cometadata/datacite-titles-descriptions-related-identifiers huggingface dataset:
DOI: 10.5286/isis.e.rb2010110-2
title: Negative muons as a probe of magnetic oxides

description: Muon research has almost exclusively utilised positive muons and they have proven to be an effective local probe of magnetism. However, negative muons offer some interesting advantages because the probe site is known: the negative muons stop close to the nucleus of each atom in the sample. The signals from different atoms can be distinguished because the lifetime depends on the atomic number. We propose a study of two prototypical magnetic oxides in which we will focus on the signals from the mu-O site. The planned experiments will support the technical developments on both the hardware and software side at ISIS which will be carried out in the long shutdown. This new development is centred around an ISIS Facility Studentship and this beam time will be an integral part of this project.
DOI: 10.14457/ku.res.2016.88
title: การวิเคราะห์เสถียรภาพผลผลิตของสายพันธุ์ถั่วลิสงจากการทดสอบในหลายสภาพแวดล้อม (เรื่องเต็มการประชุมทางวิชาการของมหาวิทยาลัยเกษตรศาสตร์ ครั้งที่ 54: สาขาพืช, สาขาสัตว์, สาขาสัตวแพทยศาสตร์, สาขาประมง, สาขาส่งเสริมการเกษตรและคหกรรมศาสตร์)
DOI: 10.14457/ku.res.2016.89
title: การพัฒนาชุดตรวจสอบโปรตีน CP4EPSPS ข้าวโพดต้านทานสารกำจัดวัชพืช Roundup ready (เรื่องเต็มการประชุมทางวิชาการของมหาวิทยาลัยเกษตรศาสตร์ ครั้งที่ 54: สาขาพืช, สาขาสัตว์, สาขาสัตวแพทยศาสตร์, สาขาประมง, สาขาส่งเสริมการเกษตรและคหกรรมศาสตร์)
DOI: 10.14457/ku.res.2016.90
title: ผลของพัมมิเชียสทัฟฟ์ต่อการเจริญเติบโตและผลผลิตสับปะรดพันธุ์ปัตตาเวีย (เรื่องเต็มการประชุมทางวิชาการของมหาวิทยาลัยเกษตรศาสตร์ ครั้งที่ 54: สาขาพืช, สาขาสัตว์, สาขาสัตวแพทยศาสตร์, สาขาประมง, สาขาส่งเสริมการเกษตรและคหกรรมศาสตร์)
DOI: 10.14457/ku.res.2016.91
title: ความสัมพันธ์ระหว่างสัดส่วนประเภทของอาหารในกองมูลของอีเห็นข้างลาย (Paradoxurus hermaphroditus) และปัจจัยทางอุตุนิยมวิทยาในสถานีวิจัยสิ่งแวดล้อมสะแกราช ประเทศไทย (เรื่องเต็มการประชุมทางวิชาการของมหาวิทยาลัยเกษตรศาสตร์ ครั้งที่ 54: สาขาพืช, สาขาสัตว์, สาขาสัตวแพทยศาสตร์, สาขาประมง, สาขาส่งเสริมการเกษตรและคหกรรมศาสตร์)
DOI: 10.14457/ku.res.2016.92
title: ผลการลดความเข้มข้นของโปรตีนและพลังงานในสูตรอาหารต่อสมรรถภาพการผลิตและคุณภาพซากของเป็ดเนื้อ (เรื่องเต็มการประชุมทางวิชาการของมหาวิทยาลัยเกษตรศาสตร์ ครั้งที่ 54: สาขาพืช, สาขาสัตว์, สาขาสัตวแพทยศาสตร์, สาขาประมง, สาขาส่งเสริมการเกษตรและคหกรรมศาสตร์)
DOI: 10.15468/2ra367
title: Two new cryptic species of Isometrus (Scorpiones Buthidae) from the northern Western Ghats India

