bluuebunny/crossref_metadata_2025 huggingface dataset:
Arbovirus infections incidence in the south of the European part of the Russian Federation
Authors: Vasilenko N. F. , Prislegina D. A. , Maletskaya O. V. , Taran T. V. , Platonov A. E. , Kulichenko A. N.
Published: March 2021

Purpose: analysis of the arbovirus infections incidence in the south of the European part of the Russian Federation in 2015–2019.Materials and methods. Data from statistical documentation (epidemiological examination of the infectious disease cases, reports on the arbovirus infections incidence) reported by Departments of Rospotrebnadzor to Scientific and Methodological Center for monitoring pathogens of infectious and parasitic diseases of 1–3 risk groups for subjects of the North Caucasian and Southern Federal Districts were analyzed. The obtained data were processed using Microsoft Excel 2010 program.Results. In the south of the European part of the Russian Federation Crimean-Congo hemorrhagic fever (CCHF), West Nile fever (WNF), tick-borne viral encephalitis and dengue fever cases are registered annually.An expansion of the territory with registered epidemic manifestations of CCHF and WNF was noted, reflecting an increase in the area of circulation of their pathogens. An expansion of CCHF and WNF epidemic season with the involvement into the epidemic process of people from all age groups including young children was observed. Significant increase in number of imported cases of dengue fever was documented. Markers of tick-borne viral encephalitis, Batai, Inko, Sindbis, and Tyaginya fevers were detected in residents of a number of territories. A high levels of population humoral immunity to West Nile, Batai, Inko, Sindbis Tyaginya, Ukuniemi, Bhanja, Dkhori viruses were identified in the Astrakhan region.Conclusion. The data obtained indicate the need for epidemiological surveillance both for arbovirus infections with a pronounced epidemiological and clinical manifestations, and for infections, the proportion of which in the structure of infectious pathology in southern Russia has not been sufficiently studied, but carrying a potential risk of spreading.
Composition of microflora and state of the system of signal image-recognizing receptors of the family of Toll-like cell factors of innate immunity during 120-day isolation in sealed compartment
Authors: Ilyin V. K. , Orlov O. I. , Rykova M. P. , Komissarova D. V. , Usanova N. A. , Antropova E. N. , Kutko O. V. , Kalinin S. A. , Ponomarev S. A. , Shef K. A. , Sakharova A. V.
Published: March 2021

Aim. This work was undertaken to assess the effect of 120-day isolation conditions in a sealed compartment with an artificial habitat on the formation of microbiocenosis and the system of signaling image-recognizing receptors of the Toll-like (TLR) family of innate immunity.Materials and methods. The microflora of the intestine and upper respiratory tract, as well as the content of monocytes and granulocytes expressing TLRs (TLR1, TLR2, TLR4, TLR6, TLR9) in the peripheral blood, and the basal production of cytokines (IL-1β, IL-6, IL-8, IL-10, TNF-α) by immunocompetent cells of six volunteers was studied. To prevent intestinal and upper respiratory tract dysbiosis, two groups of medication were used: commercial strains (Linex and Bifidumbacterin Forte) and autoprobiotics made on the basis of protective microflora representatives isolated from each individual before the experiment.Results. The studies showed that the stay of a healthy person in an artificial environment had a significant impact on the state of microflora and the system of TLRs of innate immunity cells. This work demonstrates for the first time unidirectional changes in the absolute content of monocytes in the peripheral blood expressing TLR1, TLR2, TLR4, TLR6, TLR9, and the total microbial count in the gastrointestinal tract and in the upper respiratory tract from the 30th to the 120th day of the experimental exposure. Oral administration of autoprobiotic medication contributed to a decrease in the content of opportunistic microflora, while maintaining a high level of protective intestinal microflora, as well as an increase in the production of TNF-α and IL-10 by immunocompetent peripheral blood cells in vitro.
Rights of elders in the light of Quran and Sunnah: A descriptive study
Authors: Ali Nazakat , Khan Muhammad Ajmal
Published: March 2021

Human being, when gets closer to annihilation, he becomes vulnerable as he progresses towards weakness and eventually he becomes mortal. It is the natural process of a human being that he becomes weak over time, but at the same time, where he is near death, then Allah makes him his beloved. He increases the importance of his weakness and develops sympathy for the elders in his immediate surroundings. If Allah has kept his command in a natural order, he has not left it on the requirements of this natural process, but has revealed the guidance of revelation for it, so that if human beings are to be lacking in these matters. If found, then the instructions of revelation should enlighten him on the completion of this process, and he will succeed in the test that is being run in the background of whole system. Thus, the Shari’ah has produced the precise incentive of each and every order in this order, even though there are those who institute the natural requirements. One of these countless issues is the rights of the elders & elderly. The following two main sources of Islamic Shariah are discussed with the Qur’an and Sunnah. The rules of the law are the same for all, but the Shari’ah separates elders from the end of life and gives special priority to them. This research explains their significant rights, describes their rights in the Qur’an.
Legal maxim ‘there is neither crime nor punishment except by text’: Study in the perspective of Islamic criminal law and Pakistani criminal law
Authors: Khan Dr. Naveed Altaf , Zaheer Hafiz Muhammad
Published: March 2021

