bluuebunny/crossref_metadata_2025 huggingface dataset:
Peran New Media Dalam Menciptakan Daya Tarik Wisata Indonesia Bagi Warga Negara Korea Selatan
Authors: Mardiana Lisa , Ratnawati Fithra Ayu
Published: July 2023

Pariwisata kini telah menjadi kebutuhan hidup manusia, tak terkecuali bagi Warga Negara Korea Selatan. Sebagai negara yang telah hidup berdampingan dengan internet, new media menjadi salah satu alat yang dimanfaatkan untuk mencari informasi pariwisata, termasuk wisata Indonesia. Tujuan dari penelitian ini adalah untuk mengetahui bagaimana peran new media dalam menciptakan daya tarik wisata Indonesia bagi Warga Negara Korea Selatan. Penelitian ini menggunakan pendekatan deskriptif dengan metode kualitatif. Penelitian ini menggunakan model AISAS (Attention, Interest, Search, Action, Share) yang merupakan salah satu model dari teori perilaku konsumen. Hasil dari penelitian ini menunjukkan bahwa new media berperan penting dalam proses pencarian informasi hingga keputusan pemilihan destinasi wisata. Dalam proses tersebut, situs Naver menjadi situs new media yang paling sering diakses oleh Warga Negara Korea Selatan, dan dari hasil pencarian yang ditemukan, Warga Negara Korea Selatan memilih atraksi budaya sebagai daya tarik wisata Indonesia yang paling menarik.
Mothers Community, COVID-19, and Family Resilience
Authors: Yuliarti Monika Sri
Published: July 2023

The COVID-19 pandemic has had a huge impact on all aspects of human life. One of the things that changed drastically during the crisis was the change in human activities from offline to online. This happened because of the physical distancing policy that was enforced to prevent the spread of the virus. One of the things that is challenged is family resilience. This study aims to explore the role of women in the family, in relation to family resilience during the COVID-19 pandemic crisis, by specifically conducting studies on the ‘Ibu Profesional’ community. As a country where patriarchal values are still attached, in Indonesia, women are always placed exclusively in the private sphere and do not receive respect because of this position. Nevertheless, it is very interesting to explore the extent to which the private sphere contributes to family resilience in times of crisis. By conducting interviews with 6 members of the community from the Surakarta branch, Indonesia, this research yielded the following findings: (1) Women play an important role in family resilience during the COVID-19 pandemic, both in the private and public spheres: (2) Women have the ability to master technology internet due to the changing mode of community activity from offline to online. Furthermore, they also prefer online activities compared to offline activities because of its simplicity.
Penerapan Standar dan Sertifikasi dalam Rantai Nilai Kopi: Peluang dan Kendala Bagi Petani
Authors: Ibnu Muhammad
Published: July 2023

ENGLISHSustainable standards and certification have been implemented in Indonesia for more than two decades. Although promoted as 'voluntary', standards and certification have become de facto 'requirements' for farmers to be able to access global markets. Most coffee plantations in Indonesia (about 98%) are managed by smallholders with limited participation in standards and certification. However, standards and certification programs continue to run, as well as international market demands for sustainable coffee are increasing. This research is a literature review, aiming to identify opportunities and barriers for farmers concerning the implementation of standards and certification in the coffee value chain. The research method used is a chain network approach with a business administration perspective and a public administration perspective, supported by empirical research. The results show that coffee farmers are still the most vulnerable and weakest actors in the coffee value chain. Sustainable standards and certification need to focus more on increasing the organizational capabilities of farmers and improving access to markets that balance quality and price. INDONESIAStandar dan sertifikasi berkelanjutan diimplementasikan di Indonesia sejak lebih dari dua dekade yang lalu. Walaupun dipromosikan sebagai ‘sukarela’, secara de facto standar dan sertifikasi telah menjadi suatu ‘persyaratan’ bagi petani untuk bisa mengakses pasar global. Sebagian besar perkebunan kopi di Indonesia (sekitar 98%) dikelola oleh petani kecil (smallholders) dengan tingkat partisipasi yang terbatas untuk standar dan sertifikasi. Namun demikian, program standar dan sertifikasi terus berjalan, demikian pula permintaan pasar internasional akan kopi berkelanjutan cenderung meningkat. Penelitian ini bersifat kajian literatur, bertujuan mengidentifikasi peluang dan kendala bagi petani terkait implementasi standar dan sertifikasi di rantai nilai kopi. Metode penelitian yang digunakan adalah pendekatan rantai jaringan (chain network) dengan perspektif administrasi bisnis dan perspektif administrasi publik, didukung oleh hasil-hasil penelitian empiris. Hasil penelitian menunjukkan bahwa petani kopi masih menjadi pelaku yang paling rentan dan terlemah dalam rantai nilai kopi.  Standar dan sertifikasi berkelanjutan perlu lebih fokus pada peningkatan kemampuan organisasi petani dan peningkatan akses ke pasar yang menyeimbangkan antara kualitas dan harga.
Cooperación transfronteriza yoeme: por la defensa de sus derechos humanos de territorio y agua
Authors: Castro Peralta Elia Anell , Rivera Cohen Aracely
Published: July 2023

