bluuebunny/crossref_metadata_2025_split huggingface dataset:
Finite Element Analysis of Tapped Thread Joints: Setup of a Computationally Efficient Modeling Approach
Authors: De Agostinis Massimiliano , Croccolo Dario , Fini Stefano , Olmi Giorgio , Robusto Francesco , Bagnoli Leonardo 
Published: November 2019

Abstract
This contribution deals with the efficient numerical modeling of tapped thread joints. Commercial FE packages provide different strategies to tackle the problem of modeling threaded joints, which is a recurrent one for the design engineer. Different modeling techniques are characterised by how the screw is modeled: either three-dimensional elements (thetra, hexa or wedge) or mono-dimensional elements (beam) can be used. In the case of three-dimensional approaches, the thread helix is seldom modeled: the actual geometry is often replaced by a plain cylinder and a suitable choice of contact settings between the screw and the “threaded” hole. In the case of road vehicles, due to the high number of threaded connections to be modeled, it is paramount to reach a trade-off between modeling accuracy and computational effort. This paper aims at comparing two modeling approaches, namely a three dimensional approach (baseline) and a mono-dimensional one (simplified model). Based on several criteria, such as equivalent stress on the screw shank, pressure distribution at the interface of the plates and in the underhead region, optimal contact settings for the simplified model are suggested. These settings allow replicating the results provided by the three-dimensional approach for given load case. The comparison is carried out on single lap, single screw joints, by the ANSYS R17 software. The methodology can be easily extended to other softwares or joint configurations.
SR-102 Package Replacement
Authors: Cable Christopher P. 
Published: November 2019

Abstract
The SR-101 Reservoir Package was placed into service in the early 1990s to ship various configurations of pressurized gas bottles. The SR-101 replacement, the SR-102, is a performance based Department of Transportation (DOT) package designed for shipping currently authorized compressed gases. This paper presents the design, fabrication, and testing processes used to produce the requisite Safety Analysis Report (SAR) that will provide the basis for package certification.
Evaluation of Structural Honeycomb Sensitivity to Filler Metal Reinforcement
Authors: Flach Joshua P. , Blanton Paul S. 
Published: November 2019

Abstract
Structural honeycomb is widely used as both an impact limiter and rigid structural support in applications which require a high specific strength and highly characterized energy absorption profile. Structural honeycomb is an anisotropic material with limited strength in directions perpendicular to the cells and features mechanical properties that are largely driven by the materials of construction and structure density. As a result, the mechanical properties of honeycomb are sensitive to the specific geometry, orientation, and reinforcement of the honeycomb structure. This study evaluates the effects of these characteristics on stainless steel structural honeycomb to account for the complex loading conditions experienced during radioactive material package regulatory testing. This material is intended for use in applications where organically bonded honeycomb cannot be used.
Verifying Spatiotemporal Systems via Robustness Bounds: An Application to Unmanned Underwater Vehicles
Authors: Liu T. , Zhao X. , Quigley K. , Azarm S. , Gabriel S. A. , Lordan D. J. 
Published: November 2019

Abstract
The authors present an approach for verifying computer simulations for spatiotemporal systems. Specifically, the goal is to confirm that the computer simulation for a linear controller of an Unmanned Underwater Vehicle (UUV) correctly captures key elements of a conceptual model for the UUV controller. The key elements considered are stability and robustness of the UUV’s control system model. Here, stability refers to asymptotic stability of the model’s state variables, assuming bounded input parameters. Robustness refers to the model’s ability to handle uncertainty in these parameters. The verification is performed in two steps. First, for a fixed UUV controller, a maximum range of uncertain parameters is found and for that entire range confirmed that the computer simulation remains stable as required by the conceptual model. Next, a combination of control cost function and range of uncertain parameters is optimized while maintaining UUV stability, again, for the entire range of uncertainty and as required by the conceptual model. In both steps, independent Monte-Carlo simulations are performed to confirm the verification.
Localized Metabolomic Gradients in Patient-Derived Xenograft Models of Glioblastoma
Authors: Randall Elizabeth C. , Lopez Begoña G.C. , Peng Sen , Regan Michael S. , Abdelmoula Walid M. , Basu Sankha S. , Santagata Sandro , Yoon Haejin , Haigis Marcia C. , Agar Jeffrey N. , Tran Nhan L. , Elmquist William F. , White Forest M. , Sarkaria Jann N. , Agar Nathalie Y.R. 
Published: November 2019

