bluuebunny/crossref_metadata_2025_split huggingface dataset:
Laminopathies’ Treatments Systematic Review: A Contribution Towards a ‘Treatabolome’
Authors: Atalaia Antonio , Ben Yaou Rabah , Wahbi Karim , De Sandre-Giovannoli Annachiara , Vigouroux Corinne , Bonne Gisèle 
Published: March 2021

Background: Variants in the LMNA gene, encoding lamins A/C, are responsible for a growing number of diseases, all of which complying with the definition of rare diseases. LMNA-related disorders have a varied phenotypic expression with more than 15 syndromes described, belonging to five phenotypic groups: Muscular Dystrophies, Neuropathies, Cardiomyopathies, Lipodystrophies and Progeroid Syndromes. Overlapping phenotypes are also reported. Linking gene and variants with phenotypic expression, disease mechanisms, and corresponding treatments is particularly challenging in laminopathies. Treatment recommendations are limited, and very few are variant-based. Objective: The Treatabolome initiative aims to provide a shareable dataset of existing variant-specific treatment for rare diseases within the Solve-RD EU project. As part of this project, we gathered evidence of specific treatments for laminopathies via a systematic literature review adopting the FAIR (Findable, Accessible, Interoperable, and Reusable) guidelines for scientific data production. Methods: Treatments for LMNA-related conditions were systematically collected from MEDLINE and Embase bibliographic databases and clinical trial registries (Cochrane Central Registry of Controlled Trials, clinicaltrial.gov and EudraCT). Two investigators extracted and analyzed the literature data independently. The included papers were assessed using the Oxford Centre for Evidence-Based Medicine 2011 Levels of Evidence. Results: From the 4783 selected articles by a systematic approach, we identified 78 papers for our final analysis that corresponded to the profile of data defined in the inclusion and exclusion criteria. These papers include 2 guidelines/consensus papers, 4 meta-analyses, 14 single-arm trials, 15 case series, 13 cohort studies, 21 case reports, 8 expert reviews and 1 expert opinion. The treatments were summarized electronically according to significant phenome-genome associations. The specificity of treatments according to the different laminopathic phenotypical presentations is variable. Conclusions: We have extracted Treatabolome-worthy treatment recommendations for patients with different forms of laminopathies based on significant phenome-genome parings. This dataset will be available on the Treatabolome website and, through interoperability, on genetic diagnosis and treatment support tools like the RD-Connect’s Genome Phenome Analysis Platform.
Resiliencia y compromiso en estudiantes de Enfermería de la Universidad Nacional Jorge Basadre Grohmann en Tacna, Perú 2019
Authors: Yalpa Mojica Diana , Cachicatari Vargas Elena , Flores Ledesma Katia 
Published: March 2021

Objetivo: Determinar la relación entre la resiliencia y compromiso en los estudiantes de Enfermería en Tacna, Perú. Material y métodos: Estudio no experimental, correlacional, de corte trasversal. La población estuvo conformada por 179 estudiantes de primero a cuarto año de la Escuela Profesional de Enfermería de la Universidad Nacional Jorge Basadre Grohmann en Tacna, durante el año 2019, a quienes se encuestó previo consentimiento informado, se aplicó dos cuestionarios validados. Para el análisis se utilizó el estadístico Chi cuadrado, con una confianza al 95 %. Resultados: Del total de estudiantes, el 88,8 % fue de sexo femenino; el 57 % de 19 a 21 años; el 60,3 % expresó un nivel de compromiso alto y el 35,8 % un nivel medio, siendo este compromiso alto por dedicación (69,3 %), vigor (52 %) y absorción (55,3 %). El 54,7 % presentó resiliencia de nivel alto y el 44,7 %, de nivel medio; siendo esta resiliencia alta por competencia personal (96,1 %), y por optimismo (60,3 %); el 44,7 % presentó un compromiso y resiliencia alta con una asociación estadísticamente significativa (p<0,01), la resiliencia presentó asociación directa con todas las dimensiones del compromiso (dedicación, vigor y absorción) y el compromiso se asoció con todas las dimensiones de la resiliencia (competencia personal, confianza en el propio instinto, optimismo y relaciones) (p<0,05). Conclusión: Existe relación significativa entre la resiliencia y el compromiso en estudiantes de Enfermería.
PROFIL LITERASI DIGITAL SISWA KELAS XI PADA PEMBELAJARAN JARAK JAUH MATA PELAJARAN KIMIA
Authors: Abdul Latip  , Nursida Sutantri  
Published: March 2021

