cometadata/datacite-titles-descriptions-related-identifiers huggingface dataset:
DOI: 10.5281/zenodo.1001032
title: Model Spectra For Morley Et Al. 2017 (Observing The Atmospheres Of Known Temperate Earth-Sized Planets With Jwst)

description: README

This file contains the model spectra presented in Morley et al. 2017, Observing the Atmospheres of Known Temperate Earth-sized Planets with JWST. 

The models are organized as follows: 

##########################<br>
## Transmission spectra ##<br>
##########################

transmission_spectra contains 4 folders:<br>
alb0.0_massradiusrel includes models with Bond albedo=0.0, and planet masses assuming the Weiss & Marcy 2014 mass-radius relationship<br>
alb0.3_massradiusrel includes models with Bond albedo=0.3, and planet masses assuming the Weiss & Marcy 2014 mass-radius relationship<br>
alb0.0_measured_masses includes models with Bond albedo=0.0, and observed planet masses, as described in Morley et al. 2017<br>
alb0.3_measured_masses includes models with Bond albedo=0.3, and observed planet masses, as described in Morley et al. 2017

each file contains the wavelength and model transit depth from 0.3 to 250 microns, calculated at 1 cm-1 wavenumber resolution. 

The file name indicates the planet name, model surface pressure (in bar), Bond albedo, and the assumed composition (Earth-, Venus-, or<br>
Titan-based compositions, calculated in chemical equilibrium at each layer of the model, as described in Morley et al. 2017). 

(e.g. trans_spect_massradiusrel_gj1132b_psurf0.1_alb0.0_chem_earth.p.txt is a model of GJ 1132b, assuming the Weiss/Marcy mass-radius relationship, with a surface pressure of 0.1 bar, Bond albedo of 0.0, and an Earth-based composition). 

##########################<br>
##   Emission spectra   ##<br>
##########################

emission_spectra contains 4 folders:<br>
alb0.0 includes models with Bond albedo=0.0<br>
alb0.3 includes models with Bond albedo=0.3<br>
alb0.7 includes models with Bond albedo=0.7<br>
emission_spectra_dividestar includes models that have already been divided by a model stellar spectrum, for convenience. 

<br>
each file contains the wavelength and model thermal emission flux in W/m2/m from 0.3 to 250 microns, calculated at 1 cm-1 wavenumber resolution. 

The file name indicates the planet name, model surface pressure (in bar), Bond albedo, and the assumed composition (Earth-, Venus-, or<br>
Titan-based compositions, calculated in chemical equilibrium at each layer of the model, as described in Morley et al. 2017). 

(e.g. gj1132b_psurf0.01_alb0.0_chem_earth.spec is a model of GJ 1132b with a surface pressure of 0.01 bar, Bond albedo of 0.0, and an Earth-based composition). 

The models in emission_spectra_dividestar instead contain the flux of the planet divided by the flux of the star. 

 

##########################<br>
##    Eclipse Depths    ##<br>
##########################

eclipse_depths contains a file for each planet with calculated eclipse depths for each of the wide-band JWST MIRI filters (http://ircamera.as.arizona.edu/MIRI/pces.htm).
DOI: 10.5281/zenodo.1001033
title: Model Spectra For Morley Et Al. 2017 (Observing The Atmospheres Of Known Temperate Earth-Sized Planets With Jwst)

description: README

This file contains the model spectra presented in Morley et al. 2017, Observing the Atmospheres of Known Temperate Earth-sized Planets with JWST. 

The models are organized as follows: 

##########################<br>
## Transmission spectra ##<br>
##########################

transmission_spectra contains 4 folders:<br>
alb0.0_massradiusrel includes models with Bond albedo=0.0, and planet masses assuming the Weiss & Marcy 2014 mass-radius relationship<br>
alb0.3_massradiusrel includes models with Bond albedo=0.3, and planet masses assuming the Weiss & Marcy 2014 mass-radius relationship<br>
alb0.0_measured_masses includes models with Bond albedo=0.0, and observed planet masses, as described in Morley et al. 2017<br>
alb0.3_measured_masses includes models with Bond albedo=0.3, and observed planet masses, as described in Morley et al. 2017

each file contains the wavelength and model transit depth from 0.3 to 250 microns, calculated at 1 cm-1 wavenumber resolution. 

