bluuebunny/crossref_metadata_2025_split huggingface dataset:
High-Resolution Melting Curve Analysis of Genomic and Whole-Genome Amplified DNA
Authors: Cho Michael H , Ciulla Dawn , Klanderman Barbara J , Raby Benjamin A , Silverman Edwin K 
Published: October 2008

Abstract
Background: High-resolution melting curve analysis is an accurate method for mutation detection in genomic DNA. Few studies have compared the performance of high-resolution DNA melting curve analysis (HRM) in genomic and whole-genome amplified (WGA) DNA.
Methods: In 39 paired genomic and WGA samples, 23 amplicons from 9 genes were PCR amplified and analyzed by high-resolution melting curve analysis using the 96-well LightScanner (Idaho Technology). We used genotyping and bidirectional resequencing to verify melting curve results.
Results: Melting patterns were concordant between the genomic and WGA samples in 823 of 863 (95%) analyzed sample pairs. Of the discordant patterns, there was an overrepresentation of alternate melting curve patterns in the WGA samples, suggesting the presence of a mutation (false positives). Targeted resequencing in 135 genomic and 136 WGA samples revealed 43 single nucleotide polymorphisms (SNPs). All SNPs detected in genomic samples were also detected in WGA. Additional genotyping and sequencing allowed the classification of 628 genomic and 614 WGA amplicon samples. Heterozygous variants were identified by non–wild-type melting pattern in 98% of genomic and 97% of WGA samples (P = 0.11). Wild types were correctly classified in 99% of genomic and 91% of WGA samples (P &lt; 0.001).
Conclusions: In WGA DNA, high-resolution DNA melting curve analysis is a sensitive tool for SNP discovery through detection of heterozygote variants; however, it may misclassify a greater number of wild-type samples.
Relevance and potential of sphingosine-1-phosphate in vascular inflammatory disease
Authors: van der Giet Markus , Tölle Markus , Kleuser Burkhard 
Published: October 2008

Abstract
The typical pathological feature of atherosclerosis is inflammation. In the last years, it has become evident that inhibition of inflammation is one important therapeutic option in atherosclerosis. Recently, sphingolipid sphingosine-1-phosphate (S1P) was identified as a crucial molecule with potent anti-inflammatory properties. Indeed, S1P activates various G protein-coupled receptors, namely S1P1–S1P5. In the vasculature, mainly S1P1–3 receptors are present. FTY720, after phosphorylation to FTY720-P, is an orally active S1P mimetic. FTY720 has been developed for therapy in the field of autoimmune diseases and organ transplantation. In analogy to S1P, FTY720 shows potent anti-inflammatory effects and several groups have tested the in vivo effects of FTY720 on the progression of inflammatory vascular diseases. They could show that S1P receptor activation might lead to a partial inhibition of the progression of atherosclerotic lesions. S1P receptor activation therefore might be a concept for anti-inflammatory drug treatment. However, it is not clear how S1P and FTY720 exactly act on vascular inflammation. This review article gives a brief overview over the known actions of S1P in vascular inflammatory disease.
Test Results from Round Robin on Precracking and CTOD Testing of Welds
Authors: Graham Stephen M. , Stanley Richard 
Published: October 2008

Abstract
A weld fracture toughness round robin test program was initiated by ASTM to evaluate a proposed annex to E1290-93 on fracture toughness testing of ferritic steel weldments. The focus of the round robin was on specimen preparation procedures and their effect on crack tip opening displacement (CTOD). The local compression procedure was used to reduce the influence of residual stress on precrack curvature. Specimens were tested at −196 °C, which is on the lower shelf for this metal, to minimize variability in fracture toughness and maximize influence of residual stress. Seven labs participated in the round robin and among them conducted 51 tests per E1290-93 to measure CTOD. Statistical analysis of the data showed that crack curvature decreased by 5.2 % ±2.1 % for each 1 % increase in local compression, over the range of compressions tested (0–2.9 % with a nominal target value of 1 %). However, mean values of curvature varied significantly between labs, and when results from all labs are considered, local compression of about 1 % did not reliably reduce crack front curvature. It appears that the procedure used is more important than the amount of local compression, as evidenced by the straight cracks obtained by two labs that exercised tight control on local compression. The statistical analysis revealed that the mean value of measured CTOD for all data with less than 10 % curvature was not statistically different than the mean for less than 20 %, as it is in BS7448 (1997). Perhaps the most surprising observation from this round robin is that there does not appear to be a correlation between CTOD measured at −196 °C and amount of local compression or crack front curvature.
Vasa praevia: diagnosis and management
Authors: Murray Aoife , Murphy Deirdre J 
Published: October 2008

