ブエノスアイレスで生まれたフローレスは、1990年にcaベレス・サルスフィエルドでキャリアを始め、1990年代半ばのクラブの黄金時代で大きな役割を果たした。在籍中は、リーグ優勝3回,コパ・リベルタドーレス,インターコンチネンタルカップ,コパ・インテラメリカーナ,スーペルコパ・スダメリカーナを獲得。