bluuebunny/crossref_metadata_2025 huggingface dataset:
Ecriture et imaginaire dans L'Herbe rouge de Boris Vian
Authors: Κανάρη Παρασκευή
Published: September 2021

Στόχος της παρούσας έρευνας είναι η προσέγγιση του μυθιστορήματος «Το κόκκινο χορτάρι» του Μπόρις Βιάν μέσω των εννοιών της γραφής και του φαντασιακού. Για την αφηγηματική ανάλυση του έργου χρησιμοποιήθηκαν κυρίως οι θεωρίες των J. M. Adam, U. Eco, G. Genette, P. Hamon, O. Rank και T. Todorov. Η έρευνα χωρίστηκε σε τρία μέρη. Το πρώτο μέρος μελετάει το χωρόχρονο του έργου, τα πρόσωπα και τον κοινωνικό περίγυρο και το πώς αυτές οι παράμετροι παρουσιάζονται αφηγηματικά μέσα από τη γραφή και το φαντασιακό.Το δεύτερο μέρος επικεντρώνεται κυρίως στη γραφή και στο γλωσσικό σύμπαν που έχει δημιουργήσει ο Βιάν. Μελετώντας τη συχνότητα των λέξεων με τη βοήθεια του λογισμικού Atlas.ti και τη συνύπαρξή τους, παρατηρείται ότι η ιστορία εξελίσσεται γύρω από το σημειωτικό δίπολο «θάνατος και έρωτας». Αναλύοντας τα κρυμμένα ποιήματα μέσα στο έργο, πραγματοποιείται μια σύγκριση με τη μπαρόκ ποίηση. Τέλος, εντοπίζονται τα αυτοβιογραφικά στοιχεία τόσο στην τελική έκδοση του μυθιστορήματος όσο και στις διαφορετικές εκδοχές του χειρόγραφου και μελετάται το κατά πόσο ο συγγραφέας έχει υπογράψει αυτοβιογραφικό ή μυθιστορηματικό συμβόλαιο με τον αναγνώστη. Στο τρίτο μέρος, εξετάζονται η επιρροή της επιστημονικής φαντασίας μέσα από τη μελέτη της «μηχανής» καθώς και η επιρροή του φανταστικού μέσα από την έννοια του «σωσία». Η έννοια του σωσία, που εμφανίζεται στο μυθιστόρημα στην ιστορία του Lazuli με τη μορφή ενός μυστηριώδη άντρα που τον παρακολουθεί, προσεγγίζεται μέσα από τις θεωρίες των O. Rank και T. Todorov καθώς και μέσα από τη σύγκριση με γνωστά έργα όπως ο Σωσίας του Ντοστογιέφσκι. Η μηχανή υπόκειται επίσης σε διακειμενική μελέτη, και συγκρίνεται ιδιαίτερα με τις μηχανές στα έργα του Van Vogt, συγγραφέα επηρεασμένο από τη μη-αριστοτελική φιλοσοφία του Korzybski. Το τρίτο μέρος ολοκληρώνεται με μια ευρύτερη αναφορά στις επιρροές του μυθιστορήματος τόσο από άλλα έργα (λογοτεχνικά και κινηματογραφικά) όσο και από φιλοσοφικές και καλλιτεχνικές τάσεις (μη-αριστοτελική φιλοσοφία, ’Pataphysique, OuLiPo).Μέσα από αυτή τη μελέτη προσπαθήσαμε να ορίσουμε το φαντασιακό στοιχείο μέσα στο συγκεκριμένο έργο αλλά και με αναφορές στο ευρύτερο έργο του Μπόρις Βιάν και συμπεράναμε ότι το φαντασιακό είναι άρρηκτα συνδεδεμένο με τη γραφή, εφόσον η γλωσσική δημιουργία του συγγραφέα είναι ικανή να μας μεταφέρει σε ένα εναλλακτικό φαντασιακό σύμπαν, που ακολουθεί τους δικούς του κανόνες, τη δική του λογική. Στο σύμπαν αυτό δε λείπει η εισβολή του φανταστικού που ανατρέπει αυτή την εναλλακτική πραγματικότητα, με κατάληξη την αποκατάσταση της μη-αριστοτελικής λογικής.
Διερεύνηση μεταλλάξεων του μιτοχονδριακού DNA σε πρωτοπαθή μυελοδυσπλαστικά σύνδρομα
Authors: Γκίρκας Κωνσταντίνος
Published: September 2021

