cometadata/datacite-titles-descriptions-related-identifiers huggingface dataset:
DOI: 10.22002/7775x-8s756
title: Pfl 121509 MP36

description: Prosthecobacter fluviatilis, 10jan14a_MP36_Pfl-stat_012, filaments,
description: <strong>Tilt Series Date:</strong> 2010-01-14</p>
<strong>Data Taken By:</strong> Martin Pilhofer</p>
<strong>Species / Specimen:</strong> Prosthecobacter fluviatilis</p>
<strong>Strain:</strong> None</p>
<strong>Tilt Series Settings:</strong>  Single Axis, tilt range: (-60.0°, 60.0°), step: 1°, constant angular increment, dosage: 180.0 eV/Å²,  defocus: -10.0 μm,  magnification: 22500x. </p>
<strong>Acquisition Software:</strong> Leginon</p>
<strong>Upload Method:</strong> rundir</p>
<strong>Processing Software Used:</strong> raptor</p>
<strong>Collaborators and Roles:</strong> cultured by Martin Pilhofer; data collected by Martin Pilhofer; processed by Martin Pilhofer</p>
<strong>Sample Preparation:</strong> quantifoil grid, 10nm gold, 100% humidity, blotting 1/-2/2/0/1/4/200</p>
  mpa2010-01-14-9_slicer5932.jpg: Unknown mpa2010-01-14-9_slicer5934.jpg: Flat vesicle ? mpa2010-01-14-9_slicer5936.jpg: Unknown
description: Files available via S3 at https://sdsc.osn.xsede.org/ini210004tommorrell/tomography_archive/mpa2010-01-14-9/rawdata/</p>10jan14a_MP36_Pfl-stat_012.mrc,  Tilt Series (Pixel Size 0.95 nm), 1.0 GB  
        
<a role="button" class="ui compact mini button" href="https://sdsc.osn.xsede.org/ini210004tommorrell/tomography_archive/mpa2010-01-14-9/rawdata/10jan14a_MP36_Pfl-stat_012.mrc"
        > <i class="download icon"></i> Download </a></p>

        10jan14a_MP36_Pfl-stat_012_part.rec,  Reconstruction (Pixel Size 1.9 nm), 838.9 MB  
        
<a role="button" class="ui compact mini button" href="https://sdsc.osn.xsede.org/ini210004tommorrell/tomography_archive/mpa2010-01-14-9/3dimage_14435/10jan14a_MP36_Pfl-stat_012_part.rec"
        > <i class="download icon"></i> Download </a></p>
DOI: 10.22002/bckd3-x8348
title: E. coli N050

description: Sandwich fusion to sfGFP. Wild Type MreB (no point mutations)
description: <strong>Tilt Series Date:</strong> 2014-03-27</p>
<strong>Data Taken By:</strong> Matt Swulius</p>
<strong>Species / Specimen:</strong> Escherichia coli </p>
<strong>Strain:</strong> NO50</p>
<strong>Tilt Series Settings:</strong>  Single Axis, tilt range: (-64.0°, 64.0°), step: 1°, constant angular increment, dosage: 200.0 eV/Å²,  defocus: -10.0 μm,  magnification: 22500x. </p>
<strong>Microscope:</strong> Caltech Polara</p>
<strong>Acquisition Software:</strong> UCSFTomo</p>
<strong>Upload Method:</strong> pipeline</p>
<strong>Processing Software Used:</strong> Raptor</p>
<strong>Collaborators and Roles:</strong> Josh Schaevitz</p>
<strong>Purification / Growth Conditions / Treatment:</strong> Grown at 37 to OD600 = 0.3 then plunge frozen.</p>
<strong>Sample Preparation:</strong> Plunge Frozen</p>
description: Files available via S3 at https://sdsc.osn.xsede.org/ini210004tommorrell/tomography_archive/mst2014-03-27-11/rawdata/</p>032714_NO500018.mrc,  Tilt Series (Pixel Size 0.48 nm), 3.7 GB  
        
