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Bioinformatic evaluation of L-arginine catabolic pathways in 24 cyanobacteria and transcriptional analysis of genes encoding enzymes of L-arginine catabolism in the cyanobacterium Synechocystis sp. PCC 6803
Authors: Schriek Sarah , Rückert Christian , Staiger Dorothee , Pistorius Elfriede K , Michel Klaus-Peter 
Published: November 2007

Abstract

Background
So far very limited knowledge exists on L-arginine catabolism in cyanobacteria, although six major L-arginine-degrading pathways have been described for prokaryotes. Thus, we have performed a bioinformatic analysis of possible L-arginine-degrading pathways in cyanobacteria. Further, we chose Synechocystis sp. PCC 6803 for a more detailed bioinformatic analysis and for validation of the bioinformatic predictions on L-arginine catabolism with a transcript analysis.

Results
We have evaluated 24 cyanobacterial genomes of freshwater or marine strains for the presence of putative L-arginine-degrading enzymes. We identified an L-arginine decarboxylase pathway in all 24 strains. In addition, cyanobacteria have one or two further pathways representing either an arginase pathway or L-arginine deiminase pathway or an L-arginine oxidase/dehydrogenase pathway. An L-arginine amidinotransferase pathway as a major L-arginine-degrading pathway is not likely but can not be entirely excluded. A rather unusual finding was that the cyanobacterial L-arginine deiminases are substantially larger than the enzymes in non-photosynthetic bacteria and that they are membrane-bound. A more detailed bioinformatic analysis of Synechocystis sp. PCC 6803 revealed that three different L-arginine-degrading pathways may in principle be functional in this cyanobacterium. These are (i) an L-arginine decarboxylase pathway, (ii) an L-arginine deiminase pathway, and (iii) an L-arginine oxidase/dehydrogenase pathway. A transcript analysis of cells grown either with nitrate or L-arginine as sole N-source and with an illumination of 50 μmol photons m-2 s-1 showed that the transcripts for the first enzyme(s) of all three pathways were present, but that the transcript levels for the L-arginine deiminase and the L-arginine oxidase/dehydrogenase were substantially higher than that of the three isoenzymes of L-arginine decarboxylase.

Conclusion
The evaluation of 24 cyanobacterial genomes revealed that five different L-arginine-degrading pathways are present in the investigated cyanobacterial species. In Synechocystis sp. PCC 6803 an L-arginine deiminase pathway and an L-arginine oxidase/dehydrogenase pathway represent the major pathways, while the L-arginine decarboxylase pathway most likely only functions in polyamine biosynthesis. The transcripts encoding the enzymes of the two major pathways were constitutively expressed with the exception of the transcript for the carbamate kinase, which was substantially up-regulated in cells grown with L-arginine.
The candidate genes TAF5L, TCF7, PDCD1 , IL6 and ICAM1 cannot be excluded from having effects in type 1 diabetes
Authors: Cooper Jason D , Smyth Deborah J , Bailey Rebecca , Payne Felicity , Downes Kate , Godfrey Lisa M , Masters Jennifer , Zeitels Lauren R , Vella Adrian , Walker Neil M , Todd John A 
Published: November 2007

Abstract

Background
As genes associated with immune-mediated diseases have an increased prior probability of being associated with other immune-mediated diseases, we tested three such genes, IL23R , IRF5 and CD40 , for an association with type 1 diabetes. In addition, we tested seven genes, TAF5L , PDCD1, TCF7, IL12B , IL6 , ICAM1 and TBX21 , with published marginal or inconsistent evidence of an association with type 1 diabetes.

Methods
We genotyped reported polymorphisms of the ten genes, nonsynonymous SNPs (nsSNPs) and, for the IL12B and IL6 regions, tag SNPs in up to 7,888 case, 8,858 control and 3,142 parent-child trio samples. In addition, we analysed data from the Wellcome Trust Case Control Consortium genome-wide association study to determine whether there was any further evidence of an association in each gene region.

Results
We found some evidence of associations between type 1 diabetes and TAF5L , PDCD1 , TCF7 and IL6 (ORs = 1.05 – 1.13; P = 0.0291 – 4.16 × 10-4). No evidence of an association was obtained for IL12B , IRF5 , IL23R, ICAM1, TBX21 and CD40 , although there was some evidence of an association (OR = 1.10; P = 0.0257) from the genome-wide association study for the ICAM1 region.

