bluuebunny/crossref_metadata_2025 huggingface dataset:
CNV-P: a machine-learning framework for predicting high confident copy number variations
Authors: Wang Taifu , Sun Jinghua , Zhang Xiuqing , Wang Wen-Jing , Zhou Qing
Published: December 2021

Background

Copy-number variants (CNVs) have been recognized as one of the major causes of genetic disorders. Reliable detection of CNVs from genome sequencing data has been a strong demand for disease research. However, current software for detecting CNVs has high false-positive rates, which needs further improvement.

Methods

Here, we proposed a novel and post-processing approach for CNVs prediction (CNV-P), a machine-learning framework that could efficiently remove false-positive fragments from results of CNVs detecting tools. A series of CNVs signals such as read depth (RD), split reads (SR) and read pair (RP) around the putative CNV fragments were defined as features to train a classifier.

Results

The prediction results on several real biological datasets showed that our models could accurately classify the CNVs at over 90% precision rate and 85% recall rate, which greatly improves the performance of state-of-the-art algorithms. Furthermore, our results indicate that CNV-P is robust to different sizes of CNVs and the platforms of sequencing.

Conclusions

Our framework for classifying high-confident CNVs could improve both basic research and clinical diagnosis of genetic diseases.
A GREEN REFORMATION OF CHRISTIANITY? ANTHROPOLOGICAL, ETHICAL AND PEDAGOGICAL REFLECTIONS ON ECOLOGY AS ECUMENICAL THEME
Authors: Conradie Ernst
Published: December 2021

This contribution builds upon and contributes to many recent ecumenical calls for an ecological reformation of Christianity. It seeks to guide such calls on the use of the term “ecology” by offering five brief statements in this regard, namely 1) on ecology as a transversal theme; 2) on ecology as an ecumenical theme; 3) on the root metaphor of the “whole household of God”; 4) on Christian doctrinal assumptions on such a household; and 5) on the (ecological) limitations of the metaphor of the whole household of God.
ОБЪЕМНЫЙ РЕЛЬЕФ НА ПЛОСКИХ ИЗОБРАЖЕНИЯХ: ИССЛЕДУЕМ СЕЛИ И ЛАВИНЫ ПО КОСМИЧЕСКИМ СНИМКАМ, "Земля и Вселенная"
Authors: Зорина В.В.
Published: December 2021

Опасные процессы высокогорных территорий, особенно сели и лавины, являются причиной мощных и катастрофичных изменений в географических средах Земли. Такие явления неблагоприятно сказываются на жизни и деятельности людей, проживающих в высокогорных районах, или приезжих, посещающих горы для отдыха и спортивного интереса. Ежегодно тысячи туристов посещают горнолыжные курорты, ходят в походы, занимаются спортом и просто наслаждаются красотой и величественностью гор, зачастую забывая, насколько они могут быть опасны. В России такой привлекательностью обладает Центральный Кавказ, наиболее высокая часть Большого Кавказа, расположенная между вершинами Эльбрус и Казбек. Объектом нашего исследования был выбран бассейн ледника Безенги, с высотами около 5000 м и разнообразием рельефа, который может угодить не только любителям экстремальных походов и покорителям вершин, но и тем, кто предпочитает зимние виды спорта. Однако, включая новости по ТВ, часто можно услышать о сходах лавин, несчастных случаях или тяжелых положениях туристов в горах. Поэтому особой значимостью обладают исследования опасностей – ведь однажды это может спасти жизни людей.
ДОМНИНА Е.Г. ДИПЛОМАТИЯ В ЭПОХУ ПЕРЕМЕН: ТЮДОРЫ И РИМСКАЯ КУРИЯ (1485–1558 гг.). М.; СПб.: Петроглиф, Центр гуманитарных инициатив, 2020. 240 с. (MEDIEVALIA), "Средние века"
Authors: Гусарова Т.П.
Published: December 2021

В рецензируемой монографии история дипломатических отношений между ранними Тюдорами (1485–1558) и римской курией изучается в контексте существенных изменений, происходивших во внутренней эволюции европейских национальных государств – в первую очередь, Англии – на рубеже позднего Средневековья и раннего Нового времени, укрепления в них светской власти в ущерб универсалистским притязаниям папства. Этот путь прослеживается автором книги во всей его сложности и противоречивости, учитывая двойственную природу папской власти. Автору удалось показать англо-папскую дипломатию включенной в сложные международные отношения эпохи: Итальянские войны, растущую турецкую угрозу, преодоление последствий Столетней войны и др. Автор подробно анализирует состав английских дипломатических миссий в Риме и, наоборот, их функции, особенности, связанные с тем, что эти дипломаты, находясь на службе английского короля, нередко становились и служителями римской курии.
ПЕРСПЕКТИВЫ ИСПОЛЬЗОВАНИЯ НАНОЧАСТИЦ АЛМАЗА ДЛЯ АДРЕСНОЙ ДОСТАВКИ ЛЕКАРСТВ, "Вестник Центрального научно-исследовательского института туберкулеза"
Authors: Масютин А.Г. , Тарасова Е.К.
Published: December 2021

Введение. Одним из наиболее перспективных направлений в наномедицине является адресная доставка лекарств в органы и ткани, а также в определенные клеточные компартменты. Предполагается, что подобная адресная доставка с применением специализированных носителей за счет целенаправленного действия позволяет увеличить локальную концентрацию препарата в органе и клетках-мишенях и снизить побочные эффекты, что повышает эффективность химиотерапии. В настоящее время в связи с увеличением случаев лекарственно-устойчивого туберкулеза (ЛУ ТБ) остро стоит вопрос о повышении эффективности существующих лекарственных препаратов, в том числе и с использованием достижений нанотехнологии. Решением данной проблемы может стать использование композитных лекарственных средств, в которых в качестве носителя выступают наночастицы – объекты, диаметр которых не превышают 100 нм. В связи с тем, что подобные носители должны обладать высокой биосовместимостью, наиболее целесообразным представляется использование углеродных наночастиц. Их преимущество состоит в том, что многие из них не оказывают токсического эффекта на клетки и ткани. В качестве таковых могут выступать наночастицы алмаза. Наноалмазы (НА) представляют собой округлые частицы со слоистой структурой: химически инертное алмазное ядро покрыто графитоподобной оболочкой, обладающей реакционной способностью. Большая площадь и широкий диапазон возможных модификаций поверхности позволяют рассматривать наночастицы алмаза как один из материалов-носителей для адресной доставки препаратов. При этом влияние наночастиц алмаза и их конъюгатов с лекарственными препаратами на клетки и их биораспределение в тканях и органах недостаточно изучены. Цель исследования: оценка возможности применения наночастиц алмаза для адресной доставки лекарственных средств в макрофаги в моделях in vitro и in vivo. В качестве модельных объектов нами были выбраны нативные наночастицы алмаза и конъюгаты НА с мезо-тетра(4-карбоксифенил)порфирином. Порфирин выбран в качестве потенциального фотосенсибилизирующего агента, а также флуоресцентной метки, позволяющей оценить устойчивость конъюгатов с НА при попадании в клетки.
ЧАСТОТА ВСТРЕЧАЕМОСТИ РАЗЛИЧНЫХ ФОРМ НЕЙРОТУБЕРКУЛЕЗА У ПАЦИЕНТОВ С ВИЧ-ИНФЕКЦИЕЙ, "Вестник Центрального научно-исследовательского института туберкулеза"
Authors: Мухаметшина Е.Р.
Published: December 2021