This article analyzes the strategies of cross-border cooperation that the Yoeme community (also called “Yaquis”) in Sonora, Mexico, carries out with the support of the Pascua Yaqui Tribe in Tucson, Arizona, United States, for the strengthening of their autonomous rights. This paper employs an interdisciplinary methodology, using observation, interviews, and documentary analysis techniques. The results reveal a cross-border collaboration of the Yoeme group in the form of legal, cultural, and economic alliances that have allowed them to create new international spaces to demand justice and strengthen their collective ties. It is concluded that such collaboration must be based on their traditional and cultural normative framework supported by international human rights instruments to strengthen their autonomous rights of territory and water. The main limitation was the restricted access to Yaqui groups due to the COVID-19 pandemic.
El nacionalismo como actor de las relaciones internacionales: evolución, trayectoria y manifestaciones pasadas y presentes
Authors: Sánchez González Teresa
Published: July 2023

Prólogo del monográfico
Truth, success, and epistemology
Authors: Drayson Zoe
Published: July 2023

In Thinking and Perceiving, Stokes challenges “the pernicious cognitive effects assumption”: the assumption that it would be epistemically problematic if our thoughts were to directly influence our perceptual experience. In doing so, Stokes takes himself to be supplementing the epistemological claims of philosophers like Siegel and Lyons with descriptive claims about human psychology. I argue that his conclusions are more radical than they first appear, to the extent that Stokes’s project is at odds with the standard epistemological discussions of cognitive penetration.
ОЦІНКА ЕФЕКТИВНОСТІ РЕПРЕСИВНОЇ ТА КРИМІНОЛОГІЧНОЇ МОДЕЛЕЙ УБЕЗПЕЧЕННЯ ДОРОЖНЬОГО РУХУ
Authors: Колодяжний М. Г.
Published: July 2023

У науковій статті на підставі результатів емпіричного та теоретичного дослідження здійснена спроба визначення дієвості карального і некарального підходів щодо підвищення рівня безпеки дорожнього руху та експлуатації транспорту шляхом зменшення смертності й дорожньо-транспортного травматизму і так само запобігання автотранспортним правопорушенням. Виділені прояви тяжіння сучасної державної політики України у вказаній сфері до репресії: криміналізація окремих діянь; посилення адміністративної відповідальності за окремі правопорушення на транспорті; відповідна організаційна налаштованість керівництва МВС України і Національної поліції, активне застосування примусу в діяльності органів та підрозділів патрульної поліції. Наголошено, що некаральна (кримінологічна) модель убезпечення дорожнього руху базується на європейській стратегії Vision Zero. Вона відноситься до управління дорожнім рухом, безпечних доріг, сучасних транспортних засобів, убезпечення пересування учасників дорожнього руху, поставарійної діяльності. Здійснений ґрунтовний кримінологічний аналіз адміністративних стягнень за вчинення найбільш поширених правопорушень у сфері дорожнього руху та експлуатації транспорту в багатьох країнах-членах ЄС. Установлено кореляційні взаємозалежності між рівнем безпеки дорожнього руху у відповідних європейських державах та розміром штрафів за деякі правопорушення у сфері дорожнього руху, а також рівнем ВВП на душу населення. Проведено такий аналіз й щодо України. Зауважено, що оцінка рівня безпеки дорожнього руху має ураховувати не лише правові, а й передусім економічні чинники. Констатовано, що кримінологічна (некаральна) модель убезпечення дорожнього руху є більш ефективною порівняно з репресивним підходом. Водночас в Україні має бути застосована комбінована модель запобігання автотранспортним правопорушенням. Вона охоплює кримінологічні та деякі примусові заходи.
КРИМІНАЛЬНА ВІДПОВІДАЛЬНІСТЬ ЗА «ВИБОРЧІ» ПРАВОПОРУШЕННЯ ЗА ПРОЄКТОМ НОВОГО КРИМІНАЛЬНОГО КОДЕКСУ УКРАЇНИ
Authors: Мовчан Р. О.
Published: July 2023

Статтю присвячено критичному осмисленню запропонованої у проєкті нового Кримінального кодексу України концептуальної моделі регламентації відповідальності за кримінальні правопорушення проти виборчих прав та референдумного права. За результатом проведеного дослідження були виявлені недоліки відповідних проєктованих приписів, а також розроблені пропозиції щодо їхнього вдосконалення. Зокрема, доведено помилковість втіленого в проєкті підходу, коли злочинами 3-го ступеня тяжкості були визнані такі діяння, як «зрив роботи виборчої комісії чи комісії з референдуму» й «знищення, пошкодження або приховання виборчої документації чи документації референдуму після проведення виборів чи референдуму». Аргументовано доцільність «об’єднання» деяких передбачених розділом 4.10 проєкту статей. Обґрунтовано необхідність удосконалення запропонованого у проєкті наскрізного уніфікованого, який не використаний у жодній європейській країні, підходу до визначення ступеня тяжкості всіх «виборчих» злочинів, який, по-перше, ігнорує можливість диференціації відповідальності за діяння з різним ступенем суспільної небезпеки, по-друге, призводить до виникнення невиправданого дисонансу між кримінально-правовим статусом окремих таких правопорушень, одні з яких визнаються відразу злочинами 3-го ступеня тяжкості, а інші, попри характерний для них приблизно рівний ступінь суспільної небезпеки, принаймні, з деякими злочинами, – проступками. Наведено низку аргументів, які вказують на необхідність корегування назви аналізованої структурної ланки проєкту, у якій, замість вказівки на «кримінальні правопорушення проти виборчих прав та референдумного права», доцільно вживати формулювання «кримінальні правопорушення проти виборчих та референдумних прав». Наприкінці статті визначено перспективні напрями досліджень у розглядуваній сфері.
ПРОДОВЖЕННЯ, ЗМІНА Й ПРИПИНЕННЯ ЗАСТОСУВАННЯ ПРИМУСОВИХ ЗАХОДІВ МЕДИЧНОГО ХАРАКТЕРУ: ПРОГАЛИНИ, МІЖГАЛУЗЕВІ Й «ВНУТРІШНІ» СУПЕРЕЧНОСТІ ТА ЇХ ПОДОЛАННЯ
Authors: Навроцька В. В.
Published: July 2023

