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Circulation of hepatitis delta virus and occult hepatitis B virus infection amongst HIV/HBV co-infected patients in Korle-Bu, Ghana
Authors: Attiku Keren , Bonney Joseph , Agbosu Esinam , Bonney Evelyn , Puplampu Peter , Ganu Vincent , Odoom John , Aboagye James , Mensah John , Agyemang Seth , Awuku-Larbi Yaw , Arjarquah Augustina , Mawuli Gifty , Quaye Osbourne 
Published: January 2021

Background
Within HIV/HBV infected patients, an increase in HDV infection has been observed; there is inadequate information on HDV prevalence as well as virologic profile in Ghana. This study sought to determine the presence of HDV in HIV/HBV co-infected patients in Ghana.

Methods
This was a longitudinal purposive study which enrolled 113 HIV/HBV co-infected patients attending clinic at Korle-Bu Teaching Hospital (KBTH) in Accra, Ghana. After consenting, 5 mL whole blood was collected at two-time points (baseline and 4–6 months afterwards). The sera obtained were tested to confirm the presence of HIV, HBV antibodies and/or antigens, and HBV DNA. Antibodies and viral RNA were also determined for HDV. Amplified HBV DNA and HDV RNA were sequenced and phylogenetic analysis carried out with reference sequences from the GenBank to establish the genotypes.

Results
Of the 113 samples tested 63 (55.7%) were females and 50 (44.25%) were males with a median age of 45 years. A total of 100 (88.5%) samples had detectable HBV surface antigen (HBsAg), and 32 out of the 113 had detectable HBV DNA. Nucleotide sequences were obtained for 15 and 2 samples of HBV and HDV, respectively. Phylogenetic analysis was predominantly genotype E for the HBVs and genotype 1 for the HDVs. Of the 13 samples that were HBsAg unreactive, 4 (30.8%) had detectable HBV DNA suggesting the incidence of occult HBV infections. The percentage occurrence of HDV in this study was observed to be 3.54.

Conclusion
Our data suggest the presence and circulation of HDV and incidence of occult HBV infection in HIV/HBV co-infected patients in Ghana. This informs health staff and makes it imperative to look out for the presence of HDV and occult HBV in HIV/HBV co-infected patients presenting with potential risk of liver cancers and HBV transmission through haemodialysis and blood transfusions.
First approach to the population structure of Mycobacterium tuberculosis complex in the indigenous population in Puerto Nariño-Amazonas, Colombia
Authors: Marín Alejandro Vega , Rastogi Nalin , Couvin David , Mape Viviana , Murcia Martha Isabel 
Published: January 2021

Introduction
Tuberculosis affects vulnerable groups to a greater degree, indigenous population among them.

Objective
To determine molecular epidemiology of clinical isolates of Mycobacterium tuberculosis circulating in an indigenous population through Spoligotyping and 24-loci MIRU-VNTR.

Methodology
A descriptive cross-sectional study was conducted in 23 indigenous communities of Puerto Nariño-Amazonas, Colombia. Recovered clinical isolates were genotyped. For genotyping analyzes global SITVIT2 database and the MIRU-VNTRplus web portal were used.

Results
74 clinical isolates were recovered. Genotyping of clinical isolates by spoligotyping determined 5 different genotypes, all of them belonged to Euro-American lineage. By MIRU-VNTR typing, a total of 14 different genotypes were recorded. Furthermore, polyclonal infection was found in two patients from the same community. The combination of the two methodologies determined the presence of 19 genotypes, 8 formed clusters with 63 clinical isolates in total. Based on epidemiological information, it was possible to establish a potential chain of active transmission in 10/63 (15.9%) patients.

Conclusions
High genomic homogeneity was determined in the indigenous population suggesting possible chains of active transmission. The results obtained showed that specific genotypes circulating among the indigenous population of Colombia are significantly different from those found in the general population.
Histologic factors associated with nintedanib efficacy in patients with idiopathic pulmonary fibrosis
Authors: Nemoto Masahiro , Zaizen Yoshiaki , Kataoka Kensuke , Kuroda Kishio , Tabata Kazuhiro , Bychkov Andrey , Sumikawa Hiromitsu , Johkoh Takeshi , Aoshima Masahiro , Kondoh Yasuhiro , Fukuoka Junya 
Published: January 2021

Background
Histopathologic factors predictive of nintedanib efficacy in idiopathic pulmonary fibrosis have not been studied. We aimed to describe the characteristics, focusing on histopathology, of idiopathic pulmonary fibrosis patients who did and did not respond to nintedanib.

