bluuebunny/crossref_metadata_2025_split huggingface dataset:
Le lapin angora : production et amelioration génétique
Authors: THEBAULT R.G. , DE ROCHAMBEAU H. 
Published: August 2020

Cet article présente l’état actuel des connaissances sur les niveaux de productivité quantitatifs et qualitatifs des lapins angora, et plus précisément dans les deux grandes souches sélectionnées : allemande et française. Dans leur système de production respectif, la souche allemande a un potentiel de production quantitative supérieure d’environ 20 % à la souche française, mais cette dernière produit un angora spécial nécessaire à la fabrication de fil fleuffé de haut de gamme. Les paramètres zootechniques sont précisés : quantité individuelle de poil produit, qualité laineuse ou jarreuse de la toison : proportion de poils à colonnes médullaires multiples (jarres) (critère allemand), homogénéité, structure, dureté (critères français). Les systèmes de production diffèrent selon les souches au niveau de l’habitat, mais surtout par le procédé de récolte de la toison : tonte pour les allemands, épilation pour les français. Les facteurs de variations de la production de poil sont le sexe, le numéro de récolte, l’intervalle entre récoltes, la saison, la reproduction. Les paramètres démographiques : taux de renouvellement, taux de fécondité ... doivent être améliorés, en France, par la modification de pratiques d’élevage et l’utilisation de l’insémination artificielle. Un nouveau programme d’amélioration génétique de la souche française est en place, dans le but d’améliorer la productivité, au point de vue quantitatif, tout en conservant sa spécificité qualitative (angora « jarreux »).
La composition corporelle du lapin. Facteurs de variation
Authors: OUHAYOUN J. 
Published: August 2020

Dans les élevages de lapins spécialisés, la production d’une femelle est de l’ordre de 45 lapereaux abattus par an, soit 60 kg de viande. Généralement de format adulte moyen (4 kg) ces lapereaux fournissent en 10-11 semaines une carcasse de 1,3 kg dont les morceaux nobles (83 % de la carcasse), comestibles à 85 %, sont particulièrement maigres (moins de 3 % de tissu gras). L’espèce cunicole est riche en races de formats très différents. Celles-ci représentent un potentiel important de diversification qualitative de la viande. En particulier, les races géantes sont intéressantes dans la mesure où la découpe et la transformation se développent. Les principales caractéristiques bouchères des carcasses : le rendement à l’abattage, le rapport muscle/os et éventuellement l’adiposité peuvent être modifiées par sélection en race pure. L’amélioration de la vitesse de croissance par sélection ou par augmentation de la teneur en protéines de l’aliment, qui favorise la voie glycolytique du métabolisme énergétique musculaire, peut entraîner une dégradation de la qualité de la viande. Lorsque la vitesse de croissance des lapereaux est accrue, soit par un meilleur équilibre des nutriments (protéines/ énergie, notamment), soit par un apport alimentaire élevé (nourriture à volonté, teneur en lest minimum), les caractéristiques corporelles sont modifiées. Les proportions des tissus précoces (tractus digestif, squelette et éventuellement peau) sont réduites, celles des tissus tardifs (tissu musculaire et surtout tissu adipeux) sont augmentées ; par conséquent, le rendement à l’abattage, le rapport muscle/os et l’adiposité sont favorisés. Chez le lapin, herbivore monogastrique, la supplémentation en lipides de l’aliment, destinée à élever le niveau énergétique de la ration sans abaisser celui des glucides indigestibles, peut intervenir sur la stabilité thermique et chimique des graisses corporelles.
Les défauts de couleur du tissu adipeux sous-cutané des carcasses d’ovins
Authors: PRACHE S. , AUROUSSEAU B. , THERIEZ M. , RENERRE M. 
Published: August 2020

