bluuebunny/crossref_metadata_2025_split huggingface dataset:
Caveolin-1 influences human influenza A virus (H1N1) multiplication in cell culture
Authors: Sun Lijing , Hemgård Gun-Viol , Susanto Sony A , Wirth Manfred 
Published: May 2010

Abstract

Background
The threat of recurring influenza pandemics caused by new viral strains and the occurrence of escape mutants necessitate the search for potent therapeutic targets. The dependence of viruses on cellular factors provides a weak-spot in the viral multiplication strategy and a means to interfere with viral multiplication.

Results
Using a motif-based search strategy for antiviral targets we identified caveolin-1 (Cav-1) as a putative cellular interaction partner of human influenza A viruses, including the pandemic influenza A virus (H1N1) strains of swine origin circulating from spring 2009 on. The influence of Cav-1 on human influenza A/PR/8/34 (H1N1) virus replication was determined in inhibition and competition experiments. RNAi-mediated Cav-1 knock-down as well as transfection of a dominant-negative Cav-1 mutant results in a decrease in virus titre in infected Madin-Darby canine kidney cells (MDCK), a cell line commonly used in basic influenza research as well as in virus vaccine production. To understand the molecular basis of the phenomenon we focussed on the putative caveolin-1 binding domain (CBD) located in the lumenal, juxtamembranal portion of the M2 matrix protein which has been identified in the motif-based search. Pull-down assays and co-immunoprecipitation experiments showed that caveolin-1 binds to M2. The data suggest, that Cav-1 modulates influenza virus A replication presumably based on M2/Cav-1 interaction.

Conclusion
As Cav-1 is involved in the human influenza A virus life cycle, the multifunctional protein and its interaction with M2 protein of human influenza A viruses represent a promising starting point for the search for antiviral agents.
Mathematical modeling of translation initiation for the estimation of its efficiency to computationally design mRNA sequences with desired expression levels in prokaryotes
Authors: Na Dokyun , Lee Sunjae , Lee Doheon 
Published: May 2010

Abstract

Background
Within the emerging field of synthetic biology, engineering paradigms have recently been used to design biological systems with novel functionalities. One of the essential challenges hampering the construction of such systems is the need to precisely optimize protein expression levels for robust operation. However, it is difficult to design mRNA sequences for expression at targeted protein levels, since even a few nucleotide modifications around the start codon may alter translational efficiency and dramatically (up to 250-fold) change protein expression. Previous studies have used ad hoc approaches (e.g., random mutagenesis) to obtain the desired translational efficiencies for mRNA sequences. Hence, the development of a mathematical methodology capable of estimating translational efficiency would greatly facilitate the future design of mRNA sequences aimed at yielding desired protein expression levels.

Results
We herein propose a mathematical model that focuses on translation initiation, which is the rate-limiting step in translation. The model uses mRNA-folding dynamics and ribosome-binding dynamics to estimate translational efficiencies solely from mRNA sequence information. We confirmed the feasibility of our model using previously reported expression data on the MS2 coat protein. For further confirmation, we used our model to design 22 luxR mRNA sequences predicted to have diverse translation efficiencies ranging from 10-5 to 1. The expression levels of these sequences were measured in Escherichia coli and found to be highly correlated (R

2
= 0.87) with their estimated translational efficiencies. Moreover, we used our computational method to successfully transform a low-expressing DsRed2 mRNA sequence into a high-expressing mRNA sequence by maximizing its translational efficiency through the modification of only eight nucleotides upstream of the start codon.

Conclusions
We herein describe a mathematical model that uses mRNA sequence information to estimate translational efficiency. This model could be used to design best-fit mRNA sequences having a desired protein expression level, thereby facilitating protein over-production in biotechnology or the protein expression-level optimization necessary for the construction of robust networks in synthetic biology.
Electrical muscle stimulation prevents critical illness polyneuromyopathy: a randomized parallel intervention trial
Authors: Routsi Christina , Gerovasili Vasiliki , Vasileiadis Ioannis , Karatzanos Eleftherios , Pitsolis Theodore , Tripodaki Elli , Markaki Vasiliki , Zervakis Dimitrios , Nanas Serafim 
Published: May 2010

Abstract
Introduction
Critical illness polyneuromyopathy (CIPNM) is a common complication of critical illness presenting with muscle weakness and is associated with increased duration of mechanical ventilation and weaning period. No preventive tool and no specific treatment have been proposed so far for CIPNM. Electrical muscle stimulation (EMS) has been shown to be beneficial in patients with severe chronic heart failure and chronic obstructive pulmonary disease. Aim of our study was to assess the efficacy of EMS in preventing CIPNM in critically ill patients.