Conclusion
We failed to exclude the possibility of some effect in type 1 diabetes for TAF5L , PDCD1 , TCF7 , IL6 and ICAM1 . Additional studies, of these and other candidate genes, employing much larger sample sizes and analysis of additional polymorphisms in each gene and its flanking region will be required to ascertain their contributions to type 1 diabetes susceptibility.
A comparative study between mixed-type tumours from human salivary and canine mammary glands
Authors: Genelhu Marisa CLS , Cardoso Sérgio V , Gobbi Helenice , Cassali Geovanni D 
Published: November 2007

AbstractBackgroundIn comparative pathology, canine mammary tumours have special interest because of their similarities with human breast cancer. Mixed tumours are uncommon lesions in the human breast, but they are found most frequently in the mammary gland of the female dogs and in the human salivary glands. The aim of the study was to compare clinical, morphological and immunohistochemical features of human salivary and canine mammary gland mixed tumours, in order to evaluate the latter as an experimental model for salivary gland tumours.MethodsTen examples of each mixed tumour type (human pleomorphic adenoma and carcinomas ex-pleomorphic adenomas and canine mixed tumour and metaplastic carcinoma) were evaluated. First, clinical and morphologic aspects of benign and malignant variants were compared between the species. Then, streptavidin-biotin-peroxidase immunohistochemistry was performed to detect the expression of cytokeratins, vimentin, p63 protein, estrogen receptor, β-catenin, and E-cadherin.ResultsAfter standardization, similar age and site distributions were observed in human and canine tumours. Histological similarities were identified in the comparison of the benign lesions as well. Metaplastic carcinomas also resembled general aspects of carcinomas ex-pleomorphic adenomas in morphological evaluation. Additionally, immunohistochemical staining further presented similar antigenic expression between lesions.ConclusionThere are many similar features between human salivary and canine mammary gland mixed tumours. This observation is of great relevance for those interested in the study and management of salivary gland tumours, since canine lesions may constitute useful comparative models for their investigations.
Coordination Failure in Foreign Aid
Authors: Halonen-Akatwijuka Maija 
Published: November 2007

Abstract
We analyze allocation of foreign aid to different sectors in a recipient developing country. Donors tend to favor social sectors over other public expenditure programs. Due to incomplete information coordination failure occurs. The donors may concentrate too much on the priority sectors leaving the lower priority, yet important, sectors lacking of funds. Alternatively there may be gaps in services in the priority areas because of the information problem. We find that the more similar preferences the donors have, the more scope there is for coordination failure.
Bank Fragility and Growth Expectations
Authors: Proto Eugenio 
Published: November 2007

Abstract
Banks supply liquidity to insure individuals against possible short-term consumption shocks. The higher this level of illiquidity insurance the lower the investments in long run assets, and the higher the risk of a bank run generated by a real negative shock. If individuals are sufficiently risk averse, competitive banks trade off liquidity insurance for portfolio risk. High growth expectations, typical of emerging economies, increase the optimal liquidity supply even when this increases the risk of a bank run. On the contrary, deposit contracts offered when economic performances are very uncertain (like in less developed economies), and where output fluctuations are milder (like in developed economies), are less exposed to the risk of a bank run. In this setting, a bail-out in case of crisis is ex-ante Pareto efficient even if it always increases the risk of crisis.
The Unpleasant Effects of Price Deregulation in the European Third-Party Motor Insurance Market: A Theoretical Framework
Authors: Scalera Domenico , Zazzaro Alberto 
Published: November 2007

Abstract
In some European countries, the liberalization of the motor insurance market in the 1990s led to substantial increases in fares and claims throughout the whole decade. In this paper we argue that these phenomena are due to the impact of liberalization on companies' optimal incentives to fight fraud. By developing a circular city competition model with a cost-reducing stage prior to the price game and a settlement stage following it, we show that price deregulation entails decreasing monitoring investments and increasing claims both in the short and long run. Even equilibrium premiums may steadily increase if the ``competition effect" connected to new entries is outweighed by a ``monitoring effect" that raises marginal costs.
Strategic Use of Copyright Protection to Deter Entry
Authors: Kim Jin-Hyuk 
Published: November 2007

