Phylogenetic analysis of Kars' endemic plant species through amplification of the 26S rDNA gene region
Authors: Uluğ Asiye , Özdemir Değirmenci Funda 
Published: September 2024

Phylogenetic analysis of Kars' endemic plant species through amplification of the 26S rDNA gene region
Asiye Uluğ1*, Funda Özdemir Değirmenci2
ORCID: 0000-0001-5524-8431; 0000-0002-8875-0273

1 Department of Biology, Faculty of Science and Literature, Kafkas University, Kars, Türkiye
2 Department of Crop Science, Faculty of Agriculture, Ahi Evran University, Kırşehir, Türkiye

Abstract
The province of Kars, hosting 16% of Türkiye's plant cover, exhibits a high degree of floral diversity, including 71 endemic species. These species are located at the intersection of Türkiye's Caucasian lands, the Iran-Turan, Euro-Siberian, and Mediterranean flora regions. In this study, the 26S rDNA region of 14 endemic plant species sampled from Kars was amplified, and sequence data were obtained. NCBI GenBank database searches confirmed the first-time sequencing of the 26S rDNA gene region for these endemic plant species. The molecular characteristics of the 26S rDNA region of the 14 endemic plant species were examined, providing significant genetic data on the diversity and evolutionary relationships of endemic plants. Comparative analysis of the 26S rDNA sequences of the studied endemic species revealed notable genetic relationships within these plant groups, uncovering considerable variations among the species. The observed high polymorphism in the 26S rDNA region suggests its potential for accurate species identification. The genetic data obtained in this study have the potential to contribute to genetic research for the conservation of endemic species and biodiversity, emphasizing the importance of exploring and documenting the genetic uniqueness of endemic species. Furthermore, the genetic data obtained not only contribute to understanding the phylogenetic relationships among endemic species but also have implications for preserving and sustaining biological diversity by providing molecular identity to endemic plants in international databases.

Keywords: Kars, endemic, 26S rDNA, diversity, conservation

----------  ----------

Kars’ın endemik bitki türlerinin 26S rDNA gen bölgesi amplifikasyonu ile filogenetik analizi
Özet
Türkiye'nin bitki örtüsünün %16'sine ev sahipliği yapan Kars ili, 71'i endemik olmak üzere yüksek oranda floral çeşitliliğe sahiptir. Bu türler, Türkiye'nin Kafkas toprakları, İran-Turan, Euro-Sibirya ve Akdeniz bitki coğrafyasının kesişim noktasında bulunmaktadır. Bu çalışmada, Kars ilinden örneklenen 14 endemik bitki türünün 26S rDNA bölgesi amplifiye edilerek sekans verileri elde edilmiştir. NCBI GenBank veri tabanı eşleştirmeleri bu endemik bitki türlerinin 26S rDNA gen bölgesinin ilk defa sekanslandığını göstermiştir. 14 endemik bitki türünün 26S rDNA bölgesinin moleküler özellikleri incelenerek, endemik bitkilerin genetik çeşitlilikleri ve evrimsel ilişkileriyle ilgili önemli genetik veriler elde edilmiştir. Çalışılan endemik türlerin 26S rDNA dizilerinin karşılaştırılması, bu bitki grupları arasında önemli genetik ilişkileri ortaya koyarak, türler arasında dikkate değer varyasyonları açığa çıkarmıştır. Yüksek polimorfizm 26S rDNA bölgesinin doğru tür tanımlamasında ki potansiyelini göstermiştir. Bu çalışmada elde edilen genetik veriler, endemik türlerin ve biyoçeşitliliğin korunmasına yönelik genetik araştırmalara katkıda bulunma potansiyeline sahiptir ve endemik türlerin genetik benzersizliğinin keşfedilmesinin ve belgelenmesinin önemini açığa çıkarmaktadır. Ayrıca elde edilen genetik veriler, endemik türler arasındaki filogenetik ilişkilerin anlaşılmasına katkı sağlamasının yanı sıra, uluslarası veri tabanlarında endemik bitkilere moleküler kimlik vermede kullanılabileceğinden biyolojik çeşitliliğin korunması ve sürdürülebilir olması açısından önem arz etmektedir.

Anahtar kelimeler: Kars, endemik, 26S rDNA, çeşitlilik, koruma