bluuebunny/crossref_metadata_2025_split huggingface dataset:
Widespread Adoption of Precision Anticancer Therapies After Implementation of Pathologist-Directed Comprehensive Genomic Profiling Across a Large US Health System
Authors: Dowdell Alexa K. , Meng Ryan C. , Vita Ann , Bapat Bela , Hanes Douglas , Chang Shu-Ching , Harold Lauren , Wong Cliff , Poon Hoifung , Schroeder Brock , Weerasinghe Roshanthi , Leidner Rom , Urba Walter J. , Bifulco Carlo B. , Piening Brian D. 
Published: November 2024

PURPOSE
Precision therapies and immunotherapies have revolutionized cancer care, with novel genomic biomarker-associated therapies being introduced into clinical practice rapidly, resulting in notable gains in patient survival. Despite this, there is significant variability in the utilization of tumor molecular profiling that spans the timing of test ordering, comprehensiveness of gene panels, and clinical decision support through therapy and trial recommendations.

METHODS
To standardize testing, we designed a pathologist-directed test ordering system at the time of diagnosis using a 523-gene DNA/RNA hybrid comprehensive genomic profiling (CGP) panel and extensive clinical decision support tools. To comprehensively characterize the clinical impact of this protocol, we developed a novel natural language processing (NLP)–based approach to extract clinical features from physician chart notes. We assessed test actionability rates, therapy choice, and outcomes across a set of 3,216 patients with advanced cancer.

RESULTS

We observed 49% of patients had at least one actionable genomic biomarker-driven–approved and/or guideline-recommended targeted or immunotherapy (IO) and 53% of patients would have been eligible for a precision therapy clinical trial from three large basket trials. When assessing CGP versus an in silico 50-gene panel, 67% of tumors compared with 33% harbored actionable alterations including clinical trials. Among patients with 6 months or more of follow-up, over 52% received a targeted therapy (TT) or IO, versus 32% who received conventional chemotherapy alone. Furthermore, patients receiving TT had significantly improved overall survival compared with patients receiving chemotherapy alone (
P
< .001).

CONCLUSION
Overall, these data represent a major shift in standard clinical practice toward molecularly guided treatments (targeted and immunotherapies) over conventional systemic chemotherapy. As guidelines continue to evolve and more precision therapeutics gain approval, we expect this gap to continue to widen.
Optimal Control of Service Systems with Heterogeneous Servers and Priority Customers
Authors: Chen David , Chen Ruoran , Wang Rowan , Wang Xuan 
Published: November 2024

We study service systems with parallel servers and random customer arrivals and focus on the waiting cost of customers. Using a Markov decision process (MDP) modeling approach, we analytically characterize the structures of the optimal dynamic server assignment policies for two important systems, one consisting of multiple homogeneous servers and two classes of customers and the other consisting of two heterogeneous servers and multiple classes of customers. Based on the obtained results, we propose a threshold-type heuristic policy for the generalized system consisting of multiple heterogeneous servers and multiple classes of customers. To design such a heuristic policy, we first develop techniques for the performance evaluation of general threshold-type policies with any given threshold values. We then construct a path to search for the optimal threshold values. We compare the performance of the best threshold-type heuristic policy with that of the optimal policy and show that our proposed heuristic policy is computationally efficient yet generates great performance. To derive additional managerial insights, we compare the system under our threshold-type dynamic server assignment policy with other commonly seen and simple systems, such as the dedicated system and the work-conserving flexible priority system. The clear performance advantage observed from extensive numerical experiments demonstrates the importance and usefulness of dynamic server assignment control for systems serving multiple classes of customer arrivals. Finally, we extend our analysis to incorporate customer-dependent service rates and sojourn-time minimization performance metrics. This paper was accepted by Chung Piaw Teo, optimization. Funding: This work was supported by the Hong Kong Research Grants Council [16500921, 16505819] and the National Natural Science Foundation of China [72201233, 72301222]. Supplemental Material: The online appendix and data files are available at https://doi.org/10.1287/mnsc.2023.01228 .
Media Conglomeration, Local News, and Capital Market Consequences
Authors: Dyer Travis , Lang Mark , Oh Jun 
Published: November 2024

