bluuebunny/crossref_metadata_2025_split huggingface dataset:
Application of Recombinant Proteins in Contemporary Food Biotechnology: A Scoping Review
Authors: Filkin Sergey , Lipkin Alexey , Fedorov Alexey 
Published: January 2025

Introduction: Since 1994, the dynamic development of biotechnology and the widespread application of recombinant enzymes have led to new technological solutions in food production. Modern technologies enable the production of sugar, bread, beer, cheese, sausages, and other products using biotechnological processes and industrial food enzymes. The bioproduction of recombinant proteins has replaced natural enzymes, offering enzymes with enhanced catalytic functions, stability, and an extended range of operating conditions. These recombinant enzymes have proven to be economically more advantageous compared to natural and previously used recombinant enzymes.Purpose: To delineate the scope of research on recombinant proteins and their role in modern food production from 1973 to 2024.Materials and Methods: Sources were searched in the databases PubMed, RSCI, and Google Scholar. The review methodology adhered to the PRISMA-ScR protocol. The chronological scope of the review spans from 1973 to 2024.Results: The initial search with keywords identified 121 sources: 101 from databases and 20 from other sources. After removing duplicates, 113 sources remained. A total of 111 full-text publications were assessed for eligibility, with two full publications excluded as ineligible. The main body of research indicates a trend towards the use of recombinant enzymes modified for improved physicochemical and catalytic properties. There is a noticeable trend towards the more widespread use of recombinant proteins produced by precision fermentation methods. General information on the application of recombinant proteins in the food industry is provided. The role of recombinant proteins in modern food production is highlighted.Conclusions: The development of molecular biotechnology has led to the creation of new enzymes and proteins for the food industry, expanding their use in cheese making, confectionery, and baking. Challenges exist in developing new enzymes, expression systems for bioproduction, and bioprocesses with fundamentally new characteristics, leading to greater economic feasibility. The analysis revealed challenges related to the need for regulatory compliance with current capabilities and trends in the bioproduction of recombinant proteins for the food industry. The results obtained can be used to improve the catalytic properties of recombinant enzymes and enhance the stability of enzyme preparations. These findings are useful for the targeted development of recombinant protein and enzyme production systems, increasing their productivity through a better understanding of the main directions of the modern recombinant enzyme industry for food production.
Development of Food Technology with a Mixture of Whole-Milled Wheat and Sesame Flours
Authors: Suvorov Oleg A. , Kandrokov Roman Kh. , Kandiano Tatyana V. 
Published: January 2025

Introduction: In the modern world, the growing interest in healthy eating stimulates the development of products with improved nutritional properties. Whole-grain wheat flour, enriched with dietary fiber, vitamins, and micronutrients, combined with sesame flour, rich in plant proteins and polyunsaturated fatty acids, has significant potential. However, the improvement of technologies for products based on such mixtures remains insufficiently studied and requires further research.Purpose: To investigate the potential of using a mixture of whole-grain wheat and sesame flours in creating new types of confectionery, culinary, and pasta products, such as cottage cheese cookies, carrot cake, and homemade noodles.Materials and Methods: The study focused on a mixture of whole-grain wheat and sesame flours and products such as cottage cheese cookies, carrot cake, and homemade noodles made from the composite wheat-sesame flour in various ratios. The quality of whole-grain wheat and sesame flours was assessed based on physicochemical and organoleptic properties. Standard methodologies were used to evaluate the sensory qualities of the test products.Results: Rational recipes for nutritional products such as cottage cheese cookies, carrot cake, and homemade noodles made from the studied mixture of whole-grain wheat and sesame flours were developed. It was found that during the storage of cottage cheese cookies for the first 10 days, the acid numbers in all samples remained practically unchanged. However, by the 20th day, an increase in acid numbers was observed in the samples. In samples made from the mixture of whole-grain wheat and sesame flours, the hydrolytic breakdown products continued to increase, which was reflected in the rise of their acid number. It was established that homemade noodles made from the mixture of whole-grain wheat and sesame flours retained their shape and characteristic sesame flavor well. It was shown that noodles containing 9% whole-grain sesame flour in the mixture can be recommended for practical use.Conclusion: The obtained results can be utilized in the food industry to expand the range of fortified flour-based products from a mixture of whole-grain wheat and sesame flours. Recipes for cottage cheese cookies, carrot cake, and homemade noodles have been developed. The data contribute to the development of health-preserving technologies and expand the practical scope in the production of high-nutritional-value products.
Toxicity and Safety of Induction Chemotherapy in Locally Advanced Oropharynx, Hypopharynx and Larynx: Non-Randomized Study Comparing DCF and Immunochemotherapy (ICT) with PF-Pembrolizumab
Authors: Носова Маргарита Владимировна , Покатаев Илья Анатольевич , Стативко Олеся Алексеевна , Cтрояковский Даниил Львович , Жукова Людмила Григорьевна , Лисицына Кристина Николаевна , Сыдыкова Розана Саматовна , Кузьмина Евгения Сергеевна , Антонова Татьяна Галяутдиновна , Лядова Марина Александровна , Сабитов Эмиль Рамильевич , Партс Сергей Адольфович , Кравцов Сергей Анатольевич , Царева Елена Владимировна , Федорова Алина Николаевна , Долов Магомед Мустапович , Феоктистова Полина Сергеевна , Галкин Всеволод Николаевич 
Published: January 2025

