bluuebunny/crossref_metadata_2025 huggingface dataset:
Analysis of Surface Plasmon Resonance Curves with a Novel Sigmoid-Asymmetric Fitting Algorithm
Authors: Jang Daeho , Chae Geunhyoung , Shin Sehyun
Published: October 2015

The present study introduces a novel curve-fitting algorithm for surface plasmon resonance (SPR) curves using a self-constructed, wedge-shaped beam type angular interrogation SPR spectroscopy technique. Previous fitting approaches such as asymmetric and polynomial equations are still unsatisfactory for analyzing full SPR curves and their use is limited to determining the resonance angle. In the present study, we developed a sigmoid-asymmetric equation that provides excellent curve-fitting for the whole SPR curve over a range of incident angles, including regions of the critical angle and resonance angle. Regardless of the bulk fluid type (i.e., water and air), the present sigmoid-asymmetric fitting exhibited nearly perfect matching with a full SPR curve, whereas the asymmetric and polynomial curve fitting methods did not. Because the present curve-fitting sigmoid-asymmetric equation can determine the critical angle as well as the resonance angle, the undesired effect caused by the bulk fluid refractive index was excluded by subtracting the critical angle from the resonance angle in real time. In conclusion, the proposed sigmoid-asymmetric curve-fitting algorithm for SPR curves is widely applicable to various SPR measurements, while excluding the effect of bulk fluids on the sensing layer.
Design and Performance Evaluation of a Dual Antenna Joint Carrier Tracking Loop
Authors: Guo Wenfei , Lin Tao , Niu Xiaoji , Shi Chuang , Zhang Hongping
Published: October 2015

In order to track the carrier phases of Global Navigation Satellite Systems (GNSS) signals in signal degraded environments, a dual antenna joint carrier tracking loop is proposed and evaluated. This proposed tracking loop processes inputs from two antennas, namely the master antenna and the slave antenna. The master antenna captures signals in open-sky environments, while the slave antenna capture signals in degraded environments. In this architecture, a Phase Lock Loop (PLL) is adopted as a master loop to track the carrier phase of the open-sky signals. The Doppler frequency estimated by this master loop is utilized to assist weak carrier tracking in the slave loop. As both antennas experience similar signal dynamics due to satellite motion and clock frequency variations, a much narrower loop bandwidth and possibly a longer coherent integration can be adopted to track the weak signals in slave channels, by utilizing the Doppler aid from master channels. PLL tracking performance is affected by the satellite/user dynamics, clock instability, and thermal noise. In this paper, their impacts on the proposed phase tracking loop are analyzed and verified by both simulation and field data. Theoretical analysis and experimental results show that the proposed loop structure can track degraded signals (i.e., 18 dB-Hz) with a very narrow loop bandwidth (i.e., 0.5 Hz) and a TCXO clock.
An Integrated Decision-Making Model for the Location of a PV Solar Plant
Authors: Lee Amy , Kang He-Yau , Lin Chun-Yu , Shen Kuan-Chin
Published: October 2015

Due to the increasing demand for electricity, the depletion of fossil fuels and the increase in environmental consciousness, generating power from renewable energy resources has become necessary. How to select the most appropriate site is a critical and foremost decision that must be made when setting up a renewable energy plant. This research proposes a two-stage framework for evaluating the suitability of renewable energy plant site alternatives. In the first stage, a fuzzy analytic hierarchy process (FAHP) is adopted to set the assurance region (AR) of the quantitative factors, and the AR is incorporated into data envelopment analysis (DEA) to assess the efficiencies of plant site candidates. A few sites are selected for further analysis. In the second stage, experts are invited to evaluate the qualitative characteristics of the selected sites, and FAHP is used to calculate the priorities of these sites. Solar energy is one of the most promising renewable energy sources, because of its abundance, inexhaustibility, safety and cleanliness. Based on the proposed integrated decision-making model, a case study for selecting the most appropriate photovoltaic (PV) solar plant site is examined.
Isolation and Genome Characterization of the Virulent Staphylococcus aureus Bacteriophage SA97
Authors: Chang Yoonjee , Shin Hakdong , Lee Ju-Hoon , Park Chul , Paik Soon-Young , Ryu Sangryeol
Published: October 2015

A novel bacteriophage that infects S. aureus, SA97, was isolated and characterized. The phage SA97 belongs to the Siphoviridae family, and the cell wall teichoic acid (WTA) was found to be a host receptor of the phage SA97. Genome analysis revealed that SA97 contains 40,592 bp of DNA encoding 54 predicted open reading frames (ORFs), and none of these genes were related to virulence or drug resistance. Although a few genes associated with lysogen formation were detected in the phage SA97 genome, the phage SA97 produced neither lysogen nor transductant in S. aureus. These results suggest that the phage SA97 may be a promising candidate for controlling S. aureus.
Données quantitatives sur la préparation et la cuisson en four à bois de reconstitutions actuelles de poteries grecques et romaines [Technologies céramiques]
Authors: Echallier Jean-Claude , Montagu Jean
Published: October 2015

Quantitative data about the preparation and baking in wood-kiln of actual reproductions of Greek and Roman pottery.

