bluuebunny/crossref_metadata_2025_split huggingface dataset:
ArchMap: A web-based platform for reference-based analysis of single-cell datasets
Authors: Bright Chelsea , Lotfollahi Mohammad , Theis Fabian , Skorobogat Ronald , George Xavier , Richter Simon ,   Mohammad Dehkordi1, Lücken Malte , Topalova Aleksandra 
Published: September 2024

Abstract

Leveraging single cell reference atlases to analyse new data has brought about a paradigm shift in single cell data science akin to the first reference genome in genomics. However methods to perform this mapping require computational expertise as well as sometimes considerable compute power, and thus may exclude the researchers from this innovation who may benefit the most from it. ArchMap, a no-code query-to-reference mapping tool, removes this barrier by providing all-in-one automated mapping, cell type annotation, and collaborative features to analyse single-cell datasets from a wide range of integrated, often published, reference atlases and allows extension of atlases with the growing Human Cell Atlas and related efforts. This paves the way for a democratisation of reference mapping capabilities.
Anti-Markovnikov hydroallylation reaction of alkenes via scandium-catalyzed allylic C‒H activation
Authors: Dong Shunxi , Wang Shiyu , Ning Lichao , Mao Tao , Zhou Yuqiao , Pu Maoping , Feng Xiaoming 
Published: September 2024

Abstract

Here, we described a direct anti-Markovnikov hydroallylation reaction of styrene derivatives with 1-aryl-2-alkyl alkenes and α-alkenes by rare-earth metal catalysts. This protocol provided a straightforward and atom-efficient route for the synthesis of valuable chain elongated internal alkenes (65 examples, up to 99% yield, >19:1 E/Z ratio). The reaction proceeded via an allylic Csp3‒H activation pathway initiated by site-selective deprotonation with the assistance of cationic imidazolin-2-iminato scandium alkyl species followed by alkene insertion into the resulting scandium-allyl bond. A catalytic amount of Lewis base additives, such as amine and THF showed significant effects on the reactivity and E/Z selectivity. The reaction mechanism has been elucidated by experimental studies and theoretical calculations.
A Comparative Study on the Length-Weight Relationships of Two Freshwater Fish Families, Nandidae and Channidae, from Kawadighi Haor in North-eastern Bangladesh
Authors: Hridoy MD. Abdullah Al Mamun , Shahriar Fardin , Chowdhury Shahir 
Published: September 2024

Abstract

Length-weight relationships (LWRs) were determined for two fish species from the Kawadighi Haor, Moulvibazar District, Bangladesh. Fish specimens were collected across the Haor region from March to July 2024 using multi-mesh gill nets (approximately 1 cm) and conical and box-shaped traps. Additional specimens were obtained from local fish markets and small-scale fishermen in the Haor region. Statistical analysis was done by linear regression model and confidence interval using rstudio 4.3.2. The relationships between length and weight were found to fit well, with R² values of 0.931 for Nandus nandus and 0.708 for Channa punctatus. The b values of the LWR equations ranged from 2.976 for N. nandus to 3.231 for C. punctatus.
Identifying ordinal categories for the Water Insecurity Experiences Scales
Authors: Frongillo Edward A. , Bethancourt Hilary J. , Miller Joshua D. , Young Sera L. ,   the Household Water Insecurity Experiences Scales (HWISE)-Research Coordination Network (RCN)
Published: September 2024

ABSTRACT

The Household Water Insecurity Experiences (HWISE) and Individual Water Insecurity Experiences (IWISE) Scales are globally suitable tools for comparably measuring water insecurity experiences among households and adults, respectively. The potential range for HWISE and IWISE scores is 0–36. When the WISE Scales were first published, scores of 12 and higher were considered indicative of water insecurity, but additional cut-points are needed to provide more nuanced insights. We therefore sought to develop a practical set of cut-points for the WISE Scales using HWISE data from 13 sites across 12 countries (n = 3,293) and nationally representative samples of IWISE data from 38 countries collected by the Gallup World Poll (n = 52,343). We selected cut-points in water insecurity scores to establish four ordinal categories: no-to-marginal (0–2), low (3–11), moderate (12–23), and high (24–36) water insecurity. These categories were monotonically associated with increasing odds of reporting water dissatisfaction and helped to differentiate the breadth of water insecurity across populations with heterogenous water insecurity experiences and frequencies. These four water insecurity categories can be used to better understand how water insecurity may be related to livelihoods, health, and well-being, both at low and high water insecurity.
Assessment of cardiometabolic age and aging rate in individuals with type 2 diabetes
Authors: Pysaruk A.V. , Saenko Ya.A. , Mankovsky B.M. 
Published: September 2024

