bluuebunny/crossref_metadata_2025_split huggingface dataset:
Cytogenetics studies in Hymenaea Clade (Leguminosae, Detarioideae)
Authors: Serbin Giulia Melill , Pinto Rafael Barbosa , Machado Raquel Moura , Mansano Vidal de Freitas , Tozzi Ana Maria Goulart de Azevedo , Forni-Martins Eliana Regina 
Published: January 2023

The genera Hymenaea L., Guibourtia Benn. and Peltogyne Vog. belong to the Detarioideae subfamily (Leguminosae) and they are supported by phylogenetic studies as a clade which we call here the Hymenaea clade. Representatives of this clade are mainly recognized by their resin production capability and the bifoliolate leaves. Hymenaea and Guibourtia currently comprise about 23 and 14 species, distributed mainly in the Neotropical region and the African continent respectively. Peltogyne comprises ca. 24 species, all of them restricted to the New World. Even with this biogeographical pattern and an evident difficulty in the delimitation of taxa, especially at an infrageneric level, the knowledge on cytological characteristics for the group is scarce and restricted only to chromosome number. Thus, this work aims to provide karyotype data for taxa from the Hymenaea clade, helping further taxonomic and evolutionary studies that are being developed. After the cataloging of the data available in the literature we observed that apparently, the predominant chromosome number in the Detarioideae subfamily is 2n=24 but, within the Hymenaea clade this information is available only for 11 species of Hymenaea and two species of Guibourtia. Other cytogenetic approaches as CMA/DAPI and FISH analyses have never been applied for the clade. The seeds of 11 taxa (three Guibourtia, seven Hymenaea and one Peltogyne) were collected in several regions of Brazil. We observed some variations in numbers of chromosome, CMA+ bands and rDNA sites. Representatives of the Hymenaea clade presented predominantly 2n=24 (except G. coleosperma - 2n=48), two pairs of CMA+ bands (except G. coleosperma and G. conjugata with one pair, and H. altissima Ducke with three pairs), one pair of rDNA 5S (except P. pauciflora, with two pairs), and one pair of rDNA 45S. Despite the apparent karyotype stability among taxa from the three genera, some finds support important ideas as the possible non-monophyly of Guibourtia, since species as G. coleosperma and G. conjugata belong to different lineages as pointed by ongoing phylogentic studies. More taxa are being investigated to improve the support for clades and for taxonomic decisions.
Distribuição de sequências subteloméricas no genoma C de Solanum.
Authors: Oliveira Gleicy Kelly de , Oliveira Ludmila Cristina , Torres Giovana Augusta 
Published: January 2023

As sequências subteloméricas CL14 e CL34 foram identificadas em Solanum. tuberosum (genoma A) como longos arranjos adjacentes aos telômeros, sendo localizadas exclusivamente na região terminal dos cromossomos. CL14 está presente também em outras espécies do genoma A e também nos genomas B, P, T e E do gênero, enquanto CL34 foi encontrada apenas em espécies do genoma A. Foi mostrado que essas sequências são muito dinâmicas e evoluem rapidamente nos genomas estudados, mas não foi feita ainda a caracterização nos genomas C e D presentes apenas em espécies poliploides. Esse trabalho teve por objetivo verificar a presença e distribuição dessas duas sequências no genoma C, na espécie alopoliploide Solanum agrimonifolium (2n=4x=48; AACC). Os cromossomos metafásicos foram hibridizados com as sondas CL14 e CL34, marcadas com biotina e digoxigenina. A detecção das sondas foi feita com o uso dos anticorpos antibiotina e antidigoxigenina, conjugados com fluorocromos FITC e rodamina, respectivamente, e os cromossomos contracorados com DAPI (diamidinefenilindole). A sonda CL14 foi mais abundante, estando presente nas regiões terminais de 17 pares de cromossomos, enquanto CL34 foi observada em 6 pares. Foi observada co-localização das duas sondas em três extremidades cromossômicas. Considerando que o genoma de S. agrimonifolium apresenta 12 pares de genoma A e 12 do genoma C, podemos inferir que o genoma C também apresenta a sequência CL14 nos subtelômeros, o que também evidencia a origem mais antiga dessa sequência. Uma característica inédita observada em S. agrimonifolium foi a presença de CL14 na região intersticial de um par cromossômico. Isso pode estar relacionado à fusão de cromossomos com posterior preservação das sequências subteloméricas. A repetição CL34 observada provavelmente pertence apenas ao genoma A, estando ausente no genoma C, assim como nos genomas previamente estudados. Os resultados confirmam que CL14 é uma repetição mais ancestral, abundante e com ampla distribuição no gênero Solanum, enquanto CL34 é relativamente mais recente. Apoio Financeiro: FAPEMIG, CAPES e CNPq
Formação de micronúcleos, micrócitos e políades em um híbrido interespecífico sexual de Brachiairia
Authors: Ragalzi Celina de Medeiros , Sales Gabriel Luiz de Melo , Vido Felipe Cardoso Tarifa , Valle Cacilda Borges do , Bonato Andréa Beatriz Mendes 
Published: January 2023

