bluuebunny/crossref_metadata_2025_split huggingface dataset:
High-Risk Neuroblastoma: Poor Outcomes Despite Aggressive Multimodal
Therapy
Authors: Abbas Adil Abdelhamed , Samkari Alaa Mohammed Noor 
Published: August 2021

:
Neuroblastoma (NBL) is a highly malignant embryonal tumor that originates from the
primordial neural crest cells. NBL is the most common tumor in infants and the most common extracranial
solid tumor in children. The tumor is more commonly diagnosed in children of 1-4 years
of age. NBL is characterized by enigmatic clinical behavior that ranges from spontaneous regression
to an aggressive clinical course leading to frequent relapses and death. Based on the likelihood
of progression and relapse, the International Neuroblastoma Risk Group classification system categorized
NBL into very low risk, low risk, intermediate risk, and high risk (HR) groups. HR NBL is
defined based on the patient's age (> 18 months), disease metastasis, tumor histology, and MYCN
gene amplification. HR NBL is diagnosed in nearly 40% of patients, mainly those > 18 months of
age, and is associated with aggressive clinical behavior. Treatment strategies involve the use of intensive
chemotherapy (CTR), surgical resection, high dose CTR with hematopoietic stem cell support,
radiotherapy, biotherapy, and immunotherapy with Anti-ganglioside 2 monoclonal antibodies.
Although HR NBL is now better characterized and aggressive multimodal therapy is applied, the
outcomes of treatment are still poor, with overall survival and event-free survival of approximately
40% and 30% at 3-years, respectively. The short and long-term side effects of therapy are tremendous.
HR NBL carries a high mortality rate accounting for nearly 15% of pediatric cancer deaths.
However, most mortalities are attributed to the high frequency of disease relapse (50%) and disease
reactiveness to therapy (20%). Newer treatment strategies are therefore urgently needed. Recent
discoveries in the field of biology and molecular genetics of NBL have led to the identification
of several targets that can improve the treatment results. In this review, we discuss the different
aspects of the epidemiology, biology, clinical presentations, diagnosis, and treatment of HR
NBL, in addition to the recent developments in the management of the disease.
Occurrence and Severity of Adverse Reactions of Immune Checkpoint
Inhibitors (PD-1 and PD L1) Based on Mordovian Dispensary Data
Analysis
Authors: Marzoog Basheer 
Published: August 2021

Background:
Recently, a novel therapeutic technique has been revealed to recruit PDL1
and PD1 inhibitors to promote and enhance the cytotoxic T cell activity in combating the tumor.
But unfortunately, several followed patients who didn’t tolerate the drug appeared unfavorable
autoimmune side effects, such as anemia, pneumonitis, hepatitis, colitis, in addition to fatigue/
asthenia, decreased appetite, nausea, cough, dyspnea, constipation.

Aim:
To assess the severity of the adverse reactions of PD-1 and PD-L1 inhibitors in treating patients
with positive PD-1 or PD-L1; non-small cell lung cancer patients (NSCLCs), small cell lung
cancer (SCLC), nodular sclerosis Hodgkin lymphoma, classic Hodgkin's lymphoma, gastric cancer,
renal cell carcinoma, caecal carcinoma, buccal mucosa carcinoma, nasopharyngeal carcinoma,
laryngopharynx cancer, bladder cancer, cervical cancer, and melanoma.

Materials and Methods:
The study data was collected and analyzed randomly from the period of
January 2019 to November 2020 from the Mordovian oncological dispensary. The data are collected
from the electronic archive of the hospital. Then, we followed up with the patients for the same
period, and we recorded the presented adverse reactions. The patients received anti-tumor drug;
PD-L1/PD-L inhibitors (Atezolizumab; 1200mg, Pembrolizumab; 200mg, and Nivolumab; 240mg
or 3 mg/kg) every 21 or 14 days they got IV infusion of PD-1 and/or PD-L1 inhibitors. After the
progression and metastasis of the tumor, the patients received a combination of chemotherapy prior
to the immunotherapy.

