bluuebunny/crossref_metadata_2025_split huggingface dataset:
Characterisation of APOBEC3B-Mediated RNA editing in breast cancer cells reveals regulatory roles of NEAT1 and MALAT1 lncRNAs
Authors: Zhang Chi , Lu Yu-Jing , Wang Mei , Chen Bingjie , Xiong Feifei , Mitsopoulos Costas , Rossanese Olivia , Li Xiuling , Clarke Paul A. 
Published: September 2024

AbstractRNA editing is a crucial post-transcriptional process that influences gene expression and increases the diversity of the proteome as a result of amino acid substitution. Recently, the APOBEC3 family has emerged as a significant player in this mechanism, with APOBEC3A (A3A) having prominent roles in base editing during immune and stress responses. APOBEC3B (A3B), another family member, has gained attention for its potential role in generating genomic DNA mutations in breast cancer. In this study, we coupled an inducible expression cell model with a novel methodology for identifying differential variants in RNA (DVRs) to map A3B-mediated RNA editing sites in a breast cancer cell model. Our findings indicate that A3B engages in selective RNA editing including targeting NEAT1 and MALAT1 long non-coding RNAs that are often highly expressed in tumour cells. Notably, the binding of these RNAs sequesters A3B and suppresses global A3B activity against RNA and DNA. Release of A3B from NEAT1/MALAT1 resulted in increased A3B activity at the expense of A3A activity suggesting a regulatory feedback loop between the two family members. This research substantially advances our understanding of A3B’s role in RNA editing, its mechanistic underpinnings, and its potential relevance in the pathogenesis of breast cancer.
Gene therapy of Dent disease type 1 in newborn ClC-5 null mice for sustained transgene expression and gene therapy effects
Authors: Lyu Pin , Yadav Manish Kumar , Yoo Kyung Whan , Jiang Cuili , Li Qingqi , Atala Anthony , Lu Baisong 
Published: September 2024

AbstractDent disease type 1 is caused by changes in the chloride voltage-gated channel 5 (CLCN5) gene on chromosome X, resulting in the lack or dysfunction of chloride channel ClC-5. Individuals affected by Dent disease type 1 show proteinuria and hypercalciuria. Previously we found that lentiviral vector-mediated hCLCN5 cDNA supplementary therapy in ClC-5 null mice was effective only for three months following gene delivery, and the therapeutic effects disappeared four months after treatment, most likely due to immune responses to the ClC-5 proteins expressed in the treated cells. Here we tried two strategies to reduce possible immune responses: 1) confining the expression of ClC-5 expression to the tubular cells with tubule-specific Npt2a and Sglt2 promoters, and 2) performing gene therapy in newborn mutant mice whose immune system has not fully developed. We found that although Npt2a and Sglt2 promoters successfully drove ClC-5 expression in the kidneys of the mutant mice, the treatment did not ameliorate the phenotypes. However, gene delivery to the kidneys of newborn Clcn5 mutant mice enabled long-term transgene expression and phenotype improvement. Our data suggest that performing gene therapy on Dent disease affected subjects soon after birth could be a promising strategy to attenuate immune responses in Dent disease type 1 gene therapy.
Structural insights into translocation and tailored synthesis of hyaluronan
Authors: Górniak Ireneusz , Stephens Zachery , Erramilli Satchal K. , Gawda Tomasz , Kossiakoff Anthony A. , Zimmer Jochen 
Published: September 2024

Abstract
Hyaluronan (HA) is an essential component of the vertebrate extracellular matrix. It is a heteropolysaccharide of N-acetylglucosamine (GlcNAc) and glucuronic acid (GlcA) reaching several megadaltons in healthy tissues. HA is synthesized and translocated in a coupled reaction by HA synthase (HAS). Here, structural snapshots of HAS provide insights into HA biosynthesis, from substrate recognition to HA elongation and translocation. We monitor the extension of a GlcNAc primer with GlcA, reveal the coordination of the uridine diphosphate product by a conserved gating loop and capture the opening of a translocation channel to coordinate a translocating HA polymer. Furthermore, we identify channel-lining residues that modulate HA product lengths. Integrating structural and biochemical analyses suggests an avenue for polysaccharide engineering based on finely tuned enzymatic activity and HA coordination.
Investigating the binding affinity, molecular dynamics, and ADMET properties of curcumin-IONPs as a mucoadhesive bioavailable oral treatment for iron deficiency anemia
Authors: Alsedfy M. Yasser , Ebnalwaled A. A. , Moustafa Mona , Said Alaa Hassan 
Published: September 2024

