bluuebunny/crossref_metadata_2025 huggingface dataset:
Narrative and Spatial Form in Digital Media
Authors: Black Michael L.
Published: April 2012

Simplistic by today’s standards, the graphical adventure genre has been overlooked in favor of the vast narratives unfolding across more recent three-dimensional virtual worlds and the complex social relationships within online environments. Yet this genre established practices in game construction that allow developers to foreground narrative experiences. Graphical adventure games made with the Script Creation Utility for Maniac Mansion (SCUMM) engine like Ron Gilbert’s The Secret of Monkey Island were among the earliest to produce a sense of a temporal narrativity across the game’s many spaces that is not inscribed explicitly at the level of code. These games are therefore key to understanding the origins of video games as a narrative medium. This essay examines the source code to the SCUMM engine in order to show both how its spatialized data structures were used to produce temporal effects similar to those found in more familiar narrative media and how Monkey Island parodies the engine’s mechanisms.
Looking Beneath the Surface
Authors: Lynch Shannon M. , Fritch April , Heath Nicole M.
Published: April 2012

Female offenders report higher rates of interpersonal violence (IPV) and mental health problems than incarcerated men. The purpose of this study was to describe the nature of incarcerated women’s ( N = 102) IPV experiences, to investigate characteristics of IPV as predictors of current mental health, and to explore women’s perceptions of their treatment needs. Utilizing multivariate multiple regression analyses, the authors found that recent partner violence, multiple types of IPV, chronic IPV, and distress at the time of the IPV were all significant predictors of current mental health. In narrative responses, participants recognized the connection between IPV and their mental health and indicated a need for trauma-informed interventions.
Out of Sight Should Not Be Out of Mind
Authors: Ault Mark J. , Rosen Bradley T.
Published: April 2012

Paracentesis is a commonly performed procedure in both inpatient and outpatient settings. Useful for diagnostic and therapeutic purposes, prior studies have documented the inherent safety of this procedure. In proper hands, modern techniques such as the use of safety (Turkel) tipped needles and ultrasound localization have reduced the risk of major complications to less than 1%. Nevertheless, major bleeding remains a dreaded complication of this procedure, especially in patients with liver failure. Our historical experience has been that this complication is unpredictable, likely because of procedural injury to an abdominal wall artery or peritoneal varix. The authors report a case where the risk of vascular injury was mitigated using portable ultrasound and suggest a simple procedure for future risk reduction.
Mate Preferences Across Life and Across the World
Authors: Brumbaugh Claudia Chloe , Wood Dustin
Published: April 2012

A body of research has demonstrated that people adopt a more interpersonally positive orientation as they age. The current study extends this line of research by examining how mate preferences shift as a function of age. Our worldwide sample rated their attraction to various photographs and completed self-report measures of attraction. Based on a revealed preference measure, the authors found that older individuals preferred people who displayed communal characteristics, and this pattern was fairly universal. On the other hand, self-reported preferences were less consistent. The authors’ findings suggest that, in addition to becoming more agreeable with age, people are drawn to others with similarly agreeable qualities. This universal pattern indicates that mate preferences across the life span shift largely toward increased preference for communal characteristics.
Control of murine Ly6Chigh monocyte traffic and immunosuppressive activities by atypical chemokine receptor D6
Authors: Savino Benedetta , Castor Marina G. , Caronni Nicoletta , Sarukhan Adelaida , Anselmo Achille , Buracchi Chiara , Benvenuti Federica , Pinho Vanessa , Teixeira Mauro M. , Mantovani Alberto , Locati Massimo , Bonecchi Raffaella
Published: April 2012

The atypical chemokine receptor D6 is a decoy and scavenger receptor for most inflammatory CC chemokines and prevents the development of exacerbated inflammatory reactions. Here we report that mice lacking D6 expression in the nonhematopoietic compartment have a selective increase in the number of Ly6Chigh monocytes in the circulation and in secondary lymphoid tissues. Under inflammatory conditions, Ly6Chigh monocytes accumulate in increased number in secondary lymphoid organs of D6−/− mice in a CCR2-dependent manner. Ly6Chigh monocytes derived from D6−/− mice have enhanced immunosuppressive activity, inhibit the development of adaptive immune responses, and partially protect mice from the development of GVHD. Thus, control of CCR2 ligands by D6 regulates the traffic of Ly6Chigh monocytes and controls their immunosuppressive potential.
A context-based approach to identify the most likely mapping for RNA-seq experiments
Authors: Bonfert Thomas , Csaba Gergely , Zimmer Ralf , Friedel Caroline C
Published: April 2012

Background

Sequencing of mRNA (RNA-seq) by next generation sequencing technologies is widely used for analyzing the transcriptomic state of a cell. Here, one of the main challenges is the mapping of a sequenced read to its transcriptomic origin. As a simple alignment to the genome will fail to identify reads crossing splice junctions and a transcriptome alignment will miss novel splice sites, several approaches have been developed for this purpose. Most of these approaches have two drawbacks. First, each read is assigned to a location independent on whether the corresponding gene is expressed or not, i.e. information from other reads is not taken into account. Second, in case of multiple possible mappings, the mapping with the fewest mismatches is usually chosen which may lead to wrong assignments due to sequencing errors.

Results

To address these problems, we developed ContextMap which efficiently uses information on the context of a read, i.e. reads mapping to the same expressed region. The context information is used to resolve possible ambiguities and, thus, a much larger degree of ambiguities can be allowed in the initial stage in order to detect all possible candidate positions. Although ContextMap can be used as a stand-alone version using either a genome or transcriptome as input, the version presented in this article is focused on refining initial mappings provided by other mapping algorithms. Evaluation results on simulated sequencing reads showed that the application of ContextMap to either TopHat or MapSplice mappings improved the mapping accuracy of both initial mappings considerably.

