bluuebunny/crossref_metadata_2025 huggingface dataset:
A behavioral economic intervention to increase psychiatrist adherence to tobacco treatment guidelines: a provider-randomized study protocol
Authors: Rogers Erin , Wysota Christina , Prochaska Judith J. , Tenner Craig , Dognin Joanna , Wang Binhuan , Sherman Scott E.
Published: January 2020

Background People with a psychiatric diagnosis smoke at high rates, yet are rarely treated for tobacco use. Health care systems often use a ‘no treatment’ default for tobacco, such that providers must actively choose (opt-in) to treat their patients who express interest in quitting. Default bias theory suggests that opt-in systems may reinforce the status quo to not treat tobacco use in psychiatry. We aim to conduct a pilot study testing an opt-out system for implementing a 3A’s (ask, advise, assist) tobacco treatment model in outpatient psychiatry. Methods We will use a mixed-methods, cluster-randomized study design. We will implement a tobacco use clinical reminder for outpatient psychiatrists at the VA New York Harbor Healthcare System. Psychiatrists (N = 20) will be randomized 1:1 to one of two groups: (1) Opt-In Treatment Approach: Psychiatrists will receive a reminder that encourages them to offer cessation medications and referral to cessation counseling; or (2) Opt-Out Treatment Approach: Psychiatrists will receive a clinical reminder that includes a standing cessation medication order and a referral to cessation counseling that will automatically generate unless the provider cancels. Prior to implementation of the reminders, we will hold a 1-hour training on tobacco treatment for psychiatrists in both arms. We will use VA administrative data to calculate the study’s primary outcomes: 1) the percent of smokers prescribed a cessation medication and 2) the percent of smokers referred to counseling. During the intervention period, we will also conduct post-visit surveys with a cluster sample of 400 patients (20 per psychiatrist) to assess psychiatrist fidelity to the 3 A’s approach and patient perceptions of the opt-out system. At six months, we will survey the clustered patient sample again to evaluate the study’s secondary outcomes: 1) patient use of cessation treatment in the prior 6 months and 2) self-reported 7-day abstinence at 6 months. At the end of the intervention period, we will conduct semi-structured interviews with 12-14 psychiatrists asking about their perceptions of the opt-out approach. Discussion This study will produce important data on the potential of opt-out systems to overcome barriers in implementing tobacco use treatment in outpatient psychiatry.
High endemicity of Clonorchis sinensis infection in Binyang County, southern China
Authors: Sun Junling , Xin Hualei , Jiang Zhihua , Qian Menbao , Duan Kaixia , Chen Yingdan , Li Shizhu , Li Wei , Huang Shiyong , Gan Xiaoqin , Yang Yichao , Li Zhongjie
Published: January 2020

BackgroundHigh-intensity clonorchiasis infection is associated with serious outcomes, even cancers. Understanding the infection intensity of Clonorchis sinensis and the impact factors in local endemic regions would facilitate effective control measures. Methods In a county located in a highly endemic area in Guangxi Province, P. R. China, local residents were randomly enrolled in the study; helminth egg examinations were performed with the Kato-Katz method, and the intensity of infection was identified as mild, moderate or heavy. Knowledge, attitudes, and high-risk behaviours were investigated among those infected with Clonorchis sinensis . Results A total of 2521 local residents participated in this study, and the Clonorchis sinensis infection proportion was 28.9% (728 persons). Among the infected persons, the percentages of mild, moderate and heavy infections were 66.2%, 28.4% and 5.4%, respectively. Males experienced a higher proportion of moderate and heavy infections (37.5%) than females (18.1%) (p<0.05). The highest infection proportion among the different levels of infection intensity was identified among persons aged 30-59 years (15.7% for moderate and heavy infections). Among the 509 persons who reported eating raw fish, 302 persons (59.3%) had eaten raw fresh fish for more than 10 years, and 131 (25.7%) persons ate raw fish ≥12 times a year. Multivariate logistic regression revealed that eating raw fish 12-50 times in the last year (adjusted odds ratio [aOR] = 1.74, 95%CI: 1.09-2.80) and eating raw fish >50 times in the last year (aOR = 2.89, 95%CI: 1.20-7.50) were risk factors of higher infection intensity (moderate and heavy). Conclusions The overall infection proportion was high in the study area, with a large group of residents experiencing high-intensity infections. Intervention strategies should be implemented with people with a high frequency of raw fish consumption to reduce the probability of severe consequences.
Gut Microbiota Related to Fiber Digestibility were Identified by Variation of Apparent Fiber Digestibility in Chinese Suhuai pig
Authors: Niu Qing , Pu Guang , Fan Lijuan , Gao Chen , Wang Huan , Lan Tingxu , Liu Chenxi , Wang Binbin , Ma Xiang , Du Taoran , Kim Sung Woo , Niu Peipei , Zhang Zongping , Li Qiang , Li Pinghua , Huang Ruihua
Published: January 2020

