المقر البابوى هو مقر الكرسى البطريركى او الباباوى لالكنيسه القبطيه الارثوذكسيه يستقر فيه البطريرك القبطى المقر الأصلى للكرسى المرقسى هو مدينة اسكندرية اتنقل مقر الكرسى للالكنيسه المعلقه بمصر القديمة فى عهد البابا خريستوذولوس 66 (1040 - 1077) من القرن الحداشر اللى تقع مع المتحف القبطى فى حصن بابليون فى شارع مار جرجس بمصر القديمة. اتنقل المقر لكنيسة القديس مرقوريوس أبى سيفين، بشارع عمرو بمصر القديمة. اتنقل المقر لكنيسة السيدة العذراء بحارة زويلة من القرن الاربعتاعشر (بشارع بورسعيد) . اتنقل الكرسى لكنيسة السيدة العذراء حارة الروم - قسم الدرب الاحمر. من سنة 1660 لغاية سنة 1800. اتنقلت البطرياركيه للكنيسه المرقسيه بمنطقه فم الخليج - بالقاهره. وفى سنة 1799 اتنقل للأزبكية بالكنيسة المرقسية بكلوت بك لغاية سنة 1964. وفي 1964 وفي عهد البابا كيرلس السادس اتبنت الكاتدرائيه الحاليه كاتدرائية القديس مرقس القبطية الأرثوذكسية والموجوده بمنطقه ديرالانبا رويس بالعباسيه اللى فيهادلوقتى المقر البابوى.