bluuebunny/crossref_metadata_2025_split huggingface dataset:
Unraveling tuberculosis patient cluster transmission chains: integrating WGS-based network with clinical and epidemiological insights
Authors: Sadovska Darja , Ozere Iveta , Pole Ilva , Ķimsis Jānis , Vaivode Annija , Vīksna Anda , Norvaiša Inga , Bogdanova Ineta , Ulanova Viktorija , Čapligina Valentīna , Bandere Dace , Ranka Renāte 
Published: May 2024

BackgroundTuberculosis remains a global health threat, and the World Health Organization reports a limited reduction in disease incidence rates, including both new and relapse cases. Therefore, studies targeting tuberculosis transmission chains and recurrent episodes are crucial for developing the most effective control measures. Herein, multiple tuberculosis clusters were retrospectively investigated by integrating patients’ epidemiological and clinical information with median-joining networks recreated based on whole genome sequencing (WGS) data of Mycobacterium tuberculosis isolates.MethodsEpidemiologically linked tuberculosis patient clusters were identified during the source case investigation for pediatric tuberculosis patients. Only M. tuberculosis isolate DNA samples with previously determined spoligotypes identical within clusters were subjected to WGS and further median-joining network recreation. Relevant clinical and epidemiological data were obtained from patient medical records.ResultsWe investigated 18 clusters comprising 100 active tuberculosis patients 29 of whom were children at the time of diagnosis; nine patients experienced recurrent episodes. M. tuberculosis isolates of studied clusters belonged to Lineages 2 (sub-lineage 2.2.1) and 4 (sub-lineages 4.3.3, 4.1.2.1, 4.8, and 4.2.1), while sub-lineage 4.3.3 (LAM) was the most abundant. Isolates of six clusters were drug-resistant. Within clusters, the maximum genetic distance between closely related isolates was only 5–11 single nucleotide variants (SNVs). Recreated median-joining networks, integrated with patients’ diagnoses, specimen collection dates, sputum smear microscopy, and epidemiological investigation results indicated transmission directions within clusters and long periods of latent infection. It also facilitated the identification of potential infection sources for pediatric patients and recurrent active tuberculosis episodes refuting the reactivation possibility despite the small genetic distance of ≤5 SNVs between isolates. However, unidentified active tuberculosis cases within the cluster, the variable mycobacterial mutation rate in dormant and active states, and low M. tuberculosis genetic variability inferred precise transmission chain delineation. In some cases, heterozygous SNVs with an allelic frequency of 10–73% proved valuable in identifying direct transmission events.ConclusionThe complex approach of integrating tuberculosis cluster WGS-data-based median-joining networks with relevant epidemiological and clinical data proved valuable in delineating epidemiologically linked patient transmission chains and deciphering causes of recurrent tuberculosis episodes within clusters.
Implementing exercise recommendations into clinical practice—new findings from mental health professionals' and patients' perspectives in a university psychiatric setting
Authors: Hirschbeck Anna , Kossmann David , Schwegler Hannah , Greiner Sophie-Kathrin , Hasan Alkomiet , Roeh Astrid 
Published: May 2024

IntroductionTo date, concrete recommendations for physical activity in psychiatric treatments are limited. Thus, we evaluated knowledge, barriers and beliefs associated with exercise prescription of mental health professionals (MHP) to people with mental illnesses. We aimed to identify patients' barriers to exercise participation and to work out options addressing these barriers.MethodsIn our cross-sectional and questionnaire-based investigation, we recruited medical, nursing and therapeutic staff and patients of a psychiatric clinic by email and personal contact. Questionnaires contained the German versions of The Exercise in Mental Illness Questionnaire (EMIQ-G) and the International Physical Activity Questionnaires (IPAQ).ResultsWe included 100 MHP and 100 patients. MHP had significantly more knowledge regarding positive effects of exercise on general health than patients. Exercise was prescribed mostly (48.4%) or always (37.9%) by MHP. The data showed missing education in exercise prescriptions and different recommendation behavior. Male patients seemed to experience exercise more often as a positive distraction and had lower physical health barriers than females.DiscussionPhysical activity needs to be more integrated in psychiatric treatments. Some strategies as educating MHP and patients regarding potential benefits of exercise via psychoeducative brochures and adapting recommendations to individual symptoms could improve exercise behavior in psychiatric patients.
Advanced Computational Analysis of Cobalt-Based Superalloys through Crystal Plasticity
Authors: Keshavarz Shahriyar , Campbell Carelyn E. , Reid Andrew C. E. 
Published: May 2024