Methods
This study retrospectively examined the clinicoradiopathologic features of 40 consecutive patients with surgical lung biopsy-confirmed idiopathic pulmonary fibrosis treated with nintedanib. Additionally, we compared the histopathologic scoring of 21 microscopic features between patients with functional or radiological progression and those with non-progression during 12 months of treatment.

Results
The histopathologic evaluation showed edematous changes in the interlobular septum as the only histologic finding observed more frequently in patients with both functional and radiological progression than in those without (58% vs. 14%, P = 0.007 and 50% vs. 0%, P = 0.003, respectively). Regarding per-year change, patients with edematous changes in the interlobular septum showed greater progression in median changes in spared area (-12%, interquartile range: [-25%–-5%], vs. -3% [-7%–0%], P = 0.004) and reticular shadow (7% [3%–13%], vs. 0% [0%–5%], P = 0.041) on computed tomography. Functional and radiological progression-free survival were shorter in patients with edematous changes in the interlobular septum than in those without (6.6 months, 95% confidence interval: [5.9–25.3], vs. event <50%, [12.1–Not available], P = 0.0009, and 6.1 months, [5.2–6.6] vs. 14.5 months [7.8–not available], P<0.0001).

Conclusions
Edematous changes in the interlobular septum may indicate poor nintedanib efficacy in idiopathic pulmonary fibrosis. Further studies are needed to validate these findings and address the mechanism behind ECIS.
Enhancement Of Yield, Starch, And Amylose Content Of Two Indonesian Cassava Genotypes By Producing Gamma Irradiated-Induced Mutants
Authors: Sudarmonowati Enny , Hartati N Sri , Supatmi Supatmi 
Published: January 2021

As an important carbohydrate-source food crop and raw materials of starch-based industries, accelerated cassava breeding has been extensively pursued through various procedures, among others, is mutant induction using gamma irradiation combined with molecular marker. Iding, a local genotype cassava has been compared with a national variety Adira 4 for its yield attributes following gamma irradiation at various dose levels ( 2, 20, 30, and 50 krad). The mutation rate was conducted based on morphological characteristics and identification using RAPD by employing random primer OPB-10. Evaluation was conducted on mutant lines producing high potential yield, high starch and amylose contents. The fourth generation of irradiated Adira 4 (2 and 30 krad) and Iding (2 krad) exhibited higher yield and amylose content as compared to their representative controls. The yield of 30 krad irradiated Adira 4 indicated by mean tuber weight per individual could reach more than twice of that of control and almost 1.5 times of that irradiated with 2 krad. The levels of amylose content of all irradiated ones, regardless of genotypes and gamma irradiation doses (2 and 30 krad) were higher than that of control. In most parameters, irradiated Adira 4 was superior to irradiated Iding.
Poblaciones de fitonematodos asociados al vigor de plantas de plátano
Authors: González-García Hebandreyna , González-Pedraza Ana F. , Pineda-Zambrano Maryori , Casanova-Yepez Mery , Rodríguez-Yzquierdo Gustavo , Soto-Bracho Aníbal 
Published: January 2021

Introducción. La fracción biótica del suelo es el componente esencial en los procesos ecológicos y pueden ejercer influencia en la productividad agrícola de los cultivos. Objetivo. Identificar la población de fitonematodos asociados al vigor de las plantas de plátano en la zona de sur del lago de Maracaibo, Venezuela. Materiales y métodos. Se seleccionaron ocho lotes de plantas de plátano (Musa AAB cv. Hartón) de 2 ha, ubicados en el sur del lago de Maracaibo, los cuales se dividieron en dos áreas o lotes de 1 ha, durante octubre y diciembre del año 2018. La designación de los lotes por vigor (AV= alto vigor y BV= bajo vigor) se realizó con base en los parámetros del número de manos por racimo, circunferencia de la planta madre y altura del hijo de sucesión, en veinte plantas próximas a la cosecha, por cada uno. La muestra de suelo se recolectó a 15 cm de profundidad en tres plantas recién florecidas por lote y para las raíces se realizó una microcalicata por planta hasta 30 cm de profundidad. Para la extracción nematológica en suelo se empleó el método de levigación de oostenbrink con embudo de Baermann y en raíz el método de licuado. Posteriormente, se cuantificó por género los especímenes encontrados. Resultados. Se encontró una población en el suelo (14 140 individuos) más significativa (p<0,05) que en la raíz (2670 individuos). Al comparar la población total por vigor no se observó diferencia estadística entre AV (395) y BV (305). Se determinaron doce géneros taxonómicos en las muestras de raíz y en suelo. Los especímenes más predominantes en AV fueron Helicotylenchus multicinctus y Radopholus similis y en los lotes BV fue Pratylenchus sp. Conclusión. Se observó una alta diversidad de la nematofauna presente tanto en los suelos como en raíces del cultivo.
Fertilización con nitrógeno y potasio en maíz en un Alfisol de Guanacaste, Costa Rica
Authors: Garbanzo-León Gabriel , Alvarado-Hernández Alfredo , Vargas-Rojas Jorge Claudio , Cabalceta-Aguilar Gilberto , Vega-Villalobos Edgar V. 
Published: January 2021