Введение. Стандартный режим индукционной химиотерапии по схеме DCF характеризуется высокой частотой объективного ответа у пациентов с распространенными опухолями головы и шеи. Высокая токсичность режима ограничивает возможность его применения. Проспективное нерандомизированное исследование оценивает эффективность и безопасность иммунохимиотерапии (ИХТ) в качестве индукции.
Цель. В этой работе представлены данные сравнения безопасности режима DCF и PF — пембролизумаб, а также риски отказа или незавершения последующей химиолучевой терапии (ХЛТ).
Методы. В проспективное нерандомизированное исследование II фазы включались пациенты с III-IV стадией плоскоклеточного местнораспространенного рака ротоглотки, гортани, гортаноглотки в случае положительной экспрессии PD-L1 в опухоли (CPS>=1). Пациентам проводились 3 цикла ИХТ пембролизумабом, цисплатином и 5-фторурацилом с последующим проведением ХЛТ. Группа контроля была оценена ретроспективно. В неё включались пациенты, которые в этот же период времени получали режим DCF (доцетаксел + цисплатин + 5-фторурацил) с последующим проведением ХЛТ.
Результаты. В период с апреля 2022 г. по июль 2024 г. включено 120 пациентов для проведения ИХТ. Контрольная группа включила данные по 115 пациентам. Частота нежелательных явлений 3-5 степени составила 30 % и 30,4 % для группы ИХТ и группы DCF (p = 1,00). На этапе индукционной терапии отмечено 6 случаев смерти (5,2 %) в группе DCF, в группе пембролизумаб-PF летальных случаев на этапе индукционной терапии не было (р = 0,01). Высокая доза цисплатина в группе ИХТ ассоциирована с более значимой тенденцией к снижению скорости клубочковой фильтрации (СКФ), в сравнении с группой DCF. Медиана снижения составила СКФ 10,5 %. Во всех случаях снижение СКФ не привело к необходимости проведения гемодиализа. В группе ИХТ 4 пациентам (3,3 %) не проведена лучевая терапия в связи с общим ухудшением здоровья на фоне индукционной терапии, в группе DCF — 12 пациентам (10 %), p = 0,06.
Заключение. Индукционный режим PF-пембролизумаб обладает приемлемым профилем токсичности. Дальнейшее изучение эффективности ИХТ представляется актуальной задачей. Исследование зарегистрировано на портале clinicaltrials.gov (номер NCT05551767).
Complications after Delayed Reconstructions in Patients with Maxillofacial Tumors
Authors: Азовская Дария Юрьевна , Кульбакин Денис Евгеньевич , Чойнзонов Евгений Лхамацыренович , Шелупанов Александр Александрович , Костюченко Евгений Юрьевич 
Published: January 2025

