bluuebunny/crossref_metadata_2025_split huggingface dataset:
ПОКАЗНИКИ ЕНДОГЕННОЇ ІНТОКСИКАЦІЇ У ЩУРІВ ПРИ ДОБРОЯКІСНІЙ ГІПЕРПЛАЗІЇ ПРОСТАТИ НА ТЛІ ТОКСИЧНОЇ ДІЇ ЕТАНОЛУ
Authors: Макодрай Ю. І. , Кліщ І. М. 
Published: March 2022

Вступ. Доброякісна гіперплазія простати серед урологічних захворювань чоловіків старшого віку посідає вагоме місце з тенденцією до зростання. Найпоширенішою соціальною проблемою є вживання алкоголю. Його токсичної дії зазнає багато систем та органів, адже він легко взаємодіє з багатьма процесами життєдіяльності організму. За рахунок синдрому ендогенної інтоксикації ми можемо оцінити багато даних та отримати результати про перебіг багатьох захворювань за рівнем молекул середньої маси та змінами еритроцитарного індексу.
Мета дослідження – вивчити зміни показників ендогенної інтоксикації за рівнем молекул середньої маси та змінами еритроцитарного індексу в щурів з доброякісною гіперплазією простати при поєднаній дії етанолу.
Методи дослідження. Експериментальних тварин поділили на 4 групи: 1-ша (контрольна) – щури, яким протягом 28 діб вводили дистильовану воду перорально; 2-га – тварини, яким упродовж 28 днів вводили 40 % розчин етанолу з розрахунку 2 мл/100 г маси тіла внутрішньошлунково 1 раз на добу; 3-тя – щури, яким моделювали розвиток доброякісної гіперплазії передміхурової залози шляхом підшкірного введення ампульного 5 % тестостерону в дозі 0,1 мг/кг 1 раз на добу тривалістю 28 діб; 4-та – тварини, в яких відтворювали модель доброякісної гіперплазії передміхурової залози з додатковим токсичним впливом 40 % розчину етанолу з розрахунку 2 мл/100 г маси тіла внутрішньошлунково 1 раз на добу тривалістю 28 діб.
Результати й обговорення. У результаті досліджень, які ми провели у тварин різних дослідних груп за умов експериментального моделювання доброякісної гіперплазії простати, встановлено, що відбувається поступове зростання показників ендогенної інтоксикації на 7-му, 14-ту, 21-шу доби експерименту. Найвищих показників усі маркери ендогенної інтоксикації досягли на 21-шу добу дослідження.
Висновок. Ми змогли встановити значні зміни і порушення процесів інтоксикації у тварин під токсичною дією етанолу, що має важливе значення для їх патогенезу.
ЗМІНИ ЛІПІДНОГО ПРОФІЛЮ У ТВАРИН З МОДЕЛЬОВАНИМ МЕТАБОЛІЧНИМ СИНДРОМОМ
Authors: Дзюбановський І. Я. , Продан А. М. , Підручна С. Р. , Мельник Н. А. , Ярошенко Т. Я. 
Published: March 2022

