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Source verification of mis‐identified Arabidopsis thaliana accessions
Authors: Anastasio Alison E. , Platt Alexander , Horton Matthew , Grotewold Erich , Scholl Randy , Borevitz Justin O. , Nordborg Magnus , Bergelson Joy 
Published: April 2011

SummaryA major strength of Arabidopsis thaliana as a model lies in the availability of a large number of naturally occurring inbred lines. Recent studies of A. thaliana population structure, using thousands of accessions from stock center and natural collections, have revealed a robust pattern of isolation by distance at several spatial scales, such that genetically identical individuals are generally found close to each other. However, some individual accessions deviate from this pattern. While some of these may be the products of rare long‐distance dispersal events, many deviations may be the result of mis‐identification, in the sense that the data regarding location of origin data are incorrect. Here, we aim to identify such discrepancies. Of the 5965 accessions examined, we conclude that 286 deserve special attention as being potentially mis‐identified. We describe these suspicious accessions and their possible origins, and advise caution with regard to their use in experiments in which accurate information on geographic origin is important. Finally, we discuss possibilities for maintaining the integrity of stock lines.
Antagonistic role of 9‐lipoxygenase‐derived oxylipins and ethylene in the control of oxidative stress, lipid peroxidation and plant defence
Authors: López Miguel A. , Vicente Jorge , Kulasekaran Satish , Vellosillo Tamara , Martínez Marta , Irigoyen Maria L. , Cascón Tomas , Bannenberg Gerard , Hamberg Mats , Castresana Carmen 
Published: April 2011

Summary9‐lipoxygenases (9‐LOXs) initiate fatty acid oxygenation in plant tissues, with formation of 9‐hydroxy‐10,12,15‐octadecatrienoic acid (9‐HOT) from linolenic acid. A lox1 lox5 mutant, which is deficient in 9‐LOX activity, and two mutants noxy6 and noxy22 (non‐responding to oxylipins), which are insensitive to 9‐HOT, have been used to investigate 9‐HOT signalling. Map‐based cloning indicated that the noxy6 and noxy22 mutations are located at the CTR1 (CONSTITUTIVE ETHYLENE RESPONSE1) and ETO1 (ETHYLENE‐OVERPRODUCER1) loci, respectively. In agreement, the noxy6 and noxy22 mutants, renamed as ctr1‐15 and eto1‐14, respectively, showed enhanced ethylene (ET) production. The correlation between increased ET production and reduced 9‐HOT sensitivity indicated by these results was supported by experiments in which exogenously added ethylene precursor ACC (1‐aminocyclopropane‐1‐carboxylic acid) impaired the responses to 9‐HOT. Moreover, a reciprocal interaction between ET and 9‐HOT signalling was indicated by results showing that the effect of ACC was reduced in the presence of 9‐HOT. We found that the 9‐LOX and ET pathways regulate the response to the lipid peroxidation‐inducer singlet oxygen. Thus, the massive transcriptional changes seen in wild‐type plants in response to singlet oxygen were greatly affected in the lox1 lox5 and eto1‐14 mutants. Furthermore, these mutants displayed enhanced susceptibility to both singlet oxygen and Pseudomonas syringae pv. tomato, in the latter case leading to increased accumulation of the lipid peroxidation product malondialdehyde. These findings demonstrate an antagonistic relationship between products of the 9‐LOX and ET pathways, and suggest a role for the 9‐LOX pathway in modulating oxidative stress, lipid peroxidation and plant defence.
Achieving STOP TB Partnership goals: perspectives on development of new diagnostics, drugs and vaccines for tuberculosis
Authors: Mwaba Peter , McNerney Ruth , Grobusch Martin Peter , O’Grady Justin , Bates Matthew , Kapata Nathan , Maeurer Markus , Zumla Alimuddin 
Published: April 2011

