実科は東京帝国大学農学部の中で旧制専門学校レベルの教育機関としての役割を成していたが、1903年(明治36年)の専門学校令の発令により全国で独立した農林系専門学校が次々設立されていたため、教育制度上の理由から実科廃止論が持ち上がっていた。