bluuebunny/crossref_metadata_2025_split huggingface dataset:
Chromospheric extension of the MURaM code
Authors: Przybylski D. , Cameron R. , Solanki S. K. , Rempel M. , Leenaarts J. , Anusha L. S. , Witzke V. , Shapiro A. I. 
Published: May 2022

Context. Detailed numerical models of the chromosphere and corona are required to understand the heating of the solar atmosphere. An accurate treatment of the solar chromosphere is complicated by the effects arising from non-local thermodynamic equilibrium (NLTE) radiative transfer. A small number of strong, highly scattering lines dominate the cooling and heating in the chromosphere. Additionally, the recombination times of ionised hydrogen are longer than the dynamical timescales, requiring a non-equilibrium (NE) treatment of hydrogen ionisation.
Aims. We describe a set of necessary additions to the MURaM code that allow it to handle some of the important NLTE effects. We investigate the impact on solar chromosphere models caused by NLTE and NE effects in radiation magnetohydrodynamic simulations of the solar atmosphere.
Methods. The MURaM code was extended to include the physical process required for an accurate simulation of the solar chromosphere, as implemented in the Bifrost code. This includes a time-dependent treatment of hydrogen ionisation, a scattering multi-group radiation transfer scheme, and approximations for NLTE radiative cooling.
Results. The inclusion of NE and NLTE physics has a large impact on the structure of the chromosphere; the NE treatment of hydrogen ionisation leads to a higher ionisation fraction and enhanced populations in the first excited state throughout cold inter-shock regions of the chromosphere. Additionally, this prevents hydrogen ionisation from buffering energy fluctuations, leading to hotter shocks and cooler inter-shock regions. The hydrogen populations in the ground and first excited state are enhanced by 102–103 in the upper chromosphere and by up to 109 near the transition region.
Conclusions. Including the necessary NLTE physics leads to significant differences in chromospheric structure and dynamics. The thermodynamics and hydrogen populations calculated using the extended version of the MURaM code are consistent with previous non-equilibrium simulations. The electron number and temperature calculated using the non-equilibrium treatment of the chromosphere are required to accurately synthesise chromospheric spectral lines.
Importance of source structure on complex organics emission
Authors: Nazari P. , Tabone B. , Rosotti G. P. , van Gelder M. L. , Meshaka R. , van Dishoeck E. F. 
Published: May 2022

Context. The protostellar stage is known to be the richest star formation phase in emission from gaseous complex organic molecules. However, some protostellar systems show little or no millimetre (mm) line emission of such species. This can be interpreted as a low abundance of complex organic molecules. Alternatively, complex species could be present in the system, but are not seen in the gas.
Aims. The goal is to investigate the second hypothesis for methanol as the most abundant complex organic molecule in protostellar systems. This work aims to determine how effective dust optical depth is in hiding methanol in the gas, and whether methanol can mainly reside in the ice due to the presence of a disk that lowers the temperatures. Hence, we attempt to answer the question whether the presence of a disk and optically thick dust reduce methanol emission even if methanol and other complex species are abundant in the ices and gas.
Methods. Using the radiative transfer code RADMC-3D, we calculated methanol emission lines from an envelope-only model and from an envelope-plus-disk model. We compared the results with each other and with the observations. Methanol gas and ice abundances were parametrised inside and outside of the snow surfaces based on values from observations. Both models included either dust grains with low mm opacity or high mm opacity, and their physical parameters such as envelope mass and disk radius were varied.
Results. Methanol emission from the envelope-only model is always stronger than from the envelope-plus-disk model by at least a factor ∼2 as long as the disk radius is larger than ∼30 au (for L = 8 L⊙). In most cases, this is due to lower temperatures (disk shadowing), which causes the smaller amount of warm (≳70 K) methanol inside the snow surface of the envelope-plus-disk model. The intensities drop by more than an order of magnitude for models including high mm opacity dust grains and disk radii of at least ∼50 au (for L = 8 L⊙) due to continuum over-subtraction.
Conclusions. The line intensities from the envelope-only models match the observations moderately well when methanol emission is strong, but they overproduce the observations of protostars with lower methanol emission even with large dust optical depth effects. The envelope-plus-disk models can explain the bulk of the observations. However, they can only reproduce the observations of sources with high luminosities and very low methanol emission when the dust optical depth is significant in the envelope and continuum over-subtraction becomes effective in the disk (high mm opacity dust grains are used). Therefore, both the effects of disk and dust optical depth should be considered to explain the observations. In conclusion, it is important to take physical structure into account in future chemical studies of low-mass protostars: absence of gas-phase methanol emission does not imply absence of methanol molecules in either gas or ice.
Carbon Plate Shoes Improve Metabolic Power and Performance in
Recreational Runners
Authors: Nielsen Anders , Franch Jesper , Heyde Christian , de Zee Mark , Kersting Uwe , Larsen Ryan Godsk 
Published: May 2022

