bluuebunny/crossref_metadata_2025 huggingface dataset:
Comparative genomic analysis of T-box regulatory systems in bacteria
Authors: Vitreschak Alexey G. , Mironov Andrei A. , Lyubetsky Vassily A. , Gelfand Mikhail S.
Published: March 2008

T-box antitermination is one of the main mechanisms of regulation of genes involved in amino acid metabolism in Gram-positive bacteria. T-box regulatory sites consist of conserved sequence and RNA secondary structure elements. Using a set of known T-box sites, we constructed the common pattern and used it to scan available bacterial genomes. New T-boxes were found in various Gram-positive bacteria, some Gram-negative bacteria (δ-proteobacteria), and some other bacterial groups (Deinococcales/Thermales, Chloroflexi, Dictyoglomi). The majority of T-box-regulated genes encode aminoacyl-tRNA synthetases. Two other groups of T-box-regulated genes are amino acid biosynthetic genes and transporters, as well as genes with unknown function. Analysis of candidate T-box sites resulted in new functional annotations. We assigned the amino acid specificity to a large number of candidate amino acid transporters and a possible function to amino acid biosynthesis genes. We then studied the evolution of the T-boxes. Analysis of the constructed phylogenetic trees demonstrated that in addition to the normal evolution consistent with the evolution of regulated genes, T-boxes may be duplicated, transferred to other genes, and change specificity. We observed several cases of recent T-box regulon expansion following the loss of a previously existing regulatory system, in particular, arginine regulon in Clostridium difficile and methionine regulon in Lactobacillaceae. Finally, we described a new structural class of T-boxes containing duplicated terminator–antiterminator elements and unusual reduced T-boxes regulating initiation of translation in the Actinobacteria.
Observed versus predicted structure of fluorescent self-quenching reporter molecules (SQRM): Caveats with respect to the use of “stem–loop” oligonucleotides as probes for mRNA folding
Authors: Pattanayak Vikram , Gifford Lida K. , Lu Ponzy , Gewirtz Alan M.
Published: March 2008

We developed self-quenching reporter molecules (SQRMs), oligodeoxynucleotides with fluorophore and quencher moieties at the 5′ and 3′ ends respectively, to probe mRNAs for single-stranded, hybridization accessible sequences. SQRMs and their homologous antecedents, Molecular Beacons (MB), are designed with the assumption that they adopt a stem–loop structure thought critical for regulating their reporter function. Recently, we observed that stem–loop structures are not required for SQRM function, and on this basis proposed that these reporter molecules be classified according to whether they were stemmed (Type I) or not (Type II). This finding further stimulated us to investigate whether Type I SQRMs, and by extension MBs, actually adopt a stem–loop configuration under physiologic conditions. Accordingly, we synthesized Type I and Type II SQRMs and studied the thermodynamic characteristics of each by fluorescence melting analysis. The results of these studies suggested that the majority of stem–loop Type I SQRMs are unstructured at 37°C, while some of the stemless Type II SQRMs are, surprisingly, structured. These results were not predicted by the mfold computer program. Type I and II SQRMs were then employed to “map” the mRNA secondary structure of a gene encoding a tyrosine kinase receptor, c-kit. Neither experimentally determined melting temperatures nor mfold-“predicted” thermodynamic parameters were useful in predicting the fluorescence signal-to-noise ratios obtained for SQRMs incubated with c-kit mRNA. We conclude that stem–loop reporter molecules are in fact unlikely to adopt their presumed structures at 37°C, and this design consideration may be dispensed when their use is contemplated under physiologic conditions.
Microarray-based analysis of stress-regulated microRNAs in Arabidopsis thaliana
Authors: Liu Han-Hua , Tian Xin , Li Yan-Jie , Wu Chang-Ai , Zheng Cheng-Chao
Published: March 2008

High-salinity, drought, and low temperature are three common environmental stress factors that seriously influence plant growth and development worldwide. Recently, microRNAs (miRNAs) have emerged as a class of gene expression regulators that have also been linked to stress responses. However, the relationship between miRNA expression and stress responses is just beginning to be explored. Here, we identified 14 stress-inducible miRNAs using microarray data in which the effects of three abiotic stresses were surveyed in Arabidopsis thaliana. Among them, 10 high-salinity-, four drought-, and 10 cold-regulated miRNAs were detected, respectively. miR168, miR171, and miR396 responded to all of the stresses. Expression profiling by RT-PCR analysis showed great cross-talk among the high-salinity, drought, and cold stress signaling pathways. The existence of stress-related elements in miRNA promoter regions provided further evidence supporting our results. These findings extend the current view about miRNA as ubiquitous regulators under stress conditions.
An important role of G638 in the cis-cleavage reaction of the Neurospora VS ribozyme revealed by a novel nucleotide analog incorporation method
Authors: Jaikaran Dominic , Smith M. Duane , Mehdizadeh Reza , Olive Joan , Collins Richard A.
Published: March 2008

We describe a chemical coupling procedure that allows joining of two RNAs, one of which contains a site-specific base analog substitution, in the absence of divalent ions. This method allows incorporation of nucleotide analogs at specific positions even into large, cis-cleaving ribozymes. Using this method we have studied the effects of substitution of G638 in the cleavage site loop of the VS ribozyme with a variety of purine analogs having different functional groups and pKa values. Cleavage rate versus pH profiles combined with kinetic solvent isotope experiments indicate an important role for G638 in proton transfer during the rate-limiting step of the cis-cleavage reaction.
Process Virtualization Theory and the Impact of Information Technology
Authors: Overby Eric
Published: March 2008