Results:
The analyzed data have shown 7.14% of the studied patients (n=28) have developed adverse
reactions that ranged from mild to moderate severity (anemia and biochemical tests deviation).

Conclusion:
These clinical findings supported the moderate risk of developing life-threatening adverse
reactions after administration of immune checkpoint inhibitors (Nivolumab, Pembrolizumab,
Atezolizumab) to patients with advanced-stage tumors. The patients who were treated with PD-1 inhibitors
developed less severe adverse reactions than patients who were treated with PD-L1 inhibitors.
The adverse reaction severity depends on the period of administration and the type of the treated
tumor, which consequently determines the dose of immunotherapy. Also, the aggressiveness of
the autoimmune reactions depends on the patient's immune state and its reactivity.
New Method for Sequence Similarity Analysis Based on the Position and Frequency of Statistically Significant Repeats
Authors: Jovanovic Jasmina T. 
Published: August 2021

Background:
The analysis of DNA nucleotide sequence similarity among different species is
crucial in identifying their functional, structural or evolutionary relationships. The number of bioinformatics
tools designed to perform the similarity analysis of nucleotide sequences has been growing rapidly.
According to the current literature, alignment-free methods have not been performed on repetitive
nucleotide sequence of different lengths.

Objective:
To develop a new algorithm for determining sequence characteristics and similarity based on
statistically significant repetitive elements of different lengths, which are located in analyzed sequences.

Methods:
This paper presents Repeats-Position/Frequency method (R-P/F method), for determining nucleotide
sequence similarity which takes into consideration statistically significant repetitive parts of analyzed
sequences. It is based on information theory and the fact that both position and frequency of repeated
sequences are not expected to occur with the identical presence in a random sequence of the
same length. Nucleotide sequences are presented in rn-dimensional vector space and their hierarchy is
constructed by applying hierarchical clustering algorithm.

Results:
R-P/F method has been validated on multiple data sets of nucleotide sequences and compared
with results obtained from alignment-based algorithms BLAST and Clustal Omega, and multiple wellestablished
alignment-free dissimilarity measures. Presented method provides results comparable with
other commonly used methods focused on resolving the same problem, with the novel view on the used
repetitive parts of sequences in these calculations.

Conclusion:
The presented, novel algorithm for calculating sequence similarity measure is effective in
discovering relationships among the sequences and makes a powerful and complementary addition to
existing sequence similarity methods.
History, Diagnosis, and Treatment of Coronavirus Disease 2019
(COVID-19)
Authors: Tripathi Vishwas , Mishra Amaresh , Nair Nisha , Pathak Yamini , Majeed Jaseela 
Published: August 2021

:
The Coronavirus Disease 2019 (COVID-19), also known as a novel coronavirus (2019-n-
CoV), reportedly originated from Wuhan City, Hubei Province, China. Coronavirus Disease 2019
rapidly spread all over the world within a short period. On January 30, 2020, the World Health Organization
(WHO) declared it a global epidemic. COVID-19 is a Severe Acute Respiratory Syndrome
coronavirus (SARS-CoV) evolves to respiratory, hepatic, gastrointestinal, and neurological
complications, and eventually death. SARS-CoV and the Middle East Respiratory Syndrome coronavirus
(MERS-CoV) genome sequences similar identity with 2019-nCoV or Severe Acute Respiratory
Syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2). However, few amino acid sequences of 2019-nCoV
differ from SARS-CoV and MERS-CoV. COVID-19 shares about 90% amino acid sequence similarity
with SARS-CoV. Effective prevention methods should be taken in order to control this pandemic
situation. To date, there are no effective treatments available to treat COVID-19. This review
provides information regarding COVID-19 history, epidemiology, pathogenesis and molecular
diagnosis. Also, we focus on the development of vaccines in the management of this
COVID-19 pandemic and limiting the spread of the virus.
WITHDRAWN: Treatment Patterns Should be Carefully Chosen in Different
Primary Sites of GI-NECs
Authors: Hu Hanguang , Cai Wen , Zhang Jiawei , Mao Jianshan , Ge Weiting 
Published: August 2021

The article has been withdrawn at the request of the authors and editor of the journal The International Journal of Gastroenterology
and Hepatology Diseases due to incoherent content.

