bluuebunny/crossref_metadata_2025_split huggingface dataset:
Calcium Paradox, Vitamin D dan Vitamin K2
Authors: Mose Johanes C. 
Published: November 2024

Suplementasi kalsium dalam kehamilan merupakan praktik ANC yang rutin dan standar ANC yang baik sesuai rekomendasi WHO, FIGO, POGI, maupun Kemenkes RI.Kalsium sangat dibutuhkan baik selama kehamilan ataupun diluar kehamilan, terutama untuk pertumbuhan tulang dan gigi, mencegah osteoporosis, ikut dalam proses pembekuan darah, mencegah pendarahan dalam kehamilan dan persalinan, berperan pada mekanisme kontraksi otot, mencegah hipertensi, preeklamsi, prematuritas, BBLR, stunting, meningkatkan kekebalan tubuh, dll.Prevalensi hipokalsemia dalam kehamilan bervariasi antara 60% (Pakistan), 66,4% (India) dan 70,55% (Algeria) pada kelompok negara berkembang (LMIC=low-medium income countries) dan sekitar 30-60% dikelompok negara maju (HIC=high income countries).Suatu penelitian systematic review tentang kecukupan asupam kalsium selama kehamilan (2019) melaporkan prevalensi asupan kalsium < 800 mg/hari (normal: 1000-1200 mg/hari) sebesar 29% di HIC dan 82% di LMIC. Termasuk Malaysia 377 mg/hari, Indonesia < 400 mg/hari.
Complete blood count parameters and inflammation-related biomarkers in patients with colorectal carcinoma
Authors: Koržinek Martha , Ćelap Ivana , Fabijanec Marija , Žanić Tena , Ljubičić Neven , Baršić Neven , Verbanac Donatella , Barišić Karmela , Rajković Marija Grdić 
Published: November 2024

Abstract
The aim of this study was to determine whether there are differences in complete blood count parameters (CBC) and inflammation-related biomarkers, MPV/PC, PLR, NLR, LWR, LMR, NMR, and LCR, among patients with colorectal carcinoma (CRC) and patients with colorectal adenomas. The study included 155 patients who were divided into two groups according to histopathological analysis – 74 adenomas patients and 81 CRC patients. A routine examination of CBC was conducted on Sysmex XN1000 whereas CRP was measured on Alinity ci-series. Statistical analysis was performed by ROC curve analysis using MedCalc Statistical Software. In CRC patients, hemoglobin concentration, hematocrit, MCV, MCH, and MCHC were lower, while RDW was higher (p < 0.001), compared to patients with adenomas. Total leukocyte count (p = 0 .006), absolute neutrophils (p = 0.005), and absolute monocytes (p = 0.007) were lower while relative eosinophils (p = 0.001) and relative basophils (p = 0.001) were higher in CRC patients. Platelet count (p < 0.001) was significantly higher and MPV (p = 0.003) was significantly lower in CRC patients. Furthermore, MPV/PC (p < 0.001) was significantly lower and PLR (p < 0.001) was significantly higher in CRC. Moreover, Receiver Operating Characteristic (ROC) analysis revealed poor diagnostic accuracy, for all tested parameters (AUC was 0.7 or less). PC, MPV, MPV/PC, and PLR were significantly different between study groups, but ROC analysis revealed poor diagnostic accuracy. Lower hemo globin levels in CRC patients are possibly due to more frequent and excessive bleeding. Higher levels of basophils and eosinophils in CRC patients are indicators of inflammatory reaction, which is linked to CRC.
Knockdown of ribosomal protein L22-like 1 arrests the cell cycle and promotes apoptosis in colorectal cancer
Authors: Li Chunming , Du Xinna , Zhang Hu , Liu Shuang 
Published: November 2024

Objective:
Colorectal cancer (CRC) remains a remarkable challenge despite considerable advancements in its treatment, due to its high recurrence rate, metastasis, drug resistance, and heterogeneity. Molecular targets that can effectively inhibit CRC growth must be identified to address these challenges. Therefore, we aim to reveal the regulatory effect of ribosomal protein L22-like 1 (RPL22L1) on the proliferation and apoptosis of CRC cells and its potential mechanism.

Material and Methods:
We detected the expression of RPL22L1 from the Cancer Genome Atlas, Gene Expression Omnibus and UALCAN databases. The effects of RPL22L1 on CRC growth and migration were determined by knocking down RPL22L1 in human CRC cell lines and those on the cell cycle and apoptosis using flow cytometry. The influence of RPL22L1 knockdown on xenograft tumor growth was verified in vivo. The potential RPL22L1 mechanisms in promoting cancer were predicted with RNA sequencing (RNAseq). The molecular mechanism of enhanced apoptosis and cell cycle arrest in RPL22L1 knockdown was revealed using real-time reverse transcriptase-quantitative polymerase chain reaction (RT-qPCR) and Western blotting.

