bluuebunny/crossref_metadata_2025 huggingface dataset:
Identification of 1q21.1 microduplication by microarray analysis in a boy with intellectual disability
Authors: Pinto Irene Plaza , Minasi Lysa Bernardes , Silva Cláudio Carlos da , Cruz Aparecido Divino da
Published: January 2023

Chromosomal 1q21.1 region is structurally complex with a presence of large paralogous segmental duplications that make this region susceptible to non-allelic homologous recombination causing a spectrum of recurrent rearrangements, including deletions and duplications. Chromosome 1q21.1 Duplication Syndrome (MIM612475) is a rare genomic disorder caused by microduplications of an approximately 1.35 Mb and includes at least 12 genes. This syndrome has been associated with variable phenotypes including intellectual disability, autism, dysmorphic features, macrocephaly, congenital heart anomalies or normal phenotype. Herein, we report the first case of a boy who presented intellectual disability, behavior disorder, clinodactyly, facial dysmorphism such as frontal bossing and hypertelorism, and low-set ears with paternal inherited 1q21.1 microduplication in Central Brazil. Karyotyping at > 550 band resolution showed a male karyotype (46,XY). Chromosomal Microarray Analysis (CMA) using GeneChip® CytoScanHDTM array revealed paternal inherited 1.92 Mb microduplication at 1q21.1q21.2 (145,895,746-147,819,294) x3, encompassing 13 morbid genes (NBPF10, HYDIN2, NBPF12, PRKAB2, FMO5, CHD1L, BCL9, ACP6, GJA5, GJA8, GPR89B, NBPF11, and NBPF8). Duplication at 1q21.1 region has been reported in phenotypically affected individuals and apparently normal carriers. We detected microduplication at 1q21.1 in an affected boy who his father is asymptomatic. CHD1L gene has been involved with chromatin remodeling as well as DNA damage response and chromatin remodeling has been implicated in developmental and intellectual disability disorders. The HYDIN2 gene, a paralogous segment of the primary ciliary dyskinesia-associated gene HYDIN is exclusively expressed in the brain, and dosage sensitivity of HYDIN2 gene was responsible for the variation in head circumference. NBPF10, NBPF12, NBPF11 and NBPF8 genes are member of the neuroblastoma breakpoint family (NBPF) and copy number variations involving these genes have been implicated in a number of developmental and neurogenetic diseases. The CMA was a powerful and efficient method to identify at the first time in Central Brazil the 1q21.1 microduplication in a boy with intellectual disability and dysmorphic features. Furthermore, it is recommended the family to do genetic counseling to provide information and help to understand about the penetrance and variable expressivity related to this syndrome, the familial implications of genetic contribution to disease and the chance of disease recurrence.
Identification of deletions and duplications in the CYP2E1 gene in a population in Goiânia – GO by MLPA.
Authors: Pereira Lucas Carlos Gomes , Bérgamo Nádia Aparecida , Silveira-Lacerda Elisângela de Paula
Published: January 2023

Human CYPs are important in physiology, drug metabolism, and pathogenesis of certain diseases, and there is a strong need to explore the genetic variations and regulatory mechanisms of these enzymes. Mutations in CYP genes leading to deficiency in the enzymes result in a wide spectrum of human diseases. The aim of the present study was to investigate, the importance of CYP2E1 genetic polymorphisms in the health population in Goiânia. The study was performed acording approved by the ethics committee of Federal University of Goias (approval CEP: 895.552). In the current survey, 100 patients (35M/65F) of both genders and aged 18-90 (M: 30.2) years old were enrolled after receiving their informed consent. The Multiplex ligation-dependent probe amplification (MLPA) was performed using the P128 CYP450 MLPA kit (Version C1; MRC-Holland, Amsterdam, The Netherlands) according to the manufacturer’s instructions. This gene is located on chromossome 10 and has 9 exons, but only 3 (5, 6 and 8) were analyzed. In the exon 5 was found (2 duplications and 3 deletions), exon 6 (2 duplications and 2 deletions) and the exon 8 (3 duplications and 2 deletions). This gene is the second responsible for the metabolism of alcohol in the body, after the enzyme alcohol dehydrogenase and therefore the importance of checking what these deletions and duplications can cause in the body. Is the first time this methodology is used, and we believe it is a great tool for future studies with other genes.
Impacto da inibição de survivina na heterogeneidade e instabilidade cromossômica em glioblastoma
Authors: Gomes Ilze Mari Olivi , Martins Rafael Fernandes , Oliveira Leilane Sales de , Tavares Eduardo José Soares , Horvath Renato de Oliveira , Ionta Marisa , Castro Gamero Angel Maurício
Published: January 2023

