cometadata/datacite-rtg-text-other-reclassification-records huggingface dataset:
Polysomy and p16 deletion by fluorescence in situ hybridization in the diagnosis of indeterminate biliary strictures
Creators: Gonda, Tamas A.
Glick, Michael P.
Sethi, Amrita
Poneros, John M.
Palmas, Walter R.
Iqbal, Shahzad
Gonzalez, Susana
Nandula, Subhadra
Emond, Jean C.
Brown, Robert S.
Vundavalli, Murty V.
Stevens, Peter D.
Publisher: name: Columbia University
Year: 2012
Subjects: Endoscopy

description: Background: The diagnosis of indeterminate biliary strictures is limited because of the low sensitivity of cytology. However, an accurate diagnosis of malignancy is critical in the management of patients with suspected biliary malignancy. Testing for chromosomal aneuploidy by fluorescence in situ hybridization (FISH) may increase the yield. Objective: To evaluate the diagnostic accuracy of FISH in indeterminate biliary strictures and the additional value of including deletion of 9p21 (p16) in the diagnostic criteria of malignant biliary strictures. Design: Retrospective review. Setting: Academic medical center. Patients: This study involved 76 consecutive patients who were seen for the evaluation of indeterminate strictures at our institution. These patients were screened, and 50 patients with either a final pathologic diagnosis or ≥ 12 months' conclusive follow-up were included in the analysis. Main outcome measurements: Sensitivity, specificity, and area under the curve (AUC) analysis of cytology alone compared with the presence of FISH polysomy versus FISH polysomy and 9p21 deletion. Results: The presence of increased copy numbers (polysomy) of chromosome 3, 7, or 17 by FISH increased the sensitivity of brush cytology from 21% to 58%, and when the presence of 9p21 deletion was included, the sensitivity increased to 89%. The specificity of FISH was 97% (vs 100% for cytology). The accuracy of cytology combined with FISH polysomy (AUC = 0.93) or p16 deletion was significantly greater than the accuracy of cytology alone (AUC 0.6; P < .001) or even cytology combined with FISH polysomy (AUC = 0.77; P ≤ .05). Limitations: Sample size. There is a relatively high incidence of malignant biliary strictures in the entire cohort but low incidence among primary sclerosing cholangitis patients, and the majority of cancers are cholangiocarcinomas (as opposed to pancreatic). Conclusion: FISH significantly improves the diagnostic accuracy of brush cytology in indeterminate biliary strictures. In our series, the addition of 9p21 deletion to FISH polysomy and cytology further improved sensitivity. This suggests that 9p21 deletion may be added to the diagnostic criteria in indeterminate strictures.
DARSDAN TASHQARI MASHG'ULOTLARDA MATEMATIKA FANINI  ZAMONAVIY METODLAR BILAN OLIB BORISH
Creators: name: Bekdurdiyev, Zufarbek
Publisher: name: Zenodo
Year: 2024

description: Ushbu maqolada darsdan tashqari mashg‘ulotlarda matematika fanini o‘qitishda yangi va zamonaviy pedagogik texnologiyalar, turli xil  samarali metodlardan foydalanish, darsdan tashqari mashg‘ulotlarni asosan amaliy mashg‘ulotlar bilan bog‘lagan holda olib borish haqida so‘z yuritiladi.
title: Perspective—Challenges in Developing Wearable Electrochemical Sensors for Longitudinal Health Monitoring
Creators: name: Fan, Ruolan
name: Andrew, Trisha L.
Publisher: name: University of Massachusetts Amherst
Year: 2020

description: Wearable electrochemical sensors have the potential to overcome the problem of infrequent clinical visits that leads to transient events of potential diagnostic importance being unduly overlooked. The promise of real-time, personalized health care has driven multidisciplinary work on fabricating various forms of wearable sensors. Although remarkable advances in device form factor and integrated circuit design have been achieved, notable hurdles, such as shelf life, reuseability, flex and sweat resistance, and longitudinal performance, remain unaddressed. This perspective seeks to summarize major advances in current wearable electrochemical sensors and to highlight the most pressing challenges that will benefit from collective research endeavors.
Research Data Management in Academic Libraries : Landmarks and Uncertainties
Creators: name: Coravu, Robert
Publisher: name: Zenodo
Year: 2019
Subjects: Library and Information Science
Academic Libraries
Research Data Management

description: In the last two decades, due to the vast quantities of born-digital data produced in a wide variety of forms (texts, images, audio and video recordings, codes a.s.o.) and file formats and to the evolution of tools for dealing with, research data management (RDM) became one of the main topics of interest for scientists and information professionals, as a part of good research practice. The preservation, sharing and re-use of research data are requested not only by scholars, but also by governmental agencies, public and private funders, or publishers. The possibility to verify the research findings is complemented, under the extension of open access
 movement, by the facilitation of new research based on the output of the existing one. The universities and their libraries are among the institutional stakeholders that have begun to address these issues, becoming engaged in developing policies, services, and infrastructure for RDM.
КЛИМАТИЧЕСКАЯ АДАПТАЦИЯ ДЕХКАНСКИХ И ФЕРМЕРСКИХ ХОЗЯЙСТВ НА ЗАСУШЛИВЫХ ЗЕМЛЯХ ПРИАРАЛЬЯ: ПАРАДИГМА ИЗМЕРЕНИЙ
Creators: name: Г. А. Фоменко
name: М. А. Фоменко
Publisher: name: Проблемы региональной экологии
Year: 2020
Subjects: опустынивание
засушливые земли
засуха
системная концепция Жизни
устойчивое развитие
жизнестойкость
антропо-природная экосистема
климатическая уязвимость
климатические неопределенности и риски
технологии адаптации к климатическим изменениям
оценка результативности и эффективности проектов.

