bluuebunny/crossref_metadata_2025_split huggingface dataset:
The Organophosphate Esters Used as Flame Retardants and Plasticizers Affect H295R Adrenal Cell Phenotypes and Functions
Authors: Li Zixuan , Robaire Bernard , Hales Barbara F 
Published: July 2023

Abstract
Adverse effects associated with exposure to brominated flame retardants have led to regulations for their use and their replacement with organophosphate esters (OPEs). However, little is known about the impact of OPEs on the adrenal, a vital endocrine gland. Here, we used a high-content screening approach to elucidate the effects of OPEs on H295R human adrenal cell phenotypic endpoints and function. The effects of 2,2′,4,4′-tetrabromodiphenyl ether (BDE-47), a legacy brominated flame retardant, on H295R cell cytotoxicity, oxidative stress, mitochondria, lysosomes, and lipid droplets were compared with those of 6 OPEs. Most OPEs reduced oxidative stress, increased the numbers of mitochondria, decreased lysosomes, and increased lipid droplets. Two potency ranking approaches, the lowest benchmark concentration/administered equivalent dose methods and Toxicological Prioritization Index analyses, revealed that the triaryl-OPEs (isopropylated triphenyl phosphate [IPPP], tris(methylphenyl) phosphate [TMPP], and triphenyl phosphate [TPHP]) and 1 nontriaryl OPE (tris(1,3-dichloro-2-propyl) phosphate [TDCIPP]) were more potent than BDE-47. The steroidogenic activity of adrenal cells in the presence or absence of forskolin, a steroidogenic stimulus, was determined after exposure to triaryl-OPEs. The basal production of cortisol and aldosterone was increased by IPPP but decreased by TPHP or TMPP exposure; the response to forskolin was not affected by these OPEs. All 3 triaryl OPEs altered the expression of rate-limiting enzymes involved in cholesterol and steroid biosynthesis; CYP11B1 and CYP11B2 were the most prominently affected targets. The OPE chemical-specific effects on cortisol and aldosterone production were best explained by alterations in STAR expression. Thus, the adrenal may be an important target for these endocrine-disrupting chemicals.
Commentary on “The Impact of Vertical Integration on Physician Behavior and Healthcare Delivery: Evidence from Gastroenterology Practices”
Authors: Shah Eric D. 
Published: July 2023

This paper was accepted by Stefan Scholtes, healthcare management. Conflict of Interest Statement: E. D. Shah has consulted or served on advisory boards for Ardelyx, GI Supply, Mahana, Mylan, Neuraxis, Salix, Sanofi, and Takeda. Funding: E. D. Shah is funded by the National Institute of Diabetes and Digestive and Kidney Diseases [Grant NIH 1K23DK134752].
The Traveling Salesman Problem with Stochastic and Correlated Customers
Authors: Wissink Pascal L. J. 
Published: July 2023

It is well-known that the cost of parcel delivery can be reduced by designing routes that take into account the uncertainty surrounding customers’ presences. Thus far, routing problems with stochastic customer presences have relied on the assumption that all customer presences are independent from each other. However, the notion that demographic factors retain predictive power for parcel-delivery efficiency suggests that shared characteristics can be exploited to map dependencies between customer presences. This paper introduces the correlated probabilistic traveling salesman problem (CPTSP). The CPTSP generalizes the traveling salesman problem with stochastic customer presences, also known as the probabilistic traveling salesman problem (PTSP), to account for potential correlations between customer presences. I propose a generic and flexible model formulation for the CPTSP using copulas that maintains computational and mathematical tractability in high-dimensional settings. I also present several adaptations of existing exact and heuristic frameworks to solve the CPTSP effectively. Computational experiments on real-world parcel-delivery data reveal that correlations between stochastic customer presences do not always affect route decisions, but could have a considerable impact on route cost estimates. Supplemental Material: The online appendix is available at https://doi.org/10.1287/trsc.2022.0005 .
Application of mendelian randomization to study the causal relationship between smoking and the risk of chronic obstructive pulmonary disease
Authors: Huang Yuenuo , Li Xianchao , Ye Wei 
Published: July 2023

Background
Smoking is a risk factor for chronic obstructive pulmonary disease (COPD). Few studies have assessed the causal relationship between smoking and COPD using Mendelian randomization.

