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Comprehensive Genomic Profiling of 282 Pediatric Low- and High-Grade Gliomas Reveals Genomic Drivers, Tumor Mutational Burden, and Hypermutation Signatures
Authors: Johnson Adrienne , Severson Eric , Gay Laurie , Vergilio Jo-Anne , Elvin Julia , Suh James , Daniel Sugganth , Covert Mandy , Frampton Garrett M. , Hsu Sigmund , Lesser Glenn J. , Stogner-Underwood Kimberly , Mott Ryan T. , Rush Sarah Z. , Stanke Jennifer J. , Dahiya Sonika , Sun James , Reddy Prasanth , Chalmers Zachary R. , Erlich Rachel , Chudnovsky Yakov , Fabrizio David , Schrock Alexa B. , Ali Siraj , Miller Vincent , Stephens Philip J. , Ross Jeffrey , Crawford John R. , Ramkissoon Shakti H. 
Published: September 2017

Abstract

Background
Pediatric brain tumors are the leading cause of death for children with cancer in the U.S. Incorporating next-generation sequencing data for both pediatric low-grade (pLGGs) and high-grade gliomas (pHGGs) can inform diagnostic, prognostic, and therapeutic decision-making.

Materials and Methods
We performed comprehensive genomic profiling on 282 pediatric gliomas (157 pHGGs, 125 pLGGs), sequencing 315 cancer-related genes and calculating the tumor mutational burden (TMB; mutations per megabase [Mb]).

Results
In pLGGs, we detected genomic alterations (GA) in 95.2% (119/125) of tumors. BRAF was most frequently altered (48%; 60/125), and FGFR1 missense (17.6%; 22/125), NF1 loss of function (8.8%; 11/125), and TP53 (5.6%; 7/125) mutations were also detected. Rearrangements were identified in 35% of pLGGs, including KIAA1549-BRAF, QKI-RAF1, FGFR3-TACC3, CEP85L-ROS1, and GOPC-ROS1 fusions. Among pHGGs, GA were identified in 96.8% (152/157). The genes most frequently mutated were TP53 (49%; 77/157), H3F3A (37.6%; 59/157), ATRX (24.2%; 38/157), NF1 (22.2%; 35/157), and PDGFRA (21.7%; 34/157). Interestingly, most H3F3A mutations (81.4%; 35/43) were the variant K28M. Midline tumor analysis revealed H3F3A mutations (40%; 40/100) consisted solely of the K28M variant. Pediatric high-grade gliomas harbored oncogenic EML4-ALK, DGKB-ETV1, ATG7-RAF1, and EWSR1-PATZ1 fusions. Six percent (9/157) of pHGGs were hypermutated (TMB &gt;20 mutations per Mb; range 43–581 mutations per Mb), harboring mutations deleterious for DNA repair in MSH6, MSH2, MLH1, PMS2, POLE, and POLD1 genes (78% of cases).

Conclusion
Comprehensive genomic profiling of pediatric gliomas provides objective data that promote diagnostic accuracy and enhance clinical decision-making. Additionally, TMB could be a biomarker to identify pediatric glioblastoma (GBM) patients who may benefit from immunotherapy.
Obesity and periodontitis: An experimental study to evaluate periodontal and systemic effects of comorbidity
Authors: Virto Leire , Cano Pilar , Jiménez‐Ortega Vanesa , Fernández‐Mateos Pilar , González Jerián , Esquifino Ana Isabel , Sanz Mariano 
Published: September 2017