The file name indicates the planet name, model surface pressure (in bar), Bond albedo, and the assumed composition (Earth-, Venus-, or<br>
Titan-based compositions, calculated in chemical equilibrium at each layer of the model, as described in Morley et al. 2017). 

(e.g. trans_spect_massradiusrel_gj1132b_psurf0.1_alb0.0_chem_earth.p.txt is a model of GJ 1132b, assuming the Weiss/Marcy mass-radius relationship, with a surface pressure of 0.1 bar, Bond albedo of 0.0, and an Earth-based composition). 

##########################<br>
##   Emission spectra   ##<br>
##########################

emission_spectra contains 4 folders:<br>
alb0.0 includes models with Bond albedo=0.0<br>
alb0.3 includes models with Bond albedo=0.3<br>
alb0.7 includes models with Bond albedo=0.7<br>
emission_spectra_dividestar includes models that have already been divided by a model stellar spectrum, for convenience. 

<br>
each file contains the wavelength and model thermal emission flux in W/m2/m from 0.3 to 250 microns, calculated at 1 cm-1 wavenumber resolution. 

The file name indicates the planet name, model surface pressure (in bar), Bond albedo, and the assumed composition (Earth-, Venus-, or<br>
Titan-based compositions, calculated in chemical equilibrium at each layer of the model, as described in Morley et al. 2017). 

(e.g. gj1132b_psurf0.01_alb0.0_chem_earth.spec is a model of GJ 1132b with a surface pressure of 0.01 bar, Bond albedo of 0.0, and an Earth-based composition). 

The models in emission_spectra_dividestar instead contain the flux of the planet divided by the flux of the star. 

 

##########################<br>
##    Eclipse Depths    ##<br>
##########################

eclipse_depths contains a file for each planet with calculated eclipse depths for each of the wide-band JWST MIRI filters (http://ircamera.as.arizona.edu/MIRI/pces.htm).
DOI: 10.5281/zenodo.1003672
title: Mapping Of Phosphorylation Modifications Of Insect Cell Derived Huntingtin (2017/10/05)

description: Huntingtin structure-function open lab notebook project
DOI: 10.5281/zenodo.1003673
title: Mapping Of Phosphorylation Modifications Of Insect Cell Derived Huntingtin (2017/10/05)

description: Huntingtin structure-function open lab notebook project
DOI: 10.14457/tu.the.2013.7
title: “คนกลุ่มน้อยนิด” กับ “ชีวิตแห่งการต่อรอง” ในบริบทความรุนแรงถึงตาย: กรณีศึกษาชาวคาทอลิกในปัตตานี
DOI: 10.14457/tu.the.2014.10
title: แนวทางการใช้วิธีการประเมินผลแสงธรรมชาติโดยวิธีการพลวัตสำหรับอาคารสำนักงาน

