cometadata/datacite-rtg-text-other-reclassification-records huggingface dataset:
Additional file 1 of Independent and joint associations between the triglyceride-glucose index and NT-proBNP with the risk of adverse cardiovascular events in patients with diabetes and acute coronary syndrome: a prospective cohort study
Creators: name: Wang, Man
name: Zhou, Li
name: Su, Wen
name: Dang, Wenxi
name: Li, Hongwei
name: Chen, Hui
Publisher: name: figshare
Year: 2023
Subjects: subject: Medicine
subject: Chemical Sciences not elsewhere classified
subject: Immunology
subject: FOS: Clinical medicine
subject: Mathematical Sciences not elsewhere classified

description: Additional file 1: Figure S1. Flowchart of the participants selection. Figure S2. Standardized cumulative incidence curves for MACCEs by the TyG indexand NT-proBNPcategories in the fully adjusted model. Figure S3. Association between TyG index and NT-proBNP in men and women. Figure S4. Association between TyG index and NT-proBNP stratified by age subgroups. Figure S5. E-value for MACCEs according to the TyG index for the adjusted model. Figure S6. E-value for MACCEs according to NT-proBNP for the adjusted model. Table S1. Baseline and clinical characteristics by triglyceride-glucose index categories. Table S2. Estimated hazard ratios for all-cause mortality, non-fatal myocardial infarction, non-fatal stroke, and revascularization. Table S3. Estimated hazard ratios for MACCEs stratified by sex. Table S4. Estimated hazard ratios for MACCEs stratified by age subgroups. Table S5. Sensitivity analyses for the independent association of triglyceride-glucose index and NT-proBNP categories with incident MACCEs. Table S6. Sensitivity analysis 4 for the independent association of triglyceride-glucose index and NT-proBNP categories divided by the optimal cutoff value with incident MACCEs. Table S7. Sensitivity analyses for the joint association of triglyceride-glucose index and NT-proBNP categories with MACCEs risk in the fully adjusted model.
L'utilizzo di OpenStreetMap all'interno del Club Alpino Italiano
Creators: name: Delucchi, Luca
name: Gattai, Alfredo
name: Piccioli, Alessio
Publisher: name: Zenodo
Year: 2020
Subjects: OSM
volunteered geographic information
VGI
OpenStreetMap
CAI

description: La collaborazione tra il Club Alpino Italiano (CAI) e OpenStreetMap (OSM) è iniziata ufficialmente con la firma di una convenziona tra lo stesso CAI e Wikimedia Italia, il capitolo italiano della OSM Foundation, nel 2016. A tre anni da quella firma molto è stato fatto con un’impennata nell’ultimo anno anche grazie al finanziamento del CAI attraverso il Contratto per il servizio di implementazione dati nel sistema INFOMONT. Nella presentazione verranno illustrate le attività svolte: inserimento dati in OSM con la procedura utilizzata e la situazione regione per regione; sviluppo di un software rilasciato con una licenza FOSS in grado di ottenere i dati relativi al CAI da OSM e svolgere alcune operazioni di conversione e reportistica; attività di formazione.
description: luca.delucchi@fmach.it
Additional file 1 of Can facet joint block be a complementary or alternative therapeutic option for patients with osteoporotic vertebral fractures: a meta-analysis
Creators: name: Chen, Zhi
name: Song, Chenyang
name: Chen, Jianwen
name: Sun, Jun
name: Liu, Wenge
Publisher: name: figshare
Year: 2022
Subjects: subject: Space Science
subject: Medicine
subject: Biotechnology
subject: Evolutionary Biology
subject: FOS: Biological sciences
subject: Immunology
subject: FOS: Clinical medicine
subject: Biological Sciences not elsewhere classified

description: Additional file 1. The PRISMA checklist.
title: 02_1519
Creators: name: Wesley Baldwin, John
name: Baldwin, John W.
Publisher: name: NAKALA - https://nakala.fr (Huma-Num - CNRS)
publisherIdentifier: https://ror.org/04ces3204
publisherIdentifierScheme: ROR
Year: 2018
Subjects: subject: LaMOP
subject: Laboratoire de Médiévistique Occidentale de Paris

description: L'ensemble de ces notes ont été crée par John Baldwin lors d'une de ses premières périodes de résidence à Paris. Ces documents comprennent tous les magistri qu’il avait pu rencontrer dans ses sources. Aux XIIème et XIIIème siècles, les universités n'existant pas encore, le titre de magister s'il évoque certainement une compétence n'est pas rattaché de façon systématique au passage par les écoles. De surcroît, les magistris sont le plus souvent désignés par leur seul prénom. La lecture de ces données est donc difficile et suppose un long travail pour tenter d'identifier un individu auquel on pourrait rattacher plusieurs mentions. John Baldwin avait donc renoncé à utiliser ces données pour donner un prolongement à sa magnifique étude sur les gradués d'université et leur emploi par les Capétiens et les Plantagenêts. Néanmoins, il a conservé ces données et elles sont potentiellement très utile dans le cadre de Studium, comme le sont toutes les mentions dans les volumes des Fasti Ecclesiae Gallicanae de chanoines portant ce titre de magister sans autres précisions. L'ampleur des dépouillements rend ces données très utiles et nous devons une grande reconnaissance à John Baldwin pour avoir pris la peine de faire photocopier ses fiches et de nous les avoir transmises amicalement.
Les données ainsi que les images des fiches sont accessibles sur le site Internet à l'adresse suivante : http://studium-baldwin.lamop.fr/.
Les transcriptions des fiches ont été effectuées par des étudiants de Paris 1 Panthéon - Sorbonne mais elles n'ont pas été corrigées par la suite.
description: Relation: https://lamop.hypotheses.org/
title: Sommaire du numéro spécial 20 ans de recherches sur le sida
Creators: name: Leibowitch, Jacques
Publisher: name: NAKALA - https://nakala.fr (Huma-Num - CNRS)
publisherIdentifier: https://ror.org/04ces3204
publisherIdentifierScheme: ROR
Year: 2020

