataset for manuscripts or other forms of reporting.
description: Ce paquet de données fait partie du projet collaboratif iTrack du laboratoire Marna Wet Lab de l'Institut Hakai et de Caren Helbing (Université de Victoria, UVic) qui étudie les effets environnementaux sur l'ADNe et l'eRNA. Le programme de recherche expérimentale Marna Wet Lab de l'Institut Hakai utilise des expériences de laboratoire pour évaluer les réponses des organismes marins à des conditions environnementales océaniques simulées actuelles et futures. L'objectif principal de la recherche expérimentale du Hakai Wet Lab est d'étudier les mécanismes de vulnérabilité et de résilience de diverses espèces et communautés marines dans des conditions environnementales futures statiques ou dynamiques, et de comprendre comment les organismes réagissent phénotypiquement, physiologiquement et/ou génomiquement au stress thermique et à l'acidification.

Cette expérience faisait partie d'une série d'expériences sur le mésocosme et a eu lieu au Marna Wet Lab de l'observatoire écologique de l'île Quadra de Hakai du 19 au 28 septembre 2023. Le but de cette expérience était d'étudier la production et la dégradation d'ADNe et d'eRNA chez des huîtres adultes du Pacifique (Crassostrea gigas) dans différentes conditions de pCO2 et de température. Les huîtres ont été exposées à différentes températures (10 oC et 20 oC) et à des concentrations de pCO2 (en moyenne 735 µatm et 1 540 µatm), ce qui a donné lieu à quatre traitements distincts de température/pCO2. Un réservoir par combinaison de traitement température/pCO2 ne contenait aucune huître servant de témoin. Les huîtres ont été échantillonnées de manière destructive pour déterminer leur poids, leur taille, leur capacité à fermer les valves, l'état des tissus, la récession du manteau, les dépôts de conchioline, les lésions, la coloration des glandes digestives et l'ADN des branchies et des gonades.

Ce paquet de données contient uniquement les données relatives à la température du mésocosme et à la chimie des carbonates, ainsi que des données sur la santé des huîtres. Il sera disponible sur demande jusqu'à ce que le manuscrit soit accepté, date à laquelle les données seront mises à la disposition du public. 

Compte tenu des efforts nécessaires pour obtenir ces données et créer des packages de données, nous demandons à tous les utilisateurs de données de respecter les termes de la licence CC-BY, de citer les fournisseurs de données et de suivre les directives d'utilisation équitable : 1) respecter les fournisseurs de données et fournir des commentaires utiles sur la qualité des données, et 2) communiquer et/ou collaborer avec les chercheurs et collaborateurs du Hakai Marna Wet Lab si vous envisagez d'utiliser cet ensemble de données pour des manuscrits ou d'autres formes de reporting.