Vasa praevia occurs when unprotected fetal vessels cross the cervix beneath the presenting part.
It occurs in approximately 1 in 3000–6000 births.
Rapid fetal haemorrhage can result.
A high index of suspicion and appropriate use of prenatal ultrasonography may prevent perinatal death.

Learning objectives:

To recognise the risk factors and diagnostic criteria.
To review the role of expert ultrasonography.
To recognise the need for prompt action and a clear care plan.

Ethical issues:

Should prenatal detection of vasa praevia be a routine component of antenatal care?
Should resource constraints influence the availability of prenatal diagnostic testing?

Please cite this article as: Murray A, Murphy DJ. Vasa praevia: diagnosis and management. The Obstetrician & Gynaecologist 2008;10:217–223.
Correlates of Incarceration Among Young Methamphetamine Users in Chiang Mai, Thailand
Authors: Thomson Nicholas , Sutcliffe Catherine G. , Sirirojn Bangorn , Keawvichit Rassamee , Wongworapat Kanlaya , Sintupat Kamolrawee , Aramrattana Apinun , Celentano David D. 
Published: October 2008

Objectives. We examined correlates of incarceration among young methamphetamine users in Chiang Mai, Thailand in 2005 to 2006. Methods. We conducted a cross-sectional study among 1189 young methamphetamine users. Participants were surveyed about their recent drug use, sexual behaviors, and incarceration. Biological samples were obtained to test for sexually transmitted and viral infections. Results. Twenty-two percent of participants reported ever having been incarcerated. In multivariate analysis, risk behaviors including frequent public drunkenness, starting to use illicit drugs at an early age, involvement in the drug economy, tattooing, injecting drugs, and unprotected sex were correlated with a history of incarceration. HIV, HCV, and herpes simplex virus type 2 (HSV-2) infection were also correlated with incarceration. Conclusions. Incarcerated methamphetamine users are engaging in behaviors and being exposed to environments that put them at increased risk of infection and harmful practices. Alternatives to incarceration need to be explored for youths.
Effect of concentrate supplementation on growth and reproductive performance of rabbit under rural condition
Authors: Hasanat MS , Hossain ME , Mostari MP , Hossain MA 
Published: October 2008

Crossbred New Zealand White meat type 8 male and 16 female rabbits aged 3.5 to 4.5 months weighing 9.5 to 13.0 kg were used in a 128 day trial to study the effects of concentrate supplementation on growth and reproductive performance of rabbit under rural condition. Rabbits were divided according to live weight into two treatment groups, i.e. T1 (conventional diet) and T2 (conventional diet + concentrate 75 g/d per rabbit) with four replications per treatment in a Complete Randomized Design (CRD). All animals had free access to locally available green grasses. Results showed that, average daily live weight gain was significantly (p < 0.01) higher in T2 (13.02 Â± 0.43 g/d) than T1 (5.30 Â± 0.43 g/d) group. Litter weight at birth was better (p < 0.05) in T2 (180.38 Â± 16.37g) than T1 (137.19 Â± 16.37g) group. Litter size at weaning differed (p < 0.05) and the mean values were 1.37 Â± 0.30 for T1 and 2.37 Â± 0.27 for T2 group. Kit weight at weaning was superior (p < 0.01) in T2 (408.12 Â± 3.85g) than T1 (310.62 Â Â± 3.56g) group. Kit mortality up to weaning was higher (p < 0.01) in T1 (45.0 Â± 10.07 %) than T2 (26.92 Â± 10.7 %) group. These results indicate that, supplementation of concentrate in addition to conventional feeding may improve growth and reproductive performance of rabbit under rural condition.Â Key words: Crossbred, New Zealand White rabbit, reproductive performance, growth, concentrate DOI = 10.3329/bjvm.v4i2.1296 Bangl. J. Vet. Med. (2006). 4 (2): 129-132
Production of formalin killed fowl typhoid vaccine using local isolates of <i>Salmonella</i> Gallinarum in Bangladesh
Authors: Haider MG , Rahman MM , Hossain MM , Rashid M , Sufian MA , Islam MM , Haque AFMH 
Published: October 2008