In our increasingly virtual society, more and more processes that have traditionally been conducted via physical mechanisms are being conducted virtually. This phenomenon of “process virtualization” is happening in many contexts, including formal education (via distance learning), shopping (via electronic commerce), and friendship development (via social networking sites and virtual worlds). However, some processes are more amenable to virtualization than others. For example, distance learning seems to work better for some educational processes than others, and electronic commerce has worked well for some shopping processes but not for others. These observations motivate the central question posed in this paper: What factors affect the “virtualizability” of a process? This question is becoming increasingly important as advances in information technology create the potential for society to virtualize more and more processes. To provide a general theoretical basis for investigating this question, this paper proposes “process virtualization theory,” which includes four main constructs (sensory requirements, relationship requirements, synchronism requirements, and identification and control requirements) that affect whether a process is amenable or resistant to being conducted virtually. Recognizing that processes can be virtualized with or without the use of information technology, this paper makes explicit the theoretical significance of information technology in process virtualization by discussing the moderating effects of representation, reach, and monitoring capability. This helps explain how advances in information technology are enabling a new generation of virtual processes.
Too Risky to Hold? The Effect of Downside Risk, Accumulated Equity Wealth, and Firm Performance on CEO Equity Reduction
Authors: Matta Elie , McGuire Jean
Published: March 2008

Although the alignment effect of equity ownership is often studied with emphasis on changes in firm strategy, the exposure of CEOs' firm-specific wealth to firm risk is more easily controlled by changing their level of equity holdings than by changing firm strategic risk. We rely on prospect theory and the behavioral theory of the firm to examine the antecedents of CEO equity reduction and investigate whether it serves to decouple CEO wealth from firm risk. Given its central role in loss avoidance, we underline the effect of the firm's downside risk and distinguish the total loss potential on equity holdings from the loss potential due to firm-specific factors. Allowing for own-performance referents, we also consider firm performance and the value of a CEO's equity holdings in the analysis. Based on a sample of 208 U.S. CEOs for the years 1997–1999, we find empirical support for the role of downside risk and firm performance in CEO equity reductions. Implications on incentive alignment through equity ownership are presented.
Exon-Level Expression Profiling: A Comprehensive Transcriptome Analysis of Oral Fluids
Authors: Hu Zhanzhi , Zimmermann Bernhard G , Zhou Hui , Wang Jianghua , Henson Bradley S , Yu Weixia , Elashoff David , Krupp Guido , Wong David T
Published: March 2008

Background: The application of global gene expression profiling to saliva samples is hampered by the presence of partially fragmented and degraded RNAs that are difficult to amplify and detect with the prevailing technologies. Moreover, the often limited volume of saliva samples is a challenge to quantitative PCR (qPCR) validation of multiple candidates. The aim of this study was to provide proof-of-concept data on the combination of a universal mRNA-amplification method with exon arrays for candidate selection and a multiplex preamplification method for easy validation.

Methods: We used a universal mRNA–specific linear-amplification strategy in combination with Affymetrix Exon Arrays to amplify salivary RNA from 18 healthy individuals on the nanogram scale. Multiple selected candidates were preamplified in one multiplex reverse transcription PCR reaction, cleaned up enzymatically, and validated by qPCR.

Results: We defined a salivary exon core transcriptome (SECT) containing 851 transcripts of genes that have highly similar expression profiles in healthy individuals. A subset of the SECT transcripts was verified by qPCR analysis. Informatics analysis of the SECT revealed several functional clusters and sequence motifs. Sex-specific salivary exon biomarkers were identified and validated in tests with samples from healthy individuals.

Conclusions: It is feasible to use samples containing fragmented RNAs to conduct high-resolution expression profiling with coverage of the entire transcriptome and to validate multiple targets from limited amounts of sample.
Genetic Variants of Tumor Necrosis Factor Superfamily, Member 4 (TNFSF4), and Risk of Incident Atherothrombosis and Venous Thromboembolism
Authors: Mälarstig Anders , Eriksson Per , Rose Lynda , Diehl Kirsti A , Hamsten Anders , Ridker Paul M , Zee Robert Y L
Published: March 2008

Background: Recent data have implicated tumor necrosis factor (ligand) superfamily, member 4 (TNFSF4) gene variation in myocardial infarction in women; however, no prospective data are available on either incident arterial or venous disorders.

Methods: We evaluated 2 previously characterized TNFSF4 gene variants (−921C>T and dbSNP rs3850641) with a) incident arterial events using a prospective case-cohort design with 344 incident CVD cases and 2254 control participants, all white, drawn from the Women’s Health Study cohort with 10 years of follow-up, and b) venous thromboembolism (VTE) risk using a nested, matched case-control design of 108 white male pairs (drawn from the Physicians’ Health Study cohort) and a case-cohort design of white female participants consisting of 125 cases and 2269 controls (drawn from the Women’s Health Study cohort), analyzed separately.

Results: Genotype distributions were in Hardy-Weinberg equilibrium. Results from a marker-by-marker regression analysis, adjusting for traditional risk factors, showed a significant association of −921C>T with an increased risk of VTE in women (additive: odds ratio 1.86; 95% CI 1.17–2.92, P = 0.008) in women. Furthermore, using a haplotype-based regression analysis, haplotype C-G was associated with a reduced risk of VTE relative to the referent haplotype, C-A (odds ratio 0.50; 95% CI 0.27–0.92; P = 0.02). In contrast, we found little evidence for an association of the variants/haplotypes with risk of VTE in men or CVD risk in women (as previously reported).

Conclusions: Our present findings, if corroborated in other prospective investigations, suggest that the TNFSF4 variants tested may be useful indicators for assessing the risk of venous thromboembolism.
Screening Autoantibody Profiles in Systemic Rheumatic Disease with a Diagnostic Protein Microarray That Uses a Filtration-Assisted Nanodot Array Luminometric Immunoassay (NALIA)
Authors: McBride Jeffrey D , Gabriel Francis Guy , Fordham John , Kolind Torsten , Barcenas-Morales Gabriela , Isenberg David A , Swana Marlene , Delves Peter J , Lund Torben , Cree Ian A , Roitt Ivan M
Published: March 2008

Background: We developed a cost-efficient modular system for multiplex analysis of the multiple autoantibodies that characterize systemic rheumatoid diseases.

