bluuebunny/crossref_metadata_2025 huggingface dataset:
Super-resolution microscopy of chromatin fibers and quantitative DNA methylation analysis of DNA fiber preparations
Authors: Franek Michal , Kilar Agata , Fojtík Petr , Olšinová Marie , Benda Aleš , Rotrekl Vladimír , Dvořáčková Martina , Fajkus Jíří
Published: July 2021

Analysis of histone variants and epigenetic marks is dominated by genome-wide approaches in the form of chromatin immunoprecipitation-sequencing (ChIP-seq) and related methods. Although uncontested in their value for single-copy genes, mapping the chromatin of DNA repeats is problematic for biochemical techniques that involve averaging of cell populations or analysis of clusters of tandem repeats in a single-cell analysis. Extending chromatin and DNA fibers allows us to study the epigenetics of individual repeats in their specific chromosomal context, and thus constitutes an important tool for gaining a complete understanding of the epigenetic organization of genomes. We report that using an optimized fiber extension protocol is essential in order to obtain more reproducible data and to minimize the clustering of fibers. We also demonstrate that the use of super-resolution microscopy is important for reliable evaluation of the distribution of histone modifications on individual fibers. Furthermore, we introduce a custom script for the analysis of methylation levels on DNA fibers and apply it to map the methylation of telomeres, ribosomal genes and centromeres.
Die Südmauer der Remise an der Rittergasse 29
Authors: Reicke Daniel
Published: July 2021

An der mehr als 20 Meter langen Mauer - der Rückwand der Remise - konnten neben jüngeren Befunden eine hochmittelalterliche Partie mit einem vermauerten Portal und - Richtung Rhein - eine grössere, spätmittelalterlich datierte Mauerfläche dokumentiert werden.
Archäologische Sondierungen im Eckhaus Nadelberg 21, 1993/20
Authors: Matt Christoph Ph. , Bing Christian
Published: July 2021

Das Gelände im Bereich der Hangkante war vermutlich zu Beginn des 2. Jahrtausends stellenweise recht unregelmässig ausgebildet und wurde wohl erst im Laufe des 13./14. Jahrhunderts, anlässlich der Errichtung der ersten Steinbauten, begradigt bzw. eingeebnet.

Die Funde über dem natürlichen Untergrund belegen eine Begehung im 12. und 13. Jahrhundert. Unmittelbar neben der Hangkante wurde eine einfache Feuerstelle gefasst, wie sie in gleicher Art auch im benachbarten Rosshofareal nachgwiesen worden ist.

 Die wenigen Fundamentaufschlüsse des Hauses sind vom Mauercharakter her mittelalterlich und dürften im Zeitraum zwischen ausgehendem 13. Jahrhundert und dem Basler Erdbeben ( 1356) bzw. kurz danach (erste schriftliche Nennungen) errichtet worden sein.
Tätigkeitsbericht des Kantonsarchäologen für das Jahr 1993
Authors: D'Aujourd'hui Rolf
Published: July 2021

Der erste Teil des Jahresberichts umfasst den Tätigkeitsbericht des Kantonsarchäologen, der die im Berichtsjahr erfolgten Aktivitäten des Amtes vorstellt und kommentiert, sowie eine Fundchronik mit einem Kurzbeschrieb sämtlicher im Laufe eines Jahres registrierter Fundstellen.
Vorbericht über die Grabungen 1994 im Bereich der spätlatènezeitlichen Fundstelle Basel-Gasfabrik
Authors: Jud Peter , Spichtig Norbert
Published: July 2021

Berichte zu den archäologischen Untersuchungen in der Fundstelle «Basel-Gasfabrik» im Jahr 1994.
Geologisch-bodenkundliche Untersuchungen an den Niederterrassenfeldern bei Basel unter besonderer Berücksichtigung der spätlatènezeitlichen Fundstelle Basel-Gasfabrik
Authors: Rentzel Philippe
Published: July 2021

Im ersten Teil des Aufsatzes werden quartärgeologisch-bodenkundliche Untersuchungsergebnisse an Aufschlüssen der linksrheinischen Niederterrasse bei Basel vorgelegt.

Im zweiten Teil werden Resultate mikromorphologischer Analysen an archäologischen Sedimenten der Fundstelle Basel-Gasfabrik diskutiert. Aufgrund der künstlich gekappten Bodenprofile steht fest. dass zu Beginn der latenezeitlichen Besiedlung ein beträchtlicher Abtrag von Bodenmaterial stattgefunden hat. An der Basis der archäologischen Schichtenfolge liess sich indessen mehrfach ein Stampflehmboden beobachten, der mit Hausstrukturen in Verbindung gestanden haben muss.
Ausgrabungen im Bereich des Murus Gallicus 1990-1993
Authors: Richner Kaspar , Deschler-Erb Eckhard , Stegmüller Christian
Published: July 2021

Die Ausgrabungen im Bereich des Murus Gallicus auf dem Basler Münsterhügel in den Jahren 1990- 1993 haben zwei Ergebnisse gezeitigt, die auch ausserhalb der lokalen Forschung auf Interesse stossen dürften.

Zum einen wurde eine Methode perfektioniert, mit der sich komplexe Holzstrukturen selbst in Trockenböden dokumentieren und zuverlässig dreidimensional rekonstruieren lassen .

Zum andern wurde, unter Anwendung der oben erwähnten Methode, die Struktur des Murus Gallicus auf dem Basler Münsterhügel vollständig dokumentiert, soweit sie überhaupt noch erhalten war.
Zur Untersuchung des Heuslerschen Hauses St. Alban-Tal 34
Authors: Reicke Daniel , Merki Matthias
Published: July 2021

Anlässlich der Renovation sämtlicher Gebäude auf der Parzelle St. Alban-Tal 34/36 - der Papierfabrik von 1847, des barocken Stallbaus an der Strasse und des historischen Hauses St. Alban-Tal 34 - in den Jahren 1991-1995 leistete die Basler Denkmalpflege Dokumentations- und Untersuchungsarbeiten.