This study contains on a legal maxim; crime neither can be proved nor be punished without verse or legal text (statute), as well as it is a comparative analysis in prospective of Islamic criminal law and Pakistani criminal law. In contemporary world it is a basic principle in the criminal justice system that a person can neither be convicted nor be punished without prescribed law. Islamic law has fixed some punishments strictly like ?ud?d, qi??? and d?yy?t. while some of the punishments like taz?r?t & siy?sah shar’iah come under the jurisdiction of state according to the circumstances, which can be fixed by practicing parliamentary ijt?h?d by if and only if the experts islamic legal system. This study will deal with the literal meaning of the legal maxim, & will be explained with the references of Qur’an & Sunnah and its applications from Islamic law (al-fiqh al-isl?m?). To make it more clear & evident this maxim will be compared with the constitution & penal code of Pakistan, focusing on the main differences between the concept of crime in both i.e. Islamic criminal law and the Pakistani law.
Discourses of Principles of Ijtihad and Ibn e Hazm’s Approach: an Analytical Study
Authors: Islam Tahir , Perveen Dr. Hafiza Shahida
Published: March 2021

Ibn e ?azm was a notable and leading scholar of al-??hir?yyah. He extended enormous research work in the multiple Islamic sciences such as principles of jurisprudence (‘U??l), fiqh, and comparative study of religions & Islamic philosophy. He presents novel idea regarding juristic effort or Islamic legal reasoning (Ijtih?d). Ibn e ?azm negates the very concept of analogical reasoning (Qiy?s) and calls for mandatory adoption of ijtihad on everyone. Moreover, he mandates few necessary requirements for an Islamic jurist (mujtahid). Further elaborating his notion on this point, he presents different rankings of a mujtahid regarding their right and wrong inferences while performing juristic work. This paper presents such ideas especially discourses of principles of Ijtih?d by Im?m Ibn e ?azm.
Academic Materials on Hinduism in Urdu: A Thematic Bibliography
Authors: Akram Dr. Muhammad , Ul-Ain Dr. Ayesha Qurrat
Published: March 2021

Three types of academic sources are crucial for understanding the Hindu tradition in our times: a) scriptures and the classical texts that are available mostly in Sanskrit b) works in the English language produced by orientalists, religious studies scholars, and some modern Hindu religious leaders themselves, and c) writings of colonial/post-colonial Hindu and Muslim scholars on Hinduism in Hindi/Urdu language that is understood by a vast majority of the population in South Asia. Many Hindu authors used to write on their religion in Urdu using the Perso-Arabic script in colonial India. Similarly, some Muslim authors also produced scholarly works on Hinduism in Urdu, which could open up better Hindu-Muslim understanding. However, Urdu ceased to be the medium of such writings when religion and language surfaced as two vital factors in national identity constructions in the changing sociopolitical milieu, a process through which the Urdu language became associated with Muslim culture and religion. As a result, the number of Urdu works on Hinduism decreased sharply after British India's partition along religious lines. Nevertheless, this body of Urdu literature is an essential part of the history of modern Hinduism. Keeping this in view, we have produced a comprehensive thematic bibliography of Urdu works on Hinduism, including books, dissertations, and journal articles, which would help preserve the history of the indigenous study of Hinduism in modern times.
ANALISIS LOCATION QUOTIENT DAN SHIFT SHARE SEKTOR PARIWISATA SEBAGAI INDIKATOR LEADING SECTOR DI INDONESIA
Authors: Basorudin Muhammad , Afifah Nurul , Rizqi Aniisa , Yusuf Muhammad , Humairo Nadia , Nugraheni Laila Marwinda Siami
Published: March 2021

Tourism is an important sector in supporting national development programs as the largest foreign exchange contributor. But in reality it has a relatively small contribution to GDP. To improve the economy effectively and efficiently, knowledge of provinces that have potential tourism is needed. Based on the results of LQ analysis and 2014 and 2015 quadrant analysis, potential provinces are the provinces of Bali, DKI Jakarta, East Java and DI Yogyakarta. In addition, based on the results of DLQ's analysis, the potential provinces in developing the tourism sector in the future are Aceh, Riau, Jambi, Papua, Bengkulu, South Kalimantan, Lampung, North Sumatra, and East Java. Overall, the tourism sector in East Java Province is a base sector in 2014 and 2015 and remains a base sector in the future.
Justification of regional programs for the control and prevention of malignant neoplasms of the digestive system based on an international comparison of morbidity, mortality and survival rates (research based on materials from CI5 and Concord 3)
Authors: Egorova Alla , Orlov Andrey , Suslin Sergey
Published: March 2021

In the Russian Federation, in comparison with the average European indicators, mortality with malignant neoplasm of the digestive system, even against the background of low morbidity, remains high.
For the scientific substantiation and detailing of organizational measures to improve the control and prevention programs for malignant neoplasm of the digestive system, currently being carried out within the framework of the national project "Fight against cancer in 2019-2024", using the example of one of the typical regions of the Russian Federation - the Samara region, an international assessment was carried out the quality of medical care for this group of patients. At the same time, data on patients included in the database of the Samara population cancer registry in the period 2003-2017, data on cancer patients in the Samara region for the period 2008-2012, included in Cancer Incidence in Five Continents Vol.XI, as well as data on patients with malignant neoplasms registered in the Samara region in 2010-2014 and included in the Concord 3 study. The quality of medical care was assessed for all localizations of the digestive system based on the analysis of trends in morbidity, mortality and relative survival rates.
An international study has shown that in the Samara region, in comparison with European countries, practically in all malignant neoplasms of the digestive system, with a low morbidity, high mortality and low survival are noted.
Based on the data of a reliable onco-epidemiological study carried out in accordance with international standards, it was found that in the regions of the Russian Federation, when developing the financial, human and organizational resources of the national project to combat malignant neoplasms, special attention should be paid to primary prevention programs for colon cancer, liver cancer and gallbladder; organization of comprehensive colorectal cancer screening programs; as well as active implementation of programs for early diagnosis and effective treatment of stomach, pancreas, liver, esophagus and gallbladder cancer.
Prozesslücken modellbasierter Baukostenermittlung aus ausgewählter Akteurskonstellation/Process gaps of model-based construction cost estimation from selected constellation of actors
Authors: Bender Sara , Stoy Christian
Published: March 2021

