Rapport Final GT HUITRE
Creators: name: Gueguen, Yannick
name: Arzul, Isabelle
name: Goulletquer, Philippe
Publisher: name: Ifremer
Year: 2024

description: Fin 2018, la Direction d’Ifremer a demandé aux Unités de Recherche travaillant sur l’huître creuse Crassostrea gigas de mener une réflexion permettant de faire émerger les « grandes questions scientifiques » sur ce modèle biologique. L’objectif était aussi de rassembler les équipes autour du projet d’Institut Horizon 2030 et du triptyque Recherche / Innovation / Appui à la puissance publique. Cette démarche a été initiée via la création d’un groupe de travail qui a reçu comme mission de rédiger un plan d'actions intégrées visant à accompagner une « trajectoire de développement durable de l’ostréiculture face au changement global ». Cette réflexion a permis de faire émerger trois axes stratégiques de recherche ainsi que des actions transversales structurantes. Le 1er axe concerne la santé de l’huître dans le contexte des changements globaux. Il avait pour ambition d’étudier l’adaptabilité de l’huître à un environnement changeant. L’objectif était de mieux comprendre et prédire le devenir des populations d’huîtres en réponse au changement global. L’intensification des élevages étant souvent associée à l’émergence de maladies, l’étude des mécanismes moléculaires responsables de la résistance de l’huître, de la virulence des agents pathogènes et in fine de leur coévolution était une des questions clé. Le 2nd axe concernait l’huître et son socio-écosystème. Il avait pour objectif d’étudier d’une part le rôle potentiel de l’huître creuse comme réservoir de pathogènes et comme niche favorable à l’émergence de résistance ou de virulence, et d’autre part de mieux comprendre les interactions réciproques entre l’élevage des huîtres et l’environnement et cela à différentes échelles d’observation. Le 3ème axe concerne l’huître comme objet d’innovation. Il visait à évaluer les possibilités de protection des huîtres contre les agents pathogènes par la stimulation de ses capacités immunitaires ou la phagothérapie et d’étudier l’effet Warburg chez l’huître pour participer à la découverte de nouvelles molécules d’intérêt pharmacologique. Enfin, des techniques de filtration spécifiques aux virus ont été développées avec pour objectif la sécurisation des productions. Trois actions transversales ont été identifiées. La première était centrée sur la Communication avec une volonté de faire évoluer les modalités de communication de l’Ifremer avec la filière dans un objectif de transparence et de prise en compte de ses besoins. La seconde concernait la nécessaire mise en œuvre d’une gestion partagée à l’échelle de l’Institut des infrastructures expérimentales et du matériel biologique. Une troisième action était liée à la détection récente en France de l’organisme pathogène Haplosporidium costale. Enfin, trois verrous méthodologiques transversaux ont été identifiés comme importants à lever : le réassemblage du génome de l’huître, la caractérisation de ses populations hémocytaires et la mise au point de méthodes d’invalidation de gènes chez l’huître. Trois actions transversales ont été identifiées. La première était centrée sur la Communication avec une volonté de faire évoluer les modalités de communication de l’Ifremer avec la filière dans un objectif de transparence et de prise en compte de ses besoins. La seconde concernait la nécessaire mise en œuvre d’une gestion partagée à l’échelle de l’Institut des infrastructures expérimentales et du matériel biologique. Une troisième action était liée à la détection récente en France de l’organisme pathogène Haplosporidium costale. Enfin, trois verrous méthodologiques transversaux ont été identifiés comme importants à lever : le réassemblage du génome de l’huître, la caractérisation de ses populations hémocytaires et la mise au point de méthodes d’invalidation de gènes chez l’huître. La rédaction de cette synthèse fait suite à l’organisation d’un séminaire final qui s’est tenu à Nantes les 26 et 27 juin 2024 et qui a permis de faire le point sur les résultats obtenus et d'aborder certains sujets connexes. Le rapport final fait état des discussions et des résultats présentés à cette occasion Après un rappel des actions du projet, une synthèse des résultats obtenus et de leurs perspectives action par action est présentée.