description: ปัจจุบันการประเมินผลแสงธรรมชาติจะใช้ค่าตัวประกอบแสงธรรมชาติซึ่งเป็นวิธีแบบอพลวัต (Static Daylighting Metric) อย่างไรก็ตามวิธีดังกล่าวไม่สามารถแสดงประสิทธิภาพและประโยชน์ของแสงธรรมชาติได้โดยแท้จริง ดังนั้นงานวิจัยนี้ได้ทำการศึกษาการจำลองแสงธรรมชาติในอาคารสำนักงานเปรียบเทียบระหว่างวิธีการอพลวัตและวิธีการพลวัต (Dynamic Daylighting Metric) โดยเลือกใช้ค่า Daylight Autonomy และค่า Useful Daylight Illuminance ซึ่งสามารถแสดงปริมาณและคุณภาพของแสงที่แตกต่างกันตามสภาพท้องฟ้าจริงในแต่ละช่วงเวลาได้ การศึกษาครั้งนี้ใช้โปรแกรม DAYSIM 2.1 ผ่านการสร้างแบบจำลองอาคารด้วยโปรแกรม Ecotect Analysis 2011 และกำหนดขอบเขตอาคารที่ศึกษาเป็นอาคารสำนักงานที่พบได้ทั่วไปในเขตกรุงเทพมหานคร มีขนาดความกว้าง 19.8 เมตร และระยะความลึกจากขอบอาคารถึงแกนอาคาร 12.2 เมตร กำหนดสัดส่วนช่องเปิดต่อพื้นผนัง  (Window to wall ratio) 40% 60% และ 80% และกำหนดรูปแบบการติดตั้งหิ้งสะท้อนแสงที่แตกต่างกันเพื่อดูผลของแสงในอาคารที่ติดตั้งอุปกรณ์บังแดดผลการทดลองชี้ให้เห็นว่าการใช้ค่าตัวประกอบแสงธรรมชาติเป็นหน่วยวัดในการประเมินผลแสงธรรมชาติด้วยวิธีการอพลวัตกับอาคารที่มีสัดส่วนช่องเปิดต่อพื้นที่ผนัง 40% 60% และ 80% นั้นส่งผลให้สัดส่วนพื้นที่ใช้งานแสงธรรมชาติที่มีค่าตัวประกอบแสงธรรมชาติมากกว่า 2% เพิ่มขึ้นตามขนาดของช่องเปิดและมีสัดส่วนของพื้นที่ใช้งานแสงธรรมชาติใกล้เคียงกันในทุกทิศของช่องเปิด ในส่วนของการใช้ค่า Daylight Autonomy ในการประเมินผลแสงธรรมชาติด้วยวิธีการพลวัตนั้นแม้ว่าสัดส่วนช่องเปิดต่อพื้นที่ผนังที่มากขึ้นจะทำให้สัดส่วนของพื้นที่ที่ได้รับแสงธรรมชาติเพิ่มมากขึ้นก็ตาม แต่เป็นการให้ข้อมูลในเชิงปริมาณเท่านั้นหากนำผลการประเมินแสงธรรมชาติ   โดยใช้ค่า Useful Daylight Illuminance มาพิจารณาควบคู่กันจะเห็นว่าสัดส่วนพื้นที่ที่ได้รับแสงธรรมชาติที่เพิ่มขึ้นตามขนาดช่องเปิดที่ใหญ่ขึ้นไม่ได้บ่งบอกถึงคุณภาพของแสงที่สอดคล้องกันตามไปด้วย ซึ่งการออกแบบเพื่อใช้แสงธรรมชาติในประเทศไทยควรคำนึงถึงปริมาณความส่องสว่างที่มากเกินไปเพราะจะทำให้ความร้อนถ่ายเทเข้าสู่อาคารมากขึ้น ดังนั้นหากใช้ค่า Daylight Autonomy   ในการประเมินผลแสงธรรมชาติจึงควรใช้ Useful Daylight Illuminance ในการพิจารณาประสิทธิภาพการใช้แสงธรรมชาติในอาคารควบคู่กันจึงจะทำให้เกิดความสอดคล้องกันทั้งในเชิงปริมาณและคุณภาพของแสงที่ได้รับ ทั้งนี้ผลการวิจัยดังกล่าวเป็นจุดเริ่มต้นของข้อเสนอแนะในการปรับเปลี่ยนรูปแบบการประเมินผลแสงธรรมชาติในอาคารสำนักงานให้มีประสิทธิภาพสอดคล้องกับสภาพแสงในการใช้งานจริงมากขึ้น
DOI: 10.5281/zenodo.1003548
title: Costa Rica Friction Experiments