We examine the effect of news media consolidation on local business coverage and its consequences for firms, investors, and capital markets. Using television transcripts, we find a substantial drop in coverage of local firms following the consolidation of local television stations associated with Sinclair acquisitions. Local information search, institutional portfolio local bias, and overall retail trading decrease for firms in treated geographic areas. Results are most pronounced for small firms, for stations with higher ex ante viewership, and for stations with greater reductions in local coverage. Our results provide insight into the consequences of media consolidation for local business coverage, firms, investors, and capital markets. This paper was accepted by Eric So, accounting. Funding: Financial support from the Brigham Young University Marriott School of Business, Purdue University Mitch Daniels School of Business, and Kenan-Flagler Business School is gratefully acknowledged. Supplemental Material: The online appendix and data files are available at https://doi.org/10.1287/mnsc.2023.02247 .
A Squared Smoothing Newton Method for Semidefinite Programming
Authors: Liang Ling , Sun Defeng , Toh Kim-Chuan 
Published: November 2024

This paper proposes a squared smoothing Newton method via the Huber smoothing function for solving semidefinite programming problems (SDPs). We first study the fundamental properties of the matrix-valued mapping defined upon the Huber function. Using these results and existing ones in the literature, we then conduct rigorous convergence analysis and establish convergence properties for the proposed algorithm. In particular, we show that the proposed method is well-defined and admits global convergence. Moreover, under suitable regularity conditions, that is, the primal and dual constraint nondegenerate conditions, the proposed method is shown to have a super-linear convergence rate. To evaluate the practical performance of the algorithm, we conduct extensive numerical experiments for solving various classes of SDPs. Comparison with the state-of-the-art SDP solvers demonstrates that our method is also efficient for computing accurate solutions of SDPs. Funding: The research of D. Sun was supported in part by the Hong Kong Research Grants Council under Grant 15307523, and the research of K.-C. Toh was supported by the Ministry of Education, Singapore, under its Academic Research Fund Tier 3 grant call [MOE-2019-T3-1-010].
Effect of treatment on quality of life of rural asthmatic children
Authors: Muley Dr Prasad , Dave Dr Hemal , Dave Dr Hardik , Bhatt Dr Sargam , Mithaiwala Dr Vaibhavi 
Published: November 2024

Introduction: Medications relieve symptoms of asthma but affected children are significantly bothered by physical, educational and emotional impairments. Urban studies from India evaluated on how this disease affects quality of life. Aim of our study was to evaluate quality of life of rural asthmatic children both before as well as after the treatment. Methods: Asthmatic children 7 to 17 years visiting to rural tertiary care teaching hospital were included. Tool used for the study was Pediatric Asthma Quality of Life Questionnaire - Standard (PAQLQS) which were measured at the time of inclusion and four weeks after treatment. It assessed the QOL (Quality of Life) under symptoms, activity limitation and emotional function domains. Mean difference in pre and post treatment PAQLQ score was assessed. Results: Total 46 children were included from rural setup. Majority were male 60% and had a normal BMI (54%) which was followed by undernutrition (28%). Majority children in both age group 7-11year and 12-17 year, presented with moderate asthma (80%) and (62%) (according to GINA 2022) respectively followed by mild. The rural cohort post treatment showed significant improvement in individual (p<0.005) as well as in overall PAQLQ post treatment (p<0.002). Conclusion: The study has highlighted that good asthma control even after short duration of treatment helped in improvement quality of life of affected children. To maintain quality of life it is expected that the patient remains adhered to proper treatment.
Excessive Pharmaceutical Pricing and Repercussions on Paediatric Health Services
Authors: Vuletić Dominik 
Published: November 2024

