bluuebunny/crossref_metadata_2025 huggingface dataset:
Changing Landscape of Clinical-Genomic Oncology Practice
Authors: Trivedi Harsha , Kling Heather M. , Treece Tina , Audeh William , Srkalovic Gordan
Published: May 2021

The current paper discusses the use of genomics in the context of the changing landscape of clinical practice and modern medicine. Medical practice has shifted considerably over the past few decades, from empirical to evidence-based to personalized medicine, and the transition from reliance on observation to measureable parameters. Scientific innovation is required to collect an ever-increasing number and variety of data points and sophisticated analyses capable of distilling vast datasets into meaningful information. The next phase of innovation seeks to personalize disease management, in particular through genomics in oncology. With expanding use of genomics in medicine, and several initiatives collecting genomic data at the population level, education of patients and physicians is critical for data utility. By combining genomic and clinical data, bioinformatics approaches can be applied to developing individualized or targeted therapies. Breast cancer provides an example through which to understand the evolution of genomic data from purescience to clinical utility. From intrinsic subtype classification to development of multigene panels estimating recurrence risk, new studies, such as the FLEX trial, will expand to evaluate the whole transcriptome of tumours. This approach will enable discovery of novel gene signatures and ultimately pave the way toward a personalized approach to breast cancer management.

Conclusion. Despite the potential for genomics to personalize treatments, a number of challenges remain to fully integrate these types of large datasets in a manner that provides clinicians and patients with meaningful, actionable information. However, if challenges are addressed, precision medicine has the capacity to transform patient care.
Prospective Validation of a Genomic Assay in Breast Cancer: The 70-gene MammaPrint Assay and the MINDACT Trial
Authors: Audeh William , Blumencranz Lisa , Kling Heather , Trivedi Harsha , Srkalovic Gordan
Published: May 2021

MammaPrint was the first genomic assay in breast cancer to be validated with a prospective randomized trial, the MINDACT trial. The 70 gene MammaPrint assay was developed to determine the risk of distant metastasis in early stage breast cancer through gene expression analysis and was the first FDA cleared genomic assay for breast cancer. The assay identifies primary breast cancers likely to metastasize within the first five years of diagnosis and has clinical utility for helping to determine the expected benefit from adjuvant chemotherapy. The MINDACT Trial was the first trial of a genomic assay in breast cancer to provide prospective, randomized evidence of clinical utility for this important clinical question, identifying a significant proportion of patients who could safely forgo chemotherapy within a cohort of patients with high risk clinical characteristics. Nearly half of all patients (46%) who would have been advised chemotherapy according to clinical guidelines were identified genomically by MammaPrint as being low risk and found to have equivalent rates of freedom from metastasis at 5 years with or without chemotherapy. Based upon the MINDACT trial, the ASCO Biomarker Guidelines now approve the use of MammaPrint to inform decisions regarding chemotherapy for women with clinically high-risk ER+ breast cancer, and as the only approved assay for use in women with 1-3 involved lymph nodes. Recent studies suggest information obtained from the 70-gene assay may also help inform decisions regarding endocrine therapy, as well as chemotherapy, targeted therapy and immunotherapy.

Conclusion. The power of gene expression analysis in breast cancer, effectively illustrated with MammaPrint in the MINDACT trial, is now being explored through examination of the full transcriptome in breast cancer.
Genomic-Based Therapy of Gynecologic Malignancies
Authors: Markman Maurie
Published: May 2021

This paper will review the current status of genomic-based therapy of gynecologic malignancies. The routine “standard-of-care” delivery of targeted therapeutics based on the presence of specific molecular biomarkers in the management of the gynecologic malignancies has been delayed compared to the substantial progress made in several other tumor types.  However, relatively recently reported and rather robust phase 3 trial data have confirmed a potentially major role for PARP inhibitors as both active treatment and maintenance therapy of advanced ovarian cancer.  Further, data demonstrating the presence of a specific molecular phenotype (micro-satellite instability high – MSI-H) is a valid biomarker for the potential clinical utility of checkpoint inhibitor immunotherapy has relevance for all gynecologic malignancies, and particularly in the setting of metastatic or recurrent endometrial cancer.

Conclusions. The introduction of PARP inhibitors into the oncology armamentarium has substantially impacted standard-of-care strategies in the management of ovarian cancer. It is anticipated that the results of ongoing and future trials will further define the role of genomic-based therapy in ovarian cancer and other gynecologic malignancies.
Knowledge and Attitudes of Sexually Transmitted Infections Among High School Students in Sarajevo
Authors: Mahmutovic Vranic Sabina , Aljicevic Mufida , Segalo Sabina , Joguncic Anes
Published: May 2021

Objective. The aim of the study was to evaluate knowledge and behavioural risks related to sexually transmitted infection (STIs) among high school students.

Methods. The cross sectional study was conducted among students aged 15-18 years old from two high schools in the Sarajevo Canton in the period from October 2017 to March 2018. An anonymous self-administered questionnaire was used. The survey investigated their socio-demographic characteristics, sexual habits and level of knowledge about STIs. The data were analysed using SPSS version 25 and MS Excel 2016.

Results. In total 278 high school students participated in the study, with a mean age of 17.79±1.026 years, of which 89 (32%) were male, and 189 (68%) were female. There was no significant difference in age in relation to sex distribution (P=0.074). Regarding the number of participants, 234 (84.2%) were from the dental school, while 44 (15.8%) were from a gimnazija (grammar high school). There was no significant difference in gender-based distribution by school (P=0.080). Students from the grammar high school had significantly better knowledge about the impact of STI on the foetus (P=0.025) and infected individuals (P=0.001), also about the impact of STI on sterility (P=0.005).

