bluuebunny/crossref_metadata_2025_split huggingface dataset:
CatbNet: A Multi Network Analyzer for Comparing and Analyzing the Topology of Biological Networks
Authors: Pournoor Ehsan , Elmi Naser , Masoudi-Nejad Ali 
Published: December 2018

Background:
Complexity and dynamicity of biological events is a reason to use comprehensive
and holistic approaches to deal with their difficulty. Currently with advances in omics data
generation, network-based approaches are used frequently in different areas of computational biology
and bioinformatics to solve problems in a systematic way. Also, there are many applications and tools
for network data analysis and manipulation which their goal is to facilitate the way of improving our
understandings of inter/intra cellular interactions.

Methods:
In this article, we introduce CatbNet, a multi network analyzer application which is prepared
for network comparison objectives.

Result and Conclusion:
CatbNet uses many topological features of networks to compare their structure
and foundations. One of the most prominent properties of this application is classified network
analysis in which groups of networks are compared with each other.
A Review on the Recent Developments of Sequence-based Protein Feature Extraction Methods
Authors: Zhang Jun , Liu Bin 
Published: December 2018

Background:Proteins play a crucial role in life activities, such as catalyzing metabolic reactions, DNA replication, responding to stimuli, etc. Identification of protein structures and functions are critical for both basic research and applications. Because the traditional experiments for studying the structures and functions of proteins are expensive and time consuming, computational approaches are highly desired. In key for computational methods is how to efficiently extract the features from the protein sequences. During the last decade, many powerful feature extraction algorithms have been proposed, significantly promoting the development of the studies of protein structures and functions.Objective:To help the researchers to catch up the recent developments in this important field, in this study, an updated review is given, focusing on the sequence-based feature extractions of protein sequences.Method:These sequence-based features of proteins were grouped into three categories, including composition-based features, autocorrelation-based features and profile-based features. The detailed information of features in each group was introduced, and their advantages and disadvantages were discussed. Besides, some useful tools for generating these features will also be introduced.Results:Generally, autocorrelation-based features outperform composition-based features, and profile-based features outperform autocorrelation-based features. The reason is that profile-based features consider the evolutionary information, which is useful for identification of protein structures and functions. However, profile-based features are more time consuming, because the multiple sequence alignment process is required.Conclusion:In this study, some recently proposed sequence-based features were introduced and discussed, such as basic k-mers, PseAAC, auto-cross covariance, top-n-gram etc. These features did make great contributions to the developments of protein sequence analysis. Future studies can be focus on exploring the combinations of these features. Besides, techniques from other fields, such as signal processing, natural language process (NLP), image processing etc., would also contribute to this important field, because natural languages (such as English) and protein sequences share some similarities. Therefore, the proteins can be treated as documents, and the features, such as k-mers, top-n-grams, motifs, can be treated as the words in the languages. Techniques from these filed will give some new ideas and strategies for extracting the features from proteins.
Ultrasonography as a Diagnostic Aid in Evaluating Cystic Lesions, Benign Tumors and Malignancies of Maxillofacial Region: A Clinical Study
Authors: Puri Nidhi , Ahuja Upasana Sethi , Dhillon Manu , Rathore Akshay 
Published: December 2018

Aim:To evaluate the accuracy of Ultrasonography as a diagnostic aid in cysts, benign tumors and malignancies of maxillofacial region.Objectives:This study was conducted to evaluate the accuracy of ultrasonography in the diagnosis of the osseous lesions of the jaws including cysts, benign tumors and malignant tumors. All the findings obtained by ultrasonography were compared and correlated with the clinical diagnosis, radiographic diagnosis and histopathological findings.Materials and Methods:The study was conducted on 42 patients with osseous maxillofacial swellings. The clinical and radiographic examination was carried out for all the patients who were afterward subjected to ultrasonography with color Doppler followed by histopathology. All the findings obtained were then statistically analyzed.Results:The utility of ultrasonography was evaluated considering histopathology as a gold standard. The diagnostic accuracy of ultrasound was found to be 100% in cystic lesions, 80% in benign tumors, and 85.71% in malignant tumors.Conclusion:Ultrasonography provides an accurate imaging of the head and neck region and does provide information about the nature of the lesion, its extent, and relationship with the surrounding structures. We propose the use of ultrasonography as an adjunctive examination for osseous lesions of the jaws before any invasive treatment.
Immunophenotyping Oral Amyloidosis for the Precise Identification of the Biochemical Forms: A Retrospective Study
Authors: Binmadi Nada , Intapa Chidan , Chaisuparat Risa , Akeel Sara , Sindi Amal , Meiller Timothy 
Published: December 2018