Der vorliegende Bericht befasst sich aber nur mit dem denkmalgeschützten Haus St. Alban-Tal 34.
Vorbericht über die Grabungen 1995 im Bereich der spätlatènezeitlichen Fundstelle Basel-Gasfabrik
Authors: Jud Peter , Spichtig Norbert
Published: July 2021

Berichte zu den archäologischen Untersuchungen in der Fundstelle «Basel-Gasfabrik» im Jahr 1995.
Tätigkeitsbericht des Kantonsarchäologen für das Jahr 1995
Authors: D'Aujourd'hui Rolf
Published: July 2021

Der erste Teil des Jahresberichts umfasst den Tätigkeitsbericht des Kantonsarchäologen, der die im Berichtsjahr erfolgten Aktivitäten des Amtes vorstellt und kommentiert, sowie eine Fundchronik mit einem Kurzbeschrieb sämtlicher im Laufe eines Jahres registrierter Fundstellen.
The Attraction and Compromise Effects in Bargaining: Experimental Evidence
Authors: Galeotti Fabio , Montero Maria , Poulsen Anders
Published: July 2021

We experimentally investigate, in an unstructured bargaining environment with commonly known money payoffs, the attraction effect and compromise effect (AE and CE) in bargaining, namely, a tendency for bargainers to agree to an intermediate option (CE) or to an option that dominates another option (AE). We conjecture that the relevance of the AE and CE in bargaining is constrained by how focal the feasible agreements’ payoffs are. We indeed observe that there are significant AEs and CEs, but these effects are mediated by the efficiency and equality properties of the feasible agreements. Due to the allure of equality, the effects are harder to observe when an equal earnings contract is available. Decoys are more effective in shifting agreements from a very unequal contract to a less unequal one rather than the reverse.

This paper was accepted by Yuval Rottenstreich, behavioral economics and decision analysis.
Escalas da desigualdade urbana - a cidade do Rio de Janeiro e as favelas
Authors: E Silva de Carvalho Camila Lima
Published: July 2021

No Brasil, o senso comum aponta as favelas como o lugar urbano da pobreza, da violência emarginalidade, por excelência. O objetivo deste trabalho é mostrar que essa descrição das favelas como bolsões de pobreza só é pertinente numa determinada estratégia de agregação espacial dos dados censitários – ou seja, uma certa escala geográfica. Quando a análise é feita considerando os limites de uma favela individual, o que emerge é um mosaico de faixas de renda, a exemplo do observado na escala da cidade. A hipótese deste trabalho é de que as favelas possuem uma estrutura socioespacial análoga à da cidade, caracterizando-as como uma espécie de “cidades dentro da cidade”. Utilizando dados do Censo, agregados ao nível do setor censitário, calculamos o Índice de Moran para a variável renda e, uma vez identificados os clusters de alta e baixa renda, analisamos os dados socioeconômicos e de infraestrutura, relativos a 2010. Estudamos os três maiores agrupamentos de favelas no Rio de Janeiro: Rocinha, Complexo do Alemão e Fazenda Coqueiro. Os resultados indicaram que as favelas têm reproduzido a desigualdade observada na escala da cidade. Articuladas à estrutura urbana mais ampla, as favelas se comportam como fractais, na medida em que também reproduzem esta estrutura.
Efeitos da corrosão atmosférica nas empresas do Porto do Açu cinco anos após o início das operações
Authors: Da Silva Luiz Guilherme , Rego Henrique , Erthal Milton
Published: July 2021

Os sais presentes na atmosfera dos ambientes costeiros, quando associado ao tempo e a humidade, causam a oxidação de alguns materiais. Os prejuízos econômicos ocasionados pela corrosão são estimados em 3% do PIB mundial e o uso de tecnologias preventivas pode reduzir de 20% a 25% deste custo. Este trabalho tem o objetivo de avaliar o impacto da corrosão atmosférica nas empresas instaladas no Porto do Açu, localizado no município de São João da Barra, RJ. A pesquisa foi conduzida por aplicação de questionários junto aos gestores de três empresas em atividade há mais de cinco anos no porto. Buscou elencar informações sobre o impacto financeiro, material, saúde das pessoas e as ações preventivas e corretivas associadas aos efeitos da corrosão atmosférica. Na opinião dos gestores os prejuízos causados pela corrosão nas empresas são de nível intermediário (nota = 3), em uma escala de 1 a 5. Cerca de 50% dos impactos estão associados a infraestrutura, 30% em peças e 20% em equipamentos. A estimativa nos custos gerais das empresas com a manutenção preventiva e corretiva (reposição de peças e equipamentos danificados) ainda não são totalmente compreendidos pelos gestores. Este trabalho faz o primeiro levantamento deste aspecto no Complexo Industrial do Porto do Açu. Os dados sugerem que o problema da corrosão atmosférica pode não ter sido adequadamente avaliado pelas empresas em operação. A implantação de técnicas específicas de prevenção e controle de corrosão atmosférica faz-se necessária no Porto do Açu.
Tecnologia Industrial Básica (TIB) no Setor Metalmecânico: um Estudo Exploratório no Rio de Janeiro
Authors: Mendes Heitor Soares , Ferreira Marta Lucia Azevedo
Published: July 2021