Les caractéristiques de couleur et de fermeté de 27 échantillons de tissu adipeux récoltés en abattoir (4 blancs, 4 jaunes, 19 brun-rouge) ont été décrites par différentes méthodes utilisables en abattoir ou en laboratoire (en particulier, la spectrocolorimétrie). Pour certains de ces échantillons, des informations concernant les conditions d’élevage des animaux ont pu être collectées. Les tissus adipeux blancs « de référence » étaient fermes et correspondaient à des agneaux produits essentiellement à l’herbe. Nous y avons trouvé une faible quantité de pigments héminiques, probablement de l’oxyhémoglobine résiduelle après saignée. Les tissus adipeux jaunes étaient colorés par des pigments héminiques, et par des pigments caroténoïdes et/ou de la bilirubine et présentaient des caractéristiques de fermeté assez proches de celles des tissus adipeux blancs. Les origines possibles de ces défauts de coloration sont présentées. Les tissus adipeux brun-rouge provenaient généralement d’animaux ayant reçu des rations riches en concentré. Ces tissus présentaient des défauts de fermeté dus à une diminution de leur teneur en lipides et à une modification de leur composition en acides gras. Le défaut de coloration a pu être attribué 1) à un effet du degré de fermeté du tissu adipeux sur la réflexion de la lumière, 2) à l’accumulation excessive de pigments héminiques. Celle-ci résulte de la fragilisation de la membrane des érythrocytes du fait des caractéristiques de composition en acides gras des phospholipides, 3) aux produits de la peroxydation des acides gras insaturés, elle même stimulée par ces pigments héminiques.
Production laitière et fonctionnement des exploitations : facteurs de variation dans les exploitations du Pays de Thônes (Haute-Savoie)
Authors: COULON J.B. , ROYBIN D. , CRISTOFINI B. 
Published: August 2020

La production laitière (kg/vache/an) de 67 exploitations du Pays de Thônes adhérentes au Contrôle Laitier a été analysée. Ces exploitations avaient fait l’objet d’une étude préalable détaillée de leurs caractéristiques, aboutissant à une typologie de fonctionnement (12 types différents). Les variations de la production laitière (1 800 à 6 220 kg/vache/an selon les exploitations) n’ont pas été liées à la structure des exploitations (taille, système fourrager) mais à la maîtrise plus ou moins complète des facteurs génétiques et de conduite du troupeau (conduite des vêlages, alimentation hivernale et estivale). Les exploitations les plus productives présentent aussi une meilleure valorisation économique du lait, liée en partie à une meilleure qualité des fromages produits. Lorsque l’on analyse les différences de production laitière entre les différents types d’exploitations, et à l’intérieur des principaux types, on s’aperçoit qu’il existe des fonctionnements : 1 / plus favorables que d’autres à l’expression de cette production, 2 / dans lesquels il n’y a pas cohérence entre les 2 principaux facteurs d’amélioration (génétique et alimentation) de cette production, 3 / pour lesquels la prise en compte de ces seuls facteurs s’avère inopérante pour comprendre les variations de la production laitière. Par ailleurs, tous les types d’exploitations ne présentent pas les mêmes marges de progrès. Ces résultats sont discutés en fonction de la méthode d’analyse employée et de leur intérêt pour le développement.
Niveau et répartition des apports de concentré hivernaux chez la vache laitière. Résultats sur primipares
Authors: COULON J.B. , D’HOUR P. , PETIT M. , ALBARET E. , JAWOREK M. 
Published: August 2020

Cent dix neuf vaches laitières en première lactation ayant vêlé en moyenne le 6 décembre ont été utilisées au cours d’un essai conduit 3 années consécutives. Au cours de l’hiver, tous les animaux recevaient une ration de base composée d’ensilage d’herbe (à volonté) et de foin (4 kg/j). Chaque année 5 lots ont été constitues : 3 niveaux d’apport de concentré au cours de la période hivernale (haut H, moyen M et bas B), et pour chacun des 2 niveaux inférieurs, 2 modes de répartition du concentré (classique (C) ou uniforme (U)), ont été comparés. Au pâturage toutes les vaches ont été conduites ensemble. Au cours de la période expérimentale (semaine 4 à 18 de lactation), les vaches du lot H et des lots M et B ont ingéré respectivement 6,3, 4,8 et 3,5 kg MS/j de concentré et 9,2, 9,5 et 9,8 kg MS/j de fourrages. Les vaches du lot H ont produit en moyenne plus de lait (1,2 et 3,1 kg/j par rapport a celles des lots MC et BC), lait d’une teneur plus élevée en protéines (+ 0,6 et + 1,7 g/kg). Au cours de l’hiver, les variations de poids vifs ont été respectivement de + 1, - 26 et - 39 kg dans les lots H, M et B. A l’échelle de la lactation (305 j) les écarts de production atteignent 169 et 577 kg pour des écarts d’apport de concentré de 202 et 420 kg MS. Il n’y a pas eu d’effet significatif du mode de répartition du concentré sur les performances des animaux. Ces résultats sont discutes en fonction du niveau de production des animaux, et de leur conséquence sur leur carrière ultérieure.
Systèmes de production laitiers en montagne : évolutions récentes et adaptations possibles. Exemple d’exploitations en Haute-Loire
Authors: DOBREMEZ L. , LIENARD G. , BARRET M. 
Published: August 2020

