bluuebunny/crossref_metadata_2025_split huggingface dataset:
Pilot Clinical Trial of Perioperative Durvalumab and Tremelimumab in the Treatment of Resectable Colorectal Cancer Liver Metastases
Authors: Kanikarla Marie Preeti , Haymaker Cara , Parra Edwin Roger , Kim Young Uk , Lazcano Rossana , Gite Swati , Lorenzini Daniele , Wistuba Ignacio I. , Tidwell Rebecca S. Slack , Song Xiaofei , Foo Wai Chin , Maru Dipen M. , Chun Yun Shin , Futreal Andy , Kee Bryan , Menter David , Solis Luisa , Tzeng Ching-Wei , Parseghian Christine , Raghav Kanwal , Morris Van , Chang Chia-Chi , Jenq Robert , Tam Alda , Bernatchez Chantale , Kopetz Scott , Vauthey Jean-Nicolas , Overman Michael J. 
Published: April 2021

AbstractPurpose:Despite the prognostic importance of immune infiltrate in colorectal cancer, immunotherapy has demonstrated limited clinical activity in refractory metastatic proficient mismatch-repair (pMMR) colorectal cancer. This study explores combining anti–CTLA-4 and an anti–PD-L1 therapy in the preoperative management of resectable colorectal cancer liver metastases with the intent to improve immune responses in this disease setting.Patients and Methods:Patients with resectable colorectal cancer liver-only metastases received one dose of tremelimumab and durvalumab preoperatively followed by single-agent durvalumab postoperatively. Primary objectives were to determine feasibility and safety.Results:A total of 24 patients were enrolled between November 2016 and November 2019. Twenty-three patients received treatment [21 pMMR and 2 deficient mismatch-repair (dMMR)] and subsequently 17 (74%; 95% CI: 53%–88%) underwent surgical resection. Grade 3/4 treatment-related immune toxicity and postoperative grade 3/4 toxicity were seen in 5/23 (22%; 95% CI: 10%–44%) and 2/17 (12%; 95% CI: 2%–38%) patients. The median relapse-free survival (RFS) was 9.7 (95% CI: 8.1–17.8) months, and overall survival was 24.5 (95% CI: 16.5–28.4) months. Four patients demonstrated complete pathologic response, two dMMR patients and two POLE mutation patients. Pre- and post-tumor tissue analysis by flow cytometry, immunofluorescence, and RNA sequencing revealed similar levels of T-cell infiltration, but did demonstrate evidence of CD8+ and CD4+ activation posttreatment. An increase in B-cell transcriptome signature and B-cell density was present in posttreatment samples from patients with prolonged RFS.Conclusions:This study demonstrates the safety of neoadjuvant combination tremelimumab and durvalumab prior to colorectal cancer liver resection. Evidence for T- and B-cell activation following this therapy was seen in pMMR metastatic colorectal cancer.
Autophagy-Dependent Sensitization of Triple-Negative Breast Cancer Models to Topoisomerase II Poisons by Inhibition of the Nucleosome Remodeling Factor
Authors: Tyutyunyk-Massey Liliya , Sun Yilun , Dao Nga , Ngo Hannah , Dammalapati Mallika , Vaidyanathan Ashish , Singh Manjulata , Haqqani Syed , Haueis Joshua , Finnegan Ryan , Deng Xiaoyan , Kirberger Steve E. , Bos Paula D. , Bandyopadhyay Dipankar , Pomerantz William C.K. , Pommier Yves , Gewirtz David A. , Landry Joseph W. 
Published: April 2021

