“DNA Barcoding” αυτοφυών φυτών: χρήση των “DNA barcode” ITS, matK και trnH-psbA για την ταυτοποίηση αυτοφυών φυτών του γένους Mentha στη Χίο (Ελλάδα) και τη χερσόνησο Ερυθραία (Τουρκία)
Creators: name: Καλφαγιάννη, Αγνή Αθανασίου
Publisher: name: Aristotle University of Thessaloniki
Year: 2012
Subjects: DNA bacoding
Mentha
ITS

description: Η μελέτη της φυτικής ποικιλότητας τόσο σε επίπεδο ειδών και οικοσυστημάτων, όσο και σε γενετικό επίπεδο αποτελεί βασική προϋπόθεση για τη διατήρηση και αειφορική χρήση αυτής, γεγονός που αποτυπώνεται σε διεθνείς και εθνικές στρατηγικές, όπως η Παγκόσμια και Ευρωπαϊκή Στρατηγική για τη Διατήρηση της Φυτικής Ποικιλότητας και η Ελληνική Στρατηγική προς τη Βιώσιμη Ανάπτυξη. Η οικογένεια Labiatae είναι γνωστή για τα καλλωπιστικά και αρτυματικά της βότανα. Στην οικογένεια αυτή ανήκει και το γένος Mentha. Από την εποχή του Λινναίου έχουν δοθεί περισσότερα από 3.000 ονόματα στα φυτά του γένους Mentha. Ο ταξινομικός προσδιορισμός των ειδών αυτών είναι ιδιαίτερα δύσκολος εξαιτίας του συχνού υβριδισμού των αυτοφυών φυτών, αλλά και των καλλιεργούμενων. Το «DNA barcoding» είναι μια τεχνική κατά την οποία η ταυτοποίηση των ειδών πραγματοποιείται με τη χρήση αλληλουχιών του DNA από ένα μικρό τμήμα του γονιδιώματος και στόχος της είναι η συνεισφορά σε ένα μεγάλο εύρος των τομέων της οικολογίας και της διατήρησης ειδών, όπου η παραδοσιακή ταξινομική ταυτοποίηση δεν είναι πρακτική. Στη Χίο, που είναι και η περιοχή προέλευσης των δειγμάτων, έχουν παρατηρηθεί διαφορές ανάμεσα στο ίδιο taxon και εικάζεται ότι αυτό οφείλεται σε γεωγραφικούς και κλιματικούς παράγοντες, που οδήγησαν στον υβριδισμό του γένους Mentha. Αντικείμενο της μεταπτυχιακής διπλωματικής εργασίας είναι η συμβολή της στη μελέτη του γένους Mentha που φύεται στη περιοχή της Χίου και της χερσονήσου Ερυθραίας. Με την παρούσα διπλωματική εργασία στοχεύουμε στην ταυτοποίηση υβριδίων του γένους Mentha από την περιοχή της Χίου με DNA barcodes, προκειμένου να γίνει μία διάκριση των ειδών του συγκεκριμένου γένους.
description: The study of plant diversity at both species and ecosystems levels, and at the genetic level is a prerequisite for the conservation and sustainable use of native plants, which is reflected in international and national strategies, such as World and European Strategy for the Conservation of Plant Diversity and the Greek Strategy for Sustainable Development. Labiatae family is known for its decorative and flavoring herbs. In Labiatae family belongs the genus Mentha. Since Linnaeus more than 3,000 names have been given on the plants of the genus Mentha. The taxonomic classification and identification of these species is particularly difficult because of frequent hybridization between wild and cultivated plants. «DNA barcoding» is a technique in which species identification is undertaken using DNA sequences from a small part of the genome and aims is contribute to a wide range of fields of ecology and conservation of species, where taxonomic identification is not practical. In Chios Island, differences have been observed among individuals between the same taxon and it is assumed that this is due to geographical and climatic factors, leading to hybridization of the genus Mentha. The main purpose of this thesis is to identify hybrids of genus Mentha from the region of Chios using DNA barcodes, trying to distinguish differences between species of this genus.