bluuebunny/crossref_metadata_2025_split huggingface dataset:
DYNAMICS OF GROWTH AND DEVELOPMENT OF THE RESOURCE POPULATION OF SHEEP
Authors: Петров С.Н. , Денискова Т.Е. , Зиновьева Н.А. 
Published: September 2024

Современное состояние научно-технического обеспечения исследовательских методов позволяет использовать новые аспекты при планировании и проектировании в изучении влияния генетики исследуемых объектов на их морфофункциональные характеристики. Одним из таких подходов является создание и использование ресурсной популяции животных для поиска ассоциаций в геноме субъекта с хозяйственно-полезными признаками. Использование таких субпопуляций для проведения полногеномных ассоциативных исследований (GWAS) способствует повышению уровня точности и снижению возможности получения ложноположительных результатов. На базе физиологического двора ФГБНУ ФИЦ ВИЖ им. Л.К. Эрнста, в результате скрещивания карачаевской и романовской породы овец и их потомков, создана ресурсная популяция в виде первой и второй генерации животных.
The current state of scientific and technical support of research methods allows the use of new aspects in planning and design in studying the influence of the genetics of the studied objects on their morphological and functional characteristics. One of these approaches is the creation and use of a resource population of animals to search for associations in the subject's genome with economically useful traits. The use of such subpopulations for genome-wide association studies (GWAS) improves the level of accuracy and reduces the possibility of false positive results. On the basis of the physiological yard of the Federal State Budgetary Scientific Institution FITs VIZH them. OK. Ernst, as a result of crossing the Karachai and Romanov breeds of sheep and their descendants, a resource population was created in the form of the first and second generations of animals.
WHAT NEW CAN BE LEARNED BY CRISPR/CAS9 INTRO EDITING OF lncRNA GENES
Authors: Степанов Г.А. , Матвеева А.М. , Журавлев Е.С. , Власов В.В. 
Published: September 2024

Развитие подходов к геномному редактированию позволило изменять структуру индивидуальных генов, регулировать их экспрессию и соответствующие клеточные процессы. Получившие широкое распространение методы на основе систем CRISPR/Cas значительно расширили арсенал генетической инженерии. Тем не менее, основная часть работ по геномному редактированию направлена на исследование и регуляцию экспрессии белок-кодирующих генов для получения клеточных линий и модельных организмов с заданными свойствами. Для данных целей использование систем CRISPR/Cas носит фактически рутинный характер. В связи с этим на сегодняшний день редактирование интронов представляет интересный и многообещающий инструмент изучения механизмов пост-транскрипционного созревания РНК, а также связанных клеточных процессов.
The development of approaches to genomic editing has made it possible to change the structure of individual genes, regulate their expression and the corresponding cellular processes. The widely used methods based on CRISPR/Cas systems have significantly expanded the arsenal of genetic engineering. Nevertheless, the main part of the work on genomic editing is aimed at studying and regulating the expression of protein-coding genes to obtain cell lines and model organisms with desired properties. For these purposes, the use of CRISPR/Cas systems is actually routine. In this regard, intron editing is currently an interesting and promising tool for studying the mechanisms of RNA post-transcriptional maturation, as well as related cellular processes.
GENE EDITING OF THE TRANSLATION ELIGATION FACTOR IN TOMATO
Authors: Баранов Д.Ю. , Долгов С.В. , Тимербаев В.Р. 
Published: September 2024

По мере роста мирового населения растет спрос на продовольствие. Один из возможных способов решения этой проблемы – создание новых сортов сельскохозяйственных культур с ценными признаками, такими как повышенная урожайность, устойчивость к болезням, холодостойкость, улучшенная соле- и засухоустойчивость. Для производства новых сортов в течение десятилетий использовали методы традиционной селекции, но новые технологии, такие как редактирование генома, позволяют добиться желаемого результата быстрее и дешевле, путем точной модификации аллелей в разных видах и сортах растений. Менее чем за 5 лет метод, базирующийся на использовании CRISPR/Cas9, стал одним из самых широко применяемых методов в генной инженерии, в том числе растений. Некоторые системы геномного редактирования позволяют избежать встраивания чужеродной ДНК в геном экспериментального объекта или избавиться от нее в следующих поколениях.
As the world population grows, so does the demand for food. One possible way to solve this problem is to develop new crop varieties with valuable traits such as increased yield, disease resistance, cold tolerance, improved salt and drought tolerance. Traditional breeding methods have been used to produce new varieties for decades, but new technologies, such as genome editing, can achieve the desired result faster and cheaper by precisely modifying alleles in different plant species and varieties. In less than 5 years, the CRISPR/Cas9 based method has become one of the most widely used methods in genetic engineering, including plants. Some genomic editing systems make it possible to avoid the insertion of foreign DNA into the genome of an experimental object or to get rid of it in future generations.
PRODUCTION OF TRANSGENIC PETUNIA PLANTS WITH THE codA GENE FROM Arthrobacter globiformis
Authors: Каракай М.В. , Халилуев М.Р. 
Published: September 2024