Context: Paediatric pharmaceutics have a significant share in expensive drugs. Recent years have seen significant calls for intervention against high prices for pharmaceutical products. The prohibition of prices that are excessive as a form of abuse of dominance is considered as Competition law violation in the European Union Law and national legal orders of its Member States. Majority of the Organization for Economic Cooperation and Development (OECD) member countries have similar prohibitions in their respective Competition laws with important exemption of United States (US) Antirust Law, although there is some indication of change in US exactly in the area of pharmaceutical sector. Regulation of excessive prices also exists in Competition laws of all BRICS (Brazil, Russian Federation, India, China, and South Africa) countries. The problem of excessive prices in pharmaceutics is one of the emerging themes in Competition law literature and case law development. This is the area where intellectual property rights, usually patent protection, collide with competition rules. Costs of research and development for such pharmaceutics are often very high emphasizing the need for balance between colliding legitimate interests: access to health and research development. Aim: To present regulatory and case law development of application of excessive prices as form of abuse of dominance in pharmaceutical sector with emphasis on paediatric health services. Data source: OECD, PubMed, Google Scholar, Scopus. Conclusion: Balance between competition rules on excessive prices as form of abuse of dominance and intellectual property rights in the area of expensive paediatric pharmaceutics can be regarded as suboptimal. Thus, there is a need for further regulatory development and application of rules on excessive prices in that field.
Pompeova bolest – progresivna multiorganska bolest: dijagnostički i terapijski izazovi
Authors: Ramadža Danijela Petković 
Published: November 2024

Pompeova bolest je progresivna multiorganska bolest koja nastaje zbog nedostatka lizosomskog enzima kisele alfa-glukozidaze teposljedičnog nakupljanja glikogena i kaskade patoloških procesa. Klinički se očituje rasponom fenotipova, od fatalnog infantilnogdo blažih oblika bolesti. Infantilni oblik je obilježen progresivnom hipertrofi čnom kardiomiopatijom, propadanjem mišića i, ako sene liječi, neizbježnom smrću najčešće u prvoj godini života. Enzimskim nadomjesnim liječenjem postignuti su izvanredni rezultati:promijenjen je prirodni tijek bolesti i izbjegnuta rana smrt. Preživljenjem djece s infantilnim oblikom razotkrio se novi fenotip. Pacijenti razvijaju nove znakove bolesti i brojne poteškoće za koje tek treba pronaći novo terapijsko rješenje. Kasni oblik bolesti kliničkimože biti vrlo raznolik. Premda su slabost mišića koštanog sustava i onih dišnih vodeći simptomi, riječ je o multiorganskoj bolesti.Karakteristični klinički trijas (slabost pojasne, paravertebralne i dišne muskulature) razvija se u kasnijim fazama bolesti, dok su u ranim fazama često prisutni samo neki od navedenih ili drugi, netipični, simptomi i znakovi. Zbog toga se bolest kasno prepoznaje igubi se dragocjeno vrijeme za početak liječenja, koje je najučinkovitije ako se započne u početnim fazama bolesti. Jednostavan putdo dijagnoze je mjerenje aktivnosti enzima kisele alfa-glukozidaze iz suhe kapi krvi, što je uputno učiniti u svih osoba s pozitivnomobiteljskom anamnezom, nejasno povišenom kreatin kinazom i drugim znakovima Pompeove bolesti. Rezultati dugogodišnje primjene enzimske nadomjesne terapije u bolesnika s kasnim oblikom pokazali su da liječenje usporava bolest, stabilizira plućnufunkciju i pokretljivost te produljuje život bolesnika. S obzirom na ograničenja u učinkovitosti dostupne terapije i novootkrivena klinička obilježja, razvijaju se novi modaliteti liječenja.
Dijagnostički, klinički i terapijski izazovi u oboljelih od Duchenneove mišićne distrofi je - prikaz serije bolesnika
Authors: Šamija Radenka Kuzmanić , Plejić Marta 
Published: November 2024

