bluuebunny/crossref_metadata_2025 huggingface dataset:
Distribution of estuarine fish fauna along coast of Brazil
Authors: PAIVA Andréa Carla Guimarães de , CHAVES Paulo De Tarso , De ARAÚJO Maria Elisabeth
Published: April 2017

O presente estudo teve como objetivos: listar a ictiofauna estuarina que ocorre no Brasil, a partir de dados compilados de artigos publicados em periódicos e em livros; rever a nomenclatura taxonômica válida das espécies; além de analisar ecologicamente as similaridades entre os segmentos ictiofaunísticos. Foram compilados os dados de 52 artigos científicos e livros, que tratam sobre assembleias de peixes estuarinos ou listas com abundância por espécie. Os trabalhos registraram 451 espécies válidas, sendo 225 associadas aos ambientes recifais, e 64 exclusivamente dulciaquícolas. Quatro espécies: Lutjanus apodus, L. griseus, Scartella nuchifilis e Scomberomorus maculatus não ocorrem na costa brasileira. Dentre as 104 famílias registradas, Sciaenidae foi predominante em todos os segmentos, exceto no V e no VIII. A análise de agrupamento indicou uma maior similaridade entre os segmentos II e III, e entre os segmentos V e VII. Palavras chave: Estuários, Peixes recifais, Similaridade.
The ichthyofauna of the brazilian surf zone: a compilation for ecological comprehension per region.
Authors: SANTANA Fábio Magno da Silva , SEVERI William , De SOUZA Flavo Elano Soares , De ARAÚJO Maria Elisabeth
Published: April 2017

The ichthyofauna of the surf zones of the Brazilian coast was determined and characterized by the territorial division of Brazil. We compiled 22 scientific papers published in scientific journals which presented the distribution of fish species in these sites. Two hundred and thirty-nine species belonging to seventy-one families of fish were validated and listed. The northern Brazil showed no study in this habitat. The southeast region showed a higher richness of species, families and uniqueness of species, whereas the southern had lower values of richness among the regions studied. In the northeast, most of the unique species are associated with reef environments and the southern presented species typical in freshwater among the unique ones. Finally, the presence of 239 fish species and 71 families represents a considerable number for the ichthyofauna of the Brazilian coast surf zone, for this environment has been scarcely studied. However, because there have been found species inhabiting other environments and by the presence of 61 species with 100% frequency of occurrence in the three regions studied, it can be concluded that it is an ecologically important site. Key words: fish, sea beaches, trawls, Brazil, bibliography
Pilot aerial study of the marine megafauna in northern coast Alagoas, Brazil
Authors: ALVES Maria Danise de Oliveira , BORGES João Carlos Gomes , De ARAÚJO Maria Elisabeth
Published: April 2017

This study aimed to investigate the feasibility of strip-transect aerial survey for the study of the marine megafauna in northern coast of Alagoas, chosen as the pilot area due to the better water clarity and the occurrence of the Antillean manatee. It was sighted 15 dolphins, 13 sea turtles and 10 manatees. From five aspects tested on the experimental flight, three adjustments were necessary on the methodology as following: 1) reduction of the transect angle to 40º to increase the sampling area; 2) constant transects of 1.5 nautical miles from shore to standardize the area of coverage; and 3) transects restricted to the mouths of estuaries due to low visibility in turbid waters. This study demonstrated the effectiveness of aerial surveys for the detection of marine megafauna. However, the adjustments proposed are necessary to minimize the characteristic limitations of each species and/or habitat. Keywords: aerial method, manatees, dolphins, sea turtles, limitations
As assembléias de peixes dos estuários de Conceição da Barra e Barra Nova, Espírito Santo.
Authors: HOSTIM-SILVA M. , LIMA A. C. , DAMASCENO J. , SCIARRETTA T. , SILVA J. V. , BOT NETO R. L. , CARVALHO B. M. , SPACH H. L.
Published: April 2017

Coletas mensais foram realizadas em quatro pontos amostrais de cada um dos estuários de Conceição da Barra e Barra Nova, utilizando-se para tal uma rede de arrasto de fundo com portas. Um total de 6243 indivíduos foi coletado pertencente a 55 taxa (28 famílias). Nos dois estuários as espécies mais abundantes foram Stellifer sp. e Diapterus rhombeus. Em ambos os estuários foram detectadas diferenças temporais na composição da ictiofauna, o mesmo tendo sido observado entre os pontos de coleta do estuário de Conceição da Barra. Palavras chave: ictiofauna, variação espacial, variação temporal, Brasil.
Population dynamics of Calanopia americana Dahl F., 1894 (Copepoda, Calanoida) in a reef environment in tropical Brazil
Authors: PESSOA Valdylene T. , MELO Pedro A. M. C. , MELO JÚNIOR Mauro , NEUMANN-LEITÃO Sigrid
Published: April 2017

The present study aimed to analyze variations in population dynamics of the Copepoda Calanopia americana (C. americana) in a reef area in tropical Brazil. Diurnal and nocturnal samples were collected at a fixed station during ebb tide, over four lunar cycles, and in the dry and rainy seasons. C. americana presence was very frequent (94%) and occurred in nearly all samples. Overall, juveniles presented higher densities than adults, and females were more abundant than males. There was a significant difference (p < 0.001) between the dry and rainy period for density, biomass and production, with the largest average values observed during the dry season (97.2 ± 91.0 ind.m-3 , 157.64 ± 131.80 µg C m-3 and 34.20 ± 30.36 µg C m-3 day-1 , respectively). In relation to the variation between day and night, the population dynamics of C. americana followed a pattern noted in previous studies, showing density peaks at (522,3 ± 402,68 ind.m-3 ) and lower values during the day (324,0 ± 336,36 ind.m-3 ). During the dry season, the amount of available light coupled with a lower amount of suspended material interferes with the community by increasing the density and influencing the productivity of C. americana. Although some studies have shown the influence of the lunar cycle on the migration processes of C. americana, in this study these variation did not have significant influence on population dynamics. Key-words: lunar cycle, plankton, production, biomass
Morphometry of the sagittal otolith from Atherinella brasiliensis (Quoy & Gaimard, 1824) (Actinopterygii - Atherinopsidae), at the coast of Paraná.
Authors: CARVALHO Bárbara M. de , CORRÊA Marco F. M.
Published: April 2017

