Epidemiological analysis of infections due to multidrug resistant pathogens in oncological patients
Creators: name: Περδικούρη, Ελένη-Ισιδώρα Άγγελου
Publisher: name: Aristotle University of Thessaloniki
Year: 2019
Subjects: Λοιμώξεις
Πολυανθεκτικά μικρόβια
Ογκολογικοί ασθενείς
Infections
Multidrug resistant (MDR)
Oncological patients

description: Bacterial infection is one of the most frequent complications in immunosuppressed cancer patients. The extensive use of antimicrobial agents leads to spread of resistant strains of microbes. Treatment of infections caused by multidrug resistant bacteria seems to be a clinical challenge especially when there are just limited therapeutic options. Taking into consideration that microbiological identification of pathogens requires time, antibiotic therapy has to be initiated as an empirical therapy. As microbes and resistance patterns demonstrate regional and temporal variations, the aims of this retrospective study are firstly to characterize the contemporary microbial patterns in different kind of infections in our Oncological department and secondly to identify risk factors for the existence of pathogens probable resistant to empirical antibiotics. The last data will help in the earlier introduction of effective empirical treatment in order to reduce mortality. In order to achieve the aforementioned aims, a retrospective single cohort observational study is performed by collecting data through health dataset of participants. The recorded data, concerning potent risk factors, include clinical, laboratory and microbiological information such as positive cultures (blood, urine, sputum, ascites, pleural). Moreover, the multidrug resistant bacteria isolated from them, such as Enterococcus faecium, Staphylococcus aureus, Klebsiella pneumoniae, Acinetobacter baumanii, Pseudomonas aeruginosa and Enterobacter spp, resistant to three or more of commonly used antibiotics, are registered. As far as the results are concerned, factors such as comorbidities, prior administration of chemotherapy independently of the existence of neutropenia at time of patients’ admission to the hospital, prior use of antibiotics, recent surgical interventions and hospitalization, the early use both of empirical and guided antibiotics seem to be important ones, despite the lack of statistical significance in both univariate and multivariate analysis, perhaps due to small sample size. Their timely identification and consideration may lead to the early administration of effective empirical treatment, a fact that could influence the management and decrease mortality because of infections from multidrug resistant bacteria. Οι βακτηριακές λοιμώξεις αποτελούν μια από τις συχνότερες επιπλοκές που αφορούν σε ανοσοκατασταλμένους ογκολογικούς ασθενείς. Η εκτεταμένη χρήση αντιβιοτικών οδηγεί σε διασπορά ανθεκτικών μικροβιακών στελεχών. Η αντιμετώπιση λοιμώξεων που οφείλονται σε πολυανθεκτικά σε αντιβιοτικά στελέχη βακτηρίων, φαίνεται να αποτελεί κλινική πρόκληση, ειδικά στην περίπτωση όπου οι θεραπευτικές επιλογές είναι περιορισμένες. Λαμβάνοντας υπόψη ότι η μικροβιολογική ταυτοποίηση των παθογόνων απαιτεί χρόνο, η αντιβιοτική θεραπεία πρέπει να ξεκινήσει ως εμπειρική θεραπεία. Δεδομένου ότι το μικροβιακό φάσμα και τα πρότυπα ανθεκτικότητας επιδεικνύουν τοπικές και χρονικές διακυμάνσεις, οι στόχοι αυτής της αναδρομικής μελέτης είναι να χαρακτηρίσουν πρώτα το μικροβιακό φάσμα διαφορετικών ειδών λοιμώξεων στο Ογκολογικό μας τμήμα και δεύτερον να εντοπίσουν πιθανούς παράγοντες κινδύνου για την ύπαρξη πολυανθεκτικών παθογόνων σε εμπειρικά αντιβιοτικά . Τα τελευταία αυτά δεδομένα θα βοηθήσουν στην έγκαιρη χορήγηση αποτελεσματικής εμπειρικής θεραπείας, προκειμένου να μειωθεί η θνησιμότητα λοιμώξεων από πολυανθεκτικά στελέχη μικροβίων. Προκειμένου να επιτευχθούν οι