bluuebunny/crossref_metadata_2025_split huggingface dataset:
Drug design targeting the AMPK signalling pathway with herbal medicines for atherosclerosis therapy
Authors: Zuo Hanheng , Li Yinping , Hao Peng , Liu Jing-Hua 
Published: November 2017

Abstract

Background:
Atherosclerosis (AS) is a vascular disease which causes cardiovascular diseases such as stroke, heart attack and acute coronary syndrome. It is a major cause of death worldwide, especially in developed countries. In AS, the artery walls become thickened due to the accumulation and invasion of white blood cells (foam cells) and form a fibro-fatty plaque. Hence, these investigations aim to identify the potential applications of herbal compounds targeting the AMPK signalling pathway for AS therapy.

Methods:
In this investigation, in vitro kinase activity was determined for a set of herbal compounds present in herbal plants and herbal medicines against 5′ AMP-activated protein kinase (AMPK). This enzyme plays a vital role in AS, having an effect on the invasion and accumulation of white blood cells, leading to the thickening of artery walls and vascular remodelling. In addition, a molecular docking simulation study was carried out for the AMPK enzyme (PDB ID: 3AQV) against the herbal compounds.

Results:
The in vitro kinase activity showed that 10 of the herbal compounds possessed IC50 values lower than 10 μM, which showed the potent inhibitory effect of the AMPK enzyme. In addition, a molecular docking simulation carried out on the AMPK enzyme (PDB ID: 3AQV) against the herbal compounds observed a positive correlation with IC50 values and docking scores of the docked compounds with an IC50 <10 μM. The subsequent protein-ligand interaction analyses for the best docking hits showed favourable interactions. Also, the molecular dynamics simulation enabled the generation of a trajectory file for the RMSD backbone, illustrating the stability of the docked protein-ligand complex without any structural fluctuations.

Conclusions:
The study concludes that baicalin, curcumin, campesterol, emodin and gingerol provide a promising lead for AS and can therefore be prescribed for the treatment of AS.
Evaluierung und Einführung des STA R Max® Hämostaseologie – Analysators im Zentrallabor eines Großkrankenhauses
Authors: Hofmann Babette , Schröder Cathleen , Geisler Niels , Stamminger Gudrun 
Published: November 2017

Zusammenfassung:
Im Rahmen des Anbieterwechsels erfolgte im Zentrum für Diagnostik am Klinikum Chemnitz eine umfassende Validation des STA R Max® der Firma Stago. Neben der Ermittlung von Intra- und Interassay – Präzisionen wurden umfassende Vergleichsmessungen mit der bisherigen Routinemethode (BCS XP von Siemens) mit gepoolten Patientenplasmen durchgeführt. In dieser Publikation werden die Ergebnisse für Parameter der Basis – und Notfallversorgung vorgestellt. Die Ergebnisse waren gut bis sehr gut und ließen eine zügige Umstellung zu. Darüber hinaus wurden Anwenderfreundlichkeit von System und Reagenzien, die durchschnittliche Bearbeitungszeit sowie die allgemeine Störanfälligkeit des neuen Systems getestet. Nach verschiedenen Anpassungen im diagnostischen Prozess erfolgte die Überführung der neuen Geräte in die Routine.
Quantity quotient reporting versus z-value for standardizing quantitative laboratory results
Authors: Haeckel Rainer , Wosniok Werner , Gurr Eberhard , Postma Theo , Streichert Thomas 
Published: November 2017

Abstract:
The rapid increase to digitalize whatever is possible in human lives will lead to electronic storage of medical data probably during the whole life of most individuals. This requires standardization and condensation of an enormous amount of data. Most laboratory data are already reported in digitalized form, but they are far from being sufficiently standardized. Several attempts for standardization have been suggested. The most common standardizing approach is the z-transformation of laboratory data. It is proposed to modify the z-value to a quantity quotient in analogy to the intelligence quotient well known even to laymen.
Steroid analysis in clinical routine diagnostics – discussing crucial questions
Authors: Gaudl Alexander , Bae Yoon Ju , Kratzsch Jürgen 
Published: November 2017