AbstractIron deficiency anemia (IDA) is a common health issue, and researchers are interested in overcoming it. Nanotechnology green synthesis is one of the recent approaches to making efficient drugs. In this study, we modeled curcumin-coated iron oxide nanoparticles (cur-IONPs) to study their predicted toxicity and drug-likeness properties, then to investigate mucoadhesive behavior by docking cur-IONPs with two main mucin proteins in gastrointestinal tract (GIT) mucosa (muc 5AC and muc 2). Furthermore, the stability of cur-IONPs/protein complexes was assessed by molecular dynamics. Our in-silico studies results showed that cur-IONPs were predicted to be potential candidates to treat IDA due to its mucoadhesive properties, which could enhance the bioavailability, time residency, and iron absorbance through GIT, in addition to its high safety profile with high drug-likeness properties and oral bioavailability. Finally, molecular dynamic simulation studies revealed stable complexes supporting strength docking studies. Our results focus on the high importance of in-silico drug design studies; however, they need to be supported with in vitro and in vivo studies to reveal the efficacy, toxicity, and bioavailability of cur-IONPs.
Chromatin protein complexes involved in gene repression in lamina-associated domains
Authors: Manzo Stefano G , Mazouzi Abdelghani , Leemans Christ , van Schaik Tom , Neyazi Nadia , van Ruiten Marjon S , Rowland Benjamin D , Brummelkamp Thijn R , van Steensel Bas 
Published: September 2024

AbstractLamina-associated domains (LADs) are large chromatin regions that are associated with the nuclear lamina (NL) and form a repressive environment for transcription. The molecular players that mediate gene repression in LADs are currently unknown. Here, we performed FACS-based whole-genome genetic screens in human cells using LAD-integrated fluorescent reporters to identify such regulators. Surprisingly, the screen identified very few NL proteins, but revealed roles for dozens of known chromatin regulators. Among these are the negative elongation factor (NELF) complex and interacting factors involved in RNA polymerase pausing, suggesting that regulation of transcription elongation is a mechanism to repress transcription in LADs. Furthermore, the chromatin remodeler complex BAF and the activation complex Mediator can work both as activators and repressors in LADs, depending on the local context and possibly by rewiring heterochromatin. Our data indicate that the fundamental regulators of transcription and chromatin remodeling, rather than interaction with NL proteins, play a major role in transcription regulation within LADs.
RNA degradation triggered by decapping is largely independent of initial deadenylation
Authors: Audebert Léna , Feuerbach Frank , Zedan Mostafa , Schürch Alexandra P , Decourty Laurence , Namane Abdelkader , Permal Emmanuelle , Weis Karsten , Badis Gwenaël , Saveanu Cosmin 
Published: September 2024

AbstractRNA stability, important for eukaryotic gene expression, is thought to depend on deadenylation rates, with shortened poly(A) tails triggering decapping and 5′ to 3′ degradation. In contrast to this view, recent large-scale studies indicate that the most unstable mRNAs have, on average, long poly(A) tails. To clarify the role of deadenylation in mRNA decay, we first modeled mRNA poly(A) tail kinetics and mRNA stability in yeast. Independent of deadenylation rates, differences in mRNA decapping rates alone were sufficient to explain current large-scale results. To test the hypothesis that deadenylation and decapping are uncoupled, we used rapid depletion of decapping and deadenylation enzymes and measured changes in mRNA levels, poly(A) length and stability, both transcriptome-wide and with individual reporters. These experiments revealed that perturbations in poly(A) tail length did not correlate with variations in mRNA stability. Thus, while deadenylation may be critical for specific regulatory mechanisms, our results suggest that for most yeast mRNAs, it is not critical for mRNA decapping and degradation.
S3-Leitlinie Klinische Ernährung bei
Pankreaserkrankungen
Authors: Ockenga Johann , Fromhold-Treu Sophie , Löser Christian , Madl Christian , Martignoni Marc , Meier Rémy , Rubin Diana , Schütte Kerstin , Stang Katharina , Török Helga Paula , Wehle Lena , Weimann Arved 
Published: September 2024

