第2代フェアファクス子爵トマス・フェアファクス(1641年9月24日没)とアラシア・ハワード(、1677年9月3日没、サー・フィリップ・ハワードの娘)の次男(長男ウィリアムは1620年に生まれ、1641年にフェアファクス子爵を継承した)として生まれた。