bluuebunny/crossref_metadata_2025_split huggingface dataset:
Mapping of Leaf Rust Resistance Genes and Molecular Characterization of the 2NS/2AS Translocation in the Wheat Cultivar Jagger
Authors: Xue Shulin , Kolmer James A , Wang Shuwen , Yan Liuling 
Published: April 2018

Abstract
Winter wheat cultivar ‘Jagger’ was recently found to have an alien chromosomal segment 2NS that has Lr37, a gene conferring resistance against leaf rust caused by Puccinia triticina. The objective of this study was to map and characterize the gene(s) for seedling leaf rust resistance in Jagger. The recombinant inbred line (RIL) population of Jagger × ‘2174’ was inoculated with leaf rust pathogen THBJG and BBBDB, and evaluated for infection type (IT) response. A major quantitative trait locus (QTL) for THBJG and BBBDB was coincidently mapped to chromosome arm 2AS, and the QTL accounted for 56.6–66.2% of total phenotypic variation in infection type (IT) response to THBJG, and 72.1–86.9% to BBBDB. The causal gene for resistance to these rust races was mapped to the 2NS segment in Jagger. The 2NS segment was located in a region of approximately 27.8 Mb starting from the telomere of chromosome arm 2AS, based on the sequences of the A genome in tetraploid wheat. The Lr17a gene on chromosome arm 2AS was delimited to 3.1 Mb in the genomic region, which was orthologous to the 2NS segment. Therefore, the Lr37 gene in the 2NS segment can be pyramided with other effective resistance genes, rather than Lr17a in wheat, to improve resistance to rust diseases.
Phylogenetic and Phylogenomic Definition of Rhizopus Species
Authors: Gryganskyi Andrii P , Golan Jacob , Dolatabadi Somayeh , Mondo Stephen , Robb Sofia , Idnurm Alexander , Muszewska Anna , Steczkiewicz Kamil , Masonjones Sawyer , Liao Hui-Ling , Gajdeczka Michael T , Anike Felicia , Vuek Antonina , Anishchenko Iryna M , Voigt Kerstin , de Hoog G Sybren , Smith Matthew E , Heitman Joseph , Vilgalys Rytas , Stajich Jason E 
Published: April 2018

Abstract
Phylogenomic approaches have the potential to improve confidence about the inter-relationships of species in the order Mucorales within the fungal tree of life. Rhizopus species are especially important as plant and animal pathogens and bioindustrial fermenters for food and metabolite production. A dataset of 192 orthologous genes was used to construct a phylogenetic tree of 21 Rhizopus strains, classified into four species isolated from habitats of industrial, medical and environmental importance. The phylogeny indicates that the genus Rhizopus consists of three major clades, with R. microsporus as the basal species and the sister lineage to R. stolonifer and two closely related species R. arrhizus and R. delemar. A comparative analysis of the mating type locus across Rhizopus reveals that its structure is flexible even between different species in the same genus, but shows similarities between Rhizopus and other mucoralean fungi. The topology of single-gene phylogenies built for two genes involved in mating is similar to the phylogenomic tree. Comparison of the total length of the genome assemblies showed that genome size varies by as much as threefold within a species and is driven by changes in transposable element copy numbers and genome duplications.
Земна цивілізація у XXI столітті: проблеми світового і національного розвитку
Authors: Synyakevych I. 
Published: April 2018

Розглянуто актуальні екологічні, економічні, політичні та соціальні проблеми розвитку, з якими зіткнулася земна цивілізація в ХХІ ст. Найбільш загрозливими серед них є глобальне потепління клімату, спричинене парниковими газами, забруднення довкілля відходами виробництва та споживання, вичерпання енергетичних ресурсів (нафти, газу, вугілля та інших), послаблення стійкості екологічних систем і динамічне згасання біорізноманіття. Земна спільнота постала перед такими глобальними екологічними викликами антропогенного походження, яких у минулому не було. Свою деструктивну роль при цьому зіграли і деякі науковці, які замовчували і загладжували нагальність сучасних екологічних проблем. Не менш шкідливим виявилося галасливе пропагування глобалістських неконструктивних ідей щодо подолання глобальної екологічної кризи, які в багатьох випадках були надто відірвані від запитів реального політичного та економічного життя.
Засоби масової інформації і сучасна економічна наука продовжують зомбувати споживацьку ментальність населення. Сучасні економічні системи не стимулюють ефективне споживання товарів. Високотехнологічні товари часто невиправдано швидко стають відходами споживання, оскільки характеризуються коротким життєвим циклом. Світова економіка залишається високомілітаристською.
У ХХІ ст. Україна буде стикатися з тими ж проблемами, що будуть притаманними для земної цивілізації загалом. Основна проблема полягає в тому, щоб вийти зі складної політичної, екологічної, економічної і соціальної ситуації з мінімальними втратами.
Моніторинг лісів Розточчя як системна складова поліфункційного сталого лісового господарства
Authors: Danchuk O. , Korol M. , Chaskovskyy O. , Cunjak A. 
Published: April 2018