Le développement des exploitations laitières de montagne, déjà handicapées par les conditions naturelles qui limitent les rendements et génèrent des surcoûts, a été très perturbé par l’instauration des quotas de production en 1984. Dans les montagnes de Haute-Loire, la production laitière est relativement récente ; elle s’est développée à partir d’un système basé sur le veau de boucherie sous la mère et beaucoup d’exploitations conservent les marques de cette évolution. Ainsi, les quotas ont touché beaucoup d’élevages dont la mutation laitière n’était pas achevée. L’étude se propose, à partir d’un échantillon de 30 exploitations, « ayant de l’avenir », de montrer quelles ont été les évolutions depuis le début des quotas. Les trois premières années, les effets ont été masqués par les limitations de rendement provenant du climat lui-même et par l’octroi de références supplémentaires. Mais les conditions favorables de la quatrième campagne ont provoqué une forte amélioration des rendements laitiers obligeant les éleveurs à prendre des mesures d’ajustement. La constitution d’une typologie de « profils » d’exploitations permet d’analyser les trajectoires et les logiques de fonctionnement en dégageant des voies d’adaptation différenciées. Certaines exploitations ont adopté, depuis longtemps, une forte spécialisation laitière, avec vaches Pie-Noires et intensification poussée ; cette voie est exigeante en technicité et en ressources alimentaires ; elle est très sensible aux quotas. D’autres, ayant plus de surface, ont conservé, avec des vaches Pie-Rouges de bon niveau laitier, une orientation lait + veaux croisés vendus à un mois. Cette voie est sans doute mieux adaptée à l’évolution que doivent réaliser beaucoup de jeunes restés proches du système traditionnel. L’évolution difficile des exploitations ayant réalisé trop brutalement une modernisation complète montre la nécessité, plus forte en montagne qu’en plaine, de mieux préparer et étaler les investissements très lourds. L’important est de préserver une certaine diversité d’orientation pour les systèmes laitiers en montagne, et de proposer, à côté des voies basées sur une forte intensification, des évolutions prenant mieux en compte les systèmes mixtes possibles et une intensification modérée, plus facilement envisageables dans l’avenir avec l’agrandissement progressif des exploitations.
Gènes majeurs chez la poule (Gallus Gallus) : autres gènes que ceux affectant la taille
Authors: MERAT P. 
Published: August 2020

Les effets et l’utilité de gènes chez la poule autres que ceux influant sur la taille ont été recherchés. Plusieurs gènes liés au sexe (coloration, emplumement) permettent le sexage à l’éclosion. Le gène « crête en pois » améliore de 2 % le taux de conversion des pondeuses. Plusieurs gènes de dépigmentation du plumage abaissent légèrement le poids, améliorent l’indice de consommation pour la ponte et l’état du plumage. L’allèle albinos lié au sexe apparaît supérieur pour la ponte en forte intensité lumineuse. Le gène « Cou nu » augmente le rendement en viande des poulets ; il amoindrit l’efficacité alimentaire aux températures modérées, mais, au-dessus de 30°, est bénéfique pour la croissance, la viabilité, le poids des oeufs et la reproduction. Il pourrait être utile en climats chauds. Le gène « Frisé » n’a pas d’effets aussi prononcés. L’emplumement lent, utilisé dans des croisements sexables, est lié en race Leghorn à un « gène viral » et augmente le risque d’infection leucosique par l’oeuf. Au locus B (complexe majeur d’histocompatibilité), certains génotypes affectent la résistance à la maladie de Marek, contre laquelle les vaccins ne sont pas totalement efficaces. Un gène responsable d’une mauvaise odeur des oeufs lorsque du tourteau de colza est incorporé dans la ration existe dans certaines populations où son éradication a été envisagée. L’emploi de facteurs mendéliens peut être indiqué en vue de caractères coûteux à sélectionner directement ou d’environnements non réalisables par le sélectionneur. Les conditions optimales d’utilisation d’un gène nouveau peuvent comporter la correction de certains de ses effets.
Les lipides de dépôt chez les poissons d’élevage : contrôle cellulaire, métabolique et hormonal
Authors: FAUCONNEAU B. , CORRAZE G. , LEBAIL J.Y. , VERNIER J.M. 
Published: August 2020

