cometadata/datacite-titles-descriptions-related-identifiers huggingface dataset:
DOI: 10.12770/f8f7f98e-d31e-4a64-bf0c-f6db5cce3551
title: ATLANTIC_CH02_Product_1 / MPA Atlantic network classified in IUCN classification

description: It's a result of conditional overlap between MPA extent and human activities. For example :- If an MPA extent contain only traditional fishing area, the IUCN classe is 1b- If an MPA contain habitation area, the IUCN classe is V
DOI: 10.12770/01c1b4d6-7fa4-4f57-9999-38a8c2fcf7ff
title: ATLANTIC_CH05_Product_6 / Spatial layer of relative annually averaged sea level trend (in mm/year) for period of 100 years

description: This product attempt to follow up on the sea level rise per stretch of coast of the North Atlantic, over past 100 years as follows:•	Characterization of absolute sea level trend at annual resolution, along the coasts of EU Member States (including Outermost Regions), Canada, Faroes, Greenland, Iceland, Mexico, Morocco, Norway and  USA;The stretchs or coast are defined by the administrative regions of the Atlantic Coast:•	from NUTS3** administrative division for EU countries (see Eurostat),  and 	•	from GADM*** administrative divisions for non-EU countries. ** Third level of Nomenclature of Territorial Units for Statistics	*** Global Administrative Areas   For relative sea level trend for 100 years we extract the information from available tide gauge sea level data for each stretch of Coast. The product is Provided in tabular form and as a map layer.
DOI: 10.12770/36e6d7de-b6ae-45a7-bc7b-734526eab4ed
title: Données maillées représentant l'intensité de l'activité de mouillages forains à l'échelle métropolitaine (grille 1' par 1') - Carpediem 03/08/2018

description: Données produites dans le cadre du projet Carpediem piloté par l'Agence Française pour la Biodiversité avec l'appui scientifique et technique de l'UMR Amure (convention AFB-UBO réference AAMP/16 007). Données sources : CEREMA. Le projet Carpediem a pour objectif la production de cartographies de synthèse des pressions anthropiques et de leurs effets probables ou potentiels sur les écosystèmes marins. Thématique du jeu de données : mouillages forains. Données maillées représentant l'intensité de l'activité produite à partir de la moyenne interannuelle du nombre de bateaux-jour par an sur la période 2014-2016 obtenue par traitement des données AIS. Davantage d'informations sur les différents traitements mis en œuvre et la description de chaque champ de la table sont disponibles dans le document pdf Méthodo_intégration_mouillages_carpediem joint aux données.
DOI: 10.12770/3af47544-00b7-43b7-9040-773dfdba2d48
title: ATLANTIC_CH09_Product_8 / Annual temporal series and long term average of salmon recruitment biomass [ton] (2005-2014)

description: Annual time series of salmon recruitement biomass (2005-2014):•	Time series of atlantic salmon recruitment•	Location and Long Term Average (LTA) of atlantic salmon recruitment per  Management Unit, that could be a river, basin district, a region or a whole country.
DOI: 10.12770/6acca879-5257-44e1-bdcb-6e84ce5df895
title: BLACKSEA_CH04_Product_1 / Map of the change of the average temperature over 2006-2015 period (10 years) - At surface

description: The product gives the change of the Black Sea sea surface temperature for the period 2006-2015 with spatial resolution of  ~4 km. It is based on the CMEMS product SST_BS_SST_L4_REP_OBSERVATIONS_010_022 (1981-2015).
DOI: 10.12770/78bba5d5-2112-467c-b35c-722992ded656
title: Inter and intra-specific transcriptional and phenotypic responses of Pseudo-nitzschia under different nutrient conditions

description: fastq files obtained following a RNA-seq experiment (Illumina HiSeq3000, 2x150bp) investigating the expression of seven strains of Pseudo-nitzschia (two P. fraudulenta strains, two P. pungens strains and three P. australis strains) in three experimental media.
DOI: 10.12770/951e70d9-1d4b-4258-a313-d0a4ced9e3e5
title: Données descriptives de l'activité de cultures marines à l'échelle métropolitaine - Carpediem 01/08/2018