Abstract
Copyright protection can be used to raise entry barriers by impairing the demand. When there is a complementary market in addition to the copyrighted goods market, the incumbent prefers stronger copyright protection than is needed to maximize the sales profit in the primary market. Although strong protection can reduce demand substitution by copies, it makes it more difficult for the entrant to reach a large audience and become established. In some cases, the entrant may choose to opt out of copyright protection.
Does the Minimum Wage Cause Inefficient Rationing?
Authors: Luttmer Erzo F.P. 
Published: November 2007

Abstract
By not allowing wages to clear the labor market, the minimum wage could cause workers with low reservation wages to be rationed out while equally skilled workers with higher reservation wages are employed. This paper exploits overlapping CPS panels to more precisely identify those most affected by the minimum wage, a group I refer to as the "unskilled." I test for inefficient rationing by examining whether the reservation wages of employed unskilled workers in states where the 1990-1991 federal minimum wage increase had the largest impact rose relative to reservation wages of unskilled workers in other states. I find that proxies for reservation wages of unskilled workers in high-impact states did not rise relative to reservation wages in other states, suggesting that the increase in the minimum wage did not cause jobs to be allocated less efficiently. However, even if rationing is efficient, the minimum wage can still entail other efficiency costs (e.g., from employment reductions).
Foreign Direct Investment, Endogenous Tariffs, and Preferential Trade Agreements
Authors: Blanchard Emily J 
Published: November 2007

Abstract
This paper examines the complementarity between international trade and investment policies, and argues that preferential trade agreements may be a particularly effective means for harnessing the tariff liberalizing potential of foreign direct investment. A simple two country model demonstrates that export-platform foreign investment induces unilateral tariff liberalization by the investment-source country, suggesting that international capital mobility may substitute partially for multilateral forums such as the WTO in achieving efficient tariffs. A multi-country extension of the model in which countries can compete for foreign investors via subsidies then develops an efficiency argument in favor of discriminatory tariff allowances such as Article XXIV of the GATT or the Generalized System of Preferences. When small countries can earn preferential tariff treatment from a large trading counterpart by encouraging local export-platform investment (or by discouraging import competing investment), the equilibrium tariff level will be lower when discriminatory tariffs are possible rather than when they are not.
Effect of Focus of Attention and Age on Motor Acquisition, Retention, and Transfer: A Randomized Trial
Authors: Emanuel Michal , Jarus Tal , Bart Orit 
Published: November 2007

Background and PurposeAdult participants benefit more from external focus than internal focus when learning a new motor skill. Because learners from different age groups use different learning strategies, the purpose of this study was to investigate whether the effect of attention focus varies among children and adults.Subjects and MethodsThirty-four children and 32 adults were randomly assigned to internal or external focus-of-attention practice groups. Throwing darts toward a static target, participants performed 50 acquisition trials, 20 retention trials, and 20 transfer trials.ResultsThe results indicate that focus of attention varies between children and adults in accuracy and variability in the acquisition phase and in accuracy in the transfer phase. No interactions were found in the retention phase.Discussion and ConclusionThe findings suggest that external focus is more effective than internal focus in adults; therefore, physical therapists should instruct adult clients to focus their attention externally to facilitate motor learning. Physical therapists working with children should perhaps direct the client's attention internally; however, further study is needed.
Le bassin du Congo, notes de géographie physique
Authors: Fourmarier Paul 
Published: November 2007