This study introduces an advanced computational method aimed at accelerating continuum-scale processes using crystal plasticity approaches to predict mechanical responses in cobalt-based superalloys. The framework integrates two levels, namely, sub-grain and homogenized, at the meso-scale through crystal plasticity finite element (CPFE) platforms. The model is applicable across a temperature range from room temperature up to 900 °C, accommodating various dislocation mechanisms in the microstructure. The sub-grain level explicitly incorporates precipitates and employs a dislocation density-based constitutive model that is size-dependent. In contrast, the homogenized level utilizes an activation energy-based constitutive model, implicitly representing the γ′ phase for efficiency in computations. This level considers the effects of composition and morphology on mechanical properties, demonstrating the potential for cobalt-based superalloys to rival nickel-based superalloys. The study aims to investigate the impacts of elements including tungsten, tantalum, titanium, and chromium through the homogenized constitutive model. The model accounts for the locking mechanism to address the cross-slip of screw dislocations at lower temperatures as well as the glide and climb mechanism to simulate diffusions at higher temperatures. The model’s validity is established across diverse compositions and morphologies, as well as various temperatures, through comparison with experimental data. This advanced computational framework not only enables accurate predictions of mechanical responses in cobalt-based superalloys across a wide temperature range, but also provides valuable insights into the design and optimization of these materials for high-temperature applications.
Unveiling Non-Covalent Interactions in Novel Cooperative Photoredox Systems for Efficient Alkene Oxidation in Water
Authors: Guerrero Isabel , Viñas Clara , Teixidor Francesc , Romero Isabel 
Published: May 2024

A new cooperative photoredox catalytic system, [RuII(trpy)(bpy)(H2O)][3,3′-Co(8,9,12-Cl3-1,2-C2B9H8)2]2, 5, has been synthesized and fully characterized for the first time. In this system, the photoredox catalyst [3,3′-Co(8,9,12-Cl3-1,2-C2B9H8)2]− [Cl6-1]−, a metallacarborane, and the oxidation catalyst [RuII(trpy)(bpy)(H2O)]2+, 2 are linked by non-covalent interactions. This compound, along with the one previously synthesized by us, [RuII(trpy)(bpy)(H2O)][(3,3′-Co(1,2-C2B9H11)2]2, 4, are the only examples of cooperative molecular photocatalysts in which the catalyst and photosensitizer are not linked by covalent bonds. Both cooperative systems have proven to be efficient photocatalysts for the oxidation of alkenes in water through Proton Coupled Electron Transfer processes (PCETs). Using 0.05 mol% of catalyst 4, total conversion values were achieved after 15 min with moderate selectivity for the corresponding epoxides, which decreases with reaction time, along with the TON values. However, with 0.005 mol% of catalyst, the conversion values are lower, but the selectivity and TON values are higher. This occurs simultaneously with an increase in the amount of the corresponding diol for most of the substrates studied. Photocatalyst 4 acts as a photocatalyst in both the epoxidation of alkenes and their hydroxylation in aqueous medium. The hybrid system 5 shows generally higher conversion values at low loads compared to those obtained with 4 for most of the substrates studied. However, the selectivity values for the corresponding epoxides are lower even after 15 min of reaction. This is likely due to the enhanced oxidizing capacity of CoIV in catalyst 5, resulting from the presence of more electron-withdrawing substituents on the metallacarborane platform.
Factores de riesgo cardiovascular en pacientes geriátricos atendidos en el centro de salud INNFA
Authors: Tasé Martínez María Josefa , Alabuela Tiriats Angela América , Cabrera Chacha Esthefany Nayeli , Mena Pérez Silvia Nayeli 
Published: May 2024

