Il Museo si compone oggi di tre sale.Nella principale;di maggiore dimensione;si trovano;esposte su due livelli;le sezioni di:Osteologia con varie tipologie di scheletri dai neonati agli adulti;una ricca collezione di crani;tra cui la sezione dedicata alle “persone illustri” con il cranio dello scienziato Valentino Brugnatelli;le ossa del tronco;degli arti superiori;degli arti inferiori;la sezione di Angiologia che conserva nella teca centrale;le “statue naturali”;cadaveri interi preparati a secco ottenuti con la tecnica di iniezione dei vasi;oltre a una serie di preparati relativi al cuore;al sistema venoso;arterioso e linfatico;la sezione di Embriologia con embrioni;feti umani e uteri in gestazione;la sezione di Anatomia generale con fini preparati relativi al tessuto connettivo;cartilagineo e osseo;preparati di tessuto muscolare;nervoso e vasi sanguigni.Nelle due sale più piccole trovano posto preparati relativi alla Splacnologia;Estesiologia;Neurologia;e Anatomia Topografica.