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Transports fluviaux de matières dissoutes et particulaires sur un bassin versant en région tropicale : le bassin amont du Niger au cours de la période 1990-1993. / Fluvial transports of dissolved and suspended matters in a tropical river basin : the upper Niger basin during the period 1990-1993
Authors: Boeglin Jean-Loup , Probst J.L. 
Published: June 2018

Fluvial transports of dissolved and suspended matters in a tropical river basin : the upper Niger basin during the period 1990-1993
During the period January 1990-July 1993. 85 samples were collected in the Niger river waters at Bamako sampling station (Mali). The chemical analyses and the available river discharge data allowed us to calculate specific fluxes of different solute elements (in decreasing order : HCO₃⁻ &gt; SiO₂ &gt;&gt; COD &gt; Na⁺ &gt; Ca²⁺ &gt; К⁺ &gt; Mg²⁺ &gt;&gt; Сl⁻ &gt; SO₄²⁻ &gt;&gt; Fe &gt; Al) and of suspended matter. The specific flux of TDS, which characterizes the chemical weathering rate, is estimated to 8 t/km²/year. Whereas the TSS flux, which characterizes the mechanical erosion rate, averages 5 t/km²/year. These fluxes of solute and suspended matters are compared with those of 16 river basins of tropical Africa. Relationships between TDS or TSS and drainage are determined for all these river basins characterizing this tropical zone.
The high resolution biosphere model : status of development, validation, results. / Le modèle biosphère haute résolution (HRBM) : état des travaux, validation, résultats
Authors: Esser Gerd , Hoffstadt Johannes , Mack Frank , Qu Weiqing , Wittenberg Uwe 
Published: June 2018

Le modèle biosphère haute résolution (HRBM) : état des travaux, validation, résultats
Dans le cadre du projet ESCOBA, le Modèle de Biosphère Haute Résolution (HRBM) a été utilisé afin d'atteindre trois objectifs.
Premièrement, des expériences de validation ont été menées sur plusieurs parties de la structure modulaire du HRBM. Des données ponctuelles de productivité et de phytomasse ont été utilisées pour valider le module de productivité. Un test de sensibilité montre que la productivité du HRBM est principalement limitée par la disponibilité en eau (précipitations). Une étude régionale sur la distribution du carbone organique dans le sol a été effectuée en collaboration avec la station de recherches de l'ITE de Merlewood (Hoffstadt et al., dans ce volume). Un deuxième objectif consistait à étudier l'impact du facteur anthropique sur le cycle du carbone. Le HRBM considère les changements d'utilisation du sol ainsi que les incendies de la végétation. Dans le module d'incendies, les probabilités de feux sont fonction de variables climatiques et des types de biomes. Ce module a été validé par comparaison avec les observations.de feux saisonniers en Afrique de l'Ouest (Cahon et al., 1992 ; Menaut et al., 1991). Pour 1980, le HRBM estime une quantité maximum de 1,6 Pg С provenant de la combustion des déchets agricoles.
Le besoin général d'un module approprié de cycle de l'eau nous a conduit à choisir un schéma de surface existant (SiB2, Sellers et al., 1992). Nous avons testé ce modèle avec succès en utilisant des données micrométéorologiques acquises sur une longue période. Les résultats ont suggéré quelques modifications dans le couplage de SiB2 et du HRBM.
Le cycle de l'eau et les processus de productivité sont liés du fait de leur dépendance commune à la conductance foliaire pour l'eau et le CO₂.
La troisième partie de nos activités a été consacrée à l'amélioration de notre compréhension de la conductance stomatique pour différentes conditions climatiques et concentrations en CO₂.
Nous avons donc mené des expériences en laboratoire conjointement à des campagnes sur le terrain en Italie du Nord et au Paraguay. Nous avons confirmé l'existence de classes fonctionnelles se distinguant par la réponse de leur conductance à la concentration interne en CO₂. Nous avons répertorié les distributions de ces classes pour des espèces dominantes le long de gradients d'humidité.
A Kinematical Detection of Two Embedded Jupiter-mass Planets in HD 163296
Authors: Teague Richard , Bae Jaehan , Bergin Edwin A. , Birnstiel Tilman , Foreman-Mackey Daniel 
Published: June 2018