Methods
Exposure and outcome datasets were obtained from the IEU Open GWAS project (https://gwas.mrcieu.ac.uk/). The exposure data set includes smoking (ever smoke, smoking/smokers in household, exposure to tobacco smoke at home). The outcome data set includes COPD susceptibility and acute COPD admissions. The main methods of Mendelian randomization analysis are weighted median method and MR-Egger method. Heterogeneity and polymorphism analyses were performed to ensure the accuracy of the results.

Resluts
ever smoke increased the risk of COPD prevalence, and ever smoke and smoking/smokers in household increased the risk of acute COPD admission. Conclusion
Therefore, we should enhance the management of nonpharmacological prescription of COPD to reduce the individual incidence.
Economic analysis of open versus laparoscopic versus robot-assisted versus transanal total mesorectal excision in rectal cancer patients: A systematic review
Authors: Geitenbeek Ritchie T. J. , Burghgraef Thijs A. , Broekman Mark , Schop Bram P. A. , Lieverse Tom G. F. , Hompes Roel , Havenga Klaas , Postma Maarten J. , Consten Esther C. J. ,   on behalf of the MIRECA study group
Published: July 2023

Objectives
Minimally invasive total mesorectal excision is increasingly being used as an alternative to open surgery in the treatment of patients with rectal cancer. This systematic review aimed to compare the total, operative and hospitalization costs of open, laparoscopic, robot-assisted and transanal total mesorectal excision.

Methods
This systematic review was performed according to the Preferred Reporting Items for Systematic Reviews and Meta-Analyses statement (PRISMA) (S1 File) A literature review was conducted (end-of-search date: January 1, 2023) and quality assessment performed using the Consensus Health Economic Criteria.

Results
12 studies were included, reporting on 2542 patients (226 open, 1192 laparoscopic, 998 robot-assisted and 126 transanal total mesorectal excision). Total costs of minimally invasive total mesorectal excision were higher compared to the open technique in the majority of included studies. For robot-assisted total mesorectal excision, higher operative costs and lower hospitalization costs were reported compared to the open and laparoscopic technique. A meta-analysis could not be performed due to low study quality and a high level of heterogeneity. Heterogeneity was caused by differences in the learning curve and statistical methods used.

Conclusion
Literature regarding costs of total mesorectal excision techniques is limited in quality and number. Available evidence suggests minimally invasive techniques may be more expensive compared to open total mesorectal excision. High-quality economical evaluations, accounting for the learning curve, are needed to properly assess costs of the different techniques.
Physical well-being recovery trajectories by reconstruction modality in women undergoing mastectomy and breast reconstruction: Significant predictors and health-related quality of life outcomes
Authors: Xu Cai , Lu Peiyi , Pfob André , Pusic Andrea L. , Hamill Jennifer B. , Sidey-Gibbons Chris 
Published: July 2023

Objectives
We sought to identify trajectories of patient-reported outcomes, specifically physical well-being of the chest (PWBC), in patients who underwent postmastectomy breast reconstruction, and further assessed its significant predictors, and its relationship with health-related quality of life (HRQOL).

Methods
We used data collected as part of the Mastectomy Reconstruction Outcomes Consortium study within a 2-year follow-up in 2012–2017, with 1422, 1218,1199, and 1417 repeated measures at assessment timepoints of 0,3,12, and 24 months, respectively. We performed latent class growth analysis (LCGA) in the implant group (IMPG) and autologous group (AUTOG) to identify longitudinal change trajectories, and then assessed its significant predictors, and its relationship with HRQOL by conducting multinomial logistic regression.

