cometadata/datacite-titles-descriptions-related-identifiers huggingface dataset:
DOI: 10.25573/data.24938799.v2
title: Scripts, Data and Maps in Support of Viquez et al 2025: APPLICATION OF OPEN ACCESS DATA FOR DOCUMENTING MANGROVE COVER, COVER CHANGE AND UNCERTAINTY IN PANAMA

description: As part of a regional effort to generate detailed open-source maps of mangrove cover for Central America, we used Sentinel-2 MSI satellite imagery and Google Earth Engine to generate a 10 m resolution map of mangrove cover for Panama for 2020 and an unbiased estimate of the total mangrove cover. We compared this to estimates from Landsat data to understand how source data and workflows impact results To understand impacts of different management types on mangrove cover changes we used this workflow to estimate cover for 1999 and 2020 from Landsat data.<br>The files below are included as archived data. To cite these data or for further details, please reference the related Viquez et al., 2025 manuscript.<br>AreaEstimates Folder: AreaEstimates_Landsat1999.csv - Calculations for error-adjusted area estimates for mangrove map derived from 1999 Landsat 5 imagery AreaEstimates_Landsat2020.csv - Calculations for error-adjusted area estimates for mangrove map derived from 2020 Landsat 8 imagery AreaEstimates_Sentinel2020.csv - Calculations for error-adjusted area estimates for mangrove map derived from 2020 Sentinel-2 imagery<br>Classifications Folder (Raster Pixel Values: 1=mangrove, NA=non-mangrove): L1999_Merged_Byte.tif - GIS raster layer for 1999 mangrove classification from 1999 Landsat 5 imagery in GeoTIFF format (all provinces merged) L2020_Merged_Byte.tif - GIS raster layer for 2020 mangrove classification from 2020 Landsat 8 imagery in GeoTIFF format (all provinces merged) S2020_Merged_Byte.tif - GIS raster layer for 2020 mangrove classification from 2020 Sentinel-2 imagery in GeoTIFF format (all provinces merged) S2020_Merged_Cleaned_Byte.tif - Manually modified version of S2020_Merged_Byte.tif with mis-classified mangroves removed around Gatun Lake, Lake Alajuela, and Bayano Lake
DOI: 10.25573/data.24938799.v1
title: Scripts, Data and Maps in Support of Viquez et al 2025: APPLICATION OF OPEN ACCESS DATA FOR DOCUMENTING MANGROVE COVER, COVER CHANGE AND UNCERTAINTY IN PANAMA

description: As part of a regional effort to generate detailed open-source maps of mangrove cover for Central America, we used Sentinel-2 MSI satellite imagery and Google Earth Engine to generate a 10 m resolution map of mangrove cover for Panama for 2020 and an unbiased estimate of the total mangrove cover. We compared this to estimates from Landsat data to understand how source data and workflows impact results To understand impacts of different management types on mangrove cover changes we used this workflow to estimate cover for 1999 and 2020 from Landsat data.<br>The files below are included as archived data. To cite these data or for further details, please reference the related Viquez et al., 2025 manuscript.<br>AreaEstimates Folder: AreaEstimates_Landsat1999.csv - Calculations for error-adjusted area estimates for mangrove map derived from 1999 Landsat 5 imagery AreaEstimates_Landsat2020.csv - Calculations for error-adjusted area estimates for mangrove map derived from 2020 Landsat 8 imagery AreaEstimates_Sentinel2020.csv - Calculations for error-adjusted area estimates for mangrove map derived from 2020 Sentinel-2 imagery<br>Classifications Folder (Raster Pixel Values: 1=mangrove, NA=non-mangrove): L1999_Merged_Byte.tif - GIS raster layer for 1999 mangrove classification from 1999 Landsat 5 imagery in GeoTIFF format (all provinces merged) L2020_Merged_Byte.tif - GIS raster layer for 2020 mangrove classification from 2020 Landsat 8 imagery in GeoTIFF format (all provinces merged) S2020_Merged_Byte.tif - GIS raster layer for 2020 mangrove classification from 2020 Sentinel-2 imagery in GeoTIFF format (all provinces merged) S2020_Merged_Cleaned_Byte.tif - Manually modified version of S2020_Merged_Byte.tif with mis-classified mangroves removed around Gatun Lake, Lake Alajuela, and Bayano Lake
DOI: 10.15468/dl.s7g7xx
title: Occurrence Download

description: A dataset containing 166831 species occurrences available in GBIF matching the query:
{
 "and" : [
 "TaxonKey is Felis catus",
 "HasCoordinate is true",
 "HasGeospatialIssue is false",
 "Geometry POLYGON((-180 -90, 180 -90, 180 90, -180 90, -180 -90))"
 ]
}

