Proportion of paternal marker gametes identified in progeny
Authors: Gaillard C. , Smith C. 
Published: February 2011

SummaryMarker assisted selection (MAS) depends on the proportion of offspring which are informative. Formulas are presented which calculate the average proportion of progeny in which the different paternal gametes are 1) known to be transmitted and 2) can be identified in the progeny, when the linkage phase of the sire is known. The expressions were derived first for one marker and then for two markers per quantitative trait locus (QTL). Only a limited proportion of sires (or linkage groups within a sire) will be doubly (or triply) heterozygous for the marker(s) and the QTL. This greatly restricts the practical value of MAS. For doubly or triply heterozygous sires, the proportions of informative progeny for MAS are generally moderate to high. With more information (two markers vs. one marker, mates typed for the marker bs. mates not typed), the proportions become high. In the future with many polymorphic marker loci, the proportion of parents which are informative will be increased, so MAS will become more efficient.ZusammenfassungAnteil identifizierter väterlicher Markergameten bei den NachkommenMarkergestützte Selektion (MAS) hängt vom Anteil der Nachkommen ab, die informativ sind. Formeln werden angegeben, die den durchschnittlichen Anteil an Nachkommen ermitteln, in denen einer der beiden väterlichen Gameten 1. erkennbar vererbt wurde und 2. in den Nachkommen identifiziert werden kann, wenn die Kopplungsverhältnisse beim Vater bekannt sind. Die Formeln wurden vorerst für einen Marker und dann für zwei Marker pro Locus eines quantitativen Merkmals (QTL) entwickelt. Nur eine beschränkte Anzahl Vatertiere (oder Kopplungsgruppen innerhalb eines Vatertieres) wird doppelt (oder dreifach) heterozygot für den (die) Marker und den QTL sein. Dies schränkt den praktischen Verwendungszweck der MAS stark ein. Für doppelt oder dreifach heterozygote Vatertiere sind die Anteile an informativen Nachkommen für MAS im allgemeinen mittel bis hoch. Mit zusätzlichen Informationen (zwei Marker vs einen Marker, Mutter nicht typisiert für den Marker vs Mutter typisiert für den Marker) werden diese Anteile höher. In Zukunft, wenn viele polymorphe Markerloci zur Verfügung stehen, wird die Anzahl an informativen Eltern steigen, so daß MAS effizienter wird.RésuméProportion de gamètes paternels identifiés dans la descendanceLa sélection assistée par un ou plusieurs marqueurs (MAS) dépend de la proportion de descendants dits informatifs. Des formules présentées calculent la proportion moyenne de descendants parmi lesquels l'un des deux gamètes paternels 1. est reconnu d'avoir été transmis et 2. peut être identifié dans la descendance lorsque le linkage du père est connu. Les formules ont tout d'abord été developpées pour un marqueur puis pour deux marqueurs par locus d'un caractère quantitatif (QTL). Seule une proportion limitée de géniteurs (ou de groupes de linkage chez un géniteur) sera double (ou triple) hétérozygote pour le(s) marqueur(s) et le QTL. Cela restreint fortement l'utilisation pratique de la MAS. La proportion de descendants informatifs pour la MAS est, pour des géniteurs double ou triple hétérozygote, moyenne à grandes. Avec des informations supplémentaires (deux marqueurs vs un marqueur, mère typisée pour le(s) marqueur(s) vs mère non typisée pour le(s) marqueur(s)), ces proportions augmentent. A I'avenir avec beaucoup de loci de marqueurs polymorphes à disposition, le nombre de parents informatifs va augmenter, de sorte que la MAS deviendra plus efficiente.