cometadata/datacite-titles-descriptions-related-identifiers huggingface dataset:
DOI: 10.15468/dl.tx5jne
title: Occurrence Download

description: A dataset containing 455 species occurrences available in GBIF matching the query:
{
 "and" : [
 "TaxonKey is Paspalum distichum L.",
 "Country is Italy",
 "HasCoordinate is true"
 ]
}

 The dataset includes 455 records from 15 constituent datasets; see https://api.gbif.org/v1/occurrence/download/0086032-250525065834625/datasets/export for details.
 
Data from some individual datasets included in this download may be licensed under less restrictive terms.
DOI: 10.3535/52y-erf-1el
title: Animalia

description: Digital Specimen for the physical specimen hosted at Naturalis Biodiversity Center.
DOI: 10.3535/m58-nyc-fye
title: Animalia

description: Digital Specimen for the physical specimen hosted at Naturalis Biodiversity Center.
DOI: 10.17026/dans-25j-xuug
title: Plangebied Zuidzijde, gemeente Bodegraven

description: &lt;p&gt;onderzoeksrapport&lt;/p&gt;
DOI: 10.3535/6nz-381-lvt
title: Horstia Deland, Cameron, Rao, Ritter & Bullock, 2010

description: Digital Specimen for the physical specimen hosted at Naturalis Biodiversity Center.
DOI: 10.3535/v25-94s-wwh
title: Horstia Deland, Cameron, Rao, Ritter & Bullock, 2010

description: Digital Specimen for the physical specimen hosted at Naturalis Biodiversity Center.
DOI: 10.15468/dl.dqkcyj
title: Occurrence Download

description: A dataset containing 1258 species occurrences available in GBIF matching the query:
{
 "and" : [
 "TaxonKey is Paspalum distichum L.",
 "Country is Israel",
 "HasCoordinate is true"
 ]
}

 The dataset includes 1258 records from 6 constituent datasets; see https://api.gbif.org/v1/occurrence/download/0086031-250525065834625/datasets/export for details.
 
Data from some individual datasets included in this download may be licensed under less restrictive terms.
DOI: 10.3535/g7n-hce-lcl
title: Animalia

description: Digital Specimen for the physical specimen hosted at Naturalis Biodiversity Center.
DOI: 10.3535/w4h-3fg-k71
title: Animalia

description: Digital Specimen for the physical specimen hosted at Naturalis Biodiversity Center.
DOI: 10.17026/dans-25j-xw8t
title: PAN-00118239 - fingerring with two shifting wires

description: &lt;p&gt;This find is registered at Portable Antiquities of the Netherlands with number PAN-00118239&lt;/p&gt;
description: Modified: 2022-12-02T16:43:20+01:00
DOI: 10.3535/655-jtz-3s2
title: Animalia

description: Digital Specimen for the physical specimen hosted at Naturalis Biodiversity Center.
DOI: 10.3535/h3h-wlp-x5n
title: Animalia

description: Digital Specimen for the physical specimen hosted at Naturalis Biodiversity Center.
DOI: 10.3535/hcs-xq9-q3l
title: Animalia

description: Digital Specimen for the physical specimen hosted at Naturalis Biodiversity Center.
DOI: 10.17026/dans-25j-y49x
title: PAN-00140189 - bone / antler sewing needle

description: &lt;p&gt;This find is registered at Portable Antiquities of the Netherlands with number PAN-00140189&lt;/p&gt;
description: Modified: 2023-11-20T16:48:12+01:00
DOI: 10.3535/7lw-gn2-fv2
title: Animalia

description: Digital Specimen for the physical specimen hosted at Naturalis Biodiversity Center.
DOI: 10.3535/eqx-75d-wpn
title: Animalia

description: Digital Specimen for the physical specimen hosted at Naturalis Biodiversity Center.
DOI: 10.3535/xpq-gj1-zpx
title: Animalia

description: Digital Specimen for the physical specimen hosted at Naturalis Biodiversity Center.
DOI: 10.3535/ync-pa6-r5l
title: Animalia

description: Digital Specimen for the physical specimen hosted at Naturalis Biodiversity Center.
DOI: 10.17026/dans-25j-yauc
title: Oirschot, Oude Grintweg 54. Inventariserend veldonderzoek door middel van proefsleuven