Duchenneova mišićna distrofi ja najčešća je mišićna distrofi ja koja se javlja u djece.Cilj istraživanja: Procijeniti pravodobno prepoznavanje kliničke slike, provođenje multidisciplinskog pristupa prema najnovijimsmjernicama te analizirati klinički tijek u oboljelih na suvremenoj terapiji.Materijali i metode: Retrospektivnom analizom medicinske dokumentacije izdvojeni su bolesnici s distrofi nopatijama. Izdvojeni supodatci o kliničkom tijeku bolesti, kliničkoj slici u trenutku postavljanja dijagnoze, metodama njene potvrde, tipovima mutacija iterapiji koju primaju.Rezultati: U istraživanje je uključeno ukupno devet ispitanika, osam s dijagnozom Duchenneove i jedan s dijagnozom Beckerovemišićne distrofi je. Dob pri postavljanju dijagnoze Duchenneove mišićne distrofi je bila je u rasponu između dvije i šest i pol godina,dok je kod ispitanika s Beckerovom mišićnom distrofi jom postavljena u dobi od jedanaest godina. Od tipova mutacija četvorica ispitanika ima delecije, trojica duplikacije i dvojica točkaste mutacije. Samostalno pokretna su šestorica ispitanika, dok su trojicaovisna o uporabi kolica. Plućna funkcija uredna je kod sedmorice ispitanika, dok su dvojica razvila kroničnu plućnu insufi cijenciju ikod njih se primjenjuju metode neinvazivne ventilacije. Na glukokortikoidnoj terapiji ukupno je šestorica ispitanika i svi primjenjujudefl azacort.Zaključak: Pacijenti s Duchenneovom mišićnom distrofi jom uz osnovnu progresivnu slabost mišića, razvijaju i komplikacije drugihorganskih sustava, što zahtijeva multidisciplinsku skrb. Pojava genske terapije kao uzročne terapije Duchenneove mišićne distrofi jestavila je dodatni naglasak na što ranijem postavljanju dijagnoze. Time se postiže dodatno produljenje životnog vijeka te podizanjekakvoće života u bolesnika s Duchenneovom mišićnom distrofi jom.
Molekularna dijagnostika alergije na kravlje mlijeko
Authors: Džajić Anica , Topalušić Iva , Marković Asja Stipić 
Published: November 2024

Alergija na kravlje mlijeko najčešća je alergijska bolest u ranom djetinjstvu. Oko 80% proteina prisutno je u krutoj frakciji (kazeini,kazeinski kompleks), a oko 20% u tekućoj frakciji (sirutki) mlijeka. Sirutka sadrži α-laktalbumin (Bos d 4) i β-laktoglobulin (Bos d 5),albumin goveđeg seruma (Bos d 6), imunoglobuline (Bos d 7) i laktorferin. Ukupni kazein (Bos d 8) čine četiri različite frakcije:αS1-kazein (Bos d 9), αS2-kazein (Bos d 10), β-kazein (Bos d 11) i κ-kazein (Bos d 12). Za određivanje tih pojedinačnih alergenskih molekula primjenjuje se tzv. komponentna dijagnostika (engl. Component Resolved Diagnosis, CRD), koja je omogućila identifi kaciju glavnih (Bos d 4 i Bos d 5 i sve kazeinske molekule) i sporednih (Bos d 6, Bos d 7 i laktoferin), odnosno križno reaktivnih (Bos d 5 iBos d 6) alergenskih molekula. Buduća istraživanja omogućit će određivanje dijagnostičke značajnosti otkrivanja pojedinačnih alergenskih molekula. Veliki napredak očekuje se i u području molekularne biologije, genomike, proteomike i bioinformatike.
he objective of this study was to explore age and gender diff erences in depression among children and adolescents. We hypothesized that girls would be more depressed than boys would, and that depression would be more pronounced in older age groups. A tot
Authors: Jakupčević Katija Kalebić , Ercegovac Ina Reić 
Published: November 2024

