bluuebunny/crossref_metadata_2025_split huggingface dataset:
Quantifying EGFR Alterations in the Lung Cancer Genome with Nanofluidic Digital PCR Arrays
Authors: Wang Jun , Ramakrishnan Ramesh , Tang Zhe , Fan Weiwen , Kluge Amy , Dowlati Afshin , Jones Robert C , Ma Patrick C 
Published: March 2010

Abstract
Background: The EGFR [epidermal growth factor receptor (erythroblastic leukemia viral (v-erb-b) oncogene homolog, avian)] gene is known to harbor genomic alterations in advanced lung cancer involving gene amplification and kinase mutations that predict the clinical response to EGFR-targeted inhibitors. Methods for detecting such molecular changes in lung cancer tumors are desirable.
Methods: We used a nanofluidic digital PCR array platform and 16 cell lines and 20 samples of genomic DNA from resected tumors (stages I–III) to quantify the relative numbers of copies of the EGFR gene and to detect mutated EGFR alleles in lung cancer. We assessed the relative number of EGFR gene copies by calculating the ratio of the number of EGFR molecules (measured with a 6-carboxyfluorescein–labeled Scorpion™ assay) to the number of molecules of the single-copy gene RPP30 (ribonuclease P/MRP 30kDa subunit) (measured with a 6-carboxy-X-rhodamine–labeled TaqMan™ assay) in each panel. To assay for the EGFR L858R (exon 21) mutation and exon 19 in-frame deletions, we used the ARMS™ and Scorpion technologies in a DxS/Qiagen EGFR29 Mutation Test Kit for the digital PCR array.
Results: The digital array detected and quantified rare gefitinib/erlotinib-sensitizing EGFR mutations (0.02%–9.26% abundance) that were present in formalin-fixed, paraffin-embedded samples of early-stage resectable lung tumors without an associated increase in gene copy number. Our results also demonstrated the presence of intratumor molecular heterogeneity for the clinically relevant EGFR mutated alleles in these early-stage lung tumors.
Conclusions: The digital PCR array platform allows characterization and quantification of oncogenes, such as EGFR, at the single-molecule level. Use of this nanofluidics platform may provide deeper insight into the specific roles of clinically relevant kinase mutations during different stages of lung tumor progression and may be useful in predicting the clinical response to EGFR-targeted inhibitors.
Inter-laboratory variation in cerebrospinal fluid biomarkers for Alzheimer's disease: united we stand, divided we fall
Authors: Mattsson Niklas , Blennow Kaj , Zetterberg Henrik 
Published: March 2010

Abstract
Several drug candidates for Alzheimer's disease are being evaluated in clinical trials, with the goal of finding a drug with disease-modifying effects. When such a drug finally reaches the market, there will be a demand for accurate diagnostic tools useful for early detection of disease and for monitoring biochemical effects. The core cerebrospinal fluid (CSF) biomarkers amyloid peptides (Aβ42), total-tau and phospo-tau are promising in this respect. However, inter-center variation (caused by pre-analytical, analytical and post-analytical factors), and inter-laboratory variation (caused by analytical factors), particularly for CSF Aβ42, lowers their utility in multicenter studies. Here, we discuss the causes of these variations, and present a global quality control program to overcome them.
Clin Chem Lab Med 2010;48:603–7.
Positive predictive value of serological diagnostic measures in celiac disease
Authors: Toftedal Peter , Nielsen Christian , Madsen Jonas Trolle , Titlestad Kjell , Husby Steffen , Lillevang Søren Thue 
Published: March 2010

Abstract

Background: Celiac disease (CD) antibodies, immunoglobulin A (IgA) anti-tissue transglutaminase (anti-tTG), IgA endomysium antibody (EMA), IgA and IgG anti-gliadin antibodies (IgA and IgG AGA) are first-line diagnostic tools used in selecting patients for duodenal biopsy. The goal of this study was to evaluate the diagnostic quality of serological testing for CD.

Methods: CD serological tests (IgA and IgG AGA, anti-tTG and EMA) from 11,915 individuals were measured. Data were combined with clinical data and results of duodenal biopsy using a unique Danish personal identification number.