SummaryGlobal eradication of tuberculosis (TB) depends on identification and treatment of all active TB cases and of the two billion people who are estimated to be latently infected with Mycobacterium tuberculosis. The past decade has seen a renaissance of scientific activities and funder investment into development of new TB drugs, diagnostics, biomarkers and vaccines. This viewpoint critically summarises the promising portfolio of more accurate TB diagnostics, new TB drugs and vaccines that have been endorsed by the STOP TB Partnership. Increasing numbers of Phase 2 and 3 drug, vaccine and diagnostic clinical trials in high‐TB endemic areas reflect substantial progress towards attaining Global STOP‐TB Partnership targets. Achievement of STOP‐TB Partnership goals will crucially depend on political will and serious investment by funders and developing country governments into improving delivery of better health services and living conditions for their people. Long‐term sustainability of any newer tools implemented at point of care is essential.
Conserved sequences of thrombospondin‐related adhesive protein gene of Plasmodium vivax in clinical isolates from Korea
Authors: Nam Myung H. , Jang Jin W. , Kim Hanna , Han Eun T. , Lee Won J. , An Seong S. A. , Park Ae S. D. , Lim Chae S. 
Published: April 2011

SummaryThrombospondin‐related adhesive protein (TRAP) from Plasmodium vivax (P. vivax) became one of the important vaccine candidates for malaria, because P. vivax TRAP (PvTRAP) is responsible for the sporozoite–host interactions. PvTRAP polymorphisms in the isolates from Republic of Korea (ROK) were analysed, setting the valuable baseline data for the future vaccine developments and clinical trials with PvTRAP, as a strong vaccine candidate. A total of 54 isolates were collected in 2010. PvTRAP genes from above isolates were amplified and sequenced, and the results were analysed and compared against Sal‐1 strain. Sequencing analysis of 1424‐bp‐size PvTRAP PCR products revealed one major allelic type with six non‐synonymous substitutions, where S81T, E95D, I121V and T127R substitutions were found in region II, and K371N and A425E substitutions from region IV. The ROK isolates revealed the limited sequence polymorphisms in PvTRAP in comparison with the reported isolates from other nations.
Use of haplotypes to estimate Mendelian sampling effects and selection limits
Authors: Cole J.B. , VanRaden P.M. 
Published: April 2011

SummaryLimits to selection and Mendelian sampling (MS) terms can be calculated using haplotypes by summing the individual additive effects on each chromosome. Haplotypes were imputed for 43 382 single‐nucleotide polymorphisms (SNP) in 1455 Brown Swiss, 40 351 Holstein and 4064 Jersey bulls and cows using the Fortran program findhap.f90, which combines population and pedigree haplotyping methods. Lower and upper bounds of MS variance were calculated for daughter pregnancy rate (a measure of fertility), milk yield, lifetime net merit (a measure of profitability) and protein yield assuming either no or complete linkage among SNP on the same chromosome. Calculated selection limits were greater than the largest direct genomic values observed in all breeds studied. The best chromosomal genotypes generally consisted of two copies of the same haplotype even after adjustment for inbreeding. Selection of animals rather than chromosomes may result in slower progress, but limits may be the same because most chromosomes will become homozygous with either strategy. Selection on functions of MS could be used to change variances in later generations.
Wachstumsverhalten humanpathogener Pilze in vitro auf verschiedenen Strumpfgeweben
Authors: Günther A. , Effendy I. 
Published: April 2011

