bluuebunny/crossref_metadata_2025_split huggingface dataset:
Understanding the cumulative risk of maternal prenatal biopsychosocial factors on birth weight: a DynaHEALTH study on two birth cohorts
Authors: Parmar Priyanka , Lowry Estelle , Vehmeijer Florianne , El Marroun Hanan , Lewin Alex , Tolvanen Mimmi , Tzala Evangelia , Ala-Mursula Leena , Herzig Karl-Heinz , Miettunen Jouko , Prokopenko Inga , Rautio Nina , Jaddoe Vincent WV , Järvelin Marjo-Riitta , Felix Janine , Sebert Sylvain 
Published: June 2020

BackgroundThere are various maternal prenatal biopsychosocial (BPS) predictors of birth weight, making it difficult to quantify their cumulative relationship.MethodsWe studied two birth cohorts: Northern Finland Birth Cohort 1986 (NFBC1986) born in 1985–1986 and the Generation R Study (from the Netherlands) born in 2002–2006. In NFBC1986, we selected variables depicting BPS exposure in association with birth weight and performed factor analysis to derive latent constructs representing the relationship between these variables. In Generation R, the same factors were generated weighted by loadings of NFBC1986. Factor scores from each factor were then allocated into tertiles and added together to calculate a cumulative BPS score. In all cases, we used regression analyses to explore the relationship with birth weight corrected for sex and gestational age and additionally adjusted for other factors.ResultsFactor analysis supported a four-factor structure, labelled closely to represent their characteristics as ‘Factor1-BMI’ (body mass index), ‘Factor2-DBP’ (diastolic blood pressure), ‘Factor3-Socioeconomic-Obstetric-Profile’ and ‘Factor4-Parental-Lifestyle’. In both cohorts, ‘Factor1-BMI’ was positively associated with birth weight, whereas other factors showed negative association. ‘Factor3-Socioeconomic-Obstetric-Profile’ and ‘Factor4-Parental-Lifestyle’ had the greatest effect size, explaining 30% of the variation in birth weight. Associations of the factors with birth weight were largely driven by ‘Factor1-BMI’. Graded decrease in birth weight was observed with increasing cumulative BPS score, jointly evaluating four factors in both cohorts.ConclusionOur study is a proof of concept for maternal prenatal BPS hypothesis, highlighting the components snowball effect on birth weight in two different European birth cohorts.
Does urbanicity modify the relationship between a polygenic risk score for depression and mental health symptoms? Cross-sectional evidence from the observational HUNT Study in Norway
Authors: Sund Erik Reidar , van Lenthe Frank J , Avendano Mauricio , Raina Parminder , Krokstad Steinar 
Published: June 2020

BackgroundResearch suggests that genetic predisposition for common mental disorders may be moderated by the environment. This study examines whether a polygenic risk score (PRS) for depression is moderated by the level of residential area urbanicity using five symptoms of poor mental health as outcomes.MethodsThe study sample consisted of 41 198 participants from the 2006–2008 wave of the Norwegian HUNT study. We created a weighted PRS for depression based on 99 variants identified in a recent genome -wide association study. Participants were classified into urban or rural place of residence based on wards that correspond to neighbourhoods. Mixed effects logistic regression models with participants nested in 477 neighbourhoods were specified.ResultsA SD increase in PRS for depression was associated with a small but statistically significant increase in the odds of anxiety, comorbid anxiety and depression and mental distress. Associations for depression were weaker and not statistically significant. Compared with urban residents, rural resident had higher odds for reporting poor mental health. Genetic propensity for depression was higher for residents of urban than rural areas, suggesting gene–environment correlation. There was no sign of effect modification between genetic propensity and urbanicity for depression, anxiety, comorbid anxiety and depression, or mental distress.ConclusionThe PRS predicted small but significant odds of anxiety, comorbid anxiety and depression and mental distress, but we found no support for a differential effect of genetic propensity in urban and rural neighbourhoods for any of the outcomes.
MRI of tumor T cell infiltration in response to checkpoint inhibitor therapy
Authors: Jiang Xiaoyu , Dudzinski Stephanie , Beckermann Kathryn E , Young Kirsten , McKinley Eliot , McIntyre J Oliver , Rathmell Jeffrey C , Xu Junzhong , Gore John C 
Published: June 2020