Петуния является не только ценной декоративной культурой, но и важным объектом для фундаментальных исследований. Абиотические стрессовые воздействия, такие как засуха, затопление, низкие или повышенные температуры, низкие положительные и отрицательные температуры, избыток ультрафиолета могут вызывать значительное снижение ростовых процессов растений петунии, а также ее декоративных свойств. Помимо традиционных методов селекции для повышения устойчивости к действию различных стрессовых факторов абиотической природы широко используются методы генетической трансформации.
Petunia is not only a valuable ornamental crop, but also an important object for fundamental research. Abiotic stresses such as drought, flooding, low or high temperatures, low positive and negative temperatures, excess ultraviolet radiation can cause a significant reduction in the growth processes of petunia plants, as well as its decorative properties. In addition to traditional breeding methods, genetic transformation methods are widely used to increase resistance to various abiotic stress factors.
Genome Editing of the Expressed Retrotransposon ARABIDOPSIS THALIANA
Authors: Константинов З.С. , Лебедева М.В. , Корчинская В.Ю. , Таранов В.В. , Киров И.В. 
Published: September 2024

Среди них выделяют ретротранспозоны – мобильные элементы, использующие процесс обратной транскрипции для своей транспозиции. Всплески активности транспозонов в ходе эволюции многих сельскохозяйственых культур приводили к увеличению размера их геномов.2 Поэтому им приписывается исключительно большая роль в процессах эволюции генома. Большая часть ретротранспозонов растений метелированы и не активны в нормальных условиях.
Among them, retrotransposons are distinguished - mobile elements that use the process of reverse transcription for their transposition. Bursts of transposon activity during the evolution of many agricultural crops led to an increase in the size of their genomes.2 Therefore, they are assigned an exceptionally large role in the processes of genome evolution. Most plant retrotransposons are methylated and inactive under normal conditions.
POLYPLOID FORMS OF ONION (Allium cepa L. × Allium fistulosum L.) AND GARLIC (Allium sativum L.)
Authors: Романова О.В. , Середин Т.М. , Романов В.С. , Мастяев И.С. 
Published: September 2024

Полиплоидия играет важную роль в формировании культурных растений. В роде Allium большинство видов обладают полиплоидным числом хромосом, а некоторые виды образуют полиплоидные ряды. Лук репчатый (Allium cepa L.) относится к диплоидным формам. Тогда как A nutans L., A. odorum L., A. schoenoprasum L. являются полиплоидными видами, обладающим рядом ценных признаков, такие как хорошая зимостойкость и устойчивость к пероноспорозу. Однако из-за разного количества хромосом эти виды очень трудно скрещиваются с луком репчатым. Для улучшения скрещиваемости используют метод полиплоидизации, который позволяет кратно увеличить число хромосом, то есть перевести исходные формы к одинаковому уровню плоидности (Полумордвинова, Марьяхина, 1985).
Polyploidy plays an important role in the formation of cultivated plants. In the genus Allium, most species have a polyploid number of chromosomes, and some species form polyploid series. Bulb onion (Allium cepa L.) refers to diploid forms. Whereas A nutans L., A. odorum L., A. schoenoprasum L. are polyploid species with a number of valuable traits, such as good winter hardiness and resistance to downy mildew. However, due to the different number of chromosomes, these species are very difficult to interbreed with onions. To improve crossability, the polyploidization method is used, which makes it possible to multiply the number of chromosomes, that is, to transfer the original forms to the same level of ploidy (Polummordvinova, Maryakhina, 1985).
COMPARATIVE ANALYSIS OF REPEATING DNA FRACTIONS IN PLANTS OF THE FAMILY CANNABACEAE AND ITS ROLE IN DIFFERENTIATION OF SEX CHROMOSOMES
Authors: Разумова О.В. , Бочаркина Ю.В. , Боне К.Д. , Романов Д.В. , Почтовый А.А. , Александров О.С. 
Published: September 2024

