bluuebunny/crossref_metadata_2025_split huggingface dataset:
Discovery and characterisation of long-period eclipsing binary stars from Kepler K2 campaigns 1, 2, and 3
Authors: Maxted P. F. L. , Hutcheon R. J. 
Published: March 2018

Context. The Kepler K2 mission now makes it possible to find and study a wider variety of eclipsing binary stars than has been possible to-date, particularly long-period systems with narrow eclipses.
Aims. Our aim is to characterise eclipsing binary stars observed by the Kepler K2 mission with orbital periods longer than P ≈ 5.5 days.
Methods. The ellc binary star model has been used to determine the geometry of eclipsing binary systems in Kepler K2 campaigns 1, 2 and 3. The nature of the stars in each binary is estimated by comparison to stellar evolution tracks in the effective temperature – mean stellar density plane.
Results. 43 eclipsing binary systems have been identified and 40 of these are characterised in some detail. The majority of these systems are found to be late-type dwarf and sub-giant stars with masses in the range 0.6–1.4 solar masses. We identify two eclipsing binaries containing red giant stars, including one bright system with total eclipses that is ideal for detailed follow-up observations. The bright B3V-type star HD 142883 is found to be an eclipsing binary in a triple star system. We observe a series of frequencies at large multiples of the orbital frequency in BW Aqr that we tentatively identify as tidally induced pulsations in this well-studied eccentric binary system. We find that the faint eclipsing binary EPIC 201160323 shows rapid apsidal motion. Rotational modulation signals are observed in 13 eclipsing systems, the majority of which are found to rotate non-synchronously with their orbits.
Conclusions. The K2 mission is a rich source of data that can be used to find long period eclipsing binary stars. These data combined with follow-up observations can be used to precisely measure the masses and radii of stars for which such fundamental data are currently lacking, e.g., sub-giant stars and slowly-rotating low-mass stars.
Ergebnisse der Rekonstruktion der Mittelgliedbasis am Finger durch ein osteochondrales Transplantat vom Os hamatum
Authors: Pillukat Thomas , Kalb Karlheinz , Windolf Joachim , van Schoonhoven Jörg 
Published: March 2018

ZusammenfassungDie frakturierte Mittelgliedbasis wurde bei 13 Patienten durch ein osteochondrales Transplantat aus der karpometakarpalen Gelenkfläche des Os hamatum rekonstruiert. Ziel war die Wiederherstellung der Gelenkstabilität unter Erhalt der Beweglichkeit. Die Indikation bestand bei akuter oder veralteter isolierter Destruktion der palmaren Mittelgliedbasis ≥ 30 %. Kontraindikationen waren eine Destruktion des Grundgliedkopfes, fortgeschrittene Knorpelschäden am Grundgliedkopf bei veralteten Verletzungen und ausgedehnte Weichteilverletzungen mit fehlender Hautdeckung des Mittelgelenkes.Bei der Operation wurde die frakturierte Mittelphalanxbasis debridiert und der Defekt durch ein passendes Transplantat aus der karpometakarpalen Gelenkfläche des Os hamatum ersetzt, das mit Minischrauben fixiert wurde.Die knöcherne Heilung wurde zu 100 % erreicht mit Wiederherstellung der Gelenkkongruenz in 12 von 13 Fällen und einer leichten Subluxationsstellung in einem Fall. Eine Nachuntersuchung war in 9 Fällen nach 23 (5 – 51) Monaten möglich.Der durchschnittliche Bewegungsumfang der rekonstruierten Gelenke betrug für Extension/Flexion 0/9/73°, die Grobkraft 82 % der nichtbetroffenen Gegenseite. 5 von 9 Patienten entwickelten eine milde Beugekontraktur. Im DASH-Score wurden 6 (0–33) Punkte erreicht, die Ruheschmerzen betrugen 1 (0–5), die Belastungsschmerzen 2 (0–6) auf der visuellen Analogskala von 0 – 10. Alle Patienten waren mit der Behandlung zufrieden und bereit, die gleiche Operation nochmals durchführen zu lassen. In Übereinstimmung mit der Literatur ist die Rekonstruktion der Mittelgliedbasis durch ein osteochondrales Transplantat vom Os hamatum eine zuverlässige Prozedur, um die Stabilität und Beweglichkeit des Mittelgelenkes wiederherzustellen.
Betreffend der Wrist-to-Forearm-Ratio des N. medianus ist die Sonographie zur Verlaufskontrolle nach Operation eines Karpaltunnelsyndroms
ungeeignet
Authors: Nitto Agnese , Baur Eva-Maria , Gruber Hannes , Löscher Wolfgang , Loizides Alexander , Mattesich Monika , Pülz Petra 
Published: March 2018