Background:Amyloidosis refers to a group of systemic and localized disorders associated with the accumulation of misfolded protein aggregates called amyloids in different parts of the body. Owing to the existence of multiple forms of amyloids with similar tertiary structures, precise identification of their biochemical form is critical for correct therapy.Objective:This retrospective study aimed to determine whether typing of oral amyloid deposits can help diagnose a serious systemic condition in the early phase of the diseaseMethods:All histopathologically confirmed cases of amyloidosis managed over a 14-year period (January 1, 1997 to December 31, 2011) were retrieved for analysis. Two board-certified oral and maxillofacial pathologists reviewed the histopathological findings of amyloidosis on the basis of its classic Congo red staining characteristics. This was followed by immunohistochemical analysis of biopsy samples using a panel of antibodies specific for different forms of amyloidosis.Results:The most common location of amyloidosis was the tongue, and women were more commonly affected than men. The patient age ranged from 11 to 83 years (average 59.3 years). In patient 9, light-chain and pre-albumin (transthyretin) antibodies were related to arthritis and senile amyloidosis, respectively. The biopsy sample of patient 10, who was reported to have multiple myeloma, was positive for light chains and β2 microglobulin. All other samples exhibited localized (solitary) amyloidosis.Conclusion:Histological analysis coupled with immunostaining with a panel of specific antibodies might assist in identifying early systemic amyloidosis in patients with localized oral forms of the disease.
Prognostic Significance Of Serum Urea Concentration at Admission in older patients with hip fracture
Authors: Fisher Alexander , Fisher Leon , Srikusalanukul Wichat , Smith Paul N 
Published: December 2018

Background:There are unmet needs in objective prognostic indicators for Hip Fracture (HF) outcomes.Objectives:To evaluate the determinants and prognostic impact of elevated serum urea, a key factor of nitrogen homeostasis, in predicting hospital mortality, inflammatory complications and length of stay in HF patients.Methods:In 1819 patients (mean age 82.8±8.1 years; 76.4% women) with osteoporotic HF, serum urea level at admission along with 22 clinical and 35 laboratory variables were analysed and outcomes recorded. The results were validated in a cohort of 455 HF patients (age 82.1±8.0 years, 72.1% women).Results:Elevated serum urea levels (>7.5mmol/L) at admission were prevalent (44%), independently determined by chronic kidney disease, history of myocardial infarction, anaemia, hyperparathyroidism, advanced age and male gender, and significantly associated with higher mortality (9.4% vs. 3.3%, p<0.001), developing a high postoperative inflammatory response (HPIR, 22.1% vs.12.1%, p=0.009) and prolonged hospital stay (>20 days: 31.2% vs. 26.2%, p=0.021). The predictive value of urea was superior to other risk factors, most of which lost their discriminative ability when urea levels were normal. Patients with two abnormal parameters at admission, compared to subjects with the normal ones, had 3.6-5.6 -fold higher risk for hospital mortality, 2.7-7.8-fold increase in risk for HPIR and 1.3-1.7-fold higher risk for prolonged hospital stay. Patients with increased admission urea and a high inflammatory response had 9.7 times greater mortality odds compared to patients without such characteristics.Conclusion:In hip fracture patients admission serum urea is an independent and valuable predictor of hospital outcomes, in particular, mortality.
KINERJA PENYULUH LAPANGAN KELUARGA BERENCANA (PLKB) PADA KANTOR BADAN PEMBERDAYAAN MASYARAKAT DAN KELUARGA BERENCANA (BPMKB) DI KABUPATEN SUBANG
Authors: Wicaksono Wasis 
Published: December 2018