Cilj ovog rada bio je istražiti dobne i spolne razlike u depresivnosti kod djece i adolescenata. U istraživanje se krenulo od pretpostavkeda će djevojke u odnosu na mladiće postizati više rezultate te da će rezultati depresivnosti biti viši u starijim dobnim skupinama. Uistraživanju je sudjelovalo 564-ero učenika (N=240) i učenica (N=324) škola na području grada Splita u dobi od 10 do 18 godina, aprimijenjena je ljestvica depresivnosti za djecu i adolescente. Pokazalo se da su najviši ukupni rezultati na ljestvici depresivnosti utvrđeni u osmom razredu, odnosno na početku srednje adolescencije, pri čemu su u sedmom i osmom razredu utvrđene i značajnespolne razlike u korist djevojaka. Analize spolnih razlika, provedene posebno za emocionalni i kognitivni aspekt depresivnosti, pokazale su da djevojke u odnosu na mladiće pokazuju veću emocionalnu depresivnost, dok u kognitivnoj komponenti nisu utvrđeneznačajne spolne razlike. Iznadprosječni ukupni rezultat depresivnosti transformiran na C ljestvicu postiže čak 20,43% sudionika, odčega klinički značajan rezultat njih 5,68%. Pritom su najugroženije djevojke u osmom razredu osnovne škole. Poželjne su preventivneaktivnosti usmjerene na osnaživanje adolescenata radi kontroliranja depresivnih simptoma. Budući da rezultati istraživanja pokazuju kako su djevojke na kraju osnovne škole u posebnom riziku za povišenu depresivnost, čini se važnim implementirati spolno -specifi čne preventivne aktivnosti kojima bi cilj bio jačanje njihova samopouzdanja i samopoštovanja te razvijanje socijalnih i emocionalnih vještina potrebnih za suočavanje s izazovima u adolescenciji i ostvarivanje njenih razvojnih zadataka.
Metrijske karakteristike Upitnika predškolske inkluzije
Authors: Mihić Sanja Skočić , Galešev Snježana Sekušak 
Published: November 2024

Istraživanja pokazuju da kakvoća inkluzije predškolske djece i njihova kompetentnost za rad u skupinama ovisi o pozitivnim stavovima odgajatelja prema uključenosti predškolske djece s teškoćama kao i njihovoj kompetentnosti za rad u inkluzivnim skupinama.U Republici Hrvatskoj nedostaju mjerni instrumenti koji bi ispitivali stavove odgajatelja prema predškolskoj inkluziji. Cilj istraživanjabio je konstruirati mjerni instrument koji ispituje stavove odgajatelja prema predškolskoj inkluziji te utvrditi njegove metrijske karakteristike. U istraživanju je sudjelovalo 476-ero odgajatelja zaposlenih u vrtićima Primorsko-goranske županije. Primijenjen je Upitnikstavova odgajatelja prema predškolskoj inkluziji, dvofaktorske strukture: (1) stav prema predškolskoj inkluziji i (2) samoprocijenjenakompetentnost za rad s djecom s teškoćama. Ovo je prvo takvo istraživanje u nas i pokazuje da odgajatelji imaju pozitivan stavprema predškolskoj inkluziji, a neodlučni su u procjeni osobne kompetentnosti za rad s djecom s teškoćama, što je u skladu s inozemnim istraživanjima. Pozi tivniji stav odgajatelja prema predškolskoj inkluziji povezan je s višom razinom samoprocijenjenihkompetencija za rad s djecom s teškoćama, a ukupni rezultat na upitniku je indeks proinkluzivosti odgajatelja. Na temelju rezultatadobivenih primjenom upit nika moguće je: (1) utvrđivanje proinkluzivnih stavova odgajatelja i vrtića, (2) educiranje i pripremanjedjelatnika vrtića čiji indika tori upućuju na nižu razinu proinkluzivnosti, (3) mjerenje i evaluiranje programa stručnih usavršavanjausmjerenih na jačanje kompetencija odgajatelja za rad s djecom s teškoćama u redovitim skupinama
Prevalencija i incidencija razvojnog poremećaja kuka kod donošene novorođenčadi u Općoj bolnici Gospić tijekom desetogodišnjeg razdoblja od 2004. do 2013. godine
Authors: Čubelić Sandra , Atalić Bruno 
Published: November 2024