Cet article a pour but de dégager les spécificités cellulaires, métaboliques et hormonales du dépôt de lipides chez les poissons sur la base de données bibliographiques existantes et de données personnelles. Il n’existe que très peu d’informations sur l’existence et les caractéristiques des tissus adipeux chez les poissons. Nous supposons indirectement que le développement des tissus adipeux se fait selon des mécanismes similaires à ceux observés chez les mammifères, c’est-à-dire à la fois par hypertrophie et par hyperplasie. Toutefois l’implication du phénomène d’hyperplasie doit être démontrée directement. Les lipoprotéines circulantes impliquées dans le transport des lipides provenant de l’aliment et des lipides provenant des dépôts sont similaires chez les poissons et chez les mammifères exceptée pour la vitellogénine qui apparaît lors du développement des gonades femelles. Le transport du cholestérol semble différent de celui des mammifères, mais la spécificité de ce phénomène reste à étudier. Les points de contrôle du transport et de la mobilisation des lipides se situent à deux niveaux : la composition en apoprotéines des lipoprotéines et les enzymes responsables de la métabolisation des lipoprotéines. Le dépôt de lipides est contrôlé directement par une hormone : l’insuline. Le contrôle indirect du dépôt de lipides et le contrôle direct de la mobilisation des lipides font appel à un complexe multi-hormonal impliquant les hormones hypohysaires, thyroïdiennes, pancréatiques et corticostéroïdes. Le poisson présente l’originalité d’être dépendant de l’environnement dans sa capacité de stockage des lipides et d’avoir une forte capacité physiologique de mobilisation et de redistribution de ses dépôts.
LncRNA and transcriptomic analysis of fetal membrane reveal potential targets involved in oligohydramnios
Authors: Ou Yu-hua , Liu Yu-kun , Zhu Li-qiong , Chen Man-qi , Yi Xiao-chun , Chen Hui , Zhang Jian-ping 
Published: August 2020

Abstract
Background: The multiple causes of oligohydramnios make it challenging to study. Long noncoding RNAs (lncRNAs) are sets of RNAs that have been proven to function in multiple biological processes. The purpose of this study is to study expression level and possible role of lncRNAs in oligohydramnios.Methods: In this study, total RNA was isolated from fetal membranes resected from oligohydramnios pregnant women (OP) and normal amount of amniotic fluid pregnant women (Normal). LncRNA microarray was used to analyze the differentially expressed lncRNAs and mRNAs. Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes (KEGG) was used to analyze the main enrichment pathways of differentially expressed mRNAs. Real-time quantitative PCR (qPCR) was used to validate the lncRNA expression level.Results: LncRNA microarray analysis revealed that a total of 801 lncRNAs and 367 mRNAs were differentially expressed in OP; in these results, 638 lncRNAs and 189 mRNAs were upregulated, and 163 lncRNAs and 178 mRNAs were downregulated. Of the lncRNAs, 566 were intergenic lncRNAs, 351 were intronic antisense lncRNAs, and 300 were natural antisense lncRNAs. The differentially expressed lncRNAs were primarily located in chromosomes 2, 1, and 11. KEGG enrichment pathways revealed that the differentially expressed mRNAs were enriched in focal adhesion as well as in the signaling pathways of Ras, TNF, estrogen, and chemokine. The qPCR results confirmed that LINC00515 and RP11-388P9.2 were upregulated in OP. Furthermore, the constructed lncRNA–miRNA–mRNA regulatory network revealed TNR, CFTR, ABCA12, and COL9A2 as the candidate targets of LINC00515 and RP11-388P9.2.Conclusions: In summary, we revealed the profiles of lncRNA and mRNA in OP. These results might offer potential targets for biological prevention for pregnant women with oligohydramnios detected before delivery and provided a reliable basis for clinical biological treatment in OP.
Comparative transcriptome analysis reveals evolutionary divergence and shared network of cold and salt stress response in diploid D-genome cotton
Authors: Xu Yanchao , Magwanga Richard , Jin Dingsha , Cai Xiaoyan , Hou Yuqing , Zheng Juyun , Agong Stephen Gaya , Zhou Baoliang , Wang Kunbo , Liu Fang , Zhou Zhongli 
Published: August 2020

