Obbiettivo principale del museo è quello di salvaguardare e valorizzare;attraverso iniziative di varia natura;il patrimonio artistico diffuso nelle chiese del territorio diocesano.Alcune opere sono consevate nel museo permanentemente per ragioni di sicurezza e salvaguardia;altre invece vengono esposte a rotazione all'interno di allestimenti tematici che permettono di approfondire argomenti specifici e far conoscere aspetti della cultura atistica poco noti al pubblico.Tali mostre sono l'occasione per condurre mirate campagne di studio e di restauro dei materiali.