Statistical biases due to anonymization evaluated in an open clinical dataset from COVID-19 patients
Authors: Koll Carolin E. M. , Hopff Sina M. , Meurers Thierry , Lee Chin Huang , Kohls Mirjam , Stellbrink Christoph , Thibeault Charlotte , Reinke Lennart , Steinbrecher Sarah , Schreiber Stefan , Mitrov Lazar , Frank Sandra , Miljukov Olga , Erber Johanna , Hellmuth Johannes C. , Reese Jens-Peter , Steinbeis Fridolin , Bahmer Thomas , Hagen Marina , Meybohm Patrick , Hansch Stefan , Vadász István , Krist Lilian , Jiru-Hillmann Steffi , Prasser Fabian , Vehreschild Jörg Janne ,   NAPKON Study Group,   NAPKON Infrastructure Group, Bernemann I. , Illig T. , Kersting M. , Klopp N. , Kopfnagel V. , Muecke S. , Anton G. , Kraus M. , Kuehn-Steven A. , Kunze S. , Tauchert M. K. , Vehreschild J. , Brechtel M. , Fuhrmann S. , Hopff S. M. , Koll C. E. M. , Lee C. , Mitrov L. , de Miranda S. M. Nunes , Nunnendorf M. , Sauer G. , Seibel K. , Stecher M. , Appel K. , Geisler R. , Hagen M. , Scherer M. , Schneider J. , Weismantel C. , Balzuweit B. , Berger S. , Hummel M. , Schmidt S. , Witzenrath M. , Zoller T. , Krannich A. , Kurth F. , Lienau J. , Lorbeer R. , Pley C. , Schaller J. , Thibeault C. , Bauer C. , Fiessler C. , Goester M. , Grau A. , Heuschmann P. , Hofmann A. L. , Jiru-Hillmann S. , Kammerer K. , Kohls M. , Miljukov O. , Reese J. P. , Ungethuem K. , Krawczak M. , Hellmuth J. C. , Bahls T. , Hoffmann W. , Nauck M. , Schäfer C. , Schattschneider M. , Stahl D. , Valtentin H. , Chaplinskaya I. , Hanß S. , Krefting D. , Pape C. , Hoffmann J. ,   NAPKON Study Site Group, Fricke J. , Helbig T. , Keil T. , Kretzler L. , Krist L. , Lippert L. , Mittermaier M. , Mueller-Plathe M. , Roennefarth M. , Sander L. E. , Steinbeis F. , Steinbrecher S. , Treue D. , Triller P. , Zvorc S. , Hammer F. , Horvarth L. , Kipet A. , Schroth M. , Unterweger M. T. , Bernemann I. , Drick N. , Hoeper M. , Illig T. , Kersting M. , Klopp N. , Kopfnagel V. , Pink I. , Ratowski M. , Zetzsche F. , Bremer C. M. , Halfar H. H. , Herold S. , Nguyen L. H. , Ruppert C. , Scheunemann M. , Seeger W. , Munoz A. Uribe , Vadasz I. , Wessendorf M. , Azzaui H. , Gräske M. , Hower M. , Kremling J. , Landsiedel-Mechenbier E. , Riepe A. , Schaaf B. , Frank S. , Huber M. , Kaeaeb S. , Keppler O. T. , Khatamzas E. , Mandel C. , Mueller S. , Muenchhoff M. , Reeh L. , Scherer C. , Stubbe H. , von Bergwelt M. , Weiß L. , Zwißler B. , Milovanovic M. , Pauli R. , Ebert M. , Hofmann W. K. , Neumaier M. , Siegel F. , Teulfel A. , Wyen C. , Allerlei C. , Keller A. , Walter J. , Bals R. , Herr C. , Krawczyk M. , Lensch C. , Lepper P. M. , Riemenschneider M. , Smola S. , Zemlin M. , Raichle C. , Slesak G. , Bader S. , Classen J. , Dhillon C. , Freitag M. , Gruenherz V. , Maerkl B. , Messmann H. , Roemmele C. , Steinbrecher M. , Ullrich M. , Altmann H. , Berner R. , Dreßen S. , Koch T. , Lindemann D. , Seele K. , Spieth P. , Tausche K. , Toepfner N. , von Bonin S. , Kraska D. , Kremer A. E. , Leppkes M. , Mang J. , Neurath M. F. , Prokosch H. U. , Schmid J. , Vetter M. , Willam C. , Wolf K. , Addo M. , Engels A. L. F. , Jarczak D. , Kerinn M. , Kluge S. , Kobbe R. , Roedl K. , Schlesner C. , Shamsrizi P. , Zeller T. , Arendt C. , Bellinghausen C. , Cremer S. , Groh A. , Gruenewaldt A. , Khodamoradi Y. , Klinsing S. , Rohde G. , Vehreschild M. , Vogl T. , Becker K. , Doerr M. , Lehnert K. , Nauck M. , Piasta N. , Schaefer C. , Schaefer