ワレイタムシ類自体は四肺類(クモ・ウデムシ・サソリモドキなどを含んだ系統群)の近縁として広く認められるため、もしクツコムシ類とワレイタムシ類は近縁であれば、クツコムシ類自体も四肺類の近縁と見なされる。