Results
Of the included 1424 patients, 843 were in IMPG, and 581 were in AUTOG. Both groups experienced reduced PWBC at follow-up. LCGA identified four distinct PWBC trajectories (χ2 = 1019.91, p<0.001): low vs medium high vs medium low vs high baseline PWBC that was restored vs. not-restored after 2 years. In 76.63%(n = 646) of patients in IMPG and 62.99% (n = 366) in AUTOG, PWBC was restored after two years. Patients in IMPG exhibited worse PWBC at 3 months post-surgery than that in AUTOG. Patients with low baseline PWBC that did not improve at 2-year follow up (n = 28, 4.82% for AUTOG) were characterized by radiation following reconstruction and non-white ethnicity. In IMPG, patients with medium low-restored trajectory were more likely to experience improved breast satisfaction, while patients developing high-restored trajectories were less likely to have worsened psychosocial well-being.

Conclusion
Although more women in IMPG experienced restored PWBC after 2 years, those in AUTOG exhibited a more favorable postoperative trajectory of change in PWBC. This finding can inform clinical treatment decisions, help manage patient expectations for recovery, and develop rehabilitation interventions contributing to enhancing the postoperative quality of life for breast cancer patients.
Identifying adolescents’ gaming preferences for a tobacco prevention social game: A qualitative study
Authors: Khalil Georges Elias , Kim Jeanie , McLean David , Ramirez Erica , Zhao Bairu , Salloum Ramzi G. 
Published: July 2023

Introduction
Considering the dangers of adolescent tobacco use, the successful design of behavioral programs is crucial for tobacco prevention. According to preliminary research, social game interventions can improve adolescent tobacco outcomes. The current qualitative study aims to (1) uncover the gaming elements that adolescents deem important for a positive learning experience, and (2) confirm these gaming elements with adolescents who are presented with a tobacco prevention game concept that applies these elements.

Methods
Findings from this study are drawn from two phases. Phase 1 involved in-person focus group discussions (n = 15) and Phase 2 included three online focus groups and a paired interview with another set of adolescents (n = 15). The study was conducted under a project that aimed to design and test a social game-based tobacco prevention program for adolescents (Storm-Heroes). With open coding and thematic analysis, two research team members identified repeated topics and relevant quotes to organize them into themes. The themes evolved as new content was identified during the process. This process was repeated until thematic saturation was reached.

Results
Thematic analysis across Phase 1 and Phase 2 revealed four major themes: 1) Balance during gaming challenges, 2) Healthy social interaction, 3) Performance and creative freedom, and 4) Fictional world and game mechanics for tobacco prevention.

Conclusion
This study identified specific intervention features that best fit the needs of adolescents in the context of a social game for tobacco prevention. For future research, we will use a participatory approach to allow adolescents to take part in the design process, improve Storm-Heroes, and develop health promotional messages that can be incorporated into the program. Ultimately, a board game for tobacco prevention is expected to bring adolescents together to create lasting memories that nudge them away from tobacco use and the harm it can cause.
Immediate and short-term effects of eccentric muscle contractions on structural, morphological, mechanical, functional and physiological properties of peripheral nerves: A protocol for a systematic review and meta-analysis
Authors: Lungu Dorina , Neto Tiago , Andrade Ricardo J. , Coppieters Michel W. , Oliveira Raúl , Freitas Sandro R. 
Published: July 2023

Background
It is widely acknowledged that eccentric muscle contractions may cause skeletal muscle damage. However, there is little knowledge about the impact of eccentric contractions on non-muscular structures. Animal and human studies revealed that eccentric contractions can also induce immediate and short-term nerve dysfunction. The purpose of this review is to examine whether eccentric muscle contractions induce immediate and short-term effects on structural, morphological, mechanical, functional and physiological properties of peripheral nerves, from both animal and human studies.

Methods and analysis
A systematic review of randomised (RCTs) and non-randomised controlled trials will be conducted. Four electronic databases (i.e., Medline/Pubmed, Science Direct, PEDro and Cochrane) will be searched using predefined search terms to identify relevant studies. Eligible studies have to comprise any type of eccentric contraction of upper or lower limb muscles. Primary outcomes will include measures related to structure, morphology, mechanical, functional and physiological properties of peripheral nerves. Two independent reviewers will assess eligibility, evaluate risk of bias, and extract relevant data. In human studies, the risk of bias will be assessed by the Cochrane Collaboration risk of bias tool (RoB 2.0 tool) for RCTs and by risk of bias in non-randomised studies of interventions (ROBINS-I) for non-randomised controlled trials; while for animal studies, the risk of bias will be assessed using the SYRCLE’s RoB tool. A narrative synthesis will be conducted for all included studies. Also, if appropriate, a meta-analysis will be performed, where the effect size of each outcome will be determined by the standardized mean difference as well as the 95% confidence intervals. I2 statistics will be used to assess heterogeneity.