Survivina é uma proteína membro da família de inibidores de apoptose que apresenta elevada expressão em diversos tumores malignos, sendo considerada um potencial alvo terapêutico, principalmente em Glioblastoma (GBM). GBM é o tumor maligno mais comum do sistema nervoso central em adultos, sendo invasivo e metastático, além de possuir altos níveis de instabilidade cromossômica (CIN). Os objetivos deste trabalho foram identificar o perfil cariotípico de células de GBM e avaliar os efeitos do inibidor transcricional de Survivina, o Ácido Tetra-O-metil Nordihidroguaiarético (M4N), sobre a proliferação, heterogeneidade citogenética e perfil CIN. Para isso, 10x103 células da linhagem celular de GBM humano U251 foram semeadas em placas de 96 poços a 37°C e 5% de CO2. Após 24 horas, as células foram tratadas com 0?M, 5?M, 10?M, 20?M, 40?M, e 60?M de M4N. Posteriormente, foram obtidas as curvas dose-resposta nos tempos de 24, 48 e 72 h, utilizando o reagente Rezasurina. Diferenças estatísticas (p<0.05) foram determinadas utilizando o software GraphPad Prism 5®. Para a análise citogenética, culturas celulares 75% confluentes foram expostas a 5mg/mL de colchicina por 6 h, tripsinizadas, coletadas para hipotonização com KCl (0,75 M) e fixação com ácido acético:metanol (1:3). Após o bandeamento GTG, dezenove células metafásicas foram fotografadas e analisadas utilizando o software GeneAll® de acordo com o critério da ISCN (2016). Resultados preliminares apontam a dose sub-letal de 10?M no tempo de 48 h para futuras análises cariotípicas. Citogeneticamente, as células de U251 foram caracterizadas pela presença de células hipo e hiperdiploides com um número cromossômico modal entre 43 e 48 cromossomos, apresentando monossomias, principalmente dos cromossomos 10, 15, 18 e 20, rearranjos estruturais envolvendo o cromossomo 11, além da presença de múltiplos cromossomos marcadores (1~8), resultando na fórmula cromossômica: 43~48, XY, -Y [8], -6[4], -7[9], -8[4], -9[6], -10[10], der (1) t (11?) p (12, ?) [19], der (11) t(11,?) p (14, ?) [8], -11[3], -14[6], - 15[12], -16[3], -17[3], -18[14], +19[2] -19[3], -20[10], -21[5], -22[8], +1~8mar[cp19]. Estes resultados demonstram alto nível de heterogeneidade citogenética presente nas células U251, a mesma que poderia se ver afetada após a inibição transcricional da survivina, produzida pelo M4N.
Isolamento, caracterização e mapeamento físico do elemento retrotransponível non-LTR REX3 no cariótipo de populações de Ancistrus da bacia do Rio Paraná
Authors: Prizon Ana Camila , Bruschi Daniel Pacheco , Gazolla Camilla Borges , Borin Luciana Andreia , Cius Andrea , Lemos Layon Zafra , Ranucci Leandro , Lupepsa Luara , Barbieri Pablo Americo , Nascimento Stéphanie Getsaian , Oliva Julio Henrique , Portela Castro Ana Luiza de Brito
Published: January 2023

Transposons e retrotransposons (ETs) representam uma grande porção do genoma eucariótico e diferentes linhas de evidência reportam uma massiva presença dessas sequencias no genoma de peixes. Atribui-se a esses elementos um significativo papel para a evolução dos genomas e na diversificação cariotípica em eucariotos. O gênero Ancistrus é um interessante candidato às investigações dessa natureza, visto que extensa variação cromossômica tem sido reportada. Visando a compreensão da distribuição e comportamento do elemento retrotransponível Rex 3 no gênero Ancistrus e melhor entendimento da organização genômica nesses representantes, o presente estudo objetivou isolar, caracterizar e mapear cromossômicamente o ET Rex 3 no genoma de diferentes populações de Ancistrus sp. coletados em diversos rios da bacia do rio Paraná, no estado do Paraná. O ET foi isolado através da amplificação com os primers para Rex 3 e revelou resultado positivo gerando fragmentos de aproximadamente 500 pb para as dez populações analisadas. Experimentos de hibridação in situ fluorescente foram realizados em 6 populações utilizando como sonda o ET Rex 3 isolado de uma espécime de Ancistrus sp. do rio Keller. O mapeamento físico revelou sinais fluorescentes dispersos pelos cromossomos de todas as populações de Ancistrus analisadas, sendo observados clusters desse elemento em alguns pares cromossômicos associados com blocos de heterocromatina previamente detectados. Não foram observados sinais de hibridação acumulados nos cromossomos sexuais heteromórficos (XX/XY) das populações de Ancistrus sp. rio Keller e Córrego 19. A análise das sequências nucleotídicas das cópias isoladas do genoma das populações de Ancistrus revelaram alta similaridade com sequências desse mesmo elemento depositadas no banco de dados online CENSOR. O alinhamento da sequência de aminoácidos presumida com Xiphophorus maculatus revelaram domínios da transcriptase reversa altamente conservados e íntegros, o que sugere que esse elemento é potencialmente ativo nesse genoma e pode ter contribuído no espalhamento das cópias detectadas por FISH. As populações de Ancistrus apresentam grande variação quanto ao padrão de heterocromatina e a presença de ETs Rex 3 em alguns dos blocos sugerem sua participação na dispersão dos mesmos. Nossos dados permitem a formulação de hipóteses sobre os mecanismos de diversificação cariotípica no gênero Ancistrus, envolvendo efetivamente esses elementos.
Karyology of Agapanthus africanus (L.) Hoffmanns (Agapanthaceae)
Authors: Souza Flávia Rangel de , Campos Victória Rabelo , Franco Ana Luiza , Reis Aryane Campos , Viccini Lyderson Facio , Sousa Saulo Marçal de
Published: January 2023

The genus Agapanthus L'Héritier (Agapanthaceae) is a monocotyledonous, herbaceus and perennial plant group endemic to southern Africa. Ten species have been described for this group, in which three are considered evergreen and seven deciduous plants.  Nevertheless, Agapanthus L'Héritier taxonomy is considered very difficult once there are few unique characters and a high plasticity depending on circumstances of growing. This feature takes some authors to believe in the existence of only one species with innumerous varieties.The cytogenetic has been an important tool to aid the plant taxon identification, and to date, all taxa of Agapanthus L'Héritier studied cytologically presented 2n = 30. Although the species possess large chromosomes, few karyological studies has been explored. This work aimed to increase the cytogenetic knowledge of Agapanthus africanus (L.) Hoffmanns by chromosome banding techniques with DAPI / CMA3 and Fluorescent in situ Hybridization (FISH). In addition, flow cytometry was used to determinate   DNA content and the percentage of AT / GC nitrogenous bases. Plants studied showed 2n = 30 chromosomes, ranging from 4.34 - 8.55 µm, with karyotype formulae (KF) = 10m + 5sm. The FISH technique revealed one 45S rDNA signal observed proximally to centromere of the chromosome 7, and one 5S rDNA signal observed proximally to centromere of chromosome 9. The 2C DNA content estimated for the species was 2C = 24.4pg, with 59% of AT and 41% of GC. Our data allowed important upgrade for biology and cytotaxonomy of Agapanthus africanus (L.) Hoffmanns, and will be used to future taxonomic and phylogenetics studies, as well as for the chromosome evolution of the genus. APOIO FINANCEIRO: Fapemig, Capes, CNPq
Karyotype and pollen features on the endemic species Calydorea crocoides Ravenna (Iridaceae)
Authors: Tacuatiá Luana Olinda , Alencar Juliana Lustosa Matos de , Forni Martins Eliana , Souza Chies Tatiana Teixeira de , Kaltchuk Santos Eliane
Published: January 2023

