bluuebunny/crossref_metadata_2025_split huggingface dataset:
Enabling Digital Specimen and Extended Specimen Concepts in Current Tools and Services
Authors: Glöckler Falko 
Published: October 2020

Digital specimens (Hardisty 2018, Hardisty 2020) are the cyberspace equivalent to objects in a physical, often museum-based collection. They consist of references to data and metadata related to the collection object. Through the ongoing process of digitizing legacy data, gaining knowledge from new field collections or research, and annotating and linking to related resources, a digital specimen can evolve independently from the original physical object. Especially the provenance records cannot always be assigned to the physical object when the knowledge was gained solely from the digital representation.
A physical specimen can also be understood as a physical preparation (or a set of multiple preparations, e.g. DNA samples taken from a preserved organism) accompanied by related digital and non-digital data sources (e.g. images, descriptions in fieldbooks, research data) rather than just a single object. This concept of an extended specimen has been described by Webster (2017) and is used in the initiative The Extended Specimen Network (Lendemer et al. 2019) to enhance the access and research potential of specimens.
Digital specimens need to reflect both, eventual complexity of the physical object (extended specimen) and the knowledge gained from and linked to the digital object itself. In order to provide, track and make use of the digital specimens, the community of collection-holding institutions might need to think of digital specimens as standalone virtual collections that emanate from physical collections. Additionally, new versions of a digital specimen continuously derive from changes of the physical specimen as the (meta)data are being updated in collection management systems to document the state and treatment of the physical objects. Consequently, there is a challenge to enable the management of both: linked digital specimens in the World Wide Web and the local data of physical specimens in databases of collection-holding institutions and other tools and services.
In this panel discussion, central questions about the requirements, obstacles and opportunities of implementing the concepts of digital specimens and extended specimens in software tools like collection management systems are discussed. The aim is to identify the major tasks and priorities regarding the transformation of tools and services from multiple perspectives: local collection data management, international data infrastructures like the Distributed System of Scientific Collections (DiSSCo) and the Global Biodiversity Information Facility (GBIF), and data usage outside of domain-specific subject areas.
La gouvernance du marché de la publication scientifique à l’ère du numérique : une analyse de la connaissance scientifique en tant que commons
Authors: Bechis Jaele 
Published: October 2020

La nature de la connaissance en tant que bien économique est déterminée à partir de la rivalité et excluabilité du bien, mais aussi du faisceau de droits qui en règlent l’accès et l’utilisation. Si la numérisation a permis à la connaissance de devenir un bien non-rival, c’est la transition d’un modèle de gestion de type public order à une gestion de type private ordering qui pourrait aboutir à la transformation de la connaissance en tant que commun. Cette ressource ouverte et partagée, dont la gestion est assurée par une communauté, a profondément changé la structure du marché de la publication scientifique. À travers l’ Institutional Analysis Development framework nous proposons une analyse du marché de la publication scientifique, afin de comprendre quel a été l’impact de la numérisation de l’information sur les différents acteurs du marché, leurs intérêts et, surtout, sur la chaîne de valeur du commun de la connaissance scientifique. Codes JEL : O32, L22
Repenser la place de l’antagonisme dans la gouvernance de l’innovation technoscientifique : vers un modèle agonistique des relations publiques
Authors: Bellion Amélie , Robert-Demontrond Philippe 
Published: October 2020

Sur la base d’une étude ethnomarketing des résistants à la gouvernance des nanotechnologies (NT) ainsi que de ses promoteurs, cet article propose une nouvelle approche de relations publiques (RP). En s’intéressant aux rôles et aux formes que peut prendre l’activisme – ou la résistance – à l’égard de l’innovation technoscientifique et de sa gouvernance ( e.g ., activisme cognitif, procédural, symbolique), il s’attache à valoriser – plutôt que déplorer – le conflit en contexte innovant. La forme de relations publiques que nous proposons d’en dériver est agonistique. Elle sublime l’antagonisme, qu’elle considère d’ailleurs comme l’une des formes d’interaction les plus opérantes pour établir un système légitime d’exploration et de régulation de l’innovation. À la différence de ce que la littérature a jusqu’ici proposé, nous n’envisageons pas l’antagonisme comme un obstacle à la gouvernance de l’innovation, mais comme un préalable et une constante nécessaires. Codes JEL : O3, O32, O33
La recherche agronomique face au virage de la biodiversité
Authors: Mauguin Philippe , Caquet Thierry 
Published: October 2020

