Il museo riunisce le opere d'arte;disperse nel tempo;già appartenute alla Compagnia del Bigallo;ente attivo fin dal Medioevo in opere di beneficenza e assistenza.E' stato riaperto nel giugno 1998;al termine dei lavori di messa a norma.Dal luglio 2007 il percorso museale è stato ampliato con l'apertura al secondo piano della esposizione permanente :Leonardo a Firenze.Vi sono esposti riproduzioni scientifiche o interattive di macchine e disegni del grande maestro;unitamente a opere originali come l'incisione del nodo vinciano di Durer.