bluuebunny/crossref_metadata_2025_split huggingface dataset:
Evolution of novel genes in three-spined stickleback populations
Authors: Schmitz Jonathan F. , Chain Frédéric J. J. , Bornberg-Bauer Erich 
Published: June 2020

AbstractEukaryotic genomes frequently acquire new protein-coding genes which may significantly impact an organism’s fitness. Novel genes can be created, for example, by duplication of large genomic regions or de novo, from previously non-coding DNA. Either way, creation of a novel transcript is an essential early step during novel gene emergence. Most studies on the gain-and-loss dynamics of novel genes so far have compared genomes between species, constraining analyses to genes that have remained fixed over long time scales. However, the importance of novel genes for rapid adaptation among populations has recently been shown. Therefore, since little is known about the evolutionary dynamics of transcripts across natural populations, we here study transcriptomes from several tissues and nine geographically distinct populations of an ecological model species, the three-spined stickleback. Our findings suggest that novel genes typically start out as transcripts with low expression and high tissue specificity. Early expression regulation appears to be mediated by gene-body methylation. Although most new and narrowly expressed genes are rapidly lost, those that survive and subsequently spread through populations tend to gain broader and higher expression levels. The properties of the encoded proteins, such as disorder and aggregation propensity, hardly change. Correspondingly, young novel genes are not preferentially under positive selection but older novel genes more often overlap with FST outlier regions. Taken together, expression of the surviving novel genes is rapidly regulated, probably via epigenetic mechanisms, while structural properties of encoded proteins are non-debilitating and might only change much later.
Centrosome reduction in newly-generated tetraploid cancer cells obtained by separase depletion
Authors: Galofré Claudia , Asensio Elena , Ubach Maria , Torres Irianna M. , Quintanilla Isabel , Castells Antoni , Camps Jordi 
Published: June 2020

AbstractTetraploidy, a common feature in cancer, results in the presence of extra centrosomes, which has been associated with chromosome instability (CIN) and aneuploidy. Deregulation in the number of centrosomes triggers tumorigenesis. However, how supernumerary centrosomes evolve during the emergence of tetraploid cells remains yet to be elucidated. Here, generating tetraploid isogenic clones in colorectal cancer and in non-transformed cells, we show that near-tetraploid clones exhibit a significant increase in the number of centrosomes. Moreover, we find that centrosome area in near-tetraploids is twice as large as in near-diploids. To evaluate whether centrosome clustering was occurring, we next analysed the number of centrioles revealing centriole amplification. Notwithstanding, more than half of the near-tetraploids maintained in culture do not present centrosome aberrations. To test whether cells progressively lost centrioles after becoming near-tetraploid, we transiently transfected diploid cells with siRNA against ESPL1/Separase, a protease responsible for triggering anaphase, to generate newly near-tetraploid cells. Finally, using this model, we assessed the number of centrioles at different time-points after tetraploidization finding that near-tetraploids rapidly lose centrosomes over time. Taken together, these data demonstrate that although most cells reduce supernumerary centrosomes after tetraploidization, a small fraction retains extra centrioles, potentially resulting in CIN.
Tiered approach for the identification of Mal d 1 reduced, well tolerated apple genotypes
Authors: Romer Emilia , Chebib Soraya , Bergmann Karl-Christian , Plate Katrin , Becker Sylvia , Ludwig Christina , Meng Chen , Fischer Thilo , Dierend Werner , Schwab Wilfried 
Published: June 2020

AbstractA rising proportion of the world population suffers from food-related allergies, including incompatibilities to apples. Although several allergenic proteins have been found in apples, the most important proteins that cause allergic reactions to apples in Central-Northern Europe, and North America are the Mal d 1 proteins, which are homologues of the birch pollen allergen Bet v 1. As the demand for hypoallergenic fruits is constantly increasing, we selected apple genotypes with a low total content of Mal d 1 by enzyme-linked immunosorbent assay analysis from segregating populations and tested the tolerability of these fruits through a human provocation study. This tiered approach, which exploited the natural diversity of apples, led to the identification of fruits, which were tolerated by allergic patients. In addition, we found a significant correlation (coefficient >0.76) between the total Mal d 1 content and flavan-3-ol amount and show that the isoform composition of the Mal d 1 proteins, which was determined by LC-MS/MS has a decisive effect on the tolerability of apple genotypes. The approach presented can be applied to other types of fruit and to other allergenic proteins. Therefore, the strategy can be used to reduce the allergen content of other plant foods, thereby improving food safety for allergy subjects.
Harmonics mitigation and non‐ideal voltage compensation utilising active power filter based on predictive current control
Authors: Alhasheem Mohammed , Mattavelli Paolo , Davari Pooya 
Published: June 2020

