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Ophiolites des nappes de Semail (Oman) : nouvelles données de terrain sur les parties plutoniques supérieures des massifs de Rustaq et de Nakhl
Authors: Dahl Richard , Juteau Thierry , Boudier Françoise , Nicolas Adolphe , Bouchez Jean-Luc , Crambert Sylvie 
Published: June 2018

Cet article présente les données de terrain concernant les unités plutoniques supérieures de la nappe ophiolitique de Semail dans les massifs de Rustaq et de Nakhl. Six coupes de référence sont décrites en détail, partant de la zone de transition entre tectonites et cumulats et allant jusqu'au complexe filonien ou aux laves en coussin.
Une attention particulière a été accordée aux variations longitudinales des unités lithologiques : dans la partie nord-ouest du massif de Rustaq, les coupes sériées effectuées sur un segment de 10 km de long montrent une diminution considérable de l'épaisseur des cumulats magmatiques, qui passent de plus de 3 000 m à environ 400 m d'Est en Ouest, les gabbros isotropes montrant en revanche un épaississement notable. Cette remarquable évolution correspond selon nous à la terminaison longitudinale de la chambre magmatique, qui viendrait se bloquer vers le N W contre une zone de fractures transverse fossile (zone du Wadi Hawasinah). Par ailleurs, la plupart des séries à cumulats étudiées commencent directement par des gabbros lités au niveau du «Moho » pétrologique, et non par des cumulats ultrarnafiques de transition comme cela a été décrit dans d'autres parties de la nappe de Semail. Ces cumulats montrent une stratification généralement lenticulaire à toutes échelles, ce qui rend impossible les corrélations à distance d'une coupe à l'autre.
Des intrusions de wehrlites ou dunites à plagioclases à différents niveaux de la séquence cumulative indiquent clairement que des liquides primaires de composition picritique s'élaborent par fusion partielle dans les péridotites du manteau supérieur sous-jacent et montent à travers la pile de cumulats déjà formés au plancher de la chambre. En outre, de nombreux filons et filonnets de gabbros leucocrates recoupent l'ensemble de la séquence cumulative litée, formant par endroits un véritable réseau anastomosé dans les couches les plus ultrarnafiques (wehrlites, dunites) : nous les interprétons comme des liquides résiduels issus des couches gabbroïques en cours de consolidation, injectés par «filtre-presse » et fracturation hydraulique dans les couches voisines, en particulier dans les couches ultrarnafiques précocement consolidées et donc compétentes au moment de la fracturation. D'autres types de brèches magmatiques ont été observés plus haut dans la série, au niveau de la zone de transition entre cumulats lités et gabbros isotropes : ces brèches extrêmement hétérogènes, à grain fin à pegmatitique, comportent une matrice gabbroïque à dioritique cimentant des éléments de composition variée (cumulats gabbroïques à ultrarnafiques, gabbros isotropes et même diabases ...) ; elles correspondent vraisemblablement à la zone de rencontre des deux fronts de cristallisation (au plancher et au toit de la chambre), dans les parties distales de celle-ci.
Effets de la maghémitisation des titanomagnétites sur les propriétés magnétiques des basaltes sous-marins : synthèse et résultats relatifs aux basaltes du Leg 51
Authors: Smith Brigitte 
Published: June 2018

