bluuebunny/crossref_metadata_2025_split huggingface dataset:
G4-Interacting DNA Helicases and Polymerases: Potential Therapeutic Targets
Authors: Estep Katrina N. , Butler Thomas J. , Ding Jun , Brosh Robert M. 
Published: November 2017

Background:Guanine-rich DNA can fold into highly stable four-stranded DNA structures called G-quadruplexes (G4). In recent years, the G-quadruplex field has blossomed as new evidence strongly suggests that such alternately folded DNA structures are likely to exist in vivo. G4 DNA presents obstacles for the replication machinery, and both eukaryotic DNA helicases and polymerases have evolved to resolve and copy G4 DNA in vivo. In addition, G4-forming sequences are prevalent in gene promoters, suggesting that G4-resolving helicases act to modulate transcription.Methods:We have searched the PubMed database to compile an up-to-date and comprehensive assessment of the field’s current knowledge to provide an overview of the molecular interactions of Gquadruplexes with DNA helicases and polymerases implicated in their resolution.Results:Novel computational tools and alternative strategies have emerged to detect G4-forming sequences and assess their biological consequences. Specialized DNA helicases and polymerases catalytically act upon G4-forming sequences to maintain normal replication and genomic stability as well as appropriate gene regulation and cellular homeostasis. G4 helicases also resolve telomeric repeats to maintain chromosomal DNA ends. Bypass of many G4-forming sequences is achieved by the action of translesion DNS polymerases or the PrimPol DNA polymerase. While the collective work has supported a role of G4 in nuclear DNA metabolism, an emerging field centers on G4 abundance in the mitochondrial genome.Conclusion:Discovery of small molecules that specifically bind and modulate DNA helicases and polymerases or interact with the G4 DNA structure itself may be useful for the development of anticancer regimes.
The Presence of Beneficial Organisms Associated to N and P Economy in the Rhizosphere of Native Vegetation in an Oligotrophic Savanna of Guárico State, Venezuela
Authors: Mora Edith , Toro Marcia , López-Hernández Danilo 
Published: November 2017

Background:In natural conditions, tropical plants are adapted to different ecological niches that can be associated to soil microorganisms which play a key role in nutrient cycling likeArbuscular mycorrhiza(AM), phosphate solubilizing bacteria (PSB) and/or nitrogen fixing rhizobia.Methods:We report a survey of the presence in a Trachypogon savanna located at Estación Experimental La Iguana (EELI) in Central Venezuela, of some beneficial plant-microorganism associations. In this savanna, plants present a high AM symbiosis affinity. The high mycorrhization and the presence of potential PSB suggest a synergic effect in plant P-uptake.Results:After screening the rhizospheres of 25 plant species from the zone, we could isolate a high proportion of potential PSB in relation to the total bacteria number from the rhizospheres ofCentrosema venosumandGalactia jussiaeana.Conclusion:Therefore, the presence of potential PSB in the rhizosphere of those species constitutes an important finding to discover novel biofertilizers for crop plants.
Scurvy: When it is a Forgotten Illness the Surgery Makes the Diagnosis
Authors: Bouaziz Wajdi , Rebai Mohamed Ali , Rekik Mohamed Ali , Krid Nabil , Ellouz Zoubaier , Keskes Hassib 
Published: November 2017

Background:
Unlike most of animal species, human beings lack the enzymatic process for the conversion of glucose to ascorbic acid (vitaminC), and therefore getting the vitamin from food sources is essential. The association of the various signs caused by a deficiency of vitamin C is called scurvy or Barlow’s disease, an easily treatable disease but can be fatal. It is rare in the developed countries and even economically underdeveloped societies in which the basic diet is already rich in ascorbate.

Methods:
We describe here the case of a 4-year-old girl with cerebral palsy, in whom diagnosis concerns were oriented for osteomyelitis, based upon clinical presentation, ultrasonic and magnetic resonance imaging, led to a surgery revealing subperiosteal hematomas that argues in favor of scurvy.

Results:
After vitamin C therapy, the symptoms are gone and the general condition of the patient improved despite persistent radiological signs.