Abstract
Background Wild species of cotton are excellent resistance to abiotic stress. Diploid D-genome cotton showed abundant phenotypic diversity and was the putative donor species of allotetraploid cotton which produce the largest textile natural fiber. Results A total of 41,053 genes were expressed in all samples by mapping RNA-seq Illumina reads of G. thu rberi (D1), G. klotzschianum (D3-k), G. raimondii (D5) and G. trilobum (D8) to reference genome. The numbers of differently expressed genes (DEGs) were significantly higher under cold stress than salt stress. However, 34.1% DEGs under salt stress were overlapped with cold stress in four species. Notably, a potential shared network (cold and salt response, including 16 genes) was mined out by gene co-expression analysis. A total of 47,180- 55,548 unique genes were identified in four diploid species by De novo assembly. Furthermore, 163, 344, 330, and 161 positively selected genes (PSGs) were detected in thurberi, G. klotzschianum, G. raimondii and G. trilobum by evolutionary analysis, respectively, and 9.5% - 17% PSGs of four species were DEGs in corresponding species under cold or salt stress. What’s more, most of PSGs were enriched GO term related to response to stimulation. G. klotzschianum showed the best tolerance under both cold and salt stress. Interestingly, we found that a RALF-like protein coding gene not only is PSGs of G. klotzschianum, but also belongs to the potential shared network. Conclusion Our study provided new evidence that gene expression variations of evolution by natural selection were essential drivers of the morphological variations related to environmental adaptation during evolution. Additionally, there exist shared regulated networks under cold and salt stress, such as Ca2+ signal transduction and oxidation-reduction processes. Our work establishes a transcriptomic selection mechanism for altering gene expression of the four diploid D-genome cotton and provides available gene resource underlying multi-abiotic resistant cotton breeding strategy.
Impact of polyclonal antithymocyte globulins on kidney transplant outcomes in real-life: a propensity score analysis
Authors: Bamoulid Jamal , Crepin Thomas , Gaiffe Emilie , Moulin Bruno , Frimat Luc , Rieu Philippe , Mousson Christiane , Durrbach Antoine , Heng Anne-Elisabeth , Rebibou Jean-Michel , Saas Philippe , Courivaud Cécile , Ducloux Didier 
Published: August 2020

Abstract
Background: Randomized studies reported a marginal superiority of polyclonal antithymocyte globulins (ATG, Thymoglobulin®, Sanofi, Gentilly, France, or Fresenius®, Bad Homburg, Germany) to prevent acute rejection compared to monoclonal anti-CD25 antibodies (IL2Ra). Nevertheless, the representativeness and the generalizability of these studies are questionable. Methods: We studied the impact of ATG use in real-life conditions in a multicenter study. Propensity score analysis was performed to address potential confounding by indication. Results: 817 patients were included. Logistic regression revealed that age, male gender, a pre-transplant history of cancer, presence of anti-HLA antibodies, previous kidney transplantation, and transplant center were associated with ATG use. The area under the curve of the propensity score was 0.84 + 0.02. ATG use was not associated with a lower rate of acute rejection (18.2% in ATG-treated patients vs 15.8% in non-ATG-treated patients, p =0.356). Adjustment for propensity score slightly modified the relationship between ATG and acute rejection towards a more neutral effect ( p =0.913). Score match analysis recapitulated the previous result. ATG use was associated with the occurrence of opportunistic infection ( p =0.034). There was no difference in graft loss or death between the two groups. Conclusions: In real-life conditions, ATG does not substantially reduce the risk of acute rejection after kidney transplantation. A better discrimination of patients who may benefit from ATG is required.
Relationship between Internet addiction and sleep disturbance in high school students: a cross-sectional study
Authors: Tokiya Mikiko , Itani Osamu , Otsuka Yuichiro , Kaneita Yoshitaka 
Published: August 2020

Abstract
Background: The increase in the number of Internet users has increased Internet dependence worldwide. In adolescents, this dependence may interfere with sleep, which is important for the development of psychophysiological capabilities. However, few large-scale surveys have described the relationship between Internet addiction (IA) and sleep disturbance using standardized questionnaires. We conducted a survey in one prefecture in Japan to determine the relationship between sleep disturbance and IA in adolescents based on the categories of the Young Diagnostic Questionnaire (YDQ).Methods: In 2016, high school students (N=10,405, age range: 15–16 years) in all 54 daytime high schools in the selected prefecture were surveyed using a self-administered questionnaire. Participants with scores > 5.5 points on the Japanese version of the Pittsburgh Sleep Quality Index were defined as having a sleep disturbance. IA was evaluated using the YDQ: Participants with five to eight YDQ items present were classified as having IA; those with three or four items present were classified as “at risk of IA”; and those with two or less YDQ items were classified as “non-IA”. Multiple logistic regression analysis was performed with sleep disturbance as the dependent variable, IA as the explanatory variable, and adjustments for eight other variables.Results: High YDQ scores were associated with a high prevalence of sleep disturbance in boys and girls. These findings persisted after controlling for other factors in the multiple regression model.Conclusions: Among Japanese adolescents, there was a significant independent relationship between IA and sleep disturbance.