description: В статье раскрываются проблемы оценки проектов технической помощи по снижению климатической уязвимости населения засушливых территорий, на примере территории Аральского региона, который, несмотря на участившиеся засухи и ускорение процессов опустынивания, активно используется людьми. Проектом поддерживаются стремления по переходу от борьбы с деградацией засушливых земель к устойчивому развитию антропо-природных систем. В основе такого перехода — повышение ценности человеческой жизни, возрастание внимания к социокультурным традициям обеспечения жизнеспособности домашних хозяйств и местных сообществ. Тем более это справедливо сегодня, когда нарастание неопределенностей и рисков жизнеспособности наблюдается повсеместно: пандемия COVID 19, климатические изменения, эрозия экономических и социальных структур. Парадигма жизнеспособности (resilience) засушливых земель исходит из того, что экосистемы в соответствии с системной концепцией Жизни — это постоянно эволюционирующий живой организм, который периодически проходит точки фазового перехода перед новой стадией динамической стабильности, когда система следует детерминированной траектории. В методологическом отношении такой подход предполагает расширение классической парадигмы рациональности и повышение значение категории «ответственности» как базовых предпосылок снижения неопределенностей и рисков. В соответствии с принятым методологическим подходом разработана система показателей оценки проектов в составе трех взаимосвязанных блоков. Первый блок содержит показатели оценки результативности проектных мероприятий, то есть достижения результатов проекта по снижению климатических неопределенностей, реализации защитных мероприятий глобального значения (гидрометеорологический мониторинг, предотвращение пыления и т. п.). Второй блок содержит показатели оценки эффективности и устойчивости результатов проекта в долгосрочной перспективе, с точки зрения: (1) выгод для бенефициаров проекта от внедрения переданных технологий по климатической адаптации, по параметрам экономической эффективности и (2) выгод для местного сообщества, в виде социальных, экологических, а также экономических благ. Третий блок содержит показатели системной оценки повышения жизнеспособности территорий районов, где расположены пилотные площадки реализации переданных адаптационных технологий и реализуются институциональные и организационные меры поддержки.
ЛАНДШАФТНО- ЭКОЛОГИЧЕСКАЯ ХАРАКТЕРИСТИКА БАШКИРСКОГО ЗАУРАЛЬЯ
Creators: name: З. Б. Латыпова
name: М. К. Омаров
Publisher: name: Проблемы региональной экологии
Year: 2020
Subjects: Башкирское Зауралье
природный территориальный комплекс
ландшафт
степи
антропогенное воздействие
горнообогатительный комбинат
источники загрязнения.

description: В статье дана ландшафтно-экологическая характеристика Башкирского Зауралья. При анализе ландшафтной структуры территории выявлены следующие роды ландшафтов: предгорий, денудационных плато и цокольных равнин, речных долин и озерных котловин, в пределах которых выделены и описаны виды ландшафтов. Природные комплексы рассматриваемой территории стали испытывать более существенное влияние человека с XVI века в связи с переходом от кочевничества к оседлости и пашенному земледелию. До этого население занималось в основном скотоводством, для чего требовалось наличие обширных пастбищных просторов. И антропогенному воздействию в результате развития скотоводства подверглись, прежде всего, зауральские степи. Природа Башкирского Зауралья ныне далека от «первозданного» вида — она сильно изменена в результате хозяйственной деятельности. Если в прошлом природным комплексам территории были присущи аграрный, аграрно-рекреационный типы освоенности, то в настоящее время они подвергаются активному воздействию предприятий горнорудной промышленности, развивающейся на местных ресурсах сырья. Хозяйственное использование природных территориальных комплексов на современном этапе сопровождается формированием природно-антропогенных комплексов, что приводит к возникновению экологических проблем.
Interaction entre la zone endommagée autour d’un tunnel et son soutènement – Simulation numérique
Creators: name: Charlier, R.
name: Sillen, X.
name: Li, X.L.
name: Salehnia, F.
Publisher: name: Academic Journal of Civil Engineering
Year: 2020

description: Cet article porte sur la modélisation numérique de la localisation des déformations en bande de cisaillement autour d’une galerie creusée à Mol, dans le laboratoire souterrain d’EURIDICE. La simulation numérique a permis la mise en évidence d’un réseau de bandes de cisaillement en bon accord avec les observations sur site. La déformabilité de l’argile de Boom impose le placement d’un soutènement, qui limite la convergence et le développement de la zone plastique. L’anisotropie de contrainte initiale et de comportement ainsi que la localisation des déformations en bandes de cisaillement influencent fortement la répartition des pressions sur le soutènement. Il apparait que celles-ci sont fortement couplées à la structure en bande de cisaillement et donc fort hétérogènes. Ceci devrait avoir des conséquences sur le dimensionnement du soutènement, qui doit être capable de reprendre une telle distribution d’efforts.
description: Academic Journal of Civil Engineering, Vol 34 No 1 (2016): Special Issue - RUGC 2016 Liège
ЛАНДШАФТНАЯ ШКОЛА ПРОФЕССОРА В. Т. СТАРОЖИЛОВА
Creators: name: Б. И. Кочуров
name: В. Т. Старожилов
Publisher: name: Проблемы региональной экологии
Year: 2020
Subjects: ландшафт
освоение
структура
морфология
картографирование

