bluuebunny/crossref_metadata_2025_split huggingface dataset:
High-throughput computational X-ray absorption spectroscopy
Authors: Mathew Kiran , Zheng Chen , Winston Donald , Chen Chi , Dozier Alan , Rehr John J. , Ong Shyue Ping , Persson Kristin A. 
Published: July 2018

AbstractX-ray absorption spectroscopy (XAS) is a widely-used materials characterization technique. In this work we present a database of computed XAS spectra, using the Green's formulation of the multiple scattering theory implemented in the FEFF code. With more than 500,000 K-edge X-ray absorption near edge (XANES) spectra for more than 40,000 unique materials, this database constitutes the largest existing collection of computed XAS spectra to date. The data is openly distributed via the Materials Project, enabling researchers across the world to access it for free and use it for comparisons with experiments and further analysis.
Fifteen–year record of soil temperature at the Bear Brook Watershed in Maine
Authors: Patel Kaizad F. , Nelson Sarah J. , Spencer Cheryl J. , Fernandez Ivan J. 
Published: July 2018

AbstractThis paper describes a record of air and soil temperature collected from 2001 to 2016 in temperate forests at the Bear Brook Watershed in Maine (BBWM). BBWM is a long-term research site established to study the response of forest ecosystem function to various environmental disturbances, including chronic acidic deposition. Replicate HOBO data loggers were deployed in BBWM’s two forest types (coniferous and deciduous), to record temperatures at four positions: (1) air temperature, 100 cm above the forest floor; (2) surface organic soil, 2 cm below the forest floor surface; (3) mineral soil, 10 cm below the organic–mineral horizon interface; and (4) mineral soil, 25 cm below the organic–mineral horizon interface. Data were recorded every three hours, and these raw data were used to compute daily maximum, daily minimum, daily average, and monthly average values. This fifteen–year record represents one of the few readily–available soil temperature datasets in the region, and provides information on long-term changes in climatology, and seasonal and episodic weather patterns.
High step‐up DC–DC converter using one switch and lower losses for photovoltaic applications
Authors: Maalandish Mohammad , Hosseini Seyed Hossein , Jalilzadeh Tohid , Vosoughi Naser 
Published: July 2018

In this study, a new non‐isolated high step‐up dc–dc converter using one switch and low‐voltage stress on semiconductors is presented for photovoltaic applications. The proposed converter consists of one switch in the input side (S), voltage multiplier units (D–C–L), one diode in the output side (Do) and one capacitor (Co). To achieve high‐voltage gain and power level, the proposed converter can be extended to n stages of voltage multiplier units. Hence, the output voltage level will be reasonably increased and the nominal value of power devices will be decreased. Therefore, the voltage stress across the power switch is decreasing for different duty cycles at high power levels. As a result, the efficiency of the proposed converter can be increased by using one switch with lower resistance rDS(on). To verify the carried mathematical analysis of the proposed converter and circuit implementation are validated through both the simulation and experimental results that accordance each other well. The experimental results of two prototypes (with n = 2, 3) in about 290 W operating at 33 kHz are provided.
Stellar populations of the central region of M 31
Authors: Saglia R. P. , Opitsch M. , Fabricius M. H. , Bender R. , Blaña M. , Gerhard O. 
Published: July 2018

Aims.We continue the analysis of the data set of our spectroscopic observation campaign of M 31, whose ultimate goal is to provide an understanding of the three-dimensional structure of the bulge, its formation history, and composition in terms of a classical bulge, boxy-peanut bulge, and bar contributions.Methods.We derive simple stellar population (SSP) properties, such as age metallicity andα-element overabundance, from the measurement of Lick/IDS absorption line indices. We describe their two-dimensional maps taking into account the dust distribution in M 31.Results.We found 80% of the values of our age measurements are larger than 10 Gyr. The central 100 arcsec of M 31 are dominated by the stars of the classical bulge of M 31. These stars are old (11−13 Gyr), metal-rich (as high as [Z/H] ≈ 0.35 dex) at the center with a negative gradient outward and enhanced inα-elements ([α/Fe]≈ 0.28±0.01 dex). The bar stands out in the metallicity map, where an almost solar value of [Z/H] (≈0.02 ± 0.01 dex) with no gradient is observed along the bar position angle (55.7 deg) out to 600 arcsec from the center. In contrast, no signature of the bar is seen in the age and [α/Fe] maps, which are approximately axisymmetric, delivering a mean age and overabundance for the bar and boxy-peanut bulge of 10–13 Gyr and 0.25–0.27 dex, respectively. The boxy-peanut bulge has almost solar metallicity (−0.04 ± 0.01 dex). The mass-to-light ratio of the three components is approximately constant atM/LV≈ 4.4−4.7M⊙/L⊙. The disk component at larger distances is made of a mixture of stars, as young as 3–4 Gyr, with solar metallicity and smallerM/LV(≈3 ± 0.1M⊙/L⊙).Conclusions. We propose a two-phase formation scenario for the inner region of M 31, where most of the stars of the classical bulge come into place together with a proto-disk, where a bar develops and quickly transforms it into a boxy-peanut bulge. Star formation continues in the bulge region, producing stars younger than 10 Gyr, in particular along the bar, thereby enhancing its metallicity. The disk component appears to build up on longer timescales.
Fused CLEAN deconvolution for compact and diffuse emission
Authors: Zhang L. 
Published: July 2018

