cometadata/datacite-titles-descriptions-related-identifiers huggingface dataset:
DOI: 10.15468/dl.qw2cf4
title: Occurrence Download

description: A dataset containing 447 species occurrences available in GBIF matching the query:
{
 "and" : [
 "BasisOfRecord is one of (Material sample, Specimen)",
 "TaxonKey is Chrysocyon brachyurus (Illiger, 1815)"
 ]
}

 The dataset includes 447 records from 51 constituent datasets; see https://api.gbif.org/v1/occurrence/download/0052765-240626123714530/datasets/export for details.
 
Data from some individual datasets included in this download may be licensed under less restrictive terms.
DOI: 10.15468/dl.uqhy2k
title: Occurrence Download

description: A dataset containing 9 species occurrences available in GBIF matching the query:
{
 "and" : [
 "TaxonKey is Pandalus latirostris M.J.Rathbun, 1902",
 "Geometry POLYGON((170 20, 170 50, 120 50, 120 20, 170 20))",
 "HasCoordinate is true"
 ]
}

 The dataset includes 9 records from 3 constituent datasets; see https://api.gbif.org/v1/occurrence/download/0052767-240626123714530/datasets/export for details.
 
Data from some individual datasets included in this download may be licensed under less restrictive terms.
DOI: 10.15468/dl.u4fcrn
title: Occurrence Download

description: A dataset containing 106 species occurrences available in GBIF matching the query:
{
 "and" : [
 "TaxonKey is Pleurogrammus azonus Jordan & Metz, 1913",
 "Geometry POLYGON((170 20, 170 50, 120 50, 120 20, 170 20))",
 "HasCoordinate is true"
 ]
}

 The dataset includes 106 records from 14 constituent datasets; see https://api.gbif.org/v1/occurrence/download/0052768-240626123714530/datasets/export for details.
 
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DOI: 10.5281/zenodo.13242882
title: Referentes legales internacionales

description: Referentes legales



Alcances







Pacto Internacional de derechos económicos, sociales y culturales (diciembre de 1966).



Establece que, sin importar la situación socioeconómica de los estados, estos deben garantizar los derechos a las personas más vulnerables, incluyendo la educación al menor costo posible.





Convención americana de derechos humanos de San José – Costa Rica (1969).



Acuerdo interamericano para el reconocimiento y protección integral de los derechos humanos de las personas, sin distinción de género, credo, raza, lengua u otra categoría.





Convención contra todas las formas de discriminación a la mujer (1979)



Además de reconocer la discriminación a las mujeres en todos los niveles sociales, fomenta la protección de sus derechos como agente de paz e igualdad.





Protocolo de derechos económicos, sociales y culturales de San Salvador (1988).



Derecho a la educación en todos los niveles de todas las personas, para desarrollar su personalidad, dignidad, respeto a los derechos humanos, las libertades, la paz y la justicia. (artículo 13)





Convenio No. 169 de la OIT, sobre los pueblos indígenas y tribales en los países independientes (1989).



Reconoce la protección de los derechos de los pueblos indígenas contra la discriminación y opresión que enfrentan en sus países por sus diversas maneras de expresar sus culturas. La educación debe posibilitar su inclusión para ser pertinente según sus intereses, valores, saberes y expectativas.





Convención de Naciones Unidas sobre los derechos de las personas con discapacidad (2007)



Trabaja en el derecho de las personas con alguna discapacidad a ingresar al servicio educativo en todo nivel y modalidad, sin importar su edad y sin que su condición de discapacidad sea motivo de exclusión.
DOI: 10.5281/zenodo.13242883
title: Referentes legales internacionales

description: Referentes legales



Alcances







Pacto Internacional de derechos económicos, sociales y culturales (diciembre de 1966).



Establece que, sin importar la situación socioeconómica de los estados, estos deben garantizar los derechos a las personas más vulnerables, incluyendo la educación al menor costo posible.





Convención americana de derechos humanos de San José – Costa Rica (1969).



Acuerdo interamericano para el reconocimiento y protección integral de los derechos humanos de las personas, sin distinción de género, credo, raza, lengua u otra categoría.





Convención contra todas las formas de discriminación a la mujer (1979)



Además de reconocer la discriminación a las mujeres en todos los niveles sociales, fomenta la protección de sus derechos como agente de paz e igualdad.





Protocolo de derechos económicos, sociales y culturales de San Salvador (1988).



Derecho a la educación en todos los niveles de todas las personas, para desarrollar su personalidad, dignidad, respeto a los derechos humanos, las libertades, la paz y la justicia. (artículo 13)





Convenio No. 169 de la OIT, sobre los pueblos indígenas y tribales en los países independientes (1989).



