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Air Quality in Riga and Its Improvement Options
Authors: Kleperis Janis , Bajars Gunars , Bremere Ingrida , Menniks Martins , Viksna Arturs , Osite Agnese , Pavlicuks Dmitrijs 
Published: February 2012

Air Quality in Riga and Its Improvement Options
Air quality in the city of Riga is evaluated from direct monitoring results and from accounting registered air pollutants in the city. It is concluded that from all air polluting substances listed in the European Commission directives, only nitrogen dioxide NO2 and particulate matter PM10 exceed the limits. In assessing the projected measures to improve air quality in Riga, it can be concluded that the implementation of cleaner fuels and improvements in energy efficiency of household and industrial sectors will decrease particle pollution, but measures in the transport sector will also contribute to reducing air pollution from nitrogen oxides.
Trace and Major Elements in Food Articles in Latvia: Root Vegetables
Authors: Vincevica-Gaile Zane , Klavins Maris , Rudovica Vita , Viksna Arturs 
Published: February 2012

Trace and Major Elements in Food Articles in Latvia: Root Vegetables
It is known that the content of trace and major elements in plants is dependent on several factors, such as type of species, soil properties, climate conditions, agricultural and agrichemical factors, pollution. The aim of the study was to quantify element content of root vegetables grown in farmlands and allotment gardens in Latvia. Samples of onion bulbs and carrot roots were analyzed by atomic absorption spectrometry and inductively coupled plasma mass spectrometry. Quantitative amounts of 17 trace elements (Ag, As, Ba, Cd, Ce, Co, Cr, Cu, La, Mn, Ni, Pb, Rb, Se, Sr, V, Zn) and 5 major elements (Ca, Fe, K, Mg, Na) were determined. It was detected that carrot roots contained higher amounts of several elements than onion bulbs. Differences in element content of vegetables were also detected between the subgroups of samples grown in farmlands versus samples grown in allotment gardens. Data revealed that onions grown in farmlands were more affected by contaminants.
Targeted enrichment strategies for next‐generation plant biology
Authors: Cronn Richard , Knaus Brian J. , Liston Aaron , Maughan Peter J. , Parks Matthew , Syring John V. , Udall Joshua 
Published: February 2012

• Premise of the study: The dramatic advances offered by modern DNA sequencers continue to redefine the limits of what can be accomplished in comparative plant biology. Even with recent achievements, however, plant genomes present obstacles that can make it difficult to execute large‐scale population and phylogenetic studies on next‐generation sequencing platforms. Factors like large genome size, extensive variation in the proportion of organellar DNA in total DNA, polyploidy, and gene number/redundancy contribute to these challenges, and they demand flexible targeted enrichment strategies to achieve the desired goals.• Methods: In this article, we summarize the many available targeted enrichment strategies that can be used to target partial‐to‐complete organellar genomes, as well as known and anonymous nuclear targets. These methods fall under four categories: PCR‐based enrichment, hybridization‐based enrichment, restriction enzyme‐based enrichment, and enrichment of expressed gene sequences.• Key results: Examples of plant‐specific applications exist for nearly all methods described. While some methods are well established (e.g., transcriptome sequencing), other promising methods are in their infancy (hybridization enrichment). A direct comparison of methods shows that PCR‐based enrichment may be a reasonable strategy for accessing small genomic targets (e.g., ≤50 kbp), but that hybridization and transcriptome sequencing scale more efficiently if larger targets are desired.• Conclusions: While the benefits of targeted sequencing are greatest in plants with large genomes, nearly all comparative projects can benefit from the improved throughput offered by targeted multiplex DNA sequencing, particularly as the amount of data produced from a single instrument approaches a trillion bases per run.
Un interprète en quête d'origine
Authors: Garon Josette 
Published: February 2012