The authors present the results of practical experimentation obtained in reproducing Greek and Roman pottery. The surface area required for the activity of a pottery workshop, the quantity of water and wood needed for the preparation, than the firing of the kiln and the control of the fire are some of the precious indications for a better understanding of antique pottery workshops and their contraints.
L'oppidum protohistorique de La Courtine (Ollioules, Var). Les collections anciennes
Authors: Arcelin Patrice , Bérato Jacques , Brien-Poitevin Françoise
Published: October 2015

Depuis les fouilles et les découvertes publiées par J. Layet (entre 1942 et 1961), l'oppidum de La Courtine est considéré par les chercheurs provençaux comme un des sites majeurs de la région de Toulon. L'amplitude chronologique de l'habitat (du Chalcolithique à la fin de la Protohistoire), la superficie occupée à l'Age du Fer (jusqu'à 6 ha), la variété des documents céramiques ou numismatiques découverts conduisent aujourd'hui une équipe à reprendre les recherches sur ce gisement.

Au cours de ces dernières années, les auteurs de l'article ont été amenés séparément à étudier certains aspects du mobilier des anciennes fouilles. En regroupant leurs réflexions et leurs analyses sur les vestiges conservés, il leur a paru utile de mieux faire connaître l'évolution de cet habitat, de dresser un premier bilan des acquis archéologiques disponibles, de replacer également ce site dans son contexte historique et culturel régional.
Le Touar, Les Arcs-sur-Argens (Var). Un habitat de plaine du Bronze final II/IIIa et du premier Age du fer dans son environnement
Authors: Bérato Jacques , Magnin Frédéric , Bérato Nicole , Brien Françoise , Columeau Philippe , Dugas Franck , Galliano Gilbert , Imbert Louis , Marinval Philippe , Thinon Michel
Published: October 2015

Au Bronze final II/IIIa, le site du Touar est implanté en bordure d'un marécage subpermanent, en relation avec des barrages travertineux développés sur le cours de l'Argens et dont les niveaux tourbeux sont datés du Chalcolithique. L'habitat qui s'y implante est saisonnier. Les ressources alimentaires de ce groupe humain sont principalement liées à la chasse et à l'élevage, les terres exploitées étant encore de superficie restreinte. La datation C14, après correction dendrochronologique, est de 1400-1030 av. J.-C. Ultérieurement, des apports détritiques remblaient le marécage qui transgresse ; le site n'est plus habité mais toujours utilisé. Au premier Age du fer, le milieu est plus sec et l'habitat devient permanent. La vie pastorale est alors mieux organisée mais c'est l'agriculture qui est désormais dominante dans l'alimentation. L'augmentation des volumes de céréales à stocker se traduit par l'apparition de grands récipients de réserve et cela antérieurement aux sollicitations économiques du monde méditerranéen. Le site est abandonné au début du Ve s. av. n. è.
Les Courtinals à Mourèze (Hérault). Etude préliminaire de l'habitat protohistorique et de son territoire.
Authors: Garcia Dominique , Orliac Catherine , Marinval Philippe , Pernaud-Orliac Jacques
Published: October 2015

Dans le cadre d'une enquête systématique sur l'occupation protohistorique de la vallée de l'Hérault, les auteurs présentent le résultat de leurs recherches sur un petit habitat installé dans un chaos de rochers et occupé au Bronze final III, puis vers le milieu du Ve s. av. J.-C. Les sondages pratiqués ont révélé deux habitations de cette seconde période établies entre des parois rocheuses à l'aide de poteaux porteurs. Ces constructions sont en matériaux périssables. Parmi les aménagements intérieurs, on relève la présence, sur un foyer, d'une plaque perforée en torchis, vestiges d'un gril très certainement lié à la torréfaction des céréales en épis. Le faciès du mobilier céramique est composé à 92,6 % de fragments de vases non tournés, chiffre élevé en comparaison de ceux d'autres habitats régionaux du VIe s. Les auteurs s'interrogent sur le terroir et l'étendue du territoire de ce modeste habitat par une approche des possibilités du milieu, des découvertes contemporaines voisines (nécropoles). Deux analyses carpologique et de la macrofaune complètent cette étude.
Nouvelle approche des collections de Roquepertuse : l'étude du mobilier ancien (fouilles Henri de Gérin-Ricard)
Authors: Lescure Brigitte , Gantès Lucien-François
Published: October 2015

Le transfert des vestiges lapidaires découvert sur le site de Roquepertuse, du musée Borély à celui de la Vieille Charité de Marseille, constitue aujourd'hui une occasion unique de reconsidérer la fiabilité des anciennes reconstitutions monumentales (statuaire, structures architecturales) proposées dans les années 30. La mise en place d'une commission scientifique pluridisciplinaire contribue à déterminer de nouvelles approches complémentaires, techniques, architecturales et chronologiques, de cet ensemble archéologique remarquable.
Roquepertuse et la polychromie en Gaule méridionale à l'époque préromaine
Authors: Barbet Alix
Published: October 2015

Recent cleaning and reconstruction of stone architectural elements (pillars, lintels) allow a better understanding of the painted motifs and their disposition. The author (after a first study in 1987) reconsiders the whole of the architectural painted decoration of Roquepertuse and its use as a complement to the sculpture. For this purpose he uses a direct copy of the perceptible painted traces, sometimes clarified by using ultraviolet fluorescence. The catalogue is increased by most of the remains on which traces of the use of polychromy have been preserved : e.g. at Entremont, Glanum and Sainte-Anastasie (in the Gard department). Several graphic reconstructions of decorations are proposed by means of two colours most frequently recovered (black and red). Completed by black-and-white and colour photographs, this new documentation clearly shows the stylistic and artistic importance of this account for the protohistoric societies and the underlying reality of the messages expressed.
La grotte I de Castelvielh à Sainte-Anastasie (Gard)
Authors: Dedet Bernard , Pène Jean-Michel
Published: October 2015

