cometadata/datacite-titles-descriptions-related-identifiers huggingface dataset:
DOI: 10.21954/ou.rd.29383073.v1
title: Metagenomes associated with the publication Ensemble Binning Approach to Identify Functional Diversity in Cleanroom Environments

description: Abstract for data:<br>This study involved the generation of 26 medium and high-quality metagenome-assembled genomes (MAGs) from published metagenomic datasets. These MAGs originated from NASA cleanrooms, specifically the Jet Propulsion Laboratory (JPL) and Kennedy Space Center's Payload Hazardous Servicing Facility (KSC-PHSF).<br>The original sequence data for these MAGs were derived from NCBI Genbank BioProjects PRJNA668809 PRJNA681008 and PRJNA327691. The respective original publications contributing these datasets include Wood et al., 2021, Highlander et al., 2023, and Bashir et al., 2016. All MAGs generated and described in this study are submitted under BioProject PRJEB90846.<br>The MAGs were assembled using Megahit and binned via an ensemble approach integrating MaxBin2, MetaBAT2, and CONCOCT, followed by refinement with DasTool and dRep. Quality assessment was performed using CheckM, with completeness scores ranging from 65.62% to 99.64% and contamination scores from 0.00% to 6.75%. Each MAG is derived from specific cleanroom metagenome samples, identified by their SRA accession (e.g., SRR13152093 for JPL 2018 samples, SRR393690 for KSC 2007 samples). Geographic coordinates for the sampling locations are 34.2013° N, 118.1714° W for JPL and 28.5744° N, 80.6520° W for KSC. The assemblies are characterized as "Multiple fragments where gaps span repetitive regions. Presence of the 23S, 16S, and 5S rRNA genes and at least 18 tRNAs", reflecting their high or medium quality according to MIMAG standards.<br>Abstract for the paper:<br>Cleanroom environments, crucial for spacecraft assembly, are subject to stringent sterilisation protocols to minimise microbial contamination. However, tolerant microbes can persist and pose a potential risk for planetary protection. This study employs an ensemble binning approach, integrating multiple metagenome binning programs, to analyse published metagenomic datasets generated from NASA cleanrooms to investigate functional diversity within cleanrooms. Twenty-six medium and high quality, non-redundant metagenome-assembled genomes (MAGs) spanning six bacterial phyla were generated. Functional analysis of these MAGs identified potential metabolic pathways for the degradation of commonly used cleaning agents, suggesting that these compounds could serve as carbon sources. Furthermore, genomic analyses identified diverse physiological tolerances, with many MAGs possessing polyextremophilic traits, including resistance to high salinity , temperature, and alkalinity. Growth Rate Index analysis also suggested some MAGs were actively replicating within the cleanroom environments. This study demonstrates the power of ensemble binning in revealing the functional diversity and adaptive strategies of cleanroom microbiomes and provides critical insights for refining planetary protection protocols.<br><br>
DOI: 10.15468/dl.tfpwap
title: Occurrence Download

description: A dataset containing 30 species occurrences available in GBIF matching the query:
{
 "and" : [
 "TaxonKey is Pleiospilos compactus",
 "HasCoordinate is true",
 "BasisOfRecord is one of (Specimen)"
 ]
}

 The dataset includes 30 records from 8 constituent datasets; see https://api.gbif.org/v1/occurrence/download/0021662-260208012135463/datasets/export for details.
 
Data from some individual datasets included in this download may be licensed under less restrictive terms.
DOI: 10.15468/dl.bfnpj8
title: Occurrence Download

description: A dataset containing 63 species occurrences available in GBIF matching the query:
{
 "and" : [
 "Geometry POLYGON((24.98082 36.62025,24.9848 36.60888,24.99597 36.61305,24.99566 36.61945,24.98082 36.62025))",
 "OccurrenceStatus is Present"
 ]
}

 The dataset includes 63 records from 3 constituent datasets; see https://api.gbif.org/v1/occurrence/download/0021663-260208012135463/datasets/export for details.
 
