bluuebunny/crossref_metadata_2025 huggingface dataset:
Promotion of Tourism Area of Pangandaran Regency through Instagram Social Media Accounts
Authors: Afryantono Muhammad Yuka , Rani Cinthia Kusuma , Salim Angelia
Published: January 2023

This study aims to understand the use of Instagram social media as a medium for tourism promotion in Pangandaran Regency through the @explorepangandaran and @berandapangandaran accounts.  For the reasons @explorepangandaran and @berandapangandaran accounts are used as tourism promotion media in Pangandaran Regency. This research uses  a qualitative research method with a case study approach. Based on observations and interviews conducted, the results of the study show that tourism activists use Instagram social media as the only medium in carrying out promotional activities. The explore feature is to expand the reach of the promotion through the use of the hashtags (#)explorepangandaran and (#)berandapangandaran. Through this hashtag, tourism activists can produce  promotional content. The @explorepangandaran and @berandapangandaran accounts are promotional accounts that are managed independently by tourism activists. In addition, these two accounts have advantages in terms of engagement compared to other tourism promotion methods.
Mapping The Digital Movement in The Hashtags #2024AniesPresiden, #GanjarPresiden and #PrabowoPresiden
Authors: Asmawarini Restia Tities , Murwani Endah , Murtiningsih Bertha Sri Eko
Published: January 2023

Hashtag mobilization has currently become one of the ways to mobilize opinion. As the 2024 presidential election draws nearer, hashtags which are considered effective to mobilize support for presidential candidates in 2024 have emerged and have been widely discussed on Twitter, using different hashtags, namely #2024AniesPresiden, #GanjarPresiden, and #PrabowoPresiden. This research uses Theory of Digital Movement of Opinion, a type of digital activism characterized by spontaneous and disorganized reactions from social media users on Twitter. This research aims to map those three hashtags: can different hashtags produce different mobilizations? The research method is descriptive and quantitative with social network analysis conducted by taking data from the three hashtags in the period from April 29, 2022 to May 12, 2022. This study found 235 accounts talking about #2024AniesPresiden, 22 accounts talking about #GanjarPresiden, and eight accounts talking about #PrabowoPresiden, where data was processed using NodeXL software. The base and its mappings are related to the diameter, density, and centrality (betweenness, closeness, and degree). The @SMILEINDO24 in the hashtag #2024AniesPresiden, the @ganjar_center in the hashtag #GanjarPresiden, and the @djagger17 in the hashtag #PrabowoPresiden are also found as the central or most influential actors in disseminating information and serving as a liaison. In contrast, the @AniesIndonesia in the hashtag #2024AniesPresiden, the @ganjar_center in the hashtag #GanjarPresiden, and the @prabowo in the hashtag #PrabowoPresiden are the critical actors in the formation of communication networks and information flow. The findings of this study have implications on dominant actors that can be used or exploited by policymakers so that these actors can influence public opinion and mobilize opinion movements.
Digital Speech Acts on Social Media: The Content Ethnographic of Audiences Response to the Publication of Illegal Online Loans on @Ojkindonesia's Instagram Account
Authors: Nasrullah Rulli , Gustini Dewi Rahmawati
Published: January 2023

Social media is no longer just a channel for users to socialise with each other on the Internet but also mediates the spreading of information to applications that can be utilised in the practice of legal aspects in the economy. The character of social media, which is full of information, forms a network (networking), stores data (archive), and interactivity which is an important point in the development of legal aspects in the economy related to online loans.  Using virtual ethnography on the discourse of digital citizens in the comments column of the Financial Services Authority (OJK) Instagram account regarding  Daftar 102 Pinjaman Online Legal Berizin OJK, this study concludes that  social media is a source for users (1) to seek information;  (2) spread information;  and  (3) functiom as a centre and gateway for information that exists throughout social media users  who consciously or not have been involved as a tool of discourse among netizen in a virtual community related to legal aspects in the economy.  Information contestation cannot be avoided because, in reality, on social media, any user can produce and distribute content and have a great influence on the opinions of other users.
The Analysis of Urban Adolescents’ Reception of Pornography on Social Media
Authors: Kholisoh Nur , Ritonga Rajab , Ridaryanthi Melly
Published: January 2023

There are many pornographic sites on social media nowadays. In 2018, The Indonesian Child Protection Commission found that 91.58% of 6,000 adolescents had been exposed to pornography. Adolescents are those   in the age group that is very vulnerable to the effects of pornography. This study aims to identify and examine urban adolescents’ reception of pornography on social media. The selection of urban adolescents as research objects was because they have easier access to social media than other age groups. The sample of this research was taken from adolescents in DKI Jakarta and Surabaya considering that these two cities are among the six cities with the highest number of adolescents in Indonesia. This study uses the reception theory presented by Stuart Hall who suggests that audiences can play an active role in decoding messages. In addition, this study employs a constructivist paradigm with a qualitative approach. The method used was the reception analysis which focuses on production, text, and audience in a framework that can be utilized to analyze the relationship of each element. The informants in this study were adolescents in DKI Jakarta and Surabaya who were aged between 15 and 19 years. Informants' preference was conducted purposively by considering variations based on social and cultural context backgrounds. The results showed that all the informants had watched pornography on social media, either intentionally or not. In addition, four out of ten informants are in an Oppositional Position for rejecting messages conveyed in pornographic broadcasts on social media. Meanwhile, six other adolescents are in a Negotiated Position, where they disagree with pornography on social media but can accept the meaning of pornography because it satisfies their curiosity.
Sustainable Primary Education in Andhra Pradesh During COVID-19
Authors: Pranavi Dake , Surayya Teki , Deepika Dake
Published: January 2023

