bluuebunny/crossref_metadata_2025 huggingface dataset:
Abstract 52: Implementation of a Hospital-Based Peer Support Intervention Model for Cancer Patients: Results From a Pilot Study in Vietnam
Authors: Le PhuongThao , Taylor Carolyn , Monahan Rachel , Do Mai , Nguyen Linh , Phan Minh Tri , Wang Cong , Tran Huong , Ginsburg Ophira
Published: June 2023

Purpose: Provision of mental health psychosocial support can reduce psychological distress experienced by cancer patients, which can in turn improve their treatment adherence and outcomes. In this study, we present the results from the pilot trial of Stronger Together, a culturally adapted peer-to-peer support program, conducted in Vietnam.

Methods: We recruited eligible women from four hospitals in Vietnam (K3 National Cancer Hospital, Hue Central Hospital Oncology Center, Can Tho Oncology Hospital, and Hung Vong Women’s Hospital Oncology Unit). Participants were newly diagnosed with breast or gynecologic cancers, and self-selected into either the control (usual care) or intervention arm (mentees who were matched up with trained peer mentors).

Validated questionnaires were administered at baseline (0), 2-, 4-, and 6-months. We conducted a difference-in-difference (DID) analysis for the primary outcomes (assessed by the Depression, Anxiety, and Stress Scale [DASS-21]), comparing the difference in scores from baseline to 6 months and between intervention arms (mentees vs. usual care).

Results: The analytic sample included n=186 participants (mentees: 91; usual care: 95), with the majority having breast cancer (85.5%), followed by cervical cancer (7.5%) and ovarian cancer (7.0%). There were no statistically significant differences between study arms in demographic and cancer characteristics (cancer type and stage). DID analyses showed that compared to usual care participants, mentees (those who received peer support) showed greater reductions in depression, anxiety, and stress scores between baseline and 6 months. Adjusting for age, education, marital status, and cancer stage, statistically significant reductions in stress scores (β=-1.47; 95%CI: [-2.9,-0.02]; p=0.047) were observed. Among breast cancer patients only, adjusted models showed significant reductions in depression scores (β=-1.80; 95%CI: [-3.0,-0.48]; p=0.007) and stress scores (β=-1.9; 95%CI: [-3.3,-0.37; p=0.015).

Conclusion: The Stronger Together pilot study study shows that utilizing peer cancer survivors is a promising strategy to address the psychosocial needs of newly diagnosed cancer patients in low-resource settings. Future research should test this intervention model in larger samples or other similar populations and settings.

Citation Format: PhuongThao Le, Carolyn Taylor, Rachel Monahan, Mai Do, Linh Nguyen, Minh Tri Phan, Cong Wang, Huong Tran, Ophira Ginsburg. Implementation of a Hospital-Based Peer Support Intervention Model for Cancer Patients: Results From a Pilot Study in Vietnam [abstract]. In: Proceedings of the 11th Annual Symposium on Global Cancer Research; Closing the Research-to-Implementation Gap; 2023 Apr 4-6. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Epidemiol Biomarkers Prev 2023;32(6_Suppl):Abstract nr 52.
Abstract 57: Knowledge and Recommendation of HPV Vaccination Among Providers Involved in Cervical Cancer Prevention Activities in Africa
Authors: Domgue Joel Fokom , Pande Mala , Manjuh Florence , Yu Robert , Kamgno Joseph , Shete Sanjay
Published: June 2023

Purpose: Although cervical cancer burden in Africa is among the highest worldwide, HPV vaccination coverage remains low in this region. While provider recommendation is recognized as a key driver of HPV vaccination uptake globally, little is known about the knowledge and practices of African clinicians with regard to HPV vaccine.

Methods: A cross-sectional study was conducted in 2021-2022 among providers involved in cervical cancer prevention activities in Africa. Through an online survey administered by email, providers were invited to report the availability of HPV vaccine in their practice, whether they recommend HPV vaccine, and for those who did not recommend it, the reasons for not recommending it. Participants’ knowledge about HPV vaccine was assessed through three questions.

Results: Of the 104 providers from 18 African countries who responded to the survey, less than half (43.3%) reported having received prior training on how to educate their patients and the community about HPV vaccination, 38.8% indicated that HPV vaccine was available at the facility where they work. Most respondents (83.7%) reported that they recommend HPV vaccination, and this recommendation was frequently made to girls only (82.4%). Among those who did not recommend the HPV vaccine, unavailability of the vaccine (47.1%), lack of effective communication tools and information to give to patients (35.3%), and lack of adequate training (29.4%) were the most commonly reported reasons. Only 16.0% of respondents provided adequate responses to all the knowledge questions.

Conclusion: Despite a higher rate of HPV vaccine recommendation among providers in Africa, providers’ knowledge about HPV vaccine is limited and availability of the vaccine is reportedly low in the region. To increase HPV vaccine uptake in Africa, further training to improve providers’ knowledge and adapted educational material to facilitate communication with their patients and the community is needed. Ongoing efforts to make the HPV vaccine widely available in the region should be reinforced.

Citation Format: Joel Fokom Domgue, Mala Pande, Florence Manjuh, Robert Yu, Joseph Kamgno, Sanjay Shete. Knowledge and Recommendation of HPV Vaccination Among Providers Involved in Cervical Cancer Prevention Activities in Africa [abstract]. In: Proceedings of the 11th Annual Symposium on Global Cancer Research; Closing the Research-to-Implementation Gap; 2023 Apr 4-6. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Epidemiol Biomarkers Prev 2023;32(6_Suppl):Abstract nr 57.
Abstract 6: Applying Next-Generation Sequencing to Improve Pediatric Cancer Diagnosis in Mexico
Authors: Ruiz-Cordero Roberto , Alcantara Ela , Quintanar-Alfaro Ana , Espinoza-Mendez Carlos A , Van Loon Katherine , Breithaupt Lindsay , Zajgla Jorge Melendez , Sweet-Cordero Alejandro
Published: June 2023

Purpose: In Mexico, cancer is the second leading cause of mortality among children between 4 to 15 years old. The overall cure rates remain below 50%, compared to >90% in the United States. This discrepancy is in part explained by the limited access to methods for accurate diagnosis and identification of appropriate therapies in Mexico. Only 48% of large hospitals across Mexico report having the capacity to perform some of the complex testing necessary for subclassification of pediatric cancers. Pan-cancer next generation sequencing (NGS) panels are not available in Mexico. We developed a strategy to perform clinical NGS in pediatric cancer patients in Mexico for identification of single nucleotide variants, copy number changes, and fusion events that are useful for risk stratification and adjusted therapy.

