bluuebunny/crossref_metadata_2025_split huggingface dataset:
Current directions in development of postgenomic medical technologies
Authors: Кайшева А.Л. , Гришин Д.В. , Каменский П.А. , Федорончук Т.В. , Мальсагова К.А. , Чойнзонов Е.Л. , Лисица А.В. 
Published: December 2020

Цель работы - анализ ключевых постгеномных технологий, ожидаемых в рамках реализации приоритета научно-технологического развития, определённого пунктом 20в «Переход к персонализированной медицине, высокотехнологичному здравоохранению и технологиям сохранения здоровья, в том числе за счет рационального применения лекарственных препаратов (прежде всего антибактериальных)» СНТР Российской Федерации». Результаты. Обозначены наиболее перспективные направления дальнейших исследований. Мировой уровень развития постгеномных технологий (ПГТ) позволяет перейти от этапов исследований и разработок к внедрению в медицинскую практику. На сегодняшний день к основным направлениям успешного практического применения ПГТ в России и за рубежом относят биофармацевтику, включая разработку методов генного редактирования для лечения онкологических и орфанных заболеваний, развитие методов молекулярного профилирования для персонализированной медицины и питания, увеличения активного возраста человека. Заключение. Быстрое развитие высокопроизводительных постгеномных технологий и вычислительных систем позволило беспрепятственно исследовать биологические системы. Индивидуальные и интегративные постгеномные профили полезны для мониторинга состояния здоровья человека, оказания превентивных мероприятий и выбора эффективной лекарственной терапии.The aim of this study was to analyze key expected postgenomic technologies as a part of priority in scientific and technological development defined in item 20 of the Strategy for Scientific and Technological Development of the Russian Federation, «Transition to personalized medicine, high-tech health care and health saving technologies through the rational use of medicines (primarily antibacterial)». Results. The most promising areas of further research were identified. The international level of postgenomic technologies (PGT) allows to move from research and development to implementation in medical practice. Presently, industrial biotechnology, biopharmaceuticals, including development of gene editing methods for treatment of oncological and orphan diseases and molecular profiling methods for individualized medicine, nutrition, and prolonging the active life are considered the main directions for successful practical use of PGT in Russia and other countries. Conclusion. Rapid development of high-performance postgenomic technologies and computer systems has expedited studying biological systems. Individual and integrative postgenomic profiles are useful for monitoring the state of human health, taking preventive measures, and selecting effective drug therapy.
ADAPTIVE VARIABILITY OF TOTAL RNA IN LYMPHOID CELLS AS A CAUSE FOR NON-REPRODUCIBILITY OF ITS EFFECTS
Authors: Бабаева А.Г. , Геворкян Н.М. , Тишевская Н.В. 
Published: December 2020

В обзоре анализируются причины невоспроизводимости эффектов лимфоцитарной РНК в процессах регенерации и иммуногенеза. Подчеркивается необходимость учета изменчивости свойств РНК при изменении функционального режима лимфоцитов в разных фазах регенерационного процесса и иммунного ответа. Рассмотренные в обзоре вопросы имеют решающее значение для разработки нового фармакотерапевтического направления по созданию оригинальных лечебных препаратов на основе органных РНК, не имеющих аллогенного и ксеногенного ограничений.
A review of the analysis of the causes of non-reproducibility of the effects of lymphocyte RNA during regeneration and immunogenesis. The necessity to take into account the variability of RNA properties when the functional regimen of lymphocytes varies in different phases of regenerative process and immune response is emphasized.
METHODS FOR SIMULATION OF ACUTE BRAIN ISCHEMIA: PATHOPHYSIOLOGICAL SUBSTANTIATION OF SELECTION AND IMPORTANCE FOR CLINICAL PRACTICE
Authors: Гельцер Б.И. , Слабенко Э.В. , Заяц Ю.В. , Котельников В.Н. 
Published: December 2020

