bluuebunny/crossref_metadata_2025_split huggingface dataset:
Cardiac Troponin T and Right Ventricular Systolic Pressure Predict Cardiovascular and Mortality Risk in Kidney Transplant Candidates
Authors: Firth Christine , Kaur Tripta , Chakkera Harini , Zhang Nan , Shamoun Fadi , Steidley Eric , Heilman Raymond , Keddis Mira 
Published: October 2019

<b><i>Background:</i></b> Patients presenting for kidney transplant (KTx) evaluation are subject to high rates of mortality and cardiovascular (CV) events pre- and post-KTx. CV and mortality risk assessment is needed. <b><i>Methods:</i></b> We evaluated cardiac troponin T (cTnT) as a predictor of CV events and mortality in a racially diverse cohort with significant CV disease burden presenting for KTx evaluation. Right ventricular systolic pressure (RVSP) was also assessed in predicting these outcomes. The population consisted of 561 patients presenting for KTx evaluation from 2011 to 2013 at Mayo Clinic, Arizona. A cutoff value for cTnT and RVSP that was most associated with CV events or mortality was derived. Multivariate Cox regression analysis was used to assess cTnT, RVSP, traditional, and other risk factors for the outcomes of interest. <b><i>Results:</i></b> Mean age was 53.5 ± 13.7 years and the median follow-up after KTx evaluation was 48.0 months. The cohort was 70.6% (<i>n</i> = 392) White, 11.4% (<i>n</i> = 63) Black, 8.5% (<i>n</i> = 47) Native American, and 3.1% (<i>n</i> = 17) Asian. Preexisting CV disease at the time of evaluation was prevalent in 24.4% (<i>n</i> = 137) of patients. During follow-up, 66.3% (<i>n</i> = 372) received a KTx and 21.9% (<i>n</i> = 123) had a composite event (16.8% death, 6.6 % CV events). It was found that 70.7% (<i>n</i> = 87) of events occurred in patients who were not transplanted; 53.5% (<i>n</i> = 300) had an elevated cTnT (≥0.01 ng/mL, median 0.02 ng/mL) and 84.1% (<i>n</i> = 344) of patients with RVSP data had an elevated RVSP (&#x3e;25 mm Hg). Time to event analysis identified a cTnT ≥0.036 ng/mL and RVSP ≥31 mm Hg to be best predictive of CV events and mortality. Smoking, CV disease, hypoalbuminemia, RVSP, and cTnT independently predicted CV events and mortality. <b><i>Conclusion:</i></b> Elevated cTnT and RVSP were independently predictive of CV events and mortality in the cohort. Clinicians should consider the value of RVSP and cTnT as markers of CV risk in KTx evaluation.
ВИВЧЕННЯ ДУМКИ ПАЦІЄНТІВ З ЕПІДЕРМАЛЬНИМИ ДИСПЛАЗІЯМИ ШКІРИ ЩОДО ВАЖЛИВОСТІ ТА ЗАДОВОЛЕНОСТІ СПЕЦІАЛІЗОВАНОЮ МЕДИЧНОЮ ДОПОМОГОЮ
Authors: Oshуvalova O. O. 
Published: October 2019

