APG III sistemi

APG III sistemi, uzun adıyla "bitkilerde (Evrimsel Kapalı Tohumlu Gelişimi Topluluğu III sistemi)" bu topluluğun APG II sistemi sonrası bulunan yenilikler neticesi 2009'da ortaya çıkardığı, bu sistemin modifiye edilmiş üçüncü ve halen günümüz için geçerli bir versiyonudur. Bu sistem bu sefer modern teknik ve çoğunlukla moleküler filogenetik moleküler biyolojiden yararlanılarak ortaya çıkarılmış bir sınıflandırmadır. APG II siteminden 6,5 ve hepsinin atası APG Sistemi'nden 11 yıl sonra yapılan güncellemelerle sistem bugün geçerli 3. halini almıştır.Bu yeni sistemi açıklayan bu yayından hemen ardından 2 tane Botanical Journal of the Linnean Society dergisinin aynı sayısında takip eden makaleye yer verilmiştir. Bunlardan ilki Chase & Reveal adlı iki yazarca yayınlanan bütün kara bitkilerinin APG III sistemine göre resmi filogenetik sınıflandırılmasıdır. Linnaneas'ın mevcut sınıflandırması ile APG sistemi arasında bir uyum sağlama peşinde bir makaledir. Bütün kara bitkileri Equisitopsida sınıfına alınıp 16 alt sınıfa bölünmüştür. (İçinde bütün çiçekli bitkiler (Magnoliidae'de dahil) bulunmaktadır. İkincisi Haston adlı bir botanist tarafından yazılan et al. adlı makaledir, APG III sistemine (LAPG III)göre ailelerin doğrusal sıralamalarını vermektedir. 413 kabul edilmiş aile ile ilgili olarak çeşitli bitki müzesi katılımcıları ve gönüllü flora çalışmalarının kullanılmasına onay veren kişilerin çalışmaları bir araya getirilip düzenlenilerek APG III sistemi dahilinde bu sıralamalar yapılmıştır.The APG III sistemi eski APG II sistemindeki 45 takım yanında 14 tanede yeni takım öngörmüştür. Yanlışlıkla diğer eski APG sistemlerinde yer alan Ceratophyllales yeni bir takımmış gibi lanse edilmiştir. Bu hata haricinde sınıflandırmada geçen yeni takım adları şunlardır:Amborellales, Nymphaeales, Chloranthales, Petrosaviales, Trochodendrales, Buxales, Vitales, Zygophyllales, Picramniales, Huerteales, Berberidopsidales, Escalloniales, Bruniales ve Paracryphiales.Alternatif opsiyonel parantez familya uygulaması APG III sisteminde terk edilmiştir zira önceki sistemde bu alternatif familyalar pek ilgi görmemiştir. APG III 413 familyayı tanır ve bu önceki sistemden 44 adet eksiktir, 55 parantez familya uygulamasına son verildiği gibi 18 familya adı da artık kullanılmamak üzere kaldırılmıştır.Illiciaceae, Alliaceae, Agapanthaceae, Agavaceae, Aphyllanthaceae, Hesperocallidaceae, Hyacinthaceae, Laxmanniaceae, Ruscaceae, Themidaceae, Asphodelaceae, Hemerocallidaceae, Kingdoniaceae, Fumariaceae, Pteridophyllaceae, Didymelaceae, Tetracentraceae, Pterostemonaceae, Hypseocharitaceae, Francoaceae, Memecylaceae, Lepuropetalaceae, Rhoipteleaceae, Medusagynaceae, Quiinaceae, Malesherbiaceae, Turneraceae, Bretschneideraceae, Diegodendraceae, Cochlospermaceae, Peganaceae, Tetradiclidaceae, Nyssaceae, Ternstroemiaceae, Pellicieraceae, Aucubaceae, Donatiaceae, Lobeliaceae, Desfontainiaceae, Diervillaceae, Dipsacaceae, Linnaeaceae, Morinaceae, ve Valerianaceae.Limnocharitaceae, Luzuriagaceae, Sparganiaceae, Ledocarpaceae, Heteropyxidaceae, Psiloxylaceae, Oliniaceae, Rhynchocalycaceae, Parnassiaceae, Maesaceae, Myrsinaceae, Theophrastaceae, Eremosynaceae, Polyosmaceae, Tribelaceae, Aralidiaceae, Mackinlayaceae, ve Melanophyllaceae.Eski 2 sistemde de bulunmayan 19 yeni familyaya ise APG III sistemi yer vermiştir az miktardaki familyalar ise farklı yerlere alınarak yeri değiştirilmiştir. sitemdeki yeni familyalar:Petermanniaceae, Schoepfiaceae, Limeaceae, Lophiocarpaceae, Montiaceae, Talinaceae, Anacampserotaceae, Centroplacaceae, Calophyllaceae, Guamatelaceae, Gerrardinaceae, Dipentodontaceae, Capparidaceae, Cleomaceae, Cytinaceae, Mitrastemonaceae, Metteniusaceae, Linderniaceae, ve Thomandersiaceae.Hiçbir takımda bulunmayan familya sayısı 39'dan 10'a düşürülmüştür ve Kapalı tohumlular ile incertae sedis(Latince kelimedir.Türkçesi: Emin olunamayan yerleştirme-sıralama), arasına