bluuebunny/crossref_metadata_2025_split huggingface dataset:
Opposing Forces of A/T-Biased Mutations and G/C-Biased Gene Conversions Shape the Genome of the Nematode Pristionchus pacificus
Authors: Weller Andreas M , Rödelsperger Christian , Eberhardt Gabi , Molnar Ruxandra I , Sommer Ralf J 
Published: January 2014

Abstract
Base substitution mutations are a major source of genetic novelty and mutation accumulation line (MAL) studies revealed a nearly universal AT bias in de novo mutation spectra. While a comparison of de novo mutation spectra with the actual nucleotide composition in the genome suggests the existence of general counterbalancing mechanisms, little is known about the evolutionary and historical details of these opposing forces. Here, we correlate MAL-derived mutation spectra with patterns observed from population resequencing. Variation observed in natural populations has already been subject to evolutionary forces. Distinction between rare and common alleles, the latter of which are close to fixation and of presumably older age, can provide insight into mutational processes and their influence on genome evolution. We provide a genome-wide analysis of de novo mutations in 22 MALs of the nematode Pristionchus pacificus and compare the spectra with natural variants observed in resequencing of 104 natural isolates. MALs show an AT bias of 5.3, one of the highest values observed to date. In contrast, the AT bias in natural variants is much lower. Specifically, rare derived alleles show an AT bias of 2.4, whereas common derived alleles close to fixation show no AT bias at all. These results indicate the existence of a strong opposing force and they suggest that the GC content of the P. pacificus genome is in equilibrium. We discuss GC-biased gene conversion as a potential mechanism acting against AT-biased mutations. This study provides insight into genome evolution by combining MAL studies with natural variation.
From Clinical Expert to Guide: Experiences From Coaching People With Rheumatoid Arthritis to Increased Physical Activity
Authors: Nessen Thomas , Opava Christina H. , Martin Cathrin , Demmelmaier Ingrid 
Published: January 2014

Background
Physical activity levels in people with rheumatoid arthritis are lower than what are recommended for a healthful lifestyle. To support physical activity, health care professionals may use behavioral change techniques based on a biopsychosocial perspective. Investigating the implementation process may be relevant for understanding how these techniques translate to practice.

Objectives
The study objective was to explore the experiences of physical therapists using behavioral change techniques to coach people with rheumatoid arthritis to health-enhancing physical activity in a 2-year trial, the Physical Activity in Rheumatoid Arthritis 2010 study.

Design
This was an exploratory study with qualitative content analysis.

Methods
Semistructured interviews were conducted with all 12 physical therapists in the study. They were asked about their experiences with an educational program and with their delivery of a health-enhancing physical activity intervention. Codes, subcategories, categories, and an overarching theme were derived from the transcribed interviews by use of qualitative content analysis.

Results
The overarching theme (from clinical expert to guide) was based on 3 main categories: challenges in the coaching role, growing into the coaching role, and coach education and support. Early in the process, the physical therapists encountered challenges that needed to be addressed for a smoother transition into their coaching role. Assisted by education and support, they gradually adopted practices that facilitated their use of behavioral change techniques and promoted growth into the role of coach.

Conclusions
Adapting to a new role is a challenging process for health care professionals; it requires relevant education and support. The experiences identified in the present study may inform future educational programs targeting the skills of health care professionals in promoting various health-related behaviors.
Regional free movement of people: The case of African Regional Economic Communities
Authors: Nita Sonja 
Published: January 2014

