bluuebunny/crossref_metadata_2025_split huggingface dataset:
Oligonucleotide probes for DNA fingerprinting in dogs
Authors: Jung M. , Wilke K. , Geldermann H. 
Published: March 2011

SummaryTen different oligonucleotide probes were evaluated for DNA fingerprinting in dogs. Seven probes are able to detect polymorphic bands. Probes (GT)8, (GTG)5 and (GGAT)4 are most informative for individual identification. The probabilities that two individuals from different breeds have the same DNA fingerprint pattern are 1.7 × 10−7, 5.5 × 10−8 and 4.5 × 10−6, respectively. Using a combination of the three probes, paternity tests were performed with exclusion probabilities between 0.006% and 3%.ZusammenfassungOligonucleotid Sonden für DNA fingerprinting bei HundenZur Darstellung von DNA‐Fingerprints beim Hund wurden zehn verschiedene Oligonukleotid‐Sonden verglichen. Mit sieben Sonden konnten polymorphe Banden nachgewiesen werden. Die Sonden (GT)8, (GTG)5 und (GGAT)4 besaßen die größte Informativität für den Indentitätsnachweis. Die Wahrscheinlichkeit, daß zwei Individuen dieselben Fingerprint‐Muster aufweisen, liegt bei 1,7 × 10−7, 5,5 × 10−8 bzw. 4,5 × 10−6. Bei Verwendung einer Kombination der drei Sonden wurden Vaterschaftskontrollen mit Ausschlußwahrscheinlichkeiten zwischen 0,006% und 3 % erreicht.
The joint regulation of genetic gain and inbreeding under mate selection
Authors: Klieve H. M. , Kinghorn B. P. , Barwick S. A. 
Published: March 2011

SummaryStochastic simulation was used to evaluate a range of selection strategies with respect to both additive genetic response and inbreeding. Strategies involving selection on BLUP ebvs or individual phenotype, followed by random mating, were compared with mate selection strategies which used portfolio analysis to give joint consideration to genetic merit and inbreeding. An adapted Mean Of Total Absolute Deviations (MOTAD) method was used in a mate selection model to define optimal matings with regard to aggregate genetic merit and inbreeding for a base population h2 of 0.2. Compared with random mating following selection on BLUP ebvs, inbreeding levels after 10 years of selection were able to be reduced under BLUP plus mate selection from ∼.23 to as little as .11. Additive genetic gain was either little compromised or increased.The results suggest that information linking expected levels of genetic merit and inbreeding can be used to find the preferred selection strategy.ZusammenfassungGemeinsame Kontrolle von Zuchtfortschritt und Inzucht bei PartnerselektionEs wurde stochastische Simulation zur Auswertung einer Reihe von Selektionsstrategien hinsichtlich Zuchtwertzuwachs und Inzucht verwendet. Strategien mit Selektion auf der Basis von BLUP ebvs oder individuellem Phänotyp mit nachfolgender Zufallspaarung wurden mit Partnerselektionsstrategien verglichen, die Portfolioanalyse zur gemeinsamen Beachtung von Zuchtwert und Inzucht verwendeten. Eine Methode adaptierter MITTELWERTE TOTALER ABSOLUTER ABWEICHUNGEN (MOTAD) Methode wurde beim Partnerselektionsmodell zur Definition optimaler Paarungen in Hinblick auf Gesamtzuchtwert und Inzucht bei einer Populationsheritabilität von 0,2 verwendet. Verglichen mit Zufallspaarung nach Selektion auf BLUP ebvs waren die Inzuchtgrade nach 10 Selektionsjahren von 0,23 auf 0,11 reduziert und additiver Zuchtfortschritt war dabei wenig beeinträchtigt oder nahm sogar zu. Die Ergebnisse weisen darauf hin, daß Information, die Zuchtwert und Inzucht verbindet, zur Identifikation erwünschter Selektionsstrategien führen kann.
Optimum bias in selection index parameters estimated with uncertainty
Authors: Amer P. R. , Hofer A. 
Published: March 2011