description: This dataset contains the digitized treatments in Plazi based on the original journal article Sulakhe, Shauri, Dandekar, Nikhil, Padhye, Anand, Bastawade, Deshabhushan (2020): Two new cryptic species of Isometrus (Scorpiones Buthidae) from the northern Western Ghats India. Euscorpius 305: 1-24, DOI: http://doi.org/10.5281/zenodo.4648343
DOI: 10.14457/ku.res.2016.93
title: ผลของการตัดปากต่อสมรรถภาพการผลิต คะแนนความเสียหายของขนและความเสียหายของผิวหนังในเป็ดปักกิ่ง (เรื่องเต็มการประชุมทางวิชาการของมหาวิทยาลัยเกษตรศาสตร์ ครั้งที่ 54: สาขาพืช, สาขาสัตว์, สาขาสัตวแพทยศาสตร์, สาขาประมง, สาขาส่งเสริมการเกษตรและคหกรรมศาสตร์)
DOI: 10.14457/ku.res.2016.94
title: การศึกษาแหล่งความร้อนเชิงเหนี่ยวนำเพื่อใช้กับการอบแห้ง (เรื่องเต็มการประชุมทางวิชาการของมหาวิทยาลัยเกษตรศาสตร์ ครั้งที่ 54: สาขาวิทยาศาสตร์, สาขาพันธุวิศวกรรม, สาขาสถาปัตยกรรมศาสตร์และวิศวกรรมศาสตร์, สาขาอุตสาหกรรมเกษตร, สาขาทรัพยากรธรรมชาติและสิ่งแวดล้อม)
DOI: 10.14457/ku.res.2016.95
title: การเปรียบเทียบการเจริญของตัวอ่อนระยะ 1 เซลล์ของหนูแรทสายพันธุ์ Mlac:WR ในสารละลาย M16 และ KSOM (เรื่องเต็มการประชุมทางวิชาการของมหาวิทยาลัยเกษตรศาสตร์ ครั้งที่ 54: สาขาพืช, สาขาสัตว์, สาขาสัตวแพทยศาสตร์, สาขาประมง, สาขาส่งเสริมการเกษตรและคหกรรมศาสตร์)
DOI: 10.14457/ku.res.2016.96
title: สมบัติความเสียดทานและการสึกหรอของวัสดุเชิงประกอบฟีนอลิกที่เติมผงเถ้าจากธรรมชาติ (เรื่องเต็มการประชุมทางวิชาการของมหาวิทยาลัยเกษตรศาสตร์ ครั้งที่ 54: สาขาวิทยาศาสตร์, สาขาพันธุวิศวกรรม, สาขาสถาปัตยกรรมศาสตร์และวิศวกรรมศาสตร์, สาขาอุตสาหกรรมเกษตร, สาขาทรัพยากรธรรมชาติและสิ่งแวดล้อม)
DOI: 10.14457/ku.res.2016.97
title: ผลการเสริมสาคูต่อการเจริญเติบโตของเป็ดบาบารี่ (เรื่องเต็มการประชุมทางวิชาการของมหาวิทยาลัยเกษตรศาสตร์ ครั้งที่ 54: สาขาพืช, สาขาสัตว์, สาขาสัตวแพทยศาสตร์, สาขาประมง, สาขาส่งเสริมการเกษตรและคหกรรมศาสตร์)
DOI: 10.23669/bxmsci/ow5d0e
title: cda1010_dat_SOCRES_RapidCATI_SUF11032021_hr.tab

description: :unav
DOI: 10.23669/bxmsci/0t7ozf
title: cda1010_src_SOCRES_RapidCATI_priprema_kodiranja_ciscenje_hr.do

description: Skripta koja opisuje transformacije sirovih podataka
DOI: 10.23669/bxmsci/5pg8ii
title: cda1010_src_SOCRES_RapidCATI_anonimizacija_SUF_hr.do

description: Skripta koja opisuje postupak anonimizacije podataka
DOI: 10.23669/bxmsci/lv7cxl
title: cda1010_doc_SOCRES_RapidCATI_upitnik_hr.pdf

description: :unav
DOI: 10.23669/bxmsci/tbhusb
title: cda1010_doc_SOCRES_RapidCATI_metod_izvjestaj_hr.pdf

description: Metodološki izvještaj
DOI: 10.6084/m9.figshare.14607540
title: Microcosm Microbial Community Count Table

description: Microbial community data from summing biological replicate data from experimental treatments. Generated in the Microcosm_Community_Analysis R script and exported on line 101. <br>Used for subsequent analyses of experimental data.
DOI: 10.6084/m9.figshare.14607540.v1
title: Microcosm Microbial Community Count Table

