イエロー・サブマリンのショップは大きくわけて「ゲーム系ショップ」と「ホビー系ショップ」に分けられており、「ゲーム系ショップ」ではテーブルトークrpg、トレーディングカードゲーム、ボードゲーム、ボード・ウォーゲームなどを取り扱い、「ホビー系ショップ」ではプラモデル、フィギュア、ラジコンなどを取り扱う。