bluuebunny/crossref_metadata_2025_split huggingface dataset:
Automatische Blutdruck- und Pulsmessung vs. manuelle Messung
Authors: Waibel Iris 
Published: May 2018

ZusammenfassungBei einer Dialysebehandlung wird mehrfach der Blutdruck kontrolliert, um mögliche Komplikationen zu minimieren. Da es viele automatische/oszillometrische
Messgeräte gibt, werden diese auch gerne verwendet. Es stellt sich die Frage, ob die Messergebnisse der automatischen Blutdruck- und Pulsmessung mit der
manuellen Messung generell gleichwertig sind und auch bei Patienten mit Vorhofflimmern nicht abweichen. Das Ziel dieser Untersuchung war es, während der Dialyse
den Blutdruck sowie den Puls nach beiden Messmethoden zu messen, um Unterschiede zu erkennen. Eine Patientengruppe litt neben der Niereninsuffizienz auch an
Vorhofflimmern. Eine Vergleichsgruppe ohne Vorhofflimmern wurde genau gleich gemessen und diente zur Kontrolle der Werte auf ihre Richtigkeit. Um Messfehler zu
reduzieren, wurde die passende Blutdruckmanschette verwendet. Die Messung wurde am Oberarm durchgeführt, ohne Bekleidung oder mit einer dünnen Bekleidung. Die
Messung erfolgte zu Beginn, während und am Ende der Dialyse. Es wurde automatisch und manuell gemessen. Der Puls wurde über 60 Sekunden durchgezählt. Die
RR-Messungen haben gezeigt, dass beide Messmethoden ähnliche Werte erbringen, sowohl bei Patienten mit Vorhofflimmern als auch bei der Kontrollgruppe. Die
Pulsmessungen sind jedoch stärker voneinander abgewichen: Der manuell gemessene Puls ist etwas höher als der oszillometrisch gemessene Wert. Für die Dialyse
sollte man individuell entscheiden, welche Messmethoden man verwenden möchte. Die gemessenen Werte sollten jedoch immer hinterfragt werden.
Substanzmissbrauch – Entwicklung des Vergiftungsgeschehens im Einzugsbereich des Giftnotrufes Erfurt 2002–2016
Authors: Gollmann Mandy , Frimlova Germaine , Just Simone , Liebetrau Gesine , Prasa Dagmar , Stürzebecher Anne , Deters Michael 
Published: May 2018

Zusammenfassung
Ziel der Studie Substanzmissbrauch war in den letzten Jahren starken Veränderungen unterworfen und ist eine große Herausforderung für die Klinische Toxikologie. Deswegen wurden Substanzmissbrauchsfälle der letzten 15 Jahre im Einzugsbereich des Giftnotrufs Erfurt analysiert und mit humanen Expositionsfällen anderer Ursache verglichen.
Methodik Retrospektive Analyse aller Humanexpositionsfälle (Expositionsfälle des Menschen gegenüber einer Substanz unter akzidentellen, missbräuchlichen oder unbekannten Umständen oder im Rahmen eines Suizidversuches) von Anfang 2002 bis Ende 2016 nach Substanzklassen, Symptomschwere, Altersgruppen und Geschlecht.
Ergebnisse Substanzmissbrauchsfälle (7237, 3,5% aller Expositionsfälle) stiegen kontinuierlich von 250 (Einzelsubstanzmissbrauch: 159; Mischkonsum: 91) in 2002 auf 830 in 2016 (Einzelsubstanzmissbrauch: 398; Mischkonsum: 432) an. Die Fallzahl von Methamphetaminmissbrauch stieg von 10 in 2003 auf 100 in 2012 und fiel auf 52 in 2016. Die Anzahl der Missbrauchsfälle mit Neuen Psychoaktiven Substanzen (NPS) erhöhte sich von 1 in 2008 auf 130 in 2015 und sank auf 90 in 2016. Substanzmissbrauchsfälle verursachten signifikant (p<0,001) häufiger mittelschwere (29,1%) und schwere Symptome (5,8%) als Expositionsfälle in suizidaler Absicht (11,6%; 4,9%). Missbrauchsfälle mit NPS und der Untergruppe synthetischer Cannabinoide zeigten signifikant (p<0,001 u. 0,025) öfter mittelschwere und schwere Symptome (46,9% u. 43,6%; 7.9% u. 6,0%) als Missbrauchsfälle mit Cannabis (19,7%; 2,1%).
Schlussfolgerung Die klinische Bedeutung des Substanzmissbrauchs wird daran erkennbar, dass er häufiger mittelschwere und schwere Symptome verursachte als Suizidversuche. Daten zu Substanzmissbrauch von Giftnotrufzentralen könnten offizielle Drogenberichte hinsichtlich klinisch-toxikologischer Aspekte ergänzen.
Welche Faktoren sind mit Verhaltensauffälligkeiten im Vorschulalter assoziiert? Eine Sekundärdatenanalyse der Schuleingangsuntersuchungen von 2010 bis 2014 in der Region Hannover
Authors: Bantel Susanne , Schlaud Martin , Walter Ulla , Dreier Maren 
Published: May 2018