La question de l’antagonisme apparent entre biodiversité, d’une part, et agriculture et systèmes alimentaires, d’autre part, est posée par de nombreuses analyses récentes réalisées à l’échelle mondiale. L’un des enjeux de la recherche agronomique du XXI e siècle est d’explorer de nouvelles pistes pour transformer cet antagonisme en synergie. Il s’agit, grâce aux recherches sur et pour la biodiversité, de contribuer à transformer les systèmes agri-alimentaires pour assurer la sécurité alimentaire et nutritionnelle, en particulier via la diversification et la transition agroécologique ; de conserver et restaurer la biodiversité, tout en promouvant son utilisation durable ; de protéger et gérer durablement les ressources naturelles indispensables à la vie (l’eau, les sols, l’air) ; de préserver la santé humaine et celle de l’environnement ; et de contribuer à la lutte contre les changements climatiques et leurs impacts dans une double stratégie d’atténuation et d’adaptation.
Amicale du Corps des Mines – Groupe de réflexion sur le climat
Authors: Bougrain-Dubourg Allain 
Published: October 2020

Il est difficile d’évoquer le climat sans se poser la question de la crise de la biodiversité. En effet, le changement climatique est considéré comme la troisième source d’extinction des espèces vivantes et, à l’inverse, les solutions pour lutter contre celui-ci (barrages, la biomasse ou les énergies renouvelables) peuvent avoir de forts impacts sur la biodiversité. La métaphore de la tour Eiffel proposée par Bruno David permet d’opérer un rapprochement entre ingénieurs et protecteurs de la biodiversité : « Enlevez une poutrelle, rien ne se passe ; enlevez une deuxième, rien ne passe…, mais continuez d’en enlever, et au bout d’un certain nombre, la tour s’écroulera, d’un coup, sans que l’on puisse prévoir exactement à quel nombre de poutrelles retirées sera atteint le seuil de rupture. »
Que faire pour la biodiversité ?
Authors: Chevassus-au-Louis Bernard 
Published: October 2020

Dès le milieu du XIX e siècle, notre pays a pris des initiatives pour protéger des éléments remarquables de la nature. Ces actions ont pris de l’ampleur dans la seconde moitié du XX e siècle et, à la suite de la Conférence de Rio de 1992, qui a consacré l’émergence du concept de biodiversité, se sont étendues à l’ensemble de notre patrimoine naturel et de ses usages. En dépit de ces efforts, l’érosion de la biodiversité se poursuit, même si certaines réussites témoignent du caractère non inéluctable de cette érosion. Alors que seront définies en 2021 de nouvelles stratégies décennales, à la fois au niveau international et dans les différents États, quelles leçons peut-on tirer de cette déjà longue histoire de la protection de la nature, pour parvenir enfin à stopper cette érosion et à initier une dynamique positive ?
Sur quelques aspects de la réflexion des Machiavéliens
Authors: Berthoux André-Michel 
Published: October 2020

Cet article a pour but de montrer les limites de l’analyse de la pensée politique de Machiavel conduite par les auteurs que James Burnham dénomme les « machiavéliens » : Pareto, Mosca et Michels. Leur conception de la lutte pour le pouvoir a donné naissance au concept d’élite politique mais dénature en partie la réflexion du Florentin qui conçoit la politique comme arte dello stato , soit l’œuvre d’un prince vertueux sachant osciller entre éthique et morale pour défendre son état. Une réflexion qui nous semble proche de celle de Max Weber, auteur pourtant oublié de la liste.
L’État dans la réflexion d’Angelo Tasca : la conception marxiste de l’État (1910-1940)
Authors: Rancon Catherine 
Published: October 2020

L’État, sujet récurrent de la réflexion d’Angelo Tasca, y prit une importance croissante quand, dans les années 1930, il revit ses positions marxistes antérieures. La conception marxiste de l’État forma le socle de sa réflexion à ce sujet. L’interprétation antiétatiste (dépérissement des classes et de l’État) qu’il en retint favorisa, après la révolution russe, sa prise de position conseilliste et son adhésion au soviétisme, selon une approche de la révolution « par le bas ». L’expérience soviétique russe nourrit dès lors continûment, mais de façon contradictoire, cette réflexion : il s’en réclama d’abord explicitement ; mais, après sa rupture avec le mouvement communiste (1929), il commença à y voir un exemple à ne pas suivre, qui l’amena à remettre en cause sa propre conception de l’État. La notion de dictature du prolétariat représenta, dans ce processus de révision, la principale pierre d’achoppement. Il s’efforça d’abord d’en donner une interprétation démocratique, grâce à la notion d’hégémonie. Mais, à la lumière de l’expérience russe et de l’examen du principe d’économie dirigée, il en vint à prôner l’abandon de cette notion ambiguë, puis, à la veille de la défaite de 1940, celle de l’ensemble de la conception marxiste de l’État.
Les vitraux du haut Moyen Âge de Baume-les-Messieurs (Jura, France) : contexte stratigraphique, analyses archéométriques et mesures conservatoires
Authors: Bayol Carine , Bully Sébastien , Loisel Claudine , Wersch Line Van , Veronesi Umberto 
Published: October 2020