Die korrespondierenden und bestimmenden Erfolgsfaktoren von Bauprojekten sind im Wesentlichen Qualität, Termine und Kosten. Die Kostenplanung ist deshalb bereits in frühen Phasen ein Bestandteil der Planungsleistung und hat maßgeblich Einfluss auf das Für und Wider einer Projektumsetzung. Im Rahmen der Digitalisierung wurden digitale Werkzeuge und neue Prozessabläufe in der Baubranche etabliert. Die modellbasierte Baukostenermittlung findet in BIM-basierten Bauprojekten Anwendung und bezieht Elementmengen und Informationen aus digitalen Bauwerksmodellen, die aus Objekten mit alphanumerischen und grafischen Eigenschaften bestehen. Die modellbasierten Kostenplanungsprozesse sind wissenschaftlich nicht hinreichend belegt und unterliegen keiner einheitlichen Vorgehensweise. Über Literaturquellen wird ein idealtypischer modellbasierter Soll-Kostenplanungsprozess eruiert, der durch Experteninterviews und deren Auswertung anhand einer qualitativen Inhaltsanalyse überprüft wird. Das Ergebnis ist ein Ist-Kostenplanungsprozess aus der aktuellen Praxis, der Abläufe beschreibt und Prozesslücken bei der Integration von Fachplanermodellen sowie Kostenkontrolle und Kostensteuerung aufzeigt.
Gestaltung des digitalen Kulturwandels zu Open Access im Programm Hamburg Open Science
Authors: Finger Juliane
Published: March 2021

Der Beitrag beschäftigt sich mit dem Projekt ‚Gestaltung des digitalen Kulturwandels‘ des Programms ‚Hamburg Open Science‘ (HOS). Ziel dieses Projekts ist es, den digitalen Wandel hin zu mehr OA zu
unterstützen. Denn um die tradierten oder persönlichen Strategien jeder Fachdisziplin und der Wissenschaftler*innen bei der Planung, Umsetzung und Veröffentlichung von Forschungsergebnissen zu verändern,
bedarf es eines Kulturwandels.
Structure, diversity and potential metabolic activity of prokaryotic communities of Ebro Delta wetlands (Spain) as revealed by 16S rRNA gene amplicon sequencing
Authors: Miralles-Lorenzo Javier , Picazo Antonio , Rochera Carlos , Morant Daniel , Camacho Antonio
Published: March 2021

The monitoring of the structure and potential function of the prokaryotic assemblages of aquatic ecosystems can be used for the assessment of ecosystem health. In this work, we analysed by 16S rRNA gene amplicon massive sequencing the aquatic and sediment prokaryotic communities inhabiting three wetlands located in Ebro river Delta (Spain), which differ in their salinity and trophic status. We extracted the DNA from both matrices and sequenced the V4 region of the prokaryotic 16S rRNA gene by Illumina sequencing. The raw sequences obtained were processed and clustered in ZOTUs, which are sequences at 100% identity that were the basis for the structural and statistical analyses. Our results showed that water communities have less diversity and evenness than sediment communities. Moreover, statistical analyses showed that salinity is the main environmental factor that affects the structuration of sediment prokaryotic communities, while seasonality is also a very additional important environmental driver for aquatic communities. We also studied the relationship between the environmental factors and the potential metabolism of the aquatic and sediment prokaryotic communities, specifically for the main metabolic processes of the C-cycle. Focusing on sediment, we observed that methanogenic archaea are present not only in freshwater environments but also in the saline wetlands, though the observed methane emissions decreased with salinity. To explain this, we studied the potential activity of sulfate-reducing bacteria (SRB) and methanogenic archaea inferring the expression of genes dsrB and mcrA, which are gene markers for dissimilatory sulfate reduction and methanogenesis, respectively. We observed that, in saline wetlands, the potential activity of methanogens decreases because SRB bacteria outcompete them due to the higher sulfate availability enhancing sulfate-reduction. In the sediment communities of low salinity wetlands the relevance of methanogens is lower in terms of relative abundance, but the methane emissions are higher due to the lower sulfate availability. On the other hand, aquatic methanotrophic bacteria are very important in the net balance of methane emissions in Ebro Delta wetlands, as their relative abundance in the water column influences the amount of methane that is finally released to the atmosphere. In conclusion, our study deepens in the relationship between prokaryotic community structure and function in deltaic wetlands, giving a comprehensive overview of factors influencing the ecological health and certain processes, such as methane emissions, in deltaic systems.
Mg-Traits pipeline: advancing functional trait-based approaches in metagenomics
Authors: Pereira-Flores Emiliano , Barberan Albert , Glöckner Frank Oliver , Fernandez-Guerra Antonio
Published: March 2021

Microorganisms comprise an immense phylogenetic and metabolic diversity, inhabit every conceivable niche on earth, and play a fundamental role in global biogeochemical processes. Among others, their study is highly relevant to develop biotechnological applications, understand ecosystem processes and monitor environmental systems. Functional traits (FTs) (i.e., measurable properties of an organism that influence its fitness (McGill et al. 2006)) provide complementary information to the taxonomic composition to improve the characterization of microbial communities and study their ecology (Martiny et al. 2012). The application of FT-based approaches can be particularly enhanced when coupled with metagenomics, which as a culture-independent method, allows us to obtain the genetic material of microorganisms from the environment: Metagenomic data can be used to compute functional traits at the genome level from a random sample of individuals in a microbial community, irrespective of their taxonomic affiliation (Fierer et al. 2014). Previous works using FT-based approaches in metagenomics include the study of community assembly processes (Burke et al. 2011) and responses to environmental change (Leff et al. 2015), and ecosystem functioning (Babilonia et al. 2018).