Background. Aging is associated with changes in organs and systems that contribute to the development of age-related pathology. Accelerated aging is characterized by metabolic disorders that create conditions for the development of type 2 diabetes (T2D). The development of T2D in older individuals can be considered as accelerated metabolic aging. In cases of T2D combined with cardiovascular pathology in the elderly, there is a cardiometabolic type of aging. To assess the rate of this process, it is advisable to use a formula for calculating biological age (BA) based on cardiovascular and metabolic parameters. In this case, partial BA can be called cardiometabolic age. Its value will assess the degree of hemodynamic and metabolic disturbances. The purpose of the study was to develop a simple method for assessing cardiometabolic age and to calculate it in individuals with T2D combined with cardiovascular pathology. Materials and methods. A total of 155 practically healthy individuals (without T2D, cardiovascular, and renal pathology) aged 30 to 80 years were examined, 23 patients with T2D without comorbidities, 92 with T2D and concomitant hypertension, 55 with T2D, concomitant hypertension and ischemic heart disease, 72 with T2D and chronic kidney disease, and 25 patients with T2D and peripheral neuropathy. All participants had anthropometric measurements taken, systolic and diastolic blood pressure measured. Serum levels of total cholesterol, triglycerides, low- and high-density lipoprotein cholesterol, creatinine, glomerular filtration rate, aspartate aminotransferase, alanine aminotransferase, and albuminuria were determined. A stepwise multiple regression method using the StatSoft Statistica package (USA) was used to develop the BA mathematical model. Aging rate was assessed by the difference between biological and chronological age. Results. Calculation of BA in practically healthy individuals using our formula showed that the average absolute error of calculation was 7.79 ± 0.49 years. Correction of the systematic error of the regression method significantly increased the accuracy of BA calculation (R2 = 0.78; p < 0.00001; age calculation error was 4.80 ± 0.32 years). Calculation of BA in individuals with pathology showed that it significantly exceeded their chronological age, on average by 12.7 ± 1.9 years in patients with T2D without comorbidities and from 14.5 ± 2.0 to 19.1 ± 1.5 years in the pre­sence of comorbidities or T2D complications. The obtained result indicates accelerated cardiometabolic aging in individuals with T2D and an increased risk of developing cardiovascular diseases, chro­nic kidney disease, and polyneuropathy. Conclusion. The method developed by us for assessing the rate of cardiometabolic aging has a sufficiently high accuracy and can be used to predict the risk of developing T2D in combination with cardiovascular pathology.
A UTILIZAÇÃO DA TÉCNICA DE GRUPO FOCAL: NARRATIVAS DE FAMILIARES SOBRE A CULTURA E OS SABERES TRADICIONAIS DA COMUNIDADE DE MAZAGÃO VELHO, AMAPÁ, BRASIL
Authors: Mendes Ivone Jacarandá Braga , Machado Neli Teresinha Galarce 
Published: September 2024