In this work was done the description of the morphological and morphometric of the otolith sagitta of the Atherinella brasiliensis together with the linear regressions between biometrics fish and otoliths. Were 145 specimens analyzed with total length of 7.01 cm and with a standard deviation of ± 4.28 cm. All sagitta otoliths of A. brasiliensis showed sulcus acusticus heterosulcoid shape and type ostial. With the growth of the specimens occurred changes in the shape and margins of the otoliths, in specimens having above 8 cm total length of the fish observed a dorsal depression. The appearance of this depression in the dorsal otolith this species is an indication of the stress caused by the first maturation of the species. Key words: Brazilian silverside, teleósteos and regression.
Distribuição sazonal e espacial da clorofila a e variáveis ambientais na plataforma continental de Pernambuco (Porto do Recife), Brasil
Authors: CORDEIRO Isis Amália , FEITOSA Fernando Antônio do Nascimento , FLORES MONTES Manuel De Jesus , HONORATO DA SILVA Marcos
Published: April 2017

O estudo foi desenvolvido na Plataforma Continental de Pernambuco (Porto do Recife) objetivando avaliar a influência da pluma do rio Capibaribe na distribuição sazonal e espacial da clorofila a e variáveis ambientais. As coletas de água foram realizadas na superfície em baixa-mar, com garrafa de Niskin, em 4 pontos fixos, no período de estiagem (nov/10, fev e set/11) e chuvoso (mar, mai e jul/11). As variáveis ambientais analisadas foram pluviosidade, profundidade, transparência, temperatura, salinidade, oxigênio dissolvido e taxa de saturação, DBO, MPS, pH, amônia, nitrito, nitrato, fosfato, silicato e clorofila a. A pluviosidade variou de 23,5 a 755,7 mm, a transparência de 0,6 a 6 m; a temperatura de 26 a 30 ºC; a salinidade 12,65 a 36,36; DO de 2,99 a 5,02 ml/L-¹; MPS de ,4 mg.L-¹ a 55,6 mg.L-¹; pH de 7,31 a 8,45; a amônia de 0 a 8,97 μmol.L-¹; o nitrito de 0 a 4,47 μmol.L-¹; o nitrato de 0 a 15,82 μmol.L-¹; o fosfato 0,1 a 6,36 μmol.L-¹; o silicato de 1 a 113,6 μmol.L-¹; e a clorofila a de 0,24 a 19,29 mg.m-³. De acordo com a ACP a pluviosidade foi a forçante física que mais interferiu no sistema mostrando alta correlação direta com nitrito, nitrato e silicato e inversa com a transparência, temperatura, salinidade, OD, DBO, MPS e pH. A clorofila a esteve diretamente correlacionada com a amônia, o fosfato e a profundidade. A pluma do rio Capibaribe teve capacidade de influenciar toda área estudada nos meses de maior pluviosidade. Palavras chave: Fitoplâncton; Biomassa; Zona costeira; Hidrologia.
Condições ambientais do estuário do rio Timbó (Pernambuco-Brasil): biomassa fitoplanctônica e algumas variáveis ambientais
Authors: FEITOSA Fernando Antônio do Nascimento , MONTES Manuel De Jesus Flores , MELO Danielle Caroline da Mota , De SANTANA Jana Ribeiro , Da SILVA Laisa Madureira , FILHO Simone Jorge
Published: April 2017

O ambiente estuarino é altamente complexo e produtivo, além de ser um dos principais meios de subsistência para populações costeiras e ribeirinhas. Apesar de sua relevância ecológica, econômica e social, esse ecossistema vem sofrendo forte exploração antrópica, principalmente através da urbanização e do descarte de efluentes. Diante dessa situação, o presente estudo procurou avaliar a evolução das condições ambientais do estuário do rio Timbó, através da análise da clorofila a e das variáveis físico-químicas, comparando os resultados com trabalhos pretéritos. As coletas foram realizadas em quatro pontos fixos pré- estabelecidos, nos meses de setembro e novembro de 2013, representando os períodos chuvoso e estiagem respectivamente, na baixa-mar e preamar, durante a maré de sizígia. A pluviosidade e a maré influenciaram na maioria das variáveis analisadas. A temperatura variou de 26.5°C a 29°C, a salinidade entre 22 e 37 não sendo evidenciado estratificação na coluna d’água, a transparência oscilou de 0,5m a 2,91m, o material particulado em suspensão foi de 6,4 a 17,0 mg.L-1 , a concentração do oxigênio dissolvido variou de 1,0 a 8,09 e sua taxa de 41,6% a 170,3%. O teor de clorofila a variou de 2,16 a 37,99mg.m-3 . As análises de clorofila a fracionada evidenciaram uma maior contribuição da fração menor que 20µm do fitoplâncton, onde a contribuição mínima foi de 57,07% e a máxima de 100%. A clorofila a correlacionou-se positivamente com o oxigênio dissolvido e sua taxa de saturação e temperatura. As variáveis aqui analisadas indicaram que o ambiente encontra-se em processo de eutrofização como consequência do aumento da ação antrópica. Palavras-chaves: Clorofila a; variáveis hidrológicas; qualidade ambiental
Field observation of Ornithocercus spp. (Dinophysiales, Dinophyta): reproductive stages and phased cell division (South Atlantic Ocean, Brazil)
Authors: De AQUINO Eveline Pinheiro de , HONORATO-DA-SILVA Marcos , FEITOSA Fernando Antônio do Nascimento , KOENING Maria Luise , PASSAVANTE José Zanon de Oliveira
Published: April 2017