Τα μιτοχόνδρια διαδραματίζουν σημαντικό ρόλο τόσο στην απόπτωση, όσο και στη σύνθεση της αίμης. Λόγω της σημαντικής συμβολής τους στη διατήρηση της κυτταρικής ομοιόστασης, δεν αποτελεί έκπληξη το γεγονός ότι μιτοχονδριακές μεταλλάξεις σχετίζονται με διάφορα συγγενή ( σύνδρομο Pearson ) και επίκτητα νοσήματα ( νεοπλασίες ).Σκοπός της παρούσας διατριβής είναι η ανίχνευση του ρόλου των μεταλλάξεων του μιτοχονδριακού DNA σε πρωτοπαθή μυελοδυσπλαστικά σύνδρομα στα οποία τα μιτοχόνδρια σχετίζονται με διαφόρου βαθμού κυτταροπενίες και απόπτωση των αιμοποιητικών κυττάρων και η συσχέτιση των αποτελεσμάτων αυτών με διάφορα κλινικά χαρακτηριστικά, καθώς και με το βαθμό της απόπτωσης.Η μελέτη μας συμπεριέλαβε 55 ασθενείς με πρωτοπαθές ΜΔΣ ( 38 άρρενες και 17 γυναίκες ασθενείς ) με διάμεση τιμή ηλικίας τα 71.5 έτη. Σε 29 από τους 55 ασθενείς υπολογίσθηκε η απόπτωση με κυτταρομετρία ροής τόσο σε ολικά κύτταρα μυελού των οστών ( μονοκύτταρα ), όσο και στα CD34+ κύτταρα. Τα πρώιμα αποπτωτικά κύτταρα προσδιορίσθηκαν ως Αννεξίνη+ κύτταρα και τα όψιμα αποπτωτικά κύτταρα προσδιορίσθηκαν ως Αννεξίνη+/PI+ κύτταρα.Σε 47 από τους 55 ασθενείς χρησιμοποιήθηκε μυελός των οστών για ανίχνευση μεταλλάξεων των γονιδίων των κυτοχρωμικών οξειδασών Ι και ΙΙ . Η μελέτη των μεταλλάξεων πραγματοποιήθηκε με PCR και sequencing.Κύτταρα μυελού των οστών από 13 ασθενείς με λέμφωμα χωρίς διήθηση του μυελού από νεοπλασματικά κύτταρα, χρησιμοποιήθηκαν ως μάρτυρας ( normal control ). ΑΠΟΤΕΛΕΣΜΑΤΑ Δεν διαπιστώθηκαν σημαντικά στατιστικές διαφορές όσον αφορά την πρώιμη και την όψιμη απόπτωση τόσο στα ολικά , όσο και στα CD34+ κύτταρα σε ασθενείς με ΜΔΣ και στην ομάδα των μαρτύρων ( normal controls ). Δεν διαπιστώθηκαν σημαντικά στατιστικές διαφορές όσον αφορά την πρώιμη και την όψιμη απόπτωση τόσο στα ολικά , όσο και στα CD34+ κύτταρα σε σχέση με παραμέτρους όπως οι ταξινομήσεις FAB , WHO και το IPSS score. Διαπιστώθηκε σημαντικά αυξημένη διάμεση τιμή CD34+ όψιμων αποπτωτικών κυττάρων σε ασθενείς με ποσοστό βλαστών ≥ 5%. Επιπρόσθετα διαπιστώθηκε στατιστικά σημαντική αύξηση στην όψιμη απόπτωση των ολικών κυττάρων σε σχέση με τα CD34+ κύτταρα. Από τους 47 ασθενείς με ΜΔΣ, σε τρεις ανιχνεύθηκαν μεταλλάξεις των γονιδίων της οξειδάσης Ι και ΙΙ. Μία μετάλλαξη αφορούσε το γονίδιο της οξειδάσης Ι στη νουκλεοτιδική θέση 7374 με αντικατάσταση της θυμίνης από κυτοσίνη. Όσον αφορά το γονίδιο της οξειδάσης ΙΙ του κυτοχρώματος ανιχνεύθηκαν οι ακόλουθες μεταλλάξεις : 1) αντικατάσταση της κυτοσίνης από θυμίνη στη νουκλεοτιδική θέση 7868 με αποτέλεσμα αμινοξική αλλαγή ( αλλαγή της λευκίνης από φαινυλαλανίνη) και 2) αντικατάσταση της κυτοσίνης από θυμίνη στη νουκλεοτιδική θέση 7875. Αξίζει να σημειωθεί ότι από τις παραπάνω μεταλλάξεις που ανιχνεύθηκαν, οι δύο περιγράφονται για πρώτη φορά σε ασθενείς με ΜΔΣ. Χρειάζονται περισσότερες μελέτες, με μεγαλύτερο αριθμό ασθενών για να διαπιστωθεί η βιολογική σημασία των μεταλλάξεων του μιτοχονδριακού DNA και η σχέση τους με τους μηχανισμούς της απόπτωσης στα μυελοδυσπλαστικά σύνδρομα.
Denk-, Entscheidungs- und Handlungsverhalten von DaF-Lernern unter besonderer Berücksichtigung der Geschwisterreihenfolge
Authors: Γρυπάρη Ευθυμία
Published: September 2021

Στην διατριβή εξετάζεται κατά το πόσον η σειρά του ατόμου στην οικογένεια (σειρά ανάμεσα στα αδέλφια - μοναχοπαίδια) αποτελεί παράγοντα που επηρρεάζει την σκέψη, τη λήψη αποφάσεων καθώς και την επιλογή στρατηγικών κατά την εκμάθηση της Γερμανικής Γλώσσας ως ξένης γλώσσας. Ο διαφορετικός τρόπος αντιμετώπισης προβλημάτων κατά την πρόληψη και παραγωγή της Γερμανικής γλώσσας καταδεικνύει ιδιαίτερα χαρακτηριστικά-τάσεις που διακρίνουν τις ομάδες "πρωτότοκα", "δευτερότοκα", "τελευταία παιδιά" και "μοναχοπαίδια". Τα αποτελέσματα της διατριβής δύνανται μεταξύ άλλων να αποτελέσουν ένα επιπλέον βοηθητικό εργαλείο για διδάσκοντες και συγγραφείς εκπαιδευτικών βιβλίων της Γερμανικής ως ξένης γλώσσας.
Ανίχνευση και διερεύνηση του ρόλου σημειακών μεταλλάξεων των ογκογονιδίων H-, K- και N-ras, καθώς και του B-raf σε όγκους Wilms
Authors: Δάλπα Ευτέρπη
Published: September 2021

Το νεφροβλάστωμα είναι μια νεοπλασία του νεφρού, που κατά κύριο λόγο συμβαίνει σε πολύ νεαρή ηλικία και προκύπτει από την κακοήθη εξαλλαγή των νεφρικών βλαστικών κυττάρων. Τα πρωτοογκογονιδία Ras και Β-Raf είναι μέλη ενός ενδοκυτταρικού μονοπατιού, το οποίο ρυθμίζει την κυτταρική ανάπτυξη και διαφοροποίηση, και παίζει ρόλο στην ανάπτυξη του καρκίνου. Στόχος μας ήταν να προσδιοριστεί η πιθανή ύπαρξη μετάλλαξης, αλλά και η μέτρηση της έκφρασης μέσω των επιπέδων mRNA των εν λόγω γονιδίων (Ras και Β-Raf) σε μονιμοποιημένους/παραφινομένους ιστικούς κύβους από 32 ασθενείς με νεφροβλάστωμα και από 10 φυσιολογικά νεφρά. Καμία μετάλλαξη δεν εντοπίστηκε στα τέσσερα γονίδια, ενώ η έκφραση των Ras και Β-Raf ήταν υψηλότερη στα κακοήθη δείγματα σε σχέση με τα φυσιολογικά. Η στατιστική ανάλυση έδειξε θετική συσχέτιση του K-Ras (p < 0,001) και του Β-Raf (p = 0.006) με το μέγεθος του όγκου, μια αρνητική συσχέτιση του K-Ras (p = 0.041) και του H-Ras (p = 0.033) με το ποσοστό ιστικής νέκρωσης των όγκων, και μια σύνδεση του N-Ras (p = 0.047) και του Β-Raf (p = 0,044) με την ιστολογική εικόνα του νεοπλάσματος. Από τα παραπάνω μπορούμε να συμπεράνουμε ότι, αν και οι μεταλλάξεις Ras και Β-Raf είναι σπάνιες εκδηλώσεις σε όγκους του Wilms, η έκφρασή τους δείχνει ότι παίζουν σημαντικό ρόλο στην ανάπτυξη και εξέλιξη αυτής της κακοήθειας.
Μελέτη υλικών με φωτοκαταλυτικές ιδιότητες και ενεργειακές εφαρμογές
Authors: Τάντης Ιωσήφ
Published: September 2021