description: Microbial community data from summing biological replicate data from experimental treatments. Generated in the Microcosm_Community_Analysis R script and exported on line 101. <br>Used for subsequent analyses of experimental data.
DOI: 10.15468/5skkkm
title: Novitates neocaledonicae IV: Three new species of Cryptocarya R. Br. (Lauraceae)

description: This dataset contains the digitized treatments in Plazi based on the original journal article Munzinger, Jérôme, McPHERSON, Gordon (2016): Novitates neocaledonicae IV: Three new species of Cryptocarya R. Br. (Lauraceae). Adansonia 38 (2): 165-174, DOI: 10.5252/a2016n2a3
DOI: 10.14457/ku.res.2016.98
title: ผลกระทบของอุณหภูมิน้ำมันหล่อลื่นที่มีต่อประสิทธิภาพของเทอร์โบชาร์จเจอร์ (เรื่องเต็มการประชุมทางวิชาการของมหาวิทยาลัยเกษตรศาสตร์ ครั้งที่ 54: สาขาวิทยาศาสตร์, สาขาพันธุวิศวกรรม, สาขาสถาปัตยกรรมศาสตร์และวิศวกรรมศาสตร์, สาขาอุตสาหกรรมเกษตร, สาขาทรัพยากรธรรมชาติและสิ่งแวดล้อม)
DOI: 10.14457/ku.res.2016.99
title: เสถียรภาพของการเผาไหม้เอทานอลแบบเปียกที่รอบเดินเบาภายใต้สภาวะส่วนผสมบางในเครื่องยนต์แก๊สโซลีน (เรื่องเต็มการประชุมทางวิชาการของมหาวิทยาลัยเกษตรศาสตร์ ครั้งที่ 54: สาขาวิทยาศาสตร์, สาขาพันธุวิศวกรรม, สาขาสถาปัตยกรรมศาสตร์และวิศวกรรมศาสตร์, สาขาอุตสาหกรรมเกษตร, สาขาทรัพยากรธรรมชาติและสิ่งแวดล้อม)
DOI: 10.14457/ku.res.2016.100
title: Ultrasound-assisted extraction of phenolic compounds from indigenous vegetables in Southern Thailand (Proceedings of 54th Kasetsart University Annual Conference: Science, Genetic Engineering, Architecture and Engineering, Agro-Industry, Natural Resources and Environment)
DOI: 10.14457/ku.res.2016.101
title: การศึกษาเบื้องต้นการเสริมมันสำปะหลังเส้นต่อการกินได้ การเปลี่ยนแปลงของน้ำหนักตัว ผลผลิตและองค์ประกอบน้ำนมของแพะนมพันธุ์ผสมในเขตร้อนชื้น (เรื่องเต็มการประชุมทางวิชาการของมหาวิทยาลัยเกษตรศาสตร์ ครั้งที่ 54: สาขาพืช, สาขาสัตว์, สาขาสัตวแพทยศาสตร์, สาขาประมง, สาขาส่งเสริมการเกษตรและคหกรรมศาสตร์)
DOI: 10.14457/ku.res.2016.102
title: ปัญหาทางการอ่านคำจากแบบทดสอบการอ่านคำเทียมของเด็กที่มีความบกพร่องทางการอ่าน (เรื่องเต็มการประชุมทางวิชาการของมหาวิทยาลัยเกษตรศาสตร์ ครั้งที่ 54: สาขาศึกษาศาสตร์, สาขาเศรษฐศาสตร์และบริหารธุรกิจ, สาขามนุษยศาสตร์และสังคมศาสตร์)
DOI: 10.14457/ku.res.2016.103
title: เยาวชนไทยและการเรียนรู้เกี่ยวกับวัฒนธรรมญี่ปุ่นผ่านสื่อการ์ตูนญี่ปุ่น (เรื่องเต็มการประชุมทางวิชาการของมหาวิทยาลัยเกษตรศาสตร์ ครั้งที่ 54: สาขาศึกษาศาสตร์, สาขาเศรษฐศาสตร์และบริหารธุรกิจ, สาขามนุษยศาสตร์และสังคมศาสตร์)
DOI: 10.14457/ku.res.2016.104
title: การพัฒนาแบบประเมินคุณลักษณะที่พึงประสงค์ทางจิตวิทยาของนิสิตปริญญาตรี มหาวิทยาลัยเกษตรศาสตร์ (เรื่องเต็มการประชุมทางวิชาการของมหาวิทยาลัยเกษตรศาสตร์ ครั้งที่ 54: สาขาศึกษาศาสตร์, สาขาเศรษฐศาสตร์และบริหารธุรกิจ, สาขามนุษยศาสตร์และสังคมศาสตร์)
DOI: 10.14457/ku.res.2016.105
title: Media exposure, knowledge and people's practice in solid waste separation in Chatuchak district, Bangkok metropolitan (Proceedings of 54th Kasetsart University Annual Conference: Education, Economics and Business Administration, Humanities and Social Sciences)
DOI: 10.5281/zenodo.4770129
title: SciExpeM - 10.5281/zenodo.4770129