O ciclo de vida dos dinoflagelados oceânicos tem sido pouco estudado. A divisão é iniciada em determinados tempos do dia (divisão celular faseada). Este estudo relata os estágios de divisão (zona e ponte dorsal megacítica) para a população de Ornithocercus, no Oceano Atlântico Sul (Arquipélago de Fernando de Noronha), em diferentes tempos do dia. As amostras foram coletadas a cada 3h, durante 24h, em dois pontos fixos, nos anos 2010 e 2012. Foi feito o arrasto vertical da rede de plâncton (malha de 20µm). As células em divisão de Ornithocercus foram registradas, em que ocorreram O. magnificus Stein, O. thumii (Schmidt) Kofoid & Skogsberg, O. quadratus Schütt e O steinii Schütt, os quais apresentaram a divisão faseada e pelo menos um dos estágios de divisão celular. O. quadratus ocorreu no maior número de horários, desde antes, durante e depois do amanhecer, bem como durante e depois do pôr do sol. Palavras chave: fitoplâncton, dinoflagelados, variação nictemeral.
Pico, nano e microplâncton em quatro gamboas do município de Pontal do Paraná, Paraná, Brasil
Authors: KOLM Hedda Elisabeth , SIQUEIRA Adriana
Published: April 2017

Ambientes costeiros como baías, estuários e gamboas são importantes por serem regiões de alta produtividade e influenciadas por atividades antrópicas. Neste estudo foram avaliadas o pico, nano e microplâncton auto e heterotrófico em gamboas do município de Pontal do Paraná. Foram realizadas coletas trimestrais, entre abril de 2003 e abril de 2004, de águas superficiais de três estações de quatro gamboas (Perequê, Penedo, Barranco e Olho d´Água) durante as baixamares de sizígia. Quantidades maiores de organismos protozooplanctônicos foram diretamente relacionadas com o fitoplâncton nas estações externas de todas as gamboas, destacando-se as da Gamboa Perequê. Houve uma correlação direta entre o protozooplâncton e o picoplâncton heterotró- fico no outono e primavera de 2003 e verão de 2004 e inversa no inverno de 2003 e outono de 2004. Entre o protozooplâncton e o nanoplâncton heterotrófico a correlação foi direta no inverno, verão e outono de 2004 e inversa no outono de 2003. Na primavera, a quantidade de nanoplâncton heterotrófico não apresentou relação quantitativa com o protozooplâncton. Estes resultados indicam que, na região estudada, a maior salinidade, maior transparência da água e principalmente maior quantidade de fitoplâncton parecem ser mais importantes para o protozooplâncton que uma possível quantidade de pico- e nanoplâncton heterotrófico. Palavras chave: Gamboas, autotrófico, heterotrófico, Pontal do Paraná.
Variação temporal nos recifes de corais de Maragogi, APA Costa dos Corais (2010 – 2013)
Authors: Da SILVEIRA Camila BRASIL Louro , FERREIRA Beatrice Padovani , COXEY Mariana S.
Published: April 2017

O presente trabalho teve como objetivo principal a comparação da estrutura da comunidade bentônica e cobertura coralínea entre 2010 (ano de potencial branqueamento) e 2013 nos recifes de corais de Maragogi. A pesquisa de campo foi realizada nas cristas recifais por duas metodologias do Protocolo Reef Check, que foram: point intercept transect (PIT) e foto quadrats (FOT). As anomalias de temperatura superficial no mar na área não foram suficientes para causar branqueamento nos corais dos sítios estudados em 2010. Ambos os métodos revelaram que a cobertura total de corais se manteve estável nos três anos de pesquisa. Os métodos revelaram resultados diferentes a nível de cobertura específica de corais e de cobertura de categorias indicadoras, que pôde ser em parte atribuído a dificuldade de amostragem do hidrocoral Millepora alcicornis. Ademais, comprovou-se a necessidade de correções e adaptações nos métodos atualmente utilizados, dado a variação estrutural dos recifes da área. Apenas desta forma, será possível a detecção de alterações de pequena e média escala nos recifes de corais de Maragogi, estratégia muito importante para o manejo sustentável da área. Palavras chave: recife de coral, APA Costa dos Corais, branqueamento, cobertura de corais, metodologia de campo
A variabilidade da biomassa planctônica sob influência da sazonalidade e da dragagem do porto de Aratú, Baía de Todos os Santos, Brasil
Authors: FORTE NETO João Barroso , BERETTA Magda , FERREIRA Aline Nogueira , De SOUZA Christiane Sampaio de , MAFALDA JÚNIOR Paulo De Oliveira
Published: April 2017

O objetivo deste estudo é avaliar o impacto da atividade de dragagem de aprofundamento do Porto de Aratu, na Baía de Todos os Santos, sobre a biomassa de plâncton. As amostras foram coletadas antes, durante e depois da dragagem, em 6 estações de amostragem, durante as marés enchente e vazante, somente no período seco.O plâncton foi coletado utilizando redes de malha 50μm (microfitoplâncton), 200μm (mesozooplâncton) e 500μm (ictioplâncton), através de arrastos horizontais de subsuperfície. As variáveis oceanográficas (temperatura e salinidade), qualidade da água (oxigênio dissolvido e turbidez) e nutrientes (amôniaefósforo total) foram obtidas simultaneamente. Durante o período de dragagem foram registrados os maiores valores de densidade demicrofitoplâncton,densidade de mesozooplâncton e peso orgânico de mesozooplâncton, além dos menores valores de ovos e larvas de peixes, que foram restabelecidos após a dragagem. A análise de ordenação multivariada mostrou uma nítida separação entre os períodos de amostragem, demonstrando variabilidade temporal nabiomassa de plâncton no porto de Aratu, em resposta a sazonalidade das características oceanográficas da massa de água e mudanças na qualidade de água, possivelmente associada com as atividades de dragagem. Palavras-chave: variáveis oceanográficas, qualidade da água, nutrientes, plâncton
Ictiofauna das piscinas de maré da praia do paiva: um registro anterior à exploração imobiliária
Authors: DANTAS Rafael Dos Santos , DANTAS Patrícia Silva Basílio , RAMOS Robson Tamar da Costa
Published: April 2017

