bluuebunny/crossref_metadata_2025_split huggingface dataset:
Field-Based High-Throughput Plant Phenotyping Reveals the Temporal Patterns of Quantitative Trait Loci Associated with Stress-Responsive Traits in Cotton
Authors: Pauli Duke , Andrade-Sanchez Pedro , Carmo-Silva A Elizabete , Gazave Elodie , French Andrew N , Heun John , Hunsaker Douglas J , Lipka Alexander E , Setter Tim L , Strand Robert J , Thorp Kelly R , Wang Sam , White Jeffrey W , Gore Michael A 
Published: June 2016

AbstractThe application of high-throughput plant phenotyping (HTPP) to continuously study plant populations under relevant growing conditions creates the possibility to more efficiently dissect the genetic basis of dynamic adaptive traits. Toward this end, we employed a field-based HTPP system that deployed sets of sensors to simultaneously measure canopy temperature, reflectance, and height on a cotton (Gossypium hirsutum L.) recombinant inbred line mapping population. The evaluation trials were conducted under well-watered and water-limited conditions in a replicated field experiment at a hot, arid location in central Arizona, with trait measurements taken at different times on multiple days across 2010–2012. Canopy temperature, normalized difference vegetation index (NDVI), height, and leaf area index (LAI) displayed moderate-to-high broad-sense heritabilities, as well as varied interactions among genotypes with water regime and time of day. Distinct temporal patterns of quantitative trait loci (QTL) expression were mostly observed for canopy temperature and NDVI, and varied across plant developmental stages. In addition, the strength of correlation between HTPP canopy traits and agronomic traits, such as lint yield, displayed a time-dependent relationship. We also found that the genomic position of some QTL controlling HTPP canopy traits were shared with those of QTL identified for agronomic and physiological traits. This work demonstrates the novel use of a field-based HTPP system to study the genetic basis of stress-adaptive traits in cotton, and these results have the potential to facilitate the development of stress-resilient cotton cultivars.
Genome-Wide Analysis of Transposon and Retroviral Insertions Reveals Preferential Integrations in Regions of DNA Flexibility
Authors: Vrljicak Pavle , Tao Shijie , Varshney Gaurav K , Quach Helen Ngoc Bao , Joshi Adita , LaFave Matthew C , Burgess Shawn M , Sampath Karuna 
Published: June 2016

Abstract
DNA transposons and retroviruses are important transgenic tools for genome engineering. An important consideration affecting the choice of transgenic vector is their insertion site preferences. Previous large-scale analyses of Ds transposon integration sites in plants were done on the basis of reporter gene expression or germ-line transmission, making it difficult to discern vertebrate integration preferences. Here, we compare over 1300 Ds transposon integration sites in zebrafish with Tol2 transposon and retroviral integration sites. Genome-wide analysis shows that Ds integration sites in the presence or absence of marker selection are remarkably similar and distributed throughout the genome. No strict motif was found, but a preference for structural features in the target DNA associated with DNA flexibility (Twist, Tilt, Rise, Roll, Shift, and Slide) was observed. Remarkably, this feature is also found in transposon and retroviral integrations in maize and mouse cells. Our findings show that structural features influence the integration of heterologous DNA in genomes, and have implications for targeted genome engineering.
Characterization of Chicken MMP13 Expression and Genetic Effect on Egg Production Traits of Its Promoter Polymorphisms
Authors: Yuan Zhenjie , Chen Yuxia , Chen Qiuyue , Guo Miao , Kang Li , Zhu Guiyu , Jiang Yunliang 
Published: June 2016

