1907年(明治40年)に入ると、日露戦争後の反動で事態は急変し、日本経済は停滞したが、大阪商船はあくまで積極路線を進むことを決意、土佐商船などを買収し内地航路の整備を開始、同年8月には資本金の4分の1を割って内航部を設立、大阪別府線(大阪/神戸-別府)、大阪沖縄線(大阪/神戸-名瀬/那覇)、北海道樺太線(大阪/神戸-門司-新潟-小樽-大泊)などが開設された。