Reconoce la protección de los derechos de los pueblos indígenas contra la discriminación y opresión que enfrentan en sus países por sus diversas maneras de expresar sus culturas. La educación debe posibilitar su inclusión para ser pertinente según sus intereses, valores, saberes y expectativas.





Convención de Naciones Unidas sobre los derechos de las personas con discapacidad (2007)



Trabaja en el derecho de las personas con alguna discapacidad a ingresar al servicio educativo en todo nivel y modalidad, sin importar su edad y sin que su condición de discapacidad sea motivo de exclusión.
DOI: 10.5281/zenodo.13242900
title: Planes nacionales 2002 – 2024

description: Planes



Resumen contenido







Plan Sectorial de Educación

2002- 2006



«La Revolución Educativa», con ampliación al 92 % de cobertura, creando 1,5 millones de cupos, priorizando la atención de población más vulnerable. 





Plan Sectorial de Educación

2006- 2010



«La Revolución Educativa», aumentando oportunidades de acceso y permanencia en la educación hasta el nivel medio, para disminuir la extraedad. 





Plan Sectorial de Educación 2010 – 2014



Educación de Calidad, el Camino a la Prosperidad, implementando un esquema de servicio educativo que brindara una respuesta integral a la diversidad, ofreciera condiciones de calidad y asegurara la transparencia en el uso de los recursos.

 





Plan Nacional de

Desarrollo 2014-2018



«Todos por un nuevo país». Priorizó un territorio libre de analfabetismo en 2018, para hacer de Colombia el país mejor educado de América Latina en 2025, planteando líneas estratégicas como «Colombia Libre de Analfabetismo».





Plan Nacional Decenal de Educación 2006 - 2016



Definido como pacto social por el derecho a la educación, con el fin de servir de ruta y horizonte para el desarrollo educativo del país, de referente obligatorio de planeación para todos los gobiernos e instituciones educativas y de instrumento de movilización social y política en torno a la defensa de la educación.





Plan Nacional Decenal de Educación 2017 - 2026



Definido como un pacto social en la medida en que su formulación y ejecución comprometa a todos los agentes responsables de la educación, representados en el Estado, la sociedad y la familia.





Plan Nacional de Desarrollo 2023-2026



«Colombia potencia mundial de la vida». Reivindica la justicia social, poniendo en marcha desde los territorios transformaciones del sector educativo para promover la equidad territorial y garantizar el derecho a una educación de calidad para todos.
DOI: 10.5281/zenodo.13242901
title: Planes nacionales 2002 – 2024

description: Planes



Resumen contenido







Plan Sectorial de Educación

2002- 2006



«La Revolución Educativa», con ampliación al 92 % de cobertura, creando 1,5 millones de cupos, priorizando la atención de población más vulnerable. 





Plan Sectorial de Educación

2006- 2010



«La Revolución Educativa», aumentando oportunidades de acceso y permanencia en la educación hasta el nivel medio, para disminuir la extraedad. 





Plan Sectorial de Educación 2010 – 2014



Educación de Calidad, el Camino a la Prosperidad, implementando un esquema de servicio educativo que brindara una respuesta integral a la diversidad, ofreciera condiciones de calidad y asegurara la transparencia en el uso de los recursos.

 





Plan Nacional de

Desarrollo 2014-2018



«Todos por un nuevo país». Priorizó un territorio libre de analfabetismo en 2018, para hacer de Colombia el país mejor educado de América Latina en 2025, planteando líneas estratégicas como «Colombia Libre de Analfabetismo».





Plan Nacional Decenal de Educación 2006 - 2016



Definido como pacto social por el derecho a la educación, con el fin de servir de ruta y horizonte para el desarrollo educativo del país, de referente obligatorio de planeación para todos los gobiernos e instituciones educativas y de instrumento de movilización social y política en torno a la defensa de la educación.





Plan Nacional Decenal de Educación 2017 - 2026



Definido como un pacto social en la medida en que su formulación y ejecución comprometa a todos los agentes responsables de la educación, representados en el Estado, la sociedad y la familia.





Plan Nacional de Desarrollo 2023-2026



«Colombia potencia mundial de la vida». Reivindica la justicia social, poniendo en marcha desde los territorios transformaciones del sector educativo para promover la equidad territorial y garantizar el derecho a una educación de calidad para todos.
DOI: 10.5281/zenodo.13243553
title: Matriz de triangulación, contrastación y teorización para definir población objetivo

description: CATEGORÍAS



INFORMANTES





Informante 1



Informante 2



Informante 3



Informante 4





Mayor dificultad para educarse en áreas rurales y rurales dispersas.



