bluuebunny/crossref_metadata_2025 huggingface dataset:
TeleNICU: Extending the reach of level IV care and optimizing the triage of patient transfers
Authors: Jagarapu Jawahar , Kapadia Vishal , Mir Imran , Kakkilaya Venkat , Carlton Kristin , Fokken Micky , Brown Steven , Hall-Barrow Julie , Savani Rashmin C.
Published: September 2021

Background

The use of telemedicine to provide care for critically ill newborn infants has significantly evolved over the last two decades. Children's Health System of Texas and University of Texas Southwestern Medical Center established TeleNICU, the first teleneonatology program in Texas.

Objective

To evaluate the effectiveness of Tele Neonatal Intensive Care Unit (TeleNICU) in extending quaternary neonatal care to more rural areas of Texas.

Materials and methods

We conducted a retrospective review of TeleNICU consultations from September 2013 to October 2018. Charts were reviewed for demographic data, reasons for consultation, and consultation outcomes. Diagnoses were classified as medical, surgical, or combined. Consultation outcomes were categorized into transferred or retained. Transport cost savings were estimated based on the distance from the hub site and the costs for ground transportation.

Results

TeleNICU had one hub (Level IV) and nine spokes (Levels I–III) during the study period. A total of 132 direct consultations were completed during the study period. Most consultations were conducted with Level III units (81%) followed by level I (13%) and level II (6%) units. Some common diagnoses included prematurity (57%), respiratory distress (36%), congenital anomalies (25%), and neonatal surgical emergencies (13%). For all encounters, 54% of the patients were retained at the spoke sites, resulting in an estimated cost savings of USD0.9 million in transport costs alone. The likelihood of retention at spoke sites was significantly higher for medical diagnoses compared to surgical diagnoses (89% vs. 11%).

Conclusion

Telemedicine effectively expands access to quaternary neonatal care for more rural communities, helps in the triage of neonatal transfers, promotes family centered care, and significantly reduces health care costs.
Sexual Dysfunction and Gun Ownership in America: When Hard Data Meet a Limp Theory
Authors: Hill Terrence D. , Dowd-Arrow Benjamin , Ellison Christopher G. , Garcia-Alexander Ginny , Bartkowski John P. , Burdette Amy M.
Published: September 2021

Although there has been no direct empirical evidence linking sexual dysfunction (SD) with gun ownership, speculation has been widespread and persistent for decades. In this paper, we formally examine the association between SD and gun ownership. Our primary hypothesis, derived from the psychosexual theory of gun ownership, asserts that men experiencing SD are more likely to personally own guns than other men. To test this hypothesis, we used recently collected data from the 2021 Crime, Health, and Politics Survey (CHAPS), a national probability sample of 780 men, and binary logistic regression to model gun ownership as a function of SD. Our key finding is that men experiencing SD are no more likely to own guns than men without SD. This interpretation was supported across several indicators of SD (performance anxiety, erection trouble, and ED medication) and gun ownership (personal gun ownership, purchasing a gun during the pandemic, and keeping a gun in one’s bedroom). To our knowledge, we are the first to have directly tested the association between SD and gun ownership in America. Our findings are important because they contribute to our understanding of factors associated with gun ownership by challenging the belief that phallic symbolism and masculinity somehow drive men with SD to purchase guns. Our results also remind us of the perils of gun culture rhetoric, which, in this case, function to discredit gun owners and to further stigmatize men with ED. We conclude by calling for more evidence-based discussions of SD and guns in society.
Keeping One’s Distance: Mask Wearing is Implicitly Associated With Psychological Distance
Authors: Fatfouta Ramzi , Trope Yaacov
Published: September 2021

Mask wearing plays a vital role in the fight against the novel coronavirus (COVID-19). Despite its ubiquity in everyday social life, it is still unknown how masked faces are mentally represented. Drawing on construal-level theory, we test the hypothesis that masked faces and unmasked faces are implicitly associated with psychological distance and proximity in memory, respectively. Four preregistered, high-powered experiments ( N = 354 adults) using the Implicit Association Test lend convergent support to this hypothesis across all four dimensions of psychological distance: social distance, spatial distance, temporal distance, and hypothetical distance. A mini meta-analysis validates the reliability of the findings (Hedge’s g = 0.46). The present work contributes to the growing literature on construal-level effects on implicit social cognition and enriches the current discussion on mask wearing in the pandemic and beyond.
Prevalence of Mycobacterium tuberculosis infection and rifampicin resistance among presumptive tuberculosis cases visiting tuberculosis clinic of Adare General Hospital, Southern Ethiopia
Authors: Andarge Degineh Belachew , Anticho Tariku Lambiyo , Jara Getamesay Mulatu , Ali Musa Mohammed
Published: September 2021

Objective:

Multidrug-resistant Mycobacterium tuberculosis is a public health threat in resource-limited countries where it is easily disseminated and difficult to control. The aim of this study was to determine the prevalence of tuberculosis, rifampicin-resistant/multidrug-resistant Mycobacterium tuberculosis, and associated factors among presumptive tuberculosis cases attending the tuberculosis clinic of Adare General Hospital located in Hawassa city.

Methods:

A hospital-based cross-sectional study was conducted among 321 tuberculosis suspected patients from April to July 2018. Socio-demographic, environmental, and behavioral data were collected using a structured questionnaire. Sputum specimens were analyzed using GeneXpert. Data entry was made using Epi info version 7 and analyzed by SPSS version 20. Logistic regression models were used to determine the risk factors. A p-value less than 0.05 was taken as a cut point.

Results:

In this study, the prevalence of Mycobacterium tuberculosis was 98 (30.5%) with 95% confidence interval (25.5–35.8), and the prevalence of rifampicin-resistant/multidrug-resistant Mycobacterium tuberculosis among the 98 Mycobacterium tuberculosis confirmed cases was 4 (4.1%). The prevalence of rifampicin-resistant/multidrug-resistant Mycobacterium tuberculosis among the tuberculosis suspected patients was 1.24%. Participants who had a history of treatment with anti-tuberculosis drugs were more likely to develop rifampicin-resistant/multidrug-resistant Mycobacterium tuberculosis.

