bluuebunny/crossref_metadata_2025_split huggingface dataset:
High-dose IL-2/CD25 fusion protein amplifies vaccine-induced CD4+and CD8+neoantigen-specific T cells to promote antitumor immunity
Authors: Hernandez Rosmely , LaPorte Kathryn M , Hsiung Sunnie , Santos Savio Alicia , Malek Thomas R 
Published: September 2021

BackgroundImmunization with tumor neoantigens is a promising vaccine approach to promote antitumor immunity due to their high immunogenicity, lack of expression in normal tissue, and preferential induction of tumor neoantigen-specific T cells, which are central mediators of the anti-cancer response. A drawback to targeting tumor neoantigen-specific T cells is that these cells are found at a low frequency in patients with cancer, limiting their therapeutic benefit. Interleukin-2 (IL-2) promotes expansion and persistence of tumor-reactive T cells. However, its clinical use has been hampered by toxicities arising from its multiple cellular targets. Thus, new engineered IL-2 receptor (IL-2R) agonists with distinctive cell type selectivity have been designed to harness the potential of IL-2 for tumor immunotherapy.MethodsWe investigated the potential to amplify neoantigen-specific CD4+and CD8+T cell immune responses to promote antitumor immunity through vaccination with tumor neoantigens. Following T cell receptor (TCR)-mediated induction of the high-affinity IL-2R on these T cells, amplification of the neoantigen-specific T cell response was achieved using a high dose of the mouse IL-2/CD25 (mIL-2/CD25) fusion protein, an IL-2R agonist with more favorable pharmacokinetics and pharmacodynamics than IL-2 and selectivity toward the high-affinity IL-2R.ResultsAdministration of a high dose of mIL-2/CD25 shortly after antigen-dependent induction of the high-affinity IL-2R amplified the numbers and function of TCR transgenic tumor-reactive tyrosinase-related protein-1 (TRP-1) CD4+T cells, leading to antitumor immunity to B16-F10 melanoma. This approach was adapted to amplify endogenous polyclonal B16-F10 neoantigen-specific T cells. Maximal expansion of these cells required prime/boost neoantigen vaccinations, where mIL-2/CD25 was optimal when administered only after the boosting steps. The ensuing mIL-2/CD25-driven immune response supported antitumor immunity to B16-F10 and was more effective than treatment with a similar amount of IL-2. Optimal antitumor effects required amplification of CD4+and CD8+neoantigen-specific T cells. High-dose mIL-2/CD25 supported a tumor microenvironment with higher numbers of CD4+and CD8+T effectors cells with increased granzyme B expression and importantly a more robust expansion of neoantigen-specific T cells.ConclusionThese results indicate that neoantigen-based vaccines are optimized by potentiating IL-2R signaling in CD4+and CD8+neoantigen-reactive T cells by using high-dose mIL-2/CD25, leading to more effective tumor clearance.
Multi-centric European post-market follow-up study of the Neuroform Atlas Stent System: primary results
Authors: Lefevre Pierre-Henri , Schramm Peter , Kemmling André , Barreau Xavier , Marnat Gaultier , Piotin Michel , Berlis Ansgar , Wanke Isabel , Bonafe Alain , Houdart Emmanuel 
Published: September 2021