Вступ. Формування атерогенних змін ліпідного профілю при метаболічному синдромі зумовлене дією багатьох факторів ризику. Атерогенна дисліпопротеїнемія являє собою не лише фактор ризику розвитку та прогресування атеросклерозу, а й одну з основних складових метаболічного синдрому.
Мета дослідження – оцінити зміни ліпідного профілю у щурів із змодельованим метаболічним синдромом.
Методи дослідження. Дослідження проведено на 40 білих щурах-самцях лінії Вістар масою 200–250 г. До контрольної групи ввійшли 8 тварин. Щурів-самців основної групи (n=32) годували дієтою з високим вмістом жиру (понад 60 % енергії від жирів) упродовж 16 тижнів, таким чином моделюючи в них розвиток метаболічного синдрому. Тварин виводили з експерименту шляхом декапітації. Ліпідний профіль у сироватці крові щурів оцінювали за допомогою біохімічного аналізатора “HTI BioChem SA” (США) і стандартних тест-наборів.
Результати й обговорення. Було встановлено, що на тлі перебігу метаболічного синдрому в щурів основної групи, порівняно з контрольною, розвивались явища гіперхолестеринемії, які характеризувалися підвищенням у крові тварин показників: загального холестеролу – на 18,38 %, триацилгліцеролів – на 77,35 %, ліпопротеїнів низької щільності – на 156,52 % з одночасним зниженням рівня ліпопротеїнів високої щільності на 36,14 %.
Висновок. У тварин із метаболічним синдромом зміни ліпідного обміну характеризувалися гіпер- та дисліпідемією (за статистично значимо вищими рівнями загального холестеролу, триацилгліцеролів, ліпопротеїнів низької щільності на тлі зниження вмісту ліпопротеїнів високої щільності) порівняно з контрольною групою.
ЗВ’ЯЗУВАЛЬНА ФУНКЦІЯ СИРОВАТКОВОГО АЛЬБУМІНУ ПРИ ГІПЕРТОНІЧНІЙ ХВОРОБІ, НЕАЛКОГОЛЬНОМУ СТЕАТОГЕПАТИТІ ТА ЦУКРОВОМУ ДІАБЕТІ 2 ТИПУ
Authors: Дзьордзьо Ю. Р. , Андрейчин С. М. 
Published: March 2022

Вступ. В останні роки зріс інтерес до досліджень зв’язувальної функції сироваткового альбуміну (ЗФСА) при різних патологічних станах. Однак її зміни при хронічних захворюваннях залишаються маловивченими. З огляду на існуючі докази впливу порушень транспортної функції сироваткового альбуміну на ефективність медикаментозного лікування, важливим є вивчення взаємозв’язків порушень ЗФСА з різними патологічними процесами, що супроводжуються тривалим медикаментозним лікуванням. Поміж таких захворювань інтерес викликають гіпертонічна хвороба (ГХ) та різноманітні пов’язані з нею коморбідні стани.
Мета дослідження – оцінити взаємозв’язки змін ЗФСА та показників функціонального стану печінки при ГХ у поєднанні із супутнім неалкогольним стеатогепатитом (НАСГ) і цукровим діабетом (ЦД) 2 типу та запропонувати медикаментозну корекцію виявлених змін.
Методи дослідження. Обстежено 3 групи пацієнтів із ГХ ІІ стадії з 2–3 ступенями артеріальної гіпертензії. До 1-ї групи ввійшли 28 осіб без супутніх захворювань, до 2-ї – 48 пацієнтів із супутнім НАСГ, до 3-ї – 47 осіб із НАСГ та ЦД 2 типу. В свою чергу, 2-гу і 3-тю групи поділили на 2 підгрупи (А та Б). Хворі підгрупи А отримували базову терапію ГХ і додатково препарат “Антраль” по 1 таблетці 3 рази на добу протягом 60 днів, підгрупи Б – лише базову терапію ГХ. Усі хворі пройшли стандартне клінічне обстеження, а також у них досліджували ЗФСА та показники печінки: активність аланінамінотрансферази (АлАТ), аспартатамінотрансферази (АсАТ), гамма-глутамілтранспептидази (ГГТ), лужної фосфатази (ЛФ), показник тимолової проби (ТП) і вміст загального білірубіну в сироватці крові. Групу порівняння становили 25 практично здорових осіб.
Результати й обговорення. У сироватці крові пацієнтів 1-ї групи підвищились активність ГГТ, ЛФ, показники ТП і загального білірубіну, а також спостерігали позитивний кореляційний зв’язок середньої сили ЗФСА із загальним білірубіном. У 2-й групі мали місце зниження ЗФСА і зростання всіх досліджуваних показників, окрім того, відзначили негативні кореляції середньої сили її з АсАТ та ЛФ. У 3-й групі відмітили ще більш суттєве зниження ЗФСА і показників функції печінки, а також негативні кореляційні зв’язки середньої сили ЗФСА з АлАТ і ТП та сильний зв’язок із ЛФ. У хворих обох підгруп, яких лікували антралем, порівняно з підгрупами без використання гепатопротектора, зросла ЗФСА та зменшились рівні підвищених досліджуваних біохімічних показників і збільшилася сила кореляційних зв’язків ЗФСА з усіма показниками. Це може бути пов’язано з позитивним впливом антралю на функціональний стан печінки.
Висновок. Застосування антралю у пацієнтів із ГХ у поєднанні з НАСГ та з НАСГ і ЦД 2 типу призводить до покращення показника ЗФСА та функціонального стану печінки.
ПОКАЗНИКИ ФЕРТИЛЬНОСТІ ЩУРІВ ТА РІВEНЬ ЛЕПТИНУ В ПЛАЗМІ КРОВІ ЗА УМОВ ВПЛИВУ ВИСОКОКАЛОРІЙНИХ ДІЄТ
Authors: Козопас Н. М. , Максимюк Г. В. 
Published: March 2022