Zusammenfassung
Ziel Primäres Ziel der Untersuchung war es zu ermitteln, ob und inwieweit eine Korrelation zwischen dem klinischen Verlauf nach Karpaltunneldekompression
bei Karpaltunnelsyndrom (KTS) und der sonographisch ermittelten Wrist-to-Forearm-Ratio (WFR) des N. medianus besteht und diese somit zur Verlaufskontrolle
postoperativ geeignet ist.
Patienten und Methoden In einer prospektiven Studie wurden die klinischen, elektrophysiologischen und sonographischen Befunde von 40 Patienten, bei denen
aufgrund klinischer sowie sonografischer und elektrophysiologischer Kriterien eines Karpaltunnelsyndroms eine Spaltung des Retinaculum flexorum erfolgte,
präoperativ sowie 3 und 9 Monate postoperativ erfasst und miteinander verglichen. Letztlich kamen die Datensätze von 21 komplett untersuchten Patienten mit 23
operierten Händen zur Auswertung. Es handelte sich um 5 Männer und 16 Frauen mit einem Durchschnittsalter von 58 Jahren.
Ergebnisse Eine eindeutige Korrelation zwischen dem klinischen Verlauf nach Dekompression des Karpaltunnels bei KTS und der sonographisch ermittelten WFR
konnte ebenso wenig festgestellt werden wie mit den elektrophysiologisch erhobenen Befunden.
Schlussfolgerung Die Sonographie ist in punkto WFR zur Verlaufsbeobachtung nach Operation eines Karpaltunnelsyndroms ungeeignet.
Der Einfluss von standardisierter Kälte- und Kompressionstherapie auf Schwellung, Schmerzhaftigkeit und das funktionelle Ergebnis nach
Spaltung des Retinaculum flexorum bei Karpaltunnelsyndrom
Authors: Flecke Joerg , Vogt Peter M. , Meyer-Marcotty Max V. 
Published: March 2018

Zusammenfassung
Ziel Diese prospektiv randomisierte Studie untersucht den Einfluss von standardisierter Kälte- und Kompressionstherapie auf Schwellung, Schmerzhaftigkeit
und das funktionelle Ergebnis nach Spaltung des Retinaculum flexorum bei Karpaltunnelsyndrom im Vergleich zu einer reinen Kühlung.
Patienten und Methoden Fünfzig Patienten zur Spaltung des Retinaculum flexorum wurden in zwei Gruppen randomisiert. Für eine Woche führte Gruppe 1
postoperativ eine konventionelle Kühlungstherapie durch, Gruppe 2 eine standardisierte Kühlungs- u. Kompressionstherapie mit dem Cryo/Cuff™-System (3 × 10 min
zweimal täglich). Nachuntersuchungen erfolgten am 1., 8. und 21. Tag nach der Operation. Ein Patient der Gruppe 1 und 3 Patienten der Gruppe 2 konnten nicht
nachuntersucht werden. Die Untersuchungsparameter waren Schmerz, Schwellung, Beweglichkeit, Kraft, DASH- und MHQ-Score.
Ergebnisse Bzgl. der untersuchten Parameter fanden sich zu keinem Untersuchungszeitpunkt signifikante Unterschiede zwischen beiden Gruppen.
Schlussfolgerung Ein Vorteil der standardisierten kombinierten Kühlungs- und Kompressionstherapie mit dem Cryo/Cuff™-System gegenüber einer
konventionellen Kühlung nach Spaltung des Retinaculum flexorum konnte in dieser Studie nicht nachgewiesen werden.
Mittelfristige Ergebnisse nach alleiniger perkutaner Versorgung zentraler Impressionsfrakturen der Mittelphalanxbasis
Authors: Schöll Hendrik , Hintringer Wolfgang , Mentzel Martin 
Published: March 2018