BackgroundObesity and overweight have been associated with periodontitis. This study aims to evaluate periodontal and systemic effects of this association in a validated experimental model.MethodsTwenty‐eight male Wistar rats were randomly divided into four groups: 1) control group (Con) (fed with standard diet); 2) high‐fat diet group (HFD) (fed with a diet containing 35.2% fat); 3) control group with induced periodontitis (Con‐Perio); and 4) HFD group with induced periodontitis (HFD‐Perio). To induce periodontitis, oral gavages with Porphyromonas gingivalis ATCC W83K1 and Fusobacterium nucleatum DMSZ 20482 were used. Periodontal outcomes were evaluated by inflammatory parameters, periodontal probing depth (PD), and modified gingival index (MGI). Systemic effects were evaluated by measuring levels of inflammatory cytokines, insulin, adiponectin, and leptin using multiplex immunoassays and levels of visfatin, resistin, lipid profiles, transaminases, and plasma endotoxin using colorimetric tests and the glucose tolerance test.ResultsClinical parameters (PD and MGI) were significantly increased (P < 0.05) in the induced periodontitis groups compared with controls. The HFD‐Perio group demonstrated significantly higher PD compared with Con‐Perio group. Lipid profiles, cytokines, and adipocytokines showed significantly elevated levels in the HFD‐Perio group compared with the other groups. Similarly, glucose levels in the HFD‐Perio group were significantly higher (P < 0.05) than in the HFD group, and hepatic damage parameters demonstrated a tendency toward higher levels in the HFD‐Perio group.ConclusionObesity and periodontitis demonstrated a comorbidity effect on both systemic inflammatory and metabolic dysregulation biomarkers, with increased glucose, dyslipidemia and hepatic damage.
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Authors: Ali Burhan 
Published: September 2017

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ANALISIS PENILAIAN ANGKA KREDIT PUSTAKAWAN LINGKUP KEMENTERIAN PERTANIAN
Authors: Andriaty Etty , Artati Dyah , Juariah Juju 
Published: September 2017

Pemahaman terhadap butir-butir kegiatan yang diatur dalam SK Menpan No. 132 Tahun 2002 maupun Peraturan Menpan dan RB No. 9 Tahun 2014 masih belum merata untuk setiap pustakawan. Hal ini mengakibatkan terjadinya perbedaan nilai angka kredit antara yang diajukan pustakawan dalam DUPAK dengan hasil penilaian Tim Penilai. Pengkajian ini bertujuan untuk mengetahui sebaran pustakawan, perbedaan nilai angka kredit yang diajukan pustakawan dengan hasil penilaian Tim Penilai, dan masalah yang menyebabkan perbedaan nilai angka kredit tersebut. Pengkajian deskriptif dilakukan terhadap DUPAK di Sekretariat Tim Penilai Jabatan Fungsional Pustakawan Kementerian Pertanian tahun 2012-2016. Hasil pengkajian menunjukkan bahwa sebaran pustakawan di lingkup Kementerian Pertanian belum merata, bahkan terdapat UK/UPT yang belum memiliki pustakawan. Pustakawan cenderung untuk melaporkan butir kegiatan yang nilainya besar. Hal ini dapat dilihat dari jumlah DUPAK untuk penelusuran informasi untuk bahan bacaan (117 orang), penyebaran informasi terseleksi (112 orang), dan menjadi pemandu pameran (26 orang). Kegiatan dengan nilai rata-rata angka kredit tertinggi adalah katalogisasi, membuat karya tulis populer yang diterbitkan di media massa, dan membuat karya tulis yang disampaikan pada pertemuan/diklat, dengan nilai masing-masing 34,458; 4,000; dan 8,450. Sebaliknya, kegiatan membuat karya saduran/terjemahan pada subunsur pengembangan profesi merupakan kegiatan yang mempunyai nilai Rata-rata angka kredit yang yang ditolak tertinggi (93%). Perbedaan hasil penilaian (PAK) dengan DUPAK yang diajukan antara lain karena bukti fisik tidak terpenuhi, bukti fisik tidak sesuai, dan angka kredit melebihi ketentuan.
Projection of hydro-climatological changes over eastern Himalayan catchment by the evaluation of RegCM4 RCM and CMIP5 GCM models
Authors: Singh Vishal , Sharma Ashutosh , Goyal Manish Kumar 
Published: September 2017