While the idea of global free movement of people is discussed merely in normative terms, it has become a concrete policy goal in different world regions. The article aims to assess the prospects of regional free movement by discussing its theoretical and practical implications, with a specific focus on African sub-regional organizations. This is achieved by outlining the meaning, rights, and rationale of the free movement of people and by situating the regional level within the overall context of international migration governance. The eight African Regional Economic Communities serve as a practical illustration on how the goal of free movement is translated (or not) into concrete policies. Spanish
Aunque la idea de la libre circulación mundial de personas se discute sólo en términos normativos, se ha convertido en un objetivo político concreto en diferentes regiones del mundo. Este artículo tiene como objetivo evaluar las posibilidades de libre circulación regional (continental), discutiendo sus implicaciones teóricas y prácticas, con un enfoque especí fico en las organizaciones subregionales africanas. Esto se logra delineando el significado, los derechos y la razón de ser de la libre circulación de personas, y situando el nivel regional dentro del contexto general de la gobernanza de la migración internacional. Las ocho comunidades económicas regionales de África sirven como un ejemplo práctico de cómo se traduce el objetivo de la libre circulación, o no, en políticas concretas. French
Bien que l'idée de la libre circulation mondiale des personnes soit essentiellement traitée en termes normatifs, elle est devenue un objectif politique concret dans différentes régions du monde. Cet article vise à évaluer les perspectives de la libre circulation régionale en discutant de ses implications théoriques et pratiques, avec un accent particulier sur les organisations sous régionales africaines. Ceci est réalisé en soulignant la signification, les droits et la justification de la libre circulation des personnes et en situant l'échelle régionale dans le contexte global de la gouvernance de la migration internationale. Les huit communautés économiques régionales africaines constituent un exemple concret de la façon dont l'objectif de la libre circulation se traduit (ou non) par des politiques concrètes.
Prospects for free movement in the East African Community
Authors: Oucho John 
Published: January 2014

This article traces the evolution of regional integration in East Africa, discussing its nature, scope, triumphs, and challenges. It reviews the Protocol on the Establishment of the East African Community Common Market (PEEACCM), which develops aspects of free movement policy that were implicit in earlier editions of the EAC regional integration. The article then addresses the several challenges that exist to free movement in the EAC as it endeavors to usher in the larger Southern and East Africa COMESA–EAC–SADC Tripartite Agreement and even wider continental-level coordination. It concludes that a managed migration policy rather than free movement might be more appropriate. Spanish
Este artículo traza la evolución de la integración regional en África del Este, discutiendo su naturaleza, alcances, triunfos y desafíos. Se revisa el Protocolo para el Establecimiento del Mercado Común de la Comunidad de África del Este (conocido como Protocolo de Mercado Común), el cuál desarrolla aspectos de la política de libre circulación que estaban implícitas en las previas ediciones sucesivas a la integración regional en la Comunidad de África del Este (CAE). Posteriormente, el artículo aborda los diversos desafíos que existen para la libre circulación en la CAE en contraste con los esfuerzos de la misma CAE por ser la vanguardia en el amplio Acuerdo Tripartita COMESA-CAE-SADC, que abarca países del sur y del este de África, y en la coordinación a nivel continental aún más amplia. El autor llega a la conclusión de que una política de gestión de la migración en lugar de libre circulación podría ser más apropiada. French
Cet article retrace l'évolution de l'intégration régionale en Afrique de l'Est (AE), en discutant de sa nature, de sa portée, des succès et des défis qui se posent à elle. Il examine le Protocole portant sur la création du Marché commun d'Afrique orientale communautaire (PEACCM en anglais), qui développe des aspects de la politique de libre circulation qui étaient implicites dans les éditions précédentes des accords d'intégration de l'AE. L'article aborde ensuite les nombreux défis qui se posent à la libre circulation dans la CAE, comment les CAE s'efforcent également d'inaugurer la plus grande Afrique australe et orientale de l'Accord tripartite COMESA-EAC-SADC et de la coordination encore plus large au niveau continental. Il conclut qu'une politique de gestion des migrations pourrait être plus appropriée que la libre circulation.
Investigating the pollination syndrome of the Hawaiian lobeliad genus Clermontia (Campanulaceae) using floral nectar traits
Authors: Pender Richard J. , Morden Clifford W. , Paull Robert E. 
Published: January 2014

• Premise of the study: Floral nectar sugar compositions have, for several decades, been used to predict a plant species’ pollinator guild. Plants possessing a generalist ornithophilous pollination syndrome produce nectar that is dilute (8–12% w/v sugars) with a low sucrose to hexose (glucose and fructose) ratio. The Hawaiian lobeliad genus Clermontia contains 22 endemic species of shrubs and small trees that are believed to have evolved flowers adapted for pollination by now mostly extinct or endangered endemic passerines in the Drepanidinae and Mohoidae.• Methods: We analyzed the nectar sugar compositions, concentration, and nectar standing crop of 23 taxa to test the assumption that Clermontia taxa have evolved floral traits in response to selection pressures from these avian pollinators.• Key results: All Clermontia taxa produced nectar with sugar concentrations (mean: 9.2% w/v ± 1.8 SD) comparable to the nectar of other plant species with a generalized bird pollination system. Nectar sugars were overwhelmingly composed of hexoses in all taxa (mean sucrose/hexose ratio: 0.02 ± 0.02). Nectar standing crop volumes varied widely among taxa, ranging from 9.7 µL ± 7.1 to 430.5 µL ± 401.8 (mean volume: 177.8 ± 112.0).• Conclusions: Collectively, the nectar traits indicate that Clermontia species possess a generalist passerine pollination syndrome.
Shift from bird to butterfly pollination in Clivia (Amaryllidaceae)
Authors: Kiepiel Ian , Johnson Steven D. 
Published: January 2014

