Συχνότητα εμφάνισης των Turnip mosaic virus (TuMV) και Cauliflower mosaic virus (CaMV) σε φυτά της οικ. Brassicaceae, μερικός χαρακτηρισμός και μετάδοση με το είδος Myzus persicae:
Creators: name: Γκαβαλέκα, Στυλιανή Δημητρίου
Publisher: name: Aristotle University of Thessaloniki
Year: 2011
Subjects: TuMV
CaMV
Brassicaceae

description: Η οικογένεια Brassicaceae περιλαμβάνει αρκετά καλλιεργούμενα είδη, σημαντικά για την οικονομία πολλών χωρών παγκοσμίως. Ωστόσο, τα φυτά της οικογένειας είναι ευπαθή σε πληθώρα παθογόνων μεταξύ των οποίων ιοί και φυτοπλάσματα. Στην παρούσα διατριβή διερευνήθηκε η παρουσία και η συχνότητα εμφάνισης των ιών Cauliflower mosaic virus (CaMV), Turnip mosaic virus (TuMV), Tomato spotted wilt virus (TSWV), Cucumber mosaic virus (CMV) και Lettuce mosaic virus (LMV) κυρίως στα τρία ευρέως καλλιεργούμενα είδη του γένους Brassica, Brassica oleracea var. capitata, Brassica oleracea var. botrytis και Brassica oleracea var. italica, καθώς και σε αυτοφυή φυτά διαφόρων οικογενειών. Τα δείγματα καλλιεργούμενων φυτών, από διάφορες περιοχές της Ελλάδας και από μια περιοχή της Τουρκίας, εξετάστηκαν με την ανοσοενζυμική δοκιμή της ELISA όπου διαπιστώθηκε η παρουσία και των πέντε ιών σε χαμηλά ποσοστά. Ωστόσο, η παρουσία των ιών επιβεβαιώθηκε μόνο για τους CaMV και TuMV, τόσο μοριακά (PCR) όσο και με βιοδοκιμές σε φυτοδείκτες. Σε δείγματα αυτοφυών φυτών από διάφορες περιοχές της χώρας μας που ελέγχθηκαν με ELISA, οι ιοί εντοπίστηκαν σε περιορισμένο αριθμό φυτών, χωρίς όμως να επιτευχθεί επιβεβαίωση της παρουσίας τους με μηχανικές μολύνσεις ή μοριακά. Σε καλλιεργούμενα Brassica με συμπτώματα ικτέρου εντοπίστηκε επίσης και ο Turnip yellows virus (TuYV) με τη μέθοδο της RT-PCR. Ορισμένες απομονώσεις των CaMV και TuMV χαρακτηρίστηκαν μερικώς. Οι απομονώσεις του TuMV βρέθηκε να ανήκουν στις ομάδες World-B και Basal-B, ενώ οι απομονώσεις του CaMV χωρίστηκαν σε τέσσερις διαφορετικές ομάδες, με βάση την ανάλυση πολυμορφισμού μήκους θραυσμάτων περιορισμού (RFLP) με χρήση του ενζύμου Hpy99I. Επίσης, μελετήθηκε η επίδραση μικτής μόλυνσης με δύο ελληνικές απομονώσεις των CaMV και TuMV, στην ικανότητα πρόσληψης/μετάδοσης κάθε ιού με τον φορέα Myzus persicae. Στις δοκιμές αφιδομετάδοσης ο TuMV μεταδόθηκε σε υψηλότερα ποσοστά σε σύγκριση με τον CaMV, δεν βρέθηκαν ωστόσο στατιστικώς σημαντικές διαφορές στην μετάδοση των δύο ιών από μονές και μικτές μολύνσεις. Τέλος, σε δείγματα λάχανου, ανιχνεύθηκε για πρώτη φορά στη χώρα μας φυτόπλασμα και βρέθηκε ότι ανήκει στην ομάδα Aster yellows (AY).
description: Brassicaceae family contains a high number of cultivated species that are economically important worldwide. However, the plants of this family are susceptible to many pathogens including viruses and phytoplasmas. The present thesis studied the incidence of Cauliflower mosaic virus (CaMV), Turnip mosaic virus (TuMV), Tomato spotted wilt virus (TSWV), Cucumber mosaic virus (CMV) and Lettuce mosaic virus (LMV) mainly in the three widely cultivated species of Brassica genus, Brassica oleracea var. capitata, Brassica oleracea var. botrytis and Brassica oleracea var. italica and also in arable weeds of various families. The samples of cultivated plants, collected from various regions of Greece and one region of Turkey, were examined by ELISA and the incidence of all five viruses was found in low rates. However, only the incidence of CaMV and TuMV was confirmed, with molecular methods (PCR) as well as with bioassays at indicator plants. Arable weeds from various regions of Greece were also examined by ELISA and the viruses were identified in a limited number of plants. However, virus presence has not been confirmed with mechanical inoculations or molecular methods. Finally, in Brassica plants exhibitng yellowing symptoms, Turnip yellows virus (TuYV) was also detected by RT-PCR. Some of the CaMV and TuMV isolates were partially characterized. TuMV isolates were found to belong in World-B and Basal-B groups whereas CaMV isolates were separated in four different groups based on the Restricted Fragment Length Polymorphism (RFLP) analysis using Hpy99I enzyme. The effect of mixed infection of CaMV and TuMV on the acquisition/transmission of each virus by Myzus persicae was also studied. The results showed that TuMV transmission efficiency was higher than CaMV. However, transmission of each virus from singly and doubly infected plants was similar. Finally, a phytoplasma belonging to the Aster Yellows (AY) group was detected in cabbage samples for the first time in Greece.