bluuebunny/crossref_metadata_2025 huggingface dataset:
МОДЕЛЬ РОЗВИТКУ ЦИФРОВОЇ КОМПЕТЕНТНОСТІ НАУКОВИХ ТА НАУКОВО-ПЕДАГОГІЧНИХ ПРАЦІВНИКІВ
Authors: Спірін Олег , Олексюк Василь , Василенко Ярослав , Сіренко Остап
Published: December 2024

Застосування цифрових засобів на всіх етапах проведення наукового дослідження є вимогою сьогодення. Сучасний дослідник має володіти широким переліком цифрових інструментів та сервісів. Дослідження присвячено обґрунтуванню та розробленню моделі розвитку цифрової компетентності наукових та науково-педагогічних працівників у галузі освітніх наук. З метою уточнення напрямів дослідження у статті виконано бібліометричний аналіз публікацій з наукометричних баз. Авторами вивчено концептуальні і рамкові документи Європейського Союзу, а також існуючі моделі розвитку цифрових спроможностей учителів та дослідників. На цій основі визначено складники цифрової компетентності, на розвиток яких спрямована проєктована модель. До них зокрема належать цифрова навчальна, цифрова дослідницька, цифрова методична, цифрова організаційно-виховна та кросдіяльнісна компетентності. При їх визначенні було проаналізовано та враховано типові види діяльності наукових та науково-педагогічних працівників. До кожного з вказаних складників компетентностей визначено цифрові засоби, володіння якими є необхідним з точки зору провадження професійної діяльності працівника. До них належать програмне забезпечення загального призначення, спеціалізовані цифрові застосунки й сервіси (наукометричні бази, інституційні репозитарії, референс-менеджери), хмарні сервіси, пакети для управління робочими процесами, соціальні та академічні мережі. Окремо виділено штучний інтелект як технологію, володіння якою є затребуваним для усіх видів діяльності сучасного вченого. Обґрунтовано, що визначений перелік компетентностей в основному відповідає сферам цифрової компетентності, що визначені в проєкті концептуально-референтної рамки цифрової компетентності педагогічних і науково-педагогічних працівників Міністерства цифрової трансформації України. Розроблена модель містить чотири блоки: цільовий, змістовий, технологічний та діагностично-аналітичний. У моделі передбачено використання методів очного і дистанційного навчання, сучасних систем управління навчанням та постійну готовність цільової аудиторії до самонавчання та самовдосконалення.
İbadetlerle İlgili Fetvalar ve Yapay Zekâ Uygulamaları: Karşılaştırmalı Bir Analiz
Authors: Ünal Sevim
Published: December 2024

İslami bilgi üretimi ve paylaşımının dijital dönüşümü kapsamında yapay zekâ uygulamalarının dinî sorulara verdiği cevapları inceleyen bu araştırma, Din İşleri Yüksek Kurulu fetvaları ile ChatGPT, Google Gemini ve Microsoft Copilot sistemlerinin cevaplarını karşılaştırmalı olarak analiz etmektedir. İbadetler özelinde seçilen 20 fetva sorusuna verilen toplam 80 cevap, içerik analizi yöntemiyle incelenmiştir. Bulgular; yapay zekâ uygulamalarının temel dinî hükümlerde genel bir mutabakat sergilediğini, ancak detaylı meselelerde farklılaşarak hatalı fetvalar verebildiğini, tutarsızlıklar gösterdiğini ve birbirleriyle çelişkili hükümler bildirdiğini ortaya koymaktadır. Bu araştırmada elde edilen sonuçlar, yapay zekâ teknolojisinin dinî bilgi üretimi ve paylaşımında tek başına bir fetva kaynağı olarak görülmemesi gerektiğini ancak yardımcı bir araç olarak kullanılabileceğini göstermektedir.
ChatGPT’nin İslâm Ceza Hukuku Özelinde Değerlendirilmesi
Authors: Aykul Abdulmuid , Alam Mohammed Nurul
Published: December 2024

Bu çalışma, OpenAl tarafından geliştirilen yapay zekâ modeli ChatGPT’nin İslâm ceza hukukuna dair genel nitelikli sorulara verdiği yanıtların doğruluğunu, tutarlılığını ve güvenirliğini değerlendirmeyi amaçlar. Araştırma, İslâm ceza hukukuna dair Bloom’un taksonomisi açısından bilgi, kavrama ve analiz olmak üzere üç düzey ve ayrıca konu hakkında literatüre dair üç soru olmak üzere toplamda on bir soru üzerinde gerçekleşmiştir. Yapay zekâ modeli ChatGPT tarafından verilen cevaplar klasik ve modern İslâm ceza hukuku müktesabatı açısından değerlendirilmiş ve ortaya çıkan tablo, alanında uzman akademisyenler tarafından puanlanmıştır. Yapay zekânın verdiği yanıtlar doğruluk, tutarlılık ve konu ile ilgililik olmak üzere çeşitli açılardan değerlendirilmiş, ChatGPT’nin verdiği yanıtların doğru olup olmadıkları, doğru ise bu doğruluğun nispeti ve farklı zamanlarda ChatGPT’ye yöneltilen aynı sorulara verdiği yanıtların birbirine paralelliği analiz edilmiştir. Araştırma sonucunda yapay zekâ ChatGPT’nin farklı üç zamanda verdiği yanıtların doğruluk oranının ortalamanın altında kaldığı, tutarlılığının da benzer bir durum arz ettiği görülmektedir. Bu doğruluk ve tutarlılık, verilen yanıtların kaynağının arandığı ikincil soruda kendisini daha çok göstermiş, bu alanda söz konusu doğruluk ve tutarlılık oranı daha da düşük çıkmıştır.
Din Eğitiminde İçerik Oluşturma ve Kişiselleştirilmiş Öğrenme Aracı Olarak ChatGPT
Authors: Kaya Yakup , Eliyatkin Elif
Published: December 2024

