Riêng về phương pháp xác định giá đất và khung giá các loại đất, dự thảo nghị định do Bộ Tài chính soạn thảo chưa đề cập đến các loại đất xây dựng trụ sở cơ quan, công trình sự nghiệp, đất sử dụng vào mục đích công cộng không có mục đích kinh doanh, đất do các cơ sở tôn giáo sử dụng... Vì vậy, Bộ Tài nguyên Môi trường đề nghị cần quy định giao cho UBND cấp tỉnh quy định giá các loại đất trên cho phù hợp với thực tế của địa phương để thực hiện các quan hệ tài chính giữa Nhà nước và người sử dụng đất. Trao đổi với VnExpress, một số chuyên gia trong ban soạn thảo Luật Đất đai cho rằng những vấn đề trên rất quan trọng, vì nó ảnh hưởng tới nhiều thành phần trong xã hội.