Parmi les éléments les plus caractéristiques de la géographie physique du Congo, il y a lieu d'envisager : l'orientation de la côte de l'Océan, le relief continental, la disposition du réseau hydrographique.
L'examen comparatif de la carte physique et de la carte géolo gique montre une relation évidente entre ces éléments et la constitution géologique du territoire. On voit la côte s'allonger parallèlement à la bande de terrains récents située au pied Ouest des monts de Cristal ; la grande dépression centrale correspond à la cuvette tectonique formée par les terrains récents de la série permo-triasique et au grand développement des formations récentes (système de la Husira) : la ligne de faîte, entourant d'une ceinture continue la dépression centrale, correspond aux terrains anciens plus ou moins plissés et métamorphiques. a) L'orientation de la ligne de rivage de l'Atlantique est d'origine relativement ancienne ; elle est en relation avec la transgression de la mer crétacée, qui s'est faite approximativement du Sud-Ouest vers le Nord-Est dans la région voisine de l'embouchure du Congo, et avec les balancements de la mer tertiaire. Elle paraît être indépendante de l'évolution des terrains à l'intérieur du continent. h) L'orographie, en relation apparente avec la résistance relative des roches à l'érosion, trouve cependant son origine dans les déforma- tions récentes du sol; le relief du bassin du Congo, spécialement dans la bordure de la cuvette centrale, a le type rajeuni très caractéristique. Ces déformations récentes ne sont cependant que l'accentuation de mouvements plus anciens. La crête des monts de Cristal est parallèle à l'ancienne chaîne plissée antépermienne, allant du Congo occidental au Katanga. La crête surbaissée limitant au Nord la cuvette centrale est une ride parallèle à la précédente. La région montagneuse de l'Est doit son relief à l'accentuation de mouvements orthogonaux à la direction précédente et en relation avec le grand bombement subméridien de l'Afrique orientale, mais elle le doit aussi au jeu d'un réseau de fractures radiales à deux directions conjuguées principales. c) Le réseau hydrographique a une origine complexe, encore obscure pour la plupart de ses éléments. Quelques grands lacs sont en relation avec les zones d'affaissement ou d'effondrement, d'autres résultent du barrage d'une vallée. Quant au cours même du fleuve Congo et de ses affluents principaux, il donne l'impression d'un cours originel profondément modifié par les mouvements du sol, avec, selon toute vraisemblance, intervention de phénomènes de capture. Certains cours d'eau sont d'origine structurale et se sont superposés à des déformations du sol d'allure synclinale ou à des effondrements.
Le Canada dans le monde
Authors: Holmes John W. 
Published: November 2007

Fermement attachés aux principes des Nations-Unies, les Canadiens sont aujourd'hui divisés sur leur rôle à l'intérieur de l'OTAN.
Mais il y a chez eux peu de divergences en ce qui concerne l'attitude vis-à-vis des blocs et du Tiers-Monde. (On notera l'accroissement des relations avec le Japon, l'encouragement à l'immigration japonaise et l'attitude indépendante envers la Chine).
Les Canadiens cherchent avant tout à garder leur indépendance en face du géant américain. C'est une des raisons pour lesquelles ils n'ont pas adhéré à l'Organisation des Etats américains.
Le Commonwealth a aidé le Canada à asseoir son prestige international et mérite d'être sauvegardé, le temps d'aplanir les difficultés en Asie et en Afrique.
Puissance moyenne, le Canada a cherché à jouer un rôle de médiateur, mais les résultats ont été décevants. C'est pourquoi la politique étrangère du Canada est susceptible d'être modifiée dans un proche avenir.
Révolution culturelle et politique extérieure chinoises
Authors: Joyaux François 
Published: November 2007

II est certain que ce sont les problèmes de politique intérieure qui ont été à l'origine directe de la Révolution Culturelle chinoise.
Toutefois il est possible que trois séries de difficultés extérieures aient eu, également, quelque influence de ce point de vue : la rupture idéologique avec l'U.R.S.S. qui, après les dernières négociations de 1963-64, paraît irréversible ; l'escalade américaine au Vietnam depuis février 1965 et enfin les échecs de politique étrangère que connut la Chine dans le Tiers Monde tout au long de l'année 1965, en particulier en Indonésie.
Inversement, si la Révolution Culturelle a eu des effets surtout sur le plan interne, elle n'est pas sans avoir modifié également la politique extérieure chinoise.
Vis à vis de l'U.R.S.S. et de l'Europe orientale, la Révolution Culturelle a eu pour conséquence première de « bloquer » le conflit à un niveau extrêmement bas, celui des incidents diplomatiques et des attaques sans grand intérêt doctrinal. Par contre, assez paradoxalement, les rapports de la Chine et des Etats-Unis ne semblent pas plus tendus qu'ils ne l'étaient en 1965. La Révolution Culturelle est plus anti-révisionniste et donc plus anti-soviétique qu'elle n'est anti-impérialiste ou tout au moins anti-américaine.
Enfin, les relations entre la Chine et le Tiers-Monde n'ont cessé de se détériorer, en particulier avec l'Inde et l'Indonésie.
L'Internationale socialiste : structure et idéologie
Authors: Zorgbibe Charles 
Published: November 2007