A abordagem deste artigo direcionou-se no recorte do estudo dissertativo sobre as alusões no Ensino geradas pelos preceitos e pelos saberes culturais em uma comunidade afrodescendente de Mazagão Velho, localizada no Amapá. Dessa forma, a investigação utilizou-se da técnica de grupo focal como estratégia. Objetivou analisar os saberes culturais na constituição e a valorização da realidade cultural, norteados pela vivência e as concepções de familiares dos estudantes. Metodologicamente, a pesquisa proporcionou uma investigação qualitativa por compreender que os objetivos indicados reverberam no Ensino dos anos finais do Ensino Fundamental da Escola Estadual Professora Antonia Silva Santos, os quais foram respondidos considerando a aplicação da técnica do grupo focal com familiares dos estudantes. Os resultados enfatizam a relação dos envolvidos com o contexto identitário do ensino da comunidade de Mazagão Velho/AP, o qual permitiu narrativas, interação, troca de saberes, experiências, percepções e anseios, além da problematização e alinhamento sobre cultura e os saberes tradicionais da comunidade. O grupo focal concebeu um ambiente favorável para o conhecimento e a compreensão das vivências então dos familiares, bem como os significados atribuídos por eles às experiências.
Determinación de la cobertura vegetal en el santuario nacional los Manglares de Tumbes utilizando Sistema de Aeronaves pilotadas a distancia
Authors: Hinojosa Niquén Yahaira Anabel , Hinojosa Niquén Yamira Anabelle , Niquén Tineo Katherine del Pilar , Niquen Inga Maria Isabel 
Published: September 2024

En la presente investigación se obtiene información actualizada, dato real de la superficie manglares constituyentes del sistema terrestre y marino Tumbesino, importante en la función ecológica que tiene que ver con los cambios globales, deforestación, actividades socioeconómicas y otras desarrolladas en la zona; teniendo como objetivo determinar de la cobertura vegetal del Santuario Nacional los Manglares de Tumbes utilizando un Sistema de Aeronaves Pilotadas a Distancia; para ello se dispuso de dos Receptores GPS Geodésicos ubicándose el área de recuperación LAN Zarumilla-Tumbes en el interior del Santuario, se realiza la planificación del vuelo fotogramétrico en 100.00 has y se localiza aquí 4.20 Has para la determinación de la cobertura vegetal, realizándose el vuelo fotogramétrico con el uso del drone Mavic 2; indicando que con el programa Agisoft Metashape, se ha obtenido el OrtoMosaico del Proyecto, Área obtenida y luego procesados con los programas Global Mapper y Autocad Civil 3D, obteniendo 457 imágenes al programa para su proceso. Con el ortomosaico mediante el software Agisoft Metashape y Arcgis 10.8 se obtuvo cada tipo de cobertura con 2875 individuos en un área de evaluación de 4.20 Has. Se identificaron 4 especie de manglar: rojo, negro, blanco y colorado. La interpretación de los mapas se realizó con el software ARCGIS 10.8 y obteniéndose la cobertura vegetal indicada, predominando con el 78.3% el mangle negro del total de individuos clasificados. Así mismos el Índice de vegetación Diferenciado Normalizado (NDVI) varía entre 0.005 (cuerpo de agua) con 10.50 Has. Hasta 0.6 (Bosque Manglar Maduro) con 52 has (52%) del área en estudio.
Respon Pertumbuhan Dan Hasil Tanaman Terong Ungu (Solanum melongena L.) Pada Konsentrasi Dan Jenis Pupuk Organik Cair
Authors: Adelia Putri Kiki , Sulistyono Agus , Djarwantiningsih Djarwantiningsih 
Published: September 2024