Résumé Dans la foulée de la table ronde qu’elle a organisée sur ce sujet (avec la participation de F. Conrotto, C. Lechartier-Atlan et J.-C. Stoloff), l’auteur développe le thème de la quête de l’origine, de la construction de l’originaire. Confronté au vertige et à l’angoisse suscités par le point de fuite à l’infini de la question des commencements, l’enfant construit son propre fantasme organisateur fondamental, l’analyste sa propre représentation, théorie, mythe ou fantasme fondateur. Freud et Ferenczi ont entrepris cette quête, chacun de leur côté mais, tout un temps, en étroite correspondance : le ur de Freud, le ur-ur de Ferenczi. Nombreux sont les modèles et théories qui leur succéderont, à l’exemple de la théorie de l’originaire de Piera Aulagnier. Un exemple clinique illustre comment la rencontre analytique peut ouvrir sur la perspective d’un avenir qui échappe à un « destin » dicté par la contrainte de répétition.
Sur le maternel et la sexualité
Authors: Brusset Bernard 
Published: February 2012

Résumé L’hybridation de la psychologie du développement et de la métapsychologie a contribué à la désexualisation radicale du maternel devenue une valeur idéalisée et sacralisée. La sexualité de la mère a fait retour dans la théorie avec « la censure de l’amante » selon M. Fain et D. Braunschweig. Mais, selon eux, la femme et la mère sont irréconciliables, entraînant, chez la mère, une métamorphose en double personnalité. Il y a cependant d’autres façons de concevoir les rapports du maternel et de la sublimation par exemple avec H. Troisier ou avec la notion de « reliance » proposée par J. Kristeva. Un commentaire en est proposé en relation avec son œuvre.
Noces de sang
Authors: Jozef Perelberg Rosine 
Published: February 2012

Résumé Dans ce texte, l’auteur évoque des cures de femmes par des femmes où une effrayante imago maternelle se fait présente, parfois trop rapidement, depuis le début de la cure. Ces analyses peuvent parfois laisser à l’analyste le sentiment d’être jeté dans une « tempête parfaite » où les chances de survie sont limitées. Les vagues puissantes et incontrôlables semblent venir à la fois des imagos paternelle et maternelle dans le transfert ; il n’y a aucun abri. Liliane Abensour nous rappelle que l’archaïque ne s’inscrit pas nécessairement dans une antériorité, mais plutôt dans une opacité. Dans cet article, l’auteur analysera deux exemples de cas cliniques qui illustreront comment les expériences infantiles, préalablement irreprésentables et terrifiantes, acquièrent une représentation dans l’après coup du processus analytique.
Mère passionnément
Authors: Yi Mi-Kyung 
Published: February 2012

Résumé À en croire Winnicott, le début de la vie du petit d’homme est silencieux, pour peu qu’il soit porté par la « préoccupation maternelle primaire ». Seules les défaillances font du bruit. Or, l’examen du processus identificatoire constitutif du monde maternel offrant ne met-il pas en lumière une dimension passionnelle toute chargée de rumeurs de l’infantile ? À partir d’un fragment de l’analyse d’une patiente, l’auteur s’attache à rendre audible l’ infans en retour au sein de la « mère suffisamment bonne ». « Je m’étais perdu à moi-même, tu es venu me donner de mes nouvelles », lit-on dans L’amour fou d’André Breton. Et il n’est pas rare que les nouvelles soient retentissantes...
L'arrière-pays
Authors: Denis Anne 
Published: February 2012

Résumé La trace anobjectale du maternel constitue la toile de fond de la psyché qui sert de fondement à diverses fonctions telles que : la négation antéprédicative, source du jugement ultérieur ; le sentiment océanique, source de la croyance ; et le rythme, source de la temporalité et de l’autoreprésentation. Tous ces éléments sont en relation avec la qualité de la satisfaction, dépendante elle-même de la sexualité biparentale qui apporte les sublimations nécessaires à la construction de la psyché. Le mystique de la méthode et la spiritualité maternelle-féminine sont présentés à titre d’hypothèses heuristiques issues du Congrès.
Le sauveur
Authors: Selz Monique 
Published: February 2012

Résumé Quand les valeurs véhiculées par la religion sont bafouées par ceux-là mêmes qui sont en position de les transmettre, annulant ainsi leur potentielle fonction de tiers, l’intrication du maternel dans le religieux rend la séparation du maternel particulièrement difficile. La cure de David témoigne de ce cheminement avec toutes les impasses potentielles rencontrées sur le parcours. Le « renoncement à l’action spécifique » peut résumer cette opération de dégagement que permet l’analyse.
Fondements maternels ou matériels de la vie psychique : quelques réflexions sur le rapport de C. Anzieu-Premmereur
Authors: Chauvet Évelyne 
Published: February 2012