Zusammenfassung
Hintergrund und Ziel Die psychische Gesundheit und die Prävalenz von psychischen Auffälligkeiten im Kindes- und Jugendalter haben in den letzten Jahren an Aufmerksamkeit gewonnen. Zur psychischen Gesundheit von Kindern und Jugendlichen in Deutschland gibt es mittlerweile Ergebnisse aus mehreren Studien. Mit der vorliegenden Studie soll untersucht werden, welche Faktoren mit Verhaltensauffälligkeiten im Vorschulalter assoziiert sind. Der Fokus liegt zudem auf der unversorgten Morbidität.
Methodik Die Daten der Schuleingangsuntersuchungen der Einschulungsjahrgänge 2010/11 bis 2014/15 (n=40 675) der Region Hannover wurden ausgewertet. Verhaltensauffälligkeiten und die sozial-emotionalen Kompetenz der Kinder wurde über den Elternfragebogen „Strengths and Difficulties Questionnaire“ (SDQ) und durch Beobachtung der Ärztin während der Untersuchung erfasst. Kinder, die sich zum Zeitpunkt der Schuleingangsuntersuchung wegen einer Verhaltensauffälligkeit bereits in Behandlung befanden, wurden aus der Analyse ausgeschlossen. Mittels einer multivariablen logistischen Regressionsanalyse wurde auf Zusammenhänge zwischen Verhaltensauffälligkeiten und soziodemografischen Faktoren, Dauer des Kindergartenbesuchs, Familienkonstellation und Gestationsalter untersucht.
Ergebnisse Ein geringer Bildungsgrad, errechnet aus dem höchst erreichten Schul- und Berufsabschluss beider Elternteile, ist am stärksten mit einer durch die Schuleingangsuntersuchung festgestellten Verhaltensauffälligkeit assoziiert (OR 2,5; 95%-KI 2,3–2,7). Weitere Faktoren sind männliches Geschlecht (OR 1,5; 95%-KI 1,4–1,6), kein Kindergartenbesuch (OR 1,3; 95%-KI 1,02–1,6) oder der Besuch von nur einem Kindergartenjahr (OR 1,4; 95%-KI 1,2–1,6), familiäre Konstellation ohne leibliche Eltern (OR 1,7; 95%-KI 1,2–2,4), Frühgeburtlichkeit (OR 1,5; 95%-KI 1,2–1,8) und ein Alter von 5 ½ Jahre und jünger (OR 1,4; 95%-KI 1,3–1,6) zum Untersuchungszeitpunkt.
Schlussfolgerung Die Ergebnisse verweisen auf die Wichtigkeit der frühkindlichen Förderung und Unterstützung sozial benachteiligter Familien und deren Kinder. Sie liefern public-health-relevante Ansatzpunkte und ermöglichen der Region Hannover, zukünftige Präventionsmaßnahmen im Vorschulalter zielgruppenspezifischer zu verbessern.
Low-Dose and Standard Overnight and Low Dose-Two Day Dexamethasone Suppression Tests in Patients with Mild and/or Episodic Hypercortisolism
Authors: Mojtahedzadeh Mona , Shaesteh Nesyah , Haykani Mastaneh , Tran Jennifer , Mangubat Michael , Shahinian Hraya , Nachnani Rahul , Zopey Mohan , Saidian Jason , Thomas Antolice , Lee Martin , McCutcheon Ian , Friedman Theodore 
Published: May 2018