description: Intermediate (10-2 m/s) and high (1m/s) velocity experiments on IODP samples collected offshore Costa Rica during Exp. 334 and 344
DOI: 10.5281/zenodo.1003549
title: Costa Rica Friction Experiments

description: Intermediate (10-2 m/s) and high (1m/s) velocity experiments on IODP samples collected offshore Costa Rica during Exp. 334 and 344
DOI: 10.5281/zenodo.1003122
title: Impact Of Colony Size On Survival And Sanitary Strategies In Fungus-Infected Ant Colonies

description: Data of the scientifc paper "Impact of colony size on survival and sanitary strategies in fungus-infected ant colonies"
DOI: 10.5281/zenodo.1003123
title: Impact Of Colony Size On Survival And Sanitary Strategies In Fungus-Infected Ant Colonies

description: Data of the scientifc paper "Impact of colony size on survival and sanitary strategies in fungus-infected ant colonies"
DOI: 10.14457/bru.res.2014.1
title: Decision support system for orthodontic treatment needs

description: innervate the meninges forming the trigeminocervical complex, which includes the caudal extension of
DOI: 10.5281/zenodo.1002923
title: Updated Dartmouth.Tri For Isochrones Python Package

description: This replaces the `dartmouth.tri` file from https://zenodo.org/record/161241.
DOI: 10.5281/zenodo.1002924
title: Updated Dartmouth.Tri For Isochrones Python Package

description: This replaces the `dartmouth.tri` file from https://zenodo.org/record/161241.
DOI: 10.5281/zenodo.1003084
title: River Segmentation Dataset

description: This dataset contains 300 images of rivers. Each image is associated with a ground-truth image where the 0 pixels correspond to background pixels and pixels with 1 value correspond to water pixels.
DOI: 10.5281/zenodo.1003085
title: River Segmentation Dataset

description: This dataset contains 300 images of rivers. Each image is associated with a ground-truth image where the 0 pixels correspond to background pixels and pixels with 1 value correspond to water pixels.
DOI: 10.5517/ccdc.csd.cc1p5d7h
title: CCDC 1554316: Experimental Crystal Structure Determination

description: Related Article: Gökhan Elmacı, Halil Duyar, Burcu Aydıner, Nurgül Seferoğlu, Mir Abolfazl Naziri, Ertan Şahin, Zeynel Seferoğlu|2018|J.Mol.Struct.|1162|37|doi:10.1016/j.molstruc.2018.02.035
description: An entry from the Cambridge Structural Database, the world’s repository for small molecule crystal structures. The entry contains experimental data from a crystal diffraction study. The deposited dataset for this entry is freely available from the CCDC and typically includes 3D coordinates, cell parameters, space group, experimental conditions and quality measures.
DOI: 10.5281/zenodo.1002926
title: Updated Dartmouth Grid Files For Use In Isochrones Python Package

description: These files replace the dartmouth stellar model grid files from https://zenodo.org/record/161241.
DOI: 10.5281/zenodo.1002927
title: Updated Dartmouth Grid Files For Use In Isochrones Python Package