ZusammenfassungSowohl die akute als auch die chronische Pankreatitis sind häufige Erkrankungen,
die ein erhebliches Risiko für eine Mangelernährung mit sich bringen und eine
Ernährungstherapie erfordern können. In ca. 20% der akuten Pankreatitiden tritt
eine nekrotisierende Pankreatitis auf, die mit einer erhöhten Morbidität und
Mortalität verbunden ist. Hier ist oftmals eine Ernährungstherapie mittels einer
enteralen oder parenteralen Ernährung notwendig, die neben medikamentösen,
endoskopischen, radiologischen oder chirurgischen Maßnahmen eine etablierte
Säule der multimodalen Therapie darstellt.Bei der chronischen Pankreatitis handelt es sich um eine chronische Entzündung
der Bauchspeicheldrüse mit Entwicklung einer Fibrose und langfristig Atrophie
des Organs. Bauchschmerzen, die zu einer verminderten oralen Aufnahme von
Nährstoffen führen, sowie exokrines und endokrines Versagen sind häufige
Komplikationen der Krankheit. All diese Faktoren stellen Risikofaktoren für eine
Unter- bzw. Mangelernährung dar. Daher sollten Patienten mit chronischer
Pankreatitis als ernährungsmedizinische Risikopatienten betrachtet, untersucht
und entsprechend behandelt werden. Darüber hinaus sollte bei Patienten mit
chronischer Pankreatitis auf Osteoporose und ein erhöhtes Frakturrisiko geachtet
werden, und entsprechende Präventivmaßnahmen erwogen werden.
„Rauchfrei im Mai 2024“ – Konzept und Deskription der Teilnehmenden
Authors: Hanewinkel Reiner , Barthels Friederike , Isensee Barbara 
Published: September 2024

Zusammenfassung
Hintergrund In Deutschland rauchen zu viele Menschen und die Zahl ernsthafter Rauchstoppversuche sinkt seit Jahren.
Methode Rauchfrei im Mai 2024 ist eine niedrigschwellige Maßnahme zur Förderung eines Rauchstopps. An dem Mitmachmonat konnten erwachsene Personen, die „regelmäßig“ Nikotinprodukte konsumieren, sowie unterstützende Personen teilnehmen. Während des Mitmachmonats erhielten die Teilnehmenden und Unterstützenden das Angebot einer täglichen Begleitung mittels App-Notifications, E-Mails und/oder über WhatsApp. Zudem wurden sie auf bestehende Rauchstoppangebote aufmerksam gemacht. Schließlich wurden unter den erfolgreich Teilnehmenden Gewinne verlost.
Ergebnisse 6386 Personen meldeten sich zur Teilnahme an. Von diesen haben 550 Personen eine Person ihrer Wahl zu ihrer Unterstützung mit angemeldet. Die Raucherinnen und Raucher waren überwiegend weiblich (56,5%) und im Durchschnitt 42,9 (SD=13,2) Jahre alt. Die Teilnehmenden stammten aus allen Bundesländern Deutschlands, in Relation zur Bevölkerungsverteilung überproportional häufig aus den Bundesländern Bremen, Schleswig-Holstein, Berlin, Nordrhein-Westfalen, Hamburg und Bayern. Im Vergleich zur repräsentativen Stichprobe der Studie des Robert Koch-Instituts aus dem Jahr 2012 gaben die Teilnehmenden einen signifikant höheren subjektiven sozioökonomischen Status an. 79,3% der Teilnehmenden stuften ihre Abhängigkeit als hoch ein. Der regelmäßige Gebrauch von mehreren Nikotinprodukten trat bei 35,3% der Stichprobe auf. 39,8% der teilnehmenden Personen gaben an, in den letzten 12 Monaten keinen Rauchstoppversuch durchgeführt zu haben.
Schlussfolgerungen Die Zahl der teilnehmenden Raucherinnen und Raucher ist ermutigend. Neben einer erforderlichen Wirksamkeitsstudie sollte in den folgenden Jahren geprüft werden, wie gezielt noch mehr Männer sowie Personen mit niedrigem subjektivem sozialem Status zur Initiierung eines Rauchstopps gewonnen werden können.
Gesundheitsförderung und Gesundheitskompetenz in den rechtlichen
Grundlagen des österreichischen Gesundheitswesens
Authors: Marent Johannes , Aistleithner Regina 
Published: September 2024

