農民・浪人・キリスト教・鉄砲が結合して強力な反乱に成長した島原の乱以降、徳川幕府の国内安定化政策の下で足軽の多くは帰農させられ、武士階級を意図的に銃砲から乖離させる政策がとられたため、鉄砲足軽の運用手法は形骸化した兵学としてのみ伝承され、江戸時代中期には事実上絶滅してしまう。