Abstract:
Quantitative steroid analysis via liquid chromatography-tandem mass spectrometry (LC-MS/MS) is applicable to clinical routine diagnostics by now, substituting immunoassays due to its superior selectivity and comparable sensitivity. Multiplexed assays covering a multitude of analytes represent the gold standard in this regard. There are commercially available kits which are easily adapted to individual LC-MS/MS systems required. Prior to and even after their appearance, in-house method development represented the flexible alternative in terms of solving specific analytical problems or focusing on a narrower steroid profile while maximizing sensitivity and high throughput applicability. In this work, commercial assays and in-house methods are discussed in relation to a benchmark LC-MS/MS method. Thereby, prerequisites and results are compared. Furthermore, the effect of concomitant medication on steroid assays was tested and requirements regarding quality assurance in routine steroid analysis are discussed. Most of the different commercially available or in-house LC-MS/MS methods for steroid analysis show a good or reasonable agreement of results. However, the harmonization in the methodology of mass spectrometric assays has to be improved to further reduce their variability. Such a procedure would facilitate the performance of diagnostic tests that involve the measurement of steroid hormones by the tremendous improvement of diagnostic sensitivity and specificity.
Effects of coagulation factor XIII (Val34Leu) polymorphism on recurrent pregnancy loss in Iranian Azeri women
Authors: Isazadeh Alireza , Haj Azimian Saba , Tariverdi Nazila , Rahmani Seyed Ali , Esmaeili Maryam , Karimkhanilouei Samaneh , Mohammadoo-Khorasani Milad 
Published: November 2017

Abstract

Background:
Recurrent pregnancy loss (RPL) is a heterogeneous condition consisting of two or more consecutive abortions occurring before 20 weeks of gestation. One of the clotting factor genes encodes factor XIII (FXIII), which is involved in fibrin formation. The most common polymorphism in the FXIII genes is the conversion of G to T in exon 2 (val34leu) of the FXIIIA gene, which leads to the substitution of valine with leucine. The objective of this study was to investigate the association between RPL and FXIII val34leu polymorphisms in a sample population of Iranian Azeri women.

Methods:
A prospective case-control study was performed on a cohort of 310 RPL patients and 290 healthy controls. DNA was extracted from the whole blood and fragments of the Val34Leu polymorphism were amplified by polymerase chain reaction (PCR), followed by DNA sequencing. Genotyping was performed using the Sequenom MassArray system.

Results:
The genotype frequencies of FXIII in the case group were 60.64% GG, 34.83% GT, and 4.41% TT, whereas the frequencies in the control group were 58.96% GG, 36.5% GT, and 4.48% TT. T allele frequencies in the case and control groups were 78.06% and 21.93%, respectively, and G allele frequencies were 77.24% and 22.75%, respectively.

Conclusions:
No significant association was observed between the Val34Leu polymorphism and RPL among Iranian Azeri women.
The use of LC tandem mass spectrometry as part of a workflow for the screening and identification of hemoglobin variants. Characterization of Hb Ullevaal as an example
Authors: Weber Matthias , Eekels Julia J.M. 
Published: November 2017

Abstract

Background:
About 2/3 of the hemoglobin (Hb) variants do not show a charge difference to the wildtype entity but most of them differ in hydrophobicity. In addition to cation exchange chromatography, globin differentiation by liquid chromatography-tandem mass spectrometry (MS) was introduced. Hb Ullevaal was chosen as one example to demonstrate the performance of the approach.

Methods:
Screening for Hb variants was performed using cation exchange HPLC. For globin separation reversed phase-LC/MS was performed. Tryptic digests of variants were separated on RP-HPLC with or without CID-fragmentation and database search for identification of mutation bearing fragments. Sequencing of the β-globin gene has been performed.

Results:
HbS, HbC, HbE, Hb South Florida and Hb Ullevaal show typical and distinct patterns in the globin LC/MS according to the theoretical protein data. The tryptic digest of Hb Ullevaal resulted in the identification of the respective mutated peptide βT9, which was confirmed by genetic sequencing.