description: Données produites dans le cadre du projet Carpediem piloté par l'Agence Française pour la Biodiversité avec l'appui scientifique et technique de l'UMR Amure (convention AFB-UBO réference AAMP/16 007). Données sources : CEREMA, IFREMER, les DDTM. Le projet Carpediem a pour objectif la production de cartographies de synthèse des pressions anthropiques et de leurs effets probables ou potentiels sur les écosystèmes marins. Thématique du jeu de données : cultures marines. Données vectorielles surfaciques regroupant les emprises cadastrales conchylicoles et la position des sites d'élevage de poissons provenant du CEREMA, des DDTM et de l'IFREMER sur les départements côtiers de la France métropolitaine. A chaque entité spatiale sont associées des informations concernant les espèces élevées, les techniques de production utilisées et l'estimation de la biomasse potentielle obtenue à partir des indications présentes dans les schémas des structures (SDS) et les schémas régionaux de l'aquaculture marine (SRDAM). Davantage d'informations sur les différents traitements mis en œuvre et la description de chaque champ de la table sont disponibles dans le document pdf Méthodo_intégration_cultures_marines_carpediem joint aux données.
DOI: 10.12770/9f4eaa5c-5fc1-498a-a3f6-7e70de9613e9
title: ATLANTIC_CH04_Product_8 / Ice Occurence (1915-2014)

description: Map the occurrence of ice at 1-degree resolution over different periods of the last century (1915-2014, 1965-2014, 2005-2014, 2009-2014). For each entire period (100, 50, 10, 5 years) find and map all cells of the 1 degree grid that experience ice conditions in at least 1 month.
DOI: 10.12770/c2447875-0691-48d5-9ed1-5ccf184cba8e
title: ATLANTIC_CH09_Product_3 / Annual temporal series and long term average with errors of total nitrogen loads [ton] from in situ data (2005-2014)

description: Temporal series (annual mean values) with error of estimation and Long Term Average (LTA) with error of estimation of total nitrogen load for each river mouth where in situ data is available. Different sources can be mixed if any.
DOI: 10.12770/fbb20839-ac88-48ca-bffb-417a939492f0
title: ATLANTIC_CH10_Product_1 / Sample areas of digital bathymetry covering representative areas of the North Atlantic.

description: This data product selects sample areas of digital bathymetry, chosen for their relevance to marine activities and data sources alternative to GEBCO. The approach for building the digital map of water depth is to use GEBCO as a baseline and look at a set of sample areas where GEBCO could be improved upon. Sample areas have also been selected to be representative of each continent bordering the Atlantic and expected future requirements. Data sources include GEBCO, EMODNET, USGS and CHS.
DOI: 10.12770/0829cfe9-25d1-4ab5-a2ed-73c75a32a604
title: ATLANTIC_CH05_Product_3 / Spatial layer of absolute annually averaged sea level trend (in mm/year) for period of 100 years

description: This product attempt to follow up on the sea level rise per stretch of coast of the North Atlantic, over past 100 years as follows:•	Characterization of absolute sea level trend at annual resolution, along the coasts of EU Member States (including Outermost Regions), Canada, Faroes, Greenland, Iceland, Mexico, Morocco, Norway and  USA;The stretchs or coast are defined by the administrative regions of the Atlantic Coast:•	from NUTS3** administrative division for EU countries (see Eurostat),  and 	•	from GADM*** administrative divisions for non-EU countries. ** Third level of Nomenclature of Territorial Units for Statistics	*** Global Administrative Areas   For absolute sea level trend for 100 years we extract the information from grided sea level reconstruction datasets (using a combination of satellite and tide gauges) and extrapolate it to the nearest strecth of coast. The product is Provided in tabular form and as a map layer.
DOI: 10.12770/4186eeef-32b1-4ffb-9a40-61a02a3852b7
title: Metagenomic and metatranscriptomic analyses of the hydrothermal shrimp Rimicaris exoculata symbiosis