BackgroundImmune checkpoint inhibitors, the most widespread class of immunotherapies, have demonstrated unique response patterns that are not always adequately captured by traditional response criteria such as the Response Evaluation Criteria in Solid Tumors or even immune-specific response criteria. These response metrics rely on monitoring tumor growth, but an increase in tumor size and/or appearance after starting immunotherapy does not always represent tumor progression, but also can be a result of T cell infiltration and thus positive treatment response. Therefore, non-invasive and longitudinal monitoring of T cell infiltration are needed to assess the effects of immunotherapies such as checkpoint inhibitors. Here, we proposed an innovative concept that a sufficiently large influx of tumor infiltrating T cells, which have a smaller diameter than cancer cells, will change the diameter distribution and decrease the average size of cells within a volume to a degree that can be quantified by non-invasive MRI.MethodsWe validated our hypothesis by studying tumor response to combination immune-checkpoint blockade (ICB) of anti-PD-1 and anti-CTLA4 in a mouse model of colon adenocarcinoma (MC38). The response was monitored longitudinally using Imaging Microstructural Parameters Using Limited Spectrally Edited Diffusion (IMPULSED), a diffusion MRI-based method which has been previously shown to non-invasively map changes in intracellular structure and cell sizes with the spatial resolution of MRI, in cell cultures and in animal models. Tumors were collected for immunohistochemical and flow cytometry analyzes immediately after the last imaging session.ResultsImmunohistochemical analysis revealed that increased T cell infiltration of the tumors results in a decrease in mean cell size (eg, a 10% increase of CD3+T cell fraction results a ~1 µm decrease in the mean cell size). IMPULSED showed that the ICB responders, mice with tumor volumes were less than 250 mm3or had tumors with stable or decreased volumes, had significantly smaller mean cell sizes than both Control IgG-treated tumors and ICB non-responder tumors.ConclusionsIMPULSED-derived cell size could potentially serve as an imaging marker for differentiating responsive and non-responsive tumors after checkpoint inhibitor therapies, a current clinical challenge that is not solved by simply monitoring tumor growth.
More than just filler: an empirically informed ethical analysis of non-surgical cosmetic procedures in body dysmorphic disorder
Authors: Lane Natalie M 
Published: June 2020

ObjectivesTo identify and analyse ethical considerations raised when individuals with body dysmorphic disorder (BDD) consult for non-surgical cosmetic procedures.MethodsEthical analysis was conducted addressing the issues of best interests and capacity to consent for non-surgical cosmetic procedures in individuals with BDD. Analysis was informed by the findings of semistructured interviews with non-surgical cosmetic practitioners and mental health professionals.FindingsNon-surgical cosmetic interventions were viewed not to be in the best interests of individuals with BDD, as they fail to address core psychological issues, result in dissatisfaction post-procedure, and risk harm. Referral to mental health services was advocated, however numerous obstacles to this were perceived. The issue of capacity to consent to non-surgical cosmetic procedures raised questions regarding whether standard capacity assessment is sensitive to the manner in which BDD may influence decision-making processes. In addition, concerns were voiced that decisions made by individuals with BDD in this context may be judged foolish, and thus wrongly equated with lack of capacity.Discussion/conclusionsEthical analysis, informed by the available evidence base, suggests that it is generally not in the best interests of individuals with BDD to undergo non-surgical cosmetic intervention, and referral to mental health services is indicated. Analysis of capacity draws parallels between BDD and anorexia nervosa, as decision-making capacity in both conditions can be impaired by pathological values derived from the disorder. Means of differentiating clinical assessment of pathological values from inappropriate value judgements are advocated, in order to safeguard against the latter encroaching into capacity assessment.
QCD Sum Rules Analysis of Weak Decays of Doubly-Heavy Baryons
Authors: Shi Yu-Ji , Wang Wei , Zhao Zhen-Xing 
Published: June 2020