Calydorea crocoides is distributed predominantly in Southern Brazil, occurring in a restricted area at altitudes ranging from 800 to 1500 m. The species is in the red list of threatened species of the International Union for Conservation of Nature (IUCN), however conservation measures specifically are unknown. Although cytogenetic data provide useful information for species characterization in Iridaceae, scarce cytological data are available for this species. In the present work, populations of C. crocoides from Southern Brazil were characterized from the point of view of chromosome number and morphology, number and position of heterochromatic CMA/DAPI bands, as well as of pollen morphology and viability. Mitotic analyses were performed with plants from five populations. All accessions have basic chromosome number x = 7. Although polyploid species are known for the genus, only diploid individuals (2n = 2x = 14) were found for all populations. The karyotype is reasonably bimodal in which two pairs of chromosomes are large and five are progressively smaller. The haploid karyotype formula is 5m (1sat) + 2sm. Calydorea crocoides is rather low asymmetric (Stebbins' category 2A) contrasting with other species of Tigridieae. Heteromorphism was observed in the chromosome pair I with a significant difference of total length between homologues. CMA/DAPI chromosome banding of C. crocoides was evaluated for the first time. All pairs of chromosomes presented pericentromeric regions with AT-rich DNA (CMAo/DAPI+). CMA+ bands were on the short arm of both chromosomes of pair VII. One population presented heterozigosity in this pair, indicating a pericentric inversion. Regarding the pollen grains stainability, all populations showed values above 90%, indicating regular meiotic behavior. Two types of pollen grains were found: prolate spheroidal and oblate spheroidal. Our cytological data showed that C. crocoides is a diploid species and, differently of most species of its tribe, did not experienced polyploidy or dysploidy events. We emphasize here the high viability pollen grains in C. crocoides indicating a potencial sexual reproduction that could help its maintenance in natural fields. This data coupled to genetic variability study ongoing by our team may provide important information for conservation measures of this species.
Marcadores protéicos de sinapse e dinâmica de quebras de DNA programadas em meiose aquiasmática do Escorpião T. silvestris (Scorpiones: Buthidae)
Authors: Almeida Bruno Rafael Ribeiro de , Noronha Renata Coelho Rodrigues , Nagamachi Cleusa Yoshiko , Pieczarka Júlio Cesar
Published: January 2023

Análises meióticas realizadas em escorpiões Buthidae, por microscopia óptica e eletrônica, demonstraram bivalentes holocinéticos, heterosinápticos e com ausência de quiasmas e nódulos de recombinação durante a meiose do macho. No presente estudo analisamos o mecanismo sináptico e a dinâmica de quebras programadas de cadeias de DNA na meiose do butídeo Tityus silvestris por imunofluorescência. Preparações meióticas fixadas em paraformaldeído 2%, foram submetidas à imunodetecção com anticorpos primários anti-SMC3 e anti-?H2AX, bem como Imuno-FISH com sonda telomérica de artrópodes (TTAGG) e anti-SMC3. Nossos resultados demonstraram que o cariótipo de Tityus silvestris apresenta 2n = 24, com morfologia holocêntrica e ausência de cromossomos sexuais heteromórficos. Imuno-FISH com sonda telomérica e anti-SMC3 (que detecta eixos axiais/laterais do complexo sinaptonêmico) permitiu analisar a progressão da sinapse neste escorpião: em leptóteno, a coesina SMC3 apresenta-se na forma de pontuações e curtos filamentos; no início do zigóteno, cromossomos são organizados em configuração bouquet, e a sinapse inicia-se a partir das regiões teloméricas; em paquítenos iniciais, gaps foram observados ao longo de alguns complexos sinaptonêmicos; em paquítenos tardios, a sinapse completa-se, permitindo individualizar os 12 bivalentes; finalmente, em células pós-paquitênicas, o eixo SMC3 localiza-se centralmente ao longo de cada bivalente até Metáfase I. Em relação aos eventos iniciais do processo de recombinação, quebras de cadeias duplas de DNA (evidenciadas por ?H2AX) iniciam-se em núcleos pré-leptóteno. A variante histônica ?H2AX é localizada sobre eixo SMC3, distribuindo-se de acordo com o avanço da sinapse em zigóteno e desaparecendo no final do Paquíteno. Nossos resultados mostraram que na meiose de T. silvestris, formação de quebras programadas de DNA ocorrem antes do início da sinapse, diferindo do padrão observado em Drosophila melanogaster e C. elegans. A ocorrência de ?H2AX durante a meiose aquiasmática deste escorpião sugere que quebras de cadeia dupla de DNA durante a prófase I, sejam reperadas por um mecanismo distinto ao da recombinação homóloga. Finalmente, apesar da aparente ausência de recombinação, o reparo de quebras de DNA programadas é necessário para o progresso normal da meiose em T. silvestris.
Microsporogênese e microgametogênese em Schoenoplectus californicus (C. A. Mey.) Soják.
Authors: Johnen Lucas , Reutemann Andrea Guadalupe , Rocha Danilo Massuia
Published: January 2023

