bluuebunny/crossref_metadata_2025 huggingface dataset:
STUDY OF TRANSCRIPTIONAL REGULATORY CIRCUITS AND CLUSTERS OF TRANSCRIPTION FACTOR BINDING SITES IN PLANT GENOMES ACCORDING TO CHIP-SEQ DATA
Authors: Дергилев А.И. , Добровольская О.Б. , Орлова Н.Г. , Орлов Ю.Л.
Published: September 2024

С развитием технологий высокопроизводительного геномного секвенирования, в том числе иммунопреципитации хроматина с последующим секвенированием ChIP-seq, появляется возможность исследовать сайты связывания транскрипционных факторов в масштабе генома для многих модельных организмов, включая растения, имеющие биотехнологическое значение. Объёмы данных об экспериментально определенных сайтах связывания продолжают расти, и это приводит к появлению всё новых и новых качественных задач биоинформатики, среди которых: определение параметров регуляции экспрессии генов транскрипционными факторами, определение генов-мишеней и реконструкции регуляторных генных сетей в модельных организмах и т.д. Актуальной задачей становится разработка новых инструментов анализа сайтов связывания транскрипционных факторов, их взаимного расположения в последовательностях ДНК, кластеризации в геноме, включающих в себя такие возможности, как визуализация, получение статистических оценок вероятности возникновения таких кластеров.

With the development of high-throughput genomic sequencing technologies, including chromatin immunoprecipitation followed by ChIP-seq sequencing, it becomes possible to study transcription factor binding sites at the genome scale for many model organisms, including plants of biotechnological importance. The amount of data on experimentally determined binding sites continues to grow, and this leads to the emergence of more and more new qualitative problems of bioinformatics, including: determining the parameters of regulation of gene expression by transcription factors, determining target genes and reconstructing regulatory gene networks in model organisms, etc. . An urgent task is to develop new tools for analyzing the binding sites of transcription factors, their mutual arrangement in DNA sequences, clustering in the genome, including such features as visualization, obtaining statistical estimates of the probability of occurrence of such clusters.
IMPROVEMENT OF GINOFIP - ALGORITHM FOR IDENTIFICATION OF OPERONS OF INTEREST
Authors: Кучур П.Д. , Афонникова С.Д. , Комиссаров А.С.
Published: September 2024

Бактериальные геномы – один из наиболее распространенных видов данных секвенирования. По этой причине они всё чаще становятся объектами исследований. Фокус внимания исследователей постепенно смещается с анализа одной геномной сборки на сравнительный анализ нескольких геномов. Проводить его на уровне всего генома всё ещё не целесообразно, однако можно сконцентрироваться на сопоставлении отдельных его структур. Геном бактерий представлен оперонами – функциональными единицами, которые сочетают в себе несколько генов, контролирующих общий процесс.

Bacterial genomes are one of the most common types of sequencing data. For this reason, they are increasingly becoming objects of research. The focus of attention of researchers is gradually shifting from the analysis of one genomic assembly to the comparative analysis of several genomes. It is still not advisable to conduct it at the level of the entire genome, but one can concentrate on comparing its individual structures. The genome of bacteria is represented by operons - functional units that combine several genes that control the overall process.
RELATIONSHIP OF PHYLOGENETIC ANALYSIS OF THE E183L GENE OF THE ASF VIRUS WITH THE CLASSIFICATION OF ISOLATES BY SEROGROUP
Authors: Минкова С.И. , Кольцов А.Ю. , Холод Н.С. , Кольцова Г.С.
Published: September 2024

Африканская чума свиней (АЧС) – это высококонтагиозное вирусное заболевание диких и домашних свиней. К 2021 г. только в Российской Федерации зарегистрировано более 1500 эпизоотических вспышек. В настоящее время АЧС остаётся острой проблемой для сельского хозяйства, так как отсутствуют эффективные методы профилактики и лечения.

African swine fever (ASF) is a highly contagious viral disease of wild and domestic pigs. By 2021, more than 1,500 epizootic outbreaks have been registered in the Russian Federation alone. Currently, ASF remains an acute problem for agriculture, as there are no effective methods of prevention and treatment.
POLYMORPHISM OF CSN3, LGB AND MGST1 GENES IN DAIRY COWS
Authors: Романенкова О.С. , Зимина А.А. , Сермягин А.А. , Кольцов Д.Н.
Published: September 2024

К настоящему времени выявлено большое количество генов, ассоциированных с параметрами молочной продуктивности крупного рогатого скота, определена их локализация в хромосомах и последовательность пар нуклеотидов в их молекулярной структуре [1]. При этом широкое использование современных технологий высокопроизводительного секвенирования (NGS, next generation sequencing) геномов крс и полногеномного поиска ассоциаций (GWAS, genome-wide association studies) позволило выявить ранее неизвестные аллельные варианты генов, связанных с молочной продуктивностью [2].

To date, a large number of genes associated with the parameters of dairy productivity of cattle have been identified, their localization in chromosomes and the sequence of base pairs in their molecular structure have been determined [1]. At the same time, the widespread use of modern technologies for high-throughput sequencing (NGS, next generation sequencing) of bovine genomes and genome-wide association studies (GWAS, genome-wide association studies) made it possible to identify previously unknown allelic variants of genes associated with milk production [2].
ANALYSIS OF THE SUNFLOWER COLLECTION FOR THE Pl6 LOCUS RESPONSIBLE FOR THE RESISTANCE OF HELIANTHUS ANNUUS TO DOWY POWDERY DEW
Authors: Сидоров Л.А. , Милюкова Н.А. , Пырсиков А.С.
Published: September 2024

Ложная мучнистая роса подсолнечника (ЛМР) - это заболевание растения, которое вызывается возбудителем Plasmopara halstedii (Farl.) из порядка Peronosporales, который принадлежит к оомицетам. Является облигатным паразитом, образует в органах растения толстую ветвящуюся границу диаметром 6-9 мкм с зернистым бесцеветным или желтоватым содержимым. Источниками первичной инфекции являются ооспоры, которые сохраняются в почве до 10 лет; источником вторичной инфекции являются зооспоры. Проявляется одновременно, как и системно, так и локально. Симптомами заболевания являются белый налёт на нижней стороне листа, отсутствие гелиотропизма, замедленный рост, укороченные междоузлия, карликовость.