Zusammenfassung. Durch ungeeignete Fußbekleidung können bestehende Tinea pedis und Onychomykosen verschlimmert werden. In dieser Studie wurde der Frage nachgegangen, ob die heute üblichen Faserzusammensetzungen von Strümpfen Einfluss auf das Wachstum der humanpathogenen Hautpilze Trichophyton rubrum, Trichophyton mentagrophytes und Candida albicans haben. Zwölf Strumpfproben der Hauptfasergruppen Baumwolle, Schurwolle, synthetische Fasern und Seide sowohl in reiner Form als auch als Mischgewebe wurden mit Suspensionen der Testkeime kontaminiert und die Größen der wachsenden Kolonien gemessen und verglichen. Die Ergebnisse zeigten, dass unterschiedliche Strumpffasern das Wachstum von Pilzen sowohl fördern als auch hemmen können. Alle drei getesteten Hautpilze zeigten eine signifikant hohe Wachstumstendenz auf Polyamid‐Strumpfproben mit hohem Elasthan‐Anteil sowie auf Seidengewirk.Summary. Athlete's foot and onychomycosis can be aggravated due to inappropriate footwear. In this study we examined whether stockings of synthetic and mixed fabrics may influence the growth behaviour of the commonly isolated fungi Trichophyton rubrum, Trichophyton mentagrophytes and Candida albicans. A standardized suspension of each fungus was given to each sample of twelve stockings of different materials. The size of the growing colonies and the velocity of their growth were measured and compared to each other. Based on our data stockings depending on their fabric mixture seem to support or inhibit respectively the growth of fungi. Stockings composed of polyamide and a high percentage of polyurethane (Elasthan) and silk stockings as well may likely promote the fungal growth.
Influence of voriconazole and fluconazole on Candida albicans in long‐time continuous flow culture
Authors: Zimmermann Kathrin , Bernhardt J. , Knoke M. , Bernhardt Hannelore 
Published: April 2011

Summary. We investigated the influence of voriconazole and fluconazole in a long term trial of continuous flow culture (cfc) up to 9 days. The effects of these azoles were different in dependence on the growth circumstances. Under anaerobic conditions a fungicidal effect of voriconazole was detectable, defined by an inhibition of 99.9%. This also applied to fluconazole for the majority of tested strains of C. albicans. Under aerobic conditions with an otherwise similar situation we found only a fungistatic reaction (inhibition of 90%). Fluorescence microscopy comparing fungal morphology in biofilms on glass surfaces in the cfc revealed a differentiation into blastospores, germ tubes, pseudomycelia and mycelia in the control trial after a cultivation of 8 days. Under anaerobic conditions with azoles only some single cells could be found, sometimes in cell detritus. The adhesion was clearly reduced. Under aerobic conditions more blastospores but no differentiated mycelia were to be seen.Zusammenfassung. Wir untersuchten den Einfluss von Voriconazol und Fluconazol in kontinuierlicher Langzeitkultur bei einer Zeitdauer bis zu 9 Tagen. Die Wirkung der Azole war unterschiedlich in Abhängigkeit von den Wachstumsbedingungen. Unter anaeroben Verhältnissen zeigte Voriconazol und bei den meisten Teststämmen von Candida albicans auch das Fluconazol eine fungizide Wirkung. Damit wurde eine 99,9%ige Hemmung der C. albicans‐Stämme erreicht. Unter aeroben Bedingungen konnte nur eine 90%ige Hemmung festgestellt werden. Fluoreszenzmikroskopisch wurden nach durchschnittlich achttägiger Kulturdauer große Unterschiede in Morphologie und Biofilmbildung der Pilze auf Glasoberflächen beobachtet. In der Kontrolle ohne Azol‐Zusatz fand sich eine üppige Aufwuchsflora. Die Candida waren differenziert in Blastosporen, Keimschläuche, echte und Pseudomyzelien. Unter Azol‐Einfluss ließ die Besiedlungsdichte deutlich nach. Anaerob waren nur wenige Sprosszellen, selten einmal ein Keimschlauch, häufig nur Zelldetritus nachweisbar. Die Adhäsion war deutlich herabgesetzt. Aerob waren mehr Blastosporen und keine differenzierten Myzelien vorhanden.
Beobachtungen zur Blutgerinnung bei einheimischen tiefen Mykosen
Authors: Ntefidou Maria , Elsner Christine , Spreer Annette , Weinstock N. , Kratzin H. D. , Rüchel R. 
Published: April 2011