The study aims to measure and describe the profile of students’ digital literacy who take distance learning in chemistry subjects. During the Covid-19 pandemic, learning carried out online using digital-based technology. This research measures digital literacy using descriptive research methods with quantitative approaches. Data collection carried out by giving digital literacy questionnaires to 74 eleven-grade students who are conducting online learning. The students assess themselves through a questionnaire about digital literacy, the results of the study indicate that the digital literacy of eleven-grade students on online learning are as follows: 1) The aspect of the ability to use digital media obtained an average score of 79.95; 2) The aspects of managing digital learning platforms obtained an average score of 76.29; 3) The aspect of the use of advanced digital media obtained an average score of 68.48; and 4) Ethical and safety aspects in the use of digital media obtained an average score of 79.77.
Penelitian ini bertujuan untuk mengukur dan menggambarkan profil literasi digital siswa kelas XI ketika mengikuti pembelajaran jarak jauh pada mata pelajaran kimia. Selama masa pandemi Covid-19, pembelajaran dilaksanakan secara daring dan luring dengan memanfaatkan teknologi berbasis digital. Penelitian ini melakukan pengukuran literasi digital menggunakan metode penelitian deskriptif dengan pendekatan kuantitatif. Pengumpulan data dilakukan dengan cara memberikan kuisioner pengukuran literasi digital kepada 74 siswa kelas XI yang melaksanakan pembelajaran kimia secara daring. Siswa menilai dirinya sendiri melalui kuisioner literasi digital, hasil penelitian menunjukkan bahwa literasi digital siswa kelas XI pada pembelajaran secara daring sebagai berikut: 1) Pada aspek kemampuan menggunakan media digital diperoleh rata-rata skor sebesar 79.95; 2) Pada aspek pengelolaan platform pembelajaran digital diperoleh rata-rata skor sebesar 76,29; 3) Pada aspek penggunaan media digital tingkat lanjut diperoleh rata-rata skor sebesar 68,48; dan 4) Pada aspek etika dan keamanaan dalam penggunaan media digital diperoleh rata-rata skor sebesar 79,77.
Persistent Homology Metrics Reveal Quantum Fluctuations and Reactive Atoms in Path Integral Dynamics
Authors: Hu Yunfeng , Ounkham Phonemany , Marsalek Ondrej , Markland Thomas E. , Krishmoorthy Bala , Clark Aurora E. 
Published: March 2021

Nuclear quantum effects (NQEs) are known to impact a number of features associated with chemical reactivity and physicochemical properties, particularly for light atoms and at low temperatures. In the imaginary time path integral formalism, each atom is mapped onto a “ring polymer” whose spread is related to the quantum mechanical uncertainty in the particle’s position, i.e., its thermal wavelength. A number of metrics have previously been used to investigate and characterize this spread and explain effects arising from quantum delocalization, zero-point energy, and tunneling. Many of these shape metrics consider just the instantaneous structure of the ring polymers. However, given the significant interest in methods such as centroid molecular dynamics and ring polymer molecular dynamics that link the molecular dynamics of these ring polymers to real time properties, there exists significant opportunity to exploit metrics that also allow for the study of the fluctuations of the atom delocalization in time. Here we consider the ring polymer delocalization from the perspective of computational topology, specifically persistent homology, which describes the 3-dimensional arrangement of point cloud data, (i.e. atomic positions). We employ the Betti sequence probability distribution to define the ensemble of shapes adopted by the ring polymer. The Wasserstein distances of Betti sequences adjacent in time are used to characterize fluctuations in shape, where the Fourier transform and associated principal components provides added information differentiating atoms with different NQEs based on their dynamic properties. We demonstrate this methodology on two representative systems, a glassy system consisting of two atom types with dramatically different de Broglie thermal wavelengths, and ab initio molecular dynamics simulation of an aqueous 4 M HCl solution where the H-atoms are differentiated based on their participation in proton transfer reactions.
Postoperative Long-Term Independence Among the Elderly With Meningiomas: Function Evolution, Determinant Identification, and Prediction Model Development
Authors: Li Haoyi , Huang Huawei , Zhang Xiaokang , Wang Yonggang , Ren Xiaohui , Cui Yong , Sui Dali , Lin Song , Jiang Zhongli , Zhang Guobin 
Published: March 2021