Methods: We established collaborative agreements between UCSF and the National Institute for Genomic Medicine (INMEGEN) in Mexico City. We developed a pediatric cancer focused panel (IMOP) encompassing 200 genes and created a cloud-based bioinformatic and analysis pipeline for remote data interpretation. We established concordance by comparing the sequencing results of clinical cases obtained with the validated UCSF500 panel and the IMOP panel.

Results: The results of 8 clinical samples previously sequenced using the clinically validated UCSF500 panel were compared to results obtained using the IMOP panel. Clinically relevant SNVs and fusions were successfully detected by the IMOP panel at similar variant allelic frequencies. The IMOP panel was shipped to INMEGEN where two samples with prior sequencing results were successfully sequenced. Re-sequencing of the 8 clinical samples to establish concordance at INMEGEN is pending.

Conclusion: Our ongoing pilot proof-of-concept study shows feasibility of a strategy to implement clinical NGS testing in a middle-income country. We hypothesize that implementation of centralized NGS for pediatric cancers at INMEGEN will improve diagnostic accuracy. Moving forward, we plan to complete the clinical validation of the IMOP panel for routine sequencing of pediatric cancer patients. We will use the RE-AIM implementation science framework to assess the effectiveness of the assay in refining clinical diagnosis and treatment planning for pediatric cancer cases in Mexico.

Citation Format: Roberto Ruiz-Cordero, Ela Alcantara, Ana Quintanar-Alfaro, Carlos A Espinoza-Mendez, Katherine Van Loon, Lindsay Breithaupt, Jorge Melendez Zajgla, Alejandro Sweet-Cordero. Applying Next-Generation Sequencing to Improve Pediatric Cancer Diagnosis in Mexico [abstract]. In: Proceedings of the 11th Annual Symposium on Global Cancer Research; Closing the Research-to-Implementation Gap; 2023 Apr 4-6. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Epidemiol Biomarkers Prev 2023;32(6_Suppl):Abstract nr 6.
Abstract 90: Understanding the Self-Collection Preferences of Women Living in Rwanda
Authors: Nair Varun , Dau Hallie , Vidler Marianne , AboMoslim Maryam , Mutamba Barbra , Nesbitt Zoey , Mithani Nadia , Smith Laurie , Rulisa Stephen , Ogilvie Gina
Published: June 2023

Purpose: Cervical cancer is a leading cause of cancer death among women in low- and middle-income countries. Women in Rwanda have high rates of cervical cancer due to limited access to effective screening methods. Research in low-resource settings similar to Rwanda has shown that self-collection for cervical cancer screening is an effective method. This study aimed to compare the preferences of Rwandan women in urban and rural settings toward self-collection and to report on factors related to self-collection amenability.

Methods: A cross-sectional survey was conducted from June 1-9, 2022. Women were recruited from an urban and rural clinic in Rwanda. Women were eligible for the study if they were ≥ 18 years and spoke Kinyarwanda or English. The survey consisted of 51 questions investigating demographics and attitudes towards self-collection for cervical cancer screening. All results were stratified by clinic site. We performed descriptive statistics stratified by urban and rural sites.

Results: In total, 374 Rwandan women completed the survey (urban n=169 and rural n=205). The mean age was 33.09 years for urban and 32.89 years for rural respondents. The majority of respondents at both sites had a primary school or less education and were in a relationship. Both urban and rural respondents were open to self-collection; however, rates were higher in the rural site (79.9% urban and 95.6% rural; p-value<0.001). Similarly, women in rural areas were more likely to report feeling unembarrassed about self-collection (65.3% of urban, 76.8% of rural; p-value<0.001). Both urban (87.6%) and rural (90.2%) respondents were similarly unafraid of social stigma around cervical cancer. Notably, almost all urban and rural respondents (97.6% urban and 98.5% rural) stated they would go for a cervical cancer pelvic examination to a nearby health center if their self-collected results indicated any concern (p-value=0.731).

Conclusion: Rwandan women in both urban and rural areas largely support the implementation and integration of self-collection for cervical cancer screening. Further research is needed to better understand how to implement self-collection screening services. Expanding self-collection for cervical cancer screening in Rwanda will contribute the global elimination of cervical cancer.

Citation Format: Varun Nair, Hallie Dau, Marianne Vidler, Maryam AboMoslim, Barbra Mutamba, Zoey Nesbitt, Nadia Mithani, Laurie Smith, Stephen Rulisa, Gina Ogilvie. Understanding the Self-Collection Preferences of Women Living in Rwanda [abstract]. In: Proceedings of the 11th Annual Symposium on Global Cancer Research; Closing the Research-to-Implementation Gap; 2023 Apr 4-6. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Epidemiol Biomarkers Prev 2023;32(6_Suppl):Abstract nr 90.
Abstract 94: Utilization of MGMT Promoter Methylation Status to Guide Treatment in Elderly Patients With Glioblastoma
Authors: Chu Tiffany , Wang Ting , Silberstein Peter
Published: June 2023

Purpose: Glioblastoma is the most common primary malignant brain tumor in adults. In younger patients, the standard of care is chemoradiation. However, due to the increased risk of chemotherapy-associated toxicity in older patients, monotherapy is instead recommended. O6-methylguanine-DNA methyltransferase (MGMT) promoter methylation has been found to be a prognostic indicator, with methylated MGMT (mGMT) patients having better response to chemotherapy (temozolomide) than unmethylated MGMT (uMGMT) patients. In this study, we compared the overall survival (OS) of different treatment modalities in mMGMT and uMGMT glioblastoma patients older than 60 years.

Methods: Patients diagnosed with glioblastoma (ICD-O-3 histology code 9440) after the age of 60 (N = 8356) were identified in the National Cancer Database (2004-2020). Effects of MGMT methylation status and treatment modality (chemotherapy, CT; radiation therapy, RT; chemoradiation, CRT) on OS were analyzed using Kaplan-Meier curves, log-rank tests, and Cox proportional hazards modeling.

