Comparative Analysis of Nucleotide Variability of the mtDNA cyt b Gene of tench
(Tinca tinca L.) in Populations of the Western and Eastern Parts of Eurasia
Authors: Слынько Е.Е. , Скворцова Е.Г. , Суконина А.И. , Слынько Ю.В. 
Published: October 2020

Линь (Tinca tinca L.) – один из древнейших сохранившихся представителей семейства карповых (Cyprinidae) в водоёмах Евразии, выделяемый в отдельное монотипическое подсемейство Tincinae. Ранее были выявлены филогеографические группы, разделяющиеся на западные (Англия, Испания, Польша) и восточные (Болгария, Иран, Китай) популяции Евразии. Была поставлена задача установить, к какой филогруппе будут относиться популяции северо-восточной части России, в частности, Ярославской области, а также оценить максимальное правдоподобие нуклеотидных замещений по гену cyt b. Проведён сравнительный анализ полученных данных с данными по линю западной и восточной частей Евразии. Оказалось, что общее смещение транзиции/трансверсии в российских популяциях составляет R = 168,236, в западных популяциях – R = 488,667. В популяциях линя Рыбинского водохранилища в значительной степени трансзиции преобладают над трансверсиями. Это свидетельствует о высоком генетическом разнообразии, устойчивости и адаптационных характеристиках линя из Рыбинского водохранилища. В западных популяциях количество трансзиций и трансверсий по своим значениям близки, наблюдается небольшое преобладание трансзиций над трансверсиями. В основном западные популяции линя имеют не естественное, а искусственное происхождение, являясь результатом направленного антропогенного скрещивания. Соответственно значительно снижаются показатели устойчивости и адаптации, а также повышается риск возникновения вредных (летальных) спонтанных мутаций, которые могут быстро закрепиться и повлиять на состояние западных популяций линя. Это подтверждается коэффициентами скорости транзиции/трансверсии: в западных популяциях они практически одинаковы k1 = 985.029 (пурины) и k2 = 1000 (пиримидины), в российских популяциях коэффициенты скорости транзиции/трансверсии составляют k1 = 1000 (пурины) и k2 = 1 (пиримидины). Проведённый анализ подтверждает существование двух филогеографических групп, но в связи с недостатком данных по российским популяциям необходимо продолжение исследования, тем более, что российская (в частности ярославская) популяция занимает особое положение по соотношению транзиций и трансверсий.

Tench (Tinca tinca L.) is one of the oldest surviving representatives of the cyprinid family (Cyprinidae) in water bodies of Eurasia distinguished into a separate monotypic subfamily Tincinae. Earlier phylogeographic groups were identified divided into western (England, Spain, Poland) and eastern (Bulgaria, Iran, China) populations of Eurasia. The task was to establish which phylogroup the populations of the northeastern part of Russia, in particular, the Yaroslavl region, would belong to, as well as to assess the maximum likelihood of nucleotide substitutions on the cyt b gene. A comparative analysis of the obtained data was carried out with data on the line of the western and eastern parts of Eurasia. It turned out that the total displacement of transition / transversion in Russian populations is R = 168.236, in western populations – R = 488.667. In the tench populations of the Rybinsk reservoir, to a large extent, transitions prevail over transversions. This indicates a high genetic diversity, resistance and adaptive characteristics of tench from the Rybinsk Reservoir. In western populations the number of transitions and transversions are close in their values, there is a small predominance of transitions over transversions. Basically, the western populations of tench are not of natural but artificial origin, being a result of directed anthropogenic crossing. Accordingly, the indicators of resistance and adaptation are significantly reduced and the risk of harmful (lethal) spontaneous mutations which can quickly gain a foothold and affect the state of western tench populations increases. This is confirmed by the coefficients of the rate of transition / transversion: in western populations they are practically the same k1 = 985.029 (purines) and k2 = 1000 (pyrimidines), in Russian populations the rates of transition / transversion are k1 = 1000 (purines) and k2 = 1 (pyrimidines). The performed analysis confirms the existence of two phylogeographic groups, but due to the lack of data on Russian populations, it is necessary to continue the research especially since the Russian (in particular Yaroslavl) population occupies a special position in terms of the ratio of transitions and transversions.