Abstract
Extracelluar matrix undergoes constant remodeling, cell–cell, and cell–matrix interactions during chicken ovarian follicle growth, which is coordinated by matrix metalloproteinases (MMPs), and their associated endogenous inhibitors (TIMPs). Transcriptome analysis revealed upregulation of MMP13 in sexually mature chicken ovaries. In this study, we found that the expression of MMP13 in chicken ovary was stably elevated from 60 d to 159 d, and was significantly higher at 159 d than at the other three developmental stages (P &lt; 0.05). The expression of MMP13 mRNA increased from SW (small white follicles) to F5 (fifth largest follicles), then decreased to F1 (first largest follicles), and dramatically increased again in POF1 (newly postovulatory follicles) follicles (P &lt; 0.05). The MMP13 protein was localized in stroma cells and primordial follicles of sexually immature chicken ovaries, in the theca cell layers of all sized follicles of sexually mature chicken ovaries. Furthermore, we identified a positive element (positions –1863 to –1036) controlling chicken MMP13 transcription, and, in this region, six single nucleotide polymorphisms were found and genotyped in chicken populations. In the White Recessive Rock population, hens with A–1356-C–1079/A–1356-C–1079 genotype had earlier “age at first laying” than those with G–1356-T–1079/G–1356-T–1079 genotype (P &lt; 0.05), and exhibited significantly lower transcriptional activity (P &lt; 0.01). Collectively, chicken MMP13 plays an important role in ovarian follicle growth and regression, and polymorphisms in its promoter region could be used as molecular markers for improving the trait “age at first laying” in chicken breeding.
mRNA-Associated Processes and Their Influence on Exon-Intron Structure in Drosophila melanogaster
Authors: Lepennetier Gildas , Catania Francesco 
Published: June 2016

Abstract
mRNA-associated processes and gene structure in eukaryotes are typically treated as separate research subjects. Here, we bridge this separation and leverage the extensive multidisciplinary work on Drosophila melanogaster to examine the roles that capping, splicing, cleavage/polyadenylation, and telescripting (i.e., the protection of nascent transcripts from premature cleavage/polyadenylation by the splicing factor U1) might play in shaping exon-intron architecture in protein-coding genes. Our findings suggest that the distance between subsequent internal 5′ splice sites (5′ss) in Drosophila genes is constrained such that telescripting effects are maximized, in theory, and thus nascent transcripts are less vulnerable to premature termination. Exceptionally weak 5′ss and constraints on intron-exon size at the gene 5′ end also indicate that capping might enhance the recruitment of U1 and, in turn, promote telescripting at this location. Finally, a positive correlation between last exon length and last 5′ss strength suggests that optimal donor splice sites in the proximity of the pre-mRNA tail may inhibit the processing of downstream polyadenylation signals more than weak donor splice sites do. These findings corroborate and build upon previous experimental and computational studies on Drosophila genes. They support the possibility, hitherto scantly explored, that mRNA-associated processes impose significant constraints on the evolution of eukaryotic gene structure.
Reduction of Insulin Related Preventable Severe Hypoglycemic Events in Hospitalized Children
Authors: Poppy Amy , Retamal-Munoz Claudia , Cree-Green Melanie , Wood Colleen , Davis Shanlee , Clements Scott A. , Majidi Shideh , Steck Andrea K. , Alonso G. Todd , Chambers Christina , Rewers Arleta 
Published: June 2016

OBJECTIVE:
Insulin is a commonly used, high-risk medication in the inpatient setting. Incorrect insulin administration can lead to preventable hypoglycemic events, which are a significant morbidity in inpatient diabetes care. The goal of this intervention was to decrease preventable insulin-related hypoglycemic events in an inpatient setting in a tertiary care pediatric hospital.

METHODS:
Methods included the institution of several interventions such as nursing and physician education, electronic medical record order sets, electronic communication note templates, and the development of new care guidelines.

RESULTS:
After the institution of multiple interventions, the rate of preventable hypoglycemic events decreased from 1.4 preventable events per 100 insulin days to 0.4 preventable events per 100 insulin days.

CONCLUSIONS:
Through the use of a multi-interventional approach with oversight of a multidisciplinary insulin safety committee, a sustained decreased rate of severe preventable hypoglycemic events in hospitalized pediatric patients receiving insulin was achieved.
Maternal Risk Factors and Perinatal Characteristics for Hirschsprung Disease
Authors: Löf Granström Anna , Svenningsson Anna , Hagel Eva , Oddsberg Jenny , Nordenskjöld Agneta , Wester Tomas 
Published: June 2016

BACKGROUND AND OBJECTIVES:
Hirschsprung disease (HSCR) is a congenital defect of the enteric nervous system characterized by a lack of ganglion cells in the distal hindgut. The aim of this study was to assess the birth prevalence, perinatal characteristics, and maternal risk factors in HSCR patients in Sweden.

METHODS:
This was a nationwide, population-based, case-control study of all children born in Sweden between 1982 and 2012 and registered in the Swedish Medical Birth Register. Cases were identified in the Swedish National Patient Register and data on potential maternal risk factors and patient characteristics were collected from the Swedish National Patient Register and the Swedish Medical Birth Register. Five age- and sex-matched controls were randomly selected for each case. The association between studied risk factors and HSCR was analyzed using conditional logistic regression to calculate the odds ratio (OR) and 95% confidence interval (CI).