Background: Dietary fiber plays an important role in porcine gut health and welfare. Fiber mainly degraded by the gut microbiota, whereas most gut microbiota related to fiber digestibility of pigs are still unidentified. To reveal gut microbiota associated with apparent digestibility of neutral detergent fiber (NDF) and acid detergent fiber (ADF), apparent NDF, ADF digestibility of 274 Suhuai female finishing pigs at the age of 160 days were measured. The gut microbiota of Suhuai pigs were analyzed through 16S rRNA gene sequencing, respectively. Results: Large phenotypic variations in apparent NDF and ADF digestibility were separately found among Suhuai pigs. The coefficient of variation of NDF and ADF digestibility was 12.08% and 18.08%, respectively. The mean values of digestibility of H-NDF and H-ADF groups were 30.20% and 33.76% more than those of the L-NDF and L-ADF groups (P＜0.01), respectively. A total of 927 and 935 operational taxonomic units (OTUs) were confirmed from two types of fecal samples,respectively. There were14 phyla in all samples and the abundances of Spirochaetae, Bacteroidetes and unclassified_k__norank were significantly different between H-NDF and L-NDF groups (P＜0.05) and the abundances of Spirochaetae, Verrucomicrobia, unclassified_k__norank and Fibrobactere were significantly different between H-ADF and L-ADF group (P＜0.05).A total of 188, 183, 188 and 185 genera were separately identified in H-NDF, L-NDF, H-ADF and L-ADF groups, while 6, 1, 5 and 2 genera were separately specific to H-NDF, L-NDF, H-ADF and L-ADF groups. The microbiota of H-NDF and H-ADF clustered separately from the microbiota of the L-NDF and L-ADF along principal coordinate 1, respectively. Compared with L-NDF group, 29 genera were found to be potential biomarkers in H-NDF group. Compared with L-ADF group, 23 genera were found to be potential biomarkers in H-ADF group. The most important functions and metabolic pathways of the above potential biomarkers included carbohydrate transport and metabolism. Conclusions: Microbial community structures were significantly different between high and low fiber digestibility groups. Twenty nine and 23 genera were found to be potential biomarkers in H-NDF and H-ADF group, respectively. The biomarkers may be the key functional microbiota related to apparent fiber digestibility.
Exploring the role of transtibial prosthetic use in Deep Tissue Injury development: A scoping review
Authors: Author) Marisa Graser(Former Corresponding , Day Sarah , Author) Arjan Buis(New Corresponding
Published: January 2020

Background: The soft tissue of the residual limb in transtibial prosthetic users encounters unique biomechanical challenges. Although not intended to tolerate high loads and deformation, it becomes a weight-bearing structure within the residuum-prosthesis-complex. Consequently, deep soft tissue layers may be damaged, resulting in Deep Tissue Injury (DTI). Whilst considerable effort has gone into DTI research on immobilised individuals, only little is known about the aetiology and population-specific risk factors in amputees. This scoping review maps out and critically appraises existing research on DTI in lower-limb prosthetic users according to (1) the population-specific aetiology, (2) risk factors, and (3) methodologies to investigate both. Results: A systematic search within the databases Pubmed, Ovid Excerpta Medica, and Scopus identified 16 English-language studies. The results indicate that prosthetic users may be at risk for DTI during various loading scenarios. This is influenced by individual surgical, morphological, and physiological determinants, as well as the choice of prosthetic componentry. However, methodological limitations, high inter-patient variability, and small sample sizes complicate the interpretation of outcome measures. Additionally, fundamental research on cell and tissue reactions to dynamic loading and on prosthesis-induced alterations of the vascular and lymphatic supply is missing. Conclusion: We therefore recommend increased interdisciplinary research endeavours with a focus on prosthesis-related experimental design to widen our understanding of DTI. The results have the potential to initiate much-needed clinical advances in surgical and prosthetic practice and inform future pressure ulcer classifications and guidelines.
What has been the progress in addressing financial risk in Uganda? Analysis of catastrophe and impoverishment due to health payments
Authors: Kwesiga Brendan , Aliti Tom , Kakande Pamela Nabukhonzo , Byawaka Peter , Najjuko Susan , Hsu Justine , Ataguba John , Kabaniha Grace
Published: January 2020

Background: Monitoring progress towards Universal Health Coverage (UHC) requires an assessment of progress in coverage of health services and protection of households from the impact of direct out-of-pocket payments (i.e. financial risk protection). Although Uganda has expressed aspirations for attaining UHC, out-of-pocket payments remain a major contributor to total health expenditure. The aim of this study is to monitor progress in financial risk protection in Uganda. Methods: This study uses data from the Uganda National Household Surveys for 2005/06, 2009/10, 2012/13 and 2016/17. We measure financial risk protection using catastrophic health care payments and impoverishment indicators. Health care payments are catastrophic if they exceed a set threshold (i.e. 10% and 25%) of the budget share of total household consumption expenditure. Health payments are impoverishing if they push the household below; the poverty line (using the US$1.90/day and Uganda’s national poverty lines). Logistic regression model is used to assess factors associated with household financial risk.Results: The results show that while progress has been made in reducing financial risk, this progress remains minimal and there is still a risk of reversal of this trend. We find that although catastrophic health payments at the 10% threshold decreased from 22.4% in 2005/06 to 13.8% in 2012/13, it increased to 14.2% in 2016/17. The percentage of Ugandans pushed below the poverty line (US$1.90/day) has decreased from 5.2% in 2005/06 to 2.7% in 2016/17. We show that the distribution of both catastrophic health payments and impoverishment varies across socio-economic status, location and residence. In addition, household characteristics (poverty, having a child below 5 years and an adult above 60 years) are more associated with households lacking financial risk protection. Conclusion: To address the lack of financial risk protection, there is need for interventions aimed at reducing out-of-pocket payments especially among those most affected. In short term, it is important to ensure that there is increased funding for publicly financed services to enable effective coverage with quality health care. In the medium term, introducing mandatory prepayment through health insurance will further reduce the burden due to household expenditure.
Integrate analysis and identification for different expression genes in chondrogenesis
Authors: Liu Keda , Cao Nanjue , Zhu Yuhe , Wang Wei
Published: January 2020

Background: The intricate mechanisms of articular chondrogenesis are largely unknown. Gradually, with the help of high-throughput platforms, microarrays have become an important and useful method to testify hub genes in desease. Today, advanced bioinformatic analysis of available microarray data can provide more reliable and accurate screening results by duplicating related data sets. Results: Microarray datasets GSE9451 and GSE104113 were downloaded from Gene Expression Omnibus (GEO) database. The differentially expressed genes (DEGs) were performed, and function enrichment analyses were demonstrated. The protein-protein interaction network (PPI) was constructed and the module analysis was performed by using STRING and Cytoscape. Quantitative PCR was used to confirm the results of bioinformatics analysis. Conclusion: Compared to individual studies, this study can provide extra reliable and accurate screening results by duplicating relevant records. Additional molecular experiments are required to confirm the discovery of candidate genes identified by chondrogenesis. S100A4 is predicted to integrate with miR-325-3p to promote osteogenesis.
Reproductive behavior of women from a rural community in Tefé, Amazonas, Brazil
Authors: Cabral Ivone Ketura Silva , Cella Wilsandrei , Freitas Silvia Regina Sampaio
Published: January 2020