SummaryIn the derivation of selection index weights it is typically assumed that population and economic parameters are known with certainty. In practice, however, estimates of selection index parameters must be used instead of the true parameters. It is shown that when errors in parameter estimates have asymmetrical effects on the efficiency of a selection index, the expected response from selection can be increased by biasing parameter estimates. In this way, the probability of making errors which result in large reductions in efficiency is reduced. A method of deriving optimum (biased) selection index weights when there is uncertainty in parameters is described. The method incorporates the error probability distributions of parameters estimated with uncertainty. In some examples, moderate (2–5%) increases in the expected response from selection occurred with uncertain heritability and economic weight estimates. Overall however, increases in selection response vary depending on the true index and are usually small (0 to .5 %) unless parameter estimates are extremely uncertain. Failure to account for uncertainty in unbiased parameters leads to over estimation of the value of selection. Applications of the method for both practical and theoretical purposes are discussed with specific reference to animal improvement programs.ZusammenfassungOptimale Verzerrung von ungenau geschätzten Selektionsindex‐ParameternBei der Ableitung von Selektionsindex‐Gewichten wird üblicherweise angenommen, daß die Populationsparameter und wirtschaftlichen Gewichte genau bekannt sind. In der praktischen Anwendung müssen jedoch Schätzwerte anstelle der wahren Parameter verwendet werden. Über‐ und Unterschätzungen der Parameter zeigen asymmetrische Effekte auf die Effizienz von Selektionsindices. Es wird gezeigt, daß der erwartete Selektionserfolg gesteigert werden kann, wenn verzerrte Parameterschätzwerte verwendet werden. Dabei wird die Wahrscheinlichkeit von Fehlern, welche zu großen Effizienzverlusten führen, verringert. Es wird eine Methode zur Ableitung der optimalen (verzerrten) Selektionsindex‐Parameter beschrieben. Die Methode berücksichtigt die Verteilung der Schätzfehler. In einigen Beispielen von ungenau geschätzten Heritabilitäten und wirtschaftlichen Gewichten wurden bescheidene (2 bis 5%) Steigerungen des erwarteten Selektionserfolges gefunden. Im allgemeinen waren die erwarteten Effizienzsteigerungen jedoch klein (0 bis 0,5%), außer bei Parametern mit extrem großen Schätzfehlern. Werden die Schätzfehler der im Selektionsindex verwendeten Parameter nicht berücksichtigt, wird der erwartete Selektionsfortschritt überschätzt. Praktische und theoretische Anwendungsmöglichkeiten werden diskutiert.
Calculation of prediction error variances using sparse matrix methods
Authors: Thompson R. , Wray N. R. , Crump R. E. 
Published: March 2011

SummaryThe use of exact and approximate algorithms to calculate prediction error variances using sparse matrix methods are demonstrated for an individual animal effect including maternal effects. One exact algorithm is substantially faster than two others. An approximation of the best exact method gave an acceptable level of reliabilities and reduced the computation by a factor of approximately fifty compared with the exact computation and is routine in national beef evaluation in Britain.
Comparison of two models for estimation of variance components in a sample of Spanish Holstein Friesians
Authors: Gutiérrez J. P. , Cañon J. , Rico M. 
Published: March 2011

SummaryTwo models for estimating genetic parameters in animal populations were compared. The cheapest, in terms of computing costs, was based on a sire model and the most expensive on an animal model. In order to check the accuracy of both methods they were applied to the best available sample of Spanish Friesian cattle.Milk production of each cow, as well as fat contents were simulated using prior estimates of genetic additive, permanent environment and residual variances, keeping the actual mating scheme, so that the simulation mimicked the actual population structure.Results, under the above premises, show no advantages of the more costly procedure over the cheaper one, suggesting that a sire model based estimating procedure for genetic parameters may be preferred when a small number of individuals, little pedigree information and highly disequilibrated distribution of effects characterize the data.ZusammenfassungVergleich zweier Methoden der Varianzkomponentenschätzung beim Spanischen HolsteinZwei Modelle zur Schätzung von genetischen Parametern wurden verglichen. Das im Hinblick auf die Rechenleistung günstigere Modell war ein Vatermodell, das aufwendigere Modell ein Tiermodell. Um die Genauigkeit der Modelle in der Praxis zu prüfen, wurden sie auf verfügbares Material der spanischen Holstein‐Friesian Population angewendet.Sowohl die Milchleistung jeder Kuh als auch der Fettgehalt wurden simuliert mit Hilfe von Schät‐ zwerten der additiv‐genetischen Varianz, der permanenten und der residuellen Umweltvarianz. Dabei wurde das tatsächliche Ungleichgewicht in der Population berücksichtigt.Unter den obengenannten Voraussetzungen zeigen die Ergebnisse keinen Vorteil der rechnerisch aufwendigeren Prozedur gegenäber der einfacheren. Die Schlußfolgerung lautet, daß das Vatermodell unter den Bedingungen der kleinen Tierzahlen, wenig Pedigree‐Informationen und einer stark unbalan‐ cierten Verteilung der Tiere auf die einzelnen Effektklassen zu bevorzugen ist.
Utilizing the accuracy of estimated breeding values to improve selection response
Authors: Macbeth G. M. 
Published: March 2011