description: We use shotgun metagenomics and metatranscriptomics to reconstruct novel Rimicaris exoculata symbiotic genomes and unravel their metabolic functions.
DOI: 10.12770/4aec05f4-9ef8-4117-a144-36057974c72d
title: Données maillées représentant l'intensité de l'activité de cultures marines à l'échelle métropolitaine (grille 1' par 1') - Carpediem 01/08/2018

description: Données produites dans le cadre du projet Carpediem piloté par l'Agence Française pour la Biodiversité avec l'appui scientifique et technique de l'UMR Amure (convention AFB-UBO réference AAMP/16 007). Données sources : CEREMA, IFREMER, les DDTM. Le projet Carpediem a pour objectif la production de cartographies de synthèse des pressions anthropiques et de leurs effets probables ou potentiels sur les écosystèmes marins. Thématique du jeu de données : cultures marines. Données maillées représentant l'intensité de l'activité reposant sur l'estimation de la biomasse potentielle obtenue à partir des indications présentes dans les schémas des structures (SDS) et les schémas régionaux de l'aquaculture marine (SRDAM). Davantage d'informations sur les différents traitements mis en œuvre et la description de chaque champ de la table sont disponibles dans le document pdf Méthodo_intégration_cultures_marines_carpediem joint aux données.
DOI: 10.12770/79903c21-26bf-4feb-90d8-b879b48613db
title: Données maillées représentant l'intensité de l'activité de clapage à l'échelle métropolitaine (grille 1' par 1') - Carpediem 02/08/2018

description: Données produites dans le cadre du projet Carpediem piloté par l'Agence Française pour la Biodiversité avec l'appui scientifique et technique de l'UMR Amure (convention AFB-UBO réference AAMP/16 007). Données sources : CEREMA. Le projet Carpediem a pour objectif la production de cartographies de synthèse des pressions anthropiques et de leurs effets probables ou potentiels sur les écosystèmes marins. Thématique du jeu de données : clapage. Données maillées représentant l'intensité de l'activité de clapage produites à partir des moyennes des quantités de matière sèche clapées entre 2005 et 2015 (données déclaratives) pour chaque maille. Davantage d'informations sur les différents traitements mis en œuvre et la description de chaque champ de la table sont disponibles dans le document pdf Méthodo_intégration_clapage_carpediem joint aux données.
DOI: 10.12770/862e4205-83b0-43b2-bb06-35f748f67336
title: Données maillées représentant l'intensité de l'activité de mouillages permanents à l'échelle métropolitaine (grille 1' par 1') - Carpediem 03/08/2018

description: Données produites dans le cadre du projet Carpediem piloté par l'Agence Française pour la Biodiversité avec l'appui scientifique et technique de l'UMR Amure (convention AFB-UBO réference AAMP/16 007). Données sources : Agence de l'eau RMC, les DREAL, les DDTM, Shom. Le projet Carpediem a pour objectif la production de cartographies de synthèse des pressions anthropiques et de leurs effets probables ou potentiels sur les écosystèmes marins. Thématique du jeu de données : cultures marines. Données maillées représentant l'intensité de l'activité produite à partir du nombre d'emplacements de mouillages permanents pour chaque entité spatiale. Davantage d'informations sur les différents traitements mis en œuvre et la description de chaque champ de la table sont disponibles dans le document pdf Méthodo_intégration_mouillages_carpediem joint aux données.
DOI: 10.12770/9617fdd6-e960-4e17-8d23-8f75911d774c
title: Kelp distribution model across Brittany (France)