Methods
One hundred and forty consecutive critically ill patients with an APACHE II score ≥ 13 were randomly assigned after stratification to the EMS group (n = 68) (age:61 ± 19 years) (APACHE II:18 ± 4, SOFA:9 ± 3) or to the control group (n = 72) (age:58 ± 18 years) (APACHE II:18 ± 5, SOFA:9 ± 3). Patients of the EMS group received daily EMS sessions. CIPNM was diagnosed clinically with the medical research council (MRC) scale for muscle strength (maximum score 60, <48/60 cut off for diagnosis) by two unblinded independent investigators. Duration of weaning from mechanical ventilation and intensive care unit (ICU) stay were recorded.

Results
Fifty two patients could be finally evaluated with MRC; 24 in the EMS group and 28 in the control group. CIPNM was diagnosed in 3 patients in the EMS group as compared to 11 patients in the control group (OR = 0.22; CI: 0.05 to 0.92, P = 0.04). The MRC score was significantly higher in patients of the EMS group as compared to the control group [58 (33 to 60) vs. 52 (2 to 60) respectively, median (range), P = 0.04). The weaning period was statistically significantly shorter in patients of the EMS group vs. the control group [1 (0 to 10) days vs. 3 (0 to 44) days, respectively, median (range), P = 0.003].

Conclusions
This study suggests that daily EMS sessions prevent the development of CIPNM in critically ill patients and also result in shorter duration of weaning. Further studies should evaluate which patients benefit more from EMS and explore the EMS characteristics most appropriate for preventing CIPNM.

Trial Registration Number
ClinicalTrials.gov NCT00882830
Determinants of IGF1 and GH across the weight spectrum: from anorexia nervosa to obesity
Authors: Brick D J , Gerweck A V , Meenaghan E , Lawson E A , Misra M , Fazeli P , Johnson W , Klibanski A , Miller K K 
Published: May 2010

ContextChronic starvation is characterized by GH resistance, and obesity is characterized by decreased GH secretion. In both extremes, IGF1 levels may be low and androgen levels may be abnormal.ObjectiveTo investigate the determinants of IGF1 and GH across the weight spectrum in women.DesignCross-sectional study.SettingClinical research center.Study participantsIn total, 32 women had participated in the study: 11 women with anorexia nervosa (AN), 11 normal-weight women, and 10 obese women of comparable mean age.InterventionNone.Main outcome measuresPooled hourly overnight serum samples assayed for IGF1, GH, estradiol (E2), testosterone, SHBG, insulin, free fatty acids, and trunk fat.ResultsFree testosterone was higher in obese women and lower in women with AN than in normal-weight women, and was the only independent (and positive) predictor of IGF1 levels, accounting for 14% of the variability (P=0.032) in the group as a whole. This relationship was stronger when obese women were excluded, with free testosterone accounting for 36% of the variability (P=0.003). Trunk fat accounted for 49% of the variability (P<0.0001) of GH, with an additional 7% of the variability attributable to E2 (P=0.042) in the group as a whole, but was not a significant determinant of GH secretion when obese women were excluded.ConclusionsFree testosterone is a significant determinant of IGF1 levels in women across the body weight spectrum. In contrast, GH secretion is differentially regulated at the extremes of the weight spectrum.
Effects of a fungicide on the morphology and viability of pollens of tomato (<i>Lycopersicon esculentum</i> Mill.)
Authors: Çali Ilkay Öztürk , Candan Feyza 
Published: May 2010

Effects of Agri Fos 400 (Mono and di-potassium phosphanate), a fungicide widely used on tomatoes grown in greenhouses in Turkey against Phytophthora infestans were studied on the morphology and viability of tomato (Lycopersicon esculentum Mill.) pollens. The fungicide was applied on tomato plants at recommended dosage (4 ml/l water) and double the recommended dosage (8 ml/l water). The fungicide caused changes in the morphological structures of pollens. Some pollen morphological structures that are not observed in the control group were encountered in the pollens due to application of Agri Fos 400 in equatorial view at 8 ml/l and in polar view at 4 ml/l. Level of pollen viability decreased as the dosage increased. Key words: Fungicide; Phytophthora infestans; Tomato; Pollen morphology; Viability DOI: 10.3329/bjb.v38i2.5134 Bangladesh J. Bot. 38(2): 115-118, 2009 (December)
Diversity and pathogenicity of the rice brown spot pathogen, <i>Bipolaris oryzae</i> (Breda de Haan) Shoem. in Bangladesh assessed by genetic fingerprint analysis
Authors: Kamal MM , Mia MAT 
Published: May 2010

