bluuebunny/crossref_metadata_2025_split huggingface dataset:
Outcome of a new patient pathway for managing B3 breast lesions by vacuum-assisted biopsy: time to change current UK practice?
Authors: Strachan C , Horgan K , Millican-Slater R A , Shaaban A M , Sharma N 
Published: September 2015

AimsB3 lesions of the breast represent a difficult management dilemma. The umbrella term ‘B3’ incorporates lesions with little associated malignancy risk as well as lesions with significant risk of concurrent neoplasia. Diagnosis of B3 lesions in screening populations is largely made on needle core biopsy, which provides little tissue to adequately diagnose pathologically diverse lesions. The advent of vacuum-assisted biopsy (VAB) provides the multidisciplinary team with a more representative pathology sample to direct management.MethodsIn this unit, in 2009, a pathway to guide management of B3 lesions detected on needle core biopsy in screening patients was implemented to assess whether VAB was a safe and viable alternative to surgery in selected cases.Here we present the 5-year follow-up results of this pathway.Results398 patients with B3 lesions were suitable for this pathway, of which 321 went on to have second-line VAB. 24% of these patients subsequently required surgery for malignancy or ongoing concerns, and thus 245 avoided surgery being subsequently referred for 5-year mammographic surveillance or back to screening. Median follow-up was 3 years (IQR 2), and no cancers were detected at the original B3 site during follow-up.ConclusionsWe have demonstrated here that with large volume tissue sampling for indeterminate lesions of the breast surgery can be safely avoided in selected B3 lesions with and without atypia.
An Automatic Self-Calibration Approach for Wide Baseline Stereo Cameras Using Sea Surface Images
Authors: Wang Han , Mou Wei , Mou Xiaozheng , Yuan Shenghai , Ulun Soner , Yang Shuai , Shin Bok-Suk 
Published: September 2015

Stereo rig with wide baseline is necessary when accurate depth estimation for distant object is desired. However, in order to make calibration pattern to be viewed from both left and right cameras, the wider the baseline the bigger the calibration pattern is required. In contrast to the traditional stereo calibration method using calibration pattern, we propose a self-calibration approach that can estimate cameras' rotation matrices for stereo rig with wide baseline (3 m). Given images taken from left and right cameras, the relative roll and pitch angles between two cameras are recovered by aligning sea horizon in left and right images. The pitch angle is estimated by making the projections of one point at infinite distance appear at the same location in both images. A photometric minimization is applied to refine the rotation parameters. Compared with conventional checkerboard-based calibration techniques which require extra equipments or personnel, our approach only needs a pair of sea images. Moreover, unlike most self-calibration approaches, feature detection and matching are not required which makes it possible to apply our approach on featureless images. As a result, it is flexible and easy to implement our approach on sea surface images. Real world experiments demonstrate the feasibility of our approach.
ICER preview
Authors: Dorn Brian , Cutts Quintin , Sheard Judy 
Published: September 2015

We are thrilled to welcome our colleagues to ICER 2015 in Omaha, Nebraska!
The youngest of the SIGCSE-sponsored conferences, the ACM International Computing Education Research (ICER), is just beginning its second decade, but it has already has developed a unique character. This year is shaping up to be another exciting conference, filled with late-breaking computing education research results, and our host city has a lot to offer attendees.
Molecular Pathways: At the Crossroads of Cancer Epigenetics and Immunotherapy
Authors: Maio Michele , Covre Alessia , Fratta Elisabetta , Di Giacomo Anna Maria , Taverna Pietro , Natali Pier Giorgio , Coral Sandra , Sigalotti Luca 
Published: September 2015

AbstractEpigenetic regulation allows heritably modulating gene expression profiles without modifying the primary sequence of gDNA. Under physiologic conditions, epigenetic patterns determine tissue-specific gene expression landscapes, gene imprinting, inactivation of chromosome X, and preservation of genomic stability. The most characterized mediators of epigenetic inheritance are gDNA methylation and histone posttranslational modifications that cooperate to alter chromatin state and genome transcription. According to these notions, it is not surprising that cancer cells invariantly deploy epigenetic alterations to achieve gene expression patterns required for neoplastic transformation and tumor progression. In this context, the recently uncovered use of epigenetic alterations by cancer cells to become stealth from the host's immune recognition has significant immunobiologic relevance in tumor progression, and it appears to have potential clinical usefulness. Indeed, immune evasion is among the major obstacles to further improve the efficacy of cancer immunotherapies and to increase long-lasting disease control. Luckily, different “epigenetic drugs” able to revert these “epimutations” are available, some of which have already been approved for clinical use. Here, we summarize the immunomodulatory activities of epigenetic drugs that lead to improved immune recognition of cancer cells and focus on the potential of this class of agents in improving the anticancer activity of novel immunotherapies through combinatorial epigenetic immunotherapy approaches. Clin Cancer Res; 21(18); 4040–7. ©2015 AACR.
SRC3 Phosphorylation at Serine 543 Is a Positive Independent Prognostic Factor in ER-Positive Breast Cancer
Authors: Zwart Wilbert , Flach Koen D. , Rudraraju Bharath , Abdel-Fatah Tarek M.A. , Gojis Ondrej , Canisius Sander , Moore David , Nevedomskaya Ekaterina , Opdam Mark , Droog Marjolein , Hofland Ingrid , Chan Steve , Shaw Jacqui , Ellis Ian O. , Coombes R. Charles , Carroll Jason S. , Ali Simak , Palmieri Carlo 
Published: September 2015