Data from some individual datasets included in this download may be licensed under less restrictive terms.
DOI: 10.17026/ar/nck8ua
title: Plangebied Industrieweg 6 te Woerden, gemeente Woerden.
title: Archeologisch vooronderzoek: een inventariserend veldonderzoek (verkennend booronderzoek).
title: RAAP RAPPORT 7776

description: &lt;p&gt;
In opdracht van Draw4U heeft RAAP in april 2025 een archeologisch vooronderzoek in de vorm van een inventariserend veldonderzoek (verkennend booronderzoek) uitgevoerd voor het plangebied Industrieweg 6 te Woerden in de gemeente Woerden.
&lt;p&gt;
Op basis van eerder uitgevoerd bureauonderzoek bestond er een verwachting voor archeologische resten uit perioden vanaf het neolithicum tot Romeinse tijd op eventueel aanwezige oeverafzettingen van de Linschoten stroomgordel.
&lt;p&gt;
Het verkennend booronderzoek heeft uitgewezen dat er sprake is van komafzettingen op geulafzettingen met daartussen plaatselijk oeverafzettingen en dat de top van de komafzettingen grotendeels verstoord is geraakt bij de aanleg van het huidige bedrijventerrein in de tweede helft van de 20e eeuw. In de oeverafzettingen zijn bovendien geen aanwijzingen voor bodemvorming. De
archeologische verwachting voor het plangebied kan daarmee naar beneden worden bijgesteld.
&lt;p&gt;
Op basis van de resultaten van dit onderzoek blijkt dat in het plangebied geen archeologische resten bedreigd worden. Daarom wordt in het kader van de voorgenomen bodemingrepen geen vervolgstap uit het proces van de Archeologische Monumentenzorg (AMZ) noodzakelijk geacht.
&lt;p&gt;
Dit rapport geeft (selectie)adviezen. Het is aan de bevoegde overheid, de gemeente Woerden, deze al dan niet over te nemen in de vorm van een (selectie)besluit.
&lt;p&gt;
DOI: 10.17026/ar/pvevmi
title: Plangebied Gasthuiswijk te Leiden, gemeente Leiden.
title: Archeologisch vooronderzoek: een inventariserend veldonderzoek (verkennend booronderzoek).
title: RAAP RAPPORT 7832

description: &lt;p&gt;
In opdracht van de gemeente Leiden heeft RAAP in mei 2025 een archeologisch vooronderzoek in de vorm van een inventariserend veldonderzoek (verkennend booronderzoek) uitgevoerd voor het plangebied Gasthuiswijk te Leiden in de gemeente Leiden.
&lt;p&gt;
Op basis van het booronderzoek is het volgende naar voren gekomen. In het plangebied is onder een dik ophoogpakket een deels intact potentieel archeologisch niveau aanwezig. Dit niveau betreft een oud maaiveldniveau in de top van een pakket oever - op geulafzettingen. Deze voormalige bouwvoor is
in elf boringen aangetroffen op een diepte vanaf ca. 0,8 m -NAP (ca. 1,2 à 1,5 m -mv) en is in de rest van het plangebied vermoedelijk verstoord geraakt door vroegere graafwerkzaamheden. Met name is dit het geval in het noordoosten, waar de onderliggende oeverafzettingen relatief hoog zijn gelegen. Al met al kan worden gesteld dat in het plangebied een deels intact archeologisch niveau aanwezig is,
namelijk het voormalige maaiveldniveau. Dit niveau heeft een archeologische verwachting voor bewoningssporen en sporen van landgebruik vanaf de ijzertijd. Op basis van vergelijking met diverse proefsleuvenonderzoeken in de omgeving kan worden gesteld dat dit niveau, voor zover dit intact is gebleven, in het verleden relatief laag in het landschap heeft gelegen en dat de archeologische verwachting weliswaar laag is, maar de kans op archeologische resten niet geheel afwezig is.
&lt;p&gt;
Aangezien bij de aanleg van het riool en de wadi dieper zal worden ontgraven dan de voormalige bouwvoor, bestaat het risico dat door de voorgenomen ontwikkelingen archeologische waarden worden bedreigd. Daarom wordt aanbevolen in het kader van de bestaande planvorming de onderstaande
vervolgstap uit het proces van de Archeologische Monumentenzorg (AMZ) te nemen.
&lt;p&gt;
Om de gespecificeerde verwachting te toetsen wordt vervolgonderzoek geadviseerd in de vorm van een karterende fase van een inventariserend veldonderzoek. Gezien de prospectiekenmerken is een onderzoek met behulp van proefsleuven (IVO-P) de geëigende methode voor vervolgonderzoek (zie ook Prospectie op Maat (cultureelerfgoed.nl)). Gezien de aard van de geplande ingrepen (aanleg riool en wadi), is het om praktische redenen zinvol om dit onderzoek uit te voeren als een archeologische begeleiding conform protocol IVO-P. Details omtrent deze begeleiding dienen vooraf te worden vastgelegd in een door de bevoegde overheid goed te keuren Programma van Eisen (PvE).
&lt;p&gt;
DOI: 10.17026/ar/bbwhkt
title: Plangebied Jordaan 19 te Laren, gemeente Laren.
title: Archeologisch vooronderzoek: een bureauonderzoek en inventariserend veldonderzoek (verkennend booronderzoek).
title: RAAP RAPPORT 7886