Terong adalah jenis sayuran buah yang digemari, karena selain harga yang terjangkau juga mudah ditemukan di pasar, sehingga permintaannya meningkat. Penelitian ini bertujuan untuk dapat mengetahui adanya interaksi antara konsentrasi dan jenis pupuk organik cair (POC) pada pertumbuhan dan hasil tanaman terong ungu. Penelitian ini dilaksanakan pada bulan Maret-Juli 2022, yang berlokasi di lahan Fakultas Pertanian Universitas Pembangunan Nasional “Veteran” Jawa Timur. Rancangan percobaan yang digunakan adalah Rancangan acak kelompok yang terdiri dari 2 faktor. Faktor pertama yaitu konsentrasi POC dengan 5 taraf yaitu 10%, 15%, 20%, 25% dan 30%. Faktor kedua yaitu POC kulit pisang dan POC limbah ikan. Hasil penelitian menunjukkan terdapat interaksi yang nyata antara konsentrasi dan jenis POC yang diaplikasi terhadap tinggi tanaman, jumlah daun, bobot buah per buah per tanaman pada periode ke-3 dan ke-5 dan bobot buah per tanaman periode ke-3, ke-4 dan ke-5. Kombinasi konsentrasi POC 30% dan jenis POC limbah ikan menunjukkan hasil tertinggi pada tinggi tanaman (87,17 cm) dan jumlah daun (55,50 helai), sedangan perlakuan kombinasi antara konsentrasi POC 25% dan jenis POC limbah ikan memberikan hasil tertinggi pada bobot buah per buah per tanaman pada periode ke-3 (176,95 g) dan ke-5 (219,72 g) dan bobot buah per tanaman yang dipanen periode ke-3 (357,11 g), ke-4 (381,89 g) dan ke-5 (351,33 g).
Pengaruh Penambahan Eco Enzyme Kulit Nanas Terhadap Hasil Tiga Varietas Sawi Pakcoy (Brassica chinensis L.) Pada Hidroponik Wick System
Authors: Nugraha Muhammad Martin Eka , Sa’diyah Halimatus 
Published: September 2024

Pakcoy merupakan salah satu tanaman hortikultura yang banyak dibudidayakan secara hidroponik. Tujuan penelitian ini yaitu mengetahui perbedaan hasil dari beberapa varietas pakcoy dan pengaruh eco enzyme terhadap hasil tanaman beserta interaksi antara keduanya. Penelitian ini dilakukan di greenhouse Agrotechno Park Universitas Jember pada bulan Agustus-Oktober 2022. Rancangan yang digunakan yaitu Rancangan Acak Lengkap Faktorial. Faktor pertama yaitu varietas tanaman pakcoy dengan tiga taraf perlakuan (Pakcoy Hijau Var. Nauli, Pakcoy Merah Var. Xandria, dan Pakcoy Putih Var. Dakota) dan faktor kedua yaitu dosis eco enzyme dengan 4 taraf perlakuan (AB Mix, AB Mix+eco enzyme 10 ml/l, AB Mix+eco enzyme 15 ml/l, dan AB Mix+eco enzyme 20 ml/l). Parameter yang diamati diantaranya yaitu tinggi tanaman, jumlah daun, luas daun, diameter batang, panjang akar, volume akar, berat basah, berat kering, dan kadar klorofil. Hasil penelitian menunjukkan bahwa terdapat interaksi antara perlakuan varietas dan dosis eco enzyme terhadap hasil tanaman pakcoy yang didominasi oleh kombinasi perlakuan P1E1 (Pakcoy Hijau Var. Nauli X AB Mix+eco enzyme 10 ml/l). Namun, secara umum perlakuan E1 (AB Mix+eco enzyme 10 ml/l) tidak berbeda nyata dengan perlakuan E0 (AB Mix).
Pengaruh Pemberian Dosis Pupuk Organik Cap 3 Kelapa Dan Berbagai Jenis Mulsa Organik Terhadap Pertumbuhan Dan Produksi Tanaman Kacang Hijau (Vigna radiata L.)
Authors: Nur Hardianti , Mulyani Cut , Marnita Yenni 
Published: September 2024

Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui pertumbuhan dan produksi tanaman kacang hijau dengan pemberian dosis pupuk organik cap 3 kelapa dan berbagai jenis mulsa organik, serta mengetahui interaksi antara pemberian dosis pupuk organik cap 3 kelapa dan berbagai jenis mulsa organik terhadap pertumbuhan dan produksi tanaman kacang hijau. Penelitian ini menggunakan rancangan acak kelompok pola factorial yang terdiri dari 2 faktor, yaitu faktor dosis pupuk organik cap 3 kelapa dengan notasi D yang terdiri dari 3 taraf yaitu : D₁ = 0,81 kg/plot (10 ton/ha), D₂ = 1,21 kg/plot (15 ton/ha), dan D₃ = 1,62 kg/plot (20 ton/ha). Faktor Jenis Mulsa Organik dengan notasi M yang terdiri dari 3 taraf yaitu : M₁ = Ampas tebu, M₂ = Tandan Kosong Kelapa Sawit, dan M₃ = Jerami Padi. Parameter yang diamati antara lain tinggi tanaman, jumlah cabang, jumlah polong per tanaman, jumlah polong perplot, berat 100 biji dan produksi per Ha (ton). Hasil penelitian menunjukkan bahwa dosis pupuk organik cap 3 kelapa berpengaruh nyata terhadap parameter tinggi tanaman kacang hijau umur 4, 5 dan 6 MST, Jumlah Polong per Plot dan Berat 100 biji. Hasil terbaik yaitu didapatkan pada perlakuan D₃ = 1,62 kg/plot. Pemberian jenis mulsa organik memberikan pengaruh nyata pada parameter Jumlah Polong per Plot dan Berat 100 biji. Hasil terbaik diperoleh pada perlakuan jenis mulsa organik jerami padi yaitu M₃. Interaksi dosis pupuk organik cap 3 kelapa dengan berbagai jenis mulsa organik memberikan pengaruh sangat nyata terhadap parameter tinggi tanaman kacang hijau umur 4, 5 dan 6 MST dan berpengaruh nyata pada berat 100 biji. Interkasi terbaik diperoleh pada kombinasi perlakuan dosis pupuk organik cap 3 kelapa 1,62 kg/plot dan mulsa jerami padi.
Potensi Biji Dan Daun (Clitoria ternatea) Sebagai Larvasida Ulat kantung Metisa plana
Authors: Nurliana Nurliana , Sari Ginting Makhrani , Sukapiring Dewi Novina , Anggraini Novita 
Published: September 2024

Bunga telang (Clitoria ternatea) termasuk famili fabaceae yang secara tradisional digunakan sebagai pewarna makanan dan minuman, herbal untuk berbagai penyakit pada manusia, dan banyak diteliti pengaruh larvasidanya terhadap nyamuk. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui potensi biji dan daun C. ternatea sebagai larvasida. Penggunaan pestisida nabati menjadi alternatif untuk mengurangi dampak kerusakan lingkungan akibat penggunaan pestisida kimia saat ini. Penelitian ini dilaksanakan di Laboratorium Institut Teknologi Sawit Indonesia (ITSI). Penelitian menggunakan faktor pertama adalah C. ternatea terdiri dari 2 taraf perlakuan: biji dan daun. Faktor kedua adalah konsentrasi ekstrak C. ternatea dengan 7 taraf perlakuan: K0 negatif (tanpa perlakuan), K0 positif (pemberian acefat), K1=1%, K2=2%, K3=3%, K4=4%, dan K5=5%. Perlakuan diulang sebanyak 2 kali dengan 28 kombinasi perlakuan. Data dianalisi dengan uji F dan dilanjutkan uji jarak Duncan dengan taraf 5%. Hasil penelitian menunjukkan perlakuan ekstrak biji dan daun C. ternatea memberi pengaruh yang berbeda nyata terhadap mortalitas M. plana. Konsentrasi yang efektif dalam penelitian ini dengan pemberian ekstrak biji yaitu pada konsentrasi K5 (5%) dan konsentrasi dengan pemberian esktrak daun pada konsentrasi K4 (4%).
Desempeño de cultivos de servicios invernales en la provincia de Corrientes, Argentina
Authors: Balbi Celsa N. , Zapata Nahuel , Vénica Lucas , Pérez Germán L. 
Published: September 2024

