bluuebunny/crossref_metadata_2025_split huggingface dataset:
A variable selection approach in the multivariate linear model: an application to LC-MS metabolomics data
Authors: Perrot-Dockès Marie , Lévy-Leduc Céline , Chiquet Julien , Sansonnet Laure , Brégère Margaux , Étienne Marie-Pierre , Robin Stéphane , Genta-Jouve Grégory 
Published: September 2018

Abstract
Omic data are characterized by the presence of strong dependence structures that result either from data acquisition or from some underlying biological processes. Applying statistical procedures that do not adjust the variable selection step to the dependence pattern may result in a loss of power and the selection of spurious variables. The goal of this paper is to propose a variable selection procedure within the multivariate linear model framework that accounts for the dependence between the multiple responses. We shall focus on a specific type of dependence which consists in assuming that the responses of a given individual can be modelled as a time series. We propose a novel Lasso-based approach within the framework of the multivariate linear model taking into account the dependence structure by using different types of stationary processes covariance structures for the random error matrix. Our numerical experiments show that including the estimation of the covariance matrix of the random error matrix in the Lasso criterion dramatically improves the variable selection performance. Our approach is successfully applied to an untargeted LC-MS (Liquid Chromatography-Mass Spectrometry) data set made of African copals samples. Our methodology is implemented in the R package MultiVarSel which is available from the Comprehensive R Archive Network (CRAN).
Reducing measurement uncertainties of high-pressure gas flow calibrations by using reference values based on multiple independent traceability chains
Authors: van der Grinten Jos , Foulon Henri , Gunnarsson Arnthor , Mickan Bodo 
Published: September 2018

Abstract
This paper describes the recently updated realization of the harmonized cubic metre for natural gas. It is a procedure based on an intercomparison, that combines the mutually independent traceability chains of four primary laboratories in the field of high-pressure gas flow measurement. The reference value, also called harmonized cubic metre, is the weighted average of at least two laboratories with weighing factors that are inversely proportional to the squared uncertainties of the calibration results. This results in lower uncertainties for the laboratories as long as the stochastic contributions (Type A) to the overall measurement uncertainties are significantly smaller than the uncertainties arising from the traceability chain (Type B). This condition is fulfilled in practice as traceability uncertainties are at least a factor ten greater than the other uncertainty sources. When evaluating the data of intercomparisons, curve fitting is used for the representation of the calibration data. A polynomial equation of maximum four degrees, expressed in the logarithm of the flow Reynolds number, proves to be the optimum choice for fitting the calibration curve of the turbine gasmeters.
Interferometrisches Rasterkraftmikroskop: Aufbau, messtechnische Eigenschaften und Applikationsmessungen / Interferometric atomic force microscope: design, metrological properties and application measurements
Authors: Vorbringer-Dorozhovets Nataliya , Manske Eberhard , Jäger Gerd 
Published: September 2018

Zusammenfassung
Der vorliegende Beitrag stellt die besonderen Merkmale, die Funktionsweise, den Aufbau, die messtechnischen Eigenschaften sowie wichtige Applikationsmessungen des interferometrischen Rasterkraftmikroskops dar. Das interferometrische Rasterkraftmikroskop dient als Antastsystem in der Nanopositionier- und Nanomessmaschine NMM-1. Sein Hauptmerkmal ist der Lagedetektor - das kombinierte Sondenmesssystem, das die gleichzeitige Erfassung der Torsion, Biegung und Position des Cantilevers mittels Lichtzeiger und Interferometer ermöglicht. Es wird das Prinzip der gleichzeitigen Erfassung von Position und Winkellage der Sonde mittels eines Interferometers und eines Lichtzeigers erläutert, die optische Anordnung vorgestellt und anschließend die durchgeführte Dimensionierung des Lagedetektors diskutiert. Außerdem widmet sich dieser Beitrag neben den messtechnischen Eigenschaften des interferometrischen Rasterkraftmikroskops auch der Kalibrierung des Antastsystems und insbesondere der Unsicherheitsanalyse einer Beispielmessung.
Einfluss der Biometrie des Auges auf die Messunsicherheit eines akustischen Tonometers / Influence of the biometry of the eye on the measurement uncertainty of an acoustic tonometer
Authors: Osmers Jan , Sorg Michael , Fischer Andreas 
Published: September 2018

