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An Integrative Analysis of microRNA and mRNA Expression–-A Case Study
Authors: Qin Li-Xuan 
Published: October 2017

Background MicroRNAs are believed to play an important role in gene expression regulation. They have been shown to be involved in cell cycle regulation and cancer. MicroRNA expression profiling became available owing to recent technology advancement. In some studies, both microRNA expression and mRNA expression are measured, which allows an integrated analysis of microRNA and mRNA expression. Results We demonstrated three aspects of an integrated analysis of microRNA and mRNA expression, through a case study of human cancer data. We showed that (1) microRNA expression efficiently sorts tumors from normal tissues regardless of tumor type, while gene expression does not; (2) many microRNAs are down-regulated in tumors and these microRNAs can be clustered in two ways: microRNAs similarly affected by cancer and microRNAs similarly interacting with genes; (3) taking let-7f as an example, targets genes can be identified and they can be clustered based on their relationship with let-7f expression. Discussion Our findings in this paper were made using novel applications of existing statistical methods: hierarchical clustering was applied with a new distance measure–the co-clustering frequency–to identify sample clusters that are stable; microRNA-gene correlation profiles were subject to hierarchical clustering to identify microRNAs that similarly interact with genes and hence are likely functionally related; the clustering of regression models method was applied to identify microRNAs similarly related to cancer while adjusting for tissue type and genes similarly related to microRNA while adjusting for disease status. These analytic methods are applicable to interrogate multiple types of -omics data in general.
Uncovering Biological Network Function via Graphlet Degree Signatures
Authors: Milenković Tijana , Pržulj Nataša 
Published: October 2017

MotivationProteins are essential macromolecules of life and thus understanding their function is of great importance. The number of functionally unclassified proteins is large even for simple and well studied organisms such as baker's yeast. Methods for determining protein function have shifted their focus from targeting specific proteins based solely on sequence homology to analyses of the entire proteome based on protein-protein interaction (PPI) networks. Since proteins interact to perform a certain function, analyzing structural properties of PPI networks may provide useful clues about the biological function of individual proteins, protein complexes they participate in, and even larger subcellular machines.ResultsWe design a sensitive graph theoretic method for comparing local structures of node neighborhoods that demonstrates that in PPI networks, biological function of a node and its local network structure are closely related. The method summarizes a protein's local topology in a PPI network into the vector of graphlet degrees called the signature of the protein and computes the signature similarities between all protein pairs. We group topologically similar proteins under this measure in a PPI network and show that these protein groups belong to the same protein complexes, perform the same biological functions, are localized in the same subcellular compartments, and have the same tissue expressions. Moreover, we apply our technique on a proteome-scale network data and infer biological function of yet unclassified proteins demonstrating that our method can provide valuable guidelines for future experimental research such as disease protein prediction.AvailabilityData is available upon request.
Corrosion of Post-Tensioned Tendons with Deficient Grout, Part 2: Segregated Grout with Elevated Sulfate Content
Authors: Permeh S. , Krishna Vigneshwaran K.K. , Echeverría M. , Lau K. , Lasa I. 
Published: October 2017

Corrosion failure of post-tensioning (PT) tendons with pre-packaged thixotropic grout has been documented in Florida bridges. Analysis of the deficient grout in Florida PT bridges, where severe corrosion developed, indicated elevated sulfate ion concentration, high pore water pH, low chloride ion content, and enhanced moisture content. Limited information is available on the corrosion behavior of PT strand in grout materials with elevated sulfate ion content. In this work, the corrosion performance of steel strands embedded in deficient grout was evaluated. The deficient grout was cast in large scale test assemblies that would represent geometry and material conditions found in Florida bridges, where PT strand corrosion occurred. Large scale mock up tendons (developed by the modified inclined tube [MIT] test) of about 4.57 m long were cast using expired grout materials, excess of 15% water, and sulfate ion concentrations to create deficiencies and corrosion conditions in the grout environment. Corrosion measurements such as corrosion potential (Ecorr) and corrosion current density (icorr), as well as potentiodynamic polarization tests were performed on the steel probes located along the MIT samples in contact with the deficient grout. Grout characterization parameters included the determination of the grout resistance (Rs), as well as the moisture and sulfate ion content. Also, visual inspection of the MIT samples (steel strand and steel corrosion probes) after a time was performed, as well as the corrosion products characterization. Testing confirmed that enhanced corrosion can occur in the deficient grout with high free sulfate ion accumulation.
Statistical analysis of severe magnetic fluctuations in the near-Earth plasma sheet observed by THEMIS-E
Authors: Xu Heqiucen , Shiokawa Kazuo , Frühauff Dennis 
Published: October 2017