Cultivares do gênero Brachiaria são plantadas em 90% da área de pastagens tropicais cultivadas do Brasil, cobrindo cerca de 100 milhões de hectares. A necessidade de diversificação de pastagens, devido à monocultura, e a intensificação na produção de gado de corte e sementes demanda novas cultivares no mercado. Neste sentido, o programa de melhoramento da Embrapa Gado de Corte (Campo Grande – MS) tem investido recursos no desenvolvimento de novas cultivares com desempenho e potencial agronômico desejáveis e que apresentem os genes para características de interesse. A hibridação interespecífica é possível neste gênero, mas é complexa devido à apomixia e à poliploidia. A apomixia é pseudogâmica e a poliploidia é altamente correlacionada com anormalidades meióticas. Estas anormalidades podem levar a uma baixa produção de sementes férteis, fator que compromete severamente sua utilização do híbrido como nova cultivar. O presente estudo teve como objetivo auxiliar o programa de melhoramento genético de Brachiaria através da análise do comportamento cromossômico durante a gametogênese (microsporogênese e mercado. Neste sentido, o programa de melhoramento da Embrapa Gado de Corte (Campo Grande – MS) tem investido recursos no desenvolvimento de novas cultivares com desempenho e potencial agronômico desejáveis e que apresentem os genes para características de interesse. A hibridação interespecífica é possível neste gênero, mas é complexa devido à apomixia e à poliploidia. A apomixia é pseudogâmica e a poliploidia é altamente correlacionada com anormalidades meióticas. Estas anormalidades podem levar a uma baixa produção de sementes férteis, fator que compromete severamente sua utilização do híbrido como nova cultivar. O presente estudo teve como objetivo auxiliar o programa de melhoramento genético de Brachiaria através da análise do comportamento cromossômico durante a gametogênese (microsporogênese e eliminação micronúcleos em micrócitos e a formação de pêntades e héxades ao final da meiose II. Estas anormalidades acabaram resultando em micrósporos com quantidade desbalanceada de material genético e, consequentemente, na formação de grãos de pólen inviáveis. A inviabilidade polínica pode acarretar em baixa produção de sementes e limitar o sucesso da hibridação.
Karyology of Agapanthus africanus (L.) Hoffmanns (Agapanthaceae)
Authors: Souza Flávia Rangel de , Campos Victória Rabelo , Franco Ana Luiza , Reis Aryane Campos , Viccini Lyderson Facio , Sousa Saulo Marçal de 
Published: January 2023

The genus Agapanthus L'Héritier (Agapanthaceae) is a monocotyledonous, herbaceus and perennial plant group endemic to southern Africa. Ten species have been described for this group, in which three are considered evergreen and seven deciduous plants. Nevertheless, Agapanthus L'Héritier taxonomy is considered very difficult once there are few unique characters and a high plasticity depending on circumstances of growing. This feature takes some authors to believe in the existence of only one species with innumerous varieties.The cytogenetic has been an important tool to aid the plant taxon identification, and to date, all taxa of Agapanthus L'Héritier studied cytologically presented 2n = 30. Although the species possess large chromosomes, few karyological studies has been explored. This work aimed to increase the cytogenetic knowledge of Agapanthus africanus (L.) Hoffmanns by chromosome banding techniques with DAPI / CMA3 and Fluorescent in situ Hybridization (FISH). In addition, flow cytometry was used to determinate DNA content and the percentage of AT / GC nitrogenous bases. Plants studied showed 2n = 30 chromosomes, ranging from 4.34 - 8.55 µm, with karyotype formulae (KF) = 10m + 5sm. The FISH technique revealed one 45S rDNA signal observed proximally to centromere of the chromosome 7, and one 5S rDNA signal observed proximally to centromere of chromosome 9. The 2C DNA content estimated for the species was 2C = 24.4pg, with 59% of AT and 41% of GC. Our data allowed important upgrade for biology and cytotaxonomy of Agapanthus africanus (L.) Hoffmanns, and will be used to future taxonomic and phylogenetics studies, as well as for the chromosome evolution of the genus. APOIO FINANCEIRO: Fapemig, Capes, CNPq
Natureza molecular da heterocromatina no cariótipo de uma população polimórfica de Hypostomus regani (Pisces, Loricariidae)
Authors: Gazolla Camilla Borges , Prizon Ana Camila , Oliva Júlio Henrique , Ferreira Greicy Ellen de Brito , Bruschi Daniel Pacheco , Carvalho Luciana Andréia Borin de , Portela Castro Ana Luiza de Brito 
Published: January 2023