Abstract
Purpose: The steroid receptor coactivator SRC3 is essential for the transcriptional activity of estrogen receptor α (ERα). SRC3 is sufficient to cause mammary tumorigenesis, and has also been implicated in endocrine resistance. SRC3 is posttranslationally modified by phosphorylation, but these events have not been investigated with regard to functionality or disease association. Here, we investigate the spatial selectivity of SRC3-pS543/DNA binding over the human genome and its expression in primary human breast cancer in relation with outcome.
Experimental Design: Chromatin immunoprecipitation, coupled with sequencing, was used to determine the chromatin binding patterns of SRC3-pS543 in the breast cancer cell line MCF7 and two untreated primary breast cancers. IHC was used to assess the expression of SRC3 and SRC3-pS543 in 1,650 primary breast cancers. The relationship between the expression of SRC3 and SRC3-pS543, disease-free survival (DFS), and breast cancer specific survival (BCSS) was assessed.
Results: Although total SRC3 is selectively found at enhancer regions, SRC3-pS543 is recruited to promoters of ERα responsive genes, both in the MCF7 cell line and primary breast tumor specimens. SRC3-pS543 was associated with both improved DFS (P = 0.003) and BCSS (P = 0.001) in tamoxifen untreated high-risk patients, such a correlation was not seen in tamoxifen-treated cases, the interaction was statistically significant (P = 0.001). Multivariate analysis showed SRC3-pS543 to be an independent prognostic factor.
Conclusions: Phosphorylation of SRC3 at S543 affects its genomic interactions on a genome-wide level, where SRC3-pS543 is selectively recruited to promoters of ERα-responsive genes. SRC3-pS543 is a prognostic marker, and a predictive marker of response to endocrine therapy. Clin Cancer Res; 22(2); 479–91. ©2015 AACR.
Nuclear Trapping through Inhibition of Exosomal Export by Indomethacin Increases Cytostatic Efficacy of Doxorubicin and Pixantrone
Authors: Koch Raphael , Aung Thiha , Vogel Daniel , Chapuy Bjoern , Wenzel Dirk , Becker Sabrina , Sinzig Ursula , Venkataramani Vivek , von Mach Tobias , Jacob Ralf , Truemper Lorenz , Wulf Gerald G. 
Published: September 2015

Abstract
Purpose: Although R-CHOP–based immunochemotherapy cures significant proportions of patients with aggressive B-cell lymphoma, tumor cell susceptibility to chemotherapy varies, with mostly fatal outcome in cases of resistant disease. We and others have shown before that export of cytostatic drugs contributes to drug resistance. Now we provide a novel approach to overcome exosome-mediated drug resistance in aggressive B-cell lymphomas.
Experimental Design: We used well-established centrifugation protocols to purify exosomes from DLBCL cell lines and detected anthracyclines using FACS and HPLC. We used shRNA knockdown of ABCA3 to determine ABCA3 dependence of chemotherapy susceptibility and monitored ABCA3 expression after indomethacin treatment using qPCR. Finally, we established an in vivo assay using a chorioallantoic membrane (CAM) assay to determine the synergy of anthracycline and indomethacin treatment.
Results: We show increased efficacy of the anthracycline doxorubicin and the anthracenedione pixantrone by suppression of exosomal drug resistance with indomethacin. B-cell lymphoma cells in vitro efficiently extruded doxorubicin and pixantrone, in part compacted in exosomes. Exosomal biogenesis was critically dependent on the expression of the ATP-transporter A3 (ABCA3). Genetic or chemical depletion of ABCA3 augmented intracellular retention of both drugs and shifted the subcellular drug accumulation to prolonged nuclear retention. Indomethacin increased the cytostatic efficacy of both drugs against DLBCL cell lines in vitro and in vivo in a CAM assay.
Conclusions: We propose pretreatment with indomethacin toward enhanced antitumor efficacy of anthracyclines and anthracenediones. Clin Cancer Res; 22(2); 395–404. ©2015 AACR.
Sensitivity of KRAS-Mutant Colorectal Cancers to Combination Therapy That Cotargets MEK and CDK4/6
Authors: Ziemke Elizabeth K. , Dosch Joseph S. , Maust Joel D. , Shettigar Amrith , Sen Ananda , Welling Theodore H. , Hardiman Karin M. , Sebolt-Leopold Judith S. 
Published: September 2015