Sunflower downy mildew (SMF) is a plant disease caused by the pathogen Plasmopara halstedii (Farl.) from the order Peronosporales, which belongs to the oomycetes. It is an obligate parasite that forms a thick branching border 6-9 µm in diameter with granular, colorless or yellowish contents in plant organs. Sources of primary infection are oospores that persist in the soil for up to 10 years; zoospores are the source of secondary infection. It manifests itself both systemically and locally. Symptoms of the disease are white bloom on the underside of the leaf, lack of heliotropism, slow growth, shortened internodes, dwarfism.
PHYLOGENETIC ANALYSIS OF RUSSIAN LOCAL SHEEP BREEDS BASED ON THE POLYMORPHISM OF THE MITOCHONDRIAL DNA CYTOCHROME B GENE
Authors: Кошкина О.А. , Денискова Т.Е. , Соловьева А.Д. , Зиновьева Н.А.
Published: September 2024

Генетическое разнообразие популяций сельскохозяйственных животных играет жизненно важную роль в формировании признаков, ответственных за улучшение, выживание и адаптацию биологического вида [1]. Изучение генетической изменчивости современных аборигенных пород овец позволит накопить знания об их происхождении и расселении, а также понять влияние человеческой деятельности на овец с момента одомашнивания, что является актуальной задачей в современном мире. Одним из эффективных подходов к оценке генетического разнообразия является исследование митохондриальной ДНК (мтДНК). Филогенетический анализ проводится на основе данных о полиморфизме контрольной области (D-петли) или гена цитохрома В (CytB)

The genetic diversity of farm animal populations plays a vital role in the formation of traits responsible for the improvement, survival and adaptation of a biological species [1]. The study of the genetic variability of modern native breeds of sheep will allow to accumulate knowledge about their origin and distribution, as well as to understand the impact of human activity on sheep from the moment of domestication, which is an urgent task in the modern world. One of the effective approaches to assessing genetic diversity is the study of mitochondrial DNA (mtDNA). Phylogenetic analysis is based on data on polymorphism of the control region (D-loop) or the cytochrome B (CytB) gene [2-6]. In this regard, the aim of our work was to study the genetic diversity and determine the haplotype variability and haplogroup affiliation of Russian sheep breeds based on the CytB gene sequences.
HISTOLOGICAL FEATURES OF THE STRUCTURE OF THE SPERMATOGENIC EPITHELIUM OF THE TESTILES OF MAMMALS
Authors: Дуденкова Н.А.
Published: September 2024

С наступлением половой зрелости в мужском организме млекопитающих начинается процесс образования мужских половых клеток – сперматогенез. Этот процесс происходит в извитых семенных канальцах мужских половых желез – семенниках [2].

With the onset of puberty in the male body of mammals, the process of formation of male germ cells - spermatogenesis begins. This process occurs in the convoluted seminiferous tubules of the male gonads - the testes [2].
POTENTIAL STRESS-INDUCED MATRYOSHKA GENES AS TARGETS FOR INCREASING RESISTANCE TO VARIOUS TYPES OF STRESS: A SEARCH ALGORITHM IN MODEL AND CULTURE PLANTS
Authors: Шешукова Е.В. , Ершова Н.М. , Поздышев Д.В. , Комарова Т.В.
Published: September 2024

Системные защитные реакции растений в ответ на неблагоприятные воздействия биотической и абиотической природы сопровождаются активацией экспрессии стрессиндуцируемых генов. Подобная индукция экспрессии может осуществляться как на уровне транскрипции, так трансляции и стабильности мРНК. В этот процесс вовлечены транскрипционные факторы, регуляторы трансляции, а также различные белки, которые участвуют в контроле качества мРНК. Целью настоящего исследования было изучение генных систем-матрёшек, содержащих в пределах основного гена экспрессирующиеся альтернативные открытые рамки считывания (аОРС), а также выявление их роли в формировании механизмов обеспечения устойчивости растений к стрессам.

Systemic defense reactions of plants in response to adverse effects of biotic and abiotic nature are accompanied by activation of the expression of stress-induced genes. Such induction of expression can be carried out both at the level of transcription and translation and mRNA stability. This process involves transcription factors, translational regulators, and various proteins that are involved in mRNA quality control. The aim of this study was to study matryoshka gene systems containing expressed alternative open reading frames (aORFs) within the main gene, as well as to identify their role in the formation of mechanisms for ensuring plant resistance to stress.
REPLICATION OF RECOMBINANT AFRICAN SWINE FEVER VIRUSES WITH EP402R GENE DELETION IN VIVO
Authors: Кольцов А.Ю. , Крутько С.А. , Белов С.В. , Холод Н.С. , Коротин А.В. , Сухер М.М. , Кольцова Г.С.
Published: September 2024

Африканская чума свиней - контагиозная вирусная геморрагическая болезнь домашних и диких свиней с летальностью до 100 %, сопровождающаяся лихорадкой, цианозом кожи, диареей, судорогами (Montgomery, 1921). Вирус АЧС - крупный икосаэдрический цитоплазматический вирус семейства Asfarviridae (Dixon et al., 2012). С момента регистрации первых случаев АЧС в 2007 году свиноводческая отрасль России испытывает серьезные экономические потери. Вакцины против АЧС не разработаны, а прогресс создания безопасных и эффективных вакцин сдерживается недостатком знаний о степени разнообразия штаммов вируса АЧС и вирусных антигенах, обеспечивающих защитный иммунитет у свиней. Несмотря на многолетние исследования функции многих белков вируса АЧС не изучены. Кроме того, продемонстрировано, что одни и те же белки разных штаммов могут обладать различными функциональными особенностями в инфицированных вирусом клетках.