Abstract. We statistically analyzed severe magnetic fluctuations in the nightside near-Earth plasma sheet at 6–12 RE (Earth radii; 1 RE = 6371 km), because they are important for non-magnetohydrodynamics (non-MHD) effects in the magnetotail and are considered to be necessary for current disruption in the inside-out substorm model. We used magnetic field data from 2013 and 2014 obtained by the Time History of Events and Macroscale Interactions during Substorms E (THEMIS-E) satellite (sampling rate: 4 Hz). A total of 1283 severe magnetic fluctuation events were identified that satisfied the criteria σB∕B > 0. 5, where σB and B are the standard deviation and the average value of magnetic field intensity during the time interval of the local proton gyroperiod, respectively. We found that the occurrence rates of severe fluctuation events are 0.00118, 0.00899, and 0.0238 % at 6–8, 8–10, and 10–12 RE, respectively, and most events last for no more than 15 s. From these occurrence rates, we estimated the possible scale sizes of current disruption by severe magnetic fluctuations as 3.83 RE3 by assuming that four substorms with 5 min intervals of current disruption occur every day. The fluctuation events occurred most frequently at the ZGSM (Z distance in the geocentric solar magnetospheric coordinate system) close to the model neutral sheet within 0.2 RE. Most events occur in association with sudden decreases in the auroral electrojet lower (AL) index and magnetic field dipolarization, indicating that they are related to substorms. Sixty-two percent of magnetic fluctuation events were accompanied by ion flow with velocity V > 100 km s−1, indicating that the violation of ion gyromotion tends to occur during high-speed flow in the near-Earth plasma sheet. The superposed epoch analysis also indicated that the flow speed increases before the severe magnetic fluctuations. We discuss how both the inside-out and outside-in substorm models can explain this increase in flow speeds before magnetic fluctuation events.
REAPROVEITAMENTO DE DORMENTES DE MADEIRA DA ESTRADA DE FERRO CARAJÁS PARA A COGERAÇÃO DE ENERGIA ELÉTRICA
Authors: Damasceno Fábio Gorayeb , Matlaba Valente José , Santos Jorge Filipe dos , Mota José Aroudo 
Published: October 2017

O descarte de resíduos de dormentes de madeira tem importância ambiental e econômica. Todavia, os estudos específicos que testam e avaliam a sustentabilidade de alternativas de sua destinação adequada praticamente são inexistentes. Este artigo avaliou os aspectos ambientais e econômicos do coprocessamento dos dormentes de madeira com biomassa florestal para produzir eletricidade em unidade termelétrica.Os procedimentos consistiram em aplicação de testes em branco e de queima utilizando métodos recomendados por instituições e agências nacionais e internacionais. Nesses testes foram coletadas amostras dos gases emitidos pela chaminé e cinzas residuais utilizando apenas biomassa de origem florestal. O experimento de queima consistiu na mistura de biomassa com dormentes de madeira triturada na proporção de 1/5. As comparações mostraram que os parâmetros da dimensão ambientalobtidos estavam nos limites estabelecidos para emissões atmosféricas na legislaçãoambiental brasileira de incineração de resíduos, exceto para material particuladoe das dioxinas e furanos. Se existir um controle eficiente de emissões gasosas,especialmente destas últimas, os resultados mostraram que o reaproveitamentoenergético da madeira é ambientalmente sustentável. Na dimensão econômica,considerando certas premissas, tais como a potência da termelétrica de 5 MW, aprodução nominal de 43.800 MWh por ano e o consumo de biomassa em torno de70 mil t anuais, a substituição da biomassa por 20% de dormentes reduz em 19,2% ocusto total anual da matéria-prima utilizada no processo de geração.
APROXIMACIONES TEÓRICAS PARA UN DEBATE CONCEPTUAL SOBRE PARTICIPACIÓN CIUDADANÍA, DEMOCRACIA, DESCENTRALIZACIÓN, GOBERNABILIDAD, POLÍTICAS PÚBLICAS EN LOS GOBIERNOS LOCALES
Authors: Palazio Galo Edgard 
Published: October 2017

