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Non‐canonical phosphoglycerate dehydrogenase activity promotes liver cancer growth via mitochondrial translation and respiratory metabolism
Authors: Shu Ying , Hao Yijie , Feng Junru , Liu Haiying , Li Shi‐ting , Feng Jiaqian , Jiang Zetan , Ye Ling , Zhou Yingli , Sun Yuchen , Zhou Zilong , Wei Haoran , Gao Ping , Zhang Huafeng , Sun Linchong 
Published: October 2022

AbstractPhosphoglycerate dehydrogenase (PHGDH) is a key serine biosynthesis enzyme whose aberrant expression promotes various types of tumors. Recently, PHGDH has been found to have some non‐canonical functions beyond serine biosynthesis, but its specific mechanisms in tumorigenesis remain unclear. Here, we show that PHGDH localizes to the inner mitochondrial membrane and promotes the translation of mitochondrial DNA (mtDNA)‐encoded proteins in liver cancer cells. Mechanistically, we demonstrate that mitochondrial PHGDH directly interacts with adenine nucleotide translocase 2 (ANT2) and then recruits mitochondrial elongation factor G2 (mtEFG2) to promote mitochondrial ribosome recycling efficiency, thereby promoting mtDNA‐encoded protein expression and subsequent mitochondrial respiration. Moreover, we show that treatment with a mitochondrial translation inhibitor or depletion of mtEFG2 diminishes PHGDH‐mediated tumor growth. Collectively, our findings uncover a previously unappreciated function of PHGDH in tumorigenesis acting via promotion of mitochondrial translation and bioenergetics.
Diagnostic biomarkers for active tuberculosis: progress and challenges
Authors: Nogueira Betânia M F , Krishnan Sonya , Barreto‐Duarte Beatriz , Araújo‐Pereira Mariana , Queiroz Artur T L , Ellner Jerrold J , Salgame Padmini , Scriba Thomas J , Sterling Timothy R , Gupta Amita , Andrade Bruno B 
Published: October 2022

AbstractTuberculosis (TB) is a leading cause of morbidity and mortality from a single infectious agent, despite being preventable and curable. Early and accurate diagnosis of active TB is critical to both enhance patient care, improve patient outcomes, and break Mycobacterium tuberculosis (Mtb) transmission cycles. In 2020 an estimated 9.9 million people fell ill from Mtb, but only a little over half (5.8 million) received an active TB diagnosis and treatment. The World Health Organization has proposed target product profiles for biomarker‐ or biosignature‐based diagnostics using point‐of‐care tests from easily accessible specimens such as urine or blood. Here we review and summarize progress made in the development of pathogen‐ and host‐based biomarkers for active TB diagnosis. We describe several unique patient populations that have posed challenges to development of a universal diagnostic TB biomarker, such as people living with HIV, extrapulmonary TB, and children. We also review additional limitations to widespread validation and utilization of published biomarkers. We conclude with proposed solutions to enhance TB diagnostic biomarker validation and uptake.
Analisa Terhadap Pemberian Nafkah Bekas Istri dalam Studi Kasus Putusan Pengadilan Negeri Tangerang Nomor : 927/PDT.G/2017/PN.TNG
Authors: Widodo Ragil 
Published: October 2022