description: Baldwin, R. R., Scott, M., & Walker, R. W. (1988, January). Addition of benzene and toluene to slowly reacting mixtures of hydrogen and oxygen at 773K. In Symposium (International) on Combustion (Vol. 21, No. 1, pp. 991-1000). Elsevier.
DOI: 10.5281/zenodo.4770128
title: SciExpeM - 10.5281/zenodo.4770129

description: Baldwin, R. R., Scott, M., & Walker, R. W. (1988, January). Addition of benzene and toluene to slowly reacting mixtures of hydrogen and oxygen at 773K. In Symposium (International) on Combustion (Vol. 21, No. 1, pp. 991-1000). Elsevier.
DOI: 10.5281/zenodo.4770133
title: SciExpeM - 10.5281/zenodo.4770133

description: Baldwin, R. R., Scott, M., & Walker, R. W. (1988, January). Addition of benzene and toluene to slowly reacting mixtures of hydrogen and oxygen at 773K. In Symposium (International) on Combustion (Vol. 21, No. 1, pp. 991-1000). Elsevier.
DOI: 10.5281/zenodo.4770132
title: SciExpeM - 10.5281/zenodo.4770133

description: Baldwin, R. R., Scott, M., & Walker, R. W. (1988, January). Addition of benzene and toluene to slowly reacting mixtures of hydrogen and oxygen at 773K. In Symposium (International) on Combustion (Vol. 21, No. 1, pp. 991-1000). Elsevier.
DOI: 10.6084/m9.figshare.14607492
title: Averaged Chemistry and Cell Count Data

description: Geochemical and cell count data averaged among experimental and control biological replicates. Used to make cell abundance and geochemistry plots in the Microcosm_Chem_Plot_Script R script.<br>Geochemistry data found here is also included in the meta data file for microbial community analyses without standard deviation values.
DOI: 10.6084/m9.figshare.14607492.v1
title: Averaged Chemistry and Cell Count Data

description: Geochemical and cell count data averaged among experimental and control biological replicates. Used to make cell abundance and geochemistry plots in the Microcosm_Chem_Plot_Script R script.<br>Geochemistry data found here is also included in the meta data file for microbial community analyses without standard deviation values.
DOI: 10.5281/zenodo.4770135
title: SciExpeM - 10.5281/zenodo.4770135

description: Baldwin, R. R., Scott, M., & Walker, R. W. (1988, January). Addition of benzene and toluene to slowly reacting mixtures of hydrogen and oxygen at 773K. In Symposium (International) on Combustion (Vol. 21, No. 1, pp. 991-1000). Elsevier.
DOI: 10.5281/zenodo.4770134
title: SciExpeM - 10.5281/zenodo.4770135

description: Baldwin, R. R., Scott, M., & Walker, R. W. (1988, January). Addition of benzene and toluene to slowly reacting mixtures of hydrogen and oxygen at 773K. In Symposium (International) on Combustion (Vol. 21, No. 1, pp. 991-1000). Elsevier.
DOI: 10.5281/zenodo.4770137
title: SciExpeM - 10.5281/zenodo.4770137

description: Baldwin, R. R., Scott, M., & Walker, R. W. (1988, January). Addition of benzene and toluene to slowly reacting mixtures of hydrogen and oxygen at 773K. In Symposium (International) on Combustion (Vol. 21, No. 1, pp. 991-1000). Elsevier.
DOI: 10.5281/zenodo.4770136
title: SciExpeM - 10.5281/zenodo.4770137

