MODELS FOR PREDICTING THE BREEDING VALUE OF ANIMALS IN GENOMIC EVALUATION
Authors: КАЛАШНИКОВ А.Е. , PŘIBYL J. , КОЧЕТКОВ А.А. , АХМЕТОВ Т.М. , ШАЙДУЛЛИН Р.Р. , БОЙКО Е.Г. , КАЛАШНИКОВА Л.А. , НОВИКОВ А.А. 
Published: September 2020

Представлен основной принцип оценки племенной ценности при помощи линейных моделей согласно общепринятым мировым стандартам, применяемым в геномной оценке GEBV. Алгоритм и математический аппарат GEBV основан на методе BLUP и имеет своей целью расчет величин племенной (генетической) ценности с учетом передачи генетических признаков по наследству. Рассмотрены принципы и формирование математической и программной среды GEBV для применения данных генотипирования по SNP (генетические чипы) и маркерной селекции, а также данных генетической идентификации животных. GEBV представляет собой прогноз племенной ценности молодых животных, для которых нет в наличии данных о собственной продуктивности или продуктивности потомства. Оценка племенной ценности их родителей и предков по другим родственным потомкам и сверстникам позволяет при применении в оценке данных генотипирования по нейтральным маркерам и маркерам продуктивности (SNP) производить прогноз племенной ценности сразу после рождения животных. GEBV дает возможность уточнять оценку племенной ценности молодых животных по BLUP, сократить время анализа, увеличить достоверность существующей оценки по BLUP, снизить расходы на содержание, увеличить точность определения родства, наследуемости признаков, ускорить отбор животных, сократить генерационный интервал. Применение метода BLUP в геномной оценке требует подготовки новых квалифицированных кадров в университетах и научных учреждениях ввиду их острого дефицита в практическом животноводстве и масштабной селекции.

The basic principle of evaluating breeding values using linear models in accordance with generally accepted international standards used in genomic assessment is presented. The algorithm and mathematical apparatus for it is based on the BLUP method in order to calculate the values of the breeding (genetic) value, taking into account the transmission of genetic traits by inheritance. The principles and formation of a mathematical and software environment for genomic assessment for the use of genotypic data according to SNPs (genetic chips) and marker selection, as well as data of animal genetic identification are considered. GEBV is a prediction of the breeding value of young animals for which there is no available data on their own productivity or the productivity of their progeny. The evaluation of the breeding value of their parents and progenitors by other related descendants and peers allows for the use of genotyping data for neutral markers and productivity markers (SNP) to make a prediction of the breeding value immediately after the birth of animals. GEBV makes it possible to improve the evaluation of the breeding value of young animals by SNP, with decrease the analysis time, increase the reliability of the GEBV analysis with existing software, reduce cost of maintenance, increase the accuracy of determining relationships, heritabilities of traits, accelerate the selection of animals, bring the generation interval. The use of the GEBV method of simple and genomic assessment requires the training of new qualified personnel in universities and scientific institutions due to their acute shortage in practical animal husbandry and selection.