Genetic Features of Pseudomonas Aeruginosa Isolated from Skin Infections
Authors: Buthaina H.J. , Ahmed K.A. 
Published: February 2025

Introduction. The Gram-negative opportunistic pathogen Pseudomonas aeruginosa, is frequently employed in research on virulence and bacterial resistance. It is a source of nosocomial infections including burns, and surgical site infections. Burn and wound injuries disrupt the skin’s natural defenses, allowing P. aeruginosa to colonize more easily and cause infection due to exposure to matrix proteins and inflammatory factors. Purpose. To perform a genetic analysis of P. aeruginosa isolates in various skin samples (burn and wound), from immunocompromised patients in intensive care units in Nasiriya governorate hospitals. Materials and methods. 113 samples were collected from burn patients’ and surgical wounds for this investigation. 26 of the isolates tested positive for P. aeruginosa by standard biochemical assays and molecular methods for related virulence factors. While monitoring for curtain virulence genes (OprL, ToxA, and LasR) and antimicrobial resistance genes (Blavim-2, Blakpc and MexB) to identify distinct bacterial strains. Results. PCR results showed presence of 84.62% of OprL and ToxA gene, 88.46% LasR gene and 80.77% MexB gene. However, no results showed presence of blaKPC and blaVIM2 genes. 16S rDNA sequencing of ten specifically chosen isolates were sent to Macrogen Company (Korea) showing 100% similarity to other neighboring stains according to National Center for Biotechnical Information (NCBI) site using the BLAST tool. These isolates were registered at the Gene-Bank under accession numbers (LC816373, LC816374, LC816375, LC816376, LC816377, LC816378, LC816379, LC816380, LC816381, LC816382). Conclusion. This study noted remarkable results in presence of OprL, ToxA LasR and MexB genes with a high similarity according to NCBI website.

Введение. Грамотрицательный условно-патогенный микроорганизм Pseudomonas aeruginosa является возбудителем нозокомиальных инфекций, в том числе в местах ожогов и хирургических вмешательств. Ожоги и раны нарушают естественную защиту кожи, что способствует более активной колонизации P. aeruginosa и вызывает инфекцию вследствие сочетанного воздействия матричных белков и возбудителей воспалительных процессов. Цель. Провести отбор и генетический анализ изолятов P. aeruginosa, полученных из различных образцов кожи (с ожогами и ранами) пациентов с ослабленным иммунитетом, пребывавших в реанимационных отделениях больниц мухафазы Насирия. Материалы и методы. Для исследования было отобрано 113 образцов тканей пациентов с ожогами и хирургическими ранами. С использованием стандартных методов биохимического и молекулярно-биологического определения факторов вирулентности установлено, что 26 изолятов являются положительными на P. aeruginosa. Одновременно проводили мониторинг генов вирулентности (OprL, ToxA и LasR) и генов резистентности к противомикробным препаратам (Blavim-2, Blakpc и MexB) для идентификации отдельных штаммов бактерий. Результаты. По результатам ПЦР-теста было установлено наличие генов OprL и ToxA (84,62% образцов), гена LasR (88,46%) и гена MexB (80,77%). Вместе с тем гены blaKPC и blaVIM2 не были обнаружены. Результаты секвенирования 16S рДНК десяти специально отобранных изолятов были отправлены в компанию Macrogen (Корея) для выявления 100%-ного сходства с другими родственными штаммами на основании данных сайта Национального центра биотехнической информации (NCBI) с помощью программы BLAST. Эти изоляты были зарегистрированы в Генном банке под идентификационными номерами LC816373, LC816374, LC816375, LC816376, LC816377, LC816378, LC816379, LC816380, LC816381 и LC816382. Заключение. Результаты выполненного исследования показали наличие генов OprL, ToxA, LasR и MexB.