Personas en edad escolar que residen en zonas rurales dispersas tienen más impedimentos para terminar su educación básica. 



Personas en edad escolar que residen en zonas rurales enfrentan dificultades para terminar su educación básica.



Personas en edad escolar de zonas suburbanas afrontan algunos obstáculos para terminar su educación básica.



Personas en edad escolar de zonas urbanas tienen menos problemas para terminar su educación básica. 





Observación participante



En la observación se constató que la mayoría de las personas en extraedad escolar que no pudieron terminar su educación básica y media son más proclives a la deserción escolar por su convicción de que el estudio en las zonas alejadas de los cascos urbanos es difícil de terminar y posiblemente no es tan significativa para quienes devengan sus ingresos de las labores del campo.





Apoyo técnico



Existen diferencias de acceso a la educación elemental entre los estudiantes de hoy en edad escolar y los jóvenes y adultos que no terminaron su formación primaria y secundaria cimentada en la ausencia de cupos para la modalidad de adultos en las instituciones educativas y en la creencia de que la calidad de esta modalidad educativa es inferior a la regular, máxime en zonas rurales y rurales dispersas del país; imaginario que López (2006, 148), citado por Monroy et al. (2021, 81), corrobora afirmando que: «el sector rural arrastra un rezago evidente en materia educativa, lo cual incide sobre la calidad de vida y la economía rural», por cuanto, como afirman Martín et al. (2022, 138), una de las dificultades para que los estudiantes campesinos no puedan contar con calidad en su educación, tiene que ver con la insuficiencia de la cantidad de cupos educativos en las áreas rurales, especialmente en preescolar y secundaria, aunque, por otra parte, agudizan la problemática las altas tasas de deserción.g
DOI: 10.5281/zenodo.13243554
title: Matriz de triangulación, contrastación y teorización para definir población objetivo

description: CATEGORÍAS



INFORMANTES





Informante 1



Informante 2



Informante 3



Informante 4





Mayor dificultad para educarse en áreas rurales y rurales dispersas.



Personas en edad escolar que residen en zonas rurales dispersas tienen más impedimentos para terminar su educación básica. 



Personas en edad escolar que residen en zonas rurales enfrentan dificultades para terminar su educación básica.



Personas en edad escolar de zonas suburbanas afrontan algunos obstáculos para terminar su educación básica.



Personas en edad escolar de zonas urbanas tienen menos problemas para terminar su educación básica. 





Observación participante



En la observación se constató que la mayoría de las personas en extraedad escolar que no pudieron terminar su educación básica y media son más proclives a la deserción escolar por su convicción de que el estudio en las zonas alejadas de los cascos urbanos es difícil de terminar y posiblemente no es tan significativa para quienes devengan sus ingresos de las labores del campo.





Apoyo técnico



Existen diferencias de acceso a la educación elemental entre los estudiantes de hoy en edad escolar y los jóvenes y adultos que no terminaron su formación primaria y secundaria cimentada en la ausencia de cupos para la modalidad de adultos en las instituciones educativas y en la creencia de que la calidad de esta modalidad educativa es inferior a la regular, máxime en zonas rurales y rurales dispersas del país; imaginario que López (2006, 148), citado por Monroy et al. (2021, 81), corrobora afirmando que: «el sector rural arrastra un rezago evidente en materia educativa, lo cual incide sobre la calidad de vida y la economía rural», por cuanto, como afirman Martín et al. (2022, 138), una de las dificultades para que los estudiantes campesinos no puedan contar con calidad en su educación, tiene que ver con la insuficiencia de la cantidad de cupos educativos en las áreas rurales, especialmente en preescolar y secundaria, aunque, por otra parte, agudizan la problemática las altas tasas de deserción.g
DOI: 10.5281/zenodo.13243551
title: Matriz de categorización de los datos para establecer la población objetivo

description: Cód.



Abordaje de información de la realidad estudiada



Categorías Apriorísticas



Categorías Emergentes





INF001



Interrogante 1: ¿En su edad escolar, en qué municipio, de qué departamento y qué zona (rural, rural, dispersa, urbana o urbano-marginal) residía?

Informante clave 1: Estudiante

Respuestas: En mi edad escolar residía en una zona rural dispersa. En mi edad escolar residía en una zona rural.



Mayor dificultad para adelantar la educación básica y media en las zonas rurales y rurales dispersas de Colombia. 



Personas en edad escolar que residen en zonas rurales dispersas tienen más impedimentos para terminar su educación básica y media. (Cód. EST004, EST005, EST007, EST008, EST012)





INF002



Informante clave 2: Estudiante

Respuestas: En mi edad escolar residía en una zona urbano-marginal. En mi edad escolar residía en una zona urbana.



