Association of ANKK1 polymorphism with schizophrenia: negative findings from a genetic approach
Authors: Федоренко О.Ю. , Падерина Д.З. , Пожидаев И.В. , Бойко А.С. , Корнетова Е.Г. , Бохан Н.А. , Иванова С.А. 
Published: June 2020

Введение. Шизофрения - тяжелое мультифакториальное психическое расстройство, патогенез которого связан с нарушением функционирования дофаминергической нейротрансмиссии. Ген белка 1, содержащего анкириновый повтор и киназный домен (ANKK1, ankyrin repeat and kinase domain containing 1), тесно связан с функционированием гена дофаминового рецептора типа D2 (DRD2). Полиморфный вариант гена ANKK1 rs2734849 модулирует плотность экспрессии рецепторов дофамина DRD2 посредством регуляции фактора транскрипции NF-κB. В данной работе исследована ассоциация функционального полиморфного варианта rs2734849 гена ANKK1 с шизофренией. Методы. Обследовано 468 русских больных шизофренией (235 женщин/233 мужчины) и 126 здоровых лиц (62 женщины/44 мужчины) из Сибирского региона. Полиморфизм ANKK1 rs2734849 определяли методом ПЦР в реальном времени на приборе «Step One Plus» с использованием набора реагентов «TaqMan SNPGenotyping Assay» (Applied Biosystems, США). Статистическая обработка результатов генотипирования проводилась с использованием пакета программ SPSS для Windows, версия 21.0. Частоты генотипов и аллелей сравнивали между группами пациентов с шизофренией и здоровых лиц, используя тест χ2 Фишера. Результаты. Средний возраст больных шизофренией в общей группе составил 42,1 ± 12,4 года, в группе мужчин, больных шизофренией, 37,8 ± 11, лет, в группе женщин, больных шизофренией, 45,2 ± 13,9 лет. Продолжительность заболевания в общей группе (Me; 25%Q-75%Q) составила 13 (6; 22), в группе мужчин, больных шизофренией, 11, (5; 18), в группе женщин, больных шизофренией, 15 (7; 26). Результаты по частотам аллелей ANKK1 rs2734849, полученные для контрольной группы в нашем исследовании (rs2734849 MAF 45%), сопоставимы с данными для европеоидов (MAF 50%), приведенными в проекте «1000 геномов». Частоты генотипов (р = 0,37) и аллелей (р = 0,73) полиморфного варианта гена ANKK1 rs2734849 не различалась в группах больных шизофренией и здоровых лиц. Сравнение распределения генотипов и аллелей ANKK1 rs2734849 в группах мужчин и женщин, больных шизофренией, а также сопоставление этих групп с соответствующим по полу контролем не выявило статистически значимых различий. Возможно, это связано с недостаточным размером группы здоровых доноров. Не исключено, что это обусловлено сложной природой патофизиологических процессов, лежащих в основе шизофрении. Выводы. Функциональный полиморфизм ANKK1 rs2734849 не ассоциирован с шизофренией в выборке русских Сибирского региона.

Objective. Schizophrenia is a severe highly heritable mental disorder. Genetic polymorphisms of dopaminergic pathways are related to pathogenesis of schizophrenia. Ankyrin Repeat and Kinase Domain containing 1 (ANKK1) gene is closely related to Dopamine Receptor D2 type (DRD2) gene functioning. Variants of ANKK1, specifically rs2734849, may function to affect DRD2 expression and density via regulating the transcription factor NF-κB. We examined whether the functional polymorphism ANKK1 rs2734849 is associated with schizophrenia. Methods. We recruited 468 patients with schizophrenia (235 women / 233 men) and 126 healthy individuals (62 women / 44 men) in Russian population of Siberian region. The polymorphism rs2734849 in the ANKK1 gene was genotyped with “Step One Plus”, using the kit “TaqMan SNPGenotyping Assay” (Applied Biosystems, USA). Statistical analysis was carried out using the SPSS software package for Windows, version 21.0. Genotype and allele frequencies were compared between groups of schizophrenia patients and healthy controls using the χ2 , Fisher tests. Results. The average age of patients with schizophrenia in the general group was 42.1 ± 12.4 years, in the group of men with schizophrenia - 37.8 ± 11.9 years, in the group of women with schizophrenia - 45.2 ± 13.9 years. The duration of the disease in the general group was 13 (6; 22), in the group of men with schizophrenia 11 (5; 18), in the group of women with schizophrenia 15 (7; 26), Me values were indicated (25% Q - 75% Q). The results on the allele frequencies of ANKK1 rs2734849 obtained for the control group in our study (rs2734849 MAF 45%) are comparable with the data for Europeoids (MAF 50%) presented in the 1000 Genomes project. The frequency of genotypes (р=0.37) and alleles (р=0.73) of the polymorphic variant ANKK1 rs2734849 in patients with schizophrenia did not differ from those in control subjects. Comparison of the ANKK1 rs2734849 genotypes and alleles distribution in the groups of men and women with schizophrenia, as well as a comparison of these groups with the corresponding by sex control persons, did not reveal statistically significant differences. Perhaps this is due to the insufficient size of the group of healthy controls. It is possible due to the complex nature of the pathophysiological processes underlying schizophrenia. Conclusion. The functional polymorphism rs2734849 in the ANKK1 gene was not associated with schizophrenia in Russian population of Siberian region.