cometadata/datacite-titles-descriptions-related-identifiers huggingface dataset:
DOI: 10.5281/zenodo.14862072
title: Acoustic and behavioral strategies of dolphins in relation to fishing vessel traffic in the Southern Gulf of Mexico-Dataset

description: Behavioral and acoustic plasticity allow cetaceans to exploit a variety of habitats developing strategies to overcome increasingly demanding anthropogenic pressures. Bottlenose dolphins are known to compete with artisanal fishing along the southwestern coast of the Gulf of Mexico, but the extent of marine traffic impacts on the species is unknown. We investigated dolphin behavioral dynamics through unmanned aerial vehicles (UAV) and acoustic recordings in two zones off Alvarado, Veracruz, Mexico, with high (HVP) and low-vessel presence (LVP). Within the HVP-zone (at the mouth of a lagoon) known for its greater abundance of prey, dolphins focused their behavioral budget on feeding (mostly individually), with higher emission rates for echolocation trains. Conversely, at the LVP-zone (located northwest and southeast of the lagoon mouth), groups were larger and their behavioral repertoire was more varied (dolphins traveled, fed, socialized, and rested equally), emitting not only high emission rates for echolocation trains, but also for whistles. Our findings suggest that dolphins have developed a zoning strategy through a compensatory mechanism that allows tolerance to a certain level of fishing activities and marine traffic, especially within their feeding areas, by reducing group size to individual interactions, while prioritizing certain surface and acoustic behavior when in the presence of vessels. By using this trade-off strategy, dolphins may remain at the site and continue taking advantage of the resources, at the expense of potential long-term effects, which remain to be investigated.
DOI: 10.5281/zenodo.14862091
title: My Awesome Dataset

description: This dataset contains sample data for testing.
DOI: 10.5281/zenodo.14862092
title: My Awesome Dataset

description: This dataset contains sample data for testing.
DOI: 10.5281/zenodo.14862103
title: Data_distribution_Supp_fig1
DOI: 10.5281/zenodo.14862104
title: Data_distribution_Supp_fig1
DOI: 10.5281/zenodo.14630610
title: Dataset and Model Weights files Introduced in the Paper: A unified deep framework for peptide–major histocompatibility complex–T cell receptor binding prediction

description: The dataset and model weights files used for UniPMT model introduced in the paper: A unified deep framework for peptide–major histocompatibility complex–T cell receptor binding prediction. (Model DOI: 10.5281/zenodo.14625792).
DOI: 10.5281/zenodo.14630611
title: Dataset and Model Weights files Introduced in the Paper: A unified deep framework for peptide–major histocompatibility complex–T cell receptor binding prediction

description: The dataset and model weights files used for UniPMT model introduced in the paper: A unified deep framework for peptide–major histocompatibility complex–T cell receptor binding prediction. (Model DOI: 10.5281/zenodo.14625792).
DOI: 10.5281/zenodo.14858704
title: vocalimitationset in WebDataset Format

description: This dataset is the vocal imitation set, formatted in the WebDataset format. WebDataset files are essentially tar archives, where each example in the dataset is represented by a pair of files: a WAV audio file and a corresponding JSON metadata file. The JSON file contains the class label and other relevant information for that particular audio sample.