Zusammenfassung
Fragestellung Die Gesundheitsreform im Jahr 2005 hatte das politische
Ziel, das Gesundheitswesen stärker an Gesundheitsförderung (GF) und
Gesundheitskompetenz (GK) auszurichten. Inwiefern die Rechts- und
Ausbildungsgrundlagen im österreichischen Gesundheitswesen eine Basis für eine
Orientierung an GF und GK bieten, ist Gegenstand des vorliegenden Artikels. Es
wird dabei insbesondere auf die rechtlichen Grundlagen der ärztlichen Berufe,
der Gesundheits- und Krankenpflegeberufe sowie einrichtungsbezogen auf
Krankenanstalten und Primärversorgungseinheiten fokussiert und analysiert,
inwiefern diese GF und GK im Gesundheitswesen einfordern.
Methode In einem ersten Schritt wurden die zentralen Rechtsgrundlagen und
weitere Unterlagen gesichtet. Auf dieser Basis wurde literaturgestützt ein
Codierraster zur Prüfung der Rechtsgrundlagen erstellt. In einem weiteren
Schritt wurden die rechtlichen Grundlagen anhand des Codierrasters analysiert
und interpretiert. Die Interpretation orientierte sich an den Kriterien der
einzelnen Codes. Aus der Analyse rechtlicher Grundlagen wurden Empfehlungen
abgeleitet.
Ergebnisse Gesundheitsförderung und Gesundheitskompetenz sind in den
rechtlichen Grundlagen enthalten. GF und GK werden jedoch vor allem als von der
Krankenbehandlung unabhängige Leistungen mit gesonderter Finanzierung konzipiert
und damit weniger als integraler Bestandteil jeglichen Patientenkontakts
verstanden. Die Organisationsform der Primärversorgungseinheit sowie die
Gesundheits- und Krankenpflegeberufe haben hinsichtlich GF und GK gegenüber
Krankenanstalten und ärztlichen Berufen einen relativ klaren Auftrag. Insgesamt
wurde erkannt, dass Begrifflichkeiten teilweise nicht kohärent verwendet werden
und für die unterschiedlichen Versorgungsbereiche operationalisiert werden
sollten. Insbesondere die Rechtsgrundlagen, die die ärztlichen Berufe betreffen,
bauen nicht schlüssig aufeinander auf.
Schlussfolgerungen Die Rahmenbedingungen, insbesondere die
Personalausstattung, der kompetenzorientierte Einsatz und die Teamarbeit, sind
zentrale Grundlagen, damit GF und GK in der Praxis stattfinden bzw. Anwendung
finden können. Sind diese vorhanden, sollten Kompetenzen in den Bereichen GF und
GK gefordert, gefördert, bewertet und honoriert werden. GF und GK sollten
integraler Bestandteil jeglichen Versorgungsbereichs sein. Die Begriffe GF und
GK sind in den Rechtsgrundlagen der Gesundheitsberufe und der Organisationen zu
operationalisieren. Das trifft insbesondere auf das Ärztegesetz und auf
Krankenanstalten zu. Darüber hinaus gilt es, die Rolle der Patientinnen und
Patienten zu stärken und die Einbindung der Nutzer:innen in die Planung von
Gesundheitsdienstleistungen rechtlich zu verankern.
Pflegerische und ärztlich delegierbare Maßnahmen bei
päd.-onkologischen Patienten als ambulant aufsuchende Versorgung – Das Projekt
KIKHomeCare
Authors: Toenne Rebecca , Kristiment Rebecca , Waack Katharina , Schneider Dominik T. , Simon Thorsten , Reinhardt Dirk 
Published: September 2024

