bluuebunny/crossref_metadata_2025 huggingface dataset:
ANTICIPATING BIOSECURITY HAZARDS: DISTRIBUTION AND RECOGNITION OF BIOLOGICAL THREATS
Authors: Ansari Naushin
Published: September 2024

Understanding the potential biological weapons that can be created, the technologies involved, and the entities capable of producing them is crucial for biosecurity. Equally important is comprehending the various targets a biological weapon might be aimed at, the deployment methods, and available detection strategies to counteract illegal biological threats. This chapter delves into these aspects, starting with methods of deployment.  The Center for Disease Control and Prevention (CDC) categorizes disease transmission into direct and indirect modes. Direct transmission involves contact with an infected person or environmental reservoir, including droplet spread, proven highly effective in densely populated areas. Indirect transmission occurs through contaminated objects or vectors. Vehicle-based transmission involves contaminating inanimate objects like food, water, and biological products. Vector-based transmission involves organisms carrying and transmitting pathogens. Airborne transmission, receiving significant attention for its potential in biological attacks, involves pathogens suspended in the air, posing significant risks, especially in crowded areas.
Biological weapons could target humans, agriculture, technology, and the environment. Attacks on humans, often the focus of biosecurity efforts, pose catastrophic outcomes. State-sponsored programs often focus on human pathogens like Bacillus anthracis and Yersinia pestis. Agroterrorism, targeting agriculture and livestock, can lead to economic losses and social instability. Attacks on technology, utilizing synthetic biology, have shown the potential to manipulate DNA to store and deploy malicious code, highlighting vulnerabilities in sequencing systems. While attacks on the environment remain theoretical, advancements in gene drives raise concerns about manipulating ecosystems.
Effective biosecurity involves pre- and post-deployment screening techniques. Pre-deployment screening, particularly gene synthesis, focuses on preventing the acquisition of DNA fragments for weapon production. Current measures involve background checks and screening against pathogen lists, yet gaps exist, including inadequate international policies and the potential to hide malicious sequences within longer ones. Post-deployment detection relies on traditional molecular diagnostic methods, but synthetic pathogens may evade detection, necessitating ongoing advancements in detection techniques. Real-time sensors and biosensors offer promising avenues for quick and accurate pathogen recognition, although challenges remain in detecting novel pathogens against a natural background.
In conclusion, understanding the range of biological weapons, their potential targets, deployment methods, and detection strategies is essential for effective biosecurity. Continued research and advancements in detection technologies are crucial to staying ahead of evolving biological threats, ensuring a safer and more secure future.
ИССЛЕДОВАНИЕ РАСПРОСТРАНЕННОСТИ BORRELIA MIYAMOTOI В АЛМАТИНСКОЙ ЖЕТЫСУСКОЙ ОБЛАСТЯХ КАЗАХСТАНА
Authors: Остапчук Е.O. , Бисенбай A.O. , Кулигин A.В. , Кан С.A. , Лушова A.В. , Жигайлов A.В. , Стуколова O.A. , Саякова З.З. , Абдолла Н. , Дмитровский A.M. , Перфильева Ю.В. , Машжан A.С. , Куатбекова С.A. , Досмагамбет Ж. , Шапиева Ж. Ж. , Найзабаева Д.A. , Оспанбекова Н.K. , Скиба Ю.A.
Published: September 2024

Borrelia miyamotoi относится к спирохетам Borreliae группы клещевых возвратных лихорадок, передаваемых с укусами клещей рода Ixodes и вызывающих заболевания у людей. Симптомы клещевых возвратных лихорадок у людей характеризуются повторяющимися эпизодами лихорадки, часто сопровождающимися головной болью, мышечными и суставными болями, недомоганием, артралгиями и миалгиями. Несмотря на то, что случаи укусов клещами людей, а также случаи Лайм-боррелиозов или клещевого энцефалита часто фиксируются в Алматинской и Жетысуской областях, распространенность B. miyamotoi среди клещей и людей в Казахстане практически не изучена. Нами было проанализировано 477 клещей вида I. persulcatus, собранных с растительности (n=429), снятых с людей (n=43) и собак (n=5) в Алматинской и Жетысуской областях Казахстана. Клещи были гомогенизированы, из гомогенатов выделили образцы ДНК и провели анализ инфецированности B. miyamotoi методом классической ПЦР с использованием праймеров к генам флагеллина B (flaB), глицерофосфодиэфир фосфодиэстеразы (glpQ) и порина P66 (P66). Общая превалентность B. miyamotoi в клещах составила 5.5% (26/477, 95% CI: 3,8-7,9%). ПЦР-положительные клещи были собраны с растительности (27/521, 5,2%; 95% CI: 3,6–7,4%) и человека (1/54, 1,9%; 95% CI: 0,3–9,8%). Инфицированность собранных I. persulcatus в разных районах Алматинской и Жетысуской областей достоверно не различалась (р>0,05). ПЦР-положительные образцы были секвенированы по локусам генов flaB, glpQ и P66 и в 24 образцах ТRFGB были идентифицированы как Borrelia miyamotoi, в 2 образцах не удалось провести идентификацию штамма. Мы провели серологический анализ образцов, собранных у 42 пациентов, проживающих в Алматинской и Жетысуской областях и госпитализированных с лихорадкой неизвестной этиологии или укушенных клещами с лихорадкой, эритемой или покраснением в месте укуса клеща.
Из протестированных образцов 12 % (5/42, 95% CI: 5,2–25,0%) были положительными на IgM и 5% (2/42, 95% CI: 1,3–15,8%) на антитела IgG против B. miyamotoi. Полученные данные свидетельствуют о циркуляции B. miyamotoi в Алматинской и Жетысуской областях Казахстана, подчеркивают необходимость повышения информированности населения и медицинских работников, а также улучшения эпидемиологического надзора за данной клещевой инфекцией в регионе.
GENOME-WIDE ASSOCIATION STUDY OF YIELD-RELATED TRAITS IN A NESTED ASSOCIATION MAPPING POPULATION GROWN IN KAZAKHSTAN
Authors: Amalova A. , Griffiths S. , Abugalieva S. , Turuspekov Ye.
Published: September 2024