Conclusions

In this article, we show that the context of reads mapping to nearby locations provides valuable information for identifying the best unique mapping for a read. Using our method, mappings provided by other state-of-the-art methods can be refined and alignment accuracy can be further improved.

Availability

http://www.bio.ifi.lmu.de/ContextMap.
High glucose concentrations induce TNF-α production through the down-regulation of CD33 in primary human monocytes
Authors: Gonzalez Yolanda , Herrera M Teresa , Soldevila Gloria , Garcia-Garcia Lourdes , Fabián Guadalupe , Pérez-Armendariz E Martha , Bobadilla Karen , Guzmán-Beltrán Silvia , Sada Eduardo , Torres Martha
Published: April 2012

Background

CD33 is a membrane receptor containing a lectin domain and a cytoplasmic immunoreceptor tyrosine-based inhibitory motif (ITIM) that is able to inhibit cytokine production. CD33 is expressed by monocytes, and reduced expression of CD33 correlates with augmented production of inflammatory cytokines, such as IL-1β, TNF-α, and IL-8. However, the role of CD33 in the inflammation associated with hyperglycemia and diabetes is unknown. Therefore, we studied CD33 expression and inflammatory cytokine secretion in freshly isolated monocytes from patients with type 2 diabetes. To evaluate the effects of hyperglycemia, monocytes from healthy donors were cultured with different glucose concentrations (15-50 mmol/l D-glucose), and CD33 expression and inflammatory cytokine production were assessed. The expression of suppressor of cytokine signaling protein-3 (SOCS-3) and the generation of reactive oxygen species (ROS) were also evaluated to address the cellular mechanisms involved in the down-regulation of CD33.

Results

CD33 expression was significantly decreased in monocytes from patients with type 2 diabetes, and higher levels of TNF-α, IL-8 and IL-12p70 were detected in the plasma of patients compared to healthy donors. Under high glucose conditions, CD33 protein and mRNA expression was significantly decreased, whereas spontaneous TNF-α secretion and SOCS-3 mRNA expression were increased in monocytes from healthy donors. Furthermore, the down-regulation of CD33 and increase in TNF-α production were prevented when monocytes were treated with the antioxidant α-tocopherol and cultured under high glucose conditions.

Conclusion

Our results suggest that hyperglycemia down-regulates CD33 expression and triggers the spontaneous secretion of TNF-α by peripheral monocytes. This phenomenon involves the generation of ROS and the up-regulation of SOCS-3. These observations support the importance of blood glucose control for maintaining innate immune function and suggest the participation of CD33 in the inflammatory profile associated with type 2 diabetes.
Hepatitis B surface antigen variants in voluntary blood donors in Nanjing, China
Authors: Yong-lin Yang , Qiang Fu , Ming-shun Zhang , Jie Cai , Gui-ming Ma , Zu-hu Huang , Xu-bing Cai
Published: April 2012

Background

Hepatitis B virus (HBV) is still one of the serious infectious risks for the blood transfusion safety in China. One plausible reason is the emergence of the variants in the major antigenic alpha determinant within the major hydrophilic region (MHR) of hepatitis B surface antigen (HBsAg), which have been assumed to evade the immune surveillance and pose a challenge to the disease diagnosis. It is well documented that some commercial ELISA kits could detect the wild-type but not the mutant viruses. The high prevalence of HBV in China also impaired the application of nucleic acid testing (NAT) in the improvement of blood security. Molecular epidemiological study of HBsAg variations in China is still limited. This study was designed to identify the prevalence of mutations in the HBsAg in voluntary blood donors in Nanjing, China.

Methods

A total of 20,326 blood units were enrolled in this study, 39 donors were positive for HBV S gene in the nested-PCR. Mutations in the major hydrophilic region (MHR; aa 99-169) were identified by direct sequencing of S region.

Results

Among of 20,326 blood units in the Red Cross Transfusion Center of Nanjing from October 2008 to April 2009, 296 samples (1.46%, 296/20,326) were HBsAg positive in the 2 successive rounds of the ELISA test. In these HBsAg positive units, HBV S gene could be successfully amplified from 39 donors (13.18%, 39/296) in the nested-PCR. Sequence analysis revealed that 32 strains (82.1%, 32/39) belong to genotype B, 7 strains (17.9%, 7/39) to genotype C. Besides well known G145R, widely dispersed variations in the MHR of S region, were observed in 20 samples of all the strains sequenced.

Conclusions

HBV/B and HBV/C are dominant in Nanjing, China. The mutations in the MHR of HBsAg associated with disease diagnosis are common.
Sim2 prevents entry into the myogenic program by repressing MyoD transcription during limb embryonic myogenesis
Authors: Havis Emmanuelle , Coumailleau Pascal , Bonnet Aline , Bismuth Keren , Bonnin Marie-Ange , Johnson Randy , Fan Chen-Min , Relaix Frédéric , Shi De-Li , Duprez Delphine
Published: April 2012

The basic helix-loop-helix transcription factor MyoD is a central actor that triggers the skeletal myogenic program. Cell-autonomous and non-cell-autonomous regulatory pathways must tightly control MyoD expression to ensure correct initiation of the muscle program at different places in the embryo and at different developmental times. In the present study, we have addressed the involvement of Sim2 (single-minded 2) in limb embryonic myogenesis. Sim2 is a bHLH-PAS transcription factor that inhibits transcription by active repression and displays enhanced expression in ventral limb muscle masses during chick and mouse embryonic myogenesis. We have demonstrated that Sim2 is expressed in muscle progenitors that have not entered the myogenic program, in different experimental conditions. MyoD expression is transiently upregulated in limb muscle masses of Sim2–/– mice. Conversely, Sim2 gain-of-function experiments in chick and Xenopus embryos showed that Sim2 represses MyoD expression. In addition, we show that Sim2 represses the activity of the mouse MyoD promoter in primary myoblasts and is recruited to the MyoD core enhancer in embryonic mouse limbs. Sim2 expression is non-autonomously and negatively regulated by the dorsalising factor Lmx1b. We propose that Sim2 represses MyoD transcription in limb muscle masses, through Sim2 recruitment to the MyoD core enhancer, in order to prevent premature entry into the myogenic program. This MyoD repression is predominant in ventral limb regions and is likely to contribute to the differential increase of the global mass of ventral muscles versus dorsal muscles.
Response to the BMP gradient requires highly combinatorial inputs from multiple patterning systems in the Drosophila embryo
Authors: Liang Hsiao-Lan , Xu Mu , Chuang Yi-Chun , Rushlow Christine
Published: April 2012