Мета: вивчити думки пацієнтів з епідермальними дисплазіями шкіри (ЕДШ) щодо важливості та ступеня задоволеності спеціалізованою медичною допомогою.
Матеріали і методи. Розроблено анонімну анкету і опитано 283 пацієнти, які отримали спеціалізовану медичну допомогу в Державній науковій установі «Науково-практичний центр профілактичної та клінічної медицини» Державного управління справами відповідно до Локальних протоколів медичної допомоги. Статистичну обробку матеріалів дослідження проводили з використанням методів біометричного аналізу, реалізованих у пакетах програм SPSS 10.0, EXCEL-2000. Вірогідність відмінностей оцінювали за допомогою критеріїв відповідності 2, Стьюдента (р).
Результати. Аналіз компонентів спеціалізованої медичної допомоги показав, що майже всі опитані (62,5–88 %) підкреслюють важливість всіх без виключення складових із високим рівнем задоволеності (68,2–92,2 %). Достовірні відмінності між ступенем важливості та рівнем задоволеності в дослідженні було виявлено лише при порівняльному аналізі компонентів «Надання інформації про профілактичні заходи в подальшому» і «Організація лікувального процесу» (р=0,001). Усі компоненти оцінки опинилися в сегменті «Успішні результати».
Висновки. Складові медичної допомоги (робота медперсоналу, організація лікувально-діагностичного процесу, соціально-побутові умови, поінформованість пацієнтів), з точки зору пацієнтів з ЕДШ, є важливими компонентами спеціалізованої медичної допомоги.
АЛГОРИТМ ПОБУДОВИ ДЕРЕВА ОНТОЛОГІЙ ПОНЯТТЯ ПРОФЕСІЙНОЇ КОМПЕТЕНТНОСТІ ФАХІВЦІВ ГРОМАДСЬКОГО ЗДОРОВ’Я
Authors: Lishtaba L. V. 
Published: October 2019

Мета: представити алгоритм побудови дерева онтологій та його основних складових.
Матеріали і методи. Методологічною основою дослідження є діалектичний метод наукового пізнання з використанням системного підходу. В процесі дослідження застосовано загальнонаукові та спеціальні методи пізнання: метод логічного узагальнення – при дослідженні існуючих підходів до суті компетентностей; систематиза­ції й узагальнення – при обґрунтуванні критеріїв визначення класів для кожної онтології; багатофакторний аналіз – у процесі розробки дерева онтологій поняття професійної компетентності фахівців громадського здоров’я.
Результати. З метою підвищення рівня компетентності фахівців громадського здоров’я у статті запропоновано алгоритм побудови дерева онтологій поняття професійної компетентності, що буде включати такі процедури: визначення структури дерева онтологій; визначення концептів (термінів) онтології верхнього рівня; визначення класів для кожної онтології; формування глосаріїв для кожної онтології; розподіл концептів за класами і рівнями; визначення зв’язків між концептами; редагування онтологій з метою досягнення відповідності між професійними й управлінськими вимогами.
Окреслено п’ять областей компетенцій, що будуть формувати загальне поняття професійної компетентності фахівців громадського здоров’я.
Висновки. Впровадження створених онтологій професійної компетентності фахівців громадського здоров’я дозволить привести до спільного знаменника критерії відбору осіб на відповідні посади, створити індикатори для оцінки діяльності та атестації й скласти програми підготовки фахівців громадського здоров’я враховуючи сучасні вимоги та встановлені стандарти необхідних навичок і знань.
ТЕЛЕМЕДИЦИНА ЯК ФОРМА ЯКІСНОГО НАДАННЯ МЕДИЧНИХ ПОСЛУГ
Authors: Oksak G. A. 
Published: October 2019