Conclusions:
By the application of globin-LC/MS two more dimensions for the Hb identification are added, hydropathicity and protein mass. With this workflow as screening procedure for Hb variants it is expected to be able to detect and identify the majority of variants with the exception of highly unstable variants, which cannot be determined in the peripheral blood at all. A negative result makes the presence of a significant Hb variant in the peripheral blood improbable.
ICAP – ein Versuch zur einheitlichen Beschreibung der Fluoreszenzmuster von antizellulären Antikörpern auf HEp-2-Zellen
Authors: Herold Manfred , Klotz Werner , Sack Ulrich , Conrad Karsten 
Published: November 2017

Zusammenfassung
Primäres Ziel von ICAP (internationaler Konsens für antinukleäre Antikörpermuster) ist es, einen Konsens zu finden zur Beschreibung der Fluoreszenzmuster, die mit indirekter Immunfluoreszenztechnik auf HEp-2-Zellen erkannt werden können. 28 Muster (14 Kern-, 9 zytoplasmatische und 5 mitotische Muster) wurden bisher definiert. Neben der Musterbeschreibung wurden alle Muster auch mit AC-Nummern gekennzeichnet, um eine von der Sprache unabhängige Vergleichbarkeit zu gewährleisten. Alle ICAP-Ergebnisse können von der ICAP-Internetseite (www.anapatterns.org) abgerufen werden. ICAP ist ein fortlaufender Prozess. Das nächste und 4. ICAP-Treffen wird im September 2017 im Rahmen des 13. Autoantikörpersymposiums in Dresden stattfinden (www.gfid-ev.de). Anstehende ICAP-Aufgaben sind die Ergänzung der Fluoreszenzmuster, die Erweiterung der Bildersammlung und die genauere Beschreibung der klinischen Bedeutung einzelner Muster.
Erhebliche Diskrepanzen zwischen qualitativen Troponin-Schnelltesten („Karten-Testen“) und klassischer Laboranalytik: ist der Einsatz solcher Schnellteste vertretbar?
Authors: Frohn Christoph 
Published: November 2017

Zusammenfassung
Die Bestimmung der kardialen Troponine ist von erheblicher diagnostischer Bedeutung zur Abklärung vermuteter kardialer Ischämien. In einem Kliniklabor war aufgrund äußerer Umstände (Geräteausfall) aufgefallen, daß die als Backup eingesetzten lateral flow-Schnellteste (qualitative „Kartenteste“ ohne Geräteplattform) auch an hoch positiven Proben (weit über den angegebenen Nachweisgrenzen) in einigen Fällen kein positives Ergebnis erbrachten. Diese zunächst zufällige Beobachtung wurde an einer größeren Serie positiver Proben (n=23>0,5 ng/mL Troponin I; n=17>1,0 ng/mL) systematisch unter Verwendung verschiedener lateral-flow-Teste in Vergleich zu zwei verschiedenen Zentrallabor-Troponin-I-Testen überprüft. Im Ergebnis zeigte keiner dieser Schnellteste die positiven Proben zuverlässig an. Damit sind alle untersuchten qualitativen Troponin-Schnellteste als Basis klinischer Entscheidungen ungeeignet.
Analyses of exhaled breath condensate cytokines for identification of lung cancer
Authors: Gessner Christian , Ruschpler Peter , Fricke Stephan , Gillissen Adrian , Hoheisel Gerhard , Lehmann Joerg , Sack Ulrich 
Published: November 2017

Abstract
Early non-invasive detection of lung cancer is a precondition for enabling better prognosis supported by new innovative therapy regimes. The aim of our study was to evaluate angiogenic and inflammatory proteins in exhaled breath condensate (EBC) as markers for lung cancer. Our report presents a diagnostic study of vascular endothelial growth factor (VEGF), basic fibroblast growth factor (bFGF) and tumor necrosis factor-α (TNF-α) in EBC of 300 individuals, 84 patients with lung cancer, 111 patients with stable chronic obstructive pulmonary disease (COPD), and in 105 healthy controls. Detection of VEGF and bFGF in EBC was applicable to discriminate cancer patients from COPD patients as well as from healthy volunteers. Especially VEGF seems to be suitable to discriminate between non-small cell lung cancer (NSCLC) patients and control groups with highest VEGF values in EBC of patients with progressive NSCLC. The concentration of angiogenic factors correlated with disease progression as well as higher tumor stage. This study supports cytokine analysis in EBC as a suitable noninvasive diagnostic screening method for lung cancer detection and monitoring.
Bisalbuminämie: Normvariante oder pathologischer Befund?
Authors: Steiner Michael , Lüdemann Jan 
Published: November 2017