Este artigo se propõe a analisar a capacitação em Tecnologia Industrial Básica (TIB) de Micro, Pequenas e Médias Empresas (MPME) do setor metalmecânico localizadas na Zona Oeste (ZO) do município do Rio de Janeiro (MRJ) no âmbito do Sistema Brasileiro de Tecnologia (Sibratec) e de uma de suas redes regionais de extensão tecnológica - Sibratec-ET Rede RJ. A demanda das empresas é confrontada com esta oferta de apoio em atividades de normalização e regulamentação técnica, metrologia, bem como de avaliação de conformidade e qualidade. Trata-se de uma pesquisa qualitativa, empírica e exploratória baseada no método do estudo de caso. Confirmando a literatura, os resultados mostram a fragilidade da maioria das empresas quanto à capacitação em TIB. A análise da demanda vis-à-vis a oferta de apoio revelou uma correlação positiva favorecida pelo formato flexível do atendimento proposto. Ainda assim, a Rede Sibratec-ET Rede RJ não logrou êxito em relação a seus objetivos, configurando-se mais como um arranjo institucional potencialmente positivo do que efetivo. Ademais, as empresas pesquisadas sequer souberam da existência da Sibratec-ET ou foram visitadas o que indica um campo fértil para o debate a partir de uma avaliação de impacto deste arranjo específico em outros setores ou regiões ou mesmo do Sibratec como um todo. Ratifica-se a necessidade de novas pesquisas sobre esses temas, sobretudo considerando a dimensão nacional do Sibratec e sua forma de atuação em distintos tipos de redes como centros de inovação, serviços tecnológicos e a de extensão tecnológica aqui abordada.
Sistemas Regionais de Inovação no Setor Farmacêutico Brasileiro: Estudo Comparativo
Authors: Paranhos Julia , França Caio , Mercadante Eduardo
Published: July 2021

O presente estudo visa caracterizar a configuração regional do setor farmacêutico brasileiro, tendo por base as abordagens de sistemas regionais e setoriais de inovação. Para tanto, foram analisados dados secundários do setor produtivo e de ciência e tecnologia de cinco estados da federação – Rio de Janeiro, São Paulo, Goiás, Minas Gerais e Pernambuco. Os resultados indicam queda de participação do setor farmacêutico na atividade econômica de Rio de Janeiro e São Paulo, enquanto Goiás destacou-se pelo crescimento. Contudo, São Paulo e Rio permanecem em posição de destaque quanto à capacitação científica, abrigando maior número de instituições de pesquisa e cursos superiores e de pós-graduação voltados ao setor. As políticas estaduais refletem estratégias heterogêneas, mas que apresentam como ponto comum a concessão de diferentes modalidades de incentivos fiscais. O estudo apresentado identifica aspectos político-econômicos relevantes à elaboração de políticas públicas para o fortalecimento do setor farmacêutico, especialmente, no Rio de Janeiro.
Perfil socioeconômico de feirantes do Mercado Municipal de Campos dos Goytacazes
Authors: Aparecida Profeta Graciela , Chaffin Cezario Raquel , Cristina de Mattos Lima Elen , Da Silva Pereira Ney Vanuza
Published: July 2021

Esta pesquisa objetivou definir o perfil socioeconômico de feirantes de hortifrutícolas do mercado municipal de Campos dos Goytacazes, no estado do Rio de Janeiro. Para isso foram abordados aspectos relacionados ao canal de comercialização, o perfil e as características econômicas que diferenciam os feirantes, bem como uma pesquisa bibliográfica a fim de encontrar conceitos que possam definir o que seria perfil socioeconômico. Realizou-se ainda uma pesquisa de campo no mercado municipal de Campos dos Goytacazes com os feirantes do segmento hortifrutícolas. De maneira geral, os resultados obtidos apontaram que a renda mensal oriunda da feira era de extrema importância na composição da renda total da família,e, portanto, na sobrevivência das mesmas. Observou-se também que as condições socioeconômicas desses feirantes eram provenientes das atividades no mercado municipal da cidade, e que os feirantes não usavam os circuitos curtos de produção que garantiriam a comercialização da produção local e que isso, além de não lhes fornecer produtos diferenciados para a venda, ainda implicava em perda de receita, pois acabavam competindo em condições desiguais com os supermercados da cidade. Por fim, os feirantes também apontaram a necessidade de maior apoio do poder público para a melhoria das condições e da infraestrutura do local onde desenvolviam a atividade e também suporte no escoamento da produção.
Casa popular própria: ilusão ou solução?
Authors: Siqueira Gonçalves Bianca , Maria de Souza Almeida Coura Livia , Luis Vianna da Cruz José
Published: July 2021

O objetivo deste artigo é trazer elementos para a discussão do principal sonho de consumo da maioria dos brasileiros, a propriedade de um lugar para morar, com as possibilidades de efetivação do direito à cidade. De forma geral, discorre sobre a dinâmica capitalista na construção do espaço na cidade e como se organizam as estruturas urbanas. Especificamente, apura o papel e a importância da casa própria para o trabalhador brasileiro A metodologia utilizada foi uma revisão não sistemática da bibliografia sobre a origem da casa como mercadoria e objeto de desejo do trabalhador e sobre a questão da segregação sócioespacial à luz do Direito à Cidade. Os resultados evidenciaram a complexidade dos interesses em jogo.Buscou-se compreender o grau de relevância da propriedade da casa para o trabalhador brasileiro. Noutra trilha, foram analisados alguns aspectos importantes da estrutura e dinâmica da cidade, ressaltando o papel do planejamento urbano, e, neste, procurou-se reforçar as potencialidades possibilitando mitigar a segregação socioespacial.
Mulher, política e cidade: reflexões analíticas
Authors: Seixas de Sousa Aimée , Gabriela Scotto María
Published: July 2021

