bluuebunny/crossref_metadata_2025_split huggingface dataset:
Drivers of soil nitrogen availability and carbon exchange processes in a High Arctic wetland
Authors: Hung Jacqueline K.Y. , Scott Neal A. , Treitz Paul M. 
Published: August 2023

Increased soil nutrient availability, and associated increases in vegetation productivity, could create a negative feedback between Arctic ecosystems and the climate system, thereby reducing the contribution of Arctic ecosystems to future climate change. To predict whether this feedback will develop, it is important to understand the environmental controls over nutrient cycling in High Arctic ecosystems and their impact on carbon cycling processes. Here, we examined the environmental controls over soil nitrogen availability in a High Arctic wet sedge meadow and how abiotic factors and soil nitrogen influenced carbon dioxide exchange processes. The importance of environmental variables was consistent over the 3 years, but the magnitudes of their effect varied depending on climate conditions. Ammonium availability was higher in warmer years and wetter conditions, while drier areas within the wetland had higher nitrate availability. Carbon uptake was driven by soil moisture, active layer depth, and variability between sampling sites and years ( R2 = 0.753), while ecosystem respiration was influenced by nitrogen availability, soil temperature, active layer depth, and sampling year ( R2 = 0.848). Considered together, the future carbon dioxide source or sink potential of high latitude wetlands will largely depend on climate-induced changes in moisture and subsequent impacts on nutrient availability.
Magnetic string matter collapse in rainbow gravity
Authors: Tasleem Ukasha , Sheikh Umber 
Published: August 2023

This work investigates the dynamics of a collapsing magnetic string dust and string fluid in the Plank Era via spherically symmetric rainbow geometry. The field equations are modified and solved to obtain the dynamical quantities, including mass density, pressure, string tension, and magnetic field strength. These quantities are presented graphically. The energy conditions are computed showing that all the dynamical quantities are associated with physical matter. The distance and moment of apparent horizon formation are computed. The magnetic field is found to affect the distance and moment of the apparent horizon’s formation. It accelerates the collapsing process. Further, the dynamical variables are maximum in the collapsing configuration’s center leading to compact object (black hole) formation. The probing particle’s energy affects all the dynamical variables of the fluid in a direct proportion. This resolves the information paradox as a particle with greater energy grasps the information from a particle with lesser energy and takes it out in the real world.
Open data and quantitative techniques for anthropology of road traffic
Authors: Pretnar Žagar Ajda , Hočevar Tomaž , Curk Tomaž 
Published: August 2023

AbstractWhat kind of questions about human mobility can computational analysis help answer? How to translate the findings into anthropology? We analyzed a publicly available data set of road traffic counters in Slovenia to answer these questions. The data revealed information on how a population drives, how it travels for tourism, which locations it prefers, what it does during the week and the weekend, and how its habits change during the year. We conducted the empirical analysis in two parts. First, we defined traffic profile deviations and designed computational methods to find them in a large data set. As shown in the paper, traffic counters hint at potential causes and effects in driving practices that we interpreted anthropologically. Second, we used hierarchical clustering to find groups of similar traffic counters as described by their daily profiles. Clustering revealed the main features of road traffic in Slovenia. Using the two quantitative approaches, we outlined the general properties of road traffic in the country and identified and explained the outliers. We show that quantitative data analysis only partially answers anthropological questions, but it can be a valuable tool for preliminary research. We conclude that open data are a useful component in an anthropological analysis and that quantitative discovery of small local events can help us pinpoint future fieldwork sites.
Analytical study of low energy proton interactions in the SORGENTINA’s fusion ion source-part I: beam-dump
Authors: Pietropaolo A. , Del Dotto A. , Contessa G. M. ,   the SRF-Collaboration, Agostini Pietro , Angiolini Massimo , Alberghi Ciro , Candido Luigi , Capogni Marco , Capone Mauro , Cataldo Sebastiano , Contessa Gian Marco , D’Arienzo Marco , Dongiovanni Danilo , Ferrari Paolo , Flammini Davide , Fonnesu Nicola , Frisoni Manuela , Gadani Gianni , Guidoni David , Lamberti Marco , Lepore Luigi , Mancini Andrea , Marinari Ranieri , Marzo Giuseppe A. , Mastroianni Bruno , Moro Fabio , Narcisi Vincenzo , Orefice Agostina , Pietropaolo Antonino , Rizzo Antonietta , Rydzy Alexander , Salvi Stefano , Santoli Demis , Santucci Alessia , Saraceno Luca , Sartorio Camillo , Scaglione Salvatore , Sermenghi Valerio , Serra Emanuele , Simonetti Andrea , Spassovsky Ivan Panov , Terranova Nicholas , Tosti Silvano , Ubaldini Alberto , Voukelatou Konstantina , Zito Pietro , Zummo Giuseppe 
Published: August 2023