Zusammenfassung
Hintergrund Im Zeitraum von 2019 bis 2022 wurden in einem Pilotprojekt in
Nordrhein-Westfalen (NRW) pädiatrische, hämato-onkologische PatientInnen im
Rahmen einer häuslich aufsuchenden pflegerischen Versorgung betreut, die sowohl
pflegerische als auch ärztlich delegierbare Maßnahmen umfasste. Die Aufnahme von
PatientInnen in diese Versorgungsform erfolgte auf ärztliche Zuweisung.
Fragestellung Das Ziel bestand in der Überprüfung der Machbarkeit einer
solchen Versorgung im Kontext pädiatrisch hämato-onkologischer Erkrankungen.
Methode Zur Evaluation wurde ein Dokumentationssystem konzipiert und
angewandt, welches es ermöglichte, relevante Versorgungsdaten auszuwerten. Die
Auswertung erfolgte mittels deskriptiver Statistik und
qualitativ-inhaltsanalytischer Kategorienbildung.
Ergebnisse Von 11/2019 bis 12/2022 wurden insgesamt N=475
hamäto-onkologische PatientInnen in das Versorgungsprojekt aufgenommen und
n=4005 Hausbesuche in 242 PLZ-Gebieten in NRW durchgeführt. Der überwiegende
Anteil von delegierbaren ärztlichen Tätigkeiten bestand aus Blutabnahmen
(79,2%). Die Beurteilung des Allgemeinzustandes (96,5%) stellte den größten
Anteil der Versorgungsleistungen dar. Komplikationen im Zusammenhang mit der
Versorgungsform traten nicht auf.
Diskussion Die pflegerisch-ambulant aufsuchende Versorgung von
pädiatrischen, hämato-onkologischen PatientInnen zeigte sich als patienten- und
teamorientierte Versorgungsform und scheint eine Alternative zur ausschließlich
klinischen Versorgung zu sein. Mutmaßlich ist eine Übertragung auf andere
Spezialbereiche der Pädiatrie möglich. Im nächsten Schritt bedarf es einer
prospektiven multizentrischen randomisierten Studie, um ein verlässliches Bild
über die tatsächlichen Möglichkeiten und Grenzen zu erhalten.
The Synthesis of Unsymmetrical Arylated Tetrathiafulvalenes Extended with an Anthraquinoid Spacer via Pd-Catalyzed C–H Arylation
Authors: Yoshimura Aya , Misaki Yohji , Aso Yuto , Utsumi Ryosuke , Tosa Fuma 
Published: September 2024

AbstractWe synthesized diarylated 10-(1,3-dithiol-2-ylidene)anthracene-9-(10H)-one derivatives, which serve as important precursors of unsymmetrical arylated TTFAQs, via the palladium-catalyzed direct C–H arylation. Unsymmetrical diarylated TTFAQs were synthesized by the Horner–Wadsworth–Emmons reaction using diarylated 10-(1,3-dithiol-2-ylidene)anthracene-9-(10H)-one as the starting materials. Additionally, we have successfully synthesized unsymmetrical tetraarylated TTFAQs by a second palladium-catalyzed C–H arylation of diarylated TTFAQs.
Remote out-of-hours ultrasound live supervision in pediatrics – improvement of diagnostics and training
Authors: Cetiner Metin , Kavuk Selin , Finkelberg Ilja , Kreuzer Martin , Okorn Christine , Prusinskas Benas , Schiepek Felix , Jägers Johannes , Pape Lars , Büscher Anja 
Published: September 2024

