1947年(昭和21年)、病床にあった黒板勝美が死去した後は、国史大系編纂の代表となり、1951年(昭和26年)に、国史大系本『日本書紀』を出版(なお、同書刊行にあたり文部省研究成果刊行補助金をうけた)。