bluuebunny/crossref_metadata_2025_split huggingface dataset:
Obesity alters the topographical distribution of ventilation and the regional response to bronchoconstriction
Authors: Rutting S. , Mahadev S. , Tonga K. O. , Bailey D. L. , Dame Carroll J. R. , Farrow C. E. , Thamrin C. , Chapman D. G. , King G. G. 
Published: November 2019

Obesity is associated with reduced operating lung volumes that may contribute to increased airway closure during tidal breathing and abnormalities in ventilation distribution. We investigated the effect of obesity on the topographical distribution of ventilation before and after methacholine-induced bronchoconstriction using single-photon emission computed tomography (SPECT)-computed tomography (CT) in healthy subjects. Subjects with obesity ( n = 9) and subjects without obesity ( n = 10) underwent baseline and postbronchoprovocation SPECT-CT imaging, in which Technegas was inhaled upright and followed by supine scanning. Lung regions that were nonventilated (Ventnon), low ventilated (Ventlow), or well ventilated (Ventwell) were calculated using an adaptive threshold method and were expressed as a percentage of total lung volume. To determine regional ventilation, lungs were divided into upper, middle, and lower thirds of axial length, derived from CT. At baseline, Ventnonand Ventlowfor the entire lung were similar in subjects with and without obesity. However, in the upper lung zone, Ventnon(17.5 ± 10.6% vs. 34.7 ± 7.8%, P < 0.001) and Ventlow(25.7 ± 6.3% vs. 33.6 ± 5.1%, P < 0.05) were decreased in subjects with obesity, with a consequent increase in Ventwell(56.8 ± 9.2% vs. 31.7 ± 10.1%, P < 0.001). The greater diversion of ventilation to the upper zone was correlated with body mass index ( rs = 0.74, P < 0.001), respiratory system resistance ( rs = 0.72, P < 0.001), and respiratory system reactance ( rs = −0.64, P = 0.003) but not with lung volumes or basal airway closure. Following bronchoprovocation, overall Ventnonincreased similarly in both groups; however, in subjects without obesity, Ventnononly increased in the lower zone, whereas in subjects with obesity, Ventnonincreased more evenly across all lung zones. In conclusion, obesity is associated with altered ventilation distribution during baseline and following bronchoprovocation, independent of reduced lung volumes.NEW & NOTEWORTHY Using ventilation SPECT-computed tomography imaging in healthy subjects, we demonstrate that ventilation in obesity is diverted to the upper lung zone and that this is strongly correlated with body mass index but is independent of operating lung volumes and of airway closure. Furthermore, methacholine-induced bronchoconstriction only occurred in the lower lung zone in individuals who were not obese, whereas in subjects who were obese, it occurred more evenly across all lung zones. These findings show that obesity-associated factors alter the topographical distribution of ventilation.
Purity Independent Subtyping of Tumors (PurIST), A Clinically Robust, Single-sample Classifier for Tumor Subtyping in Pancreatic Cancer
Authors: Rashid Naim U. , Peng Xianlu L. , Jin Chong , Moffitt Richard A. , Volmar Keith E. , Belt Brian A. , Panni Roheena Z. , Nywening Timothy M. , Herrera Silvia G. , Moore Kristin J. , Hennessey Sarah G. , Morrison Ashley B. , Kawalerski Ryan , Nayyar Apoorve , Chang Audrey E. , Schmidt Benjamin , Kim Hong Jin , Linehan David C. , Yeh Jen Jen 
Published: November 2019

Abstract

Purpose:
Molecular subtyping for pancreatic cancer has made substantial progress in recent years, facilitating the optimization of existing therapeutic approaches to improve clinical outcomes in pancreatic cancer. With advances in treatment combinations and choices, it is becoming increasingly important to determine ways to place patients on the best therapies upfront. Although various molecular subtyping systems for pancreatic cancer have been proposed, consensus regarding proposed subtypes, as well as their relative clinical utility, remains largely unknown and presents a natural barrier to wider clinical adoption.

Experimental Design:
We assess three major subtype classification schemas in the context of results from two clinical trials and by meta-analysis of publicly available expression data to assess statistical criteria of subtype robustness and overall clinical relevance. We then developed a single-sample classifier (SSC) using penalized logistic regression based on the most robust and replicable schema.

Results:
We demonstrate that a tumor-intrinsic two-subtype schema is most robust, replicable, and clinically relevant. We developed Purity Independent Subtyping of Tumors (PurIST), a SSC with robust and highly replicable performance on a wide range of platforms and sample types. We show that PurIST subtypes have meaningful associations with patient prognosis and have significant implications for treatment response to FOLIFIRNOX.