AbstractThis study compared metabolic power (MP) and time trial (TT) running performance
between Adidas Adizero Adios (AAA) and Nike VaporFly 4% (NVP).
Thirty-seven runners completed three laboratory sessions and two field sessions
(n=30). After familiarization (visit 1), participants completed eight
6-min treadmill running bouts (four with each shoe, counterbalanced) at their
preferred pace, and MP was assessed using indirect calorimetry (visits 2 and 3).
During visits 4 and 5, participants completed two outdoor TTs
(~3.5 km) in NVP and AAA (counterbalanced). Compared with AAA,
NVP exhibited superior MP (NVP: median=13.88
(Q1–Q3=12.90–15.08 W/kg; AAA:
median=14.08
(Q1–Q3=13.12–15.44 W/kg;
z=−4.81, p<.001, effect size=.56) and TT
(NVP=793±98 s; AAA=802±100 s,
p=.001; effect size=.09). However, there was no relationship
between changes in MP and changes in TT between shoes (r=.151
p=.425, 95% confidence interval=[−.22; .48]).
Our results demonstrate that NVP, compared with AAA, improves MP and TT in
recreational runners. The lack of correlation between changes in MP and TT
indicates that factors other than improved MP contribute to faster
short-distance TT with NVP.
Hochgradige chronische Osteomyelitis des Darmbeines bei einem Alpaka
Authors: Schoiswohl Julia , Eibl Cassandra , Kofler Johann , Brunthaler Rene , Gumpenberger Michaela , Schieder Katrin , Franz Sonja 
Published: May 2022