Abstract
Purpose: The emerging need for rational combination treatment approaches led us to test the concept that cotargeting MEK and CDK4/6 would prove efficacious in KRAS-mutant (KRASmt) colorectal cancers, where upregulated CDK4 and hyperphosphorylated retinoblastoma (RB) typify the vast majority of tumors.
Experimental Design: Initial testing was carried out in the HCT-116 tumor model, which is known to harbor a KRAS mutation. Efficacy studies were then performed with five RB+ patient-derived colorectal xenograft models, genomically diverse with respect to KRAS, BRAF, and PIK3CA mutational status. Tolerance, efficacy, and pharmacodynamic evaluation of target modulation were evaluated in response to daily dosing with either agent alone or concurrent coadministration.
Results: Synergy was observed in vitro when HCT-116 cells were treated over a broad range of doses of trametinib and palbociclib. Subsequent in vivo evaluation of this model showed a higher degree of antitumor activity resulting from the combination compared to that achievable with single-agent treatment. Testing of colorectal patient-derived xenograft (PDX) models further showed that combination of trametinib and palbociclib was well tolerated and resulted in objective responses in all KRASmt models tested. Stasis was observed in a KRAS/BRAF wild-type and a BRAFmt model.
Conclusions: Combination of trametinib and palbociclib was well tolerated and highly efficacious in all three KRAS-mutant colorectal cancer PDX models tested. Promising preclinical activity seen here supports clinical evaluation of this treatment approach to improve therapeutic outcome for patients with metastatic colorectal cancer. Clin Cancer Res; 22(2); 405–14. ©2015 AACR.
A paisagem urbana brasileira – tipos ideais
Authors: Corrêa Roberto Lobato 
Published: September 2015

Em 1976 o geógrafo Donald Meinig publicou uma coletânea de textos nos quais a paisagem era interpretada. Ele próprio apresenta o que considera ser os tipos ideais – no sentido weberiano – de paisagens americanas. Estas paisagens condensam a experiência e a visão de mundo dos americanos, sendo frequentemente reproduzidas em filmes, cartazes e folhinhas. As três paisagens discutidas por Meinig sugerem inúmeros questionamentos mas também nos leva a indagações sobre tipos ideais de paisagens brasileiras. Nostalgia e segregação residencial são temas que aparecem a partir do texto de Meinig. Em relação ao Brasil o campo de investigação em tela está aberto. Que tipos ideais de paisagens brasileiras podem ser elaborados, construídos intelectualmente pelos geógrafos com representações gerais das paisagens brasileiras? Este breve ensaio procura contribuir nesta direção.
Potencial fitoindicador de espécies dunares a partir da modelagem preditiva na praia do Jatobá – Barra dos Coqueiros, SE
Authors: Santos Sindiany Suelen Caduda , Souza Rosemeri Melo 
Published: September 2015

<span>O artigo objetiva investigar espécies endêmicas de dunas capazes de indicar a situação ambiental da área de Barra dos Coqueiros cogitada para criação de uma Unidade de Conservação, Sergipe, a partir do potencial fitogeográfico revelado pela modelagem de distribuição de espécies. Por meio do software MAXENT foram analisadas sete espécies endêmicas de dunas incipientes e semifixas. Os potenciais distributivos estabeleceram que a </span><em>R. maritima,</em><span> por sua taxa de dispersão próxima de um,</span><em> </em><span>é importante para recuperação de áreas litorâneas. Todavia, a </span><em>I. imperati</em><span>, com taxa de predição próxima de zero é a fitoindicadora de vulnerabilidade/fragilidade. A pesquisa aponta que novas ações planejadas precisam ser efetivadas para a real conservação da biodiversidade em Sergipe.</span>
A eficácia do Snoezelen na redução das estereotipias em adultos com deficiência intelectual: um estudo de caso da intervenção da terapia ocupacional em salas de estimulação multissensorial
Authors: Lopes Ana Sofia Pinto , Araújo Janine Vanessa Martins , Ferreira Marco Paulo Vieira , Ribeiro Jaime Emanuel Moreira 
Published: September 2015