Sustainable development describes the simultaneous maintenance of balance between socio-economic development and environmental sustainability without jeopardizing the future generation's potential to serve their own needs. The main aim of this article is to analyze the sustainability attained by government schools in Andhra Pradesh by providing education to elementary pupils during COVID-19. The unexpected outbreak of the deadly virus COVID-19 wreaked havoc on educational systems, harming children's education. In response to the lockdown, all educational institutions were closed for an extended length of time and remained shuttered even today. According to the information gathered, the government of Andhra Pradesh took all necessary safety measures to ensure the accessibility of government elementary schools and to minimize primary school dropouts. They televised the online lessons to every class at periodic intervals on regional government channels for students. Pupils were given worksheets to exercise according to the curriculum aired on television. These worksheets were submitted for review to the concerned faculty by students' parents. The children were given dry rations monthly as part of the "Mid-Day-Meal" program, which offered healthy meals to address the students' food difficulties, food security, and access to schooling during the COVID-19 epidemic. This document serves as a resource for teachers, administrators, and government officials on how to deal with and avoid the trajectories that primary school pupils face in the future when confronted with difficult situations. Furthermore, the whole perspective provides a list of resources, recommendations, and strategies for ensuring the sustainability of the educational system during the pandemic
الإيثار في فعل الطاعات
Authors: Jasim Qasim Ahmed
Published: January 2023

الحمد لله والصلاة والسلام على رسول الله وعلى اله وصحبه ومن والاه.
من خلال هذا البحث توصلت إلى إن الانسان يجب عليه أن يبادر في فعل الطاعات وأنه بأمس الحاجة اليها ولا يتخلى عنها إلا بترتيب أجر آخر فلا بأس بالإيثار في قربةٍ انك ترى من يستحق أن تُؤثر له حيث ترى عالما علمك وأنت في الصف الأول وهو متأخر فتتأخر من الصف الأول إلى الصف الثاني وتترك له مكانك فيأجرك الله تعالى.
وإن هذا البحث يكتسب الأهمية لأنه ينظم العلاقة ما بين العبد وربه في فعل الطاعات والتعاون على البر والتقوى
الدكتور عيسى ألبي أبوبكر وإبداعاته الفنية
Authors: Souleymanou Abbo
Published: January 2023

يعد الدكتور عيسى ألبي أبوبكر فحلا من فحول الشعر العربي الإفريقي، وفارسا من فرسانه المتحكمين فيه. قال الشعر مذ كان يافعا، وظل مواظبا على قوله وتجويده وتصقيله حتى قويت شوكته وتفجرت ينابيعه، فامتاز شعره بحسن الديباجة، وقوة المخيلة، والمقدرة الإبداعية النادرة، والوحدة العضوية والموضوعية. وقد نال بالشعر جوائز كثيرة، أعلاها الجائزة الأولى في المسابقة الشعرية التي نظمتها جامعة الملك سعود بالرياض ضمن فعاليات أسبوع التوعية حول مضار التدخين عام:1991م، ووسام التقدير الذي قلدته إياه شعبة اللغة العربية بجامعة ولاية كُوَارَا عام 2014م. وقد نشرت قصائده في مجلات علمية كثيرة في نيجيريا وبلاد العرب.
فقصائده، تميل إلى اتباع القدامى في الأبنية والتراكيب، فمفرداتها ضاربة في القدم، وبعضها معبر عن البيئة (غربيّ إفريقيا) وأماكنها، وكما وأن معظم قصائده تتصف بالسهولة والرصانة إلى جانب بساطة التراكيب وتسلسل المعاني، وجودة الأسلوب، ويمتاز شعره أيضاً بالجودة الأدبية، وقوة الخيال وامتلاؤه بالأحاسيس النفسية والوجدانية، وقد تأثر دكتور عيسى ألبي بالعلماء الذين أسهموا في بناء شخصيته. 
وقد جاء هذا البحث في: مقدمة، ومطلبين، وخاتمة، المطلب الأول؛ تحدّثت فيه عن حياة الشاعر الدكتور عيسى ألبي أبوبكر، بذكر شيء عن حياته بإيجاز، والمطلب الثاني: عرضت بعضا من نماذج شعره، أما الخاتمة فذكرت فيها أهم نتائج البحث.
هذا وقد اتبعت المنهج الوصفي التحليلي عند دراسة النصوص، كما سلكت المنهج التاريخي في دراسة حياة الشاعر، بما يمكنني أن أزعم أنني اعتمدت بشكل أو بآخر على المنهج التكاملي، إذ رأيته أوفى المناهج لحمل أعباء الدراسة في أقسامها المختلفة.
الاهمية الجيوستراتيجية لنفط افريقيا في خارطة التنافس الدولي
Authors: Ali Ahmed Hamed
Published: January 2023

هذا البحث محاولة جادة لتسليط الضوء على الاهمية الجيوستراتيجية لنفط افريقيا في خارطة التنافس الدولي, وذلك من خلال الوقوف على الوزن الجيوبولتيكي الذي تحظى به افريقيا في خريطة النفط العالمية, ومن خلال الاكتشافات الجديدة ودخول العديد من الدول الافريقية غير النفطية الى مجموعة الدول النفطية, وكذلك بروز العديد من العوامل الجديدة الدولية وغير الدولية في مسرح الصراع والتنافس على النفط الافريقي
الآثار السلبية لمحن العلماء وابتلاءاتهم في الأندلس ( 138-422هـ / 756-1031م )
Authors: saleh Matloub Qabas Farouk , Ibrahim Al- Abadi Hatem Karim
Published: January 2023