This study evaluated 290 recombinant inbred lines (RILs) from the Nested Association Mapping (NAM) population in the UK, consisting of 24 hybrid families. All genotypes were grown in southeastern Kazakhstan (Kazakh Research Institute of Agriculture and Plant Growing, Almaty region, 2021-2022) and northern Kazakhstan (Alexandr Barayev Scientific-Production Center for Grain Farming, Akmola region, 2020). The studied traits included six yield-related characteristics: spike length (SL, cm), number of productive spikes per plant (NPS, pcs), number of kernels per spike (NKS, pcs), weight of kernels per spike (WKS, g), thousand kernel weight (TKW, g), and yield per square meter (YM2, g/m2). The significant phenotypic variability among genotypes was observed, which was suitable for the genome-wide association study of yield-related traits. Pearson's index showed positive correlations among most yield-related traits, although a negative correlation was found between NKS and TKW in southeastern, and no correlation was recorded for northern regions. Top-performing RILs, surpassing local checks, were identified for NKS, TKW, and YM2, suggesting their potential for breeding programs. The application of GWAS allowed the identification of 72 quantitative trait loci (QTLs), including 36 QTLs in the southeastern region, 16 QTLs in the northern region, and 19 in both locations. Eleven QTLs matched those reported in previous QTL mapping studies and GWAS for studied traits. The results can be used for further studies related to the adaptation and productivity of wheat in breeding projects for higher grain productivity.
КЛЕТОЧНАЯ ТЕХНОЛОГИЯ СОЗДАНИЯ БИОПРЕПАРАТОВ НОВОГО ПОКОЛЕНИЯ ДЛЯ ПОВЫШЕНИЯ УРОЖАЙНОСТИ И УСТОЙЧИВОСТИ С/Х КУЛЬТУР
Authors: Бишимбаева Н.К. , Рахимбаев И.Р.
Published: September 2024

В настоящее время в мировой агроиндустрии наблюдается тенденция перехода к органическому земледелию с постепенным уменьшением доли ядовитых химически синтезированных пестицидов и средств защиты растений, накапливающихся в окружающей среде и наносящих вред здоровью человека и животных. Предпочтение отдается экологически чистым, не токсичным природным биопрепаратам, среди которых наиболее безопасными для животных и человека, а также физиологичными для с/х культур являются препараты растительного происхождения (фитопрепараты). В то же время на рынке имеется дефицит фитопрепаратов для растениеводства, т.к. их создание связано с большими затратами: требует земельных площадей, сельхозтехники, зависит от сезона, требует много времени для выращивания растительного сырья.
Нами разработана клеточная биотехнология получения фитопрепаратов (ФП) с высокой (в наномолярных концентрациях) рострегулирующей и иммуномодулирующей активностью. Предполагается сигнальный механизм действия данных соединений. Получены лабораторные образцы, которые тестированы в лабораторных, тепличных и полевых условиях в 5 селекционных центрах страны с использованием 10-ти с/х культур.  Показана способность ФП стимулировать всхожесть, энергию прорастания, урожайность и устойчивость с/х культур к болезням и абиотическим стрессам (засуха, засоление, высокие и низкие температуры). Выявлена их способность сокращать сроки созревания растений, стимулировать соматический эмбриогенез в культуре гаплоидных клеток. Показано, что данные препараты не токсичны для клеток животных.
Работа находится на стадии подготовки проекта коммерциализации и поиска бизнес партнера для совместной организации биотехнологического производства и реализации на рынке новых фитопрепаратов на взаимовыгодных условиях. Преимущества данной технологии:
- биотехнологическое производство (в биореакторах) проще, дешевле, быстрее, не зависит от сезона, не требует земельных площадей;
- экологическая безопасность и полифункциональность получаемых ФП;
- возможность регулировать структуру и функции ФП изменением состава среды.
Конечные потребители: предприятия АПК, садоводческие и тепличные хозяйства, семеноводческие и биотехнологические компании.
Работа выполнена в рамках проекта ГФ (ГР № 0106РК00297), инновационного проекта НАТР (ГР№0112РК00218), целевой научно-технической  программы (ГР № 0115РК01884).
СКРИНИГ СОРТОВ И ГИБРИДОВ ТОМАТА КАЗАХСТАНСКОЙ СЕЛЕКЦИИ (SOLANUM LYCOPERSICON L.) НА УСТОЙЧИВОСТЬ К АЛЬТЕРНАРИОЗУ
Authors: Есимсеитова А.К. , Абдрахманова А.Б. , Муранец А.П. , Какимжанова А.А.
Published: September 2024