Zusammenfassung
Zur Glaukomvorsorge ist eine Überwachung des Augeninnendrucks erforderlich, wofür ein akustisches Selbsttonometer entwickelt worden ist. Die Laborversuche an Schweineaugen und die Patientenmessungen in einer klinischen Versuchsreihe belegen jedoch signifikante Querempfindlichkeiten von den biometrischen Parametern des Auges auf den gemessenen Augeninnendruck. Um die Individualität der Augen in der Auswertung der Messdaten zu berücksichtigen, werden Finite-Elemente- Simulationen des Auges für unterschiedliche geometrische Ausprägungen durchgeführt. Anhand der Simulationsergebnisse wird der Einfluss der Augengeometrie auf die Messunsicherheit des zu messenden Augeninnendrucks quantifiziert. Dadurch lässt sich bei Kenntnis der individuellen Augengeometrie des Patienten die systematische Messabweichung des Augeninnendrucks signifikant reduzieren und für das akustische Selbsttonometer eine Messunsicherheit in der Größenordnung aktueller klinischer Tonometer erzielen.
Ansatz zur Bestimmung der Unsicherheit und Prognosefähigkeit eines FEM-Simulationsmodells einer kleinen Mehrfachfixpunktzelle für Kalibrierung von Berührungsthermometern / Approach to determining the uncertainty and predictive capability of a FEM simulation model of a small multiple fixed-point cell for calibration of contact thermometers
Authors: Marin Sebastian , Fröhlich Thomas 
Published: September 2018

Zusammenfassung
Die Definition und Variation von Eingangsparametern eines Modells erlaubt nach einer Stichprobenberechnung die Auswertung von verteilten Ausgangsparametern. Sie werden als Reproduzierbarkeit dieser Berechnung angesehen. Für ein thermisches FEM-Modell einer kleinen Mehrfachfixpunktzelle für die Kalibrierung von Berührungsthermometern wird nach dieser Prozedur und nach einem Vergleich (Validierung) mit der Reproduzierbarkeit experimentell ermittelter Ergebnisse mittels einer Validierungsmetrik ein Vertrauensintervall berechnet, in dem Prognosen mit dem Modell an einer nicht validierten Stelle durchgeführt werden könnten. Dieser Ansatz wird in diesem Beitrag vorgestellt.
Berührungslose Messung des lokalen Schalldrucks mittels Hochgeschwindigkeits-Holographie / Non-invasive measurement of the local sound pressure using high-speed holography
Authors: Ruiz Andrés Eduardo Ramos , Gürtler Johannes , Kuschmierz Robert , Czarske Jürgen 
Published: September 2018

Zusammenfassung
Für die Lärmreduzierung von Flugzeugtriebwerken kommen perforierte Bleche mit dahinterliegender Kavität (sogenannte Liner) zum Einsatz. Das aeroakustische Dämpfungsprinzip dieser Elemente beruht auf der Wechselwirkung von Schall und Strömung. Bisherige physikalische Modelle der Dämpfungsprozesse erlauben jedoch nicht die notwendige Entwicklung effizienterer Liner, da die aeroakustische Wechselwirkung noch nicht vollständig verstanden ist. Daher ist die Kenntnis relevanter Größen, wie die lokale Schalldruckverteilung, entscheidend für das Verständnis der lokalen Dämpfungsprozesse. Dazu präsentieren wir ein kamerabasiertes Messsystem für die zweidimensionale nicht-invasive ortsaufgelöste Schalldruckbestimmung.
Optische Kohärenztomographie zur kombinierten Form- und Zentrierprüfung kleinaperturiger optischer Komponenten / Optical coherence tomography for combined form and centration measurement of small-aperture optical components
Authors: Riediger Max , Schmitt Robert 
Published: September 2018

