Patent ES-2543455-T3 (ES)
Title: Métodos para identificar los hábitats de insectos
Inventor: YAMAUCHI HIROMASA
IPC: G16B10/00
Filed: 2009-09-17
Granted: 2015-08-19
Abstract: Un método para preparar un criterio basado en polimorfismos de nucleótidos únicos para identificar el hábitat de Tribolium castaneum o Rhyzopertha dominica, que comprende las etapas de: (a) determinar las secuencias de nucleótidos del ADN de uno o más insectos de dos o más hábitats; (b) alinear las secuencias de nucleótidos determinadas en dicha etapa (a); (c) eliminar sitios que consisten en uno o más nucleótidos conservados en todas las secuencias de nucleótidos alineadas en dicha etapa (b) a partir de las secuencias de nucleótidos; (d) definir todos o parte de los sitios que permanecen tras la eliminación en dicha etapa (c) como sitios discriminadores de tipos; (e) comparar nucleótidos que se corresponden entre sí en los sitios discriminadores de tipos obtenidos en dicha etapa (d) para clasificar sitios que discriminan tipos completamente idénticos como el mismo tipo y sitios que discriminan tipos incompletamente idénticos como uno o más tipos diferentes; y (f) determinar el hábitat de cada tipo clasificado en dicha etapa (e) sobre la base de los hábitats de insectos que pertenecen a cada tipo, definiendo por tanto el sitio discriminador de tipo de cada tipo como un criterio, donde el ADN es el gen de la subunidad I de la citocromo oxidasa mitocondrial (COI) y/o el gen de la subunidad de la NADH deshidrogenasa (NDS), y donde dicho sitio discriminador de tipo es al menos uno del siguiente grupo para el hábitat de Tribolium castaneum: (1) un sitio discriminador de tipo caracterizado por uno o más de los siguientes: el nucleótido 229º contado desde el extremo 5' de la secuencia de nucleótidos que se muestra en la SEC ID Nº: 1 es G, el nucleótido 253º es T, y el nucleótido 298º es G, y/o un sitio discriminador de tipo caracterizado por lo siguiente: el nucleótido 248º contado desde el extremo 5' de la secuencia de nucleótidos que se muestra en la SEC ID Nº: 8 es A; (2) un sitio discriminador de tipo caracterizado por uno o más de los siguientes: el nucleótido 121º contado desde el extremo 5' de la secuencia de nucleótidos que se muestra en la SEC ID Nº: 2 es G, y el nucleótido 331º es G, y/o un sitio discriminador de tipo caracterizado por uno o más de los siguientes: el nucleótido 248º contado desde el extremo 5' de la secuencia de nucleótidos que se muestra en la SEC ID Nº: 9 es G, y el nucleótido 308º es A; (3) un sitio discriminador de tipo caracterizado por los siguientes: el nucleótido 370º contado desde el extremo 5' de la secuencia de nucleótidos que se muestra en la SEC ID Nº: 3 es C, y/o un sitio discriminador de tipo caracterizado por uno o más de los siguientes: el nucleótido 359º contado desde el extremo 5' de la secuencia de nucleótidos que se muestra en la SEC ID Nº: 10 es A, y el nucleótido 419º es A; (4) un sitio discriminador de tipo caracterizado por los siguientes: el nucleótido 121º contado desde el extremo 5' de la secuencia de nucleótidos que se muestra en la SEC ID Nº: 4 es A, y/o un sitio discriminador de tipo caracterizado por uno o más de los siguientes: el nucleótido 248º contado desde el extremo 5' de la secuencia de nucleótidos que se muestra en la SEC ID Nº: 9 es G, y el nucleótido 308º es A; (5) un sitio discriminador de tipo caracterizado por los siguientes: el nucleótido 370º contado desde el extremo 5' de la secuencia de nucleótidos que se muestra en la SEC ID Nº: 5 es C, y/o un sitio discriminador de tipo caracterizado por uno o más de los siguientes: el nucleótido 248º contado desde el extremo 5' de la secuencia de nucleótidos que se muestra en la SEC ID Nº: 9 es G, y el nucleótido 308º es A; (6) un sitio discriminador de tipo caracterizado por uno o más de los siguientes: el nucleótido 22º contado desde el extremo 5' de la secuencia de nucleótidos que se muestra en la SEC ID Nº: 6 es T, el nucleótido 142º es G, y el nucleótido 317º es C, y/o un sitio discriminador de tipo caracterizado por uno o más de los siguientes: el nucleótido 200º contado desde el extremo 5' de la secuencia de nucleótidos que se muestra en la SEC ID Nº: 11 es T, el nucleótido 248º es G, el nucleótido 308º es C, el nucleótido 359º es G y el nucleótido 419º es G; (7) un sitio discriminador de tipo caracterizado por los siguientes: el nucleótido 317º contado desde el extremo 5' de la secuencia de nucleótidos que se muestra en la SEC ID Nº: 7 es T, y/o un sitio discriminador de tipo caracterizado por lo siguiente: el nucleótido 200º contado desde el extremo 5' de la secuencia de nucleótidos que se muestra en la SEC ID Nº: 12 es C; y donde dicho sitio discriminador de tipo es el siguiente para el hábitat de Rhyzopertha dominica: (8) un sitio discriminador de tipo caracterizado por los siguientes: el nucleótido 160º contado desde el extremo 5' de la secuencia de nucleótidos que se muestra en la SEC ID Nº: 34 es T.