bluuebunny/crossref_metadata_2025_split huggingface dataset:
Safety and Antitumor Activity of the Multitargeted Pan-TRK, ROS1, and ALK Inhibitor Entrectinib: Combined Results from Two Phase I Trials (ALKA-372-001 and STARTRK-1)
Authors: Drilon Alexander , Siena Salvatore , Ou Sai-Hong Ignatius , Patel Manish , Ahn Myung Ju , Lee Jeeyun , Bauer Todd M. , Farago Anna F. , Wheler Jennifer J. , Liu Stephen V. , Doebele Robert , Giannetta Laura , Cerea Giulio , Marrapese Giovanna , Schirru Michele , Amatu Alessio , Bencardino Katia , Palmeri Laura , Sartore-Bianchi Andrea , Vanzulli Angelo , Cresta Sara , Damian Silvia , Duca Matteo , Ardini Elena , Li Gang , Christiansen Jason , Kowalski Karey , Johnson Ann D. , Patel Rupal , Luo David , Chow-Maneval Edna , Hornby Zachary , Multani Pratik S. , Shaw Alice T. , De Braud Filippo G. 
Published: February 2017

AbstractEntrectinib, a potent oral inhibitor of the tyrosine kinases TRKA/B/C, ROS1, and ALK, was evaluated in two phase I studies in patients with advanced or metastatic solid tumors, including patients with active central nervous system (CNS) disease. Here, we summarize the overall safety and report the antitumor activity of entrectinib in a cohort of patients with tumors harboring NTRK1/2/3, ROS1, or ALK gene fusions, naïve to prior TKI treatment targeting the specific gene, and who were treated at doses that achieved therapeutic exposures consistent with the recommended phase II dose. Entrectinib was well tolerated, with predominantly Grades 1/2 adverse events that were reversible with dose modification. Responses were observed in non–small cell lung cancer, colorectal cancer, mammary analogue secretory carcinoma, melanoma, and renal cell carcinoma, as early as 4 weeks after starting treatment and lasting as long as &gt;2 years. Notably, a complete CNS response was achieved in a patient with SQSTM1–NTRK1-rearranged lung cancer.Significance: Gene fusions of NTRK1/2/3, ROS1, and ALK (encoding TRKA/B/C, ROS1, and ALK, respectively) lead to constitutive activation of oncogenic pathways. Entrectinib was shown to be well tolerated and active against those gene fusions in solid tumors, including in patients with primary or secondary CNS disease. Cancer Discov; 7(4); 400–9. ©2017 AACR.This article is highlighted in the In This Issue feature, p. 339
ЧУТЛИВІСТЬ ДО АНТИБІОТИКІВ ПЛІВКОУТВОРЮВАЛЬНОЇ МІКРОФЛОРИ ВОГНЕПАЛЬНИХ РАН
Authors: Kondratiuk V. P. , Kovalchuk V. P. , Kovalenko I. M. 
Published: February 2017

Натепер залишається неясним, чи існує прямий зв’язок між формуванням біологічної плівки і резистентністю до антибіотиків мікроорганізмів. У даному дослідженні ми прагнули вивчити взаємозв’язок між цими властивостями у клінічних ізолятів бактерій.Мікроорганізми були виділені з вогнепальних поранень протягом 2014 р. Здатність до формування біоплівок визначали методом фарбування кристалічним фіолетовим. МБсК, МБцК, мінімальну концентрацію, що приводить до ерадикації біоплівки (МЕбК), амікацину, цефтріаксону, цефоперазон/сульбактаму, ципрофлоксацину, меропенему, гатефлоксацину, левофлоксацину визначали методом серійних розведень.Штами, що виявляли чутливість до антибіотиків у планктонній формі, показали високу стійкість при формуванні біоплівки. МЕбК антибіотиків для штамів, що сформували біоплівку, сягала понад 500 мгк/мл, що в сотні разів перевищує клінічно досяжні концентрації. Кореляційний зв’язок між стійкістю до антибіотиків і здатністю до біоплівкоутворення штамів A. baumannii був різнобічним: для меронему r = –0,62, для цефоперазону з клавулановою кислотою r = +0,62, для амікацину r = +0,84. Штами P. aeruginosa також виявили різноспрямований зв’язок між досліджуваними властивостями. Можна припустити, що формування біоплівки і стійкість до антибіотиків діють як окремі механізми, що забезпечують краще виживання бактерій, особливо ізолятів зі слабким рівнем резистентності до антибіотиків.
ОЦІНКА ВПЛИВУ ТЕМПЕРАТУРНИХ ПОКАЗНИКІВ НА ФОРМУВАННЯ МАЛЯРІОГЕННОСТІ ТЕРИТОРІЇ УКРАЇНИ
Authors: Zabarna O. , Khalaim O. 
Published: February 2017