description: &lt;p&gt;
In opdracht van I. Uitendaal heeft RAAP in juni 2025 een archeologisch vooronderzoek in de vorm van een bureauonderzoek en inventariserend veldonderzoek (verkennend booronderzoek) uitgevoerd voor het plangebied Jordaan 19 te Laren in de gemeente Laren.
&lt;p&gt;
Op basis van het bureauonderzoek werden archeologische resten verwacht uit perioden vanaf de prehistorie tot en met middeleeuwen direct onder een opgebracht plaggendek (als onderdeel van een laarpodzolgrond).
&lt;p&gt;
Op basis van het booronderzoek blijkt het oorspronkelijke laarpodzolgrond niet meer aanwezig te zijn. De voor een podzolgrond kenmerkende E- en B-horizonten zijn niet aangetroffen. Het bodemprofiel is in alle vijf de boringen geheel verstoord tot in de C-horizont. Hierdoor is ook het archeologische vondstniveau, voor zover dat aanwezig is geweest, geheel verstoord geraakt. Mogelijk kunnen nog
resten van diepe grondsporen bewaard zijn gebleven, maar hiervoor is de informatiewaarde door het ontbreken van een intact vondstniveau gering.
&lt;p&gt;
Op basis van de resultaten van dit onderzoek blijkt dat in het plangebied geen archeologische resten bedreigd worden. Daarom wordt in het kader van de voorgenomen bodemingrepen geen vervolgstap uit het proces van de Archeologische Monumentenzorg (AMZ) noodzakelijk geacht. 
&lt;p&gt;
In het overige deel van het plangebied wordt in het kader van de voorgenomen bodemingrepen geen archeologisch vervolgonderzoek aanbevolen. Indien bij de uitvoering van de werkzaamheden onverwacht archeologische resten worden aangetroffen, dan is conform artikel 5.10 van de Erfgoedwet aanmelding van de desbetreffende vondsten bij de Minister van Onderwijs, Cultuur en Wetenschap c.q.
de Rijksdienst voor het Cultureel Erfgoed verplicht (vondstmelding via ARCHIS).
&lt;p&gt;
DOI: 10.5281/zenodo.18609639
title: Data for: On the single-Hessian Gaussian wavepacket dynamics

description: Data for publication: D. Barbiero, J. J. L. Vanicek, On the single-Hessian Gaussian wavepacket dynamics.

Contains data for all figures of the abovementioned publication, including simulated photoelectron spectrum of difluorocarbene anion, simulated absorption spectrum of methylamine, numerical analysis of the geometric properties of single-Hessian Gaussian wavepacket dynamics, and numerical analysis of the geometric integrators developed for the single-Hessian Gaussian wavepacket dynamics.
DOI: 10.17026/ar/nabxe8
title: Plangebied Tuinstraatkwartier te De Bilt, gemeente De Bilt .
title: Archeologisch vooronderzoek: een inventariserend veldonderzoek (verkennend booronderzoek).
title: RAAP RAPPORT 7889