Zusammenfassung
Ziel Ziel dieser Studie war es, die mittelfristigen Ergebnisse nach Impressionsfrakturen der Mittelgliedbasis, die ausschließlich mittels perkutaner Aufstopfung und K-Draht-Osteosynthese versorgt wurden, zu ermitteln.
Patienten und Methoden 19 Männer und 2 Frauen mit einem Durchschnittsalter von 31,9 (18–57) Jahren, bei denen eine zentrale Impressionsfraktur der Mittelgliedbasis ausschließlich mittels perkutaner Aufstopfung und K-Draht-Osteosynthese versorgt wurde, konnten nach durchschnittlich 13,2 (3–40) Monaten klinisch und radiologisch nachuntersucht werden.
Ergebnisse Zum Zeitpunkt der Nachuntersuchung konnten alle Patienten ihrer bisherigen beruflichen Tätigkeit sowie den gewohnten Freizeitaktivitäten nachgehen und waren schmerzfrei (VAS 0). Die betroffenen Mittelgelenke wiesen ein durchschnittliches Streckdefizit von 1° bei einer aktiven Flexion von 86° auf, was einem Bewegungsumfang von 93 % der unverletzten Gegenseite entsprach. Radiologisch zeigte sich ein schönes Remodelling der Gelenkfläche. Pin-assoziierte Komplikationen oder Wundheilungsstörungen wurden nicht beobachtet.
Schlussfolgerung Die alleinige intramedulläre Aufstopfung mit K-Draht-Osteosynthese stellt ein geeignetes und zuverlässiges Verfahren zur Therapie der zentralen Impressionsfraktur der Mittelgliedbasis dar. Gute funktionelle Ergebnis können bei nur geringem operativen Aufwand erreicht werden.
Unravelling Factors Affecting Directed Lithiation of Acylamino­aromatics
Authors: Smith Keith , El-Hiti Gamal , Alshammari Mohammed 
Published: March 2018

Ureas, pivalamides, and carbamates are widely used as directing metalation groups (DMGs) due to their good directing ability, low cost, ease of access, and ease of removal. Lithiation of substituted benzenes having such directing metalation groups using various alkyllithiums in anhydrous solvent at low temperature provides the corresponding lithium intermediates, but lithiation may take place at various sites. Reactions of the lithium reagents obtained in situ with various electrophiles give the corresponding derivatives, typically substituted at the site(s) where initial lithiation occurred, often in high yields. However, it is often difficult to predict what reagents and/or conditions might be needed to give specific products or to draw general conclusions about the factors that influence the reactions, especially when the reagents, temperature, and solvents used in reported reactions are not directly comparable. In this review, therefore, we attempt to unravel the various factors that influence the lithiation of various simple aromatic compounds containing urea, pivalamide, and carbamate groups.1	Introduction2	Lithiation with DMG Attached Directly to the Phenyl Ring2.1	Influence of the DMG2.2	Influence of Substitution on the Phenyl Ring3	Lithiation with the DMG Separated by a CH2 Group from the Phenyl­ Ring3.1	Effect of the DMG3.2	Influence of Substitution on the Phenyl Ring4	Lithiation with the Phenyl Ring and DMG Separated by Two or More CH2 Groups4.1	Effect of the DMG and Its Distance from the Phenyl Group4.2	Effect of Substituents on the Phenyl Ring5	Conclusions
Lesiones meniscales RAMP, y lesiones del ligamento meniscotibial posteromedial
Authors: Negrín Roberto , Reyes Nicolás , Iñiguez Magaly , Wainer Mauricio , Duboy Jaime 
Published: March 2018

