EPARSES cruise,Antea R/V
Creators: name: Hélène, MAGALON
Publisher: name: Sismer
Year: 2022

description: Dans un contexte de réchauffement global, l'étude de la connectivité et des diversités génétiques et spécifiques des populations apparaît essentielle pour comprendre et prédire leur capacité de résilience dans des écosystèmes fragmentés. La campagne ÉPARSES s'est déroulée dans les îles Éparses (Europa et Glorieuses). Elle s'inscrit ainsi dans la continuité des précédentes campagnes d'échantillonnage de différents compartiments benthiques de l'écosystème corallien (coraux, bénitiers, macroalgues, holothuries) et s'est focalisée davantage sur les holothuries pour qui l'effort d'échantillonnage avait été réduit lors des précédentes campagnes, tout en continuant à échantillonner les autres compartiments pour compléter les résultats des campagnes précédentes (notamment avec la description de nouvelles espèces). En effet, les holothuries, malgré leur rôle essentiel dans l'écosystème récifal, sont encore peu étudiées aux îles Éparses (océan Indien) alors que cette ressource subit une forte pression de pêche sur ces territoires et, plus largement, dans le Sud-Ouest de l'océan Indien. Par ailleurs, un autre compartiment a été étudié : celui des élasmobranches (requins et raies) qui subissent une forte pression de pêche et une dégradation de leur stock. L'inventaire s'est fait par une approche de métabarcoding à partir de l'ADN environnemental et sera comparé avec les listes déjà établies par comptage visuel, permettant de détecter des espèces cryptiques. En outre, les Éparses, îles océaniques peu anthropisées, permettront d'être des modèles de référence pour étudier l'effet de masse insulaire dans le Sud-Ouest de l'océan Indien afin de comprendre le rôle des îles océaniques tropicales dans les transferts de matière et de nutriments vers les écosystèmes récifaux et hauturiers adjacents et l'effet de l'anthropisation par comparaison avec des îles fortement anthropisées comme La Réunion.La campagne se décline en quatre objectifs :<strong>Objectif 1</strong> : étudier la distribution, l'abondance et la diversité génétique des différentes espèces d'holothuries, en particulier sur les espèces d'intérêt commercial, dont les stocks sont menacés, au sein de deux îles des Éparses : Europa et Glorieuses (et Tromelin dans une moindre mesure car les conditions de travail y sont souvent plus difficiles).<strong>Objectif 2</strong> : compléter les échantillonnages des campagnes précédentes (coraux, bénitier et macroalgues) afin de continuer à étudier la connectivité de leurs populations et de continuer le travail amorcé d'inventaire et de découverte de nouvelles espèces.  <strong>Objectif 3 </strong>: réaliser un inventaire de la communauté des élasmobranches (requins et raies) pour ces deux îles des Éparses par une approche de métabarcoding en détectant l'ADN environnemental de ces espèces dans des échantillons d'eau et comparer avec les précédents inventaires (comptage visuel), permettant de détecter des espèces cryptiques et élusives.<strong>Objectif 4</strong> : estimer les apports terrigènes des îles sur le milieu marin environnant par une approche couplée d'ADN environnemental (détection de la présence d'ADN d'animaux terrestres, notamment oiseaux) et d'isotopes stables. Cette étude est également réalisée à La Réunion pour comparer les apports entre une île anthropisée et ces îles moins impactées par la pression humaine, afin de mieux comprendre l'influence des environnements côtiers sur le milieu hauturier.  La campagne ÉPARSES a permis de réaliser tout le travail de terrain et d'échantillonnage. L'acquisition des données et des échantillons s'est faite en plongée libre (ou à pied sur le platier) ou en scaphandre autonome. Les échantillons d'eau pour l'ADN environnemental et les isotopes stables ont été prélevés lors des sorties plongée ou à partir du bateau et lors des transits. Chaque demi-journée, un site comprenant plusieurs stations a été exploré. Les échantillons pour la génétique ont été prélevés de manière non destructive et conservés dans l'éthanol 80 %. Cette campagne se rattache au programme HOLIEPOP, financé par le Consortium Iles Éparses, qui permettra les analyses des données de terrain (abondance et habitat) ainsi que les analyses génétiques des échantillons prélevés lors de la campagne.