Methods: The nanodot array luminometric immunoassay (NALIA) system consists of conventional 96-well membrane-bottomed plates in which antigens or antibodies are adsorbed onto the underside of the membrane. Current arrays use a 5 × 5 format (25 dots/well), which allows 10 analytes to be measured in duplicate: double-stranded DNA (dsDNA), centromere protein B (CENP-B), PCNA, Sm, Sm ribonucleoprotein (Sm-RNP), U1-snRNP, Scl70, SSA/Ro, SSB/La, Jo-1, and controls. The test fluid, control sera, and subsequent reagents are drawn through the membrane. The captured analytes are quantified by monitoring chemiluminescence with a charge-coupled device (CCD) and analyzed with commercial array software.

Results: The assay can detect <20 × 103 IU/L of anti-dsDNA. The interwell CV was 10%–14%. There was an 83% concordance (κ = 0.56) between the NALIA results obtained for anti-dsDNA assayed by β-testing in a routine immunology diagnostic laboratory and the results obtained with a conventional ELISA reagent set. The concordance values for Ro, La, Sm, and RNP were 98% (κ, 0.92), 93% (κ, 0.41), 97% (κ, 0.62), and 97% (κ, 0.73), respectively.

Conclusion: The NALIA approach promises to provide a highly economical platform for a wide range of applications that require assays of multiple analytes. The degree of concordance of our results with a conventional reagent set was no less than that occurring between different commercial products. A sample of serum from a finger stick provides a volume sufficient to perform the array assay.
Association of Serum Interleukin-6 Concentration with a Functional IL6 −6331T>C Polymorphism
Authors: Smith Andrew J P , D’Aiuto Francesco , Palmen Jutta , Cooper Jackie A , Samuel Jane , Thompson Simon , Sanders Julie , Donos Nikos , Nibali Luigi , Brull David , Woo Pat , Humphries Steve E
Published: March 2008

Background: Interleukin-6 (IL-6) concentrations vary substantially among individuals. This study aimed to identify novel genetic markers to explain these differences.

Methods: We sequenced a region 6-kb upstream of the IL6 [interleukin 6 (interferon, beta 2)] transcription start site in a search for functional variants and detected 3 common variants: −6331T>C, −6101A>T, and −5617/−5616C/A>T/G. IL6 −6331T>C (C allele frequency, 0.20; 95% confidence interval, 0.16–0.24) showed strong negative linkage disequilibrium with −174G>C (D′ = −0.97) and was studied further in 309 individuals who underwent coronary artery bypass grafting.

Results: Patients with the TT genotype had higher IL-6 concentrations 6 h after surgery than those with the CC genotype (mean, 199.4 ng/L vs 114.9 ng/L; P = 0.02). A similar association was seen in a cohort of 173 patients who underwent intensive periodontal therapy: Individuals with the CC genotype had significantly lower IL-6 concentrations 24 h after therapy than TT patients (mean, 0.78 ng/L vs 5.00 ng/L; P < 0.0001). A similar trend was observed in 203 healthy individuals from northern Europe (1.29 ng/L for the TT genotype vs 0.89 ng/L for the CC genotype; P = 0.07). Reporter assays that used a sequence flanking the −6331 single-nucleotide polymorphism spliced upstream to the IL-6 minimal promoter driving luciferase gene expression demonstrated a 1.3-fold increase in promoter activity (P < 0.01) for constructs containing −6331T. Electrophoretic mobility shift assays revealed enhanced binding of transcription factor Oct-1 to the T allele.

Conclusions: IL6 −6331T is associated with increased IL-6 concentrations in an acute inflammatory state via a mechanism involving binding of the Oct-1 transcription factor. This finding may help resolve conflicting studies based on the IL6 −174G>C variant.
“Die Ochsen am Berge”: Franz Xaver Süssmayr and the Orchestration of Mozart's Requiem, K. 626
Authors: Keefe Simon P.
Published: March 2008

Franz Xaver Süssmayr's letter to the publisher Härtel (1800) about his involvement in completing Mozart's Requiem implicitly and explicitly asks its recipient to take his contribution seriously. Positive appraisals of the entire Requiem in the early decades of the nineteenth century, read alongside this letter, invite reevaluation of Süssmayr's orchestration of the work. Early writings on Mozart's orchestration clarify that Süssmayr's countless musical decisions, large and small, would have carried genuine aesthetic resonance. Süssmayr's view that the winds should function primarily as support for the voices derives from Mozart's orchestration of the Introit, and manifests itself especially in voice doublings and frequent segues between vocal statements. The origin of his shaping of orchestration toward climactic points in the Lacrymosa, Sanctus, and Benedictus, however, is less clearly attributable to Mozart. Süssmayr's entitlement to a vision of his own for the completion of the work, one that may not follow Mozart's intentions in every respect, encourages us to consider putative “transgressions” evidence of active engagement with the work itself, rather than of musical misjudgment. Examining the Sanctus and Benedictus (for which no materials in Mozart's hand are extant) as well as the Sequence, reveals the consistency and coherence of Süssmayr's vision across the Requiem as a whole.
Caracterização e biodigestão anaeróbia dos dejetos de caprinos
Authors: Orrico Ana C. A. , Lucas Júnior Jorge de , Orrico Júnior Marco A. P.
Published: March 2008