description: Extrait de Nature Medicine, vol. 9, 2003, no 7(juillet).
description: Source: http://www.calames.abes.fr/pub/ms/Calames-2019311113569665
description: created: start=2003-07;end=2003-10
La 'topografía de la memoria' y la 'memoria ejemplar'. Las marcas urbanas en recuerdo de Delfor Santos Soto en el Municipio de La Matanza.
Creators: name: Agostino, Hilda Noemí
name: Bertune Fatgala, Mirta Natalia
name: Artola, Analía Yael
Publisher: name: Zenodo
Year: 2013
Subjects: dictadura
desaparecidos
Argentina
La Matanza
historia local

description: En el siguiente trabajo proponemos realizar un estudio desde la memoria territorial, intentando reconocer aquellos lugares donde el terrorismo de Estado actuó. El Municipio de La Matanza, ubicado en la Provincia de Buenos Aires, al igual que el resto de la Argentina fue escenario del horror y la violencia sistemática. Tanto el espacio público como el privado fueron testigos mudos de la acción violenta ejercida sobre la población. Con el deseo de activar la memoria, en los últimos años distintos lugares significativos fueron ‘marcados’ por la intervención política y voluntaria. En esta presentación atenderemos a aquellas marcas urbanas realizadas para recordar a las víctimas en el territorio matancero, identificando sus formas y los procesos de producción. Enfatizaremos en un estudio de caso: las aparecidas en recuerdo del concejal y literato Delfor Santos Soto, detenido desaparecido el 21 de agosto de 1976 en la localidad de Ramos Mejía. Utilizaremos como fuentes primarias los libros publicados de su autoría, entrevistas realizadas a su esposa e hija, diarios de sesiones, y observaciones y relevamientos realizados sobre la geografía matancera para identificar las marcas en su nombre diseminadas en el espacio. ¿Por qué nos detenemos en un estudio de caso? Porque de esta manera podremos trabajar desde la categoría de ‘memoria ejemplar’. Nos situamos más allá del acontecimiento, no negando su singularidad, pero permitiéndonos usarlo como modelo para pensar y abordar otros.
description: https://www.flipsnack.com/7FC58F58B7A/xi-jornadas-regionales-de-investigacion-en-humanidades-y-ciencia.html?text=1
Additional file 1 of Reduction of SARS-CoV-2 intra-household child-to-parent transmission associated with ventilation: results from a case–control study
Creators: name: Galmiche, Simon
name: Charmet, Tiffany
name: Madec, Yoann
name: Rakover, Arthur
name: Schaeffer, Laura
name: Chény, Olivia
name: Omar, Faïza
name: Martin, Sophie
name: Mailles, Alexandra
name: Carrat, Fabrice
name: Fontanet, Arnaud
Publisher: name: figshare
Year: 2023
Subjects: subject: Medicine
subject: Biological Sciences not elsewhere classified
subject: Cancer
subject: Science Policy
subject: Infectious Diseases
subject: FOS: Health sciences
subject: Computational Biology

description: Additional file 1: Table S1. Index cases reporting household contamination from their child, both overall and restricted to the subpopulation of index cases with a partner participating in this study as a related control. Table S2. Sensitivity analysis including in the study population the households other than parental pairs exposed to the same infected child and exposures associated with the risk of SARS-CoV-2 infection.
APP antisense oligonucleotides reduce amyloid-β aggregation and rescue endolysosomal dysfunction in Alzheimer's disease.
Creators: name: Hung, Christy
name: Fertan, Emre
name: Livesey, Frederick J
name: Klenerman, David
name: Patani, Rickie
Publisher: name: The Francis Crick Institute
Year: 2024
Subjects: classificationCode: Stem Cells
subject: Stem Cells
classificationCode: Neurosciences
subject: Neurosciences
subject: FOS: Clinical medicine
classificationCode: Cell Biology
subject: Cell Biology

description: APP gene dosage is strongly associated with Alzheimer's disease (AD) pathogenesis. Genomic duplication of the APP locus leads to autosomal dominant early-onset AD. Individuals with Down syndrome (trisomy of chromosome 21) harbor 3 copies of the APP gene and invariably develop progressive AD with highly characteristic neuropathological features. Restoring expression of APP to the equivalent of that of two gene copies, or lower, is a rational therapeutic strategy, as it would restore physiological levels of neuronal APP protein without the potentially deleterious consequences of inadvertently inducing loss of APP function. Here we find that antisense oligonucleotides (ASOs) targeting APP are an effective approach to reduce APP protein levels and rescue endolysosome and autophagy dysfunction in APP duplication human induced pluripotent stem cell (hiPSC)-derived cortical neurons. Importantly, using ultrasensitive single-aggregate imaging techniques, we show that APP targeting ASOs significantly reduce both intracellular and extracellular Aβ-containing aggregates. Our results highlight the potential of APP ASOs as a therapeutic approach for forms of AD caused by duplication of the APP gene, including monogenic AD and AD related to Down syndrome.
progettoPRO Punti di Riferimento Open
Creators: name: Zonetti, Fabio
Publisher: name: Zenodo
Year: 2020
Subjects: QGIS Cloud
punti di riferimento
webgis

