bluuebunny/crossref_metadata_2025_split huggingface dataset:
Genome-scale modeling for metabolic engineering
Authors: Simeonidis Evangelos , Price Nathan D 
Published: January 2015

AbstractWe focus on the application of constraint-based methodologies and, more specifically, flux balance analysis in the field of metabolic engineering, and enumerate recent developments and successes of the field. We also review computational frameworks that have been developed with the express purpose of automatically selecting optimal gene deletions for achieving improved production of a chemical of interest. The application of flux balance analysis methods in rational metabolic engineering requires a metabolic network reconstruction and a corresponding in silico metabolic model for the microorganism in question. For this reason, we additionally present a brief overview of automated reconstruction techniques. Finally, we emphasize the importance of integrating metabolic networks with regulatory information—an area which we expect will become increasingly important for metabolic engineering—and present recent developments in the field of metabolic and regulatory integration.
Expression and one-step purification of the antimicrobial peptide cathelicidin-BF using the intein system in Bacillus subtilis
Authors: He Qing , Fu Ai-yun , Li Tian-jiao 
Published: January 2015

Abstract
The intein expression system has been widely applied in Escherichia coli to express various proteins and peptides. However, the removal of endotoxin from the recombinant proteins expressed in E. coli is very difficult and therefore complicates the purification process. In this study, we constructed an intein-based expression vector for an antimicrobial peptide (cathelicidin from Bungarus fasciatus) and expressed the intein fusion peptide in a Bacillus subtilis expression system. The fusion peptide was secreted into the culture medium, identified by Western blot and purified by affinity chromatography and intein self-cleavage in just one step. Approximately, 0.5 mg peptide was obtained from 1 litre of culture medium. The purified peptide showed antimicrobial activity. Our results indicate that the intein expression system may be a safe and efficient method to produce soluble peptides and proteins in B. subtilis.
Reproductive Health Issues for Adults with a Common Genomic Disorder: 22q11.2 Deletion Syndrome
Authors: Chan Chrystal , Costain Gregory , Ogura Lucas , Silversides Candice K. , Chow Eva W.C. , Bassett Anne S. 
Published: January 2015

Abstract22q11.2 deletion syndrome (22q11.2DS) is the most common microdeletion syndrome in humans. Survival to reproductive age and beyond is now the norm. Several manifestations of this syndrome, such as congenital cardiac disease and neuropsychiatric disorders, may increase risk for adverse pregnancy outcomes in the general population. However, there are limited data on reproductive health in 22q11.2DS. We performed a retrospective chart review for 158 adults with 22q11.2DS (75 male, 83 female; mean age 34.3 years) and extracted key variables relevant to pregnancy and reproductive health. We present four illustrative cases as brief vignettes. There were 25 adults (21 > age 35 years; 21 female) with a history of one or more pregnancies. Outcomes for women with 22q11.2DS, compared with expectations for the general population, showed a significantly elevated prevalence of small for gestational age liveborn offspring (p < 0.001), associated mainly with infants with 22q11.2DS. Stillbirths also showed elevated prevalence (p < 0.05). Not all observed adverse events appeared to be attributable to transmission of the 22q11.2 deletion. Recurring issues relevant to reproductive health in 22q11.2DS included the potential impact of maternal morbidities, inadequate social support, unsafe sexual practices, and delayed diagnosis of 22q11.2DS and/or lack of genetic counseling. These preliminary results emphasize the importance of early diagnosis and long term follow‐up that could help facilitate genetic counseling for men and women with 22q11.2DS. We propose initial recommendations for pre‐conception management, educational strategies, prenatal planning, and preparation for possible high‐risk pregnancy and/or delivery.
Mission Oriented Support and Theory (MOST) for MMS—the Goddard Space Flight Center/University of California Los Angeles Interdisciplinary Science Program
Authors: Goldstein Melvyn L. , Ashour-Abdalla Maha , Viñas Adolfo F. , Dorelli John , Wendel Deirdre , Klimas Alex , Hwang Kyoung-Joo , El-Alaoui Mostafa , Walker Raymond J. , Pan Qingjiang , Liang Haoming 
Published: January 2015