Results:
The present study reveals a considerable upregulation of RPL22L1 expression in CRC as well as in diverse tumor tissues, and most cells within the CRC tumor microenvironment (TME) demonstrate RPL22L1 expression. Notably, this elevated expression level of RPL22L1 exhibits a strong association with an unfavorable prognosis among patients diagnosed with CRC (P < 0.05). Furthermore, the association between RPL22L1 expression and the CRC TME index did not exhibit statistical significance (P > 0.05). However, RPL22L1 knockdown experiments revealed a substantial suppression of growth and migratory capacities in CRC cells RKO and HCT116 (P < 0.05). Flow cytometry analysis exhibited that on RPL22L1 knockdown, a remarkable arrest of the G1 and S phases of the cell cycle (P < 0.05) occurred. In addition, a remarkable elevation in the level of cell apoptosis was observed (P < 0.001). RNAseq exhibited that cell cycle, DNA replication, and mechanistic target of rapamycin (mTOR) complex 1pathway were inhibited after RPL22L1 knockdown, whereas the apoptosis pathway was activated (P < 0.05). Validation through RT-qPCR and western blot analysis also corroborated the downregulation of P70S6K, MCM3, MCM7, GADD45B, WEE1, and MKI67 expression levels, following RPL22L1 knockdown (P < 0.05). Consequent rescue experiments offered supportive evidence, indicating the involvement of the mTOR pathway in mediating the influence of RPL22L1 on the promotion of cell cycle progression. Moreover, in vivo assays involving tumor-bearing mice exhibited that diminished RPL22L1 levels led to arrested CRC growth (P < 0.05).

Conclusion:
These findings support RPL22L1 as a possible prognostic and therapeutic target in CRC, providing novel insights into the development of anticancer medications.
Базовые компоненты аппаратно-программного комплекса моделирования и управления тороидальной плазмой методом эпсилон-сетей на гетерогенных мини -суперкомпьютерах
Authors: Ф.С. Зайцев , А.Г. Шишкин , А.А. Лукьяница , Е.П. Сучков , С.В. Степанов , Ф.А. Аникеев 
Published: November 2024

С помощью гетерогенных мини-супер-ЭВМ НИИСИ РАН сделан существенный шаг в решении новых важных фундаментальных задач управления высокотемпературной плазмой то-роидальной конфигурации. Разработаны и реализованы базовые компоненты аппаратно-программного комплекса моделирования и автоматического управления плазмой в реальном масшта-бе времени с обратной связью. В основе комплекса лежит принципиально новый, более точный и на-дёжный алгоритм управления, использующий решение с заданной точностью ряда обратных диагно-стических задач методом ε-сетей. Продемонстрирована возможность применения предложенной ме-тодики во время разряда для обеспечения управления с обратной связью границей и внутренними па-раметрами плазмы. Показано, что комплекс позволяет исследовать процессы в уже эксплуатируемых и вновь проектируемых термоядерных установках, решать задачи использования термоядерного син-теза для производства энергии. Выработаны рекомендации для инженерного исполнения систем управления плазмой. Сформулированы направления дальнейших исследований.
A significant step was made in addressing new and important fundamental problems of high-temperature toroidal plasma control. The basic hardware and software components of complex for mod-eling and automatic real-time feedback plasma control were developed and implemented. The complex is grounded on a brand new, more accurate and reliable control algorithm that uses the solution to a given accu-racy by epsilon-nets of a number of inverse diagnostic problems. The possibility of applying the proposed method during discharge to provide feedback control of the plasma boundary and internal parameters was demonstrated. It is shown that the complex allows investigating processes in already exploited and newly de-signed thermo-nuclear devices and solving problems of using fusion for energy production. Recommenda-tions for the engineering implementation of plasma control systems are worked out. Directions for further re-search are formulated.
Резервирование каналов приёма-передачи данных в коммуникационных контроллерах встроенного применения
Authors: И.М. Косарев 
Published: November 2024

