2001年(平成13年)に実施された一般公募によって、左岸側立坑には入船みなとタワー(いりふねみなとタワー)、右岸側立坑には山の下みなとタワー(やまのしたみなとタワー)という愛称がそれぞれ命名され、いずれもトンネル部開通前の2002年(平成14年)2月に竣工した。