У статті звернено увагу на наявність численних міжгалузевих та «внутрішніх» суперечностей, інших системних недоліків у положеннях вітчизняних Кримінального, Кримінального процесуального кодексу та в Законі України «Про психіатричну допомогу» в частині регламентації ними підстав продовження, зміни чи припинення застосування примусових заходів медичного характеру та порядку застосування цих заходів. Стверджено, що лише констатація таких недоліків без наведення конкретних пропозицій щодо їх подолання на законодавчому рівні не особливо допоможе працівникам органів, котрі ведуть кримінальний процес. Зазначено, що найкращим способом уникнення правозастосовних помилок у ситуаціях, коли положення нормативних актів викладено нечітко та суперечливо, є не розрахунок на слідування тлумаченню відповідних нормативних положень хай навіть із боку суперавторитетних органів чи осіб, а законодавче коректування таких положень. З огляду на це, автором запропоновано низку змін та доповнень до ст. 95 КК України, ст. 514 КПК України та ст. 19 Закону України «Про психіатричну допомогу в частині регламентації ними підстав продовження, зміни та припинення примусових заходів медичного характеру. Указані пропозиції спрямовані на уникнення дублювання положень зазначених нормативних актів, належного врахування предмета правового регулювання, узгодження відповідних положень із задекларованою у Кримінальному процесуальному кодексі України засадою диспозитивності, врахування позицій Європейського суду з прав людини й підходів, відображених у Конвенції про захист прав людини та основоположних свобод, де передбачено гарантії справедливого судочинства, одним із аспектів яких є право на доступ до правосуддя.
УЧАСТЬ У МЕДІАЦІЇ АДВОКАТА ТА ПСИХОЛОГА У КРИМІНАЛЬНОМУ ПРОВАДЖЕННІ: АКТУАЛЬНІ ПРОБЛЕМИ
Authors: Богучарова О. І. , Кравченко І. М.
Published: July 2023

У статті досліджено особливості кримінального провадження на підставі угод, які обумовлено концепцією відновного правосуддя, а саме процесу, коли всі його сторони – учасники кримінального правопорушення – зустрічаються для сумісного вирішення питань щодо наслідків правопорушення та його впливу на майбутнє. У європейських країнах інститут угод є одним із ефективних альтернативних (позасудових) методів вирішення конфліктів, який покликаний швидко відновити порушені права потерпілих, знизити строки та витрати правосуддя, зберегти державні правові й людські ресурси та запобігти насильству. Як підтвердження актуальності теми дослідження, наведено судову статистику розгляду матеріалів кримінального провадження на підставі угод судами першої інстанції, яка доводить доцільність та своєчасність запровадження в Україні такого правового інституту. Проаналізовано норми міжнародних нормативно-правових актів, вітчизняного законодавства, включаючи норми Закону України «Про медіацію». Досліджено регулювання примирних процедур на підставі медіації як одного з альтернативних інструментів вирішення правових конфліктів. Наведено різні моделі медіації. Також розглянуто проблемність деяких положень щодо застосування угод у кримінальному процесуальному законодавстві України. Окрема увага приділяється визначенню особи, яка може бути медіатором, та її правового статусу в кримінальному провадженні. Розглянуто позиції науковців щодо адвокатів та інших юристів як медіаторів, потерпілих і їхніх представників, захисників, з однієї сторони, та спеціалістів-психологів, соціологів, педагогів тощо з іншої. Констатовано, що запровадження інституту медіації в національному кримінальному суді потребує суспільного сприяння у використанні примирних процедур у кримінальному провадженні, а відтак, і продовження наукового дослідження цього правового інституту.
ПРАВО НА СВОБОДУ МИРНИХ ЗІБРАНЬ У РІШЕННЯХ ЄВРОПЕЙСЬКОГО СУДУ З ПРАВ ЛЮДИНИ: ПРАВОВІ ПОЗИЦІЇ ДЛЯ ІМПЛЕМЕНТАЦІЇ У ПРАКТИКУ ПРАВОЗАСТОСУВАННЯ В УКРАЇНІ
Authors: Самбор М. А.
Published: July 2023

Сучасне темпоральне розуміння права на свободу мирних зібрань, особливості його використання та здійснення учасниками суспільних відносин, урегульованих нормами позитивного права, неможливо без урахування здобутків юридичної науки та втілення природно-правових засад прав і свобод людини у юридичній дійсності. Європейський суд з прав людини виступає унікальним суб’єктом не лише розв’язання спорів, що виникають між особою та державою, а й творцем нових підходів до застосування норм права, розуміння змісту та призначення прав і свобод людини в суспільстві крізь призму природно-правового розуміння. Розуміння права на свободу мирних зібрань, яке демонструє Європейський суд з прав людини, особливості системного застосування норм національного законодавства здійснені судом, формування та обґрунтування виняткових підстав обмеження цього права, є важливим джерелом для імплементації сучасного європейського цивілізаційного досвіду правового регулювання права на свободу мирних зібрань, а також судового прецеденту до національної правової системи. Поєднання європейського досвіду та національних традицій є унікальним джерелом створення сучасних ефективних умов використання та здійснення права на свободу мирних зібрань. Урахування висновків Європейського суду з прав людини та їх обґрунтування під час виконання рішень Європейського суду з прав людини у справах за заявами щодо України є важливим елементом не лише їх казуального виконання, а й формування заходів загального характеру, спрямованих на усунення системних проблем, пов’язаних із використанням та здійсненням права на свободу мирних зібрань, у тому числі спричинених розумінням підстав застосування обмеження використання права на свободу мирних зібрань окремими суб’єктами. За результатами проведеного дослідження формуються узагальнені висновки, які можуть стати якісним доктринальним підґрунтям застосування норм права під час використання, здійснення права на свободу мирних зібрань його носіями, а також створення умов свободи використання цього права суб’єктами публічної адміністрації.
СЕКСУАЛЬНЕ НАСИЛЬСТВО ЯК ВОЄННИЙ ЗЛОЧИН: ОСОБЛИВОСТІ КРИМІНАЛІЗАЦІЇ ТА КВАЛІФІКАЦІЇ ЗА ЗАКОНОДАВСТВОМ УКРАЇНИ
Authors: Задоя К. П. , Дудоров О. О.
Published: July 2023