description: &lt;p&gt;Het plangebied Oude Grintweg 54 te Oirschot ligt op de noordflank van de Midden-Brabantse dekzandrug en bevindt zich iets ten noordoosten van de oude dorpskern, in de bebouwde kom van het dorp. Dat laatste is pas het geval sinds de jaren ’60 van de vorige eeuw, waarbij het onderzoeksterrein zelf echter onbebouwd is gebleven. De Oude Grintweg is een oude weg en ook het aangrenzende bouwland en de verkaveling hiervan gaan enkele honderden jaren terug. Aanleiding voor het onderzoek is de voorgenomen bouw van woningen op het terrein. Bij dergelijke ingrepen in de bodem bestaat de kans dat archeologische waarden vernietigd zullen worden. Op basis van eerder onderzoek gold voor het plangebied in eerste instantie een hoge verwachting op het aantreffen van archeologische resten uit het (laat-)paleolithicum tot en met het heden. Uit later onderzoek is gebleken dat die verwachtingen getemperd moesten worden aangezien de bodem tot in de C-horizont is verstoord. De mate van de verstoring was echter niet bekend. Daarom heeft BAAC bv op 13 augustus 2015 een proefsleuvenonderzoek uitgevoerd in het plangebied. Bij dit onderzoek is gebleken dat de bodem over het gehele terrein verstoord is tot in de top van de natuurlijke ondergrond. Alleen diepere sporen zijn nog deels bewaard gebleven. Het betreft enkele paalsporen, greppels en grondverbeteringskuilen die samenhangen met het gebruik van het terrein als akker/weidegrond in de nieuwe tijd. Een van de greppels valt samen met een perceelgrens zoals die op een kadastrale kaart uit het begin van de 19e eeuw staat aangegeven. Bij het onderzoek is weinig vondstmateriaal aangetroffen. Het betrof voornamelijk kleine fragmenten aardewerk uit de nieuwe tijd, wat goed past in het rurale karakter van deze vindplaats. Opmerkelijk is de vondst van een vuurstenen kling. Hoewel deze uit een opgebracht en verploegd pakket uit de late nieuwe tijd afkomstig is kan dit een aanwijzing zijn dat in de omgeving een jachtkamp uit het Mesolithicum heeft gelegen. Het grootste deel van het natuurlijke podzolprofiel is echter verdwenen waardoor eventuele vuursteenvindplaatsen zijn verstoord.&lt;/p&gt;
description: Issued: 2016-02
DOI: 10.3535/g0g-r9e-ek1
title: Animalia

description: Digital Specimen for the physical specimen hosted at Naturalis Biodiversity Center.
DOI: 10.6084/m9.figshare.29337209
title: The ABC type fucose operon regulated by XtrSs through CcpA contributes to Streptococcus suis survival in macrophages_Supplement material

description: The ABC type fucose operon regulated by XtrSs through CcpA contributes to Streptococcus suis survival in macrophages_Supplement material
DOI: 10.6084/m9.figshare.29337209.v2
title: The ABC type fucose operon regulated by XtrSs through CcpA contributes to Streptococcus suis survival in macrophages_Supplement material

description: The ABC type fucose operon regulated by XtrSs through CcpA contributes to Streptococcus suis survival in macrophages_Supplement material
DOI: 10.3535/2fd-z2t-fee
title: Animalia

description: Digital Specimen for the physical specimen hosted at Naturalis Biodiversity Center.
DOI: 10.3535/xmn-gpg-42v
title: Horstia Deland, Cameron, Rao, Ritter & Bullock, 2010

description: Digital Specimen for the physical specimen hosted at Naturalis Biodiversity Center.
DOI: 10.6084/m9.figshare.29337209.v1
title: The ABC type fucose operon regulated by XtrSs through CcpA contributes to Streptococcus suis survival in macrophages_Supplement material

description: The ABC type fucose operon regulated by XtrSs through CcpA contributes to Streptococcus suis survival in macrophages_Supplement material
DOI: 10.3535/c91-4xb-zla
title: Animalia

description: Digital Specimen for the physical specimen hosted at Naturalis Biodiversity Center.
DOI: 10.3535/tkd-1nl-vz8
title: Animalia

description: Digital Specimen for the physical specimen hosted at Naturalis Biodiversity Center.
DOI: 10.17026/dans-25j-yhgu
title: PAN-00051450 - boat hook

description: &lt;p&gt;This find is registered at Portable Antiquities of the Netherlands with number PAN-00051450&lt;/p&gt;
description: Modified: 2019-10-28T09:10:27+01:00
DOI: 10.3535/1zh-5t0-8bb
title: Animalia

