bluuebunny/crossref_metadata_2025_split huggingface dataset:
ДОСЛІДЖЕННЯ З ВИЗНАЧЕННЯ КІЛЬКІСНОГО ВМІСТУ КВЕРЦЕТИНУ В КОМБІНОВАНОМУ ГЕЛІ ДЛЯ ЛІКУВАННЯ ПРОМЕНЕВИХ УШКОДЖЕНЬ ШКІРИ
Authors: Бурбан О. І. , Вишневська Л. І. 
Published: August 2022

Вступ. Підвищений інтерес до фітотерапії можна пояснити переважно її відносною нешкідливістю та ефективністю, а також нижчою вартістю лікарських препаратів, отриманих із рослинної сировини, порівняно із синтетичними засобами. З огляду на це, в результаті проведення експериментальних досліджень ми розробили технологію комплексної переробки очитку великого трави з метою одержання соку і водного екстракту з вичавок після віджимання соку та дослідили показники їх якості.
Мета дослідження – провеcти експериментальні дослідження з розробки методик визначення кількісного вмісту кверцетину в комбінованому гелі під умовною назвою “Біоседум плюс” для лікування променевих ушкоджень шкіри.
Методи дослідження. Об’єктами дослідження стали модельні зразки комбінованого гелю. У роботі використовували ТШХ-пластинки із шаром силікагелю та флуоресцентним індикатором F254 (с. HX04954354, “Merk”, Німеччина), стандартний зразок кверцетину, спектрофотометр “Evolution 60s” (“Thermo Fisher Scientific”, США), аналітичні ваги “AXIS” (Польща), мірний посуд класу А і реактиви, що відповідають вимогам Державної Фармакопеї України (ДФУ).
Результати й обговорення. Для опрацювання методики кількісного визначення кверцетину в досліджуваному гелі методом абсорбційної спектрофотометрії у видимій ділянці було обрано інтенсивно виражений максимум поглинання речовини при довжині хвилі 438 нм після проведення реакції з борною кислотою. Специфічність методики доведена утворенням забарвленого комплексу кверцетину з борною кислотою за наявності суміші мурашиної та оцтової кислот. Прецизійність експериментальних результатів характеризувалася низьким стандартним відхиленням у досліджуваному діапазоні концентрацій кверцетину (RSD=0,46 %), а систематична похибка перебувала на рівні 0,01 %, коефіцієнт кореляції запропонованої методики r=0,9995. При вивченні робасності методики встановлено, що стабільність поглинання розчинів у часі спостерігається через 30 хв і розчини стабільні впродовж 60 хв.
Висновки. Розроблено методику спектрофотометричного у видимій ділянці кількісного визначення кверцетину в гелі після реакції утворення комплексу з борною кислотою при довжині хвилі 438 нм. За такими валідаційними характеристиками, як лінійність, прецизійність, правильність та робасність, методика є коректною (з використанням критеріїв прийнятності для допусків вмісту +5,0 %).
ВПЛИВ ЦИНК СУЛЬФАТУ, ТІОСУЛЬФАТУ НАТРІЮ, ЛІПОЄВОЇ КИСЛОТИ І ТАУРИНУ НА ОБМІН ГІДРОГЕН СУЛЬФІДУ В НИРКАХ ЩУРІВ З ДІЄТІНДУКОВАНИМ ОЖИРІННЯМ
Authors: Блажченко В. В. , Заічко Н. В. 
Published: August 2022