<a role="button" class="ui compact mini button" href="https://sdsc.osn.xsede.org/ini210004tommorrell/tomography_archive/mst2014-03-27-11/rawdata/032714_NO500018.mrc"
        > <i class="download icon"></i> Download </a></p>

        032714_NO500018_full.rec,  Reconstruction (Pixel Size 0.96 nm), 3.6 GB  
        
<a role="button" class="ui compact mini button" href="https://sdsc.osn.xsede.org/ini210004tommorrell/tomography_archive/mst2014-03-27-11/3dimage_40555/032714_NO500018_full.rec"
        > <i class="download icon"></i> Download </a></p>
DOI: 10.22002/gqd8f-42484
title: COS7 tfx pNL4GFP and VPS4B(E235Q)

description: Whole cell ECT of COS7 cell expressing pNLGFP and VPS4B(E235Q)
description: <strong>Tilt Series Date:</strong> 2012-03-15</p>
<strong>Data Taken By:</strong> Cora Woodward</p>
<strong>Species / Specimen:</strong> Cercopithecus aethiops (monkey, African green)</p>
<strong>Strain:</strong> COS-7 ATCC CRL-1651</p>
<strong>Tilt Series Settings:</strong>  Single Axis, tilt range: (-50.0°, 50.0°), step: 1.5°, constant angular increment, dosage: 60.0 eV/Å²,  defocus: -6.0 μm,  magnification: 22500x. </p>
<strong>Acquisition Software:</strong> UCSF tomo</p>
<strong>Upload Method:</strong> rundir</p>
<strong>Processing Software Used:</strong> Raptor</p>
<strong>Collaborators and Roles:</strong> VPS4B (E235Q) expression construct provided by W.Sundquist (Utah); pNLGFP construct provided by I. Chen (UCLA)</p>
<strong>Purification / Growth Conditions / Treatment:</strong> lipofectamine transfection</p>
<strong>Sample Preparation:</strong> manual blotting</p>
description: Files available via S3 at https://sdsc.osn.xsede.org/ini210004tommorrell/tomography_archive/cwl2012-03-15-22/rawdata/</p>12mar15_c108_1_Cos7pNLDN_AT1bt10022.mrc,  Tilt Series (Pixel Size 0.9 nm), 561.7 MB  
        
<a role="button" class="ui compact mini button" href="https://sdsc.osn.xsede.org/ini210004tommorrell/tomography_archive/cwl2012-03-15-22/rawdata/12mar15_c108_1_Cos7pNLDN_AT1bt10022.mrc"
        > <i class="download icon"></i> Download </a></p>

        12mar15_c108_1_Cos7pNLDN_AT1bt10022_full.rec,  Reconstruction (Pixel Size 1.8 nm), 722.6 MB  
        
<a role="button" class="ui compact mini button" href="https://sdsc.osn.xsede.org/ini210004tommorrell/tomography_archive/cwl2012-03-15-22/3dimage_17889/12mar15_c108_1_Cos7pNLDN_AT1bt10022_full.rec"
        > <i class="download icon"></i> Download </a></p>
DOI: 10.22002/j93av-ahe34
title: V. cholerae delta CheA1,2,3

description: Vibrio cholerae strain deleted for CheA1, CheA2, and CheA3
description: <strong>Tilt Series Date:</strong> 2014-05-05</p>
<strong>Data Taken By:</strong> Ariane Briegel</p>
<strong>Species / Specimen:</strong> Vibrio cholerae</p>
<strong>Strain:</strong> O1 biovar El Tor</p>
<strong>Tilt Series Settings:</strong>  Single Axis, tilt range: (-60.0°, 60.0°), step: 1°, constant angular increment, dosage: 160.0 eV/Å²,  defocus: -10.0 μm,  magnification: 34000x. </p>
<strong>Microscope:</strong> Caltech Polara</p>
<strong>Acquisition Software:</strong> UCSFTomo</p>
<strong>Upload Method:</strong> pipeline</p>
<strong>Processing Software Used:</strong> Raptor</p>
<strong>Collaborators and Roles:</strong> Ikuro Kawagishi</p>
<strong>Purification / Growth Conditions / Treatment:</strong> Grew in LB 24 hours at 30C; diluted 150 µL into 2 mL Ca-HEPES buffer and grew 16 hours at 30C</p>
description: Files available via S3 at https://sdsc.osn.xsede.org/ini210004tommorrell/tomography_archive/aba2014-05-05-18/3dimage_42186/</p>VibrioDelta123May0018_part121_4.rec,  Reconstruction (Pixel Size 1.28 nm), 712.7 MB  
        