Статтю присвячено з’ясуванню особливостей криміналізації та кваліфікації сексуального насильства як воєнного злочину за законодавством України. Констатовано неточність останнього в частині криміналізації сексуального насильства як воєнного злочину. Зазначено, що вказане є наслідком того, що ст. 438 Кримінального кодексу України «Порушення законів та звичаїв війни», котра покликана у вітчизняній правовій системі криміналізувати воєнні злочини, серйозно відрізняється від ст. 8 Римського статуту Міжнародного кримінального суду. Проведено порівняльний аналіз положень, з одного боку, Женевської конвенції про захист цивільного населення під час війни від 1949 року як єдиного міжнародного договору, згоду на обов’язковість якого надано Верховною Радою України та який прямо забороняє сексуальне насильство, а також, з іншого, – ст. 8 Римського статуту. З’ясовано, що перший із цих міжнародно-правових документів має вужчу сферу застосування, зважаючи на типи забороненої поведінки, так й інші значимі аспекти – типу збройного конфлікту, статі й кола потерпілих. Визначено переліки обов’язкових для України положень договірного міжнародного гуманітарного права, які імпліцитно забороняють сексуальне насильство у випадках як міжнародних збройних конфліктів, так і збройних конфліктів неміжнародного характеру. Доведено, що правові підстави, які лежать в основі цих заборон, різняться, що має братись до уваги при кримінально-правовій кваліфікації досліджуваного сексуального насильства. Аргументовано положення про те, що норми кримінального закону про відповідальність за «загальнокримінальні» злочини повинні тлумачитись як такі, що не поширюються на випадки, які підпадають під сферу дії ст. 438 КК України. Висвітлено питання, яким чином положення договірного міжнародного гуманітарного права, що забороняють сексуальне насильство, кореспондують із формами злочину «порушення законів та звичаїв війни» Проаналізовано, яким чином проблему криміналізації сексуального насильства як воєнного злочину пропонується вирішувати у проєкті нового Кримінального кодексу України. Наведено аргументи на користь вдосконалення ст. 438 КК України з урахуванням «каталогу» воєнних злочинів, закріпленого у ст. 8 Римського статуту.
Comparison of the short-term efficacy of different Amplatzer models and similar occluders in the treatment of patent foramen ovale
Authors: Lou Yuxuan , Hua Yang , Shi Jing , Yang Fengze , Wang Yifei , Yang Yang , Sun Wei , Kong Xiangqing , Zhang Hao
Published: July 2023

Objective

To compare the recent efficacy and safety of different Amplatzer models and similar occluder in the treatment of patent foramen ovale (PFO).

Methods

Patients with PFO complicated with cryptogenic stroke or migraine who underwent transcatheter closure of PFO in the First Affiliated Hospital of Nanjing Medical University from September 2019 to March 2021 were selected. Patients were grouped according to the type of occluder device. The basic data of the patients were collected and followed up within 1 year after occlusion. Effectiveness was defined as no recurrence of stroke/remission of migraine symptoms and a negative postoperative foaming test, and safety events were counted as the combined results of serious adverse events.

Results

A total of 92 patients were selected, including 45 cases in the symmetrical group and 47 cases in the asymmetric group. There were no serious adverse events in the 2 groups during follow-up. 3 days and 1 month after occlusion, the number of shunt patients in the asymmetric group was significantly less than that in the symmetric group (χ2 = 5.484, P = 0.019; χ2 = 5.146, P = 0.023). The negative rate of blocked residual shunts in the asymmetric group was higher than that in the symmetric group at 1, 3, 6 and 12 months after occlusion (χ2 = 6.473, P = 0.011; χ2 = 4.305, P = 0.038; χ2 = 4.842, P = 0.027; χ2 = 4.034, P = 0.045). Headache in migraine patients in the asymmetric group was significantly better than headache in patients in the symmetric group (P = 0.038; P = 0.049).

Conclusion

Asymmetric Amplatzer and similar occluders provide greater efficacy in short-term occlusion than symmetric ones.
Geochronology, pyrite trace elements, and sulfur isotope geochemical characteristics of the Saibagou gold deposit in the eastern part of the northern Qaidam Basin
Authors: Xing Jia , Wang Jianguo , Liu Jianbao , Liu Yanguang , Bian Kai , Liu Jianwei , Cai Lina , Wei Shengyun
Published: July 2023

Introduction: The Saibagou gold deposit, located in the eastern part of the tectonic belt of the northern Qaidam Basin in western China, has its gold ore bodies strictly controlled by the regional fault system. Despite this understanding, there remain controversies surrounding the deposit’s metallogenic epochs, sources of ore-forming materials, and properties of ore-forming fluids. To address these controversy, the metallogenic process of the Saibagou gold deposit can be further determined by analyzing the U-Pb ages of hydrothermal zircons in the gold-bearing quartz veins and investigating the trace element and sulfur isotope compositions of pyrite in the gold deposit.

