Γενετική ταυτοποίηση του περιεχομένου εμπορικών ιχθυαλεύρων:
Creators: name: Βλαχάβας, Αντώνιος Αθανασίου
Publisher: name: Aristotle University of Thessaloniki
Year: 2014
Subjects: Ιχθυάλευρα
Νοθεία
Μεταγονιδιωματική
Fishmeals
Fraud
Metagenomics

description: Τα ιχθυάλευρα, είναι εμπορικά προϊόντα συνήθως σε μορφή σκόνης τα οποία χρησιμοποιούνται για την παραγωγή ζωοτροφών. Η σύσταση των ιχθυαλεύρων ποικίλει ανάλογα με τα είδη των ιχθύων ή και των υπολειμμάτων τους που χρησιμοποιούνται κάθε φορά. Στόχος της παρούσας εργασίας, ήταν η ανάπτυξη μιας μεθοδολογίας που θα επιτρέπει την ποιοτική και ημι-ποσοτική γενετική ταυτοποίηση ιχθυαλεύρων που χρησιμοποιούνται στις ελληνικές ιχθυοκαλλιέργειες. Αναλύθηκαν τρία ιχθυάλευρα και δύο ιχθυοτροφές. Και στα πέντε δείγματα υπήρξε επιτυχής απομόνωση DNA, ενισχύθηκε το γονίδιου 16S-rDNA και κλωνοποιήθηκε. Αλληλουχήθηκαν περισσότεροι από 500 κλώνοι και πραγματοποιήθηκε αναζήτηση BlastN με σκοπό να βρεθούν ομόλογες αλληλουχίες με τις αλληλουχίες της μελέτης. Τέλος, εφαρμόστηκε το πρόγραμμα μεταγονιδιωματικής MEGAN 4 για να κατασκευαστούν φυλογενετικά δέντρα. Τα είδη που βρέθηκαν με τα μεγαλύτερα ποσοστά, ήταν δύο είδη του γαύρου (E. ringens - E. Encrasicolus) και ένα της σαρδέλας (S. aurita), σε ποσοστά 91,6% και 39,4% αντίστοιχα. Διακρίνονται μεγάλες διαφορές στη σύσταση ως προς τον αριθμό των ειδών αλλά και ως προς το ποσοστό συμμετοχής αυτών ανά δείγμα, υποδεικνύοντας την ανάγκη για ποιοτικές αναλύσεις της σύστασης τους. Εκτός όμως από τα είδη των ιχθύων, εντοπίστηκε DNA οικόσιτου χοίρου σε ένα από τα ιχθυάλευρα. DNA οικόσιτου χοίρου και όρνιθας, εντοπίστηκαν και σε μία ιχθυοτροφή. Αυτό το εύρημα, αποτελεί μη αναμενόμενο αποτέλεσμα σύμφωνα με πληροφορίες του προμηθευτή μας. Κατά τον υπολογισμό του τροφικού επιπέδου των ιχθύων που εντοπίστηκαν στα δείγματα, φαίνεται ότι χρησιμοποιήθηκαν ιχθύες υψηλού τροφικού επιπέδου (&gt;4). Το γεγονός αυτό, ενισχύει την άποψη ότι σταδιακά, οι αλιευτικές δραστηριότητες ασκούν όλο και μεγαλύτερη πίεση στους ιχθύες υψηλού τροφικού επιπέδου (fishing down) και ότι υπάρχει μια τάση αύξησης του τροφικού επιπέδου των εκτρεφόμενων ιχθύων στα οποία δίνονται τροφές υψηλού τροφικού επιπέδου (farming up). Επιπλέον, μετά τον εντοπισμό της προέλευσης των ιχθύων που χρησιμοποιήθηκαν για την παρασκευή αυτών των δειγμάτων, αποκαλύφθηκε ότι η πλειονότητα αυτών των ψαριών δεν προέρχεται αποκλειστικά από τον Βόρειο Ατλαντικό, αλλά και από τα ύδατα του Περού και της Αφρικής (σε μικρότερα ποσοστά). Ως εκ τούτου, φαίνεται ότι υπάρχει απομάκρυνση βιομάζας από μη Ευρωπαϊκές θάλασσες, προκειμένου να παρασκευαστούν ιχθυοτροφές για εκτρεφόμενους ιχθύες Ευρωπαϊκών υδατοκαλλιεργειών.Η παρούσα εργασία, παρέχει μια ακριβή μεθοδολογία που μπορεί να εφαρμοστεί σε ιδιαιτέρως επεξεργασμένα δείγματα, όπως είναι τα ιχθυάλευρα και οι ιχθυοτροφές.
description: Fish meals are commercial products, usually in the form of powder or cake, that are used for feed production. There has been an increase in the use and demand of fish meals in the aquaculture sector since 2000, however there is few work conducted on fish meal composition, which usually varies and depends on the type of fish used. The aim of this work was the development of a methodology that will allow the qualitative and semi-quantitative genetic identification of fish meals and fish feeds used in Greek aquaculture market. Three fishmeals and two fishfeeds were analyzed. DNA was successfully extracted, while the 16S-rRNA gene was successfully amplified and cloned. More than 500 clones were sequenced. A BlastN search was performed to find homologous sequences to the study sequence, while the meta-genome program MEGAN 4 was applied to built phylogenetic trees. Two species of anchovy (E. ringens, E. encrasicolus) and one of sardine (S. aurita) were detected reaching levels of 91% and 39%, respectively, in some of the studied samples. Besides fish species, pig DNA was detected in one of the three fishmeals, while DNA of domestic pig and chicken was also found in one fish feeds. Finding this species in our samples was an unexpected result according to information from our supplier.When calculating the trophic level of the fishes used in the studied samples, it is evident that in all cases (except for fish meal 3) fish of high (&gt;4) trophic level were used. This fact reinforces the view that gradually fishing activities put more and more pressure on fish of high trophic level (fishing down) and that there is a tendency to use fish meals of high trophic level for the feeding of fish of even higher trophic level (farming up). Additionally, after identifying the origin of the fishes used in these fishmeals, it was revealed that the majority of these fish come not only from the North Atlantic but also from Peruvian waters as well as from Africa (in lower percentages). Based on our results it therefore seems that there is a biomass removal from non European seas in order to feed European aquaculture fishes. The present project provides an accurate methodology that can be applied in highly processed samples like fish meals and fish feeds.