A survey on the occurrence of rice brown spot pathogen, Bipolaris oryzae (Breda de Haan) Shoem. was carried out across Bangladesh. A representative set of 152 isolates were characterized based on DNA fingerprinting, using variable number tandem repeat analysis and assessed their phylogenetic identity, diversity and pathogenicity. The analysis showed considerable diversity among the isolates, being separated into 12 fingerprint types at 75% similarity level. Majority of the samples possessed one fingerprint type. Pathogenicity test with nine fingerprint types on rice variety BR24, showed 20.5-84.5% germination failure, 2.50-12.50, 5.84-11.67 and 7.50-14.17% post-emergence seedling death at 15, 30 and 45 days after transplanting and 18.75-22.50% yield loss. Significant differences in aggressiveness were observed among the isolates of the same fingerprint types. Key words: Bipolaris oryzae; Rice brown spot; Pathogenicity; Agarose-synergel; Fingerprints DOI: 10.3329/bjb.v38i2.5135 Bangladesh J. Bot. 38(2): 119-125, 2009 (December)
Effects of some limnological factors on the growth of <i>Nelumbo nucifera</i> Gaertner
Authors: Alfasane Md Almujaddade , Khondker Moniruzzaman , Begum ZN Tahmida 
Published: May 2010

Nelumbo nucifera Gaertner was grown in a mesoscale culture by sowing seeds in cow dung compost and loamy soil (1 : 1). Rhizomes and young plantlets under ex-situ condition did not survive but germination was possible via seeds where the rate of germination was 50% and seedlings less than four months old also grew. Leaf area positively correlated with air temperature, water temperature, PAR, day length, rainfall, relative humidity, NO3-N, Chl a and phaeopigment. Petiole length showed positive correlation with rainfall, relative humidity and pH. Highest growth and flowering were found to be associated with a water depth of 100 cm under full sunshine and high nutrient conditions. Under shaded condition, plants did not produce flowers. Water flow rate of 50 ml/sec in the culture pit hampered flowering. Flowering was observed only in the stagnant condition. Key words: Nelumbo nucifera; Growth; Limnological factors DOI: 10.3329/bjb.v38i2.5137 Bangladesh J. Bot. 38(2): 133-138, 2009 (December)
Gynandrosporous species of <i>Oedogonium borisianum</i> (LE CL.) Wittr. ex Hirn (Chlorophyceae) from Bangladesh
Authors: Naz Sabrina , Nahar Umma , Ali Md Solaiman , Azam Shah Md Golam Gousul 
Published: May 2010

Gynandrosporus species of Oedogonium borisianum (Le Cl.) Wiltr. ex Hirn not reported earlier from Bangladesh has been described and illustrated. Key words: DOI: 10.3329/bjb.v38i2.5151 Bangladesh J. Bot. 38(2): 209-210, 2009 (December)
Réalité du sous-prolétariat
Authors: Glardon M.-J. , Glardon M. 
Published: May 2010

En tant que pauvres, laissés pour compte du progrès, les sous- prolétaires restent une couche sociale gênante dans les sociétés industrielles avancées. On préfère souvent, plutôt que de reconnaître leur existence sociale, parler d'eux en tant qu'individus, déviants, aberrants, anormaux. C'est-à-dire expliquer leur inadaptation comme s'il s'agissait d'une pathologie.
Les auteurs, engagés dans une recherche portant sur l'expression sociale de cette population en Suisse, établissent les bases théoriques qui permettent de mieux la situer dans la structure de classe.
Le Ministère Public et la poursuite du vol à l'étalage. Une étude empirique
Authors: Van Kerckvoorde J. 
Published: May 2010

Resumé
Après une description du contexte structurel de l'action des magistrats du parquet, les résultats d'une analyse de dossiers sont présentés.
Dans cette analyse les facteurs qui influencent la décision de poursuite ou de classement sans suite des cas du vol à l'étalage sont déterminés.
Les antécédents judiciaires du suspect se révèlent particulièrement importants. Par contre, sa nationalité, son sexe et sa position sociale ne constituent pas (ou à peine) des critères de décision.
Très important est le magistrat qui traite l'affaire : bien que chaque magistrat suive une ligne de décisions plutôt consistante, l'on observe entre ces magistrats des différences très marquées.
Limites et chances d'une réflexion psychanalytique en criminologie
Authors: Labadie J.M. 
Published: May 2010