Context. CLEAN algorithms are excellent deconvolution solvers that remove the sidelobes of the dirty beam to clean the dirty image. From the point of view of the scale, there are two types: scale-insensitive CLEAN algorithms, and scale-sensitive CLEAN algorithms. Scale-insensitive CLEAN algorithms perform excellently well for compact emission and perform poorly for diffuse emission, while scale-sensitive CLEAN algorithms are good for both point-like emission and diffuse emission but are often computationally expensive. However, observed images often contain both compact and diffuse emission. An algorithm that can simultaneously process compact and diffuse emission well is therefore required.
Aims. We propose a new deconvolution algorithm by combining a scale-insensitive CLEAN algorithm and a scale-sensitive CLEAN algorithm. The new algorithm combines the advantages of scale-insensitive algorithms for compact emission and scale-sensitive algorithms for diffuse emission. At the same time, it avoids the poor performance of scale-insensitive algorithms for diffuse emission and the great computational load of scale-sensitive algorithms for compact emission in residuals.
Methods. We propose a fuse mechanism to combine two algorithms: the Asp-Clean2016 algorithm, which solves the computationally expensive problem of convolution operation in the fitting procedure, and the classical Högbom CLEAN (Hg-Clean) algorithm, which is faster and works equally well for compact emission. It is called fused CLEAN (fused-Clean) in this paper.
Results. We apply the fused-Clean algorithm to simulated EVLA data and compare it to widely used algorithms: the Hg-Clean algorithm, the multi-scale CLEAN (Ms-Clean), and the Asp-Clean2016 algorithm. The results show that it performs better and is computationally effective.
Myokardinfarkt bei jungem Seminompatient während Chemotherapie mit Cisplatin, Etoposid und Bleomycin (PEB-Schema)
Authors: Brinkmann Mathias , Tallone Ezequiel Marcelo , Würschmidt Florian , Wülfing Christian , Dieckmann Klaus-Peter 
Published: July 2018

Zusammenfassung
Einleitung Die Keimzelltumoren des Hodens können durch Chemotherapie mit Cisplatin, Etoposid und Bleomycin (PEB) in weit über 90 % aller Fälle geheilt werden. Die Chemotherapie wird von den zumeist jungen Männern ohne schwerwiegende Komplikationen toleriert. Kardiovaskuläre Komplikationen sind äußerst selten, sind aber in den letzten Jahren zunehmend in den Fokus geraten.
Fallbericht Ein 33-jähriger Mann mit testikulärem Seminom im klinischen Stadium 2b wurde einer PEB-Chemotherapie unterzogen. Am Ende des ersten Zyklus dieser Therapie ereignete sich ein akuter ST-Hebungs-Infarkt (STEMI). Die Koronarangiografie zeigte eine umschriebene Stenose im proximalen Ramus circumflexus der linken Koronararterie mit einer Dissektion und thrombotischer Auflagerung bei sonst unauffälligem Gefäßstatus. Die Stenose konnte durch Stenteinlage versorgt werden. Die Seminomtherapie wurde fortgesetzt durch Strahlentherapie mit 30 Gy. Es wurde eine komplette Remission erreicht. 6 Monate später ist der Patient herzgesund und rezidivfrei.
Kommentar Bei etwa 0,3 % aller Chemotherapien bei Hodentumorpatienten treten schwerwiegende kardiovaskuläre Komplikationen auf. Als Ursache wird ein direkter Endothelschaden durch Cisplatin mit konsekutiver thrombotischer Auflagerung vermutet. Aufgrund fehlender Komorbidität ist die Prognose dieser Komplikationen zumeist günstig. Die behandelnden Personen sollen von dieser seltenen Komplikationsmöglichkeit wissen, damit im gegebenen Fall eine unverzügliche Diagnostik und Therapie eingeleitet werden kann.
Der Pflegekomplexmaßnahmen-Score: Paradigmenwechsel im G-DRG System oder Tropfen auf den heißen Stein? Eine Sekundäranalyse auf Basis von
Abrechnungsdaten
Authors: Olivier Matthias , Boeker Martin , Hanser Susanne , Hehn Philip , Kaier Klaus 
Published: July 2018