It is well‐known that the presence of non‐linear loads in the distribution system can impair the power quality. The problem becomes worse in microgrids and power electronic‐based power systems as the increasing penetration of single‐phase distributed generation may result in a more unbalanced grid voltage. Shunt active power filters (SAPFs) are used for improving the power quality and compensating for the unbalance grid voltage. This study presents a modification of the classical control structure based on the finite control set model predictive control (FCS‐MPC). The proposed control structure can retain all the advantages of FCS‐MPC, while improving the input current quality. Furthermore, a computationally efficient cost function based on only a single objective is introduced, and its effect on reducing the current ripple is demonstrated. The presented solution provides a fast response to the transients as well as compensates for the unbalanced grid voltage conditions. A straightforward single loop controller is compared to the conventional way of realising the active power filters, which is based on space vector pulse width modulation. The simulation results have been obtained from MATLAB/SIMULINK environment, while the obtained experimental results, utilising a 15 kVA power converter, highlight the effective performance of the proposed control scheme and verifies the introduced MPC‐based method as a viable control solution for SAPFs.
Umfassende präoperative Evaluation von Patienten mit Lungenkrebs
Authors: Ewig S. , Larrosa-Lombardi S. , Halboos A. , Hecker E. 
Published: June 2020

ZusammenfassungAnatomische Resektionsverfahren sind unverändert etablierter Standard in der kurativen Behandlung des nichtkleinzelligen Lungenkarzinoms in den Stadien I – III und einiger kleinzelliger Lungenkarzinome. Die Angaben in der Literatur zur Letalität sowie den Komplikationsraten der Resektionsverfahren schwanken jedoch erheblich. Eine Variable, die das Operationsergebnis maßgeblich beeinflusst, ist die Auswahl der Kandidaten für eine Resektion sowie die Bestimmung des Umfangs der Resektion auf dem Boden einer adäquaten Durchführung und Interpretation einer umfassenden mehrdimensionalen präoperativen Evaluation. Elemente dieser Evaluation sind entsprechend verfügbarer Daten und Leitlinien: der ECOG-Score; kardiales Assessment, ggf. zerebrovaskuläres Assessment; pulmonales Assessment, ggf. mit Ergebnissen der Split-Funktionsanalysen, jeweils ggf. nach Therapie bzw. Adjustierung einer Therapie; bei Patienten über 70 Jahren: Score zur allgemeinen Funktionalität (IADL). Im Rahmen dieser Evaluation ergeben sich demnach 3 verschiedene Risikogruppen: Patienten mit einem geringen Risiko für intra- und postoperative Komplikationen und Letalität; Patienten mit einem entsprechend erhöhten Risiko; Patienten, die als inoperabel eingeschätzt werden. Um eine autonome Entscheidung des Patienten über die optimale Therapie auf dem Hintergrund definierter Risiken zu ermöglichen, ist zudem auch die Kenntnis des Patienten, seiner Präferenzen und Wertmaßstäbe sowie seiner familiären und sozialen Einbindung unverzichtbar.
Neuromodulative Schmerztherapie
Authors: Morgalla Matthias 
Published: June 2020

