bluuebunny/crossref_metadata_2025_split huggingface dataset:
Construction of Network Biomarkers Using Inter-Feature Correlation Coefficients
(FeCO3) and their Application in Detecting High-Order Breast
Cancer Biomarkers
Authors: Lin Shenggeng , Lin Yuqi , Wu Kexin , Wang Yueying , Feng Zixuan , Duan Meiyu , Liu Shuai , Fan Yusi , Huang Lan , Zhou Fengfeng 
Published: January 2022

Aims:
This study aims to formulate the inter-feature correlation as the engineered features.

Background:
Modern biotechnologies tend to generate a huge number of characteristics of a sample,
while an OMIC dataset usually has a few dozens or hundreds of samples due to the high costs of generating
the OMIC data. Therefore, many bio-OMIC studies assumed inter-feature independence and selected
a feature with a high phenotype association.

Objective:
Many features are closely associated with each other due to their physical or functional interactions,
which may be utilized as a new view of features.

Method:
This study proposed a feature engineering algorithm based on the correlation coefficients
(FeCO3) by utilizing the correlations between a given sample and a few reference samples. A comprehensive
evaluation was carried out for the proposed FeCO3 network features using 24 bio-OMIC datasets.

Result:
The experimental data suggested that the newly calculated FeCO3 network features tended to
achieve better classification performances than the original features, using the same popular feature selection
and classification algorithms. The FeCO3 network features were also consistently supported by the
literature. FeCO3 was utilized to investigate the high-order engineered biomarkers of breast cancer and detected
the PBX2 gene (Pre-B-Cell Leukemia Transcription Factor 2) as one of the candidate breast cancer
biomarkers. Although the two methylated residues cg14851325 (P-value = 8.06e-2) and cg16602460 (Pvalue
= 1.19e-1) within PBX2 did not have a statistically significant association with breast cancers, the
high-order inter-feature correlations showed a significant association with breast cancers.

Conclusion:
The proposed FeCO3 network features calculated the high-order inter-feature correlations as
novel features and may facilitate the investigations of complex diseases from this new perspective. The
source code is available on FigShare at 10.6084/m9.figshare.13550051 or the web site
http://www.healthinformaticslab.org/supp/.
In-vitro and In-vivo Experimental Models for MERS-CoV, SARSCoV,
and SARS-CoV-2 Viral Infection: A Compendious Review
Authors: Singh Sonia , Kumar Aman , Sharma Himanshu 
Published: January 2022

Abstract:
SARS-CoV-2 belongs to the Coronaviridae family of coronaviruses.
This novel virus has predominantly affected a vast world population and was declared
a pandemic outbreak. The clinical and scientific communities strive to develop
and validate potential treatments and therapeutic measures. The comparative
study of existing synthetic drugs, evaluation of safety aspects, and the development
of novel vaccines can be efficiently achieved by using suitable animal
models of primary infection and validating translational findings in human cell
lines and tissues. The current paper explores varied animal and cell/tissue models
employed and recapitulate various critical issues of ailment manifestation in humans
to develop and evaluate novel therapeutic countermeasures.
Investigation of Carers’ Perspectives of Dementia Misconceptions on Twitter: Focus Group Study
Authors: Hudson Georgie , Jansli Sonja M , Erturk Sinan , Morris Daniel , Odoi Clarissa M , Clayton-Turner Angela , Bray Vanessa , Yourston Gill , Clouden Doreen , Proudfoot David , Cornwall Andrew , Waldron Claire , Wykes Til , Jilka Sagar 
Published: January 2022

Background
Dementia misconceptions on social media are common, with negative effects on people with the condition, their carers, and those who know them. This study codeveloped a thematic framework with carers to understand the forms these misconceptions take on Twitter.

Objective
The aim of this study is to identify and analyze types of dementia conversations on Twitter using participatory methods.