Conclusion. Our study confirmed the need for implementation of sexual education programs in the final grades of elementary school or in first grades of high school, aimed at improving knowledge of sexually transmitted infections and improving sexual and reproductive health.
Retrospective Evaluation of the Diagnostic Accuracy of the Modified Alvarado Scoring System (MASS) in a Croatian Hospital
Authors: Bakula Branko , Radišić Biljak Vanja , Bakula Mirko , Rašić Fran , Šimundić Ana-Maria
Published: May 2021

Objective. Diagnosing acute appendicitis (AA) is challenging and this has stimulated surgeons to develop scoring systems that could potentially decrease the rate of misdiagnosis in patients with suspected appendicitis. One of the most widely used today is the Modified Alvarado scoring system (MASS), however its sensitivity and specificity varies a great deal between studies. As a result, we wanted to assess the diagnostic accuracy of MASS retrospectively at our institution to achieve the highest possible value of sensitivity and decrease the number of false negative patients.

Material and Methods. We retrospectively calculated MASS for all subsequent patients who had undergone an appendectomy at our institution between July 2015 and March 2017.

Results. In 118 out of 146 operated patients, AA was confirmed intraoperatively. There was a statistically significant difference between the average MASS score in the positive and negative appendectomy groups (6 v. 4, respectively, P<0.001), with a significantly higher number of females among the negative appendectomies (P<0.001). When lowering the cut-off to a value as low as ≥3, the sensitivity of the MASS score increased to 97.45% (95% CI: 92.7 – 99.5), thus obtaining a very low false negative rate of merely 2.55%.

Conclusion. This retrospective diagnostic accuracy study confirmed the higher average MASS score in the group of patients with confirmed AA diagnosis. A MASS score above the proposed low cut-off value (≥3) can be a useful tool to help surgeons ruling in patients with AA in order to reduce the risk of missing diagnosis.
Bogusławą Keckova: An Official Female Doctor in Bosnia and Herzegovina, 1893–1911
Authors: Tahirović Husref , Fuchs Brigitte
Published: May 2021

The purpose of this paper is to bring to light the biographical details, the professional work and the publishing activities of Bogusławą Keckovą (Bohuslava Keckova in Czech and Keck in German), who functioned as an Austro-Hungarian health officer in Mostar from 1893 to 1911 during the period of the Austro-Hungarian occupation of Bosnia and Herzegovina (BH). Keckovą, who came from Prague, was the second of nine female physicians to be employed by the Austro-Hungarian authorities between 1892 and 1918. Keckovą contributed significantly to the improvement of public health and hygiene in BH, especially by organising the medical treatment of Muslim women. She published a series of popular medical articles, both in Czech and in Bosnian. Her medical articles in the Mostar newspaper, ‘Osvit’, were among the first in BH to promote public health education and aimed at improving the health of the population. In the Czech Republic, ‘Bohuslava Kecková’ is renowned for being the first Czech female physician to graduate, who, due to Austria’s conservativism and anti-feminism, had been forced to study and practise abroad. After Keckovą’s efforts to have her Swiss MD degree (1880) recognised in Austria failed in 1882, she acquired an Austrian midwife’s diploma and established a maternity home in Prague. In 1892, she accepted the invitation to serve as an Austro-Hungarian female health officer in Mostar, where she initialised and popularised the utilisation of public health among (Muslim) women. Conclusion. Bogusławą Keckovą’s work as a physician, medical writer and health educator, which she continued tirelessly until her death in 1911, was based on gender-specific socialmedical concepts, which were at the core of the contemporary Czech feminist movement.
Evaluation of Solubility of Luting Cements in Different Solutions
Authors: Gavranović-Glamoč Alma , Ajanović Muhamed , Kazazić Lejla , Strujić-Porović Sanela , Zukić Selma , Jakupović Selma , Kamber-Ćesir Alma , Berhamović Lejla
Published: May 2021

Objective. To evaluate and compare the solubility of three luting cements in three different solutions: distilled water and artificial saliva with different pH values (7.4 and 3.0).

Materials and Methods. Resin-modified glass-ionomer cement (GC Fuji Plus) and two resin cements (Multilink Automix and Variolink II) were used. A total of 45 specimens, 15 specimens (15x1 mm) for each cement, were prepared according to ISO standard 4049:2009. The solubility of the cements was calculated by weighing the specimens before and after immersion and desiccation. Values of solubility in water (Wsl) in microgram/mm3 for each of the five specimens were calculated using the following formula (ISO 4049:2009): Wsl=(m1-m3)∕V. The Mann-Whitney U nonparametric statistical method and Post hoc sample comparisons were applied.

Results. GC Fuji Plus showed statistically significant higher solubility in comparison with Variolink II and Multilink Automix in all three solutions. In acidic artificial saliva (pH 3.0) Multilink Automix showed significantly higher values of solubility compared to Variolink II (P<0.016). By studying the effect of pH value on the solubility of GC Fuji Plus cement, significantly higher values of solubility in pH 3.0 artificial saliva were confirmed (P<0.009). The influence of the surrounding pH value on the solubility of the resin cements Multilink Automix and Variolink II was researched. No statistically significant difference was found.

Conclusion. Solubility values were mainly influenced by the proportion of hydrophilic matrix, the type and composition of filler, and the pH value of the solutions.
Acceptance of Orthodontic Therapy according to the Aesthetic Component of the Index of Orthodontic Treatment Need among Schoolchildren - a CrossSectional Study
Authors: Zovko Ruzica , Gorseta Kristina , Cvitanovic Stipo , Mabic Mirela , Coric Anka , Sarac Zdenko , Glavina Domagoj
Published: May 2021

Objective. Orthodontic anomalies with impaired facial aesthetics and disturbed oral functions have a major effect on emotional and social development. It is necessary to determine the degree of acceptance of treatment. This study includes an evaluation of the Index of Orthodontic Treatment Need (IOTN) according to the Aesthetic Component (AC) of dental health in schoolchildren.

