不過，明成祖的允諾後來並沒有完全兌現。明朝不允許三衛蒙古人南遷到大寧地區駐牧。兀良哈三衛蒙古各部，為了獲得大寧地區的駐牧權，聯合了當時頗為強大的阿速特部首領阿魯台，不斷向明朝發起進攻。永樂帝在1422年-1424年連續三次御駕親征，攻打阿魯台，並重創了兀良哈三衛。但是兀良哈三衛為了爭得大寧地區，並沒有因此而放棄與明朝的抗爭。不久，他們揮師南下，進入灤河流域駐牧。1428年，他們又進入大寧城，並經會州抵寬河。在這裡兀良哈三衛與明宣宗皇帝親率的三千騎兵進行了激戰。宣宗末年和英宗初年，即15世紀30年代後期，伴隨著明朝國力的漸微，兀良哈三衛蒙古部落從西拉木倫河到遼河流域全面向南推進。到了15世紀的40年代，蒙古三大部落中的瓦剌的勢力逐漸壯大，對明朝形成了巨大威脅。而此時已占據興寧重地的兀良哈三衛，再也不聽命於明朝，而是與瓦剌結成了聯盟。1449年7月1日，蒙古瓦剌部首領，執掌蒙古三部大權的也先。率三路大軍發動了對明王朝的戰爭。這場戰場與其說是明朝與瓦剌的戰爭，不如說是明朝與「蒙古部落聯盟」的戰爭。瓦剌的南侵大軍共分三路，一路是由被瓦剌征服的韃靼人的首領脫脫不花率領，進攻明朝遼東地區；一路由瓦剌知院阿刺率領，主要包括部分瓦剌軍以及兀良哈三衛軍，進攻明朝軍事重鎮宣府；最精銳一路是也先親自統領的中路軍，攻擊明朝的軍事重鎮大同。戰端一開，長城沿線烽火綿延，九邊重鎮自朱棣去世後二十多年的短暫安寧被徹底打破。1449年的土木堡之變是明朝和蒙古的軍事力量對比的轉折點，也使得兀良哈三衛與明朝的關係從根本上發生了改變。
兀良哈三衛為什麼要聯合阿速特部首領阿魯台向明朝發起進攻?