AbstractWe previously reported on the lack of utility of the 1 mg overnight dexamethasone (DEX) test in mild and/or periodic Cushing’s syndrome, as most patients with the condition suppressed to 1 mg DEX. It is possible that a lower dose of DEX as part of an overnight DEX test might be able to distinguish between mild and/or periodic Cushing’s syndrome and those without the condition. The objective of the current study is to determine the sensitivity and specificity of a 0.25 mg overnight DEX suppression test, the standard 1 mg overnight DEX suppression test, and the two-day low-dose (Liddle test) DEX suppression test with and without correction for DEX levels in patients evaluated for mild and/or periodic Cushing’s syndrome. Thirty patients determined to have Cushing’s syndrome by biochemical testing and 14 patients determined not to have the condition had the 0.25 mg and standard 1 mg overnight DEX suppression test and the two-day low-dose DEX suppression tests. Our results show that morning serum cortisol and cortisol/DEX ratios following an overnight dexamethasone suppression test were similar in patients with Cushing’s syndrome and those not having Cushing’s syndrome. However, a morning cortisol value above 7.6 μg/dl following a dose of DEX of 0.25 mg was found in 12 patients with Cushing’s syndrome and none in those not having Cushing’s syndrome, suggesting that a high cortisol value after this low dose of dexamethasone can indicate that further testing for Cushing’s syndrome is warranted. Our data suggest that the traditional 1 mg overnight or the 2 mg/2 day DEX suppression testing should no longer be used as a screening test in patients who could have mild and/or periodic Cushing’s syndrome, while the 0.25 mg dose of DEX may pick up some patients with mild Cushing’s syndrome.
Der Lift-off-Test
Authors: Petermann Jenny 
Published: May 2018

ZusammenfassungDas Schultergelenk ist ein muskelgeführtes Gelenk und besitzt kaum knöcherne Führung. Umso wichtiger ist, dass die Arbeit aller umgebenden Muskeln aufeinander
abgestimmt ist und keine Disharmonie entsteht. Die Rotatorenmanschette ist an der Sicherung des Schultergelenks beteiligt. Der Lift-off-Test ist ein Assessment
zur Beurteilung der schultergelenkumgebenden Muskulatur.
Physiotherapie bei SAPS
Authors: Ophey Martin 
Published: May 2018

Zusammenfassung
Subakromiales Schmerzsyndrom ist die meist gestellte medizinische Diagnose bei Schulterbeschwerden (subacromial pain syndrome, kurz SAPS). Eine neue
Studie legt nahe, dass Physiotherapie dabei das erste Mittel der Wahl ist. Erst wenn Therapieerfolge ausbleiben, sollte man eine Operation in Betracht
ziehen.
Bedeutung von Ausdauersport für die Verbesserung von Kognition und Remission bei post-akuter Schizophrenie
Authors: Malchow B. , Lembeck M. , Maurus I. , Roeh A. , Papiol S. , Hasan A. , Falkai P. , Schmitt A. 
Published: May 2018

ZusammenfassungDie Schizophrenie geht häufig mit einer verminderten sozialen Funktion aufgrund kognitiver Defizite einher, die mit gehirnstrukturellen Veränderungen wie einer Verminderung des Hippocampusvolumens assoziiert sind. In einer ersten Studie haben wir eine Verbesserung des episodischen Gedächtnisses und eine Volumenvergrößerung des Hippocampus nach aerobem Sporttraining bei Menschen mit einer Mehrfacherkrankung einer Schizophrenie gefunden. In einer Folgestudie unter Kombination mit kognitivem Training konnten wir eine Vergrößerung des temporalen Kortex zeigen, allerdings fanden wir für die Gesamtgruppe keine signifikante Zunahme des Hippocampusvolumens. Bei diesen Patienten war jedoch ein erhöhter polygenetischer Risikofaktor (Polygenetic Risk Score, PRS) mit einer verminderten Volumenzunahme des Hippocampus assoziiert sowie verbesserter körperlicher Fitness und psychosozialen Funktionsniveau. In der Sportstudie (Clinical-Trials.gov ID: NCT03466112) des „Enhancing Schizophrenia Prevention and Recovery through Innovative Treatments” (ESPRIT) Forschungsnetzwerkes zu psychischen Erkrankungen erweitern wir die Dauer des Trainings nach den Richtlinien des American College of Sports Medicine. Langzeiteffekte des Ausdauertrainings auf Kognition, Symptome und funktionelle Genesung werden verglichen mit einer Kontrollgruppe, die Gleichgewichtsübungen und Muskeltonustraining durchführt.
Verbesserung der sozialen Funktionsfähigkeit schizophren Kranker
Authors: Eißler L. , Wölwer W. ,   für die ISST-Studiengruppe
Published: May 2018