Предложен алгоритм настройки, инициализации и контроля физического дуплексного канала связи с Nx/Mx/1x сигнальными парами, обеспечивающий многократное резервирование передающих линий с возможностью выбора числа резервных сигнальных пар. Представленные подходы к реализации обеспечивают максимальную пропускную способность в отсутствие ошибок и высокую надёжность физического канала приёма-передачи данных с сохранением высокой пропускной способности в случае повреждений и повторяющихся ошибок одной или нескольких линий связи.
Methods and link training algorithm for robust serial data links in a high speed serial interconnect having multiple Nx/Mx/1x data lanes with parallelism. Operational aspects of the interconnect provide highest data rate in serial interconnect having a plurality of data lanes n absence of link errors and high reliability of physical serial data interface combined with high data rate in case of multiple bit data errors or multi lane failures. Keywords: multi-lane channel data parallelism, robust serial data interface, link training and status state machine, crosslink.
Тестирование инструментальных средств разработки ПО
Authors: В.А. Галатенко , К.А. Костюхин , М.Д. Дзабраев 
Published: November 2024

Настоящая статья посвящена обзору инструментария автоматизированного тестирования DejaGnu, на основе которого в проекте GNU были разработаны тесты для GCC и GDB. Также в рамках данной статьи будут подробно рассмотрены тесты GCC и GDB, применяемые в ФГУ ФНЦ НИИСИ РАН для проверки качества разрабатываемых программных изделий
This article is devoted to a review of the automated testing tool DejaGnu. This tool is used in various GNU projects such as GDB and GCC. Also this work discuss tests of GCC and GDB, which used in SRISA RAS for testing the quality of these software products
Составление многопроцессорных расписаний с ограничениями на связи между процессорами
Authors: М.Г. Фуругян 
Published: November 2024

Решается задача составления многопроцессорного расписания с прерываниями и ограниче-ниями на связи между процессорами. Кроме того, учитываются затраты на обработку прерываний и пере-ключений с одного процессора на другой. Разработаны алгоритмы, основанные на сведении исходной задачи к многопродуктовой потоковой задаче и целочисленной системе линейных ограничений
The problem of deadline scheduling in multiprocessor system with identical directive intervals and with cost accounting for interrupts is studied. The algorithm of construction of feasible schedule was elaborated. This algorithm is pseudopolynomial and has linear complexity depending on number of jobs when number of processors is fixed
Реализация возможности пошаговой отладки при отладке тестовых сценариев на модели СБИС СиК
Authors: А.В. Андрианов 
Published: November 2024

При разработке и отладке программных тестов на модели СБИС средства пошаговой и интерактивной отладки в большинстве недоступны, а программные средства отладки, такие как форматированный вывод, требуют существенных ресурсов. Коммерческие программно-аппаратные комплексы для отладки по интерфейсу JTAG в большинстве своем не поддерживают работу на модели СБИС. В статье описана практика применения свободной реализации JTAG отладчика OpenOCD для реализации функции пошаговой отладки на модели СБИС
Step-through and interactive debugging is usually unavailable during development and debugging of software tests for “System-on-Chip” model. Software debugging facilities like formatted output require a lot of resources. Commercial JTAG debuggers usually can’t be connected to a SoC simulation model therefore can’t be used. The article describes how to use OpenOCD, a free and open-source software-based JTAG debugger to implement step-through and interactive debugging on a SoC model
Моделирование устойчивости к сбоям КМОП элементов ассоциативной памяти с использованием средств TCAD
Authors: Ю.В. Катунин , В.Я. Стенин 
Published: November 2024

Ячейки памяти STG DICE (Spaced Transistor Groups DICE) с транзисторами, разделенными на две группы, совместно с комбинационной логикой являются основой для проектирования устойчивых к сбоям элементов ассоциативной памяти. Результаты TCAD моделирования воздействий одиночных ядерных частиц с треками, проходящими на глубинах от 50 нм до 850 нм от поверхности кристалла, показывают, что воздействия заряда с трека только на одну из групп транзисторов не приводит к сбоям в диапазоне линейных потерь энергии (ЛПЭ) 1-60 МэВ×см2/мг. Сбой логического состояния STG DICE возможен при треках вдоль линии, соединяющей две разнесённые группы транзисторов и при треках по нормали к поверхности кристалла при ЛПЭ больше 60 МэВ×см2/мг. Логические элементы сопоставления и маскирования на основе ячейки STG DICE устойчивы при ЛПЭ до 60 МэВ×см2/мг. Возможны кратковременные импульсы помех на выходе комбинационной логики при ЛПЭ, начиная с 30 МэВ×см2/мг
TCAD simulation of effects of single nuclear particles to the STG DICE memory cells (Spaced Transistor Groups DICE) were made with the tracks on lines connecting the drains of mutually sensitive CMOS transistors inside one group of transistors, and between the two groups at depths ranging from 50 nm to 850 nm from the chip surface. The impacts of the charge from the track only on one group of transistors does not lead to the upset of STG DICE cells for tracks at depths 450-850 nm in range of linear energy transfer (LET) on tracks 1-60 MeV×cm2/mg. The cell upset is possible when the particle tracks are along the line joining the two groups of cell transistors, and angular deviation from it is in the range of 40°. At the direction of the track normal to the chip surface failure is possible if the LET is more than 50-60 MeV×cm2/mg. TCAD simulation results obtained for logical elements of matching and masking on the STG DICE cell confirm their stability to single nuclear particles with LET up to 60 MeV×cm2/mg. Short-term noise pulses are possible at the output of the combinational logic at LET from 30 MeV×cm2/mg
Повышение надёжности считывания данных в статических КМОП ОЗУ при воздействии отдельных ядерных частиц
Authors: П.В. Степанов , Ю.В. Катунин 
Published: November 2024