Вступ. Проблема профілактики та корекції нефропатії ожиріння набуває все більшої актуальності. У нирках синтезується багатофункціональний регулятор – гідроген сульфід (H2S), порушення обміну якого при ожирінні можуть прискорювати розвиток хронічної хвороби нирок. Питання щодо пошуку метаболічних коректорів, які б нормалізували обмін H2S у нирках при ожирінні та не проявляли ліпогенного ефекту, залишається актуальним. Такий ефект можуть мати кофактори і косубстрати тіосульфатозалежного обміну H2S.
Мета дослідження – встановити вплив цинк сульфату, тіосульфату натрію, ліпоєвої кислоти і таурину на обмін гідроген сульфіду в нирках щурів з дієтіндукованим ожирінням.
Методи дослідження. Досліди проведено на 60 білих лабораторних щурах-самцях з дотриманням принципів біоетики (Страсбург, 1986; Київ, 2001). Дієтіндуковане ожиріння викликали у 50 тварин шляхом застосування впродовж 10 тижнів висококалорійної високожирової дієти (енергетична цінність – 4,33 ккал/г). Тварини контрольної групи (10 щурів) отримували стандартну дієту (енергетична цінність – 2,71 ккал/г). Коректори обміну Н2S (цинк сульфат, тіосульфат натрію, ліпоєву кислоту, таурин) вводили протягом останніх 2 тижнів. У гомогенатах нирок визначали активність ензимів обміну Н2S. Статистичну обробку проводили в пакеті IBM Statistics SPSS 26, відмінності оцінювали в тесті Краскела – Уолліса при рівні значущості р<0,05.
Результати й обговорення. У тварин з дієтіндукованим ожирінням виявили порушення обміну H2S у нирках: зниження активності ПАЛФ-залежних ензимів транссульфування (цистатіонін-γ-ліази, цистатіонін-β-синтази, цистеїнамінотрансферази), активності тіосульфатозалежних шляхів обміну H2S (тіосульфат(тіол)сульфуртрансферази, тіоредоксинредуктази, сульфітоксидази) та рівня H2S (в 1,3–1,4 раза, p<0,001), що корелювало зі зростанням індексу маси тіла й індексу Лі. Препарати цинку сульфату, ліпоєвої кислоти, тіосульфату натрію і таурину підвищували рівень H2S та активність H2S-синтезувальних ензимів транссульфування і тіосульфатозалежних шляхів у нирках (в 1,4–1,5 раза, р<0,01), при цьому не спричиняли ліпогенного ефекту в щурів з дієтіндукованим ожирінням.
Висновок. Препарати цинку сульфату, ліпоєвої кислоти, тіосульфату натрію зменшують порушення обміну H2S у нирках та стримують розвиток ожиріння у щурів за умов висококалорійної високожирової дієти.
ДОСЛІДЖЕННЯ ВПЛИВУ ЕКСТРАКТУ МАРУНИ ДІВОЧОЇ (TANACETUM PARTHENIUM L.) НА СТАН СУГЛОБІВ ЩУРІВ З МОДЕЛЬОВАНИМ АД’ЮВАНТНИМ АРТРИТОМ
Authors: Кириченко І. В. , Міщенко О. Я. 
Published: August 2022

Вступ. Удосконалення фармакотерапії ревматоїдного артриту залишається актуальним завданням сучасної фармакології. Одним з напрямків його вирішення є пошук і розробка засобів із протизапальними та хондропротекторними властивостями на основі рослинної сировини.
Мета дослідження – оцінити ефективність густого екстракту з трави маруни дівочої (Tanacetum parthenium L.) за умови хронічного запалення (ад’ювантного артриту) в щурів за даними гістологічного дослідження.
Методи дослідження. Проводили гістологічні дослідження стану суглобів щурів з модельованим ад’ювантом Фрейнда (0,1 мл одноразово підшкірно в основу хвоста) артритом. Відсепаровані від шкіри та м’язів суглоби фіксували в 10 % розчині нейтрального формаліну, після промивання у проточній воді декальцинували в 5 % розчині азотної кислоти протягом 14–16 днів. Після проведення по спиртах висхідної концентрації тканини заливали в целоїдин-парафін за стандартною методикою. З блоків виготовляли фронтальні зрізи завтовшки 6–8 мк, щонайменше по 3 зрізи з кожного суглоба. Зрізи фарбували гематоксиліном та еозином. Усі етапи виготовлення мікропрепаратів було проведено згідно з рекомендаціями OARSI (Osteoarthritis Research Society International). Мікроскопічні дослідження виконували під мікроскопом “Granum Trino R 6003” (DSM-310). Статистичну обробку отриманих цифрових даних проводили із застосуванням непараметричних критеріїв (Statistics 6, Mann-Whitney U Test, Fisher test).
Результати й обговорення. Введення ад’юванта Фрейнда щурам призводило до розвитку в них морфологічних ознак артриту гомілковостопних суглобів: проліферативного синовіту; формування пануса; деструктивно-дистрофічних змін хрящової тканини; запальної інфільтрації в періартикулярних тканинах. Нестероїдний протизапальний засіб “Диклофенак натрію” проявляв виражений нормалізувальний вплив на морфологічні зміни в суглобах щурів при ад’ювантному артриті. Деструкція хряща була відсутня, гіперплазія тканин, що його покривають, траплялася в 6 разів рідше, ніж у нелікованих тварин. Спостерігали залишкові явища в періартикулярних тканинах. Застосування екстракту маруни дівочої сприяло зниженню кількості щурів із деструкцією суглобового хряща у 2,6 раза порівняно з групою конт­рольної патології та кількості тварин з вираженим запальним процесом у синовіальній оболонці й періартикулярних тканинах у 3 рази.
Висновки. Встановлено здатність екстракту маруни дівочої знижувати виразність деструкції сугло­бового хряща, запального процесу в синовіальній оболонці та періартикулярних тканинах щурів з моделлю ад’ювантного артриту.
A Hasidic Leader Migrating to America: Egodocuments by Rabbi Joshua Heschel Rabinowitz of Monastyryshche (1860–1938)
Authors: Sagiv Gadi 
Published: August 2022