description: &lt;p&gt;
In opdracht van Buro BOOT heeft RAAP in juni 2025 een archeologisch vooronderzoek in de vorm van een inventariserend veldonderzoek (verkennend booronderzoek) uitgevoerd voor het plangebied Tuinstraatkwartier te De Bilt in de gemeente De Bilt .
&lt;p&gt;
Op basis van eerder uitgevoerd bureauonderzoek werd in het plangebied de aanwezigheid van een plaggendek of esdek verwacht. Dit dek, dat het resultaat is van ophoging door soms eeuwenlange bemesting, heeft in het algemeen een beschermende werking op een onderliggend potentieel archeologisch niveau.
&lt;p&gt;
Het uitgevoerde booronderzoek heeft de aanwezigheid van dit plaggendek in het noordwestelijke deel van het plangebied inderdaad bevestigd. Onder het plaggendek zijn geen restanten van de oorspronkelijke podzolbodem aangetroffen, behalve een Ah-horizont in boring 7. Vermoedelijk zijn de oorspronkelijke E- en B-horizonten bij de vroegste ontginningen vermengd geraakt met het plaggendek.
Het aantreffen van een oude akkerlaag in boring 3 wijst ook in deze richting.
De archeologische verwachting voor resten vanaf de prehistorie is in deze zone desondanks hoog te noemen.
&lt;p&gt;
Op basis van de resultaten van het onderzoek blijkt dat in het plangebied (mogelijk) archeologische resten bedreigd worden door de voorgenomen bodemingrepen. Daarom wordt geadviseerd om de plannen zodanig aan te passen dat verstoring wordt voorkomen. Dat kan door in de zone waar een plaggendek is aangetroffen graafwerkzaamheden tot 20 cm boven het potentieel archeologisch niveau
te vermijden. 
&lt;p&gt;
Omdat deze planaanpassing vermoedelijk niet mogelijk is, wordt aanbevolen in het kader van de bestaande planvorming de onderstaande vervolgstap uit het proces van de Archeologische Monumentenzorg (AMZ) te nemen.
&lt;p&gt;
Om de gespecificeerde verwachting te toetsen wordt in de betreffende zone vervolgonderzoek geadviseerd in de vorm van een karterende fase van een inventariserend veldonderzoek. Gezien de prospectiekenmerken is een onderzoek met behulp van proefsleuven (IVO-P) de geëigende methode voor vervolgonderzoek (zie ook Prospectie op Maat (cultureelerfgoed.nl)).
&lt;p&gt;
Tevens dient in deze zone de sloop van de funderingen van de huidige bebouwing archeologisch begeleid te worden (archeologische begeleiding conform protocol proefsleuven). In het overige deel van het plangebied wordt
&lt;p&gt;
 in het kader van de voorgenomen bodemingrepen geen archeologisch vervolgonderzoek aanbevolen. Indien bij de uitvoering van de werkzaamheden onverwacht archeologische resten worden aangetroffen, dan is conform artikel 5.10 van de Erfgoedwet aanmelding van de desbetreffende vondsten bij de Minister van Onderwijs, Cultuur en Wetenschap c.q. de Rijksdienst voor het Cultureel Erfgoed verplicht (vondstmelding via ARCHIS).
&lt;p&gt;
DOI: 10.5281/zenodo.18609638
title: Data for: On the single-Hessian Gaussian wavepacket dynamics

description: Data for publication: D. Barbiero, J. J. L. Vanicek, On the single-Hessian Gaussian wavepacket dynamics.

Contains data for all figures of the abovementioned publication, including simulated photoelectron spectrum of difluorocarbene anion, simulated absorption spectrum of methylamine, numerical analysis of the geometric properties of single-Hessian Gaussian wavepacket dynamics, and numerical analysis of the geometric integrators developed for the single-Hessian Gaussian wavepacket dynamics.
DOI: 10.6084/m9.figshare.31346563
title: Supplementary materials for food security-related article.

description: Supplementary materials for food security-related article.
DOI: 10.6084/m9.figshare.31346563.v1
title: Supplementary materials for food security-related article.