description: progettoPRO è un progetto per la raccolta e la condivisione delle coordinate di punti materializzati sul territorio e misurati con strumentazione GNSS in modalità RTK o FAST-STATIC o STATIC. La condivisione avviene tramite la piattaforma QGISCloud con licenza CC BY NC, pertanto tutti i dati contenuti nel webGIS devono essere liberi. Le informazioni (attributi) sono ricavabili direttamente sulla mappa web dedicata o tramite servizi OGC wms e wfs. L'obiettivo è quello di creare una maglia capillare di caposaldi liberi, senza alcun costo per l'utilizzatore. ProgettoPRO è anche una sorta di protesta riguardo gli oneri richiesti per le monografie dei punti geodetici IGM e catastali. ProgettoPRO è raggiungibile all'url http://progettopro.e42.it e i suoi confini sono limitati al territorio del comune di Roma, ma il progetto può essere copiato e attivato anche su altre realtà comunali.
 La partecipazione è aperta a tutti, purché le misurazioni avvengano con strumentazione professionale e si riferiscano a punti materializzati sul territorio. inoltre, è obbligatorio fornire il file rinex delle misurazioni perché dev'essere condiviso e scaricabile dalla piattaforma webgis. L'idea di progettoPRO è ispirata ad OSM che ha lo scopo di creare la mappa del mondo, progettoPRO vuole creare la maglia geodetica libera.
 Gli scopi principali di progettoPRO sono due:
 - essere una rete di appoggio per le misurazioni topografiche tradizionali (stazione totale) al fine di georeferenziare misure che hanno coordinate locali, fornendo un valido aiuto a chi non possiede una strumentazione GNSS;
 - creare una rete di raffittimento tramite misure topografiche appoggiate ai punti GNSS, al fine di ottenere una maglia di caposaldi in zone di canyon urbani o zone di forte copertura dovuta dagli alberi, le quali sarebbero da ostacolo alle misurazioni GNSS.
description: info@e42.it
HASHAROTLARNING AGROBIOSENOZDAGI O'RNI VA UYGUNLASHGAN HIMOYA QILISH.
Creators: name: Nishonov, Norjigit
name: Jurayev, Baxriddin
Publisher: name: Zenodo
Year: 2024

description: Ushbu Maqolada Hasharotlarning Agrobiosenozdagi, Oziq Ovqat Xavfsizligini Ta’minlashdagi Hamda Tuproq Hosil Boʻlish Jarayonidagi Hamda O’simliklarni Uyg‘Unlashgan Himoya Qilishni Axamiyati Haqida Yozilgan.
Segmentazione liscia a tratti e calibrazione radiometrica per la ricostruzione di immagini satellitari
Creators: name: Vitti, Alfonso
name: Case, Nicola
Publisher: name: Zenodo
Year: 2020
Subjects: immagini satellitari
ricostruzione di immagini
segmentazione di immagini
Landsat 7

description: La disponibilità di immagini ottiche acquisite da satellite è alla base dello sviluppo di attività di ricerca e applicazione in numerose discipline. L’evoluzione tecnologica permette di acquisire dati con sempre maggiori risoluzioni spettrali, radiometriche, spaziali e temporali. Per vari motivi, le immagini possono essere affette da disturbi o alterazioni radiometriche e da parziali mancanze di dati. Esistono diverse strategie per la correzione e la ricostruzione di dati mancanti. In questo lavoro si presenta una soluzione originale al problema della ricostruzione. La soluzione individuata si basa sulla disponibilità di immagini satellitari non alterate, sulla applicazione di un modello variazionale per ottenere una segmentazione liscia a tratti di immagini alterate e non, e su due strategie alternative per la calibrazione radiometrica della ricostruzione. Il modello variazionale si basa sul funzionale di Mumford-Shah per ottenere una segmentazione di una immagine che contemporaneamente rispetti le discontinuità radiometriche e rimuova una componente di rumore dei dati. Questa elaborazione viene condotta su immagini non alterate (base) e su immagini danneggiate (obiettivo). La geometria delle discontinuità individuate dalla elaborazione di immagini base viene utilizzata per vincolare la ricostruzione delle immagini obiettivo. In una immagine obiettivo, le porzioni corrotte vincolate con le discontinuità individuate nella immagine base vengono ricostruite effettuando una calibrazione radiometrica. Si sono individuate e testate due strategie di calibrazione alternative basate entrambe su statistiche di base delle distribuzioni dei valori radiometrici in aree non danneggiate comuni a immagine base e obiettivo. La ricostruzione è stata validata su immagini danneggiate sinteticamente così da valutare le prestazioni massime raggiungibili. La ricostruzione è stata applicata a set di immagini Landsat 7 affette dalle caratteristiche bande senza dati prodotte dal malfunzionamento dello Scan Line Corrector (SLC). Gli sviluppi della soluzione proposta riguardano in particolare l’estensione delle statistiche utilizzate nella fase di calibrazione radiometrica e la ricostruzione di immagini elaborate con algoritmi per la identificazione automatica di nuvole, e.g. FMASK.
description: alfonso.vitti@unitn.it
Additional file 1 of Engineering a triple-functional magnetic gel driving mutually-synergistic mild hyperthermia-starvation therapy for osteosarcoma treatment and augmented bone regeneration
Creators: name: Yu, Kexiao
name: Zhou, Hang
name: Xu, Yamei
name: Cao, Youde
name: Zheng, Yuanyi
name: Liang, Bing
Publisher: name: figshare
Year: 2023
Subjects: subject: Biochemistry
subject: Medicine
subject: Genetics
subject: FOS: Biological sciences
subject: Cancer

description: Supplementary Material 1
Grafici interattivi e dinamici, un esempio di successo di crowdfunding
Creators: name: Ghetta, Matteo
name: Cavallini, Paolo
Publisher: name: Zenodo
Year: 2020
Subjects: QGIS
DataPlotly
dataviz
python
plugin