Résumé. La fouille du site monastique de Baume-les-Messieurs a livré un ensemble exceptionnel de vitraux. Dans un contexte daté de la fin du VIIIe siècle, 1574 tessons ont été mis au jour, certains portant des traces de peinture rouge, d’autres des grisailles. Cet article présente les étapes successives de leur restauration et de leur étude comprenant un examen visuel, des analyses PIXE-PIGE et MEB-EDS.
De nouvelles formes en verre à Orléans de la seconde moitié du XVe à la première moitié du XVIe siècle : regards croisés entre typologie et analyses
Authors: Guérit Magalie , Gratuze Bernard , Joyeux Pascal 
Published: October 2020

Résumé. Trois ensembles de verreries ont été récemment mis au jour à Orléans dans des contextes datés de la seconde moitié du XVe à la première moitié du XVIe siècle. En position de rejet, ce vaisselier se compose principalement de gobelets et de verres à boire à pied tronconique, mais aussi d’un probable plat, d’un flacon, d’une carafe et de deux flacons-gourdes. Ces lots contemporains sont l’occasion de réaliser des analyses, de les comparer et de déterminer leur provenance.
Représenter et transmettre la Première Guerre mondiale dans les jeux vidéo
Authors: Maillard Antoine 
Published: October 2020

La Première Guerre mondiale est un évènement qui a été largement sous-représenté dans les jeux vidéo face aux multiples productions qui s’intéressent à la Seconde Guerre mondiale. Cependant, depuis le début du Centenaire de la Grande Guerre, l’on voit une multitude de nouvelles productions autour de ce conflit. Par l’intermédiaire des jeux Soldats Inconnus : Mémoires de la Grande Guerre et Verdun 1914-1918, nous nous intéressons dans cet article au travail des développeurs pour représenter ce conflit majeur du XXe siècle dans le média vidéoludique.
La Grande Guerre et les jeux vidéo. La recherche historique face à Battlefield 1
Authors: Patin Nicolas 
Published: October 2020

Première Guerre mondiale et jeux vidéo sont rarement associés dans l’industrie vidéoludique et les historiens ne s’intéressent par ailleurs qu’assez peu aux jeux. Le jeu Battlefield 1 (DICE/EA) a pourtant été l’événement du Centenaire, avec des millions d’exemplaires vendus à travers le monde. Quel intérêt y a-t-il à en faire une analyse historique ? Le jeu est en lui-même une production culturelle à propos de la Grande Guerre. Plus encore, il sait parfois donner à voir des vérités à la pointe des débats historiographiques, tout comme faire de grossières erreurs.
La Grande Guerre dans le jeu vidéo : jouer une histoire délaissée
Authors: Lacheze Cyril , Weckerle Marion 
Published: October 2020

La sortie récente de quelques jeux vidéo particulièrement médiatisés en lien avec les commémorations du Centenaire de la Première Guerre mondiale a induit dans la conscience collective une impression de nouveauté de cette thématique dans le champ vidéoludique. En réalité, celle-ci a été abondamment, mais inégalement traitée depuis les années 1980, dans environ 150 titres. Nous parcourons leur historique afin d’en restituer les modalités d’approche du conflit proposées, depuis les premiers simulateurs de vol jusqu’aux jeux de stratégie réalistes, en passant par l’arcade ou l’horreur.
Qu’est-ce qu’une norme professionnelle
Authors: Prairat Eirick 
Published: October 2020

Qu’est-ce qu’une norme professionnelle ? C’est à cette périlleuse question que le présent article entend répondre. La première partie de l’article précisera le concept de norme en s’inspirant des perspectives ouvertes par Ludwig Wittgenstein ; la seconde proposera un éclairage sur l’idée de norme professionnelle en montrant qu’il est légitime de distinguer deux grands types de norme au sein d’une profession : les normes techniques et les normes morales.
Des normes professionnelles auto-prescrites. Le cas de la mise en œuvre de la démarche d’enseignement scientifique en Suisse romande
Authors: Marlot Corinne , Audrin Catherine , Morge Ludovic 
Published: October 2020

