bluuebunny/crossref_metadata_2025_split huggingface dataset:
A Deep Clustering-based Novel Approach for Binning of Metagenomics
Data
Authors: Mishra Dwijesh Chandra , Madival Sharanbasappa D. , Sharma Anu , Kumar Sanjeev , Maji Arpan Kumar , Budhlakoti Neeraj , Sinha Dipro , Rai Anil 
Published: September 2022

Background:
One major challenge in binning Metagenomics data is the limited availability
of reference datasets, as only 1% of the total microbial population is yet cultured. This has given rise
to the efficacy of unsupervised methods for binning in the absence of any reference datasets.

Objective:
To develop a deep clustering-based binning approach for Metagenomics data and to evaluate
results with suitable measures.

Method:
In this study, a deep learning-based approach has been taken for binning the Metagenomics
data. The results are validated on different datasets by considering features such as Tetra-nucleotide
frequency (TNF), Hexa-nucleotide frequency (HNF) and GC-Content. Convolutional Autoencoder is
used for feature extraction and for binning; the K-means clustering method is used.

Results:
In most cases, it has been found that evaluation parameters such as the Silhouette index and
Rand index are more than 0.5 and 0.8, respectively, which indicates that the proposed approach is giving
satisfactory results. The performance of the developed approach is compared with current methods
and tools using benchmarked low complexity simulated and real metagenomic datasets. It is found
better for unsupervised and at par with semi-supervised methods.

Conclusion:
An unsupervised advanced learning-based approach for binning has been proposed, and
the developed method shows promising results for various datasets. This is a novel approach for solving
the lack of reference data problem of binning in metagenomics.
Does the Brain Matter? Cortical Alterations in Pediatric Bipolar Disorder:
A Critical Review of Structural and Functional Magnetic Resonance
Studies
Authors: Luciano Mario , Di Vincenzo Matteo , Mancuso Emiliana , Marafioti Niccolò , Di Cerbo Arcangelo , Giallonardo Vincenzo , Sampogna Gaia , Fiorillo Andrea 
Published: September 2022

Abstract:
Pediatric bipolar disorder (PBD) is associated with significant psychosocial impairment,
high use of mental health services and a high number of relapses and hospitalization. Neuroimaging techniques
provide the opportunity to study the neurodevelopmental processes underlying PBD, helping to
identify the endophenotypic markers of illness and early biological markers of PBD. The aim of the
study is to review available studies assessing structural and functional brain correlates associated with
PBD. PubMed, ISI Web of Knowledge and PsychINFO databases have been searched. Studies were
included if they enrolled patients aged 0-18 years with a main diagnosis of PBD according to ICD or
DSM made by a mental health professional, adopted structural and/or functional magnetic resonance
as the main neuroimaging method, were written in English and included a comparison with healthy
subjects. Of the 400 identified articles, 46 papers were included. Patients with PBD present functional
and anatomic alterations in structures normally affecting regulations and cognition. Structural neuroimaging
revealed a significant reduction in gray matter, with cortical thinning in bilateral frontal, parietal
and occipital cortices. Functional neuroimaging studies reported a reduced engagement of the
frontolimbic and hyperactivation of the frontostriatal circuitry. Available studies on brain connectivity
in PBD patients potentially indicate less efficient connections between regions involved in cognitive
and emotional functions. A greater functional definition of alteration in brain functioning of PBD patients
will be useful to set up a developmentally sensitive targeted pharmacological and nonpharmacological
intervention.
Drug Repurposing in Cancer Research: A Bibliometric Analysis from 2012
to 2021
Authors: Bali Elif Burcu 
Published: September 2022

Background:
In this study, it was aimed to evaluate the research articles indexed on the
Web of Science about drug repurposing in cancer between 2012 and November 2021.

Method:
Findings were obtained from the Web of Science database. A bibliometric method was
performed to analyze publication types, research fields, citations, countries, institutions, active journals,
authors, and keywords. The data were supported by using collaboration networks, including
visualization maps. Globally, of 5,568 publications, only 408 were research papers in cancer
research. However, the number of publications and citations was observed to increase significantly
over the years, especially in 2020 and 2021. The majority of the publication types were original articles
in the oncology field. Unsurprisingly, the USA was the most active country in publishing articles.

Results:
The University of Texas in the USA was the institution with the highest number of publications.
A team of researchers led by Zdenek Skrott published the most cited paper. While Pantziarka’s
research team was the most active in publication productivity, Ferlay J’s research group had the
highest value of citation burst. Cancers and Cancer Research were the most active journals in terms
of publications and citation numbers, respectively. After the keyword drug repurposing, the most
frequently used keywords were “apoptosis” and “breast cancer”, indicating the research hotspots.