Quantificar e caracterizar os dejetos gerados por cabras Saanen em quatro categorias de idade e alimentadas com três dietas e na seqüência, e promover a biodigestão anaeróbia dos dejetos constituíram os objetivos deste trabalho. Para a produção de dejetos, foram utilizadas 36 cabras Saanen, com idades entre 2 e 4 (C1), 4 e 8 (C2), 8 e 12 (C3) e acima de 12 meses (C4), alimentadas com as dietas 1 (D1: 80% volumoso (Vol) e 20% concentrado (Con)); 2 (D2: 60% Vol e 40% Con) e 3 (D3: 40% Vol e 20% Con). Foram quantificadas as produções diárias de fezes e urina e seus teores em N, P, K, Ca, Mg, Na, Fe, Cu, Zn e Mn. Com a mistura das fezes e urina de todas as categorias, separadas segundo as dietas, foram abastecidos biodigestores batelada, com capacidade para 4 L de substrato em fermentação. A C1 apresentou menor (P<0,05) excreção de fezes (164,1 g de MS (massa seca)/animal por dia) e o menor consumo de alimento (362,2g MS (massa seca)/animal por dia). As maiores concentrações de N, P, K, Ca, Mg e K ocorreram nas fezes e urina geradas por cabras da C4 e alimentadas pela D3. O substrato preparado com dejetos oriundos da D3 apresentou 45% de redução nos teores de sólidos voláteis (SV). Os substratos preparados com dejetos obtidos de animais alimentados com a D3 produziram mais biogás (P<0,01) por kg de sólidos totais e SV adicionados.
Identificação e diferenciação de herpesvírus bovino tipos 1 e 5 isolados de amostras clínicas no Centro-Sul do Brasil, Argentina e Uruguai (1987-2006)
Authors: Silva Mariana Sá e , Brum Mário Celso S. , Weiblen Rudi , Flores Eduardo F.
Published: March 2008

Os herpesvírus bovino tipos 1 e 5 (BoHV-1; BoHV-5) são genética e antigenicamente muito semelhantes e por isso são indistinguíveis pela maioria dos testes diagnósticos. Como o BoHV-1 tem sido classicamente associado com doença respiratória e genital, os herpesvírus isolados dessas enfermidades têm sido provisoriamente - e às vezes definitivamente - identificados como BoHV-1. Da mesma forma, os casos de infecção neurológica por herpesvírus em bovinos têm sido atribuídos em sua totalidade ao BoHV-5. Este trabalho relata a identificação de 40 amostras de herpesvírus isoladas de diferentes casos clínicos na região Centro-Sul do Brasil, Argentina e Uruguai entre 1987 e 2006, pelo uso de um PCR capaz de diferenciar esses vírus. As amostras identificadas como BoHV-1 (n=16) foram isoladas de doença respiratória (n=3), balanopostite e/ou vulvovaginite (n=3), do sêmen de touros saudáveis (n=5) e de casos doença neurológica (n=5). As amostras virais identificadas como BoHV-5 (n=24) foram em sua maioria isoladas de doença neurológica (n=21), mas também do sêmen de touros saudáveis (n=2) e do baço de um bezerro com doença sistêmica (n=1). Esses resultados demonstram que tanto o BoHV-1 como o BoHV-5 não estão estritamente associados às suas respectivas síndromes clínicas e que podem estar freqüentemente envolvidos em casos clínicos classicamente atribuídos ao outro vírus. Esses achados também reforçam a necessidade de se identificar corretamente os isolados de herpesvírus para um melhor conhecimento da sua patogenia e epidemiologia.
Mecanoreceptores da mucosa palatina de avestruz (Struthio camelus): estudo ao microscópio de luz
Authors: Guimarães Juliana P. , Mari Renata B. , Miglino Maria Angélica , Hernandez-Blasquez Francisco J. , Watanabe Ii-sei
Published: March 2008

Foram estudados corpúsculos de Herbst da mucosa palatina de avestruz em nível de microscopia de luz. Os corpúsculos compõem-se de uma cápsula externa, cápsula interna e axônio central. A cápsula externa apresentou numerosas lamelas, enquanto que a cápsula interna mostrou estrutura de folhas compactas. Os corpúsculos apresentaram formato ovalado ou circular e circundado por espessos feixes de fibras colágenas. Cada lamela estava composta de uma densa rede de fibras espessas. Os axônios terminais estavam situados ao longo do eixo, terminando em um bulbo terminal. As fibras da cápsula externa, coradas por Picrosirius e examinadas no microscópio óptico sob luz polarizada, revelou a presença de fibras colágenas do tipo I em verde e na região periférica observou-se grande quantidade de fibras colágenas do tipo III. Os corpúsculos apresentaram-se envoltos por células planas e envoltos por fibras colágenas.
Estimativa das perdas de produtividade de grãos em cultivares de arroz (Oryza sativa) pela interferência do capim-arroz (Echinochloa spp.)
Authors: Galon L. , Agostinetto D. , Moraes P.V.D. , Tironi S.P. , Dal Magro T.
Published: March 2008

Objetivou-se com este trabalho avaliar o grau de interferência do capim-arroz em cultivares de arroz irrigado e comparar variáveis explicativas, visando identificar aquela que propicia melhor ajuste dos dados a modelo matemático. Para isso, foi conduzido experimento a campo no ano agrícola 2005/06, com cultivo de arroz em sistema convencional. Os tratamentos foram constituídos por seis cultivares de arroz com diferentes durações do ciclo de desenvolvimento e por dez populações de capim-arroz. As variáveis respostas foram avaliadas aos 28 dias após a emergência do arroz. O modelo da hipérbole retangular foi utilizado para descrever a relação entre perda de produtividade de grãos de arroz e variáveis explicativas população de plantas, massa da matéria seca da pare aérea, cobertura do solo e área foliar. As perdas de produtividade de grãos de arroz devidas à interferência do capim-arroz podem ser estimadas satisfatoriamente pelo modelo da hipérbole retangular. Os cultivares de arroz IRGA 421, 416 ou 417 foram os mais competitivos, obtendo-se adequado ajuste dos dados ao modelo testado para todas as variáveis avaliadas. A variável população de plantas de capim-arroz apresenta melhor ajuste ao modelo do que massa da matéria seca da parte aérea, cobertura do solo ou área foliar.
Níveis de dano econômico para decisão de controle de capim-arroz (Echinochloa spp.) em arroz irrigado (Oryza sativa)
Authors: Galon L. , Agostinetto D. , Moraes P.V.D. , Dal Magro T. , Panozzo L.E. , Brandolt R.R. , Santos L.S.
Published: March 2008

