Ταυτοποίηση φυτών του γένους Hypericum με DNA barcoding
Creators: name: Πύρκα, Ιωάννα Βασιλείου
Publisher: name: Aristotle University of Thessaloniki
Year: 2020
Subjects: Hypericum perforatum
matK, trnH-psbA
Αυτοφυή φυτά στη Βόρεια Ανατολική Ελλάδα
Native plants in North East Greece

description: Το γένος Hypericum L. (Hypericaceae) το οποίο περιλαμβάνει πάνω από 500 είδη, είναι ένα από τα πολυπληθέστερα γένη αγγειόσπερμων, με σχεδόν παγκόσμια εξάπλωση. Τα φυτά του γένους, γνωστά στην Ελλάδα με τις κοινές ονομασίες «σπαθόχορτο», «βάλσαμο» και «φυτό του Άη Γιάννη» (St. John’s wort), χρησιμοποιούνται από την αρχαιότητα για τις θεραπευτικές τους ιδιότητες. Στην σύγχρονη φαρμακολογία, είναι οικονομικά σημαντικά λόγω των βιολογικά δραστικών τους ουσιών, υπερικίνη και υπερφορίνη, οι οποίες προσφέρουν αντικαταθλιπτικές, αντιμικροβιακές και αντιικές δράσεις. Το DNA barcoding, μία μοριακή μέθοδος η οποία χρησιμοποιεί μικρές περιοχές του γονιδιώματος των οργανισμών ως δείκτες, μπορεί να χρησιμοποιηθεί για την ταυτοποίηση των φυτικών οργανισμών. Στην παρούσα εργασία (α) πραγματοποιήθηκαν δειγματοληψίες και ταξινομικός προσδιορισμός φυτών του γένους Hypericum που φύονται στο φυτογεωγραφικό διαμέρισμα της Βόρειας Ανατολικής Ελλάδας και (β) μελετήθηκε η αποτελεσματικότητα του γονιδίου matK και της διαγονιδιακής περιοχής trnH-psbA του χλωροπλαστικού γονιδιώματος ως δείκτες DNA, για την ταυτοποίηση αυτών. Τα αποτελέσματα του ταξινομικού προσδιορισμού έδειξαν πως από τις τοποθεσίες δειγματοληψίας συλλέχθηκαν πέντε taxa (τέσσερα sections): H. aucheri, H. montbretii, H. olympicum, H. perforatum subsp. perforatum και H. thasium. Το H. perforatum subsp. perforatum είναι το κυρίαρχο taxon, ενώ το σπάνιο και Βαλκανικό ενδημικό είδος H. thasium, καταγράφεται για πρώτη φορά στην περιοχή της Κεραμωτής. Τα αποτελέσματα του DNA barcoding έδειξαν πως οι δείκτες matK, trnH-psbA και ο συνδυασμός τους μπορούν να χρησιμοποιηθούν αποτελεσματικά για την ταυτοποίηση των πέντε taxa του γένους Hypericum σε επίπεδο είδους και να διακρίνουν επιμέρους πληθυσμούς του H. perforatum subsp. perforatum
description: The genus Hypericum L. (Hypericaceae), containing over 500 species, is one of the largest angiosperm genera with worldwide distribution. The species of the genus, commonly known in Greece as “spathohorto”, “valsamo” and “St. John’s wort”, have been used since antiquity for their therapeutic properties. In modern pharmacology, they are economically important due to their bioactive compounds, hypericin and hyperforin, with antidepressant, antimicrobial and antiviral activity. DNA barcoding, a molecular method that uses small sequences of organisms’ genome as barcodes, can be used for the identification of plants. In this study (a) sampling and taxonomic identification of plants of the genus Hypericum that grow in North-East Greece was carried out and (b) the efficiency of matK gene and trnH-psbA intergenic spacer as DNA barcodes for their identification was studied. The results of the taxonomic identification show that five taxa (four sections) were collected from the sampling locations: H. aucheri, H. montbretii, H. olympicum, H. perforatum subsp. perforatum and H. thasium. H. perforatum subsp. perforatum is the most common taxon, whereas, the rare and Balkan endemic species H. thasium, is first recorded in the area of Keramoti. DNA barcoding results indicate that matK, trnH-psbA and their combination can be used effectively for the identification of the five Hypericum taxa and the discrimination of different H. perforatum subsp. perforatum populations