Одним из основных требований к разработке экспериментальных моделей цереброваскулярных заболеваний является их максимальная приближенность к реальной клинической практике. В работе систематизированы данные по основным методам моделирования острой ишемии головного мозга (ОИГМ), представлена их классификация, анализируются данные о преимуществах и недостатках той или иной модели. Обсуждаются результаты экспериментальных исследований по изучению патогенеза ОИГМ с использованием различных моделей (полной и неполной глобальной, локальной и мультифокальной ишемии) и способов их реализации (перевязка артерий, клипирование, коагуляция, эмболизация и др.). Особое внимание уделяется «стабильности» последствий острого нарушения мозгового кровообращения: необратимых ишемических повреждений головного мозга или обратимых с реперфузией заданной продолжительности. Отмечается, что важное значение в этих исследованиях должно принадлежать современным методам прижизненной визуализации очагов острого ишемического повреждения, что позволяет оценивать динамику патологического процесса. Предлагаемый метод отвечает требованиям гуманного обращения с животными. Подчеркивается, что выбор релевантной модели ОИГМ определяется задачами предстоящего исследования и технологическими ресурсами научной лаборатории.
Development of experimental models for acute forms of cerebrovascular diseases is essential for implementation of methods for their prevention and treatment. One of the principal requirements to such models is their maximum approximation to actual clinical practice. This review systematized major models of acute cerebral ischemia (ACI), their classification, and presented information about their advantages and shortcomings. Also, the review presented results of experimental studies on pathophysiological mechanisms of different types of modeled ACI (complete and incomplete global, local, and multifocal ischemia) and methods for creating these models (arterial ligation, clipping, coagulation, embolization, etc.). Particular attention was paid to “stability” of the consequences of acutely impaired cerebral circulation - an irreversible ischemic brain injury or a reversible injury with reperfusion of a given duration. The authors emphasized that in such studies, a special significance should be given to intravital imaging of acute ischemic damage foci using modern methods, which allow assessing the dynamics of the pathological process and meet the requirements to humane treatment of animals. The choice of a relevant ACI model is determined by objectives of the planned study and the technological resources available at the research laboratory.
AN EXPERIMENTAL MODEL OF PERI-IMPLANTITIS
Authors: Плюхин Д. В. , Асташина Н. Б. , Соснин Д. Ю. , Мудрова О. А. 
Published: December 2020

Цель исследования - разработка и оценка эффективности экспериментальной модели периимплантита, как осложнения при дентальной имплантации. Методика. Предложена экспериментальная модель для изучения процесса формирования осложнений (периимплантита) после дентальной имплантации. Периимплантит моделировали на белых крысах в 2 этапа. На первом этапе 50 крысам экстрагировали первый моляр верхней челюсти слева. На втором этапе осуществляли имплантацию. Использовали модели - импланты, изготовленные не фабричным способом из чистого титана. Животные были разделены на 2 группы. Основную группу составили 25 крыс с моделированием периимплантита. Периимплантит моделировали путем создания нестабильности положения импланта за счет наложения лигатуры из хлопковой нити на область его шейки. Группу сравнения составили 24 крысы с установкой импланта без моделирования условий для формирования периимплантита. Результаты. Приведено подробное описание модели эксперимента. Результаты оценивали через 12 нед после имплантации. В основной группе периимплантит развился у 86,4% животных (19 из 22), в группе сравнения у 17,4% (4 из 23). Заключение. Предложенный способ является эффективной экспериментальной моделью для формирования периимплантита, что позволяет использовать ее для изучения патофизиологии формирования и оценки различных методов профилактики и лечения данного осложнения.
Aim. To present an experimental model of complications following dental implantation (peri-implantitis). Methods. Peri-implantitis was modeled on white rats (n=50) in two steps. At the first step, the first molar was extracted from the left side of the upper jaw. At the second step, the implantation was performed. Non-commercial implants made of pure titanium were used. The animals were divided into two groups. The main group consisted of 25 rats with peri-implantitis modeled by creating instability of the implant position by ligation of the implant neck area with a cotton thread. The comparison group (n=24) consisted of rats with an installed implant without modeling peri-implantitis. Results. A detailed description of the experimental model was provided. The outcome was evaluated at 12 weeks after implantation. In the main group, peri-implantitis developed in 86.4% of rats in the experimental group vs. 17.4% in the comparison group. Conclusion. The suggested method is an effective experimental model of peri-implantitis, which allows studying the pathophysiology of peri-implantitis and evaluating different methods for prevention and treatment of this complication.
The effect of Notrombel on FeCl3-induced carotid artery thrombosis in rats
Authors: Васина Е.Ю. , Чефу С.Г. , Петрищев Н.Н. 
Published: December 2020

