SELECTION OF HIGHLY POLYMORPHIC MARKERS TO EVALUATE THE GENE POOL CHARACTERISTICS OF DOGS OF DIFFERENT ORIGINS
Authors: Блохин И.Г. , Блохин Г.И. , Васина А.М. , Диков А.В. , Глазко В.И. 
Published: February 2022

Одной из общих проблем в собаководстве является необходимость разработки методов формирования представлений о «генофондном стандарте» пород. Если для исключения ошибок происхождения широко используются рекомендации ISAG (International Society of Animal Genetics) о генотипировании животных по микросателлитным локусам, то область выявления породной принадлежности собак до сих пор остается недостаточно развитой. В этой связи представляются актуальными оценка внутрипородной изменчивости рекомендованных ISAG микросателлитных локусов, а также исследования полиморфизма геномных элементов, фланкированных инвертированными повторами микросателлитов (Inter-Simple Sequence Repeats – ISSR). Полилокусные спектры ISSR маркеров позволяют получать воспроизводимые профили ДНК маркеров (Gemmill, Grierson, 2021) у отдельных особей и оценивать их внутригруппвую изменчивость. Это требует накопления данных о таких полиморфизмах по разным микросателлитам для подбора наиболее информативных из них по количеству и полиморфизму выявляемых геномных фрагментов у разных пород собак. В этих целях в настоящем исследовании выполнен сравнительный анализ накопленных в литературе данных, позволяющих оценить внутрипородный полиморфизм рекомендованных ISAG маркеров, а также результатов генотипирования трёх пород собак – русской псовой борзой, хортой борзой и грейхаунда по ISSR маркерам с использованием в качестве праймеров микросателлитов (ACC)6C, (ACC)6T, (CAC)7T, (ACC)6G. В результате выполненных исследований по ряду рекомендованных ISAG маркеров обнаружено выраженное внутрипородное разнообразие по полиморфизму, исследованные профили ISSR маркеров у трех пород борзых позволяют рекомендовать их сочетание для разработок представлений о «генофондном стандарте» пород.

One of the common problems in dog breeding is the need to develop methods for forming ideas about the «gene pool standard» of breeds. If the ISAG (International Society of Animal Genetics) recommendations on the genotyping of animals by microsatellite loci are widely used to exclude origin errors, the field of revealing the breed identity of dogs still remains underdeveloped. Therefore, evaluation of inbreeding variability of ISAG recommended microsatellite loci and study of polymorphism of genomic elements flanked by inverted microsatellite repeats (Inter-Simple Sequence Repeats – ISSR) appear to be relevant. Polylocus spectra of ISSR markers make it possible to obtain reproducible DNA marker profiles (Gemmill, Grierson, 2021) in individuals and assess their intragroup variability. This requires the accumulation of data on such polymorphisms for different microsatellites to select the most informative of them by the number and polymorphism of detectable genomic fragments in different dog breeds. For this purpose in the present study was carried out a comparative analysis of data accumulated in the literature, allowing to estimate intra-breed polymorphism of recommended ISAG markers, as well as the results of genotyping of three dog breeds – Russian greyhound, hound and greyhound by markers using as primers microsatellites (ACC)6C, (ACC)6T, (CAC)7T, (ACC)6G. As a result of the studies on a number of the recommended ISAG markers, a pronounced intra-breed diversity in polymorphism was found, the studied profiles of ISSR markers in three greyhound breeds allow to recommend their combination for the development of ideas about the «gene pool standard» of the breeds.