bluuebunny/crossref_metadata_2025_split huggingface dataset:
Clinical utility of personalized reference intervals for CEA in the early detection of oncologic disease
Authors: Martínez-Espartosa Débora , Alegre Estíbaliz , Casero-Ramírez Hugo , Díaz-Garzón Jorge , Fernández-Calle Pilar , Fuentes-Bullejos Patricia , Varo Nerea , González Álvaro 
Published: August 2024

Abstract

Objectives
Personalized reference intervals (prRI) have been proposed as a diagnostic tool for assessing measurands with high individuality. Here, we evaluate clinical performance of prRI using carcinoembryonic antigen (CEA) for cancer detection and compare it with that of reference change values (RCV) and other criteria recommended by clinical guidelines (e.g. 25 % of change between consecutive CEA results (RV25) and the cut-off point of 5 μg/L (CP5)).

Methods
Clinical and analytical data from 2,638 patients collected over 19 years were retrospectively evaluated. A total 15,485 CEA results were studied. For each patient, we calculated prRI and RCV using computer algorithms based on the combination of different strategies to assess the number of CEA results needed, consideration of one or two limits of reference interval and the intraindividual biological variation estimate (CVI) used: (a) publicly available (CVI-EU), (b) CVI calculated using an indirect method (CVI-NOO) and (c) within-person BV (CVP). For each new result identified falling outside the prRI, exceeding the RCV interval, RV25 or CP5, we searched for records identifying the presence of tumour at 3 and 12 months after the test. The sensitivity, specificity and predictive power of each strategy were calculated.

Results
PrRI approaches derived using CVI-EU, and both limits of reference interval achieve the best sensitivity (87.5 %) and NPV (99.3 %) at 3 and 12 months of all evaluated criteria. Only 3 results per patients are enough to calculate prRIs that reach this diagnostic performance.

Conclusions
PrRI approaches could be an effective tool to rule out new oncological findings during the active surveillance of patients.
Separability properties of nilpotent ℚ[𝑥]-powered groups II
Authors: Majewicz Stephen , Zyman Marcos 
Published: August 2024

Abstract
In this paper, we study nilpotent

Q
⁢

[
x
]

\mathbb{Q}[x]

-powered groups that satisfy the following property: for some set of primes 𝜔 in

Q
⁢

[
x
]

\mathbb{Q}[x]

, every

ω
′

\omega^{\prime}

-isolated

Q
⁢

[
x
]

\mathbb{Q}[x]

-subgroup in some family of its

Q
⁢

[
x
]

\mathbb{Q}[x]

-subgroups is finite 𝜔-type separable.
Automated sex and age partitioning for the estimation of reference intervals using a regression tree model
Authors: Klawitter Sandra , Böhm Johannes , Tolios Alexander , Gebauer Julian E. 
Published: August 2024

Abstract

Objectives
Reference intervals (RI) play a decisive role in the interpretation of medical laboratory results. An important step in the determination of RI is age- and sex specific partitioning, which is usually based on an empirical approach by graphical representation. In this study, we evaluate an automated machine learning approach.

Methods
This study uses pediatric data from the CALIPER RI (Canadian Laboratory Initiative on Pediatric Reference Intervals) study. The calculation of potential partitions is carried out using a regression tree model included in the rpart package of the statistical programming language R. The Harris & Boyd method is used to compare the corresponding partitions suggested by rpart and CALIPER. For better comparability, the reference ranges of the partitions of both approaches are then calculated using reflimR.

Results
Most of the partitions suggested by rpart or CALIPER show sufficient heterogeneity among themselves to justify age- and/or sex-specific RI partitioning. With only few individual exceptions, both methods yield comparable results. The partitions of both approaches for albumin and γ-glutamyltransferase are very similar to each other. For creatinine rpart suggests a slightly earlier distinction between the sexes. Alkaline phosphatase shows the most pronounced differences. In addition to a considerable earlier sex split, rpart suggests different age intervals for both sexes, resulting in three partitions for females and four partitions for males.

