Микробиом кишечника человека: научная парадигма и клиническая практика
Authors: Н.В. Евдокимова , Т.В. Черненькая 
Published: November 2024

Исследования микробиома человека, начатые 15 лет назад и активно продолжающиеся в настоящее время, позволили во многом пересмотреть наши взгляды о глубинных механизмах взаимодействия организма человека и населяющих его микроорганизмов. Представшая картина оказалась много сложнее, чем ожидалось, особенно это относится к микробиому кишечника. В настоящее время научные концепции того, что из себя представляет микробиом кишечника, продолжают активно разрабатываться. В основе их лежит, конечно, редукционный подход. Так, предлагается теория «корового микробиома» и сопряженная с ней концепция «здорового микробиома». Еще более упрощенно подходит к решению проблемы многообразия и вариабельности кишечных микробиомов теория «энтеротипов». Она допускает существование предпочтительных (устойчивых) вариантов микробиомов, структурно организованных вокруг определенных групп микроорганизмов. Если структурообразующими являются анаэробные грамотрицательные палочки, то такие микробиомы отличаются низким видовым разнообразием, доминированием небольшой группы микроорганизмов и низкой стрессоустойчивостью. Именно такие типы микробиомов обнаруживают у пациентов с различными патологиями, в том числе, внекишечной локализации. Поэтому предполагается, что выделение энтеротипов имеет практический смысл. В настоящее время научная концепция микробиомов имеет мало выходов в медицинскую практику. Но уже имеющийся практический опыт применения про- и синбиотиков, препаратов бактериофагов и фекальной трансплантации свидетельствует о реальной возможности изменения микробиомов для профилактики и лечения различных заболеваний человека.
The study of the human microbiome, which began 15 years ago and is actively ongoing at the present time, has largely resulted in reconsideration of our views on the underlying mechanisms of interaction between the human body and the microorganisms inhabiting it. The picture that emerged has turned out to be much more complex than expected, especially for the gut microbiome. At present, the scientific concepts of what constitutes the gut microbiome are actively developing. They are based, of course, on a reductionist approach. Thus, the theory of «a core microbiome» and the associated concept of «a healthy microbiome» have been proposed. An even more simplified approach to solving the problem of diversity and variability of intestinal microbiomes is the theory of «enterotypes.» It presupposes the existence of preferred (stable) variants of microbiomes structurally organized around certain groups of microorganisms. If anaerobic gram-negative rods are structure-forming, then such microbiomes are characterized by low species diversity, dominance of a small group of microorganisms, and low stress resistance. These types of microbiomes are found in patients with various pathologies, including extraintestinally localized. Therefore, it is assumed that stratification of microbiomes based on enterotypes is convenient from the practical point of view. At present, the scientific concept of microbiomes has little input into medical practice. However, the already existing experience of using pre- and symbiotics, bacteriophages and fecal transplantation indicates the real possibility of changing microbiomes for the prevention and treatment of various human diseases.