BackgroundFew prospective series have described the safety and effectiveness of the Neuroform Atlas Stent System. We aimed to investigate the efficacy and safety of the device in patients treated for unruptured aneurysm.MethodsATLAS EU PMCF is a consecutive, prospective, multicentric study that included patients with unruptured saccular aneurysm of all sizes. Follow-up visits were scheduled at 3–6 months and 12–16 months with digital subtraction angiography (DSA) or MRI imaging follow-up as per the site standard of care. The primary efficacy endpoint was adequate aneurysm occlusion (Raymond Roy occlusion grade I and II) on 12 month angiography. The primary safety endpoint was any major stroke or ipsilateral stroke or neurological death within 12 months.ResultsOf the 106 patients consented, 105 were treated with at least one Neuroform Atlas stent. There was a failed implantation attempt in 1 patient, 85 patients received lateral stenting, and 19 patients received Y-stenting. Mean aneurysm neck size was 4.2 mm (range 1.9–33 mm). Adequate occlusion was observed in 95.1% immediately after the procedure and in 98.9% of cases at 1 year DSA follow-up. Overall, 1.0% (1/102; 95% CI 0.0% to 5.3%) of patients experienced a primary safety endpoint of major stroke. Three minor strokes resulted in a modified Rankin Scale score of 2.ConclusionsIn this multicentric, prospective study, stent-assisted coiling of medium size unruptured aneurysms with the Neuroform Atlas stent resulted in a favorable rate of satisfactory occlusion. In our findings, the use of the Y-stenting technique was associated with increased rates of procedural complications.Clinical trial registrationhttps://clinicaltrials.gov/ct2/show/NCT02783339.
Patient and healthcare professional eHealth literacy and needs for systemic sclerosis support: a mixed methods study
Authors: Kocher Agnes , Simon Michael , Dwyer Andrew A , Blatter Catherine , Bogdanovic Jasmina , Künzler-Heule Patrizia , Villiger Peter M , Dan Diana , Distler Oliver , Walker Ulrich A , Nicca Dunja 
Published: September 2021

ObjectivesWe engaged patients with systemic sclerosis (SSc) and healthcare professionals to assess electronic health (eHealth) literacy and needs relating to web-based support using internet-based information and communication technologies (ICT).MethodsWe employed an explanatory sequential mixed methods design. First, we conducted a cross-sectional survey in patients (n=101) and professionals (n=47). Next, we conducted three focus groups with patients, family members and professionals (n=17).ResultsOf patients, 89.1% used ICT at least weekly for private communication. Patients reported relatively high comprehension of eHealth information (x¯=6.7, 95% CI: 6.2 to 7.3, range 1–10), yet were less confident evaluating information reliability (x¯=5.8, 95% CI: 5.1 to 6.4) and finding eHealth apps (x¯=4.8, 95% CI: 4.2 to 5.4). Patients and professionals reported little experience with web-based self-management support. Focus groups revealed ‘considering non-ICT-accessible groups’and ‘fitting patients’ and professionals’ technology’as crucial for acceptability. In relation to understanding/appraising eHealth, participants highlighted that general SSc information is not tailored to individual’s disease course. Recommendations included ‘providing timely, understandable and safe information’and ‘empowering end-users in ICT and health decision-making skills’. Professionals expressed concerns about lacking resources. Patients were concerned about data security and person-centredness. Key eHealth drivers included ‘addressing end-user perceptions’and ‘putting people at the centre of technology’.ConclusionsPatients and professionals need education/training to support uptake of eHealth resources. Key elements include guiding patients to timely/reliable information and using eHealth to optimise patient–provider communication. Design that is responsive to end-users’ needs and considers individuals with limited eHealth literacy and/or ICT access appears to be critical for acceptability.
Looking for Lorentz invariance violation (LIV) in the latest long baseline accelerator neutrino oscillation data
Authors: Rahaman Ushak 
Published: September 2021

AbstractIn this paper, we have analysed the latest data from NO$$\nu $$
ν
A and T2K with the Lorentz invariance violation along with the standard oscillation hypothesis. We have found that the NO$$\nu $$
ν
A data cannot distinguish between the two hypotheses at $$1\, \sigma $$

1

σ

confidence level. T2K data and the combined data analysis excludes standard oscillation at $$1\, \sigma $$

1

σ

. All three cases do not have any hierarchy sensitivity when analysed with LIV. There is a mild tension between the two experiments, when analysed with LIV, as $${\theta _{23}}$$

θ
23

at NO$$\nu $$
ν
A best-fit is at higher octant but the same for T2K is at lower octant. The present data from accelerator neutrino long baseline experiments lose octant determination sensitivity when analysed with LIV. The tension between the two experiments is also reduced when the data are analysed with LIV.
A Single-Node Classifier Implementation on Chua Oscillator within a Physical Reservoir Computing Framework
Authors: Sychou Uladzislau 
Published: September 2021