Conclusions:

This study identified relatively high rifampicin-resistant/multidrug-resistant Mycobacterium tuberculosis among tuberculosis suspected patients in the study area. Early detection of drug-resistant Mycobacterium tuberculosis should be given enough attention to strengthen the management of tuberculosis cases and improve direct observation therapy short-course and eventually minimize the spread of rifampicin-resistant tuberculosis strain in the community.
Coping Power in the City: Promoting Coping in African American Male Students
Authors: Thomas Duane E. , Bradshaw Catherine P. , Bottiani Jessika H. , McDaniel Heather L. , Debnam Katrina J.
Published: September 2021

This article describes efforts to adapt an adolescent version of the Coping Power program, called Coping Power in the City, for use with high school students attending an urban school district with high concentrations of students exposed to community violence and challenges related to elevated tensions between youth and police. The goal of this group-based preventive intervention is to provide a comprehensive, school-based approach to stem rates of violence, discipline problems, and related mental health concerns for adolescents. A novel feature is the integration of a school police component into the intervention model with concurrent supports for students, parents, and teachers to supplement school counseling efforts. We present an overview of the program and a rationale for its adaptation to meet the needs of African American males in urban high schools. We summarize baseline data for 514 ninth graders (46% African American males) across 10 urban high schools participating in a randomized controlled trial. We also address lessons learned and implications for school-based counseling practices for African American male students and engagement of school police officers in urban high schools.
Clinical characteristics and outcomes of critically ill patients with acute COVID-19 with Epstein-Barr virus reactivation
Authors: Xie Yun , Cao Song , Dong Hui , Lv Hui , Teng Xiaolei , Zhang Jiaxiang , Wang Tao , Zhang Xiaoyan , Qin Yun , Chai Yujing , Yang Luyu , Liu Jun , Wang Ruilan
Published: September 2021

Background

Our goal is to further elucidate the clinical condition and prognosis of patients with severe acute COVID-19 with EBV reactivation.

Method

This is a retrospective single-center study of COVID-19 patients admitted to the intensive care unit of Wuhan No. 3 Hospital (January 31 to March 27, 2020). According to whether Epstein-Barr virus reactivation was detected, the patients were divided into an EBV group and a Non-EBV group. Baseline data were collected including epidemiological, larithmics, clinical and imaging characteristics, and laboratory examination data.

Results

Of the 128 patients with COVID-19, 17 (13.3%) were infected with Epstein-Barr virus reactivation. In the symptoms,the rate of tachypnoea in the EBV group was apparently higher than that in the Non-EBV group. In lab tests, the lymphocyte and albumin of EBV group decreased more significantly than Non-EBV group, and the D-dimer and serum calcium of EBV group was higher than Non-EBV group. Regarding the infection index, CRP of EBV group was apparently above the Non-EBV group, and no significant difference was found in procalcitonin of the two groups. The incidence of respiratory failure, ARDS, and hypoproteinaemia of EBV group had more incidence than Non-EBV group. The 28-day and 14-day mortality rates of EBV group was significantly higher than that of Non-EBV group.

Conclusions

In the COVID-19 patients, patients with EBV reactivation had higher 28-day and 14-day mortality rates and received more immuno-supportive treatment than patients of Non-EBV group.
Oral care practices in stroke: findings from the UK and Australia
Authors: Bangee Munirah , Martinez-Garduno Cintia Mayel , Brady Marian C. , Cadilhac Dominique A. , Dale Simeon , Hurley Margaret A. , McInnes Elizabeth , Middleton Sandy , Patel Tahera , Watkins Caroline L. , Lightbody Elizabeth
Published: September 2021

Aims

To examine current practice, perceptions of healthcare professionals and factors affecting provision for oral care post-stroke in the UK and Australia.

Background

Poor oral care has negative health consequences for people post-stroke. Little is known about oral care practice in hospital for people post-stroke and factors affecting provision in different countries.

Design

A cross-sectional survey.

Methods

Questionnaires were mailed to stroke specialist nurses in UK and Australian hospitals providing inpatient acute or rehabilitation care post-stroke. The survey was conducted between April and November 2019. Non-respondents were contacted up to five times.

Results

Completed questionnaires were received from 150/174 (86%) hospitals in the UK, and 120/162 (74%) in Australia. A total of 52% of UK hospitals and 30% of Australian hospitals reported having a general oral care protocol, with 53% of UK and only 13% of Australian hospitals reporting using oral care assessment tools. Of those using oral care assessment tools, 50% of UK and 38% of Australian hospitals used local hospital-specific tools. Oral care assessments were undertaken on admission in 73% of UK and 57% of Australian hospitals. Staff had received oral care training in the last year in 55% of UK and 30% of Australian hospitals. Inadequate training and education on oral care for pre-registration nurses were reported by 63% of UK and 53% of Australian respondents.

Conclusion

Unacceptable variability exists in oral care practices in hospital stroke care settings. Oral care could be improved by increasing training, performing individual assessments on admission, and using standardised assessment tools and protocols to guide high quality care. The study highlights the need for incorporating staff training and the use of oral care standardised assessments and protocols in stroke care in order to improve patient outcomes.
Brief report: The uricase mutation in humans increases our risk for cancer growth
Authors: Fini Mehdi A. , Lanaspa Miguel A. , Gaucher Eric A. , Boutwell Brian , Nakagawa Takahiko , Wright Richard M. , Sanchez-Lozada Laura G. , Andrews Peter , Stenmark Kurt R. , Johnson Richard J.
Published: September 2021

Background

Recent studies suggest that fructose, as well as its metabolite, uric acid, have been associated with increased risk for both cancer incidence and growth. Both substances are known to cause oxidative stress to mitochondria and to reduce adenosine triphosphate (ATP) production by blocking aconitase in the Krebs cycle. The uricase mutation that occurred in the Miocene has been reported to increase serum uric acid and to amplify the effects of fructose to stimulate fat accumulation. Here we tested whether the uricase mutation can also stimulate tumor growth.

Methods

Experiments were performed in mice in which uricase was inactivated by either knocking out the gene or by inhibiting uricase with oxonic acid. We also studied mice transgenic for uricase. These mice were injected with breast cancer cells and followed for 4 weeks.

Results

The inhibition or knockout of uricase was associated with a remarkable increase in tumor growth and metastases. In contrast, transgenic uricase mice showed reduced tumor growth.

Conclusion

A loss of uricase increases the risk for tumor growth. Prior studies have shown that the loss of the mutation facilitated the ability of fructose to increase fat which provided a survival advantage for our ancestors that came close to extinction from starvation in the mid Miocene. Today, however, excessive fructose intake is rampant and increasing our risk not only for obesity and metabolic syndrome, but also cancer. Obesity-associated cancer may be due, in part, to a mutation 15 million years ago that acted as a thrifty gene.
Evaluating latent content within unstructured text: an analytical methodology based on a temporal network of associated topics
Authors: Camilleri Edwin , Miah Shah Jahan
Published: September 2021

In this research various concepts from network theory and topic modelling are combined, to provision a temporal network of associated topics. This solution is presented as a step-by-step process to facilitate the evaluation of latent topics from unstructured text, as well as the domain area that textual documents are sourced from. In addition to ensuring shifts and changes in the structural properties of a given corpus are visible, non-stationary classes of cooccurring topics are determined, and trends in topic prevalence, positioning, and association patterns are evaluated over time. The aforementioned capabilities extend the insights fostered from stand-alone topic modelling outputs, by ensuring latent topics are not only identified and summarized, but more systematically interpreted, analysed, and explained, in a transparent and reliable way.
Endovascular therapy for severely calcified plaque at the superficial femoral artery using myocardial biopsy forceps
Authors: Hirano Shojiro , Funatsu Atsushi , Nakamura Shigeru , Ikeda Takanori
Published: September 2021

Background

Currently, the success rate of EVT for treating CTO of the SFA is high; however, EVT is still found to be insufficient in treating CTOs with severely calcified lesions. Even if the guidewire crosses the lesion, the calcifications may still cause difficulties during stent expansion.

