Ha sede all’interno del Cassero barocco di Porta Lame;costruito a metà del Seicento una delle porte di accesso alla città lungo le antiche mura cittadine abbattute agli inizi del Novecento.Contiene un ricco patrimonio mineralogico;in gran parte derivante dall’area dei Gessi bolognesi;ma che comprende anche campioni originari di altre regioni italiane.Molteplici sono anche gli esemplari di cristallizzazioni;mineralizzazioni e concrezionamenti.Alcune vetrine espositive di carattere "storico" presentano gli attrezzi utilizzati dai primi esploratori del Gruppo Speleologico Bolognese;fondato nel 1932 da Luigi Fantini;pioniere delle ricerche sulla preistoria bolognese;a cui il museo è intitolato.Corredano le collezioni una biblioteca speleologica contenente circa novemila volumi e un archivio fotografico ricco di circa cinquemila immagini di grotte e ambienti carsici.