In this work, we present the Metagenomic Traits pipeline: Mg-Traits. Mg-Traits is dedicated to the computation of 25 (and counting) functional traits in short-read metagenomic data, ranging from GC content and amino acid composition to functional diversity and average genome size (see Fig. 1). As an example application, we used the Mg-Traits pipeline to process the 139 prokaryotic metagenomes of the TARA Oceans data set (Sunagawa et al. 2015). In this analysis, we observed that the computed metagenomic traits track community changes along the water column, which denote microorganisms’ environmental adaptations.

Mg-Traits allows the systematic computation of a comprehensive set of metagenomic functional traits, which can be used to generate a functional and taxonomic fingerprint and reveal the predominant life-history strategies and ecological processes in a microbial community. Mg-Traits contributes to improving the exploitation of metagenomic data and facilitates comparative and quantitative studies. Considering the high genomic plasticity of microorganisms and their capacity to rapidly adapt to changing environmental conditions, Mg-Traits constitutes a valuable tool to monitor environmental systems.

The Mg-Traits pipeline is available at https://github.com/pereiramemo/metagenomic_pipelines. It is programmed in AWK, BASH, and R, and it was devised using a modular design to facilitate the integration of new metagenomic traits.
Biogeographic structuring of benthic microbial communities influence the establishment of global bioindicators for coastal aquaculture impact monitoring
Authors: Frühe Larissa , Pochon Xavier , Laroche Olivier , Keeley Nigel , Dully Verena , Cordier Tristan , Pawlowski Jan , Stoeck Thorsten
Published: March 2021

With an increasing demand for finfish from aquaculture, the importance of monitoring the impact of aquaculture installations on coastal ecosystems becomes more and more important. The traditional approach employs macroinvertebrates as bioindicators to assess the ecological quality (EQ) of near-field benthic ecosystem, which is costly and time consuming. Modern approaches using environmental DNA metabarcodes of microbial organisms (eukaryotes and prokaryotes) have shown to be a powerful alternative. It is crucial that the ecological quality determined by molecular bioindicator signatures mirrors the results of standard macroinvertebrate inventories. Previous studies looking for bioindicators of organic enrichment have so far only analyzed samples within a specific geographic location (e.g. one farm, farms from one country). To answer the question if there are global bioindicators (or core communities) across different biogeographic regions, we analyzed 328 samples from three salmon producing countries (Norway, New Zealand, Scotland) to find commonalities in bacterial and ciliate DNA metabarcodes communities within the same ecological quality groups. We used supervised machine learning (SML) to predict both country origin and ecological status for both bacterial and ciliate eDNA markers. We then investigated if prediction accuracy for ecological quality increases if the dataset is reduced to single-country or two-country subsets to eliminate country/region specific effects. Further, core communities including only cosmopolitan ASVs were tested to detect possible global bioindicators for each individual EQ class. Based on the obtained results, we discuss the potential of a globally applicable database and a global training of an SML algorithm to predict ecological quality in aquafarm sediments using eDNA metabarcodes from benthic bacterial and ciliate communities.
Consistency between high throughput sequencing and microscopy-based morphological characterization of phytoplankton communities
Authors: Vuorio Kristiina , Mäki Anita , Salmi Pauliina , Aalto Sanni , Tiirola Marja , Järvinen Marko
Published: March 2021

Thus far, the phytoplankton community composition analyses, used e.g. monitoring and assessment of the ecological status of water bodies, are based on time-consuming and expertise-demanding light microscopy analyses. Currently, DNA-based molecular tools are being developed to replace microscopy-based analyses. Although most of the DNA is expected to be found in living cells, long-lasting DNA in damaged cells or soluble extracellular or relic DNA can make up a large proportion of the total DNA in water samples. DNA-based phytoplankton analysis has been shown to be affected by the huge variation in the copy number of the rRNA gene between phytoplankton species (Mäki et al. 2017). On the contrary, RNA is present only in living organisms and reflects active protein synthesis. Therefore, RNA-based methods can provide a more reliable estimate of community composition.

The large copy number variation of ribosomal genes and the absence of universal primers for simultaneous amplification of cyanobacterial and eukaryotic phytoplankton genes hinder the application of DNA-based molecular methods. We applied a directional random-primed high throughput sequencing (HTS) approach (Mäki and Tiirola 2018) to analyse 16S and 18S rRNA community structures of 83 boreal lakes in Finland, Northern Europe. With the method it was possible to simultaneously amplify all groups of aquatic microorganisms in addition to cyanobacteria and eukaryotic phytoplankton.

A comparison between microscopy and HTS showed that the relative phylum (Fig. 0) and class level abundances of eukaryotic phytoplankton and order level abundances of cyanobacteria were consistent between the methods, despite that the HTS method overestimated the relative abundance of cyanobacteria. However, correspondence was low at genus and species level, mainly due to the lack of reference library sequences. HTS revealed more genera and was able to differentiate cryptic genera lacking morphological characteristics, but microscopy revealed a longer list of species (Vuorio et al. 2020).