Введение. В последние годы отмечается тенденция к снижению заболеваемости туберкулезом (ТБ) и смертности от него, но сохраняется тяжелая эпидемическая ситуация, что демонстрируют высокая заболеваемость среди молодых людей, миграционная нагрузка, высокая доля больных с лекарственной устойчивостью (ЛУ) , рост числа пациентов с сочетанием ТБ и ВИЧ-инфекции. По мере прогрессирования ВИЧ-инфекции и угнетения иммунной системы растет и уязвимость организма в отношении микобактерий туберкулеза (МБТ), что повышает вероятность развития внелегочного ТБ, в том числе поражения нервной системы. Больные ВИЧ-инфекцией с активным ТБ ЦНС с вовлечением оболочек и вещества головного мозга (менингит, менингоэнцефалит, энцефалит) составляют от 70 до 81,8% от числа ВИЧ-инфицированных больных, умерших от генерализации ТБ. Цель исследования: изучение лучевой семиотики поражений головного мозга при ТБ на фоне приобретенного иммунодефицита.
ДИНАМИКА ПОПУЛЯЦИОННОГО РИСКА РАЗВИТИЯ ХРОНИЧЕСКОГО БРОНХИТА НА ФОНЕ СНИЖЕНИЯ РАСПРОСТРАНЕННОСТИ УПОТРЕБЛЕНИЯ ТАБАКА В РОССИЙСКОЙ ФЕДЕРАЦИИ, "Вестник Центрального научно-исследовательского института туберкулеза"
Authors: Передельская М.Ю.
Published: December 2021

Введение. Табак является ведущим фактором риска развития многих неинфекционных заболеваний, одним из которых является хронический бронхит (ХБ). В 2013 г. в Российской Федерации принят Федеральный закон № 15-ФЗ «Об охране здоровья граждан от воздействия окружающего табачного дыма и последствий потребления табака» (ФЗ № 15), что привело в дальнейшем к ежегодному постоянному снижению распространенности потребления табака. Цель исследования: установить уровень индивидуального риска развития ХБ при табакокурении и оценить динамику популяционного атрибутивного риска после внедрения мер государственной антитабачной политики, направленных на снижение распространенности потребления табака в России.
ОПРЕДЕЛЕНИЕ РОЛИ РАЗЛИЧНЫХ БИОМАРКЕРОВ В ДИАГНОСТИКЕ АКТИВНОСТИ САРКОИДОЗА, "Вестник Центрального научно-исследовательского института туберкулеза"
Authors: Адамовская Е.Н. , Шепелькова Г.С.
Published: December 2021

Введение. Саркоидоз – системное воспалительное заболевание неизвестной природы, характеризующееся образованием неказеифицирующихся эпителиоидно-клеточных гранулем, мультисистемным воспалением и активацией Т-клеток в месте гранулематозного воспаления с высвобождением различных хемокинов и цитокинов. Во многих случаях происходит спонтанное разрешение заболевания, однако, в случаях хронизации процесса, возможно образование фиброза, что приводит к ограничению качества жизни пациента. Несмотря на развитие лучевых методов диагностики, поиск надежных лабораторных критериев, позволяющих оценить активность заболевания и спрогнозировать его течение, по-прежнему актуален. В настоящее время в качестве маркера активности саркоидоза в клинической практике используют определение уровня ангиотензин-превращающего фермента (АПФ), однако этот тест имеет низкую чувствительность и не позволяет с достоверностью прогнозировать течение заболевания и определить необходимость назначения противовоспалительной терапии. Много работ посвящено исследованию интерферона-гамма (ИФН- ), интерлейкинов, а также различным субпопуляциям лимфоцитов. В последнее время появляются работы, в которых изучается роль различных микроРНК в патофизиологии саркоидоза. МикроРНК (miRs) – небольшие молекулы некодирующей РНК, регулирующие разнообразные биологические процессы. MiRs влияют на экспрессию генов путем взаимодействия с транскриптами мРНК, вызывая их разрушение либо подавление трансляции. Недавние исследования позволили предположить, что отдельные miRs играют роль в поддержании иммунного гомеостаза и индукции иммунной защиты. Накапливаются данные, свидетельствующие о том, что miRs способны регулировать клеточные процессы при различных патологиях бронхолегочной системы, таких как ХОБЛ, интерстициальные заболевания легких и некоторые гранулематозные болезни (саркоидоз, туберкулез). Целью настоящего исследования явился поиск маркеров активности и прогнозирования фиброзообразования при саркоидозе внутригрудных лимфатических узлов и легких, что позволит решить вопрос о своевременности назначения противовоспалительной терапии.
ОРГАНИЗАЦИОННЫЕ ПОДХОДЫ ПО СОКРАЩЕНИЮ СРОКОВ ДИАГНОСТИКИ ТУБЕРКУЛЕЗА В ПУЛЬМОНОЛОГИЧЕСКИХ ОТДЕЛЕНИЯХ, "Вестник Центрального научно-исследовательского института туберкулеза"
Authors: Кузнецова А.Н. , Шубина А.Т.
Published: December 2021

