Βιοστατιστική: η περίπτωση της χρήσης της γλώσσας R στην Ανάλυση Επιβίωσης
Creators: name: Ποζίδου, Παρθένα Μενελάου
Publisher: name: Aristotle University of Thessaloniki
Year: 2015
Subjects: Ανάλυση Επιβίωσης
Γλώσσα R
Μη Παραμετρικά Μοντέλα
Survival Analysis
Language R
Non Parametric Models

description: Η ανάλυση επιβίωσης χρησιμοποιείται για την εύρεση της σχέσης μεταξύ μιας μεταβλητής που δηλώνει το χρόνο επιβίωσης κι άλλων μεταβλητών. Η χρήση της είναι συνεχής μιας κι αφορά διάφορες επιστήμες και μελέτες. Στις κοινωνικές επιστήμες ονομάζεται ανάλυση της ιστορίας του γεγονότος (event history analysis) και στη μηχανική είναι γνωστή ως θεωρία αξιοπιστίας (reliability analysis). Η R είναι μια ελεύθερη γλώσσα ανοιχτή προς χρήση και τροποποίηση κι εξελίσσεται καθημερινά. Χρησιμοποιείται ευρέως από φοιτητές, ακαδημαϊκούς ακόμη κι από εταιρείες που σκοπό έχουν τις στατιστικές μελέτες, την έρευνα αγοράς, ιατρικές μελέτες κ.τ.λ. Στόχος της εργασίας αυτής είναι ο εμπλουτισμός της ιστοσελίδας της R, http://cran.r-project.org με ένα εγχειρίδιο χρήσης της R σε θέματα ανάλυσης επιβίωσης, στην ελληνική γλώσσα, ώστε να ενισχυθεί η διάδοση της και η εξέλιξη της. Αξίζει να σημειωθεί ότι το εγχειρίδιο αυτό αφορά άτομα που γνωρίζουν τα στοιχειώδη της R όπως διανύσματα, πίνακες κτλ. Συγκεκριμένα, η εργασία χωρίζεται σε τρία κεφάλαια, τα δύο πρώτα αφορούν το θεωρητικό μέρος, το τρίτο το πρακτικό με τα παραδείγματα κι ακολουθεί το παράρτημα στην R. Συγκεκριμένα, στο πρώτο κεφάλαιο γίνεται μια εισαγωγή στην ανάλυση επιβίωσης, στις έννοιες των λογοκριμένων και αποκομμένων δεδομένων, στο δεύτερο στη συνάρτηση του χρόνου επιβίωσης, καθώς επίσης στις σχέσεις μεταξύ τους. Αμέσως μετά αναπτύσσεται η μέθοδος Kaplan Meier ως μη παραμετρική μέθοδος εκτίμησης της συνάρτησης επιβίωσης. Ακολουθεί η ανάλυση για το μοντέλο του Cox, των καταλοίπων και των μεθόδων για τη σύγκριση καμπυλών επιβίωσης όπως επίσης αναπτύσσονται παραμετρικές μέθοδοι εκτίμησης των συναρτήσεων επιβίωσης. Στο τρίτο αναλύονται δεδομένα με τις προαναφερθείσες μεθόδους, που εμπεριέχονται στην R κι ακολουθεί το μέρος στο οποίο εμπεριέχονται οι συναρτήσεις της R για την ανάλυσης επιβίωσης.
description: Survival analysis, also called event history analysis in social science, or reliability analysis in engineering, deals with time until occurrence of an event or the time of failure. Survival analysis is used to find the relationship between a variable that indicates the survival time and other variables. The use of it is continuous and concerns various sciences and studies. R is a free open language and is used with great success in terms of being free to be changed, modified and evolved daily. The aim of this work is to enrich the site of R, http://cran.r-project.org with a manual of using R in survival analysis in the Greek language in order to strengthen the diffusion and development of R. It should be noted that this manual is applicable to people who know the basics of R as vectors, arrays, etc. The work is divided into three sections, the first two is the theoretical part and the third includes the practical examples. The appendix in R, follows with the function used in survival analysis and in the examples presented in this task. Specifically, in the first chapter we introduce concepts such as the survival analysis, the uncensored and truncated data, the function of survival time and their interrelations. The second chapter is about the estimation of survival analysis and the methods that compare the survival curves. Following we refer to the Kaplan Meier method as a nonparametric method to estimate the survival function. Next is the Cox model, the residuals as well the parametric methods for estimating the survival functions. In the third chapter, there is the analysis of the data included in R using the methods mentioned above and the next the functions of R for survival analysis are presented.