Yapay zekâ (YZ), eğitim dâhil hayatımızın birçok alanında kapsamlı etkileri olan önemli bir teknolojik yeniliktir. Din eğitimi ise bireylerin manevi gelişimini destekleyen ve toplumsal değerlerin aktarılmasında kritik rol oynayan bir disiplindir. Bu çalışma, özellikle ChatGPT’nin, ortaokul 5. sınıf seviyesinde din eğitimine uygulanabilirliğini incelemektedir. Çalışmada YZ teknolojilerinin tarihsel gelişimi özetlenerek, üretken dil modellerinin insanlık için önemli bir dönüm noktası olduğu ve eğitsel süreçleri yeniden yapılandırma potansiyeli taşıdığı savunulmaktadır. ChatGPT’nin ders içerikleri oluşturma, kişiselleştirilmiş öğrenme süreçleri geliştirme ve öğrenme deneyimlerini zenginleştirme gibi alanlardaki katkıları detaylandırılmıştır. Ayrıca bu teknolojilerin, öğretim süreçlerini daha verimli, dinamik ve erişilebilir hâle getirebileceği vurgulanmıştır. Araştırmada nitel bir yöntemle ChatGPT’nin içerik üretme, sorulara cevap verme ve etkileşim kurma yetenekleri uygulamalı olarak test edilmiştir. Sonuçlar, YZ teknolojilerinin öğrenci ilgisini artırma, kavramları sadeleştirme ve öğretmenlerin yükünü hafifletme gibi olumlu etkilerini ortaya koymuştur. Ancak etik ve pedagojik riskler de belirlenmiştir. Bu bağlamda, din eğitiminde YZ’nin etkili ve bilinçli kullanımına yönelik öneriler sunulmuştur.
Yapay Zekâ, Dinde Dijitalleşme, Distopya, Dijital Gözetim ve Büyük Veri Çerçevesinde Netflixte “Kübra” Dizisinin Analizi
Authors: Keskin Alptekin
Published: December 2024

Bu çalışmada Netflix’te iki sezonda toplam 16 bölüm olarak yayınlanan Kübra dizisi, yapay zekâ, dinde dijitalleşme, distopya, dijital gözetim ve büyük veri kavramları etrafında incelenmiştir. Dizide yapay zekâ aracılığıyla bireyler, toplum ve kültür arasında manipülatif süreçler işlenmekte; iktidar, din ve toplumsal çatışmalarla ilişkilendirilmektedir. Başrol karakter Gökhan, Soultouch uygulamasındaki "Kübra" adlı kullanıcıdan aldığı mesajların Allah tarafından gönderildiğine inanmakta ve bu inanç çerçevesinde bazı toplumsal etkiler meydana gelmektedir. Dizi, dinî inançların yapay zekâ teknolojileri tarafından nasıl manipüle edilebileceğini, bunun politika, sermaye ve farklı toplumsal kesimlerle nasıl bağlantılı olabileceğini göstermektedir. Çalışmada, dizinin içeriği betimsel analiz tekniğiyle incelenerek, yapay zekânın birey, toplum ve kültürle ilgili gelecekte nasıl manipülatif ve distopik bir araca dönüşebileceği ortaya konmuştur.
Yahudiliğin Yapay Zekaya Yaklaşımı Ve ChatGPT'de Yahudilik
Authors: Taşpınar İsmail
Published: December 2024

Bu araştırmada, ChatGPT’nin dinler konusunda kendisine sorulan sorulara verdiği cevaplar değerlendirilmektedir. Araştırmada, örnek din olarak ‘Yahudilik’ ele alınmaktadır. Buna bağlamda, araştırmanın birinci kısmında cevabı aranan soru, Yahudi din adamlarının yapay zekanın dini konularda verdiği bilgilere ve yaptığı analizlere yaklaşımları, güvenleri ve yapay zekaya dayalı uygulamalara dair tavırlarının ne yönde olduğudur. Araştırmanın ikinci kısmında ise, yapay zeka uygulaması ChatGPT’nin, Yahudilik konusunda sorulan sorulara verdiği cevapların ne kadar doğru ve tutarlı olduğu sorusuna cevap aranmaktadır Bunun için. ChatGPT’ye Yahudilikle ilgili dört temel kavrama dair soru sorulmuştur. Bu sorular, Tevrat, On Emir, Yahudiliğin iman esasları ve seçilmişlik kavramları hakkındadır. Araştırmanın sonucunda, Yahudi din adamları ve düşünürlerin yapay zekanın dinle ilişkisine dair yaklaşımlarının gerçekçi bir değerlendirmeden yoksun olduğu hem de ChatGPT’nin kendisine Yahudilikle ilgili sorulan sorulara verdiği bilgilerin genel olarak doğru bilgiler içerse de, ciddi eksiklikler ve yanlışlıklar içerdiği sonucuna varılmaktadır.
Yapay Zekâ Modellerinin Hadis Tarihi Sorularına Verdiği Yanıtların Karşılaştırmalı Analizi: Chatgpt ve Gemini Örneği
Authors: Ayhan Mehmet , Kılıç Zülal
Published: December 2024

Bu çalışmada, hadis tarihi alanında belirlenen sekiz soruya, ChatGPT ve Gemini adlı iki yapay zekâ modelinin verdiği cevaplar detaylı bir şekilde analiz edilecektir. Her iki modelin yanıtları, hadis uzmanı beş kişi tarafından puanlanarak değerlendirilecek ve yapılan analizde, her bir soruya verilen cevapların içeriği, doğruluğu, ayrıntı düzeyleri, kullanılan dil ve konulara yaklaşım biçimleri dikkate alınacaktır. İlgili sorulara ChatGPT ve Gemini yapay zekâ modelleri tarafından verilen yanıtlar, içerik ve derinlik bakımından karşılaştırılmaktadır. Çalışma, her iki yapay zekâ modelinin İslam ilimlerine dair bilgi sunma kapasitesini incelemek ve cevaplarının hadis rivayetinin erken dönem özelliklerini ne ölçüde yansıttığını belirlemek amacıyla yapılmaktadır. Sonuçlar, ChatGPT’nin konuya daha sistematik ve derinlemesine bir yaklaşım sunduğunu, Gemini’nin ise daha yüzeysel ve genel bir perspektif sağladığını ortaya koymaktadır. Çalışma, yapay zekâların İslâmî literatür konusundaki bilgi seviyesini değerlendirmenin yanı sıra, bu teknolojilerin hadis ilmi gibi köklü disiplinlerdeki yerini ve sınırlamalarını da incelemektedir. Yapay zekâların, İslâmî ilimler alanında bilgi aktarımına katkı sağladığı ancak bazı temel kavramlar ve terminolojilerde eksiklikler gösterdiği görülmektedir. Ayrıca, kaynak kullanımı konusunda da yetersizlikler gözlemlenmektedir. Bu analiz, hadis ilmi alanında daha kapsamlı bilgi sistemleri geliştirilmesi ve bu teknolojilerin geleneksel ilimlerle entegrasyonu adına önemli bir katkı sunmayı amaçlamaktadır.
Din Eğitimi Biliminin Temel Konularında ChatGPT Yapay Zeka Uygulama Verilerinin Güvenirliliği
Authors: Çakmak Ahmet , Genç Muhammet Fatih , Hendek Abdurrahman , Budak Bahaeddin
Published: December 2024