ZusammenfassungBeeinträchtigungen in der sozialen Funktionsfähigkeit sind schwerwiegende, subjektiv sehr belastende Merkmale schizophrener Erkrankungen. Sie führen zu einer reduzierten Lebensqualität und stehen einer umfassenden „Recovery” entgegen. Medikamentöse und psychosoziale Therapiemaßnahmen haben diesbezüglich nur unzureichende Effekte, ebenso wie spezifische Behandlungsansätze, die isoliert auf basale Kognitionen, soziale Kognitionen und soziale Verhaltenskompetenzen als wesentliche Determinanten der Funktionsfähigkeit abzielen. Daher wird in einer laufenden multizentrischen randomisierten kontrollierten klinischen Studie des Forschungsverbunds ESPRIT versucht, die Funktionsfähigkeit durch die Integration von sozial kognitiven und sozialen verhaltensbezogenen Behandlungsstrategien wirksamer als bisher möglich zu verbessern. Neben der Haltequote in der Therapie als gemeinsamer Endpunkt aller klinischen Studien des ESPRIT-Verbunds werden insbesondere die soziale Funktionsfähigkeit und subjektive Lebensqualität als Wirksamkeitsindikatoren vor (V1) und nach Abschluss der jeweils sechsmonatigen Behandlung (V6) sowie nach sechs Monaten Nachbeobachtung (V12) erfasst.
Totale Laryngektomie: Wundinfektionen sind bei Diabetespatienten häufiger
Authors: Dyckhoff Gerhard 
Published: May 2018

Filimonov A et al. Postoperative Complications of Total Laryngectomy in Diabetic Patients. Laryngoscope 2017; 127: 2247–2251
Diabetes Mellitus gilt als Risikofaktor vieler Komorbiditäten und Komplikationen. Ob sich die Stoffwechselerkrankung ebenso negativ auf das Ergebnis einer
totalen Laryngektomie auswirken kann, haben Filimonov und Kolleginnen/Kollegen jetzt anhand einer retrospektiven Datenanalyse genauer betrachtet.
EGFR im Speichel: neuer Tumormarker für Plattenepithelkarzinom im Mund?
Authors: Albers Andreas E. , Kaufmann Andreas M. 
Published: May 2018

Zanotti L et al. Epidermal growth factor receptor detection in serum and saliva as a diagnostic and prognostic tool in oral cancer. Laryngoscope 2017; 127:
E408–E414
Der EGF-Rezeptor (EGFR) ist ein Transmembranrezeptor mit intrinsischer Tyrosinkinase-Aktivität, der in allen Zellarten vorkommt. Die Überexpression des EGFR
ist bei verschiedenen Tumorarten nachweisbar, so auch beim Plattenepithelkarzinom im Mundraum (OSCC). Den diagnostischen und prognostischen Wert des EGFR
beim OSCC aus Serum und Speichel bestimmten italienische Ärzte der Universität von Brescia.
Die neue Leitlinie Rhinosinusitis – eine Miniaturversion
Authors: Stuck Boris A. , Beule Achim , Jobst Detmar , Klimek Ludger , Laudien Martin , Lell Michael , Vogl Thomas , Popert Uwe 
Published: May 2018