Вступ. Вплив ожиріння на плідність чоловіків є предметом багатьох досліджень, а молекулярні механізми, що лежать в основі цього взаємозв’язку, активно вивчає наукова спільнота. Лептин є пептидним гормоном, який в основному синтезується у жировій тканині та підтримує енергетичний гомеостаз організму. Крім того, він активно залучений у регуляцію репродуктивної функції через модуляцію гіпоталамо-гіпофізарно-гонадної осі. Ймовірно, лептин можна розглядати як біомаркер, що поєднує метаболічний статус із репродуктивною системою організму.
Мета дослідження – оцінити вплив висококалорійних дієт на показники фертильності щурів-самців і рівень лептину в плазмі крові.
Методи дослідження. Дослідження було проведено на 30 білих нелінійних щурах-самцях масою 250–300 г, яких поділили на 3 групи по 10 тварин у кожній: щури контрольної групи (КГ) споживали стандартний корм; тварини дослідних груп отримували високожирову дієту (ВЖД) і дієту з високим вмістом жиру та цукру (ВЖЦД) відповідно. Утримували лабораторних тварин на зазначених раціонах протягом 7 тижнів. Після евтаназії щурів проводили їх морфометричні заміри, на основі яких обчислювали індекс Лі, тестикулярний коефіцієнт та коефіцієнт вісцерального жиру. Кров для дослідження забирали з хвостових судин тварин у еппендорфи з гепарином. Отриманий матеріал 5 хв центрифугували при 800 g, після чого відбирали плазму для подальших досліджень. Суспензію сперматозоїдів готували з каудальної частини епідидимісів яєчок. Розраховували загальну кількість статевих клітин та їх рухливість. Життєздатність сперматозоїдів досліджували шляхом їх фарбування флуоресцентним барвником пропідій йодидом. Концентрацію лептину в плазмі крові визначали методом імуноферментного аналізу.
Результати й обговорення. Утримування щурів на ВЖД і ВЖЦД протягом 7 тижнів суттєво не позначилося на прирості маси тіла. Індекс Лі незначно відрізнявся між дослідними групами (p=0,59). Однак коефіцієнт вісцерального жиру в групі ВЖЦД був на 40 % вищим порівняно з КГ (p=0,04). Не було виявлено істотної різниці між дослідними групами щодо кількості сперматозоїдів (p=0,72), рухливості (p=0,63) та життєздатності (p=0,87). Дієта з високим вмістом жиру і цукру спричиняла зростання концентрації лептину в плазмі крові щурів на 14 % від вихідних даних (p=0,01).
Висновок. Короткострокове перебування на раціоні з високим вмістом жиру і цукру викликає метаболічні зміни, на що вказує значне зростання відносної частки жирової тканини та рівня лептину в плазмі крові.
Beyond 10-Year Risk: A Cost-Effectiveness Analysis of Statins for the Primary Prevention of Cardiovascular Disease
Authors: Kohli-Lynch Ciaran N. , Lewsey James , Boyd Kathleen A. , French Dustin D. , Jordan Neil , Moran Andrew E. , Sattar Naveed , Preiss David , Briggs Andrew H. 
Published: March 2022

