bluuebunny/crossref_metadata_2025_split huggingface dataset:
Isolation by Distance, Source-Sink Population Dynamics and Dispersal Facilitation by Trade Routes: Impact on Population Genetic Structure of a Stored Grain Pest
Authors: Cordeiro Erick M G , Campbell James F , Phillips Thomas , Akhunov Eduard 
Published: February 2019

AbstractPopulation genetic structure of agricultural pests can be impacted not only by geographic distance and the broader ecological and physical barriers but also by patterns related to where crops are produced and how they are moved after harvest. Stored-product pests, for instance, specialize in exploiting grains such as wheat and rice from on-farm storage through transportation to final processing at often geographically distant locations; therefore human-aided movement may impact their dispersal. Although stored product insects are associated with stored grain, they can also exploit resources in the surrounding environments so different ecological regions where the grain is grown and stored may also influence population structure. Here we used 1,156 SNP markers to investigate how geographic distance, ecological and agricultural variables can impact the genetic structure and gene flow of the stored food pest beetle Rhyzopertha dominica. We found a substantial degree of admixture between weakly structured populations in the US. Ecological regions were more important in explaining R. dominica population structure than crop type, suggesting insect movement between wheat and rice grain distribution channels. We have also found a significant correlation between the genetic and geographical distance (i.e., isolation by distance). However, our modeling approach combining the ecological and management variables has highlighted the importance of the volume of grain received by a location in the dispersal dynamics of the pest. The first-generation migrant analysis offered additional supported to movement over great distances that are likely associated with grain movement. Our data suggest that a multitude of factors play small but significant parts in the movement dynamics of the pest. The beetles can take advantage of the source-sink dynamic of grain movement in the US, but also engage in a high rate of movement at the local scale. Understanding population structure for R. dominica will provide insights into the potential for local processes of adaptation and broader patterns of movement that will impact management programs and the potential for spread of resistance genes.
Efficient Implementation of Penalized Regression for Genetic Risk Prediction
Authors: Privé Florian , Aschard Hugues , Blum Michael G B 
Published: February 2019

AbstractPolygenic risk scores (PRS) combine many single-nucleotide polymorphisms into a score reflecting the genetic risk of developing a disease. Privé, Aschard, and Blum present an efficient implementation of penalized logistic regression...Polygenic Risk Scores (PRS) combine genotype information across many single-nucleotide polymorphisms (SNPs) to give a score reflecting the genetic risk of developing a disease. PRS might have a major impact on public health, possibly allowing for screening campaigns to identify high-genetic risk individuals for a given disease. The “Clumping+Thresholding” (C+T) approach is the most common method to derive PRS. C+T uses only univariate genome-wide association studies (GWAS) summary statistics, which makes it fast and easy to use. However, previous work showed that jointly estimating SNP effects for computing PRS has the potential to significantly improve the predictive performance of PRS as compared to C+T. In this paper, we present an efficient method for the joint estimation of SNP effects using individual-level data, allowing for practical application of penalized logistic regression (PLR) on modern datasets including hundreds of thousands of individuals. Moreover, our implementation of PLR directly includes automatic choices for hyper-parameters. We also provide an implementation of penalized linear regression for quantitative traits. We compare the performance of PLR, C+T and a derivation of random forests using both real and simulated data. Overall, we find that PLR achieves equal or higher predictive performance than C+T in most scenarios considered, while being scalable to biobank data. In particular, we find that improvement in predictive performance is more pronounced when there are few effects located in nearby genomic regions with correlated SNPs; for instance, in simulations, AUC values increase from 83% with the best prediction of C+T to 92.5% with PLR. We confirm these results in a data analysis of a case-control study for celiac disease where PLR and the standard C+T method achieve AUC values of 89% and of 82.5%. Applying penalized linear regression to 350,000 individuals of the UK Biobank, we predict height with a larger correlation than with the best prediction of C+T (∼65% instead of ∼55%), further demonstrating its scalability and strong predictive power, even for highly polygenic traits. Moreover, using 150,000 individuals of the UK Biobank, we are able to predict breast cancer better than C+T, fitting PLR in a few minutes only. In conclusion, this paper demonstrates the feasibility and relevance of using penalized regression for PRS computation when large individual-level datasets are available, thanks to the efficient implementation available in our R package bigstatsr.
Est-Ce Vraiment une Bande Dessinée? Langues des Signes, Déconstruction et Intermédialité
Authors: Leduc Véro 
Published: February 2019

