cometadata/datacite-rtg-text-other-reclassification-records huggingface dataset:
sj-docx-1-cmc-10.1177_17416590231196125 – Supplemental material for Misogynist incels gone mainstream: A critical review of the current directions in incel-focused research
Creators: name: Czerwinsky, Allysa
Publisher: name: SAGE Journals
Year: 2023
Subjects: subject: Communication and Media Studies not elsewhere classified
subject: Criminology not elsewhere classified
subject: Cultural Studies not elsewhere classified
subject: Sociology
subject: FOS: Sociology

description: Supplemental material, sj-docx-1-cmc-10.1177_17416590231196125 for Misogynist incels gone mainstream: A critical review of the current directions in incel-focused research by Allysa Czerwinsky in Crime, Media, Culture
BOSHLANGʻICH SINF OʻQUVCHILARINING KREATIV FIKRLASHINI RIVOJLANTIRISHDA ZAMONAVIY TEXNOLOGIYALARNING OʻRNI
Creators: name: Ravshanova, Ra'no
Publisher: name: Zenodo
Year: 2025

description:  ushbu maqolada boshlang‘ich sinf o‘quvchilarining kreativ fikrlashini rivojlantirishda zamonaviy texnologiyalarning o‘rni tahlil qilinadi. Maqolada kreativ fikrlash tushunchasi, uning rivojlanish bosqichlari va zamonaviy ta’lim texnologiyalarining ushbu jarayonga ta’siri haqida so‘z yuritiladi. Ta’lim jarayonida interaktiv vositalar, raqamli resurslar, virtual laboratoriyalar, mobil ilovalar va dasturlash asoslarining qo‘llanilishi o‘quvchilarning ijodiy salohiyatini oshirishdagi muhim omil sifatida ko‘rsatib beriladi. Shuningdek, texnologiyalardan foydalanishning afzalliklari va pedagogik jarayondagi imkoniyatlari ilmiy asosda yoritiladi.
title: Προσέγγιση της Εργοθεραπείας σε ενήλικα άτομα με Αμυοτροφική πλευρική σκλήρυνση (ALS)
title: An Approach to Occupational Therapy in adults with Amyotrophic Lateral Sclerosis (ALS)
titleType: AlternativeTitle
Creators: name: Διαμάντη, Αντωνία
Publisher: name: Πανεπιστήμιο Δυτικής Αττικής
Year: 2024
Subjects: Εργοθεραπεία
ALS
Σύμπτωμα
Αξιολόγηση
Παρέμβαση
Αποκατάσταση

description: Η πραγματοποίηση αυτής της εργασίας στηρίχτηκε στην αναζήτηση ερευνών σε δύο βάσεις δεδομένων από όπου συγκεντρώθηκαν συνολικά δεκαέξι. Οι συγκεκριμένες μελέτες παρουσίαζαν παρεμβάσεις με σκοπό τη βελτίωση του βιωτικού επιπέδου των πασχόντων από Αμυοτροφική Πλευρική Σκλήρυνση (ALS). Από αυτές αναφέρονταν τέσσερις στη σημασία διατήρησης ή βελτίωσης της σωματικής κατάστασης, δύο στις μεθόδους αξιολόγησης και περιορισμού του πόνου, μία στη γνωστική έκπτωση, δύο στην αξιοποίηση της υποστηρικτικής τεχνολογίας, δύο στη διαχείριση του άγχους και της κατάθλιψης, μία στην αντιμετώπιση της κόπωσης, μία σε εναλλακτικούς τρόπους επικοινωνίας και τρεις στη δυσφαγία και στη δυσαρθρία. Συνοψίζοντας τα παραπάνω δεδομένα, παρατηρήθηκε σημαντική έλλειψη ερευνητικών δεδομένων όσον αφορά στις παρεμβάσεις που θα μπορούσαν να εφαρμοστούν στους πάσχοντες από ALS από την πλευρά της εργοθεραπείας. Επομένως, κρίνεται επιτακτική η ανάγκη πραγματοποίησης ερευνών σχετικά τόσο με το πεδίο των νευρολογικών παθήσεων όσο και με τις εργοθεραπευτικές παρεμβάσεις που μπορούν να κριθούν κατάλληλες προς όφελος των διαφόρων νευρολογικών ασθενών. Μέσα από αυτή τη διαδικασία θα προσδιοριστούν οι παρεμβάσεις εκείνες της εργοθεραπείας που θα επιφέρουν το βέλτιστο αποτέλεσμα, δηλαδή αν όχι τη βελτίωση, τουλάχιστoν τη διατήρηση ενός καλού βιωτικού επιπέδου για τους πάσχοντες από ALS.
CDRterra Policy Brief "Was heißt eigentlich MRV? CO2-Entnahmen messen, berichten und verifizieren"
Creators: name: Götz, Inga
name: Hagemann, Nikolas
name: Honegger, Matthias
name: Kammann, Claudia
name: Jiménez, Marcos
name: Oschlies, Andreas
name: Schulte, Ingrid
Publisher: name: Zenodo
Year: 2025

description: Kaum ein Begriff wird in der aktuellen wissenschaftlichen und politisch-gesellschaftlichen Debatte um Methoden zur CO2-Entnahme so oft verwendet wie die Abkürzung „MRV”. Sie steht für die englischen Wörter „Measurement/Monitoring, Reporting and Verification". Ins Deutsche übersetzt heißt das so viel wie „Messen/Beobachten, Bericht erstatten, Überprüfen und Bestätigen“. 

Welche Prozesse und Maßnahmen im Themenkomplex CO2-Entnahme allerdings konkret gemessen, beobachtet, dokumentiert, kontrolliert und verifiziert werden sollen, ist nicht genau definiert. Denn der MRV-Begriff wird in unterschiedlichen Kontexten und mit unterschiedlichen Zielen verwendet. Als Folge dessen ist häufig nicht klar, was Wissenschaftler:innen und andere Fachleute meinen, wenn sie robuste Vorgaben, Standards und Technologien für das Messen, die Berichterstattung und die Verifikation von CO2-Entnahmen fordern. In dieser Publikation unternehmen CDRterra-Forschende deshalb einen Klärungsversuch.
Confirmability And Reproducibility Of Scientific Insights And Artefacts: From Coding To Results (A Management Summary)
Creators: name: Aschermann, Malte
name: Kraus, Philipp
Publisher: name: Zenodo
Year: 2017

description: In publications, academic research often only applies confirmability, transparency and reproducibility to (formal) models and analysis.

Typical workflow to answer research questions:

modelling → coding → simulating → analysing → more coding . . .

A correct model does not imply a correct, i.e. error-free implementation⇒ correctness of simulation results? ⇒ correctness of model?