Results: The positive predictive value (PPV) varied according to different combinations of positive CD antibodies, being highest when all antibodies were positive (97.6%). The anti-tTG concentration correlated strongly with EMA positivity, number of additional positive antibodies, and higher PPV. A logistic regression model predicted the probability of later biopsy-proven CD in relation to concentrations of IgA AGA and anti-tTG at initial serological screening.

Conclusions: The anti-tTG concentration at initial serological CD screening was highly informative in relation to EMA positivity, number of additional CD specific antibodies and PPV. Furthermore, in the high-risk group of patients investigated, the concentrations of anti-tTG and IgA AGA at initial serological screening could accurately predict the probability of future biopsy-proven CD.
Clin Chem Lab Med 2010;48:685–91.
Recommendations for the implementation of international standardization of glycated hemoglobin in Italy
Authors: Mosca GLAD Working Group (Ac delegates WG) Andrea , Branca Maria Teresa , Carta Mariarosa , Genna Maria Ludovica , Giorda Carlo B. , Ghidelli Rosangela , Ghislandi Germana , Iafusco Dario , Lapolla Annunziata , Lombardi Vera Buondonno , Lovagnini Scher Carlo Augusto , Marra Maurizio , Medea Gerardo , Meschi Franco , Pizzini Andrea , Rossi Francesco , Scalpone Raffaele , Tofini Gianni , Trovati Mariella , Zaninotto Martina 
Published: March 2010

Abstract
This document is issued by the Italian Society of Clinical Biochemistry and Clinical Molecular Biology (SIBioC) and a number of other National Scientific Societies and Associations in order to promote a coordinated plan for implementing the standardization of glycated hemoglobin (HbA1c) measurement in Italy according to the recommendations by the International Federation of Clinical Chemistry and Laboratory Medicine (IFCC). Changes in reporting HbA1c results, new units, how to relate old and new units, a timeline for changes and definition of the analytical goals are the main issues discussed.
Clin Chem Lab Med 2010;48:623–6.
Das Wiederaufgreifen des Verfahrens gemäß § 51 VwVfG
Authors: Sasse Thorsten 
Published: March 2010

Der Beitrag erörtert thematisch das Wiederaufgreifen des Verfahrens gemäß § 51 VwVfG. Dem Wiederaufgreifen liegt ein zweistufiges Verfahren zugrunde. Der Beitrag stellt beide Stufen dar, indem er die Zulässigkeits- und Begründetheitsvoraussetzungen systematisiert und so dem Rechtsanwender ein Prüfungsprogramm an die Hand gibt.
In einem zweiten Schritt werden aktuelle problematische Konstellationen erörtert – namentlich das Wiederaufgreifen des Verfahrens im Hinblick auf Verwaltungsakte mit Drittwirkung und die Frage, ob § 51 VwVfG die zutreffende Norm ist, wenn es dem Betroffenen um die Aufhebung eines gemeinschaftsrechtswidrigen belastenden, bestandskräftigen nationalen Verwaltungsakts geht.
Übungsklausur ÖR Die unfaire Professorenbewertung
Authors: Staufer Michaela 
Published: March 2010

Die Klausur greift die Entscheidungen auf, die in jüngster Vergangenheit zu den Internetseiten »www.Spickmich.de« und »www.MeinProf.de« ergangen sind: LG Köln, Az: 28 O 263/07 – MMR 2007, 729 ff.; LG Köln, Az 28 O 333/07 – RDV 2007, 252ff; OLG Köln, Az 15 U 142/07 – NJW-RR 2008, 203 ff.; LG Köln, Az 28 O 319/07 – K & R 2008, 188 ff.; LG Duisburg, Az 10 O 350/0, 7 – Urteil vom 18. 4. 2008. Auf den in Rede stehenden Internetseiten können LehrerInnen und ProfessorInnen von SchülerInnen und Studierenden bewertet werden.
Die Schwerpunkte der Klausur liegen auf einer umfassenden Auseinandersetzung mit dem Schutzbereich der Meinungsfreiheit und der Abwägung der Meinungsfreiheit mit dem Allgemeinen Persönlichkeitsrecht.
Die Klausur wurde in modifizierter Form als Hausarbeit in der Veranstaltung Öffentliches Recht II/Die Grundrechte an der Universität Frankfurt am Main im WS 2007/2008 gestellt.
StR Der strafrechtliche Rechtsgüterschutz des Schlafenden und Bewusstlosen
Authors: Kretschmer Joachim 
Published: March 2010