Мета: вивчити використання телемедицини як форми якісного надання медичних послуг в Україні та, зокрема, Полтавській області.
Матеріали і методи. Чинні законодавчі та галузеві нормативні матеріали проаналізовано за принципом бібліосемантичного та структурно-логічного аналізу.
Результати. У статті висвітлено значимість мережі віддаленого/дистанційного зв’язку (телекомунікації) для надання медичних послуг в Україні та, зокрема, Полтавській області. Доведено, що розвиток телемедицини особливо важливий в кардіології, оскільки небезпека серцево-судинних захворювань полягає в тому, що вони часто мають гострий несподіваний початок й атипову клінічну картину. Це не дозволяє самим пацієнтам, а часто і дільничним лікарям поліклінік, швидко й правильно оцінити ситуацію, що, у свою чергу, може призвести до смерті пацієнта. Широкого розвитку набула система дистанційної цілодобової невідкладної консультативної кардіологічної допомоги з можливістю безпосереднього передавання ЕКГ по телефонних лініях. Це дозволяє в 3–9 разів скоротити час із моменту появи перших симптомів захворювання до надання кваліфікованої медичної допомоги в повному обсязі, що в багатьох випадках допомагає зберегти життя й здоровʼя пацієнтів. Відповідно до наказу директора Департаменту охорони здоров’я Полтавської обласної державної адміністрації «Про взаємодію лікувальних закладів Полтавської області при наданні ургентної кардіологічної допомоги при гострих коронарних синдромах (ГКС)» прийнято рішення про надання медичної допомоги із застосуванням телемедичного (дистанційного) консультування з метою розмежування функцій між дистанційно-діагностичним (телемедичним) центром КУ «Полтавський обласний центр екстреної медицини та медицини катастроф» і телемедичним центром Полтавського обласного клінічного кардіологічного диспансеру на догоспітальному етапі ургентним хворим на ГКС та інші невідкладні стани.
Висновки. Завдяки впровадженню телемедицини переваги отримують насамперед пацієнти. Ці переваги полягають в підвищенні ефективності та якості лікування; прискоренні передачі інформації про результати обстежень між різними спеціалізованими клініками без транспортування хворого (особливо у критичних випадках); проведенні дистанційних (телемедичних) консультацій вузькими спеціалістами у територіально віддалених медичних установах; проведенні лікарських консиліумів (телеконференцій) з фахівцями лікувальних закладів незалежно від місця їх розташування; уникненні помилок через нерозбірливий почерк лікарів; зменшенні термінів обстеження пацієнтів.
Epigenome‐Wide Association Study for All‐Cause Mortality in a Cardiovascular Cohort Identifies Differential Methylation in Castor Zinc Finger 1 (
CASZ1
)
Authors: Abdulrahim Jawan W. , Kwee Lydia Coulter , Grass Elizabeth , Siegler Ilene C. , Williams Redford , Karra Ravi , Kraus William E. , Gregory Simon G. , Shah Svati H. 
Published: October 2019

Background

DNA
methylation is implicated in many chronic diseases and may contribute to mortality. Therefore, we conducted an epigenome‐wide association study (
EWAS
) for all‐cause mortality with whole‐transcriptome data in a cardiovascular cohort (
CATHGEN
[Catheterization Genetics]).

Methods and Results

Cases were participants with mortality≥7 days postcatheterization whereas controls were alive with≥2 years of follow‐up. The Illumina Human Methylation 450K and
EPIC
arrays (Illumina, San Diego, CA) were used for the discovery and validation sets, respectively. A linear model approach with empirical Bayes estimators adjusted for confounders was used to assess difference in methylation (Δβ). In the discovery set (55 cases, 49 controls), 25 629 (6.5%) probes were differently methylated (
P
<0.05). In the validation set (108 cases, 108 controls), 3 probes were differentially methylated with a false discovery rate–adjusted
P
<0.10: cg08215811 (

SLC
4A9

; log
2
fold change=−0.14); cg17845532 (

MATK

; fold change=−0.26); and cg17944110 (castor zinc finger 1 [
CASZ1
];
FC
=0.26;
P
<0.0001; false discovery rate–adjusted
P
=0.046–0.080). Meta‐analysis identified 6 probes (false discovery rate–adjusted
P
<0.05): the 3 above, cg20428720 (intergenic), cg17647904 (

NCOR
2

), and cg23198793 (

CAPN
3

). Messenger
RNA
expression of 2

MATK

isoforms was lower in cases (fold change=−0.24 [
P
=0.007] and fold change=−0.61 [
P
=0.009]). The

CASZ
1

,

NCOR
2

, and

CAPN
3

transcripts did not show differential expression (
P
>0.05); the

SLC
4A9

transcript did not pass quality control. The cg17944110 probe is located within a potential regulatory element; expression of predicted targets (using GeneHancer) of the regulatory element,

UBIAD
1

(
P
=0.01) and

CLSTN
1

(
P
=0.03), were lower in cases.

