Patent AR-123483-A1 (AR)
Title: Enzimas modificadoras de adn y fragmentos activos y variantes de las mismas y métodos de uso
IPC: C12N15/62
Filed: 2021-09-10
Abstract: Se proporcionan composiciones y métodos que comprenden nuevos polipéptidos de desaminasa para la edición dirigida de ácidos nucleicos. Las composiciones comprenden polipéptidos de desaminasa. También se proporcionan proteínas de fusión que comprenden un polipéptido de unión a ADN y una desaminasa de la invención. Las proteínas de fusión incluyen nucleasas guiadas por ARN fusionadas con desaminasas, opcionalmente en complejo con ARN guía. Las composiciones también incluyen moléculas de ácido nucleico que codifican las desaminasas o las proteínas de fusión. También se proporcionan vectores y células huésped que comprenden las moléculas de ácido nucleico que codifican las desaminasas o las proteínas de fusión.  Reivindicación 1: Un polipéptido aislado que comprende una secuencia de aminoácidos que tiene al menos un 90% de identidad de secuencia con cualquiera de las SEQ ID Nº 407, 399, 405, 1 - 10, 400 - 404, 406 y 408 - 441, en donde dicho polipéptido tiene actividad de desaminasa. Reivindicación 2: Una molécula de ácido nucleico que comprende un polinucleótido que codifica un polipéptido de desaminasa, donde la desaminasa está codificada por una secuencia de nucleótidos que: a) tiene al menos un 80% de identidad de secuencia con cualquiera de las SEQ ID Nº 451, 449, 443, 11 - 20, 444 - 448, 450 y 452 - 485, o b) codifica una secuencia de aminoácidos que tiene al menos un 90% de identidad de secuencia con cualquiera de las SEQ ID Nº 407, 399, 405, 1 - 10, 400 - 404, 406 y 408 - 441. Reivindicación 5: Una proteína de fusión que comprende un polipéptido de unión a ADN y una desaminasa que tiene al menos un 90% de identidad de secuencia con cualquiera de las SEQ ID Nº 407, 399, 405, 1 - 10, 400 - 404, 406 y 408 - 441. Reivindicación 86: Una molécula de ácido nucleico que comprende un polinucleótido que codifica un polipéptido de nucleasa guiada por ARN (RGN), en donde dicho polinucleótido comprende una secuencia de nucleótidos que codifica un polipéptido RGN que comprende una secuencia de aminoácidos que tiene al menos un 95% de identidad de secuencia con la SEQ ID Nº 41 ó 60, pero que carecen de los residuos de aminoácidos 590 a 597 de SEQ ID Nº 41 ó 60; en donde dicho polipéptido RGN es capaz de unirse a una secuencia de ADN diana de una manera específica de secuencia guiada por ARN cuando se une a un ARN guía (ARNg) capaz de hibridar con dicha secuencia de ADN diana. Reivindicación 91: Un polipéptido aislado que comprende una secuencia de aminoácidos que tiene al menos un 95% de identidad de secuencia con SEQ ID Nº 41 ó 60, pero que carece de los residuos de aminoácidos 590 a 597 de SEQ ID Nº 41 ó 60, en donde dicho polipéptido es una nucleasa guiada por ARN. Reivindicación 96: Un polipéptido aislado que comprende una secuencia de aminoácidos que tiene al menos un 90% de identidad de secuencia con la SEQ ID Nº 407, en donde dicho polipéptido tiene actividad desaminasa. Reivindicación 98: Una molécula de ácido nucleico que comprende un polinucleótido que codifica un polipéptido de desaminasa, en donde la desaminasa está codificada por una secuencia de nucleótidos que: a) tiene al menos un 80% de identidad de secuencia con SEQ ID Nº 451, o b) codifica una secuencia de aminoácidos que tiene al menos un 90% de identidad de secuencia con cualquiera de SEQ ID Nº 407. Reivindicación 135: Una molécula de ácido nucleico que comprende un polinucleótido que codifica un polipéptido de desaminasa, en donde la desaminasa está codificada por una secuencia de nucleótidos que: a) tiene al menos un 80% de identidad de secuencia con SEQ ID Nº 449, o b) codifica una secuencia de aminoácidos que tiene al menos un 90% de identidad de secuencia con cualquiera de SEQ ID Nº 405. Reivindicación 138: Una proteína de fusión que comprende un polipéptido de unión a ADN y una desaminasa que tiene al menos un 90% de identidad de secuencia con la SEQ ID Nº 405. Reivindicación 144: Una molécula de ácido nucleico que comprende un polinucleótido que codifica una proteína de fusión que comprende un polipéptido de unión al ADN y una desaminasa, en donde la desaminasa está codificada por una secuencia de nucleótidos que: a) tiene al menos un 80% de identidad de secuencia con SEQ ID Nº 449, o b) codifica una secuencia de aminoácidos que tiene al menos un 90% de identidad de secuencia con la SEQ ID Nº 405. Reivindicación 170: Un polipéptido aislado que comprende una secuencia de aminoácidos que tiene al menos un 90% de identidad de secuencia con la SEQ ID Nº 399, en donde dicho polipéptido tiene actividad desaminasa. Reivindicación 172: Una molécula de ácido nucleico que comprende un polinucleótido que codifica un polipéptido de desaminasa, en donde la desaminasa está codificada por una secuencia de nucleótidos que: a) tiene al menos un 80% de identidad de secuencia con SEQ ID Nº 443, o b) codifica una secuencia de aminoácidos que tiene al menos un 90% de identidad de secuencia con cualquiera de SEQ ID Nº 399. Reivindicación 181: Una molécula de ácido nucleico que comprende un polinucleótido que codifica una proteína de fusión que comprende un polipéptido que se une al ADN y una desaminasa, en donde la desaminasa está codificada por una secuencia de nucleótidos que: a) tiene al menos un 80% de identidad de secuencia con SEQ ID Nº 443, o b) codifica una secuencia de aminoácidos que tiene al menos un 90% de identidad de secuencia con la SEQ ID Nº 399.