Conclusions:
The flexibility and utility of PurIST on low-input samples such as tumor biopsies allows it to be used at the time of diagnosis to facilitate the choice of effective therapies for patients with pancreatic ductal adenocarcinoma and should be considered in the context of future clinical trials.
Statin Use Is Associated with Lower Risk of PTEN-Null and Lethal Prostate Cancer
Authors: Allott Emma H. , Ebot Ericka M. , Stopsack Konrad H. , Gonzalez-Feliciano Amparo G. , Markt Sarah C. , Wilson Kathryn M. , Ahearn Thomas U. , Gerke Travis A. , Downer Mary K. , Rider Jennifer R. , Freedland Stephen J. , Lotan Tamara L. , Kantoff Philip W. , Platz Elizabeth A. , Loda Massimo , Stampfer Meir J. , Giovannucci Edward , Sweeney Christopher J. , Finn Stephen P. , Mucci Lorelei A. 
Published: November 2019

Abstract

Purpose:
Statins are associated with lower risk of aggressive prostate cancer, but lethal prostate cancer is understudied and contributing mechanisms are unclear. We prospectively examined statins and lethal prostate cancer risk in the Health Professionals Follow-up Study (HPFS), tested associations with molecular subtypes, and integrated gene expression profiling to identify putative mechanisms.

Experimental Design:
Our study included 44,126 men cancer-free in 1990, followed for prostate cancer incidence through 2014, with statin use recorded on biennial questionnaires. We used multivariable Cox regression to examine associations between statins and prostate cancer risk overall, by measures of clinically significant disease, and by ERG and PTEN status. In an exploratory analysis, age-adjusted gene set enrichment analysis identified statin-associated pathways enriched in tumor and adjacent normal prostate tissue.

Results:
During 24 years of follow-up, 6,305 prostate cancers were diagnosed and 801 (13%) were lethal (metastatic at diagnosis or metastatic/fatal during follow-up). Relative to never/past use, current statin use was inversely associated with risk of lethal prostate cancer [HR, 0.76; 95% confidence interval (CI), 0.60–0.96] but not overall disease. We found a strong inverse association for risk of PTEN-null cancers (HR, 0.40; 95% CI, 0.19–0.87) but not PTEN-intact cancers (HR, 1.18; 95% CI, 0.95–1.48; P heterogeneity = 0.01). Associations did not differ by ERG. Inflammation and immune pathways were enriched in normal prostate tissue of statin ever (n = 10) versus never users (n = 103).

Conclusions:
Molecular tumor classification identified PTEN and inflammation/immune activation as potential mechanisms linking statins with lower lethal prostate cancer risk. These findings support a potential causal association and could inform selection of relevant biomarkers for statin clinical trials.
A Novel Zebrafish Model of Metastasis Identifies the HSD11β1 Inhibitor Adrenosterone as a Suppressor of Epithelial–Mesenchymal Transition and Metastatic Dissemination
Authors: Nakayama Joji , Lu Jeng-Wei , Makinoshima Hideki , Gong Zhiyuan 
Published: November 2019

Abstract

Metastasis of cancer cells is multi-step process and dissemination is an initial step. Here we report a tamoxifen-controllable Twist1a-ERT2 transgenic zebrafish line as a new animal model for metastasis research, and demonstrate that this model can serve as a novel platform for discovery of antimetastasis drugs targeting metastatic dissemination of cancer cells. By crossing Twist1a-ERT2 with xmrk (a homolog of hyperactive form of EGFR) transgenic zebrafish, which develops hepatocellular carcinoma, approximately 80% of the double transgenic zebrafish showed spontaneous cell dissemination of mCherry-labeled hepatocytes from the liver to the entire abdomen region and the tail region. The dissemination is accomplished in 5 days through induction of an epithelial-to-mesenchymal transition. Using this model, we conducted in vivo drug screening and identified three hit drugs. One of them, adrenosterone, an inhibitor for hydroxysteroid (11-beta) dehydrogenase 1 (HSD11β1), has a suppressor effect on cell dissemination in this model. Pharmacologic and genetic inhibition of HSD11β1 suppressed metastatic dissemination of highly metastatic human cell lines in a zebrafish xenotransplantation model. Through downregulation of Snail and Slug, adrenosterone-treated cells recovered expression of E-cadherin and other epithelial markers and lost partial expression of mesenchymal markers compared with vehicle-treated cells. Taken together, our model offers a useful platform for the discovery of antimetastasis drugs targeting metastatic dissemination of cancer cells.