SummaryStochastic simulation was used to evaluate the increase in selection response by incorporating accuracies of estimated breeding values (ebvs) in an index to form indexed breeding values (ibvs). Simulations were made using a standard population with a selected proportion of 5%, with 10 000 selection candidates and an average accuracy of breeding value determination, r̄ = 0.4 with variance, σr2 = 0.0752. In the standard population, candidates selected on ibvs showed an 8.4 % increase in average true breeding values (tbvs) compared to selection using ebvs. Using the same standard population, but changing the proportion selected to 1.0 % and 10 %, the relative increase in the average tbvs from ibv selection was 13.5 % and 5.5 % respectively. Similarly, changing r̄ to 0.22, 0.32 and 0.55, the relative increase from ibv selection was 48 %, 19 % and 1.3 % respectively. As σr was changed to 0.025 and 0.125, the relative increase from ibv selection was 0.6 % and 24 % respectively. In general, the average accuracy in candidates chosen for selection using ibvs was lower than that from selection using ebvs. In the standard population the accuracy was 0.38 from ibv selection and 0.43 from ebv selection. As a result the increase in inbreeding will be lower with ibv than with ebv selection.ZusammenfassungVerwendung von Genauigkeiten geschätzter Zuchtwerte zur Verbesserung des SelektionserfolgesDurch stochastische Simulation wurde Steigerung des Selektionserfolges durch Einschluß von Genauigkeiten geschätzter Zuchtwerte (ebvs) in einen Index indizierter Zuchtwerte (ibvs) untersucht. Simulationen wurden mit einer Standardpopulation 5% selektierter von 10 000 Kandidaten und einer durchschnittlichen Genauigkeit der Zuchtwertschätzung r = 0.4; σr2 = 0.0752 durchgeführt. In der Standardpopulation hatten Kandidaten, mit ibvs selektiert, eine Steigerung des durchschnittlichen wahren Zuchtwertes (tbvs) von 8.4 % verglichen mit Selektion auf ebvs‐Basis. Bei Verwendung derselben Standardpopulation, aber Remontierung von 1 % bzw. 10 %, war der relative Zuwachs im durchschnittlichen tbvs bei ibvs‐Selektion 13.5 und 5.5%. Die relative Zunahme von der ibvs‐Selektion, mit r von 0.22, 0.32 oder 0.55, war 48 %, 19 % und 1.3 %. Bei Veränderungen von σr auf 0.25 und 0.125 betrug die relative Zunahme 0.6 und 24 %. Im allgemeinen waren die durchschnittlichen Genauigkeiten bei Selektionskandidaten auf der Basis von ibvs geringer als bei Verwendung von ebvs. In der Standardpopulation waren diese Genauigkeiten 0.38 bei ibvs und 0.43 bei ebvs. Daher sollte die Zunahme der Inzucht mit ibvs geringer sein als mit ebvs.
The distribution of potassium and sodium concentrations in the erythrocytes of some breeds of cattle
Authors: Arranz J. J. , BayóN Y. , san Primitivo F. 
Published: March 2011

