ヴァガケラトプスの系統関係は現在も議論され続けており、研究者によってはコスモケラトプスに近縁であるともカスモサウルスに近縁であるとも、またはやはりヴァガケラトプスには属を分けるほどの独自性はなくc.イルヴィネンシスが有効であるとも言われる。