Abstract
The MOST IDS team was tasked with focusing on two general areas: The first was to participate with the Fast Plasma Investigation (FPI) team in the development of virtual detectors that model the instrument responses of the MMS FPI sensors. The virtual instruments can be “flown through” both simulation data (from magnetohydrodynamic, hybrid, and kinetic simulations) and Cluster and THEMIS spacecraft data. The goal is to determine signatures of magnetic reconnection expected during the MMS mission. Such signatures can serve as triggers for selection of burst mode downloads. The chapter contributed by the FPI team covers that effort in detail and, therefore, most of that work has not been included here. The second area of emphasis, and the one detailed in this chapter, was to build on past and present knowledge of magnetic reconnection and its physical signatures. Below we describe intensive analyses of Cluster and THEMIS data together with theoretical models and simulations that delineate the plasma signatures that surround sites of reconnection, including the effects of turbulence as well as the detailed kinetic signatures that indicate proximity to reconnection sites. In particular, we point out that particles are energized in several regions, not only at the actual site of reconnection.
A Report on Three Consecutive Cases using Computer Tomography 3D Preoperative Planning for Conversion of Arthrodesed Hips to Total Hip Replacements
Authors: Kuroda Yutaka , Akiyama Haruhiko , Nankaku Manabu , So Kazutaka , Goto Koji , Matsuda Shuichi 
Published: January 2015

Background Conversion of an arthrodesed hip to a total hip arthroplasty (THA) is a technically demanding procedure with high complication rates. One important issue is that determining the amount of correction for a leg length discrepancy (LLD) can be difficult at the planning stage. Questions/Purposes The aim of this study is to assess the reliable use of computer tomography (CT)-based three-dimensional (3D) preoperative planning for the conversion of arthrodesed hips to THAs. Patients and Methods CT-based preoperative 3D planning was used to convert three arthrodesed hips to THAs. The efficacy of the planning was evaluated with postoperative radiographic measurements involving the amount of correction for LLD, position of components, difference between targeted and actual values, and ratio of the moment arms. The clinical assessment was performed with the Japanese Orthopaedic Association (JOA) hip score before and after THA. Results The mean amount of LLD correction and median LLD after THA were 16 mm (range, 15–17 mm) and 4 mm (range, 1–10 mm), respectively. The components were implanted close to the positions recommended by the preoperative simulation. The ratio of the moment arms indicated that the converted hips were reconstructed in a biomechanically correct manner. The implants for the conversion to THA were successfully positioned with respect to anatomy and functional outcome. The median JOA hip score improved from 50 points (range, 30–66 points) preoperatively to 79 points (range, 72–86 points) at the latest follow-up. Conclusions CT-based preoperative 3D planning could be a powerful guidance tool for conversion of arthrodesed hips to THAs.
The Impact of Married Individuals Learning HIV Status in Malawi: Divorce, Number of Sexual Partners, and Condom Use With Spouses
Authors: Fedor Theresa M. , Kohler Hans-Peter , Behrman Jere R. 
Published: January 2015

Abstract
This article assesses how married individuals’ knowledge of HIV status gained through HIV testing and counseling (HTC) affects divorce, the number of sexual partners, and the use of condoms within marriage. This study improves upon previous studies on this topic because the randomized incentives affecting the propensity to be tested for HIV permit control for selective testing. Instrumental variable probit and linear models are estimated, using a randomized experiment administered as part of the Malawi Longitudinal Study of Families and Health (MLSFH). The results indicate that knowledge of HIV status (1) does not affect chances of divorce for either HIV-negative or HIV-positive respondents; (2) reduces the number of reported sexual partners among HIV-positive respondents; and (3) increases reported condom use with spouses for both HIV-negative and HIV-positive respondents. These results imply that individuals actively respond to information about their HIV status that they learn during HTC, invoking protective behavior against future risk of HIV/AIDS for themselves and their actual and potential sexual partners. Some limitations of this study are a small sample size for those who are HIV-positive and dependence on self-reported sexual behaviors.
Diagnóstico de necesidades de educación continua mediante un método grupal y un método individual
Authors: Maya-Ampudia Claudia Catalina , Ángeles-Zavala Oswaldo , Camarena-Olmedo Javier Alejandro 
Published: January 2015

