Hierdie is 'n lys van bekende mere in Indonesië. Indonesië het 521 natuurlike mere en meer as 100 opgaardamme, wat ongeveer 21,000 km2 bedek. Die totale volume van die water wat gehou word is ongeveer 500 km3. Die grootste meer, deur beide area en volume, is Toba meer in Sumatra. Dit hou 240 km3 van varswater, en is die grootste meer in Suidoos-Asië. Indonesië het 3 van die 20 diepste mere in die wêreld - Toba meer in Sumatra (1600 m), Matano meer in Sulawesi (590 m), en Poso meer in Sulawesi (450 m). Die enigste meer in Indonesië wat 'n kriptodepressie (waar die bodem van die meer onder seevlak is) het is Matano meer. Die mere en opgaardamme voorsien water vir persoonlike en kommersiële gebruik, en die ondersteuning van ekonomiese aktiwiteite soos visserye, hidro -, besproeiing, vervoer en ontspanning. Hulle help in die voorkoming van vloede, en is 'n belangrike ekologiese entiteite. National inventory of the major lakes and reservoirs in Indonesia 1997 ISBN 951-45-7237-8 Expedition Indodanau 2003