The RNA-based method applied showed potential, but it is not yet able to replace microscopy, mainly due to the lack of full length 16S and 18S sequences in the reference libraries. The main advantage of the method is that it is not limited to phytoplankton, but can be applied to simultaneous investigation of the total composition of microbes, including all bacteria, protists, ciliates, rotifers and zooplankton.
Using metabarcoding and « Diat.Barcode » database to perfom molecular identification on marine biofilms
Authors: Barry-Martinet Raphaëlle , Vedie Elora , Bressy Christine , Briand Jean-François
Published: March 2021

Marine benthic diatoms highly contribute to biofilms formation, playing a crucial role on both living and artificial surfaces ‘colonization (Briand 2017, Salta 2013). However, their microscopic morphological identification is time consuming and requires a high expertise in taxonomy. We therefore decided to look toward molecular analyses and especially metabarcoding. In this study, we determine : (i) if the use of the “Diat.barcode” database, mostly developed for freshwater diatoms (Rimet 2019), is relevant to characterize marine biofilm communities, (ii) if the amplification of degenerated primers targeting the rbcL gene (Vasselon et al. 2017) could improve the diversity of marine diatom biofilms, and (iii) if molecular and morphological analyses could be correlated.A large majority of OTUs (>95%) was affiliated using the “Diat.barcode” database and the pipeline FROGS, with coverage and affinity values above 80%. OTUs tables contained 75% of diatom species already reported from marine environment, with 82% belonging to the pennates group. The use of degenerated primers significantly improved richness and diversity. Moreover, it allowed us to identify taxa that were not present before, as Iconella, Sellaphora and Coronia. Finally, we showed higher richness and diversity, but also a higher repeatability (replicates closeness) leading to a better clustering with metabarcoding. We found differences in terms of biomarkers, but more broadly, we were able to correlate significantly (r = 0,404; p<0.0001) diatom assemblages.While the latest version of “Diat.barcode” database contains only 12.4% species referenced as marine, it appears to be a powerful tool, even on biofilm samples from the Mediterranean, Baltic seas and Indian Ocean. Furthermore, we confirmed the relevance of degenerated primers to amplify a higher diversity of diatoms. Finally, beta-diversity similarity using molecular and microscopic analysis appeared positive, leading to the conclusion that the two methods should be used in a complementary way.
Lake sedimentary DNA to reveal long-term changes in aquatic biodiversity and ecosystem functioning
Authors: Domaizon Isabelle
Published: March 2021

The emergence of molecular analyses based on the sequencing of sedimentary DNA has opened up many new areas of inquiry in paleolimnology. DNA preserved in sediments (SedDNA) offers the possibility to consider taxa that were traditionally not accessible because they do not leave distinct morphological fossils.

Recent applications that considered a diversity of biological groups (including bacteria, protists, zooplankton, fish) illustrate how efficiently SedDNA-based methods complement both classical paleolimnology proxies and limnological data. The knowledge gained from this approach is very diverse in scope, ranging from quantifying natural variability in population and community dynamics to understanding how these biological variables respond to anthropogenic disturbances and climatic change. The use of lake sedimentary DNA to track long-term changes in aquatic biota is a rapidly advancing field of research.

Based on recent applications, this presentation illustrates (i) the potential and challenges associated with the study of SedDNA to address critical research questions in lacustrine ecology (ii) the main methodological precautions to be taken into account for implementing these types of DNA analyses (i.e. best practices) and (iii) the emerging topics that could be addressed using sedimentary DNA, in particular to reconstruct the temporal dynamics of lacustrine biodiversity.
Professeur-documentaliste
Authors: Fabre Isabelle
Published: March 2021

Le professeur-documentaliste est à la fois un enseignant de la discipline information-documentation et le gestionnaire d’un système d’information pédagogique au service des usagers d’un établissement scolaire. Ce système d’information se matérialise dans le centre de documentation et d’information (CDI), espace a priori fondamental dans le parcours d’apprentissage mais cependant souvent vécu comme un espace non reconnu et peu valorisé. Non-lieu, espace potentiel, espace transitionnel ou encore hétérotopie, nous tenterons à travers ces différentes approches de l’espace d’en mesurer le rôle dans la construction d’un tiers-métier .
Transitions vers l'agriculture biologique
Authors: Fauriel Joël
Published: March 2021

Le verger constitue un système pérenne dans lequel la protection phytosanitaire occupe une place importante de l’itinéraire technique. L’enjeu d’une transition vers des systèmes économes en intrants est d’autant plus grand que l’espèce fruitière considérée est la cible d’un grand nombre de bioagresseurs. Le point de départ peut être un verger existant, implanté sans objectif particulier de limiter l’utilisation de fertilisants et de produits phytosanitaires, mais l’idéal est une démarche à partir d’un terrain à aménager en un verger conçu pour fonctionner d’une manière plus autonome vis-à-vis des intrants externes.
Transitions vers l'agriculture biologique
Authors: Benoît Marc , Veysset Patrick
Published: March 2021

Ce chapitre aborde conjointement les productions ovine et bovine allaitantes et montre que la réussite économique de la conversion à l’AB y repose avant tout sur la capacité à concilier productivité animale et degré d’autonomie alimentaire élevés, en adaptant le système d’élevage au contexte local.
Variations autour des PME et entreprises de taille intermédiaire
Authors: Labaki Rania
Published: March 2021