AbstractEpigenetic regulators can modulate the effects of cancer therapeutics. To further these observations, we discovered that the bromodomain PHD finger transcription factor subunit (BPTF) of the nucleosome remodeling factor (NURF) promotes resistance to doxorubicin, etoposide, and paclitaxel in the 4T1 breast tumor cell line. BPTF functions in promoting resistance to doxorubicin and etoposide, but not paclitaxel, and may be selective to cancer cells, as a similar effect was not observed in embryonic stem cells. Sensitization to doxorubicin and etoposide with BPTF knockdown (KD) was associated with increased DNA damage, topoisomerase II (TOP2) crosslinking and autophagy; however, there was only a modest increase in apoptosis and no increase in senescence. Sensitization to doxorubicin was confirmed in vivo with the syngeneic 4T1 breast tumor model using both genetic and pharmacologic inhibition of BPTF. The effects of BPTF inhibition in vivo are autophagy dependent, based on genetic autophagy inhibition. Finally, treatment of 4T1, 66cl4, 4T07, MDA-MB-231, but not ER-positive 67NR and MCF7 breast cancer cells with the selective BPTF bromodomain inhibitor, AU1, recapitulates genetic BPTF inhibition, including in vitro sensitization to doxorubicin, increased TOP2-DNA crosslinks and DNA damage. Taken together, these studies demonstrate that BPTF provides resistance to the antitumor activity of TOP2 poisons, preventing the resolution of TOP2 crosslinking and associated autophagy. These studies suggest that BPTF can be targeted with small-molecule inhibitors to enhance the effectiveness of TOP2-targeted cancer chemotherapeutic drugs.Implications:These studies suggest NURF can be inhibited pharmacologically as a viable strategy to improve chemotherapy effectiveness.
Radiomics Biomarkers Correlate with CD8 Expression and Predict Immune Signatures in Melanoma Patients
Authors: Aoude Lauren G. , Wong Bernadette Z.Y. , Bonazzi Vanessa F. , Brosda Sandra , Walters Shaun B. , Koufariotis Lambros T. , Naeini Marjan M. , Pearson John V. , Oey Harald , Patel Kalpana , Bradford Julia J. , Bloxham Conor J. , Atkinson Victoria , Law Phillip , Strutton Geoffrey , Bayley Gerard , Yang Samuel , Smithers B. Mark , Waddell Nicola , Miles Kenneth , Barbour Andrew P. 
Published: April 2021

Abstract

Treatment for metastatic melanoma includes targeted and/or immunotherapy. Although many patients respond, only a subset has complete response. As late-stage patients often have multiple tumors in difficult access sites, non-invasive techniques are necessary for the development of predictive/prognostic biomarkers. PET/CT scans from 52 patients with stage III/IV melanoma were assessed and CT image parameters were evaluated as prognostic biomarkers. Analysis indicated patients with high standard deviation or high mean of positive pixels (MPP) had worse progression-free survival (P = 0.00047 and P = 0.0014, respectively) and worse overall survival (P = 0.0223 and P = 0.0465, respectively). Whole-exome sequencing showed high MPP was associated with BRAF mutation status (P = 0.0389). RNA-sequencing indicated patients with immune “cold” signatures had worse survival, which was associated with CT biomarker, MPP4 (P = 0.0284). Multiplex immunofluorescence confirmed a correlation between CD8 expression and image biomarkers (P = 0.0028).

Implications:
CT parameters have the potential to be cost-effective biomarkers of survival in melanoma, and reflect the tumor immune-microenvironment.
Splicing Patterns in SF3B1-Mutated Uveal Melanoma Generate Shared Immunogenic Tumor-Specific Neoepitopes
Authors: Bigot Jeremy , Lalanne Ana I. , Lucibello Francesca , Gueguen Paul , Houy Alexandre , Dayot Stephane , Ganier Olivier , Gilet Jules , Tosello Jimena , Nemati Fariba , Pierron Gaelle , Waterfall Joshua J. , Barnhill Raymond , Gardrat Sophie , Piperno-Neumann Sophie , Popova Tatiana , Masson Vanessa , Loew Damarys , Mariani Pascale , Cassoux Nathalie , Amigorena Sebastian , Rodrigues Manuel , Alsafadi Samar , Stern Marc-Henri , Lantz Olivier 
Published: April 2021

Abstract

Disruption of splicing patterns due to mutations of genes coding splicing factors in tumors represents a potential source of tumor neoantigens, which would be both public (shared between patients) and tumor-specific (not expressed in normal tissues). In this study, we show that mutations of the splicing factor SF3B1 in uveal melanoma generate such immunogenic neoantigens. Memory CD8+ T cells specific for these neoantigens are preferentially found in 20% of patients with uveal melanoma bearing SF3B1-mutated tumors. Single-cell analyses of neoepitope-specific T cells from the blood identified large clonal T-cell expansions, with distinct effector transcription patterns. Some of these expanded T-cell receptors are also present in the corresponding tumors. CD8+ T-cell clones specific for the neoepitopes specifically recognize and kill SF3B1-mutated tumor cells, supporting the use of this new family of neoantigens as therapeutic targets.