Conclusion:
Recent studies of sporadic cases report a high incidence of scurvy in children with autism or psychomotor retardation and the fact that musculoskeletal manifestations are more common. The mosaics of the symptoms of scurvy are varied and include dermatological, dental, bone and systemic manifestations, making it a forgotten and misdiagnosed illness. A heightened awareness is needed to avoid an unnecessary surgery, unnecessary tests and procedures and to be able to start treatment for a potentially fatal but easily curable disease.
Prospective Evaluation of Kidney Disease in Joubert Syndrome
Authors: Fleming Leah R. , Doherty Daniel A. , Parisi Melissa A. , Glass Ian A. , Bryant Joy , Fischer Roxanne , Turkbey Baris , Choyke Peter , Daryanani Kailash , Vemulapalli Meghana , Mullikin James C. , Malicdan May Christine , Vilboux Thierry , Sayer John A. , Gahl William A. , Gunay-Aygun Meral 
Published: November 2017

Background and objectives
Joubert syndrome is a genetically heterogeneous ciliopathy associated with >30 genes. The characteristics of kidney disease and genotype-phenotype correlations have not been evaluated in a large cohort at a single center.

Design, setting, participants, & measurements
We evaluated 97 individuals with Joubert syndrome at the National Institutes of Health Clinical Center using abdominal ultrasonography, blood and urine chemistries, and DNA sequencing.

Results
Patients were ages 0.6–36 years old (mean of 9.0±7.6 years old); 41 were female. Mutations were identified in 19 genes in 92 patients; two thirds of the mutations resided in six genes: TMEM67, C5orf42, CC2D2A, CEP290, AHI1, and KIAA0586. Kidney disease was detected in 30%, most commonly in association with the following genes: CEP290 (six of six), TMEM67 (11 of 22), and AHI1 (three of six). No kidney disease was identified in patients with mutations in C5orf42 (zero of 15) or KIAA0586 (zero of six). Prenatal ultrasonography of kidneys was normal in 72% of patients with kidney disease. Specific types of kidney disease included nephronophthisis (31%), an overlap phenotype of autosomal recessive polycystic kidney disease/nephronophthisis (35%), unilateral multicystic dysplastic kidney (10%), and indeterminate-type cystic kidney disease (24%). Early-onset hypertension occurred in 24% of patients with kidney disease. Age at ESRD (n=13) ranged from 6 to 24 years old (mean of 11.3±4.8 years old).

Conclusions
Kidney disease occurs in up to one third of patients with Joubert syndrome, most commonly in those with mutations in CEP290, TMEM67, and AHI1. Patients with mutations in C5orf42 or KIAA0586 are less likely to develop kidney disease. Prenatal ultrasonography is a poor predictor of kidney involvement in Joubert syndrome. Unilateral multicystic dysplastic kidney and autosomal recessive polycystic kidney disease–like enlarged kidneys with early-onset hypertension can be part of the Joubert syndrome kidney phenotype.
Treatment patterns of biologics in US patients with ankylosing spondylitis: descriptive analyses from a claims database
Authors: Walsh Jessica A , Adejoro Oluwakayode , Chastek Benjamin , Park Yujin 
Published: November 2017

Aim:
Examine treatment patterns among patients with active ankylosing spondylitis (AS) treated with a TNF inhibitor (TNFi).
Patients & methods:
Patients with AS who initiated a TNFi between 1 January 2013, and 31 January 2015, were identified in the Optum Research Database. Outcomes included adherence, persistence, discontinuation and therapy modifications of the index TNFi during 12-month follow-up.
Results:
Of the 426 patients included, 40.6% persisted on the index TNFi for ≥12 months, 31.0% discontinued, 21.4% switched to a different TNFi, and 7.0% discontinued and then restarted. Of the 333 patients who persisted on their TNFi for >90 days, 44.7% received ≥1 add-on medication.
Conclusion:
A high proportion of patients with AS switched, discontinued or modified their TNFi therapy.
Analisa Kerusakan Formasi Akibat Pekerjaan Perforasi Dengan Menggunakan Metoda Yildiz Pada Sumur Fr 168, Sumur 154, Dan Sumur 148 Di Lapangan X
Authors: Musnal Ali 
Published: November 2017