Results: The average age of this sample was 70.8 ± 6.8 years, with nearly half of the sample being under the age of 70. Regardless of MGMT status, most patients received CRT (63.7% uMGMT, 65.1% mMGMT). uMGMT patients treated with CRT had better OS (14.0 months) than those receiving RT (8.2 months; p < 0.001), but there was no difference compared to those receiving CT (12.3 months; p = 0.247). A similar trend was seen in mMGMT patients (CRT: 16.9 months, RT: 9.3 months, CT: 11.8 months). However, among all patients receiving CRT, those with mMGMT survived significantly longer than their uMGMT counterparts (p < 0.001). After adjusting for all other variables, Cox regression analysis remained significant, with a decreased hazard ratio in mMGMT patients (HR = 0.631, p < 0.001).

Conclusion: mMGMT patients older than 60 years of age demonstrated better survival outcomes when treated with chemoradiation. While mMGMT patients had a better response to CRT than uMGMT patients, uMGMT patients experienced improved OS with CRT than single modality treatment. Therefore, combination therapy should be considered not only in younger patients but also in older patients who otherwise have no medical contraindications.

Citation Format: Tiffany Chu, Ting Wang, Peter Silberstein. Utilization of MGMT Promoter Methylation Status to Guide Treatment in Elderly Patients With Glioblastoma [abstract]. In: Proceedings of the 11th Annual Symposium on Global Cancer Research; Closing the Research-to-Implementation Gap; 2023 Apr 4-6. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Epidemiol Biomarkers Prev 2023;32(6_Suppl):Abstract nr 94.
Supplementary Data Table S2 from JMJD6 Shapes a Pro-tumor Microenvironment via ANXA1-Dependent Macrophage Polarization in Breast Cancer
Authors: Cioni Bianca , Ratti Silvia , Piva Annamaria , Tripodi Irene , Milani Matteo , Menichetti Francesca , Langella Tiziana , Botti Laura , De Cecco Loris , Chiodoni Claudia , Lecis Daniele , Colombo Mario P.
Published: June 2023

Significant enriched pathways in JMJD6-KO MCF7 and MDA-MB231 cells
Figure S3 from JMJD6 Shapes a Pro-tumor Microenvironment via ANXA1-Dependent Macrophage Polarization in Breast Cancer
Authors: Cioni Bianca , Ratti Silvia , Piva Annamaria , Tripodi Irene , Milani Matteo , Menichetti Francesca , Langella Tiziana , Botti Laura , De Cecco Loris , Chiodoni Claudia , Lecis Daniele , Colombo Mario P.
Published: June 2023

Effect of Jmjd6 silencing in PyMT41C-cells. A) Real-Time PCR showing the levels of Jmjd6 in PyMT-41C cells transfected with non-targeting siRNA (siCtr) or specific for Jmjd6. Graph is the average of two independent experiments. Two-tailed unpaired t student test was applied to calculate statistical significance. B) Western blot performed on conditioned medium collected from PyMT-41C transfected as in A). Red Ponceau is shown as loading control. C) IF to detect ANXA1 levels and D) lipid droplet formation in cell transfected as in A).
Supplementary Figures 1-8 from FOXA1 Reprogramming Dictates Retinoid X Receptor Response in ESR1-Mutant Breast Cancer
Authors: Wu Yang , Li Zheqi , Wedn Abdalla M. , Casey Allison N. , Brown Daniel , Rao Shalini V. , Omarjee Soleilmane , Hooda Jagmohan , Carroll Jason S. , Gertz Jason , Atkinson Jennifer M. , Lee Adrian V. , Oesterreich Steffi
Published: June 2023

S1. FOXA1 redistribution in ESR1 mutant cells causes distinct ER-FOXA1 interaction.S2. FOXA1 gained peaks annotated genes are significantly associated with novel target genes.S3. FOXA1 redistribution in ESR1 mutant cells confers potential RXR binding sites.S4. RXR agonist LG100268 can promote colonization and growth of ESR1 mutant cells.S5. Clonogenic survival assay and 2D growth assay to test RXR response in Park and Gertz MCF7 cell models.S6. FOXA1 knockdown drastically attenuated the base line growth of both ESR1 WT and mutant cells.S7. RXR antagonist HX531 can inhibit the response of ESR1 mutant cells to RXR agonist.S8. RXR antagonist HX531 can inhibit the basal and agonist promoted growth of IPM-PDXO-073 organoid.
Table S1 from USP10 Regulates ZEB1 Ubiquitination and Protein Stability to Inhibit ZEB1-Mediated Colorectal Cancer Metastasis
Authors: Sun Lei , Yu Jia , Guinney Justin , Qin Bo , Sinicrope Frank A.
Published: June 2023

Deubiquitinases identified from the Biogrid database that may potentially interact with ZEB1.
Supplementary Figures 1-8 from Targeting Unc51-like Autophagy Activating Kinase 1 (ULK1) Overcomes Adaptive Drug Resistance in Acute Myelogenous Leukemia
Authors: Bhattacharya Seemana , Piya Sujan , Ma Huaxian , Sharma Priyanka , Zhang Qi , Baran Natalia , Ruvolo Vivian R. , McQueen Teresa , Davis R. Eric , Pourebrahim Rasoul , Konopleva Marina , Kantarjian Hagop , Cosford Nicholas D. P. , Andreeff Michael , Borthakur Gautam
Published: June 2023

S1. Effect of genetic abrogation of ULK1 in vitro and in vivo.S2. ULK1 inhibitor SBI-0206965 has anti-leukemic activity and can overcome autophagic adaptation in drug-resistant cells.S3. ULK1 inhibition reverses drug-resistance and synergizes with AML therapies.S4. ULK1 inhibition changes signaling in AML cells.S5. ULK1 inhibition hampers ROS.S6. ULK1 inhibition accumulates dysfunctional mitochondria.S7. ULK1 inhibition impairs colony forming ability and delays leukemia progression.S8. In vitro and in vivo synergy of ULK1 inhibition with AML therapies.
Figure S8 from UBE2C-mediated Autophagy Inhibition via Ubiquitination of SIRT1 Contributes to Endometrial Cancer Progression
Authors: Zhao Rong , Liu Yan , Wang Ziwei , Zhang Jun , Zhang Wei , Zhou Xing , Tsedendorj Sevjid , Enkhtur Amarsanaa , Feng Dilu , Wang Hongbo
Published: June 2023