Ethics and dissemination
For this study, no ethical approval is required. Findings will be disseminated widely through peer-reviewed publication and conference presentations.

Systematic review registration
The protocol has been registered at the International Prospective Register of Systematic Reviews (PROSPERO). Registration number: CRD42021285767.
МОЛЕКУЛЯРНО-ГЕНЕТИЧЕСКИЕ ОСОБЕННОСТИ СЕМЕЙНЫХ ФОРМ АДЕНОМ ГИПОФИЗА
Authors: Тарасова Т. С. , Пигарова Е. А. , Дзеранова Л. К. , Тюльпаков А. Н. , Волеводз Н. Н. , Дедов И. И. 
Published: July 2023

Распространённость аденом гипофиза в популяции высокая, агрессивное течение заболевания преимущественно наблюдается при семейных формах. Поиск новых генов, вовлечённых в процесс образования
аденом гипофиза является важным фактором ранней диагностики моногенных заболеваний.
В ГНЦ ФГБУ «НМИЦ эндокринологии» Минздрава России внедрены технологии высокопроизводительного
параллельного секвенирования (Next generation sequencing, NGS) и разработана панель генов-кандидатов,
включающая следующие 15 генов MEN1, CDKN1B, PRKAR1A, GNAS, AIP, SDHA, SDHB, SDHC, SDHD, PRKCA, CDKN2C,
CDKN2A, POU1F1, PTTG2, DICER1.
Задачей настоящего исследования стала оценка частоты мутаций в генах среди 36 пациентов с семейными формами аденом гипофиза.
По результатам генетического тестирования методом NGS среди 36 представителей семей у 7 отмечены
следующие изменения нуклеотидной последовательности: мутация в гене AIP:NM_003977.2:exon 5:c.783
C>G:p.Tyr261 у пациента с семейной соматотропиномой; мутация в гене AIP:NM_003977.2:exon 6: c.811 C>T:p.
R271W у двух больных в семье с соматотропиномами; мутация в гене AIP:NM_003977.4:exon :c.649 С>Т:р.
A411GfsX47 у двух лиц с семейными соматотропиномами/пролактиномами в одной семье; у одного пациента с семейной пролактиномой идентифицирована мутация в гене DICER1:NM_177438:exon 16:c.2553 G>A:p.
Q851Q – синонимичная мутация – замена с недоказанным патологическим значением; у одного больного
с семейной пролактиномой выявлено нарушение нуклеотидной последовательности в гене DICER1:NM_
177438.2:exon 16: c.2613 C>A:p.D871E – несинонимичная замена с недоказанным патологическим значением; у одной пациентки с семейной тиреосоматотропиномой/соматотропиномой обнаружено изменение
в гене DICER1:NM_177438:exon 2:c.20 A>G:p.Q7R – несинонимичная мутация и в гене SDHA:NM_004168:exon
8:c.1002 G>A:p.A334A – синонимичная мутация с недоказанным патологическим значением; мутация в гене
GNAS: NM_080425:exon 1: c.314 A>G:p.E105G подтверждена у одного пробанда с синдромом МАS и семейной
соматотропиномой.
Частота мутаций в исследуемых 15 генах-кандидатов у пациентов с семейными формами аденом гипофиза составила 20% случаев, в 8% из которых идентифицированы изменения нуклеотидной последовательности в генах AIP и DICER1, в 3% – в генах SDHA и GNAS.
Таким образом, применение метода высокопроизводительного параллельного секвенирования NGS,
позволило предположить наличие крупных делеций в генах, сократило временные и материальные затраты на диагностику, что является предпочтительным для установления генетической природы заболевания лицам с семейными формами аденом гипофиза по сравнению с прямым секвенированием каждого
гена в отдельности.
РЕФЕРЕНСНЫЕ ИНТЕРВАЛЫ ТИРЕОТРОПНОГО ГОРМОНА В 1 ТРИМЕСТРЕ БЕРЕМЕННОСТИ
В РЕГИОНЕ ЛЕГКОГО ЙОДНОГО ДЕФИЦИТА
Authors: Макарова О. Б. , Южакова Н. Ю. , Суплотов С. Н. 
Published: July 2023