Piscinas de maré são importantes berçários para peixes recifais e estão constantemente sujeitas a impactos, principalmente oriundos de ação humana. O objetivo deste trabalho foi gerar um banco de dados acerca da ictiofauna da Praia do Paiva, uma área de piscinas de maré bem conservadas e sob ameaça antrópica. Foram amostradas três piscinas abertas e duas fechadas através de transecto de faixa e busca ativa. Um total de 66 espécies foi observado nas piscinas estudadas, muitas delas com importância socioeconômica. Embora a composição taxonômica registrada seja semelhante àquela de outros estudos na costa Nordeste, o número de espécies foi alto, quando comparado a outras áreas de piscinas desta região, o que evidencia a importância da Praia do Paiva como amostra conservada da biodiversidade. Palavras-chave: Conservação, Desenvolvimento Urbano, Peixes Recifais.
Crescimento alométrico de Callichirus major (Say 1818) (Crustacea: Callianassidae) em uma praia arenosa do nordeste brasileiro.
Authors: ALVES JÚNIOR Flávio De Almeida , De ARAÚJO Marina De Sá Leitão Câmara , FEITOSA Fernando Antônio do Nascimento
Published: April 2017

The burrowing crustaceans of the Infraorder Axiidea have as main representative Callichirus major (Say, 1818), known as ghost shrimp. The aim of this paper was to analyze the relative growth of C. major at Piedade beach, Pernambuco. The samplings were accomplished from December 2010 to November 2011. The ghost shrimps were sampled with a suction pump, sacrificed with alcohol and identified at the laboratory. A total of 389 individuals of C. major were sampled. The sexual dimorphism was evidenced, with males attaining larger sizes. Considering the carapace length as the independent variable, the growth of the total length was isometric for both sexes, while the chelipods showed positive allometry for both sexes, but with higher growth rate in males. While females direct their energy for the production and incubation of eggs, males invest in the growth of the body and chelipods, the last ones being important in territory defense and in reproduction. The growth of the telson was allometrically negative. The population of C. major at Piedade beach showed biometry very similar to other communities of the same family, but some variations were observed, due to intra and interspecific and biogeographic relations. . Key words: Axiidea, biometry, burrowing organisms, Piedade beach.
Morfologia foliar e densidade de hastes de Halodule wrightii (Cymodoceaceae), no litoral de Alagoas, Brasil
Authors: De FRANÇA Cassio Rafael Campos , PITANGA Maria Elisa , ALVES Maria Danise De Oliveira , De ARAÚJO Maria Elisabeth , SILVA Silmar Luiz , MAGALHÃES Karine Matos
Published: April 2017

O objetivo do estudo foi caracterizar quatro populações de Halodule wrightii no litoral norte de Alagoas, nordeste brasileiro. Entre novembro de 2011 e janeiro de 2012 foram coletadas 12 amostras por praia, sendo quatro por mancha, sempre se evitando as bordas. Em laboratório foram determinadas a densidade, a biomassa, o comprimento e a largura de folhas, com as diferenças entre os pontos de coleta analisadas pelo teste t e ANOVA one-way. Constatou-se diferenças significativas nas características morfológicas entre as populações, sendo as plantas de Barra Grande as maiores e de Tatuamunha as mais largas. As densidades entre as praias não apresentaram diferenças significativas, contudo as plantas de Porto da Rua revelaram diferença significativa intrapopulacional. Foi confirmada a plasticidade morfológica dentro e entre as populações de H. wrightii sendo sugeridos novos estudos que incluam diferentes variáveis ambientais de qualidade de água. Palavras chave: Capim agulha; morfologia; Atlântico Tropical.
Planktonic rotifers from a tropical estuary under high marine influence (Passos River, PE, Brazil).
Authors: JORGE FILHO Simone , NEUMANN-LEITÃO Sigrid , SILVA Tâmara De Almeida e , De MELO JÚNIOR Mauro
Published: April 2017

Passos River estuary, which is very influenced by marine waters, were carried out monthly from August/2009 to September/2010. A 64µm mesh size plankton net was hauled during low tide at two fixed stations in spring tides. Physical parameters as temperature, salinity, transparency and light extinction coefficient were obtained simultaneously. Statistical tests (Man-Whitney) were performed to evaluate possible seasonal and spatial variations. The rotifers were represented by only four species. Although there was no significant seasonal variation, the highest abundances were registered in the rainy season, with an expressive predominance of Brachionus plicatilis Müller, 1786. However, a population pick was registered in the dry season (September/2009; 13182,03 org.m-3 ) and the lowest value was registered in the rainy season (2010 May; 7,56 org.m-3 ). Brachionus plicatilis Müller, 1786 was highlighted as salinity indicator as well as its extremely opportunistic condition in eutrophic ecossistems, while Rotaria rotatoria (Pallas, 1766) and Rotaria sp. indicated organic pollution. Due to the constant high salinity regime the estuary showed few species richness. Keywords: Indicator, Rotifers, Salinity, Northeastern Brazil.
Microfitoplâncton de águas costeiras adjacentes ao porto do Recife (PE-Brasil)
Authors: De MELO Marcos Antônio Ferreira , KOENING Maria Luise , SOUTO José Rosa Filho , TRAVASSOS Rysoaurya Keyla , Da SILVA Alex Costa
Published: April 2017

Neste trabalho foram avaliadas as variações espaciais e temporais do microfitoplâncton em águas costeiras adjacentes ao porto do Recife-PE. As amostras foram tomadas na superfície em sete ocasiões entre maio/2010 e setembro/11 em quatro estações distribuídas ao longo de um transecto paralelo à linha da costa em período de estiagem e chuvoso nos estofos de baixamar de marés de sizígia. As características ambientais variaram amplamente entre os períodos de chuva e estiagem, mas pouco entre estações de coleta. Foram identificados 123 táxons destacando-se o filo Ochrophyta (diatomáceas) com 70,7%. As espécies dominantes características do período chuvoso foram Chaetoceros curvisetus Cleve, Coscinodiscus centralis Ehrenberg, Planktothrix agardhii (Gomont) Anagnostidis & Komárek e Trichodesmium thiebautiiGomont ex Gomonteno período de estiagem destacaram-se Helicotheca tamesis (Shrubsole) M. Ricard e Skeletonema cf. costatum (Greville) Cleve. Não foram registradas diferenças significativas em termos espaciais ou entre períodos climáticos no conjunto de variáveis ambientais, principalmente salinidade e concentrações de nutrientes. De uma forma geral, a comunidade fitoplanctônica variou pouco nos meses de coleta. Palavras chave: fitoplâncton, variáveis ambientais, zona costeira, sazonalidade
Condições ambientais do estuário do rio Botafogo (Itamaracá-Pernambuco-Brasil): clorofila a e algumas variáveis ambientais.
Authors: OTSUKA Amanda Yumi , FEITOSA Fernando Antônio do Nascimento , FLORES MONTES Manuel de Jesus , HONORATO DA SILVA Marcos , TRAVASSOS Rysoaurya Keyla
Published: April 2017