Figure S8
Figure S5 from UBE2C-mediated Autophagy Inhibition via Ubiquitination of SIRT1 Contributes to Endometrial Cancer Progression
Authors: Zhao Rong , Liu Yan , Wang Ziwei , Zhang Jun , Zhang Wei , Zhou Xing , Tsedendorj Sevjid , Enkhtur Amarsanaa , Feng Dilu , Wang Hongbo
Published: June 2023

Figure S5
Figure S4 from UBE2C-mediated Autophagy Inhibition via Ubiquitination of SIRT1 Contributes to Endometrial Cancer Progression
Authors: Zhao Rong , Liu Yan , Wang Ziwei , Zhang Jun , Zhang Wei , Zhou Xing , Tsedendorj Sevjid , Enkhtur Amarsanaa , Feng Dilu , Wang Hongbo
Published: June 2023

Figure S4
Figure S1 from UBE2C-mediated Autophagy Inhibition via Ubiquitination of SIRT1 Contributes to Endometrial Cancer Progression
Authors: Zhao Rong , Liu Yan , Wang Ziwei , Zhang Jun , Zhang Wei , Zhou Xing , Tsedendorj Sevjid , Enkhtur Amarsanaa , Feng Dilu , Wang Hongbo
Published: June 2023

Figure S1
Figure S2 from Interdependence of SS18-SSX–driven YAP1 and β-Catenin Activation in Synovial Sarcoma
Authors: Isfort Ilka , Berthold Ruth , Heinst Lorena , Wardelmann Eva , Larsson Olle , Trautmann Marcel , Hartmann Wolfgang
Published: June 2023

Figure S2 shows that inhibition of YAP1, TAZ or β-catenin via siRNA-mediated knockdown or inhibitor treatment reduces each other's transcriptional activity.
Data from JMJD6 Shapes a Pro-tumor Microenvironment via ANXA1-Dependent Macrophage Polarization in Breast Cancer
Authors: Cioni Bianca , Ratti Silvia , Piva Annamaria , Tripodi Irene , Milani Matteo , Menichetti Francesca , Langella Tiziana , Botti Laura , De Cecco Loris , Chiodoni Claudia , Lecis Daniele , Colombo Mario P.
Published: June 2023

Abstract
Breast cancer is the most common type of cancer in women worldwide, with the luminal subtype being the most widespread. Although characterized by better prognosis compared with other subtypes, luminal breast cancer is still considered a threatening disease due to therapy resistance, which occurs via both cell- and non–cell-autonomous mechanisms. Jumonji domain-containing 6, arginine demethylase and lysine hydroxylase (JMJD6) is endowed with a negative prognostic value in luminal breast cancer and, via its epigenetic activity, it is known to regulate many intrinsic cancer cell pathways. So far, the effect of JMJD6 in molding the surrounding microenvironment has not been explored.

Here, we describe a novel function of JMJD6 showing that its genetic inhibition in breast cancer cells suppresses lipid droplet formation and ANXA1 expression, via estrogen receptor alpha and PPARα modulation. Reduction of intracellular ANXA1 results in decreased release in the tumor microenvironment (TME), ultimately preventing M2-type macrophage polarization and tumor aggressiveness.
Implications:
Our findings identify JMJD6 as a determinant of breast cancer aggressiveness and provide the rationale for the development of inhibitory molecules to reduce disease progression also through the remodeling of TME composition.
Data from Targeting Unc51-like Autophagy Activating Kinase 1 (ULK1) Overcomes Adaptive Drug Resistance in Acute Myelogenous Leukemia
Authors: Bhattacharya Seemana , Piya Sujan , Ma Huaxian , Sharma Priyanka , Zhang Qi , Baran Natalia , Ruvolo Vivian R. , McQueen Teresa , Davis R. Eric , Pourebrahim Rasoul , Konopleva Marina , Kantarjian Hagop , Cosford Nicholas D. P. , Andreeff Michael , Borthakur Gautam
Published: June 2023

Abstract
Despite effective new therapies, adaptive resistance remains the main obstacle in acute myelogenous leukemia (AML) therapy. Autophagy induction is a key mechanism for adaptive resistance. Leukemic blasts at diagnosis express higher levels of the apical autophagy kinase ULK1 compared with normal hematopoietic cells. Exposure to chemotherapy and targeted agents upregulate ULK1, hence we hypothesize that developing ULK1 inhibitors may present the unique opportunity for clinical translation of autophagy inhibition. Accordingly, we demonstrate that ULK1 inhibition, by genetic and pharmacologic means, suppresses treatment-induced autophagy, overcomes adaptive drug-resistance, and synergizes with chemotherapy and emerging antileukemia agents like venetoclax (ABT-199). The study next aims at exploring the underlying mechanisms. Mechanistically, ULK1 inhibition downregulates MCL1 antiapoptotic gene, impairs mitochondrial function and downregulates components of the CD44-xCT system, resulting in impaired reactive oxygen species (ROS) mitigation, DNA damage, and apoptosis. For further validation, several mouse models of AML were generated. In these mouse models, ULK1 deficiency impaired leukemic cell homing and engraftment, delayed disease progression, and improved survival. Therefore, in the study, we validated our hypothesis and identified ULK1 as an important mediator of adaptive resistance to therapy and an ideal candidate for combination therapy in AML. Therefore, we propose ULK1 inhibition as a therapeutically relevant treatment option to overcome adaptive drug-resistance in AML.
Implications:
ULK1 drives a cell-intrinsic adaptive resistance in AML and targeting ULK1-mediated autophagy can synergize with existing and emerging AML therapies to overcome drug-resistance and induce apoptosis.
Supplementary Table S3 from Metabolomic, DNA Methylomic, and Transcriptomic Profiling of Suberoylanilide Hydroxamic Acid Effects on LPS-Exposed Lung Epithelial Cells
Authors: Chou Pochung Jordan , Sarwar Md Shahid , Wang Lujing , Wu Renyi , Li Shanyi , Hudlikar Rasika R. , Wang Yujue , Su Xiaoyang , Kong Ah-Ng
Published: June 2023