<p>Existem escassas evidências sobre a eficácia da intervenção em salas de Snoezelen na redução de estereotipias em adultos com deficiência intelectual. Neste sentido, o presente estudo pretendeu avaliar a relação entre esta estimulação multissensorial e a redução de estereotipias em adultos com deficiência intelectual. Por meio da metodologia de estudo de caso, analisou-se o comportamento de um sujeito antes, durante e após estimulação multissensorial em salas de Snoezelen, durante dez sessões bissemanais, com a duração de 1h30. A recolha de dados foi concretizada por entrevista semiestruturada aos cuidadores formais do sujeito e da observação direta participante e não participante com registo audiovisual das sessões. Após a análise dos dados, com a utilização do software WebQDA, foi possível concluir que a estimulação multissensorial em sala de Snoezelen contribuiu para a redução das estereotipias no sujeito em estudo, durante a sua realização como imediatamente após, num contexto distinto. Outra evidência do presente estudo sugere que existe uma redução da frequência de estereotipias a médio prazo bem como o aumento da interação e comunicação do sujeito com o terapeuta.</p>
Desenvolvimento e avaliação de jogo eletrônico interativo para o processo de aprendizagem do tratamento de crianças e adolescentes com distrofia muscular de Duchenne
Authors: Klein Adriana Nathalie , Hukuda Michele Emy , Corrêa Ana Grasielle Dionísio , Ficheman Irene Karaguilla , Lopes Roseli Deus 
Published: September 2015

<p>O trabalho visa apresentar o processo de desenvolvimento e avaliação de um jogo eletrônico interativo criado para favorecer a construção de conhecimento sobre o programa de reabilitação de crianças e adolescentes com Distrofia Muscular de Duchenne (DMD). A coleta de dados do conteúdo do jogo foi feita por brainstorms com equipe multidisciplinar de profissionais da saúde (fisioterapeutas e terapeutas ocupacionais) e pacientes com DMD. Os dados foram analisados e separados em três categorias: genética, fisiopatologia e programas de alongamento. Transformou-se essas informações em storyboard e realizou-se a programação e execução do jogo feitas por uma equipe de engenheiros. Por fim, o jogo eletrônico foi testado por pacientes com DMD por meio de um questionário pré-pós-jogo. Os resultados demonstraram aumento no repertório relacionado à reabilitação pré-adquirido e pós-jogo. O jogo eletrônico interativo DuchsVille foi criado, avaliado e pode ser utilizado como uma ferramenta de tecnologia de informação aplicável para favorecer processos de ensino e aprendizagem sobre aspectos de reabilitação na DMD, aproximando o diálogo da lógica técnico-científica dos profissionais da saúde da lógica do senso comum da população.</p>
O desenho do suporte da renovação urbana: trânsitos entre plano e projeto
Authors: Noto Felipe De Souza 
Published: September 2015

<p>A falsa concorrência entre planos e projetos urbanos pautou a discussão sobre a transformação das cidades, durante os últimos 20 anos. À luz de notáveis experiências do século 20 – o Plano Obus para Argel, Le Corbusier (1929-30) e as superestruturas metabolistas japonesas (anos 1960) – e pautado por autores focados na contemporaneidade urbanística, este ensaio sugere caminhos possíveis para a conciliação das duas instâncias de pensamento propositivo nas cidades atuais. Plano e projeto urbano são descritos como faces complementares do mesmo processo de enfrentamento das questões urbanas, a partir da identificação de uma linha condutora entre reflexão e intervenção na cidade. Descreve-se a necessidade de um suporte urbano suficientemente rígido, para manter um horizonte de sentido ao conjunto de intervenções, e suficientemente maleável, para resistir às transformações impostas pelas próprias intervenções e por aquelas inerentes aos avanços dos sistemas produtivos. Um suporte que seja fruto dos desejos coletivos da sociedade, mas que se reconheça como peça tributária do desejo autoral dos urbanistas. Trata-se de um conjunto de especulações sobre a escala de atuação do Urbanismo, com desdobramentos na condição contemporânea da realidade paulistana. Planos e instrumentos urbanísticos em vigência – e outros já superados – delimitam o recorte da leitura deste ensaio e disparam um início de discussão sobre as possibilidades e necessidades de atuação no ambiente construído desta grande cidade, propondo um espaço de reflexão que recoloque em consonância planos e projetos. Apresenta-se, portanto, uma tentativa de rompimento da cisão histórica entre dois campos de atuação profissional que deveriam se conciliar como<br />braços de um único processo. </p>
Le Corbusier, Pierre Chareau e duas obras-primas da arquitetura moderna
Authors: Zakia Sílvia Amaral Palazzi 
Published: September 2015