 The dataset includes 166831 records from 548 constituent datasets; see https://api.gbif.org/v1/occurrence/download/0031055-250827131500795/datasets/export for details.
 
Data from some individual datasets included in this download may be licensed under less restrictive terms.
DOI: 10.15468/dl.5h9kdt
title: Occurrence Download

description: A dataset containing 129 species occurrences available in GBIF matching the query:
{
 "and" : [
 "TaxonKey is Crotalaria pallida",
 "Country is Madagascar",
 "HasCoordinate is true"
 ]
}

 The dataset includes 129 records from 11 constituent datasets; see https://api.gbif.org/v1/occurrence/download/0031130-250827131500795/datasets/export for details.
 
Data from some individual datasets included in this download may be licensed under less restrictive terms.
DOI: 10.17026/dans-2ac-sc9d
title: Kruiningen, Oude Plein Kruiningen Oude Plein. Inventariserend Veldonderzoek door middel van verkennende boringen

description: &lt;p&gt;Het doel van voorliggend veldonderzoek was om het opgestelde archeologische verwachtingsmodel binnen het plangebied middels een Inventariserend Veldonderzoek door middel van verkennende boringen te toetsen. Uit de resultaten van dit veldonderzoek blijkt dat:  voor het Laagpakket van Wormer geldt een lage verwachting op het aantreffen van vindplaatsen uit het Neolithicum. De top van het Laagpakket van Wormer is in de boringen vastgesteld tussen 2,95 en 4,55 meter beneden maaiveld (2,94 en 3,48 meter –NAP).&lt;br&gt; Hollandveen Laagpakket: op het aantreffen van vindplaatsen uit de Bronstijd, IJzertijd en Romeinse Tijd geldt een lage verwachting. Het Hollandveen werd tussen 2,85 en 3,80 meter beneden maaiveld (respectievelijk 2,94 en 2,34 meter –NAP) aangetroffen. In geen enkele boring werd een veraarde en/of intacte top van het veen vastgesteld.&lt;br&gt; Laagpakket van Walcheren: voor de Vroege Middeleeuwen geldt een lage verwachting op het aantreffen van vindplaatsen. Voor de Late Middeleeuwen en Nieuwe Tijd geldt een hoge verwachting. In de meeste boringen zijn ophooglagen aangetroffen met archeologische indicatoren die dateren tussen de Late Middeleeuwen en Nieuwe Tijd. Daarnaast stuitten twee boringen op een ondoordringbare laag baksteen of puin. Deze ophooglagen en ondoordringbare lagen bevinden zich onder de recente bouwvoor tussen 0,20 en 1,15 meter beneden maaiveld (0,29 meter –NAP en 0,87 meter +NAP).&lt;/p&gt;
DOI: 10.17026/dans-25g-zubm
title: Kruiningen, Rijksweg 29-43 en 59-77 Kruiningen Rijksweg 29 t/m 43 en 59 t/m 77. Gemeente Reimerswaal. Archeologisch Bureauonderzoek en Inventariserend Veldonderzoek door middel van verkennende boringen

