CLINICAL RELEVANCE OF KRAS MUTATION TESTING IN METASTATIC COLORECTAL USING DIFFERENT SEQUENCING PLATFORMS: A CASE REPORT
Authors: Tynyshtykbayeva N.Ye. , Aitkulova A.M. , Kadenova T.B. , Rakhimova S.Ye. , Samatkyzy D. , Rogounovitch T.I. , Kukanova A.M. , Begimbetova D.A. , Yermekbayeva B.A. , Kozhamkulov U.A. , Yerezhepov D.A. , Akilzhanova A.R. , Sarbassov D.D. 
Published: January 2025

Introduction. Colorectal cancer (CRC) ranks as the second leading cause of cancer mortality and the third most common cancer worldwide. Recent statistics reveal a troubling rise in CRC incidence among adults under 50 in high-income countries, with rates increasing 1-4% annually. While screening advancements, including colonoscopy, have improved early detection and survival rates, metastatic cases with KRASmutations remain challenging due to limited treatment options and mutation-driven resistance mechanisms. Aim. The present study aims to analyze the clinical significance of multi-platform verification of KRAS gene mutation in a particular clinical case in order to optimize personalized treatment strategies for patients with KRAS-positive metastatic colorectal cancer. Materials and methods. Our study reports the case of a 58-year-old female diagnosed with advanced-stage rectal adenocarcinoma with KRASmutation and multi-organ metastasis. Following partial intestinal obstruction, the patient underwent resection surgery with cholecystectomy and metastasectomy, followed by FOLFOX chemotherapy and targeted therapy (TT). Despite initial stabilization, metastasis progressed to the lungs and liver. Multiplatform genetic analysis, including Next generation sequencing (NovaSeq 6000), Sanger sequencing, and droplet digital PCR (ddPCR), was employed to confirm KRAS variant status, highlighting minor platform-based discrepancies with clinical relevance. Discussion. KRAS mutations profoundly affect CRC treatment strategies, particularly in relation to EGFR inhibitor eligibility. Multi-platform validation ensures accurate variant detection, critical for clinical decision-making. This case emphasizes the necessity of complementary assays, given the observed KRAS mutation’s influence on therapeutic outcomes. Cross-platform diagnostic guidelines are advocated to standardize detection thresholds and improve precision in treatment planning. Conclusion. This case underscores the clinical significance of multiplatform KRAS mutation validation in metastatic CRC, highlighting the potential for improved diagnostic protocols to optimize personalized treatment strategies for KRAS-mutant CRC patients.

Актуальность. Колоректальный рак (КРР) является второй по значимости причиной смертности от рака и третьей по распространенности в мире. Последние статистические данные свидетельствуют о тревожном росте заболеваемости КРР среди взрослых в возрасте до 50 лет в странах с высоким уровнем дохода, причем показатели увеличиваются на 1-4% в год. В то время как достижения в области скрининга, включая колоноскопию, позволили улучшить раннее выявление и выживаемость, случаи метастазирования с мутациями KRAS остаются сложными из-за ограниченных возможностей лечения и механизмов резистентности, обусловленных мутациями. Цель. Настоящее исследование направлено на анализ клинической значимости много платформенной проверки мутации гена KRAS при частном клиническом случае с целью оптимизации персонализированных стратегий лечения пациентов с KRAS -позитивным метастатическим колоректальным раком. Материалы и методы. В данном исследовании сообщается о случае 58-летней женщины с диагнозом аденокарцинома прямой кишки на поздней стадии с мутацией KRAS и полиорганными метастазами. После частичной кишечной непроходимости пациентке была проведена резекция с холецистэктомией и удалением метастазов, а затем химиотерапия по методу FOLFOX и таргетная терапия (ТТ). Несмотря на первоначальную стабилизацию, метастазы прогрессировали в легких и печени. Для подтверждения статуса варианта KRAS был использован мультиплатформенный генетический анализ, включающий секвенирование следующего поколения (NovaSeq 6000), секвенирование по Сэнгеру и капельную цифровую ПЦР (ddPCR), что выявило незначительные несоответствия между платформами и клинической значимостью. Обсуждение. Мутации KRAS существенно влияют на стратегии лечения КРР, особенно в отношении приемлемости ингибиторов EGFR. Мультиплатформенная валидация обеспечивает точное выявление вариантов, что имеет решающее значение для принятия клинических решений. Данный случай подчеркивает необходимость дополнительных анализов, учитывая влияние мутации KRAS на результаты лечения. Рекомендуется использовать разные платформенные диагностические методы для стандартизации пороговых значений выявления и повышения точности планирования лечения. Вывод. Этот случай подчеркивает клиническую значимость мультиплатформенной валидации мутации KRAS при метастатическом КРР, подчеркивая потенциал усовершенствованных диагностических протоколов для оптимизации персонализированных стратегий лечения пациентов с КРР с мутацией гена KRAS.