O nível de dano econômico (NDE) para monitoramento das infestações de capim-arroz em lavouras de arroz irrigado permite adotar medidas de manejo na cultura e usar herbicidas de maneira racional. Objetivou-se com o trabalho determinar NDE para capim-arroz, presente em lavouras de arroz irrigado, calculado na base de um único ano, em função de populações de capim-arroz, de cultivares de arroz e de épocas de entrada de água na lavoura. Para isso, foram conduzidos dois experimentos em delineamento experimental completamente casualizado, sem repetição. No primeiro experimento, os tratamentos foram constituídos de seis cultivares de arroz: BRS-Atalanta e IRGA 421 (ciclo muito curto), IRGA 416, IRGA 417 e Avaxi (ciclo curto) e BRS-Fronteira (ciclo médio); e dez populações de capim-arroz. No segundo experimento usaram-se como tratamentos épocas de início da irrigação: 1, 10 e 20 dias após aplicação dos tratamentos herbicidas (DAT); e populações de capim-arroz. Os NDEs estimados para o capim-arroz variaram em função das práticas de manejo adotadas na cultura do arroz irrigado. Os NDEs estimados para os cultivares de arroz IRGA 416 e 417 foram superiores aos dos demais cultivares quando em competição com capim-arroz. O atraso da entrada de água diminui os NDEs para o cultivar de arroz BRS-Pelota. Aumentos nas perdas de produtividade por unidade de planta daninha, no potencial de produtividade da cultura, no valor do produto colhido e na eficiência do herbicida e diminuição do custo de controle reduziram os NDEs, tornando econômica a adoção de práticas de manejo sob baixas populações de capim-arroz em competição com arroz irrigado.
Investimento público no Brasil: propostas para desatar o nó
Authors: Biasoto Jr Geraldo , Afonso José Roberto R.
Published: March 2008

Um desafio imposto aos formuladores de políticas é a proposição de formas de investimento em infra-estrutura, pela ação do Estado, sem que os ganhos derivados da responsabilidade fiscal sejam postos em risco. Este artigo procura desenhar um novo formato de bloco de investimentos, caracterizado pela formação de uma empresa controlada pelo Estado, mas de gestão privada e financiada pelo mercado.
Sala de emergência em pediatria: casuística de um hospital universitário
Authors: Riccetto Adriana Gut L. , Zambon Mariana Porto , Marmo Denise Barbieri , Brandão Marcelo Barciela , Queiroz Rachel Alvarenga de , Reis Marcelo Conrado dos , Fraga Andréa de Melo A. , Belluomini Fernando
Published: March 2008

OBJETIVO: Descrever a casuística de pacientes pediátricos atendidos em sala de emergência pediátrica de um hospital universitário. MÉTODOS: Estudo retrospectivo descritivo de 1º de janeiro até 31 de dezembro de 2004, com crianças de zero a 14 anos, avaliadas quanto a dados epidemiológicos, hipótese diagnóstica, intubação orotraqueal, óbito, destino e duração da internação. Os pacientes foram divididos em quatro grupos: Não Óbitos; Óbitos <24 horas, Óbitos >24 horas e transferidos para outros hospitais. RESULTADOS: Foram atendidas 203 crianças; 59,1% meninos; média de idade 3,4 anos; 65% previamente hígidos. O diagnóstico mais freqüente foi insuficiência respiratória (31,1%). Dentre os 22 óbitos, 3,5% ocorreram nas primeiras 24 horas e 7,4% após estas primeiras 24 horas; 172 crianças (84,7%) evoluíram para alta após período médio de internação de 19,2 dias. Nove (4,4%) foram transferidas para outros hospitais. Das 203 crianças atendidas, 50 (24,6%) foram intubadas à admissão e 86 (42,4%) necessitaram internação em unidade de terapia intensiva pediátrica. CONCLUSÕES: Os pacientes que evoluíram para óbito precoce eram mais jovens e com diagnóstico de choque. Nos pacientes que evoluíram para óbito após 24 horas do atendimento inicial, predominaram meninas, com doenças prévias e insuficiência respiratória. Aqueles que sobreviveram ao atendimento de emergência eram, em maior freqüência, meninos mais velhos e com doenças respiratórias. Houve necessidade significativa de procedimento invasivo (intubação orotraqueal) e internação subseqüente em unidade de terapia intensiva, o que reforça a necessidade de equipamentos adequados e profissionais especializados no setor.
Construindo a segurança alimentar? A experiência recente dos CONSADs no Brasil meridional
Authors: Anjos Flávio Sacco dos , Caldas Nádia Valleda
Published: March 2008

O trabalho analisa a experiência recente dos Consórcios de Desenvolvimento Local e Segurança Alimentar (CONSADs) no Sul do Brasil a partir de estudo realizado pela Universidade Federal de Pelotas em conjunto com a FAO e Ministério do Desenvolvimento Social. A pesquisa examinou 137 projetos de desenvolvimento visando avaliar o grau de identidade com os objetivos de combate à fome e à insegurança alimentar. O estudo mostra que o CONSAD pode ser uma via capaz de induzir à proposição de instrumentos que atendam a esses imperativos. Entrementes, há importantes obstáculos a suplantar, entre os quais, o próprio desenho institucional e o recorte geográfico do CONSAD, assim como o "viés agrarista" dos projetos de desenvolvimento, o excessivo protagonismo dos poderes públicos e as incompreensões em torno ao conceito de segurança alimentar por parte dos atores sociais envolvidos.
Além do mecanicismo e do vitalismo: a "normatividade da vida" em Georges Canguilhem
Authors: Puttini Rodolfo Franco , Pereira Júnior Alfredo
Published: March 2008

Discutimos a epistemologia das ciências da vida e das ciências da saúde de Georges Canguilhem, revendo sua crítica à concepção mecanicista da normalidade e da patologia e seu posicionamento frente ao vitalismo. Sugerimos que, enfatizando o conceito de "normatividade da vida", Canguilhem teria apontado para uma superação da oposição entre mecanicismo e vitalismo. Para tal, fazemos uma breve comparação da "normatividade da vida" com o conceito contemporâneo de auto-organização de Michel Debrun, argumentando que a emergência da norma vital se situa num estágio secundário de um processo de (auto-)organização da vida e, portanto, tal normatividade não teria a conotação vitalista, erroneamente atribuída a Canguilhem.
Maximização da exploração da soja: xvi, efeito do corte e da adubação nitrogenada na produção de grãos oriundos da rebrota
Authors: Blank Arie Fitzgerald , Rezende Pedro Milanez de
Published: March 2008