O objetivo do artigo é abordar, sem pretensão de esgotar o assunto, algumas temáticas e discussões que consideramos fundamentais para evidenciar nossa perspectiva analítica para a compreensão das relações entre mulheres, cidade, feminismo e participação em espaços de representação política. Este artigo é parte de uma pesquisa, ainda em andamento, cujo objetivo é analisar a presença feminina na política, mais especificamente na Câmara Municipal do Rio de Janeiro. Levando em conta a existência e a implementação das cotas eleitorais para mulheres, buscaremos pensar as relações entre a participação política e o direito à cidade sob a concepção de gênero. Neste trabalho, partiremos de uma revisão de literatura que traz uma exposição contextual, histórica e teórica acerca da presença feminina nas esferas representativas de poder. Não deixaremos de lado a análise dos termos conceituais e teóricos do direito à cidade paracompreendermos a questão do direito feminino à cidadania plena na vida das cidades.
Financiamento de Ciência e Tecnologia: Uma análise sobre a Região Sudeste
Authors: Lacopo da Silva Lívia , Terra Azevedo Filho Edson , Rego Monteiro da Hora Henrique
Published: July 2021

O presente estudo examina a distribuição de recursos financeiros dedicados à Ciência e Tecnologia (C&T) no Brasil, a evolução dos programas de pós-graduação e as características que sustentam a posição de destaque da Região Sudeste quanto à sua base de competências. A metodologia utiliza como método principal a estatística descritiva, já as tabelas são estruturadas segundo uma classificação temporal e geográfica e os gráficos elaborados em séries temporais de ordem cronológica. Foram utilizados dados até o ano 2015, em função de sua disponibilidade. De acordo com os resultados encontrados, a Região Sudeste ocupa uma posição central no financiamento federal. Em 2015 concentrava 53,3% do total dos aportes financeiros do Conselho nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico e 47,6% do total destinado pela Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. No período de 1996-2014 titulou 55,5% do número total de mestrados no Brasil e 71% do número total doutorados, com São Paulo sendo responsável pela concessão de quase 50% dos títulos de doutorado no país. Além disso, há uma tendência à desconcentração nos investimentos em C&T, entretanto o Sudeste ainda ostenta uma disparidade enorme nos recursos investidos, na formação de mestres e doutores e na oferta de programas de pós-graduação. Percebe-se também que mestres e doutores titulados na região Sudeste tendem a migrar para outros estados e estão empregados principalmente em entidade públicas.
Impactos causados pelo incremento da frota de veículos na cidade de Itaperuna/RJ
Authors: Rodrigues Ferreira Prata Diego Filipe , Tomazinho Bartolazzi Victor , Rocha Gonçalves Júnior Elias , Siqueira Gonçalves Virgínia , E Silva Neto Romeu
Published: July 2021

O objetivo do artigo é avaliar os principais impactos causados pelo aumento da frota de veículos automotores na cidade de Itaperuna, RJ, no período de 2005 a 2017, além de indicar os principais efeitos sobre a economia da cidade e as problemáticas associadas ao bem-estar da população. A metodologia baseou-se em levantamento de dados junto ao Departamento Nacional de Trânsito, Instituto Brasileiro de Geografia e Estatística, sobre a frota licenciada e Departamento de Informática do Sistema Único de Saúde, além da pesquisa em fontes bibliográficas. Grande proporção da população é de idade jovem, aumentando o potencial de pessoas economicamente ativas e com porte de veículos. No período de análise, a frota de veículos automotores cresceu132%. Não houve mudança nas estruturas das vias de acesso, ruas e avenidas, mesmo com o crescimento do fluxo de veículos. Com a inexistência de estacionamento rotativo municipal e a escassez do transporte público, grande parte dos trabalhadores se desloca de carro, fazendo com que a quantidade de vagas seja reduzida, afastando assim clientes. Há também engarrafamentos devido ao crescimento da rede de ensino superior que recebe estudantes de cidades próximas. Com isso, nota-se o aumento na quantidade de acidentes de carro, e como consequência o número de óbitos. Constatou-se que a relação de habitantes por veículos no município de Itaperuna é maior do que a média nacional. Conclui-se assim que é preciso realizar um planejamento urbano na construção diária da cidade, através de investimentos em infraestrutura, ciclovias, calçadas, corredores de ônibus e ampliação de avenidas e vias de acesso a partir da demanda da mobilidade.
Terceirização na administração pública: considerações para o estudo do caso da Universidade Federal Fluminense
Authors: Koch Thaís Castro , Mamani Hernán Armando
Published: July 2021

Este trabalho tem como principal esboçar vias analíticas que permitam interpretar o processo de terceirização da Universidade Federal Fluminense entre os anos de 1995 a 2019. A terceirização é uma forma de organização dos processos de trabalho, na qual as funções produtivas e administrativas utilizam total ou parcialmente mão de obra subcontratada. Nessa perspectiva, as transformações ocorridas no universo do trabalho, em detrimento da terceirização, também alcançaram o setor público no Brasil. Tal processo de terceirização, faz parte de um paradigma da flexibilidade, que ganhou maior escopo no país a partir da Reforma do Estado em 1995, proposta por Bresser Pereira durante o governo do Fernando Henrique Cardoso. Consideramos que a universidade pública apesar de sua autonomia cientifica e acadêmica, e de dispor de orçamento próprio permitiriam observar um fenômeno muito mais amplo: a definição dos processos de organização do trabalho do alto escalão do Estado - distantes dos processos fins e seus resultados, contribuindo para a ineficiência serviços. Nesse sentido a terceirização de atividades promovidas nas universidades públicas teria escassa reflexão sobre a qualidade de seus produtos, sobre a eficiência dos processos e sobre inovação na prestação de serviços.
Caracterização dos Principais Ativos do Sistema Regional de Inovação Fluminense e Desafios para uma Agenda de Desenvolvimento pós-COVID
Authors: Santos Guilherme De Oliveira , La Rovere Renata Lèbre
Published: July 2021