Implications:
This study describes a transgenic zebrafish model for liver tumor metastasis and it has been successfully used for identification of some drugs to inhibit metastatic dissemination of human cancer cells.
СТРУКТУРНО-ФУНКЦІОНАЛЬНІ ЗМІНИ ВНУТРІШНІХ ОРГАНІВ БІЛИХ ЩУРІВ ПРИ ЕКСПЕРИМЕНТАЛЬНОМУ ЗАСТОСУВАННІ РІЗНИХ ДОЗ КАРАГІНАНУ
Authors: Kopanytsia O. M. , Mialiuk O. P. 
Published: November 2019

Мета роботи. Вивчити структурну організацію стінки тонкої кишки, міокарда і печінки експериментальних тварин при застосуванні різних концентрацій κ-карагінану.
Матеріали і методи. Дослідження проведено на 36 статевозрілих білих нелінійних щурах-самцях. Тваринам експериментальних груп забезпечили вільний доступ до 0,5 і 1,0 % розчину карагінану в питній воді протягом 1 місяця.
Результати й обговорення. Результати гістологічного дослідження стінки тонкої кишки експерементальних тварин, які отримували 0,5 % розчин карагінану, продемонстрували картину помірно виражених дистрофічних змін епітелію слизової оболонки та ознаки запального процесу (лімфоцитарно-макрофагальна інтоксикація, деформація ворсинок тонкої кишки, відсутність базальної мембрани на деяких ділянках). На світлооптичному рівні мікроскопії патологічні зміни у печінці були мінімальними; будова серцевого м’яза у більшості щурів не відрізнялася від інтактних тварин. При мікроскопічному дослідженні внутрішніх органів білих щурів, які отримували 1 % розчин карагінану, в епітелії слизової оболонки тонкої кишки відмічали ознаки дистрофії: вакуолізацію епітеліоцитів, зміну тинкторіальних властивостей їх цитоплазми, місцями відсутність війчастої облямівки. У печінці балкова структура органа зберігалася. Спостерігали помірно виражений стромальний набряк. Подекуди мали місце помірно виражені альтеративні зміни гепатоцитів, що проявлялися розвитком дрібнокраплинної жирової дистрофії. Зміни серцевого м’яза в експерементальних тварин були виражені помірно. В деяких полях зору поперечна посмугованість кардіоміоцитів визначалася нечітко. Простежували помірно виражений набряк, місцями повнокров’я судин та наявність поодиноких еритроцитів у перивазальних ділянках. Також подекуди були незначні скупчення лімфоцитів.
Висновки. Морфологічні дослідження показали, що введення щурам 0,5 % розчину карагінану зумовлює запальні зміни у тонкій кишці, проте не призводить до значних структурних змін у печінці й серці. Ушкодження епітеліоцитів та їх дистрофія, дезорганізація сполучнотканинних елементів підслизового шару тонкої кишки при застосуванні 1 % карагінану супроводжується морфологічними змінами у печінці й серці.
PREDICTING OF RESPIRATORY TRACT PATHOLOGY RISK FACTORS AND THE NURSES’ KNOWLEDGE IN NOSOCOMIAL PNEUMONIA PREVENTING
Authors: Krynytska I. Ya. , Marushchak M. I. , Mazur L. P. , Dzetsiukh T. I. , Hrad A. O. , Habor H. H. 
Published: November 2019

The aim of the work. To analyze the prevalence of nosocomial pneumonias (NP) in surgical and therapeutic departments and determine the nurses’ knowledge on the problem of preventing hospital pneumonia.
Materials and Methods. In order to determine the nurses’ level of knowledge on the problems of preventing nosocomial pneumonia, a questionnaire was developed and applied, which included 20 questions with answers.
Results and Discussion. The prevalence of hospital pneumonia in the departments of the therapeutic and surgical profiles is high. The incidence of NP in the surgical department is predominant in males, among the risk factors in which tobacco smoking prevails. In females with NP, the main etiological factors include poor nutrition and obesity. Comparing the level of nurses’ knowledge in therapeutic and surgical departments it was found that nurses of surgical department have shown better knowledge of NP identifying and epidemiology. Nursing stuff of both profiles has poor knowledge about pathogens of NP. The most problematic for nurses of both departments is the issue of preventing NP in case of various surgical interventions during preoperative period.
Conclusions. The results of the surveys with this questionnaire can be used to focus educational programs on NP prevention.
МОРФОМЕТРИЧНА ХАРАКТЕРИСТИКА ТОНКОЇ КИШКИ ЩУРІВ ІЗ ХРОНІЧНИМ ЕНТЕРОКОЛІТОМ НА ТЛІ СТРЕПТОЗОТОЦИНОВОГО ДІАБЕТУ
Authors: Lisnianska N. V. , Buchko P. I. , Musienko V. A. 
Published: November 2019

