Mto Kwisenga ni korongo linalopatikana kaskazini mwa Burundi (mkoa wa Muyinga). Maji yake huelekea Mto Naili na hatimaye Bahari ya Kati. Orodha ya mito ya mkoa wa Muyinga Orodha ya mito ya Burundi Mito mirefu ya Afrika Geonames.org