天文14年(1545年)、兄の稙長が死去すると重臣の遊佐長教に当主として擁立されたが、兄が室町幕府の権力者細川晴元に反乱を起こした細川氏綱に加担していたため、幕府から当主として認められず代わりに畠山晴俊(四郎)なる能登畠山氏の人物が擁立された。