<a role="button" class="ui compact mini button" href="https://sdsc.osn.xsede.org/ini210004tommorrell/tomography_archive/aba2014-05-05-18/3dimage_42186/VibrioDelta123May0018_part121_4.rec"
        > <i class="download icon"></i> Download </a></p>

        VibrioDelta123May0018.mrc,  Tilt Series (Pixel Size 0.32 nm), 3.4 GB  
        
<a role="button" class="ui compact mini button" href="https://sdsc.osn.xsede.org/ini210004tommorrell/tomography_archive/aba2014-05-05-18/rawdata/VibrioDelta123May0018.mrc"
        > <i class="download icon"></i> Download </a></p>
DOI: 10.17632/sjmx5fykhy
title: LINF_260009800

description: GPN-loop GTPase 2; Leishmania infantum (strain JPCM5)
DOI: 10.17632/sjmx5fykhy.1
title: LINF_260009800

description: GPN-loop GTPase 2; Leishmania infantum (strain JPCM5)
DOI: 10.17632/6r7dykvvcw
title: LINF_260009400

description: Protein of unknown function - conserved; Leishmania infantum (strain JPCM5)
DOI: 10.17632/6r7dykvvcw.1
title: LINF_260009400

description: Protein of unknown function - conserved; Leishmania infantum (strain JPCM5)
DOI: 10.17632/krb35wd4s8
title: LINF_260009300

description: Cytosolic Fe-S cluster assembly factor NUBP2 homolog | Cfd1; Leishmania infantum (strain JPCM5)
DOI: 10.17632/krb35wd4s8.2
title: LINF_260009300

description: Cytosolic Fe-S cluster assembly factor NUBP2 homolog | Cfd1; Leishmania infantum (strain JPCM5)
DOI: 10.14457/stou.the.2007.561
title: ผลการใช้บทเรียนคอมพิวเตอร์ช่วยสอนวิชาภาษาไทย ที่มีต่อผลสัมฤทธิ์ด้านการอ่านของนักเรียนชั้นประถมศึกษาปีที่ 1 โรงเรียนวัดดอนใคร จังหวัดนครศรีธรรมราช

description: การวิจัยครั้งนี้มีวัตถุประสงค์เพื่อเปรียบเทียบผลสัมฤทธิ์ด้านการอ่านของนักเรียนก่อนและหลังเรียนด้วยบทเรียนคอมพิวเตอร์ช่วยสอนวิชาภาษาไทย กลุ่มตัวอย่างคือนักเรียนชั้นประถมศึกษาปีที่ 1 ภาคเรียนที่ 2 ปีการศึกษา 2550 โรงเรียนวัดดอนใคร จังหวัดนครศรีธรรมราช จํานวน 10 คน ได้มาโดยการเลือกแบบเจาะจง เครื่องมือที่ใช้ในการวิจัยได้แก่ บทเรียนคอมพิวเตอร์ช่วยสอนวิชาภาษาไทย แผนการสอนบทเรียน คอมพิวเตอร์ช่วยสอน และ แบบทดสอบวัดผลสัมฤทธิ์ด้านการอ่าน สถิติที่ใช้ในการวิเคราะห์ข้อมูลได้แก่ ค่าร้อยละ ค่าเฉลี่ย ส่วนเบี่ยงเบนมาตรฐาน และการทดสอบค่าที ผลการวิจัยพบว่า ผลสัมฤทธิ์ด้านการอ่านของนักเรียนชั้นประถมศึกษาปีที่ 1 หลังเรียน ด้วยบทเรียนคอมพิวเตอร์ช่วยสอนวิชาภาษาไทย สูงกว่าก่อนเรียนอย่างมีนัยสําคัญทางสถิติที่ระดับ .01
DOI: 10.17632/fxybn4v9jx
title: LINF_260008700