Pattern formation in the developing embryo relies on key regulatory molecules, many of which are distributed in concentration gradients. For example, a gradient of BMP specifies cell fates along the dorsoventral axis in species ranging from flies to mammals. In Drosophila, a gradient of the BMP molecule Dpp gives rise to nested domains of target gene expression in the dorsal region of the embryo; however, the mechanisms underlying the differential response are not well understood, partly owing to an insufficient number of well-studied targets. Here we analyze how the Dpp gradient regulates expression of pannier (pnr), a candidate low-level Dpp target gene. We predicted that the pnr enhancer would contain high-affinity binding sites for the Dpp effector Smad transcription factors, which would be occupied in the presence of low-level Dpp. Unexpectedly, the affinity of Smad sites in the pnr enhancer was similar to those in the Race enhancer, a high-level Dpp target gene, suggesting that the affinity threshold mechanism plays a minimal role in the regulation of pnr. Our results indicate that a mechanism involving a conserved bipartite motif that is predicted to bind a homeodomain factor in addition to Smads and the Brinker repressor, establishes the pnr expression domain. Furthermore, the pnr enhancer has a highly complex structure that integrates cues not only from the dorsoventral axis, but also from the anteroposterior and terminal patterning systems in the blastoderm embryo.
The Effect of Budgetary Restrictions on Breast Cancer Diagnostic Decisions
Authors: Ayvaci Mehmet U. S. , Alagoz Oguzhan , Burnside Elizabeth S.
Published: April 2012

We develop a finite-horizon discrete-time constrained Markov decision process (MDP) to model diagnostic decisions after mammography where we maximize the total expected quality-adjusted life years (QALYs) of a patient under resource constraints. We use clinical data to estimate the parameters of the MDP model and solve it as a mixed-integer program. By repeating optimization for a sequence of budget levels, we calculate incremental cost-effectiveness ratios attributable to consecutive levels of funding and compare actual clinical practice with optimal decisions. We prove that the optimal value function is concave in the allocated budget. Comparing to actual clinical practice, using optimal thresholds for decision making may result in approximately 22% cost savings without sacrificing QALYs. Our analysis indicates short-term follow-ups are the immediate target for elimination when budget becomes a concern. Policy change is more drastic in the older age group with the increasing budget, yet the gains in total expected QALYs related to larger budgets are predominantly seen in younger women along with modest gains for older women.
Integrated Block Sharing: A Win–Win Strategy for Hospitals and Surgeons
Authors: Day Robert , Garfinkel Robert , Thompson Steven
Published: April 2012

We consider the problem of balancing two competing objectives in the pursuit of efficient management of operating rooms in a hospital: providing surgeons with predictable, reliable access to the operating room and maintaining high utilization of capacity. The common solution to the first problem (in practice) is to grant exclusive “block time,” in which a portion of the week in an operating room is designated to a particular surgeon, barring other surgeons from using this room/time. As a major improvement over this existing approach, we model the possibility of “shared” block time, which need only satisfy capacity constraints in expectation. We reduce the computational difficulty of the resulting NP-hard block-scheduling problem by implementing a column-generation approach and demonstrate the efficacy of this technique using simulation, calibrated to a real hospital's historical data and objectives.Our simulations illustrate substantial benefits to hospitals under a variety of circumstances and demonstrate the advantages of our new approach relative to a benchmark method taken from the recent literature.
InformationHang-oversin Healthcare Service Systems
Authors: Lahiri Atanu , Seidmann Abraham
Published: April 2012

The literature on business process design has focused on issues such as bottlenecks, workflow configuration (series versus parallel), replacing an existing workflow with a shorter one, etc. One important issue that has not received adequate attention is the information-intensive nature of medical service systems. Performance of clinical workflows depends not only on how various steps are carried out but also on when certain information items are collected. We report the results of a long-term empirical study that looked at the implementation of a radiology information system (RIS) at a large regional network of radiology clinics. We find that a failure to gather necessary clinical background information in earlier steps significantly delays later steps and causes them to hang over, with a significant impact on the total turnaround time of diagnostic reports. We show that information systems can solve this problem by separating the task of gathering information from its usage and relocating that task upstream in the workflow. We argue that such unbundling can lead to shorter report turnaround times even if it significantly increases the utilization of the bottleneck server. These results have broader implications for the optimal design of other clinical workflows, such as the process of filling prescriptions in pharmacies or the typical surgical preanesthesia evaluation in hospitals. Finally, we explain why the impact of addressing hang-over is often nonuniform across clinical modalities, providers, and patient types.
Properties and Power of the Drosophila Synthetic Population Resource for the Routine Dissection of Complex Traits
Authors: King Elizabeth G , Macdonald Stuart J , Long Anthony D
Published: April 2012

