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Next-Generation Sequencing of Dried Blood Spot Specimens: A Novel Approach to HIV Drug-Resistance Surveillance
Authors: Ji Hezhao , Li Yang , Graham Morag , Liang Ben Binhua , Pilon Richard , Tyson Shari , Peters Geoff , Tyler Shaun , Merks Harriet , Bertagnolio Silvia , Soto-Ramirez Luis , Sandstrom Paul , Brooks James 
Published: June 2011

Background HIV drug-resistance (DR) surveillance in resource-limited settings can be performed using dried blood spots (DBS) because of ease of collection, transportation and storage. Analysis of pooled specimens on next-generation sequencing (NGS)-based platforms, such as the 454 pyrosequencing, is an efficient sequencing method for determining HIV DR rates. In this study, we conducted HIV DR surveillance on DBS using NGS and identified minority variants in individual patients. Methods A total of 48 extracts of DBS from an HIV DR surveillance study in Mexico City were re-amplified using primers tagged with multiplex identifiers, pooled and pyrosequenced. Consensus sequences were generated for each specimen with mixtures identified at positions where >20% of the reads contained a variant. Individual consensus sequences were then analysed for DR mutations and compared with those derived from Sanger sequencing. Results DBS analysed with tagged pooled pyrosequencing (TPP) were highly concordant with Sanger sequencing genotypes from matching plasma and DBS (99.21% and 99.51%, respectively). An exception was an M184I mutation only detected with TPP of DBS at a frequency of 20.4%. Multiple specimens had minority variant reads below the 20% mixture threshold. Conclusions TPP using DBS is an effective method for HIV DR surveillance. TPP for genotyping results in cost savings of 40% over conventional in-house methods. The effect of low-abundance DR mutations, undetectable by conventional methods, remains to be determined. This technology might be applied to any HIV specimen (plasma/ serum) and can also be used for other diagnostic assays where DNA sequencing is required.
Les thérapies ordonnées par la justice pour les adolescents surconsommateurs de substances psychoactives : réflexions et expériences dans un débat d'actualité
Authors: Nielsen Philip , Beytrison Philippe , Croquette-Krokar Marina 
Published: June 2011

Résumé Est-il possible de mener à bien une thérapie sous contrainte ? Quelles sont les conditions pour que les thérapies ordonnées par la justice soient efficaces ? Ou faisons-nous fausse route en posant la question de cette façon ? En tout état de cause, le travail avec les jeunes envoyés par le Tribunal des Mineurs et leurs familles oblige les thérapeutes de la FONDATION PHENIX à repenser leur position dans le système de traitement. Les auteurs prennent appui sur 3 ans d’intense collaboration avec le Tribunal des Mineurs de Genève et une riche expérience qui émane d’une recherche randomisée menée conjointement avec 5 pays européens.
Al-Qaida, 2011
Authors: Steinberg Guido 
Published: June 2011

Les révolutions dans le monde arabe constituent une défaite pour Al‑Qaida, organisation déjà affaiblie par dix ans de guerre contre le terrorisme. Si elle est en crise, Al-Qaida est toutefois loin d’avoir rendu les armes. Elle fait preuve d’une résilience remarquable, liée à sa stratégie de décentralisation en Irak, au Maghreb, dans la péninsule Arabique et même en Europe où semble émerger un « djihad sans leader ». politique étrangère
La politique de défense européenne après le traité de Lisbonne
Authors: Menon Anand 
Published: June 2011

Le traité de Lisbonne, censé doter l’UE de capacités nouvelles en matière de politique étrangère et de défense, ne règle pas les grands problèmes qui se posent : la cohérence entre institutions européennes ; la question des capacités militaires ; surtout, celle de l’absence de volonté commune que génère la divergence des politiques nationales. L’Union ne pourrait désormais reprendre sa marche en avant qu’en redéfinissant des ambitions limitées, conformes à sa volonté et à ses moyens. politique étrangère
Maintien de la paix robuste : le cas de la FINUL renforcée
Authors: Michel Benoît 
Published: June 2011

Depuis 2006, les Nations unies déploient au Liban une FINUL « renforcée », politiquement – le maintien de la paix devient « robuste » –, et militairement. Ce renforcement du dispositif permet aux Casques bleus d’agir plus efficacement. Il reste que le statu quo demeure fragile. Et la capacité à agir de la force internationale est déterminée par l’évolution de la situation politique. Cette dernière est déterminante : le militaire ne peut résoudre les problèmes politiques. politique étrangère
Une politique auto-subversive
Authors: Barrault-Stella Lorenzo 
Published: June 2011