Cave I of Castelvielh was occupied in the Neo-Chalcoliticum, in Late Bronze IIIa, at the beginning of the Early Bronze Age, and then in the Middle Ages (XIIth till XIIIth c). It fits into the whole of the southern rock dwellings that are relatively numerous in the distria of Sainte-Anastasie. An rescue excavation carried out from 1984 to 1986 has yielded data that are more or less important according to the period concerned. After a study of the traces of the arrangements and an analytical presentation of the objeas (for the most part pottery), the authors fit the successive occupations into the cultural context of the area ; they discuss their purpose in the différents periods : permanent or temporary dwelling ?, specialisation of cattle breeding (for late Bronze IIIa) ?, place of worship (for the beginning of the Early Iron Age) ? A study of the faune of Late Bronze IIIa offers additional arguments for this era.
Le Bastidon, Sillans-la-Cascade (Var). Un gisement de plein air du Bronze final IIIa en milieu palustre
Authors: Bérato Jacques , Degaugue Franck , Krol Vincent , Leguilloux Martine
Published: October 2015

Sur le site du Bastidon, l'occupation humaine, s'est faite dans un milieu marécageux subpermanent. Le sondage a mis en évidence, dans une zone en creux, un habitat caractérisé par un radier en pierres, une fosse, un foyer et de la céramique. Une activité de bronzier y est vraisemblablement associée. Le faciès céramique homogène et deux datations 14C placent ce site, unique dans le Var, dans le Bronze final IlIa.
L’île et le tertre : essai de topologie littéraire
Authors: Carmignani Paul
Published: October 2015

A study of a few examples of the relationship between literary discourse (logos) and a place (topos) by which fiction is inspired or with which it is associated, this article concentrates on two particular places which can be considered as either similar (the former sticks out of the water, the latter out of the land) or complementary : the island is the place of transgresion, the mound is the place of reminiscence. Both are important places in the literature of the New World because they illustrate the fundamental dialectics between innocence and guilt.
Le style oral d’Emily Dickinson
Authors: Cazé Antoine
Published: October 2015

Emily Dickinson's poetry is an account of the immanence of the divine within the secular. In her attempt, Emily Dickinson is of necessity led to destabilize the conventional stance of the poet in front of her textual practices (rhythms) as well as her thematical choices (imagery). We have tried to show here that such a calling into question of writing is achieved through the creation of an « oral style » (Cl. Hagège) which fragilizes it. The conditions under which the real world can be perceived as the divine revealed are thus reintroduced at the textual level in the listening/speaking dialectics of the poems. The oral style is therefore for Emily Dickinson a means of efficiently turning her mystical crises into so many « crises de vers » (Mallarmé).
Moby-Dick et la question du livre
Authors: Bleikasten André
Published: October 2015

Moby-Dick and the Question of the Book

In Moby-Dick, Melville pursued the old Western dream, revived in the 19th century by German Romanticism, of the liber mundi, the unique and absolute Book that would encompass the totality of knowledge. The world's text, however, can no longer be authenticated by God's signature, as it was in the Middle Ages. Its totality has broken into fragments ; the new Bible is nothing more than « the draught of a draught. » Moby-Dick invites both a sym-bolic reading, according to the totalizing spirit of analogy, and a more modern dia-bolic reading, acknowledging the disorder and uncompletedness of a fragmented world.
Repères pour l'étude d'une voix fantôme, ou petit concert, en guise d'introduction à un autre
Authors: Chénetier Marc
Published: October 2015

Aside from would-be mimetic renderings of characters' voices in fictions, what is voice, in a literary text ? The concept is often used in literary studies but, being volatile, it is very seldom defined. Are there relations between the phone, the physical voice, and the literary « voice » or are we condemned to the metaphorical ? How legitimate is it to talk of the « voice of a text » ? Do we dream it ? Freely commenting on a collage of remarks culled from texts by a variety of writers, philosophers and critics, this introduction aims at framing the question debated throughout this dossier.
Défigurations : drapeaux de papier
Authors: Fresnault-Deruelle Pierre
Published: October 2015

Taking his stand on McLuhan's now familiar idea that « the medium is the message », the author, a plastic arts researcher, argues that taking the medium or support into account is indeed essential when one ponders over the meaning effects produced by this kind of message (which one might describe as « displaced »). For instance : what actually becomes of the national flag (here the Star-Spangled Banner) when, lowered to the status of a poster, it falls prey to all manner of manipulation ?
Postmodernism Reconsidered: The Return of the Real in John Barth’s Sabbatical and The Tidewater Tales
Authors: Carmichael Thomas
Published: October 2015

Depuis la parution de « The Literature of Replenishment : Postmodernist Fiction » (1980), les romans de John Barth ont témoigné du renouvellement de son intérêt pour les conventions de la représentation réaliste. Pourtant, ce retour au réalisme, tel qu'il se manifeste dans les deux romans publiés pendant les années 80 s'inscrit dans le contexte d'un project méta-fictionnel qui veut représenter un univers postmoderne ouvert sur les postulats de l'histoire, de la contingence et de la possibilité. Ce retour à la représentation réaliste s'effectue à partir d'une critique de la forme et d'une préoccupation continue avec la notion de responsabilité politique.
A Frolic of His Own de William Gaddis et le déplacement du récit
Authors: Félix Brigitte
Published: October 2015