Abstract
Purpose Ultrasound (US) is the preferred imaging modality in pediatrics for diagnostic and therapeutic issues. The absence of radiation and the constant on-site accessibility make it the ideal tool for children. However, despite remarkable technical advances in resolution and applicability, many sophisticated medical questions still require profound expertise on the part of the examiner, thus often hampering fast decisions particularly outside regular working hours.
Materials and Methods This single-center study, at a university children’s hospital evaluated the use of US during emergency service. A four-week documentation period was followed by a subsequent eight-week supervision period with live supervision availability on demand guided by a remote US expert. The demand for expert support, diagnosis, grading of urgency, duration and success of examination, and satisfaction of both examiners were analyzed.
Results 108 patients (mean age 9.7 years) were included. In 38% of cases, US was supervised on demand with a definite diagnosis in 92.6% of cases (25/27). Image quality and technical performance were graded sufficient in 100% of cases. Supervised compared to non-supervised US examinations were prolonged (14.4 min vs. 7.1 min, p<0.001), were more prevalent within the first 24 h in the hospital (70% vs. 56.8%, p=0.06), and were classified more frequently as emergency (22.2% vs. 2.3%; p=0.015). All participants classified the availability of US supervision as decisively helpful.
Conclusion Remote live supervised pediatric US was feasible and effective. It combined timely, high-quality diagnostics even in the case of challenging medical questions with simultaneous US training.
Electrochemically Promoted Regioselective C3–H Trifluoro/Difluoromethylation of 2H-Indazoles at Room Temperature
Authors: Behera Mousumi , Sahu Ajit Kumar , Bhat Ramakrishna G. , Shukla Shubham Y. 
Published: September 2024

AbstractA green and sustainable electrochemical approach is developed for the regioselective C3–H trifluoro/difluoromethylation of 2H-indazoles at room temperature. Relatively less expensive C-soft (+)/Ni-foam (–) electrodes are utilized to selectively functionalize the 2H-indazoles effectively by avoiding the use of any external oxidant and transition-metal salt. Moreover, along with the C3–H trifluoromethylation, for the very first time, direct C3–H difluoromethylation of 2-phenyl-2H-indazoles is accomplished. Diverse C3–H trifluoro/difluoromethylated 2H-indazoles having an array of functionalities are successfully synthesized in moderate to very good yields. As an application, a precursor of both an estrogen receptor ligand and an acetyl Co-A carboxylase inhibitor is synthesized. A plausible reaction mechanism is proposed based on control experiments and cyclic voltammetry studies.
Versorgungsdynamik von „Umsonst & Draußen“-Musikfestivals in
ländlich-geprägten Gemeinden am Beispiel des Pol’and Rock Festivals – eine
epidemiologische, retrospektive Studie im Zeitraum 2017 bis 2022
Authors: Humbsch Philipp , Studzinska Maja , Jastrzebska Izabela , Gintrowicz Robert 
Published: September 2024

Zusammenfassung
Hintergrund Das Wissen über die Epidemiologie von Musikfestivals ist
lückenhaft. Musikfestivals sind eine Herausforderung für das Sanitätspersonal
und die Veranstaltungsgemeinde bei der medizinischen Versorgung. Ziel Ziel
dieser Studie war es, Vorstellungsgründe, Patientenzahl, Transportrate und
Tageszeiten bei einem der größten Musikfestivals in Europa von 2017 bis 2022 zu
erfassen und zu vergleichen. Hieraus sollen Merkmale solcher Veranstaltungen
abgeleitet werden.
Methoden Die retrospektive Studie konnte auf die medizinische
Dokumentation des Veranstalters des „Pol’and Rock“ Festivals in Polen
zurückgreifen. Es wurde der Zusammenhang von PPTT (Patients per Ten Thousand),
TTHR (Transport to Hospital Rates) und Besucherzahl, sowie Patientenaufkommen
und der Vorstellungszeitpunkt geprüft. Eine Darstellung wichtiger Merkmale in
der Organisation der Absicherung erfolgte deskriptiv.
Ergebnisse Bei 1,48 Millionen Besuchern von 2017 bis 2022 stellten sich
6719 als Patienten vor. Es gab zwei Gipfel im Patientenaufkommen, einer in der
Zeit von 12–14 Uhr und einer in der Zeit von 20–22 Uhr (p<0,0001). Die
mediane PPTH liegt bei 45, die mediane TTRH lag bei 0,0638.
Schlussfolgerung Es gibt keine signifikante Korrelation von PPTT und TTRH
mit der Besucherzahl im Betrachtungszeitraum. Die Tageszeit hat signifikanten
Einfluss auf das Patientenaufkommen. Aufgrund langer Transportwege vom
Festivalgelände zur nächsten Klinik, ist es wichtig, bereits auf dem Gelände
eine hochwertige Versorgung der Patienten zu leisten. Weitere Untersuchungen zur
Epidemiologie von Musikfestivals sind notwendig.