African swine fever is a contagious viral hemorrhagic disease of domestic and wild pigs with a mortality rate of up to 100%, accompanied by fever, cyanosis of the skin, diarrhea, and convulsions (Montgomery, 1921). ASF virus is a large icosahedral cytoplasmic virus of the Asfarviridae family (Dixon et al., 2012). Since the first cases of ASF were registered in 2007, the Russian pig industry has experienced serious economic losses. Vaccines against ASF have not been developed, and progress in developing safe and effective vaccines has been hampered by a lack of knowledge about the degree of diversity in ASF virus strains and the viral antigens that confer protective immunity in pigs. Despite many years of research, the functions of many proteins of the ASF virus have not been studied. In addition, it has been demonstrated that the same proteins of different strains can have different functional features in virus-infected cells.
CREATING A CONVENIENT TOOL FOR STUDYING VIRUS-PLANT INTERACTION
Authors: Колесникова В.В. , Лебедева М.В.
Published: September 2024

Вирусные болезни приносят наиболее значимый ущерб вегетативно размножающимся культурам, таким как картофель. В качестве мер борьбы с вирозами используют устойчивые сорта и здоровый посадочный материал. Эффективные химические препараты против вирусов недоступны на рынке.

Viral diseases cause the most significant damage to vegetatively propagating crops such as potatoes. Resistant varieties and healthy planting material are used as measures to combat viroses. Effective chemicals against viruses are not available on the market.
EFFECTIVENESS OF THE NEW PLANT PROMOTER pro-SmAMP-X IN MODEL AND AGRICULTURAL PLANTS
Authors: Иванова Л.А. , Комахин Р.А.
Published: September 2024

Несмотря на развитие генетической инженерии растений, в настоящее время актуален вопрос расширения спектра растительных промоторов для биотехнологии модельных и сельскохозяйственных растений. Изолированные промоторы растительного происхождения могут сохранять свои основные функции в гетерологичных растениях, однако качественные и количественные вариации экспрессии рекомбинантных генов под их контролем не являются редкостью и должны быть изучены для каждого промотора, предлагаемого для биотехнологии растений. Ранее нами из генома растения мокрицы (Stellaria media) был клонирован промотор гена альфа-гарпинина SmAMP-Х. Было установлено, что в геноме мокрицы существует не менее двух версий промотора, обозначенные нами pro-SmAMP-X1 и pro-SmAMP-X2, которые благодаря 27 % полиморфизму демонстрируют различающиеся наборы цис- элементов.

Despite the development of plant genetic engineering, the issue of expanding the range of plant promoters for the biotechnology of model and agricultural plants is currently relevant. Isolated promoters of plant origin can retain their main functions in heterologous plants; however, qualitative and quantitative variations in the expression of recombinant genes under their control are not uncommon and should be studied for each promoter proposed for plant biotechnology. Previously, we cloned the promoter of the SmAMP-X alpha-harpinin gene from the genome of the woodlice plant (Stellaria media). It was found that there are at least two versions of the promoter in the woodlouse genome, which we designated as pro-SmAMP-X1 and pro-SmAMP-X2, which, due to 27% polymorphism, demonstrate different sets of cis-elements.
DEVELOPMENT OF TECHNOLOGY ELEMENTS FOR OBTAINING DOUBLE HAPLOIDS OF BEET
Authors: Заячковская Т.В. , Минейкина А.И. , Кан Л.Ю. , Заячковский В.А. , Домблидес Е.А.
Published: September 2024

Большая экономическая значимость свеклы столовой (Beta vulgaris L. ssp. europaea Krass. var. atrorubra Krass.), как одной из основных корнеплодных овощных культур России, требует в настоящее время внедрения в селекционный процесс современных биотехнологических методов, в частности культуры неопыленных семяпочек in vitro, с возможностью получения удвоенных гаплоидных растений для ускоренного создания на их основе высокопродуктивных гибридов. Наиболее распространенным объектом биотехнологических исследований семейства Амарантовые (Chenopodiaceae Vent.) является свекла сахарная.

The great economic importance of table beet (Beta vulgaris L. ssp. europaea Krass. var. atrorubra Krass.), as one of the main root vegetable crops in Russia, currently requires the introduction of modern biotechnological methods into the breeding process, in particular, the culture of unpollinated ovules in vitro , with the possibility of obtaining doubled haploid plants for the accelerated creation of highly productive hybrids on their basis. The most common object of biotechnological research of the Amaranth family (Chenopodiaceae Vent.) is sugar beet.
RESULTS OF ISOLATION OF SOMATIC CELL CULTURE FROM MATERIAL OBTAINED 10 HOURS AFTER THE DEATH OF A HYBRID OF SHEEP AND SNOW SHAM
Authors: Ворожбит Т.А. , Сингина Г.Н.
Published: September 2024

Одной из задач соматического клонирования является сохранение редких или уникальных животных [1]. В качестве доноров ядер в таких случаях как правило используются фибробласты кожи, также возможно использование и других клеток, полученных от живых животных. Однако, возможны ситуации, когда уникальное животное погибло, а от него так и не были получены образцы соматических клеток. В таком случае возникает вопрос о методе получения культуры соматических клеток от мертвого животного, и в течение какого времени это еще возможно [2]. Целью работы являлась оценка возможности получения культуры соматических клеток от погибшего животного (гибрид овцы и снежного барана). Материал (уши), для выделения первичной культуры соматических клеток был получен от гибрида овцы и снежного барана. Работа по получению первичной культуры соматических клеток началась через 10 часов после смерти животного.