description: Digital Specimen for the physical specimen hosted at Naturalis Biodiversity Center.
DOI: 10.3535/8zq-f04-rre
title: Animalia

description: Digital Specimen for the physical specimen hosted at Naturalis Biodiversity Center.
DOI: 10.3535/nrk-wrw-cwh
title: Animalia

description: Digital Specimen for the physical specimen hosted at Naturalis Biodiversity Center.
DOI: 10.17026/dans-25j-zrne
title: PAN-00026300 - composite footbow brooch group A

description: &lt;p&gt;This find is registered at Portable Antiquities of the Netherlands with number PAN-00026300&lt;/p&gt;
description: Modified: 2019-10-04T09:53:59+02:00
DOI: 10.3535/8tw-edc-ryn
title: Animalia

description: Digital Specimen for the physical specimen hosted at Naturalis Biodiversity Center.
DOI: 10.3535/smz-cem-e4k
title: Animalia

description: Digital Specimen for the physical specimen hosted at Naturalis Biodiversity Center.
DOI: 10.3535/cdv-fe8-dp4
title: Animalia

description: Digital Specimen for the physical specimen hosted at Naturalis Biodiversity Center.
DOI: 10.3535/nl8-ndz-qy8
title: Animalia

description: Digital Specimen for the physical specimen hosted at Naturalis Biodiversity Center.
DOI: 10.17026/dans-25k-2hrp
title: PAN-00018807 - decorative Roman horse gear fitting group A2

description: &lt;p&gt;This find is registered at Portable Antiquities of the Netherlands with number PAN-00018807&lt;/p&gt;
description: Modified: 2019-09-10T10:59:44+02:00
DOI: 10.3535/e6l-2wb-2xj
title: Horstia Deland, Cameron, Rao, Ritter & Bullock, 2010

description: Digital Specimen for the physical specimen hosted at Naturalis Biodiversity Center.
DOI: 10.3535/wn2-w4f-yjk
title: Animalia

description: Digital Specimen for the physical specimen hosted at Naturalis Biodiversity Center.
DOI: 10.3535/awg-22t-nj4
title: Animalia

description: Digital Specimen for the physical specimen hosted at Naturalis Biodiversity Center.
DOI: 10.3535/e4t-3jb-b1c
title: Animalia

description: Digital Specimen for the physical specimen hosted at Naturalis Biodiversity Center.
DOI: 10.17026/dans-25k-3y4x
title: PAN-00014289 - flint and flint pad

description: &lt;p&gt;This find is registered at Portable Antiquities of the Netherlands with number PAN-00014289&lt;/p&gt;
description: Modified: 2019-09-10T10:26:51+02:00
DOI: 10.3535/0my-45t-zlm
title: Animalia

description: Digital Specimen for the physical specimen hosted at Naturalis Biodiversity Center.
DOI: 10.3535/0n6-qnt-0ye
title: Animalia

description: Digital Specimen for the physical specimen hosted at Naturalis Biodiversity Center.
DOI: 10.3535/zp9-wg5-59k
title: Animalia

description: Digital Specimen for the physical specimen hosted at Naturalis Biodiversity Center.
DOI: 10.17026/dans-25k-5g7n
title: PAN-00052482 - finger ring with V-shaped profile, small bezel and granulation

description: &lt;p&gt;This find is registered at Portable Antiquities of the Netherlands with number PAN-00052482&lt;/p&gt;
description: Modified: 2019-10-28T09:15:47+01:00
DOI: 10.3535/2k1-tva-rg0
title: Animalia

description: Digital Specimen for the physical specimen hosted at Naturalis Biodiversity Center.
DOI: 10.3535/wdm-r34-28j
title: Scina Prestandrea, 1833

description: Digital Specimen for the physical specimen hosted at Naturalis Biodiversity Center.
DOI: 10.3535/mbv-7fb-cfy
title: Horstia Deland, Cameron, Rao, Ritter & Bullock, 2010

description: Digital Specimen for the physical specimen hosted at Naturalis Biodiversity Center.
DOI: 10.3535/s1p-lna-s4n
title: Horstia Deland, Cameron, Rao, Ritter & Bullock, 2010

description: Digital Specimen for the physical specimen hosted at Naturalis Biodiversity Center.
DOI: 10.17026/dans-25k-5rjq
title: PAN-00038182 - wire brooch with angular bow variant A1

description: &lt;p&gt;This find is registered at Portable Antiquities of the Netherlands with number PAN-00038182&lt;/p&gt;
description: Modified: 2019-10-11T15:55:49+02:00
DOI: 10.3535/y1r-90z-41y
title: Animalia