Цель работы - изучение влияния Нотромбела (ЗАО «Вертекс», Санкт-Петербург, РФ) на развитие экспериментального тромбоза. Методика. Опыты выполнены на крысах-самцах Вистар массой 250-270 г. Нотромбел вводили внутривенно и интрагастрально в течение 10 сут (курсовая доза 25, 50 и 100 мг/кг). В качестве препаратов сравнения использовали ацетилсалициловую кислоту (АСК) и Клопидогрел (курсовая доза 10,5 и 20 мг/кг соответственно). Тромбоз сонной артерии вызывали 60-секундной аппликацией 20% FeCl3. Кровоток регистрировали методом высокочастотной ультразвуковой допплерографии («Минимакс-Допплер-К» Санкт-Петербург, РФ, с рабочей частотой датчика 20 МГц). Прекращение кровотока рассматривали как показатель тромбоокклюзии сонной артерии. Результаты. У контрольных крыс через 20-30 мин после аппликации FeCl3 кровоток в сонной артерии не определялся, что свидетельствовало о развитии тромбоза. Нотромбел как при интрагастральном, так и при внутривенном введении тормозил развитие FeCl3-индуцированного тромбоза сонной артерии. Наиболее эффективной независимо от способа введения оказалась курсовая доза препарата 100 мг/кг, при которой ни в одном из опытов тромбоз не развивался. Антитромботический эффект Нотромбела сопоставим с эффектами АСК и Клопидогрела. В механизме антитромботического влияния Нотромбела имеют значение его прямое ингибирующее влияние на функциональную активность тромбоцитов, а также антиоксидантная активность. Заключение. Нотромбел можно рассматривать как перспективный антитромботический препарат.
Aim. To study the effect of Notrombel (ZAO Vertex, St. Petersburg, Russia), a drug of the N, N’-substituted piperazine class containing a carboximidamide group, on experimental thrombosis. Methods. Experiments were carried out on male Wistar rats weighing 250-270 g. Notrombel was administered intravenously and intragastrically for 10 days (course doses 25, 50, and 100 mg/kg). Acetylsalicylic acid (ASA) and Сlopidogrel (course doses 10.5 and 20 mg/kg, respectively) were used as comparator drugs. Carotid artery thrombosis was induced by a 60-s application of 20% FeCl3. Blood flow was recorded by high-frequency ultrasonic dopplerography (Minimax-Doppler-K, St. Petersburg, RF; sensor operating frequency, 20 MHz). Stagnation of blood flow was considered as an indicator of carotid artery occlusion. Results. In control rats 20-30 minutes after the application of FeCl3, the carotid blood flow was undeterminable, which indicated development of thrombosis. Notrombel, both intragastric and intravenous, inhibited the development of FeCl3-induced carotid thrombosis. The most effective dose was 100 mg/kg irrespective of the administration route. Thrombosis has not developed in any experiment. The antithrombotic effect of Notrombel was comparable to that of ASA and Clopidogrel. The Notrombel inhibition of platelet activity and its antioxidant properties contribute to the mechanism of Notrombel antithrombotic effect. Conclusion: Notrombel can be considered as a promising antithrombotic drug.
Pharmacogenetics of drugs in breast cancer and new approaches for improvement of their bioavailability
Authors: Бурденный А.М. , Лукина С.С. , Заварыкина Т.М. , Пронина И.В. , Бреннер П.К. , Капралова М.А. , Аткарская М.В. , Филиппова Е.А. , Иванова Н.А. , Круглова М.П. , Белова М.В. , Бахрушина Е.О. , Брага Э.А. , Логинов В.И. 
Published: December 2020

В работе была проанализирована отечественная и зарубежная литература, в которой рассматривается фармакогенетический подход к лечению рака молочной железы, а также приведены результаты клинических исследований, в которых показана роль молекулярно-генетических маркеров в эффективности терапии рака молочной железы. Известно, что аллельные варианты генов могут иметь различное влияние на эффективность лекарственных веществ. Фармакогенетическое значение имеют любые как наследуемые (герминальные), так и случайные (соматические) изменения в геноме пациенток. Как правило, для оценки эффективности и токсичности лекарственных веществ используются наследуемые генетические варианты, в то же время, случайные мутации, а также другие известные для опухолевого генома изменения используются при выборе схемы лечения и создания задела для увеличения эффективности терапии. Одним из перспективных и стремительно развивающихся направлений современной фармакологии является адресная доставка лекарственных препаратов к опухоли. В обзоре обобщаются новые актуальные разработки в области направленного транспорта лекарственных веществ в опухолевую ткань.
This review analyzed Russian and international studies focusing on the pharmacogenetic approach to treatment of breast cancer. Also, the authors presented results of clinical studies, which showed the role of molecular genetic markers in the efficacy of breast cancer therapy. Allelic variants of different genes have been shown to exert different influences on drug effects. Both inherited and somatic changes in the patient’s genome are pharmacogenetically significant. Inherited genetic variants are generally used for evaluating efficacy and toxicity of drugs while somatic mutations and other known changes in tumor cells are used primarily for selection of treatment and creation of a base for enhancing the effectiveness of therapy. A promising and rapidly developing field of modern pharmacology is targeted delivery of drugs to the tumor. This review summarized state-of-the-art knowledge of new developments in transport of drugs to tumor tissue.
The effect of a synbiotic on blood biochemistry and concentrations of leptin, ghrelin and their receptors in prepubertal rats consuming a diet containing excessive fat
Authors: Дроздова Г.А. , Линецкая О.И. , Нургалеева Е.А. , Эткина Э.И. , Аглетдинов Э.Ф. 
Published: December 2020

