Intorno al 1135 Innocenzo II concesse ai Cistercensi il monastero benedettino di S.Stefano di Fossanova;che essi ricostruirono secondo i canoni previsti dal proprio ordine a partire dal 1170.Nella planimetria;guidata da esigenze funzionali;e nella forma semplice e austera la nuova abbazia rispecchia i dettami propugnati da S.Bernardo di Chiaravalle:unala centrale riservata ai monaci e ai conversi;due agglomerati residenziali autosufficienti e separati (ciascuno con dormitorio;cucina;refettorio;infermeria);dislocati intorno al chiostro e connessi alla chiesa;un settore in cui erano situati lingresso e i luoghi daccoglienza per i pellegrini (foresteria;ospizio;cappella);una zona destinata alle attività di produzione.Lala dei monaci;a est;comprendeva anche il calefattorio (sala riscaldata da camino);lauditorio;gli scriptoria;la sala capitolare;con volta a crociera costolonata che poggia su due pilastri polistili a pianta cruciforme e capitelli a crochet;mentre nellala dei conversi;ad ovest;erano situati i magazzini;ad essi;salvo rare occasioni;era interdetta la frequentazione del chiostro e un ingresso specifico (portale dei conversi) permetteva laccesso alla parte della chiesa loro riservata.È ormai superata lipotesi che il complesso abbaziale sia stato eseguito senza interruzioni entro il 1208;anno di consacrazione della chiesa.I lavori edilizi continuarono anche dopo;grazie a ricche elargizioni di pontefici e imperatori;di nobili e potenti famiglie locali come i De Ceccano;e si interruppero bruscamente agi inizi del XIV sec.per motivi di ordine politico (contrasti con il papato;inquisizione dellabate Pietro) e difficoltà economiche economico.Colpo definitivo fu listituzione della commenda (sec.XV);nonostante alcuni interventi migliorativi furono apportati nel Seicento da cardinali commendatari come Pietro Aldobrandini e Francesco Barberini;il quale trasformò in cappella la casa dellabate dove morì S.Tommaso.