Στην παρούσα διδακτορική διατριβή μελετήθηκε η φωτο(ηλεκτρο)καταλυτική διάσπαση οργανικών και ανόργανων ουσιών, που είτε συνιστούν ρύπους είτε είναι προϊόντα της βιομάζας, με ταυτόχρονη παραγωγή υδρογόνου και ηλεκτρικής ενέργειας. Η παραγωγή ηλεκτρικής ενέργειας και υδρογόνου, με φωτοαποικοδόμηση οργανικών αποβλήτων σε ένα φωτοηλεκτροχημικό κελί αποτελεί μία ελκυστική διεργασία με διπλό περιβαλλοντικό όφελος δηλαδή, την αποικοδόμηση αποβλήτων με ταυτόχρονη παραγωγή χρήσιμων μορφών ενέργειας.Πιο συγκεκριμένα, μελετήθηκε η φωτο(ηλεκτρο)καταλυτική διάσπαση μιας σειράς οργανικών και ανόργανων ουσιών που χρησιμοποιήθηκαν ως θυσιαζόμενες ενώσεις. Οι ουσίες αυτές διακρίνονται σε δύο κύριες κατηγορίες: ουσίες που αποτελούν αναγνωρισμένους ρύπους του υδάτινου περιβάλλοντος και ουσίες που είναι παραπροϊόντα της βιομάζας που όταν συσσωρεύονται μπορούν, εν δυνάμει, να προκαλέσουν περιβαλλοντικό πρόβλημα. Οι κατηγορίες ενώσεων που μελετήθηκαν ήταν οι εξής: αζωτούχες ενώσεις όπως η ουρία που βρίσκεται σε μεγάλες ποσότητες στα ούρα και η συσσώρευση της αποτελεί περιβαλλοντικό πρόβλημα, φαρμακευτικές ουσίες οι οποίες ανιχνεύονται σε υδάτινα λύματα και η παρουσία τους σε αυτά σε μεγάλες ποσότητες προκαλεί ρύπανση, χρωστικές ενώσεις οι οποίες χρησιμοποιούνται ευρέως στη βιομηχανία και ένα μέρος τους διαφεύγει στο περιβάλλον προκαλώντας σημαντικό περιβαλλοντικό πρόβλημα, αλκοόλες όπως ή αιθανόλη, η οποία αποτελεί προϊόν βιομάζας και είναι πρότυπη θυσιαζόμενη ένωση, και τέλος σάκχαρα τα οποία βρίσκονται σε μεγάλες ποσότητες σε λύματα της βιομηχανίας τροφίμων. Η διάσπαση των ουσιών αυτών επετεύχθη σε φωτοηλεκτροχημικά κελιά διαφόρων διαμορφώσεων με σκοπό τη βελτίωση της φωτοκαταλυτικής δράσης. Έτσι, στα πειράματα της παρούσας διατριβής μελετήθηκαν τα οφέλη της φωτοηλεκτροκαταλυτικής έναντι της φωτοκαταλυτικής αποικοδόμησης και προτάθηκε ένας συνδυασμός ηλεκτροκαταλυτικής διάσπασης ακολουθούμενη από φωτοκατάλυση για τη διάσπαση αζω-χρωμάτων. Επίσης, αναπτύχθηκε ένα καινοτόμο ηλεκτρόδιο για την παραγωγή υδρογόνου που φέρει τόσο τον φωτοκαταλύτη (TiO2) όσο και τον ηλεκτροκαταλύτη (νανοσωματίδια λευκόχρυσου διεσπαρμένα σε αγώγιμη ανθρακική πάστα) προφέροντας εκτός από την απλότητα της διάταξης και κάποια ελκυστικά αποτελέσματα όσον αφορά την παραγωγή υδρογόνου. Επιπλέον, μελετήθηκαν καινοτόμες φωτοάνοδοι TiO2 που συντέθηκαν με τη μέθοδο πυρόλυσης ψεκασμού φλόγας, μια τεχνολογία που παράγει νανοσωματίδια τιτάνιας με μεγάλη ειδική επιφάνεια, πράγμα που επιτρέπει στην τιτάνια να προσροφήσει μεγαλύτερες ποσότητες κβαντικών τελειών κατά την φωτοευαισθητοποίηση αποδίδοντας υψηλότερες τιμές φωτορεύματος και τελικής απόδοσης του κελιού. Τέλος, ένας εναλλακτικός φωτοκαταλύτης, ο αιματίτης, χρησιμοποιήθηκε για την παραγωγή υδρογόνου από τη διάσπαση σακχαρούχων ενώσεων τόσο στην αρχική του μορφή όσο και μετά από ενίσχυση με μεταλλικές προσμίξεις.
Αυτοάνοσα νοσήματα σε άρρενες
Authors: Δούκας Χαράλαμπος
Published: September 2021