A locally isolated Salmonella Gallinarum (SG) was used for fowl typhoid vaccine production. 2 x 107 colony forming unit (CFU) of SG was used for the vaccine production. The fowl typhoid vaccine was produced with the local isolates of SG (LRI 49) strain. Efficacy study of the vaccine was performed primarily in laboratory trial in 6 weeks and then in 8 weeks old commercial layers in the field. Chickens were boasted after 4 wks of vaccination. Rapid serum plate agglutination (SPA) test and ELISA were carried out for the detection of antibody response against SG vaccinated and non-vaccinated birds. Positive results of the rapid plate agglutination and the ELISA were 81% and 77% in laboratory trial, and 76.4% and 73.8% in field trial, respectively. The chickens of vaccinated and non-vaccinated groups were challenged with the infective dose (2 x 2 x 107CFU) of freshly prepared live SG bacteria and lesions were not detected in vaccinated birds at necropsy.Â The vaccine was proved safe and effective in terms of preventing of fowl typhoid in chickens in Bangladesh. Â Key words: Fowl typhoid vaccine, potency, ELISA, plate agglutination test, Salmonella Gallinarum Â Â DOI = 10.3329/bjvm.v5i1.1306 Bangl. J. Vet. Med. (2007). 5 (1 & 2): 33-38
Population density of helminths in ducks: effects of hostâs age, sex, breed and season
Authors: Farjana T , Islam KR , Mondal MMH 
Published: October 2008

Â A study was conducted to investigate the population density of helminth parasites in domestic ducks (Anas boschas domesticus) in relation to host's age, sex, breed and seasons of the year from March 2002 to May 2003. A total of 300 ducks were collected from different villages of Netrokona and Mymensingh districts of Bangladesh and autopsied to collect the parasites and counted to determine the population density of parasites. Off 300 ducks examined, 290 (96.66%) were infected with 17 species of helminth parasites in which 11 species were trematodes, 4 were cestodes and 2 nematodes. Among the parasites, density of cestodes was the highest (33.15Â±5.26), followed by trematodes (5.98Â±1.32); and nematodes (2.95Â±0.68). Mean density of parasites increased with the increase of age (young: 21.23Â±1.09, adult: 26.18Â±2.14 and old: 27.87Â±2.98) while the mean density of most of the helminth parasites was higher in female ducks (31.35Â±4.72) than in males (27.52Â±3.32). Indigenous ducks (33.72Â±3.61) were infected with the highest load of helminths than Khaki Campbell breed (29.61Â±4.32) of ducks. Mean density of most trematodes (5.42Â±0.80) were highest in winter season whereas mean density of all cestodes (48.43Â±4.85) and nematodes (4.13Â±1.76) were highest in summer. Â The present study suggests that age, sex, breed of ducks and seasons of the year influence the parasitic infection to a greater extend. Key words: Population density, helminths, duck, Bangladesh DOI = 10.3329/bjvm.v6i1.1338 Bangl. J. Vet. Med. (2008). 6 (1): 45-51
Un réactif social : le parrainage. Du XVIe siècle à la Révolution : Nobles, bourgeois et paysans dans un bourg perché du Jura
Authors: Berthet Abbé 
Published: October 2008