La bande dessinée est un medium pensé en 2D et souvent déployé sur papier (Falardeau, 2008). Comment en créer une en langue des signes québécoise (LSQ), cette langue tridimensionnelle (3D) dont la vidéo s’avère la meilleure forme d’écriture ? Une bande dessinée vidéo… est-ce encore une BD ?
C’est tombé dans l’oreille d’une Sourde est une bande dessignée, néologisme créé pour désigner cette bande dessinée bilingue vidéographiée en langue des signes québécoise (LSQ) et en français. Produite à partir d’extraits de rencontres avec des personnes sourdes et des membres de ma famille entendante réalisées dans le cadre de ma thèse de recherche-création, elle propose diverses réflexions sur la sourditude (Ladd, 2005), ce concept qui englobe les diverses manières de vivre comme personnes sourdes et de réfléchir aux enjeux que cela soulève.
Chassé-croisé entre écriture créative en français, citations thématiques en LSQ et extraits de ma thèse inédite, cette contribution propose une réflexion, dans une posture de déconstruction, sur la création signée (en langues des signes) et l’intermédialité, en prenant comme site particulier la production d’une BD en LSQ, une création aux confins de la bande dessinée, de la littérature et du cinéma. L’article aborde notamment un survol des systèmes d’écriture en langue des signes, une réflexion sur la déconstruction de la bande dessinée entendante et une exploration de l’intermédialité comme site d’agentivité. Si « l’écriture est la condition de l’epistémè » (Derrida, 1967), la recherche-création à travers les médias numériques favorise cette écriture signée nécessaire à la création de savoirs et de productions culturelles en langues des signes.
A cross sectional study on the prevalence of diabetes mellitus among adult population in a peri-urban area of West Tripura, India
Authors: Tripura Kaushik , Nag Kaushik , Karmakar Nabarun , Datta Anjan , Bhattacharjee Partha 
Published: February 2019

Background: Diabetes mellitus, a major lifestyle disease is undoubtedly the most challenging public health problem of 21st century with a worldwide prevalence of 387 million (8.3%). The objective of this study was to get an estimate of the prevalence of diabetes mellitus and associated factors in a sample of adult population in a peri-urban area of West Tripura.Methods: In a cross-sectional study, prevalence of diabetes mellitus was found among adult population of a peri-urban area (Dukli) of west Tripura from April 2016 to May 2016. Multistage random sampling was followed to include 76 participants. Taking house as a sampling unit, every 5th house was chosen for this study. From every selected house, one adult participant was chosen by simple random sampling until desired sample size was attained. Collected data was compiled and analyzed with the help of statistical package for social sciences (SPSS 16.0.). Chi-square, Fischer exact test was applied to find out association.Results: The mean age of the study participants was 42.21±17.65 years, comprised of 23.7% male and 76.3% female. The prevalence of diabetes mellitus was 17.1% among study participants. Diabetes was found highest in 39-58-year age group (37.5%). Males were more affected with diabetes mellitus (22.2%) compared to females (15.5%). The study also revealed a significant association of diabetes mellitus with family history of diabetes mellitus (p value 0.00).Conclusions: Present study showed very high prevalence of diabetes mellitus among adult population. Healthy lifestyle measures might reduce burden of diabetes mellitus which could be evaluated in future research.
Storymaking Belonging
Authors: Bunda Tracey , Heckenberg Robyn , Snepvangers Kim , Phillips Louise Gwenneth , Lasczik Alexandra , Black Alison L. 
Published: February 2019

Sometimes data invites more of us. To be physically held and touched, through hands creating and crafting with matter, cultivating a closer connection to the fibres, threads, textures and sinews of data. Through touching and shaping the materiality of data, other beings, places and times are aroused. Here, we share the story of data that invited more of us and how this has spurred the creation of an exhibition titled Stories of Belonging with Indigenous and non-Indigenous artist/scholars for an arts festival in Queensland, Australia. This work by the collective, SISTAS Holding Space, deeply interrogates our ontological positionality as researchers, in particular what this means in the Australian context – a colonised nation populated through waves of migration. The scars of colonization, migration and shame are held and heard through Black and White Australian women creating and interrogating belonging alongside each other – listening and holding space for each other. We air the pains of ontological destruction, silencing, disconnection and emptiness. Through experimental making research methodology, we argue the primacy of storying and making, and for provoking resonant and entangled understandings of belonging and displacement.
Settling the Soul through Va' (Relational) Ethics: An Ekphrastic Review of Hinekura Smith's "Whatuora: Theorizing 'New' Indigenous Methodology from 'Old' Indigenous Weaving Practice
Authors: Iosefo Fetaui 
Published: February 2019