Los llamados factores de riesgo cardiovascular conductuales, como la dieta inadecuada, sedentarismo, el consumo excesivo de alcohol y el tabaquismo, aumentan la probabilidad de ataque cardíaco y accidente cerebrovascular, incluso cuando coexisten en personas sin padecimientos previos. Objetivo fue identificar los factores de riesgo cardiovascular en pacientes geriátricos del Centro de salud INNFA, en Macas, Ecuador. Metodología: Investigación con enfoque cuantitativo, diseño no experimental, alcance descriptivo, de corte transversal, empleó una muestra de 40 pacientes geriátricos atendidos en el Centro de Salud referido, la técnica para la recolección de datos fue la encuesta y el instrumento un cuestionario de riesgos cardiovasculares. La muestra de estudio se caracterizó por el predominio del sexo femenino y edades entre 60 y 69 años en los pacientes, condiciones socio-económicas que pueden incrementar el riesgo cardiovascular como como nivel educativo básico y la remuneración menor a un salario básico unificado. Conclusión: La mayoría de los pacientes presentaban dos o más factores de riesgo y entre estos predominaron la hipertensión arterial, hipercolesterolemia, sobrepeso, consumo excesivo de bebidas alcohólicas y la diabetes mellitus.
Obesidad como factor implicado en la gravedad de la infección por SARS-CoV-2
Authors: Solano Coyago Angi , Fernández Diana 
Published: May 2024

Las personas obesas enfrentan mayores complicaciones al contraer SARS-CoV-2 debido a su estado proinflamatorio crónico y respuesta inmune reducida, relacionados con el exceso de tejido adiposo. La interacción del virus con los receptores ACE2 y la retención de lípidos ectópicos renales son aspectos clave en este contexto. Objetivo. Analizar las características específicas de la obesidad que aumentan la susceptibilidad a síntomas graves de COVID-19, a partir de artículos publicados entre 2020 y 2022, y promover futuras investigaciones. Metodología. Se realizó una revisión sistemática de artículos originales entre 2020 y 2022 utilizando términos clave y operadores booleanos en bases de datos como PubMed, Scopus, ProQuest, etc. Se excluyeron estudios no originales para obtener investigaciones más específicas. Resultados. De 180 artículos encontrados, 42 fueron seleccionados. Entre estos, se destacó que pacientes obesos, especialmente hombres de edad avanzada, presentaron severas complicaciones. Sin embargo, jóvenes con obesidad severa y personas con bajo peso también mostraron mayor riesgo de mortalidad. La disminución de la función pulmonar, bajos niveles de vitamina D, y la alteración de ACE2 fueron implicados en la gravedad de la infección. La hiperglucemia asociada a la obesidad aumentó el riesgo de ingreso a UCI y ventilación mecánica, mientras que la resistencia a la insulina empeoró el pronóstico. Conclusión. La obesidad emerge como un factor de riesgo importante para la gravedad y mortalidad por COVID-19, señalando la necesidad de una atención específica para este grupo de pacientes y la continuación de investigaciones en el área.
Identificación de enterobacterias productoras de carbapenemasas en el Hospital Universitario Católico de Cuenca
Authors: Sarango Gualan Claudia , Macías Matamoros Andrea 
Published: May 2024