Conclusions

We identified 6 novel methylation sites associated with all‐cause mortality. Methylation in

CASZ
1

may serve as a regulatory element associated with mortality in cardiovascular patients. Larger studies are necessary to confirm these observations.
Effect of vessel diameter on variation of fiber morphology in Acacia mangium
Authors: Yahya Ridwan , Yansen Yansen , Tazuru-Mizuno Suyako , Sugiyama Junji 
Published: October 2019

AbstractPaper quality depends on fiber diameter and wall thickness, and their derivatives. Fiber deformation occurs due to pressure from the vessel during development. The diameter and wall thickness of the fibers were measured following the direction of pressure exerted by the vessel on the face of the fiber cells. Fiber cell diameter measured perpendicular to and parallel with vessel enlargement was referred to as radial and tangential diameter, respectively, and likewise for fiber wall thickness. Differences in radial and tangential diameter and wall thickness of fiber cells in relation to their distance from vessels were analyzed. The radial diameter of fibers adjacent to large vessels decreased from the first to the fifth fiber, and from the first to the second fiber adjacent to small vessels. Conversely, tangential fiber diameter increased from the first to the fifth fiber for fibers adjacent to large vessels, and from the first to the second fiber adjacent to small vessels. The fibers adjacent to the vessel seem to have thicker walls in both the tangential than radial directions up to 2 and 5 fibers for small and large vessels, respectively. The first two fibers adjacent to small diameter vessels may produce higher strength paper than those up to five fibers from large diameter vessels, because the Runkel ratio, Coefficient of rigidity and Muhlsteph ratio values of fibers adjacent to small vessels are lower than fibers adjacent to large vessels. The opposite occurs for flexibility coefficient values.
Gum duct formation mediated by various concentrations of ethephon and methyl jasmonate treatments in Cerasus × yedoensis, Prunus mume and Liquidambar styraciflua
Authors: Carolina Anne , Kusumoto Dai 
Published: October 2019

Abstract
We aimed to explore the effects of different concentrations, in particular, high concentrations, of exogenously applied ethephon and methyl jasmonate on gum duct formation in three broad-leaved tree species, Cerasus × yedoensis, Prunus mume and Liquidambar styraciflua. Intact shoots were treated with ethephon and methyl jasmonate in lanolin paste at concentrations of 0.1%, 1%, 2%, 5%, and 10% (w/w). The ethephon treatments induced gum duct formation in the xylem adjacent to the cambium in all three species, whereas the methyl jasmonate treatments did not. The highest induction of gum duct formation was observed after 1–2% ethephon treatments in C. × yedoensis and P. mume, and after 5–10% ethephon treatments in L. styraciflua. Meanwhile, the treatments with higher ethephon concentrations resulted in a lower induction of gum duct formation in C. × yedoensis and P. mume. In addition, we examined gum duct formation at sites distant from the treatment sites in C. × yedoensis and P. mume shoots treated with 10% ethephon. Gum duct formation was found to be the highest at sites 2 cm away from the treatment site (in the acropetal direction). We show that at least in C. × yedoensis and P. mume, trees have an optimal concentration of ethephon to induce gum duct formation, and that concentrations higher than the optimum suppress the induction.
Lateral or medial approach for valgus knee in total knee arthroplasty - which one is better? A systematic review
Authors: Wang Bin , Xing Dan , Li Jiao Jiao , Zhu Yuanyuan , Dong Shengjie , Zhao Bin 
Published: October 2019