Significance:
Mutations of the splicing factor SF3B1 in uveal melanoma generate shared neoantigens that are uniquely expressed by tumor cells, leading to recognition and killing by specific CD8 T cells. Mutations in splicing factors can be sources of new therapeutic strategies applicable to diverse tumors.
This article is highlighted in the In This Issue feature, p. 1861
Development of Immunotherapy Combination Strategies in Cancer
Authors: Yap Timothy A. , Parkes Eileen E. , Peng Weiyi , Moyers Justin T. , Curran Michael A. , Tawbi Hussein A. 
Published: April 2021

AbstractHarnessing the immune system to treat cancer through inhibitors of CTLA4 and PD-L1 has revolutionized the landscape of cancer. Rational combination strategies aim to enhance the antitumor effects of immunotherapies, but require a deep understanding of the mechanistic underpinnings of the immune system and robust preclinical and clinical drug development strategies. We review the current approved immunotherapy combinations, before discussing promising combinatorial approaches in clinical trials and detailing innovative preclinical model systems being used to develop rational combinations. We also discuss the promise of high-order immunotherapy combinations, as well as novel biomarker and combinatorial trial strategies.Significance:Although immune-checkpoint inhibitors are approved as dual checkpoint strategies, and in combination with cytotoxic chemotherapy and angiogenesis inhibitors for multiple cancers, patient benefit remains limited. Innovative approaches are required to guide the development of novel immunotherapy combinations, ranging from improvements in preclinical tumor model systems to biomarker-driven trial strategies.
Tracking Cancer Evolution through the Disease Course
Authors: Bailey Chris , Black James R.M. , Reading James L. , Litchfield Kevin , Turajlic Samra , McGranahan Nicholas , Jamal-Hanjani Mariam , Swanton Charles 
Published: April 2021

Abstract

During cancer evolution, constituent tumor cells compete under dynamic selection pressures. Phenotypic variation can be observed as intratumor heterogeneity, which is propagated by genome instability leading to mutations, somatic copy-number alterations, and epigenomic changes. TRACERx was set up in 2014 to observe the relationship between intratumor heterogeneity and patient outcome. By integrating multiregion sequencing of primary tumors with longitudinal sampling of a prospectively recruited patient cohort, cancer evolution can be tracked from early- to late-stage disease and through therapy. Here we review some of the key features of the studies and look to the future of the field.

Significance:
Cancers evolve and adapt to environmental challenges such as immune surveillance and treatment pressures. The TRACERx studies track cancer evolution in a clinical setting, through primary disease to recurrence. Through multiregion and longitudinal sampling, evolutionary processes have been detailed in the tumor and the immune microenvironment in non–small cell lung cancer and clear-cell renal cell carcinoma. TRACERx has revealed the potential therapeutic utility of targeting clonal neoantigens and ctDNA detection in the adjuvant setting as a minimal residual disease detection tool primed for translation into clinical trials.
Overcoming Resistance to Tumor-Targeted and Immune-Targeted Therapies
Authors: Aldea Mihaela , Andre Fabrice , Marabelle Aurelien , Dogan Semih , Barlesi Fabrice , Soria Jean-Charles 
Published: April 2021

