ฤดูกาล 2559 เป็นฤดูกาลแรกของ สโมสรฟุตบอลอยุธยา ยูไนเต็ด ในระบบฟุตบอลลีกอาชีพของประเทศไทย หลังจากที่ก่อนหน้านี้เคยลงแข่งขันระดับสมัครเล่นในฟุตบอลชิงถ้วยพระราชทานประเภทต่างๆ ภายใต้ชื่อ เทศบาลเมืองเสนา โดยสโมสรเริ่มลงแข่งขันอย่างเป็นทางการนัดแรกของฤดูกาลเมื่อวันที่ 19 มีนาคม พ.ศ. 2559 ในลีกภูมิภาค ดิวิชัน 2 (โซนภาคกลาง) และมีโอกาสลงแข่งขันในฟุตบอลถ้วยอย่างช้าง เอฟเอ คัพและโตโยต้า ลีกคัพเป็นครั้งแรก สโมสรใช้สนามกีฬาเสนาบดีเป็นสนามเหย้า และเปิดฤดูกาลภายใต้การคุมทีมของราชัน สาระคำ ก่อนจะเปลี่ยนเป็นอภิรักษ์ ศรีอรุณ ในเดือนพฤษภาคม โดยเมื่อจบฤดูกาลสโมสรสามารถคว้าอันดับที่ 4 ในลีกภูมิภาค ดิวิชั่น 2 โซนภาคกลางได้สำเร็จ และได้เลื่อนชั้นสู่ไทยลีก 3 ก่อนเริ่มฤดูกาล ในการแข่งขันฟุตบอลชิงถ้วยพระราชทานประเภท ข. ประจำปี 2558 เพื่อที่จะหา 2 สโมสรเลื่อนชั้นขึ้นสู่ลีกภูมิภาค ดิวิชัน 2 สโมสร เทศบาลเมืองเสนา สามารถเข้าถึงรอบรองชนะเลิศไปพบกับสถาบันการพลศึกษา วิทยาเขตสมุทรสาคร ก่อนจะแพ้ไปในที่สุด แต่ก็ยังได้สิทธิเลื่อนชั้นขึ้นสู่ลีกภูมิภาค ดิวิชัน 2เนื่องจาก โรงเรียนจ่าอากาศ และ สมาคมศิษย์เก่าโรงเรียนปากช่อง ที่เป็นคู่แข่งขันในรอบรองชนะเลิศอีกคู่ ถูกปรับตกรอบทั้งสองทีมเนื่องจากใช้ผู้เล่นผิดคุณสมบัติในการลงแข่งขัน ทำให้สถาบันการพลศึกษา วิทยาเขตสมุทรสาครที่ชนะเทศบาลเมืองเสนาในรอบรองชนะเลิศได้แชมป์ไปโดยอัติโนมัติ และทำให้ เทศบาลเมืองเสนา ที่แพ้ในรอบรองชนะเลิศ ได้สิทธิเลื่อนชั้นไปอีกหนึ่งทีม หลังจากได้เลื่อนชั้นสู่ลีกอาชีพของประเทศไทยเป็นครั้งแรก สโมสรได้จดทะเบียนนิติบุคคลดำเนินธุรกิจในรูปแบบบริษัทจำกัด ในชื่อ บริษัท อยุธยา ยูไนเต็ด (2015) จำกัด และเปลี่ยนชื่อสโมสรเป็นอยุธยา ยูไนเต็ด เพื่อลงแข่งขันในลีกภูมิภาค ดิวิชัน 2 โดยในการแข่งขันลีกภูมิภาค ดิวิชัน 2 สโมสรถูกจัดให้อยู่ในโซนภาคกลาง และยังคงใช้ผู้ฝึกสอนคนเดิมคือ ราชัน สาระคำ ที่พาสโมสรเลื่อนชั้นขึ้นมาเล่นในลีกอาชีพเป็นครั้งแรก และใช้สนามกีฬาเสนาบดี ตั้งอยู่ที่อำเภอเสนา จังหวัดพระนครศรีอยุธยา เป็นสนามเหย้า สำหรับผู้เล่นที่ย้ายมาร่วมทีมในฤดูกาลนี้ ที่น่าสนใจได้แก่การคว้าตัว รุ่งโรจน์ สว่างศรี อดีตกองหลังทีมชาติไทย และ อนนท์ บุญสุโข กองกลางประสบการณ์สูง มาร่วมทีม รวมถึงการเซ็นสัญญากับ ศุภกร รามกุหลาบสุข อดีตกองหน้าของสโมสรฟุตบอลอาร์มี่ ยูไนเต็ด ผู้เล่น ฤดูกาล 2559 ผู้เล่นฤดูกาล 2559 หมายเลข ชื่อ สัญชาติ ตำแหน่ง วันเกิด ย้ายมาจาก ลงสนาม ประตู ผู้รักษาประตู 18 ณัฐวุฒิ แสงดารา GK สงขลา ยูไนเต็ด 22 0 26 สิทธิชัย กลยนีย์ GK ปลวกแดง ระยอง ยูไนเต็ด 1 0 38 คีรินทร์ พุฒิมงคลเจริญ GK ชลบุรี เอฟซี 0 0 กองหลัง 2 ชัยวิชิต สวนชัยภูมิ DF มาแชร์ ชัยภูมิ 22 2 3 ธีระพงษ์ แก้วนาง DF แพร่ ยูไนเต็ด 4 0 4 ประกิต เพ็ญศรี (c) DF สมุทรสงคราม เอฟซี 18 0 5 วันเฉลิม ฉอ้อนโฉม DF ทีโอที 3 0 6 ครรชิต ปทุมสูตร DF - 0 0 14 ธีรวัฒน์ คำเสียง DF - 7 0 15 อวูนี บาบา DF สมุทรปราการ สองสิงห์ 21 2 23 นราธร ถูกอารมย์ DF - 0 0 24 พงศกร ประจิมนอก DF - 0 0 25 ณัฐนันท์ หวังธรรมสถิตย์ DF - 0 0 27 กฤษดา ปิสสา DF อุดรธานี เอฟซี 5 0 32 จักรกริช เข็มนาค DF เลย ซิตี้ 7 0 36 อนุรัตน์ วงศ์อนันต์ DF - 2 0 40 เทิดศักดิ์ พุ่มโพธิ์ DF - 3 0 กองกลาง 7 ศตวรรษ มั่นประสิทธิ์ MF ลพบุรี เอฟซี 7 0 8 อานนท์ เมฆฉาย MF - 12 0 10 ปรัชญา หอมเชย MF ทวีวัฒนา เอฟซี 18 1 11 วัชระ ฤทธิ์กำลัง MF มาแชร์ ชัยภูมิ 13 1 16 กมล บุญเทพ MF นครนายก เอฟซี 12 0 19 กฤษณะ จำปาเรือง MF สายมิตร กบินทร์ ยูไนเต็ด 9 0 21 อมรเดช กิตติพรประชา MF โกลเบล็ก เอฟซี 9 1 22 สามารถ โพธิ์มี MF - 18 2 34 ณัญธวัช แก้วกลาง MF เกร็กคู ลูกทัพฟ้า 1 0 กองหน้า 17 สิทธิโชค บุตรราช FW มาแชร์ ชัยภูมิ 19 3 20 ณัฐกิตติ์ มีโฉมยา FW บางกอก เอฟซี 1 0 28 ประเสริฐ หาดเจียง FW กบินทร์ ยูไนเต็ด 0 0 29 โทโมฮิโระ โอโนะเดะระ FW อำนาจ โปลี ยูไนเต็ด 10 4 30 บาโล ลาจี เซียกา FW เพชรบุรี เอฟซี 10 0 37 บาดารา อาลี ดิย็อป FW ธนบุรี ซิตี้ 10 2 ผู้เล่นที่ย้ายออกระหว่างฤดูกาล 6 รุ่งโรจน์ สว่างศรี DF แอร์ฟอร์ซ เซ็นทรัล 5 1 7 อนนท์ บุญสุโข MF 9 0 9 จักรพันธ์ เป้าศาสตร์ FW ปากน้ำโพ เอ็นเอสอาร์ยู 8 1 13 พีระพล วัฒนจินดา MF ทหารบก เอฟซี 3 0 23 ศุภกร