The opening pages of A Frolic of His Own resort to a type of narration familiar to the readers of Gaddis 's previous novels, with the dialogues conveying most of the narrative information while the narrator 's interventions are confined to a few descriptive sequences. Yet, the inclusion of other kinds of writings and the proliferation of stories grafted to the main plot dissolve the unity of a presupposed central narrative. This paper tries to examine the constant displacement of the narrative from one area of the text to another, which is also linked to an interrogation on language through its uses and abuses in the legal jargon forming the substratum of the novel's fictional world.
Immigration et citoyenneté aux Etats-Unis : la dialectique de l’inclusion et de l’exclusion.
Authors: Foucrier Annick
Published: October 2015

The article introduces the central theme with a history of the laws of naturalization from colonial times to the present, in relation to the changing policies of immigration and the meanings of citizenship. It takes into account the different and sometimes contradictory local and federal levels of legislation and practices. In a second part, it reviews the different attitudes of migrants towards American citizenship and some of the reasons that induced them to apply for naturalization.
Sémantique, rhétorique et idéologie : la construction polémique du débat sur l’affirmative action
Authors: Guerlain Pierre
Published: October 2015

This paper analyzes the discursive practices resorted to by both supporters and opponents of affirmative action programs. After a semantic analysis the focus will shift to a presentation of the syllogisms and various rhetorical approaches preferred by the two groups of opponents. The last section will deal with the ideological uses of the affirmative action debate which often operates as a polemic.
The Descent of Art
Authors: Carroll Noël
Published: October 2015

Après avoir décrit comment l 'esthétique trouve sa place dans la tradition analytique anglo-saxonne, puis présenté et critiqué les orientations principales de cette tradition de pensée au XXe siècle - depuis l'essentialisme de Clive Bell à celui de Dickie ou de Danto, en passant pas sa remise en cause néo-wittgensteinienne -, l'auteur formule l'hypothèse d'une conception à la fois narrativiste et évolutionniste de la définition de l'art.
Developing a Workflow Composite Score to Measure Clinical Information Logistics
Authors: Liebe J. D. , Straede M. C. , Thye J. , Hübner U.
Published: September 2015

Background: Availability and usage of individual IT applications have been studied intensively in the past years. Recently, IT support of clinical processes is attaining in-creasing attention. The underlying construct that describes the IT support of clinical work-flows is clinical information logistics. This construct needs to be better understood, operationalised and measured.

Objectives: It is therefore the aim of this study to propose and develop a workflow composite score (WCS) for measuring clinical information logistics and to examine its quality based on reliability and validity analyses.

Methods: We largely followed the procedural model of MacKenzie and colleagues (2011) for defining and conceptualising the construct domain, for developing the measurement instrument, assessing the content validity, pre-testing the instrument, specifying the model, capturing the data and computing the WCS and testing the reliability and validity.

Results: Clinical information logistics was decomposed into the descriptors data and information, function, integration and distribution, which embraced the framework validated by an analysis of the international literature. This framework was refined selecting representative clinical processes. We chose ward rounds, pre- and post-surgery processes and discharge as sample processes that served as concrete instances for the measurements. They are sufficiently complex, represent core clinical processes and involve different professions, departments and settings. The score was computed on the basis of data from 183 hospitals of different size, ownership, location and teaching status. Testing the reliability and validity yielded encouraging results: the reliability was high with rsplit-half = 0.89, the WCS discriminated between groups; the WCS correlated significantly and moderately with two EHR models and the WCS received good evaluation results by a sample of chief information officers (n = 67). These findings suggest the further utilisation of the WCS.

Conclusion: As the WCS does not assume ideal workflows as a gold standard but measures IT support of clinical workflows according to validated descriptors a high portability of the WCS to other hospitals in other countries is very likely. The WCS will contribute to a better understanding of the construct clinical information logistics.
Characterization of a Calmodulin‐binding Transcription Factor from Strawberry (Fragaria × ananassa)
Authors: Leng Xiangpeng , Han Jian , Wang Xiaomin , Zhao Mizhen , Sun Xin , Wang Chen , Fang Jinggui
Published: October 2015

Calmodulin‐binding transcription activator (CAMTA) is a calmodulin‐binding transcription factor that has a broad range of functions from sensory mechanisms to regulating many growth and developmental processes. In this study, we isolated four strawberry CAMTA (FaCAMTA) genes using HMMER and BLAST analysis. The chromosome scaffold locations of these CAMTA genes in the strawberry genome were determined and the protein domain and motif organization [CG‐1, transcription factor immunoglobulin, ankyrin (ANK) repeats, calmodulin‐binding IQ motif) of FaCAMTAs were also assessed. All FaCAMTAs were predicted to be Ca‐ and calmodulin‐binding proteins. The expression profiles of FaCAMTA genes were measured in different tissues and revealed distinct FaCAMTA gene expression patterns under heat, cold, and salt stress. These data not only contribute to a better understanding of the complex regulation of the FaCAMTA gene family but also provide evidence supporting the role of CAMTAs in multiple signaling pathways involved in stress responses. This investigation can provide useful information for further study.
Natural Variation in Synthesis and Catabolism Genes Influences Dhurrin Content in Sorghum
Authors: Hayes Chad M. , Burow Gloria B. , Brown Patrick J. , Thurber Carrie , Xin Zhanguo , Burke John J.
Published: October 2015