description: &lt;p&gt;De opdrachtgever heeft het voornemen om de bestaande bebouwing te slopen om plaats te maken voor nieuwbouw aan de Rijksweg 29 tot en met 43 en 59 tot en met 77 te Kruiningen. In het kader van de hiertoe benodigde omgevingsvergunning heeft Artefact! Advies en Onderzoek in Erfgoed een Archeologisch Bureauonderzoek en een Inventariserend Veldonderzoek door middel van verkennende boringen uitgevoerd. &lt;br&gt;In het kader van het bureauonderzoek werd een groot aantal bronnen bestudeerd die geleid hebben tot een gespecificeerd verwachtingsmodel voor het plangebied. Dit model werd vervolgens getoetst door het uitvoeren van een verkennend booronderzoek. Op basis van de resultaten van dit onderzoek kan gesteld worden dat:  Het plangebied is net buiten de oude kern van Kruiningen gelegen, op de noordelijke flank van de oeverwal op de rand met het lager gelegen komgebied  Binnen het gehele plangebied een lage verwachting geldt op het voorkomen van vindplaatsen vanaf het Neolithicum tot de Nieuwe tijd. Enkel binnen deelgebied B kunnen resten van een oud pad en moernering worden aangetroffen&lt;/p&gt;
DOI: 10.17026/dans-27j-dfxq
title: Kruiningen_Nijverheidstraat25 Kruiningen-Nijverheidstraat 25. Gemeente Reimerswaal. Inventariserend Veldonderzoek door middel van proefsleuven

description: &lt;p&gt;Inventariserend Veldonderzoek door middel van proefsleuven uitgevoerd voor het plangebied Nijverheidstraat 25 te Kruiningen (gemeente Reimerswaal).&lt;/p&gt;&lt;p&gt;Op basis van de aangetroffen sporen kunnen we spreken over twee vindplaatsen, namelijk een laatmiddeleeuwse vindplaats en een vindplaats uit de Nieuwe tijd. De laatmiddeleeuwse vindplaats (S2001) manifesteert zich enkel nog tussen de huidige woning en schuur vanaf ca. 0,15m-mv (ca. 0,05m-NAP), daar waar het laatmiddeleeuwse loopniveau niet is opgenomen in de cultuurlaag daterend uit de Nieuwe tijd (S1001, 2008, 3001). Deze vindplaats is als niet behoudenswaardig gewaardeerd. Er kan evenwel niet worden uitgesloten dat zich onder de huidige schuur en woning nog intacte laatmiddeleeuwse resten bevinden. Het proefsleuvenonderzoek was immers beperkt in ruimte.&lt;br&gt;De vindplaats uit de Nieuwe tijd (bewoningssporen in de vorm van kuilen, funderingen, greppels, cultuurlagen) werd aangetroffen over de gehele onderzoekslocatie, plaatselijk reeds vanaf 0,25m-mv (ca. 0,65m-NAP) ten zuiden van de schuur en vanaf ca. 0,40m-mv/0,30m-mv (ca. 0,30m-NAP/0,25m-NAP) respectievelijk ten zuiden en oosten van het woonhuis. De kans wordt evenwel klein geacht dat zich ten oosten van de huidige woning nog erfsporen bevinden uit de Nieuwe tijd aangezien deze sporen volledig zijn opgenomen in de sterk doorwerkte cultuurlaag S3001. De vindplaats werd op basis van zijn inhoudelijke aspecten behoudenswaardig gewaardeerd.&lt;/p&gt;
DOI: 10.15468/dl.6mqjxm
title: Occurrence Download

description: A dataset containing 46 species occurrences available in GBIF matching the query:
{
 "and" : [
 "TaxonKey is Crotalaria pallida",
 "Country is Malaysia",
 "HasCoordinate is true"
 ]
}

 The dataset includes 46 records from 7 constituent datasets; see https://api.gbif.org/v1/occurrence/download/0031133-250827131500795/datasets/export for details.
 
Data from some individual datasets included in this download may be licensed under less restrictive terms.
DOI: 10.15468/dl.sqvchz
title: Occurrence Download

description: A dataset containing 0 species occurrences available in GBIF matching the query:
{
 "and" : [
 "TaxonKey is Crotalaria pallida",
 "Country is Marshall Islands",
 "HasCoordinate is true"
 ]
}

 The dataset includes 0 records from 0 constituent datasets; see https://api.gbif.org/v1/occurrence/download/0031134-250827131500795/datasets/export for details.
DOI: 10.57745/2borbn
title: FructificationBiomass_data_Ventoux.csv

description: cone biomass estimation data, as “cone length” proxi
DOI: 10.57745/1k6551
title: MaleFlowers_data_Ventoux.csv

description: Male flower inflorescence production data
DOI: 10.17026/dans-zxz-5zb9
title: Kustlaboratorium Waterdunen Groede – Kustlaboratorium Waterdunen. Gemeente Sluis. Archeologisch