Résumé Questionnements sur plusieurs points qui se dégagent du rapport de Christine Anzieu-Premmereur sur sa conception de la capacité maternelle, de ses fonctions pare-excitantes, sur le statut de l’enfant « maternant », sur la transitionnalité à construire opposable à la fétichisation défensive, et sur la valeur économique et dynamique des défenses antitraumatiques. Articulations avec le transfert et le travail de contre-transfert dans les problématiques où le « maternel » est en question.
Quand l'analyste devient mère...
Authors: Maurice Claire 
Published: February 2012

Résumé Lorsque L’analyste tombe enceinte, c’est une situation inédite qui a lieu au sein de la cure analytique au risque d’une réduction « périlleuse » de l’écart sujet-fonction. L’analyste femme se dévoile ainsi dans son intimité, précipitant des mouvements transféro-contre-transférentiels complexes à analyser. Mais n’est-ce pas dans cette situation particulière que peut se rencontrer, de façon inédite, la question du « maternel » qui inscrit, dès lors, l’histoire de la cure au sein d’une rencontre avec un objet maternel singulier ?
Sur les « limitations » de la méthode freudienne
Authors: Botella César 
Published: February 2012

Résumé À partir de 1910, le transfert cesse d’être considéré par Freud comme gênant pour la libre association et devient l’instrument principal pour les analyses des psycho-névroses œdipiennes. La méthode se transforme en « entonnoir mémoriel » sélectionnant les souvenirs transférentiels. L’auteur propose l’élargissement de la méthode où l’attention flottante se faisant « régrédiente », « travail en double » et « pensée de géomètre », accède à la « mémoire sans souvenirs », aux « négatifs de traumas », aux cures des patients limites.
La Hongrie entre tutelle soviétique et intérêt national au cours des années 1960
Authors: Macher Aniko 
Published: February 2012

Résumé Liée à l’Union soviétique sur les plans politique, militaire, économique et idéologique, la Hongrie est associée à la première révolution antitotalitaire et nationale de la Guerre froide. Alliée loyale de l’Union soviétique pendant l’ère de János Kádár, elle a de l’ambition sur la scène internationale. Pendant les années 1960, la Hongrie s’intéresse de près à la coopération régionale en Europe centrale. Finalement instrumentalisé par les Soviétiques, ce concept géopolitique présente un cadre possible pour la diplomatie hongroise en vue de se rapprocher des minorités hongroises vivant au-delà de ses frontières. Malgré la rhétorique « internationaliste », la prise de conscience de la situation difficile des Hongrois face à l’assimilation forcée dans certains pays voisins est alors une réalité en Hongrie. Critiquée même à Budapest, cette prise de conscience resta au niveau des études ou d’actions diplomatiques isolées pour favoriser l’unité de la nation hongroise, au-delà des frontières, par le biais des liens culturels.
Bucarest-Moscou : le ferment nationaliste des dissensions bilatérales (1964)
Authors: Gridan Irina 
Published: February 2012

Résumé Après avoir pris leurs distances avec la diplomatie de bloc économique, en 1962-1963, les dirigeants roumains recherchent des marges de manœuvre politiques à l’égard de l’urss. Le conflit sino-soviétique leur fournit matière à théoriser leur neutralité, à travers la Déclaration d’indépendance du 22 avril 1964. L’objectif de cet article est de montrer comment les Soviétiques ont réagi aux revendications roumaines, d’autant qu’elles ont été accompagnées d’une campagne de mobilisation populaire antisoviétique. La riposte se situe sur le même terrain, celui du nationalisme, notamment à travers des pressions territoriales concernant la Transylvanie et la Bessarabie exercées au cours des pourparlers roumano-soviétiques de Moscou de juillet 1964. À partir d’archives nouvellement accessibles, il s’agit d’analyser ce moment crucial pour la quête roumaine d’autonomie dans sa politique extérieure.
Structure and Function of Cytochrome P450 Enzymes
Authors: Ortiz de Montellano Paul R. 
Published: February 2012

AbstractThis chapter summarizes the distribution and function of the human cytochrome P450 enzymes, including their relative abundance and polymorphisms, general spectroscopic properties, and structures. The universal catalytic cycle of cytochrome P450 enzymes, including the requisite electron‐donor partners, is also described.
Transcriptional Regulation of Cytochrome P450 Genes
Authors: Fraser Emily A. , Henderson Colin J. , Wolf C. Roland 
Published: February 2012