Im tatsächlichen Leben ist der Schlafende ein besonders leichtes Opfer von Straftaten, da es dem Straftäter gegenüber wehrlos ist. Straftaten gegenüber Schlafenden gelten in der Bevölkerung als besonders gemein. Auch in strafrechtlichen Arbeiten taucht wiederholt das schlafende oder bewusstlose Tatopfer auf, da der strafrechtliche Rechtsgüterschutz mit einigen dogmatischen Problemen verbunden ist.

Exemplarisch an drei Delikten wird der strafrechtliche Rechtsgüterschutz des Schlafenden und des Bewusstlosen näher untersucht.

Beispiel:
Corinna schläft tief und fest in ihrem Bett. Der Einbrecher Dr. K bricht in ihre Wohnung ein. Er schließt die Tür zum Schlafzimmer ab, damit er ohne Störung die Wohnung nach Wertsachen durchsuchen kann. 1. Corinna wacht nicht auf und bemerkt erst am nächsten Morgen das Geschehene. 2. Corinna erwacht. Sie merkt aber nichts und hört auch den Einbrecher nicht und schläft wieder ein. 3. Corinna erwacht. Sie will das Schlafzimmer verlassen, um ein Glas Wasser zu trinken. Die Tür ist verschlossen.
Übungsklausur StR Folgen einer verlorenen Meisterschaft
Authors: Krumdiek Nicole 
Published: March 2010

Erfahrungsgemäß haben Studierende auch im fortgeschrittenen Stadium des Studiums erhebliche Probleme, wenn es um die Verknüpfung von Problemen aus dem allgemeinen und dem besonderem Teil geht. Dies gilt bereits für die fahrlässige Begehungsweise eines Delikts und trifft erst recht für die Darstellung eines Vorsatz-Fahrlässigkeitstatbestandes zu.
Der folgende Fall stellt eine Klausur aus dem gehobenen Schwierigkeitsbereich dar, die im Wintersemester 2008/2009 im Rahmen der Veranstaltung »Schutz kollektiver Rechtsgüter« im 5. Semester angeboten wurde, und umfasst die auch für das Examen sehr relevanten Bereiche der Straßenverkehrsdelikte sowie den häufig eher stiefmütterlich behandelten Tatbestand der Unfallflucht.
Probleme hatten die Studierenden dabei überwiegend mit der Prüfung des Tatbeteiligten B innerhalb der Strafbarkeit des A. Grund hierfür ist die Schwierigkeit der vorliegenden Fallkonstellationen in der Form, dass ein Beifahrer im Rahmen des § 315 c I Nr. 1 a als Tatobjekt ausscheiden würde, sofern er als Tatbeteiligter in Betracht kommt. Eine solche Tatbeteiligung des B an der Tat des A kann zu diesem frühen Zeitpunkt hingegen noch nicht festgestellt werden, da die hierfür erforderliche Prüfung der vorsätzlichen, rechtswidrigen Haupttat des A noch nicht abgeschlossen ist.
Zudem fehlte häufig das juristische Gespür für eine schwerpunktmäßige Bearbeitung, so dass irrelevante Tatbestände zu weit ausgeführt wurden, während die zu behandelnden Probleme gar nicht oder nur oberflächlich erörtert wurden.
Die Klausur ist auf einen Bearbeitungszeitraum von drei Stunden angelegt.
Diesbezüglich soll die aufbereitete Lösung den Studierenden eine Hilfestellung bei der Bewältigung strafrechtlicher Sachverhalte geben und vorhandene Probleme minimieren. Durch entsprechende Bearbeiterhinweise sollen bestehende Unsicherheiten und typische Fehlerquellen zudem gezielt angesprochen und geklärt werden.
Die Haftung des eintretenden Sozius – Die analoge Anwendung des § 28 HGB auf die GbR
Authors: Petig Ulrike , Gonzalez Esther Iglesias 
Published: March 2010