Малярія – антропонозна трансмісивна хвороба, частка якої становить 2,6 % від усіх захворювань у світі. При оцінці рівня маляріогенності території враховують показники температури повітря. Зміна клімату може створити сприятливіші умови для поширення малярії; необхідною є оцінка просторового розподілу переносників і збудників малярії для подальшого визначення потенційних ареалів цих видів. Порівняно температурні показники (1991-2010 рр.) і прогнози (Шевченко, 2014) для 5 регіонів України (Північний, Південний, Східний, Західний, Центральний) з температурними діапазонами толерантності для переносників малярії (комарів Anopheles) та збудників (P. vivax, P. malariae, P. falciparum).Сформовані кліматичні особливості України передбачають придатні умови для завершення статевого розвитку малярійних плазмодіїв виду P. vivax та P. malariae в організмі комара у всіх регіонах країни влітку. Для формування спорозоїтів P. falciparum необхідною є середньосезонна температура не нижче 18 °С, що не спостерігається в наш час та не прогнозується в майбутньому у межах Західного регіону. Температури на території Україні взимку не є оптимальними для розвитку спорозоїтів в організмі комара, а тому можуть виступати лімітуючим фактором при поширенні малярії.
Лапароскопічна корекція рецидивних пахвинних гриж у дітей
Authors: Baibakov V. M. 
Published: February 2017

Повторна операція з приводу рецидиву пахвинної грижі у дітей, яка виконується традиційним доступом у пахвинній ділянці, завжди ускладнюється наявністю грубих рубців та порушенням звичайних анатомічних відношень між органами та тканинами пахвинної ділянки. Висока травматичність повторного втручання також ускладнюється наявністю зрощень між кремастерним м’язом та елементами сім’яного канатика у хлопчиків та значними спайками в ділянці круглої зв’язки матки у дівчат, що призводить до грубого порушення усіх ланок дренажних систем яєчка у хлопчиків та розвитку порушень васкуляризації яєчника у дівчат. Наведені чинники спонукають дитячих хірургів до пошуку нових, менш травматичних та високоефективних методів операційного лікування рецидивних пахвинних гриж у дітей. Цим завданням повною мірою відповідає вдосконалений нами спосіб лапароскопічної корекції рецидивної пахвинної грижі з проведенням інтраопераційного УЗД-контролю пахвинної ділянки з боку втручання. За період з 2013 до 2015 р. у хірургічному відділенні КЗ “ДСКМЦМД ім. проф. М. Ф. Руднєва” ДОР м. Дніпра було виконано 18 лапароскопічних втручань при рецидивних пахвинних грижах у дітей, яким перше втручання виконували традиційним доступом у пахвинній ділянці. Всі діти були у віці до 3 років. При аналізі випадків рецидиву пахвинних гриж дійшли висновку, що рецидиви з’являлися у дітей раннього віку і, частіше, після операційних втручань з приводу защемлених пахвинних гриж, які оперували традиційними способами. Таким чином, запропонований нами спосіб лапароскопічної корекції рецидивних пахвинних гриж дозволяє ліквідувати грижовий мішок без додаткового травмування структур пахвинного каналу, які перебувають у стані рубцевого процесу, що виник після попереднього хірургічного втручання в пахвинній ділянці. Крім того, гарний косметичний ефект операції перешкоджає формуванню повторних спайок та грубих післяопераційних рубців. У ході проведеної нами роботи доведено, що серед заходів, які спрямовані на відновлення порушень дренажних систем яєчка при порушенні облітерації піхвового відростка очеревини у хлопчиків та для збереження васкуляризації яєчника у дівчат, головне місце займають: своєчасне повторне хірургічне лікування дітей, використання патогенетично обґрунтованих способів хірургічної корекції патології на рівні глибокого пахвинного кільця з використанням сучасної лапароскопічної техніки.
The Stained Glass Windows Installed like an Object at the Parque da Água Branca’s Entrance Portal
Authors: Mello Regina Lara Silveira , Barbosa Paulo Eduardo 
Published: February 2017