description: A habitat distribution modelling approach was used to model the spatial distribution of kelp forests along Britanny’s coast (France).Lineage:Data represents percentage cover of kelp forest. The Habitat model was generated from kelp forest presence/absence determined from acoustic surveys of laminarial algae. KdPar, sea surface temperature, depth and current speed were used as predictive variables. Habitat model represents only the areas where kelp forests may occur, not the areas confirmed in field observations.Type of occurrence data used:Acoustic surveys of kelp forest were carried out in spring 2005-2006-2007 in 10 study areas along the coast of Brittany. A specific algorithm was developed for automatic detection of presence/absence of kelp forest from the acoustic data.Environmental covariates/explanatory variables: Covariates used were:- KPAR (proxy of light availability): spatial resolution 1km, averaged values (temporal coverage 7 years -1998-2004-, temporal resolution 1 week)- Sea surface temperature: spatial resolution 1km, averaged values (temporal coverage 20 years, temporal resolution 1 week)- Tidal current velocity: spatial resolution 300m, maximum values (temporal coverage one mean spring tide)Algorithm/modelling approach:A stepwise multiple regression with a backward selection of variables was used to predict values of kelp frequency (%)
DOI: 10.12770/d9310aa6-c6b3-4657-a3c9-b0a4dd0f016c
title: North Sea - Temperature and salinity Historical Data Collection SeaDataCloud V1

description: The data collection of the North Sea is divided in two datasets : the discrete collection and the trajectories collection.The Discrete SeaDataCloud Temperature and Salinity Historical Data Collection for the North Sea includes open access in situ data on temperature and salinity measured with “discrete” instruments (CTD, XBT, discrete water samplers…). The data span between 4°W and 10°E in longitude, and from 49°N to 62°N in latitude. It covers the time period 1893 – 2017. The data were retrieved from the SeaDataNet infrastructure in November 2017. The “Trajectories” SeaDataCloud Temperature and Salinity Historical Data Collection for the North Sea includes open access in situ data on temperature and salinity measured by continuously recording sensors (e.g. Ferryboxes). The data span between 4°W and 10°E in longitude, and from 49°N to 62°N in latitude. It covers the time period 1989 – 2017. The data were retrieved from the SeaDataNet infrastructure in November 2017. The quality control of the data has been performed with the help of ODV software. Data Quality Flags have been revised following common recommended procedures defined under SeaDataNet 2 project in conjunction with visual expert check. The dataset format is ODV binary collections. You can read, analyse and export from the ODV application provided by Alfred Wegener institute at http://odv.awi.de/.For data access please register at http://www.marine-id.org/.
DOI: 10.12770/eb90b070-c647-11df-a9b6-005056987263
title: MNT du fleuve Manche, zone Levi - campagne Sedimanche 2 en 1993 (réalisé en 1993, résolution 22m)

description: Modèle bathymétrique (MNT) situé en Manche ouest, au droit du Cap Levi. Les données ont été acquises lors de la campagne Sedimanche 2 en 1993, avec le SMF EM1000. Le pas de la grille est de 22m.Produit interne Ifremer.
DOI: 10.12770/52b1f566-cafb-4d91-9acc-491386a58a46
title: Safefishdish : Ecosystème bactérien de gravelaks biopreservé

description: Ecosystème bactérien de gravlaks à l'aneth sous vide, biopréservé par différentes souches bioprotectrices. Séquençage Illumina MiSeq V3+ paired-end de la région V4 de l'ADNr16S après 0, 7, 14, 21 et 28 jours de conservation à 8°C
DOI: 10.12770/575cf2fe-3792-4f95-bf81-7253ea1b6188
title: Données maillées représentant l'intensité de l'activité de dragage à l'échelle métropolitaine (grille 1' par 1') - Carpediem 02/08/2018