Las enterobacterias productoras de carbapenemasas desarrollan infecciones resistentes a los medicamentos en neumonía, infección del tracto urinario e infecciones relacionadas con dispositivos. Klebsiella pneumoniae, Escherichia coli y Enterobacter cloacae son amenazas de resistencia emergentes importantes a nivel mundial, lo que representa alta mortalidad y limitadas opciones de tratamiento. Objetivo: Detectar la presencia de EPC de clase A, mediante la aplicación del test fenotípico de sinergia con ácido borónico en cepas de enterobacterias aisladas de superficies inertes en el Hospital Universitario Católico de Cuenca, Ecuador. Materiales y Métodos: Estudio cuali-cuantitativo de tipo experimento puro de corte transversal y alcance exploratorio - descriptivo. Las enterobacterias se identificaron mediante test bioquímicos del sistema estandarizado API 20 E. Para la detección fenotípica de carbapenamasas de clase A se utilizó el método de sinergia de discos con ácido borónico y discos imipenem, meropenem y ertapenem. Resultados: Se identificaron 25 géneros de enterobacterias, el 24 % fue Pseudomonas aeruginosam, el 20 % de enterobacterias fue productoras de carpapenemasas clase Am mientras que el 32 % fue resistente para los tres carbapenémicos en estudio, el 68 % mostró sensibilidad para imipenem, el 56 % para meropenem y 44 % para ertapenem. El 48 % de enterobacterias fueron resistentes a ertapenem, el 44 % a meropenem y 32 % a imipenem. Conclusiones: Enterobacterias como P. aureginosa, E. cloacae, Cronobacter spp. y E. coli presentan mecanismos de resistencia asociados a carbapenemasas clase A tipo KPC por lo que se recomienda vigilancia continua y estrategias de manejo para abordar la resistencia a carbapenémicos en entornos hospitalarios.
Relación entre la calidad de sueño y somnolencia diurna en estudiantes universitarios
Authors: Palacios Garay Jessica Paola , Rodríguez Salazar Raúl Eduardo , Fuerte Montaño Leonardo , Pereyra Zaldívar Violeta , Ramírez Maldonado Yenncy Petronila 
Published: May 2024

Los estudiantes universitarios están propensos a sufrir alteraciones en el sueño como la somnolencia diurna, lo cual tiene repercusión directa en su calidad de vida y desempeño diario. Objetivo. Determinar la relación entre la calidad de sueño y somnolencia diurna en estudiantes de la Universidad nombre, en Perú. Materiales y Métodos. Se consideró el enfoque cuantitativo, de diseño no experimental, con la aplicación de los instrumentos de calidad del sueño de Pittsburgh y la escala de somnolencia Epworth. La población fue de 446 estudiantes y se obtuvo una muestra de 220 estudiantes universitarios, mediante un muestreo no probabilístico. Resultados. Se presentan severos problemas en relación a la calidad del sueño en un 60,9 %; así como en la calidad subjetiva del sueño en un 49,5 %, duración del sueño en un 54,5 %, uso de medicación hipnótica en un 56,8 %, disfunción diurna 50,5 %; y la latencia del sueño, eficiencia de sueño habitual y alteraciones del sueño en un 57,7 %. Entre tanto, la somnolencia diurna fue alta en un 58,6 %. Conclusiones. Existe relación positiva y significativa entre la calidad del sueño y la somnolencia diurna en los alumnos de la Universidad nombre, alcanzando una ? = 0.000 (? < 0.05); del mismo modo se encontró relación significativa en cada una de las dimensiones de la calidad del sueño y la somnolencia diurna; de lo que se interpreta que la calidad del sueño de problemas de nivel leve, la somnolencia diurna se encuentra en niveles bajos en los universitarios.
Prognostic Significance of Conventionally Used Clinical and Laboratory Tests Findings in Assessing COVID-19 Severity in Pregnant Women
Authors: Хрыщанович В.Я. , Скобелева Н.Я. , Красько О.В. 
Published: May 2024