Seit der BGH im Jahr 2001 die Rechtsfähigkeit der (Außen-)Gesellschaft bürgerlichen Rechts (GbR) anerkannt hat, stellen sich Folgefragen zur Haftung ihrer Gesellschafter. Diese beschäftigen Rechtsprechung und Lehre seitdem in besonderem Maße. Eine Haftung der Gesellschafter analog § 128 S. 1 sowie der eingetretenen Gesellschafter analog § 130 ist inzwischen höchstrichterlich anerkannt.
In diesem Beitrag soll die Möglichkeit der analogen Anwendung des § 28 auf die GbR, also die Haftung der neu entstehenden Gesellschaft für die Altverbindlichkeiten des vorher einzeln Tätigen, untersucht werden. Dies soll anhand eines Falles unter dem Gesichtspunkt der Haftung des in die Einzelkanzlei eintretenden Sozius erfolgen. Dieser Beitrag möchte das Für und Wider einer solchen Analogie aufzeigen und den Umgang hiermit in der Klausur verdeutlichen.
ÖR Amtseid à la Obama – Verfassungsrechtliche Grundfragen und Probleme des Amtseids nach dem Grundgesetz
Authors: Haensle Walter 
Published: March 2010

Das Grundgesetz schreibt sowohl für den Bundespräsidenten als auch für den Bundeskanzler und die Bundesminister einen Amtseid als zentrales Element ihrer Amtsübernahme vor.
Dabei hat der Amtseid in Deutschland eine lange Verfassungstradition und auch in der heutigen Zeit seine Bedeutung nicht verloren. In seiner staatsrechtlichen Bedeutung stellt der Amtseid den Schnittpunkt von Staatsorganisationsrecht, Verfassungstradition und Politik dar.
Man mag beim Amtseid deswegen vielleicht sogar von den Wurzeln des Staatsrechts an sich sprechen. Es gibt wenige staatliche Akte, in denen sich das Selbstverständnis des Staates so deutlich offenbart wie beim Amtseid der höchsten staatlichen Organe. Dabei stellen sich hier Grundfragen des Staatsrechts, die folgender Beitrag erörtert.
StR Der Einfluss der EMRK auf das deutsche Straf- und Strafprozessrecht – Grundlagen und wichtige Einzelprobleme
Authors: Satzger Helmut 
Published: March 2010

Nach den schrecklichen Erfahrungen des zweiten Weltkriegs hatten die Mitglieder des am 5.5.1949 gegründeten Europarats das Ziel, einen umfassenden internationalen Schutz der Menschenrechte zu gewährleisten und eine Wiederholung solcher Verbrechen zu verhindern. Die Parlamentarische Versammlung des Europarats (damals noch Beratende Versammlung genannt) nahm am 9.9.1949 den Entwurf einer Menschenrechtskonvention an. Nach der Bestellung eines Sachverständigenausschusses und einigen Abänderungen wurde im Juni 1950 vom Ministerkomitee ein Konventionsentwurf verabschiedet und der Parlamentarischen Versammlung vorgelegt. Am 4.11.1950 wurde die EMRK in Rom unterzeichnet und trat schließlich am 3.9.1953 nach Ratifizierung durch die zehn Gründungsstaaten in Kraft. Die EMRK hat seitdem die nationalen Strafrechtssysteme nachhaltig geprägt.
Ziel dieses Beitrags ist es, dem Studenten den strafrechtlichen Einfluss der EMRK und der Rechtsprechung des Europäischen Gerichtshofs für Menschenrechte (EGMR) auf das deutsche Strafrecht allgemein aufzuzeigen und anhand der wichtigen Art. 2, 3 und 6 EMRK näher zu erläutern.
Calibration Standards for Biodiesel Fuels
Authors: Clampitt Bert H. , Sardisco John B. 
Published: March 2010

Abstract
There are over 60 ASTM and other regulatory standards regarding the manufacture and sales of biodiesel fuels. These international standards require a number of calibration standards for evaluation of a biodiesel fuel. Some of the biodiesel testing are the same as required for petroleum based diesel fuel; however a number of these tests are unique to the biodiesel industry. This paper lists all the known standard procedures that biodiesel fuels must be evaluated against. It lists all the procedures where no calibration standards are required, those procedures that require calibration standards that are more or less common to the diesel industry, and those procedures that require calibration standards that are unique to the biodiesel industry (e.g., ASTM D6584, “Free and Total Glycerine”).
Glycerol Tri-Ester Derivatives as Diluent to Improve Low Temperature Properties of Vegetable Oils
Authors: Shah Shailesh N. , Moser Bryan R. , Sharma Brajendra K. 
Published: March 2010