Pemberian Nafkah terhadap bekas Istri pasca Perceraian menjadi hal yang sangat menarik untuk dibahas salah satunya sebagaimana dalam putusan Pengadilan Negeri Tangerang Nomor: 927/Pdt.G/2017/PN.Tng tentang perkara perdata gugatan perceraian. Yang dalam amar putusannya menyatakan bahwa: “Menghukum Tergugat Rekonvensi / Penggugat Konvensi untuk memberikan nafkah setiap bulan kepada Penggugat Rekonpensi / Tergugat Konvensi sebesar Rp. 17.500.000,- (tujuh belas juta lima ratus ribu rupiah) sampai dengan Penggugat Rekonvensi / Tergugat konvesi menikah lagi”. Penulis dalam hal metode penelitian menggunakan metode penelitian normatif, dengan pendekatan yuridis normatif. Bahwa hakim dalam pertimbangan putusan mengacu pada ketentuan pasal 41 Undang-undang No.1 tahun 1974, namun tidak memberikan suatu alasan-alasan hukum sama sekali dalam pertimbangan hukumnya sehingga Majelis Hakim terbukti tidak memiliki alasan-alasan hukum terkait dengan fakta-fakta dalam perkara a quo yang menjadikan dasar bagi Majelis Hakim dalam menerapkan 41 huruf (c) Undang-undang No.1 tahun 1974 tentang Perkawinan yang tidak bersifat imperatif tersebut. Sehingga perlu adanya kehati-hatian, keadilan dan berlandasan hukum untuk memutus suatu perkara sehingga tidak menjadikan putusan yang sumir atau bahkan menjadi rancu dan ambigu dalam menjalankan implementasi sebuah putusan pengadilan.
KEBUTUHAN BUKU AJAR BAHASA SEJARAH SASTRA INDONESIA PERSPEKTIF ISLAM DI LINGKUNGAN PERGURUAN TINGGI ISLAM
Authors: Bahtiar Ahmad , Haryanti Novi Diah , Dipurnomo Nur Siswo 
Published: October 2022

Abstrak: Distingsi Perguruan Tinggi Keagamaan Islam (PTKI) dengan perguruan tinggi lainnya adalah integrasi keilmuan, keislaman, dan keindonesiaan. Ketiga hal tersebut harus dapat diimplementasikan dalam pembelajaran sehingga perlunya buku ajar sejarah sastra perspektif Islam di PTKI. Kajian ini menggunakan penelitian dan pengembangan (Research and Developtment) dengan Teori Borg dan Gall untuk mengetahui kebutuhan tersebut. Data penelitian berupa hasil diskusi terpumpum (FGD) dan hasil angket yang diberikan kepada dosen dan mahasiswa PTKI serta guru. Hasil penelitian menunjukkan bahwa adanya kebutuhan buku ajar sejarah sastra Indonesia perspektif Islam. Buku ajar tersebut disusun secara kronologis dan tematik yang mencakup pengarang dan karyanya, persoalan Islam, peristiwa terkait Islam dan lembaga atau komunitas Islam.
XBP1 Activation Reduces Severity of Polycystic Kidney Disease due to a Nontruncating Polycystin-1 Mutation in Mice
Authors: Krappitz Matteus , Bhardwaj Rishi , Dong Ke , Staudner Tobias , Yilmaz Duygu Elif , Pioppini Carlotta , Westergerling Parisa , Ruemmele David , Hollmann Till , Nguyen Thuy Anh , Cai Yiqiang , Gallagher Anna-Rachel , Somlo Stefan , Fedeles Sorin 
Published: October 2022

Significance Statement
XBP1 activation in neonatal and adult doxycycline-inducible murine models of ADPKD due to a hypomorphic polycystin-1 missense mutation orthologous to human PC1R2220W delays cyst formation. Activating XBP1s, a pro-chaperone inducer of the endoplasmic reticulum stress response, can improve steady-state expression, ciliary trafficking, and cleavage of the mutant protein, providing initial in vivo proof of concept that modulating levels of poorly functioning hypomorphic PC1 alleles can slow progression of kidney cyst formation in ADPKD.

Background
Autosomal dominant polycystic kidney disease (ADPKD) is caused by mutations in Pkd1 and Pkd2. They encode the polytopic integral membrane proteins polycystin-1 (PC1) and polycystin-2 (PC2), respectively, which are expressed on primary cilia. Formation of kidney cysts in ADPKD starts when a somatic second hit mechanism inactivates the wild-type Pkd allele. Approximately one quarter of families with ADPDK due to Pkd1 have germline nonsynonymous amino acid substitution (missense) mutations. A subset of these mutations is hypomorphic, retaining some residual PC1 function. Previous studies have shown that the highly conserved Ire1α-XBP1 pathway of the unfolded protein response can modulate levels of functional PC1 in the presence of mutations in genes required for post-translational maturation of integral membrane proteins. We examine how activity of the endoplasmic reticulum chaperone-inducing transcription factor XBP1 affects ADPKD in a murine model with missense Pkd1.