ResumenLas lesiones meniscales son las lesiones más frecuentemente asociadas a lesiones del Ligamento Cruzado anterior (LCA), encontrándose 9,3 a 16,9% en el segmento posteromedial y comprometiendo el ligamento meniscotibial. Descritas por Strobel por su apariencia artroscópica de rampa, se ha presentado su importancia dado el subdiagnóstico y el efecto biomecánico de una lesión posteromedial del menisco sobre el LCA y que su reparación restaura la traslación nativa de la tibia en conjunto con la reconstrucción del pivote central. Se ha demostrado que la mejor forma para diagnosticar lesiones ramp, es por visiones artroscópicas accesorias, una a través del surco intercondíleo y la otra por un portal posteromedial, logrando diagnosticar y manejar aquellas lesiones que sean inestables, a través de suturas dentro tanto por el portal anterior como por el posterior. Los resultados quirúrgicos son buenos, con mayor riesgo de falla en casos que la lesión se extiende al cuerpo meniscal. Es una lesión que debe buscarse bajo lupa, ya que pasarla por alto puede llevar a progresión de la lesión y a un mayor riesgo de rerotura del ligamento cruzado reconstruido.
Profile of Patients with Intracranial Tumors Undergoing Surgical Resection at a Neuro-oncology Referral Hospital
Authors: Cunha Marcelo , Grosbelli Luiza 
Published: March 2018

Objectives To analyze the epidemiological aspects of primary and metastatic tumors of the central nervous system (CNS) among patients operated on by a single surgeon dedicated to neuro-oncology at Hospital Regional do Oeste, in Chapecó (Santa Catarina, Brazil), between 2013 and 2016.
Methods Cross-sectional, retrospective, and observational analysis of 347 patients undergoing surgery due to intracranial tumors. The patients' data were obtained from the hospital registry, medical records, and pathology reports.
Results Primary CNS tumors comprised 72.1% of the sample. There was a predominance of females (52.7%), and the mean age was 49.3 years, with a peak of incidence between the ages of 25 and 64 years. Gliomas were the most common primary brain tumors (23.7%), followed by meningiomas (17.0%). Lung cancer (15.3%), breast cancer (4.9%), and melanoma (3.5%) were, in descending order, the most frequent primary sites of metastases, which were recorded in 97 cases (27.9%).
Conclusion The lack of standardization in the process of notification of tumor diseases imposes challenges in the establishment of estimates close to the real ones, preventing improvement of public health care policies to protect patients with neuro-oncological conditions. Based on the current model, regionalization of the data seems to be the best option in the management of this subgroup of patients.
Intramedullary Dermoid Cyst of the Cervical Spinal Cord – C5–C7 Level
Authors: Seerangan Palanisamy , Ashok Aravinth , Mahendran Jolarpettai 
Published: March 2018

Introduction Inclusion cysts of the spinal cord are rarely intramedullary. Such cysts are commonly located in the lumbar and thoracic regions and are usually associated with congenital spinal dysraphism and dermal sinus. Intramedullary dermoid cysts in the cervical region without spinal dysraphism are extremely rare. To our knowledge, only seven such cases are reported in the literature to date.
Materials and Methods An 18-year-old female patient presented with weakness in all four limbs, more distal than proximal muscle weakness, that had been progressing for 3 years. The magnetic resonance imaging (MRI) showed an intramedullary lesion from C5– C7 with peripheral ring enhancement. “Whorls” were observed within the lesion on T2 weighted image, with associated excavation of vertebral bodies C5– C7. Operative procedure and findings: partial laminectomy of C5– D1was performed. The dura was opened. A small myelotomy was made in the root entry zone. About 1.5 ml of yellowish colored fluid was drained. White shiny debris with hair, whitish pultaceous content and teeth were removed. Complete excision of cyst and its wall was performed.
Results The histopathological examination revealed that the cyst wall was lined by stratified squamous epithelium with underlying dermis showing hair follicles, sebaceous glands, adipose tissue and cyst filled with keratin debris suggestive of dermoid cyst.
Conclusion The intramedullary location of the dermoid cyst in the cervical cord and the absence of any congenital spinal dysraphism make this case a very unique and rare entity and warrants its inclusion in the reported cases of rare intramedullary space occupying lesions.
Laboratory Diagnosis of Pediatric Herpesvirus Infections of the Central Nervous System by a Multiplex Polymerase Chain Reaction Assay and Intrathecal Antibodies
Authors: Yavru Sibel , Özdemir Mehmet , Feyzioğlu Bahadır 
Published: March 2018