Zusammenfassung
Kleinaperturige optische Komponenten mit komplexer Form spielen zunehmend eine Rolle bei Sensing- und Imagingapplikationen. Die messtechnische Charakterisierung dieser Bauteile stellt jedoch noch immer eine Herausforderung dar. Es wurde ein auf optischer Kohärenztomographie basierendes Verfahren entwickelt, welches in der Lage ist, die Form- und Zentrierung beider Funktionsflächen kleinaperturiger Linsen mit nur einer Messung zu erfassen. Die Herausforderung stellt dabei die Messung der dem Messkopf abgewandten Funktionsfläche dar, da diese aufgrund der Lichtbrechung an der dem Messkopf zugewandten Funktionsfläche verzerrt gemessen wird.
Faseroptische Überwachung von mechanisch deformierten Kabelgeflechtsstrukturen mittels optischer Zeitbereichsreflektrometrie / Fiber-optic monitoring of mechanically deformed cable structures by means of optical time-domain reflectometry
Authors: Graf Moritz A. , Ehmer Fabian , Eisermann Christoph , Jakobi Martin , Koch Alexander W. 
Published: September 2018

Zusammenfassung
In diesem Beitrag wird ein neuartiger Ansatz zur Schadensdetektion in Stromversorgungskabeln vorgestellt. Die Funktionalität des Messsystems kann bezüglich des durch Makrobiegungen induzierten Anstiegs des Dämpfungsbelags verifiziert werden. Durch den verwendeten Integrationsansatz sind Mantelschäden im Stromversorgungskabel detektierbar, wodurch langfristige Ausfallgründe frühzeitig erkannt werden. Über eine integrierte optische Faser und ein optisches Zeitbereichsreflektometer kann unabhängig von der elektrischen Energieübertragung im Kabel eine exakte und effiziente Schadenslokalisierung sichergestellt werden, was wiederum eine Zeit- und Kostenersparnis zur Folge hat.
Iterativer Spektralfilterentwurf für eine genaue optische Bestimmung von Materialanteilen / Iterative spectral filter design for a precise optical estimation of material abundances
Authors: Krippner Wolfgang , Benzing Philipp , León Fernando Puente 
Published: September 2018

Zusammenfassung
Die spektrale Information hyperspektraler Bilder (HSI) bietet die Möglichkeit, Anteile von Materialien in Mischungen zu bestimmen. Die Aufzeichnung und Verarbeitung von HSIs sind zeitaufwändig und rechenintensiv. Deshalb wird ein Ansatz mit spektraler Filterung verfolgt. Anstelle von HSIs wird ein Intensitätsbild für jedes Spektralfilter aufgezeichnet. Die Werte dieser Intensitätsbilder tragen Information in Abhängigkeit der Filterkoeffizienten, wie beispielsweise die Anteile eines Materials. Innerhalb dieses Beitrags wird der Entwurf von Spektralfiltern mithilfe iterativer Verfahren untersucht. Neben der Übertragung existierender Methoden für eine solche optische Bestimmung von Materialanteilen, wird ein neuartiger mehrstufiger Ansatz vorgestellt.
Spinal RNF20-Mediated Histone H2B Monoubiquitylation Regulates mGluR5 Transcription for Neuropathic Allodynia
Authors: Lai Cheng-Yuan , Hsieh Ming-Chun , Ho Yu-Cheng , Wang Hsueh-Hsiao , Chou Dylan , Wen Yang-Cheng , Yang Po-Sheng , Cheng Jen-Kun , Peng Hsien-Yu 
Published: September 2018