Les notes qu'on va lire sont très neuves. Elles attirent l'attention sur certaines relations d'ordre personnel et humain que les historiens, contraints d'envisager de haut les problèmes sociaux de l'Ancien Régime, négligent s'ils les aperçoivent : mais, le plus souvent, ils net les voient point.Il s'agit des rapports d'honneur ou d'amitié que, dans le cadre de nos villages et de nos bourgs, entretenaient nobles et non nobles. Il a semblé à l'abbé berthel que les registres de baptême avaient leur mot à dire sur leur évolution. De là son article. Qu'il soit le bienvenu, comme tous ceux qui nous aideront à pénétrer dans l'intimité — si difficile à reconstituer — de ces groupes sociaux de l'ancienne France : villes, bourgs, villages, dont fut faite la vie même, la vie totale et globale de notre pays.
Une industrie motrice : La haute couture parisienne et son évolution
Authors: Marcel Rouff  
Published: October 2008

« L'histoire du Costume, dans les deux derniers siècles, laisse assez Voir que les maîtres de la Couture font à la femme son image — et que la Mode, dans ses grandes lignes, livre à l'historien une explication souvent profonde de l'état d'une société, des phases du goût, des goûts, et même des idées dirigeantes. »Cette citation n'est pas de moi. Elle est tirée d'un des derniers numéros de la revue Formes et Couleurs. Mais je la fais mienne et la prends comme préface à l'histoire de la Mode dans l’entre-deux-guerres, étant convaincu que l'histoire du Costume, de 1918 à 1939, aidera l'historien à expliquer cette période extraordinaire. J'ai eu l'avantage de la vivre au sein même de la Mode, aussi bien en France qu'à l'étranger, et, d'après ce que j'ai vu et vécu, je voudrais essayer de montrer que cette époque tant critiquée a marqué, du moins, l'apogée dei la richesse et des bienfaits de tout genre, que la Mode française pouvait apporter au pays.
Problèmes de guerre : Un commentaire de lénine sur clausewitz
Authors: Nicolle Paul 
Published: October 2008

On n'accusera pas les Editions Médicis de manquer d'opportunité, lorsqu'elles nous présentent un livre intitulé : Les Fondements théoriques de la guerre, et de la paix en U. R. S. S.Première originalité : l'auteur n'est pas français. Avant de rejoindre, en qualité de chargé de mission près de l'armée américaine, le front d'Europe occidentale, M Bert,hold G. Friedl était professeur de langue et de civilisation russes à l'Université de Missouri. S'il n'a point hésité à nous donner, au passage, cette primeur en notre langue, c'est qu'il a vécu longuement chez nous — il est docteur de l'Université de Paris — et qu'il nous aime. De par ses connaissances et ses sympathies, nul n'est plus qualifié pour entreprendre cette tâche urgente : favoriser l'interprétation de trois civilisations restées trop cloisonnées : l'américaine, la russe, la française.
Exégèse de Désastre : Iéna, la crise de l'État prussien et la genèse du Romantisme
Authors: Brunschwig Henri 
Published: October 2008

L'effondrement de la Prusse après Iéna : une surprise pour toute l'Europe. On s'étonna du manque de cohésion d'une armée célèbre par sa discipline, de la désorganisation d'un système administratif réputé pour la valeur de ses fonctionnaires et, surtout, des signes de désaffection donnés par un peuple dont le loyalisme était proverbial. Comment s'expliquer cet effondrement, sinon en reconsidérant l'édifice, dont, après Kover, toute une génération d'historiens a minutieusement étudié les rouages ? Puis en décrivant les principaux aspects d'une crise qui, s'attaquant à l'économie et à l'équilibre social, transforma la mentalité populaire et s'exprima, par la plume des intellectuels, en un langage nouveau.En apparence, ce sont l'armée et l'administration qui caractérisent l'Etat prussien à la, fin du XVIIIe siècle. Mais, ce qui le rend incomparable aux autres puissances, c'est un dépouillement méthodique de la presse, des mémoires, des études politiques ou économiques publiées entre la fin du règne de Frédéric II et la catastrphe de 1806, — qui, seul, permet d'en prendre lentement conscience.
De la Constituante à Napoléon : Les vicissitudes de l'impôt indirect
Authors: Schnerb Robert 
Published: October 2008