A família Cyperaceae é a terceira maior das monocotiledôneas. Seus representantes apresentam uma microsporogênese não usual, em que os microsporócitos culminam em tétrades assimétricas, e apenas uma célula funcional, conhecida como pseudomônade. Na microgametogênese, a célula funcional origina as células vegetativa e generativa do grão de pólen, enquanto as três restantes são abortadas por PCD. Este é um exemplo peculiar de diferenciação de três linhagens celulares em uma mesma estrutura envolta por parede vegetal, cujas fases desse desenvolvimento foram parcialmente documentadas. Nesse sentido, ainda não foram esclarecidas como se dá a seleção dos núcleos degenerativos, tampouco a contribuição do citoesqueleto neste processo. Neste trabalho, foi obtido um registro completo do desenvolvimento das pseudomônades utilizando citoquímica com nitrato de prata em Schoenoplectus californicus. Para isso, anteras foram fixadas em diferentes estágios de desenvolvimento em etanol: ácido acético (3:1, v:v), lavadas e impregnadas com AgNO3 a 50%. Lâminas foram preparadas por esmagamento e observadas ao microscópio de luz. Durante a microsporogênese dessa espécie, os cromossomos separam-se regularmente na anáfase I, mas de maneira irregular entre os pares de núcleos durante a anáfase II. Nesse caso, um dos pares de núcleos se distanciam mais entre si do que o outro par. Após a telófase II, o microsporócito assimétrico apresentou quatro células, cada uma com um nucléolo evidente. Foi observada também uma diferença de tamanho entre os núcleos direcionados à região degenerativa (menor), em relação àquele que seria funcional (maior). Na microgametogênese, cinco núcleos foram observados, também em uma estrutura assimétrica. Neste caso, os núcleos vegetativos e generativos exibiram nucléolos evidentes, embora os núcleos degenerativos tenham se destacado pelo tamanho reduzido. A presença de nucléolos nas células degenerativas até estágios avançados de desenvolvimento indica um metabolismo provavelmente voltado à morte celular programada. Dados similares foram levantados em Rhynchospora, um gênero filogeneticamente distante de Schoenoplectus. Isso sugere que o processo de formação do grão de pólen é conservado na família, constituindo em uma sinapomorfia. Estudos similares estão sendo conduzidos para espécies de outros gêneros de Cyperaceae, para buscar se há outras particularidades desse processo em um contexto filogenético.
Natureza molecular da heterocromatina no cariótipo de uma população polimórfica de Hypostomus regani (Pisces, Loricariidae)
Authors: Gazolla Camilla Borges , Prizon Ana Camila , Oliva Júlio Henrique , Ferreira Greicy Ellen de Brito , Bruschi Daniel Pacheco , Carvalho Luciana Andréia Borin de , Portela Castro Ana Luiza de Brito
Published: January 2023

Hypostomus (Loricariidae) destaca-se na família pela grande diversidade cariotípica numérica (2n=64-84) e estrutural, envolvendo diferenças nas fórmulas cromossômicas até mesmo dentro da mesma espécie. Esta variabilidade pode ser melhor avaliada com a utilização de diferentes marcadores cromossômicos, os quais revelam uma diversidade críptica neste grupo. Estudos prévios em uma população de H. regani coletada no rio Taquari (bacia do rio Paraguai, Coxim, MS) revelaram 2n=72 cromossomos, porém, dois cariomorfos, sendo cariomorfo A com 12m+14sm+18st+28a e no cariomorfo B, 13m+14sm+17st+28a. O cariomorfo B é caracterizado por um intrigantante heteromorfismo de tamanho envolvendo o par cromossômico 19, constituído por um homólogo subtelocêntrico e por um cromossomo metacêntrico grande, o maior do complemento. Essa condição é observada em 43,74% de nossa amostra e independe do sexo do indivíduo analisado. O metacentrico apresentou o braço curto totalmente heterocromático (banda C positivo) e sequências ricas em CG, reveladas por CMA3. Portanto, o presente estudo tem como objetivo, complementar os dados sobre a natureza molecular da heterocromatina nos cromossomos de H. regani, com ênfase  no par heteromórfico, através do FISH com sequências de microssatélites (GA)15 e (CA)15. Foram evidenciados clusters de repetições (CA)15 principalmente nas regiões subterminais e pericentroméricas na maioria dos cromossomos do complemento. Adicionalmente, detectamos sinais discretos de hibridação na região insterticial de ambos os braços e marcações nas regiões subterminais no par de cromossomos que contém o cromossomo heteromorfo. Clusters de (GA)15  foram evidenciados nas regiões subterminais e pericentricas de vários cromossomos, destacando-se marcações subterminais, e no par 19 com o cromossomo heteromórfico, observou-se clusters  em ambas regiões subterminais e uma discreta marcação intersticial no braço longo do heteromorfo. Estes resultados contribuem com dados sobre a  composição molecular heterogênea da heterocromatina no genoma desta espécie e revela importante papel dos elementos repetitivos na evolução cariotípica da mesma.Apoio financeiro: CAPES-PBC/UEM
Next-generation sequencing analysis reveals novel insights of B chromosome evolution of the grasshopper Abracris flavolineata
Authors: Milani Diogo , Cabral de Mello Diogo Cavalcanti
Published: January 2023

B chromosomes are additional elements in a normal karyotype that has been considered frequently as parasitic and dispensable. These elements do not recombine with A chromosomes, could be accumulated and present non-mendelian patterns of inheritance. In most of the cases they comprise an enrichment of heterochromatic repetitive DNA, such as Satellite DNAs (satDNA). To contribute to understanding about origin, composition and evolutionary patterns of B chromosome in the grasshopper Abracris flavolineata, in this work we characterized through Illumina sequencing and graph-based clustering the most abundant tandem repeats of A. flavolineata, karyotype 2n = 22,X0+B?.The analyses revealed the occurrence of ten families of satDNAs comprising about 6.279% of the male genome harboring one B chromosome. For the X chromosome and autosomes, distinct patterns of hybridization was observed between the satDNAs showing variability among them, like scattered blocks on euchromatic areas or specific ones on heterochromatic regions of the chromosomes. Five of the satDNAs recovered were distributed on centromeric and both terminal regions of the B chromosome, reinforcing the hypothesis of B chromosome origin through isochromosome formation. Two satDNA families were located only in centromere, while three families were not present in B chromosome. CL220 satDNA was the unique family shared between the B chromosome and only one A element, the chromosome 1, supporting strongly the hypothesis of its origin from this autosomal pair, also noticed previously by U2 snDNA mapping. In addition, this analysis provides new information regarding the composition and evolution of B chromosome of A. flavolineata. Furthermore, the non-spreading and specific location of satDNAs and other repetitive sequences restrict to telomeres and centromere reinforces the possible idea that this B chromosome could harbor unknown euchromatic sequences along chromosomal arms and do not present intense amplification of heterochromatic ones, as have been commonly described for other species.
Número cromossômico do cruzamento de Catassetum (Dragon’s x pileatum) (Orchidaceae)
Authors: Macedo Weslaine de Almeida , Santos Bruna Natália Veloso dos , Mello Vanessa dos Santos de , Leite Douglas Machado , Karsburg Isane Vera
Published: January 2023