description: Digital Specimen for the physical specimen hosted at Naturalis Biodiversity Center.
DOI: 10.3535/qyw-4h8-sh4
title: Lepidoptera Linnaeus, 1758

description: Digital Specimen for the physical specimen hosted at Naturalis Biodiversity Center.
DOI: 10.3535/vex-mdp-yhy
title: Horstia Deland, Cameron, Rao, Ritter & Bullock, 2010

description: Digital Specimen for the physical specimen hosted at Naturalis Biodiversity Center.
DOI: 10.17026/dans-25k-5tv5
title: PAN-00091528 - bag seal

description: &lt;p&gt;This find is registered at Portable Antiquities of the Netherlands with number PAN-00091528&lt;/p&gt;
description: Modified: 2021-07-28T11:19:30+02:00
DOI: 10.3535/ggp-06r-znn
title: Animalia

description: Digital Specimen for the physical specimen hosted at Naturalis Biodiversity Center.
DOI: 10.3535/ne9-hyb-z14
title: Animalia

description: Digital Specimen for the physical specimen hosted at Naturalis Biodiversity Center.
DOI: 10.3535/l7z-004-mpa
title: Horstia Deland, Cameron, Rao, Ritter & Bullock, 2010

description: Digital Specimen for the physical specimen hosted at Naturalis Biodiversity Center.
DOI: 10.3535/lra-941-wam
title: Tarophagus

description: Digital Specimen for the physical specimen hosted at Naturalis Biodiversity Center.
DOI: 10.17026/dans-25k-6m82
title: PAN-00131250 - knob unspecified (Roman period)

description: &lt;p&gt;This find is registered at Portable Antiquities of the Netherlands with number PAN-00131250&lt;/p&gt;
description: Modified: 2023-09-08T14:16:01+02:00
DOI: 10.3535/yve-qr2-7qd
title: Animalia

description: Digital Specimen for the physical specimen hosted at Naturalis Biodiversity Center.
DOI: 10.3535/j7l-9mz-el7
title: Animalia

description: Digital Specimen for the physical specimen hosted at Naturalis Biodiversity Center.
DOI: 10.3535/www-mn1-hwl
title: Sennertia (Sennertia) vanderhammeni Fain, 1974

description: Digital Specimen for the physical specimen hosted at Naturalis Biodiversity Center.
DOI: 10.17026/dans-25k-7bk6
title: PAN-00018756 - classical divinity figurine

description: &lt;p&gt;This find is registered at Portable Antiquities of the Netherlands with number PAN-00018756&lt;/p&gt;
description: Modified: 2023-11-22T17:51:11+01:00
DOI: 10.3535/m15-q2f-2e0
title: Animalia

description: Digital Specimen for the physical specimen hosted at Naturalis Biodiversity Center.
DOI: 10.3535/r8y-hzs-80k
title: Sennertia (Sennertia) vanderhammeni Fain, 1974

description: Digital Specimen for the physical specimen hosted at Naturalis Biodiversity Center.
DOI: 10.3535/h2h-ypg-93x
title: Animalia

description: Digital Specimen for the physical specimen hosted at Naturalis Biodiversity Center.
DOI: 10.3535/zfj-w9z-pfe
title: Animalia

description: Digital Specimen for the physical specimen hosted at Naturalis Biodiversity Center.
DOI: 10.3535/mq6-sja-xyd
title: Sennertia Oudemans, 1905

description: Digital Specimen for the physical specimen hosted at Naturalis Biodiversity Center.
DOI: 10.3535/x76-p7v-ypr
title: Animalia

description: Digital Specimen for the physical specimen hosted at Naturalis Biodiversity Center.
DOI: 10.3535/3rb-6l8-l2n
title: Animalia

description: Digital Specimen for the physical specimen hosted at Naturalis Biodiversity Center.
DOI: 10.3535/p0w-vpg-405
title: Animalia

description: Digital Specimen for the physical specimen hosted at Naturalis Biodiversity Center.
DOI: 10.3535/va6-3rh-jq5
title: Animalia

description: Digital Specimen for the physical specimen hosted at Naturalis Biodiversity Center.
DOI: 10.17026/dans-25k-7yr2
title: PAN-00072039 - miniature plate/dish (Late Medieval/Modern)