รามกุหลาบสุข FW อาร์มี่ ยูไนเต็ด 6 0 27 อดิสรณ์ กิตติพรประชา MF สมุทรสงคราม เอฟซี 3 0 29 อี แต-ซึง MF 8 1 31 ณัชพล สุจิตโตสกุล FW 1 0 35 สุภัทร์ วงษ์จินดา GK 0 0 37 เอเก อึมบาห์ FW 4 0 - คัง ย็อน-แจ AM,FW 0 0 การเปลี่ยนแปลงผู้เล่น เปิดฤดูกาล ผู้เล่นย้ายเข้า ชื่อ ย้ายมาจาก 2 ชัยวิชิต สวนชัยภูมิ มาแชร์ ชัยภูมิ 4 ประกิต เพ็ญศรี สมุทรสงคราม เอฟซี 5 วันเฉลิม ฉอ้อนโฉม ทีโอที เอสซี 6 รุ่งโรจน์ สว่างศรี แอร์ฟอร์ซ เซ็นทรัล 7 อนนท์ บุญสุโข ศรีสะเกษ เอฟซี 8 อานนท์ เมฆฉาย - 9 จักรพันธ์ เป้าศาสตร์ ปากน้ำโพ เอ็นเอสอาร์ยู 10 ปรัชญา หอมเชย ทวีวัฒนา เอฟซี 11 วัชระ ฤทธิ์กำลัง มาแชร์ ชัยภูมิ 13 พีระพล วัฒนจินดา ทหารบก 14 ธีรวัฒน์ คำเสียง - 15 อวูนี บาบา สมุทรปราการ 16 กมล บุญเทพ นครนายก เอฟซี 17 สิทธิโชค บุตรราช มาแชร์ ชัยภูมิ 18 ณัฐวุฒิ แสงดารา สงขลา ยูไนเต็ด 19 วิวัฒน์ แซ่ซ้ง - 20 ณัฐกิตติ์ มีโฉมยา บางกอก เอฟซี 21 อมรเดช กิตติพรประชา โกลเบล็ก เอฟซี 22 สามารถ โพธิ์มี - 23 ศุภกร รามกุหลาบสุข อาร์มี่ ยูไนเต็ด 24 พงศกร ประจิมนอก - 25 ณัฐนันท์ หวังธรรมสถิตย์ - 26 สิทธิชัย กลยนีย์ ปลวกแดง ระยอง ยูไนเต็ด 27 อดิสรณ์ กิตติพรประชา สมุทรสงคราม เอฟซี 28 ประเสริฐ หาดเจียง สายมิตร กบินทร์ ยูไนเต็ด 29 อี แต-ซึง - 30 บาโล ลาจี เซียกา เพชรบุรี เอฟซี 31 ณัชพล สุจิตโตสกุล สระบุรี ทีอาร์ยู 34 ณัญธวัช แก้วกลาง เกร็กคู ลูกทัพฟ้า ปทุมธานี 35 สุภัทร์ วงษ์จินดา - 36 อนุรัตน์ วงศ์อนันต์ - 37 เอเก อึมบาห์ - 38 คีรินทร์ พุฒิมงคลเจริญ ชลบุรี เอฟซี 40 เทิดศักดิ์ พุ่มโพธิ์ - ภุชงค์ เทียนเจริญ บางกอกกล๊าส - นราธร ถูกอารมย์ - - คัง ย็อน-แจ - ครึ่งฤดูกาล ผู้เล่นย้ายเข้า ชื่อ ย้ายมาจาก 3 ธีระพงษ์ แก้วนาง แพร่ ยูไนเต็ด 6 ครรชิต ปทุมสูตร อ่างทอง เอฟซี 7 ศตวรรษ มั่นประสิทธิ์ อ่างทอง เอฟซี 19 กฤษณะ จำปาเรือง สายมิตร กบินทร์ ยูไนเต็ด 27 กฤษดา ปิสสา อุดรธานี เอฟซี 29 โทโมฮิโระ โอโนะเดะระ อำนาจ โปลี ยูไนเต็ด 32 จักรกฤช เข็มนาค เลย ซิตี้ 37 บาดารา อาลี ดิย็อป ธนบุรี ซิตี้ ผู้เล่นย้ายออก ชื่อ ย้ายไป 6 รุ่งโรจน์ สว่างศรี เลิกเล่น 