Abstract
Egodocuments constitute valuable sources for the study of Hasidism. Yet those penned by hasidic leaders are relatively rare. This article explores egodocumentary material written by hasidic leader Joshua Heschel Rabinowitz of Monastyryshche (1860–1938), who was persecuted in Russia, migrated to America in 1923, and settled in New York. In contrast to the previous scholarship that focuses on Rabinowitz’s public opinions, this article centers on his personal notes. Moreover, rather than read Rabinowitz’s personal writings as reflecting his life and worldview in Eastern Europe from decades earlier, the egodocuments will be read as highlighting the challenges he faced during the years he wrote most of his works, namely, after migrating to the United States. Rabinowitz’s egodocuments not only teach us about him as an individual, but also shed light on the challenges that many admorim faced upon arrival to America between the two world wars.
Investigating the Fidelity of Explainable Artificial Intelligence Methods for Applications of Convolutional Neural Networks in Geoscience
Authors: Mamalakis Antonios , Barnes Elizabeth A. , Ebert-Uphoff Imme 
Published: August 2022

Abstract
Convolutional neural networks (CNNs) have recently attracted great attention in geoscience because of their ability to capture nonlinear system behavior and extract predictive spatiotemporal patterns. Given their black-box nature, however, and the importance of prediction explainability, methods of explainable artificial intelligence (XAI) are gaining popularity as a means to explain the CNN decision-making strategy. Here, we establish an intercomparison of some of the most popular XAI methods and investigate their fidelity in explaining CNN decisions for geoscientific applications. Our goal is to raise awareness of the theoretical limitations of these methods and to gain insight into the relative strengths and weaknesses to help guide best practices. The considered XAI methods are first applied to an idealized attribution benchmark, in which the ground truth of explanation of the network is known a priori, to help objectively assess their performance. Second, we apply XAI to a climate-related prediction setting, namely, to explain a CNN that is trained to predict the number of atmospheric rivers in daily snapshots of climate simulations. Our results highlight several important issues of XAI methods (e.g., gradient shattering, inability to distinguish the sign of attribution, and ignorance to zero input) that have previously been overlooked in our field and, if not considered cautiously, may lead to a distorted picture of the CNN decision-making strategy. We envision that our analysis will motivate further investigation into XAI fidelity and will help toward a cautious implementation of XAI in geoscience, which can lead to further exploitation of CNNs and deep learning for prediction problems.
Tropical Cyclone Precipitation, Infrared, Microwave, and Environmental Dataset (TC PRIMED)
Authors: Razin Muhammad Naufal , Slocum Christopher J. , Knaff John A. , Brown Paula J. , Bell Michael M. 
Published: August 2022

Abstract
To study tropical cyclones and generate forecast applications using satellite observations, researchers often consolidate disparate sources of raw and ancillary data. Data consolidation involves obtaining, collocating, and intercalibrating data from different sensors and derived products; calculating environmental diagnostics from a homogeneous source; and standardizing these various products for a straightforward analysis. To alleviate preprocessing issues and provide a long-term, global digital dataset of tropical cyclone satellite observations, we construct the Tropical Cyclone Precipitation, Infrared, Microwave, and Environmental Dataset (TC PRIMED). TC PRIMED contains tropical cyclone–centric 1) intercalibrated, multichannel, multisensor microwave brightness temperatures, 2) retrieved rainfall from NASA’s Goddard Profiling Algorithm (GPROF), 3) nearly coincident geostationary satellite infrared brightness temperatures and derived metrics, 4) tropical cyclone position and intensity information, 5) ECMWF fifth-generation reanalysis fields and derived environmental diagnostics, and 6) precipitation radar observations from the TRMM and GPM Core Observatory satellites. TC PRIMED consists of over 176,000 overpasses of 2,101 storms from 1998 to 2019, providing researchers with an analysis-ready dataset to promote and support research into improving our understanding of the relationship between tropical cyclone convective and precipitation structure, intensity, and environment. Here, we briefly describe data sources and processing steps to create TC PRIMED. To demonstrate TC PRIMED’s potential utility for studying important tropical cyclone processes and for application development, we present a shear-relative composite analysis of several multisensor satellite variables relative to the tropical cyclone lifetime maximum intensity. The composite analysis provides a simple example of how TC PRIMED can benefit future studies to advance our understanding of tropical cyclones and improve forecasts.
Employee stock ownership plans and firm productivity in China
Authors: Li Haitong , Lin Ziang , Huang Bo 
Published: August 2022

