;Il Museo della Lacrimazione è il più importante dei tre Musei del Santuario poichè qui sono esposti documenti;fotografie e articoli di giornale riguardanti la ""Lacrimazione della Madonna a Siracusa"";ma anche numerosi oggetti legati a quest'evento come alcuni stracci utilizzati per pulire la statua piangente della ""Madonnina"";le provette e gli arnesi utilizzati per analizzare la composizione chimica di queste lacrime (rivelatesi poi ""umane"" con una composizione chimica simile a quella delle lacrime di un bambino) ma anche la scrivania in legno con cui si attestò l'autenticità delle lacrime piante dalla ""Madonna"";la cazzuola con cui venne innalzata la ""Prima Pietra"" del Santuario nel 1964 utilizzata dall'allora Cardinale di Sicilia Ernesto Ruffini;l'anello pontificale del Monsignor Ettore Baranzini che era Arcivescovo di Siracusa durante gli anni in cui si sviluppò il culto alla "Madonna delle Lacrime" (1953 - 1973);la "Croce" in oro di Monsignor Sebastiano Rosso primo rettore del nascente "Santuario";vari oggetti liturgici tra cui un Calice e un Ostensorio argentei donati dalla famiglia Cassone e numerosi Ex voto piuttosto preziosi.