On peut distinguer dans les écrits des psychanalystes à propos de la criminalité et de la délinquance, trois sortes d'approches. Les psychanalystes ont d'abord essayé de situer l'origine de l'asocialité dans une absence morale ou phantasmatique et dans un archaïsme dont la violence dirait l'impossibilité de verbalisation. Ceux qui ont ensuite préféré stigmatiser le conflit intérieur du délinquant en sont venus, à partir notamment des thèmes de la culpabilité, de l'aveu ou du symptôme, à faire de la criminalité la figuration scénique de la première tragédie du sang et de la différence (c.a.d. l'oedipe). D'autres enfin se sont penchés sur l'économie de l'asocial, sujet qui s'ajusterait par son comportement à un vide ou à une carence qui lui seraient propres.
Ces trois essais révèlent certes une grande intuition de la notion de transgression, mais ils reposent sur une pratique et des modèles explicatifs totalement étrangers à une délinquance qui, elle, se tait. La question qui se pose est alors de savoir à quoi peut donc prétendre la psychanalyse en criminologie. Et si le psychanalyste, plutôt que de nommer ce qu'il ne fait qu'imaginer, acceptait d'errer entre l'arme et le symptôme, la complicité ou la rupture, ne pourrait-il approcher les mécanismes de mise en scène et de différence qui opèrent sur les tréteaux de la criminalité, et retrouver du "jeu" là où justement le système ne produit que de la faute, de l'aveu ?
Commentaire d'une exposition
Authors: Requet André 
Published: May 2010

A partir de la mort du peintre Fusco ayant vécu le bagne et l'asile, l'auteur pose le problème de l'incapacité que présente la société actuelle de reconnaître le rôle de la folie et de la mort. Elle les dépouille en quelque sorte de leur sens pour les rendre acceptables, en médicalisant la première et en occultant la seconde.
Une telle "opération" se rattache à une philosophie de la conscience, du "je" cartésien, historique et limité, face à laquelle l'auteur pose, par opposition, la structure de l'infinissable (l'inconscient posthume) à laquelle participent la folie et la mort.
Conflit social et criminalité. Pour la critique de la théorie du conflit en criminologie
Authors: Baratta Alessandro 
Published: May 2010

L'auteur présente une analyse des théories du conflit en sociologie et en criminologie (Dahrendorf, Void, Turk, Quinney...).
L'examen est d'abord porté sur la signification politique et culturelle de la critique des théories structuralo-fonctionnalistes de la part des théoriciens du conflit.
Le changement, le conflit et la coercition sont les trois éléments contribuant à former le modèle sociologique du conflit opposés à ceux d'équilibre et d'intégration chez le fonctionnalisme.
L'auteur décèle dans la théorie du conflit l'expression idéologique d'une société capitaliste avancée, où le conflit n'est pas perçu dans les relations matérielles de propriété, de production et de distribution, mais uniquement dans les relations d'hégémonie politique de certains individus sur d'autres. Une fonction positive est ainsi, dans le cadre de ces théories, attribuée aux conflits qui ne mettent pas en question la légitimité du système.
L'auteur arrive à la conclusion que la principale caractéristique du conflit réside dans le fait d'être institutionnalisé, de posséder une médiation à l'intérieur de la structure juridique de l'industrie et de l'Etat monopolisé. La théorie du conflit se voit ainsi réduite à une théorie fonctionnelle par rapport à la société établie, dans la mesure où elle exorcise les conflits non institutionnalisés qui se développent en dehors de la médiation juridique et qui sont liés à la marginalisation sociale, alors que se sont justement ceux-ci qui devraient prendre la place centrale dans une théorie de la criminalité.
A propos de l'origine et des transformations des maisons pour jeunes délinquants en Belgique au XIXe siècle : l'histoire du pénitencier de Saint-Hubert (1840-1890)
Authors: Digneffe Françoise , Dupont-Bouchat M.-S. 
Published: May 2010