Цель работы - изучить возможности патогенетической коррекции синбиотиком метаболических нарушений, вызванных чрезмерным потреблением жиров и оценить уровень лептина, грелина и их рецепторов. Методика. В работе использовалось второе поколение лабораторных крыс линии Вистар препубертатного возраста, находившихся на диете с избыточным содержанием жиров (51% от общего рациона). В возрасте 5 нед. в рацион экспериментальной подгруппы включали синбиотик, по достижению 7-недельного возраста животных выводили из эксперимента декапитацией с последующим забором материала для бактериологических, биохимических и иммуноферментных исследований. Результаты. Показано, что избыточное потребление жиров способствует росту условно-патогенной микробиоты, снижению содержания лакто- и бифидобактерий в толстом кишечнике и развитию дислипидемии. Наблюдается статистически значимое повышение уровня лептина в сыворотке крови на 49,9 %. В жировой ткани отмечено увеличение количества рецепторов к лептину ( в два раза) и грелину (на 28,2%). После коррекции синбиотиком положительная динамика отмечалась со стороны микробиоты, липидного профиля, снижался уровень лептина в сыворотке крови и рецепторов к грелину в жировой ткани. Заключение: синбиотик способствует нормализации микробиоты желудочно-кишечного тракта, липидного профиля и уровня пептидных гормонов, ответственных за чувство голода и насыщения.
The aim of the study was to evaluate a possibility of using synbiotics for pathogenetic correction of metabolic disorders induced by excessive consumption of fat and to measure levels of leptin, ghrelin, and their receptors. Methods. Experiments were conducted on the second generation of prepubertal Wistar rats consuming a diet with excessive fat (51% of diet). A synbiotic was included into the diet of a rat group aged 5 weeks. At age of 7 weeks, animals of the experimental and control groups were decapitated and samples were taken for bacteriological, biochemical, and enzyme immunoassay studies. Results. Excessive fat consumption resulted in growth of conditionally pathogenic microbiota, decreased levels of lacto- and bifidobacteria in the large intestine and feces, and development of dyslipidemia. Also, serum level of leptin was increased by 49.9%, ghrelin receptor density in adipose tissue was increased by 28.2%, and leptin receptors density in adipose tissue was increased twofold. The synbiotic treatment resulted in beneficial changes of the microbiota and lipid profile; serum level of leptin and ghrelin receptors density in adipose tissue decreased. Conclusion: The synbiotic drug normalized the gastrointestinal microbiota, lipid profile, and peptide hormones responsible for feelings of hunger and satiety.
About of the Co-morbidity of Alcoholism: a Clinical Case of the co-occurring Alcohol Dependence and Schizophrenia
Authors: Ежкова Е.В. , Винникова М.А. , Булатова Р.А. 
Published: December 2020

Многочисленные исследования последних лет указывают на увеличение коморбидной психиатрической патологии в популяции больных алкоголизмом. Представлен анализ клинического случая алкогольной зависимости, протекающей на фоне шизофренического процесса. Особое внимание обращено на трудности диагностики шизофрении, сочетанной с алкогольной зависимостью, а также особенности клинической картины алкогольной зависимости, протекающей на фоне шизофрении.
Numerous research studies reveal that degree of incidence of psychiatric co-morbidity increases among patients with alcohol dependence at the present time. The analysis of the clinical case of the co-morbidities like as alcohol dependence and schizophrenia is presented. The clinical case shows difficulties in diagnostic of co-morbidity psychiatric disease, as well as the peculiarities of alcohol dependence on the background of schizophrenia.
Identification of genetic predisposition to latent tuberculosis infection
Authors: Бабушкина Н.П. , Брагина Е.Ю. , Гараева А.Ф. , Гончарова И.А. , Цитриков Д.Ю. , Гомбоева Д.Е. , Рудко А.А. , Фрейдин М.Б. 
Published: December 2020