AbstractAn analytical study, corroborated by Monte Carlo simulations, is presented which describes the interaction of a 300 keV–830 mA proton beam with a Cu and Al dumping system. The analytical calculations rely on the theoretical framework of the Particle Induced X-ray Emission, while the Monte Carlo simulations are performed by means of the GEANT4 toolkit. The case study is related to the project SORGENTINA-RF fusion neutron source and in particular to the tests devoted to assess the performance of the ion source of the plant. The results provide a detailed physical insight of the main processes occurring in the beam dump material, and are also important to give some realistic figures of the radiation emission expected during operation.
Effectiveness and Cost of an Enhanced Mailed Fecal Test Outreach Colorectal Cancer Screening Program: Findings from the PROMPT Stepped-Wedge Trial
Authors: Coronado Gloria D. , Nyongesa Denis B. , Escaron Anne L. , Petrik Amanda F. , Thompson Jamie H. , Smith Dave , Davis Melinda M. , Schneider Jennifer L. , Rivelli Jennifer S. , Laguna Tanya , Leo Michael C. 
Published: August 2023

Abstract

Background:
Mailed fecal immunochemical test (FIT) outreach can improve colorectal cancer screening rates, yet little is known about how to optimize these programs for effectiveness and cost.

Methods:
PROMPT was a pragmatic, stepped-wedge, cluster-randomized effectiveness trial of mailed FIT outreach. Participants in the standard condition were mailed a FIT and received live telephone reminders to return it. Participants in the enhanced condition also received a tailored advance notification (text message or live phone call) and two automated phone call reminders. The primary outcome was 6-month FIT completion; secondary outcomes were any colorectal cancer screening completion at 6 months, implementation, and program costs.

Results:
The study included 27,585 participants (80% ages 50–64, 82% Hispanic/Latino; 68% preferred Spanish). A higher proportion of enhanced participants completed FIT at 6 months than standard participants, both in intention-to-treat [+2.8%, 95% confidence interval (CI; 0.4–5.2)] and per-protocol [limited to individuals who were reached; +16.9%, 95% CI (12.3–20.3)] analyses. Text messages and automated calls were successfully delivered to 91% to 100% of participants. The per-patient cost for standard mailed FIT was $10.84. The enhanced program's text message plus automated call reminder cost an additional $0.66; live phone calls plus an automated call reminder cost an additional $10.82 per patient.

Conclusions:
Adding advance notifications and automated calls to a standard mailed FIT program boosted 6-month FIT completion rates at a small additional per-patient cost.

Impact:
Enhancements to mailed FIT outreach can improve colorectal cancer screening participation. Future research might test the addition of educational video messaging for screening-naïve adults.
Immune Marker Spatial Distribution and Clinical Outcome after PD-1 Blockade in Mismatch Repair–deficient, Advanced Colorectal Carcinomas
Authors: Saberzadeh-Ardestani Bahar , Graham Rondell P. , McMahon Sara , Ahanonu Eze , Shi Qian , Williams Crystal , Hubbard Antony , Zhang Wenjun , Muranyi Andrea , Yan Dongyao , Jin Zhaohui , Shanmugam Kandavel , Sinicrope Frank A. 
Published: August 2023

Abstract

Purpose:
Targeting the programmed cell death protein 1 (PD-1)/programmed cell death ligand 1 (PD-L1) interaction has led to durable responses in fewer than half of patients with mismatch repair–deficient (MMR-d) advanced colorectal cancers. Immune contexture, including spatial distribution of immune cells in the tumor microenvironment (TME), may predict immunotherapy outcome.

Experimental Design:
Immune contexture and spatial distribution, including cell-to-cell distance measurements, were analyzed by multiplex immunofluorescence (mIF) in primary colorectal cancers with d-MMR (N = 33) from patients treated with anti–PD-1 antibodies. By digital image analysis, density, ratio, intensity, and spatial distribution of PD-L1, PD-1, CD8, CD3, CD68, LAG3, TGFβR2, MHC-I, CD14, B2M, and pan-cytokeratin were computed. Feature selection was performed by regularized Cox regression with LASSO, and a proportional hazards model was fitted to predict progression-free survival (PFS).

