以前はクロストリジウム・ディフィシル("clostridium difficile")と呼ばれていたが、2016年、表現型、化学分類学、系統発生学による分類に基づいて、新しい属としてクロストリディオイデス属(clostridioides spp.)が提案され、そこに属することになった。