Zusammenfassung
Ziel der Studie Die Einführung des Pflegekomplexmaßnahmen-Score (PKMS) wird oft als Paradigmenwechsel im G-DRG-System bezeichnet. Ziel dieser Arbeit war
es, die durch das PKMS entstehende Anreizwirkung innerhalb des G-DRG-Systems zu analysieren.
Methodik Mit Hilfe einer Sekundäranalyse mit Routine-Abrechnungsdaten wurden dazu alle im Jahr 2014 am Universitätsklinikum Freiburg behandelten
PKMS-Fälle untersucht.
Ergebnisse Die durchschnittliche Mittlere Verweildauer der abgerechneten DRGs wurde von den PKMS-Patienten deutlich überschritten (16,5 Tage oder um 77,8
%, p < 0.001). Bei Annahme durchschnittlicher Krankenhauskosten reichen die im PKMS-System vorgesehenen Zusatzentgelte bei weitem nicht aus, um die Kosten
der Verweildauerüberschreitungen zu kompensieren.
Schlussfolgerung Obwohl ein gewisser kompensatorischer Effekt des Zusatzentgeltes nicht ausgeschlossen werden kann, muss davon ausgegangen werden, dass
die durch das PKMS-E-System gewährten Zusatzentgelte schlicht zu niedrig sind, um einen Einfluss auf die im G-DRG-System enthaltenen Anreize zur
Verweildauerreduktion zu entfalten.
Über das Gehirn hinaus
Authors: Walter H. 
Published: July 2018

ZusammenfassungMentale Prozesse sind Hirnprozesse – das ist das Credo der kognitiven Neurowissenschaft. Entgegen dieser internalistischen Sichtweise werde ich dafür argumentieren, dass mentale Prozesse über das Gehirn hinausgehen. Der Grund dafür ist, dass der Gehalt eines mentalen Prozesses, seine Bedeutung, nicht allein durch gehirninterne, sondern durch externe Faktoren mitbestimmt ist. In diesem Artikel werde ich zwei philosophische Argumente dafür erörtern, das Argument der Gleichwertigkeit und ein teleosemantisches Argument. Kognitive Prozesse sind ihrer Natur nach Vorgänge, die über das Hirn hinausgehen, da sie durch einen handelnden, verkörperten, in seiner Umwelt situierten Organismus realisiert werden. Ich werde dann zwei aktuelle Diskussionsstränge aus Philosophie und Neurowissenschaft darstellen, die unser herkömmliches Verständnis des Mentalen in Frage stellen: den radikalen Enaktivismus einerseits und die These der vorausschauenden Verarbeitung (predictive processing) andererseits. Dabei wird sich zeigen, dass überraschenderweise der radikale Enaktivismus eliminative Tendenzen aufweist, während die These der vorausschauenden Verarbeitung zwar mit externalistischen Thesen kompatibel ist, aber internen Hirnprozessen eine entscheidende Rolle für eine Theorie des Mentalen zuweist.
Gedankenlesen aus der Hirnaktivität?
Authors: Haynes J.-D. 
Published: July 2018