A severa crise econômica e social que afeta o Estado do Rio de Janeiro desde 2014 foi intensificada pelos efeitos trazidos pela crise sanitária iniciada em março de 2020. Esta convergência de crises restringe as possibilidades de desenvolvimento do estado. O estímulo à inovação e a resolução de desafios societais complexos são caminhos para a superação do atual cenário. Neste sentido, este artigo tem como objetivos: i) realizar uma caracterização dos principais ativos do Sistema Regional de Inovação fluminense, com base no levantamento de dados primários e secundários associado ao uso de estatística descritiva; ii) refletir, a partir dos resultados encontrados e de outros trabalhos de nossa autoria em parceria com colaboradores, sobre os desafios que o estado possui para construir uma agenda de desenvolvimento pós Covid-19. Os resultados apontam que o SRI possui ativos financeiros, humanos e tecnológicos relevantes, contudo precisa articular melhor os subsistemas de geração e aplicação do conhecimento; aumentar a taxa de inovação da economia; e se desprender da puramente lógica setorial e de vocações, utilizando seus ativos para elaborar uma política de inovação orientada por missões, que articule diversos atores e tecnologias e tenha como foco solução de grandes desafios societais por meio da geração, aplicação e difusão do conhecimento científico-tecnológico.
As prerrogativas dos Institutos Federais e a oferta educacional
Authors: Patrão de Aquino Carla Nogueira , Campinho Ana Lúcia Mussi de Carvalho , De Arruda Ana Paula Serpa Nogueira
Published: July 2021

O estudo tem, como objetivo, analisar a atuação do Instituto Federal Fluminense (IFFluminense) no Norte Fluminense (NF), um equipamento público de educação, ciência e tecnologia que traz, como missão, concorrer para o desenvolvimento local e regional. O recorte que se estabelece neste artigo, como um indicativo do “ir ao encontro” da sociedade como um vetor do desenvolvimento, é a oferta de formação técnica e tecnológica nos campi localizados nessa mesorregião. Assim, na escrita do artigo, apresenta-se, em linhas gerais, o pari passu da trajetória das instituições federais de educação profissional e tecnológica no contexto do crescimento brasileiro, com uma ênfase na constituição dos Institutos Federais e na expansão da Rede Federal, que proporcionou uma interiorização da oferta de formação. E, considerando a diversidade social e cultural e a diferenciação produtiva características dos municípios brasileiros, a exemplo do Norte Fluminense, pode-se falar também em vários interiores no interior do território brasileiro, caracterizados, muitas vezes, como núcleos urbanos que, contemplados com grandes investimentos, configuram-se, por um lado, como ilhas de prosperidade e, de outro, a periferia, os que se encontram fora do raio de alcance dos benefícios e que demandam ações em direções e sentidos diferentes, sendo esses territórios que dão sentido à presença de um Instituto Federal.
Happy hypoxia in COVID-19: pathophysiology and pulse oximetry accuracy
Authors: Wilson-Baig Noamaan
Published: July 2021

Many patients with COVID-19 have presented to emergency departments with arterial hypoxaemia but without breathlessness; this is called ‘happy hypoxia’ or, more accurately, ‘silent hypoxaemia’. Hypoxaemia needs to be identified correctly in patients with COVID-19 as it is associated with in-hospital mortality. The aetiology of silent hypoxia is unclear, and the pathophysiological processes involved in the relationship between the response to hypoxaemia and the sensation of dyspnoea may explain its clinical presentation. Pulse oximetry is used routinely to measure oxygen saturation. However, recent literature has questioned its accuracy in patients with COVID-19. Inaccuracies in readings, which arise for several reasons, could in part explain silent hypoxaemia. Caution should be taken when interpreting pulse oximeter readings or patients could be given a higher inspired oxygen fraction than necessary. Silent hypoxaemia may also mask disease severity in patients with COVID-19.
The emergency blues…
Authors: Price Jolyon
Published: July 2021

In this month's Student Column, Jolyon Price reflects on his choice to transition from acting to paramedicine, as well as everything he gave up, and everything he has gained
Vietnamese Students’ Satisfaction toward Higher Education Service: The Relationship between Education Service Quality and Educational Outcomes
Authors: Dinh Hong-Van Thi , Nguyen Quynh Anh Thi , Phan Mai-Huong Thi , Pham Kien The , Nguyen Tham , Nguyen Hung Thanh
Published: July 2021

Student satisfaction with education service has been considered one of the most critical strategic factors to attract students of higher education institutions around the world. Various models of satisfaction with education service quality have been developed to motivate actions towards improving the education quality. This study aimed to confirm a Vietnamese theoretical five-dimension model of student satisfaction with higher education service and investigate the relationship between student satisfaction with education service quality and student satisfaction with educational outcomes in this model. A cross-sectional survey on 2933 students from four-member universities of Hue University in Central Vietnam was conducted. The research results showed that the model of student satisfaction with education service in Hue University was consistent with the proposed theoretical model, which comprises five dimensions including access to education service, facilities and teaching equipment, educational environment, educational activities, and educational outcomes. In addition, the satisfaction of all dimensions of education service quality from dimension 1 to 4 affects the satisfaction of educational outcomes, of which educational activities have the most significant impact. This research result can provide a number of implications and recommendations for Hue University to implement appropriate measures to improve student satisfaction with education services received, thereby enhancing educational outcomes, attracting and retaining students.
Vector magnetic field sensor based on orthogonal off-set spliced optical fiber cladded with magnetic fluid
Authors: Hao Zijian , Pu Shengli , Li Yongxi , Li Dihui
Published: July 2021