The study lies in the field of physical reservoir computing and aims to develop a classifier using Fisher Iris dataset for benchmark tasks. Single Chua chaotic oscillator acts as a physical reservoir. The study was performed using computer simulation. The features of Iris flowers are represented as the consequence of short pulses at a constant level of a control parameter, which is fed to the oscillator, changing its dynamics. During the classification of flowers, the oscillator works without being reset, so each pulse on the input changes the phase trajectory and makes it unique for each Iris flower. Finally, the estimation of the symmetry of an attractor makes it possible to connect each species of Iris with the properties of the attractor. The resulting architecture of the classifier includes a single-node externally-driven Chua oscillator with time-delayed input. The classifier shows two mistakes in classifying the dataset with 75 samples working in chaotic mode.
Investigating the Selective Control of Photoassociation of Yb2
Authors: Cheng Junxia , Tian Bo , Li Siyu , Wang Jia , Wu Shenjiang 
Published: September 2021

The selective control of photoassociation of Yb2 is investigated in theory. Based on ab initio to rationalize Franck–Condon filtering, the optimal target states of photoassociation have been obtained. The corresponding vibrational transitions from X1Σ+g to the excited state (A1Σu+, B1Πu, C1Σu+, and D1Πu) are

v

′

= 23, 50, 55, and 0, respectively. By using quantum wave packet dynamic methods, we calculated the yields with time evaluation for the selected target states. The projections of time-dependent wave functions of initial states on the target vibrational eigenstates reflected the synthetic yields of Yb2. For target A1Σu+, we used Gaussian pulse to make the yield of

v

′

= 23 up to 97% at 725 fs. After a laser pulse, the positive chirp promoted the yield of vibrational states to increase, but the negative chirp inhibited its decrease. For the D1Πu state, when laser intensity is 1.0 × 1014 W/cm2, the purity and yield of target state

v

′

= 0 reached the maximum at 1350 fs. That is to say, changing the laser parameters and pulse shapes could control the photochemical reaction along our desired direction. These conditions will provide an important reference and suggest a scheme for a feasible photoassociation of further experimental and theoretical research studies. Current study may promote an important step toward the realization of highly accurate quantum manipulation and material synthesis.
Patients with Biallelic BRCA1/2 Inactivation Respond to Olaparib Treatment Across Histologic Tumor Types
Authors: van der Wijngaart Hanneke , Hoes Louisa R. , van Berge Henegouwen J. Maxime , van der Velden Daphne L. , Zeverijn Laurien J. , Roepman Paul , van Werkhoven Erik , de Leng Wendy W.J. , Jansen Anne M.L. , Mehra Niven , Robbrecht Debbie G.J. , Labots Mariette , de Groot Derk Jan A. , Hoeben Ann , Hamberg Paul , Gelderblom Hans , Voest Emile E. , Verheul Henk M.W. 
Published: September 2021