Main text

A 78-year-old male had been reported to have intermittent claudication with chronic total occlusion (CTO) of the right superficial femoral artery (SFA). Angiography revealed severely calcified plaque (Angiographic calcium score: Group4a [1]) at the ostium of the SFA. Stenting posed a risk of underexpansion, causing the plaque to shift to the deep femoral artery. we decided to remove the calcified plaque using biopsy forceps. After removing the extended calcified plaque, the guidewire could cross easily, and the self-expandable stent was well dilated without causing the plaque to shift to the DFA.

Conclusions

Biopsy forceps may be used in some endovascular cases to remove severely calcified lesions.

To ensure the safety of the patient, the physician must be adept at performing this technique before attempting it.
Pinch grip strength and fine manual control in children with diplegic cerebral palsy: a cross-sectional study
Authors: Abd El-samad Asmaa Ahmed , El-Meniawy Gehan Hassan , Nour El-Din Sahar Mohamed , Mohamed Nanees Essam
Published: September 2021

Background

In children with spastic diplegia, efficient use of the upper extremity especially the hands play an important role in participation in daily living. Hands can perform heavy activities and also enable to perform extremely gentle, skillful, and precise activities. Inadequate hand strength and fine motor skills may lead to functional limitations. This study was planned to investigate the pinch grip strength and fine manual control in children with spastic diplegic cerebral palsy and to determine if there is a relation between them. Thirty children with diplegic cerebral palsy and 30 normal developed children from both sexes between 5 and 10 years old were included in this study as diplegic and control groups. For all children, pinch grip strength measured by Baseline Mechanical Pinch Gauge and Bruininks-Oseretsky Test of Motor Proficiency, Second Edition used to evaluate fine manual control.

Results

Children with diplegic cerebral palsy have significant impairment in the pinch grip strength (tip, tripod, and key) and the fine manual control (fine motor precision and integration) compared to their healthy peers of the same age. There was large positive significant correlation (r > 0.5, p < 0.05) between tip and tripod pinch strength, and fine motor precision and medium positive significant correlation (r = 0.47, p < 0.05) between key pinch and fine motor precision in children with spastic diplegia. Also, there was large positive significant correlation between tip pinch and fine motor integration (r = 0.54, p < 0.05). The correlations are small and medium positive between tripod and key pinch strength, and fine motor integration respectively but they are not statistically significant.

Conclusions

Pinch grip strength and fine manual skills are affected in children with spastic diplegia. Also, there is a significant correlation between the pinch strength and activities require precise control of the hand.
Trans Aesthetics and Similes of Oppression
Authors: Miller Shae (Shaeleya) D.
Published: September 2021

Because we live in a cisnormative society, trans inclusion is often filtered through cis subjectivities, allowing real or potential allies to “make sense” of transness without decentering their own experiences. This article investigates these dynamics through analysis of “trans aesthetics”—the symbols, language, and cultural meanings stereotypically associated with transness—when used by cisgender queer college students to signal trans-inclusive investments and forge solidarity with trans peers. This study examines three deployments of trans aesthetics: 1) using queer to signal trans-inclusive identities and community, 2) routinizing pronoun introductions, and 3) formulating “similes of oppression” that link trans and cisgender queer people's experiences of heterosexism. While potentiating opportunities for trans solidarity and inclusion, these practices simultaneously reinscribe cisnormative understandings and articulations of gender by empowering cisgender students to filter transness through their own lenses, and to construct hybrid cis subjectivities in the process. Ultimately, this research extends trans and critical allyship studies through empirical analysis of how cisnormativity infuses ostensibly trans-inclusive discourses.
ANÁLISE CLASSIFICATÓRIA DOS CURSOS DE CIÊNCIAS CONTÁBEIS QUANTO AO RENDIMENTO NO ENADE E NO EXAME DE SUFICIÊNCIA
Authors: Silva Francisco Juanito Costa da , Cavalcante Danival Sousa
Published: September 2021

Este estudo analisa as características dos cursos de Ciências Contábeis no Brasil, classificando-os quanto aos melhores e aos piores desempenhos no Enade e no Exame de Suficiência, assim como desenvolve análises descritivas e comparativas entre os desempenhos dos cursos nos dois exames e a possível associação entre os resultados dos referidos exames, fundamentando a discussão das relações à luz da Teoria da Função da Produção educacional no âmbito do curso de Ciências Contábeis. Com abordagem quantitativa e classificatória, o estudo abrange técnicas de estatística descritiva, análise de correlação e estatística multivariada, com o uso de árvore de classificação (método chaid). A amostra foi composta por 746 cursos de Ciências Contábeis, com um total de 7.460 observações sobre as variáveis características dos cursos. Verificou-se que existe uma correlação positiva entre os resultados no Enade e no Exame de Suficiência, e que os cursos das Universidades Federais do Sul e Sudeste estão entre os que apresentam os melhores desempenhos nos exames, enquanto os cursos da Região Norte predominam entre os que apresentam os piores desempenhos.
INOVAÇÃO PARA O DESENVOLVIMENTO E A SUSTENTABILIDADE DE NEGÓCIOS: UM ESTUDO BIBLIOMÉTRICO SOBRE PESQUISAS RELACIONADAS À COVID-19
Authors: Pacheco Rodrigo , Silva João Victor Santos da , Silva Rafael Eduardo da , Ganzer Paula Patrícia , Dullius Rodrigo , Olea Pelayo Munhoz
Published: September 2021

A pandemia do coronavírus acarretou, além do caos na saúde, um desequilíbrio econômico e organizacional. Diante desses desafios enfrentados em nível mundial, negócios tradicionais, com trajetória consolidada no mercado, assim como novos negócios, precisaram se reinventar e inovar para permanecerem oferecendo seus produtos e serviços e manterem seus empreendimentos ativos e sustentáveis. Tendo isso em vista, o objetivo deste estudo consiste em analisar pesquisas publicadas em 2020, na área de gestão, relacionadas à inovação, à sustentabilidade e à COVID-19. Para atingir tal objetivo, foi realizada uma pesquisa bibliométrica na base de dados Web of Science, e os artigos resultantes da busca foram analisados por meio da análise de conteúdo. Os resultados evidenciam a falta de estudos mais aprofundados sobre crises pandêmicas, como a vivida com a COVID-19. Além disso, nota-se que o ambiente hospitalar constitui o foco dos estudos existentes, o que indica uma lacuna de pesquisa acerca dos impactos negativos na vida das pessoas e das organizações.
Υπερηχογραφικά καθοδηγούμενος αποκλεισμός σαφηνούς νεύρου
Authors: Άδωνη Αρετή
Published: September 2021

