しかし、滋賀県教育委員会と当時の信楽町教育委員会が2004年(平成16年)9月に「古代史を理解する上で欠くことができない」として、遺跡の現地保存を旧日本道路公団(jh)に要請、2005年(平成17年)4月20日に両教育委員会とjhが、当初の計画からあった隼人川と市道を跨ぐ140mの橋梁を遺跡側に50m延長し、橋梁で遺跡を跨ぐ橋梁構造に工法変更することで合意した。