Methods
We engineered a Pkd1 REJ domain missense murine model, Pkd1R2216W
, on the basis of the orthologous human hypomorphic allele Pkd1R2220W
, and examined the effects of transgenic activation of XBP1 on ADPKD progression.

Results
Expression of active XBP1 in cultured cells bearing PC1R2216W mutations increased levels and ciliary trafficking of PC1R2216W. Mice homozygous for Pkd1R2216W
or heterozygous for Pkd1R2216W

in trans with a conditional Pkd1fl
allele exhibit severe ADPKD following inactivation in neonates or adults. Transgenic expression of spliced XBP1 in tubule segments destined to form cysts reduced cell proliferation and improved Pkd progression, according to structural and functional parameters.

Conclusions
Modulating ER chaperone function through XBP1 activity improved Pkd in a murine model of PC1, suggesting therapeutic targeting of hypomorphic mutations.
Thermal conductivity of single crystals zirconia stabilized by scandium, yttrium, gadolinium, and ytterbium oxides
Authors: Agarkov D. A. , Borik M. A. , Korableva G. M. , Kulebyakin A. V. , Lomonova E. E. , Milovich F. O. , Myzina V. A. , Popov P. A. , Tabachkova N. Yu. 
Published: October 2022

The phase composition and heat conductivity of (ZrO2)0.9(R2O3)0.1 solid solution single crystals have been studied, where R = (Gd, Yb, Sc, Y), (ZrO2)0.9(Sc2O3)0.09(Gd2O3)0.01 and (ZrO2)0.9(Sc2O3)0.09(Yb2O3)0.01. Single crystals have been grown by directional melt crystallization in a cold skull. The phase composition of the crystals has been studied using X-ray diffraction and Raman spectroscopy. The heat conductivity of the crystals has been studied using the absolute steady-state technique of longitudinal heat flow in the 50—300 K range. We show that at a total stabilizing oxide concentration of 10 mol.% the phase composition of the crystals depends on the ionic radius of the stabilizing cation. The (ZrO2)0.9(Sc2O3)0.1 crystals have the lowest heat conductivity in the 50—300 K range while the (ZrO2)0.9(Gd2O3)0.1 solid solutions have the lowest heat conductivity at 300 K.Analysis of the experimental data suggests that the heat conductivity of the crystals depends mainly on the phase composition and ionic radius of the stabilizing cation. Phonon scattering caused by the difference in the weight of the co-doping oxide cation has a smaller effect on the heat conductivity.
Primer registro del género Tikuna Savage, Flowers y Porras (EPHEMEROPTERA: LEPTOPHLEBIIDAE) para el Chocó, Colombia
Authors: Mosquera Murillo Zuleyma , Córdoba Aragón Karen E. 
Published: October 2022

En este artículo se presenta por primera vez el registro del género Tikuna (Ephemeroptera: Leptophlebiidae) para el departamento del Chocó y segundo para Colombia. El registro se basa en ninfas colectadas en tres pequeñas quebradas de los municipios de Quibdó y Unión Panamericana; caracterizadas por presentar aguas trasparentes, corriente moderada, fondo arenoso y abundante vegetación ribereña. Los ejemplares se encuentran depositados en la Colección Limnológica del Chocó (CLCH-Insec).
Coccinélidos depredadores de Crypticerya multicicatrices (HEMIPTERA: MONOPHLEBIDAE) en San Andrés Isla, Colombia
Authors: Silva Gómez Marcela , Quiroz Gamboa John Alveiro , Hoyos Carvajal Lilliana María , Yepes R. Francisco Cristóbal , Maya A. María Fernanda , Santos M. Adriana 
Published: October 2022