description: &lt;p&gt;This find is registered at Portable Antiquities of the Netherlands with number PAN-00072039&lt;/p&gt;
description: Modified: 2020-07-30T09:46:42+02:00
DOI: 10.3535/gmq-9xm-1f1
title: Lista Walker, 1859

description: Digital Specimen for the physical specimen hosted at Naturalis Biodiversity Center.
DOI: 10.3535/rgd-e6f-65t
title: Animalia

description: Digital Specimen for the physical specimen hosted at Naturalis Biodiversity Center.
DOI: 10.3535/emy-jwd-382
title: Animalia

description: Digital Specimen for the physical specimen hosted at Naturalis Biodiversity Center.
DOI: 10.3535/s1j-wht-zfv
title: Animalia

description: Digital Specimen for the physical specimen hosted at Naturalis Biodiversity Center.
DOI: 10.17026/dans-25k-8ar4
title: PAN-00046182 - button with solid convex head and flat base, loop-shaped shank, decorated

description: &lt;p&gt;This find is registered at Portable Antiquities of the Netherlands with number PAN-00046182&lt;/p&gt;
description: Modified: 2019-10-11T16:52:52+02:00
DOI: 10.3535/eae-fbp-9ck
title: Animalia

description: Digital Specimen for the physical specimen hosted at Naturalis Biodiversity Center.
DOI: 10.3535/jld-71e-pn2
title: Animalia

description: Digital Specimen for the physical specimen hosted at Naturalis Biodiversity Center.
DOI: 10.3535/ekj-mfq-n1v
title: Animalia

description: Digital Specimen for the physical specimen hosted at Naturalis Biodiversity Center.
DOI: 10.3535/mkc-kac-r5m
title: Animalia

description: Digital Specimen for the physical specimen hosted at Naturalis Biodiversity Center.
DOI: 10.17026/dans-25k-8dsv
title: Geerbosch te Veghel, gemeente Veghel

description: &lt;p&gt;Synthegra heeft in opdracht van Milon een archeologisch bureauonderzoek uitgevoerd voor een terrein aan de weg Prins Willem Alexander Sportpark in Veghel (afbeelding 1.1). De aanleiding voor het onderzoek is de voorgenomen nieuwbouw van een woning. De diepte van de toekomstige bodemverstoring is op dit moment onbekend, maar uitgaande van de aanleg van bouwputten voor de bebouwing zal de bodem waarschijnlijk tot in het archeologische niveau worden verstoord, dat in dit gebied vanaf het maaiveld verwacht kan worden.&lt;/p&gt;&lt;p&gt;Op basis van het bureauonderzoek is voor het plangebied een gespecificeerde archeologische verwachting opgesteld, waarvan de essentie is weergegeven in tabel 1.&lt;br&gt;Het plangebied ligt naar verwachting in een vlakte van ten dele verspoelde dekzanden of misschien op een dekzandrug. In het eerste geval is er waarschijnlijk een beekeerdgrond aanwezig en in het tweede geval een hoge zwarte enkeerdgrond. Op de oorspronkelijke podzolgrond is vanwege intensieve bemesting vanaf de late middeleeuwen of nieuwe tijd een hoge zwarte enkeerdgrond ontstaan. Op basis van de ouderdom van de verwachte afzettingen kunnen binnen het plangebied vindplaatsen aanwezig zijn vanaf het laat-paleolithicum tot en met de nieuwe tijd.&lt;/p&gt;&lt;p&gt;Op grond van de resultaten van het onderzoek en de richtlijnen van de provincie Noord-Brabant inzake de mogelijke aanwezigheid van een enkeerdgrond wordt er voor het plangebied een vervolgonderzoek geadviseerd in de vorm van een verkennend booronderzoek. Mocht blijken dat er sprake is van een beekeerdgrond dan wordt het onderzoek omgezet in een karterend booronderzoek.&lt;/p&gt;
DOI: 10.3535/cgn-gfk-k50
title: Animalia

description: Digital Specimen for the physical specimen hosted at Naturalis Biodiversity Center.
DOI: 10.3535/59q-h70-wl3
title: Horstia Deland, Cameron, Rao, Ritter & Bullock, 2010

description: Digital Specimen for the physical specimen hosted at Naturalis Biodiversity Center.
DOI: 10.3535/gkx-9j2-qhe
title: Horstia Deland, Cameron, Rao, Ritter & Bullock, 2010

description: Digital Specimen for the physical specimen hosted at Naturalis Biodiversity Center.
DOI: 10.17026/dans-25k-9aqp
title: Archeologisch onderzoek Steunpunt Kloosterveen te Assen