Introducción. En Guanacaste, Costa Rica, el maíz (Zea mays) es un cultivo de consumo cultural desde épocas precolombinas, muchos agricultores destinan zonas para su siembra en asocio con otros cultivos. Sin embargo, las variedades utilizadas requieren estudios de fertilización y nutrición para mejorar la calidad de las mazorcas y vida postcosecha. Objetivo. Evaluar en la variedad de maíz J-Sáenz, el efecto de dosis crecientes de nitrógeno y potasio, en combinación con tres densidades de siembra. Materiales y métodos. El estudio se realizó en la Finca Experimental de Santa Cruz, Universidad de Costa Rica, en 2018. Se evaluaron tres dosis de N (100, 200, 300 kg ha-1 con una base de 160 kg ha-1 de K2O) y K2O (100, 160 y 200 kg ha-1 con una base de 300 kg N ha-1) con tres densidades de siembra (50 000, 57 143 y 66 667 plantas ha-1) con la variedad J-Sáenz. Se evaluó el rendimiento del cultivo, el porcentaje de mazorca expuesta y la acumulación de nutrimentos en estado fenológico R5. Los datos se sometieron a análisis de varianza con estructura factorial y modelos lineales generalizados con pruebas de separación de medias DGC. Resultados. Hubo incremento significativo en la producción de grano al aumentar la densidad de siembra de 50 000 a 66 667 plantas ha-1. La mayor eficiencia en el uso de N y K se logró con la aplicación de 100 kg de cada elemento a la densidad de 57 000 plantas ha-1. La variable mazorca expuesta no se relacionó con las dosis de nutrimentos. El maíz aumentó la absorción con el incremento de las dosis de N pero no de K. Conclusión. La densidad de siembra de 57 143 plantas ha-1 mostró el mejor rendimiento a dosis de 100 kg de N ha-1 y 100 kg de K2O ha-1.
Sensibilidad de Phytophthora infestans a extractos acuosos de Lippia origanoides y Origanum vulgare
Authors: Burbano-David Diana , Lagos-Mora Luz Estela , Álvarez-Ordoñez Sandra , Chañag-Miramag Harold Andrés 
Published: January 2021

Introducción. Phytophthora infestans (Mont.) de Bary, es considerado el agente causal de una de las enfermedades más devastadoras y limitantes de cultivos de papa (Solanum tuberosum L.) en el departamento de Nariño (Colombia). Esta enfermedad es controlada con fungicidas sistémicos, los cuales tienen un impacto negativo sobre el ambiente e incrementan los costos de producción, sin embargo, existen alternativas como los denominados fungicidas orgánicos, los cuales se basan en el uso de extractos de plantas con propiedades antifúngicas para el control del patógeno. Objetivo. Evaluar extractos acuosos de O. vulgare y L. origanoides para el control de P. infestans bajo condiciones in vitro. Materiales y métodos. La presente investigación se desarrolló en el Laboratorio de microbiología del grupo de investigación en Genética y Evolución de Organismos Tropicales (GENPAT) de la Universidad de Nariño, durante el año 2017. Se evaluó la sensibilidad in vitro de P. infestans frente a extractos de las especies botánicas Lippia origanoides (orégano silvestre) y Origanum vulgare (orégano común). Resultados. Los datos obtenidos permitieron el establecimiento de la línea base de comportamiento de las poblaciones del patógeno frente a los compuestos evaluados, hubo una reducción gradual tanto en el crecimiento como en la esporulación cuando se empleó el extracto de Lippia origanoides y que este mismo tiene la capacidad de controlar el patógeno en concentraciones de 100 mg ml-1. Con el empleo de Origanum vulgare los aislamientos de P. infestans presentaron diferentes niveles de sensibilidad al compuesto con bajos niveles de inhibición y altos valores de EC-50. Conclusión. Los aislamientos de P. infestans presentaron diferentes niveles de sensibilidad frente a los dos extractos acuosos evaluados, con una reducción del 100 % en la inhibición del crecimiento radial y la esporulación a partir de la concentración de 100 mg ml-1, cuando se empleó el extracto de L. origanoides.
Selección temprana en ensayos clonales de melina (Gmelina arborea Robx.) en Costa Rica
Authors: Hernández-Castro William , Murillo-Gamboa Olman , Badilla-Valverde Yorleny 
Published: January 2021