Often no implementation referenced in paper (→transparency)⇒ how to assess correctness and ensure reproducibility without?
CDRterra Policy Brief "Was heißt eigentlich MRV? CO2-Entnahmen messen, berichten und verifizieren"
Creators: name: Götz, Inga
name: Hagemann, Nikolas
name: Honegger, Matthias
name: Kammann, Claudia
name: Jiménez, Marcos
name: Oschlies, Andreas
name: Schulte, Ingrid
Publisher: name: Zenodo
Year: 2024

description: Kaum ein Begriff wird in der aktuellen wissenschaftlichen und politisch-gesellschaftlichen Debatte um Methoden zur CO2-Entnahme so oft verwendet wie die Abkürzung „MRV”. Sie steht für die englischen Wörter „Measurement/Monitoring, Reporting and Verification". Ins Deutsche übersetzt heißt das so viel wie „Messen/Beobachten, Bericht erstatten, Überprüfen und Bestätigen“. 

Welche Prozesse und Maßnahmen im Themenkomplex CO2-Entnahme allerdings konkret gemessen, beobachtet, dokumentiert, kontrolliert und verifiziert werden sollen, ist nicht genau definiert. Denn der MRV-Begriff wird in unterschiedlichen Kontexten und mit unterschiedlichen Zielen verwendet. Als Folge dessen ist häufig nicht klar, was Wissenschaftler:innen und andere Fachleute meinen, wenn sie robuste Vorgaben, Standards und Technologien für das Messen, die Berichterstattung und die Verifikation von CO2-Entnahmen fordern. In dieser Publikation unternehmen CDRterra-Forschende deshalb einen Klärungsversuch.
Additional file 1 of A novel strategy for l-arginine production in engineered Escherichia coli
Creators: name: Nie, Mengzhen
name: Wang, Jingyu
name: Zhang, Kechun
Publisher: name: figshare
Year: 2023
Subjects: subject: Microbiology
subject: FOS: Biological sciences

description: Additional file 1: Table S1. Comparison of l-arginine production in strains N8, N9 and N11. Figure S1. n-acetylglutamate was synthesized by chemical acetylation of l-glutamate with acetic anhydride. Figure S2. HPLC signal shows n-acetylglutamate accumulation.
SupplementaryFile2_rev.tree
Creators: name: Gontijo, Marco
Publisher: name: figshare
Year: 2024
Subjects: classificationCode: 310701
subject: Bacteriology
classificationCode: 310706
subject: Virology

description: Supplementary File 2. Phylogenetic tree of SAR-lysozymes described in the literature for "Combined effect of SAR-endolysin LysKpV475 with polymyxin B and Salmonella bacteriophage phSE-5"
A research programme for queer studies
Creators: name: Dell'Aversano, Carmen
Publisher: name: Whatever. A Transdisciplinary Journal of Queer Theories and Studies
Year: 2018

description: Starting from a definition of queer as the deontologization of categories and the denaturalization of performances, this paper aims to delineate a research programme for queer studies based on American sociologist’s Harvey Sacks’s work on social categories. This would make it possible both to generalize the application of queer theory to the analysis of the repressive consequences of all forms of categorization, and to elucidate these repressive effects in a huge variety of social contexts and situation, thus considerably broadening the range of convenience of queer theory.
description: Whatever. A Transdisciplinary Journal of Queer Theories and Studies, Vol 1 No 1 (2018): Whatever. A transdisciplinary journal of queer theories and studies
Additional file 1 of A longitudinal evaluation of oxidative stress - mitochondrial dysfunction - ferroptosis genes in anthracycline-induced cardiotoxicity
Creators: name: Qianqian, Ren
name: Peng, Zhu
name: Licai, Zhang
name: Ruizhi, Zhang
name: Tianhe, Ye
name: xiangwen, Xia
name: Chuansheng, Zheng
name: Fan, Yang
Publisher: name: figshare
Year: 2024
Subjects: subject: Biochemistry
subject: Medicine
subject: Microbiology
subject: FOS: Biological sciences
subject: Cell Biology
subject: Genetics
subject: Molecular Biology
subject: Pharmacology
subject: Immunology
subject: FOS: Clinical medicine
subject: Biological Sciences not elsewhere classified
subject: Developmental Biology
subject: Cancer
subject: Infectious Diseases
subject: FOS: Health sciences

description: Supplementary Material 1
Climate Coffee presentation on Cooler Arctic surface temperatures simulated by climate models are closer to satellite-based data than the ERA5 reanalysis
Creators: name: Tian, Tian
Publisher: name: Zenodo
Year: 2024

description: This talk is to disseminate our recent studies: on the comparison of Arctic surface temperatures simulated by climate models with the ERA5 reanalysis and satellite-based datasets, addressing the cold bias in climate models noted in the IPCC Sixth Assessment Report.

Tian, T., Yang, S., Høyer, J.L. et al. Cooler Arctic surface temperatures simulated by climate models are closer to satellite-based data than the ERA5 reanalysis. Commun Earth Environ 5, 111 (2024). https://rdcu.be/dEkd4

What is a Climate Coffee? #climatecoffees are short (circa 40 min: 20 min talk + 20 min Q&A), relaxed meetings for scientists to share ideas, discuss methods and communicate new results. They are open to speakers of all levels of seniority, we especially encourage early-career scientists to become a speaker. The Coffees are an exciting opportunity for scientists to build a network and disseminate recent results, peer-to-peer. We invite researchers from across the climate science community to join us for this series of regular online knowledge exchange events.

Catch my talk on YouTube https://www.youtube.com/watch?v=sHUe0l0V32E
title: Αναζήτηση νέων ενώσεων ενεργοποιητών της umami γεύσης με χρήση υπολογιστικών τεχνικών
title: Discovery of novel umami taste activators using computational techniques
titleType: AlternativeTitle
Creators: name: Kούνουπα, Αγγελική
Publisher: name: Πανεπιστήμιο Δυτικής Αττικής
Year: 2024
Subjects: Umami γεύση
T1R1/T1R3 υποδοχείς
Zυμώμενα τρόφιμα
Yπολογιστικές τεχνικές
Μοριακή πρόσδεση
Mοριακή δυναμική