To date, histone H2B monoubiquitination (H2Bub), a mark associated with transcriptional elongation and ongoing transcription, has not been linked to the development or maintenance of neuropathic pain states. Here, using male Sprague Dawley rats, we demonstrated spinal nerve ligation (SNL) induced behavioral allodynia and provoked ring finger protein 20 (RNF20)-dependent H2Bub in dorsal horn. Moreover, SNL provoked RNF20-mediated H2Bub phosphorylated RNA polymerase II (RNAPII) in the promoter fragments ofmGluR5, thereby enhancingmGluR5transcription/expression in the dorsal horn. Conversely, focal knockdown of spinal RNF20 expression reversed not only SNL-induced allodynia but also RNF20/H2Bub/RNAPII phosphorylation-associated spinalmGluR5transcription/expression. Notably, TNF-α injection into naive rats and specific neutralizing antibody injection into SNL-induced allodynia rats revealed that TNF-α-associated allodynia involves the RNF20/H2Bub/RNAPII transcriptional axis to upregulate mGluR5 expression in the dorsal horn. Collectively, our findings indicated TNF-α induces RNF20-drived H2B monoubiquitination, which facilitates phosphorylated RNAPII-dependentmGluR5transcription in the dorsal horn for the development of neuropathic allodynia.SIGNIFICANCE STATEMENTHistone H2B monoubiquitination (H2Bub), an epigenetic post-translational modification, positively correlated with gene expression. Here, TNF-α participated in neuropathic pain development by enhancing RNF20-mediated H2Bub, which facilitates phosphorylated RNAPII-dependentmGluR5transcription in dorsal horn. Our finding potentially identified neuropathic allodynia pathophysiological processes underpinning abnormal nociception processing and opens a new avenue for the development of novel analgesics.
Glagolski akcenat zadarskog štokavskog zaleđa
Authors: Anić Vladimir 
Published: September 2018

U stručnoj literaturi o našem književnom akcentu u više na- vrata je naglašeno da još nema uvjeta za konačnu kodifikaciju ortoepskog standarda i da se problem kodifikacije književnog akcen- ta može smatrati otvorenim. U svakom slučaju, savlađivanje knji- ževnog akcenta suočava se s ozbiljnim poteškoćama na cijelom području hrvatskosrpskog jezika. Mišljenje da na tom području nema u akcentu strukturalnih razlika traži argumentaciju takvih iznalaženja na planu dvovarijantnosti. Međutim, šarolika dijalekat- ska slika i nejednak kulturni kontinuitet i tip kulture markiraju jezično izražavanje. Zbog toga mislim da se u hrvatskosrpskom jeziku moraju zapažati i proučavati zonalna svojstva književnog akcenta. Potpuno novoštokavsko prilagođavanje akcenta u sistem- ski relevantnom vidu i bogatom vokabularu u nadgradnji ocrtava se kao zona štokavske Dalmacije, a očituje se u mijenjanju i mjesta i intonacije (a ne samo intonacije) silaznog akcenta (vio- linistkinja : violinistkinja ~ violinistkinja). Naš akcenat, promatran sinkronijski, a upotrebljavan prema zonalnim svojstvima, može se promatrati i kao stupanj prilagođenosti u odnosu na ishodišni akce- nat, ali ne i u odnosu na drugačiji način prilagođavanja. Na drugom mjestu zadržao sam se na tom procesu shvaćajući ga lcao stilističko pitanje?
Compilación de oligonucleótidos para la detección y clasificación de fitoplasmas
Authors: Araujo-Ruiz Karina , Cambrón-Crisantos José Manuel , Cruz-Jaramillo José Luis , Ronces-Frutos Liliana Elizabeth , López-Buenfil José Abel , Torres-Martínez José Gustavo 
Published: September 2018