Zusammenfassung. Die Aktivierung der Blutgerinnung tritt in unterschiedlichem Maß bei invasiven einheimischen Mykosen auf. Während es bei Candidosen und Aspergillosen nach Einbruch der Pilze in die Blutbahn gelegentlich zur Bildung von Thromben kommt, die zu septischen Embolien Anlass geben können, werden bei Mucormykosen (Syn. Zygomykosen) regelmäßig ausgedehnte thrombotische Verschlüsse der befallenen Gefäße und folglich Nekrosen des abhängigen Gewebes beobachtet. Für die Auslösung der Gerinnung durch Candida und Aspergillen können sekretorische Aspartat‐Proteinasen der Pilze verantwortlich sein, die den Gerinnungsfaktor X aktivieren, wie bereits früher gezeigt wurde [1, 2]. Für die gravierenden Gerinnungsereignisse bei Mucormykosen ist hingegen offenbar eine extrazelluläre subtilisin‐ähnliche Serinproteinase (Arp) verantwortlich, die bereits in geringen Konzentrationen bei Raumtemperatur eine Parakoagulation von Fibrinogen auslöst, und die zugleich den wichtigsten Inhibitor der Gerinnung, das Antithrombin III, zerstört. Neue Befunde zur Wirkung von Arp werden diskutiert.Summary. Activation of blood coagulation to a varying extent affect the course of domestic invasive mycoses. Upon invasion of blood vessels by Candida or aspergilli, occasionally thrombi are formed, which may cause septic embolism. In the course of mucormycosis (syn. zygomycosis) thrombotic occlusion of afflicted blood vessels and subsequent necrosis of dependent tissue regularly occurs. Coagulation during candidosis or aspergillosis may be triggered by secreted aspartic proteinases which are able to activate factor X as has been shown previously [1, 2]. During mucormycosis, severe blood coagulation apparently is due to paracoagulation of fibrinogen which is triggered by low concentrations of extracellular fungal subtilisin‐like proteinase (Arp). The enzyme is also able to inactivate the major inhibitor of blood coagulation (antithrombin III). Recent findings on the action of Arp are discussed.
Die Dermatomykologie im geschichtlichen Überblick
Authors: Mittag Hannelore 
Published: April 2011

Zusammenfassung. Diese Übersicht bezieht sich im ersten Abschnitt auf klinische Aspekte in der Geschichte der Dermatomykologie, im zweiten Teil kommt die Phase der Entdeckung der Pilze bei bestimmten Hauterkrankungen im 19. Jh. zur Sprache, was den Beginn der Dermatomykologie kennzeichnete. Es wird auf die Bedeutung der Interaktion von Pilzen und Wirtsorganismus in diesem Kontext hingewiesen und auch auf erste Untersuchungen, die zu dieser Thematik an Pflanzen am Ende des 17. Jahrhunderts von Marcello Malpighi durchgeführt wurden, aufmerksam gemacht.Summary. This historical review is focussed on clinical aspects of dermatomycology on one hand and on the discovery of fungi as pathogenic agents in dermatologic diseases on the other hand. This latter period in the 19th century established the beginning of dermatomycology. The basic role of fungus‐host‐interrelationship is mentioned with reference to earliest microscopical investigations of this issue on plants by Marcello Malphighi in the late 17th century.
Wirkungsweise von Ciclopiroxolamin auf Candida albicans
Authors: Niewerth M. , Schaller M. , Korting H. C. , Hube B. 
Published: April 2011

