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Prediction of Microvascular Invasion of Hepatocellular Carcinoma Based on Contrast-Enhanced MR and 3D Convolutional Neural Networks
Authors: Zhou Wu , Jian Wanwei , Cen Xiaoping , Zhang Lijuan , Guo Hui , Liu Zaiyi , Liang Changhong , Wang Guangyi 
Published: March 2021

Background and PurposeIt is extremely important to predict the microvascular invasion (MVI) of hepatocellular carcinoma (HCC) before surgery, which is a key predictor of recurrence and helps determine the treatment strategy before liver resection or liver transplantation. In this study, we demonstrate that a deep learning approach based on contrast-enhanced MR and 3D convolutional neural networks (CNN) can be applied to better predict MVI in HCC patients.Materials and MethodsThis retrospective study included 114 consecutive patients who were surgically resected from October 2012 to October 2018 with 117 histologically confirmed HCC. MR sequences including 3.0T/LAVA (liver acquisition with volume acceleration) and 3.0T/e-THRIVE (enhanced T1 high resolution isotropic volume excitation) were used in image acquisition of each patient. First, numerous 3D patches were separately extracted from the region of each lesion for data augmentation. Then, 3D CNN was utilized to extract the discriminant deep features of HCC from contrast-enhanced MR separately. Furthermore, loss function for deep supervision was designed to integrate deep features from multiple phases of contrast-enhanced MR. The dataset was divided into two parts, in which 77 HCCs were used as the training set, while the remaining 40 HCCs were used for independent testing. Receiver operating characteristic curve (ROC) analysis was adopted to assess the performance of MVI prediction. The output probability of the model was assessed by the independent student’s t-test or Mann-Whitney U test.ResultsThe mean AUC values of MVI prediction of HCC were 0.793 (p=0.001) in the pre-contrast phase, 0.855 (p=0.000) in arterial phase, and 0.817 (p=0.000) in the portal vein phase. Simple concatenation of deep features using 3D CNN derived from all the three phases improved the performance with the AUC value of 0.906 (p=0.000). By comparison, the proposed deep learning model with deep supervision loss function produced the best results with the AUC value of 0.926 (p=0.000).ConclusionA deep learning framework based on 3D CNN and deeply supervised net with contrast-enhanced MR could be effective for MVI prediction.
Feasibility of Wave Intensity Analysis in Patients With Conotruncal Anomalies Before and After Pregnancy: New Physiological Insights?
Authors: Ordonez Maria Victoria , Neumann Sandra , Caputo Massimo , Curtis Stephanie , Biglino Giovanni 
Published: March 2021

Background: Conotruncal anomalies (CTA) are associated with ongoing dilation of the aortic root, as well as increased aortic stiffness, which may relate to intrinsic properties of the aorta. Pregnancy hormones lead to hemodynamic changes and remodeling of the tunica media, resulting in the opposite effect, i.e., increasing distensibility. These changes normalize post-pregnancy in healthy women but have not been fully investigated in CTA patients.Methods: We examined aortic distensibility and ventriculo-arterial coupling before and after pregnancy using cardiovascular magnetic resonance (CMR)-derived wave intensity analysis (WIA). Pre- and post-pregnancy CMR data were retrospectively analyzed. Aortic diameters were measured before, during, and after pregnancy by cardiac ultrasound and before and after pregnancy by CMR. Phase contrast MR flow sequences were used for calculating wave speed (c) and intensity (WI). A matched analysis was performed comparing results before and after pregnancy.Results: Thirteen women (n = 5, transposition of the great arteries; n = 6, tetralogy of Fallot; n = 1, double outlet right ventricle, n = 1, truncus arteriosus) had 19 pregnancies. Median time between delivery and second CMR was 2.3 years (range: 1–6 years). The aortic diameter increased significantly after pregnancy in nine (n = 9) patients by a median of 4 ± 2.3 mm (range: 2–7.0 mm, p = 0.01). There was no difference in c pre-/post-pregnancy (p = 0.73), suggesting that increased compliance, typically observed during pregnancy, does not persist long term. A significant inverse relationship was observed between c and heart rate (HR) after pregnancy (p = 0.01, r = 0.73). There was no significant difference in cardiac output, aortic/pulmonary regurgitation, or WI peaks pre-/post-pregnancy.Conclusions: WIA is feasible in this population and could provide physiological insights in larger cohorts. Aortic distensibility and wave intensity did not change before and after pregnancy in CTA patients, despite an increase in diameter, suggesting that pregnancy did not adversely affect coupling in the long-term.
Chemokine Therapy in Cats With Experimental Renal Fibrosis and in a Kidney Disease Pilot Study
Authors: Bennington Julie , Lankford Shannon , Magalhaes Renata S. , Shankle Douglas , Fanning Jason , Kartini Cucu , Suparto Irma , Kusumawardhani Winda , Putra M. ArRaniri , Mariya Silmi , Badlani Gopal , Williams J. Koudy 
Published: March 2021