Введение. Своевременное выявление больных туберкулезом (ТБ) является определяющим фактором в повышении эффективности лечения и улучшения эпидемиологической обстановки по ТБ в целом. Решающее значение при постановке диагноза ТБ имеет обнаружение микобактерий туберкулеза (МБТ) в мокроте или бронхоальвеолярной жидкости (БАЛЖ). Основным методом при выполнении диагностического минимума для выявления МБТ является бактериоскопическое исследование с окраской по Цилю–Нильсену, обладающее низкой чувствительностью. В последнее десятилетие получают распространение молекулярно-генетические методы (МГМ) выявления ДНК МБТ в диагностическом материале. Самым применяемым является метод полимеразной цепной реакции (ПЦР), в основе которого лежит многократное увеличение числа копий специфического участка ДНК. В настоящее время успешно применяется технология GeneXpert MTB/RIF. Преимуществом этой методики является одновременное определение лекарственной устойчивости МБТ к рифампицину, что позволяет сразу определить штамм МБТ с множественной лекарственной устойчивостью (МЛУ). В связи с этим представляется актуальным определить возможность использования МГМ. Применение картриджной технологии GeneXpert MTB/RIF входит в диагностический минимум при обследовании пациента с пневмонией при подозрении на ТБ в пульмонологическом отделении. Цель исследования: сократить сроки дифференциальной диагностики пневмонии и ТБ с помощью МГМ на примере картриджной технологии GeneXpert MTB/RIF.
СПЕКТР ЛЕКАРСТВЕННОЙ УСТОЙЧИВОСТИ МИКОБАКТЕРИЙ ТУБЕРКУЛЕЗА, ВЫДЕЛЕННЫХ ИЗ РЕЗЕКТАТОВ ЛЕГКИХ У БОЛЬНЫХ ТУБЕРКУЛЕЗОМ, "Вестник Центрального научно-исследовательского института туберкулеза"
Authors: Ураксина М.В. , Рогожкин П.В. , Еременко Е.П.
Published: December 2021

Введение. В период снижения заболеваемости туберкулезом (ТБ) легких актуальны вопросы повышения эффективности его лечения. Серьезной проблемой является рост лекарственно устойчивых форм возбудителя ТБ, что усложняет и увеличивает сроки лечения таких пациентов. Больные без бактериовыделения, с неизвестной лекарственной чувствительностью (ЛЧ) микобактерий туберкулеза (МБТ) могут длительно получать неадекватную антибактериальную терапию. Быстрая и надежная этиологическая диагностика с определением ЛЧ МБТ, необходима для эффективного лечения ТБ. Основными лабораторными методами подтверждения диагноза ТБ остается сочетание микроскопического и бактериологического методов выявления МБТ. В последнее годы большую диагностическую значимость получили молекулярно-генетические методы (МГМ) выявления ДНК МБТ. Таким методом является применяемый в настоящее время ПЦР тест в режиме реального времени в картридже GeneXpert MTB/RIF (Cepheid, США), который в том числе определяет в исследуемом материале генетические маркеры МБТ и наличие мутаций, ассоциированных с лекарственной устойчивостью (ЛУ) к рифампицину. Картридж GeneXpert MTB/RIF используют как экспресс-метод для поиска МБТ при обязательном параллельном применении классических методов диагностики. Использование автоматизированных систем позволяет сокращать сроки постановки диагноза и выбора правильного режима химиотерапии. Рост количества больных с множественной ЛУ (МЛУ) МБТ обуславливает возрастающую потребность в хирургических методах лечения ТБ. При выполнении радикальной резекции легкого у больным ТБ, в особенности пациентам с отрицательными анализами мокроты на МБТ, проводится исследование операционного материала на МБТ. Использование данных о ЛЧ непосредственно в очагах туберкулезного поражения является перспективным в определении комплексного подхода к тактике ведения больных ТБ. Цель исследования: изучить спектр лекарственной устойчивости МБТ, полученных из резецированных участков легких больных ТБ.
ОСОБЕННОСТИ СОВМЕСТНОГО ПРИМЕНЕНИЯ У ДЕТЕЙ ТЕСТОВ IN VIVO И IN VITRO, ОСНОВАННЫХ НА АНТИГЕНАХ ESAT6-CFP10, "Вестник Центрального научно-исследовательского института туберкулеза"
Authors: Шорина А.В.
Published: December 2021

Введение. В течение последнего десятилетия в Российской Федерации для диагностики латентной туберкулезной инфекции (ЛТИ) и туберкулеза (ТБ) у детей используется внутрикожная проба с аллергеном туберкулезным рекомбинантным (АТР или Диаскинтест), содержащим антигены микобактерии туберкулеза (МБТ): ESAT6-CFP10. Вместе с тем в зарубежных странах с высоким уровнем экономики используются тесты in vitro, основанные на индукции интерферона-гамма под воздействием тех же антигенов Interferon-Gamma Release Assays (IGRA). К ним относится, в частности, QuantiFERON-тест (QFT), который сертифицирован в нашей стране, но применяется ограниченно в связи с высокой стоимостью и сложностью исполнения. Однако в ряде случаев (наличие противопоказаний к постановке внутрикожных проб, различные варианты иммунодефицитов, желание родителей и др.) использование QFT оправдано наряду с АТР или вместо него. Цель исследования: провести анализ результатов одновременного применения тестов с АТР и QFT для определения особенностей реагирования организма ребенка in vivo и in vitro.
ЧАСТОТА И СТРУКТУРА СОПУТСТВУЮЩЕЙ ПАТОЛОГИИ У ПАЦИЕНТОВ С НЕТУБЕРКУЛЕЗНЫМ МИКОБАКТЕРИОЗОМ ОРГАНОВ ДЫХАНИЯ, ВЫЗВАННЫМ РАЗЛИЧНЫМ СПЕКТРОМ ВОЗБУДИТЕЛЕЙ, "Вестник Центрального научно-исследовательского института туберкулеза"
Authors: Егорова А.Д. , Гордеева О.М. , Шишкина Е.Р.
Published: December 2021