Ce chapitre nous livre les grandes lignes du cheminement de la recherche sur les entreprises familiales, articulées autour des travaux de Gérard Hirigoyen et de ses co-auteurs. À travers une épopée récitée en 7 actes, il retrace les paroles académiques à portée opérationnelle que prononcerait le prophète de l’Entreprise Familiale en réponse aux questionnements de chercheurs, dirigeants et consultants sur les thématiques phares de l’hétérogénéité, la finance, l’identité, la succession, le temps, la gouvernance, et les liens familiaux dans les entreprises familiales.
Variations autour des PME et entreprises de taille intermédiaire
Authors: Ousseini Djibrilla Moussa
Published: March 2021

Que ce soit pour financer la croissance, remplacer un actionnaire sortant, ou se désendetter, les problèmes sont nombreux qui amènent les EFNC à choisir entre ouvrir ou ne pas ouvrir le capital. Elles sont en général hostiles à l’arrivée d’investisseurs extérieurs. Les enjeux sont à la fois économiques et financiers, socio-psychologiques et de gouvernance. Il ressort de cette étude que la décision mérite d’être analysée sous le triple angle du management, de la famille et de la propriété, afin de mieux comprendre les arbitrages entre les menaces et les opportunités.
Vivre avec une maladie neuro-évolutive
Authors: Demoures Geneviève
Published: March 2021

Parce que la personne a du mal à décider, à anticiper, parce qu’on ne prend pas le temps d’expliquer ou qu’on décide à sa place, l’égalité dans l’accès aux soins peut être discriminante à son égard. Au motif de ne pas subir ou faire subir d’acharnement thérapeutique, le risque d’abandon de soins menace le malade, ses proches et les professionnels.
Vivre avec une maladie neuro-évolutive
Authors: de la Sayette Vincent
Published: March 2021

Il faut expliquer la démarche diagnostique, l’intérêt et les limites des différents examens comme l’impossibilité de prédire l’évolution et plus largement l’avenir. Moyennant ces précautions, le diagnostic de maladie d’Alzheimer (ou d’une autre maladie) peut être annoncé : il est probable, possible, indéterminé ou très peu probable, mais une part variable d’incertitude règne toujours.
Vivre avec une maladie neuro-évolutive
Authors: Hirsch Emmanuel
Published: March 2021

La maladie neuro-évolutive expose à des énigmes et à des effrois qui, du fait d’incidences possibles sur l’autonomie, la faculté d’agir et de penser, de contrôler parfois ses comportements, accablent de tourments, d’incertitudes et de peurs diffuses qui avivent le sentiment de souffrir. Certains osent pourtant évoquer, comme à contre-courant, une expérience philosophique et spirituelle de leur confrontation à la souffrance, l’acquisition d’une sagesse et d’une maîtrise de soi, d’une capacité de dépassement et d’engagement. C’est ainsi qu’ils défient la souffrance, et déjouent ses menaces lancinantes.
Vivre avec une maladie neuro-évolutive
Authors: Fiat Éric
Published: March 2021

Dans le regard de beaucoup de nos contemporains sur les malades, n’y a-t-il pas cet étrange mélange de l’élaboré et de l’archaïque, de respect et de rejet, d’estime et d’effroi, de considération et de fascination ? Comment veiller au quotidien sur la dignité ontologique de tout homme ? Surtout quand dans ledit quotidien la rencontre du soignant et du soigné est plus souvent celle d’une fatigue et d’une souffrance que celle d’une forme et d’une gratitude ? La dignité, à l’épreuve de la grise et fatigante succession des nuits blanches et des jours noirs : tel sera ici mon objet d’étude.
L'enfant en Centrafrique
Authors: Kobelembi Frédéric
Published: March 2021

Depuis son apparition en 1984, le sida a été considéré par les autorités politiques et sanitaires centrafricaines comme un véritable problème de santé publique. Malgré les actions multiformes de campagne de sensibilisation menées à travers le pays, on se rend compte grâce aux résultats de l’enquête MICS 2000 que les femmes ont encore un faible niveau de connaissance des modes de transmission du VIH/sida. Considérant la jeunesse de la population centrafricaine, notre propos est d’identifier les différentes perceptions du VIH/sida chez les adolescentes et de mettre en lumière les facteurs qui les sous-tendent et les expliquent. Les déterminants des perceptions sont variables suivant qu’il s’agit de la connaissance des trois modes de prévention, de la connaissance des trois modes erronés de transmission et de la connaissance des quatre modes de transmission. Les principaux déterminants de la connaissance des trois modes de prévention sont la région de résidence, le niveau d’instruction, le niveau de vie, la religion et le milieu de résidence. Quant à la connaissance des trois modes erronés de transmission, le niveau d’instruction, la région administrative, le niveau de vie et la religion sont les principaux facteurs qui influencent cette connaissance chez les adolescentes. Enfin, la connaissance des quatre modes de transmission chez les adolescentes est déterminée par l’âge, le niveau d’instruction, la religion, la région de résidence et le niveau de vie du ménage. On s’aperçoit ainsi que l’instruction est une variable cruciale qui favorise l’émergence des nouvelles idées, l’ouverture vers la modernité. En définitive, la relation entre les perceptions du VIH/sida chez les adolescentes et les principaux déterminants dépassent le simple truisme, mais les mécanismes complexes qui les relient ne sont pas élucidés dans le cadre de cet article et constituent l’une des limites de ce travail.
Neuropsychologie du bégaiement
Authors: Estienne Françoise , Piérart Bernadette
Published: March 2021