A exemplo das cidades europeias do período pós‐revolução industrial no século XVIII, parques públicos urbanos surgem em São Paulo, como o Parque da Água Branca, inaugurado em 1929, instituído para atender à demanda da crescente indústria agropecuária. Neste, destaca‐se o Portal de Entrada de aparência futurista, completamente diferente das demais. O portal projetado pelo engenheiro Mário Tomaz Whately emoldura um conjunto de vitrais com temática da agricultura e pecuária, criado pelo artista Antônio Gomide em parceria com a Casa Conrado. Por ocasião do restauro completo do portal, incluindo os vitrais, realizado pelos autores deste artigo em 1997, foram encontrados documentos que embasam reflexões e ajudam a situar historicamente esta edificação tão interessante, entre eles uma foto do portal em 1940 em que é perceptível a funcionalidade daqueles imensos objetos brilhantes, atualmente ofuscados pela luminosidade do entorno.
Glycated Hemoglobin Is Associated With the Growth Rate of Abdominal Aortic Aneurysms
Authors: Kristensen Katrine Lawaetz , Dahl Marie , Rasmussen Lars Melholt , Lindholt Jes Sanddal 
Published: February 2017

Objective—
An inverse association between abdominal aortic aneurysms (AAAs) and diabetes mellitus exists; however, the cause remains unknown. This study aimed to evaluate whether the degree of glycemia is associated with aneurysm growth.

Approach and Results—

The study was based on VIVA trial (Viborg Vascular), the randomized clinically controlled screening trial for abdominal aortic aneurysm in men aged 65 to 74 years in the Central Denmark Region. The screening included measurement of the abdominal aorta by ultrasound, analysis of glycated hemoglobin (HbA1c), and follow-up for ≤5 years for aneurysms <5 cm. Analyses were conducted using mixed-effect models. At baseline, VIVA screening identified 619 individuals (3.3%) with abdominal aortic aneurysms. A total of 103 individuals were referred for vascular evaluation, and after removal of additional individuals who were lost to follow-up or had missing blood samples, we were left with 319 individuals. Sixty-one individuals (19.1%) had diabetes mellitus. The median growth rate was 1.7 versus 2.7 mm/y in individuals with and without diabetes mellitus, respectively (
P
<0.001). We found a significant inverse association between aneurysmal growth rate and HbA1c in the total study population (
P
=0.002). Both crude and adjusted analyses identified slower growth for the group with the highest HbA1c tertile compared with the lowest HbA1c tertile. After 3 years, the mean difference was 1.8 mm (confidence interval, 0.98–2.64). Similar significant differences were observed in subgroup analysis of individuals without self-reported diabetes mellitus.