Ячейка памяти STG DICE обладает повышенной сбоеустойчивостью к воздействию отдельных ядерных частиц за счет разделения транзисторов на две группы и разнесения этих групп. При воздействии частицы ячейка переходит в нестационарное состояние длительностью до 1 нс. Известные схемы считывания данных ячейки памяти STG DICE используют данные одного, двух или четырех узлов ячейки. Представленный блок чтения на основе считывающих усилителей со смещенной передаточной характеристикой отличается способностью осуществить чтение данных в нестационарном состоянии ячейки, определяя два из четырех узлов ячейки STG DICE, сохраняющих свое состояние
The STG DICE memory cell has increased fault tolerance to the effects of single nuclear particles due to the separation of transistors into two groups and the spacing of two transistor groups. When a particle impacts to a cell, it goes into an unsteady state with a duration of up to 1 ns. Different reading schemes for STG DICE memory cells use data from one, two or four cell nodes. The presented reading scheme based on the reading amplifiers with the shifted transfer characteristic is able to read data in the unsteady state of the cell by determining two of the four STG DICE cell nodes, that keep their logic levels unchanged during the unsteady state
Анализ пригодности современных компактных моделей КНИ МОП-транзисторов к моделированию в расширенном диапазоне температур
Authors: Г.А. Яшин , А.В. Амирханов , А.А. Глушко , В.В. Макарчук , А.С. Новосёлов 
Published: November 2024

В работе был проведен анализ пригодности компактных моделей BSIMSOI4.5 и HISIMSOI1.30 для моделирования электрических характеристик в расширенном диапазоне температур. Была проведена экстракция параметров моделей на основе измерений КНИ МОП-транзисторов, выпол ненных по технологии с минимальной проектной нормой 0.35 мкм, после чего было проведен анализ со ответствия модельных пара метров экспериментальным для таких электрических характеристик транзи стора, как пороговое напряжение и ток стока в режиме насыщения
In the paper, the suitability of compact models BSIMSOI4.5 and HISIMSOI1.30 was simulated to simulate electrical characteristics over an extended temperature range. Extraction of model parameters was made on the basis of experi-mental measurements of SOI MOS transistors made using the technology with a minimum design length of 0.35 μm, after which the model parameters were analyzed for the experimental characteristics of such electrical characteristics of the transistor as threshold voltage, drain current in saturation mode
Гауссова аппроксимация спектральной плотности для 1D модели Изинга
Authors: И.М. Каганова , Л.Б. Литинский 
Published: November 2024

Изучена плотность состояний для 1D модели Изинга. Установлено, что гауссова аппроксимация спектральной плотности делает метод n-окрестностей непригодным для описания 1D модели Изинга. Найдено точное комбинаторное выражение для распределения энергий в n-окрестности. На этой основе получено распределение намагниченности для произвольной температуры
Normal approximation of a spectral density for 1D Ising Model
Нульмерная математическая модель для анализа разработки нефтяных месторождений методом ячеек заводнения
Authors: И.В. Афанаскин , А.В. Королев 
Published: November 2024