Zusammenfassung
Ausgehend von der kasuistischen Beobachtung einer zweigipfligen Albuminbande in der Serumproteinelektrophorese wird die Bisalbuminämie als angeborene oder erworbene Proteinanomalie nach Durchsicht der Literatur in einer Kurzübersicht dargestellt. Nach einer Einführung zur Bisalbuminämie werden deren Nachweismethoden, funktionelle und klinische Bedeutung sowie Befundinterpretation behandelt. Bei der Bisalbuminämie handelt es sich um eine seltene neutrale Normvariante ohne Symptom- bzw. Krankheitswert, die keiner weiteren Abklärung bedarf.
Molekulare und Zelluläre Möglichkeiten in der Allergiediagnostik
Authors: Hoffmann Hans Jürgen , Darsow Ulf , Hofmaier Stephanie , Kleine-Tebbe Jörg , Matricardi Paolo M. , Wedi Bettina , Eberlein Bernadette 
Published: November 2017

Zusammenfassung
Eine Allergiediagnostik beruht auf einer gründlichen Anamnese, Sensibilisierungstests und Provokationstests zur objektiven Bestätigung des verursachenden Allergenes unter kontrollierten Bedingungen. In dieser Übersicht werden die verfügbaren molekularen und zellulären Tests zur Allergensuche beschrieben. Seit der Identifikation, Klonierung und Expression des Hauptallergens der Birkenpollen, Bet v 1, haben sich die molekularen Einsatzmöglichkeiten in der Allergiediagnostik enorm gesteigert. In einer frei verfügbaren Monographie der European Academy of Allergy and Clinical Immunology (EAACI), dem „Molecular Allergy Users Guide 2016“, werden die Möglichkeiten einer modernen molekularen serologischen Diagnostik detailliert beschrieben. Auch die zelluläre Diagnostik hat sich in den letzten Jahren rasch weiterentwickelt mit der Möglichkeit molekulare Allergene einzusetzen und dem Ziel eine wiederholte Exposition des Patienten mit dem Allergen zu vermeiden. Exakte Messungen sind von externer Qualitätssicherung abhängig, die für die Serumdiagnostik bereits vorhanden ist und in der zellulären Diagnostik derzeit entwickelt wird. Mit der europäischen Standardisierung der diagnostischen Tests im Labor erweitert sich die Palette der Möglichkeiten zur persönlichen Allergiediagnostik.
The values of mean platelet volume and the mean platelet volume/platelet ratio for predicting deep venous thrombosis in Behçet’s disease
Authors: Erden Fatma , Karagoz Hatice , Avci Atil , Avci Deniz , Cetinkaya Ali , Erden Abdulsamet 
Published: November 2017

Abstract

Background:
Behçet’s disease (BD) is a systemic vasculitis of all types of vessels of both the venous and arterial sites. Mean platelet volume (MPV) is the most commonly used measure of platelet (Plt) size and is also a potential marker of Plt activity. In this study, we wanted to evaluate the MPV value and the MPV/Plt ratio in patients with deep venous thrombosis (DVT) in BD.

Methods:
Overall, 228 patients – 49 BD patients with a thrombotic complication and 179 BD patients without a thrombotic complication (as the control group) – were included the study.

Results:
Of the 49 patients with thrombosis, there was a very significant difference between the genders: 41 (83.6%) were males while only eight (16.4%) were females (p<0.0001). There was a statistically significant difference among the patients with and without thrombosis according to the median MPV value and the MPV/Plt ratio (p<0.0001).