Conclusions—
We found an inverse association between the growth rate of abdominal aortic aneurysms and the level of HbA1c, indicating that long-lasting elevated blood sugar impairs aneurysmal progression in individuals with and without known diabetes mellitus.
Mediterranean Diet Improves High-Density Lipoprotein Function in High-Cardiovascular-Risk Individuals
Authors: Hernáez Álvaro , Castañer Olga , Elosua Roberto , Pintó Xavier , Estruch Ramón , Salas-Salvadó Jordi , Corella Dolores , Arós Fernando , Serra-Majem Lluis , Fiol Miquel , Ortega-Calvo Manuel , Ros Emilio , Martínez-González Miguel Ángel , de la Torre Rafael , López-Sabater M. Carmen , Fitó Montserrat 
Published: February 2017

Background:
The biological functions of high-density lipoproteins (HDLs) contribute to explaining the cardioprotective role of the lipoprotein beyond quantitative HDL cholesterol levels. A few small-scale interventions with a single antioxidant have improved some HDL functions. However, to date, no long-term, large-scale, randomized controlled trial has been conducted to assess the effects of an antioxidant-rich dietary pattern (such as a traditional Mediterranean diet [TMD]) on HDL function in humans.

Methods:
This study was performed in a random subsample of volunteers from the PREDIMED Study (Prevención con Dieta Mediterránea; n=296) after a 1-year intervention. We compared the effects of 2 TMDs, one enriched with virgin olive oil (TMD-VOO; n=100) and the other enriched with nuts (TMD-Nuts; n=100), with respect to a low-fat control diet (n=96). We assessed the effects of both TMDs on the role of HDL particles on reverse cholesterol transport (cholesterol efflux capacity, HDL ability to esterify cholesterol, and cholesteryl ester transfer protein activity), HDL antioxidant properties (paraoxonase-1 arylesterase activity and total HDL antioxidant capacity on low-density lipoproteins), and HDL vasodilatory capacity (HDL ability to induce the release of nitric oxide in endothelial cells). We also studied the effects of a TMD on several HDL quality-related characteristics (HDL particle oxidation, resistance against oxidative modification, main lipid and protein composition, and size distribution).

Results:

Both TMDs increased cholesterol efflux capacity relative to baseline (
P
=0.018 and
P
=0.013 for TMD-VOO and TMD-Nuts, respectively). The TMD-VOO intervention decreased cholesteryl ester transfer protein activity (relative to baseline,
P
=0.028) and increased HDL ability to esterify cholesterol, paraoxonase-1 arylesterase activity, and HDL vasodilatory capacity (relative to control,
P
=0.039,
P
=0.012, and
P
=0.026, respectively). Adherence to a TMD induced these beneficial changes by improving HDL oxidative status and composition. The 3 diets increased the percentage of large HDL particles (relative to baseline,
P
<0.001).

Conclusions:
The TMD, especially when enriched with virgin olive oil, improved HDL atheroprotective functions in humans.

Clinical Trial Registration:

URL:
http://www.controlled-trials.com
. Unique identifier: ISRCTN35739639.
Coexistent Sickle Cell Disease Has No Impact on the Safety or Outcome of Lytic Therapy in Acute Ischemic Stroke
Authors: Adams Robert J. , Cox Margueritte , Ozark Shelly D. , Kanter Julie , Schulte Phillip J. , Xian Ying , Fonarow Gregg C. , Smith Eric E. , Schwamm Lee H. 
Published: February 2017

Background and Purpose—
The recommended treatment for ischemic stroke is tPA (tissue-type plasminogen activator). Although sickle cell disease (SCD) represents no known contraindication to tPA, National Heart Lung and Blood Institute of the National Institutes of Health recommended acute exchange transfusion for stroke in SCD, not tPA. Data on safety and outcomes of tPA in patients are needed to guide tPA use in SCD.

Methods—
We matched patients from the American Heart Association and American Stroke Association Get With The Guidelines-Stroke registry with SCD to patients without SCD and compared usage, complications, and discharge outcomes after tPA. Multivariable logistic regression models using generalized estimating equations were used to assess outcomes.