AbstractA growing number of Chinese firms motivate their employees through employee stock ownership plans (ESOPs). Using a sample of listed firms in China, this paper examines the impact of ESOPs on firms’ total factor productivity (TFP), as well as the mechanisms of ESOPs. The empirical results show that ESOPs have a positive impact on firm TFP. The mechanism tests convey that ESOPs increase firm TFP by promoting research and development (R&D) investment and mitigating agency costs. These results are robust after accounting for endogeneity and using alternative metrics of TFP. In addition, we find that the positive effect of ESOPs on firm TFP is more pronounced in non-state-owned firms and firms with a less severe free-riding problem. Furthermore, the effect on firm TFP is positively associated with the subscription proportion of non-executive employees in ESOPs. Overall, the results of this study underscore the important role of employee ownership in firms’ productivity improvement.
Weather impacts on various types of road crashes: a quantitative analysis using generalized additive models
Authors: Becker Nico , Rust Henning W. , Ulbrich Uwe 
Published: August 2022

Abstract Adverse weather conditions can have different effects on different types of road crashes. We quantify the combined effects of traffic volume and meteorological parameters on hourly probabilities of 78 different crash types using generalized additive models. Using tensor product bases, we model non-linear relationships and combined effects of different meteorological parameters. We evaluate the increase in relative risk of different crash types in case of precipitation, sun glare and high wind speeds. The largest effect of snow is found in case of single-truck crashes, while rain has a larger effect on single-car crashes. Sun glare increases the probability of multi-car crashes, in particular at higher speed limits and in case of rear-end crashes. High wind speeds increase the probability of single-truck crashes and, for all vehicle types, the risk of crashes with objects blown on the road. A comparison of the predictive power of models with and without meteorological variables shows an improvement of scores of up to 24%, which makes the models suitable for applications in real-time traffic management or impact-based warning systems. These could be used by authorities to issue weather-dependent driving restrictions or situation-specific on-board warnings to improve road safety.
SEMgsa: topology-based pathway enrichment analysis with structural equation models
Authors: Grassi Mario , Tarantino Barbara 
Published: August 2022

AbstractBackgroundPathway enrichment analysis is extensively used in high-throughput experimental studies to gain insight into the functional roles of pre-defined subsets of genes, proteins and metabolites. Methods that leverages information on the topology of the underlying pathways outperform simpler methods that only consider pathway membership, leading to improved performance. Among all the proposed software tools, there’s the need to combine high statistical power together with a user-friendly framework, making it difficult to choose the best method for a particular experimental environment.ResultsWe propose SEMgsa, a topology-based algorithm developed into the framework of structural equation models. SEMgsa combine the SEMpvalues regarding node-specific group effect estimates in terms of activation or inhibition, after statistically controlling biological relations among genes within pathways. We used SEMgsa to identify biologically relevant results in a Coronavirus disease (COVID-19) RNA-seq dataset (GEO accession: GSE172114) together with a frontotemporal dementia (FTD) DNA methylation dataset (GEO accession: GSE53740) and compared its performance with some existing methods. SEMgsa is highly sensitive to the pathways designed for the specific disease, showing lowpvalues ($$< 0.001$$<0.001) and ranking in high positions, outperforming existing software tools. Three pathway dysregulation mechanisms were used to generate simulated expression data and evaluate the performance of methods in terms of type I error followed by their statistical power. Simulation results confirm best overall performance of SEMgsa.ConclusionsSEMgsa is a novel yet powerful method for identifying enrichment with regard to gene expression data. It takes into account topological information and exploits pathway perturbation statistics to reveal biological information. SEMgsa is implemented in the R package SEMgraph, easily available athttps://CRAN.R-project.org/package=SEMgraph.
Genome-wide analysis of the DREB family genes and functional identification of the involvement of BrDREB2B in abiotic stress in wucai (Brassica campestris L.)
Authors: Wu Ying , Zhang Liting , Nie Libing , Zheng Yushan , Zhu Shidong , Hou Jinfeng , Li Renjie , Chen Guohu , Tang Xiaoyan , Wang Chenggang , Yuan Lingyun 
Published: August 2022