$ tar tvf vocal_imitations_fold00_0000000.tar|head                                                                    
-r--r--r-- bigdata/bigdata  76 2025-01-13 14:07 117Music_Musical instrument_Percussion_Wood block-6522746431340544.json
-r--r--r-- bigdata/bigdata 450604 2025-01-13 14:07 117Music_Musical instrument_Percussion_Wood block-6522746431340544.wav
-r--r--r-- bigdata/bigdata     60 2025-01-13 14:07 024Animal_Wild animals_Frog_Croak-5747610597982208.json
-r--r--r-- bigdata/bigdata 892972 2025-01-13 14:07 024Animal_Wild animals_Frog_Croak-5747610597982208.wav
-r--r--r-- bigdata/bigdata     91 2025-01-13 14:07 282Source-ambiguous sounds_Deformable shell_Crumpling_ crinkling-6533838721253376.json
-r--r--r-- bigdata/bigdata 319532 2025-01-13 14:07 282Source-ambiguous sounds_Deformable shell_Crumpling_ crinkling-6533838721253376.wav
-r--r--r-- bigdata/bigdata     65 2025-01-13 14:07 063Human sounds_Human voice_Wail_ moan-4839157100707840.json
-r--r--r-- bigdata/bigdata 311340 2025-01-13 14:07 063Human sounds_Human voice_Wail_ moan-4839157100707840.wav
-r--r--r-- bigdata/bigdata     86 2025-01-13 14:07 176Sounds of things_Domestic sounds_ home sounds_Door_Knock-5671984008527872.json
-r--r--r-- bigdata/bigdata 778284 2025-01-13 14:07 176Sounds of things_Domestic sounds_ home sounds_Door_Knock-5671984008527872.wav

 

$ cat Animal_Wild\ animals_Frog_Croak-5747610597982208.json
{"imitation": "024Animal_Wild animals_Frog_Croak_reference"}
DOI: 10.5281/zenodo.14862060
title: vocalimitationset in WebDataset Format

description: This dataset is the vocal imitation set, formatted in the WebDataset format. WebDataset files are essentially tar archives, where each example in the dataset is represented by a pair of files: a WAV audio file and a corresponding JSON metadata file. The JSON file contains the class label and other relevant information for that particular audio sample.

$ tar tvf vocal_imitations_fold00_0000000.tar|head                                                                    
-r--r--r-- bigdata/bigdata  76 2025-01-13 14:07 117Music_Musical instrument_Percussion_Wood block-6522746431340544.json
-r--r--r-- bigdata/bigdata 450604 2025-01-13 14:07 117Music_Musical instrument_Percussion_Wood block-6522746431340544.wav
-r--r--r-- bigdata/bigdata     60 2025-01-13 14:07 024Animal_Wild animals_Frog_Croak-5747610597982208.json
-r--r--r-- bigdata/bigdata 892972 2025-01-13 14:07 024Animal_Wild animals_Frog_Croak-5747610597982208.wav
-r--r--r-- bigdata/bigdata     91 2025-01-13 14:07 282Source-ambiguous sounds_Deformable shell_Crumpling_ crinkling-6533838721253376.json
-r--r--r-- bigdata/bigdata 319532 2025-01-13 14:07 282Source-ambiguous sounds_Deformable shell_Crumpling_ crinkling-6533838721253376.wav
-r--r--r-- bigdata/bigdata     65 2025-01-13 14:07 063Human sounds_Human voice_Wail_ moan-4839157100707840.json
-r--r--r-- bigdata/bigdata 311340 2025-01-13 14:07 063Human sounds_Human voice_Wail_ moan-4839157100707840.wav
-r--r--r-- bigdata/bigdata     86 2025-01-13 14:07 176Sounds of things_Domestic sounds_ home sounds_Door_Knock-5671984008527872.json
-r--r--r-- bigdata/bigdata 778284 2025-01-13 14:07 176Sounds of things_Domestic sounds_ home sounds_Door_Knock-5671984008527872.wav

 

$ cat Animal_Wild\ animals_Frog_Croak-5747610597982208.json
{"imitation": "024Animal_Wild animals_Frog_Croak_reference"}
DOI: 10.5281/zenodo.14561492
title: In-depth Analysis of 17,115 Rice Transcriptomes Reveals Extensive Viral Diversity in Rice Plants