description: Données produites dans le cadre du projet Carpediem piloté par l'Agence Française pour la Biodiversité avec l'appui scientifique et technique de l'UMR Amure (convention AFB-UBO réference AAMP/16 007). Données sources : CEREMA, BRGM. Le projet Carpediem a pour objectif la production de cartographies de synthèse des pressions anthropiques et de leurs effets probables ou potentiels sur les écosystèmes marins. Thématique du jeu de données : dragage. Données maillées représentant l'intensité de l'activité de dragage produites à partir de la somme des quantités de matériaux draguées entre 2006 et 2015 (données déclaratives) pour chaque maille. Davantage d'informations sur les différents traitements mis en œuvre et la description de chaque champ de la table sont disponibles dans le document pdf Méthodo_intégration_dragage_carpediem joint aux données.
DOI: 10.12770/970bb3ba-aaf6-4066-9656-87c85da41dbb
title: North Atlantic Ocean - Temperature and Salinity Historical Data Collection SeaDataCloud V1

description: The SeaDataCloud TS historical data collection v1 for the North Atlantic Ocean, includes open access in situ data on temperature and salinity of water column in the North Atlantic Ocean from 10°N to 62°N, including the Labrador Sea, The data were retrieved from the SeaDataNet infrastructure at the end of November 2017. The dataset format is Ocean Data View (ODV - http://odv.awi.de/) binary collection. The quality control of the data has been performed with the help of ODV software. Data Quality Flags have been revised and set up using the elaborated by SeaDataNet2 project QC procedures in conjunction with the visual expert check. The final number of the Temperature and Salinity profiles (stations) in the collection is 9091773.For data access please register at http://www.marine-id.org/.
DOI: 10.12770/b797270a-8e14-41e2-8853-f6fb016cdb8e
title: Faciès sédimentaires surfaciques de la rade de Brest (2016)

description: Cette carte sédimentologique selon la nomenclature de Folk résulte de l'analyse de données bathymétriques, d'imagerie sonar et de prélèvements sédimentaires (2007-2013) par G. Grégoire (Gregoire et al, 2016) et F. Pluquet (Pluquet et Ehrhold, 2009)
DOI: 10.12770/ad07a55f-5de7-4abc-ba89-8899b16c4b59
title: SeaDataCloud Mediterranean Sea - Temperature and Salinity Climatology V1

description: The SDC_MED_CLIM_TS_V1 product contains Temperature and Salinity Climatologies for Mediterranean Sea: monthly and seasonal fields for periods 1955-2017, 1955-1984 and 1985-2017 and seasonal fields for 6 decades covering the time period 1955 to 2017. The climatic fields were computed from an integrated Mediterranean Sea data set that combines data extracted from SeaDataNet infrastructure (https://doi.org/10.12770/2698a37e-c78b-4f78-be0b-ec536c4cb4b3) and Coriolis Ocean Dataset for Reanalysis (CORA5.2) distributed by the Copernicus Marine Service (http://marine.copernicus.eu/services-portfolio/access-to-products/?option=com_csw&view=details&product_id=INSITU_GLO_TS_REP_OBSERVATIONS_013_001_b). The computation was done with the DIVAnd (Data-Interpolating Variational Analysis in n dimensions), version 2.4.0.
DOI: 10.12770/25bf53ff-08a8-41ac-8001-3999ec24c8f4
title: Safefishdish : Ecosystème bactérien de saumon fumé biopreservé

description: Ecosystème bactérien de saumon fumé sous vide, biopréservé par différentes souches bioprotectrices. Séquençage Illumina MiSeq V3+ paired-end de la région V4 de l'ADNr16S après 0, 7, 14, 21 et 28 jours de conservation à 8°C
DOI: 10.12770/a02f96a8-9cdf-47d3-a015-3d0e8499cf36
title: Carte des proportions de carbonate dans le sédiment des baies de Morlaix et Lannion (2015)

description: La carte des taux de carbonate dans le sédiment a été réalisée sur la base des mesures de calcimétrie en laboratoire,des observations de terrain et des travaux historiques (Beslier, 1981).Echelle de la carte : 1/100 000
DOI: 10.12770/c4e8a19b-8ff2-4e11-9a6a-0080dc14fdf4
title: Seascape genetics of the honeycomb worm Sabellaria alveolata