Цель. Оценка частоты ранних и поздних осложнений и предрасполагающих к ним факторов у больных со злокачественными опухолями челюстно-лицевой области при выполнении отсроченных реконструктивно-пластических операций.
Материалы и методы. Был проведен ретроспективный анализ результатов лечения 68 пациентов со злокачественными опухолями челюстно-лицевой области (полость рта и верхняя челюсть) Т2-4аN0-2M0 (II-IVA) стадий, которым выполнен реконструктивно-пластический этап с использованием свободных реваскуляризированных лоскутов. Все пациенты проходили лечение на базе отделения опухолей головы и шеи НИИ онкологии Томского НИМЦ в период с 2009 по 2023 гг. Больные были разделены на две группы: 1 группа (34 человека), которым реконструктивно-пластический этап выполнен одномоментно (сразу после удаления первичного опухолевого процесса) и 2 группа (34 человека), которым он произведен отстрочено. Отсроченная реконструкция проводилась в среднем через 13,3 мес. после завершения специализированного лечения.
Результаты. Среднее время наблюдения составило 23 мес. после проведенной реконструкции. Ранние осложнения в 1 группе развились в 32,3 % случаев; тогда как во 2 — в 50 % случаев. При сравнении ранних осложнений, возникших после отсроченных и одномоментных реконструкций верхней челюсти, статистические различия не выявлены (р = 0,47). Тогда как в группах сравнения реконструкций в области нижней челюсти обнаружена статистически значимая разница (р = 0,03). Осложнения были разделены на те, с которыми справлялись консервативно (I-II по классификации Clavien–Dindo: в 1 группе — 11,7 %, во 2 — 29,4 %), и те, которые требуют хирургического лечения (III по классификации Clavien–Dindo: в 1 группе — 26,4 %, во 2 — 47 %). Среди значимых предикторов ранних осложнений во 2 группе можно выделить предшествующий радикальный курс лучевой терапии, комбинированное лечение, хирургическое лечение; в 1 группе — неоадъювантный курс лучевой терапии. Однако полученные различия были статистически не значимы. В данном исследовании текущий и предыдущий анамнез курения не был связан с развитием ранних и отдаленных осложнений, как и наличие сердечно-сосудистых заболеваний. Пол и возраст не влияли на частоту развития осложнения (р > 0,05).
Выводы. Отсроченные реконструктивно-пластические операции у больных опухолями челюстно-лицевой области позволяют достигать приемлемых функциональных и эстетических результатов, однако высокая частота послеоперационных осложнений заставляет искать новые решения и подходы к ведению данной группы пациентов.
Spectrum of BRCA1, BRCA2, PALB2, ATM and TP53 Mutations in Breast Cancer and Ovarian Cancer Patients from Kabardino-Balkaria
Authors: Хамгоков Заур Магометович , Загребин Фёдор Альбертович , Янус Григорий Аркадьевич , Венина Айгуль Рифовна , Романько Александр Андреевич , Пирмагомедов Альберт Шихмагомедович , Кадырова Азинат Османовна , Белогубова Евгения Витальевна , Джеус Елизавета Игоревна , Соколенко Анна Петровна , Имянитов Евгений Наумович 
Published: January 2025