Methods. The research included 300 schoolchildren (150 girls, 150 boys) with an age range from 12 to 15 years. An evaluation of the need for orthodontic treatment according to the AC consisted of a ten-grade scale illustrated with a sequence of ten intraoral photographs showing different degrees of acceptability of dental appearance. Results were expressed as absolute and relative frequencies. The Chi-square test (in the absence of the expected frequencies of Fisher’s Exact test) was used for testing the significance of differences. Cohen’s kappa statistic measure was used for measuring the agreement between the children and
 dentists.

Results. There is a significant substantial agreement between children and dentists in assessing the need for orthodontic treatment. Differences in assessment of the degree of orthodontic anomalies by the doctor of dental medicine with respect to boys and girls, are negligible, and statistical analysis did not show any significant difference. Analysis of the need for orthodontic treatment with respect to the age of the children showed a significant difference.

Conclusion. The need for orthodontic treatment is more pronounced in older children, and there is no difference between boys and girls.
Sealing Ability of Mineral Trioxide Aggregate, Biodentine and Glass Ionomer as Root-End Materials: A Question of Choice
Authors: Džanković Aida , Hadžiabdić Naida , Korać Samra , Tahmiščija Irmina , Konjhodžić Alma , Hasić-Branković Lajla
Published: May 2021

 

Objectives. The goal of this study was to determine the sealing ability of MTA, Biodentine, and Fuji IX as root-end materials after ultrasonic retrograde preparation using a dye penetration method.

Materials and Methods. Seventy permanent anterior teeth were used in this study. Root canals were prepared using rotary endodontic files, and obturated using the lateral condensa­tion technique. The resection of the root apices was performed perpendicularly to the long axis, and 3 mm deep retrocavities were made by ultrasonic tips. The samples were randomly divided into three experimental groups (N=20) and two control groups (N=5). The root-end cavities were filled with mineral-trioxide aggregate (Rootdent MTA, TehnoDent, Russia) in Group 1, Biodentine (Septodont, Saint Maur des Fossés, France) in Group 2 and Fuji IX GP (GC Corporation, Tokyo, Japan) in Group 3. The retrocavities of the positive control group were left unfilled, while retrocavities in the negative control group were sealed using a flowable composite material. The samples were made transparent, and dye penetration was assessed under a stereomi­croscope (x10). The data were analyzed with the Kruskal-Wallis test and the Mann-Whitney U-test.

Results. The Biodentine group had a lower mean leakage value than the MTA and Fuji IX groups, and the difference was statistically significant (P<0.01). No statistical difference in apical microleakage was found between the MTA and Fuji IX groups (P>0.05).

Conclusion. Within the limitations of this study, it was concluded that Biodentine provides better sealing ability as a root-end material than MTA and Fuji IX. There was no statistically significant difference between the sealing ability of MTA and Fuji IX as root-end materials.
Norovirus Infections Drop 49% in the United States with Strict COVID-19 Public Health Interventions
Authors: Lennon Robert P. , Griffin Christopher , Miller Erin L. , Dong Huamei , Rabago David , Zgierska Aleksandra E.
Published: May 2021

Norovirus is a substantial burden on the U.S. We compared norovirus outbreaks before and during COVID-19. There were fewer norovirus outbreaks during COVID-19 compared to a similar time period in 2019 (326 versus 638, P<0.001).

Conclusion. COVID-19 public health interventions may be considered to decrease the burden of norovirus. This demonstrates the ability of more restrictive interventions to decrease other outbreaks of known or emerging viruses.
Letter to the Editor: Regarding “An Unusual Bilateral Duplication of the Suprascapular Vein and Its Relation to the Superior Transverse Scapular Ligament Revealed by Anatomage Table”
Authors: Al-Redouan Azzat , Kachlik David
Published: May 2021

No abstract available.
Modelos de Markov Aplicados na Avaliação de Usabilidade de um Sistema para Educação à Distância
Authors: Penedo Janaina R. , Diniz Morganna , Ferreira Simone B. Leal , Silveira Denis  S. , Capra Eliane
Published: May 2021

A usabilidade ganhou destaque na área de Interação Humano-Computador (IHC). Os métodos de avaliação de usabilidade consistem de processos de coleta de dados com a finalidade de analisar como os usuários usam um produto para executar suas tarefas. A presente pesquisa tem por objetivo avaliar a usabilidade de um sistema de educação à distância utilizando uma avaliação de usabilidade quantitativa através de modelos markovianos a fim de identificar falhas de usabilidade na interface. Esses modelos permitem o cálculo de uma série de medidas de interesse e têm sido utilizados com sucesso na avaliação de sistemas, mas são ainda pouco aproveitados em avaliações de usabilidade de sistemas Web.
InfoSecRM: Uma Abordagem Ontológica para a Gestão de Riscos de Segurança da Informação
Authors: Gualberto Éder S. , De Sousa Jr Rafael  T. , De Deus Flávio E. G. , Duque Cláudio  G.
Published: May 2021

Processos de Gerenciamento de Riscos de Segurança da informação utilizam informações de fontes variadas como dados sobre ativos e suas vulnerabilidades, logs de sistemas, decisões gerenciais etc. Recursos que possam auxiliar na manipulação de informações deste complexo arcabouços ao necessidades reais e relevantes a serem consideradas. Neste artigo, e apresentada uma ontologia como proposta de representação para formalizar, compartilhar, manipular e processar conceitos e informações relacionadas ao domínio de gestão de riscos de segurança da informação.
Análise da Incorporação de Requisitos não Funcionais na Modelagem de Processos de Negócio
Authors: Salles Guilherme B. M. , Fantinato Marcelo
Published: May 2021