AbstractWe calculate the weak decay form factors of doubly-heavy baryons using three-point QCD sum rules. The Cutkosky rules are used to derive the double dispersion relations. We include perturbative contributions and condensation contributions up to dimension five, and point out that the perturbative contributions and condensates with lowest dimensions dominate. An estimate of a part of the gluon–gluon condensates show that it plays a less important role. With these form factors at hand, we present a phenomenological study of semileptonic decays. The future experimental facilities can test these predictions, and deepen our understanding of the dynamics in the decays of doubly-heavy baryons.
BISTRO
Authors: Feygin Sidney A. , Lazarus Jessica R. , Forscher Edward H. , Golfier-Vetterli Valentine , Lee Jonathan W. , Gupta Abhishek , Waraich Rashid A. , Sheppard Colin J. R. , Bayen Alexandre M. 
Published: June 2020

The current trend toward urbanization and adoption of flexible and innovative mobility technologies will have complex and difficult-to-predict effects on urban transportation systems. Comprehensive methodological frameworks that account for the increasingly uncertain future state of the urban mobility landscape do not yet exist. Furthermore, few approaches have enabled the massive ingestion of urban data in planning tools capable of offering the flexibility of scenario-based design.
This article introduces Berkeley Integrated System for Transportation Optimization (BISTRO), a new open source transportation planning decision support system that uses an agent-based simulation and optimization approach to anticipate and develop adaptive plans for possible technological disruptions and growth scenarios. The new framework was evaluated in the context of a machine learning competition hosted within Uber Technologies, Inc., in which over 400 engineers and data scientists participated. For the purposes of this competition, a benchmark model, based on the city of Sioux Falls, South Dakota, was adapted to the BISTRO framework. An important finding of this study was that in spite of rigorous analysis and testing done prior to the competition, the two top-scoring teams discovered an unbounded region of the search space, rendering the solutions largely uninterpretable for the purposes of decision-support. On the other hand, a follow-on study aimed to fix the objective function. It served to demonstrate BISTRO’s utility as a human-in-the-loop cyberphysical system: one that uses scenario-based optimization algorithms as a feedback mechanism to assist urban planners with iteratively refining objective function and constraints specification on intervention strategies. The portfolio of transportation intervention strategy alternatives eventually chosen achieves high-level regional planning goals developed through participatory stakeholder engagement practices.
A Genetic Risk Score to Personalize Prostate Cancer Screening, Applied to Population Data
Authors: Huynh-Le Minh-Phuong , Fan Chun Chieh , Karunamuni Roshan , Walsh Eleanor I. , Turner Emma L. , Lane J. Athene , Martin Richard M. , Neal David E. , Donovan Jenny L. , Hamdy Freddie C. , Parsons J. Kellogg , Eeles Rosalind A. , Easton Douglas F. , Kote-Jarai Zsofia , Amin Al Olama Ali , Benlloch Garcia Sara , Muir Kenneth , Grönberg Henrik , Wiklund Fredrik , Aly Markus , Schleutker Johanna , Sipeky Csilla , Tammela Teuvo LJ , Nordestgaard Børge Grønne , Key Timothy J. , Travis Ruth C. , Pharoah Paul D.P. , Pashayan Nora , Khaw Kay-Tee , Thibodeau Stephen N. , McDonnell Shannon K. , Schaid Daniel J. , Maier Christiane , Vogel Walther , Luedeke Manuel , Herkommer Kathleen , Kibel Adam S. , Cybulski Cezary , Wokolorczyk Dominika , Kluzniak Wojciech , Cannon-Albright Lisa A. , Brenner Hermann , Schöttker Ben , Holleczek Bernd , Park Jong Y. , Sellers Thomas A. , Lin Hui-Yi , Slavov Chavdar Kroumov , Kaneva Radka P. , Mitev Vanio I. , Batra Jyotsna , Clements Judith A. , Spurdle Amanda B. , Teixeira Manuel R. , Paulo Paula , Maia Sofia , Pandha Hardev , Michael Agnieszka , Mills Ian G. , Andreassen Ole A. , Dale Anders M. , Seibert Tyler M. 
Published: June 2020

