律令制においては肥後国にも国府が置かれ、その場所は『和名類聚抄』には益城郡、『伊呂波字類抄』には飽田郡(熊本市二本木)、鎌倉時代の『拾芥抄』では益城・飽田郡のふたつが併記されている。