Cyanogenic glucosides are natural compounds found in more than 1000 species of angiosperms that produce HCN and are deemed undesirable for agricultural use. However, these compounds are important components of the primary defensive mechanisms of many plant species. One of the best‐studied cyanogenic glucosides is dhurrin [(S)‐p‐hydroxymandelonitrile‐β‐D‐glucopyranoside], which is produced primarily in sorghum [Sorghum bicolor (L.) Moench]. The biochemical basis for dhurrin metabolism is well established; however, little information is available on its genetic control. Here, we dissect the genetic control of leaf dhurrin content through a genome‐wide association study (GWAS) using a panel of 700 diverse converted sorghum lines (conversion panel) previously subjected to pre‐breeding and selected for short stature (∼1 m in height) and photoperiod insensitivity. The conversion panel was grown for 2 yr in three environments. Wide variation for leaf dhurrin content was found in the sorghum conversion panel, with the Caudatum group exhibiting the highest dhurrin content and the Guinea group showing the lowest dhurrin content. A GWAS using a mixed linear model revealed significant associations (a false discovery rate [FDR] < 0.05) close to both UGT 185B1 in the canonical biosynthetic gene cluster on chromosome 1 and close to the catabolic dhurrinase loci on chromosome 8. Dhurrin content was associated consistently with biosynthetic genes in the two N‐fertilized environments, while dhurrin content was associated with catabolic loci in the environment without supplemental N. These results suggest that genes for both biosynthesis and catabolism are important in determining natural variation for leaf dhurrin in sorghum in different environments.
Characterization of Expression Patterns of Grapevine MicroRNA Family Members using MicroRNA Rapid Amplification of Complementary DNA Ends
Authors: Leng Xiangpeng , Fang Jinxiang , Pervaiz Tariq , Li Yu , Wang Xiaomin , Liu Dan , Zhu Xudong , Fang Jinggui
Published: October 2015

Grapevine (Vitis vinifera L.), with important nutritional values and health benefits, is one of the most economically fruit crop worldwide. In the present study, real‐time quantitative polymerase chain reaction (qRT‐PCR) and microRNA rapid amplification of cDNA ends (miR‐RACE) techniques were used to characterize the expression and diversification patterns of various grapevine microRNAs (Vv‐miRNAs) and their family members in grapevine. Based on our results, eight different grapevine miRNAs (miR159, miR164, miR167, miR172, miR319, miR393, miR396, and miR398) and their family members were expressed in different tissues at various developmental stages. The qRT‐PCR results showed that the expression levels of Vv‐miRNAs during grapevine development were dynamic. Furthermore, based on miR‐RACE analysis and polymerase chain reaction (PCR) product sequencing results, different members within the same miRNA family were also expressed at different levels. Comparing the spatiotemporal expression levels of different members in the same miRNA family indicated that some miRNA families might have a key miRNA member that played the prominent role in regulation of their subsequent common target genes. In conclusion, our results showed that miR‐RACE is a powerful technique to analyze the expression patterns of different members in the same miRNA family in terms of reverse‐transcription (RT) efficiency and specificity. The findings of the expression diversification among Vv‐miRNA family members and the existence of some Vv‐miRNAs playing the key role could add to our understanding about the regulatory role of miRNAs in grapevine.
Genomic Simple Sequence Repeat Markers Reveal Patterns of Genetic Relatedness and Diversity in Sesame
Authors: Uncu Ayşe Özgür , Gultekin Visam , Allmer Jens , Frary Anne , Doganlar Sami
Published: October 2015

Sesame (Sesamum indicum L. syn. Sesamum orientale L.) is an orphan crop species with most molecular genetic research work done in the last decade. In this study, we used a pyrosequencing approach for the development of genomic simple‐sequence repeat (SSR) markers in sesame. Our approach proved successful in identifying 19,816 nonredundant SSRs, 5727 of which were identified in a contig assembly that covers 19.29% of the sesame genome. Mononucleotide repeats were the most abundant SSR type identified in the sesame genome (48.5% of all SSRs), followed by dinucleotide SSRs (45.0%). Adenine–thymine‐rich motifs were predominant, representing 81.7, 51.7, 66.5, and 22.1% of the mononucleotide, dinucleotide, trinucleotide, and tetranucleotide SSRs, respectively. As a result of this work, we introduce 933 experimentally validated sesame specific markers, 849 of which are also applicable in Sesamum mulayanum (syn. Sesamum orientale var. malabaricum Nar.), the wild progenitor of cultivated sesame. Using a subset of the newly identified SSR markers, we analyzed molecular genetic diversity and population structure of a collection of world accessions. Results of the two analyses almost overlapped and suggested correlation between genetic similarity and geographical proximity. Indeed, a pattern of gene flow among sesame diversity centers was apparent, with levels of variability in some regions similar to that seen in the domestication origin of the crop. Taken together with the high rate of genomic marker transferability detected between S. indicum and S. mulayanum, our results represent additional molecular genetic evidence for designating the two taxa as cultivated and wild forms of the same species.
A Cluster of Recently Inserted Transposable Elements Associated with siRNAs in Gossypium raimondii
Authors: Gong Lei , Masonbrink Rick E. , Grover Corrinne E. , Renny‐Byfield Simon , Wendel Jonathan F.
Published: October 2015

Stabilization of transposable element (TE) copy number involves the biosynthesis of short silencing RNAs (siRNAs) and further initialization of siRNA‐mediated TE silencing. To gain insight into the relationship between the biosynthesis of siRNAs and their source TEs, we examined the co‐evolutionary dynamics and expression of these two entities by characterizing the siRNA distribution across the genome of Gossypium raimondii Ulbr. We identified an unusual region at the 3’ end of chromosome 1 with significantly enriched siRNA coverage. Analysis of the correlation pattern between uniquely mapped siRNAs and those mapping to multiple regions implicated active biogenesis of siRNAs from these potential young TEs. Furthermore, divergence estimates of TEs within this region confirmed that the majority of TEs are young. Active transcription of the source TEs and their positive correlation with expressed siRNAs indicates that sufficient expression of TEs may be necessary to generate siRNAs and maintain the silenced state of recently transposed TEs.
Genomic Prediction of Biomass Yield in Two Selection Cycles of a Tetraploid Alfalfa Breeding Population
Authors: Li Xuehui , Wei Yanling , Acharya Ananta , Hansen Julie L. , Crawford Jamie L. , Viands Donald R. , Michaud Réal , Claessens Annie , Brummer E. Charles
Published: October 2015

