bluuebunny/crossref_metadata_2025_split huggingface dataset:
Correct equations for comparing models in diallel analysis
Authors: Wolf J. , Vítek M. , Herrendörfer G. , Sumpf D. 
Published: March 2011

SummaryCorrect equations are given to express the parameter estimates of four models for complete diallels as a function of the parameter estimates in the model of Eisen et al. (1983). In recent literature these equations have been partly incorrect.ZusammenfassungKorrekte Gleichungen für den Vergleich von Modellen in der DiallelanalyseFür die Darstellung der Parameterschätzwerte von vier Modellen für vollständige Diallele als Funktion der Parameterschätzwerte des Modells von Eisen et al. (1983), die in der Literatur teilweise fehlerhaft erfolgte, werden korrekte Formeln angegeben.
Relations between the goat MHC (GLA) and antibody response to diphtheria toxoid, human serum albumin and tetanus toxoid, using a twin model
Authors: Eide D. M. , Nesse L. L. , Larsen H. J. 
Published: March 2011

SummaryNorwegian dairy goats were tested for possible associations between the goat lymphocyte antigen system (GLA) and antibody response to the antigens diphtheria toxoid, human‐serum albumin and tetanus toxoid. The serum titres to these antigens following immunization, and their GLA‐specificities, were determined in 96 twin pairs. The antibody response and GLA specificity were compared between twins: twins sharing one or more GLA specificities showed a more similar primary‐antibody response to diphtheria toxoid than twins with no common specificity. The main point in comparing twins is that the MHC specificity then serves as a marker for the complete haplotype, including MHC class‐II genes. However, a gene substitution model that only tests the effect of the observed class‐I alleles revealed that animals with GLA specificity Eu2 had a significantly higher anti‐diphtheria response than Eu2‐negative animals.ZusammenfassungUntersuchungen über Beziehungen zwischen Ziegen MHC (GLA) und Antikörperreaktion auf Diptherietoxin, humanes Serum Albumin und Tetanustoxin mit ZwillingsmodellNorwegische Milchziegen wurden in Hinblick auf mögliche Assoziationen zwischen Ziegen Lymphozytenantigensystem (GLA) und Antikörperreaktion auf Antigene Diptherie Toxin, humanes Serum Albumin una Tetanustoxin untersucht. Die Serumtiter nach Immunisation und die GLA‐Spezifität wurden an 96 Zwillingspaaren erhoben und zwischen Zwillingen verglichen; Zwillinge mit ein oder mehr GLA Spezifitäten zeigten ähnlichere Primärantikörperreaktion auf Diptherie Toxin als solche ohne gemeinsame Spezifität. Der wesentliche Vorteil der Zwillinge ist, daß MHC‐Spezifität als Marker für den gesamten Haplotyp dienen kann, einschließlich MHC Klasse‐II gene. Allerdings, ein Gen‐Substitutionsmodell, das nur die Wirkungen der beobachteten Klasse‐I Allele prüft, zeigte, daß Tiere mit GLA‐Spezifität EU2 signifikant höhere Antidiptheriespiegel als EU2 negative Tiere hatten.
Genetic regulation of meat production by embryonic muscle formation – a review
Authors: te Pas M. F. W. , Visscher A. H. 
Published: March 2011