Актуальность. В России, по данным за 2019 г., значительную часть первичной заболеваемости составляют болезни органов дыхания (45,6%), при этом в структуре общей заболеваемости населения они встречаются в 25,1% случаев (Здравоохранение в России, 2019). Нетуберкулезный микобактериоз (НТМБ) – заболевание инфекционной природы, этиологическим агентом которого являются нетуберкулезные микобактерии. К факторам, влияющим на риск развития заболевания, относятся: структурные перестройки бронхолегочной системы, изменение мукоцилиарного клиренса, длительно текущие воспалительные процессы в дыхательных путях, прием иммуносупрессивных препаратов и нарушение иммунного ответа (W.J. Koh, 2017; Wassilew N., 2016; Axson E.L., 2018). Однако в настоящее время отсутствуют данные о частоте встречаемости микобактериоза среди лиц с впервые выявленными патологическими заболеваниями легких по данным рентгенологического обследования (очаговые изменения, диссеминация, полостные образования). В последние годы распространенность микобактериоза возрастает и варьирует от 2,5 до 8% в год. Наряду с этим отмечается увеличение числа пациентов с хронической неспецифической патологией легких (Литвинов В.И., 2008; Зимина В.Н., 2017). Актуальность возможности развития НТМБ у лиц, которые не входят в группы риска по развитию заболевания, увеличивается из года в год и привлекает все большее внимание исследователей и клиницистов. Цель исследования: сравнительный анализ сопутствующих заболеваний у больных НТМБ органов дыхания, вызванным различным спектром возбудителей.
ПРЕДОПЕРАЦИОННАЯ ПОДГОТОВКА БОЛЬНЫХ ФИБРОЗНО-КАВЕРНОЗНЫМ ТУБЕРКУЛЕЗОМ ЛЕГКИХ С ПРИМЕНЕНИЕМ ВНУТРИВЕННОГО ЛАЗЕРНОГО ОБЛУЧЕНИЯ КРОВИ, "Вестник Центрального научно-исследовательского института туберкулеза"
Authors: Алиев В.К. , Тарасов Р.В. , Читорелидзе Г.В.
Published: December 2021

Цель исследования: повышение эффективности хирургического лечения больных фиброзно-кавернозным туберкулезом (ФКТ) легких с множественной и широкой лекарственной устойчивостью (МЛУ/ШЛУ) возбудителя за счет использования в комплексной предоперационной подготовке курса внутривенного лазерного облучения крови (ВЛОК).
КОМПЛЕКСНОЕ ХИРУРГИЧЕСКОЕ ЛЕЧЕНИЕ РАСПРОСТРАНЕННОГО ДЕСТРУКТИВНОГО ТУБЕРКУЛЕЗА ЛЕГКИХ С ПРИМЕНЕНИЕМ ИННОВАЦИОННОЙ ТЕХНОЛОГИИ ОБРАБОТКИ СЛИЗИСТОЙ КУЛЬТИ ГЛАВНОГО БРОНХА ПРИ ПНЕВМОНЭКТОМИИ, "Вестник Центрального научно-исследовательского института туберкуле
Authors: Асоян Г.А. , Эргешова А.Э. , Никитина Н.М. , Базылюк А.В.
Published: December 2021

Цель исследования: повышение эффективности хирургического лечения больных распространенным деструктивным туберкулезом (ТБ) легких за счет применения инновационной технологии (ИТ), основанной на обработке слизистой культи главного бронха при пневмонэктомии высокоэнергетическим лазерным излучением.
ЭФФЕКТИВНОСТЬ ПРИМЕНЕНИЯ СИЛИКОНОВОГО ИМПЛАНТА И КЛАПАННОЙ БРОНХОБЛОКАЦИИ ПРИ КОЛЛАПСОХИРУРГИЧЕСКОМ ЛЕЧЕНИИ БОЛЬНЫХ ТУБЕРКУЛЕЗОМ ЛЕГКИХ С ШИРОКОЙ ЛЕКАРСТВЕННОЙ УСТОЙЧИВОСТЬЮ, "Вестник Центрального научно-исследовательского института туберкулеза"
Authors: Аубакиров Е.А.
Published: December 2021

Введение. Туберкулез (ТБ) с широкой лекарственной устойчивостью (ШЛУ) возбудителя – опасное и практически не поддающееся химиотерапии заболевание. Как правило, при длительно протекающем ТБ с ШЛУ наступают морфологические изменения в легких и дальнейшее лечение становится бесперспективным. В таких случаях наиболее эффективными у данной категории больных являются хирургические методы лечения. Но и при хирургических вмешательствах эффективность лечения больных ТБ с ШЛУ находится в зависимости от степени развития фиброзных изменений в легочной ткани, снижения защитных сил организма, ухудшения функционального состояния жизненно важных органов, а также от спектра лекарственной устойчивости микобактерий туберкулеза (МБТ) к применяемым антибактериальным препаратам (АБП). Эффективность хирургических методов лечения при ШЛУ ТБ составляет 74,2–82,7%, при летальности 7,4%, а по сообщению ряда авторов, особенно у больных с ШЛУ ТБ, послеоперационные осложнения достигают 50% с летальностью 20–26%. У больных ТБ с ШЛУ целесообразно использовать коллапсохирругические способы лечения, которые позволяют достигнуть стойкого излечения у 75% оперированных. Немаловажное значение для достижения высокой эффективности коллапсохирургических вмешательств имеет химиотерапия, на фоне которой они выполняются. Применение хирургических методов лечения на фоне химиотерапии АБП второго и третьего ряда у больных ТБ с ШЛУ позволяет достигнуть конверсии мазка мокроты в 65,5% случаев. Существует множество способов коллапсохирургического лечения больных ТБ легких. Наиболее известным является способ экстраплеврального пневмолиза с интраоперационной пломбировкой при лечении деструктивного ТБ легких. Нами разработан способ выполнения различных модификаций торакопластики в сочетании с экстраплевральным пневмолизом, при котором в качестве пломбировочного материала использован силиконовый имплант. Цель исследования: определение эффективности ТМПЛ с силиконовым имплантом в сочетании КББ в комплексном лечении больных с ШЛУ ТБ.
ИЗМЕНЕНИЕ МАРКЕРОВ СИСТЕМЫ ГЕМОСТАЗА У БОЛЬНЫХ КОСТНО-СУСТАВНЫМ ТУБЕРКУЛЕЗОМ ДО И ПОСЛЕ ХИРУРГИЧЕСКОГО ЛЕЧЕНИЯ, "Вестник Центрального научно-исследовательского института туберкулеза"
Authors: Гусейнов Т.Ш. , Читорелидзе Г.В. , Пенаги Р.Н.-А. , Базылюк А.В.
Published: December 2021