description: &lt;p&gt;In mei 2018 is een Archeologisch Bureauonderzoek uitgevoerd in het kader van het project Kastlaboratorium Waterdunen dat gelegen is ten noordoosten van Groede, gemeente Sluis.&lt;/p&gt;&lt;p&gt;De beschikbare geologische informatie doet vermoeden dat binnen het plangebied geulafzettingen van het Laagpakket van Walcheren aanwezig zijn en dat deze geulafzettingen de Afzettingen van de Formatie van Nieuwkoop, het Laagpakket van Wormer (Formatie van Naaldwijk) en Formatie van Boxtel weg geërodeerd hebben. Voor de betreffende niveaus geldt dan ook geen archeologische verwachting binnen het onderzoeksgebied. Voor de Volle en Late Middeleeuwen wordt de verwachting op het aantreffen van vindplaatsen in onderzoeksgebied A laag ingeschat. Uit het bureauonderzoek is namelijk gebleken dat het onderzoeksgebied vanaf het begin 16e eeuw door bedijkingen opnieuw geschikt was voor bewoning (bovenop het Laagpakket van Walcheren, afzettingen van Duinkerke IIIb). Voordien betrof het een schorrengebied.&lt;br&gt;Voor onderzoeksgebied B wordt de verwachting voor deze periode dan weer hoog ingeschat. Dit gebied is namelijk gelegen ter plaatse van een polder uit het einde van de 13e eeuw. Langs de noordelijke en westelijke rand van gebied B is daarenboven vanaf de inpoldering op het eind van de 13e eeuw een dijk gelegen. Deze dijk is in recentere tijden afgegraven.&lt;br&gt;Voor de Nieuwe Tijd wordt de verwachting op het aantreffen van vindplaatsen binnen het onderzoeksgebied eveneens hoog ingeschat. Uit de beschikbare historische informatie uit de 17e eeuw, alsook het AHN en luchtfoto’s, is gebleken dat in het westen van onderzoeksgebied A een mogelijk deels omgrachtte woning heeft gelegen. In onderzoeksgebied B is op dat ogenblik nog steeds de dijk gelegen en is, net op de rand of net buiten het onderzoeksgebied, eveneens bewoning vastgesteld op 16e-eeuwse kaarten.&lt;/p&gt;
DOI: 10.57745/ecigao
title: Readme_en_Reproduction_data_Ventoux_VF.txt

description: :unav
DOI: 10.57745/dk4dln
title: Fructification_data_Ventoux.csv

description: :unav
DOI: 10.57745/xpsfx2
title: Individual fruit and cone production, pollen and biomass data for European beech (Fagus sylvatica L.) and silver fir (Abies alba Mill.) from their geographic range margins in south-eastern France

description: Among the phenotypic and functional traits of interest in a context of rapidly changing environmental conditions linked to anthropogenic global warming, fruiting data are often lacking, even though they are fundamental for assessing the adaptive capacities of species and for modeling their ecological niche and simulating their evolution. Inter-annual alternations of high and low fruiting and the correlation between this masting phenomenon and resource allocation to other functions, such as growth, are relatively poorly documented in forest trees. This paper presents a long-term monitoring dataset containing observations of the annual production of female reproductive structures (strobili) over an 18-year period, combined with observations of the annual production of male flowers and cones, dendrometric data (circumference at breast height, total height, crown base heights) and tree health status, at individual tree level. The observations concern two major species of European lowland and mountain forest ecosystems, common beech (Fagus sylvatica L.) and silver fir (Abies alba Mill.). The individual observations were made in a mountain forest located at the southern edge of the distribution range of these two species, along a marked altitude gradient [963 to 1521m] that makes this site a natural laboratory for deciphering processes of micro-geographical adaptation and plasticity: Mont Ventoux (France). For financial reasons (long-term monitoring is dependent on shorter-term, project-based research funding), the number of trees monitored per year varies. For example, there are no fruiting data for 2008, 2009 and 2010 for common beech and 2022 for both species. Despite these short interruptions, the publication contains a total of 2247 cone observations made on 334 fir trees and 2694 fruiting observations made on 422 beech trees between 2006 and 2024. The dataset contains 3 data files: - Fructification_data_Ventoux.csv : Data on fruit production, dendrometry (CBH and Ht), health status and mortality; - MaleFlowers_data_Ventoux.csv : Male flower inflorescence production ; - FructificationBiomass_data_Ventoux.csv : cone biomass estimation data, as the “cone length” proxi. Common variables (Original_ID, Taxon_Name and Year) make it easy to compare data from the 3 files. The dataset also contains a documentation file describing the variables measured and observed, that are present in the 3 data files.
DOI: 10.17026/dans-zcf-7sy3
title: Kwadendamme Kerkeboomgaardstraat 20-28 Kwadendamme Kerkeboomgaardstraat 20-28. Gemeente Borsele. Archeologisch Bureauonderzoek en Inventariserend Veldonderzoek door middel van verkennende boringen