Επειδή τα αυτοάνοσα νοσήματα είναι συχνότερα στις γυναίκες απ’ ό,τι στους άνδρες, θεωρείται ότι ίσως ορμονικές παράμετροι παίζουν κάποιο ρόλο. Είναι γνωστό ότι οι υποδοχείς των ορμονών του φύλου εκφράζονται σε κύτταρα του ανοσοποιητικού συστήματος.Διερευνήσαμε τον πιθανό ρόλο των ορμονών αλλά και συχνών πολυμορφισμών των γονιδίων του οιστρογονικού υποδοχέα α (ESR1), και β(ESR2) καθώς του ανδρογονικού υποδοχέα (AR) σε σχέση με την εμφάνιση αυτοανόσων νοσημάτων (ΑΝ) στους άνδρες. Μελετήθηκαν 277 άνδρες, 125 με≥1 ΑΝ: θυρεοειδίτιδα Hashimoto (n=65), νόσο Graves (n=12), ΣΕΛ (n=10),Ρευματοειδή Αρθρίτιδα (n=38). Παράλληλα μελετήσαμε 152 άτομα χωρίς αυτοάνοσα νοσήματα, τα οποία αποτέλεσαν την ομάδα ελέγχου. Ο ορμονολογικός και βιοχημικός έλεγχος έγινε μετά από διακοπή τυχόν αγωγής με κορτικοειδή για διάστημα ≥1 μήνα. Έγινε ανάλυση των πολυμορφισμώνPvuII του ESR1, AluI του ESR2 και(CAG)n του AR. Οι ασθενείς με ΑΝ είχαν σημαντικά υψηλότερα επίπεδα οιστραδιόλης (p<0.001). Στην πολυπαραγοντική ανάλυση σημαντικοί προγνωστικοί παράγοντες για ΑΝ ήταν τα οιστρογόνα και ο δείκτης μάζας σώματος. Οι συχνότητες των αλληλίων PvuII του ESR1, και AluI του ESR2 δε διέφερε μεταξύ ασθενών και ομάδας ελέγχου (ΑΝ: 47.8%, 37.6%, μάρτυρες 49.8%, 39.9%). Η κατανομή των CAG)n επαναλήψεων του AR δε διέφερε ανάμεσα στις δύο ομάδες επίσης. Στην ομάδα των ασθενών με ΑΝ βραχύτερο μήκος επαναλήψεων(CAG)n παρουσίαζε συσχέτιση με νεώτερη ηλικία κατά την έναρξη του νοσήματος (βραχύ μήκος: 38.52±14.8, μακρύ μήκος: 47.14±17.34 έτη,p=0.048). Οι φορείς της πολυμορφίας ESR1 PvuII παρουσίαζαν λιγότερο συχνά ≥2 ΑΝ (φορείς 6.5%, μη-φορείς 25.1%, p=0.019). Οι φορείς της πολυμορφίας AluI είχαν χαμηλότερα επίπεδα SHBG και υψηλότερο ΒΜΙ,συγκρινόμενοι με τους μη– φορείς της πολυμορφίας (p<0.04). Πιθανολογούμε ότι οι υψηλότερες τιμές της οιστραδιόλης ίσως παίζουν κάποιο ρόλο σεάνδρες με ΑΝ. Η κατανομή των πολυμορφισμών των γονιδίων των υποδοχέων των ορμονών του φύλου είναι όμοια σε ασθενείς και σε ομάδα ελέγχου. Βραχύτερο μήκος πολυμορφίας (CAG)n του AR πιθανόν να προδιαθέτει για έναρξη του ΑΝ σε μικρότερη ηλικία. Η συνύπαρξη ≥2 ΑΝ είναι λιγότερο πιθανή σε φορείς του πολυμορφισμού PvuII του ESR1. Τέλος η πολυμορφία AluI ESR2 ίσως επιδρά αντιστρόφως ανάλογα στους δείκτες παχυσαρκίας.
Impact assessment methodology for connected and automated vehicles
Authors: Cleij Diane , Weijermars Wendy , Elvik Rune
Published: September 2021

Connected and automated vehicles have become more common in recent years, increasing the need to assess their societal level impacts. In this paper a methodology is presented to explore and define these impacts as a starting point for quantitative impact assessment. The many interrelations between impacts increases the complexity of obtaining a complete overview. Therefore, a structured approach is used, which shows many similarities with the modelling of causal-loop-diagrams. Feedback loops between impacts are taken into account at an early stage and both literature review and expert interviews are used to produce a holistic overview of impacts. The methodology was developed and applied in the European H2020 project LEVITATE. Results from the qualitative assessments in this project are presented and further steps needed to perform a quantitative evaluation of the impacts are discussed.
Bacteriophage Structure, Classification, Assembly and Phage Therapy
Authors: Giri Nabanita
Published: September 2021

Current emergence of multidrug resistance and limitations in the development of the new antibiotics has proposed the problem of treating bacterial infections more challenging. This scenario may lead to the fear of failure in treating the multidrug resistant (MDR) bacterial infections and fuelled the uses of bacteriophages as an alternative of the conventional antibiotics in the post antibiotic era.So it is very much essential to know about the details of phage life cycle, assembly of phage complete structure, configuration and function of phage associated proteins etc. Although phages have been discovered a century ego, detailed study about lytic phages are gaining more interest in global fight against MDR bacterial species. This review has highlighted the basic knowledge of bacteriophage with the past and present scenario of several clinical studies targeting the MDR bacterial species. On the other hand it also discussed about the other uses of phages except human clinical trials.
Flavonoid Biosynthetic Pathway: Genetics and Biochemistry
Authors: Kaur Ramanjeet , Aslam Lubna , Hussain Shajaat , Kapoor Nisha , Mahajan Ritu
Published: September 2021

Plants are sessile organisms which are capable of producing a large array of metabolites, required for their adaption and survival. Flavonoids are low molecular weight metabolites with C6–C3–C6 carbon backbones and are categorised into different classes on the basis of structural organization and polymerization. The biosynthesis and distribution of flavonoids depends on the development stage of the plant as well as on diverse environmental conditions. They play a significant role as pigments, phytoalexins, attractants of pollinators and promotes auxin transport. In plants, antioxidant and antimicrobial activities are attributed to interaction of flavonoids with various enzymes, transcription factor and signalling pathways. This review aims to provide the current understanding of structure, their types, biosynthesis and regulation of flavonoid pathway that provide the insights to the key regulating factors and their interactions which makes them the most promising and interesting targets for plant breeding programs to enhance the value-added products in plants. In this review the deep knowledge of flavonoid regulation by micro-RNAs has been provided that attracts the biotechnologists to develop new molecular approaches so as to engineer various plant metabolic pathways to enhance the health-promoting metabolites in plants for human consumption.
Density, Ultrasonic Velocity, Isentropic Compressibility, Molar Volumes and Related Excess Parameters Studies on Ethyl Acetate with 1-Ethanol at 303K, 308K, and 313K
Authors: Elangovan Sampandam
Published: September 2021

A binary liquid mixture that consists of ethyl acetate and 1-ethanol has been prepared at various concentrations by the mole fraction method. The ultrasonic velocity and density have been determined at 303K, 308K and 313K. From the experimental data, the excess isentropic compressibility, excess molar volumes, excess internal pressures, and excess molar enthalpy have been computed. The variations were observed as polynomial and fitted to the Redlich-Kister polynomial functions. By using this function, adjustable parameters and the standard deviations have been calculated. The experimental and theoretical data reveal that the existence of the intermolecular interactions between the selected liquid system. The partial molar compressibility’s and partial molar volume also calculated at infinite dilution of the system. In general, the intermolecular forces have tended to the variations in the magnitude and sign of the excess parameters. The excess molar volume (Vme), excess isentropic compressibility (), excess internal pressure ( ) and the enthalpy ( ) show the negative magnitude at the entire range of concentrations and temperatures. The significant variations of these parameters with the mole fraction of ethyl acetate have been analysed. Furthermore, the strength of the intermolecular interactions decreased with increasing the experimental temperatures as 303K > 308K >313K.
Beyond 2020, Vision of the Future: Selected Papers from the Sixth Decennial National Irrigation Symposium
Authors: Lamm Freddie R. , Dukes Michael D. , Stone Kenneth C. , Mecham Brent Q.
Published: September 2021

Highlights

ASABE/IA 6th National Irrigation Symposium includes 80 papers, with 36 introduced here in this Special Collection.

