Patent AR-123489-A1 (AR)
Title: AGENTES DE ARNi PARA INHIBIR LA EXPRESIÓN DE DUX4, COMPOSICIONES DE DICHOS AGENTES, Y MÉTODOS DE USO
Inventor: DING ZHI
IPC: C12N15/11
Filed: 2021-09-10
Abstract: Se describen agentes de ARNi, composiciones que incluyen agentes de ARNi, y métodos para inhibir un gen doble homebox 4 (DUX4). Los agentes de ARNi contra DUX4 y los conjugados de agentes de ARNi que se divulgan en la presente memoria inhiben la expresión de un gen DUX4. También se describen composiciones farmacéuticas que incluyen uno o más agentes de ARNi contra DUX4, opcionalmente con uno o más agentes terapéuticos adicionales. El transporte de los agentes de ARNi contra DUX4 descritos hasta las células de músculo esquelético en vivo, causa la inhibición de la expresión del gen DUX4 y la disminución en niveles de DUX4, lo cual puede causar un efecto beneficioso a los sujetos, incluidos los sujetos humanos, que padecen ciertas enfermedades o trastornos relacionados con las células de músculo esquelético incluida la distrofia muscular facioescapulohumeral (FSHD).  Reivindicación 1: Un agente de ARNi para inhibir la expresión de un gen doble homebox 4 (DUX4), que comprende: i. una hebra antisentido que comprende al menos 17 nucleótidos contiguos que difieren en 0 ó 1 nucleótidos de una cualquiera de las secuencias que se muestran en la Tabla 2, Tabla 3, o Tabla 5.4; y ii. una hebra sentido que comprende una secuencia de nucleótidos que es al menos parcialmente complementaria con la hebra antisentido. Reivindicación 31: Un agente de ARNi conforme a una cualquiera de las reivindicaciones 1 - 30, que comprende: (i) una hebra antisentido que consiste en, consiste esencialmente en, o comprende la secuencia de nucleótidos modificada (de 5 a 3) usAfsGfsAfauuucacGfgAfaGfaacasg (SEQ ID Nº 82), y una hebra sentido que consiste en, consiste esencialmente en, o comprende la secuencia de nucleótidos modificada (de 5 a 3) cuguucuuCfCfGfugaaauucua (SEQ ID Nº 149); (ii) una hebra antisentido que consiste en, consiste esencialmente en, o comprende la secuencia de nucleótidos modificada (de 5 a 3) cPrpusAfsGfsAfauuucacGfgAfaGfaacasg (SEQ ID Nº 84), y una hebra sentido que consiste en, consiste esencialmente en, o comprende la secuencia de nucleótidos modificada (de 5 a 3) cuguucuuCfCfGfugaaauucua (SEQ ID Nº 149); (iii) una hebra antisentido que consiste en, consiste esencialmente en, o comprende la secuencia de nucleótidos modificada (de 5 a 3) cPrpusAfsgsAfauuucacGfgAfaGfaacasg (SEQ ID Nº 100), y una hebra sentido que consiste en, consiste esencialmente en, o comprende la secuencia de nucleótidos modificada (de 5 a 3) cuguucuuCfCfGfugaaauucua (SEQ ID Nº 149); (iv) una hebra antisentido que consiste en, consiste esencialmente en, o comprende la secuencia de nucleótidos modificada (de 5 a 3) cPrpusAfsGfsaauuucacGfgAfaGfaacasg (SEQ ID Nº 101), y una hebra sentido que consiste en, consiste esencialmente en, o comprende la secuencia de nucleótidos modificada (de 5 a 3) cuguucuuCfCfGfugaaauucua (SEQ ID Nº 149); (v) una hebra antisentido que consiste en, consiste esencialmente en, o comprende la secuencia de nucleótidos modificada (de 5 a 3) cPrpusGfsasaaccagauCfuGfaAfuccusg (SEQ ID Nº 97), y una hebra sentido que consiste en, consiste esencialmente en, o comprende la secuencia de nucleótidos modificada (de 5 a 3) caggauucAfGfAfucugguuuca (SEQ ID Nº 147); (vi) una hebra antisentido que consiste en, consiste esencialmente en, o comprende la secuencia de nucleótidos modificada (de 5 a 3) cPrpusGfsasAfaccagauCfuGfaAfuccusg (SEQ ID Nº 99), y una hebra sentido que consiste en, consiste esencialmente en, o comprende la secuencia de nucleótidos modificada (de 5 a 3) caggauucAfGfAfucugguuuca (SEQ ID Nº 147); (vii) una hebra antisentido que consiste en, consiste esencialmente en, o comprende la secuencia de nucleótidos modificada (de 5 a 3) cPrpusGfsasAfaCfcAfgAfuCfuGfaAfuCfcUfsg (SEQ ID Nº 75), y una hebra sentido que consiste en, consiste esencialmente en, o comprende la secuencia de nucleótidos modificada (de 5 a 3) caggauucAfGfAfucugguuuca (SEQ ID Nº 147); (viii) una hebra antisentido que consiste en, consiste esencialmente en, o comprende la secuencia de nucleótidos modificada (de 5 a 3) usGfsasaaccagauCfuGfaAfuccusg (SEQ ID