Il Museo è situato all’interno dello storico Palazzo Cerio;costruito nel 1372 dal conte Giacomo Arcucci segretario della regina Giovanna I d’Angiò;primo signore di Capri fra il 1371 e il 1374.Faceva parte del complesso dei conti Arcucci noto nel Medioevo come "Case Grandi" che comprendeva il Palazzo Farace e il Palazzo Vanalesti.Il Museo trae la sua origine dall’attività instancabile del Dott.Ignazio Cerio.Nato a Giulianova d’Abruzzo nel 1840;Ignazio Cerio amò profondamente l’isola tanto da risiedervi stabilmente fin dal 1868 e vi rimase fino alla morte avvenuta nel 1921.Medico condotto sull’isola;quest’uomo eclettico;appassionato di preistoria e di scienze naturali;per più di cinquant’anni collezionò conchiglie;fossili;rocce;piante e reperti archeologici provenienti da Capri e da altre parti del mondo;promuovendo studi scientifici e intrattenendo rapporti con i più noti studiosi del tempo.Costituì il Museo come un museo di famiglia a partire dalla seconda metà del XIX secolo;ma fu formalmente istituito come museo pubblico con la nascita del centro Caprense Ignazio Cerio nel 1949.Il Museo è composto di quattro sale:La sala geo-paleontologica offre l’opportunità di comprendere le principali tappe dell’evoluzione geologica di Capri;da quando;circa 190 milioni di anni fa;l’isola era parte di una piattaforma carbonatica sommersa.È possibile osservare gli organismi fossili rinvenibili nelle sue rocce ed è esposta la fauna di grandi mammiferi portati alla luce durante i lavori di scavo dell’Hotel Quisisana (1905) del Pleistocene medio (circa 300.000 anni fa) e quella insulare testimoniata dal Cervus tyrrhenicus del Pleistocene superiore (circa 75.000 anni fa) ritrovata alla Grotta delle Felci;alla Grotta Vascio ’o Funno e alla Certosa.
Oltre al materiale raccolto da Ignazio Cerio;nuovo materiale è stato aggiunto nel 2000 per completare l’allestimento della sala.
Nella sala paletnologica sono esposti reperti relativi alle più antiche scoperte effettuate dal Cerio sull’isola.È possibile ammirare i manufatti lasciatici dai primi abitanti del territorio di Capri e ritrovati al Quisisana e a Grotta delle Felci;nonché tracce di un atelier di taglio dell’ossidiana;che testimonia la partecipazione dell’isola in un circuito commerciale florido;rinvenute in località Le Parate.
La sala di archeologia classica espone con criterio tipologico e cronologico reperti di età classica greca e romana (IV secolo a.C.- II secolo d.C.) delle collezioni Benner-Pagano e Cerio provenienti da varie località isolane;in massima parte corredo di sepolture e delle ville imperiali di Capri.
La sala di Biologia conserva numerosi organismi animali;marini e terrestri;provenienti dall’Isola di Capri.Si possono ammirare oltre alla famosa Lucertola azzurra dei Faraglioni;conchiglie marine rarissime o scomparse;coralli ormai introvabili nel mare di Capri e tantissime altre specie animali e vegetali sia marine che terrestri.