تعرض العديد من علماء الأندلس لمحن وابتلاءات كثيرة في كافة مجالات الحياة سواء كانت اجتماعية أو سياسية أو علمية ومدى تأثير شدتها عليهم ، بل اخذت هذه المحن بالتفاقم ، ولم تعد مجرد بلاء يلحق بهم وانما صارت داء ينخر وعيهم الديني .  
  وقد حاز علماء الأندلس وأدباؤهم مكانة مرموقة لدى الأمراء وعامة المجتمع الأندلسي على حد سواء ، نظراً لمكانة العلم في قلوب العامة والحكام بالإضافة إلى احتياج هؤلاء الحكام للشرعية الدينية بهدف تدعيم نفوذهم وترسيخ حكمهم وسلطانهم من خلال تأييد العلماء لهم ، والعلماء كغيرهم من سائر البشر معرضون للابتلاء في أنفسهم وأموالهم او اصحابهم وهي سنة سنها الله في عباده المؤمنين ، فكانت الابتلاءات التي تعرض لها هؤلاء نتيجة مكر حيك لهم بليل من بعض الحكام ، خوفاً من تزايد نفوذهم أو اشتداد سطوتهم ، أو طمع البعض منهم بالإمارة ، كذلك الضغائن والاحقاد دفعت العديد من الامراء الى سلب اموالهم وممتلكاتهم بحجج واعذار واهية ، وكانت تلك الاسباب التي ذكرناها آنفاً سبباً في اختيار هذا الموضوع ومعالجة هذه الفترة الزمنية  ، للدور الكبير الذي لعبه هؤلاء العلماء في التاريخ الإسلامي والمشكلات والاضطرابات السياسية في هذه الفترة الزمنية ( عصر الامارة والخلافة ) التي ألقت بظلالها على علماء الأندلس ، لذلك سلط الضوء من خلال هذه الدراسة على جزء من حياة العلماء ونخبة مهمة من المجتمع في تلك الفترة .
Physicochemical and Sensory Characteristics of Rose-Spices Drink with Red Ginger, Lemongrass, and Cinnamon Extract as Functional Beverage
Authors: Anis Saati Elfi , Eka Haprinata Edwin , Winarsih Sri , Wachid Mochammad , Amroini Wahyudi Vritta
Published: January 2023

Rose flower has varieties of compounds, one of that is antioxidants, but it's not been widely used in the food sector. The processing that can be applied to roses is to make them for functional drinks by adding variations of the three spice filtrate, which are expected to increase the quality, characteristics and increase the antioxidant activity of the product. This study aims to determine the interaction between the type of spice filtrate and the concentration of the spice filtrate to the quality of the Rose-Spices Drink. Randomized block design (RBD) with 2 replications. The best treatment for Rose-Spices Drink was P4K1 (Spice Combination: 5%) with antioxidant activity 89.67%, brightness level (L) 32.7, redness level (a+) 2.7, yellowness level (b+) 4.1, pH 4.053, total dissolved solids (TDS) 11.7 °Brix, total anthocyanin 0,20 mg/L,  taste 3.60 (quite like ), flavor 3.50 (quite like) and preference 3.23 (quite like).
Relative Mobility (Rf) Analysis of Albumin Isolates from Snakehead Fish (Ophiocephalus striatus) Extracted at Different Temperatures and Times
Authors: Nugroho Matheus , Sugiono Sugiono , Kurnia Hartati Fadjar
Published: January 2023

Snakehead fish was a fish that has a high albumin content. Snakehead fish was used in the health sector known as medicinal freshwater fish, to accelerate the process of healing wounds after surgery and childbirth. The purpose of this study was to analyze the relative mobility (Rf) of the snakehead fish (Ophiocephalus striatus) albumin isolates by steaming at different temperatures and times. The research method for analyze the relative mobility (Rf) of the snakehead fish (Ophiocephalus striatus) albumin isolates by using gel filtration column chromatography, was detected by the SDS-PAGE electrophoresis method. Electrophoresis was carried out at a constant voltage of 125 v/ slab. Gel staining was carried out with Commasie Brilliant Blue R-250 in methanol-acetic acid-water. A standard protein mixture consisting of: myosin (200.0 kDa), β-galactosidase (116.3 kDa), phosphorylase B (97.4 kDa), bovine serum albumin (66, 2 kDa), ovalbumin (45.0 kDa), carbonic anhydrose (31.0 kDa), trypsin inhibitor (21.5 kDa), lysozyme (14.4 kDa) and aprotinim (6.5 kDa). The data analysis of this research was descriptive analysis to see the photos of the electrophoresis results. Meanwhile, for the analysis, the measurement of albumin isolation by gel filtration Sephadex G-75 was carried out with a divided plot design. The results showed that SDS-PAGE electrophoresis with the most complex amount of protein was albumin isolate, the effect of the steaming temperature was 40 oC for 30 minutes, located in 5 ml of the 1st fraction, 5 ml of the 2nd fraction and 5 ml of the 3rd fraction, with values of  relative mobility (Rf) 0.0833 to 0.6944.
GoGirls: Evaluation and Testing of the Gender Equality Site Integrated With Google Drive
Authors:   Universidade Federal da Grande Dourados (Brasil), Lopes Emely Vitória Vasconcelos Albernaz , Odakura Valguima V. Viana Aguiar ,   Universidade Federal da Grande Dourados (Brasil)
Published: January 2023

This work presents the GoGirls project, which addresses gender equity together with digital literacy. The objective is to contribute to the empowerment of teenagers in high school, in extension actions, through workshops with activities using Web 2.0 tools. The GoGirls website is built within the concept of Learning Objects (LOs), thus constituting a digital tool to support education. The site was submitted to a usability test by potential LO applicators and also evaluation of the teaching-learning potential in an instructional context.
Sposoby i rodzaje uczestnictwa w mediach na wsi polskiej, słowackiej i węgierskiej
Authors: Kinal Jarosław
Published: January 2023