Background:
Cholesterol guidelines typically prioritize primary prevention statin therapy on the basis of 10-year risk of cardiovascular disease. The advent of generic pricing may justify expansion of statin eligibility. Moreover, 10-year risk may not be the optimal approach for statin prioritization. We estimated the cost-effectiveness of expanding preventive statin eligibility and evaluated novel approaches to prioritization from a Scottish health sector perspective.

Methods:
A computer simulation model predicted long-term health and cost outcomes in Scottish adults ≥40 years of age. Epidemiologic analysis was completed using the Scottish Heart Health Extended Cohort, Scottish Morbidity Records, and National Records of Scotland. A simulation cohort was constructed with data from the Scottish Health Survey 2011 and contemporary population estimates. Treatment and cost inputs were derived from published literature and health service cost data. The main outcome measure was the lifetime incremental cost-effectiveness ratio, evaluated as cost (2020 GBP) per quality-adjusted life-year (QALY) gained. Three approaches to statin prioritization were analyzed: 10-year risk scoring using the ASSIGN score, age-stratified risk thresholds to increase treatment rates in younger individuals, and absolute risk reduction (ARR)–guided therapy to increase treatment rates in individuals with elevated cholesterol levels. For each approach, 2 policies were considered: treating the same number of individuals as those with an ASSIGN score ≥20% (age-stratified risk threshold 20, ARR 20) and treating the same number of individuals as those with an ASSIGN score ≥10% (age-stratified risk threshold 10, ARR 10).

Results:
Compared with an ASSIGN score ≥20%, reducing the risk threshold for statin initiation to 10% expanded eligibility from 804 000 (32% of adults ≥40 years of age without CVD) to 1 445 500 individuals (58%). This policy would be cost-effective (incremental cost-effectiveness ratio, £12 300/QALY [95% CI, £7690/QALY–£26 500/QALY]). Incremental to an ASSIGN score ≥20%, ARR 20 produced ≈8800 QALYs and was cost-effective (£7050/QALY [95% CI, £4560/QALY–£10 700/QALY]). Incremental to an ASSIGN score ≥10%, ARR 10 produced ≈7950 QALYs and was cost-effective (£11 700/QALY [95% CI, £9250/QALY–£16 900/QALY]). Both age-stratified risk threshold strategies were dominated (ie, more expensive and less effective than alternative treatment strategies).

Conclusions:
Generic pricing has rendered preventive statin therapy cost-effective for many adults. ARR–guided therapy is more effective than 10-year risk scoring and is cost-effective.
Reproducible Research Publication Workflow: A Canonical Workflow
Framework and FAIR Digital Object Approach to Quality Research
Output
Authors: Peer Limor , Biniossek Claudia , Betz Dirk , Christian Thu-Mai 
Published: March 2022

Abstract
In this paper we present the Reproducible Research Publication Workflow (RRPW) as an example of how generic canonical workflows can be applied to a specific context. The RRPW includes essential steps between submission and final publication of the manuscript and the research artefacts (i.e., data, code, etc.) that underlie the scholarly claims in the manuscript. A key aspect of the RRPW is the inclusion of artefact review and metadata creation as part of the publication workflow. The paper discusses a formalized technical structure around a set of canonical steps which helps codify and standardize the process for researchers, curators, and publishers. The proposed application of canonical workflows can help achieve the goals of improved transparency and reproducibility, increase FAIR compliance of all research artefacts at all steps, and facilitate better exchange of annotated and machine-readable metadata.
The Specimen Data Refinery: A Canonical Workflow Framework and FAIR Digital Object Approach to Speeding up Digital Mobilisation of Natural History Collections
Authors: Hardisty Alex , Brack Paul , Goble Carole , Livermore Laurence , Scott Ben , Groom Quentin , Owen Stuart , Soiland-Reyes Stian 
Published: March 2022