Томат (Solanum lycopersicum L.) является одной из самых универсальных и экономически важных овощных культур в мире. Также плоды томата полезны для здоровья в связи с высоким содержанием витаминов и антиоксидантов. Различные патогены влияют на производство томатов и снижают его качество и урожайность. Альтернариоз, вызываемый грибами рода Alternaria spp., является одним из наиболее распространенных заболеваний томата и проявляется в виде круглых коричневых пятен на нижних листьях, которые по мере прогрессирования приводят к увяданию и отмиранию листьев; при этом на урожайность влияет влажность и температура воздуха, инфекционная нагрузка патогена  и восприимчивость растения-хозяина. В борьбе с альтернариозом используют следующие меры - это агротехника, применение фунгицидов и использование устойчивых сортов. С экономической и экологической точки зрения наиболее эффективным и альтернативным методом борьбы с этим заболеванием является использование устойчивых сортов.
В нашем исследовании для скрининга томата на устойчивость к альтернариозу на искусственном инфекционном фоне было использовано 39 сортов и гибридов казахстанской селекции, предоставленные Казахским научно-исследовательским институтом плодоовощеводства (КазНИИПО), г. Алматы. Инокуляцию растений проводили путем опрыскивания суспензией спор гриба A.alternata в концентрации  10000 спор/мл.  Далее учитывали степень заражения каждого растения томата и рассчитывали процент индекса заболеваемости (PDI) по методике Pandey et al. (2003). Согласно данной классификации генотипы ВенерахМечта и ГлорияхBSS-335 продемонстрировали высокую устойчивость к альтернариозу по сравнению с другими генотипами. Умеренная устойчивость с PDI от 12,1 до 25% наблюдали у генотипов Меруерт, Лучезарный, Пламя, Нарттай, Рассвет, Заря востока, Огонек-777, Янтарь, Венера, Аян, Чудесный, Г-2005, Ситора х Сантьяго, Авицена х BBS-335, Пламя х  Polset,  Искорка х Г-71-88-1, Авицена х ТМК, Янтарь х BZ,  BSS-335 х Лидер, Роза Востока х Г-205, Л-51-95-2, Г-103-88-2, Глория х Г-201. В то время как умеренно восприимчивыми (PDI 25,1-50%) генотипами были  К-10 х Танаит, Самаладай, Сюрприз, Лидер,  Таншолпан, Восторг, Дарын, Мечта, Коркем, Г-205 х Polset, Китай-12 х Моя радость, Авицена х Г-205, Лидер х Лучезарный. Сорт томата Умит, характеризовался как устойчивый. Таким образом, устойчивые генотипы могут быть использованы в программах селекции томата на устойчивость к альтернариозу.
Исследования проводятся в рамках проекта АР19679502 при финансовой поддержке Министерства науки и высшего образования Республики Казахстан  (2023-2025 гг.).
СОЗДАНИЕ СОВРЕМЕННЫХ ФЕРМЕНТНЫХ ПРЕПАРАТОВ ДЛЯ ПРИМЕНЕНИЯ В СЕЛЬСКОМ ХОЗЯЙСТВЕ
Authors: Зоров И.Н. , Рожкова А.М. , Чулкин А.М , Синельников И.Г. , Кислицин В.Ю. , Шашков И.А. , Волков П.В. , Осипов Д.О. , Семенова М.В. , Синицына О.А. , Синицын А.П.
Published: September 2024

Зерновой комбикорм - важнейший источник кормов для домашних животных во всем мире. Корма - самый дорогостоящий компонент процесса производства мяса. На каждый килограмм произведенного мяса коровы и овцы потребляют около 8 кг зернового корма, свиньи - около 4 кг, а птица потребляет 1,6 кг корма. В состав зерновой части комбикормов входят различные виды сырья, включая кукурузу, пшеницу, овес, ячмень, рис и многие другие. Крахмал и некрахмальные полисахариды (НПС), такие как целлюлоза и бета-глюканы, пектины, ксиланы и маннаны, присутствуют в зерновых как основные структурные и энергетические материалы. Наличие НПС приводит к снижению питательной ценности корма, уменьшению доступности полезных компонентов, снижению степени конверсии корма что приводит к потере продуктивности и росту производственных затрат. Карбогидразы, а именно ксиланазы и бета-глюканазы, широко используются в кормлении животных для модификации НПС с целью улучшения качества кормов и повышения продуктивности животных. Подходы к разведению сельскохозяйственных животных, домашней птицы и аквакультуры следуют строгим рекомендациям в соответствии с требованиями к современным породам, особенно актуальными для получения органических продуктов, снижению энергопотребления и выбросов углекислого газа. Современные кормовые ферментные препараты должны обладать высокой молекулярной активность, быть устойчивыми к действию белковых ингибиторов злаков, сохранять стабильность при высоких температурах в процессах гранулирования кормов, а также сохранять активность при воздействии пищеварительных протеаз.
На основе экспрессионной системы высокопродуктивного мицеллиального гриба Penicillium verruculosum (ВКМ F-3972D) с использованием современных достижений генетической и белковой инженерии в лаборатории биотехнологии ферментов ФИЦ Биотехнологии РАН были созданы штаммы-продуценты, секретирующие собственную эндоглюканазу 2 (ЭГ2) и ксиланазу Е (КсилЕ) P. canescens. Продуктивность P. verruculosum достигает 60 г/л внеклеточного белка, что позволяет использовать его в качестве базового продуцента ферментов и ферментных комплексов, востребованных агропромышленными биотехнологиями. Полученные ферментные препараты (ФП) отличаются высокой молекулярной активностью и устойчивостью к действию растительных ингибиторов. Кроме того, сбалансированность состава ферментов, широкий диапазон значений рН их действия и высокое содержание целевых активных белков в новых ФП позволяет использовать низкие нормы ввода ФП в качестве добавок при производстве комбикормов.
Успешное тестирование разработанных ФП в качестве добавки в корма бройлеров и поросят и организация заводом ООО «Агрофермент» производства промышленных партий ферментных препаратов позволило внедрить разработки в сельхозпроизводство.
Работа выполнена при поддержке Министерства науки и высшего образования РФ в соответствии с договором № 075-15-2022-318 от 20.04.2022.
RECOMBINANT LUMPY SKIN DISEASE VIRUS AS A VACCINE VECTOR
Authors: Issabek A. , Bopi K. , Sultankulova M. , Orynbayev O. , Chervyakova O.
Published: September 2024