The objective of this descriptive and retrospective study was to delineate the reproductive profile of women living in a rural community of Tefé Municipality, Amazonas State, Brazil. The target audience included women (n = 10), aged 18 years and older, living in the Agrovila community, rural area, distant 13.2 km from the center of Tefé. All participants were interviewed, individually, based on a questionnaire designed exclusively for the present study. The results of the descriptive analyzes indicated that the interviewees reached the menarche between 13 and 17 years old, and the first pregnancy occurred during adolescence, between 14 and 16 years old. Half of the women interviewed reported regular use of contraceptive methods regularly. However, the average number of children per woman was 4.6 children. All women reported prenatal care in all pregnancies. However, 50% reported complications during pregnancy; while 20% had one or two miscarriages due to eclampsia. These data point to the need to improve prenatal consultations, raise awareness about the risks of eclampsia for maternal health, as well as the creation of reproductive health programs that recognize the social and cultural conditions of isolated Amazonian communities.
Biodegradation of alkali lignin by Bacillus flexus RMWW II: analyzing performance for abatement of rice mill wastewater
Authors: Kumar Anuj , Priyadarshinee Rashmi , Singha Subhajit , Sengupta Bratin , Roy Abhishek , Dasgupta Dalia , Mandal Tamal
Published: January 2020

A potential bacterium Bacillus flexus RMWW II has been isolated from rice mill effluent, and examined for its decolorizing potential for lignin-mimicking dyes. The biodegradation of alkali lignin by the rod-shaped, Gram-positive, oxidase and catalase-positive Bacillus flexus RMWW II bacteria is due to its uptake of lignin as the sole carbon source. The lignin degradation was 100% at a lignin concentration of 50 mg L−1 but the degradation reduced to 20% at 400 mg L−1. The bacterial-mediated biodegradation of alkali lignin was suitably explained by the Edward kinetics model with a maximal specific biodegradation rate (qmax) of 0.056 h−1 and true specific biodegradation rate (q*) of 0.042 h−1. The non-toxic nature of the metabolites of alkali lignin after bacterial degradation was illustrated by phytotoxicity studies. This bacterium was utilized to treat complex rice mill wastewater, as lignin is one of the major components of the effluent. A considerable reduction of 84% of chemical oxygen demand (COD) was observed in a batch reactor in 70 h of operation. The bacterial treatment results for the actual rice mill effluent indicate that Bacillus flexus RMWW II could be a promising agent for microbial remediation of lignin-laden raw rice mill wastewater.
Turkey’s Fight Against ISIS In The Context Of The Historical Development Of Terrorism: Example of Foreign Terrorist Fighters
Authors: Çetinkaya Şeref
Published: January 2020

Terrorism has
become one of the most important issues affecting international relations in
recent years. The
unstability and chaos in the Middle East, in particular, has led to the growth
of terrorist organizations in the region. ISIS is only one of the terrorist
organizations which has established its presence in the region by use of this
chaotic situation and has become known by the whole world through the execution
videos publishing on the internet. ISIS, acting with its Salafist-jihadist
ideology, has been showing the reached point of international terrorism by
making sensational actions in many countries in recent years. ISIS has used the
people called “Foreign Terrorist Fighter” (FTF) in terrorist acts in many
countries. Some of the FTFs remain in their own countries and support ISIS in
these countries. The other part of FTFs shows their supports by crossing to the
conflict zones in Syria and Iraq and by fighting in the ISIS ranks. With the
participation of Turkey and many other countries, there is a fight against
FTFs. The main purpose of this study is to determine the role of the FTFs in
ISIS and to try to analyze Turkey's multi-dimensional fight against FTFs.
Official data declared from the Ministry of Interior of the Republic of Turkey
were used in the analyses.
Hepatocyte Growth Factor Secreted from Human Adipose-Derived Stem Cells Inhibits Fibrosis in Hypertrophic Scar Fibroblasts
Authors: Ma Ji , Yan Xin , Lin Yue , Tan Qian
Published: January 2020

Aims:

To study the effect of Adipose-derived stem cells (ADSCs) on fibrosis of hypertrophic scar-derived fibroblasts (HSFs) and its concrete mechanism. Background: ADSCs have been reported to reduce collagen production and fibroblast proliferation in co-culture experiments. Conditioned medium from adipose-derived stem cells (ADSCs-CM) has successfully inhibited fibrosis by decreasing the expression of collagen type І (Col1) and α-smooth muscle actin (α-SMA) in rabbit ear scar models. Hepatocyte growth factor (HGF), the primary growth factor in ADSCs-CM, has been shown to reverse fibrosis in various fibrotic diseases.

Background:

ADSCs have been reported to reduce collagen production and fibroblast proliferation in co-culture experiments. Conditioned medium from adipose-derived stem cells (ADSCs-CM) has successfully inhibited fibrosis by decreasing the expression of collagen type І (Col1) and α-smooth muscle actin (α-SMA) in rabbit ear scar models. Hepatocyte growth factor (HGF), the primary growth factor in ADSCs-CM, has been shown to reverse fibrosis in various fibrotic diseases.

Objective:

To test the hypothesis that ADSCs inhibit fibrosis of HSFs through the secretion of HGF.