description: Η ανθρώπινη γεύση μπορεί να αναλυθεί στις 5 βασικές γευστικές ιδιότητες: γλυκιά (sweet), όξινη (sour), πικρή (bitter), αλμυρή (salty) και umami. Η umami γεύση έλαβε ευρεία αποδοχή ως βασική γεύση έπειτα από την ανακάλυψη ότι ετεροδιμερείς υποδοχείς συζευγμένοι με πρωτεΐνες G, T1R1/T1R3 μεσολαβούν στην ανίχνευσή της. Ο ετεροδιμερής υποδοχέας T1R1/T1R3 είναι εξειδικευμένος στην ανίχνευση ερεθισμάτων με γεύση umami (L-αμινοξέα), καθώς in vitro δεν ανταποκρίνεται σε γλυκά ερεθίσματα αλλά ανταποκρίνεται αποκλειστικά σε ερεθίσματα umami (MSG και L-γλουταμινικό). Την τελευταία πενταετία, πολυάριθμες έρευνες έχουν στραφεί στην ανακάλυψη ενώσεων, και ιδιαίτερα πεπτιδίων που προκαλούν την umami γεύση και προέρχονται από τα τρόφιμα. Στην παρούσα εργασία μελετήθηκε η πιθανότητα πεπτιδίων, τα οποία περιέχονται στο γιαούρτι, να ενεργοποιούν την umami γεύση μέσω εφαρμογής υπολογιστικών τεχνικών. Αρχικά, τα πεπτίδια που περιέχονται στο γιαούρτι χρησιμοποιήθηκαν ως ο εξεταζόμενος δειγματοχώρος και η αμινοξική τους αλληλουχία καταγράφηκε με χρήση της διαδικτυακής βάσης δεδομένων ελεύθερης πρόσβασης Fermented Food Database (FermFOODb). Δεδομένης της απουσίας κρυσταλλικής δομής του ανθρώπινου ετεροδιμερούς T1R1/T1R3 δημιουργήθηκε ομόλογο μοντέλο του υποδοχέα χρησιμοποιώντας τη βάση πρωτεϊνικών δομών AlphaFold καθώς και τον επίσης ελεύθερης πρόσβασης διακομιστή ομόλογης μοντελοποίησης SWISS-MODEL. Στη συνέχεια, τα πεπτίδια υποβλήθηκαν σε πειράματα μοριακής πρόσδεσης (Molecular Docking), στοχεύοντας στην εύρεση των πεπτιδίων με εν δυνάμει ικανότητα ενεργοποίησης της umami γεύσης. Για τον σκοπό αυτό πραγματοποιήθηκε "Τυφλή μοριακή πρόσδεση – Blind Docking" και στη συνέχεια "Στοχεμεύνη" μοριακή πρόσδεση, μέσω εφαρμογής των διαδικτυακών εργαλείων DockThor και Webina. Η αξιολόγηση των αποτελεσμάτων βασίστηκε στην ενέργεια πρόσδεσης (docking score) των εξεταζόμενων πεπτιδίων στον T1R1/T1R3 υποδοχέα και στη σύγκριση των αλληλεπιδράσεων των εξεταζόμενων πεπτιδίων με τις αλληλεπιδράσεις πεπτιδίων γνωστών από τη βιβλιογραφία με umami γεύση. Από την αξιολόγηση των αποτελεσμάτων επιλέχθηκαν δέκα πεπτίδια (FLL,YP,QQQTED,TVQVT, YAKPA, FAQ, YQEPVL,YQQPVL,IPIQY,KFQSEE), στα οποία εφαρμόστηκαν προσομοιώσεις μοριακής δυναμικής (Molecular Dynamics). Από τα αποτελέσματα προέκυψε ότι τα πεπτίδια QQQTED και YQQPVL παρουσίασαν σταθερότητα εντός του υποδοχέα γεγονός που καταδεικνύει την εν δυνάμει ενεργοποίηση της umami γεύσης.
title: Κοινωνικά δίκτυα και Influencers: Ο ρόλος τους στις πωλήσεις στην ελληνική βιομηχανία οίνου
title: Social networks and Influencers: Their role in sales in Greek wine industry
titleType: AlternativeTitle
Creators: name: Κονόμι, Φελίσια
Publisher: name: Πανεπιστήμιο Δυτικής Αττικής
Year: 2024
Subjects: Μέσα κοινωνικής δικτύωσης
Influencers
Ερωτηματολόγιο
Έρευνα
Social media
Μάρκετινγκ οίνου

description: Τα μέσα κοινωνικής δικτύωσης (Social Media) έχουν αναδειχθεί ως ένα ισχυρό εργαλείο επικοινωνίας και μάρκετινγκ σε διάφορους τομείς της βιομηχανίας, και η βιομηχανία του οίνου δεν αποτελεί εξαίρεση. Με την ευρεία διάδοση πλατφορμών όπως το Facebook, το Instagram και το Twitter, οι οινοπαραγωγοί και οι διανομείς έχουν βρει νέους τρόπους να συνδεθούν με το κοινό τους, να προωθήσουν τα προϊόντα τους και να δημιουργήσουν πιστούς πελάτες. Ιδιαίτερα σημαντικός είναι ο ρόλος των επηρεαστών γνώμης (Ιnfluencers), των ατόμων δηλαδή που διαθέτουν σημαντική επιρροή στο κοινό μέσω των λογαριασμών τους στα social media. Οι influencers στο χώρο του οίνου, είτε είναι εξειδικευμένοι γευσιγνώστες είτε lifestyle bloggers, έχουν τη δυνατότητα να επηρεάζουν την αντίληψη των καταναλωτών για συγκεκριμένες ετικέτες και να καθοδηγούν τις αγοραστικές τους επιλογές. Μέσω συνεργασιών με οινοποιεία και προωθητικών καμπανιών, οι influencers συμβάλλουν στην αύξηση της αναγνωρισιμότητας και της ζήτησης για συγκεκριμένα προϊόντα. Η επίδρασή τους μπορεί να είναι καθοριστική, ιδίως όταν πρόκειται για την προβολή νέων ή λιγότερο γνωστών οινοπαραγωγών στην αγορά. Η ανάλυση του ρόλου των influencers αποτελεί κεντρικό στοιχείο για την κατανόηση του σύγχρονου τοπίου της οινοβιομηχανίας στα social media. Η παρούσα εργασία εξετάζει τον αντίκτυπο που έχουν τα social media στη βιομηχανία του οίνου, αναλύοντας πώς οι ψηφιακές πλατφόρμες αλλάζουν τον τρόπο με τον οποίο οινοπαραγωγοί επικοινωνούν με τους καταναλωτές, προβάλλουν τα προϊόντα τους και προσεγγίζουν νέες αγορές. Επιπλέον, διερευνά τους τρόπους με τους οποίους οι καταναλωτές χρησιμοποιούν τα social media για να ενημερωθούν, να μοιραστούν εμπειρίες και να επηρεάσουν τις αγοραστικές αποφάσεις τους. Η έρευνα διεξήχθη τον Φεβρουάριο και Μάρτιο του 2024 σε δείγμα 209 Ελλήνων καταναλωτών μέσω του διαδικτύου και με τα αποτελέσματα έγινε ανάλυση συσχετίσεων μεταβλητών και εξέταση των μέσων τιμών. Επομένως, τα ευρήματα της παρούσας εργασίας, κατά κύριο λόγο, επιβεβαιώνουν προηγούμενες έρευνες και οδηγούν στο συμπέρασμα ότι τα μέσα κοινωνικής δικτύωσης επηρεάζουν την καταναλωτική συμπεριφορά των φίλων του κρασιού. Οι καταναλωτές φαίνεται να επηρεάζονται τόσο από το πόσο συχνά χρησιμοποιούν τα social media όσο και από τις διαφημίσεις, ενώ οι influencers δεν φαίνεται να έχουν ιδιαίτερη επιρροή. Παρά την επίδραση των social media, οι προσωπικές προτιμήσεις και οι κριτικές των πελατών παραμένουν σημαντικοί παράγοντες στις αγοραστικές αποφάσεις.
Additional file 1 of Influence of virtual reality and task complexity on digital health metrics assessing upper limb function
Creators: name: Kanzler, Christoph M.
name: Armand, Tom
name: Simovic, Leonardo
name: Sylvester, Ramona
name: Domnik, Nadine
name: Eilfort, Antonia M.
name: Rohner, Carola
name: Gassert, Roger
name: Gonzenbach, Roman
name: Lambercy, Olivier
Publisher: name: figshare
Year: 2024
Subjects: subject: Space Science
subject: Medicine
subject: Sociology
subject: FOS: Sociology
subject: Biological Sciences not elsewhere classified
subject: Mental Health