Conclusion:
This is the first bibliometric research in detail to point out that drug repurposing in
cancer is a novel and growing area, especially in developed countries.
“TAKE PITY OF YOUR TOWN AND OF YOUR PEOPLE”
Authors: Hale Christopher John 
Published: September 2022

It has been argued that the practice of siege warfare is at the very limit of legality under the terms of International Humanitarian Law.[1] The question addressed in this essay might be rephrased: how do the laws of armed conflict permitsieges to become humanitarian disasters? More precisely, can military doctrine regarding the efficacy of siege warfare operations to induce surrender of besieged forces comply in real world terms with the laws of armed conflict? Since February, 2022 it is alleged that Russian armed forces perpetrated a number of crimes against humanity in Ukraine during sieges of cities such as Mariupol. These alleged crimes include indiscriminate targeting of civilian habitation and attacks on evacuation corridors.[2] In the 1990s, siege warfare in the former Yugoslavia provoked international censure and criminal prosecution of perpetrators. Nevertheless, siege operations in Syria and Kashmir today show no sign of respecting the rights of civilian populations despite international censure. The core legal issue regarding sieges is the principle of distinction between combatants and non-combatant civilians and thus decisions regarding targeting and proportionality. The essay will show that distinction is a recent innovation in International Humanitarian Law and uncertainly embodied in military doctrine. The first part reviews evolving IHL norms pertinent to modern sieges. In the second, the essay examines modern jurisprudence regarding the conduct of siege warfare derived from the International Criminal Tribunal for the Former Yugoslavia (ICTY) prosecution of Major General Stanislav Galić and Major General Dragomir Milosević.[3]

[1] Riordan, K., ‘Shelling, Sniping and Starvation: the Law of Armed Conflict and the Lessons of the Siege of Sarajevo’, Victoria University of Wellington Law Review, 41 (2), p.150; Watts, S., Under Siege: International Humanitarian Law and Security Council Practice Concerning Urban Siege Operations’, Research and Policy Paper, CHE Project, May 2014.
[2] https://blogs.icrc.org/law-and-policy/2022/03/17/armed-conflict-in-ukraine-a-recap-of-basic-ihl-rules/
[3] https://www.icty.org/case/galic
ANALISA KINEMATIK SESAR PALU-KORO SEGMEN PALU DAERAH WISOLO HINGGA WERA KABUPATEN SIGI PROVINSI SULAWESI TENGAH
Authors: Hamad Harly 
Published: September 2022

The Sulawesi Island is composed of a complex tectonic arrangement, one of the reasons for the complexity of the tectonic arrangement in Central Sulawesi, namely the presence of the Palu-Koro Fault (Bellier, et al. 2001). This research discussed the tectonic evolution and kinematics of the Palu Koro fault in the Palu segment from Wisolo to Wera, Sigi District, Central Sulawesi Province and its surroundings, to describe the succession of paleostress fields, 150 striations in the fault plane were measured in 5 paths of the measurement location. The stress inversion method developed by Delvaux and Sperner (2003) used in analyzing the stress regime to determine the evolution of stresses that developed in the research area using the Win Tensor 5.0.1 application. The results of rock deformation stress inversion analysis shows the order of 4 orientations of the elongation axis, namely in the first phase with the Southwest – Northeast orientation, the second phase with the South – North orientation, the third phase with the North West – South Southeast orientation, and finally the fourth phase with the Northwest – Southeast orientation. Based on the results of the reconstruction, the Palu-Koro Fault in the Palu segment from the Wisolo to Wera area was formed in the first phase with a downward or oblique movement on the Southwest – Northeast elongation axis and the Northwest – Southeast stress orientation with the stress regime type, namely strike slip
STUDI EKSPERIMENTAL PENGARUH PENGGUNAAN BATANG KAYU YANG DIMIRINGKAN TERHADAP DEFORMASI TANAH AKIBAT LIKUIFAKSI
Authors: Susanti Rini 
Published: September 2022