• Premise of the study: Pollinator shifts have been implicated as a driver of divergence in angiosperms. We tested the hypothesis that there was a transition from bird‐ to butterfly pollination in the African genus Clivia (Amaryllidaceae) and investigated how floral traits may have been either modified or retained during this transition.• Methods: We identified pollinators using field observations, correlations between lepidopteran wing scales and pollen on stigmas, and single‐visit and selective exclusion experiments. We also quantified floral rewards and advertising traits.• Key results: The upright trumpet‐shaped flowers of C. miniata were found to be pollinated effectively by swallowtail butterflies during both nectar‐feeding and brush visits. These butterflies transfer pollen on their wings, as evidenced by positive correlations between wing scales and pollen loads on stigmas. All other Clivia species have narrow pendulous flowers that are visited by sunbirds. Selective exclusion of birds and large butterflies from flowers of two Clivia species resulted in a significant decline in seed production.• Conclusions: From the distribution of pollination systems on available phylogenies, it is apparent that a shift took place from bird‐ to butterfly pollination in Clivia. This shift was accompanied by the evolution of trumpet‐shaped flowers, smaller nectar volume, and emission of scent, while flower color and nectar chemistry do not appear to have been substantially modified. These results are consistent with the idea that pollinator shifts can explain major floral modifications during plant diversification.
Le Commentaire du Cantique des Cantiques de Thomas de Perseigne revisité
Authors: Bell David N. 
Published: January 2014

Thomas de Perseigne est un personnage étrangement mal connu. Son commentaire sur le Cantique des Cantiques, écrit entre 1170 et 1189, fut l’un des commentaires de ce type les plus largement diffusés et il en subsiste aujourd’hui soixante-dix-huit manuscrits. On trouve également mention de sept autres copies perdues. Seuls trois autres commentaires médiévaux ont été conservés dans un plus grand nombre de manuscrits – ceux de Bernard de Clairvaux, d’Honoré d’Autun et le commentaire combiné de Grégoire le Grand et de Robert de Tombelaine – et le commentaire de Thomas fut imprimé à cinq reprises entre 1521 et 1853. Sa popularité se doit à son style moderne et à la richesse de son contenu. En ce qui concerne le style, la totalité du commentaire est organisée en une succession de parties (distinctiones) et de sous-parties ; le contenu propose quant à lui des interprétations théologiques, morales, spirituelles, mystiques, ecclésiologiques, mariologiques et liturgiques puisées à un très grand nombre de sources. Il s’agit d’une véritable encyclopédie de l’allégorie médiévale.
La place des abbayes cisterciennes dans l’histoire de l’Anjou
Authors: Tonnerre Noël-Yves 
Published: January 2014

L’originalité des cinq établissements cisterciens de l’Anjou vient du caractère resserré et précoce des fondations, puisque seule l’abbaye du Perray est postérieure à 1150. Elle vient aussi d’un paradoxe ; d’un côté les cisterciens ont su intégrer deux monastères de Savigny, un ermitage et un établissement bénédictin traditionnel, ce qui fait du Loroux la seule véritable création cistercienne. En clair, les cisterciens ont vraiment été en Anjou des spécialistes des refondations ! De l’autre les cisterciens ont été dès la seconde moitié du xiie siècle victimes du succès des nouveaux monastères concurrents : Fontevraud et les grandmontains. Ainsi les cisterciens n’ont réussi à fédérer l’ensemble des énergies du nouveau monachisme que pour une courte période : un tiers de siècle. À la question : y a-t-il eu une économie cistercienne en Anjou ?, la réponse présente un caractère également contradictoire : oui les cisterciens ont joué un rôle pionnier dans les aménagements hydrauliques et l’essor des cultures spéculatives, l’exemple de la vigne présente beaucoup d’intérêt, mais leur rôle dans les défrichements doit être nuancé.
Les anciennes carrières de la région lorientaise (Morbihan)
Authors: Chauris Louis 
Published: January 2014

