選擇標記用於區分轉化的和未轉化的細胞。這些標記通常存在於基因轉殖生物體中，儘管已經開發了可以從成熟基因轉殖植物中除去選擇性標記的多種策略。當產生後代時，可以篩選基因的存在。來自第一代的所有後代對於插入的基因將是雜合的，並且必須交配在一起以產生純合動物。進一步的測試使用PCR，南方墨點法可以進行DNA測序以確認生物體含有新基因。即將基因轉殖生物的基因組DNA提取出來，在含有目的基因的DNA片段上用放射性同位素等做標記，以此作為探針，使探針與基因組DNA雜交，如果顯示出雜交帶，就表明目的基因已插入染色體DNA中。該方法因發現者而命名為南方墨點法。這些測試還可以確認插入基因的染色體位置和拷貝數。基因的存在並不保證其在靶組織中以適當的水平表現，因此也使用尋找和測量基因產物的方法。這些包括北方墨點法，定量即時聚合酶鏈鎖反應。西方墨點法可免疫螢光，酵素免疫分析法和表型分析。為了穩定轉化，該基因應以孟德爾遺傳模式傳遞給後代，因此也應研究該生物的子代。
可以使用DNA測序以確認生物體含有新基因的方法為哪種?