Lumpy skin disease (LSD) is a viral highly contagious transboundary disease of cattle, less often - sheep, goats and buffaloes accompanied by fever, swelling of the subcutaneous connective tissue and organs, the formation of skin nodes, damage to the eyes, mucous membrane of the respiratory and digestive tracts. Mortality in lumpy skin disease does not exceed 10%, however, the financial damage is great, it is manifested by a decrease in gains and milk yields, as well as the inability to use cowhides. Since there are no specific treatments for LSD, vaccination is the most effective way to control and eradicate LSD. Vaccination with live attenuated vaccines is a key element in the prevention of LSD. The mechanism of virus attenuation by long-term passaging in sensitive systems remains unclear. Targeted inactivation of virulence genes is the most promising way to obtain attenuated viruses.
In this study, we sequentially knocked out four virulence genes in the lumpy skin disease virus (LSDV) genome using homologous recombination under transient dominant selection conditions. The knockout of the LSDV005, LSDV008, LSDV142 genes was carried out by completely deleting the coding sequence; the reading frame was broken in the LSDV066 gene due to the insertion of a foreign sequence. The presence of deletions and insertions was confirmed by both PCR and viral genome sequencing (GenBank ID: ON005067). Recombinant LSDV Atyrau-5BJN(IL18) stably expressed interleukin 18 in vitro in lamb testicles cells. It was found that the recombinant LSDV Atyrau-5BJN(IL18) retained its genetic stability for ten passages and replicated efficiently in lamb testicles cells as well as bovine and saiga kidney cells. Knockout of four genes did not affect virus replication in vitro. In vivo experiments with cattle have shown that injection of the LSDV Atyrau-5BJN(IL18) at a high dose does not cause disease in animals or other deviations from the physiological norm. Immunization of cattle with the LSDV Atyrau-5BJN(IL18) induced the production of virus-neutralizing antibodies in titers of 4–5 log2. The challenge did not cause disease in immunized animals. The knockout of four virulence genes resulted in attenuation of the virulent LSDV without loss of immunogenicity. LSDV Atyrau-5BJN(IL18) demonstrated high safety and immunogenicity. The ability to stably express foreign genes demonstrates the potential of using this virus also as a vaccine vector.
This research was funded by the Science Committee of the Ministry of Science and Higher Education of the Republic of Kazakhstan, grants number AP08856376
РАЗРАБОТКА БИОТЕХНОЛОГИИ КОМПЛЕКСНОЙ ПЕРЕРАБОТКИ ВТОРИЧНОГО СЕЛЬСКОХОЗЯЙСТВЕННОГО СЫРЬЯ – ФРУКТОВ И ОВОЩЕЙ ПОНИЖЕННОГО КАЧЕСТВА С ПРИМЕНЕНИЕМ МЕТОДА ФЕРМЕНТОЛИЗА И ПОЛУЧЕНИЕМ ФУНКЦИОНАЛЬНЫХ ПИЩЕВЫХ ДОБАВОК
Authors: Карлов В.А. , Гольбрайх А.А. , Мезенова О.Я.
Published: September 2024

Одной из наиболее актуальных проблем современной пищевой промышленности является переработка твердых пищевых отходов, большую часть которых составляет сельскохозяйственная продукция – фрукты и овощи (ФРОВ). В отходы часто попадают фрукты и овощи без признаков микробиологической порчи, но с внешними дефектами (битости, нестандартная форма и цвет, царапины, вмятины и прочее) – фрукты и овощи пониженного качества (ФРОВПК).
Эти продукты обладают высокой биологической ценностью, включая содержание многих БАВ: углеводов, витаминов, минералов и фитосоединений. При современных методах утилизации и переработки эта ценность либо полностью теряется, либо не реализуется в должном объеме. Согласно нормативной документации (приказ Росприроднадзора от 22.05.2017 № 242; СанПиН 2.1.3684-21; European Commission № 1169/2011), такое растительное сырье запрещено к дальнейшей реализации: оно не может быть реализовано по сниженным ценам или передано на благотворительность.
В качестве эффективного метода переработки ФРОВПК предлагается комплексная переработка фруктов и овощей пониженного качества с применением ферментативного гидролиза для получения перспективных пищевых функциональных добавок. Ферментативный гидролиз, проводимый при щадящих условиях, обеспечивает сохранение биологически активных веществ на более высоком уровне по сравнению с традиционной термической обработкой. Этот подход также гарантирует экологичность процесса, так как исключает необходимость использования химических реагентов и больших затрат ресурсов.
Подбор ферментов для проведения ферментолиза осуществлялся с учетом состава используемого сырья. Фрукты, содержащие много целлюлозы в клеточных стенках и кожуре, эффективно разлагаются β-глюканазой и целлюлазой. Овощные смеси, богатые крахмалом, требуют использования амилазы и глюкоамилазы для его расщепления. В смесях фруктов и овощей присутствуют все вышеперечисленные компоненты, поэтому применяется сочетание всех указанных ферментов.
Для оптимизации условий ферментативной обработки была разработана математическая модель, которая в натуральном выражении имеет следующий вид: Y = 17.9934 - 0.14857B - 0.52176T + 0.002865BT - 0.00260625B2 + 0.00375T2. При решении данной модели были получены оптимальные значения факторов: время ферментолиза (B) – 8 часов, температура (T) - 65℃.
Полученные функциональные пищевые добавки серии «ВИТУМИН» являются концентратами БАВ. В добавках отмечается повышенное содержание витамина С и веществ с Р-витаминной активностью. Добавки серии «ВИТУМИН» имеют приятные органолептические характеристики, что делает их привлекательными для потребителей. Перспективными направлениями использования полученных добавок являются пищевая промышленность, в частности специализированное питание, а также косметология и фармакология.
ПЕРСОНАЛИЗИРОВАННАЯ ТЕРАПИЯ БИОЛОГИЧЕСКИМИ ПРЕПАРАТАМИ
Authors: Буркитбаева С.С. , Ахмадьяр Н.С. , Болатбек С.Д. , Болатбек А.Д. , Сергазиева С.Ж.
Published: September 2024

