Μοριακή ταυτοποίηση νωπής ρίγανης και θυμαριού που διακινούνται στην ελληνική αγορά τροφίμων
Creators: name: Λυκούδη, Ελισάβετ Νικολάου
Publisher: name: Aristotle University of Thessaloniki
Year: 2022
Subjects: Ρίγανη
Θυμάρι
Μοριακή Ταυτοποίηση
Oregano
Thyme
DNA barcoding

description: Η ρίγανη και το θυμάρι θεωρούνται από τα πιο δημοφιλή αρτύματα στη μεσογειακή διατροφή και τα συναντάμε στα γένη Origanum, Satureja, Thymus και Thymbra. Είναι δύο αρωματικά φυτά με παρόμοια οσμή, η οποία οφείλεται κυρίως στα συστατικά καρβακρόλη και θυμόλη, καθώς και σε άλλα συστατικά όπως το α- και β-πινένιο, λιμονένιο, βορνεόλη, κυμένιο κ.ά. Η χρήση τους είναι γνωστή από την αρχαιότητα καθώς εκτός από τη χρήση τους στη μαγειρική, όπου χρησιμοποιούνται ως καρυκεύματα, αφεψήματα ή συντηρητικά τροφίμων, έχουν χρησιμοποιηθεί και για τη θεραπεία αναπνευστικών διαταραχών, δυσπεψίας, επώδυνης έμμηνου ρύσεως, ρευματοειδούς αρθρίτιδας, νεφρικής νόσου και διαταραχών του ουροποιητικού συστήματος, ενώ επίσης εμφανίζουν αντιοξειδωτική και αντισηπτική δράση. Το DNA barcoding, μία μοριακή μέθοδος η οποία χρησιμοποιεί μικρές περιοχές του γονιδιώματος των οργανισμών ως δείκτες, μπορεί να χρησιμοποιηθεί για την ταυτοποίηση των φυτικών οργανισμών. Στην παρούσα διπλωματική εργασία χρησιμοποιήθηκαν νωπά δείγματα ρίγανης και θυμαριού που διακινούνται στην ελληνική αγορά τροφίμων και πραγματοποιήθηκε ένας προσδιορισμός με βάση την ανάλυση του Blast με σκοπό: (α) Να ταυτοποιηθούν τα διαφορετικά είδη που διακινούνται στην ελληνική αγορά τροφίμων και (β) να μελετηθεί η αποτελεσματικότητα της διαγονιδιακής περιοχής trnH-psbA και του γονιδίου matK του χλωροπλαστικού γονιδιώματος ως δείκτες DNA, για την ταυτοποίηση αυτών. Τα αποτελέσματα του προσδιορισμού αυτού, για τα δείγματα νωπής ρίγανης και θυμαριού δείχνουν ότι στην ελληνική αγορά τροφίμων διακινούνται είδη του γένους Thymus και του γένους Origanum. Τα αποτελέσματα του DNA barcoding έδειξαν πως οι δείκτες trnH-psbA, matK και ο συνδυασμός τους μπορούν γενικά να χρησιμοποιηθούν για το διαχωρισμό των ειδών μεταξύ τους, ωστόσο κανένας από τους δύο δείκτες δεν ήταν ικανός να διαχωρίσει τα υποείδη του O.vulgare. Ο trnH-psbA δύναται να διαχωρίσει το Origanum majorana από το Origanum vulgare, όπως και τα διαφορετικά θυμάρια μεταξύ τους, ενώ ο matK αδυνατεί να κάνει αυτό το διαχωρισμό
description: Oregano and thyme are considered to be the most popular flavorings in the Mediterranean diet and are distributed in the genera Origanum, Satureja, Thymus and Thymbra. They are two aromatic plants with a similar smell, which is mainly due to the components carvacrol and thymol, as well as to other components such as a- and b-pinene, limonene, borneol, cumin, etc. They are known since antiquity for their use in cooking, where they are used as spices, decoctions or food preservatives, but they have also been used in medicine to treat respiratory disorders, indigestion, painful menstruation, rheumatoid arthritis, kidney disease and urinary system disorders, while also exhibiting antioxidant and antiseptic activity. DNA barcoding, a molecular method that uses small sequences of organisms’ genome as barcodes, can be used for the identification of plants. In this study, fresh samples of oregano and thyme circulating in the Greek food market were used and classification of these plants was performed based in a Blast analysis in order to (a) Identify the different species that circulate the Greek food market and (b) study the effιciency of the trnH-psbA transgenic region and the matK gene of the chloroplast DNA genome to identify them. The results of the taxonomic identification show that in the Greek food market, the species that are mainly traded belong to the Thymus and Origanum genuses. DNA barcoding results showed that the trnH-psbA, matK markers and their combination could generally be used to separate species from each other; however neither of the two markers was able to distinguish the subspecies of O. vulgare. TrnH-psbA can separate Origanum majorana from Origanum vulgare, as it can distinguish all the different Thymus sp., while matK is unable to do so