Se realiza la identificación y primer reporte de los coccinélidos Anovia punica Gordon, 1972, Cryptognatha auriculata Mulsant, 1850 y Zagloba beaumonti Casey, 1899 (Coleoptera: Coccinellidae), durante la evaluación realizada para el reconocimiento de depredadores de Crypticerya multicicatrices Kondo y Unruh, 2009 (Hemiptera: Monophlebidae) en Coco (Cocos nucifera) y limón (Citrus limon), hallados en la isla de San Andrés (Colombia), en muestreos llevados a cabo entre agosto y noviembre de 2012.
Primer registro de Notiobia (Notiobia) umbrifera Bates y redescubrimiento de Notiobia (Anisotarsus) praeclara Putzeys (COLEOPTERA: CARABIDAE) en Colombia
Authors: Arenas Clavijo Anderson 
Published: October 2022

Se aporta información sobre la distribución geográfica de dos especies de Notiobia Perty, 1830, en Colombia; se encontraron especímenes Notiobia (Notiobia) umbrifera, así como especímenes de Notiobia (Anisotarsus) praeclara. Este último fue hallado 115 años después de su descripción. Los especímenes registrados se encontraron asociados a coberturas boscosas del Suroccidente colombiano.
Análisis fisicoquímico y biológico del río santo domingo, afluente Río Verde, cuenca del río La Vieja, Alto Cauca, Colombia
Authors: García Alzate Carlos A. , Villegas Acosta Paola A. , Román Valencia César 
Published: October 2022

Se realizó un análisis fisicoquímico y biológico del río Santo Domingo, afluente río Verde, cuenca río La Vieja, Alto Cauca, Colombia, en 12 estaciones de muestreo durante bajas (febrero, junio y julio) y altas lluvias (abril, marzo y mayo). Se aplicaron índices de diversidad alfa como Shannon-Wiener, Dominancia, Margalef y Pielou; diversidad beta con Jaccard y diversidad gamma Schluter-Ricklefs y BMWP/Col para estimar la calidad del agua. El ANDEVA mostró diferencias significativas entre las épocas de lluvia para el oxígeno disuelto, el pH, la conductividad y la humedad relativa. Se registraron en total 12405 ejemplares de macroinvertebrados: 8177 en bajas y 4228 en altas lluvias; Ephemeroptera fue el orden más abundante para ambas épocas con el género Baetodes; el ANDEVA de dos factores mostró significancia de la abundancia absoluta entre épocas y zonas; el BMWP/Col indicó que la calidad del agua fue buena, a excepción de la estación 3 que presentó una calidad aceptable. Se capturaron 97 ejemplares de peces: 70 para bajas y 27 para altas lluvias; las especies de peces más abundantes fueron Astroblepus chapmani y Brycon henni. Los índices de diversidad y riqueza fueron bajos para las comunidades de macroinvertebrados y peces. La diversidad gamma para macroinvertebrados y peces fue consistente con el número de especies encontradas en el estudio. El río es oligotrófico, con tendencia a la eutroficación en ambos periodos climáticos.
Distribución potencial de Oxysternon conspicillatum (Weber, 1801) en diferentes escenarios de cambio climático en Colombia
Authors: Martínez Quintero Bedir Germán , Echeverri Rubio Alejandro , Gaviria Ortiz Fabián Guillermo 
Published: October 2022