Семейство Cannabaceae sensu stricto включает два рода - род Humulus и род Cannabis с единственным крайне полиморфным видом Cannabis sativa. Характерной особенностью растений данных родов является наличие в кариотипе у всех видов гетероморфных половых хромосом, что является чрезвычайно редким явлением в царстве растений, при этом данные хромосомы различны у разных видов: XX/ XY с большой Y-хромосомой у конопли посевной, XX/XY с маленькой Y-хромосомой у хмеля обыкновенного и мультихромосомная система с большими половыми хромосомами XX/XY1Y2 у хмеля японского. Такое разнообразие типов половых хромосом в пределах одного семейства открывает широкие возможности для изучения эволюции пола в целом, поскольку ранее показано, что размер и количество половых хромосом у растений связано с эволюционной древностью или молодостью вида (Ming et al., 2011).
The family Cannabaceae sensu stricto includes two genera, the genus Humulus and the genus Cannabis, with a single extremely polymorphic species, Cannabis sativa. A characteristic feature of plants of these genera is the presence in the karyotype of all species of heteromorphic sex chromosomes, which is an extremely rare occurrence in the plant kingdom, while these chromosomes are different in different species: XX/XY with a large Y-chromosome in cannabis, XX/XY with a small Y-chromosome in common hop and a multichromosome system with large XX/XY1Y2 sex chromosomes in Japanese hop. Such a variety of sex chromosome types within the same family opens up wide opportunities for studying the evolution of sex in general, since it was previously shown that the size and number of sex chromosomes in plants is associated with the evolutionary antiquity or youth of the species (Ming et al., 2011).
VOCAL COMPOUNDS ISSUED BY MICROORGANISMS: BIOLOGICAL ACTIVITY, MECHANISMS OF ACTION, APPLIED ASPECTS
Authors: Плюта В.А. , Сидорова Д.Е. , Мелькина О.Е. , Кокшарова О.А. , Хмель И.А. 
Published: September 2024

В последние годы способность микроорганизмов синтезировать летучие органические соединения (ЛОС) и изучение их функциональной роли привлекает активное внимание исследователей различного профиля, работающих как в фундаментальных, так и в прикладных областях биологии. Известно, что бактерии и грибы выделяют огромное количество ЛОС различной химической природы. Эти вещества характеризуются низкой молекулярной массой (в среднем порядка 300 Да), липофильной природой, низкой температурой кипения. Среди них – спирты, кетоны, терпены, пиразины, альдегиды, серо- и азот-содержащие соединения и др.
In recent years, the ability of microorganisms to synthesize volatile organic compounds (VOCs) and the study of their functional role has attracted the active attention of researchers in various fields, working in both fundamental and applied fields of biology. It is known that bacteria and fungi emit a huge amount of VOCs of various chemical nature. These substances are characterized by low molecular weight (about 300 Da on average), lipophilic nature, and low boiling point. Among them are alcohols, ketones, terpenes, pyrazines, aldehydes, sulfur- and nitrogen-containing compounds, etc.
APPLICATION OF TERPENE SALTS OF SIBERIAN PINE PINE GAIN AS GROWTH REGULATORS OF AGRICULTURAL PLANTS
Authors: Никитин Е.Н. , Шаронова Н.Л. , Теренжев Д.А. , Белов Т.Г. , Шуматбаев Г.Г. , Рахмаева А.М. , Крупин Е.О. 
Published: September 2024

В связи с интенсификацией сельскохозяйственного производства крайне остро стоит проблема повышения урожайности и качества продукции растениеводства. Использование регуляторов роста способствует реализации генетического потенциала растений, повышению устойчивости к факторам окружающей среды, фитопатогенным микроорганизмам, росту урожайности и улучшению качества продукции. В условиях экологизации сельского хозяйства предъявляются особые требования к ассортименту применяемых препаратов, наблюдается повышенный интерес к природным веществам, экстрагируемым из растений, в качестве эффективной альтернативы промышленно синтезированным химическим веществам [1].
In connection with the intensification of agricultural production, the problem of increasing the yield and quality of crop production is extremely acute. The use of growth regulators helps to realize the genetic potential of plants, increase resistance to environmental factors, phytopathogenic microorganisms, increase yields and improve product quality. In the conditions of greening agriculture, special requirements are imposed on the range of drugs used, there is an increased interest in natural substances extracted from plants as an effective alternative to industrially synthesized chemicals [1].
INFLUENCE OF UV-B ON POLLEN GERMINATION AND POLLEN TUBES GROWTH Petunia hybrida L.
Authors: Зинкевич В.В. , Захарова Е.В. 
Published: September 2024