Notre collaborateur, M. R. Sehnerb, nous a offert pour les Annales l'article qu'on va lire. Nous l'avons accepté avec plaisir, parce que nous tenons à attirer de nouveau l'attention de tous — des historiens, mais aussi des techniciens et surtout des simples citoyens — sur ce problème de l'impôt qui n'est point étudié. Jamais étudié. Je veux dire comme il sied, et autrement qu'à la Marion.Rares partout, les historiens qui ont le courage de pénétrer dans les fourrés, les ronciers de la finance publique, et d'en commencer le débroussaillement. Il y faut de fortes bottes. Plus rares en France que partout, ces pionniers, et quand on a cité R. Sehnerb… J'ai dit en son temps, dans les Annales, le plaisir que j'avais à le voir s'orienter de ce côté. Et nous montrer, par ses études même, ce qu'une analyse sociale à l'affût de renseignements précis pouvait espérer de travaux qui, en apparence, n'ont de quoi intéresser que les historiens — et les plus rébarbatifs.
Dialogues de Grands Esprits : Leibniz, spinoza et le problème de l'incroyance au XVIIe siècle
Authors: Febvre Lucien 
Published: October 2008

« Leibniz juge de Spinoza : qu'avons-nous à faire, historiens, avec un livre, avec une thèse philosophique de Sorbonne qui porte ce titre ? Ne nous trompons point de rayon. Ne transformons pas les Annales en Revue Philosophique… » Ainsi disent les sages, amis des justes barrières. Leur prudence éprouvée se trouve en défaut aujourd'hui. Confiez-vous à Georges Friedmann, installez-vous au coeur de son livre : quel beau voyage, plein de périls, mais que la finesse du guide permettra d'éviter — quel beau voyage pour l'historien à travers les profondeurs de l'esprit et du cœur des hommes, des grands hommes du XVIIe siècle finissant !…L'esprit, le coeur : vieux mots, grands mots. Je ne les écris que pour « rattraper » ce qu'il y a de sec, d'inexact et de pauvre dans la conception traditionnelle d'une histoire Intellectuelle n'accordant d'attention qu-au seul jeu des concepts.
Conflits et refus de civilisation : Espagnols et Morisques au XVIe siècle
Authors: Braudel Fernand 
Published: October 2008

Son nom même indique que le problème morisque est un conflit de religions, autrement dit, au sens fort, un conflit de civilisations, donc difficile à résoudre et appelé à durer. Par Morisques, on entend, en effet, les descendants des Musulmans d'Espagne, convertis au christianisme en 1501 dans les pays de Castille, en 1526 dans ceux de la Couronne d'Aragon. Tour à tour malmenés, endoctrinés, favorisés, redoutés toujours, ils seront finalement chassés, au cours des grandes expulsions des années 1609-1611.Étudier le problème revient, en fait, à mettre au clair, au delà de la prise de Grenade de 1492, la longue survie, le lent naufrage de l'Islam ibérique. S'étonnera-t-on que, de ce naufrage, beaucoup de choses aient surnagé, même au delà de la date fatidique de 1609 ?
Les fondements d'une géographie sociale de la bourgeoisie française
Authors: Chatelain Abel 
Published: October 2008

