bluuebunny/crossref_metadata_2025_split huggingface dataset:
Deep Learning for Forest Species Identification Based on Macroscopic Images
Authors: Mata-Montero Erick , Arias-Aguilar Dagoberto , Figueroa-Mata Geovanni , Valverde Juan Carlos 
Published: May 2018

The fast and accurate identification of forest species is critical to support their sustainable management, to combat illegal logging, and ultimately to conserve them. Traditionally, the anatomical identification of forest species is a manual process that requires a human expert with a high level of knowledge to observe and differentiate certain anatomical structures present in a wood sample (Wiedenhoeft (2011)).
In recent years, deep learning techniques have drastically improved the state of the art in many areas such as speech recognition, visual object recognition, and image and music information retrieval, among others (LeCun et al. (2015)). In the context of the automatic identification of plants, these techniques have recently been applied with great success (Carranza-Rojas et al. (2017)) and even mobile apps such as Pl@ntNet have been developed to identify a species from images captured on-the-fly (Joly et al. (2014)). In contrast to conventional machine learning techniques, deep learning techniques extract and learn by themselves the relevant features from large datasets.
One of the main limitations for the application of deep learning techniques to forest species identification is the lack of comprehensive datasets for the training and testing of convolutional neural network (CNN) models. For this work, we used a dataset developed at the Federal University of Parana (UFPR) in Curitiba, Brazil, that comprises 2939 images in JPG format without compression and a resolution of 3.264 x 2.448 pixels. It includes 41 different forest species of the Brazilian flora that were cataloged by the Laboratory of Wood Anatomy at UFPR (Paula Filho et al. (2014)). Due to the lack of comprehensive datasets world wide, this has become a benchmark dataset in previous research (Paula Filho et al. (2014), Hafemann et al. (2014)).
In this work, we propose and demonstrate the power of deep CNNs to identify forest species based on macroscopic images. We use a pre-trained model which is built from the resnet50 model and uses weights pre-trained on ImageNet. We apply fine-tuning by first truncating the top layer (softmax layer) of the pre-trained network and replacing it with a new softmax layer. Then we train again the model with the dataset of macroscopic images of species of the Brazilian flora used in (Hafemann et al. (2014), Paula Filho et al. (2014)).
Using the proposed model we achieve a top-1 98% accuracy which is better than the 95.77% reported in (Hafemann et al. (2014) )using the same data set. In addition, our result is slightly better than the reported in (Paula Filho et al. (2014)) of 97.77% which was obtained by combining several conventional techniques of computer vision.
Best Practices for using Cloud Services for Digital Data Archive and Disaster Recovery
Authors: Gerbracht Jeff , Kelling Steve 
Published: May 2018

Managing digital data for long-term archival and disaster recovery is a key component of our collective responsibility in managing digital data and metadata. As more and more data are collected digitally and as the metadata for traditional museum collections becomes both digitized and more comprehensive, the need to ensure that these data are safe and accessible in the long term becomes essential. Unfortunately, disasters do occur and many irreplaceable datasets on biodiversity have been permanently lost. Maintaining a long-term archive and putting in place reliable disaster recovery processes can be prohibitively expensive, both in the cost of hardware and software as well as the costs of personnel to manage and maintain an archival system. Traditionally, storing digital data for the long term and ensuring the data are loss-less, safe and completely recoverable when a disaster occurs has been managed on-premises with a combination of on-site and off-site storage. This requires complex data workflows to ensure that all data are securely and redundantly stored in multiple highly dispersed locations to minimize the threat of data loss due to local or regional disasters. Files are often moved multiple times across operating systems and media types on their way to and from a deep archive, increasing the risk of file integrity issues. With the recent advent of an array of Cloud Services from organizations such as Amazon, Microsoft and Google to more focused offerings from Iron Mountain, Atempo and others, we have a number of options for long term archival of digital data. Deep archive solutions, storage where retrieval expected only in the case of a disaster, are offered by many of these organizations at a rate substantially less than their normal data storage fees.
The most basic requirement for an archival system is storing multiple replicates of the data in geographically isolated locations with a mechanism for guaranteeing file integrity, usually using a checksum algorithm. Additional components that are integral to a robust archive include a simple metadata search and reliable retrieval.
In this presentation, we’ll discuss the need for long term archive and disaster recovery capabilities, detail the current best practices of data archival systems and review a variety of archival options that have become available with Cloud Services.
Le perceur d’enveloppes. De la violence sonore à l’adolescence
Authors: Brault Anthony 
Published: May 2018