Les propriétés magnétiques des roches résultent essentiellement des effets combinés de la concentration, du chimisme et des dimensions de leurs minéraux magnétiques ; or ces effets s'interpénétrent dans le cas de la maghémitisation, car celle-ci entraîne systématiquement une diminution de la taille et éventuellement de la concentration des titanomagnétites. Les contradictions souvent observées dans les résultats antérieurs proviennent en partie de ce que les effets observés représentent en réalité la résultante des variations de ces trois paramètres.
La présente étude tente de mettre en évidence les effets de la maghémitisation sur les propriétés magnétiques de basaltes d'âge Crétacé, indépendamment de la concentration et de la taille de leurs minéraux magnétiques. Les échantillons sont classés en deux groupes, selon la microstructure des minéraux magnétiques : les échantillons de «pillow » à grains essentiellement monodomaines (SD) et les échantillons d'«unité massive » à grains pseudomonodomaines (PSD) et polydomaines (MD). Les analyses thermomagnétiques et chimiques à la microsonde électronique montrent qu'indépendamment du type de roche, la composition chimique des titanomagnétites varie faiblement de 0,55 < x' < 0,65 et la teneur en éléments mineurs, Al et Mg, reste sensiblement constante. La plage des degrés d'oxydation est plus étendue et la maghémitisation généralement plus faible dans les échantillons d'unité massive (0,3 < z' < 0,9) que dans les pillows (0,7 < z' <1).
Une fois mises en évidence, dans chacun des types de roche, les variations d'un échantillon à l'autre de la concentration et de la taille moyenne des titanomagnétites, les effets magnétiques de la maghémitisation peuvent se résumer comme suit.
La maghémitisation entraîne une diminution régulière de l'aimantation spontanée, js, de la titanomagnétite et donc une décroissance de l'intensité de l'aimantation rémanente, Jr, de la roche. Bien qu'aucune variation claire de la susceptibilité ferrimagnétique, K, en fonction du degré d'oxydation ne ressorte des présents résultats, il semble que celle-ci augmente si les titanomagnétites ont des microstructures SD et diminue faiblement pour des grains MD. Inversement, la coercivité des grains SD diminue et celle des grains MD augmente avec la maghémitisation. Contrairement à toute attente, la viscosité magnétique des grains SD des pillows de cette étude reste négligeable, même lorsque l'oxydation est totale. La viscosité est toujours grande dans les unités massives mais aucune tendance n'apparaît. Il semble que la viscosité magnétique soit davantage contrôlée par la microstructure des minéraux magnétiques que par leur degré de maghémitisation.
Fractionnement des argiles par ultracentrifugation en continu : évolution des illites en milieu podzollque / Clay fractionation by continuous flow uitracentrifugation : evolution of illites in a podzolic soil
Authors: Rouiller James , Brethes Alain , Burtin Gérard , Guillet Bernard 
Published: June 2018

A fractionation method of soil clays is described. The separation of the clay fraction into size classes (< 0. 1/µm ; 0. 1 -0.5 /µm ; 0.5 -2 µm) is made by repeated dispersion and ultracentrifugation with a Sharpies centrifuge. The fractionation quality depends on the dispersion quality of the clay suspension. The use of cation exchange resins (Na+ form) improves the dispersion.
The method applied to a podzol developed on triassic sandstone gives evidence of accumulation of small clays (< 0. 1 µm) in the spodic horizons. This accumulation is certainly old and would result in clay illuviation that happened during the deposit of the colluvium along the slopes. During the podzolization phase, mixed-layer clay minerals (I — Sm) and smectites were formed from weathered and fragmented illites. The smectites tend to disapear from the eluvial A2 horizon : a part was translocated toward the Bh horizon, the greatest part of them being melted. The released aluminum was distributed in the spodic Bs horizon, where its hydroxi-polymerization occured. This provokes the formation of amorphous alumina, mixed silica-aluminous gels like allophane and hydroxi-interlayered smectite and vermiculite.
Caractérisation des mécanismes du gonflement intracristallin d'une montmorillonite homoionique sodique. / Characterization of the innercrystalline swelling process of a homoionic sodium montmorillonite
Authors: Cases Jean-Maurice , Bérend Isabelle , Besson Gérard , François Michel , Uriot Jean-Pierre , Thomas Fabien 
Published: June 2018