AbstractThe discovery and characterization of nuclear receptors, such as the aryl hydrocarbon receptor (AHR), constitutive androstane receptor (CAR), and pregnane X receptor (PXR), and their involvement in the transcriptional regulation of cytochrome P450s have greatly increased our understanding of this process while providing a mechanistic basis for additional levels of control. This chapter details the role of AHR, CAR, and PXR in controlling cytochrome P450 expression, including cross talk between the receptors, the different classes of ligands bound by the receptors and the responses that they elicit, polymorphisms and splice variants of CAR and PXR, and species specificity in the context of CAR and PXR. Each of these factors and the interplay between them contribute to the growing layers of complexity that are being uncovered with regard to the transcriptional regulation of cytochrome P450 genes. The potential contributions of humanized transgenic models to this field are also discussed.
Carboxylesterases
Authors: Yan Bingfang 
Published: February 2012

AbstractCarboxylesterases (CESs, E.C.3.1.1.1) constitute a large class of enzymes that hydrolyze chemicals containing such a functional group as a carboxylic acid ester, amide, and thioester. These enzymes are major pharmacokinetic determinants of ester/amide drugs and detoxify against organophosphorus and pyrethroid insecticides. In addition, these enzymes hydrolyze endogenous lipids and involve the assembling of lipoproteins. CESs exhibit overlapping substrate specificity; however, many drugs are hydrolyzed predominately by a single CES. Although there are exceptions, the relative sizes between the alcohol and acyl (acid) moieties of an ester contribute significantly to the isoform‐specific hydrolysis. CES activity is widely distributed in mammalian tissues, with the highest level in liver microsomes. High abundance of CESs in the liver is linked to certain cellular roles, notably in directing protein trafficking. CESs belong to the superfamily of α/β fold proteins and have similar crystal structure to other enzymes in this superfamily. CESs use a two‐step mechanism for catalysis. Hydrolysis of carboxylic acid esters leads to the formation of an alcohol and a carboxylic acid. Compounds with these moieties are substrates for conjugation enzymes or transporters. Likewise, hydrolysis may create or eliminate a substrate of other phase I enzymes, particularly cytochrome P450s. Like many other drug‐metabolizing enzymes, the expression of CESs is regulated by many factors including age, hormones, therapeutic agents, and environmental chemicals. Mammalian species express multiple forms of CESs. However, there are notable differences in substrate specificity, tissue distribution, and regulated expression.
Functional Genomics of the Human Glutathione Transferases
Authors: Board Philip G. 
Published: February 2012

AbstractThe glutathione transferase (GST) super family of enzymes catalyze the conjugation of glutathione (GSH) to a wide range of exogenous and endogenous compounds. In addition to catalytic reactions, the GSTs also modulate several cell signaling kinases and ion channels such as Jun N‐terminal kinase and ryanodine receptors via protein /protein interactions. Pharmacogenetic studies have identified variations in drug response and susceptibility to cancer and other disorders associated with variant GST isoforms. In humans, the cytosolic GSTs have been subdivided into seven distinct classes termedAlpha, Mu, Pi, Theta, Sigma, Zeta, andOmegaand there are multiple genes in some classes. So far, 48 allelic variants that cause amino acid substitutions have been documented, and in many cases, the variant proteins have been functionally and structurally characterized. Some polymorphisms in promoter regions have been shown to affect the level of GST expressionin vitroandin vivo, and this area requires further investigation. Although the various members of the GST superfamily are characterized by striking differences in the reactions they catalyze and their substrate specificities, they share a similar structural fold. Representative structures of all the human GST classes have been determined by X‐ray crystallography.
ADMEProfiling in Drug Discovery and Development: An Overview
Authors: Bohnert Tonika , Prakash Chandra 
Published: February 2012