description: Supplementary Material 1.
title: Η επίδραση της κλιματικής αλλαγής στην φυσιολογία και σε κύρια παθογόνα της αμπέλου
title: The effect of climate change on physiology and main pathogens of Vitis vinifera L
titleType: AlternativeTitle
Creators: name: Πουσαίου, Βασιλική
Publisher: name: Πανεπιστήμιο Δυτικής Αττικής
Year: 2024
Subjects: Κλιματική αλλαγή
Φυσιολογία αμπέλου
Εχθροί και ασθένειες αμπέλου
Παθογόνοι μικροοργανισμοί
Ελληνικός αμπελώνας
Βιώσιμη αμπελουργία

description: Στην παρούσα πτυχιακή εργασία εξετάζονται οι επιπτώσεις της κλιματικής αλλαγής στην άμπελο και στους οργανισμούς που διαβιούν στο ευρύτερο περιβάλλον ενός αμπελώνα. Η κλιματική αλλαγή επιφέρει - μεταξύ άλλων - σημαντική αύξηση των μέσων τιμών θερμοκρασίας και διοξειδίου του Άνθρακα (CO2). Είναι δεδομένο ότι η οινοφόρος άμπελος (Vitis vinifera L.) είναι ένα ιδιαιτέρως ευπροσάρμοστο φυτό και ότι η ανάπτυξή του, καθώς και η παραγωγή του οίνου, επηρεάζονται άμεσα και σημαντικά από τις εδαφοκλιματικές συνθήκες που επικρατούν στην εκάστοτε περιοχή. Μέσα από τη βιβλιογραφική επισκόπηση, παρέχεται μια θεμελιώδης κατανόηση των κυριότερων ασθενειών και εχθρών της αμπέλου στη λεκάνη της Μεσογείου. Εξετάζονται επίσης οι μηχανισμοί άμυνας του φυτού και οι τρόποι με τους οποίους η κλιματική αλλαγή επηρεάζει τη φυσιολογία της αμπέλου, την παραγωγή οίνου και την γεωγραφική κατανομή της καλλιέργειας. Η κλιματική αλλαγή μπορεί να επηρεάσει τα πρότυπα των ασθενειών των φυτών και την ανάπτυξη των αρθροπόδων με πιο σύνθετους τρόπους από ό,τι αναμενόταν. Στην πραγματικότητα, ενώ τόσο οι καλλιέργειες όσο και τα παθογόνα τους επηρεάζονται από τις κλιματικές μεταβλητές, ενδέχεται να επηρεάζονται από διαφορετικούς συνδυασμούς παραγόντων και να ανταποκρίνονται στην αλλαγή αυτών με διαφορετικούς ρυθμούς. Προκειμένου να διαχωριστούν αυτές οι επιδράσεις, θα πρέπει να αναβαθμιστεί η κατανόηση του συστήματος Περιβάλλον - ξενιστής - εχθρός/παθογόνο και να ληφθεί υπόψη η αλληλεπίδρασή τους. Μακροπρόθεσμος στόχος είναι να βελτιωθούν οι τρέχουσες εκτιμήσεις των επιπτώσεων της κλιματικής αλλαγής στην πίεση των παρασίτων της αμπέλου. Εκτός από τις αλλαγές στους παθογόνους μικροοργανισμούς και τους εχθρούς της αμπέλου που προκαλούνται από την κλιματική αλλαγή, έχει ιδιαίτερη σημασία η κατανόηση των ευρύτερων επιπτώσεων της κλιματικής αλλαγής για την αμπελοκαλλιέργεια, με στόχο την ενίσχυση της βιωσιμότητας του Μεσογειακού αμπελώνα.
INNOVACIÓN EN EL CUIDADO DEL RECIEN NACIDO PREMATURO
Creators: name: Díaz Torres, Mónica
Publisher: name: Zenodo-HGOIA
Year: 2024
Subjects: subject: Neonatology
subject: Neonatology/trends
subject: Neonatology/methods

description:  

La neonatología ha evolucionado significativamente en las últimas décadas, enfrentando desafíos asociados a la prematuridad, la principal causa de morbimortalidad neonatal. En el Hospital Gineco-Obstétrico Pediátrico de Nueva Aurora, el cuidado del recién nacido prematuro ha incorporado avances en tecnología, atención integral y participación familiar. Factores como la desigualdad en el acceso, recursos limitados y necesidades formativas persisten como obstáculos en la región. Este enfoque busca optimizar las tasas de supervivencia y reducir complicaciones, priorizando la innovación en equipos médicos, prácticas humanizadas y protocolos basados en evidencia para brindar un cuidado neonatal de calidad y equitativo.
CDRterra Policy Brief "Empfehlungen für eine deutsche Langfriststrategie zur Kohlendioxidentnahme im großen Maßstab"
Creators: name: Schenuit, Felix
name: Minx, Jan Christoph
name: Pongratz, Julia
name: Geden, Oliver
name: Fuss, Sabine
Publisher: name: Zenodo
Year: 2025

description: Um die globale Erwärmung bis 2100 auf 1,5 Grad zu begrenzen, muss die Menschheit bis zur Mitte des Jahrhunderts Kohlendioxidneutralität erreichen und danach netto negative Emissionen anstreben. Die Reduktion von Emissionen hat dabei oberste Priorität und muss mit Abstand den größten Beitrag leisten. Es wird jedoch Restemissionen geben. Diese müssen wir mit der Entnahme einer gleichwertigen Menge an CO2 aus der Atmosphäre (englisch: Carbon Dioxide Removal, CDR) ausgleichen. Welche Entnahmekapazitäten wir in Deutschland mittel- und langfristig benötigen und wie wir diese aufbauen können, muss jetzt im Rahmen der Langfriststrategie Negativemissionen diskutiert werden. Wissenschaftlerinnen und Wissenschaftler im vom Bundesministerium für Bildung und Forschung geförderten Forschungsprogramm CDRterra zur landbasierten CO2-Entnahme haben Empfehlungen für die Ausgestaltung dieser Strategie entwickelt und in einem Policybrief zusammengefasst.
Monitoring the ocean, a regional perspective from Catalonia
Creators: name: Isern-Fontanet, Jordi
Publisher: name: Zenodo
Year: 2024