Bu çalışma, yapay zekâ (YZ) uygulamalarının din eğitimi biliminin temel konularındaki veri güvenilirliğini incelemektedir. Araştırmada, ChatGPT'nin ücretsiz (3.5 versiyonu) ve ücretli (4.0 versiyonu) sürümlerinin performansı, Revize Bloom Taksonomisinin hatırlama, anlama, uygulama, analiz, değerlendirme ve yaratma düzeylerine göre karşılaştırılmıştır. Bulgular, ücretli sürümün genellikle daha detaylı ve kapsamlı cevaplar sunduğunu göstermektedir. Örneğin, ücretli sürüm medrese gibi kavramlara dair tarihsel analizlerde daha derin bilgiler sağlarken, ücretsiz sürüm çoğunlukla yüzeysel ve genel bilgiler sunmaktadır. Bununla birlikte her iki sürüm de kaynak uydurma ve yanlış atıflar gibi önemli eksiklikler içermektedir. Aynı şekilde her iki versiyonda da zaman zaman yanlış bilgi ve konuyla ilgisiz açıklamalara rastlamak mümkündür. Bu durum, YZ’nin din eğitimi bağlamında akademik güvenilirlik açısından dikkatle değerlendirilmesi gerektiğini ortaya koymaktadır. Çalışmada ChatGPT’nin din eğitimi gibi hassas bir alandaki potansiyeli ve sınırlılıkları tartışılmaktadır. Sonuç olarak, YZ araçlarının din eğitimi alanında bireysel öğrenmeyi destekleme potansiyeli bulunsa da veri doğruluğu, etik sorunlar ve algoritmik önyargılar gibi konuların ele alınması gerekmektedir. Bu bağlamda, gelecekte YZ'nin bu alandaki uygulamalarını iyileştirmek için daha kapsamlı veri setleri ve etik çerçevelerin geliştirilmesi önemlidir.
Dini Bağlamda Robot Kullanımı: Budist Robot Rahip Mindar Örneği Üzerinden Tutumların Niteliksel Analizi
Authors: Şahin Meryem
Published: December 2024

Farklı inançlar ekseninde geliştirilen çeşitli dini sosyal robot örnekleri bulunmakta, bu robotlara yönelik tutumlar kullanıldıkları toplumun inanç ve kültüründen etkilenmektedir. Çarpıcı örneklerden birisi Budist Robot Rahip Mindar’dır. Bu çalışmada Mindar’ı ele alan üç farklı haber videosuna Türkçe, İngilizce ve Japonca yapılan yorumların niteliksel desende ve doküman analizi tekniğiyle dini robotlara karşı tutumlar ekseninde analiz edilmesi amaçlanmıştır. Çalışma sonucunda bu robotlara yönelik olumlu ve olumsuz tutumlar, kaygı ve hayranlık duyguları, din ve maneviyatın dönüşümüne dair içerikler tespit edilmiştir. Türkçe yorumlarda mevcut din hizmetlerine duyulan memnuniyetsizlik üzerinden robotlara olumlu tutum sergilenmesi ayırt edici bulgulardandır. Animist değerlendirme Japonca yorumlarda kendisini gösterip Türkçe ve İngilizcede mevcut değildir. İnsan merkezci düşünmeye ise üç dilde farklı ağırlıklarla olsa da rastlanmıştır. Sosyal robotlar günlük hayat işleyişinde daha fazla görünür olmaya başladıkça dini robotiğe yönelik tutumların da farklılaşması olasıdır.
Yapay Zekânın Din Eğitimindeki Rolü: Fırsatlar, Zorluklar ve Geleceğe Yönelik Çıkarımlar
Authors: Gül Ali , Sipahioglu Mete
Published: December 2024

Bu araştırma, yapay zekânın (YZ) din eğitimi üzerindeki etkilerini, fırsatlarını ve sınırlılıklarını incelemektedir. YZ, öğrenme deneyimlerini kişiselleştirme, pedagojik yaklaşımları yenilikçi yöntemlerle dönüştürme ve dinî metinlerin daha geniş kitlelere erişimini artırma potansiyeline sahiptir. Bununla birlikte, kutsal metinlerin yanlış yorumlanması, etik sorunlar ve öğretmen-öğrenci ilişkisinin zayıflaması gibi zorluklar da gündeme gelmektedir. Çalışmada, din eğitimi bağlamında YZ'nin sunduğu katkılar teorik ve uygulamalı boyutlarıyla ele alınmış, aynı zamanda bu teknolojinin pedagojik ve etik riskleri değerlendirilmiştir. Literatür taraması yöntemiyle gerçekleştirilen bu araştırma, YZ’nin dinî eğitim süreçlerini modernize etme potansiyeline dikkat çekerken, bu sürecin dikkatle yönetilmesi gerektiğini vurgulamaktadır. Sonuçlar, dinî değerlerin korunması ve teknolojik ilerlemenin dengeli bir şekilde birleştirilmesi gerektiğini ortaya koymaktadır.
AHENK GAZETESİ BAŞYAZARI MEHMET ŞEVKİ ERTUĞRUL’UN SERBEST FIRKA HATIRATI VE TEK PARTİ DÖNEMİNE DAİR DÜŞÜNDÜRDÜKLERİ
Authors: Selçuk Fatih
Published: December 2024