The Drosophila Synthetic Population Resource (DSPR) is a newly developed multifounder advanced intercross panel consisting of >1600 recombinant inbred lines (RILs) designed for the genetic dissection of complex traits. Here, we describe the inference of the underlying mosaic founder structure for the full set of RILs from a dense set of semicodominant restriction-site–associated DNA (RAD) markers and use simulations to explore how variation in marker density and sequencing coverage affects inference. For a given sequencing effort, marker density is more important than sequence coverage per marker in terms of the amount of genetic information we can infer. We also assessed the power of the DSPR by assigning genotypes at a hidden QTL to each RIL on the basis of the inferred founder state and simulating phenotypes for different experimental designs, different genetic architectures, different sample sizes, and QTL of varying effect sizes. We found the DSPR has both high power (e.g., 84% power to detect a 5% QTL) and high mapping resolution (e.g., ∼1.5 cM for a 5% QTL).
Chaperoning the Chaperone: A Role for the Co-chaperone Cpr7 in Modulating Hsp90 Function in Saccharomyces cerevisiae
Authors: Zuehlke Abbey D , Johnson Jill L
Published: April 2012

Heat-shock protein 90 (Hsp90) of Saccharomyces cerevisiae is an abundant essential eukaryotic molecular chaperone involved in the activation and stabilization of client proteins, including several transcription factors and oncogenic kinases. Hsp90 undergoes a complex series of conformational changes and interacts with partner co-chaperones such as Sba1, Cpr6, Cpr7, and Cns1 as it binds and hydrolyzes ATP. In the absence of nucleotide, Hsp90 is dimerized only at the carboxy-terminus. In the presence of ATP, Hsp90 also dimerizes at the amino-terminus, creating a binding site for Sba1. Truncation of a charged linker region of yeast Hsp90 (Hsp82Δlinker) was known to disrupt the ability of Hsp82 to undergo amino-terminal dimerization and bind Sba1. We found that yeast expressing Hsp82Δlinker constructs exhibited a specific synthetic lethal phenotype in cells lacking CPR7. The isolated tetratricopeptide repeat domain of Cpr7 was both necessary and sufficient for growth in those strains. Cpr6 and Cpr7 stably bound the carboxy-terminus of wild-type Hsp82 only in the presence of nonhydrolyzable ATP and formed an Hsp82–Cpr6–Cpr7 ternary complex. However, in cells expressing Hsp82Δlinker or lacking CPR7, Cpr6 was able to bind Hsp82 in the presence or absence of nucleotide. Overexpression of CNS1, but not of other co-chaperones, in cpr7 cells restored nucleotide-dependent Hsp82–Cpr6 interaction. Together, our results suggest that the in vivo functions of Cpr7 include modulating Hsp90 conformational changes, mediating proper signaling of the nucleotide-bound state to the carboxy-terminus of Hsp82, or regulating Hsp82–Cpr6 interaction.
Ribosomal DNA Organization Before and After Magnification in Drosophila melanogaster
Authors: Bianciardi Alessio , Boschi Manuela , Swanson Ellen E , Belloni Massimo , Robbins Leonard G
Published: April 2012

In all eukaryotes, the ribosomal RNA genes are stably inherited redundant elements. In Drosophila melanogaster, the presence of a Ybb− chromosome in males, or the maternal presence of the Ribosomal exchange (Rex) element, induces magnification: a heritable increase of rDNA copy number. To date, several alternative classes of mechanisms have been proposed for magnification: in situ replication or extra-chromosomal replication, either of which might act on short or extended strings of rDNA units, or unequal sister chromatid exchange. To eliminate some of these hypotheses, none of which has been clearly proven, we examined molecular-variant composition and compared genetic maps of the rDNA in the bb2 mutant and in some magnified bb+ alleles. The genetic markers used are molecular-length variants of IGS sequences and of R1 and R2 mobile elements present in many 28S sequences. Direct comparison of PCR products does not reveal any particularly intensified electrophoretic bands in magnified alleles compared to the nonmagnified bb2 allele. Hence, the increase of rDNA copy number is diluted among multiple variants. We can therefore reject mechanisms of magnification based on multiple rounds of replication of short strings. Moreover, we find no changes of marker order when pre- and postmagnification maps are compared. Thus, we can further restrict the possible mechanisms to two: replication in situ of an extended string of rDNA units or unequal exchange between sister chromatids.
Effects of Ad-atom Diffusivity Throughout Sb-Mediated Formation of Ge/Si Nanoislands
Authors: Tonkikh Alexander A. , Zakharov Nikolay D. , Suvorova Alexandra A. , Werner Peter
Published: April 2012

The effect of Sb on the formation of Ge nano islands in Si by means of molecular beam epitaxy is reported. We observe in the Ge/Si(100) system a non-monotonic dependence of the Stranski-Krastanov critical thickness of Ge islands formation on the adsorbed Sb amount. Dome- and hut-shaped Ge islands are replaced with the pyramids, when Ge is deposited on the Sb-covered Si(100) surface. The Sb-mediated conservation of the shape of Ge islands during embedding them in Si is shown. We assume that the decrease of the surface diffusion of Si and Ge ad-atoms causes these effects.
Neurosarcoidosis: guidance for the general neurologist
Authors: Dutra Lívia Almeida , Braga-Neto Pedro , Oliveira Ricardo Araújo , Pedroso José Luiz , Abrahão Agessandro , Barsottini Orlando Graziani Povoas
Published: April 2012

Neurosarcoidosis (NS) more commonly occurs in the setting of systemic disease. The diagnosis is based on a clinical history suggestive of NS, presence of noncaseating granulomas, and supportive evidence of sarcoid pathology, laboratory, and imaging studies. NS could involve any part of the nervous system and often demands high doses of steroids for symptom control. It presents low response to isolated steroids administration and frequently requires immunosuppressive agents. In NS, lymphocytes are polarized toward an excessive Th1 response, leading to overproduction of TNF-alpha and INF-gama, as well as lL-2 and IL-15. Infliximab, a chimeric monoclonal antibody that neutralizes the biological activity of TNF-alpha, is a new option in the NS treatment. We revised pathophysiology, clinical manifestations, diagnostic work up, and treatment of NS as guidance for the general neurologist.
Promoção, prevenção e cuidado da hipertensão arterial no Brasil
Authors: Piccini Roberto Xavier , Facchini Luiz Augusto , Tomasi Elaine , Siqueira Fernando Vinholes , Silveira Denise Silva da , Thumé Elaine , Silva Suele M , Dilelio Alitéia Santiago
Published: April 2012