Conclusions:
Increased MPV can predict the risk of DVT development as well as the male sex among BD patients. The MPV/Plt ratio may also be used for predicting DVT.
Kongressbericht: 3. Münchner POCT-Symposium, 13. – 15. März 2017, Klinikum rechts der Isar der TU München
Authors: Bietenbeck Andreas , Schmalenberg Michael , Luppa Peter B. 
Published: November 2017

Zusammenfassung
Die Arbeitsgruppe POCT der Deutschen Gesellschaft für Klinische Chemie und Laboratoriumsmedizin (DGKL) hat vom 13. bis 15. März 2017 das dritte Münchner Symposium zum Thema „Weiterentwicklung der patientennahen Sofortdiagnostik in unterschiedlichen klinischen Anwendungsbereichen“ organisiert. Unter der Kongressleitung von Prof. Dr. Peter B. Luppa, TU München wurden die Themenschwerpunkte von 43 Vortragenden behandelt. Dabei wurden insgesamt 9 Sitzungen von den Mitgliedern der Arbeitsgruppe POCT geleitet. Die Kongresssprachen waren Deutsch und Englisch. Eine angeschlossene Industrieausstellung mit 29 IVD-Unternehmen zeigte die neuesten POCT-Analysengeräte. Erstmals fand zudem eine ePosterausstellung mit 24 Postern in zwei eigenen Sessions statt. Dabei lagen die Poster elektronisch vor, der vorstellende Autor konnte es an einem speziellen Monitor allen Teilnehmern wie eine Bilderpräsentation vorführen. Neu war auch die Vergabe von 4 Vortrags- und 2 Posterpreisen.
Application guide: training of professional users of devices for near-patient testing
Authors: Barabas Nicola , Bietenbeck Andreas 
Published: November 2017

Abstract
Insufficient operator training has been identified as an underlying root cause for many errors of point-of-care testing. However, while the need for operator training is beyond doubt, the practical solutions on how to train operators remain challenging. Therefore a multidisciplinary team of experts created the application guide VDE-AR-E 2411-2-101 “Schulung professioneller Anwender von patientennahen Tests” (Training of professional users of devices for near-patient testing). This work is based on the talk of Nicola Barabas during the POCT-Symposium in Munich 2017 and presents selected aspects of the application guide such as the role of the manufacturer, the learning path, the selection of training topics, the train-the-trainer concept and e-learning.
HbA1c-POC-Systeme zur Therapiekontrolle und Diagnostik des Diabetes: Ausreichende Qualität und Qualitätskontrolle?
Authors: Freckmann Guido 
Published: November 2017

Zusammenfassung
Der HbA1c-Wert ist ein in der Diabetologie etablierter Langzeitmarker zur Stoffwechselkontrolle, der mit der mittleren Glukosekonzentration der letzten ~2–3 Monate korreliert. Der HbA1c dient zur Kontrolle der Therapieziele ist somit ein wichtiger Bestandteil jeder Patientenvisite. Mit Point-of-Care-Messsystemen (POC) erfolgt die HbA1c-Bestimmung direkt in der Praxis und das Ergebnis steht innerhalb kurzer Zeit zur Verfügung. Ein POC- HbA1c-Messsystem in der Arztpraxis unterliegt nach Rili-BÄK der praxisinternen Qualitätskontrolle mit vom Hersteller geliefertem Kontrollmaterial, allerdings ist eine Teilnahme an Ringversuchen nicht verpflichtend. Wenn man dennoch an Ringversuchen teilnimmt beträgt die zulässige Abweichung ±18% vom Zielwert, was in Kombination mit dem teilweise noch verwendeten, nicht für alle Systeme kommutablen Ringversuchsmaterial, keine sichere Beurteilung der Genauigkeit zulässt. Die Messgenauigkeit von HbA1c-POC-Systemen variiert nach der aktuellen Studienlage deutlich. Teilweise zeigte sich zum Beispiel ein deutlicher Bias in beide Richtungen. Um eine zuverlässige Überprüfung der Messqualität von POC- HbA1c-Messsystem zu ermöglichen sollte die Teilnahme am Ringversuch verpflichtend werden. Eine Umstellung auf Vollblut als Kontrollmaterial im Ringversuch und eine deutliche Senkung der zulässigen Abweichung im Ringversuch sollte angestrebt werden. Mit solchen Maßnahmen ließe sich eine aussagekräftige herstellerunabhängige Qualitätskontrolle sicherstellen.
Charakteristika der neuen EU-Verordnung über In-vitro-Diagnostika und Auswirkungen auf POCT und medizinische Laboratorien
Authors: Spitzenberger Folker 
Published: November 2017