H ανατομική περιοχή και ο όγκος έγχυσης τοπικού αναισθητικού που χρειάζεται για τον υπερηχογραφικά καθοδηγούμενο αποκλεισμό του σαφηνούς νεύρου διαφέρει στη βιβλιογραφία. Ο σκοπός αυτής της μελέτης ήταν να ερευνήσουμε το αποτέλεσμα δύο διαφορετικών μεθόδων με την χρήση υπερήχων στο σαφηνές νεύρο και στο νεύρο του έσω πλατύ μυός όταν έγινε έγχυση χαμηλού όγκου τοπικού αναισθητικού. Υλικά και μέθοδοι: 48 ασθενείς έλαβαν μέρος στη μελέτη, οι οποίοι προγραμματίστηκαν για ορθοπεδικό χειρουργείο χωρίστηκαν με τη μέθοδο τυχαιοποίησης σε δύο ομάδες. Στην πρώτη ομάδα η έγχυση του τοπικού αναισθητικού (5ml) για τον υπερηχογραφικά καθοδηγούμενο αποκλεισμό του σαφηνούς νεύρου έγινε περιφερικότερα στο κατώτερο στόμιο του πόρου των προσαγωγών ακριβώς στο σημείο εξόδου του σαφηνούς νεύρου από τον πόρο (DAC). Στη δεύτερη ομάδα η υπερηχογραφικά καθοδηγούμενη έγχυση τοπικού αναισθητικού (5ml) για τον αποκλεισμό του σαφηνούς νεύρου έγινε μέσα στον πόρο των προσαγωγών (ΑC). Αμέσως μετά την έγχυση του τοπικού αναισθητικού, η εξέλιξη του αποκλεισμού ελέγχεται συγκριτικά με το άλλο κάτω άκρο σε χρονικά διαστήματα 5, 10 και 15 λεπτών στην περιοχή που βρίσκονται οι ραπτικοί κλάδοι του σαφηνούς νεύρου και στο σημείο του νεύρου του έσω πλατύ μυός. Αποτελέσματα: Τη μελέτη ολοκλήρωσαν 22 ασθενείς από την κάθε ομάδα. Πλήρης αισθητικός αποκλεισμός του σαφηνούς νεύρου παρατηρήθηκε στο 55% των ασθενών στην πρώτη ομάδα (AC) και στο 59% των ασθενών στη δεύτερη ομάδα (DAC) (P=0.88). Όταν η έγχυση πραγματοποιήθηκε μέσα στον πόρο των προσαγωγών (36%) των ασθενών παρουσίασαν κάποιου βαθμού κινητική αδυναμία λόγω αποκλεισμού του νεύρου του έσω πλατύ μυός, ένα ποσοστό σαφώς πολύ μεγαλύτερο σε σχέση με την τεχνική έγχυσης στο κατώτερο στόμιο του πόρου των προσαγωγών DAC (0/22)(P=0.021). Συμπεράσματα: Η έγχυση χαμηλού όγκου τοπικού αναισθητικού μέσα στον πόρο των προσαγωγών ή περιφερικότερα στο σημείο εξόδου του νεύρου από τον πόρο, οδηγεί σε μέτρια ποσοστά επιτυχίας του αποκλεισμού του σαφηνούς νεύρου. Επιπλέον, η έγχυση του τοπικού αναισθητικού μέσα στον πόρο των προσαγωγών μπορεί να οδηγήσει σε μερικό κινητικό αποκλεισμό του έσω πλατύ μυός.
Συσχέτιση της mRNA έκφρασης του γονιδίου της καλλικρεΐνης-13 (KLK13) με την κλινική έκφραση του αδενοκαρκινώματος του στομάχου
Authors: Κωνσταντουδάκης Γεώργιος
Published: September 2021

Σκοπός Ο καρκίνος του στομάχου έχει υψηλά ποσοστά νοσηρότητας και αποτελεί μία από τις συχνότερες αιτίες θανάτου από καρκίνο. Αρκετές γονιδιακές μεταλλάξεις έχει βρεθεί ότι εμπλέκονται στην καρκινογένεση στο στόμαχο και τα γονίδια των καλλικρεϊνών αποτελούν πηγή μοριακών δεικτών. Στην παρούσα μελέτη εξετάστηκε η δυνητική προγνωστική σημασία του KLK13 στο γαστρικό αδενοκαρκίνωμα.Υλικά και ΜέθοδοςΚαρκινική σειρά γαστρικού αδενοκαρκινώματος (AGS) και ιστικά δείγματα στομάχου χρησιμοποιήθηκαν στην παρούσα μελέτη. Έγινε απομόνωση του ολικού RNA, σύνθεση cDNA και εν συνεχεία ενίσχυση αυτού με qRT-PCR ώστε να προσδιοριστεί η mRNA έκφραση του KLK13.ΑποτελέσματαΣτατιστικώς σημαντικά (p=0.002) μειωμένη έκφραση του KLK13 βρέθηκε στους καρκινικούς σε σχέση με τους φυσιολογικούς ιστούς στομάχου, καθώς επίσης και στους όγκους χαμηλής διαφοροποίησης (p=0.029). Διαπιστώθηκε επιπλέον στατιστικώς σημαντική (p=0.038), αντιστρόφως ανάλογη σχέση μεταξύ της mRNA έκφρασης του KLK13 και του μεγέθους του όγκου. Τέλος παρατηρήθηκε μακρότερη επιβίωση (p=0.014), χωρίς υποτροπές (p=0.043), σε όσους ήταν KLK13- θετικοί σε σχέση με όσους ήταν KLK13-αρνητικοί.Συμπεράσματα Συμπερασματικά, τα ευρήματα της παρούσας μελέτης δίνουν για πρώτη φορά ενδείξεις για την προγνωστική σημασία του KLK13 στον καρκίνο του στομάχου, καθώς και για την ικανότητα διάκρισης ιστικών δειγμάτων αδενοκαρκινώματος του στομάχου από δείγματα φυσιολογικού γαστρικού βλεννογόνου.
'Εκφραση των υποδοχέων της GHRH/SV-1 variant στον καρκίνο του παχέος εντέρου
Authors: Θεοφάνους Έλενα
Published: September 2021