Supplementary Table S3 shows the distribution of differentially methylated regions (DMRs) in the promoter region in control vs. LPS and LPS vs. SAHA comparisons.
Supplementary Fig. S1 from Metabolomic, DNA Methylomic, and Transcriptomic Profiling of Suberoylanilide Hydroxamic Acid Effects on LPS-Exposed Lung Epithelial Cells
Authors: Chou Pochung Jordan , Sarwar Md Shahid , Wang Lujing , Wu Renyi , Li Shanyi , Hudlikar Rasika R. , Wang Yujue , Su Xiaoyang , Kong Ah-Ng
Published: June 2023

Supplementary Fig. S1 shows the top metabolites regulated by suberoylanilide hydroxamic acid (SAHA) treatment in lipopolysaccharide (LPS)-treated BEAS-2B cells.
Supplementary Table S3 from Phase II Trial of Nelipepimut-S Peptide Vaccine in Women with Ductal Carcinoma In Situ
Authors: O'Shea Anne E. , Clifton Guy T. , Qiao Na , Heckman-Stoddard Brandy M. , Wojtowicz Malgorzata , Dimond Eileen , Bedrosian Isabelle , Weber Diane , Garber Judy E. , Husband Alexander , Pastorello Ricardo , Lee J. Jack , Hernandez Mike , Liu Diane D. , Vornik Lana A. , Brown Powel H. , Alatrash Gheath , Peoples George E. , Mittendorf Elizabeth A.
Published: June 2023

Supplementary Table S3: Pathologic characteristics
Data from Metabolomic, DNA Methylomic, and Transcriptomic Profiling of Suberoylanilide Hydroxamic Acid Effects on LPS-Exposed Lung Epithelial Cells
Authors: Chou Pochung Jordan , Sarwar Md Shahid , Wang Lujing , Wu Renyi , Li Shanyi , Hudlikar Rasika R. , Wang Yujue , Su Xiaoyang , Kong Ah-Ng
Published: June 2023

Abstract
Suberoylanilide hydroxamic acid (SAHA) is a histone deacetylase (HDAC) inhibitor with anticancer effects via epigenetic and non-epigenetic mechanisms. The role of SAHA in metabolic rewiring and epigenomic reprogramming to inhibit pro-tumorigenic cascades in lung cancer remains unknown. In this study, we aimed to investigate the regulation of mitochondrial metabolism, DNA methylome reprogramming, and transcriptomic gene expression by SAHA in lipopolysaccharide (LPS)-induced inflammatory model of lung epithelial BEAS-2B cells. LC/MS was used for metabolomic analysis, while next-generation sequencing was done to study epigenetic changes. The metabolomic study reveals that SAHA treatment significantly regulated methionine, glutathione, and nicotinamide metabolism with alteration of the metabolite levels of methionine, S-adenosylmethionine, S-adenosylhomocysteine, glutathione, nicotinamide, 1-methylnicotinamide, and nicotinamide adenine dinucleotide in BEAS-2B cells. Epigenomic CpG methyl-seq shows SAHA revoked a list of differentially methylated regions in the promoter region of the genes, such as HDAC11, miR4509–1, and miR3191. Transcriptomic RNA sequencing (RNA-seq) reveals SAHA abrogated LPS-induced differentially expressed genes encoding proinflammatory cytokines, including interleukin 1α (IL1α), IL1β, IL2, IL6, IL24, and IL32. Integrative analysis of DNA methylome-RNA transcriptome displays a list of genes, of which CpG methylation correlated with changes in gene expression. qPCR validation of transcriptomic RNA-seq data shows that SAHA treatment significantly reduced the LPS-induced mRNA levels of IL1β, IL6, DNA methyltransferase 1 (DNMT1), and DNMT3A in BEAS-2B cells. Altogether, SAHA treatment alters the mitochondrial metabolism, epigenetic CpG methylation, and transcriptomic gene expression to inhibit LPS-induced inflammatory responses in lung epithelial cells, which may provide novel molecular targets to inhibit the inflammation component of lung carcinogenesis.
Prevention Relevance:
Inflammation increases the risk of lung cancer and blocking inflammation could reduce the incidence of lung cancer. Herein, we demonstrate that histone deacetylase inhibitor suberoylanilide hydroxamic acid regulates metabolic rewiring and epigenetic reprogramming to attenuate lipopolysaccharide-driven inflammation in lung epithelial cells.
Pancreatic Cancer Disparities among Gender, Race, and Ethnicity: The PRECEDE Consortium Outcomes and Impact
Authors: Yamada Hiroshi Y. , Rao Chinthalapally V.
Published: June 2023

The Pancreatic Cancer Early Detection (PRECEDE) Consortium was launched internationally to assess the surveillance of high-risk individuals (HRI) of pancreatic cancer, focusing on genetic risk factors. In the early recruitment period of 3 years from May 2020 to March 2022, the PRECEDE gathered analysis-eligible data on 1,113 HRIs. In this issue of Cancer Prevention Research, Katona and colleagues reported current portrait of demographics of the participants, with significant disparities in gender, race and ethnicity. Now the PRECEDE Consortium aims at correcting these disparities in the next 3 years and double the percentage of underrepresented groups to more closely represent the demographics of patients.

See related article by Katona et al., p. 343
Supplementary Tables from KRT17 Promotes T-lymphocyte Infiltration through the YTHDF2–CXCL10 Axis in Colorectal Cancer
Authors: Liang Wenfeng , Liu Huashan , Zeng Ziwei , Liang Zhenxing , Xie Hao , Li Wenxin , Xiong Li , Liu Zhihang , Chen Mian , Jie Haiqing , Zheng Xiaobin , Huang Liang , Kang Liang
Published: June 2023

Materials were used in the research.
Supplementary Legends from KRT17 Promotes T-lymphocyte Infiltration through the YTHDF2–CXCL10 Axis in Colorectal Cancer
Authors: Liang Wenfeng , Liu Huashan , Zeng Ziwei , Liang Zhenxing , Xie Hao , Li Wenxin , Xiong Li , Liu Zhihang , Chen Mian , Jie Haiqing , Zheng Xiaobin , Huang Liang , Kang Liang
Published: June 2023

Detailed descriptions of supplementary figures.
Supplementary Fig. 8 from KRT17 Promotes T-lymphocyte Infiltration through the YTHDF2–CXCL10 Axis in Colorectal Cancer
Authors: Liang Wenfeng , Liu Huashan , Zeng Ziwei , Liang Zhenxing , Xie Hao , Li Wenxin , Xiong Li , Liu Zhihang , Chen Mian , Jie Haiqing , Zheng Xiaobin , Huang Liang , Kang Liang
Published: June 2023