description: As part of the 2024 UN Ocean Decade Conference, TipESM co-organised the Satellite Event, Monitoring the Ocean, in Barcelona on April 8th, 2024. The event consisted of a panel discussion and exhibition event. As part of the panel discussion, we had 6 experts providing overviews on ocean monitoring from Earth Observations to in situ observations, to supercomputers and modelling. Jordi Isern Fontanet (ICM-CSIC, ICATMAR) presented on Monitoring the ocean, a regional perspective from Catalonia.
CDRterra Policy Brief "Empfehlungen für eine deutsche Langfriststrategie zur Kohlendioxidentnahme im großen Maßstab"
Creators: name: Schenuit, Felix
name: Minx, Jan Christoph
name: Pongratz, Julia
name: Geden, Oliver
name: Fuss, Sabine
Publisher: name: Zenodo
Year: 2024

description: Um die globale Erwärmung bis 2100 auf 1,5 Grad zu begrenzen, muss die Menschheit bis zur Mitte des Jahrhunderts Kohlendioxidneutralität erreichen und danach netto negative Emissionen anstreben. Die Reduktion von Emissionen hat dabei oberste Priorität und muss mit Abstand den größten Beitrag leisten. Es wird jedoch Restemissionen geben. Diese müssen wir mit der Entnahme einer gleichwertigen Menge an CO2 aus der Atmosphäre (englisch: Carbon Dioxide Removal, CDR) ausgleichen. Welche Entnahmekapazitäten wir in Deutschland mittel- und langfristig benötigen und wie wir diese aufbauen können, muss jetzt im Rahmen der Langfriststrategie Negativemissionen diskutiert werden. Wissenschaftlerinnen und Wissenschaftler im vom Bundesministerium für Bildung und Forschung geförderten Forschungsprogramm CDRterra zur landbasierten CO2-Entnahme haben Empfehlungen für die Ausgestaltung dieser Strategie entwickelt und in einem Policybrief zusammengefasst.
Masters_Thesis_Saakshi_DikshitMS.pdf
Creators: name: Dikshit, Saakshi
Publisher: name: Purdue University Graduate School
Year: 2024
Subjects: classificationCode: 510804
subject: Quantum optics and quantum optomechanics
classificationCode: 510805
subject: Quantum technologies

description: This work is the first report of optically addressable spin qubits in a semi-1D material, Boron Nitride Nanotubes (BNNTs). We perform the characterization of these spin defects and utilize their properties to do omnidirectional magnetic field sensing. We transfer these BNNTs with spin defects onto an AFM cantilever and perform scanning probe magnetometry of a 2D Nickel pattern on a gold waveguide.
sj-pdf-1-eqs-10.1177_87552930221094344 – Supplemental material for Identification of optimal ground-motion intensity measures for assessing liquefaction triggering and lateral displacement of liquefiable sloping grounds
Creators: name: Wu, Qiang
name: Li, Dian-Qing
name: Du, Wenqi
Publisher: name: SAGE Journals
Year: 2022
Subjects: Engineering not elsewhere classified

description: Supplemental material, sj-pdf-1-eqs-10.1177_87552930221094344 for Identification of optimal ground-motion intensity measures for assessing liquefaction triggering and lateral displacement of liquefiable sloping grounds by Qiang Wu, Dian-Qing Li and Wenqi Du in Earthquake Spectra
NEMIS VA O'ZBEK TILLARIDAGI HARBIY TEXNIKAGA OID TERMINLARDA ZID MA'NOLILIK
Creators: name: Kazakova, Laylo
Publisher: name: Zenodo
Year: 2024

description: Ushbu maqolada harbiy texnikaga oid terminlar tizimida antonym hodisasining voqe’lanishi xususida fikr yuritilib, zid ma’nolilik nemis va o’zbek tillaridagi misollar orqali yoritib beriladi.
The Chinese encyclopedia and the living dead
Creators: name: Petricola, Mattia
Publisher: name: Whatever. A Transdisciplinary Journal of Queer Theories and Studies
Year: 2018

description: This article presents a case study in queer hermeneutics dealing with the construction of a corpus in a comparative study. More specifically, I propose to queer the category ‘living dead’ by restructuring its internal taxonomy. This will be achieved through the intersection of two approaches to categorization, both developed in the field of cognitive sciences as elaborations of Wittgenstein’s notion of ‘family resemblance’: Eleanor Rosch’s prototype theory and George Lakoff’s discussion of classification strategies in the Dyirbal language. I will then analyse the epistemological implications that derive from restructuring the taxonomy of the living dead in the light of the notion of ‘nonce taxonomy’, described by Eve Sedgwick in Epistemology of the Closet. My aim will be to show, firstly, that Rosch and Lakoff could provide nonce taxonomy with the theoretical support it needs; and secondly, how the field of comparative literature could be queered through the systematic use of prototype-based and nonce-taxonomic categorization.
description: Whatever. A Transdisciplinary Journal of Queer Theories and Studies, Vol 1 No 1 (2018): Whatever. A transdisciplinary journal of queer theories and studies
Erat vir unus (1 Sam 1,1) in der Auslegung der Väter
Creators: name: Kasper, Clemens M.
Publisher: name: Theologie und Philosophie
Year: 1970

description: Theologie und Philosophie, Bd. 63 Nr. 2 (1988): Theologie und Philosophie, Band 63, Heft 2
Seasonal patterns and phytoplankton blooms influence sediment FA composition in a large reservoir
Creators: name: Pickett, Patrick
Publisher: name: Deakin University
Year: 2025
Subjects: classificationCode: 37
subject: Earth sciences
classificationCode: 41
subject: Environmental sciences

description: This study investigated the spatial and temporal dynamics of sediment fatty acid composition in the backwater areas of two tributaries of the Three Gorges Reservoir, examining its relationships with both phytoplankton communities and water quality. Sediment FA composition was used as an indicator of microbial community structure and organic matter sources, while stable isotope analysis was used to determined whether sediment carbon was primarily autochthonous or allochthonous.