Введение. У больных раком молочной железы (РМЖ) и раком яичников (РЯ) — представительниц народностей с относительно компактным проживанием и выраженным «эффектом основателя» анализ этноспецифических мутаций BRCA1 и BRCA2 может быть приемлемой альтернативой секвенированию полной кодирующей последовательности этих генов.
Цель. Характеристика спектра РМЖ- и РЯ-ассоциированных патогенных вариантов у пациенток кабардинской и балкарской национальностей, проживающих в Кабардино-Балкарской Республике (КБР) и выявление повторяющихся аллелей.
Материалы и методы. В исследование включено 273 больных РМЖ (n = 200) и РЯ (n = 73): 221 кабардинка, 44 балкарки и 8 пациенток со смешанным кабардино-балкарским происхождением. Информация об этнической принадлежности предоставлялась пациентками. Кодирующие последовательности генов BRCA1 и BRCA2, а также PALB2, ATM и TP53 были проанализированы методом таргетного высокопроизводительного секвенирования.
Результаты. В исследованной группе выявлено 39 патогенных вариантов BRCA1/BRCA2. В группе РМЖ было обнаружено 26 носителей мутаций (13 %); в спектре мутаций преобладали аллели BRCA2 (BRCA1: 6/200 (3 %) vs. BRCA2: 20/200 (10 %), p = 0,007). Среди РЯ было обнаружено 8/73 (11 %) мутаций BRCA1 и 5/73 (6,8 %) мутаций BRCA2. В спектре патогенных аллелей 84 % вариантов были повторяющимися. Самым частым аллелем, обнаруженным как у пациенток кабардинского (n = 6), так и балкарского происхождения (n = 3), являлся миссенс-вариант BRCA2 c.7868A>G [p.His2623Arg]. К другим повторяющимся в этом регионе патогенным вариантам относились BRCA1 c.5266dupC (n = 5), c.1961delA (n = 4), BRCA2 c.993_994delAA (n = 4), c.8437G>T [G2813X] (n = 4), c.6486_6489delACAA (n = 4), c.8009C>A [p.Ser2670Ter] (n = 2). У балкарцев единственным повторяющимся аллелем был BRCA2 c.7868A>G. Патогенные аллели ATM были обнаружены у 8 пациенток (3,0 %), при этом только один патогенный вариант встретился более одного раза (ATM c.8874_8877del [rs770704493]). Патогенные и вероятно патогенные варианты TP53 и PALB2 обнаружены не были.
Выводы. Таким образом, спектр РМЖ/РЯ-ассоциированных мутаций в исследуемом регионе характеризуется выраженным «эффектом основателя» (founder-effect) в отношении гена BRCA2. Можно утверждать, что мутация BRCA2 c.7868A>G [p.His2623Arg] — это мажорный founder-вариант у кабардинцев, и, вероятно, у балкарцев.
Criterion validity of five open-source app-based cognitive and sensory tasks in an Australian adult life course sample aged 18 to 82: Labs without walls
Authors: Zhou Shally , Brady Brooke , Anstey Kaarin J. 
Published: January 2025

Abstract
With recent technical advances, many cognitive and sensory tasks have been adapted for smartphone testing. This study aimed to assess the criterion validity of a subset of self-administered, open-source app-based cognitive and sensory tasks by comparing test performance to lab-based alternatives. An in-person baseline was completed by 43 participants (aged 21 to 82) from the larger Labs without Walls project (Brady et al., 2023) to compare the self-administered, app-based tasks with researcher-administered equivalents. 4 preset tasks sourced from Apple’s ResearchKit (Spatial Memory, Trail Making Test, Stroop Test, and dBHL Tone Audiometry) and 1 custom-built task (Ishihara Color Deficiency Test) were compared. All tasks except the Spatial Memory task demonstrated high comparability to the researcher-administered version. Specifically, the Trail Making Tests were strongly correlated (.77 and .78 for parts A and B, respectively), Stroop correlations ranged from .77 to .89 and the Ishihara tasks were moderately correlated (r = .69). ICCs for the Audiometry task ranged from .56 to .96 (Moderate to Excellent) with 83% sensitivity and 100% specificity. Bland–Altman plots revealed a mean bias between -5.35 to 9.67 dB for each ear and frequency with an overall bias of 3.02 and 1.98 for the left and right ears, respectively, within the minimum testing interval. Furthermore, all app-based tasks were significantly correlated with age. These results offer preliminary evidence of the validity of four open-source cognitive and sensory tasks with implications for effective remote testing in non-lab settings.
Efecto del Manejo Fisiátrico en Lumbalgia Crónica
Authors: Loredo Ramírez José David , Ramírez Dueñas Luz Karina , Malpica Soto Patricia , Aguilar Cózatl Israel 
Published: January 2025

