前作『零式艦上戦闘記』(同)の続編でありシリーズを通じて歴史の“if"を主題としている(しかし、前作はニンテンドーゲームキューブ用ソフト『零ファイター撃墜戦記』に若干のミッションと使用可能機体を追加して移植したものであり、“if"と呼べる要素は決して多くはなかった。