Résumé Cet article aborde les dynamiques de l'action publique éducative à travers l'attribution des dérogations à la sectorisation dans l'enseignement primaire. L'analyse des pratiques des acteurs institutionnels, sur la base d'observations ethnographiques (notamment en commissions), d'entretiens diversifiés et d'archives, souligne les logiques institutionnelles et politiques des aléas de l'acceptation des demandes. Les différents acteurs défendent des intérêts contrastés et sont susceptibles de se réapproprier cette « passe du droit » à différents moments pour ajuster les effectifs scolaires, mettre en œuvre des stratégies d'établissement ou encore entretenir des relations clientélaires. Les incertitudes de l'aboutissement des demandes sont ainsi liées à des contraintes structurelles, à l'application fluctuante de normes casuistiques, et aux variations des rapports de force au sein de la configuration des producteurs de dérogations. À travers le dispositif étudié, l'article propose une analyse processuelle et relationnelle de l'action publique qui invite à penser ensemble ses caractéristiques structurelles et ses contingences.
Biomechanical Evaluation of Open Suture Anchor Fixation Versus Interference Screw for Biceps Tenodesis
Authors: Papp Derek F. , Skelley Nathan W. , Sutter Edward G. , Ji Jong Hun , Wierks Carl H. , Belkoff Stephen M. , McFarland Edward G. 
Published: June 2011

Biceps tenodesis provides reliable pain relief for patients with biceps tendon abnormality. Previous cadaver studies have shown that, for biceps tenodesis, an interference screw provides biomechanical strength to failure superior to that of suture anchors. This finding has led some providers to conclude that screw fixation for biceps tenodesis is superior to suture anchor fixation. The purpose of the current study was to test the hypothesis that the strength of a 2-suture-anchor technique with closing of the transverse ligament is equal to that of interference screw fixation for biceps tenodesis.
In 6 paired, fresh-frozen cadaveric shoulder specimens, we excised the soft tissue except for the biceps tendon and the transverse ligament. We used 2 different methods for biceps tenodesis: (1) suture anchor repair with closing of the transverse ligament over the repair, and (2) interference screw fixation of the biceps tendon in the bicipital groove. Each specimen was preloaded with 5 N and then stretched to failure at 5 mm/sec on a materials testing machine. The load-to-failure forces of each method of fixation were recorded and compared. Mean loads to failure for the suture anchor and interference screw repairs were 263.2 N (95% confidence interval [CI], 221.7–304.6) and 159.4 N (95% CI, 118.4–200.5), respectively. Biceps tenodesis using suture anchors and closure of the transverse ligament provided superior load to failure than did interference screw fixation. This study shows that mini-open techniques using 2 anchors is a biomechanically comparable method to interference fixation for biceps tendon tenodesis.
Long-term Results of Dorsally Displaced Distal Radius Fractures Treated With the Pi-Plate: Is Hardware Removal Necessary?
Authors: Tyllianakis Minos E. , Panagopoulos Andreas M. , Saridis Alkis 
Published: June 2011

The purpose of this study was to evaluate the outcome of patients treated with open reduction and internal fixation (ORIF) using dorsal plates and screws (AO/ASIF pi-plate) for dorsally displaced fractures of the distal radius. Although extensor tendon rupture is a recognized complication of all distal radial fractures, there appears to be an increased risk of this using dorsal plating. In addition, there is the added complication of extensor tendon irritation and dorsal wrist pain, which may necessitate plate removal. The low-profile pi-plates intended to overcome this problem have not done so, with quoted rates ranged from 19% to 55%.
We treated 32 completely evaluated patients (13 men and 19 women) in our department between 2000 and 2004, with an average age of 46 years. They underwent ORIF of dorsally displaced fractures of the distal radius using the specially designed pi-plate. Bone graft was used in 18 patients who had significant metaphyseal defect. Clinical examination, plain radiographs, and functional assessments using the modified Mayo Wrist Score were performed at an average follow-up of 86 months (range, 56–115 months). Satisfactory reduction was achieved in all 32 fractures at the time of operative fixation with no instances of loss of fracture reduction during the study period. According to the Mayo Wrist Score, 23 patients (72%) had excellent or very good results, 7 (22%) had fair results, and 2 (6%) had poor results. Two cases (6.25%) of extensor tendon rupture were noted during the first postoperative month, and 2 other patients showed progressive weakness of index finger extension 6 months postoperatively. The remaining 28 patients had no soft tissue problems.
Barbarisation moderne des guerres dans l’empire global : le paradigme de la guerre de banlieue
Authors: Joxe Alain 
Published: June 2011