AbstractHere, a regional climate model (RCM) RegCM4 and Coupled Model Intercomparison Project phase 5 (CMIP5) global climate models (GCMs) such as Coupled Physical Model (CM3), Coupled Climate Model phase 1 (CM2P1) and Earth System Model (ESM-2M) with their representative concentration pathway (RCP) datasets were utilized in projecting hydro-climatological variables such as precipitation, temperature, and streamflow in Teesta River basin in north Sikkim, eastern Himalaya, India. For downscaling, a ‘predictor selection analysis’ was performed utilizing a statistical downscaling model. The precision and applicability of RCM and GCM datasets were assessed using several statistical evaluation functions. The downscaled temperature and precipitation datasets were used in the Soil and Water Assessment Tool (SWAT) model for projecting the water yield and streamflow. A Sequential Uncertainty Parameter Fitting 2 optimization algorithm was used for optimizing the coefficient parameter values. The Mann–Kendall test results showed increasing trend in projected temperature and precipitation for future time. A significant increase in minimum temperature was found for the projected scenarios. The SWAT model-based projected outcomes showed a substantial increase in the streamflow and water yield. The results provide an understanding about the hydro-climatological data uncertainties and future changes associated with hydrological components that could be expected because of climate change.
LA GESTION DES DÉCHETS À L’HÔPITAL: DU DISCOURS AUX RÉSULTATS
Authors: Regazzetti Loic 
Published: September 2017

Comme le rappelle l’Organisation Mondiale de la Santé (OMS) sur la scène internationale ou encore la Haute Autorité de Santé (HAS) en France, une gestion rigoureuse des déchets hospitaliers permet de : participer à la lutte contre les infections nosocomiales et la dissémination des bactéries multi résistantes ; prévenir les accidents d’exposition au sang, ou encore la réutilisation et la revente illégales de matériels infectés (limitant ainsi les risques de transmission du VIH, VHB, VHC) ; limiter les dépenses inutiles de traitement des déchets; éviter les effets néfastes sur l’environnement. Dans un tel contexte, le Centre Hospitalier Universitaire de Nice est engagé depuis 2011 dans un vaste projet d’amélioration répondant à la fois aux recommandations de la HAS et autres exigences réglementaires, mais également à une démarche plus générale inscrite dans sa politique qualité. Par conséquent, une nouvelle gouvernance a été définie, les règles internes ont été révisées (protocoles de tri et de gestion), et une importante campagne de communication a été menée. Si aujourd’hui les résultats sont encourageants, il est toutefois indispensable de maintenir l’établissement dans une dynamique d’amélioration cohérente avec les évolutions nationales et internationales. Le présent article a donc pour objectif de présenter de manière synthétique la stratégie appliquée au CHU de NICE. Au travers d’une politique, d’une méthode, d’un nombre de données chiffrées, il sera possible de mieux appréhender ce que représente le potentiel d’une gestion des déchets en établissement de santé. Ces données sont à considérer pour la plupart comme reflétant la situation à son état de commencement, c’est-à-dire en 2011, avec une évolution allant jusqu’en 2014.
Mots-clefs: Déchets. Développement durable. Qualité. Sécurité.
INDICADORES DE AVALIAÇÃO DA QUALIDADE HOSPITALAR E DE SATISFAÇÃO DO USUÁRIO
Authors: Barreto dos Santos Helena 
Published: September 2017