Bentham Science apologizes to the readers of the journal for any inconvenience this may have caused.

The Bentham Editorial Policy on Article Withdrawal can be found at https://benthamscience.com/editorial-policies-main.php

Bentham Science Disclaimer:
It is a condition of publication that manuscripts submitted to this journal have not been published and will not be simultaneously
submitted or published elsewhere. Furthermore, any data, illustration, structure or table that has been published elsewhere
must be reported, and copyright permission for reproduction must be obtained. Plagiarism is strictly forbidden, and by submitting
the article for publication the authors agree that the publishers have the legal right to take appropriate action against the
authors, if plagiarism or fabricated information is discovered. By submitting a manuscript, the authors agree that the copyright
of their article is transferred to the publishers if and when the article is accepted for publication.
COCARDE Study–Cardiac Imaging Phenotype in Patients With COVID-19: Protocol for a Prospective Observational Study
Authors: Lairez Olivier , Blanchard Virginie , Balardy Laurent , Vardon-Bounes Fanny , Cazalbou Stéphanie , Ruiz Stéphanie , Collot Samia , Houard Valérie , Rolland Yves , Conil Jean-Marie , Minville Vincent 
Published: August 2021

Background
The effects of SARS-CoV-2 (COVID-19) on the myocardium and their role in the clinical course of infected patients are still unknown. The severity of SARS-CoV-2 is driven by hyperinflammation, and the effects of SARS-CoV-2 on the myocardium may be significant. This study proposes to use bedside observations and biomarkers to characterize the association of COVID-19 with myocardial injury.

Objective
The aim of the study is to describe the myocardial function and its evolution over time in patients infected with SARS-CoV-2 and to investigate the link between inflammation and cardiac injury.

Methods
This prospective, monocentric, observational study enrolled 150 patients with suspected or confirmed SARS-CoV-2 infection at Toulouse University Hospital, Toulouse, France. Patients admitted to the intensive care unit (ICU), regular cardiologic ward, and geriatric ward of our tertiary university hospital were included during the pandemic period. Blood sampling, electrocardiography, echocardiography, and morphometric and demographic data were prospectively collected.

Results
A total of 100 patients were included. The final enrolment day was March 31, 2020, with first report of results at the end of the first quarter of 2021. The first echocardiographic results at admission of 31 patients of the COCARDE-ICU substudy population show that biological myocardial injury in COVID-19 has low functional impact on left ventricular systolic function.

Conclusions
A better understanding of the effects of COVID-19 on myocardial function and its link with inflammation would improve patient follow-up and care.

Trial Registration
Clinicaltrials.gov NCT04358952; https://clinicaltrials.gov/ct2/show/NCT04358952

International Registered Report Identifier (IRRID)
DERR1-10.2196/24931
Expanding Video Consultation Services at Pace and Scale in Scotland During the COVID-19 Pandemic: National Mixed Methods Case Study
Authors: Wherton Joseph , Greenhalgh Trisha , Shaw Sara E 
Published: August 2021

Background
Scotland—a country of 5.5 million people—has a rugged geography with many outlying islands, creating access challenges for many citizens. The government has long sought to mitigate these through a range of measures including an ambitious technology-enabled care program. A strategy to develop a nationwide video consultation service began in 2017. Our mixed methods evaluation was commissioned in mid-2019 and extended to cover the pandemic response in 2020.

Objective
To draw lessons from a national evaluation of the introduction, spread, and scale-up of Scotland’s video consultation services both before and during the pandemic.

Methods
Data sources comprised 223 interviews (with patients, staff, technology providers, and policymakers), 60 hours of ethnographic observation (including in-person visits to remote settings), patient and staff satisfaction surveys (n=20,349), professional and public engagement questionnaires (n=5400), uptake statistics, and local and national documents. Fieldwork during the pandemic was of necessity conducted remotely. Data were analyzed thematically and theorized using the Planning and Evaluating Remote Consultation Services (PERCS) framework which considers multiple influences interacting dynamically and unfolding over time.