Methods
A total of 3 focus groups with dementia carers were held to develop a framework of dementia misconceptions based on their experiences. Dementia-related tweets were collected from Twitter’s official application programming interface using neutral and negative search terms defined by the literature and by carers (N=48,211). A sample of these tweets was selected with equal numbers of neutral and negative words (n=1497), which was validated in individual ratings by carers. We then used the framework to analyze, in detail, a sample of carer-rated negative tweets (n=863).

Results
A total of 25.94% (12,507/48,211) of our tweet corpus contained negative search terms about dementia. The carers’ framework had 3 negative and 3 neutral categories. Our thematic analysis of carer-rated negative tweets found 9 themes, including the use of weaponizing language to insult politicians (469/863, 54.3%), using dehumanizing or outdated words or statements about members of the public (n=143, 16.6%), unfounded claims about the cures or causes of dementia (n=11, 1.3%), or providing armchair diagnoses of dementia (n=21, 2.4%).

Conclusions
This is the first study to use participatory methods to develop a framework that identifies dementia misconceptions on Twitter. We show that misconceptions and stigmatizing language are not rare. They manifest through minimizing and underestimating language. Web-based campaigns aiming to reduce discrimination and stigma about dementia could target those who use negative vocabulary and reduce the misconceptions that are being propagated, thus improving general awareness.
An Investigation Into the Use of mHealth in Musculoskeletal Physiotherapy: Scoping Review
Authors: Agnew Jonathon M R , Hanratty Catherine E , McVeigh Joseph G , Nugent Chris , Kerr Daniel P 
Published: January 2022

Background
Musculoskeletal physiotherapy provides conservative management for a range of conditions. Currently, there is a lack of engagement with exercise programs because of the lack of supervision and low self-efficacy. The use of mobile health (mHealth) interventions could be a possible solution to this problem, helping promote self-management at home. However, there is little evidence for musculoskeletal physiotherapy on the most effective forms of mHealth.

Objective
The aim of this review is to investigate the literature focusing on the use of mHealth in musculoskeletal physiotherapy and summarize the evidence.

Methods
A scoping review of 6 peer-reviewed databases was conducted in March 2021. No date limits were applied, and only articles written in the English language were selected. A reviewer screened all the articles, followed by 2 additional researchers screening a random sample before data extraction.

Results
Of the 1393 studies, 28 (2.01%) were identified. Intervention characteristics comprised stretching and strengthening exercises, primarily for degenerative joint pain and spinal conditions (5/28, 18%). The most reported use of mHealth included telephone and videoconferencing calls to provide a home exercise program or being used as an adjunct to physiotherapy musculoskeletal assessment (14/28, 50%). Although patient satisfaction with mHealth was reported to be high, reasons for disengagement included a lack of high-quality information and poor internet speeds. Barriers to clinical uptake included insufficient training with the intervention and a lack of time to become familiar.

Conclusions
mHealth has some benefits regarding treatment adherence and can potentially be as effective as normal physiotherapy care while being more cost-effective. The current use of mHealth is most effective when ongoing feedback from a health care professional is available.
Official Websites Providing Information on COVID-19 Vaccination: Readability and Content Analysis
Authors: Yeung Andy Wai Kan , Wochele-Thoma Thomas , Eibensteiner Fabian , Klager Elisabeth , Hribersek Mojca , Parvanov Emil D , Hrg Dalibor , Völkl-Kernstock Sabine , Kletecka-Pulker Maria , Schaden Eva , Willschke Harald , Atanasov Atanas G 
Published: January 2022

Background
Online information on COVID-19 vaccination may influence people’s perception and willingness to be vaccinated. Official websites of vaccination programs have not been systematically assessed before.

Objective
This study aims to assess and compare the readability and content quality of web-based information on COVID-19 vaccination posted on official/governmental websites. Furthermore, the relationship between evaluated website parameters and country vaccination rates were calculated.