Współczesny rozwój technologiczny mediów, wraz z możliwościami dostępu do treści praktycznie zniwelował lukę informacyjną pomiędzy mieszkańcami wsi oraz miasta. Celem artykułu jest prezentacja wyników badań dotyczących partycypacji medialnych przeprowadzonych w trzech krajach Europy Środkowo-Wschodniej. Badania przeprowadzono na grupie losowej metodą webankiety. Zgromadzony agregat badawczy pozwolił na wskazanie różnić w partycypacji transmedialnej oraz pozwolił nakreślić wzorce zachowań konsumpcji mediów na terenach wiejskich. Dokonana w tym celu analiza komparatystyczna pomiędzy respondentami reprezentującymi różne systemy medialne, posiadające różne praktyki medialne pozwoliła na wyłuskanie cech wspólnych i różnic, które mogą być interesujące nie tylko dla medioznawców, ale także dla osób zarządzających kampaniami reklamowymi w mediach w badanych krajach.
Traumatic scalp arteriovenous fistula post capillary implantation successfully treated using PHIL embolic agent
Authors: Alfaro Alejandro José Quiroz , Ortíz Andrés Felipe Herrera , Mejia Juan Andres , Ortegon Jose David Cardona , Gutierrez Laura Camila , Tovar Catalina Andrea Dussan , Zarate Miguel , Gil-Quiñones Sebastian Ramiro , Montañez Marlon Yesid Barrera , Beaujon Lorena Fernández , Daza Orlando Manuel Diaz
Published: January 2023

Background:

A traumatic arteriovenous fistula of the scalp due to hair transplantation (AVFHT) is a rare fistulous communication between branches of the arteries and draining veins in the scalp’s subcutaneous tissue. Its incidence is unknown and its clinical manifestations may range from a pulsatile mass to seldom epilepsy. Surgery and interventional approaches (percutaneous and endovascular embolization) using coils and embolic agents such as Onyx have been used as treatment options. The authors report a rare case of an AVFHT successfully treated through percutaneous and endovascular embolization using coils and precipitating hydrophobic injectable liquid (PHIL) embolic agent. This is possibly the first reported case using PHIL embolic agent to treat an AVFHT.

Case Description:

The patient presented with a painful and disabling scalp swelling in the right parieto-occipital region 2 years after a hair transplant in 2011. A computed tomography angiography showed an arteriovenous fistula between branches of the right superficial temporal artery and branches of the right occipital artery to the right superficial temporal vein that was successfully embolized using coils and PHIL. The patient was discharged after a smooth recovery and 1 month later remained healthy.

Conclusion:

Percutaneous and endovascular embolization using PHIL embolic agent can be an alternative treatment for AVFHT.
Ververi-Brady syndrome associated with QRICH1 variants (clinical cases)
Authors: Т.В. Кожанова, , С.С. Жилина, , Т.И. Мещерякова, , Е.Г. Лукьянова, , Л.М. Сушко, , К.В. Осипова, , С.О. Айвазян, , А.Г. Притыко, , Н.Н. Заваденко,
Published: January 2023

В последние десятилетия достижения в области применения полноэкзомных и полногеномных технологий секвенирования позволили идентифицировать большое количество генов, связанных с умственной отсталостью, включая редкие формы, в частности, ассоциированные с мутациями в гене QRICH1. Синдром Вервери-Брэди (СВБ; MIM# 617982) - редкий синдром с аутосомно-доминантным типом наследования, характеризуется нарушением интеллекта, задержкой речи и легкими дисморфическими чертами лица. Впервые в России представлено клиническое и молекулярное описание двух пациентов с эпилепсией, задержкой развития и речи, мягкими дисморфическими чертами лица. При полноэкзомном секвенировании выявлены варианты нуклеотидной последовательность в гене QRICH1 -миссенс-мутация (c.1711G>A; p. Asp571Asn) и мутация сдвига рамки считывания (c.1963_1964insT; p.Lys655IlefsTer). На сегодняшний день в мире зарегистрировано 38 пациентов с мутациями в гене QRICH1.

Recent advances in sequencing technologies have enabled identification of multiple genes associated with intellectual disability disorders, including QRICH1 gene. Ververi-Brady syndrome (VBS; MIM: #617982) is a rare developmental disorder, characterized by mild developmental delay, mildly impaired intellectual development and speech delay and mild dysmorphic facial features. For the first time in Russia, clinical and molecular description of two patients with epilepsy, developmental and speech delay, and mild dysmorphic facial features is presented. The variants nucleotide sequence in QRICH1 gene - missense mutation (c.1711G>A; p. Asp571Asn) and frameshift mutations (c.1963_1964insT; p.Lys655IlefsTer) were detected by whole exome sequencing. To date, thirty-eight individuals have been reported with QRICH1 mutations in the world.
Populational genetic parameters of the North Ossetian Kumyks
Authors: Г.И. Ельчинова, , З.К. Гетоева, , В.В. Кадышев, , Ю.А. Ревазова, , Р.А. Зинченко,
Published: January 2023

Изучение популяционно-генетической структуры североосетинских кумыков проводится в рамках генетико-эпидемиологического обследования населения республики Северная Осетия-Алания. Кумыки компактно проживают в Моздокском районе и составляют 18% населения района. В данной работе использованы небиологические источники информации - 6303 брачные записи (тотальная выборка) и 50 демографических анкет, полученных в ходе опроса женщин пострепродуктивного возраста. Параметры изоляции расстоянием Малеко: Nе=4220, σ=35,6, а=0,00067, b=0,0277. Индекс территориальной эндогамии 0,86. Этническая брачная ассортативность 3,3. Интенсивность метисации 17,6%. Эффективная плодовитость 2,94±0,17. Тотальный индекс Кроу составил 0,214, а его компоненты Im=0,048, If=0,159.

The study of the genetic structure of the North Ossetian Kumyks is carried out as part of a genetic and epidemiological survey of the population of the Republic of North Ossetia-Alania. Kumyks compactly live in Mozdoksky district and present 18% of district population. Based on the marriage records for 1990-2000, the main population genetic parameters of the North Ossetian Kumyks were determined. Malekot’s parameters of isolation are Ne=4220, σ=35.6, a=0.00067, b=0.0277. The territorial endogamy index is 0.86. Ethnic marital assortativity is 3.3. The intensity of mestization is 17.6%. Effective fertility is 2.94±0.17. The total Crow index is 0.214, and its components Im=0.048, If=0.159.
Clinical case of tyrosinemia type I in the newborn
Authors: С.В. Черкасова,
Published: January 2023

Представлен случай тирозинемии 1 типа (НТ1) у новорожденного ребенка с описание клинической картины, иллюстрирующей сложности диагностики заболевания у новорожденного. Особое внимание уделено описанием неврологических проявлений и результатов инструментального обследования. Включение НТ1 в расширенный неонатальный скрининг позволит сократить время диагностики заболевания у новорожденных и как можно раньше начать патогенетическое лечение.