Komplesi perforasi merupakan salah satu alternatif penyelesaian sumur untuk formasi yang tidak kompak. Perforasi dilakukan pada lapisan produktif dengan cara membuat lubang pada casing sebagai penghubung antara lapisan produktif dengan lubang sumur, sehingga terjadi aliran fluida dari formasi kelubang sumur. Pada umumnya ketika kegiatan perforasi dilakukan akan terjadi kerusakan sumur yang ditandai dengan adanya skin. Untuk menentukan besarnya harga skin yang di akibatkan oleh perforasi tersebut pada penelitian ini diterapkan metoda Yildiz. Perhitungan skin diperoleh berturut turut pada sumur FR 168,154 dan 148 adalah 6.835,6.784 dan7.610. Berdasarkan skin tersebut diperoleh produktivitas indeks (PI)berturut turut adalah 0.10 bpd/psi, 1.86 bpd/psi dan 0,24 bpd/psi serta harga laju produksi (Q) berturut-turut adalah 168.297 bfpd, 1151.533 bfpd dan 371.271 bfpd. Dari perbandingan kedua parameter hasil perhitungan Q dan PI menggunakan metoda Yildiz menghasilkan harga yang lebih besar dibandingkan harga dari aktualnya.
Pengaruh Lumpur Pemboran Dengan Emulsi Minyak Terhadap Kerusakan Formasi Batu Pasir Lempungan (Analisa Uji Laboratporium)
Authors: Fitrianti Fitrianti 
Published: November 2017

Porositas dan permeabilitas merupakan bagian dari sifat fisik batuan yang memiliki keterkaitan. Porositas merupakan perbandingan dari volume bulk batuan terhadap total volume batuan sementara permeabilitas merupakan ukuran media berpori untuk meloloskan fluida agar fluida dapat mengalir. Untuk menentukan harga porositas dan permeabilitas tersebut dapat dilakukan pada uji laboratorium. Dengan adanya perbandingan harga permeabilitas dari sample batuan, dapat diketahui seberapa besar nilai skin dari batuan reservoir tersebut. Tujuan dari penelitian ini yaitu untuk mengetahui seberapa besar pengaruh lumpur pemboran dengan emulsi minyak terhadap kerusakan formasi batu pasir lempungan. Adapun data yang menjadi acuan utama untuk penelitian ini adalah data permeabilitas dari sample core yang didapat dengan menggunakan alat Gas Permeameter. Dalam penelitian ini , Sample core yang digunakan yaitu sample core batu pasir lempungan sebanyak 10 buah dengan harga porositras yang seragam sesuai dengan pengukuran helium porosimeter dan akan dikontaminasi terhadap lumpur pemboran emulsi minyak. Pembuatan lumpur emulsi minyak disesuaikan dengan standar API SPEC. Sifat fisik lumpur yang perlu diukur dalam penelitian ini yaitu : Densitas lumpur, Rheologi lumpur, pH lumpur, Filtare lumpur dan ketebalan Mud Cake. Setelah dilakukan pengukuran dan uji laboratorium didapat harga permeabilitas sample core rata – rata sebelum dijenuhi dengan lumpur pemboran sebesar 1.2 Darcy dan permeabilitas rata – rata sample core setelah dijenuhi dengan lumpur pemboran sebesar 0.13 Darcy. Dari hasil perbandingan permeabilitas awal dan permeabilitas akhir sample core didapat nilai kerusakan sample core setelah dikontaminasi dengan lumpur emulsi minyak sebesar 8.2. Dari hasil penelitian yang telah dilakukan maka dapat disimpulkan bahwa kerusakan sample core batu pasir lempungan setelah dikontaminasi dengan lumpur emulsi minyak cukup besar jika dibandingakan dengan kontaminasi pada sample core batu pasir, yang ditunjukkan oleh kecilnya harga skin dari sample core tersebut.
Evaluasi Kinerja Injeksi Air Menggunakan Analisa Fall-Off Test Dan Analisa Kualitas Air Menggunakan Metode Stiff-Davis Di Lapangan Selta
Authors: Veri Irfan Nofta 
Published: November 2017