Results:
For predicting survival among patients with MMR-d advanced colorectal cancer receiving PD-1 blockade, cell-to-cell distance measurements, but not cell densities or ratios, achieved statistical significance univariately. By multivariable feature selection, only mean number of PD-1+ cells within 10 μm of a PD-L1+ cell was significantly predictive of PFS. Dichotomization of this variable revealed that those with high versus low values had significantly prolonged PFS [median not reached (&gt;83 months) vs. 8.5 months (95% confidence interval (95% CI), 4.7–NR)] with a median PFS of 28.4 months for all patients [adjusted HR (HRadj) = 0.14; 95% CI, 0.04–0.56; P = 0.005]. Expression of PD-1 was observed on CD8+ T cells; PD-L1 on CD3+ and CD8+ T lymphocytes, macrophages (CD68+), and tumor cells.

Conclusions:
In d-MMR colorectal cancers, PD-1+ to PD-L1+ receptor to ligand proximity is a potential predictive biomarker for the effectiveness of PD-1 blockade.
ANXA1 Promotes Tumor Immune Evasion by Binding PARP1 and Upregulating Stat3-Induced Expression of PD-L1 in Multiple Cancers
Authors: Xiao Ding , Zeng Ting , Zhu Wei , Yu Zheng-Zheng , Huang Wei , Yi Hong , Lu Shan-Shan , Feng Juan , Feng Xue-Ping , Wu Di , Wen Qi , Zhou Jian-Hua , Yuan Li , Zhuang Wei , Xiao Zhi-Qiang 
Published: August 2023

Abstract
The deregulation of Annexin A1 (ANXA1), a regulator of inflammation and immunity, leads to cancer growth and metastasis. However, whether ANXA1 is involved in cancer immunosuppression is still unclear. Here, we report that ANXA1 knockdown (i) dramatically downregulates programmed cell death-ligand 1 (PD-L1) expression in breast cancer, lung cancer, and melanoma cells; (ii) promotes T cell–mediated killing of cancer cells in vitro; and (iii) inhibits cancer immune escape in immune-competent mice via downregulating PD-L1 expression and increasing the number and killing activity of CD8+ T cells. Mechanistically, ANXA1 functioned as a sponge molecule for interaction of PARP1 and Stat3. Specifically, binding of ANXA1 to PARP1 decreased PARP1’s binding to Stat3, which reduced poly(ADP-ribosyl)ation and dephosphorylation of Stat3 and thus, increased Stat3’s transcriptional activity, leading to transcriptionally upregulated expression of PD-L1 in multiple cancer cells. In clinical samples, expression of ANXA1 and PD-L1 was significantly higher in breast cancer, non–small cell lung cancer, and skin cutaneous melanoma compared with corresponding normal tissues and positively correlated in cancer tissues. Moreover, using both ANXA1 and PD-L1 proteins for predicting efficacy of anti–PD-1 immunotherapy and patient prognosis was superior to using individual proteins. Our data suggest that ANXA1 promotes cancer immune escape via binding PARP1 and upregulating Stat3-induced expression of PD-L1, that ANXA1 is a potential new target for cancer immunotherapy, and combination of ANXA1 and PD-L1 expression is a potential marker for predicting efficacy of anti–PD-1 immunotherapy in multiple cancers.
СИНДРОМ ВЗАЄМНОГО ОБТЯЖЕННЯ ПРИ ХВОРОБІ ЖИЛЬБЕРА
Authors: Процайло М. Д. , Процайло О. М. 
Published: August 2023