Introducción: La educación continua debe responder a las necesidades sociales de salud dentro del contexto histórico y social de los profesionistas, para lo cual es necesario contar con información precisa sobre las necesidades de actualización del personal en salud. El método tradicional comúnmente utiliza una encuesta individual, e identifica las necesidades individuales o sentidas del personal, sin referencia a las necesidades reales de la institución, ni del equipo de salud. Un método grupal debe posibilitar la identificación de las necesidades reales y prioritarias que respondan a las necesidades sociales de salud.
Objetivo: El estudio comparó la utilidad de un método grupal de diagnóstico de necesidades de educación continua vs. un método de encuesta individual.
Método: Se realizó un estudio observacional y transversal, con metodología cualitativa y técnica de grupos nominales. El estudio constó de dos fases, incluyó al personal profesional médico y paramédico del Servicio de Parálisis Cerebral y Estimulación Temprana del Instituto Nacional de Rehabilitación (INR). En la primera fase se aplicó una encuesta individual utilizada en el INR para el diagnóstico de necesidades de educación continua. En la segunda fase, mediante consenso grupal, se generó el diagnóstico de necesidades de educación continua requeridas para: a) optimizar la práctica profesional de atención a la salud; b) realizar investigación, y c) el diagnóstico y la referencia oportuna por personal no especialista.
Resultados: El método individual identificó las necesidades de educación continua respecto a las funciones profesionales y el método grupal detectó las necesidades en los tres niveles indagados, y agregó una categoría, las necesidades de educación de los pacientes y de sus familiares.
Conclusiones: El método grupal incorporó el contexto epidemiológico y social de la institución y el método individual identificó las necesidades personales respecto a funciones profesionales. Se considera que los dos métodos son complementarios.
Expectativas y sentimientos de los estudiantes de Medicina ante el internado de pregrado
Authors: Valdez-Nava Sabás , Heshiki-Nakandakari Luis , Osornio-Castillo Leticia , Domínguez-Álvarez Edilberto , Sánchez-de Tagle Herrera Rafael 
Published: January 2015

Introducción: El internado de pregrado es una etapa fundamental de la formación médica en donde el alumno pone en práctica aptitudes y actitudes adquiridas en ciclos previos, y desarrolla nuevas en un escenario real.
Objetivo: Explorar las expectativas y sentimientos que los alumnos tienen al momento de la elección de plazas de internado de pregrado.
Método: muestra intencional, participaron 156 alumnos de la Carrera de Médico Cirujano de la generación 2009-2012, de la Facultad de Estudios Superiores Iztacala (FESI). Se aplicó un cuestionario que exploró elección de plaza, expectativas, cualidades y aptitudes para su desempeño, y sentir.
Resultados: Se encontró que el 85.2% de la muestra seleccionó plazas del Instituto Mexicano de Seguro Social (IMSS). La mayoría eligió plaza por la cercanía a su domicilio; esperan aumentar sus conocimientos y habilidades en la realización de procedimientos médico-quirúrgicos, en la integración de diagnósticos y prescripción de tratamientos, reforzando su capacidad de razonamiento clínico. Para ello, mencionaron contar con cualidades y habilidades para un buen desempeño, apoyando al médico de base y tomando mayor responsabilidad en el trato con los pacientes y la institución hospitalaria. Refirieron tener sentimientos ambivalentes (nervioso/contento, preocupado/entusiasmado, temeroso/tranquilo) ante esta nueva etapa por vivir.
Conclusiones: Previo al internado los alumnos tienen altas expectativas sobre su formación clínica, su desempeño ante los pacientes y el manejo de sus emociones en un escenario real.
Efecto de un curso-taller de formación docente sobre los referentes pedagógicos de profesores de Embriología
Authors: Urrutia-Aguilar María Esther , Guevara-Guzmán Rosalinda , Aburto- Arciniega Mónica Beatriz 
Published: January 2015