Methods: This study does not focus on the mineral characteristics susceptible to interference by the metallogenic condition in gold ore bodies. Instead, it offers a detailed discussion on stable associated minerals and their indicative markers formed in the process of gold mineralization.

Results: The results of this study showed that the metallogenic process of the gold deposit can be categorized into the following stages: 1) quartz–pyrite veins, 2) milky-white quartz—pyrite—native gold veins, 3) hoary quartz—native gold—polymetallic sulfide veins. As indicated by the U-Pb ages of hydrothermal zircons in the gold-bearing quartz veins, the Saibagou gold deposit has two metallogenic ages, namely, 423.91 ± 4.5 Ma (the Silurian) and 470.18 ± 4.92 Ma (the Ordovician).

Discussion: The Silurian metallogenic age, predominates and nearly aligns with the expansion of the regional NWW-trending brittle-ductile shear zone, followed by the Ordovician metallogenic age. Data on the trace elements and sulfur isotopes of pyrite, show that the Saibagou gold deposit has similar pyrite compositions in the three metallogenic stages. Gold in the deposit primarily occurs as native gold or minor petzite inclusions and has a very low lattice gold concentration. As indicated by the concentrations of elements such as Co, Ni, and as in the pyrite, as well as the variation range of δ34S values, the ore-forming fluids were derived from low-temperature arsenic-bearing acidic magmas. In addition, the primary ore-forming materials appear to encompass mantle-derived materials from the deep earth.
Influence of maternal age on the birthweight of infants delivered from frozen-thawed blastocyst transfer cycles
Authors: Wang Xue , Xiao YaLing , Tao Tao , Xiong Wei
Published: July 2023

The aim of this study was to investigate whether maternal age had an effect on the birthweight of singletons delivered from frozen-thawed blastocyst transfer (FBT) cycles. A total of 1203 FBT cycles occurring between July 2011 and June 2021 at a single centre were retrospectively analysed. Based on the maternal age at FBT, the patients were divided into four groups: <30, 30–34, 35−37, and ≥38 years of age. Main outcomes measured included singleton birthweights, preterm births, large-for-gestational-age (LGA) and small-for-gestational-age (SGA) live births among the groups. There was no significant difference in birth weight among the four groups, while the highest birth weight was found in the <30 years group. The incidence of very preterm births and very low birth weights demonstrated an increasing trend with age; on the contrary, the incidence of preterm births, low birth weight (LBW), high birth weight and LGA and SGA live births gradually decreased with increasing age, but these differences were not statistically significant among groups (P>0.05, respectively). Although the proportion of females was lower than that of males, the difference was not statistically significant among the groups. After adjusting for possible confounders, maternal age was found to have no effect on adverse neonatal outcomes in the regression analyses (P>0.05). Birthweight in singleton births from FBT was not affected by maternal age.
The impact of the COVID-19 pandemic on thyroid nodular disease: a retrospective study in a single center in the western part of Romania
Authors: Popa Oana , Barna Robert Alexandru , Borlea Andreea , Cornianu Marioara , Dema Alis , Stoian Dana
Published: July 2023

Introduction

The COVID-19 pandemic had a significant impact on the healthcare system, leading to a prioritization of hospital admissions in many countries. Romania was no exception, and it had to restrict patient access to medical services in hospitals with chronic diseases and oncological pathology, including thyroid cancer. This study aimed to compare the clinical and pathological factors of patients with nodular thyroid disease diagnosed and surgically treated during the two years before and after the COVID-19 pandemic, in a single medical institution.

Methods

The retrospective study included 1505 patients who were diagnosed and operated on for nodular thyroid disease between January 2018 and December 2021. The patients were divided into two groups: the “PRECOVID” group (January 2018 to February 2020), and the “POSTCOVID” group (March 2020 to December 2021). The analyzed parameters included patients’ gender, age, preoperative diagnosis, type of surgical intervention, and pathological diagnosis.

Results

A significant decrease was observed in the number of surgeries performed for thyroid nodular disease during the COVID-19 pandemic period (450 versus 1055 cases, p<0.00001). There was a significant decrease in the number of surgical reinterventions (0.9% in the POSTCOVID group versus 2.9% in the PRECOVID group, p=0.01) and a significant increase in the number of total thyroidectomies (84.9% in the POSTCOVID group versus 80.1% in the PRECOVID group, p=0.02). We also observed a higher incidence of malignant/borderline tumors in the POSTCOVID group compared to the PRECOVID group (p=0.04) and a significantly higher frequency of aggressive forms of thyroid cancer in the POSTCOVID group (p=0.0006).