description: ll plugin DataPlotly è nato da una semplice idea personale ed è stato pubblicato per la prima volta nel 2017 per la futura versione di QGIS 3 (ancora in fase di sviluppo). Ad oggi è stato scaricato da oltre 40.000 utenti. DataPlotly permette di colmare una lacuna di QGIS: creare facilmente dei grafici dinamici e interattivi con pochi comandi e con una interfaccia user friendly. Tutto è reso possibile dalla libreria open source javascript plotly che offre la possibilità di scrivere la sintassi dei grafici anche in altri linguaggi di programmazione, fra cui Python. La crescita degli utenti di DataPlotly ha portato all’idea di estendere le sue funzionalità e di permettere all’utente di creare dei grafici nel compositore di stampe di QGIS con la funzionalità atlante compresa. Dato l’alto investimento delle ore di lavoro è stato deciso di lanciare un crowdfunding (marzo 2019) congiunto fra Faunalia e North Road. Grazie al successo del crowdfunding è stato quindi possibile estendere le funzionalità del plugin (refactoring del codice, test automatici, compositore di stampe, atlante, salvataggio impostazioni del grafico) e aumentare le potenzialità di data visualization di QGIS.
description: matteo.ghetta@gmail.com
D1.4 Lightweight materials selection
Creators: name: International Center for Numerical Methods in Engineering
name: Jiménez Reyes, Sergio
Publisher: name: Zenodo
Year: 2024

description: D1.4 is produced in the context of WP1. The characterization information for the different materials is gathered in this deliverable. The document contains a solid database based on the results obtained from each test such as tensile test, fatigue, fracture toughness, hole expansion ratio and degradation tests. A material selection criterion is defined based on eco-design, critical raw materials and material performance required for EVs.
Geeco: GEoEditor Configurabile
Creators: name: Capitani, Simone
Publisher: name: Zenodo
Year: 2020
Subjects: editing GIS
QGIS
open source

description: Geeco è una soluzione configurabile per l’editing di dati geografici via web costruita con tecnologie open source. È completamente agnostica rispetto ai contesti di utilizzo e permette di integrare, in una logica a plugin, ulteriori funzionalità. Le configurazioni possibili, effettuate mediante un plugin per QGIS, includono: la vestizione grafica del visualizzatore, il contesto geografico di lavoro, il salvataggio dei dati centralizzato o verticale, la validazione topologica centralizzata e/o verticale, e molto altro. Verranno presentati architettura ed alcuni casi d’utilizzo reale.
description: simone.capitani@csi.it
D1.2 Eco-design of Fatigue4Light materials
Creators: name: International Center for Numerical Methods in Engineering
name: Jiménez Reyes, Sergio
name: RISE Research Institutes of Sweden
Publisher: name: Zenodo
Year: 2024

description: In this report, the methodological framework that supports the integrated eco-design of electrical vehicle components is applied. Aspects that present a potential critical environmental performance are identified as hotspots. Eco-design strategies and specific actions are recognized towards the reduction of these potential environmental results. Strategies and actions are studied for each of the life cycle stages: Production (raw material extraction, manufacturing and assembly); Use (energy consumption, driving cycle); and End-of-life (final waste management). Compiling the results from a dedicated webinar including an analytic hierarchy process, a ranking of the more significant and suitable actions for the eco-design of electrical vehicle components is presented.
Red and processed meat intakes and cardiovascular disease and type 2 diabetes mellitus: An umbrella systematic review and assessment of causal relations using Bradford Hill’s criteria
Creators: name: Hill, Erica R.
name: O’Connor, Lauren E.
name: Wang, Yu
name: Clark, Caroline M.
name: McGowan, Bethany S.
name: Forman, Michele R.
name: Campbell, Wayne W.
Publisher: name: Taylor & Francis
Year: 2022
Subjects: subject: Biophysics
subject: Medicine
subject: Molecular Biology
subject: Neuroscience
subject: Sociology
subject: FOS: Sociology
subject: Immunology
subject: FOS: Clinical medicine
subject: Mathematical Sciences not elsewhere classified
subject: Cancer
subject: Science Policy
subject: Infectious Diseases
subject: FOS: Health sciences

description: Observational research suggests higher red and processed meat intakes predict greater risks of developing or dying from cardiovascular diseases (CVD) and type 2 diabetes mellitus (T2DM), but this research limits causal inference. This systematic review of reviews utilizes both observational and experimental research findings to infer causality of these relations. Reviews from four databases were screened by two researchers. Reviews included unprocessed red meat (URM), processed meat (PM), or mixed URM + PM intake, and reported CVD or T2DM outcomes. Twenty-nine reviews were included, and causality was inferred using Bradford Hill’s Criteria. Observational assessments of CVD outcomes and all meat types consistently reported weak associations while, T2DM outcomes and PM and Mixed URM + PM assessments consistently reported strong associations. Experimental assessments of Mixed URM + PM on CVD and T2DM risk factors were predominately not significant which lacked coherence with observational findings. For all meat types and outcomes, temporality and plausible mechanisms were established, but specificity and analogous relationships do not support causality. Evidence was insufficient for URM and T2DM. More experimental research is needed to strengthen these inferences. These results suggest that red and processed meat intakes are not likely causally related to CVD but there is potential for a causal relationship with T2DM.
THE REFLECTION OF NATIONAL-CULTURAL LEXICON IN ABDULLA QAKHHOR'S WORKS
Creators: name: Djalilova, Umida
Publisher: name: Zenodo
Year: 2024

description: The article describes the rich lexical units of Uzbek language and the specific features of the national-cultural lexicon in the works of A. Qakhhor. Examples from the story "Tales from the Past" are also analyzed.
Total dietary flavonoid intake and risk of cardiometabolic diseases: A dose-response meta-analysis of prospective cohort studies
Creators: name: Li, Tianze
name: Zhao, Yang
name: Yuan, Lijun
name: Zhang, Dongdong
name: Feng, Yifei
name: Hu, Huifang
name: Hu, Dongsheng
name: Liu, Jiaye
Publisher: name: Taylor & Francis
Year: 2022
Subjects: subject: Medicine
subject: Biotechnology
subject: Chemical Sciences not elsewhere classified
subject: Immunology
subject: FOS: Clinical medicine
subject: Cancer
subject: Science Policy