Methods
By referring to an open data set hosted at Our World in Data, the 58 countries/regions with the highest total vaccination count as of July 8, 2021, were identified. Together with the websites from the World Health Organization and European Union, a total of 60 vaccination campaign websites were targeted. The “frequently asked questions” or “questions and answers” section of the websites were evaluated in terms of readability (Flesch Reading Ease score and Flesch-Kincaid Grade Level), quality (Health On the Net Foundation code [HONcode] certification and Quality Evaluation Scoring Tool), and content stating vaccination duration of protection and potential side effects.

Results
In terms of readability, the Flesch Reading Ease score of the vaccination frequently asked questions websites ranged between 11.2 and 69.5, with a mean of 40.9 (SD 13.2). Meanwhile, the Flesch-Kincaid Grade Level ranged between 6.5 and 17.6, with a mean of 12.1 (SD 2.8). In terms of quality, only 2 websites were HONcode certified, and the Quality Evaluation Scoring Tool score of the websites ranged between 7 and 20, with a mean of 15.3 (SD 3.1). Half of the websites (25/50) did not present a publication date or date of the last update. Regarding the duration of protection offered by the vaccines, 46% (23/50) of the websites stated that they do not know, and another 40% (20/50) did not address it. Five side effects of the vaccinations were most frequently mentioned, namely, fever/chill (41/50, 82%), various injection site discomfort events (eg, swelling, redness, or pain; 39/50, 78%), headache (36/50, 72%), fatigue (33/50, 66%), and muscle/joint pain (31/50, 62%).

Conclusions
In general, the content quality of most of the evaluated websites was good, but HONcode certification should be considered, content should be written in a more readable manner, and a publication date or date of the last update should be presented.
Від редакції
Authors: Povoroznyuk V.V. 
Published: January 2022

Шановні читачі!Це число журналу ми відкриваємо розповіддю головного редактора нашого журналу, президента Української асоціації остеопорозу, Української асоціації менопаузи, андропаузи та захворювань кістково-м’язової системи, директора Українського науково-медичного центру проблем остеопорозу, керівника відділу клінічної фізіології та патології опорно-рухового апарату ДУ «Інститут геронтології ім. Д.Ф. Чеботарьова НАМН України» (м. Київ), заслуженого діяча науки і техніки України, доктора медичних наук, професора Владислава Володимировича Поворознюка про видатні події, що відбулися у 2016 році під егідою та за участю Української асоціації остеопорозу.
ПАТОГЕНЕТИЧЕСКИЕ АСПЕКТЫ НЕОВАСКУЛЯРНОЙ ПАТОЛОГИИ СЕТЧАТКИ
Authors: Dyomin Y. A. , Biletska P. V. 
Published: January 2022

В течение эмбриогенеза развитие и дифференцировка тканей глаза требует соответствующего формирования глиальных элементов и плотной сосудистой сети. Сетчатка взрослого человека получает кровоснабжение из двух сосудистых систем: собственные сосуды сетчатки и сосуды хориоидеи. Эти два источника различаются не только своей характерной эмбриональной дифференцировкой, но также и функциями во взрослом организме.Сосудистая сеть сетчатки имеет барьерные свойства, в то время как стенки сосудов хориоидеи фенестрированы. Высокая зависимость ткани сетчатки от кровоснабжения делает ее крайне подверженной малейшим сосудистым изменениям, что, в конечном итоге, приводит к патологии органа зрения – пролиферативной ретинопатии, возрастной макулярной дегенерации. Многочисленные факторы вовлечены в процессы эмбрионального и патологического формирования сосудов, включая фактор роста фибробластов, тромбоцитарный фактор роста эндотелия, фактор роста эндотелия сосудов и др.Знания о молекулярных и клеточных взаимодействиях, вовлеченных в формирование, стабилизацию и регресс новообразованных сосудов позволит идентифицировать потенциальные точки приложения новых методов лечения.
ИЗМЕНЕНИЯ ГЛАЗНОГО ДНА У НОВОРОЖДЕННЫХ И ФАКТОРЫ, ОБУСЛАВЛИВАЮЩИЕ ИХ ВОЗНИКНОВЕНИЕ
Authors: Sukhina L. , Lysenko A. , Buchanovska T. 
Published: January 2022