Η υποθαλαμική εκλυτική ορμόνη της αυξητικής ορμόνης (GHRH), ρυθμίζει την απελευθέρωση της αυξητικής ορμόνης (GH) από την αδενοϋπόφυση. Οι υποδοχείς της GHRH (GHRH-R) εκφράζονται κυρίως στην υπόφυση. Τελευταία ερευνητικά δεδομένα αποδεικνύουν ότι splice variants του υποδοχέα της GHRH εκφράζονται επίσης σε αρκετούς ιστούς εκτός της υπόφυσης, τόσο φυσιολογικούς όσο και καρκινικούς, όπως επίσης και σε καρκινικές κυτταρικές σειρές. Η μελέτη αυτή στόχο είχε τη διερεύνηση της έκφρασης του splice variant 1 (SV-1) της GHRH-R στον καρκίνο του παχέος εντέρου. Σ’ αυτή τη μελέτη συμμετείχαν εβδομήντα ασθενείς που υποβλήθηκαν σε μερική κολεκτομή για καρκίνο παχέος εντέρου. Η ανοσοϊστοχημική έκφραση του SV-1 μελετήθηκε σε τομές παραφίνης των όγκων των παραπάνω ασθενών. Κυτταροπλασματική υπερπυρηνική έκφραση του SV-1 παρατηρήθηκε στον καρκίνο του παχέος εντέρου, καθώς και στο φυσιολογικό βλεννογόνο του παχέος εντέρου. Ο βαθμός διαφοροποίησης του όγκου και το παθολογοανατομικό στάδιο συσχετίστηκαν αρνητικά με την έκφραση του SV-1 (Ρ = 0.012 και Ρ = 0.013, αντίστοιχα). Τα καρκινώματα με ηπατικές μεταστάσεις έδειξαν χαμηλότερη έκφραση του SV-1 απ’ ότι έκαναν οι πρωτοπαθείς όγκοι, παρ’ όλο που στατιστικά η διαφορά αυτή δε θεωρείται σημαντική. Οι μονοπαραγοντικές αναλύσεις επιβίωσης Kaplan-Meier και Cox υπέδειξαν ένα βελτιωμένο χρόνο επιβίωσης σε ασθενείς με ψηλή έκφραση SV-1 σε σύγκριση με αυτούς με χαμηλή έκφραση GHRH-R, αλλά η διαφορά αυτή στατιστικά δε θεωρείται σημαντική. Η ανοσοϊστοχημική έκφραση του SV-1 φαίνεται να αποτελεί ένα ευνοϊκό προγνωστικό παράγοντα για τον καρκίνο του παχέος εντέρου.
Αξιολόγηση των επιπέδων της πρωτεΐνης-δέσμευσης-λιποπολυσακχαρίτη στον ορό και το ασκιτικό υγρό σε ασθενείς με κίρρωση ήπατος με και χωρίς επιπλοκές
Authors: Αγιασωτέλλη Δανάη
Published: September 2021

Η πρωτεΐνη δέσμευσης του λιποπολυσακχαρίτη (LBP) είναι πρω¬τεΐνη οξείας φάσης που παράγεται από το ήπαρ. Η αύξηση των συγκεντρώσεων της LBP συσχετίζεται με το φαινόμενο της παθολογικής βακτηριακής μετατό¬πισης και με την αυξημένη εντερική διαπερατότητα σε μη αντιρροπούμενη κίρρωση (ΜΑΚ). Στην παρούσα μελέτη εκτιμήσαμε τα επίπεδα LBP σε ορό και ασκίτη και εξετάσαμε τη συσχέτισή τους με τη θνησιμότητα σε ασθενείς με ΜΑΚ. Ογδόντα οκτώ διαδοχικοί ασθενείς [73.9% άνδρες, διάμεση τιμή MELD score 18, (ενδοτεταρτημοριακό εύρος 13-23)] μελετήθηκαν και υποβλήθηκαν σε ενδελεχή έλεγχο για διάγνωση πιθανής λοίμωξης. Η LBP (ng / ml) μετρήθηκε στον ορό (Ν = 88) και ασκίτη (Ν = 49) με τη μέθοδο ELISA (enzyme-linked immunosorbent assay) και εκφράστηκε σε λογαριθμική κλίμακα (ln).Τα επίπεδα lnLBP ορού ήταν υψηλότερα σε 18 ασθενείς με τεκμηριωμένη λοίμωξη σε σύγκριση με εκείνους που δεν είχαν [13.99 (13.39 – 14.95) έναντι 13.13 (12.71 – 13.89), αντίστοιχα, P<0.001]. Στην καμπύλη ROC, η τιμή LBP 13.49 ήταν η βέλτιστη στην διάκριση της λοίμωξης προσφέροντας ευαισθησία 72.2% και ειδικότητα 64.3% (c-statistic = 0.773). Οι τιμές C-αντιδρώσας πρωτεΐνης (CRP) παρουσίασαν χαμηλότερη διαγνωστική ικανότητα (c-statistic = 0.708). Οι τιμές lnLBP ορού ήταν υψηλότερες από εκείνες του ασκιτικού υγρού [13.44 (12.93 – 14.03) έναντι 11.06 (10.76 – 11.84), P<0,001]. Τα επίπεδα LBP ορού είχαν θετική συσχέτιση με τα επίπεδα του αριθμού των λευκών αιμοσφαιρίων και της CRP. Τα επίπεδα της LBP του ασκιτικού υγρού παρουσίασαν θετική συσχέτιση με τον αριθμό των λευκών αιμοσφαιρίων και της γαλακτικής αφυδρογονάσης του ασκιτικού υγρού. Οι ασθενείς χωρίς λοίμωξη (Ν = 70) παρακολουθήθηκαν προοπτικά. Η Kaplan Meier καμπύλη επιβίωσης 90 ημερών έδειξε ότι ασθενείς με υψηλά επίπεδα lnLBP (> 13.49) είχαν πτωχότερη επιβίωση σε σύγκριση με εκείνους με χαμηλότερες τιμές (log rank P= 0.045). Στη μονοπαραγοντική ανάλυση Cox, τα ουδετερόφιλα (P = 0.061), η LBP (P = 0.007), το MELD score (P = 0.01) και η CRP (P = 0.048) ήταν προγνωστικοί παράγοντες της θνησιμότητας 90 ημερών. Ωστόσο, μόνο τα υψηλά επίπεδα LBP (HR 8.1 95% CI 2.0 – 31.5, P = 0.003) και το MELD (HR 1.1 95% CI 1.0-1.2, P = 0.002) ήταν προγνωστικά της θνησιμότητας 90 ημερών στην πολυπαραγοντική ανάλυση. Η LBP ασκιτικού υγρού δεν αποτέλεσε προγνωστικό δείκτη θνησιμότητας. Τα επίπεδα της LBP ορού και ασκίτη συσχετίζονται με συστηματική φλεγμονώδη απάντηση σε ασθενείς με ΜΑΚ και είναι σημαντικά υψηλότερα σε ασθενείς με λοίμωξη. Υψηλές τιμές LBP ορού μετρήθηκαν σε ασθενείς χωρίς τεκμηριωμένη λοίμωξη που απεβίωσαν κατά τη διάρκεια της περιόδου παρακολούθησης 90 ημερών, ένα εύρημα που πιθανόν σχετίζεται με μηχανισμούς διαταραχής της εντερικής διαπερατότητας και της βακτηριακής μετατόπισης.
Ο ρόλος της τηλεκυτταρολογίας στη πρωτογενή διάγνωση και στον έλεγχο της ποιότητας παρακεντήσεων δια λεπτής βελόνης μαστού σε επιχρίσματα υγρής φάσεως
Authors: Βάιντα Σιμόνα
Published: September 2021