Цель. Установить прогностическую значимость показателей традиционно применяемых клинико-лабораторных тестов в оценке тяжести течения COVID-19 у беременных женщин. Материалы и методы. Ретроспективно были изучены клинические и лабораторные данные 41 беременной пациентки. Женщины с диагнозом COVID-19 были разделены на две группы – легкой/умеренной и тяжелой степени тяжести. При поступлении в стационар оценивались лабораторные показатели функции печени и почек, острой фазы воспаления, коагуляции, общего анализа крови. Возможность использования биомаркеров как критериев прогнозирования тяжести заболевания исследовалась с помощью ROC-анализа. Результаты. Активированное частичное тромбопластиновое время (аЧТВ), уровни активности аспартатаминотрансферазы (АСТ), лактатдегидрогеназы (ЛДГ), содержание пресепсина претерпевают значительное возрастание в случаях тяжелого течения COVID-19 при сравнении с группой легкой/средней степени тяжести COVID-19 (p=0,003, p=0,006, p=0,01 и p=0,032 соответственно). Наибольшая площадь под ROC-кривой (area under curve) составила 0,82 для пресепсина (с точкой отсечения 484 нг/л); различий в информативности при сравнении AUC ACT, ЛДГ, аЧТВ и пресепсина не выявлено (р>0,05). Заключение. Достоверными предикторами тяжелого течения COVID-19 во время беременности являются лабораторные тесты определения аЧТВ, активности АСТ, ЛДГ и содержания пресепсина; по данным, представленным в доступной литературе, информативность последнего биомаркера до настоящего времени не оценивалась.
Purpose. To establish the prognostic significance of conventionally used clinical and laboratory tests in assessing COVID-19 severity in pregnant women. Materials and methods. A retrospective study of clinical and laboratory findings of 41 pregnant women was performed. Women diagnosed with COVID-19 were divided into two groups: with mild/moderate or severe disease course. Laboratory values of liver and kidney function, acute phase of inflammation, coagulation, and total blood count were evaluated on admission to the hospital. The utility of biomarkers as criteria for disease severity predicting was evaluated using ROC-analysis. Results. Activated partial thromboplastin time (aPTT), aspartate aminotransferase (AST), presepsin and lactate dehydrogenase (LDH) levels underwent a significant increase in cases of severe COVID-19 when compared to the mild/moderate COVID-19 group (p=0.003, p=0.006, p=0.01 and p=0.032 respectively). The largest area under the ROC curve was 0.82 for presepsin (with a cut-off value of 484 ng/L), but there was no difference in significance when comparing AUC AST, LDH, aPTT and presepsin (p>0.05). Conclusion. Significant predictors of COVID-19 severe course in pregnancy are laboratory tests for aPTT, AST activity, LDH, and presepsin level; in accordance with data presented in the available literature, the last biomarker’s usefulness has not been evaluated to date.
Penerapan Teknologi Tepat Guna (TTG) Mesin Pencacah Pelepah Sawit Untuk Masyarakat Suku Sakai Di Desa Kesumbo Ampai Kecamatan Bathin Solapan
Authors: Indra Akmal , Fajrul Rahmat 
Published: May 2024

Kehidupan masyarakat suku sakai sekarang ini sudah tidak seperti dahulu yang hidup di dalam hutan tetapi masyarakat suku sakai sudah berbaur dengan masyarakat lokal dan hidup sudah menetap. Masyarakat asli suku sakai di Kecamatan Bathin Solapan Kabupaten Bengkalis menggeluti mata pencaharian di bidang pertanian, peternakan, dan perikanan. Salah satu mata pencaharian masyarakat suku sakai di desa Kesumbo Ampai adalah bidang perkebunan sawit. Hasil perkebunan sawit langsung di jual ke Pabrik Kelapa Sawit (PKS) yang berada di kecamatan Bathin Solapan. Dalam pemeliharaan pohon sawit, masyarakat suku sakai memotong (pruning) pelepah sawit yang sudah tidak hijau lagi dan pelepah sawit juga akan dipotong jika akan melakukan panen. Biasanya pelepah sawit ini akan di tumpuk dan di biarkan begitu saja serta ada juga yang membakar pelepah sawit. Tujuan dari kegiatan pengabdian masyarakat ini adalah memanfaatkan pelepah sawit dengan cara melatih masyarakat suku sakai dalam penggunaan dan perawatan mesin, melatih membuat pakan ternak dan pupuk kompos dari pelepah sawit.Kata Kunci: pelepah, pupuk, pakan
Mesin Pembelah Buah Pinang Untuk Meningkatkan Efisiensi Proses Produksi Biji Pinang BUMDES Kembung Baru Bengkalis
Authors: Marzuarman Marzuarman , Stephan Stephan , Muharnis Muharnis , Putra Hari 
Published: May 2024