SummaryThe distribution of erythrocyte potassium and sodium concentrations was studied in Sayaguesa (n = 150), Brown Swiss (n = 163) and two populations of Avileña‐Negra Ibérica cattle (n = 141 and 141 respectively).No polymorphism was detected for red‐cell cation content in any of the breeds investigated. Mean values of potassium concentrations varied between 21.42 and 24.92 mmol/l red cells, those of sodium contents ranging from 77.50–93.44 mmol/1. The cattle studied can thus be considered as belonging to the ‘low potassium’ (LK) type.Significant differences were found both in potassium and sodium concentrations between one of the populations of Avileña‐Negra Ibérica and the other groups examined. Mean values of sodium levels in Brown Swiss were also significantly different from the other groups.ZusammenfassungVerteilung von Kalium‐ und Natriumblutspiegelwerten in Erythrozyten einiger RinderrassenDie Verteilung von Kalium‐ und Natriumkonzentrationen in Erythrozyten wurde in vier Gruppen untersucht: Sayaguesa (n = 150), Braunvieh (n = 163) und zwei Gruppen von Avileña‐Negra Ibérica Rindern (n = 141). In keiner der untersuchten Gruppen wurde Polymorphismus für den Cationenspiegel gefunden. Mittelwerte für Kaliumkonzentration schwankten zwischen 21,4 und 24,9 mmol/l roter Zellen, die für Natriumgehalt zwischen 77,5 und 93,4 mmol/1. Die Rinder könnten daher als ‘niedrigere Kalium’ Type bezeichnet werden. Signifikante Unterschiede wurden sowohl für den Kalium‐als auch für der Natriumspiegel zwischen den beiden Avileña‐Negra Ibérica Gruppen gefunden. Die Mittelwerte für Natriumspiegel in Braunvieh waren ebenfalls significant unterscniedlich im Vergleich zu den anderen.ResumenDistributión del potasio y sodio eritrocitarios en algunas razas de ganado vacunoSe estudió la distribución de las concentraciones de potasio y sodio eritrocitarios en cuatro grupos de ganado vacuno: Sayaguesa (n = 150), Pardo Alpina (n = 163) y dos poblaciones de Avileña‐Negra Ibérica (n = 141 y n = 141).No se detectó polimorfismo en el contenido eritrocitario de cationes en ninguno de los grupos estudiados. Los valores medios de las concentraciones de potasio oscilaron entre 21.42 y 93.44 mmol/l de glóbulos rojos, mientras que los correspondientes al sodio oscilaron entre 77.50 y 93.44 mmol/l. Por tanto, los animates estudiados pueden considerarse como pertenecientes al tipo ‘bajo potasio’.Se encontraron diferencias significativas entre el contenido en potasio y en sodio de una de las poblaciones de Avileña‐Negra Ibérica y el resto de los grupos analizados. Además, los niveles medios de sodio eritrocitario de la raza Pardo‐Alpina presentaron diferencias significativas con los demás grupos.
Influence of growth‐hormone genotypes on breeding values of Simmental bulls
Authors: Schlee P. , Graml R. , Rottmann O. , Pirchner F. 
Published: March 2011

SummaryA leucine/valine substitution of growth hormone amino‐acid 127 was genotyped in 221 Bavarian Simmental bulls by PCR/RFLP. Gene frequencies for leucine (L) and valine (V) were 0.68 and 0.32, respectively. Breeding values for meat traits were significantly different between genotypes. The heterozygous genotype LV was superior to LL and VV in both carcass gain (p < 0.01) and meat value, an index which includes carcass gain and classification score (p < 0.05). In relation to classification score, genotype VV was significantly better (p < 0.05) than LV and VV. No effects on milk breeding values were apparent even though those of milk composition approached significance.ZusammenfassungEinfluß von Wacbstumshormon‐Genotypen auf Zuchtwerte von FleckviehbullenEin Polymorphismus der Aminosäure 127 des bovinen Wachstumshormones wurde bei 221 bayerischen Fleckviehbullen mit PCR/RFLP genotypisiert. Die Genfrequenzen für Leucin (L) und Valin (V) betrugen 0.68 und 0.32. Es bestand ein signifikanter Einfluß auf die Fleischzuchtwerte. Der heterozygote Genotyp LV war in den Merkmalen Nettozunahme (p < 0.01) und Fleischwert (p < 0.05) den Geno‐typen LL und VV signifikant überlegen. Im Merkmal Handelsklasse war Genotyp VV signifikant günstiger als LV und LL. Es konnten keine Beziehungen zu den Milchzuchtwerten beschrieben werden, allerdings grenzte der Einfluß auf Milchzusammensetzung an statistische Signifikanz.
Selection on the basis of progeny test with low‐heritability traits
Authors: Kownacki M. , Sobczyńska M. , Lipińska Z. 
Published: March 2011