Sampling was conducted at six sites in 2021—three in the Pengxi River and three in the Modao River, including locations with a history of phytoplankton blooms. Samples collected included sediment fatty acid composition, stable isotopes, pelagic phytoplankton communities, and water quality variables. Sampling took place during winter (March), spring (May), and summer (September) to capture seasonal and operational variations in the Three Gorges Reservoir, with additional daily sampling during the bloom period to assess fine-scale variability. In addition, daily sediment stable isotope samples were collected during spring 2022.
sj-docx-1-mso-10.1177_20552173221115023 - Supplemental material for Immune cell subset profiling in multiple sclerosis after fingolimod initiation and continued treatment: The FLUENT study
Creators: name: Mao-Draayer, Yang
name: Cohen, Jeffrey A
name: Bar-Or, Amit
name: Han, May H
name: Singer, Barry
name: Williams, Ian M
name: Meng, Xiangyi
name: Elam, Chelsea
name: Weiss, Jamie L
name: Cox, Gina Mavrikis
name: Ziehn, Marina
name: Cree, Bruce AC
Publisher: name: SAGE Journals
Year: 2022
Subjects: subject: 110904 Neurology and Neuromuscular Diseases
subject: FOS: Clinical medicine
subject: Neuroscience

description: Supplemental material, sj-docx-1-mso-10.1177_20552173221115023 for Immune cell subset profiling in multiple sclerosis after fingolimod initiation and continued treatment: The FLUENT study by Yang Mao-Draayer, Jeffrey A Cohen, Amit Bar-Or, May H Han, Barry Singer, Ian M Williams, Xiangyi Meng, Chelsea Elam, Jamie L Weiss, Gina Mavrikis Cox, Marina Ziehn, Bruce AC Cree and in Multiple Sclerosis Journal – Experimental, Translational and Clinical
Additional file 1 of Diagnosis of pediatric central nervous system tumors using methylation profiling of cfDNA from cerebrospinal fluid
Creators: name: Cornelli, Lotte
name: Van Paemel, Ruben
name: Ferro dos Santos, Maísa R.
name: Roelandt, Sofie
name: Willems, Leen
name: Vandersteene, Jelle
name: Baert, Edward
name: Mus, Liselot M.
name: Van Roy, Nadine
name: De Wilde, Bram
name: De Preter, Katleen
Publisher: name: figshare
Year: 2024
Subjects: subject: Cell Biology
subject: Genetics
subject: FOS: Biological sciences
subject: Neuroscience
subject: Biotechnology
subject: Biological Sciences not elsewhere classified
subject: Cancer

description: Additional file 1.
Additional file 3 of Diagnosis of pediatric central nervous system tumors using methylation profiling of cfDNA from cerebrospinal fluid
Creators: name: Cornelli, Lotte
name: Van Paemel, Ruben
name: Ferro dos Santos, Maísa R.
name: Roelandt, Sofie
name: Willems, Leen
name: Vandersteene, Jelle
name: Baert, Edward
name: Mus, Liselot M.
name: Van Roy, Nadine
name: De Wilde, Bram
name: De Preter, Katleen
Publisher: name: figshare
Year: 2024
Subjects: subject: Cell Biology
subject: Genetics
subject: FOS: Biological sciences
subject: Neuroscience
subject: Biotechnology
subject: Biological Sciences not elsewhere classified
subject: Cancer

description: Additional file 3.
sj-pdf-1-pus-10.1177_09636625221111900 – Supplemental material for Imagined futures for livestock gene editing: Public engagement in the Netherlands
Creators: name: Middelveld, Senna
name: Macnaghten, Phil
name: Meijboom, Franck
Publisher: name: SAGE Journals
Year: 2022
Subjects: subject: 200199 Communication and Media Studies not elsewhere classified
subject: FOS: Media and communications
subject: Science Policy

description: Supplemental material, sj-pdf-1-pus-10.1177_09636625221111900 for Imagined futures for livestock gene editing: Public engagement in the Netherlands by Senna Middelveld, Phil Macnaghten and Franck Meijboom in Public Understanding of Science
Reheis, Fritz, Konkurrenz und Gleichgewicht als Fundament von Gesellschaft
Creators: name: Nell-Breuning, Oswald Von
Publisher: name: Theologie und Philosophie
Year: 1970

description: Theologie und Philosophie, Bd. 63 Nr. 1 (1988): Theologie und Philosophie, Band 63, Heft 1
sj-docx-1-nvs-10.1177_08997640221113801 – Supplemental material for What Matters for Charitable Donations Under Authoritarianism? An Examination of Organizational Legitimacy and Political Connections
Creators: name: Wang, Qun
Publisher: name: SAGE Journals
Year: 2022
Subjects: Organisation and Management Theory
Public Administration

description: Supplemental material, sj-docx-1-nvs-10.1177_08997640221113801 for What Matters for Charitable Donations Under Authoritarianism? An Examination of Organizational Legitimacy and Political Connections by Qun Wang in Nonprofit and Voluntary Sector Quarterly
Additional file 7 of PCSK9 inhibitors and osteoporosis: mendelian randomization and meta-analysis
Creators: name: Chen, Ding-Qiang
name: Xu, Wen-Bin
name: Xiao, Ke-Yi
name: Que, Zhi-Qiang
name: Feng, Jin-Yi
name: Sun, Nai-Kun
name: Cai, Di-Xin
name: Rui, Gang
Publisher: name: figshare
Year: 2024
Subjects: Cell Biology
Molecular Biology
Pharmacology
Biological Sciences not elsewhere classified
Marine Biology

description: Supplementary Material 7
A positive quasilocal mass for causal variational principles
Creators: name: Finster, Felix
name: Kamran, Niky
Publisher: name: Universität Regensburg
Year: 2025
Subjects: subject: 510 Mathematik
subject: 49S05 · 49Q20 · 58C35 · 28A33

description: A new inequality for a nonlinear surface layer integral is proved for minimizers of causal variational principles. This inequality is applied to obtain a new proof of the positive mass theorem with volume constraint. Next, a positive mass theorem without volume constraint is stated and proved by introducing and using the concept of asymptotic alignment. Moreover, a positive quasilocal mass and a synthetic definition of scalar curvature are introduced in the setting of causal variational principles. Our notions and results are illustrated by the explicit examples of causal fermion systems constructed in ultrastatic spacetimes and the Schwarzschild spacetime. In these examples, the correspondence to the ADM mass and similarities to the Brown–York mass are worked out.
Dilcher, Gerhard/Diestelkamp, Bernhard, Recht, Gericht, Genossenschaft, Policey
Creators: name: Nell-Breuning, Oswald Von
Publisher: name: Theologie und Philosophie
Year: 1970

description: Theologie und Philosophie, Bd. 63 Nr. 1 (1988): Theologie und Philosophie, Band 63, Heft 1
sj-docx-1-jtt-10.1177_1357633X221078490 - Supplemental material for Effectiveness of eHealth mindfulness-based interventions on cancer-related symptoms among cancer patients and survivors: A systematic review and meta-analysis
Creators: name: Fung, Jonathan Ying Ting
name: Lim, Helen
name: Vongsirimas, Nopporn
name: Klainin-Yobas, Piyanee
Publisher: name: SAGE Journals
Year: 2022
Subjects: subject: 111708 Health and Community Services
subject: FOS: Health sciences
subject: 111799 Public Health and Health Services not elsewhere classified

description: Supplemental material, sj-docx-1-jtt-10.1177_1357633X221078490 for Effectiveness of eHealth mindfulness-based interventions on cancer-related symptoms among cancer patients and survivors: A systematic review and meta-analysis by Jonathan Ying Ting Fung, Helen Lim, Nopporn Vongsirimas, and Piyanee Klainin-Yobas in Journal of Telemedicine and Telecare
Additional file 1 of AFITbin: a metagenomic contig binning method using aggregate l-mer frequency based on initial and terminal nucleotides
Creators: name: Darabi, Amin
name: Sobhani, Sayeh
name: Aghdam, Rosa
name: Eslahchi, Changiz
Publisher: name: figshare
Year: 2024
Subjects: subject: Microbiology
subject: FOS: Biological sciences