Phytoplasmas are phytopathogenic prokaryotes of great importance because they have been linked to numerous diseases around the world. The aim of these research was to present the general characteristics, the size and composition of the genome and the genes and/or regions used as molecular markers for the identification and characterization of phytoplasmas. Among its main hosts are fruit and wood trees, vegetables, cut flowers and weeds, which generate alterations in the hormonal balance producing symptoms such as philodias and virescence. Because its isolation in vitro has not been possible, the detection and characterization has been carried out, mainly, with molecular techniques. In addition, the use of New Generation Sequencing (NGS) has allowed to know the complete genome of some phytoplasmas, as well as the regions and genes that constitute it. In the present bibliographic review, the information generated from the molecular techniques and NGS sequencing is compiled, as well as the primers reported to identify some groups of phytoplasmas.
Aspectos epidemiológicos de Cryptosporidium spp. en terneros del estado Táchira en Venezuela
Authors: Moreno-Manresa Carlos David , Arellano-Semidey Angela , Martin-Pérez Cindy 
Published: September 2018

Diarrheic processes are most commonly involved in losses due to mortality or decline of growth and occur at early ages in the farm animals. In Venezuela, particularly in the Tachira state, the presence of protozoa of the genus Cryptosporidium has been determined in calves, but its relationship with a clinical gastrointestinal disease is not sufficiently evaluated. The objective of this work was to evaluate the epidemiology of Cryptosporidium spp. in the calves of herds in Tachira state and its relation with clinical manifestations of a digestive disease. 338 calves were randomly sampled during 2008. The epidemiological variables studied were: a) the age in months, taken from existing records in production units; b) the gender of the animal; c) the Tachira state zone (north or south); d) presence of obvious signs of diarrhea; and e) positivity or negativity to cryptosporidium upon coprological examination. 27% of the samples showed positivity to Cryptosporidium spp. by the Zielh Neelsen modified technique. The study suggests that this genus of protozoa constitutes an important risk factor for the presentation of diarrhea in calves from birth to weaning in the Tachira state (OR> 1, p <0.05); where 18.8% of cases of undifferentiated diarrhea may be related to the presence of the parasite (p <0.05). Infections were less common in older calves (OR <1; p <0.01); however, age did not act as a determinant factor for the presentation of diarrhea in already infected animals. Gender does not present as a risk factor for infection by Cryptosporidium spp.
A Case of Superior Vena Cava Syndrome in Pregnancy within a Developing Country in Sub-Saharan Africa
Authors: Mchome Bariki Lawrence , PS Mlay , JW Schmitt 
Published: September 2018

IntroductionSuperior Vena Cava Syndrome is a rare but potentially life-threatening condition that can occur during pregnancy. The case presented here describes a dramatic presentation culminating in a potentially preventable maternal death at a tertiary hospital in East Africa.Case presentationA HIV positive, 28 years old primegravida at a gestational age of 34 weeks presented to a tertiary health facility in Nothern Tanzania with generalised facial swelling and difficult in breathing .She was referred from primary health facility where she was treated presumptively as a case of Ludwings angina. On examination she was dyspnoeic and had extensive supraclavicular and cervical lymphadenopathy. On second day post-admission, she was induced ,but later her condition deteriorated and developed severe dyspnoeic, confusion, convulsions and died. A Narrative of this case, challenges encountered in investigating, establish a diagnosis and management are explored in this case report. Furthermore pathophysiology and treatment options for superior venal caval occurring in pregnancy will be reviewed.ConclusionSuperior vena syndrome is a fatal condition and rare to occur in pregnancy. A rigorous and timely approach to investigate and manage is of a critical importance. Additionally a collaborative multidisciplinary team approach is necessary to prevent complication.
Big mass: is it a big issue?
Authors: Yi Myat San , Lwin Soe , Khaing Mi Mi 
Published: September 2018

Women present with a big mass will feel worried and uncertain about herself as there is a possibility of cancer. Most of the big masses are originated from the uterus or ovarian origin and it is vital for the patient to find out the most possible diagnosis. With the improvement of modern technology, the ultrasound plays an important role to get the diagnosis, however, it has some limitations like difficulty to visualize the whole mass. Other investigations like CT and especially, MRI will help to reach the appropriate diagnosis and as a result, aid in making an efficient plan for the respective diagnosis with least morbidity. It is a great challenge for the clinician but those who have adequate knowledge, competency in surgical skill with well-learnt experience will not consider it as a big deal.
Türk Gölge Oyunu “Karagöz”de Doğaüstü Tasvir ve Semboller
Authors: TARLAKAZAN Burak Erhan 
Published: September 2018

