bluuebunny/crossref_metadata_2025 huggingface dataset:
Comparison of alternative computational procedures in BLUP sire evaluation
Authors: Misztal I. , Haussmann H.
Published: March 2011

The main ideas for implementing BLUP programs were developed when computer possibilities were much more limited. Now, it is possible to improve the programs, fully utilizing the power of modern computers.

Three new techniques – modified group equations, HASH storing of coefficients, and an alternative iteration procedure – were applied to sire evaluation using a repeatability model in a dairy cattle population. It was proved that applying new techniques leads to a 3 fold decrease of program length in source form over a program using old design, and running times are reduced from 30 to over 70%.

Vergleich alternativer Rechenverfahren bei der BLUP‐ Zuchtwertschätzung

Die Konzepte der Implementierung von BLUP‐Programmen wurden entwickelt, als die Computer‐Möglichkeiten noch sehr beschränkt waren. Es ist heute möglich, die Programme unter voller Ausnutzung der Leistungsfähigkeit moderner Computer zu verbessern.

Drei neue Techniken – modifizierte Gruppengleichungen, HASH‐Speicherung der Koeffizienten und ein alternatives Iterationsverfahren – wurden bei der Zuchtwertschätzung von Bullen nach einem Wiederholbarkeitsmodell angewandt. Es wurde gezeigt, daß die neuen Techniken zu einer Verkürzung der Programme auf ein Drittel der ursprünglichen Länge und zu einer Reduzierung der Laufzeiten um 30 bis 70% führten.

Comparaison de methodes alternatives pour ordinateurs pour l'estimation de la valeur héréditaire moyennant BLUP.

Les idées principales de réalisation des programmes BLUP ont été développées lorsque les possibilités «ordinateurs» étaient encore très limitées. Aujourd'hui, il est possible d'améliorer les programmes par l'utilisation totale de la capacité de rendement des ordinateurs modernes.

Trois techniques nouvelles – équations modifées des groupes, HASH‐accumulation des coéfficients et un procédé alternatif d'itération – ont été appliquées pour l'estimation de la valeur héréditaire des taureaux en utilisant un modèle de répétabilité. Il est prouvé que l'application de nouvelles techniques mène au raccourcissement des programmes jusqu'à un tiers de la longueur d'origine et à une réduction des délais de 30 à 70%.

Comparación de procedimientos computacionales alternativos en la evaluación de padres a traves de BLUP

Los principales ideas en la implementación de BLUP‐programas, fueron desarrolladas aún cuando las posibilidades de computación eran muy límitadas. Ahora, es posible mejorar los programas, utilizando el poder total de los computador tadores modernos.

Tres nuevas técnicas – grupos de ecuaciones modificadas, HASH almacenajes de coeficientes y unaalternativo prodecimiento iterativo – fueron aplicados para la evaluación de padres, usando un modelo de repetibilidad en una población de ganado lechero.

Se prueba que, aplicando nuevas têcnicas se disminuye hasta en un tercio del largo del programa original y se reduce el tiemempoe ejecución en un 30 hasta un 70%.
Modelled relationships between animal size and production efficiency
Authors: Kinghorn B.
Published: March 2011

A genetically standardised growth equation is proposed, and this fits real data reasonably well. From here, a simple model is developed to predict the effect of genotype size on growth, food intake, food conversion efficiency and dam family efficiency over all stages of growth. Genotype size is not expected to affect overall production efficiency except through any effect on reproductive efficiency. Use of growth and food intake equations which cover all stages of growth permits a graphic description of these results. This type of model provides a framework for evaluation of different genotypes.

Relations‐modèle entre grandeur animale et efficience

Une équation de croissance génétiquement standardisée et s'adaptant relativement bien à la réalité et proposée. D'ici, un modèle simple est développè pour estimer l'effet de la grandeur du gènotype sur la croissance, consommation de fourrage, indice de consommation et indice de consommation familiale. La grandeur influence l'indice de consommation uniquement par l'effet sur l'efficience reproductive. Les èquations de croissance et de consommation, couvrants tout les stades de croissance, permettent une description graphique de ces rèsultats. Ce type de modéle fournit un cadre pour l'èvaluation des gènotypes.

Modelo de relación entre tamaño y eficiencia del animal

Se propone una ecuación de crecimiento, geneticamente estandarizada y que se ajusta bién relativamente a datos reales. Con esta se desarrolla un módelo simple para predecir el efecto de tamañno del genotípo sobre crecimiento, consumo de alimento, eficiencia en la conversión de alimento y eficiencia de las familias maternas durante todos los estados del crecemiento. Tamaño influye en la conversión de alimento soló a traves del efecto sobre la eficiencia reproductiva. El uso de las ecuaciones de crecimiemto y consumo de alimento, las cuales cubren todos los estados de crecimiento, permiten una descripción gráfica de estos resultados. Este tipo de módelo entrega una forma de trabajo para la evaluación de los diferentes genotípos.

Modell‐Beziehungen zwischen Tiergröße und Effizienz

Es wird eine genetisch standardisierte Wachstumsgleichung vorgeschlagen, welche relativ gut sich der Wirklichkeit anpaßt. Davon ausgehend wird ein einfaches Modell entwickelt, welches die Auswirkung des Größengenotyps auf Wachstum, Futterverzehr, Futterverwertung und Familien Futterverwertung schätzt. Größe beeinflußt Futterverwertung nur durch Wirkung auf reproduktive Effizienz. Wachstums‐ und Futterverzehrsgleichungen, die alle Wachstumsstadien umspannen, erlauben graphische Darstellung dieser Resultate. Diese Art von Modellen liefert einen Rahmen zur Bewertung von Genotypen.
Pleiotrope Wirkungen von β‐Lactoglobulin‐ und Casein‐Genotypen auf Milchinhaltsstoffe des bayerischen Fleckviehs und Braunviehs1
Authors: Graml R. , Buchberger J. , Klostermeyer H. , Pirchner F.
Published: March 2011

An zwei umfangreichen Stichproben der bayerischen Fleckvieh‐ und Braunviehpopulation mit jeweils etwa 2000 Tieren wurden bei den Merkmalen Milchserumeiweißgehalt, Caseingehalt, Gesamteiweißgehalt und Fettgehalt pleiotrope Wirkungen von β‐Lactoglobulin‐ und Casein‐Genotypen geschätzt. Alle Genotypen zeigten bei allen Eigenschaften und bei beiden Rassen Einflüsse, wobei zwischen den Wirkungen der Fleckvieh‐ und Braunviehpopulation eine gute Übereinstimmung deutlich wird. Die deutlichsten Effekte zeigten sich bei den Teilmerkmalen Milchserumeiweißgehalt und Caseingehalt. Ein beträchtlicher Teil der Genotypeneffekte verhält sich antagonistisch, so daß Kompensation bei den Hauptmerkmalen vorliegt.