One of the tasks of somatic cloning is the preservation of rare or unique animals [1]. In such cases, skin fibroblasts are usually used as nuclear donors, and other cells obtained from living animals can also be used. However, situations are possible when a unique animal has died, and somatic cell samples have not been obtained from it. In this case, the question arises about the method of obtaining a culture of somatic cells from a dead animal, and for how long it is still possible [2]. The aim of the work was to evaluate the possibility of obtaining a culture of somatic cells from a dead animal (a hybrid of a sheep and a bighorn sheep). The material (ears) for the isolation of the primary culture of somatic cells was obtained from a hybrid of a sheep and a bighorn sheep. Work on obtaining a primary culture of somatic cells began 10 hours after the death of the animal.
INFLUENCE OF CYTOCHALASIN B ON THE DEVELOPMENT OF CLONED PORK EMBRYOS DEPENDING ON THE DURATION OF THE PROCEDURE OF ENUCLEATION AND SOMATIC CELL NUCLE TRANSFER
Authors: Лопухов А.В. , Сингина Г.Н.
Published: September 2024

При соматическом клонировании механическое удаление ядра может оказывать негативное влияние на ультраструктуру энуклеируемых ооцитов, вызывая утрату и разрушение ряда функционально значимых клеточных компартментов и, как следствие, снижение метаболической активности и жизнеспособности получаемых цитопластов. По мнению ряда авторов, способность цитохалазина Б к разрушению актин-содержащих филаментов может повышать пластичность цитоскелета и устойчивость ооцита к механическим повреждениям в ходе удаления хромосомного материала и подсадки донорской соматической клетки [1,2].

During somatic cloning, mechanical removal of the nucleus can have a negative effect on the ultrastructure of enucleated oocytes, causing the loss and destruction of a number of functionally important cellular compartments and, as a result, a decrease in the metabolic activity and viability of the resulting cytoplasts. According to some authors, the ability of cytochalasin B to destroy actin-containing filaments can increase the plasticity of the cytoskeleton and the resistance of the oocyte to mechanical damage during the removal of chromosome material and transplantation of a donor somatic cell [1, 2].
MICROCLONAL REPRODUCTION OF KOK-SAGYZ (TARAXACUM KOK-SAGYZ RODIN), A PROMISING SOURCE OF NATURAL RUBBER
Authors: Мартиросян Л.Ю. , Эсембаева М.А. , Мягкова Е.Р. , Филатова С.И. , Цыганкова Е.А. , Джумакулыева М.
Published: September 2024

Натуральный каучук является высоко востребованным сырьем, широко применяется при производстве медицинских и бытовых изделий, шин для авиации и военной техники. Основную часть натурального каучука получают из Hevea brasiliensis. Родина гевеи — Бразилия — сейчас практически не производит каучук, все плантации там поражены патогенным грибом, Microcyclus Ulei, бороться с которым пока еще очень сложно. Это заболевание, против которого не существует эффективных методов борьбы, поражает деревья до того, как они достигают своей физиологической зрелости, и уничтожает каучуковые плантации. Наиболее перспективным альтернативным гевее каучуконосом по праву считается кок-сагыз (Taraxacum kok-saghyz Rodin) [1,2]. В его корнях синтезируется каучук, не уступающий по качеству полученному из гевеи, и его содержание у высокопродуктивных коллекционных образцов достигает до 17% к сухой массе корней.

Natural rubber is a highly demanded raw material, widely used in the production of medical and household products, tires for aviation and military equipment. The main part of natural rubber is obtained from Hevea brasiliensis. The birthplace of hevea - Brazil - now practically does not produce rubber, all plantations there are affected by a pathogenic fungus, Microcyclus Ulei, which is still very difficult to fight. This disease, for which no effective control methods exist, infects trees before they reach their physiological maturity and destroys rubber plantations. Kok-saghyz (Taraxacum kok-saghyz Rodin) is considered to be the most promising alternative to hevea rubber [1,2]. In its roots, rubber is synthesized, which is not inferior in quality to that obtained from hevea, and its content in highly productive collection samples reaches up to 17% of the dry weight of the roots.
ISOLATION OF SUNFLOWER PROTOPLASTS
Authors: Абрамова А.С. , Гарибян Ц.С.
Published: September 2024

Протопласты растений представляют собой отправную точку многих методик для генетической модификации целых растений и в настоящее время широко используются в качестве исходного материала для генетических манипуляций с культурными растениями. Несмотря на значительные успехи в технологии получения протопластов для ряда культурных растений, подсолнечник (Heliánthus ánnuus) является одним из наиболее сложных культур в этом отношении.

Plant protoplasts represent the starting point of many techniques for the genetic modification of whole plants and are now widely used as starting material for genetic manipulation of crop plants. Despite significant advances in protoplast technology for a number of cultivated plants, sunflower (Heliánthus ánnuus) is one of the most challenging crops in this regard.
STUDY OF THE PROCESSES OF METABOLISM AND ACCUMULATION OF SECONDARY METABOLITES IN TISSUE CULTURE OF SCUTELLARIA BAICALENSIS GEORGI
Authors: Бронских Е.Д. , Орехова И.А. , Шебитченко Т.С.
Published: September 2024

Шлемник байкальский – многолетнее травянистое растение рода Scutellaria семейства Lamiaceae, которое обладает широчайшим спектром биологически активных веществ, ценных для человека [1, 5]. В настоящее временя из S. baicalensis выделено 81 производное флавона [4]. Основные флавоны шлемника: байкалеин, вогонин и их глюкурониды являются физиологически активными компонентами, которые обладают антимикробным, гипотензивным и седативным действием [1].

Baikal skullcap is a perennial herbaceous plant of the genus Scutellaria of the Lamiaceae family, which has the widest range of biologically active substances valuable to humans [1, 5]. To date, 81 flavone derivatives have been isolated from S. baicalensis [4]. The main skullcap flavones: baicalein, wogonin and their glucuronides are physiologically active components that have antimicrobial, hypotensive and sedative effects [1].
DEVELOPMENT OF A PROBIOTIC PRODUCT BASED ON SUNFLOWER MEAL
Authors: Клишин А.А. , Мальцева О.Ю.
Published: September 2024

В современном мире назначение продуктов питания состоит не только в удовлетворении голода и обеспечении питательными веществами, но и для профилактики, предотвращения или уменьшения развития различных заболеваний, для улучшения физического благополучия. Одним из таких продуктов являются пробиотические препараты. Традиционно считается, что пробиотики возможно получить, употребляя исключительно молочные продукты.

