Uislamu ndiyo dini kubwa katika kisiwa cha Zanzibar. Kwa mujibu wa CIA Factbook, Zanzibar ina Waislamu zaidi ya 99%. Uislamu uliingia mjini Zanzibar kunako karne ya 10. Kwa mujibu wa chanzo kimoja, "Uislamu mjini Zanzibar imetia msukumo harakati za kupinga ukoloni, kisiasa na hata kitaifa wakati wa kupigania uhuru." Ni jumuiya ya wanaharakati wa Kiislamu wa Zanzibar (Association for Islamic Mobilisation and Propagation) ambayo ina mpango wa kupigania uhuru wa Zanzibar kutoka mikononi mwa Jamhuri ya Muungano wa Tanzania pia wanajulikana kama JUMIKI au Jumuiya ya Uamsho na Mihadhara ya Kiislam. JUMIKI walisajiliwa rasmi mnamo mwaka wa 2001 huko mjini Zanzibar na Nambari yao ya Usajili ni 149 chini ya kifungu cha 6 cha mwaka wa 1995 kuhusiana na Taasisi za Kijamii. 1) Zanzibar irudi katika asili yake ya zamani kuwa kitovu cha dini ya Uislamu na taasisi. 2) Kuhakikisha sheri za Kiislamu zinatekelezwa. 3) Kuhakikisha Kuipa Uhuru Zanzibar wa kujiamulia mambo yake yenyewe.