Après la IIe guerre mondiale, les conférences socialistes se succèdent pour aboutir, en 1951, à créer l'internationale socialiste, qui n'est plus qu'une tribune libre. Aux Congrès et au Conseil annuel, les partis nationaux sont représentés à égalité et non selon leurs effectifs. Les pays asiatiques n'y figurent pas : ils ont créé, en 1953, leur propre organisation.
L'Internationale de la jeunesse socialiste date de 1946 ; organisme de mission plutôt que forum, elle recrute un tiers de ses membres dans les pays du Tiers-Monde. Elle est autonome, mais travaille en collaboration avec l'Internationale socialiste.
Le Conseil de l'Internationale a vainement tenté d'étendre sa sphère de supra-nationalité.
Le général de Gaulle et la politique extérieure
Authors: Vernant Jacques 
Published: November 2007

L'action du général de Gaulle est indissociable de sa pensée politique. Elles ont pour fondement la reconnaissance du fait national.
La nation, réalité sociologique, manifeste son existence au dehors par une politique extérieure qui, par définition, doit être indépendante. Quant à son contenu, la politique extérieure est sans doute fonction des diversités historiques qui donnent à chaque Etat une physionomie qui lui est propre et des atouts particuliers. Mais elle tient compte aussi des changements intervenus dans le monde, en particulier depuis 1945. C'est par rapport à ces changements, qui ne vont pas tous dans le même sens, qu'est conçu le rôle de la France, un rôle à la mesure de ses moyens (1).
Un point de vue américain sur l'Europe
Authors: Green Andrew Wilson 
Published: November 2007

La politique des pays européens est examinée sans indulgence par l'auteur. L'Europe, dont il constate le manque d'unanimité, est-elle en mesure d'aider à la recherche d'un règlement des problèmes de la sécurité européenne ?
Selon l'auteur, la France pourrait difficilement continuer à jouer un rôle prépondérant ; l'Allemagne fédérale aurait, sans contre partie, affermi la position de l'U.R.S.S et il est à craindre qu'elle s'engage un jour dans la voie de la neutralité ; l'Italie est presque ingouvernable ; le Vatican lui-même penche à gauche. Seule la Grande-Bretagne a le même point de vue que les Etats-Unis sur la sauvegarde de l'équilibre stratégique en Europe.
L'auteur préconise pour les Etats-Unis une attitude favorable au maintien des forces américaines en Allemagne, hostile à une neutralisation, encourageant l'entrée de la Grande-Bretagne dans le Marché Commun et la création d'une force nucléaire européenne comportant la collaboration technique de l'Allemagne et de l'Italie.
Renaissance et déclin de la résistance palestinienne
Authors: Hechiche Abdelwahab 
Published: November 2007

Cette étude traite historiquement de la résistance palestinienne sous toutes ses formes jusqu'à la veille de la guerre d'octobre. Ce mouvement de résistance a connu son apogée lors de la bataille de Karameh où l'armée jordanienne avait été appuyée par les commandos palestiniens, et son plus gros échec en 1970 pendant la guerre palestino-jordanienne.
Sa stratégie révolutionnaire a provoqué les craintes des régimes arabes conservateurs, et le terrorisme a fait perdre à la cause palestinienne beaucoup de sympathies. Le peuple palestinien a cependant réussi à recueillir le soutien officiel de nombreux pays d'Afrique et d'Amérique latine.
L'auteur est partisan de la création d'un Etat palestinien sur la rive occidentale du Jourdain.
L'année 1973 dans la politique étrangère du président Pompidou
Authors: Teyssier Jean-Pierre 
Published: November 2007

II peut apparaître prématuré et ambitieux d'engager dès à présent une réflexion sur la politique extérieure de Georges Pompidou, alors que l'on ne dispose pas encore des témoignages, des documents et du recul nécessaires. Cependant, huit mois après la disparition du précédent chef de l'Etat, son action internationale peut être légitimement rappelée.
Le monde va très vite et les choses s'oublient au même rythm. Les conceptions diplomatiques de l'ancien Président de la République ne peuvent que faciliter la compréhension d'une situation internationale particulièrement complexe et grave. L'auteur, ancien collaborateur du Président Pompidou, a préféré pour cette étude se limiter à l'année 1973. Il analyse les différents aspects de l'action diplomatique de l'ancien chef de l'Etat pendant cette année troublée (rapport entre les Grands, crise de l'alliance, Europe, Proche- Orient, crise économique mondiale) et tente de répondre à la question : devant les difficultés de 1973, Georges Pompidou a-t-il cherché un certain repli de la France ou, au contraire, a-t-il assuré sa vocation et son rôle dans le monde ?