In the modern world, the purpose of food is not only to satisfy hunger and provide nutrients, but also to prevent, prevent or reduce the development of various diseases, to improve physical well-being. One such product is probiotics. It is traditionally believed that probiotics can be obtained by consuming exclusively dairy products.
INFLUENCE OF TREATMENT OF PESTLES WITH A CASPASE-LIKE PROTEASE INHIBITOR (AC-DEVD-CHO) ON THE GROWTH OF POLLEN TUBES IN THE PROGRAM FERTILIZATION PHASE IN PETUNIA (Petunia hybrid L.)
Authors: Соболев Д.С. , Демьянчук И.С. , Захарова Е.В.
Published: September 2024

Petunia hybridа L. является классическим объектом для изучения явления самонесовместимости. Для нее характерна самонесовместимость S-РНКазного типа. При совместимом опылении пыльцевые трубки растут по проводниковым тканям пестика и достигают завязи через 30 часов после опыления, далее происходит оплодотворение и, в конечном итоге, завязывание семян.

Petunia hybrid L. is a classic object for studying the phenomenon of self-incompatibility. It is characterized by self-incompatibility of the S-RNase type. With compatible pollination, pollen tubes grow along the conductive tissues of the pistil and reach the ovary 30 hours after pollination, then fertilization occurs and, ultimately, seed setting.
IMPROVEMENT OF THE PCR TEST FOR THE DIAGNOSIS OF PLANT MATERIAL OF GRAIN LEGUMS FOR THE PRESENCE OF THE PEA Blight Pathogen
Authors: Игнатьева И.М. , Словарева О.Ю.
Published: September 2024

Горох является одной из ведущих экспортных культур России. В связи с его экспортной привлекательностью растут как посевные площади, так и урожайность гороха. Возбудитель бактериального ожога гороха Pseudomonas syringae pv. pisi (Sackett) Young et al. (далее P. syringae pv. pisi) – угроза стабильному производству значимой продовольственной сельскохозяйственной культуры во всем мире. Фитопатоген включен в карантинный список ряда стран-импортеров из РФ (Бангладеш, Иран, Китай, Пакистан, Сирия, Турция).

Peas are one of the leading export crops of Russia. Due to its export attractiveness, both the sown area and the yield of peas are growing. The causative agent of bacterial pea blight, Pseudomonas syringae pv. pisi (Sackett) Young et al. (hereinafter P. syringae pv. pisi) is a threat to the sustainable production of an important food crop worldwide. The phytopathogen is included in the quarantine list of a number of importing countries from the Russian Federation (Bangladesh, Iran, China, Pakistan, Syria, Turkey).
PROTEOMAL ANALYSIS OF VICIA CRACCA LEAF TISSUE GROWING IN THE EXCLUSION ZONE OF THE CHERNOBYL NPP
Authors: Казакова Е.А. , Битаришвили С.В. , Волкова П.Ю.
Published: September 2024

В рамках проекта по исследованию адаптивных реакций травянистых растений на ионизирующее излучение с применением мультиомиксного подхода для поиска кандидатных молекул устойчивости к абиотическим стрессорам был проведён протеомный анализ листьев горошка мышиного (Vicia cracca L.) из зоны отчуждения Чернобыльской АЭС. Выявление детерминант устойчивости к стрессору представляет особый интерес для биотехнологии хозяйственно ценных растений, придавая прикладной смысл фундаментальным исследованиям последствий хронического действия излучения. Летом 2021 года в зоне отчуждения ЧАЭС в Полесском радиационноэкологическом заповеднике Республики Беларусь были заложены несколько экспериментальных участков: два радиационно-загрязнённых Кулажин и Масаны и два контрольных Бабчин и Ломыш.

As part of a project to study the adaptive responses of herbaceous plants to ionizing radiation using a multiomics approach to search for candidate molecules of resistance to abiotic stressors, a proteomic analysis of the leaves of mouse pea (Vicia cracca L.) from the exclusion zone of the Chernobyl nuclear power plant was carried out. Identification of the determinants of resistance to a stressor is of particular interest for the biotechnology of economically valuable plants, giving applied meaning to fundamental research on the effects of chronic exposure to radiation. In the summer of 2021, several experimental sites were laid in the Chernobyl exclusion zone in the Polessky radiation-ecological reserve of the Republic of Belarus: two radiation-contaminated Kulazhin and Masany and two control Babchin and Lomysh.
VEGETATIONAL PERIOD AS A FACTOR IN SELECTING PARENT FORMS FOR CREATING EARLY MATURING OAT VARIETIES IN WESTERN SIBERIA
Authors: Мишечкина В.С. , Любимова А.В. , Кочнева Д.А.
Published: September 2024

Овес – одна из основных возделываемых зерновых культур на территории Западной Сибири, а в Тюменской области его посевы есть в большинстве сельскохозяйственных зон. Он используется в качестве зернофуражной и кормовой культуры. При этом овес имеет минимальные изменения в количестве урожая по сравнению с другими культурами. По мнению некоторых авторов, в почвенноклиматических условиях Тюменской области выращивание овса наиболее целесообразно [1]. Количество получаемого урожая, а также качество и посевные свойства зерна, устойчивость сорта к поражению вредителями и болезнями зависит от продолжительности вегетационного периода.

Oats are one of the main cultivated grain crops on the territory of Western Siberia, and in the Tyumen region, its crops are found in most agricultural zones. It is used as a grain forage and fodder crop. At the same time, oats have minimal changes in yield compared to other crops. According to some authors, in the soil and climatic conditions of the Tyumen region, the cultivation of oats is the most appropriate [1]. The amount of the crop, as well as the quality and sowing properties of the grain, the resistance of the variety to damage by pests and diseases depends on the length of the growing season.
CHANGES IN GLUTAMATE DEHYDROGENASE GENE EXPRESSION IN VIVO CORN LEAVES INDUCED BY HYPOXIC STRESS
Authors: Оя П.С.
Published: September 2024

Важное значение для сельского хозяйства и растениеводства имеют исследования, посвящённые изучению механизмов адаптации растительных организмов к изменяющимся внешним факторам. В естественных условиях растительные организмы нередко подвергаются гипоксическому стрессу в результате затопления. Глутаматдегидрогеназа (ГДГ, КФ 1.4.1.3) растений - энзим, катализирующий обратимое превращение 2- оксоглутарата в глутамат, обеспечивая тем самым связь энергетического и пластического обменов, а также метаболизм углерода и азота.