ZusammenfassungEine 5,5 Jahre alte Alpakastute wurde aufgrund einer Lahmheit hinten rechts an die Universitätsklinik für Wiederkäuer überwiesen. Vorberichtlich war bereits vor ca. 6 Monaten eine systemische antibiotische Therapie über mehrere Tage durchgeführt worden, worauf sich das Gangbild verbesserte und die Lahmheit kaum noch zu beobachten war. Zum damaligen Zeitpunkt gab es seitens der Tierhalter keinen Hinweis auf eine traumatische Ursache für diese Lahmheit. Bei der klinischen Aufnahmeuntersuchung zeigte sich kaudal des rechten Tuber coxae eine ca. 2 × 2 cm große, fluktuierende, nicht vermehrt warme, nicht schmerzhafte Umfangsvermehrung, welche zum darunterliegenden Gewebe hin verschieblich war. Zudem wurde eine mittelgradige, gemischte Lahmheit mit überwiegendem Anteil der Hangbeinkomponente am rechten Hinterbein diagnostiziert. Als weiterführende diagnostische Maßnahme wurde eine sonographische Untersuchung der rechten Gluteal- und Hüftgelenksregion durchgeführt, wobei hochgradige Knochenkonturveränderungen im Bereich des rechten Hüftgelenkes festgestellt wurden. Zur weiteren Abklärung wurde eine röntgenologische Untersuchung des Beckens vorgenommen. Unter Miteinbeziehung der klinisch festgestellten Fistelöffnung an der rechten Glutealregion und den Befunden der radiologischen Untersuchung wurde die Diagnose einer bereits seit längerem bestehenden infizierten Fraktur des rechten Darmbeines mit hochgradiger unregelmäßig verkalkter Kallusbildung und gering- bis mittelgradiger Osteomyelitis gestellt. Aufgrund der sonografischen und röntgenologischen Befunde wurde eine schlechte Prognose gestellt und der Patient euthanasiert. Zur weiteren Dokumentation und um das Ausmaß der pathologischen Veränderungen besser darstellen zu können, wurde zusätzlich eine computertomografische Untersuchung vom Becken und der Lendenwirbelsäule im Bereich L3–L6 durchgeführt. Zur finalen Abklärung wurde eine pathohistologische Untersuchung der festgestellten Knochenveränderungen sowie eine bakteriologische Untersuchung des Abszessinhaltes vorgenommen.Anhand des hier vorgestellten Falles wird ersichtlich, wie wichtig eine gründliche klinische und orthopädische Untersuchung und vor allem zusätzlich weiterführende Untersuchungen sind, da vor allem Neuweltkamele oftmals nur geringe klinische Symptome zeigen, obwohl Veränderungen bereits massiv ausgeprägt sein können.
Vorgehensweise und Hygienemaßnahmen beim Ausbruch von Herpes, Influenza, Druse oder Infektionen mit multiresistenten Keimen
Authors: Gehlen Heidrun , Rutenberg Dusty , Simon Claudia , Reinhold-Fritzen Birgitta , Drozdzewska Karolina 
Published: May 2022

ZusammenfassungDas Ziel dieses Reviews ist, die allgemein gültigen Hygienemaßnahmen im Pferdestall zusammenzufassen sowie aktuelle Empfehlungen bei Ausbruch relevanter Infektionskrankheiten zu liefern. Die allgemeine Sauberkeit, Handhygiene, stressarme Haltung sowie regelmäßige Entwurmungen und Impfungen gehören dabei zur Basishygiene im Pferdebestand. Wichtige Maßnahme in der Infektionsprävention stellen dabei die Quarantäne aller rückkehrenden oder neu eingestallten Equiden und das regelmäßige Waschen und Desinfizieren der Hände zur Reduktion der Übertragung von Krankheitserreger dar.Die Erstellung eines Hygieneplans, welcher die allgemeinen Biosicherheitsregeln sowie die Vorgehensweise für den Fall eines Ausbruchs einer ansteckenden Erkrankung, Zoonose bzw. Infektion mit multiresistenten Erregern (MRE) festlegt, wird empfohlen. Bereits bei begründetem Verdacht auf eine dieser Erkrankungen sollten weitere, über die übliche Basishygiene hinausgehende Maßnahmen (inklusive Schutzkleidung, Flächen- und Gerätereinigung und Desinfektion sowie Isolation potenziell erkrankter Tiere) eingeleitet werden. Die erforderlichen diagnostischen Proben sollen möglichst zeitnah entnommen werden, um einen Krankheitsverdacht schnellstmöglich zu bestätigen. Die entsprechenden Schutzmaßnahmen sind dem Übertragungsrisiko der Infektionserreger und der Art ihrer potenziellen Übertragung anzupassen.Neben dem „Lock-Down“ des ganzen Stalls, der Klinik oder des Turnier-/Veranstaltungsgeländes spielt die räumliche Trennung der Tiere eine wichtige Rolle. Ein „Ampelsystem“ wird empfohlen, bei dem kranke oder positiv getestete Pferde in die rote Gruppe eingeordnet werden („erkrankt“). Tiere mit möglichem Kontakt zum pathogenen Agens sollten der gelben Gruppe („verdächtig“) zugeteilt und regelmäßig auf Anzeichen der Erkrankung und Fieber kontrolliert werden. In der grünen Kategorie („unverdächtig“) befinden sich klinisch unauffällige Pferde ohne Kontakt zu erkrankten Tieren. Zwischen den räumlich getrennten Bereichen sollte die Schutzkleidung gewechselt werden und eine entsprechende Desinfektion stattfinden.Alle erweiterten Hygienemaßnahmen sollten beibehalten werden bis alle Tiere negativ getestet wurden und keine Symptome der Erkrankung über eine ausreichend lange Zeit zeigen.
Ultrasonografische Früherkennung von Venenveränderungen sowie der Nachweis von Biofilmen auf Venenverweilkathetern beim Pferd
Authors: Doerffel Annika , Reinert Anja , Böttcher Denny , Winter Karsten , Brehm Walter , Gittel Claudia 
Published: May 2022