Alfalfa (Medicago sativa L.) is a widely planted perennial forage legume grown throughout temperate and dry subtropical regions in the world. Long breeding cycles limit genetic improvement of alfalfa, particularly for complex traits such as biomass yield. Genomic selection (GS), based on predicted breeding values obtained using genome‐wide molecular markers, could enhance breeding efficiency in terms of gain per unit time and cost. In this study, we genotyped tetraploid alfalfa plants that had previously been evaluated for yield during two cycles of phenotypic selection using genotyping‐by‐sequencing (GBS). We then developed prediction equations using yield data from three locations. Approximately 10,000 single nucleotide polymorphism (SNP) markers were used for GS modeling. The genomic prediction accuracy of total biomass yield ranged from 0.34 to 0.51 for the Cycle 0 population and from 0.21 to 0.66 for the Cycle 1 population, depending on the location. The GS model developed using Cycle 0 as the training population in predicting total biomass yield in Cycle 1 resulted in accuracies up to 0.40. Both genotype × environment interaction and the number of harvests and years used to generate yield phenotypes had effects on prediction accuracy across generations and locations, Based on our results, the selection efficiency per unit time for GS is higher than phenotypic selection, although accuracies will likely decline across multiple selection cycles. This study provided evidence that GS can accelerate genetic gain in alfalfa for biomass yield.
La famille sous l’éclairage de l’histoire
Authors: Burguière André
Published: October 2015

Les historiens réactivent aujourd’hui l’hypothèse qui avait guidé, au milieu du XIX e siècle, les recherches de Frédéric Le Play, l’inventeur de la sociologie de la famille, mais en la débarrassant de son évolutionnisme pessimiste qui voyait la famille traditionnelle se décomposer sous l’effet de la Révolution française et de l’individualisme bourgeois pour devenir la famille nucléaire moderne. L’application des catégories de Le Play aux données statistiques leur a permis de reconstituer une histoire moins linéaire et une géographie plus contrastée où trois modèles familiaux, l’un ouvert et les deux autres repliés sur l’espace domestique et la parenté, se sont longtemps partagé l’espace européen et l’espace français. Les modèles de repli n’ont pas résisté à l’urbanisation et à l’industrialisation. Mais ils survivent dans les têtes comme idéologies politiques et visions du monde.
« De Freud, derechef, qu’il existe »...
Authors: Sédat Jacques
Published: October 2015

Se situant délibérément, dès sa jeunesse, à l’écart des traditions religieuses, Freud n’en saisit pas moins pour autant l’apport essentiel du judaïsme, à savoir l’arrachement de l’homme au cosmos et son ouverture à la temporalité. Cet arrachement à la « masse compacte » est au cœur du processus analytique : sortir de « l’indivision d’avec un objet extérieur ». Cette intuition freudienne qui est au cœur du « malaise dans la culture » nous éclaire sur toutes les formes de fondamentalismes, dans lesquelles l’individu négocie son identité avec un objet extérieur, par horreur de l’individuation.
L’image liquide ou voir au bord de la noyade : remarques sur la mutation du statut des images au début du XXI e siècle
Authors: Poitevin Jean-Louis
Published: October 2015

Dans le régime post-historique et multimédia qui règne aujourd’hui dans les pays dits développés, les images changent à la fois de matérialité, de fonction et de signification. De l’invention de la vidéo à la pratique incessante des selfies quelque chose se joue qui est de l’ordre d’une mutation perceptuelle, intellectuelle et psychique. Le miroir même s’efface et est remplacé par des images de soi plus complexes qui visent à se situer dans l’espace-temps plutôt qu’à constituer un sujet. Dans cette faille ouverte au cœur de nos habitudes de penser un monde s’effondre, un autre naît.
L’expatriation du sujet. Entre nostalgie de la langue des origines et quête de l’étranger
Authors: Pestre Élise
Published: October 2015

L’auteur propose d’explorer le rapport du sujet expatrié aux langues maternelle et étrangère. À la suite de son déplacement territorial, le sujet se sent parfois envahi par la nostalgie de la terra patria et gagné par le vœu inconscient d’un retour à la langue maternelle première, la lalangue selon la formule de Lacan. Malgré son désir de vivre ailleurs, il peut se mélancoliser, ou ressentir des sentiments de menace et d’envahissement par l’autochtone et sa langue. Ces vécus intrusifs pourront le conduire à l’impossibilité de construire un chez-soi à lui, ainsi qu’à des vacillements dans ses transmissions, comme nous l’envisagerons avec le cas de Sophie. En terre étrangère, le passage par un travail analytique permettra un va-et-vient productif entre les langues, favorisant l’avènement d’une nécessaire dialectique entre l’étranger et le familier.
Acte et désir de l’analyste
Authors: Leyack Patricia
Published: October 2015

Le désir de l’analyste est l’opérateur de la rencontre de l’analysant avec sa vérité, avec la vérité de sa jouissance. Dans cette direction travaillent trois devoirs de l’analyste : aux niveaux imaginaire, symbolique et réel. Ce dernier, réel, est avancé comme anticipant ce que Lacan formalisera comme acte analytique dans le Séminaire XV. Dans l’acte, l’analyste, grâce à la fonction du désir de l’analyste, est la vérité de l’objet a.
Approches multiplexes des systèmes de villes dans les réseaux d’entreprises multinationales
Authors: Rozenblat Céline
Published: October 2015