Porositas dan permeabilitas merupakan bagian dari sifat fisik batuan yang memiliki keterkaitan. Porositas merupakan perbandingan dari volume bulk batuan terhadap total volume batuan sementara permeabilitas merupakan ukuran media berpori untuk meloloskan fluida agar fluida dapat mengalir. Untuk menentukan harga porositas dan permeabilitas tersebut dapat dilakukan pada uji laboratorium. Dengan adanya perbandingan harga permeabilitas dari sample batuan, dapat diketahui seberapa besar nilai skin dari batuan reservoir tersebut. Tujuan dari penelitian ini yaitu untuk mengetahui seberapa besar pengaruh lumpur pemboran dengan emulsi minyak terhadap kerusakan formasi batu pasir lempungan. Adapun data yang menjadi acuan utama untuk penelitian ini adalah data permeabilitas dari sample core yang didapat dengan menggunakan alat Gas Permeameter. Dalam penelitian ini , Sample core yang digunakan yaitu sample core batu pasir lempungan sebanyak 10 buah dengan harga porositras yang seragam sesuai dengan pengukuran helium porosimeter dan akan dikontaminasi terhadap lumpur pemboran emulsi minyak. Pembuatan lumpur emulsi minyak disesuaikan dengan standar API SPEC. Sifat fisik lumpur yang perlu diukur dalam penelitian ini yaitu : Densitas lumpur, Rheologi lumpur, pH lumpur, Filtare lumpur dan ketebalan Mud Cake. Setelah dilakukan pengukuran dan uji laboratorium didapat harga permeabilitas sample core rata – rata sebelum dijenuhi dengan lumpur pemboran sebesar 1.2 Darcy dan permeabilitas rata – rata sample core setelah dijenuhi dengan lumpur pemboran sebesar 0.13 Darcy. Dari hasil perbandingan permeabilitas awal dan permeabilitas akhir sample core didapat nilai kerusakan sample core setelah dikontaminasi dengan lumpur emulsi minyak sebesar 8.2. Dari hasil penelitian yang telah dilakukan maka dapat disimpulkan bahwa kerusakan sample core batu pasir lempungan setelah dikontaminasi dengan lumpur emulsi minyak cukup besar jika dibandingakan dengan kontaminasi pada sample core batu pasir, yang ditunjukkan oleh kecilnya harga skin dari sample core tersebut.
Mengatasi Kerusakan Formasi Dengan Metoda Pengasaman Yang Kompetibel Pada Sumur Minyak Dilapangan X
Authors: Musnal Ali 
Published: November 2017

Laju produksi suatu sumur minyak akan mengalami penurunan di akibatkan antara lain menurunnya tekanan reservoir (Pr), dan juga karena terjadi kerusakan formasi produktif.
Adapun type-type penyebab kerusakan formasi itu adalah :

Scale : Suatu endapan yang terbentuk akibat kristalisasi dari ion-ion mineral yang larut dalam air dan disebabkan oleh adanya senyawa pembentuk kerak didalam air yang melebihi kelarutannya pada keadaan kesetimbangan.
Clay : Disebabklan karena fress water atau filtrat Lumpur pemboran yang merembes keformasi yang mengandung shale.
Partikel Plugging : Partikel lumpur pemboran atau bubur semen dapat menyebabkan tertutupnya pori pori batuan.

Untuk melarutkan atau menghilangkan penyebab kerusakan formasi tersebut diatas, dilakukan pengasaman. Sebelum dilakukan pengasaman harus melakukan analisa pemilihan jenis asam yang compatible dengan teknik dan pelaksanaan yang baik dilapangan. Ada 3 jenis pengasaman yang lazim digunakan yaitu : Matrik acidizing, Acid Washing dan Acid Fracturing.Methoda yang dilakukan dalam penelitian ini dengan mengambil data dilapangan seperti, Data Produksi, Water Analysis, Mineralogi, Menghitung Volume Asam,kemudian menghitung parameter skin,laju produksi, produktivitas Indek dan Flow Effisiensi baik sesudah maupun sebelum pengasaman dilakukan. Dari data lapangan ini didapat mineral quartz (grain) sebanyak 71,2%, illite dan dolomite 4,6 %, calcite2,3 %, kaolinite 1,8 %, smeltite 0,1 % dan kandungan kalsium carbonat 22,2 %,maka dipilih jenis asam yang compatible digunakan yaitu Mud Acid (HCL + HF), untuk lebih jelas dapat dilihat uraian yang dipaparkan dalam penelitian ini.
Perhitungan Laju Aliran Fluida Kritis Untuk Mempertahankan Tekanan Reservoir Pada Sumur Ratu Di Lapangan Kinantan
Authors: Musnal Ali 
Published: November 2017

