しかし、1612年(慶長17年)の禁教令により弾圧が始まると多くは五島列島などへと逃れたが、大村藩領の西杵築にあって出津は佐賀藩の飛地(深堀鍋島家領)で追求の手が及びにくかったこともあり、一部は残留し潜伏キリシタンと化した。