E. , Schattschneider M. , Scheer C. , Stahl D. , Baber R. , Bercker S. , Krug N. , Mueller S. D. , Wirtz H. , Boeckel G. , Meier J. A. , Nowacki T. , Tepasse P. R. , Vollenberg R. , Wilms C. , Arlt A. , Griesinger F. , Guenther U. , Hamprecht A. , Juergens K. , Kluge A. , Meinhardt C. , Meinhardt K. , Petersmann A. , Prenzel R. , Brauer-Hof A. , Brochhausen-Delius C. , Burkhardt R. , Feustel M. , Hanses F. , Malfertheiner M. , Niedermair T. , Schmidt B. , Schuster P. , Wallner S. , Mueller-Wieland D. , Marx N. , Dreher M. , Dahl E. , Wipperfuerth J. , Bahmer T. , Enderle J. , Friedrichs A. , Hermes A. , Kaeding N. , Koerner M. , Krawczak M. , Kujat C. , Lehmann I. , Lessing M. , Lieb W. , Maetzler C. , Oberländer M. , Pape D. , Plagge M. , Reinke L. , Rupp J. , Schreiber S. , Schunk D. , Tittman L. , Barkey W. , Erber J. , Fricke L. , Lieb J. , Michler T. , Mueller L. , Schneider J. , Spinner C. , Voit F. , Winter C. , Bitzer M. , Bunk S. , Göpel S. , Häberle H. , Kienzle K. , Mahrhofer H. , Malek N. , Rosenberger P. , Struemper C. , Trauner F. , Frantz S. , Frey A. , Haas K. , Haertel C. , Haeusler K. G. , Hein G. , Herrmann J. , Horn A. , Isberner N. , Jahns R. , Kohls M. , Liese J. , Meybohm P. , Morbach C. , Schmidt J. , Schulze P. , Stoerk S. , Weissbrich B. , Brinkmann F. , Brueggemann Y. , Gambichler T. , Hellwig K. , Luecke T. , Reinacher-Schick A. , Schmidt W. E. , Schuette C. , Steinmann E. , Reyes C. Torres , Alsaad K. , Berger B. , Hamelmann E. , Heidenreich H. , Hornberg C. , Kulamadayil-Heidenreich N. S. A. , Maasjosthusmann P. , Muna A. , Olariu C. , Ruprecht B. , Schmidt J. , Stellbrink C. , Tebbe J. , August D. , Barrera M. , Goetz V. , Imhof A. , Koch S. , Nieters A. , Peyerl-Hoffmann G. , Rieg S. R. , Amanzada A. , Blaschke S. , Hafke A. , Hermanns G. , Kettwig M. , Moerer O. , Nussbeck S. , Papenbrock J. , Santibanez-Santana M. , Zeh S. , Dolff S. , Elsner C. , Krawczyk A. , Madel R. J. , Otte M. , Brochhagen L. , Witzke O. ,   NAPKON Steering Committee, Herold S. , Heyder R. , Neuhauser H. , Schreiber S. , von Lilienfeld-Toal M. ,   NAPKON Use & Access Committee, Ellert C. , Friedrichs A. , Milger K. , Schmidt G. , Witzke O. 
Published: December 2022

AbstractAnonymization has the potential to foster the sharing of medical data. State-of-the-art methods use mathematical models to modify data to reduce privacy risks. However, the degree of protection must be balanced against the impact on statistical properties. We studied an extreme case of this trade-off: the statistical validity of an open medical dataset based on the German National Pandemic Cohort Network (NAPKON), which was prepared for publication using a strong anonymization procedure. Descriptive statistics and results of regression analyses were compared before and after anonymization of multiple variants of the original dataset. Despite significant differences in value distributions, the statistical bias was found to be small in all cases. In the regression analyses, the median absolute deviations of the estimated adjusted odds ratios for different sample sizes ranged from 0.01 [minimum = 0, maximum = 0.58] to 0.52 [minimum = 0.25, maximum = 0.91]. Disproportionate impact on the statistical properties of data is a common argument against the use of anonymization. Our analysis demonstrates that anonymization can actually preserve validity of statistical results in relatively low-dimensional data.