Studien zur Totalsynthese von Myxovalargin und Darstellung einer Myxovalargin-Bibliothek
Creators: name: Siebke, Maik
Publisher: name: Hannover : Institutionelles Repositorium der Leibniz Universität Hannover
Year: 2021
Subjects: subject: peptide antibiotics
subject: natural product synthesis
subject: oligopeptide
subject: dehydro amino acids
subject: dehydrovaline
subject: dehydroisoleucine
subject: beta-tyrosine
subject: copper-mediated cross-coupling
subject: nitro-elimination
subject: solid-phase-peptide-synthesis
subject: diastereoselective aza-Michael-reaction
subject: Peptidantibiotika
subject: Naturstoffsynthese
subject: Oligopeptid
subject: Dehydroaminosäuren
subject: Dehydrovalin
subject: Dehydroisoleucin
subject: Beta-Tyrosin
subject: Kupfer-katalysierte Kreuzkupplung
subject: Nitroeliminierung
subject: Festphasenpeptidsynthese
subject: diastereoselektive Aza-Michael-Reaktion
subject: Dewey Decimal Classification::500 | Naturwissenschaften::540 | Chemie

description: Myxovalargin, ein lineares Peptid bestehend aus 14 Aminosäuren (AS), welches am C-Terminus mit 3-Methylbutansäure beginnt und am N-Terminus mit dem Amin Agmitin endet, wurde im Jahr 1981 aus dem Bakterium Myxococcus fulvus Mx f65 isoliert und entstammte ursprünglich einer Bodenprobe der Kaiserstuhl-Gebirge. Neben der nicht-kanonischen AS β-Tyrosin beinhaltet die Struktur des Myxovalargins Dehydrovalin und (E)-Dehydroisoleucin, Aminosäuren, deren Synthesen einen zentralen Aspekt dieser Arbeit darstellen. Seine bakterizide Wirkung gegenüber GRAM-positiven Bakterien beruht auf der Inhibierung der Proteinbiosynthese und macht das Myxovalargin zu einem Vertreter der Peptid-Antibiotika. Während ein Großteil der Aminosäuresequenz durch einen hohen Valin-Anteil sehr unpolar ist, besitzt das Peptid durch die Agmatin- und Arginin-Seitenketten einen kationischen Charakter in wässriger Lösung. Hieraus ergeben sich Sekundärinteraktionen mit der Zellmenbran und voraussichtlich auch die gemessene, nicht unerhebliche cyctotoxische Wirkung. Der erste Teil dieser Promotionsschrift befasst sich mit den Studien zur Totalsynthese des Myxovalargins und damit, wie ein Dipeptid und ein Tetrapeptid synthetisiert werden können, welche jeweils einmal Dehydrovalin beinhalten. Es wird gezeigt, wie der Baustein 3-Nitrovalin verwendet werden kann, um Doppelbindungen in Peptiden durch die Eliminierung der NO2-Funktion aufzubauen, was durch Verseifungsbedingungen oder den Einsatz starker Aminbasen gelingt. Außerdem befasst sich der erste Teil damit wie die Synthese eines Tripeptides, welches Dehydroisoleucin beinhaltet mithilfe einer Kupfer-katalysierten Kreuzkupplung gelingt, welche ein Vinyliodid und ein primäres Amid als Substrate verwendet. Das Vinyliodid konnte in der erforderlichen (E)-Konfiguration durch eine Cuprat-Addition an einen 2-Butinester gewonnen werden. Der zweite Teil dieser Arbeit handelt von der Synthese von vereinfachten Myxovalargin-Derivaten, welche für einen Festphasen-Ansatz optimiert werden und zwar mit dem Ziel, Informationen zu den Struktur-Wirk-Beziehungen der Dehydro-ASs zu erhalten und auf diese Weise zu überprüfen, ob diese eine Rolle für die biologische Aktivität spielen. Folglich werden Bestrebungen unternommen, zunächst alle Dehydroaminosäuren durch Kanonische Aminosäuren zu ersetzen. Im Laufe dieser Synthesestudien wurden entsprechend erste Erkenntnisse gewonnen, um Myxovalargin und seine Derivate unter den Bedingungen der Festphasenpeptidsynthese zugänglich zu machen.
description: Myxovalargin, a linear peptide containing 14 amino acids (AA) and starting with 3-methylbutanic acid at its N-terminus and terminated with the amine agmatine at its C-terminus, was isolated from Myxococcus fulvus Mx f65 in 1981 after extraction from a soil sample of the Kaiserstuhl mountains. Beside the non-canonical AA β-tyrosine the structure of Myxovalargin contains dehydrovaline and dehydro-isoleucine, amino acids, whose syntheses represent the core of this work. Its bactercidal activity against GRAM-positve bacteria stems from the inhibition of protein synthesis and makes Myxovalargin a member of the peptide antibiotics. The structure of Myxovalargin is dominated by valine making its sequence unpolar to a great extend. But the peptide also contains agmatine and arginine sidechains making the molecule cationic in aqueous solution, which is supposed to cause cytotoxicity by secondary interactions with cell membranes. The first part of this work covers efforts towards the total synthesis of Myxovalargin, especially strategies on how to synthesize a dipeptide and a tetrapeptide containing a single dehydro-valine, respectively. It will be demonstrated, how the building block 3-NO2-valine can be used to build up α,β-alkenes in peptides by elimination of the NO2-group, which is achieved by saponification or by the use of strong amine bases. Furthermore, the first part will cover the synthesis of an (E)-dehydroisoleucine containing tripeptide, that can be achieved via copper-mediated cross-coupling starting from a primary amide and a vinyl iodide, whose (E)-selective synthesis was possible via a syn-selective cuprate-addition to a 2-pentyne ester. The second part of this work will be about the syntheses of simplified Myxovalargin derivatives. which are optimized for a solid phase approach with the main goal of getting insights into the structure-activity relationship of dehydo AAs and thus verifying their importance to the biologic activity. Therefore progress towards derivatives free of dehydro AAs has been pursued, replacing those AAs through canonical ones. In the course of these studies first insights into synthesizing Myxovalargin and its derivatives under solid-phase conditions were gained.