SummaryThe biological basis for meat production in livestock animals is localized in the muscles, where lean meat production is under the genetic control of tissue‐specific and more ubiquitously operating genes. The muscle tissue‐specific MyoD gene family is at the centre of the genetic regulation of myoblast proliferation and differentiation into myofibres. The regulation of embryonic muscle tissue formation (development) by the MyoD genes is duscussed in the context of livestock animals used in meat production. The possibility that the MyoD genes could be useful candidate genes for breeding is discussed. It is concluded that marker assisted selection (MAS) using markers in functional genes is advantageous over MAS using associated markers.ZusammenfassungGenetische Regulierung der Fleischproduktion bei der embryonalen Muskelbildung – Ein LiteraturüberblickDie biologische Grundlage für Fleischproduktion, lokalisiert in den Muskeln, steht unter genetischer Kontrolle durch gewebsspezifische una mehr ubiquitär arbeitende Gene. Die gewebsspezifische MyoD Genfamilie in den Muskeln befindet sich im Zentrum der genetischen Regulierung des Prozesses der Myoblastteilung und Differenzierung zu Myofasern. Die Ubersicht betrifft Regulierung der Bildung des embryonalen Muskelgewebes (Entwicklung) mit Hilfe der MyoD Gene. Die Möglichkeit, daß MyoD Gene erfolgreiche Kandidatengene für Tierzüchtung sein können, wird besprochen. ‘Marker‐assisted selection’ (MAS) mit Hilfe von Markern funktioneller Gene sollte vorteilhafter sein als MAS mit gekoppelten DNA‐Sequenzen.RésuméRégulation génétique de la production de viande par la formation embryologique des muscles — un résuméLa base biologique de la production de viande dans les animaux d'élevage se situe dans les muscles, là où la production de viande maigre est sous contrôle génétique de gènes générals et tissu‐spécifiques. La famille des gènes muscle‐spécifiques MyoD forme le centre de la régulation des procès de prolifération des myoblastes et de différenciation vers les myofibres. Le but de cet article rétrospectif est de situer la discussion sur la régulation de la formation embryologique des muscles par les gènes MyoD dans le cadre de l'élevage. La possibilité que les gènes MyoD soient des gènes candidats utiles pour l'élevage sera discutée. La conclusion faite est que ‘marker assisted selection’ (MAS) en employant des marquers situés dans des gènes fonctionnels a plus d'avantages que MAS avec des marquers associés.
Liegeverhalten und diurnale Verteilung der Liegeperioden von Dromedaren*
Authors: Sambraus H. H. 
Published: March 2011

ZusammenfassungIn Kenia und in Indien wurde je eine Dromedarherde von ca. 70 bzw. ca. 85 Tieren tagsüber und nachts beobachtet. Ermittelt wurde in 30 Min Abständen die Zahl der liegenden Tiere. Die übliche Liegeposition von Kamelen ist in Zusammenhang mit besonderen morphologischen Strukturen zu sehen. Die Dromedare lagen fast ausschließlich (Kenia) bzw. weit überwiegend (Indien) nachts. Das Liegen nahm in beiden Herden bei den Stuten fast die Hälfte des 24‐Stunden‐Tages ein. Es werden Vergleiche mit dem Liegeverhalten von Rindern angestellt.SummaryLying‐down behaviour and its diurnal distribution in dromedariesTwo herds of dromedaries, one in Kenya, consisting of about 70 animals, and one in India, consisting of about 85 animals, were observed during the day and at night. The number of animals lying down was determined at 30 min intervals. The usual lying position of camels is rotated to the specific morphological structure. The dromedaries in Kenya lie almost exclusively, and in India predominantly, at night. In both herds, the females spend almost half of the 24‐h day lying down. This behaviour is compared to the lying‐down behaviour of cattle.
Model determination in a case of heterogeneity of variance using sampling techniques
Authors: Varona L. , Moreno C. , Garcia‐Cortes L. A. , Altarriba J. 
Published: March 2011