Results—

From 2 016 652 stroke patients admitted to Get With The Guidelines-Stroke sites in the United States, 832 SCD and 3328 non-SCD controls with no differences in admission National Institutes of Health Stroke Scale or blood pressure were identified. Neither the fraction receiving thrombolytic therapy (8.2% for SCD versus 9.4% non-SCD) nor symptomatic intracranial hemorrhage (4.9% of SCD versus 3.2% non-SCD;
P
=0.4502) was different. There was no difference in a prespecified set of outcome measures for those with SCD compared with controls.

Conclusions—
Coexistent SCD had no significant impact on the safety or outcome of thrombolytic therapy in acute ischemic stroke. Although the sample size is relatively small, these data suggest that adults with SCD and acute ischemic stroke should be treated with thrombolysis, if they otherwise qualify. Addition studies, however, should track the intracranial hemorrhage rate and provide information on other SCD-related care such as transfusion.
Pagurodofleinia, a replacement generic name for Dofleinia McLaughlin &amp; Asakura, 2004 (Crustacea: Decapoda), preoccupied by Dofleinia Wassilieff, 1908 (Cnidaria: Anthozoa)
Authors: ASAKURA AKIRA 
Published: February 2017

It has been called to my attention that the generic name Dofleinia, established by McLaughlin and Asakura (2004) for Parapagurodes doederleini (Doflein, 1902), is a junior subjective homonym of Dofleinia Wassilieff, 1908 (Cnidaria: Anthozoa: Actiniidae). In accordance with Article 60 of the International Code of Zoological Nomenclature (International Commission on Zoological Nomenclature, 1999), I now propose Pagurodofleinia as a replacement name. The type species, Catapagurus doederleini Doflein, 1902, the gender (feminine), and the etymology (named for F. Doflein who first described the type species) remain as given by McLaughlin & Asakura (2004), as does the generic diagnosis.
Linking Atmospheric River Hydrological Impacts on the U.S. West Coast to Rossby Wave Breaking
Authors: Hu Huancui , Dominguez Francina , Wang Zhuo , Lavers David A. , Zhang Gan , Ralph F. Martin 
Published: February 2017

Atmospheric rivers (ARs) have significant hydrometeorological impacts on the U.S. West Coast. This study presents the connection between the characteristics of large-scale Rossby wave breaking (RWB) over the eastern North Pacific and the regional-scale hydrological impacts associated with landfalling ARs on the U.S. West Coast (36°–49°N). ARs associated with RWB account for two-thirds of the landfalling AR events and >70% of total AR-precipitation in the winter season. The two regimes of RWB—anticyclonic wave breaking (AWB) and cyclonic wave breaking (CWB)—are associated with different directions of the vertically integrated water vapor transport (IVT). AWB-ARs impinge in a more westerly direction on the coast whereas CWB-ARs impinge in a more southwesterly direction. Most of the landfalling ARs along the northwestern coast of the United States (states of Washington and Oregon) are AWB-ARs. Because of their westerly impinging angles when compared to CWB-ARs, AWB-ARs arrive more orthogonally to the western Cascades and more efficiently transform water vapor into precipitation through orographic lift than CWB-ARs. Consequently, AWB-ARs are associated with the most extreme streamflows in the region. Along the southwest coast of the United States (California), the southwesterly impinging angles of CWB-ARs are more orthogonal to the local topography. Furthermore, the southwest coast CWB-ARs have more intense IVT. Consequently, CWB-ARs are associated with the most intense precipitation. As a result, most of the extreme streamflows in southwest coastal basins are associated with CWB-ARs. In summary, depending on the associated RWB type, ARs impinge on the local topography at a different angle and have a different spatial signature of precipitation and streamflow.
A Qualitative Study of Cognitive, Behavioral, and Psychosocial Challenges Associated With Pediatric Type 2 Diabetes in Ethnic Minority Parents and Adolescents
Authors: St. George Sara M. , Pulgarón Elizabeth R. , Ferranti Dina , Agosto Yaray , Toro Maria I. , Ramseur Kevin C. , Delamater Alan M. 
Published: February 2017

