過去にはストラメノパイル、ハプト藻、クリプト藻は、全てクロミスタに分類されていたが、その後ストラメノパイルは除外され、ハプト藻とクリプト藻は近い関係にあると考えられた(そして"cryptophyta+haptophyta"グループと総称されることもある)。