Introducción: Actualmente, en la Facultad de Medicina de la Universidad Nacional Autónoma de México (UNAM) se encuentra vigente el Plan de Estudios 2010 de la Carrera de Médico Cirujano, que promueve el desarrollo de ocho competencias en los estudiantes. Sin duda, los sistemas educativos dependen de la calidad y desempeño de sus docentes, por lo que su formación debe estar dirigida a fortalecer aspectos que impacten la diversificación de las estrategias de enseñanza de referentes pedagógicos.
Objetivo: Identificar la modificación en los referentes pedagógicos de los profesores, después de asistir al “Curso Taller de Formación Docente en Competencias”.
Método: Estudio observacional, descriptivo, prospectivo y longitudinal. La población de estudio se conformó de 24 ayudantes de profesor, que impartieron la asignatura de Embriología Humana durante el ciclo escolar 2012-2013. Éste se impartió durante 30 horas. Se aplicó antes y después del curso un instrumento de referentes pedagógicos conformado por 42 reactivos, con escala tipo Likert, con alfa de Cronbach de 0.77, agrupados en cinco estrategias: aprendizaje, planeación, metodología, evaluación y relación docente-estudiante.
Resultados: El 17% y 10% de los docentes que estuvieron de acuerdo con el referente tradicional en estrategias de aprendizaje y planeación, respectivamente, tuvieron un cambio hacia los referentes alternativos y de tecnología educativa después de asistir al curso. Cabe señalar que gran parte de los profesores después del curso refirió estar de acuerdo con los referentes tradicionales de la relación docente-estudiante.
Conclusión: Se encontró que algunos profesores mantienen creencias vinculadas al referente tradicional en las estrategias de metodología, evaluación y relación docente-estudiante después del curso-taller. Es necesario que los cursos de formación docente incluyan una amplia gama de estrategias de enseñanza que incorpore el uso de tecnología como herramienta, así como diferentes procesos de evaluación que sean acordes al contexto educativo institucional.
Herramientas de estudio utilizadas por alumnos de ciencias de la salud en la materia de Anatomía
Authors: Narváez-Hernández Erik , Murillo-Rábago Elvira Ivonne 
Published: January 2015

Introducción: Las herramientas de estudio varían de acuerdo al acceso a la tecnología y presupuesto de la Facultad, en Anatomía el uso de modelos virtuales y videos en línea, son una realidad con cada vez mayor uso.
Objetivo: Conocer las herramientas de estudio más utilizadas por alumnos que cursaron la materia de Anatomía General en cuanto a tiempo de estudio, tecnología de la información que utilizan, libros preferidos, uso de modelos anatómicos y utilidad de las disecciones.
Método: Se realizó un estudio observacional y descriptivo a los alumnos que cursaron la materia de Anatomía, aplicándoles un cuestionario para recabar información sobre sus herramientas de estudio, preguntándoles sobre el libro preferido, el tiempo en internet, la utilidad de los modelos anatómicos y las disecciones.
Resultados: Se encuestó a un total de 225 alumnos respecto a la preferencia de los libros de Anatomía, 49% prefirió el libro de Anatomía Clínica de Moore, 33% Anatomía Humana de Latarjet, 10.5% Anatomía de Grey y 3.5% Anatomía Humana de Quiroz. Al encuestar el tiempo de uso en internet para el estudio en proporción horas/semana, 23.6% lo utilizó una hora, 24.9% dos horas, 19.6% tres horas y 29.3% más de tres horas. Respecto a las disecciones, el 97% consideró que las prácticas en anfiteatro son útiles como actividad complementaria. Referente a los materiales en clase, el 36% prefirió los modelos anatómicos como una adecuada herramienta, el 23% los videos, el 20% las imágenes, el 12% las exposiciones y el 9% las preguntas exploratorias.
Conclusiones: Se debe orientar respecto a la búsqueda de información confiable y útil en internet para su mejor aprovechamiento; también se observó que dentro del aula prefieren el uso de modelos anatómicos como herramienta docente y que se continúa prefiriendo la disección cadavérica como actividad complementaria.
Síntesis de la evidencia en educación para la salud
Authors: García-Perdomo Herney Andrés 
Published: January 2015

