High-performance and energy-efficient irregular graph processing on GPU architectures
Authors:   , Segura Salvador Albert 
Published: July 2023

Graph processing is an established and prominent domain that is the foundation of new emerging applications in areas such as Data Analytics and Machine Learning, empowering applications such as road navigation, social networks and automatic speech recognition. The large amount of data employed in these domains requires high throughput architectures such as GPGPU. Although the processing of large graph-based workloads exhibits a high degree of parallelism, memory access patterns tend to be highly irregular, leading to poor efficiency due to memory divergence.In order to ameliorate these issues, GPGPU graph applications perform stream compaction operations which process active nodes/edges so subsequent steps work on a compacted dataset. We propose to offload this task to the Stream Compaction Unit (SCU) hardware extension tailored to the requirements of these operations, which additionally performs pre-processing by filtering and reordering elements processed.We show that memory divergence inefficiencies prevail in GPGPU irregular graph-based applications, yet we find that it is possible to relax the strict relationship between thread and processed data to empower new optimizations. As such, we propose the Irregular accesses Reorder Unit (IRU), a novel hardware extension integrated in the GPU pipeline that reorders and filters data processed by the threads on irregular accesses improving memory coalescing.Finally, we leverage the strengths of both previous approaches to achieve synergistic improvements. We do so by proposing the IRU-enhanced SCU (ISCU), which employs the efficient pre-processing mechanisms of the IRU to improve SCU stream compaction efficiency and NoC throughput limitations due to SCU pre-processing operations. We evaluate the ISCU with state-of-the-art graph-based applications achieving a 2.2x performance improvement and 10x energy-efficiency.
El processament de grafs és un domini prominent i establert com a la base de noves aplicacions emergents en àrees com l'anàlisi de dades i Machine Learning, que permeten aplicacions com ara navegació per carretera, xarxes socials i reconeixement automàtic de veu. La gran quantitat de dades emprades en aquests dominis requereix d’arquitectures d’alt rendiment, com ara GPGPU. Tot i que el processament de grans càrregues de treball basades en grafs presenta un alt grau de paral·lelisme, els patrons d’accés a la memòria tendeixen a ser irregulars, fet que redueix l’eficiència a causa de la divergència d’accessos a memòria. Per tal de millorar aquests problemes, les aplicacions de grafs per a GPGPU realitzen operacions de stream compaction que processen nodes/arestes per tal que els passos posteriors funcionin en un conjunt de dades compactat. Proposem deslliurar d’aquesta tasca a la extensió hardware Stream Compaction Unit (SCU) adaptada als requisits d’aquestes operacions, que a més realitza un pre-processament filtrant i reordenant els elements processats.Mostrem que les ineficiències de divergència de memòria prevalen en aplicacions GPGPU basades en grafs irregulars, tot i que trobem que és possible relaxar la relació estricta entre threads i les dades processades per obtenir noves optimitzacions. Com a tal, proposem la Irregular accesses Reorder Unit (IRU), una nova extensió de maquinari integrada al pipeline de la GPU que reordena i filtra les dades processades pels threads en accessos irregulars que milloren la convergència d’accessos a memòria. Finalment, aprofitem els punts forts de les propostes anteriors per aconseguir millores sinèrgiques. Ho fem proposant la IRU-enhanced SCU (ISCU), que utilitza els mecanismes de pre-processament eficients de la IRU per millorar l’eficiència de stream compaction de la SCU i les limitacions de rendiment de NoC a causa de les operacions de pre-processament de la SCU.