ZUSAMMENFASSUNGNeuromodulative Verfahren zur Behandlung von Schmerzen sind seit über 50 Jahren im Einsatz. In den letzten Jahren wurden entscheidende Neuentwicklungen eingeführt, die die Schmerztherapie weiter verbessern werden. Aus diesem Grunde sollten neuromodulative Verfahren zur Behandlung chronischer Schmerzen in das Behandlungskonzept fest mit einbezogen sein und viel früher eingesetzt werden als bisher.
Robotisch assistierte obere gastrointestinale und hepatopankreatobiliäre Chirurgie: Etablierung durch einen Stepwise Approach und eine Analyse der ersten 100 Operationen
Authors: Thomaschewski Michael , Zimmermann Markus , Müller-Debus Charlotte Friederieke , Windisch Viola , Wellner Ulrich Friedrich , Hummel Richard , Keck Tobias , Bausch Dirk 
Published: June 2020

Zusammenfassung
Einleitung Die robotisch assistierte Chirurgie ist eine vielversprechende Technik zur Überwindung der Grenzen der laparoskopischen Chirurgie – insbesondere bei komplexen chirurgischen Eingriffen in der Oberbauchchirurgie. Im Folgenden beschreiben wir die Etablierung komplexer robotisch assistierter Oberbauchchirurgie in unserem Zentrum für minimalinvasive Chirurgie und präsentieren die Ergebnisse aus den ersten 100 Eingriffen.
Material und Methoden Die robotisch assistierte Chirurgie wurde mit dem Da Vinci® Xi Surgical System™ durchgeführt. Die Eingriffe wurden von 2 Chirurgen durchgeführt, die Spezialisten auf dem Gebiet der minimalinvasiven Chirurgie sind. Die robotisch assistierte Oberbauchchirurgie wurde in 3 Schritten etabliert. Step 1: Zunächst wurden robotisch assistierte Eingriffe mit leichterem Schwierigkeitsgrad durchgeführt (Cholezystektomien, atypische Magenresektionen und Fundoplikationen). Step 2: Anschließend wurden linksseitige Pankreasresektionen, Adrenalektomien und Lebersegment- bzw. atypische Leberresektionen als Verfahren mit mittlerem Schwierigkeitsgrad durchgeführt. Step 3: Schließlich wurden fortgeschrittene und hochkomplexe Verfahren durchgeführt (Hemihepatektomien, komplexe Pankreasresektionen, Gastrektomien und Ösophagektomien). Die von Juli 2017 bis Oktober 2018 erhobenen Daten wurden retrospektiv hinsichtlich Konversionsrate, Morbidität (Clavien-Dindo > 2) und Mortalität analysiert.
Ergebnisse Der 1. Schritt der Etablierung unseres Roboterprogramms umfasste 26 Eingriffe. Hier betrugen die Konversionsrate, die Morbidität und die Mortalität jeweils 0%. Im 2. Schritt wurden 23 Eingriffe durchgeführt. Die Konversionsrate, Morbidität und Mortalität lagen bei 28, 8 und 0%. Der letzte Schritt umfasste 51 hochkomplexe operative Verfahren. Diese Verfahren hatten eine Konversionsrate 43%, eine Morbidität von 41% und eine Mortalität von 4%.
Schlussfolgerung Unser Stepwise Approach ermöglicht eine sichere Etablierung robotisch assistierter Oberbauchchirurgie mit vergleichbaren Morbiditäts- und Mortalitätsraten – auch bei hochkomplexen operativen Eingriffen. Hochkomplexe Eingriffe erforderten jedoch vergleichsweise häufig eine Konversion, was durch die geringen Erfahrungswerte und durch die Lernkurve beeinflusst sein könnte.
Ambulante Rehabilitationssportangebote für Krebspatienten: Eine Befragungsstudie zu Barrieren und Zugangswegen
Authors: Graf Katharina , Vogt Lutz , Middelmann Felix , Jäger Elke , Banzer Winfried 
Published: June 2020

