bluuebunny/crossref_metadata_2025_split huggingface dataset:
Fundamentals of Scaling of Overall Cooling Effectiveness With Temperature Ratio
Authors: Cartlidge James , Povey Thomas 
Published: October 2023

Abstract
In this paper we study the relationship between overall cooling effectiveness (or so-called metal effectiveness) and mainstream-to-coolant total temperature ratio (TR), for typical high-pressure nozzle guide vane (HPNGV) cooling systems. The temperature ratio range studied is that between typical experimental conditions (TR ≅ 1.2) and typical engine conditions (TR ≅ 2.0). The purpose is twofold: firstly, to quantify the difference in overall cooling effectiveness between experimental and engine conditions of temperature ratio; and—secondly—to understand the physical bases for the difference, separated in terms of changes in five local surface boundary conditions. We do this using a bespoke conjugate thermal model which includes models of both the internal cooling and the external film cooling layer. Three typical cooling architectures are studied. The results allow comparison and scaling between situations at different conditions of temperature ratio.
Native plants change the endophyte assembly and growth of an invasive plant in response to climatic factors
Authors: Fang Kai , Yang Ai-Ling , Li Yu-Xuan , Zeng Zhao-Ying , Wang Rui-Fang , Li Tao , Zhao Zhi-Wei , Zhang Han-Bo 
Published: October 2023

ABSTRACT

Climate change, microbial endophytes, and local plants can affect the establishment and expansion of invasive species, yet no study has been performed to assess these interactions. Using a growth chamber, we integrated the belowground (rhizosphere soils) and aboveground (mixture of mature leaf and leaf litter) microbiota into an experimental framework to evaluate the impacts of four native plants acting as microbial inoculation sources on endophyte assembly and growth of the invasive plant
Ageratina adenophora
in response to drought stress and temperature change. We found that fungal and bacterial enrichment in the leaves and roots of
A. adenophora
exhibited distinct patterns in response to climatic factors. Many fungi were enriched in roots in response to high temperature and drought stress; in contrast, many bacteria were enriched in leaves in response to low temperature and drought stress. Inoculation of microbiota from phylogenetically close native plant species (i.e., Asteraceae
Artemisia atrovirens
) causes the recipient plant
A. adenophora
(Asteraceae) to enrich dominant microbial species from inoculation sources, which commonly results in a lower dissimilar endophytic microbiota and thus produces more negative growth effects when compared to non-Asteraceae inoculations. Drought, microbial inoculation source, and temperature directly impacted the growth of
A. adenophora
. Both drought and inoculation also indirectly impacted the growth of
A. adenophora
by changing the root endophytic fungal assembly. Our data indicate that native plant identity can greatly impact the endophyte assembly and host growth of invasive plants, which is regulated by drought and temperature.

IMPORTANCE

There has been increasing interest in the interactions between global changes and plant invasions; however, it remains to quantify the role of microbial endophytes in plant invasion with a consideration of their variation in the root vs leaf of hosts, as well as the linkages between microbial inoculations, such as native plant species, and climatic factors, such as temperature and drought. Our study found that local plants acting as microbial inoculants can impact fungal and bacterial enrichment in the leaves and roots of the invasive plant
Ageratina adenophora
and thus produce distinct growth effects in response to climatic factors; endophyte-mediated invasion of
A. adenophora
is expected to operate more effectively under favorable moisture. Our study is important for understanding the interactions between climate change, microbial endophytes, and local plant identity in the establishment and expansion of invasive species.
NhaA facilitates the maintenance of bacterial envelope integrity and the evasion of complement attack contributing to extraintestinal pathogenic
Escherichia coli
virulence
Authors: Mao Zhao , Zhang Haobo , Cai Wentong , Yang Yan , Zhang Xinyang , Jiang Fengwei , Li Ganwu 
Published: October 2023