O presente artigo faz uma breve revisão narrativa do papel dos indicadores na gestão da qualidade e da segurança em instituições de saúde, apresentando as categorias de indicadores propostas por Donabedian. Ressaltam-se as diferenças que distinguem indicadores de qualidade e segurança daqueles usados em pesquisas ou auditorias: apesar de terem os mesmos requisitos de validade, repetibilidade, confiabilidade e adequação das medidas que estes, há um aprendizado obtido durante a mensuração da qualidade e segurança dos processos assistenciais e a hipótese a ser testada pode mudar no decorrer do projeto, para permitir que a intervenção de fato funcione em dado contexto. Entre as possíveis seleções de indicadores, existem aqueles já estabelecidos por agências reguladoras, agências governamentais ou agências de acreditação, que permitem a comparação entre organizações ou o estabelecimento de indicadores próprios. Por fim, é revisado o uso da avaliação de satisfação com a assistência pelos usuários para construir indicadores de avaliação da qualidade e segurança, e suas limitações. Como conclusão, pode-se dizer que avaliação do desempenho do cuidado hospitalar por meio de indicadores não é a única ferramenta para gestão da qualidade, mas é indispensável para a melhoria da qualidade assistencial. Quanto às medidas obtidas mediante experiência do paciente com o cuidado prestado, estas não são uniformemente aceitas na avaliação da qualidade assistencial, mas há algumas evidências publicadas que demonstram correlação positiva entre resultados avaliados pelo paciente e aqueles medidos por outros indicadores. Considerando que o cuidado centrado no paciente é uma dimensão da qualidade assistencial, não se pode dispensar sua participação na avaliação da qualidade.
Palavras-chave: Indicadores de qualidade em assistência à saúde. Satisfação do paciente. Melhoria da qualidade.
GESTÃO HOSPITALAR E CULTURA DE SEGURANÇA DO PACIENTE NA PERCEPÇÃO DA EQUIPE DE ENFERMAGEM
Authors: Santos da Silva-Batalha Edenise Maria , Melleiro Marta Maria 
Published: September 2017

O objetivo deste estudo foi avaliar a percepção de trabalhadores de enfermagem de um hospital de ensino acerca da cultura de segurança do paciente frente à gestão hospitalar. Trata-se de uma pesquisa quantitativa desenvolvida em um hospital de 900 leitos. A amostra foi composta por 301 profissionais de enfermagem. O instrumento de coleta foi o questionário da Agency for Healthcare Research and Quality, intitulado Hospital Survey on Patient Safety Culture, traduzido para o Português e adaptado da versão original em inglês. A análise deu-se por meio de estatísticas descritivas e testes específicos. Os resultados referentes à dimensão “Apoio da gestão hospitalar para segurança do paciente” evidenciaram que 53,6% dos participantes discordavam que a administração propiciava um clima de trabalho favorável à segurança do paciente, 46% discordavam que a segurança do paciente fosse uma prioridade da administração e 58,3% concordavam que a administração apenas se interessava pela segurança após a ocorrência de eventos adversos. Tais resultados demonstram a necessidade de envolvimento maior da gestão hospitalar para com a segurança dos pacientes, favorecendo o amadurecimento da cultura de segurança. Ainda, a relação entre a enfermagem e a gestão hospitalar deve ser fortalecida, baseando-se em relações mais próximas e lineares. Conclui-se que não é apenas uma parte da organização que é responsável pela cultura de segurança, há, portanto, a necessidade de envolver a gestão e todos os trabalhadores na criação, implementação e fortalecimento dos sentimentos, valores, comportamentos, atitudes e ações que irão fomentar essa cultura.
Palavras-chave: Administração hospitalar. Segurança do paciente. Enfermagem.
INCIDÊNCIA DE EVENTOS ADVERSOS CIRÚRGICOS EM HOSPITAL DIA
Authors: M. Costa Eliana Auxiliadora , Moreira Lícia Lígia , Neves Gusmão Maria Enoy 
Published: September 2017