Abstract

Glioblastoma (GBM) is increasingly recognized as a disease involving dysfunctional cellular metabolism. GBMs are known to be complex heterogeneous systems containing multiple distinct cell populations and are supported by an aberrant network of blood vessels. A better understanding of GBM metabolism, its variation with respect to the tumor microenvironment, and resulting regional changes in chemical composition is required. This may shed light on the observed heterogeneous drug distribution, which cannot be fully described by limited or uneven disruption of the blood–brain barrier. In this work, we used mass spectrometry imaging (MSI) to map metabolites and lipids in patient-derived xenograft models of GBM. A data analysis workflow revealed that distinctive spectral signatures were detected from different regions of the intracranial tumor model. A series of long-chain acylcarnitines were identified and detected with increased intensity at the tumor edge. A 3D MSI dataset demonstrated that these molecules were observed throughout the entire tumor/normal interface and were not confined to a single plane. mRNA sequencing demonstrated that hallmark genes related to fatty acid metabolism were highly expressed in samples with higher acylcarnitine content. These data suggest that cells in the core and the edge of the tumor undergo different fatty acid metabolism, resulting in different chemical environments within the tumor. This may influence drug distribution through changes in tissue drug affinity or transport and constitute an important consideration for therapeutic strategies in the treatment of GBM.

Significance:
GBM tumors exhibit a metabolic gradient that should be taken into consideration when designing therapeutic strategies for treatment.
See related commentary by Tan and Weljie, p. 1231
Intake or Blood Levels of n-3 Polyunsaturated Fatty Acids and Risk of Colorectal Cancer: A Systematic Review and Meta-analysis of Prospective Studies
Authors: Kim Youngyo , Kim Jeongseon 
Published: November 2019

Abstract

Background:
Previous results of the association between n-3 polyunsaturated fatty acids (PUFA) and colorectal cancer were inconsistent. We conducted a systematic review and meta-analysis of prospective studies.

Methods:
The PubMed and Embase databases were searched through July 10, 2019, followed by a manual search. A random-effects model was used.

Results:
Twenty prospective studies, including 18,102 cases and 1,360,046 participants, were included. The pooled RR of colorectal cancer for the highest versus lowest category of n-3 PUFA intake was 0.97 [95% confidence interval (CI), 0.90–1.04]. Regarding the type of n-3 PUFA, eicosapentaenoic acid (EPA) and docosahexaenoic acid (DHA) intakes were inversely associated with 11% (RR = 0.89; 95% CI, 0.80–0.99) and 12% (RR = 0.88; 95% CI, 0.81–0.96) lower colorectal cancer risks, respectively, in the comparison of the highest versus lowest category. Increments of 0.1 g/day of EPA (RR = 0.95; 95% CI, 0.92–0.98) and DHA (RR = 0.97; 95% CI, 0.95–0.99) intakes were associated with a lower colorectal cancer risk. Regarding the blood levels of n-3 PUFAs, the pooled RR of colorectal cancer for the highest versus lowest category of blood levels of n-3 PUFAs was 0.79 (95% CI, 0.64–0.98). The risk of colorectal cancer decreased by 4% for every 1% increase in blood n-3 PUFA levels (RR = 0.96; 95% CI, 0.92–1.00).

Conclusions:
High blood n-3 PUFA levels are inversely associated with colorectal cancer risk, and high n-3 PUFA intake is suggestively associated with lower colorectal cancer risk.

Impact:
Our findings suggest that high blood n-3 PUFA levels may be associated with reduced colorectal cancer risk, but further studies are needed.
ВИВЧЕННЯ ФАКТОРІВ, ЯКІ ВПЛИВАЮТЬ НА ЗРОСТАННЯ РІВНЯ КЕСАРЕВОГО РОЗТИНУ, ЗА ПЕРІОД 2017–2018 рр.
Authors: Moskviak-Lesniak D. Ye. , Krasivska A. V. , Zhygaliak I. T. 
Published: November 2019