BackgroundMaintenance of postoperative long-term independence has value for older adults who undergo surgical procedures. However, independence has barely caught attention for the elderly with meningiomas. Preventing postoperative long-term independence decline in this population necessitates the identification of the factors related to this outcome and minimizing their implications. Therefore, we assessed the independence evolution and identified potential determinants and population.Materials and MethodsFrom 2010 to 2016, elderly meningioma patients (≥65 years old) undergoing operation at Beijing Tiantan Hospital were included in our study. The primary outcome was 3-year (i.e., long-term) postoperative independence measured by Karnofsky performance scale (KPS) score. We used univariate and multivariate analyses to determine the risk factors for postoperative long-term independence, and nomogram was established.ResultsA total of 470 patients were included eligibly. The distribution in each KPS was significantly different before and 3 years after resection (P &lt; 0.001). Especially in patients with preoperative KPS 80 and 70, only 17.5 and 17.3% of the patients kept the same KPS after 3 years, and the remaining patients experienced significant polarization. The most common remaining symptom cluster correlated with postoperative long-term independence included fatigue (R = −0.795), memory impairment (R = −0.512), motor dysfunction (R = −0.636) and communication deficits (R = −0.501). Independent risk factors for postoperative long-term non-independence included: advanced age (70–74 vs. 65–69 OR: 2.631; 95% CI: 1.545–4.481 and ≥75 vs. 65–69 OR: 3.833; 95% CI: 1.667–8.812), recurrent meningioma (OR: 7.791; 95% CI: 3.202–18.954), location in the skull base (OR: 2.683; 95% CI: 1.383–5.205), tumor maximal diameter &gt;6 cm (OR: 3.089; 95% CI: 1.471–6.488), nerves involved (OR: 3.144; 95% CI: 1.585–6.235), high risk of WHO grade and biological behavior (OR: 2.294; 95% CI: 1.193–4.408), recurrence during follow-up (OR: 10.296; 95% CI: 3.253–32.585), lower preoperative KPS (OR: 0.964; 95% CI: 0.938–0.991) and decreased KPS on discharge (OR: 0.967; 95% CI: 0.951–0.984) (P &lt; 0.05). The discrimination and calibration of the nomogram revealed good predictive ability (C-index: 0.810).ConclusionElderly meningioma patients might present significant polarization trend in maintaining long-term independence after surgery. Our findings will be helpful for guiding surgical management for the elderly with meningioma and provide proposals for early functional rehabilitation.
Benign Endobronchial Tumors: A Clinicopathologic Review
Authors: Insler Joshua E. , Seder Christopher W. , Furlan Karina , Mir Fatima , Reddy Vijaya B. , Gattuso Paolo 
Published: March 2021