A case of type 1 tyrosinemia in a newborn is presented with a description of clinical signs illustrating the complexity of diagnosing the disease in a newborn. Particular attention is paid to the description of neurological manifestations and the results of instrumental examination. The inclusion of type 1 tyrosinemia in expanded neonatal screening will reduce the time for diagnosing the disease in newborns and start pathogenetic treatment as early as possible.
Association analysis of miRNA-146a SNPs rs57095329 and rs2910164 with the efficacy of immune checkpoint inhibitors of clear cell renal cell carcinoma therapy
Authors: Д.Д. Асадуллина, , И.Р. Гилязова, , Е.А. Иванова, , Р.Р. Рахимов, , А.Ф. Насретдинов, , А.А. Измайлов, , Г.Р. Гилязова, , В.Н. Павлов, , Э.К. Хуснутдинова,
Published: January 2023

Ингибиторы контрольных точек иммунитета (ИКТИ) совершили революционный прорыв в лечении онкологических заболеваний, в частности светлоклеточной почечно-клеточной карциномы (скПКК), однако существенная доля пациентов демонстрирует резистентность к терапии. Причины различного исхода терапии до сих пор остаются неясными. МикроРНК, участвующие в регуляции многих путей развития раковых и иммунных клеток, активно исследуются в качестве потенциальных биомаркеров. Некоторые микроРНК являются факторами, определяющими эффективность ИКТИ. Проанализированы ассоциации полиморфных вариантов микроРНК-146а rs57095329 и rs2910164 с риском развития осложнений и резистентности на фоне терапии ИКТИ у 86 пациентов с метастатической скПКК. Анализ ассоциации rs2910164 показал, что носители генотипа CC и аллеля C имели более высокий риск развития тяжелых иммуноопосредованных реакций при терапии ИКТИ.

Immune checkpoint inhibitors (ICIs) have made a revolutionary breakthrough in the cancer treatment, particularly clear cell renal cell carcinoma (ccRCC), but a substantial proportion of patients show therapy resistance. The reasons for the different treatment outcomes are still unclear. MicroRNAs involved in the regulation of many cancer and immune cell pathways are actively studied as potential biomarkers. Some microRNAs are factors determining the ICI efficacy. We analyzed the associations of rs57095329 and rs2910164 polymorphic variants of microRNA-146a with the risk of complications and resistance during ICI treatment in 86 patients with metastatic ccRCC. Association analysis of rs2910164 showed that CC genotype and the C allele had a higher risk of developing severe immune-mediated reactions when treated with ICIs.
Single-cell RNA Sequencing Data Analysis Reveals Structural Diversity of T-lymphocyte and Macrophage Infiltration in Atherosclerosis
Authors: А.Р. Дягель, , А.А. Зарубин, , М.С. Назаренко, , А.А. Слепцов,
Published: January 2023

Атеросклероз - многофакторное заболевание, существенный вклад в развитие которого вносят такие факторы, как иммунный ответ и физиологическое состояние артерии,. Иммунная система организма, включающая врожденный и адаптивный иммунный ответы, является драйвером патогенеза атеросклероза и играет не сколько протективную, антиатерогенную, сколько проатерогенную роль. На сегодняшний день пристальное внимание уделяется изучению Т-лимфоцитов, которые обладают как про-, так и антиатерогенными свойствами. В настоящем исследовании проведена оценка характера Т-клеточных субпопуляций в зависимости от макрофагального компонента в атеросклеротической бляшке. С этой целью были проанализированы транскриптомные данные единичных клеток атеросклеротических бляшек человека из базы данных SRА (SRP199578, SRP274629, SRP287809). Выявлена прямо-пропорциональная зависимость CD8+ стволовых Т-клеток памяти (TSCM) и отношения пула CD8+ Т-клеток к пулу макрофагов. Кроме того, показаны различия в лиганд-рецепторных взаимодействиях среди TSCM при разном соотношении CD8+ Т-клеток и макрофагов, в частности IL2RA, SELP, LEPR, SDC2, CCR6, TGFBR3, IL1R2, CD247, CXCR6, LIFR, ERBB3.

Atherosclerosis is a multicomponent disease that depends on immune response, and physiological condition of the arteries. Innate and adaptive immunity act as a driver of the pathogenesis of atherosclerosis rather than play an atheroprotective role. T-lymphocytes, as a key part of the immune response, can exhibit both pro- and anti-atherogenic properties. In this regard, the study of this cell population is of particular interest. In the present study, we performed the analysis of T-cells subpopulations depending on the T-cells to macrophages ratio. We applied bioinformatics methods to three single-cell RNA-sequencing datasets of human coronary and carotid arteries downloaded from the SRA database (SRP199578, SRP274629, SRP287809). The present study demonstrated a direct proportionality between CD8+ T memory stem cells (TSCM) and the ratio of the CD8+ T cells pool to the macrophage pool. In addition, we revealed differences in TSCM receptors (IL2RA, SELP, LEPR, SDC2, CCR6, TGFBR3, IL1R2, CD247, CXCR6, LIFR, ERBB3) that are involved in ligand-receptor interactions with other atherosclerotic plaques cell populations, between two groups of patients with high and low CD8+ T-cells to macrophages ratio.
The genome-wide search of SNPs in 3’-UTR microRNA target sequences associated with individual drug susceptibility
Authors: Е.Е. Корболина, , Н.И. Ершов, , Е.Ю. Рыкова,
Published: January 2023