Conclusions
Our findings indicate that the automated analysis provided by rpart yields results that comparable to traditional methods. Nevertheless, the medical plausibility of the automatic suggestions needs to be validated by human experts.
Antituberculosis, antimicrobial, antioxidant, cytotoxicity and anti-inflammatory activity of Schiff base derived from 2,3-diaminophenazine moiety and its metal(II) complexes: structural elucidation, computational aspects, and biological evaluation
Authors: Bufarwa Saleh M. , El-Sefait Reem M. , Thbayh Dalal K. , Belaidi Mustapha , Al-Shemary Rehab K. , Abdusamea Rema. M. , El-Ajaily Marei M. , Fiser Béla , Bader Hanan A. , Saleh Abdulsalam A. , Bufarwa Mohamad M. 
Published: August 2024

Abstract
Enticed by the present scenario of infectious diseases, four new Co(II), Ni(II), Cu(II), and Cd(II) complexes of Schiff base ligand were synthesized from 6,6′-((1E-1′E)(phenazine-2,3-dielbis(azanylidene)-bis-(methanylidene)-bis-(3-(diethylamino)phenol)) (H

2

L) to ascertain as effective drug for antituberculosis, anti-inflammatory, antioxidant, cytotoxic and antimicrobial activities. The organic ligand and its metal(II) complexes were characterized by numerous physical and spectroscopic methods, which showed that the complexes have a general formula, [ML], (where M = Co(II) (C1), Ni(II) (C2), Cu(II) (C3) and Cd(II) (C4)), for metal complexes have been proposed and have a square planar geometry, are amorphous in nature, and are thermally stable. Data highlight obtained from activity testing against tuberculosis, inflammation, and oxidants that all compounds are significantly active against these symptoms. Also, was to evaluate the effectiveness of various compounds against bacterial and fungal strains. Specifically, four bacterial strains (Bacillus subtilis, Staphylococcus aureus, Escherichia coli, and Pseudomonas aeruginosa) and two fungal strains (Aspergillus flavus and Candida albicans) were tested and compared to the results of some standard drugs. The results revealed that compound C4 was more effective against bacterial strains than the comparison standard drugs. In addition, C3 was found to be the most effective of the comparison antibiotics against fungi, while the other compounds showed moderate antifungal activity. Moreover, to support the vitro results, certain computational studies as molecular docking studies, DFT, MESP, and AMEDT were also conducted to confirm the effectiveness of an organic ligand and its complexes against tuberculosis. These studies revealed that C4 is the most effective against tuberculosis and has desirable effects such as absorption, no degradation and no hepatotoxicity, etc.
Labeling by type
Authors: Rouveret Alain 
Published: August 2024

Abstract
The primary goal of this article is to take advantage of some recent theoretical innovations in syntactic theorizing to propose a novel characterization of some of the basic word-order types isolated by typological research. In the minimalist framework, a necessary condition for a derivation to converge is that the structure it generates should be appropriately labeled. This requirement in particular holds for the major syntactic structures displayed by the various linguistic types. It will be argued that labeling theory, combined with phase theory and the variable syntax of inflectional and discourse features, offers contrasting characterizations of these structures and, as such, provides a window on how exactly SVO, V1 and V2 grammatical systems differ: they differ precisely in the strategy that each type selects in order for neutral declarative root clauses to satisfy the labeling requirement. It will also be shown that the topic and focus structures involving phrasal movement to the periphery, although different parametric choices are made by the various grammatical systems considered here, basically conform to the same requirement.
The macrozoobenthos in different types of littoral zone of Lake Onego
Authors: Сидорова А.И. 
Published: August 2024

Представлены результаты исследований донных биоценозов на трех типах литоральной зоны (каменистом биотопе, гравийно-песчаном биотопе и прибойной зоне с зарослями высшей водной растительности) Онежского озера в 2013 и2014 гг. Полученные нами результаты показывают, что среди трех типов прибрежной зоны максимальные значения биомассы макрозообентоса отмечены на каменистой литорали (3,4–6,6 г/м2), минимальные – на песчаной(0,1–0,2 г/м2). Инвазионный вид Gmelinoides fasciatus (Stebbing 1899) (Crustacea: Amphipoda) в последние десятилетия успешно натурализовался на всех типах литорали водоема. На каменистом типе биотопа G. fasciatus доминирует как по численности, так и по биомассе.
The results of studies of bottom biocenoses in three types of littoral zone (rocky biotope, gravel-sand biotope and surf zone with thickets of higher aquatic vegetation) of Lake Onego in 2013 and 2014 are presented. Our results show that among the three types of coastal zone, the maximum values of macrozoobenthos biomass were noted in the rocky littoral zone (3.4–6.6 g/m2), the minimum values in the sandy zone (0.1–0.2 g/m2). The invasive species Gmelinoides fasciatus (Stebbing 1899) (CRUSTACEA: AMPHIPODA) has successfully naturalized in all types of littoral zones of the reservoir in recent decades. On the rocky type of biotope, G. fasciatusdominates both in numbers and biomass.
Are soil nematode communities altered by tree introduction and prolonged cultivation in Subarctic region?
Authors: Калинкина Д.С. , Сущук А.А. , Матвеева Е.М. 
Published: August 2024