Personas en edad escolar que residen en zonas rurales enfrentan dificultades para terminar su educación básica y media. (Cód. EST002, EST003, EST011)





INF003



Informante clave 3: Estudiantes

Respuestas: En mi edad escolar residía en una zona urbano-marginal. En mi edad escolar residía en una zona urbana.



Personas en edad escolar que residen en zonas urbano-marginales afrontan algunos obstáculos para terminar su educación básica y media. (Cód.EST001, EST006, EST010)





INF004



Informante clave 4: Estudiantes

Respuestas: En mi edad escolar residía en una zona urbano-marginal. En mi edad escolar residía en una zona urbana.



Personas en edad escolar que residen en zonas urbanas tienen menos problemas para terminar su educación básica y media. (Cód. EST009)
DOI: 10.5281/zenodo.13243552
title: Matriz de categorización de los datos para establecer la población objetivo

description: Cód.



Abordaje de información de la realidad estudiada



Categorías Apriorísticas



Categorías Emergentes





INF001



Interrogante 1: ¿En su edad escolar, en qué municipio, de qué departamento y qué zona (rural, rural, dispersa, urbana o urbano-marginal) residía?

Informante clave 1: Estudiante

Respuestas: En mi edad escolar residía en una zona rural dispersa. En mi edad escolar residía en una zona rural.



Mayor dificultad para adelantar la educación básica y media en las zonas rurales y rurales dispersas de Colombia. 



Personas en edad escolar que residen en zonas rurales dispersas tienen más impedimentos para terminar su educación básica y media. (Cód. EST004, EST005, EST007, EST008, EST012)





INF002



Informante clave 2: Estudiante

Respuestas: En mi edad escolar residía en una zona urbano-marginal. En mi edad escolar residía en una zona urbana.



Personas en edad escolar que residen en zonas rurales enfrentan dificultades para terminar su educación básica y media. (Cód. EST002, EST003, EST011)





INF003



Informante clave 3: Estudiantes

Respuestas: En mi edad escolar residía en una zona urbano-marginal. En mi edad escolar residía en una zona urbana.



Personas en edad escolar que residen en zonas urbano-marginales afrontan algunos obstáculos para terminar su educación básica y media. (Cód.EST001, EST006, EST010)





INF004



Informante clave 4: Estudiantes

Respuestas: En mi edad escolar residía en una zona urbano-marginal. En mi edad escolar residía en una zona urbana.



Personas en edad escolar que residen en zonas urbanas tienen menos problemas para terminar su educación básica y media. (Cód. EST009)
DOI: 10.17632/dx6kyrszsn.1
title: Goan Fish Dataset - Day1&2

description: This dataset was created for:
1. Fish Identification
2. Fish Freshness Detection
3. Formalin Detection

For this study, the fish dataset was created for fish identification using 4 different fish families. Also, for fish freshness, a dataset was created using one fish family. 


The illumination condition and background were kept the same for all the images. 
Fish family used were local fish namely Green Chromide (Calandor), Crescent Grunter (Kharkhare), Gray Mullet (Shevto), Jibra (Local name) from brackish water for identification of fish whereas Indian Mackerel (Bangda) from seawater for experimental analysis of fish freshness from day 0 to day 5.

The next part of this dataset can be taken from: 
Simu, Shreyas (2024), “Goan Fish Dataset - Day3to7”, Mendeley Data, V1, doi: 10.17632/nz6tdyvjdh.1
DOI: 10.5281/zenodo.10822882
title: Biosurfer for systematic tracking of regulatory mechanisms leading to protein isoform diversity

description: This Zenodo repository contains data used for running Biosurfer_analysis, a tool to surf the biological network, from genome to transcriptome to proteome and back to gain insights into human disease biology.Repository content:



biosurfer_gencode_toy_data.zip: is a small subset of the GENCODE version 38 files (GTF, transcript FASTA, and protein FASTA) for the purpose of trial run and testing Biosurfer scripts.

biosurfer_gencode_toy_output.zip: Biosurfer generated output files for the toy data. 

biosurfer_gencode_v42_data.zip: contains GENCODE version 42 (basic) files (GTF, transcript FASTA, and protein FASTA).

biosurfer_gencode_v42_output.zip: Biosurfer generated output files for GENCODE 42 input files.

biosurfer_wtc11_data.zip: contains karyotypically normal human stem cell line data (WTC11) file (GTF, transcript FASTA, and protein FASTA).

biosurfer_wtc11_output.zip: Biosurfer generated output files for WTC11 files.