ЦЕЛЬ: определить референсные интервалы для тиреотропного гормона (ТТГ) в 1 триместре беременности в регионе легкого йодного дефицита (ЙД).
МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ: проведено одноцентровое, проспективное, одновыборочное исследование
в популяции беременных женщин – региона легкого йодного дефицита. Выборка формировалась сплошным способом: в исследование включались все беременные женщины, вставшие на учет в консультацию
№2 г.Тюмени в 1 триместре с июля по декабрь 2019 г, не имеющие патологии щитовидной железы в анамнезе и подписавшие информированное согласие на участие в исследовании. Из 477 беременных, вставших
на учет в женскую консультацию в течение полугода 213 были исключены по причине несоответствия,
таким образом в исследование было включено 264 условно здоровых беременных женщин в 1-м триместре. Средний возраст беременных составил 29 ± 5,2 лет (от 18 до 43 лет). Средний срок гестации при
обследовании – 9,9 нед. Для оценки тиреоидного статуса определялся уровень тиреотропного гормона
(ТТГ), свободной фракции тироксина (Т4 св.), антител к тиреопероксидазе (АТ-ТПО), тиреоглобулина (ТГ)
и антител к тиреоглобулину (АТ-ТГ) методом иммунноферментного анализа в клинико-диагностической
лаборатории университетской многопрофильной клиники ФГБОУ ВО Тюменского ГМУ Минздрава России
(зав. диагностическим отделением УМК ФГБОУ ВО Тюменского ГМУ Минздрава России к.м.н. Н.Ю. Южакова).
Проведение исследования было одобрено Комитетом по этике при ФГБОУ ВО Тюменского ГМУ Минздрава
России от 27 мая 2019 г. (выписка из протокола №85). Женщины с повышенными титрами АТ-ТПО и/или
АТ-ТГ, а также высокими уровнями ТГ и манифестным гипотиреозом были исключены из анализа. Для
определения верхнего и нижнего уровней ТТГ использовались 2,5 и 97,5 перцентили.
РЕЗУЛЬТАТЫ: в исследовании у 207 (78,4%) беременных показатели ТТГ находились в пределах референсных значений, рекомендованных для 1 триместра беременности 0,1–2,5 мМЕ/л). Увеличение уровня
ТТГ выше верхней границы референсного интервала (2,5 мМЕ/л) определен у 57 (21,5%) женщин, среди них
только у 16 (6%) беременных ТТГ был выше 4,0 мМЕ/л, и у 1 (0,37%) диагностирован манифестный гипотиреоз. Остальные 40 (15%) обследованных имели уровень ТТГ в интервале от 2,5–4,0 мМЕ/л. Уровень ТТГ
ниже референса (ниже 0,1 мМЕ/л) определен у 3 (1%) беременных. Кроме того, 10,6% (28) женщин имели
повышенный титры АТ-ТПО и 1,9% (5) АТ-ТГ.
После исключения женщин с повышенными титрами АТ-ТПО, АТ-ТГ, манифестным гипотиреозом, в анализ включено 225 женщин, в соответствии с 2,5 и 97,5 перцентилями определены верхний и нижний референсный интервал для I триместра беременности в регионе легкого ЙД как 0,211 – 4,15 мМЕ/л, что сопоставимо с результатами, полученными Рыбаковой А.А. и Платоновой Н.М. в Москве, Иваново и Смоленске
(2022). Для определения национальных триместрспецифических референсных интервалов ТТГ у беременных женщин необходимы дальнейшие исследования с расширением выборки и с учетом разного статуса
йодного обеспечения в регионах.
СЛУЧАЙ ВТОРИЧНОГО ОСТЕОПОРОЗА: ПЕРВИЧНЫЙ ГИПЕРПАРАТИРЕОЗ С ДИСТОПИЕЙ
ПАРАЩИТОВИДНОЙ ЖЕЛЕЗЫ ИЛИ ИДИОПАТИЧЕСКАЯ ГИПЕРКАЛЬЦИУРИЯ
Authors: Лобашова В. Л. , Бандолик Е. Ф. , Теляткова С. С. , Поташ А. В. , Куль Е. В. , Васильева Н. А. 
Published: July 2023

