Etiological Structure of Fungal Pathogens Isolated from Blood in Children with Oncohematological Pathology
Authors: Черновецкий М.А. , Кондаурова С.Л. , Кульбицкая Т.Т. , Литуновская Л.Г. , Райко Т.В. , Скоповец Е.Я. 
Published: February 2022

Введение. Грибковые заболевания человека составляют актуальную проблему отечественного и мирового здравоохранения. Наиболее опасными формами данного вида патологии являются инвазивные микозы с поражением внутренних органов и тканей, характеризующиеся тяжелым течением заболевания и высокой летальностью.Цель. Установление этиологической структуры грибов, выделенных из крови у детей с онкогематологическими заболеваниями.Материалы и методы. В исследование были включены все штаммы грибов (микромицеты), выявленные в крови детей с инвазивными микозами на фоне онкогематологической патологии за период с 2002 по 2020 г. Выделенные из крови грибы (гемокультуры) были идентифицированы методами фенотипирования микромицет и оценки биохимических свойств дрожжевых патогенов с последующим подтверждением видовой идентификации ряда штаммов кандид путем дополнительного исследования методами масс-спектрометрии белкового профиля (в варианте MALDI-TOF MS) и ПЦР-диагностики (в варианте PCR real-time) специфичных участков генома.Результаты. В общей сложности было выделено 212 штаммов микромицет, среди которых дрожжевые патогены составляли 91,04% (193 гемокультуры). «Удельный вес» широко распространенной Candida albicans cоставил лишь 13,21% (28 гемокультур). Основными возбудителями инвазивных микозов в виде фунгемий были так называемые новые дрожжевые патогены в виде Candida guillermondii (48 штаммов, 22,64%) и Candida parapsilosis (49 штаммов, 23,11%). Среди 19 штаммов гемокультур плесневых микромицет основная этиологическая роль принадлежала Fusarium spp. (8 штаммов, 42,1%). Микробиологическая идентификация 15 гемокультур рода Сandida (4 образца Candida parapsilosis, 2 образца Candida pelliculosa, а также по одному образцу Candida glabrata, Canduda krusei и Candida tropicalis) полностью подтверждена видовой идентификацией штаммов кандид путем дополнительного исследования белкового профиля грибов методом MALDI TOF MS и специфичных участков генома микромицет методом PCR real-time.Выводы. Микромицеты рода Candida продолжают оставаться основными возбудителями инвазивных микозов в виде фунгемий у детей с онкогематологической патологией. Наблюдаетсянегативная тенденция к возрастанию этиологической роли в развитии инвазивных микозов так называемых новых дрожжевых патогенов, характеризующихся большей агрессивностью и устойчивостью к противогрибковым препаратам. Принимая во внимание полное совпадение результатов фенотипической и биохимической идентификации группы дрожжевых микромицет с результатами использование MALDI TOF MS и PCR real-time, имеется основание полагать, что молекулярно-генетические технологии могут быть применены для диагностики инвазивных микозов, осуществляемой с учетом целесообразности их использования (альтернативная экспресс-детекция и подтверждение специфичности выявления грибковых патогенов).

Introduction. Human fungal diseases are the actual problem for national and world health service. The most dangerous form of this pathology is the invasive mycoses with damage to internal organs. Those fungal infections are characterized by severe clinical course and high mortality.Purpose. To reveal the etiologic structure of fungal pathogens isolated from blood of children with oncohematological diseases.Materials and methods. All fungal cultures revealed in the period 2002–2021 in the blood of patients with invasive mycosis and oncohematological pathology were included in this study. Fungal blood cultures were identified with phenotype and biochemistry (for yeast pathogens) assays. A lot of Candida pathogens were confirmed additionally with the help of matrix-assisted laser desorption ionization (MALDI TOF MS) and real-time PCR.Results. There were found 212 fungal blood cultures. The prevalence of Candida spp. and other yeasts was 91,04% (193 cultures). Etiological significance of Candida albicans was only 13,21% (28 cultures). The main pathogens of blood invasive mycosis (fungemia) were indicated as Candida parapsylosis (49 cultures, 23,11%) and Candida guillermondii (48 cultures, 22,64%). Microbiological identification of the group of Candida pathogens (15 cultures) was confirmed additionally with MALDI TOF MS and real-time PCR. Fusarium spp. (8 cultures) was found as the main fungal pathogen in 19 mold blood cultures.Conclusions. Representatives of Candida spp are the main cause of blood invasive mycosis (fungemia) in patients with oncohematological pathology. There is observed the negative tendency of increase of etiological role of the so-called“new” yeast pathogens (such as Candida guillermondii and Candida parapsilosis). Taking into account the results of complex laboratory identification of the group of Candida pathogens, real-time PCR and MALDI TOF MS may be useful for diagnostics of invasive mycoses as alternative rapid detection and specific confirmation methods.