Les changements texturaux et structuraux qui se manifestent au cours du gonflement intracristallin d'une montmorillonite du Wyoming rendue sodique par échange ionique ont été étudiés par utilisation de l'analyse thermique à vitesse de décomposition contrôlée (ATVDC), la volumétrie d'adsorption d'azote, la gravimétrie d'ad-sorption d'eau, la microcalorimétrie d'immersion dans l'eau et la diffraction des rayons X sous atmosphère contrôlée de vapeur d'eau.
L'analyse de la forme de la raie dOOl des spectres expérimentaux de diffraction des rayons X et la comparaison avec celle des spectres calculés a permis de suivre l'évolution de la structure au cours de l'adsorption et de la désorption de la vapeur d'eau. Aux valeurs de pression relative de vapeur d'eau inférieures à 0,16 les molécules d'eau s'adsorbent uniquement sur les faces externes des tactoïdes. Dans ce domaine la surface spécifique croît de 43 à 105 m2. g-1 et la taille des tactoïdes diminue pour atteindre celle observée après immersion dans l'eau, soit 6 feuillets en moyenne par tactoïde. Pour les valeurs de pression relative comprises entre 0,16 et 0,50 et après que la monocouche a été atteinte sur les faces externes, l'eau pénètre dans l'espace interlamellaire pour former un hydrate à une couche sur environ 40 % de la surface interne. Pour les valeurs de pression relative comprises entre 0,5 et 0,93, un état hydrate à deux couches et à trois couches est tout d'abord observé après que la capacité correspondante à la bicouche a été atteinte sur les faces externes des tactoïdes. Pour P/Po = 0,90, 73 % des feuillets sont recouverts par une bicouche d'eau dont l'organisation correspond au modèle proposé par BEN BraHIM (1985). La surface spécifique interne est alors voisine de 710 m2. g-1.
Lors de la désorption, jusqu'à une pression relative de vapeur d'eau égale à 0,72, les molécules d'eau des faces externes des tactoïdes et celles contenues dans la mésoporosité d'empilement des particules sont désorbées en priorité. Entre 0,5 et 0,25 de valeur de pression relative, environ 70% de l'espace interlamellaire est dans un état hydrate à une couche. L'état sec interlamellaire initial est atteint pour une valeur de P/Po = 0,05.
Contrairement aux résultats obtenus, par exemple avec la beidellite, on n'observe jamais d'état homogène. De plus, l'espace interlamellaire n'est jamais complètement rempli. Il a été possible de distinguer la phase d'hydratation des cations qui correspond à la formation d'îlots d'eau condensée de la phase de remplissage du reste de l'espace interlamellaire. Enfin, la phase de formation du gel à la suite du gonflement d'origine osmotique correspond à une réaction isoenthalpique.
Palynologie du Permien et du Trias dans le centre de la Péninsule Ibérique / Permian and Triassic Palynology in the Middle part of the Iberian Peninsula
Authors: Sopeña Alfonso , Doubinger Jeanne , Ramos Amparo , Pérez-Arlucéa Marta 
Published: June 2018

Palynological data from the carbonatic and siliciclastic sediments in the Central System and western Iberian Ranges has allowed us to make some age-dating for most of the sediments unconformably overlying the lower Paleozoic metamorphic basement.
Twelve palynological assemblages have been identified. They range in age from early Permian (Autunian) to late Triassic (Carnian). Early Permian consists mainly of grey-black sediments filling small isolated half graben basins. Saxonian fades unconformably overly Autunian or early Paleozoic rocks. Paleontological data for Saxonian facies point to a middle to late Permian age. The overlying lower Buntsandstein is also late Permian (Thuringian) in age in some areas in south-western Iberian Range. The overlying Triassic rocks (upper Buntsandstein, Muschelkalk and Keuper) contain several palynological assemblages : Anisian, Anisian-Ladinian, Ladinian s.l., late Ladinian and Kamian. Some ages have been also compared with ammonoids and conodonts dating in the same areas.
Origines du carbone inorganique dissous dans les eaux de la Garonne. Variations saisonnières et interannuelles. / Sources of dissolved inorganic carbon in the Garonne river water. Seasonal and inter annual variations
Authors: Amiotte Suchet Philippe , Probst J.L. 
Published: June 2018

Sources of dissolved inorganic carbon in the Garonne river water. Seasonal and interannual variations
The dissolved inorganic carbon transported by rivers as bicarbonate ions mainly originates from two sources : i) the dissolution of carbonate minerals which outcrops in the substratum of the drainage basin, and ii) the dissolved CO₂ in the soil leaching water which participates as H₂CO₃ to the weathering of most of the minerals. In order to distinguish these two sources in the bicarbonate flux transported by the Garonne river, we have applied a model of decomposition of dissolved major elements (MEGA model) to the monthly fluxes of elements transported in solution by the Garonne river from 1971 to 1991.
The mean annual flux of soil C02 consumed by rock weathering amount to 411 10³ moles/km².yr. which corresponds to two times the annual average flux estimated for the whole continental area. The soil C02 contribution to the total bicarbonate flux varies from 47% in winter to 57% in summer. These variations are related to the contribution of two different hydro-logical reservoirs which supply the Garonne discharge : i) the non-saturated zone and the karst zone during period of high water level (winter), and ii) deeper groundwater during period of low water level (summer).
The modelling results show that rock weathering in the Garonne basin is disturbed by the spreading of nitrogen fertilizers of which nitrification releases protons in soil solutions, leading to an average increase of 16% in the dissolution of carbonate minerals.
A global model of the biosphere : validation and applications to present and post climatic conditions. / Un modèle global de la biosphère : validation et applications aux conditions climatiques passées et présentes
Authors: François Louis , Gérard Jean-Claude , Nemry Bernard , Warnant Pierre , Delire Christine , Munhoven Guy 
Published: June 2018