Цель исследования: изучить изменения системы гемостаза у больных с туберкулезным поражением позвоночника, костей и суставов до и после хирургического лечения.
ВЗАИМОСВЯЗЬ ПОСЛЕОПЕРАЦИОННЫХ ОСЛОЖНЕНИЙ С ПРОГНОЗИРУЕМОЙ ФУНКЦИЕЙ ЛЕГКИХ ПОСЛЕ ПНЕВМОНЭКТОМИИ У БОЛЬНЫХ ТУБЕРКУЛЕЗОМ ЛЕГКИХ, "Вестник Центрального научно-исследовательского института туберкулеза"
Authors: Денисова Н. В. , Кокорина Е.В.
Published: December 2021

Введение. С увеличением доли лекарственно-устойчивого туберкулеза (ТБ) легких актуальность хирургического метода в комплексном лечении этого заболевания возрастает. Оперативное вмешательство является сложным этапом лечения для пациентов с ТБ легких, так как исходно низкие функциональные резервы сопровождаются высокой частотой осложнений и летальности после операции. Крайне важно тщательно оценивать операбельность пациента при планировании и выборе объема хирургического лечения. Однако прогностическая ценность прогнозируемых послеоперационных величин респираторных параметров при хирургическом лечении больных ТБ легких в настоящее время остается неизученной. Цель исследования: оценка влияния прогнозируемых постоперационных величин респираторных параметров на легочные осложнения после пневмонэктомии (ПЭ) у пациентов с ТБ легких.
ПРИМЕНЕНИЕ ЭКСТРАПЛЕВРАЛЬНОГО ПНЕВМОЛИЗА С УСТАНОВКОЙ СИЛИКОНОВОГО ИМПЛАНТА ПРИ ЛЕЧЕНИИ РАСПРОСТРАНЕННЫХ ДЕСТРУКТИВНЫХ ФОРМ ТУБЕРКУЛЕЗА ЛЕГКИХ, "Вестник Центрального научно-исследовательского института туберкулеза"
Authors: Никитина Н.М. , Тарасов Р.В. , Асоян Г.А.
Published: December 2021

Введение. Коллапсхирургические методы лечения деструктивного туберкулеза (ТБ) легких были одними из первых методов лечения пациентов. До 1940 г. хирургия легочного ТБ развивалась преимущественно в направлении хирургической коллапсотерапии. Данные методики приводили к спаданию и созданию механического покоя пораженного легкого. Впервые такой хирургический метод, как экстраплевральный пневмолиз был предложен в 1891 г. французским хирургом Тюффье. Методика экстраплеврального пневмолиза заключается в отслойке верхушки легкого в экстраплевральном слое после резекции ребра. Образовавшуюся экстраплевральную полость вначале поддерживали вдуванием азота или воздуха на протяжении длительного времени при туберкулезных кавернах. В последствии начали разрабатывать методики с использованием пломбировочного материала. Материал, использовавшийся для экстраплеврального пневмолиза, был достаточно разнообразным. С развитием резекционной хирургии ТБ легких, операция экстраплеврального пневмолиза стала применяться крайне редко и осталась лишь исторической вехой в хирургическом лечении ТБ легких. Но распространение лекарственно-устойчивого ТБ и увеличение числа больных с хроническими распространенными деструктивными процессами создали условия для возвращения интереса к данной операции. Цель исследования: проиллюстрировать эффективность лечения деструктивного ТБ легких у пациентов с тяжелым преморбидным фоном и дыхательной недостаточностью путем применения экстраплеврального пневмолиза с использованием силиконового импланта (ЭПСИ).
ЛАЗЕРНАЯ ДЕСТРУКЦИЯ ОЧАГОВ В ХИРУРГИЧЕСКОМ ЛЕЧЕНИИ РАСПРОСТРАНЕННОГО ТУБЕРКУЛЕЗА ЛЕГКИХ, "Вестник Центрального научно-исследовательского института туберкулеза"
Authors: Пенаги Р.Н.-А. , Эргешова А.Э. , Базылюк А.В. , Гусейнов Т.Ш.
Published: December 2021

Введение. В связи с высоким числом больных туберкулезом (ТБ) с распространенным двусторонним поражением легких с множественной и широкой лекарственной устойчивостью (МЛУ/ШЛУ) микобактерий туберкулеза (МБТ) и очагами диссеминации, сопровождающимися выраженной дыхательной недостаточностью, необходима разработка и внедрение новых методов хирургического лечения. Анализ литературы свидетельствует о том, что попытка расширения показаний к хирургическому лечению у больных с МЛУ МБТ дает малоудовлетворительные результаты. Применение обширных резекций легких у отягощенного контингента больных сопровождается тяжелыми осложнениями и высокой послеоперационной летальностью, а после успешного завершения послеоперационного периода нередко наступает реактивация ТБ. Определенную сложность представляет собой категория больных фиброзно-кавернозным ТБ легких с диссеминацией вне зоны основного поражения легочной ткани, так как остающиеся рассеянные множественные очаги представляют опасность рецидива ТБ. Поэтому актуальным является разработка новых методических подходов, направленных не только на уменьшение объема резецируемой пораженной легочной ткани, но и на ликвидацию туберкулезных очагов в оставшихся отделах легкого. Доказано, что термическое действие лазерного излучения на легочную паренхиму носит локальный характер с минимальным повреждением подлежащих тканей, а величина деструкции имеет прямую функциональную зависимость от плотности, мощности лазерного излучения и экспозиции. Особенности заживления лазерных ран легочной ткани заключаются в развитии продуктивного асептического воспаления с активной ранней пролиферацией клеточных элементов макрофагального и фибробластического ряда, при отсутствии экссудативных процессов и лейкоцитарной инфильтрации, а аэрогемостатический эффект связан с формированием на поверхности облучаемой ткани стерильного коагуляционного струпа с образованием тромбов в просвете прилежащих сосудов. Цель исследования: повышение эффективности хирургического лечения за счет интраоперационного лазерного воздействия на туберкулезные очаги у больных с распространенным деструктивным туберкулезом легких.
ОДНОМОМЕНТНАЯ ИНТРАОПЕРАЦИОННАЯ КОРРЕКЦИЯ МЕДИАСТИНАЛЬНОЙ ЛЕГОЧНОЙ ГРЫЖИ ПРИ ТРАНССТЕРНАЛЬНОЙ ОККЛЮЗИИ ГЛАВНОГО БРОНХА У БОЛЬНЫХ РАСПРОСТРАНЕННЫМ ОСЛОЖНЕННЫМ ДЕСТРУКТИВНЫМ ТУБЕРКУЛЕЗОМ ЛЕГКИХ, "Вестник ЦНИИТ"
Authors: Тарасов Р.В. , Алиев В.К. , Эргешова А.Э. , Эргешова Л.А. , Салихов Б.У.
Published: December 2021