description: These files replace the dartmouth stellar model grid files from https://zenodo.org/record/161241.
DOI: 10.14457/stou.the.2006.296
title: บทบาทในการจัดทำแผนพัฒนาการเกษตร ของคณะกรรมการบริหารศูนย์บริการ และถ่ายทอดเทคโนโลยีการเกษตรประจำตำบล จังหวัดอุดรธานี /
DOI: 10.14457/stou.the.2006.297
title: บทบาทผู้บริหารสถานศึกษา ตามแนวทางการบริหารงาน โดยใช้โรงเรียนเป็นฐาน ในทรรศนะของคณะกรรมการสถานศึกษาขั้นพื้นฐาน สังกัดสำนักงานเขตพื้นที่การศึกษาอุตรดิตถ์ เขต 1 /
DOI: 10.14457/stou.the.2006.298
title: บทบาทผู้นำทางการเมืองของ พ.ต.ท.ทักษิณ ชินวัตร กับการพัฒนาการทางการเมืองในระบอบประชาธิปไตย /
DOI: 10.14457/stou.the.2006.299
title: บทบาทที่คาดหวังและบทบาทที่ปฏิบัติจริงของเครือข่ายผู้ปกครอง ในสถานศึกษาขั้นพื้นฐานระดับมัธยมศึกษา ในกรุงเทพมหานคร /
DOI: 10.14457/stou.the.2006.300
title: ความพึงพอใจของผู้ใช้บริการกิจการสวัสดิการ พีเอ็กซ์กองทัพบก /
DOI: 10.14457/tu.the.2006.299
title: บทบาทและการมีส่วนร่วมของชุมชนในกระบวนการยุติธรรมเชิงสมานฉันท์ /
DOI: 10.14457/tu.the.2006.300
title: บทบาทนิตยสารทางการเมือง ที่มีผลต่อการมีส่วนร่วมทางการเมือง ของนักศึกษาในเขตกรุงเทพมหานคร /
DOI: 10.14457/tu.the.2006.301
title: บทบาทของอัยการสูงสุด ในการดำเนินคดีในศาลฎีกา แผนกคดีอาญา ของผู้ดำรงตำแหน่งทางการเมือง /
DOI: 10.14457/tu.the.2006.302
title: บทบาทของหนังสือพิมพ์ท้องถิ่น กับการส่งเสริมสุขภาพใน 4 จังหวัดภาคเหนือตอนบน /
DOI: 10.14457/tu.the.2006.303
title: บทบาทของราษฎรอาสาสมัครตำรวจชุมชนตำบล จังหวัดสมุทรสาคร /
DOI: 10.14458/krirk.the.2006.108
title: บทบาทและอำนาจหน้าที่ของผู้ตรวจการแผ่นดินของรัฐสภาไทย /
DOI: 10.14458/krirk.the.2006.109
title: บทบาทของอนุศาสนาจารย์เรือนจำ /
DOI: 10.14458/krirk.the.2006.110
title: บทบาทของพนักงานสอบสวนคดีพิเศษและเจ้าหน้าที่คดีพิเศษ /
DOI: 10.14457/cu.the.2005.664
title: พฤติกรรมการบริโภคอาหารจานด่วน : ศึกษากรณีนิสิตจุฬาลงกรณ์มหาวิทยาลัย /
DOI: 10.14457/pnru.the.2006.123
title: บทบาทผู้บริหารในการส่งเสริมการจัดการเรียนการสอนพระพุทธศาสนาในโรงเรียนที่เปิดสอนช่วงชั้นที่ 3-4 สังกัดสำนักงานเขตพื้นที่การศึกษาสระบุรี เขต 1 และ 2 /
DOI: 10.14457/pnru.the.2006.124
title: บทบาทผู้นำในการพัฒนาบุคลากร ในโรงงานอุตสาหกรรมขนาดกลางและขนาดย่อม เขตอำเภอธัญบุรี จังหวัดปทุมธานี /
DOI: 10.14457/su.the.2006.285
title: บทบาทของผู้บริหารที่มีต่อการสนับสนุนสื่อการเรียนการสอน : กรณีศึกษาในมหาวิทยาลัยเอเชียอาคเนย์ /
DOI: 10.14457/su.the.2006.286
title: บทบาทของผู้บริหารต่อการพัฒนาหลักสูตรและกระบวนการเรียนการสอนตามหลักสูตรการศึกษาขั้นพื้นฐาน พุทธศักราช 2544 /
DOI: 10.14457/swu.the.2006.2
title: บทบาทของเลขานุการผู้บริหารมหาวิทยาลัยเอกชน เขตกรุงเทพมหานครและปริมณฑล /
DOI: 10.14457/tu.the.2006.304
title: บทบาทของผู้นำชุมชนในการจัดการปัญหาความรุนแรงต่อผู้สูงอายุในครอบครัว : ศึกษาเฉพาะกรณีอำเภอชนบท จังหวัดขอนแก่น /
DOI: 10.14458/dpu.the.2006.159
title: บทบาทของสำนักราชเลขาธิการในกระบวนการข่าวในพระราชสำนัก /
DOI: 10.14458/dpu.the.2006.160
title: บทบาทของศาลชั้นต้นในการค้นหาความจริง /
DOI: 10.14457/kku.res.2006.27
title: บทบาทของแฟกเตอร์ XIII เกี่ยวกับการเกิดลิ่มเลือดในหัวใจห้องบนซ้ายของผู้ป่วยโรคลิ้นหัวใจไมตรัลตีบ /
DOI: 10.14457/kku.res.2009.155
title: ระดับของปัจจัยการห้ามเลือดที่สัมพันธ์ กับการทำงานผิดปกติของเซลล์เอนโดทีเลียม และจีนที่เกี่ยวข้องในผู้ป่วยโรคหลอดเลือดหัวใจ /
DOI: 10.14457/kku.res.2009.156
title: โพลีมอร์ฟิซึมของไกลโคโปรตีนของเกล็ดเลือด ในผู้ที่มีระดับไขมันในเลือดผิดปกติ /
DOI: 10.14457/pnru.res.2006.8
title: บทบาทของพระสังฆาธิการ ในการเผยแผ่พระพุทธศาสนา ในโรงเรียนเขตอำเภอเมือง จังหวัดสระบุรี สังกัดสำนักงานเขตพื้นที่การศึกษาสระบุรี เขต 1 /
DOI: 10.14457/rru.res.2006.1
title: บทบาทของผู้นำท้องถิ่นในการอนุรักษ์และฟื้นฟูวัฒนธรรมท้องถิ่นจังหวัดฉะเชิงเทรา /
DOI: 10.14457/ssru.res.2006.10
title: ความพึงพอใจของผู้ใช้บริการสำนักส่งเสริมวิชาการและงานทะเบียน มหาวิทยาลัยราชภัฏสวนดุสิต /
DOI: 10.14457/tru.the.2006.139
title: บทบาทของผู้ทำหน้าที่นิเทศภายในโรงเรียน สังกัดสำนักงานเขตพื้นที่การศึกษาเพชรบูรณ์ เขต 3 /
DOI: 10.14457/tru.the.2006.140
title: ความพึงพอใจของผู้ใช้บริการบัตรเครดิตธนาคารกสิกรไทย ในจังหวัดลพบุรี /
DOI: 10.14457/tru.the.2006.141
title: บทบาทหน้าที่ในการบริหารของคณะกรรมการสถานศึกษาขั้นพื้นฐาน สังกัดสำนักงานเขตพื้นที่การศึกษานครสวรรค์ /
DOI: 10.14458/sju.res.2009.1
title: การเปิดรับสื่อและการใช้ประโยชน์จากข่าวสารการเมืองที่เปิดรับทางสื่อมวลชนของประชาชน /
DOI: 10.4225/08/59d7d6f2c9520
title: Parkes observations for project P892 semester 2017APRS_BPSR_21