Мета дослідження – загострити увагу на комплексному обстеженні дітей з хворобою Жильбера. Ця «доброякісна» хронічна недуга поєднується з низкою розладів розвитку дітей – синдром взаємного обтяження, що необхідно враховувати при плануванні профілактичних та лікувальних заходів.
Матеріали та методи. Досліджено два сімейні випадки хвороби Жильбера. Вивчали сімейний анамнез шляхом співбесіди з дітьми, батьками, аналізували виписки амбулаторних та стаціонарних документів, результати клінічних обстежень, даних біохімічних лабораторних, рентгенологічних, ультрасонографічних, медико-генетичних результатів. Особливу увагу надавали скаргам, погрішностям дієти, рухливого способу життя.
Результати дослідження та їх обговорення. Описано сімейні випадки із практики хвороби Жильбера. Головною ознакою хвороби Жильбера є жовтизна шкіри, долонь, стоп, носо-губного трикутника, пахових ділянок, іктеричність склер, яка мала перемінний характер. Хворобу діагностували в хлопчиків (вік 13–14 років) випадково з приводу інших обстежень – хронічного гастриту, дисфункції жовчного міхура, підшлункової залози, головного мозку. Точний діагноз був встановлений після молекулярного обстеження – (гомозиготне носійство) Т1, А1. При загостренні ХЖ спостерігалися нудота, блювання, печія, метеоризм, біль у правому підребер’ї, загальне нездужання, головний біль, підвищене потовиділення, серцебиття, розлади сну, астенодепресивний синдром, м’язовий біль, безпричинний страх, напади паніки. Головними причинами загострення хвороби Жильбера були порушення дієти, фізичні навантаження на тлі статевого дозрівання. В обох клінічних випадках хвороба Жильбера поєднувалася з низкою природжених захворювань лицевого черепа, грудної клітки, стоп, хребетного стовпа, гіпереластичністю зв’язкового апарату скелета, ретинопатією очей, високорослістю (фенотип хвороби Марфана), множинними невусами шкірних покровів.
Висновки. Генетичний дефект довгого плеча 37 смужки 2 хромосоми, що відповідає за обмін білірубіну, очевидно, опосередковано або напряму негативно впливає на морфогенез усього організму дитини і проявляється різними клінічними захворюваннями – синдром взаємного обтяження. Надлишковий непрямий, токсичний білірубін, внаслідок притаманної йому жиророзчинності потрапляє до центральної нервової системи, підшлункової залози, кісткового мозку, де спричиняє функціональні розлади з відповідними клінічними проявами.
ПРОФІЛАКТИКА ПРЕЕКЛАМПСІЇ: СУЧАСНИЙ СТАН ПРОБЛЕМИ
Authors: Гусєва А. Є. , Кирильчук М. Є. , Медведь В. І. 
Published: August 2023

Прееклампсія – це класичне вагітність-асоційоване захворювання, що має негативний вплив як на вагітну жінку, так і на плід. Важливо запобігати захворюванню заради покращення перинатальних результатів. Зазвичай жінкам групи ризику призначають ацетилсаліцилову кислоту, а тим, хто у раціоні харчування отримують недостатньо кальцію, додають препарати кальцію. Проте через їх недостатню ефективність пошуки нових альтернативних методів активно продовжуються. Найбільшої уваги серед них заслуговують застосування низькомолекулярних гепаринів, метформіну, правастатину, вітамінів D, C та E, фолієвої кислоти, магнію, омега-3 поліненасичених жирних кислот, фізичної активності або, навпаки, фізичного відпочинку. Низькомолекулярний гепарин має сприятливий вплив на судини, вірогідно, він може принести користь жінкам із найвищим ризиком ранньої прееклампсії. Клінічні дослідження показали, що метформін може зменшити ризик гестаційної гіпертензії у жінок з гестаційним діабетом і може запобігти прееклампсії. Правастатин знижує секрецію ендотеліну-1 та розчинної fms-подібної тирозинкінази-1 в ендотеліальних клітинах пупкової вени людини та мікросудинних клітинах матки. Вітамін D може бути потужним ендокринним супресором та регулювати ренін-ангіотензинову систему, яка відіграє важливу роль в урегулюванні артеріального тиску. Оскільки одним із потенційних механізмів розвитку прееклампсії є окислювальний стрес – додавання антиоксидантів може зменшити тяжкість захворювання або запобігти його появі. Вітаміни-антиоксиданти сприяють стабілізації реактивних вільних радикалів, які поводяться як перша лінія захисту від вільних радикалів і перекисного окислення ліпідів. Підвищений рівень гомоцистеїну в крові є причиною гестаційної гіпертензії та прееклампсії, фолієва кислота здатна знизити його рівень. Приймання пероральних добавок магнію може знизити ризик прееклампсії, проте цей ефект ймовірно помітніший у вагітних жінок із групи високого ризику. У мета-аналізі було показано, що приймання добавок омега-3 знижує ризик прееклампсії на 16 %. Фізичні вправи можуть зменшити ризик гестаційної гіпертензії та прееклампсії на ≈30 і 40 % відповідно. Вважається, що відпочинок є корисним для жінок із підвищеним ризиком прееклампсії, у тому числі з нормальним артеріальним тиском. Усі альтернативні профілактичні методи за диференційованого підходу можуть знайти місце у стратегії профілактики прееклампсії.
РАК МОЛОЧНОЇ ЗАЛОЗИ, АСОЦІЙОВАНИЙ З МУТАЦІЄЮ 5382INSC У ГЕНІ BRCA1
Authors: Лисенко С. А. , Березовський А. М. , Некращук О. П. , Стойка Я. В. , Людкевич Г. П. , Дністріянська А. П. 
Published: August 2023