ABSTRACT

Extraintestinal pathogenic
Escherichia coli
(ExPEC) is responsible for severe bloodstream infections in humans and animals. However, the mechanisms underlying ExPEC’s serum resistance remain incompletely understood. Through the transposon-directed insertion-site sequencing approach, our previous study identified
nhaA
, the gene encoding a Na
+
/H
+
antiporter, as a crucial factor for infection
in vivo
. In this study, we investigated the role of NhaA in ExPEC virulence utilizing both
in vitro
models and systemic infection models involving avian and mammalian animals. Genetic mutagenesis analysis revealed that
nhaA
deletion resulted in filamentous bacterial morphology and rendered the bacteria more susceptible to sodium dodecyl sulfate, suggesting the role of
nhaA
in maintaining cell envelope integrity. The
nhaA
mutant also displayed heightened sensitivity to complement-mediated killing compared to the wild-type strain, attributed to augmented deposition of complement components (C3b and C9). Remarkably, NhaA played a more crucial role in virulence compared to several well-known factors, including Iss, Prc, NlpI, and OmpA. Our findings revealed that NhaA significantly enhanced virulence across diverse human ExPEC prototype strains within B2 phylogroups, suggesting widespread involvement in virulence. Given its pivotal role, NhaA could serve as a potential drug target for tackling ExPEC infections.
Nationwide molecular epidemiology of carbapenemase-producing
Citrobacter
spp. in France in 2019 and 2020
Authors: Biez Laura , Bonnin Rémy A. , Emeraud Cecile , Birer Aurélien , Jousset Agnès B. , Naas Thierry , Dortet Laurent 
Published: October 2023

ABSTRACT

Carbapenemase-producing Enterobacterales have emerged in the last decades as one of the main threats in modern medicine.
Enterobacter
is a genus increasingly recognized as a key player in carbapenemase diffusion besides
Escherichia coli
and
Klebsiella pneumoniae
, but information regarding
Citrobacter
spp. remained scarce. A collection of 803 isolates of
Citrobacter
spp. recovered from the French National Center for carbapenem resistance over a 2-year period during 2019–2020 was analyzed. A total of 15 different carbapenemases were identified of which OXA-48 followed by NDM-1 and OXA-181 represented the main enzymes. Phylogenetic analysis of this collection revealed that
Citrobacter freundii
was the main species among which three main clones are circulating in France, being ST8, ST22, and ST91. ST22 and ST8 were distributed in all regions whereas ST91 demonstrated a regional spread. Analysis of the species diversity revealed that among the
C. freundii
complex,
Citrobacter portucalensis
and
Citrobacter braakii
were also disseminated. We revealed the dissemination of a clone carrying both
bla
DHA-15
(β-lactamase-encoding gene rarely reported in Enterobacterales) and
bla
OXA-48
in the north of France and allowed to identify an outbreak not previously investigated. This study analyzed the largest collection of carbapenemase-producing
Citrobacter
spp. and allowed deciphering of molecular epidemiology of
Citrobacter
spp. in France.

IMPORTANCE

The emergence of carbapenemase producers in Enterobacterales mostly involves
Escherichia coli
,
Klebsiella pneumoniae
, and
Enterobacter cloacae
complex species. However, in France, we observed the emergence and the rapid dissemination of carbapenemase in
Citrobacter
spp. In this study, we demonstrated that a wide variety of carbapenemases is produced by many different species of
Citrobacter
spp. However, we clearly identify three high-risk clones of
Citrobacter freundii
, ST8, ST22, and ST91 that drive the spread of carbapenemase in France. This epidemiological study paves the way of further analysis that would aim to identify the virulence factors involved in this pellicular ability of these three clones to disseminate at the hospital.
Meta-analysis reveals the predictable dynamic development of the gut microbiota in commercial pigs
Authors: Dong Wenxuan , Ricker Nicole , Holman Devin B. , Johnson Timothy A. 
Published: October 2023