description: Tetratricopeptide repeat-containing protein; Leishmania infantum (strain JPCM5)
DOI: 10.17632/fxybn4v9jx.1
title: LINF_260008700

description: Tetratricopeptide repeat-containing protein; Leishmania infantum (strain JPCM5)
DOI: 10.14457/stou.the.2015.318
title: ปัจจัยส่วนประสมการตลาดบริการที่มีต่อการใช้บริการของลูกค้าตลาดฟู้ดวิลล่า ราชพฤกษ์ เขตตลิ่งชัน กรุงเทพมหานคร

description: การศึกษาครั้งนี้มีวัตถุประสงค์เพื่อศึกษา (1) ลักษณะส่วนบุคคลของผู้ใช้บริการตลาดฟู้ดวิลล่า ราชพฤกษ์ (2) ระดับความสําคัญของปัจจัยส่วนประสมการตลาดบริการที่มีต่อการใช้บริการของลูกค้าตลาดฟู้ดวิลล่า ราชพฤกษ์ (3) ลักษณะการใช้บริการของลูกค้าตลาดฟู้ดวิลล่า ราชพฤกษ์ การศึกษาครั้งนี้เป็นการวิจัยเชิงสํารวจ ประชากรคือ ผู้ใช้บริการตลาดฟู้ดวิลล่า ราชพฤกษ์ เขตตลิ่งชัน กรุงเทพมหานคร ไม่ทราบจํานวนประชากรที่แน่นอน กำหนดขนาดตัวอย่าง โดยใช้ความเชื่อมั่นร้อยละ 95 ได้จํานวน 400 คน สุ่มตัวอย่างแบบระบบ การเก็บรวบรวมข้อมูลใช้แบบสอบถามเป็นเครื่องมือ วิเคราะห์ข้อมูลโดยใช้สถิติเชิงพรรณนา คือ ค่าร้อยละ ค่าเฉลี่ย และ ส่วนเบี่ยงเบนมาตรฐาน ผลการศึกษา พบว่า (1) ผู้ตอบแบบสอบถามส่วนใหญ่เป็นเพศชาย มีอายุระหว่าง 25 - 34 ปี มีการศึกษาระดับปริญญาตรี ประกอบอาชีพธุรกิจส่วนตัว มีถิ่นที่อยูคือ แขวงตลิ่งชัน และ มีรายได้เฉลี่ย 10,001 – 30,000 บาทต่อเดือน (2) ระดับความสําคัญของปัจจัยส่วนประสมการตลาด บริการที่มีต่อการใช้บริการโดยรวมและรายด้านอยู่ในระดับมาก (3) ลักษณะการใช้บริการของ ลูกค้าตลาดฟู้ดวิลล่า ราชพฤกษ์ ประเภทสินค้าที่ซื้อส่วนใหญ่เป็นสินค้าอาหารสด โดยมีความถี่ ในการใช้บริการ 1 ครั้งต่อเดือน ช่วงวันที่มาใช้บริการคือวันเสาร์ – อาทิตย์ อยู่ในช่วงเวลา 13.01 – 17.00 น. โดยใช้ระยะเวลา 1 ชั่วโมงในการเลือกซื้อ ยอดเงินที่จ่ายต่อครั้งตํ่ากว่า 1,000 บาท โดยชําระด้วยเงินสด และระยะเวลาของการเป็นลูกค้าน้อยกวา 1 ปี || The objectives of this study were to study: (1) the personal characteristics of Food Villa Ratchaphruek’s customers; (2) the significant level of service marketing mix factors toward service use of Food Villa Ratchaprhuek’s customers; and (3) the service-use patterns of Food Villa Ratchaphruek’ s customers. This study was a survey research. Population was the customers of Food Villa Ratchaphruek, Taling Chan District, Bangkok. The population was infinite. Sample size was calculated by using a level of confidence at 95 percent in order to obtain 400 samples. The sampling method was systematic sampling. Questionnaires were used as instruments for data collection. Descriptive statistics was applied for data analysis including percentage, mean and standard deviation. The result showed that: (1) the majority of respondents was male, aged 25- 34 years old with Bachelor Degree, lived in Taling Chan District, had their owned business with average monthly income of 10,001-30,000 baht. (2) The significant level of overall and each of service marketing mix factors toward service use were at a high level. (3) The service-use patterns of Food Villa Ratchapruek’s customers were that most of the purchased product was fresh food. The service-use frequency was once a month. Visiting duration was Saturday-Sunday at 1:01-5:00 pm for one hour purchasing. Payment per visit was less than 1,000 baht by cash, and customary period was less than one year.
DOI: 10.14457/stou.the.2018.105
title: สมรรถะด้านเทคโนโลยีสารสนเทศและการสื่อสารของนักเรียนระดับชั้นมัธยมศึกษาตอนต้นโรงเรียนเทศบาล 1 (สุขวิทยากรตั้งตรงจิตร 15) จังหวัดยโสธร