Discussion

The COVID-19 pandemic had a significant impact on the surgical management of nodular thyroid disease, resulting in a decrease in surgeries and a change in the type of surgical interventions performed. The higher incidence of malignant/borderline tumors diagnosed during the pandemic highlights the importance of timely diagnosis and treatment of thyroid nodules to prevent cancer progression.
A prioritization protocol for coastal wetland restoration on Molokaʻi, Hawaiʻi
Authors: Drexler Judith Z. , Raine Helen , Jacobi James D. , House Sally , Lima Pūlama , Haase William , Dibben-Young Arleone , Wolfe Bret
Published: July 2023

Hawaiian coastal wetlands provide important habitat for federally endangered waterbirds and socio-cultural resources for Native Hawaiians. Currently, Hawaiian coastal wetlands are degraded by development, sedimentation, and invasive species and, thus, require restoration. Little is known about their original structure and function due to the large-scale alteration of the lowland landscape since European contact. Here, we used 1) rapid field assessments of hydrology, vegetation, soils, and birds, 2) a comprehensive analysis of endangered bird habitat value, 3) site spatial characteristics, 4) sea-level rise projections for 2050 and 2100 and wetland migration potential, and 5) preferences of the Native Hawaiian community in a GIS site suitability analysis to prioritize restoration of coastal wetlands on the island of Molokaʻi. The site suitability analysis is the first, to our knowledge, to incorporate community preferences, habitat criteria for endangered waterbirds, and sea-level rise into prioritizing wetland sites for restoration. The rapid assessments showed that groundwater is a ubiquitous water source for coastal wetlands. A groundwater-fed, freshwater herbaceous peatland or “coastal fen” not previously described in Hawaiʻi was found adjacent to the coastline at a site being used to grow taro, a staple crop for Native Hawaiians. In traditional ecological knowledge, such a groundwater-fed, agro-ecological system is referred to as a loʻipūnāwai (spring pond). Overall, 39 plant species were found at the 12 sites; 26 of these were wetland species and 11 were native. Soil texture in the wetlands ranged from loamy sands to silt and silty clays and the mean % organic carbon content was 10.93% ± 12.24 (sd). In total, 79 federally endangered waterbirds, 13 Hawaiian coots (‘alae keʻokeʻo; Fulica alai) and 66 Hawaiian stilts (aeʻo; Himantopus mexicanus knudseni), were counted during the rapid field assessments. The site suitability analysis consistently ranked three sites the highest, Kaupapaloʻi o Kaʻamola, Kakahaiʻa National Wildlife Refuge, and ʻŌhiʻapilo Pond, under three different weighting approaches. Site prioritization represents both an actionable plan for coastal wetland restoration and an alternative protocol for restoration decision-making in places such as Hawaiʻi where no pristine “reference” sites exist for comparison.
Transcriptome-based phylogenomic analysis reveals evidence of ancient hybridization events in the Mepraia genus (Hemiptera: Reduviidae: Triatominae)
Authors: Belintani Tiago , Congrains Carlos , Pinotti Heloisa , Chahad-Ehlers Samira , de Brito Reinaldo A. , Oliveira Jader , Frias-Lasserre Daniel , Fontes Felipe Mendes , da Rosa João Aristeu
Published: July 2023

Introduction

The Mepraia genus is composed of three endemic species in Chile, namely Mepraia spinolai, Mepraia gajardoi, and Mepraia parapatrica, all capable of transmitting the causative agent of Chagas disease. Although species divergence within this genus is supported by morphological, molecular, and geological evidence, it has never been validated by genome-wide data.

Methods

In this sense, a pioneering phylogenomic study was conducted using transcriptome data of the three species, aiming to infer robust phylogenies and evaluate the impact of interspecific gene flow on the evolution of these insects. Our transcriptomes were used to robustly infer the phylogenetic relationships, employing multi-species coalescent and supermatrix approaches, as well as to investigate the occurrence of introgression.

Results and discussion

The inferred phylogenies support the monophyly of the three described taxa and infer divergence times, although gene trees display high levels of discordance. Our results indicate widespread introgression among Mepraia lineages. Thus, our results support that Mepraia diversification occurred in a short period resulting in reticulate phylogenies and low genetic diversity. Additionally, we obtained evidence of introgression suggesting that ancient hybridization has had a major role in the evolution of the three Mepraia species.
Stable C and N isotope abundances in water-extractable organic matter from air-dried soils as potential indices of microbially utilized organic matter
Authors: Nagano Hirohiko , Atarashi-Andoh Mariko , Tanaka Sota , Yomogida Takumi , Kozai Naofumi , Koarashi Jun
Published: July 2023

Stable carbon (C) and nitrogen (N) isotopes (13C and 15N) in water-extractable organic matter (WEOM) derived from air-dried soils may be applicable to elucidate the microbial decomposition of soil organic matter (SOM), which is crucial in terrestrial C cycles. A total of 40 soil samples were collected from a depth of 0–6 cm from a temperate broadleaved forest in Japan with vegetation succession from grassland approximately 150 years ago. Those soil samples were air-dried before the water extraction process and organic matter analysis. The C and N concentrations of WEOM were <3.6% of those of the bulk soil and were positively correlated with those of the bulk soil at a p-value of < 0.01. A positive correlation between the two fractions (i.e., WEOM and bulk soils) was also found for natural 13C and 15N abundances (δ13C and δ15N; p < 0.01). However, the C/N ratio of WEOM was slightly correlated with that of bulk soils, exhibiting a narrow range of values of ~10. Thus, those features of the WEOM were similar to the well-known features of microbial biomass. The δ13C and δ15N enrichments in WEOM relative to bulk soil, the difference in stable isotope abundances between bulk SOM and WEOM were negatively and positively correlated, respectively, with the concentrations of organo-mineral complexes and short-range order minerals (non-crystalline oxyhydroxides of aluminum and iron, allophane, imogolite, and allophane-like constituents), which play significant roles in SOM stabilization in soils. These relationships suggest that the stable isotopic enrichments in WEOM can be a good indicator of the microbial utilization of soil C and N under different substrate availabilities, which are crucial to SOM decomposition and decomposability substantially varying from local to global scales.
Mitochondria-related genes and metabolic profiles of innate and adaptive immune cells in primary Sjögren’s syndrome
Authors: Luo Danyang , Li Lei , Wu Yicheng , Yang Yi , Ye Yulin , Hu Jiawei , Gao Yiming , Zeng Naiyan , Fei Xiaochun , Li Ning , Jiang Liting
Published: July 2023

Background

Primary Sjogren’s syndrome (pSS) is a prototypical systemic autoimmune disease characterised by lymphocyte infiltration and immune-complex deposition in multiple organs. The specific distribution of immune cell populations and their relationship with mitochondria remain unknown.