1930 yılının Ağustos ayında Cumhurbaşkanı Gazi Mustafa Kemal tarafından yakın dostu Paris Büyükelçisi Fethi Bey’e kurdurulan Serbest Cumhuriyet Fırkası, sebepleri ve sonuçlarıyla tek parti dönemi açısından bir kırılma olarak kabul edilmelidir. Tek parti dönemine dair araştırmalarda Serbest Cumhuriyet Fırkası ile ilgili geniş sayılabilecek bir literatür vardır. Bu geniş literatüre rağmen tek parti döneminin bu önemli aşamasına dair birinci el kaynaklar genellikle birbirini tekrar eder niteliktedir. Bu makalede İzmirli gazeteci, eğitimci ve siyasetçi Mehmet Şevki Ertuğrul’un Serbest Cumhuriyet Fırkası günlerine ait hatıraları ilk defa yayımlamak suretiyle literatüre katkı sunulmaktadır. Bu hatırat, diğer pek çok hatırattan farklı olarak kamuoyunu bilgilendirmek yahut bir dönemi aydınlatmak için kaleme alınmamış. Bu bakımdan hatıratın yazım süreci belirli bir arka plana ve neden sonuç ilişkisine sahiptir. İlk olarak 1939 Mart’ında yılında genel seçimlerde Cumhuriyet Halk Partisi’nden milletvekili adaylığı başvurusunda bulunan Mehmet Şevki Ertuğrul, bu girişiminde başarısız olduktan kısa bir süre sonra Muğla için yapılan bir ara seçimde şansını bir kere daha denemiştir. 1939 Kasım’ında Muğla için yaptığı adaylık başvurusunda, herkes için standart bir formalite olan başvuru evraklarını doldurmasının yanında, kaleme aldığı bazı diğer ek yazılarda kendisini parti nezdinde ön plana çıkarak bilgiler sunmayı amaçlamıştır. Ertuğrul bu yazılarda bir yandan da mesleki ve siyasi kariyerini anlatırken, diğer yandan da partiye bağılığını kanıtlamak amacıyla, Serbest Cumhuriyet Fırkası’nın kurulduğu ve kısa bir süre sonra da belediye seçimlerine girdiği süreçte İzmir’de CHP için neler yaptığını anlatmaktadır. Dokuz sayfalık daktilo metin, Mehmet Şevki Ertuğrul’un, istemeden de olsa, ardında bir hatırat bırakmasını sağlamıştır. Bu hatırat sayesinde Serbest Cumhuriyet Fırkası tecrübesinin İzmir ayağının CHP’li bir yerel göz tarafından nasıl görüldüğü anlaşılabilmektedir. Ayrıca bu hatıratın yazım aşamasının analizi, tek parti döneminde uzun vadede Serbest Cumhuriyet Fırkası’na nasıl bakıldığını da ortaya koymaktadır.
AVUSTURYA SİYASİ MİZAH DERGİLERİNİN BALKAN SAVAŞLARINI SUNUMU
Authors: Gülada Mehmet Ozan
Published: December 2024

8 Ekim 1912 tarihinde Karadağ’ın Osmanlı İmparatorluğu’na savaş ilanıyla başlayan Balkan Savaşları, Sırbistan, Bulgaristan ve Yunanistan’ın da Osmanlı İmparatorluğu’na karşı harekete geçmesiyle geniş bir alana yayılmıştır. Dört Balkan devletine karşı tek başına savaşan Osmanlı İmparatorluğu, cephelerde peş peşe ağır yenilgiler almıştır. Osmanlı İmparatorluğu’nun son yıllarında meydana gelen Balkan Savaşları’nda imparatorluk, Avrupa kıtasındaki topraklarının önemli bir bölümünü kaybetmiştir. Dünya basının yakından takip ettiği Balkan Savaşları, Avrupa’daki siyasi mizah dergilerinin pek çok karikatürüne konu edilmiştir. Balkanlar’da etkinlik mücadelesi içerisine giren Avusturya-Macaristan İmparatorluğu’nda da Avusturya siyasi mizah dergileri, savaşa geniş yer vermiştir. Bu dergilerde yer alan karikatürlerin incelenmesi, siyasi mizah dergileri üzerinden Avusturya-Macaristan İmparatorluğu kamuoyunun Balkan Savaşları’na ilişkin ne yönde şekillendirilmeye çalışıldığının ortaya konulması bakımından önem taşımaktadır. Çalışmada Avusturya siyasi mizah dergilerinin Balkan Savaşları’nı ne şekilde sunduğu ve okuyucularına ne tür mesajlar verdiğinin tespit edilmesi amaçlanmıştır. Bu amaçla Balkan Savaşları sırasında Avusturya’nın önde gelen mizah dergileri içerisinde yer alan Die Muskete, Kikeriki ve Wiener Caricaturen mizah dergilerinin Balkan Savaşlarını konu alan karikatürleri, Roland Barthes’ın göstergebilim modeli kullanılarak incelenmiştir. Barthes’ın göstergebilim modeli üzerinden karikatürlerde verilmek istenen açık ve gizli mesajlar ile inşa edilmek istenen mitlerin ortaya konulmasına çalışılmıştır. Karikatürlerde Osmanlı İmparatorluğu’nun zayıf ve çaresiz resmedilirken Balkan devletlerinin ise elde ettiği zafere odaklanıldığı tespit edilmiştir. Bununla birlikte her üç mizah dergisinde Balkan Savaşları’nda Avusturya-Macaristan İmparatorluğu’nun bölgedeki en büyük rakibi Rusya’nın Balkan devletlerini yönlendirdiği ya da desteklediği üzerinde durulmuştur. Çalışmada mizah dergilerinde Balkan Savaşları’nda Osmanlı İmparatorluğu ve Balkan Devletleri’ne mesafeli bir yaklaşım sergilendiği ve Rusya’nın Balkan devletleri üzerindeki potansiyel nüfuzuna yönelik okurların dikkatinin çekilmesine çalışıldığı sonucuna ulaşılmıştır.
In silico Molecular Docking, Molecular Dynamic Simulation and ADME Study of New (2-Methyl Benzimidazole-1-yl)-N- Derivatives with Potential Anti-proliferative Activity
Authors: Saeb Mariam , Mahdi Monther Faisal , Al-saady Foad A.
Published: December 2024