description: การวิจัยครั้งนี้มีวัตถุประสงค์เพื่อศึกษาสมรรถนะด้านเทคโนโลยีสารสนเทศ และ การสื่อสารของนักเรียนระดับชั้นมัธยมศึกษาตอนต้น โรงเรียนเทศบาล (สุขวิทยากร ตั้งตรงจิตร 15) กลุ่มตัวอย่างที่ใช้ในการวิจัย ได้แก่ นักเรียนระดับชั้นมัธยมศึกษา ตอนต้น โรงเรียนเทศบาล (สุขวิทยากรตั้งตรงจิตร 15) จังหวัดยโสธร จำนวน 214 คน โดยการสุ่มตัวอย่างแบบหลายขั้นตอน เครื่องมือที่ใช้ในการวิจัย ได้แก่ แบบสอบถามสมรรถนะด้านเทคโนโลยีสารสนเทศ และการสื่อสารของนักเรียน สถิติที่ใช้ในการวิเคราะห์ข้อมูล ได้แก่ ค่าร้อยละ ค่าเฉลี่ย และส่วนเบี่ยงเบนมาตรฐาน ผลการวิจัยปรากฏว่า นักเรียนมีการรับรู้เกี่ยวกับสมรรถนะด้านเทคโนโลยีสารสนเทศ และการสื่อสาร โดยภาพรวมอยู่ในระดับมาก เมื่อพิจารณารายด้านพบว่าอยู่ในระดับมากทุกด้าน โดยข้อที่มีค่าเฉลี่ยสูงสุดในแต่ละด้าน ได้แก่ สมรรถนะด้านความรู้ คือ การใช้โทรศัพท์สมาร์ทโฟน สมรรถนะด้านทักษะ คือ การใช้โทรศัพท์สมาร์ทโฟน และสมรรถนะด้านเจตคติ คือ การยอมรับข้อตกลงร่วมกันในการทำงานร่วมกับผู้อื่น || The objective of this research was to study the information and communication technology competencies of lower secondary students of Tessaban 1 (Sukkhawitthayakon Tangtrongchit 15) School in Yasothon province. The research sample consisted of 214 lower secondary students of Tessaban 1 (Sukkhawitthayakon Tangtrongchit 15) School in Yasothon province, obtained by multi-stage sampling. The employed research instrument was a questionnaire on the information and communication technology competencies of students. Statistics employed for data analysis were the percentage, mean, and standard deviation. Research findings revealed that students perceived that their competency as a whole on information and communication technology was at the high level. When specific competency aspects were considered, it was found that all of their specific competencies were at the high level. The items that received the highest rating mean in each specific competency aspect were specified as follows: in the competency aspect of knowledge, the item on the use of smart phones; in the competency aspect of skills, the item on the use of smart phones; and in the competency aspect of attitude, the item on the acceptance of mutual agreement on working with the others.
DOI: 10.22002/2ejgs-56s39
title: Rhesus Macaque Fibroblast