Биологические препараты относительно новые лекарства. Они специфически воздействуют на определенные белки или клетки – мишени. С их созданием появилась возможность лечить пациентов, которые ранее не поддавались терапии. Первым биопрепаратом была вакцина против оспы, созданная в 1796 году. В настоящее время в мире существует 3894 биопрепаратов, в том числе 51 биосимиляров, из них, имеют лицензию FDA - 370. К биопрепаратам относят вакцины, кровь и компоненты крови, аллергены, соматические клетки, генные и рекомбинантные терапевтические белки. Их производят из тканей человека, животных и микроорганизмов. Среди биологических препаратов можно выделить моноклональные антитела, цитокины, биологические препараты фактора роста, биологические ферменты и иммуномодуляторы.
В топ 5 широко используемых биопрепаратов вошли моноклональное антитело - Адалимумаб, антикоагулянт - Апиксабан, противоопухолевое средство - Леналидомид, противомеланомное - Ниволумаб, противораковое- Пембролизумаб. Биосимиляры похожи на исходные биопрепараты. Они применяются по тем же показаниям и не имеют значимых отличий по эффективности, безопасности, чистоте, фармакокинетическим параметрам и точно также должны быть одобрены FDA. При этом, биоаналоги не являются дженериками. Так, 26 апреля 2024 года последним биосимиляром одобренный FDA стал шестой аналог трастузумаба – Герценси. Применение биоаналогов способствует сокращению расходов финансовых средств. В среднем стоимость года лечения одного пациента биопрепаратом составляет более чем 100 000 долларов!
Определить доступность биопрепаратов для персонализированного, таргетного лечения в Республике Казахстан (РК) путем выявления регистрации и анализа стоимости лечения.
Проведен фармакоэкономический анализ Государственного реестра лекарственных средств РК за 26 апреля 2024 год (сайт Национального центра экспертизы лекарств, ndda.kz). В программе Excel использовались фильтры: биологическое происхождение, иммунобиологический препарат, биоаналогическое. Анализ стоимости проводился на основе приказа РК от 5 августа 2021 года №77 «Об утверждении предельных цен на торговое наименование лекарств». Исследовались топ 5 биопрепаратов - Адалимумаб, Апиксабан, Леналидомид, Ниволумаб и Пембролизумаб. К сожалению, Ниволумаб исключен из анализа, так как не имеет государственной регистрации в РК.
В нашей стране зарегистрированы 388 биопрепаратов и биосимиляров, из них биопрепаратов 320, биоаналогов 68. Среди анализируемых ЛС средняя стоимость в тенге 1 флакона составила: Пембролизумаба (1 346 394,26). Адалимумаба (158 591,14), Леналидомида (55 319,98), Апиксабана (324,28).
Из 370 биопрепаратов, одобренных FDA, в РК применяются 320, что составляет 86,5%, и средняя стоимость топ 4 ЛС составила 43 558,61 тенге. Следовательно, биопрепараты и биосимиляры доступны пациентам для лечения различных заболеваний, для которых отсутствуют альтернативные терапевтические методы. При этом, у большинства биопрепаратов имеются несколько показаний к применению.
ПРОТЕОЛИТИЧЕСКАЯ, КЕРАТИНОЛИТИЧЕСКАЯ И КОЛЛАГЕНАЗНАЯ АКТИВНОСТЬ ШТАММА BACILLUS SP.T7
Authors: Актаева С.А. , Балтин К.К. , Хасенов Б.Б.
Published: September 2024

Протеазы встречаются в микробах, животных и растениях. Среди микробиальных источников протеаз перспективными являются бактерии Bacillus с их способностью к секреции нейтральных и щелочных протеаз. Бациллярные протеолитические ферменты обладают широкой субстратной специфичностью и способны к гидролизу различных белков. Особый интерес вызывают протеазы, способные к гидролизу коллагена, гемоглобина, кератинов, которыми богаты отходы мясоперерабатывающей и животноводческой индустрии. Продукты гидролиза таких отходов могут выступать в качестве дешевого источника аминокислот и пептидов. Целью работы является изучение протеаз почвенного штамма Bacillus sp.T7, обладающего высокой протеолитической, кератинолитической и коллагеназной активностью.
Из почвы близ города Тараз выделен штамм Bacillus sp.T7, который показал высокую протеазную, кератиназную и коллагеназную активность. В ходе масс-спектрометрического исследования секреторной протеомы и зимографического анализа было установлено, что штамм секретирует протеазы, относящиеся к семейству сериновых протеаз и металлопротеаз с молекулярной массой 26-154 кДа. Изучение субстратной специфичности показало, что протеолитические ферменты штамма полностью гидролизуют казеин, гемоглобин, кератин, овальбумин, бычий сывороточный альбумин, коллаген с образованием полипептидов и свободных аминокислот. Изучение биохимических параметров показало, что протеазы являются щелочными, обладают максимальной активностью при 60-70°С, демонстрируют высокую термостабильность и устойчивы к ряду ионных и неионных детергентов. Протеазы штамма эффективно гидролизуют такие отходы животноводства как путовые суставы, рога, копыта, шкура, шерсть крупного рогатого скота и куриные перья. Данные, полученные с помощью сканирующей электронной микроскопии показывают, что клетки Bacillus sp.T7 обладают высокой адгезивностью и плотно прилегают к поверхности белковых субстратов, что ускоряет процесс деградации. Штамм Bacillus sp.T7 способен к культивированию в условиях глубинной ферментации в биореакторе с использованием перьев в качестве единственного источника органических веществ. С использованием биотехнологического оборудования показана возможность получения протеолитического ферментного препарата в жидкой и порошкообразной форме. Штамм Bacillus sp.T7 имеет высокую перспективу для использования в качестве штамма-продуцента протеаз, кератиназ и коллагеназ для применения в технологиях глубокой переработки белкового сырья, коллагенсодержащих и кератинсодержащих отходов мясной промышленности и животноводства.
Ultrasonographic and pathological features of primary adrenal lymphoma
Authors: Meng Qingkai , Cao Xiaoli , Yu Xintong
Published: September 2024

.
Hybrid Exb/Mot stators require substitutions distant from the chimeric pore to power flagellar rotation
Authors: Ridone Pietro , Baker Matthew A. B.
Published: September 2024