Abstract
We present the first kinematical detection of embedded protoplanets within a protoplanetary disk. Using archival Atacama Large Millimetre Array (ALMA) observations of HD 163296, we demonstrate a new technique to measure the rotation curves of CO isotopologue emission to sub-percent precision relative to the Keplerian rotation. These rotation curves betray substantial deviations caused by local perturbations in the radial pressure gradient, likely driven by gaps carved in the gas surface density by Jupiter-mass planets. Comparison with hydrodynamic simulations shows excellent agreement with the gas rotation profile when the disk surface density is perturbed by two Jupiter-mass planets at 83 and 137 au. As the rotation of the gas is dependent upon the pressure of the total gas component, this method provides a unique probe of the gas surface density profile without incurring significant uncertainties due to gas-to-dust ratios or local chemical abundances that plague other methods. Future analyses combining both methods promise to provide the most accurate and robust measures of embedded planetary mass. Furthermore, this method provides a unique opportunity to explore wide-separation planets beyond the mm continuum edge and to trace the gas pressure profile essential in modeling grain evolution in disks.
Stellar and Planetary Characterization of the Ross 128 Exoplanetary System from APOGEE Spectra
Authors: Souto Diogo , Unterborn Cayman T. , Smith Verne V. , Cunha Katia , Teske Johanna , Covey Kevin , Rojas-Ayala Bárbara , García-Hernández D. A. , Stassun Keivan , Zamora Olga , Masseron Thomas , Johnson J. A. , Majewski Steven R. , Jönsson Henrik , Gilhool Steven , Blake Cullen , Santana Felipe 
Published: June 2018

Abstract
The first detailed chemical abundance analysis of the M-dwarf (M4.0) exoplanet-hosting star Ross 128 is presented here, based upon near-infrared (1.5–1.7 μm), high-resolution (R ∼ 22,500) spectra from the SDSS Apache Point Galactic Evolution Experiment survey. We determined precise atmospheric parameters T
eff = 3231 ± 100 K, log g = 4.96 ± 0.11 dex and chemical abundances of eight elements (C, O, Mg, Al, K, Ca, Ti, and Fe), finding Ross 128 to have near solar metallicity ([Fe/H] = +0.03 ± 0.09 dex). The derived results were obtained via spectral synthesis (1D LTE) adopting both MARCS and PHOENIX model atmospheres; stellar parameters and chemical abundances derived from the different adopted models do not show significant offsets. Mass–radius modeling of Ross 128b indicates that it lies below the pure-rock composition curve, suggesting that it contains a mixture of rock and iron, with the relative amounts of each set by the ratio of Fe/Mg. If Ross 128b formed with a subsolar Si abundance, and assuming the planet’s composition matches that of the host star, it likely has a larger core size relative to the Earth despite this producing a planet with a Si/Mg abundance ratio ∼34% greater than the Sun. The derived planetary parameters—insolation flux (S
Earth = 1.79 ± 0.26) and equilibrium temperature (T
eq = 294 ± 10 K)—support previous findings that Ross 128b is a temperate exoplanet in the inner edge of the habitable zone.
Data Detectives - The Backlog Cataloguing Project at Auckland War Memorial Museum
Authors: Schlumpf Heidi , Gaze Nina , Grenfell Hugh , Duff Frances , Hall Kelly , Charles Judith , Mortensen Benjamin 
Published: June 2018