description: SUPERBx is an extension to the SUPERB survey which looks at the highest Galactic latitudes in a search for fast radio bursts (FRBs). We will focus our efforts at high Galactic latitudes where our previous work has shown FRB detectability to be as much as 4 times higher than in the plane. SUPERBx uses optimised GPU codes to search for pulsars and fast radio bursts (FRBs), making discoveries in real time. Handling our data as it comes in is essential for the SKA Phase I era so this work applies directly to the high-data rates of next generation telescopes. The FRBs discovered (we have already discovered four FRBs in this project) will have much more associated information than all previous detections. Firstly our discovery lag is ~1 second, rather than months/years. The Parkes observations will be shadowed by other radio telescopes (in particular the refurbished Molonglo which has now reached a level of performance where it has independently discovered 3 FRBs in 2016) to allow localisation of the discovered FRBs, and a host of optical and high-energy telescopes will then be triggered as appropriate. This is key for identifying FRB host galaxies, so as to solve the mystery of their progenitors and to exploit their many uses as tools for precision cosmology measurements.
DOI: 10.14455/dpim.res.2003.1
title: การใช้ประโยชน์ยิปซัม และอุตสาหกรรมต่อเนื่องในประเทศไทย /
DOI: 10.14455/dpim.res.2005.1
title: การใช้ประโยชน์เฟลด์สปาร์และอุตสาหกรรมต่อเนื่องในประเทศไทย /
DOI: 10.14455/dpim.res.2006.1
title: บทบาทของเทคโนโลยีต่อการพัฒนาอุตสาหกรรม /
DOI: 10.14455/shr.res.2009.1
title: ความแตกต่างระหว่างท้องถิ่นกับการออกเสียงประชามติร่างรัฐธรรมนูญ พ.ศ.2550 : กรณีศึกษา เปรียบเทียบภาคตะวันออกเฉียงเหนือและภาคใต้ /
DOI: 10.14457/rru.res.2003.1
title: ภูมิปัญญาท้องถิ่นอำเภอเมือง อำเภอบางคล้า และอำเภอบ้านโพธิ์ จังหวัดฉะเชิงเทรา /
DOI: 10.14457/sru.res.2006.21
title: บทบาทของสื่อที่มีผลต่อการประหยัดพลังงานของประชาชนในจังหวัดสุราษฎร์ธานี /
DOI: 10.5281/zenodo.1003136
title: Amended Pama-Nyungan Colour Vocabularies