description: Several epidemiological studies have suggested that flavonoid intake is associated with a decreased risk of cardiometabolic disease. However, the results remained inconsistent and there is no dose-response meta-analysis for specific outcomes. We conducted a meta-analysis to synthesize the knowledge about their associations and to explore their dose-response relationships. We comprehensively searched the PubMed, Embase, and Web of Science databases for prospective cohort studies published up to December 1, 2021. Summary relative risks (RR) and 95% confidence intervals (CI) were pooled for the association between flavonoid intake and cardiometabolic disease. Evaluations of linear or nonlinear dose-response were presented by restricted cubic splines. We identified 47 articles, including 1,346 676 participants and 127,507 cases in this meta-analysis. The summary of RR per 500 mg/d increase in flavonoid intake was 0.93 (95% CI 0.88–0.98) for cardiovascular disease, 0.89 (95% CI 0.84–0.94) for diabetes, and 0.97 (95% CI 0.94–0.99) for hypertension, respectively. We also found a linearity dose-response association between total flavonoid intake and cardiovascular disease (p nonlinearity = 0.541), and diabetes (p nonlinearity = 0.077). Our finding based on quantitative data suggested that a higher level of flavonoid intake is beneficial for the prevention of cardiometabolic diseases.
Additional file 1 of Transcriptome-scale spatial gene expression in rat arcuate nucleus during puberty
Creators: name: Zhou, Shasha
name: Zang, Shaolian
name: Hu, Yanping
name: Shen, Yifen
name: Li, Hua
name: Chen, Wenlian
name: Li, Pin
name: Shen, Yihang
Publisher: name: figshare
Year: 2022
Subjects: subject: Genetics
subject: FOS: Biological sciences

description: Additional file 1: Figure S1. H&E staining of ovaries in PND-25, 35 and 45. The solid circular substances indicate corpus luteum. “*” and “**” represent the p-value less than 0.05 and 0.01 adjusted by Student’s t-test. Figure S2. Quality control of spatial transcriptomics sequencing. Figure S3. Top 10 highly-expressed genes in 14 clusters shown by violin plots. Refer to Fig. 2 for the name of 14 clusters. Figure S4. Different cell types shown by feature plots across PND-25, 35 and 45. Figure S5. Expression of Kiss1, Tac3, Pdyn and Slc18a3 shown by feature plots across PND-25, 35 and 45. Figure S6. The top 10 highly-expressed gene of Cluster 9 shown by violin plots in all 14 clusters. Figure S7. The tSNE plot showing the cells are classified into 4 subclusters based on the transcriptomes of overall gene expression relationship among the 1,787 spots of VMH (left). Feature plots showing the distribution of clusters in PND-25, 35 and 45 (right). Different cell clusters are color-coded. Figure S8. The dynamics of spots based on the gene expression profiles along the pseudo-timeline shown by feature plots. Figure S9. The proportion of different cell types in ARC of PND-25, 35 and 45 shown by feature plots.
Impact of Neural Network Architecture on Generalization and Regularization.pdf
Creators: name: Muaz, Zohaib
Publisher: name: figshare
Year: 2025
Subjects: classificationCode: 461199
subject: Machine learning not elsewhere classified
classificationCode: 461101
subject: Adversarial machine learning
classificationCode: 461103
subject: Deep learning
classificationCode: 460299
subject: Artificial intelligence not elsewhere classified
classificationCode: 460304
subject: Computer vision
classificationCode: 460399
subject: Computer vision and multimedia computation not elsewhere classified

description: This paper investigates the impact of increasing the depth and width of convolutional neural networks (CNNs) on their generalization performance across image classification tasks. Experiments were conducted using PyTorch on two datasets of varying complexity: MNIST (simple) and CIFAR-10 (complex). A variety of CNN architectures were trained with different depths and widths, and regularization techniques including dropout and L2 weight decay were applied to analyze their effects on overfitting. Results indicate that shallow networks are sufficient for achieving high accuracy on MNIST, while deeper or wider networks yield significant performance gains on CIFAR-10. However, high-capacity models are more prone to overfitting without appropriate regularization. Techniques such as dropout and L2 regularization were found to consistently improve generalization, particularly in deeper architectures. These findings underscore the importance of balancing model complexity and regularization, especially when dealing with datasets of differing size and variability.
Nitrate, nitrite and nitrosamines in the global food supply
Creators: name: McMahon, Nicholas F.
name: Brooker, Paige G.
name: Pavey, Toby G.
name: Leveritt, Michael D.
Publisher: name: Taylor & Francis
Year: 2024
Subjects: subject: Biochemistry
subject: Environmental Sciences not elsewhere classified
subject: Chemical Sciences not elsewhere classified
subject: Ecology
subject: FOS: Biological sciences
subject: Biological Sciences not elsewhere classified
subject: Science Policy
subject: Plant Biology