description: Supplementary materials for food security-related article.
DOI: 10.17026/ar/lfwtif
title: Plangebied Den Ilp tussen 46 en 51 te Den Ilp, gemeente Landsmeer.
title: Archeologisch vooronderzoek: een bureauonderzoek en inventariserend veldonderzoek (verkennend booronderzoek).
title: RAAP RAPPORT 7932

description: &lt;p&gt;
In opdracht van dhr. S. Ramdjan heeft RAAP in juni 2025 een archeologisch vooronderzoek in de vorm van een bureauonderzoek en inventariserend veldonderzoek (verkennend booronderzoek) uitgevoerd voor het plangebied Den Ilp tussen 46 en 51 te Den Ilp in de gemeente Landsmeer.
&lt;p&gt;
Op basis van het bureauonderzoek werden in het plangebied ophogingspakketten verwacht van een huisplaats uit de late middeleeuwen of nieuwe tijd.
&lt;p&gt;
Tijdens het booronderzoek zijn dergelijke ophogingspakketten niet aangetroffen.
&lt;p&gt;
Op basis hiervan blijkt dat in het plangebied geen archeologische resten bedreigd worden. Daarom wordt in het kader van de voorgenomen bodemingrepen geen vervolgstap uit het proces van de Archeologische Monumentenzorg (AMZ) noodzakelijk geacht.
&lt;p&gt;
Indien bij de uitvoering van de werkzaamheden onverwacht archeologische resten worden aangetroffen, dan is conform artikel 5.10 van de Erfgoedwet aanmelding van de desbetreffende vondsten bij de Minister van Onderwijs, Cultuur en Wetenschap c.q. de Rijksdienst voor het Cultureel Erfgoed verplicht (vondstmelding via ARCHIS).
&lt;p&gt;
DOI: 10.58145/akf/hxrch1
title: Before Śniadecki: Uncovering the True Foundations of Polish Physical Education - research data
title: Przed Śniadeckim: odkrywanie prawdziwych podstaw dziejów polskiego wychowania fizycznego - dane badawcze

description: Twenty Polish publications classified as original Polish works (not translated from other languages) published between 1740 and 1805, i.e. until the appearance of Jędrzej Śniadecki's work in the "Dziennik Wileński" entitled Uwagi o Fizycznym Wychowaniu Dzieci (Remarks on the Physical Education of Children), were analysed. The study aimed to attempt to change the perception and appreciation of Polish Enlightenment reformers who influenced the popularisation of physical education before the publication of Jędrzej Śniadecki's work.
DOI: 10.15468/dl.3fkk8m
title: Occurrence Download

description: A dataset containing 1525683 species occurrences available in GBIF matching the query:
{
 "and" : [
 "Geometry POLYGON((-20 -38,55 -38,55 38,-20 38,-20 -38))",
 "HasCoordinate is true",
 "HasGeospatialIssue is false",
 "OccurrenceStatus is Present",
 "TaxonKey is Gruiformes"
 ]
}

 The dataset includes 1525683 records from 210 constituent datasets; see https://api.gbif.org/v1/occurrence/download/0021644-260208012135463/datasets/export for details.
 
Data from some individual datasets included in this download may be licensed under less restrictive terms.
DOI: 10.15468/dl.q2nz95
title: Occurrence Download

description: A dataset containing 160 species occurrences available in GBIF matching the query:
{
 "and" : [
 "Geometry POLYGON((-20.04493 -11.76768,47.98881 -11.76768,47.98881 15.46971,-20.04493 15.46971,-20.04493 -11.76768))",
 "HasCoordinate is true",
 "HasGeospatialIssue is false",
 "OccurrenceStatus is Present",
 "TaxonKey is Picathartes oreas"
 ]
}

 The dataset includes 160 records from 7 constituent datasets; see https://api.gbif.org/v1/occurrence/download/0021665-260208012135463/datasets/export for details.
 
Data from some individual datasets included in this download may be licensed under less restrictive terms.
DOI: 10.15468/dl.6bwwxc
title: Occurrence Download

description: A dataset containing 19 species occurrences available in GBIF matching the query:
{
 "and" : [
 "TaxonKey is Prepodesma orpenii",
 "HasCoordinate is true",
 "BasisOfRecord is one of (Specimen)"
 ]
}

 The dataset includes 19 records from 1 constituent datasets; see https://api.gbif.org/v1/occurrence/download/0021666-260208012135463/datasets/export for details.
 