Los escenarios de cambio climático son herramientas útiles para la evaluación de impactos, iniciativas de adaptación y mitigación, y creación de modelos climáticos; estos se proyectan en el tiempo para predecir la unidad de hábitat en que se encuentran las especies. Adicionalmente, los modelos de distribución de especies estiman el área de ocupación de un organismo con potencial bioindicador como los escarabajos coprófagos, entre ellos la especie Oxysternon conspicillatum con amplia distribución geográfica en Colombia. El propósito de este trabajo fue determinar la distribución potencial de O. conspicillatum en un escenario pesimista (A2) y uno optimista (B1) de cambio climático en Colombia para los años 2050 y 2080. Para el desarrollo del modelo se recolectó información publicada y/o depositada en diferentes colecciones del país, de manera tal que se obtuvieron 427 registros, distribuidos en 11 fuentes de información. La especie se registró en 18 departamentos, donde el Eje Cafetero fue el que presentó mayor disponibilidad de datos geográficos. Se encontró que la probabilidad de ocupación de O. conspicillatum en la Cordillera Oriental disminuye drásticamente para estos dos años. Este resultado concuerda con lo observado en otros grupos bioindicadores como las plantas y las mariposas. O. conspicillatum es una especie ampliamente distribuida en Colombia, sin embargo, para los años 2050 y 2080 bajo dos escenarios de cambio climático (A2 y B1) presentará una disminución considerable de su presencia a nivel nacional.
New species of the genus Trigonospila Pokorny (DIPTERA: TACHINIDAE) parasitises adult Compsus sp. schoenherr (COLEOPTERA: CURCULIONIDAE) in Colombia
Authors: Vinasco Natalia , Vallejo Luis Fernando , Soto Alberto 
Published: October 2022

Trigonospila unicaldasi new specie, is described for the first time for science. In order to differentiate it from other rarely occurring species in the Americas, key characteristics of the adult were identified through scanning electron microscopy. The species was found parasitising adult weevils of the genus Compsus sp. (Coleoptera: Curculionidae) associated with citrus crops in the central coffee-growing region of Colombia. The interesting symbiotic phenomenon of control described in this paper is considered unusual in the biology of Tachinidae given that only 5-10% of the family parasitise their hosts at the adults stage.
Bird assemble associated to two landscape units in a tropical dry forest
Authors: Sánchez Montenegro Juan Pablo , Pérez Castillo Katherine , Garcés Restrepo Mario Fernando , Giraldo Alan 
Published: October 2022

The transformation of ecosystems through human activities can affect the biological and ecological processes of bird species, and can even lead to groups of species becoming isolated due to deforestation, causing a decrease in genetic diversity and the extirpation of species. To evaluate the composition and structure of bird communities associated with the tropical dry forest ecosystem in the Guarinocito jurisdiction (La Victoria, Caldas) we identified two landscape units: a forest area (dry forest matrix) and an interfered area (matrix of lands), presenting human intervention such as roads and grassland systems. Point counts of 10 min long were carried out in each unit to survey birds between 06:00 and 09:00 hours and between 16:00 and 18:00 hours. Mist nets were set up to complete the species record. Three four-day long sampling trips were carried out in April 2013, November 2013, and October 2014 to consider the seasonal variability that affects the environmental conditions in the study area. The sampling representativeness was evaluated using non-parametric estimates. All observed or captured individuals were assigned to a trophic guild in order to evaluate the community structure in the two established landscape units. A total of 1,005 individuals from 36 families and 127 species were recorded. The most abundant species were Thraupis episcopus (7.36%) and Sicalis flaveola (6.77%). Sample representativeness ranged from 68.18% (Jack 2) to 86.03% (Bootstrap). Although no significant differences between the two landscape units were detected (THutchinson=1.59, p=0.81), species diversity was higher in the forested area than in the intervened area. The dominant trophic guild in both landscape units was that of insectivorous birds. No significant differences in bird community trophic structure were found between the two landscape units (X 2 =14.60, p=0.33). The size, shape, or intervention history of the fragments could have resulted in a lack of differences in the structure and composition of the avifauna in the two landscape units.
Estructura poblacional de Mecistogaster ornata Rambur 1842 (ODONATA: PSEUDOSTIGMATIDAE) en dos fragmentos de bosque seco tropical en el departamento del Atlántico, Colombia
Authors: Díaz Flórez Brayan , Pozo García María , Altamiranda Saavedra Mariano , Martínez Hernández Neis 
Published: October 2022