Objective: This study investigates the role of telecytology as a tool forquality assessment and improvement in the evaluation of breast fineneedle aspiration specimens that were prepared by ThinPrep® technique.Methods: The study was performed on 200 specimens of similar numberof patients referred to our clinic for preoperative evaluation of breast lesions.In all cases surgical excision followed the initial cytological evaluation.Six diagnostic categories of cytological reports were used. All caseswere imaged while 10 characteristic images from each case were transferredvia FTP protocol to password-protected accounts and were reviewedremotely by 4 different cytopathologists. The reviewers commented alsoon overall digital image quality. contributor’s and reviewer’s diagnoseswere collected, recorded and statistically elaborated. Moreover, they werecompared to the histological diagnoses.Results: According to our findings no significant difference in diagnosticaccuracy could be detected between the diagnoses proffered on the basisof digitized images and liquid based cytology slides.Conclusions: Telecytology is a rapid and valid method for quality assessmentand proficiency testing and has to be integrated into the dailyworkflow. The use of liquid based-cytology ensures that additional materialis kept for ancillary studies (if necessary) and that sufficient numberof replicate microscope slides can be produced. The use of telecytology inthe daily workflow will ensure the reproducibility of cytological diagnosesand make possible the production of digital educational material. Besidesdiagnostic accuracy, the implementation of a diagnostic telecytology systemrequires consideration of numerous financial, legal, professional andethical issues.
Μελέτη της στάγδην ενδοφλέβιας χορήγησης λιδοκαΐνης στη θεραπεία του νευροπαθητικού πόνου
Authors: Σταυροπούλου Ευμορφία
Published: September 2021

Εισαγωγή: Η νευραλγία τριδύμου είναι μία από τις πιο συνηθισμένες μορφές νευροπαθητικού πόνου. Η θεραπευτική της προσέγγιση αποτελεί πρόκληση, καθώς η θεραπεία πρώτης γραμμής αυτής της πάθησης δε βοηθά πάντα και πολλές φορές προκαλεί ανυπόφορες ανεπιθύμητες δράσεις. Η παρούσα μελέτη εξετάζει κατά πόσο η λιδοκαΐνη σαν πρόσθετο θεραπευτκό μέσο επιδρά θετικά στην αντιμετώπιση τόσο του αυτόματου όσο και του προκλητού πόνου(στην αλλοδυνία /υπεραλγησία) που προκαλεί η νευραλγία τριδύμου. Υλικό-Μέθοδος: Στη διπλή, τυφλή, τυχαιοποιημένη, διασταυρούμενη ελεγχόμενη με εικονικό φάρμακο μελέτη μας, έλαβαν μέρος είκοσι ασθενείς που έπασχαν από νευραλγία τριδύμου. Κάθε ασθενής έλαβε μέρος σε δύο συνεδρίες με το ενεργό φάρμακο, τη λιδοκαΐνη σε δοσολογία 5 mg/kgr βάρους σώματος διαλυμένη σε 250 ml φυσιολογικού ορού και σε δύο συνεδρίες με 250 mlφυσιολογικό, με διάρκεια έγχυσης κάθε φορά τα 30 λεπτά. Κατά την έναρξη κάθε συνεδρίας, κατά το τέλος και 24 ώρες μετά δηλ. το επόμενο πρωινό εκτιμούσαμε την ένταση του αυτόματου πόνου με την κλίμακα VAS και τον προκλητό πόνο (αλλοδυνία/ υπεραλγησία) με την δοκιμασία εφαρμογής θερμού, ψυχρού, πίεσης και νυγμού. Επίσης χρησιμοποιήθηκε το νευρόμετρο για την καταγραφή του ουδού του πόνου όλων των ινών των αισθητικών ινών(Αβ, Αδ, C ). Καταγράψαμε επίσης τις ανεπιθύμητες δράσεις κατά τη διάρκεια των εγχύσεων. Για τη στατιστική ανάλυση χρησιμοποιήσαμε το σύστημα STATA version 11.Aποτελέσματα: Τόσο η λιδοκαΐνη όσο και το εικονικό φάρμακο ελάττωσαν τη βαθμολογία VAS στο τέλος και 24 ώρες μετά-το επόμενο πρωινό (p<0,001), αλλά η λιδοκαΐνη υπερείχε του εικονικού φαρμάκου. Οι ανεπιθύμητες δράσεις της λιδοκαΐνης και του εικονικού φαρμάκου(ήπια σύγχυση, υπνηλία, ξηροστομία κ.λ.π.) ήταν ήπιες , όχι ιδιαίτερα ενοχλητικές, γι αυτό άλλωστε δεν είχαμε καμμία απόσυρση ασθενούς από τη μελέτη. Οι κλινικές δοκιμασίες έδειξαν ότι η λιδοκαΐνη ελάττωσε τη μηχανική, θερμική και ψυχρή αλλοδυνία περισσότερο από το εικονικό φάρμακο, ενώ το εικονικό φάρμακο ελάττωσε μόνο τη μηχανική και θερμική αλλά όχι την αλλοδυνία στο ψυχρό, σε μικρότερο βαθμό από τη λιδοκαΐνη(p<0,05) . Σχετικά με την καταγραφή του ουδού του πόνου με το νευρόμετρο διαπιστώσαμε ότι αυξήθηκε τόσο στην επώδυνη όσο και στην υγιή πλευρά του προσώπου των ασθενών στις συχνότητες 5, 250, 2000 Hz, περισσότερο όμως στις συχνότητες 5 και 250 Hz κατά τις εγχύσεις με λιδοκαΐνη στην επώδυνη πλευρά ενώ δε είχαμε σημαντική αύξηση μετά την έγχυση του εικονικού φαρμάκου (p<0,001) .Συμπέρασμα: Η λιδοκαΐνη ελάττωσε την ένταση του αυτόματου πόνου αλλά και του προκλητού πόνου περισσότερο από το εικονικό φάρμακο, χωρίς να προκαλέσει σοβαρές παρενέργειες για σχεδόν 24 ώρες σε ασθενείς που πάσχουν από νευραλγία τριδύμου, γεγονός που δείχνει ότι η συστηματική χορήγηση της, μπορεί να θεωρηθεί σα μία επί πλέον θεραπευτική εκδοχή και να χρησιμοποιηθεί σαν πρόσθετη θεραπεία στον ανυπόφορο πόνο που συχνά προκαλείται από αυτή την πάθηση.
Μελέτη του ρόλου του πρωτεασώματος στη γήρανση βλαστικών κυττάρων
Authors: Καπετάνου Μαριάννα
Published: September 2021