Os eventos adversos cirúrgicos têm especial relevância pelo impacto sobre a saúde dos pacientes e por serem eventos preveníveis. A despeito do crescente número de publicações nessa área, persistem lacunas de conhecimento sobre esses eventos na modalidade da assistência cirúrgica ambulatorial. O objetivo deste trabalho é estimar a incidência de eventos adversos cirúrgicos em um Hospital Dia. Para tanto, o método utilizado foi estudo de coorte histórica, dinâmica de 55.879 pacientes operados em um Hospital Dia entre 2010 e 2014. Os resultados indicam que incidência de eventos adversos cirúrgicos foi de 0,51%. Destes eventos, 0,31% foi de infecções do sítio cirúrgico e 0,19% de outros eventos adversos cirúrgicos distribuídos proporcionalmente em: deiscência da ferida cirúrgica (12,9%), hemorragia (5,2%), flebite (5,2%) e trombose dos membros inferiores (4,9%). Assim, os resultados deste estudo ratificam que a cirurgia realizada em regime ambulatorial de Hospital Dia está relacionada a menores incidências de eventos adversos cirúrgicos quando comparados com outros estudos no mesmo tipo de organização, bem como, com estudos em hospitais convencionais. Esses dados ratificam a segurança da cirurgia ambulatorial, entretanto, é indispensável um sistema de seguimento dos pacientes após alta, no sentido de evitar a subnotificação e sub-registros dos dados, que, na ausência desse, pode ocultar dados e identificar taxas irreais.
Palavras-chave: Reação adversa. Hospital Dia. Segurança do paciente.
CARACTERIZAÇÃO DOS SERVIÇOS DE ATENDIMENTO A PESSOAS COM LESÃO CEREBRAL DE MUNICÍPIO DO INTERIOR DO RIO GRANDE DO SUL
Authors: Ponte Aline Sarturi , Pommerehn Jodeli , Prado Ana Lucia Cervi , Fedosse Elenir 
Published: September 2017

A lesão cerebral pode ter como consequência uma diversidade de disfunções que merecem atenção integrada da Fisioterapia, da Fonoaudiologia e da Terapia Ocupacional. O objetivo deste estudo foi caracterizar os serviços de reabilitação neurológica de adultos fornecidos pelo Sistema Público de Saúde de uma cidade de médio porte do interior do estado do Rio Grande do Sul. Esta pesquisa caracterizou-se como descritiva, qualitativa. A coleta de dados foi realizada entre junho e outubro de 2014, nos diferentes serviços de reabilitação de Fisioterapia, Fonoaudiologia e Terapia Ocupacional do município. Os resultados indicaram a carência de serviços públicos de natureza interdisciplinar, bem como de serviços fonoaudiológicos e de Terapia Ocupacional; a realização dos processos terapêuticos se dá de forma fragmentada ou são parcialmente realizados. Concluiu-se que os serviços de reabilitação neurológica fornecidos pelo Sistema Público de Saúde no município estudado ofereciam dificuldades de acesso e eram poucas as oportunidades de as pessoas com esse tipo de lesão serem cuidadas integralmente em suas necessidades, o que produzia ainda mais efeitos negativos para elas e seus familiares.
Palavras-chave: Sistema único de saúde. Lesão cerebral. Afasia. Hemiplegia. Hemiparesia.
FATORES PSICOSSOCIAIS DE ESTRESSE NO TRABALHO DE AGENTES COMUNITÁRIOS DE SAÚDE NO MUNICÍPIO DE PARNAÍBA, PIAUÍ
Authors: Bezerra Jairon Leite Chaves , Lucca Sérgio Roberto de 
Published: September 2017