ABSTRACT
Understanding the mechanisms of microbiome assembly during host development is crucial for successful modulation of the gut microbiome to improve host health and growth. However, results from previous microbial intervention studies to improve swine growth have largely been inconsistent due to the constantly changing nature of the gut microbiota and limited longitudinal sampling. Detailed characterization of the swine gut microbiota through meta-analysis allows us to understand the dynamics of microbial community succession, as well as the transient and natural variations between time points and animals. A total of 3,313 fecal microbial communities from over 349 pigs covering 60 time points (from birth to market age) from 14 publications were included in this meta-analysis. Despite differences in animal breeds and management, generalizable patterns of community assembly were identified. Alpha diversity continuously increased during early stages of animal growth and more slowly in the later stages. Beta regression analysis revealed that more microbial taxa were enriched, while fewer were excluded by the gut microbiota. The microbial community structure also changed significantly between days at early ages and became more similar as pigs aged, as revealed by dissimilarity and distance metrics. Dirichlet multinomial mixtures analysis supported gradient microbial clustering in longitudinal pig fecal samples, and we found that the early samples spread to more clusters than those from older pigs. Random forest regression identified 30 operational taxonomic units as potential microbial biomarkers for modeling swine gut microbiota development. External validation showed this model could be generalized to future microbiome studies conducted in suckling and weaning pigs and adds to the toolkit to quantify community succession.

IMPORTANCE
The swine gut microbiome undergoes an age-dependent assembly pattern with a developmental phase at early ages and a stabilization phase at later ages. Shorter time intervals and a wider range of data sources provided a clearer understanding of the gut microbiota colonization and succession and their associations with pig growth and development. The rapidly changing microbiota of suckling and weaning pigs implies potential time targets for growth and health regulation through gut microbiota manipulation. Since swine gut microbiota development is predictable, swine microbiota age can be calculated and compared between animal treatment groups rather than relying only on static time-matched comparisons.
Effect of Integrated Treatment with Traditional Chinese Medicine on Hashimoto’s Thyroiditis Patients
Authors: Lou Xudan , Huang Yuxin , Qiu Jieyuzhen , Sun Jiao , Gu Qin , Wang Haidong , Tao Xiaoming , Jiang Cuiping 
Published: October 2023

What is Known and Objective. To explore the effects of traditional Chinese medicine (TCM) combined with levothyroxine (L-T4) on thyroid autoantibodies, inflammation, and sleep quality in Hashimoto’s thyroiditis patients. Methods. Patients were randomly divided into group A and group B. Group A was treated with L-T4 alone, while group B was treated with integrated TCM and L-T4. TCM symptoms were quantified before and after treatment as well as PSQI. Blood samples were taken to detect clinical indicators and thyroid autoantibodies. Cytokines in serum and thyroid tissues were analyzed by ELISA and RT-PCR. Results and Discussion. Totally, 196 patients were enrolled in the study, and there were no differences between group A and group B at the baseline. TCM treatment effectively reduced the levels of TGAb and TPOAb and was a protective factor for the improvement of Hashimoto’s thyroiditis antibody titers,

p

<

0.05

. The serum expressions of IL-17A, IL-6, and IFN-γ in group B after treatment were lower than those in group A and before, while the IL-10 level was raised from the baseline,

p

<

0.05

. Similar results were found in the comparison of IL-17A, IFN-γ, and IL-10 in thyroid tissues of group A, B, and control,

p

<

0.05

. Besides, with integrated treatment, all TCM symptoms except for poor memory were improved as well as sleep quality and mood,

p

<

0.05

. However, these changes were not observed before and after treatment with L-T4 in group A. What is New and Conclusion. The integrated treatment with TCM had a significant effect on thyroid autoantibodies, inflammation, and sleep quality in Hashimoto’s thyroiditis patients and provided a new and effective method for future treatment.
Amelioration of Tumor-promoting Microenvironment via Vascular Remodeling and CAF Suppression Using E7130: Biomarker Analysis by Multimodal Imaging Modalities
Authors: Ito Ken , Yamaguchi Masayuki , Semba Taro , Tabata Kimiyo , Tamura Moe , Aoyama Muneo , Abe Takanori , Asano Osamu , Terada Yasuhiko , Funahashi Yasuhiro , Fujii Hirofumi 
Published: October 2023