This piece is layered unapologetically with indigenous ways of being as the norm. From Fetaui’s bio, she aligns herself with Hinekura’s decolonization locale. The positioning of the author’s parents also connects and honours Hinekura’s mother who is instrumental in Whatuora. The migration of Fetaui’s parents from Samoa highlights the importance of our Pacific history and where our ancestors both Māori and Samoa traversed our Moana/Vasa(ocean). This migration and positionality is significant in aligning Samoa as respectful cousins to the land of Māori, Aotearoa, notwithstanding the birth place of her parents and of her ancestors bones in Samoa. Her chosen life partner and children are also named and her position within higher education is last. Our whanau/aiga (family) our whenua/fenua (land) are our collective priorities. Our academic credentials are ranked last.
Special Issue: Making as Method: Reimagining Traditional and Indigenous Notions of “Craft” in Research Practice
Authors: Fitzpatrick Esther , Reilly Rosemary C 
Published: February 2019

In this special issue of “making as method” we aim to help shift the cultural narrative about craft by celebrating a diverse range of creative researchers who disrupt Western ways of knowing, celebrate a reclaiming of Indigenous knowledge and methods, provide space for decolonising practices, and in this digital age, reimagine traditional and Indigenous notions of craft in research. These authors in this issue all theorise their craft and provide, a rich and varied theoretical justification for “making as method.”
Quitosano y extractos de Pseudomonas fluorescens para el control de Alternaria alternata en jitomate (Solanum lycopersicum)
Authors: Rodríguez-Romero Víctor Manuel , Villanueva-Arce Ramón , Trejo-Raya Ariadna Berenice , Bautista-Baños Silvia 
Published: February 2019

<em>Alternaria alternata</em> es un hongo que ocasiona daños en el cultivo de jitomate, se caracteriza por producir manchas negras y marchitez en plantas y frutos; los fungicidas sintéticos son las principales herramientas para controlar este hongo. El objetivo del estudio fue evaluar el efecto de la aplicación de mezclas de quitosano y extractos de <em>Pseudomonas fluorescens</em> en el control de <em> A. alternata</em> bajo condiciones in vitro sobre micelio y conidios, así como la incidencia y severidad en plantas de jitomate en invernadero. El uso de la mezcla de quitosano 1.5% (p/v) + extracto de <em>P. fluorescens</em> 50% (v/v) resultó en 60 y 100% de inhibición <em>in vitro</em> de crecimiento micelial y germinación de conidios de <em>A. alternata</em> respectivamente. En invernadero, las plantas se inocularon con A. alternata, posteriormente se asperjaron con la mezcla de quitosano 1.5% (p/v) + extracto de <em>P. fluorescens</em> 50% (v/v) cada 7 días hasta la floración. La incidencia fue del 100 %, mientras que la severidad fue 51.8 y 38.9 para 7 días y 16.9 y 16.2% para 60 días, respectivamente. La mezcla utilizada es una opción para el control de <em>A. alternata.</em>
ОСОБЕННОСТИ ИСПОЛЬЗОВАНИЯ ГЕОТЕРМАЛЬНОЙ ЭНЕРГИИ С ПРИМЕНЕНИЕМ ТЕПЛОНАСОСНЫХ УСТАНОВОК В УСЛОВИЯХ НИЗКИХ ТЕМПЕРАТУР ВОЗДУХА
Authors: (Vyacheslav I. Maksimov) Максимов Вячеслав Иванович , (Amer Saloum) Салум Амер 
Published: February 2019