Powered by ion transport across the cell membrane, conserved ion-powered rotary motors (IRMs) drive bacterial motility by generating torque on the rotor of the bacterial flagellar motor. Homologous heteroheptameric IRMs have been structurally characterized in ion channels such as Tol/Ton/Exb/Gld, and most recently in phage defense systems such as Zor. Functional stator complexes synthesized from chimeras of PomB/MotB (PotB) have been used to study flagellar rotation at low ion-motive force achieved via reduced external sodium concentration. The function of such chimeras is highly sensitive to the location of the fusion site, and these hybrid proteins have thus far been arbitrarily designed. To date, no chimeras have been constructed using interchange of components from Tol/Ton/Exb/Gld and other ion-powered motors with more distant homology. Here, we synthesized chimeras of MotAB, PomAPotB, and ExbBD to assess their capacity for cross-compatibility. We generated motile strains powered by stator complexes with B-subunit chimeras. This motility was further optimized by directed evolution. Whole-genome sequencing of these strains revealed that motility-enhancing residue changes occurred in the A-subunit and at the peptidoglycan binding domain of the B-unit, which could improve motility. Overall, our work highlights the complexity of stator architecture and identifies the challenges associated with the rational design of chimeric IRMs.

IMPORTANCE

Ion-powered rotary motors (IRMs) underpin the rotation of one of nature’s oldest wheels, the flagellar motor. Recent structures show that this complex appears to be a fundamental molecular module with diverse biological utility where electrical energy is coupled to torque. Here, we attempted to rationally design chimeric IRMs to explore the cross-compatibility of these ancient motors. We succeeded in making one working chimera of a flagellar motor and a non-flagellar transport system protein. This had only a short hybrid stretch in the ion-conducting channel, and function was subsequently improved through additional substitutions at sites distant from this hybrid pore region. Our goal was to test the cross-compatibility of these homologous systems and highlight challenges arising when engineering new rotary motors.
Whole-genome sequencing and analysis of
Streptococcus iniae
strain isolated from the brain of tilapia (
Oreochromis
sp.)
Authors: Safwat Anan , Ellward Garrett L. , Pouder Deborah B. , Yanong Roy P. E. , Czyż Daniel M.
Published: September 2024

Streptococcus iniae
is a bacterium that can infect fish, mammals, and humans. In this study, the
S. iniae
-313 strain was isolated from the brain of an infected tilapia, and the analysis of its sequenced genome is reported. The data revealed that
S. iniae
-313 carried antibiotic-resistant genes and virulence factors.
Complete genome sequence of
Deinococcus sonorensis
type strain KR-87: a rare biofilm-producing representative of the genus
Deinococcus
Authors: Boren Leilani S. , Grosso Ryan A. , Hugenberg-Cox Alex N. , Hill Jonathan T.E. , Albert Chad M. , Tuohy James M.
Published: September 2024

Here, we present a complete genome of
Deinococcus sonorensis
KR-87
T
, a biofilm-producing mesophile from the Arizonan Sonoran Desert. The sequence, assembled using Oxford Nanopore Technologies’ long-read sequencing platform, predicts a genome size of 4.78 Mbp, with 6 replicons, 4,361 protein-coding genes, and a G+C content of 69.0%.
Deciphering the complete genome sequence of multidrug-resistant
Escherichia coli
strain Hakim RU_GHWS isolated from ladies' hall sewage water in Bangladesh
Authors: Polash Md. Arif-Uz-Zaman , Zahan Nusrat , Khan Muhib Ullah , Sarker Subir , Zhang Tianyu , Haque Md. Hakimul
Published: September 2024

This report details the genome sequence of
Escherichia coli
strain Hakim RU_GHWS, isolated from sewage water. The assembled genome comprises 5.022 Mb with 77.675× coverage, depicting an average GC content of 50.50%. This genome contains 10 CRISPR arrays, 14 prophages, 65 antibiotic resistance genes, and 28 virulence factor genes.
Supplemental Material: Rubidium (Rb) enrichment processes in a highly evolved granitic system: Insights from the petrology and geochemistry of the Guobaoshan Rb deposit in eastern Tianshan, NW China
Authors: Wu Shi-Bao , Lei Ru-Xiong , al. et
Published: September 2024

Table S1: LA-ICP-MS zircon U-Pb dating results of the biotite granite and columbite-group minerals from the amazonite granite. Table S2: In situ Rb-Sr isotope analysis results of amazonite-bearing granites, amazonite granite, amazonite pegmatite, and host rock minerals in the Guobaoshan granitic pluton. Table S3: Major- and trace-element compositions of the biotite granites, muscovite granites, amazonite-bearing granites, amazonite granite, and amazonite pegmatite. Table S4: Hf isotope composition of zircon and Nd isotope composition of bulk rock from the Guobaoshan granitic pluton. Table S5: Summary of age data for the Guobaoshan deposit in eastern Tianshan. 
Importance of 3D imaging in the evaluation of root formation following regenerative endodontic procedures: a case series
Authors: Rahul Morankar , Asaithambi Rathika , Mishra Richa , Tewari Nitesh
Published: September 2024

The follow-up of teeth that have undergone regenerative endodontic procedures through radiographic imaging is crucial for evaluating their success and determining their future prognosis. The periapical radiographs stand out as the primary tool for this task and are also recommended by the existing guidelines. However, two-dimensional (2D) imaging may not reveal the findings accurately, mimicking the root formation success which may not be true otherwise when assessed using cone beam CT (CBCT) imaging. This case series featuring two instances underscores the significance of CBCT in identifying such signs of failure, particularly when they might be obscured in 2D imaging.
Advancing collaborative research for health: why does collaboration matter?
Authors: Saenz Carla , Krahn Timothy M , Smith Maxwell J , Haby Michelle M , Carracedo Sarah , Reveiz Ludovic
Published: September 2024