Based on the anisotropic
distribution of magnetic nanoparticles within magnetic fluid under an
external magnetic field, a novel, to the best of our knowledge, vector
magnetic field sensor based on an orthogonal offset spliced optical
fiber structure cascaded with fiber taper has been proposed. The
expression of interference dip wavelength with respect to external
magnetic field is formulated, and the dual-parameter sensing matrix is
established. Simultaneous measurement of magnetic field intensity and
direction is realized. The corresponding physical principle is
clarified. The sensing properties are experimentally investigated and
theoretically verified. The theoretical results are in good agreement
with the experimental ones.
Experimental demonstration of pre-electronic dispersion compensation in IM/DD systems using an iterative algorithm
Authors: Wu Xiong , Karar Abdullah S. , Zhong Kangping , Lau Alan Pak Tao , Lu Chao
Published: July 2021

To combat chromatic dispersion (CD) in intensity modulation and direct detection (IM/DD) systems, three chirp-free demonstrations are experimentally performed with an iterative pre-electronic dispersion compensation (pre-EDC) algorithm at the transmitter end, for 28 GBaud non-return-to-zero on-off keying (NRZ-OOK), 56 GBaud NRZ-OOK and 28 GBaud four-level pulse-amplitude-modulation (PAM-4) signals, over distances of 100 km, 50 km and 40 km of single mode fiber (SMF), respectively. The iterative pre-EDC algorithm is based on the Gerchberg-Saxton (GS) algorithm, which treats the unconstrained phase at the direct detection receiver as a degree of freedom. At the receiver side, only a linear fractionally-spaced (T/2) post-feed-forward equalizer (post-FFE) is employed to combat the residual inter-symbol interference (ISI). Experimental results show that the aforementioned three demonstrations can approach the forward error correction (FEC) bit error rate (BER) threshold of 3.8 × 10−3 with (15 pre-EDC iterations and 5-tap post-FFE), (30 pre-EDC iterations and 15-tap post-FFE), and (10 pre-EDC iterations and 25-tap post-FFE), respectively. The results indicate the applicability of the pre-EDC algorithm in high-capacity IM/DD systems for transmission distances below 100 km of SMF.
Robust phase unwrapping algorithm for noisy and segmented phase measurements
Authors: Zong Yi , Duan Mingliang , Yu Caiyun , Li Jianxin
Published: July 2021

This paper proposes a robust phase unwrapping algorithm (RPUA) for phase unwrapping in the presence of noise and segmented phase. The RPUA method presents a new model of phase derivatives combined with error-correction iterations to achieve an anti-noise effect. Moreover, it bridges the phase islands in the spatial domain using numerical carrier frequency and fringe extrapolation thus eliminating height faults to enable solving segmented phase unwrapping. Numerical simulation and comparison with three conventional methods were performed, proving the high robustness and efficiency of the RPUA. Further, three experiments demonstrated that the RPUA can obtain the unwrapped phase under different noise accurately and possesses the capability to process segmented phases, indicating reliable practicality.
Phase-corrected buffer averaging for enhanced OCT angiography using FDML laser
Authors: Miao Yusi , Siadati Mahsa , Song Jun , Ma Da , Jian Yifan , Beg Mirza Faisal , Sarunic Marinko V. , Ju Myeong Jin
Published: July 2021

Megahertz-rate optical coherence tomography angiography (OCTA) is
highly anticipated as an ultrafast imaging tool in clinical settings.
However, shot-noise-limited sensitivity is inevitably reduced in
high-speed imaging systems. In this Letter, we present a coherent
buffer averaging technique for use with a Fourier-domain mode-locked
(FDML) laser to improve OCTA contrast at 1060 nm MHz-rate retinal
imaging. Full characterization of spectral variations among the FDML
buffers and a numerical correction method are also presented, with the
results demonstrating a 10-fold increase in the phase alignment among
buffers. Coherent buffer averaging provided better OCTA contrast than
the conventional multi-frame averaging approach with a faster
acquisition time.
Airborne temperature profiling in the troposphere during daytime by lidar utilizing Rayleigh–Brillouin scattering
Authors: Witschas Benjamin , Lemmerz Christian , Lux Oliver , Marksteiner Uwe , Reitebuch Oliver , Schäfler Andreas
Published: July 2021

The airborne measurement of a temperature profile from 10.5 km down towards ground (

≈

1.4

k
m

above sea level) during daytime by means of a lidar utilizing Rayleigh–Brillouin (RB) scattering is demonstrated for the first time, to our knowledge. The spectra of the scattered light were measured by tuning the laser (

λ
=
354.9

n
m

) over a 11 GHz frequency range with a step size of 250 MHz while using a Fabry–Perot interferometer as a spectral filter. The measurement took 14 min and was conducted over a remote area in Iceland with the ALADIN Airborne Demonstrator on-board the DLR Falcon aircraft. The temperature profile was derived by applying an analytical RB line shape model to the backscatter spectra, which were measured at different altitudes with a vertical resolution of 630 m. A comparison with temperature profiles from radiosonde observations and model temperatures shows reasonable agreement with biases of less than

±

2

K

. Based on Poisson statistics, the random error of the derived temperatures is estimated to vary between 0.1 K and 0.4 K. The work provides insight into the possible realization of airborne lidar temperature profilers based on RB scattering.
Crystal growth and spectroscopic analysis of Ho, Pr:Sc2O3 crystal for 2.9 μm mid-IR laser
Authors: Dong Jianshu , Zhao Hengyu , Cao Xiao , Wang Wudi , Xu Xiaodong , Wu Feng , Luo Ping , Wang Qingguo , Xue Yanyan , Xu Jun
Published: July 2021