Les géographes français, depuis Vidal de la Blache, ont très inégalement fouillé les divers domaines de la géographie humaine. Ils n'ignorent pas la géographie sociale, mais ils n'ont pas encore cherché à lui donner la place qui lui est due. Les analyses restent très superficielles; les limites sont à peine tracées et les méthodes propres de cette géographie sociale sont encore à préciser.Parmi les derniers ouvrages sur les classes sociales et la vie sociale de notre pays, deux surtout doivent retenir l'attention des géographes : celui d'un historien, Charles Morazé, et celui d'un géographe, Pierre George. Tous deux, avec raison, montrent le lien étroit entre économie et société. Mais chacun traite de la société française en utilisant ses méthodes propres ; l'historien insiste sur l'évolution et le rôle de cette bourgeoisie depuis le XVIIIe siècle, tandis que le géographe fait un tableau de la situation sociale présente ; il s'agit en quelque sorte de deux analyses, menées sur des plans différents, mais qui possèdent leurs qualités respectives.
L'Utopie réalisée : Thomas More au Mexique
Authors: Zavala Silvio 
Published: October 2008

Les Annales sont heureuses de publier ces quelques pages d'un des plus éminents historiens de l'Amérique latine, Silvio Zavala, qui prend à la vie intellectuelle de son pays une part considérable, en présidant à de nombreuses activités d'enseignement et de publication, et en dirigeant à Mexico, au Palais de Chapullepec, cet admirable Musée d'histoire mexicaine, qui n'est pas seulement un magnifique conservatoire du passé, mais un des centres vivants où s'élabore la forte personnalité d'une grande nation moderne. Silvio Zavala attire notre attention, aujourd'hui, sur une des manifestations les plus émouvantes de l'humanisme espagnol au temps de la Renaissance.Déjà par le beau livre de Marcel Bataillon, Érasme et l'Espagne, nous pouvions entrevoir la fortune en Nouvelle-Espagne de l'auteur de l'Enchiridion. Voici que Silvio Zavala nous révèle un curieux épisode de ce grand transfert de civilisation qui s'est opéré, du fait de la conquête cortésienne, dans ces terres lointaines et hier encore inconnues des Européens.
L'ouvrier français sous le second Empire
Authors: Febvre Lucien 
Published: October 2008

Il y a deux façons de s'acquitter de sa dette, s'agissant d'un livre considérable comme celui que Georges Duveau vient de consacrer à La VieOuvrière en France sous le Second Empire : ou le refaire à sa façon, en s'installant sur ses maîtresses branches comme un parasite ; ou dire d'un mot, simplement : « Voilà un livre fait de main d'ouvrier. Qu'il traite d'un très grand sujet, vous n'avez pas besoin de moi pour le savoir. Mais qu'il soit plein de talent, et de vie, et d'intérêt, je vous le dis en toute assurance. Lisez-le. » On ne m'en voudra pas d'adopter ce second parti.Je ne voudrais cependant pas qu'on en déduisît, d'avance, que ce très beau livre est un livre facile. Non. C'est un livre profond. Il est assis sur de fortes bases érudites : la bibliographie qui le précède (et qui rendra d'éminents services aux travailleurs) en témoigne.
Pour connaître le passé belge
Authors: Febvre Lucien 
Published: October 2008

Je suis en retard avec l'excellente collection Notre Passé, à quoi donne tous ses soins Mme Tassier-Charlier. Elle demeure aussi riche en bons livres que variée dans ses sujets.Une bataille, et c'est, pesée dans ses conséquences, cette Bataille desÉperons d'Or de 1302, que M. Hénri Nowe, conservateur des Archives Communales de Gand, nous raconte en essayant de ne donner, nous dit-il, ni dans les travers de Français, comme Funck-Brentano, « qui croient que des événements vieux de 600 ans peuvent ternir la renommée d'un peuple », ni dans l'exaltation de ces nationalistes flamands qui incorporent les faits historiques, de gré ou de force, dans leur mystique.Une ville : et c'est Gand, dont notre collaborateur Hans Van Werveke (qui déjà a donné à la collection un remarquable Jacques Van Artevelde) esquisse l'histoire sociale dans un petit livre d'une rare autorité : heureuse collection qui nous apporte et le livre si judicieux et si vivant de Férnand Vercauteren sur les Luttes sociales à Liège — et cette remarquable « esquisse » gantoise qu'il fallait être un maître pour oser, et réussir.