Επιδημιολογική Επιτήρηση Αστικών Λυμάτων για Sars-CoV-2
Creators: name: Χριστούδια, Νικολέττα Δημητρίου
Publisher: name: Aristotle University of Thessaloniki
Year: 2022
Subjects: Κορονοϊοί
Λύματα
Επιτήρηση
Coronaviruses
Wastewater
Surveillance

description: Στην παρούσα διπλωματική εργασία πραγματοποιείται η καθημερινή επιδημιολογική επιτήρηση λυμάτων για την ανίχνευση θραυσμάτων γενετικού υλικού του ιού Sars-CoV-2, καθώς και η ποσοτικοποίηση των ιοσωματίων Sars που εντοπίζονται στις μονάδες βιολογικού καθαρισμού στις περιοχές της Αλωπίας, της Κατερίνης, των Γιαννιτσών και του Ρεθύμνου. Ταυτόχρονα, λόγω του γεγονότος ότι η μέθοδος αυτή δεν αποτελεί διαδεδομένης χρήσης εργαλείο με ευρεία εφαρμογή, αυτό δίνει τη δυνατότητα για παρακολούθηση και επιλογή της βέλτιστης μεθοδολογίας για την εξαγωγή όσο το δυνατόν πιο αξιόπιστων και ακριβών αποτελεσμάτων. Μέσω των αποτελεσμάτων προκύπτει το συμπέρασμα ότι η επιδημιολογική επιτήρηση αστικών λυμάτων των διαφορετικών περιοχών που εξετάζονται ακολουθεί την ίδια τάση με την καθημερινή καταγραφή των ατόμων που έχουν μολυνθεί από Sars-CoV-2. Αυτό επιβεβαιώνει την αξιοπιστία της μεθόδου, αφού αποτελεί μια αμερόληπτη μέθοδο για την αξιολόγηση της εξάπλωσης της μόλυνσης εντός των περιοχών που εξετάζονται. Επιπρόσθετα, τα αποτελέσματα παρουσιάζουν ιδιαίτερα έντονες και απότομες διακυμάνσεις για το ιικό φορτίο. Οι περιπτώσεις που αντιστοιχούν σε ιδιαίτερα μικρό αριθμό ιοσωματίων, πιθανώς οφείλονται στην υψηλή εμβολιαστική κάλυψη που παρατηρείται στις περιοχές αυτές, καθώς και στη λήψη αυστηρών μέτρων προστασίας, με σκοπό την καταπολέμηση της πανδημίας. Αντίθετα οι περιπτώσεις, οι οποίες αντιστοιχούν σε ιδιαίτερα μεγάλο αριθμό ιοσωματίων, πιθανώς οφείλονται στην εμφάνιση διαφορετικών μεταλλάξεων που θεωρούνται ως μεταδοτικότερες συγκριτικά με το αρχικό στέλεχος Sars-CoV-2. Επίσης, πιθανώς οφείλεται στην άρση των περιοριστικών μέτρων και στη χαμηλή εμβολιαστική κάλυψη που λειτουργεί υπέρ της διασποράς του ιού
description: In the present dissertation thesis, the daily epidemiological surveillance of wastewater is carried out for the detection of fragments of genetic material of Sars-CoV-2, as well as the quantification of the Sars viral copies found in the biological treatment of wastewater in the areas of Almopia, Katerini, Pella and Rethymnon. At the same time, since this method is not a widespread use tool with wide application, we are enabled to monitor and select the optimal methodology for extracting as many reliable and accurate results as possible. Τhe results show that the epidemiological surveillance of urban wastewater from the different areas examined follows the same trend as the daily recording of infected people. This confirms the reliability of the method, as it is an unbiased method for assessing the spread of contamination within the areas examined. In addition, the results show particularly strong and abrupt variations for the viral load. A particularly small number of viral copies are probably due to the high vaccination coverage observed in these areas, as well as to the adoption of strict protective measures aimed at combating the pandemic. In contrast, the cases, which correspond to a particularly large number of viral copies, are probably due to the appearance of different variants that are considered to be more contagious compared to the original strain of Sars-CoV-2. Another reason for this might be the lifting of restrictive measures and low vaccination coverage, which works in favor of the spread of the virus