Di fondazione settecentesca come le raccolte universitarie di paleontologia e mineralogia;con cui condivide l'origine;il Museo di Zoologia e di Anatomia comparata ha come finalità quella di conservare reperti faunistici di particolare interesse per il territorio locale.In seguito a lasciti di cittadini modenesi ed acquisti;avvenuti a più riprese tra il 1830 ed il 1845;il patrimonio museale si è accresciuto rapidamente;soprattutto nel settore ornitologico;anche grazie a frequenti donazioni da parte del Duca Francesco IV sia di esemplari esotici allevati a corte e morti in cattività;sia di fauna locale.Recentemente;le collezioni zoologiche hanno visto un nuovo incremento grazie a materiale donato da privati o enti pubblici;o proveniente da sequestri effettuati presso tassidermisti o confiscati a cacciatori o frutto di raccolte di studio.Allestito nell'ambito del Dipartimento universitario di Biologia animale;conta oggi all'incirca 3000-3500 vertebrati naturalizzati (uccelli;mammiferi;pesci;rettili);un centinaio dei quali appartenenti alla "fauna vertebrata del Modenese";montati sotto forma di piccoli diorami;circa 1000 esemplari di vertebrati (soprattutto pesci e rettili) conservati sotto liquidi;circa 250 scheletri e parti anatomiche di vertebrati;qualche centinaio di invertebrati conservati in alcool o formalina.Il patrimonio comprende anche un'importante collezione malacologica costituita da qualche migliaio di scatole;ciascuna delle quali con uno o più esemplari;un centinaio di scatole entomologiche con un numero imprecisato di esemplari;una decina di vetrine contenenti una ricca collezione di animali parassiti e velenosi (Collezione Franchini).