Μοριακή ποικιλότητα ελληνικών πληθυσμών ελάτης:
Creators: name: Μπέλλα, Ελένη Νιάρχου
Publisher: name: Aristotle University of Thessaloniki
Year: 2012
Subjects: Μοριακοί δείκτες
Μιτοχονδριακό DNA (nad5-4)
Χλωροπλαστικό DNA (PCR-RFLP και SSR δείκτες)
Ελληνικοί πληθυσμοί ελάτης
Abies cephalonica και Abies x borisii-regis
Molecular markers
Mitochondrial DNA (nad5-4)
Chloroplast DNA (PCR-RFLP and SSR markers)
Fir populations from Greece
Abies cephalonica and Abies x borisii-regis

description: Η μελέτη της μοριακής ποικιλότητας των ειδών είναι απαραίτητη σε περιπτώσεις ύπαρξης υβριδίων μεταξύ τους, όπου εμφανίζονται δυσκολίες ταξινομικού προσδιορισμού με μορφολογικούς χαρακτήρες. Χαρακτηριστική περίπτωση είναι τα taxa ελάτης (Abies) που υπάρχουν στην Ελλάδα, τα Abies cephalonica, A. alba και A. x borisii-regis. Το τελευταίο έχει χαρακτηριστεί υβρίδιο των δύο πρώτων ειδών, αν και ο τρόπος που προέκυψε αυτό δεν έχει ακόμα αποσαφηνιστεί. Η παρούσα μεταπτυχιακή διπλωματική εργασία είχε ως σκοπό τη μελέτη της μοριακής ποικιλότητας των ελληνικών πληθυσμών ελάτης στο χλωροπλαστικό DNA (με τη χρήση των δεικτών PCR-RFLP και μικροδορυφόρων) και στο μιτοχονδριακό DNA προκειμένου να ταυτοποιηθεί η ύπαρξη ή όχι υβριδογενών πληθυσμών ελάτης και η εκτίμηση των ορίων εξάπλωσής τους. Σε σύνολο 251 ατόμων ελάτης από εννέα πληθυσμούς έγινε ανάλυση της ποικιλότητας με τη χρήση μίας μιτοχονδριακής περιοχής (nad5-4) και πέντε δεικτών του χλωροπλαστικού DNA, δύο PCR-RFLP (matK/ΤaqI, trnV-trnH/HinfI-XmnI) και τριών SSR (Pt15169, AAssrCD, Pt30141). Στη μιτοχονδριακή περιοχή nad5-4 καταγράφηκαν πέντε αλληλόμορφα. Οι απλότυποι που προσδιορίστηκαν για τους PCR-RFLP δείκτες ήταν επτά, για τους SSR ήταν 66, ενώ για τους πέντε δείκτες μαζί ήταν 85. Από τις αναλύσεις για τη μιτοχονδριακή περιοχή προκύπτει μια σαφής εικόνα ύπαρξης υβριδογενών πληθυσμών ελάτης, ενώ επίσης καταγράφηκε ένα νέο αλληλόμορφο. Από τις αναλύσεις των χλωροπλαστικών δεικτών, που ήταν ιδιαίτερα πολυμορφικοί μέσα στους πληθυσμούς, φάνηκε η κοινή καταγωγή των, ενώ σημειώθηκαν σημαντικές ενδείξεις υβριδισμού. Από το συνδυασμό του χλωροπλαστικού και μιτοχονδριακού DNA αποδεικνύεται ότι τα είδη A. cephalonica και A. alba συναντήθηκαν και διασταυρώθηκαν στην περιοχή της Βόρειας Ελλάδας και δημιούργησαν το υβρίδιο A. x borisii-regis. Τα όρια εξάπλωσης των υβριδογενών πληθυσμών σύμφωνα με την παρούσα εργασία συγκλίνουν με αυτά των χλωριδικών συγγραμμάτων τουλάχιστον για τη Βόρεια Ελλάδα, ενώ στους πληθυσμούς της Πελοποννήσου δε βρέθηκαν στοιχεία υβριδισμού.
description: The study of species’ molecular diversity is necessary in cases of hybrids existence, where taxonomic difficulties occur in trying to identify them by morphological traits. A typical case is the fir taxa (Abies) of Greece (Abies cephalonica, A. alba and A. x borisii-regis). The latter is characterized as a hybrid of the first two taxa above, although the way it derived is not clear yet. The present postgraduate thesis aimed to study the molecular diversity of Greek fir populations at the chloroplast DNA (with the use of PCR-RFLP markers and microsatellites) and mitochondrial DNA, so as to identify the existence or not of the hybrid fir populations and to estimate the limits of their distribution. The analysis of genetic diversity was done in a total of 251 fir individuals from nine populations using a mitochondrial region (nad5-4) and five chloroplast markers, two PCR-RFLP (matK/ΤaqI, trnV-trnH/HinfI-XmnI) and three SSR (Pt15169, AAssrCD, Pt30141). Five nad5-4 alleles were recorded. The haplotypes identified for PCR-RFLP were seven, for SSR were 66 and for both were 85. The analysis of the mitochondrial region came up with a clear sign of the hybrid populations’ existence, while a new allele was recorded. The analysis of the very polymorphic chloroplast markers showed the common lineage of the species, while clues for hybridization were posted. The combination of chloroplast and mitochondrial DNA proved that A. cephalonica and A. alba met, intersected in the area of northern Greece and the hybrid A. x borisii-regis came up. The distribution limits of the hybrid populations seem to be in-line with the works on the flora, at least for the northern Greece, while in the populations from Peloponnesus no signs of hybridization were detected.