一方で、屋内で調理などに使う場合はpm2.5が発生する事が指摘されているほか、など土壌や地下水がヒ素で汚染されている地域では、ウシの体内で生物濃縮されたヒ素が牛糞ケーキの煙に含まれるなど、健康面の悪影響が存在する。