Invaginasie is die invouing van een deel in ’n ander deel of struktuur, waardeur ’n holte geskep word. In biologie verwys dit veral na die morfogenetiese prosesse waardeur 'm embrio vorm aanneem, en is dit die eerste stap van gastrulasie, die massiewe herrangskikking van die embrio van ’n eenvoudige, sferiese bol selle (blastula) in ’n organisme met vele lae en gedifferensieerde kiemlae: die endoderm, mesoderm en ektoderm. Invaginasie kom ook in ander stadiums van embrio-ontwikkeling voor. Die term, wat aanvanklik net in embriologie gebruik is, is in ander dissiplines ook opgeneem. Dit beteken op elke terrein iets anders. "Medical Dictionary". Wortham, Simon Morgan (2010). The Derrida Dictionary. Continuum International. p. 76. ISBN 9781847065261. Besoek op 12 Januarie 2013. Alberts (2002). Molecular Biology of the Cell. New York: Garland Science.