МИКОБИОТА ДОННЫХ ГРУНТОВ ПРИБРЕЖНОЙ ЗОНЫ ОЗЕРА БАЙКАЛ
Authors: М.Д. ФЕДОРОВА , А.В. КУРАКОВ 
Published: November 2024

На основе культурального метода и высокопроизводительного секвенирования ITS2 участка рДНК определена численность колониеобразующих единиц (КОЕ), таксономическая структура и видовое богатство грибных сообществ в донных грунтах озера Байкал с глубин от 9 до 178 м. Выявлено 215 видов, 138 родов, 50 порядков, 22 класса, 6 отделов - Ascomycota, Basidiomycota, Mucoromycota, Mortierellomycota, Chytridiomycota, Glomeromycota. Только ДНК-баркодинг позволил обнаружить представителей отделов Chytridiomycota, Glomeromycota и Rozellomycota. Культуральными методами и высокопроизводительным секвенированием ITS2 участка рДНК в грунтах выявлено 77 и 146 видов соответственно, и только восемь видов установлено обоими подходами. Большая часть нуклеотидных последовательностей не была идентифирована до уровня семейств и видов. В составе микобиоты грунтов есть представители различных эколого-трофических групп - сапротрофов, патогенов, симбиотрофов. Это преимущественно психротолерантные организмы, среди них есть факультативно-анаэробные виды. Установлены изменения таксономической структуры грибных сообществ в зависимости от глубины и виды, способные функционировать в грунтах. Это, в частности, Pseudeurotium bakeri, Pseudeurotium hygrophilum, Pseudogymnoascus pannorum, Pseudogymnoascus roseus, Trichoderma hamatum, Trichoderma harzianum, Trichoderma lixii, Trichoderma polysporum, Penicillium glandicola, Penicillium swiecickii, виды родов Rhizophydium, Fusarium, Daldinia, Mortierella, Coniochaeta, Cystobasidium, Mrakia, Rhodothorula, Solicoccozyma и ряд других. Создана коллекция штаммов грибов, изолированных из донных грунтов Байкала.
Based on the culture method and high-performance sequencing of the ITS2 rDNA site, the number of colony-forming units (CFU), taxonomic structure and species richness of fungal communities in the bottom ground of Lake Baikal from depths from 9 to 178 m were determined. 215 species of 138 genera of 50 orders of 22 classes of 6 divisions - Ascomycota, Basidiomycota, Mucoromycota, Mortierellomycota, Chytridiomycota, Glomeromycota have been identified. Only DNA barcoding allowed to detect representatives of the Phyla of Chytridiomycota, Glomeromycota and Rozellomycota. The cultural method and high-performance sequencing of the ITS2 rDNA site in the soil revealed 77 and 146 species, respectively, and only 8 species were established by both approaches. Most of the nucleotide sequences have not been identified to the level of families and species. There are representatives of various ecological and trophic groups - saprotrophs, pathogens, symbiotrophs in the mycobiota of the bottom grounds. These are mainly psychrotolerant organisms, among them there are facultative anaerobic species. Changes in the taxonomic structure of fungal communities depending on the depth and species, and able to function in soils, have been established. These are, in particular, Pseudeurotium bakeri, Pseudeurotium hygrophilum, Pseudogymnoascus pannorum, Pseudogymnoascus roseus, Trichoderma hamatum, Trichoderma harzianum, Trichoderma lixii, Trichoderma polysporum, Penicillium glandicola, Penicillium swiecickii, species of the genera Rhizophydium, Fusarium, Daldinia Mortierella, Coniochaeta, Cystobasidium, Mrakia, Rhodothorula, Solicoccozyma and a number of others. A collection of fungal strains isolated from the bottom soils of Lake Baikal has been created.