S obzirom na to da je razvojni poremećaj kuka najčešća prirođena deformacija lokomotornog sustava, cilj rada je bio utvrditi incidenciju i prevalenciju različitih stupnjeva prirođenog iščašenja kukova prema Grafu u novorođenčadi rođene u rodilištu Odjela zaginekologiju i obstetriciju Opće bolnice Gospić tijekom desetogodišnjeg razdoblja od 2004. do 2013. godine. Svoj novorođenoj djecirođenoj u rodilištu Odjela za ginekologiju i obstetriciju Opće bolnice Gospić tijekom desetogodišnjeg razdoblja od 2004. do 2013.godine tijekom boravka u bolnici obavljen je neselektivni ultrazvučni neonatalni skrining razvojnog poremećaja kuka metodomprema Grafu, pri čemu su I.A i I.B stupnjevi smatrani zdravima, II.A+ stupanj graničnim nalazom, kod kojega je za četiri do šest tjedana obavljena kontrola ultrazvukom na Odjelu za pedijatriju, dok su uopćeni II.A i viši, III. i IV. stupanj smatrani patološkim nalazom,te su upućeni specijalistu ortopedije na daljnju obradu. Istraživanjem tijekom desetogodišnjeg razdoblja ukupno je obuhvaćeno3874 kukova u 1937-ero novorođenčadi čiji su modifi cirani stupnjevi zrelosti kukova prema Grafu bili: I.A kod 1265 kukova, I.B kod1532, II.A+ kod 828, uopćeni II.A- i viši kod 173, III. kod 66 te IV. kod 10 kukova. Istraživanje je potvrdilo opravdanost provođenja neselektivnog ultrazvučnog neonatalnog skrininga metodom prema Grafu radi utvrđivanja stupnjeva zrelosti kukova, jer je kod djeces prirođenim iščašenjima kukova uopćenog II.A i višeg, III. i IV. stupnja održanim nakon redovite kontrole provedena ortopedska korekcija, te je tako navrijeme spriječena njihova progresija
Trihotilomanija i komorbiditet u adolescenata: prikaz dvaju bolesnika
Authors: Klobučar Aleksandra , Jakušić Nenad , Tomac Aran , Šmalc Vera Folnegović 
Published: November 2024

Trihotilomanija je relativno rijedak poremećaj. U Dijagnostičkom i statističkom priručniku mentalnih poremećaja (DSM-V, 2013.)svrstan je u skupinu s opsesivno-kompulzivnim i njemu srodnim poremećajima. Trihilomanija ima i karakteristike poremećaja impulsa i navika. Prvi simptomi trihilomanije najčešće se pojavljuju u adolescenciji. Klinička slika u djece i adolescenata često jekomplicirana postojanjem komorbiditeta. Najčešće opisivani komorbiditet su anksioznost i depresija iz područja osjećaja iraspoloženja, a rjeđi su tikovi, hiperkinetski i opsesivno-kompulzivni poremećaj, različiti oblici regresivnog ponašanja i neki drugi.Prikazana su dva bolesnika kod kojih je prepoznavanje poremećaja bilo otežano time što djeca i adolescenti nerado priznaju trihilomaniju, a daljnje liječenje bilo je dijelom multidisciplinarno i u mnogo čemu je ovisilo o komorbiditetu. U prvom prikazu etiopatogeneza je najvećim dijelom emocionalna. U drugom prikazu prateći poremećaj je iz skupine neurorazvojnih poremećaja. Odabirpsihoterapijske tehnike i širi pristup liječenju u cijelosti su ovisili o komorbiditetu i zahtjevali su suradnju dječjeg psihijatra sastručnjacima iz drugih područja pedijatrijske medicine. Mislimo da istraživanja ovog poremećaja treba ustrajno i dalje usmjeravatiotkrivanju izravne i druge povezanosti trihilomanije i komorbiditeta, kako bi se omogućilo što primjerenije i učinkovitije prepoznavanje i liječenje ovog poremećaja.