Hypostomus (Loricariidae) destaca-se na família pela grande diversidade cariotípica numérica (2n=64-84) e estrutural, envolvendo diferenças nas fórmulas cromossômicas até mesmo dentro da mesma espécie. Esta variabilidade pode ser melhor avaliada com a utilização de diferentes marcadores cromossômicos, os quais revelam uma diversidade críptica neste grupo. Estudos prévios em uma população de H. regani coletada no rio Taquari (bacia do rio Paraguai, Coxim, MS) revelaram 2n=72 cromossomos, porém, dois cariomorfos, sendo cariomorfo A com 12m+14sm+18st+28a e no cariomorfo B, 13m+14sm+17st+28a. O cariomorfo B é caracterizado por um intrigantante heteromorfismo de tamanho envolvendo o par cromossômico 19, constituído por um homólogo subtelocêntrico e por um cromossomo metacêntrico grande, o maior do complemento. Essa condição é observada em 43,74% de nossa amostra e independe do sexo do indivíduo analisado. O metacentrico apresentou o braço curto totalmente heterocromático (banda C positivo) e sequências ricas em CG, reveladas por CMA3. Portanto, o presente estudo tem como objetivo, complementar os dados sobre a natureza molecular da heterocromatina nos cromossomos de H. regani, com ênfase no par heteromórfico, através do FISH com sequências de microssatélites (GA)15 e (CA)15. Foram evidenciados clusters de repetições (CA)15 principalmente nas regiões subterminais e pericentroméricas na maioria dos cromossomos do complemento. Adicionalmente, detectamos sinais discretos de hibridação na região insterticial de ambos os braços e marcações nas regiões subterminais no par de cromossomos que contém o cromossomo heteromorfo. Clusters de (GA)15 foram evidenciados nas regiões subterminais e pericentricas de vários cromossomos, destacando-se marcações subterminais, e no par 19 com o cromossomo heteromórfico, observou-se clusters em ambas regiões subterminais e uma discreta marcação intersticial no braço longo do heteromorfo. Estes resultados contribuem com dados sobre a composição molecular heterogênea da heterocromatina no genoma desta espécie e revela importante papel dos elementos repetitivos na evolução cariotípica da mesma.Apoio financeiro: CAPES-PBC/UEM
Número cromossômico do cruzamento de Catassetum (Dragon’s x pileatum) (Orchidaceae)
Authors: Macedo Weslaine de Almeida , Santos Bruna Natália Veloso dos , Mello Vanessa dos Santos de , Leite Douglas Machado , Karsburg Isane Vera 
Published: January 2023

O gênero Catasetum Rich. ex Kunth, Orchidaceae, destaca-se dos demais grupos por apresentar dimorfismo sexual e também pelo mecanismo de disparo das polínias quando em contato com alguma estrutura externa. Para este gênero, estudos mostram que há uma ampla diversidade morfológica, numérica e cromossômica. A hibridação interespecífica é um dos principais aspectos responsáveis por esta vasta diversidade. Pela relevância do gênero poucos estudos referentes aos híbridos do gênero, este trabalho objetivou-se determinar o número cromossômico do híbrido oriundo do cruzamento de Catassetum (Dragon’s x pileatum). O presente trabalho foi realizado no Laboratório de Citogenética e cultura de Tecidos Vegetais, na Universidade do Estado de Mato Grosso, utilizou-se meristemas radiculares de um híbrido obtido do cruzamento de Catasetum (Dragon’s x pileatum), foram submetidas ao processo de bloqueio permanecendo em solução de Amiprofos-metyl 3µM APM durante um período que variou de 12 a 18 horas a uma temperatura de 4ºC e fixadas em solução metanol-ácido acético (PA) em uma proporção de 3:1 sob as mesmas condições de temperatura, sendo posteriormente transferidas para tubos do tipo Eppendorf® contendo 200?L de enzima Pectinase SIGMA® à 100%, permanecendo por 5 horas a 35ºC em banho-maria. As lâminas foram preparadas pela técnica de dissociação celular, secagem ao ar e em placa aquecedora a 50ºC e submetidas à solução Giemsa a 5% por 3 minutos. As imagens com cromossomos bem distribuídos e sem sobreposições nas lâminas foram fotografadas com o uso de objetiva de 100x em um microscópio fotômico binocular (Leica ICC 50) acoplado a um computador e no software LAZ EZ V1. 7.0. O híbrido estudado apresentou o número de 2n=36 3µM cromossomos, corroborando assim com a média apresentada na literatura sobre o gênero e seus híbridos provenientes (2n=40 à 2n=162). Sendo assim, o número cromossômico encontrado pode oferecer informações necessárias para contribuir com estudos de melhoramento e também de variações genéticas que são ocorrentes dentro do gênero Catasetum.
Organização genômica do RNA repetitivo e evolução do cariótipo em Elaenia flavogaster (Passeriformes, Aves)
Authors: Rodrigues Benilson Silva , Kretschmer Rafael , Garnero Analía Del Valle , Gunski Ricardo José , Cioffi Marcelo de Bello , Oliveira Edivaldo Herculano Corrêa de 
Published: January 2023

