ペンタゴン防護局の任務はペンタゴン及びその周辺280エーカー(約113万平方メートル)の国家重要地域(national capital region)での警備、犯罪捜査、核・化学・生物・放射能兵器防衛や入館・駐車許可及びペンタゴン職員への教育などである。