Введение. Пациентам с распространенным деструктивным туберкулезом (ТБ) легких, осложненным эмпиемой плевры с бронхоплевральными свищами, показано выполнение трансстернальной окклюзии главного бронха (ТСОГБ) с последующей пневмонэктомией. Из-за длительного течения и фибротизации ткани пораженного легкого у этих больных формируется медиастинальная легочная грыжа (МЛГ), проявляющаяся перерастяжением противоположного легкого и его дислокацией в пораженный гемиторакс, что служит причиной последующего нарушения вентиляции и газообмена, а также приводит к прогрессированию ТБ в оставшихся очагах единственного легкого. В хирургическом отделе ФГБНУ «ЦНИИТ» разработана методика одномоментного выполнения трансстернальной окклюзии главного бронха и пластики переднего средостения сетчатым имплантом с целью коррекции МСГ. Цель исследования: повышение эффективности хирургического лечения больных распространенным деструктивным ТБ легких путем одномоментного выполнения ТСОГБ и коррекции МЛГ легких с помощью полимерного сетчатого импланта.
БЕДАКВИЛИН В РЕЖИМАХ ХИМИОТЕРАПИИ ТУБЕРКУЛЕЗА ОРГАНОВ ДЫХАНИЯ С МНОЖЕСТВЕННОЙ И ШИРОКОЙ ЛЕКАРСТВЕННОЙ УСТОЙЧИВОСТЬЮ МИКОБАКТЕРИЙ ТУБЕРКУЛЕЗА У ПОДРОСТКОВ, "Вестник Центрального научно-исследовательского института туберкулеза"
Authors: Пискунова О.А.
Published: December 2021

Введение. На общем фоне снижения эпидемических показателей по заболеваемости, распространенности и смертности от туберкулеза (ТБ) остается актуальной проблема нарастания доли больных с множественной лекарственной устойчивостью (МЛУ) и широкой лекарственной устойчивостью (ШЛУ) возбудителя, в том числе и среди детского населения. Лекарственная резистентность является основной причиной снижения эффективности лечения у детей и подростков, приводящей в последующем к развитию хронических форм заболевания и пополнению резервуара туберкулезной инфекции в будущем. По данным официальной статистики, в 2019 г. в Российской Федерации доля больных ТБ детей и подростков с МЛУ среди бактериовыделителей составила 45,8%. Экспансия лекарственно-устойчивых штаммов микобактерий туберкулеза (МБТ), в частности и среди детской возрастной категории, закономерно приводит к необходимости использования новых эффективных противотуберкулезных препаратов, прежде всего бедаквилина (Bdq), в режимах химиотерапии (РХТ). Цель исследования: оценить эффективность применения бедаквилина в режимах РХТ с МЛУ/ШЛУ возбудителя у подростков.
ЛЕКАРСТВЕННО-ИНДУЦИРОВАННЫЕ ПОРАЖЕНИЯ ПЕЧЕНИ У ДЕТЕЙ С РАЗЛИЧНОЙ ПАТОЛОГИЕЙ ГЕПАТОБИЛИАРНОЙ СИСТЕМЫ НА ФОНЕ ХИМИОТЕРАПИИ ТУБЕРКУЛЕЗА, "Вестник Центрального научно-исследовательского института туберкулеза"
Authors: Торопова В.А.
Published: December 2021

Введение. Во фтизиатрической практике нередко течение туберкулеза (ТБ) сопровождается развитием патологических изменений со стороны гепатобилиарной системы. Проблема сочетания ТБ и заболеваний печени у детей определяется, с одной стороны, применением комплексной противотуберкулезной терапии с использованием 4 и более препаратов (лекарственно-индуцированное поражение печени у взрослых является преобладающим видом патологии печени у больных ТБ и составляет 67,5%), с другой – наличием фоновой патологии печени в виде дискинезии желчевыводящих путей (ДЖВП), болезни Жильбера, вирусных гепатитов. Сочетание ТБ и поражения печени различной этиологии является неблагоприятным фактором как для течения заболевания, так и для возможности применения полноценного курса химиотерапии, что приводит к более длительным срокам лечения, и в то же время усугубляет токсическое медикаментозное воздействие на печень. Цель исследования: провести сравнительный анализ развития лекарственно-индуцированных поражений печени у детей с различной патологией печени и без нее на фоне химиотерапии ТБ, эффективности проведения гепатотропной терапии в разных группах пациентов.
ВАКЦИНАЦИЯ ПРОТИВ ТУБЕРКУЛЕЗА КАК ВОЗМОЖНЫЙ СПОСОБ ПРОФИЛАКТИКИ НОВОЙ КОРОНАВИРУСНОЙ ИНФЕКЦИИ, "Вестник Центрального научно-исследовательского института туберкулеза"
Authors: Мудракова Т.А. , Чиина С.А.
Published: December 2021

Цель исследования: оценка заболеваемости и смертности от COVID-19 в странах с различной национальной политикой БЦЖ и возможных механизмов влияния вакцины БЦЖ на течение и исходы COVID-19.
Antifungal Efficacy of Triple Antibiotic Paste, Double Antibiotic Paste with Fungicide and Calcium Hydroxide with Chitosan as a Vehicle against Candida albicans: An In vitro Study
Authors: Naidu Seera Sudhakar , Rajashekar Vemareddy , Balaraju Korrai , Gayathri Chava , Harshitha Garapati , Sreeha Kaluva Kolanu
Published: December 2021

Introduction: The purpose of current research is to assess the in vitro antimicrobial efficacy of different medicaments with two different vehicles against Candida albicans (C. albicans).

Materials and Methodology: An agar well diffusion assay was used to determine the experimental medicaments' efficacy against C. albicans. Medicaments were divided into six groups, which includes Triple antibiotic powder (TAP) with saline or chitosan, Double antibiotic powder with fungicide (DAPF) with saline or Chitosan, and calcium hydroxide with saline or Chitosan. The diameters of growth inhibition zones were recorded and compared for each group for three days, i.e., 1,4,7 days. The differences between groups were analyzed by Kruskal-Wallis and Mann-Whitney U tests.