Papers include current irrigation research about ET, management, turf systems, technology, humid region, water supply.

Irrigation in the U.S. is growing more rapidly in humid regions, and pressurized irrigation continues to grow in usage.

There has been much progress in irrigation science in the last decade, and the vision of the future looks bright.

Abstract. This article introduces the ASABE Special Collection associated with the 6th Decennial National Irrigation Symposium: Beyond 2020, Vision of the Future. This U.S. symposium, jointly sponsored by ASABE and the Irrigation Association in December 2021, was postponed from 2020 due to the pandemic and consists of approximately 80 presentations, of which 36 were accepted as journal articles for this Special Collection. Irrigated land area appears to be growing slightly in the U.S. but is shifting geographically somewhat toward humid regions. Pressurized irrigation continues to grow, and gravity-fed irrigation continues to decline. Competition for stressed water resources among diverse water users remains great, and smaller numbers of irrigation scientists are available to meet the informational needs. Improved ability to acquire, assess, and use water and crop information helps to meet these challenges. This article discusses irrigation research progress in evapotranspiration (ET), irrigation management, turf systems, sensors and technologies, irrigation strategies in the humid region, and water supply. Challenges and opportunities continue to exist for irrigation in the U.S., but progress in the last decade has been steady, and a good vision for the future of irrigation beyond 2020 is anticipated. Keywords: Evapotranspiration, Irrigation, Irrigation management, Irrigation scheduling, Irrigation systems, Turf and landscape irrigation.
Head identification in binominal constructions
Authors: Gomes Camacho Roberto , Saverio Serafim Monielly Cristina
Published: September 2021

Determining the head of complex noun phrases is in general not an easy task in Portuguese. In the case of uma garrafa de vinho ‘a bottle of wine’, in combination with quebrou-se ‘broke’ or derramou ‘spilled’, it is the selection restrictions of the verb that determine which noun functions as head. This paper deals with a specific type of Brazilian Portuguese NP, aquele idiota do médico ‘that idiot of a doctor’, called “binominal” by Aarts (1998). The two types of nominal elements, linked by the preposition de, are the first constituent, idiota ‘idiot’, which has an evaluative status, and the second constituent, médico ‘doctor’, which has a referential status. The hypothesis defended here is that the evaluative nature of the first constituent and the referential nature of the second consist in a conclusive criterion for the determination of headedness.
Relativsätze im Deutschen und im Italienischen
Authors: Murelli Adriano
Published: September 2021

This contribution focuses on relative constructions in German and Italian. After sketching the theoretical background, the relativization strategies attested in standard and non-standard varieties of both languages will be presented and analysed from a typological perspective. Then, an attempt will be made to understand why some of these constructions were excluded from the standard variety when both languages were codified; this can only be done by adopting a sociolinguistic perspective. Finally, the rise of a new standard variety, the so-called neo-standard, will be discussed and the relative constructions attested in it will be examined.
Linguistic Impoliteness and Interpersonal Positioning in Nigerian Online Political Forum
Authors: Taiwo Rotimi , Akinwotu Alaba , Kpolugbo Stella
Published: September 2021

Interactional positioning has to do with how people express their attitudes and dispositions to others (stance) and signal how they wish to relate with other participants in the discourse (engagement). These are closely connected with the extent to which impoliteness is expressed in discourse and the resources and strategies employed. This study investigates interactional positioning and impoliteness in two Nigerian political discussion sites, Nairaland Forum and Gistmania. The findings show that bald-on-record and negative impoliteness were predominant in the discussions. The common linguistic expressions of impoliteness were name-calling, vulgarism, cursing, dismissal and sarcasm. Participants also used questions, directives and reader pronouns you and your for face attacks and heightening of the effect of impolite expressions. Self-mentions and attitude markers, especially cognitive verbs, were used to convey feelings and attitudes towards other participants within and outside the discussion. The study concludes that impoliteness thrives in political debates online because of the uninhibited context, which gives freedom to participants to deliberately inject invective language in order to set the emotional temperature in the discussion and cause disaffection among the participants and the group they represent.
El «Proceso de Aproximaciones Sucesivas-Acumulativas» (PASA) como nueva propuesta de lectura de la novela (problema de las singularidades artísticas)
Authors: Solé Zapatero Francisco Xavier
Published: September 2021

Cuando se empieza a trabajar en una novela, uno se pregunta cómo leerla, y generalmente se concluye que hay básicamente tres formas de hacerlo. Una, buscando un tema dado; otra, utilizando uno de los métodos existentes para hacerlo, sean de los que se aplican, es decir, que nos dicen qué debemos buscar y cómo, hasta aquellos que dan ciertas pistas de lectura; y una tercera que implica una mezcla de las dos anteriores. Mas, en todos los casos (o casi), se pasa por alto que el texto tiene una «lógica», una configuración, una poética, que debe ser respetada, cuando menos si se quiere dar cuenta, hasta donde sea posible, de lo que el Autor, a través del narrador, quiso dialogar con su oyente-Lector. Para «resolver» este problema, se ha venido proponiendo, a partir de la revisión de algunas importantes propuestas teóricas, una forma des-centrada de lectura, a la que se ha denominado Proceso de aproximaciones sucesivas-acumulativas (PASA), la cual está «in-determinada», en cada caso, por la obra concreta dada. Aquí daremos un breve síntesis de la misma.
«Todavía viven en el orden esperanzado de la temporalidad». La imatge del forat negre com a expressió d’una nova idea de crisi a "Black Hole" i a "Sistema nervioso"
Authors: Isern Ordeig Maria
Published: September 2021

L’article proposa una anàlisi comparada de Black Hole (Charles Burns, 2005) i Sistema nervioso (Lina Meruane, 2018) a partir de la textualització de la imatge del forat negre apareguda en ambdues obres. Tot atenent als motius a partir dels quals es construeixen la mena de crisis que s’hi narren, es proposarà que en l’ús d’aquesta imatge hi ha en joc una construcció i representació de la temporalitat de la crisi que trenca amb la lògica de l’estancament i la permanència, tot obrint la possibilitat de construir noves i alternatives formes de futurabilitat que estan profundament lligades amb els fenòmens de la malaltia i el contagi, transversals als dos textos.
La eremitización a la luz de Agamben en cuatro novelas pre-pandémicas: Moshfegh, Houellebecq, Vilas, González
Authors: Szukała Wiosna
Published: September 2021