Methods

Histological analysis was performed to assess the specific distribution of innate and adaptive immune cell populations in labial salivary gland (LSG) samples from 30 patients with pSS and 13 patients with non-pSS. The ultrastructural morphometric features of mitochondria within immune cells were observed under the transmission electron microscope (TEM). RNA sequencing was performed on LSG samples from 40 patients with pSS and 7 non-pSS patients. The Single-sample Gene Set Enrichment Analysis (ssGSEA), ESTIMATE, and CIBERSORT algorithms and Pearson correlation coefficients were used to examine the relationship between mitochondria-related genes and immune infiltration. Weighted Gene Co-expression Network Analysis (WGCNA) was used to identify the mitochondria-specific genes and the related pathways based on the immune cell types.

Results

HE staining revealed a massive infiltration of plasma cells with abundant immunoglobulin protein distributed around phenotypically normal-appearing acinar and ductal tissues of patients with pSS. Immunohistochemical analyses revealed that innate immune cells (macrophages, eosinophils and NK cells) were distributed throughout the glandular tissue. Dominant adaptive immune cell infiltration composed of B cells, CD4+T cells and CD8+ T cells or ectopic lymphoid follicle-like structures were observed in the LSGs of patients with pSS. TEM validated the swelling of mitochondria with disorganised cristae in some lymphocytes that had invaded the glandular tissue. Subsequently, bioinformatic analysis revealed that innate and adaptive immune cells were associated with different mitochondrial metabolism pathways. Mitochondrial electron transport and respiratory chain complexes in the glandular microenvironment were positively correlated with innate immune cells, whereas amino acid and nucleic acid metabolism were negatively correlated with adaptive immune cells. In addition, mitochondrial biogenesis and mitochondrial apoptosis in the glandular microenvironment were closely associated with adaptive immune cells.

Conclusion

Innate and adaptive immune cells have distinct distribution profiles in the salivary gland tissues of patients with pSS and are associated with different mitochondrial metabolic pathways, which may contribute to disease progression.
Divergent transcriptional response to thermal stress among life stages could constrain coral adaptation to climate change
Authors: Ruggeri Maria , Zhang Yingqi , Aglyamova Galina V. , Kenkel Carly D.
Published: July 2023

The ability for adaptation to track environmental change depends on how efficiently selection can act on heritable genetic variation. Complex life cycles may promote or constrain adaptation depending on the integration or independence of fitness-related traits over development. Reef-building corals exhibit life cycle complexity and are sensitive to increasing temperatures, highlighting the need to understand heritable potential of the thermal stress response and its developmental regulation. We used tag-based RNA-seq to profile holobiont gene expression of inshore and offshore Porites astreoides adults and recruit offspring in response to a 16-day heat stress, and larvae in response to a 4-day heat stress. Host developmental stage affected both broad patterns of host and symbiont expression, and modulated the stress response in both partners, suggesting that symbiotic interactions could vary between host developmental stages and influence the thermal stress response. Populations also exhibited origin-specific treatment responses, but response magnitude differed among life-stages. Inshore parents and recruit offspring exhibited a more robust stress response, exhibiting greater expression profile divergence and differentially expressing more genes compared to offshore-origin corals. This suggests genetic or epigenetic inheritance of regulatory mechanisms giving rise to expression plasticity, although ontogenetic plasticity as a result of the local reef environment during larval development could also explain the origin effect. However, larval populations exhibited the opposite response, with offshore larvae exhibiting a more robust stress response, possibly due to stage-specific effects or exposure duration. Overall, these results show that putatively adaptive regulatory variation persists in thermally naïve life stages, but thermally responsive genes are stage-specific, which could complicate the evolutionary response of corals to climate change.
Characterizing the bending behavior of underground utility tunnel roofs in a fabricated composite shell system
Authors: Dong Lei , Yao Aijun , Zhou Daxing , Zhang Pengfei
Published: July 2023

The traditional underground utility tunnel system is characterized by a lengthy construction period, material waste, and poor engineering quality. This study proposes the prefabricated composite shell system underground utility tunnel as a new type of prefabricated underground utility tunnel system. This system uses 20 mm thick high-performance cement-based materials as permanent templates, with steel reinforcement skeletons placed in the cavity between the two side molds, and concrete can be poured after on-site hoisting and positioning to form an integrated tunnel. This study first systematically introduces the system design method of the prefabricated composite shell system underground utility tunnel and clarifies its component and connection structures. Then, bending tests are conducted on the composite shell tunnel top plate specimens, and a cast-in-place top plate specimen is selected as a control group. A suitable bearing capacity calculation formula for composite shell top plates is derived and proposed based on test phenomena and results analysis. The results showed that the prefabricated outer template and internal cast-in-place concrete of the composite shell top plate specimen have good collaborative performance. Its bearing capacity, stiffness, and failure phenomena are consistent with those of cast-in-place components, as are its mechanical properties. In addition, the proposed bearing capacity calculation formula for a composite shell top plates is highly accurate and can guide the design of such components.
fIDBAC: A Platform for Fast Bacterial Genome Identification and Typing
Authors: Liang Qian , Liu Chengzhi , Xu Rong , Song Minghui , Zhou Zhihui , Li Hong , Dai Weiyou , Yang Meicheng , Yu Yunsong , Chen Huan
Published: July 2023