APPRIS analysis.zip: Intermediate files (CSV) detailing the APPRIS isoforms information utilized in the associated manuscript.
DOI: 10.5281/zenodo.10822881
title: Biosurfer for systematic tracking of regulatory mechanisms leading to protein isoform diversity

description: This Zenodo repository contains data used for running Biosurfer_analysis, a tool to surf the biological network, from genome to transcriptome to proteome and back to gain insights into human disease biology.Repository content:



biosurfer_gencode_toy_data.zip: is a small subset of the GENCODE version 38 files (GTF, transcript FASTA, and protein FASTA) for the purpose of trial run and testing Biosurfer scripts.

biosurfer_gencode_toy_output.zip: Biosurfer generated output files for the toy data. 

biosurfer_gencode_v42_data.zip: contains GENCODE version 42 (basic) files (GTF, transcript FASTA, and protein FASTA).

biosurfer_gencode_v42_output.zip: Biosurfer generated output files for GENCODE 42 input files.

biosurfer_wtc11_data.zip: contains karyotypically normal human stem cell line data (WTC11) file (GTF, transcript FASTA, and protein FASTA).

biosurfer_wtc11_output.zip: Biosurfer generated output files for WTC11 files.

APPRIS analysis.zip: Intermediate files (CSV) detailing the APPRIS isoforms information utilized in the associated manuscript.

biosurfer_mouse.zip: contains GENCODE Mouse version M35 (basic) files (GTF, transcript FASTA, and protein FASTA).

biosurfer_mouse_output.zip: Biosurfer generated output files for GENCODE M35 input files.
DOI: 10.5281/zenodo.13243233
title: Biosurfer for systematic tracking of regulatory mechanisms leading to protein isoform diversity

description: This Zenodo repository contains data used for running Biosurfer_analysis, a tool to surf the biological network, from genome to transcriptome to proteome and back to gain insights into human disease biology.Repository content:



biosurfer_gencode_toy_data.zip: is a small subset of the GENCODE version 38 files (GTF, transcript FASTA, and protein FASTA) for the purpose of trial run and testing Biosurfer scripts.

biosurfer_gencode_toy_output.zip: Biosurfer generated output files for the toy data. 

biosurfer_gencode_v42_data.zip: contains GENCODE version 42 (basic) files (GTF, transcript FASTA, and protein FASTA).

biosurfer_gencode_v42_output.zip: Biosurfer generated output files for GENCODE 42 input files.

biosurfer_wtc11_data.zip: contains karyotypically normal human stem cell line data (WTC11) file (GTF, transcript FASTA, and protein FASTA).

biosurfer_wtc11_output.zip: Biosurfer generated output files for WTC11 files.

APPRIS analysis.zip: Intermediate files (CSV) detailing the APPRIS isoforms information utilized in the associated manuscript.

biosurfer_mouse.zip: contains GENCODE Mouse version M35 (basic) files (GTF, transcript FASTA, and protein FASTA).

biosurfer_mouse_output.zip: Biosurfer generated output files for GENCODE M35 input files.
DOI: 10.5281/zenodo.13244008
title: Lab_21_SOP - Concordant inter-laboratory derived concentrations of ceramides in human plasma reference materials via authentic standards

description: Lab_21_SOP - Concordant inter-laboratory derived concentrations of ceramides in human plasma reference materials via authentic standards - mzML files
This dataset is part of the ILS Ceramide Ring Trial. The suffix 'SOP' indicates that the results were obtained using the recommended and standard operating procedure protocol to prepare and measure all samples, while the suffix 'OTHER' indicates that the corresponding lab prepared and measured the samples according to their own internal protocol. Please check the corresponding mapping file 'ILS-Ceramide-Ring-Trial-Datasets.csv' in the ILS Ceramide Ring Trial record for a mapping of the originally submitted lab reports and the final lab number as reported in the manuscript.
All reports together with the code for analysis and visualization, reproducing the figures in the manuscript, are available under the following doi: https://zenodo.org/doi/10.5281/zenodo.10081970. This links to releases of the following GitHub repository: https://github.com/lifs-tools/ils-ceramide-ring-trial. The archived version of the lab reports, workflow source code and manuscript visualizations are also available here.
Please note that most datasets have been acquired in MRM mode, such that the msconvert conversion to mzML has stored the MRM data in the chromatogram part of the mzML files. 
The msconvert Docker container (Proteowizard release: 3.0.24172 (63d00b1), build date Jun 202 2024 20:01:14) was used with the native vendor libraries / peak picking for conversion, using default arguments. m/z values were encoded with 64 bit (default), while intensity values were encoded with 32 bit (default). All binary data was zlib-compressed.