Purpose The purpose of this descriptive qualitative study was to explore cognitive, behavioral, and psychosocial challenges associated with having and/or parenting an adolescent with pediatric type 2 diabetes (T2D) from the perspectives of ethnic minority parents and adolescents. Methods Ethnic minority (79.2% non-Hispanic black, 29.6% Hispanic) adolescents (n = 14, 78.6% female, 14.7 ± 1.9 years) and their parents (n = 13, 100% female) participated in either individual family interviews or multifamily focus group sessions. Sessions were audio recorded, transcribed, and coded by a team of 4 raters. QSR NVivo 10 was used to perform a content analysis and to extract coded adolescent and parent responses. Results Six themes corresponding to 3 broad categories (cognitive, behavioral, and psychosocial challenges) emerged. Regarding cognitive challenges, families described difficulties learning about a new disease and managing youth knowledge deficits and/or superficial knowledge. In terms of behavioral challenges, parents and adolescents discussed ongoing difficulties with making and maintaining positive youth health behavior changes as well as with ensuring regimen adherence. Finally, managing youth emotions related to diabetes and navigating social relationships with peers and other family members around the disclosure of T2D were the primary psychosocial challenges to emerge. Conclusions Directions for future research include developing and evaluating brief family interventions and adolescent psychosocial screening measures. Recommendations for clinical practice include increasing family knowledge of T2D, enhancing parenting skills for managing youth behavior change, and conducting routine psychosocial screening during follow-up clinic visits.
The Ottawa panel clinical practice guidelines for the management of knee osteoarthritis. Part two: strengthening exercise programs
Authors: Brosseau Lucie , Taki Jade , Desjardins Brigit , Thevenot Odette , Fransen Marlene , Wells George A , Mizusaki Imoto Aline , Toupin-April Karine , Westby Marie , Álvarez Gallardo Inmaculada C , Gifford Wendy , Laferrière Lucie , Rahman Prinon , Loew Laurianne , De Angelis Gino , Cavallo Sabrina , Shallwani Shirin Mehdi , Aburub Ala’ , Bennell Kim L , Van der Esch Martin , Simic Milena , McConnell Sara , Harmer Alison , Kenny Glen P , Paterson Gail , Regnaux Jean-Philippe , Lefevre-Colau Marie-Martine , McLean Linda 
Published: February 2017

Objective: To identify effective strengthening exercise programs and provide rehabilitation teams and patients with updated, high-quality recommendations concerning traditional land-based exercises for knee osteoarthritis. Methods: A systematic search and adapted selection criteria included comparative controlled trials with strengthening exercise programs for patients with knee osteoarthritis. A panel of experts reached consensus on the recommendations using a Delphi survey. A hierarchical alphabetical grading system (A, B, C+, C, D, D+ or D-) was based on statistical significance ( p < 0.5) and clinical importance (⩾15% improvement). Results: The 26 high-quality studies identified demonstrated that various strengthening exercise programs with/without other types of therapeutic exercises are generally effective for improving knee osteoarthritis management within a six-month period. Strengthening exercise programs demonstrated a significant improvement for pain relief (four Grade A, ten Grade B, two Grade C+), physical function (four Grade A, eight Grade B) and quality of life (three Grade B). Strengthening in combination with other types of exercises (coordination, balance, functional) showed a significant improvement in pain relief (three Grade A, 11 Grade B, eight Grade C+), physical function (two Grade A, four Grade B, three Grade C+) and quality of life (one Grade A, one Grade C+). Conclusion: There are a variety of choices for strengthening exercise programs with positive recommendations for healthcare professionals and knee osteoarthritis patients. There is a need to develop combined behavioral and muscle-strengthening strategies to improve long-term maintenance of regular strengthening exercise programs.