Etiological Structure of Fungi Found in the Biological Material of the Respiratory Organs of Children with Oncohematological Pathology
Authors: Черновецкий М.А. , Кондаурова С.Л. 
Published: July 2022

Введение. Несмотря на успехи, достигнутые в последнее время, грибковые заболевания человека продолжают оставаться в числе актуальных проблем отечествен- ного и мирового здравоохранения. Одной из наиболее опасных форм данного вида патологии являются инвазивные микозы с поражением системы дыхания (дыхательных путей и органов дыхания), характеризующиеся тяжелым течением заболевания и высоким уровнем летальности.Цель. Установление этиологической структуры грибов, выделенных из биологиче- ского материала дыхательных путей и органов дыхания детей с онкогематологическими заболеваниями.Материалы и методы. В исследование были включены все штаммы грибов (микромицеты), выявленные в биологическом материале из клинически значимых локусов (жидкости, забранные при дренировании трахеобронхиального дерева и проведении бронхоальвеолярного лаважа; содержимое гайморовых пазух и решетчатой кости черепа; плевральная жидкость, биоптаты и аутоптаты легких), полученном в период с 2002 по 2021 г. от пациентов с сопутствующими инфекционными осложнениями на фоне основной онкогематологической патологии, находящихся на лечении в Республиканском научно-практическом центре детской онкологии, гематологии и иммунологии (далее – Центр). При этом результаты микробиологических анализов образцов мокроты не были включены в исследование ввиду высокой вероятности контаминации тестируемого биоматериала грибковой микрофлорой полости рта, ротоглотки и носоглотки. Выделенные из дыхательной системы грибковые микроорганизмы были идентифицированы методами фенотипирования микромицетов и оценки их биохимических свойств (при выявлении дрожжевых патогенов), с подтверждением родовой и видовой принадлежности отдельных штаммов путем дополнительного исследования (в сложных для диагностики случаях) белкового профиля выявленных штаммов грибов в варианте масс-спектрометрического анализа с матрично-активированной лазерной десорбцией/ионизацией c задержкой во времени (MALDI-TOF MS) при использовании автоматического спектрофотометра Vitek MS (bioMerieux, Франция).Результаты. В общей сложности было выделено 259 штаммов микромицетов (без учета повторного выделения у ребенка одной и той же микрофлоры в динамике), среди которых дрожжеподобные грибы (дрожжи) составляли 69,5% (180 культур микроорганизмов). Общий спектр дрожжеподобных микромицетов был представлен различными видами представителей рода Candida и штаммами Saccharomyces cerevisiae. При этом среди дрожжей выявлено 77 культур Candida albicans (42,77%). В качестве других наиболее часто встречаемых представителей рода Candida обнаружено 20 штаммов Candida glabrata (11,11%), 17 образцов Candida krusei (9,44%) и 15 микромицетов Candida parapsilosis (8,33%). Общее число выявления в исследованном клиническом материале плесневых (мицелиальных) микроорганизмов составило 79 культур (30,5%) с выраженным превалированием среди них представителей рода Aspergillus в количестве 56 штаммов (70,89%), и в частности Aspergillus fumigatus в количестве 29 высевов (36,70%). Суммарное обнаружение так называемых мукоровых грибов (порядок Mucorales), включая выявленных представителей родов Mucor, Rhizopus, Rhizomucor и Lichtheimia (Absidia), составило 11 культур (13,92% от общего числа мицелиальных грибов. Большинство из них (8 штаммов) выявлены во второй половине анализируемого периода времени.Выводы. Дрожжеподобные грибы продолжают оставаться основными представителями грибковой микрофлоры, выделяемой из дыхательной системы детей с сопутствующими инфекционными осложнениями на фоне основной онкогематологической патологии. Подавляющее число высевов данных микромицетов из дыхательной системы приходится на долю широко распространенной в окружающей среде Candida albicans, а также так называемых новых дрожжевых патогенов (чаще всего Candida glabrata, Candida krusei, Candida parapsilosis), характеризующихся, как правило, большей агрессивностью и устойчивостью к противогрибковым лекарственным средствам по сравнению с Candida albicans. В свою очередь в этиологической структуре мицелиальных грибов, обнаруженных в биологическом материале из дыхательных путей, преобладают микромицеты рода Aspergillus, и в частности Aspergillus fumigatus. Вызывают настороженность участившиеся в последнее время случаи обнаружения грибов порядка Mucorales.

Introduction. Human fungal diseases are the actual medical problem still despite successes in this field during last years. One of most dangerous forms of this pathology are the invasive mycoses with damage of respiratory system. Those fungal infections are characterized by severe clinical diseases course and high level of mortality.Purpose. To reveal the etiologic structure of fungi isolated from respiratory systems of children with oncohematological diseases.Materials and methods. All fungal cultures revealed during investigation in 2002–2021 years period at the clinical biological materials from respiratory system (tracheal, bronchial, alveolar and pleural aspirates; lungs biopsy and autopsy; ethmoid bone of the scull and maxillary sinus contents) of children with oncohematological pathologу complicated infectious diseases were included in this study. Sputum samples were excluded from investigation taking into account high likely possibility of contamination by fungi from oral cavity, nasopharynx and oropharynx. Cultures of fungi were indicated and identified by phenotype and biochemistry (for yeast only) assays. A lot fungal strains were confirmed additionally at diagnostic difficult cases by matrix-assisted laser desorption ionization- time of flight mass spectrometry (MALDI-TOF MS) using Vitek MS.Results. In sum 259 fungal cultures were found. The prevalence of Candida spp. and other yeasts was 69,5% (180 cultures). Specific gravity of Candida albicans among yeasts was 42,77% (77 cultures). The other main representatives of Candida spp. were Candida glabrata (20 cultures, 11,11%), Candida krusei (17 culture, 9,44%) and Candida parapsilosis (15 cultures, 8,33%). The prevalence of mycelial fungi (mold) was in sum 30,5% (79 cultures) with Aspergillus spp dominance among mold (70,89%, 56 cultures) and particularly – Aspergillus fumigatus (36,70%, 29 cultures). So-called «mucor» fungi (Mucor spp, Rhizopus spp, Rhizomucor spp. и Lichtheimia (Absidia) spp. representatives) were revealed in 11 cases (13,92% among micelial samples). From those 11 cases abovementioned 8 mucormycetes were detected during last 10-years period.Conclusions. Representatives of Candida spp. are the main fungal pathogens, revealed at respiratory systems in patients with opportunistic infectious on the background oncohematological pathology. Negative tendency for increasing etiologic roles most aggressive and drug resistance «non-albicans» yeast (such as Сandida glabrata, Candidakrusei, Candida parapsilosis) and individual mucormycetes took place. Prevalence of Aspergillus spp. was detected among mycelial fungi with Aspergillus fumigatus dominate.