Next Generation Sequencing as a Method for Discovering the Nature of Chronic Lymphocytic Leukemia and Transition to Personalized Treatment
Authors: Михалева М.А. , Мартынкевич И.С. , Булдаков И.А. , Петров С.В. , Мотыко Е.В. , Кувшинов А.Ю. , Богданов А.Н. , Волошин С.В. 
Published: February 2022

Новейший метод секвенирование нового поколения (Next Generation Sequencing, NGS) позволяет выявлять генетическое и эпигенетическое разнообразие хронического лимфолейкоза (ХЛЛ), декодируя мутационный статус и оценивая его влияние на течение заболевания. Учитывая, что тактика лечения пациентов с ХЛЛ претерпела революционные изменения в последние два десятилетия, детекция драйверных мутаций позволит выбирать оптимальные терапевтические схемы и содействовать разработке и дальнейшему внедрению новейших таргетных препаратов и их комбинаций. Риск-адаптированный подход к терапии ХЛЛ, основанный на группах генетического риска, будет являться базисом персонифицированного лечения. Целью настоящей работы является оценка мутационного статуса пациентов сХЛЛ с использованием разработанной лимфоидной таргетной NGS-панели и изучение возможной корреляции мутационного статуса с клиническими характеристиками заболевания. В проспективное исследование было включено 68 пациентов с ХЛЛ: нелеченые (n=56) и рецидивирующие и рефрактерные формы (n=12). С целью апробации «Лимфоидной таргетной NGS панели генов» было выполнено исследование на образцах ДНК пациентов (n=19) с ХЛЛ. Использование NGS позволило выявить генетические аберрации у всех исследуемых пациентов. Общее количество мутаций составило 767. Полученные нами данные пилотного исследования демонстрируют возможность применения технологии NGS в клинической практике. Для оценки корреляции клинико-лабораторных параметров с мутационным статусом пациентов сХЛЛ исследование будет продолжено. Учитывая, что информация о прогностической значимости ряда выявленных мутаций в настоящее время отсутствует, требуются дополнительные исследования с целью определения их влияния на течение ХЛЛ.

The newest method - Next Generation Sequencing (NGS) - allows detecting the genetic and epigenetic diversity of chronic lymphocytic leukemia (CLL), decoding the mutational status and assessing its effect on the course of the disease. Considering that the tactics of treatment of patients with CLL have undergone revolutionary changes in the past two decades, the detection of driver mutations will allow choosing the optimal therapeutic regimens and promoting the development and further implementation of the latest targeted drugs and their combinations. A risk-adapted approach to CLL therapy based on genetic risk groups will be the base for personalized treatment. This work aims to assess the mutational status of patients with CLL using the developed “Lymphoid targeted NGS panel” and to study the possible correlation of the mutational status with the clinical characteristics of the disease. The prospective study included 68 patients with CLL: untreated (n=56) and relapse/refractory (n=12). In order to test the “Lymphoid targeted NGS gene panel”, the study was carried out on DNA samples from patients (n=19) with CLL. The use of NGS let to identify genetic aberrations in all patients. The total number of mutations was 767. Our pilot study data demonstrate the possibility of using NGS technology in clinical practice. The study will be continued to assess the correlation of clinical and laboratory parameters with CLL’s mutational status. Considering that there is currently no information on the prognostic significance of several identified mutations, additional studies are required.