Visando verificar o efeito da adubação nitrogenada, no plantio e em cobertura, na produção de grãos provenientes da rebrota da soja, foi instalado um experimento na Universidade Federal de Lavras (UFLA), em Lavras - MG. Esse experimento foi conduzido em Latossolo roxo distrófico de textura argilosa, utilizando-se o delineamento experimental de blocos ao acaso em esquema de parcelas subdivididas, com três repetições. O fator corte foi colocado nas parcelas e às subparcelas atribuiu-se o fatorial cultivares x sistemas de adubação nitrogenada. As cultivares Cristalina e IAC-8 apresentaram os maiores rendimentos de massa verde, matéria seca e feno. O corte das plantas reduziu o rendimento de grãos, o índice de acamamento e a altura de planta. A cultivar Cristalina demonstrou melhor desempenho da rebrota, alcançando, quando cortada, rendimentos de palha e proteína bruta total acima do tratamento sem corte, o mesmo se verificando para a cultivar IAC-8 em relação a proteína bruta total. A adubação nitrogenada de plantio e/ou cobertura não influenciou significativamente as características analisadas.
Desempenho e uniformidade da distribuição de água de um pivô central
Authors: Cainelli Vitor Hugo , Robaina Adroaldo Dias , Carlesso Reimar , Dotto Carlos Renan Denardin
Published: March 2008

O objetivo deste experimento foi avaliar as características de desempenho de um equipamento de irrigação pivô central, de baixa pressão, bem como determinar a uniformidade de distribuição de água, tanto abaixo como acima da superfície do solo. Para a avaliação do desempenho do sistema utilizaram-se os coeficientes de uniformidade de Christiansen (CUC) e de distribuição (CUD), calculados a partir de dados da precipitação dos aspersores. O pivô central foi ensaiado nas velocidades de 25%, 50%, 75% e 100% da velocidade máxima de deslocamento do equipamento. Utilizou-se quatro linhas de coletores, uniformemente espaçados. Os valores encontrados do CUC e o CUD foram superiores ao mínimo recomendado para a cultura do milho, confirmando o bom desempenho do pivô central. Em todas as profundidades do solo estudadas os coeficientes de uniformidade foram superiores aos obtidos acima do solo, ocorrendo um aumento nos valores dos coeficientes de uniformidade abaixo da superfície do solo com o tempo.
Valores sangüíneos de chumbo em bovinos nelore suplementados com sal mineral naturalmente contaminado por chumbo
Authors: Marçal Wilmar Sachetin , Campos Neto Otávio , Nascimento Marcos Roberto do
Published: March 2008

A pesquisa foi realizada em 8 propriedades rurais com regime de criação extensiva, situadas às margens da represa de Barra Bonita, no município de Anhembi, estado de São Paulo. Amostras de sal mineral, capim e sangue animal foram colhidas para análise laboratorial, para se investigar a presença de chumbo. Foram utilizados 160 bovinos, machos e fêmeas, da raça Nelore, divididos em dois grupos de 80 animais. A finalidade precípua foi realizar um estudo comparativo entre os dois grupos, sendo que no primeiro os animais recebiam sal mineral sabidamente contaminado com chumbo. O segundo grupo serviu como lote para efeito comparativo. O critério de comparação foi a análise sangüínea que revelou valores aquém do limite de tolerância biológico atribuído à espécie bovina, em ambos os grupos. Os resultados permitem a conclusão de que, aos níveis de chumbo detectados nas amostras mineralizadas, ainda não há risco de efeito cumulativo e tóxico para os bovinos avaliados.
Intraocular pressure evaluation of equines anesthetized with romifidine, tiletamine/zolazepam, halothane and vecuronium
Authors: Bechara Juliana Noda , Barros Paulo Sérgio de Moraes , Fantoni Denise Tabacchi , Cortopassi Silvia Renata Gaido , Silva Luis Claudio Lopes Correa da
Published: March 2008

The purpose of this study was to evaluate an anesthetic association with and without the use of a nondepolarizing muscle relaxant agent and its effect on intraocular pressure of horses, and also obtain an anesthetic technique free of adverse effects for ophthalmic surgeries in this specie. Sixteen horses were randomly divided in two groups of eight horses each. In group I, horses were pre-medicated with romifidine, anesthesia induced with tiletamine/zolazepam and maintained with halothane and vecuronium. Horses of group II received the same anesthetic association except for vecuronium. Intraocular pressure, arterial pressure and heart rate were evaluated in different moments during the experiment. The anesthetic association composed by romifidine, tiletamine/zolazepam and halothane with and without vecuronium did not promote statistically significant alterations in horses intraocular pressure and its use is practicable in ophthalmologic procedures.
Osteossíntese diafisiária de tíbia em cães mediante inserção intramedular de pinos de Steinmann pela crista tibial
Authors: El-Warrak Alexander de Oliveira , Schossler João Eduardo Wallau
Published: March 2008

As fraturas diafisárias de tíbia possuem alta prevalência na espécie canina. Este estudo visa avaliar o uso de pinos intramedulares de Steinmann na redução destas fraturas. Dez cães de idade, sexo e peso variados, portadores de fratura de tíbia foram submetidos à osteossíntese mediante inserção de dois pinos intramedulares de Steinmann pela crista tibial e em seguida, avaliados clinicamente e radiograficamente durante o período de cicatrização óssea. Diante dos resultados, demonstrou-se a versatilidade e eficiência do método.
Comparação entre o fio de náilon e o fio de aço na imobilização de fraturas patelares induzidas em cães
Authors: Del Carlo Ricardo Junqueira , Andrade Junior Arnaldo de , Galvão Simone Rezende
Published: March 2008