Results
By the time the pandemic hit, there had been considerable investment in material and technological infrastructure, staff training, and professional and public engagement. Scotland was thus uniquely well placed to expand its video consultation services at pace and scale. Within 4 months (March-June 2020), the number of video consultations increased from about 330 to 17,000 per week nationally. While not everything went smoothly, video was used for a much wider range of clinical problems, vastly extending the prepandemic focus on outpatient monitoring of chronic stable conditions. The technology was generally considered dependable and easy to use. In most cases (14,677/18,817, 78%), patients reported no technical problems during their postconsultation survey. Health care organizations’ general innovativeness and digital maturity had a strong bearing on their ability to introduce, routinize, and expand video consultation services.

Conclusions
The national-level groundwork before the pandemic allowed many services to rapidly extend the use of video consultations during the pandemic, supported by a strong strategic vision, a well-resourced quality improvement model, dependable technology, and multiple opportunities for staff to try out the video option. Scotland provides an important national case study from which other countries may learn.
Analisis faktor yang mempengaruhi kinerja karyawan pada hotel bakung sari kuta badung
Authors: Yani Ni Wayan Mega Sari Apri , Rinayanthi Ni Made , Paramita Putu Dian Yuliani 
Published: August 2021

Tujuan dari penelitian ini adalah mengetahui faktor-faktor yang mempengaruhi kinerja karyawan pada Hotel Bakung Sari Kuta, Badung. Responden dalam penelitian ini sebanyak 64 orang. Teknik analisis yang digunakan adalah teknik analisis faktor. Hasil analisis diperoleh bahwa seluruh indikator yang terdapat dalam penelitian ini mampu membentuk faktor-faktor yang mempengaruhi kinerja karyawan pada Hotel Bakung Sari Kuta, Badung. Motivasi berupa dukungan dari pemimpin kepada karyawan dapat meningkatkan kinerja karyawan yang merupakan variabel yang mewakili faktor motivasi dengan loading factor sebesar 0,835. Besarnya gaji/upah yang diterima sudah dapat memenuhi kebutuhan pokok karyawan memiliki loading factor tertinggi yang mewakili faktor kompensasi yaitu sebesar 0,931. Pewarnaan, penataan ruang kerja, posisi kursi, meja, lemari dan peralatan lain teratur rapi yang mewakili faktor lingkungan kerja memiliki loading factor sebesar 0,885. Faktor yang berpengaruh dominan adalah faktor kompensasi dengan nilai extraction sums of squared loadings sebesar 84,919 persen. Maka dari itu, untuk mencapai kinerja karyawan yang baik demi terciptanya tujuan perusahaan dan khusus untuk variabel kompensasi yang lebih dominan mempengaruhi kinerja karyawan disarankan agar motivasi, kompensasi dan lingkungan kerja menjadi prioritas perhatian di Hotel Bakung Sari Kuta, Badung
Monogenic Diabetes in Youth With Presumed Type 2 Diabetes: Results From the Progress in Diabetes Genetics in Youth (ProDiGY) Collaboration
Authors: Todd Jennifer N. , Kleinberger Jeffrey W. , Zhang Haichen , Srinivasan Shylaja , Tollefsen Sherida E. , Levitsky Lynne L. , Levitt Katz Lorraine E. , Tryggestad Jeanie B. , Bacha Fida , Imperatore Giuseppina , Lawrence Jean M. , Pihoker Catherine , Divers Jasmin , Flannick Jason , Dabelea Dana , Florez Jose C. , Pollin Toni I. 
Published: August 2021

OBJECTIVE
Maturity-onset diabetes of the young (MODY) is frequently misdiagnosed as type 1 or type 2 diabetes. Correct diagnosis may result in a change in clinical treatment and impacts prediction of complications and familial risk. In this study, we aimed to assess the prevalence of MODY in multiethnic youth under age 20 years with a clinical diagnosis of type 2 diabetes.

RESEARCH DESIGN AND METHODS
We evaluated whole-exome sequence data of youth with a clinical diagnosis of type 2 diabetes. We considered participants to have MODY if they carried a MODY gene variant classified as likely pathogenic (LP) or pathogenic (P) according to current guidelines.

