Istituito per esporre sinopie o affreschi staccati che non potevano essere ricollocati nel luogo di provenienza;conserva anche arredi sacri del convento di San Domenico.L'allestimento originario del museo è attualmente mutato per la presenza (dal 1998 fino alla riapertura del Museo Civico);della mostra "I tesori della città";che espone le opere più prestigiose del Museo Civico;attualmente chiuso per restauro.Tra queste si trovano dipinti di Bernardo Daddi;Giovanni da Milano;Lorenzo Monaco;Filippo Lippi;Filippino Lippi.