Considerando a gestão de processos de negócio, o propósito do alinhamento estratégico deve-se à necessidade de gerenciar e otimizar a TI a partir dos processos mais importantes à organização. Na fase de engenharia de requisitos de um SI, é importante atentar-se não só aos requisitos funcionais, mas também às restrições de operação e a qualidade que os processos devem considerar. O presente artigo busca, por meio de uma análise sistemática, apresentar os artigos existentes para associar a modelagem de processos de negócio a requisitos não funcionais. Como resultado, tem-se a discussão dos estudos publicados para abordar esse tema e a observação de lacunas nessa linha de pesquisa.
Uma Técnica Orientada por Objetivos para a Construção de Ontologias de Aplicação
Authors: Santos Luis Eduardo , Girardi Rosario
Published: May 2021

As ontologias são estruturas de representação do conhecimento capazes de expressar um conjunto de entidades em um domínio, seus relacionamentos e axiomas. Para a sua construção, diversas técnicas têm sido propostas. Entretanto, poucas dessas apoiam o desenvolvimento de ontologias de aplicação. Este artigo propõe GAODT, uma técnica orientada por objetivos para o desenvolvimento de ontologias de aplicação. Sua avaliação foi realizada através do desenvolvimento de uma ontologia de aplicação, que é o principal componente de um sistema baseado em conhecimento para apoio a tomada de decisões no domínio do Direito Sucessório.
GenPolis - Prototipagem e aplicação de uma ferramenta especializada para otimização via algoritmos genéticos de planos fixos de sinalização semafórica em sub-redes urbanas
Authors: Mugnela Bruno Sarno , Lobo Netto Marcio
Published: May 2021

A aplicação de algoritmos genéticos (AGs) para otimizações em engenharia de tráfego possui boa base bibliográfica, mas são raras as aplicações reais em meios onde há escassez de dados e de sistemas inteligentes de controle de tráfego. Este artigo apresenta um novo modelo de simulação sobre o qual um AG é aplicado para encontrar planos de sinalização semafórica que reduzam atrasos e paradas em sub-redes congestionadas. A ferramenta é simplificada para execução rápida, usando apenas os parâmetros colhidos pela CET-SP. O estudo de caso em uma sub-rede paulistana resultou em reduções da ordem de 30% no nível de atraso calculado nas simulações dos planos anteriores.
Um Método para Seleção de Padrões para Melhoria de Processos de Negócio
Authors: Souza Alexandre , Azevedo Leonardo Guerreiro , Santoro Flavia
Published: May 2021

Gestão de Processos de Negócio está cada vez mais presente nas organizações, e a melhoria de processos é um de seus focos. Padrões para redesenho de processos tem sido o foco de alguns trabalhos, os quais buscam apresentar soluções para problemas recorrentes de melhoria de processos. Contudo, a escolha destes padrões não é uma tarefa simples, principalmente quando executada em cenários onde se tem modelos de processos grandes e complexos, o que torna a análise manual uma tarefa muito custosa. Este trabalho tem como objetivo propor um método para auxiliar na análise destes padrões através da automatização da escolha dos padrões a serem aplicados utilizando informações presentes nos modelos de processos.
Um sistema de informação extensível para o reconhecimento automático de LIBRAS
Authors: Digiampietri Luciano A. , Teodoro Beatriz , Santiago Caio R. N. , Oliveira Guilherme A. , Araujo Jonatas  C.
Published: May 2021

Este artigo apresenta um sistema de informação para o reconhecimento automático de LIBRAS, fundamentado em dois pilares: um ambiente configurável e extensível para o gerenciamento de experimentos de processamento de línguas de sinais, baseado no uso de workflows científicos e um conjunto de modulos desenvolvidos especificamente para o processamento de imagens é vídeos, composto por metodos para a segmentação e classificação de imagens.
Problema de roteirização de veículos com janelas de atendimento, frotas heterogeneas e entregas fracionadas
Authors: De Queiroz Marc A. Vieira , Campos Pedro Casagrande , De Barros Rodolfo Miranda , Brancher Jacques Duílio
Published: May 2021

Este artigo apresenta uma solução para o problema de roteirização veículos utilizando a técnica de construção de rotas por inserção sequencial. A construção de rotas baseia-se na heurística de economia inspirada em algoritmos clássicos, como o desenvolvido por Clarke e Wright em 1964. A heurística de economia empregada faz uso de quatro algoritmos, Economia Combinada (EC), Oportunidade Otimista de Economia (OOE), Oportunidade Real de Economia (ORE) e Oportunidade Real de Economia com parâmetro modelador de rota (OREλ). Os algoritmos são testados por um conjunto de benchmarks e apresentam soluções gráficas e numéricas.
Uma proposta de Solução de Mineração de Dados aplicada à Segurança Pública
Authors: Braz Fernando José , Coan Walter Silvestre , Rosseti Andrei
Published: May 2021

A seguranc ̧a publica tem importância fundamental no planejamento de qualquer cidade. A analise dos dados das ocorrências policiais é fundamental nas políticas de combate ao crime. Este artigo apresenta um sistema de informação desenvolvido sobre as tecnologias de bancos de dados e mineração de dados com o objetivo de permitir o acesso a resumos de dados georeferenciados relacionados com os atendimentos prestados por um batalhao da Polícia Militar. Tambem permite o acesso a modelos de mineração de dados previamente processados sobre a base de dados. Considerando a localização do emitente da consulta, resumos de dados e modelos de mineração são apresentados ao usuario, revelando o conhecimento relativo aquela área espaço-temporal.
Modelo Arquitetural para Coleta, Processamento e Visualização de Informações de Clima Espacial
Authors: Sant'Anna Nilson , Guerra Eduardo , Ivo André , Pereira Fernando , Moraes Marcos , Gomes Vitor , Veras Luis Gustavo
Published: May 2021