OBJETIVO: Estimar a prevalência de ações de promoção, prevenção e cuidado da hipertensão arterial em adultos e identificar sua associação com estado descompensado de hipertensão. MÉTODOS: Estudo epidemiológico transversal de base populacional realizado por meio de entrevista com 12.324 adultos, de 20 a 59 anos, em 100 municípios brasileiros. As variáveis independentes, consideradas como promoção, prevenção e cuidado, foram: ter recebido orientações sobre a manutenção do peso ideal e sobre atividade física; ter consultado um médico e ter realizado eletrocardiograma no último ano. Pressão arterial acima de 140/90 mmHg foi considerada estado descompensado, sendo a variável dependente para a avaliação da qualidade do cuidado. RESULTADOS: Do total, 16,3% (n = 2.004) referiram diagnóstico médico de hipertensão. As maiores prevalências de hipertensão foram observadas na categoria de idade de 50 a 59 anos, concentradas nas regiões Sudeste e Centro-Oeste. Mais da metade (66,1%) esteve em consulta médica por hipertensão no último ano, da qual metade (52,4%) realizou eletrocardiograma. Dos hipertensos que tiveram sua pressão arterial aferida na entrevista (74,6%), menos da metade (42,4%) apresentava cifras tensionais descompensadas. CONCLUSÕES: Não houve associação entre haver consultado médico no último ano e cifras tensionais descompensadas. A proporção de hipertensos descompensados foi significativamente menor entre os que foram orientados para manter o peso ideal, realizar atividade física e os que fizeram eletrocardiograma. Ser do sexo masculino, ter idade acima de 40 anos e habitar na região Sul mostraram-se associados a estado descompensado da hipertensão.
Indicadores de desempenho e decisão sobre terceirização em rede pública de laboratórios
Authors: Santos Maria Angelica Borges dos , Moraes Ricardo Montes de , Passos Sonia Regina Lambert
Published: April 2012

OBJETIVO: Elaborar indicadores de desempenho e terceirização em rede de laboratórios clínicos, baseados em sistemas de informações e registros administrativos públicos. MÉTODOS: A rede tinha 33 laboratórios com equipamentos automatizados, mas sem informatização, 90 postos de coleta e 983 funcionários, no município de Rio de Janeiro, RJ. As informações foram obtidas de registros administrativos do Sistema de Informações de Orçamentos Públicos para a Saúde e do Sistema de Informações Ambulatoriais e Hospitalares do Sistema Único de Saúde. Os indicadores (produção, produtividade, utilização e custos) foram elaborados com dados colhidos como rotina de 2006 a 2008. As variações da produção, custos e preços unitários dos testes no período foram analisadas por índices de Laspeyres e de Paasche, específicos para medir a atividade dos laboratórios, e pelo Índice de Preços ao Consumidor Amplo do Instituto Brasileiro de Geografia e Estatística. RESULTADOS: A produção foi de 10.359.111 testes em 2008 (aumento de 10,6% em relação a 2006) e a relação testes/funcionário cresceu 8,6%. As despesas com insumos, salários e prestador conveniado aumentaram, respectivamente 2,3%, 45,4% e 18,3%. Os testes laboratoriais por consulta e internação cresceram 10% e 20%. Os custos diretos totalizaram R$ 63,2 milhões em 2008, com aumento de 22,2% em valores correntes no período. Os custos diretos deflacionados pelo Índice de Preços ao Consumidor Amplo (9,5% para o período) mostram aumento do volume da produção de 11,6%. O índice de volume específico para a atividade, que considera as variações do mix de testes, mostrou aumento de 18,5% no preço unitário do teste e de 3,1% no volume da produção. CONCLUSÕES: Os indicadores, em especial os índices específicos de volume e preços da atividade, constituem uma linha de base de desempenho potencial para acompanhar laboratórios próprios e terceirizados. Os indicadores de desempenho econômicos elaborados mostram a necessidade de informatização da rede, antecedendo a decisão de terceirização.
Morbidade materna extremamente grave: uso do Sistema de Informação Hospitalar
Authors: Magalhães Maria da Consolação , Bustamante-Teixeira Maria Teresa
Published: April 2012

OBJETIVO: Estimar a prevalência da morbidade materna extremamente grave e identificar procedimentos hospitalares associados. MÉTODOS: Foram utilizados dados do Sistema de Informação Hospitalar fornecidos pela Secretaria de Saúde de Juiz de Fora, MG, de 2006 a 2007. Foram selecionadas as internações para procedimentos obstétricos (n = 8.620 mulheres) cujo diagnóstico principal compreendia todo o capítulo XV, gravidez, parto e puerpério, da Classificação Estatística Internacional de Doenças e Problemas Relacionados à Saúde, Décima Revisão. Foram identificados os códigos dos procedimentos realizados, procedimentos especiais e atos profissionais que pudessem contemplar o critério de morbidade materna extremamente grave da Organização Mundial da Saúde e outros procedimentos não habitualmente utilizados no período gravídico-puerperal. A análise de regressão logística foi utilizada para identificar associações entre desfecho e variáveis selecionadas. RESULTADOS: A prevalência de morbidade materna foi 37,8/1000 mulheres e a proporção de mortalidade foi 12/100.000 mulheres. O tempo de internação > 4 dias foi 13 vezes mais alto entre as mulheres que apresentaram alguma morbidade. Após análise ajustada, os fatores preditores de morbidade materna extremamente grave foram: tempo de internação, número de internações e filhos natimortos, e os procedimentos/condições mais frequentes foram a transfusão de hemoderivados (15,7/1.000), "permanência a maior" (9,5/1.000) e pré-eclâmpsia grave/eclâmpsia (8,2/1.000). CONCLUSÕES: Foi alta a prevalência de morbidade materna extremamente grave, associada principalmente às internações e variáveis relacionadas ao recém-nascido. O critério para identificação dos casos e o uso do Sistema de Informações Hospitalares mostraram-se úteis para a vigilância da morbimortalidade materna e para ampliar o conhecimento sobre os aspectos que a envolvem, contribuindo para a melhoria na qualidade da assistência à mulher no período gravídico-puerperal.
Traditional knowledge for promotion of socioeconomic inclusion of local communities
Authors: Sorte Junior Waldemiro Francisco
Published: April 2012