El objetivo de este artículo es el análisis literario y comparativo de cuatro novelas publicadas al mismo tiempo, justo antes del surgimiento de la pandemia de la COVID-19, cuyos protagonistas experimentan una crisis, una sensación de fin, un agotamiento ampliamente entendido, que desencadena en ellos la necesidad de retirarse del mundo y reflexionar sobre el modo en que viven. Este acto se define con el término «eremitización», propuesto por el sociólogo polaco Marek Krajewski. La autora examina las representaciones literarias de este fenómeno en los textos mencionados, analizando su génesis, elementos constitutivos y las consecuencias a las que en cada caso conduce. A continuación, utilizando principalmente el aparato teórico elaborado por Giorgio Agamben —conceptos como acedia, relación bios-zoé,katargeo, inoperosidad— reflexiona sobre el potencial contestatario de la eremitización, prestando especial atención a la tensión entre las categorías de la vida cotidiana, la inacción y la productividad.
Analytical description of resonances in Fabry–Perot and whispering gallery mode resonators
Authors: Atvars Aigars
Published: September 2021

Whispering gallery mode optical resonators have attracted attention due to their simplicity and applicability for sensing. In this paper, analytical formulas are provided that describe resonance conditions in optical resonators. Basic terms (resonance wavelengths and frequencies, free spectral range,Q-factor, summation principle ofQ-factors of various processes, finesse, etc.) are introduced. A description of interference of an infinite number of waves of progressively smaller amplitudes and equal phase differences is given. A description of a Fabry–Perot resonator with nonequal reflection coefficients is also given as well as analysis of all-pass and add-drop optical filters. The presented description of resonators will help to analyze the effects of optical resonators, interpret the results of experiments, and guide the development of novel applications of microresonators.
Dynamic manipulation of three-color light reflection in a defective atomic lattice
Authors: Li Tianming , Wang Maohua , Yin Chengping , Wu Jinhui , Yang Hong
Published: September 2021

We extend a recent theoretical work [Phys. Rev. A 101, 053856 (2020)10.1103/PhysRevA.101.053856] by replacing disorders characterized by varied atomic densities with defects characterized by vacant lattice cells to evaluate again three-color reflection in a one-dimensional optical lattice filled with cold 87Rb atoms. This is based on the consideration that trapped atoms may escape from some lattice cells and effects of vacant cells on light propagation are of major importance from both fundamental and applied research viewpoints. We consider two types of defective atomic lattices where vacant cells are randomly or continuously distributed among filled cells. Numerical results show that the wider reflection band in a large detuning region of negligible off-resonance absorption is quite sensitive to, while the narrower reflection bands in two near-resonant regions of electromagnetically induced transparency are rather robust against, the number of random vacant cells. In contrast, all three reflection bands exhibit strong robustness against the number of continuous vacant cells. Note, however, that both narrower reflection bands may become widened and exhibit a blue shift when continuous vacant cells appear in the front of our atomic lattice due to the joint contributions of Bragg scattering and quantum interference.
Orbital effects in strong-field Rydberg state excitation of N2, Ar, O2 and Xe
Authors: Sun Fenghao , Lu Chenxu , Ma Yongzhe , Pan Shengzhe , Wang Jiawei , Zhang Wenbin , Qiang Junjie , Chen Fei , Ni Hongcheng , Li Hui , Wu Jian
Published: September 2021

Rather than being freed to the continuum, the strong-field tunneled electrons can make a trajectory driven by the remaining laser fields and have certain probability to be captured by the high lying Rydberg states of the parent atoms or molecules. To explore the effect of molecular orbital on Rydberg state excitation, the ellipticity dependence of Rydberg state yields of N2 and O2 molecules are experimentally investigated using cold target recoil ion momentum spectroscopy and are compared with their counterpart atoms Ar and Xe with comparable ionization potentials. We found the generation probability of the neutral Rydberg fragment O2* was orders of magnitude higher than that of Xe* due to the butterfly-shaped highest occupied molecular orbital of O2. Meanwhile, our experimental and simulation results reveal that it is the initial momentum distribution (determined by the detailed characteristics of orbitals) that finally leads to the tendency that the Rydberg state yield of O2 (Ar) decreased slower than that obtained for Xe (N2) when the ellipticity of the excitation laser field is increased.
Multiple Stokes sectional plane image based modulation format recognition with a generative adversarial network
Authors: Zhu Xu , Liu Bo , Zhu Xiaorong , Ren Jianxin , Mao Yaya , Han Shun , Chen Shuaidong , Li Mingye , Tian Feng , Guo Zhiruo , Chen Yunyun
Published: September 2021

A novel modulation format recognition (MFR) scheme based on multiple Stokes sectional planes images by generative adversarial network (GAN) is proposed and demonstrated to adapt to next-generation elastic optical network (EON). The application of the encoder, along with the suitable loss function, is able to achieve better performance with regards to MFR of GAN. Experimental verifications were performed for the polarization division multiplexing (PDM)-EON system at a symbol rate of 12.5GBaud. Five modulation formats, including PDM-BPSK, PDM-QPSK, PDM-8PSK, PDM-8QAM, PDM-16QAM, were recognized by our scheme under the condition of practical optical signal-to-noise ratio (OSNR) over both back-to-back transmission and 25km standard signal-mode fiber (SSMF). Specifically, the minimum required OSNR of PDM-16QAM signal to achieve 100% MFR success rate is 18 dB, which is lower than its corresponding 7% forward error correction (FEC) threshold. Results show that, compared with three other machine learning algorithms, the proposed scheme obtains the higher recognition accuracy in the case of the same OSNR. Moreover, the training data required by the proposed scheme is less than the traditional convolutional neural network (CNN) in MFR task, which means the training cost of the neural network is greatly reduced by using GAN.
High performance ZnS antireflection sub-wavelength structures with HfO2 protective film for infrared optical windows
Authors: Liu Fei , Jiao Hongfei , Zhang Jinlong , Yin Bin , Liu Huasong , Ji Yiqin , Wang Zhanshan , Cheng Xinbin
Published: September 2021