Hasil penelitian tentang Kinerja Penyuluh Lapangan Keluarga Berencana pada Kantor Badan Pemberdayaan Masyarakat dan Keluarga Berencana di Kabupaten Subang didasarkan pada adanya permasalahan mengenai rendahnya partisipasi masyarakat untuk mendukung program Keluarga Berencana, hal ini terkait dengan kinerja penyuluh lapangan keluarga berencana yang belum maksimal. Kinerja pegawai itu sendiri merupakan hasil kerja yang bisa didapat baik oleh individu maupun kelompok didalam sebuah organisasi sesuai dengan pekerjaanya masing - masing dalam hal menggapai tujuan organisasi tersebut. Adapun tujuan penelitian ini, penulis ingin mengetahui bagaimana Kinerja Penyuluh Lapangan Keluarga Berencana pada Kantor Badan Pemberdayaan Masyarakat dan Keluarga Berencana di Kabupaten Subang, Untuk mengetahui dan menganalisis bagaimana Kinerja Penyuluh Lapangan Keluarga Berencana tersebut, penulis menggunakan teori dari Terence Mitchell, yang menjelaskan bahwa kinerja pegawai yang baik harus dilihat dari 5 dimensi, antara lain: Kualitas pekerjaan, Komunikasi, Kecepatan kerja, Kemampuan pegawai, dan Inisiatif. Metode yang digunakan dalam penelitian ini adalah metode deskriptif melalui pendekatan kuantitatif. Data dikumpulkan melalui wawancara, studi dokumentasi, dan penyebaran angket kepada seluruh Kepala Unit Pelayanan Teknis pada masing-masing Kecamatan yang ada di Kabupaten Subang. Hasil penelitian menunjukan bahwa Kinerja Penyuluh Lapangan Keluarga Berencana pada Kantor Badan Pemberdayaan Masyarakat dan Keluarga Berencana di Kabupaten Subang secara keseluruhan dilihat berdasarkan teori Mitchell berada dalam kategori baik, kendati demikian ada beberapa indikator yang perlu ditingkatkan untuk memaksimalkan kinerja pegawai
Model Pencekram Beban Pintar Metode Elektromagnetik
Authors: Yuda Mindara Jajat , Kin Men Liu , Setianto Setianto , Hidayat Sahrul 
Published: December 2018

Kecakapan robot tergantung pada piranti yang dipasang pada lengan robot yang disebut end effector. Ada dua jenis end effector yaitu Peralatan (Tools) dan Pencengkram (Gripper), umumnya robot yang digunakan pada bidang industri menggunakan kedua jenis tersebut. Contoh untuk Tools. digunakan untuk melakukan operasi pada suatu objek, contohnya bor, penyemprot cat, gerinda, alat las, dan banyak lainnya. Jenis Gripper yaitu suatu piranti yang dapat digunakan untuk memegang atau mencekram sebuah objek, contohnya tangan mekanik dan piranti pengait dengan metoda elektromagnetik atau metoda hisap. Pencekram metoda elektromagnetik dapat digunakan untuk mengangkat objek bahan logam khusunya besi. Pencekram ini pada prinsinya menggunakan hukum Biot savart, yaitu medan magnet pada lilitan kawat yang ditimbulkan akibat arus listrik. Model pencekram beban pintar yang didesain dimana pemberian arus berdasarkan beban terangkat, dengan peraba terang atau gelap menggunakan piranti Light Dependence Resistor (LDR)
Pengaruh Penyuluhan Mengenai Imunisasi terhadap Pengetahuan dan Sikap Ibu di Desa Sukarapih Kec. Sukasari
Authors: Pramodya Reizza Dwitara , Susanti Ari Indra , Nirmala Sefita Aryati 
Published: December 2018