Bencana alam berupa gempa bumi, tsunami dan likuifaksi yang terjadi di Kota Palu pada tanggal 28 September 2018 telah mengakibatkan dampak kerusakan dan juga korban jiwa yang sangat besar. Berdasarkan kejadian tersebut Pemerintah Kota Palu berinisiatif untuk melakukan pencegahan berupa perbaikan tanah agar mengurangi dampak kerusakan yang ditimbulkan jika kejadian serupa terjadi di masa depan. Studi ini bertujuan untuk mengetahui seberapa besar efektifitas batang kayu dalam mereduksi deformasi tanah yang diakibatkan oleh likuifaksi sebagai alternatif pencegahan yang memenuhi syarat teknik maupun ekonomis. Pengujian dilakukan menggunakan shaking table yang diisi pasir jenuh untuk menciptakan simulasi likuifaksi. Pemodelan perkuatan kayu menggunakan kayu diameter 1,5 cm dan panjang 15 cm yang dipasang dengan cara ditancapkan ke dalam pasir dengan kemiringan 150 terhadap posisi vertikal. Dalam pengujian ini, digunakan beberapa variasi kondisi yang nantinya akan di analisis efektifitasnya. Hasil dari pengujian eksperimental diperoleh persentase efektifitas penggunaan batang kayu yang dimiringkan per tiap variasi. Persentase efektifitas dari perkuatan satu lapis batang kayu adalah sebesar 10,34 %. Persentase efektifitas dari perkuatan dua lapis batang kayu adalah sebesar 14,94 %. Persentase efektifitas dari perkuatan untuk rumah baru adalah sebesar 18,16 %. Sehingga dapat ditarik kesimpulan bahwa penerapan variasi-variasi perkuatan pada pengujian tersebut telah berhasil mereduksi penurunan pasir daripada penurunan model rumah pada pasir lepas dan jenuh tanpa perkuatan tanah. Hasil dari penelitian ini diharapkan mampu menjadi alternatif perkuatan tanah untuk mencegah dampak likuifaksi.
KAJIAN BANGKITAN–TARIKAN PERJALANAN BERDASARKAN DATA PARKIR DI GEDUNG PERBANKAN KOTA PALU
Authors: Ramdani Desi Salsa , Setiawan Arief 
Published: September 2022

Salah satu peningkatan pelayanan publik adalah perbankan. Gedung perbankkan mempunyai peran penting sebagai pusat pelayanan jasa keuangan dan merupakan salah satu guna lahan yang cukup banyak menimbulkan arus pergerakan berupa bangkitan dan tarikan perjalanan. Berdasarkan dimensi waktu harian, suatu tata guna lahan yang pada pagi hari membangkitkan perjalanan, maka pada sore hari tata guna lahan tersebut akan menarik perjalanan. Begitu pula sebaliknya, tata guna lahan yang di pagi hari berfungsi menarik perjalanan, pada sore hari akan berubah fungsi menjadi daerah bangkitan perjalanan. Tujuan penelitian ini untuk mengetahui modelbangkitan tarikan berdasarkan data parkir. Penelitian dilakukan pada gedung perbankan di kota palu yakni, PT. Bank Sulteng Jl.Sultan Hasanuddin. Pengambilan data penelitian dilakukan survei secara langsung di lapangan pada hari Senin dan Jumat. Pengolahan data dilakukan dengan menggunakan metode analisa regresi untuk memodelkan bangkitan tarikan perjalanan. Dari hasil analisis diperoleh bangkitan perjalanan untuk sepeda motor (Y = 11,25x0,2956, R² = 0,6703) ,untuk tarikan perjalanan sepeda motor ( Y = 2,8991x0,7091, R² = 0,8153 ) , bangkitan perjalanan Mobil (Y = 8,0735x0,3388,R² = 0,7072) dan untuk tarikan perjalanan Mobil (Y = 3,8457x0,583,R² = 0,8091).
Study of Inflation using Stationary Test with Augmented Dickey Fuller & Phillips-Peron Unit Root Test (Case in Bukittinggi City Inflation for 2014-2019)
Authors: Roza Afnita , Violita Evony Silvino , Aktivani Sherly 
Published: September 2022

This classical regression model is designed to handle the relationship between stationary variables and should not be applied to non-stationary series. A time series data is said to be stationary if the mean, variance, and covariance remain constant over time. The problem associated with non-stationary variables, and often encountered by researchers when dealing with time series data, is spurious regression. A clear indicator of false regression is the low Durbin-Watson statistic but has a higher coefficient of determination (R2). Therefore, before doing modeling or forecasting using time series data, it is very important to do a stationary test. In this study, we use inflation data in the City of Bukittinggi from January 2014 to December 2019 as a case study. The data shows an uptrend and correlated error terms. Empirical results show that inflation data in Bukittinggi City is a stationary series.
Peran Parenting dalam Pendidikan Anak di SD Negeri Percobaan Kota Padang
Authors: Maza R Difri , Erianjoni Erianjoni 
Published: September 2022