KRT17 exerts an immunomodulatory effect through YTHDF2-CXCL10 axis.
Supplementary Fig. 2 from KRT17 Promotes T-lymphocyte Infiltration through the YTHDF2–CXCL10 Axis in Colorectal Cancer
Authors: Liang Wenfeng , Liu Huashan , Zeng Ziwei , Liang Zhenxing , Xie Hao , Li Wenxin , Xiong Li , Liu Zhihang , Chen Mian , Jie Haiqing , Zheng Xiaobin , Huang Liang , Kang Liang
Published: June 2023

KRT17 has no effect on proliferation, migration and invasion of CRC cells.
Supplementary Figure S4 from Nuclear Export Inhibitor Selinexor Enhances Oncolytic Myxoma Virus Therapy against Cancer
Authors: Rahman Masmudur M. , van Oosterom Fleur , Enow Junior A. , Hossain Maksuda , Gutierrez-Jensen Ami D. , Cashen Mackenzie , Everts Anne , Lowe Kenneth , Kilbourne Jacquelyn , Daggett-Vondras Juliane , Karr Timothy L. , McFadden Grant
Published: June 2023

Prolonged replication of MYXV in the tumor bed of the Selinexor treated mice.
Supplementary Figure S2 from Nuclear Export Inhibitor Selinexor Enhances Oncolytic Myxoma Virus Therapy against Cancer
Authors: Rahman Masmudur M. , van Oosterom Fleur , Enow Junior A. , Hossain Maksuda , Gutierrez-Jensen Ami D. , Cashen Mackenzie , Everts Anne , Lowe Kenneth , Kilbourne Jacquelyn , Daggett-Vondras Juliane , Karr Timothy L. , McFadden Grant
Published: June 2023

Tumor burden of individual mouse received Colo205 cells.
FIGURE 6 from Nuclear Export Inhibitor Selinexor Enhances Oncolytic Myxoma Virus Therapy against Cancer
Authors: Rahman Masmudur M. , van Oosterom Fleur , Enow Junior A. , Hossain Maksuda , Gutierrez-Jensen Ami D. , Cashen Mackenzie , Everts Anne , Lowe Kenneth , Kilbourne Jacquelyn , Daggett-Vondras Juliane , Karr Timothy L. , McFadden Grant
Published: June 2023

Selinexor significantly enhanced MYXV infection and replication in 3D culture of human cancer cell lines. PANC-1 (A), MDA-MB435 (C), and HT29 (E) cells were treated with different concentration of selinexor for 1 hour and then infected with vMyx-GFP-TdTomato in the presence of selinexor. Fluorescence images were taken 72 or 96 hpi. Quantification of the level of GFP fluorescence as relative fluorescence units (RFU) from PANC-1 (B), MDA-MB435 (D), and HT29 (F) cells are shown. Data represent mean ± SD and n = 3. Statistically significant differences in comparison with infection without selinexor are indicated. *, P < 0.05; **, P < 0.01; ***, P < 0.001.
Дослідження антибактерійних властивостей кріоліофілізованої ксеноочеревини, насиченої розчином хлоргексидину біглюконату
Authors: Чарківський Т. Ю. , Авдєєв О. В.
Published: June 2023

Резюме. Антисептики широко застосовують у різних напрямках медицини, зокрема у пародонтології. На даний момент хлоргексидин вважається «золотим стандартом» антисептиків у цьому напрямку стоматології.
Мета дослідження – визначити наявність у кріоліофілізованій ксеноочеревині, насиченій розчином хлоргексидину, достатніх антисептичних властивостей для використання її в ролі пародонтальних вкладок при лікуванні пацієнтів із захворюваннями тканин пародонта, а також визначення оптимальної концентрації хлоргексидину у вищезгаданих вкладках.
Матеріали і методи. Експерименти проводили за допомогою методів серійних розведень у рідкому поживному середовищі та локальної дифузії в агар. Вкладки, виготовлені з кріоліофілізованої ксеноочеревини, насичені 2,5 %, 5 %, 10 % та 20 % розчинами хлоргексидину біглюконату, використали в дослідженнях. Тотожні експерименти проводили з вкладками, що не проходили процес насичення.
Результати досліджень та їх обговорення. У підсумку результати були наступними: кріоліофілізовані ксеноочеревинні вкладки, насичені 20 % розчином хлоргексидину біглюконату, 10 % розчином хлоргексидину біглюконату, 5 % розчином хлоргексидину біглюконату, 2,5 % розчином хлоргексидину біглюконату, володіють достатніми антибактерійними та протигрибковими властивостями, власні антисептичні властивості ксеноочеревини виявились надто низькими, щоби виступати в ролі єдиного антисептичного агента при застосуванні сучасних протоколів пародонтального лікування.
Висновки. Вкладки, насичені 10 % та 20 % розчинами хлоргексидину біглюконату, були відібрані для подальших досліджень.
Результати опитування батьків дітей молодшого віку щодо індивідуальної гігієни порожнини рота
Authors: Шкляр Х. В. , Авдєєв О. В.
Published: June 2023

Резюме. Стоматологічне здоров’я є важливою складовою соматичного здоров’я. Аналізуючи етіологічні фактори ризику виникнення раннього карієсу в дітей, стає зрозумілим, що найбільша відповідальність лежить саме на батьках, які повинні контролювати якість, регулярність індивідуальної гігієни порожнини рота дітей, засвоєння ними практичних навичок з догляду за зубами та використання предметів і засобів для видалення назубних нашарувань.

Мета дослідження – оцінити санітарно-гігієнічні знання батьків дітей дошкільного віку щодо догляду за порожниною рота із застосуванням опитування.

Матеріали і методи. Для даного дослідження ми провели анкетування 222 батьків дітей молодшого віку, які відвідують заклади дошкільної освіти. Батькам роздавали паперовий опитувальник, до якого входили питання щодо оцінки санітарно-гігієнічних знань батьків дитини. Відповіді записувались у домашніх умовах.