Background: Chronic tubulointerstitial fibrosis is a common final pathway leading to end stage kidney disease in cats and has no effective treatment. The use of cell-based molecules to treat kidney fibrosis may be a promising approach. The objectives were to test the effects of intra-renal chemokine CXCL12 injection in a pre-clinical cat model of unilateral ischemia/reperfusion (I/R)-induced kidney fibrosis and then, within a clinical pilot study, test the safety/feasibility of CXCL12 injection in cats that might have early chronic kidney disease (CKD).Methods:Pre-clinical: Thirty cats received intra-renal injection of 100, 200, or 400 ng of recombinant human CXCL12, or sterile saline, into the I/R kidney 70 days post-injury, or were non-injured, non-injected controls (n = 6/group). Kidney collagen content was quantified 4 months post-treatment using Masson's Trichrome and Picrosirius Red (PSR) stained tissues. In a separate study (n = 2) exploring short-term effects of CXCL12, 200 ng CXCL12 was injected into I/R kidneys and then harvested either 30 min (n = 1) or 1 month (n = 1) post-injection. Kidney concentrations of CXCL12, matrix metalloproteinase 1 (MMP-1), and lysyl oxidase-like enzyme 2 (LOXL-2) were quantified via ELISA. Clinical Pilot: 14 client-owned cats with potential early kidney disease received a single-treatment, bilateral intra-renal injection of 200 ng CXCL12 (n = 7), or received no injection (n = 7). Blood/urine samples were collected monthly for 9 months to assess renal function and CKD staging.Results:Pre-clinical: I/R increased the affected kidney collagen content, which both mid and high doses of CXCL12 restored to normal (ps &lt; 0.05 vs. untreated). I/R increased collagen fiber width, which both mid and high doses of CXCL12 restored to normal (p &lt; 0.001 vs. untreated). Early changes in kidney MMP-1, associated with collagen breakdown, and subsequent decreases in LOXL-2, associated with collagen cross-linking, in response to CXCL12 treatment may contribute to these findings. Clinical Pilot: Bilateral intra-renal injection of CXCL12 using ultrasound guidance in cats with CKD was feasible and safe in a general practice clinical setting with no obvious side effects noted during the 9-month follow-up period.Conclusions: Intra-renal injection of CXCL12 may prove to be an effective treatment for kidney fibrosis in cats with CKD. Additional mechanistic and clinical evaluations are needed.
Economic Perspectives on the Impact of Covid Vaccines
Authors: Sangamithra A , Thilagavathy S 
Published: March 2021

Vaccination and the impact on health on the world’s people is very difficult to exaggerate. The main aim is to treat people with mental health issues and substance use of disorder. Vaccination is crucial in terms of ensuring the overall health conditions and well–being. The development of vaccines is an expensive and lengthy process. Depreciation is high and takes multiple candidates and long years to produce a licensed vaccine. The access to vaccines that prevent life-threatening infectious diseases remains not equal to all the population. The benefits of vaccination derive from health and economic benefits and the health benefits have diminishing returns as a result of high-risk individuals been vaccinated first. Economic benefits depend both on the health benefits and on how reduced risk of infection and death translates into a leading general economic activity. Department of Government is required to perform a systematic economic analyses of vaccines and to justify their given pressure on both private and public finances on a global level; provoke in the year 2008 financial crash. Mostly, the government supports charities and non-governmental organizations, where people invest in these, with the hope of improving the health conditions.
Consistency between high throughput sequencing and microscopy-based morphological characterization of phytoplankton communities
Authors: Vuorio Kristiina , Mäki Anita , Salmi Pauliina , Aalto Sanni , Tiirola Marja , Järvinen Marko 
Published: March 2021