description: Terminology for basic colours in about 187 Pama-Nyungan languages.

Amended data table, based on the Word table http://www.pnas.org/content/suppl/2016/11/10/1613666113.DCSupplemental/pnas.1613666113.st01.docx published with H&B

H&B: Haynie, Hannah J & Claire Bowern. 2016. Phylogenetic approach to the evolution of color term systems. PNAS 113(48), 3666–13671. http://www.pnas.org/content/113/48/13666<br>
<br>
amendments (additions in green, deletions in red) as detailed in Supporting information http://hdl.handle.net/1885/123084 to:<br>
Nash, David. 2017. Loss of color terms not demonstrated. PNAS 114. 201714007. https://doi.org/10.1073/pnas.1714007114
description: H&B's footnotes omitted in this version.
DOI: 10.5281/zenodo.1003137
title: Amended Pama-Nyungan Colour Vocabularies

description: Terminology for basic colours in about 187 Pama-Nyungan languages.

Amended data table, based on the Word table http://www.pnas.org/content/suppl/2016/11/10/1613666113.DCSupplemental/pnas.1613666113.st01.docx published with H&B

H&B: Haynie, Hannah J & Claire Bowern. 2016. Phylogenetic approach to the evolution of color term systems. PNAS 113(48), 3666–13671. http://www.pnas.org/content/113/48/13666<br>
<br>
amendments (additions in green, deletions in red) as detailed in Supporting information http://hdl.handle.net/1885/123084 to:<br>
Nash, David. 2017. Loss of color terms not demonstrated. PNAS 114. 201714007. https://doi.org/10.1073/pnas.1714007114
description: H&B's footnotes omitted in this version.
DOI: 10.5517/ccdc.csd.cc1pdq2w
title: CCDC 1561348: Experimental Crystal Structure Determination

