АНАЛИЗ МЕЖГЕННЫХ ВЗАИМОДЕЙСТВИЙ И ВЛИЯНИЕ ПОЛИМОРФНЫХ САЙТОВ ГЕНОВ НА ПРЕДРАСПОЛОЖЕННОСТЬ К РАКУ С ПОМОЩЬЮ MDR ПРОГРАММИРОВАНИЯ
Authors: Курманалиева Г.Р. , Токтосунов Т.А. , Исакова Ж.Т. 
Published: October 2024

Цель данного исследования - изучить взаимодействие полиморфных сайтов в генах HMMR, TP53, XRCC1, TNFα, MDM2 и PALB2, а также их вклад в формирование предрасположенности к раку молочной железы (РМЖ) у женщин кыргызской национальности. Для этого были включены 103 женщины с диагнозом РМЖ и 102 женщины без онкопатологии в индивидуальном анамнезе. Генотипирование проводилось методом полиморфизма длин рестрикционных фрагментов (ПЦР-ПДРФ), а межгенные взаимодействия анализировались с помощью программы MDR 3.0.2. Результаты исследования показали, что сочетанные носительства отдельных вариантов полиморфных сайтов в HMMR, TP53, XRCC1, TNFα, MDM2 и PALB2 ассоциированы с повышенным риском развития РМЖ у женщин кыргызской национальности. Конкретно, гетерозиготный вариант Gln/Arg по полиморфному сайту p.Gln399Arg гена XRCC1, а также некоторые сочетания носительств вариантов генов XRCC1, TP53, MDM2, TNFα и PALB2 также оказались ассоциированы с повышенным риском РМЖ. Таким образом, результаты исследования позволяют сделать вывод, что взаимодействие полиморфных сайтов в HMMR, TP53, XRCC1, TNFα, MDM2 и PALB2 может играть важную роль в формировании предрасположенности к раку молочной железы у женщин кыргызской национальности.

The purpose of this study was to investigate the interaction of polymorphic sites in HMMR, TP53, XRCC1, TNFα, MDM2 и PALB2 genes and their contribution in the formation of breast cancer (BC) susceptibility in Kyrgyz women. For this purpose, 103 women diagnosed with breast cancer and 102 women without a history of cancer were enrolled. Genotyping was performed by restriction fragment length polymorphism (PCR-PDF), and intergenic interactions were analyzed using MDR 3.0.2 software.The results of the study showed that combined carriers of certain polymorphic site variants in HMMR, TP53, XRCC1, TNFα, MDM2 и PALB2 genes are associated with an increased risk of BC development in women of Kyrgyz ethnicity. Specifically, the heterozygous Gln/Arg variant at the p.Gln399Arg polymorphic site of the XRCC1 gene, as well as some combinations of carriers of variants in the XRCC1, TP53, MDM2, TNFα, and PALB2 genes also appeared to be associated with an increased risk of breast cancer.Thus, the study results allow concluding that interaction of polymorphic sites in HMMR, TP53, XRCC1, TNFα, MDM2 и PALB2 genes may play an important role in breast cancer predisposition in Kyrgyz women.

Бул изилдөөнүн максаты - HMMR, TP53, XRCC1, TNFα, MDM2 жана PALB2 гендердеги полиморфтук сайттардын өз ара аракетин изилдөө, ошондой эле алардын кыргыз улутундагы аялдардын эмчек рагына (РМЖ) ыктуулугун калыптандырууга кошкон салымы. Бул үчүн РМЖ диагнозу коюлган 103 аял жана онкопатологиянын жеке тарыхы жок 102 аял киргизилген. Генотиптөө чектөө фрагменттеринин узундугундагы полиморфизм ыкмасы менен жүргүзүлгөн (ПЦР-ПДРФ), ал эми гендер аралык өз ара аракеттешүүлөр 3.0.2 программасынын жардамы менен талданды. Изилдөөнүн жыйынтыктары HMMR, TP53, XRCC1, TNFα, MDM2 жана PALB2 гендердеги полиморфтук сайттардын айрым варианттарынын айкалышкан ташуучулары кыргыз улутундагы аялдарда РМЖнын өнүгүү тобокелдигинин жогорулашы менен ассоциацияланган экенин көрсөттү. Тактап айтканда, Gln/Arg гетерозиготалуу вариант p.Gln399Arg гена XRCC1 полиморфтук сайт боюнча XRCC1 гени, ошондой эле кээ бир айкалыштары алып жүрүүчү XRCC1, TP53, MDM2, TNFα жана PALB2 ген варианттары РМЖ тобокелдигинин жогорулашы менен байланышкан.