Masyarakat Desa Kembung baru, Kecamatan Bantan, Kabupeten Bengkalis, umumnya bekerja sebagai petani pinang. Banyaknya hasil panen dan terbatasnya tenaga pekerja yang bertugas membelah pinang menyebabkan waktu dalam produksi biji pinang menjadi lebih lama. Dengan adanya mesin pembelah pinang ini akan mempermudah mitra untuk membelah pinang setiap harinya, karena mesin yang didesain ini mampu membelah pinang setiap waktu secara terus menerus. Dalam kegiatan pengabdian masyarakat ini ada beberapa kegiatan yang akan dilakukan, mulai dari survei ke lokasi mitra, perancangan dan pembuatan mesin, dan serah terima mesin pembelah pinang kepada mitra, serta sosialisasi cara penggunaan mesin. Berdasarkan hasil kegiatan, mesin pembelah pinang yang dibuat mampu membelah pinang hingga mencapai 250 kg/ jam, dan mesin ini telah diserahkan ke BUMDES Desa Kembung Baru Bengkalis melalui Kepala Desa Hendri Cong Meng pada tanggal 29 September 2021.Kata Kunci: Desa Kembung Baru Bengkalis, Mesin Pembelah Pinang, Buah Pinang
Pemasaran Berbasis Digital dan Penerapan Alat Pengasapan Ikan pada Kelompok Nelayan (Studi Kasus : Kelompok Nelayan Berkah Sepakat)
Authors: Gultom Lipantri Mashur , Amirullah Desi 
Published: May 2024

Desa Deluk merupakan salah satu Desa di Kabupaten Bengkalis, sebagian besar kondisi perekonomian masyarakatnya tertumpu pada sektor kelautan dan pertanian. Kelompok Nelayan Berkah Sepakat merupakan salah satu Kelompok Nelayan tradisional yang ada di Desa Deluk dan menjadi Mitra dalam pengabdian ini. Kelompok ini memiliki 4 unit kapal tangkap dan 12 orang nelayan. Kelompok Nelayan ini telah melakukan aktifitas pengasapan ikan secara tradisional jika ada pesanan dari masyarakat sekitar untuk dapat meningkatkan nilai jual dan menambah pendapatan ekonomi. Permasalahan mitra, yaitu rendahnya kualitas dan kuantitas produk ikan asap karena model pengasapan ikan dilakukan secara tradisional. Dari analisis wawancara dan analisis permasalahan Mitra, selanjutnya tim pengusul bersama Kelompok Nelayan Berkah Sepakat, menyepakati untuk mengatasi permasalah tersebut dengan solusi pertama yaitu melakukan pemasaran berbasis digital yang bertujuan untuk memudahkan dalam menyampaikan informasi produk penjualan ikan asap, agar dapat langsung dijual kepada konsumen, sehingga kelompok nelayan dapat menikmati hasil penjualan yang lebih tinggi. Solusi kedua yaitu pembuatan dan penerapan Alat Pengasapan Ikan agar kelompok mitra dapat meningkatkan kualitas dan kuantitas serta dapat memproduksi secara rutin. Hasil akhir dari program pengabdian masyarakat ini adalah transfer knowledge dan penerapan pemasaran Digital, serta penerapan TTG untuk peningkatan ekonomi masyarakat khususnya kelompok Nelayan Berkah Sepakat. Dari hasil penerapan alat pengasapan ikan, mampu memberikan hasil pengasapan yang lebih merata dan lebih baik dari metode pengasapan tradisional yang dilakukan sebelumnya. Beberapa keunggulan alat TTG ini adalah tidak mudah gosong, dan aman ketika ditinggalkan menunggu hasil pengasapannya matang.Kata Kunci: Nelayan Tradisional, Ikan Asap, Digital Marketing, TTG Pengasapan Ikan