Los procesos políticos modernos traen consigo importantes debates acerca de la legitimidad de los modelos de gestión pública, los mecanismos en que se reproducen y ejecutan acciones de gobierno, la efectividad misma de dichas políticas sociales y los niveles en que los ciudadanos participan como sujetos activos en los procesos de democratización. Conceptos como gobernabilidad y gobernanza deben ser objeto de discusión propositiva en el estudio de las acciones legítimas y eficaces de gobierno. Ampliando este concepto es útil relacionarlo con gobernanza desde donde podemos explicar la capacidad de un gobierno para transformar necesidades en políticas sociales En un nivel macro el concepto democracia evoca la idea de autogobierno presuponiendo un modelo de gobierno en la cual el poder logra estar distribuido de manera incluyente entre los miembros de la demarcación espacial determinada, ampliando de esa forma los derechos de participación efectiva. De manera que la función ideal de la democracia será producir decisiones colectivas con máximo de consenso social y mínimo de imposiciones. Es sustantivo tener presente en la comprensión de la ciudadanía, la evolución histórica conflictiva que los mismos derechos ciudadanos han tenido a lo largo del tiempo, la trayectoria histórica de los derechos que dan origen y configuración a la ciudadanía por tanto es resultado de un múltiple proceso con consecuencias de alcances sociales o socio-políticos, de legitimación de reivindicaciones y valores que las justifican; y político-jurídico institucional, de legalización y de nuevas políticas públicas. El estudio de la ciudadanía resulta una importante oportunidad para enfocar y restituir a la esfera social la centralidad del estudio y análisis de los sistemas sociopolíticos.
RECORRIDOS HISTORIOGRÁFICOS Y METODOLÓGICOS DE LA CONTEMPORANEIDAD
Authors: Torres Montenegro Antonio 
Published: October 2017

En este artículo se hace un recuento de las experiencias personales vividas en materia de investigación histórica, principalmente en relación a los problemas u obstáculos enfrentados, desde el punto de vista metodológico y la necesidad de estructurar un instrumento de análisis apropiado para comprender un presente y pasado complejo, como fue el Brasil de finales la década del 70 e inicios del 80 del siglo pasado.Se dan a conocer la impresión causada en la vida académica, los hallazgos de algunos autores prohibidos por la dictadura, como algunos teóricos clásicos del marxismo y otros que recién se divulgaban sus obras, como Edward Thompson, Michel Foucault, cuyas lecturas abrieron nuevas perspectivas de análisis de la realidad social.Luego se relatan las vivencias y retos enfrentados para escribir "Acción laboral, represión policial y asesinato en tiempos de régimen militar". Las dificultades metodológicas para el abordaje de un tema ocurrido treinta años antes, en especial la utilización de las fuentes documentales, orales y las implicaciones de la memoria, para poner en perspectiva un sangriento suceso de la época de la dictadura.
REMONTANDO EL 32 La memoria histórica contra el archivo
Authors: Lara-Martínez Rafael 
Published: October 2017

Remotando el 32. La memoria histórica contra el archivo” analiza el papel que desempeña el escritor salvadoreño Salarrué (1899-1975) —y los círculos de artistas teósofos— durante el año clave de 1932. El siglo XXI rescata la imagen del autor como prototipo de la denuncia de una represión desmesurada que organiza el régimen del general Maximiliano Hernández Martínez (1931-1934; 1935-1939; 1939-1944) contra una revuelta ocurrida en enero de ese año. Para tal efecto, la ley de la memoria histórica suprime casi toda la documentación primaria de ese año clave. La argumentación cimienta su tesis en una sola publicación del autor eliminando el amplio archivo histórico que haría del artista un colaborador solapado del régimen. El artículo restituye el registro borrado adrede por una historiografía ansiosa de olvidar.
NARRATIVA PERSONAL, TRAYECTORIA DE VIDA Y CONSTRUCCIÓN DE IDENTIDADES
Authors: Barbieri Mirta Ana 
Published: October 2017