description: Rice viruses seriously threaten rice cultivation and cause significant economic losses, but they have not yet been systematically identified, with only 20 rice-infecting viruses reported. Here, we performed a large-scale analysis of 17,115 RNA-seq libraries spanning 24 Oryza species across 51 countries. Using de novo assembly and homology-based methods, we identified 810 complete or near-complete viruses, including 276 known viruses and 534 novel viruses. Given the high divergence and atypical genome organizations of novel viruses, more than a half of them were tentatively assigned to 1 new order, 61 new families, and at least 104 new genera. Utilizing homology-independent approaches, we additionally identified 49 divergent RdRPs (RdRPs RNA-dependent RNA polymerases), which were confirmed by protein structural alignment. Furthermore, we analyzed the metadata of related SRA (SRA, Sequence Read Archive) libraries and estimated viral abundance in each library, leading to the screening of 427 viruses closely associated with rice plants. Overall, our study vastly expands the viral diversity in rice plants, providing new insights for the prevention and control of viral disease.
DOI: 10.5281/zenodo.14561493
title: In-depth Analysis of 17,115 Rice Transcriptomes Reveals Extensive Viral Diversity in Rice Plants

description: Rice viruses seriously threaten rice cultivation and cause significant economic losses, but they have not yet been systematically identified, with only 20 rice-infecting viruses reported. Here, we performed a large-scale analysis of 17,115 RNA-seq libraries spanning 24 Oryza species across 51 countries. Using de novo assembly and homology-based methods, we identified 810 complete or near-complete viruses, including 276 known viruses and 534 novel viruses. Given the high divergence and atypical genome organizations of novel viruses, more than a half of them were tentatively assigned to 1 new order, 61 new families, and at least 104 new genera. Utilizing homology-independent approaches, we additionally identified 49 divergent RdRPs (RdRPs RNA-dependent RNA polymerases), which were confirmed by protein structural alignment. Furthermore, we analyzed the metadata of related SRA (SRA, Sequence Read Archive) libraries and estimated viral abundance in each library, leading to the screening of 427 viruses closely associated with rice plants. Overall, our study vastly expands the viral diversity in rice plants, providing new insights for the prevention and control of viral disease.
DOI: 10.14457/tu.the.2024.126
title: การปรับปรุงเครือข่ายน้ำใช้ในโรงงานอุตสาหกรรม: กรณีศึกษาอุตสาหกรรมการผลิตสินค้าอุปโภคขนาดใหญ่

description: งานวิจัยนี้ศึกษาเครือข่ายน้ำ สมดุลมวลน้ำของการใช้น้ำและการนำน้ำทิ้งในโรงงานผลิตสินค้าอุปโภคขนาดใหญ่ โดยมุ่งเน้นที่กระบวนการผลิตน้ำบริสุทธิ์ เนื่องจากเป็นกระบวนการที่ใช้น้ำดิบมากที่สุดในโรงงานและสามารถบรรลุเป้าหมายได้ ด้วยการวิเคราะห์วอเตอร์พินซ์ เพื่อปรับปรุงการใช้น้ำดิบและนำน้ำทิ้งกลับมาใช้ใหม่ โดยหาจุดเหมาะสมหรือจุดพินซ์รวมถึงการประเมินความคุ้มค่าทางเศรษฐศาสตร์ มีการวิเคราะห์วอเตอร์พินซ์สถานการณ์พื้นฐาน กรณีการนำน้ำทิ้งกลับมาใช้ซ้ำโดยตรง ไม่ผ่านการปรับปรุงคุณภาพน้ำ 6 สถานการณ์จำลอง คือ เน้นปริมาณและความสะอาดของน้ำทิ้งกลับไปใช้ซ้ำโดยตรงที่ต้นกระบวนการของกระบวนการผลิตน้ำบริสุทธิ์ และเน้นนำน้ำทิ้งให้เกิดประสิทธิภาพสูงสุดของอุปกรณ์โดยการวนกลับเข้ากระบวนการย่อยเดิม และกรณีนำน้ำทิ้งผ่านระบบการปรับปรุงคุณภาพเดิมของโรงงาน 2 สถานการณ์จำลอง เนื่องจากน้ำทิ้งจากขั้นตอนย่อยของกระบวนการผลิตน้ำบริสุทธิ์มีค่าของแข็งที่ละลายน้ำและค่าความนำไฟฟ้าสูงกว่าน้ำดิบ เพื่อนำน้ำทิ้งกลับมาใช้ใหม่ในกระบวนการผลิตน้ำบริสุทธิ์และผ่านตามค่าความเข้มข้นสูงสุดที่ระบบสามารถรับได้ หลังจากทำการศึกษาแล้วพบว่าจุดเหมาะสมที่สุด คือ สถานการณ์ที่ 1.3 กรณีที่ค่อย ๆ นำน้ำทิ้งที่มีค่าความเข้มข้นสิ่งปนเปื้อนจากน้อยไปมากที่จะสามารถนำกลับมาใช้ซ้ำได้ โดยไม่เกินค่าความเข้มข้นที่ยอมรับได้ของระบบ โดยไม่ผ่านการปรับปรุงคุณภาพน้ำ ซึ่งคิดเป็นร้อยละ 62.9 ของน้ำทิ้งทั้งหมด สามารถลดการใช้น้ำดิบได้เฉลี่ย 74,059 ลูกบาศก์เมตรต่อปี ลดค่าใช้จ่ายจากการนำน้ำนำกลับไปใช้ซ้ำ ลดค่าบริการน้ำดิบและบำบัดน้ำทิ้ง รวม 2,095,776 บาทต่อปี คิดเป็นร้อยละ 29 จากสถานการณ์พื้นฐาน มีมูลค่าปัจจุบันสุทธิ 12,634,129 บาท อัตราผลตอบแทนภายในร้อยละ 122 และระยะเวลาคืนทุน 0.67 ปี ภายใต้ระยะเวลาคืนทุน 5 ปี อายุโครงการ 10 ปี และอัตราดอกเบี้ยร้อยละ 6.98
DOI: 10.14457/tu.the.2024.127
title: สมรรถนะในการสกัดสารประกอบลิเทียมจากแบล็คแมสของแบตเตอรี่ลิเทียม