O gênero Catasetum Rich. ex Kunth, Orchidaceae, destaca-se dos demais grupos por apresentar  dimorfismo sexual e também pelo mecanismo de disparo das  polínias quando em contato com alguma estrutura externa. Para este gênero, estudos mostram que há uma ampla diversidade morfológica, numérica e cromossômica. A hibridação interespecífica é um dos principais aspectos responsáveis por esta vasta diversidade. Pela relevância do gênero poucos estudos referentes aos híbridos do gênero, este trabalho objetivou-se determinar o número cromossômico do híbrido oriundo do cruzamento de Catassetum (Dragon’s x pileatum). O presente trabalho foi realizado no Laboratório de Citogenética e cultura de Tecidos Vegetais, na Universidade do Estado de Mato Grosso, utilizou-se meristemas radiculares de um híbrido obtido do cruzamento de Catasetum (Dragon’s x pileatum), foram submetidas ao processo de bloqueio permanecendo em solução de Amiprofos-metyl 3µM APM  durante um período que variou de 12 a 18 horas a uma temperatura de 4ºC e fixadas em solução metanol-ácido acético (PA) em uma proporção de 3:1 sob as mesmas condições de temperatura, sendo posteriormente transferidas para tubos do tipo Eppendorf® contendo 200?L de enzima Pectinase SIGMA® à 100%, permanecendo por 5 horas a 35ºC em banho-maria. As lâminas foram preparadas pela técnica de dissociação celular, secagem ao ar e em placa aquecedora a 50ºC e submetidas à solução Giemsa a 5% por 3 minutos. As imagens com cromossomos bem distribuídos e sem sobreposições nas lâminas foram fotografadas com o uso de objetiva de 100x em um microscópio fotômico binocular (Leica ICC 50) acoplado a um computador e no software LAZ EZ V1. 7.0. O híbrido estudado apresentou o número de 2n=36 3µM cromossomos, corroborando assim com a média apresentada na literatura sobre o gênero e seus híbridos provenientes (2n=40 à 2n=162). Sendo assim, o número cromossômico encontrado pode oferecer informações necessárias para contribuir com estudos de melhoramento e também de variações genéticas que são ocorrentes dentro do gênero Catasetum.
Número cromossômico permite distinguir duas espécies de Hyperophora de Mato Grosso do Sul (Tettigoniidae: Phaneropterinae)
Authors: Silva Bruno Cansanção , Chamorro Rengifo Juliana , Araújo Douglas
Published: January 2023

Phaneropterinae é uma subfamília de Tettigoniidae que possui 2.566 espécies distribuidas por todo o mundo. Nesta subfamília, inserido no grupo de sete gêneros denominado Aniarae, está Hyperophora, que possui 15 espécies distribuídas na América do Sul. Dessas, apenas Hyperophora augustipennis foi analisada citogeneticamente, apresentando 2n?=31 acrocêntricos, com sistema cromossômico sexual (SCS) do tipo X0?/XX?, que são as características mais comuns para Phaneropterinae. Este trabalho teve como objetivo analisar duas espécies de Hyperophora encontradas em Mato Grosso do Sul. As gônadas de machos e fêmeas foram submetidas à colchicina (0,16%, 2 h.), hipotonizadas (água de torneira, 15 min.) e fixadas em Carnoy I. As células em suspensão foram obtidas pela dissociação do órgão em ácido acético 60% sobre lâminas, com secagem em placa aquecedora. Algumas lâminas foram coradas com Giemsa (3%) e outras foram submetidas técnica de hibridação in situ fluorescente (FISH) com sonda telomérica de invertebrados (TTAGG)n. Nos três machos e uma fêmea de Hyperophora sp.1, coletados na Fazenda Sossego, município de Campo Grande, foram analisadas 58 células em divisão, que revelaram 2n?=31 e 2n?=32 nas metáfases mitóticas, o mesmo número já descrito para o gênero e o mais comum para a subfamília. Já as 98 células analisadas de dois machos e uma fêmea de Hyperophora sp.2, coletados na Base de Estudos do Pantanal da Universidade Federal de Mato Grosso do Sul (BEP), município de Corumbá, mostraram 2n?=29 e 2n?=30 nas metáfases mitóticas. Ambas as espécies exibiram morfologia cromossômica acro/telocêntrica em todo o cariótipo. O cromossomo sexual X é o maior elemento do complemento. Diplótenos dos machos com 14 bivalentes e um univalente permitiram a confirmação do SCS do tipo X0?/XX?, devido ao fácil reconhecimento do univalente X pelo seu tamanho. A FISH telomérica revelou marcações apenas na extremidade de todos os cromossomos, sem sítios teloméricos intersticiais, indicativo de que a redução em um par cromossômico nesta espécie pode ter sido um evento evolutivo antigo. Fusão in tandem tem sido proposto como o mecanismo envolvido na origem do cariótipo 2n?=29,X0, encontrado em algumas espécies de Phanetopterinae, inclusive do Brasil, a partir do cariótipo 2n?=31,X0, supostamente plesiomórfico para a subfamília.
Organização genômica do RNA repetitivo e evolução do cariótipo em Elaenia flavogaster (Passeriformes, Aves)
Authors: Rodrigues Benilson Silva , Kretschmer Rafael , Garnero Analía Del Valle , Gunski Ricardo José , Cioffi Marcelo de Bello , Oliveira Edivaldo Herculano Corrêa de
Published: January 2023