Pleiotropy of β‐lactoglobulin und casein genotypes on milk composition in Bavarian Fleckvieh and Braunvieh

The effects of β‐lactoglobulin and casein alleles on milk content of whey protein, casein, total protein and fat were estimated on some 2000 cows each of Bavarian Fleckvieh and Braunvieh. The effects of the alleles appeared to be similar in the two populations. The effects were most prominent on whey protein and casein content. Quite a number of alleles affect the contents of the different proteins antagonistically. Therefore the effects on the components of the total milk protein compensate each other.

Effets pléiotropiques des génotypes β‐lactoglobuline et caséine dans la composition du lait du Fleckvieh bavarois et Braunvieh

Les effets des alléles lactoglobuline et caséine de la teneur en lait de protéine du petit‐lait, caséine, protéine totale et teneur en graisse ont été estimés à environ 2000 vaches respectives des races Fleckvieh bavorois et Braunvieh. Les effets des alléles semblaient étre similaires dans les deux populations. Les effets les plus proéminents se montraient pour protéine du petit‐lait et teneur en caséine. Un antagonisme fut observé pour un nombre considérable d'effets génotypiques, de sorte qu'il existe compensation pour les caractéristiques principales.

Resumén

Efectos pleiotropicos de β‐Lactoglobulina y Caseína genotipos sobre los componentes de la leche en ganado manchado y pardo bavarico

Los efectos de los alelos de β‐Lactoglobulina y Caseína sobre los componentes de la leche, como proteín séríca de la leche, caseína, proteîna y grasa total fueron estimados en las mismas 2000 vacas, en cada población de ganado manchado y pardo bavarico. Todos genotipos mostraron para todas las propiedades y en ambas razas influencias, donde una buena concordancia pudo ser obtenida entre los efectos de ambas poblaciones. Los efectos más claros se mostraron en el contenido de proteína séríca de la leche y contenido de caseína. Una considerable parte de los efectos genotípicos se portaron antágonicamente, pero mostraron compensación en las características principales.
About camel breeds: A reevaluation of current classification systems
Authors: Köhler‐Rollefson Ilse
Published: March 2011

This article revaluates the current dromedary breed classifications based on Leese's (1927) division into hills, riverine and plains camel according to camel breeding zones, and the even earlier distinction by Cross (1917) and Leonard (1894) between baggage and riding camels. It is suggested that these classifications are inappropriate to portray the wide variety of camel breeds actually existing, since they do not accurately reflect the ecological context of camel breeding and also depict incompletely the actual uses to which camels are put in camel pastoral societies. The breeding practices of traditional camel pastoral societies are described and discussed, and it is concluded that these have been conducive to the development of a large number of specialized camel breeds. It is pointed out that many camel breeds are endangered, and that it is imperative to take steps for their documentation.

Kamelrassen: Revision des gegenwärtigen Klassifikationssystems

In diesem Artikel werden die heute gebräuchlichen Klassifikationssysteme für Dromedarrassen einer Prüfung unterzogen: Diese beruhen auf der Einteilung von Leese (1927) nach Kamelzuchtgebieten in Berg‐, Fluß‐ und Flachlandkamele und der noch älteren Unterscheidung von Cross (1917) und Leonard (1894) zwischen Reit‐ und Lastkamelen. Es wird vorgeschlagen, daß diese Einteilungen der tatsächlichen Variabilität zwischen Kamelrassen nicht gerecht werden, weil sie die ökologischen Bedingungen, unter denen Kamelzucht betrieben wird, nicht richtig reflektieren und die tatsächlichen Nutzungsweisen, denen das Kamel in Kamelhirtenkulturen unterzogen wird, nur unvollständig wiedergeben. Die Zuchtmethoden traditioneller Kamelhirten werden beschrieben und diskutiert, und es wird die Schlußfolgerung gezogen, daß diese für die Herausbildung vieler spezialisierter Rassen ideale Vorbedingungen darstellten. Auf die große Gefahr des Verlustes vieler dieser Rassen und die Notwendigkeit diese zu katalogisieren wird hingewiesen.
Effects of homozygosity and stress on blood and bone calcium and magnesium
Authors: Kosowska Barbara
Published: March 2011

The effect of homozygosity (measured by inbreeding coefficient) on the concentration of serum Ca and Mg ions as well as Mg ions concentrations in whole blood and bone tissue Mg and Ca content was studied.

Wild Norway rats (Rattus norvegicus Erxleben) were crossbred with albino outbred rats (Ipf:RIZ). F]‐hybrids constituted the control group (0% of inbred). Using full‐sibs mating, rats of 50% and 91% of inbred were reproduced. Half of each group was exposed to physical stress (PS) involving 3 d starvation, 3 h swimming and ether anaesthesia (to collect blood for examination), the other half was given only ether anaesthesia (ES).

A significant (p < 0,01) linear decrease was observed in the concentration of Ca and Mg ions in serum, of Mg and Ca ions in bone tissue due to homozygosity increase, and a quadratic decrease of Mg content in whole blood.

A considerable effect of the sex on Ca and Mg ion concentrations in serum, in particular under the conditions of severe physical stress was observed as well. Physical stress differentiated significantly Mg ion content in whole blood and serum.

Die Senkung der Konzentration von Calcium und Magnesium im Blut und im Knochengewebe bei Ratten durch Homozygotie und Streß

Bei Ratten unterschiedlichen Inzuchtgrades (%): 0, 59 und 91 wurden unter physischem Streß (3 Tage Hungern und 3 h Schwimmen) mittels RIA die Konzentrationen von Calcium und Magnesium Ionen im Blutserum, Mg im ganzen Blut und Mg und Ca im Knochengewebe untersucht. Der Ausgangselternbestand (0% Inzucht) waren F1‐Kreuzungen von wilden Wanderratten (Rattus norvegius Erxleben) mit Albino Ratten der nichtverwandten Linie Ipf:RIZ.