A new model of the continental biosphere is presented. The descriptions of the C₃ and C₄ photosynthetic pathways are mechanistic. The model calculates the net primary productivity (NPP) of land vegetation on a 1°x1° longitude-latitude grid. The soil heterotrophic respiration (SHR) is estimated on the same continental grid by using a parameterization based on published soil CO₂ flux data. The NPP and SHR fields are combined to derive monthly maps of the net ecosystem productivity (NEP). These NEP maps are used as boundary conditions in an atmospheric transport model to calculate the seasonal changes of the atmospheric CO₂ concentration. A validation of the biospheric model is then performed by comparing the model atmospheric seasonal signal with detrended measurements from CO₂ monitoring stations. This global model is also coupled to a bioclimatic scheme to describe the state of the continental biosphere at the last glacial maximum under reduced atmospheric CO₂ levels and colder climatic conditions.
The model does not include a nitrogen cycle. However, the role of nitrogen is central to understand the CO₃ fertilization effect. A more complete model including the carbon-nitrogen interactions is thus built and applied to the temperate deciduous forest biome. This latter model is calibrated with in situ measurements and used to analyse the response of typical temperate forests to a doubling of the atmospheric CO₂ concentration.
“Critter of the Week”: Wikipedia as a Museum Outreach Tool
Authors: Dickison Mike 
Published: June 2018

Many museums spend time and money fruitlessly competing with Wikipedia, creating online information resources and image galleries that will be mostly ignored, as Wikipedia is usually the highest ranked search result for any query. Wikimedia Commons can host searchable, downloadable images and Wikipedia can be easily edited by volunteers and specialists; both cost nothing to use and have a global audience. Yet most museums have no Wikipedia strategy, and often their institutional copyright policies – needlessly, for most natural history collections – prevent them from engaging and openly sharing collection information. I’ll illustrate this with the case study of the Critter of the Week project, a collaboration between Radio NZ and the Department of Conservation that relies on the open image libraries of Auckland Museum and Landcare Research.
There are simple institutional policies and procedures any museum can take that will support the work of the 70,000 volunteer Wikipedia editors. An institution can also directly host edit-a-thons and Wikipedia events, organise backstage tours for local Wikipedians, and host a Wikipedian in Residence. Subject specialists in a museum can even edit and update Wikipedia themselves, reaching a larger audience than almost any other science communication medium. In some ways, this is the opposite of how GLAM (Galleries, Libraries, Archives and Museums) institutions are used to working: collaborating with non-experts, releasing imperfect and unfinished content, abandoning branding opportunities, and no longer being the single voice of authority. But if we’re serious about being relevant to our public, we need to meet them where they are – which is on Wikipedia.
Life threatening pericardial and neurologic presentations in systemic lupus erythematosus
Authors: Hou Linle , Lee Seung Eun , DeMichele Francis , Osorio Benedict , Nagella Naresh 
Published: June 2018