Aplicações científicas na área de Clima Espacial precisam agregar dados capturados por instrumentos distribuídos geograficamente para produzir mapas, índices e alertas de eventos do sol. Nesse contexto, existe uma dificuldade em trazer e integrar esses dados para a execução de análises e a disponibilização de resultados em um intervalo de tempo que viabilize o monitoramento e a previsão de eventos. Isso impede a geração de informações em tempo real, necessárias para avaliar impactos em atividades tecnológicas e econômicas, como a comunicação de satélites e sistemas de navegação de aeronaves. O objetivo deste artigo é apresentar um modelo arquitetural denominado Alfrodul, utilizado em aplicações científicas na área de Clima Espacial, visando a integração e processamento dos dados em tempo hábil para sua análise por especialistas. Esse modelo foi utilizado na implementação de seis aplicações web para visualização de informações de Clima Espacial.
Aplicação OLAP para Segurança Pública: um Estudo de Caso a Partir de Dados Governamentais Abertos do Estado do Rio de Janeiro
Authors: Leite Adriano Barboza , Souza Ellen Polliana Ramos , Correa Neto Jorge da Silva , Oliveira Marcelo Iury de Sousa
Published: May 2021

Dar transparência aos dados sobre segurança pública já tem sido uma prática em alguns Estados brasileiros, contudo, as ferramentas de manipulação e análise não tem conseguido atender às expectativas da população. O uso de data marts e de ferramentas de processamento analítico online (OLAP), empregados no desenvolvimento deste projeto, permite uma interação mais rica e efetiva com a sociedade. Também, por meio de painéis de bordo é possível analisar os índices de criminalidade disponibilizados pelo Instituto de Segurança Pública do Estado do Rio de Janeiro e, dessa forma, contribuir com o exercício da cidadania e o empoderamento da sociedade civil.
Ambiente Analítico Web para Análise da Colaboração Científica no Cenário Médico
Authors: Melo Hector N.  , Perorazio Ruben A. , Oliveira Jonice
Published: May 2021

O governo brasileiro implantou o Instituto Nacional de Ciência e Tecnologia para o Controle do Câncer (INCTCC) com o objetivo de investir estrategicamente em pesquisa nesta área. Visando aumentar a colaboração nacional entre os cientistas da área, uma abordagem fundamentada em Análise de Redes Sociais mostra-se importante. Entretanto, os mecanismos de tratamento de dados e visualização típicos de softwares desse tipo são limitados. O objetivo deste trabalho é descrever um ambiente analítico para tomada de decisão que permita analisar dinamicamente a produção científica e colaborações realizadas através do INCTCC.
Requisitos Funcionais para Ambientes de Apoio ao Nível G do MPS.BR
Authors: Almendra Camilo , Bezerra Carla Ilane Moreira , Nunes Letícia Mara Fernandes , Coutinho Emanuel Ferreira
Published: May 2021

Organizações desenvolvedoras de software estão adotando modelos de qualidade como o MPS.BR para a melhoria de seus processos, e consequentemente seus produtos e serviços. A adoção de ambientes de apoio computacionais é um fator crítico de sucesso para iniciativas de melhoria de processos. Este trabalho tem como objetivo definir um conjunto de requisitos funcionais de referência para ambientes de apoio, que forneçam suporte a processos aderentes ao nível G do MPS.BR. Esse conjunto de requisitos pode apoiar a seleção de ambientes de suporte. Uma avaliação da ferramenta Redmine é apresentada com base nos requisitos de referência.
Um estudo empírico sobre o uso de métricas de segurança em ambientes reais
Authors: Miani Rodrigo S. , Zarpelão Bruno B , Mendes Leonardo S. 
Published: May 2021

A pesquisa proposta nesse trabalho é um passo inicial para compre- ender como as diferentes métricas de segurança propostas na literatura são aplicadas no cotidiano das empresas e qual é a visão desses profissionais sobre os problemas que exigem maiores cuidados. Os resultados encontrados revelam alguns padrões importantes sobre o uso de métricas na prática e destaca o valor da análise de métricas de segurança sob o ponto de vista de características como complexidade e importância.
Análise Dinâmica do Comportamento de Filas de Mensagens para o Aumento do Paralelismo de Consumo
Authors: Teixeira Eduardo Henrique , de Araújo Aletéia Patrícia
Published: May 2021

A elasticidade em computação consiste em dimensionar adequadamente os recursos necessários para processar uma aplicação distribuída. Para isso, são necessários mecanismos para evitar o fenômeno do limiar de detecção de elasticidade para cima ou para baixo. Este artigo propõe um middleware para analisar dinamicamente os ﬂuxos de filas de mensagens, e um mecanismo para aumentar o paralelismo de consumo baseado no comportamento da vazão. Dessa forma, é apresentada a arquitetura do middleware IOD (Increase On Demand) com suporte ao aumento e a diminuição de threads, para conter o crescimento de filas de mensagens, utilizando a técnica de heurísticas baseada em limites por um determinado tempo, e o agrupamento de mensagens em subfilas de acordo com um critério de classificação.
Técnicas de otimização em memória para algoritmos genéticos usando computadores multicore
Authors: Silva Harison , Martins Carlos , Soares Gustavo
Published: May 2021