description: เพื่อให้เกิดระบบที่ครบวงจร ของการรีไซเคิลแบตเตอรี่ลิเทียมไอออน การชะละลายและตกตะกอนของแบล็คแมสเพื่อให้ได้โลหะมีค่าจึงได้ทำการศึกษา ในการทดสอบนี้จะอาศัยสภาวะที่ได้จากการศึกษาเดิมมาใช้ กล่าวคือความเข้มข้นของกรด (2 โมลาร์) ประเภทของกรด (กรดซัลฟิวริก) โดยมีตัวแปรศึกษาเฉพาะเวลาระหว่าง 10-90 นาที และผลของการเติมสารละลายเปอร์ออกไซด์ (2 โมลาร์) จากนั้นทำการจัดทำดุลสาร เพื่อประกอบการวิเคราะห์ผลกระทบสิ่งแวดล้อม ซึ่งจากการศึกษาพบว่า แบล็คแมสเมื่อถูกชะละลายด้วยสารละลายแอมโมเนียมไฮดรอกไซด์ 60 นาที ที่อุณหภูมิ 60 องศาเซลเซียส จะทำให้กำจัดโลหะทองแดงออกได้เท่านั้น ของแข็งที่กรองได้เมื่อแช่ใน กรดซัลฟิวริก 2 โมลาร์ พบว่า ควรใช้เวลา อย่างน้อย 60 นาทีภายใต้การเติมสารละลายเปอร์ออกไซด์ ซึ่งจะทำให้โลหะจะถูกชะออกจากแกรไฟต์จนหมด สารละลายที่กรองได้จะถูกทำการตกตะกอนโดยการปรับความเป็นกรด-เบส พบว่า pH12 ภายใต้การพ่นฝอยของแก๊สคาร์บอนไดออกไซด์ จะทำให้ได้ผงลิเทียมคาร์บอเนต จากผลประมวลทั้งหมดทำให้ค่าผลกระทบสิ่งแวดล้อมด้านภาวะโลกร้อนมีค่าเท่ากับ 1046.34 and 832.65 kg CO2 eq สำหรับ LMO และ LFP ตามลำดับ
DOI: 10.14457/tu.the.2024.128
title: การจำลองการผลิตไฮโดรเจนจากกากถั่วเหลืองด้วยกระบวนการแก๊สซิฟิเคชันโดยโปรแกรม Aspen plus