В статье изучены изменения глазного дна у новорожденных в виде ретинальных геморрагий и ишемических изменений сетчатки, а также факторы, обуславливающие возникновение ретинальных геморрагий у новорожденных, такие как возраст матери, пол и вес ребенка, течение беременности, характер родов, положение и предлежание плода, длительность родов. Проведен анализ историй родов женщин и обследовано 423 новорожденных в период 1-3 дней. Новорожденным проведена прямая и обратная офтальмоскопия на фоне медикаментозного мидриаза. Выявлено, что такие изменения сетчатки, как ретинальные геморрагии и ишемические поражения встречаются у трети новорожденных ( 32%) . Факторами значимо (p<0,001) влияющими на развитие ретинальных геморрагий и ишемических изменений сетчатки у новорожденных являются пол ребенка, возраст женщины, анемия беременных, патология в родах, стремительные роды, обвитие пуповиной плода.
Исследование состояния диска зрительного нерва после двухэтапного хирургического лечения первичной открытоугольной глаукомы по результатам сканирующих лазерных методов диагностики
Authors: Rykov S. O. , Kondratenko Yu. M. , Lavryk N. S. , Makarenko I. A. , Vydyborets S. V. 
Published: January 2022

Проведен анализ данных обследования 338 глаз пациентов с первичной открытоугольной глаукомой в послеоперационном периоде двухэтапных антиглаукомных операций в течение 12 мес, распределенных на три группы по типу хирургического лечения. Определены и проанализированы распределение частоты изменений стереометрических параметров диска зрительного нерва относительно исходного состояния по стабилизации, негативизации и положительной динамике по результатам сканирующих лазерных методов диагностики первичной открытоугольной глаукомы. Показатели средней толщины слоя нервных волокон и площади нейроретинального пояска, которые демонстрируют изменения с 3-го месяца наблюдения, целесообразно выделить как наиболее чувствительные и ранние. Это надо учесть в послеоперационном наблюдении за динамикой глаукомной оптической нейропатии.
Применение интраартериального тромболизиса при окклюзии центральной артерии сетчатки: обзор литературы
Authors: Rykov S.O. , Suk S.A. , Saksonov S.G. , Topolnytska O.V. 
Published: January 2022

Острая окклюзия центральной артерии сетчатки является важной нерешенной проблемой в современной офтальмологии. В последние годы в литературе встречаются описания применения локального интраартериального тромболизиса для лечения окклюзии центральной артерии сетчатки.В статье проведен анализ мультицентрового рандомизированного контролируемого клинического исследования (the European Assessment Group for Lysis in the Eye Study), которое сравнивало эффективность локального интраартериального фибринолизису со стандартным консервативным лечением. Проанализировано также 8 нерандомизированных исследований с количеством пациентов более 5, изучавших лечение неартеритичного тромбоза центральной артерии сетчатки с помощью интраартериального тромболизиса. Описана техника проведения локального тромболизиса, указано клинические особенности, которые следует учитывать при окклюзии центральной артерии сетчатки.Авторы не пришли к однозначным выводам об эффективности применения локального тромболизиса при окклюзии центральной артерии сетчатки, поскольку проанализированы исследования имеют существенные недостатки, поэтому данная проблема остается нерешенной и является большим полем деятельности для поиска эффективных методов лечения.
ПРОБИОТИКИ В ЛЕЧЕНИИ АДЕНОВИРУСНЫХ КОНЪЮНКТИВИТОВ
Authors: Sakovych V.N. 
Published: January 2022