The calls for health research to be collaborative are ubiquitous—even as part of a recent World Health Assembly resolution on clinical trials—yet the arguments in support of collaborative research have been taken for granted and are absent in the literature. This article provides three arguments to justify why health research ought to be collaborative and discusses trade-offs to be considered among the ethical values guiding each argument.
Lean Six Sigma quality improvement approach to implement clinical practice guidelines for prescribing opiates for chronic pain in a primary care setting
Authors: Bakhai Smita , Mustafa Jawdat , Cloutier Meghan , Islam Farhana , Gudleski Gregory D , Reynolds Jessica L
Published: September 2024

Background

Implementing guidelines for chronic opioid management during a clinic merger posed significant challenges. Our aim was to increase the percentage of chronic pain evaluations and urine toxicology tests in patients on chronic opioid therapy from the baseline rate of less than 20% to 50% within 1 year at an academic, primary care clinic.

Methods

We applied the Define, Measure, Analyze, Improve, Control (DMAIC) approach of Lean Six Sigma for this quality improvement (QI) project. The QI tools included the creation of stakeholder mapping, root cause analysis, process flow mapping and a driver diagram. Lack of patient and provider education emerged as a significant barrier. The outcome measures were percentage of chronic pain evaluations and urine drug toxicology with an increase in controlled substance agreement completion rates as our process measures. Major interventions included patient and provider education, leveraging health information technology, care coordination and implementing new clinic protocols. Data analysis was performed by monthly run charts. Descriptive statistics were used to summarise clinical variables, while χ2analyses were employed to determine statistically significant differences between preintervention and postintervention measures.

Results

We observed an increase in completion rates of clinic visits for chronic pain, rising from 19.0% to 51.9% (p<0.001). During study period, we observed a steady increase in chronic pain evaluations with a median of 4.5. Urine toxicology completion rates increased from 19.9% to 65.8% (p<0.001) during the preintervention and postintervention periods. We observed variable changes in urine toxicology rates with a median of 5.19. Furthermore, we observed an increase in controlled substance agreement completion rates, increasing to 50% from the baseline rate of <10%.

Conclusions

Education to patients and providers, shared decision-making using a patient-centred approach, enhancement of health information technology and system-based interventions in clinic protocols and workflows contributed to the success of this QI project. The DMAIC approach may facilitate the implementation of practice guidelines for chronic opioid therapy and enhance providers’ opioid prescribing practices.
Common errors in statistics and methods
Authors: Flom Peter , Harron Katie , Ballesteros Javier , Kalinda Chester , Koutoumanou Eirini , Miles Jeremy , Nevitt Sarah Jane , Rohloff Peter
Published: September 2024

As statistical reviewers and editors for BMJ Paediatrics Open (BMJPO), we frequently see methodological and statistical errors in articles submitted to our journal. To make a list of these common errors and propose suitable corrections, and inspired by similar efforts at other leading journals, we surveyed the statistical reviewers and editors at BMJPO to collect their ‘pet peeves’ and examples of best practices.(1, 2) We have divided these into seven sections: graphics; statistical significance and related issues; presentation, vocabulary, textual and tabular presentation; causality; model building, regression and choice of methods; meta-analysis; and miscellaneous. Here, we present the common errors, with brief explanations. We hope that the guidance provided here will help guide authors as they prepare their submissions to the journal, leading to higher quality and more robust research reporting.
My culture soothes
Authors: Rodríguez-Zúñiga Karen Daniela , Pinzón-Segura María Camila
Published: September 2024

In the poignant words of a 12-year-old indigenous girl from the Pijao ethnicity (Tolima, Colombia), who shared her perspective before succumbing to leukaemia, we gain a profound understanding of health from her unique cultural viewpoint. Growing up in El Escobal, indigenus community, with her sister, she experienced the spiritual strength and unity that their culture attributes to twins. For her, health was deeply intertwined with the traditions and rituals of her people, emphasising the healing powers of plants and spiritual harmonisation.

She observed a stark contrast between indigenous and Western perspectives on medicine and spirituality. In her reflection, the young girl highlighted the universal language of mutual learning and support that transcends cultural differences. Her message underscores the importance of cultural harmony and the healing power of shared human experiences, advocating for a world where diverse beliefs and practices contribute to collective strength and understanding.

This text was her response to the question, "What is health?" as part of one of the methodological exercises in the doctoral research of Pinzón-Segura MC. Teoría del Intersticio Afectivo: Un nuevo enfoque feminista decolonial de análisis de políticas públicas [Internet]. Bogotá: Repositorio virtual de la Universidad Nacional de Colombia; 2024. The thesis, awarded with the distinction of summa cum laude, included various methods such as participant observation, sociological interviews, and discourse analysis of government documents. The question "What is health?" specifically guided 40 creative narrative workshops, which were an integral component of the ethnography and arts-based research design.
Association of LEAF-Q and EDE-QS scores with cholesterol levels in Finnish female athletes
Authors: Silvennoinen Julia I K , Ihalainen Johanna K , Valtonen Maarit , Mjøsund Katja , Sipilä Pyry N
Published: September 2024

Objective

Low energy availability (LEA) is common in athletes. Disturbances in sex hormone levels due to insufficient energy availability have been suggested to influence cholesterol metabolism and impact the overall risk for cardiovascular disease. We assessed the relationship between Low Energy Availability in Females Questionnaire (LEAF-Q) and Eating Disorder Examination Questionnaire Short (EDE-QS) scores with cholesterol levels in a cross-sectional study of female athletes.

Method

Finnish national- to international-level female athletes self-reported physiological symptoms of LEA, including menstrual disturbances, using the LEAF-Q (n=176) and eating disorder symptoms using the EDE-QS (n=294). Serum cholesterol concentrations (mmol/L) were determined from venous blood samples. We analysed the relationship between the different variables using Pearson’s r and linear regression. We also studied separately participants representing lean sports, that is, sports that emphasise leanness (LEAF-Q, n=60; EDE-QS, n=80).