Este trabalho teve o objetivo de caracterizar o estuário do rio Botafogo (Itamaracá-PE) a partir da análise da clorofila a e alguns parâmetros ambientais. Foram feitas coletas mensais, em três pontos de amostragem ao longo do estuário, no período de abril/07 a março/08, em diferentes estágios e em maré de sizígia. Foi utilizada a garrafa de Kitahara na camada superficial da água para a análise de biomassa, Secchi, salinidade, oxigênio dissolvido, DBO, nutrientes, material particulado em suspensão. A biomassa fitoplanctônica variou sazonalmente, com maiores concentrações no período chuvoso e em baixa-mar. Os valores em média estiveram abaixo de 20 mg.m-3 , e a fração menor que 20 µm foi a que mais contribuiu para o ecossistema. A ACP mostrou uma correlação direta da clorofila com os nutrientes e inversa com a salinidade e oxigênio dissolvido. O ambiente dessa forma mostrou uma qualidade ambiental ainda satisfatória, porém em processo moderado de eutrofização. Palavras chave: sazonalidade, biomassa fitoplanctônica, parâmetros hidrológicos, área costeira.
Anadara ovalis (Bruguière, 1789): an alternative for cultivation in euhaline environment?
Authors: FERREIRA-JR A. L. , CHRISTO S. W. , ABSHER T. M.
Published: April 2017

Este trabalho teve como objetivo descrever o crescimento do bivalve A. ovalis cultivados na desembocadura da baía de Guaratuba, Paraná. Foram coletados 200 exemplares associados aos resíduos de pesca artesanal em dois pontos localizados no município de Pontal do Paraná. Em laboratório, os organismos com altura entre 2,0 a 5,0 mm foram separados dos resíduos e colocados em uma lanterna de cultivo na desembocadura da baía de Guaratuba. O crescimento foi monitorado durante dois períodos: abril a setembro de 2011 e setembro de 2012 a outubro de 2013. Mensalmente, 30 espécimes foram medidos em relação ao comprimento (C), altura (A) e largura (L) da concha. A taxa de crescimento médio foi de 1,74 mm/mês para C, 1,73 mm/mês para A e 1,18 mm/mês para L de A. ovalis. Observou-se uma alta taxa de mortalidade desta espécie em águas com menores salinidades e uma possibilidade de cultivo em ambientes euhalinos. Palavras chaves: curva de crescimento, bivalve de areia, aquacultura, litoral paranaense.
Indicadores das mudanças da comunidade fitoplanctônica associados com a dragagem no estuário do rio Beberibe (Brasil)
Authors: BORGES Gislayne Cristina Palmeira , SILVA CUNHA Maria da Glória Gonçalves da , ESKINAZI LEÇA Enide , FERREIRA Leandro Cabanez , AQUINO Eveline Pinheiro de , SANTOS JUNIOR Antonio De Castro , SANTIAGO Marilene Felipe , GUENNES Marcella
Published: April 2017

O presente trabalho teve como objetivo investigar o fitoplâncton como indicador de alterações na qualidade da água antes (2011) e durante (2012) e depois (2012) de dragagem, abrangendo uma variação interanual no estuário do rio Beberibe (Brasil). Foram examinadas as variáveis abióticas (temperatura, transparência, OD, salinidade e DBO5), clorofila a e composição do fitoplâncton. A maioria das espécies foi planctônica marinha e apesar da dragagem, não ocorreu um aumento das espécies ticoplanctônicas. Foram dominantes a cianobacteria Planktothrix agardhii (período chuvoso) e a diatomácea Bellerochea malleus (período de estiagem). A riqueza e a diversidade das espécies foram semelhantes antes e durante o período de dragagem, evidenciando que o período de dragagem não causou modificações significativas, porém, ocorreu um aumento progressivo das diatomáceas planctônicas, principalmente depois da dragagem. O curto período da dragagem não foi suficiente para causar modificações na comunidade fitoplanctônica no estuário do rio Beberibe.
MACROALGAS COMO INDICADORAS DE IMPACTO AMBIENTAL EM CARNAUBINHA, PIAUÍ, BRASIL: SUBSÍDIOS PARA FUTUROS PROGRAMAS DE MONITORAMENTO AMBIENTAL
Authors: De ASSIS Tuany Kelly Correia , ALVES Maria Helena
Published: April 2017

Esta pesquisa teve como objetivo avaliar a ocorrência e variação das espécies de macroalgas da Praia de Carnaubinha, Piauí, a partir das condições ambientais consideradas no local. As coletas foram realizadas em duas etapas distintas (períodos seco e chuvoso), nos meses de outubro e novembro de 2014 e março e abril de 2015, totalizando 4 coletas. Para a determinação da biomassa utilizou-se a metodologia de amostragem aleatória com quadrados de 25 x 25 cm (650 cm2). O pH da agua do mar, poças recifais e salinidade também foram aferidos. Os resultados foram 31 táxons de macroalgas com representantes das três divisões. A biomassa foi expressiva, não havendo diferenças significativas entre os dias de coleta, observando-se a predominância das algas vermelhas. A comunidade de macroalgas de Carnaubinha indicou boa qualidade ambiental, podendo esta contribuir para ações de preservação.
On the Mecanism of Red Tide of Trichodesmium in Recife Northeastern Brazil, with Some Considerations of the Relation to the Human Disease "Tamandaré Fever".
Authors: SATÔ Shigekatsu , PARANAGUÁ Maryse Nogueira , ESKINAZI Enide
Published: April 2017

