新藤原駅からは野岩鉄道会津鬼怒川線・会津鉄道会津線と直通運転が行われており、当路線および野岩鉄道会津鬼怒川線・会津鉄道会津線を経由して特急「リバティ会津」が浅草駅から会津田島駅(福島県南会津町)まで、快速「aizuマウントエクスプレス」が東武日光駅・鬼怒川温泉駅-会津若松駅間で直通運転している。