Abstract

Background:
A polygenic hazard score (PHS), the weighted sum of 54 SNP genotypes, was previously validated for association with clinically significant prostate cancer and for improved prostate cancer screening accuracy. Here, we assess the potential impact of PHS-informed screening.

Methods:
United Kingdom population incidence data (Cancer Research United Kingdom) and data from the Cluster Randomized Trial of PSA Testing for Prostate Cancer were combined to estimate age-specific clinically significant prostate cancer incidence (Gleason score ≥7, stage T3–T4, PSA ≥10, or nodal/distant metastases). Using HRs estimated from the ProtecT prostate cancer trial, age-specific incidence rates were calculated for various PHS risk percentiles. Risk-equivalent age, when someone with a given PHS percentile has prostate cancer risk equivalent to an average 50-year-old man (50-year-standard risk), was derived from PHS and incidence data. Positive predictive value (PPV) of PSA testing for clinically significant prostate cancer was calculated using PHS-adjusted age groups.

Results:
The expected age at diagnosis of clinically significant prostate cancer differs by 19 years between the 1st and 99th PHS percentiles: men with PHS in the 1st and 99th percentiles reach the 50-year-standard risk level at ages 60 and 41, respectively. PPV of PSA was higher for men with higher PHS-adjusted age.

Conclusions:
PHS provides individualized estimates of risk-equivalent age for clinically significant prostate cancer. Screening initiation could be adjusted by a man's PHS.

Impact:
Personalized genetic risk assessments could inform prostate cancer screening decisions.
HIST1H2BB and MAGI2 Methylation and Somatic Mutations as Precision Medicine Biomarkers for Diagnosis and Prognosis of High-grade Serous Ovarian Cancer
Authors: Valle Blanca L. , Rodriguez-Torres Sebastian , Kuhn Elisabetta , Díaz-Montes Teresa , Parrilla-Castellar Edgardo , Lawson Fahcina P. , Folawiyo Oluwasina , Ili-Gangas Carmen , Brebi-Mieville Priscilla , Eshleman James R. , Herman James , Shih Ie-Ming , Sidransky David , Guerrero-Preston Rafael 
Published: June 2020

Abstract
Molecular alterations that contribute to long-term (LT) and short-term (ST) survival in ovarian high-grade serous carcinoma (HGSC) may be used as precision medicine biomarkers. DNA promoter methylation is an early event in tumorigenesis, which can be detected in blood and urine, making it a feasible companion biomarker to somatic mutations for early detection and targeted treatment workflows. We compared the methylation profile in 12 HGSC tissue samples to 30 fallopian tube epithelium samples, using the Infinium Human Methylation 450K Array. We also used 450K methylation arrays to compare methylation among HGSCs long-term survivors (more than 5 years) and short-term survivors (less than 3 years). We verified the array results using bisulfite sequencing and methylation-specific PCR (qMSP). in another cohort of HGSC patient samples (n = 35). Immunoblot and clonogenic assays after pharmacologic unmasking show that HIST1H2BB and MAGI2 promoter methylation downregulates mRNA expression levels in ovarian cancer cells. We then used qMSP in paired tissue, ascites, plasma/serum, vaginal swabs, and urine from a third cohort of patients with HGSC cancer (n = 85) to test the clinical potential of HIST1H2BB and MAGI2 in precision medicine workflows. We also performed next-generation exome sequencing of 50 frequently mutated in human cancer genes, using the Ion AmpliSeqCancer Hotspot Panel, to show that the somatic mutation profile found in tissue and plasma can be quantified in paired urine samples from patients with HGSC. Our results suggest that HIST1H2BB and MAGI2 have growth-suppressing roles and can be used as HGSC precision medicine biomarkers.
In Human Visualization of Ibrutinib-Induced CLL Compartment Shift
Authors: Mayerhoefer Marius E. , Haug Alexander , Jäger Ulrich , Pichler Verena , Pfaff Sarah , Wester Hans-Jürgen , Hacker Marcus , Kazianka Lukas , Staber Philipp B. 
Published: June 2020

