Il museo si compone di tre sezioni:la prima è la basilica barocca;che vanta una delle più belle facciate settecentesche tra le chiese della Sicilia orientale e al cui interno si possono ammirare affreschi di artisti acesi;sculture e arredi;la seconda sezione comprende le sale del Tesoro;in cui sono esposti preziosi;vasi sacri e arredi liturgici in argento e oro;la terza sezione;collocata nella cripta settecentesca della basilica;comprende una collezione di paramenti sacri finemente ricamati in oro e seta;statue lignee di pregevole fattura e tele di rinomati artisti siciliani.;