Methods:

HSFs were treated with DMEM containing 0%, 10%, 50% and 100% concentration of ADSCs-CM. The effect of ADSCs-CM on the viability was determined by cell viability assay, and the collagen production in HSFs was examined by Sirius red staining. Expression and secretion of fibrosis and degradation proteins were detected separately. After measuring the concentration of HGF in ADSCs-CM, the same number of HSFs were treated with 50% ADSCs-CM or HGF. HGF activity in ADSCs-CM was neutralized with a goat anti-human HGF antibody.

Results:

The results demonstrated that ADSCs-CM dose-dependently decreased cell viability, expression of fibrosis molecules, and tissue inhibitor of metalloproteinases-1 (TIMP-1), and significantly increased matrix metalloproteinase-1 (MMP-1) expression in HSFs. Collagen production and the ratio of collagen type І and type III (Col1/Col3) were also suppressed by ADSCs-CM in a dose-dependent manner. When HSFs were cultured with either 50% ADSCs-CM or HGF (1 ng/ml), a similar trend was observed in gene expression and protein secretion. Adding an HGF antibody to both groups returned protein expression and secretion to basal levels but did not significantly affect the fibrosis factors in the control group.

Conclusion:

Our findings revealed that adipose-derived stem cell-secreted HGF effectively inhibits fibrosis-related factors and regulates extracellular matrix (ECM) remodeling in hypertrophic scar fibroblasts.
Selenium and Neurological Diseases: Focus on Peripheral Pain and TRP Channels
Authors: Nazıroğlu Mustafa , Öz Ahmi , Yıldızhan Kenan
Published: January 2020

Pain is a complex physiological process that includes many components. Growing evidence supports the idea that oxidative stress and Ca2+ signaling pathways participate in pain detection by neurons. The main source of endogenous reactive oxygen species (ROS) is mitochondrial dysfunction induced by membrane depolarization, which is in turn caused by Ca2+ influx into the cytosol of neurons. ROS are controlled by antioxidants, including selenium. Selenium plays an important role in the nervous system, including the brain, where it acts as a cofactor for glutathione peroxidase and is incorporated into selenoproteins involved in antioxidant defenses. It has neuroprotective effects through modulation of excessive ROS production, inflammation, and Ca2+ overload in several diseases, including inflammatory pain, hypersensitivity, allodynia, diabetic neuropathic pain, and nociceptive pain. Ca2+ entry across membranes is mediated by different channels, including transient receptor potential (TRP) channels, some of which (e.g., TRPA1, TRPM2, TRPV1, and TRPV4) can be activated by oxidative stress and have a role in the induction of peripheral pain. The results of recent studies indicate the modulator roles of selenium in peripheral pain through inhibition of TRP channels in the dorsal root ganglia of experimental animals. This review summarizes the protective role of selenium in TRP channel regulation, Ca2+ signaling, apoptosis, and mitochondrial oxidative stress in peripheral pain induction.
In SilicoStudy of 1, 4 Alpha Glucan Branching Enzyme and Substrate Docking Studies
Authors: Kargar Farzane , Savardashtaki Amir , Mortazavi Mojtaba , Mahani Masoud Torkzadeh , Amani Ali Mohammad , Ghasemi Younes , Nezafat Navid
Published: January 2020

Background:

The 1,4-alpha-glucan branching protein (GlgB) plays an important role in the glycogen biosynthesis and the deficiency in this enzyme has resulted in Glycogen storage disease and accumulation of an amylopectin-like polysaccharide. Consequently, this enzyme was considered a special topic in clinical and biotechnological research. One of the newly introduced GlgB belongs to the Neisseria sp. HMSC071A01 (Ref.Seq. WP_049335546). For in silico analysis, the 3D molecular modeling of this enzyme was conducted in the I-TASSER web server.

Methods:

For a better evaluation, the important characteristics of this enzyme such as functional properties, metabolic pathway and activity were investigated in the TargetP software. Additionally, the phylogenetic tree and secondary structure of this enzyme were studied by Mafft and Prabi software, respectively. Finally, the binding site properties (the maltoheptaose as substrate) were studied using the AutoDock Vina.

Results:

By drawing the phylogenetic tree, the closest species were the taxonomic group of Betaproteobacteria. The results showed that the structure of this enzyme had 34.45% of the alpha helix and 45.45% of the random coil. Our analysis predicted that this enzyme has a potential signal peptide in the protein sequence.

Conclusion:

By these analyses, a new understanding was developed related to the sequence and structure of this enzyme. Our findings can further be used in some fields of clinical and industrial biotechnology.
Enhancement of Adsorption-Photocatalysis of Malachite Green Using Oil Palm Biomass-Derived Activated Carbon/ Titanium Dioxide Composite
Authors: Pang Yean L. , Teh Wen S. , Lim Steven , Abdullah Ahmad Z. , Ong Hwai C. , Wu Chien-Hou
Published: January 2020

Background:

Nowadays, effective wastewater treatment has become a hot research topic
in the field of environment. A series of novel activated carbon/ titanium dioxide (AC/TiO2) composites
at various weight ratio were synthesised using the sol-gel method and were characterised using
XRD, SEM-EDX, FT-IR, TGA and surface area analysis.

Method:

TiO2 particles were successfully incorporated on the AC surface and were mainly composed
of Ti, O and C atoms. The AC/TiO2 composites were made up of spherical TiO2 particles agglomerated
on the smooth tubular and porous structure of AC. The photocatalytic efficiency was influenced
by the weight proportion of AC:TiO2 and the degradation process was attributed to the adsorption
and photocatalytic processes.

Results:

It was found that 2.5 g/L AC/TiO2 at a weight ratio of 3:1 on an initial Malachite Green
concentration of 10 mg/L at 50°C led to a degradation efficiency of 96.3% in 7.5 minutes under a
halogen lamp. A chemical oxygen demand (COD) removal of 96.7% was also recorded. Reusability
of the AC/TiO2 composite and kinetic study of the photodegradation of Malachite Green were also
investigated. The recycled AC/TiO2 composite achieved high catalytic performance (83.1%) after
one catalytic cycle.