<p>Le Corbusier e Pierre Chareau são notoriamente responsáveis por duas obras consideradas ícones da Arquitetura moderna: as moradias Villa Savoye e Maison de Verre. São obras coetâneas, solicitadas por clientes com o mesmo perfil socioeconômico – alta burguesia francesa – e com necessidades similares. Villa Savoye é uma residência unifamiliar, enquanto Maison de Verre compartilha as funções moradia e clínica médica na mesma edificação: diferença, no entanto, que não interfere no foco da análise proposta. O artigo busca, por meio do cotejamento das relações cliente-arquiteto - Le Corbusier-Savoye e Chareau-Dalsace -,levantar questões sobre a conduta profissional que o arquiteto moderno se arrogou: revolucionário de hábitos e de costumes. As obras são respostas modernas e diversas, para solicitações semelhantes. Em ambos os casos, o papel da mulher é um indicativo de sua influência, nesse contexto histórico, como formadora de opinião. A casa, sendo o lócus de domínio feminino, expressa os gostos e hábitos da mulher.</p>
Em busca do tempo e dos espaços perdidos
Authors: Furtado Claudio Soares Braga 
Published: September 2015

<p>Celebrando os 100 anos da publicação de Em busca do tempo perdido, de Marcel Proust, é feita uma leitura de algumas relações entre esse clássico da literatura mundial e o pensamento arquitetônico, à luz da prática que se ensina na FAUUSP. A importância das inovações estilísticas de Proust é vista por reflexos no pensamento da Arquitetura brasileira, ao aceitar-se o papel dessa arte como linguagem do mundo que nos cerca. A imbricação de tempo e espaço permite a transposição da busca da reminiscência para a procura dos espaços de fruição da Arquitetura moderna.</p>
Os voos da Asa Branca: tradução e transculturação do baião brasileiro
Authors: Tooge Marly D'Amaro Blasques 
Published: September 2015

<p>Este artigo discorre sobre a forma como a canção Asa Branca, um texto originado no sertão nordestino brasileiro migrou primeiramente para as áreas urbanas do país e depois para o cenário internacional, sendo apropriada por diferentes comunidades com um interesse comum: a questão do exílio. As diferentes versões da canção ao longo do tempo e em diferentes locais mostram que agendas pontuais e locais levaram à manipulação da letra original (e à adaptação do ritmo e do canto), sem, todavia, diminuir o impacto do tema universal que é o desterro.</p>
A terminologia das redes sociais no Brasil: etapas metodológicas
Authors: Santiago Márcio Sales , Pinto Juliana Bicalho , Araújo Júlio 
Published: September 2015

<p>Este artigo objetiva apresentar as etapas metodológicas utilizadas no Projeto “Terminologia das Redes Sociais no Brasil” (TERMIREDES). Tais etapas foram desenvolvidas visando ao registro dos termos presentes em tutoriais das redes sociais. Baseamos nosso trabalho nos fundamentos teóricos e metodológicos da Terminologia, disciplina que tem o termo como objeto central de estudo. Para o desenvolvimento da proposição, assumimos as concepções de Krieger (2004) sobre o fato de a análise terminológica compreender o modo como se constituem os léxicos especializados, bem como a adoção de um valor metodológico a fim de orientar o reconhecimento da terminologia de áreas especializadas ou domínios temáticos que ainda não contam com uma sistematização no português do Brasil. Como resultado, apresentamos o modelo de ficha terminológica desenvolvido para o projeto de pesquisa em questão.</p>
Discutindo a (in)equivalência: um exercício de análise
Authors: Henge Glaucia Da Silva 
Published: September 2015

<p>Partindo de uma discussão contemporânea acerca da noção de equivalência em tradução, buscamos discutir neste artigo as definições do que é tradução, o estabelecimento de equivalentes entre diferentes textos a traduzir e a existência de zonas de inequivalência entre eles. Para tanto, propomos um primeiro momento de revisão teórica (baseada nos autores PYM 2011, HURTADO ALBIR 2001 e RABADÁN 1991), para em seguida discutirmos a produtividade da noção no fazer tradutório através da análise de um trecho de obra literária. Estabelecemos, portanto, uma prática de análise de (in)equivalências e discutimos as possibilidades de escolha do tradutor.</p>