Apodanthaceae ve Cynomoriaceae adlı kapalı tohumlularda yeri belirsiz 2 ayrı familya konulmuştur. Kalan 8 tane familya ise incertae sedis olarak çeşitli kapalı tohumlular takım gruplarına dağıtılmıştır.Apodanthaceae, Cynomoriaceae, Dasypogonaceae, Sabiaceae, Dilleniaceae, Icacinaceae, Metteniusaceae, Oncothecaceae, Vahliaceae, ve Boraginaceae dir.Icacinaceae familyasının taksonomik sınırlaması hala belirsizliğini korumaktadır; Apodytes, Emmotum, Cassinopsis ve az miktarda bir kısım cins bundan sonraki bilimsel çalışmalar nereye ait olduğunu tespit edene kadar geçici olarak bu familya içine konmuştur.3 cins (Gumillea (APG siteminde vardı;APG II sisteminde kaldırılmıştı şimdi tekrar konuldu) ve Nicobariodendron ile Petenaea) (bunlar ise yeni eklendi) incertae sedis olarak kapalı tohumlularda yer verildi.Ancak bu yayınlardan sonra Petenaea için Petenaeaceae adlı kendi familyası oluşturularak uzaktan yakınlığı saptanan Huerteales takımına alındı.2 model halinde bu sınıflandırma gösterilmiştir. Özet modellemede sadece dal (klad) ve takımlar gösterilmiştir. Detaylı modelde ise alfabetik sıralama ile takımlar ve familyalar detaylı gösterilmiştir. Kalan detaylar için aşağıda gösterilen filogenetik ağaca bakın.$ = APG II sistemi içinde daha geniş kapsamlı kullanılabilirlik seçeneği mevcut aileler tercih edilmiştir;$$ = kare parantez içinde APG II sistemi içindeki familyaların yakınındaki derecelendirmeler tercih edilmiştir.$Amaryllidaceae J.St.-Hil. (Nergisgiller) (Agapanthaceae F.Voigt ve Alliaceae Borkh. (Soğangiller)'i içine alır.)$Asparagaceae Juss. (Agavaceae Dumort. (Sabırgiller veya Agavgiller), Aphyllanthaceae Burnett, Hesperocallidaceae Traub, Hyacinthaceae Batsch ex Borkh., Laxmanniaceae Bubani, Ruscaceae M.Roem., Themidaceae Salisb.'yi içine alır.)$Papaveraceae Juss. (Gelincikgiller) (Fumariaceae Marquis, Pteridophyllaceae Nakai ex Reveal & Hoogland'yi içine alır.)$Celastraceae R.Br. (Lepuropetalaceae Nakai, Parnassiaceae Martinov, Pottingeriaceae Takht.'yi içine alır.)$Passifloraceae Juss. ex Roussel (Çarkıfelekgiller) (Malesherbiaceae D.Don, Turneraceae Kunth ex DC.'yi içine alır.)§Myrtaceae Juss. (Mersingiller) (Heteropyxidaceae Engl. & Gilg, Psiloxylaceae Croizat'yi içine alır.)§Penaeaceae Sweet ex Guill. (Oliniaceae Arn., Rhynchocalycaceae L.A.S.Johnson & B.G.Briggs'yi içine alır.)§Primulaceae Batsch ex Borkh. (Maesaceae Anderb., B.Ståhl & Källersjö, Myrsinaceae R.Br., Theophrastaceae G.Don'yi içine alır.)§Escalloniaceae R.Br. ex Dumort. (Eremosynaceae Dandy, Polyosmaceae Blume, Tribelaceae Airy Shaw'yi içine alır.)§Paracryphiaceae Airy Shaw (*Quintiniaceae Doweld, Sphenostemonaceae P.Royen & Airy Shaw'yi içine alır.)§Caprifoliaceae Juss. (Hanımeligiller) (Diervillaceae Pyck, Dipsacaceae Juss.(Tarak otugiller), Linnaeaceae Backlund, Morinaceae Raf. ve Valerianaceae Batsch (Kedi otugiller)'i içine alır.)§Torricelliaceae Hu (Aralidiaceae Philipson & B.C.Stone, Melanophyllaceae Takht. ex Airy Shaw'yi içine alır.)The APG III sistemi kapalı tohumlular için 59 takım ve 4 yer verilmemiş aileden oluşan finogenetik bir ağacı baz alır. Diğer 6 yeri belirsiz yerleştirme yapılmış aileye ise bu belirsiz konumdan ötürü ağacın polytomlerinde yer verilmez. Ayrıntılı modelleme üsttedir.Aşağıdaki filogenetik ağaç APG III sistemine göre hazırlanıp yayınlanmıştır. fakat bir kısım etiketlemeler buraya eklenmemiştir.Bir kısım APG II sisteminde belirtilen parantez familyalara APG III sisteminde yer verilmemiştir ancak alt familya olarak bu familyalar istenirse gösterilebilir.. Bunlar aşağıda gösterilmiştir.The APG III paper: An update of the Angiosperm Phylogeny Group classification for the orders and families of flowering plants: APG IIIThe LAPG III paper: The Linear Angiosperm Phylogeny Group (LAPG) III: a linear sequence of the families in APG IIIThe phylogenetic classification of land plants paper: A phylogenetic classification of the land plants to accompany APG III