Nº 96), y una hebra sentido que consiste en, consiste esencialmente en, o comprende la secuencia de nucleótidos modificada (de 5 a 3) caggauucAfGfAfucugguuuca (SEQ ID Nº 147); (ix) una hebra antisentido que consiste en, consiste esencialmente en, o comprende la secuencia de nucleótidos modificada (de 5 a 3) cPrpusUfsgsAfaAfcCfaGfaUfcUfgAfaUfcCfsu (SEQ ID Nº 76), y una hebra sentido que consiste en, consiste esencialmente en, o comprende la secuencia de nucleótidos modificada (de 5 a 3) aggauucaGfAfUfcugguuucaa (SEQ ID Nº 148); (x) una hebra antisentido que consiste en, consiste esencialmente en, o comprende la secuencia de nucleótidos modificada (de 5 a 3) cPrpusUfsgsaaaccagaUfcUfgAfauccsc (SEQ ID Nº 89), y una hebra sentido que consiste en, consiste esencialmente en, o comprende la secuencia de nucleótidos modificada (de 5 a 3) gggauucaGfAfUfcugguuucaa (SEQ ID Nº 156); o (xi) una hebra antisentido que consiste en, consiste esencialmente en, o comprende la secuencia de nucleótidos modificada (de 5 a 3) cPrpusUfsgsAfaAfcCfaGfaUfcUfgAfaUfcCfsc (SEQ ID Nº 87), y una hebra sentido que consiste en, consiste esencialmente en, o comprende la secuencia de nucleótidos modificada (de 5 a 3) gggauucaGfaUfCfugguuucaa (SEQ ID Nº 159); donde a, c, g, y u representan 2-O-metil adenosina, 2-O-metil citidina, 2-O-metil guanosina, y 2-O-metil uridina, respectivamente; Af, Cf, Gf, y Uf representan 2-fluoro adenosina, 2-fluoro citidina, 2-fluoro guanosina, y 2-fluoro uridina, respectivamente; cPrpu representa un 5-ciclopropil fosfonato2-O-metil uridina; s representa una unión de fosforotioato; y donde la respectiva hebra sentido asimismo opcionalmente incluye un residuo abásico invertido en el extremo terminal 3 de la secuencia de nucleótidos y en el extremo terminal 5 de la secuencia de nucleótidos; y siendo que la hebra sentido también opcionalmente incluye un ligando dirigido a la diana que está unido covalentemente al residuo abásico invertido en el extremo terminal 5 de la hebra sentido, donde el ligando dirigido a la diana posee afinidad por células de músculo esquelético y/o un receptor presente en células de músculo esquelético, y donde la hebra sentido asimismo opcionalmente incluye un modulador PK / PD que está unido covalentemente al residuo abásico invertido en el extremo terminal 3 de la hebra sentido. Reivindicación 40: Una composición farmacéutica que comprende el agente de ARNi conforme a una cualquiera de las reivindicaciones 1 - 39, donde la composición asimismo comprende un excipiente apto para uso farmacéutico. Reivindicación 41: Un método para inhibir la expresión de un gen DUX4 en una célula, el método que comprende introducir en una célula cantidad efectiva de un agente de ARNi conforme a una cualquiera de las reivindicaciones 1 - 39 o la composición conforme a la reivindicación 40. Reivindicación 54: Una composición para inhibir la expresión de un gen doble homebox 4 (DUX4), la composición que comprende: i. un agente de ARNi que comprende una hebra antisentido de 18 a 49 nucleótidos de longitud que es al menos parcialmente complementaria con una porción de SEQ ID Nº 1 o SEQ ID Nº 2; ii. un ligando dirigido a la diana unido al agente de ARNi, donde el ligando dirigido a la diana posee afinidad por células de músculo esquelético; y iii. un modulador PK / PD unido al agente de ARNi. Reivindicación 55: Un agente de ARNi para inhibir la expresión de un gen doble homebox 4 (DUX4), que comprende: i. una hebra sentido que comprende una secuencia de nucleótidos que comprende al menos 15 nucleótidos contiguos que difieren en 0, 1, 2, ó 3 nucleótidos de un tramo de 15 nucleótidos contiguos de SEQ ID Nº 1; y ii. una hebra antisentido que comprende una secuencia de nucleótidos que es al menos parcialmente complementaria con la hebra sentido. Reivindicación 56: Un agente de ARNi para inhibir la expresión de un gen doble homebox 4 (DUX4), que comprende: i. una hebra antisentido que comprende una secuencia de nucleótidos que comprende al menos 15 nucleótidos contiguos que son al menos parcialmente complementaria con un tramo de 15 nucleótidos contiguos de SEQ ID Nº 1; y ii. una hebra sentido que comprende una secuencia de nucleótidos que es al menos parcialmente complementaria con la hebra antisentido.