Conclusion:

The degradation kinetics of Malachite Green at various solution temperatures were fitted
to the pseudo-first-order reactions and the activation energy for the degradation of Malachite
Green was 21.48 kJ/mol. This work demonstrated that AC/TiO2 composite is a promising material
for photocatalytic degradation of organic dyes.
Screening and Analysis of Hypolipidemic Components from Shuangdan Capsule Based on Pancreatic Lipase
Authors: Qi Y.J. , Lu H.N. , Zhao Y.M. , Wang Z. , Ji Y.J. , Jin N.Z. , Ma Z.R.
Published: January 2020

Background:

Some natural pancreatic lipase inhibitors with fewer side effects are proposed.
As a traditional Chinese medicine, Shuangdan Capsule (SDC) has been used for the treatment
of higher lipid in blood, which is mainly composed by Radix Salviae and Peony skin.

Objective:

This work is aimed to investigate the molecular mechanism of the constituents from this
SDC against metabolic disorders, the molecular flexibility and intermolecular interactional characteristics
of these components in the active sites.

Methods:

The small molecules were obtained from the Traditional Chinese Medicine Database
TCM database, the systems-level pharmacological database for Traditional Chinese Medicine
TCMSP server was used to calculate the ADME-related properties. Autodock Vina was used to
perform virtual screening of the selected molecules and to return energy values in several ligand
conformations. The network parameters were calculated using the network analyzer plug-in in Cytoscape.

Results:

The most active six molecules are all enclosed by amino acids ASP79, TYR114,
GLU175, PRO180, PHE215, GLY216 and LUE264, among which, hydrophobic interaction, hydrogen
bond and repulsive forces play extremely important roles. It is worth noting that most of
the local minima of molecular electrostatic potentials on van der Waals (vdW) surface are increased
while the maxima negative ones are decreased simultaneously, implying that the electrostatic
potential tends to be stable. From the topological analysis of the Protein-Protein Interaction
(PPI) network, PNLIP related genes are also proved to be pivotal targets for hyperlipidemia, such
as LPL, AGK, MGLL, LIPE, LIPF and PNPLA2. Further GO analysis indicated that lipophilic
terpenoid compounds may reduce the blood lipid by taking part in the lipid catabolic process, the
extracellular space and the cellular components of the extracellular region part and the triacylglycerol
lipase activity.

Conclusion:

This study provides some useful information for the development and application of
natural hypolipidemic medcines. Further pharmacologically active studies are still needed both in
vivo and in vitro.
A 2D Non-degeneracy Graphical Representation of Protein Sequence and Its Applications
Authors: Xie Xiaoli , Zhao Yunxiu
Published: January 2020

Background:

The comparison of the protein sequences is an important research filed in bioinformatics. Many alignment-free methods have been proposed.

Objective:

In order to mining the more information of the protein sequence, this study focus on a new alignment-free method based on physiochemical properties of amino acids.

Methods:

Average physiochemical value (Apv) has been defined. For a given protein sequence, a 2D curve was outlined based on Apv and position of the amino acid, and there is not loop and intersection on the curve. According to the curve, the similarity/dissimilarity of the protein sequences can be analyzed.

Results and Conclusion:

Two groups of protein sequences are taken as examples to illustrate the new methods, the protein sequences can be classified correctly, and the results are highly correlated with that of ClustalW. The new method is simple and effective.
The Inhibitory Effects of Lactobacillus Supernatants and Their Metabolites on the Growth and Biofilm Formation of Klebsiella pneumoniae
Authors: Kheiri Fatemeh , Kermanshahi Rouha Kasra , Feizabadi Mohammad Mehdi
Published: January 2020

Background:

Klebsiella pneumoniae is a common cause of hospital-acquired infections,
including urinary tract infection (UTI). Biofilm formation makes the K. pneumoniae infection more
complicated and carrying extended-spectrum beta-lactamases (ESBLs) genes, it limits antibiotic
choices for treatment. Lactobacillus strains are known as natural protective barriers against UTIs.

Objectives:

This is a small in-vitro study aimed to determine the effect of probiotic Lactobacillus
strains and some types of their metabolites on the growth and biofilm of UTI isolates and reference
strain of Klebsiella pneumoniae.

Methods:

The efficacy of Lactobacillus supernatants and antibiotics in the prevention and elimination
of K. pneumoniae biofilms was determined using a quantitative adherence assay. A rapid colorimetric
microplate bioassay was applied for the detection of survived bacterial cells after treatment
with antibacterial agents. Biofilm phenotypes were studied by scanning electron microscopy
(SEM).

Results:

The results showed that seven out of eight ESBL producing uropathogenic K. pneumoniae
isolates in this study were able to produce biofilm. Lactobacillus supernatants at 1:1 to 1:16 dilutions,
had more than 95% biofilm-inhibitory and biofilm-killing properties on a strong biofilm producer
isolate. Supra-MIC levels of antibiotics had a much lower anti-biofilm effect than Lactobacillus
supernatant and left considerable alive biofilm cells.

Conclusions:

Although antibiotic resistance increases in biofilm forms of Klebsiella pneumoniae,
Lactobacillus supernatants have strong antibiofilm efficacy even in lower concentrations of MIC.
Biofilm formation decreases considerably in the presence of Lactobacillus supernatants. Hydrogen
peroxide is an effective product against growth and biofilm formation of Klebsiella pneumoniae.
ДИНАМІКА ПОКАЗНИКІВ СТАНУ СОЦІАЛЬНОГО ФУНКЦІОНУВАННЯ ПРИ МЕТАБОЛІЧНОМУ СИНДРОМІ У ХВОРИХ НА ПАРАНОЇДНУ ШИЗОФРЕНІЮ НА ТЛІ ЗАСТОСУВАННЯ АТИПОВИХ НЕЙРОЛЕПТИКІВ ТА КОРЕКЦІЇ СУПУТНЬОЇ ПАТОЛОГІЇ.
Authors: Ромаш І. Р. , Винник М. І.
Published: January 2020

Метою дослідження було вивчення особливостей динаміки соціального функціонування та його залежності від клініко-психопатологічної симптоматики у пацієнтів на параноїдну шизофренію з супутнім метаболічним синдромом на тлі тривалої нейролептичної терапії та визначення ефективності супутньої коригуючої терапії .