description: &lt;p&gt;De opdrachtgever heeft het voornemen om de bestaande bebouwing te slopen om plaats te maken voor nieuwbouw aan de Kerkeboomgaardstraat 20-28 te Kwadendamme. In het kader van de hiertoe benodigde omgevingsvergunning heeft Artefact! Advies en Onderzoek in Erfgoed een Archeologisch Bureauonderzoek en een Inventariserend Veldonderzoek door middel van verkennende boringen uitgevoerd. &lt;/p&gt;&lt;p&gt;In het kader van het bureauonderzoek werd een groot aantal bronnen bestudeerd die geleid hebben tot een gespecificeerd verwachtingsmodel voor het plangebied. Dit model werd vervolgens getoetst door het uitvoeren van een verkennende booronderzoek. Op basis van de resultaten van dit onderzoek kan gesteld worden dat: - Binnen het plangebied zich diep reikende geulafzettingen van het Laagpakket van Walcheren bevinden; - Binnen het gehele plangebied een lage verwachting geldt op het voorkomen van vindplaatsen voor de late middeleeuwen (vanaf 1472) en de nieuwe tijd. Voor de perioden hiervoor geldt geen verwachting.&lt;/p&gt;
DOI: 10.5281/zenodo.17063632
title: English interiors: 299-324
DOI: 10.5281/zenodo.17063633
title: English interiors: 299-324
DOI: 10.15468/dl.he68qw
title: Occurrence Download

description: A dataset containing 1 species occurrences available in GBIF matching the query:
{
 "and" : [
 "TaxonKey is Anadara demiri",
 "Country is Italy",
 "HasCoordinate is true"
 ]
}

 The dataset includes 1 records from 1 constituent datasets; see https://api.gbif.org/v1/occurrence/download/0031135-250827131500795/datasets/export for details.
 
Data from some individual datasets included in this download may be licensed under less restrictive terms.
DOI: 10.15468/dl.zz2ecq
title: Occurrence Download

description: A dataset containing 19766 species occurrences available in GBIF matching the query:
{
 "and" : [
 "HasCoordinate is true",
 "TaxonKey is Pilosella peleteriana"
 ]
}

 The dataset includes 19766 records from 214 constituent datasets; see https://api.gbif.org/v1/occurrence/download/0031136-250827131500795/datasets/export for details.
 
Data from some individual datasets included in this download may be licensed under less restrictive terms.
DOI: 10.15468/dl.gug8k8
title: Occurrence Download

description: A dataset containing 3154498 species occurrences available in GBIF matching the query:
{
 "and" : [
 "TaxonKey is Arthropoda",
 "HasCoordinate is true",
 "OccurrenceStatus is Present",
 "Continent is South America",
 {
 "not" : {
 "BasisOfRecord" : [
 "is one of (Fossil, Material citation, Specimen)"
 ]
 }
 }
 ]
}

 The dataset includes 3154498 records from 894 constituent datasets; see https://api.gbif.org/v1/occurrence/download/0031075-250827131500795/datasets/export for details.
 
