Il museo ha sede all'interno di palazzo Parolari.Il percorso espositivo permanente è collocato in sei sale al secondo piano;in attesa di riallestire nuove sezioni al pianterreno;compresa quella Paleontologica con i calchi delle orme dei dinosauri scoperte ai Lavini di Marco.La prima sala ospita una selezione della collezione ornitologica;la più importante della provincia con 1200 esemplari;in gran parte di provenienza locale.;Seguono le sezioni dedicate ai mammiferi europei;in particolare alpini (orso;lupo;cervo;stambecco;camosci;ecc.) e a quelli esotici (leone;leopardo;scimmia).Nelle tre sale rimanenti sono collocate le collezioni archeologiche.In apposite vetrine sono esposti reperti pre-protostorici (asce in pietra levigata;strumenti in selce;manufatti in lega di rame;terracotte);materiali d’epoca romana e medievale;monete e lapidi – in larga parte provenienti da ritrovamenti fortuiti e campagne di scavo in vari siti del Trentino meridionale (Corsi d’Isera;Corno di Mori;grotte di Castel Corno;Pizzini di Castellano;Colombo di Mori;ecc.) – ma anche la ricca ed eterogenea raccolta di antichità lasciata da Orsi a Rovereto;che comprende molti materiali della Magna Grecia e oltre 1100 esemplari di monete greche.Al terzo piano sono stati ricavati locali per mostre temporanee e una sala convegni;mentre il piano terra ospita;oltre a spazi espositivi;un ambiente dove si raccontano i 160 anni di storia dell’importante istituzione culturale.Nel giardino del Museo si trova un modernissimo Planetario;uno strumento sofisticato per svelare i misteri della volta stellata;che costituisce – insieme all’Osservatorio astronomico di Monte Zugna attivo dal 1997 – la sezione astronomica del Museo.Fuori e dentro la città il Museo Civico di Rovereto gestisce altri siti culturali e sperimentali:dal sito paleontologico dei Lavini di Marco con le orme di dinosauri carnivori ed erbivori vissuti milioni di anni fa all’orto botanico a Brentonico presso Palazzo éccheli-Baisi;dalla Villa Romana d’Isera al settecentesco Palazzo Alberti in Corso Bettini con la mostra permanente del lascito Carlo Fait;per finire con Sperimentarea;una “cittadella per la ricerca scientifica e la didattica” con spazi dedicati all’archeologia sperimentale e alle attività naturalistiche;presso il Bosco della Città;poco lontano dal centro cittadino.Nel 2011 sono state aperte anche le sale al piano terra con le sezioni di mineralogia;petrologia;paleontologia e degli invertebrati.