7 อนนท์ บุญสุโข นครสวรรค์ เอฟซี 9 จักรพันธ์ เป้าศาสตร์ นครสวรรค์ เอฟซี 13 พีระพล วัฒนจินดา นนทบุรี เอฟซี 19 วิวัฒน์ แซ่ซ้ง หมดสัญญา 23 ศุภกร รามกุหลาบสุข เลิกเล่น 27 อดิสรณ์ กิตติพรประชา เลิกเล่น 29 อี แต-ซึง หมดสัญญา 31 ณัชพล สุจิตโตสกุล นวมินทร์ คลองจั่น เอฟซี 35 สุภัทร์ วงษ์จินดา หมดสัญญา 37 เอเก อึมบาห์ นครสวรรค์ เอฟซี คัง ย็อน-แจ แทจ็อน โคเรล ภุชงค์ เทียนเจริญ หมดสัญญา ชุดแข่งขันและผู้สนับสนุน ฤดูกาลนี้สโมสรเปลี่ยนจากชุดของแกรนด์สปอร์ต มาใช้ชุดที่ผลิตโดยอีโก้ สปอร์ต และมีผู้สนับสนุนหลักบนอกเสื้อคือน้ำดื่มตรารีเจนซี่ และปั๊มน้ำมัน ปตท. (เสนา) นอกจากนี้ยังมีผู้สนับสนุนรายอื่นๆเช่น คลองสวนพลู รีสอร์ต (แขนเสื้อขวา) , อยุธยา อีซุสุ เซลส์ (แขนเสื้อซ้าย) , บ้านแพนแทรคเตอร์ , โรงแรมกรุงศรี ริเวอร์ , บริษัท สแปน จำกัด (ชายเสื้อด้านหลัง) การแข่งขันนัดอุ่นเครื่องและกระชับมิตร การแข่งขันในฤดูกาล ดิวิชั่น 2 โซนภาคกลาง สโมสรลงแข่งขันในลีกเป็นนัดแรกเมื่อวันที่ 19 มีนาคม 2559 ในนัดที่บุกไปชนะนครสวรรค์ เอฟซี 0–1 จากลูกโหม่งของรุ่งโรจน์ สว่างศรี โดยถือเป็นประตูแรกที่สโมสรยิงได้ในระดับลีกอาชีพ ตารางคะแนน รอบแชมเปียนส์ลีกและเลื่อนชั้นไปสู่ไทยลีก 3 ฤดูกาล 2560 เลื่อนชั้นไปสู่ไทยลีก 3 ฤดูกาล 2560 ผลงานโดยรวม ผลงานและอันดับในแต่ละนัด ผลการแข่งขัน เอฟเอ คัพ โตโยต้า ลีกคัพ สถิติการลงสนามและการทำประตูของผู้เล่น ผู้รักษาประตู กองหลัง กองกลาง กองหน้า ผู้เล่นที่ย้ายออกระหว่างฤดูกาล อันดับการทำประตูของผู้เล่น ชื่อ ลีกภูมิภาค ดิวิชั่น 2 เอฟเอ คัพ ลีกคัพ รวม 1 29 FW โทโมฮิโระ โอะโนะเดะระ 4 0 0 4 2 17 FW สิทธิโชค บุตรราช 3 0 0 3 3 2 DF ชัยวิชิต สวนชัยภูมิ 2 0 0 2 15 DF อวูนี บาบา 2 0 0 2 22 MF สามารถ โพธิ์มี 1 0 1 2 37 FW บาดารา อาลี ดิย็อป 2 0 0 2 7 6 DF รุ่งโรจน์ สว่างศรี 1 0 0 1 9 MF จักรพันธ์ เป้าศาสตร์ 0 0 1 1 10 MF ปรัชญา หอมเชย 1 0 0 1 11 MF วัชระ ฤทธิ์กำลัง 1 0 0 1 21 MF อมรเดช กิตติพรประชา 1 0 0 1 29 MF อี แต-ซึง 1 0 0 1 รวม 19 0 2 21 ข้อมูลล่าสุด: 3 กันยายน 2559 อ้างอิง 2559 อยุธยา