Актуальность. Использование низкопотенциальной энергии водоемов с помощью теплонасосных установок в условиях низких температур окружающей среды – воздуха (период времени «осень–зима–весна»), характерных для большей части территории России, связано с возможным обмерзанием трубок испарителя теплонасосных установок, что приводит к изменению режима его работы. Анализ основных закономерностей процессов работы теплообменного оборудования, а также оценка энергоэффективности теплонасосных установок в условиях образования слоя льда на рабочих поверхностях испарителя до настоящего времени не проводились. Цель: экспериментальное изучение основных закономерностей процессов образования льда на рабочих поверхностях трубок испарителя теплонасосных установок, погруженных в воду с температурой, соответствующей условиям осеннего, зимнего и весеннего периодов года для большинства природных водоемов, расположенных в РФ, а также анализ основных характеристик работы ТНУ в таких условиях. Объект: парокомпрессионный тепловой насос, работающий в условиях образования слоя льда на рабочих поверхностях трубок испарителя, помещённых в резервуар с водой, температура которой ниже 280 К. Методы. Значения температур в характерных точках поверхности трубки теплообменника-испарителя и воды, находящейся в этой области, измерялись 15 хромель-алюмелевыми термопреобразователями (ХА термопары), подключенными через АЦП к компьютеру, и регистрировались в реальном времени. На основании полученных данных проводился расчет коэффициента преобразования теплонасосной установки по известной методике. Результаты. Выделен эффект образования льда, толщиной до 10 мм, на поверхности трубок испарителя при температурах воды ниже 280 К и времени работы установки до 8000 сек. Установлено, что этот слой существенно снижает интенсивность передачи теплоты в зону испарения хладагента. Эффективность работы теплонасосной установки при этом снижается до минимума. По результатам выполненных экспериментов сделан вывод о возможности работы теплонасосных установок при частичном покрытии трубки испарителя льдом. Сформулирована гипотеза о механизме процессов теплопереноса и фазовых превращений, протекающих вблизи трубок теплоносителя теплонасосной установки, при температурах воды менее 286 К. Результаты выполненных исследований являются базой для обоснования условий эффективного применения теплонасосных установок в регионах с низкими температурами воздуха в период осени, зимы и весны.
СОВРЕМЕННОЕ СОСТОЯНИЕ ВОЛЬФРАМОВОЙ ПРОМЫШЛЕННОСТИ РОССИИ
Authors: (Vitaly Yu. Khatkov) Хатьков Виталий Юрьевич , (Grigory Yu. Boyarko) Боярко Григорий Юрьевич 
Published: February 2019

Актуальность работы обусловлена необходимостью изучения проблем вольфрамовой промышленности России. Цель: изучение динамики товарных потоков (производства, импорта, экспорта, потребления) вольфрамовых продуктов (вольфрамовых концентратов, паравольфрамата аммония, вольфрамового ангидрита, ферровольфрама и металлического вольфрама); выработка рекомендаций по оптимизации товарооборота вольфрамовых продуктов. Методы исследования: статистический, графический, логический. Результаты. Россия обладает достаточной сырьевой базой для обеспечения вольфрамовой продукцией национальных потребителей и поставок на экспорт. Возможно возобновление добычных работ на Тырнаузском ГОКе в Кабардино-Балкарской Республике, Джидинском вольфрамо-молибденовом комбинате в Республике Бурятия и осуществление нового добывающего проекта на Агылкинском месторождении в Республике Саха (Якутия). Российский рынок вольфрамового сырья подвержен резким колебаниям объемов производства, экспорта и импорта, осложняемым несогласованностью интересов добывающих, перерабатывающих и потребляющих вольфрамовую продукцию предприятий. Кроме сокращения добычи вольфрамового сырья вследствие остановки убыточных выработанных рудников возникли встречные импортно-экспортные потоки вольфрамовых концентратов и ферровольфрама, создавая искусственную импортозависимость для их потребителей. Для «оздоровления» российской вольфрамовой промышленности необходима консолидация предприятий, добывающих вольфрамовое сырье, и перерабатывающих предприятий в вертикально интегрированные холдинги с привлечением состоятельных инвесторов, реанимация закрытых добывающих производств на крупных и уникальных месторождениях с бедными рудами на основе улучшения технологий обогащения, поиски и освоение новых месторождений с богатыми вольфрамовыми рудами.
ПОДХОД К АВТОМАТИЗИРОВАННОМУ ФОРМИРОВАНИЮ НОРМ ВРЕМЕНИ НА ТЕХНИЧЕСКОЕ ОБСЛУЖИВАНИЕ СРЕДСТВ КИПиА, АСУ ТП И СООРУЖЕНИЙ СВЯЗИ ПРЕДПРИЯТИЙ НЕФТЕГАЗОВОЙ ОТРАСЛИ
Authors: (Aleksey O. Savelev) Савельев Алексей Олегович , (Vladimir P. Komagorov) Комагоров Владимир Петрович , (Sergey S. Mikhalevich) Михалевич Сергей Сергеевич 
Published: February 2019