Zusammenfassung. Candida albicans ist ein häufiger Erreger sowohl superfizieller als auch invasiver Mykosen. Zu den therapeutisch verwendeten Antimykotika bei oberflächlichen Candidosen gehört das Hydroxypyridon Ciclopiroxolamin. Während die Wirkungsweise anderer Antimykotika wie zum Beispiel der Azole gut bekannt ist, kennt man die Wirkung des Ciclopiroxolamins nur ansatzweise. Es gibt Hinweise, daß Ciclopiroxolamin als potentieller Chelatbildner auf eine ganze Reihe von zellulären Prozessen einen Einfluß ausübt. Die antimykotische Wirksamkeit von Ciclopiroxolamin könnte daher zum Beispiel sowohl auf eine allgemein eingeschränkte Lebensfähigkeit des Pilzes gegenüber dem menschlichen Immunsystem als auch auf eine reduzierte Fähigkeit, bestimmte Virulenzfaktoren zu produzieren, zurückzuführen sein. Eine zentrale Rolle hierbei scheint jedoch der Eisenstoffwechsel zu spielen.Summary. Candida albicans is a common pathogen causing both superficial and invasive mycoses. The hydroxypyridone ciclopiroxolamine belongs to antimycotic drugs used for treatment of superficial mycoses. Whereas the mode of action of other antimycotics, for example the azoles, is well known, the specific action of ciclopiroxolamine is poorly understood. There are hints, that ciclopiroxolamine acts as a potential chelating agent and influences some cellular processes by chelating metal ions. Consequently, the antimycotic effectiveness of ciclopiroxolamine could be due to a general reduced viability of the fungus, or due to a higher sensitivity of a fungus against the human immune system as well as due to a reduced capability to produce some specific virulence factors that are indispensable for infection. Nevertheless, iron metabolism seems to play a major role in its effect.
Zur Geschichte der medizinischen Mykologie in der ehemaligen DDR*
Authors: Seebacher C. , Blaschke‐Hellmessen Renate , Kielstein P. 
Published: April 2011

Zusammenfassung. Die Entwicklung der medizinischen Mykologie verlief in Deutschland nach dem Zweiten Weltkrieg ‐ bedingt durch die staatliche Teilung‐ in Ost und West unterschiedlich. Der Beitrag beschäftigt sich mit der Situation in der ehemaligen DDR. Aus anfänglich vorwiegend an Hautkliniken bestehenden mykologischen Laboratorien wurden nach und nach leistungsfähige Zentren an fast allen medizinischen Hochschulen eingerichtet, die für die Diagnostik, aber auch für Lehre und Forschung zuständig waren. Hauptleistungsträger waren dabei vor allem Diplombiologinnen und ‐biologen, die in den Hochschulbetrieb schließlich weitgehend gleichberechtigt neben Ärzten integriert waren.Das Wirken der Gesellschaft für Medizinische Mykologie der DDR, ihre Vorstände und Arbeitsgemeinschaften sowie die Schwerpunkte der human‐ und veterinärmedizinischen Mykologie während dieser Periode werden dargelegt. Im Besonderen wird der problemlose Beitritt dieser Gesellschaft zur Deutschsprachigen Mykologischen Gesellschaft nach der Wiedervereinigung Deutschlands und das aktive Mitwirken von Prof. Dr. Johannes Müller bei diesem Prozess hervorgehoben.Summary. After the Second World War the development of medical mycology in Germany had taken a very different course in the east and west parts depending on the political division. In this respect our contribution deals with the situation in the former German Democratic Republic. Efficient mycological centres were founded step by step almost in all medical universities on the basis of the mycological laboratories in dermatological hospitals competent for diagnostic work, but also for teaching and scientific research. In this context biologists were the main stay of mycology, they finally were integrated to the same degree in the universities like physicians. The effectiveness of the Gesellschaft für Medizinische Mykologie der DDR (GMM), its board of directors and its working groups as well as the topics of human and animal mycology during this period are described. Especially the merger of the GMM with the Deutschsprachige Mykologische Gesellschaft after the reunification of Germany without problems and the kind co‐operation of Prof. Dr. Johannes Müller during this procedure are emphasized.
Systemische Candida‐Infektionen bei Intensivpatienten
Authors: Glöckner A. 
Published: April 2011

Zusammenfassung. Die Inzidenz der invasiven Candidose ist weltweit steigend und die Letalität weiterhin sehr hoch. Die diagnostischen Schritte, die Wertung von entsprechenden Untersuchungsergebnissen sowie die Indikationsstellung zur antimykotischen Therapie stellen auf der Intensivtherapiestation ein Problem dar. Somit kommt der Erkennung von Risikofaktoren eine große Bedeutung zu. Der Einsatz der Antimykotika ist häufig durch ein inadäquates Spektrum, die Applikationsform oder die Nebenwirkungen limitiert. Neue Präparate geben Hoffnung für die nahe Zukunft.Summary. The incidence of invasive candidosis is increasing worldwide and the mortality is high. In the intensive care unit diagnostic measurements, correct evaluation of the findings and the right indication for antifungal treatment remain problematic. So determination of potential risk factors is very important. The therapeutic use of antifungal drugs is often limited by important disadvantages like inadequate spectrum, application form or side effects. New antifungals give hope for the near future.
Amphotericin B und seine Lipid‐Formulierungen
Authors: Ritter J. 
Published: April 2011