Методы. Для анализа были взяты 253 аллель-асимметричных события, возникающие или усиливающиеся в 5 типах клеток человека в ответ на экзогенные соединения, включающие ряд фармакологических препаратов и 5402 eQTLs, выявленных при обработке интерфероном гамма (ИФН-γ) моноцитов периферической крови человека (PBMC). Были выбраны SNPs, локализованные в 3’UTR транскриптов, и выполнен поиск потенциальных сайтов связывания миРНК с использованием базы данных PolymiRTS. Результаты. В 5270 SNPs, проявивших себя как eQTLs, обеспечивающих реакцию PBMC на ИФН-γ, выявлены 307 событий, расположенных в предсказанных сайтах связывания миРНК, аффинность которых хотя бы к одной миРНК менялась в результате нуклеотидной замены. Среди 253 событий ASE 58 совпадали с вариациями, затрагивающими сайты связывания миРНК в 3’UTR различных мРНК. В большинстве случаев снижение экспрессии варианта соответствовало появлению сайта связывания миРНК. Заключение. Как анализ eQTL, так и поиск ASE являются эффективными инструментами выявления SNPs, расположенных в 3’UTR таргетных сайтов миРНК и связанных с индивидуальным ответом на лекарства.

The aim of this study was the identification of SNPs in 3’-UTR microRNA (miRNA) target sequences, underlining individual drug susceptibility, based on available data on eQTL and allele-specific expression (ASE) analysis. Methods and Algorithms: The search for SNPs in 3’-UTR miRNA target sites was carried out in 253 ASE events identified upon exposure of 5 human cell types to various drugs, nutrients and pollutants [1] and in 5402 eQTLs that appeared upon treatment of CD14+ monocytes with IFN-γ [2]. Data on the functional impact of SNPs on predicted miRNA sites were taken from the PolymiRTS database. Results: Of the 5402 eQTLs identified under IFN-γ treatment, 317 contained predicted miRNA binding sites affected by the nucleotide substitution. The highest enrichment in the group of 317 eQTLs was shown for the terms «cellular response to stress» (41 genes) and «immune response» (36 genes). Out of 253 ASE events, 58 coincided with the predicted SNPs in 3’-UTR miRNA target sequences. In most cases, reduced expression of the allelic variant corresponded to the appearance of a binding site for a particular miR(s). Conclusion: Both eQTL and ASE analysis are effective tools to identify SNPs located in 3’-UTR miRNA target sequences and associated with individual drug response.
Association of the GRIN2A gene with tardive dyskinesia in schizophrenia patients
Authors: И.В. Пожидаев, , Е.Г. Полтавская, , Е.Г. Корнетова, , А.А. Гончарова, , С.А. Иванова, , О.Ю. Федоренко,
Published: January 2023

Поздняя или тардивная дискинезия представляет собой тяжелый моторный побочный эффект антипсихотических препаратов, характеризующийся непроизвольными быстрыми мышечными сокращениями и атетоидными движениями туловища, конечностей и орофациальных мышц. Точный механизм тардивной дискинезии до сих пор неизвестен. Глутамат является основным возбуждающим аминокислотным нейротрансмиттером в центральной нервной системе млекопитающих. Ген GRIN2A кодирует субъединицу GluN2 ионотропного глутаматного рецептора NMDA. Целью настоящего исследования было исследовать ассоциации полиморфных вариантов гена GRIN2A с поздней (тардивной) дискинезией у больных, принимающих антипсихотические препараты. Было обследовано 944 пациента с шизофренией (435 женщин и 509 мужчин), Поздняя дискинезия была диагностирована у 229 пациентов. Было проведено генотипирование 12 полиморфных вариантов гена GRIN2A. Результаты ассоциативного анализа показали, что с поздней дискинезией ассоциирован полиморфный вариант rs8057394, вариант rs7206256 гена GRIN2A показал ассоциацию с орофациальной формой дискинезии. Также выявлено, что генотип GG и аллель G rs7192557 гена GRIN2A обладают протективным действием против развития лимбторакального типа поздней дискинезии. Таким образом, удалось подтвердить гипотезу об ассоциации гена GRIN2A с антипсихотик-индуцированной тардивной дискинезией у больных шизофренией.

Tardive or tardive dyskinesia is a severe motor side effect of antipsychotic drugs characterized by involuntary rapid muscle contractions and athetoid movements of the trunk, limbs, and orofacial muscles. The exact mechanism of tardive dyskinesia is still unknown. Glutamate is the main excitatory amino acid neurotransmitter in the mammalian central nervous system. The GRIN2A gene encodes the GluN2 subunit of the ionotropic glutamate receptor NMDA. The aim of this study was to investigate the association of polymorphic variants of the GRIN2A gene with tardive (tardive) dyskinesia in patients taking antipsychotic drugs. 944 patients with schizophrenia were examined (435 women and 509 men), Tardive dyskinesia was diagnosed in 229 patients. Genotyping of 12 polymorphic variants of the GRIN2A gene was carried out. The results of the associative analysis showed that the polymorphic variant rs8057394 is associated with tardive dyskinesia. rs7206256 of the GRIN2A gene showed an association with the orofacial form of dyskinesia. It was also found that the GG genotype and the G allele rs7192557 of the GRIN2A gene have a protective effect against the development of the limbthoracic type of tardive dyskinesia. Thus, it was possible to confirm the hypothesis about the association of the GRIN2A gene with antipsychotic-induced tardive dyskinesia in patients with schizophrenia.
Analysis of polymorphism of the MMP1 gene in miners of the Kemerovo region
Authors: Р.А. Титов, , В.И. Минина, , А.В. Торгунакова, , А.В. Марущак,
Published: January 2023

Обследованы 559 шахтеров, работающих на угольных шахтах Кемеровской области, в том числе 236 человек с диагностированным раком легкого (59±7,8 лет) и 323 человека, проживающие в той же местности и не имеющие признаков онкологических заболеваний (54±8,4 лет). Проведен сравнительный анализ полиморфных вариантов гена MMP1 -1607insG (rs1799750). Анализ выявил значимую ассоциацию между риском рака легкого у шахтеров и генотипом 2G/2G гена MMP1 (OR = 1,55, CI: 1,08-2,21, p = 0,02, аллелем 2G (OR= 1,32 95% CI: 1,04-1,67, p=0,02). Показатели риска были более выражены в подгруппе курящих (для генотипа 2G/2G OR= 2,08 95% CI: 2,08 1,20-3,59, p=0,008; для аллеля 2G OR= 1,63 95%CI: 1,16-2,31, p=0,005).