description: Proteasome inhibition Campbell et al 2008 Express native levels of untagged TRIM5α. Can see RAVs in fibroblasts for the first time. Most of these cells actually cells displayed mainly auto fluorescent puncta and probably did not correlate to any virus because light image only taken in the red channel. Discovered the autofluorescent problem when looking at fibroblasts with no virus, bright puncta everywhere and correlate to onions
description: <strong>Tilt Series Date:</strong> 2015-05-19</p>
<strong>Data Taken By:</strong> Stephen Carter</p>
<strong>Species / Specimen:</strong> Rhesus Macaque Fibroblasts infected with Vpr-Ruby HIV-1</p>
<strong>Strain:</strong> </p>
<strong>Tilt Series Settings:</strong>  Single Axis, tilt range: (-60.0°, 60.0°), step: 1°, constant angular increment, dosage: 180.0 eV/Å²,  defocus: -10.0 μm,  magnification: 18000x. </p>
<strong>Microscope:</strong> Caltech Polara</p>
<strong>Acquisition Software:</strong> UCSFTomo</p>
<strong>Upload Method:</strong> reupload_downloaded</p>
<strong>Processing Software Used:</strong> IMOD</p>
<strong>Collaborators and Roles:</strong> Fibroblasts VSV-G pseudotyped virus Vpr-Ruby provided by Tom Hope</p>
<strong>Purification / Growth Conditions / Treatment:</strong> Cells infected with ZLK 106-06-06-14 HIV-1 GFP Vpr-Ruby. 500 µl of media and 500 µl of virus. Virus spinoculated at 16°C at 18 g for 1 hr. Cells were washed with warm media and incubated at 37°C. Cells frozen at early time points approximately 20 mins after temperature shift. Proteasome inhibition 200mg/ml</p>
description: Files available via S3 at s://sdsc.osn.xsede.org/ini210004tommorrell/tomography_archive/scd2015-05-19-3/3dimage_57242/</p>tomography12.rec,  Reconstruction (Pixel Size 24.0 nm), 890.9 MB  
        
<a role="button" class="ui compact mini button" href="https://sdsc.osn.xsede.org/ini210004tommorrell/tomography_archive/scd2015-05-19-3/3dimage_57242/tomography12.rec"
        > <i class="download icon"></i> Download </a></p>

        tomography12.mrc,  Tilt Series (Pixel Size 6.0 nm), 3.4 GB  
        
<a role="button" class="ui compact mini button" href="https://sdsc.osn.xsede.org/ini210004tommorrell/tomography_archive/scd2015-05-19-3/rawdata/tomography12.mrc"
        > <i class="download icon"></i> Download </a></p>

        tomography12_full.rec,  Reconstruction (Pixel Size 0.0 nm), 533.4 MB  
        
<a role="button" class="ui compact mini button" href="https://sdsc.osn.xsede.org/ini210004tommorrell/tomography_archive/scd2015-05-19-3/3dimage_76015/tomography12_full.rec"
        > <i class="download icon"></i> Download </a></p>
DOI: 10.22002/j0hdt-y3r42
title: V. cholerae RT4236 (stationary)