ZusammenfassungKann man auf der Basis der Gehirnaktivität einer Person bestimmen, was sie gerade denkt und fühlt? Im Forschungsgebiet des „Brain-Reading” (wörtlich: Gehirnlesen) wird untersucht, inwiefern es möglich ist, aus den Hirnprozessen einer Person auf ihre Gedankeninhalte zu schließen. Die Grundidee ist, dass jeder Gedanke mit einem charakteristischen Aktivierungsmuster im Gehirn einhergeht. Trainiert man einen Computer darauf, solche Muster zu erkennen, wird es möglich, die Gedanken einer Person allein aus der Hirnaktivität auszulesen. Bereits heute sind eine Reihe verschiedener Gedanken ausgelesen worden. Dazu zählen visuelle Wahrnehmungen und Vorstellungen, Erinnerungen, Absichten, Gefühle und Trauminhalte. Es ist bisweilen sogar möglich, aus der Hirnaktivität mehr über die mentalen Prozesse einer Person auszulesen, als ihr selbst bewusst ist. So kann man in bestimmten Situationen Absichten, bereits mehrere Sekunden bevor sie das Bewusstsein erreichen, auslesen. Trotz der erheblichen Erfolge in den letzten Jahren stößt das „Brain-Reading” jedoch auch schnell an Grenzen. So ist es zum Beispiel aus prinzipiellen Gründen schwierig, beliebige Gedanken auszulesen oder Erkenntnisse von einer Person auf andere zu übertragen. Es ist also noch ein langer Weg bis zu einer hypothetischen „universellen Gedankenlesemaschine”, bei der die beliebigen Gedanken einer beliebigen Versuchsperson auf Anhieb ausgelesen werden können. Es zeichnen sich mit heute verfügbaren Ansätzen bereits zwar einige Anwendungsmöglichkeiten ab, wie etwa in der Forensik und Kriminologie, in der Steuerung von Computern und künstlichen Prothesen mittels der Hirnaktivität, oder auch im „Neuromarketing”. Allerdings sind diese Techniken weit von der Anwendungsreife entfernt. Außerdem stellen sich vor ihrem Einsatz erhebliche ethische Fragen.
Enormes professionelles Unverständnis gegenüber Traumatisierten
Authors: Gerke J. , Rassenhofer M. , Fegert J. M. 
Published: July 2018

ZusammenfassungBetroffene fortgesetzter sexueller Gewalt und schwer belastete, multiplen frühen Kindheitsbelastungen ausgesetzte Personen empfinden die aussagepsychologische Methode der Glaubhaftigkeitsbegutachtung häufig als Zumutung.Klinische und neuropsychologische Befunde zu Gedächtnisleistungen nach kindlicher Traumatisierung implizieren, dass gerade für Menschen, die fortgesetzte, chronische Misshandlungs- und Missbrauchserfahrungen gemacht haben, die Anwendung der kriterienbasierten aussagepsychologischen Begutachtung nicht angemessen ist. Strukturelle Veränderungen in Nervensystem und Stressachse führen zu Einschränkungen der Gedächtnisleistung, die es in Kombination mit häufig zusätzlich vorliegenden komplexen psychischen Traumafolgestörungen unmöglich machen, einzelne, zumeist lange zurückliegende Ereignisse als distinkte Einzeltaten zu beschreiben. Zudem ist die im Strafrecht gebotene Ausrichtung auf maximale Spezifität und Verhinderung von falsch positiven Feststellungen in anderen Rechtsgebieten inadäquat. Ein wissenschaftliches aber auch rechtspolitisches Hinterfragen dieses deutschen Sonderwegs erscheint angezeigt.
The acquisition of relative clauses in Russian and Polish in monolingual and bilingual children
Authors: Peeters-Podgaevskaja Alla V. , Janssen Bibi E. , Baker Anne E. 
Published: July 2018

AbstractIn this paper, we present the results on (re)production of relative clauses in a sentence repetition task by Russian and Polish monolingual and bilingual children (3;6–6;6 years). Russian and Polish both involve overt case marking in the relative clause formation, but the case marking in Polish is more regular and transparent. Our results suggest that, when case marking is the only disambiguating cue, its transparency and regularity contributes to a significantly better performance. This explains why the Polish children, both monolingual and bilingual, were more successful in reproduction of subject and object relatives compared to their Russian peers.
Anthropometric profiles are associated with long‐term career attainment in elite junior rowers: A retrospective analysis covering 23 years
Authors: Winkert Kay , Steinacker Jürgen M. , Machus Katja , Dreyhaupt Jens , Treff Gunnar 
Published: July 2018

ABSTRACTIntroduction:Successful rowers are heavier and taller than their opponents, but the effect of these variables on long‐term career attainment in juniors has not been examined. We therefore analysed this in a large sample of elite German junior rowers.Methods: Former German Junior National Team rowers (N= 910; 399 females) were grouped according to their highest career attainment, i.e., participation in U19‐, U23‐, Senior World Championships or Olympic Games (OG). Differences in standing height (SH), body mass (BM) and body mass index (BMI) between groups were analysed using unpairedt‐tests and magnitude‐based inferences (MBI), effects of anthropometrics on career attainment were analysed with a proportional odds model. Interquartile ranges of the OG group were used to define normative data ranges.Results: SH and BMIvery likelydiffered between career attainment in females. The same was found in males for SH and BM. BM (odds ratio (OR) = 0.958,P= .0171) and BMI (OR= 0.787,P= .0004) had a significant effect on career attainment in females as SH (OR= 1.072,P= .0002) and BM (OR= 1.049,P= .0004) had in males. Interquartile ranges of SH and BM were 178–184 cm and 68–73 kg in females, 190–196 cm and 84–93 kg in males.Conclusion: Anthropometric characteristics at junior age affect long‐term career attainment even within elite U19 National Team rowers, underlining the relevance of anthropometric assessments and their consideration for talent identification and development programmes in rowing. We provide evidence‐based normative data that rule out an anthropometric limitation of junior rowers for career progression to Olympic level.
Interaction between pollution and climate change augments ecological risk to a coastal ecosystem
Authors: Lu Yonglong , Wang Ruoshi , Shi Yajuan , Su Chao , Yuan Jingjing , Johnson Andrew C. , Jenkins Alan , Ferrier Robert C. , Chen Deliang , Tian Hanqin , Melillo Jerry , Song Shuai , Ellison Aaron M. 
Published: July 2018