description: Related Article: P. Umarani, K. Jagannathan|2018|Physica B: Condensed Matter(Amsterdam)|530|215|doi:10.1016/j.physb.2017.10.020
description: An entry from the Cambridge Structural Database, the world’s repository for small molecule crystal structures. The entry contains experimental data from a crystal diffraction study. The deposited dataset for this entry is freely available from the CCDC and typically includes 3D coordinates, cell parameters, space group, experimental conditions and quality measures.
DOI: 10.5281/zenodo.1004619
title: Single Molecule, Full-Length Transcript Sequencing Provides Insight Into The Extreme Metabolism Of Ruby-Throated Hummingbird Archilochus Colubris

description: Hummingbirds can support their high metabolic rates exclusively by oxidizing ingested sugars, which is unsurprising given their sugar-rich nectar diet and use of energetically expensive hovering flight. However, they cannot rely on dietary sugars as a fuel during fasting periods, such as during the night, at first light, or when undertaking long-distance migratory flights, and must instead rely exclusively on onboard lipids. This metabolic flexibility is remarkable both in that the birds can switch between exclusive use of each fuel type within minutes and in that de novo lipogenesis from dietary sugar precursors is the principle way in which fat stores are built, sometimes at exceptionally high rates, such as during the few days prior to a migratory flight. The hummingbird hepatopancreas is the principle location of de novo lipogenesis and likely plays a key role in fuel selection, fuel switching, and glucose homeostasis. Yet understanding how this tissue, and the whole organism, achieves and moderates high rates of energy turnover is hampered by a fundamental lack of information regarding how genes coding for relevant enzymes differ in their sequence, expression, and regulation in these unique animals. To address this knowledge gap, we generated a de novo transcriptome of the hummingbird liver using PacBio full-length cDNA sequencing (Iso-Seq), yielding a total of 8.6Gb of sequencing data, or 2.6M reads from 4 different size fractions. We analyzed data using the SMRTAnalysis v3.1 Iso-Seq pipeline, including classification of reads and clustering of isoforms (ICE) followed by error-correction (Arrow). We performed orthology analysis to identify closely related sequences between our transcriptome and other avian and human gene sets. We also aligned our transcriptome against the Calypte anna genome where possible. Finally, we closely examined homology of critical lipid metabolic genes between our transcriptome data and avian and human genomes. We confirmed high levels of sequence divergence within hummingbird lipogenic enzymes, suggesting a high probability of adaptive divergent function in the lipogenic liver pathways. Our results have leveraged cutting-edge technology and a novel bioinformatics pipeline to provide a compelling first direct look at the transcriptome of this incredible organism.
description: This dataset contains high quality Arrow-polished Pacbio Iso-seq data (HQD), Cogent dataset for gene family prediction and redundancy reduction, and ANGEL predictions for coding sequence (.cds), protein sequence (.pep), and untranslated region (.utr) from both HQD and Cogent. Additionally, Cogent annotations predicted using BLAST best match are included.

Pacific Biosciences for reagents and SMRTcells as well as technical support. M. Schatz, E. Jarvis, J. Korlach, Y. Guo for discussion. HFSP grant #RGP0062/2016. Natural Sciences and Engineering Research Council of Canada Discovery Grant (#386466) to KCW.
DOI: 10.5517/ccdc.csd.cc1pk8wd
title: CCDC 1565744: Experimental Crystal Structure Determination

description: Related Article: Gangqiang Wang, Sen Zhao, Rongxing Chen, Liangfeng Yang, Jian Wang, Haibing Guo, Minghu Wu, Justin Domena, Yalan Xing, Shaofa Sun|2017|Tetrahedron Lett.|58|4308|doi:10.1016/j.tetlet.2017.10.004
description: An entry from the Cambridge Structural Database, the world’s repository for small molecule crystal structures. The entry contains experimental data from a crystal diffraction study. The deposited dataset for this entry is freely available from the CCDC and typically includes 3D coordinates, cell parameters, space group, experimental conditions and quality measures.
DOI: 10.14459/2017mp1394930
title: Result Data and Tool-Chain of the Device-to-Device Reuse Maximization Problem with Power Control