title: Genetische Analyse maligner Gliome mittels Mikroarray-Technologie
title: Genetic analysis of malignant gliomas using microarray technology
Creators: name: Köhler, Sylvia
Publisher: name: Philipps-Universität Marburg
Year: 2013
Subjects: Medizin, Gesundheit
Microarray Technology
Microarray
Genamplifikation , Sequenzanalyse

description: Malignant astrocytomas of World
      Health Organization (WHO) grade III or IV are indicated by a
      significantly reduced median survival time. Several possible
      pathways have been described for the progression of
      anaplastic astrocytomas and glioblastomas, but the molecular
      basis of malignant astrocytoma progression has not been
      analysed entirely. Microarray analysis provides the chance to
      accelerate studies by comparison of thousands of genes in
      these tumours and consequently identify targeting genes and
      this might help to understand the malignant development. We
      compared the transcriptional profile of 4608 genes in tumours
      of 14 patients, including six (6) anaplastic astrocytomas
      (WHO grade III) and eight (8) glioblastomas (WHO grade IV)
      using microarray analysis. The microarray data should be
      validated by real-time reverse transcription-polymerase chain
      reaction analysis of 3 selected genes. A successful
      validation took place with gen RAB34. We identified 166 gene
      alterations with a fold change of 2 and higher whose mRNA
      levels differed considerably (absolute value of the
      t-statistic of 1.96) between the two malignant glioma groups.
      Further analyses confirmed oppositional transcription
      directions for OLIG2 and IL13RA2 in WHO grade III
      astrocytomas as compared to glioblastomas. Homogeneous
      results of both analyses were found on RAB34 In anaplastic
      astrocytomas and glioblastomas, which are histologically
      confirmed, microarray analyses with a closed binary question
      allow an identification of genes of different expression.
      RAB34, IL13RA2 and OLIG2 have been identified to be
      interesting candidate genes whose differential expression
      likely plays a role in malignant progression of
      astrocytomas.
description: Maligne Astrozytome des World
      Health Organization Grad III und IV haben eine stark
      reduzierte mediane Überlebenszeit. Zahlreiche möglichen
      molekularen Transduktionswege wurden bisher für die
      Progression des anaplastischen Astrozytoms zum Glioblastom
      beschrieben, jedoch ist die molekulare Basis der malignen
      Astrozytomprogression bisher noch sehr unerforscht.
      Mikroarray-Analysen erlauben den Vergleich von tausenden
      Genen in diesen Tumoren und dienen damit der Identifizierung
      von möglichen Schlüsselgenen und können dazu beitragen die
      molekularen Mechanismen der malignen Progression zu
      verstehen. Es erfolgte der Vergleich des Transkriptionslevel
      von 4608 Genen in den Tumoren von 14 Patienten (6
      anaplastische Astrozytome und 8 Glioblastome WHO Grad IV)
      mittels Mikroarray-Analysen. Die Mikroarray-Daten sollten
      validiert werden durch die RT Real-Time PCR an drei
      ausgewählten Genen. Bei dem Gen RAB34 is eine erfolgreiche
      Validierung erfolgt. Wir identifizierten 166
      Genexpressionsänderungen mit einem Fold change &gt;2. Die
      mRNA-Level dieser Gene differierten signifikant in den beiden
      malignen Gliomgruppen (absoluter Wert der T-Statistik 1,96).
      Die Mikroarray-Analysen und Real-Time PCR Quantifizierungen
      zeigten gegensätzliche Transkriptionsrichtungen für OLIG2und
      IL13RA2 in den anaplastischen Astrozytomen WHO Grad III im
      Vergleich zum Glioblastom. Homogene Ergebnisse der beiden
      Analysen fanden sich beim RAB34. Mikroarray-Analysen mit
      einer geschlossenen binären Fragestellung erlauben in
      histologisch gesicherten anaplastischen Astrozytomen und
      Glioblastomen eine Identifizierung von Genen verschiedener
      Expression. RAB34, OLIG2und IL13RA2 scheinen interessante
      Gene zu sein, die durch ihre unterschiedliche Expression eine
      wichtige Rolle in der malignen Progression der Astrozytome
      spielen könnten.