Abstract
E7130 is a novel anticancer agent created from total synthetic study of the natural compound norhalichondrin B. In addition to inhibiting microtubule dynamics, E7130 also ameliorates tumor-promoting aspects of the tumor microenvironment (TME) by suppressing cancer-associated fibroblasts (CAF) and promoting remodeling of tumor vasculature. Here, we demonstrate TME amelioration by E7130 using multi-imaging modalities, including multiplexed mass cytometry [cytometry by time-of-flight (CyTOF)] analysis, multiplex IHC analysis, and MRI. Experimental solid tumors characterized by large numbers of CAFs in TME were treated with E7130. E7130 suppressed LAP-TGFβ1 production, a precursor of TGFβ1, in CAFs but not in cancer cells; an effect that was accompanied by a reduction of circulating TGFβ1 in plasma. To our best knowledge, this is the first report to show a reduction of TGFβ1 production in TME. Furthermore, multiplex IHC analysis revealed reduced cellularity and increased TUNEL-positive apoptotic cells in E7130-treated xenografts. Increased microvessel density (MVD) and collagen IV (Col IV), an extracellular matrix (ECM) component associated with endothelial cells, were also observed in the TME, and plasma Col IV levels were also increased by E7130 treatment. MRI revealed increased accumulation of a contrast agent in xenografts. Moreover, diffusion-weighted MRI after E7130 treatment indicated reduction of tumor cellularity and interstitial fluid pressure. Overall, our findings strongly support the mechanism of action that E7130 alters the TME in therapeutically beneficial ways. Importantly, from a translational perspective, our data demonstrated MRI as a noninvasive biomarker to detect TME amelioration by E7130, supported by consistent changes in plasma biomarkers.
ЕФЕКТИВНІСТЬ ЗАСТОСУВАННЯ ПРОБІОТИКА «ЛАКТІАЛЄ ЖЕРМІНА ФОРТЕ» У КОМПЛЕКСНОМУ ЛІКУВАННІ ХВОРИХ НА COVID-19
Authors: Юрко К. В. , Соломенник Г. О. , Кучерявченко В. В. 
Published: October 2023

Мета роботи – проаналізувати частоту виникнення та спектр розладів з боку травного каналу (ТК) у пацієнтів із COVID-19 та оцінити ефективність застосування пробіотика, що містить спори B. clausii UBBC-07.
Матеріали і методи. Обстежено 85 хворих на COVID-19, з яких 59 (69,4 %) осіб мали шлунково-кишкові розлади. Їх було поділено на дві групи: до групи I увійшли 30 (50,9 %) пацієнтів, яким додатково до стандартної терапії призначали пробіотик «Лактіалє Жерміна Форте» по 1 флакону 2 рази на добу протягом 7 діб, до групи II – 29 (49,1 %) хворих, які отримували стандартну етіотропну та патогенетичну терапію.
Результати досліджень. Шлунково-кишкові розлади у хворих на COVID-19 характеризувалися зниженням або відсутністю апетиту, діареєю, гіркотою в роті, болем у животі, нудотою, блюванням. Симптоми ураження ТК на 7-й день від початку лікування зберігалися в 5 (16,7 %) хворих групи I і 20 (69,0 %) осіб із групи II (р˂0,001). У представників I групи вміст інтерлейкіну-1β, інтерлейкіну-2 та інтерлейкіну-8 знижувався в динаміці, порівняно з початковим рівнем (р˂0,01), був нижчим за аналогічний показник у групі порівняння (р˂0,05) після лікування. Також у цих хворих відбулося підвищення вмісту біфідо- та лактобактерій відносно значно зниженого початкового рівня (р˂0,001), пригнічення росту золотистого стафілокока (р˂0,001), грибів роду Candida (р˂0,01), зменшення кількості кишкової палички зі зниженою ферментативною активністю (р˂0,001), ентерококів (р˂0,001), тенденція до зменшення кількості кишкової палички з гемолітичною активністю (р˃0,05).
Висновки. Виникнення розладів з боку ТК є типовим для COVID-19. Застосування в комплексній терапії пацієнтів «Лактіалє Жерміна Форте» сприяє регресії клінічних проявів, нормалізації або наближенню до нормалізації вмісту прозапальних цитокінів у сироватці крові, відновленню стану кишкової мікрофлори, порівняно зі стандартною терапією.
СИНДРОМ ГІПЕРЧУТЛИВОСТІ ДО АНТИКОНВУЛЬСАНТІВ, ПОВ’ЯЗАНИЙ З РЕАКТИВАЦІЄЮ ЕПШТЕЙНА-БАРР-ВІРУСНОЇ ІНФЕКЦІЇ
Authors: Колотило Т. Р. , Москалюк В. Д. , Дучко М. В. 
Published: October 2023