ZusammenfassungZu Beginn dieses Jahres wurde die neue Leitlinie „Rhinosinusitis“ als gemeinsame Leitlinie der Deutschen Gesellschaft für Hals-Nasen-Ohren-Heilkunde, Kopf- und
Hals-Chirurgie e. V. (DGHNOKHC) und der Deutschen Gesellschaft für Allgemeinmedizin und Familienmedizin (DEGAM) veröffentlicht. Die Zielgruppe der neuen
Leitlinie sind erwachsene Patienten mit einer entzündlichen Erkrankung der Nasennebenhöhlen und sie richtet sich an alle ärztlichen Berufsgruppen, die mit der
Diagnostik und Therapie dieser Patienten befasst sind. Die aktuelle Herausforderung besteht darin, die Inhalte der Leitlinie in die klinische Praxis zu
implementieren. Hierzu wurde eine Miniaturversion für den Klinik- und Praxisalltag entwickelt, die eine schnelle Hilfe bei klinischen Fragestellungen bieten
soll.
The “Democratic Counterrevolution” of 1918 in Siberia
Authors: Pereira Norman G. O. 
Published: May 2018

The conventional distinction between Soviet and Western uses of the term democracy juxtaposes socioeconomic against political considerations— that is, for the former the stress is upon social equality and economic security, whereas for the latter it is upon civil liberty and political freedom. The tone and character of the Bolshevik approach to institutions which in the West are associated with liberal, parliamentary democracy can best be captured in the words of Lenin himself:[T]he democratic republic, the Constituent Assembly, general elections, etc., are, in practice, the dictatorship of the bourgeoisie, and for the emancipation of labour from the yoke of capital there is no otherwaybut to replace this dictatorship with the dictatorship of the proletariat… This means replacing democracy for the rich by democracy for the poor.
Canonical methods in classical and quantum gravity: An invitation to canonical LQG
Authors: Reyes Juan D 
Published: May 2018

Abstract
Loop Quantum Gravity (LQG) is a candidate quantum theory of gravity still under construction. LQG was originally conceived as a background independent canonical quantization of Einstein’s general relativity theory. This contribution provides some physical motivations and an overview of some mathematical tools employed in canonical Loop Quantum Gravity. First, Hamiltonian classical methods are reviewed from a geometric perspective. Canonical Dirac quantization of general gauge systems is sketched next. The Hamiltonian formultation of gravity in geometric ADM and connection-triad variables is then presented to finally lay down the canonical loop quantization program. The presentation is geared toward advanced undergradute or graduate students in physics and/or non-specialists curious about LQG.
Toward more accurate prediction of caspase cleavage sites: a comprehensive review of current methods, tools and features
Authors: Bao Yu , Marini Simone , Tamura Takeyuki , Kamada Mayumi , Maegawa Shingo , Hosokawa Hiroshi , Song Jiangning , Akutsu Tatsuya 
Published: May 2018

AbstractAs one of the few irreversible protein posttranslational modifications, proteolytic cleavage is involved in nearly all aspects of cellular activities, ranging from gene regulation to cell life-cycle regulation. Among the various protease-specific types of proteolytic cleavage, cleavages by casapses/granzyme B are considered as essential in the initiation and execution of programmed cell death and inflammation processes. Although a number of substrates for both types of proteolytic cleavage have been experimentally identified, the complete repertoire of caspases and granzyme B substrates remains to be fully characterized.To tackle this issue and complement experimental efforts for substrate identification, systematic bioinformatics studies of known cleavage sites provide important insights into caspase/granzyme B substrate specificity, and facilitate the discovery of novel substrates. In this article, we review and benchmark 12 state-of-the-art sequence-based bioinformatics approaches and tools for caspases/granzyme B cleavage prediction. We evaluate and compare these methods in terms of their input/output, algorithms used, prediction performance, validation methods and software availability and utility. In addition, we construct independent data sets consisting of caspases/granzyme B substrates from different species and accordingly assess the predictive power of these different predictors for the identification of cleavage sites. We find that the prediction results are highly variable among different predictors. Furthermore, we experimentally validate the predictions of a case study by performing caspase cleavage assay. We anticipate that this comprehensive review and survey analysis will provide an insightful resource for biologists and bioinformaticians who are interested in using and/or developing tools for caspase/granzyme B cleavage prediction.
canvasDesigner: a versatile interactive high-resolution scientific multi-panel visualization toolkit
Authors: Zhang Baohong , Zhao Shanrong , Neuhaus Isaac 
Published: May 2018

Abstract

Summary
We present a bioinformatics and systems biology visualization toolkit harmonizing real time interactive exploring and analyzing of big data, full-fledged customizing of look-n-feel and producing multi-panel publication-ready figures in PDF format simultaneously.