Par le présent article, l’auteur souhaite mettre en lumière la place et la fonction du sonore et de la musique au sein du processus d’adolescence. Après une discussion théorique de la notion « d’enveloppe sonore » de Didier Anzieu, l’auteur illustre par une articulation théorico-clinique dans quelle mesure l’enveloppe sonore est attaquée au temps de l’adolescence et comment elle peut y résister, tout en se remaniant, grâce à la musique. Enfin l’auteur dresse l’hypothèse selon laquelle l’émergence de l’écoute plurivocale à l’adolescence implique un réaménagement de l’intériorisation du « Groupe Vocal Familial » (E. Lecourt) nécessaire pour que le sujet puisse faire le deuil de ses objets internes parentaux. Cette hypothèse est illustrée par la vignette clinique d’une adolescente de 16 ans inscrite au sein d’un dispositif de « musicothérapie analytique de groupe », permettant ainsi de témoigner d’une proposition thérapeutique face aux achoppements de ces réaménagements pubertaires.
Silence, dynamiques de survie et engagement du travail psychothérapeutique du traumatisme psychique grave dans l’exemple de patients en demande d’asile
Authors: Jan Olivier 
Published: May 2018

De nombreux demandeurs d’asile présentent des traumatismes cumulatifs, associant les chocs ayant déterminé leur départ, ceux du voyage et de l’arrivée. Le silence fait partie des défenses prégnantes pour qui a été plongé en dynamique de survie. Le sujet serait inféodé, pour se défendre psychiquement, à l’hypervigilance et la répression, les contenus traumatiques exerçant contre ce rempart une poussée constante. Insistance est faite sur les modalités d’accueil à réserver, sur l’engagement personnel requis, respectant le mutisme des patients mais faisant usage de verbalisations « éclairées » du thérapeute, de ses facultés psychiques et mnémoniques pour contenir, d’une part, et, d’autre part, pour relancer la possibilité de mentalisation, d’abord par l’intellect. Les non-dits des patients sur la souffrance psychique en France sont mentionnés, réserves à faire émerger dans l’optique de plus de liberté d’exister et de penser.
« Entreprise libérée » et sociopsychanalyse. Les obstacles à l’intervention
Authors: Prades Jean-Luc , Escanes Jean-David , Morin Philippe 
Published: May 2018

La sociopsychanalyse s’interroge sur les évolutions du contexte de ses interventions. Elle se demande si ces évolutions ne seraient pas en mesure de les empêcher. « L’entreprise libérée », en tant qu’elle représente une nouvelle forme de management, s’imposerait comme objet particulièrement pertinent de cette réflexion. Pour ce faire, ce texte décrit les principales caractéristiques de ce néo-management. Il explicite les conceptions de l’individu et de la liberté et objective les principales caractéristiques de l’ el (entreprise libérée) faisant obstacle à l’introduction d’un Dispositif Institutionnel Mendel ( dim ) en son sein. Les auteurs sont ainsi amenés à interroger l’organisation du travail, la question de l’autorité (et de l’auto-autorité) et à montrer la place prépondérante du leader-libérateur.
Interrogations sur les femmes d’alcooliques : (dé)fondation du couple
Authors: Dudaczyk Delphine , Cloës Claude 
Published: May 2018

Ce travail interroge la place occupée par l’alcool au sein du couple conjugal. Contrairement aux idées reçues, les auteurs soutiennent que l’alcool ne constitue pas un facilitateur de rupture du lien mais s’envisage plus comme un intercalaire venant prévenir le couple de la fusion. Pour chacun des membres du couple, l’alcool revêt une fonction dans l’économie psychique et c’est souvent à l’occasion de la séparation conjugale que se révèlent les fantasmes nouant les sujets entre eux. Le récit de la cure de Simone vient souligner que de tels couples peuvent s’instituer à partir du défaut d’élaboration de chaque sujet de la « solitude sereine ». Progressivement, le travail thérapeutique aura pour objet de permettre au sujet de découvrir sa « capacité à être seul », créatrice d’un nouveau lien à l’autre.
Là où ça peine à avoir un papa, il y a de la peine
Authors: Herbin Andrée 
Published: May 2018