З цією метою, було обстежено 140 пацієнтів хворих на параноїдну шизофренію (F20.0), які були розділені на три групи. І група – 40 осіб, які отримували галоперідол у середній добовій дозі 4,6±1,3мг/добу, ІІ група – 40 пацієнтів, які отримували рисперидон (3,7±1,8 мг/добу), ІІІ – 40 пацієнтів, які приймали кветіапін (413±116 мг/добу). У кожній із представлених груп половина пацієнтів (групи порівняння) продовжували отримувати нейролептичну терапію за вище прописаною схемою, а другій половині (дослідні групи) до стандартної терапії було додано препарат метформіну гідрохлорид в дозі 500 мг/добу. Контрольну групу склали 20 пацієнтів із діагнозом «параноїдна шизофренія, ремісія» без ознак метаболічного синдрому, які на протязі останніх пів року не отримували нейролептиків. Для детального вивчення психічного стану пацієнтів використано The Positive and Negative Syndrome Scale (PANSS) та шкалу Personal and social performance (PSP).

В дослідженні ми прослідкували вплив коморбідної патології на патопсихологічну симптоматику та показники СФ у пацієнтів із параноїдною шизофренією, які тривало отримують нейролептичну терапію. За результатами обстеження нами було запропоновано та проведено супутню корекцію метаболічних порушень в комплексній терапії шизофренії, коморбідної із метаболічним синдромом. Клінічна та статистична оцінка ефективності запропонованої корекції виявила вагому її результативність порівняно з традиційною терапією.
ЗМІНИ ЯКОСТІ ЖИТТЯ ЛЮДЕЙ З РОЗЛАДАМИ ПСИХІКИ ТА ПОВЕДІНКИ ВНАСЛІДОК ВЖИВАННЯ АЛКОГОЛЮ ПІСЛЯ ФІЗИЧНОЇ ТЕРАПІЇ
Authors: Баскевич О. В.
Published: January 2020

Резюме. Мета роботи – визначити вплив фізичної терапії на якість життя і психо-фізичний стан людей з розладами психіки та поведінки внаслідок вживання алкоголю.

В основу дослідження покладено ретроспективний аналіз результатів лікування пацієнтів психоневрологічного відділення віком 25-40 років, де проведено курс фізичної терапії з метою підвищення якості життя, яку оцінювали за даними хворобонеспецифічної анкети. Методика фізичної терапії включала працетерапію. Її рекомендують для підвищення і збереження фізичної працездатності, зміцнення м’язів і рухливості в суглобах, збільшення енерговитрат та недопущення збільшення маси тіла. Робота пов’язана з доглядом за рослинами, передбачає часті підйоми на носки і дотягування до рослин верхніх ярусів з подальшим згинанням тулуба і нижніх кінцівок для укладання плодів та овочів в продуктові ящики. До засобів авторської програми входять різноманітні види масажу.

У ході дослідження виявлено, що фізична терапія призводить до значного збільшення психологічного та фізичного компонента здоров’я людей з розладами психіки та поведінки внаслідок вживання алкоголю за даними хворобонеспецифічного анкетування в період спостереження до 12 міс. Поліпшення якості життя зазначеної категорії пацієнтів після фізичної терапії підтверджено даними тестування фізичної підготовленості за допомогою відповідних тестів. Отримані результати продемонстрували, що засоби фізичної терапії можна використовувати в комплексі консервативного лікування з метою покращення якості життя людей з розладами психіки та поведінки внаслідок вживання алкоголю і зниженою фізичною здатністю організму. Показник якості життя можна використовувати для оцінки ефективності лікування пацієнтів.
ДІАГНОСТИКА ІНСУЛІНОРЕЗИСТЕТНОСТІ У ХВОРИХ НА АРТЕРІАЛЬНУ ГІПЕРТЕНЗІЮ
Authors: Човганюк О. С. , Оринчак М. А. , Гаман І. О.
Published: January 2020

Резюме. Мета дослідження – дослідити інкреторну функцію підшлункової залози за показником С-пептиду залежно від рівня ендогенного інсуліну (ЕІ) та гомеостатичних моделей інсулінорезистентності (ІР) у хворих на артеріальну гіпертензію (АГ) з метаболічним синдромом (МС). Обстежено 94 хворих на АГ з МС. Проводили пероральний глюкозо-толерантний тест (ПГТТ) із визначенням рівня глікемії, ЕІ та С-пептиду натще і через 2 години після навантаження. Розраховували індекси чутливості до інсуліну (ІЧІ), НОМА-ІR, НОМА-β. Залежно від рівня ЕІ хворих розділили на 3 групи: 1 група – 29 хворих з нормальним рівнем ЕІ; 2 – 38 хворих із реактивною гіперінсулінемією (ГІ); 3 – 27 хворих із спонтанною ГІ. Встановлено, що у 1 групі рівень С-пептиду в умовах ПГТТ становив (0,97±0,016) і (1,02±0,10) нг/мл (р>0,05) відповідно, контроль – (1,06±0,30) нг/мл; показник ІЧІ коливався в межах контролю (р>0,05). У 2 групі рівень С-пептиду натще був у межах контролю (р>0,05), після ПГТТ – виявився підвищеним у 2,0 рази (р<0,05); показник ІЧІ був нижчим у 1,5 рази (р<0,05) від контролю. У 3 групі рівень С-пептиду був підвищеним як натще і після ПГТТ у 1,5 та 2,8 рази (р<0,05) відповідно; показник ІЧІ складав у 3,4 рази нижче (р<0,05) порівняно з контролем. Показник HOMA-IR виявився підвищеним у 1,5; 2,6 та 6,7 рази (р<0,05) в 1; 2 і 3 групах відповідно, порівняно з контролем. Показник НОМА-β у 1 і 2 групах знаходився в межах контролю (р>0,05), у 3 групі – підвищений у 2,0 рази (р<0,05). Отже, передумовами розвитку ІР є натщесерцева і постпрандіальна гіперглікемія та ГІ. Визначення рівнів ЕІ, С-пептиду в умовах ПГТТ, розрахунок індексу HOMA-IR, ІЧІ є високоінформативними показниками для визначення наявності та оцінки ступеня ІР.
РЕАЛІЗАЦІЯ МІЖПРЕДМЕТНИХ ЗВ’ЯЗКІВ ПРИ ВИВЧЕННІ ПРИРОДНИЧО-НАУКОВИХ ДИСЦИПЛІН ЗАКЛАДІВ ВИЩОЇ МЕДИЧНОЇ ОСВІТИ
Authors: Абуватфа С. І. Х.
Published: January 2020

