Il museo racconta la vicenda plurimillenaria di Ancona attraverso reperti;plastici;dipinti;stampe;riproduzioni fotografiche e documenti audiovisivi.Il percorso espositivo rilegge il passato offrendo gli strumenti di comprensione della città attuale.Una struttura in continua espansione che è anche porta d’accesso al Museo Diffuso Urbano;punto di partenza per diversi itinerari attorno ad un città che vive e si trasforma nel tempo.L'esposizione si sviluppa in quattro sezioni:dalle origini all'anno 1000;dal 1000 al 1532;dal 1532 alla fine del '600;dall'occupazione francese all'unità d'Italia.E’ Situato all’interno dei suggestivi ambienti dell’antico Ospedale di San Tommaso di Canterbury e dell’ex Pescheria.