Of great importance for agriculture and crop production are studies devoted to the study of the mechanisms of adaptation of plant organisms to changing external factors. Under natural conditions, plant organisms are often exposed to hypoxic stress as a result of flooding. Plant glutamate dehydrogenase (GDH, EC 1.4.1.3) is an enzyme that catalyzes the reversible conversion of 2-oxoglutarate to glutamate, thereby providing a link between energy and plastic metabolism, as well as carbon and nitrogen metabolism.
DETERMINATION OF THE MAIN CMS TYPES IN THE COLLECTION OF NEW BREEDING SAMPLES BRASSICA NAPUS
Authors: Пырсиков А.С. , Артюшин А.В. , Соловьёв А.А. , Милюкова Н.А.
Published: September 2024

Рапс является ценнейшей масличной и кормовой культурой семейства крестоцветных, экономическая целесообразность выращивания которой сегодня остается одной из самых востребованных как на Российском, так и на зарубежном рынке. Содержание полувысыхающего масла в семенах рапса доходит до 45 %, белка– до 33 %, а минеральных веществ– до 5 % [3]. Возможности выращивания рапса на территории нашей страны практически не ограничены за счёт её географического положения. Анализ мировых и европейских цен свидетельствует, что выращивание рапса обеспечивает высокую рентабельность [1]. Кроме экономической выгоды, рапс положительно влияет и на экологическое состояние окружающей среды.

Rapeseed is the most valuable oilseed and fodder crop of the cruciferous family, the economic feasibility of growing which today remains one of the most popular both on the Russian and foreign markets. The content of semi-drying oil in rape seeds reaches 45%, protein - up to 33%, and minerals - up to 5% [3]. The possibilities of growing rapeseed on the territory of our country are practically unlimited due to its geographical location. An analysis of world and European prices shows that the cultivation of rapeseed provides high profitability [1]. In addition to economic benefits, rapeseed has a positive effect on the ecological state of the environment.
MECHANISMS INVOLVED IN THE PROTECTIVE ANTIVIRAL RESPONSE OF POTATO PLANTS DURING EXOGENOUS APPLICATION OF dsRNA AGAINST POTATO VIRUS Y
Authors: Самарская В.О. , Спеченкова Н.А. , Маркин Н.В. , Супрунова Т.П. , Завриев С.К. , Калинина Н.О. , Тальянский М.Э.
Published: September 2024

Технология опрыскивания растений экзогенной двуцепочечной РНК (дцРНК) или спрей-индуцированный сайленсинг генов применяется для индукции устойчивости растений к вирусам сельскохозяйственных культур [1]. В настоящей работе мы использовали этот подход для обработки растений картофеля Solanum tuberosum препаратами дцРНК, гомологичной консервативному фрагменту гена репликазы Y вируса картофеля (дцРНК-YВК), и изучили влияние экзогенной дцРНК на защитный ответ растений, основанный на механизмах специфической РНК интерференции (РНКи) [2] и неспецифического иммунитета, индуцируемого молекулярными паттернами, ассоциированными с патогеном (PTI), элиситором которого является дцРНК [3] при заражении растений YВК и неродственным вирусом Х вирусом картофеля (XВК).

The technology of spraying plants with exogenous double-stranded RNA (dsRNA) or spray-induced gene silencing is used to induce plant resistance to crop viruses [1]. In the present work, we used this approach to treat Solanum tuberosum potato plants with dsRNA preparations homologous to the conserved fragment of the potato virus replicase Y gene (dsRNA-YVR) and studied the effect of exogenous dsRNA on the plant defense response based on the mechanisms of specific RNA interference (RNAi) [ 2] and nonspecific immunity induced by pathogen-associated molecular patterns (PTI), the elicitor of which is dsRNA [3] upon infection of plants with YVC and unrelated potato virus X (XVC).
METHOD FOR EDITING CONFIRMATION OF POTATO PLANTS USING CAPILLARY ELECTROPHORESIS
Authors: Самарина М.А. , Архипов А.В. , Дивашук М.Г.
Published: September 2024

В настоящее время многие научно-исследовательские лаборатории прибегают к различным методам редактирования хозяйственно-ценных генов, а основными методами проверки достоверности прохождения редактирования остаются секвенирование по Сэнгеру и NGS. Метод капиллярного электрофореза так же может быть использован для оценки прохождения редактирования, обнаружения делеций и инсерций размером в один и более нуклеотид, благодаря точности определения размеров амплифицированных фрагментов.

Currently, many research laboratories resort to various methods of editing economically valuable genes, and Sanger sequencing and NGS remain the main methods for verifying the validity of editing. The method of capillary electrophoresis can also be used to assess the passage of editing, detect deletions and insertions of one or more nucleotides, due to the accuracy of determining the size of amplified fragments.
INFLUENCE OF GROWTH REGULATORS ON THE PRODUCTIVITY OF GRAIN SORGO GROWN IN STEPPE AGROCOENOSIS
Authors: Барановский А.В. , Косогова Т.М. , Меркулов А.Е.
Published: September 2024

В настоящее время выращивание зерновых культур в Донбасском регионе сопряжено с влиянием неблагоприятных засушливых и суховейных явлений в период вегетации культур, значительного температурного стресса, недостатка и даже полного отсутствия продуктивной влаги в пахотном и подпахотном слоях почвы и длительных бездождевых периодов. Для адаптации растений к неблагоприятным факторам окружающей среды, стрессовым ситуациям в критические периоды роста и развития необходимы регуляция обмена веществ и структурные перестройки растительных клеток. В адаптационных процессах антистрессовое действие оказывают именно регуляторы роста растений. При предпосевной обработке семян защитно-стимулирующими композициями регуляторы роста снимают токсичное действие, как остатков почвенных гербицидов, так и протравителей, и тем самым способствуют ускорению роста растений, помогают в борьбе культурных растений с сорняками и засухой [3].