This paper discusses the key role played by public research institutes for promoting socioeconomic inclusion of local communities based on traditional knowledge and traditional medicine. Nongovernmental organizations and cooperatives have had an important role in raising financial resources, being involved with advocacy of local communities and advancing legislation changes. But strict best manufacturing practices regulations imposed by the Brazilian National Health Surveillance Agency on the requirements for approval and commercialization of drugs based on herbal medicine products call for the involvement of strong public research institutes capable of supporting community-based pharmacies. Thus, public research institutes are pivotal as they can conduct scientific research studies to evidence the efficacy of herbal medicine products and help building the capacity of local communities to comply with current regulations.
Nutrição mineral de hortaliças. XXXVII. deficiências de macronutrientes em cubiu (Solanum topiro Humb. & Bonpl.)
Authors: Weber H. , Sarruge J.R. , Haag H.P. , Dechen A.R.
Published: April 2012

Plantas de cubiu (Solanum topiro Humb. & Bonpl.), 'INPA-P6-PL2-BLII-Exp l', foram cultivadas, em casa de vegetação em quartzo moído, irrigadas com soluções nutritivas, conforme SARRUGE (1975), e submetidas aos seguintes tratamentos: completo, omissão de N, omissão de P, omissão de K, omissão de Ca, omissão de Mg e omissão de S, com o objetivo de: (a) obter sintomas de deficiência dos macronutrientes; (b) analisar o crescimento das plantas através da produção de matéria seca; (c) determinar a concentração dos macro e micronutrientes, exceto molibdênio e cloro, nas folhas, caules e raízes das plantas. Os sintomas visuais de deficiência foram identificados e descritos. As plantas foram coletadas e separadas em raiz, caule e folhas, e determinaram-se os teores de macro e micronutrientes, exceto molibdênio e cloro, neste material. Os resultados obtidos mostram: a) os sintomas visuais de deficiência de nitrogênio, potássio, cálcio e magnésio são bem definidos e de fácil caracterização, não ocorrendo o mesmo para os sintomas visuais de deficiência de fósforo e enxofre; b) os tratamentos que mais afetaram o desenvolvimento das plantas foram: omissão de N, omissão de P e omissão de K, seguidos por omissão de Ca e omissão de Mg. O desenvolvimento das plantas não foi afetado com o tratamento omissão de S; c) os níveis de deficiência e adequação obtidos nas folhas foram: N% = 2,02-2,53 P% = 0,12-0,20; K% = 0,84-3,44; Ca% = 0,22-2,64; Mg% = 0,07-0,48; S% = 0,10 0,25.
Estudos sobre a nutrição mineral do arroz: VII. exigências nutricionais das variedades IAC-25 e IAC-47
Authors: Malavolta E. , Silva J.C.A. , Rodrigues T.E. , Sabino J.C. , Gomes I.A. , Cruz A.P. , Oliveira F.A. , Daghlian C. , Guerrini I.A. , Mazza J.A. , Corrêa L.S. , Schiavuzzo M.A. , Costa M.P. , Cabral C.P. , Dario L.A. , Antoniolli F.C , Pavan L.H.S.
Published: April 2012

As exigências nutricionais das variedades de arroz IAC 25 e IAC 47 foram determinadas analisando-se os diferentes órgãos de plantas cultivadas em solução nutritiva até o fim do ciclo. Verificou-se serem distintas as exigências, maior na IAC 47 (mais tardia) que deu também maior produção de grãos com casca.
Estudos sobre a nutrição mineral do arroz: VIII. marcha de absorção de macronutrientes na variedade IAC-25
Authors: Malavolta E. , Penna A. , Flório A. , Frenhani A.A. , Silva A.T. , Rodrigues B.N. , Paulo E.M , Costa N.A. , Santos P.M. , Katayama P.S. , Naves R.V. , Arevalo R.A. , Amaral W. , Pavan L.H.S. , Dario L.A. , Antoniolli F.C. , Cabral C.P.
Published: April 2012

Foram estudadas, em condições controladas, a acumulação de matéria seca e a acumulação de macronutrientes pela variedade de arroz IAC 25. Como regra verificou-se que a acumulação de matéria seca e de macronutrientes obedeceu a sigmoides típicas, ambos os processos ocorendo com maior velocidade no período aproximado de 5O-9O dias após a germinação.
Estudos sobre a nutrição mineral do arroz: IX. marcha de absorção de macronutrientes na variedade IAC-47
Authors: Malavolta E. , Silva J.C.A. , Cruz A.P. , Rodrigues T.E. , Sabino J.C. , Gomes I.A. , Oliveira F.A. , DAGHLIAN C. , GUERRINI I.A. , MAZZA J.A. , CORREA L.S. , Schiavuzzo M.A. , Costa M.P. , Cabral C.P. , Pavan L.H.S. , Dario L.A. , Antoniolli F.C.
Published: April 2012

