しかし、奄美群島から沖縄本島へ労働に来ていた奄美系住民は「外国人」ということとなり、参政権剥奪や土地所有権剥奪、公職追放、低い労働賃金の設定など、様々な事実上・法律上の差別が沖縄の本土復帰まで行われた(沖縄の奄美差別)。