多剤併用療法は、短期的には単剤療法に比べてコストが高いように見えるが、適切に使用されれば、治療失敗率、症例死亡率の低下、単剤療法に比べて副作用が少ない、耐性菌の発生が遅い、その結果、新薬の開発に必要な資金が少なくて済む等、大きな節約効果がある。