Thus far, the phytoplankton community composition analyses, used e.g. monitoring and assessment of the ecological status of water bodies, are based on time-consuming and expertise-demanding light microscopy analyses. Currently, DNA-based molecular tools are being developed to replace microscopy-based analyses. Although most of the DNA is expected to be found in living cells, long-lasting DNA in damaged cells or soluble extracellular or relic DNA can make up a large proportion of the total DNA in water samples. DNA-based phytoplankton analysis has been shown to be affected by the huge variation in the copy number of the rRNA gene between phytoplankton species (Mäki et al. 2017). On the contrary, RNA is present only in living organisms and reflects active protein synthesis. Therefore, RNA-based methods can provide a more reliable estimate of community composition.
The large copy number variation of ribosomal genes and the absence of universal primers for simultaneous amplification of cyanobacterial and eukaryotic phytoplankton genes hinder the application of DNA-based molecular methods. We applied a directional random-primed high throughput sequencing (HTS) approach (Mäki and Tiirola 2018) to analyse 16S and 18S rRNA community structures of 83 boreal lakes in Finland, Northern Europe. With the method it was possible to simultaneously amplify all groups of aquatic microorganisms in addition to cyanobacteria and eukaryotic phytoplankton.
A comparison between microscopy and HTS showed that the relative phylum (Fig. 0) and class level abundances of eukaryotic phytoplankton and order level abundances of cyanobacteria were consistent between the methods, despite that the HTS method overestimated the relative abundance of cyanobacteria. However, correspondence was low at genus and species level, mainly due to the lack of reference library sequences. HTS revealed more genera and was able to differentiate cryptic genera lacking morphological characteristics, but microscopy revealed a longer list of species (Vuorio et al. 2020).
The RNA-based method applied showed potential, but it is not yet able to replace microscopy, mainly due to the lack of full length 16S and 18S sequences in the reference libraries. The main advantage of the method is that it is not limited to phytoplankton, but can be applied to simultaneous investigation of the total composition of microbes, including all bacteria, protists, ciliates, rotifers and zooplankton.
Lake sedimentary DNA to reveal long-term changes in aquatic biodiversity and ecosystem functioning
Authors: Domaizon Isabelle 
Published: March 2021

The emergence of molecular analyses based on the sequencing of sedimentary DNA has opened up many new areas of inquiry in paleolimnology. DNA preserved in sediments (SedDNA) offers the possibility to consider taxa that were traditionally not accessible because they do not leave distinct morphological fossils.
Recent applications that considered a diversity of biological groups (including bacteria, protists, zooplankton, fish) illustrate how efficiently SedDNA-based methods complement both classical paleolimnology proxies and limnological data. The knowledge gained from this approach is very diverse in scope, ranging from quantifying natural variability in population and community dynamics to understanding how these biological variables respond to anthropogenic disturbances and climatic change. The use of lake sedimentary DNA to track long-term changes in aquatic biota is a rapidly advancing field of research.
Based on recent applications, this presentation illustrates (i) the potential and challenges associated with the study of SedDNA to address critical research questions in lacustrine ecology (ii) the main methodological precautions to be taken into account for implementing these types of DNA analyses (i.e. best practices) and (iii) the emerging topics that could be addressed using sedimentary DNA, in particular to reconstruct the temporal dynamics of lacustrine biodiversity.
Vivre avec une maladie neuro-évolutive
Authors: de la Sayette Vincent 
Published: March 2021

Il faut expliquer la démarche diagnostique, l’intérêt et les limites des différents examens comme l’impossibilité de prédire l’évolution et plus largement l’avenir. Moyennant ces précautions, le diagnostic de maladie d’Alzheimer (ou d’une autre maladie) peut être annoncé : il est probable, possible, indéterminé ou très peu probable, mais une part variable d’incertitude règne toujours.
Vivre avec une maladie neuro-évolutive
Authors: Fiat Éric 
Published: March 2021

