Il Museo occupa la sede monumentale della ex Dogana pontificia voluta da Clemente XIII;così come attesta l’iscrizione sopra l’ingresso della struttura.Negli anni ‘70 è stato definitivamente allestito per accogliere i materiali archeologici provenienti dal vecchio Museo Civico e pertinenti i rinvenimenti dal territorio di Civitavecchia e dall'antistante litorale;come pure dalle zone limitrofe (S.Marinella;Allumiere;Tolfa;etc.).Il Museo è articolato su tre piani;nelle due sale del piano terra sono esposti i materiali lapidei fra i quali oltre a pregevoli statue ed elementi decorativi provenienti da ville disseminate sulla costa;sono iscrizioni dalla località Prato del Turco;sede del sepolcreto della flotta romana stanziata a Civitavecchia in età traianea.Al primo piano sono esposti alcuni corredi delle necropoli nel territorio di Allumiere;Tolfa e S.Marinella e materiale proveniente dal santuario in località Punta della Vipera.Al secondo piano sono testimonianze di varia epoca e provenienza fra le quali si segnalano i reperti rinvenuti nello scavo della cosiddetta Rocca Romana;databili da età imperiale ad epoca rinascimentale.&gt;