description: В статье констатируется, что в России сформирована под руководством профессора В. Т. Старожилова новая актуальная ландшафтная школа в Дальневосточном федеральном университете по изучению природы ландшафтной сферы и направленная на рациональное освоение и использование территорий, минимизацию глобальных и региональных последствий изменения природы и общества и поиск и внедрение инновационных подходов в устойчивом, экологически сбалансированном и безопасном развитии обширного Дальневосточного региона. Приводится информация об уровне обеспеченности Дальнего Востока разработанными ландшафтными основами и документами для решения поставленных задач по освоению и развитию Дальневосточного региона и дальнейшему развития ландшафтной науки на Дальнем Востоке.
MOESM1 of Twelve complete chloroplast genomes of wild peanuts: great genetic resources and a better understanding of Arachis phylogeny
Creators: name: Wang, Juan
name: Li, Yuan
name: Li, Chunjuan
name: Yan, Caixia
name: Zhao, Xiaobo
name: Yuan, Cuiling
name: Sun, Quanxi
name: Shi, Chengren
name: Shan, Shihua
Publisher: name: figshare
Year: 2019
Subjects: subject: Genetics
subject: FOS: Biological sciences
subject: Evolutionary Biology
subject: Environmental Sciences not elsewhere classified
subject: Ecology
subject: Biological Sciences not elsewhere classified
subject: Science Policy
subject: Plant Biology

description: Additional file 1. Basic characteristics of the twelve Arachis genomes that have been acquired in this study. A. chacoensis is now known as A. diogoi.
ЛИТОЛОГИЧЕСКИЕ И ГЕОМОРФОЛОГИЧЕСКИЕ ПРИЗНАКИ ГЕНЕЗИСА ВЕРХНЕЙ ТОЛЩИ ЧЕТВЕРТИЧНЫХ ОТЛОЖЕНИЙ В НИЖНЕМ ТЕЧЕНИИ Р. НАДЫМ
Creators: name: О. С. Сизов
name: А. О. Вольвах
name: А. В. Вишневский
name: А. В. Соромотин
Publisher: name: Проблемы региональной экологии
Year: 2020
Subjects: Западная Сибирь
палеогеография
покровное оледенение
четвертичные отложения
зерна кварца
петрография
ЦМР

description: Актуальность исследуемой проблемы обусловлена отсутствием единого представления о генезисе четвертичных отложений на севере Западной Сибири, формирование которых связывают как с морскими, так и ледниковыми обстановками осадконакопления. Целью статьи является выявление устойчивых признаков, характеризующих условия осадконакопления и рельефообразования на примере нижнего течения р. Надым. Ведущим методом изучения данной проблемы является комплексный анализ результатов литологических, петрографических и геоморфологических исследований верхней толщи четвертичных отложений. В результате работ на примере анализа окатанности и морфологии кварцевых зерен выделены признаки ледниковой обработки для некоторых слоев описанных разрезов. Проведено петрографическое исследование отобранных образцов валунов, большинство из которых по форме и наличию штриховки могут быть отнесены к ледогранникам. Использование детальной цифровой модели поверхности впервые для данной территории позволило выделить специфические формы рельефа, которые с высокой долей вероятности были сформированы в ходе оледенений. На основе проведенного анализа предлагается рассматривать обширные озерно-аллювиальные равнины в бассейне р. Надым в качестве постгляциальных областей. Такое представление закладывает литологическую основу для понимания причин формирования современной ландшафтной структуры. Материалы статьи представляют интерес для исследователей четвертичных отложений, рельефа, растительности и почвенного покрова, занимающихся восстановлением истории развития природной среды на севере Западной Сибири.
A closed-form hydro-mechanical solution for deep tunnels in elastic anisotropic rock
Creators: name: Tran, Nam-Hung
name: Do, Duc-Phi
name: Hoxha, Dashnor
Publisher: name: Academic Journal of Civil Engineering
Year: 2020

description: En basant sur la méthode variable complexe et sur la méthode de conformal mapping, une solution analytique hydro-mécanique pour les contraintes et les déplacements autour d’un tunnel profond est développée. L’approche de potentiel complexe de Lekhnitskii pour l’élasticité anisotrope est utilisée pour inclure l'effet hydraulique. Afin de valider la solution, les résultats de solution analytique pour une ouverture circulaire sont comparés à ceux obtenus en utilisant une analyse numérique réalisée avec code MEF- ASTER. En utilisant cette solution analytique, l’effet d’anisotropie du comportement poro-élastique sur la répartition des contraintes et des déplacements autour d'un tunnel profond sera détaillé. La solution analytique serait utile pour la conception du tunnel grâce à sa capacité d‘évaluer rapide des champs de contrainte et de déplacement dans milieux poro-élastiques linéaires.
description: Academic Journal of Civil Engineering, Vol 34 No 1 (2016): Special Issue - RUGC 2016 Liège
Prediction of seasonal meteorological drought onset and termination over the southern Great Plains in the North American Multimodel Ensemble
Creators: Seager, Richard
Nakamura, Jennifer A.
Ting, Mingfang
Publisher: name: Columbia University
Year: 2020
Subjects: Droughts
Meteorology