Dans le regard de beaucoup de nos contemporains sur les malades, n’y a-t-il pas cet étrange mélange de l’élaboré et de l’archaïque, de respect et de rejet, d’estime et d’effroi, de considération et de fascination ? Comment veiller au quotidien sur la dignité ontologique de tout homme ? Surtout quand dans ledit quotidien la rencontre du soignant et du soigné est plus souvent celle d’une fatigue et d’une souffrance que celle d’une forme et d’une gratitude ? La dignité, à l’épreuve de la grise et fatigante succession des nuits blanches et des jours noirs : tel sera ici mon objet d’étude.
L'enfant en Centrafrique
Authors: Kobelembi Frédéric 
Published: March 2021

Depuis son apparition en 1984, le sida a été considéré par les autorités politiques et sanitaires centrafricaines comme un véritable problème de santé publique. Malgré les actions multiformes de campagne de sensibilisation menées à travers le pays, on se rend compte grâce aux résultats de l’enquête MICS 2000 que les femmes ont encore un faible niveau de connaissance des modes de transmission du VIH/sida. Considérant la jeunesse de la population centrafricaine, notre propos est d’identifier les différentes perceptions du VIH/sida chez les adolescentes et de mettre en lumière les facteurs qui les sous-tendent et les expliquent.	Les déterminants des perceptions sont variables suivant qu’il s’agit de la connaissance des trois modes de prévention, de la connaissance des trois modes erronés de transmission et de la connaissance des quatre modes de transmission. Les principaux déterminants de la connaissance des trois modes de prévention sont la région de résidence, le niveau d’instruction, le niveau de vie, la religion et le milieu de résidence. Quant à la connaissance des trois modes erronés de transmission, le niveau d’instruction, la région administrative, le niveau de vie et la religion sont les principaux facteurs qui influencent cette connaissance chez les adolescentes. Enfin, la connaissance des quatre modes de transmission chez les adolescentes est déterminée par l’âge, le niveau d’instruction, la religion, la région de résidence et le niveau de vie du ménage. On s’aperçoit ainsi que l’instruction est une variable cruciale qui favorise l’émergence des nouvelles idées, l’ouverture vers la modernité.	En définitive, la relation entre les perceptions du VIH/sida chez les adolescentes et les principaux déterminants dépassent le simple truisme, mais les mécanismes complexes qui les relient ne sont pas élucidés dans le cadre de cet article et constituent l’une des limites de ce travail.
Les grandes décisions de l’histoire de France
Authors: Bertière Simone 
Published: March 2021

On entrait dans l’année 1661. Louis XIV, âgé de vingt-deux ans, n’était pas nouveau sur le trône. Devenu roi en 1643, à quatre ans et demi, déclaré majeur à treize ans, puis sacré à Reims, il était désormais marié, bientôt père. Comment pouvait-il se contenter d’un rôle de figuration et abandonner la réalité du pouvoir à son parrain, le cardinal Mazarin, au risque de se voir taxer de « négligence et de mollesse 1 » ? Qu’attendait-il pour rejeter le joug ? La réponse est simple : il avait vécu aux côtés de sa mère les années dramatiques où une guerre civile, jumelée à la guerre étrangère, secouait le royaume. Mazarin était venu à bout des deux et avait sauvé l’autorité royale. L’écarter eût été le désavouer. Autant attendre sa mort prochaine. Il laissait à son filleul un royaume en état de marche, dans une Europe pacifiée dominée par la France. Comment Louis XIV se comporterait-il, le moment venu, face aux décisions qu’il lui faudrait prendre ? Ce « second avènement » serait-il pour son règne une ouverture réussie ? Le jeune roi ne fut pas pris au dépourvu. Les poursuites engagées contre Fouquet, le surintendant aux finances, allaient servir de révélateur.
Les grandes décisions de l’histoire de France
Authors: Poussou Jean-Pierre 
Published: March 2021