Уровень УФ-В, достигающий поверхности Земли увеличивается из-за антропогенного воздействия. В связи с этим исследование механизмов действия УФ на физиологические процессы, в частности, на опыление сельскохозяйственных и дикорастущих растений, приобретает большое значение.
The level of UV-B reaching the Earth's surface is increasing due to human impact. In this regard, the study of the mechanisms of UV action on physiological processes, in particular, on the pollination of agricultural and wild plants, is of great importance.
TREATMENT WITH CASPASE-LIKE PROTEASE INHIBITOR (AC-DEVDCHO) RELIEVES DNA DEGRADATION CAUSED BY S-RNASE TYPE SELF-INCOMPATIBILITY IN Petunia hybrida L. in the PROGRAM FERTILIZATION PHASE
Authors: Демьянчук И.C. , Соболев Д.С. , Захарова Е.В. 
Published: September 2024

В последние годы накоплено значительное количество доказательств указывающих на участие каспазо-подобных протеаз в программируемой смерти клеток (ПКГ) растений. В наших предыдущих исследованиях было показано, что ПКГ является фактором самонесовместимости S-РНКазного типа у Petunia hybrida L. Остановка роста самонесовместимых пыльцевых трубок происходит при повышении уровня активности каспазо-подобных протеаз в первые часы опыления и к моменту остановки роста пыльцевых трубок наблюдаются все признаки ПКС (нарушение целостности плазматической мембраны, деградация/фрагментация ДНК, разрушение внутренней структуры пыльцевой трубки: отсутствие вакуолей, нарушение тургора и отделение клеточной плазматической мембраны от клеточной стенки) (Zakharova et al., 2021).
In recent years, a significant amount of evidence has been accumulated indicating the involvement of caspase-like proteases in programmed cell death (PCD) in plants. In our previous studies, it was shown that PCD is an S-RNase-type self-incompatibility factor in Petunia hybrida L. Growth of self-incompatible pollen tubes stops when the level of activity of caspase-like proteases increases in the first hours of pollination, and by the time the growth of pollen tubes stops, all signs of PCD are observed. (violation of the integrity of the plasma membrane, DNA degradation/fragmentation, destruction of the internal structure of the pollen tube: absence of vacuoles, disruption of turgor and separation of the cell plasma membrane from the cell wall) (Zakharova et al., 2021).
PRODUCTION OF POTATO PROTOPLASTS FOR GENOME EDITING
Authors: Чернова М.М. 
Published: September 2024

Микроклональное размножение — метод, основанный на размножении растений in vitro (технология выполнения экспериментов, когда опыты проводятся «в пробирке» — вне живого организма) [1], при котором полученные особи растений генетически идентичны исходному экземпляру [2]. У этого метода есть ряд преимуществ, которые выделяют его, это например: «чистота» организмов от вирусов, сокращение продолжительности селекционного процесса, возможность размножения растений, которые сложно размножить традиционными путями, искусственное ускорение роста растений.
Micropropagation is a method based on in vitro reproduction of plants (a technology for performing experiments when experiments are carried out "in a test tube" - outside a living organism) [1], in which the obtained plant individuals are genetically identical to the original specimen [2]. This method has a number of advantages that distinguish it, for example: the “purity” of organisms from viruses, the reduction in the duration of the selection process, the possibility of propagating plants that are difficult to propagate in traditional ways, artificial acceleration of plant growth.
OPTIMIZATION OF CONDITIONS OF MICROCLONAL REPRODUCTION OF THYMUS SERPYLLUM L.
Authors: Кожина С.Э. , Царева О.В. , Константинов З.С. , Галахова О.Б. , Соловьев А.А. , Гарибян Ц.С. 
Published: September 2024

Тимьян ползучий (Thymus serpyllum L.) многолетний полукустарник из рода Тимьян (Thymus) семейства Яснотковые (Lamiaceae). Тимьян широко используют в медицине, фармацевтике, кулинарии, парфюмерии, косметологии, как медонос и декоративное растение. (Garnik et al., 2009; Korsakova et al., 2012) В настоящее время промышленные плантации тимьяна в нашей стране фактически отсутствуют. Поэтому возникает необходимость расширения сырьевой базы в России, путем культивирования тимьяна. В связи с этим, а также с сохранением и размножением редких видов возникает проблема ускоренного размножения этого растения.
Creeping thyme (Thymus serpyllum L.) is a perennial subshrub from the genus Thymus of the Lamiaceae family. Thyme is widely used in medicine, pharmaceuticals, cooking, perfumery, cosmetology, as a honey plant and an ornamental plant. (Garnik et al., 2009; Korsakova et al., 2012) Currently, there are virtually no commercial thyme plantations in our country. Therefore, there is a need to expand the raw material base in Russia, by cultivating thyme. In connection with this, as well as with the conservation and reproduction of rare species, the problem of accelerated reproduction of this plant arises.
THE USE OF FAST NEUTRONS AS A PHYSICAL MUTAGEN FOR STUDYING THE POSSIBILITY OF IMPROVING RICE VARIETARY PROPERTIES
Authors: Кругляк А.И. , Алексеенок Ю.В. , Дорошкевич А.С. , Аппазов Н.О. , Бакирулы К.Б. 
Published: September 2024

