Mto Mukagera unapatikana nchini Burundi (mkoa wa Ngozi na mkoa wa Kirundo). Maji yake huelekea Mto Naili na hatimaye Bahari ya Kati. Orodha ya mito ya mkoa wa Ngozi Orodha ya mito ya mkoa wa Kirundo Orodha ya mito ya Burundi Mito mirefu ya Afrika Geonames.org