正親町天皇が年始三日間の記事に宸翰を染めた元亀三年(1572年)正月分の原本が東山文庫に伝存するほか、江戸時代の霊元天皇貞享元年(1684年)より仁孝天皇文政九年(1826年)までの正本御湯殿上日記が約四百五十冊伝来し、そのうち慶長十六年(1611年)から延宝二年(1674年)までは寛永二年(1625年)一年分のみが現存する。