Alain Joxe entend quant à lui partir du champ stratégique (vs juridique, psychologique, politique, social, religieux), d’où sa proposition d’un examen d’« identités stratégiques » (identités préconstituées des forces en présence projetées dans un temps long d’avant le combat) pourvues elles-mêmes de « modules génétiques » de leurs représentations (par exemple Gilgamesh) et où comptent les échelles d’organisation de la protection (la fixation des échelles étant un moyen de donner un lieu aux mutations importantes qui rapprochent de la barbarisation). Il s’interroge sur le fait que nous soyons ou non aujourd’hui à un moment de « rupture systémique ». Les États-Unis depuis la chute du mur constituent un nouvel empire dans la mesure où, pour la première fois, il peut apparaître comme « unique ». Sous Bill Clinton, cet empire d’abord économique n’était pas stratégiquement fondé sur l’existence de « barbares » dans un « ailleurs » quelconque et était donc dépourvu de limes, ce qui est en train de changer avec George W. Bush par la redéfinition d’un ennemi déterminé et présent. Le nouveau militarisme américain relève d’une régression vers une nouvelle territorialisation liée à la perte initiale de l’ennemi, d’où une contradiction du point de vue des échelles entre la conquête du monde par le capital et le maintien d’une présence militaire délimitée, sans pour autant que n’émerge une représentation claire de la sécurité des États-Unis ni une pensée claire de ce que peut être dans ce cas la fonction de protection de l’État. L’horizon est celui de la reconstitution d’une périphérie barbare dans un monde pourtant dépourvu de limes (cf. paradigme de la guerre de banlieue, la création d’un ennemi étant nécessaire pour réaffirmer le rôle protecteur de l’État). La logique de la nouvelle guerre asymétrique du fort au faible fait que la force des uns est tellement supérieure qu’elle les rend incapables de penser les éléments nouveaux et différents d’une situation. Voulant maîtriser toutes les échelles, l’hyperpuissance court le risque d’arriver ainsi à toutes les échelles de barbarie.
Penser la guerre à partir des femmes et du genre : l’exemple de la Grande Guerre
Authors: Thébaud Françoise 
Published: June 2011

Françoise Thébaud, en posant la question de savoir comment le genre structure les politiques de guerre, présente une intervention qui fait le point sur la « barbarisation » de la guerre dans le cadre de l’histoire du genre, à partir de la mise en évidence du passage du problème de l’émancipation, ou de l’autonomisation (cf. travaux des années 1960-1970), des femmes à celui de la réflexion plus récente sur la violence de guerre (depuis les années 1980) qui conteste la thèse de la guerre « émancipatrice » (si provisoire et superficielle qu’ait été cette émancipation). Dans ce cadre-là, la guerre en ex-Yougoslavie a pu jouer un rôle d’accélérateur de la prise de conscience du caractère très relatif de l’émancipation des femmes par la guerre des hommes. Certains historiens récents de la Première Guerre mondiale en viennent à travailler sur la culture de guerre qui serait le fondement d’une « brutalisation » du conflit au nom d’une « ethnicisation » de l’ennemi. Leurs thèses sont contestées par ceux qui rejettent l’idée d’un simple consentement à la guerre au profit d’un mélange complexe de contraintes, fraternité, patriotisme et refusent que la « culture de guerre » prenne le pas sur les autres cultures pré-existantes. La place des femmes et du genre dans la guerre est d’abord abordée par F. Thébaud à la lumière d’une double mythologie sexualisée (l’équation pureté nationale/pureté sexuelle et la féminisation de l’ennemi comme décadent) et de l’autre mythe de la femme « naturellement » pacifiste en tant que mère potentielle. Or, les féministes ont adhéré massivement à l’effort de guerre et l’internationalisme « féministe » s’est effondré. Par ailleurs, la relative « humanisation » du conflit dont sont porteuses les femmes aux armées se fait toujours au service exclusif de la patrie. Dans un dernier volet de son intervention, F. Thébaud s’attarde sur la réalité des violences faites aux femmes et les réactions qu’elles ont pu susciter. Les viols ont eu lieu pendant l’invasion plus que pendant l’occupation et le débat sur l’« enfant de l’ennemi » s’il a été animé d’un point de vue discursif ne permet pas d’en savoir beaucoup plus sur la réalité. Les déportations de femmes hors des villes occupées suscitèrent, quant à elles, suffisamment de réactions violentes pour que les Allemands mettent fin à cette pratique dès 1916. Certaines interventions féministes visèrent à modifier les lois de la guerre mais on en sait peu sur la place des femmes dans l’humanisation de la guerre. Par ailleurs, une comparaison s’avérerait nécessaire entre les histoires respectives de la guerre dans les pays dits occidentaux et dans les pays de l’Est.
Les fonctions du paradigme mélancolique dans la Préface de l’Anatomie de la Mélancolie de Robert Burton
Authors: Crignon Claire 
Published: June 2011