Результати досліджень та їх обговорення. Клінічні спостереження вказують на те, що тісна співпраця дитячого стоматолога та педіатра з перших місяців життя дитини може забезпечити формування мотивації батьків до збереження стоматологічного здоров’я дитини, створити повноцінні умови для дозрівання тимчасових зубів та можливість усунути чинники ризику розвитку карієсу, забезпечити проведення профілактичних заходів, а також здійснити корекцію харчування та гігієнічного догляду за порожниною рота Результи анкет засвідчили, що діти, які проживають у місті, краще та ретельніше доглядають за порожниною рота, ніж діти, що проживають у сільській місцевості.

Висновки. Потрібно періодично проводити санітарно-просвітницьку роботу серед батьків дітей молодшого шкільного віку з метою зменшення ризику розвитку раннього дитячого карієсу.
Історичний нарис розвитку щелепно-лицевої травматології. Повідомлення перше
Authors: Бєліков О. Б. , Бєлікова Н. І. , Сорохан М. М. , Бєлікова Л. О.
Published: June 2023

Резюме. У статті здійснено історично-науковий огляд літератури, у якому в хронологічному порядку представлено розвиток щелепно-лицевої ортопедії, зокрема щелепно-лицевої травматології.

Мета дослідження – проаналізувати дані джерел літератури стосовно хронологічних аспектів розвитку щелепно-лицевої травматології, визначити позитивні та негативні моменти.

Матеріали і методи. Використано бібліосемантичний метод для з’ясування стану проблеми, здійснено аналіз результатів поперед­ніх наукових досліджень на основі джерел літератури та електронних ресурсів.

Результати досліджень та їх обговорення. У літературі в розрізненому і суперечливому плані представлені дані щодо історичних віх розвитку щелепно-лицевої травматології, принципи надання допомоги при травмах шелепно-лицевої ділянки, розробки ортопедичних конструкцій для правильної репозиції та фіксації відламків щелеп при їх переломах, для виправлення положення відламків, які змістилися, та відламків, що неправильно зрослись, а також для усунення інших наслідків травм щелепно-лицевої ділянки. Розглянуто хронологію способів іммобілізації нижньої щелепи. Подано варіанти репозиції та фіксації відламків нижньої щелепи, інструменти та засоби, описані конструкційні матеріали.

Висновки. Уточнено багато історичних фактів, повідомлено про цікаві подробиці, наведено рідкісні документи. В умовах сучасної війни ми спостерігаємо збільшення кількості бійців із травматичними ушкодженнями щелепно-лицевої ділянки, із посттравматичними дефектами та деформаціями обличчя, що є результатом неадекватної та несвоєчасної медичної допомоги на полі бою. Отже, дотримуючись історичного досвіду, при таких пораненнях необхідно володіти алгоритмом дій безпосередньо на полі бою, в госпіталях та реабілітаційних центрах.
OSTEOARTHRITIS: ITS PREVALENCE, RISK FACTORS, CLINICAL MANIFESTATION, DIAGNOSIS AND TREATMENT
Authors: Fiksman F. , Krekhovska-Lepiavko O. M. , Lokay B. A.
Published: June 2023

Osteoarthritis is a degenerative joint disease that affects the cartilage, underlying bone, and synovial fluid. It is a leading cause of disability and chronic pain, affecting approximately 10 % of men and 18 % of women over the age of 60 worldwide . This literature review aims to summarize the current understanding of OA with regards to its prevalence, risk factors, clinical manifestation, diagnosis, and treatment.
ФІЗИЧНА ТЕРАПІЯ ПІСЛЯ ЕНДОПРОТЕЗОПЛАСТИКИ СУГЛОБІВ НИЖНІХ КІНЦІВОК
Authors: Тімофєєва А. Ю. , Голяченко А. О. , Голяченко О. А.
Published: June 2023

Остеоартроз колінного суглоба є одним з найпоширеніших дегенеративних захворювань в організмі людини. Радикальним шляхом вирішення проблеми гонартрозу в пацієнта вважають хірургічне втручання. Рання реабілітація після операції – невід’ємний елемент одужання, в результаті пацієнт зможе виконувати повсякденну діяльність і навіть займатися спортом. Невід’ємними елементами реабілітації є кінезотерапія та фізіотерапія.
ФІЗІОТЕРАПІЯ ТА ОСОБЛИВОСТІ ЇЇ ЗАСТОСУВАННЯ У ПАЦІЄТІВ З НЕВЕРТЕБРОГЕННИМ БОЛЬОВИМ СИНДРОМОМ ШИЙНОГО ВІДДІЛУ ХРЕБТА
Authors: Павленко О. В. , Голяченко А. О.
Published: June 2023

Сучасною медико-соціальною проблемою населення та одним з найбільш поширених захворювань опорно-рухового апарату є остеохондроз шийного відділу хребта. Цю статтю присвячено вивченню ефективності лікування даної патології з використанням комплексної реабілітації на основі методів фізичної терапії та апаратної фізіотерапії.
Спосіб діагностики кровотечі в просвіт черевної порожнини спричиненої двомоментним розривом субкапсулярної гематоми печінки
Authors: Запорожан С. Й. , Хоменко В. С.
Published: June 2023

Мета роботи: розробити оригінальний, ефективний метод діагностики кровотечі в просвіт черевної порожнини внаслідок ушкодження паренхіматозних органів.

Матеріали і методи. Експериментальні дослідження виконано на лабораторних свинях-самцях в’єтнамської породи. Дослід проведено на 30 вказаних тваринах масою 10–12 кг. Свиню вводили в наркоз і фіксували на операційному столі на спині. Лапароскопічно субкапсулярно (під фіброзну оболонку) правої частки печінки вводять 6–8 мл крові, взятої із внутрішньої яремної вени. За допомогою лапароцентезу у просвіт вільної черевної порожнини вводили зонд пристрою для ранньої діагностики кровотечі в просвіти черевної порожнини із датчиками в таз. Через добу після моделювання субкапсулярної гематоми печінки здійснювали розрив печінкової субкапсулярної гематоми шляхом нанесення удару по правій підреберній ділянці. Через 5 секунд після розриву субкапсулярної гематоми печінки за допомогою розробленого оригінального приладу визначали потрапляння крові в просвіт вільної очеревинної порожнини.

