Молекулярно-генетическая изменчивость генов 18S-rRNA и 28S-rRNA у цестод рода Bothriocephalus Rud., 1808 (Cestoda: Bothriocephalidea) из рыб Чёрного моря
Authors: Slynko Yu.V. , Polyakova T.A. , Slynko E.E. 
Published: February 2020

Проведён молекулярно-генетический анализ фрагментов двух генов 18S-rRNA (длиной 568 п.н.) и 28S-rRNA (длиной 312 п.н.) цестод рода Bothriocephalus Rud., 1808, паразитирующих у скорпены Scorpaena porcus (Linnaeus, 1758) и у черноморской камбалы Scophthalmus maeoticus (Pallas, 1814), обитающих в Чёрном море. Материал был собран в северной части Чёрного моря возле побережья Крымского полуострова. Пробы тела паразитов фиксировали в 96 этаноле. В результате, как по каждому гену в отдельности, так и при их объединении установлено, что образец, извлечённый из скорпены (деп. в NCBI MH011407 18S-rRNA и MH000375 28S-rRNA), надёжно идентифицируется, как относящийся к кладе, содержащей B. timii, B. scorpii и B. australis, р-расстояние между нашим образцом и другими видами этой группы не превышает 1,6. Остальные три образца MH011408, MH011409, MH011410 (для гена 18s-rRNA) и MH000376 (для гена 28s-rRNA) сформировали отдельную кладу, состоящую из двух субклад: одна включает образцы МН011409 и МН011410, другая образец МН011408 (указаны только регистрационные номера для гена 18s-rRNA). Следует также отметить, что виды Bothriocephalus timii и Bothriocephalus scorpii дистанцированы всего лишь на 0,5, а Bothriocephalus timii и Bothriocephalus australis на 0,6. Гаплотипы вида Bothriocephalus claviceps составили внешнюю группу, р-расстояние от которого всех, как наших образцов, так и рассматриваемых видов комплекса scorpio , не опускалось ниже 26,3. Вместе с тем, дистанцированность объединённых гаплотипов цестод из черноморской камбалы на уровне 45 р-расстояний, а также значения бутстрепа позволяют полагать их близнецовыми видами (или подвидами) в пределах рода, по аналогии с генами мтДНК. В результате анализа нуклеотидной изменчивости данных фрагментов генов подтверждена принадлежность рассматриваемых экземпляров к роду Bothriocephalus, и они идентифицированы как виды, входящие в комплекс видов Bothriocephalus scorpii .Molecular genetic analysis of fragments of the two genes 18S-rRNA (568 bps long) and 28S-rRNA (312 bps long) cestodes of the genus Bothriocephalus Rud., 1808, parasitizing in Scorpaena porcus (Linnaeus, 1758) and at the Black Sea flounder Scophthalmus maeoticus (Pallas, 1814) living in the Black Sea. Material was collected in the northern Black Sea off the coast of the Crimean Peninsula. Samples of the body of parasites were fixed in 96 ethanol. As a result it was established both for each gene individually and when combining them that the sample extracted from scorpion ( in NCBI MH011407 18S-rRNA and MH000375 28S-rRNA) is reliably identified as referring to clade containing B. timii, B. scorpii and B. australis, the p-distance between our sample and other species of this group does not exceed 1.6. The remaining three samples MH011408, MH011409, MH011410 (for the 18s-rRNA gene) and MH000376 (for the 28s-rRNA gene) formed a separate clade which consists of two subclades: one includes samples MH011409 and MH011410 the other sample MH011408 (only registration numbers are indicated for MH011408 gene 18s-rRNA). It should also be noted that the species Bothriocephalus timii and Bothriocephalus scorpii are only 0.5 apart while Bothriocephalus timii and Bothriocephalus australis are 0.6 apart. Haplotypes of the species Bothriocephalus claviceps constituted an external group, the p-distance from which of all both our samples and the species of the scorpio complex under consideration did not fall below 26.3. At the same time the distance between the combined haplotypes of cestodes from the Black Sea flounder at the level of 45 p-distances as well as bootstrap values allow us to consider them to be twin species (or subspecies) within the genus by analogy with mtDNA genes. An analysis of the nucleotide variability of these gene fragments confirmed the affiliation of the examined species to the genus Bothriocephalus and they were identified as species forming part of the complex of species Bothriocephalus scorpii.