縄文時代における常願寺川流域では白岩川と神通川との間を大小の支流が多数流れており、奈良時代にはいたち川と現在の河道との間を流れ、平安時代にはいたち川と熊野川との間を、続いて鎌倉時代〜室町中期にはいたち川付近、室町末期には現在の河道の東側を流れ、江戸時代以降は現在と同じ位置を流れていると考えられている。