Cet article revisite les bases conceptuelles et méthodologiques des approches par les réseaux, utilisées depuis une vingtaine d’années pour étudier les processus spatiaux qui lient les villes et les entreprises multinationales, et qui sont couramment mobilisées dans la littérature des « villes globales ». L’objectif est d’expliciter à chaque étape les choix opérés, demeurant souvent implicites, et leurs implications dans les résultats. Partant d’approches multiniveaux et multidimensionnelles de la relation ville-entreprises, l’article examine les liens intrinsèques entre les concepts mobilisés et les constructions empiriques de réseaux. Deux niveaux d’hypothèses sont identifiés : les hypothèses faites sur les réseaux eux-mêmes qui conditionnent les définitions des interactions ; celles faites sur les dimensions des objets construits. Dans cette perspective d’implémentation de la théorie de l’acteur-réseau, l’article propose des pistes de recherche se basant sur l’approche « multiplexe » des réseaux.
Entrepreneuriat, territoire et industrialisation : une intermédiation singulière
Authors: Crague Gilles
Published: October 2015

Certains grands groupes industriels français ont organisé en leur sein une action volontaire et pérenne (dite action d’industrialisation) qui vise à aider des projets entrepreneuriaux localisés dans leurs territoires d’implantation. Le grand groupe industrialisateur constitue alors un intermédiaire dans l’entrepreneuriat local. Il est amené, en toute autonomie, à qualifier, juger et évaluer les projets d’entreprise locaux qu’il aura au préalable sélectionnés. Les interactions qui s’établissent à cette occasion (entre grand groupe et porteur de projet d’entreprise) contribuent à construire une relation que le porteur de projet pourra valoriser auprès des financeurs traditionnels. Ces interactions s’inscrivent dans un champ sectoriel proche de celui du groupe, mais à distance de ses capacités opérationnelles. Elles visent à éviter de conduire à une relation organique afin de conforter la responsabilité entrepreneuriale du porteur de projet, même si elles prennent la forme, dans certains cas, d’une relation de prescription technique.
L’acceptabilité d’un péage urbain introduit simultanément à la création d’un contournement payant. Le cas de la rocade de Strasbourg
Authors: Broussolle Damien
Published: October 2015

L’article examine une suggestion de péage urbain de congestion faite par un rapport du Conseil d’Analyse Stratégique (2009) pour l’agglomération de Strasbourg. Il étudie les raisons pour lesquelles le scénario envisagé risquerait de se heurter à une forte opposition. L’article s’intéresse aux divergences entre les évaluations individuelles et collectives des variations de bien-être, au sentiment de justice (équité verticale et territoriale). Dans une dernière étape, en s’appuyant sur les enseignements mis à jour, l’article suggère un scénario plus acceptable de mise en œuvre d’un péage urbain avec financements croisés et un système de coupons échangeables.
La diversité des expériences locales d’indicateurs alternatifs : une étape nécessaire ?
Authors: Le Roy Anne , Ottaviani Fiona
Published: October 2015

Face au développement des expériences de construction d’indicateurs alternatifs à l’échelle locale, l’article propose une lecture transversale des raisons communes participant à leur multiplicité, ainsi qu’aux apports et limites associés à cette diversité. S’inscrivant dans une approche de type constructive, il est question d’apprécier la contribution de ces expériences à la fois au renouvellement des cadres de l’observation sociale à l’échelle locale et plus largement au processus complexe et non linéaire d’émergence de nouvelles conventions sociopolitiques. À ce double titre, la diversité des expériences locales d’indicateurs alternatifs nous apparaît une étape nécessaire au renouvellement des outils d’observation.
Le droit romain et les parlementaires anglais du XVII e siècle
Authors: Roynier Céline
Published: October 2015

Les rapports des parlementaires anglais du XVII e siècle avec le droit romain sont ambivalents : d’un côté, en effet, l’opposition entre civil lawyers et common lawyers recoupe en grande partie l’opposition entre défenseurs de l’absolutisme et défenseurs du parlement mais de l’autre, la conception de la liberté qui est défendue à l’époque par ces common lawyers est très largement celle du droit romain. L’appel au droit romain dans un contexte de common law traduit donc généralement une conception particulière des rapports que les îles britanniques entretiennent, ou sont censées entretenir, avec le continent.
« A fructibus eorum cognoscetis eos » : Denis Serrigny, le droit administratif romain et la dénonciation du despotisme impérial
Authors: Hiebel Dominique
Published: October 2015

En 1862, Denis Serrigny publie son Droit public et administratif romain , œuvre érudite et novatrice consacrée à la description des institutions et du droit administratif du Dominat. Cependant, la portée de l’ouvrage dépasse le cadre de l’étude du Bas-Empire. À l’heure où la censure guette, le professeur de droit administratif s’appuie sur le droit romain afin de livrer sa pensée intime non sur le seul régime impérial antique, mais également sur le Second Empire sous lequel il vit. La condamnation est sans appel : le despotisme impérial corrompt tout, broie les hommes et tue les libertés dans une machine centralisatrice dévorante.
État et secteur énergétique en France : quels dirigeants pour quelles relations ?
Authors: Viallet-Thévenin Scott
Published: October 2015