description: The predictability on the seasonal time scale of meteorological drought onsets and terminations over the southern Great Plains is examined within the North American Multimodel Ensemble. The drought onsets and terminations were those identified based on soil moisture transitions in land data assimilation systems and shown to be driven by precipitation anomalies. Sea surface temperature (SST) forcing explains about a quarter of variance of seasonal mean precipitation in the region. However, at lead times of a season, forecast SSTs only explain about 10% of seasonal mean precipitation variance. For the three identified drought onsets, fall 2010 is confidently predicted and spring 2012 is predicted with some skill, and fall 2005 was not predicted at all. None of the drought terminations were predicted on the seasonal time scale. Predictability of drought onset arises from La Niña–like conditions, but there is no indication that El Niño conditions lead to drought terminations in the southern Great Plains. Spring 2012 and fall 2000 are further examined. The limited predictability of onset in spring 2012 arises from cool tropical Pacific SSTs, but internal atmospheric variability played a very important role. Drought termination in fall 2000 was predicted at the 1-month time scale but not at the seasonal time scale, likely because of failure to predict warm SST anomalies directly east of subtropical Asia. The work suggests that improved SST prediction offers some potential for improved prediction of both drought onsets and terminations in the southern Great Plains, but that many onsets and terminations will not be predictable even a season in advance.
SUDPLAN Scenario Management System - Product Implementation Companion Report V2
Creators: name: Dihé, Pascal
Publisher: name: Zenodo
Year: 2012
Subjects: software documentation
report
software architecture
scenario management
climate change
climate change adaptation
FP7
OGC Services
model integration
downscaling
SOA
meta-data
data-model
FP7-ICT-2009-6

description: This document has been produced by the consortium of the European Project FP7-247708 Sustainable Urban Development Planner for Climate Change Adaptation (SUDPLAN). It is the companion report to the second deliverable of T3.3 Product Implementation which represents the software developed on the basis of the results of T3.2 Product Prototyping and T3.1 Requirements Specification. It is an update of the first report (D3.2.1) and provides an overview of the distinct building blocks of the SUDPLAN platform and briefly explains their architecture and reports on the developments performed during the second product implementation phase. This document is a brief report to accompany the software developed in WP3 (Scenario Management System) in the second year of the SUDPLAN project bundled into D3.2.2 Product Implementation V2. The software described here constitutes the components that make up one of the core results of SUDPLAN - the Scenario Management System. In contrast to D3.3.2 Scenario Management System V2 the developed software components are not presented as an integrated solution but rather as individual building blocks. The results of D3.2.2 combined with the results of D3.3.2 are the basis for the second validation cycle performed by the pilot applications.
description: {"references": ["Meyer, Bertrand: Applying \"Design by Contract\", in Computer (IEEE), 1992, pp. 40\u201351", "Grady Booch et al.: The Unified Modeling Language User Guide, 2005 , Addision Wesley Longman", "Williams, M., Cornford, D., Bastin, L., Pebesma, E.: Uncertainty markup language, UncertML (2007)", "Klopfer, M., Simonis, I. (eds.): SANY - an open service architecture for sensor networks. SANY Consortium (2009)", "Klopfer, M., Kanellopoulos, I. (eds.): orchestra - an open source architecture for risk management. In: The ORCHESTRA Consortium (2008)", "Hrebicek, J., Pillmann, W.: Shared environmental information system and single information space in europe for the environment: Antipodes or associates? In: Hrebicek, J.,Hradec, J., Pelikn, E., Mrovsk, O., Pillmann, W., I.Holoubek, Bandholtz, T. (eds.) Proceedings of the European conference of the Czech Presidency of the Council of the European Union, TOWARDS eENVIRONMENT. pp. 447\u2013458. Masaryk University, Prague, (03 2009)", "Botts, M., Percivall, G., Reed, C., Davidson, J.: Ogc sensor web enablement: Overview and high level architecture (July 2007)", "SANY fusion and modelling architecture. Discussion Paper OGC 10-001, Deliverable D3.3.2.3 of the European Integrated Project SANY FP6-IST- 033564 OGC 10-001, Open Geospatial Consortium (2010)"]}
К ВОПРОСУ О ГЕОГРАФИЧЕСКИХ И ГЕОПОЛИТИЧЕСКИХ ПРИНЦИПАХ РАСПОЛОЖЕНИЯ ДРЕВНИХ ФОРТИФИКАЦИОННЫХ СООРУЖЕНИЙ ЧЕРНОМОРСКОГО ПОБЕРЕЖЬЯ: МЕЖДУ БОСПОРОМ И АБАЗГИЕЙ
Creators: name: А. С. Кизилов
name: Г. В. Требелева
Publisher: name: Проблемы региональной экологии
Year: 2020
Subjects: Черноморское побережье Кавказа
крепости
храмы
караванные тропы
Понтийский лимес

description: Расположение античных и средневековых крепостей, городов и поселений на Черноморском побережье Кавказа всегда вызывало дискуссии, связанные с вопросом об их локализации. Археологические изыскания последних двух десятилетий на Черноморском побережье России и Абхазии показали, что наука располагает далеко не полным списком стратегических для разных эпох объектов фортификационного и административно-культурного значения. Причиной тому явилось изменение геополитического значения этих объектов, их поглощение современными объектами урбанизации, уничтожение надземной части археологических памятников в процессе строительной деятельности XIX—XX веков, а также естественного разрушения. Данное исследование основано на сопоставлении координат известных ныне крепостей и храмов, путей караванных троп через Кавказский хребет и торговых маршрутов вдоль побережья Черного моря. Аналитически сопоставляя расстояние дневного перехода каботажного флота в античное и средневековое время, географическое и ситуационное удобство рассматриваемых объектов и описания в трудах древних географов и историков, можно не только подтвердить спорные аспекты локализации крепостей, но и спрогнозировать наличие объектов, не выявленных на данный момент наукой.
КОМПЛЕКСНЫЙ АНАЛИЗ ПОТЕНЦИАЛА ЭНЕРГООБЕСПЕЧЕНИЯ АКМОЛИНСКОЙ ОБЛАСТИ С ИСПОЛЬЗОВАНИЕМ ВОЗОБНОВЛЯЕМЫХ ИСТОЧНИКОВ ЭНЕРГИИ
Creators: name: A. А. Тулегенова
name: С. В. Киселева
name: Ю. Ю. Рафикова
Publisher: name: Проблемы региональной экологии
Year: 2020
Subjects: возобновляемые источники энергии
солнечная энергия
ветровая энергия
Акмолинская область
Казахстан