Data from some individual datasets included in this download may be licensed under less restrictive terms.
DOI: 10.15468/dl.w5g8gg
title: Occurrence Download

description: A dataset containing 1603620 species occurrences available in GBIF matching the query:
{
 "and" : [
 "Geometry POLYGON((-20 -38,55 -38,55 38,-20 38,-20 -38))",
 "HasCoordinate is true",
 "HasGeospatialIssue is false",
 "OccurrenceStatus is Present",
 "TaxonKey is Bucerotiformes"
 ]
}

 The dataset includes 1603620 records from 240 constituent datasets; see https://api.gbif.org/v1/occurrence/download/0021640-260208012135463/datasets/export for details.
 
Data from some individual datasets included in this download may be licensed under less restrictive terms.
DOI: 10.23668/psycharchives.21664
title: Data for: Development and Validation of the Eco-Stress Scale: A Multidimensional Approach to Measure Environmental Stressors Across Contexts

description: EFA Dataset: This dataset contains anonymized responses from 462 participants used for the Exploratory Factor Analysis (EFA) during the development of the Eco-Stress Scale. It includes responses to all 17 scale items and demographic variables including age and gender. The dataset can be used to replicate the EFA, examine the factor structure, or conduct secondary analyses on environmental stress constructs. All data are fully anonymized to protect participant confidentiality.; EFA Codebook: This codebook documents all variables included in the EFA dataset of the Eco-Stress Scale study, including variable names, labels, types, valid values, and missing value coding. It provides detailed information on the 17 scale items, subscales, and demographic variables (age, gender). The codebook is intended to help researchers understand the dataset, replicate the exploratory factor analysis, and conduct secondary analyses on environmental stress constructs. All information reflects fully anonymized participant data.; CFA Dataset: This dataset contains anonymized responses from 428 participants used for the Confirmatory Factor Analysis (CFA) during the validation of the Eco-Stress Scale. It includes responses to all 17 scale items and demographic variables including age, gender, education, marital status, profession, and city. The dataset can be used to replicate the CFA, assess model fit, or explore psychometric properties of the scale. All data are fully anonymized to ensure participant confidentiality.; CFA Codebook: This codebook documents all variables included in the CFA dataset of the Eco-Stress Scale study, including variable names, labels, types, valid values, and missing value coding. It provides detailed information on the 17 scale items, subscales, and demographic variables (age, gender, education, marital status, profession, city). The codebook is intended to help researchers understand the dataset, replicate the confirmatory factor analysis, assess model fit, and explore psychometric properties. All data are fully anonymized to protect participant confidentiality.; Scale Items & Scoring: This document contains all 17 items of the Eco-Stress Scale, including scoring and computation of subscale scores. The scale measures four dimensions of environmental stress: Built Environment Stress, Climate Change Stress, Natural Disasters Stress, and Environmental Damages Stress. The file is intended for use by researchers, educators, or students for measurement, replication studies, or educational purposes.
description: Data for: Ijaz, F., & Maqsood, A. (2026). Development and Validation of the Eco-Stress Scale: A Multidimensional Approach to Measure Environmental Stressors Across Contexts. European Journal of Psychology Open.
DOI: 10.6084/m9.figshare.31346596
title: Cisplatin-based chemotherapy is a possible risk factor for cerebral stroke in patients with testicular germ cell tumour – a case report and review of the literature

description: Cerebral stroke secondary to cisplatin-based chemotherapy in young patients undergoing chemotherapy for testicular germ cell tumour (GCT) has been reported only sporadically. Here, we report a 49-year-old man undergoing adjuvant chemotherapy with one cycle of bleomycin, etoposide, and cisplatin for nonseminomatous testicular GCT clinical stage 1b. On the sixth day of treatment, a sudden onset of right-sided hemiparesis and aphasia prompted computed tomography and angiography. An occlusion of the left middle cerebral artery was detected. The patient recovered after immediate thrombolytic therapy, but minor neurological deficits were present 9 months after the event. Among 221 GCT patients undergoing cisplatin-based chemotherapy during 2017–2025, one stroke occurred, revealing a relative incidence of 0.45% in this cohort. A literature survey yielded 31 previous GCT cases with a median age of 35 years, most of them were caused by occlusion of brain supplying arteries. Thrombotic occlusions of brain-supplying arteries secondary to cisplatin-based chemotherapy can arise in otherwise healthy young men with no risk factors for vascular disease. Care givers of GCT patients must be cognizant of such events upon counselling patients before chemotherapy, because this complication of treatment may foil the attempts of restoring health in a basically well curable disease.