Il nucleo più importante della Sezione Archeologica è costituito dai corredi tombali provenienti dalle note necropoli di San Bernardo e in Persona di Ornavasso;scavate dal 1890 al 1892 dallo storico ed archeologo ossolano Enrico Bianchetti.Gli oltre 1500 pezzi conservati al Museo offrono uno spaccato dell’evoluzione di una piccola comunità di Leponti;già influenzata dall’elemento celtico e progressivamente introdotta nel mondo romano.Dal sito più antico;San Bernardo;i corredi funerari mostrano particolare ricchezza;con armi;gioielli in argento;utensili e monete oltre ad oggetti di lusso di provenienza mediterranea;documentanti l’esistenza di una classe elevata che intratteneva rapporti privilegiati con Etruschi e Romani.Le iscrizioni in alfabeto leponzio su numerosi vasi dimostrano l’uso diffuso della scrittura in lingua celtica e tramandano i nomi dei defunti.La raccolta;nota a livello internazionale dalla fine dell’Ottocento;è stata riaperta al pubblico nel settembre 2000 con un nuovo allestimento.Trovano spazio nell’esposizione anche la collezione di reperti ;magno greci di ;don Secondo Falciola di Miazzina;costituita da un nucleo omogeneo di oggetti;databili tra l’VIII e il IV secolo a.C.;riconducibili alla necropoli daunia di Ascoli Satriano (Foggia) e la collezione depositata dal C.A.I.di Intra ;nella quale sono confluiti un nucleo di oggetti di età romana di provenienza locale e una raccolta di vasellame proveniente dall’Italia centrale.