Objective To identify whether the medial or lateral approach is superior for patients with valgus knees undergoing primary total knee arthroplasty (TKA). Methods Studies evaluating the 2 approaches were sourced from the PUBMED, EMBASE, Web of Science, and OVID databases. The quality of included studies was assessed using a modified quality evaluation method, and differences between approaches were systematically reviewed. Results Seventeen observational studies were included. The studies were published between 1991 and 2016, and included 5 retrospective studies and 12 prospective studies. Sixteen evaluation methods for the study outcomes were identified. Twelve and eight complication types were identified by studies reporting the lateral and medial approaches for valgus knee, respectively. Several studies showed that pain scores and knee function were superior using a lateral approach. Conclusion The lateral approach (combined with a tibial tubercle osteotomy or proximal quadriceps snip) was more useful and safer than the medial approach in the treatment of severe uncorrectable valgus knee deformity in patients undergoing TKA. Most of the available evidence supports the use of a lateral approach provided that the surgeon is familiar with the pathological anatomy of the valgus knee.
Renin–angiotensin system gene polymorphisms and colorectal cancer risk: a meta-analysis
Authors: Cheng Zhen , Liu Zhiwei 
Published: October 2019

Objective: The renin–angiotensin system gene has been implicated in the progression of colorectal cancer. Nevertheless, the details of that role remain controversial. We performed a meta-analysis to investigate the correlation between renin–angiotensin system gene polymorphisms and colorectal cancer. Methods: We retrieved relevant studies from PubMed and Embase. Subsequently, fixed or random-effects models were used to calculate pooled odds ratios (ORs) with 95% confidence intervals (CIs). Results: We identified six studies of the angiotensin-converting enzyme insertion/deletion (I/D) polymorphism, and two studies of the angiotensinogen M235T polymorphism. The angiotensin-converting enzyme I/D polymorphism did not significantly correlate with colorectal cancer risk in the total population (DD vs. II: OR 0.77, 95% CI 0.39–1.50; DI vs. II: OR 1.05, 95% CI 0.85–1.30; dominant model: OR 0.94, 95% CI 0.68–1.31; recessive model: OR 1.01, 95% CI 0.80–1.27). Similarly, the angiotensinogen M235T polymorphism was not associated with colorectal cancer risk (TT vs. MM: OR 1.38, 95% CI 0.52–3.67; TM vs. MM: OR 1.19, 95% CI 0.96–1.47; dominant model: OR 1.28, 95% CI 0.77–2.14; recessive model: OR 1.17, 95% CI 0.53–2.59). Conclusion: Our findings suggest that the angiotensin-converting enzyme I/D and angiotensinogen M235T polymorphisms are unlikely to correlate with colorectal cancer.
Differences in β-thujaplicin content of wood between plantation- and naturally grown Thujopsis dolabrata var. hondae (hinokiasunaro) trees in Shimokita Peninsula, Aomori, Japan
Authors: Tanabe Jun , Takashima Yuya , Ishiguri Futoshi , Sanpe Hiroyuki , Ohshima Jyunichi , Iizuka Kazuya , Yokota Shinso 
Published: October 2019

Abstract
β-Thujaplicin (hinokitiol) is an important extractive of Thujopsis dolabrata var. hondae (hinokiasunaro) that confers high durability to its wood. We investigated differences in β-thujaplicin content in wood from plantation- and naturally grown trees of T. dolabrata var. hondae, and also examined growth rate and wood density. A total of 29 trees were collected from two natural forests and a plantation forest in the Shimokita Peninsula, Aomori, Japan. β-Thujaplicin content was determined for each heartwood sample by gas chromatography. The content ranged from 0.29 to 3.67 mg/g (oven-dry weight basis). β-thujaplicin content of plantation-grown trees was significantly higher than for naturally grown trees, though with a large variation. The effect of radial growth rate on β-thujaplicin content was minimal. We conclude that T. dolabrata var. hondae wood from both plantation and natural forest has similar durability. The coefficient of variation of β-thujaplicin content in each stand was higher than for other wood properties. This degree of tree-to-tree variation in the trait suggests that promising production with more durable wood could be achieved by selecting T. dolabrata var. hondae trees containing a high content of β-thujaplicin for plantations.
De novo transcriptome sequencing of radish (Raphanus sativus L.) fleshy roots: analysis of major genes involved in the anthocyanin synthesis pathway
Authors: Gao Jian , Li Wen-Bo , Liu Hong-Fang , Chen Fa-Bo 
Published: October 2019