Kegiatan imunisasi merupakan salah satu cara untuk mencegah terjadinya penyakit tertentu, selain bermanfaat imunisasi juga memberikan efek samping yang dikenal dengan Kejadian Ikutan Pasca Imunisasi (KIPI). Berdasarkan Riskesdas 2013 didapatkan bahwa dari 91,3% anak di Indonesia yang pernah diimunisasi, terdapat 33,4% yang pernah mengalami KIPI. Keluhan yang sering terjadi adalah kemerahan dan bengkak, sedangkan keluhan demam tinggi dialami 6,8% anak. Perlu penyuluhan pada masyarakat untuk mengerti akan terjadinya efek samping. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui pengaruh penyuluhan mengenai imunisasi terhadap pengetahuan dan sikap ibu di Desa Sukarapih, Kecamatan Sukasari, Kabupaten Sumedang. Metode penelitian yang digunakan adalah analitik kuasi eksperimen. Populasi dalam penelitian ini adalah seluruh ibu yang memiliki bayi usia 0-10 buan. Sampel yang digunakan yaitu accidental sampling berjumlah 40 orang. Instrumen yang digunakan adalah kuesioner. Hasil penelitian ini menunjukan pengetahuan responden sebelum diberikan penyuluhan imunsasi berada dalam kategori baik sebanyak 45,0%, sikap responden yang mendukung sebesar 67,5%. Setelah diberikan penyuluhan terdapat peningkatan pengetahuan dalam kategori baik menjadi 65,0%, sedangkan sikap responden setelah diberikan penyuluha 50,0% responden memiliki sikap mendukung. Hasil uji wilcoxon menunjukan terdapat pengaruh bermakna penyuluhan terhadap pengetahuan ibu sebelum dan sesudah diberikan penyuluhan (p<0,05%) tetapi tidak terdapat pengaruh bermakna penyuluhan terhadap sikap ibu sebelum dan setelah dilakukan penyuluhan (p>0,05%). Kata Kunci : imunisasi, pengetahuan, penyuluhan, sikap
Korelasi Nilai Komunikasi Mahasiswa Fakultas Kedokteran Universitas Padjadjaran pada OSCE Tahap Akademik dengan OSCE UKMPPD
Authors: Lestari Qori , Dewi Sari Puspa , Desy Insi Farisa 
Published: December 2018

Kurangnya kemampuan komunikasi dokter dalam menyampaikan informasi kepada pasien masih menjadi masalah yang sering dikeluhkan. Objective Stuctured Clinical Examination (OSCE) merupakan salah satu alat evaluasi kemampuan komunikasi. OSCE diterapkan mulai tahap akademik dan berlanjut sampai tahap Uji Kompetensi Mahasiswa Program Profesi Dokter (UKMPPD). Penelitian ini bermaksud melihat korelasi nilai komunikasi mahasiswa pada tahap akademik dengan UKMPPD untuk mengevaluasi kurikulum komunikasi yang dilaksanakan di Fakultas Kedokteran Universitas Padjadjaran (FKUP). Metode Studi potong lintang dilakukan pada nilai OSCE tahap akademik dan UKMPPD dari 264 data mahasiswa FK Unpad angkatan 2009 dan 2010 pada September – November 2015. Rerata nilai OSCE untuk komunikasi maupun nilai komponen anamnesis dan komunikasi (communication skills, drug education, breaking bad news, informed concent) dianalisis dengan uji korelasi Spearman. Hasil Rerata nilai OSCE komunikasi tahap akademik dan UKMPPD secara berurutan adalah 88,77 (+2,21) dan 86,33 (+6,74) dengan koefisien korelasi r=0,158 (p< 0,05). Untuk komponen anamnesis dan komunikasi diperoleh koefisien korelasi secara berurutan adalah r=0,131 (p<0,05) dan r= 0,181 (p>0,05). Simpulan Terdapat korelasi positif lemah antara nilai komunikasi OSCE tahap akademik dengan OSCE UKMPPD. Perlu dilakukan penelitian lebih lanjut mengenai pendidikan dan penilaian komunikasi yang berlangsung selama proses pendidikan profesi dokter.Kata kunci : komunikasi, OSCE
Gambaran Karakteristik Ibu Menyusui Tidak Memberikan Asi Eksklusif Di Desa Cikeruh Kecamatan Jatinangor Kabupaten Sumedang Tahun 2015
Authors: Hanifah Silva Agustini , Astuti Sri , Susanti Ari Indra 
Published: December 2018