Os algoritmos genéticos são heurísticas da computação evolucionária com características que permitem otimizações de memória em arquiteturas de computadores paralelos. Neste trabalho são apresentadas técnicas que tiram proveito destas características em relação a uma arquitetura específica, neste caso, de computadores com múltiplos núcleos e memória compartilhada. Os experimentos mostram que o ganho de desempenho em relação ao tempo de implementação motiva realizar tais procedimentos em algoritmos com casos similares.
Explorando a Elasticidade em Nível de Programação
Authors: Galante Guilherme , De Bona Luís Carlos
Published: May 2021

Diversos mecanismos para a exploração da elasticidade em nuvens computacionais tem sido propostos, no entanto, estes ainda apresentam uma série de limitações ao fornecer suporte a algumas classes de aplicações. Neste trabalho, propõe-se uma abordagem para o desenvolvimento de aplicações elásticas, na qual o controle da elasticidade é feito em nível de programação, permitindo que as ações de elasticidade sejam realizadas pela própria aplicação. A avaliação experimental comprova que o controle de elasticidade em nível de programação permite que novas funcionalidades sejam acrescidas a aplicações de diversos modelos, sem apresentar as restrições dos mecanismos de elasticidade atuais.
Implementação e Experimentação de Políticas de Escalonamento Baseadas na Aleatoriedade e nos Estados dos Recursos
Authors: Rodrigues Irwing , Ishii Renato , Gomes Antônio Tadeu , dos Reis Valéria
Published: May 2021

Este trabalho tem como objetivo a implementação e a avaliação de políticas de metaescalonamento que utilizam pouca ou nenhuma informação a respeito dos recursos na infraestrutura onde elas atuam. Para isso, foram realizados experimentos que simulam o sistema encontrado no SINAPAD, uma rede nacional de processamento de alto processamento disponível a comunidade científica nacional. Esses experimentos, como esperado, mostraram que políticas que utilizam informações facilmente obtidas, como a taxa de ocupação de CPU, levam a decisões de escalonamento melhores que a escolha aleatória de recursos. Dentre as políticas avaliadas, a política que obteve melhor desempenho foi baseada em um histórico de execuções prévias de tarefas e na estimativa de uso de CPU dos recursos. Tal política, por outro lado, foi uma das que necessitou de maior tempo de decisão. No entanto, o tempo gasto no momento do escalonamento tende a ser facilmente recuperado pelo ganho no tempo de execução que essa política é capaz de gerar.
Geração automática de hardware a partir de programas descritos em linguagem C com pragmas
Authors: Porto Lucas , Menotti Ricardo
Published: May 2021

Compiladores de síntese de alto nível vem se popularizando. Esses permitem transformar códigos de alto nível em hardware de maneira simples e rápida. As soluções atuais geram hardware que não exploram as técnicas que permitam melhorar o pipeline em hardware. Este trabalho apresenta o compilador LALPC que utiliza técnicas para explorar paralelismo em FPGAs a partir de projetos descritos em linguagem C. As técnicas permitem identificar e aplicar otimizações para acelerar trechos de códigos baseados em loops. LALPC é capaz de gerar sistemas de alto desempenho, permitindo a exploração de espaço de projeto pelo programador.
Um Método Numérico com Paralelismo no Tempo para Aproximar Soluções de EDP’s
Authors: da Silva Washington , de Castro Maria , de Moura Carlos
Published: May 2021

Este artigo apresenta um método numérico com paralelismo no tempo e investiga a sua viabilidade computacional. Esse método numérico está associado a problemas de condição inicial e de contorno para equações diferenciais parciais (evolutivas). A maioria dos métodos numéricos associados a equações diferencias parciais evolutivas e tradicionalmente encontrados na literatura contemplam apenas o paralelismo no espaço. A implementação foi desenvolvida em linguagem C utilizando a biblioteca MPI, para um cluster com mútiplos cores. A análise de desempenho dos resultados obtidos com os experimentos revelam um método numérico escalável e que exige pouca comunicação entre processadores.
CoreTool: Identificação e Análise de Threads em Sistemas Multicore
Authors: Koike Camila , Max Eduardo , Gheleri Rodolpho , Santos Ricardo
Published: May 2021

A disponibilidade de recursos de processamento nos processadores atuais aliada à complexidade do software faz com que ferramentas automatizadas sejam cada vez mais importantes no processo de validação e avaliação de aplicações multithreaded. Este artigo apresenta o desenvolvimento de uma ferramenta para análise do comportamento de threads em sistemas multicore. Especificamente, a ferramenta proposta, denominada CoreTool, acompanha o escalonamento e execução das threads de uma aplicação e retorna informações precisas sobre a utilização dos núcleos de processamento assim como a execução de instruções por thread. CoreTool foi desenvolvida a partir da infraestrutura PIN para instrumentação binária dinâmica de aplicações multithreaded. Experimentos de validação e avaliação foram realizados com a ferramenta e aplicações Linux e do benchmark Splash-2. Os experimentos foram executados sobre duas configurações de processadores multicore com quatro e oito núcleos. 1.
Algoritmo Kmeans para Mapeamento Estático de Processos em Redes-em-Chip
Authors: Avelar Cíntia , Penna Pedro , Freitas Henrique
Published: May 2021