Abstract
The large-scale production of biodiesel has led to a surplus of glycerol, so the new commercial uses of this co-product are being sought. Twenty-three vegetable oils were screened using glycerol tris(2-ethylhexanoate) [GTEH] as a diluent to improve the low temperature properties. Epoxidized soybean oil (ESBO) and palm oil (PO) have shown maximum improvements in pour points (PPs) upon addition of GTEH as diluent. Maximum improvements in PP of 16 and 9°C were observed in ESBO and PO, with 50 and 25 vol % GTEH, respectively. The five vegetable oils (ESBO, PO, sunflower oil (SFO), mid-oleic SFO, and camelina oil (CO)) with maximum improvement in PP were studied further at lower concentrations of GTEH. The variation in PP response to GTEH is attributed to variations in the fatty acid compositions of the vegetable oils. This study demonstrates the viability of using GTEH as diluents with vegetable oils to improve their low temperature properties.
Direct effect of methylprednisolone on renal sodium and water transport via the principal cells in the kidney
Authors: Lauridsen Thomas G , Vase Henrik , Bech Jesper N , Nielsen Søren , Pedersen Erling B 
Published: March 2010

BackgroundGlucocorticoids influence renal concentrating and diluting ability. We tested the hypothesis that methylprednisolone treatment increased renal water and sodium absorption by increased absorption via the aquaporin-2 (AQP2) water channels and the epithelial sodium channels (ENaCs) respectively.MethodsThe effect of methylprednisolone was measured during fasting in a randomized, placebo-controlled, single-blinded cross-over study of 15 healthy humans. The subjects received a standardized diet on day 1, fasted on day 2, and received 500 mg methylprednisolone intravenously on day 3. The effect variables were urinary excretions of AQP2 (u-AQP2), urinary excretion of the β-fraction of the ENaC (u-ENaCβ), cAMP (u-cAMP), prostaglandin E2(u-PGE2), free water clearance (), and fractional excretion of sodium (FENa), and plasma vasopressin (p-AVP), angiotensin II (p-Ang II), aldosterone (p-Aldo), atrial natriuretic peptide (p-ANP), and brain natriuretic peptide (p-BNP).ResultsMethylprednisolone treatment increased u-AQP2, u-ENaCβ, and p-AVP significantly, but did not change u-cAMP,, and FENa. P-ANP increased during methylprednisolone treatment, but after the increase in u-AQP2 and u-ENaCβ. U-PGE2, p-Ang II, and p-BNP were unchanged. Heart rate increased and diastolic blood pressure fell.ConclusionsMethylprednisolone increased u-AQP2 and u-ENaC. Neither the AVP–cAMP axis nor changes in the renin–angiotensin–Aldo system, or the natriuretic peptide system seems to bear a causal relationship with the increase in either u-AQP2 or u-ENaC. Most probably, the effect is mediated via a direct effect of methylprednisolone on the principal cells. The lack of decrease in urinary output and sodium reabsorption most likely can be attributed to the diuretic and natriuretic properties of the increased secretion of ANP.
Parasitoids (Hymenoptera: Braconidae: Aphidiinae) Attacking Aphids Feeding on Solanaceae and Cucurbitaceae Crops in Southeastern Europe: Aphidiine-Aphid-Plant Associations and Key
Authors: Kavallieratos Nickolas G , Tomanović Željko , Starý Petr , Žikić Vladimir , Petrović-Obradović Olivera 
Published: March 2010