Zusammenfassung
Hintergrund Trotz einer steigenden Anzahl an Rehabilitationssportgruppen für Krebspatienten wird häufig von Schwierigkeiten beim Zugang zu entsprechenden wohnortnahen Angeboten berichtet. Ziel der Untersuchung war daher die Erhebung von Zugangswegen sowie wahrgenommenen Barrieren und Einflussgrößen für den Einstieg und die langfristige Teilnahme am Rehabilitationssport für Krebspatienten.
Methode An der quantitativen und qualitativen Befragung beteiligten sich 189 Teilnehmer aus 21 ambulanten Rehabilitationssportgruppen (63 ± 10 Jahre; 96 % weiblich; 82 % Brustkrebs; Rehasport-Teilnahme seit im Median 29 Monaten). Mittels standardisierten Instruments (offene und geschlossene Fragen, validierte Skalen) wurden systematisch Faktoren erfasst, die Einstieg und Teilnahme am Rehabilitationssport potenziell beeinflussen können (z. B. Barrieren, Motive).
Ergebnisse Vor dem Einstieg hatten 151 (80 %) der Befragten eine Empfehlung für die Teilnahme am Rehabilitationssport bekommen (40 % stationäre Rehabilitation/Anschlussheilbehandlung, 24 % Familie/Freunde, 16 % Onkologe, 11 % Personal der onkologischen Einrichtung, 10 % Hausarzt/Gynäkologe). Hindernisse / Bedenken vor dem Einstieg umfassten insbesondere eine als zu stark wahrgenommene Müdigkeit/Erschöpfung (37 %), zu starke Schmerzen/Unwohlsein (15 %) und das Gefühl einer therapie-/erkrankungsbedingt zu geringen Fitness (14 %) sowie fehlende Kenntnisse über passende Angebote (19 %) und unzureichende Empfehlungen (13 %). Primäre Motive für den Einstieg und die Teilnahme am Rehabilitationssport lagen in einer Verbesserung von Gesundheit und Wohlbefinden (97 bzw. 93 %) sowie einer Reduktion von (Krankheits-) Beschwerden (96 %) und Rezidivrisiko (82 %). Fast alle Teilnehmer (n = 185; 98 %) wollen nach der Teilnahme am Rehasport weiterhin regelmäßig körperlich-sportlich aktiv bleiben (74 % im Sportverein, davon 36 % zusätzlich privat, 17 % ausschließlich privat). Gut 2 / 3 der Befragten (68 %) haben Interesse, an weiteren regulären Vereinssportangeboten teilzunehmen, 38 % kennen keine anderen Angebote bzw. Möglichkeiten im Verein.
Diskussion Konkrete Empfehlungen und adäquate Aufklärung über Durchführbarkeit, Nutzen und Möglichkeiten von Rehabilitationssport scheinen für den Einstieg in eine entsprechende Krebssportgruppe relevant. Informationen zu Angeboten und Möglichkeiten, bestenfalls bereits während der Krebstherapie, könnten den Einstieg in den Rehasport und konsekutiv einen aktiven Lebensstil sowie die Nutzung des Potenzials von Bewegung unterstützen.
Mikronährstoffe in der Onkologie: Risiko und Nutzen – Update 2020
Authors: Mücke Ralph , Micke Oliver , Büntzel Jens , Adamietz Irenaeus A. , Fakhrian Khashayar 
Published: June 2020

Zusammenfassung
Hintergrund Das Interesse sowohl von betreuenden Ärzten als auch Tumorpatienten an der zusätzlichen Einnahme von Mikronährstoffen während einer onkologischen Therapie mit unterschiedlichen Intentionen nimmt zu. Dieses Update liefert deshalb eine Standortbestimmung zum zusätzlichen Einsatz von ausgewählten Mikronährstoffen während der Tumortherapie.
Methoden Es wurde eine Literaturrecherche hinsichtlich des Einsatzes von ausgewählten Mikronährstoffen in der Onkologie, die bis 2018 in zitierfähigen Journalen erschienen sind, durchgeführt.
Ergebnisse Daten zu Mikronährstoffen, die sowohl hinsichtlich der Lebensqualität als auch der Prognose einen Nutzen für onkologische Patienten bringen, als auch Erkenntnisse zu Mikronährstoffen, die für die Patienten keinen Benefit haben oder sogar schaden, werden präsentiert. Die gute Datenlage hinsichtlich Vitamin D und Selen erlaubt hier die Empfehlung zur Supplementation nach Spiegelbestimmung im Serum.
Schlussfolgerung Nicht nur vorrangig onkologisch tätige Ärzte, sondern auch alle Ärzte, die Tumorpatienten mitbetreuen, sollten Kenntnisse über die wichtigsten Mikronährstoffe haben, um diese an die Patienten weiterzugeben und sie auch gezielt zum Nutzen der Patienten einzusetzen.
Operationsindikationen bei zystischen Tumoren des Pankreas
Authors: Brunner Maximilian , Belyaev Orlin , Bösch Florian , Müller-Debus Charlotte Friederieke , Radulova-Mauersberger Olga , Wellner Ulrich Friedrich , Keck Tobias , Uhl Waldemar , Werner Jens , Witzigmann Helmut , Grützmann Robert 
Published: June 2020