AbstractPurpose:To assess the efficacy of olaparib, a PARP inhibitor (PARPi) in patients with tumors with BRCA1/2 mutations, regardless of histologic tumor type.Patients and Methods:Patients with treatment-refractory BRCA1/2-mutated cancer were included for treatment with off-label olaparib 300 mg twice daily until disease progression or unacceptable toxicity. In Drug Rediscovery Protocol (DRUP), patients with treatment-refractory solid malignancies receive off-label drugs based on tumor molecular profiles while whole-genome sequencing (WGS) is performed on baseline tumor biopsies. The primary endpoint was clinical benefit (CB; defined as objective response or stable disease ≥ 16 weeks according to RECIST 1.1). Per protocol patients were enrolled using a Simon-like two-stage model.Results:Twenty-four evaluable patients with nine different tumor types harboring BRCA1/2 mutations were included, 58% had CB from treatment with olaparib. CB was observed in patients with complete loss of function (LoF) of BRCA1/2, while 73% of patients with biallelic BRCA LoF had CB. In 17 patients with and seven without current labeled indication, 10 and four patients had CB, respectively. Treatment resistance in four patients with biallelic loss might be explained by an additional oncogenic driver which was discovered by WGS, including Wnt pathway activation, FGFR amplification, and CDKN2A loss, in three tumor types.Conclusions:These data indicate that using PARPis is a promising treatment strategy for patients with non–BRCA-associated histologies harboring biallelic BRCA LoF. WGS allows to accurately detect complete LoF of BRCA and homologous repair deficiency (HRD) signature as well as oncogenic drivers that may contribute to resistance, using a single assay.
Six-Month Efficacy and Toxicity Profile of BNT162b2 Vaccine in Cancer Patients with Solid Tumors
Authors: Waldhorn Ithai , Holland Roy , Goshen-Lago Tal , Shirman Yelena , Szwarcwort-Cohen Moran , Reiner-Benaim Anat , Shachor-Meyouhas Yael , Hussein Khetam , Fahoum Liana , Peer Avivit , Almog Ronit , Shaked Yuval , Halberthal Michael , Ben-Aharon Irit 
Published: September 2021

Abstract

We had previously reported short-term efficacy, immunogenicity, and safety of the BNT162b2 vaccine among cancer patients with solid tumors. We aimed to evaluate these outcomes at six months postvaccination. The study cohort comprised patients who were on treatment during vaccination and throughout six months postvaccination. Serologic tests were performed after second vaccination and six months afterward. An age-matched cohort of health care workers served as controls. Documentation of COVID-19 infection, blood tests, and imaging studies during the study period was reviewed. Participants included 154 patients and 135 controls. Six months postvaccination, 122 (79%) patients were seropositive compared with 114 (84%) controls (P = 0.32). Serology titer dramatically decreased in a similar manner in both cohorts. No COVID-19 cases were documented in controls, and one case occurred in patient cohort. All previously reported adverse effects resolved. Taken together, the pattern of immunogenicity, efficacy, and safety of BNT162b2 in patients with cancer with solid tumors at six months postvaccination resembles that of the general population.

Significance:
Evidence regarding efficacy and safety of COVID-19 vaccines in patients with cancer indicate a favorable short-term profile. Immunomodulation due to anticancer treatments may affect immunity and immunogenicity of patients with cancer to the BNT162b2 vaccine over time. Our study sheds light on these long-term outcomes and portrays a trend that resembles the general population.
This article is highlighted in the In This Issue feature, p. 2355
ПРЕДИКТОРИ НАПРУЖЕНОСТІ АНТИТОКСИЧНОГО ПРОТИДИФТЕРІЙНОГО ІМУНІТЕТУ У ВІЛ-ІНФІКОВАНИХ ДОРОСЛИХ ОСІБ
Authors: Ревенкo Г. О. 
Published: September 2021