Desempenho é um ponto crucial em arquiteturas many-core com networks-on-chip. Uma das alternativas para alcanç á-lo consiste em mapear processos nos núcleos de processamento de forma a minimizar o custo de comunicação global entre processos. Nesse contexto, esse trabalho propõe o algoritmo Kmeans como uma estratégia alternativa às heurísticas BRD e Guloso. Para determinados padrões de comunicação, os resultados de simulação apontaram que o Kmeans conduz a melhores mapeamentos que as outras estratégias, sendo portanto uma boa opção para o mapeamento de processos em arquiteturas many-core com networks-on-chip.
Accelerating Pre-stack Kirchhoff Time Migration by using SIMD Vector Instructions
Authors: Alves Maicon , Drummond Lúcia Maria , Pestana Reynam
Published: May 2021

The Pre-stack Kirchhoff Time Migration (PKTM) is a central process in petroleum exploration. As PKTM is computationally intensive, many works have proposed the use of accelerators like GPU and FPGA to improve its execution time. On the other hand, although many off-the-shelf processors are endowed with a set of SIMD vector instructions, few papers tackle the problem considering vectorization and, all of them, consider that compilers can successfully vectorize the code. In this paper, we show that a hand-written Kirchhoff code by using SIMD vector instructions is more efﬁcient than the autovectorized code provided by GCC. Experiments considering both real and synthetic datasets showed that our solution is up to eight times faster than the autovectorized one. We believe that the proposed strategy can be used together with the other ones to accelerate seismic migration methods in general without new investments in hardware and software.
Relógio Virtual Estritamente Crescente para o Computador Raspberry Pi
Authors: Corrêa Edilson , Dutra Diego , Amorim Claudio
Published: May 2021

Projetos de redes de sensores sem ﬁo requerem plataformas computacionais energeticamente eﬁcientes como a plataforma Raspberry Pi (RPI). Para esse ﬁm, um mecanismo típico que tais plataformas oferecem é o DVFS (Dynamic Voltage and Frequency Scale). Porém, o uso desse mecanismo pode afetar negativamente o desempenho dos circuitos contadores de tempo da plataforma RPI, em oposição a sua eﬁciência energética. Este trabalho propõe o relógio RVEC como uma nova solução que viabiliza o uso do contador de ciclos do processador ARM da plataforma RPI enquanto que garante a temporização ser estritamente crescente e precisa. A solução RVEC também provê resolução de nanosegundos com um custo de acesso equivalente aos dos relógios de sistemas.
Portabilidade com Eficiência da Advecção do Modelo BRAMS entre Arquiteturas Multi-Core e Many-Core
Authors: da Silva Jr. Manoel , Panetta Jairo , Stephany Stephan
Published: May 2021

Este trabalho investiga a possibilidade de se obter portabilidade com eficiência do código da advecção de escalares para arquiteturas multicore e many-core utilizando diretivas OpenMP e OpenACC. O código da advecção utilizado neste estudo é um trecho da dinâmica do modelo meteorológico regional BRAMS, correntemente executado em produção no CPTEC/INPE, paralelizado com a biblioteca de comunicação por troca de mensagens MPI. Demonstramos que é possível obter desempenho aceitável nas duas arquiteturas com umaúnica codificação contendo as duas classes de diretivas.
Impacto de estratégias combinatórias no precondicionador paralelo híbrido SPIKE
Authors: Lugon Brenno , Catabriga Lucia , Rangel Maria , de Lima Leonardo
Published: May 2021

Neste trabalho, utilizamos o algoritmo paralelo híbrido SPIKE como um precondicionador para um método iterativo não-estacionário combinando as arquiteturas de memória distribuída e compartilhada, MPI e OpenMP. A ﬁm de obter um bom precondicionador, resolvemos um conjunto de problemas combinatórios como reordenamentos e particionamento de grafos. Apresentamos os resultados avaliando a inﬂuência de cada estratégia na convergência e tempo de CPU do método iterativo.
Scheduling Moldable BSP Tasks on Clouds
Authors: Okada Thiago , Gonzáles Marcos , vel Lejbman Alfredo
Published: May 2021

O foco deste estudo é escalonamento de tarefas BSP moldáveis em ambientes de computação em nuvem. "Moldável" neste contexto está relacionado em possivelmente reduzir o número de processadores requisitados por uma tarefa BSP, recalculando seu custo de execução total a partir de um modelo de custo. A partir daí, analisamos como uma tarefa BSP moldável é inﬂuenciada pelo comportamento imprevisível das nuvens, simulando a execução de diversas tarefas BSP em nuvens computacionais públicas. O objetivo desse artigo é analisar a diferença entre o tempo de término daúltima tarefa (makespan), tanto em simulação quanto em nuvens reais, analisando os resultados e concluindo o quanto um modelo teórico é próximo a realidade.
Comparando o Desempenho de Implementações de Tabelas Hash Concorrentes em Haskell
Authors: Duarte Rodrigo , Du Bois André , Pilla Maurício , Reiser Renata
Published: May 2021

Implementar um algoritmo de tabela hash concorrente que extraia desempenho está longe de ser trivial. Neste artigo apresentamos sete diferentes implementações de tabelas hash em Haskell, explorando desde modelos de sincronização de baixo nível até os de mais alta abstração como memórias transacionais. Nos testes realizados a implementação usando a biblioteca STM Haskell de memória transacional foi a que apresentou melhor desempenho.
Otimização de Simulação de Computação Quântica Através da Redução e Decomposição Baseados no Operador Identidade
Authors: Avila Anderson , Reiser Renata , Pilla Maurício
Published: May 2021

Um dos maiores obstáculos para a simulação de algoritmos quânticos é o crescimento exponencial nas complexidades espaciais e temporais, especialmente em transformações quânticas densas como o operador Hadamard. Neste trabalho, são introduzidas novas otimizações para a execução de transformações quânticas no ambiente Distributed Geometric Machine (DGM).Ao invés de executá-las em umúnico passo, estas são decompostas e apenas os valores que diferem do operador Identidade são armazenados. Como benchmark, transformações Hadamard foram simuladas com até 28 qubits em uma GPU. Comparando à implementação anterior, os resultados foram 10.829x mais rápidos e permitiram a simulação de um número maior de qubits.
Reavaliando o Conjunto de Aplicações STAMP em um Novo Hardware Transacional
Authors: de Carvalho João P. , Murari Rafael , Baldassin Alexandro
Published: May 2021

