DOI: 10.20350/digitalcsic/17890
title: Abundance_and_Biomass_Data_Set_Lopez-Haslett_2026

description: 1 file.-- Todos los datos de abundancia se dan en cel/mL, y los datos de biomasa en µgC/L. Hoja 1) “Bacteria Flow Citometry” Datos obtenidos por método de citometría de flujo. Abundancia y biomasa de bacterias heterótrofas. El método es el siguiente: Se toman muestras de agua que se fijan con una solución P+G (1% paraformaldehyde + 0.05% glutaraldehyde) a 10% de la concentración final, se congelan rápidamente en nitrógeno líquido, y se almacenan a -80ºC hasta su análisis. A estas muestras se les añade una sustancia SYBR (tinte verde) para teñir las células heterótrofas y hacerlas visibles para el citómetro. El análisis se realiza mediante citometría de flujo: el citómetro hace pasar las células una por una por un conducto muy estrecho mientras las ilumina con un láser. Cada vez que una célula pasa por delante del láser, emite una señal de luz que es detectada por el instrumento. Esta señal es la que permite saber cuántas células hay. A partir de estas observaciones, se estima la biomasa según Morán et al. (2002) para las bacterias heterótrofas. Detalle columnas: columna A= fecha de muestreo columna B= profundidad de la estación de muestreo columna C= abundancia columna D= biomasa Detalle filas: A partir de la fila 4: Para cada fecha hay 6 filas, que corresponden a las 6 profundidades (de 5 a 70 metros aproximadamente) de muestreo Hoja 2) “Picophytoplank Flow Citometr” Datos obtenidos por método de citometría de flujo. Abundancia y biomasa de picofitoplancton (cianobacterias (autótrofas) y picoeucariotas). El método es el mismo que el anterior, solo que, en este caso, las células autótrofas contienen pigmentos con fluorescencia natural. Estas células se detectan gracias a la fluorescencia natural de estos pigmentos propios. El análisis se realiza mediante citometría de flujo: el citómetro hace pasar las células una por una por un conducto muy estrecho mientras las ilumina con un láser. Cada vez que una célula pasa por delante del láser, emite una señal de luz que es detectada por el instrumento. Esta señal es la que permite saber cuántas células. A partir de estas observaciones, se estima la biomasa según Bratbak & Dundas (1984) para Synechococcus y según Varity et al. (1992) para los picoflagelados autótrofos. Detalle columnas: columna A= fecha de muestreo columna B= profundidad de la estación de muestreo columna C, D, E= abundancia de Synechococcus (especie de cianobacteria), Plochlorococcus (especie de cianobacteria) y Picoeucariotas respectivamente columna F, G, H= biomasa de Synechococcus (especie de cianobacteria), Plochlorococcus (especie de cianobacteria) y Picoeucariotas respectivamente Detalle filas: A partir de la fila 4: Para cada fecha hay 6 filas, que corresponden a las 6 profundidades (de 5 a 70 metros aproximadamente) de muestreo Hoja 3) “DAPI ANP HNP” Datos obtenidos por método de tinción usando DAPI y contadas posteriormente con microscopio de epifluorescencia. Abundancia y biomasa de nanoflagelados autótrofos y heterótrofos. La técnica es la siguiente: Las muestras de agua se filtran sobre filtros negros, donde quedan retenidos los microorganismos. A estos filtros se les añade un fluorocromo (DAPI) que se une al ADN, y se dejan incubando durante 10 minutos en oscuridad (metodología según Porter & Feig 1980). El DAPI es un fluorocromo que se une a las regiones ricas en adenina y timina del ADN. Cambia de estructura al unirse con el ADN, emitiendo fluorescencia al ser excitado con luz UV. Las muestras se observan con un microscopio de epifluorescencia. Dependiendo del tipo de luz que se utilice, se pueden distinguir diferentes grupos de organismos. Con luz azul, solo se observan los organismos autótrofos, que aparecen de color rojo debido a la clorofila que contienen (la clorofila que presentan absorbe la luz azul y emite el color rojo). Con luz UV, se observan todos los organismos presentes, ya que el DAPI marca el ADN de todas las células. A partir de estas observaciones, se estima la biomasa de los distintos grupos de microorganismos según el método descrito por Verity et al. (1992). Detalle columnas: columna A= fecha de muestreo columna B= profundidad de la estación de muestreo columna C= nada (solo se añade por la Fila 6 que da título a las celdas a su derecha) columna D= abundancia de ANP columna E= abundancia HNP columna F= biomasa de ANP columna G= biomasa de HNP Detalle filas: A partir de la fila 8: Para cada fecha hay 6 filas, que corresponden a las 6 profundidades (de 5 a 70 metros aproximadamente) de muestreo Hoja 4) “Microplankton Abundance” Datos obtenidos por método de observación mediante microscopía invertida. Abundancia y biomasa de microplancton autótrofo y heterótrofo. La técnica consiste en fijar las muestras de agua en una solución de Lugol para su conservación óptima hasta el momento de analizar en laboratorio. Para analizar estas muestras, se sedimenta un volumen dado de la muestra (generalmente entre 25 y 50 mL, según la concentración de clorofila medida en cada muestra) usando cámaras de sedimentación. Una vez transcurrido el tiempo adecuado (proporcional al volumen de muestra que se deja sedimentar), se procede a observar la muestra usando un microscopio invertido. Los organismos se identifican lo más detalladamente posible. Se cuentan los organismos observados, obteniendo así la abundancia de estos. Detalle columnas: columna A= tamaño columna B= modo de nutrición columna C= nombre de la especie columnas [D– I];[J–O];[P–U];[V–AA];[AB–AG];[AH–AM];[AN–AS];[AT–AY];[AZ–BE];[BF–BK];[BL–BQ];[BR–BW]= número de organismos por fechas y por profundidad Detalle filas: A partir de la fila 16: Cada fila corresponde a un organismo. Hoja 5) “Microplankton Biomass” Datos obtenidos por conversión de abundancias (hoja 4) a biomasas, según Menden-Deuer & Lessard (2000), Verity et al. (1992) y Putt & Stoecker (1989). Detalle columnas: columna A= tamaño columna B= modo de nutrición columna C= nombre de la especie columnas [D– I];[J–O];[P–U];[V–AA];[AB–AG];[AH–AM];[AN–AS];[AT–AY];[AZ–BE];[BF–BK];[BL–BQ];[BR–BW]= número de organismos por fechas y por profundidad Detalle filas: A partir de la fila 16: Cada fila corresponde a un organismo.
description: Este dataset contiene 5 hojas distintas. Cada una presenta los datos correspondientes a una fracción de la comunidad de plancton microbiano. Según la fracción en cuestión (tamaño y modo de nutrición), se empleó un método para su identificación y contaje (abundancia). Estos datos sirvieron para obtener datos de biomasa