Mto Rukoni (Ntungamo) unapatikana katika wilaya ya Ntungamo, magharibi mwa Uganda. Maji yake yanaishia katika mto Naili na hatimaye katika Bahari ya Kati. Orodha ya mito ya Uganda Orodha ya mito ya wilaya ya Ntungamo Geonames.org Rivers and Lakes of Uganda.