Η γήρανση αποτελεί ένα σύνθετο πολυπαραγοντικό φαινόμενο, το οποίο χαρακτηρίζεται από σταδιακή μείωση των αμυντικών μηχανισμών, μειωμένη αναγεννητική ικανότητα όλων των ιστών και οργάνων και εκθετική συσσώρευση βλαβών σε μοριακό, κυτταρικό και οργανισμικό επίπεδο. Τα βλαστικά κύτταρα είναι υπεύθυνα για την ιστική ανανέωση και η απώλεια της λειτουργικότητάς τους συμβάλλει στη γήρανση των ιστών. Το πρωτεάσωμα, καθώς είναι το κύριο κυτταρικό πρωτεολυτικό σύστημα, διαδραματίζει θεμελιώδη ρόλο στη διατήρηση της πρωτεόστασης. Οι αλλοιώσεις του πρωτεασώματος συνδέονται με διάφορα βιολογικά φαινόμενα συμπεριλαμβανομένης της γήρανσης. Ωστόσο, λίγα είναι γνωστά σχετικά με το ρόλο του πρωτεασώματος και των άλλων αντιοξειδωτικών αποκρίσεων στη γήρανση των βλαστικών κυττάρων. Προκειμένου να αποκρυπτογραφηθούν αυτές οι διεργασίες, χρησιμοποιήθηκαν μεσεγχυματικά βλαστικά κύτταρα (hMSCs) που προέρχονταν από τη ζελατινώδη ουσία του Wharton (WJ-MSCs) και από το λιπώδη ιστό (ASCs). Στα πλαίσια της παρούσας μελέτης, παρατηρήθηκε μια σημαντική ελάττωση σε όλες τις ενεργότητες πεπτιδάσης του πρωτεασώματος, συνοδευόμενη από μείωση της έκφρασης των υπομονάδων και τροποποιήσεις των πρωτεασωμικών συμπλόκων στα γηρασμένα hMSCs. Ταυτόχρονα, τόσο τα επίπεδα έκφρασης χαρακτηριστικών δεικτών πολυδυναμικότητας, όσο και η ικανότητα διαφοροποίησης των hMSCs μειώνεται κατά τη διάρκεια της γήρανσης τους. Καθώς η γήρανση των βλαστοκυττάρων χαρακτηρίζεται από μειωμένο πρωτεασωμικό περιεχόμενο και από τις επακόλουθες διαταραχές της πρωτεόστασης, η διατήρηση της λειτουργίας του πρωτεασώματος ενδεχομένως θα μπορούσε να καθυστερήσει την πρόοδό της. Προς αυτή την κατεύθυνση, πραγματοποιήθηκε υπερέκφραση της β5 καταλυτικής υπομονάδας του πρωτεασώματος σε WJ-MSCs και διαπιστώθηκε ότι ήταν αρκετή για να αυξήσει και να διατηρήσει τις πρωτεασωμικές λειτουργίες κατά τη γήρανση και ακολούθως να αυξήσει την αναδιπλασιαστική διάρκεια ζωής και την πολυδυναμικότητά τους. Ταυτόχρονα, η ενεργοποίηση του πρωτεασώματος άμβλυνε τη μείωση του μήκους των τελομερών κατά την εκτεταμένη καλλιέργεια των βλαστικών κυττάρων και εξάλειψε τη σχετιζόμενη με την αναδιπλασιαστική γήρανση, αύξηση των επιπέδων των οξειδωτικά τροποποιημένων πρωτεϊνών. Προς την ίδια κατεύθυνση, ταυτοποιήθηκαν νέες αντιοξειδωτικές ενώσεις και νέοι ενεργοποιητές του πρωτεασώματος με ικανότητα να καθυστερούν τη γήρανση των βλαστικών κυττάρων. Τέλος, διαπιστώθηκε μια νέα σύνδεση μεταξύ των παραγόντων πολυδυναμικότητας και του πρωτεασώματος. Συγκεκριμένα, αποκαλύφθηκε για πρώτη φορά η ύπαρξη ενεργών σημείων πρόσδεσης του κεντρικού παράγοντα πολυδυναμικότητας Oct4 στους υποκινητές των γονιδίων των πρωτεασωμικών υπομονάδων β2 και β5 και ως εκ τούτου ενδεχομένως συμμετέχει τη ρύθμιση της έκφρασης τους. Η κατανόηση των μηχανισμών που ρυθμίζουν την πρωτεόσταση στα βλαστικά κύτταρα θα ανοίξει το δρόμο σε καινοτόμες βασιζόμενες σε βλαστοκύτταρα παρεμβάσεις, οι οποίες θα αποσκοπούν στη θεραπεία ηλικιοεξαρτώμενων ασθενειών και στη βελτίωση της διάρκειας ζωής.
Το ναυτεργατικό δυναμικό της ελληνόκτητης ναυτιλίας από τα μέσα του 20ου αιώνα έως σήμερα
Authors: Παπαβασιλείου Σεβαστή
Published: September 2021

Το ερευνητικό αντικείμενο της διατριβής αφορά τους Έλληνες ναυτικούς που εργάστηκαν σε πλοία ελληνικής ιδιοκτησίας κατά το δεύτερο μισό του 20 ου αιώνα, με έμφαση τις πρώτες δεκαετίες μετά τον πόλεμο, μέχρι και τα τέλη του 1970, όσο ακόμα η ζήτηση για Έλληνες ναυτικούς ήταν μεγάλη. Εξετάζει τη ναυτική εργασία σε μία περίοδο αλματώδους ανάπτυξης της ελληνικής ναυτιλίας, κατά την οποία η πλοιοκτησία ελληνικών συμφερόντων αναπτύσσει τον μεγαλύτερο εμπορικό στόλο σε παγκόσμια κλίμακα. Στόχος μας ήταν μία σφαιρική προσέγγιση της εργασίας, με κέντρο ερμηνείας τον χώρο εργασίας και την εργατική εμπειρία. Βασικές πηγές αποτέλεσαν το αρχείο του Ναυτικού Απομαχικού Ταμείου και οι προφορικές μαρτυρίες. Η διατριβή χωρίζεται σε τρία μέρη. Στο πρώτο μέρος εξετάζεται η αριθμητική δυναμική του ναυτεργατικού δυναμικού και ο τόπος προέλευσης των ναυτικών. Η ανθρωπογεωγραφική μελέτη μας βοήθησε στον προσδιορισμό των σχέσεων των ναυτικών με τη στεριά. Στο δεύτερο μέρος, προσπαθήσαμε με τη βοήθεια των προφορικών μαρτυριών να ανιχνεύσουμε τις εργασιακές συνθήκες στο ελληνικό πλοίο αλλά και τον ναυτικό βίο. Στο τρίτο μέρος, εξετάσαμε τη διάρθρωση της ναυτικής εκπαίδευσης, ορισμένες πτυχές από τον τρόπο διαμόρφωσης της κοινωνικής ασφάλισης των ναυτικών, και τέλος, με την έρευνα της ναυτεργατικής σωματειακής οργάνωσης, μπορέσαμε να έχουμε μια εικόνα για τα περιθώρια της εργατικής διεκδίκησης και τους τρόπους έκφρασης της διαμαρτυρίας.
Advances in possibilistic clustering with application to hyperspectral image processing
Authors: Ξενάκη Σπυριδούλα
Published: September 2021

