Il museo è nato nel 1992 come esposizione legata alle celebrazione del centenario della morte di Lorenzo il Magnifico.E' stato riaperto in forma totalmente rinnovata;dopo i lavori di restauro e ampliamento;il 29 maggio 1999.Illustra la vita dei monaci della badia e la funzione religiosa;sociale ed economica del monastero nel territorio.Inoltre documenta il sentimento della religiosità popolare nel passato.Il percorso espositivo del museo è completato con l'esposizione di arredi e dipinti provenienti da altre chiese della vallata e;in un prossimo futuro;sarà allestita una sezione archeologica in cui verranno esposti i reperti rinvenuti negli scavi condotti in occasione del restauro.