Для эффективного лечения заболеваний глаз вирусной этиологии необходим комплексный подход, включающий общее и местное применение противовирусных и иммуномодулирующих препаратов, патогенетических и симптоматических средств. Биопрепараты на основе живых микробных культур применяются в медицине и ветеринарии для коррекции микрофлоры желудочно-кишечного тракта, для борьбы с вирусными и бактериальными инфекциями. Важной ролью пробиотиков является их способность повышать специфическую и неспецифическую иммунную реактивность организма, усиливать клеточный и гуморальный ответ. При введении пробиотиков активизируется продукция цитокинов, особенно интерферона.Цель исследования. Повышение эффективности лечения аденовирусных конъюнктивитов с включением в комплексную терапию индуктора эндогенного интерферона субалина.Материалы и методы исследований. В исследование включены 73 больных (146 глаз) с аденовирусными конъюнктивитами в возрасте от 19 до 72 лет, средний возраст ( М±м) – 38,2 ± 1,1 лет. Все больные с аденовирусными конъюнктивитами были подразделены на 2 клинические группы: основная – 43 больных (86 глаз), контрольная – 40 больных (80 глаз). Группы были сопоставимы и рандомизированы по полу, возрасту, клиническим проявлениям заболевания. Пациенты основной группы получали базисное лечение и дополнительно пробиотик субалин: по 2 капли каждые 2 часа до полного выздоровления (1 ампулу препарата разводили в 5 мл физ. раствора). Больные контрольной группы получали только базисное лечение. Базисная терапия больных с аденовирусными конъюнктивитами вне зависимости от группы, в которую они входили, включала применение противовирусных, антисептических, противовоспалительных, десенсибилизирующих лекарственных средств.Результаты и их обсуждение. Применение пробиотика субалина дополнительно к традиционной терапии в основной группе больных способствовало положительной динамике со стороны органа зрения. Так, исчезновение отека век и конъюнктивы в основных группах больных с аденовирусным конъюнктивитом происходило на 2,39 дня раньше по сравнению с контрольной группой больных с этой патологией (p < 0,05). В основной группе больных выздоровление происходило быстрее на 6,01 дня (p < 0,01). В процессе лечения у всех больных последовательно повышалась коррегированная острота зрения. Применение пробиотика способствовало более высокой остроте зрения у больных в основной группе после проведенного лечения: прирост остроты зрения более 0,7 в основной группе больных с аденовирусным конъюнктивитом составил 23 %, в контрольной – 9, 2%.Выводы. Использование субалина в основной группе в составе комплексной терапии способствовало более быстрому исчезновению фолликулов и гиперемии конъюнктивы, сокращению сроков лечения.
НАУЧНОЕ ОБОСНОВАНИЕ НАЦИОНАЛЬНОЙ СТРАТЕГИИ БОРЬБЫ СО СЛЕПОТОЙ В УКРАИНЕ НА ПЕРИОД ДО 2030 ГОДА
Authors: Varyvonchyk D. V. , Rykov S. O. , Gudz A. S. , Denysyuk L. I. 
Published: January 2022

В настоящее время в Украине не разработана Национальная стратегия по борьбе со слепотой согласно рекомендациям ВОЗ, что и определяет актуальность указанного.Цель работы. Обоснование концепции Национальной стратегии борьбы со слепотой в Украине на период до 2030 года.Материалы и методы. На основе рекомендаций WHA62.1 «Предупреждение слепоты и нарушений зрения» и ранее полученных научных данных разрабатывалась Национальная стратегия борьбы со слепотой в Украине на период до 2030 года (Стратегия).Результаты и их обсуждение. Определены основные концептуальные основы Стратегии, ее цель, имеющиеся в Украине проблемы и их последствия, организационные пути и способы решения существующих проблем, ожидаемые результаты. Определена Стратегия борьбы со слабовидением и слепотой вследствие глаукомы, возрастной макулодистрофии и катаракты.Выводы. Определены ожидаемые экономическая, социальная и медицинская эффективность от внедрения Стратегии. Предложены меры и индикаторные показатели борьбы с глаукомой, возрастной макулодистрофией и катарактой.
ЭФФЕКТИВНОСТЬ ПРИМЕНЕНИЯ ФТОРХИНОЛОНОВ В ЛЕЧЕНИИ КЕРАТИТОВ
Authors: Efi mova Y. V. , Vitovskaya O. P. 
Published: January 2022