Objetivo: Se evaluó la variación de la estructura poblacional de M. ornata en dos fragmentos (La Montaña y Sarmiento) de bosque seco tropical en el departamento del Atlántico, Colombia. Alcance: Determinar las variaciones espaciales y temporales de la abundancia de M. ornata y su relación con las variables ambientales; así como la disponibilidad de fitotelmas y la estructura de la vegetación. Metodología: Se realizaron 26 muestreos (13 por fragmento) cada 8 días entre las 8:00 hasta las 17:00 horas (9 horas/hombre/fragmento). Por fragmento se estableció un área de 600 m de largo por 30 m de ancho, donde se marcaron 10 puntos distanciados 50 m uno del otro y de esta forma se obtuvieron 10 tramos con igual longitud. Los odonatos fueron capturados con redes entomológicas, usando el método de marcaje y recaptura. Por otro lado, en cada tramo se midió la temperatura ambiente, humedad relativa y la intensidad lumínica; así como el número de fitotelmas y algunas de sus características (altura, densidad, volumen) y la estructura de la vegetación (densidad de árboles, cobertura vegetal, área basal y altura promedio). Principales resultados: En La Montaña fueron capturados y liberados 90 individuos (35 ♂, 55 ♀), de los cuales 40 fueron recapturados (15 ♂, 25 ♀) una o más veces. El mayor número de capturas (19) se presentó en el muestreo 2 realizado en marzo (7 ♂, 12 ♀); mientras en Sarmiento, fueron capturados y liberados 31 individuos (14 ♂, 17 ♀). En este fragmento, el mayor número de capturas se registró en el evento 1 realizado en marzo (3 ♂, 4 ♀). Teniendo en cuenta las proporciones sexuales, en La Montaña fueron 2:1 (80♀, 50♂) con diferencias significativas (X2=23,403, p=0,02449), mientras en Sarmiento fueron 27♀ y 29 ♂ (proporción 1:1) y sin diferencias. Con el análisis de componentes principales (ACP), se determinó que la variación del número de individuos entre los puntos y fragmentos de muestreo, puede ser explicada en un 59,76% por las variables vegetales y la de las fitotelmas. Conclusiones: Se determinó que la temperatura y la intensidad lumínica son factores abióticos que juegan un papel importante en la dinámica temporal de la abundancia de esta especie en el área de estudio. Adicionalmente, la disposición no aleatoria de las especies vegetales y la cobertura vegetal, así como la altura de las fitotelmas influyen en la variación espacial de M. ornata en la zona.
Variación espacial y temporal en la densidad poblacional de la bangsia del tatamá (Bangsia Aureocincta : Thraupidae), especie endémica y vulnerable de Colombia, en el parque nacional natural Tatamá.
Authors: Giraldo María Elena , Guzmán V. Carolina , Troncoso Juan C. , Roncancio D. Néstor 
Published: October 2022

Para conocer el estado de conservación de una especie es necesario determinar su abundancia y el cambio de ésta en el tiempo a través de programas rigurosos de monitoreo. Especialmente, cuando esta especie ha sido seleccionada como objeto de conservación de las áreas protegidas, su monitoreo se convierte en la herramienta de base para evaluar la efectividad del manejo. La bangsia del Tatamá (Bangsia aureocincta) se seleccionó como valor objeto de conservación –VOC– del Parque Nacional Natural Tatamá –PNN Tatamá–; este parque representa la integridad ecológica de la confluencia Andino-Pacífica en esta zona. Para conocer su estado de conservación y tendencia, se estimó la densidad poblacional usando el método de muestreo por distancia con puntos de conteo, en dos localidades separadas por 50 km lineales con una réplica temporal en 2016 y otra en 2018. Las densidades estimadas en 2016 fueron de 152 individuos/km2 (IC95% = 84 - 272; CV= 29,99) y 1036 individuos/ km2 (IC95% = 745 - 1442, CV= 16,82) y para 2018 de 341 individuos/km2 (IC95% = 213 - 547; CV= 23,96) y de 118 individuos/km2 (IC95% = 78 - 181, CV= 21,4). Estos resultados reflejan variaciones espaciales y temporales en la densidad de la especie que probablemente sean producto de migraciones longitudinales o altitudinales. No obstante, ante la falta de conocimiento de la historia natural de la especie, no es posible asociar estos movimientos a algún factor en particular.