Results

LEA symptoms were common; 72 (41%) of 176 participants scored ≥8 points in the LEAF-Q, which is indicative of a high risk of problematic LEA. A one-point increase in LEAF-Q score was associated with a small, non-significant increase in low-density lipoprotein (LDL) cholesterol level (beta=0.024, 95% CI −0.0011 to 0.049, p=0.061). Higher EDE-QS scores were associated with higher LDL cholesterol levels (beta=0.028, 95% CI 0.0098 to 0.046, p=0.0029). These associations were somewhat stronger among athletes representing lean sports (LEAF-Q and LDL: beta=0.043, 95% CI 0.0041 to 0.08, p=0.031; EDE-QS and LDL: beta=0.036, 95% CI 0.0041 to 0.068, p=0.028).

Conclusion

In this study, LEAF-Q and EDE-QS were associated with higher LDL cholesterol levels among athletes representing lean sports.
Many body gravity and the galaxy rotation curves
Authors: Ganesh S.
Published: September 2024

A novel theory was proposed earlier to model systems with thermal gradients, based on the postulate that the spatial and temporal variation in temperature can be recast as a variation in the metric. Combining the variation in the metric due to the thermal variations and gravity, leads to the concept of thermal gravity in a 5-D space-time-temperature setting. When the 5-D Einstein field equations are projected on to a 4-D space, they result in additional terms in the field equations. This may lead to unique phenomena such as the spontaneous symmetry breaking of scalar particles in the presence of a strong gravitational field. This theory, originally conceived in a quantum mechanical framework, is now adapted to explain the galaxy rotation curves. A galaxy is not in a state of thermal equilibrium. A parameter called the “degree of thermalization” is introduced to model partially thermalized systems. The generalization of thermal gravity to partially thermalized systems, leads to the theory of many-body gravity. The theory of many-body gravity is now shown to be able to explain the rotation curves of the Milky Way and the M31 (Andromeda) galaxies, to a fair extent. The radial acceleration relation (RAR) for 63 galaxies, with their galactic masses spanning three orders of magnitude, has been replicated. Finally, the wide binary star (WBS) system is touched upon.
Influence of velocity and thermal slips on Magneto Casson fluid heat transmission flow past an exponential porous stretching surface with chemical reaction and radiation
Authors: Radhika M. , Dharmendar Reddy Y.
Published: September 2024

This research discusses the investigation of heat and mass transfer in a magnetohydrodynamic (MHD) Casson fluid (CF) flow over an exponentially porous stretching sheet. The analysis takes into account the existence of thermal radiation, viscous dissipation, chemical reactions, and the influence of velocity and thermal slips. A recognized Casson model is taken into account in order to distinguish the characteristics of Casson fluid from those of Newtonian fluids. Using the geometry under consideration, the current physical problem is modeled. Appropriate similarity conversions are implemented to reduce the resultant set of coupled nonlinear PDEs to a set of nonlinear ODEs. By implementing the Keller-Box technique, numerical solutions to these reduced non-dimensional governing flow field equations are obtained. Tables and diagrams are utilized to illustrate the physical behavior of various control parameters. The temperature profile is enhanced and velocity profile diminished as the CF parameter value increased, according to this study. An increase in the velocity slip factor resulted in a diminution in the velocity field, while a gain in the thermal and concentration contours. With growing amounts of the chemical reaction factor, the concentration profile exhibited a decline. Indeed, the similar outcomes elucidated in this paper exhibit a remarkable correspondence with solutions that have been previously documented in the academic literature. This research may be motivated by a desire to improve the comprehension of fluid flow in different engineering and environmental situations, where these conditions are common, such as geothermal energy extraction, thermal management, chemical processing industries, and environmental control technologies.
Investigating the Stickiness in a Potential Well
Authors: Graciano Flávio H. , Szezech José D. , Batista Antonio M. , Leonel Edson D. , da Costa Diogo R. , de Oliveira Juliano A.
Published: September 2024

In this work, we use the finite-time Lyapunov exponent (FTLE) for a version of the potential well model with an oscillating bottom. This model is described by a conservative two-dimensional mapping that exhibits a mixed phase space, namely it contains a sea of chaos and the regions of stability. Via FTLE, we show that throughout its orbit, an initial condition in the chaotic sea can become trapped in a certain region. We construct and analyze phase spaces for different ranges of Lyapunov exponents in finite time, highlighting these traps. For smaller and larger values of FTLE, we identified a very regular phase space and a phase space with more chaos. By means of low FTLE values, we observe some small regions in the phase space that present regularities. Therefore, we demonstrate that FTLE can be useful to identify the stickiness effect in a time-dependent potential well.
THE EFFECT OF ENTERPRISE RISK MANAGEMENT ON FIRM PERFORMANCE: THE MEDIATING ROLE OF RESEARCH & DEVELOPMENT INVESTMENT
Authors: RESENDE SÉRGIO , MONJE-AMOR ARIADNA , CALVO NURIA
Published: September 2024

This study explores the dynamics of the relationship between Enterprise Risk Management (ERM) and firm performance, including the mediating role of innovation management. While previous research has separately examined various links between ERM and firm performance and between innovation and firm performance, a research gap remains in studying the dynamics of the ERM-firm strategy-performance relationship, also considering the mediating role of innovation management. We used structural equation modelling (SEM) to measure the impact of ERM on firm performance directly and indirectly through its influence on the firm’s innovation management, represented by R&D investment. We gathered data from 2015 to 2019 from a sample of 2,666 companies in Europe, East Asia, and North America. The results reveal that ERM exerts both direct and indirect influences on firm performance, the latter occurring through its effect on the firm’s innovation management. These findings contribute to the literature on the resource-based view of the firm, underscoring the potential of the strategic alignment between innovation management and ERM, and reinforcing ERM’s importance on firm performance.