Ho3+, Pr3+: Sc2O3 crystal was successfully grown by the TGT method. The spectroscopic properties of the crystal were analyzed. The absorption cross section of Ho, Pr: Sc2O3 at 636 nm was 1.58×10–20 cm2. J-O theory was applied to analyze the fluorescence properties of the grown crystal at 2.9 μm. The intensity parameters Ωt (t=2,4,6), radiative transition rates, branching ratios and radiative lifetime were calculated. Ho, Pr: Sc2O3 exhibited strong emission at 2110 nm and 2864 nm with a stimulated emission cross section of 2.4 × 10–21 cm2 and 4.2 × 10–21 cm2, respectively. The fluorescence lifetime of the Ho3+ 5I6 and 5I7 levels were measured to be 1.64 ms and 5.74 ms. These results show that the Ho, Pr: Sc2O3 crystal would be a potential laser material at the 2.9 μm region.
Bacterial communities of indoor surface of stingless bee nests
Authors: de Sousa Leandro Pio
Published: July 2021

Microbes have been identified as fundamental for the good health of bees, acting as pathogens, protective agent against infection/inorganic toxic compounds, degradation of recalcitrant secondary plant metabolites, definition of social group membership, carbohydrate metabolism, honey and bee pollen production. However, study of microbiota associated with bees have been largely confined to the honeybees and solitary bees. Here, I characterized the microbiota of indoor surface nest of four brazilian stingless bee species (Apidae:Meliponini) with different construction behaviors and populations. Bees that use predominantly plant material to build the nest (Frieseomelitta variaandTetragonisca angustula) have a microbiome dominated by bacteria found in the phylloplane and flowers such asPseudomonassp. andSphingomonassp. Species that use mud and feces (Trigona spinipes) possess a microbiome dominated by coliforms such asEscherichia coliand Alcaligenes faecalis.Melipona quadrifasciata, which uses both mud / feces and plant resin, showed a hybrid microbiome with microbes found in soil, feces and plant material. These findings indicate that indoor surface microbiome varies widely among bees and reflects the materials used in the construction of the nests.
An integrative network-based approach for drug target indication expansion
Authors: Han Yingnan , Wang Clarence , Klinger Katherine , Rajpal Deepak K. , Zhu Cheng
Published: July 2021

Background

The identification of a target-indication pair is regarded as the first step in a traditional drug discovery and development process. Significant investment and attrition occur during discovery and development before a molecule is shown to be safe and efficacious for the selected indication and becomes an approved drug. Many drug targets are functionally pleiotropic and might be good targets for multiple indications. Methodologies that leverage years of scientific contributions on drug targets to allow systematic evaluation of other indication opportunities are critical for both patients and drug discovery and development scientists.

Methods

We introduced a network-based approach to systematically screen and prioritize disease indications for drug targets. The approach fundamentally integrates disease genomics data and protein interaction network. Further, the methodology allows for indication identification by leveraging state-of-art network algorithms to generate and compare the target and disease subnetworks.

Results

We first evaluated the performance of our method on recovering FDA approved indications for 15 randomly selected drug targets. The results showed superior performance when compared with other state-of-art approaches. Using this approach, we predicted novel indications supported by literature evidence for several highly pursued drug targets such as IL12/IL23 combination.

Conclusions

Our results demonstrated a potential global approach for indication expansion strategies. The proposed methodology enables rapid and systematic evaluation of both individual and combined drug targets for novel indications. Additionally, this approach provides novel insights on expanding the role of genes and pathways for developing therapeutic intervention strategies.
Cryptococcal antigen carriage among HIV infected children aged 6 months to 15 years at Laquintinie Hospital in Douala
Authors: Kalla Ginette Claude Mireille , Mboumnyemb Josette Farida , Assob Jules Clément Nguedia , Ehouzou Mandeng Marcelle Nina , Kamgaing Noubi Nelly , Okomo Assoumou Marie Claire , Mbopi-Keou Francois-Xavier , Monebenimp Francisca
Published: July 2021

Background

Up to 15% of deaths of people living with HIV is attributable to meningeal cryptococcosis, with nearly 75% occuring in sub-Saharan Africa. Although rare in children, it is a major cause of morbidity and mortality in people living with HIV. A strong association between cryptococcal antigenemia and the development of meningeal cryptococcosis has been shown in adults. Thus, in 2018, the World Health Organization published an updated version of its guidelines for the diagnosis, prevention and management of cryptococcal infection in adults, adolescents and the HIV-infected child.

Goal

To determine the prevalence of cryptococcal antigenemia and to identify its determinants in children infected with HIV.

Methods

An analytical cross-sectional study was carried out at the approved treatment center of Laquintinie hospital in Douala over a period of 4 months. Children were recruited consecutively after informed parental consent. Cryptococcal antigenemia and CD4 assay were performed using a Cryptops® immunochromatographic rapid diagnostic test and flow cytometry, respectively. The data collected included the socio-demographic, clinical and paraclinical variables of the children, as well as their antecedents. Data analysis was performed using Epiinfo software version 3.1 and SPSS 21.0. The significance threshold was set at 5%.

Results

A total of 147 children were enrolled. The mean age was 9.8 ± 4.09 years. The majority were on antiretroviral therapy (142, 96.60%). Only 13 (8.80%) were in severe immunosuppression. No child showed signs of meningeal cryptococcosis. The prevalence of cryptococcal antigenemia was 6.12%. Severe immunosuppression [OR: 10.03 (1.52–65.91), p = 0.016] and contact with pigeons [OR: 9.76 (1.14–83.65), p = 0.037] were independent factors significantly associated with the carriage of the cryptococcal antigen.