description: Впоследние десятилетия прослеживается устойчивая тенденция увеличения масштабов применения возобновляемых источников энергии (ВИЭ) в ТЭК многих стран и регионов. Основными факторами, определяющими потенциал использования ВИЭ, являются величина ресурсов, их пространственная, временная неоднородность и стоимость выработанной энергии в сравнении с традиционными источниками энергии. Для определения этого потенциала необходим комплексный анализ территории с точки зрения как физико-географических условий, так и экономических факторов. В статье представлены результаты пространственного анализа потенциала энергообеспечения на основе ВИЭ для территории Акмолинской области Казахстана.
РОЛЬ ЭКО-ИНДУСТРИАЛЬНЫХ ПАРКОВ В КОМПЛЕКСНОМ УПРАВЛЕНИИ РЕСУРСАМИ В РОССИЙСКОЙ ФЕДЕРАЦИИ
Creators: name: В. А. Марьев
name: О. В. Голуб
name: Т. С. Смирнова
name: В. А. Широков
Publisher: name: Проблемы региональной экологии
Year: 2020
Subjects: обращение с отходами
система планирования
эко-индустриальный парк
промышленный симбиоз
ресурсная эффективность

description: В условиях современной социально-экономической ситуации в Российской Федерации, а также для выполнения целевых показателей, определенных национальными проектами, необходимо применять новые подходы во всех сферах управления. Сфера обращения с отходами не является исключением. В соответствии с иерархией методов обращения с отходами приоритетными направлениями являются предотвращение и минимизация образования, использование материального или энергетического потенциала отходов. Развитие этих направлений подразумевает комплексное использование ресурсов, включая техногенные, полученные из отходов, и ресурсосберегающих технологий во всех отраслях промышленности. В статье определены роль и возможности эко-индустриальных парков (экотехнопарков) в комплексном управлении ресурсами в Российской Федерации. В экотехнопарках потоки отходов используются с целью замещения части природных ресурсов, включая энергетические, или для производства новой продукции из вторичных ресурсов.
О ГЕОГРАФИЧЕСКИХ И ГЕОПОЛИТИЧЕСКИХ ПРИНЦИПАХ РАСПОЛОЖЕНИЯ ДРЕВНИХ ФОРТИФИКАЦИОННЫХ СООРУЖЕНИЙ: ОТ РЕКИ ХАШУПСЫ ДО РЕКИ ААЛДЗГИ
Creators: name: Г. В. Требелева
name: А. С. Кизилов
name: В. А. Лобковский
name: Л. Г. Лобковская
Publisher: name: Проблемы региональной экологии
Year: 2020
Subjects: Черноморское побережье Кавказа
крепости
храмы
караванные тропы
Понтийский лимес

description: Данная статья посвящена обзору побережья южнее Цандрипша до реки Аалдзга, по которой проходит условная граница между историческими областями Абхазии Абжуа и Самурзакан, а также Великая Абхазская (Келасурская) стена. Можно отметить, что на описанном участке побережья Абхазии мы видим следующие принципы расположения памятников, как приморского лимеса, так и местного населения на географическом и геополитическом пространстве: это расположение их на путях основных караванных троп и в районе побережья на расстоянии дневного перехода кабатажного флота в местах с удобной стоянкой для судов. Более того, мы часто видим соседство в прибрежной зоне античных полисов и крепостей с крупными населенными пунктами местного населения: в районе Гагр это следы множественных могильников цебельдинского времени, в районе Пицунды — это храмовый комплекс Алахадзы и святилище Лдзаа, в районе Бамборы — поселение Кистрик, жизнь на котором начинается с периода неолита, в районе Сухума — это знаменитое Эшерское городище, в районе Санто-Томассо — Тамышское поселение. Не все памятники исследованы в полной мере, не все выявлены, но определенные тенденции в их расположении таки наблюдаются достаточно четко.
ИССЛЕДОВАНИЕ ГОРОДСКОЙ ЭКОСИСТЕМЫ
Creators: name: И. Г. Неудачин
Publisher: name: Проблемы региональной экологии
Year: 2020
Subjects: рейтинг
экологические показатели
статистический анализ
частотный анализ
корреляционный анализ

description: Целью работы являлся сравнительный анализ экологических показателей городов России на основе статистических данные Федеральной службы государственной статистики. Разработана методология вычисления экологического рейтинга на основе удельных показателей, которые больше всего влияют на ухудшение качества жизни. Произведен статистический анализ показателей качества жизни горожан. Корреляционный анализ установил тесноту связи отдельных пар экологических показателей, разработаны уравнения линейной регрессии, которые дают возможность восстановить отсутствующие данные и предсказать будущие показатели при изменении демографической ситуации. Частотный анализ выделил среди исследуемых ряд городов, которые больше всего загрязняют окружающую среду, в которых следует перейти от нынешнего неблагополучного состояния сочетания потребностей человека и возможностей городской среды к их оптимальному соответствию. Для этого предлагаются различные механизмы управления экологической безопасностью и охраной окружающей среды на основе объективной информации. Предложен принцип числовых оценок сравнительного анализа состояния городской среды, на основе которого предложен метод расчета экологического рейтинга. Разработана методика сравнения экологических данных и сравнительного статистического анализа.
Pretending Civil Society: Western NGO Scripts and Local Actors in Post-Soviet Tajikistan
Creators: Paggi, Livia Alexandra
Publisher: name: Columbia University
Year: 2009
Subjects: Non-governmental organizations
Civil society
Social networks
Newly independent states