Penelitian ini bertujuan untuk mendeskripsikan bagaimana peran parenting dalam pendidikan anak di Sekolah Dasar Percobaan Kota Padang. Kegiatan ini sudah lama diterapkan dibeberapa sekolah terutama pada anak tingkatan PAUD sama TK. Keterlibatan orang tua merupakan salah bentuk partisipasi orang tua dalam pendidikan dan kehidupan anak. Selama ini orang tua beranggapan dengan mencukupi kebutuhan yang diperlukan anak sudah cukup, dengan cara pola pikir tersebut orang tua tidak memahami apakah yang diberikan sudah sesuai dengan perkembangan dan kebutuhan seorang anak. Salah satunya solusi untuk mengatasihal tersebut sekolah tetap melanjutkan kegiatan parenting dengan cara memanfaatkan kegiatan parenting untuk menumbuh perkembangan dan mendidik anak melalui kegiatan parenting yang di adakan di sekolah tersebut. Teori yang digunakan dalam penelitian ini adalah teori aksi yang dijelaskan oleh Talcott Parsons. Penelitian ini menggunakan pendekatan kualitatif dengan tipe deskriptif, teknik pemilihan informan dilakukan secara purposive sampling dengan 10 orang informan. Dalam pengumpulan data dilakukan dengan cara observasi, wawancara mendalam dan dokumentasi. Data dianalisis dengan teknik analisis interaktif Miles dan Hubertman dengan cara reduksi data,penyajian data dan menarik kesimpulan. Hasil penelitin ini menunjukkan dari peran parenting dalam pendidikan anak di SD Negeri Percobaan Kota Padang adalah (1) peran parenting sebagai pembentukan karakter anak (2) peran parenting sebagai menyalurkan bakat anak (3) peran parenting sebagai menumbuhkan bakat wirausaha anak.
Interaksi Virtual Mahasiswa Praktek Lapangan Kependidikan di SMA Negeri 1 Kecamatan Guguak Melalui Aplikasi WhatsApp Group
Authors: Sary Cindy Fatika , Gautama Mohammad Isa 
Published: September 2022

Penelitian ini bertujuan menjelaskan bentuk-bentuk interaksi virtual yang terjadi pada mahasiswa PLK di SMA Negeri 1 Kecamatan Guguak melalui aplikasi WhatsApp Group. Hal ini menarik dikaji karena aplikasi WhatsApp Group berfungsi sebagai wadah dalam berinteraksi secara virtual, untuk penyebaran informasi dalam pelaksanaan kegiatan PLK. Setiap informasi yang diberikan oleh anggota di dalam group adanya respon yang diberikan oleh anggota lain dengan cara mengirimkan pesan panjang, voice note, gambar, stiker beserta emoticon. Setiap anggota memiliki pemahaman yang berbeda-beda dari informasi yang diterima. Ada yang memberikan respon yang baik dengan disertai penggunaan emoticon ada juga yang menentang atau menggunakan kata-kata kasar atau sindiran. Penelitian ini menggunakan teori interaksionisme simbolik yang dijelaskan oleh George Herbert Mead. Metode penelitian dengan menggunakan pendekatan kualitatif dengan tipe studi kasus. Pemilihan informan dengan purposive sampling dengan 6 orang informan. Pengumpulan data dengan cara observasi, wawancara, dan studi dokumentasi. Teknik analisis Miles dan Huberman. Lokasi penelitian di WhatsApp Group PLK SMANSAGU yang dilakukan secara online. Hasil penelitian menunjukkan bahwa adanya bentuk-bentuk interaksi virtual yang terjadi pada mahasiswa PLK melalui aplikasi WhatsApp Group SMANSAGU, yaitu 1) Terjadinya kerjasama (kekompakan) pada interaksi virtual mahasiswa PLK melalui aplikasi WhatsApp Group PLK SMANSAGU. 2) Usaha penyelesaian masalah pada WhatsApp Group PLK SMANSAGU. 3) Terjadinya kontravensi dalam interaksi virtual mahasiswa melalui aplikasi WhatsApp Group PLK SMANSAGU. 4) Terjadinya konflik pada interaksi virtual mahasiswa melalui aplikasi WhatsApp Group PLK SMANSAGU.
INTERVIEW: PATRICK O’DONNELL
Authors: O’DONNELL Patrick 
Published: September 2022