ABSTRACT

Although there has been great progress in the development of anticancer medications, numerous obstacles remain, including drug resistance, poor effectiveness, and excessive toxicity, which have all profoundly impacted the daily lives of cancer patients. Because of this, finding highly selective, effective, and non-toxic anticancer drugs is a major challenge in current cancer research.
We present an in silico evaluation of a new series of 2-methylbenzimidazole derivatives to determine the anti-proliferative effect in the epidermal growth factor receptor (EGFR) active sites.
Our six compounds docked with the EGFR crystal structure (protein data bank code: 4HJO) to determine their binding affinity to active sites.
One of these compounds showed a high score (75.5) and two compounds had as binding energy as the gold standard drug erlotinib.
The molecular dynamic simulation study revealed that compound 1 had good alignment with the EGFR receptor
according to Root Mean Square Deviation (RMSD) and Root Mean Square Fluctuation (RMSF) data.
After analyzing the ADME study of virtually active compounds, they achieved Lipinski's rules, and other pharmacokinetic properties.
Lastly, these compounds can function as precursors for the development of novel anti-proliferative drug.
Identification of Indole Derivatives as Selective Cyclooxygenase-2 Inhibitors by Virtual Screening and Molecular Dynamic Simulation
Authors: Abdulaali Sahib Mohammed , Faisal Mahdi Monther
Published: December 2024

Selective COX-2 inhibitors present a promising strategy in pain management due to their reduced adverse effects compared to non-selective COX inhibitors targeting COX-1. This study focuses on the design and virtual exploration of 8 indole derivatives using molecular docking, ADMET, and molecular dynamics (MD) simulations. Molecular docking highlighted the significance of hydrophobic and hydrophilic amino acid residues for ligand stability, with compounds 4 and 5 exhibiting notably strong in silico affinities to COX-2 (docking scores of -11.349 kcal/mol and -10.872 kcal/mol, respectively). Molecular dynamics simulations confirmed the stability of the COX-2-compound 4 complex over 50 ns, revealing consistent ligand-protein interactions through Root Mean Square Deviation (RMSD), Root Mean Square Fluctuation (RMSF), and ligand binding analysis. ADMET analysis of the active compounds showed favorable drug-like profiles and desirable pharmacokinetic properties. This comprehensive computational approach sheds light on the structural dynamics and pharmacological characteristics of these indole derivatives, underscoring their potential as selective COX-2 inhibitors for pain management and paving the way for further experimental validation and clinical exploration.
Study of the structure of atomics by the method of electron scattering in the distorted-wave approximation: Atomic energy
Authors: Mirteimour M.m. , Aliyeva Mina
Published: December 2024

Using distorted-wave approximation obtained the differential cross-section (DCS) of elastic scattering at energy of 80 eV of electrons on 49In, 31Ga, 34Se and 70Yb atoms, and calculated accordingly on the proposed mathematical method. The electron density distribution in the atom is chosen as a function calculated in the Dirac-Hartree-Fock-Slater approximation, which is a superposition of the spherically symmetric Yukawa potential. In addition, the DCSs were calculated for the electron density in the 49 In and 20 Ca atoms expressed as a three-parameter Fermi function at incident electron energy of 100 eV. The obtained theoretical calculations of the cross sections were compared with the experimental data. Besides, the proposed mathematical method simplifies the calculation of integral expressions and makes it possible to obtain a convenient and simple expression for the atomic form factor. Data on the scattering cross sections of electrons on atoms are of considerable interest both in the field of fundamental science for in-depth study of interaction processes and in practical applications, and are necessary in many areas of research, such as modeling low-temperature plasma, astrophysics phenomena, laser physics, and atmospheric effects etc. In addition to natural phenomena, the processes of collision of electrons with matter play an essential role in plasma technologies, such as, for example, microelectronics and biomedicine. Atomic physics, plasma physics and optics - fields directly related to electron-atom make a significant contribution to the fundamental understanding of the world. Despite the long study of the effects of electron scattering on atoms, and the results obtained in the physics of atomic collisions, this area still requires theoretical and experimental research, there is a significant lack of data on collision cross sections for their subsequent use in modeling and calculations. In particular, there are no systematized data on the cross sections for elastic scattering of high energy electrons by atomic.
DFT theoretical calculations on (Z)-2-hydroxy-N′-(4-oxo-1,3-thiazolidin-2-ylidene) benzohydrazide as a methylene tetrahydrofolatereductase inhibitor: An in silico study, molecular docking, and molecular dynamics simulations
Authors: Boudjenane Fatima , Rahmani Rachida , Megrouss Youcef , Chouaih Abdelkader , Benhalima Nadia
Published: December 2024

In this study, (Z)-2-hydroxy-N′-(4-oxo-1,3-thiazolidin-2-ylidene)benzohydrazide (HTBH) was theoretically studied. The B3LYP/6-311G (d,p) level of calculation was used to accomplish the optimal molecular geometry, the global reactivity descriptor parameters, Fukui functions, and molecular electrostatic potential (MEP) parameters. The reduced density gradient (RDG) was used to explore the non-covalent interactions in the molecular system. Furthermore, possible nonlinear optical characteristics were explored. These properties include the electric dipole moment, mean polarizability, and first and second hyperpolarizabilities, indicating the intriguing uses of the HTBH in optical systems. The dipole moment of HTBH molecule was calculated to be 6.81 D, while the static second order hyperpolarizabilitywas found to be of 29.86×10-36esu. In addition, the MEP map provides insight into the electrostatic potential distribution within the molecule indicating that most nucleophilicand electrophilic regions are around oxygen atoms and H atom of the hydroxyl group, respectively.Using molecular docking, the inhibitory nature of HTBH against the methylene tetrahydrofolatereductase (NADPH) protein was analyzed. This enzyme involves in folate metabolism, and its inhibition can have implications for various biological processes. Finally, through a detailed molecular dynamics (MD) simulation, we unravel the compound's inhibitory potential and binding characteristics, offering valuable information for developing therapeutic interventions. The binding energies were computed as well by using the MM-PBSA.
An in silico study of new 1-aminoquinoline-2(1H)-one derivatives as tyrosine kinase inhibitors
Authors: Jabbar Sarah , Mohammed Mohammed
Published: December 2024