description: Baldwin, R. R., Scott, M., & Walker, R. W. (1988, January). Addition of benzene and toluene to slowly reacting mixtures of hydrogen and oxygen at 773K. In Symposium (International) on Combustion (Vol. 21, No. 1, pp. 991-1000). Elsevier.
DOI: 10.5281/zenodo.4770139
title: SciExpeM - 10.5281/zenodo.4770139

description: Baldwin, R. R., Scott, M., & Walker, R. W. (1988, January). Addition of benzene and toluene to slowly reacting mixtures of hydrogen and oxygen at 773K. In Symposium (International) on Combustion (Vol. 21, No. 1, pp. 991-1000). Elsevier.
DOI: 10.5281/zenodo.4770138
title: SciExpeM - 10.5281/zenodo.4770139

description: Baldwin, R. R., Scott, M., & Walker, R. W. (1988, January). Addition of benzene and toluene to slowly reacting mixtures of hydrogen and oxygen at 773K. In Symposium (International) on Combustion (Vol. 21, No. 1, pp. 991-1000). Elsevier.
DOI: 10.5066/p9kvm4ih
title: Wolf survival and cause-specific mortality from 1968-2018 in the Superior National Forest. In

description: This dataset contains gray wolf (Canis lupus) survival and cause-specific mortality data from radiocollared wolves (n=756 collared-wolf tenures) from 1968-2018 in the USGS Wolf Project study area (2,060 km2) of the Superior National Forest, USA, an area that also includes the Boundary Waters Canoe Area Wilderness. Also, included are the annual resident winter wolf counts for the study area.
DOI: 10.6084/m9.figshare.11823192
title: Data from "Habitat amount and distribution modify community dynamics under climate change"

description: File "CTI.csv":<br><br>Values of community temperature index for each monitoring site and each year, both abundance-weighted and using presence-only data.<br>Type: indicates whether the CTI value was weighted by abundance (Abundance) or not (Presence)<br>Country: indicates whether the site was located in Finland (FIN) or in the Netherlands (NL)<br>Site: site identification name<br>Year: year of monitoring from which CTI was calculated<br>CTI: value of the community-temperature index<br>---File "Frag_indices.csv":<br><br>Values of fragmentation indices for each monitoring site and 7 spatial scales.<br>Scale: spatial scale of the buffer around monitoring sites (in m)<br>Map_year: year of the reference habitat map (CORINE land cover maps)<br>Type: type of habitat considered for defining semi-natural habitat (SNH) and non-habitat (Generalist, Forest or Open)<br>Country: indicates whether the site was located in Finland (FIN) or in the Netherlands (NL)<br>Site: site identification name<br>x: Longitude of the site in ETRS89 coordinate system<br>y: Latitude of the site in ETRS89 coordinate system<br>Landcover: Dominant type of land cover around monitoring site (according to CORINE land cover codes)<br>gridCell50: ID of a 50km x 50km grid cell within which the site is lovated<br>CLUMPY: value of the aggregation of SNH<br>PLAND: proportion of SNH<br>---File "col_ext.csv":<br>Events of colonisation of warm adapted species and extinction of cold-adapted species.<br>Country: indicates whether the site was located in Finland (FIN) or in the Netherlands (NL)<br>Site: site identification name<br>Year: year of the event of colonisation or extinction<br>Species: species scientific name<br><br>Event: indicates whether this is a colonisation or extinction
DOI: 10.5281/zenodo.4770157
title: Canopy height to canopy density relationship

description: Results of an investigation into the relationship between forest canopy density and canopy height using ICESat GLAS metrics.
DOI: 10.5281/zenodo.4770156
title: Canopy height to canopy density relationship

description: Results of an investigation into the relationship between forest canopy density and canopy height using ICESat GLAS metrics.
DOI: 10.15468/ev2cd6
title: Le genre Argentina Hill (Rosaceae) en Nouvelle-Guinée: une espèce et une combinaison nouvelles

description: This dataset contains the digitized treatments in Plazi based on the original journal article Danet, Frédéric (2016): Le genre Argentina Hill (Rosaceae) en Nouvelle-Guinée: une espèce et une combinaison nouvelles. Adansonia 38 (2): 233-239, DOI: 10.5252/a2016n2a7
DOI: 10.6073/pasta/da6f0efe58725ebddc4d5b59dd35bc8b
title: Plant Species Composition percent cover:Nutrient Network: A cross-site investigation of bottom-up control over herbaceous plant community dynamics and ecosystem function.

