Ο ρόλος του ογκοκατασταλτικού γονιδίου cyld στην αστάθεια μικροδορυφορικών δεικτών
Creators: name: Βαλέτα, Μαρίνα Αθανασίου
Publisher: name: Aristotle University of Thessaloniki
Year: 2020
Subjects: Ογκοκατασταλτικό γονίδιο cyld
Μικροδορυφορική αστάθεια
Επαναλαμβανόμενες αλληλουχίες STRs
Tumor suppressor gene cyld
Microsatellite Instability
Short tandem repeats (STRs)

description: H καταστολή της έκφρασης της πρωτεΐνης CYLD, μέσω της μειορρύθμισης του mRNAή της παντελούς αποσιώπησης του γονιδίου της, έχει συσχετισθεί με την ανάπτυξη ποικίλων τύπων καρκίνου, μέσω διάφορων μηχανισμών. Παράλληλα, έχει δειχθεί η αλληλεπίδραση της CYLD με τις πρωτεΐνες PMS1 καιPMS2 του συστήματος επιδιόρθωσης αταίριαστου ζεύγους νουκλεοτιδίων DNA(MMR), υποδεικνύοντας τον ενδεχόμενο ρόλο της CYLD στο σύστημα αυτό και στην πρόκληση μικροδορυφορικής αστάθειας. Στο πλαίσιο αυτό, διερευνήθηκε η επίδραση της αποσιώπησης του γονιδίου Cyld στη μικροδορυφορική αστάθεια στον καρκίνο του παχέος εντέρου και στον καρκίνο του μαστού. Για την εξυπηρέτηση του συγκεκριμένου σκοπού, ελέγχθηκε και συγκρίθηκε η ύπαρξη μικροδορυφορικής αστάθειας σε 5 διαφορετικούς μικροδορυφορικούς τόπους (mbat26, mbat59, mbat67, D7Mit91 και D1Mit79) σε όγκους του μαστού και του παχέος εντέρου ποντικών, μεταξύ ποντικών όπου είχε αποσιωπηθεί το γονίδιο Cyld και ποντικών αγρίου τύπου. Οι μέθοδοι που αξιοποιήθηκαν για τη μελέτη των μικροδορυφορικών αυτών τόπων ήταν η αλυσιδωτή αντίδραση πολυμεράσης και η τριχοειδής ηλεκτροφόρηση σε αναλυτή DNA τύπου ABI 3730, ενώ η ανάλυση των δειγμάτων πραγματοποιήθηκε με τη βοήθεια του εργαλείου “Microsatellite Analysis” του λογισμικού “Applied Biosystems Analysis Module Variant Analysis (VA)” που φιλοξενείται στο περιβάλλον της ThermoFisher Cloud. Τα αποτελέσματα της συγκεκριμένης έρευνας έδειξαν πως η έλλειψη της CYLD δεν οδηγεί σε αυξημένα επίπεδα μικροδορυφορικής αστάθεια στους τόπους που εξετάστηκαν. Ωστόσο, τα ευρήματα αυτά δεν αποκλείουν τη συμμετοχή της CYLD στο σύστημα MMR και στην πρόκληση μικροδορυφορικής αστάθειας σε άλλους τόπους
description: Suppression of CYLD expression through mRNA downregulation or complete gene inactivation has been associated with the development of various types of cancer through the deregulation of different mechanisms. At the same time, it has been shown that CYLD can interact with the PMS1 and PMS2 proteins of the DNA mismatch repair system (MMR), indicating the possible role of CYLD in this system and the induction of microsatellite instability. In this context, the effect of Cyld gene silencing on microsatellite instability in colorectal cancer and breast cancer was investigated. In order to achieve this goal, the existence of microsatellite instability in 5 different microsatellite loci (mbat26, mbat59, mbat67, D7Mit91 and D1Mit79) in breast and colon tumors of mice was tested and compared between wild type mice and mice in which the Cyld gene was inactivated. The methods used to study these microsatellite loci were the polymerase chain reaction and the capillary electrophoresis on an ABI 3730 type DNA analyzer, while the analysis of the samples was performed with the "Microsatellite Analysis" software of Applied Biosystems Analysis Module Variant Analysis (VA) hosted in the Thermo Fisher Cloud environment. The results of this research have shown that the lack of CYLD expression does not lead to increased levels of microsatellite instability in the sites examined. However, these findings do not exclude a possible involvement of CYLD in the MMR system and microsatellite instability in other locations