Orodha ya mito ya kaunti ya Mombasa inataja kwa mpangilio wa alfabeti baadhi tu ya mito ya eneo hilo la Kenya kusini mashariki (kwenye bahari ya Hindi). Mto Beguro Mto Bokini Mto Chidaluni Mto Gandeni Mto Golo Mto Kisiwani Mto Kokota Mto Kombeni Mto Lwandani Mto Mafigani Mto Maru Mto Mbuzini Mto Mtomkuu Mto Mtsapuni Mto Mvuvu Mto Tsalu Mito ya Kenya