Au moment où paraît l’Anatomie de la Mélancolie de Robert Burton (1e édition en 1621), l’humorisme se trouve sérieusement remis en cause par les découvertes du contemporain de Burton, William Harvey, concernant la circulation du sang. Comment expliquer alors la parution de cet ouvrage qui se présente comme une somme de toutes les connaissances médicales, philosophiques ou historiques accumulées au sujet de la mélancolie depuis l’Antiquité jusqu’à la fin de la Renaissance ? L’article se donne pour objectif de comprendre quel peut être l’intérêt stratégique d’un recours au discours mélancolique et à la théorie des humeurs, lesquels deviennent sous la plume de Burton des instruments idéals permettant d’attirer l’attention sur la crise politique, sociale, économique et religieuse que traverse la monarchie anglaise de Jacques Ier.
Hayek lecteur des philosophes de l’ordre spontané : Mandeville, Hume, Ferguson
Authors: Le Jalle Eleonore 
Published: June 2011

L’article discute la lecture par Hayek de trois philosophes qu’il a inscrits dans une « tradition de l’ordre spontané » : Mandeville, Hume et Ferguson. C’est à bon droit qu’une mise en évidence, et même une valorisation, de l’ordre spontané, se trouvent identifiées par Hayek chez ces auteurs. Néanmoins, certaines distorsions peuvent être repérées dans les lectures hayékiennes. Ainsi, l’ordre spontané présent dans le texte mandevillien relève d’une évolution par croissance des institutions, des techniques et des règles humaines, ou encore d’une sélection « par essais et erreurs », mais non, comme le voudrait Hayek, d’une sélection par concurrence des groupes les pratiquant. Ainsi encore, l’ordre spontané repéré par Hayek dans l’émergence de l’ordre social et juridique chez Hume se trouve à tort identifié à un mécanisme impersonnel et abstrait de coordination des conduites analogue à la « main invisible » du marché. La convention humienne renvoie bien plutôt à une coordination consciente et résolue des actions, appuyée sur un véritable sens de l’intérêt commun. Enfin, autant Hayek repère judicieusement chez Ferguson une thématique de la formation spontanée des établissements humains, autant Hayek, en se focalisant sur l’analyse fergusonienne des mécanismes protecteurs des biens et des personnes propres aux sociétés marchandes, manque la contrepartie de ce constat chez ce même auteur, à savoir, l’analyse fergusonienne du déclin de la liberté politique dans ces mêmes sociétés marchandes. Or cette prise en compte pourrait permettre de mettre en question une opposition chère à Hayek : celle du « concept essentiellement français de liberté politique » et de « l’idéal anglais de liberté individuelle ».
La critique du réalisme leibnizien dans le De Motu de Berkeley.
Authors: Peterschmitt Luc 
Published: June 2011

L’objet de Berkeley dans le De Motu est de marquer l’autonomie de la mécanique (ou dynamique) et de la métaphysique, en montrant que le concept de force tel qu’on l’utilise en mécanique ne peut servir à déterminer ce qu’il en est de la nature des choses. Pour établir cette distinction entre ces deux domaines du savoir, Berkeley à la fois s’appuie sur et critique la notion leibnizienne de force : Leibniz assure la réalité de la force dérivative (concept mécanique) en la fondant sur la forme substantielle des corps, ou force primitive (concept métaphysique), qui permet d’attribuer aux corps une efficace causale. En récusant la forme substantielle comme inconcevable, Berkeley ruine alors le réalisme leibnizien, en vertu du lien posé par Leibniz lui-même entre sa métaphysique et sa dynamique. Mais du coup, cela permet à Berkeley d’instaurer un nouveau rôle à la métaphysique face à la mécanique : non plus un rôle fondateur comme celui que lui assigne Leibniz, mais un rôle critique, celui d’une instance qui dit les conditions sous lesquelles l’usage des concept est valide en science.
La place de l’horizon de mort dans la violence guerrière
Authors: Bach Général André 
Published: June 2011