Depuis la fin des années 1980, l’État a engagé un mouvement de retrait de la gestion des entreprises nationalisées. L’environnement institutionnel des firmes industrielles a de ce fait fortement évolué. Elles se sont internationalisées et nombre de marchés ont été libéralisés. Comment ces mouvements se sont-ils traduits dans les relations entre l’État et les grandes entreprises ? On se propose, dans cet article, de répondre à cette question en prenant pour cas le secteur de l’énergie, au sein duquel l’État joue un rôle actionnarial fort au début des années 1990. En considérant les dirigeants des plus grandes firmes de ce secteur comme autant de ressources pour les entreprises, on spécifiera les stratégies mises en œuvre par les firmes, qui révèlent un recours à l’État et notamment à la sphère politique. Les transformations des propriétés sociales des dirigeants énergéticiens ont suivi un double mouvement durant les deux dernières décennies. Jouant sur deux tableaux, les firmes affichent leur indépendance vis-à-vis de l’État via les conseils d’administration, tout en renforçant des liens informels avec la sphère politique via leurs comités exécutifs.
Integración de métodos escalares y vectoriales en la evaluación del riesgo de incendio en el ciclo de vida de una construcción
Authors: Rey E. , Aguayo F. , Peralta M.ª E. , Lama J. R. , Ávila M.ª J.
Published: October 2015

Los incendios son uno de los principales riesgos en el ámbito constructivo. Consecuencias como pérdidas materiales, interrupción de actividad o daños personales hacen que la evaluación del riesgo de incendio y el conocimiento del comportamiento de la construcción ante el fuego sean imprescindibles a la hora de disminuir la probabilidad de ocurrencia, prevenir efectos y minimizar consecuencias. Actualmente existen un conjunto de métodos convencionales (escalares) que cuantifican el nivel de riesgo y aportan diferentes medidas de protección. Además se encuentran en desarrollo métodos (vectoriales) de Modelado y Simulación Computacional que aportan información multidimensional. El presente trabajo establece un modelo para la integración de métodos escalares y vectoriales para conocer el desarrollo y evolución del incendio junto al nivel de riesgo no solo en la etapa de diseño de la instalación, sino en su ciclo de vida facilitando las tareas de ingenieros de proyectos y técnicos de prevención de riesgos laborales.
Une identité en éclats : écrire sa vie de Juif errant. Les écrivains juifs contemporains de langue française après 1945
Authors: Lévy Clara
Published: October 2015

À partir de l’analyse d’un corpus littéraire de près de 300 ouvrages, publiés par une soixantaine d’écrivains juifs contemporains de langue française entre 1945 et le début des années 80, nous nous interrogerons sur les modalités d’écriture de l’exil et du déracinement mis en œuvre dans ces textes littéraires. Nous montrerons comment les écrivains juifs s’attachent à re-créer le territoire qu’ils ont perdu en recourant à des matériaux extrêmement divers (souvenirs proprement autobiographiques, épisodes les plus significatifs de l’histoire juive, ou encore légendes susceptibles d’être réactualisées). Les textes des écrivains juifs sont, le plus souvent, imprégnés d’une intense nostalgie ; la mémoire est omniprésente, et se manifeste à deux niveaux complémentaires — celui du culte de l’origine et celui du devoir de perpétuation. Le territoire natal est alors en partie idéalisé a posteriori.La représentation littéraire des ghettos et territoires juifs comme des espaces préservés, autarciques, peuplés d’habitants différents de ceux qui évoluent à l’extérieur est postérieure à l’exil : c’est la disparition des ghettos qui conduit à les lester d’une charge émotionnelle aussi forte, tout particulièrement pour les écrivains ashkénazes.
« Dieu ne croit plus en nous. » Trois journaux personnels de l’exil dans la France des années troubles
Authors: Rezgui Adelhakim
Published: October 2015

À partir de trois études de cas, le journal personnel est envisagé comme une source d’histoire donnant accès à l’univers mental de l’exil, dans diverses formes qu’il revêt, en France, du milieu des années 1930 aux premiers temps de l’Occupation et de Vichy. Le journal de Paul Loffler est une porte d’entrée dans l’exil en asile, face à la montée des périls (1934-1939), celui de Monique d’Hesse donne à voir l’exode comme exil, dans les yeux de l’enfance (mai-août 1940), le carnet d’Abraham Dymentsztajn permet d’envisager l’internement à Drancy, « camp de la faim », comme un exil de persécution (août-octobre 1941). Bien qu’ils soient censés résulter d’une écriture sur le vif, ces ego-documents constituent aussi des objets stimulants d’histoire de la mémoire.
S’en remettre à la “divine Providence” ? Prêtres dans l’exil pendant la Révolution française
Authors: Gomis Stéphane
Published: October 2015

Pendant longtemps, l’étude de l’émigration ecclésiastique a été le domaine réservé d’auteurs, pour la plupart issus eux-mêmes du clergé, dont le premier objectif était de célébrer le culte de ces « proscrits ». Pour autant, si le sujet n’a guère obtenu la faveur de l’historiographie la plus récente, quelques travaux sont venus renouveler notre approche. Dans le cadre spécifique de cette contribution, nous avons tenté de mesurer en quoi l’exil vécu par nos scripteurs a pu modifier leur rapport au dieu dont ils sont les serviteurs. En définitive, ceux-ci dévoilent une foi simple, nourrie de piété traditionnelle. Pour ces prêtres, la Providence ne cesse de les accompagner. Les signes de sa bienveillance et de sa protection apparaissent régulièrement dans leurs écrits. Leur retour d’expérience montre également que ces moments extrêmes furent l’occasion d’éprouver le sens de leur vocation.