ЦЕЛЬ: представить клинический случай пациента с остеопорозом на фоне первичного гиперпаратиреоза вследствие дистопии паращитовидной железы (ПЩЖ) с сохраняющейся гиперкальциурией после
хирургического лечения.
МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ: пациентка 63 лет обратилась с жалобами на боли в костях. В анамнезе хронический гастрит, артериальная гипертензия. Менопауза с 51 года. МКБ и переломы в анамнезе отрицала.
При проведении денситометрии выявлен остеопороз (Ткр –4,4 L2), при нормальном уровне кальция,
фосфора, креатинина, пациентке были назначены бисфосфонаты, кальций 1000 мг и вит Д 2000 Ед/сутки,
которые принимала 2 года. Через 2 года обратилась для контроля.
РЕЗУЛЬТАТЫ: наблюдалась положительная динамика денситометрии (Ткр – 3,1 L2), однако выявлен повышенный уровень кальция общего 2,58 (2,25-2,55) ммоль/л и паратгормона 165 (10-65) пг/мл, кальциурия
11,5 (2,5-7,5) ммоль/сутки при сниженном уровне витамина Д 26. Фосфор, щелочная фосфатаза, креатинин
и скорость клубочковой фильтрации находились в пределах референсных значений. Сцинтиграфия ПЩЖ
не выявила признаков трансформации ПЩЖ. Гиперпаратиреоз был расценен как вторичный на фоне
недостаточности витамина Д. Дальнейшее наблюдение пациентки состоялось через год. Выявлена отрицательная динамика денситометрии (Ткр – 3,8 L2), уровень кальция ионизированного и паратгормона
нарастали (1,64 ммоль/л и 867 пг/мл соответственно). Проведена повторная сцинтиграфия ПЩЖ – на уровне тела 1 грудного позвонка превертебрально, срединноретротрахеально и антевертебрально выявлена
аденоматозная трансформация дистопированной ПЩЖ 8*9 мм. Проведено удаление верхней левой ПЩЖ
с опухолью, гистологически в присланном материале обнаружена ткань щит железы с зобом. Спустя 3 месяца сохранялся повышенный уровень кальция 2,69 ммоль/л, кальция ионизированного 1,4 ммоль/л, паратгормона 150 пг/мл, витамин Д 34. Повторная сцинтиграфия указала на сохраняющуюся метаболически
активную структуру на границе 1 и 2 грудных позвонков, после чего была проведена повторная операция
- удаление дистопированной ПЩЖ. Отмечалась нормализация показателей: паратгормон 49,3 пг/мл, кальций ионизированный 1,14 ммоль/л, витамин Д 40, положительная динамика денситометрии через год –
прирост + 4,8% (Ткр -2,8 L2). Однако сохраняется гиперкальциурия - кальций суточной мочи 10 ммоль/сутки
при нормальных значениях уровня кальция 2,48 ммоль/л, паратгормона 57 пг/мл и витамина Д 39, что
требует проведения дифференциально-диагностических проб и уточнения причины гиперкальциурии.
ВЫВОДЫ: важным этапом диагностики и лечения остеопороза является исключение вторичных форм,
являющихся следствием различных патологических состояний и заболеваний. Успешность этого процесса
во многом определяется информированностью врачей различных специальностей (в первую очередь
эндокринологов) и возможностью длительного наблюдения за пациентом.