At present, the cultivation of grain crops in the Donbass region is associated with the influence of unfavorable dry and dry winds during the growing season of crops, significant temperature stress, lack and even complete absence of productive moisture in the arable and subarable soil layers, and long rainless periods. In order for plants to adapt to adverse environmental factors and stressful situations during critical periods of growth and development, regulation of metabolism and structural rearrangements of plant cells are necessary. In adaptive processes, it is plant growth regulators that have an anti-stress effect. During presowing treatment of seeds with protective and stimulating compositions, growth regulators remove the toxic effect of both soil herbicide residues and dressing agents, and thereby accelerate plant growth, help cultivated plants fight weeds and drought [3].
A STUDY OF THE STRUCTURE OF MITOCHONDRIAL MEMBRANES IN PEA EPICOTYLES EXOGENOUSLY TREATED WITH A NO DONOR IN THE NORM
Authors: Герасимов Н.Ю. , Неврова О.В. , Жигачева И.В. , Генерозова И.П. , Голощапов А.Н.
Published: September 2024

Оксид азота (NO) является сигнальной молекулой клетки при стрессе. Известно, что воздействие стрессовых факторов может не только задерживать рост всего растения, листьев, корней, но и прорастание семян, а также скорость роста проростков. NO участвует в процессах адаптации, позволяя растению защищать себя от стресс-факторов путем предотвращения дисфункции митохондрий. Однако, о защитных механизмах оксида азота известно мало. Натрий-μ2-дитиосульфатотетранитозилдиферрат тетрагидрат (ТНКЖ-тио) - кристаллический водорастворимый донор NO.

Nitric oxide (NO) is a cell signaling molecule during stress. It is known that the impact of stress factors can not only retard the growth of the whole plant, leaves, roots, but also the germination of seeds, as well as the growth rate of seedlings. NO is involved in adaptation processes, allowing the plant to protect itself from stress factors by preventing mitochondrial dysfunction. However, little is known about the protective mechanisms of nitric oxide. Sodium-μ2-dithiosulfatetetranitosyl diferrate tetrahydrate (TNIC-thio) is a crystalline water-soluble NO donor.
ACRYLIC SUPER MOISTURE ABSORBENTS IN THE QUALITY OF MINERAL MOISTURE CARRIERS
Authors: Глухова А.С.
Published: September 2024

Суперабсорбенты представляют собой полимерные материалы, которые обладают способностью поглощать и удерживать в себе большое количество воды (до 2 кг на 1 г сухого материала). Наилучшими показателями цена/качество обладают суперабсорбенты на основе акриловой кислоты и ее производных, которые используются в различных областях промышленности, в сельском хозяйстве, при решении водных и экологических проблем. Применение акриловых абсорбентов при незначительном внесении в почву позволяет существенно повысить влагообеспеченность почв, а использование композиционных материалов, содержащих органические и минеральные удобрения, и урожайность.

Superabsorbents are polymeric materials that have the ability to absorb and retain a large amount of water (up to 2 kg per 1 g of dry material). Superabsorbents based on acrylic acid and its derivatives, which are used in various industries, in agriculture, in solving water and environmental problems, have the best price / quality indicators. The use of acrylic absorbents with a slight introduction into the soil can significantly increase the moisture content of soils, and the use of composite materials containing organic and mineral fertilizers and productivity.
EFFECT OF BIOLOGICAL PREPARATIONS ON GROWTH AND DEVELOPMENT OF PLANTS SETARIA ITALICA (L.) P. BEAUV. SUBSP. ITALICA IN THE CONDITIONS OF THE VOLOGDA REGION
Authors: Сухарева Л.В.
Published: September 2024

В последнее время все больше внимания уделяется экологизации производств, в частности сельского хозяйства. Для снижения химической нагрузки, увеличения коэффициента использования удобрений, улучшении адаптации растений и для большего наращивания надземной массы на кормовые цели все чаще используют биопестициды, аналогом которых являются биологические препараты нового поколения. Вытекающая из этого цель исследования заключается в изучении действия биопрепаратов на ростовые и продуктивные характеристики ценной кормовой культуры - Setaria italica (L.) P. Beauv. subsp. italica в условиях Вологодской области.

Recently, more and more attention has been paid to the greening of industries, in particular agriculture. To reduce the chemical load, increase the utilization rate of fertilizers, improve the adaptation of plants and to increase the aboveground mass for fodder purposes, biopesticides are increasingly being used, the analogues of which are biological preparations of a new generation. The aim of the study, which follows from this, is to study the effect of biological preparations on the growth and productive characteristics of a valuable fodder crop - Setaria italica (L.) P. Beauv. subsp. italica in the conditions of the Vologda region.
DEVELOPMENT OF PARTHENOGENETIC EMBRYOS OF CATTLE DEPENDING ON THE ENVIRONMENT OF POST-ACTIVATION CULTIVATION
Authors: Лопухов А.В.
Published: September 2024

Дополнительное культивирование совместно с пост-активационными агентами, такими как 6-диметиламинопурин (6-DMAP) и циклогексимид, стимулирует снижение уровня фактора промоции созревания (MPF) у активированных ооцитов и, как следствие, преодоление блока мейоза на стадии MII, что наряду с действием основного активирующего сигнала способствует успешному развитию партеногенетических эмбрионов, а также эмбрионов, полученных методом переноса ядер соматических клеток (somatic cell nuclear transfer, SCNT).