Es wurde statistisch signifikante lineare Senkung der Konzentration von Ca und Mg Ionen im Blutserum, von Mg und Ca im Knochengewebe sowie (P ≤ 0,01) der Mg Konzentration im ganzen Blut unter dem Einfluß der Inzucht gefunden. Letztere folgt einem Polynom 2. Grades.

Es wurde auch ein signifikanter Einfluß von Geschlecht auf Ca und Mg Ionen Konzentration im Blutserum, besonders bei dem starken physischen Streß, beobachtet. Der physische Streß hat großen Einfluß (P ≤ 0,01) auf Mg Konzentration im Blutserum sowie im ganzen Blut.
Assignment of genes to chromosome 4 of the River buffalo with a panel of buffalo‐hamster hybrid cells
Authors: El Nahas S. M. , de Hondt H. A. , Othman O. S. , Bosma A. A. , de Haan N. A.
Published: March 2011

To identify the river buffalo chromosome carrying the genes coding for GAPD, TPI1, and LDHB, karyotypic examination was carried out on 14 buffalo‐hamster hybrid clones previously tested for presence of this syntenic group. In cattle, this group (U3) has been assigned to chromosome 5, which is assumed to be homologous to the long arm of buffalo chromosome 4. Chromosome 4 was present in all five clones expressing the three enzymes, and absent in all seven negative clones, indicating that in the buffalo GAPD, TPI1, and LDHB are located on chromosome 4. One clone, expressing GAPD and TPI1, but not LDHB, was found to carry a translocation between hamster marker chromosome M2 and buffalo 4q1 → 4qter. In another clone, expressing LDHB, but not GAPD and TPI1, chromosome 4 was absent, while a very small, unidentifiable acrocentric was present. These observations suggest that LDHB is located in the proximal part of 4q1, and that GAPD and TPI1 are located more distally, in 4q1 → 4q2.

Lokalisierung von Genen auf Chromosom 4 des Flußbüffels durch Büffel‐Hamster‐Hybridzellen

Zur Identifikation von Flußbüffelchromosomen mit Genen für GAPD, TPI1 und LDHB wurden Karyotypenbestimmungen an 14 Büffel‐Hamster‐Hybridklonen durchgeführt, die vorher auf Anwesenheit der betreffenden synthenischen Gruppen geprüft worden waren. Bei Rindern wird diese Gruppe (U3) dem Chromosom 5 zugeordnet, welches als homolog mit dem langen Arm des Büffelchromosoms 4 betrachtet wird. Chromosom 4 war in allen fünf Klonen, die die drei Enzyme exprimiert haben, vorhanden und fehlte in allen sieben negativen klonen, so daß angenommen werden kann, daß sich bei Büffeln GAPD, TPI1 und LDHB auf Chromosom 4 befinden. Bei einem Klon, der GAPD und TPI1, aber nicht LDHB zeigte, wurde eine Translokation zwischen dem Hamstermarkerchromosom M2 und Büffel 4q1 → 4qter gefunden. Im einem anderen Klon, der LDHB, nicht aber GAPD und TPI1 zeigte, war Chromosom 4 nicht vorhanden, wohl aber ein sehr kleines, nicht identifizierbares akrozen‐trisches Chromosom. Diese Beobachtungen weisen darauf hin, daß sich LDHB im proximalen Teil von 4q1 befindet und GAPD und TPI1 vertu distal in 4q1 → 4q2 lokalisiert sind.
Genetic relationship, inbreeding and generation interval in registered Gir cattle in Brazil
Authors: Queiroz S. A. , Lôbo R. B.
Published: March 2011

Two‐hundred random pedigrees of cows and fifty of sires born in 1987 from the Gir herdbook of the Brazilian Association of Zebu Breeders were analized. The bull Chave de Ouro DGR no. 2851 was the most influential animal with a 7% direct relationship to the breed. Total average inbreeding was 3.62 and 3.25 for the female and male sample, respectively. The subdivision of total inbreeding into current and non‐current components resulted in values of 1.62, 1.25, 2.00 and 2.00 for the female and male sample, respectively. Long‐term inbreeding was the principal component of non‐current inbreeding, with values of 1.52% and 1.26%, respectively. Inbreeding due to strain formation strain due formation was less important (0.48% and 0.74%, respectively). The average generation interval was 8.02 years. The breed appears not yet to be subdivided into strains but this process may be starting. The average generation interval for the pedigree population was very high. Culling of old bulls could decrease this interval.

Verwandtschaft, Inzucht und Generationsintervall bei Gir Herdbuchrindern in Brasilien

200 zufällige Stammbäume von Kühen und 50 von 1987 geborenen Stieren wurden vom Gir Herdbuch des brasilianischen Zebu Zuchtverbandes genommen. Der Stier Chave de Ouro DGR Nr. 2851 war das einflußreichste Tier mit einer 7%igen direkten Verwandtschaft zur Rasse. Der gesamte Inzuchtkoeffizient war 3.6 und 3.25% für die weibliche und männliche Stichprobe. Die Unterteilung der gesamten Inzucht in laufende und nicht laufende Komponenten resultierte in Werten von 1.62, 1.25, 2.0, 2.0 für die weibliche und die männliche Stichprobe. Langfristige Inzucht war die Hauptursache für Nicht‐Rezente Inzucht mit Werten von 1.5 und 1.26. Inzucht aufgrund von Linienbildung war weniger wichtig (0.48% und 0.74%). Das durchschnittliche Generationsintervall war 8.02 Jahre. Die Rasse scheint noch nicht in Linien unterteilt zu sein, aber dieser Prozeß könnte begonnen haben. Das durchschnittliche Generationsintervall ist mit 8.02 Jahren sehr hoch. Nichtverwendung alter Stiere könnte dieses Intervall verkürzen.
A note on the use of inbreeding in progeny test schemes
Authors: Toro M. A.
Published: March 2011

In this note some theoretical and simulated results are presented comparing the selection response in a progeny test scheme that utilizes inbred offspring for testing, with respect to a standard progeny test. The theory indicates a substantial increase in selection response, although the advantage decreases as the number of dams mated to a sire and the number of offspring per dam increases. The advantage is at a maximum when the variation of the trait is due to segregation of recessive alleles at low frequencies unfavourable to the direction of selection. Computer simulation confirmed the advantage of the method.