Cette recherche pose l’hypothèse d’une relation entre les difficultés de mise en œuvre de la démarche d’enseignement scientifique en classe (pour les enseignants) et l’existence de normes auto-prescrites. Celles-ci seraient pour partie le résultat de la renormalisation par les acteurs des prescriptions primaires (les programmes) et secondaires (les discours des instances de formation). Dans cet article, nous rendons compte de la phase exploratoire de cette recherche liée à une enquête par questionnaire auprès d’enseignants du premier degré, débutants et expérimentés, en Suisse romande. Le traitement des données a été réalisé grâce à une analyse factorielle et une classification ascendante hiérarchique. Cette analyse quantitative a permis de mettre au jour l’existence de normes auto-prescrites relatives à la mise en place de la démarche d’enseignement scientifique à l’école ainsi que l’existence de catégories d’enseignants selon leur positionnement relatif vis-à-vis des principes pédagogiques et épistémologiques de cette démarche ; et de formuler des premières hypothèses concernant l’existence d’un clivage générationnel (expérimentés /non expérimenté) et/ou d’un clivage lié au niveau d’enseignement (élèves de 4 à 7 ans / élèves de 8 à 11 ans), permettant d’expliquer la variabilité interindividuelle.
Quand des parents interprètent les normes scolaires : le cas du travail scolaire hors la classe en début de primaire
Authors: Robin Françoise 
Published: October 2020

Nous tentons de percevoir, à partir des tâches qui circulent de l’école vers les familles et de leur décodage par celles-ci, ce que les parents voient et font des normes scolaires. Par normes, nous entendons des régularités contraignantes et partagées (Prairat, 2019) mais aussi potentiellement transformatrices du milieu par leur action créatrice (Canguilhem, 1996). Notre étude se situe dans le prolongement des théories défendant une « hypothèse relationnelle » (Bautier & Goigoux, 2004) qui considère que les malentendus (Bautier & Rochex, 2007 ; Bautier & Rayou, 2013) sont une source importante d’explication de la production des inégalités scolaires. Ceux-ci peuvent en effet donner lieu à des interprétations éloignées de l’attendu scolaire par les parents et leurs enfants. Nous analysons les pratiques parentales d’accompagnement des tâches qui constituent le travail scolaire hors la classe. Nous optons pour une interprétation de l’accompagnement des parents en termes de « renormalisation » (Schwartz, 2009) dans le sens que les parents réinterprètent les normes scolaires perçues et les réajustent en fonction de la responsabilité de l’instruction scolaire qui leur est en partie dévolue (Glasman, 2004, 2013).
Permettre la compréhension de l’action dans un jeu d’imitation. Le cas de l’action conjointe entre un artiste chorégraphique et des élèves-danseurs à l’école élémentaire
Authors: Messina Virginie 
Published: October 2020

Le rôle central joué par l’imitation au sein des différentes sociétés humaines nous conduit à l’envisager comme un processus anthropologique complexe permettant la transmission intergénérationnelle de comportements et d’éléments culturels. Notre approche est ici didactique et questionne les conditions d’une avancée, d’un gain épistémique lors de situations d’enseignement-apprentissage en danse s’appuyant sur l’imitation. Dans le cas de la danse, la transmission du geste dansé par monstration/reproduction est largement pratiquée et relève d’un allant de soi que nous souhaitons ici interroger. À quelles conditions l’usage de l’imitation permet-il la construction de savoirs nouveaux ? En particulier, en situation d’enseignement-apprentissage, quels gestes didactiques permettent à ceux qui apprennent une compréhension des actions qu’ils ont à imiter ? Pour en rendre compte, nous nous appuyons sur une situation observée à l’école élémentaire, entre un artiste chorégraphique et des élèves d’une classe de CE2-CM1. Mobilisant la théorie de l’action conjointe en didactique et le modèle du jeu en didactique, notre analyse envisage l’imitation avant tout comme un jeu d’imitation qui se construit entre celui qui enseigne le geste (l’artiste) et ceux qui l’apprennent (les élèves-danseurs). L’observation de cette action conjointe conduit à saisir les conditions permettant aux élèves de passer progressivement d’une imitation ne retenant que les traits de surface du geste montré, à une imitation témoignant d’une compréhension des principes générateurs de sa forme.
IFN Regulatory Factor 3 in Health and Disease
Authors: Petro Thomas M. 
Published: October 2020

