Il museo è costituito dalle sale pubbliche (Salone dei Cinquecento;Sala dei Duecento;Sala dei Gigli e sala dell'Udienza) e dai quartieri medicei cosiddetti degli Elementi e di Eleonora;che si trovano nel Palazzo della Signoria.Il percorso di visita comprende anche il mezzanino dove è esposta la collezione Loeser.