Изучены сообщества почвенных нематод в подкроновых пространствах древесных растений, интродуцированных и длительное время культивируемых в ботаническом саду о. Большой Соловецкий (Архангельская область, Россия). В качестве контроля исследованы сообщества почвенных нематод естественных лесных биоценозов (сосняк, ельник, березняк). В результате проведенного исследования показано повышение общего таксономического разнообразия и численности нематод, а также доли паразитов растений в эколого-трофической структуре сообществ нематод в почве под интродуцированными деревьями по сравнению с естественными лесами. Примененные эколого-популяционные индексы (индекс структурированияSI, индекс обогащенияEI) изменялись разнонаправленно, поэтому не являлись эффективным инструментом при оценке последствий интродукции для почвенной экосистемы. В результате проведения корреляционного анализа была получена достоверная положительная связь между содержанием С и N в почве и группой паразитов растений, достоверная отрицательная связь между С : N и микотрофами, а также pH и таксономическим разнообразием нематод, бактериотрофами и ЕI. Впервые на территории России обнаружена энтомопатогенная нематода Steinernema affine Bovien.
This study is focused on soil nematode communities in under-crown areas of tree plants introduced to and cultivated for a long time in the botanical garden on Is. Bolshoy Solovetsky (Arkhangelsk Region, Russia). Soil nematode communities of natural forests (pine-, spruce-, birch stands) were studied as the control. The study has demonstrated that the taxonomic diversity and abundance of nematodes, as well as the share of plant parasites in the trophic structure of nematode communities in the soil under introduced trees were higher compared to natural forests. The ecological indices (structure index SI, enrichment index EI) changed non-uniformly and so had poor performance as tools for evaluating the consequences of the plant introductions for the soil ecosystem. Correlation analysis revealed a significant positive relationship between the content of carbon and nitrogen in soil and the absolute and relative abundance and the taxonomic diversity of plant parasites, as well as a significant negative relationships between C: N and fungal feeders, also between the soil pH and the taxonomic diversity of nematodes and the relative abundance of bacterial feeders and EI. The entomopathogenic nematode Steinernema affine Bovien revealed on the island has been reported for the first time in Russia.
First data about the dietary pattern of the eastern bat Myotis petax(Hollister, 1812) feeding near Lake Baikal based on visual analysis of feces
Authors: Ботвинкин А.Д. , Клопова А.А. , Механикова И.В. , Романова Е.В. , Шиленков В.Г. , Рудаков Д.М. , Самусёнок В.П. 
Published: August 2024

Трофические связи рукокрылых(Chiroptera) c биотой Байкала оценивали по результатам микроскопии фекалий восточной ночницы (n = 22). Хитиновые остатки ручейников(Trichoptera) и двукрылых (Diptera) обнаружены в82–86 % проб. Эти таксоны преимущественно аквабиотических и околоводных насекомых представлены на Байкале большим количеством эндемичных видов. Таксоны насекомых, развитие которых не связано с водной средой, встречались значительно реже(Hymenoptera – 41 %, Neuroptera – 27 %, Heteroptera –9 %). Впервые подтверждено присутствие остатков эндемичных байкальских амфипод в фекалиях восточной ночницы. Результаты исследования указывают на перспективность использования более эффективных методов генетического анализа для изучения экологических связей рукокрылых с водными организмами оз. Байкал.
Trophic relationships of bats (Chiroptera) with Lake Baikal biota were assessed based on microscopic studies Myotis petaxfeces (n=22). From 82 to 86 % of samples maintained fragments of exoskeletons of caddis flies (Trichoptera) and dipterans (Diptera). These taxa include mainly aquatic and semi-aquatic species. Many species from these taxa are endemic to Lake Baikal. Terrestrial insects were found in studied samples less frequently (Hymenoptera – 41 %, Neuroptera – 27 %, Heteroptera – 9 %). The morphological analysis revealed fragments of Baikal amphipods in two fecal samples of M. pretax. Further molecular studies will allow the detection of greater invertebrate taxa diversity in fecal samples of bats feeding near Lake Baikal.
Neurodevelopmental and Mental Health Conditions in Children With Medical Complexity
Authors: Leyenaar JoAnna K. , Arakelyan Mary , Schaefer Andrew P. , Freyleue Seneca D. , Austin Andrea M. , Simon Tamara D. , Van Cleave Jeanne , Ahuja Namrata , Chien Alyna T. , Moen Erika L. , O’Malley A. James , Goodman David C. 
Published: August 2024