The Collection Access and Readiness Programme (CARP) is a unique, well-defined programme with committed funding at Auckland War Memorial Museum (AWMM). In the Natural Sciences department, CARP has funded the equivalent of five positions over five collecting areas for four years. These are filled by six part-time collection technicians and a senior full-time manager. As Collection Technicians, our role, across Botany, Entomology, Geology, Marine, and Palaeontology, is to digitise acquisitions prior to December 2012. We are processing the backlogs of our collections, which are prioritised across all museum activities in distinct taxonomic projects. The cataloguing method involves gathering and verifying all available information and entering data into Vernon, our collections management system (https://vernonsystems.com/products/vernon-cms/), with specifically designed record standards aligned to Darwin Core (Wieczorek et al. 2012).
CARP has allowed us the freedom to explore backlog collections, some of which have not been fully processed, revealing mysteries that would otherwise have sat undiscovered, and to resolve uncertainties across the collections. For example, in Botany, cataloguing the foreign ferns reveals previously unrealised type specimens; in Marine, cataloguing all 9117 specimen lots of the New Zealand Bivalvia collection, brought classification and locality data uncertainties to resolution. There are multiple projects running concurrently in each collecting area, continually enriching our collection data. In turn, this is opening up a far wider range of information to the public through our online collection portal, AWMM Collections Online http://www.aucklandmuseum.com/discover/collections-online (currently 800,000 records). Open accessibility promotes careful consideration of how and what data we deliver, as it is disseminated through global portals, such as the Global Biodiversity Information Facility (GBIF) and Atlas of Living Australia (ALA).
Collections that have often had no more attention than recording of their original labels, have interesting stories beyond “just” cataloguing them. As cataloguers, we have found that the uncertainties or sometimes apparent lack of detail increases our engagement with our collections. Rather than solely copying information into the database, we become detectives, resolving uncertainties and verifying the background of our objects, collection sites and collectors. This engagement and the global reach of our data mean that we are invested in the programme, so that data entry continuity and accuracy are maximised. Our presentation will give an overview of the CARP and our method, and a look at our progress two years in, highlighting some of our discoveries and how the uncertainty in our data allows us to engage more with our collections.
Project Paleo: Citizen Curation and Community Science at the Natural History Museum of Los Angeles County
Authors: Ellwood Elizabeth , Estes-Smargiassi Kathryn , Graham Noel , Takeuchi Gary , Hendy Austin , Porter Molly , Lindsey Emily 
Published: June 2018

The School and Teacher Programs of the Natural History Museum of Los Angeles County have partnered with the La Brea Tar Pits and Museum (LBTPM) and the Invertebrate Paleontology (LACMIP) collection to create two “citizen curation” exercises dubbed “Project Paleo”. Classroom kits were created with unsorted fossils from either LBPTM or from a local invertebrate paleontological field site, to be sorted and identified by local elementary and middle school students and then returned to the museum for curation, analysis, and research purposes. Each kit contains background information about the project and fossils, and an identification guide to assist the students and teachers.
The “Project Paleo: Rancho La Brea” kit contains three tablespoons of unsorted fossil matrix from LBTPM’s Project 23. Groups of students learn about past and present food webs of the Los Angeles Basin, then sort the matrix into several categories (bones, plants, other fossils, and rocks) using a guide with drawn examples of each. An online iNaturalist (inaturalist.org) project also serves as an identification resource as well as a platform by which students can contribute photos for identification by staff researchers. This project is aimed at middle schoolers and over 700 students have used the sorting kits. Results will help to recreate past ecosystems of Southern California and help to inform a National Science Foundation (NSF) funded project, “A Mouse’s Eye View of Rancho La Brea”.
The “Project Paleo: Marine Invertebrates of Southern California” kit produced by LACMIP, contains approximately two cups of washed but unsorted coarse fossil matrix from a salvaged (now destroyed) construction site. This kit is aimed at 5th grade Los Angeles Unified School District classrooms and homeschooling families. Students are asked to sort fossils by species and use included identification cards to identify the sorted fossils to the best of their ability. Results of this project will be included in an NSF funded digitization project and will contribute to research on the paleoecology of Pleistocene Southern California.
Early evaluation of both kits has shown positive feedback from students and educators, as well as some room to improve instructions to students. These kits are designed to conform to Next Generation Science Standards while generating useful data for museum scientists. Collections staff are able to outsource the curation of critical data to students who get the experience of handling real museum fossils and contributing to the body of paleontological research.
Putting your Finger upon the Simplest Data
Authors: Ariño Arturo 
Published: June 2018