Verwendung von Inzuchttieren bei der Nachkommenschaftsprüfung

Hier wurden theoretische und simulierte Selektionserfolge konventioneller Nachkommenschaftsprüfung mit Prüfung von Inzuchtnachkommen verglichen. Theoretisch zeigt sich ein erheblicher Vorteil der letzteren, wenn dieser auch mit steigende Zahl von Partnern und deren Nachkommen abnimmt und nach null tendiert. Der Vorteil der Nachkommenschaftsprüfung ingezüchteter Nachkommen ist am höchsten, wenn seltene ungünstige rezessive Gene eine Rolle spielen. Rechner‐Simulation bestätigt den Vorteil dieser Vorgangsweise.
Breed differences and intra‐breed genetic variability of dermatoglyphic pattern of cattle
Authors: Baranov A. S. , Graml R. , Pirchner F. , Schmid D. O.
Published: March 2011

Muzzle dermatoglyphics — n. ridges, granula and vibrissae — were analysed in various breeds. Differences among these in most traits were significant. Herd effects accounted for about 1/10 of the variance and heritability, estimated by combining sib, halfsib and dam‐daughter correlations corrected for herd differences was above 50% for ridges and vibrissae and about 30% for granula. Genetic correlations between ridge counts and n. vibrissae in different nose fields, respectively, were high as they were between the former and n. granula but they were negative or very low between vibrissae and the other two traits.

Asymmetry among the counts in the two muzzle sides was significant for nearly all traits, Heritabilities were low, around 10 to 20%, and the crossbreds had less asymmetry than their parental breeds. The correlations among asymmetry measures were low.

Rassenunterschiede und genetische Variabilität von Flotzmaulmustern

Flotzmaulmerkmale — Zahl von Leisten, Warzen und Haaren — wurden in verschiedenen Rassen untersucht. Unterschiede zwischen diesen waren für alle Merkmale signifikant. Herdeneinflüsse verursachten etwa 1/10 der Varianz und Heritabilitätswerte, geschätzt aus Korrelationen zwischen Zwillingen, Halbgeschwistern und Töchter‐Müttern, korrigien für Herdeneinflüsse, variierten zwischen 36 und mehr als 50%. Genetische Korrelationen zwischen Leistenzahl und Zahl von Haaren in verschiedenen Flotzmaulfeldern waren hoch, ebenso wie die zwischen ersteren und Zahl von Warzen, aber sie waren negativ oder sehr gering zwischen Haaren und den andern beiden Merkmalen.

Asymmetrie zwischen Zahlen in beiden Flotzmaulhälften war signifikant für fast alle Merkmale. Heritabilitätswerte waren niedrig, etwa 10–20% und Kreuzungstiere zeigten weniger Asymmetrie als ihre Herkunftsrassen. Die Korrelationen zwischen Asymmetriemaßen waren niedrig.
Correlated responses in growth hormone to selection for weight gain in mice
Authors: Moride Y. , Hayes J. F.
Published: March 2011

Correlated responses in pituitary gland weight and growth hormone (GH) concentration in the serum and pituitary were studied in lines of mice selected for growth rate, and in controls. The selection criteria were weight gain between 28 and 38 days on an ad libitum feed intake (EPA line), or on intake restricted to 80% of the control mice (EPR line), and weight gain between 48 and 58 days under the above two feeding regimes (LPA and LPR lines). The control line was maintained by random breeding. In generation 13, pituitary weight and growth hormone levels were determined at 38 days in lines EPA, EPR and the control and at 58 days in lines LPA, LPR and the control. Pituitary weight, corrected for body weight gain, was smaller in the EPA line than in the control line at 38 days and was greater in the LPR line than in the control line at 58 days. There were large differences in serum GH concentrations between the selected lines and the control; the differences were statistically significant at 38 days, with the EPA and EPR lines having lower levels than the controls.

Veränderung von Wachstumshormonspiegel bei Selektion für Zuwachs bei Mäusen

Veränderungen im Hypophysengewicht und Wachstumshormon‐(GH)‐Konzentrationen im Serum und in der Hypophyse wurden bei Wachstumsselektionslinien und bei Kontrollmäusen untersucht. Selektionskriterien waren Zuwachs zwischen 28 und 38 Tagen bei ad libitum Futteraufnahme (EPA Linie) oder bei Linien, wo Futteraufnahme auf 80% derjenigen der Kontrollmäuse (EPR Linie) begrenzt wurde und Zuwachs zwischen 48 und 58 Tagen unter beiden Futterweisen (LPA und LPR Linie). Die Kontrollinie wurde durch Zufallspaarung fortgepflanzt. In Generation 13 wurden Hypophysengewicht und Wachstumshormonspiegel im Alter von 38 Tagen in Linien EPA, EPR und in Kontrollen und bei 58 Tagen in Linien LPA und LPR und Kontrollen bestimmt. Hypophysengewicht, korrigiert für Zuwachs, war geringer in der LPA Linie als in der Kontrolle bei 38 Tagen Alter und größer in der LPR Linie als in der Kontrolle bei 58 Tagen. Zwischen GH Konzentrationen selektierter und Kontrollinien waren erhebliche Differenzen, die bei 38 Tagen signifikant waren, wobei EPA und EPR Linien geringere Werte als die Kontrollen aufwiesen.
Serum hypoxanthine and xanthine concentrations in horses heterozygous for combined immunodeficiency
Authors: Kettler Michelle K. , Weil M. R. , Mascotti Kristin , Perryman L. E.
Published: March 2011

A group of diseases termed combined immunodeficiency (CID) results in a severe form of immunodeficiency. While CID in humans has two genetics bases, in Arabian it is inherited in an autosomal recessive manner.

