欠番発生により、山手線では先頭車の車両番号を編成番号にしているため、国鉄時代製造分の編成番号はヤテ1-34編成、jr東日本投入分はヤテ41-60編成となっている(クハ205-60・クハ204-60まで・なお、ヤテ35-40編成の編成番号は欠番)。