Il Museo è stato ampliato e ristrutturato nel corso del 2007/2008 ed è stato inaugurato il 20 settembre 2008.Ai locali della Chiesa di Santa Maria del Gesù si sono aggiunti i nuovi locali nei quali sono state allestite la sezione archeologica e la sezione delle abitazioni primitive.La prima sezione è costituita dall'aula rettangolare della chiesa stessa;dove sono rimaste le opere originarie.Nella sacrestia adiacente alla chiesa sono riunite le opere più preziose.Vi è poi una sezione dedicata agli arredi liturgici e ai paramenti.