Pouco se sabe sobre a organização de sequências repetitivas no cariótipo das Aves, e sondas de microssatélites foram usadas em um pequeno grupo de espécies até o momento. Tyrannidae (Passeriformes, Suboscines), é uma das maiores famílias de aves das Américas, e dados citogenéticos evidenciaram uma interessante variação cariotípica nesse grupo. Assim, o objetivo desse estudo foi analisar o cariótipo da guaracava-de-barriga-amarela (Elaenia flavogaster), por meio de técnicas de citogenética clássica (coloração convencional com Giemsa e bandeamento C) e molecular (sondas teloméricas, 18S rDNA e sondas de microssatélites: (CAT)10, (GAG)10, (GC)15, (GA)15 e (TA)15). Os resultados mostraram um número diploide de 2n=80. A distribuição da heterocromatina exibiu marcações apenas nos centrômeros dos cromossomos. O padrão de hibridização das sondas teloméricas revelou sinais mais intensos nos microcromossomos e ausência de sequências teloméricas intersticiais (ITSs), reforçando o fato de que ITSs são menos frequentes em ordens de Aves consideradas mais derivadas, visto que em Ratitas e Galloanserae essas sequências já foram detectadas. As sondas de 18S rDNA marcaram dois pares de microcromossomos, semelhante a Elaenia spectabilis e Serpophaga subcristata, indicando que esta característica pode representar uma sinapomorfia dentro de Elaeniinae, pois até o momento não foi encontrada em outras subfamílias dentro de  Tyrannidae. Das sondas de microssatélites utilizadas, (GA)15 e (TA)15 não produziram sinais detectáveis, já as sondas de microssatélites (CAT)10 marcaram apenas na extremidade distal do braço longo do 1º par, e em alguns microcromossomos, as sondas (GAG)10 apresentaram intensa marcação nos microcromossomos, diferentemente de Leptotila verreauxi (Columbiformes), na qual essas sondas marcam poucos microcromossomos. Já as sondas (GC)15 marcaram apenas o braço curto de um microcromossomo e o braço longo de um macrocromossomo. Esses resultados evidenciam a variação de distribuição dessas sequências repetitivas em diferentes grupos de Aves e o pequeno número de sinais detectados concorda com o fato de que o genoma das Aves é compacto com pouca quantidade de DNA repetitivo. Conclui-se que a evolução do cariótipo dos tiranídeos envolveu a amplificação de sítios de 18S rDNA e que apresenta uma distribuição distinta de microssatélites quando comparada com espécies de outras ordens.
Origem e evolução do sistema de cromossomos sexuais XY 1 Y 2 no peixe Hoplias malabaricus: (Characiformes, Erythrinidae)
Authors: Oliveira Ezequiel Aguiar de , Sember Alexandr , Bertollo Luiz Antonio Carlos , Moreira Filho Orlando , Cioffi Marcelo de Bello
Published: January 2023

O peixe Hoplias malabaricus (Characiformes, Erythrinidae) é caracterizado por uma ampla diversidade cariotípica, com uma ampla variação em seus números diploides e tipos cromossômicos, incluindo distintos sistemas de cromossomos sexuais entre seus cariomorfos. Até o presente momento, três sistemas XY [um altamente diferenciado (Cariomorfo B) e outros dois em estágios iniciais de diferenciação (Cariomorfos C e F)] e um sistema X1X2Y (Cariomorfo D), foram extensivamente estudados por procedimentos de citogenética convencional e molecular, elucidando seus processos de diferenciação e evolução. Os resultados apontaram para uma origem independente dos sistemas XY, onde distintos autossomos se diferenciaram nos cromossomos sexo-específicos nos distintos cariomorfos. Neste estudo, foi analisada a origem e evolução do sistema XX/XY1Y2, presente no cariomorfo G desta espécie, utilizando procedimentos citogenéticos convencionais e moleculares, incluindo bandamento C, mapeamento cromossômico de DNAs repetitivos, hibridação genômica comparativa (CGH) e pintura cromossômica total (WCP). Os dados obtidos possibilitaram evidenciar os rearranjos cromossômicos envolvidos na gênese deste raro sistema de cromossomos sexuais múltiplos observado entre os peixes. Os experimentos de CGH foram resolutivos para identificar a ocorrência de uma região cromossômica macho-específica no cromossomo Y1, onde as sequencias ali existentes podem estar associadas à fase inicial da diferenciação deste cromossomo. Ficou também evidenciada uma estreita correlação entre o sistema XY1Y2 do cariomorfo G e o sistema XY do cariomorfo F de H. malabaricus, reforçando a maior proximidade evolutiva entre eles, bem como a origem independente destes sistemas em relação à outros encontrados nesta mesma espécie. Os resultados destacam o excelente modelo fornecido por este grupo taxonômico nos estudos dos cromossomos sexuais.Apoio: CAPES, CNPq, FAPESP, SEDUC-MT
Population study of the B chromosome frequency in the grasshopper Abracris flavolineata
Authors: Silva Ana Elisa Gasparotto da , Milani Diogo , Loreto Vilma , Martí Dardo Andrea , Cabral de Mello Diogo Cavacanti
Published: January 2023

Additional parasitic elements known as B chromosomes have been described in approximatey 15% of eukaryotic species. They have primary characteristics that define their origin, composition, ways of accumulation and evolution, such as irregular modes of inheritance, pairing incapacity with standard A chromosomes during meiosis and accumulation of distinct repetitive DNAs. The grasshopper Abracris flavolineata presents diploid number 2n = 23, X0 (male) and 2n = 24, XX (female) and presence of one or two B submetacentric chromosomes were reported exclusively in Rio Claro/SP population, varying in frequency temporally from 13.5% to 31.5% in males. In this work aiming to understand the spatial variation of B chromosome we investigated presence and frequency of B chromosomes in males belonging to three populations, Santa Bárbara do Pará/PA, Cabo/PE and Posadas/Misiones/Argentina using 61, 19 and 14 individuals, respectively. For Argentina population the frequency estimated was only 7,14% (one individual), while for Pernambuco it was higher with about 21,05% (four individuals), and for Pará none of the individuals presented B chromosomes. None of the populations presented individuals with 2B chromosome as reported in Rio Claro/SP, suggesting differential drive and accumulation. The fluctuation of B chromosome frequency and accumulation in these natural populations could be explained by several factors, like differences in parasitism rate, genetic drift or else by negative effects for host development. Moreover local environment characteristics, associated to possible reproductive isolation, caused by vicariance processes, could also influence B chromosome frequency variation. Here we expanded the knowledge of B chromosome geographic distribution in A. flavolineata and the next step is to check if the B chromosome is the same variant in distinct populations, using for example the U2 snDNA as probe, wich is present in the B chromosome from Rio Claro/SP population.
Prevalência de mosaicismo na síndrome de Turner no estado de Pernambuco
Authors: Pinto Rafaella do Nascimento , Santos Luana Oliveira dos , Barros Juliana Vieira de , Laranjeira Raysa Samanta Moraes , Silva Kamylla Ramos da , Silva Rarysa Ferraz de Almeida e , Bispo Adriana Valéria Sales , Duarte Andréa de Rezende , Araújo Jacqueline , Gomes Bárbara , Santos Neide
Published: January 2023

