Mto Rugongo unapatikana magharibi mwa Burundi (mkoa wa Cibitoke). Maji yake huelekea ziwa Tanganyika, Mto Kongo na hatimaye bahari ya Atlantiki. Orodha ya mito ya Burundi Orodha ya mito ya mkoa wa Cibitoke Mito mirefu ya Afrika Geonames.org