Мета дослідження – висвітлити клінічний випадок пацієнтки, яка хворіла на рак молочної залози, асоційований з мутацією 5382insC у гені BRCA1.
Матеріали та методи. Проведено динамічне обстеження пацієнтки, яка хворіла на рак молочної залози. Пошук актуальної інформації щодо механізмів розвитку захворювання, асоційованого з мутаціями в гені BRCA, проводили в наукометричних базах, зокрема PubMed, Google Scholar, Web of Science, Scopus.
Результати дослідження та їх обговорення. Після діагностики раку молочної залози пацієнтці було проведено чотири курси хіміотерапії та органозберігальну операцію. Після лікування п’ять років спостерігалася ремісія, але згодом у пацієнтки було діагностовано рак яєчників. З приводу цього їй було рекомендовано провести діагностику на наявність мутації в гені BRCA. В результаті було виявлено наявність поліморфізму 5382insC вищезгаданого гену. Відомо, що для пацієнтів з даною мутацією рекомендовано інші схеми лікування, зокрема призначення інгібіторів полі (ADP-рибозо) полімерази, які є більш ефективними в пацієнток із раком молочної залози, асоційованим з мутаціями в гені BRCA. Також даним пацієнтам рекомендуються радикальні операції з мастектомією і видаленням придатків. Дане лікування могло би бути більш ефективним та запобігти розвитку раку яєчників через п’ять років. Пацієнтка мала двох доньок, яким був проведений такий самий аналіз і в результаті було виявлено, що старша дочка є носієм поліморфізму 5382insC. Їй було рекомендовано проводити щорічні планові обстеження для раннього виявлення патології у разі маніфестації захворювання та дотримуватися заходів задля запобігання розвитку раку молочної залози.
Висновки. Визначення поліморфізмів у груп ризику розвитку раку молочної залози, зокрема наявність в сімейному анамнезі хворих на дане захворювання, є доцільним задля запобігання розвитку даної патології, а також для призначення відповідної терапії, задля запобігання рецидивам.
Ефективність лікувальної тактики в пацієнтів із післяопераційним перитонітом
Authors: Шевчук І. М. , Дроняк М. М. , Дроняк В. М. 
Published: August 2023

Мета роботи: покращити результати лікування пацієнтів із післяопераційним перитонітом шляхом застосування ефективної хірургічної тактики з пріоритетним застосуванням міні-інвазивних технологій.
Матеріали і методи. У клініці проліковано 198 пацієнтів на післяопераційний перитоніт, які знаходились на лікуванні у відділенні хірургії комунального неприбуткового підприємства Івано-Франківської обласної ради “Обласна клінічна лікарня” у період від 2016 до 2021 р.
Результати досліджень та їх обговорення. Метод та обсяг операційного втручання у пацієнтів на післяопераційний перитоніт встановлювали індивідуально на підставі результатів об’єктивного обстеження, клінічних і лабораторних даних та оцінки результатів застосованих інструментальних методів дослідження. Перевагу віддавали міні-інвазивним технологіям. Міні-інвазивні повторні операційні втручання були виконані у 114 (57,6 %) пацієнтів на післяопераційний перитоніт. Із 114 пацієнтів, яким були виконані міні-інвазивні операційні втручання, у 55 (48,2 %) була застосована лапароскопічна санація і дренування абсцесу очеревинної порожнини. При цьому серед 34 (30,9 %) пацієнтів на післяопераційний перитоніт при міжпетельних абсцесах у 19 (55,9 %) хворих проведено лапароскопічну санацію та дренування гнійника. У 8 (23,5 %) пацієнтів операційне втручання розпочинали з лапароскопії, проте із-за неможливісті повноцінного доступу до абсцесу виконали конверсію в лапаротомію. У 11 (27,9 %) пацієнтів на при міжпетельних абсцесах виконали релапаротомію, санацію і дренування черевної порожнини. Померло 45 з 244 хворих на післяопераційний перитоніт з абдомінальним сепсисом, післяопераційна летальність склала 18,4 %. Застосування хірургічного лікування в пацієнтів із післяопераційним перитонітом із пріоритетним застосуванням міні-інвазивних технологій із застосуванням лапароскопії та черезшкірного дренування гнійників стилет-катетером дозволило збільшити число міні-інвазивних втручань над відкритими у 4,2 раза, знизити відсоток релапаротомій на 32,3 % та зменшити післяопераційну летальність з 31,6 % до 18,4 %.