Синдром гіперчутливості до антиконвульсантів – небезпечна реакція, спричинена прийомом ароматичних протисудомних засобів, а саме: фенітоїну, карбамазепіну, фенобарбіталу. Клінічні ознаки включають висип, гарячку, лімфаденопатію, ураження внутрішніх органів (гепатит, кардит, внутрішній нефрит або інтерстиційний пневмоніт), а також гематологічні відхилення, такі як лейкоцитоз з еозинофілією чи атиповий лімфоцитоз. Синдром виникає після тривалого впливу антиконвульсантів на організм.
Мета – дослідити закономірність впливу антиконвульсантів на організм пацієнта з латентною інфекцією, спричиненою HHV-4 людини (вірусом Епштейна-Барр – EBV).
Можливою причиною синдрому гіперчутливості до протисудомних препаратів вважають генетичний дефіцит детоксикаційних ферментів, зокрема епоксидгідролази, що призводить до накопичення токсичних метаболітів, або взаємодії між вірусом і ліками, як це спостерігається у випадках вірусу імунодефіциту людини та вірусу герпесу людини. Ароматичні протисудомні засоби метаболізуються цитохромом Р-450 до проміжних метаболітів, таких як оксиди арена. Якщо є дефекти метаболізму, ці токсичні метаболіти можуть спричинити некроз або апоптоз клітин і індукувати вторинну імунну відповідь. Клінічний випадок характеризує симптоматику синдрому, діагностичні критерії та підтверджує доцільність лікування синдрому глюкокортикостероїдами. Доведено, що у пацієнтів із синдромом гіперчутливості до антиконвульсантів генетичний алель HLA-A-3101 асоціюється із шкірними реакціями, спричиненими карбамазепіном.
Висновки. Метаболіти ареноксиду ароматичних протисудомних засобів (фенітоїну, фенобарбіталу та карбамазепіну) можуть брати участь у патогенезі реакцій гіперчутливості та реактивації латентної EBV-інфекції. Перехресна реакція серед основних протисудомних засобів поширена, тож її слід враховувати перед тим, як ухвалювати рішення про альтернативну терапію. Беручи до уваги високий рівень носіїв HLA-A-3101 у всьому світі, підвищення обізнаності медичних працівників із синдромом гіперчутливості до антиконвульсантів має важливе значення для зниження кількості клінічних випадків реактивації латентної EBV-інфекції і запобігання можливим серйозним ускладненням.
АНАЛІЗ ПОКАЗНИКІВ ЕНДОТОКСИКОЗУ У ХВОРИХ НА ЦИРОЗ ПЕЧІНКИ З МЕТАБОЛІЧНИМ СИНДРОМОМ ТА ДИСБІОЗОМ
Authors: Олійник Н. М. 
Published: October 2023