Over the past decades, digitization endeavors across many institutions holding natural history collections (NHCs) have multiplied with three broad aims: first, to facilitate collection management by moving existing analog catalogues into digital form; second, to efficiently document and inventory specimens in collections, including imaging them as taxonomical surrogates; and third, to enable discovery of, and access to, the resulting collection data.
NHCs contain a unique wealth of potential knowledge in the form of primary biodiversity data records (PBR): at its most basic level, the “what, where and when” of occurrences of the specimens in the collections. But as T.S. Eliot famously said, “knowledge is invariably a matter of degree”. For such data to be transformed into digitally accessible knowledge (DAK) that is conducive to an understanding about how the natural world works, release of digitized data (the “this we know”) is necessary.
At least two billion specimens are estimated to exist in NHCs already, but only a small fraction can be considered properly DAK: most have either not been digitized yet, or not released through a discovery facility. Digitizing is relatively costly as it often entails manually processing each specimen unit (e.g. a herbarium sheet, a pinned insect, or a vial full of invertebrates). How long could it take us to transform all NHCs into DAK? Can we keep up with the natural growth in collections?
The Global Biodiversity Information Facility (GBIF) has become the de facto main index of PBR, both originated in NHCs or as field observations. Digitized NHC that are standards-compliant and can be connected to, or harvested by, GBIF, effectively become DAK. I have examined GBIF growth data looking for a pattern of DAK generation.
I found that the rate of NHC-based PBR accrual is remarkably constant: the total DAK shows a strongly linear growth, as opposed to the exponential growth exhibited by cumulative observation data. Projecting the trend to the estimated holdings shoots the completion many decades ahead. In addition, digitized data appear to be taxonomically biased.
Digitization efforts must therefore step up qualitatively in order to enable processing the backlog, let alone newly-acquired accessions, within one generation. Among several possible solutions, emerging, industrial-scale mass-digitization techniques may help harnessing this otherwise daunting task—but there’s also a risk that DAK becomes even more uneven across taxon groups because of the narrow application specificity of such techniques, thus potentially biasing our knowledge of nature.
Kurator: Tools for Improving Fitness for Use of Biodiversity Data.
Authors: Morris Paul J. , Hanken James , Lowery David , Ludäscher Bertram , Macklin James , McPhillips Timothy , Wieczorek John , Zhang Qian 
Published: June 2018

As curators of biodiversity data in natural science collections, we are deeply concerned with data quality, but quality is an elusive concept. An effective way to think about data quality is in terms of fitness for use (Veiga 2016). To use data to manage physical collections, the data must be able to accurately answer questions such as what objects are in the collections, where are they and where are they from. Some research uses aggregate data across collections, which involves exchange of data using standard vocabularies. Some research uses require accurate georeferences, collecting dates, and current identifications. It is well understood that the costs of data capture and data quality improvement increase with increasing time from the original observation. These factors point towards two engineering principles for software that is intended to maintain or enhance data quality: build small modular data quality tests that can be easily assembled in suites to assess the fitness of use of data for some particular need; and produce tools that can be applied by users with a wide range of technical skill levels at different points in the data life cycle.
In the Kurator project, we have produced code (e.g. Wieczorek et al. 2017, Morris 2016) which consists of small modules that can be incorporated into data management processes as small libraries that address particular data quality tests. These modules can be combined into customizable data quality scripts, which can be run on single computers or scalable architecture and can be incorporated into other software, run as command line programs, or run as suites of canned workflows through a web interface. Kurator modules can be integrated into early stage data capture applications, run to help prepare data for aggregation by matching it to standard vocabularies, be run for quality control or quality assurance on data sets, and can report on data quality in terms of a fitness-for-use framework (Veiga et al. 2017). One of our goals is simple tests usable by anyone anywhere.
Une opération de séduction : la libération de prisonniers politiques par les occupants à l’été 1940
Authors: Poulhès Louis 
Published: June 2018

Résumé Dans le département de la Seine, les occupants ont libéré 423 détenus entre le 17 juin et le 9 juillet 1940, principalement les 24, 25 et 26 juin 1940, dont 86 % avaient été emprisonnés pour raisons politiques : 300 pour propos défaitistes, 63 pour menées communistes. Le contexte dans lequel cette opération s’inscrit, une entreprise de séduction de la population française à laquelle participe la tentative d’instrumentalisation du PCF menée par Otto Abetz, est largement ignoré, alors qu’il est essentiel pour comprendre cet épisode et qu’il fournit un éclairage important sur les débuts de l’Occupation.
La résilience à l’épreuve du local : la gestion du risque redéfinie par les habitants de Barrio Luján, Costa Rica
Authors: Guevara Viquez Sofia 
Published: June 2018