Kettler et al. (1989) determined that uric acid was significantly (p < .001) greater in the serum of carrier Arabian horses than in non‐carrier horses. The current study measured serum levels of hypoxanthine and xanthine two other products of this pathway. There were no significant differences (p > 0.05) between carrier and non‐carrier horse's serum levels of hypoxanthine or xanthine. These data, combined with our previous ones suggest that an enzymatic lesion in the purine salvage pathway may occur at the urate oxidase step.

Serum‐Hypoxanthin‐ und ‐Xanthin‐Spiegel in Pferden mit Heterozygotie für kombinierte Immundefizienz

Kombinierte Immundefizienz (CID), die zu einer schweren Krankheit führt, hat beim Menschen zwei genetische Ursachen, wird aber bei Araberpferden autosomal rezessiv vererbt. Kettler u. Ma. (1989) fanden den Harnsäureserumspiegel in Überträgern signifikant höher als in freien Tieren. Hier wurden mit Hypoxanthin und Xanthin zwei andere Produkte des biochemischen Pfades bestimmt, jedoch keine statistisch signifikanten Unterschiede zu Nicht‐Trägern der CID gefunden. Die Ergebnisse zusammen mit unseren früheren lassen vermuten, daß der Enzymmangel im Purinpfad auf der Harnsäureoxidationsstufe existiert.
Variation of the growth hormone gene in ryr 1 genotyped Austrian pig breeds
Authors: Schellander K. , Peli J. , Kneissl F. , Schmoll F. , Mayr B.
Published: March 2011

Polymorphism in the second intron of the porcine growth hormone gene of 273 Austrian Landrace and 81 Austrian Edelschwein pigs was investigated with a PCR‐RFLP‐technique. Results showed significantly different genotype patterns between the two breeds. The frequency of the Hae II− allele was significantly (P < 0,001) higher in the landrace than in the Edelschwein population (0,83 and 0,47 resp.). The Msp I+ allele was predominant in both breeds but signifanctly higher in the Landrace (0,98 versus 0,69; P < 0,01). Analyses the Hae II/Msp I locus combination revealed also in breed specific difference. In the Landrace a very low interaction was found between the Hae II and ryr 1 locus, and between Msp I and ryr 1 locus (c. c. = 0,181 and 0,186 resp.). The correlation was slightly stronger (c. c. = 0,266) between the ryr 1 and Hae II/Msp I genotypes. No correlation was detected among the three loci in the Edelschwein population.

Variabilität des Somatotropin Gens in österreichischen Schweinerassen genotypisiert hinsicbtlich ryr 1

An 273 Österreichischen Landrasse Schweinen und 81 Österreichischen Edelschweinen wurde der Polymorphismus am zweiten Intron des Schweinewachstumshormons mittels PCR‐RFLP‐Technik untersucht. Genotypen–und Genfrequenzen waren zwischen den beiden Rassen signifikant verschie‐ den. Die Hae II− Allelfrequenz war bei den Landrassetieren signifikant höher (P < 0,001) als bei den Edelschweinen (0,83 bzw. 0,47). In beiden Rassen überwiegte das Msp I+ Allel, das aber signifikant öfters bei der Landrasse auftrat (0,98 bzw. 0,69; P < 0,01). Die Verteilung der Locuskombination von Hae II/Msp I zwischen den beiden Rassen war ebenfalls unterschiedlich. Bei der Landrasse konnte nur ein sehr geringer Zusammenhang zwischen dem Hae II und ryr 1 Locus (c. c. = 0,181 bzw. 0,186) und auch zwischen dem Msp I und ryr 1 Locus festgestellt werden. Die Korrelation zwischen dem ryr 1 und Hae II/Msp I Genotyp war geringfügig größ;er (c. c. = 0,266). Bei den Edelschweinen konnte kein Zusammenhang zwischen den drei untersuchten Loci festgestellt werden.
Implications of using an average relationship matrix in genetic evaluation of a population using multiple‐sire matings
Authors: Kerr R. J. , Graser H. U. , Kinghorn B. P. , Johnston D. J.
Published: March 2011

Ambiguous paternity can be incorporated into the mixed model equations (MME) by including the average numerator relationship matrix (average A), which averages the true sire‐offspring relationship over the putative sires. A previous study has shown that some overestimation of genetic trend results from this substitution. A population of 40 breeding females and 2 breeding males was simulated 1000 times with either random mating or sequential selection continuing for eight breeding cycles. In the selection case, candidates were ranked on estimated breeding values (EBVs) calculated from the MME with an animal model and the average A. Variances of the EBVs and prediction errors were computed. The results showed that the average A incorrectly perceives both the variance of family sizes among males and the variance loss due to selection to be smaller. This leads to an overestimation of genetic trend.

Auswirkung der durchschnittlichen genetischen Verwandtschaftsmatrix auf die Zuchtwertschätzung in einer Population mit Paarungen mehrerer Vatertiere

Zweifelhafte väterliche Abstammung kann in die Mischmodellgleichung (MME) mittels durch‐ schnittlicher Numerator Verwandtschaftsmatrix (Durchschnitt A) eingebaut werden, die die durchschnittlichen wahren Verwandtschaften der in Frage kommenden Vatertiere beinhaltet. Eine frühere Untersuchung hat gezeigt, daß der genetische Trend dadurch eine gewisse Überschätzung erfährt. Eine Population aus 40 weiblichen und 2 männlichen Zuchttieren wurde 1000 mal simuliert, entweder unter Panmixie oder unter sequentieller Selektion durch acht Zuchtzyklen. Im Selektionsfall wurden die Kandidaten nach dem geschätzten Zuchtwert (EBV) rangiert der aus MME des Tiermodells mit durchschnittlicher A geschätzt worden ist. Varianzen der EBV und Schätzungsfehler wurden berechnet. Es zeigt sich, daß durchschnittliche A die Varianzen der Familiengrößen zwischen Vatertieren und den Varianzverlust durch Selektion als zu gering erfaßt, was zu einer Überschätzung des genetischen Trends führt.
Correct equations for comparing models in diallel analysis
Authors: Wolf J. , Vítek M. , Herrendörfer G. , Sumpf D.
Published: March 2011

Correct equations are given to express the parameter estimates of four models for complete diallels as a function of the parameter estimates in the model of Eisen et al. (1983). In recent literature these equations have been partly incorrect.