The field of oncology has been revolutionized by the discovery and development of targeted therapies for cancer. A study focuses on the development of tyrosine kinase inhibitors (TKIs) as effective targeted therapies. Although TKIs have shown promise in targeting cancer cell signaling pathways, the emergence of resistance poses a significant challenge, necessitating the development of novel and potent inhibitors.
Virtual docking simulations, which use molecular docking algorithms and scoring functions, predict how these TKIs bind to the enzyme and assess their binding strength. Preliminary results show that several of the designed TKIs have a strong binding affinity and form key interactions with the target tyrosine kinase. These interactions include hydrogen bonds, hydrophobic interactions, and electrostatic interactions, which are crucial for stabilizing the complex between the TKI and the enzyme. Additionally, the study identifies specific amino acid residues within the tyrosine kinase binding site that enhance the binding affinity of the TKIs. This detailed information is valuable for further optimizing TKI design and developing more effective inhibitors with improved binding properties.
Theoretical Study of Structure and Acidity of Uric Acid and its Metal Complexes: M(UA)+n (M= Li+, Be++, Na+, Mg++, K+, Ca++) and M(UA)2+n (M= Zn+2, Cd+2, Cu+, Ag+)
Authors: Hafied Meriem , Aichi Mohammed
Published: December 2024

Uric acid (UA) is a biological molecule which is susceptible to be investigated theoretically. A theoretical investigation is carried out in the gas phase and by water effect at the ground state by using density functional theory method (DFT) at the B3LYP/6-31(d) and B3LYP/ LANL2DZ levels on the structure of different chemical forms of Uric Acid (UA) and its metal complexes. Solvent effect (water) is included using the polarizable continuum model (PCM). Neutral structures (ketonic, enolic, dimeric, monohydrate) and anionic structures has been fully optimized. Furthermore, and in order to estimate the Brönsted acidity of (UA), the interaction of both enolic and ketonic forms with alkali meta cations (Li+, Na+, K+, Be++, Mg++, Ca++) was calculated in M(UA)+n complex structures. Proton acidity of (UA) and its complexes was estimated by calculating deprotonation energy (DE) and δ (ppm)11H NMR chemical shift using GIAO method. Metal cations effects on distinct N-H and O-H stretching vibrational modes of studied structures have also been examined. Further, we explored the geometry, and acidity of several uric acid transition metal complexes M(UA)2+n (M= Zn+2, Cd+2, Ag+, Cu+) in water. The complex was calculated using mixed basis set 6-31G(d) and LANL2DZ (on the transition metal).
SARS-COV-2 Inhibitors from Azadirachta indica Leaves: Chemical Composition, Molecular Docking and Quantum Chemical Studies
Authors: Otuokere Ifeanyı
Published: December 2024

Since late 2019, the highly transmissible and virulent coronavirus SARS-CoV-2 has been the source of a pandemic called COVID-19. The public's health and safety were at risk because of this pandemic. The aim of this research is to identify phytoactive compounds derived from Azadirachta indica that may be employed as a possible SARS-CoV-2 inhibitor. Twenty chemicals were found in the leaves of A. indica by GC-MS analysis. Molecular docking indicated that the phytocompounds had good binding energies. Based on drug-likeness results, every identified compound complied with Lipinski's Rule of Five (RO5). This demonstrated that the compounds found in A. indica leaves will experience less attrition in clinical trials, increasing their likelihood of being marketed. According to the current research, the phytocompounds of A. indica leaves that have been identified may be used to synthesize novel COVID-19 drugs. The findings indicate that the compounds have the potential to effectively inhibit SARS-CoV-2 and could be developed into therapeutic medicines for treating COVID-19, pending experimental validation and clinical approvals.
Molecular docking Screening, in silico drug design and ADME prediction of 10-amidinobenzonaphthyridines as potent inhibitors of Plasmodium falciparum Lactate Dehydrogenase
Authors: Mahmud Aliyu Wappah , Ibrahim Muhammad Tukur , Abdullahi Usman , Mustapha Ahmad
Published: December 2024

Management and control of malaria remain challenging due to the continuous emergence of drug resistant and the adaptive nature of the mosquito vector. This necessitates the continuous discovery of potent antimalaria drugs. Lactate dehydrogenase from Plasmodium falciparum (PfLDH) is an essential catalyst for the parasite’s energy production. PfLDH is a significant target in the design and discovery of antimalarial drugs because its inhibition leads to the death of the parasite. In this work, fifteen 10-amidinobenzonaphthyridine molecules active against Chloroquine-sensitive and Chloroquine-resistant strains of P. falciparum were screened through molecular docking with the view to find lead inhibitor of PfLDH. The binding affinities of the compounds ranged from -5.5 to -7.8kcal/mol. The compound with the highest binding affinity was modified and nine novel 10-amidinobenzonaphthyridines were designed. The designed compounds have better binding affinity toward the target ranging from -7.8 to -8.8kcal/mol and four of which have better binding affinities than Pyronaridine, a 10-amidinobenzonaphthyridine antimalaria drug. Furthermore, ADME properties of the designed compounds were predicted in silico and their drug-likeness investigated using Lipinski’s rule of five and Veber’s rule of two. Based on these rules, compound D1, D2, D3, D4, D5 and D8 are potential oral drug candidates. Compound D2, D3 and D8 have good binding affinities and ADME properties therefore, can be developed into potent antimalaria targeting PfLDH. The results of this work can be used to develop active antimalaria drug capable of inhibiting PfLDH.
DFT study of CdSe nanotube doped with Cr atom
Authors: Guliyev Jeyhun , Jalilli Javid , Ismayilova Narmin
Published: December 2024

Electronic and optical properties of doped with Cr atom CdSe nanotube investigated from first principles calculations. It was found that, doped with Cr atoms CdSe nanotube show half metallic properties. The imaginary and real part of dielectric function were calculated for pure and Cr doped nanotube and compared. Our calculations show that Cr atom induce blue shift for spin down states and red shift for spin up states. The half metallic behavior makes Cr doped CdSe nanotube suitable to be used in spintronic devices.
Virtual Screening Bioactive Compounds of Rheum Genus in Inhibiting Steatohepatitis: In silico studies
Authors: Ahmad Ahmad , Firdayani Firdayani , Kartika Irma
Published: December 2024