Представлена нульмерная математическая модель для анализа разработки нефтяных месторождений методом ячеек заводнения. Кроме классических возможностей метода ячеек заводнения эта модель позволяет прогнозировать показатели разработки при режимах работы скважин, отличающихся от базовых. Модель справедлива при условии, что пластовое и забойное давление выше давления насыщения нефти газом. При этом скважины должны быть уже обводнены (параметры необводненных скважин прини-маются по аналогии). Предлагается подход к автоматизации процесса адаптации модели ячеек заводнения. В приведенном примере использования модели получено хорошее совмещение фактических и расчетных пока-зателей разработки не только на истории, но и при прогнозе. В примере дается анализ влияния шага по вре-мени на точность расчета пластового давления и водонасыщенности.
A null-dimensional mathematical model is derived for the oil field production analysis using the method of waterflooding cells. In addition to the classic capabilities of the waterflooding cell method, this model makes it possible to evaluate the development indices at well operating modes that differ from the basic ones. But the only limit in this case is that the reservoir and bottomhole pressures should be higher than the bubble point pressure. At the same time, the wells should already be flooded (the parameters of non-watered wells are taken by analogy). An approach is proposed for automatic history matching using the waterflood cell model. In the example given, good results for the model in question were obtained not only in history matching, but for the forecast too. The example gives an analysis of the time step effect on the reservoir pressure and water saturation calculation
Применение методики расчета двухфазной фильтрации жидкости в пористых средах на модели реального месторождения
Authors: О.И. Бутнев , В.Ю. Кузнецов , В.А. Пронин , М.Л. Сидоров , И.В. Афанаскин , А.В. Королев , П.В. Ялов 
Published: November 2024

Ранее авторами была опубликована методика расчета двухфазной фильтрации жидкостей (на основе модели BlackOil) с использованием призматических структурированных и неструктурированных сеток, в которой для решения уравнений был применен полностью неявный конечно-объемный метод. Работоспособность методики была продемонстрирована на тестовой задаче, основанной на стандартном тесте SPE8. В данной статье приводятся результаты расчета гидродинамической модели реального месторождения по методике, изложенной ранее. Полученные результаты сравниваются с результатами коммерческого программного обеспечения.
Results of hydrodynamic modelling on a real oil field are reported. Modelling was done by using a special methodology published earlier by authors. Proposed methodology of two-phase flow modelling is based on a “Black Oil” model with using a prismatic structured and unstructured grids and totally implicit finite-volumetric approach. Earlier this method was tested by using standard SPE8 test. In this article it was tested using real oil-field data and compared with results obtained by using standard commercial software.
Производительность современных вычислительных платформ в расчетах молекулярной динамики белок-мембранных систем
Authors: Д.Е. Нольде , Н.А. Крылов , П.Н. Телегин , Р.Г. Ефремов , Б.М. Шабанов 
Published: November 2024

На примере программного пакета Gromacs проведено исследование скорости расчета классической молекулярной динамики на различных компьютерных системах: настольных компьютерах, кластеров на основе процессоров x86_64, многоядерных процессоров архитектуры MIC, а также гетерогенных систем с использованием «игровых» видеокарт или графических ускорителей. Рассмотрен вопрос выбора оптимальной платформы для проведения расчетов молекулярной динамики.
The performance of molecular dynamics software package Gromacs was measured on various hardware: desktop computers, clusters based on x84_64 processors or many integrated core processors, and heterogeneous system with gaming graphic cards or general purpose GPU systems. The optimal choice of hardware for molecular dynamics simulations is discussed.
О некоторых подходах к построению цифровых моделей 3D-объектов и формированию виртуальных коллекций
Authors: А.Н. Сотников , И.Н. Соболевская , И.Н. Чередниченко 
Published: November 2024

В данной статье рассмотрены некоторые подходы к построению цифровых моделей 3D-объектов и формированию виртуальных коллекций на основе полученный цифровых объектов. Рассмотрен, в частности, подход, основанный на методе фотограмметрии - трехмерной реконструкция объекта по стереоти-пам фотоизображениям. Описаны подходы, основанные на использовании технологий лазерного 3D-сканирования, а также, рассказано о подходе к построению цифровых 3D-объектов с использованием скане-ров со структурированной подсветкой. Описано для каких наборов данных реконструкция 3D-модели мето-дом фотограмметрии невозможна. Также рассмотрены виды технологий лазерного 3D-сканирования. Пред-ложена технология представления виртуальных коллекций через интернет
This article is about some approaches to the construction of digital models of 3D-objects and the formation of virtual collections based on the resulting digital objects. The method based on photogrammetry (a three-dimensional reconstruction of an object according to stereotypes of photographic images) is described too. The ap-proaches based on the use of 3D laser scanning technology are described, as well as an approach to the construction of digital 3D objects using scanners with structured backlighting is described. Described for which data sets the re-construction of the 3D-model by photogrammetry is impossible. Also considered are the types of 3D laser scanning technology. The technology of presentation of virtual collections via the Internet is proposed
Аппаратная реализация алгоритма Adler32 для вычисления контрольных сумм
Authors: А.В. Крыницкий 
Published: November 2024

В статье рассказывается о вариантах аппаратной реализации алгоритма Adler32 для вычисления контрольных сумм и описывается разработка синтезируемых моделей на языке Verilog
This paper observes variants of hardware realization of the Adler32 checksum algorithm and describes synthesizable Verilog RTL model