Una scala aperta al principio della navata destra conduce al percorso archeologico sotto l’attuale livello pavimentale.Scavi condotti intorno e poco dopo la metà del XX secolo;;hanno rivelato diverse tracce e materiali archeologici databili fra l’età romana e il medioevo.;;Si tratta di elementi cronologicamente precedenti il primitivo edificio di culto cristiano messo in luce al di sotto dell'abside attuale;usato forse come cripta della chiesa eretta in età romanica (alla fine del sec.XI - inizi sec.XII).Il pozzo con drenaggio rinvenuto sotto la navata centrale;;;variamente interpretato da taluni come piccolo forno o fornace e da altri come "celletta per cure termali";è stato recentemente identificato come;;pozzetto per la gettata di campane.In loco si conservano diversi reperti archeologici:mattoni manubriati;laterizi bollati;mattoni con impronte animali;frammenti di capitelli;stele funerarie iscritte;un bronzo;forse votivo;esagonette pavimentali;frammenti di balsamari in vetro e alcuni grandi doli in cotto segnati con numerazione progressiva graffita sull'orlo.Fra i materiali di spoglio inglobati nelle strutture architettoniche e nei paramenti murari si segnalano frammenti di epigrafi;sette capitelli in parte rilavorati (dal I sec.;;a.C.al V-VI sec.d.C.);alcune basi di colonne;una colonna in marmo rosa di Verona e otto in granito orientale:di notevole importanza è quella che reimpiega un miliario commemorante gli imperatori Valente;Graziano;Valentiniano II;generalmente attribuito al percorso della via Faventina.Altri reperti;in prevalenza dell'età romana;sono murati o infissi alle pareti in vari punti del complesso chiesastico.Meritano citazione fra questi la tavola lusoria incisa su mattone;una transenna di marmo greco;un frantoio per la spremitura delle olive;diversi frammenti di epigrafi funerarie.