Απομόνωση, μοριακός χαρακτηρισμός και φυλογενετική ανάλυση γονιδίων της οικογένειας HSP70 από το είδος Mytilus galloprovincialis, Lamarck 1819
Creators: name: Κουρτίδης, Αντώνιος Σ.
Publisher: name: Aristotle University of Thessaloniki
Year: 2004
Subjects: Μαλάκια
Γονίδια hsp70, hsc70
Γονιδιωματική βιβλιοθήκη
Κυτταροπλασματικά μέλη
Mollusca
hsp70, hsc70 genes
Genomic library
Cytoplasmic members

description: Τα γονίδια της οικογένειας HSP70, παρά τη μεγάλη τους σημασία, δεν ήταν ως τώρα καλά μελετημένα στα μαλάκια. Για το λόγο αυτό, πραγματοποιήθηκε απομόνωση και ανάλυση γονιδίων της οικογένειας HSP70 από το είδος Mytilus galloproviancialis(Mollusca, Bivalvia). Για την απομόνωση των γονιδίων κατασκευάστηκε γονιδιωματική βιβλιοθήκη και απομονώθηκαν ανασυνδυασμένοι κλώνοι, από τους οποίους αναλύθηκαν και χαρακτηρίστηκαν έξι κυτταροπλασματικά μέλη της οικογένειας HSP70, τα δύο συστατικά που ονομάστηκαν hsc71 και hsc70 και τα τέσσερα θερμοεπαγόμενα που ονομάστηκαν hsp70-1, hsp70-2, hsp-3 και hsp70-4. Τα ιντρόνια στα συστατικά μέλη βρέθηκε ότι περιέχουν δορυφορικές απαναλήψεις, μία ήδη γνωστή(Apal) και τρεις που χαρακτηρίστηκαν στην παρούσα μελέτη και ονομάστηκαν MsSat1, MgSat2, MgSat3. Τα hsc71 και hsc70 εμφανίζουν υψηλή ομοιότητα, είτε λόγω πρόσφατου γονιδιακού διπλασιασμού, είτε λόγω ενερμονισμένης εξέλιξης. Τα γονίδια hsp70-1 ως 4 είναι αντίγραφα που υπόκεινται σε εναρμονισμένης εξέλιξης λόγω γονιδιακής μετατροπής και εκκαθαρίζουσας επιλογής. Η μελέτη των φυλογενετικών σχέσεων όλων των απομονωμένων αλληλουχιών της οικογένειας HSP70 από τα μαλάκια έδειξε ότι πολλές από αυτές δεν είναι καλά μελετημένες και χρειάζονται επανεξέταση, ενώ φανέρωσε αλληλουχίες ταυτοποίησης. Η μελέτη των φυλογενετικών σχέσεων των γονιδίων της οικογένειας HSP70 στους ευκαρυώτες έδειξε ότι, τα θερμοεπαγόμενα και τα συστατικά μέλη με κυτταροπλασματικό εντοπισμό υπόκεινται σε αποκλίνουσα εξέλιξη
description: The genes of the HSP70 family are considered to be very important but are not well studied in molluscs. For the reason, several genes of the family were isolated and analyzed from the species Mytilus galloprovincialis(Mollusca, Bivalvia). A genomic library was constructed for the isolation of genes and a number of recombinant clones were isolated leading to the analysis of six cytoplasmic members of the HSP70 family, two constitutive designated as hsc71 and hsc70, and four inducible designed hsp70-1, hsp70-2, hsp70-3 and hsp70-4. Introns in the constitutive genes were found to cantain satellite repeats, one already known(Apal) and three chatacterized in the present study and designated as MgSat1, MgSat2 and MgSat3. The genes hsc71 and hsc70 exhibit high sequence similarity, due to either recent gene duplication of concerted evolution. The genes hsp70-1 to 4 are copies that undergo concerted evolution via gene conversion and purifying selection. Study of the phylogenetic relationships of all the isolated HSP70 family sequences from molluscs showed that many of them are not well studied and need to be reevaluated, while signature sequences were also revealed. Study of the phylogenetic relationships of the genes of the HSP70 family in eukaryotes showed that cytoplasmic and constitutive genes divergent evolution