RESULTS
Of 3,333 participants, 93 (2.8%) carried an LP/P variant in HNF4A (16 participants), GCK (23), HNF1A (44), PDX1 (5), INS (4), and CEL (1). Compared with those with no LP/P variants, youth with MODY had a younger age at diagnosis (12.9 ± 2.5 vs. 13.6 ± 2.3 years, P = 0.002) and lower fasting C-peptide levels (3.0 ± 1.7 vs. 4.7 ± 3.5 ng/mL, P &lt; 0.0001). Youth with MODY were less likely to have hypertension (6.9% vs. 19.5%, P = 0.007) and had higher HDL cholesterol (43.8 vs. 39.7 mg/dL, P = 0.006).

CONCLUSIONS
By comprehensively sequencing the coding regions of all MODY genes, we identified MODY in 2.8% of youth with clinically diagnosed type 2 diabetes; importantly, in 89% (n = 83) the specific diagnosis would have changed clinical management. No clinical criterion reliably separated the two groups. New tools are needed to find ideal criteria for selection of individuals for genetic testing.
Аналіз результатів гібридних артеріальних реконструкцій у лікуванні хворих на цукровий діабет з хронічною критичною ішемією нижньої кінцівки
Authors: Діденко С.М. , Субботін В.Ю. , Орлич О.М. 
Published: August 2021

Вступ. За даними ВООЗ, гангрена у хворих на ЦД зустрічається в 30 разів частіше, ніж у хворих, які на діабет не хворіють. Високу ампутацію нижньої кінцівки пацієнтам з ЦД виконують в 10-12 разів частіше ніж пацієнтам без ЦД.
Мета дослідження. Вивчити та проаналізувати результати гібридних артеріальних реконструкцій у хворих на цукровий діабет із хронічною критичною ішемією нижньої кінцівки.
Матеріали та методи. Вивчені результати хірургічного лікування 164 хворих на цукровий діабет (ЦД), ІІ типу, з хронічною критичною ішемією нижньої кінцівки (ХКІНК) та поєднаним стенотично-оклюзійним ураженням (СОУ) поверхневої стегнової артерії (ПСА) та артерій підколінно-гомілкового сегментів (ПГС). Згідно з характером виконаного оперативного втручання, пацієнти були розподілені на групу 1 – 61 хворий, яким була виконана відкрита реконструкція артерій стегнового сегменту без втручання на артеріях ПГС; групу 2 – 38 хворих, яким була виконана відкрита дворівнева реконструкція артерій; групу 3 – 65 хворих, яким була виконана гібридна артеріальна реконструкція.
Результати досліджень та їх обговорення. Первинна прохідність зони стегнової реконструкції у пацієнтів групи 1 становила 65,6%, вторинна – 81,9%, частка високих ампутацій – 18%, летальність – 11,5%. Первинна прохідність зони стегнової реконструкції у пацієнтів групи 2 становила 89,5%, вторинна – 92,1%, частка високих ампутацій – 5,2%, летальність – 7,9%. Первинна прохідність зони стегнової реконструкції у пацієнтів групи 3 становила 81,5%, вторинна – 93,9%, частка високих ампутацій – 7,7%, летальність – 4,6%.
Висновки. У хворих групи 1 відновлення прохідності ПСА без втручання на артеріях ПГС має незадовільні результати: найвищий рівень летальності 11,5% (достовірно відрізняється від летальності в групі 2 (p<0,05) та 3 (p<0,001)), частку високих ампутацій – 14,8% (достовірно відрізняється від частки високих ампутацій в групі 2 та 3 (p<0,001)) та достовірно найгірший показник за шкалою R.B. Rutherford та співавт. (1997) – 77,1% (p<0,05). Відмова від реконструкції артерій ПГС суттєво погіршує кровопостачання стопи та перспективи загоєння виразково-некротичного ураження (ВНУ) стопи і є провокуючим фактором тромбозу зони артеріальної реконструкції (ЗАР)
стегнового сегменту. Показники первинної та вторинної прохідності ЗАР і частки високих ампутацій у хворих групи 2 та 3 є зіставними – 89,5 і 81,5%, 94,7 і 96,9% та 2,6 і 3,1% відповідно (p>0,05). Проте летальність у групі 2 достовірно вища в порівнянні з летальністю в групі 3 – 7,9% проти 4,6% (p<0,05). Таким чином, методом вибору хірургічного лікування хворих на ЦД із ХКІНК при поєднанні СОУ артерій ПГС та ПСА є гібридна артеріальна реконструкція, оскільки при порівняних інших показниках демонструє майже вдвічі нижчу летальність.
Ключові слова: цукровий діабет, хронічна критична ішемія нижньої кінцівки, гібридна артеріальна реконструкція.
Дослідження гемомікроциркуляторного русла при хронічній критичній ішемії нижньої кінцівки у хворих на цукровий діабет
Authors: Діденко С.М. 
Published: August 2021