AbstractThe applications of parallel synthesis and combinatory chemistry to expedite lead finding and lead optimization processes have shifted the chemical libraries toward poorer biopharmaceutical, ADME (absorption, distribution, metabolism, and excretion), and pharmacokinetic (PK) properties. A drug candidate should have desirable biopharmaceutical properties such as good solubility and good permeability, as well as optimal and ADME/PK properties. The early knowledge of liability of biopharmaceutical, ADME/PK, and DDI properties is very valuable in drug candidate selection process. In the last one decade, multiplein silico, in vitro,andin vivoADME studies have been developed and implemented in the drug discovery and development process to alert chemists and drug metabolism scientists of the potential ADME, PK and DDI issues in the clinic. In this chapter, we attempt to discuss these various ADME profiling approaches in drug discovery and development process and the latest technologies of the selected assays.
Drug Metabolism in Drug Safety Evaluation
Authors: Baillie Thomas A. 
Published: February 2012

AbstractOver the past two decades, drug metabolism has become an indispensible component of both research and development activities in the pharmaceutical industry, where it has played an increasingly important role in support of the safety assessment of new chemical entities (NCEs). In response to recent regulatory guidance on the safety evaluation of metabolites of candidate drugs in humans, novel approaches have been adopted to define the identities and levels of circulating metabolites in the plasma of both human subjects and the animal species employed in safety assessment programs. Considering the factors that need to be taken into account in assessing the safety of metabolites of NCEs, biotransformation products can be classified into two categories on the basis of their chemical reactivity: namely, “stable” and “chemically reactive.” In this chapter, the different experimental approaches employed to study these two groups are outlined, and the implications of the findings for lead optimization efforts in drug discovery, and for later phase clinical development programs, are discussed in the context of establishing the human safety of the NCE.
In VitroToxicity Screening in Early Drug Discovery: Importance of Metabolism and Reactive Metabolites
Authors: MKim James M. 
Published: February 2012

AbstractIn recent years, pharmaceutical companies have focused on understanding the potential liabilities associated with new chemical entities while they are optimizing standard drug like properties. When this tandem approach to drug development is applied, the result is the selection of a candidate for preclinical safety testing, which has a much higher probability of success. Bioavailability and metabolism are important determinants of drug like properties and toxicity. Absorption from the gut following the oral administration of a drug is important and is controlled by several factors. Metabolism in enterocytes and liver can profoundly affect both efficacy and toxicity. Data obtained fromin vitrosystems for determining gut absorption, metabolism, metabolic activation, activation or inhibition of molecular signaling pathways of toxicity, and biochemical function can be used to predictin vivoadverse events with a high degree of accuracy. The application ofin vitroscreening methods can also identify risk profiles that can help identify low incidence adverse events in humans that would result in the withdrawal of promising new drugs. By identifying and characterizing compound liabilities (hazard), it is possible to perform risk assessment analysis before moving a new drug candidate into preclinical safety testing, which will reduce late‐stage attrition.
The Application of Preclinical Toxicogenomics for Predicting and Understanding Drug‐Induced Toxicity and Metabolism
Authors: Fielden Mark , Karbowski Christine 
Published: February 2012

AbstractThe pharmaceutical industry is challenged by high rates of attrition during development because of preclinical and clinical toxicities that are not adequately predicted using current preclinical testing paradigms. Large‐scale gene expression profiling technologies, such as toxicogenomics, are being applied preclinically during drug discovery and lead optimization to diagnose and predict drug‐induced effects. When used together with classical pharmacokinetic parameters, toxicogenomics can provide an understanding of the pathways (phases I and II) of drug metabolism induced by drug treatment. This chapter focuses on the application of toxicogenomics in drug discovery for the prediction and mechanistic understanding of drug‐induced toxicity, as well as understanding mechanisms of drug metabolism for small‐molecule therapeutics.
Genetics of Drug Disposition
Authors: Bhathena Anahita , Katz David A. 
Published: February 2012

AbstractDrug disposition, a complex process culminating from the interplay of numerous drug–metabolizing enzymes, drug transport proteins, serum‐binding proteins, and transcription factors, is affected by multiple environmental and endogenous factors. Genetic variations in drug–metabolizing enzymes and drug transport proteins contribute toward variability in drug disposition. Our knowledge of these functional genetic variants and the tools to interrogate them are well developed. These tools have found use in drug development within the pharmaceutical industry, and for limited applications, making clinical treatment decisions. This chapter discusses the genetic variations in drug–metabolizing enzymes and transporters and their relevance for clinical pharmacokinetics.