Мета: дослідити та проаналізувати фактори, які впливають на збільшення частоти проведення кесаревого розтину, в пологових будинках м. Львова (2017–2018 рр.).
Матеріали і методи. Об’єктами дослідження були породіллі та лікарі акушер-гінекологи пологових будинків міста Львова: Комунального некомерційного підприємства «Пологовий клінічний будинок № 1 м. Львова», Пологового відділення комунального некомерційного підприємства «3-тя міська клінічна лікарня м. Львова», Комунального закладу Львівського обласного перинатального центру.
Проведено одномоментне, когортне дослідження з використанням методів: анонімного індивідуального анкетування; ретроспективного аналізу статистичного звіту структури показань до кесаревого розтину в Комунальному некомерційному підприємстві «Пологовий клінічний будинок № 1 м. Львова» у 2018 (1180 операцій) та 2017 рр. (1006 операцій); статистичного; аналітичного. Виконано розрахунок середніх (М±SE) та відносних показників.
Результати. У 2018 р. метод розродження шляхом кесаревого розтину був обраний у 25,7 % від загальної кількості пологів, що зросло в 1,2 раза порівняно з 2017 р. – 20,8 %. Серед опитаних жінок близько 86 % породіль, які повторно народжували, з яких 10 % – з багатоплідною вагітністю. Проаналізувавши частку фізіологічних пологів при першій вагітності – 52 %, повторній вагітності – 34 % та кесаревого розтину – 48 і 66 % відповідно в опитаних породіль, отримали, що кількість повторних пологів шляхом кесаревого розтину (КР) зросла у 1,26 раза. Встановлено, що на збільшення частоти загальної кількості розроджень шляхом кесаревого розтину впливає наявність медичних показань (90,58 %), зокрема: рубець на матці після операції кесаревого розтину – 27,12 %, дистрес плода – 14,16 %, тазове та ніжне передлежання – 9,7 %; збільшення кількості повторних пологів після попереднього КР; зростання частоти хронічних захворювань в анамнезі: варикозне розширення вен нижніх кінцівок, зниження гостроти зору, артеріальна гіпертензія, цукровий діабет; психологічний фактор (емоційне напруження з боку родичів і породіллі; страх спровокований громадою, страх болю, страх перед пологами); бажання жінки (після попередньої операції кесаревого розтину).
Висновки. На збільшення частоти загальної кількості розроджень шляхом КР у пологових будинках м. Львова впливають: медичні показання; збільшення кількості повторних пологів, після попереднього КР; зростання частоти хронічних захворювань в анамнезі; психологічний фактор; бажання жінки.
МЕДИКО-ДЕМОГРАФІЧНА СИТУАЦІЯ ЯК ГЛОБАЛЬНА ПРОБЛЕМА ГРОМАДСЬКОГО ЗДОРОВ’Я УКРАЇНИ
Authors: Slabkiy G. O. , Mironyuk I. S. , Koshelia I. I. , Dudnyk S. V. 
Published: November 2019

Мета: визначити основні медико-демографічні проблеми України, які підлягають рішенню в межах діяльності системи громадського здоров’я країни.
Матеріали і методи. Матеріалами дослідження слугували дані державної і галузевої статистичної звітності та оперативні дані Центру громадського здоров’я МОЗ України з питань медико-демографічної ситуації в країні. Використано статистичний метод та метод структурно-логічного аналізу.
Результати. Демографічна ситуація в Україні характеризується зниженням рівня народжуваності за період 2014–2019 рр. на 19,4 % з перевищенням показника смертності населення на 6,16 на 100 тис. населення. При цьому частка випадків смерті чоловіків працездатного віку в загальній кількості смертей складає 20,3 %. Частка сільського населення має тенденцію до скорочення і становить 30,99 % в його загальній кількості. Відзначають високі рівні зареєстрованих випадків поширеності хвороб як серед всього, так і серед дитячого населення. Спостерігають тенденцію до зниження вказаних показників, що є чинником зменшення звертань населення до закладів охорони здоров’я. Встановлено різке погіршення епідемічної ситуації в країні та високі рівні саморуйнівної поведінки населення. При цьому більшість населення безвідповідально ставиться до власного здоров’я.
Висновки. В Україні реєструють складну медико-демографічну ситуацію, яка потребує від системи громадського здоров’я комплексних, цілеспрямованих та ефективних дій, спрямованих на зниження рівня смертності дітей та осіб працездатного віку, профілактику, раннє виявлення та ефективне лікування неінфекційних хвороб, подолання епідемій вакцинокерованих інфекцій, забезпечення доступу населення до здоров’язберігальних технологій та формування у населення відповідального ставлення до власного здоров’я.
ІНВЕСТУВАННЯ В УНІВЕРСИТЕТСЬКІ КЛІНІКИ НА ОСНОВІ МЕХАНІЗМУ ДЕРЖАВНО-ПРИВАТНОГО ПАРТНЕРСТВА
Authors: Chopchik V. D. 
Published: November 2019