O Trichodesmium que ocasionou a maré vermelha é uma espécie de alga verde azulada (Cyanoficea) que apareceu 3 vezes no período de outubro a novembro de 1963 nas águas costeiras do Recife, nordeste do Brasil. Para as amostras destas águas contendo Trichodesmium foram feitos os estudos planctológicos e hidrológicos.
Estudo da Barra das Jangadas - Parte V - Efeitos da Poluição sobre a Ecologia do Estuário.
Authors: OTTMANN François , OKUDA Taizo , CAVALCANTI Lourinaldo , SILVA Olímpio C. da , ARAÚJO Júlio V. A. de , COELHO Petrônio Alves , PARANAGUÁ Maryse Nogueira , ESKINAZI Enide
Published: April 2017

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Os Crustáceos Decápodos de Alguns Manguezais de Pernambuco.
Authors: COELHO Petrônio Alves
Published: April 2017

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Sédimentation Das L'estuaire de Potengi-Natal (Nord-est du Brésil)
Authors: COUTINHO Paulo Nóbrega
Published: April 2017

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Sedimentation at the Mouth of the São Francisco River (Brazil).
Authors: COUTINHO Paulo Nóbrega
Published: April 2017

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Contribuição ao Estudo dos "Beach-Rocks" do Nordeste do Brasil.
Authors: MORAIS Jáder Onofre
Published: April 2017

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Nota Preliminar Sobre Fundos Costeiros da Região de Itamaracá (Norte do Estado de Pernambuco, Brasil).
Authors: KEMPF Marc
Published: April 2017

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A Plataforma Continental de Pernambuco (Brasil): Nota Preliminar sobre a Natureza do Fundo.
Authors: KEMPF Marc
Published: April 2017

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Estudo da Plataforma Continental na Área do Recife (Brasil). I. Generalidades Sobre o Fundo.
Authors: KEMPF Marc , MABESOONE Jannes Markus , TINOCO Ivan De Medeiros
Published: April 2017

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Estudo da Plataforma Continental na Área do Recife (Brasil). II. Meteorologia e Hidrologia.
Authors: CAVALCANTI Lourinaldo Barreto , KEMPF Marc
Published: April 2017

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Contribuição ao Estudo da Biologia da Agulha-Preta (Hemirhamphus brasiliensis).
Authors: SANTOS Salatiel Menezes
Published: April 2017

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Single-molecule visualization of fast polymerase turnover in the bacterial replisome
Authors: Lewis Jacob S , Spenkelink Lisanne M , Jergic Slobodan , Wood Elizabeth A , Monachino Enrico , Horan Nicholas P , Duderstadt Karl E , Cox Michael M , Robinson Andrew , Dixon Nicholas E , van Oijen Antoine M
Published: April 2017

The Escherichia coli DNA replication machinery has been used as a road map to uncover design rules that enable DNA duplication with high efficiency and fidelity. Although the enzymatic activities of the replicative DNA Pol III are well understood, its dynamics within the replisome are not. Here, we test the accepted view that the Pol III holoenzyme remains stably associated within the replisome. We use in vitro single-molecule assays with fluorescently labeled polymerases to demonstrate that the Pol III* complex (holoenzyme lacking the β2 sliding clamp), is rapidly exchanged during processive DNA replication. Nevertheless, the replisome is highly resistant to dilution in the absence of Pol III* in solution. We further show similar exchange in live cells containing labeled clamp loader and polymerase. These observations suggest a concentration-dependent exchange mechanism providing a balance between stability and plasticity, facilitating replacement of replisomal components dependent on their availability in the environment.
Structure of Fam20A reveals a pseudokinase featuring a unique disulfide pattern and inverted ATP-binding
Authors: Cui Jixin , Zhu Qinyu , Zhang Hui , Cianfrocco Michael A , Leschziner Andres E , Dixon Jack E , Xiao Junyu
Published: April 2017

Mutations in FAM20A cause tooth enamel defects known as Amelogenesis Imperfecta (AI) and renal calcification. We previously showed that Fam20A is a secretory pathway pseudokinase and allosterically activates the physiological casein kinase Fam20C to phosphorylate secreted proteins important for biomineralization (Cui et al., 2015). Here we report the nucleotide-free and ATP-bound structures of Fam20A. Fam20A exhibits a distinct disulfide bond pattern mediated by a unique insertion region. Loss of this insertion due to abnormal mRNA splicing interferes with the structure and function of Fam20A, resulting in AI. Fam20A binds ATP in the absence of divalent cations, and strikingly, ATP is bound in an inverted orientation compared to other kinases. Fam20A forms a dimer in the crystal, and residues in the dimer interface are critical for Fam20C activation. Together, these results provide structural insights into the function of Fam20A and shed light on the mechanism by which Fam20A mutations cause disease.
Presynaptic morphology and vesicular composition determine vesicle dynamics in mouse central synapses
Authors: Guillaud Laurent , Dimitrov Dimitar , Takahashi Tomoyuki
Published: April 2017

Transport of synaptic vesicles (SVs) in nerve terminals is thought to play essential roles in maintenance of neurotransmission. To identify factors modulating SV movements, we performed real-time imaging analysis of fluorescently labeled SVs in giant calyceal and conventional hippocampal terminals. Compared with small hippocampal terminals, SV movements in giant calyceal terminals were faster, longer and kinetically more heterogeneous. Morphological maturation of giant calyceal terminals was associated with an overall reduction in SV mobility and displacement heterogeneity. At the molecular level, SVs over-expressing vesicular glutamate transporter 1 (VGLUT1) showed higher mobility than VGLUT2-expressing SVs. Pharmacological disruption of the presynaptic microtubule network preferentially reduced long directional movements of SVs between release sites. Functionally, synaptic stimulation appeared to recruit SVs to active zones without significantly altering their mobility. Hence, the morphological features of nerve terminals and the molecular signature of vesicles are key elements determining vesicular dynamics and movements in central synapses.
Incidental Findings in Student Ultrasound Models: Implications for Instructors
Authors: Siegel‐Richman Yonaton , Kendall John L.
Published: April 2017

As ultrasonography continues to become integrated into undergraduate medical education, there have been concerns raised about the use of volunteer models and the ability to maintain patient privacy during scanning sessions. To date, there have been no reports on how instructors should manage situations in which incidental findings are made during educational ultrasonography sessions. We present three different examples of incidental findings that occurred at our institution and the various approaches taken by the instructors. Furthermore, we outline an approach that can be utilized by other medical schools to better maintain patient confidentiality.
Sequence motifs capable of forming DNA stem–loop structures act as a replication diode
Authors: Shirak Andrey , Seroussi Uri , Gootwine Elisha , Seroussi Eyal
Published: April 2017