Additional cultivation together with post-activation agents, such as 6-dimethylaminopurine (6-DMAP) and cycloheximide, stimulates a decrease in the level of maturation promotion factor (MPF) in activated oocytes and, as a result, overcoming the block of meiosis at the MII stage, which, along with the action the main activating signal contributes to the successful development of parthenogenetic embryos, as well as embryos obtained by somatic cell nuclear transfer (SCNT)
IMMUNOLOCALIZATION OF MODIFICATIONS OF HISTONE PROTEINS ON THE SEX CHROMOSOMES OF CANNABIS SATIVA L.
Authors: Романов Д.В. , Дивашук М.Г.
Published: September 2024

Конопля посевная является важным сельскохозяйственным растением. Лечебными свойствами в разной степени обладают все надземные части растения. Используют при лечении ожогов, сердечно-сосудистых и бронхолегочных заболеваний, анемии, хрупкости костей и диатезе, заболеваний системы пищеварения. Кроме широкого использования в медицине, конопля успешно используется в качестве технической культуры, а также в косметологии и в кулинарии

Hemp is an important agricultural plant. All aerial parts of the plant have medicinal properties to varying degrees. Used in the treatment of burns, cardiovascular and bronchopulmonary diseases, anemia, bone fragility and diathesis, diseases of the digestive system. In addition to being widely used in medicine, hemp is successfully used as an industrial crop, as well as in cosmetology and cooking.
OBTAINING PROTOPLASTS OF SUNFLOWER (HELIANTHUS ANNUUS L.) FOR GENOME EDITING
Authors: Абрамова А.С. , Соловьев A.A. , Гарибян Ц.С.
Published: September 2024

Подсолнечник (Heliánthus ánnuus) является одной из основных масличных культур не только в России, но и в мире. В связи с этим, актуальным является изучение методов увеличения генетического разнообразия данной культуры. В настоящее время широко используются протопласты (клетки, лишенные клеточной стенки) в качестве исходного материала для генетических манипуляций с культурными растениями. Успешное выделение протопластов зависит от многих факторов от сортовых особенностей в том числе, их необходимо индивидуально оптимизировать.

Sunflower (Heliánthus ánnuus) is one of the main oilseeds not only in Russia but also in the world. In this regard, it is relevant to study methods for increasing the genetic diversity of this crop. Currently, protoplasts (cells lacking a cell wall) are widely used as starting material for genetic manipulations with cultivated plants. Successful isolation of protoplasts depends on many factors, including varietal characteristics, which must be individually optimized.
INTEGRATE DURUM WHEAT BREEDING APPROACH: SPRING AND WINTER CASE STUDY
Authors: Natoli V. , Bespalova L. , Mudrova A. , Yanovsky A. , Malchikov P. , Shevchenko S. , Miasnikova M. , Dolaberidze S. , Vita P.De. , Esposito S.
Published: September 2024

Durum wheat (Triticum turgidum L. ssp. durum) is an allotetraploid species with 2n=4x=28 (AABB genomes) and is used predominantly for food products such as pasta, couscous, and bulgur.
СРАВНЕНИЕ ЭФФЕКТИВНОСТИ МЕТОДОВ ПОЛУЧЕНИЯ УДВОЕННЫХ ГАПЛОИДОВ У ГИБРИДОВ МЯГКОЙ ПШЕНИЦЫ, СОДЕРЖАЩИХ ЧУЖЕРОДНЫЕ ИНТРОГРЕССИИ
Authors: Логинова А.С. , Тимонова Е.М. , Баранцова М.А. , Леонова И.Н. , Салина Е.А.
Published: September 2024

Один из подходов для сокращения сроков селекционного процесса – это использование удвоенных гаплоидов или дигаплоидов (ДГ). Однако для большинства сельскохозяйственных культур успех использования ДГ во многом зависит от разработки эффективного протокола индукции гаплоидов. В работах с мягкой пшеницей и ее гибридами чаще других используют метод культуры пыльников на основе андрогенеза in vitro, при котором растение развивается из незрелой гаплоидной микроспоры. Однако большое количество сортов проявляет низкую способность к андрогенезу in vitro (Lantos et al., 2013). Альтернативой является метод отдаленной гибридизации с последующей селективной элиминацией хромосом вида-опылителя.
СВЯЗЬ ПРИЗНАКОВ МОЛОЧНОЙ ПРОДУКТИВНОСТИ И ЗДОРОВЬЯ ГОЛШТИНСКОГО СКОТА С ГЕНАМИ ASS1, SMC2, UMPS
Authors: Пиметьев В.О. , Шатохин К.С. , Камалдинов Е.В. , Петров А.Ф.
Published: September 2024

Идентификация конкретных локусов моногенных заболеваний и их возможная роль в изменчивости признаков отбора остается непростой задачей. Известно, что моногенные заболевания, проявляющиеся у животных с высокой степенью гомозиготности часто бывают нежизнеспособными либо имеют более низкий уровень продуктивности по сравнению со здоровыми. Обнаружение таких носителей позволяет скорректировать схему подбора родительских пар и оздоровить стадо, создав основу для дальнейшего разведения.
ПОИСК ИСТОЧНИКОВ УСТОЙЧИВОСТИ ТРИТИКАЛЕ К СТЕБЛЕВОЙ РЖАВЧИНЕ
Authors: Дудникова К.Ю. , Дудников М.В.
Published: September 2024

По сравнению с другими зерновыми, тритикале (пшенично-ржаной гибрид), относительно недавно получил хозяйственное значение и имеет ограниченный ареал распространения и поэтому не успел пройти длительную коэволюцию с внешними факторами. Однако тритикале за счёт своего гибридного происхождения имеет характерные особенности - высокий уровень урожайности зерна и зеленной массы, характерный для пшеницы, а также устойчивость к болезням, пришедшая от ржаного генома.
АНАЛИЗ ФЕНОТИПИЧЕСКОГО ПРОЯВЛЕНИЯ АЛЛЕЛЕЙ ГЕНОВ-РЕГУЛЯТОРОВ РОСТА (GRF) У КОРОТКОСТЕБЕЛЬНОЙ ПШЕНИЦЫ И ТРИТИКАЛЕ
Authors: Баженов М.С. , Черноок А.Г. , Крупина А.Ю. , Ермолаев А.С. , Беспалова Л.А. , Дивашук М.Г.
Published: September 2024

Основой «Зеленой революции» было создание полукарликовых сортов растений. Такие сорта демонстрируют повышенную урожйаность, однако также они имеют относительно низкую эффективность использования азота и требуют большого количества азотных удобрений для достижения высокого урожая. Стремление к устойчивому сельскому хозяйству требует сокращения использования удобрений при одновременном повышении урожайности зерна.