Pouco se sabe sobre a organização de sequências repetitivas no cariótipo das Aves, e sondas de microssatélites foram usadas em um pequeno grupo de espécies até o momento. Tyrannidae (Passeriformes, Suboscines), é uma das maiores famílias de aves das Américas, e dados citogenéticos evidenciaram uma interessante variação cariotípica nesse grupo. Assim, o objetivo desse estudo foi analisar o cariótipo da guaracava-de-barriga-amarela (Elaenia flavogaster), por meio de técnicas de citogenética clássica (coloração convencional com Giemsa e bandeamento C) e molecular (sondas teloméricas, 18S rDNA e sondas de microssatélites: (CAT)10, (GAG)10, (GC)15, (GA)15 e (TA)15). Os resultados mostraram um número diploide de 2n=80. A distribuição da heterocromatina exibiu marcações apenas nos centrômeros dos cromossomos. O padrão de hibridização das sondas teloméricas revelou sinais mais intensos nos microcromossomos e ausência de sequências teloméricas intersticiais (ITSs), reforçando o fato de que ITSs são menos frequentes em ordens de Aves consideradas mais derivadas, visto que em Ratitas e Galloanserae essas sequências já foram detectadas. As sondas de 18S rDNA marcaram dois pares de microcromossomos, semelhante a Elaenia spectabilis e Serpophaga subcristata, indicando que esta característica pode representar uma sinapomorfia dentro de Elaeniinae, pois até o momento não foi encontrada em outras subfamílias dentro de Tyrannidae. Das sondas de microssatélites utilizadas, (GA)15 e (TA)15 não produziram sinais detectáveis, já as sondas de microssatélites (CAT)10 marcaram apenas na extremidade distal do braço longo do 1º par, e em alguns microcromossomos, as sondas (GAG)10 apresentaram intensa marcação nos microcromossomos, diferentemente de Leptotila verreauxi (Columbiformes), na qual essas sondas marcam poucos microcromossomos. Já as sondas (GC)15 marcaram apenas o braço curto de um microcromossomo e o braço longo de um macrocromossomo. Esses resultados evidenciam a variação de distribuição dessas sequências repetitivas em diferentes grupos de Aves e o pequeno número de sinais detectados concorda com o fato de que o genoma das Aves é compacto com pouca quantidade de DNA repetitivo. Conclui-se que a evolução do cariótipo dos tiranídeos envolveu a amplificação de sítios de 18S rDNA e que apresenta uma distribuição distinta de microssatélites quando comparada com espécies de outras ordens.
Prevalência de mosaicismo na síndrome de Turner no estado de Pernambuco
Authors: Pinto Rafaella do Nascimento , Santos Luana Oliveira dos , Barros Juliana Vieira de , Laranjeira Raysa Samanta Moraes , Silva Kamylla Ramos da , Silva Rarysa Ferraz de Almeida e , Bispo Adriana Valéria Sales , Duarte Andréa de Rezende , Araújo Jacqueline , Gomes Bárbara , Santos Neide 
Published: January 2023