Korrekte Gleichungen für den Vergleich von Modellen in der Diallelanalyse

Für die Darstellung der Parameterschätzwerte von vier Modellen für vollständige Diallele als Funktion der Parameterschätzwerte des Modells von Eisen et al. (1983), die in der Literatur teilweise fehlerhaft erfolgte, werden korrekte Formeln angegeben.
Relations between the goat MHC (GLA) and antibody response to diphtheria toxoid, human serum albumin and tetanus toxoid, using a twin model
Authors: Eide D. M. , Nesse L. L. , Larsen H. J.
Published: March 2011

Norwegian dairy goats were tested for possible associations between the goat lymphocyte antigen system (GLA) and antibody response to the antigens diphtheria toxoid, human‐serum albumin and tetanus toxoid. The serum titres to these antigens following immunization, and their GLA‐specificities, were determined in 96 twin pairs. The antibody response and GLA specificity were compared between twins: twins sharing one or more GLA specificities showed a more similar primary‐antibody response to diphtheria toxoid than twins with no common specificity. The main point in comparing twins is that the MHC specificity then serves as a marker for the complete haplotype, including MHC class‐II genes. However, a gene substitution model that only tests the effect of the observed class‐I alleles revealed that animals with GLA specificity Eu2 had a significantly higher anti‐diphtheria response than Eu2‐negative animals.

Untersuchungen über Beziehungen zwischen Ziegen MHC (GLA) und Antikörperreaktion auf Diptherietoxin, humanes Serum Albumin und Tetanustoxin mit Zwillingsmodell

Norwegische Milchziegen wurden in Hinblick auf mögliche Assoziationen zwischen Ziegen Lymphozytenantigensystem (GLA) und Antikörperreaktion auf Antigene Diptherie Toxin, humanes Serum Albumin una Tetanustoxin untersucht. Die Serumtiter nach Immunisation und die GLA‐Spezifität wurden an 96 Zwillingspaaren erhoben und zwischen Zwillingen verglichen; Zwillinge mit ein oder mehr GLA Spezifitäten zeigten ähnlichere Primärantikörperreaktion auf Diptherie Toxin als solche ohne gemeinsame Spezifität. Der wesentliche Vorteil der Zwillinge ist, daß MHC‐Spezifität als Marker für den gesamten Haplotyp dienen kann, einschließlich MHC Klasse‐II gene. Allerdings, ein Gen‐Substitutionsmodell, das nur die Wirkungen der beobachteten Klasse‐I Allele prüft, zeigte, daß Tiere mit GLA‐Spezifität EU2 signifikant höhere Antidiptheriespiegel als EU2 negative Tiere hatten.
Genetic regulation of meat production by embryonic muscle formation – a review
Authors: te Pas M. F. W. , Visscher A. H.
Published: March 2011

The biological basis for meat production in livestock animals is localized in the muscles, where lean meat production is under the genetic control of tissue‐specific and more ubiquitously operating genes. The muscle tissue‐specific MyoD gene family is at the centre of the genetic regulation of myoblast proliferation and differentiation into myofibres. The regulation of embryonic muscle tissue formation (development) by the MyoD genes is duscussed in the context of livestock animals used in meat production. The possibility that the MyoD genes could be useful candidate genes for breeding is discussed. It is concluded that marker assisted selection (MAS) using markers in functional genes is advantageous over MAS using associated markers.

Genetische Regulierung der Fleischproduktion bei der embryonalen Muskelbildung – Ein Literaturüberblick

Die biologische Grundlage für Fleischproduktion, lokalisiert in den Muskeln, steht unter genetischer Kontrolle durch gewebsspezifische una mehr ubiquitär arbeitende Gene. Die gewebsspezifische MyoD Genfamilie in den Muskeln befindet sich im Zentrum der genetischen Regulierung des Prozesses der Myoblastteilung und Differenzierung zu Myofasern. Die Ubersicht betrifft Regulierung der Bildung des embryonalen Muskelgewebes (Entwicklung) mit Hilfe der MyoD Gene. Die Möglichkeit, daß MyoD Gene erfolgreiche Kandidatengene für Tierzüchtung sein können, wird besprochen. ‘Marker‐assisted selection’ (MAS) mit Hilfe von Markern funktioneller Gene sollte vorteilhafter sein als MAS mit gekoppelten DNA‐Sequenzen.

Régulation génétique de la production de viande par la formation embryologique des muscles — un résumé

La base biologique de la production de viande dans les animaux d'élevage se situe dans les muscles, là où la production de viande maigre est sous contrôle génétique de gènes générals et tissu‐spécifiques. La famille des gènes muscle‐spécifiques MyoD forme le centre de la régulation des procès de prolifération des myoblastes et de différenciation vers les myofibres. Le but de cet article rétrospectif est de situer la discussion sur la régulation de la formation embryologique des muscles par les gènes MyoD dans le cadre de l'élevage. La possibilité que les gènes MyoD soient des gènes candidats utiles pour l'élevage sera discutée. La conclusion faite est que ‘marker assisted selection’ (MAS) en employant des marquers situés dans des gènes fonctionnels a plus d'avantages que MAS avec des marquers associés.
Liegeverhalten und diurnale Verteilung der Liegeperioden von Dromedaren*
Authors: Sambraus H. H.
Published: March 2011

In Kenia und in Indien wurde je eine Dromedarherde von ca. 70 bzw. ca. 85 Tieren tagsüber und nachts beobachtet. Ermittelt wurde in 30 Min Abständen die Zahl der liegenden Tiere. Die übliche Liegeposition von Kamelen ist in Zusammenhang mit besonderen morphologischen Strukturen zu sehen. Die Dromedare lagen fast ausschließlich (Kenia) bzw. weit überwiegend (Indien) nachts. Das Liegen nahm in beiden Herden bei den Stuten fast die Hälfte des 24‐Stunden‐Tages ein. Es werden Vergleiche mit dem Liegeverhalten von Rindern angestellt.