У рамках програми комплексного моніторингу лісів, що грунтується на основі використання сучасних дистанційних і наземних методів збору та оброблення інформації, описано просторову структуру лісових масивів Українського Розточчя. Для цього використано супутникові знімки Landsat 5 TM, Landsat 7 ETM+, QuikBird Transnavikom Ltd. та Cnes/Spot. На їх основі побудовано карти розподілу лісових масивів, обчислено їх достовірність та зроблено висновки щодо структури. Розраховано растрову сітку розміщення пробних площ на досліджуваній території. Опрацьовано та доповнено методику збору й оброблення отриманої інформації.
Seed quality indeces of Tilia under environment pollution conditions caused by Prydniprovska TPP emissions, Dnipro city
Authors: Gritsay Z. V. , Iusypiva T. I. , Tryfonov M. O. 
Published: April 2018

The problem of full seed is one of the major issues of reproductive biology of plants. The gap between potential and real seed production, which is constantly observed in nature, becomes dramatically evident in terms of the extreme growth terms. This issue became relevantin connection with the growth of environmental pollution caused by technogenic influence. This paper discusses the research results obtained while analysing the effect that emissions, produced by Prydniprovska TPP (Dnipro, Ukraine), have on Tilia genus seed quality indices. The research objects were Tilia platyphyllos Scop., T. europaea L. and T. cordata Mill. The samples were taken in October of 2016 in the two sites of the monitoring coverage: the test area was the tree plantation adjacent to the Prydniprovska TPP (the main toxic substanceswere NOx, SO2, CO, solid impurities) in the city of Dnipro, Ukraine; the reference area was the Botanical Garden of Oles’ Honchar Dnipropetrovsk National University.In terms of the industrial site, there is the decrease of seed viability in all the examined representatives of Tilia genus. Moreover, the indices of the seed fullness and 1,000 seed weight went down in the two species (T. cordata and T. platyphyllos). The research demonstrated the difference in the sensitivity of the reproductive systems of the research objects to technogenic exposure. Thus, T. cordata seeds appear to be the most vulnerable, while the seeds of T. platyphyllos and T. europaea remain the most tolerant to it. Recommendations are suggested to use the species of Tilia genus in planting of greenery in the inductrial zonez of the steppe Pryniprovya.
Сучасний лісовий фонд бука лісового в Українському Розточчі
Authors: Krynytskyy H. , Pavlyuk N. , Jachnyckyy V. 
Published: April 2018

Бук лісовий на Розточчі є однією з основних лісотвірних порід. За зайнятою площею (12810 га, 28,4 %) букові лісостани тут поступаються лише сосновим (20359 га або 45 %). Більшість букових деревостанів в Українському Розточчі досягають І бонітету, а деякі з них мають Іа і навіть Іb бонітет. Загалом у регіоні переважають середньоповнотні букові деревостани (60,7 %), водночас високою є частка і низькоповнотних деревостанів (15,2 %).
Серед деревостанів Українського Розточчя букові деревостани мають найбільший вік – 82 роки. Найменшу площу займають молодняки (7,9 %) та перестійні деревостани (2,0 %). У лісовому фонді максимально представлені середньовікові деревостани (32,5 %), дещо менше – пристигаючі (29,9 %) та стиглі (27,7 %). Середній запас букових деревостанів у регіоні є найвищим порівняно з деревостанами інших порід і становить 282 м3/га. Максимальні запаси стовбурової деревини на одиницю площі спостережено у бука в пристигаючому і стиглому віці (відповідно 313 і 314 м3/га).
Найбільші площі букових лісів приурочені до грудів (9509 га, 74,2 %), у сугрудах вони займають 3283 га (25,6 %). У суборах бук росте як характерна кліматична домішка і займає площу лише 19 га (0,2 %).
За ступенем зволоженості ґрунту бук в умовах Українського Розточчя займає свіжі і вологі гігротопи всіх трьох трофотопів – В, С, D, причому віддає превагу свіжим умовам (59,3 %).
Загалом бук лісовий у регіоні бере участь в утворенні 11 типів лісу. Найбільшими за площею типами лісу, які в умовах Українського Розточчя формує бук лісовий, є свіжа і волога грабово-дубова бучини. Найменшу площу в регіоні займає волога грабово-дубова субучина. Похідні букові деревостани в Українському Розточчі поширені у семи типах лісу інших порід і займають площу 289 га.
Сучасний стан і перспективи збереження генетичних ресурсів тополі в Україні
Authors: Vysotska N. 
Published: April 2018