To study the contamination of microorganisms in the food industry, pharmaceutical industry, clinical diagnosis, or bacterial taxonomy, accurate identification of species is a key starting point of further investigation. The conventional method of identification by the 16S rDNA gene or other marker gene comparison is not accurate, because it uses a tiny part of the genomic information. The average nucleotide identity calculated between two whole bacterial genomes was proven to be consistent with DNA–DNA hybridization and adopted as the gold standard of bacterial species delineation. Furthermore, there are more bacterial genomes available in public databases recently. All of those contribute to a genome era of bacterial species identification. However, wrongly labeled and low-quality bacterial genome assemblies, especially from type strains, greatly affect accurate identification. In this study, we employed a multi-step strategy to create a type-strain genome database, by removing the wrongly labeled and low-quality genome assemblies. Based on the curated database, a fast bacterial genome identification platform (fIDBAC) was developed (http://fbac.dmicrobe.cn/). The fIDBAC is aimed to provide a single, coherent, and automated workflow for species identification, strain typing, and downstream analysis, such as CDS prediction, drug resistance genes, virulence gene annotation, and phylogenetic analysis.
Differential expression spectrum and targeted gene prediction of tRNA-derived small RNAs in idiopathic pulmonary arterial hypertension
Authors: Chen Yusi , Tang Yi , Hou Sitong , Luo Jun , Chen Jingyuan , Qiu Haihua , Chen Wenjie , Li Kexing , He Jin , Li Jiang
Published: July 2023

Background: Idiopathic pulmonary arterial hypertension (PAH) is a potentially fatal pulmonary vascular disease with an extremely poor natural course. The limitations of current treatment and the unclear etiology and pathogenesis of idiopathic PAH require new targets and avenues of exploration involved in the pathogenesis of PAH. tRNA-derived small RNAs (tsRNAs), a new type of small non-coding RNAs, have a significant part in the progress of diverse diseases. However, the potential functions behind tsRNAs in idiopathic PAH remain unknown.

Methods: Small RNA microarray was implemented on three pairs of plasma of idiopathic PAH patients and healthy controls to investigate and compare tsRNAs expression profiles. Validation samples were used for real-time polymerase chain reaction (Real-time PCR) to verify several dysregulated tsRNAs. Bioinformatic analysis was adopted to determine potential target genes and mechanisms of the validated tsRNAs in PAH.

Results: Microarray detected 816 statistically significantly dysregulated tsRNAs, of which 243 tsRNAs were upregulated and 573 were downregulated in PAH. Eight validated tsRNAs in the results of Real-time PCR were concordant with the small RNA microarray: four upregulated (tRF3a-AspGTC-9, 5’tiRNA-31-GluCTC-16, i-tRF-31:54-Val-CAC-1 and tRF3b-TyrGTA-4) and four downregulated (5’tiRNA-33-LysTTT-4, i-tRF-8:32-Val-AAC-2, i-tRF-2:30-His-GTG-1, and i-tRF-15:31-Lys-CTT-1). The Gene Ontology analysis has shown that the verified tsRNAs are related to cellular macromolecule metabolic process, regulation of cellular process, and regulation of cellular metabolic process. It is disclosed that potential target genes of verified tsRNAs are widely involved in PAH pathways by Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes.

Conclusion: This study investigated tsRNA profiles in idiopathic PAH and found that the dysregulated tsRNAs may become a novel type of biomarkers and possible targets for PAH.
Purinergic signaling via P2X receptors and mechanisms of unregulated ATP release in the outer retina and age-related macular degeneration
Authors: Molcak Haydn , Jiang Kailun , Campbell Christopher J. , Matsubara Joanne A.
Published: July 2023

Age-related macular degeneration (AMD) is a chronic and progressive inflammatory disease of the retina characterized by photoceptor loss and significant central visual impairment due to either choroidal neovascularization or geographic atrophy. The pathophysiology of AMD is complex and multifactorial, driven by a combination of modifiable and non-modifiable risk factors, molecular mechanisms, and cellular processes that contribute to overall disease onset, severity, and progression. Unfortunately, due to the structural, cellular, and pathophysiologic complexity, therapeutic discovery is challenging. While purinergic signaling has been investigated for its role in the development and treatment of ocular pathologies including AMD, the potential crosstalk between known contributors to AMD, such as the complement cascade and inflammasome activation, and other biological systems, such as purinergic signaling, have not been fully characterized. In this review, we explore the interactions between purinergic signaling, ATP release, and known contributors to AMD pathogenesis including complement dysregulation and inflammasome activation. We begin by identifying what is known about purinergic receptors in cell populations of the outer retina and potential sources of extracellular ATP required to trigger purinergic receptor activation. Next, we examine evidence in the literature that the purinergic system accelerates AMD pathogenesis leading to apoptotic and pyroptotic cell death in retinal cells. To fully understand the potential role that purinergic signaling plays in AMD, more research is needed surrounding the expression, distribution, functions, and interactions of purinergic receptors within cells of the outer retina as well as potential crosstalk with other systems. By determining how these processes are affected in the context of purinergic signaling, it will improve our understanding of the mechanisms that drive AMD pathogenesis which is critical in developing treatment strategies that prevent or slow progression of the disease.