AbstractResistance to anticancer therapies includes primary resistance, usually related to lack of target dependency or presence of additional targets, and secondary resistance, mostly driven by adaptation of the cancer cell to the selection pressure of treatment. Resistance to targeted therapy is frequently acquired, driven by on-target, bypass alterations, or cellular plasticity. Resistance to immunotherapy is often primary, orchestrated by sophisticated tumor–host–microenvironment interactions, but could also occur after initial efficacy, mostly when only partial responses are obtained. Here, we provide an overview of resistance to tumor and immune-targeted therapies and discuss challenges of overcoming resistance, and current and future directions of development.Significance:A better and earlier identification of cancer-resistance mechanisms could avoid the use of ineffective drugs in patients not responding to therapy and provide the rationale for the administration of personalized drug associations. A clear description of the molecular interplayers is a prerequisite to the development of novel and dedicated anticancer drugs. Finally, the implementation of such cancer molecular and immunologic explorations in prospective clinical trials could de-risk the demonstration of more effective anticancer strategies in randomized registration trials, and bring us closer to the promise of cure.
The Next Decade of Immune Checkpoint Therapy
Authors: Sharma Padmanee , Siddiqui Bilal A. , Anandhan Swetha , Yadav Shalini S. , Subudhi Sumit K. , Gao Jianjun , Goswami Sangeeta , Allison James P. 
Published: April 2021

AbstractImmune checkpoint therapy (ICT) can provide durable clinical responses and improve overall survival. However, only subsets of patients with specific tumor types respond to ICT. Thus, significant challenges remain, including understanding pathways of resistance, optimizing patient selection, improving management of immune-related adverse events, and identifying rational therapeutic combinations. These challenges will need a focused approach encompassing both clinical and basic research, with the integration of reverse translational studies. This integrated approach will lead to identification of potential targets for subsequent clinical trials, which will guide decisions as we develop novel combination strategies to maximize efficacy and minimize toxicities for patients.Significance:ICTs induce durable antitumor responses for subsets of patients with cancer. Recent evidence suggests that rational combinatorial strategies can improve response by overcoming primary and adaptive resistance mechanisms, although these may carry an increased risk of immune-mediated toxicities. This review surveys the current understanding of mechanisms of response and resistance to ICTs and active areas of investigation, and proposes a path forward to improving efficacy and minimizing toxicities through better patient selection and rational combinations.
The Promising Evolution of Targeted Therapeutic Strategies in Cancer
Authors: Peters Solange , Mok Tony , Passaro Antonio , Jänne Pasi Antero 
Published: April 2021

Abstract

Summary:
The upcoming decade of precision medicine for cancer is moving from the translation of specific genetic findings into clinically relevant improvement to the qualitative analyses of the genomic and immune tumor microenvironment, for an integrated treatment strategy in both metastatic and early disease.
Treatment Decisions for Patients with Cancer during the COVID-19 Pandemic
Authors: Labaki Chris , Peters Solange , Choueiri Toni K. 
Published: April 2021

Abstract
Patients with cancer have been disproportionally affected by the COVID-19 pandemic, with high rates of severe outcomes and death. Similarly, treatment decisions in this vulnerable population have been altered to a major degree during the past year, with significant disruption of care reported. Although complex, therapeutic choices in patients with cancer in times of COVID-19 are critical, as they may save thousands of lives. A mounting body of evidence, in addition to clear recommendations by multiple international societies, can help oncologists decide appropriately the necessity to administer antineoplastic regimens, helping to avoid a surge in cancer-related deaths in the upcoming months.
Genomics and Cancer Disparities: The Justice and Power of Inclusion
Authors: Davis Melissa B. 
Published: April 2021

Abstract

Summary:
Advances in genomic science have transformed our ability to interrogate cancer, revealing biases that drive disparities in minority populations. Cancer disparities research engages diverse ethnic group inclusion as a matter of rigor, to address underrepresentation in genomic data sources, and has led to groundbreaking work, enhancing our understanding of tumor biology.
ВІДНОВЛЕННЯ МІКРОБІОМУ ВАГІНИ ПРИ БАКТЕРІЙНОМУ ВАГІНОЗІ ІЗ ЗАСТОСУВАННЯМ ПРОБІОТИКА ДІАЛАК
Authors: Mykhaylyshyn H. I. , Klуmnyuk S. І. , Spivak M. Y. , Lazarenko L. M. , Malanchuk L. M. , Korda I. V. 
Published: April 2021