Abstract
Bruton tyrosine kinase inhibitor ibrutinib is effective in treating chronic lymphocytic leukemia (CLL). However, after ibrutinib treatment initiation, patients frequently experience an increase of CLL blood cell count. This phenomenon in clinical practice is thought to reflect a “compartment shift” of CLL cells from lymph nodes to the peripheral blood, but the actual shifting has not yet been demonstrated. Using [68Ga]Pentixafor-PET/MRI for in vivo CXCR4 visualization, we here provide images of topical changes of CLL cells upon ibrutinib treatment. Within the first month of ibrutinib treatment, mean standardized [68Ga]Pentixafor uptake decreased in the bone marrow and lymph nodes, whereas [68Ga]Pentixafor uptake increased in the spleen. Leukocytosis rose, as did numbers of CXCR4high (tissue-resident) CLL cells. Volumes of lymph nodes and spleen decreased. Upon longer ibrutinib treatment, leukocytosis decreased, followed by a decrease of [68Ga]Pentixafor uptake in the spleen. These results support the preexisting clinical hypothesis of a “compartment shift” of CLL cells from the lymph nodes to the peripheral blood, but also refine the mechanistic model by describing early clearing of the bone marrow and redistribution of CLL cells to the orthotopic splenic cavernous system in response to ibrutinib treatment.
КЛІНІЧНИЙ ВИПАДОК ВНУТРІШНЬОУТРОБНОГО МІКСТ-ІНФІКУВАННЯ У НОВОНАРОДЖЕНОЇ ДИТИНИ
Authors: Kretsu N. M. , Koliubakina L. V. 
Published: June 2020

Мета – проаналізувати клінічний випадок внутрішньоутробного мікст-інфікування у новонародженої дитини.
В останні роки відзначається зростання частоти та поширеності внутрішньоутробних інфекцій, які є провідними у структурі захворюваності та смертності немовлят. Серед них провідну роль посідає родина герпесвірусів, до яких належить й цитомегаловірус (ЦМВ). Здатність вірусу спричиняти тяжке ураження плода можливе у будь-якому триместрі вагітності, особливо у випадках первинного зараження під час вагітності. У 5-18 % немовлят розвивається маніфестна вроджена цитомегаловірусна інфекція, яка характеризується тяжким ступенем з високою летальністю. Вірус володіє здатністю викликати супресію практично всіх ланок імунітету, а саме: дисфункцію макрофагів, дисбаланс синтезу інтерлейкінів, пригнічувати активність Т-лімфоцитів, спричиняти зниження співвідношення CD4/CD8, синтезу інтерферонів й активності природних кілерів, що створює передумови для нашарування бактерійних генералізованих інфекційно-запальних процесів.
Наведено особливості клініки та перебігу внутрішньоутробного мікст-інфікування у новонародженої дитини.
ФАКТОРИ ПСИХІЧНОЇ ТРАВМАТИЗАЦІЇ У ВНУТРІШНЬО ПЕРЕМІЩЕНИХ ОСІБ: ЇХ СТРУКТУРА ТА ДИНАМІКА У ЧАСІ
Authors: Maruta N. O. , Panko T. V. , Kalenska G. Yu. , Kolyadko S. P. , Yavdak I. O. , Volkova S. O. 
Published: June 2020

