Ο ρόλος της ανάλυσης της Εξονικής Αλληλουχίας των Κλινικά σημαντικών γονιδίων (CES) στην προγεννητική διάγνωση.
Creators: name: Σπυροπούλου, Κυριακή Πολυχρόνη
Publisher: name: Aristotle University of Thessaloniki
Year: 2024
Subjects: Προγεννητική Διάγνωση
Εξονική Αλληλουχία
Σκελετικές Δυσπλασίες
Prenatal Diagnosis
CES
Skeletal Malformations

description: Σκοπός της μελέτης ήταν να διερευνηθεί κατά πόσο η ανάλυση της Εξονικής Αλληλουχίας των Κλινικά σημαντικών γονιδίων - Clinical Exome Sequencing (CES), αυξάνει τη διαγνωστική ικανότητα στις κυήσεις που υπάρχουν υπερηχογραφικές εμβρυϊκές ενδείξεις. Πρόκειται για αναδρομική μελέτη παρατήρησης κατά την οποία αναλύθηκαν περιστατικά με φυσιολογικό μοριακό καρυότυπο στα οποία πραγματοποιήθηκε και ανάλυση Εξονικής Αλληλουχίας των Κλινικά σημαντικών γονιδίων (CES) σε ένα εργαστήριο γενετικής, κατά το χρονικό διάστημα 2022-2023. Τα περιστατικά κατηγοριοποιήθηκαν σε τέσσερις ομάδες βάσει των υπερηχογραφικών ενδείξεων: Περιορισμό εμβρυϊκής αύξησης (ΠΕΑ), σκελετικές δυσπλασίες, αυξημένη Αυχενική Διαφάνεια και Λοιπές Εμβρυϊκές Δυσπλασίες (ΛΕΔ). Ακολούθησε συσχέτιση του ποσοστού των παθολογικών/πιθανώς παθολογικών ευρημάτων, για κάθε μια από τις τέσσερις ομάδες υπερηχογραφικών εμβρυϊκών ενδείξεων που αναλύθηκαν, με τα αντίστοιχα ποσοστά της διεθνούς βιβλιογραφίας. Συνολικά, αναλύθηκαν 130 περιστατικά εγκύων γυναικών, οι οποίες υποβλήθηκαν σε επεμβατικό προγεννητικό έλεγχο με λήψη χοριακών λαχνών, ή αμνιοπαρακέντηση. Από την ανάλυση εξαιρέθηκαν 15/130 (11,54%) περιστατικά που γενετικά ήταν αγνώστου κλινικής σημασίας (VUS). Τα προς εκτίμηση περιστατικά ανά ομάδα ελέγχου ήταν: ΠΕΑ 18/115 (15,65%), σκελετικές δυσπλασίες 38/115 (33,05%), αυξημένη Αυχενική Διαφάνεια 17/115 (14,78%), ΛΕΔ 42/115 (36,52%). Αναδείχθηκαν παθολογικοί ή πιθανώς παθολογικοί γονότυποι: ΠΕΑ 1/18 (5,55%), σκελετικές δυσπλασίες, 14/38 (36,84%), αυξημένη Αυχενική Διαφάνεια 6/17 (35,29%) και ΛΕΔ 16/42 (38,1%). Τα ευρήματα μας δεν παρουσίαζαν στατιστικά σημαντική διαφορά από αυτά της διεθνούς βιβλιογραφίας: ΠΕΑ 4%, σκελετικές δυσπλασίες, 30,4%, αυξημένη Αυχενική Διαφάνεια 25,5% και ΛΕΔ 25,9%. Τέλος, αναφορικά με το σύνολο των υπερηχογραφικών εμβρυϊκών ενδείξεων, τα 37/115 (32,2%) έμβρυα παρουσίασαν παθολογικό/πιθανώς παθολογικό καρυότυπο, ποσοστό που παρόμοιο με αυτό της διεθνούς βιβλιογραφίας (31%). Τα αποτελέσματα της έρευνάς μας συμφωνούν με αυτά της διεθνής βιβλιογραφία. Φαίνεται ότι, ιδιαίτερα στην ομάδα των σκελετικών ανωμαλιών, η χρήση της είναι σήμερα αναγκαία, εφόσον οι συμβατικές εξετάσεις είναι φυσιολογικές.
description: The objective of this study was to determine if fetal abnormalities identified using ultrasound in the first and second trimester of pregnancy are consistent with chromosomal abnormalities identified through Clinical Exome Sequencing (CES) analysis. This investigation was conducted retrospectively, using case records from a network of genetics laboratories over the period of 2022-2023. Analysis was conducted on 130 cases of pregnant women who underwent invasive prenatal screening (chorionic villus sampling, amniocentesis) because fetal abnormalities were found by ultrasound in the first and second trimesters of pregnancy. CES (Clinical Exome Sequencing) was utilized to do genetic analysis on the collected material. In total, 130 cases of pregnant women who underwent invasive prenatal screening with chorionic villus sampling or amniocentesis were analysed. 15/130 (11.54%) cases that were genetically of unknown clinical significance (VUS) were excluded from the analysis. The cases to be evaluated per control group were: PEA 18/115 (15.65%), skeletal malformations 38/115 (33.05%), increased Nucal Translucency 17/115 (14.78%), other malformations 42/115 (36.52%). Pathological or possibly pathological genotypes were identified: PEA 1/18 (5.55%), skeletal malformations, 14/38 (36.84%), increased Nucal Translucency 6/17 (35.29%) and other malformations 16/42 (38.1%). Our findings showed no statistically significant difference from those of international literature: PEA 4%, skeletal malformations, 30.4%, increased Nucal Translucency 25.5% and other malformations 25.9%. Finally, regarding all ultrasonographic fetal findings, 37/115 (32.2%) fetuses showed pathogenic/likely pathogenic karyotype, a rate similar to that of the international literature (31%). The results of our study agree with those of the international literature. It seems that, especially in the group of skeletal anomalies, its use is nowadays necessary if conventional tests are normal.