冷戦終結後、戦略航空軍団の部隊は分割再編されていたが、2007年のマイノット事件(外された筈の核弾頭が付いたままのacm巡航ミサイルが、ノースダコタ州マイノット空軍基地からバークスデール空軍基地まで空輸されていた事件)はアメリカ空軍において兵器管理に問題があることを明らかにした。