The study involved 559 miners living in the Kemerovo region of Russia were examined, including 236 patients with lung cancer and 323 without signs of oncological diseases. A comparative analysis of polymorphic variants of the MMP1 -1607insG (rs1799750) gene was carried out in miners with lung cancer and individuals without cancer living in the same area. Analysis of single-locus effects showed a significant relationship between the risk of lung cancer and the 2G/2G genotype of the MMP1 gene in the general group (OR = 1.55, CI: 1.08-2.21, p = 0.02) and the smoking group (OR= 2.08 95% CI: 2.08 1.20- 3.59, p=0.008). The 2G allele also showed a significant association with the risk of developing PD in miners in the general group (OR= 1.32 95% CI: 1.04-1.67, p=0.02) and the smoking group (OR= 1.63 95% CI: 1.16-2.31, p =0.005).
Study of genetic and epigenetic factors of primary osteoporosis development in men and women from the Volga-Ural region of Russia
Authors: Б.И. Ялаев, , Р.И. Хусаинова,
Published: January 2023

Проведен поиск генетических и эпигенетических маркеров остеопороза (ОП), ассоциированных с развитием переломов и низким уровнем минеральной плотности костной ткани (МПКТ), а также разработаны клинико-генетические модели ОП в выборках 701 женщины и 476 мужчин, подразделенных на группы в зависимости от наличия и отсутствия остеопоретических переломов и вариации уровня МПКТ в разных отделах скелета. С использованием технологии KASP-генотипирования и непараметрических критериев статистического анализа обнаружено, что маркерами переломов являются полиморфные варианты генов OPG, miR-146, а также сайтов связывания микроРНК генов VDR, ZNF239 и FGF2, маркерами низкого уровня МПКТ - варианты гена OPG, miR-196 и сайтов связывания микроРНК генов FBOX5, SOX9, MMP1 и ZNF239. Проведена полигенная оценка риска 140 ДНК-локусов, выявленных в результате репликации GWAS, и установлены клинико-генетические модели, прогнозирующие риск ОП с эффективностью до 90%. Анализ профиля метилирования 4 генов с использованием пиросеквенирования выявил ассоциацию гипометилирования гена RUNX2 с тяжелой формой первичного ОП в выборке женщин.

The authors searched for genetic and epigenetic markers of osteoporosis associated with the development of fractures and low bone mineral density and also developed clinical and genetic models of OP in 701 and 476 male samples divided into comparison groups depending on the presence or absence of osteoporotic fractures and variation in the BMD in different skeletal parts. Using the technology of KASP-genotyping and nonparametric criteria of statistical analysis, polymorphic variants of the OPG gene, miR-146, as well as microRNA binding sites of the VDR, ZNF239 and FGF2 genes, and variants of the OPG gene, miR-196 and microRNA binding sites of FBOX5, SOX9, MMP1 and ZNF239 genes were found to be markers of fractures. We performed a polygenic risk assessment of 140 full genome-wide association replication (GWAS) DNA locus and established clinical and genetic models predicting OP risk with up to 90% efficiency, with a 6,6-fold increased risk of fracture. Analysis of the methylation profile of 4 genes using pyrosequencing revealed an association of RUNX2 gene hypomethylation with severe primary OP in a sample of women.
Spectrum and frequency of pathogenic changes in patients with incomplete osteogenesis from the Republic of Bashkortostan
Authors: А.Р. Зарипова, , Д.Д. Надыршина, , Р.И. Хусаинова,
Published: January 2023

Проведен поиск патогенных изменений в целевых генах у 62 пациентов с несовершенным остеогенезом (НО) из 52 семей из Республики Башкортостан с использованием NGS-технологии. В результате проведенного исследования выявлены 29 мутаций в 4 генах (COL1A1, COL1A2, IFITM5, P3H1), ответственных за развитие НО у 42 пациентов из 32 семей. Дополнительно у 7 пациентов с низкотравматичными переломами были найдены гетерозиготные мутации в генах CLCN7, ALOX12B, PLEKHM1, ERCC4, ARSB, PTH1R, TGFB1, которые не участвуют в патогенезе НО.

In our study, we searched for pathogenic changes in target genes in 62 patients with osteogenesis imperfecta from 52 families from the Republic of Bashkortostan using NGS technology. The study revealed 29 mutations in 4 genes (COL1A1, COL1A2, IFITM5, P3H1) responsible for the development of OI in 42 patients from 32 families. Additionally, heterozygous mutations in the CLCN7, ALOX12B, PLEKHM1, ERCC4, ARSB, PTH1R, and TGFB1 genes were found in 7 patients with low-traumatic fractures that are not involved in the pathogenesis of OI.
Cellular stress blocks the transcription of satellite III on the first chromosome and reduces the content of satellite III in the DNA of cultured skin fibroblasts in patients with schizophrenia
Authors: Н.А. Салимова, , Н.Н. Вейко, , Е.С. Ершова, , Н.В. Захарова, , С.В. Костюк,
Published: January 2023

Ранее обнаружено, что в лейкоцитах крови больных шизофренией по сравнению с контролем значительно снижено содержание тандемного повтора - субфракции сателлита III (SatIII), который входит в состав прицентромерного гетерохроматина первой хромосомы (район 1q12). Одной из причин низкого содержания повтора в ДНК больных может являться низкий уровень транскрипции SatIII в условиях стресса. В работе показано, что клеточный стресс в культивируемых фибробластах кожи больных шизофренией и здоровых людей, вызванный повышением температуры культивирования, значительно блокирует транскрипцию SatIII (1q12) и увеличивает в десятки раз уровень транскрипции SatIII на хромосоме 9. В клетках больных шизофренией снижение содержания SatIII(1q12) в ДНК положительно коррелирует со снижением количества РНК SatIII. В контрольных клетках содержание SatIII(1q12) в ДНК при стрессе не изменялось. Блокировка транскрипции SatIII в условиях стресса потенциально может быть одной из причин снижения содержания повтора SatIII(1q12) в ДНК больных шизофренией.

