Il museo è organizzato secondo un sistema espositivo in cui il visitatore e' accompagnato alla scoperta dei segreti dell'acqua e della foresta;attraverso l'ausilio di elementi espositivi;modellini;esperimenti scientifici e giochi interattivi.Il percorso si articola in poli tematici;paesaggistico;tecnologico e naturalistico;localizzati lungo la diga.All'interno della sede centrale;collocato all'ultimo piano;si trova uno spazio dedicato alla Fauna della Vallata del Bidente;composta da esemplari provenienti dal Museo Naturalistico di Ridracoli.L'allestimento della collezione ha richiesto;causa gli spazi ridotti;una selezione degli esemplari del precedente museo che sono stati collocati in sale appositamente allestite per ricreare l'ambiente naturale d'origine.Una prima sala ospita gli ungulati e i grandi erbivori;la successiva i predatori:lupi;volpi;mustelidi e aquile reali;la terza e la quarta espongono rapaci diurni e notturni ed infine l'ultima è dedicata alle specie non più presenti nella vallata.