description: Inorganic nitrate provided by either nitrate salts or food supplements may improve cardiometabolic health. However, current methods to assess dietary nitrate, nitrite and nitrosamine consumption are inadequate. The purpose of this study was to develop a reference database to estimate the levels of nitrate, nitrite and nitrosamines in the global food supply. A systematic literature search was undertaken; of the 5,747 articles screened, 448 met the inclusion criteria. The final database included data for 1,980 food and beverages from 65 different countries. There were 5,105 unique records for nitrate, 2,707 for nitrite, and 954 for nitrosamine. For ease of use, data were sorted into 12 categories; regarding nitrate and nitrite concentrations in food and beverages, ‘vegetables and herbs’ were most reported in the literature (n = 3,268 and n = 1,200, respectively). For nitrosamines, ‘protein foods of animal origin’ were most reported (n = 398 records). This database will allow researchers and practitioners to confidently estimate dietary intake of nitrate, nitrite and nitrosamines. When paired with health data, our database can be used to investigate associations between nitrate intake and health outcomes, and/or exercise performance and could support the development of key dietary nitrate intake guidelines.
Il nuovo plugin CDU Creator per la compilazione dei Certificati di Destinazione Urbanistica
Creators: name: Fagandini, Roberta
name: Marzocchi, Roberto
Publisher: name: Zenodo
Year: 2020
Subjects: CDU
Catasto
Terreni
Urbanistica

description: Il Plugin QGIS CDU Creator nasce dall’esigenza di avere uno strumento, semplice, veloce e gratuito per la compilazione dei Certificati di Destinazione Urbanistica. Questa esigenza, che accomuna la maggior parte dei Comuni Italiani, viene ancora oggi gestita con soluzioni “manuali” che non garantiscono né una grande precisione nel risultato né la sua ripetibilità. Esistono diverse soluzioni online, dai portali che gestiscono la richiesta per l’utente con costi piuttosto elevati e lunghi tempi di attesa, ai portali che consentono agli utenti accreditati del comune di compilare il CDU. Questi ultimi generano automaticamente il CDU, ma non è chiaro come venga gestito l’aggiornamento dei dati sia catastali che urbanistici e i ben noti problemi di georeferenziazione del catasto. Il Plugin CDU Creator non risolve questi problemi, né gestisce l’aggiornamento automatico dei dati catastali ma, unito alle tante funzioni di QGIS disponibili, permette all’utente di compilare il proprio CDU in modo semplice, veloce e personalizzato. Essendo un plugin di QGIS infatti, l’utente ha la possibilità di gestire i propri dati, sia urbanistici che catastali, con un unico strumento GIS Desktop, può apportare modifiche sia geometriche che alfanumeriche, gestire in modo più preciso e corretto eventuali traslazioni dei dati catastali, avvalersi di altri plugin per scaricare gli aggiornamenti dei dati catastali e, sempre all’interno di QGIS, compilare il CDU servendosi del Plugin. Queste operazioni, che possono garantire un risultato più preciso e soprattutto ripetibile, sono difficilmente disponibili nelle soluzioni online e consentono ai tecnici delle pubbliche amministrazioni un maggior controllo sui loro dati territoriali. Infatti, l’utente può organizzare i propri dati non solo a livello tematico ma inserendo anche tutte le informazioni che devono comparire sul CDU come, ad esempio nel caso dei dati urbanistici, i vari riferimenti alla normativa vigente, i testi dei singoli articoli o con una semplice sintassi html, anche link a pagine web, ecc. Non meno importante, è la possibilità di personalizzare il proprio CDU aggiungendo non solo loghi, nome del comune, titoli ma anche tutte le diciture necessarie a rendere il documento finale valido per i propri scopi. Inoltre è possibile anche inserire tutte le informazioni sulla richiesta (numero di protocollo, nominativo richiedente, ecc.) e, qualora fossero necessarie ulteriori personalizzazioni, il plugin permette di salvare il CDU in formato testo modificabile (.odt). Sarà sufficiente quindi aprire il file e apportare le modifiche necessarie.
description: roberta.fagandini@gter.it
Stima della batimetria costiera con Machine Learning e immagini satellitari
Creators: name: Pirotti, Francesco
name: Tonion, Filippo
Publisher: name: Zenodo
Year: 2020
Subjects: Batimetria
Regressione
Machine learning
Intelligenza artificiale
R-cran
Random Forest

description: Le misure di batimetria vengono solitamente fatte mediante sonar che misura la profondità lungo la traiettoria di spostamento dell'imbarcazione dove è montato il sensore. Tecnologie recenti, e.g. multi-beam, prendono un ventaglio di misure in senso ortogonale a questa direzione, acquisendo quindi un corridoio più o meno largo di misure. E' possibile sfruttare i valori di assorbanza della luce, che differiscono in funzione della lunghezza d'onda della stessa, e delle caratteristiche del mezzo che attraversa, per stimare valori di profondità. I metodi possono essere empirici o basati su modelli fisici. Vengono qui presentati i risultati dell'applicazione di due metodi di machine learning per stimare la profondità lungo costa, usando immagini satellitari e combinazioni di bande da esse derivate: 1) Il metodo Random Forest (RF) 2) Il metodo Support Vector Machine (SVM). I risultati forniscono valori di errore quadratico medio (RMSE) di 0.228 m e 0.409 m rispettivamente per questi due metodi. Circa 12000 misure di profondità eseguite su transetti mediante sonar sono state utilizzate per le operazioni di training e validazione. L'autocorrelazione spaziale è stata minimizzata usando misure per la validazione. Tutte le operazioni sono state fatte usando funzioni implementate tramite librerie in R-CRAN.
description: francesco.pirotti@unipd.it
Additional file 2 of Association of Ureaplasma infection pattern and azithromycin treatment effect with bronchopulmonary dysplasia in Ureaplasma positive infants: a cohort study
Creators: name: Chen, Xueyu
name: Huang, Xuemei
name: Lin, Yanqing
name: Lin, Bingchun
name: Yang, Chunyu
name: Huang, Zhifeng
name: Yang, Chuanzhong
Publisher: name: figshare
Year: 2023
Subjects: subject: Medicine
subject: Cell Biology
subject: Physiology
subject: FOS: Biological sciences
subject: Biotechnology
subject: Sociology
subject: FOS: Sociology
subject: Immunology
subject: FOS: Clinical medicine
subject: Cancer
subject: Science Policy
subject: Infectious Diseases
subject: FOS: Health sciences