Data from some individual datasets included in this download may be licensed under less restrictive terms.
DOI: 10.6084/m9.figshare.28039832
title: <b>A</b><b> </b><b>G</b><b>lobal</b><b> </b><b>R</b><b>eview of Monitoring Cropland Abandonment</b><b> </b><b>U</b><b>sing Remote Sensing:</b><b> </b><b>Temporal</b><b>-spatial</b><b> </b><b>P</b><b>atterns, Causes, Ecological Effects, and Future Prospects</b>

description: Using remote sensing methodologies to uncover the temporal-spatial patterns of cropland abandonment (CA) offers significant advantages at bothmacro scales and in real time. However, the current literature lacks a systematic review of specific typologies and methods regarding the application of remote sensing technology to CA monitoring. To address this knowledge gap, we systematically review remote sensing-based methods for monitoring CA, its causes, and ecological effects. Our results show thatthe methods for monitoring abandoned cropland can be classified into two major categories: those based on image spectral featuresand thosebased on land covertemporal trajectories and vegetation phenologydynamics. Among the eight subcategories, vegetation phenology and dynamic methods exhibit the highest average overall accuracy at 89.33±3.37%, compared to the other methods. It is crucial to assess the causes of CA through remote sensing observations, such as road density, spatial information of agricultural infrastructure, and the ecological effects resulting from abandonment, including food loss risks, carbon sequestration, wildfire risk, evapotranspiration, wilderness quality, biodiversity, and climate change. Through this systematic review, we argue that remote sensing has greater potential for monitoring CA in the future, with room for further progress in the classification of abandoned cropland types, the observation of fragmented and temporally unstable parcels, and the ecological effects in different scenarios. More importantly, we presenta trinity CA monitoring framework based on the cause-pattern-effect pillars, which offers a novel perspective for comprehensive research on CA. Overall, our work provides a systematic and insightful perspective for advancing remote sensing research on CA
DOI: 10.6084/m9.figshare.28039832.v2
title: <b>A </b><b>G</b><b>lobal </b><b>R</b><b>eview of Monitoring Cropland Abandonment </b><b>U</b><b>sing Remote Sensing methodology: </b><b>Temporal</b><b>-spatial </b><b>P</b><b>atterns, Causes, Ecological Effects, and Future Prospects</b>

description: Using remote sensing methodologies to uncover the temporal-spatial patterns of cropland abandonment (CA) offers significant advantages at bothmacro scales and in real time. However, the current literature lacks a systematic review of specific typologies and methods regarding the application of remote sensing technology to CA monitoring. To address this knowledge gap, we systematically review remote sensing-based methods for monitoring CA, its causes, and ecological effects. Our results show thatthe methods for monitoring abandoned cropland can be classified into two major categories: those based on image spectral featuresand thosebased on land covertemporal trajectories and vegetation phenologydynamics. Among the eight subcategories, vegetation phenology and dynamic methods exhibit the highest average overall accuracy at 89.33±3.37%, compared to the other methods. It is crucial to assess the causes of CA through remote sensing observations, such as road density, spatial information of agricultural infrastructure, and the ecological effects resulting from abandonment, including food loss risks, carbon sequestration, wildfire risk, evapotranspiration, wilderness quality, biodiversity, and climate change. Through this systematic review, we argue that remote sensing has greater potential for monitoring CA in the future, with room for further progress in the classification of abandoned cropland types, the observation of fragmented and temporally unstable parcels, and the ecological effects in different scenarios. More importantly, we presenta trinity CA monitoring framework based on the cause-pattern-effect pillars, which offers a novel perspective for comprehensive research on CA. Overall, our work provides a systematic and insightful perspective for advancing remote sensing research on CA
DOI: 10.15468/dl.fdlsx2
title: Occurrence Download

description: A dataset containing 7112112 species occurrences available in GBIF matching the query:
{
 "DatasetKey" : [
 "is NMNH Extant Specimen Records (USNM, US)"
 ]
}

 The dataset includes 7112112 records from 1 constituent datasets; see https://api.gbif.org/v1/occurrence/download/0003940-190307172214381/datasets/export for details.
 
Data from some individual datasets included in this download may be licensed under less restrictive terms.
DOI: 10.15468/dl.3fofs8
title: Occurrence Download

description: A dataset containing 2623 species occurrences available in GBIF matching the query:
{
 "and" : [
 "TaxonKey is Trillium grandiflorum (Michx.) Salisb.",
 "HasCoordinate is true",
 "HasGeospatialIssue is false"
 ]
}

 The dataset includes 2623 records from 37 constituent datasets; see https://api.gbif.org/v1/occurrence/download/0000857-181003121212138/datasets/export for details.
 
Data from some individual datasets included in this download may be licensed under less restrictive terms.