Εκτίμηση της γενετικής ποικιλότητας αυτοφυών πληθυσμών τσάι του βουνού (Sideritis raeseri) με τη χρήση μοριακών δεικτών
Creators: name: Πατέλου, Ευσταθία Ευστρατίου
Publisher: name: Aristotle University of Thessaloniki
Year: 2015
Subjects: σιδερίτης
μοριακοί δείκτες URP
γενετική παραλλακτικότητα
Sideritis
URP molecular markers
genetic variation

description: Τα είδη του γένους Sideritis (Lamiaceae) χρησιμοποιούνται παραδοσιακά ως τσάι για διάφορους θεραπευτικούς σκοπούς. Το τσάι του βουνού έχει γίνει πολύ δημοφιλές τελευταία, εξαιτίας των φαρμακευτικών ιδιοτήτων των κύριων συστατικών του. Έτσι, τα είδη Sideritis υφίστανται εμπορευματοποίηση η οποία οδηγεί σε εκτεταμένη συλλογή φυτών, με αποτέλεσμα τη δραματική μείωση του πραγματικού μεγέθους των φυσικών πληθυσμών τους ή ακόμα και την απώλεια κάποιων από αυτούς. Η γενετική παραλλακτικότητα είναι ενδεικτική του βαθμού απειλής προς εξαφάνιση αυτών των ειδών. Αναλύθηκαν συνολικά 156 ατομικά φυτά του είδους Sideritis raeseri που συλλέχθηκαν από 9 αυτοφυείς πληθυσμούς ορεινών περιοχών της Β. Ελλάδας και της FYROM. Χρησιμοποιήθηκαν 12 URP μοριακοί δείκτες (Universal Rice Primers) στην ανάλυση με PCR (URP-PCR). Η μέθοδος αυτή δίνει πολυμορφικές ζώνες σε ένα εύρος δειγμάτων φυτικού, ζωικού και μικροβιακού DNA και ανιχνεύει γενετική παραλλακτικότητα μεταξύ ειδών, ποικιλιών, ακόμα και ατομικών γενοτύπων στα φυτικά είδη. Οι 12 δείκτες ενίσχυσαν συνολικά 283 ευδιάκριτες και αξιόπιστες πολυμορφικές ζώνες σε όλους τους πληθυσμούς, με κάθε ατομικό φυτό να έχει ένα μοναδικό προφίλ ηλεκτροφόρησης. Η διαπληθυσμιακή γενετική παραλλακτικότητα ήταν μεγαλύτερη σε σχέση με την ενδοπληθυσμιακή, ωστόσο, η διαφοροποίηση αυτή των πληθυσμών δε σχετίζεται με τη γεωγραφική τους απόσταση. Ως κατάλληλα μέτρα διαχείρισης για την προστασία των φυτογενετικών πόρων ενάντια στη γενετική διάβρωση, προτείνεται η ex situ διατήρηση σε τράπεζες γενετικού υλικού και η ενίσχυση της καλλιέργειας.
description: Sideritis species (Lamiaceae) are traditionally used as herbal tea for several therapeutical purposes. This mountain tea has become very popular recently due to the pharmaceutical properties of its main compounds. Therefore, Sideritis species undergo commercialisation leading to extensive collection of plants which results in reduction of observed census size or even complete loss of some of their natural populations. The degree of endangerement of these species is indicated by genetic variation. 156 individual plants from 9 native populations that belong to the Sideritis raeseri species, growing in mountainous regions of N. Greece and FYROM were analysed. 12 Universal Rice Primers were used in the PCR analysis (URP-PCR). This technique generates polymorphic bands in a wide range of plant, animal and microbial DNA samples and detects genetic diversity among species, cultivars, even individual genotypes in plant species. The 12 markers amplified a total of 283 distinct and reliable polymorphic bands in all populations, each individual plant having a unique electrophoretic profile. Genetic diversity between populations was greater than diversity found in each population, however inter-population diversity was not correlated to geographic distance. Ex citu conservation strategies and culture development are suggested as appropriate management measures for protection of germplasm resources against genetic erosion.