Μελέτη των ιών της προϊούσας πνευμονίας των προβάτων και της αρθρίτιδας εγκεφαλίτιδας των αιγών
Creators: name: Καρανικολάου, Αικατερίνη Χ.
Publisher: name: Aristotle University of Thessaloniki
Year: 2003
Subjects: Αρθρίτιδα-εγκεφαλίτιδα
lenti-ιοί μικρών μηρυκαστικών
CAEV (Caprine arthritis-encephalitis)
Small rumminant lentiviruses (SRLV)

description: Η παρούσα έρευνα είχε δύο στόχους. Ο πρώτος στόχος ήταν η απομόνωση και ο μοριακός χαρακτηρισμός στελεχών των lenti-ιών των μικρών μηρυκαστικών από μικτά κοπάδια προβάτων και αιγών, καθώς και η σύγκρισή της αλληλουχίας τμήματος του γονιδίου gag του γενώματός τους που κωδικοποιεί την δομική πρωτεΐνη p25 μεταξύ τους, αλλά και με τα πρότυπα στελέχη. Ο δεύτερος στόχος ήταν μια «τυχαία» καταγραφή και σύγκριση του ποσοστού των οροθετικών προβάτων και των οροθετικών αιγών, σε επίπεδο εκτροφής, σε μικτά κοπάδια με ιστορικό εμφάνισης προϊούσας πνευμονίας, καθώς και η διερεύνηση του ποσοστού των οροθετικών ζώων τα οποία εμφανίζονται ως κλινικώς υγιή. Για πρώτο στόχο χρησιμοποιήθηκαν δύο μικτά κοπάδια προβάτων και αιγών (από την περιοχή Θεσσαλονίκης) τα οποία είχαν ιστορικό προϊούσας πνευμονίας και περιελάμβαναν αρκετά πρόβατα με εμφανή κλινικά συμπτώματα. Από αυτά επιλέχθηκαν τέσσερα πρόβατα με εκδηλωμένη κλινικά νόσο της προϊούσας πνευμονίας σε διάφορα στάδια, και δύο αίγες χωρίς κανένα κλινικό σύμπτωμα. Η επιλογή των ζώων έγινε μετά από τη θετική αντίδραση που έδωσαν και στην ορολογική εξέταση (ανοσοδιάχυση σε άγαρ), αλλά και στην LTR-PCR που εφαρμόστηκε στη στοιβάδα των λευκοκυττάρων του αίματός τους. Από όλα τα ζώα απομονώθηκαν μονοκύτταρα περιφερειακού αίματος που συγκαλλιεργήθηκαν με κυτταροκαλλιέργειες χοριοειδούς πλέγματος υγιούς αμνού για την απομόνωση του ιού. Στελέχη του ιού απομονώθηκαν από 3 πρόβατα και μία αίγα. Κατά την απομόνωση των παραπάνω στελεχών παρατηρήθηκε ότι αυτά εμφάνισαν διαφορετικές βιολογικές ιδιότητες: Τα στελέχη που προέρχονταν από πρόβατα προκαλούσαν έντονο κυτταροπαθογόνο αποτέλεσμα και γρήγορη λύση των κυττάρων ενώ αυτό που προέρχονταν από αίγα προκαλούσε επίμονη μόλυνση. Στη συνέχεια τα κύτταρα συλλέχθηκαν, το DNA απομονώθηκε και εφαρμόστηκε η μέθοδος της αλυσιδωτής αντίδρασης της πολυμεράσης με ειδικούς εκινητές για το γονίδιο gag του γενώματος του DNA προϊού. Στο τμήμα του DNA που πολλαπλασιάστηκε, των παραπάνω στελεχών, έγινε ανάλυση της σημειακής αλληλουχίας (sequensing) και τα αποτελέσματα συγκρίθηκαν μεταξύ τους, καθώς και με τα πρότυπα στελέχη K1514, EV1, SA-OL και CAEV-CO, για τα διαπιστωθεί ο βαθμός της ομοιότητας που υπάρχει στο τμήμα αυτό του γενώματος. Διαπιστώθηκε ότι τα στελέχη που προέρχονταν από πρόβατα είχαν μεγάλη ομοιότητα συγκρινόμενα μεταξύ τους (96-98% σε επίπεδο νουκλεοτιδίων και 99-98% σε επίπεδο αμινοξέων), και σημαντικά μικρότερη συγκρινόμενα με το στέλεχος που απομονώθηκε από αίγα (90-92% σε επίπεδο νουκλεοτιδίων και 95-96% σε επίπεδο αμινοξέων). Κατά τη σύγκριση των τεσσάρων στελεχών που απομονώθηκαν με τα πρότυπα στελέχη διαπιστώθηκε ότι υπάρχει μεγαλύτερος βαθμός ομοιότητας με τα στελέχη που προέρχονται από πρόβατο (K1514, EV1, SA-OL) παρά με το στέλεχος CAEV-CO που προέρχεται από αίγα.Για το δεύτερο στόχο έγινε ορολογική εξέταση (ανοσοδιάχυση σε άγαρ) σε 286 πρόβατα και αίγες από 7 μικτά κοπάδια προβάτων και αιγών της Β. Ελλάδας τα οποία είχαν ιστορικό εμφάνισης προϊούσας πνευμονίας στα πρόβατα. Το ποσοστό των οροθετικών προβάτων ήταν 49% και των οροθετικών αιγών ήταν 60%. Επίσης, καταγράφτηκε το ποσοστό των οροθετικών ζώων που εμφανίζονται ως κλινικώς υγιή (47%). Παρατηρήθηκε ακόμη πως τα οροθετικά πρόβατα εμφανίζουν συμπτώματα σε ποσοστό 22% ενώ αντίθετα στις αίγες κανένα από τα οροθετικά ζώα δεν εμφάνιζε συμπτώματα.Παράλληλα, εφαρμόστηκε μέθοδος ανίχνευσης του DNA προϊού (LTR-PCR), άμεσα σε στοιβάδα λευκοκυττάρων περιφερειακού αίματος χωρίς το στάδιο της συγκαλλιέργειας. Για τον σκοπό αυτό συλλέχτηκαν και εξετάστηκαν δείγματα αίματος από 76 πρόβατα και αίγες τα οποία εξετάστηκαν παράλληλα και ορολογικά με τη μέθοδο της ανοσοδιάχυσης σε άγαρ. Τα αποτελέσματα των δύο μεθόδων συγκρίθηκαν για τη διαπίστωση της πλέον ευαίσθητης μεθόδου ανίχνευσης των μολυσμένων ζώων, και διαπιστώθηκε ότι η LTR-PCR υστερεί σε ευαισθησία σε σχέση με την ανοσοδιάχυση (ποσοστό σχετική ευαισθησίας 79% η LTR-PCR και 88% η ανοσοδιάχυση) ανιχνεύει όμως ένα ποσοστό ζώων τα οποία με την ανοσοδιάχυση εμφανίζονται ως αρνητικά.