Мета: розглянути можливість інвестування в університетські клініки на основі використання механізму державно-приватного партнерства (ДПП).
Матеріали і методи. Для досягнення поставленої мети у роботі використано загальнонаукові методи аналізу, синтезу, узагальнення, інтерпретації наукових даних, а також системний і структурно-функціональний підходи. Інформаційною базою дослідження є наукові праці вітчизняних і зарубіжних спеціалістів із державно-приватного партнерства та менеджменту.
Результати. Обмеження фінансових ресурсів в охороні здоров’я зумовило потребу інвестувань в університетські клініки та необхідність пошуку нових, ефективних форм реалізації інвестиційної діяльності.
У статті розглянуто можливість інвестування в університетські клініки на основі використання механізму держав­но-приватного партнерства. При переході університетської клініки на роботу на принципах державно-приватного партнерства змінюється статус клініки, вона стає юридично і господарсько самостійним закладом, у якому управління переходить до приватного інвестора, але сама клініка залишається у державній власності. Інвестування реалізується на основі договору і програм із визначенням прав та обов’язків партнерів. Запропоновано алгоритм реалізації проекту державно-приватного партнерства, який забезпечує інвестування і формування сучасних клінічних баз університетів, розвиває бізнес-процеси, що залучають ресурси приватного інвестора і підвищують ефективність роботи університетської клініки.
Висновки. У статті визначені вектори інвестування в університетські клініки через механізми державно-приватного партнерства, а також основні умови реалізації ДПП в університетських клініках.
Identifying Alzheimer’s disease-related proteins by LRRGD
Authors: Zhao Tianyi , Hu Yang , Zang Tianyi , Cheng Liang 
Published: November 2019

AbstractBackgroundAlzheimer’s disease (AD) imposes a heavy burden on society and every family. Therefore, diagnosing AD in advance and discovering new drug targets are crucial, while these could be achieved by identifying AD-related proteins. The time-consuming and money-costing biological experiment makes researchers turn to develop more advanced algorithms to identify AD-related proteins.ResultsFirstly, we proposed a hypothesis “similar diseases share similar related proteins”. Therefore, five similarity calculation methods are introduced to find out others diseases which are similar to AD. Then, these diseases’ related proteins could be obtained by public data set. Finally, these proteins are features of each disease and could be used to map their similarity to AD. We developed a novel method ‘LRRGD’ which combines Logistic Regression (LR) and Gradient Descent (GD) and borrows the idea of Random Forest (RF). LR is introduced to regress features to similarities. Borrowing the idea of RF, hundreds of LR models have been built by randomly selecting 40 features (proteins) each time. Here, GD is introduced to find out the optimal result. To avoid the drawback of local optimal solution, a good initial value is selected by some known AD-related proteins. Finally, 376 proteins are found to be related to AD.ConclusionThree hundred eight of three hundred seventy-six proteins are the novel proteins. Three case studies are done to prove our method’s effectiveness. These 308 proteins could give researchers a basis to do biological experiments to help treatment and diagnostic AD.
A novel algorithm based on bi-random walks to identify disease-related lncRNAs
Authors: Hu Jialu , Gao Yiqun , Li Jing , Zheng Yan , Wang Jingru , Shang Xuequn 
Published: November 2019

AbstractBackgroundsThere is evidence to suggest that lncRNAs are associated with distinct and diverse biological processes. The dysfunction or mutation of lncRNAs are implicated in a wide range of diseases. An accurate computational model can benefit the diagnosis of diseases and help us to gain a better understanding of the molecular mechanism. Although many related algorithms have been proposed, there is still much room to improve the accuracy of the algorithm.ResultsWe developed a novel algorithm, BiWalkLDA, to predict disease-related lncRNAs in three real datasets, which have 528 lncRNAs, 545 diseases and 1216 interactions in total. To compare performance with other algorithms, the leave-one-out validation test was performed for BiWalkLDA and three other existing algorithms, SIMCLDA, LDAP and LRLSLDA. Additional tests were carefully designed to analyze the parameter effects such asα,β,landr, which could help user to select the best choice of these parameters in their own application. In a case study of prostate cancer, eight out of the top-ten disease-related lncRNAs reported by BiWalkLDA were previously confirmed in literatures.ConclusionsIn this paper, we develop an algorithm, BiWalkLDA, to predict lncRNA-disease association by using bi-random walks. It constructs a lncRNA-disease network by integrating interaction profile and gene ontology information. Solving cold-start problem by using neighbors’ interaction profile information. Then, bi-random walks was applied to three real biological datasets. Results show that our method outperforms other algorithms in predicting lncRNA-disease association in terms of both accuracy and specificity.Availabilityhttps://github.com/screamer/BiwalkLDA
Associations of serum low-density lipoprotein and systolic blood pressure levels with type 2 diabetic patients with and without peripheral neuropathy: systemic review, meta-analysis and meta-regression analysis of observational studies
Authors: Naqvi Syed Shah Zaman Haider , Imani Saber , Hosseinifard Hossein , Wen Qing-Lian , Shahzad M. Naveed , Ijaz Iqra , Deng Youcai , Guo Man , Xu Yong 
Published: November 2019