Туберкулез является значимой медико-социальной проблемой в связи с широкой распространенностью, высокой степенью инвалидизации и смертности населения. После инфицирования M. tuberculosis у подавляющего большинства развивается латентная туберкулезная инфекция (ЛТБИ), адекватно оценить истинную распространенность которой (по оценкам ВОЗ - это около 30% населения) практически невозможно, поскольку диагностику данного состояния проводят лишь у детей и ВИЧ-инфицированных. Целью настоящего исследования был поиск генетических маркеров, ассоциированных с ЛТБИ. У 70 пациентов с ЛТБИ и 445 индивидов из контрольной выборки изучено 62 однонуклеотидных полиморфизма (SNPs). Ассоциации с ЛТБИ выявлены для трех маркеров: rs2505675 (p = 0,020), rs958617 (p = 0,019), rs6676375 (p = 0,021). С использованием MB-MDR выявлены информативные для оценки риска развития ЛТБИ межлокусные комбинации генотипов, характеризующие возможные межгенные (эпистатические) взаимодействия. Получено 4 двухлокусных (p<0,01) и 5 трехлокусных статистически значимых моделей (p<0,001), включающих 14 SNPs. Детальное рассмотрение полученных моделей позволило для каждой межлокусной комбинации получить от одного до трех сочетаний генотипов, предрасполагающих к развитию ЛТБИ, значения OR для которых составляют от 1,97 до 15,66. Полученные результаты указывают на выраженную роль эпистатических взаимодействий генов при ЛТБИ.
Tuberculosis is a significant medical and social problem due to the high prevalence, high degree of disability and mortality. Latent tuberculosis infection (LTBI) develops in the majority of cases after infection of M. tuberculosis . It is almost impossible to estimate exactly the prevalence LTBI (according to WHO - it is about 30% of population), because this condition diagnoses only in children and HIV-infected people. The aim of our study was to determine the genes associated with LTBI. 62 SNPs were analyzed in 70 LTBI patients and 445 healthy donors. Associations with LTBI were identified for three markers: rs2505675 (p = 0.020), rs958617 (p = 0.019), rs6676375 (p = 0.021). Interlocus combinations of genotypes characterizing possible intergenic (epistatic) interactions were revealed for the risk assessment of LTBI by MB-MDR. Four two-locus statistically significant models (p <0.01) and 5 - three-locus models (p<0.001) were obtained including 14 SNPs. Detailed consideration of obtained models allowed for each inter locus combination to get from one to three combinations of genotypes predisposing to the development of LTBI, the OR values for which are from 1.97 to 15.66. Our results indicate that epistatic interactions might play an important role in LTBI.
Relationship between the genetic structure of human populations and geographical and climatic parameters
Authors: Попович А.А. , Вагайцева К.В. , Бочарова А.В. , Степанов В.А. 
Published: December 2020

Популяции человека проживают в различных условиях среды обитания, которые требуют адаптации, особенно к экстремальным средовым факторам. Действие адаптивной эволюции отражается и на генетической структуре популяций человека. В настоящем исследовании был проведен анализ вариабельности 25 однонуклеотидных полиморфизмов (SNP), связанных с адаптацией к холодному климату, в мировых популяциях. Показано влияние климатических и географических факторов на генетическое разнообразие популяций человека. Выявлен рост генетического разнообразия по изученным маркерам от Африки по мере расселения современного человека по земному шару. Вероятно, высокая частота аллелей, ассоциированных с адаптацией к климату, в некоторых популяциях человека может быть объяснена в рамках гипотезы канализации/деканализации геном-феномных отношений в ходе расселения современного человека.Human populations live in different environmental conditions that require adaptation, especially to extreme environmental factors. The action of adaptive evolution is also reflected on human populations’ genetic constitution. The study highlights the variability analysis of 25 SNPs single nucleotide polymorphisms (SNP) related to adaptation to a cold climate, as well as influence of climatic and geographical factors on the genetic diversity of human populations. The growth of the genetic diversity among the studied markers from Africa according to a modern human’s displacement around the earth identified. Probably, the variability of alleles associated with adaptation to climate in some populations could be explained in the framework of the hypothesis of canalization/decanalization of genome-phenome relationships under natural selection during modern human dispersion.