Results: The largest inhibition zones were observed for the double antibiotic paste + fungicide with chitosan and the smallest for Ca(OH)2 with saline. Over a week, zones of inhibition were consistent only with group V – double antibiotic paste with fungicide and chitosan as the vehicle.

Conclusion: DAPF with chitosan is more efficient against Candida albicans. Since the endodontic infections are polymicrobial in origin, the combined local drug delivery of antimicrobial agents such as ciprofloxacin, metronidazole, doxycycline along with antifungal drugs such as fluconazole with an efficient drug carrier (chitosan) is recommended to combat the microbial load.
Impact of Heavy Metals Consumption on Human Health: A Literature Review
Authors: Qureshi Yaser
Published: December 2021

While some heavy metals are essential trace components, many are bio toxic in human biochemistry. As a result, a full grasp of underlying systems is required. For supporting life and minimizing environmental damage, we must grasp their sources, liquidation techniques, chemical modifications, and deposition patterns These metals are discharged into the environment by both natural and human activity, including mining, industrial operations, and vehicular emissions. Soils and groundwater are contaminated when they leak into subsurface fluids and eventually into the aquifer. The world's commerce and coordinating systems frequently generate environmental toxicity and poisoning. Swallowed, they generate bio toxic compounds, lose structural integrity, and block bio reactions. This study's goal is to learn more about heavy metals and their bio toxic effects on humans.
Beliefs and Factors Affecting the Usage and Compliance of Inhalers in Treatment of Asthma in Children
Authors: Bhupathi S. Dinesh , Vidhyasagar .
Published: December 2021

Background: Despite the availability of several treatment modalities-various formulations of inhaled corticosteroids and delivery devices, the prevalence of asthma is increasing in the developing countries, especially among the paediatric age group. Though Inhaled corticosteroids are effective in the management of asthma, parents prefer oral medications and nebulisers as the treatment modality for their children. Thus, there is a general reluctance amongst the parents towards the use of inhalers. This article focuses on the beliefs and factors affecting the usage and compliance of inhalers in the treatment of asthma.

Objectives: To assess Beliefs and factors affecting the usage and compliance of inhalers in treatment of asthma in children.

Materials and Methods: This study was conducted in Tamilnadu from March 2021 to June 2021.A cross -sectional study was conducted among 112 asthma patients of paediatric age group in a tertiary care medical college and hospital in Chennai through a questionnaire containing the demographic details, details regarding the treatment modalities, the inhalers and their usage. The results obtained were tabulated and analyzed.

Result: The study included 112 asthmatic patients,68 boys and 44 girls of whom 87.17% of the children had recurrent episodes of cough and cold. 45.53% of the patients used oral medications along with nebulisation,26.8% used inhalers and 27.67% used inhalers along with oral medications. 78.57% of the parents were aware about the use of inhalers in the treatment of asthma and 59.82% of the parents showed reluctance to use inhalers for their children.

Conclusion: In spite of inhaled corticosteroids being effective in the management of asthma, oral medications and nebulisers are the mainstay treatment in majority of the cases. Social stigma, fear of addiction and lack of knowledge are the major reasons for the reluctance of parents towards the use of inhalers.
Excavation of a settlement and souterrain at Newmill, near Bankfoot, Perthshire
Authors: Watkins Trevor , Barclay Gordon J
Published: December 2021

The accidental discovery of a souterrain beside the A9 road 14 km (8–7 miles) N of Perth led to its complete excavation and the investigation of several hundred square metres of the settlement with which it was associated. A single grave of the Beaker period was also discovered during excavation and is reported elsewhere in this volume. The souterrain was a massive example of the ‘southern Pictland’ group, and the settlement consisted of timber-framed circular houses of the familiar British Iron Age tradition. Little material cultural remains were recovered, but a series of radiocarbon dates places the souterrain's construction in the last century or so be, its use contemporary with the timber houses alongside, its destruction around 200 AD, and the continued use of the site into the 9th century at least.
Sites of the third millennium BC to the first millennium AD at North Mains, Strathallan, Perthshire
Authors: Barclay Gordon J , Barnetson L P D , Bohncke S , Collins G , Cowie T G , Denston C B , Hulme P , Kenworthy M , Lunt D , Pare C , Powers R , Robertson L , Romans J C C , Shirriffs J , Stenhouse M , Thorpe O W , Thorpe R S , Wickham-Jones C R , Young A , Birkeland M , Rideout J S , Townshend A
Published: December 2021

Three sites were excavated: a class II henge, a massive round barrow and a pair of ring-ditches.
Five periods of activity were noted on the henge site: I - pre henge-bank activity, including one burial; II - the class II henge, a ditch with an external bank enclosing a timber ring (late third millennium BC); III - burial and ritual/domestic activity, the former associated with food vessels, cinerary urns and a beaker, the latter with beaker material (second millennium BC); IV - in situ cremation and burial (late second/early first millennium BC); V-long grave cemetery (mid/late first millennium AD). A second timber ring, three burials and a number of pits could not be securely related to this sequence. One of the Period III food vessels had contained a cereal-based material.The barrow covered a substantial area of old land surface (Period II) exhibiting probable cultivation traces which in turn sealed small pits (Period I). The construction of the barrow (Period III) was undertaken in six phases, which include a complex timber substructure (A), a ring-bank (B), a fire set near the top of the mound (D) and a stone capping (F). The mound was largely built of material dug from a surrounding ditch, though large quantities of field-stone and turf were also used. The mound has been dated to the early/mid second millennium be. Phosphate concentrations suggest that the barrow had covered burials. Two food vessel sherds were incorporated into the lower mound material. A spindle whorl was found in the upper part of the mound. Multiple and single cremation deposits and two inhumations, both with food vessels, one with a disc-bead jet necklace, had been dug into the mound's surface or had been incorporated during its building. A large cupmarked slab was found at the barrow's summit.The two ring-ditches may have enclosed low barrows. A pit containing cremated bone and 'WesternNeolithic' pottery dated to the early/mid third millennium BC was cut by ring-ditch 2.
Excavations at Upper Suisgill, Sutherland
Authors: Barclay Gordon J , Andrews Martha V , Blackham Anne M , Gilbertson D , Lee Jenny A , Van der Veen Marijke , Rideout J S , Townshend Angela
Published: December 2021