Узагальнено інформацію про наявні площі природних і штучних деревостанів, розподіл за категоріями лісів, а також про видове різноманіття представлених в Україні тополь за результатами аналізу бази даних ВО "Укрдержліспроект". Встановлено сучасний стан лісових генетичних ресурсів тополі та пріоритети їхнього збереження і використання.
З’ясовано, що у лісовому фонді рівнинної частини України представлено 7 видів тополь, які включено до секцій Aigeiros, Populus, Tacamahaca, зокрема: P. nigra, P. deltoides, P. alba, P. balsamifera, P. laurifolia, P. simonii, P. tremula, а також три культивари: P. nigra var. Pyramidalis, P. alba var. Bolleana і P. х canescens. Загальна площа тополевих лісів сягає 29071,1 га, зокрема природного походження – 15522,7 га.
Визначено такі пріоритети зі збереження та сталого використання генетичних ресурсів тополі в Україні: поширення інформації про розповсюдження та використання, біологію та генетичну мінливість видів і популяцій тополі в Україні; розробка та реалізація стратегії та відповідної нормативно-правової бази зі збереження, відтворення та використання генофонду Populus sp.; відбір та паспортизація нових об'єктів, зокрема із застосуванням різних методів геномної та генної селекції, а також ДНК-маркування; дослідження міжвидової та внутрішньовидової мінливості тополь в умовах кліматичних змін та визначення значущості тополь у виконанні екосистемних послуг; укріплення раціонального використання ресурсів тополь, розвитку та управління ними.
Для ефективного культивування тополі в Україні необхідно виконати такі ключові програмні та наукові заходи, як пошук міжнародних дослідницьких програм для розроблення інноваційного застосування тополь і створення нових клонів з підвищеною стійкістю проти посухи, засолення ґрунту та шкідників і хвороб.
Теоретичні аспекти функціонального призначення парків як основа для формування підходів до оцінювання естетичних якостей паркового середовища
Authors: Oleksiichenko N. , Gatalska N. 
Published: April 2018

Виявлено принципову різницю у підходах, наукових стратегіях і методах, які застосовують у дослідженнях естетики природних та штучно створених ландшафтів.
Оцінювання естетичної привабливості природних ландшафтів грунтується на визначенні потенційних функцій середовища, а саме спрямовано на виявлення найцінніших ландшафтних угруповань для їх збереження та використання результатів такого оцінювання у формуванні перспективних напрямів розвитку регіону, адаптації окремих територій до потреб населення. Дослідження естетичних якостей ландшафту штучно створених парків різного функціонального призначення здійснюють для визначення рівня їх відповідності сучасним потребам людини та функціям, що на них покладені.
Виявлено, що ключовим питанням у формуванні підходів та визначенні методів дослідження паркового середовища є його функціональне призначення, що нерозривно пов’язано з композиційною структурою міста, а їх невідповідність призводить до погіршення стану паркового середовища, що негативно впливає як на екологію, так і естетику урбосередовища загалом.
Запропоновано концептуальну схему формування програми дослідження естетичних якостей паркового ландшафту, яка базується на функціональному призначенні (сучасному або потенційному) дослідних об’єктів та передбачає п’ять взаємопов’язаних етапів.
Allegorical interpretations of Hera-Juno at the end of Antiquity: The example of Fulgentius
Authors: Wolff Étienne 
Published: April 2018

The allegorical interpretations of pagan gods flourished in late Antiquity. They were the work of the pagans, who thus sought to spiritualize their religion, but also of some Christians, who thought that the pagan fables were hiding truths they needed to discover.
The goddess Hera-Juno has not escaped the phenomenon. Here we consider, taking as one basis the works of Fabius Planciades Fulgentius, African writer of the fifth-sixth century, what these interpretations are and what they tell us both about this goddess and the mentality of late Antiquity.
Ivnones: An approach to their personality and geography of cult
Authors: Simón Francisco Marco 
Published: April 2018