Nos últimos quatro anos, IBM® e Intel® disponibilizaram processadores com suporte para memória transacional. A maioria dos trabalhos avaliaram esses processadores usando as aplicações STAMP e consideraram apenas as causas de cancelamentos das aplicações como um todo. Neste trabalho, apresenta-se uma análise por transação do STAMP e contrasta-se diferentes métricas de desempenho para determinar os motivos fundamentais pelo baixo desempenho do HaswellTM em algumas aplicações. Em resumo, os resultados mostram que uma transação domina o tempo de execução e tem poucas efetivações porque excede a capacidade restrita do processador, ou gera muitos conﬂitos quando executada em hardware.
Análise da Eficiência Energética de uma Aplicação HPC de Geofísica em um Cluster de Baixo Consumo
Authors: Bez Jean Luca , Bernart Eliezer , dos Santos Fernando , Schnorr Lucas , Navaux Phillipe
Published: May 2021

Neste artigo buscamos analisar a viabilidade e a eﬁciência energética ao utilizar um cluster não convencional de processadores ARM para executar uma aplicação cientíﬁca real. Utilizamos, para este ﬁm, o Ondes3D que permite simular eventos geofísicos. Apresentamos um comparativo entre a execução da aplicação empregando diferentes ﬂags de compilação e diferentes valores para a frequência do processador. Os resultados demonstraram ganhos de até 54.24% no tempo para a solução e 53.24% na energia para a solução, quando comparado com a execução sem nenhuma otimização. Estes resultados apontam que é possível explorar tal plataforma através da correta conﬁguração do ambiente para se obter um bom equilíbrio entre desempenho e custo energético.
Soziale Aspekte des Leidens
Authors: Mierzwa Roland
Published: May 2021

Several unresolved social and political challenges have engendered suffering and illness. Social problems have become an issue in medical ethics. Medication is being prescribed or psychological therapy recommended in cases where sociopolitical intervention is necessary. What we are dealing with is a high mortality rate as a consequence of social exclusion and discrimination plus an imperial way of life.

This book explains the phenomenology of suffering as the foundations of empathetic ethics and reveals ways for social ethics to intervene to prevent illness, suffering and death on a huge scale, which are needed particularly urgently at the moment as a result of the coronavirus crisis. The book also highlights courses of action that Christians and their milieus can take in this respect.
Analysis of the Orthodontic Exams in Department of Orthodontics of Shahid Beheshti Dental School
Authors: Dalaei Kazem , Khorsand Nobahar Ali , Behnaz Mohammad , Nouri Mahtab , Anbari Fahimeh
Published: May 2021

Background: Exams are an inseparable part of education, and they are the main tool to evaluate the results of educational process. If based on scientific rules, exams can show the level of achievement to educational goals. Objectives: This study aimed to evaluate the quality of orthodontic exams in Shahid Beheshti Dental School, Iran. Methods: In this cross-sectional study, the quality of all written and multiple-choice questions (MCQ) exams of orthodontic department in 2014 - 2015 were evaluated in terms of content validity, structural rules, discrimination index, difficulty index, and taxonomy. To collect the data, the Millman checklist, content analysis table, and standard formula were used. SPSS software version 21 was used to analyze the data. T-test, chi square, and independent sample test were used for statistical analysis. Results: Our results showed that 86.55% of exams were in MCQ form and 13.5% in written form. Content validity was considered in 94.8% of exams. Standard structural rules were observed in 93.61% of questions. Discriminative index and difficulty index were estimated to be 41.6 and 68.8%, respectively. Also, 43.7% of questions were categorized as taxonomy I, 44.38% as taxonomy II, and 11.58% as taxonomy III. Conclusions: Exams held in Shahid Beheshti Dental School in the 2014 - 2015 academic year were acceptable considering their content validity, structural rules, and difficulty index. However, their discrimination index was low, and they were in poor conditions in terms of taxonomy.
Ruptured Hydatid Cysts Resulted in Infectious Pericardial Effusion and Development of Cardiac Tamponade: A Rare Presentation
Authors: Alizadeh sani Zahra , Azdaki Nahid , Moezi SeyedAli , Behjati Mohaddeseh , Alizadehsani Roohallah , Shoeibi Afshin , Khosravi Abbas , Nahavandi Saeid , Shariful Islam Sheikh Mohammed
Published: May 2021

Introduction: Cardiac Hydatidosis is a rare and ominous complication of hydatid disease. Cardiac echinococcosis may be asymptomatic for several years but could be discovered after the development of lethal complications. Case Presentation: A 31-year-old-male referred with possible diagnosis of acute pericarditis. Abdominal and pelvic spiral CT scan showed focal and heterogeneous increased thickness of lateral left ventricular (LV) wall with protrusion into LV and bulging into pericardial space without central enhancement. His condition deteriorated suddenly due to cardiac tamponade with round cystic lesions suspected to hydatid cyst. Cardiac magnetic resonance imaging showed some round particles within effusion suggestive of possible scolex around the LV. There was round, and inhomogeneous cystic mass originated from sub-epicardial layer of mid-lateral LV that protruded into pericardial space. Diagnosis of hydatic cyst was confirmed by surgical specimen. Conclusions: We suggest that patients with pericarditis should be probed with echocardiography for the presence of hydatid cysts.