Dit artikel schetst het ontstaan en de evolutie van de eerste gevangenis voor kinderen die in België werd ingericht in de oude abdij van Saint-Hubert en Ardennes. Het betreft de période van 1840 tot 1890. Om deze historische studie te verwezenlijken hebben we ons gesteund op de analyse van drie soorten bronnen : vooreerst de programmai van de hervormers (Ducpétiaux, Prins en Lejeune) ; vervolgens het geheel van normatieve bronnen die betrekking hebben op deze période ; tenslotte hebben we getracht bepaalde aspecten van het dagelijks leven van het tuchthuis te achterhalen vanuit de archieven die in de inrichting werden teruggevonden.
Die drie benaderingen beogen een dubbel doel. Vooreerst goat het er om te zien of ieder niveau een eigen logica vertoont en om dan de relatieve autonomie van de praktijken tenaanzien van de theorieën te meten. We hebben nadien getracht aan te tonen hoe de projecten van hervormers, de richtlijnen van de gevangenisadministradie en de. dagelijkse praktijk opelkaar inwerken en aldus wijzigingen ondergaan.
L'amendement ou l'entreprise de réforme morale des prisonniers en France au XIXe siècle
Authors: Petit J.G. 
Published: May 2010

L'amendement ou l'entreprise de réforme morale des prisonniers en France au XIXe siècle. G. Petit.
Schrijver onderzoekt de begrippen m.b.t. de door de vrijheidsberoving nagestreefde doeleinden, zoals die werden ontwikkeld door vier persoonlijkheden, representatief voor de verschillende gedachtenstromingen in het Frankrijk van XIXe eeuw.
Het sleutelbegrip door de auteur gekonen is dat van de "verbe-tering". Moreau — Christophe, Beaumont, Tocqueville en Lucas worden beschreven in functie van hun stellingname t.a.v. dit begrip : moet, kan de opsluiting dienen of leiden tot de verbetering van de gevangene ?
Ces signes qui font la délinquance
Authors: Soubiran Francine , Robert Ch.-N. 
Published: May 2010

Cet article rend compte des mécanismes de diffusion idéologique à l'œuvre au sein d'une presse régionale à Genève, en Suisse et à Nice, en France, à propos de la peur du crime.
On verra qu'une série de signes servent à désigner les auteurs d'actes avant tout violents, contribuant à les exclure du champ social et que ces signes sont quasiment absents des références dont usent les journalistes à propos d'auteurs délinquants d'affaires.
Les pions de la Reine ou la place des témoins et des victimes dans le droit criminel canadien
Authors: Laflamme-Cusson Suzanne 
Published: May 2010

Le droit criminel canadien est essentiellement focalisé sur l'auteur d'un crime ou d'un délit, d'où rendre justice consiste à prouver la culpabilité et punir le délinquant. Dans un tel contexte, le témoin et la victime ne sont que des outils à l'usage du système judiciaire ; ils ne possèdent aucun droit et sont à la merci des besoins de la poursuite et de la défense.
Bien que l'idée de réparation à la victime se répande rapidement, elle ne saurait mener à des changements réels importants si le code criminel doit continuer de s'appuyer sur ses bases actuelles.
De l'événement à l'infraction: le processus de mise en forme pénale
Authors: Acosta Fernando 
Published: May 2010

Le point de départ de cette recherche est l'étude d'un dossier de corruption politique (Ville d'Anjou, Québec) et du procès qui l'a suivi. Sur cette base, l'auteur met l'accent sur la mise en forme (formalisation) pénale, c'est-à-dire le passage du fait social au fait juridique et judiciaire.
Deux moments décisifs sont retenus : celui de l'enquête et celui des poursuites judiciaires. Ce sont elles qui effectuent les opérations essentielles de reconstitution, interprétation et codage juridique des faits. De plus, chacune de ces opérations s"effectue en anticipant sur les opérations ultérieures afin d'assurer la recevabilité finale du produit.
La professionnalisation de la police en France : un phénomène nouveau au début du XXème siècle
Authors: Berlière J. M. 
Published: May 2010

C'est entre 1880 et 1914, aux débuts de la IIIème République, que l'on s'est, pour la première fois en France, préoccupé du recrutement et de la formation de ces travailleurs bien particuliers que sont les policiers.
Les débuts de la professionnalisation de la police qui vont de pair avec une première réflexion sur la définition, la nature, l'organisation et les fonctions d'une police républicaine, furent essentiellement l'oeuvre des Préfets de Police eux-mêmes qui rejoignaient ainsi les voeux du public et des policiers. Toute insuffisante qu'elle paraisse cette « technicisation » marque néanmoins le début d'un processus irréversible en même temps que des velléités d'autonomie des policiers vis-à-vis de ces non-professionnels : les politiques.