Les façons de « faire un enfant » deviennent biotechniques, des formes nouvelles de famille apparaissent. Est-ce pour autant que ce qui fait l’humanité se déliterait ? L’écoute des patients enseigne que la structure est étonnamment préexistante, y compris dans les failles et les manques. Comme un appel possible au père/à la parole. Là où les fonctions paternelle et maternelle peuvent être soutenues par quiconque s’y propose, être un papa demande qu’un homme s’engage concrètement à élever un enfant. S’il n’est pas là, c’est une privation qui demande à être reconnue pour que le chagrin de l’enfant soit consolé et qu’il puisse ensuite, le cas échéant, se laisser adopter par un autre qui le désirerait. La valeur du récit, d’une parole qui prenne acte de la situation réelle, est ici essentielle et redonne à un enfant son histoire singulière.
Représenter ‘V.’ : récit de soi, récit de l’autre, récit d’un « nous »
Authors: Abdelmoumen Mélikah 
Published: May 2018

Il y a cinq ans, j’ai rencontré des familles roms de Roumanie vivant dans un bidonville de la région lyonnaise. C’était la première fois que je pénétrais dans un tel endroit (mais c’était loin d’être la dernière), et que je me retrouvais face à des personnes qui vivent dans des conditions aussi inhumaines, tout en étant les victimes d’une discrimination dont je n’avais jamais vu l’équivalent. Je suis écrivaine, et chercheuse. Mon réflexe – tout en nouant des liens avec V., une mère de famille nombreuse, et en tentant d’apprendre à la soutenir de la bonne façon (c’est-à-dire de la façon qui lui convienne, à elle, selon ses choix et ses valeurs) – a été de rendre compte non seulement de ce dont j’étais témoin, mais de ma propre position, moi, gadji, privilégiée (qui pouvais perdre ce privilège du jour au lendemain, comme nous tous), mais également immigrée, et appartenant à un groupe (les « Arabes ») dont la position dans la société française actuelle n’est pas non plus anodine. Ce texte raconte donc le parcours de la femme, de l’immigrée, de la citoyenne et de l’autrice que je suis, en réfléchissant également aux problèmes qu’a pu poser au fil du temps et que pose encore le choix d’écrire au sujet de ces personnes auxquelles je suis personnellement liée, attachée, et de les représenter.
Les corvées domestiques sont-elles solubles dans le jeu vidéo ?
Authors: Lignon Fanny 
Published: May 2018

En France, les textes officiels enjoignent les enseignants d’éduquer à l’image et à l’égalité entre les femmes et les hommes. Pourquoi ne pas joindre ces demandes et éduquer à l’un par le truchement de l’autre ? Dans cet article, je présente un jeu sérieux non stéréotypé qui traite du partage des tâches ménagères et j’analyse ses potentialités pédagogiques.
Accumulation, destruction et hybridation chez Gustave Moreau : rêver pour ou contre l’histoire
Authors: Fauriac Lilie 
Published: May 2018

La rémanence du passé visite et tourmente l’œuvre de Gustave Moreau qui est « tatouée » d’une empreinte historique indéniable. Célébré par le xix e siècle, l’éclectisme des arts est observé activement par le peintre curieux et sensible à « l’air du temps ». Dans un processus d’accumulation, l’artiste réceptionne, fragmente et violente l’histoire et les arts qu’il observe au musée et dans les livres. Dans ses toiles, les histoires se rencontrent et donnent naissance à une vision chimérique inédite. L’abondance ornementale, l’hybridation des mythes, l’étreinte des passés se transforment en des ailleurs qui déforment l’histoire. Cette distorsion semble tout autant étrange que symptomatique d’un siècle marqué par la brutalité des changements politiques et sociaux. Moreau use d’un imaginaire affranchi des limites du présent, préférant ainsi le rêve à son histoire cauchemardesque.
Voir le passé dans les ruines romantiques : une histoire politique et littéraire
Authors: Lyon-Caen Judith 
Published: May 2018