Le mystère de la Révolution française tient d’abord au flou entourant ses origines. Selon la tradition, elle débute le plus souvent par la prise de la Bastille ou par les journées d’octobre 1789, scellant la mystique du peuple en armes dressé contre l’Ancien Régime pour la conquête de ses libertés. En réalité, les jeux étaient déjà faits, non à l’initiative du peuple mais d’une minorité active de notables et de nobles libéraux, frondant depuis deux ans un pouvoir royal à la dérive, malade d’impuissance et incapable de prendre la moindre initiative pour résoudre la crise économique et conjurer une crise politique de plus en plus virulente depuis la chute de Calonne en mai 1787 1 . La réunion des états généraux, deux ans plus tard, cristallise les mécontentements et donne l’occasion à la majorité de « couper le câble » comme l’y invitait Sieyès. Le 17 juin, sur proposition la veille au soir d’un député berrichon, Legrand, les députés du tiers état qui siégeaient aux états généraux depuis le 5 mai, et qu’avaient rejoints dix-neuf curés de la députation du clergé, décidèrent de se nommer « Assemblée nationale ». L’expression n’était pas absolument nouvelle, Sieyès, notamment, l’ayant déjà employée à plusieurs reprises, mais dans ces circonstances elle marquait un changement proprement révolutionnaire .
Les grandes décisions de l’histoire de France
Authors: Chavanette Loris 
Published: March 2021

L’abolition de la monarchie, le 21 septembre 1792, précipitée par la guerre et par les massacres de Septembre, oblige la Convention nationale tout juste réunie à répondre à la question : que faire de Louis XVI, prisonnier depuis qu’il a été renversé par les insurgés de la « Journée du 10 août » ? Faut-il le juger ? Encore faudrait-il qu’il soit justiciable, ce dont le préserve en théorie la Constitution de 1791. Certains, comme Saint-Just, demandent la mort sans autre forme de procès. L’obstacle juridique surmonté, Girondins et Montagnards s’affrontent sur la procédure du jugement. Les premiers préconisent la voie référendaire et le recours au peuple, pour les seconds la décision doit revenir aux représentants de la nation. Les Montagnards font prévaloir leur point de vue, prémices de leur victoire au moment de la Terreur. Cet acte de foi et de souveraineté entériné, rien ne s’oppose plus au déroulement d’une tragédie dont la scène centrale, le vote, dura près de vingt-quatre heures, scellant à jamais en lettres de sang la ligne de partage des eaux de l’histoire de France .
Les grandes décisions de l’histoire de France
Authors: Malye François 
Published: March 2021

« Le dernier mot est-il dit ? L’espérance doit-elle disparaître ? La défaite est-elle définitive ? » Il est environ 18 heures lorsque la voix d’un quasi-inconnu, le général de Gaulle, franchit la Manche pour s’adresser à ces Français qu’il a laissés la veille, le jour même où par la voie radiophonique également, le maréchal Pétain leur annonçait qu’il avait demandé aux Allemands les conditions d’un armistice. Éternel rebelle, Charles de Gaulle vient de franchir le Rubicon ce 18 juin 1940 en lançant son appel depuis le studio 4B de la BBC. Devenu le « général micro » pour ses détracteurs, il « entre dans l’aventure », celle de la France libre. Sa décision de prendre la parole découle logiquement d’une autre décision prise dans la nuit du 16 au 17 juin par le sous-secrétaire d’État à la Guerre : quitter Bordeaux où s’était réfugié le gouvernement français désormais dirigé par Pétain. Dès qu’il pose le pied dans la capitale anglaise, il sollicite auprès de Winston Churchill, Premier Ministre britannique, l’autorisation d’utiliser la radio afin de se faire connaître auprès de ses compatriotes. Séduit par cet immense personnage qui « avait emporté avec lui l’honneur de la France », Churchill la lui accorde sans hésiter. Mais si ce choix fut pris avec la résolution la plus ferme, sa mise en pratique et en ondes se heurta à de multiples obstacles dressés par les Anglais et fut bien plus chaotique que la légende gaullienne ne voudra le faire accroire. L’intrusion de ce général français inconnu n’était en effet pas du goût du Cabinet de guerre qui tenta par tous les moyens d’empêcher un discours qui pouvait nuire à l’Angleterre. Si, par cet appel, de Gaulle devint le symbole même de l’homme libre, il dut aussi ce jour-là en rabattre sur sa liberté. Mais bien soutenu par quelques alliés déjà dans la place, il démontra pour faire entendre sa voix cette opiniâtreté à laquelle il exhortait lui-même les Français. « Quoi qu’il arrive, la flamme de la résistance française ne doit pas s’éteindre et ne s’éteindra pas. »