The fatty liver disease known as steatohepatitis is characterized by liver inflammation. De novo lipogenesis and mevalonate pathway have been identified as contributing to the development of fatty liver. Rheum genus has pharmacological properties such as antioxidant, anti-inflammatory, hepatoprotective, and hypolipidemic. Consequently, the current study investigated bioactive compounds from Rheum genus using in-silico method. The 109 compounds and their natural inhibitors against the enzyme targets ATP-citrate lyase (ACLY), Acetyl-CoA carboxylase (ACC), Fatty Acid Synthase (FASN), Stearoyl-CoA desaturase (SCD1), and HMG-CoA reductase (HMGCR) were performed. The results obtained are in the form of a re-rank score, with the best compound results for each enzyme is Catechin 7,3'-di-O-β-D-glucopyranoside (A1) (-148.73), 4' - Methoxy - 3, 3',5 - trihydroxystilbene' - O - β – D (2"-O-p-coumaryl) - glucopyranoside (A2) (-136,808), 2-Cinnamoyl-1,6-digalloyl glucose (A3) (-149,589), 3-O-Galloyl Epicatechin (A4) (-160,018), and 6-C-Glucopyranosyl Procyanidin B2 (A5) (-84,843) as ACLY, ACC, FASN, SCD1 and HMGCR inhibitors, respectively. Analyses using the ADMET and Lipinski rules revealed that A4 has the potential to be a lead compound for oral drug use, but more research is required.
Computational Insight into the Dual AXL/MerTK Inhibition Potential of Some AXL Inhibitors
Authors: Muhammed Muhammed Tilahun , Bekteş Cihan , İleri Amine
Published: December 2024

Cancer is a multifactorial disease characterized by uncontrolled cell growth and spreading. It is still one of the leading causes of death globally. In addition to this, various side effects of the clinically available anticancer drugs and resistance developments against them have been reported. Therefore, there is an urgent need for novel drugs with high efficacy and low side effects. Tyrosine kinases are among the primary targets of research groups working in this area. MerTK and AXL are members of the TAM (TYRO3, AXL, MERTK) family of receptor tyrosine kinases. MerTK and AXL have a direct involvement in tumor cell survival, chemoresistance, and metastasis. Researches demonstrate the role of MerTK and AXL inhibitors in tumor cell inhibition and immune response modulation. Hence, dual inhibition of the two enzymes is an attractive target in the anticancer drug candidate discovery. There are efforts to discover novel chemical agents that are dual inhibitors of MerTK/AXL. In light of these findings, the inhibition potential of AXL inhibitors on MerTK was investigated through computational methods to find out their dual inhibition potency.
The binding potential of the selected AXL inhibitors to MerTK was explored through molecular docking. The docking study revealed that BGB324 might have the highest binding potential to the enzyme. Hence, BGB324 is anticipated to exhibit the highest dual inhibition among the investigated ligands. Furthermore, the interaction of the selected inhibitors to the enzyme via Asp741 was found to be critical in their binding. Molecular electrostatic potential and frontier molecular orbital appraisal of the selected inhibitors were also undertaken through density functional theory (DFT). The DFT study demonstrated that BGB324 would exhibit the highest chemical stability. The computational study findings need confirmation by further in vitro and in vivo studies.
Virtual screening, Molecular Docking, Molecular Dynamic and ADME of new pyrazole derivatives as anticancer
Authors: Alamiri Ameer , Abd Razik Basma M , Aldabagh Noor
Published: December 2024

Cancer poses a significant global health challenge, demanding the continuous development of effective treatments. This paper explores the domains of virtual screening, molecular docking, pharmacokinetic, and anti-cancer estimation of cell-cycle inhibitors as new pyrazole derivatives. Cancer, a complex ailment characterized by uncontrolled cell growth and metastasis, necessitates innovative and safer anticancer drugs. Traditional chemotherapy, while a primary treatment option, faces challenges such as drug resistance. This paper focuses on finding the safer and effective treatment for lung cancer, the most prevalent and deadly type. NSCLC (Non-small cell lung cancer) account for about 84% of lung malignancies, with LUAD and LUSC being the predominant subtypes. Despite surgery being a common treatment option for NSCLC, many patients are diagnosed at advanced stages, making radiation and chemotherapy the primary treatment modalities. This paper present emphasizing targeted therapy and the role of epidermal growth factor receptor (EGFR). The study introduces a class of heterocyclic compounds, pyrazole derivatives, explored for their distinctive structures and pharmacological activities against cancer. In silico studies, including molecular docking, molecular dynamics and predictions of ADME of the molecules. The results of the molecular docking studies revealed that all six pyrazole derivatives presented respectable attachment energies with the receptor active pocket as comparing with erlotinib and were expected to have promising activity with EGFR protein.
In Silico Assessment of the Insecticidal and Herbicidal Potential of Silichristin Isolated from Silybum Marianum: Pharmacokinetic-Toxicity properties, Molecular Docking, and Molecular Dynamics
Authors: Lanez Touhami , Aissaoui Regadia , Rebizi Mohamed Nadjib , Boussaid Khadidja , Elhafnaoui Lanez
Published: December 2024

The present study aims to evaluate the pesticidal potential of a series of novel silichristin analogues isolated from silybum marianum using in silico approaches, focusing on their effects on the 4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase (HPPD) and acetylcholinesterase (AChE) receptors. A combinatorial library of 729 silichristin derivatives was constructed and virtual screening was performed to evaluate their pharmacokinetic and toxicity properties. Molecular docking analyses were performed to assess the binding affinity of the most potent candidates with target proteins. Our findings revealed that all selected compounds exhibited activity against both HPPD and AChE, with SIL3 and SIL7 demonstrating the lowest binding free energies (-8.4 and -7.9 kcal/mol, respectively). Further investigation via molecular dynamic simulation indicated that SIL3 and SIL7remained stable within the HPPD and AChE active sites, with RMSD values consistently below 2Å throughout the simulation. Overall, these results suggest that the newly identified silichristin derivatives hold promise as anti-pesticide agents.
Theoretical investigations, Molecular Docking, ADMET analysis, Molecular Dynamic Simulation, and Drug-Likeness Scoring of (E)-1-[2-(3,4-Dimethylphenyl) Diazen-2-Ium-1-Yl] Naphthalen-2-Olate as a Corticosteroid Side-Chain-Isomerase Inhibitor
Authors: Megrouss Youcef , Chetioui Souheyla , Kaouche Chafika Farah , Salem Yahıaouı , Drim Khaled , Benyahlou Zohra Douaa , Azayez Mansour , Kaas Sid Ahmed , Drıssı Mokhtaria , Chouaih Abdelkader
Published: December 2024