RESULTS:
The study population comprised 600 HSCR cases and 3000 controls with a male-to-female ratio of 3.7:1. The birth prevalence of HSCR was 1.91/10 000. Maternal obesity was associated with an increased risk for the child to have HSCR (OR 1.74; CI 1.25–2.44). Children with HSCR were born at an earlier gestational age (OR 1.60; CI 1.18–2.17) than control children. Associated malformations were identified in 34.5% of the cases.

CONCLUSIONS:
This study showed that the Swedish birth prevalence of HSCR was 1.91/10 000. Children with HSCR disease were born at a lower gestational age than controls. Maternal obesity may increase the risk for the child to have HSCR.
Protocolo de extracciones en ortodoncia
Authors: Villada Castro Mauricio , Pedroza Garcés Andrea 
Published: June 2016

En muchas ocasiones, la extracción dental como resultado de una necesidad de espacio para el tratamiento ortodóncico, crea alteraciones en la cresta alveolar que pueden resultar en problemas funcionales y estéticos para la correcta finalización del tratamiento, por la insuficiente cantidad de tejido óseo. Este problema le exige al especialista hacer un razonamiento ordenado de cada situación clínica individual y considerar una serie de factores propios del paciente, del tratamiento y del profesional al que remiten, que le indiquen el momento apropiado para realizar las exodoncias de su paciente. El propósito de este artículo es hacer una descripción de los cambios del alvéolo dentario posextracción, y sugerir un protocolo que sea apropiado para definir el momento y la mejor manera en que se deban realizar las extracciones dentales de un paciente ortodóncico.
Frecuencia de asistencia a la consulta odontológica en estudiantes de secundaria de Pereira y los factores emocionales asociados
Authors: Benitez Salazar Mariana , Montoya Cañon Santiago 
Published: June 2016

Introducción: este estudio pretende identificar la frecuencia de asistenciaa la consulta odontológica y los factores emocionales asociados, en los estudiantesde grado noveno del colegio Hans Drews Arango en el municipio de Pereira en el2014. Materiales y métodos: estudio con aplicación de dos tipos de encuestas a 20estudiantes. Se hizo un estudio descriptivo de enfoque mixto. El componente cuantitativotoma elementos de un estudio de corte transversal y en la parte cualitativase recolectaron datos a través de la aplicación de talleres pedagógicos con la utilizaciónde diarios de campo. El análisis de datos cuantitativos se hizo en tabulacióny análisis de las variables en el programa Excel 2010 para Windows. El análisis cualitativose basó en la información de los diarios de campo, y se realizó un procesode identificación de unidades de sentido, codificación y categorización. Resultados:el 30% de los encuestados reportó no asistir a la consulta odontológica; entre el20% y 25% de los jóvenes que no asisten a la consulta presenta como factores relacionados el económico y la distancia del consultorio odontológico. Asimismo, seobservó que el miedo fue el sentimiento de mayor impacto para los estudiantes,reflejado con mayor énfasis hacia las agujas, y lo manifiestan por medio de expresionesvisuales y orales; también expresaron sentimientos asociados como temor,ansiedad y tensión muscular. Discusión: estos resultados permitieron conocer queel miedo y la ansiedad pudieron ser factores emocionales que incidieron en la inasistenciaa la consulta odontológica.
Tecnologías de la Información y la Comunicación (TIC) en Educación Física. Una revisión teórica
Authors: Rodríguez Quijada Mateo 
Published: June 2016

En esta revisión bibliográfica se hace un recorrido por el tratamiento que tienen las Tecnologías de la Información y de la Comunicación (TIC) en el ámbito de la educación física por parte del profesado y del alumnado. Para ello se analizan las líneas de investigación existentes sobre el tema así como los trabajos más notables de reciente publicación de diferentes autores, con especial atención a la situación en la comunidad autónoma de Galicia. Por último se tratan los principales problemas relacionados con el empleo de estas tecnologías en las sesiones de educación física. Todo ello con el fin de arrojar luz sobre un tema de gran actualidad en lo referente a la educación de nuestros jóvenes. Los estudios demuestran que las TIC cada vez están más presentes en el asignatura de educación física, pero todavía queda mucho trabajo por hacer para lograr un uso realmente efectivo de ellas en el ámbito educativo.
Variables motivacionales influyentes en una unidad didáctica de rugby: claves para la mejora de la intervención docente
Authors: Abós Catalán Ángel , Sevíl Serrano Javier , Sanz Remacha María , García-González Luis 
Published: June 2016