Метою дослідження було оцінити напруженість імунітету проти дифтерії у ВІЛ-інфікованих дорослих осіб і дослідити його зв’язок з основними клінічними та лабораторними показниками для визначення предикторних можливостей комплексного використання означених факторів. У дослідження було залучено 90 хворих на ВІЛ-інфекцію віком від 22 до 60 років, середній вік становив (40,1±0,9) років, серед яких чоловіків було 39 (43,3 %), жінок – 51 (56,7 %). До конт­рольної групи було залучено 49 здорових імунокомпетентних добровольців відповідної вікової групи та гендерного складу. Нами встановлено, що медіана протидифтерійних антитіл становила 0,17 (0,09-0,38) МО/мл, що у 6,1 разу нижче від відповідного показника у контрольній групі – 1,03 (0,56-1,27) МО/мл (р<0,001 за U-критерієм).
Високий ризик відсутності або низьких рівнів протидифтерійних антитіл достовірно (від p<0,05 до p<0,001) асоціюється з анемією, тромбоцитопенією, підвищеною ШОЕ, низьким рівнем Т-хелперів (nadir), наявністю волосистої лейкоплакії язика, дефіцитом маси тіла, фактом тютюнокуріння. Найбільші протективні можливості щодо підвищення рівня протидифтерійного імунітету у ВІЛ-інфікованих дорослих відповідно пов’язані з отриманням людьми, які вживають наркотики ін’єкційно, замісної підтримувальної терапії (rs=0,57; p=0,002), відсутністю волосистої лейкоплакії язика (rs=-0,23; p=0,030), відмовою від куріння (rs=-0,26; p=0,013), нормальними лабораторними показниками крові (рівень гемоглобіну – rs=0,25; p=0,02, тромбоцитів – rs=0,41; p<0,001, ШОЕ – rs=-0,55; p<0,001) та маси тіла – rs=0,31; p=0,003), а також більшою кількістю Т-хелперів (nadir) – rs=0,49 (p<0,001).
Комплексна оцінка зазначених факторів дозволить виявляти групи ризику, які потребують щеплення проти дифтерії, не проводячи спеціальних досліджень.
ЗАРАЖЕНІСТЬ КЛІЩІВ У ЛІСОВИХ БІОТОПАХ ТЕРНОПІЛЬСЬКОЇ ОБЛАСТІ
Authors: Паничев В. О. , Андрейчин М. А. , Кравчук Ю. А. , Даутов А. Г. , Дубровська А. М. 
Published: September 2021

Зараженість кліщів патогенними мікроорганізмами впливає на епідемічне благополуччя територій, адже ці членистоногі є резервуаром і вектором передачі збудників багатьох зоонозних хворобах. Кліщі забезпечують циркуляцію низки бактерій у природних осередках як важлива складова паразитарних систем.
Мета роботи. З’ясувати зараженість кліщів окремими патогенними мікроорганізмами у трьох погодно-географічних зонах Тернопільської області: малому Поліссі, холодному та теплому Поділлі. Порівняти ступені їх зараженості, спектри патогенів. Дослідити структуру угрупувань мишуватих гризунів як складової паразитарних систем.
Матеріали і методи. Ентомологічні: збір кліщів та їх ідентифікація за допомогою визначника. Облік чисельності кліщів з обрахунком індексу рясності. Вивчення видового складу та чисельності угрупувань мишуватих гризунів, їх відловлення стандартними живоловками, встановленими в одну лінію. Перевірку здійснювали через добу, облік вели у пастко-добах і відсотках потрапляння.
Лабораторні: дослідження суспензії кліщів у полімеразно-ланцюговій реакції (ПЛР) в режимі реального часу. Використовували тест-системи виробництва Vector-Best для визначення фрагментів ДНК B. burgdorferi s. l., B. miyamotoi, Babesia sp., А. phagocytophilum, E. muris та E. chaffeensis.
Результати. Встановлено середні значення індексів рясності кліщів у погодно-географічних зонах за трирічний період. Отримано дані щодо чисельності та складу популяцій мишуватих гризунів в обраних біотопах. Виявлено фрагменти ДНК B. burgdorferi s. l., B. miyamotoi, Babesia sp., A. рhagocytophilum. Не виявлено – E. muris та E. сhaffeensis.
Висновки. Кліщі у лісових біотопах трьох погодно-географічних зон Тернопільської області заражені B. burgdorferi s. l., B. miyamotoi, Babesia sp., А. phagocytophilum. Домінуючим паразитом є I. ricinus, роль хазяїна забезпечують вісім видів мишуватих гризунів.
МЕДИЧНЕ ЗАБЕЗПЕЧЕННЯ ВОДОЛАЗНИХ СПУСКІВ І РОБІТ У СИСТЕМІ ДЕРЖАВНОЇ СЛУЖБИ УКРАЇНИ З НАДЗВИЧАЙНИХ СИТУАЦІЙ
Authors: Смірнова В. Л. , Репута В. В. 
Published: September 2021