Наведено результати дослідження мікробіому піхви осіб з бактерійним вагінозом до і після перорального застосування капсульної форми та вагінальних супозиторіїв пробіотика «Діалак» з вмістом штаму L. casei IMB B-7280. Цей препарат, який рекомендовано для корекції вагінальної мікробіоти, має комбіновану протизапальну та вибіркову протимікробну активність. Він має широкий спектр антагоністичної активності відносно умовно-патогенних мікроорганізмів: стафілококів, стрептококів, псевдомонад, кишкової палички тощо, ефективно пригнічує ріст грибів.
Мета дослідження – оцінити ефективність застосування пробіотика «Діалак» у жінок із бактерійним вагінозом.
Пацієнти і методи. При обстеженні жінок із бактерійним вагінозом проводився традиційний гінекологічний огляд з метою визначення загальних анамнестичних даних, зокрема з’ясування частоти, тяжкості клінічних проявів та тривалості рецидивів урогенітальної інфекції. Лабораторні методи діагностики включали мікроскопію мазків для виявлення ключових клітин, амінотест, рН виділень, класичне бактеріологічне дослідження піхвового вмісту до початку лікування та на 10-й день після завершення лікування. Проводили забір периферичної крові до лікування та через 1 міс. після пробіотикотерапії для вивчення клітинного імунітету.
Результати. Проведені дослідження свідчать, що при вагінальному та пероральному застосуванні пробіотика «Діалак» відбувається стабільне заселення слизових оболонок піхви власною мікробіотою. Клінічно доведено ефективність дії препарату проти гарднерел, мобілункуса, лактококів і вейлонел.
Висновок. Доцільність застосування пробіотика «Діалак» з вмістом штаму L. casei IMB B-7280 для лікування хворих з бактерійним вагінозом доведена клінічно. Гарна переносність біопрепарату, відсутність побічної дії, відновлення лактофлори, зручна форма використання обґрунтовують його призначення в акушерстві та гінекології для лікування хворих на бактерійні вагінози.
ПРОБЛЕМА СУПЕРІНФЕКЦІЙ: СВІТОВА ЗАГРОЗА СМЕРТІ ЧИ МОЖЛИВОСТІ ЇЇ ГЛОБАЛЬНОГО ПОДОЛАННЯ?
Authors: Koshak Yu. F. 
Published: April 2021

За даними ВООЗ, у 2017 р. 10,4 млн осіб захворіли на туберкульоз, 47 % хворих були інфіковані збудниками з множинною медикаментозною стійкістю до антимікобактерійних препаратів, а 1,7 млн з них померли. Щороку фіксують до 700 тис. випадків смерті від інфекційних захворювань у пульмонології: ХОЗЛ, бронхіальної астми, атипової пневмонії та інтерстиційних захворювань легень. Генералізовані септичні інфекції з нагноєннями коронавіруси викликають мутації мікроорганізмів до антибактерійних препаратів та формують стійкість до медикаментів.
Мета дослідження – покращити ранню діагностику резистентного туберкульозу та перервати шляхи її формування за допомогою молекулярно-технологічних методів.
Огляд даних доводить необхідність покращення ранньої діагностики суперінфекцій, яка дасть змогу запобігти формуванню розширеної стійкості мікроорганізмів до антибактерійних препаратів. Велика швидкість утворення резистентності бактерій нині випереджає впровадження нових протимікробних препаратів, що становить загрозу старіючому населенню планети. Через формування резистентності мікроорганізмів, змішаної специфічної та неспецифічної флори до основних препаратів у світі спостерігається поява глобальних захворювань, зумовлених «супербактерією – жахливою бактерією – superbug». Через низький рівень сучасної молекулярної діагностики цей рівень «суперінфекцій» є прихованим, а зареєстрована кількість суттєво занижена. За відсутності ефективних глобальних кроків, спрямованих на зменшування швидкості формування резистентності мікроорганізмів, до 2050 р. кількість населення планети може зменшуватися по 10 млн осіб на рік через реактивацію атипових пневмоній, вторинного туберкульозу (ТБ), розширення тотального резистентного туберкульозу (XXDR).
Висновки. Впровадження сучасних молекулярно-генетичних технологій дозволить з високою точністю встановити етіологію процесу, провести видову ідентифікацію мікобактерій та мікроорганізмів і визначити фенотипну та генотипну чутливість бактерій до антимікобактерійних препаратів. Така діагностика сприятиме ефективному лікуванню пацієнтів, які вже заражені стійкими штамами бактерій.
МУЛЬТИСИСТЕМНИЙ ЗАПАЛЬНИЙ СИНДРОМ, АСОЦІЙОВАНИЙ ІЗ SARS-COV-2 У ДИТИНИ
Authors: Pavlyshyn H. A. , Dyvonyak O. M. , Boyarchuk O. R. , Tomashivska T. V. , Chornota I. D. , Slyva V. V. , Horishna I. L. , Panchenko O. I. 
Published: April 2021