Calculating peak‐height ratios between single‐nucleotide polymorphisms (SNP) alleles in sequencing chromatograms is a practical method for estimating their copy number proportions (CNPs). However, it is surprising that sequencing DNA from different directions might yield different results. We analyzed three adjacent SNPs within the ovine period circadian‐clock 2 (PER2) gene that displayed such behavior. We compared Sanger and DNA‐seq sequencing for this locus and applied high‐resolution melt and MFOLD analyses to point to the DNA secondary structure that underlined this phenomenon. A synthetic system of oligonucleotides cloned into plasmids was used to further test the effect of such structures on sequencing. Our analyses indicated that a stem–loop structure capable of G–T pairing mediated the orientation bias by stabilizing this structure for specific alleles in heterozygous situations. We propose that this wobble‐like pairing hinders DNA polymerase passage on one strand while, on the complementary strand, the nonpaired A–C nucleotide counterparts allow unobstructed replication. Experimentation with synthetic amplicons that form similar stem–loop structures supported our hypothesis. We coined the term ‘replication diode’ for this effect and demonstrated that we can minimize it by lowering DNA and salt concentration. We also demonstrated that common genomic palindromes might induce the replication diode effect by applying bidirectional sequencing to an amplicon containing the palindrome within the human miRNA 1‐1 gene. Hence, to obtain reliable peak‐height ratios, bidirectional sequencing should be practiced at the lowest possible ionic strength whenever estimating CNPs. Further research is needed to determine whether the observed variable stem–loop structures affect PER2 regulation in vivo.
Multifunctional Biomedical Imaging in Physiological and Pathological Conditions Using a NIR‐II Probe
Authors: Shou Kangquan , Qu Chunrong , Sun Yao , Chen Hao , Chen Si , Zhang Lei , Xu Haibo , Hong Xuechuan , Yu Aixi , Cheng Zhen
Published: April 2017

Compared with imaging in the visible (400–650 nm) and near‐infrared window I (NIR‐I, 650–900 nm) regions, imaging in near‐infrared window II (NIR‐II, 1000–1700 nm) is a highly promising in vivo imaging modality with improved resolution and deeper tissue penetration. Here, a small molecule NIR‐II dye,5,5′‐(1H,5H‐benzo[1,2‐c:4,5‐c′] bis[1,2,5]thiadiazole)‐4,8‐diyl)bis(N,N‐bis(4‐(3‐((tert‐butyldimethylsilyl)oxy)propyl)phenyl) thiophen‐2‐amine), is successfully encapsulated into phospholipid vesicles to prepare a probe CQS1000. The novel NIR‐II probe is studied for in vivo multifunctional biological imaging. The results of this study indicate that the NIR‐II vesicle CQS1000 can noninvasively and dynamically visualize and monitor many physiological and pathological conditions of circulatory systems, including lymphatic drainage and routing, angiogenesis of tumor, and vascular deformity such as arterial thrombus formation and ischemia with high spatial and temporal resolution. More importantly, by virtue of the favorable half‐life of blood circulation of CQS1000, NIR‐II imaging is capable of aiding precise resection of tumor such as osteosarcoma and accelerating the process of lymph node dissection to complete sentinel lymph node biopsy for better decision making during the tumor surgery. Overall, CQS1000 is a highly promising NIR‐II probe for multifunctional biomedical imaging in physiological and pathological conditions, surpassing traditional NIR‐I imaging modality and pathologic assessments for clinical diagnosis and treatment.
Omniligase‐1: A Powerful Tool for Peptide Head‐to‐Tail Cyclization
Authors: Schmidt Marcel , Toplak Ana , Quaedflieg Peter J. L. M. , Ippel Hans , Richelle Gaston J. J. , Hackeng Tilman M. , van Maarseveen Jan H. , Nuijens Timo
Published: April 2017

Strategies for the efficient synthesis of peptide macrocycles have been a long‐standing goal. In this paper, we demonstrate the use of the peptide ligase termed omniligase‐1 as a versatile and broadly applicable enzymatic tool for peptide cyclization. Several head‐to‐tail (multi)cyclic peptides have been synthesized, including the cyclotide MCoTI‐II. Cyclization and oxidative folding of the cyclotide MCoTI‐II were efficiently performed in a one‐pot reaction on a 1‐gram scale. The native cyclotide was isolated and the correct disulfide bonding pattern was confirmed by NMR structure determination. Furthermore, compatibility of chemo‐enzymatic peptide synthesis (CEPS) using omniligase‐1 with methods such as chemical ligation of peptides onto scaffolds (CLIPS) was successfully demonstrated by synthesizing a kinase‐inhibitor derived tricyclic peptide. Our studies indicate that the minimal ring size for omniligase‐1 mediated cyclization is 11 amino acids, whereas the cyclization of peptides longer than 12 amino acids proceeds with remarkable efficiency. In addition, several macrocycles containing non‐peptidic backbones (e.g., polyethylene glycol), isopeptide bonds (amino acid side‐chain attachment) as well as d‐amino acids could be efficiently cyclized.

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Chemo‐ and Stereoselective Cytochrome P450‐BM3‐Catalyzed Sulfoxidation of 1‐Thiochroman‐4‐ones Enabled by Directed Evolution
Authors: Wang Jian‐bo , Ilie Adriana , Reetz Manfred T.
Published: April 2017

Directed evolution utilizing an unconventional approach to saturation mutagenesis has been applied to cytochrome P450‐BM3 as a catalyst in the asymmetric sulfoxidation of 1‐thiochroman‐4‐one and two derivatives thereof with complete chemoselectivity as well as (S)‐ and (R)‐selectivity on an optional basis. Whereas wild‐type P450‐BM3 shows in the case of the parent compound poor enantioselectivity in slight favor of the (S)‐sulfoxide (er=75:25), (S)‐selectivity was enhanced to er=93:7, while reversal of enantioselectivity favoring the (R)‐sulfoxide was also achieved (er=7:93). Two derivatives of the parent substrate underwent similar stereoselective sulfoxidation reactions. Sulfoxides of this type are of potential pharmaceutical interest. This biocatalytic approach nicely complements synthetic methods.

