title: Reframing Biodiversity from the Data Up: Challenges from Plant Data Semantics
title: Eine Neukonzipierung der Biodiversität von den Daten aufwärts: Herausforderungen bei der Kommunikation von Pflanzendaten
Creators: name: Leonelli, Sabina
Publisher: name: MyCoRe Community
Year: 2022
Subjects: subject: Biodiversität
subject: Biodiversity
subject: Taxonomie
subject: Data Science
subject: Data Semantics
subject: 000

description: Historically and conceptually, the study of biodiversity has been closely associated with the attempt to understand and preserve what Darwin aptly characterised as the “endless forms most beautiful and most wonderful”. Thus, biodiversity is typically defined within evolutionary and conservation biology, and taxonomic nomenclatures arising from these domains inform more consumption-related research such as plant breeding and gene editing for food, drugs or fuel production. I consider taxonomic challenges that emerge in relation to contemporary efforts to produce, disseminate and re-use data about plant traits, where concerns about conservation and consumption are unavoidably intertwined. This is often referred by curators and participants in plant data infrastructures as the question of plant data semantics. The effort to share phenomic data about crops across different locations, and between high-resourced and low-resourced research environments, places in sharp relief the complexity and diversity of biological and environmental characteristics as well as of the methods used to generate and process data and the goals, skills and expectations of the stakeholders involved. I argue that the attempt to articulate semantic differences among plant varieties and methods of data collection, sharing and analysis is generating new ways to develop and communicate biological knowledge, including a reframing of the study of biodiversity.
description: Historisch und konzeptionell gesehen ist die Biodiversitätsforschung eng mit dem Bestreben verbunden, das zu verstehen und zu erhalten, was Darwin treffend beschrieb als „eine unendliche Zahl der schönsten und wunderbarsten Formen“. So wird die Biodiversität typischerweise im Rahmen der Evolutions- und Naturschutzbiologie definiert. Die aus diesen Bereichen stammenden taxonomischen Nomenklaturen prägen eine stärker anwendungsorientierte Forschung wie Pflanzenzüchtung und Genom-Editierung für die Produktion von Lebensmitteln, Medikamenten oder Treibstoff. Ich betrachte die taxonomischen Herausforderungen, die sich im Zusammenhang mit den aktuellen Bemühungen um die Produktion, Verbreitung und Wiederverwendung von Daten über Pflanzeneigenschaften ergeben, wenn Bedenken bezüglich des Schutzes und des Verbrauchs unweigerlich miteinander verwoben sind. Dies wird oft von Kuratoren und Akteuren der Pflanzendaten-Infrastrukturen als eine Frage der Datensemantik von Pflanzendaten bezeichnet. Das Bestreben eines Austausches phänomischer Daten von Nutzpflanzen über verschiedene Standorte hinweg und zwischen Forschungsumgebungen mit hohen und niedrigen Ressourcen verdeutlicht die Komplexität und Vielfalt der biologischen und umweltbedingten Merkmale und der Methoden, die zur Erzeugung und Verarbeitung von Daten verwendet werden, sowie der Ziele, Fähigkeiten und Erwartungen der beteiligten Akteure. Ich argumentiere, dass die angestrebte Artikulierung der datensemantischen Unterschiede zwischen den Pflanzensorten und den Methoden zur Datensammlung, zum Austausch und zur Analyse neue Möglichkeiten zur Entwicklung und Kommunikation von biologischem Wissen generiert, einschließlich einer Neukonzipierung der Biodiversitätsforschung.
description: Biodiversität und die Zukunft der Vielfalt: Vorträge anlässlich der Jahresversammlung am 24. und 25. September 2021 in Halle (Saale), p. 39