Метою роботи був аналіз клінічних особливостей та лікування мультисистемного запального синдрому, асоційованого із SARS-CoV-2, на прикладі клінічного випадку у хлопчика раннього шкільного віку.
Наведено динаміку клінічних проявів, лабораторно-інструментальних показників у дитини з Кавасакі-подібним захворюванням, асоційованим із COVID-19, під час стаціонарного лікування у відділенні інтенсивної терапії міської дитячої комунальної лікарні м. Тернополя. Акцентується увага практичних лікарів на важливості своєчасної діагностики рідкісного, але потенційно тяжкого мультисистемного запального синдрому, асоційованого з COVID-19, у дітей.
ПОШИРЕНІСТЬ ВЖИВАННЯ ТЮТЮНОВИХ ВИРОБІВ СЕРЕД МОЛОДОГО НАСЕЛЕННЯ ЛЬВІВСЬКОЇ ОБЛАСТІ
Authors: Gutor T. H. , Kozij-Bredelyeva S. P. 
Published: April 2021

Мета: проаналізувати поширеність вживання тютюнових виробів серед молодого населення Львівської області.
Матеріали і методи. Проведено соціологічне вибіркове анонімне опитування молодих осіб (n=410, віком 18–44 роки) Львівської області щодо поширеності вживання тютюнових виробів і популярності новітніх методів куріння.
Результати. У ході дослідження з’ясовано, що з появою новітніх систем нагрівання тютюну прихильників звичайних сигарет серед молодих осіб Львівської області не поменшало. Навпаки, до них приєднались курці IQOS та Glo. Встановлено, що кожна третя молода особа Львівської області ((34,39±2,35) %) вживала тютюнові вироби. Вперше в Україні пристрої для нагрівання тютюну з’явилися у продажу в 2016 (IQOS) і 2018 (Glo) роках, а частка осіб, які їх використовують, постійно зростає. З’ясовано, що зі всіх респондентів (11,71±1,59) % використовували тютюнові вироби для нагрівання IQOS та Glo, при чому з-поміж них (47,92±2,47) % вживали їх щодня. Також встановлено, що значно зростає поширеність альтернативних методів вживання тютюну серед жіночого населення молодого віку.
Дослідження показало, що (72,92±2,19) % респондентів назвали основною причиною початку використання даних виробів як спосіб заміни куріння традиційних сигарет. Решта користувачів спробували їх як розвагу і через цікавість (продукцію постійно вдосконалюють – це стосується як оновлення дизайну, розмірів, форми, так і зручностей при використанні – зростає тривалість роботи без підзарядки тощо). Серед опитаних (6,25±1,20) % осіб повною мірою не усвідомлювали ризиків використання цих пристроїв для власного здоров’я. А з курців звичайних сигарет (1,85±0,67) % анкетованих частково розуміли шкідливий вплив куріння на свій організм.
Висновки. Робота аргументує потребу в науковому опрацюванні системи попередження новітніх методів вживання тютюнових виробів з-поміж молодого населення і запровадження правил контролю за тютюном та новими пристроями для куріння на законодавчому рівні.