Η ομαδοποίηση δεδομένων είναι μια εδραιωμένη μεθοδολογία ανάλυσης δεδομένων που έχει χρησιμοποιηθεί εκτενώς σε διάφορα πεδία εφαρμογών κατά τη διάρκεια των τελευταίων δεκαετιών. Η παρούσα διατριβή εστιάζει κυρίως στην ευρύτερη οικογένεια των αλγορίθμων βελτιστοποίησης κόστους και πιο συγκεκριμένα στους αλγόριθμους ομαδοποίησης με βάση τα ενδεχόμενα (Possibilistic c-Means, PCM). Συγκεκριμένα, αφού εκτίθενται τα αδύνατα σημεία τους, προτείνονται νέοι (batch και online) PCM αλγόριθμοι που αποτελούν επεκτάσεις των προηγουμένων και αντιμετωπίζουν τα αδύνατα σημεία των πρώτων. Οι προτεινόμενοι αλγόριθμοι ομαδοποίησης βασίζονται κυρίως στην υιοθέτηση των εννοιών (α) της προσαρμοστικότητας παραμέτρων (parameter adaptivity), οι οποίες στους κλασσικούς PCM αλγορίθμους παραμένουν σταθερές κατά την εκτέλεσή τους και (β) της αραιότητας (sparsity). Αυτά τα χαρακτηριστικά προσδίδουν νέα δυναμική στους προτεινόμενους αλγορίθμους οι οποίοι πλέον: (α) είναι (κατ' αρχήν) σε θέση να προσδιορίσουν τον πραγματικό αριθμό των φυσικών ομάδων που σχηματίζονται από τα δεδομένα, (β) είναι ικανοί να αποκαλύψουν την υποκείμενη δομή ομαδοποίησης, ακόμη και σε δύσκολες περιπτώσεις, όπου οι φυσικές ομάδες βρίσκονται κοντά η μία στην άλλη ή/και έχουν σημαντικές διαφορές στις διακυμάνσεις ή/και στις πυκνότητές τους και (γ) είναι εύρωστοι στην παρουσία θορύβου και ακραίων σημείων. Επίσης, δίνονται θεωρητικά αποτελέσματα σχετικά με τη σύγκλιση των προτεινόμενων αλγορίθμων, τα οποία βρίσκουν επίσης εφαρμογή και στους κλασσικούς PCM αλγορίθμους. Η δυναμική των προτεινόμενων αλγορίθμων αναδεικνύεται μέσω εκτεταμένων πειραμάτων, τόσο σε συνθετικά όσο και σε πραγματικά δεδομένα. Επιπλέον, οι αλγόριθμοι αυτοί έχουν εφαρμοστεί με επιτυχία στο ιδιαίτερα απαιτητικό πρόβλημα της ομαδοποίησης σε υπερφασματικές εικόνες. Τέλος, αναπτύχθηκε και μια μέθοδος επιλογής χαρακτηριστικών κατάλληλη για υπερφασματικές εικόνες.
Properties of massive stars in the local group
Authors: Κουρνιώτης Μιχαήλ
Published: September 2021

Στην παρούσα διδακτορική διατριβή, παρουσιάζεται μια εκτενής μελέτη δυο διαφορετικών εξελικτικών σταδίων αστέρων μεγάλης μάζας: εξελιγμένοι, μέσης μάζας αστέρες που έχουν επιβιώσει του σταδίου των ερυθρών υπεργιγάντων (RSGs) και εμφανίζονται ως Κίτρινοι Υπεργίγαντες (YHGs), και θερμοί αστέρες της Κύριας Ακολουθίας που παρατηρούνται ως μέλη σε ενα εκλειπτικό σύστημα μεγάλης μάζας στο Γαλαξιακό σμήνος Danks 2. Στο πρώτο μέρος, γίνεται χρήση υπέρυθρης και μακροχρόνιας οπτικής φωτομετρίας η οποία συμπληρώνεται απο φασματοσκοπία "σκονισμένων" πηγών με το 10-μ τηλεσκόπιο GTC, προκειμένου να προσεγγίσουμε την αινιγματική φύση των YHGs στον γαλαξία M33. Η μελέτη προτείνει την ανακάλυψη ενος ισχυρού υποψηφίου YHG, μετά το γνωστό Var A στον Μ33, καθώς και την περαιτέρω διερεύνηση επιλεγμένων "σκονισμένων" στόχων ιδανικών για να θέσουν περιορισμούς στα θεωρητικά μοντέλα αστρικής εξέλιξης. Στο δεύτερο μέρος της διατριβής, γίνεται μοντελοποίηση του αμυδρού Γαλαξιακού συστήματος μεγάλης μάζας D2-EB για την διεξαγωγή των θεμελιωδών παραμέτρων των προγενέστερου τύπου μελών του. Ακριβείς μετρήσιμες ακτίνες επιτρέπουν το προσδιορισμό της λαμπρότητας των μελών και την μέτρηση της απόστασης στο σύστημα και το μητρικό σμήνος, με ακρίβεια 2%
Computational methods of analysis for gene expression and genomewide variation data
Authors: Παντμαναμπούνι Σανμούκα Σαμπάθ
Published: September 2021

Η διδακτορική μου διατριβή επικεντρώνεται στις υπολογιστικές μεθόδους και τα σύνολα εντολών για την ανάλυση διαφορετικών τύπων γονιδιωματικών, μεταγραφικών και επιγονιδιωματικών δεδομένων με στόχο την κατανόηση της αιτιολογίας του συνδρόμου Gilles de la Tourette (GTS), μιας ψυχιατρικής διαταραχής πολύπλοκου υποβάθρου. Οι εξελίξεις στις τεχνολογίες μικροσυστοιχιών έχουν καταστήσει δυνατή την ανάλυση του γονιδιώματος μεγάλων ομάδων ασθενών παράγοντας τεράστιο όγκο δεδομένων. Η ανάλυση του μεγάλου όγκου δεδομένων από τις τεχνολογίες μικροσυστοιχιών πρέπει να αντιμετωπίσει ένα ευρύ φάσμα προβλημάτων, που εκτείνονται από το βασικό έλεγχο ποιότητας έως τα πολύπλοκα μοντέλα συσχέτισης. Η ανάλυση τέτοιων δεδομένων μεγάλου όγκου υποβάλλονται σε αυστηρό ποιοτικό έλεγχο τόσο σε επίπεδο παραλλαγών όσο και επίπεδο δειγμάτων για την εξάλειψη τεχνικών προβλημάτων που μειώνουν τα ψευδώς θετικά αποτελέσματα της συσχέτισης. Εδώ παρουσιάζουμε τις υπολογιστικές μεθόδους και τα σύνολα εντολών που χρησιμοποιούνται για την ανάλυση της γονιδιακής έκφρασης σε επίπεδο ολόκληρου του γονιδιώματος, των μονονουκλεοτιδικών πολυμορφισμών (SNPs), των παραλλαγών αριθμού αντιγράφων (CNVs) και των μελετών δεικτών μεθυλίωσης DNA. Η εφαρμογή των παραπάνω μεθόδων στο GTS ρίχνουν φως στην αιτιολογία της διαταραχής, εμπλέκοντας πολλά υποψήφια γονίδια προδιάθεσης που δικαιολογούν περαιτέρω διερεύνηση.