AbstractBackgroundCompositional abnormalities in lipoproteins and cardiovascular risk factors play an important role in the progression of diabetic peripheral neuropathy (DPN). This systematic review aimed to estimate the predicting value of low-density lipoprotein (LDL) and systolic blood pressure (SBP) level in type-2 diabetes mellitus (T2DM) patients with and without peripheral neuropathy. We also tried to determine whether LDL and SBP are associated with an increased collision risk of DPN.MethodsA systematic search was conducted for eligible publications which explored the LDL and SBP level in T2DM patients with and without peripheral neuropathy. The quality of the included studies was assessed by the QUADAS-2 tool. The standardized mean difference (SMD) with 95% CI of LDL and SBP level were pooled to assess the correlation between LDL and SBP level with DPN. We performed random effects meta-regression analyses to investigate factors associated with an increased collision risk of DPN.ResultsThere was a significant association between LDL and SBP with poor prognosis of DPN in those included studies (I2 = 88.1% and I2 = 84.9%, respectively, BothP < 0.001). European T2DM patients have higher serum level of LDL in compare with the European DPN patients (SMD = 0.16, 95% CI: − 0.06 - 0.38;P < 0.001). SBP level was associated with a 2.6-fold decrease in non-DPN patients of T2DM (SMD = − 2.63, 95% CI: − 4.00 - -1.27,P < 0.001). Old age European T2DM patients have significantly high risk for diabetes drivers. Furthermore, the results of the case-control study design model are more precise to show the accuracy of SBP in Asian T2DM patients.ConclusionOur finding supports the LDL and SBP status could be associated with increased risk of peripheral neuropathy in T2DM patients.
Determinants of linear growth faltering among children with moderate-to-severe diarrhea in the Global Enteric Multicenter Study
Authors: Brander Rebecca L. , Pavlinac Patricia B. , Walson Judd L. , John-Stewart Grace C. , Weaver Marcia R. , Faruque Abu S. G. , Zaidi Anita K. M. , Sur Dipika , Sow Samba O. , Hossain M. Jahangir , Alonso Pedro L. , Breiman Robert F. , Nasrin Dilruba , Nataro James P. , Levine Myron M. , Kotloff Karen L. 
Published: November 2019

AbstractBackgroundModerate-to-severe diarrhea (MSD) in the first 2 years of life can impair linear growth. We sought to determine risk factors for linear growth faltering and to build a clinical prediction tool to identify children most likely to experience growth faltering following an episode of MSD.MethodsUsing data from the Global Enteric Multicenter Study of children 0–23 months old presenting with MSD in Africa and Asia, we performed log-binomial regression to determine clinical and sociodemographic factors associated with severe linear growth faltering (loss of ≥ 0.5 length-for-agez-score [LAZ]). Linear regression was used to estimate associations with ΔLAZ. A clinical prediction tool was developed using backward elimination of potential variables, and Akaike Information Criterion to select the best fit model.ResultsOf the 5902 included children, mean age was 10 months and 43.2% were female. Over the 50–90-day follow-up period, 24.2% of children had severe linear growth faltering and the mean ΔLAZ over follow-up was − 0.17 (standard deviation [SD] 0.54). After adjustment for age, baseline LAZ, and site, several factors were associated with decline in LAZ: young age, acute malnutrition, hospitalization at presentation, non-dysenteric diarrhea, unimproved sanitation, lower wealth, fever, co-morbidity, or an IMCI danger sign. Compared to children 12–23 months old, those 0–6 months were more likely to experience severe linear growth faltering (adjusted prevalence ratio [aPR] 1.97 [95% CI 1.70, 2.28]), as were children 6–12 months of age (aPR 1.72 [95% CI 1.51, 1.95]). A prediction model that included age, wasting, stunting, presentation with fever, and presentation with an IMCI danger sign had an area under the ROC (AUC) of 0.67 (95% CI 0.64, 0.69). Risk scores ranged from 0 to 37, and a cut-off of 21 maximized sensitivity (60.7%) and specificity (63.5%).ConclusionYounger age, acute malnutrition, MSD severity, and sociodemographic factors were associated with short-term linear growth deterioration following MSD. Data routinely obtained at MSD may be useful to predict children at risk for growth deterioration who would benefit from interventions.