Al plantearse la investigación social, y utilizarse el instrumento de la entrevista como proceso comunicativo (re-conocimiento), los sujetos que narran reconstruyen sus itinerarios. Los relatos de vida ponen en evidencia la trama social a través de lo particular, permitiendo asomarse a una diversidad de espacios complejos donde dialogan y/o se producen los cambios intergeneracionales. Los interlocutores develan sus experiencias, algunas íntimas, poniendo de maní, sto aquellas familiares, sociales, conectando con valores y modelos. La situación de encuentro, en la que el investigador se ve involucrado, es una frente de conocimiento útil, una instancia oportuna para la reflexión sobre la intersubjetividad a la que se enfrenta. Estos son algunas de las preocupaciones teóricas y metodológicas abordadas en el ensayo.
LOS FINES DEL JARDIN INFANTIL EN EL PENSAMIENTO DE FRIEDRICH FROEBEL
Authors: Gadea Rivas Ileana 
Published: October 2017

Con el interés de contribuir a un mejor conocimiento de las raíces de la educación inicial y a la reflexión de actualidad sobre el propósito de la educación, este trabajo analiza los planteamientos de Friedrich Froebel con respecto a los fines del jardín infantil. Para ello se ha consultado la Carta a las Esposas y Jóvenes Alemanas de 1840 como fuente primaria porque en ella Froebel esbozó un plan para la implementación del jardín infantil y presentó reflexiones acerca de su filosofía de la educación. Froebel pensó en la implementación universal del jardín infantil como sistema educativo para la humanidad, como institución para la educación integral y atención de la niñez de todas las clases sociales y para la formación docente, como proyecto para ser divulgado y puesto en práctica más allá del ámbito local de su origen y como una misión encargada especialmente a las mujeres. En el contexto de la industrialización, urbanización y modernización de la familia, Froebel recurrió a ideas del cristianismo y del pensamiento idealista, neo humanista, romántico y naturalista para impulsar una reforma y responder a deficiencias en la educación y a problemas en la familia y en la sociedad.
LOS TALLERES DE POESÍA DEL MINISTERIO DE CULTURA EN LA NICARAGUA DE LOS AÑOS OCHENTA
Authors: Pastrana Hernández Guadalupe Xochitlanetzin 
Published: October 2017

El triunfo de la Revolución Popular Sandinista implicó para Nicaragua profundas transformaciones en distintos ámbitos, uno de ellos fue el cultural. Con la creación del Ministerio de Cultura, que tuvo como Ministro a Ernesto Cardenal, se impulsaron –entre otros proyectos– Talleres Populares de Poesía. Dar cuenta de la historia de estos Talleres, de sus formas de organización, de los poetas que en ellos participaron y que continúan escribiendo, e incluso hablar de la polémica que se desató entre la intelectualidad nicaragüense, porque a decir de algunos, los Talleres limitaban la creación poética en el país, es lo que se hace en este ensayo que además, pretende ser un aporte para entender e interpretar –desde otras miradas– a aquella Nicaragua recién liberada, aquella Nicaragua que a finales de los años ochenta (época en que en México y en otros países de América Latina se hablaba de neoliberalismo) constituyó un ejemplo de dignidad y rebeldía.
ANÁLISIS HISTÓRICO: PASADO Y PRESENTE DE CIUDAD SANDINO
Authors: Mejía Flores Verónica 
Published: October 2017

El ensayo “Análisis histórico: pasado y presente de Ciudad Sandino” tiene como propósito indagar el contexto histórico de esta población, caracterizando la vida desde sus orígenes hasta la actualidad, abordando sus diferentes aspectos sociales, culturales, políticos, administrativos y territoriales. El estudio permite identificar los problemas que ha tenido la población en su desarrollo como comunidad. Para ello, fue necesaria la utilización de Historia Oral para construir aquellas fuentes no registradas por medio de escritos y que son determinante para la comprensión de la evolución del municipio. Por medio de los testimonios expuestos por los habitantes, protagonistas de la historia del municipio, se analizó y sintetizó la información requeridas para la reconstrucción, rescate y comprensión de los cambios suscitados en su evolución. En este trabajo se reflejan los antecedentes históricos, comparando pasado y presente utilizando fuentes bibliográficas y orales para determinar los elementos que todavía persisten en la práctica de la cotidianeidad. A manera de conclusión se destaca que este territorio ha presentado significativos cambios observables en el crecimiento poblacional e infraestructura del municipio, permitiendo hacer comparaciones entre un inicio muy difícil y un presente promisorio.
TURISMO COMUNITARIO Y SU ESTUDIO: REFLEXIONES DESDE UN ENFOQUE CULTURAL PROPOSITIVO PARA EL DESARROLLO RURAL
Authors: Torres Obando Joseph Orlando 
Published: October 2017