Abstract

Background
The HongXin radish (Raphanus sativus L.), which contains the natural red pigment (red radish pigment), is grown in the Fuling district of Chongqing City. However, the molecular mechanisms underlying anthocyanin synthesis for the formation of natural red pigment in the fleshy roots of HongXin radish are not well studied.

Results
De novo transcriptome of HX-1 radish, as well as that of the advanced inbred lines HX-2 and HX-3 were characterized using next generation sequencing (NGS) technology. In total, approximately 66.22 million paired-end reads comprising 34, 927 unigenes (N50 = 1, 621 bp) were obtained. Based on sequence similarity search with known proteins, total of 30, 127 (about 86.26%) unigenes were identified. Additionally, functional annotation and classification of these unigenes indicated that most of the unigenes were predominantly enriched in the metabolic process-related terms, especially for the biosynthetic pathways of secondary metabolites. Moreover, majority of the anthocyanin biosynthesis-related genes (ABRGs) involved in the regulation of anthocyanin biosynthesis were identified by targeted search for their annotation. Subsequently, the expression of 15 putative ABRGs involved in the anthocyanin synthesis-related pathways were validated using quantitative real-time polymerase chain reaction (qRT-PCR). Of those, RsPAL2, RsCHS-B2, RsDFR1, RsDFR2, RsFLS, RsMT3 and RsUFGT73B2-like were identified significantly associated with anthocyanin biosynthesis. Especially for RsDFR1, RsDFR2 and RsFLS, of those, RsDFR1 and RsDFR2 were highest enriched in the HX-3 and WG-3, but RsFLS were down-regulated in HX-3 and WG-3. We proposed that the transcripts of RsDFR1, RsDFR2 and RsFLS might be act as key regulators in anthocyanin biosynthesis pathway.

Conclusions
The assembled radish transcript sequences were analysed to identify the key ABRGs involved in the regulation of anthocyanin biosynthesis. Additionally, the expression patterns of candidate ABRGs involved in the anthocyanin biosynthetic pathway were validated by qRT-PCR. We proposed that the transcripts of RsDFR1, RsDFR2 and RsFLS might be acted as key regulators in anthocyanin biosynthesis pathway. This study will enhance our understanding of the biosynthesis and metabolism of anthocyanin in radish.
Congenital prepubic sinus with dorsal penile curvature: a case report and literature review
Authors: Wang Chuan , Ma Xue 
Published: October 2019

Abstract

Background
Congenital prepubic sinus (CPS) is a rare congenital anomaly and widely thought to be a variant of urethral duplication. Histological examination of this case gives a clue to this theory. CPS with dorsal penile curvature has been reported in previous publications, but their procedures to correct the curvature are different from this case.

Case presentation
A 10-year-old boy complained of the pain in the dorsal base of the penis. Physical examination revealed an accessory meatus located in the midline of the dorsal proximal penis and moderate dorsal penile curvature with deficient dorsal foreskin. Imaging examination showed that the meatus did not communicate with either normal urethra or urinary bladder, and ended blindly at the level of the symphysis pubis. The intact 4-cm-long sinus was completely separated and excised. Penile curvature was corrected after the dorsal proximal fibrous cord was detached. Histological examination confirmed the diagnosis of urethral duplication.

Conclusions
The histological result of this case supports the theory that CPS is a variant of the dorsal urethra. Moreover, this case indicates that the curvature in patients with CPS may be caused by the dorsal fibrous cord at the beginning and the operation should be conducted at an early age to avoid further development of the curvature during puberty.