Мета роботи. Встановити морфометричні зміни стінки тонкої кишки тварин із стрептозотоциновим діабетом (СТД), хронічним ентероколітом (ХЕК) та їх поєднанням.
Матеріали і методи. Дослідження проведено на 120 білих нелінійних самцях-щурах з дотриманням принципів Європейської конвенції про захист хребетних тварин, що використовуються для дослідних та інших наукових цілей (Страсбург, 1986) . Цукровий діабет моделювали шляхом однократного внутрішньочеревного введення тваринам стрептозотоцину («Sigma Aldrich», США, в дозі 60 мг/кг маси тіла). Хронічний ентероколіт відтворювали шляхом вільного доступу тварин до 1,0 % розчину карагінану в питній воді протягом 1 місяця.
Результати й обговорення. За результатами мікроморфометрії важливим індикатором дистрофічних змін слизової оболонки у щурів із СТД було істотне зростання частки ушкоджених епітеліоцитів: від контрольного значення (4,47±0,34) % до (16,00±0,59) %. При ХЕК мали місце прояви дистрофії та атрофії, хоча і менш виражені, ніж при експериментальній гіперглікемії: кількість ворсинок зменшувалася на 7,23 %, крипти поглиблювалися на 12,84 %, частка уражених клітин епітелію зростала на 7,83 %. Максимально вираженими були патологічні зміни, які реєстрували при ХЕК на тлі СТД: слизова оболонка стоншувалася на 12,49 %, кількість ворсинок істотно зменшувалася на 44,03 %, частка ушкоджених епітеліоцитів сягала (23,63±0,79) %, зростаючи на 19,17 % щодо контрольної групи.
Висновки. Структурні зміни стінки тонкої кишки білих щурів із СТД характеризуються превалюванням дистрофічних і атрофічних процесів, у тварин із ХЕК переважає картина хронічного запалення, тоді як моделювання ХЕК на тлі СТД указує на поєднання дистрофічних і атрофічних змін та ентериту.
ІСТОРІЯ КВАНТОВО-МЕХАНІЧНИХ МЕТОДІВ ДОСЛІДЖЕННЯ МЕДИКО-БІОЛОГІЧНИХ І ХІМІЧНИХ СИСТЕМ
Authors: Didukh V. D. , Rudyak Yu. A. , Bahrii-Zaiats O. A. , Naumovа L. V. 
Published: November 2019

Мета роботи. Висвітлити історичні шляхи розвитку квантово-механічних методів дослідження, показати їх значущість для минувшини і сьогодення. Матеріали і методи. Результати й обговорення. Історичні шляхи розвитку науки, розкриття закономірностей мають особливе значення для сьогодення. Процес історії становлення та розвитку фізико-медичних і біологічних знань нерозривно пов’язаний із загальною історією людства, науки і змінював наукову картину світу упродовж тисячоліть. Луї де Бройль, Нобелівський лауреат з фізики, писав: «…історія науки не може не цікавити вчених природознавців: учений знаходить у ній… багаточисельні уроки і, навчений власним досвідом, він може краще, ніж будь-хто інший, тлумачити із знанням справи ці уроки». Фізика і медицина – могутні гілки дерева філософії, коріння якого сягає правікових часів. В історії науки шляхи розвитку медицини і фізики і збігалися й перетиналися. Відкриття у медицині та біології породжували нові фізичні ідеї, а досягнення у фізиці сприяли новітнім медико-біологічним дослідженням. У роботі висвітлено роль квантово-механічних методів дослідження медико-біологічних та хімічних систем. Висновки. У статті віддзеркалено історію розвитку квантово-механічних знань, показано як змінювалась наукова картина світу впродовж тисячоліть, розглянуто взаємодоповнюваність і спадкоємність наукових знань, що визначали напрямок розвитку науки та показано ефективність резонансних методів у медико-біологічних дослідженнях.
Cumulative Blood Pressure Exposure During Young Adulthood and Mobility and Cognitive Function in Midlife
Authors: Mahinrad Simin , Kurian Shawn , Garner Chaney R. , Sedaghat Sanaz , Nemeth Alexander J. , Moscufo Nicola , Higgins James P. , Jacobs David R. , Hausdorff Jeffrey M. , Lloyd-Jones Donald M. , Sorond Farzaneh A. 
Published: November 2019

Background:
High blood pressure (BP) is a known risk factor for mobility and cognitive impairment in older adults. This study tested the association of cumulative BP exposure from young adulthood to midlife with gait and cognitive function in midlife. Furthermore, we tested whether these associations were modified by cerebral white matter hyperintensity (WMH) burden.