Purpose: Benign endobronchial tumors are rare entities that can be difficult to diagnose because they often present with non-specific symptoms and vague radiographic findings. The current study reviews the clinical, radiologic and pathologic features, diagnosis, and treatment of patients with benign endobronchial tumors.Methods: We examined the charts of all patients who presented with biopsy-proven benign endobronchial tumors at a tertiary-care academic medical center between 1993 and 2018. Pertinent clinicopathologic and radiologic data were analyzed, with particular attention paid to treatment modalities and mean overall patient survival.Results: A total of 28 cases were identified. The most common benign neoplasm was hamartoma (37%), followed by lipoma (19%), squamous papilloma (11%), pleomorphic adenoma (7%), mucin gland adenoma (7%), papillary adenoma (3%), hemangioma (3%), neurofibroma (3%), leiomyoma (3%), and papillomatosis (3%). Cough (58%), shortness of breath (44%), and hemoptysis (15%) were the most frequent presentations. Most cases demonstrated well-defined submucosal or pedunculated endobronchial lesions with segmental pneumonia or atelectasis on imaging. Histologic diagnosis was obtained by endobronchial resection in 43% of patients, thoracoscopic lobectomy in 36%, endobronchial biopsy in 18%, and thoracoscopic wedge resections in 3%. All procedures were performed with no intraoperative or in-hospital deaths (mean overall survival: 20.2 years).Conclusion: Benign endobronchial tumors typically present as well-defined submucosal and/or pedunculated lesions, and may lead to post-obstructive complications. Endobronchial resection is the preferred strategy for diagnosis and treatment of these tumors.
Hukum Badan Usaha yang Dapat Didirikan oleh Yayasan untuk Mewujudkan Kemudahan Iklim Berusaha di Indonesia
Authors: Kasiani . 
Published: March 2021

Sebagai subyek hukum natural person, Undang-Undang Yayasan mengatur bahwa Yayasan dapat menjalankan kegiatan usaha sebagai sarana untuk menunjang Yayasan dalam menjalankan maksud dan tujuannya, namun undang-undang tidak menjelaskan bentuk badan usaha apa yang dapat dijalankan oleh Yayasan, fakta di masyarakat suatu Yayasan mendirikan kegiatan usaha seperti kegiatan di bidang perternakan, perkebunan, pertokoan yang mana bentuk kegiatan tersebut layaknya kegiatan usaha perorangan, dengan menggunakan nama para organ Yayasan. Permasalahan dalam penelitian ini yaitu bentuk badan usaha apa yang dapat didirikan dan atau diikuti oleh Yayasan sebagai investor, serta bagaimana legalitas kepemilikan kegiatan usaha Yayasan yang didirikan atas nama organ Yayasan. Melalui penelitian normatif disimpulkan bahwa Pertama, bentuk badan usaha yang dapat didirikan dan atau diikuti oleh yayasan pada pekerkembangan pengaturan yang ada adalah berbentuk perseroan terbatas (PT), Koperasi dan bentuk-bentuk lain yang telah diatur dalam Undang-Undang yang dengan tegas menyatakan bahwa Yayasan merupakan badan penyelenggara dari kegiatan tersebut. Kedua, Yayasan tidak memiliki legalitas sebagai pemilik badan usaha dan legalitas kepemilikan ada pada nama organ Yayasan secara pribadi, sesuai nama yang tercantum di dalam akta pendirian badan usaha. Artinya meskipun kekayaan yang digunakan badan usaha seluruhnya adalah berasal dari kekayaan Yayasan, namun secara yuridis Yayasan tidak memiliki alas hukum bahwa badan usaha tersebut adalah milik Yayasan.
SISTEM PENJADWALAN PRAKTIKUM MENGGUNAKAN ALGORITMA GENETIKA (Studi Kasus : Teknik Informatika S-1 ITN Malang)
Authors: Haifan Azrul , Agus Pranoto Yosep , Vendyansyah Nurlaily 
Published: March 2021

