L'Erbario comprende un patrimonio erbariologico di notevole entità e valore scientifico.Costituitosi nel corso dell'Ottocento;espone numerosi erbari raccolti dal XVI secolo in poi.Di particolare interesse sono l'Hortus siccus florae italicae;iniziato nel 1816;e l'Hortus siccus exoticus;costituito tra il 1820 e il 1830 da Antonio Bertoloni (1775-1869);professore di Botanica e Prefetto dell'Orto Botanico dal 1816 al 1868.Il Museo Botanico occupa una piccola saletta dove sono stati esposti in otto vetrine alcuni campioni appartenenti alle collezioni più significative ospitate nell'Erbario:due sono dedicate all'Orto Botanico;quattro ospitano campioni di collezioni d'erbario storiche e due contengono informazioni generali sull'erbario e sulla sua funzione.Il percorso di visita è corredato da pannelli che illustrano la storia di questa istituzione conservativa;nonché brevi cenni sull'evoluzione dell'iconografia botanica.