description: Supplementary Material 1
sj-docx-1-jom-10.1177_01492063221115061 - Supplemental material for Crossing the Streams of Plural Governance Research: Simultaneously Considering Franchising, Dual Distribution, and Concurrent Sourcing
Creators: name: Sørensen, Sarah B.
name: Hoetker, Glenn
name: Leiblein, Michael J.
name: Mellewigt, Thomas
Publisher: name: SAGE Journals
Year: 2022
Subjects: subject: 150310 Organisation and Management Theory
subject: FOS: Economics and business

description: Supplemental material, sj-docx-1-jom-10.1177_01492063221115061 for Crossing the Streams of Plural Governance Research: Simultaneously Considering Franchising, Dual Distribution, and Concurrent Sourcing by Sarah B. Sørensen, Glenn Hoetker, Michael J. Leiblein, and Thomas Mellewigt in Journal of Management
sj-docx-1-asm-10.1177_10731911221109448 – Supplemental material for Examining the Psychometric Properties of the Expanded Levenson Self-Report Psychopathy Scale in Community and University Samples
Creators: name: Lagera, Lourdes M.
name: Sellbom, Martin
Publisher: name: SAGE Journals
Year: 2022
Subjects: subject: 160807 Sociological Methodology and Research Methods
subject: FOS: Sociology
subject: 170199 Psychology not elsewhere classified
subject: FOS: Psychology

description: Supplemental material, sj-docx-1-asm-10.1177_10731911221109448 for Examining the Psychometric Properties of the Expanded Levenson Self-Report Psychopathy Scale in Community and University Samples by Lourdes M. Lagera and Martin Sellbom in Assessment
Cellular Responses to Complex Strain Fields Studied in Microfluidic Devices
Creators: name: Chagnon-Lessard, Sophie
Publisher: name: Université d'Ottawa / University of Ottawa
Year: 2018
Subjects: mechanobiology
cyclic stretching
microfluidic device
mechanoresponse
nonuniform strain field
oncogenic transformed cells
microfabrication
strain gradient

description: Cells in living organisms are constantly experiencing a variety of mechanical cues. From the stiffness of the extra cellular matrix to its topography, not to mention the presence of shear stress and tension, the physical characteristics of the microenvironment shape the cells’ fate. A rapidly growing body of work shows that cellular responses to these stimuli constitute regulatory mechanisms in many fundamental biological functions. Substrate strains were previously shown to be sensed by cells and activate diverse biochemical signaling pathways, leading to major remodeling and reorganization of cellular structures. The majority of studies had focused on the stretching avoidance response in near-uniform strain fields. Prior to this work, the cellular responses to complex planar strain fields were largely unknown. In this thesis, we uncover various aspects of strain sensing and response by first developing a tailored lab-on-a-chip platform that mimics the non-uniformity and complexity of physiological strains. These microfluidic cell stretchers allow independent biaxial control, generate cyclic stretching profiles with biologically relevant strain and strain gradient amplitudes, and enable high resolution imaging of on-chip cell cultures. Using these microdevices, we reveal that strain gradients are potent mechanical cues by uncovering the phenomenon of cell gradient avoidance. This work establishes that the cellular mechanosensing machinery can sense and localize changes in strain amplitude, which orchestrate a coordinated cellular response. Subsequently, we investigate the effect of multiple changes in stretching directions to further explore mechanosensing subtleties. The evolution of the cellular response shed light on the interplay of the strain avoidance and the newly demonstrated strain gradient avoidance, which were found to occur on two different time scales. Finally, we extend our work to study the influence of cyclic strains on the early stages of cancer development in epithelial tissues (using MDCK-RasV12 system), which was previously largely unexplored. This work reveals that external mechanical forces impede the healthy cells’ ability to eliminate newly transformed cells and greatly promote invasive protrusions, as a result of their different mechanoresponsiveness. Overall, not only does our work reveal new insights regarding the long-range organization in population of cells, but it may also contribute to paving the way towards new approaches in cancer prevention treatments.
Erler, Adalbert/Kaufmann, Ekkehard, Handwörterbuch zur deutschen Rechtsgeschichte (HRG.)
Creators: name: Nell-Breuning, Oswald Von
Publisher: name: Theologie und Philosophie
Year: 1970

description: Theologie und Philosophie, Bd. 63 Nr. 1 (1988): Theologie und Philosophie, Band 63, Heft 1
Supplemental Material - Young people don’t tend to ask for help more than once: Child and adolescent psychiatrists’ views on ailing mental health services for young New Zealanders
Creators: name: Every-Palmer, Susanna
name: Grant, Marion L
name: Thabrew, Hiran
Publisher: name: SAGE Journals
Year: 2022
Subjects: subject: 170199 Psychology not elsewhere classified
subject: FOS: Psychology
subject: 110319 Psychiatry (incl. Psychotherapy)
subject: FOS: Clinical medicine
subject: Neuroscience

description: Supplemental Material for Young people don’t tend to ask for help more than once: Child and adolescent psychiatrists’ views on ailing mental health services for young New Zealanders by Susanna Every-Palmer, Marion L Grant and Hiran Thabrew in Australasian Psychiatry
Additional file 1 of Acriflavine: an efficient green fluorescent probe for sensitive analysis of aceclofenac in pharmaceutical formulations
Creators: name: El-Masry, Amal A.
name: Zeid, Abdallah M.
Publisher: name: figshare
Year: 2023
Subjects: subject: Biophysics
subject: Biochemistry
subject: Physical Sciences not elsewhere classified
subject: Pharmacology
subject: Biotechnology
subject: Chemical Sciences not elsewhere classified
subject: Biological Sciences not elsewhere classified
subject: Inorganic Chemistry
subject: FOS: Chemical sciences

description: Additional file 1: Table S1. Robustness data for the spectrofluorimetric analysis of aceclofenac. Table S2. Comparison between the performance of the developed method and the other reported methods for determination of aceclofenac.
Deliverable D6.1 - Initial Dissemination and Exploitation Plan
Creators: name: Hrasnica, Halid
name: Gavras, Anastasius
name: Koumaras, Vaios
name: Koulaloglou, Marina
name: Koumaras, Georgios
name: Setaki, Fofy
Publisher: name: Zenodo
Year: 2023

description: This document presents the initial dissemination and exploitation plan of the 6G-SANDBOX project. The document also provides information on the completed project branding / project logo as well as other components of the graphical project identity. 6G-SANDBOX launched its website and further social media channels, as presented in the document as well. Finally, an initial plan for implementation of the open calls is presented.
BOSHLANG'ICH SINFLARDA "O'QISH SAVODXONLIGI" DARSLIGIDAGI TOPISHMOQLAR ORQALI O'QUVCHILARNING XOTIRASINI MUSTAHKAMLASH USULLARI
Creators: name: Boltayeva, Marjona
Publisher: name: Zenodo
Year: 2025