Introducción. La edad de selección temprana permite acelerar los programas de mejoramiento genético y optimizar la producción forestal, en este caso con melina (Gmelina arborea), la cual es la segunda especie forestal más importante para la reforestación comercial en Costa Rica. Objetivo. Determinar la edad óptima de selección de melina en Costa Rica, mediante la evaluación de cuatro caracteres genéticos. Materiales y métodos. El estudio se llevó a cabo en Siquirres y Pérez Zeledón, región Caribe y zona sur de Costa Rica, respectivamente. Se utilizó un diseño de bloques completos al azar con cuatro repeticiones (sitios 1 y 3) y seis repeticiones (sitio 2) por tratamiento. El distanciamiento inicial fue de 4 m x 3 m para el ensayo del El Porvenir y de 4 m x 4 m para los ensayos de Siquirres y La Ceniza. Se calcularon parámetros genéticos a diferentes edades, para las variables diámetro a la altura del pecho (DAP), altura comercial, volumen comercial y calidad del fuste, con el software SELEGEN, el cual se basa en el método REML/BLUP, además, se realizaron correlaciones genéticas entre las variables evaluadas. Resultados. El DAP y el volumen comercial fueron los caracteres con mayor control genético, presentaron los mayores valores promedio de heredabilidad individual y media clonal, entre los 2,8 y 4 años de edad. Las mayores correlaciones genéticas (>80 %), entre las variables DAP y volumen comercial, se presentaron a partir de los 2,8 años de edad, que aumentan en edades posteriores hasta alcanzar valores mayores a 90 %. Conclusión. Pudo determinarse el rango entre los 2,8 y 4 años, como posible edad de selección genética para melina.
Caracterización multivariada de la eficiencia productivo-reproductiva y edad al primer parto en vacas Holstein
Authors: Marini Pablo Roberto , Biga Pablo , Di-Masso Ricardo 
Published: January 2021

Introducción. La evaluación de la eficiencia productiva debe estar acompañada por indicadores integrales para valorar el comportamiento de las vacas lecheras en los sistemas de pastoreo. Objetivo. Identificar en un rodeo de vacas lecheras Holstein agrupadas por su edad al primer parto, las de mayor eficiencia en sistemas de pastoreo, con base en una caracterización multivariada en indicadores productivos y reproductivos. Materiales y métodos. Se utilizaron datos retrospectivos de 1785 vacas primíparas de raza Holstein entre los años 1999-2016, en dos establecimientos comerciales pertenecientes a la empresa Los Ángeles - Argentina, las que se dividieron en tres grupos por su edad al primer parto: Grupo 1 - 750 días, Grupo 2 - 840 días y Grupo 3 - 1098 días. Las variables vida productiva total, producción total de leche, índice de leche e intervalo entre partos promedio se utilizaron asociadas a la edad al primer parto mediante la técnica multivariada de componentes principales. Resultados. No se observaron agrupamientos asociados al grupo de edad al primer parto. Los dos primeros componentes principales explicaron el 92,9 % de la variancia total observada. Se pudo definir cuatro cuadrantes representando todas las combinaciones entre los valores positivos y negativos. La distribución de las vacas de los tres grupos en los cuatro cuadrantes resultó homogénea (x2=6,291; p=0,391). La distribución por cuadrante, independientemente del Grupo de edad al primer parto fue de: Cuadrante I (52/150, 34,7 %), Cuadrante II (42/150; 28,0 %), Cuadrante III (28/150; 18,7 %) y Cuadrante IV (28/150; 18,7 %). Conclusión. Las vacas ubicadas en el Cuadrante II (valores negativos de la CP1 y positivos de la CP2), fueron las eficientes al sistema de pastoreo, mostraron mayor longevidad con niveles productivos compatibles con las limitaciones del sistema y un eficiente comportamiento reproductivo.
Lecciones aprendidas de la implementación de un Sistema de Información Gerencial diseñado en la Universidad de Otavalo, Ecuador
Authors: Becerra Lois Francisco Angel , Del Río César A. , Narváez Cristain 
Published: January 2021