Вступ. Протягом останніх десятиліть захворюваність на цукровий діабет ЦД прийняла масштаби неінфекційної пандемії. Поширеність ЦД кожні 10–15 років подвоюється. Більше ніж у половини хворих виникає діабетична мікро-макроангіопатія. Це ускладнення ЦД пов’язують з високим ризиком розвитку і швидкого прогресування судинної патології.
Мета дослідження. Проаналізувати результати дослідження гемомікроциркуляторного русла (ГМЦР) при хронічній критичній ішемії нижньої кінцівки (ХКІНК) у хворих на цукровий діабет (ЦД). Розробити методику розрахунку показника ступеня діабетичної мікроангіопатії (ПСДМ) на підставі визначення кількісних характеристик ураження ГМЦР шкіри у хворих на ЦД із ХКІНК.
Матеріали та методи. Були відібрані зразки парафінових блоків шкіри 63 хворих (дослідна група) на ЦД, тип ІІ з ХКІНК на тлі поєднаного стенотично-оклюзійного ураження артерій стегнового та підколінно-гомілкового сегментів в поєднанні з виразково-некротичним ураженням стопи, які проходили лікування в Центрі судинної хірургії Клінічної лікарні «ФЕОФАНІЯ» Державного управління справами протягом 2013–2017 рр. Групою порівняння були вибрані зразки шкіри та м’язів 30 пацієнтів, що не мали системних захворювань. Проводили гістологічні та імуногістохімічні дослідження для виявлення колагену IV – маркера базальних мембран, VEGF – васкулярного ендотеліального росткового фактора; CD 31 – ендотеліального фактора; гладком’язового актину. Вимірювали та порівнювали діаметр кровоносних судин ГМЦР шкіри та м’язів, щільність капілярів на одиницю площі. На підставі отриманих даних проводили розрахунок ПСДМ.
Результати досліджень та їх обговорення. Були виявлені характерні зміни морфометричних показників судин ГМЦР шкіри у хворих на ЦД, тип ІІ з хронічною критичною ішемією нижньої кінцівки. Розроблена методика розрахунку ПСДМ. Виявлена кореляція між ступенем діабетичної мікроангіопатії ймовірністю тромбозу після гібридної артеріальної реконструкції та розроблений алгоритм обстеження хворих в післяопераційному періоді.
Висновки.

Сукупність отриманих даних про якісні та кількісні зміни ГМЦР шкіри дозволила розробити критерії для розрахунку ПСДМ.
Виявлена кореляція між ступенем діабетичної мікроангіопатії та ймовірністю тромбозу після гібридної артеріальної реконструкції.
Визначення ступеня тяжкості діабетичної мікроангіопатії може бути використане при створенні алгоритму обстеження для встановлення показань до превентивних операцій, що попереджують тромбоз зони артеріальної реконструкції (ЗАР) та характеру консервативного лікування після артеріальних реконструкцій у хворих на ЦД із ХКІНК.

Ключові слова: цукровий діабет, синдром діабетичної стопи, діабетична мікроангіопатія, гемомікроциркуляторне русло, ішемія, гібридна артеріальна реконструкція.