Foram estudadas, em condições controladas, a acumulação de matéria seca e a de macronutrientes na variedade de arroz IAC-47. Ambos os processos em geral são descritos por sigmóides típicas; picos para os valores totais de produção de matéria seca e de acumulação de elementos entre: 100 e 140 dias depois da germinação.
Estudos sobre a nutrição mineral do arroz: XI. Marcha de absorção de micronutrientes pela variedade IAC-47
Authors: Malavolta E. , Gomes I.A. , Guerrini I.A. , Carneiro I.F. , Mazza J.A. , Silva J.C.A. , Sabino J.C. , Ramos J.V. , Chaves J.C.D. , Daniel L.A. , Corrêa L.S , Schiavuzzo M.A. , Costa M.P. , Cabral C.P. , Pavan L.H.S. , Dario L.A. , Antoniolli F.C.
Published: April 2012

A produção de matéria seca e a absorção de micronutrientes (B, Cu, Fe, Mn e Zn) pelo arroz var. IAC-47 foram estudadas usando-se plantas cultivadas em solução nutritiva. Verificou-se que: enquanto as curvas que descrevem o crescimento e a acumulação de B e Fe mostram tendência sigmóide, as demais não o fazem, evidência de redistribuição foi observada somente nos casos do B (diminuição no conteúdo foliar) e no do Fe (diminuição no conteúdo da raiz).
Efeitos da densidade de plantio sobre a qualidade de cravos, Dianthus caryophyllus L.
Authors: Sousa Maria Alice de Lourdes Bueno , Simão Salim
Published: April 2012

O trabalho teve como objetivo estudar a influência de diferentes densidades populacionais de craveiros, cultivados em casa de vegetação sobre a qualidade das flores. As densidades de plantio estudadas foram de 233.333, 175.000 e 116.667 plantas por hectare, obtidas da utilização dos seguintes espaçamentos: 0,15 m x 0,20 m; 0,20 mx 0,20m e 0,30 m x 0,30 m. Scania Red foi o cultivar utilizado. Os parâmetros analisados foram o número de cravos com cálice inteiro e rachado por planta e por hectare, bem como comprimento da haste com flor, peso da haste com flor e diâmetro da corola. Concluiu-se que o aumento da densidade de plantio ocasionou um acréscimo na produção de cravos com cálice inteiro por hectare, uma diminuição da produção de cravos com cálice rachado por planta, uma diminuição do peso da haste com flor e uma diminuição do diâmetro da corola. Não houve influência da densidade de plantio sobre a produção de cravos com cálice inteiro por planta, sobre a produção de cravos com cálice rachado por hectare e sobre o comprimento da haste com flor.
Estudos sobre a nutrição mineral do arroz: XII. Efeitos das deficiências de macronutrientes nas variedades IAC-25 e IAC-47
Authors: Malavolta E. , Nobrega C. , Azeredo D.F. , Pereira H.H.G. , Carneiro I. F. , Leite J.S.T. , Chaves J.C.D. , Daniel L.A. , Berto P.N.A. , Rufino R.L. , Stipp S.R.C. , Ramos J.V. , Cabral C.P. , Pavan L.H.S. , Dário L.A. , Antoniolli F.C.
Published: April 2012

Plantas de arroz, variedades IAC-25 e IAC-47, foram cultivadas em solução nutritiva completa e com deficiência de macronutrientes. Foram obtidos dados sobre a influência dos tratamentos na área foliar, produção de matéria seca e na composição mineral e observados os sintomas de carência. O estado nutricional das plantas deficientes em N foi também avaliado pela determinação da atividade da redútase de nitrato na folha.
Estudos sobre a nutrição mineral do arroz: XIV. efeitos dos excessos de Al, Cl e Mn nas variedades IAC-25 e IAC-47
Authors: Malavolta E. , Berto P.N.A. , Katayama P.S. , Santos P.M. , Arevalo R.A. , Rufino R.L. , Naves R.V. , Rodrigues T.E. , Leite J.S.T. , Stipp S.R.C. , Daghlian C. , Amaral W. , Cabral C.P. , Pavan L.H.S. , Dario L.A. , Antoniolli F.C.
Published: April 2012

Plantas de arroz, variedades IAC-25 e IAC-47 foram cultivadas em solução nutritiva completa e com excesso de Al, Cl e Mn (25, 1750 e 25 ppm, respectivamente). As últimas não completaram o ciclo. Foram observados sintomas típicos de toxidez. A produção de matéria seca foi mais afetada pelos tratamentos na variedade IAC-47. Ambas as variedades mostraram-se mais sensíveis a toxidez de Mn que à de Al. Foram determinados os teores foliares de Al, Cl e Mn associados à toxidez correspondente.
Influência do teor de lípides na absorção de sal pela sardinha (Sardinella aurita)
Authors: Strano Helena C. Von Glehn , Andrade Martlia Oetterer de
Published: April 2012

Este trabalho teve por objetivos, verificar se a variação estacional no teor de lípides, que ocorreu na espécie de pescado analisada, teve influência na maior ou menor absorção de sal durante o processamento para enlatamento e qual o reflexo na qualidade do produto final. O presente trabalho foi desenvolvido durante um período de doze meses para levantamento dos teores de lípides das sardinhas. O processamento das sardinhas constou de descamação, evisceração e descabeçamento, seguido de salmouragem em três concentrações, enlatamento e esterilização por autoclavagem. Foram analisados peixes "in natura", após a salmouragem e enlatados após 90 dias de armazenamento das latas ao ambiente. Foi verificada uma variação do teor de lípides dos enlatados de 3,73% em novembro a 13,70% em setembro. Pela análise dos teores de NaCl nesses peixes verificou-se que o teor de sal na carne do produto final foi inversamente influenciado pelo teor de lípides.
Um estudo sobre as águas subterrâneas da região de Piracicaba
Authors: Oliveira Antonio Sanchez de , Salati Eneas
Published: April 2012

