Γενετική διαφοροποίηση των ειδών Epipactis (Orchidaceae) της Ελλάδας:
Creators: name: Πελτέκη, Ναταλία Γεωργίου
Publisher: name: Aristotle University of Thessaloniki
Year: 2014
Subjects: Γενετική διαφοροποίηση ειδών
Γένος Epipactis
Δείκτες DNA
Genetic differentiation of species
Genus Epipactis
DNA markers

description: Η απόδοση ενός φυσικού πληθυσμού σε ένα συγκεκριμένο taxon και ο προσδιορισμός του επιπέδου των taxa ως είδη ή υποείδη είναι απαραίτητες προϋποθέσεις για τη σωστή εφαρμογή των προγραμμάτων προστασίας και διαχείρισης. Το γένος Epipactis της οικογένειας Orchidaceae παρουσιάζει μεγάλες δυσκολίες στην ταξινόμηση των taxa που περιλαμβάνει, λόγω του πρόσφατου εξελικτικά διαχωρισμού μεταξύ τους και της παρουσίας αυτογονιμοποιούμενων πληθυσμών. Για τη διάκριση φυτικών ειδών, εκτός από τους μορφολογικούς χρησιμοποιούνται και δείκτες DNA, αλλά η βιβλιογραφία σχετικά με την ταυτοποίηση μελών του γένους Epipactis με αυτήν την τεχνολογία είναι σχετικά περιορισμένη. Για τους αυτοφυείς πληθυσμούς της Ελλάδας, έχει γίνει μόνο μια εργασία πάνω σε μικρό αριθμό ειδών. Σκοπός της παρούσας εργασίας είναι ο εντοπισμός πολυμορφισμών DNA ικανών να διακρίνουν taxa του γένους Epipactis, αυτοφυή της Ελλάδας. Μελετήθηκαν 25 πληθυσμοί Epipactis της Ελλάδας και ένας της Κύπρου που ανήκαν σε συνολικά 22 taxa. Εφαρμόστηκε η μέθοδος των PCR-RFLP (Polymerase Chain Reaction-Restriction Length Fragment Polymorphism) στις χλωροπλαστικές περιοχές trnL, matK και trnH-psbA και στην πυρηνική περιοχή ITS και η μέθοδος της αλληλούχισης (sequencing) στη χλωροπλαστική περιοχή trnL. Γενικά, δε βρέθηκε μεγάλη ποικιλότητα εντός του γένους στους δείκτες που εξετάστηκαν. Με χρήση της περιοχής trnL ταυτοποιούνται τα είδη E. microphylla, E. palustris και E. subclausa. Το E. palustris διαφοροποιείται και στην περιοχή trnH-psbA. Δεν εντοπίστηκαν δείκτες κατάλληλοι για διάκριση taxa στις περιοχές matK και ITS. Τα αποτελέσματα αυτά συμφωνούν με την άποψη ότι τα διαφορετικά taxa του γένους Epipactis έχουν διαχωριστεί μεταξύ τους πρόσφατα στην εξέλιξη και δεν εμφανίζουν μεγάλη διαφοροποίηση στο επίπεδο του DNA.
description: Αγγλική Περίληψη Attributing natural populations in specific taxa and defining the taxonomic level of the aforementioned taxa as species or subspecies is essential for the effective function of conservation projects. The taxa of the genus Epipactis of the family Orchidaceae raise taxonomic challenges due to recent evolutionary divergence and the presence of autogamous populations. Apart from morphological characters, DNA markers are also used for plant species identification, but there are relatively limited literature references concerning the use of this technology on the genus Epipactis. Regarding the native populations in Greece, there has only been one study on a few species. Aim of the present study is the detection of DNA polymorphisms capable of distinguishing taxa of the genus Epipactis, native in Greece. A total of 25 populations from Greece, plus one from Cyprus, belonging to 22 different Epipactis taxa were studied. The method of PCR-RFLP (Polymerase Chain Reaction-Restriction Length Fragment Polymorphism) was used on the chloroplast loci trnL, matK and trnH-psbA and the nuclear locus ITS and sequencing was also applied on the chloroplast locus trnL. Overall, low diversity was detected within the genus in the markers studied. Using the trnL locus, the species E. microphylla, E. palustris and E. subclausa can be identified, while E. palustris is also identified with the trnH-psbA locus. No suitable markers for distinguishing taxa were detected in the matK and ITS loci. The results are in agreement with the bibliography that the various Epipactis taxa have diverged recently and they don’t exhibit high diversity on the DNA level.