Кератиты в Украине составляют в среднем 4,2% от общей офтальмологической заболеваемости, часто они приводят к снижению зрения и в структуре первичной инвалидности патология роговицы составляет 4,4%.Бактериальный кератит занимает 2-е место по частоте после вирусных поражений роговицы, составляя 13–47%. Заболевание является важной причиной снижения зрения, слепоты, анатомической гибели глаза (8–9%), заканчиваясь энуклеацией в 23,7%, и, таким образом, в каждом четвертом случае становится причиной инвалидизации среди всей инвалидности по зрению. Часто после длительной противовоспалительной терапии у пациентов наблюдаются клинические проявления «сухого» глаза, что может снижать качество жизни пациента.Еще одной проблемой лечения воспалительных заболеваний в последние годы становится появление микроорганизмов, устойчивых к существующим антибиотикам. Таким образом, вопросы лечения бактериальных кератитов в последние годы продолжают оставаться актуальными.Было обследовано 30 больных (30 глаз) с кератитом. Пациенты были разделены на две группы. В первую группу (14 пациентов) вошли пациенты, которым в качестве местной антибактериальной терапии назначали оригинальный левофлоксацин, во вторую (16 пациентов) – пациенты, которым в качестве местной антибактериальной терапии назначали Сигницеф.Всем пациентам были проведены стандартные офтальмологические обследования. Динамика воспалительной реакции в обеих группах достоверно не отличается. В группе пациентов, которым на фоне стандартной терапии применяли Сигницеф, показатели теста Ширмера, теста Норна достоверно были выше по сравнению с группой, применяющей оригинальный левофлоксацин.
ЭФФЕКТИВНОСТЬ СТАТИНОВ И ФИБРАТОВ В ПРОФИЛАКТИКЕ ПРОГРЕССИРОВАНИЯ ДИАБЕТИЧЕСКОЙ РЕТИНОПАТИИ У БОЛЬНЫХ САХАРНЫМ ДИАБЕТОМ 2 ТИПА: 1 ГОД НАБЛЮДЕНИЯ
Authors: Mogilevskiy S. Yu. , Korobova A.V. , Petrenko О. V. 
Published: January 2022

Изучена эффективность фибратов и статинов в профилактике прогрессирования диабетической ретинопатии у больных сахарным диабетом 2 типа. Установлено, что эффективность фибратов в течение 12 месяцев наблюдения была выше, чем статинов (р<0,001).В группе, где применялся фенофибрат, макулярный отек развивался реже, чем в группе, где назначался розувастатин (р=0,023). Назначение фенофибрата позволило, в сравнении с группой применения статина, сохранить толщину сетчатки в фовеа стабильной (р=0,004).
МОНИТОРИНГ ЗАБОЛЕВАЕМОСТИ НАСЕЛЕНИЯ НА ОФТАЛЬМОЛОГИЧЕСКУЮ ПАТОЛОГИЮ КАК ОСНОВА ДЛЯ УСОВЕРШЕНСТВОВАНИЯ МЕДИЦИНСКОЙ ПОМОЩИ
Authors: Dufi netz V.A. 
Published: January 2022

В статье представлены результаты ретроспективного анализа динамики заболеваемости населения Закарпатской области болезнями глаза и его придаточного аппарата и распространенности этой патологии среди населения региона в течение 2000–2015 гг. Оценена структура офтальмологической заболеваемости и распространенности болезней глаза среди населения. По данным мониторинга охарактеризована динамика заболеваемости населения основными нозологическими формами глазной патологии. Представлены результаты сравнительного анализа региональных и национальных показателей. Установлены различия в показателях заболеваемости населения болезнями глаза в зависимости от проживания в сельской либо городской местности.