Cet article propose une histoire de l’expérience qui consiste à voir et éprouver la présence du passé dans les ruines médiévales mises au goût du jour par les romantiques. Il ne s’agit pas d’une histoire, culturelle, de la diffusion de la « sensibilité romantique », mais d’une enquête sur l’efficace politique de la publication d’images et de textes de littérature aptes à faire voir du passé aux lecteurs du xix e siècle. De l’entreprise éditoriale lancée sous la Restauration par Charles Nodier et Justin Taylor, les Voyages pittoresques et romantiques dans l’Ancienne France, aux premiers dispositifs touristiques à Jumièges, au début des années 1830, il s’agit de suivre l’effacement d’un usage politico-religieux des ruines sous la Restauration, dont les Voyages portent la trace discrète, au profit d’un usage patrimonial, destiné à traverser le temps.
Normalizing difference: Emotional intelligence and diversity management competence in healthcare managers
Authors: Oyewunmi Adebukola E. 
Published: May 2018

Purpose: Diversity is synonymous with difference. The diverse workforce presents an array of complexities which necessitates the deployment of specific managerial competencies. Empirical evidences have indicated the role of emotional intelligence in the enhancement of abilities. Thus, this study investigated the relationship between emotional intelligence and diversity management competency amongst healthcare managers in Southwest Nigeria. Design: The descriptive survey method was adopted for the study. A total of 360 respondents completed the structured questionnaire titled Emotional Intelligence and Diversity Management Competency Questionnaire (EIDMCQ). Data was analyzed using descriptive and inferential statistics such as, Multiple Regression Analyses and Pearson Product Moment Correlation Statistical methods. Findings: A positive correlation was found between emotional intelligence and diversity management competency. Gender, ethnicity, and age, did not moderate the relationship between emotional intelligence and diversity management competency. Practical Implications: As difference is the reality of modern organizations, it is important to conceptualize it as normal and positive. Emotional intelligence is recommended as a critical tool to normalize the individual perceptions of difference. The re-assessment of the functions of managers must be followed by total commitment to capacity building in emotional intelligence, as well as the re-engineering of organizational and national cultures to promote equal opportunities, inclusion and diversity leveraging. Originality/value: This study pioneers research on emotional intelligence and diversity management competency in Nigeria’s public healthcare sector. It conceptualizes diversity management on an individual- managerial level. Practical interventions are provided to enhance the application of specific competencies to optimize a diverse workplace.
Aphotic N2 fixation along an oligotrophic to ultraoligotrophic transect in the western tropical South Pacific Ocean
Authors: Benavides Mar , Shoemaker Katyanne M. , Moisander Pia H. , Niggemann Jutta , Dittmar Thorsten , Duhamel Solange , Grosso Olivier , Pujo-Pay Mireille , Hélias-Nunige Sandra , Fumenia Alain , Bonnet Sophie 
Published: May 2018

Abstract. The western tropical South Pacific (WTSP) Ocean has been recognized as a
global hot spot of dinitrogen (N2) fixation. Here, as in other marine
environments across the oceans, N2 fixation studies have focused on
the sunlit layer. However, studies have confirmed the importance of aphotic
N2 fixation activity, although until now only one had been performed
in the WTSP. In order to increase our knowledge of aphotic N2 fixation
in the WTSP, we measured N2 fixation rates and identified diazotrophic
phylotypes in the mesopelagic layer along a transect spanning from New
Caledonia to French Polynesia. Because non-cyanobacterial diazotrophs
presumably need external dissolved organic matter (DOM) sources for their
nutrition, we also identified DOM compounds using Fourier transform ion
cyclotron resonance mass spectrometry (FTICRMS) with the aim of searching for
relationships between the composition of DOM and non-cyanobacterial N2
fixation in the aphotic ocean. N2 fixation rates were low (average
0.63 ± 0.07 nmol N L−1 d−1) but consistently detected across
all depths and stations, representing ∼ 6–88 % of photic
N2 fixation. N2 fixation rates were not significantly
correlated with DOM compounds. The analysis of nifH gene amplicons
revealed a wide diversity of non-cyanobacterial diazotrophs, mostly matching
clusters 1 and 3. Interestingly, a distinct phylotype from the major
nifH subcluster 1G dominated at 650 dbar, coinciding with the
oxygenated Subantarctic Mode Water (SAMW). This consistent pattern suggests
that the distribution of aphotic diazotroph communities is to some extent
controlled by water mass structure. While the data available are still too
scarce to elucidate the distribution and controls of mesopelagic
non-cyanobacterial diazotrophs in the WTSP, their prevalence in the
mesopelagic layer and the consistent detection of active N2 fixation
activity at all depths sampled during our study suggest that aphotic N2 fixation may contribute significantly to fixed nitrogen inputs in this area
and/or areas downstream of water mass circulation.
ReOBS: a new approach to synthesize long-term multi-variable dataset and application to the SIRTA supersite
Authors: Chiriaco Marjolaine , Dupont Jean-Charles , Bastin Sophie , Badosa Jordi , Lopez Julio , Haeffelin Martial , Chepfer Helene , Guzman Rodrigo 
Published: May 2018