Pemberian ASI banyak manfaatnya, baik untuk ibu maupun untuk bayinya, namun kecenderungan untuk ibu menyusui bayinya secara ekslusif masih rendah. Riset WHO pada tahun 2011 di seluruh dunia menyatakan kurang dari 40% bayi menyusu eksklusif. Rendahnya pemberian ASI ekslusif dapat disebabkan oleh faktor karakteristik, internal, dan eksternal. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui gambaran karakteristik yang dapat menyebabkan ibu tidak memberikan ASI ekslusif di Desa Cikeruh pada bulan Agustus 2015. Metode yang digunakan dalam penelitian ini adalah deskriptif dengan pendekatan potong lintang. Data yang diperoleh adalah data primer yang diperoleh dari kuesioner. Dengan sampel sebanyak 36 orang responden. Analisis statistik yang digunakan adalah univariat. Hasil penelitian ini adalah rendahnya pemberian ASI ekslusif oleh ibu menyusui berdasarkan karakteristik yaitu ibu berusia 20-35 tahun (80,6%), tidak bekerja (66,7%), multipara (66,7%), motivasi ibu dalam menyusui (50%), ibu dengan pengetahuan kurang (41,7%), dukungan keluarga mengenai ASI eksklusif yang rendah (55,6%), dan waktu awal pemberian susu formula diberikan kepada bayi saat usia 0-1 bulan (91,7%). Simpulan penelitian ini adalah gambaran karakteristik ibu menyusui yang tidak memberikan ASI eksklusif yaitu usia ibu 20-35 tahun, dan waktu ibu memberikan susu formula saat bayi berusia 0-1 bulan.Kata Kunci : ASI eksklusif, ibu menyusui, karakteristik
Hubungan Indeks Massa Tubuh dengan Usia Menarche Siswi Sekolah Dasar Kelas 4 – 6 di Kecamatan Sukajadi
Authors: Maulidya Annisa Nur , Ismiarto Yoyos Dias , Mayasari Wulan 
Published: December 2018

Perubahan usia menarche saat ini telah terjadi di berbagai belahan dunia termasuk di Indonesia. Salah satu faktor penyebabnya adalah keadaan nutrisi yang dapat dinilai dengan indeks massa tubuh (IMT) yang telah mengalami perubahan. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui korelasi indeks massa tubuh dengan usia menarche. Penelitian cross sectional dilakukan antara bulan September sampai November 2016 terhadap 163 siswi Sekolah Dasar di Kecamatan Sukajadi yang sudah menarche. Subjek penelitian dipilih secara multistage random sampling. Usia menarche didapatkan dengan kuisioner. Indeks massa tubuh didapatkan dengan mengukur tinggi dan berat badan. Data dianalisis dengan metode Spearman’s Correlation Test. Berdasarkan dari 163 responden, hanya 125 siswi yang memenuhi kriteria inklusi penelitian. Didapatkan usia menarche dengan rata-rata 11,05 tahun, nilai tengah 11 tahun, dalam rentang 9 sampai 13 tahun. Indeks massa tubuh kemudian digolongkan ke dalam tiga kategori yaitu; sebanyak 76 siswi dengan status gizi normal, 35 siswi overweight, dan 14 siswi obesitas. Rata-rata indeks massa tubuh yaitu 20,10 kg/m2. Hasil analisis uji korelasi didapatkan nilai koefisien korelasi rs = -0,089 dan nilai signifikasi p = 0,324 (p>0,05). Kesimpulan penelitian diperoleh bahwa tidak terdapat korelasi antara indeks massa tubuh dengan usia menarche.Kata kunci: indeks massa tubuh, menstruasi, pubertas, remaja, usia menarche
Gambaran Lama Waktu Pelepasan Plasenta Dengan Manajemen Aktif Kala Iii Dan Masase Fundus Setelah Bayi Lahir Di Rsud Kelas B Kabupaten Subang
Authors: Alviani Euis Sisca , Wijaya Merry , Aprilliani Irna Kurnia 
Published: December 2018