The epigraphic expression of plural female divinities, represented sometimes in triads, is a feature of Romano-Celtic realms. This is the case of the Matres and Matronae, as well as the Fortunae, with epithets expressing the local identity of the divine personality – or of their cult group – in an increasingly globalized world such as the Roman Empire.
In this context, my aim is to focus on the Iunones. We have about 70 inscriptions dedicated to these deities, sometimes appearing with the epitet Augustae, others as Matronae, Montanae, Domesticae, Suleviae, associated with other deities such as IOM, Hercules, Genius Loci or the Augustorum Numina, or assimilated to the Gabiae. The sacred geography of the Iunones includes Italy (with a higher density in Venetia and Histria, but with manifestations in Transpadana, Umbria, Aemilia, Latium and Campania), but they are also testamented in diverse provinces of Celtic tradition, such as Germania Inferior, Noricum, Belgium, Aquitania, Lugdunensis or Narbonensis. The analysis of individual or collective dedicants, the activities commemorated in the altars, and the processes that make visible – at a regional or local level – these goddesses in theonyms related to the Roman Iuno, are the aims of this paper.
Museus, coleções, exposições e povos indígenas
Authors: Van Velthem Lucia Hussak , Benchimol Alegria 
Published: April 2018

Os estudos antropológicos, em suas tendências mais atuais, começaram a se debruçar sobre a teoria museológica e as práticas conduzidas nos espaços museais, os quais são compreendidos como locais que carregam as marcas de produções específicas. Constata-se, assim, que nos museus etnográficos, a guarda ou exposição de suas coleções são efetivadas em territórios que produzem algumas dessas marcas, pois são características dessas instituições. O presente artigo aborda os vínculos que os museus de antropologia estabelecem com suas coleções etnográficas, nos espaços da reserva técnica e da exposição destacando alguns dos sentidos que os marcam e os definem. A metodologia utilizada foi a pesquisa documental e etnográfica.
Folate Nutrition Status in Mothers of the Boston Birth Cohort, Sample of a US Urban Low-Income Population
Authors: Cheng Tina L. , Mistry Kamila B. , Wang Guoying , Zuckerman Barry , Wang Xiaobin 
Published: April 2018

Objectives. To examine maternal folic acid supplementation and plasma folate concentrations in the Boston Birth Cohort, a predominantly urban, low-income, minority population in Boston, Massachusetts. Methods. This report includes 7612 mothers with singleton live births (3829 Black, 2023 Hispanic, 865 White, and 895 others) enrolled in the Boston Birth Cohort at the Boston Medical Center, during 1999 to 2014. Folic acid supplementation during preconception and each trimester was obtained via interview questionnaire. In a subset (n = 2598), maternal plasma folate concentrations were measured in blood samples drawn within a few days of delivery. Results. The percentage of mothers taking folic acid supplementation almost daily during preconception and the first, second, and third trimesters were 4.3%, 55.9%, 59.4%, and 58.0%, respectively. Most striking, we observed a wide range of maternal plasma folate concentrations, with approximately 11% insufficient (< 13.4 nmol/L) and 23% elevated (> 45.3 nmol/L). Conclusions. Findings indicate that fewer than 5% of mothers in the Boston Birth Cohort started folic acid supplements before pregnancy, and approximately one third of mothers had either too low or too high plasma folate levels, which may have important health consequences on both the mother and the child.
Suicide Prevention Training: Policies for Health Care Professionals Across the United States as of October 2017
Authors: Graves Janessa M. , Mackelprang Jessica L. , Van Natta Sara E. , Holliday Carrie 
Published: April 2018

Objectives. To identify and compare state policies for suicide prevention training among health care professionals across the United States and benchmark state plan updates against national recommendations set by the surgeon general and the National Action Alliance for Suicide Prevention in 2012. Methods. We searched state legislation databases to identify policies, which we described and characterized by date of adoption, target audience, and duration and frequency of the training. We used descriptive statistics to summarize state-by-state variation in suicide education policies. Results. In the United States, as of October 9, 2017, 10 (20%) states had passed legislation mandating health care professionals complete suicide prevention training, and 7 (14%) had policies encouraging training. The content and scope of policies varied substantially. Most states (n = 43) had a state suicide prevention plan that had been revised since 2012, but 7 lacked an updated plan. Conclusions. Considerable variation in suicide prevention training for health care professionals exists across the United States. There is a need for consistent polices in suicide prevention training across the nation to better equip health care providers to address the needs of patients who may be at risk for suicide.
Early‐Season Wind Erosion Influenced by Soil‐Incorporated Green Manure in the Pacific Northwest
Authors: Sharratt B. S. , McGuire A. , Horneck D. 
Published: April 2018

