Η πρόσδεση μορίων RNA ή η φωσφορυλίωση των RS περιοχών παρεμποδίζει την συσσωμάτωση πρωτεϊνών που περιέχουν RS ακολουθίες
Creators: name: Δρόσου, Βικτωρία Βασιλείου
Publisher: name: Aristotle University of Thessaloniki
Year: 2007
Subjects: Ακολουθίες αργινίνης σερίνης
Κινάσες πρωτεϊνών αργινίνης-σερίνης (SRPKS)
Rs domains
LBR (Lamin B Receptor)
SRPKS (Serine-Arginine Protein kinases)
Acinus
PGC-1a

description: Περιοχές πλούσιες σε αμινοξέα αργινίνης σερίνης (RS περιοχές) εντοπίζονται σε μια ποικιλία ευκαρυωτικών πρωτεϊνών, οι οποίες εμπλέκονται σε διάφορες κυτταρικές διαδικασίες όπως είναι η ωρίμανση του πρόδρομου mRNA, η δομή της χρωματίνης, η μεταγραφή από την RNA πολυμεράση ΙΙ, ο κυτταρικός κύκλος, η ρύθμιση της οσμωτικής πίεσης όπως και η ανάπτυξη των γεννητικών κυττάρων. Η επικρατούσα άποψη είναι ότι οι RS περιοχές λειτουργούν ως περιοχές για πρωτεϊνικές αλληλεπιδράσεις, προωθώντας με τον τρόπο αυτό την οργάνωση ανωτέρων κυτταρικών δομών. Στην παρούσα εργασία, με την χρήση καθαρών ανασυνδυασμένων πρωτεϊνών και in vitro αντιδράσεων, διαπιστώθηκε ότι οι RS περιοχές αλληλεπιδρούν άμεσα με μόρια RNA και αυτή η αλληλεπίδραση παρεμποδίζει την συσσωμάτωση των RS πρωτεϊνών. Η κατεργασία κυτταρικών εκχυλισμάτων με RNAse έχει σαν αποτέλεσμα την απομόνωση μιας ομάδας RS πρωτεϊνών, όμοιας με αυτής που κατακρημνίζεται με την χρήση χλωριούχου μαγνησίου. Επιπρόσθετα, η φωσφορυλίωση από την κινάση SRPK1 παρεμποδίζει την δέσμευση RNA, ενώ ταυτόχρονα ενισχύει την ποσότητα των RS πρωτεϊνών που ανακτώνται στην διαλυτή φάση, λειτουργώντας δηλαδή με τον ίδιο τρόπο όπως και η δέσμευση του RNA στις RS πρωτεΐνες. Βασισμένοι στα προηγούμενα αποτελέσματα, προτείνουμε ότι η τάση για συσσωμάτωση είναι μια γενική ιδιότητα των RS πρωτεϊνών, ενώ η δέσμευση μορίων RNA ή η φωσφορυλίωση από την κινάση SRPK1 έχουν σαν αποτέλεσμα την παρεμπόδιση της συσσωμάτωσης.
description: Domains rich in alternating arginine and serine residues (RS domains) are found in a variety of eukaryotic proteins involved in a large array of cellular processes such as pre-mRNA splicing, chromatin structure, transcription by RNA polymerase II, cell cycle, cell structure, osmotic regulation and germ cell development. The prevailing view suggests that RS domains function as protein-interaction domains, thereby promoting the assembly of higher-order cellular structures. Using purified recombinant proteins and in vitro assays we now demonstrate that RS domains directly associate with RNA and that this interaction prevents aggregation of RS domain-containing proteins. RNAse treatment of cellular extracts results in the isolation of a set of SR proteins, similar to the one previously obtained following magnesium-dependent aggregation. Phosphorylation by SRPK1 prevents RNA association, yet it greatly increases the fraction of RS domain-containing proteins recovered in soluble form, thereby mimicking the RNA effect. Based on these results we propose that the tendency to self-associate and form aggregates is a general property of RS domain-containing proteins, whereas RNA binding or SRPK1-mediated phosphosphorylation of the serine residues within the RS domain prevents aggregation and could serve to modulate the RS domain interaction modes.