SummaryMethods of selection based on progeny evaluation with that based on own performance were compared. Twelve generations of mice were selected by these methods for a low‐heritable trait, i.e. body weight at weaning (21st day of life).No significant differences were found in response to selection and cumulative selection differentials between these two methods.The realized heritabilities were 0.24 for the progeny test line but above 1 for the mass selected line. Significant differences were found between correlated responses to selection in the group of males at 42 days of age and in weight gains.Realized genetic correlations estimated for the growth traits were high in the performance test group (0.83 with 6‐week weight and 0.78 with body gains) and overestimated in the progeny test group. Results demonstrated a larger correlated response for the progeny test group relative to the performance test group.ZusammenfassungSelektion mittels Nachkommenschaftsprüfung für Merkmale geringer HeritabilitätVerglichen wurden Selektionsmethoden, die auf Eigenleistungsprüfung bzw. Nachkommenschafts prüfung beruhen. Mit diesen Prüfmethoden wurden 12 Maüsegenerationen nach dem Körpergewicht beim Absetzen (21. Lebenstag) als Merkmal geringer Heritabilität selektiert. Es wurden signifikanten Unterschiede im Selektionserfolg und bei der kumulativen Selektionsdifferenz zwischen den beiden Prüfmethoden gefunden. Die realisierten h2‐Werte lagen bei 0,24 in der Selektionslinie mit Nachkommenschaftsprüfung und über 1 in der Linie mit Eigenleistungsprüfung. Signikante Differenzen im korrelierten Selektionserfolg wurden in der Gruppe der männlichen Tiere beim 42‐Tage‐Gewicht und bei der Körperzunahme gefunden.Die für die Merkmale des Körperwachstums realisierten genetischen Korrelationen waren hoch in der Gruppe mit Eigenleistungsprüfung (0,83: 6‐Wochen‐Gewicht; 0,78: Körperzunahme) und waren überschätzt in der Gruppe mit Eigenleistungsprüfung. Die Ergebnisse zeigen einen höheren korrelierten Erfolg für die Gruppe mit Nachkommenschaftsprüfung.
Investigations into traditionally managed Djallonké‐sheep production in the humid and subhumid zones of Asante, Ghana
Authors: London J. C. , Weniger J. H. 
Published: March 2011

