Молекулярно-генетический анализ вариантов ВИЧ-1, циркулирующих на территории Забайкальского края
Authors: Л.В. Максименко , Л.Г. Готфрид , А.В. Тотменин , Н.Ф. Белозерцева , М.М. Зверочкина , Т.Б. Жалсанова , Т.Ю. Логинова , Н.М. Гашникова 
Published: October 2024

Введение. ВИЧ-инфекция остается одной из глобальных медико-социальных проблем как в России, так и во всем мире. Высокая генетическая гетерогенность в сочетании с развитием лекарственной устойчивости негативно влияют на достижение цели по элиминации ВИЧ, поэтому важно проводить постоянный мониторинг циркулирующих ВИЧ-1. Цель. Исследовать молекулярно-эпидемиологические особенности территориального распространения ВИЧ-инфекции в Забайкальском крае, оценить уровень распространенности мутаций лекарственной устойчивости ВИЧ-1 к антиретровирусным препаратам. Материалы и методы. Выполнен комплексный анализ молекулярно-генетических характеристик ВИЧ-1 и клинико-эпидемиологических данных 200 ВИЧ- инфицированных жителей Забайкальского края. Нуклеотидные последовательности гена pol получали секвенированием амплифицированных фрагментов вируса. Генотипирование, филогенетический и мутационный анализы выполняли с помощью специализированного программного обеспечения. Результаты. В исследуемой выборке в 93,0% случаев были выявлены ВИЧ-1 под- субтипа А6, 47,5% нуклеотидных последовательностей формировали кластеры, состоящие из 2–9 образцов вируса, что указывает на наличие внутренних эпидемических сетей распространения ВИЧ-инфекции на территории края. Также были обнаружены ВИЧ-1 CRF02_AG, CRF63_02A6, URF_63/A6 и URF_A6B в 2,0; 2,5; 2,0 и 0,5% случаев соответственно. Анализ мутаций лекарственной устойчивости показал, что распространенность первичной резистентности ВИЧ-1 составляет 11,3%, резистентные вирусы в случаях неэффективной терапии найдены в 55,1% образцов. Чаще всего лекарственная устойчивость как среди наивных, так и среди леченых ВИЧ- инфицированных пациентов развивалась к ингибиторам обратной транскриптазы. Заключение. Современная эпидемия в Забайкальском крае характеризуется преобладанием ВИЧ-1 подсубтипа А6. Высокий уровень распространенности мутаций как первичной, так и вторичной резистентности может оказать негативное влияние на стабилизацию эпидемии ВИЧ-инфекции в крае.

Introduction. HIV infection remains one of the major medical and social problems not only in Russian Federation, but worldwide. Such negative factors as high genetic diversity and quick accumulation of drug resistance significantly slow down HIV infection elimination. Thus, surveillance for currently circulating and novel HIV variants is critically needed. Purpose. Study for molecular-epidemiological characteristics of the local HIV epidemic in Zabaikalsky Krai and assess the levels of drug resistance mutations prevalence to antiretroviral drugs. Materials and methods. Analysis of the subset of the HIV-1 molecular-epidemiological features in association with clinical and epidemiological characteristics of the 200 HIV- positive patients resided Zabaikalsky Krai was performed. Pol gene sequences were obtained by population sequencing approach. Virus genotyping, phylogenetic and genetic analyses were performed using corresponding software. Results. Out of the study patients, 93% had HIV-1 sub-subtype A6 infection. Also, 47,5% of the study sequences were found in genetic clusters of size two to nine sequences indicating to local transmission events. Among other HIV-1 genetic variants, CRF02_ AG, CRF63_02A6, URF_63/A6 и URF_A6B were detected in 2,0; 2,5; 2,0 и 0,5% of cases, respectively. Drug resistance mutations were found in 11% of the newly diagnosed HIV-positive patients; 55,1% of the patients with low-level ART adherence had drug resistance mutations identified. The most prevalent mutations were those confer resistance to reverse transcriptase inhibitors. Conclusion. Modern HIV epidemiology in Zabaikalsky Krai characterized by HIV-1 sub- subtype A6 prevalence. High drug resistance both among newly and chronically HIV- infected individuals negatively influence to the local HIV epidemic slowdown.