Lying‐down behaviour and its diurnal distribution in dromedaries

Two herds of dromedaries, one in Kenya, consisting of about 70 animals, and one in India, consisting of about 85 animals, were observed during the day and at night. The number of animals lying down was determined at 30 min intervals. The usual lying position of camels is rotated to the specific morphological structure. The dromedaries in Kenya lie almost exclusively, and in India predominantly, at night. In both herds, the females spend almost half of the 24‐h day lying down. This behaviour is compared to the lying‐down behaviour of cattle.
Model determination in a case of heterogeneity of variance using sampling techniques
Authors: Varona L. , Moreno C. , Garcia‐Cortes L. A. , Altarriba J.
Published: March 2011

A sampling determination procedure has been described in a case of heterogeneity of variance. The procedure makes use of the predictive distributions of each data given the rest of the data and the structure of the assumed model. The computation of these predictive distributions is carried out using a Gibbs Sampling procedure. The final criterion to compare between models is the Mean Square Error between the expectation of predictive distributions and real data. The procedure has been applied to a data set of weight at 210 days in the Spanish Pirenaica beef cattle breed. Three proposed models have been compared: (a) Single Trait Animal Model; (b) Heterogeneous Variance Animal Model; and (c) Multiple Trait Animal Model. After applying the procedure, the most adjusted model was the Heterogeneous Variance Animal Model. This result is probably due to a compromise between the complexity of the model and the amount of available information. The estimated heritabilities under the preferred model have been 0.489 ± 0.076 for males and 0.331 ± 0.082 for females.

Contraste de modelos en un caso de heterogeneidad de varianzas usando métodos de muestreo

Se ha descrito un método de contraste de modelos mediante técnicas de muestreo en un caso de heterogeneidad de varianza entre sexos. El procedimiento utiliza las distribucviones predictivas de cada dato, dado el resto de datos y la estructura del modelo. El criterio para coparar modelos es el error cuadrático medio entre la esperanza de las distribuciones predictivas y los datos reales. El procedimiento se ha aplicado en datos de peso a los 210 días en la raza bovina Pirenaica. Se han propuesto tres posibles modelos: (a) Modelo Animal Unicaracter; (b) Modelo Animal con Varianzas Heterogéneas; (c) Modelo Animal Multicaracter. El modelo mejor ajustado fue el Modelo Animal con Varianzas Heterogéneas. Este resultado es probablemente debido a un compromiso entre la complejidad del modelo y la cantidad de datos disponibles. Las heredabilidades estimadas bajo el modelo preferido han sido 0,489 ± 0,076 en los machos y 0,331 ± 0,082 en las hembras.
A simulation study on variation in response to selection and population size required for selection programmes
Authors: Nomura T.
Published: March 2011

To obtain a simple formula for predicting variation in selection response, the drift variance of selection response has been approximated by that under random selection. Using computer simulation, the validity of this approximation was examined under various combinations of population size, heritability, and proportion selected. It was shown that the approximation gives a good prediction when the heritability of the selected trait is low, but produces a serious error when applied to a trait with high heritability. However, when the approximation was used for the prediction of coefficient of variation of selection response, a satisfactory prediction was obtained in all cases studied. Although this predictor includes a coincidental factor, it may be used as a criterion for determining the population size required for selection programmes.

Simulationsuntersuchung über Selektionserfolg und notwendige Populationsgrößen für Selektions‐programme

Zur Schätzung der Variabilität von Selektionserfolgen wurde die Driftvarianz durch die bei Zufallspaarung erwartete approximiert. Die Gültigkeit dieser Approximation wurde an verschiedenen Kombinationen von Populationsgröße, Heritabilität und Remontierungsprozentsat überprüft. Die Approximation ergibt gute Schätzwerte bei geringer Heritabilität, aber erhebliche Fehler bei hoher. Allerdings konnte der Variationskoeffizient des Selektionserfolges in allen Fällen zufriedenstellend geschätzt werden. Obwohl dies auf Über‐bzw. Unterschätzung von Zähler wie Nenner zurückzuführen ist, kann es als Kriterium zur Bestimmung der bei Selektionsprogrammen notwendigen Populationsgröße verwendet werden.
Population structure of the Japanese Brown breed
Authors: Ibi T. , Moriya K. , Matsumoto M. , Koba S. , Sasaki Y.
Published: March 2011

The population structure of the Japanese Brown in Kumamoto Prefecture was investigated with pedigree analysis. Two hundred heifers were randomly sampled, in 1960, 1970, 1980, and 1990. Population genetic parameters, i.e. F‐statistics, index of subdivision, generation interval, effective population size, and effective number of sires, were estimated. The effective number of sires decreased, most dramatically, from 1970 to 1980. The average inbreeding coefficient (FIT) increased, from 0.64% in 1960 to 5.43% in 1990. FST increased in parallel with FIT, while FIS remained low. From 1960 to 1980, the index of diversity showed a decreasing trend, but this improved a little, with the index at 1.1 in 1990. The generation interval tended to be longer year by year, and was 5.52 during 1980–90. On the other hand, Ne decreased, from 724.6 before 1960 to 40.1 at the present. The population structure of the Japanese Brown is not problematical at present, when considering FIT, but the irreversible inbreeding coefficient (FST) increases constantly.

Untersuchungen der Populationsstruktur der japanischen braunen Rasse

Die Populationsstruktur in der Kumamotopräfektur wurde an Hand einer Pedigreeanalyse untersucht. Zweihundert Kalbinnen wurden in den Jahren 1960, 1970, 1980 und 1990 zufällig ausgewählt und populationsgenetische Parameter F‐Werte, Index der Unter‐teilung und genetisch wirksame Zahl von Stieren geschätzt. Die wirksame Zahl von Vatertieren hat abgenommen, wobei das am stärksten zwischen 1970 und 1980 vor sich gegangen ist. Der durchschnittliche Inzuchtkoeffizient (FIT) zeigte Zunahme von 0, 64% im Jahr 1960 auf 5, 43% im Jahr 1990. FST nahm parallel mit FIT zu, während FIS nieder geblieben ist. Von 1960 bis 1980 zeigte der Diversitätsindex eine abnehmende Tendenz, hat aber später etwas zugenommen, wobei der Index im Jahr 1990 1, 1 erreicht hat. Die Populationsstruktur des japanischen Braunviehs ist derzeit keinen alarmierenden Status, aber FST steigt kontinuierlich an.
Assessment of parental genomic proportions in crossbred chickens by DNA fingerprints
Authors: Wimmers K. , Ponsuksili S. , Valle‐Zarate A. , Horst P. , Wittig B.
Published: March 2011