ZusammenfassungEine stetige Verbesserung der modernen Bildgebung sowie ein steigendes Alter in der Gesellschaft haben dazu geführt, dass zunehmend häufiger zystische Pankreastumoren detektiert werden. Zystische Pankreasraumforderungen stellen eine klinisch herausfordernde Entität dar, da sie ein breites biologisches Spektrum umfassen und ihre Differenzierung untereinander vor allem bei kleinen Tumoren häufig schwierig ist. Sie bedingen daher eine differenzierte Operationsindikationsstellung. Zur Bestimmung von Empfehlungen zur Operationsindikation bei zystischen Tumoren des Pankreas wurde von einer Qualitätskommission für Pankreaserkrankungen der Deutschen Gesellschaft für Allgemein- und Viszeralchirurgie eine systematische Literaturrecherche durchgeführt und daraus resultierend folgende Übersichtsarbeit erstellt. Auf Grundlage der aktuellen Evidenz besteht bei Vorliegen von Malignitätszeichen oder Hochrisikokriterien (Ikterus bei Obstruktion des Ductus choledochus durch die
zystische Pankreasläsion, kontrastmittelaufnehmende intramurale Knoten ≥ 5 mm oder solide Komponenten in der Zyste oder Pankreashauptgang ≥ 10 mm) sowie bei Symptomen unabhängig von der Zystenentität (ausgenommen Pankreaspseudozysten) eine Operationsindikation. Ist die Entität der Pankreaszyste mittels bildgebender Diagnostik eruierbar, so sollten alle intraduktalen papillär-muzinösen Neoplasien (IPMN) vom Hauptgang und vom Mischtyp, alle muzinös-zystischen Neoplasien (MCN) > 4 cm sowie alle soliden pseudopapillären Neoplasien (SPN) reseziert werden. Serös-zystische Neoplasien (SCN) und Seitengang-IPMN ohne Risikokriterien stellen primär keine Operationsindikation dar. Die Operationsindikationsstellung bei Seitengang-IPMN mit relativen Risikokriterien und MCN < 4 cm ist Gegenstand aktueller Diskussionen und sollte individuell erfolgen. Die vorliegende Arbeit soll durch ein Herausarbeiten von Indikationsempfehlungen helfen, die Indikationsqualität bei
zystischen Pankreastumoren zu verbessern. Die letztendliche Operationsindikationsstellung sollte jedoch immer individualisiert unter Berücksichtigung von Alter, Komorbiditäten und Patientenwunsch erfolgen.
Latent (Pro)Nucleophiles in Enantioselective Lewis Base Catalyzed Allylic Substitutions
Authors: Vilotijevic Ivan , Lange Markus , Zi You 
Published: June 2020

The use of latent nucleophiles, which are molecules that are not nucleophilic but can be activated to act as a nucleophile at an opportune time during the reaction, expands the scope of Lewis base catalyzed reactions. Here, we provide an overview of the concept and show examples of applications to N- and C-centered nucleophiles in allylic substitutions. N- and C-silyl compounds are superior latent (pro)nucleophiles in Lewis base catalyzed reactions with allylic fluorides in which the formation of the strong Si–F bond serves as the driving force for the reactions. The latent (pro)nucleophiles ensure high regio­selectivity in these reactions and enable enantioselective transformations of Morita–Baylis–Hillman adducts by the use of common chiral Lewis base catalysts.1	Introduction2	Substitution of MBH Carbonates3	The Concept of Latent (Pro)Nucleophiles4	Enantioselective Allylation of N-Heterocycles5	Enantioselective Phosphonyldifluoromethylation of Allylic Fluorides6	Conclusion
Amide Synthesis by Transamidation of Primary Carboxamides
Authors: Laclef Sylvain , Kolympadi Marković Maria , Marković Dean 
Published: June 2020