Background: Posterior reversible encephalopathy syndrome (PRES) is characterized by altered mental status, visual perception abnormalities and seizures. Systemic lupus erythematosus (SLE) is a rare etiology of PRES and affects less than 1% of SLE patients. We present a unique case of a new-onset SLE patient presenting with borderline cardiac tamponade requiring emergent pericardiocentesis and hospital course complicated by intractable seizures found to have PRES on imaging.Case presentation: A 21-year-old female underwent outpatient evaluation for new-onset SLE presenting to the emergency room with dyspnea. She was found to have a large circumferential pericardial effusion with borderline tamponade features requiring emergent pericardiocentesis. On her fifth hospital day, she developed generalized motor seizure (tonic-clonic) with magnetic resonance imaging (MRI) revealing bilateral parieto-occipital edema consistent with a radiographic diagnosis of PRES. Induction therapy with mycophenolate was started and follow-up studies showed improvement in the cortical and subcortical regions on MRI with no evidence of recurrent pericardial effusion.Conclusions: PRES is a rare complication of lupus and has been infrequently described in literature. It is thought that the association is secondary to the effect of SLE on endothelial dysfunction and the effect of cytotoxic medication on the loss of autoregulation of systemic hypertension. It is important to recognize this condition and its significant associations as early detection and intervention often lead to favorable outcomes. To our knowledge, this is the first case report of SLE with associations of both PRES and circumferential pericardial effusion with tamponade physiology, both of which are rare in the SLE patient population.
Iodide‐Catalyzed Ring‐Opening Cyclization of Cyclohexane‐1,3‐dione‐2‐spirocyclopropanes
Authors: Nambu Hisanori , Onuki Yuta , Ono Naoki , Yakura Takayuki 
Published: June 2018

AbstractThe ring‐opening cyclization of 2′,3′‐nonsubstituted and 2′‐electron‐withdrawing group (EWG)‐substituted cyclohexane‐1,3‐dione‐2‐spirocyclopropanes was accomplished using iodide as a catalyst. The nonsubstituted derivatives afforded 3,5,6,7‐tetrahydro‐1‐benzofuran‐4(2H)‐ones in high yields in the presence of trimethylsilyl iodide at room temperature. The EWG‐substituted spirocyclopropanes, in turn, underwent regioselective ring opening followed by cyclization, which gave rise to 2‐substituted tetrahydrobenzofuran‐4‐ones when a combination of tetrabutylammonium iodide catalyst and trifluoromethanesulfonic acid was used, whereas calcium iodide afforded the 3‐substituted derivatives.magnified image
DNAbarcoding of economically important freshwater fish species from north‐central Nigeria uncovers cryptic diversity
Authors: Iyiola Oluyinka A. , Nneji Lotanna M. , Mustapha Moshood K. , Nzeh Chioma G. , Oladipo Segun O. , Nneji Ifeanyi C. , Okeyoyin Agboola O. , Nwani Christopher D. , Ugwumba Obih A. , Ugwumba Adiaha A. A. , Faturoti Emmanuel O. , Wang Yun‐yu , Chen Jing , Wang Wen‐Zhi , Adeola Adeniyi C. 
Published: June 2018

AbstractThis study examines the utility of morphology andDNAbarcoding in species identification of freshwater fishes from north‐central Nigeria. We compared molecular data (mitochondrial cytochromecoxidase subunit I (COI) sequences) of 136 de novo samples from 53 morphologically identified species alongside others in GenBank andBOLDdatabases. UsingDNAsequence similarity‐based (≥97% cutoff) identification technique, 50 (94.30%) and 24 (45.30%) species were identified to species level using GenBank andBOLDdatabases, respectively. Furthermore, we identified cases of taxonomic problems in 26 (49.00%) morphologically identified species. There were also four (7.10%) cases of mismatch inDNAbarcoding in which our query sequence in GenBank andBOLDshowed a sequence match with different species names. UsingDNAbarcode reference data, we also identified four unknown fish samples collected from fishermen to species level. Our Neighbor‐joining (NJ) tree analysis recovers several intraspecific species clusters with strong bootstrap support (≥95%). Analysis uncovers two well‐supported lineages withinSchilbe intermedius. The Bayesian phylogenetic analyses of NigerianS. intermediuswith others from GenBank recover four lineages. Evidence of genetic structuring is consistent with geographic regions of sub‐Saharan Africa. Thus, cryptic lineage diversity may illustrate species’ adaptive responses to local environmental conditions. Finally, our study underscores the importance of incorporating morphology andDNAbarcoding in species identification. Although developing a completeDNAbarcode reference library for Nigerian ichthyofauna will facilitate species identification and diversity studies, taxonomic revisions ofDNAsequences submitted in databases alongside voucher specimens are necessary for a reliable taxonomic and diversity inventory.