Μελέτη του εύρους ξενιστών των ιών που προκαλούν ίκτερο στην τομάτα:
Creators: name: Δημητρίου, Χρήστος Νικηφόρου-Νίκου
Publisher: name: Aristotle University of Thessaloniki
Year: 2014
Subjects: Ίκτερος
Ξενιστές
Τομάτα
Crinivirus
Hosts
TICV-ToCV

description: Ο ιός της χλώρωσης της τομάτας (Tomato chlorosis virus, ToCV) και ο ιός της μολυσματικής χλώρωσης της τομάτας (Tomato infectious chlorosis virus, TICV) αποτελούν δύο αναδυόμενους ιούς της τομάτας τόσο στην Ελλάδα όσο και διεθνώς. Στην παρούσα μελέτη διερευνήθηκε το εύρος των φυσικών ξενιστών των δύο ιών για την καλύτερη κατανόηση και τη μελέτη της επιδημιολογίας τους. Για τον σκοπό αυτό, κατά τα έτη 2009-2011, πραγματοποιήθηκαν εκτεταμένες δειγματοληψίες συμπτωματικών φυτών τομάτας, αυτοφυών φυτών, καθώς και άλλων καλλιεργούμενων φυτών που γειτνίαζαν με τις καλλιέργειες τομάτας, από διάφορες περιοχές της Ελλάδας. Από τα φυτικά δείγματα πραγματοποιήθηκε εξαγωγή ολικού RNA και ενίσχυση μέρους του γονιδίου HSP70h των TICV και ToCV με την εφαρμογή της πολλαπλής εστιασμένης αντίστροφης μεταγραφής - αλυσιδωτής αντίδρασης της πολυμεράσης (multiplex nested Reverse transcription - Polymerase chain reaction, RT-PCR). Συνολικά ελέγχθηκαν 685 δείγματα τομάτας, 155 δείγματα άλλων καλλιεργούμενων φυτών και 1180 δείγματα αυτοφυών φυτών. Τα αποτελέσματα έδειξαν την παρουσία των δύο ιών σε μεγάλο αριθμό αυτοφυών φυτών. Ο TICV εντοπίστηκε σε: Abutilon theophrasti, Amaranthus retroflexus, Anagallis foemina, Anthemis arvensis, Capsella bursa-pastoris, Chenopodium album, Cirsium arvense, Conyza sp., Datura stramonium, Fumaria officinalis, Galium aparine, Heliotropium sp., Lactuca serriola, Malva sylvestris, Oxalis pes-carpae, Plantago major, Portulaca oleracea, Sinapis sp., Solanum nigrum, Sonchus oleraceous, Stellaria media, Veronica hederifolia και Xanthium spinosum. Αντίστοιχα για τον ToCV αναφέρονται ως ξενιστές τα είδη: A. retroflexus, A. foemina, C. album, C. arvense, Conyza sp., Convolvulus arvensis, D. stramonium, M. sylvestris, O. pes-carpae, P. major και P. oleracea. Επίσης για πρώτη φορά γίνεται αναφορά του ToCV σε καλλιέργεια μαρουλιού, παγκοσμίως.
description: Tomato chlorosis virus (ToCV) and Tomato infectious chlorosis virus (TICV) are two emergent viruses of tomato in Greece and worldwide. In the present study the natural host range of the two viruses inducing yellowing in tomato crops was investigated. During 2009-2011 symptomatic tomato samples, other cultivated crops and neighboring weeds of infected crops were collected from different regions of Greece. Total RNA was isolated from all plant samples and a multiplex nested reverse transcription - polymerase chain reaction (RT-PCR) assay was applied to detect and differentiate the two virus species. In total, 685 tomato, 155 other cultivated crops and 1180 weed samples were tested. Results showed the presence of the two viruses in many weed species. TICV was detected in: Abutilon theophrasti, Amaranthus retroflexus, Anagallis foemina, Anthemis arvensis, Capsella bursa-pastoris, Chenopodium album, Cirsium arvense, Conyza sp., Datura stramonium, Fumaria officinalis, Galium aparine, Heliotropium sp., Lactuca serriola, Malva sylvestris, Oxalis pes-carpae, Plantago major, Portulaca oleracea, Solanum nigrum, Sonchus oleraceous, Stellaria media, Sinapis sp., Veronica hederifolia and Xanthium spinosum. ToCV was detected in: A. retroflexus, A. foemina, C. album, C. arvense, Conyza sp., Convolvulus arvensis, D. stramonium, M. sylvestris, O. pes-carpae, P. major and P. oleracea. Also this is the first report for the presence of ToCV in lettuce, worldwide.