description: Mazkur maqolada boshlang‘ich sinflarda “O‘qish savodxonligi” darsligidagi topishmoqlardan foydalanish orqali o‘quvchilarning xotirasini rivojlantirish usullari tahlil qilinadi. Topishmoqlarning ta’lim jarayonidagi o‘rni, ularning mantiqiy tafakkur, xotira va ijodiy fikrlashga ta’siri yoritiladi. Shuningdek, xotirani mustahkamlash uchun samarali metodlar va interaktiv o‘yin shakllari taklif etiladi.
Supplemental Material, sj-docx-1-cll-10.1177_09636897211051743 - Preclinical and Clinical Amelioration of Bone Fractures with Mesenchymal Stromal Cells: a Systematic Review and Meta-Analysis
Creators: name: Yi, Hanxiao
name: Wang, Yang
name: Liang, Qunying
name: Mao, Xiaoqun
Publisher: name: SAGE Journals
Year: 2022
Subjects: Medicine
Cell Biology

description: Supplemental Material, sj-docx-1-cll-10.1177_09636897211051743 for Preclinical and Clinical Amelioration of Bone Fractures with Mesenchymal Stromal Cells: a Systematic Review and Meta-Analysis by Hanxiao Yi, Yang Wang, Qunying Liang and Xiaoqun Mao in Cell Transplantation
Supplemental Material, sj-docx-2-cll-10.1177_09636897211051743 - Preclinical and Clinical Amelioration of Bone Fractures with Mesenchymal Stromal Cells: a Systematic Review and Meta-Analysis
Creators: name: Yi, Hanxiao
name: Wang, Yang
name: Liang, Qunying
name: Mao, Xiaoqun
Publisher: name: SAGE Journals
Year: 2022
Subjects: Medicine
Cell Biology

description: Supplemental Material, sj-docx-2-cll-10.1177_09636897211051743 for Preclinical and Clinical Amelioration of Bone Fractures with Mesenchymal Stromal Cells: a Systematic Review and Meta-Analysis by Hanxiao Yi, Yang Wang, Qunying Liang and Xiaoqun Mao in Cell Transplantation
Enhanced Gene and Repeat Annotations (EugrA1) for the Euglena gracilis Genome
Creators: name: Kim, June-Sik
name: Mochida, Keiichi
name: Nomura, Toshihisa
Publisher: name: figshare
Year: 2025
Subjects: classificationCode: 310509
subject: Genomics

description: We present EugrA1, an enhanced genome annotation for the previously published Euglena gracilis genome assembly (Chen Z et al. 2024 Sci Data; PMID: 39013888). Our improved annotation addresses limitations in the original gene annotation, which achieved suboptimal RNA-seq read alignment rates (<30%). By implementing non-conventional intron-considering alignment strategies with E. gracilis Iso-seq data (NCBI SRA; PRJNA1146561) and supplementing with short-read derived annotation, EugrA1 significantly increases RNA-seq alignment rates to >75% on average across sixteen RNA-seq datasets from five independent studies. Additionally, we provide a comprehensive repeat_region annotation for the same assembly, generated using standard RepeatMasker/Modeler pipelines. These improvements enhance both the quality and usability of the E. gracilis genome resource for the research community.
Eugr-Chen2024.verA1.gene2.gff3: Gene annotation data in GFF3 format, validated using gffread.Eugr-Chen2024.verA1.cdna.fa: Transcript sequences (cDNA) in multi-FASTA format, derived from the annotation using gffread (-w option).Eugr-Chen2024.verA1.cds.fa: Coding sequences in multi-FASTA format, derived from the annotation using gffread (-x option).Eugr-Chen2024.verA1.pep.fa: Translated protein sequences in multi-FASTA format, derived from the annotation using gffread (-y option).Eugr-Chen2024.verA1.RM2.gtf: Repeat region annotation data in GTF format.Gene, transcript, and protein identifiers follow the format 'EugrA01G000300.1', where:
'EugrA' indicates the annotation version
'01G' represents one of the 46 chromosomes
The 6-digit number (e.g., '000300') is a unique gene identifier indicating its relative position on the chromosome
The suffix (e.g., '.1') is a unique transcript/protein identifier for alternatively spliced variants
sj-docx-1-aop-10.1177_10600280221115460 – Supplemental material for Safety and Efficacy of Ceftriaxone in the Treatment of Methicillin-Susceptible Staphylococcus aureus Bloodstream Infections: A Noninferiority Retrospective Cohort Study
Creators: name: Ganguly, Anisha
name: de la Flor, Carolina
name: Alvarez, Kristin
name: Brown, L. Steven
name: Mang, Norman S.
name: Smartt, Jillian
name: King, Helen
name: Perl, Trish M.
name: Filizola, Hector
name: Bhavan, Kavita P.
Publisher: name: SAGE Journals
Year: 2022
Subjects: subject: 111599 Pharmacology and Pharmaceutical Sciences not elsewhere classified
subject: FOS: Clinical medicine

description: Supplemental material, sj-docx-1-aop-10.1177_10600280221115460 for Safety and Efficacy of Ceftriaxone in the Treatment of Methicillin-Susceptible Staphylococcus aureus Bloodstream Infections: A Noninferiority Retrospective Cohort Study by Anisha Ganguly, Carolina de la Flor, Kristin Alvarez, L. Steven Brown, Norman S. Mang, Jillian Smartt, Helen King, Trish M. Perl, Hector Filizola and Kavita P. Bhavan in Annals of Pharmacotherapy
Comparative Analysis of Surgical Techniques for Pediatric Congenital Choledochal Cysts: A Network Meta-analysis
Creators: name: Cao, Chuang
name: Huang, Jihuang
Publisher: name: Zenodo
Year: 2024
Subjects: subject: Congenital choledochal cysts
subject: Pediatric surgery
subject: Open surgery
subject: Laparoscopic surgery
subject: Robotic-assisted surgery
subject: Network meta-analysis
subject: Postoperative complications
subject: Operative outcomes
subject: Length of hospital stay
subject: Intraoperative blood loss
subject: Intraoperative Awareness/blood

description: This study aims to evaluate the comparative effectiveness and safety of different surgical techniques for the treatment of congenital choledochal cysts in children. Specifically, it focuses on comparing three common surgical approaches—open surgery, laparoscopic surgery, and robotic-assisted surgery—in terms of clinical outcomes, including operative time, intraoperative blood loss, length of hospital stay, and postoperative complications.

Using a network meta-analysis, the study synthesizes available evidence from published literature to rank the efficacy and safety of these surgical methods. In addition, clinical data will be integrated to validate the findings of the meta-analysis, ensuring a comprehensive assessment of the interventions.

The findings from this research aim to provide evidence-based guidance for clinicians in selecting the most appropriate surgical approach for pediatric patients with congenital choledochal cysts, contributing to improved clinical decision-making and patient outcomes.