A existência de mosaicismo cromossômico tem sido apontada como um fator determinante para a viabilidade das pacientes portadoras da Síndrome de Turner (ST), tendo em vista que apenas 1% dos fetos com o cariótipo 45,X são nativivos, pois 99% são abortados espontaneamente Diversos casos de mosaicismo cromossômico têm sido descritos, com as mais variadas constituições celulares associadas à linhagem clássica para a ST (45,X). Essa coexistência de linhagens pode resultar na maior parte dos casos  no abrandamento dos sintomas que caracterizam a síndrome, sendo as consequências fenotípicas decorrentes do mosaicismo dependentes da proporção de células alteradas Esse estudo teve como objetivo determinar a prevalência de mosaicismo cromossômico em portadores da Síndrome de Turner e verificar possíveis associações entre os fenótipos e cariótipos dessas pacientes oriundas do Estado de Pernambuco. Para o desenvolvimento da investigação foram coletadas amostras de sangue periférico em pacientes que foram recrutadas do Serviço de Genética Médica do Instituto Materno Infantil Prof. Fernando Figueira (IMIP) e Serviço de Endocrinologia Pediátrica do Hospital das Clínicas (HC), entre outubro de 2006 e agosto de 2016. O cultivo de linfócitos de sangue periférico foi realizado para cada paciente e, posteriormente, um bandeamento G foi utilizado para identificação cromossômica e detecção das alterações encontradas. A análise citogenética detectou cariótipos compatíveis com a ST em 84 pacientes, O cariótipo 45,X foi observado em 58,3% da amostra, seguido de indivíduos portadores de mosaicismo, que representaram 33,3% dos casos. Entre as pacientes portadoras de mosaicismo, o cariótipo 46,X,i(Xq)/45,X foi o mais prevalente, representando 16,6% da amostra. Linhagens celulares contendo cromossomo em anel (46,X,r(X)/45,X) e o cromossomo Y (45,X/46,XY) também foram detectadas. As manifestações clínicas mais incidentes nas pacientes com ST foram a baixa estatura e amenorréia primária, sendo constatado a ocorrência de 89,2% e 64,3%, respectivamente, em pacientes com mosaicismo confirmado. Os resultados obtidos confirmaram a necessidade de investigação de mosaicismo cromossômico, para determinar uma relação entre a expressão fenotípica específica e cada tipo de associação de linhagens cromossômicas diferentes. Além disso, a avaliação precisa da constituição cromossômica irá proporcionar às portadoras da ST um diagnóstico conclusivo, prognóstico adequado e tratamento com terapias específicas.Auxílio financeiro: FACEPE, UFPE
Síndrome de 49,XXXXY com mosaicismo em um paciente atendido na clínica de especialidades infantis/UEL
Authors: Mestre Viviane de Fátima , Spolari Isabella Carolina , Geha Mohamad Walyd Nabil , Santana Bruna Ribeiro , Barroso Maria Eliane Longhi , Paiva Wagner José Martins , Salles Maria José Sparça
Published: January 2023

A síndrome 49,XXXXYé uma aneuploidia cromossômica com 3 cromossomos X extras em indivíduos do sexo masculino. Pode ser classificada como Síndrome de Klinefelter ou ainda como sua variante, devido às suas características clínicas, especialmente, a prevalência de cardiopatia congênita. Apresenta frequência de 1:85.000 a 100.000 nascidos. A etiologia está relacionada a não disjunção dos cromossomos homólogos, sendo o mosaicismo comum. Apresenta QI variável com atraso de desenvolvimento sutil na infância com deterioração progressiva, estatura baixa e déficit de hormônio de crescimento. A disfunção testicular torna-se evidente no individuo prépubere e adolescente. Problemas comportamentais como timidez e irritabilidade podem estar presentes. Diante do exposto, objetivou-se estudar a literatura a respeito da Síndrome 49,XXXXY e relatar um caso. Para isso, utilizou-se dados coletados do prontuário do Clínica de Especialidades Infantis / UEL além de uma entrevista com a mãe da criança por meio de um questionário semiestruturado e revisão literária da síndrome em questão. Indivíduo masculino, 11 anos, mãe e pai com 19 e 22 anos, respectivamente, no momento da concepção, sem consanguinidade e moradores da zona urbana. Realizou pré-natal a partir do 1º trimestre, negando o uso de tabaco, álcool e substâncias ilícitas, relata a utilização de antibiótico, com indicação médica, durante a gestação, para infecção do trato urinário. Parto cesariana com 36 semanas e peso 2085g. Aos 2 meses foi submetido à cirurgia cardíaca para correção de persistência de canal arterial. A suspeita da síndrome teve início aos 18 meses de idade após a identificação do atraso cognitivo. O diagnóstico ocorreu aos 5 anos com cariótipo 49,XXXXY[45]/46,XY[5]. Apresenta pênis atrófico, hipogonadismo, baixa estatura e déficit cognitivo. A dosagem hormonal mostra: hormônio FSH 0,28mUI/ml; testosterona livre 0,01 e hormônio luteinizante 0,04 mUI/ml. O início do tratamento hormonal objetivou estimular o aparecimento dos caracteres secundários masculinos. Diante disso, conclui-se que meninos com 49, XXXXY necessitam de avaliação e tratamento multidisciplinar, o que coincide com a literatura consultada. Salientando a necessidade de pesquisas futuras e investigações mais aprofundadas, como rastreio molecular, que facilitarão a compreensão dessa Síndrome.Aprovação no comitê de ética: 1.784.134
Toxicidade e citogenotoxicidade ambiental do Rio São Francisco no polo Petrolina (PE)/Juazeiro (BA) mediante bioensaio Allium cepa L.
Authors: Pereira Ilka Fernanda Mendes , Vidal Ana Christina Brasileiro , Motta Laysla dos Santos , Silva Cinthia dos Santos , Silva Draulio Costa da , Silva Paula Tereza da , Bortoleti Kyria Cilene de Andrade
Published: January 2023