Starting with the second crossbred generation, parental genomic‐proportion lines in individuals deviate considerably from expectation. These individual variations offer the potential to increase the efficiency of crossbreeding programmes. DNA fingerprinting was established as an approach, to quantify the genomic contribution of the parental lines in individuals of two crossbred generations. For this purpose, line‐specific bands were identified in representative banding patterns of pooled DNA from purebreds. The representative banding patterns obtained with eight combinations of restriction enzymes HinfI and AluI, and oligonucleotide probes [CA]8, [CAC]5, [GGAT]4, and [GACA]4, contained between nine and 14 line‐specific bands. The estimation of the proportion was based on the relative proportion of line‐specific bands of one parental line in banding patterns of crossbreds. This was first done in F1 individuals with a definite 50% genomic proportion of each parental line, to determine the accuracy of the approach. The mean value, 51.0 ± 0.34%, observed in 45 F1s using all eight combinations of enzymes and probes, of genomic contribution of one parental line, was close to the theoretical value of 50%. In 24 animals of the BC1, considerable shifting of the parental genomic proportion was observed.

Schätzung der Genomanteile bei Hühnern verschiedener Kreuzungsstufen durch DNA‐Fingerprinting

Von der ersten Rückkreuzungsgeneration an treten erhebliche, individuelle Verscheibungen in der Verteilung der Genomanteile der parentalen Ausganslinien vom Durchschnitt auf. Diese individuelle Variation stellt ein Potential zur Steigerung der Effektivität von Kreuzungszuchtprogrammen dar. Mit der vorliegenden Arbeit wird eine Untersuchungsmethode zur direkten Quantifizierung der Genombeiträge der parentalen Ausganslinien bei Individuen verschiedener Kreuzungsstufen durch DNA fingerprints vor gestellt. Dazu wurden in für die Ausgangslinien repräsentativen Bandenmustern aus DNA‐Gemischen linienspezifische Banden identifiziert. Die repräsentativen Bandenmuster wurden mit den RestriktionsenzymenHinfI andAluI sowie den Oligonukleotidsonen [CA]8, [CAC]5, [GGAT]4, und [GACA]4erzeugt und enthielten 9–14 linienspezifische Banden. Die Bestimmung der parentalen Genomanteile beruhte auf der Identifizierung linienspezifischer Banden in den Bandmustern von Kreuzungsindividuen und der anschließenden Berechnung des relativen Anteils an für eine parentale Linie spezifischen Banden. Um die Genauigkeit der Untersuchungsmethode zu evaluieren, wurde sie zunächst bei F1Tieren angewandt, die einen Anteil von jeweils 50% der elterlichen Linien aufweisen müssen. Der Durchschnittswert berechnet über alle 45 F1Individuen und alle acht Kombinationen von Enzymen und Sonden betrug 51,0 ± 0,34% Genomanteil der einen parentalen Linie und lag somit nahe dem theoretischen Wert von 50%. Bei 24 Tieren der R1 konnte eine beachtliche Verschiebung der Genombeiträge der parentalen Ausgangslinien gezeigt werden.
Correlation between purebred and crossbred performance under a two‐locus model with additive by additive interaction
Authors: Baumung R. , Sölkner J. , Essl A.
Published: March 2011

The behaviour of the genetic correlation between purebred and crossbred performance (rpc) was studied under a model with two loci, in populations with varying gene frequencies, degrees of dominance, and (additive by additive) epistasis. The value of rpc depends not only on dominance and epistasis, but also on gene‐frequency differences between the parental populations. The value of rpc is unity if neither epistasis nor dominance exist, or if there are the same gene frequencies in both purebred populations. Special ratios of the assumed genotypic effects and gene‐frequency differences between the parental populations may also cause a rpc of unity. Therefore, a high rpc is possible with small gene‐frequency differences, small non‐additive gene effects, or certain ratios of the assumed genotypic effects and gene frequencies. Further, overdominance is not necessary for a negative rpc. The correlation becomes negative in the case of partial dominance in combination with epistasis and certain gene frequencies. In general, rpc decreases with increasing gene‐frequency difference or increasing dominance and/or epistatic effects.

orrelation zwischen den Leistungen von Reinzucht‐ und Kreuzungstieren unter einem Zwei‐Locus Modell mit Additiv mal Additiv Interaktion

Das Verhalten der genetischen Korrelation zwischen den Leistungen von Reinzucht‐ und Kreuzungstieren (rpc) wurde anhand eines Zwei‐Locus Modelles in Abhängigkeit von Genfrequenzen, Dominanzgrad und Epistasie (additiv mal additiv) untersucht. Die Größe von rpc hängt nicht nur von Dominanzgrad und Epistasie, sondern auch von der Genfrequenzdifferenz zwischen den elterlichen Populationen ab. Der Wert von rpc beträgt immer eins, wenn weder Dominanz noch Epistasie wirken oder die gleichen Genfrequenzen in beiden Elternpopulationen vorliegen. Bestimmte Verhältnisse der unterstellten genotypischen Effekte und Genfrequenzdifferenzen zwischen den Elternpopulationen können ebenfalls zu einem rpc‐Wert von eins führen. Daher ist es nicht möglich zu unterscheiden, ob ein hoher Wert für rpc durch geringe Genfrequenzdifferenzen, geringe nichtadditive Geneffekte oder bestimmte Verhältnisse der vorliegenden genotypischen Effekte und Genfrequenzdifferenzen zueinander verursacht wird. Weiters konnte gezeigt werden, daß keine Überdominanz für das Auftreten von nagativen Korrelationen notwendig ist. Die Korrelation wird auch dann negativ, wenn partielle Dominanz in Kombination mit Epistasie und bestimmten Genfrequenzen vorliegt. Im allegemeinen nimmt die genetische Korrlelation zwischen den Leistungen von Reinzucht‐ und Kreuzungstieren mit steigenden Genfrequenzdifferenzen oder steigenden Dominanz‐ und/oder Epistasieeffekten ab.