Methods:
We included 191 participants from the CARDIA study (Coronary Artery Risk Development in Young Adults), a community-based cohort of young individuals followed over 30 years. Cumulative BP was calculated as the area under the curve (mm Hg×years) from baseline up to year 30 examination. Gait and cognition were assessed at the year 30 examination. Cerebral WMH was available at year 30 in a subset of participants (n=144) who underwent magnetic resonance imaging. Multiple linear regression models were used to assess the association of cumulative BP exposure with gait and cognition. To test effect modification by WMH burden, participants were stratified at the median of WMH and tested for interaction.

Results:

Higher cumulative systolic and diastolic BPs were associated with slower walking speed (both
P
=0.010), smaller step length (
P
=0.011 and 0.005, respectively), and higher gait variability (
P
=0.018 and 0.001, respectively). Higher cumulative systolic BP was associated with lower cognitive performance in the executive (
P
=0.021), memory (
P
=0.015), and global domains (
P
=0.010), and higher cumulative diastolic BP was associated with lower cognitive performance in the memory domain (
P
=0.012). All associations were independent of socio-demographics and vascular risk factors (body mass index, smoking, diabetes mellitus and total cholesterol). The association between cumulative BP and gait was moderated by WMH burden (interaction
P
<0.05). However, the relation between cumulative BP and cognitive function was not different based on the WMH burden (interaction
P
>0.05).

Conclusions:
Exposure to higher BP levels from young to midlife is associated with worse gait and cognitive performance in midlife. Furthermore, WMH moderates the association of cumulative BP exposure with gait, but not with cognitive function in midlife. The mechanisms underpinning the impact of BP exposure on brain structure and function must be investigated in longitudinal studies using a life course approach.
Pasolini’s Pauls
Authors: Aichele George 
Published: November 2019

AbstractBecause Pier Paolo Pasolini never completed his movie Saint Paul, any discussion of it must be speculative. However, insofar as the film appears in Pasolini’s screenplay outline and plan, it depicts Paul, in relation to the Pauline writings of the Bible, as a seriously fragmented person. This Paul struggles with multiple personalities that are continually fragmenting and at war with one another. In this way the film fuses together in a single cinematic narrative the many “Pauls” who appear in the Pauline letters and the Acts of the Apostles. The “remixed” quality that then appears in the screenplay contrasts sharply to Pasolini’s The Gospel According to St. Matthew. The resulting story echoes some of the writings of Italo Calvino, as well as Spike Jonze’s movie Adaptation.
Publish or Perish in Social Science?
Authors: Lu Jinjin 
Published: November 2019

Abstract
The national “Double First-class” strategic plan, a new ambitious higher education policy, which was officially launched at the end of September 2017. This emphasises that 42 Chinese universities have a target of being ranked in the global “First-class” category within ten years. Under the guidance of the strategic plan, Chinese academics in Humanities and Social Sciences (HSS) will face significant opportunities and challenges. Compared with those in Science and Technology (S&T), academics in the HSS have less internationalisation in terms of academic discourse power. This study used a mixed-research method to investigate Chinese HSS academics’ perceptions of this innovative strategic plan across different types of universities, academics’ ranks and locations of academic training. Findings showed that these three variables have significant influences on Chinese academics’ perceptions in research publications, research policy understandings and academic promotion strategies.
Inclusive Urban Eco-systems
Authors: Sekhani Richa , Mohan Deepanshu , Roy Sneha 
Published: November 2019

Abstract
Informality, associated with street vendors, is now seen as a generalised mode of metropolitan urbanisation. Street vendors form an important part of several economies around the world and are seen as a vital source of livelihood and employment opportunity for the low-skilled, lower-income class of the population. A closer understanding of profiles of street vendors and the nature of complexities present in the business of street vending—studied through the supply chain processes of product procurement and distribution—helps one in observing an entwined relationship between what are perceived as “informal” or “formal” in the urban ecosystem. This study on street vendors working across Kolkata emphasises the need to adopt an inclusive view to urban “informal” arrangements, providing a comprehensive picture in identified local market spaces. Our research focuses on two critical aspects: (a) capturing samples of oral account(s) from merchants/vendors operating in local markets across Kolkata, and (b) gauging the supply-chain (inventory) process of products procured and sold by street vendors in these markets. The observations made from the field help highlight the complexities present in studying urban supply-chain processes—especially street vending businesses—that form the core of most urban metropolises in cities (such as Kolkata) and are representative of the Global South.