1959年，他演出導演茂文·李洛埃的《聯邦調查局》。真實的美國聯邦調查局以及當時的約翰·胡佛局長，都有協助、或者干涉此片的製作過程。雖然衡諸當時國際情勢，《聯邦調查局》的性質，多少有些為政府機關做形象及政策宣傳的成份。但是由於本片主角及導演的盛名，以及這是早期對聯邦調查局寫實之作。因此此片依然留傳數十年至今。1959年，詹姆斯·史都華晉升准將，他的父親在親見兒子官拜將軍之後不久過世，母親則在前幾年過世。1960年、1961年，好友瑪格麗特·蘇利文、賈利·古柏先後去世。直到史都華與仰慕已久的導演約翰·福特開始合作，才稍微緩解他此時的悲傷。從1940年代後期，到整個1950年代，史都華與導演亞佛烈德·希區考克及導演安東尼·曼分別都展開一連串精彩的合作。1950年到1955年間，他與安東尼·曼推出一系列西部片：《無敵連環槍》、《怒河》、《血泊飛車》、《遠鄉》、《聖戰家園蛇江》，在當時及現在的美國，都是膾炙人口的西部片。在經紀人利蘭·海沃德的幫助下，詹姆斯·史都華在此時同環球電影公司達成合約，成為有聲電影時代第一位爭取到電影票房抽成的演員，至今已被引為常例。
《聯邦調查局》製作過程中獲得哪一個政府單位的協助?