Proses pembuatan jadwal praktikum pada Laboratorium Teknik Informatika ITN Malang saat ini masih dilakukan secara manual dan masih menghasilkan cukup banyak kesalahan. Kesalahan yang ada pada jadwal praktikum saat ini adalah, adanya jadwal praktikum mahasiswa yang bentrok dengan jadwal kuliah, alokasi waktu praktikum yang menempati ruang yang sama pada waktu yang bersamaan, dan adanya mahasiswa yang ditempatkan pada ruang yang berbeda disatu waktu. Proses pembuatan jadwal dilakukan dengan cara mencocokan secara manual data parsial yang ada, diantaranya adalah pencocokan data jadwal kuliah mahasiswa dengan data ketersediaan ruang dan data mata kuliah praktikum
Permasalahan-permasalahan yang telah dipaparkan, dalam bidang Teknologi Informatika dapat diselesaikan menggunakan teori penjadwalan. Dengan menggunakan algoritma genetika, peneliti bermaksut untuk menciptakan sistem penjadwalan praktikum yang dapat meminimalisir kesalahan dengan cara mengolah data jadwal matakuliah, matakuliah praktikum, praktikan, dan data ruangan. Algoritma genetika diharapkan mampu menghasilkan penjadwalan dengan menghindari kesalahan sebanyak mungkin serta memangkas waktu pembuatan jadwal, sehingga jadwal praktikum yang terbentuk bisa menjadi lebih baik.
Setelah dilakukan pengujian dengan data yang didapatkan dari Prodi Teknik Informatika S-1 ITN Malang periode Semester Ganjil Tahun Akademik 2019/2020 didapatkan hasil rata-rata bahwa sistem yang dibangun mampu menghasilkan penjadwalan praktikum dengan error sebesar 2.26 % dalam waktu 15.5 detik.
IMPLEMENTASI METODE FUZZY TIME SERIES UNTUK PREDIKSI PENJUALAN BOX MOTOR BERBASIS WEB (STUDI KASUS : TOKO SIPIT BOX MALANG)
Authors: Saputra Dwi Adi , Agus Pranoto Yosep , Santi Wahyuni Febriana 
Published: March 2021

Toko Sipit Box Malang merupakan toko yang menjual bermacam-macam asesoris dan variasi motor. Toko Sipit Box malang menyediakan box motor mulai dari box atas dan box samping, selain itu juga menyediakan braket box untuk pemasangan di berbagai jenis motor. Pada proses pendataan data penjualan toko sipit box malang masih menggunakan cara lama yaitu dengan memasukkannya ke dalam buku nota. Karena pada toko belum ada sistem yang membantu untuk memprediksi penjualan maka pemilik toko kesulitan untuk menentukan stok barang yang akan disediakan.
Pada penelitian yang dikembangkan ini peneliti menggunakan metode fuzzy time series untuk melakukan.prediksi penjualan box motor menggunakan data histori penjualan toko Sipit Box Malang. Proses yang dilakukan dalam penelitian ini adalah yang pertama mengambil data historis penjualan box motor mulai dari januari 2016 – oktober 2019, kemudian mencari jumlah interval dan Panjang interval didapat hasil 16 jumlah interval dan 1 panjang interval. Kemudian melakukan proses fuzzifikasi pada data histori. Lalu menentukan fuzzy logical relationship dan menentukan fuzzy logical relationship grup. Langkah terakhir adalah melakukan proses prediksi atau defuzzifikasi menggunakan fuzzy logical relationship grup sebagai acuan.
Hasil pengujian yang dilakukan oleh peneliti dengan menerapkan metode fuzzy time series pada sistem yang dibuat menghasilkan prediksi untuk bulan September 2019 sebanyak 13 pcs. Pada pengujian manual didapatkan hasil prediksi untuk bulan September 2019 sebanyak 12 pcs. Kemudian nilai error Dari hasil perhitungan sistem dengan hasil manual didapatkan tingkat kesalahan sebesar 7,88% untuk prediksi penjualan box motor tipe GIVI E20.
SISTEM INFORMASI GEOGRAFIS DAERAH PERIKANAN DAN PETERNAKAN KABUPATEN PASURUAN
Authors: Saputra Sugiarto Tedi Andika , Zahro’ Hani Zulfia , Agus Pranoto Yosep 
Published: March 2021