Өзектілігі. Колоректальды қатерлі ісік (КҚІ) қатерлі ісіктен болатын өлім-жітімнің екінші себебі және әлемде үшінші орын алады. Соңғы статистика табысы жоғары елдерде 50 жасқа дейінгі ересектер арасында CRP ауруының алаңдатарлық өсуін көрсетеді, бұл көрсеткіштер жылына 1-4% - ға артады. Скринингтік жетістіктер, соның ішінде колоноскопия ерте анықтау мен өмір сүруді жақсартуға мүмкіндік бергенімен, kras мутациялары бар метастаз жағдайлары шектеулі емдеу мүмкіндіктері мен мутацияға байланысты төзімділік механизмдеріне байланысты күрделі болып қала береді. Мақсаты. Бұл зерттеу KRAS-тың метастаздық колоректальды қатерлі ісігі бар науқастарды емдеудің жекелендірілген стратегияларын оңтайландыру үшін арнайы клиникалық жағдайда көп платформалы KRAS мутациясына тестілеудің клиникалық маңыздылығын талдауға бағытталған. Материалдар мен әдістер. Бұл зерттеуде KRAS мутациясы және көп мүшелі метастаздары бар кеш сатыдағы тік ішектің аденокарциномасы диагнозы қойылған 58 жастағы әйелдің жағдайы туралы хабарланды. Ішінара ішек өтімсіздігінен кейін пациентке холецистэктомиямен және метастаздарды жоюмен резекция жасалды, содан кейін FOLFOX әдісімен химиотерапия және мақсатты терапия (ТТ) жүргізілді. Бастапқы тұрақтануға қарамастан, метастаздар өкпе мен бауырда дамыды. KRAS нұсқасының мәртебесін растау үшін келесі ұрпақ секвенциясы (NovaSeq 6000), Сангер сиквинерлеу және тамшылатып цифрлық ПТР (ddPCR) кіретін көп платформалы генетикалық талдау қолданылды, бұл платформалар мен клиникалық маңыздылық арасындағы шамалы сәйкессіздіктерді анықтады. Талқылау. KRAS мутациялары КҚІ емдеу стратегияларына, әсіресе EGFR ингибиторларының қолайлылығына айтарлықтай әсер етеді. Көп платформалы валидация клиникалық шешімдер қабылдау үшін өте маңызды нұсқаларды дәл анықтауға мүмкіндік береді. Бұл жағдай байқалған kras мутациясының емдеу нәтижелеріне әсерін ескере отырып, қосымша сынақтардың қажеттілігін көрсетеді. Емдеуді жоспарлаудың дәлдігін анықтау және жақсарту шектерін стандарттау үшін әртүрлі платформалық диагностикалық әдістерді қолдану ұсынылады. Қорытынды. Бұл жағдай метастатикалық КҚІ-де KRASмутациясының мультиплатформалық валидациясының клиникалық маңыздылығын көрсетеді, KRAS мутациясы бар КҚІ науқастарын емдеудің жекелендірілген стратегияларын оңтайландыру үшін жетілдірілген диагностикалық хаттамалардың әлеуетін көрсетеді.