description: This experiment is one implementation of a globally distributed experiment, known as the Nutrient Network. At Cedar Creek, as in over 70 other sites in grasslands around the world, the experiment aims to describe impacts of increased nutrients (nitrogen, phosphorus, potassium, sulfur and other metals) and decreased herbivory (removal of mammals by fencing). Two overarching questions are being explored with these manipulations: 1. To what extent are plant production and diversity co-limited by multiple nutrients in herbaceous-dominated communities? 2. Under what conditions do grazers or fertilization control plant biomass, diversity, and composition? By utilizing identical protocols at diverse grassland sites around the world, NutNet aims to uncover both the generalities in ecosystem functioning, and the contingencies or differences which can obscure those common mechanisms. In addition to the standard NutNet protocol, e247 includes an additional low Nitrogen gradient (1 gram Nitrogen per meter squared per year and 5 grams Nitrogen per meter squared per year in addition to the standard 10 grams Nitrogen per meter squared per year).
DOI: 10.6084/m9.figshare.14607447
title: Final OTU IDs

description: Text file containing the OTU IDs associated with OTUs retained in the final dataset after contaminant filtering.
DOI: 10.6084/m9.figshare.14607447.v1
title: Final OTU IDs

description: Text file containing the OTU IDs associated with OTUs retained in the final dataset after contaminant filtering.
DOI: 10.6084/m9.figshare.14607441
title: Final Count Table used in analyses

description: Final count table used in analyses. Experimental samples from a related project that are in this count table are removed from the count table in R.
DOI: 10.6084/m9.figshare.14607441.v1
title: Final Count Table used in analyses

description: Final count table used in analyses. Experimental samples from a related project that are in this count table are removed from the count table in R.
DOI: 10.6084/m9.figshare.14605335
title: Ghana EMBRACE Implementation Research

description: <br>The database is saved as .dta (Stata 13 or above) format.The dataset contains the pooled data from the baseline survey (conducted from July 1 to September 30, 2014) and the follow-up survey (conducted from October 1 to December 31, 2015). The dataset is .dta (Stata 13 or later) format.<br>
DOI: 10.6084/m9.figshare.14605335.v1
title: Ghana EMBRACE Implementation Research

description: <br>The database is saved as .dta (Stata 13 or above) format.The dataset contains the pooled data from the baseline survey (conducted from July 1 to September 30, 2014) and the follow-up survey (conducted from October 1 to December 31, 2015). The dataset is .dta (Stata 13 or later) format.<br>
DOI: 10.6084/m9.figshare.14607435
title: Final Taxonomy File used in analyses

description: Final taxonomy file used in R for analyses.
DOI: 10.6084/m9.figshare.14605836
title: Removed Contaminant OTUs - Count and Taxonomy Information

description: Unnormalized counts and OTU IDs for the OTUs identified as contaminants in the CRO_Drill_Contaminant_Removal script. Also contains taxonomy information, raw total abundance, and normalized total abundance of OTUs in the entire dataset. Exported from CRO_Drill_Contaminant_Removal script on line 349.
DOI: 10.6084/m9.figshare.14605836.v1
title: Removed Contaminant OTUs - Count and Taxonomy Information

description: Unnormalized counts and OTU IDs for the OTUs identified as contaminants in the CRO_Drill_Contaminant_Removal script. Also contains taxonomy information, raw total abundance, and normalized total abundance of OTUs in the entire dataset. Exported from CRO_Drill_Contaminant_Removal script on line 349.
DOI: 10.6084/m9.figshare.14605788.v1
title: Contaminant Filtering R Script

description: R script used to perform contaminant filtering of sequence data based on results from Shiek et al. (2018 ). Portions of code within were written by Katherine M. Fullerton (KMF) and utilized in work by Fullerton et al. (2021). Code comments indicate code written by KMF.<br>Sheik et al. 2018 doi:10.3389/fmicb.2018.00840<br>Fullerton et al. 2021 doi:10.1038/s41561-021-00725-0<br>Also contains code that imports and combines BLAST results from species classifications and that subsets taxa that are closely related to the candidate Genus <i>Serpentinomonas</i>. Fasta file from the phyloseq object was used to BLAST these sequences against published sequence data for <i>Serpentinomonas </i>strains A1 and B1 to identify <i>Serpentinonomas </i>OTUs in the dataset.
DOI: 10.6084/m9.figshare.14605788
title: Contaminant Filtering R Script