Резюме. У статті порушено проблему реалізації міжпредметних зв’язків у процесі навчання природничо-наукових дисциплін у закладах вищої медичної освіти. Автором проаналізовано різні підходи науковців до визначення поняття «міжпредметні зв’язки» та їх реалізації у навчальних процесах різних закладів освіти. Основну увагу в роботі закцентовано на проблемі реалізації міжпредметних зв’язків у закладах вищої медичної освіти на сучасному етапі реформування медичної освіти. Стаття присвячена детальному аналізу реалізації міжпредметних зв’язків при вивченні природничо-наукових дисциплін на прикладі навчального предмету «Анатомія людини». Значну увагу приділено об’єктивним та суб’єктивним причинам важливості використання міжпредметних зв’язків під час практичних та лекційних занять: розбіжність у часі вивчення спорідненого матеріалу на заняттях з різних навчальних дисциплін; різне тлумачення одних і тих самих понять у різних навчальних предметах теоретичних та клінічних дисциплін тощо. Наведено варіанти використання міжпредметних зв’язків за допомогою інформаційно-комунікаційних технологій: виконання віртуальних лабораторних робіт, проведення демонстрацій, застосування комп’ютерних симуляцій, віртуальних тренажерів, презентацій, відеофрагментів, медичних додатків, наукових електронних ресурсів тощо. На прикладі природничо-наукової дисципліни «Анатомія людини» розкрито поняття «дидактичний синтез», що здійснюється як на рівні змісту навчального матеріалу, так і на рівні методів, принципів, форм діяльності (наприклад, інтегровані лекції, практикуми, семінари). Розкрито особливості використання на різних етапах занять міжпредметних фрагментів, що сприяє синтезу знань і умінь з теоретичних та клінічних дисциплін; здатності інтегрувати базові знання задля створення фундаменту професійних компетентностей.
ПРОБЛЕМИ ВИКЛАДАННЯ НАВЧАЛЬНОЇ ДИСЦИПЛІНИ "КЛІНІЧНА ЛАБОРАТОРНА ДІАГНОСТИКА" СТУДЕНТАМ ФАКУЛЬТЕТУ ПІДГОТОВКИ ІНОЗЕМНИХ ГРОМАДЯН
Authors: Данилюк О. І.
Published: January 2020

Резюме. Залучення на навчання іноземних громадян є запорукою розвитку вищих навчальних закладів України. На світовому ринку вищої освіти для України наразі склалася вдала ситуація щодо співвідношення вартості та якості освіти, що є провідним критерієм у виборі місця навчання. Інтернаціоналізація сучасної вищої освіти зумовлює проблему адаптації іноземних студентів до нового мовного, соціального та навчального середовища. Створення умов для отримання якісної освіти іноземцями в Україні безперечно сприятиме покращенню іміджу нашої країни, Проте слід зазначити, що організація їх успішного навчання потребує більшої уваги. У статті розглянуто особливості надання освітніх послуг у вищих навчальних закладах України для студентів-іноземців. Проаналізовано особливості національної освіти та спектр студентів-іноземців залежно від національності. Доведено важливість дисципліни "Клінічна лабораторна діагностика" у виборі майбутньої спеціальності студентами у вищих навчальних медичних закладах. Наведено особливості проведення і оцінювання дисципліни "Клінічна лабораторна діагностика" на кафедрі клінічної фармакології і фармакотерапії Івано-Франківського національного медичного університету для студентів за фаховим напрямком «Фармація, промислова фармація». Визначено засоби проведення практичних занять та самостійної роботи студентів із дисципліни, наведено тематику лекційного матеріалу. Комплексне застосування новітніх інформаційних та педагогічних технологій дозволяє суттєво підвищити рівень підготовки фахівців із числа іноземних громадян. Нормативні дисципліни у студентів-іноземців формують освітньо-кваліфікаційний досвід та раціонально націлюють на вибір майбутньої спеціальності.
СУЧАСНІ АСПЕКТИ ВИВЧЕННЯ ТЕМИ “ОСНОВИ ФІЗИЧНОЇ РЕАБІЛІТАЦІЇ” НА МЕДИЧНИХ ФАКУЛЬТЕТАХ ЗАКЛАДІВ ВИЩОЇ ОСВІТИ
Authors: Рудий Ю. Й. , Чурпій І. К. , Марчук О. В. , Руда І. В. , Атаманчук Л. Є.
Published: January 2020

Резюме. У статті викладені методичні особливості та теоретичні аспекти вивчення теми “Основи фізичної реабілітації” серед студентів-медиків.