Antireflection sub-wavelength structures (SWSs) on ZnS were designed and ZnS SWSs with HfO2 protective film were prepared, and their properties in long-wave infrared applications were examined and compared to AR coatings. The SWS has good antireflection performance and exhibits less polarization sensitivity than the AR coating. At temperatures above 500 °C, the SWS with HfO2 protective film has a better thermal endurance property than the multilayer AR coating. Moreover, the HfO2 protective film significantly improved the mechanical properties of the ZnS SWS and was similar to HfO2 covered AR coating when the HfO2 film was not broken. This study shows that the ZnS SWS with HfO2 protective film has promising application prospects in infrared optical windows.
Wavelength-switchable ultra-narrow linewidth fiber laser enabled by a figure-8 compound-ring-cavity filter and a polarization-managed four-channel filter
Authors: Feng Ting , Wei Da , Bi Wenwen , Sun Weiwei , Wu Shengbao , Jiang Meili , Yan Fengping , Suo Yuping , Yao X. Steve
Published: September 2021

We propose and demonstrate a high-performance wavelength-switchable erbium-doped fiber laser (EDFL), enabled by a figure-8 compound-ring-cavity (F8-CRC) filter for single-longitudinal-mode (SLM) selection and a polarization-managed four-channel filter (PM-FCF) for defining four lasing wavelengths. We introduce a novel methodology utilizing signal-flow graph combined with Mason’s rule to analyze a CRC filter in general and apply it to obtain the important design parameters for the F8-CRC used in this paper. By combining the functions of the F8-CRC filter and the PM-FCF assisted by the enhanced polarization hole-burning and polarization dependent loss, we achieve the EDFL with fifteen lasing states, including four single-, six dual-, four tri- and one quad-wavelength lasing operations. In particular, all the four single-wavelength operations are in stable SLM oscillation, typically with a linewidth of <600 Hz, a RIN of ≤−154.58 dB/Hz@≥3 MHz and an output power fluctuation of ≤±3.45%. In addition, all the six dual-wavelength operations have very similar performances, with the performance parameters close to those of the four single-wavelength operations, superior to our previous work and others’ similar work significantly. Finally, we achieve the wavelength-spacing tuning of dual-wavelength operations for photonic generation of tunable microwave signals, and successfully obtain a signal at 23.10 GHz as a demonstration.
Artificially formed resistive ITO/p-GaN junction to suppress the current spreading and decrease the surface recombination for GaN-based micro-light emitting diodes
Authors: Hang Sheng , Zhang Muyao , Zhang Yidan , Chu Chunshang , Zhang Yonghui , Zheng Quan , Li Qing , Zhang Zi-Hui
Published: September 2021

Due to the increased surface-to-volume ratio, the surface recombination caused by sidewall defects is a key obstacle that limits the external quantum efficiency (EQE) for GaN-based micro-light-emitting diodes (µLEDs). In this work, we propose selectively removing the periphery p+-GaN layer so that the an artificially formed resistive ITO/p-GaN junction can be formed at the mesa edge. Three types of LEDs with different device dimensions of 30 × 30 µm2, 60 × 60 µm2 and 100 × 100 µm2 are investigated, respectively. We find that such resistive ITO/p-GaN junction can effectively prevent the holes from reaching the sidewalls for µLEDs with smaller size. Furthermore, such confinement of injection current also facilitates the hole injection into the active region for µLEDs. Therefore, the surface-defect-caused nonradiative recombination in the edge of mesa can be suppressed. Meantime, a reduction of current leakage caused by the sidewall defects can also be obtained. As a result, the measured and calculated external quantum efficiency (EQE) and optical output power for the proposed LED with small sizes are increased.
Generation of wavelength-tunable optical vortices using an off-axis spiral phase mirror: publisher’s note
Authors: Lee Dong-Ho , Kim Hong-Seung , Han Ilkyu , Bae Ji Yong , Yeo Woo-Jong , Jeong Seok Kyung , Jeon Minwoo , Choi Hwan-Jin , Kim Dong Uk , Lee Kye-Sung , Chang Ki Soo , Lee Wonkyun , Kim Geon Hee , Jong Kim I.
Published: September 2021

This publisher’s note contains corrections to Opt. Lett. 46, 4216 (2021)OPLEDP0146-959210.1364/OL.432413.
Efficient simulation of ultrafast quantum nonlinear optics with matrix product states
Authors: Yanagimoto Ryotatsu , Ng Edwin , Wright Logan G. , Onodera Tatsuhiro , Mabuchi Hideo
Published: September 2021

Ultrashort pulses propagating in nonlinear nanophotonic waveguides can simultaneously leverage both temporal and spatial field confinement, promising a route towards single-photon nonlinearities in an all-photonic platform. In this multimode quantum regime, however, faithful numerical simulations of pulse dynamics naïvely require a representation of the state in an exponentially large Hilbert space. Here, we employ a time-domain, matrix product state (MPS) representation to enable efficient simulations by exploiting the entanglement structure of the system. To extract physical insight from these simulations, we develop an algorithm to unravel the MPS quantum state into constituent temporal supermodes, enabling, e.g., access to the phase-space portraits of arbitrary pulse waveforms. As a demonstration, we perform exact numerical simulations of a Kerr soliton in the quantum regime. We observe the development of non-classical Wigner-function negativity in the solitonic mode as well as quantum corrections to the semiclassical dynamics of the pulse. A similar analysis of

χ

(
2
)

simultons reveals a unique entanglement structure between the fundamental and second harmonics. Our approach is also readily compatible with quantum trajectory theory, allowing full quantum treatment of propagation loss and decoherence. We expect this work to establish the MPS technique as part of a unified engineering framework for the emerging field of broadband quantum photonics.
Universal compressive tomography in the time-frequency domain
Authors: Gil-Lopez Jano , Teo Yong Siah , De Syamsundar , Brecht Benjamin , Jeong Hyunseok , Silberhorn Christine , Sánchez-Soto Luis L.
Published: September 2021

Quantum state tomography is a basic tool in quantum information, but it becomes a challenging task that requires an immense number of measurement configurations as the system dimension grows. We implement an adaptive compressive tomography scheme capable of reconstructing any arbitrary low-rank spectral-temporal optical signal with extremely few measurement settings and without any ad hoc assumption about the initially unknown signal. This is carried out by implementing projections onto arbitrary user-specified optical modes. We present conclusive experimental results for both temporal modes and frequency bins, which showcase the versatility of our method and thereby introduce a universal optical reconstruction framework to these platforms.
Language statistical learning responds to reinforcement learning principles rooted in the striatum
Authors: Orpella Joan , Mas-Herrero Ernest , Ripollés Pablo , Marco-Pallarés Josep , de Diego-Balaguer Ruth
Published: September 2021