Zusammenfassung. Die vor über 40 Jahren eingeführte Behandlung mit Amphotericin B stellt nach wie vor den Goldstandard bei der Behandlung invasiver Pilzinfektionen mit Hefe‐ oder Schimmelpilzen dar. Seit mehr als 10 Jahren sind drei verschiedene Lipid‐Formulierungen von Amphotericin B verfügbar, von denen derzeit in Deutschland nur das liposomale Amphotericin B (Ambisome®) zugelassen ist.Wegen der geringeren Nephrotoxizität, der besseren subjektiven Verträglichkeit — bei gleicher bzw. höherer Wirksamkeit — sowie der Möglichkeit einer höher dosierten Therapie zu Beginn der Behandlung (loading‐dose) ist die liposomale Form von Amphotericin B dem konventionellen Amphotericin B überlegen.Summary. More than 40 years after its approval, Amphotericin B is still the gold standard in the treatment of invasive fungal infections due to Candida and Aspergillus spp. Three different lipid formulations of Amphotericin B have been available for over 10 years, with only one of them, i.e. liposomal Amphotericin B (Ambisome®), approved in Germany.Liposomal Amphotericin B is superior to conventional Amphotericin B due to its reduced nephrotoxicity, the option of a higher initial loading‐dose, and fewer infusion‐related side‐effects, all this with identical or even higher efficacy.
Voriconazol — Perspektiven und klinische Aspekte
Authors: Ruhnke M. 
Published: April 2011

Zusammenfassung. Der Wirkstoff von Vfend® ist Voriconazol, ein neues Antimykotikum aus der Gruppe der Triazole mit sehr breitem Wirkspektrum. Die Wirksamkeit wurde gegen Sproßpilz‐Arten wie Candida‐Species und Cryptococcus neoformans sowie gegen diverse Fadenpilze, insbesondere die Aspergillus‐Species, aber auch dimorphe Pilze in vitro und in vivo (in Tierexperimenten) nachgewiesen. In klinischen Phase‐II‐ und Phase‐III‐Studien konnte die Wirksamkeit insbesondere bei der oralen und ösophagealen Candidose sowie der akut invasiven und chronisch‐invasiven Aspergillose nachgewiesen werden. Das bisher bekannte Nebenwirkungsspektrum gleicht dem anderer Triazole, bis auf ein vermehrtes Auftreten von Sehstörungen. Für den Einsatz in der Therapie invasiver Mykosen stellt Voriconazol eine deutliche Bereicherung dar. In der Behandlung der akut invasiven Aspergillosen ist Voriconazol dem Amphotericin B‐Desoxycholat überlegen.Summary. Voriconazole (Vfend®) is a new broadspectrum antifungal agent belonging to the group of triazole drugs. In vitro and in vivo efficacy was demonstrated against a large variety of yeasts with excellent activity against all Candida species but as well against Cryptococcus neoformans. Furthermore, voriconazole has shown excellent activity against many moulds in particular against Aspergillus species, but endemic fungi such as Histoplasma capsulatum are in the spectrum as well. Clinical efficacy was demonstrated in several large phase II/III studies in diseases such as oral and oesophageal candidosis, acute invasive aspergillosis or chronic invasive aspergillosis. New adverse events such as visual disturbances has been described together with the use of voriconazole, but the majority of adverse events are similar to other triazole drugs and in particular not life‐threatening. With the introduction of voriconazole a great progress in the therapy of invasive fungal infections was achieved. In the therapy of invasive aspergillosis, voriconazole is significantly more effective compared to amphotericin B desoxycholate.