木古内駅-江差駅間の輸送密度(1km当たりの1日平均利用客数)はjr発足当初の1987年(昭和62年)度の253人が2011年(平成23年)度は6分の1以下の41人に減少し、jr北海道管内で乗降客が最も少ない区間であったため、北海道新幹線の開業に先立ち、2014年(平成26年)5月12日に廃止された(経緯は後述)。