Conclusion

We recommend screening for cryptococcal antigenemia and routine treatment with fluconazole of all HIV positive children with cryptococcal antigen whether symptomatic or not.
The KrasG12D;Trp53fl/fl murine model of undifferentiated pleomorphic sarcoma is macrophage dense, lymphocyte poor, and resistant to immune checkpoint blockade
Authors: Hildebrand Karys M. , Singla Arvind K. , McNeil Reid , Marritt Kayla L. , Hildebrand Kurt N. , Zemp Franz , Rajwani Jahanara , Itani Doha , Bose Pinaki , Mahoney Douglas J. , Jirik Frank R. , Monument Michael J.
Published: July 2021

Sarcomas are rare, difficult to treat, mesenchymal lineage tumours that affect children and adults. Immunologically-based therapies have improved outcomes for numerous adult cancers, however, these therapeutic strategies have been minimally effective in sarcoma so far. Clinically relevant, immunologically-competent, and transplantable pre-clinical sarcoma models are essential to advance sarcoma immunology research. Herein we show that Cre-mediated activation ofKrasG12D, and deletion ofTrp53, in the hindlimb muscles of C57Bl/6 mice results in the highly penetrant, rapid onset undifferentiated pleomorphic sarcomas (UPS), one of the most common human sarcoma subtypes. Cell lines derived from spontaneous UPS tumours can be reproducibly transplanted into the hindlimbs or lungs of naïve, immune competent syngeneic mice. Immunological characterization of both spontaneous and transplanted UPS tumours demonstrates an immunologically-‘quiescent’ microenvironment, characterized by a paucity of lymphocytes, limited spontaneous adaptive immune pathways, and dense macrophage infiltrates. Macrophages are the dominant immune population in both spontaneous and transplanted UPS tumours, although compared to spontaneous tumours, transplanted tumours demonstrate increased spontaneous lymphocytic infiltrates. The growth of transplanted UPS tumours is unaffected by host lymphocyte deficiency, and despite strong expression of PD-1 on tumour infiltrating lymphocytes, tumours are resistant to immunological checkpoint blockade. This spontaneous and transplantable immune competent UPS model will be an important experimental tool in the pre-clinical development and evaluation of novel immunotherapeutic approaches for immunologically cold soft tissue sarcomas.
Availability of essential medicines in Pakistan—A comprehensive document analysis
Authors: Rafi Sunaina , Rasheed Huma , Usman Muhammad , Nawaz Hafiz Awais , Anjum Syed Muneeb , Chaudhry Mamoona , Babar Zaheer-Ud-Din
Published: July 2021

Introduction

Access to essential medicines (EMs) is a basic human right. Non-availability and shortages of EMs are reported for Pakistan but there is insufficient data to define the nature and magnitude of this problem. The current study is designed to systematically analyze the medicines included in the National Essential Medicines List (NEML) for their availability through comprehensive document analysis.

Methods

An expanded list of medicinal items was developed using the NEML of Pakistan (2018) to enlist individual medicines with their specifications. Registration status of the medicines was searched using three publicly accessible information sources; Pharmaguide 25thEdition, 2018–19, the on-line Drug Information System, and the Mobile Application Pharmapedia followed by a later 3-step validation of the data. The unregistered EMs were then further categorized into three subgroups in accordance with their possible remedial strategies.

Findings

The 19 studied categories comprised 690 EMs and it was found that 179 (26%) of these EMs don not have a registration status. However, it was also identified that the availability of 47 (26.2%) out of 179 unregistered EMs can be enssured by strengthening compounding services, and prioritizing registration of age-appropriate formulations. Availability of another 39 (21.7%) such medicines can be ensured by revising the NEML or the product registrations for the slight differences in their different specifications. The categories showing high proportion of unregistered medicines included anti-Parkinson’s medicines (100%), antidotes and other substances used in poisoning (60%), diuretics (47%), anticonvulsants/antiepileptics (42%), hormones and other endocrine medicines and contraceptives (38%), medicines for mental and behavioral disorders (30%), anti-infectives (27%), medicines for pain and palliative care (26%), medicines for neonatal care (25%), medicines for diseases of joint (25%), gastrointestinal medicines (24%) and cardiovascular medicines (15%).

Conclusion

The study shows the absence of registration status of a significant number of EMs in Pakistan. This could be major barrier in their access. Strategies are needed to strengthen the processes of their registration on priority basis.
No evidence of host-specific egg mimicry in Asian koels
Authors: Nahid Mominul Islam , Fossøy Frode , Stokke Bård G. , Abernathy Virginia , Begum Sajeda , Langmore Naomi E. , Røskaft Eivin , Ranke Peter S.
Published: July 2021

Avian brood parasitism is costly for the host, in many cases leading to the evolution of defenses like discrimination of parasitic eggs. The parasite, in turn, may evolve mimetic eggs as a counter-adaptation to host egg rejection. Some generalist parasites have evolved host-specific races (gentes) that may mimic the eggs of their main hosts, while others have evolved ‘jack-of-all-trades’ egg phenotypes that mimic key features of the eggs of several different host species. The Asian koel (Eudynamys scolopaceus) is a widely distributed generalist brood parasite that exploits a wide range of host species. Based on human vision, previous studies have described Asian koel eggs as resembling those of its main host, the house crow (Corvus splendens). Using measurements of egg length and breadth, digital image analysis, reflectance spectrophotometry and avian visual modelling, we examined Asian koel egg variation and potential mimicry in egg size and shape, and eggshell pattern and color in three sympatrically occurring host species in Bangladesh: the common myna (Acridotheres tristis), house crow, and long-tailed shrike (Lanius schach). We found some differences among Asian koel eggs laid in different host nests: a) Asian koel eggs in long-tailed shrike nests were larger than those laid in common myna and house crow nests, and b) Asian koel eggs in house crow nests were less elongated than those in common myna nests. However, these changes in Asian koel egg volume and shape were in the opposite direction with respect to their corresponding host egg characteristics. Thus, our study found no evidence for Asian koel host-specific egg mimicry in three sympatrically occurring host species.