description: ddRAD genotyping was used to evaluate population connectivity and putative loci under selection in honeycomb worm from 13 sites spanning its distribution in the Atlantic and Mediterranean coasts.
DOI: 10.12770/4adbe32a-8c81-4c18-8da3-4c361889820c
title: Kelp species L. digitata and L. hyperborea mapping along Molène Archipelagos (France)

description: A habitat distribution modelling approach was used to model the spatial distribution of the two main species of kelp forests along Molène archipelagos (France).Lineage:Data represents percentage cover of kelp forest as well as biomass of the 2 main species: L. digitata and L. hyperoborea.The used approach consists in firstly establishing surveys and appropriate processing methods in order to provide a detailed underwater topography of the area and to accurately delineate hard substrates (bedrock) potentially colonized by kelp. Secondly, a habitat suitability model is fitted for each species on some carefully selected field stations, measuring kelp presence/absence and biomass. Predictive maps are produced, based on hard substrate areas previously delineated.Type of occurrence data used:In situ data were acquired in the period from late summer to early autumn. Information on the presence/absence of Laminaria species was acquired by towing a high definition video. Species-specific biomass were sampled at low tide for the intertidal areas and by Scuba diving for the sub-tidal areas.Environmental covariates/explanatory variables: Presence–absence of L. digitata distribution was best determined through the combined effects of depth, sediment proximity along current direction, benthic position index (BPI), immersion rate and winter temperature.The sub-model for biomass of L. digitata where present, was predicted using the additional contribution of several variables, with light being the most important (55.62% of deviance explained) and its interactions withwave exposure and spring temperature. Total suspended matter contributed little and only then through the interaction with light.The best model that explained 78.89% of deviance for the presence of L. hyperborea included depth, winter temperature, sediment proximity along current direction and BPIBiomass where L. hyperborea was present was mainly modeled by the same predictors as presence/absenceAlgorithm/modelling approach:Kelp biological response (presence/absence or biomass) was estimated using Generalized Additive Models (GAM)
DOI: 10.12770/53ec04ce-5b9e-4e1d-9904-9a1366f7b7b5
title: Levé topographique - Plage sableuse de la Capte - 09 octobre 2009

description: Levé topographique réalisé le 9 octobre 2009 de la plage de la Capte, commune de Hyères.Type d'entité spatiale : pointFormat : coordonnées numériques en X, Y, Z Objectifs : étudier la morphodynamique en réponse aux conditions météo-marines.
DOI: 10.12770/7ac2cb17-b7d7-48fd-9d0a-e8094f7165a2
title: Carte des formations sédimentaires superficielles simplifiées des baies de Morlaix et Lannion (2015)

description: La carte des formations sédimentaires superficielles simplifiées des baies de Morlaixet Lannion provient de la fusion des cartes sédimentologiques au format shape des baie de Morlaix (Ehrhold, Gautier, 2015) et Lannion (Simplet, Augris 2011).Echelle : 1/100 000
DOI: 10.12770/8bed2328-a0fa-4386-8a3e-d6d146cafe54
title: Abrasion superficielle des fonds par les arts trainants – Méditerranée (surface Swept Area Ratio)

description: Données d’abrasion des fonds générée par les arts trainants (chaluts de fonds à panneaux, chalut jumeaux à panneaux, drague) calculées à l’aide des données de surveillance des navires par satellite (Vessel Monitoring System : VMS) croisées au fichier de flotte de pêche communautaire et, dans le cas des navires français,  aux données de déclarations entre 2008 et 2017. La donnée se présente sous la forme de 11 couches maillées de résolution 1’ x 1’ (10 couches d’abrasion annuelle entre 2008 et 2017 et 1 couche représentant le percentile 90 inter-annuel d’abrasion). L’abrasion est exprimée en ratio de surface balayée sur chacune de ces couches.Ce travail a été réalisé dans le but d’étudier l’effet du chalutage sur les communautés benthiques du Golfe du Lion et de Corse. L’objectif était de mieux décrire la répartition spatiale et temporelle de l’effort de pêche aux arts trainants dans cette zone et leur impact potentiel sur les habitats benthiques.