Q: Literary history, be it national, local, or regional, is perhaps the most conservative form of literary study, with many claiming that the method is outmoded. What can literary histories do to overcome both the risk of obsolescence and their inherent conservatism?
A: The first thing to recall in addressing this matter is the wide recognition amongst historians that any historical account is a narrative, with specific and identifiable narrative investments and agendas. When it comes to literary history, the question of method is an interesting one, since encounters between history and romance, or the imagined and the factual are foundational elements of the very subject being considered; there is no escaping the “meta” dimension (a narrative about narratives) of literary history. What might be perceived as the anachronistic bent of many older literary histories may be due to a reliance on “methods” that simply replicate received canonical investments instead of challenging them. But this, I suggest, is an incorrect perception: even fairly traditional literary histories, such as the multivolume Oxford History of English Literature—those large tomes that proceeded century by century through eight hundred years of literary production in national space that changed considerably over that time—did not merely repeat canonical history, for in many cases, they in fact made the canon as they unearthed heretofore ignored works or promoted a specific set of works as being more important than others. And there are shelves-full of literary histories and anthologies which purposely set out to radically reshape the canon as received through the likes of the Oxford History. The issue then, for me, is not whether a literary history is conservative or not—it is inevitably conservative in that it is engaging in some form of canon-formation, even if it is a new one—but whether or not it openly engages with its equally inherent radicality in actively reshaping the canon and recognizing its own historical investments and agendas.
Representasi Gerakan Feminisme pada Akun Instagram @perempuanfeminis
Authors: Shabira Fakhira 
Published: September 2022

Perkembangan teknologi hari ini memungkinkan terjadinya interaksi antar individu maupun kelompok dapat dilakukan melalui media sosial. Interaksi yang terjadi di media sosial semakin berkembang menjadi wadah bagi komunitas maupun gerakan-gerakan tertentu salah satunya adalah gerakan feminis. Dengan adanya perkembangan internet dan media sosial, gerakan feminisme ini melanjutkan perjuangannya menggunakan media sosial seperti akun @perempuanfeminis. Penelitian ini melihat representasi gerakan feminisme pada akun Instagram @perempuanfeminis menggunakan analisis isi yang dilakukan secara kualitatif. Dilihat dari unggahan dan tampilan profil Instagram @perempuanfeminis, akun ini merepresentasikan gerakan feminis yang berjuang melawan terjadinya kekerasan seksual yang sedang marak terjadi, melawan ketidakadilan hukum bagi korban kekerasan seksual sehingga mendukung disahkannya RUU PKS dan Permendikbud sebagai payung hukum kekerasan seksual di negara ini. Selain itu, unggahan yang ada merepresentasikan bahwa gerakan ini mendukung adanya kesetaraan gender laki-laki dan perempuan melawan budaya patriarki yang dianggap sebagai toxic culture. Perempuan memiliki kesempatan yang sama dalam menentukan pilihan dan jalan hidupnya. Gerakan feminisme juga direpresentasikan sebagai gerakan saling mendukung sesama perempuan.
Kata Kunci : Feminis, media sosial, kekerasan seksual, kesetaraan gender
Representasi tentang Eksistensi Perempuan pada Iklan Teh Sariwangi
Authors: Ramdhan Ali Muhammad , Yusanto Freddy 
Published: September 2022

Ditengah perjuangan kaum feminis yang memperjuangkan kesetaraan gender, praktikpraktik budaya patriarki terus mensubdordinasi perempuan pada hampir seluruh aktivitas kehidupan. Hal tersebut disebabkan oleh budaya patriarki yang sudah mengakar sejak lama di Indonesia. Teh Sariwangi merilis sebuah iklan yang berjudul “#MariBicara dengan Pasangan Bersama Hangatnya SariWangi”. Iklan tersebut menceritakan kisah seorang istri yang mencoba meminta izin suaminya untuk tetap bisa bekerja di luar rumah. Dengan menggarisbawahi perempuan yang memperjuangkan eksistensinya di dalam budaya patriarki. Penelitian ini dilakukan untuk mengetahui bagaimana eksistensi perempuan dalam budaya patriarki pada iklan Teh Sariwangi Versi #maribicara Dengan Pasangan Bersama Hangatnya Sariwangi dengan menggunakan metode penelitian semiotika John Fiske yang terbagi menjadi tiga level yaitu; level realitas yang terdiri dari kode tampilan, gesture, perilaku, ekspresi, dan percakapan; level representasi yang terdiri dari kode kamera, musik, karakter, editing, setting; level ideologi yang ditemukan adalah eksistensi perempuan. Pendekatan yang diterapkan dalam penelitian ini adalah deskriptif kualitatif. Dari hasil penelitian ini ditemukan sebuah ideologi eksistensi perempuan dibalik iklan ini. Eksistensi perempuan praktis diluncurkan dalam adegan pada iklan. Ditunjukan dengan adanya sejarah perempuan, mitos perempuan, dan perempuan masa kini yang diperlihatkan melalui level realitas dan representasi pada iklan.
Kata Kunci : Eksistensi Perempuan, Patriarki, Semiotika, Iklan