РЕЗЮМЕ. У розвитку та прогресуванні ендотоксикозу при цирозі печінки доведена роль метаболічного синдрому та дисбіозу кишечника.
Мета – дослідити окремі показники ендотоксикозу, вираження його дисбалансу у хворих на ЦП з дисбіозом кишечника при наявності метаболічного синдрому.
Матеріал і методи. Було обстежено 101 хворого на ЦП різної етіології. Верифікацію діагнозу проводили на основі анамнестичних, клінічних, лабораторних (біохімічних, серологічних) даних, визначали сироваткові маркери вірусів гепатиту В та С, результатів ультразвукового дослідження печінки за допомогою уніфікованих методик, затверджених МОЗ України.
Результати. Аналіз показників ЕІ у хворих на ЦП різної етіології виявив вірогідне підвищення рівня маркерів у всіх етіологічних групах. У жінок з ЦП алкогольної етіології спостерігали більш виражений рівень ІЕІЕ порівняно із чоловіками. Спостерігалося вірогідне зростання маркерів ендотоксикозу при декомпенсації ЦП. Аналіз маркерів ендотоксикозу у хворих на ЦП при наявності метаболічного синдрому виявив вірогідне підвищення всіх показників у групі М, порівняно з групою Ц.
Висновки. У хворих на ЦП з дисбіозом спостерігається виражений ендотоксикоз. Рівень ІЕІЕ був вищим за контрольний в 2,3 раза, СМП1 – в 1,7 раза, СМП2 – в 2,0 раза (p<0,05), що є показником виражених проявів ендотоксикозу при ЦП. Рівень маркерів ендотоксикозу виявився достовірно вищим у хворих на ЦП при наявності метаболічного синдрому, що призводить до поглиблення процесів фіброгенезу.
ПОКАЗНИКИ ЦИТОКІНОВОГО СТАТУСУ (IL-6 ТА IL-10) У ХВОРИХ, ЯКІ ЗАЗНАЛИ ОПЕРАТИВНОГО ВТРУЧАННЯ В УМОВАХ ЗАГАЛЬНОЇ АНЕСТЕЗІЇ
Authors: Салій З. В. , Салій І. І. , Салій М. І. 
Published: October 2023

РЕЗЮМЕ. З огляду на поширеність післяопераційної когнітивної дисфункції, актуальним є встановлення факторів ризику її розвитку з метою корекції та профілактики.
Мета – встановити діагностичну цінність визначення вмісту IL-6 та IL-10 для прогнозування розвитку ПОКД.
Матеріал і методи. У 32 хворих, які зазнали оперативного втручання в умовах загальної анестезії, дослідили вміст IL-6 та IL-10 в сироватці крові в перед- та ранньому післяопераційному періоді. Середній вік хворих – (52,28±2,13) років. Середня тривалість оперативного втручання – (78,91±5,04) хвилин. Тривалість дії анестезії – (103,91±6,59) хвилин. Розподіл за видом оперативного втручання: ендопротезування – 17 хворих (53,13 %), металоостеосинтез – 15 хворих (46,87 %). З метою оцінки стану когнітивних функцій використовували Монреальську шкалу оцінки когнітивних функцій (МоСА), для визначення рівня тривожності та депресії – Госпітальну шкалу тривожності і депресії (HADS). До контрольної групи увійшли 22 практично здорові особи, репрезентативні за віком та статтю.
Результати. До оперативного втручання у пацієнтів основної групи, в порівнянні з контрольною, вміст IL-6 був достовірно вищим, що можна розцінювати як реакцію на травму. Оперативне втручання сприяло зростанню рівня прозапального цитокіну IL-6 в 3,57 раза на тлі помірного зростання протизапального – IL-10 (в 1,2 раза).
Післяопераційний вміст IL-6 був достовірно вищим у групі з ендопротезуванням (р=0,04). Встановлено кореляційний зв’язок між рівнем IL-6 і тривалістю операції (r=0,77, р=0,001), рівнем IL-10 і депресією (r=0,64, р=0,013).
Висновок. Оперативне втручання в умовах загальної анестезії сприяло зростанню рівня прозапального цитокіну IL-6 та тлі помірного зростання протизапального – IL-10. Достовірно вищий рівень післяопераційного IL-6 був у пацієнтів з тривалістю анестезії понад 120 хвилин, негативно корелюючи з результатом МоСА-тесту (r=-0,57, р=0,035). Установлено особливості реагування системи цитокінового статусу залежно від характеру патології, з приводу якої виконувалося ортопедичне втручання.