description: การผลิตอาหารย่อมมีการกำเนิดของเสียในระหว่างกระบวนการ ผลิตภัณฑ์จากถั่วเหลืองก็เช่นกันย่อมทำให้เกิดกากถั่วเหลืองจำนวนมาก ดังนั้นเพื่อการส่งเสริมการจัดการของเสียจากกระบวนการผลิตอาหารและการใช้ทรัพยากรให้เกิดประโยชน์สูงสุด จึงได้ศึกษาการจำลองทางเคมีความร้อนด้วยกระบวนการแก๊สซิฟิเคชันด้วยโปรแกรม Aspen Plus เพื่อวิเคราะห์โอกาสในการผลิตแก๊สไฮโดรเจนจากกากถั่วเหลืองจากการผลิตน้ำเต้าหู้ โดยมีตัวแปรในการศึกษา 1) อัตราส่วนอากาศต่อชีวมวล 2) อัตราส่วนไอน้ำต่อชีวมวล 3) อุณหภูมิ จากการจำลองกระบวนการพบว่า อัตราส่วนอากาศต่อชีวมวลเกิดผลลัพธ์ที่ดีที่สุดเมื่อใช้อากาศเป็นตัวเร่งที่ 0.5 เท่าของชีวมวล การศึกษาอัตราส่วนไอน้ำต่อชีวมวลพบว่าเกิดผลลัพธ์ที่ดีที่สุดเมื่อใช้ไอน้ำที่อัตราส่วนเท่ากับ 1.5 เท่าของชีวมวลโดยไอน้ำเป็นตัวเร่งช่วยเพิ่มผลผลิตแก๊สไฮโดรเจน และอุณหภูมิของเตาปฏิกิริยาที่ 800 องศาเซลเซียสเป็นช่วงอุณหภูมิเหมาะสมที่สุดในการผลิตแก๊สไฮโดรเจน โดยสามารถผลิตได้ที่ 565 กิโลกรัม/ชั่วโมง
DOI: 10.5281/zenodo.14612417
title: Datasets for "Application of Machine Learning Techniques to Distinguish Between Mare, Cryptomare and Light Plains in Central Lunar South Pole-Aitken Basin"

description: Final Hapke photometrically-standardized band ratios and TRI data (32-bit floating point values) available as GeoTiff and ASCII text files. See README file for further details.

Data used in the research article:

Chuang, F.C., M.D. Richardson, J.L. Whitten, D.P. Moriarty, and D.L. Domingue, 2025. Application of Machine Learning Techniques to Distinguish Between Mare, Cryptomare and Light Plains in Central Lunar South Pole-Aitken Basin. The Planetary Science Journal, 6:35. doi://10.3847/PSJ/ada4a6
DOI: 10.5281/zenodo.14612418
title: Datasets for "Application of Machine Learning Techniques to Distinguish Between Mare, Cryptomare and Light Plains in Central Lunar South Pole-Aitken Basin"

description: Final Hapke photometrically-standardized band ratios and TRI data (32-bit floating point values) available as GeoTiff and ASCII text files. See README file for further details.

Data used in the research article:

Chuang, F.C., M.D. Richardson, J.L. Whitten, D.P. Moriarty, and D.L. Domingue, 2025. Application of Machine Learning Techniques to Distinguish Between Mare, Cryptomare and Light Plains in Central Lunar South Pole-Aitken Basin. The Planetary Science Journal, 6:35. doi://10.3847/PSJ/ada4a6
DOI: 10.6084/m9.figshare.28405772
title: MaMsb2, a signaling mucin, is involved in conidiation, stress tolerances, and virulence in the entomopathogenic fungus Metarhizium acridum

description:   
<strong>Background:</strong> The signal transduction mucin Msb2 initiates the signal transduction response in the HOG pathway and participates in the infection and pathogenesis of fungal pathogens. <em>Metarhizium acridum</em>, an entomopathogenic fungus, is a promising biopesticide for agricultural, forestry, and urban pest control. This study focuses on the characterization of MaMsb2 in <em>M. acridum</em>.
<strong>Materials and Methods: </strong>Gene expression profiles of <em>MaMsb2</em> in <em>M. acridum</em> were analyzed using RT-qPCR. Knockout strain of <em>MaMsb2</em> was constructed via homologous recombination, and the Δ<em>MaMsb2</em> complementation strain was constructed via ectopic insertion. Their phenotypic characteristics were examined. The conidial germination rates and conidial yield of different fungal strains were ascertained on 1/4 SDAY. The fungal tolerances to UV-B radiation and heat stress was evaluated. Fungal virulence was evaluated using the fifth instar nymphs of <em>Locusta migratoria manilensis</em>, and infection structures formation and penetration ability were assessed on locust hind wings. 
<strong>Results: </strong>Disruption of <em>MaMsb2</em> resulted in the delayed conidial germination, the increased conidial yield owing to the changed conidiation pattern, the reduced tolerances to multiple stresses, the decreased virulence because of the impairments of appressorium formation and the growth of <em>M. acridum</em> in the hemolymph of locusts. RNA-seq showed that MaMsb2 governed the appressorium formation of <em>M. acridum</em> by mediating the expression of related genes such as conidial adhesion, appressorium formation, and host cuticle penetration.
<strong>Conclusion:</strong> MaMsb2 is crucial for fungal conidiation, stress tolerances, virulence in <em>M. acridum</em>, playing essential roles in infection structures formation, penetration. Understanding its functions provides insights into the pathogenic mechanisms of insect pathogenic fungi.
DOI: 10.6084/m9.figshare.28405772.v1
title: MaMsb2, a signaling mucin, is involved in conidiation, stress tolerances, and virulence in the entomopathogenic fungus Metarhizium acridum

description:   
<strong>Background:</strong> The signal transduction mucin Msb2 initiates the signal transduction response in the HOG pathway and participates in the infection and pathogenesis of fungal pathogens. <em>Metarhizium acridum</em>, an entomopathogenic fungus, is a promising biopesticide for agricultural, forestry, and urban pest control. This study focuses on the characterization of MaMsb2 in <em>M. acridum</em>.
<strong>Materials and Methods: </strong>Gene expression profiles of <em>MaMsb2</em> in <em>M. acridum</em> were analyzed using RT-qPCR. Knockout strain of <em>MaMsb2</em> was constructed via homologous recombination, and the Δ<em>MaMsb2</em> complementation strain was constructed via ectopic insertion. Their phenotypic characteristics were examined. The conidial germination rates and conidial yield of different fungal strains were ascertained on 1/4 SDAY. The fungal tolerances to UV-B radiation and heat stress was evaluated. Fungal virulence was evaluated using the fifth instar nymphs of <em>Locusta migratoria manilensis</em>, and infection structures formation and penetration ability were assessed on locust hind wings. 
<strong>Results: </strong>Disruption of <em>MaMsb2</em> resulted in the delayed conidial germination, the increased conidial yield owing to the changed conidiation pattern, the reduced tolerances to multiple stresses, the decreased virulence because of the impairments of appressorium formation and the growth of <em>M. acridum</em> in the hemolymph of locusts. RNA-seq showed that MaMsb2 governed the appressorium formation of <em>M. acridum</em> by mediating the expression of related genes such as conidial adhesion, appressorium formation, and host cuticle penetration.
<strong>Conclusion:</strong> MaMsb2 is crucial for fungal conidiation, stress tolerances, virulence in <em>M. acridum</em>, playing essential roles in infection structures formation, penetration. Understanding its functions provides insights into the pathogenic mechanisms of insect pathogenic fungi.
DOI: 10.34740/kaggle/dsv/10736961
title: cypto_data
DOI: 10.34740/kaggle/dsv/10736965
title: cypto_data
DOI: 10.21227/63g9-5752
title: Bearing-based collision-free formation control for spacecrafts under dynamic event-triggered input