AbstractDehydration responsive element binding protein (DREB) is a significant transcription factor class known to be implicated in abiotic stresses. In this study, we systematically conducted a genome-wide identification and expression analysis of the DREB gene family, including gene structures, evolutionary relationships, chromosome distribution, conserved domains, and expression patterns. A total of 65 DREB family gene members were identified in Chinese cabbage (Brassica rapa L.) and were classified into five subgroups based on phylogenetic analysis. Through analysis of the conserved domains of BrDREB family genes, only one exon existed in the gene structure. Through the analysis of cis-acting elements, these genes were mainly involved in hormone regulation and adversity stress. In order to identify the function of BrDREB2B, overexpressed transgenic Arabidopsis was constructed. After different stress treatments, the germination rate, root growth, survival rate, and various plant physiological indicators were measured. The results showed that transgenic Arabidopsis thaliana plants overexpressing BrDREB2B exhibited enhanced tolerance to salt, heat and drought stresses. Taken together, our results are the first to report the BrDREB2B gene response to drought and heat stresses in Chinese cabbage and provide a basis for further studies to determine the function of BrDREBs in response to abiotic stresses.
Impact of water deficiency on leaf cuticle lipids and gene expression networks in cotton (Gossypium hirsutum L.)
Authors: Yang Fan , Han Yongchao , Zhu Qian-Hao , Zhang Xinyu , Xue Fei , Li Yanjun , Luo Honghai , Qin Jianghong , Sun Jie , Liu Feng 
Published: August 2022

Abstract
Background
Water deficit (WD) has serious effect on the productivity of crops. Formation of cuticular layer with increased content of wax and cutin on leaf surfaces is closely related to drought tolerance. Identification of drought tolerance associated wax components and cutin monomers and the genes responsible for their biosynthesis is essential for understanding the physiological and genetic mechanisms underlying drought tolerance and improving crop drought resistance.

Result
In this study, we conducted comparative phenotypic and transcriptomic analyses of two Gossypium hirsutum varieties that are tolerant (XL22) or sensitive (XL17) to drought stress. XL17 consumed more water than XL22, particularly under the WD conditions. WD significantly induced accumulation of most major wax components (C29 and C31 alkanes) and cutin monomers (palmitic acid and stearic acid) in leaves of both XL22 and XL17, although accumulation of the major cutin monomers, i.e., polyunsaturated linolenic acid (C18:3n-3) and linoleic acid (C18:2n-6), were significantly repressed by WD in both XL22 and XL17. According to the results of transcriptome analysis, although many genes and their related pathways were commonly induced or repressed by WD in both XL22 and XL17, WD-induced differentially expressed genes specific to XL22 or XL17 were also evident. Among the genes that were commonly induced by WD were the GhCER1 genes involved in biosynthesis of alkanes, consistent with the observation of enhanced accumulation of alkanes in cotton leaves under the WD conditions. Interestingly, under the WD conditions, several GhCYP86 genes, which encode enzymes catalyzing the omega-hydroxylation of fatty acids and were identified to be the hub genes of one of the co-expression gene modules, showed a different expression pattern between XL22 and XL17 that was in agreement with the WD-induced changes of the content of hydroxyacids or fatty alcohols in these two varieties.

Conclusion
The results contribute to our comprehending the physiological and genetic mechanisms underlying drought tolerance and provide possible solutions for the difference of drought resistance of different cotton varieties.
SAfE transport: wearing face masks significantly reduces the spread of COVID-19 on trains
Authors: Grzybowska Hanna , Hickson R. I. , Bhandari Bishal , Cai Chen , Towke Michael , Itzstein Benjamin , Jurdak Raja , Liebig Jessica , Najeebullah Kamran , Plani Adrian , Shoghri Ahmad El , Paini Dean 
Published: August 2022

AbstractCOVID-19 has had a substantial impact globally. It spreads readily, particularly in enclosed and crowded spaces, such as public transport carriages, yet there are limited studies on how this risk can be reduced. We developed a tool for exploring the potential impacts of mitigation strategies on public transport networks, called the Systems Analytics for Epidemiology in Transport (SAfE Transport). SAfE Transport combines an agent-based transit assignment model, a community-wide transmission model, and a transit disease spread model to support strategic and operational decision-making. For this simulated COVID-19 case study, the transit disease spread model incorporates both direct (person-to-person) and fomite (person-to-surface-to-person) transmission modes. We determine the probable impact of wearing face masks on trains over a seven day simulation horizon, showing substantial and statistically significant reductions in new cases when passenger mask wearing proportions are greater than 80%. The higher the level of mask coverage, the greater the reduction in the number of new infections. Also, the higher levels of mask coverage result in an earlier reduction in disease spread risk. These results can be used by decision makers to guide policy on face mask use for public transport networks.