description: On the basis of my fieldwork6 as well as my reading of civil society studies and INGO civil society projects, I would maintain that INGOs have created a “bubble civil society,” infused with Western rhetoric and resources, but without effective roots in Tajik society. By bubble civil society, I refer to INGO resources (equipment, services, and support from Western governments) that have attracted key actors (mainly government, elites, and motivated youth), enabling them to hook into the resources. But they are not necessarily reform-minded, nor does the assistance create strong links of solidarity among members even among other groups outside of the particular sector for which aid is provided. This happens for two reasons: first, INGOs ignore existing systems of social networks and the dependency of citizens on clans or informal organization of political and social networks of Tajikistan that were established during the pre-Soviet as well as Soviet political systems.7 Second, as INGOs attempt to collaborate and build relations of solidarity with local individuals on project implementation, Western staff members establish their own new relations of hierarchy with local employees.8 Local staff has very little voice in their operations and can only participate by articulating Tajikistan's problems in terms of Western universal rights rhetoric. Often this rhetoric fails to reflect the nuances of Tajik society. The bubble civil society created by INGOs thus accommodates both international and local actors' interests just enough to distract or deter both of them from making real institutional change in Tajikistan. As local actors reconfigure themselves to engage with international actors and resources, they try to adapt the organizations to their own interests. Once this dynamic has been institutionalized, it contributes to maintaining the status quo, obstructing any new dialogue about social values and politics, much less new social movements. To explain this phenomenon, this article will look at the “scripts” for the bubble society in Western ideas of civil society before looking more closely at the interaction between international and local actors and the contrast between larger INGO goals and the interests of local actors. At the center of my research, is a case study of ABA/CEELI, an American INGO in Tajikistan funded by USAID to promote criminal law reform and legal education. The case of ABA/CEELI demonstrates how an initial focus on legal reform becomes diluted as actors reconfigure themselves to the project and resources.
title: Modeling Macroecological Patterns in Marine Ecosystems: From Community Structures to Gene Expressions
Creators: name: Pigani, Emanuele
Publisher: name: The Open University
Year: 2025

description: Marine ecosystems, characterized by extraordinary species diversity, rely heavily on microbial communities that drive key ecological and biogeochemical processes. Although high-throughput molecular techniques have substantially expanded our knowledge of microbial communities, many open questions persist regarding the processes shaping their composition, diversity, and function.


This thesis addresses these gaps through two complementary lines of research. First, it investigates how temporal delays influence the stability and collective dynamics of large ecological systems. Delays arise naturally from spatial diffusion or interactions with environmental variables, and we show that they alter classical stability criteria in ways that generalize May’s complexity–stability result. By examining near-equilibrium and generalized Lotka–Volterra dynamics, we find that delayed self-interactions can trigger not only instability regimes, but also chaotic states and collective oscillations, offering alternative explanations for synchronization in real-world ecosystems, beyond traditional predator–prey cycles.


Second, we adopt a macroecological lens to study marine phytoplankton, focusing on diatoms. We revisit Hutchinson’s paradox of the plankton and a proposed inverted paradox, which predicts unrealistically high biodiversity under neutral assumptions. Our analytical approach reveals that extinction timescales depend critically on initial conditions, and incorporating a realistic rare-biosphere distribution resolves the paradox without invoking non-neutral processes. Building on this insight, we analyze diatom community data from the Tara Oceans expeditions, finding that neutral models capture the majority of rare species but fail for hyper-dominant taxa. This suggests that while neutrality is helpful in describing much of the community, additional selective or historical factors underlie the rise of dominant diatoms. Finally, to explore the functional dimension of diatom communities, we propose a null model coupling metagenomic and metatranscriptomic abundances, which we successfully fit to empirical data, offering a possible new way to normalize unigene abundances across samples. We quantify gene-expression patterns, proposing a temperature-dependent transcription efficiency, that is able to reproduce a universal sublinear scaling in the number of expressed genes.


Taken together, these findings highlight the value of integrating advanced theoretical models with empirical datasets to illuminate how microbial communities assemble, persist, and function—ultimately contributing to a deeper understanding of Earth’s remarkable biodiversity.
Open Science, Legal issues & Licenses
Creators: name: Hannesschläger, Vanessa
name: Trognitz, Martina
Publisher: name: Zenodo
Year: 2020
Subjects: legal issues
copyright
open science
open licensing
creative commons

description: Slides accompanying the presentation of legal issues in DH research in the course of the "Meet the Researchers" program for interns of the Austrian Centre for Digital Humanities & Cultural Heritage at the Austrian Academy of Sciences.
L'ÉTENDUE DE LA PROTECTION PÉNALE DES SYSTÈMES DE TRAITEMENT AUTOMATISÉ DES DONNÉES
Creators: name: ADNANI El Mehdi
name: AKKOUR Soumaya
Publisher: name: Zenodo
Year: 2024

description: La protection des données dans un système implique de prendre des mesures pour s'assurer que les informations sensibles et personnelles sont protégées contre l'accès non autorisé, la perte, la fuite ou la destruction. Les systèmes peuvent inclure des bases de données informatiques, des réseaux de stockage de données, des systèmes de gestion de la confidentialité, etc.