description: The present research had two objectives. The first was the isolation and the molecular characterization of strains of small ruminant Lentiviruses from mixed flocks of sheep and goats, as well as the comparison of a part of the gag gene which encodes the structural protein p25 both among themselves and with the prototype strains.The second objective was the random recording and the comparison of the percentage of seropositive sheep and goats, in mixed flocks with a history of progressive pneumonia, as well as the investigation of the frequency of seropositive animals which were clinical healthy.For the first objective two mixed flocks of sheep and goats (from the region of Thessaloniki) with a history of progressive pneumonia in sheep were used. Three sheep with clinical symptoms of progressive pneumonia and three goats were selected from these flocks. These animals were both, serologically (Agar Gel Immunodifussion Test) and LTR-PCR (Long Terminal Repeat-Polymerase Chain Reaction in blood leukocytes) positive. For the isolation of the virus from each animal, monocytes from the peripheral blood were isolated and cocultivated with cell-cultures from choroid plexus of a healthy lamb. The cells were collected upon the appearance of the cytopathic effect. The total DNA was extracted for the detection of the proviral DNA. A PCR method was applied with a pair of primers for the gag gene of DNA provirus. The virus was isolated from all three sheep and only one goat. During isolation it was observed that the viral strains had different biological properties: The sheep strains had cause severe cpe, while nothing was observed in the goat strain. The nucleotide and the deduced amino acid sequences of the amplified proviral DNA were compared among the Greek strains and with the prototype strains K1514, SA-OL, EV1 and CAEV-CO in order to verify the degree of resemblance. It was observed that the sheep strains were similar compared among them (96-98% in DNA and 99-98% in aminoacids) and less similar compared with the goat strain (90-92% in DNA and 95-96% in aminoacids). It was also observed that there was greater degree of resemblance with the prototype sheep strains (K1514, EV1, SA-OL) than with the prototype goat strain CAEV-CO. For the second objective a serological examination (AGIDT) was done in 286 sheep and goats from 7 mixed flocks of N. Greece with a history of progressive pneumonia in their sheep population. Percentage comparison were made with respect to seropositivity and the presence or absence of clinical symptoms. It was observed that the seroprevalence in sheep was 49% and the seroprevalence in goat was 60%. It was also observed that 47% of seropositive sheep were appeared as clinical healthy. The seropositive sheep appeared symptoms in 22% while none seropositive goat appeared any symptoms. In addition, LTR-PCR was done directly in the peripheral blood leucocytes of 76 out of the 286 sheep and goats. The results of the AGIDT and the LTR-PCR methods were then compared so as to determine sensitivity of the two methods for the detection of infected animals. It was observed that, in agreement with other references the serological method was more sensitive than the LTR-PCR method (the sensitivity was 88% for AGIDT and 79% for LTR-PCR).