ZusammenfassungGegenstand und Ziel Die Nutzung intravenöser Verweilkatheter ist trotz größter Sorgfalt mit Komplikationen verbunden. Gewebeveränderungen und minimale Entzündungsreaktionen an der Vene können bereits vor klinisch erkennbaren Veränderungen auftreten. Ziel dieser Studie war es, die Vena jugularis während und nach der Katheterisierung klinisch und ultrasonografisch zu beurteilen und eine mögliche bakterielle Besiedlung des Katheters zu evaluieren.Material und Methoden In einer prospektiven Beobachtungsstudie wurden 55 Pferde mit einem Venenverweilkatheter täglich klinisch und ultrasonografisch untersucht. Die steril entfernte Katheterspitze wurde mikrobiologisch mittels Anzucht sowie morphologisch in der Rasterelektronenmikroskopie untersucht. Die erhobenen Daten wurden deskriptiv analysiert und die Venenwanddicke an verschiedenen Lokalisationen und Zeitpunkten hinsichtlich verschiedener Parameter mit nicht-parametrischen Tests verglichen (Signifikanzniveau p < 0,05; Bonferroni-Korrektur bei multiplem Testen).Ergebnisse Die Verweildauer des Katheters betrug zwischen 19 Stunden und 10 Tagen (Median 69,5 Stunden). Es konnten keine behandlungswürdigen Venenerkrankungen beobachtet werden, lediglich transiente geringgradige Gewebeveränderungen traten bei 41,8 % der Patienten auf. Im Ultraschall konnten Venenklappen und Kollateralgefäße zuverlässig dargestellt werden. Lokalisation (p ≤ 0,001), Jahreszeit (p = 0,006) und Allgemeinanästhesie (p ≤ 0,001) hatten einen signifikanten Einfluss auf die im Ultraschall gemessene Venenwanddicke, welche an der Einstichstelle verbreitert war. Der Nachweis von Bakterien war positiv in 23,5 % (12/51 Proben, mikrobiologische Anzucht) bzw. 25,0 % (4/16 Proben, Rasterelektronenmikroskopie).Schlussfolgerung und klinische Relevanz Jeder Katheter erzeugt eine Entzündungsreaktion der Venenwand und des umliegenden Gewebes. Diese Veränderungen können vor allem in der ultrasonografischen Untersuchung dargestellt werden, welche eine praxistaugliche Diagnostik darstellt. Eine Vorhersage über sich entwickelnde Venenerkrankungen war bei den untersuchten Probanden nicht möglich. Die Ergebnisse der Rasterelektronenmikroskopie zeigen, dass nicht in jedem Fall morphologisch auf dem Katheter erkennbare Bakterien auch in der Kultivierung nachgewiesen werden können.
Modelling Changes in Bone and Body Composition Over a Season in Elite
Male Footballers
Authors: Varley Ian , Ward Marcus , Thorpe Chris , Beardsley Nathan , Greeves Julie , Sale Craig , Saward Chris 
Published: May 2022