BACKGROUND AND OBJECTIVESChildren with medical complexity (CMC) may be at a high risk of neurodevelopmental and mental health conditions given disease comorbidities and lived experiences. Little is known about the prevalence of these conditions at a population level. In this study, we estimated the prevalence of neurodevelopmental and mental health diagnoses in CMC relative to children without medical complexity and measured associations between these diagnoses in CMC and subsequent health care utilization and in-hospital mortality.METHODSWe applied the Child and Adolescent Mental Health Disorders Classification System to identify neurodevelopmental and mental health diagnoses using all-payer claims data from three states (2012–2017). Poisson regression was used to compare outcomes in CMC with neurodevelopmental and mental health diagnoses to CMC without these diagnoses, adjusting for sociodemographic and clinical characteristics.RESULTSAmong 85 581 CMC, 39 065 (45.6%) had ≥1 neurodevelopmental diagnoses, and 31 703 (37.0%) had ≥1 mental health diagnoses, reflecting adjusted relative risks of 3.46 (3.42–3.50) for neurodevelopmental diagnoses and 2.22 (2.19–2.24) for mental health diagnoses compared with children without medical complexity. CMC with both neurodevelopmental and mental health diagnoses had 3.00 (95% confidence interval [CI]: 2.98–3.01) times the number of ambulatory visits, 69% more emergency department visits (rate ratio = 1.69, 95% CI: 1.66–1.72), 58% greater risk of hospitalization (rate ratio = 1.58, 95% CI: 1.50–1.67), and 2.32 times (95% CI: 2.28–2.36) the number of hospital days than CMC without these diagnoses.CONCLUSIONSNeurodevelopmental and mental health diagnoses are prevalent among CMC and associated with increased health care utilization across the continuum of care. These findings illustrate the importance of recognizing and treating neurodevelopmental and mental health conditions in this population.
Optimización del aprendizaje en Microbiología: evaluación del impacto de las Tecnologías de la Información y Comunicación
Authors: Nina Nina Diana Gabriela , Vásquez Michel Aneth María 
Published: August 2024

Las elevadas cifras de deserción estudiantil y bajos rendimientos educativos que fueron propiciados por la pandemia del COVID-19 presentaron el desafío urgente de mejorar el nivel educativo, un reto que involucra a todos los participantes del proceso de enseñanza-aprendizaje. En este contexto, y teniendo en cuenta el rápido avance de las Tecnologías de la Información y Comunicación (TIC), diversos expertos en pedagogía sostienen que las TIC pueden contribuir a establecer un ambiente de aprendizaje didáctico y efectivo. Sin embargo, en Bolivia no existen registros sobre la implementación y el impacto de las TIC. Por tal motivo, este estudio tuvo como objetivo identificar el panorama del uso y el impacto de las TIC en una disciplina teórico-práctica como Microbiología, mediante un análisis exploratorio, cuantitativo, descriptivo y transversal de las percepciones recogidas a través de un instrumento proporcionado al estudiantado. La muestra fue conformada por 43 estudiantes de la Carrera de Bioquímica y Farmacia de la Universidad del Valle – Sede La Paz quienes cursaron la disciplina de Microbiología durante el segundo semestre del año 2022 y que aceptaron participar en el estudio firmando un consentimiento informado. Esta muestra fue seleccionada por conveniencia de manera no probabilística. Del análisis porcentual de las declaraciones del estudiantado, se pudo identificar que cerca del 75 % del estudiantado está familiarizado con la expresión TIC. Además, el 81,40 % del alumnado afirmó que el uso de TIC en las actividades académicas mejoró su rendimiento académico. Asimismo, el estudiantado refirió que en el 46,6% de los casos el plantel docente implemento las TIC. Por otro lado, el estudiantado evidencia que existe una selección adecuada de TIC en el 53,45% de los casos. Estos hallazgos confirman el impacto positivo que trae el uso de TIC en los entornos educativos. Asimismo, se sugiere realizar estudios similares para evaluar la eficacia de las diferentes herramientas tecnológicas en los procesos de enseñanza-aprendizaje actuales, con el fin de sugerir adecuaciones a las metodologías educativas y mejorar la formación integral de los futuros profesionales.
ВИБІР ПРОБІОТИЧНИХ КУЛЬТУР LACTOBACILLUS ACIDOPHILUS ДЛЯ ВИРОБНИЦТВА ПРОБІОТИЧНИХ СИРІВ
Authors: Клименко О. Г. , Ткаченко Н. А. 
Published: August 2024

