この頃に藩主・鍋島直正へ海軍創設の必要性を説き、自ら海軍所の責任者となる。1857年(安政4年)、佐賀藩がオランダから購入した飛雲丸の船将となり、翌1858年(安政5年)、三重津海軍所の監督となる。