La croissance rapide de Lorient à partir du XVIIIe siècle sous l'impulsion de la Compagnie des Indes, puis de la Marine, induisant la mise en œuvre d'infrastructures urbaines, portuaires et défensives, a entraîné l'exploitation de nombreuses carrières aux environs de la ville. En 1741, un ingénieur du Roi choisit 18 sites en fonction de leur position géographique et de la qualité des matériaux ; ce nombre élevé s'interprète par une faible dimension individuelle et par les énormes besoins d'une ville en gestation. Dans la première partie du XIXe siècle, est entrepris sans grand succès, un inventaire systématique des carrières... Des prospections sur le terrain ont permis de retrouver de très nombreuses perrières depuis longtemps abandonnées. Les chantiers étaient ouverts en bordure de l'Océan (entre autres sur les rivages de Ploemeur) et sur les versants des rias navigables (le Scorff, le Blavet et la rivière d'Etel). Ces situations offraient deux atouts majeurs : facilité de l'extraction sans coûteux travaux de « découverte » et possibilité d'acheminement par voie d'eau aux époques où les charrois s'avéraient pénibles et dispendieux. Toutefois, les environs de Lorient n'ont pu fournir toutes les pierres nécessaires, d'où appel à d'autres matériaux bretons, en particulier au granite de Trégunc dans le Finistère ; déjà au XVIIIe siècle, aux « pierres dures » bretonnes (granites) venaient s'adjoindre les « pierres tendres » (calcaires) du Val de Loire et de la Charente. Dans le cadre de la sauvegarde du patrimoine d'archéologie industrielle est suggérée la « réhabilitation » d'un des sites les plus célèbres (Polvern).
Le Léon dans la Bretagne des X e -XI e siècles (Kemenet et vicomté)
Authors: Soubigou Jean-Paul 
Published: January 2014

L’histoire du Léon s’inscrit, de la fin des
invasions normandes, vers 936, jusqu’à la première Croisade, en 1096,
dans celle du duché de Bretagne. Le fief de Kemenet-Ily, en Léon, fut
l’un des sept Kemenet (en incluant la vicomté de Poudouvre) recensés
en Bretagne. Ce mot, désignant en langue bretonne un fief donné à un
baron, était déjà cité dans les actes dès la première moitié du XIe siècle. On peut penser qu’ils furent créés par le
duc Alain Barbetorte, vers le milieu du Xe siècle,
afin de restaurer la principauté bretonne, et que certains eurent à
leur tête des vicomtes, comme le Kemenet de Cornouaille et le
Kemenet-Ily. L’étude cherche à identifier leurs descendants dans des
lignages qui portaient encore le titre, devenu honorifique, de
vicomte, jusqu’au XVe siècle. Puis, des lignages
plus puissants s’imposèrent au XIe siècle. Ainsi,
la maison vicomtale de Léon, dont les origines seraient
cornouaillaises, supplanta l’aristocratie léonarde (« primates leonenses »). Ils édifièrent la forteresse
de la Roche-Morvan et renforcèrent les cités de Lesneven, en
Kemenet-Ily, puis de Brest et de Morlaix, cette dernière devenant le
centre de leur pouvoir jusqu’à la fin du XIIe
siècle.
L’établissement et la diffusion de l’illumination publique à Rennes au XVIIIe siècle
Authors: Reculin Sophie 
Published: January 2014