A existência de mosaicismo cromossômico tem sido apontada como um fator determinante para a viabilidade das pacientes portadoras da Síndrome de Turner (ST), tendo em vista que apenas 1% dos fetos com o cariótipo 45,X são nativivos, pois 99% são abortados espontaneamente Diversos casos de mosaicismo cromossômico têm sido descritos, com as mais variadas constituições celulares associadas à linhagem clássica para a ST (45,X). Essa coexistência de linhagens pode resultar na maior parte dos casos no abrandamento dos sintomas que caracterizam a síndrome, sendo as consequências fenotípicas decorrentes do mosaicismo dependentes da proporção de células alteradas Esse estudo teve como objetivo determinar a prevalência de mosaicismo cromossômico em portadores da Síndrome de Turner e verificar possíveis associações entre os fenótipos e cariótipos dessas pacientes oriundas do Estado de Pernambuco. Para o desenvolvimento da investigação foram coletadas amostras de sangue periférico em pacientes que foram recrutadas do Serviço de Genética Médica do Instituto Materno Infantil Prof. Fernando Figueira (IMIP) e Serviço de Endocrinologia Pediátrica do Hospital das Clínicas (HC), entre outubro de 2006 e agosto de 2016. O cultivo de linfócitos de sangue periférico foi realizado para cada paciente e, posteriormente, um bandeamento G foi utilizado para identificação cromossômica e detecção das alterações encontradas. A análise citogenética detectou cariótipos compatíveis com a ST em 84 pacientes, O cariótipo 45,X foi observado em 58,3% da amostra, seguido de indivíduos portadores de mosaicismo, que representaram 33,3% dos casos. Entre as pacientes portadoras de mosaicismo, o cariótipo 46,X,i(Xq)/45,X foi o mais prevalente, representando 16,6% da amostra. Linhagens celulares contendo cromossomo em anel (46,X,r(X)/45,X) e o cromossomo Y (45,X/46,XY) também foram detectadas. As manifestações clínicas mais incidentes nas pacientes com ST foram a baixa estatura e amenorréia primária, sendo constatado a ocorrência de 89,2% e 64,3%, respectivamente, em pacientes com mosaicismo confirmado. Os resultados obtidos confirmaram a necessidade de investigação de mosaicismo cromossômico, para determinar uma relação entre a expressão fenotípica específica e cada tipo de associação de linhagens cromossômicas diferentes. Além disso, a avaliação precisa da constituição cromossômica irá proporcionar às portadoras da ST um diagnóstico conclusivo, prognóstico adequado e tratamento com terapias específicas.Auxílio financeiro: FACEPE, UFPE
Citogenômica de Mamíferos
Authors: Svartman Marta 
Published: January 2023

Descritos pela primeira vez em 1999, os neocentrômeros evolutivos (NCEs) têm-se revelado muito mais comuns do que se imaginava à época e é agora claro que têm um papel importante na arquitetura dos genomas de vertebrados. Os NCEs são evidenciados pela presença de um centrômero em uma região cromossômica nova sem qualquer alteração na ordem dos marcadores e acompanhados pela inativação do centrômero antigo. Os mecanismos subjacentes à formação e progressão dos NCEs ainda são pouco conhecidos e acredita-se que se originam pela inativação e degeneração do centrômero original e aparecimento epigenético do novo centrômero no mesmo cromossomo. Os macacos-de-cheiro (Saimiri) têm-se mostrado especialmente interessantes para o estudo de NCEs. Exemplares de diferentes regiões geográficas têm o mesmo 2n=44, mas diferem no número fundamental (NF). Desenvolveu-se um consenso de que as diferenças em NF se deviam a inversões pericêntricas, que distinguiriam os Saimiri tanto taxonomicamente, quanto geograficamente. Entretanto, resultados obtidos por nós recentemente mostraram que as diferenças entre os cariótipos de Saimiri não se devem a inversões pericêntricas, como proposto, mas ao reposicionamento centromérico ou NCEs. Utilizamos bandeamento cromossômico, pintura cromossômica e BAC-FISH para caracterizar cromossomos que diferenciam taxa de Saimiri: os cromossomos 5 e 15 de Saimiri sciureus e seus homólogos em Saimiri boliviensis boliviensis e Saimiri b. peruviensis. Nos dois casos, os dados obtidos mostraram que as diferenças nestes cromossomos não se devem a inversões ou outro tipo de rearranjo estrutural, mas à presença de NCEs. Também foi descrito um NCE no cromossomo X de Saimiri, cujas diferenças morfológicas interespecíficas haviam sido previamente atribuídas a uma série de inversões complexas. Experimentos com BACs demonstraram que não havia mudanças na ordem de marcadores em relação ao cromossomo X de primatas e que a diferença se devia a um NCE, o único conhecido no cromossomo X de mamíferos. A análise de nossos dados em conjunto com árvores filogenéticas nos permitiram datar a origem dos NCEs em Saimiri. Estamos agora começando analisar outras espécies de Platyrrhini, nas quais temos indicações da presença de NCEs.