Для більш чіткого розуміння та вивчення основних аспектів цієї теми запропоновано розглянути узагальнені дані сучасних україномовних підручників та посібників, якими студенти найчастіше користуються при підготовці до практичних занять. Також доцільно розглянути деякі аспекти вивчення цієї теми при самостійній підготовці студентів до практичних занять, зокрема й питання визначення та застосування рухових режимів в різні періоди фізичної реабілітації.

Багаторічний досвід застосування фізичних вправ показав їхню значимість в охороні здоров’я. Ефективність впливу фізичних вправ знаходиться в прямій залежності від обсягу та своєчасності їх призначення та визначається руховими режимами.

Режими рухової активності хворих розроблені для умов стаціонарного, санаторного та амбулаторно-поліклінічного етапів реабілітації. Кожен з них чітко визначає об’єм і інтенсивність фізичного навантаження, яке повинен отримати хворий при кожному з них. Це дає можливість розробити алгоритм рухової активності людини в конкретний період захворювання, поставити завдання, визначити засоби для їх вирішення і обґрунтувати особливості методики ЛФК.

Представлені в статті матеріали значно розширять теоретичні уявлення та допоможуть студентам краще засвоїти цю тему. Сучасний підхід до питань визначення та застосування рухових режимів в різні періоди фізичної реабілітації забезпечує більш якісний рівень підготовки студентів до науково обґрунтованого проведення занять лікувальної фізкультури, праце- та механотерапії хворим на різних етапах реабілітації  та відновного лікування.
ПАТОГЕНЕТИЧНІ АСПЕКТИ НЕЙРОПРОТЕКТОРНОЇ ТЕРАПІЇ ПРИ ТРАВМАТИЧНІЙ ОПТИЧНІЙ НЕВРОПАТІЇ
Authors: Мойсеєнко Н. М.
Published: January 2020

Резюме. Вивчали патогенетичні механізми розвитку ультраструктурних змін сітківки під дією лікування при травматичній оптичній невропатії, яку моделювали у 90 кролів, яких лікували за допомогою базового лікування Метилпреднізолоном дозі 30 мг/кг та комбінованого з фосфен-електричної стимуляції із силою струму 800 мА на боці ураження і 300 мА на протилежному боці.

За результатами експериментального дослідження можна стверджувати, що, структурні зміни в сітківці відбуваються в два етапи: дистрофічно-деструктивний на 14-у добу та деструктивно-атрофічний - на 30-у. Роздроблення зорового нерва приводить до зменшення амплітуди зіничного циклу (АЗЦ) до нуля. Виникає брадикардія на 35% на 14-тий і на 28% - на 30-тий день експерименту. Збільшується продукція сльози на 14-тий на 36% і 30-тий на 25% на стороні ураження та на 37 і 73% на протилежній стороні, відповідно. Також через місяць після пошкодження зорового нерва визначено зниження ВОТ на стороні ураження на 24%.

Застосування базового лікування сприяє на 14-ту добу зменшенню набряку сітківки. У ґангліонарному шарі більшість нейронів знаходиться в стані вакуольної дистрофії та апоптозу, при цьому компенсаторно-атрофічні зміни нейронів поєднуються з аксональною деґенерацію. Через 1 місяць лікування простежується часткове відновлення морфологічних параметрів правої сітківки. У ґангліонарних нейронах відмічались компенсаторно-атрофічні зміни, а в окремих нервових волокнах простежувались явища аксональної деґенерації. При використанні комбінованого лікування, гісто-ультраструктура сітківки та її морфометричні параметри наближаються до інтактної групи тварин. Спостерігається нормалізація частоти серцебиття, сльозопродукції та гідродинаміки, що є ознакою відновлення автономної регуляції. Збільшується амплітуда зіничного циклу до 1,5 мм.
Identificação automática de unidades de informação em testes de reconto de narrativas usando métodos de similaridade semântica
Authors: Borges dos Santos Leandro Dos , Aluísio Sandra Maria
Published: January 2020

Os diagnósticos da Doença de Alzheimer (DA) e do Comprometimento Cognitivo Leve (CCL) baseiam-se na análise das funções cognitivas do paciente pela administração de baterias de avaliação cognitiva e neuropsicológica. O emprego do reconto de narrativas é comum para auxiliar a identificação e quantificação do grau de demência: é atribuído um ponto para cada unidade recordada, e o escore final representa a quantidade de unidades recordadas. Avaliamos duas tarefas da área clínica: a identificação automática de quais elementos de uma narrativa recontada foram recordados; e a classificação binária da narrativa produzida por um paciente, tendo as unidades identificadas como atributos, visando uma triagem automática dos pacientes com comprometimentos cognitivos. Utilizamos dois conjuntos de dados de reconto transcritos que possuem as sentenças divididas e anotadas manualmente com as unidades de informação e os disponibilizamos publicamente. São eles: a Bateria Arizona para Desordens de Comunicação e Demência (ABCD) com narrativas de pacientes com CCL e Controles Saudáveis e a Bateria de Avaliação da Linguagem no Envelhecimento (BALE), com narrativas de pacientes com DA e CCLs, e Controles Saudáveis. Avaliamos dois métodos baseados em similaridade semântica, chamados de STS e Chunking, e transformamos o problema multirrótulo de identificação de elementos de uma narrativa recontada em problemas de classificação binária, encontrando um ponto de corte para o valor de similaridade de cada unidade de informação. Dessa forma, conseguimos superar dois baselines para os dois conjuntos de dados na métrica SubsetAccuracy, que é a mais punitiva para o cenário multirrótulo. Na classificação binária nem todos os seis métodos de aprendizado de máquina avaliados tiveram melhor desempenho do que os baselines de identificação de unidades de informação. Para a ABCD, os melhores métodos foram Árvores de Decisão e KNN, e para a BALE, o SVM com kernel RBF.