La inactividad física es uno de los problemas que atañe a la sociedad debido a la falta de motivación del alumnado en algunos contenidos curriculares. El objetivo del estudio fue estudiar la relación entre el clima motivacional transmitido por el profesor de Educación Física en una unidad didáctica de rugby y las necesidades psicológicas básicas, la motivación autodeterminada, así como las consecuencias afectivas experimentadas por el alumnado. Un total de 77 alumnos (M edad = 15.35; DT = 0.53) de un centro de enseñanza, pertenecientes a 4º de ESO, cumplimentaron los siguientes cuestionarios: la Escala de Percepción del Clima Motivacional (EPCM), la Escala de Medición de las Necesidades Psicológicas Básicas (BPNES), la Escala de Motivación Situacional (SIMS-14) y la Escala de Diversión/Aburrimiento en Educación Física (SSI-EF). Los resultados mostraron que el clima tarea predecía positiva y significativamente las tres necesidades psicológicas básicas y las formas de motivación más autodeterminadas, mientras que el clima ego predecía la desmotivación. Las tres necesidades psicológicas básicas predecían positivamente la motivación intrínseca, mientras que la desmotivación fue predicha negativamente por la percepción de competencia y las relaciones sociales. Se encontró una predicción positiva entre la motivación intrínseca y la diversión, y de forma negativa respecto al aburrimiento, el cual también fue predicho por la desmotivación. Los resultados apoyan la idea de que el profesorado de Educación Física debería generar un clima motivacional tarea, favoreciendo la satisfacción de los mediadores psicológicos y desarrollando una motivación más autodeterminada que podría desencadenar consecuencias afectivas como la diversión.
Conocimientos previos y adquiridos tras una jornada de formación sobre primeros auxilios en futuros docentes de Educación Física
Authors: Navarro Patón Rubén , García Marín Pablo , Rodríguez Fernández José Eugenio 
Published: June 2016

Con esta investigación se pretendió indagar acerca de los conocimientos sobre primeros auxilios, y en especial de RCP, que poseía el alumnado del grado de maestro en Educación Primaria de la Facultad de Formación de Profesorado de Lugo, antes y después de recibir una jornada de formación teórico-práctica de 3 horas en tres fases (1- expositiva-demostrativa, 2- interactiva con resolución de problemas en pequeños grupos y 3- interactiva con resolución de problemas en gran grupo). La muestra (N=23) estuvo compuesta por 9 hombres (39,1%) y 14 mujeres (60,9%) matriculados en la mención de Educación Física. Para saber los conocimientos previos (CI) y adquiridos (CF) tras la jornada de formación, se administró un cuestionario Ad Hoc con 25 ítems. Los resultados descriptivos del CI revelaron una falta de conocimiento de los futuros docentes de Educación Física en relación a los primeros auxilios. Los datos arrojados por el CF, alcanzando una media del 90 % de preguntas correctamente contestadas, avalan la eficacia de la metodología y duración de la formación propuesta a corto plazo. La retención de los conocimientos se presenta como limitación del estudio y será evaluada más adelante. En conclusión, se destaca la importancia de que los futuros docentes de Educación Física se formen adecuadamente en la materia de primeros auxilios y se propone que forme parte de los contenidos del grado en Educación Primaria.
Análisis bibliométrico de la producción científica sobre el uso del acelerómetro en la medición del nivel de actividad física (2010-2014)
Authors: Santos Labrador Ricardo Manuel 
Published: June 2016

