DYNAMOGIRSEINE cruise,Côtes De La Manche R/V
Creators: name: HUGUET Arnaud
Publisher: name: Sismer
Year: 2023

description: Le continuum terre-mer (bassin versant/estuaire/mer côtière) représente une zone écosystémique critique, au carrefour de nombreux enjeux et soumis à une grande diversité de pressions. Les différents sous-hydrosystèmes qui constituent le continuum terre-mer (fleuve, estuaire, mer côtière) se caractérisent par des rôles spécifiques dans le transfert et la transformation de la matière en suspension (MES), minérale ou organique, dissoute ou particulaire, des continents aux océans. La matière organique (MO), dissoute et particulaire, est issue de la production, la dégradation et transformation (bio-géo)chimique du matériel biologique, d'origine terrestre ou aquatique. L'origine et la qualité du contenu organique (taille, structure, composition moléculaire, biodisponibilité) varient spatialement et temporellement, influencées tant par les conditions physicochimiques que sédimentaires. De nouvelles approches intégrées doivent désormais être développées pour contraindre la diversité, les mécanismes de transformation et le devenir de la MO estuarienne, au niveau global et moléculaire et lever les verrous associés. Analyser les processus de transformation de la MO à fine échelle, i.e. moléculaire, représente un défi analytique et méthodologique, que la mise en oeuvre de techniques innovantes peut aujourd'hui relever. Cette connaissance est indispensable pour in fine formaliser ces mécanismes et les intégrer de façon explicite au sein des modèles décrivant le fonctionnement de l'écosystème.Les campagnes DYNAMOGIRSEINE s'inscrivent dans le cadre du projet EC2CO CNRS/OFB RUNTIME, qui s'intéresse en particulier au transfert et la transformation de la MO à la fois particulaire et dissoute dans les estuaires de Seine et de la Gironde. L'approche proposée combinant caractérisation chimique et écologie microbienne vise à acquérir des connaissances mécanistiques sur les processus reliant MO, communautés planctoniques et bactériennes, avec une comparaison de la variabilité spatio-temporelle de ces processus dans les deux estuaires étudiés. Les données obtenues seront utiles pour la modélisation du fonctionnement biogéochimique estuarien. Les campagnes réalisées permettront de compléter les données en cours d'acquisition en Seine et en Gironde via le projet RUNTIME.L'objectif des campagnes DYNAMOGIRSEINE était de plus précisément contribuer à (i) la détermination  et comparaison des sources, de la réactivité et du devenir de la MO dans les estuaires de la Seine et de la Gironde et (ii) d'étudier conjointement la variabilité spatio-temporelle de la diversité des communautés microbiennes et de la production algale.Pour ce faire, les caractéristiques globales et moléculaires de la MO ont été déterminées dans la colonne d'eau (compartiments dissous/colloïdal et particulaire) à différents points des deux estuaires, c'est-à-dire, dans le bouchon vaseux ainsi qu'en amont et en aval de ce dernier. Pour relier les transformations de la MO à l'activité biologique du milieu estuarien, la productivité primaire a été évaluée par des méthodes de fluorescence variable calibrée. La structure et la diversité des communautés microbiennes métaboliquement actives ont été déterminées par une approche d'écologie moléculaire.Des échantillons d'eau (une vingtaine de litres par point) ont été prélevés durant deux périodes contrastées en hiver et en été afin de prendre en compte l'influence de la variabilité saisonnière sur les caractéristiques de la MO et les processus biologiques. La dynamique biogéochimique a été suivie via des prélèvements en point fixe à pleine mer, basse mer et mi-marée, et en surface et au fond de la colonne d'eau.