Informasi data komoditas sekarang ini masih disajikan dalam bentuk laporan statistik setiap tahunnya di setiap-setiap Kecamatan. Dalam penelitian ini pada wilayah Kabupaten Pasuruan. Untuk saat ini Dinas perikanan dan peternakan Kabupaten Pasuruan masih mengalami kesulitan memantau perikanan dan peternakan di Kabupaten Pasuruan karena luasnya wilayah dan belum ada sistem yang dapat membantu pendataan hasil panen perikanan dan peternakan.
Sistem yang dibangun yaitu sebuah sistem informasi geografis perikanan dan peternakan Kabupaten Pasuruan peta pada sistem ini dibuat menggunakan ArcGis 10.3 dan menggunakan Qgis dalam hal ini dengan adanya teknologi informasi ini langkah kedepannya akan lebih mempermudah untuk melihat informasi daerah perikanan dan peternakan yang sudah ada maupun yang belum ada di kecamatan tersebut.
Hasil pengujian dari penelitian yang telah dibangun yaitu Sistem Informasi Geografis Daerah Perikanan Dan Peternakan Kabupaten Pasuruan berbasis website menyatakan bahwa hasil dari program yang telah dibuat memiliki hasil yang sesuai, hal itu dibuktikan dari hasil pengujian black-box yaitu pengujian terhadap cara kerja program dan pengujian fungsional sistem dengan akses sebagai admin, user sesuai dengan fungsinya pada browser. Pada tahap pengujian aplikasi website menggunakan beberapa browser yaitu Google Chrome, Mozila Firefox dan Microsoft Edge Semua fungsi dari sistem berjalan sesuai dengan yang di inginkan.
APLIKASI VISUAL DNA MANUSIA MENGGUNAKAN AUGMENTED REALITY SEBAGAI SARANA MEDIA PEMBELAJARAN
Authors: Adiatma Lalu Heru , Agus Pranoto Yosep , Wahid Abdul 
Published: March 2021

DNA (Deoxyribose Nucleic Acid) adalah molekul dalm tubuh manusia dalam mencari informasi hubungan antara barang bukti medis dengan pelaku, ilmu pengetahuan ini berkembang pesat digunakan sesudah tahun 90 an. Memanfaatkan sampel DNA memiliki nilai lebih dalam identifikasi sebuah kasus.
Dengan menghadapi kemjuan teknologi, belajar atau mengenal struktur DNA manusia tidaklah sulit.Bagi yang masih asing mengetahui tentang bentuk struktur DNA manusia denagn aplikasi edukasi interaktif berbasis android. Dimana aplikasi tersebut akan mempermudah kita belajar mengenai bentuk struktur DNA manusia yang diterapkan menggunakan teknologi Augmented Reality.
Oleh karena itu penulis bermaksud membuat aplikasi visual DNA Manusia menggunakan Augmented Reality adalah sebagai sarana belajar dan salah satu cara untuk mengenal bentuk struktur DNA manusia secara efisien dan efektif. Tapi perlu di ketahui bahwa belajar yang baik adalah dengan mendatangi sumber ilmu itu sendiri secara langsung.
SISTEM PAKAR DIAGNOSIS PENYAKIT BUAH ANGGUR MENGGUNAKAN METODE DEMPSTER SHAFER BERBASIS WEB
Authors: Amin Muhammad Yusuf , Mahmudi Ali , Vendyansyah Nurlaily 
Published: March 2021

Salah satu penyebab rendahnya produksi dan kualitas buah anggur di Desa Sumberbendo, Kecamatan Sumberasih, Kabupaten Probolinggo adalah adanya serangan hama penyakit yang menyerang mulai dari tanaman sampai buahnya sendiri. Untuk meningkatkan produksi hasil tanaman anggur akibat adanya serangan hama penyakit tanaman, perlu dilakukan langkah-Iangkah yang terkoordinasi di lapangan, khususnya dalam mengantisipasi muncul dan berkembangnya hama penyakit, sesuai rakitan teknologi budidaya anggur yang dianjurkan. Untuk membantu para petani dalam pengelolaan tanaman anggur dalam mendiagnosa penyakit akibat serangan hama, dikembangkan perangkat lunak yang dapat diakses melalui web. Aplikasi yang dikembangkan dalam penelitian ini berbasis pada sistem pakar, dimana segala macam penyakit yang lazim pada tanaman anggur akibat serangan hama dapat didiagnosis dan memberi solusi penanganan layaknya seorang pakar. Sistem pakar pada penelitian kali ini menggunakan metode Dempster shafer. Data yang digunakan pada penelitain kali ini berupa data gejala, data penyakit, dan data solusi pengendalian yang didapatkan dari Balai Tanaman Jeruk dan Subtropika Kota Batu, dan divalidasi oleh pakar ahli dalam bidang tanaman pada instansi tersebut.