En este escrito se pretende proveer al lector de una discusión acerca de lo que es y conlleva el turismo comunitario, en comunidades rurales y semi-rurales de Nicaragua. Se presenta una discusión teórica basada en una experiencia de campo en Villa Chagüitillo (Sébaco-Matagalpa), contrastando lo encontrado con datos de investigación documental, con la finalidad de comprender, como las diferentes modalidades de turismo alternativo – turismo cultural y rural – representan el eje sustentador del turismo comunitario, el cual se complementa con otras actividades económicas, integrando a las diferentes unidades familiares en su proceso de producción, facilitando de esa manera el desarrollo rural.
Estresse e fatores psicossociais no trabalho de enfermeiros intensivistas
Authors: Lima da Silva Jorge Luiz , Teixeira Liliane Reis , Soares Rafael Da Silva , Costa Felipe Dos Santos , Aranha Joélinton Dos Santos , Teixeira Enéas Rangel 
Published: October 2017

El estudio tiene por objeto los aspectos psicosociales y agotamiento. Este estudio tuvo como objetivo describir los factores psicosociales de los trabajadores de enfermería de cuidados intensivos, según las variables socio-demográficas y laborales del mercado. Estudio transversal con 134 profesionales, con aplicación de cuestionario autoadministrado que contenía: un resumen de la Escala de Estrés Trabajo - para medir el estrés; Maslach Burnout Inventory - para evaluar el desgaste; y Self Reporting Questionnaire - para evaluar los trastornos mentales comunes. En cuanto a las dimensiones de estrés: 30,8% eran trabajadores de alta exigencia; 24,6% en el trabajo activo; 20,8% trabajos pasivos y el 23,8% en baja exigencia. La prevalencia de burnout fue de 55.3% estando 72.5% en alta exigencia (p = 0,006). La prevalencia de los trastornos mentales comunes fue de 27,7%. La organización del trabajo en unidades de cuidados intensivos favorece al estrés de alta exigencia y, como consecuencia muestra prevalencia significativa de los trastornos mentales comunes y burnout. La salud mental se muestra como un elemento clave en el entorno de trabajo en el hospital y necesita de mayor atención por parte de los equipos y autoridades.
Fatores que dificultam a alimentação por via oral do idoso hospitalizado
Authors: Lima Deise Feijó , Pelzer Marlene Teda , Lima Barros Edaiane Joana , Cabral Semedo Deisa Salyse dos Reis , Rosales Rita Arim 
Published: October 2017

<p>Identificar los factores que dificultan la alimentación por vía oral en pacientes ancianos hospitalizados. Es esta una investigación cualitativa, con delineamiento transversal, desarrollada con 111 ancianos hospitalizados en una institución hospitalaria ubicada en el sur del Rio Grande do Sul. Para recolección de datos se ha utilizado un instrumento denominado Escala de Evaluación Alimentaria para el Anciano Hospitalizado. Ha sido realizado un análisis factorial y descriptivo. Los datos cuantitativos generados fueron digitalizados y organizados en el software Statistical Package for the Social Sciences, versión 20.0. Fueron identificados cuatro valores relacionados con la dificultad de alimentación por vía oral por los ancianos hospitalizados: factores ambientales, alimentarios, fisiológicos y los relacionados con el equipo de salud. Los factores ambientales se destacaron como aquellos que más dificultan la alimentación por vía oral de los pacientes ancianos hospitalizados, más fielmente los ítems que contemplan el dolor, la depresión y el uso/ acción de las medicinas.</p><p> </p>