The purpose of this paper is to analyze the essential features of a Management Information System (MIS), designed and implemented at the Universidad de Otavalo to support strategic planning, institutional evaluation, and decision making. A five-phase and fifteen-stage process was applied, along with their corresponding techniques and expected results. Based on the literature review and their experience with the implementation, the authors devised a novel MIS implementation approach, comprising the following phases: planning, information analysis, MIS design, implementation and evaluation. The MIS consisted of four main modules: teaching, research, linkages with society, and management, and was based on the client-server model. The literature review did not yield any publications that discussed truly integrated management information systems applied to university management covering the four main modules, thus confirming the originality of the work described in this paper. The MIS implementation results contributed to the improvement of the management of the university through the automation of most of the processes and activities related to institutional planning and evaluation, and considerably accelerated the processing and analysis of useful information for decision making.
DEPENDENCE OF THE COSMIC MUON FLUX ON ATMOSPHERIC PRESSURE AND TEMPERATURE
Authors: DIEP PHAM NGOC , NHUNG PHAM THI TUYET , DINH PHAM NGOC , DUONG NGUYEN HAI , DARRIULAT PIERRE , THAO NGUYEN THI , THIEU DANG QUANG , THUAN VO VAN 
Published: January 2021

The dependence upon atmospheric pressure of the cosmic muon flux in Hanoi
has been measured to be -1.47± 0.50 permil per mbar in agreement with expectation from a
naive estimate. The dependence over ground temperature is observed to largely reflect the
correlation existing between temperature and pressure. Once the effect of this correlation is
removed a smaller, barely significant temperature dependence of -0.57± 0.34 permil per °C
subsists.
Repensar la conservación. Naturaleza, mercado y sociedad civil
Authors: González-Puente Marc 
Published: January 2021

Ressenya del llibre: Cortés Vázquez, José A.; Beltran, Oriol (coord.) (2019) Repensar la conservación. Naturaleza, mercado y sociedad civil. Barcelona: Edicions de la Universitat de Barcelona.
Notes de recerca
Authors: Zafra Aparici Eva , Masana Lina , Vidal Fernando , Roca Escoda Mireia , Martínez-Hernáez Angel , Pié-Balaguerc Asun , Serrano-Miguel Mercedes , Bekele Deborah , Alegre-Agís Elisa , Morales Sáez Nicolás , Cela Bertran Xavi , García-Santesmases Andrea , Correa-Urquiza Martín 
Published: January 2021

Consecuencias del feminicidio en violencia machista: análisis de necesidades de hijos, hijas y familiares para nuevas propuestas de intervención integral en CataluñaAntropologia i fenomenologia de la síndrome del captiveri (Locked-in Syndrome)El cuidado importa. Impacto de género en las cuidadoras/es de mayores y dependientes en tiempos de la Covid-19La gestió col·laborativa de la medicació: cap a una nova cultura assistencial en salut mentalSYNCHROS: SYNergies for Cohorts in Health Integrating the ROle of Stakeholders
Minimally invasive video-assisted sphincter-sparing treatment of complex rectal fistulas using the VAAFT technique
Authors: Atroschenko A. O. , Pozdnyakov S. V. , Teterin A. V. 
Published: January 2021

Background. Video-assisted anal fistula treatment (VAAFT) is a new minimally invasive sphincter-sparing technology.Objective: to describe technical characteristics of VAAFT and evaluate short-term outcomes.Materials and methods. We used a specialized surgical video system (VAAFT®; Karl Storz) for the treatment of complex high rectal fistulas. This technology allows a surgeon to use a special fistuloscope to perform visual examination of the fistula, find its internal opening, and detect secondary fistula passages and inflows. In addition to visual inspection, it is possible to simultaneously conduct a cytological brush through the working channel of the endoscope in order to clear the fistula from detritus and desquamate lining mucosa, and then perform fistula ablation using a monopolar electrode. The internal opening of the fistula can be either closed by a flap or sutured using a linear stapling device or closed using an endoscopic clip with additional sealing of the suture line with biological glue.Results. Between September 2017 and August 2019, a total of 112 patients underwent VAAFT® surgeries. Ninety-three patients (83 %) were followed up for 6 months postoperatively. We observed no significant complications during the follow-up period. The majority of study participants (85 %) did not experience severe pain (>2–4 points on a visual-analog scale) in the early postoperative period. Primary healing was achieved in 98 patients (87.5 %) within 2–3 months. Eighty-nine individuals (79.5 %) were followed up for more than 1 year. Rectal fistula healing within 1 year after VAAFT® surgery was observed in 82 % of patients.Conclusions. The main advantage of the VAAFT® technique is the combination of the diagnostic stage for fistula visualization and identification of the internal opening with the possibility of simultaneous surgical treatment.