Évaluer un bégaiement est une tâche complexe qui intéresse les contextes cliniques et ceux de la recherche avec des impératifs partiellement différents. Une revue critique des outils disponibles axés sur des mesures objectives et subjectives utilisés respectivement dans le secteur clinique et à des fins de recherches aboutit à la présentation d’une lecture intégrative qui prend en compte le bégaiement, la personne qui bégaie et son milieu.
Les grandes décisions de l’histoire de France
Authors: Bertière Simone
Published: March 2021

On entrait dans l’année 1661. Louis XIV, âgé de vingt-deux ans, n’était pas nouveau sur le trône. Devenu roi en 1643, à quatre ans et demi, déclaré majeur à treize ans, puis sacré à Reims, il était désormais marié, bientôt père. Comment pouvait-il se contenter d’un rôle de figuration et abandonner la réalité du pouvoir à son parrain, le cardinal Mazarin, au risque de se voir taxer de « négligence et de mollesse 1  » ? Qu’attendait-il pour rejeter le joug ? La réponse est simple : il avait vécu aux côtés de sa mère les années dramatiques où une guerre civile, jumelée à la guerre étrangère, secouait le royaume. Mazarin était venu à bout des deux et avait sauvé l’autorité royale. L’écarter eût été le désavouer. Autant attendre sa mort prochaine. Il laissait à son filleul un royaume en état de marche, dans une Europe pacifiée dominée par la France. Comment Louis XIV se comporterait-il, le moment venu, face aux décisions qu’il lui faudrait prendre ? Ce « second avènement » serait-il pour son règne une ouverture réussie ? Le jeune roi ne fut pas pris au dépourvu. Les poursuites engagées contre Fouquet, le surintendant aux finances, allaient servir de révélateur.
Les grandes décisions de l’histoire de France
Authors: Poussou Jean-Pierre
Published: March 2021

Le mystère de la Révolution française tient d’abord au flou entourant ses origines. Selon la tradition, elle débute le plus souvent par la prise de la Bastille ou par les journées d’octobre 1789, scellant la mystique du peuple en armes dressé contre l’Ancien Régime pour la conquête de ses libertés. En réalité, les jeux étaient déjà faits, non à l’initiative du peuple mais d’une minorité active de notables et de nobles libéraux, frondant depuis deux ans un pouvoir royal à la dérive, malade d’impuissance et incapable de prendre la moindre initiative pour résoudre la crise économique et conjurer une crise politique de plus en plus virulente depuis la chute de Calonne en mai 1787 1 . La réunion des états généraux, deux ans plus tard, cristallise les mécontentements et donne l’occasion à la majorité de « couper le câble » comme l’y invitait Sieyès. Le 17 juin, sur proposition la veille au soir d’un député berrichon, Legrand, les députés du tiers état qui siégeaient aux états généraux depuis le 5 mai, et qu’avaient rejoints dix-neuf curés de la députation du clergé, décidèrent de se nommer « Assemblée nationale ». L’expression n’était pas absolument nouvelle, Sieyès, notamment, l’ayant déjà employée à plusieurs reprises, mais dans ces circonstances elle marquait un changement proprement révolutionnaire .
Les grandes décisions de l’histoire de France
Authors: Chavanette Loris
Published: March 2021

L’abolition de la monarchie, le 21 septembre 1792, précipitée par la guerre et par les massacres de Septembre, oblige la Convention nationale tout juste réunie à répondre à la question : que faire de Louis XVI, prisonnier depuis qu’il a été renversé par les insurgés de la « Journée du 10 août » ? Faut-il le juger ? Encore faudrait-il qu’il soit justiciable, ce dont le préserve en théorie la Constitution de 1791. Certains, comme Saint-Just, demandent la mort sans autre forme de procès. L’obstacle juridique surmonté, Girondins et Montagnards s’affrontent sur la procédure du jugement. Les premiers préconisent la voie référendaire et le recours au peuple, pour les seconds la décision doit revenir aux représentants de la nation. Les Montagnards font prévaloir leur point de vue, prémices de leur victoire au moment de la Terreur. Cet acte de foi et de souveraineté entériné, rien ne s’oppose plus au déroulement d’une tragédie dont la scène centrale, le vote, dura près de vingt-quatre heures, scellant à jamais en lettres de sang la ligne de partage des eaux de l’histoire de France .
Les grandes décisions de l’histoire de France
Authors: Malye François
Published: March 2021

« Le dernier mot est-il dit ? L’espérance doit-elle disparaître ? La défaite est-elle définitive ? » Il est environ 18 heures lorsque la voix d’un quasi-inconnu, le général de Gaulle, franchit la Manche pour s’adresser à ces Français qu’il a laissés la veille, le jour même où par la voie radiophonique également, le maréchal Pétain leur annonçait qu’il avait demandé aux Allemands les conditions d’un armistice. Éternel rebelle, Charles de Gaulle vient de franchir le Rubicon ce 18 juin 1940 en lançant son appel depuis le studio 4B de la BBC. Devenu le « général micro » pour ses détracteurs, il « entre dans l’aventure », celle de la France libre. Sa décision de prendre la parole découle logiquement d’une autre décision prise dans la nuit du 16 au 17 juin par le sous-secrétaire d’État à la Guerre : quitter Bordeaux où s’était réfugié le gouvernement français désormais dirigé par Pétain. Dès qu’il pose le pied dans la capitale anglaise, il sollicite auprès de Winston Churchill, Premier Ministre britannique, l’autorisation d’utiliser la radio afin de se faire connaître auprès de ses compatriotes. Séduit par cet immense personnage qui « avait emporté avec lui l’honneur de la France », Churchill la lui accorde sans hésiter. Mais si ce choix fut pris avec la résolution la plus ferme, sa mise en pratique et en ondes se heurta à de multiples obstacles dressés par les Anglais et fut bien plus chaotique que la légende gaullienne ne voudra le faire accroire. L’intrusion de ce général français inconnu n’était en effet pas du goût du Cabinet de guerre qui tenta par tous les moyens d’empêcher un discours qui pouvait nuire à l’Angleterre. Si, par cet appel, de Gaulle devint le symbole même de l’homme libre, il dut aussi ce jour-là en rabattre sur sa liberté. Mais bien soutenu par quelques alliés déjà dans la place, il démontra pour faire entendre sa voix cette opiniâtreté à laquelle il exhortait lui-même les Français. « Quoi qu’il arrive, la flamme de la résistance française ne doit pas s’éteindre et ne s’éteindra pas. »
Le bébé et les interactions précoces
Authors: Premack David , Premack Ann James
Published: March 2021