Les mesures de protection des données peuvent inclure l'authentification, l'autorisation, la cryptographie, la sauvegarde de données, la gestion des accès et les contrôles de sécurité. Il est également important de former les employés sur les bonnes pratiques en matière de protection des données et de s'assurer que les politiques et les procédures sont mises en place pour protéger les données.Il est important de noter que la protection des données est une responsabilité en constante évolution en raison de l'évolution constante des technologies et des menaces de sécurité. Il est donc important de surveiller régulièrement les systèmes pour détecter les vulnérabilités et mettre en place des mises à jour pour renforcer la sécurité des données.En général, la protection des données dans un système est un élément crucial pour garantir la sécurité et la confidentialité des informations sensibles et personnelles, ainsi que pour maintenir la confiance des utilisateurs dans le système.
Memorandum of Understanding concerning a National Open Access Publishing Framework for Germany (between Forschungszentrum Jülich GmbH and Frontiers Media SA)
Creators: name: Buitenhuis, Ronald
name: Hellwig, Frank
Publisher: name: Zenodo
Year: 2020
Subjects: open access agreement
open access
open science
transformative agreement

description: Jülich, 17 February 2020 – A successful outcome has been reached in the negotiations between Forschungszentrum Jülich and leading open access publisher Frontiers. The two partners signed this Memorandum of Understanding today at Forschungszentrum Jülich for a pilot project that will enable researchers to publish in Frontiers’ journals through a simplified publishing process with university libraries managing the publication costs centrally. Forschungszentrum Jülich led the two-year negotiations on behalf of the members of the Helmholtz Association - Germany’s largest scientific organisation. Under the terms of the agreement, all German research institutions and universities have the option to participate.
IN03111 Ruvanvälisǟya Pillar Inscription of the Reign of Buddhadāsa
Creators: name: Paranavitana, S.
Publisher: name: Zenodo
Year: 2020
Subjects: IN03111
Epigraphia Zeylanica
Ruvanvälisǟya
Anuradhapura
Buddhadasa

description: IN03111 Ruvanvälisǟya Pillar Inscription of the Reign of Buddhadāsa - Transcript and Translation Source: Paranavitana, S. (1928-33). ‘No. 7. Ruvanvälisǟya Pillar Inscription of the Reign of Buddhadāsa (388–416 A. D.) (A.S.I. No. 374),’ Epigraphia Zeylanica 3, pp. 122.
Mécanismes et cinétique d’évaporation d’un limon compacté
Creators: name: Mpawenayo, Régis
name: Debaste, Frédéric
name: Gerard, Pierre
Publisher: name: Academic Journal of Civil Engineering
Year: 2020

description: Des modèles d’évaporation de l’eau du sol tenant compte des conditions atmosphériques ont été formulés par de nombreux chercheurs. La plupart de ces modèles sont calibrés via des essais réalisés in situ ou dans des chambres environnementales. L’utilisation en laboratoire d’échantillons de taille réduite permettrait de diminuer la durée des essais et faciliterait la calibration des modèles d’évaporation. Il faut néanmoins s’assurer que les mécanismes d’évaporation observés au laboratoire sur de petits échantillons soient similaires à ceux observés in situ. Pour analyser cette question, des essais de séchage ont été réalisés sur des échantillons cylindriques d’un limon compacté de hauteurs et de diamètres variables. Les essais sont réalisés dans une chambre hermétiquement fermée sans convection forcée de l’air où l’humidité relative est contrôlée via des solutions salines saturées. Les résultats des essais de séchage réalisés montrent que la surface et la hauteur de l’échantillon ont une influence sur la cinétique d’évaporation de l’eau du sol. Ils mettent également en évidence la nécessité de tester un échantillon suffisamment grand pour que les coefficients de transfert de masse déterminés soient pertinents pour les applications géotechniques.
description: Academic Journal of Civil Engineering, Vol 34 No 1 (2016): Special Issue - RUGC 2016 Liège
MOESM2 of Twelve complete chloroplast genomes of wild peanuts: great genetic resources and a better understanding of Arachis phylogeny
Creators: name: Wang, Juan
name: Li, Yuan
name: Li, Chunjuan
name: Yan, Caixia
name: Zhao, Xiaobo
name: Yuan, Cuiling
name: Sun, Quanxi
name: Shi, Chengren
name: Shan, Shihua
Publisher: name: figshare
Year: 2019
Subjects: subject: Cell Biology
subject: Genetics
subject: FOS: Biological sciences
subject: Evolutionary Biology
subject: Environmental Sciences not elsewhere classified
subject: Ecology
subject: Biological Sciences not elsewhere classified
subject: Information Systems not elsewhere classified
subject: Plant Biology

description: Additional file 2. The genes that have been identified from the twelve acquired chloroplast genomes. Intron-containing genes are marked by asterisks (*).
Primary large B-cell lymphoma of the central nervous system with cyclin D1 expression and t(11;14) (IGH-CCND1): Diffuse large B-cell lymphoma with CCND1 rearrangement or mantle cell lymphoma?
Creators: Parrott, Andrew M.
Haggiagi, Aya M.
Vundavalli, Murty V.
Bhagat, Govind
Alobeid, Bachir
Publisher: name: Columbia University
Year: 2020
Subjects: Lymphomas
Oncology

description: Mantle cell lymphomas (MCLs) are the prototypic B-cell non-Hodgkin lymphomas defined by cyclin D1 gene (CCND1; or other cyclin D family gene) rearrangements. However, extremely rare cases of diffuse large B-cell lymphomas (DLBCLs) harboring CCND1 rearrangements, resulting in cyclin D1 protein expression, have also been reported. In this report, we describe an unusual primary large B-cell lymphoma of non-germinal center immunophenotype of the central nervous system (CNS) in an elderly male patient, which was negative for CD5 and SOX11, and exhibited cyclin D1 expression. Fluorescence in situ hybridization analysis detected IGH-CCND1 and BCL6 rearrangements. This case may represent the first report of a primary CNS DLBCL with IGH-CCND1 rearrangement. The clinico-pathologic features that can help differentiate primary CNS MCL from primary DLBCL of the CNS with IGH-CCND1 rearrangement are discussed.
A Swedish Network for Research Data Management
Creators: name: Taberman, Ida
name: Toljander, Ylva
name: Lindroos, Hanna
Publisher: name: Zenodo
Year: 2020
Subjects: Research data management
Swedish national data service
Svensk nationell datatjänst
data curation
Swedish University of Agricultural Sciences
Sveriges Lantbruksuniversitet
Data access unit
Domain specialist
Research data catalogue