Introducción: La lumbalgia afecta al 84% de la población, 90% remiten y 10% se vuelve crónico. El tratamiento rehabilitatorio multimodal con agentes físicos, terapia física e higiene postural puede lograr disminución del dolor y recuperación de funcionalidad. Objetivo: Evaluar el efecto de un programa individualizado de rehabilitación en la percepción de dolor y funcionalidad en pacientes con lumbalgia crónica (LC). Métodos: Se realizó un estudio longitudinal y prospectivo en el servicio de Rehabilitación del HGZ20-Puebla año 2022. Incluyó 77 individuos con LC, 60 mujeres y 17 hombres. 100% concluyó la intervención. Se evaluó el efecto de un programa de rehabilitación midiendo el dolor con la Escala Numérica Análoga del dolor (ENA) y la funcionalidad con el Índice de Discapacidad de Oswestry (ODI) antes y después del tratamiento. Resultados: Mediciones pre y post de intensidad del dolor y funcionalidad demostraron diferencia significativa con p 0.000 en la evaluación inicial de dolor con ENA se presentó una media de 6.16 (±1.2), y al término de 2.17 (±1.5). En la evaluación inicial de funcionalidad con ODI, se obtuvo una media de 44.78 (±10.3), y al término una media de 20.43 (±9.3). Conclusiones: Existe una diferencia estadísticamente significativa en la disminución del dolor e incremento de funcionalidad posterior al tratamiento de rehabilitación en pacientes con LC.
An Investigation into the Selection and Colors of Little Red Dots and Active Galactic Nuclei
Authors: Hainline Kevin N. , Maiolino Roberto , Juodžbalis Ignas , Scholtz Jan , Übler Hannah , D’Eugenio Francesco , Helton Jakob M. , Sun Yang , Sun Fengwu , Robertson Brant , Tacchella Sandro , Bunker Andrew J. , Carniani Stefano , Charlot Stephane , Curtis-Lake Emma , Egami Eiichi , Johnson Benjamin D. , Lin Xiaojing , Lyu Jianwei , Pérez-González Pablo G. , Rinaldi Pierluigi , Silcock Maddie S. , Venturi Giacomo , Williams Christina C. , Willmer Christopher N. A. , Willott Chris , Zhang Junyu , Zhu Yongda 
Published: January 2025

Abstract
Recently, a large number of compact sources at z > 4 with blue UV slopes and extremely red rest-frame optical slopes have been found in James Webb Space Telescope (JWST) extragalactic surveys. As a subsample of these sources, commonly called “little red dots” (LRDs), have been spectroscopically observed to host a broad-line active galactic nucleus (AGN), they have been the focus of multiple recent studies in an attempt to understand the origin of their UV and optical emission. Here, we assemble a sample of 123 LRDs from the literature along with spectroscopic and photometric JWST-identified samples of AGNs to compare their colors and spectral slopes. We find that while obscured AGNs at z < 6 have highly dissimilar colors to LRDs, unobscured AGNs at z < 6 span a wide range of colors, with only a subsample showing colors similar to LRDs. At z > 6, the majority of the unobscured AGNs that have been found in these samples are LRDs, but this may be related to the fact that these sources are at large bolometric luminosities. Because LRDs occupy a unique position in galaxy color space, they are more straightforward to target, and the large number of broad-line AGNs that do not have LRD colors and slopes are therefore underrepresented in many spectroscopic surveys because they are more difficult to preselect. Current LRD selection techniques return a large and disparate population, including many sources having 2–5 μm colors impacted by emission-line flux boosting in individual filters.
Potential Technosignature from Anomalously Low Deuterium/Hydrogen in Planetary Water Depleted by Nuclear Fusion Technology
Authors: Catling David C. , Krissansen-Totton Joshua , Robinson Tyler D. 
Published: January 2025

