Метод детекции Mycobacterium tuberculosis подтипа B0/W148 генетического семейства Beijing
Authors: Слизень В.В. , Суркова Л.К. , Скрягина Е.М. , Гуревич Г.Л. 
Published: December 2024

Введение. Повышение эффективности лечебно-профилактических мероприятий и эпидемиологического надзора за туберкулезом требует совершенствования микробиологической диагностики и слежения за циркулирующими генетическими вариантами М. tuberculosis, в связи с чем важна разработка быстрых и нетрудоемких методов детекции эпидемических клонов M. tuberculosis, одним из которых является подтип B0/W148 генотипа Beijing. Цель. Разработать метод детекции M. tuberculosis подтипа B0/W148 генотипа Beijing с помощью ПЦР в режиме реального времени и оценить его специфичность и чувствительность. Материалы и методы. Исследованы 192 изолята M. tuberculosis и 8 нетуберкулезных микобактерий с помощью разработанного метода ПЦР в реальном времени. Результаты. В ходе исследования было установлено, что мутации в генах mce3B и Rv1720 (tcc145gcc – в гене mce3B и gca95gcg – в гене Rv1720) являются маркерами подтипа B0/W148 и могут использоваться для определения этого генетического подтипа M. tuberculosis. Лабораторные испытания разработанного метода (на 192 изолятах M. tuberculosis и 8 нетуберкулезных микобактериях) в сравнении со стандартным методом ПЦР (с праймерами INS1, RV2665R, W139F2) показали высокую чувствительность, специфичность, положительную и отрицательную предсказательную ценность разработанного метода, которые составили 97,5; 99,99; 99,99; 98,3% соответственно. С помощью разработанного метода было установлено, что удельный вес подтипа B0/W148 генетического семейства Beijing среди исследованных культур M. tuberculosis, выделенных в 2020 и 2021 гг., составлял 33,8% (27/80) и 48,9% (54/112) соответственно. Заключение. Применение разработанного метода детекции M. tuberculosis подтипа B0/W148 генотипа Beijing с помощью ПЦР в режиме реального времени повысит эффективность инфекционного контроля и эпидемиологического надзора за туберкулезной инфекцией.

Introduction. It is important to develop fast and not laborious methods for M. tuberculosis epidemic clones detection, such as the cluster B0/W148 of Beijing genetic family. Purpose. To develop method for M. tuberculosis subtype B0/W148 of Beijing genetic family detection by real-time PCR, and evaluate its specificity and sensitivity. Materials and methods. A total of 192 isolates of M. tuberculosis and 8 non-tuberculous mycobacteria were investigated by the developed real-time PCR method. Results. Mutations in mce3B and Rv1720 genes (tcc145gcc in the mce3B gene and gca95gcg in the Rv1720 gene) were shown to be specific for the B0/W148 subtype. Laboratory trials of the developed method (by testing 192 isolates of M. tuberculosis and 8 non-tuberculosis mycobacteria) in comparison with the standard PCR method (with primers INS1, RV2665R, W139F2) showed high sensitivity, specificity, positive and negative predictive value of the developed method (97.5; 99.99; 99.99; 98.3% respectively). By mean of the developed method the occurrence of M. tuberculosis subtype B0/W148 was estimated among 192 cultures isolated from patients with pulmonary in 2020 and 2021, which was 33.8% (27/80) and 48.9% (54/112) respectively. Conclusion. The developed method for M. tuberculosis subtype B0/W148 of Beijing genetic family detection by real-time PCR can find application in infection control and epidemiological surveillance of tuberculosis infection.