The amide functionality is one of the most important and widely used groups in nature and in medicinal and industrial chemistry. Because of its importance and as the actual synthetic methods suffer from major drawbacks, such as the use of a stoichiometric amount of an activating agent, epimerization and low atom economy, the development of new and efficient amide bond forming reactions is needed. A number of greener and more effective strategies have been studied and developed. The transamidation of primary amides is particularly attractive in terms of atom economy and as ammonia is the single byproduct. This review summarizes the advancements in metal-catalyzed and organocatalyzed transamidation methods. Lewis and Brønsted acid transamidation catalysts are reviewed as a separate group. The activation of primary amides by promoter, as well as catalyst- and promoter-free protocols, are also described. The proposed mechanisms and key intermediates of the depicted transamidation reactions are shown.1	Introduction2	Metal-Catalyzed Transamidations3	Organocatalyzed Transamidations4	Lewis and Brønsted Acid Catalysis5	Promoted Transamidation of Primary Amides6	Catalyst- and Promoter-Free Protocols7	Conclusion
Antiepileptic Drugs, Polypharmacy, and Quality of Life in People Living with Epilepsy Managed in General Practice
Authors: Moran Samuel , Peterson Chris , Blackberry Irene , Cook Mark , Walker Christine , Furler John , Shears Graeme , Piccenna Loretta 
Published: June 2020

Abstract
Objective Recently, instances of general practitioners (GPs) prescribing antiepileptic drugs (AEDs) have increased. We aimed to investigate the use of AEDs in a community sample of people with epilepsy and the effect on quality of life (QoL).
Methods Responses from the Australian Epilepsy Longitudinal Study (AELS), Pharmaceutical Benefit Scheme (PBS), and Medicare Benefit Scheme (MBS) data were used. Linear regression was used to investigate the relationship between the numbers of AEDs and QoL.
Results Fifty people with epilepsy were prescribed an average of two AEDs. The most common were lamotrigine, sodium valproate, and levetiracetam. Eighty-two percent were prescribed medications from two or more categories of medications. A lower QoL at wave 2 of the AELS was significantly associated with a higher number of AEDs.
Conclusion Given the high number of people with epilepsy being cared for in general practice, GPs must understand the risks and benefits of epilepsy monotherapy, polytherapy, and polypharmacy.
Hypothyroxinemia Detected at 4 Weeks of Life in Preterm Infants Born at Less than 30 Weeks of Gestation
Authors: Kaluarachchi Dinushan C. , Colaizy Tarah T. , Lasarev Michael R. , Allen David B. , Klein Jonathan M. 
Published: June 2020

AbstractObjective Data on free thyroxine (FT4) concentrations beyond first 2 weeks of preterm infants are limited. This study was aimed to describe the association between perinatal characteristics and FT4 concentrations and the incidence of hypothyroxinemia at 4 weeks.Study Design Retrospective analysis of serum thyroid function tests at 4 weeks in preterm infants <30 weeks of gestation. Association between FT4 at 4 weeks of life and perinatal characteristics were determined by bivariate analysis and multivariable regression. Incidence of hypothyroxinemia was determined using a gestational age adjusted definition based on in utero levels at the equivalent postmenstrual age.Results The study cohort consisted of 280 infants. FT4 concentrations at 4 weeks of life were significantly associated with gestational age, birth weight, gender, and maternal history of thyroid disease. Hypothyroxinemia was found in 32.8% of the study cohort.Conclusion Perinatal characteristics are associated with FT4 concentrations at 4 weeks of life. Nearly one-third of infants born <30 weeks had hypothyroxinemia at 4 weeks of life when compared with in utero levels at the equivalent postmenstrual age.