Penyebab AKI di Indonesia yaitu perdarahan saat persalinan, MAK III terbukti mengurangi perdarahan, MAK III yaitu suntik oksitosin 1 menit setelah bayi lahir ketika tidak ada janin ke dua, penegangan tali pusat terkendali, masase fundus uteri setelah plasenta lahir, dengan MAK III dapat mengurangi perdarahan namun, penelitian lain menyebutkan masase fundus uteri sebelum plasenta lahir dapat mengurangi kehilangan darah, waktu pengeluaran plasenta berpengaruh terhadap pengeluaran darah. Penelitian ini bertujuan mengetahui lamanya waktu pelepasan plasenta dengan MAK III dan masase fundus uteri setelah bayi lahir di RSUD Subang. Metode yang digunakan adalah metode penelitian deskriptif dengan pendekatan secara Cross Sectional. Pengambilan sampel menggunakan accidental sampling sebanyak 66 ibu bersalin di RSUD Subang dengan menggunakan lembar observasi dan dilaksanakan pada 29 April – 3 Juli 2015. Hasil penelitian diperoleh gambaran lama waktu pelepasan plasenta dengan MAK III dari 33 responden 87,9% dan 33 responden masase fundus uteri 81,8% terbanyak dalam waktu <15 menit untuk usia, paritas yang dilakukan dengan MAK III <15 menit adalah usia 20-35 tahun 60,6% dan 2-4 (multipara) 48,4% untuk masase 20-35 tahun 36,3% dan 1 (primipara) 54,5%. Simpulan dari penelitian adalah lama pelepasan plasenta dengan MAK III dan masase fundus uteri setelah bayi lahir terbanyak <15 menit.Kata Kunci: Manajemen Aktif Kala III, Masase fundus uteri, Pelepasan Plasenta, Waktu
Faktor Predisposisi Bidan dalam Pelaksanaan Program Stimulasi, Deteksi Dini dan Intervensi Tumbuh Kembang (SDIDTK)
Authors: Khairunnisa Dhea Nevira , Handayani Dini Saraswati , Nirmala Sefita Aryuti , Astuti Sri , Judistiani Tina Dewi 
Published: December 2018

Pembinaan tumbuh kembang anak secara komprehensif dan berkualitas diselenggarakan melalui kegiatan Stimulasi, Deteksi dan Intervensi Dini Tumbuh Kembang (SDIDTK). Program SDIDTK adalah program pokok Puskesmas DTP Kota Bandung yang dilaksanakan oleh tenaga kesehatan khususnya oleh bidan. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui faktor predisposisi bidan dalam pelaksanaan program SDIDTK. Metode penelitian yang digunakan adalah metode deskriptif dengan pendekatan cross sectional. Sampel yang digunakan adalah seluruh bidan yang bekerja di Puskesmas DTP Kota Bandung, berjumlah 75 bidan. Data yang digunakan adalah data primer diperoleh dari kuesioner yang diberikan kepada bidan. Penelitian ini dilaksanakan pada bulan Juli - Agustus 2016. Berdasarkan hasil penelitian diperoleh bidan berumur 26-30 tahun 37 orang (49,3%), berpendidikan D3 66 orang (88,0%), lama bekerja >5 tahun 37 orang (49,3%), pernah pelatihan 15 orang (20,0%) dan lama pelatihan <1 tahun,1-2 tahun, >3 tahun masing-masing 5 orang (6,7%). Gambaran bidan yang memiliki pengetahuan cukup 39 orang (52,0%) dan memiliki sikap positif 39 orang (52,0%) Simpulan dari penelitian ini adalah pengetahuan dan sikap bidan yang merupakan faktor predisposisi dalam pelaksanaan program SDIDTK dapat dikatakan masih dalam kategori cukup. Pelatihan SDIDTK, seminar atau workshop mengenai pentingnya pemantauan tumbuh kembang anak sangat disarankan dengan harapan dapat meningkatkan pengetahuan bidan mengenai SDIDTK.Kata Kunci : Bidan, Faktor Predisposisi, SDIDTK