description: Classical strain with ctxA deletion.Cell harbors pMT5 plasmid (inducible toxT).
description: <strong>Tilt Series Date:</strong> 2015-05-11</p>
<strong>Data Taken By:</strong> Yi-Wei Chang</p>
<strong>Species / Specimen:</strong> Vibrio cholerae</p>
<strong>Strain:</strong> O395-N1</p>
<strong>Tilt Series Settings:</strong>  Single Axis, tilt range: (-60.0°, 60.0°), step: 1.0°, constant angular increment, dosage: 180.0 eV/Å²,  defocus: -6.0 μm,  magnification: 27500x. </p>
<strong>Microscope:</strong> Caltech Polara</p>
<strong>Acquisition Software:</strong> UCSFTomo</p>
<strong>Upload Method:</strong> reupload_downloaded</p>
<strong>Processing Software Used:</strong> SIRT</p>
<strong>Collaborators and Roles:</strong> Strain from Ronald K. Taylor</p>
<strong>Purification / Growth Conditions / Treatment:</strong> Overnight cultures of Vibrio cholerae O395 NI pMT5 grown in LB pH 6.5, 1 mM IPTG and 100 ug/mL ampicilin</p>
<strong>Sample Preparation:</strong> Vitrobot (MK iv) settings: 100% humidity, 3µl sample, 10 mg/ml BSA treated gold. Blot force 6, blot time 2.5 sec. Wait time 0 sec. Drain time 1 sec. Ethane/propane mix. Grid: Quantifoil Cu 2/2 finder.</p>
description: Files available via S3 at https://sdsc.osn.xsede.org/ini210004tommorrell/tomography_archive/ycw2015-05-11-62/3dimage_73319/</p>20150511_AK07_10062_SIRT_2K.rec,  Reconstruction (Pixel Size 0.0 nm), 5.7 GB  
        
<a role="button" class="ui compact mini button" href="https://sdsc.osn.xsede.org/ini210004tommorrell/tomography_archive/ycw2015-05-11-62/3dimage_73319/20150511_AK07_10062_SIRT_2K.rec"
        > <i class="download icon"></i> Download </a></p>

        20150511_AK07_10062.mrc,  Tilt Series (Pixel Size 0.39 nm), 3.4 GB  
        
<a role="button" class="ui compact mini button" href="https://sdsc.osn.xsede.org/ini210004tommorrell/tomography_archive/ycw2015-05-11-62/rawdata/20150511_AK07_10062.mrc"
        > <i class="download icon"></i> Download </a></p>

        20150511_AK07_10062_SIRT_2K.rec~,  5.7 GB  
        
<a role="button" class="ui compact mini button" href="https://sdsc.osn.xsede.org/ini210004tommorrell/tomography_archive/ycw2015-05-11-62/file_16620/20150511_AK07_10062_SIRT_2K.rec~"
        > <i class="download icon"></i> Download </a></p>
DOI: 10.22002/jytbj-zfh93
title: hupAB knockout_LB_PS149

description: Andrew's DNA project
description: <strong>Tilt Series Date:</strong> 2016-08-24</p>
<strong>Data Taken By:</strong> Poorna Subramanian</p>
<strong>Species / Specimen:</strong> Escherichia coli</p>
<strong>Strain:</strong> </p>
<strong>Tilt Series Settings:</strong>  Single Axis, tilt range: (-60.0°, 60.0°), step: 1.5°, constant angular increment, dosage: 170.0 eV/Å²,  defocus: -10.0 μm,  magnification: 18000x. </p>
<strong>Microscope:</strong> Caltech Polara</p>
<strong>Acquisition Software:</strong> UCSFTomo</p>
<strong>Upload Method:</strong> pipeline</p>
<strong>Processing Software Used:</strong> Raptor</p>
<strong>Purification / Growth Conditions / Treatment:</strong> Started from overnight culture. Grown till OD was 0.6. Froze when OD was 0.6, no spinning. Cell density and distribution looked good.</p>
description: Files available via S3 at ://sdsc.osn.xsede.org/ini210004tommorrell/tomography_archive/psa2016-08-24-28/rawdata/</p>hupAB_LB_PS149_atlas10002.mrc,  Tilt Series (Pixel Size 0.6 nm), 2.3 GB  
        
