POPULATION CHARACTERISTICS OF GENES ASSOCIATED WITH IDIOPATHIC RECURRENT MISCARRIAGE IN THE KAZAKH POPULATION
Authors: G.M. Berezina , G.S. Svyatova , A.V. Murtazaliyeva , A.T. Terlikbayeva , M.S. Eset , A.T. Sadyrbekova 
Published: October 2024

Background.Miscarriage is relevant medical and social problem, according to WHO its frequency is 20% and has no tendency to decrease, despite effective modern methods of diagnosis and treatment. The aim was to study alleles and single nucleotide polymorphisms (SNP) population frequencies of the coagulation system and cardiovascular system genes, associated with idiopathic recurrent pregnancy loss (iRPL) development as a risk factor in an ethnically homogeneous Kazakh population: MTHFR (C677T, A1298C), MTR (A2756G), MTRR (A66G), F5 (A506G), F2 (G20210A), FGB (G455A), ITGB (Leu33Pro), PLANH1 (5G / 4G); GPIa (C807T), AGTR1 (A1166C), ACE (I / D), eNOS (Glu298Asp). Materials and Methods. The genomic database was analysed based on the results of genotyping of 700 conditionally healthy individuals of Kazakh nationality ~2.5 million SNPs using OmniChip 2.5 M Illumina chips at the DECODE Iceland Genomic Center as part of the joint implementation of the project “Genetic Studies of Preeclampsia in Populations of Central Asia and Europe” (InterPregGen) within the 7th Framework Programme of the European Commission under Grant Agreement No. 282540. Results. The Kazakh population occupies an intermediate position between Europe and Asia populations described in project 1000 genomes by genes of the coagulation and cardiovascular systems. Distribution frequency analysis of the studied genotypes in the Kazakh population showed their correspondence to Hardy-Weinberg equilibrium for the majority of the studied polymorphisms (p>0.05), significant deviations from the expected heterozygosity demonstrated by the polymorphisms A1298C MTHFR gene (p<0.002) and A1166C AGTR1 gene (p<0,0001). Conclusion. Coagulation and cardiovascular systems genes studied polymorphisms can be considered as possible genetic factors for the development of iRPL, due to the high frequency of this pathology in different populations, and its significant contribution to reproduction and fertility indicators. Conduct further studies to determine their significance in the development of iRPL in the Kazakh population.

Цель исследования: изучить популяционные особенности частота ллелейи генотипов полиморфных вариантов генов свертывающей и кардиоваскулярной системы: MTHFR (C677T, A1298C), MTR (А2756G), MTRR (A66G), F5 (А506G), F2 (G20210А), FGB (G455A), ITGB3 (Leu33Pro), PLANH1 (5G/4G); GPIa (C807T), AGTR1 (A1166C), АСЕ (I/D), eNOS (Glu298Asp), предположительно ассоциированных с развитием идиопатической формы привычного невынашивания беременности в этнически однородной популяции казахов. Материалы и методы. Проведен анализ геномной базы данных по результатам генотипирования 1800 условно здоровых лиц казахской национальности ~2,5 млн SNP с использованием чипов OmniChip 2,5 M Illumina в Геномном центре DECODE Iceland в рамках совместного выполнения проекта «Генетические исследования преэклампсии в популяциях Центральной Азии и Европы» (InterPregGen) 7 рамочной программы Европейской Комиссии по Грантовому соглашению №. 282540. Результаты. Казахская популяция по генам свертывающей и кардиоваскулярной системы при сравнении с другими популяциями мира занимает промежуточное положение между описанными в проекте 1000 геномов популяциями Европы и Азии. Анализ частотного распределения исследованных генотипов в популяции казахов показал их соответствие равновесию Харди-Вайнберга для большинства изученных полиморфизмов (p>0,05), достоверные отклонения от ожидаемой гетерозиготности продемонстрировали полиморфизмы - A1298С гена MTHFR (Р<0,002) и A1166C гена AGTR1 (Р<0,0001). Выводы. В связи с высокой частотой идиопатической формы привычного невынашивания беременности (иПНБ) в популяциях человека, ее значимым вкладом в показатели репродукции и рождаемости, изученные полиморфизмы генов свертывающей и кардиоваскулярной системы можно рассматривать как возможные генетические факторы развития данной патологии, провести дальнейшие исследования для определения их значимости в развитии иПНБ в казахской популяции.

Зерттеудің мақсаты: популяция ерекшеліктерін зерттеу коагуляциялық және кардиоваскулярлық жүйе гендерінің полиморфты нұсқаларының генотиптерінің ллелия жиілігі: MTHFR (C677T, A1298C), MTR (A2756G), MTRR (A66G), F5 (A506G), F2 (G20210A), FGB (G455A), ITGB3 (leu33pro), planh1 (5G/4G); Gpia (C807T), AGTR1 (A1166C), АСЕ (I/D), eNOS (Glu298Asp), болжам бойынша идиопатиялық форманың дамуымен байланысты. Материалдар мен әдістер. "Орталық Азия мен Еуропа популяцияларындағы преэклампсияны генетикалық зерттеу" (Interpreggen) жобасын бірлесіп орындау шеңберінде decode Iceland геномдық орталығында OmniChip 2,5 M illumina чиптерін пайдалана отырып, 1800 шартты дені сау қазақ ұлтының ~2,5 млн SNP генотиптеу нәтижелері бойынша геномдық деректер базасына талдау жүргізілді. 282540. Нәтижелер. Қазақ популяциясы әлемнің басқа популяцияларымен салыстырғанда ұю және кардиоваскулярлық жүйенің геномдары жобада сипатталған Еуропа мен Азияның 1000 геномы арасында аралық орынды алады. Зерттелген генотиптердің қазақтар популяциясында жиіліктік таралуын талдау олардың зерттелген полиморфизмдердің көпшілігі үшін Харди-Вайнберг тепе - теңдігіне сәйкестігін көрсетті (p>0,05), күтілетін гетерозиготалықтан сенімді ауытқулар MTHFR генінің-а1298с полиморфизмдерін көрсетті (Р<0,002) және AGTR1 генінің A1166C (Р<0,0001). Қорытындылар. Адам популяцияларында жүктіліктің әдеттегі түсік түсіруінің идиопатиялық түрінің жоғары жиілігіне, оның репродукция және туу көрсеткіштеріне елеулі үлесіне, генді ұю және кардиоваскулярлық жүйенің зерттелген полиморфизмдеріне байланысты осы патологияны дамытудың ықтимал генетикалық факторлары ретінде қарастыруға, олардың қазақ популяциясындағы жтсб дамуындағы маңыздылығын анықтау үшін одан әрі зерттеулер жүргізуге болады.