Uma opção para abastecimento de água às indústrias e populações tem sido a utilização das águas subterrâneas. Na região de Piracicaba, onde os mananciais de superfície apresentam os maiores teores de poluição do Brasil, tem-se procurado a utilização dos recursos hídricos subterrâneos. Com uma contribuição às medidas de ordem prática no estabelecimento de baterias de poços artesianos, iniciamos um estudo sistemático dessas águas visando sua utilização para o abastecimento da população, indústria e agricultura. Neste estudo foram analisadas amostras de águas subterrâneas da região de Piracicaba, colhidas em 23 poços artezianos, 3 artezianos jorrantes, 4 freáticos e 3 mananciais. Por meio da espectrometria de massa foram feitas determinações das concentrações dos isótopos D e (18)0 e estudou-se a correlação destes dados com as concentrações de D e (18)0, previamente determinadas por SALATI et alii (1972) para as águas de precipitação da mesma região e para o rio Piracicaba. Algumas análises químicas também foram efetuadas. De um exame preliminar pode deduzir-se que: a) as águas subterrâneas de vários poços de região podem ser representativas de um único aquífero, em virtude das pequenas variações apresentadas por suas concentrações isotópicas; b) a concordência entre as concentrações de D e (18)0 das águas de precipitação e subterrâneas sugere que as zonas de recarga são muito permeáveis; c) as concentrações isotópicas mais elevadas das águas do rio Piracicaba, em comparação com as das águas subterrâeas indicam ser este rio um efluente dos aquíferos da região em foco; d) de maneira geral, as águas subterrâneas, apresentam-se de qualidade imprópria para o consumo humano; e) evidenciou-se também a pequena vazão oferecida pela maioria dos poços profundos. Por ultimo, este estudo proporcionou outras informações que permitirão melhor orientação nas futuras investigações hidrogeológicas.
Phytochemistry and quantification of polyphenols in extracts of the Asteraceae weeds from Diamantina, Minas Gerais state, Brazil
Authors: Petacci F. , Tavares W.S. , Freitas S.S. , Teles A.M. , Serrão J.E. , Zanuncio J.C
Published: April 2012

Asteraceae weeds are rich in chemicals that have biological and pharmaceutical activities. The aims of this work were to describe the phytochemistry and quantify the polyphenols in ethanol extracts from leaves of 12 species of Asteraceae weeds collected in Diamantina, Minas Gerais State, Brazil. The screening of Asteraceae extracts revealed the presence of tannins, steroids, triterpenes, anthocyanins, and flavonoids. The total phenolic content was high in extracts of Lychnophora ericoides (147.97 ± 2.66), Lepidaploa lilacina (141.11 ± 1.99), and Eremanthus elaeagnus (134.61 ± 7.81) and low in extracts of Lychnophora ramosissima (32.65 ± 0.70), and Lychnophora sp. (54.03 ± 0.73). Extracts of Asteraceae weeds from Diamantina could have potential for biological studies that are searching for new pesticides and drugs.
Interferência de Brachiaria plantaginea com a cultura do arroz, cv. Primavera
Authors: Velho G.F. , Crusciol C.A.C. , Velini E.D. , Castro G.S.A. , Borghi E
Published: April 2012

O objetivo deste trabalho foi avaliar os efeitos da interferência de Brachiaria plantaginea, em diferentes densidades e períodos de convivência, nos componentes de produção e produtividade de grãos de arroz. O experimento foi instalado no município de Santo Antônio de Posse - SP em delineamento de blocos ao acaso, com seis repetições, em esquema fatorial 7 x 4. Os tratamentos consistiram de sete períodos de convivência, expressos em dias após a emergência das plântulas (DAE) de B. plantaginea: controle - 0 DAE, 7 DAE, 14 DAE, 21 DAE, 28 DAE, 35 DAE e sem controle das plantas daninhas, combinados com quatro densidades dessas plantas: 1, 5, 25 e 90 plantas m-2. Foi avaliada a produção de massa seca de B. plantaginea, além dos componentes da produção e produtividade de grãos do arroz. O acúmulo de massa seca de B. plantaginea aumentou significativamente em todas as densidades com o aumento do período de convivência. O aumento do período de convivência e da densidade de plantas de B. plantaginea ocasionou redução dos componentes da produção e, consequentemente, da produtividade de grãos de arroz.
Determinação dos períodos de interferência de plantas daninhas na cultura do girassol
Authors: Silva J.I.C. , Martins D. , Pereira M.R.R. , Rodrigues-Costa A.C.P. , Costa N.V
Published: April 2012

O objetivo deste estudo foi determinar o período anterior à interferência e o período total de prevenção à interferência da comunidade infestante sobre a cultura do girassol (híbrido M 734). O delineamento experimental utilizado foi o de blocos casualizados, com quatro repetições. Os tratamentos foram compostos por parcelas constituídas por períodos de controle e de presença de plantas daninhas. Para os períodos de controle, o girassol foi mantido livre das plantas daninhas pelos períodos crescentes de 7, 14, 21, 28, 35, 42, 49 e 125 dias após a sua emergência (DAE). Quanto a convivência, a cultura foi mantida na presença da comunidade infestante pelos mesmos períodos. Foram avaliados a densidade e o peso da matéria seca das plantas daninhas e, no girassol, a altura de plantas, o diâmetro de capítulos e a produtividade de aquênios e de óleo. Para a produtividade de aquênios, o período anterior à interferência foi de 15 DAE da cultura, e o período total de prevenção à interferência, de 39 DAE. O período crítico de prevenção à interferência abrangeu 24 dias do ciclo da cultura. Quanto à produtividade de óleo, o período anterior à interferência foi de 32 DAE, e o período total de prevenção à interferência, de 28 DAE.