Availability and implementation
Source code and detailed user guides are available at http://canvasxpress.org, https://baohongz.github.io/canvasDesigner and https://baohongz.github.io/canvasDesigner/demo_video.html.

Supplementary information
Supplementary data are available at Bioinformatics online.
Generic accelerated sequence alignment in SeqAn using vectorization and multi-threading
Authors: Rahn René , Budach Stefan , Costanza Pascal , Ehrhardt Marcel , Hancox Jonny , Reinert Knut 
Published: May 2018

Abstract

Motivation
Pairwise sequence alignment is undoubtedly a central tool in many bioinformatics analyses. In this paper, we present a generically accelerated module for pairwise sequence alignments applicable for a broad range of applications. In our module, we unified the standard dynamic programming kernel used for pairwise sequence alignments and extended it with a generalized inter-sequence vectorization layout, such that many alignments can be computed simultaneously by exploiting SIMD (single instruction multiple data) instructions of modern processors. We then extended the module by adding two layers of thread-level parallelization, where we (a) distribute many independent alignments on multiple threads and (b) inherently parallelize a single alignment computation using a work stealing approach producing a dynamic wavefront progressing along the minor diagonal.

Results
We evaluated our alignment vectorization and parallelization on different processors, including the newest Intel® Xeon® (Skylake) and Intel® Xeon PhiTM (KNL) processors, and use cases. The instruction set AVX512-BW (Byte and Word), available on Skylake processors, can genuinely improve the performance of vectorized alignments. We could run single alignments 1600 times faster on the Xeon PhiTM and 1400 times faster on the Xeon® than executing them with our previous sequential alignment module.

Availability and implementation
The module is programmed in C++ using the SeqAn (Reinert et al., 2017) library and distributed with version 2.4 under the BSD license. We support SSE4, AVX2, AVX512 instructions and included UME: SIMD, a SIMD-instruction wrapper library, to extend our module for further instruction sets. We thoroughly test all alignment components with all major C++ compilers on various platforms.

Supplementary information
Supplementary data are available at Bioinformatics online.
MACARON: a python framework to identify and re-annotate multi-base affected codons in whole genome/exome sequence data
Authors: Khan Waqasuddin , Varma Saripella Ganapathi , Ludwig Thomas , Cuppens Tania , Thibord Florian , Génin Emmanuelle , Deleuze Jean-Francois , Trégouët David-Alexandre 
Published: May 2018

Abstract

Summary
Predicted deleteriousness of coding variants is a frequently used criterion to filter out variants detected in next-generation sequencing projects and to select candidates impacting on the risk of human diseases. Most available dedicated tools implement a base-to-base annotation approach that could be biased in presence of several variants in the same genetic codon. We here proposed the MACARON program that, from a standard VCF file, identifies, re-annotates and predicts the amino acid change resulting from multiple single nucleotide variants (SNVs) within the same genetic codon. Applied to the whole exome dataset of 573 individuals, MACARON identifies 114 situations where multiple SNVs within a genetic codon induce an amino acid change that is different from those predicted by standard single SNV annotation tool. Such events are not uncommon and deserve to be studied in sequencing projects with inconclusive findings.

Availability and implementation
MACARON is written in python with codes available on the GENMED website (www.genmed.fr).

Supplementary information
Supplementary data are available at Bioinformatics online.
Learning through participation: towards defining adult learning in an African rural village context
Authors: Hlela Zamokwakho 
Published: May 2018

AbstractThis article analyses the studies of adult learning in Africa, where they exist, often draw uncritically on Western theoretical and methodological frameworks such as andragogy, experiential learning, and transformative learning. These frameworks are informed by individualistic conceptions of learners and learning, shaped by industrial and postindustrial political economy, liberal democratic politics and consumerist culture. Such structures are then imposed on African ‘territories’ of learning, much like a colonial template for carving up the continent, for and under Western eyes. This article, based on a study conducted in a rural village in South Africa, challenges the appropriateness of these frameworks. It adopts an Afrocentric research paradigm which understands research as a collective and collaborative humanizing project which is contextually sensitive and culturally informed. The article presents four community learning places, defines the nature of learning in each place, and concludes that learning in the village is still informed by values of interdependence, interconnectedness, and spiritual values.