同様に、高度に多様化した昆虫(約3億5000万年前に分岐したと考えられる)では、いくつかの重要な遺伝子の類似した遺伝子発現パターンは、類似した構成のcrmによって制御されているものの、これらのcrmにはblastなどの標準的な配列アラインメント法で検出できるほどの配列保存性はみられなかった。