Los cultivos de servicio (CS), también conocidos como cultivos de cobertura o abonos verdes, son plantas cultivadas con la finalidad de proporcionar beneficios al ecosistema o servicios ecosistémicos, sin la intención de ser cosechadas. Estos cultivos ofrecen una amplia gama de servicios, tales como la cobertura del suelo, la contribución de materia orgánica, la reducción de la dinámica poblacional de malezas, así como mejoras químicas, físicas y biológicas del suelo. En los últimos diez años, en Argentina, se observó un aumento significativo en la utilización de estos cultivos, con resultados variables según la especie empleada y los objetivos buscados. El objetivo fue evaluar la inclusión de cultivos de servicio invernales, en relación a la disponibilidad de agua en suelo, la biomasa generada y la cobertura aérea como beneficios potenciales para la producción agrícola de Corrientes. Se llevó a cabo un ensayo en el campo experimental de la Facultad de Ciencias Agrarias de la UNNE. Se utilizaron vicia, avena y nabo forrajero como cultivos de servicio. También se observó la presencia de malezas e insectos plaga. A los setenta y siete días después de la siembra hubo diferencias en la biomasa de las tres especies. La producción fue superior en avena, seguida por vicia y nabo. El cultivo que presentó el mayor valor promedio de cobertura fue vicia, seguido por avena y nabo. Los cultivos de avena y vicia acumularon más agua a lo largo del ciclo.Tanto el cultivo de avena como el de vicia, brindaron los servicios de manera favorable.
Microclimate and ramulosis occurrence in a cotton crop under three plant population densities in Southern Brazil
Authors: Monteiro J. E. B. A , Sentelhas P. C. , Chiavegato E. J. 
Published: September 2024

El objetivo de este trabajo fue evaluar el microclima en el cultivo de algodón a tres densidades poblacionales y su efecto sobre la intensidad de la ramulosis. El experimento fue conducido en Piracicaba, SP, Brasil. Los genotipos IAC 23 y Coodetec 401 fueron sembrados a las densidades de 55.000, 111.000 y 166.000 plantas por hectárea. El cultivo fue inoculado con una suspensión de conidios de Colletotrichum gossypii var. cephalosporoides a los 30 y a los 45 días después de la siembra.Las variables temperatura del aire, humedad relativa y duración del follaje mojado fueron registradas a través de una estación automática instalada en el sitio experimental y de seis micro-estaciones ubicadas dentro de la canopia del cultivo (tres en cada genotipo). Los resultados mostraron que la densidad de plantas tuvo poco efecto sobre la temperatura del aire, aunque se registraron diferencias en la humedad relativa y la duración de follaje mojado. Estas diferencias fueron observadas hasta el momento en el cual la cobertura de la canopia fue total. El microclima generado por las tres densidades de plantas tuvo poco efecto en el progreso de la enfermedad, ya que el macroclima durante el experimento fue siempre favorable para el desarrollo de la ramulosis. El genotipo IAC 23 fue más resistente a la ramulosis.El área bajo la curva de progreso de la enfermedad presentó buena asociación con el rendimiento (R2 = 0,7 en todoslos tratamientos y R2 = 0,93 en los promedios), manifestándose como un parámetro potencial para la evaluación del impacto de la ramulosis en la producción de algodón en el sudeste de Brasil.
Vertical variation of atrazine mineralization capacity in soils
Authors: Hang S , Houot S. , Barriuso E. 
Published: September 2024

Se estudió la variación de la capacidad de mineralización de atrazina en dos suelos de la provincia de Córdoba, Argentina. Se seleccionaron dos perfiles de suelos con (suelo adaptado) y sin (suelo no adaptado) historia de aplicación de atrazina. La evolución de atrazina fue caracterizada mediante el balance de la radioactividad del 14C del anillo triazínico identificando las fracciones mineralizada,extractable y no extractable, durante incubaciones en condiciones de laboratorio con suelo tratado con calor (T105) y sin él (Control). La disminución de la capacidad de degradación de atrazina después de la inactivación microbiana y la limitada recuperación de esa capacidad observada en el perfil de suelo adaptado sugirió que los microorganismos degradadores de atrazina estarían distribuidos en todo el perfil siendo los responsables de la mineralización de atrazina en los horizontes subsuperficiales. Contrariamente, en el perfil de suelo no adaptado,la recuperación de la mineralización de atrazina a niveles similares o ligeramente superiores a los del Control corroboró la vía cometabólica del proceso característica de suelos sin historia de uso de atrazina. La capacidad de mineralizaciónde atrazina por los horizontes subsuperficiales, donde tiende a acumularse este herbicida, en suelos con aplicaciones frecuentes de atrazina debiera ser considerada y estimulada como un mecanismo de bioremediación natural.