Μελέτη γενετικών πολυμορφισμών και τροπισμού HIV-1 στελεχών οροθετικών
Authors: Αντωνιάδου Ζωή-Άννα 
Published: August 2021

Δείγματα αίματος 98 νεοδιαγνωσθέντων HIV-1 οροθετικών ατόμων κατά το χρονικό διάστημα 2009 - 2010 εξετάσθηκαν με μεθόδους αλληλούχισης του DNA και φυλογενετικής ανάλυσης της πρωτεάσης και ορισμένων περιοχών της ανάστροφης μεταγραφάσης του γονιδίου Pol και του γονιδίου Env της περιοχής C2 – C5 της γλυκοπρωτεϊνης gp120 του HIV-1.Τα φυλογενετικά δένδρα του γονιδίου Pol, τα οποία κατασκευάστηκαν με τις αλληλουχίες των 98 οροθετικών ατόμων της μελέτης και με αλληλουχίες αναφοράς, έδειξαν ότι οι επικρατέστεροι υπότυποι του HIV-1 ήταν οι υπότυποι B και Α1 με ποσοστά 44,9% και 42,9% αντίστοιχα, ακολουθούμενοι από τούς υπότυπους C (3,1%), CRF02_AG (4,1%), CRF04_cpx (2,0%) και τους υπότυπους CRF01_ 01, F1 και G (1%).Σε σύγκριση με προηγούμενες μελέτες που αφορούσαν την ίδια γεωγραφική περιοχή δεν βρέθηκαν νέοι υπότυποι του ιού αλλά κατά την τελευταία δεκαετία παρατηρήθηκε μία αλλαγή στην επικράτηση των υπότυπων Β και Α1 από 98,3% και 1,7% σε 44,9% και 42,9% αντίστοιχα. Παράλληλα παρατηρήθηκε αύξηση του ποσοστού μόλυνσης της ομάδος υψηλού κινδύνου των ανδρών που ανέφεραν σεξουαλική επαφή με άλλους άνδρες από 31,4% σε 75%.Η συνολική επικράτηση των μεταλλάξεων μεταδιδόμενης αντοχής στα αντιρετροϊκά φάρμακα βρέθηκε 17,4%. Από αυτά τα άτομα το 29,4% μολύνθηκε με στελέχη του HIV-1 τα οποία έφεραν μια μετάλλαξη μεταδιδόμενης αντοχής, το 64,7% δύο και το 5,9% πολλαπλές. Ειδικότερα, η αντοχή έναντι των αναστολέων του νουκλεοσιδίου της ανάστροφης μεταγραφάσης (NRTI) βρέθηκε 12,24%, των αναστολέων της μη-νουκλεσιδικής ανάστροφης μεταγραφάσης (NNRTI) 17,35% και των αναστολέων της πρωτεάσης (PI) 1,02%. Υψηλό ποσοστό συστοιχιών μεταφερόμενης αντοχής του υπότυπου Α1 στους αναστολείς της ανάστροφης μεταγραφάσης παρατηρήθηκε μεταξύ των ανδρών με σεξουαλικές επαφές με άλλους άνδρες. Τα δεκαπέντε (15) από τα δεκαεπτά (17) άτομα της μελέτης (82,8%) μολύνθηκαν με στελέχη μεταφερόμενης αντοχής, τα οποία εμπλέκονταν με συστοιχίες μετάδοσης αντοχής. Από τα 15 άτομα με μεταφερόμενη αντοχή σε συστοιχίες μετάδοσης, δέκα (10) άτομα (66,7%) ήταν άνδρες με σεξουαλική επαφή με άλλους άνδρες οι οποίοι μολύνθηκαν με στελέχη του υπότυπου Α1. Η κύρια συστοιχία του υπότυπου Α1 περιελάμβανε οκτώ άνδρες οι οποίοι ήταν κάτοικοι της Θεσσαλονίκης και ανέφεραν σεξουαλικές επαφές με άλλους άνδρες. Όλα αυτά τα άτομα μολύνθηκαν με στελέχη του ιού Α1, τα οποία μετέφεραν διπλή αντοχή, με μεταλλάξεις T215C και Y181C της ανάστροφης μεταγραφάσης. Επιπλέον, τα αποτελέσματα αυτής της μελέτης αποδεικνύουν ότι οι οκτώ υπότυποι ( A, B, C, CRF- AG, CRF04-cpx, CRF-01, F1 και G ) οι οποίοι ενδημούν στην Β. Ελλάδα δεν συσχετίζονται με διαφορετικά επίπεδα κυτταρικού DNA του HIV-1 και επίσης ότι τα επίπεδα του κυτταρικού HIV-1 DNA είναι ανεξάρτητα από το HIV-1 RNA (ιϊκό φορτίο) του και του αριθμού των CD4 T λεμφοκυττάρων πλάσματος. Ο μέσος όρος των επιπέδων του κυτταρικού HIV-1 DNA έδειξε ότι δεν υπάρχει συσχέτιση μεταξύ των επιπέδων του κυτταρικού HIV-1 DNA των οροθετικών ατόμων και της μεταφερόμενης αντοχής στα αντιρετροϊκά φάρμακα. Μεταξύ των 98 νεοδιαγνωσθέντων ατόμων με αντοχή στα φάρμακα και των ατόμων με ευαισθησία σε αυτά δεν υπήρχε σημαντική στατιστική διαφορά του κυτταρικού φορτίου HIV-1 (STS) DNA μεταξύ των δειγμάτων που δεν είχαν μεταλλάξεις αντοχής στα αντιρετροϊκά φάρμακα και των δειγμάτων με μεταλλάξεις αντοχής.Ο γενοτυπικός τροπισμός των συνυποδοχέων του HIV-1 των 98 οροθετικών ατόμων, ο οποίος προσδιορίσθηκε από το κυτταρικό DNA, έδειξε ότι τα περισσότερα δείγματα ήταν CCR5 τροπισμού (95,7%) και τα υπόλοιπα μεικτού τροπισμού CCR5 και CXCR4 (4,3%).