Abstract
Deuterium–deuterium (DD) fusion is viewed as an ideal energy source for humanity in the far future, given a vast seawater supply of D. Here, we consider long-lived, extraterrestrial, technological societies that develop DD fusion. If such a society persisted over geologic timescales, oceanic deuterium would diminish. For an ocean mass and initial deuterium/hydrogen (D/H) ratio that were Earth-like, fusion power use of only ∼10 times that projected for humankind next century would deplete the D/H ratio in ∼(a few) ×108 yr to values below that of the local interstellar medium (ISM). Ocean masses of a few percent of Earth’s would reach an anomalously low D/H in ∼106–107 yr. The timescale shortens with greater energy consumption, smaller oceans, or lower initial D/H. Here, we suggest that anomalous D/H in planetary water below local ISM values of ∼16 × 10−6 (set by Big Bang nucleosynthesis plus deuterium loss onto dust or small admixtures of deuterium-poor stellar material) may be a technosignature. Unlike SETI using radio signals, anomalous D/H would persist for eons, even if civilizations perished or relocated. We discuss the wavelengths of strong absorption features for detecting D/H anomalies in atmospheric water vapor. These are vibrational O–D stretching at 3.7 μm in transmission spectroscopy of Earth-like worlds, ∼1.5 μm (in the wings of the 1.4 μm water band) in the shorter near-infrared for direct imaging by the Habitable Worlds Observatory, and ∼7.5-8 μm (in the wings of the broad 6.3 μm bending vibration of water) for concepts like the Large Interferometer for Exoplanets.
Constraining Binary Mergers in Active Galactic Nuclei Disks Using the Nonobservation of Lensed Gravitational Waves
Authors: Leong Samson H. W. , Janquart Justin , Sharma Aditya Kumar , Martens Paul , Ajith Parameswaran , Hannuksela Otto A. 
Published: January 2025

Abstract
The dense and dynamic environments within active galactic nuclei (AGN) accretion disks may serve as prolific birthplaces for binary black holes (BBHs) and one possible origin for some of the BBHs detected by gravitational-wave (GW) observatories. We show that a considerable fraction of the BBH in AGN disks will be strongly lensed by the central supermassive black hole (SMBH). Thus, the nonobservation of lensed GW signals can be used to constrain the fraction of BBH binaries residing in AGN disks. The nondetection of lensing with current

O
(
100
)

detections will be sufficient to start placing constraints on the fraction of BBHs living within accretion disks near the SMBH. In the next-generation detectors era, with

O
(
1

0

5

)

BBH observations and no lensed events, we will be able to rule out most migration traps as dominant birthplaces of BBH mergers; moreover, we will be able to constrain the minimum size of the accretion disk. On the other hand, should AGNs constitute a major formation channel, lensed events from AGNs will become prominent in the future.
GRB 241107A: A Giant Flare from a Close-by Extragalactic Magnetar?
Authors: Rodi James Craig , Pacholski Dominik Patryk , Mereghetti Sandro , Arrigoni Edoardo , Bazzano Angela , Natalucci Lorenzo , Salvaterra Ruben , Ubertini Pietro 
Published: January 2025

Abstract
We report the results on the short gamma-ray burst GRB 241107A, obtained with the IBIS instrument on board the INTEGRAL satellite. The burst had a duration of about 0.2 s, a fluence of 8 × 10−7 erg cm−2 in the 20 keV–10 MeV range, and a hard spectrum, characterized by a peak energy of 680 keV. The position of GRB 241107A has been precisely determined because it fell inside the imaging field of view of the IBIS coded mask instrument. The presence of the nearby galaxy PGC 86046 in the 3′ radius error region suggests that GRB 241107A might be a giant flare from a magnetar rather than a canonical short gamma-ray burst. For the 4.1 Mpc distance of PGC 86046, the isotropic energy of 1.6 × 1045 erg is in agreement with this hypothesis, which is also supported by the time-resolved spectral properties similar to those of the few other extragalactic magnetars giant flares detected so far.