En este trabajo, se presentan los datos obtenidos a través del análisis bibliométrico, de los artículos encontrados sobre la utilización del acelerómetro para la medición de la actividad física, tanto a nivel nacional como internacional, entre los años 2010 y 2014. El objetivo principal, es conocer cuál ha sido la producción científica sobre la utilización del acelerómetro, como instrumento de cuantificación de la actividad física. Los datos han sido extraídos de la base de datos: Scopus y, el número de artículos encontrados en la misma es de 2207. Las palabras clave utilizadas en la búsqueda fueron: accelerometer y physical activity. Se ha analizado la producción científica por años, revistas, autores, instituciones, países y áreas, identificando aquellos más productivos. Los resultados a nivel nacional e internacional, indican como aspectos más relevantes: la utilización del acelerómetro en gran cantidad de áreas científicas diferentes, así como que algunos organismos, autores, revistas y países, se están afianzando como referentes. Por otro lado, es importante destacar la diferencia en la productividad científica por años a nivel nacional e internacional, ya que, en la segunda se observa un crecimiento regular que no aparece en la primera.
Análisis praxiológico de la lógica interna del juego en profesores de educación física en formación
Authors: Illanes Aguilar Lucía Ernestina , Vergara Tapia María Angélica 
Published: June 2016

El estudio tiene como foco conocer el uso de los juegos en la clase de Educación Física, que realizan profesores en formación, determinando el tipo de juego, de acuerdo a la lógica interna que éstos presentan y a los objetivos que se plantean, analizando su efecto, desde la perspectiva de la Praxiología motriz. Se pretende responder la interrogante: ¿Cuál es la lógica interna que presentan los juegos implementados por profesores en formación en su práctica profesional, durante la clase de educación física y qué objetivos orientan su utilización?. El estudio es descriptivo, transversal y de diseño no experimental. La muestra no probabilística, por conveniencia está formada por 37 profesores en formación que realizan su práctica profesional en cursos de Kinder a 8º año de establecimientos educacionales de diferente dependencia. Se aplica una pauta de observación por los profesores supervisores de práctica. Los resultados evidencian que los juegos que implementan los sujetos de la muestra son de tipo sociomotrices, donde se utiliza comunicación mixta, es decir comunicación motriz y contra comunicación mientras que el rol de los participantes es estable. El propósito de los juegos es de activación con variantes, se utilizan pequeños implementos y la duración es generalmente 6 a 10 minutos. Los profesores en formación establecen las reglas de los juegos, donde participan todos los alumnos del curso.
Empathy as a Tool for Embodiment Processes in Vocal Performance
Authors: Heisel Erin 
Published: June 2016

One way of understanding empathy in music performance is as a process by which singers closely identify with the characters they encounter and portray in opera or art song. As singers embody these characters, they literally give them voice. Musical performance thus humanizes characters as well as performers and audiences as deeper, empathetic engagement may also reflect or elicit new pathways of growth, knowledge, and understanding. What is the process a singer goes through in empathizing with a character? How can young singers learn to empathize with the characters they are tasked with portraying, even when they may find the characters or their behavior to fall outside of their own moral convictions? This paper posits that empathy is a necessary part of the role preparation process for singers and introduces the “role journal” as a way for young singers to track embodiment processes and develop healthy habits of empathy and boundaries in their work.
Simplificações e Adaptações para Redução do Custo Computacional do Pré-processamento de Voz na Plataforma Arduino
Authors: Ribeiro Albuquerque Pedro Ítalo , Cunha Emerson Barbosa da , Silva Daniella Dias Cavalcante da , Vasconcelos César Rocha 
Published: June 2016

<div class="page" title="Page 1"><div class="layoutArea"><div class="column"><p><span>Atualmente, existe um crescente interesse por aplicações em que a interação homem-máquina seja realizada via a voz humana. No entanto, alguns equipamentos, como telefones celulares e eletrodomésticos, possuem limitações de armazenamento e processamento, dificultando a implementação deste tipo de sistema. Neste trabalho, foram implementadas simplificações matemáticas e estratégias de programação em duas etapas típicas de um sistema de reconhecimento da fala, a pré-ênfase e o janelamento. Oobjetivo desta implementação foi analisar o impacto das mesmas no desempenho e, consequentemente, no custo computacional as referidas etapas. Diante das adaptações efetuadas, o tempo de execução foi reduzido para 1/5 do tempo original da pré-ênfase e para 1/10 no caso do janelamento. </span></p></div></div></div>
Desarrollo y planificación en América Latina. Teorías e instrumentos
Authors: Olano Alor Aldo 
Published: June 2016

Este artículo revisa los componentes teóricos de la estrategia de desarrollo por sustitución de importaciones promovida por la Cepal, con base en documentos de la Comisión y de sus altos funcionarios. La implantación del modelo desarrollista, que no tuvo en cuenta la evolución histórica ni las particularidades de América Latina, fue un compromiso con las entidades que lo promovían a escala global.