SummaryA sampling determination procedure has been described in a case of heterogeneity of variance. The procedure makes use of the predictive distributions of each data given the rest of the data and the structure of the assumed model. The computation of these predictive distributions is carried out using a Gibbs Sampling procedure. The final criterion to compare between models is the Mean Square Error between the expectation of predictive distributions and real data. The procedure has been applied to a data set of weight at 210 days in the Spanish Pirenaica beef cattle breed. Three proposed models have been compared: (a) Single Trait Animal Model; (b) Heterogeneous Variance Animal Model; and (c) Multiple Trait Animal Model. After applying the procedure, the most adjusted model was the Heterogeneous Variance Animal Model. This result is probably due to a compromise between the complexity of the model and the amount of available information. The estimated heritabilities under the preferred model have been 0.489 ± 0.076 for males and 0.331 ± 0.082 for females.ResumenContraste de modelos en un caso de heterogeneidad de varianzas usando métodos de muestreoSe ha descrito un método de contraste de modelos mediante técnicas de muestreo en un caso de heterogeneidad de varianza entre sexos. El procedimiento utiliza las distribucviones predictivas de cada dato, dado el resto de datos y la estructura del modelo. El criterio para coparar modelos es el error cuadrático medio entre la esperanza de las distribuciones predictivas y los datos reales. El procedimiento se ha aplicado en datos de peso a los 210 días en la raza bovina Pirenaica. Se han propuesto tres posibles modelos: (a) Modelo Animal Unicaracter; (b) Modelo Animal con Varianzas Heterogéneas; (c) Modelo Animal Multicaracter. El modelo mejor ajustado fue el Modelo Animal con Varianzas Heterogéneas. Este resultado es probablemente debido a un compromiso entre la complejidad del modelo y la cantidad de datos disponibles. Las heredabilidades estimadas bajo el modelo preferido han sido 0,489 ± 0,076 en los machos y 0,331 ± 0,082 en las hembras.
A simulation study on variation in response to selection and population size required for selection programmes
Authors: Nomura T. 
Published: March 2011

SummaryTo obtain a simple formula for predicting variation in selection response, the drift variance of selection response has been approximated by that under random selection. Using computer simulation, the validity of this approximation was examined under various combinations of population size, heritability, and proportion selected. It was shown that the approximation gives a good prediction when the heritability of the selected trait is low, but produces a serious error when applied to a trait with high heritability. However, when the approximation was used for the prediction of coefficient of variation of selection response, a satisfactory prediction was obtained in all cases studied. Although this predictor includes a coincidental factor, it may be used as a criterion for determining the population size required for selection programmes.ZusammenfassungSimulationsuntersuchung über Selektionserfolg und notwendige Populationsgrößen für Selektions‐programmeZur Schätzung der Variabilität von Selektionserfolgen wurde die Driftvarianz durch die bei Zufallspaarung erwartete approximiert. Die Gültigkeit dieser Approximation wurde an verschiedenen Kombinationen von Populationsgröße, Heritabilität und Remontierungsprozentsat überprüft. Die Approximation ergibt gute Schätzwerte bei geringer Heritabilität, aber erhebliche Fehler bei hoher. Allerdings konnte der Variationskoeffizient des Selektionserfolges in allen Fällen zufriedenstellend geschätzt werden. Obwohl dies auf Über‐bzw. Unterschätzung von Zähler wie Nenner zurückzuführen ist, kann es als Kriterium zur Bestimmung der bei Selektionsprogrammen notwendigen Populationsgröße verwendet werden.
Population structure of the Japanese Brown breed
Authors: Ibi T. , Moriya K. , Matsumoto M. , Koba S. , Sasaki Y. 
Published: March 2011

