FEATURES OF THE MYCOLOGICAL COMPONENT OF THE SOIL MICROBIOME IN MONOCULTURE AND IN CROP ROTATION
Authors: Альсаед Н. , Селицкая О.В. 
Published: September 2022

Разнообразие грибов в почве может быть ограничено в естественных условиях неподходящими факторами окружающей среды, такими как питательные ресурсы, биотические и абиотические факторы, системой обработки почвы и микробными взаимодействиями, которые препятствуют возникновению или выживанию видов в окружающей среде. Цель этой статьи состояла в том, чтобы определить генетическое разнообразие грибов на уровне рода в почве при монокультуре бессменных посевов (пар, лен, картофель) и в севообороте.Исследование включало оценку генетического разнообразия грибов с помощью анализа ПЦР V3-V4 праймера гена ITS86F/ITS4R с помощью высокопроизводительного секвенатора (MiSeq, Illumin).Методы исследования, использованные в данной работе, способствовали лучшему пониманию генетического разнообразия и родового состава грибов в почве под влиянием изменений, произошедших в почве при монокультуре бессменных посевов (пар, лен, картофель) и в севообороте на примере длительного опыта РГАУ-МСХА им. К.А. Тимирязева.Исследование показало, что во всех почвенных пробах наибольший процент приходится на роды грибов, которых меньше 1%.Все образцы почвы (пар, лен, севооборот) содержали грибы родов Fusarium и Mortierella, кроме образца почвы под картофелем, где мы не заметили присутствия этих двух родов в процентах больше 1%. Мы наблюдали в пробе почвы под картофелем высокий процент таксономических групп, составляющих меньше 1%. Их содержание достигает 54,38% и увеличение процента фитопатогенных грибов в составе микробного сообщества при монокультуре.

Diversity of fungi in soil can be limited in nature by inappropriate environmental factors such as: nutrient resources, biotic and abiotic factors, tillage system, and microbial interactions that prevent species from emerging or surviving in the environment. The purpose of this article was to determine the genetic diversity of fungi at the genus level in soil under monoculture of permanent crops (fallow, flax, potatoes) and in crop rotation.The study included an assessment of the genetic diversity of fungi using PCR analysis of the V3-V4 region of the ITS86F/ITS4R gene using a high-performance sequencer (MiSeq, Illumin).The research methods used in this work contributed to a better understanding of the genetic diversity and composition of the fungal population in the soil under the influence of changes that occurred in the soil during the monoculture of permanent crops (fallow, flax, potatoes) and in crop rotation on the example of the long-term experience of the Russian State Agrarian University-Moscow Agricultural Academy. K.A. Timiryazev.The study showed that in all soil samples, the largest percentage falls on genera, which are less than 1%, and this confirms the importance of this widespread part of fungi in soil biomarkers.In the soil samples (fallow, flax, crop rotation) they all contained the genera Fusarium and Mortierella, except for the potato soil sample, we did not notice the presence of these two sexes in percentages greater than 1%, where we observed in the soil sample planted with potatoes a high percentage of taxonomic groups less than 1%, reaching 54.38%, since this high percentage may indicate a high bioindicator of the soil.