能登半島沖不審船事件の教訓を基に2001年3月にアメリカ海軍のnavy sealsの様な特殊部隊を目指して設立された部隊で、海上警備行動発令時における不審船舶・艦艇へのヘリコプターや高速ボートによる移乗強襲、潜水による水中浸透の訓練、また一部隊員は空挺降下の訓練や野戦等の地上戦の訓練なども行っている。