Isaias Afwerki (kwa Kitigrinya: ኢሳያስ ኣፍወርቂ; amezaliwa 2 Februari 1946) ni mwanasiasa wa Eritrea ambaye amekuwa Rais wa kwanza na wa sasa wa Eritrea, msimamo ambao ameshikilia tangu baada ya Vita vya Uhuru vya Eritrea mnamo 1993. Aliongoza Ushirikiano wa Eritrea wa Liberation Front (EPLF) hadi ushindi mnamo Mei 1991, na kumaliza vita vya miaka 30 vya kupigania uhuru. Isaias ndiye kiongozi wa chama cha pekee cha siasa cha Eritrea, Chama cha Demokrasia na haki (PFDJ). Ametajwa kwa ukiukwaji wa haki za binadamu na Umoja wa Mataifa na Amnesty International. Mnamo mwaka wa 2015, Waandishi wa Habari bila Mipaka waliweka Eritrea chini ya serikali ya Rais Isaias Afewerki nafasi ya mwisho katika orodha yake ya uhuru wa waandishi wa habari kwa mwaka wa nane.