description: The Swedish National Data Service (SND) is a national infrastructure facilitating access to research data. SND supports accessibility, preservation, and re-use of data and related material. Research data from any subject area can be described in and published via the SND research data catalogue. This repository is CoreTrustSeal-certified, and published datasets are provided with DOI persistent identifier. The SND network: •SND is run by a consortium of nine universities, of which the Swedish University of Agricultural Sciences (SLU) is one. ( ) •The SND Network consists of 34 universities and governmental authorities, including the consortium members. ( ) •The network’s purpose is to support Swedish researchers in making their data available and FAIR. •All members of the network have agreed to establish a local support function for researchers, a so-called Data Access Unit. The consortium universities contribute expert knowledge to SND in the form of domain specialists. The Swedish University of Agricultural Sciences (SLU) provides expertise in climate and environmental data. The domain specialists •act as a bridge between SND and researchers. •advice on domain specific matters such as standard vocabularies and metadata standards. •are involved in information and education initiatives. •monitor the research data development in their domain. •participate in national and international collaborations. •work towards an increased understanding, use, and publication of open research data. DCU - The Data Curation Unit at SLU DCU is a support organization for researchers and environmental analysts at SLU regarding research data management. DCU acts as the SLU Data Access Unit for SND. The unit assists in the publication and archiving of research data, mainly through education and support. DCU combines several areas of competence found at SLU: competence and expertise in matters regarding both library and archive as well as climate and environmental data. What does DCU do for researchers? •Assists in the preparation of data management plans. •Provides support in questions related to data archiving and long-term preservation. •Advices on how to document and prepare data for publication. •Suggests repositories suitable for data publication. •Informs and advices on approaches towards Open and FAIR data. •Curates submitted data and metadata with regard to FAIRness.
Development of an Interactive Textbook Backed by Cloud Infrastructure to Pilot Active Computational Learning in an Upper Level Mechanical Vibrations Engineering Course
Creators: name: Moore, Jason K.
name: Lyons, Kenneth
Publisher: name: figshare
Year: 2017
Subjects: subject: Mechanical Engineering
subject: FOS: Mechanical engineering
subject: Education

description: A proposal submitted by Jason K. Moore to the UC Davis Center for Educational Effectiveness in 2017.
MOESM3 of Twelve complete chloroplast genomes of wild peanuts: great genetic resources and a better understanding of Arachis phylogeny
Creators: name: Wang, Juan
name: Li, Yuan
name: Li, Chunjuan
name: Yan, Caixia
name: Zhao, Xiaobo
name: Yuan, Cuiling
name: Sun, Quanxi
name: Shi, Chengren
name: Shan, Shihua
Publisher: name: figshare
Year: 2019
Subjects: subject: Cell Biology
subject: Genetics
subject: FOS: Biological sciences
subject: Evolutionary Biology
subject: Ecology
subject: Biological Sciences not elsewhere classified
subject: Information Systems not elsewhere classified
subject: Developmental Biology
subject: Marine Biology
subject: Science Policy
subject: Plant Biology

description: Additional file 3. The SSR makers that have been developed from the twelve acquired Arachis chloroplast genomes.
Boom clay drying behavior : experimental and numerical study
Creators: name: Hubert, J.
name: Plougonven, E.
name: Prime, N.
name: Leonard, A.
name: Collin, F.
Publisher: name: Academic Journal of Civil Engineering
Year: 2020

description: Ce papier présente le modèle utilisé pour simuler le séchage de l’argile de Boom. Une campagne expérimentale a été menée à bien [PRI 16] et ses résultats sont utilisés afin de valider le modèle utilisé. La première partie de ce papier est donc consacrée à un bref rappel de la campagne expérimentale. Ensuite, les différentes équations et paramètres du modèle utilisé sont détaillés. Finalement, des simulations numériques sont effectuées et permettent de mettre en exergue la capacité dudit modèle à représenter précisément le comportement observé expérimentalement.
description: Academic Journal of Civil Engineering, Vol 34 No 1 (2016): Special Issue - RUGC 2016 Liège
Polyketides with quorum sensing inhibitory activity from the marine-derived fungus Aspergillus sp. ZF-79
Creators: name: Zhang, Fei
name: Kong, Fan-Dong
name: Ma, Qing-Yun
name: Xie, Qing-Yi
name: Zhou, Li-Man
name: Zhao, You-Xing
name: Guo, Lei
Publisher: name: Taylor & Francis
Year: 2019
Subjects: subject: Biochemistry
subject: Microbiology
subject: FOS: Biological sciences
subject: Pharmacology
subject: Environmental Sciences not elsewhere classified
subject: Chemical Sciences not elsewhere classified
subject: Ecology
subject: Biological Sciences not elsewhere classified
subject: Plant Biology
subject: Virology

description: Seven compounds were isolated from a marine-derived fungus Aspergillus sp. ZF-79, including three new polyketides (1–3), named asperochrins D-F, along with four known compounds 4–7. Their structures were determined on the basis of spectroscopic methods. All the compounds were tested for quorum sensing inhibitory (QSI) activity. Compounds 1, 3, 4, 5, and 6 exhibited QSI activity against Chromobacterium violaceum CV026 with MIC values of 50, 100, 50, 50, and 6.25 μM, respectively.