Foi realizado estudo comparativo entre o fio de náilon e o fio de aço, na imobilização das fraturas patelares induzidas em quatorze cadelas, sem raça definida, adultas, separadas em dois grupos iguais denominados grupos I e II. Em ambos os grupos a patela foi fraturada transversalmente e transfixada com broca por onde foi colocada a primeira sutura. Um segundo fio foi passado em forma de "x" sobre a patela, funcionando como banda de tensão. No grupo I foi utilizado fio de náilon para pesca número 0,60, e no grupo II o fio de aço ortopédico número 2. A melhora clínica dos animais, independentemente do tipo de fio utilizado, foi diretamente relacionada ao tempo pós-operatório. O fio de náilon, além de ser mais facilmente maneável, foi capaz de manter os fragmentos ósseos alinhados e aproximados. O fio de aço não foi capaz de realizar a função de banda de tensão, pois rompeu em todos os animais.
Estudo comparativo das reações teciduais produzidas pela "linha de pesca" (poliamida) e fio de náilon cirúrgico
Authors: Rahal Sheila Canevese , Rocha Noeme Sousa , Figueiredo Laura Alvarez de , Iamaguti Paulo
Published: March 2008

Foram empregados 30 ratos, machos, linhagem Wistar. Implantou-se sob a pele segmentos de 3cm de comprimento de "linha de pesca " mantida em formalina, "linha de pesca " autoclavada uma vez, "linha de pesca " autoclavada duas vezes e fio de náilon cirúrgico. Cada animal recebeu dois tipos de material de sutura, em locais paralelos e eqüidistantes da coluna vertebral. Foram sacrificados com cinco, 15 e 90 dias de pós-operatório para que se procedesse o exame histopatológico. Pelo grau de reação tecidual pode-se concluir que: a maior reação ocorreu com a "linha de pesca mantida em formalina e a menor com o fio de náilon cirúrgico; as "linhas de pesca " autoclavadas uma e duas vezes se comportaram de forma semelhante e apresentaram um reação intermediária.
Aspectos clínico e cirúrgicos do tumor mamário canino: clinical and surgical evolution
Authors: Daleck Carlos Roberto , Franceschini Paulo Henrique , Alessi Antonio Carlos , Santana Áureo Evangelista , Martins Maria Izabel Mello
Published: March 2008

As neoplasias mamárias em cadelas representam importante parcela das neoplasias em cães, merecendo atenção dos pesquisadores quanto ao diagnóstico, tratamento e prognóstico. No presente trabalho, 23 cadelas de várias raças ou cruzamentos, com idades entre 8 e 11 anos portadoras de neoplasia mamária foram estudadas. Doze eram multíparas, 6 primíparas e 5 nulíparas. Todas eram da região de Jaboticabal, SP, atendidas no Hospital Veterinário da FCAVJ-UNESP. Os animais foram avaliados clínica e radiolagicamente e submetidos à punção aspirativa da massa anormal de tecido, com agulha fina. Dessa mesma massa foi também retirado, cirurgicamente, um fragmento para exame histopatológico. A maior incidência foi de carcinoma (52,17%), seguidos por tumores mistos (17,39%). Os tratamentos cirúrgicos empregados nos 23 animais foram: mastectomia regional ou mastectomia em bloco, com remoção de linfonodos. Quinze cadelas foram tratadas com doxorubicina, na dose de 20mg/m² e ciclofosfamida, na dose de 100mg/m², aos 7, 9 e 11 dias após o ato cirúrgico. Todos os animais tiveram evolução favorável e, 12 meses após a cirurgia, 18 deles foram reavaliados, não constatando nenhuma recidiva ou surgimento de metástase.
Aglutininas anti-leptospíricas em cães na área de influência do centro de controle de zoonoses, Pelotas, RS, Brasil, no ano de 1995
Authors: Avila Marilda Oliveira , Furtado Loren Renata Iribarrem , Teixeira Maristela Mariano , Rosado Rosa Lia Ienckzack , Martins Luís Fernando da Silva , Brod Claudiomar Soares
Published: March 2008

Durante o ano de 1995, usando a técnica de soroaglutinação microscópica com antígenos vivos, para diagnóstico de leptospirose, foram examinadas 425 amostras sangüíneas provenientes de cães da área de influência do Centro de Controle de Zoonoses de Pelotas. Foram detectadas 148 (34,8%) amostras positivas, com título igual ou maior a 1:100, para os seguintes sorovares; L. canicola (58,1%), L. icterohaemorrhagiae (20,9%), L. copenhageni (11,4%), L. grippotyphosa e L. castellonis (2,7%), L andamana, L. autumnalis e L. pyrogenes (1,4%). Houve maior ocorrência da infecção nos meses de março, agosto, setembro, outubro e novembro, coincidindo com o registro de temperaturas mais elevadas e maiores precipitações pluviométricas, um mês antes de cada surto, caracterizando que estes dois fatores são importantes para a manutenção das leptospiras a nível ambiental.
Desempenho de perus de corte alimentados com níveis crescentes de aflatoxinas, com ou sem adição de adsorvente
Authors: Santurio Janio Morais , Reginatto Marcus , Kracker Cláudio , Surdi Glaucio , De Toni Jair , Kraker Jorge , Mallmann Carlos Augusto
Published: March 2008