Стаття присвячена скринінгу пробіотичних культур Lactobacillus acidophilus для виробництва пробіотичних сирів, які користуються попитом на споживчому ринку України.
Визначено, що монокультури L. acidophilus La-5 та L. acidophilus LA 02 стійкі до кислого середовища, характерного для рН шлунку, розчину жовчі з масовою часткою 40 %, 0,3 %-вого розчину фенолу та хлористого натрію. Встановлено, що швидкість відмирання клітин L. acidophilus La-5 та L. acidophilus LA 02 при рН=3,0 од. склала 0,23 і 0,32 год-1 відповідно протягом перших 3 год експозиції, а також 0,34 і 0,40 год-1 відповідно – при експозиції від 3 до 5 годин. При підвищенні концентрації HCl до рН=2,0 од. популяції L. acidophilus La-5 та L. acidophilus LA 02 за 5 год експозиції зменшились на 25,0 та 23,9 %, відповідно.
Визначено, що протягом 24 годин експозиції монокультур L. acidophilus La-5 та L. acidophilus LA 02 у присутності молочної кислоти при рН=4,0 од. відбулося зменшення популяції на 0,3 і 0,12 год-1 відповідно; при підвищенні концентрації молочної кислоти до рН=3,0 од. популяції L. acidophilus La-5 та L. acidophilus LA 02 за 24 години експозиції зменшились на 4,54% та 4,49% відповідно, що свідчить про здатність обох культур виживати в умовах, характерних для сирів.
Показано високу антагоністичну активність монокультур L. acidophilus La-5 та L. acidophilus LA 02 по відношенню до патогенних (St. аureus), умовно-патогенних (E. coli) бактерій та до залишкової мікрофлори пастеризованого молока (Bac. subtilis), що свідчить про їх потенціал для використання у виробництві ферментованих молочних продуктів, зокрема пробіотичних сирів, з метою корегування дисфункцій травної системи споживача.
Визначено, що обидва досліджені штами L. acidophilus мають прийнятні технологічні властивості, що дозволяє рекомендувати їх для виробництва ферментованих пробіотичних молочних продуктів. З огляду на високу енергію кислотоутворення культури L. acidophilus LA 02 у технологіях цільових пробіотичних сирів рекомендовано застосовувати пробіотичну культуру L. acidophilus La-5 у складі бакконцентрату безпосереднього внесення FD DVS La-5.
Применение отраслевых принципов международного экологического права для системного толкования норм экономических и экологических соглашений
Authors: Абатурова Варвара Александровна 
Published: August 2024

В последнее время отмечается динамический рост числа заключаемых международных договоров, регулирующих взаимосвязанные международные экологические и экономические отношения. Так, практика Международного Суда, Органа по разрешению споров ВТО, Международного трибунала по морскому праву показывает, что дела, касающиеся экологических вопросов, тем или иным образом связаны с международными экономическими отношениями. Этот факт подтверждает взаимосвязанность экономических и экологических государственных интересов. Значит, разрешение споров без учета этих групп интересов становится невозможным. Стоит отметить, что именно системное толкование можно рассматривать как один из юридических механизмов приведения в действие концепции устойчивого развития. Исходя из идейного содержания системной интеграции, в настоящей статье на основе доктринальных исследований и практики международных судебных учреждений проанализирована эффективность использования четырех отраслевых принципов международного экологического права в рамках системного толкования в пяти межгосударственных разбирательствах. Поскольку, несмотря на свой отраслевой характер, эти экологические принципы приобрели характер международного обычая, они являются нормой по смыслу пункта 3(с) статьи 31 Венской конвенции о праве международных договоров 1969 года, которая, в свою очередь, может быть применима к толкованию международных договоров, регламентирующих межгосударственные экономические отношения.