Gene expression profile in CART Cell recipients
Creators: name: Κούτρα, Μαρία Γεωργία Χρήστου
Publisher: name: Aristotle University of Thessaloniki
Year: 2024
Subjects: Γονιδιακή έκφραση
Τ-λεμφοκύτταρα που φέρουν χιμαιρικό Τ-υποδοχέα
Ενεργοποίηση συμπληρώματος
Gene expression
CART CELLS
Complement activation

description: Η θεραπεία με CART cells αποτελεί έναν τύπο κυτταρικής ανοσοθεραπείας με τροποποιημένα Τ λεμφοκύτταρα. Η CART θεραπεία χρησιμοποιείται επιτυχώς για την αντιμετώπιση αιματολογικών κακοηθειών. Αν και τα αποτελέσματα είναι ενθαρρυντικά, η CART θεραπεία σχετίζεται με την εμφάνιση μοναδικών τοξικοτήτων. Τα συχνότερα αναφερόμενα σύνδρομα είναι το CRS (σύνδρομο απελευθέρωσης κυτοκινών) και το ICANS, σύνδρομο που αφορά νευρολογικές ανεπιθύμητες ενέργειες. Και τα δύο σύνδρομα εμφανίζουν κοινά χαρακτηριστικά με τα σύνδρομα ενδοθηλιακών βλαβών που παρατηρούνται μετά τη μεταμόσχευση αιμοποιητικών κυττάρων (HCT). Στην παρούσα μελέτη αποφασίσαμε να καταγράψουμε τα επίπεδα έκφρασης γονιδίων που σχετίζονται με την εμφάνιση φλεγμονής και την ενεργοποίηση του συμπληρώματος, σε υποψήφιους λήπτες CART θεραπείας. Η μέθοδος που χρησιμοποιήσαμε για τη μελέτη του μεταγραφώματος είναι η RNA στοχευμένη αλληλούχιση, με τεχνολογία βασισμένη στην μαζική παράλληλη αλληλούχιση. Ακολούθησε διαφορική ανάλυση της έκφρασης με τη χρήση βιοπληροφορικών εργαλείων. Τα αποτελέσματα μας ανέδειξαν στατιστικά σημαντικές διαφορές στην έκφραση γονιδίων που σχετίζονται με την εμφάνιση φλεγμονής και την ενεργοποίηση του συμπληρώματος μεταξύ των υποψηφίων ληπτών της CART θεραπείας και της ομάδας ελέγχου που αποτελείτο από υγιή άτομα. Οι διαφορές που καταγράφηκαν στην έκφραση των γονιδίων, ήταν αναμενόμενες καθώς θεωρείται φυσιολογικό τα άτομα με αιματολογικές κακοήθειες να εμφανίζουν κάποιου βαθμού ενδοθηλιακή ενεργοποίηση. Ωστόσο η χρήση της RNA στοχευμένης αλληλούχισης για την καταγραφή των επιπέδων έκφρασης γονιδίων που αφορούν την ενεργοποίηση του ενδοθηλίου, των ατόμων που κρίνονται κατάλληλοι για τη λήψη CART θεραπείας και η καταγραφή των κλινικών ευρημάτων πριν και μετά τη χορήγηση της, μπορούν να μας προσφέρουν τις απαραίτητες πληροφορίες στην προσπάθεια κατανόησης του μηχανισμού πρόκλησης των τοξικοτήτων.
description: Chimeric antigen receptor T (CART) cell therapy is a novel immunotherapy with modified T lymphocytes, showing great efficacy in treating hematological malignancies. Side effects of CART cell therapy are potentially severe, specifically cytokine release syndrome (CRS) and immune effector cell associated neurotoxicity syndrome (ICANS). Both syndromes share similar characteristics with endothelial injury syndromes developing post hematopoietic cell transplantation (HCT). In our study we documented the expression levels of 75 genes associated with complement activation and inflammation, to further explore the pathophysiology of CART cell-related toxicities. Consecutive patients were enrolled before CART therapy, along with healthy individuals as controls. Target RNA regions were amplified using custom RNA sequencing panel based on next generation sequencing. RNA seq data and differential expression analysis between samples was performed using bioinformatics tools. Our data revealed statistically significant differences in expression of genes related with complement activation and inflammation. Regarding gene expression, hematological patients are expected to have some degree endothelium injury. In summary, using RNA targeted sequencing technology, we report for the first time an expression analysis of 75 genes related to complement and inflammation that may play a role in the mechanisms underlying CART cell-related toxicities. Our data suggest that there are changes in gene expression before therapy.