Sumur yang telah diproduksikan fluida reservoirnya, sehubungan dengan perjalanan waktu lamanya produksi sumur tersebut, sudah dipastikan laju produksinya akan berkurang, hal ini disebabkan salah satu parameternya adalah turunnya tekanan reservoir. Tekanan reservoir mempunyai peranan aktif untuk mendorong fluida dari reservoir kepermukaan. Banyak cara yang telah dilakukan untuk mempertahankan Tekanan reservoir antara lain dengan menginjeksikan air kelapangan minyak tersebut melalui sumur injeksi, hal ini terkenal dengan istilah water Flooding. Dan pada penelitian ini untuk mempertahankan tekanan reservoir suatu sumur adalah dengan melakukan produksi sumur tersebut dibawah laju aliran kritis. Untuk mendapatkan laju alir kritis dan menetukan panjang interval perforasi suatu sumur dapat dihitung dengan menggunakan beberapa metode. Antara lain yaitu metode Chaperon, Chierici, Meyer, Gardner and Pirson. Sebagai aplikasi dari penelitian ini diambil data sumur Ratu dilapangan Kinantan yang merupakan salah satu lapangan minyak di daerah Riau.
Perbandingan Analisis Decline Curve antara Metode Trial Error dan Decline Type Curve Matching Untuk Menentukan Cadangan Minyak Sisa
Authors: Setiawan Guntur 
Published: November 2017

Decline curve analysis often used to determine remaning reserves in a reservoir. To analyze with this method, the decline type curve from production period (trend) must be known. To determine decline type curve, in this paper will use two methods there are: trial error & x2 chisquare test and decline type curve matching. Both of methods have different way to determine decline type curve. Trial error done by making tabulation and calculation, while decline type curve matching done by overlay. The calculation are aimed to determine decline type curve, Remaining Reserves (RR) and Estimate Ultimate Recovery (EUR). Analysis done by taking sample of data well X which is a new well produced since September 2013 till the last data is Febuary 2016. First step of this study done by making type curve from equations and assumptionin literature then plot production rate vs time and choose production period (trend) to be analyzed. After that, determine decline type curve by trial error and decline type curve matching and do forecast until get remaining reserves and estimated ultimate recovery if economic limit rate production known. From calculation of both methods, resulted exponential decline type curve. For the error method obtained RR 41322,3 STB and EUR 240328,9 STB, while for decline type curve matching obtained RR 40534,2 STB and EUR 239540,8 STB
Karstifikasi dan Pola Struktur Kuarter Berdasarkan Pemetaan Lapangan dan Citra SRTM Pada Formasi Wapulaka, Pasar Wajo, Buton, Sulawesi Tenggara.
Authors: Yuskar Yuniarti , Choanji Tiggi , Buburanda Harisma 
Published: November 2017

Karstification process occurs as a result of dissolution on limestone lithology formed in typical morphology of caves, rounded or elongated pits and conical hills. This also related with structural pattern that also intesively occurs at western part of Buton Island. Research area located at lattitude 5027’0” S – 5032’0’’ S and longitude 122049’30” E - 122052’30” E. Purpose of this research was to identified karst landscape and karstificatiom process on Wapulaka Formation and recognize the structural pattern on this formation. By using field observation and SRTM data interpretation we considered that karst formations formed on Wapulaka Formation was Quarter limestone which diagenesis process of dissolution forming karst landform also related with uplifted event at pliocene – pleistocene. This formed related with complex interaction between the geology, climate, hydrology and biological factors that created various landscape morphology such as caves, underground river, stalagtite, stalagmite and others cave ornament.
RETOS DEL EMPRENDEDOR EN MEXICO
Authors: Jiménez Rebeca Almanza , Campos Patricia Calderón , Hernández José Vargas 
Published: November 2017