Polysémique, le concept de résilience est mobilisé depuis une dizaine d’années dans le domaine de la gestion du risque, à l’échelle internationale et nationale. Ainsi, le concept est incorporé dans les politiques publiques de gestion du risque au Costa Rica pour aborder l’échelle locale du risque et renforcer la capacité de réponse des habitants face aux événements. Des Comités de riverains de gestion de l’urgence sont ainsi créés. À partir des résultats d’un travail d’observation et d’entretiens réalisé dans le cadre d’une formation pour les habitants dans un quartier de San José exposé au risque d’inondation, l’objectif de cet article est d’interroger l’ambivalence du concept de résilience tel que défini par le cadre des dispositifs socio-politiques de gestion de crise au Costa Rica. Nous montrons que le cadre de la résilience, pensé par les gestionnaires pour consolider la capacité de réponse des habitants en cas de crise, ouvre la voie à son propre débordement. Les riverains se réapproprient l’espace du comité créé et s’efforcent de pluraliser les causes de leur vulnérabilité pour remettre en cause la gestion du risque assurée par la municipalité.
Les capabilités à faire face ou comment repenser la résilience des individus
Authors: Benitez Fanny , Reghezza Magali 
Published: June 2018

Cet article interroge, dans une perspective critique, les liens existant entre capacités à faire face, vulnérabilité et résilience afin de contribuer à la prévention des catastrophes naturelles. Il s’appuie sur une enquête réalisée en 2016 à Port-au-Prince sur le séisme de janvier 2010. Si la notion de capacité à faire face est largement utilisée dans la littérature et chez les professionnels, elle est rarement définie et n’est pas formalisée. Elle est en revanche associée à la réduction de la vulnérabilité et à l’amélioration de la résilience. Au-delà du problème théorique, on se heurte à un problème opérationnel avec l’impossibilité de définir des actions permettant de développer les capacités à faire face à un risque et/ou une catastrophe. Il faut plus largement se demander comment peuvent naître, exister, et de facto s’exprimer ces capacités, et a fortiori, les conditions nécessaires à leur expression. L’hypothèse principale est que ces capacités à faire face peuvent être définies et développées en s’appuyant sur la notion de capabilités définie par A. Sen et M. Nussbaum. Appliquées à la résilience, les capabilités vont désigner non seulement les capacités à faire face individuelles qui permettent à chacun de s’en sortir, de se relever, de se construire, mais aussi les ressources qui permettent d’activer ces capacités ou, le cas échéant, de pallier leur absence. Il est ainsi nécessaire de prendre en compte ce que nous appelons le « contexte capabilitaire » pour comprendre (et augmenter) la résilience des vulnérables.
Estimations de la résilience des territoires, sociétés, villes
Authors: Rufat Samuel 
Published: June 2018

Les organisations internationales multiplient ces dernières années les rapports proposant des mesures de la résilience face aux catastrophes ou aux changements climatiques. Mais d'un côté les agences des Nations unies promeuvent la résilience avec d'importants enjeux financiers; de l'autre, elles reconnaissent à mi-mot qu'il n'est pas possible d'estimer ou de mesurer la résilience, ou en tout cas de s'assurer que les différentes méthodes mesurent bien la résilience et non pas un autre construit, comme la pauvreté, ou un proxy, comme la vulnérabilité, etc. Cette situation est paradoxale : comment promouvoir des guides d'application, enjoindre les acteurs locaux à des plans d'action, les gouvernements à lever des fonds, voire suivre le déroulé des projets et les éventuels progrès sur le terrain à partir d'une notion qu'on ne sait pas mesurer? Le champ semble submergé par la multitude des approches théoriques, modèles et cadres d'analyse de la résilience qui émergent continuellement, mais avec peu de liens entre eux. Ce foisonnement des cadres théoriques et modèles semble à son tour alimenter une prolifération des approches méthodologiques de l'estimation et de la mesure de la résilience. Mais de nombreux travaux révèlent que les choix méthodologiques, lorsqu'ils sont mentionnés à défaut d'être justifiés ou argumentés, sont bien plus dépendants de l'accès aux données que des cadres théoriques ou des objectifs de la mesure. Et il semble presque impossible de valider ces estimations pour s'assurer que c'est bien la résilience qu'elles mesurent. C'est la critique la plus radicale que l'on peut adresser à la résilience : s'il n'est pas possible de la mesurer, son utilisation doit rester cantonnée à l'analyse de discours.