Gölge oyunu televizyon, radyo, sinema gibi görsel
iletişim araçlarının doğuşundan çok önce hayat bulmuş, önceleri hoşça vakit
geçirmek, daha sonra günlük yaşam, eğitim, politika, siyasi görüş ve farklı
kişisel tipler gibi pek çok ana konuyu işleyerek, iletişim kaynağı olmuştur. Karagöz’ü
geleneksel diğer gösteri sanatlarından ayıran yanı, kendine has tekniği ve
sitili ile beraber, toplumun her kesiminden her yaşa hitap etmesidir. Karagöz,
saraydan mahalle kahvelerine, çocuklardan yetişkinlere kadar çok geniş bir
çeşitlilikte izleyici kitlesine sahip, nadir gösteri sanatlarındandır. Karagöz
oyunlarının ilgiyle izlenmesinin sebeplerinden biri de; sahip olduğu
tasvirlerin hem gerçek dünyayla ilişkili kişiliklerin ve hem de sınırsız hayal
dünyasında hayat bulan doğaüstü ve insan dışı varlıkların tasvirlerini
barındırmasıdır. Araştırmada Karagöz
oyunlarında yer alan doğaüstü varlıklara ait tasvir ve sembollere ait görseller
belirlenerek tasvirlemede kullanılan resimleme özellikleri üzerinde
durulmuştur.
Editorial: Las internets de e-Salud
Authors: Sepúlveda Cardona Edwin Andrés 
Published: September 2018

Internet es un gran laboratorio de exploración, un LAB para todos los ensayos posibles, porque, como dice Friedman (2012), aún está en una fase beta. Estamos experimentando: los ciudadanos conectados, los nuevos ingenieros y los nuevos profesionales de la salud. En los laboratorios de Internet se están fraguando todo tipo de iniciativas. La efervescencia de una civilización hiperconectada -si acaso- nos permite inventariar los cocteles digitales que se desarrollan a diario, ya sea desde un garaje (como se forjó Sillicon Valley) o en una clínica especializada con los recursos de un Estado o de alguna organización supranacional.
Aporte del químico farmacéutico en el tratamiento de pacientes drogodependientes de Medellín
Authors: Cataño Montoya Yan Carlos , Mejía Paniagua Valentina , Restrepo Cano John Sebastián , Higuera Cogollo Héctor Esteban , López Cárdenas María Alejandra 
Published: September 2018

Antecedentes: la drogadicción es una enfermedad que afecta a un individuo de manera física, mental y social, por tanto, los pacientes con esta condición deben ser atendidos de manera multidisciplinaria (National Institute on Drug Abuse, s. f.). Objetivo: describir el aporte del Profesional en Química Farmacéutica en el tratamiento de pacientes drogodependientes de la Corporación Papá Vanegas ubicada en la ciudad de Medellín. Método: la metodología utilizada fue cualitativa con estrategia de investigación acción participativa, se realizó un muestreo no probabilístico con un tamaño de 40 personas, utilizando instrumentos como las entrevistas, diario de campo, historias de vida. Resultados: los participantes destacaron su intención de interiorizar los conocimientos adquiridos sobre los mecanismos de acción, efectos anatómicos y fisiológicos, enfermedades derivadas del abuso de sustancias y la importancia de una alimentación adecuada, resaltando un interés por la atención farmacéutica personalizada en cuanto a interacciones medicamentosas, debido a la polimedicación que presentan algunos de los pacientes derivados de sus distintas condiciones patológicas. Conclusiones: se encontró que el Químico Farmacéutico es indispensable en el proceso de rehabilitación de pacientes drogodependientes porque su formación se basa en principios activos, entre los cuales se encuentran las sustancias psicoactivas. Las acciones realizadas por el profesional permitieron que los pacientes comprendieran los daños fisioanatómicos del consumo patológico de drogas.