Alterações genéticas, em nível de cromossomo, são amplamente utilizadas na identificação de danos gerados por contaminantes ambientais. O presente trabalho avaliou a toxicidade e citogenotoxicidade de compostos presentes nas águas e sedimentos do rio São Francisco, coletadas em duas áreas receptoras de efluentes em Juazeiro-BA (A1/efluente urbano-agrícola) e Petrolina-PE (A2/urbano-industrial) mediante bioensaio Allium cepa L. Três pontos de amostragem [à montante (M), no despejo (E) e à jusante (J) do efluente] foram determinados em cada área, coletando-se amostras compostas durante as estações de estiagem (Agosto/2015) e chuvosa (Março/2016). Raízes de A. cepa germinadas nas amostras em análise, nos controles negativo (água ultrapura) e positivos (Metil metano-sulfonato e Trifluralina) foram medidas, fixadas e utilizadas na confecção de lâminas seguindo método de Feulgen. Foram analisadas 7500 células/tratamento e os resultados comparados ao controle negativo, utilizando teste de Tukey ou Kruskal-Wallis (p<0,05). Na estação de estiagem, foi notada diminuição do índice de germinação (%) em cinco amostras [água (MA1; 64,7); (EA2; 61,3); (JA2; 60,7) e sedimento (MA2; 68); (JA2; 56,7)], bem como do comprimento médio das raízes (cm) submetidas a sete amostras [água (MA1; 0,59); (EA1; 0,61); (JA1; 0,63); (EA2; 0,53) e sedimento (EA1; 0,55); (JA1; 0,65); (JA2; 0,42)]. Entretanto, na estação chuvosa, quatro amostras [água (MA1; 0,45) e sedimento (MA1; 0,50); (EA2; 0,50); (JA1; 0,5)] estimularam o crescimento das raízes, evidenciando-se toxicidade em ambas as estações. Para a citotoxicidade, observou-se um baixo índice mitótico (%) em três amostras na estiagem [sedimento (EA1; 12,83); (EA2; 11,40); (JA2; 7,08)] e uma na chuvosa [água (JA2; 9,83)], situação contrária ao aumento de divisão celular notado para amostra de sedimento EA2 (19,67). A frequência de micronúcleos, perdas e quebras cromossômicas (%) apontaram genotoxicidade nas amostras de água EA1 (1,17 e 0,96, nas estações de estiagem e chuvosa), em todas as amostras de sedimento da A1 na estiagem, bem como para os sedimentos EA2 (2,60) e JA2 (1,71) na chuvosa. Sugere-se que a ação antagonista e/ou sinergética das concentrações elevadas de nutrientes e metais pesados (Ni, Pb, Fe, Cu e Cr) nas amostras em estudo seja responsável pelas alterações evidenciadas, ressaltando a importância do monitoramento deste rio.
Variabilidade cariotípica em população de Akodon montensis Thomas, 1913 da floresta nacional de Piraí do Sul (PR)
Authors: Gatto Almeida Fernanda , Grazzini Guilherme , Soares Amanda de Araújo , Oliveira Gabriel Francisco Santos de , Tiepolo Liliani Marília , Hass Iris
Published: January 2023

O gênero Akodon é um dos mais diversificados da América do Sul, com 41 espécies reconhecidas, e se distribui ao longo de todo o continente, indo da Colômbia até a Argentina. As espécies desse gênero são morfologicamente muito similares, e por isso a citogenética é uma ferramenta chave para a identificação específica. O objeto deste estudo, a espécie A. montensis, possui cariótipo padrão com 2n=24 e NA=42. De modo geral o conjunto cromossômico de uma espécie deve se manter constante a fim de evitar erros na formação dos gametas e garantir assim a viabilidade da prole, porem variações morfológicas e até numéricas nesse conjunto podem ser encontradas com certa frequência. O objetivo desse trabalho foi avaliar as variações cromossômicas encontradas em indivíduos de Akodon montensis coletados na Floresta Nacional de Piraí do Sul, Paraná. Foram coletados 15 indivíduos de A. montensis, sendo sete fêmeas e oito machos. Foram identificadas alterações morfológicas nos cromossomos X, sendo a mais comum a ocorrência de um braço p, alterando a morfologia do X de acrocêntrico para subtelocêntrico. Esses cromossomos X subtelocêntricos foram registrados em, apenas um cromossomo, em duas fêmeas e em um macho, não estando portanto relacionado a um único sexo. Outra alteração observada nessa amostra de roedores foi a presença de um cromossomo extranumerário (B) de dois braços, em quatro indivíduos: duas fêmeas e dois machos. Esse cromossomo se apresentou sempre único nos indivíduos porem sua forma e tamanho variou. Nos dois exemplares machos o cromossomo B é metacêntrico com tamanho próximo ao do par 11, nas duas fêmeas os cromossomos B apresentaram variações: um metacêntrico menor do que o par 11 e outro submetacêntrico com tamanho maior do que o par 11. Nos indivíduos portadores de cromossomo extranumerário os cariótipos foram identificados como: 2n=25 e NA=44. A frequência em quase 27% da amostra possuindo B é considerada alta para a espécie. Além disso, destaca-se que as duas fêmeas que apresentaram o cromossomo extranumerário são as mesmas que apresentaram o cromossomo X subtelocêntrico. Novos estudos com um aumento no n amostral poderão elucidar melhor os padrões até o momento observados.