AbstractA key limiting factor in organising and using information from physical specimens curated in natural science collections is making that information computable, with institutional digitization tending to focus more on imaging the specimens themselves than on efficiently capturing computable data about them. Label data are traditionally manually transcribed today with high cost and low throughput, rendering such a task constrained for many collection-holding institutions at current funding levels. We show how computer vision, optical character recognition, handwriting recognition, named entity recognition and language translation technologies can be implemented into canonical workflow component libraries with findable, accessible, interoperable, and reusable (FAIR) characteristics. These libraries are being developed in a cloud-based workflow platform—the ‘Specimen Data Refinery’ (SDR)—founded on Galaxy workflow engine, Common Workflow Language, Research Object Crates (RO-Crate) and WorkflowHub technologies. The SDR can be applied to specimens’ labels and other artefacts, offering the prospect of greatly accelerated and more accurate data capture in computable form. Two kinds of FAIR Digital Objects (FDO) are created by packaging outputs of SDR workflows and workflow components as digital objects with metadata, a persistent identifier, and a specific type definition. The first kind of FDO are computable Digital Specimen (DS) objects that can be consumed/produced by workflows, and other applications. A single DS is the input data structure submitted to a workflow that is modified by each workflow component in turn to produce a refined DS at the end. The Specimen Data Refinery provides a library of such components that can be used individually, or in series. To cofunction, each library component describes the fields it requires from the DS and the fields it will in turn populate or enrich. The second kind of FDO, RO-Crates gather and archive the diverse set of digital and real-world resources, configurations, and actions (the provenance) contributing to a unit of research work, allowing that work to be faithfully recorded and reproduced. Here we describe the Specimen Data Refinery with its motivating requirements, focusing on what is essential in the creation of canonical workflow component libraries and its conformance with the requirements of an emerging FDO Core Specification being developed by the FDO Forum.
Making Canonical Workflow Building Blocks Interoperable across Workflow Languages
Authors: Soiland-Reyes Stian , Bayarri Genís , Andrio Pau , Long Robin , Lowe Douglas , Niewielska Ania , Hospital Adam , Groth Paul 
Published: March 2022

AbstractWe introduce the concept of Canonical Workflow Building Blocks (CWBB), a methodology of describing and wrapping computational tools, in order for them to be utilised in a reproducible manner from multiple workflow languages and execution platforms. The concept is implemented and demonstrated with the BioExcel Building Blocks library (BioBB), a collection of tool wrappers in the field of computational biomolecular simulation. Interoperability across different workflow languages is showcased through a protein Molecular Dynamics setup transversal workflow, built using this library and run with 5 different Workflow Manager Systems (WfMS). We argue such practice is a necessary requirement for FAIR Computational Workflows and an element of Canonical Workflow Frameworks for Research (CWFR) in order to improve widespread adoption and reuse of computational methods across workflow language barriers.
A Semantic Approach to Workflow Management and Reuse for Research Problem Solving
Authors: Skvortsov Nikolay A. , Stupnikov Sergey A. 
Published: March 2022

Abstract
The investigation proposes the application of an ontological semantic approach to describing workflow control patterns, research workflow step patterns, and the meaning of the workflows in terms of domain knowledge. The approach can provide wide opportunities for semantic refinement, reuse, and composition of workflows. Automatic reasoning allows verifying those compositions and implementations and provides machine-actionable workflow manipulation and problem-solving using workflows. The described approach can take into account the implementation of workflows in different workflow management systems, the organization of workflows collections in data infrastructures and the search for them, the semantic approach to the selection of workflows and resources in the research domain, the creation of research step patterns and their implementation reusing fragments of existing workflows, the possibility of automation of problemsolving based on the reuse of workflows. The application of the approach to CWFR conceptions is proposed.
“Promises in policy” and “policy as participation”: Equity and language in and across the wilderness of contemporary human life
Authors: Bagga-Gupta Sangeeta 
Published: March 2022