<a role="button" class="ui compact mini button" href="https://sdsc.osn.xsede.org/ini210004tommorrell/tomography_archive/psa2016-08-24-28/rawdata/hupAB_LB_PS149_atlas10002.mrc"
        > <i class="download icon"></i> Download </a></p>

        hupAB_LB_PS149_atlas10002_full.rec,  Reconstruction (Pixel Size 2.4 nm), 712.7 MB  
        
<a role="button" class="ui compact mini button" href="https://sdsc.osn.xsede.org/ini210004tommorrell/tomography_archive/psa2016-08-24-28/3dimage_78515/hupAB_LB_PS149_atlas10002_full.rec"
        > <i class="download icon"></i> Download </a></p>

        psa2016-08-24-28_slicer17049.png,  534.6 kB  
        
<a role="button" class="ui compact mini button" href="https://sdsc.osn.xsede.org/ini210004tommorrell/tomography_archive/Caps/psa2016-08-24-28_slicer17049.png"
        > <i class="download icon"></i> Download </a></p>
DOI: 10.22002/f45av-0pv88
title: V. cholerae RT4236 (stationary)

description: Classical strain with ctxA deletion.Cell harbors pMT5 plasmid (inducible toxT).
description: <strong>Tilt Series Date:</strong> 2015-05-11</p>
<strong>Data Taken By:</strong> Yi-Wei Chang</p>
<strong>Species / Specimen:</strong> Vibrio cholerae</p>
<strong>Strain:</strong> O395-N1</p>
<strong>Tilt Series Settings:</strong>  Single Axis, tilt range: (-60.0°, 60.0°), step: 1.0°, constant angular increment, dosage: 180.0 eV/Å²,  defocus: -6.0 μm,  magnification: 27500x. </p>
<strong>Microscope:</strong> Caltech Polara</p>
<strong>Acquisition Software:</strong> UCSFTomo</p>
<strong>Upload Method:</strong> reupload_downloaded</p>
<strong>Processing Software Used:</strong> SIRT</p>
<strong>Collaborators and Roles:</strong> Strain from Ronald K. Taylor</p>
<strong>Purification / Growth Conditions / Treatment:</strong> Overnight cultures of Vibrio cholerae O395 NI pMT5 grown in LB pH 6.5, 1 mM IPTG and 100 ug/mL ampicilin</p>
<strong>Sample Preparation:</strong> Vitrobot (MK iv) settings: 100% humidity, 3µl sample, 10 mg/ml BSA treated gold. Blot force 6, blot time 2.5 sec. Wait time 0 sec. Drain time 1 sec. Ethane/propane mix. Grid: Quantifoil Cu 2/2 finder.</p>
description: Files available via S3 at https://sdsc.osn.xsede.org/ini210004tommorrell/tomography_archive/ycw2015-05-11-75/3dimage_73330/</p>20150511_AK07_10075_SIRT_2K.rec,  Reconstruction (Pixel Size 0.0 nm), 5.7 GB  
        
<a role="button" class="ui compact mini button" href="https://sdsc.osn.xsede.org/ini210004tommorrell/tomography_archive/ycw2015-05-11-75/3dimage_73330/20150511_AK07_10075_SIRT_2K.rec"
        > <i class="download icon"></i> Download </a></p>

        20150511_AK07_10075.mrc,  Tilt Series (Pixel Size 0.39 nm), 3.4 GB  
        
<a role="button" class="ui compact mini button" href="https://sdsc.osn.xsede.org/ini210004tommorrell/tomography_archive/ycw2015-05-11-75/rawdata/20150511_AK07_10075.mrc"
        > <i class="download icon"></i> Download </a></p>

        20150511_AK07_10075_SIRT_2K.rec~,  5.7 GB  
        
<a role="button" class="ui compact mini button" href="https://sdsc.osn.xsede.org/ini210004tommorrell/tomography_archive/ycw2015-05-11-75/file_16631/20150511_AK07_10075_SIRT_2K.rec~"
        > <i class="download icon"></i> Download </a></p>