アポロニアの町はいくつかの時代においてアポロニア・ポンティカ("apollonia pontica"、黒海の古名"pontus euxinus"にちなむ名称で、黒海のアポロニアの意)、あるいはアポロニア・マグナ("apollonia magna"、大アポロニア)と呼ばれた。