Este trabalho foi realizado durante o verão de 1995/96 com o objetivo de determinar o nível de aflatoxinas (AFL) capaz de causar prejuízos no desempenho de perus de corte criados sob condições ambientais de baixo desafio, bem como avaliar a eficácia da adição de bentonita sódica natural (BSN) como um adsorvente. Foram utilizados 1008 perus de corte, alojados em 84 boxes seguindo um delineamento experimental de blocos casualizados com 14 tratamentos distribuídos em um arranjo fatorial 7x2, sendo 7 níveis de adição de AFL, (0, 10, 50, 100, 500, 1000 e 2000ppb) e 2 níveis de adição de BSN (0 e 0,5%). Aos 21 dias de idade, as aves alimentadas com as dietas sem adição de BSN mostraram uma redução significativa (P<0,05) no ganho de peso (GP) e no consumo de ração (CR) com níveis de AFL iguais ou superiores a 500ppb, enquanto que aves alimentadas com as dietas com 0,5% de BSN mostraram redução significativa (P<0,05) no GP e CR apenas à partir de 1000ppb de AFL. Estes mesmos resultados foram observados aos 40 dias de idade, entretanto aos 70 dias ocorreu uma redução significativa (P<0,05) no GP e CR das aves à partir de 500ppb de AFL, com ou sem adição de BSN, demonstrando um efeito cumulativo desta micotoxina. Em geral, em todos os níveis de adição de AFL que ocorreu redução significativa no GP e CR das aves, esta foi cerca de 15 a 20% menor nos grupos alimentados com 0,5% de BSN. A conversão alimentar (CA) das aves foi menos afetada pelos níveis de AFL dietéticos, embora tenha existido uma tendência de piora na CA com altos níveis de AFL, em todas as idades. Aflatoxinas tiveram um grande efeito sobre a taxa de mortalidade (%MOR), sendo que já aos 21 dias a %MOR verificada nos lotes que receberam 1000 e 2000ppb de AFL, sem BSN, foi de 15,3 e 72,2%, respectivamente. Antes de completar 40 dias de experimento, 100% das aves alimentados com dietas contendo 2000 ppb de AFL, sem e com BSN, morreram. A adição de 0,5% BSN proporcionou uma redução média de 35% na %MOR em comparação aves alimentadas com dietas sem BSN. Com base nos resultados pode ser concluído que AFL são extremamente deletérias aos perus e que a adição de 0,5% de BSN na ração protege parcialmente os perus dos efeitos negativos desta micotoxina.
Observações sobre o modo de reprodução em Adesmia latifolia Spreng. Vog.
Authors: Tedesco Solange Bosio , Dall'Agnol Miguel , Schifino-Wittmann Maria Teresa
Published: March 2008

Um experimento foi conduzido em casa de vegetação, com plantas de um acesso de Adesmia latifolia, para fazer observações relativas ao seu modo de reprodução. As plantas foram isoladas individualmente e, após o florescimento, foram submetidas a três tratamentos: estímulo mecânico, cruzamentos manuais e isolamento. Os resultados indicaram versatilidade da espécie, a qual pode reproduzir-se por fecundação cruzada e por autofecundação.
Herniorrafia inguinal em potro neonato
Authors: Teixeira Marcelo Weinstein , Schossler João Eduardo
Published: March 2008

As hérnias inguinais congênitas em potros não são um achado raro na casuística hospitalar. A maioria dos casos são conduzidos clinicamente, por se tratar de hérnias indiretas. As hérnias inguinais congênitas diretas, irredutíveis, em potros são uma urgência cirúrgica e se não tratadas imediatamente causam 100% de óbito. Um potro da raça Quarto-de-milha, com 36 horas de vida, apresentando volume parcialmente redutível na região inguinal esquerda, desconforto abdominal contínuo e congestão de mucosas aparentes, foi admitido no hospital veterinário. O animal foi imediatamente encaminhado à cirurgia, onde a herniorrafia com ressecção de alça intestinal, por acesso inguinal foi realizada. A recuperação pós-operatória foi satisfatória e o animal apresenta desenvolvimento físico normal para a raça.
Paniculite fibrogranulomatosa focal em bovino de Minas Gerais
Authors: Varaschin Mary Suzan , Silva Adelina Maria da
Published: March 2008

Um caso de "lechiguana" bovina, é relatado em bovino proveniente de Fama, MG, que apresentou aumento de volume de aproximadamente 30x8cm, de consistência firme e com superfície ulcerada, localizado no lado esquerdo da região toracolombar. As lesões microscópicas caracterizaram-se por paniculite piogranulomatosa proliferativa, com linfangite e microabscessos eosinofilicos. Em alguns abscessos havia rosetas (Splendore-HoeppIi) associadas a bactérias Gram-negativas. Após a biópsia o animal foi tratado com 3g diárias de cloranfenicol, por 5 dias. Houve total recuperação dentro de 30 dias.
Infecção pelo vírus da leucose enzoótica bovina(BLV)
Authors: Braga Fátima Machado , Van der Laan Carlos Willi , Schuch Luiz Filipe , Halfen Daniza Coelho
Published: March 2008

O vírus da leucose bovina (BLV) é o agente causal de duas condições clínicas relacionadas aos bovinos: o linfossarcorma, doença neoplásica comum no gado adulto, e linfocitose persistente, proliferação benigna das células linfóides. A identificação do BLV em 1969 e o subseqüente desenvolvimento de técnicas sorológicas sensíveis permitiram o reconhecimento da infecção como prevalente em muitos países, principalmente no gado leiteiro. Devido a inexistência de tratamento ou de uma vacina eficaz, as pesquisas concentram-se nos modos de transmissão e no desenvolvimento de programas de controle e prevenção da infecção. Este trabalho faz uma revisão bibliográfica sobre o BLV, incluindo modos de infecção, sinais clínicos e diagnóstico laboratorial, além de descrever medidas que o produtor deve seguir para prevenir ou controlar a disseminação do vírus no rebanho.
Enzimas na alimentação de suínos
Authors: Fireman Francisco Antonio Tenorio , Fireman Alba Kyonara Barbosa Alves Tenório
Published: March 2008

Enzimas são proteínas globulares de estrutura terciária ou quaternária que agem como catalisadores bilógicos e estão envolvidas em todos os processos do metabolismo animal. As enzimas comercialmente produzidas são provenientes, geralmente, de bactérias do gênero Bacillus sp ou fungos do gênero Aspergillus sp. Os efeitos benéficos de sua utilização na alimentação de suínos têm sido observados por pesquisadores de todo o mundo. Este artigo objetiva abordar os efeitos do uso de enzimas em vários aspectos da nutrição de suínos.