Os fatores psicossociais como desencadeadores de estresse no trabalho podem exercer influência na saúde física e mental dos profissionais da equipe da Saúde da Família, atores indispensáveis do cuidado em saúde no modelo público de atenção à saúde. Este estudo teve por objetivo compreender os fatores psicossociais de estresse no trabalho dos agentes comunitários que atuavam na Atenção Básica à saúde do município de Parnaíba, Piauí. Trata-se de estudo epidemiológico transversal, com abordagem combinada quanti-qualitativa. Como instrumento para avaliação dos fatores psicossociais utilizou-se um questionário de avaliação de estresse relacionado ao trabalho, além de discussão dos resultados por meio de grupo focal. Os resultados da amostra de 168 participantes destacaram a predominância do sexo feminino, idade acima dos 30 anos, alto nível de escolaridade e tempo de exercício na profissão e no SUS superior aos 14 anos. Para os sujeitos da pesquisa, os principais fatores psicossociais desencadeadores de estresse no trabalho foram problemas de relacionamentos, mudanças e controle. Os agentes não se sentiam reconhecidos pela comunidade e demais profissionais da equipe de saúde, a autonomia do agente era limitada e a falta de comunicação prévia promovia descontentamento dos profissionais e da comunidade. Concluiu-se que é necessária uma revisão do trabalho desses profissionais, incluindo as mudanças na organização do trabalho nas Unidades Básicas de Saúde do Município.
Palavras-chave: Agentes comunitários de saúde. Condições de trabalho. Estresse psicológico.
IMPLICAÇÕES DO EXERCÍCIO FÍSICO EM CRIANÇAS E ADOLESCENTES FIBROCÍSTICOS: UMA REVISÃO SISTEMÁTICA
Authors: Araújo Andressa De Oliveira , Silva Maria Elvira Oliveira , Cavalcante Neto Jorge Lopes 
Published: September 2017

Crianças e adolescentes com fibrose cística apresentam muitas complicações na saúde ao longo da vida, que implicam na diminuição da capacidade de exercício. O objetivo deste estudo foi investigar o papel do exercício físico na melhoria da função pulmonar e na qualidade de vida em crianças e adolescentes fibrocísticos. Adotou-se a metodologia da revisão sistemática da literatura. Os resultados mostraram que os sete artigos aqui revisados são recentes, apresentam propostas de melhoria da função pulmonar apoiadas em diferentes programas de exercícios. Contudo, ainda há lacunas em relação à prescrição de exercícios para essa população. Concluiu-se que, apesar da importância do exercício físico para a melhoria da função pulmonar e da qualidade de vida de crianças e adolescentes com fibrose cística, a utilização de instrumentos específicos que avaliem a quantidade e intensidade do exercício ainda é limitada.
Palavras-chave: Fibrose cística. Exercício. Criança. Adolescente.
CONHECIMENTO DE ESTUDANTES DE MEDICINA SOBRE HANSENÍASE EM UMA REGIÃO ENDÊMICA DO BRASIL
Authors: Viana Ana Caroline Brasil , Araújo Fernando Costa , Pires Carla Andréa Avelar 
Published: September 2017

A hanseníase é uma doença infecciosa, crônica, de grande importância para a saúde pública devido à sua prevalência e ao seu alto poder incapacitante. A Amazônia brasileira é região endêmica dessa moléstia. Este estudo teve como objetivo avaliar o conhecimento acerca da hanseníase dos estudantes do último ano do curso de Medicina de universidades públicas da capital do estado do Pará, comparando-o com variáveis da formação acadêmica. Trata-se de um estudo observacional de corte transversal. Para a coleta de dados, utilizaram-se questionários de perfil do acadêmico e avaliação em hanseníase. Os resultados apontaram que 55% dos acadêmicos tiveram índice de acertos maior que 50%. O menor índice de acertos ocorreu em questões sobre o contato intradomiciliar, diagnóstico e formas clínicas, nesta ordem. Não se evidenciou influência significativa/correlação entre as variáveis de participações em Iniciação Científica, Curso Preparatório de Residência Médica ou Ligas Acadêmicas com o nível de conhecimento dos acadêmicos em hanseníase. Concluiu-se que os estudantes avaliados apresentaram nível de conhecimento regular, o que aponta para a necessidade de aperfeiçoamento das estratégias de ensino-aprendizado em hanseníase.
Palavras-chave: Hanseníase. Estudantes de Medicina. Educação Médica.