description: &lt;p&gt;In opdracht van de provincie Drenthe heeft Grontmij een archeologisch onderzoek uitgevoerd voor de locatie wegensteunpunt Kloosterveen. Het onderzoek heeft bestaan uit een bureauonderzoek en een inventariserend veldonderzoek in de vorm van een booronderzoek.&lt;/p&gt;&lt;p&gt;Uit het bureauonderzoek is gebleken dat archeologische resten verwacht kunnen worden uit de periode Steentijd-Bronstijd in de top van het dekzand en uit de Nieuwe tijd, vanaf het begin van de 19e eeuw in de vorm van funderingsresten, kuilen en andere sporen die gerelateerd zijn aan bebouwing en de voor die periode kenmerkende vondsten. Archiefonderzoek heeft geen aanvullende relevante informatie opgeleverd.&lt;/p&gt;&lt;p&gt;Uit het veldonderzoek is gebleken dat de bodem in het plangebied bestaat uit opgebrachte toplaag op natuurlijke afzettingen van zand (dekzand). In één boring is een restant veen onder de toplaag aangetroffen. Er zijn tijdens het veldonderzoek geen archeologische indicatoren waargenomen.&lt;/p&gt;&lt;p&gt;Recente verstoringen als gevolg van de aanleg van het huidige wegensteunpunt en diverse leidingen en kabels in en rond het terrein hebben zeer waarschijnlijk eventueel aanwezige archeologische resten ernstig verstoord of vernietigd.&lt;/p&gt;
DOI: 10.3535/c0b-k8r-ryg
title: Animalia

description: Digital Specimen for the physical specimen hosted at Naturalis Biodiversity Center.
DOI: 10.3535/yne-hx9-nms
title: Animalia

description: Digital Specimen for the physical specimen hosted at Naturalis Biodiversity Center.
DOI: 10.3535/1ds-tdp-2xj
title: Animalia

description: Digital Specimen for the physical specimen hosted at Naturalis Biodiversity Center.
DOI: 10.3535/zgw-eg1-9ca
title: Animalia

description: Digital Specimen for the physical specimen hosted at Naturalis Biodiversity Center.
DOI: 10.6084/m9.figshare.28910930
title: Downsampled images for FijiFISH tutorial

description: Downsampled images for FijiFISH tutorial.The file folder contains the original z-stacks for analysis in FijiFISH. Once you have run all steps, the analyzedTables folder is where one can begin the RUHi portion of analysis. See our other figshare folder with the CSVs contained in the analyzedTables folder to start straight away with the RUHi tutorial.Data contains 4 rounds of imaging of mouse 20 micron thick mouse brain sections with DAPI as a marker for registration and segmentation. First, animals underwent stereotaxic surgery wherein retrograde viral tracers were injected into the retrosplenial cortex (RSC) and lateral entorhinal cortex (LEC). After allowing these tracers to express, the animals were perfused, sectioned, stained with DAPI, and the circuit mapping was imaged on a Leica SP8 WLL confocal. After this, the tissue was decoverslipped and underwent RNAscope HiPlex, which was then imaged using identical settings to the viral imaging over the course of 3 rounds of imaging.This data was originally published by Erwin*, Bristow*, et al (<i>eLife</i> 2023) DOI: 10.7554/eLife.68967
DOI: 10.6084/m9.figshare.28910930.v1
title: Downsampled images for FijiFISH tutorial

description: Downsampled images for FijiFISH tutorial.The file folder contains the original z-stacks for analysis in FijiFISH. Once you have run all steps, the analyzedTables folder is where one can begin the RUHi portion of analysis. See our other figshare folder with the CSVs contained in the analyzedTables folder to start straight away with the RUHi tutorial.Data contains 4 rounds of imaging of mouse 20 micron thick mouse brain sections with DAPI as a marker for registration and segmentation. First, animals underwent stereotaxic surgery wherein retrograde viral tracers were injected into the retrosplenial cortex (RSC) and lateral entorhinal cortex (LEC). After allowing these tracers to express, the animals were perfused, sectioned, stained with DAPI, and the circuit mapping was imaged on a Leica SP8 WLL confocal. After this, the tissue was decoverslipped and underwent RNAscope HiPlex, which was then imaged using identical settings to the viral imaging over the course of 3 rounds of imaging.This data was originally published by Erwin*, Bristow*, et al (<i>eLife</i> 2023) DOI: 10.7554/eLife.68967