Analisi molecolare dei linfomi cutanei aggressivi
Molecular Analysis of Aggressive Cutaneos Lymphomas
Creators: name: Girgenti, Valentina <1980>
Publisher: name: Alma Mater Studiorum - Università di Bologna
Year: 2012
Subjects: MED/35 Malattie cutanee e veneree

description: I linfomi primitivi cutanei riconosciuti nella classificazione della WHO/EORTC si presentano come “entità cliniche distinte” su base clinica, morfologica, immunofenotipica e molecolare.
Il fenotipo linfocitario T helper CD4+ caratterizza i CTCL, ma alcune entità a prognosi aggressiva presentano un immunofenotipo citotossico CD8+. Numerosi studi di citogenetica (CGH) e gene-expression profiling (GEP) sono stati condotti negli ultimi anni sui CTCL e sono state riscontrate numerose aberrazioni cromosomiche correlate ai meccanismi di controllo del ciclo cellulare.
Scopo del nostro studio è la valutazione delle alterazioni genomiche coinvolte nella tumorigenesi di alcuni CTCL aggressivi: il linfoma extranodale NK/T nasal-type, il linfoma primitivo cutaneo aggressivo epidermotropo (AECTCL) e il gruppo dei PTCL/NOS pleomorfo CD8+. 
Il materiale bioptico dei pazienti è stato sottoposto alla metodica dell’array-CGH per identificare le anomalie cromosomiche; in alcuni casi di AECTCL è stata applicata la GEP, che evidenzia il profilo di espressione genica delle cellule neoplastiche. 
I dati ottenuti sono stati valutati in modo statistico, evidenziando le alterazioni cromosomiche comuni significative di ogni entità.
In CGH, sono state evidenziate alcune aberrazioni comuni fra le entità studiate, la delezione di 9p21.3, l’amplificazione di 17q, 19p13, 19q13.11-q13.32 , 12q13 e 16p13.3, che determinano la delezione dei geni CDKN2A e CDKN2B e l’attivazione del JAK/STAT signaling pathway. Altre alterazioni definiscono l’amplificazione di c-MYC (8q24) e CCND1/CDK4-6 (11q13). In particolare, sono state evidenziate numerose anomalie genomiche comuni in casi di AECTCL e PTCL/NOS pleomorfo. 
L’applicazione della GEP in 5 casi di AECTCL ha confermato l’alterata espressione dei geni CDKN2A, JAK3 e STAT6, che potrebbero avere un ruolo diretto nella linfomagenesi.
Lo studio di un numero maggiore di casi in GEP e l’introduzione delle nuove indagini molecolari come l’analisi dei miRNA, della whole-exome e whole genome sequences consentiranno di evidenziare alterazioni molecolari correlate con la prognosi, definendo anche nuovi target terapeutici.
description: Primary cutaneous lymphomas included in the WHO/EORTC classification are distinctive clinical entities defined by clinical, morphological, immunophenotypical and molecular findings.
CTCLs are characterized by T-helper CD4+ lymphocytic phenotype but some aggressive entities present CD8+cytotoxic immunophenotype.
In the last years numerous study of cytogenesis (CGH) and gene expression profiling (GEP) about CTCLs have found many chromosomal aberrations related to control mechanisms of cell cycle.
The aim of our study is to value genomic alterations involved in tumorigenesis of some aggressive CTCLs: extranodal NK/T nasal-type lymphoma, primary cutaneous aggressive epidermotropic lymphoma (AECTCL) and pleomorphic CD8+ PTCL/NOS.  
Array-CGH analysis was applied to tissue biopsies of all patients in order to identify chromosomal alterations; GEP was also performed in a few cases of AECTCL to point out genomic expression profile of neoplastic cells.
We assessed our results with statistical analysis to evidence significant common chromosomal aberrations for all entities.
In CGH analysis, we have underlined some common alterations: loss of 9p21.3, gain of 17q, 19p13, 19q13.11-q13.32 , 12q13 e 16p13.3, that determine CDKN2A deletion and JAK/STAT signaling pathway activation. Other alterations define c-MYC (8q24) and CCND1/CDK4-6 (11q13) amplification. Particularly, AECTCL and pleomorphic PTCL/NOS include many common genomic anomalies.
GEP analysis of 5 cases of AECTCL confirmed altered expression of CDKN2A, JAK3 and STAT6 genes, that could have a direct role in lymphomagenesis.
The application of GEP in a major number of cases and the introduction of new molecular probes like miRNA, whole-exome and whole genome sequences could show molecular alterations related to prognosis, defining also new therapeutic targets.