It was previously found that in the blood leukocytes of patients with schizophrenia, compared to the control, the content of the tandem repeat - the subfraction of satellite III (SatIII), which is part of the pericentromeric heterochromatin of the first chromosome (region 1q12) - is significantly reduced. One of the reasons behind the low repeat level in the DNA of patients may be the low level of SatIII transcription under stress conditions. The study shows that cellular stress in cultured skin fibroblasts of patients with schizophrenia and healthy people, caused by an increase in cultivation temperature, significantly blocks the transcription of SatIII (1q12) and increases the transcription level of SatIII on the 9th chromosome tenfold. For cells of patients with schizophrenia, a decrease in the content of SatIII(1q12) in DNA positively correlates with a decrease in the amount of SatIII RNA. In control cells, the content of SatIII in DNA did not change under stress. Blocking of SatIII transcription under stress conditions can potentially be one of the reasons for the decrease in the content of the SatIII repeat in the DNA of patients with schizophrenia.
The structure of the gene pool of Tomsk Tatars according to Y-chromosome markers
Authors: Л.В. Валихова, , В.Н. Харьков, , В.Г. Волков, , И.Ю. Хитринская, , В.А. Степанов,
Published: January 2023

Изучен генофонд томских татар, проживающих в трех населенных пунктах: д. Черная речка, д. Тахтамышево, д. Эушта. Выявлено, что томские татары являются самой гетерогенной группой на территории Сибири. Полученные данные о генофонде томских татар отражают сложный процесс его формирования на базе различных по происхождению предковых групп населения. По результатам анализа генетической дифференциации по частотам гаплогрупп при делении томских татар на три выборки в соответствии с населенными пунктами показана высокая степень их межгрупповых различий. Томские татары значительно отличаются от других групп сибирских татар по составу гаплогрупп. По разным гаплогруппам показана связь томских татар с телеутами, северными алтайцами, шорцами, хакасами, тувинцами и бурятами, что подтверждает их связь с южносибирскими тюркоязычными и монголоязычными народами. Также выявлена значительная доля генофонда, унаследованная от переселенцев из Поволжья и бухарцев из Средней Азии.

The gene pool of Tomsk Tatars living in three settlements was studied: the village of Chernaya Rechka, the village of Takhtamyshevo, and the village of Eushta. It was revealed that the Tomsk Tatars are the most heterogeneous group in Siberia. The obtained results of the gene pool of the Tomsk Tatars reflect the complex process of their formation on the basis of ancestral population groups of different origins. According to the results of the analysis of genetic differentiation according to the frequencies of haplogroups, when dividing the Tomsk Tatars into three samples in accordance with the settlements, a high degree of their intergroup differences was shown. Tomsk Tatars differ significantly from other groups of Siberian Tatars in terms of the composition of haplogroups. According to different haplogroups, the connection of Tomsk Tatars with Teleuts, Northern Altaians, Shors, Khakass, Tuvans and Buryats is shown, which confirms their connection with the South Siberian Turkic-speaking and Mongolian-speaking peoples. A significant proportion of the gene pool inherited from people from the Volga region and Bukharians from Central Asia was also revealed.
Dynamics of Siberian Tatars fund of surnames: four ethnographic groups in three generations
Authors: М.Б. Лавряшина, , М.В. Ульянова, , З.А. Тычинских, , Д.О. Имекина, , Б.А. Тхоренко, , А.В. Мейер,
Published: January 2023

Изучен фонд фамилий искеро-тобольских, иштякско-токузских, саргатско-утузских тоболо-иртышских татар и сибирских бухарцев за 1950-е, 1980-е и 2010-е гг. (18630 человек, более 1150 фамильных вариантов). Территории расселения обследованных групп находятся в контактных зонах - группы территориально граничат друг с другом и, характеризуются «реципрокными» миграциями, что может стать причиной «стирания» четких границ популяционных генофондов. Фамилии, как аналог генетических маркеров, применены для исследования трансформации популяционно-генетической структуры сибирско-татарского населения во времени и географическом пространстве. Полученные результаты свидетельствуют о выраженном своеобразии фамильного состава исследованных этнографических групп и подтверждают эффективность татарских фамилий, как инструмента в оценке трансформации структуры их популяций не только для фиксации событий, но и понимания их причин. Данные анализа фондов фамилий на основе генетических расстояний согласуются с географией расположения этнических ареалов в пределах контактных зон и характеризуют перспективность применения фамилий для решения задач популяционной генетики.

The fund of surnames of Iskero-Tobolsk, Istiak-Tokuzsk, Sargatsko-Utuz Tobolo-Irtysh Tatars and Siberian Bukharans for the 1950s, 1980s and 2010s was studied (18630 people, over 1150 surname variants). The surveyed groups territories of settlement are located in contact zones - the groups are geographically connected to each other and are characterized by “reciprocal” migrations, which can cause the “erasure” of the clear boundaries in population gene pools. Surnames, as an analogue of genetic markers, are used to study the transformation of the population-genetic structure of Siberian-Tatar population in time and geographical space. The acquired results testify to the distinctive identity of surname composition of the ethnographic groups studied and confirm the effectiveness of Tatar surnames as a tool in assessing the transformation of their populations structure: not only to record events, but also to understand their causes. The data analysis of surname funds based on genetic distances is consistent with the geography of their ethnic habitats within the contact zones and characterize the prospects of using surnames to solve problems of population genetics.