AbstractThis study investigated the change in bone and body composition characteristics of elite football players and recreationally
active control participants across the course of a season. Fortysix participants (20 footballers and 26 recreationally active
controls) were assessed by dual-energy x-ray absorptiometry
and peripheral Quantitative Computed Tomography for a range
of bone and body composition characteristics at four points
over the course of a competitive season. Multilevel modelling
was used to examine changes. Footballers had higher characteristics than controls for 24 out of 29 dual-energy x-ray absorptiometry and peripheral Quantitative Computed Tomography variables (all p<0.05). However, there was also significant
random inter-individual variation in baseline values for all
variables, for both footballers and controls (p < 0.05). Wholebody bone mineral density, leg and whole-body bone mineral
content, tibial bone mass and area (38%) increased across the
season in footballers (p < 0.05), and there was significant random inter-individual variation in the rate of increase of leg and
whole-body bone mineral content (p<0.05). Whole-body bone
mineral density, leg and whole-body bone mineral content,
tibial bone mass and area (38%) increased over the course of the
season in elite football players. The modelling information on
expected changes in bone characteristics provides practitioners with a method of identifying those with abnormal bone
response to football training and match-play
Recent Advances in the Synthesis and Medicinal Chemistry of SF5 and SF4Cl Compounds
Authors: Sani Monica , Zanda Matteo 
Published: May 2022

AbstractThis short review covers the most important advances published in the literature during the last five years, concerning the synthesis, chemical modifications, and applications of SF5 and SF4Cl compounds in medicinal/bioorganic chemistry and materials science.1	Introduction2	Methods for Incorporation/Manipulation of SF4Cl/SF5 Groups2.1	Nonaromatic SF5 Compounds via Direct Pentafluorosulfanylation of Alkenes and Alkynes2.2	SF4Cl- and SF5-Aryl/Heteroaryl Derivatives3	Synthesis of SF5/SF4Cl/SF4-Substituted Small Molecules3.1	Heterocycles3.2	Amines and Amino Acids3.3	α-SF5 ketones3.4	Miscellaneous Alkyl-, Alkenyl-, and Aryl-SF5 Compounds4	Medicinal/Biological Applications4.1	Anticancer Compounds4.2	Antibacterial and Antiparasitic Compounds4.3	Central Nervous System4.4	Miscellaneous Biological Activity5	Materials Science Applications6	Conclusion
Using big data to understand the online ecology of COVID-19 vaccination hesitancy
Authors: Teng Shasha , Jiang Nan , Khong Kok Wei 
Published: May 2022

AbstractWith a large population of people vaccinated, it is possible that at-risk people are shielded, and the coronavirus disease is contained. Given the low vaccine uptakes, achieving herd immunity via vaccination campaigns can be challenging. After a literature review, we found a paucity of research studies of vaccine hesitancy from social media settings. This study aims to categorise and create a typology of social media contents and assess the priority of concerns for future public health messaging. With a dataset of 43,203 YouTube comments, we applied text analytics and multiple regression analyses to examine the correlations between vaccine hesitancy factors and vaccination intention. Our major findings are (i) Polarized views on vaccines existed in the social media ecology of public discourse, with a majority of people unwilling to get vaccinated against COVID-19; (ii) Reasons behind vaccine hesitancy included concerns about vaccine safety, potential side-effects, lack of trust in government and pharmaceutical companies; (iii) Political partisan-preferences were exemplified in vaccine decision-making processes; (iv) Anti-vaccine movements with amplified misinformation fuelled vaccine hesitancy and undermined public confidence in COVID-19 vaccines. We suggest public health practitioners engage in social media and craft evidenced-based messages to online communities in a balanced and palatable way.
Amyloid-like amelogenin nanoribbons template mineralization via a low-energy interface of ion binding sites
Authors: Akkineni Susrut , Zhu Cheng , Chen Jiajun , Song Miao , Hoff Samuel E. , Bonde Johan , Tao Jinhui , Heinz Hendrik , Habelitz Stefan , De Yoreo James J. 
Published: May 2022