description:  This is the multimedia of the paper “Bearing-based collision-free formation control for spacecrafts under dynamic event-triggered input”, including datasets (in .xlsx format), presentations (in .pptx format), and illustrative videos. This paper investigates a motion planning problem for multiple spacecrafts under dynamic event-triggered input and bearing constraint. As a safety-critical system, collision avoidance plays a key role in endowing the formation system with fully autonomous operating space under obstacle-cluttered environment. Given this fact, a control barrier function (CBF)-based quadratic programming (QP) is developed based on backstepping framework, such that each spacecraft is able to move to its predefined position without collisions among static/moving obstacles and its neighbors. Considering the limited communication and actuation capability, an input-based event-triggered mechanism (ETM) is then introduced with dynamic parameter to schedule the triggering instants. By doing so, the data transmission from the controller to the actuator can be well-regulated with system input only, which offers a more practical solution to limited communication resources. The stability of the system is proved via Lyapunov analysis and the simulations are conducted to show the effectiveness of the proposed strategy.
DOI: 10.15485/1603775
title: WHONDRS Summer 2019 Sampling Campaign: Global River Corridor Surface Water FTICR-MS, NPOC, TN, Anions, Stable Isotopes, Bacterial Abundance, and Dissolved Inorganic Carbon (v6)

description: The WHONDRS Summer 2019 Sampling (S19S) Campaign collected samples in 97 globally distributed river corridor systems between July and September 2019. Surficial streambed sediments were collected at three locations within each site (upstream, midstream, and downstream). Surface water was collected at the downstream site. This dataset includes a portion of the data types produced from the surface water samples and does not include any results from the sediment. Sediment data can be found at https://data.ess-dive.lbl.gov/view/doi:10.15485/1729719. Future datasets from this study will include hydrologic and microbial data from the surface water and sediment. The S19S campaign was designed with the science community to ask questions associated with links among core/transient metabolomes, microbial metabolism, biogeochemical function, and physical properties of watershed and river corridor systems. This dataset contains (1) high resolution characterization of dissolved organic matter from surface water via 12 Tesla Fourier transform ion cyclotron resonance mass spectrometry (FTICR-MS) through the Environmental Molecular Sciences Laboratory (EMSL; https://www.pnnl.gov/environmental-molecular-sciences-laboratory); (2) non-purgeable organic carbon (NPOC); (3) stable water isotopes (O and H); (4) specific conductivity (SpC), total nitrogen (TN), and anions; (5) flow cytometry bacterial abundance data; (6) dissolved inorganic carbon (DIC) data; (7) metadata, including international generic-sample number (IGSN) mapping file; (8) file-level metadata (flmd); and (9) data dictionary (dd). The FTICR-MS files are .xml, and the data package includes instructions for using Formularity (https://omics.pnl.gov/software/formularity) and an R script to process the data based on the user’s specific needs. All other files are .csv, .pdf, or .txt. This data package was updated in July 2021 to add SpC, TN, and anion data and accompanying documentation. This data package was updated in January 2023 to add flow cytometry bacterial data, accompanying documentation, flmd, and dd. The data package was updated in February 2023 to add DIC data and accompanying documentation. The data package was updated in August 2023 to add IGSN mapping file, correct field metadata, and update accompanying documentation. See change history in readme for details.Please use the data package’s DOI to cite the data package. We ask that you email us at WHONDRS@pnnl.gov to let us know that you are using the data and acknowledge WHONDRS and the U.S. Department of Energy's Environmental System Science program—which generously provides funding to WHONDRS—in your publications, proposals, presentations, etc. All data are free to be used for any purpose, such as for manuscripts, presentations, and grant proposals. There is no obligation to include WHONDRS members as co-authors.