Il museo è un vero e proprio centro di raccolta di reperti naturali e di manufatti che tiene viva la memoria di un passato naturale quanto artigianale.Nelle sue otto sale sono conservati esemplari della flora (interessante la collezione micologica) e della fauna dell'Etna (una ricca raccolta di esemplari imbalsamati;alcuni in via di estinzione;e una collezione di farfalle fra le quali l'Anthocaris damone;farfalla tipica delle zone dell'Etna);oltre a ritrovamenti minerali rappresentativi della particolare tipologia del vulcano (reperti di lava preistorici e più recenti come le "bombe vulcaniche" di tutta l'area etnea).Varie vetrine ricostruiscono invece la vita quotidiana delle popolazioni dell'Etna:manufatti in pietra lavica;catenacci;imbuti;ferri da maniscalco;numerosi attrezzi per la lavorazione dell'uva.La biblioteca contiene circa 960 volumi riferiti all'attività dell'Istituto.;