προαναφερθέντες στόχοι, μια αναδρομική μελέτη παρατήρησης πραγματοποιείται, που αφορά στη συλλογή δεδομένων από ηλεκτρονική βάση δεδομένων των συμμετεχόντων. Τα καταγεγραμμένα δεδομένα αφορούν σε ενδεχόμενους παράγοντες κινδύνου και περιλαμβάνουν κλινικές, εργαστηριακές και μικροβιολογικές πληροφορίες, όπως θετικές καλλιέργειες (αίματος, ούρων, πτυέλων, ασκιτικού και υπεζωκοτικού υγρού). Επίσης, καταγράφονται τα πολυανθεκτικά βακτήρια τα οποία απομονώνονται στις παραπάνω καλλιέργειες και εμφανίζουν αντοχή σε τρία ή περισσότερα χρησιμοποιούμενα αντιβιοτικά, όπως οι Enterococcus faecium, Staphylococcus aureus, Klebsiella pneumoniae, Acinetobacter baumanii, Pseudomonas aeruginosa και Enterobacter spp. Σε ό,τι αφορά τα αποτελέσματα, η ύπαρξη παραγόντων όπως συννοσηρότητες, η πρόσφατη χορήγηση χημειοθεραπείας ανεξάρτητα από την εμφάνιση ουδετεροπενίας κατά την εισαγωγή των ασθενών στο νοσοκομείο, πρόσφατη χρήση αντιβιοτικών, πρόσφατες χειρουργικές παρεμβάσεις και γενικότερα πρόσφατη νοσηλεία, μοιάζουν να είναι σημαντικοί για την έγκαιρη χρήση τόσο εμπειρικών όσο και κατευθυνόμενων αντιβιοτικών , παρά την έλλειψη στατιστικής σημαντικότητάς τους τόσο σε μονοπαραγοντική όσο και σε πολυπαραγοντική ανάλυση, πιθανότατα λόγω του μικρού μεγέθους του δείγματος. Η ταυτοποίηση και εκτίμηση των ανωτέρω παραγόντων μπορεί να οδηγήσει στην έγκαιρη χορήγηση αποτελεσματικής εμπειρικής θεραπείας, γεγονός που θα μπορούσε να μειώσει τη θνησιμότητα των λοιμώξεων από πολυανθεκτικά βακτηρίδια.
description: Bacterial infection is one of the most frequent complications in immunosuppressed cancer patients. The extensive use of antimicrobial agents leads to spread of resistant strains of microbes. Treatment of infections caused by multidrug resistant bacteria seems to be a clinical challenge especially when there are just limited therapeutic options. Taking into consideration that microbiological identification of pathogens requires time, antibiotic therapy has to be initiated as an empirical therapy. As microbes and resistance patterns demonstrate regional and temporal variations, the aims of this retrospective study are firstly to characterize the contemporary microbial patterns in different kind of infections in our Oncological department and secondly to identify risk factors for the existence of pathogens probable resistant to empirical antibiotics. The last data will help in the earlier introduction of effective empirical treatment in order to reduce mortality. In order to achieve the aforementioned aims, a retrospective single cohort observational study is performed by collecting data through health dataset of participants. The recorded data, concerning potent risk factors, include clinical, laboratory and microbiological information such as positive cultures (blood, urine, sputum, ascites, pleural). Moreover, the multidrug resistant bacteria isolated from them, such as Enterococcus faecium, Staphylococcus aureus, Klebsiella pneumoniae, Acinetobacter baumanii, Pseudomonas aeruginosa and Enterobacter spp, resistant to three or more of commonly used antibiotics, are registered. As far as the results are concerned, factors such as comorbidities, prior administration of chemotherapy independently of the existence of neutropenia at time of patients’ admission to the hospital, prior use of antibiotics, recent surgical interventions and hospitalization, the early use both of empirical and guided antibiotics seem to be important ones, despite the lack of statistical significance in both univariate and multivariate analysis, perhaps due to small sample size. Their timely identification and consideration may lead to the early administration of effective empirical treatment, a fact that could influence the management and decrease mortality because of infections from multidrug resistant bacteria.