ABSTRACT
Pollution and climate change are among the most challenging issues for countries with developing economies, but we know little about the ecological risks that result when these pressures occur together. We explored direct effects of, and interactions between, environmental pollution and climate change on ecosystem health in the Bohai Sea region of Northern China. We developed an integrated approach to assess ecological risks to this region under four scenarios of climate change. Although ecological risks to the system from pollution alone have been declining, interactions between pollution and climate change have enhanced ecological risks to this coastal/marine ecosystem. Our results suggest that current policies focused strictly on pollution control alone should be changed to take into account the interactive effects of climate change so as to better forecast and manage potential ecological risks.
The Excision of the Buccal Fat Pad for Cheek Refinement: Volumetric Considerations
Authors: Sezgin Billur , Tatar Sedat , Boge Medine , Ozmen Selahattin , Yavuzer Reha 
Published: July 2018

Abstract

Background
Although the excision of the buccal fat pad has become very popular for achieving a slimmer midface, not all patients are good candidates for this procedure. Unfortunately, studies that provide guidelines by emphasizing volumetric and technical details are limited.

Objectives
The study compared preoperative and postoperative volumetric data to identify the amount of tissue that can safely be removed and important technical concepts involved in lower cheek contouring with buccal fat pad excision.

Methods
Patients complaining of cheek fullness were evaluated to determine if they were good candidates for the procedure. Eligible patients were screened with transbuccal ultrasound to determine tissue volumes and anatomical details. Intraoperative and postoperative, 6th-month volume measurements were undertaken and residual tissues and vascular pedicles reevaluated.

Results
Ultrasound imaging showed that the mean preoperative volume of the fat pads was 11.67 ± 1.44 mL, and the mean postoperative volume was 8.58 ± 1.07 mL. The mean volume of the excised tissues was 2.74 ± 0.69 mL. Postoperative buccal fat pad volume values correlated with the reported average in the literature for the same age group.

Conclusions
Buccal fat pad removal is an effective technique for refining the facial silhouette that should be reserved for patients with increased buccal fat pad volume. Removal of only the excessive portion of the fat pad is important because this structure provides significant volume in the midface that can be difficult to restore once aging affects the surrounding soft and bony tissue.

Level of Evidence: 4
JustOrthologs: a fast, accurate and user-friendly ortholog identification algorithm
Authors: Miller Justin B , Pickett Brandon D , Ridge Perry G 
Published: July 2018

Abstract

Motivation
Orthologous gene identification is fundamental to all aspects of biology. For example, ortholog identification between species can provide functional insights for genes of unknown function and is a necessary step in phylogenetic inference. Currently, most ortholog identification algorithms require all-versus-all BLAST comparisons, which are time-consuming and memory intensive.

Results
In contrast to existing approaches, JustOrthologs exploits the conservation of gene structure by using the lengths of coding sequence regions and dinucleotide percentages to identify orthologs. In comparison to OrthoMCL, OMA and OrthoFinder, JustOrthologs decreases ortholog identification runtime by more than 96% and achieves comparable precision and recall scores. The computational speedup allowed us to conduct pairwise comparisons of 1197 complete genomes (780 eukaryotes and 417 archaea). We confirmed gene annotations for 384 120 genes, grouped 1 675 415 genes in previously unreported ortholog groups, and identified 51 429 potentially mislabeled genes across 622 843 ortholog groups.

Availability and implementation
JustOrthologs is an open source collaborative software package available in the GitHub repository: https://github.com/ridgelab/JustOrthologs/. All test FASTA files used for comparisons are freely available at https://github.com/ridgelab/JustOrthologs/comparisonFastaFiles/. Reference genomes used in this work are available for download from the NCBI repository: ftp://ftp.ncbi.nih.gov/genomes/.

Supplementary information
Supplementary data are available at Bioinformatics online.