SummaryThe population structure of the Japanese Brown in Kumamoto Prefecture was investigated with pedigree analysis. Two hundred heifers were randomly sampled, in 1960, 1970, 1980, and 1990. Population genetic parameters, i.e. F‐statistics, index of subdivision, generation interval, effective population size, and effective number of sires, were estimated. The effective number of sires decreased, most dramatically, from 1970 to 1980. The average inbreeding coefficient (FIT) increased, from 0.64% in 1960 to 5.43% in 1990. FST increased in parallel with FIT, while FIS remained low. From 1960 to 1980, the index of diversity showed a decreasing trend, but this improved a little, with the index at 1.1 in 1990. The generation interval tended to be longer year by year, and was 5.52 during 1980–90. On the other hand, Ne decreased, from 724.6 before 1960 to 40.1 at the present. The population structure of the Japanese Brown is not problematical at present, when considering FIT, but the irreversible inbreeding coefficient (FST) increases constantly.ZusammenfassungUntersuchungen der Populationsstruktur der japanischen braunen RasseDie Populationsstruktur in der Kumamotopräfektur wurde an Hand einer Pedigreeanalyse untersucht. Zweihundert Kalbinnen wurden in den Jahren 1960, 1970, 1980 und 1990 zufällig ausgewählt und populationsgenetische Parameter F‐Werte, Index der Unter‐teilung und genetisch wirksame Zahl von Stieren geschätzt. Die wirksame Zahl von Vatertieren hat abgenommen, wobei das am stärksten zwischen 1970 und 1980 vor sich gegangen ist. Der durchschnittliche Inzuchtkoeffizient (FIT) zeigte Zunahme von 0, 64% im Jahr 1960 auf 5, 43% im Jahr 1990. FST nahm parallel mit FIT zu, während FIS nieder geblieben ist. Von 1960 bis 1980 zeigte der Diversitätsindex eine abnehmende Tendenz, hat aber später etwas zugenommen, wobei der Index im Jahr 1990 1, 1 erreicht hat. Die Populationsstruktur des japanischen Braunviehs ist derzeit keinen alarmierenden Status, aber FST steigt kontinuierlich an.
Correlation between purebred and crossbred performance under a two‐locus model with additive by additive interaction
Authors: Baumung R. , Sölkner J. , Essl A. 
Published: March 2011

SummaryThe behaviour of the genetic correlation between purebred and crossbred performance (rpc) was studied under a model with two loci, in populations with varying gene frequencies, degrees of dominance, and (additive by additive) epistasis. The value of rpc depends not only on dominance and epistasis, but also on gene‐frequency differences between the parental populations. The value of rpc is unity if neither epistasis nor dominance exist, or if there are the same gene frequencies in both purebred populations. Special ratios of the assumed genotypic effects and gene‐frequency differences between the parental populations may also cause a rpc of unity. Therefore, a high rpc is possible with small gene‐frequency differences, small non‐additive gene effects, or certain ratios of the assumed genotypic effects and gene frequencies. Further, overdominance is not necessary for a negative rpc. The correlation becomes negative in the case of partial dominance in combination with epistasis and certain gene frequencies. In general, rpc decreases with increasing gene‐frequency difference or increasing dominance and/or epistatic effects.Zusammenfassungorrelation zwischen den Leistungen von Reinzucht‐ und Kreuzungstieren unter einem Zwei‐Locus Modell mit Additiv mal Additiv InteraktionDas Verhalten der genetischen Korrelation zwischen den Leistungen von Reinzucht‐ und Kreuzungstieren (rpc) wurde anhand eines Zwei‐Locus Modelles in Abhängigkeit von Genfrequenzen, Dominanzgrad und Epistasie (additiv mal additiv) untersucht. Die Größe von rpc hängt nicht nur von Dominanzgrad und Epistasie, sondern auch von der Genfrequenzdifferenz zwischen den elterlichen Populationen ab. Der Wert von rpc beträgt immer eins, wenn weder Dominanz noch Epistasie wirken oder die gleichen Genfrequenzen in beiden Elternpopulationen vorliegen. Bestimmte Verhältnisse der unterstellten genotypischen Effekte und Genfrequenzdifferenzen zwischen den Elternpopulationen können ebenfalls zu einem rpc‐Wert von eins führen. Daher ist es nicht möglich zu unterscheiden, ob ein hoher Wert für rpc durch geringe Genfrequenzdifferenzen, geringe nichtadditive Geneffekte oder bestimmte Verhältnisse der vorliegenden genotypischen Effekte und Genfrequenzdifferenzen zueinander verursacht wird. Weiters konnte gezeigt werden, daß keine Überdominanz für das Auftreten von nagativen Korrelationen notwendig ist. Die Korrelation wird auch dann negativ, wenn partielle Dominanz in Kombination mit Epistasie und bestimmten Genfrequenzen vorliegt. Im allegemeinen nimmt die genetische Korrlelation zwischen den Leistungen von Reinzucht‐ und Kreuzungstieren mit steigenden Genfrequenzdifferenzen oder steigenden Dominanz‐ und/oder Epistasieeffekten ab.
Genetic parameters for ultrasonic fat thickness of Japanese Shorthorn cattle
Authors: Nagamine Y. , Roehe R. , Awata T. , Kalm E. 
Published: March 2011