description: R script used to perform contaminant filtering of sequence data based on results from Shiek et al. (2018 ). Portions of code within were written by Katherine M. Fullerton (KMF) and utilized in work by Fullerton et al. (2021). Code comments indicate code written by KMF.<br>Sheik et al. 2018 doi:10.3389/fmicb.2018.00840<br>Fullerton et al. 2021 doi:10.1038/s41561-021-00725-0<br>Also contains code that imports and combines BLAST results from species classifications and that subsets taxa that are closely related to the candidate Genus <i>Serpentinomonas</i>. Fasta file from the phyloseq object was used to BLAST these sequences against published sequence data for <i>Serpentinomonas </i>strains A1 and B1 to identify <i>Serpentinonomas </i>OTUs in the dataset.
DOI: 10.5281/zenodo.4770187
title: Supplementary Data: Citizen science approach reveals groundwater fauna in Switzerland and a new species of Niphargus (Amphipoda, Niphargidae)

description: Alignments used for phylogenetic analysis with maximum likelihood (IQ-TREE 1.6.6) and bayesian inference (MrBayes v3.2.6) approach.
DOI: 10.5281/zenodo.4770186
title: Supplementary Data: Citizen science approach reveals groundwater fauna in Switzerland and a new species of Niphargus (Amphipoda, Niphargidae)

description: Alignments used for phylogenetic analysis with maximum likelihood (IQ-TREE 1.6.6) and bayesian inference (MrBayes v3.2.6) approach.
DOI: 10.6084/m9.figshare.14605779
title: Contaminant Filtering Starting Fasta File

description: Raw fasta file from initial 16S processing. Used as input into CRO_Drill_Contaminant_Removal R script. Imported on line 37.
DOI: 10.6084/m9.figshare.14605779.v1
title: Contaminant Filtering Starting Fasta File

description: Raw fasta file from initial 16S processing. Used as input into CRO_Drill_Contaminant_Removal R script. Imported on line 37.
DOI: 10.15468/xs7s7r
title: New species and new synonymy in the genus Gypsophila L. subgenus Pseudosaponaria Williams (Caryophyllaceae)

description: This dataset contains the digitized treatments in Plazi based on the original journal article Falatoury, Atiye Nejad, Assadi, Mostafa, Ghahremaninejad, Farrokh (2016): New species and new synonymy in the genus Gypsophila L. subgenus Pseudosaponaria Williams (Caryophyllaceae). Adansonia 38 (2): 257-265, DOI: 10.5252/a2016n2a9
DOI: 10.5281/zenodo.4762155
title: Representative metagenomics assembled genomes (rMAGs) from longitudinally sampled anoxic tank floating sludge islets of the Schifflange (Luxembourg) communal wastewater treatment plant

description: This archive contains the representative metagenomics assembled genomes (rMAGs) derived from the longitudinally sampled anoxic tank floating sludge islets of the Schifflange (Luxembourg) communal wastewater treatment plant. These rMAGs were assembled using both metagenomic and metatranscriptomic data. These rMAGs were used in the publications referenced as part of this record. Please refer to these publications for more information about raw data and details about methods.
description: - The initial upload (v0.1) was removed on 14/05/20201 because the compressed file was corrupted and did not contain all the content.
description: {"references": ["Mart\u00ednez Arbas, S., Narayanasamy, S., Herold, M. et al. Roles of bacteriophages, plasmids and CRISPR immunity in microbial community dynamics revealed using time-series integrated meta-omics. Nat Microbiol 6, 123\u2013135 (2021). https://doi.org/10.1038/s41564-020-00794-8", "Herold, M., Mart\u00ednez Arbas, S., Narayanasamy, S. et al. Integration of time-series meta-omics data reveals how microbial ecosystems respond to disturbance. Nat Commun 11, 5281 (2020). https://doi.org/10.1038/s41467-020-19006-2"]}