Сьогодні Україна займає дев’яте місце у світі за кількістю внутрішньо переміщених осіб (ВПО). Масштабні вимушені внутрішні міграції останніх років не могли не відобразитися на стані здоров’я як певної соціальної групи, так і на стані здоров’я населення у цілому.
Мета – вивчення факторів психічної травматизації, їх динаміки у часі та впливу на стан психічного здоров’я, визначення стресостійкості та соціальної адаптації у ВПО.
Матеріал і методи. Методи обстеження включали клініко-психопатологічний з оцінкою факторів психічної травматизації, методику визначення стресостійкості та соціальної адаптації Т. Холмса і Р. Раге для оцінки актуального рівня стресу протягом останнього року, статистичні методи.
Дослідження проведено в ДУ «Інститут неврології, психіатрії та наркології НАМН України» у відділі пограничної психіатрії. Всього було обстежено 213 ВПО. Усі обстежені були поділені на 3 групи: до І групи увійшли 94 ВПО із загальної популяції, у яких не було виявлено психічних розладів (умовно здорові); 68 осіб, у яких були визначені окремі психічні симптоми, що не сягали клінічного рівня, склали ІІ групу (група ризику) та 51 особа, що звернулася за медичною допомогою та мала діагностовані психічні розлади, увійшли до ІІІ групи (обстежені з психічними розладами).
Результати. Всім обстеженим була проведена оцінка стресогенних факторів (СФ), що включали фізіологічні, психоемоційні, соціально-психологічні та інформаційні чинники та відображала їх динаміку в часі. Рівень опірності стресу відрізнявся у здорових, хворих та осіб з групи ризику.
Висновки. Загальна оцінка впливу стресогенних чинників на ВПО свідчить про їх поєднану дію, різний ступінь патогенності та динаміки у часі.
САМООЦІНКА СТАНУ ЗДОРОВ’Я ПАЦІЄНТІВ ТЕРАПЕВТИЧНОГО ПРОФІЛЮ
Authors: Moiseeva Yu. A. , Zhukovska M. M. 
Published: June 2020

Показники стану здоров’я населення України вказують на те, що хронічні неінфекційні хвороби є визначальними в структурі захворюваності й смертності населення нашої країни і залежать перш за все від способу життя. Найнебезпечнішими чинниками зниження стану здоров’я в Україні є артеріальний тиск та тютюнокуріння, яке зумовлює захворювання як дихальної, так і серцево-судинної систем.
Мета дослідження – проаналізувати анкетні дані щодо самооцінки здоров’я хворих із патологією дихальної і серцево-судинної систем.
Матеріали і методи. Дослідження проводили за матеріалами опитування 60 хворих із пульмонологічними та кардіологічними патологіями за анкетою, розробленою Київським міжнародним інститутом соціології.
Результати. Встановлено, що серед опитаних ре­спондентів переважали особи з досить низьким рівнем матеріального добробуту (яким вистачає на їжу, проте не вистачає грошей на задоволення іншим потреб). В обох групах пацієнтів зареєстровано найменшу кількість заможних осіб. Результати аналізу самооцінки стану здоров’я пацієнтів терапевтичного профілю показали, що хворі із патологією дихальної системи у 33,3 % випадків вважають своє здоров’я посереднім, а у 23,3 % випадків – поганим, тоді як пацієнти із серцево-судинними захворюваннями однаковою мірою оцінили своє здоров’я як хороше, посереднє, погане і дуже погане. Стан здоров’я є важливою умовою для відчуття щастя: серед тих, хто має легеневі й серцево-судинні захворювання, більшість почувається недостатньо щасливими (швидше ні, ніж так), а найменший відсоток тих, котрі є щасливими. Порівнюючи отримані дані у пацієнтів пульмонологічного і кардіологічного профілів, можна говорити про те, що за умов практично однакового матеріального добробуту, своє здоров’я як «посереднє» оцінили на 13,3 % більше пульмонологічних пацієнтів, тоді як на 16,7 % більше кардіологічних хворих вважають себе нещасливими.
Висновки. У пацієнтів із серцево-судинними та легеневими захворюваннями важливою умовою для відчуття щастя є не тільки стан здоров’я, але й матеріальний добробут та місце проживання.