Abstract
Immunity to viruses requires an array of critical cellular proteins that include IFN regulatory factor 3 (IRF3). Consequently, most viruses that infect vertebrates encode proteins that interfere with IRF3 activation. This review describes the cellular pathways linked to IRF3 activation and where those pathways are targeted by human viral pathogens. Moreover, key regulatory pathways that control IRF3 are discussed. Besides viral infections, IRF3 is also involved in resistance to some bacterial infections, in anticancer immunity, and in anticancer therapies involving DNA damage agents. A recent finding shows that IRF3 is needed for T cell effector functions that are involved in anticancer immunity and also in T cell autoimmune diseases. In contrast, unregulated IRF3 activity is clearly not beneficial, considering it is implicated in certain interferonopathies, in which heightened IRF3 activity leads to IFN-β–induced disease. Therefore, IRF3 is involved largely in maintaining health but sometimes contributing to disease.
Psychological morbidity in interstitial lung disease: a study from India
Authors: Rajpoot Akhlesh , Garg Kranti , Saini Varinder , Gupta Nitin 
Published: October 2020

Evaluation of mental health in chronic lung diseases like interstitial lung disease (ILD) and chronic obstructive pulmonary disease (COPD) has always been neglected and underrated. The aim of the study was to determine the psychological morbidity in patients of ILD and to determine its various socio-clinical and psychological correlates. A cross-sectional clinic based descriptive study with 50 ILD patients, 30 COPD patients and 30 healthy controls was undertaken. Psychological distress was assessed using different psychological scales, like General Health Questionnaire-12 (GHQ-12), Patient Distress Thermometer (PDT), Coping Strategy Checklist (CSCL), WHO Quality of Life-Brief-26 (WHOQOL-Bref-26) and Depression Anxiety Stress Scale (DASS). The patients with a GHQ-12 score of ≥3 were considered as experiencing psychological distress and additionally referred to consultant psychiatrist for further detailed evaluation and management. Fifty-eight percent of ILD patients and 60% of COPD patients experienced psychological distress after screening with GHQ-12; 40% of all the ILD and COPD patients were ultimately diagnosed with a psychiatric disorder, after evaluation by the psychiatrist. Patients of ILD and COPD had significantly higher scores on GHQ-12, CSCL and DASS, and significantly lower scores on WHOQOL-Bref-26 when compared with healthy controls. However, these scores, including PDT did not differ significantly between ILD and COPD patients. The scores on all these scales in the patients of ILD and COPD who were experiencing psychological distress (GHQ ≥3) were significantly poorer than those without psychological distress (GHQ<3). GHQ-12 emerged as an excellent predictor of psychological morbidity. Various other psychological scales correlated with GHQ-12 and amongst each other in both the groups experiencing psychological distress. GHQ-12 and other different scales also significantly correlated with the different clinical indicators in ILD as well as COPD patients having psychological distress. Psychological distress and poorer quality of life was present in a significant percentage of ILD patients, and was comparable to that seen in COPD. Mental health evaluation should be incorporated in the routine management of these patients. Simple, easy and brief screening tools like GHQ-12 can be of immense help.
TP53 lacks tetramerization and N-terminal domains due to novel inactivating mutations detected in leukemia patients
Authors: Hameed Yasir , Ejaz Samina 
Published: October 2020

Background:
TP53 is a highly conserved tumor suppressor gene present on chromosome 17 and comprised 11 exons and 12 introns. The TP53 protein maintained the genomic integrity of the cell by regulating different pathways. The association of TP53 with leukemia and the increasing prevalence of leukemia in Pakistan instigated us to initiate the current study.

Materials and Methods:
The TP53 gene of acute myeloid leukemia patients (n = 23) and normal individuals (n = 30) was amplified through polymerase chain reaction (PCR). The PCR amplified products of 3 samples 1 normal (NC-30) and 2 cancerous (LK-6 and LK-19) were subjected to deoxyribonucleic acid (DNA) sequence analysis. Bioinformatics analysis of the obtained DNA sequences helped to identify nature, type, and functional impact of mutations, if any.

Results:
Results revealed 2 novel mutations in Case No. 1 (c. G >A10987 and c. InsA13298_13299) and Case No. 2 (c. InsC13284_13285, c. T >A13365) which generate a premature codon (ocher) at position 239 and lead to truncated TP53 protein. In Case No. 3, 16 novel mutations were identified and c. delC11093 mutation created a premature codon (opal) at 59th position. Hence, the resultant protein will lack its tetramerization and N-terminal domain required for its normal functioning. Moreover, some intronic mutations were noticed and found to have a negative impact on splicing related regulatory sequences.

Conclusion:
Results suggest the role of TP53 inactivating mutations in pathogenesis of leukemia.