SummaryRecords of performance testing from 309 Japanese Shorthorn bulls were used to estimate genetic parameters for ultrasonic fat thickness. Young bulls were tested for 140 days from 9 months of age. Backfat was measured by ultrasound at six positions on each side, from shoulder to loin, at a constant weight of 470 kg. Four of the positions were approximately 10 cm from the mid‐line and were defined as upper positions. Two positions were 25 cm from the mid‐line and were defined as lower positions. Variance components were estimated by restricted maximum likelihood, using canonical transformation under a multi‐trait animal model. Heritabilities (h2) from a single measurement were 0.32‐0.48 on upper positions and 0.37‐0.27 on lower positions. Corresponding positions on each side of the animal showed very high genetic correlations, from 0.94 to 0.99. The estimated h2 values of the sum of measurements of four left and right upper positions were 0.52 on both sides. The sum of measurements from eight upper positions showed the highest h2, 0.55, and genetic correlations among these summed measurements were nearly 1. Genetic correlations between average daily gain and all fat measurements were mostly slightly negative. The estimated h2 value for daily gain was 0.44.ZusammenfassungGenetische Parameter für ultraschallgemessene Fettdicke japanischer Shorthorn RinderDie Messungen an 309 japanischen Shorthorn Bullen wurden zur Schätzung herangezogen. Diese waren von 140 Tagen bis 9 Monate Alter einer Mastleistungas prüfung unterzogen worden. Ultraschall Fettdicke wurde an 6 Positionen von Schulter bis Lende bei 470 kg Gewicht erhoben, vier ungefähr 10 cm der Mittellinie werden als obere, zwei 25 cm entfernt als untere Position definiert. Die Varianzkomponenten wurden nach kanonischer Transformation auf der Basis eines Mehr‐Merkmalmodells mittels restringiertier Maximum Likelihood geschätzt. Heritabilitäten für Einzelmerkmale waren für obere Positionen 0,32 bis 0,48, fü untere 0,37 bis 0,27, die genetischen Korrelationen waren zwischen 0,94 und 0,99. Die Heritabilität für die Summe der vier oberen Positionen an jeder Seite war 0,52, die für alle acht oberen Positionen 0,55. Genetishce Korrelationen zwischen Tageszuwachs und allen Fettdicken waren meistens schwach negativ, die Heritabilität für ersteren 0,44.
Indigenous practices of animal genetic resource management and their relevance for the conservation of domestic animal diversity in developing countries
Authors: Köhler‐Rollefson I. 
Published: March 2011