Le général André Bach dans une réflexion sur l’« horizon de mort dans la violence de guerre » part d’une approche anthropologique du phénomène de violence et de la peur (quasiment biologique) qu’il engendre en soulignant les difficultés des sociétés occidentales à penser la mort. C’est l’État qui donne à la guerre un sens politique et sacré et qui crée les catégories fonctionnelles de la guerre (les concepts de paix et de guerre ne sont pas en eux-mêmes opérationnels). Dans le cadre d’une réflexion clausewitzienne sur la montée aux extrêmes, l’« extrême » pour le soldat est toujours sa propre mort (plus que celle de l’ennemi). Les notions de barbarisation et humanisation ne peuvent en ce sens rendre compte de la violence et de la peur radicales présentes dans toute guerre où le rôle du commandement est toujours de mettre en œuvre un degré de violence supérieur à celui de l’adversaire, sans aucune considération de « proportionnalité » de cette violence. La mise à distance technique ne diminue pas la violence mais l’augmente à proportion de l’éloignement de la peur. Seul le politique peut et doit mettre des limites à cette violence militaire par nature illimitée. La modernisation des armes ne relève jamais d’une humanisation du combat mais d’une recherche d’une violence plus efficace. L’entraînement du soldat en temps de paix n’est jamais entraînement à la violence mais apprentissage de savoir-faire et effort de constitution d’un groupe soudé, doté d’un bon moral. L’ordre et la formation tentent de limiter la sauvagerie mais il existe une constitution endogène de comportements propres au soldat, que la hiérarchie tente de canaliser dans une symbolique guerrière fondée sur le sentiment de l’honneur (destiné à compenser la peur d’être une proie vouée à mourir et à faire préférer la lutte au coude à coude sur l’instinct de conservation). Le couple violence/honneur fait que l’armée dépourvue de contrat social n’est pas soluble dans le politique (aujourd’hui dans les écoles militaires on ne parle plus d’« honneur » mais d’« éthique »…, mais pour dire la même chose). La conscription fut une rupture de la logique endogène de l’armée et introduisit une brèche dans ce système archaïque. Mais religion (au Moyen Âge) ou logique démocratique (de nos jours) s’avèrent surtout des « béquilles idéologiques » qui, en définitive, sont souvent plus efficaces pour accroître la barbarisation que pour l’éviter (exemple de la colonisation algérienne où une armée de paix, fonctionnarisée et rigoureusement canalisée, appartenant à une génération n’ayant jamais connu de violence de guerre, développe des massacres de masse).
Les charniers en Bosnie-Herzégovine. Les crimes contre les survivants
Authors: Masovic Amor 
Published: June 2011

Amor Masovic, responsable de la commission de recherche des disparus en Bosnie-Herzégovine et ancien responsable de la commission pour l’échange des prisonniers pendant la guerre de 1992-1995, nous présente ensuite un tableau accablant des disparitions dans les guerres récentes en ex-Yougoslavie, et des pratiques pour faire en sorte que ceux-ci ne soient ni retrouvés ni, encore moins, identifiés (d’où des fosses communes de deux types : « primaires » – où les corps furent enterrés initialement – et « secondaires » – où ces mêmes corps furent ré-enterrés, souvent démembrés, après avoir été déterrés pour être dispersés et moins aisés à repérer). 28 000 des 40 000 disparus ex-Yougoslaves relèvent du conflit en Bosnie et sont à 95 % des civils protégés par les conventions de Genève. Sur les 280 charniers identifiés la plupart se trouvaient à l’arrière et non sur le front et les disparitions sont datables à des périodes de non-combat. Le but de la commission est donc d’abord de retrouver et identifier les morts pour « faire savoir » et permettre le deuil (puisque la barbarisation qui a été exercée est double : contre les victimes et contre leurs familles qui ne peuvent « vivre » tant qu’elles n’ont pas de certitude). En outre, faute de disposition légale et d’une absence de droit spécifique des disparus personne ne peut être incriminé pour une disparition devant le TPIY où les « disparus » ne sont donc pas représentés. Amor Masovic tire quatre conclusions de son exposé : 1) la barbarie exprimée aujourd’hui est pour partie un résultat des manques de la justice à l’égard des crimes de guerre de la seconde guerre mondiale ; 2) la guerre contre les civils augmente en même temps qu’augmentent les dispositions internationales contre ces exactions qui restent donc purement formelles ; 3) en Bosnie, la barbarisation s’est exercée sur les corps des victimes de façon redoublée puisque l’anéantissement des preuves du crime fait que la mort n’est pas une vraie fin. D’où une forme particulière de barbarisation d’après-guerre ; 4) seul élément plus « positif » : en Bosnie des échanges de prisonniers eurent lieu pendant la guerre sans attendre la fin du conflit ce qui est rarissime et va au-delà des exigences posées par les conventions de Genève en matière de libération des prisonniers.