Рис (Oryza sativa L.) является не только популярной продовольственной культурой, обеспечивая едой около 40% населения земного шара [1], но и хорошим модельным объектом для всех злаковых культур, ввиду простоты своего генома [2]. При этом данная культура является вторым по счету растением, у которого был полностью секвенирован геном [3] после арабидопсиса (Arabidopsis thaliana), размер генома которого примерно в четыре раза меньше [4]. Знания обо всей структуре геномной последовательности дают возможность менять свойства конкретного гена, отвечающего за определенные агрономически важные признаки.
Rice (Oryza sativa L.) is not only a popular food crop, providing food for about 40% of the world's population [1], but also a good model object for all cereal crops due to the simplicity of its genome [2]. Moreover, this culture is the second plant in which the genome was completely sequenced [3] after Arabidopsis (Arabidopsis thaliana), the genome size of which is approximately four times smaller [4]. Knowledge of the entire structure of the genomic sequence makes it possible to change the properties of a particular gene responsible for certain agronomically important traits.
MICROCLONAL REPRODUCTION OF PLANTS OF THE GENUS BELL
Authors: Куприянова Д.М. , Савлуковская С.В. , Репина А.С. , Галахова О.Б. , Соловьев А.А. , Константинов З.С. , Гарибян Ц.С. 
Published: September 2024

В Красную книгу Москвы и Московской области внесены три вида Колокольчика: Бубенчик лилиелистный (Adenophora liliifolia), Колокольчик алтайский (Campanula altaica), Колокольчик сибирский (Campanula sibirica) (Варлыгина и др., 2018). В настоящее время перед человечеством стоит потребность в сохранении исчезающих видов растений. Колокольчики широко используются в медицине и в садоводстве. Многие виды даже без селекционных преобразований обладают высокими декоративными качествами. Колокольчик сибирский синтезирует много вторичных метаболитов, важных для фармацевтики, таких как алкалоиды, флавоноиды и др. Сохранение редких видов растений – это часть общей проблемы восстановления и рационального использования природных растительных ресурсов, в том числе колокольчика. Для поддержания биоразнообразия в настоящее время наряду с традиционными методами используется способ сохранения редких и исчезающих видов растений в виде растущих коллекций в условиях in vitro.
Three types of Bellflower are listed in the Red Data Book of Moscow and the Moscow Region: Lily-leaved Bellflower (Adenophora liliifolia), Altai Bellflower (Campanula altaica), and Siberian Bellflower (Campanula sibirica) (Varlygina et al., 2018). Currently, humanity is faced with the need to conserve endangered plant species. Bluebells are widely used in medicine and horticulture. Many species, even without breeding transformations, have high decorative qualities. Bluebell synthesizes many secondary metabolites important for pharmaceuticals, such as alkaloids, flavonoids, etc. Preservation of rare plant species is part of the general problem of restoration and rational use of natural plant resources, including bluebell. To maintain biodiversity, at present, along with traditional methods, a method is used to preserve rare and endangered plant species in the form of growing collections under in vitro conditions.
CATCH A MOBILE IF YOU CAN
Authors: Меркулов П.Ю. , Егорова Е.Г. , Серганова М.А. , Петров Г.А. , Киров И.В. 
Published: September 2024

Значительная часть геномов эукариот, включая растения, представлена последовательностями мобильных элементов, совокупность которых представляет собой мобилом. Несмотря на давний интерес исследователей к мобильным элементам, закономерности формирования мобилома остаются малоизученными. Активная часть мобилома, способная к транспозиции, сравнительно небольшая ввиду накопления большинством мобильных элементов мутаций, а также работы систем эпигенетического сайленсинга мобильных элементов.
A significant part of the genomes of eukaryotes, including plants, is represented by sequences of transposable elements, the totality of which is a mobile. Despite the long-standing interest of researchers in mobile elements, the patterns of mobiloma formation remain poorly understood. The active part of the mobilome capable of transposition is relatively small due to the accumulation of mutations by the majority of mobile elements, as well as the work of systems of epigenetic silencing of mobile elements.