L'opera e' giunta nelle collezioni nel 1915 dalla sagrestia del Duomo di Urbino.Esistono innumerevoli interpretazioni iconografiche di questo capolavoro che colloca l'avvenimento religioso in secondo piano rispetto al gruppo di personaggi disposti in evidenza sulla destra.L'ipotesi tradizionale piu'antica riconosce Oddantonio da Montefeltro;ucciso durante una sommossa popolare del 1444 che porto' al potere l'illegittimo Federico;nel protagonista biondo in primo piano al centro;affiancato dai suoi due cattivi consiglieri.Il dipinto sarebbe stato quindi commissionato dallo stesso Federico a Piero della Francesca con funzione riabilitativa del fratellastro.La proposta interpretativa piu' accreditata;invece;collega cronologicame le scene della 'Flagellazione' al Concilio di Mantova del 1459;simboleggiando cosi' le traversie della Chiesa sotto le minacce turche.La costruzione della scatola prospettica dimostra l'alta capacita' matematica di Piero esaltata dal colore e dalla suprema luce in perenne mezzogiorno.