SummaryThis paper aims to suggest an alternative, or supplementary, conceptual and practical framework for livestock genetic resource conservation in developing countries. In a paradigmatic shift away from the reductionist approach of regarding ‘breeds’ as manifestations of certain genes that deserve to be either saved or not saved, an evolutionary model is adopted which views livestock genetic resources as products of certain specific socioeconomic conditions. This model focuses on the processes that have caused the development of domestic animal diversity historically, such as the livestock‐exchange mechanisms and breeding practices that function among traditional societies. A new definition for the term ‘breed’ is suggested that does not only apply to western Europe and its former colonies, but also to developing countries. The need to integrate knowledge into the identification and conservation of threatened livestock breeds is emphasized. By exploring these additional dimensions, new and participatory strategies for maintaining livestock genetic diversity can be discovered, that will have a wider application than technical approaches.ZusammenfassungIn diesem Artikel werden alternative, bzw. zusätzliche Ansatzweisen zur Erhaltung tiergenetischer Ressourcen in Entwicklungsländern vorgeschlagen. Abweichend von der vorherrschenden reduktionistischen Perspektive, die Tierpopulationen nur noch als Träger bestimmter Allele betrachtet, wird hier ein evolutionäres Modell aufgezeigt, das tiergenetische Ressourcen als Produkte bestimmter sozioökonomischer Kontexte betrachtet. Im Mittelpunkt stehen die Prozesse, die historisch zur Entstehung der tiergenetischen Vielfalt in traditionellen Kulturen geführt haben, wie Viehaustauschmechanismen und indigene Zuchtpraktiken. Eine neue, anthropologisch orientierte Definition des Begriffs “Rasse”wird vorgeschlagen, die auch auf die phänotypisch oft nicht einheitlichen Tierpopulationen in Entwicklungsländern anwendbar ist. Die Notwendigkeit indigenes Tierzuchtwissen in die Identifikation und Erhaltung bedrohter Rassen einzubeziehen wird betont. Durch Erforschung dieser zusätzlichen Dimensionen werden sich neue partizipatorische Ansätze zur rhaltung der tiergenetischen Vielfalt entwickeln lassen, die eine breitere Anwendungsbasis haben als rein technische Maßnahmen.
Effects of excluding a set of random effects on prediction error variance of breeding value
Authors: Cantet R. J. C. 
Published: March 2011

SummaryThe effects of excluding a set of random effects (U‐effects) uncorrelated to breeding values (BV) on prediction error variance (PEV) is studied analytically. Two situations are considered for model comparison: (a) existence of a ‘true’ model, (b) uncertainty about which of the competing models is ‘true’. Models compared are the ‘long’ one, which includes BV + U‐effects, and the ‘short’ one which includes BV's as the only random systematic effect. Expressions for PEV(BV) were obtained for the long model (PEVL); the short model (PEVS); and the short model assuming the long model is the correct one (PEVSI). It is shown that in general PEVS ≤ PEVL ≤ PEVSI. Results are exemplified by means of an example including a computer simulation.ResumenEn este trabajo se estudia analiticamente el efecto de excluir una variable aleatoria (efecto U) no correlacionada con el valor de cría (BV), sobre la varianza del error de predicción de este último (PEV(BV)). Para ello se utilizan dos enfoques de comparación de modelos: (a) existencia de un modelo ‘verdadero’, (b) incertidumbre respecto de cuál de ambos modelos alternativos es el correcto. Los modelos que se comparan son: el ‘largo’, que incluye BV+U, y el ‘corto’, el cuál solo incluye BV. Se obtienen las expresiones para PEV(BV) en las siguientes situaciones: (1) en el modelo largo (PEVL), (2) en el modelo corto (PEVS), y (3) en el modelo corto pero asumiendo que el largo es el verdadero (PEVSI). Se demuestra que en general PEVS ≤ PEVL ≤ PEVSI. Los resultados obtenidos son ilustrados mediante un ejemplo que incluye una simulación estocástica.ZusammenfassungVeränderung der Fehlervarianz der Zuchtwertvoraussage durch Vernachlässigung einer Gruppe zufäliger Wirkungen.Es wird die Auswirkung der Ausschaltung einer Gruppe zufälliger Wirkungen (U‐effects), die mit Zuchtwerten (BV) nicht korreliert sind, auf die Varianz des Voraussage‐Fehlers (PEV) analytisch untersucht. Zwei Modelle werden betrachtet: (a) Existenz eines “wahren”Modells, (b) Ungwißheit hinsichtlich des “wahren”Modells. Es werden verglichen: ein langes Modell, das BV und U‐Wirkungen umfaßt und ein kurzes, das nur BV als zufällige systematische Wirkung aufweist. Für PEV(BV) wurden Größen erhalten: (1) für das lange Modell (PEVL), (2) das kurze (PEVS) und (3) für das kurze unter der Annahme, daß das lange Modell das richtige ist (PEVSI). Im allgemeinen gilt PEVS ≤ PEVL ≤ PEVSI. Ergebnisse werden anhand einer Computersimulation erläutert.