description: Additional file 2: Supplemental Table 1. Clinical characteristics stratified by BPD status.
Multiplexor de 2 entradas - Circuitos combinacionales
Creators: name: Machado, Felipe
Publisher: name: Zenodo
Year: 2020
Subjects: Electrónica Digital
Bloques combinacionales
Puertas lógicas

description: Presentación de clase del multiplexor de dos entradas. Video de la presentación disponible: https://youtu.be/LElFYHnz1Ls
L'opensource per la mappatura delle aree verdi universitarie: il progetto UniTreePD tra QField, QGIS e Geonode
Creators: name: Codato, Daniele
name: Rosina, Giacomo
name: Peroni, Francesca
name: De Marchi, Massimo
Publisher: name: Zenodo
Year: 2020
Subjects: QField
QGIS
GEONODE
Sostenibilità Verde
Università

description: Gli obiettivi di sviluppo sostenibile (SDG) al 2030 dell’Organizzazione delle Nazioni Unite, in particolare le azioni per contrastare il cambiamento climatico, promuovere la sostenibilità ambientale e sociale e l’efficienza energetica, l’importanza del contesto internazionale in questo ambizioso programma, conducono molte università a realizzare studi sulla propria impronta ecologica (o carbonica), mettendo in campo possibili meccanismi di mitigazione e compensazione ecologica ed economica. L’Università di Padova (UNIPD) è da sempre attenta a questi temi e a trovare soluzioni per incrementare la propria sostenibilità, priorità menzionate nello statuto universitario e che trovano applicazione anche con l’adesione all’Higher Education Sustainability Initiative e al ranking internazionale GreenMetric. Per proseguire su questa strada, è importante che l’Università di Padova, assieme agli altri atenei ed in un’ottica internazionale, incrementi e consolidi la ricerca applicata e si doti di strumenti per definire meglio le proprie pressioni sull’ambiente e gli ecosistemi, elaborando soluzioni con migliori performance ambientali. Tra le iniziative messe in campo da UNIPD, nel 2019 è stato dato avvio al progetto di ricerca UniTreePD che mira a mappare e quantificare il verde universitario erbaceo e arboreo/arbustivo e alcuni servizi ecosistemici da esso forniti, attraverso strumenti di GIS-RS e di GIS partecipativo. Le attività principali consistono nella definizione spaziale delle aree universitarie, la mappatura e quantificazione del verde presente attraverso l’analisi delle ortofoto fornite dalla regione Veneto e l’uso di indici vegetazionali, la mappatura partecipata, attraverso geo-app opensource, del verde arboreo di due aree campione, la quantificazione biofisica e socio-economica di alcuni servizi ecosistemici quale lo stoccaggio e sequestro di carbonio e la costruzione di un geodatabase e webGIS di progetto in ambiente opensource. Il presente contributo vuole evidenziare le possibilità date dall’opensource in questo tipo di ricerche geografiche in ambito universitario, per raccogliere, elaborare, gestire e condividere dati spaziali, in questo caso relativi alle aree verdi. In particolare verrà presentata la fase di creazione del progetto e la raccolta dati sulle essenze arboree e arbustive nelle aree del complesso Vallisneri e del campus Agripolis, utilizzando l’app QField assieme ad altri strumenti e app proprie della Citizen Science, quali PlantNet per la determinazione tassonomica delle piante. Verranno inoltre presentati i principali risultati ottenuti dall’elaborazione dei dati raccolti con il software QGIS 3.x e la loro condivisione via web utilizzando la piattaforma Geonode.
description: danielcod@hotmail.it
Additional file 2 of Genome-wide analysis of circular RNAs and validation of hsa_circ_0086354 as a promising biomarker for early diagnosis of cerebral palsy
Creators: name: Hu, Yuanyuan
name: Bian, Xuzhao
name: Wu, Chao
name: Wang, Yan
name: Wu, Yang
name: Gu, Xiaoqin
name: Zhuo, Suyan
name: Sun, Shiquan
Publisher: name: figshare
Year: 2022
Subjects: subject: Biophysics
subject: Biochemistry
subject: Space Science
subject: Medicine
subject: Cell Biology
subject: Genetics
subject: FOS: Biological sciences
subject: Molecular Biology
subject: Neuroscience
subject: Chemical Sciences not elsewhere classified
subject: Biological Sciences not elsewhere classified
subject: Mental Health

description: Additional file 2: Fig. S1. Top 30 of biological_process, cellular_component and molecular_function obtained using Gene Ontology enrichment. Plot size refers to gene number.
Additional file 1 of GABAergic neurons differentiated from BDNF- and Dlx2-modified neural stem cells restore disrupted neural circuits in brainstem stroke
Creators: name: Tang, Xiangyue
name: Wu, Li
name: Zhu, Juehua
name: Xu, Mindong
name: Li, Shaojun
name: Zeng, Guanfeng
name: Zhu, Shuanggen
name: Jiang, Yongjun
Publisher: name: figshare
Year: 2023
Subjects: subject: Biochemistry
subject: Cell Biology
subject: Genetics
subject: FOS: Biological sciences
subject: Neuroscience
subject: Physiology
subject: Pharmacology
subject: Biotechnology
subject: Developmental Biology

description: Additional file 1: Table S2. Primer sequences.
Additional file 2 of GABAergic neurons differentiated from BDNF- and Dlx2-modified neural stem cells restore disrupted neural circuits in brainstem stroke
Creators: name: Tang, Xiangyue
name: Wu, Li
name: Zhu, Juehua
name: Xu, Mindong
name: Li, Shaojun
name: Zeng, Guanfeng
name: Zhu, Shuanggen
name: Jiang, Yongjun
Publisher: name: figshare
Year: 2023
Subjects: subject: Biochemistry
subject: Cell Biology
subject: Genetics
subject: FOS: Biological sciences
subject: Neuroscience
subject: Physiology
subject: Pharmacology
subject: Biotechnology
subject: Developmental Biology