Core Ideas
Irrigated soils in the Pacific Northwest are highly susceptible to wind erosion.
Early‐season wind erosion potential was assessed from soil‐incorporated green manure and no green manure treatments.
Soil‐incorporated green manure did not influence wind erosion.
Management strategies are sought to minimize wind erosion of irrigated agricultural soils along the Columbia River of the Inland Pacific Northwest (PNW), particularly during the early season (March–April) when high winds coincide with sowing of vegetable crops. Early‐season wind erosion potential from soil‐incorporated green manure (i.e., incorporation of a cover crop of mustard into the soil in autumn) and no green manure treatments was assessed at two locations over 2 yr using a portable wind tunnel. Incorporation of green manure the preceding autumn did not influence wind erosion or soil erodible characteristics the following spring. Soil‐incorporated green manure, however, did influence early‐season crop residue characteristics. Although differences were significant, low residue cover and stem silhouette area suggested relatively small differences in empirical estimates of windblown soil loss between manure treatments. Soil crusting resulting from irrigation and/or rainfall prior to assessing wind erosion may have masked any influence of green manure on wind erosion. Due to the high erosion rates measured from the crusted soils, multiple years of green manure or minimum or reduced tillage may be required to promote aggregation and/or enhance residue cover and thereby reduce wind erosion of irrigated soils.
Hydraulic optimization of corrugated stilling basin with adverse slope
Authors: Honar Tooraj , Khoramshokooh Nafiseh , Nikoo Mohammad Reza 
Published: April 2018

AbstractIn this paper, perhaps for the first time, a data-driven simulation–optimization model is developed based on experimental results to find the effects of state and decision variables on the optimum characteristics of a stilling basin with adverse slope and corrugated bed. The optimal design parameters of the stilling basin are investigated to minimize the length of the hydraulic jump and ratio of the sequent depths of the jump while the relative amount of energy loss is maximized. In order to model the relationship between design variables of the bed, the experimental results are converted to a data-driven simulation model on the basis of a multilayer perceptron (MLP) neural network. Then, the validated MLP model is used in a genetic algorithm optimization model in order to determine the optimum characteristics of the bed under the hydraulic jump considering the interaction between the bed design variables and the hydraulic parameters of the flow. Results indicate that the optimum values of bed slope and the diameter of the corrugated roughness (2r) can be considered as −0.02 and 20 millimetres, respectively.
Current Trends in Cancer Biomarker Discovery Using Urinary Metabolomics: Achievements and New Challenges
Authors: Burton Casey , Ma Yinfa 
Published: April 2018

Background:The development of effective screening methods for early cancer detection is one of the foremost challenges facing modern cancer research. Urinary metabolomics has recently emerged as a potentially transformative approach to cancer biomarker discovery owing to its noninvasive sampling characteristics and robust analytical feasibility.Objective:To provide an overview of new developments in urinary metabolomics, cover the most promising aspects of hyphenated techniques in untargeted and targeted metabolomics, and to discuss technical and clinical limitations in addition to the emerging challenges in the field of urinary metabolomics and its application to cancer biomarker discovery.Methods:A systematic review of research conducted in the past five years on the application of urinary metabolomics to cancer biomarker discovery was performed. Given the breadth of this topic, our review focused on the five most widely studied cancers employing urinary metabolomics approaches, including lung, breast, bladder, prostate, and ovarian cancers.Results:As an extension of conventional metabolomics, urinary metabolomics has benefitted from recent technological developments in nuclear magnetic resonance, mass spectrometry, gas and liquid chromatography, and capillary electrophoresis that have improved urine metabolome coverage and analytical reproducibility. Extensive metabolic profiling in urine has revealed a significant number of altered metabolic pathways and putative biomarkers, including pteridines, modified nucleosides, and acylcarnitines, that have been associated with cancer development and progression.Conclusion:Urinary metabolomics presents a transformative new approach toward cancer biomarker discovery with high translational capacity to early cancer screening.