Abstract
Introduction Central nervous system (CNS) viral infections are a serious problem requiring accurate diagnosis and treatment. Human herpesviruses (HHVs) are an important cause of these infections. Recent research has focused on new diagnostic methods allowing accurate and rapid identification of viral infections because there are still diagnostic difficulties for these infections. This study was done to determine the etiologic role of human herpes viruses and to obtain information that will contribute to the diagnostic algorithm in suspected cases of viral encephalitis or aseptic meningitis.
Materials and Methods In our study, herpes simplex virus (HSV)-1, HSV-2, varicella zoster virus (VZV), cytomegalovirus (CMV), Epstein–Barr virus (EBV), and HHV-6 DNA was detected in the cerebrospinal fluid (CSF) by multiplex polymerase chain reaction (PCR) and virus-specific immunoglobulin G (IgG) antibodies in CSF and serum by EIA in pediatric encephalitis/meningitis cases.
Results HSV-1 and VZV were detected in 5 and 3.3% of aseptic meningitis cases, respectively, but no encephalitis cases. Other viruses were not identified as etiologic agents. The seroprevalences were determined as 72.4, 34.3, 81.9, 93.3, 88.6, and 80.9%, respectively for HSV-1, HSV-2, VZV, CMV, EBV, and HHV-6. The performance of specific IgG CSF/serum antibody index (AI) was not satisfactory.
Conclusion Our study indicates that the multiplex PCR method is the most suitable for the diagnosis of CNS infections caused by HHVs. However, due to the high cost of the PCR method, the positive results of the specific AI may be significant, but the negative results are unreliable, especially in limited health care facilities.
Albträume
Authors: Pietrowsky Reinhard 
Published: March 2018

Albträume sind ein relativ weit verbreitetes Phänomen im Kindesund Jugendalter, kommen aber auch bei Erwachsenen vor. Sie können eine psychische Störung darstellen. Ihre Ursachen sind multifaktoriell und umfassen neben Traumata und akuter Stressbelastung auch Persönlichkeitsfaktoren.Es gibt effektive Behandlungsmöglichkeiten für Albträume, allen voran die Imagery-Rehearsal-Therapie.
Langzeitergebnisse nach Trabekulektomie kombiniert mit Mitomycin C und einem Ologen-Implantat
Authors: Fili Sofia , Seddig Sabine , Kohlhaas Markus 
Published: March 2018

Zusammenfassung
Hintergrund Das Ologen-Implantat (AeonAstron Europe B. V., Leiden, Niederlande) besteht aus einem biodegradierbaren Kollagen und Glycosaminoglykan und soll eine postoperative Filterkissenvernarbung oder Abkapselung vermeiden.
Methodik In einer retrospektiven klinischen Studie wurden 806 Patienten mit fortgeschrittenem Glaukombefund mit einer Trabekulektomie kombiniert mit Mitomycin C0,02% und einem Ologen-Implantat behandelt. Die Follow-up-Zeit der Studie betrug 8 Jahre.
Ergebnisse Bei 92,6% der Patienten wurde in der Beobachtungszeit eine dauerhafte Drucksenkung von < 16 mmHg ohne das erneute Ansetzen einer drucksenkenden Therapie erreicht. Bei 6,8% der Patienten erfolgten zusätzliche operative Eingriffe bei Überfiltration oder Hypotonie mit Aderhautamotio. Bei der kombinierten Operation mit Phakoemulsifikation und Implantation einer Hinterkammerlinse kam es bei 3,35% der Patienten zur Revision des Filterkissens oder einem erneuten drucksenkenden Eingriff innerhalb von 8 Jahren.
Schlussfolgerung Eine Trabekulektomie kombiniert mit Mitomycin C0,02% und einem Ologen-Implantat schafft einen langfristigen filtrierenden Effekt < 16 mmHg und eine verringerte postoperative Komplikationsrate.
Characterizing the human hippocampus in aging and Alzheimer’s disease using a computational atlas derived from ex vivo MRI and histology
Authors: Adler Daniel H. , Wisse Laura E. M. , Ittyerah Ranjit , Pluta John B. , Ding Song-Lin , Xie Long , Wang Jiancong , Kadivar Salmon , Robinson John L. , Schuck Theresa , Trojanowski John Q. , Grossman Murray , Detre John A. , Elliott Mark A. , Toledo Jon B. , Liu Weixia , Pickup Stephen , Miller Michael I. , Das Sandhitsu R. , Wolk David A. , Yushkevich Paul A. 
Published: March 2018