Мета: дослідити організацію медичного забезпечення водолазних спусків і робіт у системі Державної служби України з надзвичайних ситуацій (ДСНС), її основних завдань, сил та засобів, які залучають до медичного забезпечення, обсягів медичної допомоги на всіх етапах, інші питання координації взаємодії.
Матеріали і методи. Використано чинні нормативно-правові акти та керівні документи щодо організації медичного забезпечення водолазних спусків і робіт у системі ДСНС України. Методи дослідження: бібліосемантичний, аналітичний, системного підходу.
Результати. У статті досліджено медичне забезпечення водолазної служби та підпорядкованих їй формувань, органів і підрозділів служби цивільного захисту. Розглянуто порядок отримання медичного допуску для водолазів до виконання водолазних спусків та робіт. Визначено функціональні обов’язки та повноваження як штатного медичного персоналу, так й інших медичних працівників, яких залучають до здійснення заходів із медичного забезпечення. Проаналізовано обсяг надання медичної допомоги під час залучення водолазів до виконання водолазних спусків та робіт, а також у період між ними.
Висновки. Медичне забезпечення водолазної служби в системі ДСНС України є обов’язковою та невід’ємною частиною її функціонування. Заходи з медичного забезпечення водолазної служби поширюються на осіб рядового і начальницького складу служби цивільного захисту та працівників професійних аварійно-рятувальних служб, що входять до складу таких формувань та спрямовані на збереження та зміцнення здоров’я водолазів, підвищення їх працездатності, профілактику розвитку негативних медичних наслідків перебування в умовах підвищеного тиску, раннього виявлення та лікування професійних захворювань.
МОРФОЛОГІЧНЕ ПІДТВЕРДЖЕННЯ МЕХАНІЗМІВ ПРОТЕКТИВНОЇ ДІЇ L-ОРНІТИНУ L-АСПАРТАТУ ПРИ ЦИРОЗІ ПЕЧІНКИ
Authors: Дацко В. А. , Олещук О. М. , Дацко Т. В. , Головата Т. К. 
Published: September 2021

Хронічні гепатити B або C, алкогольний гепатит, цукровий діабет, ожиріння, хронічні захворювання жовчовивідних шляхів, автоімунні захворювання тощо – хвороби, які можуть ускладнюватися цирозом печінки. Ця патологія займає перше місце серед причин смертності від захворювань шлунково-кишкового тракту.
Мета – встановлення морфологічних змін у печінці при експериментальному цирозі за введення L-орнітину L-аспартату у комбінації з модуляторами синтезу оксиду азоту або поліамінів.
Матеріал і методи. Тварин із модельованим цирозом поділили на групи, яким вводили L-орнітину L-аспартат (LOLA) в дозі 200 мг/кг впродовж 10 діб; яким разом із LOLA 200 мг/кг вводили L-NAME в дозі 10 мг/кг впродовж 10 діб; яким разом із LOLA 200 мг/кг вводили та DFMO в дозі 25 мг/кг. Вивчали гістологічну структуру печінки при забарвленні гематоксиліном та еозином та за ван Гізон – Вейгертом.
Результати. Встановлено, що застосування L-орнітину L-аспартату при експериментальному цирозі печінки зменшувало прояви дистрофічних та некротичних змін гепатоцитів та лімфогістіоцитарну інфільтрацію фіброзної строми. Поєднане застосування L-орнітину L-аспартату та неселективного блокатора синтезу оксиду азоту L-NAME у тварин із CCL4 цирозом супроводжувалось помірними структурними змінами у вигляді переважно дистрофічних змін гепатоцитів та помірним зменшенням фіброзних полів у паренхімі печінки. Застосування LOLA у поєднанні з інгібітором метаболізму поліамінів DL-α-Difluoromethylornithine у тварин із CCL4 цирозом супроводжувалося вираженим набряком колагенової строми із значною лімфо-гістіоцитарною інфільтрацією та вираженими дистрофічно-некротичними змінами в гепатоцитах.
Висновок. За результатами проведених досліджень встановлено, що LOLA чинить прямий захисний вплив на печінку при експериментальному цирозі.