Abstract
While promises of equity mark (inter)national declarations and laws that contemporary democratic societies subscribe to, accessibility and participation for-all continues to remain out of reach for increasing numbers of people and “named-groups” across the global-North/South. Going beyond issues regarding gaps between progressive policies and people’s accounts of their experiences, this paper illuminates the mundane nature of participation by putting the spotlight on people’s everyday lives in and across different societal sectors. By doing so, it illustrates the mundane nature of processes that constitute the “policies of equity and language as participation”. Issues of promises in policies in contemporary democratic societies like Sweden are discussed as framings that need to be decentered and troubled through a multi-scale analytical gaze at the mundane, messy and wild nature of human life. The study draws on data from three projects where data generation has and is taking place through (n)ethnographic fieldwork and cross-scale policy sourcing. Drawing inspiration from the entanglements of two theoretical framings of significance to participation and equity – sociocultural integrationist perspectives and decolonial Southern theories, this paper maps human geographies and performative co-agencies, and illustrates how practices intrinsic to one arena are disrupted or maintained through practices in others. The study also discusses representations of “named-language”, “named-modality” and “named-identity” through a Southern analytical aperture that calls for acknowledging the roles of different types of semiotic resources when human meaning-making is made salient.
Liminality, Lim, Mobility and Memory. Disrupting the Nature of Things, Beings and Becomings
Authors: Bagga-Gupta Sangeeta , Kamei Machunwangliu 
Published: March 2022

Abstract
Engaging with four geopolitical timespaces, and the concepts of liminality, lim/lines/ borders/boundaries, mobility and memory, against the backdrop of pre-, anti-, post- and de-colonial ideas, this study illustrates how tenets of what we call a “Second Wave of Southern Perspectives” (SWaSP) can illuminate the myths and imaginations that continue to give credibility to the idea of bounded language, identity and nation-states, including the role of languaging as constitutive dimension of these processes. The study presented in this paper has two aims. First, it explicates a SWaSP framing wherein the role of languaging is both a key dimension of the (multi-scalar) organization of everyday life inside and outside institutional physical-digital spaces, and of the remembering of lim i.e., lines or boundaries as dimensions of belonging. Second, by juxtaposing ideas about belonging and (shifting) boundaries across time and spaces, it highlights the mechanisms involved in contemporary re-enforcements of archaic conceptualizations of language, identity and nation-spaces across global settings. We argue that these mechanisms constitute a similar endeavor across the global-North/South, not least given recent discussions related to mobility and digitalization more generally wherein issues regarding democracy and equity are increasingly confronted with rising right-wing agendas and a racial renaissance. We attempt to show how identity tensions of “individuals/communities” and “an-other” are co-construed and argue that such processes contribute to the re-enforcing naturalization of archaic conceptualizations pertaining to not only language, identity, nation-spaces, but also nationalism.
A new species of Volvariella (Pluteaceae, Basidiomycota) from Western Siberia, Russia
Authors: MALYSHEVA EKATERINA , KAPITONOV VLADIMIR , MALYSHEVA VERA 
Published: March 2022

Volvariella clavocystidiata sp. nov., collected from Western Siberia, is described based on morphological characters and molecular data. The new species is characterized by silky fibrillose whitish pileus, clavate cheilo- and pleurocystidia, and basidiospores on average 6.6 × 4.8 µm and swamp habitat. Detailed morphological descriptions, drawings of microstructures and comparisons with closely related taxa are provided. Phylogenetic analyses inferred from the internal transcribed spacer (nrITS) and 28S nuclear ribosomal large subunit (nrLSU) showed that novel taxon formed independent phylogenetic lineage within the genus Volvariella.