Η επίδραση των μεταγραφικών προσαρμοστών ADA3a/b στους μηχανισμούς άνθισης του Arabidopsis thaliana
Creators: name: Γαβριηλίδης, Μαξίμ Οδυσσέα
Publisher: name: Aristotle University of Thessaloniki
Year: 2017
Subjects: Μεταγραφικές προσαρμοστές ADA3a/b
Σύμπλοκο SAGA
Άνθιση
Τranscriptional adaptors ADA3a/b
SAGA complex
Flowering

description: Η ακετυλίωση των ιστονών θεωρείται μία από τις πιο σημαντικές μετα-μεταφραστικές τροποποιήσεις της χρωματίνης και συσχετίζεται άμεσα με τη ρύθμιση της γονιδιακής έκφρασης. Στη ζύμη η πρωτεΐνη GCN5 δρα ως ακετυλοτρανσφεράση των ιστονών Η3 και Η2Β και συνδέεται φυσικά με την ADA2 και ADA3 σε μεγάλα σύμπλοκα μεταγραφικών προσαρμοστών, όπως το SAGA. Σε αντίθεση με τους άλλους ευκαρυωτικούς οργανισμούς, στο γονιδίωμα του Arabidopsis thaliana πιστεύεται ότι υπάρχουν δύο γονίδια που κωδικοποιούν πρωτεΐνες παρόμοιες με την ADA3 της ζύμης, τα ADA3a (At2g19390) και ADA3b (At4g29790). Τα γονίδια αυτά κωδικοποιούν πρωτεΐνες μεγέθους 133kD που παρουσιάζουν ομοιότητες με την επικράτεια ADA3 άλλων οργανισμών. Στην εργασία αυτή μελετήθηκε ο ρόλος των ADA3α και ADA3b στη ρύθμιση του χρόνου άνθισης. Πιο συγκεκριμένα, βρέθηκε ότι το μη λειτουργικό μετάλλαγμα ada3a-2, καθώς και το διπλό μετάλλαγμα ada3a-2 ada3b-2 παρουσιάζουν πρόωρη άνθιση σε σύγκριση με τον άγριο τύπο σε συνθήκες μεγάλης διάρκειας μέρας. Αντίθετα, το απλό μετάλλαγμα ada3b-2 έχει ίδιο φαινότυπο με τα φυτά του άγριου τύπου. Τα παραπάνω αποτελέσματα υποδεικνύουν ότι η ADA3a αποτελεί αρνητικό ρυθμιστή της άνθισης, ενώ η ADA3b όχι. Επιπλέον, αναλύθηκε η αλληλεπίδραση του μεταγραφικού προσαρμοστή ADA3b με άλλες πιθανές υπομονάδες του συμπλόκου SAGA στο A. thaliana. Βρέθηκε ότι η ADA3b αλληλεπιδρά με τους παράγοντες SGF29a και SGF29b, ενώ δεν αλληλεπιδρά με τους GCN5, ADA2a, ADA2b και άλλα περιφερειακά στοιχεία, όπως οι SGF11 και TAF12b. Τα αποτελέσματα αυτά υποδεικνύουν ότι η ADA3b αποτελεί υπομονάδα του πιθανού συμπλόκου SAGA στο Arabidopsis
description: Histone acetylation is a significant modification of chromatin structure that is directly related to gene expression. In yeast, GCN5 protein is an acetyltransferase of histones H3 and H2B that associates with the transcriptional coactivators ADA2 and ADA3 in complexes such as SAGA. Contrary to other eukaryotes, in Arabidopsis thaliana, two genes encoding proteins that correspond to yeast ADA3 have been identified and designated as ADA3a (At2g19390) and ADA3b (At4g29790). These proteins include a domain which resembles the ADA3 domain of other organisms. In this research the role of ADA3a and ADA3b in the control of flowering time was investigated. Specifically, we found that the knock out mutant ada3a-2 and the double mutant ada3a-2 ada3b-2 lead to early flowering compared to the wild type in long day (LD) conditions. Conversely, the single mutant ada3b-2 has the same phenotype with the wild type. These results indicate that ADA3a is a repressor of flowering, while ADA3b is not. In addition, the interaction of the transcriptional adaptor ADA3b with other putative components of the SAGA complex in A. thaliana was analyzed. We found that ADA3b interacts with SGF29a and SGF29b, whereas it does not interact with GCN5, ADA2a, ADA2b and other peripheral components such as SGF11 and TAF12b. These results indicate that ADA3b is a component of a putative SAGA complex in Arabidopsis