La revisión sistemática (RS) de la literatura es la evaluación sistemática y explícita de la literatura, a partir de una pregunta clara de investigación, junto a un análisis crítico de acuerdo a diferentes herramientas y un resumen cualitativo de la evidencia. Al existir datos duros, claros y homogéneos es posible la realización de un análisis estadístico denominado “meta-análisis” (MA). Las RS deben presentar los siguientes aspectos: una pregunta de investigación clara y basada en la estrategia “Población, Intervención, Control, Desenlace” (PICO), una estrategia de búsqueda clara y reproducible, la selección apropiada de los estudios junto a la extracción de sus datos, la evaluación de la calidad de la evidencia con alguna de las diferentes herramientas y, si existen datos duros y homogéneos, se podrá realizar un meta-análisis. Las RS de la literatura/MA son un apoyo fundamental para la toma de decisiones tanto en el área clínica como en la educativa; además para el desarrollo de políticas públicas en todas las áreas de conocimiento.
Mapas conceptuales para favorecer el aprendizaje significativo en ciencias de la salud
Authors: Luna de la Luz Verónica 
Published: January 2015

En esta Pauta en Educación Médica se describe un proceso para facilitar la creación de mapas conceptuales como estrategia de enseñanza y aprendizaje, que permita analizar la información a través de promover la identificación del esquema de conocimientos previos, en el que se establezcan relaciones lógicas con la información a aprender, para promover el pensamiento crítico y el aprendizaje significativo.
Universal Screening and Decolonization for Control of MRSA in Nursing Homes: A Cluster Randomized Controlled Study
Authors: Bellini Cristina , Petignat Christiane , Masserey Eric , Büla Christophe , Burnand Bernard , Rousson Valentin , Blanc Dominique S. , Zanetti Giorgio 
Published: January 2015

OBJECTIVEThe risk of carrying methicillin-resistantStaphylococcus aureus(MRSA) is higher among nursing home (NH) residents than in the general population. However, control strategies are not clearly defined in this setting. In this study, we compared the impact of standard precautions either alone (control) or combined with screening of residents and decolonization of carriers (intervention) to control MRSA in NHs.DESIGNCluster randomized controlled trialSETTINGNHs of the state of Vaud, SwitzerlandPARTICIPANTSOf 157 total NHs in Vaud, 104 (67%) participated in the study.INTERVENTIONStandard precautions were enforced in all participating NHs, and residents underwent MRSA screening at baseline and 12 months thereafter. All carriers identified in intervention NHs, either at study entry or among newly admitted residents, underwent topical decolonization combined with environmental disinfection, except in cases of MRSA infection, MRSA bacteriuria, or deep skin ulcers.RESULTSNHs were randomly allocated to a control group (51 NHs, 2,412 residents) or an intervention group (53 NHs, 2,338 residents). Characteristics of NHs and residents were similar in both groups. The mean screening rates were 86% (range, 27%–100%) in control NHs and 87% (20%–100%) in intervention NHs. Prevalence of MRSA carriage averaged 8.9% in both control NHs (range, 0%–43%) and intervention NHs (range, 0%–38%) at baseline, and this rate significantly declined to 6.6% in control NHs and to 5.8% in intervention NHs after 12 months. However, the decline did not differ between groups (P=.66).CONCLUSIONUniversal screening followed by decolonization of carriers did not significantly reduce the prevalence of the MRSA carriage rate at 1 year compared with standard precautions.Infect Control Hosp Epidemiol2015;00(0): 1–8
Mapping regional vegetation developments in Twente (the Netherlands) since the Late Glacial and evaluating contemporary settlement patterns
Authors: van Beek R. , Gouw-Bouman M.T.I.J. , Bos J.A.A. 
Published: January 2015

AbstractInterdisciplinary, landscape-oriented studies from an archaeological viewpoint in the Low Countries mainly concentrate on cultural and economic research questions. Focal points are the physical setting of settlements and cemeteries, land use patterns and subsistence economy. As a result, the collected data are rather site-based and one-dimensional. As a counterweight, this study aims to look beyond the boundaries of settlements and cemeteries by offering a regional and diachronic perspective on the development of the landscape, vegetation and habitation of Twente (the Netherlands) since the Late Glacial. A detailed search for existing pollen data yielded 125 sites containing information from a wide variety of sampling contexts. A series of six evidence-based regional vegetation maps have been constructed by analysing relations between pollen data, soil data and topography. The maps serve as first-stage generalised models that predict regional trends, allow subsequent testing and place site-specific archaeological data in a wider context. The method developed is applicable to other regions. A comparison with contemporary habitation patterns, based on archaeological and historical data, reveals spatio-temporal trends in human influence on vegetation and in physical factors influencing site location. Five maps have been ‘translated’ into artist impressions.