A narrow section across an area between two souterrains was excavated in advance of road realignment; part of one of the souterrains was also exposed. The excavation revealed deposits up to c 1.8 m deep in places, largely made up of material washed downhill on to the site. 
Early-mid first millennium BC: Period I – ard tillage; II – construction and reconstruction of a round timber house, and the erection of a stone-faced earth bank; III – tillage; IV – the construction, and destruction by fire, of a post-built structure; beginning of water scouring of the site and start of hillwash deposition.
Settlement was re-established later in the millennium on the surface of the hillwash deposits (Period VI). This was subsequently covered by more hillwash. Recent settlement was represented by uncharacterized activity at the south edge of the excavated area and by two post-medieval buildings (associated with a settlement to the SE) the later of which was probably demolished during 19th-century road building.
Quantities of pottery of 10 fabrics and three main styles (I, flat rims; 2, splayed rims; 3, everted rims) were found. Carbonized plant material was recovered, including many grains of six-row (mainly naked) barley, a little wheat, and oats, possibly domesticated. The pollen analysis of a peat column taken from a bog 2 km from the site showed a notable forest decline at c 4500 BP, followed by a pinebirch regeneration, followed, shortly before 1700 BP, by a further decline.
Neolithic henge-type enclosure at Balfarg
Authors: Mercer Roger J , Barclay Gordon J , Jordan D , Russell-White Christopher J
Published: December 2021

Further excavation and pedological analysis of the gully forming the southern perimeter of the henge suggest that the channel previously interpreted as a natural stream (see 83/10516) is in fact the 'missing' southern segment of henge ditch.
The excavation of pit circles at Romancamp Gate, Fochabers, Moray, 1990
Authors: Barclay Gordon J
Published: December 2021

The excavation was undertaken with the funding and support of Grampian Regional Council to test hypotheses relating to the interpretation of cropmark pit circles: were they Neolithic or Bronze Age ceremonial or funerary structures, or were they Iron Age houses, and to what extent could the two classifications be differentiated on aerial photographs? The excavation revealed the remains of four circles (between 8.5 m and 11.5 m in diameter) of large post- holes, fence lines (one with a gate), and many other pits and post-holes. Radiocarbon dates place the post circles late in the first millennium BC uncal. The pit circles may be interpreted as the main structural elements of four substantial round houses, two of which burned down. Flint tools of the Mesolithic period were recovered.
The crystal structure of the FAM134B–GABARAP complex provides mechanistic insights into the selective binding of FAM134 to the GABARAP subfamily
Authors: Zhao Junfeng , Li Zhiwei , Li Jianchao
Published: December 2021

The mammalian Atg8 family (Atg8s proteins) consists of two subfamilies: GABARAP and LC3. All members can bind to the LC3‐interacting region (LIR) or Atg8‐interacting motif and participate in multiple steps of autophagy. The endoplasmic reticulum (ER) autophagy receptor FAM134B contains an LIR motif that can bind to Atg8s, but whether it can differentially bind to the two subfamilies and, if so, the structural basis for this preference remains unknown. Here, we found that FAM134B bound to the GABARAP subfamily more strongly than to the LC3 subfamily. We then solved the crystal structure of the FAM134B–GABARAP complex and demonstrated that FAM134B used both its LIR core and the C‐terminal helix to bind to GABARAP. We further showed that these properties might be conserved in FAM134A or FAM134C. The structure also allowed us to identify the structural determinants for the binding selectivity. Our work may be valuable for studying the differential functions of GABARAP and LC3 subfamilies in ER phagy in future.
Understanding the Role of Lithium Iodide in Lithium–Oxygen Batteries
Authors: Bi Xuanxuan , Li Jiantao , Dahbi Mouad , Alami Jones , Amine Khalil , Lu Jun
Published: December 2021

Lithium–oxygen (Li–O2) batteries possess a high theoretical energy density, which means they could become a potential alternative to lithium‐ion batteries. Nevertheless, the charging process of Li–O2 batteries requires much higher energy, due to the insulating nature of the discharge product. It has been revealed that the anion additive, lithium iodide (LiI), can tune the cell chemistry to form lithium hydroxide (LiOH) as the product and facilitate the kinetics during the charging process. Although numerous studies have been reported, the role of this additive is still under investigation. Herein, the recent advances focusing on the use of LiI in Li–O2 batteries are reviewed, its catalytic behavior on discharge and charge is discussed, and its synergistic effect with water is understood. The ambiguity existing among the studies are also revealed, and solutions to the current issues are introduced.
Processing Agricultural Cornstalks toward High‐Efficient Stable Bifunctional ORR/OER Electrocatalysts
Authors: Li Yinghui , Qu Yuanju , Liu Chaocheng , Cui Jiedong , Xu Ke , Li Yang , Shen Haoyu , Lu Zhouguang , Pan Hui , Xu Tao , Liu Detao
Published: December 2021

Bifunctional oxygen reduction/oxidation reaction (ORR/OER) electrocatalysts derived from biomass are one of the most valuable materials in terms of sustainability, ecological economy and industrial manufacturing, and are emerging as a desired alternative to the commercial Pt/C and IrO2 catalysts. This work demonstrates the processing of agricultural cornstalk waste of cornstalks into stable bifunctional ORR/OER catalysts with high‐performance by a simple and cost‐effective strategy. Rich hydrophilic active groups (e.g., hydroxyl groups) in the hierarchical porous structures of the native cornstalks enable the sufficient facile combination with transition metals (e.g., Co, Fe, Zn) and heteroatoms (e.g., B, N) from soluble Co(NO3)2, ZnCl2, H3BO3, NH4Cl in a hydrothermal reaction. The pyrolytic evaporation of Zn2+ in a high‐temperature carbonization process facilitates the generation of abundant micropores and mesopores to increase specific surface areas (941.44 m2 g−1) and also hinders aggregation between neighboring transition metals. The synergistic effects of N, B, Fe and Co doping in hierarchical porous biochar‐structures contributes to outstanding bifunctional ORR/OER activities and working stabilities, outperforming commercial Pt/C and IrO2 catalysts. Computational results further verify the valuable synergistic contributions based on density‐functional theory (DFT). This approach opens up a new possibility for the fabrication of bifunctional biochar‐based ORR/OER catalysts from artificial engineering and green processing for sustainable agricultural wastes.