Significance
There has been increasing interest in hippocampal subfield morphometry in aging and disease using in vivo MRI. However, research on in vivo morphometry is hampered by the lack of a definitive reference model describing regional effects of aging and disease pathology on the hippocampus. To address this limitation, we built a 3D probabilistic atlas of the hippocampus combining postmortem MRI with histology, allowing us to investigate Alzheimer’s disease (AD)-related effects on hippocampal subfield morphometry, derived from histology. Our results support the hypothesis of differential involvement of hippocampal subfields in AD, providing further impetus for more granular study of the hippocampus in aging and disease during life. Furthermore, this atlas provides an important anatomical reference for hippocampal subfield research.
Bartnik’s splitting conjecture and Lorentzian Busemann function
Authors: Amini Roya , Sharifzadeh Mehdi , Bahrampour Yousof 
Published: March 2018

Abstract
In 1988 Bartnik posed the splitting conjecture about the cosmological space-time. This conjecture has been proved by several people, with different approaches and by using some additional assumptions such as ‘S-ray condition’ and ‘level set condition’. It is known that the ‘S-ray condition’ yields the ‘level set condition’. We have proved that the two are indeed equivalent, by giving a different proof under the assumption of the ‘level set condition’. In addition, we have shown several properties of the cosmological space-time, under the presence of the ‘level set condition’. Finally we have provided a proof of the conjecture under a different assumption on the cosmological space-time. But we first prove some results without the timelike convergence condition which help us to state our proofs.
pyNBS: a Python implementation for network-based stratification of tumor mutations
Authors: Huang Justin K , Jia Tongqiu , Carlin Daniel E , Ideker Trey 
Published: March 2018

Abstract

Summary
We present pyNBS: a modularized Python 2.7 implementation of the network-based stratification (NBS) algorithm for stratifying tumor somatic mutation profiles into molecularly and clinically relevant subtypes. In addition to release of the software, we benchmark its key parameters and provide a compact cancer reference network that increases the significance of tumor stratification using the NBS algorithm. The structure of the code exposes key steps of the algorithm to foster further collaborative development.

Availability and implementation
The package, along with examples and data, can be downloaded and installed from the URL https://github.com/idekerlab/pyNBS.
BART: a transcription factor prediction tool with query gene sets or epigenomic profiles
Authors: Wang Zhenjia , Civelek Mete , Miller Clint L , Sheffield Nathan C , Guertin Michael J , Zang Chongzhi 
Published: March 2018

Abstract

Summary
Identification of functional transcription factors that regulate a given gene set is an important problem in gene regulation studies. Conventional approaches for identifying transcription factors, such as DNA sequence motif analysis, are unable to predict functional binding of specific factors and not sensitive enough to detect factors binding at distal enhancers. Here, we present binding analysis for regulation of transcription (BART), a novel computational method and software package for predicting functional transcription factors that regulate a query gene set or associate with a query genomic profile, based on more than 6000 existing ChIP-seq datasets for over 400 factors in human or mouse. This method demonstrates the advantage of utilizing publicly available data for functional genomics research.

Availability and implementation
BART is implemented in Python and available at http://faculty.virginia.edu/zanglab/bart.

Supplementary information
Supplementary data are available at Bioinformatics online.