اتاسس معهد الدراسات القبطية سنه 1954م، ويعد قداسة البابا تواضروس الثانى - بابا الإسكندرية وبطريرك الكرازة المرقسية - الرئيس الأعلى للمعهد. هدف المعهد الرئيسى "التراث القبطى" من (لاهوت وفن وموسيقى وألحان وآثار وعمارة وتاريخ ولغة وأدب واجتماع ودراسات إفريقية). بحثا، وتحقيقا، وترجمة، ونشرا، وتسجيلا أو تدوينا وترميما وتعليما مع تداوله مع الجامعات والمراكز والهيئات الأجنبية اللى بها تخصصاته. وعقد الندوات والمؤتمرات المحلية والدولية عنه. 1.قسم اللاهوت: رئيس القسم: الأنبا بيشوي 2.قسم اللغة القبطية رئيس القسم: نيافة الآنبا ديمتريوس 3.قسم الدراسات الأفريقية رئيس القسم: أ.د/ انطون يعقوب 4.قسم العمارة القبطية رئيس القسم: أ.د/ سامى صبرى 5.قسم الآثار والترميم رئيس القسم: أ.د/ عادل فخري 6.قسم الاجتماع والتربية رئيس القسم: أ.د/ ثروت أسحق 7.قسم التاريخ رئيس القسم: أ.د/ أنتونى سوريا 8.قسم الألحان والموسيقى القبطية رئيس القسم: أ.د/ ميشيل بديع عبد الملك 9.قسم الفن القبطى تحت إشراف: أ.د/ سامى صبرى كنيسة قبطية أرثوذكسية ↑ AlAhram weekly article on Isaac FanousArchived 2007-02-16 at the Wayback Machine.