description: Additional file 2: Table S1. Primary and secondary antibodies.
Building our Open Access Future: Empowering libraries to find solutions to sustaining community-led open infrastructures
Creators: name: Ball, Joanna
name: Tatham, Suzanne
Publisher: name: Zenodo
Year: 2024
Subjects: open research
open infrastructure
sustainable funding
community-led

description: Libraries play a crucial role in sustaining community-led open infrastructure. Through the SCOSS initiative alone, 340 libraries and institutions worldwide have pledged nearly €6m to support open scholarly infrastructure. As an example of global scholarly infrastructure, the Directory of Open Access Journals (DOAJ) derives the majority of its income from the library community and in 2022, 350 European libraries in 20 countries supported DOAJ through its supporter model. Libraries are also involved in supporting and developing infrastructures within their own universities and communities to support open research.

Although many libraries want to support community-led open infrastructures, they face many challenges. These can include competing demands on over-stretched budgets, lack of alignment with institutional priorities, restrictive procurement policies of their parent institutions, and restrictions on the use of budgets to purchase only services or content. This creates problems for libraries wanting to demonstrate their commitment and support for open access, and for the infrastructures needed to sustain their service.

We will also explore the challenges faced by community-led open infrastructures in sustaining financially viable business models and we will argue that libraries need to understand these models so that they can make informed decisions about how they support essential open infrastructures. Alongside funders, publishers and our academic colleagues, libraries have a key role to play in shaping the future of a more open scholarly landscape. Supporting open infrastructures is an area where we can have a big impact.

This presentation will explore some of the innovative strategies both open infrastructure initiatives and libraries can use to overcome barriers to supporting open infrastructure. We will discuss how you can influence institutional decision-making and strategy; how you can advocate for open infrastructures; how you can rethink your library budget based on your values and how you can look for ways to innovate in this space.

The session aims to inspire and empower attendees to find creative and sustainable solutions to supporting open infrastructure that will fit their own local context. We will argue that there is a need for a new kind of relationship between libraries and community infrastructures that moves away from the traditional supplier-customer and towards a collaborative relationship exploiting the synergies and values shared by both.
Additional file 1 of Transcriptionally regulated miR-26a-5p may act as BRCAness in Triple-Negative Breast Cancer
Creators: name: Zhang, Yue
name: Lv, Lianqiu
name: Zheng, Renjing
name: Xie, Rong
name: Yu, Yuanhang
name: Liao, Han
name: Chen, Jianying
name: Zhang, Bo
Publisher: name: figshare
Year: 2023
Subjects: subject: Biophysics
subject: Biochemistry
subject: Cell Biology
subject: Genetics
subject: FOS: Biological sciences
subject: Molecular Biology
subject: Pharmacology
subject: Chemical Sciences not elsewhere classified
subject: Biological Sciences not elsewhere classified
subject: Cancer

description: Additional file 1: Figure S1 Hormone stimulation assay in T47D cells.A After hormone deprivation for 48 h, T47D cells were stimulated with β-Estradiol. RT-qPCR was used to monitor the expression of miR-26a-5p in different concentration or at different time points. B After hormone deprivation for 48 h, T47D cells were stimulated with Etonogestrel. RT-qPCR was used to monitor the expression of miR-26a-5p in different concentration or at different time points. **P < 0.01, ***P < 0.001, ****P < 0.0001 versus control. N.S. not significant. n = 3.
Dieci anni di FOSS4G in Arpa Piemonte
Creators: name: Pispico, Rocco
name: Lanteri, Luca
Publisher: name: Zenodo
Year: 2020
Subjects: Open Source
Banche dati geografiche
Diffusione

description: A partire dal 2009 sono state utilizzate molte tecnologie FOSS4G per la realizzazione di basi dati e strumenti per la raccolta e l’analisi dei dati con componente spaziale. Dalla progressiva migrazione delle banche dati geologiche alla realizzazione di strumenti condivisi tra enti, dall’utilizzo nei contesti in tempo reale agli strumenti di rilevamento su terreno. Una panoramica critica delle esperienze realizzate che dimostrano che l’adozione di strumenti Open Source permettono di ampliare le potenzialità di utilizzo, di standardizzazione, e diffusione dei dati tra enti e professionalità.
description: rocco.pispico@arpa.piemonte.it
Additional file 1 of Molecular structures and functional exploration of NDA family genes respond tolerant to alkaline stress in Gossypium hirsutum L.
Creators: name: Fan, Yapeng
name: Zhang, Yuexin
name: Rui, Cun
name: Zhang, Hong
name: Xu, Nan
name: Wang, Jing
name: Han, Mingge
name: Lu, Xuke
name: Chen, Xiugui
name: Wang, Delong
name: Wang, Shuai
name: Guo, Lixue
name: Zhao, Lanjie
name: Huang, Hui
name: Wang, Junjuan
name: Sun, Liangqing
name: Chen, Chao
name: Ye, Wuwei
Publisher: name: figshare
Year: 2022
Subjects: subject: Genetics
subject: FOS: Biological sciences

description: Additional file 1: Table S1. Primer pairs used for qRT-PCR.
Additional file 10 of Unfractionated heparin improves the clinical efficacy in adult sepsis patients: a systematic review and meta-analysis
Creators: name: Fu, Sifeng
name: Yu, Sihan
name: Wang, Liang
name: Ma, Xiaochun
name: Li, Xu
Publisher: name: figshare
Year: 2022
Subjects: Space Science
Medicine
Chemical Sciences not elsewhere classified
Science Policy
Hematology

description: Additional file 10 : Table S2. Excluded literature information.