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Novel 3q27.2‐qter deletion in a patient with Diamond–Blackfan anemia and immunodeficiency: Case report and review of literature
Authors: Alkhunaizi Ebba , Schrewe Brett , Alizadehfar Reza , Vézina Catherine , Stewart Grant S. , Braverman Nancy
Published: April 2017

3q27.2‐qter deletion syndromes feature an overlapping set of terminal and interstitial deletions with variable congenital malformations. Diamond–Blackfan anemia (DBA) is etiologically heterogeneous disorder in which one cause is dominant mutations of the RPL35A gene on 3q29. We report a child with a 3q27.2‐qter deletion that contains the RPL35A gene. She had clinical and laboratory features consistent with DBA and as well, an unexplained immunodeficiency disorder. Given these unusual findings, we reviewed other patients in the literature with overlapping genomic deletions. In addition, we evaluated our patient for the immunodeficiency disorder, RIDDLE syndrome, due to recessive mutations in the RNF168 gene on 3q29. A PubMed search for case reports of 3q27.2‐qter overlapping deletions was performed. To determine if RPL35A was in the deletion region, the chromosomal regions reported were mapped to genomic regions using the UCSC Genome Browser. We identified 85 overlapping deletions, of which six included the RPL35A gene and all should be had DBA. Interestingly, none of the reported cases had immunodeficiency. To evaluate RIDDLE syndrome (radiosensitivity, immunodeficiency, dysmorphic features, and learning difficulties), we sequenced the remaining RNF168 gene and examined her fibroblast culture for a DNA double strand break repair deficiency. These results were normal, indicating that the immunodeficiency is unlikely to result from a RNF168 deficiency. We show that RPL35A haploinsufficiency is a cause of DBA and we report a novel case with 3q27.2‐qter deletion and immunodeficiency. The etiology for the immunodeficiency remains unsolved and could be caused by an unknown gene effect or consequent to the DBA phenotype.
CO2 Adducts of α‐Carbon Alkylated N‐Heterocyclic Olefins: Highly Active Organocatalysts for CO2 Chemical Transformation
Authors: Zhou Hui , Wang Guo‐Xu , Lu Xiao‐Bing
Published: April 2017

A series of CO2 adducts of α‐carbon alkylated N‐heterocyclic olefins (ANHOs–CO2) were synthesized and characterized by single‐crystal X‐ray diffraction analysis. The in situ FTIR studies demonstrated that ANHOs–CO2 adducts showed higher thermal stability than the previously reported α‐carbon nonsubstituted N‐heterocyclic olefins (HNHOs–CO2) due to the enhancement of the electron‐donating properties. Moreover, ANHOs–CO2 adducts exhibit higher activity in catalyzing the carboxylative cyclization of CO2 with propargylic alcohols than HNHOs–CO2 under the same experimental conditions. Meanwhile, various internal and terminal functionalized propargylic alcohols could be tolerated to obtain the corresponding α‐alkylidene cyclic carbonates in moderate to good yields with high stereoselectivity.
Small‐Molecule Anion Recognition by a Shape‐Responsive Bowl‐Type Dodecavanadate
Authors: Kuwajima Sho , Kikukawa Yuji , Hayashi Yoshihito
Published: April 2017

A dodecavanadate, [V12O32]4−, is an inorganic bowl‐type host with a cavity entrance with a diameter of 4.4 Å in the optimized structure. Linear, bent, and trigonal planar anions are tested as guest anions and the formation of host–guest complexes, [V12O32(X)]5− (X=CN−, OCN−, NO2−, NO3−, HCO2−, and CH3CO2−), were confirmed by X‐ray crystallographic analyses and a 51V NMR spectroscopy study. The degree of distortion of the bowl from a regular to an oval shape depends on the type of guest anion. In 51V NMR spectroscopy, all chemical shifts of the host–guest complexes are clearly shifted after guest incorporation. The incorporation reaction rates for OCN−, NO2−, HCO2−, and CH3CO2− are much larger than those of NO3− and halides. The incorporated nonspherical molecular anions in the dodecavanadate host are easily dissociated or exchanged for other anions, whereas spherical halides in the host are preserved without dissociation, even in the presence of the tested anions.
Gold(I)‐Complex–Titania Hybrid Photocatalyst for Hydrogen Production
Authors: Aguiló Elisabet , Soler Lluís , Casanovas Albert , Moro Artur J. , Lima João Carlos , Rodríguez Laura , Llorca Jordi
Published: April 2017

The integration of TiO2 with a AuI complex containing a thiocoumarin moiety resulted in a very efficient photocatalyst for the generation of H2. The molecular structure of the complex was preserved under the photoreaction owing to the strong AuI−S bond. The AuI complex played a determinant role in the photogeneration of H2 by accepting the photoinduced electrons originated in TiO2 upon light exposure. This is the first example of a AuI complex semiconductor hybrid photocatalyst. The rate of H2 generation under dynamic conditions from water/ethanol is approximately one order of magnitude superior on a metal basis to that obtained over conventional TiO2 decorated with Au metal nanoparticles.
Tunable Porous Coordination Polymers for the Capture, Recovery and Storage of Inhalation Anesthetics
Authors: Abrahams Brendan F. , Dharma A. David , Donnelly Paul S. , Hudson Timothy A. , Kepert Cameron J. , Robson Richard , Southon Peter D. , White Keith F.
Published: April 2017

The uptake of inhalation anesthetics by three topologically identical frameworks is described. The 3D network materials, which possess square channels of different dimensions, are formed from the relatively simple combination of ZnII centres and dianionic ligands that contain a phenolate and a carboxylate group at opposite ends. All three framework materials are able to adsorb N2O, Xe and isoflurane. Whereas the framework with the widest channels is able to adsorb large quantities of the various guests from the gas phase, the frameworks with the narrower channels have superior binding enthalpies and exhibit higher levels of retention. The use of ligands in which substituents are bound to the aromatic rings of the bridging ligands offers great scope for tuning the adsorption properties of the framework materials.