SummaryThis studies presented in this paper were undertaken on 42 households units in two ecological zones of four farming villages located in the heart of the Kumawu Traditional Area (KTA) in Asante. The traditional area is the largest (9256 km2) of the 21 traditional areas or paramouncies comprising the Asante Region (24 390 km2), one of the ten regions of Ghana. The headquarters are in the township of Kumawu, which is located 56 km north‐east of Kumase, the capital of the Asante Region. A brief discription of physical conditions, the land tenure system and the current agricultural resources of the area are given. Detailed descriptions of the physical characteristics of sheep type, ownership pattern and management practices, as well as flock structure, are discussed. The availability of fodder plants and their seasonal cover are outlined. In all, the studies covered 700 dams with almost 1500 lambings over a period of 30 months.ZusammenfassungUntersuchungen über traditionelle Schafproduktion in der Humiden und Sub‐humiden Asanter Region Ghanas. I. Natürliche Standortbedingungen und Resourcenausstattung im UntersuchungsgebietDie Untersuschungen wurden in zwei unterschiedlichen agro‐ökologischen Zonen in 42 kleinbäuerlichen Haushalten von 4 Dörfern durchegeführt. Es handelt sich um das Kumawu‐Gebiet (9256 km2) der Asanteregion (24 390 km2) 60 km nördostlich von Kumase, der Hauptstadt der Asante mit traditionell sehr starker Schafhaltung.In der 1. Mitteilung wird eine detaillierte Beschreibung der natürlichen Standortfaktoren, Landeigentumsverhältnisse und landwirtschaftlichen Resourcenaussttatung gegeben. In einer Untersuchung über 30 Monate an 700 Mutterschafen mit ca. 1500 Geburten werden zunächst Schafrassen, Management und Eigentumsverhältnisse sowie Herdenstrukturen analysiert.RésuméAnalyse de la production ovine traditionnelle (Djallonké) dans la région humide et sub‐humide d'Asante du Ghana. I. Conditions naturelles du milieu et disponibilité de ressources dans la région d'enquêteLes enquêtes ont été effectuées dans deux zones agro‐écologiques différentes, soit dans 42 petites exploitations agricoles faisant partie de quatre villages. Il s'agit du territoire traditionnel de Kumawu, territoire le plus vaste (9256 km2) dans la région d'Asante (24 390 km2), à 56 km nord‐est de Kumase, la capitale d'Asante, òu on se dédie traditionnellement à l'élevage intensif des ovins.L'article donne une brève description des facteurs naturels du milieu, de la structure agraire et des ressources agricoles de la région. L'enquête, effectuée pendant 30 mois, sur 700 brébis et à peu près 1500 parturitions s'est dédié d'abord à l'analyse des races bovines, aux pratiques de gestion, aux structures de propriété et celles des troupeaux bovins. Les enquêtes suivantes ont étudié les techniques de production, la reproduction, la commercialisation et les aspects économiques en tant que base d'une intensification de la production.
Comparison of prediction methodology for binary traits through Monte‐Carlo simulation
Authors: Oikawa T. , Sato K. 
Published: March 2011

SummaryThe purpose of this study was to evaluate simple alternatives to threshold models within the framework of a mixed‐model procedure. Four models—linear model, threshold model, normit‐transformation and pseudo‐linear model—were compared by Monte‐Carlo computer simulation. The normit‐transformation model was based on simple normit transformation within a subclass while taking into account binomial error. The simulation experiments were carried out with combinations of five subclass sizes (5, 15, 25, 35, 45), five heritabilities (0.05, 0.15, 0.25, 0.35, 0.45) and 100 replications for each experiment. The loss of accuracy in the prediction models based on binary response was greater than that in the linear model based on continuous records. The accuracy of the threshold model was superior to that of the normit‐transformation model and the pseudo‐linear model in all the experiments. But the difference in accuracy between the threshold model and the pseudo‐linear model was small when the heritability was low and the subclass size was small, while the difference in accuracy between the threshold and the normit transformation was small when the subclass size was large.ZusammenfassungVergleich von Michmodell‐Voraussagen mittels Monte‐Carlo SimulationDie Absicht dieser Untersuchung war die Bewertung einfacher Alternativen für Schwellenwert‐Modelle im Rahmen von Mischmodell Methoden. Folgende vier Modelle wurden untersucht: Lineares, Schwellenwert, Normittransformation und pseudo‐lineares Modell wurden mittels Monte‐Carlo Computersimulation verglichen. Das Normittransformationsmodell beruhte auf einfachen Normittransformation innerhalb einer Unterklasse unter Berücksichtigung des binomialen Fehlers. Die Simulationsexperimente wurden mit fünf Unterklassen‐Größen (5, 15, 25, 35, 45), fünf Heritabilitäten (0,05, 0,15, 0,25, 0,35, 0,45) und 100 Wiederholungen für jeden Versuch durchgeführt. Der Genauigkeitsverlust in den Modellen für binäre Ergebnisse war größer als in linearen Modellen mit kontinuierlichen Daten. Die Genauigkeit des Schwellenwert‐Modells war der Normittransformation und dem pseudo‐linearen Modell in alien Untersuchungen überlegen. Bei geringem h2 und kleinen Unterklassen war die Genauigkeitsdifferenz zwischen Schwellenwert‐ und pseudolinearem Modell klein, ebenso wie die zwischen ersterem und Normittransformation bei großen Unterklassen.