SignificanceUnderstanding how protein scaffolds direct mineral morphogenesis is crucial for engineering bone and tooth and would open new vistas in materials design. In the case of tooth enamel, which is the hardest tissue in the body and consists of organized bundles of coaligned apatite crystals, amyloid-like amelogenin nanoribbons are hypothesized to provide the scaffold. We show that these nanoribbons are far more potent calcium phosphate nucleators than other amelogenin motifs or collagen, which provides the scaffold for bone. This potency stems from a periodic array of charged sites that provide a template for calcium phosphate ion binding on a low-energy interface. The ubiquity of β-sheet protein structures suggests that this mechanism can be adopted for the design of synthetic mineralization-directing scaffolds.
Single-cell–resolution map of human retinal pigment epithelium helps discover subpopulations with differential disease sensitivity
Authors: Ortolan Davide , Sharma Ruchi , Volkov Andrei , Maminishkis Arvydas , Hotaling Nathan A. , Huryn Laryssa A. , Cukras Catherine , Di Marco Stefano , Bisti Silvia , Bharti Kapil 
Published: May 2022

Significance
Retinal degenerative diseases affect specific regions of the retinal pigment epithelium (RPE), suggesting the presence of functionally different RPE subpopulations. To identify these subpopulations in human eyes, we generated the first complete morphometric map of the RPE at single-cell resolution using artificial intelligence–based software. We identified five concentric RPE subpopulations, including a ring of RPE cells with cell area similar to macula in the periphery of the eye. Moreover, we found that specific RPE subpopulations are differentially susceptible to monogenic and polygenic retinal diseases. The results obtained here will allow study of molecular and functional RPE differences responsible for regional retinal diseases and will help develop precise cell and gene therapies for specific degenerative eye diseases.
Introduction
Authors: Rakhilina Ekaterina , Reznikova Tatiana 
Published: May 2022

Abstract
The chapter outlines the goals of our project, points out the aspects that distinguish the vocabulary of qualities from other lexical domains, when viewed from a typological perspective, and introduces the methods of data collection and analysis we use in this project and in other related studies. It goes on to discuss the semantic parameters that motivate the lexical oppositions in various qualitative domains.
A new approach to old studies
Authors: Vyrenkova Anastasia , Rakhilina Ekaterina , Orekhov Boris 
Published: May 2022

Abstract
This chapter gives a description of the old terms typology across 78 world languages. The sample size in the research is relatively big, as compared to the other studies in this volume, which is attributable to two main reasons: the semantics of old terms has already been thoroughly described for at least two languages – English and Russian – and the lexemes with this meaning are in most cases featured by bilingual dictionaries. On the basis of the dictionary data supported by additional expertise we propose a semantic map of the OLD domain. The paper also outlines some cross-linguistically recurrent colexification patterns and addresses the specificity of homonymous combinations of old attributes with different semantic classes of nouns.
The qualitative lexicon in Russian Sign Language from a typological perspective
Authors: Kyuseva Maria 
Published: May 2022

Abstract
The paper describes several expressions of physical qualities (namely, sharp, blunt, old, thick-wide, and thin-narrow) in Russian Sign Language (RSL) from a lexical typological perspective. This is the first study to analyse a sign language from the standpoint of the MLexT framework. The results show that RSL structures the aforementioned domains on the same grounds as spoken languages. This finding strongly supports the hypothesis that lexical systems are cognitively motivated. At the same time, RSL exhibits a number of non-trivial lexicalization strategies, which are not accidental but can be explained by the fact that this language is produced in the visual modality.
Introduction to urban pest management.
Authors: Dhang Partho , Koehler Philip , Pereira Roberto , Dye, II Daniel D. 
Published: May 2022

Abstract

This chapter discusses the need for urban pest management, types of urban pests (which include pests associated with human blood; inflicting injury; associated with allergens, contamination and phobia; stored products; buildings and structures), and the history of urban pest management. Key questions (and answers) regarding urban pests and their management are provided.