Результати досліджень та їх обговорення. В основі роботи пристрою для ранньої діагностики кровотечі в просвіт вільної черевної порожнини покладена дія двох джерел світла з різною довжиною хвиль випромінювання, відповідно, 460 і 620 нм та удосконалення схеми обробки сигналу, що за рахунок різниці відносної оптичної густини рідини на двох довжинах хвиль відповідно приводить до зміни величини струму через фотодетектор. Отримані результати засвідчили високу ефективність приладу у діагностиці цільної крові та розведеної крові фізіологічним розчином 1:14 у черевній порожнині всіх тварин.

Розроблений пристрій може бути використаний для діагностики кровотечі в просвіт черевної порожнини внаслідок двомоментного розриву субкапсульних гематом печінки та селезінки.
Оптимізація діагностики та лікування гнійних захворювань плеври
Authors: Гетьман В. Г. , Висоцький А. Г. , Пітух С. С. , Сейковський О. В. , Кошак Ю. Ф.
Published: June 2023

Мета роботи: покращення результатів лікування хворих на емпієму плеври шляхом удосконалення діагностики та хірургічної допомоги.

Матеріали і методи. Було ретроспективно досліджено 1320 стаціонарних хворих за період із 2002 до 2017 р., які проходили лікування у відділенні торакальної хірургії Комунального некомерційного підприємства “Київська міська клінічна лікарня № 17” (КНП “КМКЛ № 17”) з діагнозом емпієма плеври. Методи, що використовували в дослідженні: клінічні, статистичні, лабораторні.

Результати досліджень та їх обговорення. Методи міні-інвазивної хірургії були використані при лікуванні 1282 (97 %) пацієнтів, з яких: дренування плевральної порожнини було виконано 846 пацієнтам (66 %), полідренування плевральної порожнини було виконано 344 пацієнтам (26,8 %), ВАТС – 75 пацієнтам (5,9 %), пункційне лікування було застосовано 17 хворим (1,3 %). Досвід надання допомоги хворим на гнійні захворювання дозволив визначити та опрацювати діагностичний алгоритм лікування, а також зменшити середній термін дренування плевральної порожнини. ВАТС дозволяє досягти хороших результатів у лікуванні ЕП, а також знизити відсоток хронізації процесу, особливо за умови дотримання індивідуального підходу в лікуванні кожного пацієнта.

За результатами лікування повне видужання було досягнуто у 1051 (80 %) пацієнта, з покращенням було виписано 145 (11 %) пацієнтів, з хронічним перебігом було виписано на амбулаторне лікування 80 (6 %) пацієнтів. Летальний наслідок – 44 хворих (3 % від всіх пролікованих випадків).
Оцінка віддалених результатів застосування металевих стентів та біодеградуючої стент-платформи у хворих на ішемічну хворобу серця
Authors: Гиндич П. А.
Published: June 2023

Мета роботи: оцінити віддалені результати використання біодеградуючої стент-платформи Absorb порівняно із застосуванням металевих стентів у пацієнтів з ішемічною хворобою серця.

Матеріали і методи. Вивчено дані двох груп пацієнтів з ішемічною хворобою серця, що проходили лікування в клініці Національного інституту хірургії та трансплантології імені О. О. Шалімова та перенесли стентування вінцевих артерій з використанням біодеградуючої стент-платформи (БдСП) Absorb (основна група, n=70) та металевих стентів (група порівняння, n=159) в період від 2012 до 2015 р.

Аналіз віддалених результатів проводили через 4–5 років (2018 р.) та 7–8 років (2021 р.). За позитивний результат вважали відсутність великих несприятливих серцево-судинних подій після стентування та необхідність в повторній реваскуляризації. Оцінку результатів проводили шляхом аналізу електрокардіограм, ультразвукового дослідження серця та катамнестичного дослідження. 

Результати досліджень та їх обговорення. В обох періодах спостереження 2012/13 та 2014/15 рр. через 4–5 років після проведеного стентування БдСТ відмічено позитивний результат більш як у 75 % пацієнтів. Водночас після 2021 р. (7–8 років) цей показник дещо зменшився, проте утримувався на рівня 50 % пацієнтів, у яких не було зареєстровано серцево-судинних подій за цей період. Вказані дані підтверджують твердження багатьох досліджень щодо достатньої ефективності вказаної системи в лікуванні коронарних оклюзій.
ДОСВІД ВИКОРИСТАННЯ ТЕСТОВИХ ВПРАВ ПРИ ВИВЧЕННІ ДИСЦИПЛІНИ «МЕДИЧНА ТА БІОЛОГІЧНА ФІЗИКА»
Authors: Іванченко О. З. , Мельнікова О. З. , Мікаєлян Г. Р.
Published: June 2023

Анотація. Представлена робота присвячена розгляду різних форм тестових завдань, які можна використовувати в навчальному процесі з метою набуття студентами знань і вмінь та їх контролю. У статті викладений власний досвід авторів, який ґрунтується на наукових досягненнях дослідників проблеми тестування як стратегії навчання. На прикладі вправ із медичної та біологічної фізики показано, що їх зміст і форма можуть бути різними – тести з однією правильною відповіддю, відкриті форми, які не містять готових відповідей, а потребують їх надання в більш або менш стислій формі, завдання на встановлення відповідності між поняттям і визначенням або фізичними величинами й одиницями їх вимірювання тощо, на позначення правильної послідовності подій, які приводять до певного результату, а використання кожного типу завдань залежать від мети їх застосування. Продемонстрована важливість і можливість забезпечення варіативності змісту тестів, призначених для контролю знань, у тому числі за допомогою фасетів, що може бути основою індивідуального підходу до кожного студента, не потребуючи занадто великих витрат часу на створення завдань і тестування. У статті обговорюються такі умови ефективного тестування, як заздалегідь визначені вимоги до складання тестів студентами, надання їм своєчасного і чесного зворотного зв’язку від викладача. Показані можливості онлайн-платформи Microsoft Teams для аналітики успішності окремих студентів і їх груп, для визначення та розрахунку показників якості тестів, що може служити вдосконаленню їх змісту. Обговорюються можливості тестування як ефективної стратегії навчання в медичній освіті у зв’язку з великим обсягом фактичних знань і вмінь, якими має володіти лікар, та високими вимогами до його професійних і етичних якостей з боку сучасного суспільства. Окреслюються перспективи подальших досліджень ефективності тестування для використання набутих студентами знань поза контекстом, в якому вони були отримані, тобто при вивченні спеціальних дисциплін.