Abstract
Original information on aphidiine braconids attacking aphids feeding on Solanaceae (i.e., Capsicum annuum L., Lycium europaeum L., Lycopersicon esculentum Miller, Solanum spp.) and Cucurbitaceae (i.e., Citrullus vulgaris Schrad., Cucumis spp., Cucurbita pepo L.) plants in southeastern Europe is presented. A total of 13 species are keyed and illustrated with scanning electron micrographs, microscope micrographs and line drawings. The aphidiines presented in this work have been identified from nine aphid taxa. Two hundred four aphidiine-aphid-plant associations are presented, 176 of which are new. The results are discussed in relation to over-all parasitoid-aphid-plant associations in the area.
Across- and Within-Population Differences in the Size and Scaling Relationship of a Sexually Selected Trait in Leptoscelis tricolor(Hemiptera: Coreidae)
Authors: Miller Christine W , Emlen Douglas J 
Published: March 2010

Abstract
Sexually selected traits are often assumed to convey information to conspecifics about the condition and genetic quality of an individual. However, sexually selected traits also are hypothesized to be among the most rapidly evolving and phenotypically plastic traits in natural populations. When found, such variability can bring into question the reliability of these traits as sexually-selected signals. Here, we examine the expression of a male weapon over multiple spatial and temporal scales in the wild. Specifically, we measured the expression of enlarged hind femora across and within populations of the Neotropical bug Leptoscelis tricolor Westwood (Hemiptera: Coreidae). We found significant variation in the size of this trait across populations and even within a population according to the plant species where adult males were collected. We also found differences in the intercept of the scaling relationship with body size; for a given body size, males in some populations express larger sexually selected traits than males in other populations. These results support the hypothesis that the expression of sexually selected traits is dynamic over space and perhaps time. Such patterns suggest that environmental variation or small amounts of movement across genetically differentiated populations may confound the reliability of information contained in the expression of these traits.
The Fall Armyworm Triose Phosphate Isomerase (Tpi) Gene as a Marker of Strain Identity and Interstrain Mating
Authors: Nagoshi Rodney N 
Published: March 2010

Abstract
Fall armyworm, Spodoptera frugiperda (J.E. Smith), is a significant agricultural pest in the United States, affecting most notably sweet corn, Zea mays L., and turfgrass. Two strains exist that differ physiologically and behaviorally but are morphologically indistinguishable. Polymorphisms within the fall armyworm Triose phosphate isomerase gene (Tpi; EC 5.3.1.1) were characterized and used to develop a polymerase chain reaction-based method for discriminating fall armyworm strains. The Tpi markers were used in multilocus analysis to estimate interstrain hybrid frequency and their distribution in populations from the United States and Brazil. The results were compared with previous studies using different marker combinations to test hypotheses about interstrain mating behavior and to explain earlier observations of unusual strain distribution patterns. The importance of understanding the frequency and consequences of interstrain hybridization to deciphering the mechanism of strain divergence and the distribution of fall armyworm subpopulations in different habitats are discussed.
Biology of the Adult Stage ofUfens principalis(Hymenoptera: Trichogrammatidae), an Egg Parasitoid ofHomalodiscaspp.(Hemiptera: Cicadellidae) in Southern California
Authors: Al-Wahaibi Ali K , Morse Joseph G 
Published: March 2010

AbstractAspects of the biology of the adult stage of Ufens principalis Owen (Hymenoptera: Trichogrammatidae), an important parasitoid of Homalodisca (Hemiptera: Cicadellidae) eggs in southern California, were studied. The field-based sex ratio of U. principalis was significantly different from 1:1 and was female biased (62% females). Females and males did not differ significantly in size based on measurements of head width and hind tibia length, and these two variables were highly correlated. There was a significant effect of female age on egg load. Females aged 1, 4, and 5 d had significantly higher egg loads than freshly emerged females. There was also a significant positive linear relationship between egg load and hind tibia length. Egg load averaged 37.9 ± 1.1 eggs. Eggs, which measured 207.8 ± 12.2 µm in length, were elliptical with an anterior nipple-shaped constriction. The longevity of adults was significantly affected by temperature and food (1:1, honey/water). Food had a greater effect in prolonging life as temperature decreased from 35.0 to 10.0°C. The most long-lived adults were fed on honey and kept at 10.0°C (20.2 ± 3.3 d). The rate of parasitism was significantly affected by host age, being significantly higher for 0-h-old eggs than for 12-24-h-old host eggs. There was no significant difference in parasitism between 0-h- and 0-6-h-old eggs and between 0–6 and 12-24-h-old eggs.