Zusammenfassung
Die aktuellen regulatorischen Anforderungen für In-vitro-Diagnostika (IVD) stützen sich in der EU und in Deutschland auf die europäische IVD-Richtlinie aus dem Jahr 1998. Um verschiedene, über die Zeit entstandene Schwächen zu beheben (z. B. im Hinblick auf Produkte, die auf neueren Techniken und Anwendungen beruhen) hat die Europäische Kommission eine neue EU-Verordnung über IVD („IVDR“) im Mai des Jahres 2017 veröffentlicht. Der Anwendungsbereich der Verordnung wird vergrößert und wird zum ersten Mal explizit POCT einschließen und regulieren. Nach der IVDR wird die Klassifizierung der POC-Diagnostika nach 7 Klassifizierungsregeln auf der Grundlage des Anhangs VIII und im Rahmen eines neuen Klassifizierungssystems erfolgen, das 4 Risikoklassen einschließt: A (geringstes Risiko), B, C und D (höchstes Risiko). Grundsätzlich ähnelt die Regulierung von POC-Diagnostika dann den Produkten zur Eigenanwendung („Heimdiagnostika“). Abgesehen von Produkten der Klasse A besteht die Minimalanforderung in einer Überprüfung der technischen Dokumentation des Produkts durch eine benannte Stelle. Folglich werden benannnte Stellen vermehrt in die Konformitätsbewertung u. a. von POC-Produkten eingebunden sein. Mit der neuen IVDR werden auch erstmals auf EU-Ebene gesetzliche Anforderungen an „In-Haus-Verfahren“ formuliert. Dabei handelt es sich um Untersuchungsverfahren, die mit Produkten durchgeführt werden, die in ein und derselben Gesundheitseinrichtung hergestellt und verwendet werden.
POCT: Möglichkeiten und Anwendungsbereiche zur athletennahen Sofortdiagnostik im Hochleistungs- und Spitzensport
Authors: Achtzehn Silvia , Behringer Michael , Krüger Malte , Wahl Patrick , Wahl Yvonne , Broich Holger , Mester Joachim 
Published: November 2017

Zusammenfassung
In der Sportmedizin und -wissenschaft sowie im Hochleistungssport werden Untersuchungen sowohl unter standardisierten Bedingungen im Labor als auch im Feld durchgeführt. Es kommen dabei die unterschiedlichsten medizinischen Messmethoden zum Einsatz. Fast immer werden sie von Blutanalysen begleitet, wobei sowohl hochkomplexe Laborverfahren als auch das Point of care Testing (POCT) angewendet werden. Auch wenn das POCT schon mit Beginn seiner Entwicklung im sportlichen Kontext Beachtung gefunden hat, so ist der Begriff in diesem Bereich noch nicht etabliert und Veröffentlichungen von Untersuchungen mit Leistungs- und Spitzensportlern, bei denen das POCT als Messmethode explizit genannt wird, bisher sehr selten. Der vorliegende Artikel soll aus diesem Grund an Hand unterschiedlicher Studien und in Anlehnung an einen Vortrag auf dem 3. Münchener POCT-Symposium einen Überblick über die verschiedenen Fragestellungen mit sportwissenschaftlichem Hintergrund bieten, bei denen POCT zur athletennahen Sofortdiagnostik eingesetzt wird.
Ultra-fast PCR technologies for point-of-care testing
Authors: Ullerich Lars , Campbell Stephanie , Krieg-Schneider Frank , Bürsgens Federico , Stehr Joachim 
Published: November 2017

Abstract
This contribution presents exemplary approaches on how to improve the most time-limiting part of polymerase chain reactions, the heating and cooling steps. A new technology, Laser PCR®, promises to deliver a solution fast enough for point-of-care applications.
Optical sensing in POCT: the contribution of the Institute of Applied Physics of the Italian CNR
Authors: Giannetti Ambra , Adinolfi Barbara , Berneschi Simone , Berrettoni Chiara , Chiavaioli Francesco , Tombelli Sara , Trono Cosimo , Baldini Francesco 
Published: November 2017

Abstract
The activity developed at the Institute of Applied Physics “Nello Carrara” in strict collaboration with physicians is described with particular attention to the measurement of bile-containing refluxes in the gastroesophageal apparatus, to the detection of gastric carbon dioxide in intensive care patients, to the measurement of sepsis biomarkers in serum samples and to the measurements of immunosuppressants in transplanted patients.