Nourrissons attribuant une valeur +/ – à des actions orientées vers/ou venant des objets animés Le mouvement est une source fondamentale d’informations pour les interprétations humaines premières, il est essentiel à la conception fondamentale de la causalité et, comme le suggère le modèle présenté en fait l’argument, tout autant essentiel pour la conception fondamentale de l’intentionnalité. Le modèle s’appuie sur deux hypothèses principales : quand un nourrisson perçoit un objet (1) se déplaçant spontanément et (2) exhibant une action orientée vers un but, il interprétera l’objet comme doté d’intentionnalité et lui assignera les propriétés spécifiques du domaine psychologique. La propriété principale testée est : les nourrissons attribuent-ils des valeurs + / –  aux interactions entre objets intentionnels utilisant des critères spécifiés par le modèle ? Nous avons montre à des nouveaux-nés (d’un âge moyent de 52 semaines) des animations produites par un ordinateur et présentant des «  balles » se déplaçant spontanément, en utilisant le temps d’observation en tant que paradigme de l’accoutumance et de la désaccoutumance. Dans deux interactions positives, soit une balle «  caresse » une autre, soit « l’aide » à atteindre son but ; cependant que dans deux interactions négatives, soit une balle « frappe » l’autre, soit/’« empêche » d’atteindre son but. Conformément à la prévision du modèle , les nourrissons accoutumés aux conditions positives montrent, quand ils sont transférés dans des conditions négatives, une plus grande désaccoutumance que ceux habitués aux conditions négatives. Ces résultats ne pouvaient pas s’expliquer facilement par la similarité entre les animations représentant les interactions. Ces résultats suggèrent que bien avant l’âge où l’enfant peut attribuer des états mentaux ou possède une « théorie de l’esprit », celui-ci reconnaît les buts d’objets mus par eux-mêmes et attribue des valeurs à leurs interactions réciproques.
La première année de la vie
Authors: Dubon Rougier Corinne D.
Published: March 2021

Il s’agit d’une étude longitudinale portant sur l’apparition et l’évolution des comportements rythmés répétitifs du jeune enfant ; observation directe (papier-crayon et video) en crèche, au cours des activités familières à l’enfant (jeux, alimentation, sommeil, élimination). L’étude concerne 26 enfants âgés de 2 à 38 mois et a permis d’établir la sémiologie évolutive des comportements rythmés répétitifs, leur fréquence et leur répartition. Nous avons mis en évidence :  —  l’individualisation précoce de ce type de comportement et sa continuité durant les trois premières années de la vie malgré des éclipses plus ou moins longues,  — l’influence des paliers maturatifs sur leur nature et leur fréquence,  — l’importance durable des comportements de type oral et le glissement possible de comportements répétitifs relativement banals vers des comportements relevant d’un processus auto-offensif (rôle de l’environnement).
Capitalismes asiatiques et puissance chinoise
Authors: Chiang Min-Hua , Gerbier Bernard
Published: March 2021

Résumé Ce chapitre est consacré aux questions que posent les progrès récents des relations économiques entre les deux rives du détroit de Formose à l’économie et à la souveraineté politique de Taïwan. Premièrement, au cours de la dernière décennie, l’investissement taïwanais en Chine est passé d’une production manufacturée à forte intensité en travail, effectuée principalement par des PME, à une production à haute technologie assurée par des grandes entreprises. Bien que les firmes taïwanaises aient bénéficié de l’accroissement de leurs économies d’échelle, la surdépendance à l’égard de la production manufacturée chinoise s’est traduite par la désindustrialisation de Taïwan. Deuxièmement, le commerce tawaïnais est devenu de plus en plus dépendant de la Chine, plutôt que l’inverse. Même si les conditions d’une réconciliation politique ne sont toujours pas mûres aujourd’hui, cette dépendance économique risque de mettre Taïwan en situation désavantageuse dans la future négociation. Troisièmement, dans la perspective d’une intégration économique accrue avec la Chine, la signature de l’Accord-cadre de coopération économique est inévitable. Néanmoins, l’implication minimale de Taïwan dans le processus d’intégration avec les autres économies régionales va l’obliger à s’ouvrir encore plus à la Chine, cette dernière offrant la solution de court terme la plus facile au manque de dynamisme interne de l’île. L’intégration économique trans-détroit est également intéressante pour Pékin car elle facilite sa politique de « montée pacifique » en même temps qu’elle sert ses buts politiques de long terme concernant Taïwan.