Актуальность исследования обусловлена необходимостью постоянного обновления и пересмотра стратегии повышения общей экономической эффективности предприятий нефтегазовой отрасли путем оптимизации затрат на проведение мероприятий технического обслуживания критически важных контрольно-измерительных приборов и автоматики (КИПиА), оборудования автоматизированных систем управления технологическим процессом (АСУ ТП) и сооружений связи. Цель: разработать научно обоснованный подход к автоматизированному формированию норм времени на техническое обслуживание оборудования КИПиА, АСУ ТП и сооружений связи предприятий нефтегазодобывающей отрасли, позволяющий сократить время и повысить общую эффективность процесса планирования технического обслуживания. Объекты: технологические установки добычи нефти и газа, подготовки, перекачки и хранения нефти и газа, поддержания пластового давления, трубопроводного транспорта, контролируемые и управляемые с помощью оборудования АСУ ТП, оснащенные различными приборами КИПиА; сооружения связи: радиорелейные и спутниковые системы связи, проводные системы связи, волоконно-оптические линии связи, телефонные станции, транковые системы связи, системы видеонаблюдения и сигнализации. Методы. Для автоматизации процесса формирования норм трудозатрат на техническое обслуживание нового оборудования используется метод классификации оборудования по категориям технической сложности. Результаты. Разработана методика автоматизированного расчета нормативов трудозатрат на техническое обслуживание оборудования предприятий нефтегазовой отрасли, основанная на категориях технической сложности. Определены требования к модулю формирования базовых норм трудозатрат информационной системы управления техническим обслуживанием, выполнена соответствующая программная реализация. На основе предложенной методики сформированы базовые нормы трудозатрат на техническое обслуживание средств АСУ ТП, КИПиА и сооружений связи ОАО «Томскнефть» ВНК.
Relapse Following Allogeneic Hematopoietic Cell Transplantation for Acute Myeloid Leukemia Apparently Due to Somatic Cell Evolution via Epigenetic Variation and Immune Selection
Authors: Greenspan Neil S. 
Published: February 2019

In this brief commentary, I discuss a recently published study that documents the role of immune escape in relapse of acute myeloid leukemia (AML) after hematopoietic cell transplantation (HCT). Of particular interest, the mechanism identified by the authors for the ability of the malignant cells to evade destruction by host T cells is the loss of cell surface expression of HLA class II molecules based on processes other than mutation. The authors labeled this mechanism for altered cell surface display of HLA class II antigens “epigenetic.” This study should be of strong interest for immunologists, oncologists and even specialists in infectious diseases for several reasons. First, the results extend the range of examples for which epigenetic mechanisms can play a critical role in resistance to therapy in oncology or infectious disease. Second, findings relating to decreased cell surface display of HLA class II molecules motivate investigation of novel approaches using cytokines to increase the numbers of HLA class II proteins on malignant myeloid cell membranes and reduce the extent of immune escape by these cells. Third, the data presented suggest experimental directions intended to clarify detailed molecular mechanisms underlying the cases of AML post-HCT relapse and raise questions relating to why some mechanisms of somatic cell evolution and not others are operative in different clinical settings.
L’entreprise privée d’intérêt général
Authors: Morand-Deviller Jacqueline 
Published: February 2019

Cet article traite du nouveau visage vertueux de l’entreprise de droit privé, qui se donne des finalités et des modes d’intervention s’écartant de la seule recherche de l’intérêt particulier et du profit. Les excès de la financiarisation, ceux de la place accordée aux actionnaires et à leurs seuls intérêts, ont conduit à une remise en cause de la raison d’être de l’entreprise. Dans de nombreux domaines, un comportement plus soucieux d’éthique que par le passé est recherché, n’est plus seulement imposé par les pouvoirs publics mais choisi par les dirigeants des entreprises eux-mêmes. Cette bonne conduite traditionnellement guidée par les finalités d’ordre public et de service public sera désormais orientée aussi par celles du développement durable, c’est-à-dire la recherche de finalités sociales et environnementales au-delà du seul développement économique. Enjeu désormais capital, la protection de l’environnement sera plus particulièrement développée ici.