In this article, the optimized structure and their associated properties of the (E)-1-[2-(3,4-Dimethylphenyl)diazen-2-ium-1-yl]naphthalen-2-olate compound (EDNO) were obtained and evaluated using The density functional theory DFT at the (B3LYP/6-311G++(d,p)) level in the gas phase, To quantify the intermolecular interactions, Hirshfeld surface(HS) analysis was used, HS and 2D fingerprints indicate H⋅⋅⋅H (52%) and C− H⋅⋅⋅C (26.7%) as the most relevant intermolecular interactions in the crystal packing of EDNO. the reduced density gradient (RDG) method was used to reveal and distinguish between attractive interactions such hydrogen bonds, repulsive interactions and van der Waals interactions. Further, molecular docking, binding free energy calculations, and ADMET prole of the title compound was carried out to determine the binding affinity and toxicity. A 100 ns molecular dynamics (MD) simulation was performed to evaluate the binding stability of the compound EDNO/2WV2 complex using Desmond. Binding free energy of the complex was computed for 100 trajectory frames using the MM-GBSA approach
Molecular Dynamic Simulation Study of Newly Cytotoxic 2-(Aminomethyl)Benzimidazole Derivatives as Tyrosine Kinase Inhibitors
Authors: Al-sultan Suhair , Hassan Mohammed , Talib Wamidh
Published: December 2024

Receptor tyrosine kinases (RTK) are considered one of the main targets in cancer therapy due to their high expression. Unfortunately, multiple molecular mechanisms of resistance have been identified, leading to drug resistance and toxicity, which increases the need to discover new structural tyrosine kinase inhibitors. Instead of the rigid molecular docking method, molecular dynamic simulations can treat both the ligand and the protein in a flexible way. This lets the receptor-binding site fit around the new ligand. Also, the effect of explicit water molecules can be studied directly, and very accurate binding free energies can be obtained. The cytotoxic study does not explain the mechanism by which the tested compound could act, so further costly biological studies are needed. So, molecular dynamics is used as a computational technique that simulates the dynamic behavior of molecular systems as a function of time. Using Maestro v 13.0.135 interface (Schrodinger, New York, NY, 2021), molecular dynamic simulation was done with two proteins (EGFR and HER2) that are co-crystallized with the same ligand of a dual EGFR/HER2 inhibitor (TAK-285), and then they were tested with compounds of highly cytotoxic activity (2g and 4g) of suspected dual TKI activity from a previous study. According to the resulted data that were shown in the simulation interactions diagram reports, we recognize that the 2g compound showed a good interaction complex with both 3POZ (EGFR) and 3RCD (HRE2) proteins, while only the 4 g-3RCD complex showed a good interaction report. So, 2g could be considered a dual EGFR/HER2 inhibitor and 4g as an HER2 inhibitor, and for further investigation, both compounds could be tested further with other biological studies, especially enzyme inhibitory assays with suspected promising results.
Computational Evaluation of Molecular Docking and Molecular Dynamic, Study of New Acyloxyalkyl Carbamates Prodrug Derivatives of Fluoxetine
Authors: Alhariri İsraaa , Hamdi Mohammed Dheyaa , Rasool Mahmood Albakaa Ali
Published: December 2024

ABSTRACT
To evaluate the possible actions of five novels' fluoxetine prodrug derivatives, a number of them have been suggested. The prodrug method aims to increase the number of biopharmaceutical drug deliveries and the drug's pharmacokinetics and/or bioavailability. This strategy has additional benefits, such as therapeutic targeting by enzyme-triggered drug release. The extent of butyrylcholine esterase-mediated activation can be predicted using computational models, which also aid in the development of prodrugs. A variety of computational techniques, such as molecular docking and molecular dynamics simulations, which determined the binding affinities of the five fluoxetine prodrug derivatives molecules to the enzyme binding site by docking them. Computer simulations were performed with GOLD program (CCDC) version 5.43, and the compounds were created with ChemDraw version 22.2 (professional version). They were then evaluated for selectivity with BChE, and a control for comparison was butyrylthiocholine. and for 1nanosecond, SiBioLead server was used to run molecular dynamic simulations of compound A1 complexes with BChE enzyme. RMSD, RMSF, RG results, SASA result, and enzyme energy were estimated during this time. Results showed that the prodrug was activated by BChEenzyme, demonstrating the highest binding energy inside the active cite of the enzyme. PLP fitness values of 86.65, 80,81, and 82.819 were recorded by compounds A1, A2, and A4. This study reveals that fluoxetine prodrug molecular design guided by computational simulations can be more mechanistic and less empirical. Moving forward, the earliest possible stage in the development process should be when prodrugs' action is predicted by molecular modeling tools.
Korelasi antara Solidaritas, Status Sosial, dan Formalitas dengan Strategi Kesantunan Berbahasa dalam Talkshow Catatan Demokrasi
Authors: Amaliavanti Zhafirah , Suwadi  , Rokhmawan Tristan
Published: December 2024

Tujuan penelitian ini untuk mengukur dan menjelaskan gambaran solidaritas, status sosial, formalitas, dan strategi kesantunan
berbahasa. Selain itu, untuk menjelaskan korelasi antara solidaritas, status sosial, formalitas dengan strategi kesantunan
berbahasa dalam Talkshow Catatan Demokrasi. Penelitian ini menggunakan metode campuran dengan tipe explanatory
sequential design. Teknik analisis data kuantitatif menggunakanuji instrumen, uji asumsi klasik, dan uji hipotesis. Sementara
analisis data kualitatif menggunakan data kutipan yang berasal tuturan narasumber dalam Talkshow. Hasil penelitian ini
menunjukkan bahwa solidaritas, status sosial, dan formalitas masuk ke dalam kategori sangat tinggi. Sementara strategi
kesantunan berbahasa yang dominan digunakan adalah kesantunan positif dan kesantunan terus terang. Hasil penelitian
juga menunjukkan adanya korelasi secara parsial antarvariabel ke arah positif yang artinya semakin tinggi solidaritas, status sosial,
dan formalitas maka akan mendorong penggunaan strategi kesantunan positif dan terus terang.