En 1697, Louis XIV
impose aux principales villes du royaume l'établissement de lanternes
publiques. Le pouvoir central s'engage à assurer l'entretien du
matériel par le versement d'une rente annuelle, mais pour en
bénéficier, les villes doivent se racheter par le prélèvement d'une
taxe sur les propriétaires. En dépit des résistances de la
municipalité de Rennes qui considère l'illumination publique comme une
dépense inutile, l'intendant veille à l'application de l'édit. Dès
lors, l'éclairage public s’enracine progressivement dans le paysage
urbain jusqu'à l'incendie de 1720. L'événement marque alors un coup
d'arrêt dans le développement de l'illumination publique. Les
quartiers centraux, les plus durement touchés, perdent leur primauté
lumineuse jusqu'aux années 1740. Lorsque les luminaires reprennent
leur place sur les artères principales, les habitants des quartiers
périphériques réclament à leur tour une illumination publique.
L'intérêt pour l'éclairage urbain se renforce dans la seconde moitié
du xviiie siècle. Les
lanternes à huile utilisées à Paris – les réverbères – rencontrent
alors un vif succès à Rennes, à la différence des anciennes lanternes
à chandelle. Sous l'impulsion de l'intendant, la communauté de ville
décide d'adjuger l'éclairage au réverbère à un entrepreneur parisien
réputé, Pierre Tourtille Sangrain. De fait, l'apparition d'une demande
de lumière révèle une transformation des sensibilités urbaines.
Considérés comme une marque d'urbanité par les autorités urbaines, les
réverbères procurent désormais aux habitants un sentiment de
sécurité.
Les enseignements d’une généalogie cornouaillaise
Authors: Boudjaaba Fabrice , Le Bihan Jean 
Published: January 2014

Suite à la découverte d’une généalogie
bas-bretonne complète en ligne masculine et féminine, cet article se
propose de réinterroger l’histoire des migrations bretonnes au cours
du xixe et de la
première moitié du xxe
siècle. À rebours d’une historiographie le plus souvent focalisée sur
les migrations de longue distance et dirigées vers l’extérieur de la
Bretagne, l’enquête prend ici en compte l’ensemble des mouvements
réalisés par les membres d’une famille, aussi bien à l’intérieur qu’à
l’extérieur de la région. Après avoir présenté les conditions de
constitution de la source utilisée (une généalogie de 206 individus
répartis en quatre générations), l’article analyse la dispersion de
cette famille, génération après génération, et souligne la capacité,
finalement surprenante, de rétention du territoire d’origine. Puis, à
travers une analyse économétrique des comportements des membres de la
quatrième génération, il tente de mettre en évidence les facteurs
sociodémographiques qui ont eu l’impact le plus fort sur la mobilité
des individus étudiés. L’article s’adjoint une réflexion
méthodologique sur les ressorts de la migration. Le recours à la
généalogie, plutôt qu’au recensement des lieux d’arrivée des migrants,
conduit à redessiner la carte des mouvements ainsi qu’à en relativiser
la fréquence, tandis que la prise en compte, grâce à la généalogie, du
passé migratoire familial conduit à discuter le poids des
configurations familiales dans ces mêmes mouvements et, à l’inverse,
invite à souligner l’importance de facteurs explicatifs exogènes, liés
au contexte économique notamment.
« L’affaire A. »
Authors: Bouder Manuel 
Published: January 2014

La France métropolitaine est le théâtre de nombreux
évènements lors de la fin de la guerre d'Algérie. L'opinion publique
est divisée, les tensions sont exacerbées. Aux attentats succèdent les
grèves, les manifestations et les pétitions.En Bretagne, dans le
lycée de Lannion, l'année scolaire 1961-1962 est marquée par ces
tensions. Un jeune Bônois vient d'être assigné à résidence par le
ministre de l'Intérieur dans la région. Militant pour l'Algérie
française, ex-dirigeant d’une cellule de Jeune Nation, Jean A. ne
cache pas ses opinions et ses « faits d'armes » au lycée. Face à lui,
Maurice André et ses amis communistes ne veulent plus tolérer les
provocations de ce jeune partisan de l'OAS. Ils décident de le
dénoncer dans un tract distribué à la sortie du lycée. Le chef
d’établissement, appliquant le règlement, exclu de l'établissement
Jean A. et Maurice André. Le jeune communiste est soutenu dans la
région et l'affaire prend une tournure inattendue en ce début d'année
1962. Corentin André, le père, est un célèbre Résistant dans la
région, il dirige l'ANACR et a des responsabilités au sein du parti
communiste dans le département. Meetings et pétitions prennent fait et
cause pour le jeune André. Le chef d’établissement est dans une
position délicate. Les services de renseignements du préfet suivent
les événements avec intérêt.La presse locale puis nationale et
même internationale s'empare de cette affaire qui sert des intérêts
pour les deux camps. Pour l'extrême-gauche c'est le symbole d'une
efficace mobilisation contre les « fascistes », pour l'extrême-droite
celle d'une nouvelle persécution communiste envers un « pied
noir ».