Statistical learning (SL) is the ability to extract regularities from the environment. In the domain of language, this ability is fundamental in the learning of words and structural rules. In lack of reliable online measures, statistical word and rule learning have been primarily investigated using offline (post-familiarization) tests, which gives limited insights into the dynamics of SL and its neural basis. Here, we capitalize on a novel task that tracks the online SL of simple syntactic structures combined with computational modeling to show that online SL responds to reinforcement learning principles rooted in striatal function. Specifically, we demonstrate—on 2 different cohorts—that a temporal difference model, which relies on prediction errors, accounts for participants’ online learning behavior. We then show that the trial-by-trial development of predictions through learning strongly correlates with activity in both ventral and dorsal striatum. Our results thus provide a detailed mechanistic account of language-related SL and an explanation for the oft-cited implication of the striatum in SL tasks. This work, therefore, bridges the long-standing gap between language learning and reinforcement learning phenomena.
Using test positivity and reported case rates to estimate state-level COVID-19 prevalence and seroprevalence in the United States
Authors: Chiu Weihsueh A. , Ndeffo-Mbah Martial L.
Published: September 2021

Accurate estimates of infection prevalence and seroprevalence are essential for evaluating and informing public health responses and vaccination coverage needed to address the ongoing spread of COVID-19 in each United States (U.S.) state. However, reliable, timely data based on representative population sampling are unavailable, and reported case and test positivity rates are highly biased. A simple data-driven Bayesian semi-empirical modeling framework was developed and used to evaluate state-level prevalence and seroprevalence of COVID-19 using daily reported cases and test positivity ratios. The model was calibrated to and validated using published state-wide seroprevalence data, and further compared against two independent data-driven mathematical models. The prevalence of undiagnosed COVID-19 infections is found to be well-approximated by a geometrically weighted average of the positivity rate and the reported case rate. Our model accurately fits state-level seroprevalence data from across the U.S. Prevalence estimates of our semi-empirical model compare favorably to those from two data-driven epidemiological models. As of December 31, 2020, we estimate nation-wide a prevalence of 1.4% [Credible Interval (CrI): 1.0%-1.9%] and a seroprevalence of 13.2% [CrI: 12.3%-14.2%], with state-level prevalence ranging from 0.2% [CrI: 0.1%-0.3%] in Hawaii to 2.8% [CrI: 1.8%-4.1%] in Tennessee, and seroprevalence from 1.5% [CrI: 1.2%-2.0%] in Vermont to 23% [CrI: 20%-28%] in New York. Cumulatively, reported cases correspond to only one third of actual infections. The use of this simple and easy-to-communicate approach to estimating COVID-19 prevalence and seroprevalence will improve the ability to make public health decisions that effectively respond to the ongoing COVID-19 pandemic.
Discovery of photosynthesis genes through whole-genome sequencing of acetate-requiring mutants of Chlamydomonas reinhardtii
Authors: Wakao Setsuko , Shih Patrick M. , Guan Katharine , Schackwitz Wendy , Ye Joshua , Patel Dhruv , Shih Robert M. , Dent Rachel M. , Chovatia Mansi , Sharma Aditi , Martin Joel , Wei Chia-Lin , Niyogi Krishna K.
Published: September 2021

Large-scale mutant libraries have been indispensable for genetic studies, and the development of next-generation genome sequencing technologies has greatly advanced efforts to analyze mutants. In this work, we sequenced the genomes of 660Chlamydomonas reinhardtiiacetate-requiring mutants, part of a larger photosynthesis mutant collection previously generated by insertional mutagenesis with a linearized plasmid. We identified 554 insertion events from 509 mutants by mapping the plasmid insertion sites through paired-end sequences, in which one end aligned to the plasmid and the other to a chromosomal location. Nearly all (96%) of the events were associated with deletions, duplications, or more complex rearrangements of genomic DNA at the sites of plasmid insertion, and together with deletions that were unassociated with a plasmid insertion, 1470 genes were identified to be affected. Functional annotations of these genes were enriched in those related to photosynthesis, signaling, and tetrapyrrole synthesis as would be expected from a library enriched for photosynthesis mutants. Systematic manual analysis of the disrupted genes for each mutant generated a list of 253 higher-confidence candidate photosynthesis genes, and we experimentally validated two genes that are essential for photoautotrophic growth,CrLPA3andCrPSBP4. The inventory of candidate genes includes 53 genes from a phylogenomically defined set of conserved genes in green algae and plants. Altogether, 70 candidate genes encode proteins with previously characterized functions in photosynthesis inChlamydomonas, land plants, and/or cyanobacteria; 14 genes encode proteins previously shown to have functions unrelated to photosynthesis. Among the remaining 169 uncharacterized genes, 38 genes encode proteins without any functional annotation, signifying that our results connect a function related to photosynthesis to these previously unknown proteins. This mutant library, with genome sequences that reveal the molecular extent of the chromosomal lesions and resulting higher-confidence candidate genes, will aid in advancing gene discovery and protein functional analysis in photosynthesis.
Bracoviruses recruit host integrases for their integration into caterpillar’s genome
Authors: Wang Zehua , Ye Xiqian , Zhou Yuenan , Wu Xiaotong , Hu Rongmin , Zhu Jiachen , Chen Ting , Huguet Elisabeth , Shi Min , Drezen Jean-Michel , Huang Jianhua , Chen Xuexin
Published: September 2021

Some DNA viruses infect host animals usually by integrating their DNAs into the host genome. However, the mechanisms for integration remain largely unknown. Here, we find that Cotesia vestalis bracovirus (CvBV), a polydnavirus of the parasitic wasp C. vestalis (Haliday), integrates its DNA circles into host Plutella xylostella (L.) genome by two distinct strategies, conservatively and randomly, through high-throughput sequencing analysis. We confirmed that the conservatively integrating circles contain an essential “8+5” nucleotides motif which is required for integration. Then we find CvBV circles are integrated into the caterpillar’s genome in three temporal patterns, the early, mid and late stage-integration. We further identify that three CvBV-encoded integrases are responsible for some, but not all of the virus circle integrations, indeed they mainly participate in the processes of early stage-integration. Strikingly, we find two P. xylostella retroviral integrases (PxIN1 and PxIN2) are highly induced upon wasp parasitism, and PxIN1 is crucial for integration of some other early-integrated CvBV circles, such as CvBV_04, CvBV_12 and CvBV_24, while PxIN2 is important for integration of a late-integrated CvBV circle, CvBV_21. Our data uncover a novel mechanism in which CvBV integrates into the infected host genome, not only by utilizing its own integrases, but also by recruiting host enzymes. These findings will strongly deepen our understanding of how bracoviruses regulate and integrate into their hosts.