Abstract. A scientific approach is presented to aggregate and harmonize a set of 60
geophysical variables at hourly timescale over a decade, and to allow multiannual
and multi-variable studies combining atmospheric dynamics and
thermodynamics, radiation, clouds and aerosols from ground-based
observations. Many datasets from ground-based observations are currently in
use worldwide. They are very valuable because they contain complete and
precise information due to their spatio-temporal co-localization over more
than a decade. These datasets, in particular the synergy between different
type of observations, are under-used because of their complexity and
diversity due to calibration, quality control, treatment, format, temporal
averaging, metadata, etc. Two main results are presented in this article: (1) a set of methods available for the community to robustly and reliably process
ground-based data at an hourly timescale over a decade is described and (2) a single netCDF file is provided based on the SIRTA supersite observations.
This file contains approximately 60 geophysical variables (atmospheric and
in ground) hourly averaged over a decade for the longest variables. The
netCDF file is available and easy to use for the community. In this article,
observations are “re-analyzed”. The prefix “re” refers to six main steps:
calibration, quality control, treatment, hourly averaging, homogenization of
the formats and associated metadata, as well as expertise on more than a decade of
observations. In contrast, previous studies (i) took only some of these six
steps into account for each variable, (ii) did not aggregate all variables
together in a single file and (iii) did not offer an hourly resolution for
about 60 variables over a decade (for the longest variables). The approach
described in this article can be applied to different supersites and to
additional variables. The main implication of this work is that complex
atmospheric observations are made readily available for scientists who are
non-experts in measurements. The dataset from SIRTA observations can be
downloaded at http://sirta.ipsl.fr/reobs.html (last access: April 2017) (Downloads tab, no
password required) under https://doi.org/10.14768/4F63BAD4-E6AF-4101-AD5A-61D4A34620DE.
Characteristics and frequency of large submarine landslides at the western tip of the Gulf of Corinth
Authors: Beckers Arnaud , Hubert-Ferrari Aurelia , Beck Christian , Papatheodorou George , de Batist Marc , Sakellariou Dimitris , Tripsanas Efthymios , Demoulin Alain 
Published: May 2018

Abstract. Coastal and submarine landslides are frequent at the western tip of the Gulf
of Corinth, where small to medium failure events (106–107 m3)
occur on average every 30–50 years. These landslides trigger tsunamis and
consequently represent a significant hazard. We use here a dense grid of
high-resolution seismic profiles to realize an inventory of the large mass
transport deposits (MTDs) that result from these submarine landslides. Six
large mass wasting events are identified, and their associated deposits
locally represent 30 % of the sedimentation since 130 ka in the main western
basin. In the case of a large MTD of ∼ 1 km3 volume, the
simultaneous occurrence of different slope failures is inferred and suggests
an earthquake triggering. However, the overall temporal distribution of MTDs
would result from the time-dependent evolution of pre-conditioning factors
rather than from the recurrence of external triggers. Two likely main
pre-conditioning factors are (1) the reloading time of slopes, which varied
with the sedimentation rate, and (2) dramatic changes in water depth and
water circulation that occurred 10–12 ka ago during the last post-glacial
transgression. Such sliding events likely generated large tsunami waves in
the whole Gulf of Corinth, possibly larger than those reported in historical
sources considering the observed volume of the MTDs.