A partir del siglo XX ha existido particular interés por estudiar y entender el papel del emprendedor en México debido a que este beneficia a la economía del país y contribuye al desarrollo económico y social del territorio nacional por lo que en el presente proyecto de investigación se propone identificar los retos del emprendedor en México, el cual inicia con una breve introducción del tema objeto de estudio, posteriormente se incorpora el marco teórico el cual comprende la conceptualización del termino emprendedor desde la óptica de distintos autores así como su desarrollo teórico que analiza el emprendimiento en México y el perfil del emprendedor, dentro del cual se describen las competencias que favorecen al emprendedurismo como son las personales, sociales y profesionales, posteriormente se analizan los retos del emprendedor, y por último se incorporan las conclusiones.
HERRAMIENTAS DE PRODUCCIÓN MÁS LIMPIA, PARA EL PROYECTO BOVINO PIE DE CRÍA DE LA UFPSO
Authors: Hernández Criado Juan Carlos , Herrera Galviz Juan David 
Published: November 2017

Resumen: El objetivo principal del trabajo es la realización de análisis de la situación, mediante identificación de puntos de contaminación e impactos ambientales y la propuesta de algunas herramientas de Producción Más Limpia (PML) para el proyecto Bovino pie de cría de la Universidad Francisco de Paula Santander Ocaña. Se empleó la entrevista como principal instrumento de recolección de datos, que permitió analizar el contexto del proyecto e identificar las principales impactos ambientales que definen las necesidades en materia de gestión ambiental para el mismo, y que permitieron formular las posibles herramientas que podría implementar. Dentro de los principales resultados, se encontró que el proyecto pecuario evaluado, presenta impactos significativos por el manejo de sus residuos sólidos, líquidos y gaseosos provenientes de las excretas de los animales. Por su parte no maneja registros de los consumos y se proponen 3 programas que son manejo de potreros y suelos, uso y ahorro eficiente del agua y calidad del aire, en los cuales se establecen las respectivas medidas que podrían implementar para mejorar su Gestión Ambiental. A partir de lo anterior se puede deducir, que el proyecto por su tamaño, puede llevar a cabo las acciones planteadas, con el fin de realizar conversión a prácticas de PML, para mejorar su imagen y la calidad de su producto, y contribuir a la gestión ambiental de la Universidad en general, a partir del uso de los recursos que la institución posee. Palabras clave: Razas Criollas, PML, Residuos, Gestión Ambiental.
VIGILANCIA TÉCNOLÓGICA DE NO TEJIDOS A BASE DE NYLON-6 PRODUCIDOS POR ELECTROSPINNING PARA USO EN ENTORNOS HOSPITALARIOS.
Authors: Mejía M. L. , Cuesta D. P. , Cuesta D. P. , Ortiz I.C. , Ortiz I.C. , Botero L.E. , Botero L.E. , Galeano B. J. , Galeano B. J. , Escobar N. J. , Escobar N. J. , Hoyos. L. M. , Hoyos. L. M. 
Published: November 2017

Resumen: En esta investigación, se considera la vigilancia tecnológica de las nanofibras no tejidas a base de Nylon-6 producidas por electrospinning, diferentes parámetros sobre el proceso de electrospun (concentración, voltaje, distancia de punta a colector de aguja y caudal), fueron analizados para su aplicación en entornos hospitalarios. Se encontró que el Nylon 6 presenta buenas propiedades mecánicas, biocompatibilidad y eficiencia como filtros de agua que permite su uso en un proceso de electrospinning para desarrollar nanofibras no tejidas con porosidad, gran área superficial por unidad de masa y alta permeabilidad, lo que lo hace un material opcional para entornos hospitalarios. La variación de los parámetros de electrospinning favorece la conformación de nanofibras no tejidas, reduce las gotas y proporciona diámetros de nanofibras más pequeños. Palabras clave: Nylon-6, no tejido, nanofibra, nanotextil, electrospinning, entornos hospitalarios.